Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LR134169 | Actinobacillus lignieresii strain NCTC10568 genome assembly, chromosome: 1 | 1 crisprs | DinG,DEDDh,csa3,cas8f,cas5f,cas7f,cas6f,cas1,cas3-cas2,PD-DExK,cas3 | 7 | 16 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LR134169_1 | 1317304-1318954 | TypeI-F |
I-F
Consensus repeat of LR134169_1
|
27 spacers
spacers of LR134169_1
>1.1|1317332|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT AACATTAAAGAACATTTACAAAATAGGTAATC >1.2|1317392|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT AAATGAACCAAAATTAAAACTTGTTGCTTAAT >1.3|1317452|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT ATCATCATTGCACTAGTTGAGCCCAACACTCC >1.4|1317512|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT TTTGACCGCTGTAACAAGCGGTCTTTTTTTAC >1.5|1317572|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT ATACAATTTCTTGATGATAAAGGCGATTACGA >1.6|1317632|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT TTATTGCCAAGTGAAGTAATGACGAAATGGGT >1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT AATAAGGTTGCCGCATACAAAGTAATTAATTT >1.8|1317752|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT AAGAAGATTGCTTAGTTCGATTAAAACATCAT >1.9|1317812|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT CTCCATTTGTTCGAATATAATGGTTTGGTAAA >1.10|1317872|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT AAAATCGATTTCTATACACTATTCGATAACTG >1.11|1317932|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT AACTCCGGCATATACTAATAGTGACATAGACG >1.12|1317992|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT TTACTGAATTTATCAGAATAATAGGCTTTTAA >1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT AGGCACAGAATCTTTTTGTAGCAACCACTTTT >1.14|1318112|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT CCAAGCGAACATTGAAGCTATACTCCCCTCTA >1.15|1318172|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT GTTATGTCCGGAGGAAACCACATTAATAAAAT >1.16|1318232|33|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT TTGCCGAGGTGCTTTTTCTTTTTCCTTTCACTT >1.17|1318293|33|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT AACCACGCCCAAGCTATACATCGTTCAAAATCA >1.18|1318354|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT TTTCTTTCCTCTATCATATCCAACCACGCCCA >1.19|1318414|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT GCCGGAACCTAAAAGAATCGATAAAGACACAC >1.20|1318474|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT TATCCTGCTTTAGAAAATTTGAAGAACTAGCC >1.21|1318534|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT TGATGAAATCATTAACAGCCCGATTGCCCGTG >1.22|1318594|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT AAGTTTCGCTAGGTGCTGGCGGCGCGAACATC >1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT TCCTCAAAAGGTCAATAAAAAATCTTTGTTAA >1.24|1318714|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT ACCGAAACGTTTACCCCATTTTTCATCAACCC >1.25|1318774|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT AGCGAATAAAAAAATATCGAAGTTAGATGGAT >1.26|1318834|33|LR134169|CRISPRCasFinder AACAATTCGCACAATGCCATCTTCGATAGAATC >1.27|1318895|32|LR134169|CRISPRCasFinder GCCGGAACCTAAAAGAATTGATAAAGACACAC >1.28|1318834|32|LR134169|CRT AACAATTCGCACAATGCCATCTTCGATAGAAT >1.29|1318894|33|LR134169|CRT AGCCGGAACCTAAAAGAATTGATAAAGACACAC |
cas6f,cas7f,cas5f,cas8f,cas1,cas3-cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134169_1
The CRISPR arrays of LR134169_1 >merge|LR134169|1|1317304-1318954|CRISPRCasFinder,CRT CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAAACATTAAAGAACATTTACAAAATAGGTAATCCTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAAAATGAACCAAAATTAAAACTTGTTGCTTAATCTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAATCATCATTGCACTAGTTGAGCCCAACACTCCCTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAATTTGACCGCTGTAACAAGCGGTCTTTTTTTACCTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAATACAATTTCTTGATGATAAAGGCGATTACGACTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAATTATTGCCAAGTGAAGTAATGACGAAATGGGTCTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAAATAAGGTTGCCGCATACAAAGTAATTAATTTCTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAAAGAAGATTGCTTAGTTCGATTAAAACATCATCTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAACTCCATTTGTTCGAATATAATGGTTTGGTAAACTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAAAAATCGATTTCTATACACTATTCGATAACTGCTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAAACTCCGGCATATACTAATAGTGACATAGACGCTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAATTACTGAATTTATCAGAATAATAGGCTTTTAACTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAAGGCACAGAATCTTTTTGTAGCAACCACTTTTCTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAACCAAGCGAACATTGAAGCTATACTCCCCTCTACTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAGTTATGTCCGGAGGAAACCACATTAATAAAATCTTCACTGCCGTATAGGCAGTTTAGAAATTGCCGAGGTGCTTTTTCTTTTTCCTTTCACTTCTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAAACCACGCCCAAGCTATACATCGTTCAAAATCACTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAATTTCTTTCCTCTATCATATCCAACCACGCCCACTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAGCCGGAACCTAAAAGAATCGATAAAGACACACCTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAATATCCTGCTTTAGAAAATTTGAAGAACTAGCCCTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAATGATGAAATCATTAACAGCCCGATTGCCCGTGCTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAAAGTTTCGCTAGGTGCTGGCGGCGCGAACATCCTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAATCCTCAAAAGGTCAATAAAAAATCTTTGTTAACTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAACCGAAACGTTTACCCCATTTTTCATCAACCCCTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAAGCGAATAAAAAAATATCGAAGTTAGATGGATCTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAAACAATTCGCACAATGCCATCTTCGATAGAATCTTCACTGCCCGTATAGGCAGCTTAGAAAGCCGGAACCTAAAAGAATTGATAAAGACACACCTTCACTGCCGTATAGGCAGCCACAAAT >LR134169|1|1|1317304-1318954|CRISPRCasFinder CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AACATTAAAGAACATTTACAAAATAGGTAATC CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AAATGAACCAAAATTAAAACTTGTTGCTTAAT CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATCATCATTGCACTAGTTGAGCCCAACACTCC CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TTTGACCGCTGTAACAAGCGGTCTTTTTTTAC CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATACAATTTCTTGATGATAAAGGCGATTACGA CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TTATTGCCAAGTGAAGTAATGACGAAATGGGT CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AATAAGGTTGCCGCATACAAAGTAATTAATTT CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AAGAAGATTGCTTAGTTCGATTAAAACATCAT CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA CTCCATTTGTTCGAATATAATGGTTTGGTAAA CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AAAATCGATTTCTATACACTATTCGATAACTG CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AACTCCGGCATATACTAATAGTGACATAGACG CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TTACTGAATTTATCAGAATAATAGGCTTTTAA CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AGGCACAGAATCTTTTTGTAGCAACCACTTTT CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA CCAAGCGAACATTGAAGCTATACTCCCCTCTA CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA GTTATGTCCGGAGGAAACCACATTAATAAAAT CTTCACTGCCGTATAGGCAGTTTAGAAA TTGCCGAGGTGCTTTTTCTTTTTCCTTTCACTT CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AACCACGCCCAAGCTATACATCGTTCAAAATCA CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TTTCTTTCCTCTATCATATCCAACCACGCCCA CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA GCCGGAACCTAAAAGAATCGATAAAGACACAC CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TATCCTGCTTTAGAAAATTTGAAGAACTAGCC CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TGATGAAATCATTAACAGCCCGATTGCCCGTG CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AAGTTTCGCTAGGTGCTGGCGGCGCGAACATC CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TCCTCAAAAGGTCAATAAAAAATCTTTGTTAA CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ACCGAAACGTTTACCCCATTTTTCATCAACCC CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AGCGAATAAAAAAATATCGAAGTTAGATGGAT CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AACAATTCGCACAATGCCATCTTCGATAGAATC TTCACTGCCCGTATAGGCAGCTTAGAAA GCCGGAACCTAAAAGAATTGATAAAGACACAC CTTCACTGCCGTATAGGCAGCCACAAAT >LR134169|1|1|1317304-1318954|CRT CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AACATTAAAGAACATTTACAAAATAGGTAATC CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AAATGAACCAAAATTAAAACTTGTTGCTTAAT CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATCATCATTGCACTAGTTGAGCCCAACACTCC CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TTTGACCGCTGTAACAAGCGGTCTTTTTTTAC CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATACAATTTCTTGATGATAAAGGCGATTACGA CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TTATTGCCAAGTGAAGTAATGACGAAATGGGT CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AATAAGGTTGCCGCATACAAAGTAATTAATTT CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AAGAAGATTGCTTAGTTCGATTAAAACATCAT CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA CTCCATTTGTTCGAATATAATGGTTTGGTAAA CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AAAATCGATTTCTATACACTATTCGATAACTG CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AACTCCGGCATATACTAATAGTGACATAGACG CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TTACTGAATTTATCAGAATAATAGGCTTTTAA CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AGGCACAGAATCTTTTTGTAGCAACCACTTTT CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA CCAAGCGAACATTGAAGCTATACTCCCCTCTA CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA GTTATGTCCGGAGGAAACCACATTAATAAAAT CTTCACTGCCGTATAGGCAGTTTAGAAA TTGCCGAGGTGCTTTTTCTTTTTCCTTTCACTT CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AACCACGCCCAAGCTATACATCGTTCAAAATCA CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TTTCTTTCCTCTATCATATCCAACCACGCCCA CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA GCCGGAACCTAAAAGAATCGATAAAGACACAC CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TATCCTGCTTTAGAAAATTTGAAGAACTAGCC CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TGATGAAATCATTAACAGCCCGATTGCCCGTG CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AAGTTTCGCTAGGTGCTGGCGGCGCGAACATC CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TCCTCAAAAGGTCAATAAAAAATCTTTGTTAA CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ACCGAAACGTTTACCCCATTTTTCATCAACCC CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AGCGAATAAAAAAATATCGAAGTTAGATGGAT CTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AACAATTCGCACAATGCCATCTTCGATAGAAT CTTCACTGCCCGTATAGGCAGCTTAGAA AGCCGGAACCTAAAAGAATTGATAAAGACACAC CTTCACTGCCGTATAGGCAGCCACAAAT
>LR134169.1|VEB26589.1|1316591_1317161_+|CRISPR-associated-protein-Cas6/Csy4,-subtype-I-F/YPEST MSELTHYIELKAIPQVDILQTNVIAHGLQILHKFLPLYQGEIGLSFPAYGLGRTLGGIIRVFGNEQHCTQIKTQLIGEGLQDYVLITSVTPVPEEIVEYHRYQRVHRKGQSAIRRTEQFLVQQGKWTEEIRQEMLIHQQNQKVFPHVKLKSGSTKQHFVLAIRQLRLADSVSGLFNAYGLSKIATVPHF >LR134169.1|VEB26588.1|1315593_1316589_+|CRISPR-associated-protein MTKLTTASVLAFERKLDISDATFTQKNSMSDAPEIAVTIREKSVRGTISNRLKNALANDPAKLDAEIEKANLQCVDVATLNDDYDTLVARFTCKVLPFEGKPNVCNDPEYQAKLLSTIQNYLTAHGMSELAKRYATNLANARWLWRNRISAETIQVSIKVADDVIVFENAKQLPLNSFEQADEKLQKIASYIEKGLKGEEFIILEVEAQAKMGRGQEVYPSQELVLDTGTRKSKILYEINNKAGMHSQKIGNAIRTIDTWYAENAPFPIAAEPYGAVTNLGTAFRQPKEKIDFYTLFDNWVLKDVAPELEQQHYVISVLIRGGVFGASGKE >LR134169.1|VEB26587.1|1314632_1315592_+|CRISPR-associated-protein MNYPNFYLLFDHIEIQAANTISSPITYGFPALTGFTGTIHALSRKLFSQQVELGGVMIACHDYQILGYKNSDFSDLTFNQTRNPLKKNGDSPSIIEEGKIHLDISLVVEMEVKDPELYYALNSQDSEQKTQFLEHCKKLLMQQRIAGGSVFQIENVELFNLSEESEIKLALMPAFVLMDAKQILADITQSLQNGISNNEITIYPATPNANVLDALLEVATLHHIPLSENATSQEWETFNVNQGKGWLVPIPVGYQAISPLFTAGEMQNCRVTEYPSQYVETVYSLGKWVFPFSLPDDLSQCFWHYNTPQDNLYLITQGA >LR134169.1|VEB26586.1|1313288_1314623_+|CRISPR-associated-protein MITPLQIRAKIIDFLQAQHLKKSENDYKKLEKATEPEEIAKIKAEISKSEEKYRLDAWLHIAATEMAKQLKFGTHIAKGIHPDAKGNNINFRANLNLPATLVGSQLIDKLVLDANGNAAALPLAAFFDIMVDEVNKRTLKDLLLTDEPCLDGCFSDDHSLSAQYKIAFQMALKGNLNSPETHERNKQVLWVNSSSAIEDNHYTCLIPLYPSSFTHAIYNKLNQARFSEENKQARENRYKNKAQNPYISIPHLAATKLGGTKPQNVSLLTSKQGGRNYLLPSLPPIFTKGELRLTGTQNTIFNDRLTYVCRAGLYQLYQAVEAPKNIYTIRDSRAEAINLIVQIVLQQAYKLQKRTAGWSRDYQLAWCEKYWLDPQRAKLNGEEQFHSALTQQDWISEVEQRFAAWLNALLKKRFPKYQDDFTATEYNEWRKYFRKKLHRQLRHI >LR134169.1|VEB26585.1|1310951_1312883_-|threonyl-tRNA-synthetase MPIITLPDGSQRQFDNPVSVMEVAQSIGAGLAKATIAGRVNGERCDACDIISEDSSLEIITAKDEDGLEIIRHSCAHLLGHAIKQLFPDVKMAIGPTIDNGFYYDVDLDRSLTQEDLDAIEKRMLELAKTNYDVVKKPVSWQEARDTFEKRGEPYKMAILDENIERTATPALYHHEEYIDMCRGPHVPNMRFCHHFKLQKVAGAYWRGDSKNKMLQRIYGTAWADKKQLAEYLTRLEEAAKRDHRRIGKALDLYHMQEEAPGMVFWHNDGWTIFRELETFVRTKLKEYDYQEVKGPFMMDRVLWERTGHWQNYADLMFTTQSENREYAIKPMNCPGHVQIFNQGLKSYRDLPIRMAEFGSCHRNEPSGSLHGLMRVRGFTQDDAHIFCTEDQIESEVTSCIRMVYDIYSTFGFSNIQVKLSTRPENRIGDDAMWDRAEDGLAKALTANGLSYEIQEGEGAFYGPKIEFALRDCLDREWQCGTIQLDFALPGRLDASYVAEDNGRRTPVMIHRAILGSIERFIGIITEEYAGFFPTWLAPTQAVVMNITDSQADYVQKVTKALSDAGIRAKSDLRNEKVGFKVREHTLRRVPYMLVCGDKEIEAGKVSVRTRKGADLGTFTIEEFVEILKNQVKARELKLLGEE >LR134169.1|VEB26584.1|1310208_1310688_-|translation-initiation-factor-IF-3 MKEVRLTDGNGEQVGIVSIQDALARAEDAELDLVEISPNAEPPVCRIMNYGKFIYEKEKAAKEQKKKQKVVQIKEIKFRPGTDDGDYQIKLRSILRFLEDGDKVKITVRFRGREMAHQDIGLDVLERVKTDTAEVAVVESAPGKLEGRQAVMVIAPKKK >LR134169.1|VEB26583.1|1309765_1309963_-|50S-ribosomal-protein-L35 MPKIKTVRGAAKRFKKTASGGFKRKQSHLRHILTKKTTKRKRHLRHKSMVAKADQVLVVACLPYA >LR134169.1|VEB26582.1|1309344_1309698_-|50S-ribosomal-protein-L20 MARVKRGVIARARHKKVLKAAKGYYGARSRVYRVAFQAVIKAGQYAYRDRRQRKRQFRQLWIARINAAARQNGLSYSKFINGLKKASVEIDRKILADIAVFDKVAFAALVEKAKSAL >LR134169.1|VEB26581.1|1308759_1309296_-|Uncharacterised-protein MRKLIIIRGHSGSGKSTFAKQKIAEFEQHFPSGKVFHIEHDQFLYENGEYIWTKERFQSAKMLAEQKLALAWEFAKSHPQLPVFIVISNVNLSLQAVEKYQNIANSLQMKIEKYRLMNFFKNQHHVDIYTVLSMYLALEQQPLVDEVIVRPIKKMPYFMRIILEKMRKRRDKKDIQAV >LR134169.1|VEB26580.1|1308428_1308728_-|Uncharacterised-protein MKKVMLLALPFVVAACSAPEQQSTVPMDMQAVAEYQQRVASGNTVSEKQKQRVAQQIEPDEPLNQSDKRPKVVRQVVREPVIYPSIGIGYGYHRHRHHW >LR134169.1|VEB26590.1|1318990_1319635_+|CRISPR-associated-protein MKKTPYIPSSDLKTILHSKRANIYYLEHCRILLNGGRVEYVTDKGNESLYWNIPIANTICLLLGSGTSITQAAMRELSKAGVMVGFCSGGGTPLFNGTEAEIGCDFFSPQSEYRPVEYLQQWCRFWFDDNKRLNSAKTLQLARLQLLLRTWNKFDWEYDQDKLTALVQHYQEEFTNVKDSQSLLAAEGRLTAKLYALANQATLNDESFKRENGG >LR134169.1|VEB26591.1|1319708_1320341_-|Uncharacterised-protein MDTTHFKQRFAVLVLVDSLSSKPVYFRFIPAEKNQYYFEAISELMEKGIKIQSITCDGRRGLLNAYPDIPTQMCHFHQVGRGIFYLTKSPKSPAGKALLELYYSLKSYTKETLNQALLQWLNEYKTYFNERSEHNAKRFKHKRLRSAYWSLKRSINYLFTYQDYPELHIAHTTNLVESFFKLMKAKLAPHQGLTDEHKMVFIKDFICQRS >LR134169.1|VEB26592.1|1320725_1321022_+|CRISPR-associated-protein MDHGNYLAYGLGATACWVLGLPHGLAILHGKTRRGGLVFDAADIIKDAIILPQAFISAQNGDNEKQFRQACINNLIRFEALDIIINTLKQLASEGANI >LR134169.1|VEB26593.1|1321018_1324366_+|helicase MNILLISQCNKNALTETRRILDQFAERCGDRCWQTAITQAGLEALHNMLRQTARKNTAVACYWTHGKNLTELLWIVGDKSQFNAEGRVPTNRTQRNILRADDENGWLSAYSIQILTAIAALLHDIGKANIAFQQKLKPKAKFFPDCYRHEWISARLFEAMIVGCDTDEQWLARLANWQNYIEENPDWLPNLTLIADKSDYPHNFSHFPPIAKVVLWLILSHHKLPFTQKTLDCHSDQERILSEHFMLKTAVEPFYRFLAPVEHWVMNQSEHPQPENFWQFKTLVMESKTWQKTMQRWANKALNHAPLRELSQLNKTINDPFLLILSRLCLIVGDHNYSSAPADRQLGDLNFFEKLLANTDKKTKQPKQALDEHLLGVCKTSARFARLLPKLAKELPHIQQHRPFTKRTNLDRFKWQNRAFELVRSVQSESEQAGFFGVNMASTGCGKTLANAKIMYGLSNQDGARFTIALGLRVLTLQTGLALRQKLMLSSEQLAVLVGGSATKQLFELQNESVQSGSESVQEWFESNEVYGMNFLESGIADEEFGTLLADNKAKKLLYAPIVSCTLDHMIQATETIRGGKHIVPLLRLLTSDLVLDEPDDFSQSDLPALSRLVHLAGMFGSKVLLSSATLTPDLISGLFNAYQAGRKIYNRHQGINPELPICCAWIDEYKQQQQKCAAVKEFERYHAQFTASRAEKLMQSPIRHKAEIIQLPPFSAVENQDINYTMLADSLIEQAITLHQRYAQQDPISKKFVSVGLIRFANIKPMIPLVETLFKTPLNTQFSDYKIHLCCYHSRQLLLLRSKLEEKLDRILNRHEPEALFSQPEIMRALTQDKAVHHIFIVLGSPVTEVGRDHDYDWAIVDPSSMRSIIQLAGRVWRHRPEKIATQANILLLPTNWRGLQTKNNGSEPIFCRPGFEDQSNKLTSHKTVDLIKQEHLASITAIPRIIKPLVIQAETNLADLEHKVIGDLLNNKGINRVNAYWQDNLTNRLNANLPLITPFRKNERKWQTEVVCLPSEESHWEFMFKSSEKAWEDPYFENDYLAEISYQKLNCESPWITPWLTTPLNQALSELCEQLDEADQTQAALRFATVSLQHYGKTLPIWKFNETLGFWQP >LR134169.1|VEB26594.1|1324456_1325344_+|inorganic-polyphosphate/ATP-NAD-kinase MKPEERFFECIAIVGKPRHEIALETHLAVYNWLKDRHYRVLVEKSIAQQLNLPEARSLEEIGQQANLVIVIGGDGNMLGMARRLAEYQVPLIGINRGNLGFLTDIAPHSTFEQLHNCIERGEFVIEERFLLEARIERNGKIIATNNALNEVVIHPTQVARIIEFEVYIDGKFAFSQRSDGLIISTPTGSTAYSLSAGGPILTPNMNAIALVPMHPHTLSSRPLVIDGDSQISLRFAQYNQPSLEVSCDGQYDLPFTPEDRIIVEKSPNKLRLLHLKDYNYFTVLGSKLGWSSKLF >LR134169.1|VEB26595.1|1325574_1326840_+|serine-hydroxymethyltransferase MFTANMNIQDYDPILWQAIENENRRQEEHIELIASENYASPRVMQAQGSQFTNKYAEGYPGKRYYGGCEYADIVEQLAIDRAKQLFGADYVNVQPHSGSQANAAVYGALIQPNNTILGMDLAHGGHLTHGAKVSFSGKIYNSVLYGITAEGLIDYEDVRQKALECKPKMIVAGFSAYSQIVDWAKMREIADEVGAYLFVDMAHVAGLIAAGVYPSPLPYAHVVTTTTHKTLGGPRGGLILSACGDEEIYKKLQSSVFPANQGGPLVHIIAAKAVCFKEALEPEYKIYQQNVVKNAKAMVEVFKQRGYEVISNGTENHLFLVSFVKQGLTGKAADAALGQANITVNKNSVPNDPQKPFITSGIRVGTPAVTRRGFKEADVQALAGWMCDVLDSIGKDNHEQVIAETKAKVLDICARLPVYAK >LR134169.1|VEB26596.1|1326995_1327343_+|Uncharacterized-conserved-protein MKKFLTLTTLLAISTSALAGFNGGNNEPAKAVNTIAQAKKAIENTPVTLTGNITRQIDNDEFFFKDATGEIKIDVEDHAWQNQNITPKDKITIYGKVDQDSQGPASIDVDRIQKR >LR134169.1|VEB26597.1|1327398_1327995_+|Uncharacterized-conserved-protein MKKFMTMTSTLALSSMALTSFANAEETTAQAQNNAQTEMPATAEKAAPVIGQQAVEFTRKAADQMMQGQGRGQNFHSFHHNGKHPHDMMRMMAYHHPHQFGGYKPQGFIDQNAVAKDAKAALEAKDRSFVQLEGSISKQVNDTEYTFVDSTGQIKIEVPPSLWRGLSVGPQDKVRIEGILDKQWEQPEIKVKNITKAK >LR134169.1|VEB26598.1|1328046_1328412_+|Uncharacterized-conserved-protein MKKILVLTALATATLLAACSTKNETAQNQTFGANTANTVTIAQAKSLHDDSRVVLQGKIQRQVDGDEYIFADSTGNIKIEIDDHVWKGLDVTPNDTIRIQGKLDKETFDSSIDVYSVEKVQ >LR134169.1|VEB26599.1|1328500_1329166_+|transcriptional-regulatory-protein MRILLIEDDKLIGDGLKLGLTKQNFVVDWFQDGKLGFEALFSTEYDAVVLDLTLPKMDGLVILKNWRKENLDIPVLILTARDTLDERILGFNSGADDYLCKPFALMEVVVRLQALIRRRYKQSSTEITLGDLTIDSSTHKVTLTDKEINLTSKEFQLLLLFASNKDRVLTRSAIEEKLYSWDNDVSSNAMEVYIHNLRKKLGKEWIKTVHGIGYKIGNSDA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LR134169_1 | 1.4|1317512|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317512-1317543 | 32 | LR134169.1 | 904317-904348 | 0 | 1.0 |
LR134169_1 | 1.5|1317572|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317572-1317603 | 32 | LR134169.1 | 902474-902505 | 0 | 1.0 |
LR134169_1 | 1.6|1317632|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317632-1317663 | 32 | LR134169.1 | 907505-907536 | 0 | 1.0 |
LR134169_1 | 1.8|1317752|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317752-1317783 | 32 | LR134169.1 | 902845-902876 | 0 | 1.0 |
LR134169_1 | 1.9|1317812|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317812-1317843 | 32 | LR134169.1 | 901614-901645 | 0 | 1.0 |
LR134169_1 | 1.10|1317872|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317872-1317903 | 32 | LR134169.1 | 1316461-1316492 | 0 | 1.0 |
LR134169_1 | 1.11|1317932|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317932-1317963 | 32 | LR134169.1 | 889507-889538 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.4|1317512|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 904317-904348, mismatch: 0, identity: 1.0
tttgaccgctgtaacaagcggtctttttttac CRISPR spacer tttgaccgctgtaacaagcggtctttttttac Protospacer ********************************
2. spacer 1.5|1317572|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 902474-902505, mismatch: 0, identity: 1.0
atacaatttcttgatgataaaggcgattacga CRISPR spacer atacaatttcttgatgataaaggcgattacga Protospacer ********************************
3. spacer 1.6|1317632|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 907505-907536, mismatch: 0, identity: 1.0
ttattgccaagtgaagtaatgacgaaatgggt CRISPR spacer ttattgccaagtgaagtaatgacgaaatgggt Protospacer ********************************
4. spacer 1.8|1317752|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 902845-902876, mismatch: 0, identity: 1.0
aagaagattgcttagttcgattaaaacatcat CRISPR spacer aagaagattgcttagttcgattaaaacatcat Protospacer ********************************
5. spacer 1.9|1317812|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 901614-901645, mismatch: 0, identity: 1.0
ctccatttgttcgaatataatggtttggtaaa CRISPR spacer ctccatttgttcgaatataatggtttggtaaa Protospacer ********************************
6. spacer 1.10|1317872|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 1316461-1316492, mismatch: 0, identity: 1.0
aaaatcgatttctatacactattcgataactg CRISPR spacer aaaatcgatttctatacactattcgataactg Protospacer ********************************
7. spacer 1.11|1317932|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 889507-889538, mismatch: 0, identity: 1.0
aactccggcatatactaatagtgacatagacg CRISPR spacer aactccggcatatactaatagtgacatagacg Protospacer ********************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LR134169_1 | 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318052-1318083 | 32 | NZ_KX753679 | Pasteurella multocida strain RCAD0259 plasmid pRCADGH-2, complete sequence | 13943-13974 | 0 | 1.0 |
LR134169_1 | 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318052-1318083 | 32 | NC_002579 | Aggregatibacter actinomycetemcomitans plasmid pVT745, complete sequence | 15034-15065 | 0 | 1.0 |
LR134169_1 | 1.24|1318714|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318714-1318745 | 32 | NC_007206 | Haemophilus influenzae biotype aegyptius plasmid pF1947, complete sequence | 18032-18063 | 2 | 0.938 |
LR134169_1 | 1.24|1318714|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318714-1318745 | 32 | NC_004846 | Haemophilus influenzae biotype aegyptius plasmid pF3031, complete sequence | 17751-17782 | 2 | 0.938 |
LR134169_1 | 1.24|1318714|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318714-1318745 | 32 | NC_004058 | Haemophilus influenzae biotype aegyptius BPF plasmid pF3028, complete sequence | 17697-17728 | 2 | 0.938 |
LR134169_1 | 1.1|1317332|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317332-1317363 | 32 | NC_005913 | Beet leafhopper transmitted virescence phytoplasma plasmid pBLTVA-1, complete sequence | 2141-2172 | 6 | 0.812 |
LR134169_1 | 1.1|1317332|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317332-1317363 | 32 | NC_005913 | Beet leafhopper transmitted virescence phytoplasma plasmid pBLTVA-1, complete sequence | 7034-7065 | 6 | 0.812 |
LR134169_1 | 1.16|1318232|33|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318232-1318264 | 33 | NZ_KX753679 | Pasteurella multocida strain RCAD0259 plasmid pRCADGH-2, complete sequence | 1660-1692 | 6 | 0.818 |
LR134169_1 | 1.16|1318232|33|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318232-1318264 | 33 | NC_021724 | Aggregatibacter actinomycetemcomitans plasmid pS23A, complete sequence | 10740-10772 | 6 | 0.818 |
LR134169_1 | 1.16|1318232|33|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318232-1318264 | 33 | NC_002579 | Aggregatibacter actinomycetemcomitans plasmid pVT745, complete sequence | 8597-8629 | 6 | 0.818 |
LR134169_1 | 1.16|1318232|33|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318232-1318264 | 33 | GQ866235 | Aggregatibacter actinomycetemcomitans strain D11S-1 plasmid S57, complete sequence | 10210-10242 | 6 | 0.818 |
LR134169_1 | 1.25|1318774|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318774-1318805 | 32 | NZ_CP015884 | Enterococcus faecalis strain sorialis plasmid Efsorialis-p1, complete sequence | 95522-95553 | 6 | 0.812 |
LR134169_1 | 1.25|1318774|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318774-1318805 | 32 | NZ_CP016746 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM1 plasmid pMPJM1, complete sequence | 122944-122975 | 6 | 0.812 |
LR134169_1 | 1.1|1317332|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317332-1317363 | 32 | NC_015904 | Borreliella bissettii DN127 plasmid cp32-4, complete sequence | 27595-27626 | 7 | 0.781 |
LR134169_1 | 1.4|1317512|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317512-1317543 | 32 | NC_013284 | Cronobacter turicensis z3032 plasmid pCTU2, complete sequence | 8931-8962 | 7 | 0.781 |
LR134169_1 | 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318052-1318083 | 32 | NC_021724 | Aggregatibacter actinomycetemcomitans plasmid pS23A, complete sequence | 16197-16228 | 7 | 0.781 |
LR134169_1 | 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318052-1318083 | 32 | GQ866235 | Aggregatibacter actinomycetemcomitans strain D11S-1 plasmid S57, complete sequence | 15047-15078 | 7 | 0.781 |
LR134169_1 | 1.22|1318594|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318594-1318625 | 32 | NZ_CP021765 | Ralstonia pseudosolanacearum strain CRMRs218 plasmid unnamed, complete sequence | 1507271-1507302 | 7 | 0.781 |
LR134169_1 | 1.2|1317392|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317392-1317423 | 32 | NZ_CP029389 | Acinetobacter defluvii strain WCHA30 plasmid p1_010030, complete sequence | 76286-76317 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.5|1317572|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317572-1317603 | 32 | KU708004 | Pseudomonas phage phiAH14a, complete genome | 44274-44305 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_KX833212 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain Salmonella Typhi strain Ty004 plasmid pTy004_02 plasmid pTy004_02, complete sequence | 253-284 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_KX815983 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin strain N13-01125 plasmid pN13-01125, complete sequence | 127082-127113 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP032392 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin strain CVM 34981 plasmid p34981_2, complete sequence | 42181-42212 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP023438 | Salmonella enterica strain FORC_074 plasmid pFORC74_3, complete sequence | 12356-12387 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP024467 | Shigella dysenteriae strain BU53M1 plasmid unnamed1, complete sequence | 11048-11079 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_LS999563 | Escherichia coli isolate EC-TO143 plasmid 4, complete sequence | 8290-8321 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_LS999563 | Escherichia coli isolate EC-TO143 plasmid 4, complete sequence | 44753-44784 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP016580 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg strain SH13-006 plasmid pSH13-006_37, complete sequence | 29456-29487 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP019284 | Escherichia coli strain 13P484A plasmid p13P484A-4, complete sequence | 24899-24930 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP019284 | Escherichia coli strain 13P484A plasmid p13P484A-4, complete sequence | 93237-93268 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP047093 | Salmonella sp. S13 plasmid pS13-4, complete sequence | 24129-24160 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP037880 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar 4,[5],12:i:- strain PNCS009991 plasmid pPNCS009991_S1, complete sequence | 6210-6241 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP026570 | Salmonella enterica strain MFDS1004839 plasmid pSE1004839, complete sequence | 71120-71151 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP032386 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin strain CVM N53043 plasmid pN53043_2, complete sequence | 64951-64982 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP032388 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin strain CVM N45955 plasmid pN45955_1, complete sequence | 28462-28493 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_LT904873 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain ERL11909 plasmid 2 | 25014-25045 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP017233 | Salmonella enterica strain FORC_051 plasmid pFORC51, complete sequence | 9143-9174 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | MN086778 | Escherichia coli plasmid p16EC-IncN, complete sequence | 97742-97773 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP014974 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. USDA-ARS-USMARC-1898 isolate ST073 plasmid pSTY3-1898, complete sequence | 8617-8648 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP032397 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin strain CVM 22429 plasmid p22429, complete sequence | 265962-265993 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP035774 | Klebsiella pneumoniae strain R46 plasmid pR46-27, complete sequence | 20461-20492 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP054423 | Salmonella enterica subsp. diarizonae serovar 61:k:1,5,(7) strain 14-SA00836-0 plasmid p14-SA00836-0, complete sequence | 7240-7271 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP044182 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg strain AR-0404 plasmid pAR-0404-1, complete sequence | 31296-31327 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_KT754163 | Shigella dysenteriae 1 strain A5468 plasmid pA5468, complete sequence | 5683-5714 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP043216 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg strain SL-312 plasmid pET8.2-IncX1, complete sequence | 26442-26473 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP031361 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg strain 5 plasmid p2, complete sequence | 21282-21313 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP027574 | Escherichia coli strain 2013C-4081 plasmid unnamed1, complete sequence | 24228-24259 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NC_021842 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. CFSAN002069 plasmid pCFSAN002069_02, complete sequence | 9770-9801 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_LT985261 | Escherichia coli strain 657 plasmid RCS50_p, complete sequence | 5426-5457 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP029854 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain 343077_281186 plasmid pK43, complete sequence | 33001-33032 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | CP043751 | Escherichia coli strain CVM N62675 plasmid pN62675, complete sequence | 37115-37146 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP009074 | Escherichia coli ATCC 25922 plasmid unnamed, complete sequence | 3247-3278 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP047339 | Klebsiella pneumoniae strain 2019036D plasmid p2019036D-35kb, complete sequence | 14478-14509 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP009103 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium strain ATCC 13311 plasmid pSTY1, complete sequence | 25436-25467 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP030208 | Salmonella enterica strain SA19992307 plasmid pSA19992307.1, complete sequence | 65375-65406 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP005994 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. CFSAN002064 plasmid unnamed, complete sequence | 24277-24308 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP032450 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin strain USMARC-69838 plasmid pSDU1-USMARC-69838, complete sequence | 54670-54701 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | CP016512 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg strain SH14-028 plasmid pSH14-028_37, complete sequence | 29457-29488 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317692-1317723 | 32 | NZ_CP022281 | Escherichia coli strain STEC299 plasmid pSTEC299_2, complete sequence | 57741-57772 | 8 | 0.75 |
