CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
LS997867	Vibrio cholerae strain NCTC 30 genome assembly, chromosome: 1	1 crisprs	cas3,DEDDh,csa3,DinG,csx1	0	1	5	0
LS997868	Vibrio cholerae strain NCTC 30 genome assembly, chromosome: 2	0 crisprs	cas3,csa3	0	0	1	0

1. LS997867

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: LS997867_1

• CRISPR_ID: LS997867_1
• CRISPR_location: 2445401-2445644
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 2 spacers

Consensus repeat of LS997867_1

Consensus_repeat	Method
AAAATGTGCCTCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCAACGGACTGATAATCCG	PILER-CR

spacers of LS997867_1

>1.1|2445450|37|LS997867|PILER-CR
TAGGTCGCCAGTTCGATTCCGGCAGCCGGCACCATTT
>1.2|2445536|64|LS997867|PILER-CR
CGTGTCGGTGGTTCGATTCCGCCTCGAGGCACCACGATTAAAAGTTGTGCCAAAGACACAATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS997867_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of LS997867_1

>merge|LS997867|1|2445401-2445644|PILER-CR
TGTGCCGGCTTAGCTCAGTAGGTAGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAGGTCGCCAGTTCGATTCCGGCAGCCGGCACCATTTAAAATTTGCCTCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGAGGATTGAAAATCCTCGTGTCGGTGGTTCGATTCCGCCTCGAGGCACCACGATTAAAAGTTGTGCCAAAGACACAATAAAAATTGTTCCTCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGACGGACTGTTAATCCG

>LS997867|1|1|2445401-2445644|PILER-CR
TGTGCCGGCTTAGCTCAGTAGGTAGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAGG	TCGCCAGTTCGATTCCGGCAGCCGGCACCATTTAAAA
TTTGCCTCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGAGGATTGAAAATCCTCGTG	TCGGTGGTTCGATTCCGCCTCGAGGCACCACGATTAAAAGTTGTGCCAAAGACACAATAAAAAT
TGTTCCTCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGACGGACTGTTAATCCG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
LS997867.1|SYZ82336.1|2455134_2456127_+|4-hydroxythreonine-4-phosphate-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|234696
LS997867.1|SYZ82338.1|2457027_2457408_+|CO2+/MG2+-efflux-protein-ApaG	unknown	unknown	gnl|CDD|180098
LS997867.1|SYZ82325.1|2440499_2441420_-|glutaminase	unknown	unknown	gnl|CDD|234880
LS997867.1|SYZ82321.1|2437657_2437948_+|UPF0235-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|179931
LS997867.1|SYZ82339.1|2457417_2458227_+|diadenosine-tetraphosphatase	unknown	unknown	gnl|CDD|234673
LS997867.1|SYZ82320.1|2437100_2437658_+|Integral-membrane-protein-YggT	unknown	unknown	gnl|CDD|223833
LS997867.1|SYZ82334.1|2451445_2453797_+|organic-solvent-tolerance-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|235158
LS997867.1|SYZ82332.1|2449420_2449525_-|Uncharacterised-protein	unknown	unknown	unknown
LS997867.1|SYZ82337.1|2456140_2456956_+|dimethyladenosine-transferase	unknown	unknown	gnl|CDD|234708
LS997867.1|SYZ82324.1|2439090_2440266_+|HemN-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|235550
LS997867.1|SYZ82328.1|2443564_2443837_+|oxidative-damage-protection-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|180059
LS997867.1|SYZ82327.1|2442489_2443551_+|A/G-specific-adenine-glycosylase	unknown	unknown	gnl|CDD|182805
LS997867.1|SYZ82322.1|2437993_2438425_+|Uncharacterised-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379616
LS997867.1|SYZ82331.1|2447612_2449163_-|Pullulanase	unknown	unknown	unknown
LS997867.1|SYZ82330.1|2445934_2447560_+|methyl-accepting-chemotaxis-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223910
LS997867.1|SYZ82323.1|2438494_2439097_+|nucleoside-5-triphosphatase-RdgB	unknown	unknown	gnl|CDD|234648
LS997867.1|SYZ82333.1|2450432_2451287_-|Dna-J-like-membrane-chaperone-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236512
LS997867.1|SYZ82329.1|2444030_2445161_+|membrane-bound-lytic-murein-transglycosylase-C	unknown	unknown	gnl|CDD|183271
LS997867.1|SYZ82326.1|2441530_2442250_-|tRNA-(guanine-N(7)-)-methyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|234649
LS997867.1|SYZ82335.1|2453849_2455145_+|survival-protein-SurA	unknown	unknown	gnl|CDD|236758

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
LS997867.1|SYZ82336.1|2455134_2456127_+|4-hydroxythreonine-4-phosphate-dehydrogenase	gnl|CDD|234696	PRK00232, pdxA, 4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase; Reviewed.	0
LS997867.1|SYZ82338.1|2457027_2457408_+|CO2+/MG2+-efflux-protein-ApaG	gnl|CDD|180098	PRK05461, apaG, CO2+/MG2+ efflux protein ApaG; Reviewed.	1.16069e-74
LS997867.1|SYZ82325.1|2440499_2441420_-|glutaminase	gnl|CDD|234880	PRK00971, PRK00971, glutaminase; Provisional.	0
LS997867.1|SYZ82321.1|2437657_2437948_+|UPF0235-protein	gnl|CDD|179931	PRK05090, PRK05090, hypothetical protein; Validated.	1.24766e-59
LS997867.1|SYZ82339.1|2457417_2458227_+|diadenosine-tetraphosphatase	gnl|CDD|234673	PRK00166, apaH, symmetrical bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase.	1.62534e-168
LS997867.1|SYZ82320.1|2437100_2437658_+|Integral-membrane-protein-YggT	gnl|CDD|223833	COG0762, COG0762, Predicted integral membrane protein [Function unknown].	2.77868e-12
LS997867.1|SYZ82337.1|2456140_2456956_+|dimethyladenosine-transferase	gnl|CDD|234708	PRK00274, ksgA, 16S rRNA (adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))-dimethyltransferase RsmA.	4.52694e-145
LS997867.1|SYZ82324.1|2439090_2440266_+|HemN-family-oxidoreductase	gnl|CDD|235550	PRK05660, PRK05660, radical SAM family heme chaperone HemW.	0
LS997867.1|SYZ82328.1|2443564_2443837_+|oxidative-damage-protection-protein	gnl|CDD|180059	PRK05408, PRK05408, oxidative damage protection protein; Provisional.	5.47988e-59
LS997867.1|SYZ82327.1|2442489_2443551_+|A/G-specific-adenine-glycosylase	gnl|CDD|182805	PRK10880, PRK10880, adenine DNA glycosylase.	0
LS997867.1|SYZ82322.1|2437993_2438425_+|Uncharacterised-protein	gnl|CDD|379616	pfam14467, DUF4426, Domain of unknown function (DUF4426). Members of this entry are found mostly in g-proteobacteria, especially in Vibrio. Strangely enough, there seems to be one eukaryotic homolog in Nematostella vectensis (NEMVEDRAFT_v1g226006), where the PA0388-like domain is fused with a domain homogous to the Methionine biosynthesis protein MetW (see below). In several Pseudomonas species, but also in Vibrio vulnificus and Azotobacter vinelandii PA0388 homologs are genomic neighbors of Nucleoside 5-triphosphatase RdgB (dHAPTP, dITP, XTP-specific) (EC 3.6.1.15) and Methionine biosynthesis protein MetW. On the other hand, in most Vibrio species it appears as a part of a conserved operon involved in possible response to stress.	3.97459e-66
LS997867.1|SYZ82334.1|2451445_2453797_+|organic-solvent-tolerance-protein	gnl|CDD|235158	PRK03761, PRK03761, LPS assembly outer membrane complex protein LptD; Provisional.	0
LS997867.1|SYZ82330.1|2445934_2447560_+|methyl-accepting-chemotaxis-protein	gnl|CDD|223910	COG0840, Tar, Methyl-accepting chemotaxis protein [Cell motility and secretion / Signal transduction mechanisms].	2.89438e-58
LS997867.1|SYZ82323.1|2438494_2439097_+|nucleoside-5-triphosphatase-RdgB	gnl|CDD|234648	PRK00120, PRK00120, dITP/XTP pyrophosphatase; Reviewed.	9.51825e-128
LS997867.1|SYZ82333.1|2450432_2451287_-|Dna-J-like-membrane-chaperone-protein	gnl|CDD|236512	PRK09430, djlA, co-chaperone DjlA.	1.07185e-153
LS997867.1|SYZ82329.1|2444030_2445161_+|membrane-bound-lytic-murein-transglycosylase-C	gnl|CDD|183271	PRK11671, mltC, membrane-bound lytic murein transglycosylase MltC.	2.10591e-156
LS997867.1|SYZ82326.1|2441530_2442250_-|tRNA-(guanine-N(7)-)-methyltransferase	gnl|CDD|234649	PRK00121, trmB, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase; Reviewed.	6.91684e-111
LS997867.1|SYZ82335.1|2453849_2455145_+|survival-protein-SurA	gnl|CDD|236758	PRK10770, PRK10770, peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA; Provisional.	1.47083e-158

