CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
LS398548	Orientia tsutsugamushi isolate Karp genome assembly, chromosome: I	1 crisprs	RT,DEDDh	9	4	30	1

1. LS398548

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: LS398548_2

• CRISPR_ID: LS398548_2
• CRISPR_location: 318163-318242
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of LS398548_2

Consensus_repeat	Method
ATATCAAGAAGCAATAGAGAATTT	CRISPRCasFinder

spacers of LS398548_2

>2.1|318187|32|LS398548|CRISPRCasFinder
AATAAAGGAATTTCTTTATACCAATTAGGGCA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS398548_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of LS398548_2

>merge|LS398548|2|318163-318242|CRISPRCasFinder
ATATCAAGAAGCAATAGAGAATTTAATAAAGGAATTTCTTTATACCAATTAGGGCAATATCAAGAAGCAATAGAGAATTT

>LS398548|2|2|318163-318242|CRISPRCasFinder
ATATCAAGAAGCAATAGAGAATTT	AATAAAGGAATTTCTTTATACCAATTAGGGCA
ATATCAAGAAGCAATAGAGAATTT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
LS398548.1|SPR14479.1|320103_320682_-|(p)pGpp-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|223394
LS398548.1|SPR14471.1|316525_316756_-|conjugal-transfer-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|313610
LS398548.1|SPR14485.1|322864_323098_-|integrase	unknown	unknown	unknown
LS398548.1|SPR14474.1|317365_317722_+|IS5-family-transposase-ISOt6	unknown	unknown	gnl|CDD|372649
LS398548.1|SPR14469.1|315826_315967_-|Uncharacterised-protein	unknown	unknown	unknown
LS398548.1|SPR14470.1|316218_316506_-|Uncharacterised-protein	unknown	unknown	unknown
LS398548.1|SPR14473.1|316974_317268_-|conjugal-transfer-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|372224
LS398548.1|SPR14482.1|321439_322210_+|conjugal-transfer-protein-TraA	unknown	unknown	gnl|CDD|274289
LS398548.1|SPR14472.1|316710_316971_-|conjugal-transfer-protein-TraD	unknown	unknown	gnl|CDD|313610
LS398548.1|SPR14478.1|319082_319985_-|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|372314
LS398548.1|SPR14484.1|322662_322854_-|integrase	unknown	unknown	unknown
LS398548.1|SPR14477.1|318753_318975_+|conjugal-transfer-protein-TraD	unknown	unknown	unknown
LS398548.1|SPR14466.1|313003_313273_-|30S-ribosomal-protein-S15	unknown	unknown	gnl|CDD|180170
LS398548.1|SPR14475.1|317733_318108_+|IS5-family-transposase-ISOt6	unknown	unknown	gnl|CDD|372577
LS398548.1|SPR14468.1|315085_315526_-|transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|238045
LS398548.1|SPR14476.1|318285_318423_+|TPR-repeat-containing-protein-08	unknown	unknown	gnl|CDD|379053
LS398548.1|SPR14480.1|320915_321062_-|replicative-DNA-helicase	unknown	unknown	gnl|CDD|181676
LS398548.1|SPR14481.1|321019_321247_-|DNA-helicase	unknown	unknown	gnl|CDD|181676
LS398548.1|SPR14467.1|313296_314205_-|tRNA-pseudouridine(55)-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|179300
LS398548.1|SPR14483.1|322288_322477_+|conjugal-transfer-protein-TraA	unknown	unknown	gnl|CDD|235927

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
LS398548.1|SPR14479.1|320103_320682_-|(p)pGpp-hydrolase	gnl|CDD|223394	COG0317, SpoT, Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolases/synthetases [Signal transduction mechanisms / Transcription].	2.06194e-31
LS398548.1|SPR14478.1|319082_319985_-|transposase	gnl|CDD|372314	pfam12784, PDDEXK_2, PD-(D/E)XK nuclease family transposase. Members of this family belong to the PD-(D/E)XK nuclease superfamily. These proteins are transposase proteins.	6.31668e-48
LS398548.1|SPR14471.1|316525_316756_-|conjugal-transfer-protein	gnl|CDD|313610	pfam10412, TrwB_AAD_bind, Type IV secretion-system coupling protein DNA-binding domain. The plasmid conjugative coupling protein TrwB forms hexamers from six structurally very similar protomers. This hexamer contains a central channel running from the cytosolic pole (made up by the AADs) to the membrane pole ending at the transmembrane pore shaped by 12 transmembrane helices, rendering an overall mushroom-like structure. The TrwB_AAD (all-alpha domain) domain appears to be the DNA-binding domain of the structure. TrwB, a basic integral inner-membrane nucleoside-triphosphate-binding protein, is the structural prototype for the type IV secretion system coupling proteins, a family of proteins essential for macromolecular transport between cells and export.	1.464e-16
LS398548.1|SPR14482.1|321439_322210_+|conjugal-transfer-protein-TraA	gnl|CDD|274289	TIGR02768, conjugal_transfer_protein_TraA, Ti-type conjugative transfer relaxase TraA. This protein contains domains distinctive of a single strand exonuclease (N-terminus, MobA/MobL, pfam03389) as well as a helicase domain (central region, homologous to the corresponding region of the F-type relaxase TraI, TIGR02760). This protein likely fills the same role as TraI(F), nicking (at the oriT site) and unwinding the coiled plasmid prior to conjugative transfer.	3.88643e-30
LS398548.1|SPR14473.1|316974_317268_-|conjugal-transfer-protein	gnl|CDD|372224	pfam12615, TraD_N, F sex factor protein N terminal. This domain family is found in bacteria, and is typically between 96 and 107 amino acids in length. The family is found in association with pfam10412. TraD is a cytoplasmic membrane protein with possible DNA binding domains. It is part of the bacterial F sex factor complex.	5.58173e-05
LS398548.1|SPR14472.1|316710_316971_-|conjugal-transfer-protein-TraD	gnl|CDD|313610	pfam10412, TrwB_AAD_bind, Type IV secretion-system coupling protein DNA-binding domain. The plasmid conjugative coupling protein TrwB forms hexamers from six structurally very similar protomers. This hexamer contains a central channel running from the cytosolic pole (made up by the AADs) to the membrane pole ending at the transmembrane pore shaped by 12 transmembrane helices, rendering an overall mushroom-like structure. The TrwB_AAD (all-alpha domain) domain appears to be the DNA-binding domain of the structure. TrwB, a basic integral inner-membrane nucleoside-triphosphate-binding protein, is the structural prototype for the type IV secretion system coupling proteins, a family of proteins essential for macromolecular transport between cells and export.	1.2442e-28
LS398548.1|SPR14480.1|320915_321062_-|replicative-DNA-helicase	gnl|CDD|181676	PRK09165, PRK09165, replicative DNA helicase; Provisional.	8.47726e-21
LS398548.1|SPR14475.1|317733_318108_+|IS5-family-transposase-ISOt6	gnl|CDD|372577	pfam13359, DDE_Tnp_4, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.29654e-08
LS398548.1|SPR14466.1|313003_313273_-|30S-ribosomal-protein-S15	gnl|CDD|180170	PRK05626, rpsO, 30S ribosomal protein S15; Reviewed.	8.13406e-47
LS398548.1|SPR14474.1|317365_317722_+|IS5-family-transposase-ISOt6	gnl|CDD|372649	pfam13613, HTH_Tnp_4, Helix-turn-helix of DDE superfamily endonuclease. This domain is the probable DNA-binding region of transposase enzymes, necessary for efficient DNA transposition. Most of the members derive from the IS superfamily IS5 and rather fewer from IS4.	1.55719e-17
LS398548.1|SPR14468.1|315085_315526_-|transcriptional-regulator	gnl|CDD|238045	cd00093, HTH_XRE, Helix-turn-helix XRE-family like proteins. Prokaryotic DNA binding proteins belonging to the xenobiotic response element family of transcriptional regulators.	1.39063e-11
LS398548.1|SPR14476.1|318285_318423_+|TPR-repeat-containing-protein-08	gnl|CDD|379053	pfam13181, TPR_8, Tetratricopeptide repeat.	0.00294197
LS398548.1|SPR14481.1|321019_321247_-|DNA-helicase	gnl|CDD|181676	PRK09165, PRK09165, replicative DNA helicase; Provisional.	3.53219e-33
LS398548.1|SPR14467.1|313296_314205_-|tRNA-pseudouridine(55)-synthase	gnl|CDD|179300	PRK01528, truB, tRNA pseudouridine synthase B; Provisional.	1.9936e-97
LS398548.1|SPR14483.1|322288_322477_+|conjugal-transfer-protein-TraA	gnl|CDD|235927	PRK07078, PRK07078, hypothetical protein; Validated.	0.000652034

Protein sequences

>LS398548.1|SPR14475.1|317733_318108_+|IS5-family-transposase-ISOt6
MVDKKTNQVICTDFSNYKKHDFRLFKKSKILIHPKVKVITDTGYQGIQKIHNNSELPKKKSKKNPLTKNDKKNNHGLAGARVVNENVIGMLKRFKIIADKYRNRRKRFSLRFNLISGIYNFELP
>LS398548.1|SPR14474.1|317365_317722_+|IS5-family-transposase-ISOt6
MVDILRKADGLKKSKGGRKNKLNLEEQLLMVLEYLREYRTYFHIGQNYGISESSAYKAVKWVEDTLVKHQNFALPGRKAIMKSDMNYEVVLIDATETPIERHKKNKNSIIQERRTGIH
>LS398548.1|SPR14473.1|316974_317268_-|conjugal-transfer-protein
MQLKLAIGEHFYDIDQIGIKFYSLRFKKWIHLNAQDFLLESLIVFAIGVIISIVFFTAQGKKTIIKAKIRGADFVGYKKNGLAKMLKRAKKASRICF
>LS398548.1|SPR14472.1|316710_316971_-|conjugal-transfer-protein-TraD
MPLVKNSERLHILITGTTGTGKTNMLNELLPQIRLHKDRAIIVDTTGAFTDRFFDSKCDKLLNSLEKIVSSGCLGMIVLKQLIFMI
>LS398548.1|SPR14471.1|316525_316756_-|conjugal-transfer-protein
MPWNDCFEAADFHDIASSFSNYTPKLDDFFAKNAELVLSEALKLYQDDKDIIKLIHAIIYSDNRQFVKSFRNTDCR
>LS398548.1|SPR14470.1|316218_316506_-|Uncharacterised-protein
MVFQHKVNNILGIEHMTLIDNLKLIRVDNLNTNIALALCNEEREFLAESKARYLINAGVIKPNSKKSQAMVDKDLLYWLRVSYSIEEYSFLYYGI
>LS398548.1|SPR14469.1|315826_315967_-|Uncharacterised-protein
MKDSDFYLNKEILLVIKEALLQSIEQTLKDDFLDNSPLPLDIVEEL
>LS398548.1|SPR14468.1|315085_315526_-|transcriptional-regulator
MATSPNPNSNTKVDSIDLYVSKRLKMRRVILGLSQKKLAEAVDVSIQQIQKYEKSTNRISSGKLYSLANLLKVPIGYFFENASSYTDCKNNVNTISVFAEDQENFLSDDTVTEKEVLNLIKAFNEVKNSHVRKKIIDLVKSIKAME
>LS398548.1|SPR14467.1|313296_314205_-|tRNA-pseudouridine(55)-synthase
MKSKINGWINLYKPAGISSAQAVAKIKHWLNLSKVGHAGTLDVEAEGVLPIAIGEATKLVQYLMEATKEYHFTMKFGTKTDSGDVSGKVVQVTSNIPTYDECLSVTKKFIGEIVQVPPSYSALKINGIRAYNLARSGHKVILSPRKVKIFSLKLESYDSINLTATYSTECSKGTYIRTLSQDIALCLQSLSFVVKLARTRVGCFNYKHGSLYLNALNSFSEAKTIAYLKDGIMDTKCVLSNIPSLSIDDVVARKIYFGQLVQLPRLHNCSLVWLQYNNQLIAIGKVEDGYFRSSKVFNFITL
>LS398548.1|SPR14466.1|313003_313273_-|30S-ribosomal-protein-S15
MSITVERKKALISEYADLEKNTGSVEVQCAILTERIINLTQHCKINFKDFHSKRGLLMLVSSRRKLLSYLKKKDLNRYTQLINRLGLRK
>LS398548.1|SPR14476.1|318285_318423_+|TPR-repeat-containing-protein-08
MNKGDTLKQLGQREKAIKNFELAIKYNPGLIAPYIRDILKKLEMQ
>LS398548.1|SPR14477.1|318753_318975_+|conjugal-transfer-protein-TraD
MNQLSLHPNVQNHWTTIGKDIFDKEQQNKAAVILKFASEPDENTKRHIRLHGLKWNSFRQEWCGHVKDIEAKE
>LS398548.1|SPR14478.1|319082_319985_-|transposase
MHLSRFLDPKNDVAFKKIFGSEKNKDILIHFLNDILLFEGNREITEVEFLGTILDADIASKKESIVDVLCKDKNGAQYIIEMQVDPTQGFEKRAQYYAAKAYGRQPNRGKEGKYSDLKEVIFIAIADYKLFPNKEDYISRHVILDKKTYEHDLKDFSFTFIELPKFKKDRVEELNDITEKWCYFFKHAKETTLDGYHKIIGEDLIIKRAYEALDQFNWSEDELITYEQELKRIWDNKAVEDYKLEHAKAEGKAEGKAEGKAEAKKDLAIKLLKSELSVETIAEYTDLSIQEVLNLKNSVK
>LS398548.1|SPR14479.1|320103_320682_-|(p)pGpp-hydrolase
MIDFYSESLINKLFRTNVRFNTKIDLDRVEKAIFYAKKYHSNQKRDTGEHYYMHPLEVARMVADYSFKTDTIITAILHDTIEDTTLTKEKIAIEFNDNIAEQVLALTRNRGGKKTSSMKMIQTLVNQDKVELLLIKLFDRLDNIKTIFIKPAKRRQEIILETQQEFIPLAEYLKLPEIAIELNKYCELYTTK
>LS398548.1|SPR14480.1|320915_321062_-|replicative-DNA-helicase
MSKKQDRCFNTAEIIVAKHRNGPVGTVNLHYDNRYSKFGNIVKNFQQG
>LS398548.1|SPR14481.1|321019_321247_-|DNA-helicase
MEVAESQLSRVVEQRLDKKPILSDLRESGSIEQEADIVMLIYRDEYYLSRSEPDLGTLEHIECQKSKIDALTLLK
>LS398548.1|SPR14482.1|321439_322210_+|conjugal-transfer-protein-TraA
MKFAESNILSGITLLRQNNCVKFDNTLQDSMSKLVYNWSLSKFNPHEKLVITVRNKDVDILNSSIRSLLKANGTLQGTEYRRSIAGRKESYMAGDRIVFQTSDKDLQIQNSEFATLTSVNKNEFVAKTYTGKEVSFDPTKIQFKHGYASTVYKAQEASIKDVYVLHNGVSNISSLYVAMTRHIENLQLYCNKKATASINSLINQLSRPNDKEEYYHFTAKPEQEAKVEKVQQENSIKQYPSKDISTPLFMQIKEQR
>LS398548.1|SPR14483.1|322288_322477_+|conjugal-transfer-protein-TraA
MVYSSNVNNLKYYQPFQGEKILIAANNDKQNKEYVSTIKEAATALKSKGAITSIVIPYSFRR
>LS398548.1|SPR14484.1|322662_322854_-|integrase
MKLKKDIANGIHPMEERRKINRERKEKREKKLELQNKLTFGQMHEKYAEYSSIYHEKVRRKAM
>LS398548.1|SPR14485.1|322864_323098_-|integrase
MINISVILFNFTQSALNKIKVPTKEENIIQFRDTKERNLLLIISYTGFRRFYLVINIGGIYYKIKIGTSPDLTVKEG

Self-targeting detection

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_ID	Protospacer_location	Mismatch	Identity
LS398548_2	2.1|318187|32|LS398548|CRISPRCasFinder	318187-318218	32	LS398548.1	487190-487221	0	1.0
LS398548_3	3.1|497964|30|LS398548|CRT	497964-497993	30	LS398548.1	155630-155659	0	1.0
LS398548_3	3.1|497964|30|LS398548|CRT	497964-497993	30	LS398548.1	349417-349446	0	1.0
LS398548_3	3.1|497964|30|LS398548|CRT	497964-497993	30	LS398548.1	497916-497945	0	1.0
LS398548_3	3.1|497964|30|LS398548|CRT	497964-497993	30	LS398548.1	1624220-1624249	0	1.0
LS398548_3	3.1|497964|30|LS398548|CRT	497964-497993	30	LS398548.1	1895417-1895446	0	1.0
LS398548_3	3.1|497964|30|LS398548|CRT	497964-497993	30	LS398548.1	2033619-2033648	0	1.0
LS398548_3	3.1|497964|30|LS398548|CRT	497964-497993	30	LS398548.1	2368458-2368487	0	1.0
LS398548_3	3.2|498012|30|LS398548|CRT	498012-498041	30	LS398548.1	155630-155659	0	1.0
LS398548_3	3.2|498012|30|LS398548|CRT	498012-498041	30	LS398548.1	349417-349446	0	1.0
LS398548_3	3.2|498012|30|LS398548|CRT	498012-498041	30	LS398548.1	497916-497945	0	1.0
LS398548_3	3.2|498012|30|LS398548|CRT	498012-498041	30	LS398548.1	1624220-1624249	0	1.0
LS398548_3	3.2|498012|30|LS398548|CRT	498012-498041	30	LS398548.1	1895417-1895446	0	1.0
LS398548_3	3.2|498012|30|LS398548|CRT	498012-498041	30	LS398548.1	2033619-2033648	0	1.0
LS398548_3	3.2|498012|30|LS398548|CRT	498012-498041	30	LS398548.1	2368458-2368487	0	1.0
LS398548_3	3.3|498060|18|LS398548|CRT	498060-498077	18	LS398548.1	155666-155683	0	1.0
LS398548_3	3.3|498060|18|LS398548|CRT	498060-498077	18	LS398548.1	349333-349350	0	1.0
LS398548_3	3.3|498060|18|LS398548|CRT	498060-498077	18	LS398548.1	972393-972410	0	1.0
LS398548_3	3.3|498060|18|LS398548|CRT	498060-498077	18	LS398548.1	1624280-1624297	0	1.0
LS398548_3	3.3|498060|18|LS398548|CRT	498060-498077	18	LS398548.1	1785192-1785209	0	1.0
LS398548_3	3.4|498096|18|LS398548|CRT	498096-498113	18	LS398548.1	78897-78914	0	1.0
LS398548_3	3.4|498096|18|LS398548|CRT	498096-498113	18	LS398548.1	78909-78926	0	1.0
LS398548_3	3.4|498096|18|LS398548|CRT	498096-498113	18	LS398548.1	155690-155707	0	1.0
LS398548_3	3.4|498096|18|LS398548|CRT	498096-498113	18	LS398548.1	155702-155719	0	1.0
LS398548_3	3.4|498096|18|LS398548|CRT	498096-498113	18	LS398548.1	180083-180100	0	1.0
LS398548_3	3.4|498096|18|LS398548|CRT	498096-498113	18	LS398548.1	180095-180112	0	1.0
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119. spacer 3.1|497964|30|LS398548|CRT matches to position: 1946945-1946974, mismatch: 2, identity: 0.933

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125. spacer 3.2|498012|30|LS398548|CRT matches to position: 349369-349398, mismatch: 2, identity: 0.933

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126. spacer 3.2|498012|30|LS398548|CRT matches to position: 729222-729251, mismatch: 2, identity: 0.933

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127. spacer 3.2|498012|30|LS398548|CRT matches to position: 1624280-1624309, mismatch: 2, identity: 0.933

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128. spacer 3.2|498012|30|LS398548|CRT matches to position: 1785192-1785221, mismatch: 2, identity: 0.933

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***************.********** ***

129. spacer 3.2|498012|30|LS398548|CRT matches to position: 1785228-1785257, mismatch: 2, identity: 0.933

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***************.*.************

130. spacer 3.2|498012|30|LS398548|CRT matches to position: 1946945-1946974, mismatch: 2, identity: 0.933

tatagagattggtgaaactaaaggcatagc	CRISPR spacer
tatagagattggtgagattaaaggcatagc	Protospacer
***************.*.************

131. spacer 3.2|498012|30|LS398548|CRT matches to position: 2328229-2328258, mismatch: 2, identity: 0.933

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132. spacer 3.3|498060|18|LS398548|CRT matches to position: 912909-912926, mismatch: 2, identity: 0.889

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133. spacer 3.3|498060|18|LS398548|CRT matches to position: 1349861-1349878, mismatch: 2, identity: 0.889

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134. spacer 3.3|498060|18|LS398548|CRT matches to position: 1465039-1465056, mismatch: 2, identity: 0.889

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135. spacer 3.3|498060|18|LS398548|CRT matches to position: 1803428-1803445, mismatch: 2, identity: 0.889

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136. spacer 3.3|498060|18|LS398548|CRT matches to position: 2209152-2209169, mismatch: 2, identity: 0.889

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137. spacer 3.4|498096|18|LS398548|CRT matches to position: 78921-78938, mismatch: 2, identity: 0.889

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** ****.**********

138. spacer 3.4|498096|18|LS398548|CRT matches to position: 180107-180124, mismatch: 2, identity: 0.889

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** ****.**********

139. spacer 3.4|498096|18|LS398548|CRT matches to position: 280516-280533, mismatch: 2, identity: 0.889

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** ****.**********

140. spacer 3.4|498096|18|LS398548|CRT matches to position: 349357-349374, mismatch: 2, identity: 0.889

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** ****.**********

141. spacer 3.4|498096|18|LS398548|CRT matches to position: 349405-349422, mismatch: 2, identity: 0.889

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** ****.**********

142. spacer 3.4|498096|18|LS398548|CRT matches to position: 497940-497957, mismatch: 2, identity: 0.889

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** ****.**********

143. spacer 3.4|498096|18|LS398548|CRT matches to position: 729246-729263, mismatch: 2, identity: 0.889

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** ****.**********

144. spacer 3.4|498096|18|LS398548|CRT matches to position: 798837-798854, mismatch: 2, identity: 0.889

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** ****.**********

145. spacer 3.4|498096|18|LS398548|CRT matches to position: 972357-972374, mismatch: 2, identity: 0.889

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** ****.**********

146. spacer 3.4|498096|18|LS398548|CRT matches to position: 1135593-1135610, mismatch: 2, identity: 0.889

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** ****.**********

147. spacer 3.4|498096|18|LS398548|CRT matches to position: 1411990-1412007, mismatch: 2, identity: 0.889

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** ****.**********

148. spacer 3.4|498096|18|LS398548|CRT matches to position: 1624244-1624261, mismatch: 2, identity: 0.889

cagagctgaaggcagagc	CRISPR spacer
catagctaaaggcagagc	Protospacer
** ****.**********

149. spacer 3.4|498096|18|LS398548|CRT matches to position: 1785252-1785269, mismatch: 2, identity: 0.889

cagagctgaaggcagagc	CRISPR spacer
catagctaaaggcagagc	Protospacer
** ****.**********

150. spacer 3.4|498096|18|LS398548|CRT matches to position: 1895393-1895410, mismatch: 2, identity: 0.889

cagagctgaaggcagagc	CRISPR spacer
catagctaaaggcagagc	Protospacer
** ****.**********

151. spacer 3.4|498096|18|LS398548|CRT matches to position: 1946981-1946998, mismatch: 2, identity: 0.889

cagagctgaaggcagagc	CRISPR spacer
catagctaaaggcagagc	Protospacer
** ****.**********

152. spacer 3.4|498096|18|LS398548|CRT matches to position: 2033607-2033624, mismatch: 2, identity: 0.889

cagagctgaaggcagagc	CRISPR spacer
catagctaaaggcagagc	Protospacer
** ****.**********

153. spacer 3.4|498096|18|LS398548|CRT matches to position: 2368434-2368451, mismatch: 2, identity: 0.889

cagagctgaaggcagagc	CRISPR spacer
catagctaaaggcagagc	Protospacer
** ****.**********

154. spacer 5.1|1790745|55|LS398548|PILER-CR matches to position: 903203-903257, mismatch: 2, identity: 0.964

atctggtttatacttaatagctaaatcaaaattctctattgcatcttgatattgt	CRISPR spacer
atctggtttatacttaatagccaaatcaaaattctctattgcctcttgatattgt	Protospacer
*********************.******************** ************

155. spacer 5.1|1790745|55|LS398548|PILER-CR matches to position: 1339509-1339563, mismatch: 2, identity: 0.964

atctggtttatacttaatagctaaatcaaaattctctattgcatcttgatattgt	CRISPR spacer
atctggtttatacttaatagccaaatcaaaattctctattgcctcttgatattgt	Protospacer
*********************.******************** ************

156. spacer 5.1|1790745|55|LS398548|PILER-CR matches to position: 1455369-1455423, mismatch: 2, identity: 0.964

atctggtttatacttaatagctaaatcaaaattctctattgcatcttgatattgt	CRISPR spacer
atctggtttatacttaatagccaaatcaaaattctctattgcctcttgatattgt	Protospacer
*********************.******************** ************

157. spacer 5.1|1790745|55|LS398548|PILER-CR matches to position: 1594924-1594978, mismatch: 2, identity: 0.964

atctggtttatacttaatagctaaatcaaaattctctattgcatcttgatattgt	CRISPR spacer
atctggtttatacttaatagccaaatcaaaattctctattgcctcttgatattgt	Protospacer
*********************.******************** ************

158. spacer 6.1|2328171|52|LS398548|CRISPRCasFinder matches to position: 180083-180134, mismatch: 2, identity: 0.962

tagctaaaggcagagctgaaggcagagctgaaggcagagctgaaggcagagc	CRISPR spacer
tagctaaaggcatagctaaaggcagagctgaaggcagagctgaaggcagagc	Protospacer
************ ****.**********************************

159. spacer 6.1|2328171|52|LS398548|CRISPRCasFinder matches to position: 972333-972384, mismatch: 2, identity: 0.962

tagctaaaggcagagctgaaggcagagctgaaggcagagctgaaggcagagc	CRISPR spacer
tagctaaaggcatagctaaaggcagagctgaaggcagagctgaaggcagagc	Protospacer
************ ****.**********************************

160. spacer 6.1|2328171|52|LS398548|CRISPRCasFinder matches to position: 1895369-1895420, mismatch: 2, identity: 0.962

tagctaaaggcagagctgaaggcagagctgaaggcagagctgaaggcagagc	CRISPR spacer
tagctaaaggcatagctaaaggcagagctgaaggcagagctgaaggcagagc	Protospacer
************ ****.**********************************

161. spacer 6.1|2328171|52|LS398548|CRISPRCasFinder matches to position: 1946983-1947034, mismatch: 2, identity: 0.962

tagctaaaggcagagctgaaggcagagctgaaggcagagctgaaggcagagc	CRISPR spacer
tagctaaaggcagagctgaaggcatagctgaaggcagagctgaaggcatagc	Protospacer
************************ *********************** ***

162. spacer 6.1|2328171|52|LS398548|CRISPRCasFinder matches to position: 2368410-2368461, mismatch: 2, identity: 0.962

tagctaaaggcagagctgaaggcagagctgaaggcagagctgaaggcagagc	CRISPR spacer
tagctaaaggcatagctaaaggcagagctgaaggcagagctgaaggcagagc	Protospacer
************ ****.**********************************

163. spacer 4.2|1662361|62|LS398548|PILER-CR matches to position: 117448-117509, mismatch: 4, identity: 0.935

gaaaaatcttggaaagctactagaagcaattgacaattatgatcaagctatgcgatacaa	CRISPR spacer
gaaaaatcttggaaagctactagaagcaattgacaattatgatcaagctattcgatacag	Protospacer
*************************************************** *******.

164. spacer 5.2|1790847|72|LS398548|PILER-CR matches to position: 188819-188890, mismatch: 12, identity: 0.833

ttgtaagcatttggtaaatctggtttatacttaatagcttgatcataattttcaattgct	CRISPR spacer
ttgtaagcatttggtaaatctggtttatacttaatagcttgatcataattttcaattgct	Protospacer
************************************************************

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
LS398548_1	1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder	280447-280483	37	NC_049402	Lactococcus phage 38507, complete genome	28706-28742	4	0.892
LS398548_1	1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder	280447-280483	37	NC_049402	Lactococcus phage 38507, complete genome	29758-29794	4	0.892
LS398548_1	1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder	280447-280483	37	MF448557	Lactococcus phage 37201, complete genome	28731-28767	5	0.865
LS398548_1	1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder	280447-280483	37	NC_049402	Lactococcus phage 38507, complete genome	28694-28730	5	0.865
LS398548_1	1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder	280447-280483	37	NC_049402	Lactococcus phage 38507, complete genome	29746-29782	5	0.865
LS398548_1	1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder	280447-280483	37	NC_049401	Lactococcus phage 38503, complete genome	26121-26157	5	0.865
LS398548_1	1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder	280447-280483	37	MF448556	Lactococcus phage 30804, complete genome	27171-27207	5	0.865
LS398548_1	1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder	280447-280483	37	NC_013155	Lactococcus phage CB13, complete genome	29768-29804	6	0.838
LS398548_1	1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder	280447-280483	37	MF448557	Lactococcus phage 37201, complete genome	28743-28779	7	0.811
LS398548_1	1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder	280447-280483	37	NC_049402	Lactococcus phage 38507, complete genome	28718-28754	7	0.811
LS398548_1	1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder	280447-280483	37	NC_049402	Lactococcus phage 38507, complete genome	29770-29806	7	0.811
LS398548_1	1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder	280447-280483	37	NC_049401	Lactococcus phage 38503, complete genome	26133-26169	7	0.811
LS398548_1	1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder	280447-280483	37	MF448556	Lactococcus phage 30804, complete genome	27183-27219	7	0.811
LS398548_1	1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder	280447-280483	37	MN693255	Marine virus AFVG_25M362, complete genome	24937-24973	8	0.784
LS398548_3	3.1|497964|30|LS398548|CRT	497964-497993	30	KY065482	Streptococcus phage IPP42, complete genome	11951-11980	8	0.733
LS398548_3	3.1|497964|30|LS398548|CRT	497964-497993	30	KY065489	Streptococcus phage IPP51, complete genome	12389-12418	8	0.733
LS398548_3	3.1|497964|30|LS398548|CRT	497964-497993	30	KY065481	Streptococcus phage IPP41, complete genome	11772-11801	8	0.733
LS398548_3	3.1|497964|30|LS398548|CRT	497964-497993	30	KY065449	Streptococcus phage IPP5, complete genome	13149-13178	8	0.733
LS398548_3	3.1|497964|30|LS398548|CRT	497964-497993	30	NC_030946	Streptococcus phage phiARI0923, complete genome	21082-21111	8	0.733
LS398548_3	3.2|498012|30|LS398548|CRT	498012-498041	30	KY065482	Streptococcus phage IPP42, complete genome	11951-11980	8	0.733
LS398548_3	3.2|498012|30|LS398548|CRT	498012-498041	30	KY065489	Streptococcus phage IPP51, complete genome	12389-12418	8	0.733
LS398548_3	3.2|498012|30|LS398548|CRT	498012-498041	30	KY065481	Streptococcus phage IPP41, complete genome	11772-11801	8	0.733
LS398548_3	3.2|498012|30|LS398548|CRT	498012-498041	30	KY065449	Streptococcus phage IPP5, complete genome	13149-13178	8	0.733
LS398548_3	3.2|498012|30|LS398548|CRT	498012-498041	30	NC_030946	Streptococcus phage phiARI0923, complete genome	21082-21111	8	0.733
LS398548_2	2.1|318187|32|LS398548|CRISPRCasFinder	318187-318218	32	NC_015426	Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p2BKT015925, complete sequence	65821-65852	9	0.719
LS398548_2	2.1|318187|32|LS398548|CRISPRCasFinder	318187-318218	32	NZ_CP020413	Leptospira interrogans serovar Copenhageni strain FDAARGOS_203 plasmid unnamed1, complete sequence	126164-126195	11	0.656
LS398548_2	2.1|318187|32|LS398548|CRISPRCasFinder	318187-318218	32	MN453779	Aeromonas phage PS2, complete genome	177877-177908	16	0.5

1. spacer 1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder matches to NC_049402 (Lactococcus phage 38507, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.892

aactaaaggcatagctaaaggcatagctaaaggcata	CRISPR spacer
agctaaaggcaaagctaaaggcaaagctaaaggcaaa	Protospacer
*.********* *********** *********** *

2. spacer 1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder matches to NC_049402 (Lactococcus phage 38507, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.892

aactaaaggcatagctaaaggcatagctaaaggcata	CRISPR spacer
agctaaaggcaaagctaaaggcaaagctaaaggcaaa	Protospacer
*.********* *********** *********** *

3. spacer 1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder matches to MF448557 (Lactococcus phage 37201, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.865

aactaaaggcatagctaaaggcatagctaaaggcata	CRISPR spacer
agctaaaggcaaagctaaaggcaaagctaaaggcaag	Protospacer
*.********* *********** *********** .

4. spacer 1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder matches to NC_049402 (Lactococcus phage 38507, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.865

aactaaaggcatagctaaaggcatagctaaaggcata	CRISPR spacer
agctaaaggcaaagctaaaggcaaagctaaaggcaag	Protospacer
*.********* *********** *********** .

5. spacer 1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder matches to NC_049402 (Lactococcus phage 38507, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.865

aactaaaggcatagctaaaggcatagctaaaggcata	CRISPR spacer
agctaaaggcaaagctaaaggcaaagctaaaggcaag	Protospacer
*.********* *********** *********** .

6. spacer 1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder matches to NC_049401 (Lactococcus phage 38503, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.865

aactaaaggcatagctaaaggcatagctaaaggcata	CRISPR spacer
agctaaaggcaaagctaaaggcaaagctaaaggcaag	Protospacer
*.********* *********** *********** .

7. spacer 1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder matches to MF448556 (Lactococcus phage 30804, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.865

aactaaaggcatagctaaaggcatagctaaaggcata	CRISPR spacer
agctaaaggcaaagctaaaggcaaagctaaaggcaag	Protospacer
*.********* *********** *********** .

8. spacer 1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder matches to NC_013155 (Lactococcus phage CB13, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.838

aactaaaggcatagctaaaggcatagctaaaggcata	CRISPR spacer
agctaaaggcaaagctaaaggcaaagctaaaggtaag	Protospacer
*.********* *********** *********.* .

