Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483299 | Mannheimia haemolytica strain NCTC10609 genome assembly, chromosome: 1 | 2 crisprs | RT,cas3,PD-DExK,DEDDh,WYL,DinG,cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5 | 1 | 8 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LS483299_1 | 764494-764645 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483299_1
|
2 spacers
spacers of LS483299_1
>1.1|764519|27|LS483299|CRISPRCasFinder AAATAATTTGACAGCTATTTCTAGTTT >1.2|764571|50|LS483299|CRISPRCasFinder TGCCGTAAAAATAGGATAAACCCTTATCCTTTCGTTGAATGAATAGCTAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483299_1
The CRISPR arrays of LS483299_1 >merge|LS483299|1|764494-764645|CRISPRCasFinder ATTTGACACCTATTTCTTGTTTTCTAAATAATTTGACAGCTATTTCTAGTTTTTATGACATTTATTTCTGGTTTTTATGCCGTAAAAATAGGATAAACCCTTATCCTTTCGTTGAATGAATAGCTAATTATGACATTTATTTCTAGTTTTTA >LS483299|1|1|764494-764645|CRISPRCasFinder ATTTGACACCTATTTCTTGTTTTCT AAATAATTTGACAGCTATTTCTAGTTT TTATGACATTTATTTCTGGTTTTTA TGCCGTAAAAATAGGATAAACCCTTATCCTTTCGTTGAATGAATAGCTAA TTATGACATTTATTTCTAGTTTTTA
>LS483299.1|SQE30478.1|763424_764294_+|Competence-protein-ComM MTLAIVYSRASIGVEAPLVTIEVHISNGQPKLTIVGLPEATVKEAGDRVRSALLNANFIYPPQRITINLAPADLPKEGGRFDLPIAIGILAASGQIDSDLLTQFEFLGELALTGHLRGVHGTIPAVISADKAKRQMILAKQNANEASLVSNATTYFAGSLLEVVNMLNKRDKLPICQHISQHSAEIRPLVSRDLTDIIGQQHAKRALMIAAAGQHNLLFLVPPGTGKTMLASRLADLLPEMTDEEAIETASVTSLVQNELNFQNWKQRPFRSPHHSASMVALVGGGCEN >LS483299.1|SQE30477.1|762954_763293_+|Uncharacterised-protein MSCKTHANHEHEHGEGCGHTAIKHNDHIDYLHDGHLHHNKHGDHYDEHVLEVNETNPADCNAAHCCGDHVHGEVCGHEAVPHGDHIDYIVNGRLHHQHGDHCDDHGPVEIVK >LS483299.1|SQE30476.1|761666_762848_-|2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol-hydroxylase MKTELDMIVIGGGMIGAATALGLAKQGLRLALLEKNPLPTFNPDSDYDLRISAISMGSIQLLEKLGVWEQIVAMRSTPYTQLETWEIDGFNTLFSAADLGLEKLGDMVENNVIQIALWEQLKQYPNCLQAVGFEQIFANKAGEYWEVTVDGNTFAAPLLIAADGANSQVRQWAGIGLTAWQYRQHCLLATVTTEKPAPSGTWQQFYPTGPRAFLPLSGNHGCVVWYDSPQKIAELKMLPAEKLGVAIEQHFPSRLNAELGNIQVQASGAFPLTRQHAQHYVQNGVVLVGDAAHTINPLAGQGVNLGFKDVKTLLEVIEQAVKKGKNFASEQVLQRYEQKRKPDNLLMQTGMDVFYKAFKTDLLPLKIARNVGLVLADKVSPIKKQALKYAIGI >LS483299.1|SQE30475.1|760788_761625_+|Cell-division-protein-FtsN MPQRDYVARSNEKKSKKNQKESNVKKILMRIIGVILFFGIGLWFLKSSAPVPTVPSAPQPANSQTKSELPSRPEETWSYIRDLETRTVITDNSQTSQERLAQLTAEQKQQIEERRKQEEARLAAEQAQQKPATDVSATELAPKTEEVKSLTEEELAAKKAQEQALAQKQAEEKRRQAELKKQQEAKKEQPAKIVASAATLADKAANQAGKFGLQCGAFKNKAQAENMQARLAMAGFNARIASSADWNRVFVGPIGDRAATSRAQSNARSVAECVIVAM >LS483299.1|SQE30474.1|759945_760698_+|Ribosomal-RNA-small-subunit-methyltransferase-J MIQLINETQQHDKFRQICDKWQLVEDKSSPLALVLTEERLELRKLDEPKLGAIAVNFVDGTMAHRRKFGGGRGEAVAKAVGIKGDYLPTVIDATAGLGRDAFVLAAVGCKVLLVERNPIVAALLEDGLNRAYQDVEIGSFMQERMILADVRDISQLDPQSQMAEVVYLDPMYPHKQKSALVKKEMRVFQHLVGADLDSDSFFLPAKGLAKKRVVVKRPDYAPFLAEQKPDFSHTTKNHRFDVYLSHLKND >LS483299.1|SQE30473.1|759277_759949_+|D-alanyl-D-alanine-carboxypeptidase MIFVENFANLLTGKTREHLVPLPNALSDKHYLQPQVVEAFLTLQHAAKQAGFNLQPASTFRDFERQKGIWNVKFRGERKVHDDNGVAIDMAALSDLEKCKAMLRWSAVPGASRHHWGTEIDIFDPDLLPENTPLLLEPWEYLEGGYFADLTKWLHVNAETFGFYFPFDGKHSRVGFEPWHISYRPISNEYEQRFNDEILKAAWQDEEVAGKECLLEHFEELLK >LS483299.1|SQE30472.1|758314_759139_-|2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate-N-succinyltransferase MSLQAIIEAAFERRAEITPKTVDAETKAAVEEVIAGLDNGSLRVAEKKDGEWVVNQWVKKAVLLSFRIADNEIIDGAETKFYDKVPTKYGNYTEEQFKADGIRAVPGAVVRKGSHIEKNVVLMPSFVNIGAYVGEGTMVDTWVTVGSCAQIGKNVHLSGGVGIGGVLEPLQANPTIIGDNCFIGARSEIVEGVIVEDNCVISMGVFIGQSTKIYDRETGEVHYGRVPAGSVVVSGSLPSKDGSHNLYCAVIVKKVDEKTLSKVGLNDLLRSIDE >LS483299.1|SQE30471.1|757886_758255_-|Acetyltransferase-(GNAT)-family MAFTIRKMVEQDTHQVFPLMQKLAVFEHYIDSFAITPEVVMESGFRKSPPDFYCLVAENASNIIGILVYYFLPYTAQNRPAIYMKELYVDETARNQKVGEALMQALKNEAKAHHCKTIKSLE >LS483299.1|SQE30470.1|757363_757801_-|3-dehydroquinate-dehydratase MKKILLLNGPNLNMLGKREPQIYGSQTLADIENHLKKLAAAQDVELESFQANGEEPIINRIHQAFQHTDFIIINPGAFTHTSVAIRDALLSVSIPFVEVHLSNVHSREPFRHHSYLSDIAKGVICGLGAKGYEYALDFAISHLKA >LS483299.1|SQE30469.1|756571_757354_-|Mannosyltransferase-OCH1-and-related-enzymes MAVKNEQFIVICNGVFRLFGNIVKILSYPFHALFPKKRFTIPEYSPAKIQSSIPSKITKTIWQTNYSNKVTLPMYANYLFNRLMSLSYDYRYVSTEEREAYIKANADERTFNAYSKLTDGAAQADFWRIFTLLREGGIYIDIDGHLVYPLSKIIGENDSEVLIKRRDKYTNFFLASEAGNWILKDTLELIISNIENRRIEGGVFVMTGPDTLNNAIGDKEVNFRRDKVTCAQGTFTNEYFQYIDKPGSKWNYKKNEDLLK >LS483299.1|SQE30480.1|765052_765325_+|Competence-protein-ComM MQFERAGKINSQLTTREIERDCQLSAQDALFLETALTKLGLSVRAYHRILKVSRTIADLAGEANIQQLHLAEALGYRAMDRLLQQLQGEP >LS483299.1|SQE30481.1|765373_766213_-|2-succinyl-6-hydroxy-2,-4-cyclohexadiene-1-carboxylate-synthase MLSYQWHAQQGTPVVFLHGLLGSQQDWQAVLQHLQNFPQIRPLTIDLPFHGNSKHITCADFADLRQQLHATLESLIGSRPFYLVGYSLGGRAALDYVLNMENPNLQGVVLEGANIGLSTENDRQIRRQNDRHWANRFRQEPIEQVLEDWYKQPVFADLSDTERECYIDSRKHNQGEQIAQMLEATSLAKQPDYTEKLKQTDKNIVFFIGEKDQKFRKMASSHQLPTQLIANAGHNAHRANAKNFVEKLGLLILHSDSDLRSQSVKHNGAALLHKSPSGA >LS483299.1|SQE30482.1|766261_767968_-|2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3--cyclohexene-1-carboxylate-synthase MNTSSFNRTWAKVILSALMRYGVKHFCIAPGSRSTPLTLEAVQLQQTQYAECHTHFDERGLGFYALGIAKATDSPVAIIVTSGTAVANLYPAVIEASLSHQKLIILSADRPTELIGCGVNQAIHQQGIFANYPVASVNLPKANEAYHASWLVSTIEQACTTQAQQGGVLHINVPFEEPLYEADINEILNTPWLRPIQGWLNNAQTKWIDQQAIQSEVSMHENWDYWRTKRGVIVVGKLPPEQGTGLKTWAETMGWCLLSDVQSCIEASLPYADIWLSNETVKQRLLQADIVIQFGTQIVSKRVNEFLKAFQGEYWVVEQSHDYHNPNAHHQTRFIAKAHHFLRVHPPLRQKPWLLEPLALSQFCSTFIEQQVGGSLSEASLAHNIQDVLAINGNLFIGNSLFVRLVDALCKLPEGYPVYTNRGASGIDGLIATMAGIAKGSDRPTVGVVGDISALHDLNSIALLTKINQPTILFVVNNSGGALFDMLPVDSKAKDQYYRLAHNFEFAQVATMFGLEYIRPFTWADLKTKLKHAYARKGVTIVEIKVNEHDGSNMYKSLLKQISQAEIA >LS483299.1|SQE30483.1|768469_769105_+|General-stress-protein-A MKVCVDFSKYKSLEHINETGFYRYLIPYLDEERVLYLDSDIVVDDNLSEMYWLNFNGIPLYAVEDYVHNHIPAYLDLDLSPYFNSGVLLINNILWKKYSVCDELVTINEKIVNLTYGDQDALNIYFKGGWGALPIEYNYQVDAILELVLRREQEELARKNGYLDVIPKIIHYTSKFKPWKKELHTMQISTRKKYWFYYHLEWNDILEQHQK >LS483299.1|SQE30484.1|769150_769438_-|Protein-of-uncharacterised-function-(DUF406) MKNDKPIECEGCNTFDVGSILDNSETVATIQRTYESENEAKAALEKFTQKARDVESEPCEISSEITPIESGFELVAHFKFSCQAEVVIFQLGTRF >LS483299.1|SQE30485.1|769557_769971_+|Predicted-membrane-protein MTAWERVFHALLFECFAIIFTVILTSWLTSHRMVDLTAVIVMISVIAMVWNVIFNWGFDKVFTGERVQRGLGIRILHSFLFEGGLLVFTIPLVMYMLDIGWWQAFVMDIGMTLFVLVYSVVFNWVYDHLRLRWVKSG >LS483299.1|SQE30486.1|770055_771048_+|D-galactose/-D-glucose-binding-protein MKRTILSAFALSVICGVNLSYAQSESRVGVTIYKYDDHFMTQMRKDMQNEAKGFAGLKWFMNDAQNSQVKQLAQIETLLQHKMRVLAVNIVNANESKTIVEKAKAYNVPVVFFNRTPSKQALESYEKAYFVSADPKEAGRIQGELIAKVWKSNPDFDLNKDGKLQFVLLKGEPSDVSAERSQAVVESLNQQGVQAEEIYSDTARWRRTLARNKMNEWLVENRAAEIEVVISNNDEMAIGALDALNAHEKRLPIFGIDALPETLALMKKGEIAGTVLNDSSAQAKAVVKLVSNLAQGKPALKDTQWESHSSKTIYLPHIGIDKENLGQFLP >LS483299.1|SQE30487.1|771322_772312_+|D-galactose/-D-glucose-binding-protein MKKAVLSAVAMAVALGATISTAQAENRIGVTIYKYDDNFMALMRKEIEKEGKTQKVELLMNDSQNTQSIQNDQVDVLLSKGVKALAINLVDPSAYKTIIQKAKSEDVPVVFFNKDPGAAAIDSYPKAYYVGTEPKESGIIQGELIAKQWKAHPELDLNKDGKIQFALLKGEPGHPDAEARTKYVVESLKAQGIDSEQIFMDAALWDAAQAKDKVDAWLSSGKAKDIEVIISNNDGMALGALEATKAHGRKLPIFGVDALPEALQLIKKGELAGTVLNDGVNQGKAVVQLSANLAGGKDAVAGTQWKLENRVVRIPYVGVDKDNLSEFLK >LS483299.1|SQE30488.1|772383_772494_+|Galactose/methyl-galactoside-import-ATP-binding-protein-MglA MTGEVLLTMTNVSKSFPGVKALDNANLTVKSIVFTP >LS483299.1|SQE30489.1|772493_773882_+|Galactose/methyl-galactoside-import-ATP-binding-protein-MglA MGENGAGKSTLLKCLFGIYAKDEGDILFLGKPVNFKTSKEALENGISMVHQELNLVKQVTVMDNLWLGRYPLKGPFVDHDKMYRDTKAIFDELDIDVDPRDKVAKLSVSQMQMIEIAKAFSYNAKIVIMDEPTSSLSEKEVEHLFKIIQKLKDRGCGIIYISHKMDEIFKICDEITILRDGKWVNTVAIKDTSMDQVVSMMVGRELTQRFPEKTNLPKEVILEVEHLTAKNQPSIQDVSFSLRRGEILGIAGLVGAKRTDIVETIFGVREKAGGTIRLNDKEINNRNAFDAINNGFALVTEERRSTGIYANLSIEFNSLISNMKSYLGKFGLLSNKKMKSDTQWVIDSMNVKTPSHQTHIGSLSGGNQQKVIIGRWLLTQPEILMLDEPTRGIDIGAKFEIYQLILELANKDKGIIMISSEMPELLGVTDRILVMSNGKVAGIVETAHTSQEEILQLAAKYL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LS483299_2 | 1994844-1996000 | TypeI |
NA
Consensus repeat of LS483299_2
|
17 spacers
spacers of LS483299_2
>2.1|1994876|33|LS483299|CRT CAATGGCGAAAACATAGGATTTGTGGGTACACC >2.2|1994941|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder CTATTGTCGCCCTTGATTTCCAATTCAAGACGAG >2.3|1995007|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR TAAAGTTTTTTGCAAACCGCAATAACCCACGCCTA >2.4|1995074|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR GCTACGATTTAAAAGGTGCAACGTTTGAAGTTTGG >2.5|1995141|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR AAAATCAATTAAATCTAACCGATAAACTTATAGAC >2.6|1995208|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR ATTCATCGTGATGAATACGGCATAGGGGCAGAGT >2.7|1995274|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR GCAGTTTTAACTTCCGTGAGCCATACGTTACAGGT >2.8|1995341|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR CGCCTCGCTGATGCGAGAAAATTACCGAACAAGT >2.9|1995407|33|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR AAAACTAATAATCTAATATCAAAAAAAGCATTA >2.10|1995472|33|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR AAAACTAATAATCTAATATCAAAAAAAGCATTA >2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR ATAAATATAATATTATTTTAAAAAAATATATTTTA >2.12|1995604|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR ATCTACGCTGGCGGGTATATCTACCAGAAATAATA >2.13|1995671|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR TGCGATTGTTATCGTGGGCATTTTATGTAAAAATT >2.14|1995738|33|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR CAGGGGCTTTCCAGATGAACGCAAACAAAAAGA >2.15|1995803|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR ATACTTCTGTTCCGGTCCAAATCGGAATCGCACG >2.16|1995869|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR CAACACCCGATTTGTCAATAGCTCCGTTTGGCTG >2.17|1995935|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR AGTTTCAAGGCAGTTTCTATCGCTTGTAAGTCAA |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483299_2
The CRISPR arrays of LS483299_2 >merge|LS483299|2|1994844-1996000|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR ATTTCAATATATATTGATGCGAAGGTAGCAGCCAATGGCGAAAACATAGGATTTGTGGGTACACCGTTTCAATACACAGCCACGCGAAGGTGGCTGCCTATTGTCGCCCTTGATTTCCAATTCAAGACGAGGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCTAAAGTTTTTTGCAAACCGCAATAACCCACGCCTAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCGCTACGATTTAAAAGGTGCAACGTTTGAAGTTTGGGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCAAAATCAATTAAATCTAACCGATAAACTTATAGACGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCATTCATCGTGATGAATACGGCATAGGGGCAGAGTGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCGCAGTTTTAACTTCCGTGAGCCATACGTTACAGGTGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCCGCCTCGCTGATGCGAGAAAATTACCGAACAAGTGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCAAAACTAATAATCTAATATCAAAAAAAGCATTAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCAAAACTAATAATCTAATATCAAAAAAAGCATTAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCATAAATATAATATTATTTTAAAAAAATATATTTTAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCATCTACGCTGGCGGGTATATCTACCAGAAATAATAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCTGCGATTGTTATCGTGGGCATTTTATGTAAAAATTGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCCAGGGGCTTTCCAGATGAACGCAAACAAAAAGAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCATACTTCTGTTCCGGTCCAAATCGGAATCGCACGGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCCAACACCCGATTTGTCAATAGCTCCGTTTGGCTGGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGCAGTTTCAAGGCAGTTTCTATCGCTTGTAAGTCAAGTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC >LS483299|2|1|1994844-1996000|CRT ATTTCAATATATATTGATGCGAAGGTAGCAGC CAATGGCGAAAACATAGGATTTGTGGGTACACC GTTTCAATACACAGCCACGCGAAGGTGGCTGC CTATTGTCGCCCTTGATTTCCAATTCAAGACGAG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TAAAGTTTTTTGCAAACCGCAATAACCCACGCCTA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC GCTACGATTTAAAAGGTGCAACGTTTGAAGTTTGG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AAAATCAATTAAATCTAACCGATAAACTTATAGAC GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC ATTCATCGTGATGAATACGGCATAGGGGCAGAGT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC GCAGTTTTAACTTCCGTGAGCCATACGTTACAGGT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC CGCCTCGCTGATGCGAGAAAATTACCGAACAAGT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AAAACTAATAATCTAATATCAAAAAAAGCATTA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AAAACTAATAATCTAATATCAAAAAAAGCATTA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC ATAAATATAATATTATTTTAAAAAAATATATTTTA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC ATCTACGCTGGCGGGTATATCTACCAGAAATAATA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TGCGATTGTTATCGTGGGCATTTTATGTAAAAATT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC CAGGGGCTTTCCAGATGAACGCAAACAAAAAGA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC ATACTTCTGTTCCGGTCCAAATCGGAATCGCACG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC CAACACCCGATTTGTCAATAGCTCCGTTTGGCTG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AGTTTCAAGGCAGTTTCTATCGCTTGTAAGTCAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC >LS483299|2|2|1994909-1996000|CRISPRCasFinder GTTTCAATACACAGCCACGCGAAGGTGGCTGC CTATTGTCGCCCTTGATTTCCAATTCAAGACGAG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TAAAGTTTTTTGCAAACCGCAATAACCCACGCCTA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC GCTACGATTTAAAAGGTGCAACGTTTGAAGTTTGG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AAAATCAATTAAATCTAACCGATAAACTTATAGAC GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC ATTCATCGTGATGAATACGGCATAGGGGCAGAGT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC GCAGTTTTAACTTCCGTGAGCCATACGTTACAGGT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC CGCCTCGCTGATGCGAGAAAATTACCGAACAAGT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AAAACTAATAATCTAATATCAAAAAAAGCATTA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AAAACTAATAATCTAATATCAAAAAAAGCATTA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC ATAAATATAATATTATTTTAAAAAAATATATTTTA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC ATCTACGCTGGCGGGTATATCTACCAGAAATAATA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TGCGATTGTTATCGTGGGCATTTTATGTAAAAATT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC CAGGGGCTTTCCAGATGAACGCAAACAAAAAGA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC ATACTTCTGTTCCGGTCCAAATCGGAATCGCACG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC CAACACCCGATTTGTCAATAGCTCCGTTTGGCTG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AGTTTCAAGGCAGTTTCTATCGCTTGTAAGTCAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC >LS483299|2|1|1994975-1996000|PILER-CR GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TAAAGTTTTTTGCAAACCGCAATAACCCACGCCTA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC GCTACGATTTAAAAGGTGCAACGTTTGAAGTTTGG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AAAATCAATTAAATCTAACCGATAAACTTATAGAC GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC ATTCATCGTGATGAATACGGCATAGGGGCAGAGT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC GCAGTTTTAACTTCCGTGAGCCATACGTTACAGGT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC CGCCTCGCTGATGCGAGAAAATTACCGAACAAGT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AAAACTAATAATCTAATATCAAAAAAAGCATTA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AAAACTAATAATCTAATATCAAAAAAAGCATTA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC ATAAATATAATATTATTTTAAAAAAATATATTTTA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC ATCTACGCTGGCGGGTATATCTACCAGAAATAATA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC TGCGATTGTTATCGTGGGCATTTTATGTAAAAATT GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC CAGGGGCTTTCCAGATGAACGCAAACAAAAAGA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC ATACTTCTGTTCCGGTCCAAATCGGAATCGCACG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC CAACACCCGATTTGTCAATAGCTCCGTTTGGCTG GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC AGTTTCAAGGCAGTTTCTATCGCTTGTAAGTCAA GTTTCAATTCACAGCCACGCGTAGGTGGCTGC