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LR134169_1 | 1.12|1317992|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317992-1318023 | 32 | NC_014633 | Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence | 223704-223735 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.12|1317992|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317992-1318023 | 32 | NZ_CP039144 | Acinetobacter sp. 10FS3-1 plasmid p10FS3-1-1, complete sequence | 46265-46296 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318052-1318083 | 32 | MN256758 | Escherichia coli strain 4M8F plasmid p4M8F, complete sequence | 629-660 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.19|1318414|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318414-1318445 | 32 | MN038175 | Panteoa phage Phynn, complete genome | 154337-154368 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.25|1318774|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318774-1318805 | 32 | NZ_CP028887 | Borrelia turcica IST7 plasmid lp32-B, complete sequence | 32113-32144 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.27|1318895|32|LR134169|CRISPRCasFinder | 1318895-1318926 | 32 | NZ_AP022558 | Geobacillus subterraneus strain E55-1 plasmid pGspE55-1, complete sequence | 44276-44307 | 8 | 0.75 |
LR134169_1 | 1.1|1317332|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317332-1317363 | 32 | NZ_CP032858 | Bacillus subtilis subsp. subtilis strain 2RL2-3 plasmid unnamed1, complete sequence | 76828-76859 | 9 | 0.719 |
LR134169_1 | 1.1|1317332|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317332-1317363 | 32 | NZ_CP032873 | Bacillus subtilis subsp. subtilis strain 2KL1 plasmid unnamed1, complete sequence | 97864-97895 | 9 | 0.719 |
LR134169_1 | 1.1|1317332|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317332-1317363 | 32 | NZ_CP026534 | Bacillus velezensis strain DKU_NT_04 plasmid p1_DKU_NT_04, complete sequence | 54550-54581 | 9 | 0.719 |
LR134169_1 | 1.1|1317332|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317332-1317363 | 32 | NZ_LR134418 | Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 9 | 176079-176110 | 9 | 0.719 |
LR134169_1 | 1.1|1317332|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317332-1317363 | 32 | MN694383 | Marine virus AFVG_250M176, complete genome | 10556-10587 | 9 | 0.719 |
LR134169_1 | 1.2|1317392|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317392-1317423 | 32 | MN693329 | Marine virus AFVG_25M470, complete genome | 12816-12847 | 9 | 0.719 |
LR134169_1 | 1.12|1317992|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317992-1318023 | 32 | NZ_CP011159 | Moraxella ovis strain 199/55 plasmid pMOV1, complete sequence | 34336-34367 | 9 | 0.719 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_CP037433 | Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM4, complete sequence | 4425-4456 | 9 | 0.719 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_CP035114 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103295 plasmid unnamed1 | 29098-29129 | 9 | 0.719 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_CP035114 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103295 plasmid unnamed1 | 47593-47624 | 9 | 0.719 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_CP028239 | Lactobacillus plantarum strain SRCM101511 plasmid unnamed4, complete sequence | 5282-5313 | 9 | 0.719 |
LR134169_1 | 1.24|1318714|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318714-1318745 | 32 | MN694088 | Marine virus AFVG_250M454, complete genome | 11602-11633 | 9 | 0.719 |
LR134169_1 | 1.24|1318714|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318714-1318745 | 32 | MN694007 | Marine virus AFVG_250M456, complete genome | 11633-11664 | 9 | 0.719 |
LR134169_1 | 1.24|1318714|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318714-1318745 | 32 | MN694027 | Marine virus AFVG_250M455, complete genome | 39992-40023 | 9 | 0.719 |
LR134169_1 | 1.27|1318895|32|LR134169|CRISPRCasFinder | 1318895-1318926 | 32 | MN812211 | Flavobacterium phage vB_FspS_laban6-1, complete genome | 15415-15446 | 9 | 0.719 |
LR134169_1 | 1.8|1317752|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1317752-1317783 | 32 | NC_019749 | Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.02, complete sequence | 75881-75912 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318052-1318083 | 32 | NZ_CP013600 | Rhizobium sp. N741 plasmid pRspN741e, complete sequence | 553093-553124 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318052-1318083 | 32 | NZ_CP031815 | Klebsiella pneumoniae strain KSB1_7F-sc-2280268 plasmid unnamed1, complete sequence | 90569-90600 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318052-1318083 | 32 | NZ_CP013504 | Rhizobium esperanzae strain N561 plasmid pRspN561d, complete sequence | 553093-553124 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318052-1318083 | 32 | NZ_CP013510 | Rhizobium sp. N1341 plasmid pRspN1341e, complete sequence | 551534-551565 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318052-1318083 | 32 | NZ_CP013521 | Rhizobium sp. N113 plasmid pRspN113d, complete sequence | 555781-555812 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318052-1318083 | 32 | NZ_CP013494 | Rhizobium sp. N6212 plasmid pRspN6212d, complete sequence | 549900-549931 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318052-1318083 | 32 | NZ_CP013594 | Rhizobium sp. N871 plasmid pRspN871d, complete sequence | 553093-553124 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318052-1318083 | 32 | NZ_LT985234 | Escherichia coli strain 557 plasmid RCS32TR557_p, complete sequence | 65602-65633 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318052-1318083 | 32 | NZ_CP035203 | Klebsiella pneumoniae strain LH94 plasmid pLH94-1, complete sequence | 14297-14328 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_CP028980 | Lactobacillus plantarum strain LQ80 plasmid pLQ803, complete sequence | 19267-19298 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_CP032755 | Lactobacillus plantarum subsp. argentoratensis strain DSM 16365 plasmid unnamed4, complete sequence | 19064-19095 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_CP035561 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed5 | 35151-35182 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_CP032745 | Lactobacillus paraplantarum strain DSM 10667 plasmid unnamed1, complete sequence | 42109-42140 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_CP032746 | Lactobacillus paraplantarum strain DSM 10667 plasmid unnamed2, complete sequence | 23722-23753 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_CP046263 | Lactobacillus plantarum strain KCCP11226 plasmid pKCCP11226_01, complete sequence | 1302-1333 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_CP020096 | Lactobacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed3, complete sequence | 20645-20676 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_CP035569 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103300 plasmid unnamed3 | 29811-29842 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NC_018611 | Lactobacillus buchneri subsp. silagei CD034 plasmid pCD034-3, complete sequence | 28776-28807 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NC_021904 | Lactobacillus plantarum ZJ316 plasmid pLP-ZJ102, complete sequence | 34145-34176 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_CP017955 | Lactobacillus plantarum strain C410L1 plasmid unnamed1, complete sequence | 41415-41446 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_AP018408 | Lactobacillus plantarum strain SN35N plasmid pSN35N-3, complete sequence | 21997-22028 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_CP016700 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain 275 plasmid p275B, complete sequence | 48526-48557 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_CP044365 | Lactobacillus paracasei strain TD 062 plasmid unnamed4, complete sequence | 30052-30083 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_CP032660 | Lactobacillus pentosus strain ZFM94 plasmid unnamed1, complete sequence | 81030-81061 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NC_021519 | Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16H, complete sequence | 5883-5914 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_CP046662 | Lactobacillus plantarum strain 83-18 plasmid p83-18.2, complete sequence | 11665-11696 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_CP028263 | Lactobacillus plantarum strain SRCM102737 plasmid unnamed2, complete sequence | 60182-60213 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_CP028336 | Lactobacillus plantarum strain SRCM101167 plasmid unnamed2, complete sequence | 29707-29738 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318654-1318685 | 32 | NZ_CP032655 | Lactobacillus pentosus strain ZFM222 plasmid unnamed1, complete sequence | 30712-30743 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.27|1318895|32|LR134169|CRISPRCasFinder | 1318895-1318926 | 32 | MK448904 | Streptococcus phage Javan316, complete genome | 14484-14515 | 10 | 0.688 |
LR134169_1 | 1.20|1318474|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT | 1318474-1318505 | 32 | AP014396 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S46-C203, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 4959-4990 | 11 | 0.656 |
LR134169_1 | 1.27|1318895|32|LR134169|CRISPRCasFinder | 1318895-1318926 | 32 | AB853331 | Staphylococcus phage S25-4 DNA, complete genome | 13461-13492 | 11 | 0.656 |
1. spacer 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KX753679 (Pasteurella multocida strain RCAD0259 plasmid pRCADGH-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aggcacagaatctttttgtagcaaccactttt CRISPR spacer aggcacagaatctttttgtagcaaccactttt Protospacer ********************************
2. spacer 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_002579 (Aggregatibacter actinomycetemcomitans plasmid pVT745, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aggcacagaatctttttgtagcaaccactttt CRISPR spacer aggcacagaatctttttgtagcaaccactttt Protospacer ********************************
3. spacer 1.24|1318714|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007206 (Haemophilus influenzae biotype aegyptius plasmid pF1947, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
accgaaacgtttaccccatttttcatcaaccc CRISPR spacer gccgaaacgtttaccccatttttcatcgaccc Protospacer .**************************.****
4. spacer 1.24|1318714|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004846 (Haemophilus influenzae biotype aegyptius plasmid pF3031, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
accgaaacgtttaccccatttttcatcaaccc CRISPR spacer gccgaaacgtttaccccatttttcatcgaccc Protospacer .**************************.****
5. spacer 1.24|1318714|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004058 (Haemophilus influenzae biotype aegyptius BPF plasmid pF3028, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
accgaaacgtttaccccatttttcatcaaccc CRISPR spacer gccgaaacgtttaccccatttttcatcgaccc Protospacer .**************************.****
6. spacer 1.1|1317332|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_005913 (Beet leafhopper transmitted virescence phytoplasma plasmid pBLTVA-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-aacattaaagaacatttacaaaataggtaatc CRISPR spacer taaca-aagagaacctttacaaaatagttaatt Protospacer **** *.***** ************ ****.
7. spacer 1.1|1317332|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_005913 (Beet leafhopper transmitted virescence phytoplasma plasmid pBLTVA-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-aacattaaagaacatttacaaaataggtaatc CRISPR spacer taaca-aagagaacctttacaaaatagttaatt Protospacer **** *.***** ************ ****.
8. spacer 1.16|1318232|33|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KX753679 (Pasteurella multocida strain RCAD0259 plasmid pRCADGH-2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
ttgccgaggtgctttttctttttcctttcactt CRISPR spacer ttgcctaggtgctttttctttttcagtttcctc Protospacer ***** ****************** **. **.
9. spacer 1.16|1318232|33|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_021724 (Aggregatibacter actinomycetemcomitans plasmid pS23A, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
ttgccgaggtgctttttctttttcctttcactt CRISPR spacer ttcccgaggtgctttttctttttcagtttcctc Protospacer ** ********************* **. **.
10. spacer 1.16|1318232|33|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_002579 (Aggregatibacter actinomycetemcomitans plasmid pVT745, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
ttgccgaggtgctttttctttttcctttcactt CRISPR spacer ttcccgaggtgctttttctttttcagtttcctc Protospacer ** ********************* **. **.
11. spacer 1.16|1318232|33|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to GQ866235 (Aggregatibacter actinomycetemcomitans strain D11S-1 plasmid S57, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
ttgccgaggtgctttttctttttcctttcactt CRISPR spacer ttcccgaggtgctttttctttttcagtttcctc Protospacer ** ********************* **. **.
12. spacer 1.25|1318774|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015884 (Enterococcus faecalis strain sorialis plasmid Efsorialis-p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
agcgaataaaaaaatatcgaagttagatggat CRISPR spacer agcgaataaaaaaatatttaagttctaatgat Protospacer *****************. ***** * ***
13. spacer 1.25|1318774|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016746 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM1 plasmid pMPJM1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
agcgaataaaaaaatatcgaagttagatggat- CRISPR spacer agcgactaaaaaaatattgaagtca-ttgaatt Protospacer ***** ***********.*****.* **.**
14. spacer 1.1|1317332|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015904 (Borreliella bissettii DN127 plasmid cp32-4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aacattaaagaacatttacaaaataggtaatc CRISPR spacer aacattaaagaagatttagaaaaattaaaatc Protospacer ************ ***** **** . ****
15. spacer 1.4|1317512|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_013284 (Cronobacter turicensis z3032 plasmid pCTU2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
-tttgaccgctgtaacaagcggtctttttttac CRISPR spacer aagtga-cgctgtaacaaggggtctgttttgcc Protospacer *** ************ ***** **** *
16. spacer 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_021724 (Aggregatibacter actinomycetemcomitans plasmid pS23A, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aggcacagaatctttttgtagcaaccactttt CRISPR spacer aagcgcaaaatctttttgtagcaacagcgttc Protospacer *.**.**.***************** .* **.