9. spacer 1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder matches to MF448557 (Lactococcus phage 37201, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811

aactaaaggcatagctaaaggcatagctaaaggcata	CRISPR spacer
ggcaataggcaaagctaaaggcaaagctaaaggcaaa	Protospacer
..* * ***** *********** *********** *

10. spacer 1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder matches to NC_049402 (Lactococcus phage 38507, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811

aactaaaggcatagctaaaggcatagctaaaggcata	CRISPR spacer
ggcaataggcaaagctaaaggcaaagctaaaggcaaa	Protospacer
..* * ***** *********** *********** *

11. spacer 1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder matches to NC_049402 (Lactococcus phage 38507, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811

aactaaaggcatagctaaaggcatagctaaaggcata	CRISPR spacer
ggcaataggcaaagctaaaggcaaagctaaaggcaaa	Protospacer
..* * ***** *********** *********** *

12. spacer 1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder matches to NC_049401 (Lactococcus phage 38503, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811

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13. spacer 1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder matches to MF448556 (Lactococcus phage 30804, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811

aactaaaggcatagctaaaggcatagctaaaggcata	CRISPR spacer
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..* * ***** *********** *********** *

14. spacer 1.1|280447|37|LS398548|CRISPRCasFinder matches to MN693255 (Marine virus AFVG_25M362, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.784

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15. spacer 3.1|497964|30|LS398548|CRT matches to KY065482 (Streptococcus phage IPP42, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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***********.*********  ..  ** 

16. spacer 3.1|497964|30|LS398548|CRT matches to KY065489 (Streptococcus phage IPP51, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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***********.*********  ..  ** 

17. spacer 3.1|497964|30|LS398548|CRT matches to KY065481 (Streptococcus phage IPP41, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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***********.*********  ..  ** 

18. spacer 3.1|497964|30|LS398548|CRT matches to KY065449 (Streptococcus phage IPP5, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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***********.*********  ..  ** 

19. spacer 3.1|497964|30|LS398548|CRT matches to NC_030946 (Streptococcus phage phiARI0923, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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***********.*********  ..  ** 

20. spacer 3.2|498012|30|LS398548|CRT matches to KY065482 (Streptococcus phage IPP42, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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***********.*********  ..  ** 

21. spacer 3.2|498012|30|LS398548|CRT matches to KY065489 (Streptococcus phage IPP51, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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***********.*********  ..  ** 

22. spacer 3.2|498012|30|LS398548|CRT matches to KY065481 (Streptococcus phage IPP41, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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***********.*********  ..  ** 

23. spacer 3.2|498012|30|LS398548|CRT matches to KY065449 (Streptococcus phage IPP5, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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***********.*********  ..  ** 

24. spacer 3.2|498012|30|LS398548|CRT matches to NC_030946 (Streptococcus phage phiARI0923, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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***********.*********  ..  ** 

25. spacer 2.1|318187|32|LS398548|CRISPRCasFinder matches to NC_015426 (Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p2BKT015925, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719

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  *.  **************. ********  

26. spacer 2.1|318187|32|LS398548|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020413 (Leptospira interrogans serovar Copenhageni strain FDAARGOS_203 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.656

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.. ************** *** ****      

27. spacer 2.1|318187|32|LS398548|CRISPRCasFinder matches to MN453779 (Aeromonas phage PS2, complete genome) position: , mismatch: 16, identity: 0.5

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             .**********.******             

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	8527 : 52641	46	Streptococcus_phage(16.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	63687 : 110291	49	Pseudomonas_phage(28.57%)	transposase,integrase	attL 61736:61758|attR 99008:99030
DBSCAN-SWA_3	115743 : 159294	52	Wolbachia_phage(22.22%)	transposase,integrase	attL 138062:138075|attR 159296:159309
DBSCAN-SWA_4	170143 : 213297	46	Cryptophlebia_leucotreta_granulosis_virus(16.67%)	transposase,integrase	attL 204403:204430|attR 213716:213743
DBSCAN-SWA_5	349172 : 435633	96	Wolbachia_phage(15.38%)	transposase,integrase	attL 367736:367753|attR 427818:427834
DBSCAN-SWA_6	444618 : 498261	51	Streptococcus_phage(26.67%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_7	517927 : 568427	49	Mannheimia_phage(25.0%)	tRNA,transposase,integrase	attL 529287:529317|attR 556785:556815
DBSCAN-SWA_8	575921 : 623901	55	Mycobacterium_phage(16.67%)	tRNA,transposase,integrase	attL 566474:566513|attR 628726:628765
DBSCAN-SWA_9	632390 : 686138	52	Salicola_phage(22.22%)	tRNA,transposase,integrase	attL 645613:645636|attR 676002:676025
DBSCAN-SWA_10	689363 : 788077	112	Wolbachia_phage(17.65%)	tRNA,transposase,integrase	attL 690179:690196|attR 749095:749112
DBSCAN-SWA_11	882892 : 933236	48	Pseudomonas_phage(30.0%)	transposase,integrase	attL 927912:927928|attR 934064:934080
DBSCAN-SWA_12	946257 : 993083	48	Streptococcus_phage(33.33%)	transposase,integrase	attL 947416:947439|attR 1000788:1000811
DBSCAN-SWA_13	1003034 : 1181112	175	Wolbachia_phage(12.9%)	tRNA,transposase,integrase	attL 1022726:1022741|attR 1152824:1152840
DBSCAN-SWA_14	1184506 : 1230196	40	Streptococcus_phage(25.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_15	1249319 : 1303916	53	Mannheimia_phage(25.0%)	tRNA,transposase,integrase	attL 1289279:1289295|attR 1304479:1304495
DBSCAN-SWA_16	1312102 : 1350026	45	Streptococcus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_17	1368237 : 1414088	46	Pseudomonas_phage(25.0%)	transposase,integrase	attL 1364629:1364645|attR 1379460:1379476
DBSCAN-SWA_18	1418343 : 1527357	111	Streptococcus_phage(22.22%)	tRNA,transposase,protease,integrase	attL 1438683:1438720|attR 1516934:1516951
DBSCAN-SWA_19	1541939 : 1596325	50	Pseudomonas_phage(25.0%)	transposase,integrase	attL 1560940:1560958|attR 1586644:1586662
DBSCAN-SWA_20	1606324 : 1686519	99	Pseudomonas_phage(25.0%)	transposase,integrase	attL 1641934:1641950|attR 1672905:1672928
DBSCAN-SWA_21	1719098 : 1761501	52	uncultured_Mediterranean_phage(25.0%)	tRNA,transposase,integrase	attL 1702580:1702621|attR 1760738:1760779
DBSCAN-SWA_22	1769568 : 1814876	50	Pseudomonas_phage(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_23	1825059 : 1921795	109	Pseudomonas_phage(30.77%)	tRNA,transposase,integrase	attL 1838773:1838789|attR 1927676:1927693
DBSCAN-SWA_24	1937045 : 1992703	60	Tupanvirus(33.33%)	tRNA,transposase,integrase	attL 1953094:1953111|attR 1987027:1987044
DBSCAN-SWA_25	2001865 : 2054484	50	Brevibacillus_phage(11.11%)	tRNA,transposase,integrase	attL 1993090:1993129|attR 2055087:2055126
DBSCAN-SWA_26	2057725 : 2104519	54	Streptococcus_phage(25.0%)	tRNA,transposase,capsid	NA
DBSCAN-SWA_27	2126212 : 2231773	106	Penguinpox_virus(20.0%)	tRNA,transposase,integrase	attL 2125898:2125931|attR 2169050:2169083
DBSCAN-SWA_28	2235679 : 2292785	56	Bacillus_phage(33.33%)	tRNA,transposase,protease,integrase	attL 2231290:2231313|attR 2258939:2258962
DBSCAN-SWA_29	2301294 : 2360637	50	Pseudomonas_phage(27.27%)	transposase,integrase	attL 2323396:2323431|attR 2356820:2356855
DBSCAN-SWA_30	2365623 : 2410594	51	Bordetella_phage(28.57%)	tRNA,transposase,integrase	attL 2403475:2403494|attR 2410625:2410644

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>LS398548|8527:52641|DBSCAN-SWA
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MLKALFNSIFKPLVELLRTASFNINYLFFSNQPNLTLRIRILFVILSFLVAFLVVAFRIIKLSTYNSQYSHCSRNMHFKHRKEIVDRNNNILAVNLFAPSIIARTKKISSPEGLVKQLQYVFTDINGDKLLNTLKNNKNFVVVKRHLTPTQHKQVYDLGIPGLDFEEDYKRVYTYGNLLSHVLGYVSTDMRGLAGIENYYHNYLSNNDSQLKEEELNKPLVLSIDIRIQDIVSKELDKTIKDFNAIGGVGIIADPNNGEILALVSKPDFDPHYPAKAVERQLFNKASLGVYELGSVMHALTIAIGLDTQTITLNNTYDLTDFKIDNFRIKDYKNFVGYYTVPEIFMYSSNIGIVQIGLDIGQFNLKKYFKLLALDKTLKIELPEKANSLYHANTSWNNITTATISYGYGISISPLHFVQAMIPIVNGGNLYPITLIKRTPNDNLIAQKIFSSKTSKELNSLLRLAVKHGTSKNSDVVGYLVGGKVGTAKKIKDRKYDKNSIRSSFIGIYPSIAPKFIIYLMLDEPKSNNSTYELTNAAEHGITSAAAKIISKIGTLYGIQPYHTEMTSVQNLKNNNNSQHGIK
>LS398548|8527:52641|32619_32760_-|SPR02366.1|DBSCAN-SWA
MISNNNTAFIRDLYKDFNINTVTVVYSINEQRNPVNELIITNYKTC

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SPR02194.1|8527_8830_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR02200.1|9344_11144_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR02203.1|11914_13204_+	deoxyribodipyrimidine photo-lyase	A0A1V0SGL1	Hokovirus	4.0e-44	29.9
SPR02207.1|13224_14187_-	thioredoxin-disulfide reductase	G3MA85	Bacillus_virus	4.3e-59	43.4
SPR02214.1|14316_15240_-	permease	NA	NA	NA	NA
SPR02221.1|15416_16754_-	translocation protein TolB	NA	NA	NA	NA
SPR02228.1|17093_18521_-	dihydrolipoyl dehydrogenase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	1.6e-38	28.3
SPR02236.1|18612_19416_-	SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR02242.1|19590_20199_+	Type surface antigen 22	NA	NA	NA	NA
SPR02249.1|20312_20516_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR02254.1|20466_20937_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR02259.1|21015_21492_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR02265.1|22172_22823_+	reverse transcriptase	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	7.0e-29	39.1
SPR02287.1|22825_23047_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR02292.1|23061_23763_-	histidine kinase	NA	NA	NA	NA
SPR02298.1|23827_24106_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR02302.1|24472_24787_+	DNA methyltransferase	A0A1S5PRR3	Streptococcus_phage	7.8e-10	34.6
SPR02308.1|24773_25025_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR02314.1|25060_25435_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR02325.1|25480_25651_+	conjugal transfer protein TraD	NA	NA	NA	NA
SPR02331.1|25718_26633_-|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	9.7e-85	61.5
SPR02337.1|26754_27180_-	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR02344.1|27495_27828_-	DNA helicase	A0A218KST2	Xenohaliotis_phage	1.0e-23	50.0
SPR02349.1|28177_29749_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR02353.1|29757_31194_+	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	8.7e-72	37.2
SPR02357.1|31433_32063_+	ankyrin	A0A068ELT3	Penguinpox_virus	1.2e-06	27.5
SPR02362.1|32109_32616_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR02366.1|32619_32760_-	DNA methyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR02369.1|32997_33201_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR02372.1|33564_34440_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR02375.1|34972_35764_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR02378.1|36591_36876_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR02381.1|37070_37466_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR02385.1|37480_39259_-	multidrug ABC transporter ATP-binding protein	W8CYL7	Bacillus_phage	9.5e-28	24.7
SPR02390.1|39308_40061_-	UMP kinase	NA	NA	NA	NA
SPR02394.1|40289_41381_-	phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase	NA	NA	NA	NA
SPR02399.1|41370_42780_-	UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
SPR02404.1|42776_44246_-	UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase	NA	NA	NA	NA
SPR02410.1|44232_45984_-	penicillin-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR02412.1|46183_46444_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR02417.1|46484_47423_-	16S rRNA methyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR02421.1|47491_48625_-	molecular chaperone DnaJ	E3T4P7	Cafeteria_roenbergensis_virus	2.1e-28	29.1
SPR02423.1|48710_50639_-	molecular chaperone DnaK	A0A2P1EIW2	Megavirus	5.9e-140	46.5
SPR02426.1|51020_51308_-	BolA family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
SPR02431.1|51515_52313_+	enoyl-ACP reductase	NA	NA	NA	NA
SPR02435.1|52512_52641_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>LS398548|63687:110291|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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Homologous phage analysis in the prophage region

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SPR14207.1|66004_66292_+|integrase	integrase	A0A077KGX2	Edwardsiella_phage	1.1e-05	31.2
SPR14208.1|66377_66599_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR14209.1|66799_67123_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14210.1|67122_67542_+	conjugal transfer protein TraE	NA	NA	NA	NA
SPR14211.1|67522_67675_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14212.1|67671_67878_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14213.1|67874_68600_+	conjugative transfer protein TraC	NA	NA	NA	NA
SPR14214.1|68691_69228_+	conjugal transfer protein TraC	NA	NA	NA	NA
SPR14215.1|69141_70131_-	ankyrin repeat-containing protein	Q6VZ29	Canarypox_virus	9.1e-12	29.7
SPR14216.1|70344_70872_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14217.1|70894_71278_+	type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC	NA	NA	NA	NA
SPR14218.1|71274_72969_+	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
SPR14219.1|72980_73280_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14220.1|73246_73663_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14221.1|73659_74553_+	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR14222.1|74506_74962_+	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR14223.1|74961_76710_+	conjugal transfer protein TraG	NA	NA	NA	NA
SPR14224.1|76681_76858_+	conjugal transfer protein TraG	NA	NA	NA	NA
SPR14225.1|76844_76979_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14226.1|76984_78739_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14227.1|78748_79768_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14228.1|79767_81774_-	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR14229.1|82040_83603_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR14230.1|83648_84899_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR14231.1|85581_86817_+	reverse transcriptase	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	2.3e-65	37.7
SPR14232.1|86919_87297_+	HNH endonuclease	NA	NA	NA	NA
SPR14233.1|87507_87963_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14234.1|88264_89290_+	TPR repeat-containing protein 08	NA	NA	NA	NA
SPR14235.1|89792_89912_-|transposase	DDE transposase family protein	NA	NA	NA	NA
SPR14236.1|90325_93763_+	sodium:proline symporter	NA	NA	NA	NA
SPR14237.1|95182_95476_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14238.1|96933_98082_+	SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR14239.1|99053_99443_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
99008:99030	attR	NA	NA	NA	NA
SPR14240.1|99384_99948_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14241.1|100198_100834_+	transporter	NA	NA	NA	NA
SPR14242.1|100949_101696_+	Thiosulfate sulfurtransferase GlpE	NA	NA	NA	NA
SPR14243.1|102715_103516_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14244.1|103475_104276_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14245.1|104284_105721_+	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	1.6e-70	37.4
SPR14246.1|105960_106590_+	ankyrin	A0A068ELT3	Penguinpox_virus	2.1e-06	26.9
SPR14247.1|106636_107140_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR14248.1|107820_108603_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14249.1|108703_109282_+	(p)pGpp hydrolase	B3FJI5	Pseudomonas_phage	7.4e-06	38.6
SPR14250.1|109400_110291_+|transposase	transposase	E9P639	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	3.5e-87	62.2

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>LS398548|115743:159294|DBSCAN-SWA
AATGAAATTAGATCAGATTAAAGAGTTAAAGGATGAAAAATTTCATCGATTAACAGGAGTAAGGAAGAGGACATTTTCAAAGATGGTGGATATTTTGAGGAAAGCTGATGGTCTTAAGAAATCAAAAGGTGGACGTAAAAATAAGCTCAATTTGGAGGAACAGTTGCTGATGGTGTTAGAATACCTTAGAGAATACCGTACTTATTTCCATATAGGTCAGAACTATGGAATTAGTGAAAGTTCAGCATATAAAGCTGTAAAATGGGTAGAAGACACCCTAGTTAAACACCAAAACTTTGCTCTTCCAGGCCGTAAAGCTTTAATGAAGAGTGATATGAATTATGAAGTAGTCTTGATTGATGCTACTGAGAGTCCTATAGAAAGACCTAAAAAAACAAAAATTCTATTATTCAGGAAAGAAGAAAAGGCATACACTAAAAACTCAAATAGTGGTAGATAAGAAAACGCGCAAGTAATATGTACAGATTTTTCTAACGGTAAAAAACATGACTTTAGATTATTTAAGAAATCCAAAATTCTTATCCATCCTAAGGTAAAAGTGATTACTGATACAGGATATCAAGGCATACAAAAAATTCACAATAATTCTGAATTACCAAAGAAAAAAAGCAAGAAAAATCCTTTAACTAAAAATGATAAAAAGAATAATCATAGGTTAGCAGGAGCAAGAGTTGTGAATGAAAACGTTATTGGTATACTAAAACGCTTCAAAATTATTGCTGACAAATATCGAAATAGACGTAAAAGATTCTCTCTTAGATTTAATTTGATCTCTGGCATTTATAATTTTGAACTACTTTAACCAGTTTCGAAATAGGTCTAATGAAAAAGTAATTAGTATGACATATTCTATAGGTTTTCTGAAAAAATGTGCTGAACATATAAGGAAAGAGCGAAAATTAGTTTTGAATCAGTATCAAAACGTTTTGTGATAGGAAAGAATACAGTGTTTGTATTGCATTAAAACATATTGCGTTAAAAAACAGAAACAGAGCTTTAACAAAAATCTTTATTGATAAACTAAAAGAAGACGTGAGACAAGATAGTAACGCATATCAATATGAAAGAGCTGAACGACTATGAGTAAGTAAGTTAGGTATACAAAAAGCTTAAAGAGATTAAATATTACATATAAGAAAAACTTTAAAACATCTAAAGTCAAAAAAGAAGAGAGATTAAAATTTCAGAATAAGATAAAACGATACAAAGACAAAGAAAAAATTATTTTCTTGATGGATAAGAGAGGTTTTGTTCATAGTACAATTAGAACTCACAGATATGTAGCAAAAGGCATGAGATGTTACTGATGTTATGATTCATCAGTCAAAGAGAACTAATGTTAAGCAGCACTAGTAGATAAATTTCTGCTAACTGTATCAATTTTTGACTGCAATGTTAATCCGCTATTTTAAACTAGACCTCTTTCGAAACTGGTTAAGGTAGTTCAAAATTATTGCTGATAAATATCGAAATAGACGTAAAAGATTCGGTCTTAGATTTAATTTGATCTCTGGCATTTATAATTTTGATACGTTAACCAGTTTCGAAAGAGGTCTATTATAGTAAGCCTCTGAAAAATCTGGTTGATACTTAATAGCCAAATCAAAATTCTCTATTGCCTCTTGATATTGTTCTAGTATACATAAAGCAGATCCTTTATTATTGTAAGAGCCTGCGTAATTTGTGCTGTATCGAATAGCTTGATCATAATTGTCAATTGCTTCTAGTAGCTTTCCAAGATTTTTCAAAGCATTTCCTTTAGCATGATAAGCTTCTACCAAATCTGGTTGATACTTAATAGCTATATCATAATTTTTAATCGCCTCTTGATGGTGCCCTAATTCATTCAAAGTAATTCCTTTATTAACATAAGCTTCTATCAAATCTGGTTTATACTTAATAGCTATATCATAATTTTCAATTGCCTCTTGATTGCGCCCTAATTCAGCTAAAGAAACTCCTTTATTATAATAAGCTTCTGCATAATTAAGTTTATACTTAATAGCTAAATCAAAATTTTCTATTGCTTTTTGATATTGTCCTGATTTACATAAACAAACTCCTTTATTAACATAAGCTTTTGAATAATTAGGTTTGTACTTAATAGCTAAATCAAAATTTTCTATTGCTTCTTGAAATTGTCCTAATTCATCTAAACAATTTCCTTTATTATAATAAGCTTCTGCATCATTAGGATTATACTTAATAGCTAAATCAAAATTTTCTATTGCTTTTTGATATTGTCCTGATTCACATAAACAAACTCCTTTATTAACATAAGCTTTTGAATAATTAGGTTTGTACTTAATAGCTAAATCAAAATTTTCTATTGTTTCTTGAAATTGTCCTAATTTATCTAAACAATTTCCTTTATTATAATAAGCTTCTGCATGATTAGGATTATACTTAATAGCTAAATCGTAGTTTTCTATTGCTTCTTGAAATTGTCCTAATTCAGCTAAAGAAACTCCTTTATTAACATAAGCATTTGCATAATCAGGTTTATACTTAATAGCTAAATCGTAGTTTTCTATTGCTTCTTGATGTTGTCCTAATTTACCTAAACAAACTCCTTTATTATAATAAGCATCTGCATAATCAGGTTTATACTTAATAGCTAAATCAAAATTTTCTATTGCTTCTTGAAATTGTCCTAATTCATCTAAACAATTTCCTTTATTATAATAAGCTTCTGCATCATTAGGATTATACTTAATAGCTAAATCAAAATTTTCTATTGCTTTTTGATATTGTCCTGATTCACATAAACAAACTCCTTTATTAACATAAGCTTTTGAATAATTAGGTTTGTACTTAATAGCTACATCATAATTTTTTATTGCCTCTTGATGGTGTCCAAGTTCGCATAAAGAAACTCCTCTATTAATATAAATACCTAGATTAGTTGAATCATATTGAATAGCTTGATCATAATTTTTAATTGCTTCTTGATATTGGCCTAATTTGTCTAAAGATATTCCTTTATGATAATAAGCTTCTGCATCATTTGGATTGTATCGAATAGCTGTATCATAATTCTTTATTGCCTCTTGATATTGTCCTAGTTCGTATAAAGAAATTCCTTTAGCATAATAAGCTTCTATACAATCTGGATTACACTTAATAGCTACATCATAATTTTTAATTGCTTTTTGATATTTTCCCAACTTAAGAAATGAATTTCCTTTATTACAAAATTTGTCTGCTAGCATATCTTTACCCTAAAATTAAATACTGTTATATGAGCAGATTATTTTGATGCAACAGATGTAACTGTATTAATAATACTGTCATATATTTCATATGATTTATAAAAATTCCCCTTTAAATTTTTGATTAGCTGTGATAATTGCTAAATCAAATGTGCTGTTACAAATTTTCTTTTTTACAGCCTTATTTTTAATACTATCAGAGATTTCATCAAAATTCTTTATTTTTTTTATTATTACCATCAGTTATGTTATTCTAAAATTCTTACTCTATATTTTCTATCAGTACTAATATTGCTAGCTGTGCATATAGTTTGAACTATTATCTAAGATACAAGCTCAAGTTTATACTGAACATTGAGAAGGCCATTCTTTAAGGCCTCAATATCCTTAACATGGCCGCACCATTCTTGACGAAAACTGTTCCATTTTAAGCCATGAAGGCGAATGTGGCGCTTAGTGTTTTCATCTGGTTCAGAGGTGAATTTTAAAATCACAGCCGCTTTATTTTGCTGTTCTTTATCAAAAATATCTTTACCTATTGTAGTCCAATGATCCTGAACATTTGGATGTTGTGTTAAAGTTTCTTTTAGTGAAACAATTGCACCAAATAAAGTATTTGCTGATAAGTGATCAAGCTTAGCTTTAGCAACTAATCCACCCATTTCGATAAGACGTCGAGTACGCATTTTACGTTCTTTAATTTTAAGGTTAACCTCATCCATGATTAGCCTAGCCTTTTTTTGTTGAAGAGTAATTTTTTGCTGCATAAGATTTGCCATGTTAGTAATTCAGAAAGATAAAAAAATCAGGCAAGAATATATCAAAATAAAATTCCAGTAAAGAAAAAAAACCGCGCCTACCAAACCAACATCAAATAATTATAGTCAAAAAAACGTGAATTCAAGGTTAGAAGCTTCATTGAAAAATAAGCTTACTACGCAATACGTAAACTTGAAAGTTTACTGTTAAAAAATGAGTACTCATTAACCGATTGAATGTTAAAAAAAAAGAAGTTTGTGCTAGCAAAATCAAAAAAACCATGCTAACTTAAAACTCAGGTGAGAATTGGTATTGAGATGGCGATACAGTTTACAAGGATTGAATTTTTAAGTAGAAGTACAGGAGGTGATAGTTGTCGTAAGGCAGCGTATAATGCAAGAACTATTGTTGAAAACGAGAAGACAGGTATAAAGTATAACTTCTCTCGTAAGAAAGATAATGTATATCATACAGTGCTGATACCGGATTATGTAAATCAAGACTTCAAGAATATTCAAACATTAATGAATGAGGTAGAACGAACAGAAACAAGAGAAAATAGTAAGTTGTTGAAGGATATAGTAATAGCATTGCCAGACGAGAAGGAGCTAAATTTAGAGCATAGAATAGAACTAACTCATCGAATAGTTGATGCAATGGAATGGGTGCAAAATGGTCTTGGAGTACAGATAGACATTCATAAGCCTCAAATAGGAGATAAAAACTGGCATACACATATATTGCTTACTATGAGAAGATTTAGAAAAGATGGAACTGGTTTAGGAGATAGAGCAGTAGATTTAAACCCAAAAATCATAACAGTTAATGGCAAAAAGGTTGTTATTAAAGATTCCGAGATGATTCATGAAAGAGTAAAAGAAATAATTAATGCATTTTTCGCTAAATTAGGCTTACCATATAGAGTTAAGGATACCAGCAAAGTGCCGGAAAAGCATATTGGACCTCCTAGAATTAGGAGTTTAATTAATAGGCATCTTTCGAAACTAG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>LS398548|115743:159294|141405_141603_+|SPR14293.1|DBSCAN-SWA
MKYEQVIDKIWFSELEIANEDNVNKKIFIKALTSFANSYIKSNYKPILERAFEAQGFSFELVQCK
>LS398548|115743:159294|138562_139096_-|SPR14287.1|transposase|DBSCAN-SWA
MTKKLKHDSLAKTIMSDPVAAQEFLEYYLPTDFKSLIDLSQIKVEQESYIEESLKKEYSDIVYKVATKKHGNAFIYILIEAQSTVDYWTALRLWRYTLLLCERHKKEKTKLPLVYNLVIYNDKEVYNAPRNLWDLFTDSMIAKQLMTSDYQLVDLQSMSNDENDYTFSSVGLSSAIR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SPR14261.1|115743_116202_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14262.1|116301_116565_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14263.1|117280_118975_-	TPR repeat-containing protein 03	NA	NA	NA	NA
SPR14264.1|119071_119215_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14265.1|119298_119754_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14266.1|120033_121017_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR14267.1|121264_121528_+	conjugal transfer protein TraD	NA	NA	NA	NA
SPR14268.1|121595_122570_-|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	1.4e-84	64.5
SPR14269.1|122691_122910_-	(p)ppGpp synthetase	NA	NA	NA	NA
SPR14270.1|122914_123268_-	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR14271.1|123368_124226_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14272.1|124200_124977_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14273.1|125668_127537_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14274.1|128185_128815_+	DNA methyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR14275.1|128818_129367_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR14276.1|129469_130114_-	ankyrin	A0A167R1M3	Powai_lake_megavirus	1.1e-13	31.7
SPR14277.1|130125_130701_-	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR14278.1|130936_131728_-	replicative DNA helicase	A0A218KST2	Xenohaliotis_phage	9.4e-52	44.4
SPR14279.1|131908_132373_-	replicative DNA helicase	A0A222ZRG2	Mycobacterium_phage	1.4e-10	29.3
SPR14280.1|132381_134094_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14281.1|134654_134909_+	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
SPR14282.1|135176_135287_+	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
SPR14283.1|135517_136480_+|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14284.1|136784_137681_+	TPR repeat-containing protein 03	NA	NA	NA	NA
SPR14285.1|137790_138351_+	Uncharacterised protein	I6R0L8	Salmonella_phage	2.9e-23	39.0
138062:138075	attL	NA	NA	NA	NA
SPR14286.1|138362_138605_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14287.1|138562_139096_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14288.1|139147_139843_-	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR14289.1|140018_140456_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14290.1|140467_140842_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14291.1|140862_141069_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14292.1|141044_141272_-	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR14293.1|141405_141603_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14294.1|141833_142406_+	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR14295.1|142443_143088_+	ankyrin	A0A068ELT3	Penguinpox_virus	1.5e-07	28.1
SPR14296.1|143135_143684_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR14297.1|143687_144089_-	DNA methyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR14298.1|144945_145662_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14299.1|146012_146741_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14300.1|146762_147059_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14301.1|147251_147620_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14302.1|147720_148296_+	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR14303.1|148417_149368_+|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	2.9e-84	64.1
SPR14304.1|149435_149882_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14305.1|150168_152613_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR14306.1|152731_154243_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR14307.1|154256_154808_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR14308.1|154859_155867_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14309.1|155876_156086_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14310.1|156790_156928_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14311.1|157339_157606_+	Uncharacterised protein	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	4.4e-14	48.3
SPR14312.1|158094_159294_+|integrase	integrase	A0A0R6PGY7	Moraxella_phage	1.3e-25	25.9
159296:159309	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>LS398548|170143:213297|DBSCAN-SWA
ATTATTTCTGATTGATTAAAACATTAGGATTAAAAGGAGAATTATGCTTTAAAACACCATAAATGATATGTAATAACTTACGCATAGCGGCAATAAGGATAAGCATTTTGGGTTTGCCAGTATCAGACAAACGTTGAGAAAATTGCTTGATAATACAATTATGTCTTAAGGCAGACATAGCAGGCATATAAAAAGACTTACGTAGATCTGAATTACCAGTTCTAGAGATTCTACTAGCACCCCGCACGGAACTGCCAGATTGACGATGCTTAGGATTAAGACCTACAAAAGCTACAACTTGTTTAGCAGAACTAAATTTCTCAATATCTGCTAAAAAAGCAAGAACTACAGCCTGTGTTTTTGCTCCTATGCCTGGTATTGACTCAAGTAACATAGCCTTATTATGAAGATCTTTGTTATTTTTAATATGGTCATTGATTAGTTGTTCAATTTCTTTAATTTGTGTTTCAAGAAATTCAATATGCATTTGAATATTATTAGCAATTGCTTTAGAAGCTCCTTCTAATCTATTTGTTTCTTGTGTTTTATGCTTAATTAAAACATTCAGGCGATTAACTAGCTGCTGTAGTTCTTGAATATAAAGAGGCTGTGGATACCATGCTTCCGGTTTCATTGCTTTGCAAAAATCTGCTATTAATACACTGTCTGCTTTATCTGTTTTTGTACGACTAAGTTTACTCATTGCAAAACCTTTAATACGGGCAGGATTTACTACGCTTACTTTATAACCATAATCGTACAGATATTTAGCTAAATTTTTCCAGTAGATACCTGTTGCTTCCATACAAACATGTCCAGTTCCTCTGCTTTTTAACCATGTTACTAATTTGTTAAACCCTTCAGAATTATTATTAAATTTTCTTGTTTGAACTTTATTATTAATTAACACAGCTGCATCAAATGTCTCTTTAGAAACGTCAATTCCTACAATTATACTATTCATAATCACCAAATTTTATGTTAAATATCTCAAAACCAACCTTGTAAATACAGGCTTTTTGCCTAAGAATACCGTCCGGTTTTTAATTAAAAAAGCTAGTTACTTATCTATAGAACAGGCTATTAGCCTTAGGAACGCTACTGTATACTAGCTTTCTTTTGTGCTATTGCTATAATCTTTTATTTTATTGCAATTTCACTTATTTTTATCATACAAGGAATGCTAATATTCATATAAAAGATAAGAGTGGGAAATTTCCAATACATTTAGCTGCTGGAAATGGCTTCAAAGATGTAGTACAGTTTTTGTTAGATTTAGATATATATACATATCCTAATATGATAAATTCACAAGATAATGATGGTCAAACTCTTTTACATTTAATTGCTAAGTATAGCTTTGAAAAATTTCCTACTAATCTTCTTAGTACTGTTCTTTCTTACGAGCGTCATTTAGATGATTATGACAAGCGATTTATAGATACAGCAGATATGCTGTTGAATAGAGGAGTAGATACAAACATACAAAATAATGATGGTCAAACTGCTTTACATTTGGCTATTTTATATCATCCTAAAGATTTACATGTAAGATATGAAGAATACCTAAGAAAGAATAGTAATGTAGCTATTTCATATCGCTCAACAGAGTTAATAAAGAGTTTGTCAAGTAATAATGTTAATTTTAATTTGAAAAATAAAGACGGTTATACAGTTTTAGATTTAGCTTTAGCTATTGAACATGATCAGCATAAAATCGCAGAGCACTTGCAAGAGAAAAGGCTATTATGGAGGGAAGGGCAAATAAAGGTCGCAAATAACTCGCTGGTAATAATAGCGGAAAATAAGGAGCAGATATTAAAATTAAAACCCGATTCAGCAAAAACCGATGCTGATAAATTTTTGGAAAAGTGGCGTGAGTTACCTATCAACATAACTGAGCAGATATTAGACACATTGGATGATGATGATTTTGGAGCATTTCAACAGCTTAACGAAGAACGTAGTAAAGTACCGTTGGGAGAGGACAGTATTCATGAAATGATTTAAGATTTGACGACATCTATTTTTAGTTGCTTTGTTTTGATTTGTTATGTTCTTAGATTTGTAGTAACTAGTATTATCGCAAATAAGATAATAACTATTATGGGTTATAGTTGAAGCATTTTAGCAGTCTTTGATTGCATCATGCTTCTCTTCTTTGACTAAACTTCATTTTAGATAGATATAAAAATAATGCAATAATGAATCCATTAGCAATAATGCTAATTATAGGGCTACTTAATTACTTATCGGTAGAATTAGCTACTGCTAACTCTTTGCCTACAGGGTTTTTATGGTACAATGATAAACATGGTCATGAGCTTGATGAATCTACTTCTAAGTTGATGAGGAGCGCTCATGATCATAGAATCGAGGAATTAAAGGAGCAATTTAATCGAGCTCAGCGTATAGCGCTTGATAATCCAACGCTCGAAAATGTAATTACAGCCCAAAGATTGCAGAAGCAAATCATGGAGAAGGCGCATAAGTTTGCTACTATGTGGCAATTAGCTACTCTACTTGATTATCAACTGATTAATGCTCATGAGCCATCTAATAGCTTACATAGAAAACTGTATCAAGAAAAATCAGGACAAGAAAACGACTCAAAACTTAAAAACATTGCTAAAAACTGTGAATTAATTTTACAAGTTAAAGAAGATTGCTTGCTCTGTAATGCCTTTATGCCTATTGTTCAGAGCTTTGCTAATAAATATGCATTTCAGTTGCTAGCTGTCAGTAAGAATAATGAGTTGCTGAATAAACTAAACCCTAAGCATATTGTACCTGTGTTATACCTAGTAGCTAGCGATGGTAAAAAAATATATTCAGTAGCTAGAGGCATAATTTCTGAAGATAAAATTATCGACAATATTCTAGCAATCGATAGATATTATCATAAATTGGAGACTAGATGAGCATCAAAATCAGAGTTTATGCTATTACAATACTATTATTGCTACAAGCTCCAGTATCACTGGCTTGGAATATCGAAAACGTATTTCAAGGAATGAGTGTTAATGTCACCAGATCTGGATCATATCAAGATCAAGCGGCTGGATATTATGCAGCTGGTGGATTGTCTGCTCGAACAAGCCAAACATCCTTTCAGCCATTTGCTATAACTCCACCATCTTTAAACATGAGCTGTAGCGGTATTGACGCCTATCTTGGTAGCTTCTCTGTTATTTCTGGAGAAGAATTAGTTCAACTAATGAAAAACATTGGTTCTCAAGCTAAAGTTTATGCATTTTCATTAGGATTAAAAACATTTGCTCCACAGATTGAGAACGCTCTCAAGGACTTGCGTAATCTAGCAATGGAGATGAATCAATTTGCCAAAGGAGATTGTGAATTAACAAAAGCATTATTTGCTACAGCTTTACCAAGAAACTGGGCTATGAGAGAAGCTGTTTGCCGTGATATACAGTCACAAAGTGGATTTGATTATTTTGCTGCTAGTAAAAAATGTCGTAATGATTTAGCTCAAAAACAAGCTCTGCGACAAGCACAAAATAAGGATTCAGAGCTAATGCTAGAATGATTATAACATCTTCACTAAAGCAGCAGCAAAGGTTGGAATACCATCAGATATGCATGATTCAATCATGTCTATGACTGGCACTATCGTGGTTACAAACAATAATGTACACTTTTATGACTCATTAGCTCAGGATGAAAAAAGTTGGATTAGTCATTTAAAAGGCGGAGAATCAGCCTCGATTTACAGTTGTGATAATGTCAGTTGCTTGCATCCAAGCTTGCAATGAAATATCACAATATTGCCAGAGAAATCTTATGCAGGTAAAGCTAAACAACAATTGACTAATCTAAAAATTAAGTTTGATAAGAATTCTGAATTCATTGACTCTGAAATAGCCTTTTTATCTTCGATTGGAGATATATTTCCGATTTATGATTATATTACATTAGAAGCTATTTCTGGAGTCACAATTTTAGATAGCTCATCAGAATTAATAGCTAGCTATACATTAGTTCAGCATTTGAAGGAAGTAATCACCGAAATACGTAGAGCCGTTACTTCACTAGGTGCTAAGCAAGTTTCGAATGAACATTTAGAAAGATATTTGAAGGAATTGAATCGAGTTCAACTGTTTGCAAATGAGAAATGGACTAGCCTACAAACAGATGCAAATCGAATAGATAAAAGGGCTAGATTAATAGAGCAGCATTTAATAGCGAAGGAGAAAAGTTAATGGATTACGTAATATACACATTTGGTGGTGGAGACTTATTGTGGCATGTGTTTAACGGCATAGGTAGAGTCTTTGCTTCAAATAGCGAATACTTTACTCCAGTAGGACACTTAGCCTTGACTATTGGTGGCATATGGGCTGCTACTAGGGCTATTTTTAGAGGAAATATCGGCATCTTTGCTATGGAATGGTTTTTTCCATCGATATTTATTTTTACGCTATTATTTGCTCCCAAATCTACTGTTTGGCTGAAGGATGAGGTATCAATGAGTGCGCCAGTAAAAGTTGATAATATTCCGATAGGTATTGCAATGTTTGCTTCTCTTTCATCGCAAACGAGTTACTTTGTGTCCAAAATGTTGGAAAATCATCTTTTACCGGCTTATGAAGGACTATCAAGCAGAAAAACTGGTATTATGTTTGGAGCAAAGGCTGTAGCTAAGATTCGAGATGTGCAAATACATGATCCAGTAACTTTAACTAATACTAAGGAATTTCTTAGACAATGCTTTATGAAGCCTTACATCATAGGTAATATCTTAGGCAAAAAAGCTGCTGCTCAACAAACTAATGATATCATAGGATTTATCGAGCAGAATATACCTAATAATTTCGGTATTTATTATCGCGAACCGAGTAATTTAGCCATTAGTTTCAAGAGCTGTAGACAAGCTACTCCATTGATTAAAGCAGCAATTCATAAAGAATTAAATGAAGGGCTTTTAACAAACTTTGCAGCTGCGATTGGAGTTCAATCTGATCAATCACACATGTTAAGTC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MANLMQQKITLQQKKARLIMDEVNLKIKERKMRTRRLIEMGGLVAKAKLDHLSANTLFGAIVSLKETLTQHPNVQDHWTTIGKDIFDKEQQNKAAVILKFTSEPDENTKRHIRLHGLKWNSFRQEWCGHVKDIEALKNGLLNVQYKLELVS
>LS398548|170143:213297|170143_171106_-|SPR14330.1|transposase|DBSCAN-SWA
MNSIIVGIDVSKETFDAAVLINNKVQTRKFNNNSEGFNKLVTWLKSRGTGHVCMEATGIYWKNLAKYLYDYGYKVSVVNPARIKGFAMSKLSRTKTDKADSVLIADFCKAMKPEAWYPQPLYIQELQQLVNRLNVLIKHKTQETNRLEGASKAIANNIQMHIEFLETQIKEIEQLINDHIKNNKDLHNKAMLLESIPGIGAKTQAVVLAFLADIEKFSSAKQVVAFVGLNPKHRQSGSSVRGASRISRTGNSDLRKSFYMPAMSALRHNCIIKQFSQRLSDTGKPKMLILIAAMRKLLHIIYGVLKHNSPFNPNVLINQK
>LS398548|170143:213297|204529_204631_-|SPR14365.1|transposase|DBSCAN-SWA
MKFDQIKELKDEKFRRLTGVRKETFSKMVGYFK
>LS398548|170143:213297|210107_210620_+|SPR14371.1|DBSCAN-SWA
MNIFVLHQDPNIAAQMLCDKHIVKMPLETAQLLCSVFLVALNNSDSIVRTKSYTITVPYKLTHCNHPCSIWARISQGNFDWLIKHGQALCKEYTYRYKKEHKSENVINWCDNNKDILLFQTDCIQNFAQALPEQYKCSDAIKAYREYYLHEKLRFARWEKGRKAPNWVKI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SPR14330.1|170143_171106_-|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14331.1|171261_172152_+	ankyrin repeat-containing protein 16	NA	NA	NA	NA
SPR14332.1|172346_173063_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14333.1|173059_173689_+	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR14334.1|173738_173915_+	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR14335.1|173927_174362_+	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR14336.1|174361_176944_+	conjugal transfer protein TraG	NA	NA	NA	NA
SPR14337.1|177040_178186_+	TPR repeat-containing protein 08	NA	NA	NA	NA
SPR14338.1|178191_179949_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14339.1|179958_180927_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14340.1|180911_181463_-	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR14341.1|181476_183585_-	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR14342.1|183848_186686_-	conjugal transfer protein TraA	A0A2H4ZK82	Cryptophlebia_leucotreta_granulosis_virus	7.4e-06	23.3
SPR14343.1|186965_187421_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14344.1|187745_189155_+	TPR repeat-containing protein 03	NA	NA	NA	NA
SPR14345.1|189302_189566_+	conjugal transfer protein TraD	NA	NA	NA	NA
SPR14346.1|189633_190668_-|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	2.4e-84	64.5
SPR14347.1|190792_191398_-	hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR14348.1|191439_191934_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14349.1|191952_192885_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14350.1|192901_193228_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14351.1|193308_193479_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14352.1|193608_194310_-	histidine kinase	NA	NA	NA	NA
SPR14353.1|194374_194653_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14354.1|195019_195715_+	DNA methyltransferase	A0A0H3UYZ1	Geobacillus_virus	8.3e-12	25.2
SPR14355.1|196084_196621_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14356.1|196598_196769_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14357.1|196758_198090_-	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	5.6e-65	36.9
SPR14358.1|198098_199814_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14359.1|199946_200087_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14360.1|200704_201085_+	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	8.9e-08	33.0
SPR14361.1|201081_202644_+	protein translocase subunit SecD	NA	NA	NA	NA
SPR14362.1|203850_204039_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14363.1|204102_204207_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14364.1|204218_204422_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
204403:204430	attL	NA	NA	NA	NA
SPR14365.1|204529_204631_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14366.1|205010_206213_-	aspartate aminotransferase	NA	NA	NA	NA
SPR14367.1|206320_207358_+	Ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR14368.1|207417_208251_+	ABC transporter	NA	NA	NA	NA
SPR14369.1|208253_208838_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14370.1|208865_210086_+	coproporphyrinogen III oxidase	NA	NA	NA	NA
SPR14371.1|210107_210620_+	Uncharacterised protein	A0A0K0KVI2	Prochlorococcus_phage	1.0e-19	38.3
SPR14372.1|210679_211405_+	DNA repair protein RecO	NA	NA	NA	NA
SPR14373.1|211780_211909_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14374.1|211962_212598_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14375.1|213108_213297_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
213716:213743	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>LS398548|349172:435633|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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MNIKTLYTSLLFYSAFLPTFLMLNTTYSLIYFSCSCLNVSSFCNSSFFSLLSLLFFKQNAIQELVKYNKCLLSVTTLLAAANIIAIMATITKEEKWLLIPAIEPDRKMTVSSKNYHEPYLKEWAIFVMKGLFTTSPNDVEIQIADMKVVSSDTESLNKFFHDHLQFVKGSNVSSVFFPKKVEVIKDGILISGTLRY