>LS483299.1|SQE31855.1|1993183_1994659_-|Ribonuclease-G MSSTELLVNVTPSETRVALVENGILKELHIEREAKRGIVGNIYKGRVTRVLPGMQSAFVDIGLEKAAFLHASDIVSHTECVDENEKKQFLVKDISELVREGQDIVVQVVKDPIGTKGARLTTDITLPSRYLVFMPENSHVGVSQRIESEEERARLKSLVEPYCDELGGFIVRTAAEEATEESLKQDVEFLKRLWRKVLERKGKYSAKSMLYGELALAQRVLRDFIGTHINSVRIDSKLTYEQVREFLAEFMPELTDCVTLYTGQQTLFDAYGVEKAIQKALDKRVDLKSGGYLIIEQTEAMTTIDINTGAFVGHRNLAHTIFNTNIEAIQAIAHQLQLRNLGGIIIIDFIDMQEEEHRERVLQSLQEALKGDRVKTNVNGFTQLGLVEMTRKRTRESLERILCCDCQACQGRGTVKTVETVCYEIMREIVRVHHLFKTENIHVYAAKDVAEYLINEESHALLAELQAFIGKKIEIKLEPYYHQEQFDVVVM >LS483299.1|SQE31854.1|1991527_1993030_-|Lysine--tRNA-ligase MSEVENQELDLNGEMLARREKLNKIREQGNAFPNTFRRDALAKDLHAQYDAVEGETLKEQNIQVKVAGRIMLKRVMGKASFFTIQDVSGAIQLYVARDNLSDSVYEEKVSLWDLGDIVGVEGALFKTKTGELTVRCSEVQLLTKSLRPLPDKHHGLTDLETRYRQRYLDLISNEESRRTFMIRSQVVSGIRNFFLERDFIEVETPMLQVIPGGAAAKPFITHHNALDVDMYLRIAPELYLKRLVVGGFERVFELNRNFRNEGVSVRHNPEFTMIEYYQAYADYHDLMDNTEELLRQLALDILGTTDVPYGDYVFDFGKPFERITMHDAIVKYGNGIQREDLDSFEKSVEIAKGLGIEIQKSWGLGSVVNAIFEEVAEHQLIQPTFLMAHPAEISPLARRNDENPEVTDRFELFIGGREIGNGFSELNDAEDQAERFDAQVAAKDAGDDEAMFKDEDFIVALEHGLPPTAGEGLGIDRLVMIFANAPSIRDVILFPAMRQK >LS483299.1|SQE31853.1|1990376_1991450_+|Homoserine-O-acetyltransferase MAQQITLFEDVPLPLTLGGELSPITVAYQTYGRLNAEKSNAVLLCHALTGDAKPYYDSPTEKGWWQDFIGKGLAFDTDKYFFICSNVLGGCKGTTGPASINPKTNKPYGSLFPIITVQDIVNVQKALLDYLEIPQLHAVVGGSFGGMQATQWGISYPDKVRNIINLCSSLTLSAEAIGFNHVMRQAIINDPHFNGGNYYDGIAPDNGLKIARMLGMLTYRTDIQLAKAFGRETKQQGQIWGDHFQVESYLSYQGTKFLGRFDANTYLRLLRALDLYDPALGYENEETALKRIKANYTFVAVTSDQLFKQVDVYKSKQKLEQAGVNLEFHEFHSDFGHDAFLVDYDFFEPMIKAGLAK >LS483299.1|SQE31852.1|1989737_1990109_-|vancomycin-high-temperature-exclusion-protein MNQTRDRLEKLPLFHKMQQFIIKALKIIAIFPLLGIAILLVVDSLTSYIVRDKIYTDSKQIPYREYAVVLGTAKFYSKDVINQYYKYRLEAAKQLVQEGKVNQLLLSGDNKTPYYNEPKNNDK >LS483299.1|SQE31851.1|1989424_1989748_-|vancomycin-high-temperature-exclusion-protein MTSDLLKMGIATSKIKQDYAGYTTFYSIIRAKKVYKLPPFTIISQKFHCERALFIAKFRDIDAICYAATYPEGAYQVRMREILARSAMVFSLLIGKEPESLEDIRSK >LS483299.1|SQE31850.1|1988548_1989388_+|Formyltetrahydrofolate-deformylase MLQQHKILLTECPDDTGLVAKITNICYKHQLNIIKNSEFVENETKRFFMRTELNGIFNDETLLTDLKFTLPEGSSYKLLPKQRKRIVILVTKEAHCLGDLLMKNYYGGLDVEIAAVIGNHETLKSLVERFDIPFHLVSHENLTRVEHDKLLAEKIDEYSPDYIVLAKYMRVLNPEFVARYPNRVVNIHHSFLPAFIGAKPYHRAYERGVKIIGATAHFVNDELDEGPIIMQNVINVDHTYTAEAMMRAGRDVEKTVLSQALELVLADKVFVYKNKTIIL >LS483299.1|SQE31849.1|1988077_1988479_+|DNA-binding-protein,-nucleoid-associated MSALKSLLNIRSLRALAKDLALEQLKSISEKLDIIIAEKEEEMKQEELEKLKQLESLNKYREMLKQDGLSIDELAELLADKVIKTRKALSPRPAKYKFVDANGNEKTWTGQGRTPKALQDALDSGKKLEDFAI >LS483299.1|SQE31848.1|1986108_1987641_-|Malate-2H(+)/Na(+)-lactate-antiporter MNLVDYSTSLWSVLPALIALILAIVTRKVIISLSIGILFGAFMLTNSNFLDALTYIKNSVVSLVYKGAEEGLNSNNVNIILFLLLLGVLTSLLSISGSNQAFANWAQKKVKGKRGAKLMAAGLVFFTFIDDYFHSLAVGAIARPVTDKFRVSRAKLAYILDSTAAPMCVLMPISSWGAYIITLIAGLLATHSITGYSPLGAFMTMSAMNFYAIFAMIMVFFVAYFSFDIGSMARFERQAAHLAELDDEQIETKGHVRDLILPIIALIVATVSMMMKTGADALAESGASFSILGAFENTTVGISLVVGGVAGLIVATICIITSGNISFKNYVRAYGLGVKMMSGAITILFFAWTINGVVSDMQTGKYLSGLVAESIGAEFLPAILFVLAAAMAFSTGTSWGTFGIMLPIGASMAVHSDPALIIPCLSAVMAGAVCGDHCSPVSDTTILSSTGAQCNHMDHVISQLPYALLVATASIVGYLVVGFTQSAVLGFIATSVVMAILILLFKEKKH >LS483299.1|SQE31847.1|1985130_1985883_-|NADP-dependent-3-hydroxy-acid-dehydrogenase-YdfG MKIALVTGVTAGFGLAICKLLLQSGYKVIGTGRRAERLEELHLQFGDKFLPLAFDIQQPDEVEKALNSRPKAWQQIDLLVNNAGLALGLEPAQKADLNDWYQMIDTNIKGLVTMTRLVLPEMVERKSGHIINIGSIAGTYPYPGGNVYGGTKAFVKQFSLNLRADLAGTKVRVSNVEPGLCGGTEFSNVRFKGDDEKAAKVYENVQFVRPEDVANIVLWLNQQPEHVNINRVEVMPVAQTSSALNVARNI >LS483299.1|SQE31846.1|1983928_1985119_-|Tryptophan-synthase-beta-chain MSDTLLNPYFGEFGGMYVPEILVPVLKELEQAFVDAQQDPTFQAEFADLLKNYAGRPTALTLCRNLTKGSKTKLYLKREDLLHGGAHKTNQVLGQILLAKRMGKTRIIAETGAGQHGVATALACAMLGMPCVVYMGAKDVERQSPNVFRMRLMGAEVIPVQKGSCSLKDACCEAMRDWAANYDTTHYLIGTAAGPHPFPTMVREFQKMIGEEIKRQILAKEDRLPDAVIAAVGGGSNAIGMFADFIEEQSVKLIGVEPAGKGIETGEHGAPLKHGTTGIYFGMKSPIMQDKDGQIEESYSISAGLDFPSVGPQHAYLNATGRAEYVSITDAEALEAFQALAKNEGIIPALESSHALAYALKMIKQNPEKEQLLVVNLSGRGDKDIFTVDKILNGGE >LS483299.1|SQE31856.1|1996190_1996484_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MLMLITYDISFDDPEGQARLRRIAKHCLDYGVRAQYSVFECDVTPAQWVTLKNKLLATYNPDCDSLRFYHLGSKWRNKVEHHGAKPSVDIFKDTLIL >LS483299.1|SQE31857.1|1996550_1997564_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1,-subtype-I-C/DVULG MRKLQNTLYITTQGSYLHKERETLVVEQDRKKVAQLPIHSIGHIFCFGNVLVSPFLMGFCGENNVNLAFFTENGRYLGRLQGRQSGNVLLRRAQYKKSETNPVPVARNIIAAKIQASKRVLQRQIRNHGENADLQSTITALNYSLQQLKTADNLDLIRGIEGDAAARYFGVFSHLIKENSGFHFDGRNRRPPRDGVNALLSFLYSIVGKDISGALQGVGLDPQIGFLHADRSGRDSLAQDILEEFRAWWVDRMVLSLINRGQVKPDDFVTEASGAVTLKPEARKLLFQTLQAKKQEKIIHPFLEEEVEIGLLPYIQAMLLARHLRGDLAEYPPFLMR >LS483299.1|SQE31858.1|1997960_1998881_-|Uncharacterised-protein MITSNLERSFHGLNIAQHNYKIFLDESGGNIGKLKHTPNDKKGSNFNRTISSHIGVPPVFVLGGIAQISNANLIAPDWRKLLHLQNKELKFSKIGKNFFNKLGSKELRKVLEWINENNLCIHFALYDWVYFYDVDIIDSALIESDVCSVWKYLSEKIGNSNRYKEIKDYQRKVGLDKQSDDIIYLFYIKELLHDFIINNLQWFLSEIYNNHYKKIDNQEKTVFLDNLYNMIKGSEKYKVLEFFLEKIDRNKYLSFIYDKLDSEMNEDKTFIMLVEDMSPPYQNYLNTFPLSEFYFDKGMEHVFIDY >LS483299.1|SQE31859.1|1998907_1999582_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MGDLQNSAEILPLVQPKFGDDKRSISLSALQHYAFCPRQCALIHNEQVWAENYLTAQGQALHERVDSGEPEVRKGIRFERTVHVAAEKLGISGILDLVERDLKTGELKPVEYKRGKPKLDPIDEIQLCAQALCLEEMTEQTINEGALWYTQTRHRLPIIFSTELRTKTLATIAEVRSLLDSGTTPPPEYSKRCKACSLIDLCQPKLLERDRSKGYVVGVFGSLL >LS483299.1|SQE31860.1|1999581_2000445_-|Uncharacterized-protein-predicted-to-be-involved-in-DNA-repair MSIQNRYEFVFFFDVTNGNPNGDPDAGNMPRLDPETSKGLVTDVCLKRKIRNFIEMSYENEAGYEIYVKEKSVLNLQNKRAYEALGIESEAKKLPKEEAKAREITAWMCKNFFDIRTFGAVMTTEVNSGQVRGPVQLAFAQSIDPIIPLEVSITRMAVTNEKDLEKERTMGRKYIVPYALYRVHGFISAKLAEKTGFSDEDVQKLWQALQLMFEHDRSAARGEMAARKLIVFKHDSELGNQPAHKLFDSVKVERINGEKDTPAKDYDDYCISVQTEGLTGVTVEELL >LS483299.1|SQE31861.1|2000454_2001003_-|CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1,-subtype-I-C/DVULG MARAVISGHLYPMSLLSQLVTRIRADGDINGLRVALMKAVLQRKFRKGFIKEGVPMSLNKESDNQAYLLGRLFAVLERIQSQALGELNAGIADRYYGSASAVPFSVFPRLLSGAKHHLSRLRKDKGGMAVNLDKDLGEIIASLPENFPRHLSIDEQGRFAIGYYHQKQSYFAKKETTESIEN >LS483299.1|SQE31862.1|2001103_2002240_-|CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1,-subtype-I-C/DVULG MILSALTRYYYRLAAQEDRLTGEAKVPSYGFSEEKIGWVLELDSKGNLVNVISNLTEDKKPKPKLMSVPRPEKRTSGIKPNFLWDKTAYVLGIESNPDKATAKDQPINFAEKTFEAFKQYHLDLLADSNDEGLMAIRNFLQQWQPTHFAESICPREILDANVVFKLVGTSGYIHQREAAQTLWTSLLINQSDNAEKGLCLISGKLSPIQRTHPPIKGVFGGQSSGGSIISFNKESFTSFGKEQGSNAPVSEQAAFAYTTALNYLLRTEKHRLTIGDASTVFWAEADNTTQAEAAEGFFAALMTPPDDEQENQKIFEELQKISKGRPLAEISPELSENTRFLCVGACSKCSSHFGTFLAGYHLWATGKKPQRALARSRS >LS483299.1|SQE31863.1|2002236_2002914_-|CRISPR-associated-protein-Cas5,-subtype-I-C/DVULG MPNKIRLHIWGDYACFTRPEMKVERVSYDVITPSAARGILAAVHWKPAIRWVIDKIYVLQPIQFESVRRNELGSKISASKISGAMKRKTVADLYTVIEDDRQQRAATVLKNVGYVIEAHAVLTKMAGEAETVTKHIEMFKRRAKKGQCFQQPCMGVREFAANFALIDDDEPLPECFLAENERDRDLGWMLHDIDFEHGNQPRFFRAEMKNGVIDVPPFYAEEVKS >LS483299.1|SQE31864.1|2003087_2004839_-|Type-IV-secretory-pathway,-VirB4-components MANETLNFKDNARLGRVVTVDTSRVLISVEEHQQMTSIAVGNLIAIQGRTASEYLIGIIERVTRSISEKLLLEEISNEGEIPLGESQDDFIKAVLIGTYKAVDGSLSNTFKRGADCFPQIDRDCFHISGSNLQLFMNLLSANVKENERLTLGHFMADETAVAIANGDKFFQRHAAILGSTGSGKSWSVALILERAAALKAANLIVFDMHGEYSTLCEGKNAIAQQYRIAGPGDLDGSDERSLFIPYWLLNREEMLALILDRSDDNAPNQAARFTEHVRALKEQTLNKEERNDVLETFTVDSPIPYSIELLLARLDKDNSEMVPKEGGSGTKQGPWYSKLSRFMGRMKAKIDDRRCGFMFQPPVECNSYGWLENMLSKLFSASESEKGIKIIDFSEVPSDVLPIVTGVLARLLYNIQFWMDKDSRHPLTIICDEAHLYLPVRDSAEAAEKRALEAFERIAKEGRKYGVSLLVVSQRPSDVSRTILSQCNNFLVLRLTNDQDQSVVKRLLPESMVGITDILPLLDLGEALLLGDSILLPTRIKLAKPHIAPESATRQFWSDWANQEPKPNAVSNAVEALRRQVRS >LS483299.1|SQE31865.1|2004828_2005944_-|Uncharacterised-protein MTSRSKQLVCKNRYLEGKRKMREPLLDEDELKKWLQTIFTDNLVIIVGSGLSCAEGLPGMGALADRLKERMPECLDDIDKVTWNTISDCLDSEGLEGALLKHQANETIEAAIIKITAEYVLSEEQKAINKCIAENQKLKFSYLLPHISASNPKIARVITTNYDRLIEFAAEYENWGIDSMMVGRYWGKHNPDLSRKLQIRDIRVKGKCPKLVYRDHIKIFKPHGSLDWFMAGDVPMTSCIGKVEEPLIITPGVGKYKKGYGQPFDAHREKANEAIDSASSILCIGYGFNDDHLQTHLTGKIKSGVKTLLLTRGLSENARNVVKEAPNCKSLIFDGDKAGTRVVSKQEETFIPNVHWWDVEFFVKEILENGK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483299_2 | 2.17|1995935|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995935-1995968 | 34 | LS483299.1 | 1969543-1969576 | 0 | 1.0 |
1. spacer 2.17|1995935|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to position: 1969543-1969576, mismatch: 0, identity: 1.0
agtttcaaggcagtttctatcgcttgtaagtcaa CRISPR spacer agtttcaaggcagtttctatcgcttgtaagtcaa Protospacer **********************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483299_2 | 2.7|1995274|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995274-1995308 | 35 | NC_028743 | Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome | 18425-18459 | 0 | 1.0 |
LS483299_2 | 2.14|1995738|33|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995738-1995770 | 33 | NC_028853 | Mannheimia phage vB_MhS_535AP2, complete genome | 16830-16862 | 0 | 1.0 |
LS483299_2 | 2.14|1995738|33|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995738-1995770 | 33 | KP137439 | Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome | 16830-16862 | 0 | 1.0 |
LS483299_2 | 2.14|1995738|33|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995738-1995770 | 33 | NC_028956 | Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome | 16992-17024 | 0 | 1.0 |
LS483299_2 | 2.14|1995738|33|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995738-1995770 | 33 | NC_028743 | Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome | 16817-16849 | 0 | 1.0 |
LS483299_2 | 2.15|1995803|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995803-1995836 | 34 | NC_028743 | Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome | 18494-18527 | 0 | 1.0 |
LS483299_2 | 2.16|1995869|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995869-1995902 | 34 | NC_028853 | Mannheimia phage vB_MhS_535AP2, complete genome | 23300-23333 | 0 | 1.0 |
LS483299_2 | 2.16|1995869|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995869-1995902 | 34 | KP137439 | Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome | 23300-23333 | 0 | 1.0 |
LS483299_2 | 2.16|1995869|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995869-1995902 | 34 | NC_028956 | Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome | 23407-23440 | 0 | 1.0 |
LS483299_2 | 2.16|1995869|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995869-1995902 | 34 | NC_028743 | Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome | 22380-22413 | 0 | 1.0 |
LS483299_2 | 2.7|1995274|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995274-1995308 | 35 | NC_028853 | Mannheimia phage vB_MhS_535AP2, complete genome | 18493-18527 | 2 | 0.943 |
LS483299_2 | 2.7|1995274|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995274-1995308 | 35 | KP137439 | Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome | 18493-18527 | 2 | 0.943 |
LS483299_2 | 2.7|1995274|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995274-1995308 | 35 | NC_028956 | Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome | 18600-18634 | 2 | 0.943 |
LS483299_2 | 2.15|1995803|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995803-1995836 | 34 | NC_028853 | Mannheimia phage vB_MhS_535AP2, complete genome | 18562-18595 | 3 | 0.912 |
LS483299_2 | 2.15|1995803|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995803-1995836 | 34 | KP137439 | Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome | 18562-18595 | 3 | 0.912 |
LS483299_2 | 2.15|1995803|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995803-1995836 | 34 | NC_028956 | Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome | 18669-18702 | 3 | 0.912 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP022446 | Bacillus cereus C1L plasmid pC1L1, complete sequence | 305528-305562 | 6 | 0.829 |
LS483299_1 | 1.1|764519|27|LS483299|CRISPRCasFinder | 764519-764545 | 27 | NZ_CP024444 | Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-1, complete sequence | 88793-88819 | 7 | 0.741 |
LS483299_1 | 1.1|764519|27|LS483299|CRISPRCasFinder | 764519-764545 | 27 | NZ_CP040258 | Moraxella osloensis strain MOXF1 plasmid pMOXF1, complete sequence | 106467-106493 | 7 | 0.741 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP011146 | Bacillus cereus strain FORC_013 plasmid pFORC13, complete sequence | 20980-21014 | 7 | 0.8 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP013038 | Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838E, complete sequence | 8123-8157 | 7 | 0.8 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP019924 | Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_lp36, complete sequence | 12475-12509 | 7 | 0.8 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NC_018986 | Borrelia burgdorferi 297 plasmid 297_lp36, complete sequence | 9276-9310 | 7 | 0.8 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NC_017411 | Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp36, complete sequence | 9628-9662 | 7 | 0.8 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NC_015918 | Borreliella bissettii DN127 plasmid lp28-7, complete sequence | 17878-17912 | 7 | 0.8 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NC_011778 | Borreliella burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp36, complete sequence | 12474-12508 | 7 | 0.8 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NC_001855 | Borreliella burgdorferi B31 plasmid lp36, complete sequence | 12475-12509 | 7 | 0.8 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP019852 | Borreliella burgdorferi plasmid lp36, complete sequence | 12343-12377 | 7 | 0.8 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP019763 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_lp36, complete sequence | 12409-12443 | 7 | 0.8 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP015808 | Borrelia mayonii strain MN14-1539 plasmid lp36 | 17517-17551 | 7 | 0.8 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP017216 | Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_lp36, complete sequence | 10057-10091 | 7 | 0.8 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP015793 | Borrelia mayonii strain MN14-1420 plasmid lp36, complete sequence | 17517-17551 | 7 | 0.8 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NC_019358 | Clostridium perfringens plasmid pCP8533S12 DNA, complete sequence | 9440-9474 | 7 | 0.8 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_MK275624 | Clostridium perfringens strain JXJA17 plasmid p6, complete sequence | 7385-7419 | 7 | 0.8 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP013045 | Clostridium perfringens strain JP55 plasmid pJFP55K, complete sequence | 8006-8040 | 7 | 0.8 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | KP836355 | Marinitoga camini virus 1, complete genome | 4240-4274 | 7 | 0.8 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | AY082070 | Bacteriophage phi3626, complete genome | 30251-30285 | 8 | 0.771 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NC_003524 | Clostridium phage phi3626, complete genome | 30251-30285 | 8 | 0.771 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP040855 | Lactobacillus johnsonii strain G2A plasmid unnamed1 | 71361-71395 | 8 | 0.771 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP040855 | Lactobacillus johnsonii strain G2A plasmid unnamed1 | 71340-71374 | 8 | 0.771 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP013040 | Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838C, complete sequence | 17585-17619 | 8 | 0.771 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_KT020842 | Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJP838B, complete sequence | 41383-41417 | 8 | 0.771 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NC_011412 | Clostridium perfringens plasmid pCP8533etx, complete sequence | 3532-3566 | 8 | 0.771 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NC_010937 | Clostridium perfringens plasmid pCW3, complete sequence | 26111-26145 | 8 | 0.771 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP009558 | Clostridium perfringens strain FORC_003 plasmid pFORC3, complete sequence | 38268-38302 | 8 | 0.771 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NC_019687 | Clostridium perfringens plasmid pCpb2-CP1, complete sequence | 15880-15914 | 8 | 0.771 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NC_019688 | Clostridium perfringens plasmid pNetB-NE10, complete sequence | 16446-16480 | 8 | 0.771 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NC_008014 | Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3, complete sequence | 174908-174942 | 8 | 0.771 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | LN835295 | Clostridium perfringens plasmid pJIR4150, complete sequence, strain JIR12708 | 16932-16966 | 8 | 0.771 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NC_020130 | Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3, complete sequence | 174930-174964 | 8 | 0.771 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP023413 | Clostridium perfringens strain LLY_N11 plasmid pLLY_N11_3, complete sequence | 2837-2871 | 8 | 0.771 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_AP017631 | Clostridium perfringens strain CBA7123 plasmid pCBA7123-01, complete sequence | 2838-2872 | 8 | 0.771 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NC_019257 | Clostridium perfringens plasmid pJIR3844, complete sequence | 16428-16462 | 8 | 0.771 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NC_019259 | Clostridium perfringens plasmid pJIR3537, complete sequence | 16817-16851 | 8 | 0.771 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NC_015712 | Clostridium perfringens plasmid pCPPB-1, complete sequence | 43188-43222 | 8 | 0.771 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | AP014503 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S42-C30, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 2 ordered pieces | 17692-17726 | 8 | 0.771 |
LS483299_2 | 2.9|1995407|33|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995407-1995439 | 33 | CP016281 | Clostridium tyrobutyricum strain W428 plasmid pW428, complete sequence | 55015-55047 | 9 | 0.727 |
LS483299_2 | 2.9|1995407|33|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995407-1995439 | 33 | NZ_CP014171 | Clostridium tyrobutyricum strain KCTC 5387 plasmid pCTK01, complete sequence | 44553-44585 | 9 | 0.727 |
LS483299_2 | 2.10|1995472|33|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995472-1995504 | 33 | CP016281 | Clostridium tyrobutyricum strain W428 plasmid pW428, complete sequence | 55015-55047 | 9 | 0.727 |
LS483299_2 | 2.10|1995472|33|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995472-1995504 | 33 | NZ_CP014171 | Clostridium tyrobutyricum strain KCTC 5387 plasmid pCTK01, complete sequence | 44553-44585 | 9 | 0.727 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP022446 | Bacillus cereus C1L plasmid pC1L1, complete sequence | 305525-305559 | 9 | 0.743 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NC_009966 | Fluoribacter dumoffii Tex-KL plasmid pLD-TEX-KL, complete sequence | 65008-65042 | 9 | 0.743 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP053307 | Spiroplasma citri strain C5 plasmid pScpC5-3, complete sequence | 2943-2977 | 9 | 0.743 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP037428 | Myroides odoratimimus strain G13 plasmid pFM-G13, complete sequence | 21598-21632 | 9 | 0.743 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | JX569801 | Campylobacter phage CP30A, complete genome | 15952-15986 | 10 | 0.714 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NC_015679 | Blattabacterium sp. (Blattella germanica) str. Bge plasmid pBge, complete sequence | 1613-1647 | 10 | 0.714 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | MK448599 | Streptococcus satellite phage Javan651, complete genome | 3402-3436 | 10 | 0.714 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NC_007773 | Clostridium perfringens plasmid pCPF5603, complete sequence | 243-277 | 11 | 0.686 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP013039 | Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838D, complete sequence | 48303-48337 | 12 | 0.657 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP025502 | Clostridium perfringens strain EHE-NE18 plasmid pJIR3535, complete sequence | 4995-5029 | 12 | 0.657 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP025503 | Clostridium perfringens strain EHE-NE18 plasmid pJIR3844, complete sequence | 11610-11644 | 12 | 0.657 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP025504 | Clostridium perfringens strain EHE-NE18 plasmid pJIR3537, complete sequence | 43646-43680 | 12 | 0.657 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | CP031285 | Escherichia fergusonii strain 40A plasmid p46_40A, complete sequence | 25766-25800 | 12 | 0.657 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | NZ_CP022502 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Kentucky str. SA20030505 plasmid unnamed2, complete sequence | 35202-35236 | 12 | 0.657 |
LS483299_2 | 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1995537-1995571 | 35 | MN693472 | Marine virus AFVG_25M86, complete genome | 12077-12111 | 12 | 0.657 |
1. spacer 2.7|1995274|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcagttttaacttccgtgagccatacgttacaggt CRISPR spacer gcagttttaacttccgtgagccatacgttacaggt Protospacer ***********************************
2. spacer 2.14|1995738|33|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_028853 (Mannheimia phage vB_MhS_535AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caggggctttccagatgaacgcaaacaaaaaga CRISPR spacer caggggctttccagatgaacgcaaacaaaaaga Protospacer *********************************
3. spacer 2.14|1995738|33|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caggggctttccagatgaacgcaaacaaaaaga CRISPR spacer caggggctttccagatgaacgcaaacaaaaaga Protospacer *********************************
4. spacer 2.14|1995738|33|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caggggctttccagatgaacgcaaacaaaaaga CRISPR spacer caggggctttccagatgaacgcaaacaaaaaga Protospacer *********************************
5. spacer 2.14|1995738|33|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caggggctttccagatgaacgcaaacaaaaaga CRISPR spacer caggggctttccagatgaacgcaaacaaaaaga Protospacer *********************************
6. spacer 2.15|1995803|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atacttctgttccggtccaaatcggaatcgcacg CRISPR spacer atacttctgttccggtccaaatcggaatcgcacg Protospacer **********************************
7. spacer 2.16|1995869|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_028853 (Mannheimia phage vB_MhS_535AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caacacccgatttgtcaatagctccgtttggctg CRISPR spacer caacacccgatttgtcaatagctccgtttggctg Protospacer **********************************
8. spacer 2.16|1995869|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caacacccgatttgtcaatagctccgtttggctg CRISPR spacer caacacccgatttgtcaatagctccgtttggctg Protospacer **********************************
9. spacer 2.16|1995869|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caacacccgatttgtcaatagctccgtttggctg CRISPR spacer caacacccgatttgtcaatagctccgtttggctg Protospacer **********************************
10. spacer 2.16|1995869|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_028743 (Mannheimia phage vB_MhS_587AP2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caacacccgatttgtcaatagctccgtttggctg CRISPR spacer caacacccgatttgtcaatagctccgtttggctg Protospacer **********************************
11. spacer 2.7|1995274|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_028853 (Mannheimia phage vB_MhS_535AP2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
gcagttttaacttccgtgagccatacgttacaggt CRISPR spacer gcagttttaacttccgtgagccatacatcacaggt Protospacer **************************.*.******
12. spacer 2.7|1995274|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
gcagttttaacttccgtgagccatacgttacaggt CRISPR spacer gcagttttaacttccgtgagccatacatcacaggt Protospacer **************************.*.******
13. spacer 2.7|1995274|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
gcagttttaacttccgtgagccatacgttacaggt CRISPR spacer gcagttttaacttccgtgagccatacatcacaggt Protospacer **************************.*.******
14. spacer 2.15|1995803|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_028853 (Mannheimia phage vB_MhS_535AP2, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
atacttctgttccggtccaaatcggaatcgcacg CRISPR spacer agacttccgtgccggtccaaatcggaatcgcacg Protospacer * *****.** ***********************
15. spacer 2.15|1995803|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KP137439 (Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
atacttctgttccggtccaaatcggaatcgcacg CRISPR spacer agacttccgtgccggtccaaatcggaatcgcacg Protospacer * *****.** ***********************
16. spacer 2.15|1995803|34|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_028956 (Mannheimia phage vB_MhS_1152AP2, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
atacttctgttccggtccaaatcggaatcgcacg CRISPR spacer agacttccgtgccggtccaaatcggaatcgcacg Protospacer * *****.** ***********************
17. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP022446 (Bacillus cereus C1L plasmid pC1L1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer ataaatattatatttttttaaaaaaattttatata Protospacer ******** ***** ************ * * **
18. spacer 1.1|764519|27|LS483299|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024444 (Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
aaataatttgacagctatttctagttt CRISPR spacer caataatttgacagctattttgacaaa Protospacer *******************. *
19. spacer 1.1|764519|27|LS483299|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040258 (Moraxella osloensis strain MOXF1 plasmid pMOXF1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
aaataatttgacagctatttctagttt CRISPR spacer caataatttgacagctattttgacaaa Protospacer *******************. *
20. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP011146 (Bacillus cereus strain FORC_013 plasmid pFORC13, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer ttacatataatattattttaaacaaataaaatgtt Protospacer ** ****************** ***** * * *
21. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP013038 (Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838E, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta- CRISPR spacer cttaatataataatattttaaaaatata-ataatag Protospacer * ********* *********** *** ** **
22. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP019924 (Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_lp36, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
---ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer tctataaa---aattttattttaaaaaaagatatttat Protospacer ***** *** ************** ******
23. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_018986 (Borrelia burgdorferi 297 plasmid 297_lp36, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
---ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer tctataaa---aattttattttaaaaaaagatatttat Protospacer ***** *** ************** ******
24. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_017411 (Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp36, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
---ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer tctataaa---aattttattttaaaaaaagatatttat Protospacer ***** *** ************** ******
25. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_015918 (Borreliella bissettii DN127 plasmid lp28-7, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
---ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer tctataaa---aattttattttaaaaaaagatatttat Protospacer ***** *** ************** ******
26. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_011778 (Borreliella burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp36, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
---ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer tctataaa---aattttattttaaaaaaagatatttat Protospacer ***** *** ************** ******
27. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_001855 (Borreliella burgdorferi B31 plasmid lp36, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
---ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer tctataaa---aattttattttaaaaaaagatatttat Protospacer ***** *** ************** ******
28. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP019852 (Borreliella burgdorferi plasmid lp36, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
---ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer tctataaa---aattttattttaaaaaaagatatttat Protospacer ***** *** ************** ******
29. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP019763 (Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_lp36, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
---ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer tctataaa---aattttattttaaaaaaagatatttat Protospacer ***** *** ************** ******
30. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP015808 (Borrelia mayonii strain MN14-1539 plasmid lp36) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
---ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer gctataaa---aattttattttaaaaaaagatatttat Protospacer ***** *** ************** ******
31. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP017216 (Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_lp36, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
---ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer tctataaa---aattttattttaaaaaaagatatttat Protospacer ***** *** ************** ******
32. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP015793 (Borrelia mayonii strain MN14-1420 plasmid lp36, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
---ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer gctataaa---aattttattttaaaaaaagatatttat Protospacer ***** *** ************** ******
33. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_019358 (Clostridium perfringens plasmid pCP8533S12 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta- CRISPR spacer cttaatataataatattttaaaaatata-ataatag Protospacer * ********* *********** *** ** **
34. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_MK275624 (Clostridium perfringens strain JXJA17 plasmid p6, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta- CRISPR spacer cttaatataataatattttaaaaatata-ataatag Protospacer * ********* *********** *** ** **
35. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP013045 (Clostridium perfringens strain JP55 plasmid pJFP55K, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta- CRISPR spacer cttaatataataatattttaaaaatata-ataatag Protospacer * ********* *********** *** ** **
36. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KP836355 (Marinitoga camini virus 1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta- CRISPR spacer acaaatataatattattttgataaaat-tgtgtaaa Protospacer *.*****************.* ***** *.* * *
37. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to AY082070 (Bacteriophage phi3626, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer tgtgagataatattattgtaaaaaaatattttttt Protospacer .* *********** *********** ****
38. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_003524 (Clostridium phage phi3626, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer tgtgagataatattattgtaaaaaaatattttttt Protospacer .* *********** *********** ****
39. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP040855 (Lactobacillus johnsonii strain G2A plasmid unnamed1) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer ttttttctaatataattttataaaaatatattttt Protospacer * * ****** ****** *************
40. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP040855 (Lactobacillus johnsonii strain G2A plasmid unnamed1) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer actaagtaaatataattttataaaaatatattttt Protospacer *. ** ***** ****** *************
41. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP013040 (Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838C, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer agacactaaattttattttaaaataatatattttt Protospacer * * *. *** *********** **********
42. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_KT020842 (Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJP838B, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer agatactaaattttattttaaaataatatattttt Protospacer * * *. *** *********** **********
43. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_011412 (Clostridium perfringens plasmid pCP8533etx, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer agacactaaattttattttaaaataatatattttt Protospacer * * *. *** *********** **********
44. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_010937 (Clostridium perfringens plasmid pCW3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer agacactaaattttattttaaaataatatattttt Protospacer * * *. *** *********** **********
45. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP009558 (Clostridium perfringens strain FORC_003 plasmid pFORC3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer agacactaaattttattttaaaataatatattttt Protospacer * * *. *** *********** **********
46. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_019687 (Clostridium perfringens plasmid pCpb2-CP1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer agacactaaattttattttaaaataatatattttt Protospacer * * *. *** *********** **********
47. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_019688 (Clostridium perfringens plasmid pNetB-NE10, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer agacactaaattttattttaaaataatatattttt Protospacer * * *. *** *********** **********
48. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_008014 (Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer ttatttataatattattaaaaaaaaatatagatga Protospacer ** ************ *********** * *
49. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to LN835295 (Clostridium perfringens plasmid pJIR4150, complete sequence, strain JIR12708) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer agacactaaattttattttaaaataatatattttt Protospacer * * *. *** *********** **********
50. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_020130 (Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer ttatttataatattattaaaaaaaaatatagatga Protospacer ** ************ *********** * *
51. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP023413 (Clostridium perfringens strain LLY_N11 plasmid pLLY_N11_3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer agatactaaattttattttaaaataatatattttt Protospacer * * *. *** *********** **********
52. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_AP017631 (Clostridium perfringens strain CBA7123 plasmid pCBA7123-01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer agatactaaattttattttaaaataatatattttt Protospacer * * *. *** *********** **********
53. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_019257 (Clostridium perfringens plasmid pJIR3844, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer agacactaaattttattttaaaataatatattttt Protospacer * * *. *** *********** **********
54. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_019259 (Clostridium perfringens plasmid pJIR3537, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer agacactaaattttattttaaaataatatattttt Protospacer * * *. *** *********** **********
55. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_015712 (Clostridium perfringens plasmid pCPPB-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer agacactaaattttattttaaaacaatatattttt Protospacer * * *. *** *********** **********
56. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to AP014503 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S42-C30, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 2 ordered pieces) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer ataaatataatataattataaaaaaagagggtaaa Protospacer ************* *** ******** * . * *
57. spacer 2.9|1995407|33|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to CP016281 (Clostridium tyrobutyricum strain W428 plasmid pW428, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
aaaactaataatctaatatcaaaaaaagcatta CRISPR spacer ataactcataatctaatttcaaaaaatcacctc Protospacer * **** ********** ******** .*
58. spacer 2.9|1995407|33|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP014171 (Clostridium tyrobutyricum strain KCTC 5387 plasmid pCTK01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
aaaactaataatctaatatcaaaaaaagcatta CRISPR spacer ataactcataatctaatttcaaaaaatcacctc Protospacer * **** ********** ******** .*
59. spacer 2.10|1995472|33|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to CP016281 (Clostridium tyrobutyricum strain W428 plasmid pW428, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
aaaactaataatctaatatcaaaaaaagcatta CRISPR spacer ataactcataatctaatttcaaaaaatcacctc Protospacer * **** ********** ******** .*
60. spacer 2.10|1995472|33|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP014171 (Clostridium tyrobutyricum strain KCTC 5387 plasmid pCTK01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
aaaactaataatctaatatcaaaaaaagcatta CRISPR spacer ataactcataatctaatttcaaaaaatcacctc Protospacer * **** ********** ******** .*
61. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP022446 (Bacillus cereus C1L plasmid pC1L1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer tcctatataaaatttttttaaaaaaatataatatt Protospacer . ****** *** *************** * *
62. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_009966 (Fluoribacter dumoffii Tex-KL plasmid pLD-TEX-KL, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer ttaaaaataatattatttttaaaaaattaacctgc Protospacer **** ************* ******* *..*
63. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP053307 (Spiroplasma citri strain C5 plasmid pScpC5-3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer ttcatatttatattattttcaaaaaatttattttn Protospacer * * * ********** ******* ******
64. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP037428 (Myroides odoratimimus strain G13 plasmid pFM-G13, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer ttcattataatattattttatacaaatatagcatt Protospacer * * *************** * ******* . *
65. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to JX569801 (Campylobacter phage CP30A, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer gattctataataatattttaaagaaatatattact Protospacer . ******* *********.********* .
66. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_015679 (Blattabacterium sp. (Blattella germanica) str. Bge plasmid pBge, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
ataaatataatattattttaaaaaaatatatttta CRISPR spacer agaagtataatattatgttaaaaaaatgcaaggat Protospacer * **.*********** **********..*
67. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MK448599 (Streptococcus satellite phage Javan651, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
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68. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_007773 (Clostridium perfringens plasmid pCPF5603, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
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69. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP013039 (Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838D, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.657
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70. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP025502 (Clostridium perfringens strain EHE-NE18 plasmid pJIR3535, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.657
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71. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP025503 (Clostridium perfringens strain EHE-NE18 plasmid pJIR3844, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.657
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72. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP025504 (Clostridium perfringens strain EHE-NE18 plasmid pJIR3537, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.657
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73. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to CP031285 (Escherichia fergusonii strain 40A plasmid p46_40A, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.657
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74. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP022502 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Kentucky str. SA20030505 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.657
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75. spacer 2.11|1995537|35|LS483299|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN693472 (Marine virus AFVG_25M86, complete genome) position: , mismatch: 12, identity: 0.657
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
158570 : 181163
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483299|158570:181163|DBSCAN-SWA TTTGTCAGCAGAGAATGATGCTGAAATTATTTTATCCGGTCGCCCGATTCCATATGCACGCCAAGTTCTTGATGAAAATAAAAAAACAATTAATAAGGAAATTATAAAAGAAGGTGAATGGATTAATCGAACCTTTAGCGCAACAACCTTTCAAGCTAAGGATAATGGGAAAATTGAAGTTAGCCGTAATGTAGTTGAAGTAAACGGTAATTTTAATTTGAGTGACAATGCAACAGCTCAAGTTGGTTTCACACAGGGGAAATCTCAATCATGTGTTCGTTCGGATCGTACCGGCATAGCAAGTTGTAATTTATCTGTGTTATCTGATAAGGATTTACATAGTTGGCAACGCACTACAGTCAATAGTGATATTAAATTAACTCAGAATGCACGTTTTGAATTAGGTAGTAAGGCTGATCTTATTGGGACAATTGAAAGCAATGGCGATAGCCAAATAAACTTGCGAAATGGTTCTAGCTGGGTAATGACAGGAAACAGCAATGTCAATAAATTGAATGTAGATAATGCGACAATCACCTTAGACAATAATGTGGGTGAGCCAAATACTTTAAATATTAATAGCCTTAGCGGAAGTGGGGTTATTAACTTTATCACTTACTTTGCTCAAACAATAAGTGATTTGATAAATGTAGAGCATGCAAGCGGTGCTTTTAAGGCAAAAATTTCCCAAATTGGCACACCCACTAATGATCAGAAAATCAAATTATTAGAAACAAAATCAGAGAATAACTTTAATTTTACTTTAGATGACTCTGATATTGTGAGGGGAGATTTTCGTTATACATTAAAAAAAGAGGGGTTAGCTTACTATTTAAGCCCAGAAAAAACAGAATAGGCTAAAGCAAGAGAAGAAGCCGCACGCAAAGCTGCAGAAGAGGCGGAAAAAGCACGCCTTGCTCAAGAAGCCGCACGTAAAGCCGCAGAAGAGGCAGAAAAAGCACGCCTTGCGCAAGAAGAAGCTGCACGCAAAGCTGCGGAAGAGGCAGAAAAAGCTCGTTTTGCGCAAGAAGAAGCCGCACGTAAAGTTGCAGAAGAGGCAGAAAAAGCCCGTCTTGCGCAAGAAGAAGCTGCACGTAAAGCTGCAGAGGAAGCTGGAAAAACCAGAGCTGTGTCTCTTAGTTCAGAACTTGCTGCACAAACTAATGCTGTTTTAGGTGTGACTTCTGCATTAGATCTTTTAGTTCGTAAAGATAAAGATGAGCGAGCTAATGTTTGGTCGAAATATGAATATCAAACAACAAAATATCAGTCTGGAAATAGTGCTTTCAAACAAGATTTCAGCTTGGTACAAGTTGGAGCAGAGAAATATTTGGGTGATCATAACCTGGTTATTGGTACTATCCTATCTCAATCCAGAGCGAATAATGATTTTCAGAACTACTATAATGGTAAAGGGGATTTAACTATGTTTTCTTTTTATGGTAAGAAAACATGGGAAAATGGCATTTATGTAGGGATTGATGGTAGCATTGGGCGTGCGAATAACAAATTAAGCCATCAAAGCCAGACGATAAAACTAGCCAGAAATGTATATTCTTTAGGATTAACGGTAGGTAAAACGTTGGAAGTTGCAAGTTTTAACCTACAACCGTCATTTGGTATGCGCTATCATCATTTAACATCTGCAAATGCCCAATTAGAGAACACAAAATTTGAGACTGATAGGGTAGATCTTTTGGCCATTCAAGCTGGTTTAGCATTAAATAAAACTTTTATATTTAATGAATTAAGGGTAAAACCTGAATTAGGAAGCTATTTTGTTGATGCAAGCCACGGAACACTTAAAACTAAGTTAAATGAATTTTCCTTAAATCAAAATATAGGCCGTTATTTTAAGCAAGAAGTAGGGATTACACTCCACTATAAAGGGGTATCAAGTTCGGTACATGCTGGCTTTACAAAAGGAAATACATTACAAGAACAAAAATTCATTTCACTCAAAGCGGTTATAGCCTTGTTTCGTTACCTCGATAAAATCTGACTCTATCAACTCTTTAATAGCATTTCTGAGTGTCCTGTCGCTGATATTGAGCATTTTAGCCTGTTCTTCATTTTGCTGAAATACAATAGCTCCGTTATTAAAGCCTGTATATCTGCCACAAAAAGCAATAAATACAACTTTTGCGGATAGGCTTAAGGAATTAAATTCAATGCTTGCTACTAAGTCGTGTCTTAACGGTGTAAAGCTGTTACCGTTTAATTTGCTTTGTAGCCCGCTTTTTCCCGCTCTCCCTTTGCTTTTTTCATAGCTTGCCATAGTTACCCCTATCCCTTGGGTAATCTCGCAACTAAGAGCGGTTTAGGGGCATTTCCTACGGTATTGAATTTTGCCATAGCTTCCGCCAACGATTTAGCATAAATCAGAATGTTAATCCGCTTTGTGCCTGTAGTTTTGAATTTGTATATCATTTCCCGCCTCCTTTCGCCTCTGTTGGCGGTGTGGCTAGTAGTTCCTCAATCTCGCAATAAACCTCTTCAAGCTCGGTCATCTCTTCGCTCATTGTGGCTGTAATGAATGCCAGTACGTCTTGATATTCGCTATTTTCTACCTTGTTAGGGTCAAGGCGGGAAATAAGATTGCTTACAGTATTGATCCGCAATCGGTGCAGAATTAAGCAATAAAAAAGCCGTTAATATCAATCAACGGCTATTTGAATGTGAGGTTTTGGCAGGTAACAAGTGATAAGTTTAGCCGTTTTTGACTTGTGGAATAAGCACTAAATTGAATGCCCCTAGAATTTTTTGAATAGTGTCAAAGCGTGGTTTGCTGCCTTTGGCTAGGGTTTTATATAGGCTCTCTCTCCCTAGCCCTGTTTGCTTGGCAAGCTCCGCCATTCCTCTTGCCCTTGCCACATCGTTCAAGGCTTCTAAAAATTCGTCTTGGTCGCCCTCTTTTAACACTTCCGCTAAATAGGCTTGAATAGTTGCCTCATCGGTTAAAAACTCCGCCACGTCAAAAGGGCGTAAACCGTGCTTTTCTGCTGCCTGTTCATTGATTTGTATTGTTTCCATTGCTTTCCCCTGTAGTTTTTAATTCAGCCCATAATGCTTTCGCTTTCTCTATATCGGCTTGCTGTGTTGATTTATCGCCGCCGTGTAACAAGATATAAATTACATTTCCTTGTTGTGCGTAATAAATTCTATATCCGGCTCCTGTTGCTATCCGCATTTCATAAAGTCCGCCTGTACCGGCTAAAGATTTATGATCGCCAAAGTTGCCATTAATCGCATTTTTTATCCGCCTTGCTACCGTTGCTTTTGCGATAGGGTTCTTTAAATTCTCAAGCCATTTTGAAAAATTATCGGTAATGATGATTTGATTAGTGGTTTGCTCTGTCATTGCCAGCCTCTTATTCTATTTATTGCTTAGTGTATCCATTAAGATACAAATAATCAAGTGGTTAAATTTTGAAAAGAGAGCAGTTTCAATTATTCATATCATTGAACATTGTTCACGCTTTTAAATTATGTAGCATAAAATTACAATTTGGGTAGATTTGGATTTTTATCAAAAATCACTTTTCCAAAACACTTTTATAAAATATAGAAAAAAGTATAGGACAATTCTAGGATTTTCAACGGTTCATCGCCTCTAAAATTGTCCTATTGGCATATAACAATATAGGACAATTCTAGGACAAAATAGTAAACTGTTCATTTTTTGATAGGACAAAAACCCCTAAAATAGGACAAAAACACCCTAAAATAGGACAATTTTAGCGTTAATAGGACAAAAATTTAATGTTAAATCATTGATATATAAAGGTTTAGTAAAAATTGTCCTAATTGTCCTATAAAAAAACAGCTATTTTTCTATATGATTTTTTTATGATTGTTTGGCGGAATTTTGGTTGAAATTTAAATGTAAATTATATGCTTCATAATTTCATGCTTTATGGGTTTTGTGATTGCGATCATGATACATATTAAAGAGGTTTCAGGACGATATAAAAAAGGCTCTCTAAATAGATTAGAAAGCCTTGATATTGTATGCGGTTAATGCGTACATCATCGCCTAGGTATGTGAGTATGCTTTCGGTCATTGTTTCCCCCGTATGGTGTAAATGTTGGAATGCTTAAACCGTGAAAAGGCGTAAGCGGTACGGAGCGGATTTTGACGGGGAGAGAAAATAAAAATAATGCCCTGTGCTTGTTAAAGTCAGGGCATAGCTTGAATAAATCAGGTCTTAGCTAGTAGAACTCATATCTAAATATGCGATCCTTTTAGCCAGTTATGGCGGACAGTCTGAAATGAAACGGGATAAGTTTCGGCAATCGTTAAAGCAAAAGCAGTTTTACTTGCTTTTGTTCCGTGTTTGGCTTTGTAGCTTTTCCATAAGTCTAACACTTTGGCTTTTATTTTTCGGGTTTGCTCGTGTCGCTTATTTCCCCCTTTTCTCGCATTTGAGCTAAGAACTTTTTTATAATTGTATCCTCCATTTCTGCGTTTACTTCTTTTTGTTTTAGTTCTTTTGTTATATCTAGGGAAATGAAAGCACCCGTTACTTCTCTAAAAATCTTTTCTTTACTCATTTCCAAAAAATTATTTAAATCATCATAATCAGAAAATGATTGTATTTTATGGAAGTGTTCAAGCTGAACTTCTTTATTATTCAATCTCAAAATTCTATTTATATAATTAAGGGCAAGAAGTGCGAAAATTTCATACTTTTTGTAATCTTTTATATTGTCATCTTTTATATTGTCATCTTTTAGATAGTCTATGCCATATTCTTTTAAATATAATTCTAGTATTTCAAAACTATCATAAGAATAATAATTAGGGAGGTTGAAATAATCACAAAACTCATCATGTTTAAAACAAGAATAATCAAAGGGTTCTGTTTCAAATACATCATCAAAAAATAATTCGACTTTTTCAGGTTCTCTATTCACAAATTCCTTTGCTTTTAGCCTATATTCTTCTTCTTTCTCCGCTGGGTAGAATGTGTTTATATCCAAAATCCAATCATCAAATA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483299|158570:181163|172166_172301_-|SQE29856.1|DBSCAN-SWA