17. spacer 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to GQ866235 (Aggregatibacter actinomycetemcomitans strain D11S-1 plasmid S57, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aggcacagaatctttttgtagcaaccactttt CRISPR spacer aagcgcaaaatctttttgtagcaacagcgttc Protospacer *.**.**.***************** .* **.
18. spacer 1.22|1318594|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021765 (Ralstonia pseudosolanacearum strain CRMRs218 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aagtttcgctaggtgctggcggcgcgaacatc- CRISPR spacer cagttgcgctcggtgctggcggcgctgg-atcg Protospacer **** **** ************** .. ***
19. spacer 1.2|1317392|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029389 (Acinetobacter defluvii strain WCHA30 plasmid p1_010030, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aaatgaaccaaaattaaaacttgttgcttaat CRISPR spacer tgctgaaccaaaattaaaactcgatgcaacat Protospacer . ******************.* *** **
20. spacer 1.5|1317572|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to KU708004 (Pseudomonas phage phiAH14a, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atacaatttcttgatgataaaggcgattacga CRISPR spacer atcgaccggcttgatgagaatggcgattacga Protospacer ** * . ******** ** ***********
21. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KX833212 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain Salmonella Typhi strain Ty004 plasmid pTy004_02 plasmid pTy004_02, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aataaggttgccgcatacaaagtaattaattt CRISPR spacer cagtaagttgcagcatacaaagtaattaaaaa Protospacer * *.***** *****************
22. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KX815983 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin strain N13-01125 plasmid pN13-01125, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aataaggttgccgcatacaaagtaattaattt CRISPR spacer cagtaagttgcagcatacaaagtaattaaaaa Protospacer * *.***** *****************
23. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032392 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin strain CVM 34981 plasmid p34981_2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aataaggttgccgcatacaaagtaattaattt CRISPR spacer cagtaagttgcagcatacaaagtaattaaaaa Protospacer * *.***** *****************
24. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023438 (Salmonella enterica strain FORC_074 plasmid pFORC74_3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aataaggttgccgcatacaaagtaattaattt CRISPR spacer cagtaagttgcagcatacaaagtaattaaaaa Protospacer * *.***** *****************
25. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024467 (Shigella dysenteriae strain BU53M1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aataaggttgccgcatacaaagtaattaattt CRISPR spacer cagtaagttgcagcatacaaagtaattaaaaa Protospacer * *.***** *****************
26. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LS999563 (Escherichia coli isolate EC-TO143 plasmid 4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aataaggttgccgcatacaaagtaattaattt CRISPR spacer cagtaagttgcagcatacaaagtaattaaaaa Protospacer * *.***** *****************
27. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LS999563 (Escherichia coli isolate EC-TO143 plasmid 4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aataaggttgccgcatacaaagtaattaattt CRISPR spacer cagtaagttgcagcatacaaagtaattaaaaa Protospacer * *.***** *****************
28. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016580 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg strain SH13-006 plasmid pSH13-006_37, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aataaggttgccgcatacaaagtaattaattt CRISPR spacer cagtaagttgcagcatacaaagtaattaaaaa Protospacer * *.***** *****************
29. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019284 (Escherichia coli strain 13P484A plasmid p13P484A-4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aataaggttgccgcatacaaagtaattaattt CRISPR spacer cagtaagttgcagcatacaaagtaattaaaaa Protospacer * *.***** *****************
30. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019284 (Escherichia coli strain 13P484A plasmid p13P484A-4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aataaggttgccgcatacaaagtaattaattt CRISPR spacer cagtaagttgcagcatacaaagtaattaaaaa Protospacer * *.***** *****************
31. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP047093 (Salmonella sp. S13 plasmid pS13-4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aataaggttgccgcatacaaagtaattaattt CRISPR spacer cagtaagttgcagcatacaaagtaattaaaaa Protospacer * *.***** *****************
32. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP037880 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar 4,[5],12:i:- strain PNCS009991 plasmid pPNCS009991_S1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aataaggttgccgcatacaaagtaattaattt CRISPR spacer cagtaagttgcagcatacaaagtaattaaaaa Protospacer * *.***** *****************
33. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026570 (Salmonella enterica strain MFDS1004839 plasmid pSE1004839, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aataaggttgccgcatacaaagtaattaattt CRISPR spacer cagtaagttgcagcatacaaagtaattaaaaa Protospacer * *.***** *****************
34. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032386 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin strain CVM N53043 plasmid pN53043_2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aataaggttgccgcatacaaagtaattaattt CRISPR spacer cagtaagttgcagcatacaaagtaattaaaaa Protospacer * *.***** *****************
35. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032388 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin strain CVM N45955 plasmid pN45955_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aataaggttgccgcatacaaagtaattaattt CRISPR spacer cagtaagttgcagcatacaaagtaattaaaaa Protospacer * *.***** *****************
36. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LT904873 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain ERL11909 plasmid 2) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aataaggttgccgcatacaaagtaattaattt CRISPR spacer cagtaagttgcagcatacaaagtaattaaaaa Protospacer * *.***** *****************
37. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017233 (Salmonella enterica strain FORC_051 plasmid pFORC51, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aataaggttgccgcatacaaagtaattaattt CRISPR spacer cagtaagttgcagcatacaaagtaattaaaaa Protospacer * *.***** *****************
38. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN086778 (Escherichia coli plasmid p16EC-IncN, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aataaggttgccgcatacaaagtaattaattt CRISPR spacer cagtaagttgcagcatacaaagtaattaaaaa Protospacer * *.***** *****************
39. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014974 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. USDA-ARS-USMARC-1898 isolate ST073 plasmid pSTY3-1898, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aataaggttgccgcatacaaagtaattaattt CRISPR spacer cagtaagttgcagcatacaaagtaattaaaaa Protospacer * *.***** *****************
40. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032397 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin strain CVM 22429 plasmid p22429, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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41. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035774 (Klebsiella pneumoniae strain R46 plasmid pR46-27, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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42. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP054423 (Salmonella enterica subsp. diarizonae serovar 61:k:1,5,(7) strain 14-SA00836-0 plasmid p14-SA00836-0, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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43. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044182 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg strain AR-0404 plasmid pAR-0404-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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44. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT754163 (Shigella dysenteriae 1 strain A5468 plasmid pA5468, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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45. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043216 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg strain SL-312 plasmid pET8.2-IncX1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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46. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031361 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg strain 5 plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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47. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP027574 (Escherichia coli strain 2013C-4081 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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48. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_021842 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. CFSAN002069 plasmid pCFSAN002069_02, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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49. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LT985261 (Escherichia coli strain 657 plasmid RCS50_p, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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50. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029854 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi strain 343077_281186 plasmid pK43, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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51. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP043751 (Escherichia coli strain CVM N62675 plasmid pN62675, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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52. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009074 (Escherichia coli ATCC 25922 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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53. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP047339 (Klebsiella pneumoniae strain 2019036D plasmid p2019036D-35kb, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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54. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009103 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium strain ATCC 13311 plasmid pSTY1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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55. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP030208 (Salmonella enterica strain SA19992307 plasmid pSA19992307.1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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56. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP005994 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. CFSAN002064 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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57. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032450 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin strain USMARC-69838 plasmid pSDU1-USMARC-69838, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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58. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP016512 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg strain SH14-028 plasmid pSH14-028_37, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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59. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022281 (Escherichia coli strain STEC299 plasmid pSTEC299_2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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60. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016529 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg strain 09-036813-1A plasmid p09-036813-1A_42, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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61. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016518 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg strain CE-R2-11-0435 plasmid pCE-R2-11-0435_37, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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62. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031234 (Escherichia coli strain Es_ST410_NW1_NDM_09_2017 plasmid pEsST410_NW_4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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63. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041175 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis strain SJTUF12519v2 plasmid p12519B, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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64. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011431 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium strain YU39 isolate YUHS 05-78 plasmid pYU39_IncX, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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65. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP047580 (Escherichia coli strain 94EC plasmid p94EC-4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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66. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012922 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg strain SA02DT10168701 plasmid pSA02DT10168701_37, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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67. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012926 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg strain 12-4374 plasmid p12-4374_37, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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68. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023360 (Escherichia coli strain 1943 plasmid p54, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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69. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039600 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar 1,4,[5],12:i:- strain PNCS014867 plasmid p12-6334.1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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70. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN125608 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis strain 1.05-1C8 plasmid p1.05-1C8, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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71. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN125609 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis strain 1.15-2E5 plasmid p1.15-2E5, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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72. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011204 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 plasmid pCT02021853_74, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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73. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017624 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 plasmid pB182_37, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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74. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP019764 (Escherichia coli O111:H- strain 110512 plasmid pO111-110512_3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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75. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019106 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin plasmid pSD_77, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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76. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP027138 (Escherichia coli strain AR_0369 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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77. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP054320 (Escherichia coli strain SCU-390 plasmid pSCU-390-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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78. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024261 (Escherichia coli strain F5656C1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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79. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022072 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium strain FDAARGOS_321 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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80. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019180 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. ATCC 39184 plasmid pATCC39184, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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81. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032394 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin strain CVM 22453 plasmid p22453_2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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82. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010422 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin plasmid pOU1115, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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83. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010257 (Escherichia coli plasmid MccC7-H22, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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84. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034075 (Salmonella enterica subsp. diarizonae strain 16-SA00356 plasmid pSE16-SA00356, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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85. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041439 (Escherichia coli strain YPE12 plasmid pYPE12-106k, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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86. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MK360096 (Salmonella enterica strain 13-SA02717 plasmid pSE13-SA02717, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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87. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032381 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin strain USMARC-69807 plasmid pSDU2-USMARC-69807, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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88. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032447 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin strain USMARC-69840 plasmid pSDU1-USMARC-69840, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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89. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023476 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis strain FORC_075 plasmid pFORC75_2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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90. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG288677 (Klebsiella pneumoniae strain F160070 plasmid p160070-CTXM, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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91. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF428416 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium strain ExPB5-59 plasmid pExPB5-59-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
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92. spacer 1.7|1317692|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016575 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg strain AMR588-04-00435 plasmid pAMR588-04-00435_37, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aataaggttgccgcatacaaagtaattaattt CRISPR spacer cagtaagttgcagcatacaaagtaattaaaaa Protospacer * *.***** *****************
93. spacer 1.8|1317752|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015757 (Clostridium estertheticum subsp. estertheticum strain DSM 8809 plasmid pDSM8809, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aagaagattgcttagttcgattaaaacatcat CRISPR spacer tgtatgattgcttagttaaattaaaacaaaat Protospacer . * ************ .********* **
94. spacer 1.12|1317992|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044456 (Acinetobacter indicus strain B18 plasmid pB18-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ttactgaatttatcagaataataggcttttaa CRISPR spacer ttgactaagttatcagaataattggctttttt Protospacer **. . ** ************* *******
95. spacer 1.12|1317992|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014633 (Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ttactgaatttatcagaataataggcttttaa CRISPR spacer ttactgaatttataagaatattagagtcaaag Protospacer ************* ****** ***. *. *.
96. spacer 1.12|1317992|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039144 (Acinetobacter sp. 10FS3-1 plasmid p10FS3-1-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ttactgaatttatcagaataataggcttttaa CRISPR spacer ttgactaagttatcagaataattggctttttt Protospacer **. . ** ************* *******
97. spacer 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN256758 (Escherichia coli strain 4M8F plasmid p4M8F, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aggcacagaatctttttgtagcaaccactttt- CRISPR spacer cagcagagaatctttatgtagcaa-cactgccg Protospacer .*** ********* ******** **** ..
98. spacer 1.19|1318414|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN038175 (Panteoa phage Phynn, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
gccggaacctaaaagaatcgataaagacacac CRISPR spacer gcaagtttataaaagactcgatcaagacacac Protospacer ** .* . ******* ***** *********
99. spacer 1.25|1318774|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028887 (Borrelia turcica IST7 plasmid lp32-B, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
agcgaataaaaaaatatcgaagttagatggat CRISPR spacer aaataataaaaaaatatggaagtaagaatgag Protospacer *. ************* ***** *** **
100. spacer 1.27|1318895|32|LR134169|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP022558 (Geobacillus subterraneus strain E55-1 plasmid pGspE55-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
gccggaacctaaaagaattgataaagacacac CRISPR spacer ccaagaatccaaaagaattgataaagatccaa Protospacer * .***.*.*****************. **
101. spacer 1.1|1317332|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032858 (Bacillus subtilis subsp. subtilis strain 2RL2-3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aacattaaagaacatttacaaaataggtaatc CRISPR spacer gacataaaagaaaatttacaaaatggctggat Protospacer .**** ****** ***********.* *.. .
102. spacer 1.1|1317332|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032873 (Bacillus subtilis subsp. subtilis strain 2KL1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aacattaaagaacatttacaaaataggtaatc CRISPR spacer gacataaaagaaaatttacaaaatggctggat Protospacer .**** ****** ***********.* *.. .
103. spacer 1.1|1317332|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026534 (Bacillus velezensis strain DKU_NT_04 plasmid p1_DKU_NT_04, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aacattaaagaacatttacaaaataggtaatc CRISPR spacer gacataaaagaaaatttacaaaatggctggat Protospacer .**** ****** ***********.* *.. .
104. spacer 1.1|1317332|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR134418 (Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 9) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aacattaaagaacatttacaaaataggtaatc CRISPR spacer cttattgaagaatatttacaaaatagttggtt Protospacer .***.*****.************* *..*.
105. spacer 1.1|1317332|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694383 (Marine virus AFVG_250M176, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aacattaaagaacatttacaaaataggtaatc CRISPR spacer aaaataaaagaacatttacaaaagtagattta Protospacer ** ** ***************** .* *
106. spacer 1.2|1317392|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693329 (Marine virus AFVG_25M470, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aaatgaaccaaaattaaaacttgttgcttaat CRISPR spacer aaaagaagcaaaattaaaacttgaacaacaaa Protospacer *** *** *************** .**
107. spacer 1.12|1317992|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011159 (Moraxella ovis strain 199/55 plasmid pMOV1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttactgaatttatcagaataataggcttttaa CRISPR spacer gaaaccaatttatctgaataataggttttgag Protospacer * . ******** **********.*** *.
108. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP037433 (Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ttatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer *. ********* ***.********* . * .
109. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035114 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103295 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ttatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer *. ********* ***.********* . * .
110. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035114 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103295 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ttatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer *. ********* ***.********* . * .
111. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028239 (Lactobacillus plantarum strain SRCM101511 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ttatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer *. ********* ***.********* . * .
112. spacer 1.24|1318714|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694088 (Marine virus AFVG_250M454, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
accgaaacgtttaccccatttttcatcaaccc CRISPR spacer ttaatagcgtttaacccatttttcattaacca Protospacer . . *.****** ************.****
113. spacer 1.24|1318714|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694007 (Marine virus AFVG_250M456, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
accgaaacgtttaccccatttttcatcaaccc CRISPR spacer ttaatagcgtttaacccatttttcattaacca Protospacer . . *.****** ************.****
114. spacer 1.24|1318714|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694027 (Marine virus AFVG_250M455, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
accgaaacgtttaccccatttttcatcaaccc CRISPR spacer ttaatagcgtttaacccatttttcattaacca Protospacer . . *.****** ************.****
115. spacer 1.27|1318895|32|LR134169|CRISPRCasFinder matches to MN812211 (Flavobacterium phage vB_FspS_laban6-1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
gccggaacctaaaagaattgataaagacacac CRISPR spacer atcggaatcaaaaagaattgataaattgataa Protospacer ..*****.* *************** *.*
116. spacer 1.8|1317752|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019749 (Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.02, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aagaagattgcttagttcgattaaaacatcat CRISPR spacer tgaggcaaggcttatttcgattaaaacattat Protospacer .... * ***** **************.**
117. spacer 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013600 (Rhizobium sp. N741 plasmid pRspN741e, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aggcacagaatctttttgtagcaaccactttt CRISPR spacer gagaacagcagctttttgtagcaaccatgacg Protospacer ..* **** * ****************. .