Protein sequences

>LS997867.1|SYZ82329.1|2444030_2445161_+|membrane-bound-lytic-murein-transglycosylase-C
MKRLGLYLVVVLLLSGCSREAIENMYQVDYEPTNRFAKNLAGMPGQYSKDTDGFDALINSFSGNIEKRWGRDQLKMAGRTNYVKYIDNYLSRSDISFSEGKITVETVSPTDPKSHLRNAIITTLLTPDDPAGVELFSSKNITLANKGEPFLYQQVVDQDKQPIQWSWRANRYADYLIANHLQVKQVGFKKAYYVVIPMVKNQVEIRGNRYADIIRRASRKYDIPEDLILAIIKTESSFNPYAVSWANAYGLMQVVPATAGRDVFRMVKNRPGDPTPEYLFNPENNIDTGTAYFYLLKNHYLKDVRHPLSLEYSMISAYNGGAGGVLNTFHSDRKRAMQDLNSLQPNQVYWALTKKHANAEARRYLEKVTKFKKEFN
>LS997867.1|SYZ82328.1|2443564_2443837_+|oxidative-damage-protection-protein
MARTVFCTRLQKEADGLDFQLYPGELGKRIFDNICKEAWAQWQTKQTMLINEKKLNMMDPEHRKLLEQEMVNFLFEGKEVHIEGYTPPAK
>LS997867.1|SYZ82327.1|2442489_2443551_+|A/G-specific-adenine-glycosylase
MTPFAQAILTWYDAYGRKNLPWQQNKNAYRVWLSEIMLQQTQVATVIPYFERFLERFPTVHALAAAPQDEVLHFWTGLGYYARARNLHKAAQMVVSEYGGEFPTDLEQMNALPGVGRSTAAAVLSSVYKKPHAILDGNVKRTLARCFAVEGWPGQKSVENQLWHYAEMHTPSVDVDKYNQAMMDMGAMICTRSKPKCSLCPVESFCLAKQQGNPQEYPGKKPKTDKPVKATWFVMLYHDNTVWLEQRPQSGIWGGLYCFPQSEVANIQTTIDQRAISDSTITSQQTLIAFRHTFSHYHLDITPILLQLSRKPDIIMEGSKGLWYNLSQPDEIGLAAPVKQLLHSLPFDIDSHI
>LS997867.1|SYZ82326.1|2441530_2442250_-|tRNA-(guanine-N(7)-)-methyltransferase
MSEVITQEYTEDGKVLRRIRSFVRREGRLTKGQEAAMKECWPTMGIDYQPELLDWQQVFGNDNPVVLEIGFGMGASLVEMAKNAPEKNFLGIEVHSPGVGACLASAREAGVTNLRVMCHDAVEVFAHMIPDNSLHTLQLFFPDPWHKKRHHKRRIVQLEFAEMVRQKLIIGSGVFHMATDWENYAEHMIEVMNQAPGFANLATDGDYIPRPDERPLTKFEQRGHRLGHGVWDIKYQRNA
>LS997867.1|SYZ82325.1|2440499_2441420_-|glutaminase
MKPTAEILASIIEEVRPLTGQGKVADYIPALAKVPSEKLGIAVFTNQGEVIAAGDAQEGFSIQSISKVLSLTLAMGLYQPDELWSRVGKEPSGQAFNSLIQLEMEQGIPRNPFINAGAIVVCDMLQSRLSAPRQRLLEFVRQLSGEPLIAYDKVVAASEMMHSDRNAAIAYLMRSFGNFHNEVIPVLHNYFHACALKMSCVELAKTFSYLANKGVSVVTGETVITPTQSKQTNALLATCGLYDGAGEFAYRVGMPGKSGVGGGIIAVVPGEMTIAVWSPALDQSGNSLAGTRALELLAQRIGRSIF
>LS997867.1|SYZ82324.1|2439090_2440266_+|HemN-family-oxidoreductase
MLTPPPLSLYIHIPWCVQKCPYCDFNSHAQKGEIPEQEYLDALLQDLDRDIERYQLKGDPRLLHSIFIGGGTPSLISAEGIARLLQGVAKRIAFKPEIEITMEANPGTIEAQRFAGYRTAGVTRISIGVQSFEPEKLARLGRIHGQQEAVRAAQLAHQIGLNSFNLDLMHGLPDQTPEQALADLDQAIALNPPHLSWYQLTIEPNTLFYSKPPKLPDEDALWDIFELGHQKLSDAGYVQYEISGYSKPGYQCQHNLNYWRFGDYLGIGCGAHGKLSFADGRIVRTTKTKHPRGYLAALNNLAKAYLDSEQLVADQDKPFEFFMNRFRLIEPCPKADFTATTGLTIDVIRPTLDWAISEGYLSEDDQHWQITEKGKLFLNDLLEAFMADEEE
>LS997867.1|SYZ82323.1|2438494_2439097_+|nucleoside-5-triphosphatase-RdgB
MKKIVLATGNQGKVREMADLLSDFGFDVVAQSEFNVPEAAETGTTFIENAIIKARHAAQITGLPAIADDSGLEVDYLNGAPGIYSARYAGEHASDGDNLNKLLAAMQDVPDDQRSARFHCVLVLMRHADDPTPIVCHGKWEGKILTSPHGSNGFGYDPIFWVPEENCASAELEPVRKKQLSHRGKALQKLFKAIEEQRTC
>LS997867.1|SYZ82322.1|2437993_2438425_+|Uncharacterised-protein
MRKWMMSLLLTLLALPASAEQQKTIKDIEVHYSAFNSTFLTPKVASSYQLTRNGYTAILNISVLDRASLGKPATEAKLTGHAKNLIGNLRELSFKQVKEGNAIYYLAEIPISNEEMLTFDIDVDAGLKGAGKLTFSQKFYTEQ
>LS997867.1|SYZ82321.1|2437657_2437948_+|UPF0235-protein
MAAAWREGDDLLLRLYIQPKASRDSIVGLHGEELKVAITAPPIDGKANAHLSKYLAKLCKVAKGSVVIEKGELGRHKQVRILQPSQIPAEIAALIE
>LS997867.1|SYZ82320.1|2437100_2437658_+|Integral-membrane-protein-YggT
MNSLSFLINTLFDLYIMVVILRIWLQAARADFYNPFSQFIVKATQPVVGPLRRVIPSIGSIDLATIVFAYVLCVLKFMALVLIASSGSVSFSADFLFLGLLSLIKAAGGLLFWVLLIRAILSWVSQGRSPIEYVFHQLTEPMLAPIRRIIPVMGGFDLSILVLFIVLQFANFLMGDVIGPIWYQL
>LS997867.1|SYZ82330.1|2445934_2447560_+|methyl-accepting-chemotaxis-protein
MKLKTQAYLLSAIILAALLALATTGLWTLRVASNLDNKARVTELFNSAYSILTEVEKLAQEGKMSEPEAKALATRLMRNNLYKDNEYVYVADENMTFVATPLDPQLHDTSFHDFKDGKGNSVGRLIQDVLRHQSGKLVEYTWTQKQADGSIEEKLSIARKTPHWGWVVGTGIGFNEANARFWSTAQWQLSLCVVIAVAILSLLLVAIRKILLIIGGEPNEVRSAVQAVAQGRICREFAIKAPKESIYGAVQQMSSSLADLVAKLEQSMVALRSELADAGTRAKSIAELTDSQQQSTAMIATAMTEMASSANQVADSARDTAFNTDQADQQSQHTQKLIHNTVSNIQGLATQLQTASTAVADLDLDVKNIAKVLDVIGDIAEQTNLLALNAAIEAARAGEQGRGFAVVADEVRNLAGRTQTSTKEIQQMIHNLQEGSRNAIQTIQICGQTSQSSVQESENAASALALIVSALESISSMSHQIATAAAEQTQVSDDIARRINMIEESGSKLSRVVMESHNSTQTLTKLSLELEQWAAHFEVTR
>LS997867.1|SYZ82331.1|2447612_2449163_-|Pullulanase
MDKSVNTAPASAIRWLTPLALLLSILGCKNDDNPTVNSSPQSSLSVTVIDGYLVDALVWLDINNNYQLDEVEPRARTNAKGVAQLDLNSVINPEQYKILVRAVSGQTKDIGTGNDIPTIIQQDFMMSAPSGISVVTPLTTLVEQRMQENNNLDLAAAQQEIANLLGLSSPDEVLGDFIVSGNNRVYWYAVNIVKGLPSQLTQNSPSDLIQTTQKISDLIQELAPNFDSKPEVIVTLPKPGVIKPITPPSQEWSIRQYFIGNDKFAVFGDDDGKFWYDVYQINDKTVTFERAVLLEGMDEYSEDPSMSDNKLTLTEQGWIETTDKAPFQVEFNQNGSVSWFNGYGKMSGKCFSVADKDRAELFDGTAEVFGDDTSWPQGSEVCEVQYIPVKPAYDIRISNNNEKIGQFNTLDMLIDIDFQYRNKTYRLQQNNKVFHVNDGNETDSGLTWSKSTLGGVELMLFSDREGESLRGFAIYQGYAWAVHQEDEVGVGQPMLLINDVMINDIAKGRSEITSIL
>LS997867.1|SYZ82332.1|2449420_2449525_-|Uncharacterised-protein
MTRKRKNHSPDFKANVSSDVMDVPSSVQVPLIYA
>LS997867.1|SYZ82333.1|2450432_2451287_-|Dna-J-like-membrane-chaperone-protein
MHIFGKILGAFFGFLFGGPFGAIFGIFLGHQFDKARRLNQAGFQSGTFGAGPSQAERQEDFFKSAFSVMGHVAKAKGQVTKEEIQLATIMMDRMNLTLEQKRAAQDAFRDGKESDFPLEQVLDRVKIATGGRFDLLQFFLELQISSAFADGDVHPSERQVLHRIARGLGFSSEQLERRLRMQEAAFRFQQGGGFGGSQQQSHSGQQWQQPSSRNQLADAYEVLGVSESASAQEVKRAYRKLMNEHHPDKLMAKGLPPEMMNVAKEKSQQIQHAYELIRKEKGIK
>LS997867.1|SYZ82334.1|2451445_2453797_+|organic-solvent-tolerance-protein
MSCFSRTFLAASISAALFAPQIQAEASVDDNRAQLPNGEQCLVNQPEPTNPGQQPINVEADKLEAINGQKATYSGNVVVVQGKKRIAADNVTLHQQENVVVAEGNVQFSDGEIKTHSTKATNNLNTDEMTLENTRYQFLCEPGRGEAVYVSKTGKAVYEIEDGSITSCPDGDNAWRMRASSIDVDQNEEIATFYNPRLEVQNVPVFYLPYLTVPIGDTRKTGFLYPTASYGSRNGYSFEVPIYWNLAPQYDLETTVNYMQKRGTQLNSVFRYLTDFGAGQIKSEYLAEDQLHTELGERWALQYEHSGIYQQAWKFEIDYSKVSDINYFSDLDSGVGKREDGQLIQQGRATYRTQNWDSSLLVRDFQLLTKDTTSTNLPYRLMPQLSYNYYSPELFKYLDLDLLSHISRFETDAKGKPSATRVHIEPGLKIPFSNTWGNWTTEARILGTYYQQELDNTTDAKLEESLTRVIPEFRTAAGIVLERNTTILSGYTQTLEPKIQYLYVPEKDQSHIGLYDTTLLQTDYYGLFRQRKHSGVDRIASANQVSYGASSRFFDEAYKERLNIAFGQIFYLDSKLNPSNKNPNRVSDDSSYSAWAVEMDFNFADYLFYHGGIQYDVNSQDIQLGNSTLEYRVADGYIQGNYRYVTKDYIRSTVGESITNIDDITKDGISQAGLLAGYKLSRRWSASGQYYYDLTTEQALEWLANLTYTSDCWYMGFTYSNQLKNWNGNFVTDPYATPIYENNFSFNIGIIGFGTSVGAGSSMTGISSAGNSLGYGRPFFLNN
>LS997867.1|SYZ82335.1|2453849_2455145_+|survival-protein-SurA
MKLWKPTLISVLSALTLFNAHAAPKQLDSVAVIVNSGVILQSDVDSALKTIKANAKQNKQPLPQETVLREQVLEKLIIDTLQQQEADRIGVKIDDNRLNEAIKEIAKNNQQTQEQLIASIAQEGLTYPEFREQIRKEMAASDARNALVRRRINILPAEVDTLAELLAQETDATVQYKISHIQLRVDDGQDKSAAETLANKLVNDLKNGADFAQMAYAYSKGPKALQGGDWGWMRKEEMPTIFADQIKMQNKGSIIGPFRSGVGFHILKIDDVKGLETVAVTEVNARHILIKPTIILSDEGAQKQLNEFVQRIKNGEVTFAELAQQYSQDPGSAAQKGELGYQTPDLYVPEFKHQIETLPVGQISEPFKTVHGWHIVEVLDRREVDRTDSALKNKAYRILFNRKFNEEASAWLQELRASAFVEVLKDEKDEQ
>LS997867.1|SYZ82336.1|2455134_2456127_+|4-hydroxythreonine-4-phosphate-dehydrogenase
MSSKRIIVTAGEPAGIGPDLVLALSAQDWPHQLVVCADKALLAQRAAQLGIQVKLLDYQPDNPVQAQQAGTLLVEHISLAEPVVAGQLNPANGHYVLKTLERAAKGCMNGEFDAIVTGPVHKGVINRAGVAFSGHTEFFAEQSKTPLVVMMLATEGLRTALVTTHLPLAEVPQAITCERLEQIVHILHKDLVEKFAIAEPKIYVCGLNPHAGEDGVLGMEEIETITPTLQRLREQYGMQLVGPLPADTIFSEKYLQQADAVLGMYHDQVLPVLKYKGFGRSVNITLGLPFIRTSVDHGTALDLAGTGQADAGSFWTALAYAIELVDKKAQ
>LS997867.1|SYZ82337.1|2456140_2456956_+|dimethyladenosine-transferase
MRNDVHLGHKARKRFGQNFLNDPYIIDGIVSAINPKPGQNLVEIGPGLGAITEPVGREVDKFTVIELDRDLAERLRNHPELASKLTIHEGDAMRFDFKQLVKPNNKLRIFGNLPYNISTPLMFHLFEFHRDIQDMHFMLQKEVVNRLAAGPDSKAYGRLTVMAQYYCKVVPVLEVPPSAFVPPPKVDSAVVRLVPYEDLPHPATSLEWLDRVVREGFNQRRKTVRNCYKGLAEPETLETLGINPSMRPENLTLAQFVALANWLDATHKTHA
>LS997867.1|SYZ82338.1|2457027_2457408_+|CO2+/MG2+-efflux-protein-ApaG
MDVSLPCIKIQVQTRYIEEQSNPEYQRFVFAYLITIKNLSSQTVQLMSRRWLITDADGKQTVVEGDGVVGEQPRIKANDEYTYSSGTALDTPVGVMQGQYLMIDEQGESFTVEIEPFRLAVPHVLN
>LS997867.1|SYZ82339.1|2457417_2458227_+|diadenosine-tetraphosphatase
MANYIVGDIQGCFDELQQLLKQADFNSQLDTLWFAGDLVARGPKSLETLRFAYQLGDAARVVLGNHDLHLLSVALGHHPAKRRDQTQAILDAPDATQLLDWLRQQPLLAEHKEFVLCHAGISPLWDLETARQAAQEVESVLRSPKWSTLIEQMYSDQPDTWHPTLQGIDRLRYIVNAFTRMRFCFPDGRLDMQCKLPPQEVTDGSLLPWFQLPQRIALEKTVIFGHWAALEGYVSETVIGLDTGCVWGGTLTMLRWEDKHYFSQAALPA

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
LS997867_1	1.1|2445450|37|LS997867|PILER-CR	2445450-2445486	37	NC_049942	Escherichia phage JLK-2012, complete sequence	23524-23560	3	0.919
LS997867_1	1.1|2445450|37|LS997867|PILER-CR	2445450-2445486	37	NC_021742	Serratia liquefaciens ATCC 27592 plasmid unnamed, complete sequence	35428-35464	4	0.892

1. spacer 1.1|2445450|37|LS997867|PILER-CR matches to NC_049942 (Escherichia phage JLK-2012, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.919

taggtcgccagttcgattccggcagccggcaccattt	CRISPR spacer
caggtcgccagttcgattccggtagccggcaccatat	Protospacer
.*********************.************ *

2. spacer 1.1|2445450|37|LS997867|PILER-CR matches to NC_021742 (Serratia liquefaciens ATCC 27592 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.892

taggtcgccagttcgattccggcagccggcaccattt	CRISPR spacer
taggtcaccagttcgattccggtagccggcaccaatc	Protospacer
******.***************.*********** *.