MTTQNQNIVFTYDEEQALNFDKCTEQEKEEYKKQFQEELNNADD >LS483299|158570:181163|176730_177753_-|SQE29863.1|capsid|DBSCAN-SWA MRNETRLKFNSYREAVAQANGLTAADTDKKFTVSPSVQQILETKTQESSAFLQMINIVPVTEQQGEVLGLGAASTLASTTDTTKQNRETQSIVSLQSIPYHCQQINYDSHLTYGQLDQWAKFPDFAARIAQVKQNRIALDRIMIGFNGVRREKTSNRTANALLQDVAVGWLQKIRNEASTHNMTEVEEGTGKIYVGKGQAYQTLDALVFDAVTDLIHPQFHDDLQLVAIMGRDLLADKYFPLLNDQKATEQLAADTIISQKRVGGLSAIRVPSVPAGTILITRLDNLSIYYQEEAMRRNIVDNSSRDRVEDYLSSNDAFVIENYDCVALLENIEFKDKTN >LS483299|158570:181163|167785_168052_-|SQE29852.1|DBSCAN-SWA MNKITFTGKADKQLSKIDSRYIPAIIEAIESLALFPNVEKDIKRLQGYISRFRMRVGRYRVIFDWLEGEPRIIEIQTIAKRDERTYAH >LS483299|158570:181163|179963_181163_-|SQE29866.1|integrase|DBSCAN-SWA MASVKLTDKIIRSLKPEQIKGDFVENLYIKANKAAGSFSWLYKFTNPHNKAQRQKIILGRYPLTSIDFARKIAMEYNALVKQGIHPIEHQAQQEQQKEIEAMTFKDITSLYREFRADSVKNVDDAIRRVEMYIFPKFGDLPLNKISLAEWHRTLKPMEVGKNNTLLKICSTSKQILDYAQTCGYIDFNPLTTLRASFRKKKAKHNPTIEPKRLAEFIRDLFLSDVERSTKLSIEFQLLTATRPNETAKAKWAEIDFKNRLWKLPADKMKTGKPHIITLNTQALALLEDMKRFTGDREYIFSSSRSKTGHQSTQTANNAIKSIQGGKYHSVLTSHGLRSVFSTYLNGLHDPMIHNVHIDACLAHVVGNGVSRAYNHSIHEEQKRYIMQKWGDYIEQCKHP >LS483299|158570:181163|178510_179188_-|SQE29865.1|DBSCAN-SWA MQEKIDGFRQANAAFSAGYQHLTSLKEELNRQEKILIGLDAEISNLQAVQSKSENSEDVPNASVFLKHYQKEQELIAKRSGIRQFIQQISHNIEVLTLDLAEKKRWLINLHSELMEGLGGAMIEELAAQIAPTLRNAILTIQKSANFAEFLRNRENILRKNIDPFDYLMNVFIETLTEKARSDTGEAQDDGILKYQLNFNELDEIPDISPIKLQQKRQALQQSTY >LS483299|158570:181163|176080_176725_-|SQE29862.1|terminase|DBSCAN-SWA MRPTKKFALKMNALVAHKGDFNSPADYSGYDLMLMALRRHKRELKNIQSNERKATFKRSILPEFLPWIDGVLKADSGKQDDVLMTWLIWSIDCNEYQTAVKIAEYALKYDLAPPENFNRTLATIIAEEFATKALFIREEDRAYFLVYLCKIKQLTDDKDMPDPARAKLYKMIGLFSEENAPKTALSVLTRAIELDPYVGVKTVIKRLKKKLSLL >LS483299|158570:181163|159698_160571_+|SQE29840.1|DBSCAN-SWA MSLSSELAAQTNAVLGVTSALDLLVRKDKDERANVWSKYEYQTTKYQSGNSAFKQDFSLVQVGAEKYLGDHNLVIGTILSQSRANNDFQNYYNGKGDLTMFSFYGKKTWENGIYVGIDGSIGRANNKLSHQSQTIKLARNVYSLGLTVGKTLEVASFNLQPSFGMRYHHLTSANAQLENTKFETDRVDLLAIQAGLALNKTFIFNELRVKPELGSYFVDASHGTLKTKLNEFSLNQNIGRYFKQEVGITLHYKGVSSSVHAGFTKGNTLQEQKFISLKAVIALFRYLDKI >LS483299|158570:181163|163725_164520_-|SQE29845.1|DBSCAN-SWA MTAEKSSATQLTEFLPIVTQRHQGEIKQLVDGRQLWQFLESKQHFADWIIKAIEAGFFERNKDYFTFHKIMNRKLGVRGASKRNEYLLTVSMAKELAMLERNEQGKLARRYFIQCEERLSQLAPNDVIQYRQQWHKDREAVKTPFKRMCNSLEQAREREGKATSRKHYINEAKMLINVLLGMNVHHWRQAHNIIGDTRNALNIEQLLKLEYLEQADSLLLDMGIKAAYDRGEHLEQRFKLLQVWADFVEECSQGSLPQYHLKVA >LS483299|158570:181163|173409_173613_-|SQE29859.1|DBSCAN-SWA MQNFAYSFLCVNRTAEIYQEEVIRVIANSEENARFQLTADYRLLLAHPVSKIRLNSTACTVKGGIYA >LS483299|158570:181163|172338_172533_-|SQE29857.1|DBSCAN-SWA MLTHKTTLPNGTVIEFFDNTGDGEFFDFLGLPTEQKRHFQAKNHRMQAVKKARKTAKLARRKNR >LS483299|158570:181163|161278_161602_-|SQE29842.1|DBSCAN-SWA METIQINEQAAEKHGLRPFDVAEFLTDEATIQAYLAEVLKEGDQDEFLEALNDVARARGMAELAKQTGLGRESLYKTLAKGSKPRFDTIQKILGAFNLVLIPQVKNG >LS483299|158570:181163|164531_164768_-|SQE29846.1|DBSCAN-SWA MTESTITHLAGDVRILRPTHARQKLGVGKTTFQDWQNPKSKRYRPDFPKKIQLGANSVGYLESEINAFIHSLANSRTV >LS483299|158570:181163|160523_160847_-|SQE29841.1|DBSCAN-SWA MASYEKSKGRAGKSGLQSKLNGNSFTPLRHDLVASIEFNSLSLSAKVVFIAFCGRYTGFNNGAIVFQQNEEQAKMLNISDRTLRNAIKELIESDFIEVTKQGYNRFE >LS483299|158570:181163|161579_161930_-|SQE29843.1|DBSCAN-SWA MTEQTTNQIIITDNFSKWLENLKNPIAKATVARRIKNAINGNFGDHKSLAGTGGLYEMRIATGAGYRIYYAQQGNVIYILLHGGDKSTQQADIEKAKALWAELKTTGESNGNNTNQ >LS483299|158570:181163|166572_167160_-|SQE29850.1|DBSCAN-SWA MFDELKTAQATAYLLHKAGGTMEHIKAMKLLYLADRLSWQRYGYSISNDEYYSLPYGPVLSNTLNLMRGEEASLYQKASIWGEWIADKEDHKISLKKTVDTEDEYFFDCLSESDAEILDEVFATFGNYKPFALVEYTHNPKYIPEWEDPQGRSKPISLVTLLAKLGKTPNEIKSILEQQAEKGAMDNLFKGLGNA >LS483299|158570:181163|177767_178490_-|SQE29864.1|capsid|DBSCAN-SWA MAKQSKFFRVAKAGATTDGRKISPEWIEQMAKHYNPKVFQARISIEHIKGLHPNSDFRNMGDVLALKTEKDGKDLYLLAQIAPTDELIAYTKAKQKNFTSIEVNPRFADTGEAYLVGLAVTDNPASLGTDYLEFAAKHSNANVFNARKTDPQNVIVEAVEFTAQWEDVPDPEPAVDVAQFNALFTDFQQLKAENAAMKQELEAIKAEFAEIEKQPAIGYTPRPKATGTSPTATTDKYFSF >LS483299|158570:181163|167344_167743_-|SQE29851.1|DBSCAN-SWA MKPYQTIKDTNGNDLFVLVPVEEFEQLTGGNLYGFPYDDETDDDLVEVEYDKDEFDNVTIPFEVVKIKLEQNINSLGAWRIYRNLSQQEVAEKTGLSQSAISQAERKGNRPQKRTREKLAKIYGCTPEQLAV >LS483299|158570:181163|158570_159425_+|SQE29839.1|protease|DBSCAN-SWA MSAENDAEIILSGRPIPYARQVLDENKKTINKEIIKEGEWINRTFSATTFQAKDNGKIEVSRNVVEVNGNFNLSDNATAQVGFTQGKSQSCVRSDRTGIASCNLSVLSDKDLHSWQRTTVNSDIKLTQNARFELGSKADLIGTIESNGDSQINLRNGSSWVMTGNSNVNKLNVDNATITLDNNVGEPNTLNINSLSGSGVINFITYFAQTISDLINVEHASGAFKAKISQIGTPTNDQKIKLLETKSENNFNFTLDDSDIVRGDFRYTLKKEGLAYYLSPEKTE >LS483299|158570:181163|172526_173417_-|SQE29858.1|DBSCAN-SWA MLNHNFTSDFQLCRSLLDRAESQAKQENLKRTVANLQSLKIVIEALMLQLEDEKQANRENQAAQGGQKMANVTRNWQEIIANLQRFSEMERDRPQNFYRSFLDTAKNLRALEQNSGTEAEKEAFFKEVQEIYDYWKQNEQAIRKNRKLEATFKGLAKMGIDYQYLLDAQAENLKQIEQLEEQLKKAELQLIAKENLRKSPKKPLTTLAGLELLSTSSKAENTPIDKQEAFFYFSVNLQIAEQIPFIYDCVREFANDGQELNAGIETMIELQKAYNRHIAEQFEQLESLVFDKGDLC >LS483299|158570:181163|165358_165805_-|SQE29848.1|DBSCAN-SWA MIDVLQELSNIEKEWNDKFISIYDLMFCIKGANKNIKISDIAKVLLNRLSDFNIDTLDIQEYPDIFFNNQWLLKFDNEKQAFTCIYGIPCYFMRDDYKASSLAYKDANLFFSFLYNIKNGLFSPNLAIPLDEWNIEKAYIKRDLYRKK >LS483299|158570:181163|166259_166580_-|SQE29849.1|DBSCAN-SWA MLEVKRQVTILRPTNYGKEDNPYKHLYILLTDPCFDGETGKGDMILSVNCSSIKDGKALDETCILKAGTHEFITRDSFIFYRHIRIDSLDEIKAKYRSPVILFKKH >LS483299|158570:181163|170449_171829_-|SQE29854.1|DBSCAN-SWA MKNNHQEDFAKIFKNSKDNDRLNYFLEWYKKPLYKDELTELAYFYNGKKWELLKDNHLKFVITQFFDEKGVSYNYNNIESLYKLILVKSPTLGKQNLNVIPFSNGVIDRKTGRFLPHNQNYFLRNTLPIYYSLENKPIPNFEKWLNWVSQNNEQKKRTILAAFYMILTNSYEWQLFLEITGVGGSGKSIFNEIAIMLVGEENSTSVYLKDLEKISARTKLLDKMLIFAPDQGRIVTDGSILKALTGGDMMGFEPKYKAAFDARIQSIFLMTNNEPVIFTENNGGIGRRRVLFNFSQKVPENMKDEYLKEKLKEEIPQIINLIITTFKNSPQEAKKLLEAQKSGEEALAIKTKNDHLMHFASFLETRESNSGGLKPGITTNREDNNFMNALYSAYINYCTYYQIGKPIRRNSFLDDLKNALTEHGIKYPVFESVRDGFKRTNIYFKNDIAEVLNEWRGYS >LS483299|158570:181163|175006_175975_-|SQE29861.1|DBSCAN-SWA MFKQPFFKEWFTLAEIAQFLRNVHKINYSHLELLKRLDDSNLVEFYIYLSGGYDLEGLYIGTQEREIEFTAFILSEYMYDTDYNGSFQQLEDFILAQNGEEVEIKGENTKIYIKYDDEEKECYPTLFSGLFSLPLEIFNEQNFLFSDGTALYLPEYAFYSTFELVENPAKSNSSYNFSFLLIQFDHSKGQGKINLDDIKIHLPAYTMQDFIAYFAPNQIPNQPEQRLEAVKNKSNEKPKNGKDFYNDAMFESIKLTAEANPNAGGYTIINAVIEAFCEHYHIKKHDLYGNKHYLEQSKAKYKMTFPDRRGRQKIELNVIIAS >LS483299|158570:181163|162946_163699_-|SQE29844.1|DBSCAN-SWA MNKQIKEMLDQIENLPQSFSHIERVIYSAMELLADRTNILDIDLFDDWILDINTFYPAEKEEEYRLKAKEFVNREPEKVELFFDDVFETEPFDYSCFKHDEFCDYFNLPNYYSYDSFEILELYLKEYGIDYLKDDNIKDDNIKDYKKYEIFALLALNYINRILRLNNKEVQLEHFHKIQSFSDYDDLNNFLEMSKEKIFREVTGAFISLDITKELKQKEVNAEMEDTIIKKFLAQMREKGEISDTSKPEK >LS483299|158570:181163|168435_169662_-|SQE29853.1|integrase|DBSCAN-SWA MARKITPLNDTQIRKAKPEDSPLRDGNGLLLVITSNSKLWRFRYERPFTKKRNDLSIGAYPDVSLAQAREIREEYRALLAQNIDPQTHRQQQEQAKANEISNTYENVAWAWLEHRKTKKNFSDNYQKDVIALIKNNLLPHFGRMPITQITAPMAIKAFKQYQDEGKLEKLKRAIQKHNEIMMFAVHREMIPFNPTANIAKEFDSPTVEHFKTIKPEDLGEFLYTLQNAQIHLQTRYLILWQLLTMTRPNEAAKAKWADIDEKAKLWTIPAENMKRGIEHKITLSRQAIALLREIKKLSGGKTYLFPSVKNPQTHVNTQTANGAIKRMGYKGKLVAHGLRAIASTYLNEKGYNSDLIEVALSHLNSDRIKAAYDRGERLEQRFKLLQVWSDFVEECSQGSLPQYHLKVA >LS483299|158570:181163|174631_174832_-|SQE29860.1|DBSCAN-SWA MQTNQTYLNAQEIAAHLGISRSGIYSLMKSSHFPSPVKFGRLSRWKVDDLRQWLNNQEQNQDGHHA >LS483299|158570:181163|164931_165270_-|SQE29847.1|DBSCAN-SWA MHQLTAKDEEILRLKEEIENLKKPEFTKDETEQAKENEFIPCYLNKFIEPDPLAIAIQIRNSEWKDYNPETDAKKSATQIKNKIKSNYQGISDTLAEMIEKVACPIDRTRNK >LS483299|158570:181163|171877_172180_-|SQE29855.1|DBSCAN-SWA MQTINIEQLAESIQNLNQRVALLESQKSQTPNGLNMNDNAIWTPKHIAKYTGLSVGYITQHLIKVADFPSSIKRETGTKRQRKLYLAGDIIRYFEQRKTN |
28 | Burkholderia_virus(10.0%) | protease,integrase,terminase,capsid | attL 169935:169950|attR 181358:181373 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1459599 : 1512856
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483299|1459599:1512856|DBSCAN-SWA TCTAATAATATTGAGTAAAGTTCCAGTCAAAAAATGCAAAGAGGCGTTGCCATTGCTCATCAAGCGATGCAATTATCTCTATTTTTTGCAAATTTTTCGGGTGCTGAAATTGCAATTTATGGGCGTGTAACATTAAACGACTTACGCCTGATTTTTCAACTAAAGCACGGTTTTGGTGTAAGTCGCCATATTTGCTGTCTCCCATAATCGGGTGGAACAGGTGTTTCAGGTGGCGGCGAAGCTGATGTTTCCGCCCGGTTTTAGGGCTAAGTTCAACCAAACTATAACGAGAGGTTTGGTGCTTGCCGACAGGGTAAGGCATTTCAACCGTTGCTAAGCCTTTATAATCAGTAATCGCCGCTTGAGCCTCTTTTTCCTGAGAAAATTTATCCGCAATTTTATCTAAAATCACTTTGAGCGGATAATCAATTTGTGCCGAACCTTGTAAATAGCCACGCACCACCGCCAAATAAGTTTTTTGTACTAGGTGTTGTTCAAACTGCTCGCTCATTATTCGGGCGGTTTCGCTGTTGAGAGCAAACAGCAATACACCTGAGGTTGGGCGGTCAAGGCGGTGAATCGGAAAAACGTGTTGCCCGATTTTGATCCCTCAGGGTTTGCATTGCAAACACCGTTTCGTGTTTATCTAACCAAGAACGATGCACCAACACTCCGGCAGGTTTGTTGATGGCGATAAGCGAGTTGTCTTGGTATAAAATATCTAAGGTCATAATACATTAAGTATAATTTATCAAATCTCTATGATGGCGCAAGCGTCCTCGCTTGTGCCAAATTTTGATTAATTAACCGTTAAAATTAGTACCAGCGTGGACGCTGGCACTATCAACGAATTTGTCAGATTAATAAAAGAACTGAGAGAGAAGTTAATCTTTCAACAACTTTTCCAAACCTAATAGCGGTTCACAAATCGCTTGTAAATAACCTTCGTTTTTCAATGCCTCTTCTAAATAAGGGGTGATTGCAAAATTGCGAGGTAAATCGGCATTTGCATCTAAAATGGCCCGCATTCTGGGAATAAAAATCCATTGTAGCCATTGGGTTGGGGTTAAGGTTTCCACGCAGAAAGGTTGCTCATTGGCTAAGGCTTCAGGGCTTGGTGGTGTCGCCTCCCAAAGTTGATTAACTCTCAGGGCGATTTCTAAATAAGATAAATGCTGTATAACTTGTGATTTCATCTTAGTTTTGCTTGTGAAATGAGACTTTTTCGGGTAAAAATAAGGGCAGATTTTACCATTCAAACCGATTTCGCTCTAGGAATTTATATGCAAAACATCGTTCAAGATAACGCTCAACCAAACCAACCGACGATTTTACAAAAGATCGTACAAGATAAAGCCATTTGGGTGGCACAAAAAGAGCAAGCCTTTCCGTTAAGTGAATTTCAGCACAAAATTGTAAAAAGCGACCATGATTTCTATGCGGCTCTTGCCAAAGGCACACACCAAGAACCAGCTTATATTTTAGAATGTAAAAAAGCTTCACCGTCAAAAGGGTTAATTCGTGCTGAGTTCGATTTAGACAGTATTGCCCAAGTGTATAAAAATTACGCTGCGGCGATTTCGGTTTTAACCGATGAGCAATATTTTCAAGGCGATTTCCGTTATATCGATCAAGTCAAACGCCAAACCACACAGCCGATTTTGTGTAAAGATTTTATGATTTCGGCATACCAGGTTTACCTTGCCCGTTTTTATAATGCTGATGCGATTTTATTGATGTTATCGGTGGTAAATGATGAAACCTACCGTGAACTTGCCACACTGGCTCACGAGTTAGGAATGGGCGTTTTGACTGAAACCAGCACGGAGGCGGAATTTGAACGTGCCTTAGCCTTAGGGGCGAAGGTAATTGGCGTTAATAACCGTGATTTGCACACGCTCACGATTGATATGAACCGCATTGTGCGTTTGGTGGAAAAATACCAAGCCCAAATTTCGGCTGATGTCTGTTTGATTTCAGAATCGGGTATTAACGATCACCAGCAAGTGAAAAACATTAAGCCGTATGTTCATGCTTTTTTAATCGGCAGCAGTTTAATGGGAAGTGCCGATCTCAATAATGCGGTGCGGGCGGTGATTTTTGGTGAAAACAAAGTGTGTGGCTTAACCCGTGTGCAAGATGTGAAAGCGGTTTATGAGCAAGGGGCATTATATGGCGGTTTAATTTTTGCCGAAGGCTCGCCTCGCCAGCTTTCACTTCGCCAAGCCCAAGAATTGGTGGTGAATGCACCGTTGCGTTATGTGGGGGTGTTCCAAAATCAAGCGGTCGAATTTGTGGAAAAAAATGGCAAAACAGCTTGAGTTATTTGCAGTTCAATTGCACGGCTCGGAAGATGAGCAATACATTGCAGAACTGGCAGAGAAATTAGGTAGTAAAACTCAAATCTGGAAAGCCTTATCGGTTGATGTTGAGGTTGAAAATCTAGAATTTAACGATAATCCACAGATTGCTCGTTATGTATTAGACAGCAAAGTAGGCAATCAGCAAGGCGGCACAGGCAAAACCTTTAATTGGGCGTTGATTCCAGAAACCTTAAAACAAAAAGCGTTATTGGCAGGTGTATTGGCACTGAGAATATTGAGCAAGCCCTTGCTCAAGGCTGTGTCGGGTTAGATTTAAATTCTGGCGTGGAAAGTGCCAAAGGCGTAAAAGATTTACAAAAATTGACCGCTTGTTTTGGCAAAATTATTCAAGCATAGGCATTCAAAGCGATGGAAATTATGCTAGAATAAAGCCGTTTTAATCATAATTAACAATGAGGATTGTAAAATGGGTACTTTTGGTTATTCAATGCTAACGGTTGTAGGCGCACTTGGTATGATCGTTATTTTTGCCAGCAACATTTTCTAACATTGGTACTATTGAACTGGTTGAAACACGGAAAATCTTGGGGTTTTCCGTGTTTTGTTTTTAAGGGGATATGATGGGTAAACTGACTTTTGCGACACTTACATTTAATGATGCAGATACACCGGTGTCGGAGCAATTTGATGATATTTATTTTCTACCCAAGATGGTTTGGCGGAAAGTTACTATGTGTTTCAAGAAGGTAACCAACTGTGGGAAAAGTGGCAATCTCACCCGAAAGAGGCTTTTGTTATTGCGGAAACCGGCTTTGGCACGGGCTTGAATTTTTTAGCCGTTGCTGACAAATTCCAACAGTTTCGGGCAGCATTTCCGCAAAGTAAACTAAAACGACTCTATTTTATCTCATTTGAGAAATTTCCTCTGACGGCCAGCCAATTAGCTGATATTCACCAACGCTATCCGCAATTTGCAACATTATCTGAAAATTTAACCGCTTGTTGGCAGCCTCGCCAAATAGGTTGCCAACGTTATCATTTTGAGCAGGTTTATTTAGATTTATGGTTCGGTGAGATTGCTGAAAACTTACCCCAATTAGGCGATCTTTATAGCGGCACGATTGACGCTTGGTTTTTAGATGGCTTTTCGCCTGATAAAAACCCAGAAATGTGGAACGAACAGTTATATCTGCAAATGTTTCGACTAAGTGCCAATGGCGGCAGTTTTTGCTACTTTTACCGCTTCAAGTATGGTCAGACGAGGGCTGGAAGCCGCAGGTTTTGCAGTGAAAAAACGCAAAGGATTTGGCAAAAAAACGAGAAATGCTTTGGGGCGAGAAACCGTTAGATAGCCAAGTTTCCGAGCCTAATTACCCCTATTTTTATGCCAAAAATGAAACCGCTGATGACATTGCAATTATTGGTGGCGGAGTAGCGAGTTTCTTCGTTGCGTTATCGCTGTTAGAAAAAGGCAAGCAAGTCACGCTGTATTGCAAAGATGAAACCTTGGCAATAAATGCTTCAGGAAATTTACAAGGGGCGATTTACCCACAGTTAAGCGATGATGACGAGCGAAATGTACAGTTTTATATCCATAGTTTTGATTATGCATTGCAACGCTTGCAACAACTGAAATCCAACATTGAGTTTGAGCATAATTTAAGCGGGGTAGTGCTTTACGCCTATGACGAGAAAACGGCTAAAAAACTGGAAAAAATGGTGGAGCAGACGGCTGATGACACCTTATTAAAATCTTGTTCACAGGCAGAATTAAGTGAAAAATTAGGTTTAAGCGTGCCAAACAGCGGGGCATTTATTCCGCAAGCTGGTTGGCTTTCACCGGTACAACTTGTTAGAAATGGCTTTACTTGGCTGGAGCAGAAAGGGTTGAAGATTGTACTGAATCACAAAGTTGAGCATTTAACCTTTTCTAATGAATGTGGCAATGGCAGACGAGGGGAGAAACGGTTCGACATCAAGCGGTTTGTGCTGGCAAATGGACATACGTTGAATGAATTTAGCCAAGCGAACGGCATTCCGTTGTATCCGGTACGAGGGCAAGTGAGCCAAATTCCGACTACAAGCGAATTACAAAACTGAAGTGTGTGCTTTGTTATGATGGTTATTTAACGCCAATGTCAGCCTATGGCACGCATTGCATTGGAGCAAGCCATATTCGGGATAATGCAGAAACCGAGTTTAGTTTATCGGAGCATTGGGAGAATGTTGCAAAACTTCAGCAAAATGTAACCGTTTGTGAGTGGACGCAAGGAATTGATTTATCTGAAAATAAAGCCAAAGTCGTATTCGTGCGGCGTTTCGTGATCGTGTACCGATGGTTGGGGCAGTGCATCATTTTGAGCAGCAAAAAAGCCAATATGCCAATTTATACAACCAGTTGAGACGGAAACAAGCGGTAGAAAATGCTGAAATTTTTACCAATCTGTATATGGTAAACGGCCTGTTCTTCTCGAGGTTTGACGACTGCACCACTTCTAGGGAGATTGTTAGCAAGCCTGATTGTGAATGAGCCTGTGCCAATCAGTAGGATATTTGGCATAACCTTAGCCCAAATCGAGCTTGGATTCGAAAATTGTTGAAAGGTTCGACGGTCGCTTTGATAAAACAAACCCCGAATTGATTTCGGGGTTTCGTTTATTAACGAATAATACCACG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59 | Acinetobacter_phage(16.67%) | capsid,tail,protease,integrase,tRNA | attL 1504141:1504160|attR 1508246:1508265 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1568234 : 1572548
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483299|1568234:1572548|DBSCAN-SWA CATGTTTTATTCTAACAATCCTCTCATTAAACACAAGACCGGTTTATTAAATTTAGCAGAAGAACTGGGTAATATTTCTCAAGCCTGCAAAGTAATGGGAATGAGCCGAGATACATTCTATCGTTATCAACAAGCGGTTGAGCAAGGTGGTGTTGAAGCATTGCTGAATCAAAATAGACGCGTTCCCAACTTAAAAAATCGTGTTGATGAGGCAATAGAGCAAGCTGTTGTGAAGTTTGCTCTTGATAACCCGGCATTTGGACAGGTAAGAGTGAGTAAGGAACTCCGTAAACAAGGCATCTTTGTTTCAGCAGGAGGTGTACGTTCGATTTGGTTACGTCATCATCTTGCCAATTTTAAGCAAAGATTAATCGCCCTGGAAAAACTGGTTGCAGAACAAGGTATTATACTCAGTGAAACACAGGTACAAGCCTTAGAGCGTAAGAAAGAAGATGAGATTGCCTGTGGTGAAATTGAAACGACACACCCTGGCTATTTAGGGTCACAAGATACCTTTTATGTCGGCAATAACCATTTACATTGGTTTTTACCCGATCACCTTTTAATGCCAGTTCAAGCGATTCTAACACCCGCTGGCGATGCTCTTCTTCCTGCATATCGATAAAATCGATAATAATAATTCCGCCCAAGTTGCGTAGTTGTAATTGTTGGGCAATTATAAGCGATCGAATTATTTTGCATAGATAAAAGTTAAAAACTATGCAAAATAAATCGCAAAAAATAAAATTCCACGCCCTTTAAACCATCATTAAAGGGCGTTTAAATTTTTAGAACTTAAAAACCATATTATCCTCATATTTGCCGTTATAACTTGCCGAGGCATTAACCACTATTCTTTCCGCTCCCTCAAATGCTTGCCAGTTTTCTTTTTTGTTTTGAACCATATAGTGAATAAAGCGAATAAACTCGCTTTTGGTTGAGTTAAAGAAGATATAAGGTGGTTTGGTTAGGTCTATCAATCTCAAGAAATCAATTAAATCAAAGTAATTTTCCTGCTTATAGCTTTCCTGCCTTGTGCAAAGATAAGGTGGGTCAAGAATCAATAATACTTTCTCTTTATCGTGAAATCTCGGCAATAATTGATGAAAAGACTCGCTAACCACCTCAATATCATCATGATAACCCGTTGCTTCAGGATAGTCACTTTGCCGCACACGGTGCCAAAAATCGTGCTTAAATAACTCATCTAAGGTTGCAACTTGCTCTCCACTAAACAAAAACCAAGAACTTAAGCAGTTGAGGTCTTTAAACCCCTCAAAACCATTGATTTTATTAATAATTTTAGCTTTAATTTTATTGCTAATCCTCTTATTTTTTGGTATAATTCCATCAACAATTTGGTAGATTTCTTGGCGAAGTTGATTTGTCTCTTTGATATGGTTTAGCCCGTTCGGCGTAATTATCAAAATCATTATAAATCACTCTTGCTAACGGTTTTTCACACTTTGCGGTATGTGCAAGCAACCCACTCCCACCAAAAACATCTATAATAGTCCAATCTTTCCCGTCTGCTTCAATATTTGCATTTAACACCTGTTTGAAATGGGGTAAAAACATCCGTTTTTGCCCTGAAAAGGGTAAAGGAGCTTATTTAAATACTTTCGCCATTTCATACTCCTGCTTCTTGCTGTTTAGTCTGTGTTTGTTTTGCCGCTGCTGCAACAGCTAATGCGGTTATCCAAAATTTCCAGTAAATGACTTAAACTATACAAACCGCTCGCTAAATTTTCGGTATTTTGCACAATATCTTCAAATTCCGTTCTCATAACCCACTCCTTATTTGCCTAAATTTTCACGAATAACCGCACGCACGGCACTTTCTGAACGCCCCGATTGTTGCACAATTTGCCCTGTGCTTAATCCCTGCTGGTGCAGGCGGAAAATATGGCTTTTTTCTTCGGCACTTAGGCGTAGCTTGTACTTTTGCGGTTTCATCGCTTGTTTAAGCAATTGGTTTTGGGTTTCGAGTAGCTCAATGTATTTGGCTGTTGGAATTTCCATTGTTTCTTTCACAGTAACTTGTGATTTTTGTGCTAAACGTTCACATTCAATAAAGTATTGTCTGATGATTTTACCTTTTGGGGAGCGTTCAATCATACCGAGTTCTTTTGCCATATCAAGAGTTAGGTGGTAGTCTTTGACTTCAATTTGGCGAGAACCAAAGAAACCTCTCTCGACATTCTCAATTTTTGAGAACCTCGATAAAATCAAGGTTTTCTGTGAATTCATATTCAGAAATTCTACGATTTATCCAATCTTGGAATTTAGTTTGAACTTGTAAAAAGCTATGTAGATCACGAGCATTGCAAAGTTGGAGAGGAATATTAGCGATCTGACCAGAAAAAACTGGAATAAGTTGAGTAGTTGTCATTTTTGTTTCCTTTTCGAGGATAGATAACCCTAAAATTAGGGTGGTCGGGAGCCGAAAACTGCCAAAAATAAACAGTAGGCGTATTTCCCTTTCAGGTGTTGTATTAGCCGCACTCCCGACCATTGAACGATTTAATTGTTAATTTTTTGCCTAGACGCTCTGAAACTCAAGGTTTTCTGGCATTCAAACAAAAAATACCACGAAATAACGGTTGTTGTAATCCTCAAAACAAGCGGTTACATCTGCCACAAAATTTGCAAATTCAGGCACTTTTGCCATTGCCCGACGTTGTTCATCAGTCATTAACTGATTTTTGGTTTTCGCTTTCATCGCACTTTTTAATTTGCGATAATTCCAATGCTTAGTGGCGTTATCAGCATCTTTACCACCATAGCTGGCATAGGTTTTTGCCAGAGGAATTAAGGTGGATTGCCACAATCTTTCAATAATCCCACGCCCTTGTGGATTACCTGCCACACCTGTTTCGTGATGCACACCCAATCGGGCAAAAATCCCTGTTACATCGCTGTCTAGCACCTTGTTGGATTGACCACCACCGTTATCTGAGTAATAAATATTCGGCAATCCCACATTCATTACACCGTGCCTAAAAGCATCACCCACCGCCATCACAGACTCGCTATTAGCAATCGACCAGCCCACAACACGGTGTGAACGTACATCAATAATTGCTGTAACTTCAGGAATGTAGGGCATACCCAGCAAGTTCTTCACATATGCCTTAAAACTATGCCCATCACCCACCCAGCATTCATTTAGCCCCATTACCTTGTCATCTCTACGAATAAACGGCATTAAATTCCGCATTTCTGCTCCTGTTTTACGCCCTTGTTGAACTACATAATCGGGTAACTGCTTCAAGGCATACCGAACTTGGCTCTCTGTAGGTAAATCTTCGCCCTCATACTGCATTGCAAATTGAGCATAAGCCTGTGTGAGTGCTACATTGCTAAAGGTTTGATAAAAGGGTAAAAAGGCTTGCAACCAAGGGCAACGCTCCGGCACAGCACGTTTTTGTGTTTTCAGCGGTATCATCTGTTTTAACCGTTCCGCTGAATTTTCGCCTGCCTCATACGCCAACACCCAACTATGCAAAGTGCGTTTAGAGAGCTTTAACTTCCCACCGGCTTTACCATTGCCCGCCATAATCGCTTTGCAAATTTCCGTAGGAATTTGACCGCTTGCCACCGCTGCAATGACTTGGTCTAGCGTTTTTGTGCGGCTTAGCCCCAACTGCACTTCCTGCATCAAGAACCACCGCACCACCATAATGCGAGCATCTGCCGTAGAAAGTTGTTTATCGGTTATCCGCTCTAAATCAATCTCCTGCCTAGCTAAACTCAACTCGCCTTTGCTGATGTCTGCTGGGAGAAGTTTGAGGAGTTTGGTGCGGATTTCCTGTTGGACTTCGGCGGGCAAACTGATTAATTCATATTCAACTCCACCGCCTCTGCCTTTTCGTTTTTGAGATTGCCAGTTTTCTCTTGGCTTTCTCAAGCACATTTTTATGGGCACTTGGTAGGCTGGATAACTTAAAAACTCAATAATTCAGCCACCGAATAGTGCGTTTTTAAACTTAATTCACTCATAAATGTTCCTTTTTTTGATTTTTTATGGGTAGAATTAAAACTTATTCGTTAAAACTGGTCGGCGATTACGTTCAATTCGTTCTGCATTTCGCCCCGCCCAAATCACTTCGGGGGCAACCCCTATGGCATTTGCAACTAAGCGTTCCATTTTGGGGTAAGGCTTGTCTAAAACAGACTTCAGCGTGTTATGGCTAACATTGCCTGCTTTAGCCAAAGAACGAAGTGACCAACCTTTTTTACGAAGTTCCGCAAGAATATCGGCTCTATGCCAATCTCTCTGTGCGGTTTTTTTAACATCGTTTAATACACTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483299|1568234:1572548|1572269_1572548_-|SQE31383.1|DBSCAN-SWA