Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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LS398551 | Orientia tsutsugamushi str. Gilliam genome assembly, chromosome: I | 0 crisprs | RT,DEDDh | 0 | 0 | 28 | 0 |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
8803 : 270106
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS398551|8803:270106|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS398551|8803:270106|92130_92283_-|SPR02606.1|DBSCAN-SWA MLVNGNHIELNNLLGRHVFFDQFGFLSMKFKIQAMLAIIKEKTLYLKLAK >LS398551|8803:270106|161063_161243_-|SPR02904.1|transposase|DBSCAN-SWA MARRYSYDLRMKIFKAVDDGLSIVKAYKIFNISRNTIYSTNVGNRYIICQYEKSIKKNR >LS398551|8803:270106|219844_220891_+|SPR03144.1|DBSCAN-SWA MKNFTHLIQQLSHTQEDCILVKSKEQLPTNIAYNSDSHSLGLPQYNICNQIFIKLQGYLYQLSQCIWSPPSNESNSTVYSMDCSEAFGFSVNNDTKIDIDDEKYALRLISPEANEWIKKNACETIKNCTSNALEAISSEIIAYNKEASNEKYEPTSISHNAQYAIIGASVVSAGLAIWGAKYCITKYQEYRRNKQKIDLISHVSKDYDDNAEKEPCISSASERDIVNISKTDSFTGAKASNLNAESELAQAIELIIHNSSKTNDFSTAVNLALQELRWSEDNDNYNEITTYTSSFDNVIKKAKHITTHADIHYSEGVNSFELSTNVVGDIEENIYESVDNINRLHANF >LS398551|8803:270106|179950_180289_+|SPR02974.1|transposase|DBSCAN-SWA MIAGLCNNQIIAPVIFEGNCNKAIFTTYLETILIKELRPGQIVIMDNINFHKQTIIKVLIESVGCSILFLPTYSPDLNPIEHYWFKIKNEIRKVTAQFKDISIAVEHLMKFI >LS398551|8803:270106|172856_174305_-|SPR02949.1|DBSCAN-SWA 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MLRDELIEKIKQISKENLVFIDESGIEDNACREYGWSIKCTRCYGNKAYQHKSRVSMIAGLCNNQIIAPVIFEGNCNKVIFTTYVETILIKELRPGQIVIMDNINFHKNTIIKVLIESVGCSILFLPTYSPDLNPIEHYWFK >LS398551|8803:270106|37911_38382_+|SPR02275.1|DBSCAN-SWA MKNLTINDDAPDFNMITTSNSIINLGHYEGKNLVLYFYPKDNTPGCTIEAQKFNEAISEFNKLNTIILGVSKDNIASHQKFKDKLCLKFELGYDETGKIFEDYGVLKEKSMFKNTFLAISRTTFLINQKGKIAAIWPKVNIAQHSDEVLNMVKNSI >LS398551|8803:270106|89696_90071_+|SPR02592.1|transposase|DBSCAN-SWA MARRYSYDLRIKLFKVVDDGLSIVKACKIFNISRNTIYRWKHLKRETGDIKAKPYGPAKGYNAKIDLKEFEELIINHHDKTSKELSIILGNRLQRTRINYYRKLLGYTYKKNSFSFQKGYCVKE >LS398551|8803:270106|239852_243056_-|SPR03201.1|tRNA|DBSCAN-SWA MATPHSKYYPEVDASLSLPSIEKDILHYWKKYNIFIKSVNWHAAKSGKKSNEFIFYDGPPFANGLPHYGHLLTGFIKDTYARYQTIKGKRVERKFGWDCHGLPAEMAAEKELGISGRIAITNLGIDKFNEYCSSSVMKYASYWKEYVERQARWVDFDDSYKTMDLSFMESVLWAFKQLYNKGLIYQSMRVVPYSWACETALSNFETKLDNSYREREDKAVTVGFILHKKPKSAPPGFQEYRVLAWTTTPWTLPSNLAIAVRKDIDYIAIPSQNKNICYILGKFALKNYVKSLNLTSEKQDIYVSFKGEELEGIHYQPLFNYFANKQNAFKILCGDFITEEAGTGIVHMAPGFGEDDQLLCQQHNIELVCPVDNAGKFTKEVTDFFGMQVFDANDKIINYLKAQGNWIKTEQHIHNYPHCWRTDTALIYKAVSSWYVKVSAFKERMVQLNQQINWIPENVKDGLFGKWIENARDWSISRNRFWGTPIPIWISSDNNYPRIDVYGSIAELEKDFGVKIDNLHRPFIDQLTRVNPDDPTGQSIMKRVDDVFDCWFESGSMPYAQVHYPFKNKEWFETHFPSDFIVEYAAQTRGWFYTLLVLSTALFDRVPFLNCICHGVILDENRQKLSKRLNNYVDPLELFNKYGADALRFAMLSSGVTRGQELLIDKDEQMVFDSLRLHLKPLWNAYHFFSIYANADNIQGECITYSENVLDKFILSRLKIAVQKIDHALATFNSATACSVFSSFIEVMNNWYIRRSRQRFWKNEKDDDKKLAYNVLYTCLNYIVRAASPFLPMLCEEIYLGLHGNKRDGNISVHLVEFPNINDIEIDDHLVTVMDQIITICSAALYIRNTENIRTRQPLQSLSIIHSKASQFQKFDYLIKEEVNVKNILYYENTNDYINFKLVLNFPLLGKRIPEQIKSVIQANKANNWQKLDDGTVKLGDIDLLPEEYSLIAEPKTSDGAKAIGNDGIIMLDLSITNELYLEGIARDLIRLIQKARKDAQFHISDNIYLDISSTGTEINNAIDKCKSIITQQTLSSICTIDVYDYVYSDKIGNDTVTIKIAKAVRH >LS398551|8803:270106|84832_85666_+|SPR02559.1|DBSCAN-SWA MRIIVAIIITCTTAFMVKADTLSIKNSDNYKYTENIKEIQDSHYSDILDINEEICLKAFDPLERINRKIFYLNLFLDYILLRPIANCYYKVTNNDVKEAVENLINNTAVPVTVINSVLQFKFKNSIVSVWQFIVNTILGIGGLHNIAADFGLQSQPLNFSSTLARYGVKSGPYIILPIFGGMNFRDISNIAFSQLSPLQYIIDKTHADKLINTDILFNKKFAKGVKIIDMVHKRAKLFGNAEFVMKNSIDPYSVYRNISYQTSDYFQKCRTNKISKK >LS398551|8803:270106|41175_41688_-|SPR02300.1|DBSCAN-SWA MYKANSSSSLEVVKVAIDRLSDRKNVNDTFLIGWSIDEYLNVYKQSKNYSKVTHIVYQSPQGIYYVIFDYFDYKKKIWNMLYAYTEFNNRMKIIRYQNDISIVFNNLKKNVYLELEKVSYDKSITCDNTSVLNADDFIKLSHNELNDIDSEEKLYIGMNSETYIPKCVIS >LS398551|8803:270106|71261_71705_-|SPR02504.1|DBSCAN-SWA MIDSYSESLINKLFETNVRFNTKIDLDKVERAIKYAKKYHGQQKRDTGELYYTHPLKVAYMVSDYSFETDTIITAILHDTLEDTKLTKERIRYEFGANIAEQVSDLTRVRDNKKISAMEMIQILRSQNKTELLLIKLFDRFHNIART >LS398551|8803:270106|151445_152246_-|SPR02853.1|DBSCAN-SWA 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>LS398551|8803:270106|233719_235384_-|SPR03186.1|DBSCAN-SWA MEKASFQEILLHPGIFLILSSAILYIFRYFKIFNMLAVFLPVIAAIICSMQPYNVYYNFYEIWQFSFQYNYYNKIACLCILLCSSCINLSAWKNQHCSNFSVIIAMLYTGISIISMLSVDFSTMIYSLEFASLAAVLMIYNKTNESQIETAYQYLIVHSLSIMLILAGSSIIISSYGLPITNLAKLIEDFEYNSYLTLAAIVILLGLLINIACPIFSYWLVDSYSISKTTASVYLSMLTTTINLIWIFKLFLGLKILIIIGIFITAFGIIYSILENEIKRSFSYSSIAKTGIILVMLGIYEHNTDYNALSNYNQEAVLMLLCISYIPCQCVIMLICGWLKDKYTLTSFTDFSNKMVTIDPVLLIAIGYSLALFFATPFTTFYYTNVLALKNNNIIYFLNIIMATQLLCIPLTSICKNVRIIKFSQVYGIDGTKYINIAEYIAIICFITINLILYFYIADFTYLLQQLTIITAGLIASYVSCPTKISGKILLPENILYNKACNFIDLCSNKFFSWQAKLQFPKILRLSNNLELSNSLSIVATILILLTIIIIDII |
292 | Indivirus(25.0%) | terminase,transposase,integrase,tRNA | attL 120220:120279|attR 221275:221290 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
278294 : 368697
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS398551|278294:368697|DBSCAN-SWA 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105 | Streptococcus_phage(27.27%) | transposase,integrase | attL 278861:278920|attR 326849:326933 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
401333 : 505950