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	9450 : 45315	39	Escherichia_phage(28.57%)	holin,integrase,transposase,tRNA	attL 26006:26019|attR 35012:35025
DBSCAN-SWA_2	577113 : 583730	7	Staphylococcus_phage(66.67%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_3	2147284 : 2154477	9	Anguillid_herpesvirus(16.67%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_4	2384582 : 2391870	6	uncultured_Mediterranean_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_5	2675010 : 2720138	41	Escherichia_phage(22.22%)	transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>LS997867|9450:45315|DBSCAN-SWA
ATTATTTTTGCAGCAGCGAAATGTCGGCAATTTGCAGGAACAGGTTACGCAGCTTGTTGAGCAGCGTGAGACGGTTCTTCTTCAGTGCTTCATCGTCAGCCATCACCATCACGTTGTCGAAGAAGGCATCGACAGGCGCGCGCAGGCCAGCCAGTTTGCTCAGAGCTTCTTGGTAGTTGCCGGTTGCAAACGCAGGTTCTAACGCTTCTGCCATGATTTCGACGGCTTCGGCTAAGGCTTTTTCCGCATCTTCTTGCAGCAGAGCGAGATCGATTTCTTCACCCAATTCGCCATCGTACTTCGCCAGAATGTTGCCTACACGCTTGTTGGCAGCGGCCAGTGCTTCGGCTTCTTCAAGAGCGCGGAAGTGCGATACCGCTTTCACACGCTGATCAAAGTCAGCGGGTTTGGTTGGGTTACGCGCCAGTACCGCTTGGATGATGTCGATGCTAAAGCCCGCATCTTGGTACCAAGTTGGGAAACGGCCAAGCATAAACTCGATCACTTCCTGCTCAACGTTGGCATTCGTCAGGCGGTCACCAAACAGGGATTTGGCTTTGGCAATCAAATCCACTAGATCTAATTGGTAGCCGTACTCAACGAGAATACGCAGTACACCCAGTGAAGCACGACGTAGCGCAAATGGGTCACTGCCTTTCGGCGCTTGGCCAATACCAAAGATACCGACGATAGTATCGAGTTTGTCAGCCATCGCGACCGCAGCAGAAACCCCACGGCTTGGCAGTTCATCACCCGCAAAACGTGGCATGTACTGCTCGTTCAGCGCAACAGCCACTTCTTCTGCTTCGCCATCGTGACGCGCATAGTGCATACCCATCACGCCTTGGGTGTCGGTAAATTCAAACACCATCGAGGTCATGAGATCACATTTTGCCAGTAGGCCTGCACGCTTAGATTTCTCCACGTCAGCACCGATCTGCTCTGCGATGTAGCCTGCCAGTTCAGTAATGCGGTCGGTTTTGTCTTTAATCGTGCCGAGTTGCTGTTGGAAAATCGCGTTTTCTAGCAGAGGTAAGCGATCCACCAATGGGCGCTTGCGGTCTGTATTAAAGAAGAATTCTGCATCTGCCAGACGTGGACGAACCACCTTCTCGTTACCTTCCACAATGTGGCGAGGCTCTTTCGACTCGATGTTCGAAACGAAGATGAAGTTAGGCAGCAGTTTTTTGCTTGCGTCATAGACTGGGAAATATTTTTGGTCACCTTTCATGGTGTACACCAAAGCTTCTGCTGGAACTTTGAGGAATTTTTCTTCAAATTTCGCCGTCATCACCACTGGCCATTCCACCAGCGAGGTCACTTCTTCTACCAGCGCATCTTCCAGATCCGCGATACCGCCGAGCTGTTGAGCCGCTTGTTGTGAGCCTTCAATGATCATCACTTTACGAGTCGCGTAGTCAGCGATGACTTTGCCGCGCTCTTCAAGGATCGCAGGGTACTGCTCAGCTGATTCGATGGTGAATTCTGCCTCACCCATAAAGCGGTGACCACGGAGGGTGCGTGCAGAAGCAACGCCCAAGATTTCGCCTTGGATCAGTTCGTTACCAAACAGGATAGTCAGTGTTTTCACTGGACGGATAAATTGGGTTTCTTTATCGCCCCAACGCATCGGTTTCGCAATTGGCAGGTTTGCCAGCGCTTTGGCTGCCATTTCCACGACAACAGAAGCGGTTTGTTGGCCTTGCACTTGTTCTTTGAACAGCAGCCATTCGCCTTTGTCTGTGACGAGACGTTCTGCTTGCTCTACCGTGATGCCATTGCCACGCGCCCAGCCTTCAGCGGCTTTGGTTGGCTTGCCATCGGCATCAAACGCAACGTTGACGGCAGGACCCCGTTTTTCAACGACGCGATCCGGTTGGCTTTCTGCCAAATTGGCGACTTTCAGTGCCAAACGGCGTGGCGTGGCAAACCAAGTTACGCCTTCATGGGCGATGTCAGCTGTTGCTAGTTCTGCCGCAAAATTCGCCGCAAAGGCTTCTGCCAGTGTGCGCAGTTGCTTTGGTGGCAGCTCTTCTGTGCCTAGCTCAATTAAAAATTCTTTTGCCATGTGACGTCTTCCCCTTACTTCTGTTCTGACTTCTTACACATAGGGAAGCCCAGAGCTTCACGGGATGCGTAATAAGCTTCGGCGACCGATTTGGTTAGGTTGCGAATGCGCAGAATGTAGCGCTGACGCTCAGTCACTGAGATCGCTTTGCGTGCATCGAGCAAGTTGAAGGCGTGTGCCGCTTTCAAAATACGCTCGTAGGCTGGCAGAGGCAGTGGCTTTTCAAGCTCTAGCAGGTATTTACACTCTTTTTCGCACTGGTCGAAGTAAGTGAAGAGGAAATCCACATCCGCGTGTTCAAAGTTGTAAGTGGATTGTTCAACTTCGTTTTGGTGGAAGATGTCGCCGTAAGTCACTTTGCCGAGTGGGCCATCGGTCCAGACCAGATCGTAAACCGAATCCACGCCCTGAATGTACATTGCCAGACGCTCAATACCGTAAGTGATTTCGCCGGTCACAGGCTTACACTCAAGACCGCCAACTTGCTGGAAGTAAGTGAACTGAGTCACTTCCATGCCGTTTAGCCACACTTCCCAGCCAAGACCCCAAGCACCTAAGGTTGGGTTTTCCCAGTTGTCTTCCACAAAGCGGATGTCATGCACACAAGGGTCAACGCCCAGTACGCGCAGTGAACCTAGGTACAGCTCTTGAATGTTGTCTGGTGAGGGTTTGATGATCACCTGGAACTGGTAGTAGTGCTGCAGACGGTTTGGGTTTTCACCGTAGCGGCCGTCAGTTGGGCGGCGTGAGGGTTGAACGTACGCGGTTGCGATAGGTTCAGGGCCTAATGCTCGTAAGCAAGTCATCGGGTGAGAAGTACCTGCACCCACTTCCATGTCGAGAGGTTGCACAATAGTACAGCCTTGTTGGGCCCAATAATCCTGCAGCGCGAGGATCATACCCTGAAAGGTTTTGATGTCGTATTTTTGCATAGTCAGGTTCGCGCGATTCTTCTGTCTGAATTGATAAAAAATAACACTGAAGTATACCCAGATATTCCCTGACAAAGTAGCGGAAATCTTGCTGAATTAATCGACAATAATTTCTTTTACGCTCATTTTTCCCGACTTTTGTGCCAATTTCTCTCTGAGTCATGGAAAAGTGGGTAACGAGGGTTGCGATTCTGGATTCCGGTGGTTAGAATTCGCTCCGTCTTTGGGGAGTAGCTGGTCGCTAAGTTTTCAACTTGGTGATTCACACATCAACATATTTGGTACTCAATTACCATGGTGTGTGAGACCTGAGCCTTCAGGTTTAGCAAGACCTTAGACAAACAACGCGAACTGGGATAGGGCGTGATTGTTTGTCTACGGTTCGATAATAAATCCCTGTCCCACAGAGCATGTCATGAGCGTTTTAGCTATTTCGATTACTACTGTGGCTTTAGCCGAGATCGGGGATAAAACCCAACTGTTATCCTTGTTACTCGCCAGCCGTTACCGTAAACCCATTCCGATTATTGCCGCCATTTTTCTCGCGACGTTAGCCAATCATGCACTGGCCGCTTGGCTAGGTGTGGTGGTGGCGGATTATCTTTCTCCCGACATTTTAAAATGGGTGTTGGTGGTCAGTTTCCTCGCGATGGCGGGTTGGGTTCTCATCCCAGATAAATTGGATGGAGAAGAGTCTATCTCTACTCGCGGTCCTTTTGTGGCAAGTTTTATTGCCTTCTTTATGGCTGAAATTGGCGATAAAACCCAAATTGCCACCTCGATTTTAGGGGCGCAGTATGCCGATGCTCTCAGTTGGGTGATTGTTGGGACGACCTTAGGTATGTTGCTTGCGAATGTTCCAGTGGTGCTGATTGGTAAATTGTCCGCCGACAAAATGCCGCTGGGTTTGATCCGTAAAGTAACGGCAGGGTTATTCTTGCTAATGGCACTGGCTACGGCGTTTTTTTGAGTCGTAACGCGCGGATTTCGACTGTGTAGCGTGACCTATCACCCATCCTGATGTGGATTATCATGCTAGGGTATGAGCAGGGTTCAAGAGTAAGAGGACACCATTATGCTGACTCGTTACATGGGGATGACACCAAAAAGCCAGAGTTACTTATTCAGTTTGGGCTTAGTGTTAACGTTACTCGGTATGTCGTTGACCGATTTATGGATGCCAATGGTGGTGGGCGCGATTGTGATGACGGCGTTAGCGGTCGAATCTTGGATTCGCGTTGCCCATATTATTCCGCTGCACGATGAAGTGCGAGCGCTGCAAAAACAACTCAACAGGTTGCAGGCAGAGCTGCGTAACCTCGAAGAAGAGTAAATCAGATTGCTATCAAAAAAGACTGCCTCGGCAGTCTTTTTTATTGTCATCCCTAAAGCACCGTTTTTTGCGGTGGTGATTGTTTGTTAGGCCAACCCTTTTTTAATCAAGTACTGATAGGGCAGTTGGTCGATCTGCACACCGAGTAATTGGTGATCCATAAAGCGGCAAAAGCTCGGAATATCACGCGTGGTGGAGGGGTCATCGGCCGTAACCAATAACACTTCGCCGTCTTGCATCGTACGAATGGTTTTCCTGACCATCATCACTGGCTCTGGGCAGCGTAATCCTTCTGCTTCTAAAGTATGCGTGGCAATGTTCGGATTGAAAGTCATGCTAAAACCTGTTGGGTGTCACAATTAAGGCGTAGATGATACTGGTGGAGAAAAATTATTCAATAATCGCTTGGCAAAAGGATCATTTTGTTATAACTTCATTAACAAGTTAGTAACAAGTTAAGCGAGGGAATGATGTTAACCACACTCGATAGACTGACCATCTATGCTGTTTTGTGTTTTATTTCCTTGTGTGCTTTGGGCTTGGGAGAGACCACACAAGCTCAATTGATGCCAGTGTTAGGTACCGCTGCCTCCATCTTTGGTATTTGGCTAGAGATGCGTAGCGAACAAGACACCACTCAGCAACCACATCGTTAACCAACGTGACT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MNQERQTWLGLLARANRDYLENIWATYNPGVPIQKLAGPETGLVQLNTQACKASVSFQFGEASCTRCVIAIGKIQGYAVHLGSDLRKAELAAYLDAFLQTAPSHQRELVLHPIRQQLELKKAEREQLTAATSVRFYTTQKT
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MQTVFTSHLSLTGACVRFSERVIFQDLSFNVQKGETLAILGPNGRGKTTLLKALLGSQRLDQGQRQVPHLIGYVPQYQYGSENHCCLDVVLMARAALLPMFSLPSQRDRKLALEALEKVGGGHFAYRLYGSLSGGERQLVLLARALATGAEVLILDEPASALDLANQDLLLNVLFELRRVRSHSVVFTTHHPQHALHLADKVLLMHTNDQIKFGPADELLTESELSRLYNVRLRRLMVQTGEHFQSTICPVFGIREPDQDMPISYPLNKGKYNE
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MGLAIIHSRASIGVQAPPVTVEVHISNGMPGFTLVGLPETTVKESRDRVRSAIINSRFEFPAKRITVNLAPADLPKEGGRFDLPIALGILAASDQIARNKLESYEFIGELALSGEIRGVKGVLPAALAANQVERCLVVPHSNGDQAALVGVERHKSAQSLLEVCADLCGQQTLSLFQSSPSVQQVSQARDLQDIIGQQQGKRALEIAAAGNHNLLFLGPPGTGKTMLASRLCDLLPQMSDEEAMETASIASLTQQEINQHNWKLRPFRAPHHSSSMAALVGGGTIPRPGEISLAHNGLLFLDESLIIPMIKMYQC
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MKLDLISIIKSSSIKKAFGGLLAVSTLLGGYVAILDIWGGDDTVLTQSPETQYSEESKLSSSTQPTKPIYEEDWIAISYGDLNEFRSFLDRNVGKIVSIHSSFSFDAVLAENRLAHEVCDYDDFIAAVVNNPDKVSDIPFGMPRFLSSISSEQWQTYYDTGEYTNEIYRSVNCMDQIRLVVKHPRSLRFSYGGTGTISLPMWGDFLIEQRALSGPRIEYTLREM
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>LS997867|9450:45315|34972_35986_-|SYZ80203.1|DBSCAN-SWA
MYVPVKGGEQAIAASRIAVERSRRGDDTIPEIEINQIMAQMSLALDRIMSEGGLYDRRFAAIAFKQAQGDIAEAVFLVRAHRAQLANFGSSQNIDLKTMHYSRHISATQKELAGGQILGATYDYTHRLLNMDLEHSRPQCELPKSVITAPSSPSSSEPLYADLIRTEISKAPIDITRTVLPSLPDPCERLAHLARGEEGYLTGLAYESLRKASTSHPYVAQLMRGSVEIFVELEDLNLTVSIGEVELTACTTVAPSFSSSPHLEAGFGIAFGANERKAVAMAIVDQHFKIEGATSDALMHTDGVAASGYVSHLKLPHYSDFDADLARLRRVQAKEEI
>LS997867|9450:45315|11531_12449_-|SYZ80180.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MQKYDIKTFQGMILALQDYWAQQGCTIVQPLDMEVGAGTSHPMTCLRALGPEPIATAYVQPSRRPTDGRYGENPNRLQHYYQFQVIIKPSPDNIQELYLGSLRVLGVDPCVHDIRFVEDNWENPTLGAWGLGWEVWLNGMEVTQFTYFQQVGGLECKPVTGEITYGIERLAMYIQGVDSVYDLVWTDGPLGKVTYGDIFHQNEVEQSTYNFEHADVDFLFTYFDQCEKECKYLLELEKPLPLPAYERILKAAHAFNLLDARKAISVTERQRYILRIRNLTKSVAEAYYASREALGFPMCKKSEQK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SYZ80179.1|9450_11517_-|tRNA	glycyl-tRNA synthetase subunit beta	NA	NA	NA	NA
SYZ80180.1|11531_12449_-|tRNA	glycyl-tRNA synthetase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
SYZ80181.1|12864_13419_+	transmembrane protein	NA	NA	NA	NA
SYZ80182.1|13524_13782_+	NADH dehydrogenase subunit II-like protein	NA	NA	NA	NA
SYZ80183.1|13868_14117_-	sulfur transfer protein SirA	A0A140XB86	Dickeya_phage	9.8e-08	69.4
SYZ80184.1|14252_14438_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SYZ80185.1|14600_15581_-	zinc-binding alcohol dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
SYZ80186.1|15829_17362_-	threonine dehydratase	NA	NA	NA	NA
SYZ80187.1|17365_19207_-	dihydroxy-acid dehydratase	NA	NA	NA	NA
SYZ80188.1|19216_19711_-	branched-chain amino acid aminotransferase	NA	NA	NA	NA
SYZ80189.1|19664_20156_-	branched-chain amino acid aminotransferase	NA	NA	NA	NA
SYZ80190.1|20167_20452_-	acetolactate synthase 2 regulatory subunit	NA	NA	NA	NA
SYZ80191.1|20463_22110_-	acetolactate synthase large subunit	G8DDL3	Micromonas_pusilla_virus	6.3e-66	31.1
SYZ80192.1|22643_23591_+	magnesium chelatase family protein	NA	NA	NA	NA
SYZ80193.1|23670_26043_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
26006:26019	attL	NA	NA	NA	NA
SYZ80194.1|26036_28448_+|integrase	site-specific recombinase, phage integrase family domain protein	NA	NA	NA	NA
SYZ80195.1|28459_28990_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ80196.1|28989_30351_+|integrase	site-specific recombinase, phage integrase family protein	NA	NA	NA	NA
SYZ80197.1|30466_31141_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ80198.1|31686_31968_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SYZ80199.1|32019_32754_-	Outer membrane porin protein BP0840 precursor	NA	NA	NA	NA
SYZ80200.1|32792_33407_-|holin	choline ABC transporter ATP-binding protein	W5SAS9	Pithovirus	3.0e-05	27.5
SYZ80201.1|33406_34171_-	Phosphonates transport ATP-binding protein phnK	G9BWD6	Planktothrix_phage	3.5e-19	31.4
SYZ80202.1|34163_34976_-	Phosphonate metabolism PhnJ	NA	NA	NA	NA
SYZ80203.1|34972_35986_-	carbon-phosphorus lyase complex subunit	NA	NA	NA	NA
35012:35025	attR	NA	NA	NA	NA
SYZ80204.1|35985_36543_-	carbon-phosphorus lyase complex subunit	NA	NA	NA	NA
SYZ80205.1|36547_36973_-	Phosphonate metabolism protein PhnG	NA	NA	NA	NA
SYZ80206.1|36985_37501_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ80207.1|37493_38318_-	cobalamin/Fe3+-siderophores ABC transporter ATPase	A0A285PWH2	Cedratvirus	2.9e-11	27.4
SYZ80208.1|38320_39379_-	transport system permease	NA	NA	NA	NA
SYZ80209.1|39375_40470_-	putative ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component	NA	NA	NA	NA
SYZ80210.1|40557_41469_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
SYZ80211.1|41570_41738_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ80212.1|41718_41874_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ80213.1|42952_43666_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ80214.1|43619_43907_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ80215.1|44001_44154_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ80216.1|44273_44633_-|transposase	ISSod13, transposase	A0A077SLK2	Escherichia_phage	1.2e-57	84.9
SYZ80217.1|44670_45315_-|transposase	ISSod13, transposase	A0A077SLK2	Escherichia_phage	1.2e-94	81.0