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SPR14519.1|349172_350216_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14520.1|350267_350819_-	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR14521.1|350832_352932_-	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR14522.1|353197_353965_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR14523.1|354021_356034_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR14524.1|356312_356768_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14525.1|356826_357627_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14526.1|357702_358278_-	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR14527.1|358378_359236_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14528.1|359210_359987_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14529.1|360353_361112_+	DNA methyltransferase	A0A1S5PRR3	Streptococcus_phage	9.4e-17	27.3
SPR14530.1|361167_361719_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR14531.1|361765_362410_-	ankyrin	A0A167R1M3	Powai_lake_megavirus	3.2e-10	28.4
SPR14532.1|362444_362840_-	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR14533.1|362876_363020_-	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR14534.1|364062_365880_+	ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha	A0A0K1LMZ5	Caulobacter_phage	6.0e-187	54.3
SPR14535.1|365902_366904_+	ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta	M1I8A4	Pelagibacter_phage	1.7e-98	53.5
SPR14536.1|367394_367970_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
367736:367753	attL	NA	NA	NA	NA
SPR14537.1|368321_368570_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
367736:367753	attL	NA	NA	NA	NA
SPR14538.1|368704_369955_+	ABC transporter ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14539.1|370256_371153_-	ankyrin repeat-containing protein	Q6VZ43	Canarypox_virus	1.1e-08	30.9
SPR14540.1|371926_372577_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14541.1|372626_372959_+	type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC	NA	NA	NA	NA
SPR14542.1|373198_373780_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14543.1|373796_374159_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14544.1|374265_374478_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14545.1|374871_375834_+|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	3.0e-84	64.1
SPR14546.1|376005_376158_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14547.1|376214_376475_-|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	2.7e-16	59.7
SPR14548.1|376455_377067_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14549.1|377105_377426_-	ankyrin repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
SPR14550.1|379181_380279_-	N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase	NA	NA	NA	NA
SPR14551.1|380953_382711_+	repeat-containing protein D	NA	NA	NA	NA
SPR14552.1|383702_383864_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14553.1|383817_384192_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14554.1|384151_384373_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14555.1|384483_385074_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14556.1|385138_385354_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR14557.1|385435_385582_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR14558.1|386022_386916_+	lipase LipB	A0A2I7SAF7	Vibrio_phage	8.5e-09	28.3
SPR14559.1|387309_387426_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
387211:387228	attR	NA	NA	NA	NA
SPR14560.1|387488_387743_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
387211:387228	attR	NA	NA	NA	NA
SPR14561.1|388743_389001_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14562.1|389088_389307_-	reverse transcriptase	NA	NA	NA	NA
SPR14563.1|389664_390528_-	ankyrin repeat-containing protein 19	A0A1V0QGR0	Shearwaterpox_virus	6.9e-08	42.5
SPR14564.1|390545_390710_-	ankyrin repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
SPR14565.1|390941_391088_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14566.1|391136_391523_-	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR14567.1|391646_392315_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14568.1|392530_392674_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR14569.1|392667_392982_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR14570.1|392953_393196_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR14571.1|393217_393646_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR14572.1|393698_394022_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR14573.1|394702_395926_+	reverse transcriptase	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	1.8e-65	38.4
SPR14574.1|396040_396490_+	HNH endonuclease	NA	NA	NA	NA
SPR14575.1|396642_396804_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
SPR14576.1|396800_398627_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14577.1|399076_399217_+	TPR repeat-containing protein 08	NA	NA	NA	NA
SPR14578.1|399316_399562_+	TPR repeat-containing protein 08	NA	NA	NA	NA
SPR14579.1|399569_399698_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14580.1|399694_399811_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14581.1|399822_400197_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14582.1|400800_401025_+	translation initiation factor IF-1	NA	NA	NA	NA
SPR14583.1|401068_401665_+	septum formation inhibitor Maf	NA	NA	NA	NA
SPR14584.1|401791_402541_+	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
SPR14585.1|402639_405357_+	DNA gyrase subunit A	A0A172JHV7	Bacillus_phage	6.2e-103	35.3
SPR14586.1|405390_406671_+	serine hydroxymethyltransferase	A0A219Y950	Aeromonas_phage	5.1e-108	54.3
SPR14587.1|407423_409916_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14588.1|410154_410694_-	ribonuclease P	NA	NA	NA	NA
SPR14589.1|410694_410877_-	50S ribosomal protein L34	NA	NA	NA	NA
SPR14590.1|411608_412403_+	cytochrome c	NA	NA	NA	NA
SPR14591.1|412397_412532_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14592.1|412899_413655_-	ribonuclease PH	NA	NA	NA	NA
SPR14593.1|413783_414380_+	nucleotide exchange factor GrpE	NA	NA	NA	NA
SPR14594.1|414904_415069_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14595.1|415506_416826_+|integrase	integrase	A0A0S2GLI2	Bacillus_phage	3.5e-11	24.7
SPR14596.1|416893_417217_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14597.1|417216_417768_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14598.1|417764_418253_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14599.1|418659_418995_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14600.1|419033_420362_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14601.1|420361_420682_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14602.1|420662_423155_+	conjugal transfer protein TraC	NA	NA	NA	NA
SPR14603.1|423151_423811_+	type-F conjugative transfer system protein TraW	NA	NA	NA	NA
SPR14604.1|423901_424075_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14605.1|424108_425053_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14606.1|425075_425459_+	type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC	NA	NA	NA	NA
SPR14607.1|425455_427150_+	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
SPR14608.1|427146_427845_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14609.1|427841_429143_+	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR14610.1|429142_431038_+	conjugal transfer protein TraG	NA	NA	NA	NA
SPR14611.1|431095_431776_+	conjugal transfer protein TraG	NA	NA	NA	NA
SPR14612.1|431788_432928_+	TPR repeat-containing protein 03	NA	NA	NA	NA
SPR14613.1|432933_434688_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14614.1|434697_435633_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>LS398548|444618:498261|DBSCAN-SWA
ATTATTTTACACTATTTTTTAAATTTAATACTTCTTGTATTGATAAATCCGTATATTCAGCAATTGTCTCAACTGATAATTCAGATTTCAATAATTTTATTGCCAAATCTTTTTTTGCTTCAGCTTTGCCTTTAGCTTCACCGAGCTTTATGCCTTCAGCTTTACCTTTAGCTTCACCGAGCTTTATGCCTTCAGCTTTACCTTCAGCTTTACCTTCAGCTTTACCTTCAGCTTTACCTTTAGCTTCACCGAGCTTTATGCCTTCAGCTTTACCTTTAGCTTCACCGAGCTTTATGCCTTCAGCTTTACCTTCAGCTTTACCTTCAGCTTTAGCGCGTTCGAGTTTATAATCTTCTACTGCTTTATTATCCCATATACGCTTTAACTCTTGTTCATAGGTTATTAGTTCGTCTTCGCTCCAGTTAAACTGATCTAATGCCTCATACGCTCTTTTTATTATTAAATCTTCACCTATTATTTTATTATATCCATCTAATGTTGTTTCTTTTGCATGTTTAAAAAAATAGCACCACTTCTCTGTTATATCATTTAACTCTTCCACTCTATCTTTTTTAAATTTTGGTAATTCTATAAAGGTAAATGAAAAGTCCTTTAGATCATGCTCATATGTCTTTTTATCCAGTATTACATGCCTTGATATATAGTCTTCTTTGTTTGGAAACAATTTATAATCTGCTATAGCTATAAATATAACTTCCTTTAGGTCTGAGTATTTTCCTTCCTTTCCTCTATTTGGTTGCCTACCATATGCTTTTGCGGCATAATACTGAGCTCTTTTTTCAAATCCTTGTGTAGGATCTACTTGCATTTCTATTATATATTGCGCACCGTTTTTATCTTTACACAAAACATCTACTATTGATTCTTTTTTGGACGCTATGTCTGCATCTAATATCGTTCCTAAAAACTCTACTTCTGTTATTTCTCTATTCCCTTCAAACAACAATATATCGTTCAGAAAATGTATTAGTATGTCCTTGTTTTTTTCTGATCCAAATATCTTTTTAAATGCTACATCATTCTTTGGATCTAGAAATCTTGATAAATGCATATATTTTTCATATTTTCTATTCTTTTTAAATTATACAATAAAATAACTTACATGAACATTATCTTATTGAATTTTAATTTCTGCAATTCACTACATTAACCACCTATTAAACTTTAGTTTATTAGGTAGCATAAAGCTCACAGTATTTATTTAGCTCTATAGCAATATCTGGTAATTTAAGGTATTCAGCAAGAGGTATAAATTCTTGCTGCGTTTCTAGTATGATTTCTTGTCTTCTTTTGACTGGCTTTATGAATATAGTTTTAATATTATCCAATCGGTCCAATAGTTTGATTAGTAATAGCTCTACTTTATCTTGATTCACTAATGTTTTAATCATTTTCATGGAACTGGTTTTCTTACCACCTCTGTTTCTTGTAAGAGCTAGAACTTGCTCGGCAATGTTATCATTAAATTCCATTGCTATCTTTTCTTTAGTTAGTGTTGTGTCTTCGATGGTATCATGTAGTATTGCTGTAATAATCGTATCCGTTTTAAAGCTGTAGTCTGCAACCATGCGCGCTACTTCTAATGGATGCATATAATAAGGTTCTCCTGTATCTCGCTTTTGATTGCTATGATATTTTTTTGCATAAAATATAGCTTTTTCAACTTTATCAAGATTAATGCGTTTATCAAAACTATGATTAATCAAGTCCAGCTTATCAAGTAGTTTATTGATATGTTCACAATTTAAAAATGCCAACATTATTTCCTCCATCTCCATTAATAATTCTAATTTTCAGTTTCTCAGCGAACTTCGATAGGTATACTACACGTGAAAGCTGTATACTTGTCTTGCTGACTTTCTAGTTTAATTTTTCCAGTCATTTCATGTATAAACGGTTTAACGAGTAGTAATTCAGATTCTAGTACTGCATAGCTTTTGATATGTAAGTTTCTGAGCTCATTATTTATCTTTTTCACTTTCTCAGCTGAAATTCCAATTCCGTTATTACGAACAATTAATTGTAATATTCTATAATTTGTCTTTTTATTTGTAGAAGGCAGCAAATCAACTTCAACACTAATTTCGCTGCATTTACTATTAGTAGCATTGCAAATTAATAGTGTTAGTACTTTCTGTATTTGAGTACTATTTACAATGATTAAATCTTTTATATCATTTTTAAAGTTGCAGCTAAGATTTATTCCTTTATTTTCTGTGAATGGCTTAAGCGCTATAATAGTACTATTTACTTTTGCTTGAATACCAAAATCTTCAGATTTTATAGTATGACTCATAAAATGCTTCCATATGTTTTAATTAAAAAGTTGTACTGGTATATCGCAAGTAATAGCTGTGAACTTATTTGCCTCGCTCTTTATCTCTAATTTTCCACTTAGTTTGTTAACAATGTAATTTGTAAATCCTAGACTCGAGTCTAATATTTCTGGATCTCTAATTGAATGCAAATCAGTAAATTTTGCATTTATTTCTTGTAGTTTTTCTTGTGAAATACCTTTTCCGTTATCACGTACTATGAATCTTAATATTCTGTCTTTTTCATTTACCTTTCGATACGGCGAAGTAAATAACCTAACTATAACATCAACCTGACAGCTTTTATTAACTCTAATAGCTCCACTTATTAATTGACTAAGTATAGTTTGCAATAGACAACTATCTCCAATAACAATGTCATTTATGTTGTCCTGAACATTGTAACTGAGCGATATTTCTCTATCTTCAGCAATTTCTTTCAGCGAACTAATTGTATCCTTCAATAGTTTTTGTATGCTAAATTTTTTTAAATGTACGTTTTGAAGCTCAATTTGGTCTCTAAGTGAGTAAACCATACTGTTACAGCAGTCTTGTAGGTTAGCAACACAATTAAGTATTCTTGTTAAGCTAGTAGTTTTATATTCATCTTCTTTGAAATCATTTTGCCCACATAGTAGATCATCTGCTAGATGTCTGATTTTAGCAGTAGCAAGATCAAACATATATTTAATTTTTTGAATCAAATCTATACAATATTGCTTCATTGATTCAGCTTCCTCTAGATAATCTTCCGCTTGTTGTAGCTTTATTTTCATTCCAATATATTTATCTTCATTCATATTTTCGGTACGAAGATAAATATTTCTTTCCTTAGCTGTAGATACTAATTTGGCTGAAATAGGTGGTAGATGAATTGTCCAGACATCTTGAGAAATGTCTTTTGTTTTATTGATATTCTTTTTTTTATTTTTCATAATATTCTCCATTTGACTAATGTTGTGAATTTAAATTACTAATTTGTATTGGAATGCTAACTAAAAACTTTGTATAATGCCCTTCTTTACTGTCTATCTTAATGCTTCCTTTCATTTCATATGTAAGATGTTTGATAAATTCTAACCCTGAATCTAATGCTTGATGCTTAATTAAGTGTGGATTTTTTAATTCAGAGTTCATCTCTTGTAATTTGTTTTTTGAAATGCCAGCTCCTATGCTATGCACTACAAATTGCAATATTCTATCTTTTGAATTCGATTGTTCATTTTTAGGAGGCAAAAAATCAATGCTAACTCTAACTTTGCTATTTGTACTATGCATAATAGCACTACCAACTAACTGAGTGAGTACAGCTCTTATTCGAAACCTATCTCCAGTAATAATATCGTATATGTCATTTCCTATTTTTTCCCTTAGCTCTATATTTTCATCTTCAGCAATTAATCTGATTGCTGCAATAGTACCATTTAGCATTTTTCGTAGGCTAAATTTTGCTAGTTCTACATTCGTTGATTTTATGGTTTTTCTAAATACACAAATTTTATCATTTAGATCATTATTGTTATTTTCCACATTATTCTCCTATGGTGAAGTTTATTAACTTTGTTTTTTTAGAAATTTAAAATAGCAAGCTTAGCTAACAATTAGCTAAGCTGACTGGTATATCACATATGGCTTCCGTTTGCATAGTTGCATCCTAATTTAGGTATATAATTGAATTGGCACTTCAAACGAAGAAGATATGTAGTTACTTCCTTGATCTATTTTGAGATTTCCTTTCATTTGATGTGTAAGCTGTTTTATAAACACCAACCCTTGTCCTAGCTCTTGATGTTTTGTTAAATTCGAATTGCTTAGTTCAGAATTCATCTTTTGCAATTTTTCTTTCTGAATGCTAGGGCCTATGCTGTGTACTACAAATTGTAATATTTTATCTTTTGAATCTGTTTTTCCATCTTTAGAAGGTAACAAATGAACACAAATATTAATCGTTGTACCTTTAGTACCATATATAATGGCACTTCCAACTAACTGGCTTAGTACAGCTCTTATTCGTAAACTATCTCCAATAATACTGTCTTTTATATTAGCCTGAAAATTGCTTTTTAGATCTATTCTATCATCTTCAACAATTGCTTTTAGTCTAGCGACAGTATCCTTTACAAACGTTTGTAGGCTAAAATTTTCTAGTTCTACATTCTTTGATTCTATGTTTTTTCTAAATACACAAATTTTATCATTTAGATGATTTATTAGTTCATCAAGTGAGCCTAACGTATCTGTTATTTTTGCTATTGCATCTTGCTTATATCCTACTAGTTCTACTATATTCCGCTTTGTTTTATTGCAGTTATTTACTATATGCCTAATATATTGAATCAAATATATATTGTTATTTTCCATATTATTCTCCTATGGTTAAGTTTATTAACTTTGTTTTTTTAGAAATTTAAAATAGCAAGCTTAGCTAACTGTTAGCTAAGCTGATTGGTATATGACATATGGCTTCCCTTAATGTTGATTTTTTATTTTCTATTATTTCGGACTGAAGTGTTCTAACATCTTCTGACTCACTTTTGAGCTGTTTGAATACATCTATTATATTTAAGTTTAGTGTTTTAATTTGATGTGTAAGTTTTAAAAGCTCTTTATCACCAGCTGCTAGATGTCTTAGTAACAGTTTTGACTGTATATTTTTATTAAATA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>LS398548|444618:498261|484026_484521_+|SPR14659.1|DBSCAN-SWA
MSHTIKSGDFGIQAKVNNTIRALKPFTENKGINLSCNFKNDIKDLIIVNSTQIQKVLTLLICNATNSKCSEISVEVDLLPSTNKKTNYRILQLIVRNNGIGISAEKVKKINNELRNLHIKSYAVLESELLLVKPFIHEMTGKIKLESKQDQYTAFTCSIPIEVR
>LS398548|444618:498261|472341_472716_-|SPR14646.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVDKKTHQVICTDFSNCKKHDFRLFKKSKILINPKVKVITDTGYQSIQKIHNNSELPNKKNKKNPLTKNDKKNNRRLEEERVVNEKVIGMLKRFKIIADKYRNRRKRFDHRFNLISGIYNFDLP
>LS398548|444618:498261|458249_458900_-|SPR14638.1|DBSCAN-SWA
MSTTQNQLRLLSGIVIAMLFLSSLLYIRFLFYILMIIIAAGMIQEWFNMCYKKPFVVGLGFVIILISIICLIIMHAKLLPGMTLVSYFLMIWCTDVFAMLGGKYFQGPKLTPYISPNKTWSGLICGMTAAGFVALIIYITALDAVLTHKMNSCWYAFSFGVIIAFIAQLSDLFVSYFKRQANLKDSGNIIPGHGGMLDRFDSIIFSAPLFFMLVMM
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MSVAVANKSKPFLHWIGSKRRIVNKLIEHLPQGPHYNYYEPFLGGGALFFQVRHLFKQCFLSDINLDLITSYNAVKNNPNEVNRLLSLYHKHHSKDYYYKVKNKYSNNPNEITAKFIYLNKYSFRGIYRVYKNGQSAQTFSGECYIKLHIASRINQCSRLLHGVSIYATDFSFIEPQQNDFVYFDPPYHKSGERFYTRLPFDEKDQIRLRDFVQELTNKGVKIMISNNNTAFIRDLYKDFNINTVTVVYSINEQRNPVNELIITNYKTC
>LS398548|444618:498261|446952_447888_-|SPR14623.1|DBSCAN-SWA
MKNKKKNINKTKDISQDVWTIHLPPISAKLVSTAKERNIYLRTENMNEDKYIGMKIKLQQAEDYLEEAESMKQYCIDLIQKIKYMFDLATAKIRHLADDLLCGQNDFKEDEYKTTSLTRILNCVANLQDCCNSMVYSLRDQIELQNVHLKKFSIQKLLKDTISSLKEIAEDREISLSYNVQDNINDIVIGDSCLLQTILSQLISGAIRVNKSCQVDVIVRLFTSPYRKVNEKDRILRFIVRDNGKGISQEKLQEINAKFTDLHSIRDPEILDSSLGFTNYIVNKLSGKLEIKSEANKFTAITCDIPVQLFN
>LS398548|444618:498261|497145_498261_+|SPR14670.1|transposase|DBSCAN-SWA
MTKQLKHDSLAKTIMSDPVAAQEFLEYYLPSDFKSLIDLSQIKVEQESYIEESLKKKYSDIVYKVATKKHGNAFIYILIEAQSTVDYWTALRLWRYTLLLCERHKKEKTKLPLVYNLVIYNGKEVYNAPRNLWDLFTDSIIAKQLMTSDYQLVDLQSMSNDEIVRKKHIGMLEYMLKHIHQRDMLKLWEEFLIKFKHVLILDKEKGYVYLRSFLWYTDTKLLESQQPELEQVLAKYLSEEEKSNIMRTIAAKYIDEGIEIGETKGIAKGRAEGIEIGETKGIAKGRAEGIEIGETKGIAKGRAEGIEIGETKGRAEGRAEGRAEGRAEGRAEATQGLARNLLKAGFSVEFISENTGLSKEEVINLKNNIEY
>LS398548|444618:498261|483209_483923_+|SPR14658.1|DBSCAN-SWA
MNADNYIKMKIKLQQAEDYLEEAESMKQYCIDLIQKIKYTFDLTTAKIQDLADDLLCWQNDFKEKEYKTTSLTRILNCVANLQDCCNSIVYSLRDQIELQNVHLKKFSIQKLLKDTISSLKEIAEDREISLSYNVQDNINDIVIGDSCLLQTILSQLISGAIRVNKSCKVDVIVMLFIAPYRKENEKDKILRFIVRDNGKGISQEKLQEINAKFTDLHSIRVSRNIRLESRIYKLHC
>LS398548|444618:498261|461897_465602_-|SPR14641.1|DBSCAN-SWA
MNAKFIHLRVQSSYSLLESTLSTQKILSLAQRYEMPAVALTDKSNLFGSLEFALAAAKEGIQAIHGIILNIQYYGQNDSPKYSEILLIAQNKAGYQNLLKLASFPYIKNDRTTINHVTLDDLFTYNEGIIVLSGYFYGIIGNLLFEKNFVLAENYAKKFKTIFGNRFYFEINRITSKQIYAIEKSYVQLAQKLNIPLVATNNILFDEGEKYATHEVLMKICNPNIEIDKFKINNQCYFKSQNEMIETFWDLPQAIENTVYLTQRISFMLEAKKPLLPKFAKDADEENKLIRQLSEEGLSQKLKLQFQNYSTAEFEDKKKIYFDRLNYELSVICSMNFSGYFLIVSDFIKWSKENNISVNPRGSGAASVVAWGLGITNLDPIRFGLLFERFLNPERVSMPDFDIDFCQERRGEVINYVRRKYGEGKVGQIITFGKLQAKAVVKDVARALGLGYNYANYITSLIPFNAVRPVTLQEAIDKVNELNNAYTGNDLYNFEALINVDTRYLKLLDKWQSQNYIKIQQILNNINIKGEQLNLIKELDNKQDIQDYIDIIKSESTYQKVISYCQKLNLDSLASEFQQMHDEYQDLISNRKAQIQDVIKTALELEGLHRHVSVHAAGIVIGRQNLIDTIALYKDKNSEIPVVQYSMKYLEAAGLIKFDFLGLQTLTIISKCLELLKNKNINFDINNLNFNDKLTYQLLSNGNTIGVFQFESSGMQDALKRLKPDCIEDLIALGALYRPGPMDNLRTYIDCKHGRLQPNYLHSKLEPILKETYGTIIYQEQVMEIARVLAKYTLSKADFLRQAMAKKIKSEMENQKVIFINGAIENGISKNQAESIFAEVEKFAGYGFNKSHAAIYAVISYQTAYLKANYPTEFLVACLNLDINDQDKIDLFIQEAKQLGIKVIPPNINKSKEYFSMSADNAIIFALGAIKNVTPNIGKIIVEERLHRGEFKTILDFAVRTDSYSISRKVFESLIYAGCFDDFQQPVNRHQLFASIDRINNYASKQAKHIHQFSFITSTVEDVLSPISEYSLHEKAMKEFEVLGSFLTCNPIAPYESFLAKHGVINSKYLSTTLKSGSTAVKIAGIVQKKNSRMSPRGKFNIIKLSDSCGNSEVKIFDEEILRKYGALLEIGSLVIAQCDVFKDEGGIRIVATEFKDIETIKNDLDKHLQLTINHEQDLDEVINVITSTNITKGDTEIDMTLPFFNKKFQVIVTIKLKYSLTIDQLINLNKFIS
>LS398548|444618:498261|444618_445689_-|SPR14620.1|transposase|DBSCAN-SWA
MHLSRFLDPKNDVAFKKIFGSEKNKDILIHFLNDILLFEGNREITEVEFLGTILDADIASKKESIVDVLCKDKNGAQYIIEMQVDPTQGFEKRAQYYAAKAYGRQPNRGKEGKYSDLKEVIFIAIADYKLFPNKEDYISRHVILDKKTYEHDLKDFSFTFIELPKFKKDRVEELNDITEKWCYFFKHAKETTLDGYNKIIGEDLIIKRAYEALDQFNWSEDELITYEQELKRIWDNKAVEDYKLERAKAEGKAEGKAEGIKLGEAKGKAEGIKLGEAKGKAEGKAEGKAEGKAEGIKLGEAKGKAEGIKLGEAKGKAEAKKDLAIKLLKSELSVETIAEYTDLSIQEVLNLKNSVK
>LS398548|444618:498261|479616_480120_+|SPR14653.1|DBSCAN-SWA
MNVLKSLLQPCYAVILAFVVLSSPSICTANNNVNFNAFKDSIDTSQFYIKFSTGIATNYDTLEAGIGYRLNRHRMDVRLGFMCHHNCRDNFVQGNYYYNIIEGNKASIFVTGGLVSVLKSYSDIGVDLGVGTTINLSRDTYLDIECSTIANYRPLPIHIRFGLQVHI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SPR14620.1|444618_445689_-|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	2.5e-84	64.1
SPR14621.1|445810_446398_-	hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR14622.1|446439_446934_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14623.1|446952_447888_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14624.1|447904_448483_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14625.1|448612_449314_-	histidine kinase	NA	NA	NA	NA
SPR14626.1|449378_449657_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14627.1|450023_450833_+	DNA methyltransferase	A0A1S5PRR3	Streptococcus_phage	1.8e-18	26.0
SPR14628.1|450836_451385_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR14629.1|451432_452077_-	ankyrin	A0A068ELT3	Penguinpox_virus	9.8e-07	27.5
SPR14630.1|452111_452687_-	(p)pGpp hydrolase	A0A291L9W9	Bordetella_phage	1.6e-05	32.1
SPR14631.1|452920_454369_-	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	2.0e-71	36.6
SPR14632.1|454377_456093_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14633.1|456248_456575_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14634.1|456846_456942_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14635.1|456951_457098_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14636.1|457303_457936_-	3'-5' exonuclease	NA	NA	NA	NA
SPR14637.1|457942_458242_-	Cell division protein FtsB	NA	NA	NA	NA
SPR14638.1|458249_458900_-	phosphatidate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR14639.1|458902_459598_-	UDP pyrophosphate synthase	R9W0U9	Flavobacterium_phage	1.0e-17	43.0
SPR14640.1|459773_461579_+	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	2.4e-42	29.3
SPR14641.1|461897_465602_-	DNA polymerase III subunit alpha	A0A0K1Y9G6	Streptomyces_phage	5.8e-128	30.7
SPR14642.1|465591_468156_-|tRNA	valine--tRNA ligase	A0A2K9L2Y7	Tupanvirus	1.2e-246	50.7
SPR14643.1|468187_469063_+	4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR14644.1|469332_470094_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14645.1|470445_471444_+	peptidase S66	NA	NA	NA	NA
SPR14646.1|472341_472716_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14647.1|472669_472996_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14648.1|473242_474442_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14649.1|475057_476623_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14650.1|476631_478080_+	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	3.9e-72	36.8
SPR14651.1|478314_478890_+	(p)pGpp hydrolase	A0A291L9W9	Bordetella_phage	7.4e-06	31.3
SPR14652.1|478924_479569_+	ankyrin	A0A2H4X2N8	Flamingopox_virus	3.7e-06	27.6
SPR14653.1|479616_480120_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR14654.1|480123_480933_-	DNA methyltransferase	A0A1S5PRR3	Streptococcus_phage	4.1e-18	26.0
SPR14655.1|481306_481585_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14656.1|481649_482351_+	histidine kinase	NA	NA	NA	NA
SPR14657.1|482480_483059_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14658.1|483209_483923_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14659.1|484026_484521_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14660.1|484562_485150_+	hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR14661.1|485271_486282_+|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	6.3e-85	64.5
SPR14662.1|486389_486602_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14663.1|486882_487956_-	TPR repeat-containing protein 08	NA	NA	NA	NA
SPR14664.1|488277_488733_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14665.1|488942_489320_-	HNH endonuclease	NA	NA	NA	NA
SPR14666.1|489422_490658_-	reverse transcriptase	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	3.0e-65	37.7
SPR14667.1|491340_494160_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR14668.1|494423_496529_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR14669.1|496542_497094_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR14670.1|497145_498261_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>LS398548|517927:568427|DBSCAN-SWA
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MLQLRLKVIMQNQKLCWALSRPLKYMGLSIDEWGVVLAGVAPGIVLVNSRHAKLGLAFMAGGIALCYCFKKFKKVSENFLLKSFLVAKGLLPAPLGY