MSVLNDVKKTAQRDWHRADILAELRKKGWSLRSLAKAGNVSHNTLKSVLDKPYPKMERLVANAIGVAPEVIWAGRNAERIERNRRPVLTNKF >LS483299|1568234:1572548|1570436_1570625_-|SQE31381.1|DBSCAN-SWA MTTTQLIPVFSGQIANIPLQLCNARDLHSFLQVQTKFQDWINRRISEYEFTENLDFIEVLKN >LS483299|1568234:1572548|1569021_1569666_-|SQE31378.1|DBSCAN-SWA MILIITPNGLNHIKETNQLRQEIYQIVDGIIPKNKRISNKIKAKIINKINGFEGFKDLNCLSSWFLFSGEQVATLDELFKHDFWHRVRQSDYPEATGYHDDIEVVSESFHQLLPRFHDKEKVLLILDPPYLCTRQESYKQENYFDLIDFLRLIDLTKPPYIFFNSTKSEFIRFIHYMVQNKKENWQAFEGAERIVVNASASYNGKYEDNMVFKF >LS483299|1568234:1572548|1568234_1568858_+|SQE31377.1|DBSCAN-SWA MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSKELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETTHPGYLGSQDTFYVGNNHLHWFLPDHLLMPVQAILTPAGDALLPAYR >LS483299|1568234:1572548|1570808_1572149_-|SQE31382.1|DBSCAN-SWA MCLRKPRENWQSQKRKGRGGGVEYELISLPAEVQQEIRTKLLKLLPADISKGELSLARQEIDLERITDKQLSTADARIMVVRWFLMQEVQLGLSRTKTLDQVIAAVASGQIPTEICKAIMAGNGKAGGKLKLSKRTLHSWVLAYEAGENSAERLKQMIPLKTQKRAVPERCPWLQAFLPFYQTFSNVALTQAYAQFAMQYEGEDLPTESQVRYALKQLPDYVVQQGRKTGAEMRNLMPFIRRDDKVMGLNECWVGDGHSFKAYVKNLLGMPYIPEVTAIIDVRSHRVVGWSIANSESVMAVGDAFRHGVMNVGLPNIYYSDNGGGQSNKVLDSDVTGIFARLGVHHETGVAGNPQGRGIIERLWQSTLIPLAKTYASYGGKDADNATKHWNYRKLKSAMKAKTKNQLMTDEQRRAMAKVPEFANFVADVTACFEDYNNRYFVVFFV >LS483299|1568234:1572548|1570030_1570483_-|SQE31380.1|DBSCAN-SWA MNSQKTLILSRFSKIENVERGFFGSRQIEVKDYHLTLDMAKELGMIERSPKGKIIRQYFIECERLAQKSQVTVKETMEIPTAKYIELLETQNQLLKQAMKPQKYKLRLSAEEKSHIFRLHQQGLSTGQIVQQSGRSESAVRAVIRENLGK >LS483299|1568234:1572548|1569885_1570020_-|SQE31379.1|DBSCAN-SWA MRTEFEDIVQNTENLASGLYSLSHLLEILDNRISCCSSGKTNTD |
7 | Haemophilus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1924207 : 1931041
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483299|1924207:1931041|DBSCAN-SWA CTTAGAGTGATTTAGCTAACTCTTTAATAAATGCTTTAAATTCTTTTCCGCATTTGTCATGATTTAAACTATATTCTACAAATGCTTTCATATAGCCGACTTTATAACCACAATCAAATGAGCGCCCTGTCATATGAAAAGCTTCAACCGTTTCTTGGTGAATCAACATATCAATTGCATCCGTCAGCTGGATTTCATCACCTACGCCTACTGGCGTTTTTTCTAATAAATTCCAAATATTTGAGGAAAATACATAACGTCCTACTACCGCTAAATTAGAAGGCGCCTCTTCAATACTTGGTTTTTCAACCATTTTCGCAATAGGCGCTGCCCCCCGAGAGGGATATCTACACCATGGCAGTCAGCAACCCCATAGCTACTTACATTTTCCATTGGAACCGGCGCAACCATAATTTGGCTATATCCGGTTTCTTGGAAACGCTTCACCATCGCAGCTAAATTTTCCGTTTTTTGGTTTGCTGTAAATTCACCAAGTAATACATCTGGTAATACAACCGCAAACGGTTCATCGCCAACCACTGTTCGTCCACATAGAACCGCATGACCTAAACCTTTGGCTTGCCCTTGGCGAACGTGAATTAAGGTAACATCTTTTGGTACAATAGAACGTACATCATCTAATAATTGACGTTTTACTCGTTTCTCCAGCATCGTTTCCAATTCAAAAGAGGTATCAAAATGGTTTTCGATAGCATTCTTTGAAGAGTGAGTAACCAATACAATTTCTTTAAAACCTGCAGCCACACATTCATTTACAATGTATTGAATAAGAGGTTTATCTGCAAGGATAAGCATTTCTTTTGGAATAGCTTTGGTTGCGGGTAACATGCGCGTTCCCAATCCAGCAACAGGAATAATGACTTTCATTTGGAATCCTTTGATGACTTAACATATTAGATATAACTGAAATAAACCGCTTAGACATAACAAGCGGTCAATTTTCAGAAAATTTTGCATTGCCTGCTTCGCTGTTATCATCTAGCAGCTTTACAGTTAAAATGCTTATTCCGCATTTTCCTCTTCTGCTGAGGCTTTTATTCTTTCATAAATCTCTCGGCGGTGTACAGAGATTTCTTTTGGTGCATTCACACCTAATTTAACTTGATTTCCTCGGATGCTGAGTACCGTAATCTCAACATCATCTCCTACGAGTAAAACTTCCCCAATCTTACGAGTTAGAATAAGCATAATTGTCTCCTAAAAAGTGAAAAACTCTATAAATACTTAAATATAGAGTAAAGTTTTAAAGGCGAGTTCAGCTCGCCTTGTTATTATTTTTAAAGTTTTGCTGTAATCCATTCTTGAGCAAGTGACAATGCTTGCAATAAATGTTGTGGTTCTGAGCCTCCGGCCATTGCCATATCAGGACGTCCGCCCCCTTTACCTCCCACTTTTTCAGCCATTGCACCAACTAATTGACCAGCATTGACTTTATCGGTTAAATCTTTGGTCACACCTACAATCAAATTGACTTTATCTTCCGCCGTAGTCGCAAATACAACAACTGCACTGCCTAATTGATTTTTTAGGTCATCAACCATCGTTCTCAATGCTTTTGGTTCAACATTCTCTAATTGTTGAATCACTACATTCACGCCATTGATTTGGGTAGCTTGTTTGGCTAAATCTGAACCTGCTTGTGCTGCAAGTTTATCTTTTAGCTGTTGAAGCTCTTTTTCTGTACGTTTAGCCTTCTCTTGTAATTGAACAATTTTCTCAACGAATGAATGACTGTCTGCTTTTAACAATTCAGCACTTTGTTGAACGGCTTGTTGTAAGGTATGCAACCAAGCAATCGCATTTTCACCAGTGACAGCCTCTATACGGCGTACACCTGCTGCTACCGCACCTTCAGAGGTAATTTTGAATAAGCCAATATCACCGGTTTGTTTAACGTGTGTGCCGCCACAAAGTTCAATCGAGAAATCTGACATTTCCACTACACGCACTACTTCGCCATATTTTTCACCAAATAACGCCATTGCACCTTTCGCTTTTGCAGATTCAATATCCATTTCTTCAATGATTACCTGAATATTTTCACGCACTTTAGCATTCACGATACGTTCAACTTCTTCAAGTTGTGATTTAGTAATTGCTTCCGGCTGAGAAATATCAAAACGTAAAATATTTTCTGACACTAATGAGCCTTTTTGAGCAACGTGGTCGCCTAGCACTTGGCGTAACGCAGAATGCAGTAAGTGGGTAGCACTGTGGTTTAATGTAATAGCATGACGACGCTCTCTATCTACGATCGTATTAACTTTGTCGCCAACAGAAAGTGAGCCGGAAGTTAATTGCCCAATATGCCCGAATACTTGACCATATTTTTGCGTATCTACTACCTCAAAATTGCAAATTTCTGCGGAAATTTGACCGCTATCTCCCACTTGTCCGCCCATTTCTGCATAGAATGGGGTTTTATCTAAAATCACTACCGCATTTTCACCCGATTGAATAGACTCAACCGATTTTCCATTACTAAATAACCCAATTACAGTAGCATCATTTAAGCTGGTTTCAGTATATCCACTAAAGCATGTTTTACTGTCCACTTTAATCACATTGTTATAATCTGTGCCAAAGCTACTGCTGGCTTTCGCACGCTCACGTTGTGCGGTCATTTCTGCATTGAAGCCGTCTTCGTCAATTTTAATATCACGTTCACGGCAAACATCTGCGGTTAAATCTAACGGGAAGCCATAAGTATCATAAAGTTTGAACGCAACTTCGCCAGATAAGGTGTTATTTTCAACCTTCGCTAATGCTTCTTCTAATAAATTCAATCCACGCTCAAGAGTACGGGCAAATTGCTCTTCTTCTGCTTTGAGTGTCTTTTGAATATGCGCTTGTTTTTGGGTCAGCACCTCACCAGCTTGCCCCATTACCGTTGCAAGTGTTGGCACCAATTTATAGAAAAAGGCTTCTTTTGCACCCAAAATATTACCGTGACGAACCGCCCGGCGGATAATACGGCGTAATACATAGCCTCTTCCTTCATTTGAAGGTAAAAACACCATCGGCAATCAGATAGGAACAAGCACGAATATGGTCTGCCACTACACGTAAAGATTTATTATCTAAATCTTTCACATTAAGCAAAGTAGCGACTTCTTTAATTAAAGTTTGGAAAATATCCGTTTCGTAGTTGGAGTTTACGTGTTGCATTACCGCAGTCATACGTTCTAACCCCATCCCTGTATCTACAGAAGGCTTAGGCAGTTTTTCCATCGTACCGTCTGCTAAACGATTGAACTGCATAAATACAATATTCCATACCTCAATATAGCGGTCGCCATCTTCTTCTGGGCTACCCGGTAAGCCACCCCAATGTTCAGGCCCGTGATCATAGAAAATCTCGGTACAAGGGCCACAAGGGCCGGTATCGCCCATCGCCCAGAAGTTATCTGAAGCATAAGGTGCGCCTTTATTATCGCCAATGCGAATAATATGTTCCGATGGTACACCTACTTCTTTATGCCAAATATCGTAGGCTTCATCATCAGTTTCATACACAGTTACATATAATTTTTCTTTTGGTAAGCCAAGCCATTGTGGAGAAGTTAAAAACTCCCAACCGAATTTGATTGCATCTTGCTTGAAGTAATCACCAAAGCTGAAATTCCCCATCATTTCAAAAAAAGTATGATGGCGAGCGGTATAACCTACGTTTTCTAAATCATTGTGTTTACCACCTGCACGTACACAACGTTGTGCCGTAGTCGCTCTGCTATAAGGGCGTTTTTCTAACCCAAGAAAAACATCTTTGAATTGGTTCATGCCCGCATTGGTAAATAATAATGTCGGATCATTCTCGGGAACAAGAGAGCTGCTTGGAACAATCGTATGTCCTTTAGTTTGGAAAAACTCTAGAAAAGATTGTCTGATATCTGAAGTTGTTTTCATTAAAAATCACTCTTTTTGTAAATAGAAGTTAAACATTTAGTTATCTTGCTATTTTACACATTTTTTATGCTATTGGGGGAGCTATATGCTACTTATTTTTTCAATTAAATAATTTTTGTAAATTTTCCCAAAAAAATAACCGCTTGTAAGACAGATAAACTGTCTCAAGCGGTTATTTTTCATTCACTTTCTTGCTATTCATCTGCTAATGGCACAACCAGCATATCAACAGTGATATTATTCATGACTCGACGAGTTGAAGACATAAATTTACTCCAGAAGTCCTGATGATGGCCAGTGATGAGTAAATCGACATTGTGTTTTTCTACGGCCTCTTCCAAAACTTGACTAAAATCTCCCGTTCCGTTTAAACATTCAGATACAGGATAATTTACTTTTGAGGCAAGTTCAGCCAGTGCCGTATTTGTTTCTTCAACAACACTGTATTGTACCGAAGACATATTAATATCAATTAATCCTGTATAGAGATCCGAAAAATTAACATCAACGTGAATGAGGGAAAGTTTAGCTCCGCATTTTTCTGCTAACGCAGCCCCCTTACGCACTAAAACAAGACTTTCTTCAGAAAGATCCACTGCAACTAAGATATGTTTATACATAATATGCTCCTTGCTTGTGAGAGTTGTTTACTTTGTGTATAAACATACTAACACACTCTTTTTGATAAAAACTTGAAGTAGATCTCAAAAATAAAAATTTGATTATATTTTTCATACCTCTTTGTAAGTATTTTTATTTTTCCTTGGTATACTTTGCTTCATGTAAATTTAATGGTAAACTTTGTTCTAAATCAAATTTAGGAATACTTTTCTAATTTAAGGTTGAATGGATGAAAATTGTATCAGAACCTAAAACAAGCGGACGTCATACTTGCACAATTCATTGTCAAAATTGCAGTATTAGCCAACTATGCTTACCTTTTACTCTTAATGAAACGGAATTAACTCAACTAGATAATATTATTGAGCGTAAAAAACCGATTCAAAAATCGCAAGTTATTTTTAAGTTAGGTGATGAACTGCGTTCGCTTTATGCTATCCGTTCTGGGACATTAAAAGCCTATACCTTAAGTGAAAGTGGTGAAGAGCAAATTACCGGTTTCCATTTACCTGGCGATCTAATTGGCTTTGATGCAATTACCAATATGCAGCACGAAGGCTATGCTCAAGCACTCGAAACCTCAATGATTTGTGAGATTCCATTCGATATTTTAGATGATCTTGCCGGCAAAATGCCAAAAATTCGCCATCAAATTATGCGTTTGATGAGTAATGAAATTAAAAGCGATCAAGAAATGATTCTATTGCTCTCAAAAATGAATGCGGAAGAAAAACTAGCTGCATTTTTGTATAATCTTTCCCAACGTTACTCAGCCCGTGGTTTCTCTGCAAAAGAGTTCCGTCTAACTATGACCCGTGGAGATATCGGCAATTATCTTGGTTTAACCATTGAAACTATCAGCCGTTTATTAGGGCGTTTCCAAAAAAGCGGTATGATTTCAGTACAAGGAAAATATATTATTATTAACCGTATGGAAGAATTAGCCGAATTAGCCGGGGCAATCAAACCGCAGCAAAATATTATTGCTCAAACTACCGCTTAATTTATCTTACCAAATCCCTTTTTGAAACCTCGTTCAAAAAGGGATTTCTGATCCGATGAGCCGCTAACTCCATTTGCCCGTTTTTCCTATATCCGTTATAATCGACACAATTTTGCCCCAATCAATATAAAAGAGGAATTTTTATGGGTATCTTAACTGGTAAACGTATTTTAGTGACAGGTTTAGCAAGCAACCGTTCGATCGCTTACGGTATTGCAAACGCAATGAAGCAACAAGGTGCAGAACTTGCATTCACCTACTTAAACGATAAATTAAAACCACGAGTTGAAGAATTTGCCAAAGAATTTGGCTCAGACATTGTCCTTCCGTTAGATGTAGCAACCGATGAAAGCATTACTGAGTGCTTTACTGAATTAAGCAAACATTGGGAAAAATTTGACGGTTTTGTTCACGCTATCGCATTTGCACCGGGCGATCAATTAGACGGCGATTATGTAAATGCCGCAACCCGTGAAGGTTATCGTATTGCACACGACATCAGTGCCTATAGCTTTGTTGCAATGGCTCAAGCTGCTCGCCCCTTCTTAAATGAAAATGCCGCCCTTTTAACCTTAAGTTACTTAGGTGCAGAGCGTGCAATCCCCAACTACAATGTAATGTGCTTAGCCAAAGCCTCTTTAGAAGCTGCAACCCGTGTAATGGCAGCCGATTTAGGTAAAGAAGGTATTCGTGTAAATGCGATTTCAGCCGGCCCGATCCGTACATTAGCTGCTTCAGGCATTAAAAACTTCAAGAAAATGCTTTCTGCTTTCGAGAAAACCGCTGCTTTACGCCGCACCGTAACTATTGATGATGTAGGTAACTCTGCAGCTTTCTTATGCTCAGATTTAGCCTCTGGTGTAACAGGTGAAGTGTTACACGTTGATGCCGGCTTCAGCGTAATGGCAATGGGTGAATTAGGCGACGAAGAGTAATTCCTATAAAAATAACGGACTCAATTGAGTCCGTTATTTTTTTAATAAAATATTACTTACAATATACATTTGCAGTACGAGGTGTATAAATACCGATAGTCACAAGACCTAATAGAATGTCCCCACCTGAAAGTACTGTTTCAACCTGCTGCACTTTATCTTTGGAACCACAAACCTCTACAACATTCAATGTTTCTTCTTGCCCAATCCCACCTATAAAGAACGACTGAGTTACACTCTTAGTTGGTTTAATATTATCAGTAACTTTGCCGCCAATATGGGCAGTTTGTGTTGTACATGCTGTAGTCAGCAGGGCTGTTAATACAGACATAGCAAGCAATTTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483299|1924207:1931041|1924207_1924519_-|SQE31776.1|DBSCAN-SWA MVEKPSIEEAPSNLAVVGRYVFSSNIWNLLEKTPVGVGDEIQLTDAIDMLIHQETVEAFHMTGRSFDCGYKVGYMKAFVEYSLNHDKCGKEFKAFIKELAKSL >LS483299|1924207:1931041|1925504_1927247_-|SQE31779.1|tRNA|DBSCAN-SWA MVFLPSNEGRGYVLRRIIRRAVRHGNILGAKEAFFYKLVPTLATVMGQAGEVLTQKQAHIQKTLKAEEEQFARTLERGLNLLEEALAKVENNTLSGEVAFKLYDTYGFPLDLTADVCRERDIKIDEDGFNAEMTAQRERAKASSSFGTDYNNVIKVDSKTCFSGYTETSLNDATVIGLFSNGKSVESIQSGENAVVILDKTPFYAEMGGQVGDSGQISAEICNFEVVDTQKYGQVFGHIGQLTSGSLSVGDKVNTIVDRERRHAITLNHSATHLLHSALRQVLGDHVAQKGSLVSENILRFDISQPEAITKSQLEEVERIVNAKVRENIQVIIEEMDIESAKAKGAMALFGEKYGEVVRVVEMSDFSIELCGGTHVKQTGDIGLFKITSEGAVAAGVRRIEAVTGENAIAWLHTLQQAVQQSAELLKADSHSFVEKIVQLQEKAKRTEKELQQLKDKLAAQAGSDLAKQATQINGVNVVIQQLENVEPKALRTMVDDLKNQLGSAVVVFATTAEDKVNLIVGVTKDLTDKVNAGQLVGAMAEKVGGKGGGRPDMAMAGGSEPQHLLQALSLAQEWITAKL >LS483299|1924207:1931041|1929900_1930692_+|SQE31783.1|DBSCAN-SWA MGILTGKRILVTGLASNRSIAYGIANAMKQQGAELAFTYLNDKLKPRVEEFAKEFGSDIVLPLDVATDESITECFTELSKHWEKFDGFVHAIAFAPGDQLDGDYVNAATREGYRIAHDISAYSFVAMAQAARPFLNENAALLTLSYLGAERAIPNYNVMCLAKASLEAATRVMAADLGKEGIRVNAISAGPIRTLAASGIKNFKKMLSAFEKTAALRRTVTIDDVGNSAAFLCSDLASGVTGEVLHVDAGFSVMAMGELGDEE >LS483299|1924207:1931041|1928327_1928753_-|SQE31781.1|DBSCAN-SWA MYKHILVAVDLSEESLVLVRKGAALAEKCGAKLSLIHVDVNFSDLYTGLIDINMSSVQYSVVEETNTALAELASKVNYPVSECLNGTGDFSQVLEEAVEKHNVDLLITGHHQDFWSKFMSSTRRVMNNITVDMLVVPLADE >LS483299|1924207:1931041|1924476_1925094_-|SQE31777.1|DBSCAN-SWA MKVIIPVAGLGTRMLPATKAIPKEMLILADKPLIQYIVNECVAAGFKEIVLVTHSSKNAIENHFDTSFELETMLEKRVKRQLLDDVRSIVPKDVTLIHVRQGQAKGLGHAVLCGRTVVGDEPFAVVLPDVLLGEFTANQKTENLAAMVKRFQETGYSQIMVAPVPMENVSSYGVADCHGVDIPLGGQRLLRKWLKNQVLKRRLLI >LS483299|1924207:1931041|1925229_1925415_-|SQE31778.1|DBSCAN-SWA MLILTRKIGEVLLVGDDVEITVLSIRGNQVKLGVNAPKEISVHRREIYERIKASAEEENAE >LS483299|1924207:1931041|1928983_1929757_+|SQE31782.1|DBSCAN-SWA MKIVSEPKTSGRHTCTIHCQNCSISQLCLPFTLNETELTQLDNIIERKKPIQKSQVIFKLGDELRSLYAIRSGTLKAYTLSESGEEQITGFHLPGDLIGFDAITNMQHEGYAQALETSMICEIPFDILDDLAGKMPKIRHQIMRLMSNEIKSDQEMILLLSKMNAEEKLAAFLYNLSQRYSARGFSAKEFRLTMTRGDIGNYLGLTIETISRLLGRFQKSGMISVQGKYIIINRMEELAELAGAIKPQQNIIAQTTA >LS483299|1924207:1931041|1927224_1928133_-|SQE31780.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKTTSDIRQSFLEFFQTKGHTIVPSSSLVPENDPTLLFTNAGMNQFKDVFLGLEKRPYSRATTAQRCVRAGGKHNDLENVGYTARHHTFFEMMGNFSFGDYFKQDAIKFGWEFLTSPQWLGLPKEKLYVTVYETDDEAYDIWHKEVGVPSEHIIRIGDNKGAPYASDNFWAMGDTGPCGPCTEIFYDHGPEHWGGLPGSPEEDGDRYIEVWNIVFMQFNRLADGTMEKLPKPSVDTGMGLERMTAVMQHVNSNYETDIFQTLIKEVATLLNVKDLDNKSLRVVADHIRACSYLIADGVFTFK >LS483299|1924207:1931041|1930744_1931041_-|SQE31784.1|DBSCAN-SWA MKKLLAMSVLTALLTTACTTQTAHIGGKVTDNIKPTKSVTQSFFIGGIGQEETLNVVEVCGSKDKVQQVETVLSGGDILLGLVTIGIYTPRTANVYCK |
9 | Bacillus_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1971051 : 1981602