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>LS997867|577113:583730|DBSCAN-SWA
CATGACCACAAATCAACGAAGCATCAAAGCTCCACAAACGGTTGTTGTGAAGCTGGGAACCAGTGTTCTGACCGGCGGTACTCTTGCGCTGGATCGTGCTCATATGGTTGAGCTCGCTCGCCAGTGTGCTGAACTCAAAAAGCAAGGTCACTCAGTAGTGATCGTGACCTCGGGCGCCATTGCGGCTGGCCGTGAGCATTTAGGTTACCCTGCGCTGCCCAACGCGATTTCCAGCAAGCAACTGCTGGCAGCGGTTGGGCAAAGTCGTTTGATTCAGGTCTGGGAATCGTTATTTGCGATTTATGGCATCAAAATTGGTCAGATGCTGCTCACCCGTGCTGATCTTGATGACCGTGAGCGTTTCCTTAACGCGCGTGACACCATCAATGCGTTAGTTGAAAACGGCATTGTGCCTGTGGTCAACGAAAACGATGCGGTAGCAACCAATGAAATCAAAGTCGGTGACAACGATAACTTATCGGCGCTGGTCGGCATTTTGTGTGGCGCGGATAAGCTGCTGCTGTTGACCGATCAAAAAGGCTTGTTCACCGCCGACCCGCGTAAAGATCCCAATGCCCAACTGATCAAAGAAGTGACCACCATTGATGACACACTGCGCAAAATTGCTGGTGGCAGTGGCACTACACTCGGTACGGGCGGCATGGCCACCAAGCTGCAAGCTGCGGACATTGCTCGTCGTGCTGGTATTGAAGTCATCATTGCGGCAGGTCGTGCGCCCAATGTGATTTTTGACTCCTTAAGTCATGAGCCACAAGGCACGCGCTTCTTAGCTTTGGAAGAAGCGTTAGAAAACCGCAAACGCTGGATTTTGGCAGGCCCAGCGGCATCGGGTGATATCGTGATTGACGATGGCGCAGTGAAAGCGGTGCAAACCAAGGGCAGCAGCTTGCTCGCCAAAGGTGTGGTGCGCGTGCAAGGTCAGTTCGCCCGTGGTGAAGTGGTGCGGGTACTGGATAAGCAAAGTCATCTGATTGCGCGCGGCATCGCGGCCTACTCCAATGACGAGTTGGCGCAAATTGCTGGTAAGCACAGTAAAGAGATCATCGATATTTTAGGCTACGATCACGGCTCAGAAGTGATCCACCGCGACGACATGGTCGTGATTCAAGAATAAAGGAGAGAATGATGGATTTAACCGTACTCGGTAAAGCGGCCAAAGCGGCCTCTTTCCAACTGGCTACCGCCAGTACCGCGCAAAAAAATCAGGCTCTCGCCATTATGGCCGATCAGTTGGAAGCGCAAAGCGCGAGCATTCTTGCTGCAAACGCAAAAGATATTGCGCTGGGGCGCGAAGCGGGTTTGTCTGATGCAATGCTGGATCGTTTGCTGCTCAATGAGTCTCGCTTGCAAGCGATCGCCAACGATGTGCGTAACGTGATCAAATTGAACGATCCCGTCGGCAGCGAAATCGATAGCCGAGTGTTGGAAAACGGCATGTCATTGGCACGCCGTCGCGTACCCCTTGGTGTGGTCGGCGTTATTTATGAAGCTCGCCCTAATGTCACCATTGATATTGCAGCGCTGTGTTTAAAAACCGGTAACGCCGCGATTTTGCGCGGCGGCAAAGAGACGTTTTTCTCTAACATGGAACTGGTCAAAGTGATCCAGTCGGCGTTGGATAAAGCCGGTCTGCCAGCGGCTTCCGTGCAGTACATTGAAAAGCCGGATCGTGAACTGGTGACGCAACTCCTGAAAATGGATGATTATGTCGACATGATCATCCCACGTGGCGGTGCGGGCCTGCACAAAATGTGCAAAGAAAACAGCACTGTGCCTGTGATCATTGGCGGCTTTGGCATTAGCCATATTTTCGTGGATGAAAGTGCTGATCTGGATAAATCGGTTGCCGTGATTGAAAACGCCAAAGTGCAACGCCCATCGGCGTGTAATGCGCTAGATACCTTGTTAGTCCATCAAGCGATTGCCAAACCGTTACTAGACAAACTCATCGCAAAACTGAATGGCAAAGTGGCGTTTGTGGCGGAGCCCAAAGCTAAAGTCTTGATGCATGCCGCGGCTGAGCTGCGTGATGCGCAAGCGGGCGATTTTGATACCGAATGGCTCAGCTACACCTTAGGGGTGAAAGTGGTACAGGATGTACAAGAAGCCATTGAGCATATGCGCGAGCACAATGCGAGCCATTCCGATGCGATCATGACCAACGATCTCTATAACGCTGAGCTGTTTGTGAATACGGCTGGTTCAGCGGCGGTGTATGTCAACGCTTCTACGCGTTTTACGGACGGTGCACAGTTTGGTTTAGGCGCAGAAGTGGCAGTCTCGACACAAAAACTGCACGCGCGTGGTCCGATGGGGCTAGAAGAGCTCACCAGCTACAAGTGGGTGGGCAAAGCCAATTACCTGTCACGCAGCTAAAATTCAAGCAAAGATGTGATGTAAAGGGGCTTCGCGCCCCTTTTTCTTTGGCTCTCAACAGCACATCGGCTACACTGGTTGCCTTGTTATGGAGGTAATATGCATTGTCCTTTCTGTTCTGAAAACGATACCAAAGTGATCGATTCACGTCTGGTGGCTGACGGACATCAAGTGCGCCGTCGTCGTCAGTGTCTGGCTTGTAATGAGCGCTTTACCACCTTTGAAACCGCGGAGTTAGTGATGCCGCGCGTGATCAAATCGAATGGTAATCGTGAGCCTTTTGATGAAGAGAAAATGATTGGTGGCTTGCAGCGCGCATTGGAAAAGCGCCCAGTGAGTGCCGATGCGATTGAACTGGCGATCAGCACCATCAAATCTAAGCTGCGTGCCACTGGCGAGCGTGAAGTTCCGAGTAAACTGATTGGTAACTTGGTGATGGAACAGCTGAAAGTGCTAGATAAAGTGGCCTATATTCGCTTTGCATCCGTATATCGTAGTTTTGAAGATGTCCGTGAATTTGGCGAGGAGATCGCCAAACTGCAGGACTAACCGATAGGATTAACTGAAAGCGATTATGCCTATGTTTACCTCTTTTGATCATCAAATGATGTCTCGCGCGATTGAACTTGCGTGGCGCGGGCGTTTTACCACTTCTCCTAATCCTAATGTCGGCTGCGTCATCACTCGCGGTGAGGAGATTGTAGGGGAAGGTTTCCATTTTCGCGCGGGCGAACCCCATGCTGAAGTGCATGCTATGCGCCAAGCCGGTGAGCTTACCCGCGGTGCGACCGCTTATGTCACTTTAGAGCCTTGTTCTCATTATGGTCGCACACCGCCTTGTGCTGAAGGGCTTATTAAAGCCGGGGTTGCGAAAGTGATTTGCGCAATGCAAGACCCTAACCCACAAGTGGCGGGGAAGGGCGTACAAATGCTGCGTGATGCCGGGATTGAGGTTGAAGTGGGATTGCTGGAAGCGGATGCTCGAGCACTCAACCGCGGTTTTCTAAAGCGTATGGAAACCGGCATGCCTTATGTGCAGCTTAAAATGGCGGCGAGTCTCGATGGACAAACCGCGCTCGCTAACGGTAAAAGCCAGTGGATCACCTCTCCTGCAGCACGTAAAGATGTTCAGCGCTTTCGCGCGCAAGCCAGTGCGATTCTCTCCACCAGTCAAACTGTGCTGGCGGATAATGCTTCTCTAGCCGTGCGTTGGCACGATTTACCGTCATCGGTACAGGCGCAATACGCAGAAGCGGATTTGCGTCAGCCGCTGCGGGTGATTTTGGATCGCCAACATCAATTGCATCCTGAGTTGGCATTATACCAAACACCTTCGCCCGTACTGCGAGTTGCCAGCGAGAATGCCGATCTCTGTATTTCTGCTGAGAACGGAAAGCTTGATTTGCGTGAGCTTTTGGCACAACTCGCTCAGCAACACAATGTGAATCAAGTATGGGTAGAGGCGGGGAGCCAATTAGCGAAATCCTTGATTGAGCAAAAGTTGGTGGATGAAATTATTCTCTATTTAGCGCCGAAACTGATGGGCAGTGATGGCCGTGGTTTATTTGGTGCACTCGGTTTGACGGAAATGGCTGAGGCCATTGAACTCAAAATAGAAGATTGTCGAATGGTGGGGGCAGATTTGCGGATCATCGCCACCCCAAAAACAAAAGATTAGCATTATGTTTACAGGTATTGTTGAAGCGGTTGGCAAGCTGACCGCCATTATCCCCAAAGGCAGCGACGTCACCATCAGTGTGGATGTGGGTAAGCTGGACATGGGCGATGTTAAACTCGGTGACAGTATTGCCACTAATGGTGTCTGTTTAACGGTCGTGGCGTTTGATCAGCGTAGTTTTAGCGCGGATCTGTCGATGGAAACCCTCAAAAAATCGGGCTTTGCACAGTATCAGGTTGGCGATCGCGTTAACCTTGAAAAAGCCATGCTGCCTACGACCCGTTTTGGTGGTCATATCGTCTCAGGGCATGTGGATGGCGTAGGTGAAATCGTCGAGCGTATTCCAGTGGGGCGTGCGGTGGATTTGTGGGTCAATATGCCTGCAGAAATCAGCAAATACGTAGCTGAAAAAGGCTCGATTACCGTTGATGGCATCAGTTTAACGGTCAATGACCTGCGTAAAAACGCGTTTAAACTGACCATAGTGCCTCATACCAGCGCAGAAACCACTATCGATGAATTCCAAGTGGGACGCCGCGTCAATCTGGAAGTGGATGTATTGGCACGTTACATGGAGCGTTTACTGCAAGGTCAACAAGAGAGTGAACCTCAATCGCGTCTGACCATGGCATTTTTGCAACAAAACGGTTTTGCTTAATCTCTGCTCTCAGAGACTTCATAACAATAGGACTGACATCATGCCAATTAGCACCCCACAAGAGATCATTGAAGACATTCGTCAAGGCAAAATGGTCATCCTGATGGATGATGAAGATCGTGAAAATGAAGGCGATCTGATCATGGCGGCTGAGCACATTACGCCAGCAGCGATCAATTTTATGGCAACCCATGGTCGCGGCCTCATCTGCTTAACGCTCACGAAAGAGCGTTGTCGCCGTCTGGGTTTAAATCCCATGGTGCAAGATAATAATGCCCAGTACACCACCAATTTCACCGTTTCGATTGAAGCGGCCGAAGGCGTGACCACCGGTATTTCAGCGGCGGATCGCGCGCGCACAGTACTAGCGGCAGTGGCCAAAGAAGCGAAAGCGGCTGATTTGGTTCAGCCGGGGCATATTTTCCCGCTGGCTGCACAAGATGGCGGGGTATTAACGCGCGCTGGGCACACAGAAGCTGGGTGTGATTTAGCACGCTTGGCAGGTTTAGAGCCCGCGTCGGTGATTGTGGAAATTCTTAATGATGACGGCACCATGGCGCGTCGTCCGGACTTAGAAGTGTTCGCTGAAAAACACGGCTTAAAGCTGGGTACGATTGCAGACTTGATTGAGTACCGCAACCACACCGAAACCACTATTGAGCGTGTCGCGCAGTGTAAACTGCCAACCGAATATGGTGAGTTTGAGCTGGTGACTTACCGTGACATCATCGACAAGCAAATCCATTTTGCTCTACGTAAAGGCGATATTACTAGCGCGCCAACTCTCGTGCGAGTGCATCTGCAAGATACTTTTACCGATCTGCTGCACAGCAACCGTGCGGCAGAGCGCAGTTGGCCACTTGCGACAGCAATGCAGCGTATTGGGCAAGAAGGTGGGGTGTTGGTGATCCTGGGTCATGAAGAATCGAGTGAGCTATTGCTGCACCGAGTGAAAATGTTTGAGCTGCAAGATAAAGGCGAAGCCCCTGCGATGGCCAAAAAACAAGGCACTTCACGCCGGGTCGGAGTTGGCTCGCAAATCCTTGCTGATCTTGGAGTGAAAGAGATGCGTTTGCTCTCTTCACCAAACAAAAAGTACCACGCATTGGGTGGTTTTGGTCTCAATGTGGTCGAATACGTCTGCGAATAATCGCTATTCCCTTGCTACTTGAAGTGGCAGTGGCGTGAGCGACCTTCATTCCCCCAAGCATAGAGCCTACCCATGCTTGGGGATGAACTTACTGTCCGCCTCGCTGCAAAACCAAGTCGTTTGATGATATTTAATGGCTGGTTTACTGCGTTTGAGCTTGATGGCAGTGCGCGGTGTAACCCCAAATTTCTGTTAGATATTGCTCACAAATTTGTGCTAGAATCCGGCGATTCTCACTTGATGAACAGAGTTAAAGGAAAGCTTATGAAAGTGATCGAGGGTGGTTTCCCAGCACCAAATGCGAAAATTGCGATTGTGATTTCTCGTTTCAACAGTTTTATCAATGAAAGTTTGCTGTCTGGTGCCATCGATACTCTTAAGCGTCACGGTCAGATCAGTGATGACAACATTACTGTTGTGCGTTGTCCCGGTGCGGTTGAGCTGCCACTGGTAGCGCAACGTGTTGCAAAAACCGGCGACTACGATGCGATTGTCTCTCTGGGTTGTGTGATCCGTGGCGGTACACCGCACTTTGATTACGTTTGCAGTGAAATGAATAAAGGTCTGGCACAAGTGTCTCTGGAATTTAGCATTCCAGTCGCATTCGGTGTGTTGACTGTTGATACTATCGATCAAGCTATTGAACGCGCAGGAACCAAGGCTGGTAATAAGGGTGCTGAAGCAGCACTGAGCGCACTTGAGATGATTAATGTTCTTTCTGAAATCGATTCCTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