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SPR14690.1|517927_519148_-|integrase	integrase	A0A0M3LQN1	Mannheimia_phage	2.0e-16	27.1
SPR14691.1|519281_519482_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14692.1|519599_520295_-	cytochrome c oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
SPR14693.1|520506_520983_-	RDD family protein	NA	NA	NA	NA
SPR14694.1|522144_524361_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14695.1|524943_525111_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR14696.1|525264_525621_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14697.1|525632_525806_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14698.1|525982_528856_-	excinuclease ABC subunit A	A0A1B1IVR3	uncultured_Mediterranean_phage	2.2e-308	54.6
SPR14699.1|529255_530065_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
529287:529317	attL	NA	NA	NA	NA
SPR14700.1|530176_530647_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR14701.1|530643_530805_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR14702.1|530805_531171_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR14703.1|532152_532356_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14704.1|534476_534746_-	50S ribosomal protein L27	NA	NA	NA	NA
SPR14705.1|534786_535113_-	50S ribosomal protein L21	NA	NA	NA	NA
SPR14706.1|535252_535921_-	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
SPR14707.1|536025_536775_+	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR14708.1|536995_538366_+	exodeoxyribonuclease VII large subunit	A0A1V0SD82	Indivirus	2.6e-41	33.2
SPR14709.1|538424_539900_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14710.1|539991_542958_-	ScaD autotransporter protein	NA	NA	NA	NA
SPR14711.1|544016_545696_+	DNA polymerase III subunit gamma/tau	E7DN81	Pneumococcus_phage	4.9e-42	39.1
SPR14712.1|545707_546268_+	nucleoid-associated protein, YbaB/EbfC family	NA	NA	NA	NA
SPR14713.1|546536_547250_+	zinc ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.5e-16	31.3
SPR14714.1|547230_548019_+	zinc ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
SPR14715.1|548787_549084_+	reverse transcriptase	NA	NA	NA	NA
SPR14716.1|550636_550726_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14717.1|550985_551384_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14718.1|551371_551749_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14719.1|551911_552505_+|integrase	integrase	A0A0M3LQN1	Mannheimia_phage	5.3e-15	31.4
SPR14720.1|552549_552726_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR14721.1|552853_553147_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14722.1|553374_553731_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14723.1|553742_554087_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
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SPR14733.1|563746_563920_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14734.1|564509_565751_+|tRNA	tyrosine--tRNA ligase	K4F5T3	Cronobacter_phage	1.9e-67	36.1
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Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>LS398548|575921:623901|DBSCAN-SWA
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MQYSYLETFIGFCVMLFVTLCIYFGYKTYNDYYIKDNNFKTVFATFQNVEGLNKGSSVFVSGIKIGTVEKLTLVPLSFDVAVELKLSADINLPNDSQAIIMNRGLLGEKYITIIPGIEENYIADKGEIYFTQSAINVERMIGKVFSELFGSNYFKISSSRH
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MNSDLHNYLKGILWFFLALLCSVLNDIISKKIGLSLSAAQISFLRSFGSTLALIPFILFTGIKTLKSKTLKIHFLRGILLFCSLSTWVYGLTITSVASVTIISFSIPLITLILANLVLNEDVKWYRWVATILGFIGVIIAIPTTKTIFDIRILVLFLSAFIFAILDIINKKFVNSESMLSMLFYSAFFTTIVALPFAYYSWKPLNYTYWPLIFILGCSANLILYFLLKAFSLVDSSAVAPYRYIELILSAIAGFLYFNEAVSYDILFGGAILIFSTTFIFYTEKANINKH
>LS398548|575921:623901|604499_604865_-|SPR14769.1|DBSCAN-SWA
MNNAGVKNWFAKLSIGVYLLLVLLTLASWRSDSDSELCKLVIKDHKFEPSEIHVHANKRIELIIENLDDSVEEFESRDLKREKIIPAHSTVKIILPPLKQGSYKFFGEFNEETAQGVIIVE
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MKISTSLLNILVCPVTKSKLVYDEKSSTLISKEARLAYPIKNGIPVLLPDQATKI
>LS398548|575921:623901|614249_614918_+|SPR14781.1|DBSCAN-SWA
MRKVYYYPLCPFSRQLRIILKEVDSVFTLIKEEFWLKKKEFITLNPNGKLPVLIETSGLVVYDIFTIIEYLREIDPNFHFICNEPEKNVAIRKLFTWFNDKFYHEVTKIILDEKLIKFLKNYGSPRSDLLKIAKTSQKVHFNFITNLLQSNSYLAGDQVTIADIAAASHISVIDYFNEVIWDYYPSVKNWYVLIKSRPSFKPLLQDYTPGFFPPKYYAELDF
>LS398548|575921:623901|608956_609220_+|SPR14774.1|transposase|DBSCAN-SWA
MFLLFKLHLIINNKGEIISVKITKGNKSDLSMASVISEGLSGKLFGDKAYISKELFHQLFSNGLRLFTNLLKDMKTYLSDIDDKRLL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
566474:566513	attL	NA	NA	NA	NA
SPR14741.1|575921_576056_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14742.1|576610_576967_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14743.1|576993_577221_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14744.1|577265_577445_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR14745.1|577583_577793_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR14746.1|577957_578533_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR14747.1|579528_579696_-	tetraacyldisaccharide 4'-kinase	NA	NA	NA	NA
SPR14748.1|579828_580050_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14749.1|580325_580550_-	50S ribosomal protein L31	NA	NA	NA	NA
SPR14750.1|580559_580847_-	50S ribosomal protein L28	NA	NA	NA	NA
SPR14751.1|581090_581963_+	EamA family transporter	NA	NA	NA	NA
SPR14752.1|581980_583237_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
SPR14753.1|583820_584585_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14754.1|584857_586069_-	penicillin-binding protein 4	G3M511	Mycobacterium_phage	1.0e-09	26.9
SPR14755.1|586094_587888_-|tRNA	aspartate--tRNA(Asp/Asn) ligase	NA	NA	NA	NA
SPR14756.1|588166_592357_-	DNA-directed RNA polymerase subunit beta'	A0A2I7QNZ7	Vibrio_phage	1.3e-70	27.0
SPR14757.1|592471_596596_-	DNA-directed RNA polymerase subunit beta	A0A0N9R0K9	Chrysochromulina_ericina_virus	3.5e-25	30.7
SPR14758.1|596911_597301_-	50S ribosomal protein L7/L12	NA	NA	NA	NA
SPR14759.1|597322_597832_-	50S ribosomal protein L10	NA	NA	NA	NA
SPR14760.1|597835_598582_-	50S ribosomal protein L1	NA	NA	NA	NA
SPR14761.1|598585_599032_-	50S ribosomal protein L11	NA	NA	NA	NA
SPR14762.1|599071_599608_-	transcription termination/antitermination factor NusG	NA	NA	NA	NA
SPR14763.1|599649_599850_-	preprotein translocase subunit SecE	NA	NA	NA	NA
SPR14764.1|600104_601289_-	elongation factor Tu	A0A076FFS6	Aureococcus_anophage	2.5e-32	26.2
SPR14765.1|601462_602227_-	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR14766.1|602391_603003_-	recombination protein RecR	NA	NA	NA	NA
SPR14767.1|603091_603628_-	septation protein A	NA	NA	NA	NA
SPR14768.1|603631_604471_-	iron permease	NA	NA	NA	NA
SPR14769.1|604499_604865_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14770.1|605329_606562_-	EAL domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
SPR14771.1|606747_607479_-	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.1e-27	40.6
SPR14772.1|607471_608089_-	arginine ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
SPR14773.1|608757_608949_+|transposase	DDE transposase family protein	NA	NA	NA	NA
SPR14774.1|608956_609220_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14775.1|609748_611002_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14776.1|611174_611417_+|transposase	DDE transposase family protein	NA	NA	NA	NA
SPR14777.1|611816_612170_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14778.1|612264_612492_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14779.1|612469_612577_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14780.1|613415_613607_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14781.1|614249_614918_+	glutathione S-transferase	NA	NA	NA	NA
SPR14782.1|615055_615262_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14783.1|615174_615375_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14784.1|615612_616089_-	transcription antitermination factor NusB	NA	NA	NA	NA
SPR14785.1|616112_617384_-|tRNA	histidine--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
SPR14786.1|617386_617872_-	outer membrane lipid asymmetry maintenance protein MlaD	NA	NA	NA	NA
SPR14787.1|617876_618239_-	NADH ubiquinone oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
SPR14788.1|618210_618717_-	ribonuclease H	A0A1P8DJF0	Virus_Rctr71	1.9e-29	47.7
SPR14789.1|618716_619244_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14790.1|619372_620197_-	thiol:disulfide interchange protein	NA	NA	NA	NA
SPR14791.1|620326_620647_-	ferredoxin	NA	NA	NA	NA
SPR14792.1|620651_621362_-	heme exporter protein C	NA	NA	NA	NA
SPR14793.1|621354_621969_-	Laccase domain protein YfiH	NA	NA	NA	NA
SPR14794.1|622063_622915_+	glutamine synthetase	NA	NA	NA	NA
SPR14795.1|623418_623901_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
628726:628765	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>LS398548|632390:686138|DBSCAN-SWA
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MFKNIFSEDILINQLLTALTTSDQSKFTEDNIFLLGKNLAKVLNNIAENPSISNVEEYQKCFSDLNNQDLCKVLKILQNMIIADENKELIEIISSPLLYRLTKKYKAERAEELNNNHSQISSKHFKNSNIEELLRDRNIAKQDEFPKTEAKAIGISEGYIATEKSSGHIFLLKKFYKKDISIGKNLAKMPSEELDKLQLAWSDRRDAVQELLASSIYQLLLYGQAPKEELVIPDRSNADSLYIRSKFLDNAVQLSRFSGMKRSTGLKAEAKNLQKLEGFEKVIAACHILGELDYHSGNLIVQNGKTIAKVDHGRSLMQFYADFESMVSTTDSIFDDPFLNYNSAIQKGNLSFDINKYNDALKQMLAQIDEGQIDAIIEQKISELAKLGFDPKGFIGKVKFKGETFISTPINDYPALIKFYQVNLKENIKNMKEIVKATDVISRFSNVSSKFKKGGWLNAFATTSIKEPVLYAYNHNIKIDGKDALTWAIDNNYQMNSLNHSYIEVEKCNYEPQWQKDSNGKWQKKEHLVQTITNDIVKWHAADYILEIEKSRNDLKKQLQPLLGQSQNILTKKSVSKEIKKFDDSELARKRMLLNPRINYCTRIQKARSAFKSKNSQGVEIS
>LS398548|632390:686138|648471_649101_+|SPR14825.1|DBSCAN-SWA
MSIKIRVYVIAALFSLQAPVSLAWNIENVFQGMSVNVTRSGSYQDQAAGYYAAGGLSARTSQTSFQPFAITPPSLNMSCSGIDAYLGSFSVISGEELVQLMKNIGSQAKVYAFSLGLKTFAPQIENALKDLRNLAMEMNQFAKGDCELTKALFATALPKNWAMREAVCRDIQSQSGFDYFAAGKKCRNDLAQKQALRQAQNKDSELMLE
>LS398548|632390:686138|675631_675868_+|SPR14845.1|DBSCAN-SWA
MLQLQLKVIIQNQKLCLALSRPLKYMGLSIDEWGVVLAGVAPGIVLLNSRHAKLGLAFMVGGIALCYCFKKFKKVLMP
>LS398548|632390:686138|670385_671132_-|SPR14837.1|DBSCAN-SWA
MCSLISSWLQIIIYPLIILLNYFFPRQCLTCEQLIQSALPAGLCSTCWNKINFITLPFCQKCGRALPYDYGADVICLKCCHTAPNYELARALLIFNEDSKFLIHAFKYYDKPLIAMMLAQLLYVRYQYNILSADYIIPVPIHRFKLLLRGYNQAQVLGKYLSDIAKLPIKSNILIKYKWTKSQTKLTKKERIKNISGSFRINNSEIIKNKKIILLDDVVTTGTTVNLCAKLLKNAGAKSIFVLCIAYT
>LS398548|632390:686138|644260_644464_+|SPR14818.1|DBSCAN-SWA
MKSWKLQQLEQDLVKIVNNTLRGEIQEIVNPGGETLYLVPGVKDIENTASKFRKYKKKEVYIIKKSW
>LS398548|632390:686138|674994_675282_+|SPR14844.1|integrase|DBSCAN-SWA
MIRDFALLALYTGARKSNVLEMEWDNIDFERKIWHIPKTKNGKAQNIPLTDDAMEILQATKLISTSKWVLPSATSESGHLESHMKHGIGFVKRLA
>LS398548|632390:686138|661383_663051_+|SPR14832.1|DBSCAN-SWA
MHRRSNTQFNIHAMGSIQLCRILKDRSILSETIITEIYNRALFLLQTEDARYNRLQFDARGLATILYQFAKLNYVIGSEFIEAWTNQAINLMDEFNSQGLTNSLWAFGRLKIKPQAPFIEAWIHHSIKTIDKFNSQDLANSIWGFGRLEIKPQASFIEAWIHHATKTIDKFNSQNLANSIWGFGRLEIKPQASFIEAWIHHSIKTIDKFNSQDLANSIWGFGRLEIKPQASFIEAWIHHATKTIDKFNSQNLANSIWGFGRLEIKPQASFIEAWIHHATKTIDKFNPQELANSIYGILVLNVLYDPKIKVPQQFISAVNKNIELFDENNEIISQILKAHYYFAKQGVGILTSQNRQLLEKKFKTKLTPCHTSDLQLNVLKVVKKVLVQHPVKSEHYIKQITSSVDIFIKEKNTVIQVDGPRHFDDNNAPNISTRLNTKLLKSYGYIVHRIPYWVWDKLRTNTDKEKYICELICTDKSVSQSEMLEEIFYDAQENIPEQSTSEILPHSESQISDDDAFYDAYEYIPQDPLTHESSSHYDMQALGNIGSSDSETRSL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SPR14807.1|632390_632711_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14808.1|633337_633817_+	transcription elongation factor GreA	A0A248SJQ8	Salicola_phage	1.2e-06	27.7
SPR14809.1|633863_634763_+	RNA polymerase factor sigma-32	A0A248SJA5	Salicola_phage	6.7e-30	29.8
SPR14810.1|635361_635469_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14811.1|635961_636504_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14812.1|636786_636957_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14813.1|638402_638705_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14814.1|638716_639073_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14815.1|639588_641073_-	ankyrin repeat-containing protein 13	A0A1V0S7Q4	Shearwaterpox_virus	5.7e-10	29.8
SPR14816.1|641355_643521_+	conjugal transfer protein TraC	NA	NA	NA	NA
SPR14817.1|643517_644177_+	type-F conjugative transfer system protein TraW	NA	NA	NA	NA
SPR14818.1|644260_644464_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14819.1|644464_645442_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14820.1|645464_645596_+	type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC	NA	NA	NA	NA
645613:645636	attL	NA	NA	NA	NA
SPR14821.1|645855_647082_+	TPR repeat-containing protein 03	NA	NA	NA	NA
SPR14822.1|647185_647632_+	Uncharacterised protein	I6R0L8	Salmonella_phage	7.9e-24	43.2
SPR14823.1|647594_647747_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14824.1|647758_648475_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14825.1|648471_649101_+	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR14826.1|649289_649775_+	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR14827.1|649774_650401_+	conjugal transfer protein TraG	NA	NA	NA	NA
SPR14828.1|651556_654994_-	sodium:proline symporter	NA	NA	NA	NA
SPR14829.1|656152_657712_-	isocitrate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
SPR14830.1|657884_658781_+	hydroxymethylbilane synthase	NA	NA	NA	NA
SPR14831.1|659092_660313_+	proline/betaine transporter	NA	NA	NA	NA
SPR14832.1|661383_663051_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14833.1|663604_665473_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14834.1|666038_667052_-	threonine dehydratase	NA	NA	NA	NA
SPR14835.1|667168_669541_+	endopeptidase La	A0A0R6PGP8	Moraxella_phage	6.1e-171	43.0
SPR14836.1|669604_670255_-	Chromosomal replication initiator protein DnaA	NA	NA	NA	NA
SPR14837.1|670385_671132_-	amidophosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR14838.1|671115_672153_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase MiaA	NA	NA	NA	NA
SPR14839.1|672222_672840_+	ribonuclease HII	E3T5H8	Cafeteria_roenbergensis_virus	1.1e-23	42.5
SPR14840.1|673405_673651_+	Uncharacterised protein	B0VK10	Azospirillum_phage	5.0e-12	46.7
SPR14841.1|674144_674306_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR14842.1|674322_674433_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR14843.1|674693_675038_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR14844.1|674994_675282_+|integrase	integrase	A0A0M3LQN1	Mannheimia_phage	8.7e-08	34.1
SPR14845.1|675631_675868_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14846.1|676238_677339_+	TPR repeat-containing protein 08	NA	NA	NA	NA
676002:676025	attR	NA	NA	NA	NA
SPR14847.1|677644_678292_-	guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase	A0A292GI44	Xanthomonas_phage	1.2e-07	29.7
SPR14848.1|678475_678685_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14849.1|678653_678779_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14850.1|678838_679258_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14851.1|680348_680993_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14852.1|681093_681945_+	2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR14853.1|682035_682476_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14854.1|682485_683733_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14855.1|683734_684064_-	conjugal transfer protein TraD	NA	NA	NA	NA
SPR14856.1|684044_684443_-	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR14857.1|684492_685122_-	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR14858.1|685262_686138_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>LS398548|689363:788077|DBSCAN-SWA
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MIIDKIEKIFAKFAERCPEPKTELEYCNHFTLLVAVILSAQSTDNAVNKATKELFKYYKTPEQFLQLGEENLKKHIKSIGLYNNKAKNIIKLSEILVKEYNGQVPNTMKELEALPGVGRKSANVVLSCAFGVATMPVDTHVFRVAKRIGLATGATPLKVENELLSVIPDRWLLLAHHWLVLHGRYICKAQTPKCSECFLNNYCQYFLSGQKK
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MVMILISHLSTVDASPTGFLWYNDKHGHEPDDSTSKLINLAHDHRIEELKEQFNRAQRIALDNPTLENVITAQRLQKQIMEKAHKFATMWQLATLLDYQLINAHEPSNSLHRKLYQEKSEQKNDLKLKNIAKNWGLILQVKQDCLLCNAFMPIVQSFANKYAFQLLAVSKNNELLNKLNPKHIVPVLYLVASDGKKIYSVARGIISEDKIIDNILAIDRYYHKLETR
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MPKSYSQDFQDKVMKCVNRGKSCNATSVKFDIAENTVRNWYKRYKSEGHYKERSRHGKKGKNR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SPR14863.1|689363_690206_+|integrase	integrase	I6R9B6	Salmonella_phage	1.8e-05	24.7
690179:690196	attL	NA	NA	NA	NA
SPR14864.1|690374_690626_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
690179:690196	attL	NA	NA	NA	NA
SPR14865.1|690772_690952_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14866.1|691047_691248_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14867.1|691244_691397_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14868.1|691377_691797_-	conjugal transfer protein TraE	NA	NA	NA	NA
SPR14869.1|691796_692093_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14870.1|692184_692841_-|integrase	integrase	A0A1P8CWW9	Bacillus_phage	1.9e-05	27.4
SPR14871.1|693156_693525_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR14872.1|693956_694058_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14873.1|694408_695125_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14874.1|696004_696511_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR14875.1|696557_697202_-	ankyrin	A0A068ELT3	Penguinpox_virus	1.3e-06	25.0
SPR14876.1|697236_697809_-	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR14877.1|698039_698612_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14878.1|698613_699135_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14879.1|699176_699752_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14880.1|699980_700919_-|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	4.5e-85	64.5
SPR14881.1|701498_702071_+|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14882.1|702027_702453_+|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14883.1|702591_703179_-	hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR14884.1|703220_703715_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14885.1|703733_704417_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14886.1|704417_704669_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14887.1|704685_705264_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14888.1|705434_705611_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14889.1|705977_706673_+	DNA methyltransferase	A0A0H3UYZ1	Geobacillus_virus	8.3e-12	25.2
SPR14890.1|707042_707579_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14891.1|707556_707727_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14892.1|707716_709048_-	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	5.6e-65	37.3
SPR14893.1|709056_710772_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14894.1|710999_711254_-	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
SPR14895.1|711814_712954_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14896.1|712955_713528_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14897.1|713757_714330_+	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR14898.1|714364_715009_+	ankyrin	A0A2H4X2N8	Flamingopox_virus	3.7e-06	27.6
SPR14899.1|715056_715560_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR14900.1|715563_716373_-	DNA methyltransferase	A0A1S5PRR3	Streptococcus_phage	4.1e-18	26.0
SPR14901.1|716758_717535_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14902.1|717509_718367_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14903.1|718467_719043_+	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR14904.1|719164_720175_+|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	3.1e-84	64.1
SPR14905.1|720244_720700_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14906.1|720909_722625_-	HNH endonuclease	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	2.8e-85	36.3
SPR14907.1|723306_724347_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR14908.1|724388_726164_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR14909.1|726282_728364_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR14910.1|728415_729435_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14911.1|729444_731199_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14912.1|731204_731339_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14913.1|731325_733221_-	conjugal transfer protein TraG	NA	NA	NA	NA
SPR14914.1|733220_733700_-	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR14915.1|733894_734524_-	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR14916.1|734520_735204_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14917.1|735215_736910_-	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
SPR14918.1|737049_737406_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR14919.1|737422_737587_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR14920.1|738357_738906_-	replicative DNA helicase	A0A218KST2	Xenohaliotis_phage	2.1e-34	44.0
SPR14921.1|738966_739122_-	replicative DNA helicase	NA	NA	NA	NA
SPR14922.1|739959_740130_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR14923.1|740474_740615_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
740585:740602	attR	NA	NA	NA	NA
SPR14924.1|740590_740740_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
740585:740602	attR	NA	NA	NA	NA
SPR14925.1|740834_741041_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR14926.1|741141_741465_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14927.1|742451_746996_-	ScaA autotransporter protein	NA	NA	NA	NA
SPR14928.1|747648_748059_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14929.1|748033_748390_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14930.1|748516_748789_-	Multidrug resistance protein MdtL	NA	NA	NA	NA
SPR14931.1|748799_749051_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
SPR14932.1|749350_749698_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14933.1|749816_749990_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14934.1|749986_750862_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14935.1|751411_752152_+	S26 family signal peptidase	NA	NA	NA	NA
SPR14936.1|752207_752948_+	ribonuclease III	M1HK80	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	1.8e-20	30.5
SPR14937.1|753152_753308_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14938.1|753282_753399_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14939.1|753501_753639_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14940.1|753803_753908_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14941.1|753882_754293_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14942.1|754594_754756_+	DNA helicase	NA	NA	NA	NA
SPR14943.1|754988_755246_+	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR14944.1|755810_759284_-	acyl-[ACP]--phospholipid O-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR14945.1|759603_760236_-	esterase	NA	NA	NA	NA
SPR14946.1|760232_760871_-	endonuclease III	NA	NA	NA	NA
SPR14947.1|760946_761291_+	monothiol glutaredoxin, Grx4 family	NA	NA	NA	NA
SPR14948.1|761349_761898_+	iron transporter	NA	NA	NA	NA
SPR14949.1|763043_763841_-	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
SPR14950.1|764120_765038_+	cation-efflux pump	NA	NA	NA	NA
SPR14951.1|765093_765546_+|tRNA	tRNA-specific adenosine deaminase	NA	NA	NA	NA
SPR14952.1|765623_767723_+	DNA ligase (NAD(+)) LigA	A0A1W6DX16	Sphingobium_phage	1.0e-100	36.3
SPR14953.1|767719_769492_+	aminopeptidase	A0A0P0I8D7	Acinetobacter_phage	8.2e-96	35.2
SPR14954.1|769733_770042_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14955.1|770019_770127_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14956.1|770349_771159_-	DNA methyltransferase	A0A1S5PRR3	Streptococcus_phage	7.4e-20	27.1
SPR14957.1|771532_772261_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14958.1|772282_773140_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR14959.1|773240_773819_+	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR14960.1|773937_774582_+|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	5.6e-71	65.5
SPR14961.1|774822_774930_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14962.1|774907_775135_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14963.1|775146_775584_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR14964.1|775713_775866_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14965.1|776025_777219_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14966.1|778392_778773_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14967.1|778809_780324_-	lipid II flippase MurJ	NA	NA	NA	NA
SPR14968.1|780700_780850_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR14969.1|781637_783392_+	type I secretion system permease/ATPase	W8CYL7	Bacillus_phage	1.5e-25	38.4
SPR14970.1|783429_784968_+	HlyD family type I secretion periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
SPR14971.1|786263_786530_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14972.1|786670_786862_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR14973.1|787052_787214_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR14974.1|787600_788077_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>LS398548|882892:933236|DBSCAN-SWA
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MLLFLNQLSLHQNVQDHWTTIGKDIFDKEQQNKAAVILKFASELDENTKRHIRLHGLKWNSFRQEWCGHVKDIYALKNGLLNVQYSIELVV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SPR15085.1|882892_883903_+|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	3.1e-84	64.1
SPR15086.1|883970_884246_-	conjugal transfer protein TraD	NA	NA	NA	NA
SPR15087.1|884544_885483_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15088.1|885540_885780_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15089.1|885748_885997_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15090.1|886207_887923_-	HNH endonuclease	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	2.8e-85	36.3
SPR15091.1|888603_889188_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR15092.1|889244_890747_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR15093.1|891131_892841_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15094.1|892849_893314_+	replicative DNA helicase	A0A222ZRG2	Mycobacterium_phage	1.5e-09	28.5
SPR15095.1|893494_894298_+	replicative DNA helicase	A0A218KST2	Xenohaliotis_phage	9.9e-49	43.4
SPR15096.1|894537_895167_+	ankyrin	A0A068ELT3	Penguinpox_virus	2.1e-06	26.9
SPR15097.1|895213_895453_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR15098.1|895456_895717_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR15099.1|896586_896763_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15100.1|897006_898509_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15101.1|899404_900133_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15102.1|900154_901012_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15103.1|901112_901688_+	(p)pGpp hydrolase	B3FJI5	Pseudomonas_phage	7.4e-06	38.6
SPR15104.1|901809_902832_+|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	1.4e-84	64.5
SPR15105.1|903022_904225_-	TPR repeat-containing protein 08	NA	NA	NA	NA
SPR15106.1|904321_904465_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15107.1|904548_905004_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15108.1|905214_906930_-	HNH endonuclease	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	2.8e-85	36.3
SPR15109.1|907612_909826_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR15110.1|909944_911462_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR15111.1|911475_912027_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR15112.1|912078_913074_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15113.1|913083_914838_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15114.1|914841_915987_-	TPR repeat-containing protein 08	NA	NA	NA	NA
SPR15115.1|916002_918654_-	conjugal transfer protein TraG	NA	NA	NA	NA
SPR15116.1|918653_919088_-	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR15117.1|919100_919277_-	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR15118.1|919326_919956_-	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR15119.1|919952_920669_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15120.1|920863_922183_-	ankyrin repeat-containing protein 16	NA	NA	NA	NA
SPR15121.1|922342_924034_-	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
SPR15122.1|924030_924414_-	type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC	NA	NA	NA	NA
SPR15123.1|924436_924964_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15124.1|925612_926602_+	ankyrin repeat-containing protein	A0A068EF92	Penguinpox_virus	1.6e-08	30.1
SPR15125.1|926515_927466_-	conjugal transfer protein TraC	NA	NA	NA	NA
927912:927928	attL	NA	NA	NA	NA
SPR15126.1|928149_928287_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15127.1|928439_928805_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15128.1|928791_929085_-	peroxiredoxin	NA	NA	NA	NA
SPR15129.1|929087_929864_-|integrase	integrase	A0A0U4JNS1	Bacillus_phage	1.6e-16	28.5
SPR15130.1|929998_930226_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR15131.1|931938_932130_-	replicative DNA helicase	NA	NA	NA	NA
SPR15132.1|932444_933236_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
934064:934080	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>LS398548|946257:993083|DBSCAN-SWA
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>LS398548|946257:993083|992888_993083_-|SPR15191.1|transposase|DBSCAN-SWA
MERRYSNDLRMKIFKAVDEGLSIVKACKIFNISRNTIYRWKHLKRETGDIKAKLYGLAKGIMKK
>LS398548|946257:993083|957848_958169_+|SPR15160.1|DBSCAN-SWA
MKFLLLLLCCMSLTSFFYRSTFDCKIPKGLKCKSLYEIKNMVAQGAFDIDNLETSKIKSKRRCILCYRQAKAVQGVDVVNKSPKKPKKYLINLFKSKQSQGERKHT
>LS398548|946257:993083|988620_989196_-|SPR15188.1|DBSCAN-SWA
MIDFYSESLINKLFRTNIRFNTKIDLDKVERAIKYAKKYHGQQKRDTGELYYTHPLEVAYMVSDYSSETDTIITAILHDTIEDTTLTKERIRYEFGANIAEQVSDLTRVRDNKKISAMEMIQILRNQNKTELLLIKLFDRFHNITTIFIKPPHKRQEIIFETQQEFIALAEYLKLPEIGERLSEYCKLHAS
>LS398548|946257:993083|955260_955749_+|SPR15157.1|DBSCAN-SWA
MNIRILRFIIGFIALVNVNNIYAVEYELEADNLLKLEISDSGPTRINLKDEKINDIFMYPQNAAEVVVHESGFLFIVPREEGNKVYLTVIGEYKTIQDLMLTFTPKTPSPIMLVNAATKIEEKDNSKQNNNNLFSNDLNTKELTAKPSKKQSRNTKKKIKLA
>LS398548|946257:993083|986577_987387_+|SPR15185.1|DBSCAN-SWA
MSVAVANKSKPFLHWIGSKRRIVNKLIEHLPQGPHYNYYEPFLGGGALFFQVRHLFKQCFLSDINLDLITSYNAVKNNPNEVNRLLSLYHKHHSKDYYYKVKNKYSNNPNEITAKFIYLNKYSFRGIYRVYKNGQSAQTFSGECYIKLHIASRINQCSRLLHGVSIYATDFSFIEPQQNDFVYFDPPYHKSGERFYTRLPFDEKDQIRLRDFVKELTNKGVKIMISNNNTAFIRDLYKDFNINTVTVVYSINEQRNPVNELIITNYKTC

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SPR15144.1|946257_946557_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15145.1|946548_946923_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15146.1|946934_947039_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15147.1|947184_947310_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
947416:947439	attL	NA	NA	NA	NA
SPR15148.1|948323_950027_+	membrane protein insertase YidC	NA	NA	NA	NA
SPR15149.1|950023_950650_+	YihA family ribosome biogenesis GTP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15150.1|950597_951539_+	acetylglutamate kinase	NA	NA	NA	NA
SPR15151.1|951636_951987_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15152.1|951961_952066_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15153.1|952280_952508_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15154.1|953002_954322_+|integrase	integrase	A0A0S2GLI2	Bacillus_phage	4.6e-11	24.3
SPR15155.1|954389_954713_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15156.1|954712_955264_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15157.1|955260_955749_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15158.1|956155_956491_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15159.1|956529_957849_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15160.1|957848_958169_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15161.1|958149_960642_+	conjugal transfer protein TraC	NA	NA	NA	NA
SPR15162.1|960638_961298_+	type-F conjugative transfer system protein TraW	NA	NA	NA	NA
SPR15163.1|961388_961592_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15164.1|961592_962570_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15165.1|962592_962976_+	type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC	NA	NA	NA	NA
SPR15166.1|962972_964529_+	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
SPR15167.1|964553_964667_+	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
SPR15168.1|964678_965362_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15169.1|965358_966660_+	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR15170.1|966659_969287_+	conjugal transfer protein TraG	NA	NA	NA	NA
SPR15171.1|969299_970439_+	TPR repeat-containing protein 08	NA	NA	NA	NA
SPR15172.1|970444_972199_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15173.1|972208_973180_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15174.1|973231_975901_-	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR15175.1|976164_978984_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR15176.1|979292_980624_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15177.1|980681_981125_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15178.1|981192_982239_-|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	1.9e-84	64.5
SPR15179.1|982360_982948_-	hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR15180.1|982989_983484_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15181.1|983502_984441_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15182.1|984457_985036_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15183.1|985165_985867_-	histidine kinase	NA	NA	NA	NA
SPR15184.1|985931_986210_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15185.1|986577_987387_+	DNA methyltransferase	A0A1S5PRR3	Streptococcus_phage	1.8e-18	26.0
SPR15186.1|987390_987894_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR15187.1|987941_988586_-	ankyrin	A0A068ELT3	Penguinpox_virus	9.8e-07	27.5
SPR15188.1|988620_989196_-	(p)pGpp hydrolase	A0A291L9W9	Bordetella_phage	1.6e-05	32.1
SPR15189.1|989429_990878_-	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	6.7e-72	36.8
SPR15190.1|990886_992602_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15191.1|992888_993083_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
1000788:1000811	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>LS398548|1003034:1181112|DBSCAN-SWA
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MKYQPLYDRVLVEPIQNDEAHGKILIPDTAKEKPTEGIVVMVGGGYRNDKGDITPLKVKKGDTIVYTKWAGTEIKLESKDYVVIKESDILLVKS
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MLKHIHQRDMLKLWEEFLIKFKHVLILDKEKGYIYLRSFLWYTDTKLLESQQPELEQVLAKYLSEEEKGNIMRTIAAKYIDEGIEIGETKGRAEGIAKGRAEAAQELARNLLKAGFSVEFISENTGLSKEEVINLKNNIEY
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MGTKLSNFVSIDIGSSKIAAVASYVENNGLINVVSQGFYYSSGIKSGIISDFKKAENSVISAIYNLEKDLGKTIKHVTISLSNVCTKSYYTYSKIKIATQYVTKQDIIKLISKALYNFKIQNQEIIHYFPIEFSLDNNNSIQDPIGMHGKELGCRLHLISANSNVLLNIINCLAKCQVEVQEVVLSIYASGLACLTEDEKNLGAIIIDVGAQTTSFGVFFDGKLLYSGNVAIGGWHITSDIAKVLSLSMKTAEKLKVLYGYAMVNMVNKDNIINFEDLDPEANYSNGKSSITISQLSKIIQPRAEEILELVKIEYDKIGVDYLIARCIVLTGGGAILRGFRELASKIFDKYTRIGIPNLLPGLAEDCNPSSYSAVIGVIQYYANKQHKFYMNTNDSDKLKHGWFKQIMLWLRENI
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MLRNEFTKTIKIIPKDKIALIDESGMKILHTVTMEVAGAMVKKLINIYKE
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MVYSSNVNNLKYYQPFQGEKILIAANNDKQNKEYVSTINEAAKVLTSKGAITSIVIHSEGEDFNEMLKNKGAIAVKELMIPEIMKLINTQNVKTESEQVVKTNIAPKIGVRR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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SPR15202.1|1004394_1004676_+	replicative DNA helicase DnaB	A0A218KST2	Xenohaliotis_phage	1.6e-17	50.0
SPR15203.1|1004801_1005149_-	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15204.1|1005602_1007264_-	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15205.1|1007538_1007790_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15206.1|1008023_1010603_+	repeat-containing protein D	NA	NA	NA	NA
SPR15207.1|1011236_1012022_+	exodeoxyribonuclease III	NA	NA	NA	NA
SPR15208.1|1012063_1012519_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15209.1|1012796_1013876_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
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SPR15211.1|1014259_1014634_-	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR15212.1|1014608_1015199_-	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR15213.1|1015347_1015491_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR15214.1|1015580_1016084_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR15215.1|1016403_1018284_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR15216.1|1019117_1019624_-	peptidase A8	NA	NA	NA	NA
SPR15217.1|1019918_1020713_+	outer membrane protein assembly factor BamD	NA	NA	NA	NA
1022726:1022741	attL	NA	NA	NA	NA
SPR15218.1|1023201_1024953_-	glycosyl transferase	NA	NA	NA	NA
1022726:1022741	attL	NA	NA	NA	NA
SPR15219.1|1024937_1026248_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
1022726:1022741	attL	NA	NA	NA	NA
SPR15220.1|1026226_1027474_-	cell division protein FtsA	NA	NA	NA	NA
SPR15221.1|1027767_1028469_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR15222.1|1028706_1029120_+	iron-sulfur-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15223.1|1029131_1030418_+	aminotransferase class V-fold PLP-dependent enzyme	H7BUW1	unidentified_phage	2.1e-29	37.8
SPR15224.1|1030432_1031704_+	cysteine desulfurase	NA	NA	NA	NA
SPR15225.1|1031743_1032169_+	iron-sulfur cluster scaffold-like protein	A0A218MKD1	uncultured_virus	7.0e-46	73.8
SPR15226.1|1032178_1032553_+	iron-sulfur cluster assembly accessory protein	A0A2H4N7N5	Lake_Baikal_phage	2.1e-14	42.9
SPR15227.1|1032565_1033069_+	co-chaperone HscB	NA	NA	NA	NA
SPR15228.1|1033055_1034909_+	molecular chaperone HscA	F2Y0P3	Organic_Lake_phycodnavirus	2.0e-76	38.1
SPR15229.1|1034925_1035270_+	(2Fe-2S) ferredoxin	NA	NA	NA	NA
SPR15230.1|1035706_1036060_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15231.1|1036086_1036311_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15232.1|1036513_1037191_+	histidine phosphotransferase	NA	NA	NA	NA
SPR15233.1|1037254_1038655_+	class II fumarate hydratase	NA	NA	NA	NA
SPR15234.1|1038819_1040298_-	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	7.2e-37	29.1
SPR15235.1|1042766_1042937_-	conjugal transfer protein TraE	NA	NA	NA	NA
SPR15236.1|1043182_1043551_-	peroxiredoxin	NA	NA	NA	NA
SPR15237.1|1044499_1045372_+	ankyrin	NA	NA	NA	NA
SPR15238.1|1045368_1046031_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR15239.1|1046350_1046488_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15240.1|1046477_1046720_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15241.1|1046763_1046997_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15242.1|1046948_1047512_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15243.1|1047486_1048053_-	Uncharacterised protein	I6R0L8	Salmonella_phage	1.1e-25	41.8
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SPR15245.1|1048613_1048997_-	TPR repeat-containing protein 03	NA	NA	NA	NA
SPR15246.1|1049247_1049358_-	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
SPR15247.1|1049382_1050939_-	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
SPR15248.1|1050935_1051319_-	type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC	NA	NA	NA	NA
SPR15249.1|1051341_1052286_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15250.1|1052319_1052493_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15251.1|1052583_1053243_-	type-F conjugative transfer system protein TraW	NA	NA	NA	NA
SPR15252.1|1053239_1055732_-	conjugal transfer protein TraC	NA	NA	NA	NA
SPR15253.1|1055712_1056042_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15254.1|1056041_1056437_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15255.1|1056451_1056940_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15256.1|1056936_1057488_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15257.1|1057487_1057811_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15258.1|1057875_1058532_-|integrase	integrase	A0A1P8CWW9	Bacillus_phage	7.6e-07	27.3
SPR15259.1|1058847_1059216_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR15260.1|1059648_1059777_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15261.1|1059872_1060463_+	phospholipase D family protein	A0A1B2LRT6	Wolbachia_phage	1.3e-26	48.9
SPR15262.1|1060950_1061163_+|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15263.1|1061671_1061872_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
1061595:1061610	attR	NA	NA	NA	NA
SPR15264.1|1062065_1062194_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
1061595:1061610	attR	NA	NA	NA	NA
SPR15265.1|1062197_1062383_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
1061595:1061610	attR	NA	NA	NA	NA
SPR15266.1|1062394_1062559_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15267.1|1062649_1062811_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15268.1|1063059_1065201_+	DNA helicase II	A7KV33	Bacillus_phage	2.1e-106	36.8
SPR15269.1|1065401_1065719_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15270.1|1066017_1067454_-|tRNA	cysteine--tRNA ligase	M1PG92	Moumouvirus	1.2e-49	32.1
SPR15271.1|1067518_1068865_-|tRNA	glutamate--tRNA ligase 2	NA	NA	NA	NA
SPR15272.1|1069045_1071088_-	DNA mismatch repair protein MutL	A0A1B2LRQ5	Wolbachia_phage	7.7e-98	36.4
SPR15273.1|1071115_1072369_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
SPR15274.1|1072405_1074970_-	type VI secretion protein	NA	NA	NA	NA
SPR15275.1|1074962_1078235_-	type VI secretion protein	NA	NA	NA	NA
SPR15276.1|1078288_1082170_-	type VI secretion protein	NA	NA	NA	NA
SPR15277.1|1082191_1084639_-	type VI secretion protein	NA	NA	NA	NA
SPR15278.1|1084638_1087056_-	VirB4 family type IV secretion/conjugal transfer ATPase	NA	NA	NA	NA
SPR15279.1|1087066_1087354_-	type VI secretion protein	NA	NA	NA	NA
SPR15280.1|1087669_1089610_-	primosomal protein N'	NA	NA	NA	NA
SPR15281.1|1089796_1091332_+|tRNA	methionine--tRNA ligase	A0A1V0SEZ7	Hokovirus	2.3e-94	39.2
SPR15282.1|1091374_1092133_+	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15283.1|1092756_1092990_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15284.1|1093464_1094331_-	mechanosensitive ion channel protein MscS	NA	NA	NA	NA
SPR15285.1|1095377_1096043_+	septal ring lytic transglycosylase RlpA family lipoprotein	F5B3X9	Synechococcus_phage	7.2e-13	40.2
SPR15286.1|1096854_1098162_-	repeat-containing protein D	NA	NA	NA	NA
SPR15287.1|1098653_1098911_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15288.1|1098997_1099573_-	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR15289.1|1099805_1101242_-	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	2.4e-74	37.4
SPR15290.1|1101250_1101997_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15291.1|1102521_1102815_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15292.1|1103996_1104521_+	Uncharacterised protein	K4ICR8	Acidithiobacillus_phage	5.5e-08	26.8
SPR15293.1|1104993_1105152_-	twin-arginine translocase TatA/TatE family subunit	NA	NA	NA	NA
SPR15294.1|1105670_1106660_-	GTPase ObgE	NA	NA	NA	NA
SPR15295.1|1106679_1107057_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15296.1|1107079_1107409_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15297.1|1107588_1108329_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR15298.1|1108673_1109063_+	DNA-directed RNA polymerase subunit omega	NA	NA	NA	NA
SPR15299.1|1109080_1111216_+	(p)ppGpp synthetase	U5J9N6	Bacillus_phage	9.1e-09	35.1
SPR15300.1|1111226_1111622_+	holo-ACP synthase	NA	NA	NA	NA
SPR15301.1|1112232_1112406_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15302.1|1112749_1114417_-	molecular chaperone GroEL	A0A219YK78	uncultured_virus	1.1e-142	53.1
SPR15303.1|1114489_1114774_-	chaperonin	A0A221S4G8	uncultured_virus	4.0e-13	46.2
SPR15304.1|1115705_1116875_+	ankyrin repeat-containing protein 09	Q6VZB8	Canarypox_virus	4.0e-06	28.6
SPR15305.1|1117360_1118815_-	replicative DNA helicase	A0A218KST2	Xenohaliotis_phage	5.2e-64	34.6
SPR15306.1|1119565_1121128_-	two-component sensor histidine kinase	A0A1V0SGX0	Hokovirus	9.3e-27	34.6
SPR15307.1|1121411_1121762_+	ribosomal subunit interface protein	NA	NA	NA	NA
SPR15308.1|1122378_1122684_-	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR15309.1|1122900_1124556_+	ankyrin repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
SPR15310.1|1124584_1124923_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR15311.1|1124974_1125367_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR15312.1|1125423_1127418_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR15313.1|1127717_1127954_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15314.1|1127922_1128162_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15315.1|1128245_1128389_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15316.1|1128484_1128844_+	TPR repeat-containing protein 08	NA	NA	NA	NA
SPR15317.1|1129139_1129361_+	conjugal transfer protein TraD	NA	NA	NA	NA
SPR15318.1|1129468_1130419_-|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	1.0e-84	64.5
SPR15319.1|1130540_1131128_-	hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR15320.1|1131169_1131664_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15321.1|1131794_1132169_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15322.1|1132180_1132285_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15323.1|1132375_1132618_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15324.1|1132938_1133490_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR15325.1|1133541_1134102_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15326.1|1134117_1135080_-|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15327.1|1135308_1135734_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15328.1|1135743_1136730_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15329.1|1136806_1137244_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15330.1|1137255_1137483_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15331.1|1137460_1137631_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15332.1|1137647_1137902_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15333.1|1137903_1138233_-	conjugal transfer protein TraD	NA	NA	NA	NA
SPR15334.1|1138213_1138612_-	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR15335.1|1138661_1139291_-	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR15336.1|1139431_1139659_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15337.1|1139757_1140363_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15338.1|1140676_1140937_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15339.1|1141546_1141699_+	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR15340.1|1142061_1142205_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR15341.1|1142472_1142898_+|integrase	integrase	A0A0M3LQN1	Mannheimia_phage	1.1e-06	28.9
SPR15342.1|1143261_1144698_-	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	8.7e-72	37.7
SPR15343.1|1144706_1145240_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15344.1|1146086_1146266_+	reverse transcriptase	NA	NA	NA	NA
SPR15345.1|1147323_1147836_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15346.1|1148364_1148487_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15347.1|1148532_1148757_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15348.1|1149271_1150624_-	Outer membrane protein assembly factor BamB	NA	NA	NA	NA
SPR15349.1|1150683_1151361_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15350.1|1151499_1151766_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15351.1|1151766_1152033_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15352.1|1152697_1153090_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15353.1|1153427_1153595_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15354.1|1153862_1154330_+	single-stranded DNA-binding protein	A0A1B1IVU7	uncultured_Mediterranean_phage	1.7e-37	51.3
SPR15355.1|1154408_1155269_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15356.1|1156079_1156292_-	conjugal transfer protein TraE	NA	NA	NA	NA
SPR15357.1|1156860_1158666_-	elongation factor 4	A0A2K9L6L3	Tupanvirus	3.3e-20	32.6
SPR15358.1|1159058_1159922_+	peptide chain release factor 1	NA	NA	NA	NA
SPR15359.1|1160241_1162731_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15360.1|1163057_1163210_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15361.1|1163435_1164455_-	porphobilinogen synthase	NA	NA	NA	NA
SPR15362.1|1164625_1165315_+	protein TolQ	NA	NA	NA	NA
SPR15363.1|1165320_1165779_+	protein TolR	NA	NA	NA	NA
SPR15364.1|1165765_1167004_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15365.1|1167096_1167888_-	NAD kinase	NA	NA	NA	NA
SPR15366.1|1167904_1168939_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex transferase subunit TsaD	A0A0R6PI74	Moraxella_phage	6.5e-69	44.6
SPR15367.1|1168962_1169472_-	CarD family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
SPR15368.1|1169691_1170360_-	DNA polymerase III subunit epsilon	A0A1B2LRV5	Wolbachia_phage	2.8e-09	50.0
SPR15369.1|1171104_1174542_+	sodium:proline symporter	NA	NA	NA	NA
SPR15370.1|1175254_1175578_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15371.1|1175577_1175895_+	conjugal transfer protein TraE	NA	NA	NA	NA
SPR15372.1|1175924_1176107_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15373.1|1176926_1179632_+	pyruvate, phosphate dikinase	H8YJB7	Vibrio_phage	2.3e-57	33.0
SPR15374.1|1180128_1180803_-	membrane protein	A0A2H4J2N7	uncultured_Caudovirales_phage	1.9e-08	27.1
SPR15375.1|1180920_1181112_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>LS398548|1184506:1230196|DBSCAN-SWA
AGTGATATATTTTTATTTATCTTCATGCAAGGATTTTAAAAATTATTATCTATATTACGCACGTTATAAGTATAAAGGATACTTTTGTTTACCAAGTTATAGTAGAATAATACAACTATGGCCTAGAATGTTGCTACCACTCACTAGCTGTATAATGCATTGTCTAGGAGATGAGACAGGTATATTATATGGTACTATTGCAGCAATCAGAGTAATTATCGATTCTATAAAGTTAGCAATTTATCATAACAAATATATTTCCAGCAATAGAGTTTGTAATAAAATTTCTAAAATTTGCAAGAGTAGTTATTGCTTGTTCTTATGCTTTAAGCTACATCTTGTAATTAATAATAAAGTTCAAACAAAAAAATTTAATAATGATGCTGAATGATTGAACAAATTAGTAACATACTTAAAAAGCAGAAAGGCTAATGGTCATGTTTATGAAGAAGAAAAGTTAGTTGTTAGTAACTTCTATATTTTATAGAACTTACTACTAACTTGTGTTAACTTTTATTAGACTTCTTTCGAAACTAGAGAATGATGTAGAATAGTGTTATAAAGATCTGATTTAAGGTAATAATAAAATTCGATCAGATTAAAGAGTTAAAGGATGAAAAATTTCGTCGATTAACAGGAGTAAGGAAGGGAACATTTTCAAAGATGGTGGATATTTTGAGGAAAGCTGATGATCTTAAGAAATCAAAAGGTGTGCGTAAAAATAAGCTTGATTTGGAGGAACAGTTGCTGATGGGCTTAGAATACCTTAGAGAATACCGCACTTATTTCCATATAGGCCAGAACTATGGGATTAGTGAAAGTTCAGCATATAAAGATGTAAAATGGGTAGAAGGCACCCTAGTAAAACACCAAAACTTTGCTCTTCCAGGTCGTAAAGCTATACTGAAGAGTGATATGAATTATGAAGTAGTCTTGATTGATGCTACTGAGAGTCCTATAGAAAGACATAAAAAAAATAAAAATTCTATTATTCATGAAAGAAGAAAAGGCATACACTAAAAACTCAAATAGTGGTAGACAAGAAACCCCACCAAGTAATATGTACAGATTTTTCTAACGGTAAAAAACATGACTTTAGATTATTTAAGGAATCCAAAATCCTTATCCATCCTAAGGTTCAAGCGATTACTGATACAGGATATCAAGGTATACAAAAAATTCACAATAATTCTGAATTACCGAAGAAGAAAAGCAAGAAAAATCCTTCAACTAAAAATGATAAAAAGAATAATCTTAGGTTAGCACGAGAAAAAGTTGTGAATGAAACCGTTATCGGTATGCTAAAACAGTTCAAAATTATTGCTGATAAATATCGAAATAGAAGTAAAAGATTCGGTCTTAGATTTAATTTGATCTTTGGCATTTATAATTTTGAACTACCTTAACTAGTTTCGAAAGATGTCTATTATAAAAAAGTTGAAGCAAAAGGTAGAAAATAAATAGACTAAAAATTTAGGAAATTGAGTACTAATTTTTAATTCAGATGTTAAACTGATAATTGAACTTAAAGAGGCTTGAGCTGTATGATGCCAAAGCATCATGTGTAGTTCTTATAAAACGTAGAAGTAGCAACATTTTCTTTGTTACAAGACACAGTTAAAAACTCATAATGTCTTTTTTGCGTAAGCTATGCTATTAAATCTAAGCTGATATCAAGTAGCGTTGTTACTCTTTTATTAAAATCTCTCTTTTGCCACTATGATTTGGAGGGCTAACAACTCCTTCTCGTTCCATTTTTTCAACTATTAATGCTGCTCTATTATACCCTATTCGTAAACATCTTTGAATATAACTTGTAGAAACTCTCTTATCTGTTTTGACAATCTGTACAGCTTGCTTATATAAACTTTCATCATCTGTTGATTCATCACCATTTGATGAAAAAGAAGTAATATTTATGTTATCATCTGATATCTCAGTAATATTATCAATATACTGTGGAGTTGCTTGAGCTCTTAAAAATTTAGCAACTTGTTCAACTTCACTATCATCTACAAAAGGAGCATGCACTCTTTTGATAGTAGTTCCATTACCCATATATAACATATCACCCATACCTAGTAACTGCTCAGCTCCCATTTCTCCTAAAATAGTTCTACTATCAATTTTTGATGTTACCTTAAAACTAATTCTACTTGGGAAATTTGCCTTTATTACTCCTGTAATAACATCCACCGAAGGCCGCTGAGTTGCCATAATAATATGAATTCCAGCAGCTCTTGCCATTTGTGCTAGCCTTTGTATTGATGATTCAATGTCTTTACCAGCTACTATCATTAAATCAGCCATTTCATCCACTATAATAACTATAAATGGCAACTTTTCTAATGGAATAGGTATTGATTCATATATAGGTTGCCCTGTTTCATGATCAAAACCAGTATGTAAAGTTTTAGCCAATGTTTGCTTTTTAGCAATTGCTTCCTCAATTCTGCTATTATAACCAGCAATATTTCTAACTCCCAAAGTAGACATTAATCTATATCTGTTTTCCATTTCTCTAACTCCCCATTTTAAAGCAATAATTGCTTTGCTAGGATCAGTTACTACAGGTGTAAGTAAATGAGGGATGCCTTCATACACTGATAACTCAAGCATTTTAGGATCAATCATAATAAATTTACACTCATTAGGAGTAAGACGATAGAGCAATGAAATAATCATAGCATTAATTGCTACTGATTTTCCAGAACCAGTTGTTCCAGCTACTAGTAAATGAGGCATTTTAGCTAAATCGATTATTTCTGGCTCCCCACTTAAATCTTTACCAAGGATAATTGGCAGAGATTTATCAGATTTTTGATATTCAGCTGACTCTATCAATTCTCTAATACTAAAAAACATTCTATGTAAATTAGGTAATTCAATTCCTAAAACATTTTTACCTGGAATGACTGATATTCTAGTAGACAAGGCACTTAAAGACCTAGCTATATCATCAGATAAACCAATAACACGTGAAGATTTAGTTCCAGCTGCTGGTTCAAATTCATATAATGTAACAACTGGTCCTTGATTAATGTTAAAAATATGCCCTTTAATTCCAAAATCATTCAATATTTTTAACAACTGTTTGGAATTATAAATCAACTTTTCTTCACTTTCTGGTGCTACATTACGGTTATCATATTGTCCTAGTAGATCAACTTCAGGCAAAACAATAGTTTGGTCAGTATTGCTCTTATGATTTATAGCAACATCATTATTTTTATTCCAACTAAAATTACTATCAGAGAACGGAGAAACACTAGGCATCACAGCGTTATCATCACCATCTTCTTCATCTTTTATTAGCAAATCATTATCATTATTGCATACAACCAACTGATGCTGCTGTAGCTGCACATCTGAATTATTATTACGAGTCAAATATTTTAAACTTATCAGTCCAACAAAAAAATTTTTTATATAAATAAAAGCATGTGTAGTGAGTGAGCGTATTAATGGTATAATATTTGATAATGGATAGTCTATAATAAACGATAGATTGACTATTAGAATTGCTATCATAATGCTGTTAATTCCTATAATAGTGCTATGGTTAAAGATTTTGACTAAATCATAGATACTGCTGCCGATAATTCCCTTATACTGAAAATCTAGGCTCTCAATATTACTTATAAAATAAGAACACTCCAATATTATTATTATGGCAGATAAAATCTTGAGTTTTAAATATCTTATTTCTTGCTGAAAATAATATTTCCTTCCTAATGCAAACAAAAATATTGGAAAAAAAAATGCTGTTGAGCCTAAAATAGCTATCAGCATTCTAGTAAAATTAGCTCCAGCATGCCCTAACAAGTTGTTTGGTGTAACATCAGTCGCGATATTAAATCCAGGATCATTACTATCATATGACAATAATACCAAGAAAATTAAGAAGGAAGTAATAAAGCAAAGCGCAGACTTGAATCTGCTATCCTCCAATATTATTTTCAAGATATTAAACATTACAATCTTCTCTTAAATCAATATCATTATAGGTAATATAAGAAACTTTAGATGTAATAACAGCTAGAAAGCAAACTCGATGCTACTTAACTATCTTTTTTCTTATTGTAACTTTGTTTTTTTATCATTATAAAATATTTCTTTATAGAAGGTAAGTTATAATCTCCATGATATGTTTCTCCTTGCTCTACAATTTTTTGTAGATAAAAATTCATTTGGTCTACCTTAGATTTATCAATATCACTGTTAGTATTACTAATTAAATTTAAAGTATGATTATTATAATCCTCATCTTCTTTATTATCTAAGTCAAGGCTAGATAATATCTCATGATACGCACGTTGCAACAGCAACTTTAATGAATAAATTTGTTTAAGTAAATACTTTATATCATGAGGCTTTGCAACCAATATTGCAATTATAACAACAACAATAATCTCACCAAAAGATAATCCCATTTTATGCCAAAATTAATATATTAAAATTTAACTTATACAAATTTTTTATGTTTATATTTAGGATTTTTAGTGTCATGACCACAAATTTTAGTCATATAATTGTGATAATCTTGATAATTACCTTCAAACCAAGTTGCATTACTGGATTGGTCAAATGCAATAATATGAGTTGCAATTCTATCTAAAAACCACCTATCATGTGTTACTACTATAACACAGCCAGCAAAGTCCAAAATAGCTTCTTCCAGCGCCCTTAAAGTTTCAACATCTAAATCATTAGATGGTTCGTCAAGAAGAATAACATTAGCACCCCATCTGAGTAATTTAGCCAGATGTACTCTATTACGTTCTCCACCAGATAACTGACCTACTTTTTTTTGTTGATCACTACCTCGAAAGTTAAACGCAGCACAATATGCTCTACTTTTAACAATTATATTACCAAGCTGCATTTCATCTAAACCGCCTGAAATCTCCTCCCATACTGTTTTGCTATCATCTAGGTGATCTCTAGATTGATCAACATAACCTAACTTAACTGTTGAACCTATTTTAATAGTTCCACTA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MIKSGRDHAANLAKQGKKIISYNFLGLTCYWCKSRFDATLRLKYSTRRDRFTEKLKELRKYLRG
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MIDFYSESLINKLFRTNIRFNTKIDLDKVERAIKYAKKYHGQQKRDTGELYYTHPLKVAYMVSDYSSETDTIITAILHDTLEDTKLTKERIRYEFGANIAEQVSDLTRVRDNKKISAMEMIQILRSQNKTELLLIKLFDRFHNITTIFIKPPHKRQEIIFETQQEFIALAEYLKLPEIGERLSEYCKLHAS
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MDVSRFLDPKNDIAFKKIFGSEKNKDILIHFLNDILLFEGNKKITEVKFLGTILDADIASKKESIVDVLCKDKNGTQYIIEMQVDPTQGFEKRAQYYAAKAYGRQPNRGKEGKYSDLKEVIFIAIADYKLFPNKEDYISRHVILDKKTYEHDLKDFSFTFIELPKFKKKRVEELNNITEKWCYFFKHAKETTLDGYSKIIGEDLIIKKAYEALDQFNWSEDELITYEQELKRIWDNKAVEDYKLERAKAEGKAEGIKLGEIKGKAEGKAEGKAEAKKDFAIKLLKSELSVETIAEYTDLSIQEVLNLKNSVK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SPR15381.1|1184506_1184896_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15382.1|1185168_1185525_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15383.1|1185536_1185911_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15384.1|1186191_1188480_-	DNA translocase FtsK	A0A218M9A2	Mycobacterium_phage	3.9e-74	43.0
SPR15385.1|1188566_1188938_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15386.1|1188970_1190638_-	energy-dependent translational throttle protein EttA	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	4.7e-45	28.1
SPR15387.1|1190778_1191618_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15388.1|1192003_1192198_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15389.1|1192263_1192866_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15390.1|1193331_1194027_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15391.1|1194802_1194997_-	reverse transcriptase	NA	NA	NA	NA
SPR15392.1|1195479_1197690_+	ankyrin repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
SPR15393.1|1198146_1198308_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15394.1|1198433_1199894_-|tRNA	aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B	NA	NA	NA	NA
SPR15395.1|1199896_1201375_-|tRNA	glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A	NA	NA	NA	NA
SPR15396.1|1201374_1201674_-|tRNA	aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit C	NA	NA	NA	NA
SPR15397.1|1201756_1203493_-	RNase J family beta-CASP ribonuclease	NA	NA	NA	NA
SPR15398.1|1203624_1204362_-	DNA-binding response regulator	A0A0K0PVG9	Roseobacter_phage	1.5e-14	57.7
SPR15399.1|1207332_1207497_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15400.1|1207493_1207688_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15401.1|1208409_1208682_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15402.1|1210876_1211683_+	type I methionyl aminopeptidase	NA	NA	NA	NA
SPR15403.1|1212498_1214214_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15404.1|1214222_1215659_+	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	7.4e-71	36.8
SPR15405.1|1215893_1216469_+	(p)pGpp hydrolase	A0A291L9W9	Bordetella_phage	7.4e-06	31.3
SPR15406.1|1216503_1217148_+	ankyrin	A0A068ELT3	Penguinpox_virus	1.4e-05	26.5
SPR15407.1|1217194_1217701_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR15408.1|1217704_1218514_-	DNA methyltransferase	A0A1S5PRR3	Streptococcus_phage	1.8e-18	26.0
SPR15409.1|1218880_1219159_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15410.1|1219223_1219925_+	histidine kinase	NA	NA	NA	NA
SPR15411.1|1220054_1220633_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15412.1|1220649_1221498_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15413.1|1221604_1222099_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15414.1|1222140_1222728_+	hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR15415.1|1222852_1223791_+|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	2.9e-84	61.2
SPR15416.1|1223858_1224314_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_15