118. spacer 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031815 (Klebsiella pneumoniae strain KSB1_7F-sc-2280268 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aggcacagaatctttttgtagcaaccactttt CRISPR spacer cagcagagaatctttatgtagcaacaccgccg Protospacer .*** ********* ********* * ..
119. spacer 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013504 (Rhizobium esperanzae strain N561 plasmid pRspN561d, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aggcacagaatctttttgtagcaaccactttt CRISPR spacer gagaacagcagctttttgtagcaaccatgacg Protospacer ..* **** * ****************. .
120. spacer 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013510 (Rhizobium sp. N1341 plasmid pRspN1341e, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aggcacagaatctttttgtagcaaccactttt CRISPR spacer gagaacagcagctttttgtagcaaccatgacg Protospacer ..* **** * ****************. .
121. spacer 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013521 (Rhizobium sp. N113 plasmid pRspN113d, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aggcacagaatctttttgtagcaaccactttt CRISPR spacer gagaacagcagctttttgtagcaaccatgacg Protospacer ..* **** * ****************. .
122. spacer 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013494 (Rhizobium sp. N6212 plasmid pRspN6212d, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aggcacagaatctttttgtagcaaccactttt CRISPR spacer gagaacagcagctttttgtagcaaccatgacg Protospacer ..* **** * ****************. .
123. spacer 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013594 (Rhizobium sp. N871 plasmid pRspN871d, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aggcacagaatctttttgtagcaaccactttt CRISPR spacer gagaacagcagctttttgtagcaaccatgacg Protospacer ..* **** * ****************. .
124. spacer 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LT985234 (Escherichia coli strain 557 plasmid RCS32TR557_p, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aggcacagaatctttttgtagcaaccactttt CRISPR spacer cagcagagaatctttatgtagcaacaccgccg Protospacer .*** ********* ********* * ..
125. spacer 1.13|1318052|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035203 (Klebsiella pneumoniae strain LH94 plasmid pLH94-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aggcacagaatctttttgtagcaaccactttt CRISPR spacer cagcagagaatctttatgtagcaacaccgccg Protospacer .*** ********* ********* * ..
126. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028980 (Lactobacillus plantarum strain LQ80 plasmid pLQ803, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ctatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer .. ********* ***.********* . * .
127. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032755 (Lactobacillus plantarum subsp. argentoratensis strain DSM 16365 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ctatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer .. ********* ***.********* . * .
128. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035561 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed5) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ctatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer .. ********* ***.********* . * .
129. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032745 (Lactobacillus paraplantarum strain DSM 10667 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ctatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer .. ********* ***.********* . * .
130. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032746 (Lactobacillus paraplantarum strain DSM 10667 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ctatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer .. ********* ***.********* . * .
131. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP046263 (Lactobacillus plantarum strain KCCP11226 plasmid pKCCP11226_01, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ctatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer .. ********* ***.********* . * .
132. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020096 (Lactobacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ctatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer .. ********* ***.********* . * .
133. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035569 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103300 plasmid unnamed3) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ctatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer .. ********* ***.********* . * .
134. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018611 (Lactobacillus buchneri subsp. silagei CD034 plasmid pCD034-3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ctatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer .. ********* ***.********* . * .
135. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_021904 (Lactobacillus plantarum ZJ316 plasmid pLP-ZJ102, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ctatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer .. ********* ***.********* . * .
136. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017955 (Lactobacillus plantarum strain C410L1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ctatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer .. ********* ***.********* . * .
137. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP018408 (Lactobacillus plantarum strain SN35N plasmid pSN35N-3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ctatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer .. ********* ***.********* . * .
138. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016700 (Lactococcus lactis subsp. lactis strain 275 plasmid p275B, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ctatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer .. ********* ***.********* . * .
139. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044365 (Lactobacillus paracasei strain TD 062 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ctatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer .. ********* ***.********* . * .
140. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032660 (Lactobacillus pentosus strain ZFM94 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ctatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer .. ********* ***.********* . * .
141. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_021519 (Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16H, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ctatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer .. ********* ***.********* . * .
142. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP046662 (Lactobacillus plantarum strain 83-18 plasmid p83-18.2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ctatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer .. ********* ***.********* . * .
143. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028263 (Lactobacillus plantarum strain SRCM102737 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ctatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer .. ********* ***.********* . * .
144. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028336 (Lactobacillus plantarum strain SRCM101167 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ctatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer .. ********* ***.********* . * .
145. spacer 1.23|1318654|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032655 (Lactobacillus pentosus strain ZFM222 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcctcaaaaggtcaataaaaaatctttgttaa CRISPR spacer ctatcaaaaggtaaatgaaaaatcttgaattg Protospacer .. ********* ***.********* . * .
146. spacer 1.27|1318895|32|LR134169|CRISPRCasFinder matches to MK448904 (Streptococcus phage Javan316, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
gccggaacctaaaagaattgataaagacacac CRISPR spacer aagagaacctaaaagaaatgacaaagagcgag Protospacer . .************* ***.***** *
147. spacer 1.20|1318474|32|LR134169|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014396 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S46-C203, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
tatcctgctttagaaaatttgaagaactagcc CRISPR spacer agtccagctttagaaaattggaagattgcaaa Protospacer .*** ************* ***** . .
148. spacer 1.27|1318895|32|LR134169|CRISPRCasFinder matches to AB853331 (Staphylococcus phage S25-4 DNA, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
gccggaacctaaaagaattgataaagacacac CRISPR spacer aaaagaacttaaaaaaattgataaagaatgga Protospacer . .****.*****.************ .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
454871 : 510453
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR134169|454871:510453|DBSCAN-SWA 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MAHDVEVQNAVRRAYVFDRLSLEMAAEKAGVSFGTARRWKAQAEKNGDNWEKARDVQVMASGGIENIAQGLLTGFLIKYRTLMTELEENTDMTTAAKVESLSALADSFAKMTASSKKLLPETSAMATAMRSIELMANIVKTKKPHLLPDFLEMLDDLEVQFKKEFK |
69 | Mannheimia_phage(64.29%) | tRNA,transposase,head,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
586208 : 679810