>LS997867|577113:583730|583067_583730_+|SYZ80694.1|DBSCAN-SWA
MLGDELTVRLAAKPSRLMIFNGWFTAFELDGSARCNPKFLLDIAHKFVLESGDSHLMNRVKGKLMKVIEGGFPAPNAKIAIVISRFNSFINESLLSGAIDTLKRHGQISDDNITVVRCPGAVELPLVAQRVAKTGDYDAIVSLGCVIRGGTPHFDYVCSEMNKGLAQVSLEFSIPVAFGVLTVDTIDQAIERAGTKAGNKGAEAALSALEMINVLSEIDS
>LS997867|577113:583730|579608_580058_+|SYZ80690.1|DBSCAN-SWA
MHCPFCSENDTKVIDSRLVADGHQVRRRRQCLACNERFTTFETAELVMPRVIKSNGNREPFDEEKMIGGLQRALEKRPVSADAIELAISTIKSKLRATGEREVPSKLIGNLVMEQLKVLDKVAYIRFASVYRSFEDVREFGEEIAKLQD
>LS997867|577113:583730|578258_579509_+|SYZ80689.1|DBSCAN-SWA
MDLTVLGKAAKAASFQLATASTAQKNQALAIMADQLEAQSASILAANAKDIALGREAGLSDAMLDRLLLNESRLQAIANDVRNVIKLNDPVGSEIDSRVLENGMSLARRRVPLGVVGVIYEARPNVTIDIAALCLKTGNAAILRGGKETFFSNMELVKVIQSALDKAGLPAASVQYIEKPDRELVTQLLKMDDYVDMIIPRGGAGLHKMCKENSTVPVIIGGFGISHIFVDESADLDKSVAVIENAKVQRPSACNALDTLLVHQAIAKPLLDKLIAKLNGKVAFVAEPKAKVLMHAAAELRDAQAGDFDTEWLSYTLGVKVVQDVQEAIEHMREHNASHSDAIMTNDLYNAELFVNTAGSAAVYVNASTRFTDGAQFGLGAEVAVSTQKLHARGPMGLEELTSYKWVGKANYLSRS
>LS997867|577113:583730|577113_578247_+|SYZ80688.1|DBSCAN-SWA
MTTNQRSIKAPQTVVVKLGTSVLTGGTLALDRAHMVELARQCAELKKQGHSVVIVTSGAIAAGREHLGYPALPNAISSKQLLAAVGQSRLIQVWESLFAIYGIKIGQMLLTRADLDDRERFLNARDTINALVENGIVPVVNENDAVATNEIKVGDNDNLSALVGILCGADKLLLLTDQKGLFTADPRKDPNAQLIKEVTTIDDTLRKIAGGSGTTLGTGGMATKLQAADIARRAGIEVIIAAGRAPNVIFDSLSHEPQGTRFLALEEALENRKRWILAGPAASGDIVIDDGAVKAVQTKGSSLLAKGVVRVQGQFARGEVVRVLDKQSHLIARGIAAYSNDELAQIAGKHSKEIIDILGYDHGSEVIHRDDMVVIQE
>LS997867|577113:583730|580083_581187_+|SYZ80691.1|DBSCAN-SWA
MPMFTSFDHQMMSRAIELAWRGRFTTSPNPNVGCVITRGEEIVGEGFHFRAGEPHAEVHAMRQAGELTRGATAYVTLEPCSHYGRTPPCAEGLIKAGVAKVICAMQDPNPQVAGKGVQMLRDAGIEVEVGLLEADARALNRGFLKRMETGMPYVQLKMAASLDGQTALANGKSQWITSPAARKDVQRFRAQASAILSTSQTVLADNASLAVRWHDLPSSVQAQYAEADLRQPLRVILDRQHQLHPELALYQTPSPVLRVASENADLCISAENGKLDLRELLAQLAQQHNVNQVWVEAGSQLAKSLIEQKLVDEIILYLAPKLMGSDGRGLFGALGLTEMAEAIELKIEDCRMVGADLRIIATPKTKD
>LS997867|577113:583730|581191_581845_+|SYZ80692.1|DBSCAN-SWA
MFTGIVEAVGKLTAIIPKGSDVTISVDVGKLDMGDVKLGDSIATNGVCLTVVAFDQRSFSADLSMETLKKSGFAQYQVGDRVNLEKAMLPTTRFGGHIVSGHVDGVGEIVERIPVGRAVDLWVNMPAEISKYVAEKGSITVDGISLTVNDLRKNAFKLTIVPHTSAETTIDEFQVGRRVNLEVDVLARYMERLLQGQQESEPQSRLTMAFLQQNGFA
>LS997867|577113:583730|581885_582995_+|SYZ80693.1|DBSCAN-SWA
MPISTPQEIIEDIRQGKMVILMDDEDRENEGDLIMAAEHITPAAINFMATHGRGLICLTLTKERCRRLGLNPMVQDNNAQYTTNFTVSIEAAEGVTTGISAADRARTVLAAVAKEAKAADLVQPGHIFPLAAQDGGVLTRAGHTEAGCDLARLAGLEPASVIVEILNDDGTMARRPDLEVFAEKHGLKLGTIADLIEYRNHTETTIERVAQCKLPTEYGEFELVTYRDIIDKQIHFALRKGDITSAPTLVRVHLQDTFTDLLHSNRAAERSWPLATAMQRIGQEGGVLVILGHEESSELLLHRVKMFELQDKGEAPAMAKKQGTSRRVGVGSQILADLGVKEMRLLSSPNKKYHALGGFGLNVVEYVCE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SYZ80688.1|577113_578247_+	gamma-glutamyl kinase	A0A1X9I5D0	Streptococcus_phage	1.1e-64	40.4
SYZ80689.1|578258_579509_+	gamma-glutamyl phosphate reductase	A0A1X9I5D4	Streptococcus_phage	1.1e-99	49.2
SYZ80690.1|579608_580058_+	transcriptional regulator NrdR	NA	NA	NA	NA
SYZ80691.1|580083_581187_+	riboflavin biosynthesis protein RibD	A0A2H4PQS8	Staphylococcus_phage	5.9e-44	33.1
SYZ80692.1|581191_581845_+	riboflavin synthase subunit alpha	A0A2H4PQS5	Staphylococcus_phage	1.2e-31	38.2
SYZ80693.1|581885_582995_+	3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase/GTP cyclohydrolase II	A0A2H4PQS2	Staphylococcus_phage	1.5e-63	39.8
SYZ80694.1|583067_583730_+	6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase	A0A2H4PQS3	Staphylococcus_phage	1.3e-33	48.7

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>LS997867|2147284:2154477|DBSCAN-SWA
ACTATGGACGAGGGCAGATTTCTGATTCTGGAAAGAAAAATTCAATTTCACGAGCGGCGGATGCTGGGCTGTCGCTACCGTGTACTGAGTTGTAACGCATGCTCAGTGCATAATCGGCACGCAGAGTACCGCAGGCGGCTTCTTCTGGGTTAGTTTTCCCCATCAATTCACGGTAACGTGCAATTGCGTTTTCACCCTCTAAGACCTGCACCATGATTGGGCCTGAGGTCATAAATTCTTTCAGAGGTTCAAAAAACGGTTTGCCTTCATGCTCAGCGTAAAAGCCACTGGCTTGCTCTTCCGACAGGTGAACCATTTTCGCGGCAATGATCTGCAAACCGGCTTTTTCAATACGGTGGTAAATCTCACCAATCAAGTTACGCTTCACCGCATCCGGCTTAATGATCGAAAATGTTCTTTCTAGAGCCATAAAATTTCCTTTTGTTTATTGTGCTTATGTTATACCCAAGCGATTTGGCGTCACAGGTAATCGGCAAGGGAGTTCACCTCCATCAGCATAGACACACTATGTGATTAGGATGAACGAACAGAGCCAACACCGCTGCAGCGTCAAATTGGAAGGGTATACTCTTATTAATAAAAACAAGGCAGCTATACAAGCTGCCTTTAAATTTATGCTTGCTGCATCAAAATACGTGCGAGCATTTTCACGCCCATGCCCGTGGCTCCTGCAGCCCATTTATCGCTGGCTGACTTGCGATACGTGGCTGAACAATCGAAGTGTAACCAACCTTTTTGGTAGCCTTCCACGAAATAAGAAAGGAAGGCCGCTGCGGTGCTGGCTCCCGGCGTGTAATCGCCGTTACTGATGTTTGACAGATCCGCAAAGTTAGAAGGCAGCATTTCACGGTGGAACTCAGCTAAAGGCAGAGCCCACAGCGCTTCATTCTCTTCTTTTGCCGCAGCTAATGCTTGTTGGCTCAGCGACTCATCATAAGAAAGCAGTGCGTGGTAATCATTACCCAGCGCGTTTTTCGCCGCTCCGGTTAATGTTGCACAGTCGATAATCAATTGCGGTTTCTGTTCACTGGCGTAGATAAGACCGTCGGCCAGCACCAAACGGCCTTCCGCATCGGTGTTCATGATTTCAACGGTTTTGCCATTTTTGTAGGTGATGATGTCACCAAGCTTCAACGCACGGCCGGAAACCATGTTTTCCGCGCAGCACAGGATGAGTTTCACGCGCTTGTTGAAGCCGCGCATGATAGCCAAACCAAGCGCACCAGTGATCATGCCTGAGCCGCCCATGTCCGCTTTCATCGCTGACATCATGTTGGAAGGTTTTAAGCTGTAACCACCCGAGTCAAAAGTGATGCCTTTACCGACTAAACACGCGAATACCGGTGCATTTTCATCGCCCGTTGGGTTGTAGTCGAGTTGCAGCATCGCCGACGTACGCTCAGAGCCACGGCCTACAGCGTAAATCCCCTCCCACCCTTCAGTGAGCAGATCTTTGTCTTTGACGATACGGTAAGAAACATGGTCAGGCGCAAGCGATTTGATGAACTCTGCTGCCATGGTCGCCAATTGGCGTGGTGCAACTTCTTCCGCGCTTTTGTTGATGATATCGCGTGTCCAATCCGTCGCTTTAATGCGCGCTTCTAGCTCTGCTTGTTCAGCAGTCGCTAACGCTTTCCACTCGACGGTATTGCGCTTTTTCGCATCACGGTAACCTTGATAGAAAGCCCAAATGCTCTCCAGATCCCAACCTTCTCCAGCCAGGAATGCCGTGCGGATACCTTGATTATCTAACTTACGAGCTGCGCGTTGGATCGCGCTGAAATCTTGTGTTTGTTGCAGGTGAATGGTTGCACCTTGCTCTGCAAAAGAAATGAGCGCTTTATCTCCCCACTGAGGCTGGGCAGCTTGAGTACTCAAAAATACAGACATCTGTGTAGACATGGTTTCTCCTTGTCTTAAATATTGGCTTTGCCTGTGCCATCTCATTAAATCGCCAAGATGTTAGCATTATGTCGAGGCAAAATGTCAACCGAATAAAAAAACGGACCAAGTGGTCCGCATTTTTTGCTAAGAAGTGTTAACTCTGTGGGGTTTCTCCCCCTGCTAAACAAAGCAAGCGTCATATTGACTGACCACTCACTTCATTTTGCATGAGATGAATTATTCGAATTCATCCATCCAGCACAGAATGACGGCTTCGAGGATTTTTTCATTGGAATGATTCGGATCATCTTCAAAATCTTCCAACTCCATGATCCAACGATGCAGATCGGTAAAACGTACGGTTTTGGGATCGACATCGGGAAACTTGTCACACAGCTCAATCGCGATATCGCGTGAATCTGTCCATTTCATGGTTAGCCTTCCTATTGATTTTACCTCGGCAGCGACCGAGGCTAAGAATTAATGATCTTCGCTTGCGTGGTTTAGCGTGTATTTCGGGATCTCGACGACGAGGTCTTCATCTGCGACTCGAGCCTGACAGCTAAGACGAGATTCTGGCTCCAGACCCCAAGCTTTATCCAGCATATCGTCTTCCAGCTCATCACTCTCTTGCAGTGAATCAAACCCTTCTCGAACGATACAGTGGCAAGTAGTACAAGCGCACGATTTCTCACACGCATGCTCAATAGCGATACCGTTTTTGAGTGCCACATCAAGAATCGTTTCCCCGGTTTGCGCTTCTAACACTGCGCCTTCCGGGCAAAGGGTTTCATGAGGCAAAACAATAATCTTAGGCATGTTGGTAATCTCTTCAAATCTCGTCAACGGAGTGGCCAGCCAGTGCGCTACGAATCGATTTATCCATTCGTCTTGACGCAAAGTCCTGGCTCGCTTTGTCTGTGTCTTTTATTCCTTGCTCAATGGCATCAGCATTATCGCCATTGCGCAGTTCAATTAAGCGCTCGATCGCCTGTAATAAAGTTTGGCGCTCTTGCTCGCTCAGCAGTTCATCACCATCGGCTTGCAGCGCTGAAACTAAGCCTTCAATCACCCGATCAGCTTCTACACGCTGCTCTGCCAACGCACGCGCCAGCATATCCTCTTTAGCATAGGCCATGGAGTCTTTGAGCATCTGGGTGACTTCGTCATCGCTTAAACCATAAGATGGCTTAACTTGAATCTCTGCTTGTACACCAGTGCTTTTTTCCAAAGCCGTCACGGAAAGTAGACCATCCGCATCCACTTGATAAGTCACGCGAATATGCGCAGCACCTGCCGCCATCGGTGGTATACCTTTGAGTGAGAAGCGTGCCAGAGAGCGACAGTCATCGACCATTTCACGCTCCCCTTGTACCACATGCACACTCATCGCCGTTTGCCCATCTTTGAAAGTGGTAAACTCTTGCGCGCGAGCGACAGGAATGGTGGTGTTGCGTGGGATGATTTTCTCGACCAAACCGCCCATGGTTTCAATACCCAAAGACAGTGGGATGACATCGAGCAGCAACATTTCTGCATCCGGCTTATTACCGGCCAGAATGTCCGCCTGAATCGCCGCACCAATCGCGACCACTTCATCCGGGTTAATGCTGGTCAGTGGTGTGCGGCCAAAAAACTCCCCCACTTGCTCGCGCACAAACGGTGTACGGGTTGAACCGCCTACCATCACGACTTCGAGCACCTCATCCGCTTCAACACCGGCATCTTTCAATGCGCGGCGGCAAGAAAGTAGCGTCTTTTTCACCAATGGTGCAATCAGGTTTTCCAACTCTTCACGAGTAAGCGTACCTTGCCAGCCAAGCACATTCAGCTCAGCTGTCATTTGTTCAGTCAAATCGATTTTGGCTTGTGTCGCGCCGTTAATCAGCGCGCGCTGCTGCTCAGCGGTTAAGCTGGTGAGTCCGATTTGTGCTTGCAGGTGATCGGCGATCAGATGGTCAAAATCATCACCGCCCAGTGCAGAGTCACCACCGGTTGCGAGCACTTCAAACACGCCGCGTGAGAGGCGTAAAATCGAAATATCGAAGGTGCCGCCACCCAGATCGTACACCGCGATCACCCCTTCTTGGCCTGAGTCCAAACCATAAGCAATCGCCGCTGCTGTGGGCTCATTGAGTAAACGCAGCACATGCAAGCCCGCTAACGCCGCAGCATCTTTGGTGGCAACCCGCTGCGCATCATCAAAATACGCAGGTACCGTGATGACCACTCCCGCCAATTCGCCACCTAAGGTGGCGGTGGCACGTTCTGCCAAGGCTTTCAAAATATCGGCAGAGATTTGAATAGGGTTTTTATCCCCTTGCGCGGTTTGCACAATCGGCAAGCCTTTCTCACTCGCTTTGAAGCGGTAAGGCAGATGAGGATAACGCTGGTTGATGTCTTGCAGTGAACGTCCAAGCAGACGTTTTACCGAAATCACAGTGTTGTGCGGATCGGTTTCAGCTTGTTCACGAGCAGGATAGCCGACGCGAGTCGCATCAGCACCATAGCTCACCACAGAGGGGAGAATACTGCGCCCTTGGCTATCGACGAGTGTGCTTGCGGTTCCGCTGCGCACAGAAGCGACCAGTGAATTCGTGGTACCTAAATCAATACCCGCAGCCAACTTATGCTGGTGTGGTGCCGAACTTTGCCCCGGCTCTGCAATCTGAAGTAATGCCATCAGTTGTTCCTTTGAATCTTGAATTAGCCAAGCAGTTGGTCTTCGACTCGTTCTACTTCATTTTTGAGTTTGGCAATAAATTTGAGCTTTCTGACCTGATCAGCCGCCGCCAACCACTCACTTTGGGCTAATTGGCCTTGTAGCTGTGCGAGATAATGACGCTGCATCGCGCTTATCTTAGTGTCAAAATCGACTAAGGCGGCCTCTGGATCTGCACAAGCCGTCACAGACTCTAGCTCTTCGCGTAGCTCCATCTGCTCCATCAGAAACATCGGGTCTTGCAGCGTCTGCTGTTCAGCGTTCATCTCTATGCCTTGTAACGACAAAAGATATTCCGCGCGGCGGAGTGGATCTTTCAGTGTCTGATACGCATCGTTAATTTGCGCGGCTTGCTGCACTGCCATTAGGCGGTCACGCTCAGAAGCGGTAGCAAAATTATCCGGATGGAATCGTTTCTGCAACGCTCTGAACTGAGAAGAAAGAAGGCTACCATCCAGTTCAAACTGGATCGGCAGCCCAAATAATTCAAAATAATTCATCTTGATAGCGGTCCTGTGATCGAGAACAGTCTCGATGGTCAGTTACCGTTAAACGTTGAAGCTTTCACCACAACCACATTCGCTTTTGACATTTGGGTTGTTGAATTCAAAGCCTTCGTTTAACCCTTCTTTTTTGTAATCGAGTTGAGTGCCATCTAAATAGACCATGCTTTTGGTGTCAATGATCACCTTCACACCATGGCTTTCAAATACGTGGTCTTCTTCGTTGACCTCATCAACGAATTCGAGCACATACGCCATTCCCGAACACCCAGTTGTCTTGACACCAAGACGTAAACCGATGCCTTTTCCACGATTATCCAGAAAAGTTTTTACTCGGCTTGCTGCGGTTTCGCTAAGAGTGACGGCCATACTTCAACCTTATGATTTCAATAAATTAAAGGGTGGGAGCGCTCGACGCTCCCAAACGAATTAGTGTTGATGCTTTTTCTTGTAGTCCGCAACAGCGGCTTTGATGGCATCTTCGGCTAGGATTGAGCAGTGAATTTTCACCGGTGGCAATTCGAGCTCTTCGGCGATTTCGCTGTTCTTGATTGCTGCCGCTTCATCAATGCTCTTGCCTTTCACCCACTCAGTGACTAGCGAGCTAGAAGCAATTGCGCTGCCACAGCCGTAAGTTTTGAATTTTGCATCTTCGATGATGCCTTCTGGTGATACTTTGATCTGCAAACGCATTACATCACCACACGCAGGTGCGCCAACCATGCCGCTACCTACAGAAGGATCTTCTTTATCAAATGAACCAACGTTACGTGGGTTCTCGTAATGGTCAATGACCTTTTCGCTGTATGCCATGTTCGTTACCTCGAATCCTTTATAACCTTGGAATGATTAGTGGTGTGCCCACTCAACCGTGTTCAGATCTACGCCGTCTTTGTACATGTCCCAAAGTGGAGACATCGCACGCAGTTTATCCACTGCTACGCGGATCAGTTCGATCGCATAATCAATCTCTGCCTCGGTCGTGAAACGACCAAAAGAGAAGCGAATTGAGCTGTGTGCCAGTTCATCGTTAAGACCCAGAGCACGCAATACGTAAGAAGGCTCAAGGCTGGCTGAAGTACATGCGCTGCCTGACGATACAGCCAGATCTTTCAGTGCCATCAGCAGAGATTCACCTTCTACAAACGCAAAACTGACGTTGAGATTGTGTGGTACACGCTGATCCAGATCACCGTTAATGGTCACGGCTTCCATATCTTTAATGCCATCAAGCAGACGATTACGCAGCTTCAGTGCGTGATCGTAATCTTGCTGCAGCTCTTCCTTCGCGATACGGAACGCTTCACCCATACCCACAATTTGGTGAGTCGGCAGAGTACCAGAACGGAAACCACGTTCATGACCACCACCGTGCATTTGTGCTTCAAGACGAATACGTGGTTTACGGCGTACATACAAAGCACCAATACCTTTCGGGCCGTAGGCTTTGTGCGCAGAAAGAGAAATCAGATCAACCTTCATCTCTTGGACATCAATCGCCACTTTACCCGCGGATTGCGCTGCATCAACATGGAATACCACTTTACGTGAACGGCACAGTTCGCCGATCGCTGCGATATCTTGCACCACGCCGATTTCGTTGTTCACGTGCATGATAGAAACCAAAATAGTGTCATCGCGCATCGCGGCTTCAAGCTTAGCCAGATCAATCAAGCCATTGCTTTCTGGATCAAGATAAGTCACTTCAAAGCCTTCACGCTCCAATTGGCGCATGGTATCCAGTACCGCTTTGTGTTCGGTTTTACTGGTGATGATGTGCTTGCCTTGCTTGTTATAGAAGTGAGCAACACCTTTGATCGCGAGGTTGTCAGATTCAGTAGCACCCGAAGTGAACACAATTTCACGTGGGTCTGCATTCAGCAGGGCTGCGATTTGCTCACGCGCAGTGTCTACCGCTTCTTCTGCCTGCCAGCCATAACGGTGCGAGCGCGAAGCTGGGTTACCGAAGGTACCATCCATCGTCATGTACTGAACCATTTTTTCAGCTACGCGCGGATCAACCGGGCATGTCGCTGAATAATCTAGATAAATAGGCAGTTTCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