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483299|1971051:1981602|DBSCAN-SWA TTTAATGAGCTTCGTCCCAGTTTTCGCCTACGCCAACTTCGGCAATCAGTGGCACTTTGAGGCTAATCGCTTTTTCCATTTCGGTTTTGATTAATTGGCTGTAATGGTCGATTTTATCGGCTTTGACTTCAAACACCAATTCATCGTGAACCTGCATAATCATTTTGATTTCATCATTATCACGAATCGCATTATCAATACCAATCATCGCCACCTTAATAATATCGGCAGCCGTGCCTTGCATTGGGGCGTTGATTGCCACCCGTTCTGCTGCTTTACGCAAAATAGCATTGCCGGATTTAATATCAGGCAAGTACAAACGGCGACCAAATAGGGTTTCAACATAGCCTTTTTCAACTGCAACTTCACGAATATCGGTCATAAATTGTTGAACCGCCGGGTAACGTTGGAAGTAGAGATCCATATATTTTTGAGCCTCTGCACGCCCAATCCCTAATTGGTTTGAAAGCCCAAATGACGACATTCCGTAAATCAGCCCGAAGTTAATTGCTTTCGCACTGCGGCGTTGTTCGGAGGTGACTTCACCTAACTCCACCCCGAAAATTTCGGCAGCGGTAGCACGGTGAATATCTTTGCCCTCCGCAAAGGCGTTAATCATTCCCTCATCATTCGATAAATGAGCCATAATCCGTAGCTCAATTTGTGAATAGTCGGCAGCGACAATTTTATAACCTTCTCTCGCGACAAAAGCTTGGCGAATCCGTCTGCCCTCTTCATTGCGGATCGGAATGTTCTGCAAATTCGGATCGCTGGAAGAAAGGCGTCCGGTTGCGGTGACTGCTTGATTGTAAGAGGTATGCACCCGCCCTGTTTTTTTGTTAATCAGTTGTGGTAATTTATCGGTGTAGGTAGATTTCAACTTACTTAACCCACGATGCTCCATTAATAACTTCGGCACTAAATGCCCTTGTTGAGCCAACTCGTCTAACACTTCTTCGTTGGTTGAGGGTGCACCTTTTGGGGTTTTCTTCAACACCGGCAAGCCTAATTTTTCAAACAAAATCTCTTGTAATTGTTTAGTTGAGGCAAGATTGAAGGTTTGCCCTGCTTCTGCGTGTACTAATGTTTCAACTTCCTCCAAACGTTTTTCAATTTCAGCCGATTGGGTCAATAATTTTTTCGGGTCAATCAACACGCCATTGCGTTCAATTCGAGAAAGTACGCCCACAAGTGGCATTTCAATTTCATCGAATAACTTCACCAATTCAGGCTCTTGCTGTAGTTTTTCCCACAATACTTGGTGGAGTTTCATCGTCACATCGGCATCTTCTGCCGCATATTCAGCCGCTTTTGCTATCTCGATTTTATCGAAGGTCAGTTGATTTTTCCCCTTACCAGCAAGCTCTTCAAACGGAATCGTTTTATGCCCCAAATAACGGGCGGCTAAATCGTCCATATTATGACGACCGGTGCTGTTTTGGGTGTAAGATTCAATCATCGTATCAAAAGCAACACCTTGTAGCTCAATGCCGTAGTTCGCAAAAATGGTTAAATCATATTTAATATTCTGCCCGATCTTTTTAATCTCCGGGTTAAGCAAAATCGGCTTGAGTTTACTTAAACAAGCGGTCAAATTTAGCTGATTTTTTACCAATTCATCGGAAGACGGGCTTTCTGAACGCTCCTCATCACCGAACATATCGGCTTGTTGCGGTTGGGCTTTTTGCTTATGCCCAAGCGGAATATAGCACGCCTCGCCATTTTCCAGTGCAAAGGAAATACCGACCAAATTAGCCGACATTGCGTCAAGGCTGTCGGTTTCGGTATCCACCGCAATCAAACGAGCTGCGGTGAGTTTTTCGATCCAGGCTGATAATTTCTGTTCAGTATCAACGGTCTCATATTTGCTACGATCGATCTCGACCACATTTGCAACATTTTCCTCATTTCTGACCGCTTGTGTTACTTGGTAATTATTCGGTACTTTTTCAGCCGAAGTTTGAGTGACCGGATTGGCATTTTGATTCACTTCGTTCAGCCAGCGTTTAAATTCATAATGCTCAAATAATTGAGCAAGCTCAGCACGGTCTTGCGGCTGTGTTAAAAGTTGATCGTGAGTAACATCAAGTTCCACATCGGTTTTGATGGTAGCAAGCAAATAGGATAAATCGGCATTCGCTTTTTCCGCTTCCAATTTTGGGGCGAAATTTTTTGCCCCACGGAAAGAAAGGGTGGCAATTTGATCCAAATTAGCATAAATCTGTTCAAGTGAACCAATGCCTTGCAATAAAGCTAATGCGGTCTTTTCCCCCACACCTTTTACGCCCGGAATGTTATCGGCGGAATCGCCCATTAATGCCAGAAAGTCGATAATCAACTCAGGCGGAATGCCATATTTTTCAATCACGCCTTCACGATCTAACAAAGTATTGTTCATCGTGTTAATCAACATAATGTGATCGTTCACCAATTGTGCCATATCTTTATCGCCGGTGCTGATCAACACATCTTTGCCGTCTTTAGCGGCTTGCACAGCAAGCGTGCCGATCACATCATCAGCTTCCACACCTTCAATCGAAATCAGTGGAATGCCTAAGGCTTTGATAATGCGATGCAAAGGCTCAATTTGAGGGCGTAAATCATCGGGCATTGGTGGGCGGTGCGATTTATATTGCTTAAACAACTCATCACGGAAGGTTTTCCCTTTGGCATCAAACACCACAGCAATATGGCTTGGATTCACTTGTGAAATCAGGCTTTTTAACATATTCAGCACGCCATACATTGCCCCTGTTGGTTCGCCTAAGCGATTAGTGAGCGGAGGGAAAGCGTGAAATGCTCGATATAAATAGGAAGAACCATCCACCAATACCAGTGGATTTTTTGCGATAGTTGCCATAAAAATCTCTTTATAATCAAATAAATATTGGCGTTATTATACAAGAATATTTAAGAATTGAGTGTGTATAAGGCTTATTTTAAATAAAACGTTCCGAAAAAACATTGAATTTCATTAAAAAATTCCTTTATTTATCAAATAAATGCGATTTGTTTCGGAACGTTTTTTTAATGCTTATTTTGCAACATACGGATTATCAATGGAAAGCGTTGCTGTAGACATTGTGCCTCCTAGTACAAAAAAACCGCTTGGTTTCCCTAAGCGGTTCTAATCTATAAGAACTATTAAACTACAATCTGCCCCGTCTCTTTTAAGTACTTATAGATACGCCCTAACATAATCTGCGTTGGCGTTTTGCCAATATCCTCTTTTGTTAGCGGTGCATCAGTAATCTCCTTGGCGGACTGTGCATCAATGTATTTGTACTCACTTGTGATGATTACAAAGTTTGTTACTTCTCCATCGGTATCATCGCCTGTACCGACCACATATTTAGCATTGAGCGAGCCGTCATCTTGCGTTGAGTAGCTTGCGATGGTGGAATACATTGGGTTTAAGATTTTGTTAAAAGTTGTCATAATTTTTCCTTTTGTGGATTGTTGATAAAAAAAGACCGCTTGTAGTCATACAAACGGCTTAGTAGGAAGAGTAAATTGCTTTACATAATATAACCTTTTATTTATACTTCATTTATAAATAGTAAGTTATAAAAGGTTCAAAAATGGCAGACCCTATAGAATGGTCTATTATCACGACTGACTGCTTTGATGAATGGTTCGGTCAACAAGATGAAAGTACTCAAGAACGTGTCTTGGCTTGTTTAATCTATCTGCGGAAATTCGGTTATAGTCTAGGCAGACCTTATGCTGATACAGTTTATCAGTCTAAATTCCCTAATATGAAAGAGTTACGCATTCAAAACAAAGGTAAGCCAATTCGAGCATTTTATGCTTTTGACCCTTTACGCCAAGCGATAGTACTTTGTGCTGGCGAGAAAGGTAAAGACAAAAGATTCTATGAAAAAATGATCGCTCTTGCTGATGCGGAATTTACCTCCTATTTAAATAATTTAGAGAAAGAAAATGAAAACGTTAGATCAAATGCTCAATGAACTCTCTCCTGAACGCCGCCAAAAAGTGGAAGATATGGCTCAAGAAATGATTAGAGAGATACAACTTTCAAAACTAAGAGAAGAGCTAAATCTCTCTCAACAACAATTAGCTACAGCTCTCGGTATTTCACAGCCTGCTATTGCTAAACTTGAACAGAAAGATAACGATCCAAGATTATCCACGCTCAAACGCTATATTGAAGCAATGGGCGGTAAGTTAAAACTTGCCGTTGAATTGCCTACAGGCGATGAGCGTGTAATTAGGATTTAATTACTTTGTTAACCTGAATGCCCTCCTGAGCCAATACAGTTTTTCCCCGGTAATTGCTCTTGAGGGGCTAGTTGATAACAAAAGGTTGGTTTTGTTGTATAGTCTTGCTTATATTGAGTTGTACAAGCTGAAACCATAATTGTTGTAAGTAGTATAATTTTTTTCATATTTGCCTCCTATAATTGATAAGATGAACCATTTGTAGATGATATAATTGCTCGAAAATTCACTTTAGCACTTCTCCCACGCCCTGCACACCACGCACGACACGTTACTACATATTGAGTATTAGCAATGAGTATTGCCCCAGAATCATTAAATGGGTTAGATACATTAGGTGAAATAGTATTGCTAATATCAATTACAGACGGTAATGTAATTGTTGTCGGTGTCCGATTACTACCACTACCATAAAAAGTTTTGCTTTTACTCTCTCCTGTTGGAGTGTGGACAACATACAATGTTCTTGTCGCTTTTGTAGCAGGTAGTACAAATTGACATACATACTCATAATATGTATCACTTAATGCAAAACTGTTTTCCGTTTCTGAATATGTTTTACTTTTCCCTGTTGCTTTTGATGTCCAAGTTTTAGCCTCATAGATATTACCTCCGATCAATTGGTTGATTTCAAGTTCTCCAGTAAATTTACCTGTTAATCCCTCAATTCTTGCTCCTTTAATTATTCCCCCTGTAATTGTTGTACCTGAAATTGTCCCACCACTAATTGTCGTCCCTGTAATTGTACCAGCAGTCAC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GGCTATCTTGGCTCACAAGATACTTTCTATGTGGGCAACCTCAAAGGAGTGGGTCGTATTTATCAACAAACGTTTATTGATACTTACAGTAAAGTGGCGTTTGCAAAACTTTATACAATGAAGACCGCTATCAGTGCTGCGGATATGCTGAATGATAAAGTGTTACCATACTTTGAAAGCCAAGGTTTACCGATGTTACGCATATTAACTGACCGAGGAAGTGAATATTGTGGCAAGGTAGAAAATCACGATTATGAGCTTTATTTAGCGATAAATGACATAGAGCATACGAAAACGAAAGTGAAGCATCCCCAGACGAATGGCATCTGCGAACGGTTCCATAAAACAATCTTACAAGAATTTTACCAAGTGGCATTTAGGAAGAAAATTTATACGGATTTAACGACATTACAAGCGGATTTAGATGAGTGGTTAATGTATTATAATCACCATCGAACACATCAAGGAAAAATGTGCTGTGGCAGAACACCGATGGCAACCTTACTTGATGGAAAACGGATTTGGGTGGAAAAGAATTTAAGCTCAAATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483299|1971051:1981602|1976556_1976757_-|SQE31836.1|DBSCAN-SWA MNLTSYLSDRPRGFKADFAKKLGISKSYLRQVETGYSPMPAYLAKKIEEVTNGEVAKSELRPDLWD >LS483299|1971051:1981602|1975300_1975459_-|SQE31834.1|DBSCAN-SWA MKKIILLTTIMVSACTTQYKQDYTTKPTFCYQLAPQEQLPGKNCIGSGGHSG >LS483299|1971051:1981602|1974194_1974488_-|SQE31831.1|DBSCAN-SWA MTTFNKILNPMYSTIASYSTQDDGSLNAKYVVGTGDDTDGEVTNFVIITSEYKYIDAQSAKEITDAPLTKEDIGKTPTQIMLGRIYKYLKETGQIVV >LS483299|1971051:1981602|1978018_1978516_+|SQE31839.1|DBSCAN-SWA MNRPMIQNDPRDAIILSLLANAVYGGHNNSQISYQETEEVNLDARLRQVEGDVREIKSNYLTKEAFYKAGGSTLIALVVTAGIALWTVYSHLDTKVEARFSKIDDKFVQVETNIKNLDIRLTKVESRLDNVEQRLDNVEQRLGNMEKKIDGVDNKLDLLLQQFKR >LS483299|1971051:1981602|1976887_1977571_+|SQE31837.1|DBSCAN-SWA MIKGMTLPEIRRKKLTEWFNTRDIPEKEKSYISQLKSGKSSFGERAARRLENEYGMPSFYLDYDEETESAIVSAMSIQETQSHQYPIHLIDFKAKAGETGFVNTNYPEIIQSIYFSLDGLLEIVGRKSSNGIEMITIPTDSMSPTINKGDVVFIDTTINYYDNEGVYIFVIDDEVYIKRLQKIPGGIYRALSDNKTYEPFDIKRETLDTAIILGKFIRVLPINPKDL >LS483299|1971051:1981602|1974992_1975292_+|SQE31833.1|DBSCAN-SWA MKTLDQMLNELSPERRQKVEDMAQEMIREIQLSKLREELNLSQQQLATALGISQPAIAKLEQKDNDPRLSTLKRYIEAMGGKLKLAVELPTGDERVIRI >LS483299|1971051:1981602|1980561_1981602_+|SQE31843.1|DBSCAN-SWA MFYSNNPLIKHKTGLLNLAEELGNISQACKVMGMSRDTFYRYQQAVEQGGVEALLNQNRRVPNLKNRVDEAIEQAVVKFALDNPAFGQVRVSNELRKQGIFVSAGGVRSIWLRHHLANFKQRLIALEKLVAEQGIILSETQVQALERKKEDEIACGEIETTHPGYLGSQDTFYVGNLKGVGRIYQQTFIDTYSKVAFAKLYTMKTAISAADMLNDKVLPYFESQGLPMLRILTDRGSEYCGKVENHDYELYLAINDIEHTKTKVKHPQTNGICERFHKTILQEFYQVAFRKKIYTDLTTLQADLDEWLMYYNHHRTHQGKMCCGRTPMATLLDGKRIWVEKNLSSN >LS483299|1971051:1981602|1975468_1976536_-|SQE31835.1|DBSCAN-SWA MPRNELTKNARAIGLSESQFSRTFADNVEMVAVIIDYLSIELADIRFALRLDNIQGKANPFLFARRPMLEEASDNVTDITQPSPWQNAGVTAIHGGSIATNTVTAQQIAANTITANQIAAGTIAARNMAANSINASHIVGSSITADKLNVNNLAAISANLGKVTAGTITGTTISGGTISGTTITGGIIKGARIEGLTGKFTGELEINQLIGGNIYEAKTWTSKATGKSKTYSETENSFALSDTYYEYVCQFVLPATKATRTLYVVHTPTGESKSKTFYGSGSNRTPTTITLPSVIDISNTISPNVSNPFNDSGAILIANTQYVVTCRAWCAGRGRSAKVNFRAIISSTNGSSYQL >LS483299|1971051:1981602|1971051_1973910_-|SQE31830.1|DBSCAN-SWA MATIAKNPLVLVDGSSYLYRAFHAFPPLTNRLGEPTGAMYGVLNMLKSLISQVNPSHIAVVFDAKGKTFRDELFKQYKSHRPPMPDDLRPQIEPLHRIIKALGIPLISIEGVEADDVIGTLAVQAAKDGKDVLISTGDKDMAQLVNDHIMLINTMNNTLLDREGVIEKYGIPPELIIDFLALMGDSADNIPGVKGVGEKTALALLQGIGSLEQIYANLDQIATLSFRGAKNFAPKLEAEKANADLSYLLATIKTDVELDVTHDQLLTQPQDRAELAQLFEHYEFKRWLNEVNQNANPVTQTSAEKVPNNYQVTQAVRNEENVANVVEIDRSKYETVDTEQKLSAWIEKLTAARLIAVDTETDSLDAMSANLVGISFALENGEACYIPLGHKQKAQPQQADMFGDEERSESPSSDELVKNQLNLTACLSKLKPILLNPEIKKIGQNIKYDLTIFANYGIELQGVAFDTMIESYTQNSTGRHNMDDLAARYLGHKTIPFEELAGKGKNQLTFDKIEIAKAAEYAAEDADVTMKLHQVLWEKLQQEPELVKLFDEIEMPLVGVLSRIERNGVLIDPKKLLTQSAEIEKRLEEVETLVHAEAGQTFNLASTKQLQEILFEKLGLPVLKKTPKGAPSTNEEVLDELAQQGHLVPKLLMEHRGLSKLKSTYTDKLPQLINKKTGRVHTSYNQAVTATGRLSSSDPNLQNIPIRNEEGRRIRQAFVAREGYKIVAADYSQIELRIMAHLSNDEGMINAFAEGKDIHRATAAEIFGVELGEVTSEQRRSAKAINFGLIYGMSSFGLSNQLGIGRAEAQKYMDLYFQRYPAVQQFMTDIREVAVEKGYVETLFGRRLYLPDIKSGNAILRKAAERVAINAPMQGTAADIIKVAMIGIDNAIRDNDEIKMIMQVHDELVFEVKADKIDHYSQLIKTEMEKAISLKVPLIAEVGVGENWDEAH >LS483299|1971051:1981602|1974631_1975021_+|SQE31832.1|DBSCAN-SWA MADPIEWSIITTDCFDEWFGQQDESTQERVLACLIYLRKFGYSLGRPYADTVYQSKFPNMKELRIQNKGKPIRAFYAFDPLRQAIVLCAGEKGKDKRFYEKMIALADAEFTSYLNNLEKENENVRSNAQ >LS483299|1971051:1981602|1978868_1979288_+|SQE31841.1|DBSCAN-SWA MLRYPVEITPDDNGTYLVTCPDIPEMASVGEDLEEALLEAQDGLATALEFYFDDRREIPMPSPIKEGQHTVNLTVLQSMKVFLLNEMIKQGVRKAEMARRLDVHLPQIDRLLDFNHSTKVEFVEKAYGKLNQHFTILPH >LS483299|1971051:1981602|1979623_1980268_+|SQE31842.1|DBSCAN-SWA MFGHIWQYAREWGYTTLASPNTGMKRFPIRKREIYVENNIFEMVYEVADQDIKDLMDLAYLTGQRPVDLVNIQRDHIFDGYLHIVQQKTQAKLRIEIVGKLADIIQSRLEKTTRNFLFTTSKGEKMTSVKLGRRFTYIREQAAKKHPEYANEIKEFQFRDLRAKSGTDKALAQGEEAARQQLGHTSVQMTKVYIRKAPIVTPIQESVSSQKHKP >LS483299|1971051:1981602|1978647_1978830_+|SQE31840.1|DBSCAN-SWA MKYSEFLRYLLAQGCEIENHRRGSHRKVTLNGKQSVFPYHGSKEIGTGLVNKIKKDLDLK >LS483299|1971051:1981602|1977645_1978026_+|SQE31838.1|DBSCAN-SWA MNNKRIKPEQFADFITQRTGRNLTCPICNSQEHYLHDGYDTFTELCGEKIIGVPTIPYRIEPSPDEVMKFAAPEFHSLHFNEREGTKYWLDQKARTAVIVTCVCCNNMLFFDRERILEWIKGSQNE |
14 | Mannheimia_phage(70.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2012928 : 2021999
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS483299|2012928:2021999|DBSCAN-SWA ATCAATGTTCGCATCGGCTTTTTTTCAATACCCCGCTGTTATCCATATAGTTTTTCAACGCACGAGTTAATGCCCCACGGAAACCGGCTAAGTGCGTACCGCCATCACGCTGTGGAATATTATTGGTAAAGCAGTACACATTTTCGTTGTAACTGTCATTCCACTGTAGGGAAATTTCCACGCCAATGCCGTCTTTCTCAGTGGTCAAATAGAATGGCGTATTGTGAATATGAGTTTTGCCTTCGTTTAAATACTCAACATAGGCTTTAATACCGCCCTCATATTTAAAATGCTCTTCTTTGCCGTCTCGTTCATCAATTAATTTAATCGAAACGCCTGAATTCAAAAATGATAGTTCACGCAAGCGTTTAGACAGAATTTTATATTCAAATTCGGTTTTATTTTTGAAAATATCCAAACTTGGCCAGAAACGAACCGACGTCCCCGTTTTTTCGGTATTGCCGATAATCGCTAAAGGTGCATCAGGCTCACCTAAGCTATAGAATTGCTCGTGAACGTGTCCTTCACGGCGAATAGTGAGTTGTAATTTAGAGGAAAGTGCATTCACCACCGATACGCCCACACCGTGCAAACCGCCGGAAACCTTATAGGAGTTATCGTCAAATTTACCGCCTGCGTGAAGAACAGTCATAATGACTTCTGCTGCCGAAACGCCTTCTTCCGGGTGAATCCCCACCGGAATTCCACGACCGTCATCTTGCACAGAAACCGAATTATCGGAATGAATTGTGACAATAATGTCTTTACAATGCCCGGCTAATGCTTCGTCAATCGCATTATCAACCACCTCAAACACCATATGGTGTAAGCCCGTACCGTCATCGGTATCGCCGATATACATTCCCGGGCGTTTACGCACCGCATCTAAGCCGCGTAACACCTTAATACTGGAAGAATCATAACTTGTTGCTTGAGTTTGTTCAGACATTCTTATTCCTACTAATTTGAAATCGAAAAAATTGTGCCGATTATAGCAGAAAAATGCGTAAAAGTATCGCAAAACAAGCGGTTAAATTTTAGTTGAAATTGCAGTCTATCTCAATTCTACAAGACCACAGATTAAATTTTACAATACTCCGCAGACAGCTCCTCCACTTTCTGTACAACCCTATAATCCAAATCCTTATAATCTCTCTGTAAGCCTTTGAAATGCTTACGGGCATAGTCGATTTTCATTCGTTCACTTTCATCTAATTTTTCTTCATCTACTCCTGCTTGAATACCTTTGCCTGTATTTTTCGTTTCGGCAACCAAGTAAATTTTATTTTCTCCCTTAAACACAACTGCCCAATCGGGATTATAGCTGCCTAATGGCGTTGGAATTTTAAAACGTTTGGGTAATTTAAAATAAAACTCCACTTGCTCACTAGATTCACAATGTCGGGCGAAGATATTTTCTGTTTGGGAATCCAGTGCAATATAGTCTTCATAAATCGTTTTTGTTTTATCTTGAACTTCAAAAGTATATTGATTGAGGTAAAAATCAAAATCGCCGAATAACGTCATTTCATAGGTTTTTCCGGCAATTTTGTGATATTCCACCCCGTCTGTCATAATTTGTTGTAAAGCAAGGTTGATTTTCTCTGCAATTAAATCAATAAAGCGTTGAGGATTGCGGAAGACTTCTTGCAAGCGGTCGGATTTTTGTAAAATTTTGCAAAGGGTCGCACGCGTCAGCCCGGTTTTCTTTTGAATCTCACTCAATAAATCAGGTATCGCCCATTGTGTATTTACCGCTGTTTCATTAGATGAGCGATAATTAGTTGAAATCCCTGTTTCATTCATTTCCAATTTCACTTTGGAATGCTTAATTTTTGTCGCCTCGATATCGGGCATTTTGCGGATTTTTTCCACCGCACTTTCAATCAATTCCGCATTACTGAAATCTACCCGATAAGTGGTTTGGTGTTTAATCCGTTCCCAAATTGCCGCAAATTCCGGATGTAAGCTGAAATCTTTACGGTAGCGAACGGCTTTTTTTATCTTCCCGTTTTTTAACATTGCTTTTGGCAAACTGTACACCACAATCTTCCTCAATTTCACGCTGTAATGTGGCGGCAAATTGTTCGTAACTTTCATTTGCGATAATTGTCAGCGTATTTAGATGACGATCATAAATCCGCAATCCTTGTTGATTCACAGGCAAACGCAAGCCCCGCCCAATCTCTTGGCGTTTTTTCATTTCGCTTGCAGTATCGTTTAAAGTACAAATTTGAAACACATTCGGATTATCCCATCCTTCTTTTAAGGCAGAATGCGAGAAAATAAACCGTAACGGATTCTCCAGCGAAAGCAATTTTTCTTTATCCCGCATAATCAGTTGATAAGTCTCGTTATCCGCTTGCGTTGTGCCATTAGTATCTTTTGCTACGCCTTTTTTATCCTGTGAGAAATAACCGTTATGCACGCCTTGAGGCTCTTCTTTGGCTAGCTCCAAATAAATTTCCTCAAACCATTTTGCAAATTTTCCCCCCGTAGGGCTTTGTGCAGAAGGGCGATAATTATCCACTTTATCGATAAAGAACAAAGACAACACCTTGATCCCAAGCGGTCGTAATTTCTTTTCTTTTTGCAAATGCTCGCCAATAGTGCGGCGAATCTGCATTTTTTGCACATCTTCTTTAAGTTGGGAATGTTCCGCCCCTTGAAAAATTTGTGTGCCGTTGGAGAAGCTAACCATTTGGCTATCGGTATCCATTCCGCTTAATATAAACCCTGAACGATACATTTCATTTTGGTTGGAAAGCTCATACAAATCCTGATTCGGTTTCACGCTAATCACTTTCTTTTTCATCGCTTTTTTATCGTTAAATAAAATTTCGATTTTTGCCGACCAGCTTTTTGCCCCTGTTTTAATCTCTTTGAGGGAAAGATAAGCTCCATTTACCTCATTTTCCGCCAATACGCTATCTACCTCAATTTGTTTAACTAATCCCATTTCATAGGCTTGCACCGGATTGAGGCTAAAAATCGGGTTATACGCATTTTTATGGGTGGCAGAATAACGCAAAGTGAAAAGCGGACTTAAACTCTCAATCGCATTACGGCGAATCTCCGTTTCCATATTTTGCGGTTCATCAATAATCACAATCGGATTCGCCTGTTGAATATAGAAAATCGGAGCATCACCGCTTTCATTCACGGTATTAATCACGTTACTTTCTTTGGTGAAAGCATCAATATTCATCACTAAAATTTCAATATGATTAGCACTAGCAAAGGATTTTAAGCGTGAAGTTTGGTTACTTTTATATTCAAATTTTTGATTGACGCTCGGGTTATCAAATACCGTATTAAAATGGCTTTTTGTAGTTTCCAACGTATGCAACACTCCCTCACGAATTGCCACACTCGGCACGACAATCACAAATTTTTGCCAGCCGTATTGACGGTTTAATTCAAAAATCGTGCGTAAATAGACATAGGTTTTCCCTGTACCAGTTTCCATTTCCACGGTAAAATTTTTTCCCTGTTCGACAAGCAAAGTGCGGTCGATTTTTTGCCTGTTTTGCAGATTAGCCAAATTCTGTTGTAACTGCTCATCACTAATCTGCAAGCCTAAATTCGGCACAAACCGCATATCATTTTGGGCTTTGAGTGAAAATTCAGTTGCGGCATTCGGCTGTCCGACAAACAAATTTACTGTGGCATTAACGGCTTGTAATTGATACTCTAAGGTTTCAAATTGGAGTTCCATTTTTTCTCCTTAAATCACAAAAAACGTAATGCCGGCATCTTGCATTTGCAATTCGGTGTTTTTCTTCCGGGCATCATTGCCGTTGAATAAACGGTCTAAAGCGATGACTTTTTTCGGTTGTTGAGCGATAACAGTTTGAATAATTTCTTCGTCGGCTGCATTTAACAGCAAGGCGAAAATCAGCCCGTTTTCTTCCACCCAAAACACCTTATTTTCCAACCGCACTTTTGCCGTGAGTTTTAACCCTAAACGCAATAAAAGCTCATATAAAACGGCTTGCGTATCCGCTTTTTCACTAACAGGATCAATAAACATTTCAAGTTGATCGGCTAAATTTTCAGATGTGGGCGATTGCCATTGTTTAAAATGGCTTTCTGTCAGTTTGAAGACTTTAAAACCTACATCAAGCGGTCGGTTTTCGGGGTTATTTTGCAAAATCTGCTTTCCGGCACGGCGAATACGTTCTTTTGAAATTTCAGTTATATATAGTGGTAAATTTTTTCTTTGGCAAAATTGCTTTGCTACTTTTCCATTCTTACTCTTGATATCAATTTCTTCAGGATATTGAACCGCAATAAATTTTCTATTACCCTTATCAATTCTATTACTTTCCAATATTGCGTGTGGAAATGATGAACTGCCAGCAAAGAAATCTAAAGAAATAAAATTTTTATCTTCAAATAGAGTTATTAAATGTCTTAAAAAATTAGGATTTTTAGGTGCAGAGAAAACAGGGAGTTTTGTTTCGAATAATTCTTTTAGCAGTGTTCCTGCCGAAGTTGTCTTAACATCTAGGGTGTAATTGGTTAAATTACCAGCCGAAACTGCTTTATAGTTTTTATTATTCAGTATACTTTTCATTCTTATAGTATCACTAAAGTTTTTTTCATAAATTTTATCTTCTGTGAATTCTAAAGATTCGTCTTCAAATAACTCAAGGAATTTAAATCTTGTGTATGTGTTTTCTACAAATTCATCATCAAAAAACGAAATATATCTTACATACCCTTGATTAATTAAATTTAAATCCTTATCATCAAGAGAATCTTCGAACTTTAAAATAATATCATCATCTAATTTATTAAAATAAACTGAATAGTGTTTATCTGAGGTAAAATCTGTTACAGGCTGATTAAATTTGTTTTCCCCAACTAATACTCGTTTTCCACTTGCGTGAACATAATGTCCATTTTCATCTTGACACATATCCTTAGCATTTTTAGGAATATTTTCAACAAATTTCCCCATTTCTTTATTTTTAGCATAAATAATACAAAAATCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS483299|2012928:2021999|2016654_2018736_-|SQE31873.1|DBSCAN-SWA MPNSTAQHSTAQHSTAQHSTAQHSTAQHQHSTAQHSLANFSLKDQQLSQLKSLLPEIFTEGKIDFDKFQQLFSDNFSTEPDRYMLNWAGKSTAYQTLQTPTSKTLTPCEEESVDFENTQNIFIEGENLDVLKALQKSYFNSVKMIYIDPPYNTGNDFIYNDSFADTKADYAEKVGDVDEHGKLKRAFVRNSKENGHYHSNWLNMMLPRLHLAKNLLRDDGVIFISIDDNEQAQLKLLCDEVFGEENFVAILSVENNPKGRKNSKFISVSNDFCIIYAKNKEMGKFVENIPKNAKDMCQDENGHYVHASGKRVLVGENKFNQPVTDFTSDKHYSVYFNKLDDDIILKFEDSLDDKDLNLINQGYVRYISFFDDEFVENTYTRFKFLELFEDESLEFTEDKIYEKNFSDTIRMKSILNNKNYKAVSAGNLTNYTLDVKTTSAGTLLKELFETKLPVFSAPKNPNFLRHLITLFEDKNFISLDFFAGSSSFPHAILESNRIDKGNRKFIAVQYPEEIDIKSKNGKVAKQFCQRKNLPLYITEISKERIRRAGKQILQNNPENRPLDVGFKVFKLTESHFKQWQSPTSENLADQLEMFIDPVSEKADTQAVLYELLLRLGLKLTAKVRLENKVFWVEENGLIFALLLNAADEEIIQTVIAQQPKKVIALDRLFNGNDARKKNTELQMQDAGITFFVI >LS483299|2012928:2021999|2018935_2019811_-|SQE31874.1|DBSCAN-SWA MNNETLFSKQKWIAYAQLMRFDKPIGTLLLLHPTLWALFIAAEGMPPVAILAIFTLGVIVMRAAGCVINDYADREIDGHVKRTSQRPLATGRVTTTEAKVIFAILLLFAFLLDLMLNRYAFLLSFVAVFLAVIYPFMKRFTHLPQVVLGMAFGWSIPMAFGAVTETLPLECWLLFFANLAWTVAYDTQYAMVDRDDDLRIGVKSTAILFAQYDNKIIALLQFITLILLGLLGVVKDYHIGYFVVLALSATLFIYQCWLTKKRERSECFKAFLNNHYFGLGVFVAILVGIYF >LS483299|2012928:2021999|2014007_2014949_-|SQE31871.1|DBSCAN-SWA MLKNGKIKKAVRYRKDFSLHPEFAAIWERIKHQTTYRVDFSNAELIESAVEKIRKMPDIEATKIKHSKVKLEMNETGISTNYRSSNETAVNTQWAIPDLLSEIQKKTGLTRATLCKILQKSDRLQEVFRNPQRFIDLIAEKINLALQQIMTDGVEYHKIAGKTYEMTLFGDFDFYLNQYTFEVQDKTKTIYEDYIALDSQTENIFARHCESSEQVEFYFKLPKRFKIPTPLGSYNPDWAVVFKGENKIYLVAETKNTGKGIQAGVDEEKLDESERMKIDYARKHFKGLQRDYKDLDYRVVQKVEELSAEYCKI >LS483299|2012928:2021999|2012928_2013876_-|SQE31870.1|DBSCAN-SWA MSEQTQATSYDSSSIKVLRGLDAVRKRPGMYIGDTDDGTGLHHMVFEVVDNAIDEALAGHCKDIIVTIHSDNSVSVQDDGRGIPVGIHPEEGVSAAEVIMTVLHAGGKFDDNSYKVSGGLHGVGVSVVNALSSKLQLTIRREGHVHEQFYSLGEPDAPLAIIGNTEKTGTSVRFWPSLDIFKNKTEFEYKILSKRLRELSFLNSGVSIKLIDERDGKEEHFKYEGGIKAYVEYLNEGKTHIHNTPFYLTTEKDGIGVEISLQWNDSYNENVYCFTNNIPQRDGGTHLAGFRGALTRALKNYMDNSGVLKKSRCEH >LS483299|2012928:2021999|2020631_2021999_-|SQE31876.1|DBSCAN-SWA MELTALTALSPIDGRYQDKVASLRPIFSEFGLLKFRVTVEVRWLQKLASHTQINEVPVFSEKANDYLNQIVADFSLEDANRIKTIERTTNHDVKAVEYFLKEKCEALPELQAVNEFIHFACTSEDINNTSHALMLKTAREEVLLPEWKKVIDAVAELAKCYQHIPLLSRTHGQPASPTTMGKEMANVAYRLQRQYKQLENLEILAKINGAVGNYNAHLSAYPEIDWHTFSQEFVESLGVTWNPYTTQIEPHDYIAEFFDCVARFNTILIDFDRDMWGYIALNHFKQRTIAGEIGSSTMPHKVNPIDFENSEGNLGLANAVMAHLGQKLPISRWQRDLTDSTVLRNLGVGLGYALIAYASTLKGISKLEVNEQHLRDELNQNWEVLAEPIQTVMRRYGIEKPYEKLKELTRGKRVDETAMREFIDKLEIPENEKNRLKEMTPASYIGYAVELVDKL >LS483299|2012928:2021999|2014905_2016645_-|SQE31872.1|DBSCAN-SWA MELQFETLEYQLQAVNATVNLFVGQPNAATEFSLKAQNDMRFVPNLGLQISDEQLQQNLANLQNRQKIDRTLLVEQGKNFTVEMETGTGKTYVYLRTIFELNRQYGWQKFVIVVPSVAIREGVLHTLETTKSHFNTVFDNPSVNQKFEYKSNQTSRLKSFASANHIEILVMNIDAFTKESNVINTVNESGDAPIFYIQQANPIVIIDEPQNMETEIRRNAIESLSPLFTLRYSATHKNAYNPIFSLNPVQAYEMGLVKQIEVDSVLAENEVNGAYLSLKEIKTGAKSWSAKIEILFNDKKAMKKKVISVKPNQDLYELSNQNEMYRSGFILSGMDTDSQMVSFSNGTQIFQGAEHSQLKEDVQKMQIRRTIGEHLQKEKKLRPLGIKVLSLFFIDKVDNYRPSAQSPTGGKFAKWFEEIYLELAKEEPQGVHNGYFSQDKKGVAKDTNGTTQADNETYQLIMRDKEKLLSLENPLRFIFSHSALKEGWDNPNVFQICTLNDTASEMKKRQEIGRGLRLPVNQQGLRIYDRHLNTLTIIANESYEQFAATLQREIEEDCGVQFAKSNVKKREDKKSRSLP >LS483299|2012928:2021999|2019803_2020565_-|SQE31875.1|DBSCAN-SWA MKQANRHKKIIELVNQLGYVSTEQLVAELNVSPQTIRRDLNEMAENNLIRRHHGGAAAPSNTENSDYTHRKQFFSHEKNAIAQQVAKLIPNGASLFLDIGTTSEAVALALLSHKNLKVVTNNLNAAHILMQNEDCQITVAGGGLRSDGGLIGEETVRFINQFRLDFGILGISAVDMDGSMLDYDYHEVQVKRALMECSRQVVLVTDHSKFTRTAIARLGNVKEVNYLFTDQDLPLELQTHLSQSDVIVKICNE |