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MSNTTIGKFITFEGNEGSGKTTQSKLLYEKLLDNGIKAVWTREIGGTDIAELIRDIVLFKDMSITTELLLIMAARYEHIEKFIRPNLNEGKWVICDRFIDSTLCYQSKNSEEQQLILELHRKLLDNFFPDLTLIINVSPSIAIQRIKIREIHKNTNQLNKFDSRSQQFHQKITDAFIQVSKLFPERIVQINGEPMIEDVSSKVINIINNKMKVNLLR
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MFDLATAKIRHLADDLLCGQNDFKEEEYKTTSLARIVNCVANLQDYCNRIVYSLRGQIELQNVHLKKFSIQKLLKDTISSLKEIAEDREISLSYNVQDNINDIVIGDSCLLQTILSQLISGAIRVNKSCQVDVIVRLFTSPYRKVNEKDRILRFIVRDNGKGISQEKLQEINAKFTDLHSIRDPEILDSSLGFTNYIVNKLSGKLEIKSEANKCTAITCDMPVQLFN
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MVISYFEDKIIESAVSKTLNSVFEPIFLKYSYGFHPKLNAHDALRELNRLTYNFNKVAIVEIDITKCFNTIKHCELMEFLRKKISDKKFLKLITKLVETPIIENGTIVTNKEGCCQGSIVSPML
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MALNKLLLIRTIEENKLLQSRLVGKFTVCNCPLINYEVIKLDYSKISQGQNIVITSKFAAKIIAENMNSNVNCFVVGQVSSQILQQNKFIRVVGVYNTVEKLLLNISEVKNIIYYCGNYITHDPPNHWTKKIVYLVKYAQDLTDEAKINLSLSQISHSLIYSYNAGLNLIKLLKKNKLLWTLQNVRIICISSKVGSLFTRIAKKVSFPTTPTSKNMIKILLNHNHTI
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MAVLKEKENSQLTESQKRAERSGKIFTFISLFTAARKSNVLGMRWDEISLSEKIWHIPKTKSKSGKTLYVGLADALITILKYLKQETNSEWVLPSPRDNSKHWSSEAIQCAWDKIRTKARIPNVTIHDLRRTFATWSINNGEKLQTIAEILGHSRISTTAKIYTKISIDKVKAATNKVVNNILTSDNANTELDKIIPEILASLGRKEERQIINSLSEK
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MDVRLGFMCYHNCRDNFIQGNYYYNIIEGNKASIVVTGGLVSVLKSYSDIGVDLGVGATINLLKDTYLDIECSTIANYRPLPIHISVGWRVHI
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MMKTSRIYSFIITFIIMVTVFINAALSDNKNTKIPRFVSTKANEINMRTGPNIKYPIKWIFTKKDEPLEIVDKFDQWYYVRDITGDFGWIHSSVLSQKRTVVINSNKIQNLYKSSNYESRIIAYLEPKIRCELKKCTALMCKLHCKNYIGWIDRKILWGVYDHE
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MPIYKKTTFFVLLFTLLSSTTIYANANYTVVNNCIIQNRKFPVTISTDGIDNALSAVNILGLINDKYGLSNSIIGRIIAGYPSFYIVLLNHEVVGHGRRAYEFGGTVDGYTLRLFSAATHYDLSPNSHPQQRNAITLAGVQVNTCLASRIINQLLQTKQPLSPVTAWSYIFSAGNQLWYVLHDVIFEQAHELGTGDIRSHILGMEKIYGKTSIQDKIRSLCFLDLMNPMVFASFYTIASGQNIQVPMIPLGQINGLGQIGFMPSVNLILTPYNVLEKRITVHINTEYTPIKIAFGFGQELKSNDPVYHTLDDSVCDSSNSWYFIKKDSTPSKVHDTYYFELSVARFFSISKVDLGGSLIIWRQPELITPVPRHAEIKNGIMGLLNLTFNIDDRFSIFAEAGYKTKGFILDRPVDEGPLINFAIQCLV
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MDIKSYFASKKELNPSQIELVSILQSISDHFNSRKIIRYFRQLQYNGTYIYGKVGSGKTMLMQALNQSLEKLGEVGYFHYQFLMHSLHKVVRQNTSNYTDNSNNLMKTLACEYSSKYRIILIDEFEITDIAEALLIGSFIKWLFIKKVYIVLTSNIAPELLYNNGLKRELFLPYIDTIKQNMQIFYLKSDHDYRKAKVQSKEQRILIGIDANKQLQLIIDKLIRNKELLNHDVKVLGRNLNVNNNYGNILIITFDELCYQERSYNDYIAMCQHFDVIIVRNVTIIESANNDVIIRFINFIDNAYSMKVLIYMSVNTSLDQIYIGHNYQQPFQRTLSRLYEMNSNEYLFHSKYQEAYE
>LS398548|1249319:1303916|1259247_1260375_+|SPR15456.1|DBSCAN-SWA
MNYNSTEKFRILWRWWKSIDQYTVFLLCILSALSLMLVTTSGAAVANRIGVPQSYFASKHIFYVVLAVGTTFVVSFLNKTTIKRLAILGFILNIILLIFIKFYGNPIKGAKRWINIGGISLQPSEFIKPFFLVITGWLLSAIQSNEIRFIVTIILYLIVALLLITQPDFGMLITISVAFGIQLFIAGIPLLWLLILVCISIAGTAGAYSLLPHVKRRINSFLDPANSENYQVMKSLQAFKNGGLYGKGPGEGLVKHMLPDSHTDFIFAVAGEELGAIVCLIIVAIFTFIVIYGFVKLLFEEDNYTIFVSSGILSQFGFQAIVNMCVSTNLLPTKGMTLPFISYGGSSSVAVAIGVGILLALTRHKTDLSKYKLKI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SPR15441.1|1249319_1249496_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR15442.1|1249709_1250558_-|integrase	integrase	A0A0M3LQN1	Mannheimia_phage	6.8e-08	27.6
SPR15443.1|1250628_1250892_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15444.1|1250992_1251796_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15445.1|1251876_1252266_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15446.1|1252532_1252808_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15447.1|1252826_1253510_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15448.1|1253510_1253762_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15449.1|1253778_1254495_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15450.1|1254771_1255053_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR15451.1|1255012_1255279_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR15452.1|1255696_1256071_+	reverse transcriptase	NA	NA	NA	NA
SPR15453.1|1256170_1256332_+	reverse transcriptase	NA	NA	NA	NA
SPR15454.1|1257113_1257740_-	lipoate-protein ligase B	NA	NA	NA	NA
SPR15455.1|1257822_1259241_+	UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine--D-glutamate ligase	NA	NA	NA	NA
SPR15456.1|1259247_1260375_+	cell division protein FtsW	NA	NA	NA	NA
SPR15457.1|1260378_1261458_+	undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR15458.1|1262008_1262224_+	reverse transcriptase	NA	NA	NA	NA
SPR15459.1|1263245_1263374_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15460.1|1263421_1263619_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15461.1|1263630_1263735_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15462.1|1264333_1265548_-	aspartate kinase	NA	NA	NA	NA
SPR15463.1|1265828_1266323_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15464.1|1266306_1268049_-	potassium transporter	NA	NA	NA	NA
SPR15465.1|1268221_1268794_+	5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase	NA	NA	NA	NA
SPR15466.1|1268790_1269405_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15467.1|1269427_1269616_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15468.1|1269704_1270361_-	conjugal transfer protein TraC	NA	NA	NA	NA
SPR15469.1|1270729_1271167_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15470.1|1271178_1271553_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15471.1|1271659_1274245_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15472.1|1274285_1276784_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15473.1|1277006_1277237_+	replicative DNA helicase	NA	NA	NA	NA
SPR15474.1|1277293_1277566_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15475.1|1278813_1279167_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15476.1|1279322_1280105_-	protein disulfide-isomerase	NA	NA	NA	NA
SPR15477.1|1280969_1282415_+	sodium:pantothenate symporter	NA	NA	NA	NA
SPR15478.1|1282786_1285519_+	DNA polymerase I	D9ZNH3	Clostridium_phage	4.9e-39	31.0
SPR15479.1|1285584_1286949_+	ribosome biogenesis GTPase Der	NA	NA	NA	NA
SPR15480.1|1286957_1287641_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15481.1|1287711_1288785_+	cell division protein ZapE	NA	NA	NA	NA
SPR15482.1|1288777_1289431_+	thymidylate kinase	Q2Z0N0	Pseudomonas_phage	5.8e-23	35.8
1289279:1289295	attL	NA	NA	NA	NA
SPR15483.1|1289570_1291439_-|tRNA	tRNA uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34) synthesis enzyme MnmG	NA	NA	NA	NA
SPR15484.1|1292078_1293362_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15485.1|1293970_1294357_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15486.1|1294402_1294552_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR15487.1|1295333_1296839_-	transcription termination factor Rho	NA	NA	NA	NA
SPR15488.1|1298327_1299356_+	uroporphyrinogen decarboxylase	NA	NA	NA	NA
SPR15489.1|1299348_1300383_+	ferrochelatase	NA	NA	NA	NA
SPR15490.1|1300391_1300826_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR15491.1|1301912_1302149_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15492.1|1302575_1302944_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR15493.1|1303259_1303916_+|integrase	integrase	A0A1P8CWW9	Bacillus_phage	1.9e-05	27.4
1304479:1304495	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>LS398548|1312102:1350026|DBSCAN-SWA
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MQLHCNTSLIKVFNIYFINKLLLKLAGRYSNYHFGCKASVLNYIAKVLANELRTTDQANRDNCGFDNEFNKEKYLTQIETSANLSKESQLKHKIAGSFEAAMAYQILTSCSFGPAVRTRFFVKLLKNITLTECDESKILQAVQDVYGYEIQELQVTPFEQPTTVSQKQINEEEYLLNLSKQLGSNSTWYKVRESLIKSYGQTIDKKYFSELNIINEDNVSKKIFIKAKTGFADS
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MFASLSSQTSYFVSKMLEQHLLPAYEGLSSRKTGIMFGAKAVAKIRDVQIQDPITLTNTKEFLRQCFMKPYIIGNILGKKAAAQQTNDIIGFIEQNIPNNFGIYYREPSNLGISFKTCRQATPLIKAAIHKELNEGLLTKFAAAIGVQFDQSNMLNQRLKVMTGDTLKYLQREQQDIHEWMKQAMLLNANRESYDDWHEKFSLSRFYPNLAL
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MLADKYFNKGNSFLKLGKYQKAIKNYDVAIKCNPDCIEAYINKGIALKELGQYQKAIEIFDTTIRYKPDLAEAYYAKGITFQELGQYQEAIKNFDTAIQYNPNDADFYMSKGIVLKELGQHQEAIKNFDTAIRYRPDDAEAYVNKGISLDELGQYQEAIKNYDQAIQYDSTNLGIYINRGVSLCELGHHQEAIKNYDVAIKYKPDLVEAYVNKGESLKALGHHQEAIKNYDIAIKYKPDLVEAYINKGIALNELGHHQEAIKNYDIAIKYKPDFALAYHAKGNALKNLEKLLEAIENYDQAIRYRPNYADAYNSKGAALCTLKQYQEAIENFDLAIKYKPDVSYTYNNKGIALNELGRHQEAMESYNLAIKYDPDNVYAYQLANELAKKIKKSNLRIITD
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MNVLKSILQPCYAVILAFVVLPSPSICTASNNVNFNAFKDSIDTSQFYIKFSTGIATNHDTLEAGIGYRLDRHRMDVRLGFMCHHNCRDNFIQGNYYYNIIEGNKASIFVTGGLVSVFNGDSGTGIDLGVGTTINLARDTYLDIECSTIANYTPLPIYIRFGLRVHI
>LS398548|1312102:1350026|1341117_1341312_-|SPR15545.1|DBSCAN-SWA
MANLMQQKITLQQKNARLIMDEVNLKIKERKMRTRRLIEMGGLVALKLSLITYQQTLYLVLLFH

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SPR15507.1|1312102_1313065_+|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15508.1|1313147_1313786_+	conjugal transfer protein TraG	NA	NA	NA	NA
SPR15509.1|1313908_1314325_+	conjugal transfer protein TraC	NA	NA	NA	NA
SPR15510.1|1314617_1314974_+	DNA methyltransferase	A0A1S5PRR3	Streptococcus_phage	6.8e-10	36.6
SPR15511.1|1315006_1315876_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15512.1|1316224_1316380_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15513.1|1316472_1316628_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15514.1|1316655_1316913_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15515.1|1316888_1317125_-	conjugal transfer protein TraB	NA	NA	NA	NA
SPR15516.1|1318192_1319272_-	heme A synthase	NA	NA	NA	NA
SPR15517.1|1320268_1320493_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15518.1|1320499_1320775_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15519.1|1320774_1321167_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15520.1|1321449_1321887_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15521.1|1321898_1322273_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15522.1|1323119_1323296_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15523.1|1323838_1325140_-	malate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
SPR15524.1|1325159_1326086_-	permease	NA	NA	NA	NA
SPR15525.1|1326395_1326995_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15526.1|1327058_1327442_+	citrate synthase	NA	NA	NA	NA
SPR15527.1|1327451_1327835_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15528.1|1328031_1328832_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15529.1|1328791_1329496_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15530.1|1329600_1331037_+	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	1.3e-72	37.7
SPR15531.1|1331271_1331844_+	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR15532.1|1331878_1332523_+	ankyrin	A0A2H4X2N8	Flamingopox_virus	1.1e-05	27.6
SPR15533.1|1332570_1333074_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR15534.1|1333077_1333887_-	DNA methyltransferase	A0A1S5PRR3	Streptococcus_phage	5.3e-18	26.0
SPR15535.1|1334253_1334532_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15536.1|1334596_1335298_+	histidine kinase	NA	NA	NA	NA
SPR15537.1|1335427_1336006_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15538.1|1336156_1336960_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15539.1|1336978_1337473_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15540.1|1337514_1338102_+	hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR15541.1|1338223_1339138_+|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	3.3e-85	61.2
SPR15542.1|1339328_1340531_-	TPR repeat-containing protein 08	NA	NA	NA	NA
SPR15543.1|1340627_1340771_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15544.1|1340854_1341025_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15545.1|1341117_1341312_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15546.1|1341521_1341899_-	HNH endonuclease	NA	NA	NA	NA
SPR15547.1|1342001_1343237_-	reverse transcriptase	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	8.0e-66	38.0
SPR15548.1|1343937_1346778_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR15549.1|1346896_1348414_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR15550.1|1348427_1348979_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR15551.1|1349030_1350026_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

>LS398548|1368237:1414088|DBSCAN-SWA
GTCAGATAGTATTATAAATATTATAATTTTCAGCACATTCCCTAATTATTTTTGTAGCCTTAGACATATACTGTCGCACTAACTCCATACAAGCTATAGTATAATGCATTGTTGAGTTTGAATTCATATGATTCAATGCTGCACGAATTATATAATGACCTGCACCTATATCTGACAGACAACTTGCAAACGTCCTTCTTAGATCGTGTATCTTGAAATTTTTTATGCAAGCCTTTTTACAAATCCTATTCCATGCTTCATATGGCTGTTCTAAGTGTCCGCTTTTGCTATTATCACTTGGTAGCACCCATTTACTTGTAGATGTTAATTTCCTTGCTTGCAATATTTTTATCATCTCATTTGTTAATGGTATATTTTGCGCCTTTCCGTTCTTAGTTTTTGGTATATGCCATATTTTTCTTACAAAATCTATATTGTCCCATTCCATCTCCAACACATTACTTTTTCTAGCTCCAGTATATAACCCTAATAATGCAAAATCTCTTATCAACGTATTTTTTTCTCCACATAATACTTGTAAAAATCTACCAATTTCATCGTAACTTAGACGTCTTTCTCTTGCTTGCAGTTTATGCAGCTCTATCCCTAGAGTAGGATTGTTTTCTATTAATCCCCATTTTTTTGCCTTATTAAATATAGTGCGTAAGGTTGCTAGCAATGCATTTGCTGTGGCATATTTTCCCTCTTTGCTGATATCATTGAATATTTGTTCAATATCATTACTTTTAATATCACTTATCTTTTTTAAAATAACAGTTTCCCATAATTATGTATTCTTGCAGTATCTTTCTGCAAGTTTATAGTATATATTTTGGTATACTCTTCAATATACTTATAACACAGCTCTTTGAATGTAATCTCTTGTCTTTCTTTTATACGATTCTCATTTTCTTCTATCTGTTGTTAACATTTTACTTCTCTTGAATCTATTCCGTTCGCCATTAATGTCTTTAATTCTATTGCTTTTTTTGTAGCTTCTTTAATAGATACATATGGAAATTCTCCTATCCTTATTTTTAAACTCTGGTTTTTAAATTTTTGTTCTAAAACCCATGTTTTTCTTACTCTTCCTCCACAGACTGTACATGAGATTTTCAGTTTAAGTCCTCTTATATATGGATGGTGGATAATTTCTGATTTTTCTCCCTCAGGAATTTTAATTTTATTTAATGACCGCTTTGTAAACTTTGATGATGATGATATTGAAGGCATAATTACCCCACATAATATTAATGTTGATATTATTAATATATATTACGTTTTATTGAACATCTGATATAAATTATGCTTTTTTTGATATCAAATTTTTTATACTAATTTGTTCATAATACATATAACTTGAAAATCACTTATCAATCCCAGGTTGTATATATTTTTTGATCATTAGATTAACCTCTAGATTGAAAACTGATCACCAATTTCCTAAATTTTCTGTCAACCTTTTGTCAACCTTTTGCTTTAATTTTTTTGTTATATTGACAAATATTGCAAATATGTTTATAGTTAAGGTTGAAGCTTGATTAAAAATATTAATAAAAATTAACACAAGTTAATAGTAGGTTCTATAAAGTGTAGAAGTTAATAAAAATTAACTTTTCTTCTTCCTTATATTTGATCTACCTTTGCATTTTTACCTATAGCACATCTTATTGATTATAAGATGAAGCTTAAAGAGTAAGAACAAAACATAACTACTTTTACCAATTTTAGAAATTTTGTTAAAAACTCTATTGCTGGATGTACGTTTATTATGACAAATTGCTAACTTTGTAGAATCGATGTAATATATACCAATCTCTTCTCCTTTCAGATAATGCGTTAATACGACTAAAGGCAATAAAAGCGATCTATCTGTAGCTTCAGTTATTTCTAAAGGCTTATCTGGTAAATTGTTTGGTGATAAAGCTTACATATCTAAAGAGTTATTTCATCAACTCTTCTCCAATGGTCTACGTTTATTTACTAATCTTCGTAAAGATATGAAAACATATTTATTGGACATAGATGATAAGCTTTTATTAAATAAACGTTCCTTAATTGAGTCTGTCTTTAATGTACTAAAAAAACACATGCATTTAGAGCATACTCGACATCGCTCTCATATTAACTTCTTTGTTCATATAATTGCTTCTCTTGCTAGTTATTCCATCTCCAAACTTAATCCCTATCTTATCTCTTCTTCTTTCTCTTCTAATCACTTATCCTAAATTAGCGTTATTATGCTAAGGGAATTTCTTTATACGAACTTGGACAACATCAAGAAGCAATAGACCTCTTTCAAAACTGGTTAATGTAGTTCAAAATTATAAATGCCAGATATCAAATTAAATCTAAGACCGAATCTTTATTTGTCAGCAATAATTTTGAACCGTTTTAGCATACCAATAACGTTTTCATTCACAACTCTTGCTCCTGCTAATCTACAATTATTCTTTTTATCATTTTTAGTTAAAGGATTTTTCTTGCTTTTTTTCTTTAGTAATTCAGAATTATTGTGAATTTTTTGTATACCTTGATATCCTGTATCAGTAATCGCTTTAACCTTAGGATGAATAAGAATTTTGGATTCCTTAAATAATCTAAAGTCATGTTTTTAACCGTTAGAAAAATCTGTACATATTACTTGATGCGTTTTCTTGTCTGCCACTATTTGAGTTTTTAGTGTATGCCTTTTCTTCTTTCCTGAATAATAGAATTTTTGTTTTTTTTATGTCTTTCTATAGGAGTCTCAGTAGCATCAATCAAGACCACTTCATAATTCATATCACTCTTCATTATAGCTTTACGACCTGTAAGAGCAAAGTTTAGGTGTTTAACTAGGGTGTCTTCTACCCATTTTACAGCTTTATATGCTGAACTTTCACTAATCCCATAGTTCTGGCATATATGGAAATAAGTGCGGTATTCTCTAAGGTATTCTAAGACCATCAGCAACTGTTCATCCAAATTGAGCTATTTTTACCCACACATTTTGATTTCTTAAGACAATCAGCTTGCCTAAAAATATCCACCATCTTTGAGAATGTTCCCTTCCTTACCACTGTTAATCAACGAAATTTTTCATCCTTTAACTCTTTAATCTGATCGAATTTCATTATTACCTCAAATCAGATCTTTATAACACTATTCTACATCATTGTCTACTTTCGAAAGAAGTCTAATGATTGCAGTGTTCCTTCATTATACAAGTTAAGTCCTTGGTTTGAAAATTTTTATATACTTATTTAATTCAAGTGTTAAAATGCTTTAAGCTCATTTTTATAAGTAAGGTTTAATCTAAAAACTTAGTGATATTTTTGATAAGATTTATTAAGGTAATGTTTCATGAATCATAAATTCATTTCAGCTGTTAAAGCATTAAAATGGTATAGCTACATGTGTATTGATGATAACATAATTTATGATGGTACAGCATCTTTGGATCAATGTAATTCTATTAGTATTAGCAAAGCTAAAACATTAATAGCTCAAAATTCAGCTGGATTTAATAATAATCAAAACACACATTTAGCTGTATTATCAGATTCAAGGCAACTTGCAGATAGTGTGCATACATTAGAAGATTTAAAATCATCAGTCACTTCTTTTGATGGCTGCTTGCTCAAAAAAACAGCATTAAATACAGTATTTGGAGATGGTATTCCATCAGCTCCAATTATGCTTATAGGTGAAGCTCCAGGGCAAAATGAAGATAAACACGGTATTCCTTTTTGTGGCGAAAGTGGTAAGTTACTTGATAATATGTTACAATCCATTAATTTATCACGCACTAAAAATGTATATATTACTAATACAGTGTTTTGGCGTCCACCAGCTAATCGCAGACCTACATCTGATGAGTTGGTAATTTGCAGGCCATTTGTTGAAAAACACATTGCTATAATCAATCCCAAGCTGATAATATTGGTTGGAAGTACTGCAGCAACAAGCATGTTAGGAGATCATGTTAAAATTTCCAAAATCAGACAAGAATATTTTTTATACAAAAACTGTTATCTAACTTTCTCGATTCCTATTACTGCTATTTTTCACCCAGCATATATGTTAAGACAGCCTTTACAAAAAAAAGCTTGCTGGTTTGATTTGCTAAAAATACAACAATTCATATTACAAAAATATATTACAATATAAACTGTATGTATCTAATAGTAATTGATACGCACTACGAAGTATATATGAGCTAGCTGTTGAAAGAAAAGAACAAAGTTGGAAATTACTACCTATCACATATCTGCCTACCTATGCTTTGTCTATTACATTACTGCAATATACTCAAGGCTCTATACTTGGTATGTTTTAGGCTTGTATTTTTCCATCTCTGTTCTTTTCAATAGCTAGCTCACTTATACCATTTGTATGATGCATGCAAAATCTACCTTATAGCAGGCTTTACTTTTTAGCTAAGCTATTTTATTCTCAATCTTTCTTCTTCGCAACCTAATGATACTAAGATTTTCGATATGATTTTATTTGGATGAACATTTGAATCATCTATAGTCAACGTCTTATTTACAACTCTATTTGTATACACTGTTACTGTATTCACACTAGTTCGTGCATAAACTTCCGTTGATTTAATACTACTATTCCAGCTTTTTTACAAATTATTGTGTACTGCTGAATGTGATAAGTGTTTGCTATTGTCTATTAGGCTTAGCAATACCAATTTACATTGAGTGTTGCTTTAAGTATTCAAATATCGTTTTTCCACTTTTACTCTTAGTTTTTGGTATACGCTATATTTTTTCCAAAAAGCTTATTTCTTTCCATCACATTCTTGATATATTACCTTTACATGCTGCAGTTAATAAAGCTGCCAATGCAAGAATTTTTCTGCCAGTTCTGATCGCTTTCACGATTCTGTTATATGGCTAAGCCACTATAAAACAGTTATATTATATACTTTTTGAAAAGCATATCTAGTTTATAGTGATAGCTAAACTATTACAACTGTTTTATAATAGTTTAGCTATATGAGA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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
1364629:1364645	attL	NA	NA	NA	NA
SPR15573.1|1368237_1368915_-|integrase	integrase	A0A0M3LQN1	Mannheimia_phage	8.7e-14	28.8
SPR15574.1|1369160_1369469_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR15575.1|1370146_1370464_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15576.1|1370915_1371185_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15577.1|1371581_1372388_+	uracil-DNA glycosylase	NA	NA	NA	NA
SPR15578.1|1374069_1375353_+	amino acid transporter	NA	NA	NA	NA
SPR15579.1|1375692_1378611_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15580.1|1379043_1379439_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15581.1|1380034_1381231_-	cytochrome b	NA	NA	NA	NA
1379460:1379476	attR	NA	NA	NA	NA
SPR15582.1|1381371_1382037_-	ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit	NA	NA	NA	NA
SPR15583.1|1382148_1383288_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15584.1|1383441_1384092_-	heme exporter protein B	NA	NA	NA	NA
SPR15585.1|1384088_1384694_-	cytochrome c biogenesis protein CcmA	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	5.9e-06	26.1
SPR15586.1|1384767_1385115_+	Aconitate hydratase A	NA	NA	NA	NA
SPR15587.1|1385062_1385893_+	Aconitate hydratase A	NA	NA	NA	NA
SPR15588.1|1386553_1386778_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15589.1|1386804_1387341_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15590.1|1387359_1387671_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15591.1|1388065_1388866_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15592.1|1388825_1389626_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15593.1|1389634_1390099_+	replicative DNA helicase	G9BWB0	Planktothrix_phage	1.3e-08	32.2
SPR15594.1|1390279_1391083_+	replicative DNA helicase	A0A218KST2	Xenohaliotis_phage	8.9e-50	42.6
SPR15595.1|1391322_1391952_+	ankyrin	A0A068ELT3	Penguinpox_virus	9.5e-07	27.5
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SPR15601.1|1396212_1396359_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
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SPR15603.1|1400733_1400853_+|transposase	DDE transposase family protein	NA	NA	NA	NA
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SPR15613.1|1410650_1411202_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>LS398548|1418343:1527357|DBSCAN-SWA
ATTATTTCTGATTGATTAAAACATTAGGATTAAAAGGAGAATTATGCTTTAAAACACCATAAATGATATGTAATAACTTACGCATAGCGGCAATAAGGATAAGCATTTTGGGTTTGCCAGTATCAGACAAACGTTGAGAAAATTGCTTGATAATACAATTATGTCTTAAGGCAGACATAGCAGGCATATAAAAAGACTTACGTAGATCTGAATTACCAGTTCTAGAGATTATACTAGCCCCCCGCACGGAACTGCCAGATTGACGATGCTTAGGATTAAGACCTACAAAAGCTACAACTTGTTTAGCAGAACTAAATTTCTCAATATCTGCTAAAAAAGCAAGAACTACAGCCTGTGTTTTTGCTCCTATGCCTGGTATTGACTCAAGTAACATAGCCTTATTATGAAGATCTTTGTTATTTTTAATATGGTCATTGATTAGTTGTTCAATTTCTTTAATTTGTGTTTCAAGAAATTCAATATGCATTTGAATATTATTAGCAATTGCTTTAGAAGCTCCTTCTAATCTATTTGTTTCTTGTGTTTTATGCTTAATTAAAACATTCAGGCGATTAACTAGCTGCTGTAGTTCTTGAATATAAAGAGGCTGTGGATACCATGCTTCCGGTTTCATTGCTTTGCAAAAATCTGCTATTAATACACTGTCTGCTTTATCTGTTTTTGTACGACTAAGTTTACTCATTGCAAAACCTTTAATACGGGCAGGATTTACTACGCTTACTTTATAACCATAATCGTACAGATATTTAGCTAAATTTTTCCAGTAGATACCTGTTGCTTCCATACAAACATGTCCAGTTCCTCTGCTTTTTAACCATGTTACTAATTTGTTAAACCCTTCAGAATTATTATTAAATTTTCTTGTTTGAACTTTATTATTAATTAACACAGCTGCATCAAATGTCTCTTTAGAAACGTCAATTCCTACAATTATACTATTCATAATCACCAAATTTTATGTTAAATATCTCAAAACCAACCTTGTAAATACAGAATTTTTAGCCTAAGAATACTGTCGGGTTTTTTAGTTATTCAAAAAAAAAGCTAATTCTTATCTTGATTACAGGCTATTAGCCTAAGGAGCAGACTTGTATACTAGCTTTCTTTTGTGTTATTACTATAACTTTTATTTTATTATAACTTCTAGTAATAAATAATACTATTTAACTTAATAATTCTAAATTAGCCATTAAAAATTTATGCTCTTCTTGTAATAAAGTGCTCTGCTTTGAGGAAGTTACAGCATTAATTTCCTCAATTCTAGCTTTTATTTTGAGTATATCTATGTGCATACAATTCATTACAAACATTGAAATTATATCTACTACTTGAGAATCAACTTTTGCTATTCCACCGCTAATAGTAAAACGATCAATATTTCTATCATTATAATGAACCTCTACTATTCCAAATTTTAATACAACTAGCATAGGTAAATGTTGAGGTAAAACTGCTAACACTCCTTCCAAACCTGGAAGTACTAACATGTCAACAGTATTATTGTTGTATATTATTTTTTCTAAAGCTAAAATTTTAACTATAAGCGTTGTTCCATTTATAGGTTTCATAATGTTTTAGATTTTTCAATGGCTTCGTCAATACTACCAACCATGTAAAAAGCCATTTCTGGCAAATCATCATATTTCCCATCAATCAACCCTTTAAATCCATAAATTGTATCTTCTAAACTAACAAATCTACCTTGTTTACCTGTAAACACTTCCGCAACATGAAAAGGCTGAGTTAAAAACCTCTGTATTTTTCTAGCTCTCGAAACAATTCTTTTCTCATCATCTGACAATTCATCTACACCTAATATAGCTATTACATCTTGTAACGACTTGTATGTTTGCAAAATTTCTTGTACCTGAGTAGCTACTGAATAGTGCTCTTGTCCTATTACACTAGCATCAAGAATTTGTGAACTACTATTTAACGGATCAACAGCTGGATAAATACCAAGCTCAGCAATTTTACGACTAAGAACTGTAGTAGCATCAAGATGTGCAAAACAAGCTACTGGAGCTGGATCAGTTAAATCATCAGCTGGCACATAAATTGCTTGTATTGAAGTAATAGCACCAAATTTTGTCGATGTAATCCGCTCCTGTAAACTTCCTATATCAGTAGCTAGGGTAGGCTGATAACCAACTGCAGACGGAATACGCCCTAATAATGTAGATATTTCTGCTCCTGCCTGAGTAAATCTGAAAATATTATCAATAAATAATAGAACTTCACCTTCGTTCATATCGCGAAATGACTCTGCTATTGTTAAGCCAGTTAATGCTACTCTAGCTCTTGCTCCAGGAGGCTCGTTCATTTGCCCAAACACCAAAGTAACTTTAGAATTTTCTAACTTATTAAGATCAATTATATTAGATCCAACCATTTCTTTATATAAATCTCCACCTTCTCTAGTACGTTCTCCAACTCCAGTAAAAACTGTATAACCTTTATAAGCCTTAGCTACATTGTTAATAATCTCCATTATTAACACAGTTTTACCAACTCCAGCACCACCAAAAAGGCCAATTTTCCCTCCACTAATATATGGTGTAAGTAAATCTATTACTTTAATACCAGTAATTAGTATTTTTCTAGAAGTAGATTGATTGATAAACTTTGGAGCATCTTTATGTATTTGCGAAAAGTTGTCGCATTTAATTGGACCTAAATCATCTATTGGTTGTCCAACTACATTCAATATTCTTCCTAAAATTGATTTACCAACTGGTACTTTAATTTGTTCTCCAGTATCAATTACTTCAGCTCCTCTAAATAATCCATCAGTTGAGTTCATAGCTAGACATCGTACTATATCATCTCCTATGTGTTGTACAACTTCCAGAACTATTTTTTCATTATTAATAGTGCACTCTAAAGCATTTAAAATATGTGGTAAGTCTTTACCTGCAAAACTAACATCAACAACAGCTGAAACTACTTGTACAACCTTACCAACTTTGGATTGCTGTTTATATTTGGCTTTTAACTTCATTGGTAAATCGAAATTCGTTTAAAGTATACGCTCAGTATAATATGCTTTATACTATGCTACAATAGAAAAAATAACAAATATAAACAATTGTAAATTAGATTTTCTGCAAAATACAAAACAAAATTTAGGGTATGTATGCTTCTAATAAAGTTAAGGTAGAGAAGAGATTGCAATAACGGTAGCATCTGCAAAATGCCATATGCATTAACTCTATAAATCTGTTATAGCTTACTATCTTTGAAAAGTCTTTTTTATAATGTGTACTCAGACAATATTAATAAAAATCTTTAATTTTAGCTATATCATAACTAGCCCTAGCTAAAAAACTATAATTTTTTATTATAATCATAATTCATTGTAAACACTTAAAGTCTTGCTTTGCATTTGTTGTAAAGAAAATTGCAATAATGTAGATTGCCTTGCTTGCTTGCGCATAGTTTGCATTTTATTACTAGTTAAATTTAGTAGTACATACTTAATTTTCTCTGATAAATCCTGTACATCAGATGCGTTAATATGAAACCCTGTAACTTCATCAGCAATAGTTTCCATGGTACTACCAATATTGCTAGCAATTATAACTTTTTCCATGGCTTGAGCTTCAACTATAACACGACTAAAGGCTTCTGGCTCAATTGAAGGGCAAAGAACAATATCAGCTAAGGCATATAATTCTGGTAAATGAGCTGTAGATCCAAAAATTTGAATTTTGCTTTGCAGCTTATAATGCATAATCTTCTTTTTTATTTCATTAGTAAAATTACGATTAGATAATATATCTCCAGTCATGATACAATAAAAATCGCAATCTTTGATTGCATTTAATGCTTCAATCACAACCTCATGACCTTTTCTCTTAGTCATTTTTGCTGGTAACAATATTACACAAGTATCTTTCGGAATATTATACATTGCCTGGTATTGCTCTAACTTTTTTTGTGAAATATTTTTAGGATTAAAGTATTCTAAATCAATGCCACGATGTATTACTCTAATTTTTTCCTCAGGCACATTGTAATATTTTATAATATGATCTTTCACAAAGTTTGAAACTACAATAACTATATCGCCTTTAACCAGAATACTGTTATACATTTTCTTAATTAAAGTAGAAAAATTATAAAACCCATGAAAGGTAGTAATAAATTTAATTTTAGTCTTACGAGCTGCAAGATATGAGCTAAAAGCTGGAGCTCTTGACCTAACATGTATTATGTCTACTTTCTGTTGTTTTATGATGTCAGATAGTATTGTATGATTATACCAAATAACAAATGGATTTTTACTTGCAGTATTTACTAGATAATGTGTGCTGCCAGTATTATTTAACTGCTCAAGTAGTACTCCACCAGATGATGCTACTAAGGATTTATAGCCACTTTGTACCAAATAGTTAGCAATGTCAATAGTACTACGCTCAACACCAACATTTACGAGTGATGGTACGACTTGTAAAATTGTTTTTTTATGGTAAGTTATACTCATAATATTTTTCAATCTTTAATATTGATACTAAATAAATGCATAAAATTTATACCTTAGATGATGGTAGGTTTATTGCTTACAGGCAACATAAAAGTCAAAAAAACAGTTTAATTAATATTATTTTTCTCCATGGTATGATGTCCAACATGTCAGGTAAGAAGTCTAGTTATTTATATCAACTATGTCAAGAAGAAGATCTCAACTTCTTAGCTTTTGACAATTATGGTCATGGTAATTCTTCTGGTCGATTTATTGATCAAACCATTGAGAGTTGGTTTGATGCAACTCGCGCTATTATGTATCACACTAGCAATAATTTTAAAAATATTATTGTTGGTTCAAGTTTAGGAGGCTGGTTAGCAATACTAGCTGCTATTAAAAACGAAATTGAAATTAGTGGAGTAGTTGCTTTAGCTCCTGCAATAGATTTTACAGAAACTTTAATTTGGAATAAGCTTACTGAAAAAAATAAAAACATTATGATTCATACCGG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MYTVFVFPGQGVQFVGMGKDLYDNFPVARDVFHEVNDIIAEKLTDIIFNGPISTLTLTKNAQLAIMAVSMAIIRVLEQQATMECYHMADYVAGHSLGEYSALCVAGALSLDEVTKILKVRADAMHAVASRCDGSMAACLGVTMKELNPILDYCSTIGVCEIANDNILGQIVISGHTTAINLAMNMLHAQGKKAIKLNVSGPFHCSLMAEATSIFRQAIDKVNIKPTKMIIVANYSANIVTTPIDIKNCLIRQIEGKVRWRETLDLLQQKNVSKLVEIGPGKVLINLAKKGQYTFKCSSINSIFEIDAFLNNI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SPR15627.1|1418343_1419306_-|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15628.1|1419526_1419931_-	ATP synthase subunit epsilon	NA	NA	NA	NA
SPR15629.1|1419927_1421364_-	ATP synthase subunit beta	NA	NA	NA	NA
SPR15630.1|1421709_1422849_-	capsule biosynthesis protein CapM	NA	NA	NA	NA
SPR15631.1|1422884_1423658_+	aplha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR15632.1|1424037_1426035_-	murein transglycosylase	I1VXB7	Halocynthia_phage	3.4e-05	39.4
SPR15633.1|1426076_1427015_+	ACP S-malonyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR15634.1|1427836_1428871_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2H4UW22	Bodo_saltans_virus	2.4e-31	40.7
SPR15635.1|1428867_1431306_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
SPR15636.1|1431391_1432321_-	elongation factor Ts	NA	NA	NA	NA
SPR15637.1|1432317_1433193_-	30S ribosomal protein S2	NA	NA	NA	NA
SPR15638.1|1433520_1434372_-	ATPase	NA	NA	NA	NA
SPR15639.1|1434355_1436008_-	leucyl aminopeptidase	Q6GYZ8	Mycoplasma_phage	9.4e-46	34.6
SPR15640.1|1436812_1438300_-	ankyrin repeat-containing protein 13	A0A1V0S7Q4	Shearwaterpox_virus	6.4e-09	27.8
1438683:1438720	attL	NA	NA	NA	NA
SPR15641.1|1438734_1438923_-|transposase	DDE transposase family protein	NA	NA	NA	NA
1438683:1438720	attL	NA	NA	NA	NA
SPR15642.1|1438951_1439056_-|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15643.1|1439465_1440977_+	ATPase AAA	NA	NA	NA	NA
SPR15644.1|1441309_1441573_+|tRNA	leucine--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
SPR15645.1|1441814_1443479_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15646.1|1443572_1444988_-	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	5.6e-71	37.7
SPR15647.1|1445326_1446892_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15648.1|1446900_1448337_+	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	2.4e-74	37.4
SPR15649.1|1448572_1449148_+	(p)pGpp hydrolase	A0A291L9W9	Bordetella_phage	7.4e-06	32.1
SPR15650.1|1449185_1449830_+	ankyrin	A0A068ELT3	Penguinpox_virus	4.4e-07	28.1
SPR15651.1|1449877_1450384_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR15652.1|1450387_1451197_-	DNA methyltransferase	A0A1S5PRR3	Streptococcus_phage	2.4e-18	26.7
SPR15653.1|1451570_1452299_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15654.1|1452320_1453178_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15655.1|1453278_1453857_+	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR15656.1|1453975_1454998_+|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	9.8e-86	65.3
SPR15657.1|1455188_1456391_-	TPR repeat-containing protein 08	NA	NA	NA	NA
SPR15658.1|1456487_1456631_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15659.1|1456714_1456885_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15660.1|1456977_1457172_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15661.1|1457381_1459097_-	HNH endonuclease	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	2.8e-85	36.3
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SPR15664.1|1464244_1465240_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15665.1|1465249_1467004_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15666.1|1467009_1468155_-	TPR repeat-containing protein 08	NA	NA	NA	NA
SPR15667.1|1468177_1470814_-	conjugal transfer protein TraG	NA	NA	NA	NA
SPR15668.1|1470813_1471269_-	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR15669.1|1471222_1472116_-	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
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SPR15671.1|1472840_1473137_-	Uncharacterised protein	I6R0L8	Salmonella_phage	1.6e-12	59.3
SPR15672.1|1473247_1474657_-	TPR repeat-containing protein 03	NA	NA	NA	NA
SPR15673.1|1474910_1476602_-	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
SPR15674.1|1476598_1476982_-	type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC	NA	NA	NA	NA
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SPR15676.1|1477982_1478156_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15677.1|1478239_1478899_-	type-F conjugative transfer system protein TraW	NA	NA	NA	NA
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SPR15681.1|1483052_1483388_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15682.1|1483794_1484283_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
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SPR15684.1|1484830_1485154_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15685.1|1485295_1485970_-|integrase	integrase	A0A0M3LQN1	Mannheimia_phage	1.9e-16	31.0
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SPR15687.1|1487236_1487569_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
1487202:1487239	attR	NA	NA	NA	NA
SPR15688.1|1488952_1489573_-|protease	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit	A0A223W000	Agrobacterium_phage	1.3e-59	59.3
1487202:1487239	attR	NA	NA	NA	NA
SPR15689.1|1490142_1490403_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15690.1|1490351_1490582_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15691.1|1490550_1490859_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SCG6	Indivirus	6.7e-06	32.9
SPR15692.1|1491355_1491601_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR15693.1|1491629_1492553_+|integrase	integrase	A0A0S2GLI2	Bacillus_phage	7.2e-11	24.9
SPR15694.1|1492656_1492980_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15695.1|1492979_1493375_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15696.1|1493378_1493531_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15697.1|1493527_1493914_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15698.1|1494146_1494473_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15699.1|1494515_1495406_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15700.1|1495374_1495848_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15701.1|1495847_1496177_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15702.1|1496157_1497030_+	conjugal transfer protein TraC	NA	NA	NA	NA
SPR15703.1|1497001_1497913_+	conjugal transfer protein TraC	NA	NA	NA	NA
SPR15704.1|1497862_1498906_-	ankyrin repeat-containing protein 09	NA	NA	NA	NA
SPR15705.1|1499206_1499959_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15706.1|1499981_1500365_+	type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC	NA	NA	NA	NA
SPR15707.1|1500361_1500844_+	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
SPR15708.1|1501057_1502233_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15709.1|1502325_1502730_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15710.1|1502813_1503467_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15711.1|1503463_1504357_+	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR15712.1|1504310_1504766_+	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR15713.1|1504765_1505881_+	conjugal transfer protein TraG	NA	NA	NA	NA
SPR15714.1|1506035_1506482_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15715.1|1506453_1506789_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15716.1|1506743_1507730_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15717.1|1507739_1508630_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15718.1|1508656_1509925_-	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR15719.1|1510035_1510806_-	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR15720.1|1511072_1512311_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR15721.1|1512307_1512634_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR15722.1|1512679_1513927_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR15723.1|1514226_1514439_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15724.1|1514657_1516595_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR15725.1|1516642_1516750_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15726.1|1517282_1517738_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15727.1|1517831_1518368_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15728.1|1518394_1518970_-	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR15729.1|1519070_1519928_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15730.1|1519902_1520679_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15731.1|1521029_1521746_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15732.1|1522638_1523142_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR15733.1|1523188_1523818_-	ankyrin	A0A068ELT3	Penguinpox_virus	2.1e-06	26.9
SPR15734.1|1524057_1525494_-	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	4.3e-71	37.2
SPR15735.1|1525502_1526303_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15736.1|1526262_1526598_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15737.1|1526958_1527357_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>LS398548|1541939:1596325|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_19