>LS997867|2147284:2154477|2149668_2150007_-|SYZ82077.1|DBSCAN-SWA
MPKIIVLPHETLCPEGAVLEAQTGETILDVALKNGIAIEHACEKSCACTTCHCIVREGFDSLQESDELEDDMLDKAWGLEPESRLSCQARVADEDLVVEIPKYTLNHASEDH
>LS997867|2147284:2154477|2152458_2152782_-|SYZ82080.1|DBSCAN-SWA
MAVTLSETAASRVKTFLDNRGKGIGLRLGVKTTGCSGMAYVLEFVDEVNEEDHVFESHGVKVIIDTKSMVYLDGTQLDYKKEGLNEGFEFNNPNVKSECGCGESFNV
>LS997867|2147284:2154477|2147284_2147713_-|SYZ82074.1|DBSCAN-SWA
MALERTFSIIKPDAVKRNLIGEIYHRIEKAGLQIIAAKMVHLSEEQASGFYAEHEGKPFFEPLKEFMTSGPIMVQVLEGENAIARYRELMGKTNPEEAACGTLRADYALSMRYNSVHGSDSPASAAREIEFFFPESEICPRP
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MKLPIYLDYSATCPVDPRVAEKMVQYMTMDGTFGNPASRSHRYGWQAEEAVDTAREQIAALLNADPREIVFTSGATESDNLAIKGVAHFYNKQGKHIITSKTEHKAVLDTMRQLEREGFEVTYLDPESNGLIDLAKLEAAMRDDTILVSIMHVNNEIGVVQDIAAIGELCRSRKVVFHVDAAQSAGKVAIDVQEMKVDLISLSAHKAYGPKGIGALYVRRKPRIRLEAQMHGGGHERGFRSGTLPTHQIVGMGEAFRIAKEELQQDYDHALKLRNRLLDGIKDMEAVTINGDLDQRVPHNLNVSFAFVEGESLLMALKDLAVSSGSACTSASLEPSYVLRALGLNDELAHSSIRFSFGRFTTEAEIDYAIELIRVAVDKLRAMSPLWDMYKDGVDLNTVEWAHH
>LS997867|2147284:2154477|2150020_2151871_-|SYZ82078.1|DBSCAN-SWA
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>LS997867|2147284:2154477|2147916_2149206_-|SYZ82075.1|DBSCAN-SWA
MSTQMSVFLSTQAAQPQWGDKALISFAEQGATIHLQQTQDFSAIQRAARKLDNQGIRTAFLAGEGWDLESIWAFYQGYRDAKKRNTVEWKALATAEQAELEARIKATDWTRDIINKSAEEVAPRQLATMAAEFIKSLAPDHVSYRIVKDKDLLTEGWEGIYAVGRGSERTSAMLQLDYNPTGDENAPVFACLVGKGITFDSGGYSLKPSNMMSAMKADMGGSGMITGALGLAIMRGFNKRVKLILCCAENMVSGRALKLGDIITYKNGKTVEIMNTDAEGRLVLADGLIYASEQKPQLIIDCATLTGAAKNALGNDYHALLSYDESLSQQALAAAKEENEALWALPLAEFHREMLPSNFADLSNISNGDYTPGASTAAAFLSYFVEGYQKGWLHFDCSATYRKSASDKWAAGATGMGVKMLARILMQQA
>LS997867|2147284:2154477|2152842_2153226_-|SYZ82081.1|DBSCAN-SWA
MAYSEKVIDHYENPRNVGSFDKEDPSVGSGMVGAPACGDVMRLQIKVSPEGIIEDAKFKTYGCGSAIASSSLVTEWVKGKSIDEAAAIKNSEIAEELELPPVKIHCSILAEDAIKAAVADYKKKHQH
>LS997867|2147284:2154477|2151894_2152410_-|SYZ82079.1|DBSCAN-SWA
MNYFELFGLPIQFELDGSLLSSQFRALQKRFHPDNFATASERDRLMAVQQAAQINDAYQTLKDPLRRAEYLLSLQGIEMNAEQQTLQDPMFLMEQMELREELESVTACADPEAALVDFDTKISAMQRHYLAQLQGQLAQSEWLAAADQVRKLKFIAKLKNEVERVEDQLLG
>LS997867|2147284:2154477|2149425_2149620_-|SYZ82076.1|DBSCAN-SWA
MKWTDSRDIAIELCDKFPDVDPKTVRFTDLHRWIMELEDFEDDPNHSNEKILEAVILCWMDEFE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SYZ82074.1|2147284_2147713_-	nucleoside diphosphate kinase	D2E8E1	Anguillid_herpesvirus	1.0e-20	38.4
SYZ82075.1|2147916_2149206_-	aminopeptidase B	Q6GYZ8	Mycoplasma_phage	2.2e-34	34.6
SYZ82076.1|2149425_2149620_-	Fe-S cluster assembly protein	NA	NA	NA	NA
SYZ82077.1|2149668_2150007_-	ferredoxin	NA	NA	NA	NA
SYZ82078.1|2150020_2151871_-	chaperone protein HscA	A0A0N9QXN8	Chrysochromulina_ericina_virus	4.1e-106	41.1
SYZ82079.1|2151894_2152410_-	co-chaperone HscB	NA	NA	NA	NA
SYZ82080.1|2152458_2152782_-	iron-sulfur cluster assembly protein	A0A2H4N7N5	Lake_Baikal_phage	3.0e-25	50.5
SYZ82081.1|2152842_2153226_-	NifU-related protein	A0A218MKD1	uncultured_virus	5.4e-53	78.2
SYZ82082.1|2153262_2154477_-	cysteine desulfurase	A0A0H3TPH2	Faustovirus	8.8e-33	30.8