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR134169|586208:679810|DBSCAN-SWA CTCAATTACCGAGTTTATAAAACCAAAACACCGTCGGCACAAAAATCGGGGCTTTTAGTGTGCTTGATGCAAGAAGTTCTTGAATGAAACTCATCTTATGCTCCATTTATAGCTAAAATAAGATCGCACTTTTCTCTATTTCTGAAGTTTAAAATAACAAAAAAGTACAATATAAAAAGAAATTGATTTATTGATACCCTACAAGATAGGGGATTTTGAAAATTATCCTATTAGAAAAGGATAATATAAGATAGTGAGAATTCACTAAATTGAAATGTAGCATAACTACCAAGATGAATTAAGTGTTATGCTACAATATTGGTGATTTTTTGTCAAGAAAAAACTTAAATTATATTTATTCTAGACTATTTTAATATGAGGCTATCAACAAAAAAGCTCAAGGTTTTTATTGATTGTAAGATGTTGTTACACAAAATCCTGCATTAAATCTTCCACTACATCTTTGACAGAACGGATCGATTTAATATTAGTAATGCCGTTACCTACCGAAATATAGCCTTTCTCAAAATCGCCAAGTAACATACCTTGACGCATTCCATAGCCACCGGTTTGTGCTTTGGCAAGCTCATCTCGCGTTGCACCGTTTTCATCCATTTCCACCAATTTATGTGCTAACTGAGTGGGTAGCGAGCGGTAATACGCCGGTTGGGTGCGGAATAACAATAAATCTTGAGCCGTGCTATCGACAACGAGTTGCTTAACGCTTTCATGCATACGGTTTTCCTCAGTTGCTAACAACACAGAACCGACAAATACGCCTTCCGCACCGAGTGCAAAACTTGCTCGTACGCCTCGCACATCAGCAATACCGCCAGCCGCCATCACAGGGATACTCACCGCATCGACCATTTGAGGCACGATAGAGAATGTTCCGATCACTTGGCTTGGCACAGTGCCGCCTTCATCAAAACCGGTTGCAACGAAAATATCCGCCCCAATTTCTTCCGCATAATGAGCATTTTCTACTGTTGGCGTATGCGGACGGAAAATGGTTTTTGTGCCTGCCGCTTTAAATTTTTTCATCATCGGCTTGTAGTCATAGCCATCAATACCGTTGATTAATGCCACCGGCACGTGTTCTTCAATTAATAAATCCACTAACAAATCAATCGTACTGAAATCGTAGGATAAAATCACCGGTGCACCGAACGGCTTATCGGTTAATGCTTTGGTTTTACGGATTTCTTCACGGAAAGTGCTAAGCAAATCTTCCGTCGTTTTCGGTGCTTTCAGCAAGCCGGCATTAGGGCCTAAAATCCCTAAACCTCCGGCATTGCTTACAGCAGCAACAAATTTTGCGTCAGTCATCCACGCCATCGGGCCTTGCACGAGTGGAAATTTAATTCCGAGAATGTCAGTAATACGGTTACAAGCGGTCATTTTTTTTATCCTTTTTTGCAAATGAATGGTGGCTATTATAATCTTGCAAAATTGGTTGAGAAGTATCTAAAATAAGAATAAGTTTTCCAAAAATGAGAAGCAGGTATGGACTTAAATAATCTTCGTCTCTTCGTTGCGGTTTATCAAGCGGAGAGTTTTTCTAAAGCGGCGGAACAACTTGCAATCCCGGTTGCGACGGTTAGTCGCCGTATTGCGGAATTTGAAAAATCGCTTTCTACCCAACTTTTCGACCGCTACAAAACAGGGGTGAAACCGACCGCACTTGGTTTGCAACTGTATGAAAAGGTTTATTTGAGCTTAGACAATTTAACGCAAGCAACACAAGATTTTATTGGTGAACAGCAGGAGTTGAGCGGTTATCTGCGTATTTCCACCGTTTCCGCCTGTGAGCCGATTTGGGCGGCAATTGCTGAATTTCAGGCGGAATATCCGCAGGTGAAAGTACATTGTCAGGCGACCGATCGCGTATTGGATTTGGTAGAAGATGGCATTGATATTGCGTTTCGAATGGGCGATTTGCATACGGAAAATGTTATTGCTCGCAAAATGATGGATTTAAACGCTGTACTGGTGGCTCACCCTGATTTTCTTGTTCGATACGGCACGCCGAAAACACCGCAAGATTTGACCGCACTACCATTTGCCTGCTGGGCAAGAGCAGGGCAGAAAAGCGCAACATTACAACTGGGCGAACAAGCGGTCAAAATTGAACCGATTTTTACCTCTAATGACGTGTACGCCATCACCCATCAAGCCAAAAGTGCGCATGCCATCTGCCAATTACCAGACTATATGGCACAAGAACTCACCGAGAAATTCGGCTTAGTCGAACTGATGTCCGACTATCCGACACCAACCTATCCTATCCACGCCATCTATCCCACCCACCGACACCCCTCAGCAATCTTGAAAACCTTTTTGGGGGTCTGTGAGAGGTTTTTAACAGAAAGAGAGAAACTCTGTAAAGATTAACCATTTCACGTTTACGGGAGACAGACCGCAGAAGGATCGTTCCAGAATCCACAGGAAGAGAGGAGAGATATTCTCCTTTCTTCTTAATATGTACTTGATCTTTCAAAAGCAAATGGCAAACGTAAATTTTTTATTTATCTGGTGCATTAGATTTTTAATATTTTCAACTTTTCCTTTGAAAAAGTGTATTTGTTTTAGATTTTTTCATTGGAAAAAATGTATTTTAATTACAAATTTTCCTTTGAAAAAATGTTAAATTGTCCTTAAAATAGTTTTCAAAGAATAGAAAATGAGTAAATTATGCAAAGAAAAATTATTCAATCCTTAGAAGAATGGAAGCAGAAGCCTACTCGCAAGCCTTTGATTATTCAAGGCGCAAGACAAGTGGGTAAAACCTGGGCGATGAAGCGTTTTGGCGAACAATCTTTTGAAAAGGTGGCGTATATTAACTTCGATAATAATCCACGAATGAAAACGCTATTTTCGGGAGATTATGATATTAATCGTTTGATTCTTGGTTTAAAAATTGAAAGCGGTGTAGATATTCAAGCTGAAAATACACTGATTATTTTTGATGAAGTACAAGAAGTACCACAGGCACTCTCTTCGCTCAAATATTTTTATGAAAATGCACCGCAATTTTATATTGTGGCGGCAGGATCATTACTTGGTGTCTCATTGCATCATCAGGTTTCTTTTCCTGTGGGTAAGGTGGATTTTCTACCGCTTTACCCGATGGATTTTCACGAGTTTTTGACCGCACTTGGTAAGCAAGATTTAGTGCAGTTACTGGAACTCAAAGATTGGTCGCTTATTTCTGCGATGAAAACAAGTTATATTGATTTACTACGCCAATATTATTTTGTGGGTGGAATGCCTGAAGCCGTGAAAGTTTTTGTCGAAACGCAAAACTTTGATGAAGTTCGCCAAGTGCAACGCAATTTATTGATGGCGTACGAACAGGATTTTTCTAAACATATTAAAGATGGGCAGACAGTGCAAAAAGTGCGGTCAATTTGGGCTTCAATTCCTGAACAACTTGCCAAAGAAAATAAAAAGTTCATCTACTCGCACCTGCAAAAAGGGGCGAGAAGTAAAGACTACGAAATCGCCTTGCAGTGGCTAAAAGACAGCGGTTTAGTGCATTCCGTGCCACGTGTGAAAAAGCCACATTTACCGCTTTCTGCCTATCAAGACGGCGCATTTAAACTTTATGTATTGGACGTGGGGTTGCTTGCCGCTCAAAGTCATTTAGATGTCAGCGTTCTGCTTGAAGGCAGCCGTATTTTTACCGAATTTAAGGGCGCTTTAACCGAGCAATATGTGCTACAACAGCTTATTGCCACTCAAGAAAACCCGTGTTTTACTGGGCAACCGAAAAAGGCACGGCAGAAGTAGATTTTGTACTACAACGCAAACAAGCGGTGATCCGATTGAAGTCAAAGCCGAAGAAAACCTCAAAGCCAAAAGCTTAAAAGTCTATGTGGAACAGTTCCAACCCGAGCAAGCGGTTAGGTTTTCAATGGCGGATTATCGGGAGCAGGATTGGATAGTGAATGTGCCGTTGTATGGAGTGTTCGAAACAAGCTAATTTTTTATTTTTCTAAAATAACATTATATAATTTTACAAATGTAGCATATCAACAATAAAGAAATCATATTATGGCAAAGAAAGAAGTTAAAACCGATTTATGGGTATATGAATTACTTAAAGAAGCTGGAATTTCATTAGATCCACAAGGTAGTTCCATTAAAGAATTAAATGATGCGCTTAAAACAGCATCAAAATCAGGCAAAGGCAATGTGGGGTTTCCTGAATATTGCGGCGTAGTACAAGATTTTGTGATTGTGATAGAAGACAAAGCTGATGTTGTTAAACATATTCAGAGGAATAACGATCAGCTTATTTGTCGAGAAAATAAGAGTATTACTGATTTCGCTGTAAATGGCGCATTACATTACGGTATTCATTTAGCTCAAAATACAAGCTACAAAAAAGTTATTGCAATCGGTGTATCTGGTAATGAAAAACGCCATAAAATTTCGCCGTTGTTTATCAATGAACGTGGCGAATATAAAGAATTAGACGACGTTGAAACCTTTACACTTTTTAATGATAAAAACATTAAAGAATACTACACCAAATATATTCTCAAAGAAGAAACAGATGATGAAAAAACAACGGCTGAAATTTTAAAAGATGCCAAAGCTTTACACGAAGATTTACGCAATTATGGCAGTATTCAAGATAAAGATAAACCGCTGATTGTTTCGGGAATTTTATTAGCATTGCGTGAAATTGAGTTTCAAAATTTCAGTTTGGATCATTTGAATGGCGACGACGTAAAAACGGATGGGCAAAAAATTTATGAAGCTATTGAAAGTAATTTAAAACGAGCCCAAGTACAGCCTGAGGTAAAAAAAGACAAATTGCTTAGTCAATTTCTCGTGATTAAAGACACCAAAGCCATTAACGAAATCAACAGCACATTAGGCAAAACACCACTTAAACATTATGCTCAATTTATTTACGAACATATTTATAAGAACATTAAAAACATCCAATCGTCCGAGGATTATTTAGGGCGTTTTTACGGTGAATTTAT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|
111 | Mannheimia_phage(49.12%) | head,plate,integrase,tRNA,protease,terminase,capsid,holin,portal,tail | attL 665225:665244|attR 686311:686330 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
830455 : 912020
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR134169|830455:912020|DBSCAN-SWA 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>LR134169|830455:912020|901970_902711_+|VEB26197.1|DBSCAN-SWA MLSKQIISISESRLDAYLFCFYQNDKSKQKEAIAVYTALQHRTGIYFSLIQEIEVALRNEVSELLRRAAPNNNLYQFFHYLAQDRNAPLTVESKRQLQKAISECSKRKYDENDIISHITFGFWVNLFDYDPKRNQHVIYWQKVLKPIFNRRFSSFKDLYNTLKQIMRFRNRLYHQEIVWNKRIAKKPERALENLEKTYKQFEVALEKIAPERFVFRQLSEALKWQRDIFFDQQIFEAEITVLPQHI >LR134169|830455:912020|907712_907910_+|VEB26207.1|DBSCAN-SWA MSCTIDESGAILKIKFTDDIREKNDDILKEDVAQRFDADFFLMTEELSTFMKKLINEFGGIKERI >LR134169|830455:912020|857901_858483_-|VEB26135.1|protease|DBSCAN-SWA MNDMVKNIVLWVVVAIVLMTAFEGFNSNFGNNNTVAYSTFLNDIKSNNLKEVDFKRNDETISVTKNDGTQYQTVMPMYDEYLLADLAKTNATVTGQPEERRGLLSQILISWFPMIMLIGFWLFYMRQMQGGGGRGAMSFGKSKAKMLTAEQVKTRFTDVAGCDEAKEEVGEVVDFLKDRANSKNWADVFRKVS >LR134169|830455:912020|888363_888726_-|VEB26172.1|DBSCAN-SWA MFTLLSKAKLWAVGILAALFIGLLVKLWTTQNQLSVLKSQYDKQTSQIQSLETTNATLEAETANLKVSLVAEQQAVEQQSALAAQFRRQAIDKKEVVRYVLKNNQCANQHLPSAVIKQLQ >LR134169|830455:912020|854637_855006_-|VEB26132.1|DBSCAN-SWA 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>LR134169|830455:912020|868422_869031_-|VEB26144.1|DBSCAN-SWA MSKFLQDDYSKIGEGNLLLQFAYSEKVKLLLRALLNPFSGAQASLQQLLTERHLDKAKGKQLDGIGDILGLSRPYITIIDNNWWFGFRGQPLAKPFKQAPIRDENYYLTSSNTKFMGDDYYRRLLRWKIIKNNSHGTVEDIIRAYQAIFQPSKVEVREVDVGKIEVIITRRLEKELEGVEKSAVDWCPVVAGIKATVSFIEG >LR134169|830455:912020|840150_840447_-|VEB26118.1|DBSCAN-SWA MALTKIELAESLVEKCGFDKRIAKLFVEQFFEEIRSSLEKGEEVKLSGFGNFSLREKNARPGRNPKTGETVAVTARRVVVFKPGQKLRDRVENVKVKA >LR134169|830455:912020|849554_849950_-|VEB26127.1|DBSCAN-SWA MTAANQNYGTGRRKSSSARVFIKPGSGNITINQRSLDVYFGRETSRMVVRQPLELVELLDKLDLYITVKGGGISGQAGAIRHGITRALMEYDETLRPALRAAGFVTRDARRVERKKVGLHKARRRPQYSKR |
106 | Mannheimia_phage(32.65%) | integrase,tRNA,protease,terminase,holin,tail | attL 825107:825125|attR 865671:865689 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1109252 : 1115898
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LR134169|1109252:1115898|DBSCAN-SWA AATGGTTACCATGAATATTACGCTTTCCCAAGATCCCGCTCCCGAACAATGGGGCAAAAATGCCATTCTGTCTGCCAATCAACAAAGTATGACGATTCACCTACAAAAAGATCCGCTAACGACGATTCAGCGTGCCGCTCGTAAAATTAAAAATCAAGGCGTTTTAAACGTTACGCTTAGCGGACAAGGTTGGACATTAGAAGAATGTTGGGCATTTCATCAAGGTTTTATCAGTGTTCGCAATACCGGAACAGTAAGTTACCCCGACTTAGCCGAACAACAAGCGGAATTTGATGCACGTTTGCATTGTTCTGACTTTACACGTGCTTTGATTAACGAATCTTCCGAAACGCTTACCCCTGAGCGTTTAGCGCAAAAAGCGGCGGAGTTTATTACTAAACAGTCTGAGCAATATCTCGGTAAAAATGTAGTCTCCGCCGAAATGATTAGCGGTGAAGTGTTAAAACAGCAAGGCTATCACGGTATTTGGACGGTAGGTAAAGGCTCTGCAAATAAACCGACATTGCTCAAATTGGATTTTAATCCGAGCGGTGATATTAATGCACCCGTGCTTGCTTGTTTAGTCGGTAAAGGCATTACTTTTGATACCGGAGGTTATAGCATTAAACCGAGTGACTCAATGAGTACTATGCGTACCGATATGGGCGGTGCAGCCTTATTAACCGGTGCATTAGGCTTTGCAATCAGTCGCGGCTTAACACAACGGGTAAAACTCTACTTATGCTGTGCGGAAAATATGGTAAGCAGTACTGCATTTAAATTAGGCGATATTATCGAATATCGCAATGGCGTTAGTGCAGAAGTGCTGAATACCGATGCGGAAGGTCGCTTAGTGTTAGCGGACGGCTTAATTGAAGCCAGTGAGCAAAATGCGAAATTTCTTATTGATGCGGCAACCTTAACCGGCGCGGCAAAAGTGGCGGTCGGTAATGACTACCATTCGGTACTGTCTATGGATGATGAATTAACCGCTTGCTTATTTAATGCGGCAAAAGCGGAACACGAACCCTTCTGGCGTTTACCGTTTGAAGAATTTCATCGTTCACAAATTTCGTCATCATTTGCAGATATTGCCAATATCGGATCAGTACCGGTTGGTGCCGGTGCAAGCACGGCAACCGCCTTTTTATCGTACTTTGTGAAAGATTACGAAAAAAATTGGCTTCATATTGATGCTTCCGCCACTTTCCGTAAAACGGCGAGTGATTTATGGGCGGCAGGTGCAACCGGTTTAGGGATGAAAACCCTCGCGAATCTGCTTTTATCTCGATAAACGTTTTGTAAAATTTCCAAAAAATTTAACCGCTTGTTCCGCTAAAGTTCGCGTAAAACAAGCGGTTTTATTTTGCTTTGTGTATAATATTGCGAATTGACTTCTATTTTGCCATTTAGGAACAAATATGAATTACTTAGCGAGTGCAAACGAAACTCTCAGCCTTTACGCCCAAGCAATTAGCCAGCTTAATCAACGTTTAGACGGCGCGTTTAATCAAGCGGTCGAAATGATTTTAAACTGTGAAGGACGCGTCGTGGTTGCGGGTATCGGTAAATCCGGTTTAGTCGGGCAAAAAATGGTCGCGACGTTTGCTTCAACCGGTACACCCAGTTTTTACTTACATCCGACCGAAGCCTTCCACGGCGATTTAGGGATGTTAAAACCGATTGATGTGGTGATTCTTATTTCCAACAGCGGAGAAACCGATGATGTAATTAAATTATTACCCAGCTTAAAAAGTTTCGGTAATAAAATTATTGCGATGACCGGCAATCCGAATTCAACTCTTGCTCAACACGCCAATTTAATTCTCAATATCGGTGTTGAGCGAGAAGCCTGCCCGAATAATCTTGCCCCTACTACATCGACACTAGTAACGATGGCGCTCGGCGATGCGTTGGCGATTGCATTGATTAACGCACGTGGTTTTAAAGCGGAAGATTTTGCCCGCTTCCACCCGGGTGGCAGTTTAGGACGTAAATTGCTCAATCGCGTGAAAGACGTGATGCAAACTAAGTTGCCGATCGCCCAACCGAATGCGGATTTCAGTACGATTCTAAGTGTGATGAATGAAGGCAGAATGGGCGTGGCATTAATTATGCAAAGCGAACAATTACAAGGCATTATCACTGACGGCGATATTCGTCGTACATTAGCGCAATTCGGTACGGATAGTTTAGCGAAAACCGCCGAACAAATTATGTCAAAACAGCCAAAAACCATTTCGGACACCACTTATTTGGAGAAAGCGGAAGAAATGATGAAAGAGTTACATATTCATTCGTTGATTGCGCTAAATGATGAAGGCAAAGTATCCGGTATTATGGAATTCTCAAGTTAAGGATATTTTGTGGCGAAATCAAATTATATTACGCGCGGCGGGTGGCAAGCCTTAGATCAAGAGCTTAAATTTTTATGGAAAGACGAACGCCCCAAAATAACACAAGCGGTTTCGGAAGCGGCGGCTTTAGGTGATCGCAGCGAGAATGCCGAATATATTTACGGTAAACGTCGCTTACGTGAAATTGATCGCCGAGTTCGTTTTTTATCTAAACGCTTAGAAGTGTTACAAATCGTGGATTATCATCCGAAACAAGAAGGCAAAGTCTTTTTCGGTGCTTGGGTTGAGCTTGAAAACGAACAAGGAGAAACCAAGCAATACAGGATTGTCGGGTGTGATGAATTTGATCCGGCTAAGAATTGGATCTCAATTGATTCGCCGGTAGCCCGAGCGTTAATCGGTAAAGAAGCGGATGATGAAATTAAGGTGGATACGCCGCTTGGCAAAAGCTTGCTATATATCAACAAAATTTGGTACGAGAAAGAAGGTCTTTACTAGACATAAAAATATAAGCGGTCGTTTTTAACGGGAAATTTGCAAAATTCCAGTCAAAAACGACCGCTTGTTTTTAGTACGTCAAACGAAAAATTAGATCGCTTTTAATACGTTTACCATTTCAATTGCGCCTAATGCACATTCTGAACCTTTATTACCTGCTTTAGTACCCGCGCGTTCAATCGCCTGTTCAATATTTTCTGTGGTTAATACACCGAAAATTACCGGTACGCCGGTTTCTAATGCTACCGCCCCGATACCTTTTGCCGCTTCATTACATACGTAATCATAGTGAGTAGTTGAACCACGAATTACTGTACCTAAACAAATTACCGCATCGTATTTACCGCTGGTTGCCATTTTTTTCGCTACTAACGGGATCTCAAATGCACCTGGTACCCACGCCGTATCAATATTGTTTTCATCCGCACCGTGACGTACTAAGGTATCAATTGCACCGCTTAATAATTTATCGTTGATAAAATCGTTGAAACGTGCGGTTACAATACCAAATTTTAAACCTGTCGCAACTAAGTTACCTGTAATCTTTGCCATTTTTTTGTCCTCTCGAAATATGCAAAATTTTATAAAAAAGTGACCGCTTGTATCATTTTATAGTAGGGACGCAACGCTTGCTTCCCTAATACTACATACGGTTGTTAAAGTTAGAAGTTAAACATATGTCCCATTTTTACCTGTTTGACTTTTAGGTAATCAATGTCATTTTTGTTCGGTTCTACAATAATCGGCTCGCGTGCAACGATATTTAACCCTTGCTCTTTTAACCCTTCAATTTTTGCCGGATTATTGGTTAATAAACGGATCGATTTCACACCTAACTGCTGGAACATTTGCGCACCGATATAGTACTCACGTTCGTCTTCTTTAAATCCTAAAGCGACGTTCGCTTCAACCGTATCCATCCCTTTATCTTGTAGTTCGTAAGCACGTAGCTTATTAATTAAACCGATACCACGACCTTCTTGGCGTAAATACAGAATCACACCTCTGCCCTCTTGCTCAATTTGGGTCATTGCTGCGGCAAATTGCTGACCGCAATCACAACGTTGAGAACCGAAAGCGTCACCGGTTAAACATTCCGAATGGATACGTGCTAATACTTGCTCACCGTCCGTTAAATCGCCTTTGACTAACGCAACGTGTTCTTTACCTGAAATCACTTCAACAAAGCTATGTGCCATAAACTCACCGTATTTTGTCGGCATTTTCACCACGGAAATTTGTTTCACTAAGCTGTCATGCTTACGGCGATATTCTTGTAATTGTTGAATCGTGATAAACGGCATATTGTGTTCTACCGCAAATTTTTGTAGATCCGGCATAGTCATCATCGTGCCGTCATCCGCCATAATTTCACAACATAAACCGGCGTGTTTTAAACCGGCTAAACGAGCTAAATCCACCGTTGCTTCGGTATGACCGTTACGCACTAACACACCGCCGTCTTTGGCGATTAGCGGGAACATATGCCCCGGACGGCGGAAATCCGTTGCTTTAGCATTATCATCGACAATTTTCATTGCGGTAATCGAACGCTCAAAAGCTGAGATACCCGTTCCCGTATCAATATGATCGACTGAAACGGTAAATGCGGTTTCGTGATTGTCCTGATTAACCGGAACCATCGGATGGAAGTTTAATTTTTTAGCGATTTCCGTTGAAATCGGCGTACAAATCAAACCTTTGCCGTAAGTTGCCATAAAATTGATATTTTCCGGTGTCGCGAATTCTGCCGCACAGATAAAATCGCCTTCGTTTTCGCGATCTTCGTCATCAGTCACTAAAATGATTTTGCCTTGGCGAATCGCTTCAATCGCTTCTTCTACTTTTGAAAATTGGAAATTTGTCATCTTCTTTTCCTAAAATATATATTTTTGTCGGTAGGGTACGCTCAGTGTGTCCTACAAATCTTAAAATCCCGCCTGCTTTAAAAAGTCTAAACTAAGATTACTTTTCGGCTCATCCGCCGACTTTTTTAGTAAAAACTGTTCGATATATTTGCCGACAATATCATTTTCTAAATTGACAATACTGCCGATTTTTTTCGAGCCTAAATTGGTTTCTTTTATGGTATGTGGAATAATCGATACACGGAAACTTTCATCATCGGTATCCACTACGGTCAGGCTAATACCGTCTATGGTAATCGAACCTTTCTCAATAATATAACGCATTAACTTCGGAGAGGTTTTTATACGATACCAAGTTGAATTATGTGCCGGTATGATTTCCGCAATTTCGCCTGTGCCGTCAATATGCCCCGAAACAATGTGTCCGCCAAAACGTCCGTTTGCCGCCATCGCGCGTTCTAAATTAACCGGACTATTCGGCTTTAATTCGCCTAATGAAGTACGTTTTAATGTTTCCGACATCACATCGGCGGTAAATTGGTTGCTTGAAAAAGACGTTACGGTTAAGCAGATACCGTTTACGGCAATGCTGTCGCCTAAATGAACGTCTTGTAATACTTTGGTCGCATTAATTGTGACTACCGCAAATTCGCCTTGTTTATGAATCTGGGCAATTTTGCCGACTTCCTCAATAATACCTGTGAACATATAATTTCCTCATTATTGATCCCCCTCTTTTGTAAAGAGGGGTTAGGGGAGATTTAACAACGCCAAAGTGAAAGGCGGTGTAAATTTCAACATTATCTCAAATCTCCCCGGCCCCTCTTTGCTAAAGAGGGGAGATGACTACATAATCCAACAAAATATCTTCACCGATTAACTCGGTTGATTTCAGTATTAATTTAACCGCTTGGTCGATTTGCTGAATTCCTTCGCCGCCGATTGGGGTTTTCGCTTGTTTACCACCGACTAATTTCGGTGCGATATAACAATGTACTCGATTCACAATACCGCTTTCTAACGCACTGAAATTTAAACTTGAACCGCCTTCTAATAACAGGCTGTCGATCTGCATTTCGCCAAGCTTTTGCAAAAGATCTTGCAAATCTACCCGCTTGTTTCGTGCTTTACACACTAATACTTCTACGCCAAGCGATCTAAATTGTTCAATTTTTTGCAAATCGTCACAAACGGTTGCAATCACGGTGCGATATTCTTTCGCTGTTTGCACTAACTGGCAATCCAACGGTGTACGTAATTGGCTATCGCAGACAATCCGAACAGGTTGTTTCGCATTCGGCATTCGGCTATTTAGCATCGGGTTATCAGCAAGCACCGTATCCACTCCCACCATAATCGCACTATATTGATGGCGAGTTTGTTGCACTCTTGCTCTTGCCAATTCACCGGTAATCCATTTGGATTCCCTGGTACTAGTTGCAATTTTGCCGTCTGCCGTCATGGCATATTTCATCAGCACATACGGGCGTTTAGTTTGAATATAGTGGAAAAAAATCGGGTTTAACGCATCACATTCGTCTTTGAGTAAACCTTCTACTACTTCCACACCTGCTTGGCGTAACTGACTTGCTCCTTGCCCCGCCACTAAAGGATTCGGATCGCTTGAACCGATAAATACTTTTTTAATGCCTCGTTCAATTAATAAATCCGAACAAGGAGGCGTGCGTCCGTGATGACAACAAGGCTCAAGTGTTACATAAGCAGTCGCCCCGGAAAGATCTTCCTTACAATGTAAAATGGCATTACGTTCCGCATGCCAGCCACCAATCTTTTCATGGTAACCTTCGGCAACGATTTCACCGTTTTTGACAATTACACAACCGACAAGCGGATTGGGATTCGTCCAGCCTAAACCTTGTTTTGCCAGTGCAATGGCACGACGCATATAGTCTAAATCAGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >LR134169|1109252:1115898|1109252_1110545_+|VEB26400.1|DBSCAN-SWA MVTMNITLSQDPAPEQWGKNAILSANQQSMTIHLQKDPLTTIQRAARKIKNQGVLNVTLSGQGWTLEECWAFHQGFISVRNTGTVSYPDLAEQQAEFDARLHCSDFTRALINESSETLTPERLAQKAAEFITKQSEQYLGKNVVSAEMISGEVLKQQGYHGIWTVGKGSANKPTLLKLDFNPSGDINAPVLACLVGKGITFDTGGYSIKPSDSMSTMRTDMGGAALLTGALGFAISRGLTQRVKLYLCCAENMVSSTAFKLGDIIEYRNGVSAEVLNTDAEGRLVLADGLIEASEQNAKFLIDAATLTGAAKVAVGNDYHSVLSMDDELTACLFNAAKAEHEPFWRLPFEEFHRSQISSSFADIANIGSVPVGAGASTATAFLSYFVKDYEKNWLHIDASATFRKTASDLWAAGATGLGMKTLANLLLSR >LR134169|1109252:1115898|1111617_1112106_+|VEB26402.1|DBSCAN-SWA MAKSNYITRGGWQALDQELKFLWKDERPKITQAVSEAAALGDRSENAEYIYGKRRLREIDRRVRFLSKRLEVLQIVDYHPKQEGKVFFGAWVELENEQGETKQYRIVGCDEFDPAKNWISIDSPVARALIGKEADDEIKVDTPLGKSLLYINKIWYEKEGLY >LR134169|1109252:1115898|1112196_1112658_-|VEB26403.1|DBSCAN-SWA MAKITGNLVATGLKFGIVTARFNDFINDKLLSGAIDTLVRHGADENNIDTAWVPGAFEIPLVAKKMATSGKYDAVICLGTVIRGSTTHYDYVCNEAAKGIGAVALETGVPVIFGVLTTENIEQAIERAGTKAGNKGSECALGAIEMVNVLKAI >LR134169|1109252:1115898|1114034_1114682_-|VEB26405.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEEVGKIAQIHKQGEFAVVTINATKVLQDVHLGDSIAVNGICLTVTSFSSNQFTADVMSETLKRTSLGELKPNSPVNLERAMAANGRFGGHIVSGHIDGTGEIAEIIPAHNSTWYRIKTSPKLMRYIIEKGSITIDGISLTVVDTDDESFRVSIIPHTIKETNLGSKKIGSIVNLENDIVGKYIEQFLLKKSADEPKSNLSLDFLKQAGF >LR134169|1109252:1115898|1114803_1115898_-|VEB26406.1|DBSCAN-SWA MTDLDYMRRAIALAKQGLGWTNPNPLVGCVIVKNGEIVAEGYHEKIGGWHAERNAILHCKEDLSGATAYVTLEPCCHHGRTPPCSDLLIERGIKKVFIGSSDPNPLVAGQGASQLRQAGVEVVEGLLKDECDALNPIFFHYIQTKRPYVLMKYAMTADGKIATSTRESKWITGELARARVQQTRHQYSAIMVGVDTVLADNPMLNSRMPNAKQPVRIVCDSQLRTPLDCQLVQTAKEYRTVIATVCDDLQKIEQFRSLGVEVLVCKARNKRVDLQDLLQKLGEMQIDSLLLEGGSSLNFSALESGIVNRVHCYIAPKLVGGKQAKTPIGGEGIQQIDQAVKLILKSTELIGEDILLDYVVISPL >LR134169|1109252:1115898|1110672_1111608_+|VEB26401.1|DBSCAN-SWA MNYLASANETLSLYAQAISQLNQRLDGAFNQAVEMILNCEGRVVVAGIGKSGLVGQKMVATFASTGTPSFYLHPTEAFHGDLGMLKPIDVVILISNSGETDDVIKLLPSLKSFGNKIIAMTGNPNSTLAQHANLILNIGVEREACPNNLAPTTSTLVTMALGDALAIALINARGFKAEDFARFHPGGSLGRKLLNRVKDVMQTKLPIAQPNADFSTILSVMNEGRMGVALIMQSEQLQGIITDGDIRRTLAQFGTDSLAKTAEQIMSKQPKTISDTTYLEKAEEMMKELHIHSLIALNDEGKVSGIMEFSS >LR134169|1109252:1115898|1112768_1113974_-|VEB26404.1|DBSCAN-SWA MTNFQFSKVEEAIEAIRQGKIILVTDDEDRENEGDFICAAEFATPENINFMATYGKGLICTPISTEIAKKLNFHPMVPVNQDNHETAFTVSVDHIDTGTGISAFERSITAMKIVDDNAKATDFRRPGHMFPLIAKDGGVLVRNGHTEATVDLARLAGLKHAGLCCEIMADDGTMMTMPDLQKFAVEHNMPFITIQQLQEYRRKHDSLVKQISVVKMPTKYGEFMAHSFVEVISGKEHVALVKGDLTDGEQVLARIHSECLTGDAFGSQRCDCGQQFAAAMTQIEQEGRGVILYLRQEGRGIGLINKLRAYELQDKGMDTVEANVALGFKEDEREYYIGAQMFQQLGVKSIRLLTNNPAKIEGLKEQGLNIVAREPIIVEPNKNDIDYLKVKQVKMGHMFNF |
7 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1386476 : 1395591
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LR134169|1386476:1395591|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >LR134169|1386476:1395591|1391280_1392591_+|VEB26656.1|DBSCAN-SWA MAKIVKVIGREIIDSRGNPTVEAEVHLEGGFVGLAAAPSGASTGSREALELRDGDKSRFLGKGVLKAVSAVNNEIAQAILGKDGSAQAEIDQIMIDLDGTDNKSKFGANAILAVSLATAKAAAASKGLPLYAYIAELNGTPGVYSMPLPMMNIINGGEHADNNVDIQEFMIQPVGASTLKEALRIGAEVFHNLAKVLKSKGLNTAVGDEGGFAPNLASNADALACIKEAVEKAGYVLGKDVTLAMDCASSEFYNKENGLYEMKGEGKSFTSQEFTHYLEGLCNEYPIKSIEDGQDESDWEGFAYQTKVLGGKIQLVGDDLFVTNTKILKEGIEKGIANSILIKFNQIGSLTETLAAIKMAKDAGYTAVISHRSGETEDATIADLAVGTAAGQIKTGSMSRSDRVAKYNQLIRIEEALAAAGTPAPFNGLKEVKGQA >LR134169|1386476:1395591|1388780_1389818_+|VEB26654.1|DBSCAN-SWA MLLIDIKDKELSQEEVEILEHPLVSGLILFSRNFHDKVQLEALVKSIRQRVKKPLLITVDQEGGRVQRFREGFTKLPAMQAFHTLAKKPQESTALARQTGWLMAAEMFALDIDLSFAPVLDLGHQCKAIGDRSFGENPDAMLPIAEAFIDGMREMGMATTGKHFPGHGHVLADSHLETPFDDRPKEAIFNRDILPFKQLISKGKLSAVMPAHVIYTQCDSQPASGSEYWLKQVLRNQLNFNGVIFSDDLGMKGAGFMGNFVERSEKAIHAGCDLLLLCNEPEGVVQVLDGLKYQPTKAQTERHISLMKRKAVSWNELEASPRYQQAQQRLTALQNEWLEYKAQHC >LR134169|1386476:1395591|1393313_1393724_+|VEB26658.1|DBSCAN-SWA MLYSVLTDQLLIGQGYRNGAHSTQHEQLVVMFEDDGETGYFYAMDLHQTENPVVDSLFVYSKADIDEKTLTEPRRLEICWSENGYQAFLLLNGYPHAAFDFSQFVGYNHTKFPQPELDSMWVHKETNAELVEKWLG >LR134169|1386476:1395591|1387168_1387849_+|VEB26652.1|DBSCAN-SWA MQLSTFSHSEDELLKKANWLAGFTLGEIAHQLNIDVPLDLRRDKGWVGQLIETALGAKAGSKPEQDFAHLGIELKTIPINHKGFPLETTFVSLAPLTQNTGITWQTSHVRHKLQKVLWIPVQGERHIPVAERHIGQPILWEPSFEQEQQLKNDWEELMEYIIFGRLNEINATLGEVLQLRPKGRNSRSLTAAVNQQGERVQSLPLGFYLRKQFTAEILQNFLRSPL >LR134169|1386476:1395591|1386476_1387109_+|VEB26651.1|DBSCAN-SWA MSRKHLTARQQEIFDFVKHHIETTGMPPTRVEIAREIGFKSPNAAEEHLKALARKGYIEMLSGTSRGIRILIDNEETAANDDGLPLIGKVAAGTPIMAIEHVESHYPVNGAMFNPNADYLLKVNGNSMEKIGILDGDLLAVHKTNFARNGQVVVARVDDEVTVKRLEKKGDLIYLHPENDELQPIIVDPRIEYIEIEGIAVGVIRNNAWM >LR134169|1386476:1395591|1389898_1391074_+|VEB26655.1|DBSCAN-SWA MILNCPHFQQQDCVSCQWLEKPYATQLTDKEIDLKRLISPFILQKFTEILPPVQSLQAQFRNKAKMVVSGSVERPILGILKEQNDPQSGIDLCDCPLYPTEFEAIFPILKDFIARAGLVPYNISKKKGELKYILITQSQYNQSVMLRFVLRSEQKRPLVERELPNLLAKLPKDSVVSLNIQPQHAAILEGETEIFLTEKTTIEENFNDIPLFIRPQGFFQTNPSVASQLYATAQNWIKNLPIQQFWDLFCGVGGFGLHCAKALQEKNKNVQLTGIEISASAIASATKSAERLQLNNVTFASLDSAQFALNDKGKSPDLVIVNPPRRGIGKPLAEFLNELGTPHLIYSSCNAQTMAKDFEALSNYSLQKVQLFDMFPHTSHYEVLTFLVKKS >LR134169|1386476:1395591|1387934_1388666_+|VEB26653.1|DBSCAN-SWA MFDWIANPEAWVALLTLTGLEIVLGIDNIIVISILVSHLPIHQRQSARIIGLALAMGTRILLLLSLAWMMKLVDPLFSIAGMPISGRDLILLLGGIFLIVKSAMELKESIAGESHEEKEDSAKKASFLMILVQIAIFDVVFSLDSVITAVAMADDIPVMVIAIIIAVAVMMLAAKAIGDFVDNNPTIKNLALAFLILIGVVLVGEGFNIHIPKSAVYTAMGFSVVVELLNIKMRKNQAKHAKA >LR134169|1386476:1395591|1392669_1393299_+|VEB26657.1|DBSCAN-SWA MQEVLLSEPWLKWAIEIQSIAQNGLTYTTGIYDRERYERLRDISAEMLSCKTDIPVEKIKLLFCNEEGYQTPKIDTRAAIFKNGQILLVQENDGRWALPGGWVDVLETIDSNTVKEVKEEAGLTVKTHFIIAIHNQHRRNDPNYPYSVLKTFVMCELLGGEFVENSETIASQYFSLENLPYLAQEKNSKAQIALCFEAYQSTTWQTQFD >LR134169|1386476:1395591|1393782_1395591_-|VEB26659.1|DBSCAN-SWA MQLSQTAAKDVLNNVFGYQAFRHGQQEVIDSVLAGRDCLVIMTTGGGKSLCYQVPALCLDGITLVISPLISLMKDQVDQLLTNGIEAGFLNSTQTFEEQRLVEQKALSGQLKLLYLSPEKVMTQGFFHFISLCKISLIAVDEAHCVSQWGHDFRPEYTLLGNLRDTFPNVPLMALTATADPTTRHDILQHLRLTDPHTYLGSFDRPNIRYTVQEKFKPMEQLAKFISKQQGKSGIVYCNSRKKVEEITEKLAARKISVMGYHAGMSVQQRETVQNAFQRDNIQVVVATIAFGMGINKSNVRFVVHFDLPRSIESYYQETGRAGRDDLPSEAVLFYDPADYAWLQKVLLEEPESEQRDIKQHKLQAIGAFAESQTCRRLVLLNYFGESRQEPCKNCDICLDPPRKYDGTLDAQKVMSVIYRTGQTFGAHHVIGVLRGLNNQKIRQFNHDQLSVYGIGKEQSQDYWLSIIRQLIHLGLIRQNIVNHSALQLTEEARPVLRSEKKLELAMPRLTFSATAYVQKQSSVRYDKDLFARLRFLRKQIADKENIPPYVVFNDATLQEMAEFLPLSEVEMLDINGVGERKLERFGGAFLSLIREHCNNRQ |