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MHLWYQIILSANNQDYSLRFMTIPFRTLKIENRDVDKLPNVTCDTIDLQSSSSRHNGYIQFSSIDNVFISHLSRFNEIRYLNISDIELYLAGFDILSNYCNNNLTSLTLVNDKIGLKKVHKHCIAPTSGTGPTSGADIRNPIKKLLNNLPNISELNIGNNSISHAVIKQILNCINESNKLNIILDVSYNMKKSSDSFISIKPFIYHRQQRDYNVWMKSIDNFMKCGGTLIVEPDALVCNIHHERLTSNSGLGICIDMHFSDLQIFYKKNIDGTIIIKRFIPHSSQLNTQEDNNSVSKKELCIDNQNSDCTYTASTSSIAQKSDDDLISECLANNPNIKEQINNILSETEINNILATTFSTSELDINIAEDYLSYSDKQIANNDAIQSSFKRKREDIYTEFSNKKANFSLEESQILNLVNQHSSLSSDYNISLYDSYNKNLHYEYNC
>LS398548|1541939:1596325|1541939_1542152_+|SPR15749.1|transposase|DBSCAN-SWA
MTVKMTKADKSDLSAALVISKALSGRLFADKACILKALFHQLFTNGLLLFTNLSKDMQTYLFGHKMISFY
>LS398548|1541939:1596325|1562325_1562562_-|SPR15770.1|transposase|DBSCAN-SWA
MSVKITKSNKSDLSVSSFFSKGLSGKLFGDKAYISEELFHQLFSNGLRLFTNLRKDMKTYLLDIQDKKLLGLFRNWLR
>LS398548|1541939:1596325|1574549_1576241_+|SPR15784.1|DBSCAN-SWA
MKQLIVLVLIILNINCCLASMQSSYNEASNYNVNLGNSSNTQELFHQGSNVNYPNNDEDLTYHGRNQLSTESGAMLFQAENSKNNALTQHNINDQNYMIANSMRIESDPLSALDSSNFVTQTSTTNTEIIQSCTEGSKFNIELIRELNVECRLENVWLPWQNRQMEFATEKIKENHSNWLKSRSDVYDESGAQIYCLVDDPEAIERQMKWAIVNRLGVPTQHIGRNFLLEVNEKICILHYDYRDKTQELRKVAEYWKVLNPELEQLTESNECYEVNRINYDGGDRVFFDKFKVNRPYWKQKIVFSCTSDPKDGCKHLKIQNCELKNSTCQKSVANICLLWQHDYSCSTEKQTMLHSSLRNNSIFCLGGNCNTPTIIPNRDIAKVAHIAMLNQMSKDIKTNPVSVFSGKHRKCKKDVFSFLNCCSSMTGWGRDIGLSQCKSKEQELALYRKKGYCYYIGTYCSSRIPILGICLARKSTYCCFQSKLARIFQEEARKQLKIDFGTPECPNCRGLTVKELQKVDFTKINMDELFGDILTKAQNSMNKDIIAGIKDKVHRMQQSQSK
>LS398548|1541939:1596325|1548299_1549109_-|SPR15756.1|DBSCAN-SWA
MSVAVANKSKPFLHWIGSKRRIVNKLIEHLPQGPHYNYYEPFLGGGALFFQVRHLFKQCFLSDINLDLITSYNAVKNNPNEVNRLLSLYHKHHSKDYYYKVKNKYSNNPNEITAKFIYLNKYSFRGIYRVYKNGQSAQTFSGECYIKLHIASRINQCSRLLHGVSIYATDFSFIEPQQNDFVYFDPPYHKSGERFYTRLPFDEKDQIRLRDFVKELTNKGVKIMISNNNTAFIRDLYKDFNINTVTVVYSINEQRNPVNELIITNYKTC
>LS398548|1541939:1596325|1576932_1578234_+|SPR15786.1|DBSCAN-SWA
MSIRIRVYVITMLLLLQAPVSLAWNIENVFQGMSVNVTRSGSYQDQAAGYYAAGGLSARTSQTSFQPFAITPPSLNMSCSGIDAYLGSFSVISGEELVQLMKNIGSQAKVYAFSLGLKTFAPQIENALKDLRNLAMEMNQFAKGDCELTKALFATALPRNWAMREAVCRDIQSQSGFDYFAAGKKCRNDLAQKQSLRQAQNKDPELMLDDYNIFTKAAAKVGIPSNMHDSIMSMTGTIVVTNNNVHFYDSLAQDEKSWISHLKGGESASIYSCDNVSCLHPSLRRNITILPEKSYAGKAKQQLTNLKIKFDKNSEFIDSEIAFLSSIGDIFPIYDYITLEAISGVTILDSSSELIASYTLVQHLKEVITEIRRAVTSLGAKQVSNEHLERYLKELNRVQLFANEKWTSLQTDASRIDKRARLIEQHLIAKEKS
>LS398548|1541939:1596325|1561959_1562334_+|SPR15769.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVDKKTRQVICTDFSNGKKHDFRLFKKSKILIHPKVKVITDTGYQGIQKIHNNSELPKKKSKKNPLTKNDKKNNHRLAVARVVNENVIGMLKRSKIIADKYRNRSKRFSLRFNLISGIYNFELP
>LS398548|1541939:1596325|1584814_1585366_-|SPR15791.1|DBSCAN-SWA
MVFDEETQKSWPALTIFVKNDKDEITGAKILALNSKTCNKADVAEKSVGTISGSFAEIAQQNSKYSPVTIITKDIETALTIQQAGVEGKILCAIEAENLQNYNPSPKEKIILAVKNDVNTEKAEKVLEDKEAVVCTVKNDFNNVLKTQGLYAVRNIISPEIRKLNEKIESIQTNIQQRLCPKH
>LS398548|1541939:1596325|1566858_1567347_+|SPR15775.1|DBSCAN-SWA
MSIRFLRFIIWFIALVNVNNIYAVEYELEADNLLKLEISDSGPTRINLKDEKINDIFMYPQNAAEVVVHESGFLFIVPREEGNKVYLTVIGEYKTIQDLMLTFTPKTPSPIMLVNAATKIEEKDNSKQNNNNLFSNDLNTKELTAKPSKKQSRNTKKKIKLA
>LS398548|1541939:1596325|1576252_1576936_+|SPR15785.1|DBSCAN-SWA
MFMILISHLSTVDASPTGFLWYNDKHDHELNNSSSKLMSWTHDHRIEELKEQFNRAQRIALDNPTLENVITAQRLQKQIMEKAHKFATMWQLATLLDYQLINANEPANSLHRKLYQEKSEQENDLKLKNIAKNWGLILQVKQDCLLCKAFIPIVQSFANKYAFQLLAVSKNNELLNKLNPKHVVPVLYLVASDGKKIYAVARSIISEDKIIDNILAIDRYYHKLETA
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MKSWKLQQLEQDLVKIVNNTLRGEIQEIVNPGGETLYLIPGNRYPKLLRKISSMQAK
>LS398548|1541939:1596325|1567753_1568089_+|SPR15776.1|DBSCAN-SWA
MFIYQKSRLNMLNPTFGIQWNNVVVGLLIIIITACVFSFEPALADTLEGQLNKIDGLFSGKLKTIGISSATILSSIWAVARGNIKLAGVMVAIGVILGFYLDWIAGGMKIN
>LS398548|1541939:1596325|1565987_1566311_+|SPR15773.1|DBSCAN-SWA
MLQLGLKVIMQNQKLCWALSRPLKYMGLSIDEWGVVLAGVAPGIVLLNSRHAKLGLAFMVGGIALCYCFKKFKKVSENFLLKSFLVAKGLLPAPLGYSRLLGKKVGK
>LS398548|1541939:1596325|1580882_1582022_+|SPR15788.1|DBSCAN-SWA
MKNACKKLAIILSLILLNTAAVAAEQSIQQDLIQDRAVLAKEYFNIGSSFLRLKKYYEAIENFNIAIKYDPSYATAYNSKGMALHYLSKYHEAIKNYNIAIKYKPDFVEAYNNKAVSHRKLGKNEEAVILCNLAIKYKPDYAEAYINKGASLNDLGQYEEAMENFDIAIKYSPSNATAYYNKGIALMYLMQLQDAIENYNLAIKYKADYSEAYNNKGLVQIFLGQFSESIKNFNLAIKYDSNDATAYHNKGYVLSMLKRYPEAIKSCNLAIKYNPNCAEAYYRRGMIFEKLGKHQDAIKNYDIAAKYNPNFAENYLEKGISLVSLGQYSKAKENFNLAIKYNPNIIAEYEAMFKKLTEFENLTIAKDYEQKLQILKKYS
>LS398548|1541939:1596325|1572245_1572905_+|SPR15780.1|DBSCAN-SWA
MKHGAVISIGTFFALFAVAYQVSDIRANLLNADIGVEIKDYGTRGHVFPIIEESLLEVIMAKLNAASKSGLLNQMQLEFQEKVRQKIMRPVPVKNLSKATENKTRIYDSTYVQKDDIKTKNGIIIVKGGTKINPLEIINWGEPLILIDGDDEDQVAWAKSRPGKIVLVNGNPIELSNLLGRHVFFDQLGFLSMKFKIQAVPAIIEQENTVLKISEVSTY
>LS398548|1541939:1596325|1566310_1566862_+|SPR15774.1|DBSCAN-SWA
MNHLFKQNAIQELVKYNKCLLSVTILLAAANIIAIMAAITKEEKWLLIPAMEPDRKMMVSSKNYHETYLKEWAIYVTKLLFTTSPNEVERQIADMKVASSNTESLNKFFHDHLQFVKGSNVSSVFFPKKIEVIKDGVLISGTLRYWFSDSKDIAVDKTYLLTYKQTPNYLLLLTGVKENGIKK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SPR15749.1|1541939_1542152_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15750.1|1542316_1543498_-	Bcr/CflA family drug resistance efflux transporter	S4TR35	Salmonella_phage	6.2e-15	22.5
SPR15751.1|1544574_1544733_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15752.1|1544954_1546178_+	replicative DNA helicase	A0A218KST2	Xenohaliotis_phage	9.1e-62	43.5
SPR15753.1|1546413_1546989_+	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR15754.1|1547000_1547645_+	ankyrin	A0A167R1M3	Powai_lake_megavirus	1.1e-13	31.7
SPR15755.1|1547747_1548296_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR15756.1|1548299_1549109_-	DNA methyltransferase	A0A1S5PRR3	Streptococcus_phage	1.8e-18	26.0
SPR15757.1|1549931_1550135_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15758.1|1550146_1550584_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15759.1|1550773_1551466_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15760.1|1551515_1552910_-	preprotein translocase SecA subunit-like protein	NA	NA	NA	NA
SPR15761.1|1553427_1553787_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15762.1|1553833_1555174_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15763.1|1555341_1555794_-	HNH endonuclease	NA	NA	NA	NA
SPR15764.1|1555908_1557132_-	reverse transcriptase	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	1.6e-66	38.7
SPR15765.1|1557813_1559175_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR15766.1|1559231_1560026_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR15767.1|1560192_1560732_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
1560940:1560958	attL	NA	NA	NA	NA
SPR15768.1|1561591_1561948_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15769.1|1561959_1562334_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15770.1|1562325_1562562_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15771.1|1562758_1564198_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15772.1|1564616_1565846_+|integrase	integrase	A0A1V0E8G8	Vibrio_phage	5.8e-16	25.5
SPR15773.1|1565987_1566311_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15774.1|1566310_1566862_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15775.1|1566858_1567347_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15776.1|1567753_1568089_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15777.1|1568127_1569447_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15778.1|1569446_1569776_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15779.1|1569756_1572249_+	conjugal transfer protein TraC	NA	NA	NA	NA
SPR15780.1|1572245_1572905_+	type-F conjugative transfer system protein TraW	NA	NA	NA	NA
SPR15781.1|1572995_1573169_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15782.1|1573202_1574147_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15783.1|1574169_1574553_+	type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC	NA	NA	NA	NA
SPR15784.1|1574549_1576241_+	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
SPR15785.1|1576252_1576936_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15786.1|1576932_1578234_+	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR15787.1|1578233_1580870_+	conjugal transfer protein TraG	NA	NA	NA	NA
SPR15788.1|1580882_1582022_+	TPR repeat-containing protein 08	NA	NA	NA	NA
SPR15789.1|1582027_1583782_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15790.1|1583791_1584763_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15791.1|1584814_1585366_-	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR15792.1|1585379_1587485_-	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
1586644:1586662	attR	NA	NA	NA	NA
SPR15793.1|1587748_1590568_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR15794.1|1591250_1592966_+	HNH endonuclease	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	2.8e-85	36.3
SPR15795.1|1593176_1593632_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15796.1|1593715_1593859_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15797.1|1593955_1595158_+	TPR repeat-containing protein 08	NA	NA	NA	NA
SPR15798.1|1595350_1596325_-|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	1.6e-85	64.9

Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>LS398548|1606324:1686519|DBSCAN-SWA
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MTDKINDSNNFNNIHNSKTEIENSKANSWNHNVAVKLTNGDIADGIVLLSDNNSLRADNTLKESINQLINDWKNSKFELQDRLIIADHKEAENINQNIRNYMKENGDLKGTEYSILISGAESKKYANYMAGDRIIFQTNDKDLQIQNSEFATLVSIDENKFVAKTDTGNEVSFDLNKISFKHGYATTVCNPQTAVKKDVYVLHNNGVGIESSNISMIGNAEQVRLYYNVQATKNVANLIEQLSTAKTDSINSKEENNDVQANEVRQYQSAQNYRKNDYYSNSEEDLQKLKDAIAYRADTIARDILGDPNKRLSTYGKLRWGDTGKIQVTTEGKYAGKWYDFSTGQKGDLLSLAQRERGYSFFEAKEYLKSMVGMSNISQRYQRPPKTDDSQQYTQQSESVKIAKVQNLYERSSRIHGYEIDTSPSAEVEIVKKYLENRGITFDKSTASSDLKGSILFDTQTRENYPAFTAFARNSKGEITGVQAVYLNSAGDKANILINRRSFGKISGSFITIAKRNANDPNITIIAEGAETALSLQQSGIKGNIIASAGISNLRNYSPFPGEKIIIAADNDSKNPITYNTVIKAAKMLEMKGAITCIVKPPENGDFNNLLQSCGDQSIRDIIEPEITKLTKAVETTKLTQTENNSIAKQNDITNVKELYNKSSSLYYFKQEEEAKVETIVVNKYSENHTGIYSSKIFNNS
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MEQDNSDNNNTKEEDLELNDKPKAESVRSNSKLSELTNIIRRKPVIALTFISITIMVVSYFLSESGKTKESIIFIENRESREAISGIEQAVDLRAKWTEEILNEVKTLKDRFDSVIDSRYLEITAQINNFNQKLEILENQPKQSLYNNDSDEFSSDLNHHILNSPHDNKTEQAPVVVKPYVNLRRAESEQKKNVENYVTSGSSARAVLLTGVVVGTGTNSSSSPEPIVLQLLDTAILYNKYKTDQIKNAILIGSCNGEMSSERAKCRIETLSVVNNQGDIIEKKVEGWLIGEDGRSGIKGIVVDKSSNIASMAALNGVFSSIAKFLQSKAIKPDMLPTLNLVAGGQQQEFQIGDALQSGAYAGASNAFDKLADFAIKRADSMSPVVLIASGRVIDVVFKKGFDLLEHKKKPHNLTYSQSTNNEKVNLHNKFDQSQKLEEYYL
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MHRGNNRQFNIQAMGSIQLCQTLRDRDVLSGTIITEIDNRALFLLQTEDTRYKRLQFDARGLATILYQFAKLKYVIKYVIGSEFIDAWTNKAINLMDEFNAQDLANSIYALGQLKIHPQDEFINAWIHYATKTIKNFNPQDLANSIYALGQLKIHPQDEFINAWIHYATKTIKNFNPQNLANSIYALGQLKIHPQDEFINAWIHYATKTIKNFNPQNLANSIYALGRLEIHPQDEFINAWIHYATKTIKNFNPQDLANSIYALEQLEIHPQDEFINAWIHHATKTIKNFNPQGLANSIYALGRLEIHPQDEFINA
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MFIYQKSRLNMLNPTFGIQWNNVVVGLLIIIITACVFSFEPALADTLEGQLNKIDGLFSGKLKTIGISSATILSSIWAVARGNIKLAGVMVAIGVILGFYLDWIAGGMKIN
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MKFLLLLLCCMSLTSFFFESTFDCKIPKGLKCKSLYEIKNMVAQGAFDIDNLEKVETSKTKSKRRCILCYRQAKAIQSVAVVNKSPKKPKKYLINLFKLKQSQGERKHT
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MIKIKIVVFPDLSIKEAKKKVRELKRLMTNGIDSREVKC
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MFMILISHLSTVDASPTGFLWYNDKHDHELNNSSSKLMSWTHDHRIEELKEQFNRAQRIALDNPTLENVIAAQRLQKQIMEKAHKFATMWQLATLLDYQLINANEPSNSLHRKLYQEKSEQKNDLKLKNIAKNWGLILQVKEDCLLCNAFMPIVQSFANKYAFQLLAVSKNNELLNKLNPKHIVPVLYLVASDGKKIYSVARSIISEDKIIDNILAIDRYYHKLETR
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MHLSRFLDPKNDVAFKKIFGSEKKQGHTNTFSERYIVV
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MNVLKSLLQPCYAVILAFVVLSSPSICTANNNVNFNAFKDSIDTSQFYIKFSTGIAASYDTLEAGIGYRLNRHRMDVRLGFMCHHNCRDNFIQGNYYYNIIEGNKASIVVTGGLVSAFNSDSDTGIDLGVGTAINLSRDTYLDGVGTTINLARDTYLDIECSTIANYTPLPIYIRFGLRVHI
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MLRNECIERIKIILKDKIVFIDEFGIEDNAYLNYRSSSICSR
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MSIRILRFIIGFIALVNVNNIYAVEYELEADELLKLEISDSGPTRINLKDEKINDILMYHQNTVEVIVHESGFLFIAPREEGNKLYLTVIGEYKFLNLILLVLINQYI
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MPVPGIPVGFWEPVRLVDVTKSPMCMVSLGGLSFGSPTQKGMKDEAEGSAFYHIHWYVYSMIYWLEILLDFICLEMAAVDIAYLTEFDPLWSDDAKSAILNPETLLFQNVAAYQACIADCMSCSAGLLASDYAFWCAECQGMLYPFIETAAAHNGGVGTSVLMVSKFMARMHRQLMLWGYYGYKGLCGKYPMPIMKKSQYRLQMTYSIPETKSCKSIGQTEATWQAGREFPVNGEDFGYLIWRKRDCCLL
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MLKLRLKVIMQNQKLCWALSRPLKYMGLSIDEW
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MLTFINIYNQSSTLTINIFAIFINITKKLKQKVEKRLKKNLGNWGPVFNLKVNLMIEKYIQPRTDK
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MLQLRLKVIMQNQKLCWALSRLLKYMCLSIDEWEVVLAGVAPGIVLVNSRHAKLGLAFMVGGIALCYCFKKFKKVSENFLLKSFLVAKGLLPAPLGYSRLLGKKVGK
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MLADKFCNKGNSFLKLRKYQKAIKNYDVAIKCNPDCIEAYINKGIGATSRGNKEF
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MLATLRTIFNKAIKWRLIENNPTLGIEPHKMQARERRLSYDEMSKFLHVLCGEATPLIRDFALLALYTGARKSNVLEMEWDNIDFKRKIWHIPKN
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MSVAVANKSKPFLHWIGSKRRIVNKLIEHLPQGPHYNYYEPFLGGGALFFQVRHLFKQCFLSDINLDLITSYNAVKNNPNEVNRLLSLYHKHHSKDYYYKVKNKYSNNPNEITAKFIYLNKYSFRGIYRVYKNGQSAQTFSGECYIKLHIASRINQCSSLLHGVSIYATDFSFIEPKKGDFVYFDPPYHKSGERFYTRLPFDEKDQIRLRDFVQELTNKGVKIMISNNNTAFIRDLYKDFNINTVTVVYSINEQRNPVNELIITNYKTC
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MKEKKKTINKWMVQIPPIPITLVNGESENIDEYMEIITKLRKAKYQVEVAESLKEYCTYLIQEIKYRFNIATSEIVRLASEIMLNDSENKDKLKTILNRSANLQEYCNDVVYTLRSEIEHENLCLKKFSIQKLVKDAVRRLEDIAKEKDIKINYNFQYKMKDIVIGNSDHLQAILSQLIGSVIRFNRSCQVIITVHLFTVKNYIKSDNILQFRIHDTGSGISKEKLGNIKAKLADFELVRDYPLMLESGLWFVNYLINQLNGEMEIESEKDKFTTITCNIPVQLF
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MNHLFKQNAIQELVKYNKCLLSVTILLAAANIIAIMAAITKEEKWLLIPAMEPDRKMMVSSKNYHETYLKEWAIYVTKLLFTTSPNEVERQIADMKVASSNTESLNKFFHDHLQFVKGSNVSSVFFPKKIEVIKDGVLISGTLRYWFSDSKDIAVDKTYLLTYKQTPNYLLLLTGVKENGIKK
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MAKFGIPIAVISKLLNHNDHQSTKFYIHLNTDVVRDAIQKFANEIAK
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MLNANVTIETKDNFKKIYWHSIDWKEIIQKVNNLRRRIYRAFANGNTKLVGNLQRLMLKSRANRLLAIRRVTQINKGRKSPGIDKIVVKTDKERSLLMEKLADNNLSSVKPIKRVYIPKSNGESRPLGLPTIVDRCRQAVVKSALEPYWEAKFEGCSYGFRPGRSAHDAIQRISGIIRHGTNRNWILDADIKGAFDNIDHNFLLKIIGNFPARNWIQAWLKSGVMQDYQIIKTTAGTPQGGLISPLLLNITLHGMSDILNIIYNKYDHLYSKSEYALVRYADDFVVCAKSESSCIRAKSIINDWLSIRGLELSKEKTRILHINEGFDFLGFNIRQYKTNSTRRGVALLVKPSKDSIKSFKKRMSIEWKKSFSWNIDRIIDNLNSKIFGWCSYFNKVVSKKIFSNLDCWMWIRQARFACRKHPKKSWEWLKKKYWGRIKGRNDNWVFMNKDLYLWKLQWTTIKRHILVKGKSSPDNSKLREYWHKRQADSPKYLFKSRQILWRRQKGKCLVCFDLIDNGESVHVHHITPIRCGGTDHINNLCLLHENCHRQVHSNRGQLIAAVCKLLEPYAE
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MSIRVLRFMIGLIALVNVNNIYAVEYELEADNLLKLEISDSGPTRINLKDEKINDILMYPQNAAEVVVHESGFLFIAPQEEGNKLYLTVIGEYKTIQDLMLTFTPKTQNPVMLVNAATKIQEKDNSKQNNANLFSNDVNTKELTAKLSNFTCDN
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MLSSNRILELYHDDGESSKYFTTIEVRNEETRIIRIANKINNQVYYNDIYNLKSDIEGLANVSEEQKQALRHILLSTSGVRVLRGRAGTGKSYVLIKAHELATNRGQKVIGLAPTHKAVSELRSKGYTEVYTVKGFLYNRKKIFMQDSLIVVDEAGMVGTKAYAELFRVVRNNNCQLILAGDEKQLASIERGGMFEMLSNIFGSHVLVNIRRQSENWSREAAMEFAESNILSGITLLRQNNSVRFDNTLQDSMSKLIYNWSLSKFKPHEKLVITVRNKDVDILNSSIRSLLKANGTLKGTEYERSIDGRKKSYMAGDRIVFQKSYKDLQIQNSEFATLTSVSKNKFIAKTDTGKEVSFDPSEIQFKHGYASTVYKVQGASIKDVYVLHNGVSNISSSYVAMTRHIKSLKLYCNKEATGSINSLINQLSRPNEKSASITLKTAHDFEKERTKTTVFSKIENWFKSIINDINDRSNVNKEYYHFTAKPEEEAKVEKVQLKDISTPLFMQIKEQRQYDYDVTILSAEGKTISSFQEAGIDSRMVYSSNVNNLKYYQPFQGEKILIAANNDKQNKEYVSTINEAAKVLTSKGAITSIVIHSEGEDFNEMLKNKGAIAVKELMIPEIMKLINTQNVKTESEQVVKTDIAQKIGLRR
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MNTALHEAAKSGNIQTVQSILHEKGNDLDYINSPDRINTTALHYAIRAGHLEIASLLLTHGADPNAQDTYGNTPFHSAFRKGSLQFIKLLLKNGADPNIRNHHDDIPFHYAAHYCNPDIIKLLLLKEGGDLNALDILGTTTPFREVFTIFMEDQEKNREVMQLLVAEIVKLDHSGVKISESTLKGFNFNKQLISGSDLLKELEQKCHNEIEQMKSTLDSESNLSFFDIFMLKKDKEALARLAYDLDLIKIKGEFCMYSPFIERAIVEVMTTRSMMLQGAAESINEIFESNQDANQESQTSWLHLPPELKMMILENLGNNDLTKLQPTYFNDLMEDKLAGAYAIYEGE
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MKNLTINDDAPDFNMITTSNSIINLGHYEGKNLVLYFYPKDNTPGCTIEAQKFNEAISEFNKLNTIILGVSKDNIASHQKFKDKLCLKFELGYDETGKIFEDYGVLKEKSMFKNTFLAISRTTFLINQKGKIAAIWPKVNIAQHSDEVLNMVKNTI
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MRIGIEMAIQFARIEFLRRSEGGDSCRKAAYNARTIVKNEQTKIRYNFFTKQDVEKAVKDIPDLIAREQLVQKVLSSNRILELYHDDGESSKYFTTIEVRNEETRIIRIANKINNQVYYNDIYNLKSDIEGLANVSEEQKQALRHILLSTSGVRVLRGRAGTGKSYVLIKAHKLATNRGQKVIGLAPTHKAVSELKSKGYTEVYTVKGFLYNRKKIFMKGSLIVVDEAGMVGTKAYAELFRVVRNNNCQLILAGDEKQLASIERGGMFEMLSNNFGSHVLIDIRRQSENWSREAATKFAESNILSGITLLRQNKCVKFDNTLQDSISKLIYDWSLSKFKLHEKLVITVRNKDVDILNSSIRSLLKANGTLQGTEYRRSIAGRKESYMAGDRIVFQKSDKDLQIQNSEFATLTSVNKNEFVAKTDAGKEVSFDSVKYNLNMAMQVLFIRLRELL
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MITDTGYQGIQKIHNNSELPKKKSKKNPLTKNDKKNNHRLAVARVVNENVIGILKRFKIIADKYRNRRKRFSLRFNLISGIYNFELP
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MANLMQQKITLQQKKARLIMDEVNLKIKERKMRTRRLIEMGGLVAKAKLDHLPTNTLFGAIVSLKETLTQHPNVQDHWTTIGKDIFDKEQQNKAAVILKFASEPDENTKRHIRLHGLK
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>LS398548|1606324:1686519|1659260_1659545_+|SPR15866.1|integrase|DBSCAN-SWA
MKSITLKLTNKLIRKIKIPTKRTSTIQDKVEPELKLRISHTGRKTWSFEKKFRKEGIKIKIGVFPDLSIKEARKIARELKRLMTNGIDSREVKC
>LS398548|1606324:1686519|1656253_1656910_-|SPR15861.1|DBSCAN-SWA
MVRDLRNFASNNCKITNNNSSNNATVFYRFIGNFVPAEWKDLIGDNAKALSKTSKQLLSFIVFRLHIYYNKDIDELQESYYFFENELNLRYRRVRQCLVELSNAGFIKVENRTIIKGNLKVRNVLCVKLLKNFQRFTEKEKKEEKIVLLQQKNFHINLQEFAGEPAKNCSYIYRYNNNKKNNNRSRSTEDKLIENDQNKNRLLSKLENDVEWCYKNLI
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MYTRDLTICAAIVQYLGHYVLYSINNILPSIASNDQFRSNLPADLFNGTMNGIHVDCGRSITFDYYVVNYPRSYSLFINVMSVNYSFNNRAKNSSITIPF
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MNSIIVGIDVSKETFDAAVLINNKVQTRKFNNNSEGFNKLVTWLKSRGTGHVCMEATGIYWKNLAKYLYDYGYKVSVVNPARIKGFAMSKLSRTKTDKADSVLIADFCKAMKPEAWYPQPLYIQELQQLVNRLNVLIKHKTQETNRLEGASKAIANNIQMHIEFLETQIKEIEQLINDHIKNNTDLHNKA
>LS398548|1606324:1686519|1667852_1668005_+|SPR15884.1|DBSCAN-SWA
MNGVLISGTLRYWFSDSKHIAVDKTYLLTYKRTPNYLLLLTGVKENGIKK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SPR15809.1|1606324_1607761_+	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	1.3e-72	37.4
SPR15810.1|1607994_1608570_+	(p)pGpp hydrolase	A0A291L9W9	Bordetella_phage	1.3e-05	30.9
SPR15811.1|1608607_1609252_+	ankyrin	A0A167R1M3	Powai_lake_megavirus	1.1e-13	31.1
SPR15812.1|1609299_1609848_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR15813.1|1609851_1610661_-	DNA methyltransferase	A0A1S5PRR3	Streptococcus_phage	7.4e-20	27.1
SPR15814.1|1611034_1611763_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15815.1|1611784_1612642_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15816.1|1612742_1613327_+	(p)pGpp hydrolase	B3FJI5	Pseudomonas_phage	7.5e-06	38.6
SPR15817.1|1613432_1614515_+|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	8.8e-85	64.9
SPR15818.1|1614681_1615038_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15819.1|1615247_1616963_-	HNH endonuclease	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	2.8e-85	36.3
SPR15820.1|1617645_1618500_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR15821.1|1618508_1620464_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR15822.1|1620727_1622833_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR15823.1|1622846_1623398_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR15824.1|1623449_1624517_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15825.1|1624526_1626281_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15826.1|1626286_1627432_-	TPR repeat-containing protein 08	NA	NA	NA	NA
SPR15827.1|1627447_1630105_-	conjugal transfer protein TraG	NA	NA	NA	NA
SPR15828.1|1630104_1631406_-	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR15829.1|1631402_1632086_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15830.1|1632097_1633792_-	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
SPR15831.1|1633788_1634172_-	type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC	NA	NA	NA	NA
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SPR15833.1|1635247_1636291_+	ankyrin repeat-containing protein 09	NA	NA	NA	NA
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1641934:1641950	attL	NA	NA	NA	NA
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SPR15846.1|1643943_1644471_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
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SPR15854.1|1651937_1652747_+	DNA methyltransferase	A0A1S5PRR3	Streptococcus_phage	9.1e-18	26.4
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SPR15856.1|1653401_1654046_-	ankyrin	A0A167R1M3	Powai_lake_megavirus	8.2e-14	31.7
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SPR15862.1|1657181_1657451_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15863.1|1657466_1657892_-|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
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SPR15864.1|1657848_1658421_-|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
1657470:1657486	attR	NA	NA	NA	NA
SPR15865.1|1658637_1658844_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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SPR15881.1|1667234_1667453_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
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SPR15892.1|1672230_1672626_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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SPR15894.1|1674379_1675033_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
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SPR15900.1|1682664_1683117_+	HNH endonuclease	NA	NA	NA	NA
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SPR15907.1|1686402_1686519_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>LS398548|1719098:1761501|DBSCAN-SWA
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MTDSTTSNITCNCSQSCQKNIYGSYCQGIDIWLALGYTVALLILGFIAYYYKNKCQDLERKIKHMPQSLNVMPGTQGDCYFSTAEEVISDCRVSSLELNNVLSPCNYNCEESLQQNPSSNNQNNNEEHIIVHQNPTYFFRGINANSCTSIDNNLFSIDDSSMVGATGSIMMGTLTGNVMDDLE
>LS398548|1719098:1761501|1739475_1740042_-|SPR15955.1|DBSCAN-SWA
MRPVVFDFLTNSCNIIKKNSNNNDTIFYNFIGNIIPPEWRKLTGDNGKALSKTSKQLLSFIVFRLHIYYNKDIDELQESYQLYEDKLNVCQRRVRQCLVELRDAGFIEIENRTIIKDNLKLRNVPCIKILKNFQHYSEKGKEENIALPEKTFRPNLKEISGQPETFFRDIYRYIKISKSSMINTFYKK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
1702580:1702621	attL	NA	NA	NA	NA
SPR15930.1|1719098_1719977_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR15931.1|1720086_1721805_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15932.1|1721813_1723250_+	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	3.2e-74	37.8
SPR15933.1|1723484_1724060_+	(p)pGpp hydrolase	A0A291L9W9	Bordetella_phage	7.4e-06	31.3
SPR15934.1|1724094_1724739_+	ankyrin	A0A2H4X2N8	Flamingopox_virus	1.1e-05	27.6
SPR15935.1|1724785_1725292_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR15936.1|1725295_1726105_-	DNA methyltransferase	A0A1S5PRR3	Streptococcus_phage	5.3e-18	26.0
SPR15937.1|1726471_1726750_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15938.1|1726814_1727516_+	histidine kinase	NA	NA	NA	NA
SPR15939.1|1727645_1728224_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15940.1|1728240_1729173_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15941.1|1729191_1729686_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR15942.1|1729727_1730333_+	hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR15943.1|1730471_1730897_-|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15944.1|1730853_1731426_-|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15945.1|1731657_1733349_-	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
SPR15946.1|1733345_1733729_-	type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC	NA	NA	NA	NA
SPR15947.1|1733751_1734279_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15948.1|1734492_1735482_+	ankyrin repeat-containing protein	Q6VZ29	Canarypox_virus	4.8e-13	30.4
SPR15949.1|1735395_1736346_-	conjugal transfer protein TraC	NA	NA	NA	NA
SPR15950.1|1737029_1737167_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15951.1|1737319_1737685_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR15952.1|1737671_1737965_-	peroxiredoxin	NA	NA	NA	NA
SPR15953.1|1737967_1738744_-|integrase	integrase	A0A0U4JNS1	Bacillus_phage	1.6e-16	28.5
SPR15954.1|1738878_1739106_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR15955.1|1739475_1740042_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15956.1|1740150_1740687_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR15957.1|1740667_1740994_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR15958.1|1740997_1741120_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR15959.1|1741119_1741353_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR15960.1|1742504_1743056_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15961.1|1743308_1744301_-	glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))	NA	NA	NA	NA
SPR15962.1|1744363_1745635_-|tRNA	tRNA (N(6)-L-threonylcarbamoyladenosine(37)-C(2))- methylthiotransferase MtaB	NA	NA	NA	NA
SPR15963.1|1745842_1746346_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15964.1|1746485_1746710_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15965.1|1747126_1748053_-	protein translocase subunit SecF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	5.0e-36	37.5
SPR15966.1|1748113_1750807_-	DNA mismatch repair protein MutS	A0A1V0SJ67	Klosneuvirus	5.0e-28	23.7
SPR15967.1|1750859_1752392_-	ATP/ADP translocase	NA	NA	NA	NA
SPR15968.1|1752757_1753615_+	rRNA (cytidine-2'-O-)-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR15969.1|1753616_1754906_-|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	2.0e-99	48.2
SPR15970.1|1754883_1755651_-	twin-arginine translocase subunit TatC	A0A1B1IVR7	uncultured_Mediterranean_phage	8.0e-32	38.7
SPR15971.1|1755631_1755766_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15972.1|1755796_1756393_+	16S rRNA methyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR15973.1|1756399_1757197_+	chromosome partitioning protein ParA	V5UP47	Mycobacterium_phage	2.5e-12	32.1
SPR15974.1|1757208_1758090_+	chromosome partitioning protein	A0A0F7L836	uncultured_marine_virus	2.5e-05	25.3
SPR15975.1|1758384_1758864_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15976.1|1758990_1759347_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR15977.1|1759333_1759600_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15978.1|1759603_1759702_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR15979.1|1760359_1760470_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR15980.1|1760759_1761134_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
1760738:1760779	attR	NA	NA	NA	NA
SPR15981.1|1761087_1761501_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>LS398548|1769568:1814876|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>LS398548|1825059:1921795|DBSCAN-SWA
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MNSNNNDINIAAQFIDQGKLVIFPTETVYGIGADATNDNACQSIYKIKNRPMNNPLIIHVSNIQAAQTIGIFNNLAIKLATLWPGPISLVVPLNQSAGISRTATANLDTVAIRIPSHKVALMLLQLTQKPIAAPSANPSGYLSPTTYQHANIHFQNSPNTFILKGAQSTYGLESTIIDTTTDRPRILRHGFITTEIIKTITGQNPIIAEKHNKLLKAPGMMLKHYSPITKIRLNATKLLPKEVGLNYGPNTLTGKYCLNLSPNSNLMNAAANLYHMLHQLDNYAQNPINEVETIAIAQIPNIGIGIAINDKLNRASSY
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MYNDNSGQATSGMVNQTKIIKPTIDFLLKENNKTVILVGYDENIYSDIINGCDNYSNIKAHTVKRDNLYISIFYHPYDIQETPSNRVYALLNCRKGFILGNKGATIVFNALNYDIQKELEELKHDERFTDNNISILDTDGFIEFINHKPNDEDLDISCAGMVFEAVNSISACVIL
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MDYVIYTFGGGDLLWHVFNGIGRVFASNSEYFTPVGHLALTIGGIWAATRAIFRGNIGIFAMEWFFPSIFIFTLLFAPKSTVWLKDEVSMSAPVKVDNIPIGIAMFASLSSQTSYFVSKMLENHLLPAYEGLSSRKTGIMFGAKAVAKIRDVQIHDPVTLTNTKEFLRQCFMKPYIIGNILGKKAAAQQTNDIIGFIEQNIPNNFGIYYREPSNLGISFKTCRQATPLIKAAIHKELNEGLLTKFAAAIGVQSDQSSMLSQRLKVMTGDTLKYLQREQQDIHEWMKQAMLLNANRESYDDWREKFSLSRIYPNLVSMHAIRGLFQQSFSYLVAGEMAAHMMPILQSVFFALVVSMIFIVFPMGLLPGGYNILKTWILLIIWVSSWPVFFTIIHCLGMISLSSKSGAFGSDYGLNMLSQGSFAEMILYSYATFQMLASSIPMLSWSVIKACAHATANLASQFSPIQVASSLGSNIVDNNLSMDNYSIGNRTISQQNLAPSLHMAAIINDGSIKVTTTDDGRQIINKNVDLLLDNYRSSALLQSGYQNQFVRSQSNLDSLTKKESNLISTGNSITMEIADRITHDEALYIGLTESEYQALQKVGSSSIATTEYTGTSHSKSSSTSTSAGGGVW
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MLKLNDHVKNNKDLLDKSALLVLILDVGAKTQAIVLACLVTIEKFNSGKQVVAFVGLILSIINLVVLYVVLVKSLELLNLDLRKAFK
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MVDKKTRQVICTDFSNGKKHDFRLFKKSKILIHPKVKVITDTGYQGIQKIHNNSELPKKKSKKNPLTKNDKKNNHRLAVARVVNENVIGILKRFKIIADKYRNRRKRFSLRFNLISGIYNFELL
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MTDKINDSNNFNNIHNSKTDIENPKANSLNHNVAIKLINGDIADGIVLLSDNNSLRADNTLKESINQLINDWKNSKFELQDRLIIADHKEAENINQHIRNYMKENGALKGTEYSILISGAESKKYANYMAGDRIVFQTNDKDLQIQNSEFATLVSIDENKFVAKTDTGNEVSFDLNKISFKHGYATTVCNPQTAVKKDIYVLHNDGVGIESSNISMIGNAEQVRLYYNVQATKNVANLIEQLSTAKTDSINAQKLK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SPR16053.1|1825059_1825737_-|integrase	integrase	A0A0M3LQN1	Mannheimia_phage	8.7e-14	28.8
SPR16054.1|1825982_1826291_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR16055.1|1826424_1826625_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16056.1|1827089_1827665_+	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR16057.1|1827702_1828347_+	ankyrin	A0A068ELT3	Penguinpox_virus	1.2e-07	25.4
SPR16058.1|1828449_1828998_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR16059.1|1829001_1829811_-	DNA methyltransferase	A0A1S5PRR3	Streptococcus_phage	9.1e-18	26.4
SPR16060.1|1830177_1830906_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR16061.1|1830927_1831785_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR16062.1|1831885_1832461_+	(p)pGpp hydrolase	B3FJI5	Pseudomonas_phage	7.4e-06	38.6
SPR16063.1|1832466_1832994_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16064.1|1833145_1833358_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16065.1|1833500_1833869_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16066.1|1834088_1834196_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16067.1|1834428_1835523_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16068.1|1835726_1836296_-	preprotein translocase SecA subunit-like protein	NA	NA	NA	NA
SPR16069.1|1836451_1836613_-	preprotein translocase SecA subunit-like protein	NA	NA	NA	NA
SPR16070.1|1837031_1837487_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16071.1|1837840_1839556_-	HNH endonuclease	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	2.8e-85	36.3
1838773:1838789	attL	NA	NA	NA	NA
SPR16072.1|1840114_1841563_-	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
1838773:1838789	attL	NA	NA	NA	NA
SPR16073.1|1841559_1841943_-	type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC	NA	NA	NA	NA
SPR16074.1|1841965_1842667_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16075.1|1842892_1843156_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16076.1|1843178_1843418_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16077.1|1843429_1843987_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16078.1|1844120_1845113_-	conjugal transfer protein TraC	NA	NA	NA	NA
SPR16079.1|1845093_1845423_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16080.1|1845422_1845818_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16081.1|1845832_1846321_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16082.1|1846317_1846470_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16083.1|1846610_1846871_-	conjugal transfer protein TraE	NA	NA	NA	NA
SPR16084.1|1846870_1847167_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16085.1|1847258_1847915_-|integrase	integrase	A0A1P8CWW9	Bacillus_phage	1.9e-05	27.4
SPR16086.1|1848230_1848599_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR16087.1|1849103_1849250_+	replicative DNA helicase	NA	NA	NA	NA
SPR16088.1|1849483_1849804_+	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR16089.1|1850680_1851055_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16090.1|1851066_1851423_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16091.1|1852017_1853025_-|tRNA	tryptophan--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
SPR16092.1|1853579_1853819_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16093.1|1853999_1854347_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16094.1|1854697_1854970_-|transposase	DDE transposase family protein	NA	NA	NA	NA
SPR16095.1|1855166_1858394_-	hybrid sensor histidine kinase/response regulator	A0A1V0SGX0	Hokovirus	3.2e-21	27.2
SPR16096.1|1859442_1860837_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
1860714:1860730	attR	NA	NA	NA	NA
SPR16097.1|1861173_1861548_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
1860714:1860730	attR	NA	NA	NA	NA
SPR16098.1|1861501_1861663_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16099.1|1861753_1861996_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16100.1|1862235_1862475_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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SPR16102.1|1866225_1866384_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16103.1|1867062_1867500_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
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SPR16105.1|1867877_1868114_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16106.1|1868449_1868824_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16107.1|1868835_1869273_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16108.1|1869368_1870325_-	threonylcarbamoyl-AMP synthase	S4VW33	Pandoravirus	2.9e-39	34.4
SPR16109.1|1870314_1872366_-|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
SPR16110.1|1872358_1873237_-|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
SPR16111.1|1873785_1875384_+	Type surface antigen 56 (56 kDa)	NA	NA	NA	NA
SPR16112.1|1875613_1876342_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16113.1|1876509_1878018_+	UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
SPR16114.1|1877986_1878898_+	UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase	NA	NA	NA	NA
SPR16115.1|1878875_1879850_+	D-alanine--D-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
SPR16116.1|1879842_1880673_+	cell division protein FtsQ	NA	NA	NA	NA
SPR16117.1|1880690_1881827_+	DNA replication/repair protein RecF	NA	NA	NA	NA
SPR16118.1|1882241_1882598_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16119.1|1882609_1882984_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16120.1|1883817_1883967_+	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR16121.1|1883995_1884121_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16122.1|1884194_1884371_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16123.1|1884382_1884634_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16124.1|1885406_1887074_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16125.1|1887634_1888270_+	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
SPR16126.1|1888428_1889232_+	ankyrin repeat-containing protein 16	A0A0G2Y2X3	Acanthamoeba_polyphaga_mimivirus	7.1e-07	24.2
SPR16127.1|1889416_1889950_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16128.1|1890131_1891025_+	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR16129.1|1890978_1891434_+	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
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SPR16131.1|1893315_1893450_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
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SPR16135.1|1896267_1897536_-	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
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SPR16140.1|1903724_1904417_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
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SPR16142.1|1904941_1906237_+	ankyrin repeat-containing protein 14	NA	NA	NA	NA
SPR16143.1|1906787_1907411_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16144.1|1907562_1908090_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16145.1|1908095_1908671_-	(p)pGpp hydrolase	B3FJI5	Pseudomonas_phage	7.4e-06	38.6
SPR16146.1|1908771_1909629_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR16147.1|1909650_1910379_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR16148.1|1910729_1911446_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16149.1|1912339_1912843_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR16150.1|1912889_1913519_-	ankyrin	A0A068ELT3	Penguinpox_virus	2.1e-06	26.9
SPR16151.1|1913758_1915195_-	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	4.3e-71	37.2
SPR16152.1|1915203_1916883_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16153.1|1917091_1917274_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16154.1|1917382_1918426_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16155.1|1918468_1918795_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16156.1|1919027_1919414_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16157.1|1919410_1919563_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16158.1|1919566_1919962_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16159.1|1919961_1920285_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16160.1|1920568_1920745_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR16161.1|1920958_1921795_-|integrase	integrase	H2BDA3	Pseudomonas_phage	5.7e-07	23.7
1927676:1927693	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>LS398548|1937045:1992703|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_24

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MLHQKLMQDKAMLAEKHFNVGISFLKLNKYQEAIENFNLAIKYKPNDAEAYVNKGFCLGELEQHQEEIENYDLAIKYKPDYAEAYYNKGVCLNELKQLQKAIENFNLAIKYKPDYAEAYYNKGVCLNELKQLQKAIENFNLAIKYKPDYADAYYMKGVCLNELKQLQKAIENFNLAIKYKPDYADAYYMKGVCLNELKQLQKAIENYDLAIKYNPNHEDAYYMKGVCLGKLKQYKEAIENYDLAIKYNPNHAESYYYKGVCLGQLEQYKEAMGNFNLAIKYNPNHEDAYYNKGICLSKLEQYKEAIESFDLAIKYNPNHVDAYCNKGVCLSKLEQYKKAIESFNLAIKYKPNHSFAYYMKGFCLYRLGQHQEAIVNFDLAIKYDPNNGTLYKLINILKQEIAGIKKQS
>LS398548|1937045:1992703|1976021_1977968_+|SPR16223.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MIDIILPDGSVKQYKVGVTGQEIIQSLSISLFKKTIAVEVNNELMDLYIPIINTATVKAITIDSVQGIEILRHDTAHILAQAVKKLFPDTQVVIGPVIKDGFYYDFARDKPFTSKDLEIIEQEMQDIITKNDLIKREVWLRAKAIEFFKQQKEFYKVKLIEEIPESEEISIYRQGNFVDLCRGPHSPSTGYCAKYFKLTKVSGAYWRGNSKNESLQRIYGTAWGKKSDLESYLHRLSEAQKRDHRKLGRELELFHFQDEAQGMPFWHSKGWTIFKIIKDYISCQIQRAGYIEVNTPMVLNQKLWEKSGHWEKFRENMFTLDTNAAEQDHNLIKDSIETKCALALKPMNCPGHIQIFNYTIKSYRDLPLRMAEFGSCHRYEPSGALYGLMRVRSFVQDDAHIFCTEDQITDETIKFCHLLKQVYQDFGFPEVKIKFSDRPEKRAGTDKIWDKAEQALIHAIQTLGEEYTINRGEGAFYGPKLEFILTDAIGREWQCGTLQVDFVLPERLNASYISSEGSKKRPVILHRAILGSFERFIGILIEHYSGKLPIWLAPIQVAVVSITDEAVNYAKQLHQELIDNNIRSTLDISNQKINYKIRNFFTAKVPLIAILGKKESESGKIAIRTLGSQEQQVISSSELIAHIRKNKK
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MSNSKFNITISDTVYKRIHELNEEANEQQPLMLRIRVDAGGCSGFIYEYDLVMDYEPGDFIAKKDNAIVVIDSLSQSFINGAIIEYIEELGRSYFKITNPAAQAKCGCGNSFAL
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MGCGDLILNIIAEHETMLKRLTELKNFTGVKEYEQKLQILKKYS
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MKKLKEVINSYFAKLSLLNRVDQISRVQQAQIRPPIIRGLINEIVDNEVRREYYLKIVKDADVITDSITHYQSIFTKQRVEKEVKDIPNKIERAMLVQQVLSSSRVLELYHDDGKISKYFTTVEVRNEEARIIRMANKINDQVYYKDIYNLKNDIESLTNVSEEQKQALKHILLSTSGVRVLRGRAGTGKSHVLAAVYKLAINCGQNIIGLAPTHKAVSELKSKGYKECNTIKGFLYNQRNTVTKDILIVVDKAGMVGTREYAELFKVVRNNNCQLILVGDERQLASVERGGMFEILANTYDSHVLTDVRKQSENWSREVAEKFAEGNILSGITLLKQNNCIEFANTLQDSMNKLIYDWSHGKCKLQEKLIITVRNKDVDKLNLNIRSLLKANSTLKGHEYSRSIAKKQESYMTGDRIVFQTSDKDLQIENSEFATLVSVNKNKFVAKTDTGKDVSFDPSKINFKHGYASTVYKAHGASIKDVYILHNGVSNISSSYTAMTRHVEKLRLYCNRQATESFNSLIYQISNPNDKSASITLKTAEDLKQEQKQKKTNCFSKICNWVKSIVTDINDRSHVNEEYYQFTPKPEQSAKVERVQQENSIKLQSDKDIATPSFTQIKEQRWYDYDVTILSEEAAILSLQKVGIDSRMVYVSTVSDLKYYQPFQGEKILIAANNDKQNKEYVSTINEVAQILERKGAITSIVMPLEDKNFNEMLKNKGMIAVKELVIPEVIKLVKVEYQNIH
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MANLMQQKITLQQKKAKLIMDEVNLKIKERKMRTRRLIEMGGLVAKAKLDHLSTNTLFGAIVSLKETLTQHPNVQDQLDYNR
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MNILLLKFKQLISRVIFKSSIIIYLGKIGASIVVISNNSIIEDMFLTYDTDGVHKFNKFQELLNRYAGYSVSILIDLPEIKLQQEFLIAIETGIKKNPVDNYIKQHFGSNSIIGYYILNITYNGSELWQAQIASIELNHIIKTFVDEIIVRSEITFSGLFLCPLEIPKIIHTLLKSNIKTICNIMQHIANSTVFQITKTQYISLQQTNYLTTKTKLFKKAYENNIILIVCITKANGITFCLFNQQNIIFSNTIPYCATKSPEYIYGILKYESNEILSSFKLYILELNKKVIIHYLVDEQIQKFIENDSNSYTDTIITTIPNTYSDQLISQLFNYCSIRCAYNKYLDEFNKLRKFNSVFLRFVLIAVIILCSSLIRTWYKVFVQKKALANFYEQINTISANQHKAELELAASYNISSDIIESYYLDKHINSKHYTIALDALKLLLHDPNIEIQKITYTLNEQLPRNELLMSIEVKFYYLNNTTVNREDCLIQLEKYNANIIETFKNYEVNLTSLGQEICSHSNVSRKLLTMSISRIVN
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MHVIIQNIEIKQGIIMNPFSIAAAKALSFATESMSDAVECVNKIMLNSVSANCNVTTFRKIPPADELFASTDSILACNSSKIDPYRYLGNTMDSIRMFGITYNPDLLHECTGQEVLTSSNAISCEKNELLYEHNVPNYDDSIQNTVVRYCISSCKIINCNLIKLKEFCSGMGCDNYDNTTYSSVNFVNVTTSPEEENFFTSATATVAGVIVPWIVPTVLAVSGGIALYGIYHLRSSKNKTSSLPVNSVDVGTNANTSVKNLNAEKISTDFLDNDAQAHLYEDLKTYKCEEAAYDDTALPISGGQDAIRAEAV
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MEQDNSDNNNTKEEDLELNDKPKAESGVRSNSKLSELTNIIRRKPVIALTFISITIMVVSFFLSESGKTKESIIFIENRESREAISGIEQAVDLRAKWTEEILNEVKTLKDRFENVTESRYLEITAQINNFNQKLEILENQPKQSLYNNDSDEFSSDLNHHILNSPHDNKTEQAPVVVKPYVNLRRAESEQKKC
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MRRSFISTNKSSGYLKVNGEIKAKQVRLIDESGNMIGITSLSEAISKAEMAGLDLVEFSQSDLPLCKILDYSKYKYEIKKKAQQAKKKQTKVTVKEIKLRPNIADGDLAIKIKSIKQFLSKNNKVNISVIFKGREIVHAEFGRQILDNIIDVCQVEGKIDSPPKMQGQVITMTMSPNIIKT
>LS398548|1937045:1992703|1962892_1963216_-|SPR16212.1|DBSCAN-SWA
MLQLRLKVIMQNQKLCWALSRPLKYMGLSIDEWGVVLAGVAPGIVLLNSRHAKLGLAFMVGGIALCYCFKKFKKVPENFLLKSFLVAKGLLPAPLGYSRLLGKKVGK
>LS398548|1937045:1992703|1945865_1946123_+|SPR16188.1|DBSCAN-SWA
MQNYNPGPKEKIILAVKNDVNTEKAEKVLEDKGAVVCTVKNDFNNVLKTQGLYAVRNIISPEIRKLNEKIESIQTNIQPGLCLKH

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SPR16178.1|1937045_1937972_+|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	5.8e-85	62.0
SPR16179.1|1938039_1938315_-	conjugal transfer protein TraD	NA	NA	NA	NA
SPR16180.1|1938613_1939552_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16181.1|1939609_1939849_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16182.1|1939817_1940066_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16183.1|1940345_1941605_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR16184.1|1941650_1942361_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR16185.1|1942417_1943185_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR16186.1|1943333_1945559_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR16187.1|1945572_1945665_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16188.1|1945865_1946123_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR16189.1|1946174_1947194_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16190.1|1947203_1948451_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16191.1|1948452_1948959_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16192.1|1948964_1949099_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16193.1|1949085_1950981_-	conjugal transfer protein TraG	NA	NA	NA	NA
SPR16194.1|1950980_1952282_-	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR16195.1|1952278_1952995_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16196.1|1953006_1953159_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
1953094:1953111	attL	NA	NA	NA	NA
SPR16197.1|1953121_1953568_-	Uncharacterised protein	I6R0L8	Salmonella_phage	7.9e-24	43.2
SPR16198.1|1953671_1954898_-	TPR repeat-containing protein 03	NA	NA	NA	NA
SPR16199.1|1955157_1955289_-	type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC	NA	NA	NA	NA
SPR16200.1|1955311_1956256_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16201.1|1956289_1956463_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16202.1|1956553_1957213_-	type-F conjugative transfer system protein TraW	NA	NA	NA	NA
SPR16203.1|1957209_1958859_-	conjugal transfer protein TraC	NA	NA	NA	NA
SPR16204.1|1958830_1959703_-	conjugal transfer protein TraC	NA	NA	NA	NA
SPR16205.1|1959683_1960013_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16206.1|1960012_1960486_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16207.1|1960767_1961352_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16208.1|1961394_1961724_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16209.1|1961868_1962345_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16210.1|1962341_1962494_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16211.1|1962497_1962893_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16212.1|1962892_1963216_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16213.1|1963499_1963676_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR16214.1|1963889_1964738_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR16215.1|1964808_1965072_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16216.1|1965156_1965447_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16217.1|1965816_1966302_+	RNA pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR16218.1|1967366_1967486_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR16219.1|1967699_1969931_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR16220.1|1970422_1973065_-	preprotein translocase subunit SecA	NA	NA	NA	NA
SPR16221.1|1973310_1974342_+	peptidylprolyl isomerase	NA	NA	NA	NA
SPR16222.1|1974430_1975762_-	bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase	NA	NA	NA	NA
SPR16223.1|1976021_1977968_+|tRNA	threonine--tRNA ligase	A0A2K9L6B6	Tupanvirus	8.9e-120	38.2
SPR16224.1|1977978_1978524_+	translation initiation factor IF-3	A0A2I7S9Q1	Vibrio_phage	2.9e-12	35.2
SPR16225.1|1978690_1979137_+	deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase	A0A2R8FFV2	Cedratvirus	2.6e-35	55.5
SPR16226.1|1979231_1979777_+	ATP synthase subunit delta	NA	NA	NA	NA
SPR16227.1|1979819_1981358_+	ATP synthase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
SPR16228.1|1981372_1982263_+	ATPase	NA	NA	NA	NA
SPR16229.1|1982273_1982906_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16230.1|1982907_1984521_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16231.1|1984653_1987320_+|tRNA	alanine--tRNA ligase	A0A2K9L3D8	Tupanvirus	4.0e-70	37.5
1987027:1987044	attR	NA	NA	NA	NA
SPR16232.1|1987484_1988942_+|tRNA	glutamate--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
SPR16233.1|1988942_1989287_-	iron-sulfur cluster assembly accessory protein	NA	NA	NA	NA
SPR16234.1|1989452_1991225_+|tRNA	arginine--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
SPR16235.1|1991236_1991992_+	SPOR domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
SPR16236.1|1992285_1992420_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16237.1|1992397_1992703_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>LS398548|2001865:2054484|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_25

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MLTLLKKYSVAILCSILLTCSFSCSAIDINTALTNAYKNSVKFKLLQDEFLQQANQYQKIYTSFIPEVHASVVSGERYHNPSNRFFSNDWFPATNNLHRLQSPNVFTPKAELTISHNLFNGGQDIIKLKTIKQKSYAAKEKFYNDEQELIYEGIETYLNYYSFLETSKLYEAKVHYFQKMLEIEKQKLDLGESTSVSVANAQVQLSKALSEHIASITAVQNLEKKFYNFFGILPSNIELPRISNDLENSETALMNSALNNSFVLNYYKNQILEQQLKVKFCRAAVLPKINAQFSVISPLPFQPERSTATFAVEMRIPIFNHNTAFLDSRTEIRALNMLISQYKDKLEQIKMSVASEWKQYNSIKQQIEYSDDYVKFATIALSATQHEYELGNIRITDLLKAQNNFYDSKIENIKVNVALLKHMYKIKQLTNKLTAKSLNLKVNYFIPEQKQKFKKTL
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MIDFYSESLINKLFRTNIRFNTKIDLDRVEKAILYAKKYHCQQKRDT
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>LS398548|2001865:2054484|2024655_2025234_+|SPR16268.1|DBSCAN-SWA
MIDFYSESLLNKLFETNVRFNTEIDLDKVEKAIFYAQKYHGQQKRDTGELYYTHPLEVAYMVADYSFETDTIITAILHDTLEDTTLTKEKIVKVFGRKLQNRFQILPRLRIIKKISSREMIQTLYNRNKTELLLIKLFDRFHNIQTVSIKPYEKRQEIILETQQEFIPLAEYLKLPEIAIELNKYCELYTTK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
1993090:1993129	attL	NA	NA	NA	NA
SPR16248.1|2001865_2002630_-|tRNA	tRNA (guanine(37)-N(1))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR16249.1|2002676_2004527_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16250.1|2004528_2005092_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16251.1|2005142_2006516_-	transporter	NA	NA	NA	NA
SPR16252.1|2006859_2007789_+	site-specific tyrosine recombinase XerD	A0A0K2CP59	Brevibacillus_phage	7.0e-30	29.8
SPR16253.1|2007826_2007997_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16254.1|2008123_2008600_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16255.1|2008594_2009317_-	surfeit locus protein 1	NA	NA	NA	NA
SPR16256.1|2009556_2010042_+	beta-hydroxyacyl-ACP dehydratase	NA	NA	NA	NA
SPR16257.1|2010060_2010633_+	SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR16258.1|2010632_2011988_+	DNA repair protein RadA	NA	NA	NA	NA
SPR16259.1|2012025_2012946_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR16260.1|2013095_2014994_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16261.1|2015039_2016968_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16262.1|2017990_2018230_-	reverse transcriptase	NA	NA	NA	NA
SPR16263.1|2019616_2019880_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR16264.1|2020013_2020190_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16265.1|2020283_2020772_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16266.1|2021303_2022587_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16267.1|2023730_2024555_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR16268.1|2024655_2025234_+	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR16269.1|2025352_2026267_+|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	2.6e-85	60.5
SPR16270.1|2026345_2026609_-	conjugal transfer protein TraD	NA	NA	NA	NA
SPR16271.1|2026904_2027165_-	TPR repeat-containing protein 08	NA	NA	NA	NA
SPR16272.1|2027267_2027912_-	ankyrin	A0A2H4X2N8	Flamingopox_virus	8.3e-06	26.3
SPR16273.1|2027946_2028342_-	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR16274.1|2028378_2028522_-	(p)pGpp hydrolase	NA	NA	NA	NA
SPR16275.1|2028755_2030204_-	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	3.7e-70	36.6
SPR16276.1|2030212_2031013_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16277.1|2030972_2031308_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16278.1|2032793_2033213_+	nucleoside-diphosphate kinase	D2E8E1	Anguillid_herpesvirus	1.4e-17	37.4
SPR16279.1|2033482_2034418_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16280.1|2034570_2036421_-	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR16281.1|2036686_2037469_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR16282.1|2037525_2039538_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR16283.1|2040221_2041457_+	reverse transcriptase	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	2.3e-65	37.7
SPR16284.1|2041559_2041937_+	HNH endonuclease	NA	NA	NA	NA
SPR16285.1|2042146_2042602_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16286.1|2042699_2043266_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16287.1|2043529_2044063_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16288.1|2044246_2044684_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16289.1|2044695_2045070_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16290.1|2045123_2045267_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR16291.1|2045397_2045598_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16292.1|2046355_2048200_-	RNA polymerase sigma factor RpoD	A0A2I7SAT0	Vibrio_phage	1.7e-35	35.2
SPR16293.1|2048183_2049959_-	DNA primase	S5M810	Pseudoalteromonas_phage	2.7e-14	45.3
SPR16294.1|2050398_2050599_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16295.1|2051386_2052547_-	DNA-processing protein DprA	S6BFL3	Thermus_phage	2.7e-23	33.8
SPR16296.1|2052587_2053190_-	peroxidase	NA	NA	NA	NA
SPR16297.1|2053521_2054484_+|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
2055087:2055126	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>LS398548|2057725:2104519|DBSCAN-SWA
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MSIINFSSRLKHNITFFAKESNTSRWIEVLSCFAEIKALYRYKPIITQNLTFGNLTTEDYYLFTIRFSSAICINMRIKFAQRRFEIHRIINPLEQNHNLEIFAFELHHNKEPA