7 | Erysipelothrix_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2147229 : 2207178
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS483299|2147229:2207178|DBSCAN-SWA ATTATTTCACTCGAAACACTTTTACATTGCTGTAGCCATTCTCTTTCAAATAAAGAGCCTGCAGTTTACTCATTACCCCACGTTGGCAATAGAGCAAGTAGGTTTTGCTTTGGTCAAGCGTACTAAACTGGCTGGAAAGTTTATAAAACGGGAGTTCTTTTACTTCAACCCCGTCTAAACGGAATGGTTTTTCATCAACCTCTTCCGGGCTGCGAATATCTAGCACAACATCGTTTTTACTCAATTCTGTTGTGGTTTCAACCGAAACAACCTCTTTTTCGGTTTGCTGAGCGATCTCACGAATATCTAAATAACTCGCCGTTTGAACCGCTTGTTCTAGTACCTCAAAATTAAAGTTGCCTTCTTCTTCCAAAATTTTAGTTTCGATTGCCTTAACCGTCGGATTTTTAGAAATTACTCCACAGAACTCCGGCATTGATTTAGCAATATCGTCAGTGCCTATCGCTTTTGCCATTGCAATAATCTGCTCTTTATCGTGAGTGATGAGCGGACGTAATACTAGCGTATCTGATGCCTTATCAATTAAACGTAAATTAGTCAGTGTTTGGCTAGAGACCTGCCCCAACGCCTCACCGGTCACAATCGCTTGAATATCAAAACGCTCGGCAATACGGCTTGCCGCTCGCACCATCATACGTTTTAATACCACGCCCATTTGTCCGTTATCAACTTTTTCTAAAATCTCACCCACTACATTTTCAAAATTAATGGCGATAAAACGGACTTTGTGCGAGGTACTATAACGGCTCCAAATATGATATGCCATCTGTTTCACGCCAATTTCGTGTGCGGCACCACCTAAATTGAAAAAACAGTAATGCACACGAGAACCTCTGCGAATCAGCATATAGCTCGATACACCCGAATCAAAACCACCCGAAATCAATGACAACACATCTTCTTGTGTGCCGATTGGATACCCGCCTAACCCTTCGTGGCGAGCTTTAATCAGCAACATTTTATCATGTTCAATATCAATTCTGACCGTAACATCTGGGTTGGTTAATTTCACTTTCGCCGTTTCAATCCGCTGATTCAGCCCACCACCGACATAACGCTCTACATCAAGAGAACGGAAATCGTGCTTTCCTTTACGGCGAACCCGCACGCTAAACGTTTTGCCTTCTAGTTCAGCTTTCACTGCGGCATAAGTCTGCTCAAAAATATCGTGCATATCCGTAAAAGGGGTTTCCTCCACTTCTAAAATATGGTGAATACCCGGCGTGCGTTTAAGCAAATCCAGCACTAATGCCGTTTCTTCGTCCACTTTCGCCCGAACTTCAATAAAGTCCCAATGGCGAACCACAGACACATTTTCAGTCTCTTTTAATAATACGTTGCGAATATTTGAGGTTAAAATTTTGATAAAGCGTTTCCGAACAGAGTCGCTTTTAATCATAATTTCAGGGAAAAGTTTGATGATAAATTTCATATTTAATAAGGATCGTGTAATAAAAATGGCAAGTATTTTAGCCTTTTCTGCTGAAAAAGCCCAGAAAAAGAAATCCTCGACCAATGCCGAGGATTTGCAAAATATCCGTAAAATTAGACCGCTTGTAAATGGTTTTCATACGTCTGCAAGGTATTTTGCATTAACATTGCCACCGTCATCGGGCCTACCCCACCGGGGACAGGGGTGATAAATGCCGCTTTTTGTGAGGCAACTGAATACTCTACATCACCTTTTAGTTTGCCGTCTGCTCCACGGTTAATCCCTACATCAATCACGATAGCACCGTCTTTAACCCACTCCCCGGGAATAAATTCAGGCTTGCCGACTGCCACAACTAAAATATCTGCTTGGCGAACGTGATGCTCTAAATCTTTGGTAAAGCGATGAGTAACTGTGACTGTACAACCACCAAGCAACAATTCTAACGCCATCGGGCGACCAACAATATTAGACGCACCTACAATCACTGCGTGTTGACCATATAAATCTACCCCAGTTGTTTCAAGCAACTTCATCACACCGTATGGCGTGCAAGGGCGTAAAGTGGGAATACGCTGAGATAAACGCCCAACATTATAAGGGTGGAATCCATCAACATCTTTATGTGGTAAGATGGCTTCAATCACTTTAGTCGAATCGATCTGTTTAGGTAACGGTAATTGGACTAAAATCCCATCGACCGAATCATCTTGATTCAACTTTTCAATCAGTGCTAATAATTCAGCCTCTGTGGTTTCTTCGGGTAAATCATAAGATTTCGACGCAATCCCAATTTCGGCACAGCTTTTGCGTTTACTCCCCACATACACTTGAGAGGCTGGGTCATTCCCCACTAAAATGACCGCAAGACCAGGGTTACGTTTACCCTGTTCAAGATAATGAGCGATTTTCTCACTCACCTTTTTTTTAATTTGTGAAGAAACCTCACTCCCCGAAATAATTTGTGCAGTCATTACTACCTCCCGAAATATCACTTGGCAAAACATTCGTCATTCTCTCAAAAAATAGCCTTTTTGATAAGCTAATTTTGAATAACGGATAAACTTCAATCATTTAAGCCGACATTCACAAAAAAAGATTGACTGTTGTGCAAAGAAATCTATAATCAACAACATCTTATGTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGGGTCGTAGGTTCAAATCCTATCTCGCCGACCACTTCTTTTTATATTATCTTCATCTGCGCCCTTAGCTCAGCTGGATAGAGCAACGCCCTTCTAAGGCGTGGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTAGGGCGTGCCATTAATTACCCTTATATTTCAAATAGTTACATTTAAATATCAGTTATTAATTTTCTATGTCAAAAATACTTTGTGACTAATTTGTGACTAGAATTTAACTGAGTTAGCGTGGTTGAGTAAATGGTCTGCATTAAGATGGGCATATTTCTTTACCATCTCTAATGTTTCCCAGCCACCCAATTCTTTTAAGGTAAATAATGGTGTGCCGGCCTGAACGTGCCAACTGGCCCAAGTATGCCTTAAATCATGGAAATGGAAATCAACCAATAAACATTTTTCAGTCGCTTTGTTAAATATTTTGCGGTTAATATCTTGTAATGCCTGCCCTTTGCTTCCTACAAAAACATATTTAGGATTTTTCCCTCTCTGCTTTTGTAATAATTCAATTGCATCATCATTAAGTAAAAGCGATCTCGCTTTTTCAGATTTGGCAATATCATTCGAAACAATCGCTACTTTACGGATAAAATCTATTTTATCCCAAGTCATAGAAAGTATTTCTGTTCGCCTTGCTCCTGTTAATAAAGCAAAAGAGCAGATAGTTTTCATCCAATCAGTACTAATATTATTAATAAACTGCTTGGCTTGTTCTTTGGTAATCCAACGAACCCGGATAGGTGGCTCTTTCTTTTTAGGGATAAACGGCATTTTATCAATATATCCTGCCTGATAAGCTAATTTTAAAATTCGCATTATAGAGGTTCTATATTTATTCTTAGTAGAATTTGTCAATGGCGTGTCTTTTAACATATGCTTTTCTGGAATCGCCCCCAGTATTTCATCGCTTGTTAAAGAACTTAATATTCGACCAGCAAAAATATTTCGATAATAAATTGCGTGCCGTTTTTTGGTTGCTGTATCCTCTTTTCCTTCCGCATCTTTTAGAAATAAAACCAATGCGTTTTCAAAGAGATAATCAGGTTTTTGATCTAGCTTATCAATTTGCCACAACTGAGCTTTTAATTTATCGTGGTATTGCTGAGCTTCTTTTTTTACAGTTGTTTTAATAGTGCGTCTAATTCTTTCTCCACTAGGGGTGTAGAGGTCAATGTAATAGACGTCACCTCTTTTTCTGATCGGCATAATTTTTCCTCTCCGACCGATAGAGCAAGCCCACGGTCATTATTAGATCGTTTTTTCAACAAATCAAGATTTGATTTATCAACTCGCCATAACCGGGAGCCATCCATTTGGTAAAATCCCCATCTATGGCGATTGTTGAAAACAGTCCAATAGGATACATTAAGGATATTTGCTACCTGTTTAATGCTTAATGTTTCCACATTATTCTCCAAAAAATAACCGCTTGCGGAACAAGCGGTTAATTGTCAAATTCATTAAATGTTAAAACTTATAAACCAAATTATCTTCATAAGTAGATTGATAATTTAGATTAGCTTTAACTTTAATCCATTTCGCATTTTCAAAAGTTTGCCAGTTATCTTTTTTCTCGCTAACCATAAAATCTACGAACCTCACAAATTCACTTTTTGTTGAACTAAAAAAGATATAAGGCACTTTAGTTAAATTGATTAATCTTAAAAAATCGATTAAATCAAAATAAGTGGCTTGCTTATAGCTTTCTTGGCGAGTACAAAGATATGGCGGATCAAGTAATAACAATACCTTATCTTTATGCTGAAAACGTGGTAATAGTTTATGAAAACTTTCGTGAGTAACTTCTATTCCATCTAAATAGCCTTCCGCACTTGGATAATCGGTTTGGCGAATACCATTCCAAAATATTTTGTTAAATAGATCCTCTAAACTATTAATTTGCTGTCCGCTAAATAGCAACCAAGAAGCCACACAATTTACATCAATATACCCATCAAAAGACTGAATAATATTGATAACTTGAGATTTCTTATCAGGATCTAATCGCTTGTTTTTAGGCGTACTCTCCCCAATAATGTCATAAATTTGCTTGCGTAGCCTATTTGTATCGGGAATATGCTTTAGCCGCTCCGCATATCCATCATAATCATTGTAGATGATGTGAGCTTTTGGTTTGATATGTTTGGCAGTATGAGCTAATAACCCACTACCACCAAATACATCTATGATTGTCCAATCTTGGCCGTCATCAGGAATATTCTCATTTAAAATTTGAGAAACCTGAGCTAGAAACATTCGTTTCTGACCTACAAACGGAAGTGGGGCTTGTTTAAAGATTTGCTTTGCCATAGTTCTCCTATGGCGTTCAGGCGTTCTTAACGCTCAGACA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MRRLLVPILAVVAFVVLQAITIVNEGERGIMLRFNKVHRDSDQKVVVYEPGIHFKVPFIDSLKVLDARIQTLDGQEDRFVTVEKKDLLVDSYVKWRISDFGQFYTSTGGDYQKAADLLRRKVGDRLRSEIGSRTIKDIVSGSRGELMAGAQKALNAGEDGAERLGIEVVDVRVKQINLPNEVSSSIYQRMRAERDAVAREHRSQGNEKAEVIRAEVDKKVVLILANANKTAQALRGEGDAQAAKLYSEKFGNEPEFYSFIRSLKAYEDSFAEGQNNMMLLKPNSEFLRFMQAPTK >LS483299|2147229:2207178|2156383_2156569_-|SQE32028.1|DBSCAN-SWA MNKMKQLAPFALLILLLGIVGRMDYDDHIKMQRYKCERNQGVWQVESNGNQYCGGKYGTKN |
86 | Mannheimia_phage(39.58%) | capsid,tail,portal,terminase,protease,tRNA,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2217306 : 2224563
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS483299|2217306:2224563|DBSCAN-SWA ACTAAACCGCTAAATCTGCTTCATCTCCTCGATTTTGTAGCCATTGTTTACGATCTTCCGCTCGTTTTTTACCCAATAGCATATCCATAATTTCAAAGGTATTCAATTCGCCCTCTTCTACCGTGTCATCAAAGGTTAATTGTACTAAGCGGCGAGTGCTTGGCTCCATCGTAGTTTCACGCAACTGGCTCGGGTTCATTTCGCCTAAGCCTTTAAAGCGTTGCACATTTGGCTTTCCTTTTTTCTTGGCAAGGCGAGCTAAAATCGCCTCTTTTTCCGCCTCATCTAAGGCATAATGCACCTCATCTTTGCCGATATCAATGCGATAAAGTGGTGGCATTGCCACATAAACGTGTCCGTTTTGCACCAATTTCGGGAAATGACGAAGGAATAACGCACACAGCAAGGTGGCAATATGCAAACCGTCTGAATCCGCATCGGCAAGAATACAAACTTTGCCATAACGCAACTCTTCTAAATTATCGCTATCAGGGTCAATTCCCAAGGCTACCGCAATATCGTGTACTTCTTGTGAAGCCAATACTTGGTCTGATGAAACCTCCCAAGTGTTTAAAATCTTACCACGCAGTGGCAAAATGGCTTGATACTCTTTATCTCGAGCTTGTTTTGCCGAACCGCCGGCAGAATCACCTTCTACCAAGAAAAGTTCGGTACGGCTGAGATCTTGAGCAGTACAATCCGCCAGTTTGCCCGGTAAAGCCGGACCACTCACCAATTTCTTACGCACCACTTTTTTCGCCGCACGCATACGGCTCTGGCGGAACTAATTGCCATTTCAGCAATTAATTTACCTGTCTGCACATTTTGGTTAAGCCATAAACTAAAGGCATCTTTCAAGGTGCTATCCACATAGCTTGAGGCTTGACGGGAAGACAAACGCTCTTTGGTCTGCCCTGCAAATTGTGGCTCTTGAATTTTCAGAGAAAGCACATAAGCACAACGGTTCCACACATCATCAGCGGTTAATTTTACCCCTTTCGGCAATAAATTATGGATTTCGCAAAACTCCACCATCGCCTTTAATAAACCGTTACGCAAGCCATTAACGTGCGTGCCGCCTTGTGCGGTCGGAATCAGGTTCACATAGCTTTCCGCTACTAACTCGCCCCCTTCCGGCAACCAAGTTAATGCCCAGCTTACCGCCTCTGTTTCAGCAGTAACATCACCAATAAACGGTGGATTCGGCACGGTTTCATAACCGTTTAATGCCTCGCTCAAATAATCAGATAAGCCGTCTTCGTAATACCAACTTTCTTCGTATTGTTGATTTTATCAATAAAATTGATGGTGAGTTTCGGGCAAAGCACCGCTTTGGCTCGTAACAAATGGCGTAAACGACTCACCGAAAAACGAGGGCTATCAAAATATTTTGGGTTCGGGTAAAAACGCACTGTCGTGCCGGTCTGTTTTTTCGGGCAAGTACCAATTACCGTCAGATCTTCCACTTTTACCCCGTTGGCAAAGGCAATCGAATAGACTTCTCCGCCACGTTTAATCTGAATTTCAACCCGTTCGGACAGGGCATTTACCACCGAAATCCCCACCCCGTGCAAACCACCGGAAAACGTATAGTTTTTATTGGAAAATTTACCGCCGGCGTGCAATTTCGTTAAGATAAGCTCCACCCCTGAAATTTTCTCGGTGGAATGAATATCGACCGGCATTCCCCGCCCGTTATCCACCACTTCCAACGAATTATCAGCATGAAGAATCACATCAATTTTATCTGCAAAGCCGGACAACGCCTCATCGACACTATTATCAATCACCTCCTGCCCAAATGGTTTGGACGTGTGGTATCCGTGTACATTCCCGGGCGAAGCTGCACCGGCTCGAGGTCTTTCAGAACGGTAATTTCATCCGCCCCATAGCGTTTTTCAGACATTATGCTTTCTCTTAGGCTTAAAATAAAATAAGGCTGAATTTTAAGGAATATTCAGCTATTTTGCAAAATTTTGGTGAAAAATGACCTGTTGTTATGCAATAAAAACTATTTTTGCGATCTACATCGAAAAAATGAGTTTTAATTTCCCTATTTGCTTATTCATTCAGTATCTTAATCTCACTTTTTATTTTAAAATGGTACTATATTATGGTAGTAAAAATCCTAAAGCGGAAATCTCAAAAGACACTACAACAAATCTACACCCAGCCTATTTCTGCCAATATTAAATGGACAAATATAGAAGCTCTTTTTCTAGAGTTAGGAGCAGAAATAGAAGAACGAGAAGGGAGCAGAATTGCAGTTGTTTTATTTCAACAGGTCAGAGTATTTCATCGCCCACACCCGAATCCTGATACAGATAAGGGGCGGTAGCGAGTATTAAAAAATGGTTATCTGAAAACGGAGTCATTCCTTATGCGTAATATTATGGATATTAATGGTTATAAAGCTGTCATTGCTTACGATCCCGAAACAGAATTATTTCGAGGTGAATTTATCGGATTAAATGGTGGAGCCGATTTTTATGCCGATAATGTCATTCAATTAAAAAAAGAAGGTGAACTAAGTTTGAATATCTTTTTAGAACTTTGTAGAGAAAAAGGTATTGAGCCGTTCAAACAATATTCCGGAAAGTTTAATGTTCGCCTTTCGCCTGAATTACATAAAGCTGCGGTAATTGCAGCAACTGCTGAAAATTTAAGCTTAAATGAATGGATTAACCAAACGTTAGAAAAGAGCGTGTAGCCTAATTGCAAAACAATCACCTATTTTGACCGCTTGTATTACCCGTTTAACCCATTCAATATCGAACACTCCGAATTGGCGTTGCCACAGCAAGAGCTACTCCAGCTTTTGAGCAAAGTCAGCATTTGGTTTAAATCGGCAATTTTTTGTTCAAGCTCACCGATATGCTGTTCGGTTAATTGTTTTACATCTCGGCTTGAGCGGTTTGGGTTGTCGTTTAATTTAAGTAGTTCGCTGATTTGAGCCAGCGAAAAGCCCACTTTTCGGGCATTGCTGATAAAATGTAATCGGCTCAAATCAGTAGCATTGTAGAATCGATACCCCGCTTCGGTGCGACTTGTCGGCGGCAGAAGTCCTGCTTTTTCATAATCTCGGATTTGTTTGGCGGAAAGCCCGGTTTTTTCTGCGGCTTGGCTAATATTCATTATAATCTCTCACTTTAATCGCTTGACCTTAACCTAAGGTTAAGCTTTATTATACGCCTGAATAATCACTCAAAACAGGAGAAAATGATGACAATTACCCTACAACTTGATGGCTTACATTGTGGCAACTGTGTGAAAAGTGTCGAAAAAGCGTTAAATGGCGTGGCTGGGGTGAACCAAGTTAGCGTAACGTTAGAACCGCAAATTGCTGTGGTGGAAGGCTCAGCAGAAGCACAAGCCTTAATTGAAGCGGTTGAAGACATTGGCTTTGACGCAAAATTAGCCTAATTAATAAGGGGCAGAAATTTTGCCCTAATCTGCCCAATATTTCGGAGGATAAATGACAAGCACAGCTCACTATTCGCCAGAACAACAACTTTTGATTGATGGAATGCACTGTGCCGCCTGTGTTCGGCGAGTGGAAAAAGCCTTACTTAAAGTGGAAAAGGTGGAATTTGCCTCAGTCAATCTTGCCGATCAAACCGCTTTTGTGCAAGGCAACGCCAACCTGAAGCCTTGGTAGCAGCGGTAGTTAAAATCGGTTTTGGGGCAGAAGTGCTGGAAAGCGAGGAAGAACGCCGAATTAAACAACAAGCCCAAACGCAACGAGTGTTAGGGCATAAACGCACTCAATTTATGCTTGCCCTTGTAGTTGGTTTTGCCTTAGTTGCTTTTGGGTTCTACAAAGGAATGACGGTAAACGAAACCAATCGTTCGCTTTGGCTCAGCTGGGCAGGTATTAGCCTTGCGACAATGTATTTTTCAGGTAAAGATTTCTTTCTTGGGGCATTTTCAGCACTGAAAAACCGCTCAGCCAATATGGACATGTTAGTAGCAATCAGCACCGGCACGGCTTGGCTCTATTCTTGTTGGCTCACGCTTTTCCCACAACCGAATGCTCACGTTTATTTTGAAGCCAGCGTGATGATTCTCGGCTTTATCAATCTAGGAAAATACTTAGAACTGAAAGCCAAACAGCGTTCCTCGCTAGCATTGGAAAAATTGCTGGATCTCGCCCCAAAACAAGCGGTCATTTTTGAAGAAAATATTGCAAAAACCATTCCGGCTAAAGCAATTAAGCCACAAATGCGGGTGCAAGCCTTAACCGGTGACCGCTTGGCGGTTGATGGTATTTTAGACAGTGGCTCTATTTGGGTTGATGAATCAATGCTCACCGGTGAAGCCCTACCTGTAGAGAAAAAAATCGGTGATAAAGTGCGAGCCGGCACTCTGGTGCAAGACGGTTCAGGCACTTATATTGCCGAACAGGTCGGCTCACAAACCGCTTTGGCTCGTGTAATCAATGCCGTTCGCCACGCCCAAAGCAGCAAACCGCCATTGGCACAGTTTGTAGATAAAATCGCCGCTGTTTTTGTGCCGGTGGTGGTTTCAATCGCATTACTTTCTGCGTTAATTTGGCTGGCAGTTGGGCAGGATTTTGCCTTTGCACTCTCGATTTTTACTACCGTGTTGATCATCGCTTGCCCTTGTGCATTGGGGCTGGCAATTCCGCTTTCTACCATTGCCGGCGTGGCACGTTCTGCCGAATTTGGCGTGCTGGTGCGAAATATTGAGGCACTACAAGCAAGCAGTGAAATCGACACCCTAGTGTTCGATAAAACCGGCACACTCACCACTGGCAGAATGGAAGTGTCGGATGTTCTCACCTTTAACGGATTTGAGCAAAAGCGCTTGCTACAACTTGCTAAAAGTGTAGAGCAACACGCCTCACACCCGATTGCGAAAGCGATTGTAAAATTTGCCGAAAATCAGACCGCTTGTGGTGTAACCGATGTGCAAGTGTTGAAAGGGTTAGGCATTTCAGCAAAATATGAAGGCAGTACAATCAGAATGGGAAATTGGCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS483299|2217306:2224563|2219418_2219643_+|SQE32116.1|DBSCAN-SWA MVVKILKRKSQKTLQQIYTQPISANIKWTNIEALFLELGAEIEEREGSRIAVVLFQQVRVFHRPHPNPDTDKGR >LS483299|2217306:2224563|2223873_2224563_-|SQE32123.1|DBSCAN-SWA MTTISPELTITENTLSPEAQKVRQALLAKGIETPTVTHTKDKASRRAEIQQHMQAVLELLGLDLSDDSLEETPHRLAKMYVDEIFSGLDYATFPKITNIENRMKVSEMVLVDDITLTSTCEHHFVTIDGKVAVAYYPKKWVIGLSKINRVVQFFAQRPQVQERFTEQILTAFQTILETDDVAVYVKATHFCVKCRGIKDTNSYTVTSAFGGVFLEDRETRKEFLGLLNK >LS483299|2217306:2224563|2220053_2220440_-|SQE32118.1|DBSCAN-SWA MNISQAAEKTGLSAKQIRDYEKAGLLPPTSRTEAGYRFYNATDLSRLHFISNARKVGFSLAQISELLKLNDNPNRSSRDVKQLTEQHIGELEQKIADLNQMLTLLKSWSSSCCGNANSECSILNGLNG >LS483299|2217306:2224563|2218540_2219095_-|SQE32114.1|DBSCAN-SWA MIDNSVDEALSGFADKIDVILHADNSLEVVDNGRGMPVDIHSTEKISGVELILTKLHAGGKFSNKNYTFSGGLHGVGISVVNALSERVEIQIKRGGEVYSIAFANGVKVEDLTVIGTCPKKQTGTTVRFYPNPKYFDSPRFSVSRLRHLLRAKAVLCPKLTINFIDKINNTKKVGITKTAYLII >LS483299|2217306:2224563|2223023_2223809_-|SQE32122.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKIALGIEYDGSRYFGWQRQEAVESVQQQLEQALSVVANSPVEVFCAGRTDAGVHGTGQVVHFETQANRPLQSWCFGTNAHLPDDIAVKWAVAVNEDFHARFSATARRYRYIIFNQKLRSAILPKGVTHFHFPLDERKMHQAGQYLLGENDFSSFRAAKCQSNTPWRNIHHLNVSRQGNYVIVDIQANAFVHHMVRNIVGTLLEIGQGRQPVEWAKWVLEQRDREKAAPTAKAEGLYLVEVHYPEHFGIPKTPLGPLFLAD >LS483299|2217306:2224563|2217306_2218074_-|SQE32112.1|DBSCAN-SWA MRAAKKVVRKKLVSGPALPGKLADCTAQDLSRTELFLVEGDSAGGSAKQARDKEYQAILPLRGKILNTWEVSSDQVLASQEVHDIAVALGIDPDSDNLEELRYGKVCILADADSDGLHIATLLCALFLRHFPKLVQNGHVYVAMPPLYRIDIGKDEVHYALDEAEKEAILARLAKKKGKPNVQRFKGLGEMNPSQLRETTMEPSTRRLVQLTFDDTVEEGELNTFEIMDMLLGKKRAEDRKQWLQNRGDEADLAV >LS483299|2217306:2224563|2220780_2220963_+|SQE32120.1|DBSCAN-SWA MTSTAHYSPEQQLLIDGMHCAACVRRVEKALLKVEKVEFASVNLADQTAFVQGNANLKPW >LS483299|2217306:2224563|2219091_2219211_-|SQE32115.1|DBSCAN-SWA MSEKRYGADEITVLKDLEPVQLRPGMYTDTTRPNHLGRR >LS483299|2217306:2224563|2218034_2218544_-|SQE32113.1|DBSCAN-SWA MSEALNGYETVPNPPFIGDVTAETEAVSWALTWLPEGGELVAESYVNLIPTAQGGTHVNGLRNGLLKAMVEFCEIHNLLPKGVKLTADDVWNRCAYVLSLKIQEPQFAGQTKERLSSRQASSYVDSTLKDAFSLWLNQNVQTGKLIAEMAISSARAVCVRRKKWCVRNW >LS483299|2217306:2224563|2219685_2220015_+|SQE32117.1|DBSCAN-SWA MRNIMDINGYKAVIAYDPETELFRGEFIGLNGGADFYADNVIQLKKEGELSLNIFLELCREKGIEPFKQYSGKFNVRLSPELHKAAVIAATAENLSLNEWINQTLEKSV >LS483299|2217306:2224563|2220956_2222903_+|SQE32121.1|DBSCAN-SWA MVAAVVKIGFGAEVLESEEERRIKQQAQTQRVLGHKRTQFMLALVVGFALVAFGFYKGMTVNETNRSLWLSWAGISLATMYFSGKDFFLGAFSALKNRSANMDMLVAISTGTAWLYSCWLTLFPQPNAHVYFEASVMILGFINLGKYLELKAKQRSSLALEKLLDLAPKQAVIFEENIAKTIPAKAIKPQMRVQALTGDRLAVDGILDSGSIWVDESMLTGEALPVEKKIGDKVRAGTLVQDGSGTYIAEQVGSQTALARVINAVRHAQSSKPPLAQFVDKIAAVFVPVVVSIALLSALIWLAVGQDFAFALSIFTTVLIIACPCALGLAIPLSTIAGVARSAEFGVLVRNIEALQASSEIDTLVFDKTGTLTTGRMEVSDVLTFNGFEQKRLLQLAKSVEQHASHPIAKAIVKFAENQTACGVTDVQVLKGLGISAKYEGSTIRMGNWQFVGETIQANLASLLPAKEGDFSSKIFVSVDNQLAGVLSVSDQLRPEAKATIHQFQAEGYQCVMLTGDRQQTADYFANALGLDGVIAEVLPEQKAEKIRALQAEGKKVAMIGDGINDAPALAQANVGIAMHNGSDIAVETADLSLMREGLAPLMQILPFSKKVLKNMKQSLLGLLSIMLLRFLLLPACFTLSPAGYSTQ >LS483299|2217306:2224563|2220527_2220728_+|SQE32119.1|DBSCAN-SWA MTITLQLDGLHCGNCVKSVEKALNGVAGVNQVSVTLEPQIAVVEGSAEAQALIEAVEDIGFDAKLA |
12 | uncultured_virus(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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