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>LS997867|2384582:2391870|DBSCAN-SWA
TGTGTCTGATTTCCCCACTCTTGAAGATTATGTAGGTCAAACGCCCTTGGTGCGTTTACAGCGCCTCAATGCAGGCCGCTCTACAGTATTGGTGAAGCTCGAAGGCAATAATCCAGCGGGTTCCGTGAAAGATAGACCAGCGCTTAATATGATTGTGCAAGCCGAGGCGCGCGGCAGTTTGCAGCCCGGCGATACCATCATCGAAGCCACCAGTGGTAATACTGGCATAGCGTTGGCTATGGCTGCCGCCATCAAAGGCTACAAGATGATTCTGATCATGCCCGATAACGCCACTCAAGAGCGCAAAGATTCGATGCGCGCGTATGGCGCTGAGCTGATTTTGGTTAGCAAAGAACAAGGGATGGAAGGCGCACGCGATTTAGCCTTACAGATGCAGCAAGAAGGTAAAGGTAAGGTATTGGATCAATTCAATAACTTGGATAACCCCGATGCGCATTATCGCTCAACCGGGCCGGAAATCTGGCAGCAAAGCCAAGGCAAAATCACTCATTTTGTTTCAAGCATGGGCACCACAGGCACCATCATGGGCGTCTCTCGCTACCTGAAACAGCAAAATCCGCAGATCCAGATCATCGGCTTACAACCCTCGGAAGGCAGTGCGATTCCCGGTATTCGCCGTTGGCCGCAAGCCTACCTCCCCGGCATTTTTGATGCTGCACGAGTCGATCAGGTGCTGGACGTGACTCAAACTGACGCCGAACAGACCGCACGCGCCCTTGCGCGTGAAGAAGGAATTTGCGCCGGCGTCAGCTCTGGCGGAGCCGTGTTTGCCGCTTTGCAGATTGCCCAGCAAAATCCGGGATCCGTAGTGGTAGCGATTGTGTGCGATCGTGGCGACCGTTATTTATCCTCAGGATTATTTTCCTAACTGAGCTTGCCGACACTCGGCTTAGGCTGAGTGTCGAAACCTGTTTGACTTGGTATCCATATCACGCTCCCTACGCGCTTTTCGGTAAACCTCTTGCGGCGATGGCCTGATGAGCCGTAAGGTCATCACCATGCAAAGCAAGAGCTCAATTGCCCCGCCCTAGTCAGGTTTGCTATTCTCTGTAACCGTTTTTAAGTGACCCATGCCCGCCTTGTGATGAAATGCCGCAAGGCCTGCGCAGATGATGATAAGCAGCGATATAAGATTATGATGAAATCGAACGCCTCACCGAGCGAGTCTCTTTCGCACCACACCCCGATGATGCAACAGTATTTAAGACTCAAGGCGGAAAACCCAGACATTCTGCTGTTCTATCGCATGGGTGATTTTTACGAACTGTTTTATGACGATGCCAAACGCGCCTCTGAGCTGCTGGACATTTCCTTAACCAAACGCGGCGCATCGGCGGGTGAACCCATTCCTATGGCGGGTGTGCCTTTTCATGCCGTGGAAGGTTATTTAGCGAAACTCGTCCAAATGGGTGAATCGGTCGCGATCTGCGAACAGATTGGCGATCCAGCCACCAGCAAAGGCCCCGTTGAGCGCAAAGTGGTGCGGATTGTGACACCGGGAACCGTGACCGATGAAGCCCTGCTCTCAGAGCGAGTCGATAACCTGATCGCGGCGATTTATCATCATAACGGCCGCTTTGGCTACGCGACCATGGATATCACCTCCGGCCGTTTTCAGCTCAGTGAACCGCAAACCGAAGAAGAGATGGCGGCAGAACTGCAACGCACTTCGCCTCGTGAACTCTTGTTTCCTGAAGATTTTTCGCCAGTGCATCTAATGGCAAGCCGCCAAGGCAACCGCCGTCGTCCAATTTGGGAGTTTGAACTCGATACTGCGAAACAGCAGCTCAACCAGCAATTTGGCACGCGCGATCTGGTTGGCTTTGGTGTTGAGCAAGCACAATTAGGCTTGTGCGCAGCAGGCTGCTTGATCCAATACGTAAAAGATACTCAGCGTACTGCTTTGCCACACATTCGTTCACTGACTTGGGATCGCCAAGATCAATCGGTGATTTTGGATGCAGCGACGCGGCGCAACCTTGAGCTCACTCATAACTTGGCGGGAGGAACAGATAACACGCTTGCGGAGGTGCTCGACCATTGTGCGACCCCGATGGGCAGCCGCATGCTCAAGCGTTGGATCCACCAACCGATGCGCGATAACGCCACTCTCAATCAGCGTTTAGATGCGATCACTGAGCTCAAAGAAACCGCTTTGTATGGGGAACTGCATCCCGTACTCAAGCAGATTGGCGATATTGAACGGATCCTCGCCCGTCTAGCGCTGCGCTCAGCGCGGCCGCGCGATTTAGCTCGCCTACGCCACGCCATGCAGCAATTACCAGAATTGCACTCGGTCATGAGCGAGCTTAAGCAGCCTCACCTTACCGAGCTACGCACCCATGCCGAGCCAATGGATGAATTGTGCGATTTACTCGAACGTGCGATCAAAGAAAACCCACCCGTGGTAATTCGTGATGGCGGTGTCATTGCCGATGGTTACAGTGCTGAACTCGATGAATGGCGCGATTTAGCCAATGGCGCAACCGAATTTCTGGAACGCTTGGAAGCCGAAGAGCGCGATCGTCACGGCATTGATACCCTGAAAGTGGGTTATAACAATGTGCACGGTTTCTACATTCAAGTCAGTCGGGGTCAGAGCCATTTAGTGCCTCCCCACTATGTACGCCGTCAAACCTTAAAAAACGCTGAGCGTTACATCATCGAAGAACTTAAACAGCATGAAGACAAAGTGCTCAATTCTAAGTCTCGTGCTTTAGCGTTAGAAAAACAATTGTGGGAAGAGTTGTTCGATTTGCTGTTGCCGCATCTTGAGCAGCTGCAACAACTGGCGGCTTCCGTTGCTCAATTGGATGTGCTGCAAAACCTCGCAGAGCGCGCAGAAAACTTGGAATATTGTCGCCCAACGCTAGTTCAAGAAGCGGGCATTCATATCCAAGGTGGCCGCCACCCTGTGGTAGAGCGAGTAATGAATGAGCCGTTTATCGCCAACCCGATCGAGCTTAATCCACAGCGACGCATGCTGATTATTACTGGCCCGAATATGGGCGGTAAATCGACTTACATGCGCCAAACCGCATTGATTGCACTGATGACGCATATCGGCAGTTATGTGCCGGCTGAAAGTGCGTCAATCGGCCCACTGGATCGTATTTTTACCCGTATCGGCGCGTCCGATGATCTTGCGTCCGGCCGCTCAACCTTTATGGTGGAGATGACGGAAACCGCCAATATTTTGCACAATGCGACCCGTAACAGTTTGGTGTTGATGGATGAGATTGGCCGCGGTACCAGTACTTATGATGGACTCTCGCTCGCTTGGGCGAGTGCAGAGTGGCTTGCCAAAGAGATTGGTGCCATGACGCTGTTTGCCACTCACTATTTTGAGTTAACCGAACTGCCGAATGTGTTACCTCATCTAGCGAATGTTCATTTAGATGCGGTTGAACATGGTGATGGCATCGCCTTTATGCACGCAGTGCAAGAAGGTGCCGCGAGTAAATCGTATGGTTTAGCCGTAGCAGGACTGGCTGGCGTACCCAAGCCCGTGATTAAAAATGCGCGCGCCAAGTTACAGCAGCTTGAGCTATTAAGCTCACAACCTGCCGAGACTCGTAAGCCAAGCCGCGTCGATATTGCCAACCAGCTGAGCTTAATTCCTGAGCCAAGTGCGGTTGAGCAAGCCTTGGCAGGCGTAGATCCTGACCAGCTCACACCTCGCCAAGCTCTGGATATGCTCTATCAATTGAAAAAGCTGCTCTAGTTATTGCCCATATCTCAAGCATGAAATCTACGGATTCCAGAAACAACAAGGCACCCCACCGGGTGCCTTAGTTTTGGATGAGTCTGGAAAAAATTAGTTGTCGTATTCGACGTTAAACAGCGCTTCCATATTCAAACCTTGTTTCACCAAAATCTCACGCAGACGACGTAGACCTTCCACTTGGATTTGGCGAACACGCTCACGAGTGAGATTGATCTCACGACCCACTTCTTCCAAGGTCGATGGTTCATAGCCAAGAAGCCCAAAGCGACGAGCAAGCACTTCTTTTTGCTTTGGATTAAGTTCATCCAACCAGTTGAGCAGCGATTCACGAATGTCATCATCTTGAGTTGAAAACTCAGGATCAGCATTGTGTGAGTCTGGCAAAATATCCAGCAGTGCCTTATCACCATCACCACCAATTGGCGTATCCACTGAGCTGATCCGTTCGTTAAGACGCAGCATCTTAGTGACATCATCGACAGGTCGGTCTAACTCAAGAGCAATTTCTTCTGGCGTAGGTTCGTGGTCAAGGCGCTGTGATAATTCGCGAGCAGTACGCAAATAAATGTTCAGCTCTTTGACGACATGGATAGGTAGATGAATGGTGCGTGTTTGGTTCATCAGCGCACGTTCAATGGTTTGACGGATCCACCATGTTGCGTAGGTAGAGAAGCGGAAACCGCGTTCTGGATCGAATTTCTCAACCGCACGGATCAGACCAAGATTACCTTCTTCAATCAGATCGAGCAGTGCTAATCCTCGGTTGCTGTAACGGCGTGAAATTTTTACCACCAGACGCAAGTTACTTTCAATCATGCGTTTGCGTGCGGCTTCATCGCCACGTAAGGCACGACGAGCATAAAGCACTTCTTCTTCGGCGGTAAGGAGCGGTGAAAAACCAATTTCGCTGAGATACATCTGGGTCGCATCAAGACTTTTCGCAGAAGCATCAAACTCTTCACGAGCATCTTCACTTGCCCCTTCAACAGCAACTAATTCTTCATCACTGGCGAGCTCGGCATCAGTTTCTAGCACTTCCAGTGCTTCATCTTCAAAATCGAACTCTTCTACTTTGGTTACGGTATTGCTGACACTCATAGCGGCCTCCCCCTGGCAACTTTGCGAGTCATAGCGATTTACAACCTTTGCAGTATGACCTTAGCAATATGAGTTAAGGTAAGTAGCGTTTAGGATTCACTGACTTCCCTTGATAACGGATCTCAAAGTGCAAGCGTACGCTGTTAGTACCAGAACTTCCCATGGTGGCGATCTTCTGGCCGGCTTGCACTGTTTGTCCTTCCTTTGCTAGCAGCTGATCATTGTGGGCATAGGCACTTAGGTAGTGCTCATTATGTTTTATGATGATTAGGTTGCCATAACCACGTAATGCATTGCCCGAATACACAACGGTTCCATCTGCAGTAGCAACGACAGCCTGACCACGTTGGCCAGCGATGTCTATCCCTTTGTTGCCTTGATCGCCCGCAGAAAAGTTCTTTATGACTGTACCTTTTGTCGGCCATAGCCACTTCGCTATCTTCTCATCAGAAGGTTTAGCTTTTACTACATTAACATTAACATTTTGTTTACCGACAGGTTCAACATACTCCTTTGTTTTTGTTTGATCAACCGGCTTAACTGGATCTTTTTTAGTCAAATTTTGACTATTCACTGACCCATTTTGTACATTTTTGGTATTAGAGCTTTTGCTCACTGGTTGAGCAACTGTTGTCGTCGCCACCGTTTTGGCTGCACTCGCACTTGTGCTTGAAGCCACAGCCACTGTAGCTGCGCCTCCAGTTCCACCATAGGCAGGAGGAGTATAATTAGGCAACCAAAGCTTAATCTTTTGTCCAGGATGAATGGTGTACGGTGGAGCGAGATTGTTGTAACTGATCAAGTCATTTACATCTTTATCTGTGAGGTAGGCAATAAAATAAAGCGTGTCGCCTTTTTTAACTTCATAGTAACTTCCGCGATAACTACCACGCTCAACTTTGTTGTAATCTTTACCCAATCCAGAGACTGGTGCTGGGGTAGGCGCAGTACAGCCGAGTAATAAGCTGCAAAACAATAATAAGCCCAGTCGGAAAGAGTAAAGCGTCATCAGGCAAGATCTCCCGCGACCAGTGGCACAAAACGCACGGCTTCAACTCGATCAGAAATAAACTGACTACCTTGGCGTACAATTTTGTACAGATATTGCTCATCCTCGCCAACAGGGATCACCATACGCCCGCCATCAGCAAGCTGATCCAACAGACTTTGCGGCACCTTTGCCGCAGCTGCCGTAACAAGGATCGCATCAAAAAGTCCACGAGCAGGCCAACCTTGCCAGCCATCCCCATGCTTGGTTGACACATTATAGATATCCAACTGTTTCAAGCGTCTTTTCGCATCCCATTGCAGGGTTTTGATCCGCTCGACAGTAAACACATGATTAACCAGTTTGGCGAGCACTGCGGTTTGATAACCAGATCCCGTACCAATTTCTAGCACTTTGGTTTCTGGGGTTAATGCCAACAATTCAGTCATCTTCGCCACGATATAGGGTTGCGAAATGGTCTGTCCTTGCCCTATGGGCAGCGCATTATTGTCATAGGCTTGATGCATCATAGCTGGGGCGACAAAAAACTCGCGTGGCAGTGCATGGATTGCCGCCAACACTTGTGGTGAGGTAATCCCCTGCTCAGTTAAAAATTGAATCAGTCTGTCGGCTTTTGGGTTAGCCATTCACCTTTTCCTTTAACCAATGATCCATGCTGCGCAGTGATTCATGTGCCGTTAGGTCAACTTGTAGCGGCGTGAGTGATACCCAGCCACGCTCAATCGCATGAAAATCTGTTCCCGGACCGGCATCTTGCTCTTTTCCTGGAGGTCCAAGCCAATAAATATCATGCCCACGCGGATCTTTCTGCTTTATCATGCTTTCGGCGTGATGACGCGCACCTAAGCGGGTGACTTCAATACCTTGAATGTGTTCTAAAGGCCGATCTGGAATATTCACGTTAAGTAAGCGATTGGTAGGAATGGGATTAGCCAGATGTTGCTTGACCAATTGACGCACAAAGTGAGCAGCGCTGGCAAAATGAGTGGTTCCCGCCAGAGAAAAGGCGATTGACTGCACACCAAGAAAATGCCCTTCCATTGCCGCCGCCACCGTACCGGAATAAAGTACGTCATCACCCAAGTTAGCTCCGTGATTAATTCCGCTCAGCACCAGATCCGGTAGCGCGTCTTTCATTAGCTCATTAAGCGCAAAATGTACGCAATCGGTCGGAGTACCTTGCACGGAATAGGTATTCTCGGCAATTTGCGACACTCGTAATGGATGCTCTAAGGTCAGTGAATTCGAGGCACCACTGCGGTTACGATCCGGCGCGACAATCACAATCTCCGCTAAATCACGCAATGCATCTGCCAAAGCATGAATGCCTTGTGCGTAAACGCCATCATCGTTACTGAGTAGAATCTTCATCTTAATCTTCGCTCTCTGAATCGCGGCTCTCTTGTTCATGGTTTTGATCATAATGGCGTACAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

>LS997867|2384582:2391870|2390435_2391062_-|SYZ82275.1|DBSCAN-SWA
MANPKADRLIQFLTEQGITSPQVLAAIHALPREFFVAPAMMHQAYDNNALPIGQGQTISQPYIVAKMTELLALTPETKVLEIGTGSGYQTAVLAKLVNHVFTVERIKTLQWDAKRRLKQLDIYNVSTKHGDGWQGWPARGLFDAILVTAAAAKVPQSLLDQLADGGRMVIPVGEDEQYLYKIVRQGSQFISDRVEAVRFVPLVAGDLA
>LS997867|2384582:2391870|2389500_2390436_-|SYZ82274.1|DBSCAN-SWA
MTLYSFRLGLLLFCSLLLGCTAPTPAPVSGLGKDYNKVERGSYRGSYYEVKKGDTLYFIAYLTDKDVNDLISYNNLAPPYTIHPGQKIKLWLPNYTPPAYGGTGGAATVAVASSTSASAAKTVATTTVAQPVSKSSNTKNVQNGSVNSQNLTKKDPVKPVDQTKTKEYVEPVGKQNVNVNVVKAKPSDEKIAKWLWPTKGTVIKNFSAGDQGNKGIDIAGQRGQAVVATADGTVVYSGNALRGYGNLIIIKHNEHYLSAYAHNDQLLAKEGQTVQAGQKIATMGSSGTNSVRLHFEIRYQGKSVNPKRYLP
>LS997867|2384582:2391870|2384582_2385470_+|SYZ82271.1|DBSCAN-SWA
MSDFPTLEDYVGQTPLVRLQRLNAGRSTVLVKLEGNNPAGSVKDRPALNMIVQAEARGSLQPGDTIIEATSGNTGIALAMAAAIKGYKMILIMPDNATQERKDSMRAYGAELILVSKEQGMEGARDLALQMQQEGKGKVLDQFNNLDNPDAHYRSTGPEIWQQSQGKITHFVSSMGTTGTIMGVSRYLKQQNPQIQIIGLQPSEGSAIPGIRRWPQAYLPGIFDAARVDQVLDVTQTDAEQTARALAREEGICAGVSSGGAVFAALQIAQQNPGSVVVAIVCDRGDRYLSSGLFS
>LS997867|2384582:2391870|2388419_2389427_-|SYZ82273.1|DBSCAN-SWA
MSVSNTVTKVEEFDFEDEALEVLETDAELASDEELVAVEGASEDAREEFDASAKSLDATQMYLSEIGFSPLLTAEEEVLYARRALRGDEAARKRMIESNLRLVVKISRRYSNRGLALLDLIEEGNLGLIRAVEKFDPERGFRFSTYATWWIRQTIERALMNQTRTIHLPIHVVKELNIYLRTARELSQRLDHEPTPEEIALELDRPVDDVTKMLRLNERISSVDTPIGGDGDKALLDILPDSHNADPEFSTQDDDIRESLLNWLDELNPKQKEVLARRFGLLGYEPSTLEEVGREINLTRERVRQIQVEGLRRLREILVKQGLNMEALFNVEYDN
>LS997867|2384582:2391870|2385740_2388326_+|SYZ82272.1|DBSCAN-SWA
MKSNASPSESLSHHTPMMQQYLRLKAENPDILLFYRMGDFYELFYDDAKRASELLDISLTKRGASAGEPIPMAGVPFHAVEGYLAKLVQMGESVAICEQIGDPATSKGPVERKVVRIVTPGTVTDEALLSERVDNLIAAIYHHNGRFGYATMDITSGRFQLSEPQTEEEMAAELQRTSPRELLFPEDFSPVHLMASRQGNRRRPIWEFELDTAKQQLNQQFGTRDLVGFGVEQAQLGLCAAGCLIQYVKDTQRTALPHIRSLTWDRQDQSVILDAATRRNLELTHNLAGGTDNTLAEVLDHCATPMGSRMLKRWIHQPMRDNATLNQRLDAITELKETALYGELHPVLKQIGDIERILARLALRSARPRDLARLRHAMQQLPELHSVMSELKQPHLTELRTHAEPMDELCDLLERAIKENPPVVIRDGGVIADGYSAELDEWRDLANGATEFLERLEAEERDRHGIDTLKVGYNNVHGFYIQVSRGQSHLVPPHYVRRQTLKNAERYIIEELKQHEDKVLNSKSRALALEKQLWEELFDLLLPHLEQLQQLAASVAQLDVLQNLAERAENLEYCRPTLVQEAGIHIQGGRHPVVERVMNEPFIANPIELNPQRRMLIITGPNMGGKSTYMRQTALIALMTHIGSYVPAESASIGPLDRIFTRIGASDDLASGRSTFMVEMTETANILHNATRNSLVLMDEIGRGTSTYDGLSLAWASAEWLAKEIGAMTLFATHYFELTELPNVLPHLANVHLDAVEHGDGIAFMHAVQEGAASKSYGLAVAGLAGVPKPVIKNARAKLQQLELLSSQPAETRKPSRVDIANQLSLIPEPSAVEQALAGVDPDQLTPRQALDMLYQLKKLL
>LS997867|2384582:2391870|2391054_2391870_-|SYZ82276.1|DBSCAN-SWA
MYAIMIKTMNKRAAIQRAKIKMKILLSNDDGVYAQGIHALADALRDLAEIVIVAPDRNRSGASNSLTLEHPLRVSQIAENTYSVQGTPTDCVHFALNELMKDALPDLVLSGINHGANLGDDVLYSGTVAAAMEGHFLGVQSIAFSLAGTTHFASAAHFVRQLVKQHLANPIPTNRLLNVNIPDRPLEHIQGIEVTRLGARHHAESMIKQKDPRGHDIYWLGPPGKEQDAGPGTDFHAIERGWVSLTPLQVDLTAHESLRSMDHWLKEKVNG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SYZ82271.1|2384582_2385470_+	cysteine synthase B	A0A1X9I5K7	Streptococcus_phage	4.1e-56	41.1
SYZ82272.1|2385740_2388326_+	DNA mismatch repair protein MutS	A0A1V0SC35	Catovirus	6.4e-33	22.8
SYZ82273.1|2388419_2389427_-	RNA polymerase sigma factor RpoS	F4YCU2	Synechococcus_phage	1.7e-34	33.9
SYZ82274.1|2389500_2390436_-	lipoprotein NlpD	D7RWE0	Brochothrix_phage	7.8e-05	34.7
SYZ82275.1|2390435_2391062_-	protein-L-isoaspartate O-methyltransferase	A0A1B1IU40	uncultured_Mediterranean_phage	2.2e-35	51.5
SYZ82276.1|2391054_2391870_-	stationary phase survival protein SurE	A0A1B1ITZ2	uncultured_Mediterranean_phage	1.5e-68	51.2