9 | uncultured_Caudovirales_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1715805 : 1723426
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LR134169|1715805:1723426|DBSCAN-SWA TCTAGTCGTCTAAGAAACTACGTAAAGTTTCCGAACGGCTTGGGTGACGAAGTTTGCGTAACGCTTTCGCTTCAATCTGACGAATACGTTCACGCGTTACGTCAAACTGTTTACCGACTTCCTCAAGCGTGTGGTCTGTGTTCATATCAATACCGAAACGCATACGCAATACTTTTGCTTCACGCGGCGTTAAGCCTTCCAACACTTCATTCGTTGCTAAACGTAAACTTTCCGCAGTTGCCGAATCTAACGGTAATTCAAGGCTTTCGTCTTGAATGAAATCACCTAAATGCGAATCGTCGTCATCGCCAATCGGCGTTTCCATTGAAATCGGCTCTTTGGCAATCTTCAACACTTTACGAATCTTATCTTCCGGCATTCCCATACGTTCCGCTAACTCTTCCGGCGTCGCTTCACGTCCCATTTCTTGTAAACATTGACGAGAAATACGGTTCAGTTTATTGATGGTTTCGATCATATGTACCGGAATACGGATAGTACGCGCTTGGTCGGCGATTGAACGAGTAATCGCCTGACGAATCCACCAAGTCGCATAAGTAGAGAACTTATAACCGCGACGATATTCGAATTTATCTACTGCTTTCATCAAACCGATGTTACCTTCCTGAATTAAATCTAGGAATTGTAAACCGCGGTTGGTATATTTTTTCGCAATCGAGATTACTAAACGTAAGTTTGCTTCCACCATCTCTTTTTTCGCACGGCGAGCTTTTAATTCACCGTTTGCGATACGGCCGCCGATTTCACGAATTTGTGCGATAGTCAGACCGGTCGTTTGCTCCATACGTTGTAAATTATCGATATTTACGCGAATTTGGTCGATATAGTTCGCCAATTTAGGCGCGGCGCCTTTTTTCGCATTAATTGCTTTTTCAATCCATTCTTCCGACGTTTCGTTACCTTGGAACAATTTTAAGAAGTCAGCCTTTTTCATTTGTGCATATTCAACCGCATAACGTTGAATTTGGCGCTCTTCCGAACGTACTTGTTTCATCATTTTTTGCATCGATTCGACAAGTAAATCAAATTGTTTCGGTACTAAACGGAACTCACGGAAAATATCCGAAAGTGCTTGGATCTGCTCTCTTGATTTTTTATGGCTACGACCGTGTTTCTGAATCGCTTGTAAGGCTTTTTCGTGTTGCTCGCGTAACGCATAGAATTTTTCGCGAGCAAGTTCAGGATCGATTGAATTGTCATCACCGGTGTCCGCATTGCCGTCGCTTTCTTCCTCTTCGCTCTCGTCATCTACATCCACAACATCTTCCGCTTCTTCTTCGTCATCAAGATCTACGTCTAAATCTTCCAACGCTTCGTCCGCTTGGATATTCGGATCAACGAAAGCGGTAACAAGATCCGATAAACGCATCGTACCTTCTTCAACTTGCGCATAGAAACCGATTAATTCGGTTAAGGCTTCCGGATATTCTGCAACCGCACATTGCACTTCATTGATACCTTCTTCAATACGTTTCGCAATATCAATTTCGCCTTCACGGGTAAGCAATTCCACCGTACCCATTTCACGCATATACATACGTACCGGATCGGTCGTTCTACCTAATTCAGATTCTACCGTCGAAAGCACTTTAGTCGCTTCTTCCACGACATCTTCATCAGCGATATTTTCCGCGAGCATTAACTCGTCGGTATCCGGGGCGGTTTCTAAAACTTTAATCCCCATATCGTTGATCATTTGAATAATATCTTCGATCTGCTCCGCATCAACCAACTCTTCCGGTAAGTGGTCGTGCACTTCCGAAATGGTTAAATAACCCTGTTCACGCCCTTGGGCAATCAGAAGTTCTAATTGGGATTGCTGTTCTAATTGTTGTTCCATAATTCGTATCCGTTTTGTGTGCGCGCAAAAATAGTATTGGATTATACCATTAATTAAAATTTTCTTGATAGTTTTGCAAAAAATTTCTCAAAAATGACCGCTTAATCATTGTGCAATCAACATGACTAACTCTTGCTTTTCTTCCGCGCTTAGTCCTAGGCTGCGATCTTTGGCAATTAATACTTCGATTCGCTTTTCCACCAATTTCGCATAAAGAAAATCAAGCGTTTCAATAAAAGTCGTTTCGATGTTTTCCGATGTGACCAAATGTTCCCAATCGGCTAACAGTTCAAGAGTGCGGTAATTCGGTTTATCTCGCCAATGTTCGAGTAATGCGCCCATTGAGACACCGACTTTTTGCCGGCAAACCTCAACCAGCTCAAGTAATAATTCAAAGCCCGGTTCTTCCAACGTTTTAAGCGCGGAAATATCCGGCACGAATTTAACCAATTCGGGGTTTTGCAATAATAAGGCGATTAATAAACGCATCGGCGTTCGCTTAATTTGCGGCGTTTGCACCGCCTTTTTTTGTACGGCTTGCGAACGACTCGGTAACATTGCTTCCAATTGCGCCGGATCTAAAATGCCTAATTTTTGCCCGAGAATATTGCGTAGATAAACTCGCAGCATTTCACCCGGAATACGATTAATCAACGGTATTGCTAATGCCGCCAGTTTTGATTTACCTTCTTTGCTGGAAAGATCAACCTGTGCAATAAGCGAATCGAATAGAAAATCACTGAGTGACATCGCATTTTGCAAATATGCCTCAAAGCCTTGCTTGCCTTGTGCGCGTACAAAACTGTCCGGATCTTCGCCGTCCGGCAAGAAAATAAATTTCAGCTGCCGTCCGTCATGCAAATACGGTAATGCGTTCTCAAACGCCCGCCATGCCGCCTCTCGCCCCGCTCTATCGCCGTCATAGCAACAAATCACTTGTTCGGTGACACGGAACATCTGCTGGATTTGCTCGCCGGTAGTTGCCGTACCGAGTGACGCCACCACGTTATCCACCCCGAATTGCGCCAGTGCGACCACATCCATATACCCTTCGACCACAACGAGTGAGGTAGGATTTTCATTCTGTTGTAACGCTTGAAATAAACCATACAGTTCATTACCTTTATGATAAGTCGCCGATTCCGGTGAATTCAGATATTTAGGTCGTTCATCCCCCATGACTCGCCCACCAAAGGCAATTACCCGCCCGCGTTTATCACGAATCGGAAACATTACTCTATTGCGAAATTTATCGTAAATTCGACCGCTATCATTTTGCGTAATCATACCCGTATCGAACAATTTCTGTACTTCATCACGATTCGTGCCGAATTTACGTAGCACGGAATCCATCGAATTATATGCAAAACCAATTTCAAAACGTGCAATGATTTCCGGTGACAGCCCACGGCTTTGTAAATAGCTTTGACTCGGAATATCTTGAGTTAAATTTTGTTGATAAAACCGACTAATCGCTTCTAACAGCTCATATAAATTACGCTTGGTTTTGTAACTTACCAGAGGCTCACCGTCACGAGCCATCACATTCTCACGCGGTACTTCCAAACCTTGCATCGCGGCAAGTTCTTCAATCGCCTCGGGAAATTCCAGTTTATCGTAATCCATCAAGAAGCTAATCGCATTACCGTGCGCACCGCAACCAAAACAGTGATAAAACTGTTTAGATTGACTGACGGTAAACGAAGGACTTTTTTCGTGATGAAACGGACAACAGGCTTGATAATCTCGTCCTGCTTTTTTGAGTTTGACTCGACTATTGATGAGTTCAACAATGTCGGTACGAGCAACAAGATCATCAATAAACGAACGAGGGATAGATCCTTTCATTGATTCTCCTTGTCATAATGGCAAGCGGTTGGATTTGCGTGAAATTTTGCAAAATTTATTGAAATTTGACCGCTTATTTTACTATAGGTTACATAGGGGTTCGCTAGAAACACTAAAACCGTGATTCCAAAAGGTTTCACGGTTTTAGTTAATTTAAGCTAAATAGCAATTGCTAATTAGTATAAACGAGTGTTACGTGCATTTTCACGTGCATTACGTTTAGCGTGACGTTTAGCTAAAGATGCTTTTTCACGTTTACGAATTGTTGTCGGTTTTTCATAGAATTCACGAGCGCGAACTTCTGCTAATAAACCTGCTTTTTCGCAAGAGCGTTTGAAACGACGTAATGCAACGTCAAATGATTCATTTTCACGAACTTTAATTACTGGCATATGCCATCACCTCAGGAAATATATGTTTAAATAAAGTCGCACACAATTTTTGGCGACATAGAACTAAAAAAAGGTATCTAATTATATCGTAGTCAAGATAAAAAGTAAATAGAGAATTTACTATTCAAATAAAACAGCTTCATTTAACACCTTACCAGCTAAATCCTTTGCTGATAAACTAGGCGCGCCATCAAGATTCCAATTAATCGCTACTGTCGGATCATTCCAAATCAATGAATGTTCCGCTTTTGGATTATAGTAATCTGTGCATTTATAGGTAAATTCAGCGGTTTCTGTCAATACATAAAAACCGTGAGCAAATCCTTCAGGCACCCATAACTGTCGTTTATTTTCTGCAGATAATACTTCGCCAACCCATTGCCCAAAAGTCGGTGAACTTTTACGTAAATCTACCGCTACATCAAACACTGCACCCTGTACTACACGCACTAACTTACCTTGTGTATTTTCCGTTTGATAATGTAAACCTCTCAAAACACCCTTAATAGATTTTGAATGATTTTCTTGCACAAAAGTACGATCAGCAACATTTTGTTTAAACCATTCATCTCGAAAAGTTTCCATAAAGAAACCACGCTCATCACCAAACACTTGAGGTTCTAAGAGTTTTACATCCGGAATATTTGTTTCAATAATTTTCATTATACATATGCCTTAATATTTTTTAATGCTCGTTGCCAATCACTTGGTTTAATACCAAAAACCGCATCAATTTTAGTTAAATCTAAACGGGAATTTGCTGGTCGTTTTGCTGGTGTTGGATAATCACTCGTAGAAATAAAATTAACAAGCGGTGCTTTTTCTAATACTTTTTGTGAAACAGCTTCATTAAAAATAGTATTAGCGAAGTCTGCCCAACTCACATAAGGCTTTCCAGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >LR134169|1715805:1723426|1717770_1719513_-|VEB26984.1|DBSCAN-SWA MKGSIPRSFIDDLVARTDIVELINSRVKLKKAGRDYQACCPFHHEKSPSFTVSQSKQFYHCFGCGAHGNAISFLMDYDKLEFPEAIEELAAMQGLEVPRENVMARDGEPLVSYKTKRNLYELLEAISRFYQQNLTQDIPSQSYLQSRGLSPEIIARFEIGFAYNSMDSVLRKFGTNRDEVQKLFDTGMITQNDSGRIYDKFRNRVMFPIRDKRGRVIAFGGRVMGDERPKYLNSPESATYHKGNELYGLFQALQQNENPTSLVVVEGYMDVVALAQFGVDNVVASLGTATTGEQIQQMFRVTEQVICCYDGDRAGREAAWRAFENALPYLHDGRQLKFIFLPDGEDPDSFVRAQGKQGFEAYLQNAMSLSDFLFDSLIAQVDLSSKEGKSKLAALAIPLINRIPGEMLRVYLRNILGQKLGILDPAQLEAMLPSRSQAVQKKAVQTPQIKRTPMRLLIALLLQNPELVKFVPDISALKTLEEPGFELLLELVEVCRQKVGVSMGALLEHWRDKPNYRTLELLADWEHLVTSENIETTFIETLDFLYAKLVEKRIEVLIAKDRSLGLSAEEKQELVMLIAQ >LR134169|1715805:1723426|1721442_1722321_-|VEB26988.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPITRGVSKQLLPVYDKPMIYYPLSVLMLAGIREVLIITTPEDNESFKRLLGDGSDFGIQLSYAIQPSPDGLAQAFLIGEEFIGQDSVCLVLGDNIFYGQHFTQSLQEAVKSVETKGATVFGYQVKDPERFGVVEFDDNFRALSIEEKPIQPKSNWAVTGLYFYDNRVVEFAKQVKPSARGELEITTLNEMYLNDGSLNVQLLGRGFAWLDTGTHDSLHDAAAFVKTVQNLQNLQVACLEEIAYHNGWLSLEQLEVLAKPMAKNEYGQYLLRLAKGTK >LR134169|1715805:1723426|1722361_1723426_-|VEB26989.1|DBSCAN-SWA MKKILVTGGAGFIGSAVVRHIINNTQDSVINVDKLTYAGNLESLQMVENHSRYVFEQVDVCNRVELDRVFTQHQPDAVMHLAAESHVDRSIDGPAAFIETNIVGTYTLLEAARTYWNSLDANKKLMFRFHHISTDEVYGDLGGTDDLFTETTPYSPSSPYSASKASSDHLVRAWLRTYGLPTIVTNCSNNYGPFHFPEKLIPLMILNALDGKLLPVYGNGQQIRDWLFVEDHARALYKVVTEGKVGETYNIGGYNEKANIDVVRTICSLLEELVPNKPAGVHKYEDLITYVTDRPGHDVRYAIDATKIGRELGWKPQETFETGIRKTVEWYLNNTEWWSRVLDGSYNRERLGSN >LR134169|1715805:1723426|1715805_1717665_-|VEB26983.1|DBSCAN-SWA MEQQLEQQSQLELLIAQGREQGYLTISEVHDHLPEELVDAEQIEDIIQMINDMGIKVLETAPDTDELMLAENIADEDVVEEATKVLSTVESELGRTTDPVRMYMREMGTVELLTREGEIDIAKRIEEGINEVQCAVAEYPEALTELIGFYAQVEEGTMRLSDLVTAFVDPNIQADEALEDLDVDLDDEEEAEDVVDVDDESEEEESDGNADTGDDNSIDPELAREKFYALREQHEKALQAIQKHGRSHKKSREQIQALSDIFREFRLVPKQFDLLVESMQKMMKQVRSEERQIQRYAVEYAQMKKADFLKLFQGNETSEEWIEKAINAKKGAAPKLANYIDQIRVNIDNLQRMEQTTGLTIAQIREIGGRIANGELKARRAKKEMVEANLRLVISIAKKYTNRGLQFLDLIQEGNIGLMKAVDKFEYRRGYKFSTYATWWIRQAITRSIADQARTIRIPVHMIETINKLNRISRQCLQEMGREATPEELAERMGMPEDKIRKVLKIAKEPISMETPIGDDDDSHLGDFIQDESLELPLDSATAESLRLATNEVLEGLTPREAKVLRMRFGIDMNTDHTLEEVGKQFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSETLRSFLDD >LR134169|1715805:1723426|1720567_1721443_-|VEB26987.1|DBSCAN-SWA MARFLITGAKGQVGYCLTKQLQSKADVLAVDRDELDITNRDAVFKVVREFSPDVIINAAAHTAVDRAESEIEPSEAINVKGPQYLAEAANEIDAIILHISTDYVFEGTGSGEYKEDDKPNPQGVYGKTKLAGERVVQQANKKHIILRTAWVFGEHGNNFVKTMLRLGKERESLGIVSDQFGGPTYAGDIAKALIQIANTILNGKQDAFGIYHFTGKPYVSWADFANTIFNEAVSQKVLEKAPLVNFISTSDYPTPAKRPANSRLDLTKIDAVFGIKPSDWQRALKNIKAYV >LR134169|1715805:1723426|1719689_1719905_-|VEB26985.1|DBSCAN-SWA MPVIKVRENESFDVALRRFKRSCEKAGLLAEVRAREFYEKPTTIRKREKASLAKRHAKRNARENARNTRLY >LR134169|1715805:1723426|1720025_1720568_-|VEB26986.1|DBSCAN-SWA MKIIETNIPDVKLLEPQVFGDERGFFMETFRDEWFKQNVADRTFVQENHSKSIKGVLRGLHYQTENTQGKLVRVVQGAVFDVAVDLRKSSPTFGQWVGEVLSAENKRQLWVPEGFAHGFYVLTETAEFTYKCTDYYNPKAEHSLIWNDPTVAINWNLDGAPSLSAKDLAGKVLNEAVLFE |
7 | Enterobacteria_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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