Homologous phage analysis in the prophage region

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SPR16304.1|2060945_2061746_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16305.1|2062023_2062347_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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SPR16350.1|2100442_2100817_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16351.1|2102648_2102936_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16352.1|2103566_2103851_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16353.1|2104315_2104519_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>LS398548|2126212:2231773|DBSCAN-SWA
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MNNNDLLLEFRHASAEGNVERVKQLLAQYNAGDIINALYGIGFTLHEAVINDDINLVRLMLDSGADPNEQRGYGATPLHVAIWYNRVDIIYLLLDKNANINAQNRDGRTPLHVAACHGMNDIIMQILPNSVANINLQDDYGKTLLHFAARSGSKDLVEFLCNRN
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MINFYSESLLNKLFETNVRFNTEIDLDKVEKAIFYAQKYHGQQKRDTGELYYTHPLEVAYMVSDYSFETDTIITAILHDTIEDTTLTKEKIGQEFSHNIAEQVSDLTRIKDNKKNQF
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MKFTSYNIAALWSYIKKGDIRAIAVYGNDHGLIDYRCQEIIKLFNANLRIYDYRELTEADFIFILNSNNLFSQREIVKIYNTPGNINAALKKALTFNNKNFLIMLGSEFSTSSTTRQWFETQKYLAALGCYTENSQDIKKLLSQIVNKAGKNITAEAAVYFSNTAYGDKYCYINEINKLILYCHDCDTISKQEVNKCISSEILGTADLMCIYFAKGLAMNFFKEVEKIRNNNIPDVWMLRALIRYYINLYIVLMKREHGVSIEQAVKLIQPPIFFKYVQDFQLIAQTKTLNNVLHTLNELYMAELSVKTTHHYINNIIEVVFLKITHKLRLSFEFTTLV
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MSVKITKGNKSNISVASVFSKGLSGKLLADKAYISKELFHQLLTNGLRLLTNLRKDMKTYLLDIQDKRLLNKRSLIESVFNVLKKHMHLEHTKHRSPFNFFVHIIASLASYSISKLNPHLISSSSPDFLS
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MVDKKTRQVICTDFSNGKKHDFRLFKKSKILIHPKVKVITDTGYQGIQKIHNNSALPKKKSKRHPLTKNDKKNNRRLA
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MRFEHRKKRYKLIESVGYKVIFLLPYSQDLNLIEKFLANMKRWIRNQITQFSKFYESITASFYVQTLLYMTIYPPIAHRQHIYALYGKKIYSQ
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MLIFLQVLVHNTILNNLNIDHCNTCIYISLFLTVSYSKFAFANMRAISKWLSIFNISHNYNCTLSLVYLLYYAFPAFSYPKLAFIILHYLNQFRKRSNKRSLIESVFNVLKKHMHLEHTRHRSPINFFVHIISSLASYSISKLNPYLISSSFSSNPLS
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MIGEDGRFGIKGIVVNKSSKVVKMAALNGVFSSMAKFRQAKAIKPDMTTAPTLNIMTPGQAQSELSVGDALQSGAYAGASNAFDKLADFAIKRADSIFLKCQRMTAQSL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
2125898:2125931	attL	NA	NA	NA	NA
SPR16370.1|2126212_2126383_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16371.1|2126579_2128877_-	ankyrin repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
SPR16372.1|2129049_2129475_-|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16373.1|2129431_2130004_-|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16374.1|2130232_2130349_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16375.1|2130356_2130713_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16376.1|2130934_2134372_+	sodium:proline symporter	NA	NA	NA	NA
SPR16377.1|2134984_2135860_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16378.1|2136191_2136356_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16379.1|2138291_2138381_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16380.1|2138639_2139038_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16381.1|2139025_2139403_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16382.1|2139906_2140575_+|integrase	integrase	A0A0M4R586	Salmonella_phage	3.8e-14	27.9
SPR16383.1|2140718_2141042_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16384.1|2141041_2141434_+	conjugal transfer protein TraE	NA	NA	NA	NA
SPR16385.1|2141442_2141595_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16386.1|2141591_2142068_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16387.1|2142212_2142542_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16388.1|2142584_2143169_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16389.1|2143450_2143780_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16390.1|2143749_2144685_+	conjugal transfer protein TraC	NA	NA	NA	NA
SPR16391.1|2144681_2145341_+	type-F conjugative transfer system protein TraW	NA	NA	NA	NA
SPR16392.1|2145426_2145603_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16393.1|2145636_2146581_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16394.1|2146603_2146987_+	type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC	NA	NA	NA	NA
SPR16395.1|2146983_2148672_+	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
SPR16396.1|2148681_2149176_-	ankyrin repeat-containing protein 09	NA	NA	NA	NA
SPR16397.1|2149334_2151029_-	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
SPR16398.1|2151025_2151409_-	type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC	NA	NA	NA	NA
SPR16399.1|2151431_2152112_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16400.1|2152443_2154603_-	conjugal transfer protein TraC	NA	NA	NA	NA
SPR16401.1|2154583_2154913_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16402.1|2154912_2155095_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16403.1|2155203_2156247_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16404.1|2156289_2156616_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16405.1|2156847_2157234_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16406.1|2157230_2157383_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16407.1|2157386_2157782_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16408.1|2157781_2158105_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16409.1|2158208_2159225_-|integrase	integrase	A0A0S2GLI2	Bacillus_phage	1.3e-10	24.3
SPR16410.1|2160459_2161950_+	carboxypeptidase M32	NA	NA	NA	NA
SPR16411.1|2162053_2163418_-	magnesium transporter	NA	NA	NA	NA
SPR16412.1|2163607_2164627_-	DNA polymerase III subunit delta	NA	NA	NA	NA
SPR16413.1|2164646_2167166_-|tRNA	leucine--tRNA ligase	A0A2H4PQS0	Staphylococcus_phage	6.3e-158	38.3
SPR16414.1|2167785_2168517_-	intradiol ring-cleavage dioxygenase	NA	NA	NA	NA
SPR16415.1|2168895_2169003_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16416.1|2170002_2171466_-	exopolyphosphatase	NA	NA	NA	NA
2169050:2169083	attR	NA	NA	NA	NA
SPR16417.1|2171701_2172094_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16418.1|2172251_2172488_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16419.1|2172499_2172604_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16420.1|2172694_2172937_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16421.1|2172971_2173199_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16422.1|2173244_2173367_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16423.1|2173574_2175287_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16424.1|2175295_2176732_+	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	2.5e-71	37.4
SPR16425.1|2176971_2177601_+	ankyrin	A0A068ELT3	Penguinpox_virus	2.1e-06	26.9
SPR16426.1|2177647_2178151_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR16427.1|2178831_2179614_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR16428.1|2179714_2180296_+	(p)pGpp hydrolase	A0A292GI44	Xanthomonas_phage	1.4e-07	26.6
SPR16429.1|2180662_2181601_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16430.1|2181658_2181898_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16431.1|2181866_2182115_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16432.1|2182392_2185215_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR16433.1|2185747_2186224_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16434.1|2186443_2187004_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16435.1|2186981_2193641_+	Uncharacterised protein	Q9JMP0	Wolbachia_phage	1.2e-38	34.1
SPR16436.1|2193989_2194865_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16437.1|2195030_2197088_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR16438.1|2197263_2197416_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16439.1|2198377_2198611_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16440.1|2198687_2199512_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16441.1|2199583_2199886_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16442.1|2200042_2200192_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16443.1|2200206_2200383_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR16444.1|2200434_2200995_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16445.1|2201010_2201973_-|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16446.1|2202128_2203016_+	ankyrin repeat-containing protein 16	NA	NA	NA	NA
SPR16447.1|2203264_2203918_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16448.1|2203914_2204808_+	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR16449.1|2204761_2205217_+	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
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SPR16451.1|2207098_2207233_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
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SPR16453.1|2207746_2208994_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
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SPR16457.1|2212381_2213182_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
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SPR16459.1|2216568_2218284_+	HNH endonuclease	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	6.3e-85	36.3
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SPR16469.1|2225638_2226355_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16470.1|2227248_2227752_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
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SPR16472.1|2228667_2230104_-	replicative DNA helicase	A0A218KST2	Xenohaliotis_phage	7.4e-71	37.8
SPR16473.1|2230274_2230670_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16474.1|2230792_2231188_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16475.1|2231491_2231773_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>LS398548|2235679:2292785|DBSCAN-SWA
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MTEIPICIIFPSQNIEKLLLMLASSIKSARIIGGAIRNIILGHPVNDIDIATPLLPDQVMDLLKLNNIKCYATGIKFGTVTAVIKQEKFEITTLRQDMQCYGRYAKVEFSNDYFEDAKRRDFTINALSYSFEQSLLYDYFNGLQDLKDRRVIFIGDSDTRIQEDVLRILRFFRFSSYYARSIDQEGYQSCAKYAKSLSILSKERVVQELSKIIISPNAYETLVKMAEINITYYIGLRLKLNLSVFKNVTTIAKKKSILLNVIVLYSVLLSSNDVQDLKEILSNLRFSKAMIRKIVRLCLFLSECQSKNAIFLIRKYWLTRADNIDDYINLALLLGCISDEEANMLKQQVYELTPKLPVSGSDLKELGFKKQAIQEVLLYLNHAWINSDFTLNKQELIDLLKL
>LS398548|2235679:2292785|2285495_2287814_+|SPR16525.1|DBSCAN-SWA
MNKFVWFSWAVVLLANLSFGSIAVADKIESIEVIGNQRIEKEAIISKLGVSTGDELNPEKENDILLTLHYTKFFKDVSLDFIDGKLTVKVQEAPLVTEVKLVNDSGAITKKVLLTMITIKAGDMLIDSDLQENITRLTEEYKSAGFFLVKVTSEIDNVNNGGVVLTFKITEGPRVFIKKILFVGNDYYSDKKLSSVILCKEKSWSNFASPLTLYNVMYIENDKELLQQFYRNSGFMNCNISSSVELSPAKDSVVITYIIDEDKRFYLGELSLETSISSINSKELSKFLKVEPNTLFNSADLHSISQKITDVLQKQGLYQVRVYPKFRYRADSSSVVDVVFVIDFDKEIYIRNINISGNTITQDHVIRREIELIEGDALSERKLETTKKNISRLSFIDDVSISMVPVTDSDYCDVLVKIKEGRNLRSIGLSGGYNSITGLTGSFSFSWDNIMGTGRLINGELSVAKKSSSQAISIIDPNFNGSGFVGKLHLFHFGKDPINSESTTRASIKKYKGEYYSHNVFGAGFEVDRKLTEHFIGTLGYTIKSDKGETISDEIIQQIYGEKHDFLYSIIDGAITYNRTDNFRRPKNGYLMRYGVSFSGLGGTVKYLKNTVMAKFLKSFLDNKVTFMFVTRFNNIRGALGEEVKVYDLLKVSQDHLRGFTGIGPKIQAIDLRIGGTNSYTASAELFVPIGLPDELNARGSIFMDVGSVWGGDNIGIINRVTDSEKFNLRASIGIGLTFDIIGQPIKFFYAVPIKRENYDEVEKLGFTLGFI
>LS398548|2235679:2292785|2236126_2236285_-|SPR16481.1|DBSCAN-SWA
MLTFINIYNQSSILTINIFAIFVNITKKLKQKVENMLKKKFRKLGASFQSRG
>LS398548|2235679:2292785|2269864_2270392_-|SPR16512.1|DBSCAN-SWA
MKAKNNEIIFTLISLIVSMLILSFASVPIYSLFCKVTGFGGTVRQQIASSKKKGKKQITINFDANIEQNLQWQFIPKQKSITVTTGENNLVFYYSRNLTNRDIVGTAIYNVTPNKAGKYFVKIYCFCFEEQLLKKQEEILMPVSFYIDPAIEDDPYMNDVNTITLSYTFFKIREQ
>LS398548|2235679:2292785|2252168_2254625_-|SPR16492.1|DBSCAN-SWA
MGFIHKFLHSRKIDAKQFDSNAQNFIPITCHYNDETLLTKNGELIQILQIKGINSEYTNKDLLGIRAAIRNAIKNHINNSNFAVWIHVVRRCDNIDDSTPYSQALPNFIHNIWSKKNYWQDKFVSTLYISIVHHGCNLNIRNLDSFLNSLSFKTLDSFYDKFIASALKNLSMAINNIITELQRYNPCKLSIKIDNNKVYSDLLNFYKKIIQLNTGLIEVKDVDCAVQLATHKYSFGGDKIEVIHKQEKKFASILGIKEYQDIKDELVSKCLHAPVEFIATEIFYFADQVKAINSYSQQSKIISASRDSELALFKGIEPIVNSDNTLPQFCHQQISIMIMADSIDLLESRVAYISQRLVKQGIIHVREDINLAQTFWSQLPGNFNYIRRVSYNIIDNVAALAALHHYPVGMQHSRWGRSVTIFRTECGTPYFMNFHDESAKGHTCIIGGAQSGRATIANFLLSEASKYSPTILYLTNRNNAQVFIKGIEGTWYNGRDLPFNPLSYLESSDDLLELFKIITGNYFNNLTDSEIECITELAIAVMDMPPESRSLIKIIKDFNFKAYSAGASVKKRIKLFISDDKCSKIFNQSSTLELQDNNVTAINLADYTDYQFNQSYTPQVGEKPEIYHNKLQTLHCLRSGIIFSLIKKFSLLASPEPKILVVDNMPDLIVEQVFMNLIKQITEQLSENNGIILSVVQVNQNDQFYYSDFWKKWLKFNNTKIILPTNIRNLPIAEICNLSTREAKKFNTISPNSRLFMVKQDNNYVIVELNLEGFPAIRKLLSAEEDDLNLFHKIMQKIGDDAPSAWLSDVYDQFQNSE
>LS398548|2235679:2292785|2280585_2280894_+|SPR16520.1|DBSCAN-SWA
MSTNNQEREALNKAEFVNFIHKNNTNMTKADIERALNLILRGVEKAIENGHDINIVGFGSFCVRFRAARDGHNPKTGAKIIIPESYQVVFKPGKTLKDACNN
>LS398548|2235679:2292785|2279153_2280050_+|SPR16519.1|DBSCAN-SWA
MIFFKLKLFRLSVIAFLIFNYCSINIIFAQKKLRIVTSNIPIAAIVKAIVKDLAKVESLEFGQTGCSHGYQLRPGDIYKVQSADLIIYIDDRFEHYMTKLSSFFQSQVIRLSEIEGISLIHNRASTNWHIWYDINNVKLISLELYKLFEKQFDSYARQMLFENYQKLIVQLNIIQEKQIDLFKILSTDIIVLDSAIEYFFNCNKAKVVKVPTNCHGAVTLSAMQQIKSLSKERSLCLILGQRHEITHLSVLFNNKIKVVRLESEMCPTKEGIDDKLILSKLYDIIAKLHDCLPHGNGS
>LS398548|2235679:2292785|2284421_2285483_+|SPR16524.1|protease|DBSCAN-SWA
MFLVTTILSFVITTGSLVFVHELGHYLCARVCGVYVQEFSIGFGREIFAFVDKNLTRWKICIFPFGGFVRMEHHLQDSTSDRRSYNNQPIINRMLIVLAGPAANFIFAIVALTFLNSFYGKYIVSSVVDHVISESAAEKAGIMKSDIITEVAGVKVHDFLDLVQVVFNYPEVPIELVLERENKLMKINVVPHAKLYKLNDSEIRLGDLGVRGKLIRIKSSFIDSILESVNYTFGVSKLILIALWQKLTGKDAIAEIVGVVGIAHESSKAMCRSIDSFLLFLVNLSISLGVMNLLPILPLDGGRFLYLIYEMIVGKGSINLMVYNIAMKIGVAIIIFLIVISISNDIKNLLLKF
>LS398548|2235679:2292785|2292112_2292355_-|SPR16533.1|transposase|DBSCAN-SWA
MKFDQIKELKDEKFSRLTGVSKETFSKMVNILRKANGLKKSKGGRKNKLNLEEQLLMALEYLREYCTYFHIGQNYGISES
>LS398548|2235679:2292785|2235679_2235889_-|SPR16480.1|integrase|DBSCAN-SWA
MKKTTNLCKVVQWLRGRKSHSGRATLYVEQKFNNQSLKIKIVVFPNLSIKEARYLPKIHAISLRPCTVY
>LS398548|2235679:2292785|2292662_2292785_-|SPR16535.1|transposase|DBSCAN-SWA
MSVKITKSNKSDLSVSSFFSKGLSGKLFSDKAYISKELFH
>LS398548|2235679:2292785|2265320_2266400_+|SPR16506.1|DBSCAN-SWA
MSFTVHLNKILQKYQDLEADLNGGKLDNKELALISKEYSNLKPIIEKLNRYLKAHENIKYLQQVIDTEQDLELKSIAEVELYDTLNYLPKLEEEVKISLLPKESDDHKNAIIEVRAGTGGDEAALFAASLFQMYNKYAERKKWKFELLSISDTEIGGCKEASALISGNGVFANLKFESGVHRVQRIPKTESNGRIHTSAATVVVLPEAEEVDVKIDAKDLKIDTYRASGAGGQHVNTTDSAVRITHIPTGVVVSQQDEKSQHKNKAKAMKILYARLYDLEKQKSQQEQAMSRKVQVGTGDRSERIRTYNYPQGRVTDHRINLTLYKIEEIIQEGKLDEIINNLISENEAKKIADSNIQF
>LS398548|2235679:2292785|2257230_2257524_+|SPR16495.1|DBSCAN-SWA
MIVIVYNLDDAIKELNSIHVPVIITNPPGSIKYLGALTIDYLFKILKNKFNNISKVIINVEDDIPALFTLLKLNYSRSEIFYTGSSESAKKLLQLYN

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
2231290:2231313	attL	NA	NA	NA	NA
SPR16480.1|2235679_2235889_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR16481.1|2236126_2236285_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16482.1|2236317_2237349_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16483.1|2237626_2237806_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16484.1|2237884_2238142_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16485.1|2238161_2242280_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16486.1|2243191_2243524_+	iron donor protein CyaY	NA	NA	NA	NA
SPR16487.1|2243516_2245244_+	ATP-binding protein	W8CYL7	Bacillus_phage	5.6e-41	25.8
SPR16488.1|2245597_2245792_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16489.1|2245791_2245908_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16490.1|2246022_2246298_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16491.1|2247663_2252169_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16492.1|2252168_2254625_-	virB4 protein precursor	NA	NA	NA	NA
SPR16493.1|2254899_2255916_+	type I glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
SPR16494.1|2255996_2257217_+	phosphoglycerate kinase	NA	NA	NA	NA
SPR16495.1|2257230_2257524_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16496.1|2257537_2258839_+|tRNA	proline--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
SPR16497.1|2259067_2260321_-|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX	G3M9Z9	Bacillus_virus	1.2e-120	53.6
2258939:2258962	attR	NA	NA	NA	NA
SPR16498.1|2260526_2261096_+	elongation factor P	NA	NA	NA	NA
SPR16499.1|2261092_2261878_+	extragenic suppressor protein SuhB	NA	NA	NA	NA
SPR16500.1|2261897_2262599_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit type 1 TsaB	NA	NA	NA	NA
SPR16501.1|2262893_2263400_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16502.1|2263448_2263670_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16503.1|2264121_2264322_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16504.1|2264369_2264567_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16505.1|2264578_2264935_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16506.1|2265320_2266400_+	peptide chain release factor 1	W8EDB3	Pseudomonas_phage	5.3e-05	37.5
SPR16507.1|2266604_2267627_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16508.1|2267623_2268544_+	GTPase Era	NA	NA	NA	NA
SPR16509.1|2268751_2268877_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16510.1|2268914_2269280_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR16511.1|2269376_2269583_+	50S ribosomal protein L32	NA	NA	NA	NA
SPR16512.1|2269864_2270392_-	cytochrome c oxidase assembly protein	NA	NA	NA	NA
SPR16513.1|2270780_2271626_+	amino acid ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR16514.1|2271632_2272484_+	dihydrodipicolinate reductase	NA	NA	NA	NA
SPR16515.1|2272565_2273039_+	phosphohistidine phosphatase	NA	NA	NA	NA
SPR16516.1|2273051_2276519_+	ATP-dependent DNA helicase UvrD	NA	NA	NA	NA
SPR16517.1|2276699_2277896_+	sodium:proton antiporter	NA	NA	NA	NA
SPR16518.1|2277948_2279157_+	poly(A) polymerase	A0A2L0UZ92	Agrobacterium_phage	1.3e-33	41.6
SPR16519.1|2279153_2280050_+	zinc ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR16520.1|2280585_2280894_+	DNA-binding protein	A7KV42	Bacillus_phage	2.0e-10	37.1
SPR16521.1|2281076_2281952_+	Chaperone SurA	NA	NA	NA	NA
SPR16522.1|2282080_2282902_+	16S rRNA (adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))- dimethyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR16523.1|2282962_2284312_+	DNA recombination protein RmuC	NA	NA	NA	NA
SPR16524.1|2284421_2285483_+|protease	zinc metalloprotease	NA	NA	NA	NA
SPR16525.1|2285495_2287814_+	outer membrane protein assembly factor BamA	NA	NA	NA	NA
SPR16526.1|2287836_2288163_+	thiol reductase thioredoxin	A0A1J0GW78	Streptomyces_phage	2.0e-16	46.6
SPR16527.1|2288395_2288497_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16528.1|2289233_2289359_+	50S ribosomal protein L36	NA	NA	NA	NA
SPR16529.1|2290445_2290631_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16530.1|2290736_2291483_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16531.1|2291690_2291906_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16532.1|2291917_2292022_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16533.1|2292112_2292355_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16534.1|2292389_2292617_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16535.1|2292662_2292785_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

>LS398548|2301294:2360637|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_29

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>LS398548|2301294:2360637|2350158_2351553_-|SPR16589.1|DBSCAN-SWA
MNTDDGMLPLSDDEFSSLKNINPQELDKDLSLDEIIQEILNSNSGKIHDLATRGILKDKFKRGEEAYNHDSKVCPQGKKINSWSENDIKNWSKEIRESKLLSQNFLEEAIAIVKRANIHHCNNIPRITQILSVLIFESLQDTGTLLQIGTGEGKSTTCAMLAAIKALQGNKVDIVTTSSVLAQRDANEKEGFFNILGLSCGSNVEDPFDGQEKICYSKDIVYGPIHEFQFDWLRHEHKKYGTRGDREFGVVIVDEVDSMLIDELDQTARLARSVPGMEHIAPILCGVASELSNLNKKIIQQGDKTIYINGEFEYKDGELILGKDSSEYYISDHYAFVIGILKDLIQEMVTGGELQVPNFLKDFILYQSEVIASSAFQAQFFKENEDYIIAKRDNDNLDIIPVDYVSTGIIRSNCHWTDYLHQFLQIKHGLKLTSENLVTSFISNLGYFKHYGQKLYGMNRYHWV
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MQCMRRIFSTNVCKSITNNSVNNTIIFYKFVGNFPPEEWKWLTDADGKALGKTEKQLLAVIVRQLQVYDNKNIEEIQENYNFFTELLGVGQPRVRQCLSKLQKAGFIKYENRTITKGKYKLNHILCIKLVRNFQQVSNFEKEKTVTQTEKIFPLYPKKISGEHEKNFGSIYRYNNKKIINDRSRFIEDKLVENDQNKNEDQQQNLKFKYTESDDFIEIELVGNEKEDQHQQQNLNFYELSDFSNKKPSNKDYEQNSELATPAITKDSEVEKNECYPKRKRLADYYPLTPEDAVILQRMSSRSFNIYFINQLLLKLSNKYPNRHFANKTAVLNYMAKALANELLTTEQANSGNFGFNDVGRFKEQYLANIESSTDRSMKAQLKRKIAGVFEADMAYQILTSCDFRQAVKNKYYINLIKNITLSDHIKFKILQEVRAVHGNDIEQLQVIPFDESKQVTNSITEYQKTTVLQQQISDEDHLSELSKELGSNSVWYKVRESLIKSYGQAIDKSWFSKLEVINEDNVNKKIFIKAKTEFEDSYIRENYLKDLEPAFKAQGFSFELVKFSNFNKI
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MKNLTINDDAPDFNMITTSNSIINLGHYEGKNLVLYFYPKDNTPGCTIEAQKFNEAISEFNKLNTIILSVSKDNIASHQKFKNKLCLKFELGYDETGKIFEDYGVLKEKSMFKNTFLAISRTTFLINQKGKIAAIWPKVNIAQHSDEVLNMVKNTI
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MVVILYFTQIAISKIKPPKEKRDVYRDTKDKGLFLEVLYGGTKTFYLGITIKGVYRKIKLGNFPNISVNYARKKTLILKGQIAKGIDPLKTKNASTLKEVYNLYINHRKLKDSSKILYKGIMNKYLKNLHYIHVSNIRKEDIYKIFNNANKGGKYSANKTLKLIKAILNIAVELELIEKNPANGIKIHKMQARDRYITLEEMPRFLAAVEEDKNPYLKYFVYISLYTAARRNNVLSMRWENIRLEEGVWYIPETKNGESQTVPLINLLIEKLKQYPYSSESEWVFPGQRRNSGHLTSINVAWKRVCKRAGLKNLRIHDLRRTVGSWMAKFGISMAIITKLLNHNDPQSTKIYTQLNTDVVRDAIQKFANEIAKCTNLRD
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MLQLRLKVIMQNQKLCWALSRPLKYMGLSIDEWGVVLAGVAPGIVLLNSRHAKLGLAFMVGGIALCYCFKKFKKVSENFLLKSFLVAKGLLPAPLGYLRLLGKKVGK
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MTILKITQIFIIRLESIPGIGAKTQAVVLAFLADIEKFSSAKQVVAFVGLNPKHRQSGSSVRGASRISRTGNSDLRKSFYMPAMSALRHNCIIKQFSQRLSDTGKPKMLILIAAMRKLLHIIYGVLKHNSPFNPNVLINQK
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MVIRVMMLMVLLFVNNANAFFLDKQKTFIFVSFSMSDEALKSYFAESQKSGARLVMRGLINNSFTQTKNKTMELDISFDIDPSLFEKYKVDVVPVIVIDDEKRGLTKKLTGHIPLATALEIMNENTP
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MTIYVLHNNGVGIESSNISMIGNAEQVRLYYNVQATKNVANLIEQLSTAKTDSINSKEENNDVQANEVRQYQSAQNYRKNDYYSNSEEDLQKLRDAIAYRADTIARDILGDPNQRLSRHGRLRWGDTGKIQVTTEDKYAGKWYDFSTGQKGDLLSLAQRERGYSFFEAKEYLKSMVGMSNISQRYQRPPKTDDSQQYTQQSESVKIAKVQNLYELSSKIHGYDIDKNPHAEVVKKYLENRGITFDKSTASSDLKASILFDTQTRENYPAFTAFARNSKGEITGVQAVYLNSAGDKANISINRRSFGKIRGSFITIAKRNANDPNITIIAEGAETALSLQQSGIKGNIIASAGISNLRNYSPFPGEKIIIAADNDSKNPITNNTVIKAAKTLEMKGAITCIVKPPENGDFNNLLQSCGEQSIRDIIEPEITKLTKAVETTKLTQTENNSIAKQNDITNVKELYNKSSSLYYFKQEEEAKVEAIVVNKYSENHTGIYSSKIFNNS
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MYLLLLGEKQTELLQQIINKIEILKVIRGHIEQTKDKIFDCKGDIEIGKMTPIEEVFSKSENLKDRNIKTEVGELIDEGICWFFDVEDIQEKANRVFGTVFTFVAGLVQIGIGMVCSLYVGNINLGAQLIVEGAKDLYKSMQIASGEIKFSMEEYISEKATTLAVFMTIKGVQILLSRMAATSATAAKMLKPVISTGEAIGTASTGLLLEKTCVEVGRITAKSLISTGVNYLIDKGAQKVIEDNFKDDFQKRVINGLKECLDDSTTSSQLRQLLVLDRINYNTFNYKRILECISSLIQDNRNILREMINAGIDTVLSQSQHHIVTAIDTVIRIKKRNNNFIKKM
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MSIRIRVYVITMLLLLQAPVSLAWNIENVFQGMSVNVTRSGSYQDQAAGYYAAGGLSARTSQTSFQPFAITPPSLNMSCSGIDAYLGSFSVISGEELVQLMKNIGSQAKVYAFSLGLKTFAPQIENALKDLRNLAMEMNQFAKGDCELTKALFATALPRNWAMREAVCRDIQSQSGFDYFAAGKKCRNDLAQKQSLRQAQNKDPELMLDDYNIFTKAAAKVGIPSDMRDSIMSMTGTIVVTNNNVHFYDSLAQDEKSWISHLKGGESASIYSCDNVSCLHPSLQRNITILPEKSYAGKAKQQLKNLKINFENNSEFTDSEIAFLSSIGDIFPIYDYIILESISGVTILDSSSELIASYTLVQHLKEVITEIRRAVTSLGAKQVSNEHLERYLKELNRVQLFANEKWTSLQTDANRIDKRARLIEQHLIAKEKS
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MNHLFKQNAIQELVKYNKCLLSVTILLAAANIIAIMAVITKEEKWLLIPAMEPDRKMMVSSKNYHETYLKEWAIYVTKLLFTTSPNEVERQIADMKVASSNTESLNKFFHDHLQFVKGSNVSSVFFPKKIEVIKDGVLISGTLRYWFSDSKDIAVDKTYLLTYKQTPNYLLLLTGVKENGIKK
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MEKDLAKIAPSNIQAEQMILGAILINNRALYNINEFLLPEHFYEPLHGKIYKSINLIISKGISATVISLKNMLGNELAFEEIGGVDYLAKLTTLALSIVNVNEYGKIVYDLALRRYLIEIGEKIVTNAYSSTLADLAITQIETAESQLYDLGSRGTLSKGFTKLQTSIEESWTSISSAIKNKNSINGISSGLLDLDSKLGGFKNSDLIILAGRPSMGKTALGVNLAINACKYFLSSSTQQNSKVSNITPSVGFFSLEMSSQQISTRILSIESEINSSALFNGKIGEQDVDKLKTVQDEIQKWNFFIDDAPAISISAIRSRARRLKRTHNLAILFIDYLQLIKIDSRGSQYNRVQEISEITQSLKALAKELNIPVIALSQLSRAVEQRTDKKPILSDLRESGSIEQDADIVMLIYRDEYYLSRSEPDPGTREHIEWKARQNKCYNTAEIIVAKHRNGPVGTVKLHYNSRYSKFGNIVKNYQQA
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MPTYKPKQFEEIDGDIQNNETTWHGRITSSILDEVEKGRAVLIICATIKDAIEIRERFISVVGYDSDKVRLYSRNDNYEYLAVKDEVNSGDVIVAFLPENLRVEEQAFGRTARQGAKGTAQLIISEPNVAHKFELKSYSYNSINEFKVLRNCKEYIKTQETKLYVVEKIKLRDLLFEEYLKIECNVRNAIQNRWQVSQLEDIWGIELTKLGNLVYKNHKAQKGLQDIASKFGFIVSKENVSSLNSLYRTVNTALGRTITDEHLQLLTIGYFLDRNYVQNSISRDEIKSNEFFDKLTQEFTDQAALKILSLIKTINIVLLRSDKEEPEIYRVKGAKGTIYIGLEASSEMHSDKYKFLFNGSDTTEDIEKYLNQALEEESIYAQENQNIFQRQDVMILLDSIMRFKAREAENCNKAKKEVALNFFGEFFEQVAKDNSKFMQNPNYLVRDAIISGYKDNEYSKSLKLLDEVCNVEPQYSLSACYNKAYLLIKNHTYHKNDSYIAEASSGLSLVQAQTAKLSTCLTPEAIVHQLALAIAELNKIQNLNQIKNYDGGNYKEEAISYLSLAQEQIVL
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MTKKLKHDSLAKTIMSDPVAAQEFLEYYLPMNFKSLIDLSQIKVEQESYIEESLKKKYSDIVYRVATKKHGNAFIYILIEAQSTVDYWTALRLWRYTLLLCERHKKEKAKLPLVYNLVIYNGKKVYNAPRNLWNLFTDSMIAKQLMTSDYQLVDLQSMSNDEIVRKKHIGMLEYMLKHIHQRDMLKLWEEFLIKFKHVLILDKEKGYIYLRSFLWYTDTKLLESQQPELEQVLAKYLSEEEKGNIMRTIAAKYIDEGRAEGRAEAAQELAMNLLKAGFSVEFISENTGLSKEEVINLKNNIEY
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MPIQDEGQNKINKLTEKLSTEGINSTTIKQIDAELQKLYFQLEESEQVSINCIEWIQYFRLIVNNYDRKKVNIIASLNGMIFLFRQYIASTNVRIETFNIELLINNTVIRMREHFENENIKLNVQNDIKTVLIGDSFRIKAVISQLIGSAIINSSKNSKITINLNQYSEILQFTVQNIGLSTSKEKLERINAELENLNLVTYQELGEGLAFIKHLTDQLKGRLRAKEENNYITFSFEVPITSLNYSLGECYERKEENN
>LS398548|2301294:2360637|2344948_2345437_-|SPR16583.1|DBSCAN-SWA
MNIRILRFIIGFIALVNVNNIYAVEYELEADNLLKLEISDSGPTRINLKDEKINDIFMYPQNAAEVVVHESGFLFIVPREEGNKVYLTVIGEYKTIQDLMLTFTPKTPSPIMLVNAATKIEEKDNSKQNNNNLFSNDLNTKELTAKPSKKQSRNTKKKIKLA
>LS398548|2301294:2360637|2338062_2339007_-|SPR16575.1|DBSCAN-SWA
MSITANNCYAAAGCVGRFVNPITDVCWKCLFPITIAGFKVVSSSMPDTNASGRLICLCPKPGIPVPIPGIPVGFWEPVRLVDVTKSPMCMVSLGGLSFGTATQKGMKDEAEGSAFYHIHWYVYPVIYWLEILLDFICLEMAAVDIAYLTEFDPLWSDDAKSAILNPETLLFQNVAAYQACIADCMSCSAGLLASDYAFWCAGCQGMLYPFTGTAAAHNGGVGTSVLMVSKFMAKMHRQLMLWGYYGYKGLCGKYPMPIIKKSQYRLQMTYPIPETKSCKSIGQTEAIWQAGREFPVNGEDFGYLIWRKRDCCLL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SPR16547.1|2301294_2302245_+|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	5.9e-85	64.5
SPR16548.1|2302813_2303437_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16549.1|2303463_2305647_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16550.1|2306001_2306574_+|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16551.1|2306530_2306956_+|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16552.1|2306971_2308006_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16553.1|2308219_2309929_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16554.1|2309937_2311386_+	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	1.8e-72	37.1
SPR16555.1|2311618_2312194_+	(p)pGpp hydrolase	A0A291L9W9	Bordetella_phage	1.6e-05	32.1
SPR16556.1|2312228_2312873_+	ankyrin	A0A068ELT3	Penguinpox_virus	5.7e-07	27.5
SPR16557.1|2312920_2313469_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR16558.1|2313472_2314282_-	DNA methyltransferase	A0A1S5PRR3	Streptococcus_phage	3.1e-18	26.4
SPR16559.1|2314656_2315433_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR16560.1|2315407_2316265_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR16561.1|2316365_2316950_+	(p)pGpp hydrolase	B3FJI5	Pseudomonas_phage	7.5e-06	38.6
SPR16562.1|2317055_2318066_+|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	6.3e-85	64.9
SPR16563.1|2318133_2318589_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16564.1|2318798_2320514_-	HNH endonuclease	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	2.8e-85	36.3
SPR16565.1|2321214_2324016_+	conjugal transfer protein TraA	Q7T5H7	Cryptophlebia_leucotreta_granulosis_virus	3.6e-05	23.3
2323396:2323431	attL	NA	NA	NA	NA
SPR16566.1|2324653_2327323_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR16567.1|2327374_2328418_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16568.1|2328427_2330182_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16569.1|2330187_2331327_-	TPR repeat-containing protein 08	NA	NA	NA	NA
SPR16570.1|2331339_2333973_-	conjugal transfer protein TraG	NA	NA	NA	NA
SPR16571.1|2333972_2335274_-	conjugal transfer protein TraH	NA	NA	NA	NA
SPR16572.1|2335270_2335954_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16573.1|2335965_2337660_-	conjugal transfer protein TraN	NA	NA	NA	NA
SPR16574.1|2337656_2338040_-	type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC	NA	NA	NA	NA
SPR16575.1|2338062_2339007_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16576.1|2339040_2339214_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16577.1|2339297_2339957_-	type-F conjugative transfer system protein TraW	NA	NA	NA	NA
SPR16578.1|2339953_2342443_-	conjugal transfer protein TraC	NA	NA	NA	NA
SPR16579.1|2342423_2342753_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16580.1|2342752_2344078_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16581.1|2344116_2344452_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16582.1|2344585_2344813_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16583.1|2344948_2345437_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16584.1|2345433_2345985_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16585.1|2345984_2346308_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16586.1|2346387_2346858_-	peroxiredoxin	NA	NA	NA	NA
SPR16587.1|2346860_2348000_-|integrase	integrase	A0A0U4JNS1	Bacillus_phage	2.0e-18	27.0
SPR16588.1|2348393_2350109_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16589.1|2350158_2351553_-	preprotein translocase SecA subunit-like protein	NA	NA	NA	NA
SPR16590.1|2352070_2352427_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16591.1|2352636_2353014_-	HNH endonuclease	NA	NA	NA	NA
SPR16592.1|2353116_2354352_-	reverse transcriptase	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	2.3e-65	37.7
SPR16593.1|2355034_2357479_+	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
2356820:2356855	attR	NA	NA	NA	NA
SPR16594.1|2357597_2359109_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR16595.1|2359122_2359674_+	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR16596.1|2359725_2360637_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_30

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30

>LS398548|2365623:2410594|DBSCAN-SWA
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MVFKCKLHIFINHHGDIVSFFTLTSDNVNDRIVVEYLVCKLKGWLFADHGFISKKLVVSLTNQGLKLITKIRSNMKEKVIHPIKFSLLNKRYIIETI
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MLLQKYDIEFSNFCTILSGSGAKAKEVTQKVLGILSDEQLDASGKKQFFKNISKFARSGINAPFIFKKFLSSSLSLDETVQQTEEDTHYTDWQFEQQDDNIQAFPSTSTAALGATDIEMQESAAVSSLDLEENFQLAMDFIMKDLESSSSAATVMSSDINMTQEEYIDNIIPPLEQESSNILLDSDYYNAYEEGLQSGLTCNHANIYAAIVTRYIANGASEHSAKNFAKIYVEGFSSSIKNHHKGDCYAQNYAEAYADCIISGKPKCYAQNYAEIFAETVASGKDVNYARNYAEANTDFMFLEEEEATSGHIFEQMSANVDYTGGSIFNDDVEE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SPR16600.1|2365623_2366049_-|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16601.1|2366005_2366578_-|transposase	IS110 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16602.1|2366754_2367165_-|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16603.1|2367241_2368228_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16604.1|2368237_2369257_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16605.1|2369308_2370577_-	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR16606.1|2370687_2371458_-	conjugal transfer protein TraI	NA	NA	NA	NA
SPR16607.1|2371724_2373287_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR16608.1|2373332_2374592_-	conjugal transfer protein TraA	NA	NA	NA	NA
SPR16609.1|2374870_2375065_+	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16610.1|2375157_2375331_+	conjugal transfer protein TraD	NA	NA	NA	NA
SPR16611.1|2375398_2376421_-|transposase	transposase	A0A1B2LRR6	Wolbachia_phage	6.4e-85	64.5
SPR16612.1|2376542_2377118_-	(p)pGpp hydrolase	A0A291L9W9	Bordetella_phage	1.6e-05	29.4
SPR16613.1|2377218_2378076_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR16614.1|2378050_2378827_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SPR16615.1|2379179_2379464_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16616.1|2379776_2381762_+	ankyrin repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
SPR16617.1|2382554_2383187_+	DNA methyltransferase	NA	NA	NA	NA
SPR16618.1|2383190_2383694_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SPR16619.1|2383740_2384247_-	ankyrin	A0A2H4X2N8	Flamingopox_virus	2.9e-06	29.7
SPR16620.1|2384423_2384999_-	(p)pGpp hydrolase	A0A291L9W9	Bordetella_phage	6.2e-05	30.5
SPR16621.1|2385012_2385171_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16622.1|2385232_2386669_-	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	2.1e-73	37.6
SPR16623.1|2386677_2388393_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16624.1|2388747_2388930_-	conjugal transfer protein TraB	NA	NA	NA	NA
SPR16625.1|2389061_2389277_-	conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
SPR16626.1|2389276_2389525_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16627.1|2389747_2389915_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR16628.1|2390236_2390479_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16629.1|2390569_2390695_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16630.1|2390684_2391059_+|transposase	IS5 family transposase ISOt6	NA	NA	NA	NA
SPR16631.1|2391018_2391459_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR16632.1|2392891_2397817_-	NAD-glutamate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
SPR16633.1|2397898_2399242_+|tRNA	tRNA uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34) synthesis GTPase MnmE	NA	NA	NA	NA
SPR16634.1|2399267_2400206_+	recombinase XerC	A0A0K0N6I5	Gordonia_phage	2.5e-11	34.9
SPR16635.1|2400240_2400672_+	RNA polymerase-binding protein DksA	NA	NA	NA	NA
SPR16636.1|2400761_2401289_+	inorganic pyrophosphatase	A0A2H4J8U1	uncultured_Caudovirales_phage	1.6e-39	49.7
SPR16637.1|2401312_2402185_+	DNA polymerase III subunit delta'	NA	NA	NA	NA
SPR16638.1|2402168_2403110_+	ribosomal large subunit pseudouridine synthase	NA	NA	NA	NA
2403475:2403494	attL	NA	NA	NA	NA
SPR16639.1|2403742_2403916_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16640.1|2403905_2404199_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16641.1|2404478_2405483_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16642.1|2405671_2407051_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16643.1|2407656_2407815_+	ankyrin repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
SPR16644.1|2408463_2408691_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR16645.1|2408726_2408864_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SPR16646.1|2409303_2409462_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
SPR16647.1|2409476_2409701_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16648.1|2409727_2409991_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16649.1|2409991_2410264_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
SPR16650.1|2410282_2410594_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
2410625:2410644	attR	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
LS398548.1|SPR14662.1|486389_486602_-|conjugative-transfer-protein	486389_486602_-	70 aa aa	NA	NA	NA	444618-498261	yes

Protein sequences of LS398548.1|SPR14662.1|486389_486602_-|conjugative-transfer-protein

>LS398548.1|SPR14662.1|486389_486602_-|conjugative-transfer-protein
MTIHQNVQNHWTTIGKDIFDKEQQNKAAVILKFASEPDENTKRHIRLHDLKWNSFRQEWCGHVKDIEAKE

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
LS398548_2	Orphan	2.1|318187|32|LS398548|CRISPRCasFinder	318187-318218	32	487221-487190	0

1. spacer 2.1|318187|32|LS398548|CRISPRCasFinder matches to LS398548 position: 487221-487190, mismatch: 0

aataaaggaatttctttataccaattagggca	CRISPR spacer
aataaaggaatttctttataccaattagggca	Protospacer
********************************