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>LS997867|2675010:2720138|DBSCAN-SWA
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MSTDLVIINKSLGELEWIIKNYDGLFKGKCIDVFLYRVSIDDATLFAPDFFKRNNVRVHEVIKDRKKFNALIAFDNFFDKLSTYIFNRCGKNAQYITDIALIYVKALVSKFLKLEVNIFEVDRVYHENNDRTTCFLEKVISKVQYENLFFYPHHFGETTPKDKINVRLHKLIGVDRCIVNYKNEACFEHYHAVKKNLVVKITRNNSIPTKILILTRQCSDSFGFSYESAYNTLDELLKTIVLLVDVDIYIKNHPRDRDNKYWAVLKEKYSLSELSTSVIDFVSGNNVVCFHLYTTLCEPLSELNIKCFDVSPYKKSLVEKNAALMTQIERQERIGATRRLDKIDSSCIKGILNGIE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SYZ82520.1|2675010_2676138_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SYZ82521.1|2676395_2676593_-|transposase	ISVch5 transposase	Q38213	Escherichia_phage	2.0e-19	81.8
SYZ82522.1|2676688_2677906_-	Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes	NA	NA	NA	NA
SYZ82523.1|2677892_2678963_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ82524.1|2678952_2680344_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ82525.1|2680333_2681344_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ82526.1|2681343_2682528_-	LPS biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
SYZ82527.1|2682508_2683228_-	imidazole glycerol phosphate synthase subunit hisf2	NA	NA	NA	NA
SYZ82528.1|2683237_2683858_-	imidazole glycerol phosphate synthase subunit hish 2	NA	NA	NA	NA
SYZ82529.1|2683847_2684987_-	LPS biosynthesis protein WbpG	NA	NA	NA	NA
SYZ82530.1|2684986_2686045_-	pseudaminic acid synthase	NA	NA	NA	NA
SYZ82531.1|2686052_2687561_-	FlmD protein	NA	NA	NA	NA
SYZ82532.1|2687569_2688271_-	pseudaminic acid CMP-transferase	A0A1B1IVD3	uncultured_Mediterranean_phage	1.3e-09	35.1
SYZ82533.1|2688270_2689434_-	UDP-4-keto-6-deoxy-N-acetylglucosamine 4-aminotransferase	A0A2K9L0G1	Tupanvirus	1.9e-32	32.1
SYZ82534.1|2689442_2690456_-	UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase	A0A1V0SAI8	Catovirus	5.8e-46	37.5
SYZ82535.1|2690549_2691284_-	3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
SYZ82536.1|2691286_2691946_-	haloacid dehalogenase-like hydrolase	NA	NA	NA	NA
SYZ82537.1|2691929_2693549_-	4-hyroxy-2-oxovalerate/4-hydroxy-2-oxopentanoic acid aldolase	NA	NA	NA	NA
SYZ82538.1|2693840_2694878_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SYZ82539.1|2695051_2696056_-	OtnB protein	NA	NA	NA	NA
SYZ82540.1|2696161_2698897_-	OtnA protein	NA	NA	NA	NA
SYZ82541.1|2699016_2699565_-	wbfE protein	NA	NA	NA	NA
SYZ82542.1|2699972_2700200_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ82543.1|2700307_2700952_+	WbfD	NA	NA	NA	NA
SYZ82544.1|2700951_2701818_+	YjbG polysaccharide synthesis-related protein	NA	NA	NA	NA
SYZ82545.1|2701814_2704007_+	WbfB	NA	NA	NA	NA
SYZ82546.1|2704094_2705618_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ82547.1|2705710_2706655_+	ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase	R9S880	Prochlorococcus_phage	1.6e-34	35.2
SYZ82548.1|2706760_2708533_+	polysaccharide deacetylase	NA	NA	NA	NA
SYZ82549.1|2708546_2709107_+	transferase, hexapeptide repeat family	NA	NA	NA	NA
SYZ82550.1|2709222_2710407_-	O-antigen ligase	NA	NA	NA	NA
SYZ82551.1|2710390_2711119_-	UDP-glucose--lipooligosaccharide glucosyltransferase	A0A1D8KNF8	Synechococcus_phage	7.6e-16	29.7
SYZ82552.1|2711299_2712361_+	ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II	NA	NA	NA	NA
SYZ82553.1|2712367_2713150_+	mannosyltransferase OCH1-like enzyme	NA	NA	NA	NA
SYZ82554.1|2713149_2714415_+	3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase	NA	NA	NA	NA
SYZ82555.1|2714749_2715619_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ82556.1|2715621_2716668_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ82557.1|2716685_2717630_+	Lipopolysaccharide synthesis protein WavE	NA	NA	NA	NA
SYZ82558.1|2718065_2718377_+|transposase	transposase IS3	Q716C1	Shigella_phage	4.5e-26	64.6
SYZ82559.1|2718619_2719246_+|transposase	transposase OrfAB subunit B	Q716C2	Shigella_phage	2.1e-91	74.4
SYZ82560.1|2719238_2720138_-|transposase	ISSod13, transposase	A0A077SLK2	Escherichia_phage	1.5e-143	83.3

2. LS997868

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	533914 : 616981	103	Shigella_phage(33.33%)	transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>LS997868|533914:616981|DBSCAN-SWA
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MLWNKFRQGSLKILGGQLFFKGLACDVTLLYNFLPLGIGSTIKISYFEETMQKRSIYIPKNALSHEHWQQLLERRT
>LS997868|533914:616981|578578_579205_-|SYZ83243.1|transposase|DBSCAN-SWA
MKQMGLVSCQQPKHRYKKVTPEHIEIPNHLGRQFAVTEPNQVWVGDVTYIWAGSCWMYLAVVMDLLARKPVGWSMSRSPDSQLTGKALTMAYESRGKPKGVMFHSDQGSHYTSRAYRRLLWRYQVKQSLSRRGNCWDNSPMERFFRSLKTEWVPASGYYSFCQAVQEIVRYIIGYYSQLRPHWYNGGLTPNESERRYWVNAKNVANFS
>LS997868|533914:616981|580751_580994_-|SYZ83247.1|DBSCAN-SWA
MAKNTSITLGEHFDGFITSQIQSGRYGSASEVIRSALRLLENQETKLQSLRQLLVEGEQSGDADYDLDSFINELDSENIR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SYZ83191.1|533914_534541_-|transposase	transposase OrfAB subunit B	Q716C2	Shigella_phage	1.4e-90	73.9
SYZ83192.1|534783_535095_-|transposase	transposase IS3	Q716C1	Shigella_phage	4.5e-26	64.6
SYZ83193.1|535313_535547_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83194.1|536504_537032_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83195.1|537812_538310_+	acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
SYZ83196.1|538484_538721_-	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83197.1|540066_540876_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83198.1|541026_541791_+	FRG domain	NA	NA	NA	NA
SYZ83199.1|541944_542349_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83200.1|542988_543684_+	Metal-dependent phosphohydrolase with HD region, subdomain	A0A1D6Y7U0	Golden_Marseillevirus	6.2e-15	35.5
SYZ83201.1|543820_544216_+	N-acetyltransferase GCN5	NA	NA	NA	NA
SYZ83202.1|544260_544572_+|transposase	transposase IS3	Q716C1	Shigella_phage	4.5e-26	64.6
SYZ83203.1|544814_545441_+|transposase	transposase OrfAB subunit B	Q716C2	Shigella_phage	1.4e-90	73.9
SYZ83204.1|545630_546095_+	acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
SYZ83205.1|546244_546586_+	Variant SH3 domain	NA	NA	NA	NA
SYZ83206.1|546734_547178_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83207.1|549167_549488_+	Protein of uncharacterised function (DUF3709)	NA	NA	NA	NA
SYZ83208.1|550456_550687_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83209.1|550878_551136_+	antitoxin of toxin-antitoxin stability system	NA	NA	NA	NA
SYZ83210.1|551123_551426_+	Death on curing protein, Doc toxin	NA	NA	NA	NA
SYZ83211.1|551598_552246_+	glutathione S-transferase	NA	NA	NA	NA
SYZ83212.1|552546_552780_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83213.1|553610_554681_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83214.1|556043_556457_+	glyoxalase family protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83215.1|556682_557597_+	Lipase, GDXG family	A0A2L2DMU8	Acanthamoeba_polyphaga_mimivirus	1.2e-26	31.6
SYZ83216.1|557631_558672_-|transposase	ISSod13, transposase	A0A077SLK2	Escherichia_phage	1.0e-167	80.6
SYZ83217.1|558890_559121_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83218.1|561066_561345_-	plasmid stabilization system protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83219.1|561341_561626_-	DNA-damage-inducible protein J	NA	NA	NA	NA
SYZ83220.1|561875_562133_+	antitoxin of toxin-antitoxin stability system	NA	NA	NA	NA
SYZ83221.1|562120_562423_+	Death on curing protein, Doc toxin	NA	NA	NA	NA
SYZ83222.1|563136_563493_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83223.1|564178_564643_+	asch domain superfamily protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83224.1|564875_565097_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83225.1|565368_566268_+	beta-lactamase	A0A077SL40	Escherichia_phage	1.6e-55	45.9
SYZ83226.1|566418_566700_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83227.1|566851_567169_-	Plasmid stabilization system protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83228.1|567187_567430_-	prevent-host-death protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83229.1|567664_568465_+	ABC-type sugar transport system, periplasmic component	NA	NA	NA	NA
SYZ83230.1|569688_570693_+	microcin immunity protein MccF	NA	NA	NA	NA
SYZ83231.1|570893_571136_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83232.1|571447_571666_+	Protein of uncharacterised function (DUF3709)	NA	NA	NA	NA
SYZ83233.1|571999_572251_+	toxin-antitoxin (TA) system antitoxin	NA	NA	NA	NA
SYZ83234.1|572240_572528_+	Cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system	A0A2H4JBF4	uncultured_Caudovirales_phage	4.5e-20	54.8
SYZ83235.1|573040_573616_+	Protein of uncharacterised function (DUF2971)	NA	NA	NA	NA
SYZ83236.1|574068_574323_+	YefM protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83237.1|574315_574579_+	Toxin YoeB	NA	NA	NA	NA
SYZ83238.1|576161_576395_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83239.1|576538_577036_+	acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
SYZ83240.1|577111_577423_+|transposase	transposase IS3	Q716C1	Shigella_phage	4.5e-26	64.6
SYZ83241.1|577665_578292_+|transposase	transposase OrfAB subunit B	Q716C2	Shigella_phage	1.4e-90	73.9
SYZ83242.1|578444_578681_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83243.1|578578_579205_-|transposase	transposase OrfAB subunit B	Q716C2	Shigella_phage	1.4e-90	73.9
SYZ83244.1|579447_579759_-|transposase	transposase IS3	Q716C1	Shigella_phage	4.5e-26	64.6
SYZ83245.1|579878_580331_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83246.1|580455_580755_-	Plasmid stabilization element ParE, putative	NA	NA	NA	NA
SYZ83247.1|580751_580994_-	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
SYZ83248.1|581363_581684_+	Protein of uncharacterised function, DUF645	NA	NA	NA	NA
SYZ83249.1|581811_582093_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83250.1|582100_582766_+	DNA methylase N-4	S5MBX9	Brevibacillus_phage	3.9e-27	37.0
SYZ83251.1|582885_583506_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83252.1|584240_585137_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83253.1|585262_586303_+|transposase	ISSod13, transposase	A0A077SLK2	Escherichia_phage	8.0e-168	80.6
SYZ83254.1|586577_586949_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83255.1|587078_587396_-	plasmid maintenance protein CcdB	NA	NA	NA	NA
SYZ83256.1|587395_587641_-	plasmid maintenance protein CcdB	NA	NA	NA	NA
SYZ83257.1|587838_588180_+	Variant SH3 domain	NA	NA	NA	NA
SYZ83258.1|588913_589195_+	Antitoxin of toxin-antitoxin stability system	NA	NA	NA	NA
SYZ83259.1|589191_589479_+	Plasmid stabilization system protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83260.1|590881_591169_+	proteic killer suppression protein	A0A222YWE2	Escherichia_phage	2.1e-25	57.6
SYZ83261.1|591179_591497_+	antidote protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83262.1|591649_592273_+	Uncharacterized conserved protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83263.1|592434_592887_+	acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
SYZ83264.1|593033_593573_+	Isochorismatase hydrolase	NA	NA	NA	NA
SYZ83265.1|593770_594001_-	PAS factor	NA	NA	NA	NA
SYZ83266.1|594758_595082_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83267.1|595247_596615_-	filamentation induced by cAMP protein fic	A0A1V0E025	Clostridioides_phage	9.0e-26	29.2
SYZ83268.1|597469_597739_+	toxin-antitoxin (TA) system antitoxin	NA	NA	NA	NA
SYZ83269.1|597728_598016_+	Cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system	A0A2H4JBF4	uncultured_Caudovirales_phage	7.6e-20	54.8
SYZ83270.1|598175_598805_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83271.1|599099_599309_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83272.1|599540_599930_+	Lactoylglutathione lyase	NA	NA	NA	NA
SYZ83273.1|600170_600449_+	Protein of uncharacterised function (DUF3709)	NA	NA	NA	NA
SYZ83274.1|601235_601649_+	glyoxalase family protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83275.1|601853_602567_+	Fic/DOC family	NA	NA	NA	NA
SYZ83276.1|604314_604584_-	plasmid stabilization system protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83277.1|604576_604855_-	DNA-damage-inducible protein J	NA	NA	NA	NA
SYZ83278.1|606225_606642_+	Uncharacterized protein conserved in bacteria	NA	NA	NA	NA
SYZ83279.1|606808_607132_+	Isochorismatase hydrolase	NA	NA	NA	NA
SYZ83280.1|607166_608018_-|transposase	ISSod13, transposase	A0A077SLK2	Escherichia_phage	7.3e-135	80.6
SYZ83281.1|608052_608208_-|transposase	transposase iSSod13	A0A077SLK2	Escherichia_phage	1.0e-18	86.0
SYZ83282.1|608735_609149_+	acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
SYZ83283.1|609992_610271_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83284.1|610393_610684_-	RelE protein	A0A2H4JBF4	uncultured_Caudovirales_phage	2.7e-17	53.2
SYZ83285.1|610673_610922_-	antitoxin of toxin-antitoxin stability system, StbD family protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83286.1|611200_611503_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83287.1|611651_612146_+	acetyltransferase	G9BWD5	Planktothrix_phage	6.3e-06	32.3
SYZ83288.1|612254_613295_+|transposase	ISSod13, transposase	A0A077SLK2	Escherichia_phage	2.1e-168	80.9
SYZ83289.1|613318_613915_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83290.1|615007_615253_+	helix-turn-helix protein CopG family	NA	NA	NA	NA
SYZ83291.1|615391_615862_-	Uncharacterized conserved protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83292.1|615861_616314_-	Uncharacterized conserved protein	NA	NA	NA	NA
SYZ83293.1|616420_616981_-|transposase	putative transposase, IS116/IS110/IS902	M1NSC9	Streptococcus_phage	2.7e-05	26.9