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS398551|401333:505950|DBSCAN-SWA 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108 | Streptococcus_phage(15.0%) | transposase,integrase,tRNA,protease | attL 456643:456682|attR 513767:513806 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
513679 : 561585
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS398551|513679:561585|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS398551|513679:561585|555182_555359_-|SPR04211.1|transposase|DBSCAN-SWA MVEDTLVKHLNFALPGRKALMKSDMNYEVVLIDATESPIERPKKNKNSIIQERRKGIY >LS398551|513679:561585|519435_523140_-|SPR04101.1|DBSCAN-SWA 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>LS398551|513679:561585|555787_557929_+|SPR04217.1|DBSCAN-SWA MSQYLLDLNPEQREAVITTNGPLLVLAGAGTGKTRVITYRIAYIIDEFMALPEEILAVTFTNKAATEMQSRVAEITNNTTGIYIGTFHAIATKILKAHAELVGLTSSFSIIDQSEQVRVIKNICETHSISTKNYSPKDICEIISRWKDLGEQPKIDCHTPIYQVAQKIYQHYQTELQKSNVVDFGDLLLYNMKIFSEYPDVLNFYQTKFKYVFIDEYQDTNNVQYFWAKALVNLHENLCCVGDDDQSIYSWRGANIENILKFKDDFKNAKLIKLEQNYRSTNNILTAASSIICNNKYRHDKKLWTNKQSDQPIRIVYCYNDREEARFISSEIKKLITKSPNLSIAVLVRSSSQAHVLEESFFSNNIKYQVIGGFRFFDRMEIADMIAYLRVLVNHNDNLALTRIINVPKRSIGPATLHTIKEYAQQHESSMFTAIEQILSKKLLKPQLELTLQNLINKFKEWRSLYKAGYTPAKVTEIICDDSNYLQMLKDDKSSQSDRRIENIQEMIRAMLDYSSIEEFLEHASLFLERDNGINAKDNSVVSLMTLHASKGLEFDVVFLPGWEEGVFPHQKSLIVEDQRALEEERRIAYVGITRAKQSLYISYTDQRRIFNEFVKLQPSRFLLDIPDSISLSTTSMIHYSSAANNNYFQKLSSAAVPNSQSKASSKFFTGAKVLHKQFGQGTVIRIMNDNIEVAFYVGGIKTIKQQFLIIKK >LS398551|513679:561585|545437_545860_-|SPR04159.1|DBSCAN-SWA MEKDLAKIAPSNIQAEQMILGAILINNRALYNINEFLLPKHFYEPLHGKIYKSINLIISKGISSTVISLKNMLGNELAFEEIGRVDYLAKLTTLALSIVNVNEYGKIVYDLALRRYLIEIREKIVIIRYSIGKGAKTYQI >LS398551|513679:561585|539821_542692_-|SPR04146.1|DBSCAN-SWA 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>LS398551|513679:561585|532209_532317_-|SPR04133.1|DBSCAN-SWA MKFGHIKDLKDEKFRRLTKSKEVDIFKDGGYFEES >LS398551|513679:561585|547727_548102_-|SPR04176.1|transposase|DBSCAN-SWA MARRYSYDLRMKIFKAVDDGLSIVKACKIFNISRNTIYRWKHLKRETGDIKAKPYGPAKGYNAKIDLKEFEELIINHHDKTSKELSIILGNRLQRTRINYYRKLLGYTYKKNSFSFQKGYCVKG >LS398551|513679:561585|560238_561585_-|SPR04227.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTVITRFAPSPTGKLHIGNVRVALVNWLYAQKYNGNFILRIDDTDRDRSKVEYHEAIIKDLQWLGINWNSSFLQSTRFNKYAEVKQYLISSGRLYECYETPEMLEIERKRQLASGYPPIYSRKSLELTTAQKAQLQAEGYKVHYRFLIDRNKPIIWNDLIKGEIKYDGSNISDPIVIKEDGTMIYMLCSVIDDIEYRISHIIRGDDHITNTAIQIQMFEALGAAIPQLGHLSLIKSDSGKISKRIGGFTIDYLRDKLGIEPMAVNNLLALSGTSNNVDAYFSLESLITKFDLSAFSKSTIIYNENELVTLNHKLLVNTEYDTIKHMLTAIGLPDVTKEFWLAVRHNLNTLNDIKIWWQICYLPTLDKFQEQDSEFLKLAAELLPSGKLTDNSWDDWVQNIIKATNRRGKALFMPLRLALTGITYGPELKYLLPLIGGEEVRARLLRYQ >LS398551|513679:561585|554797_554926_-|SPR04208.1|transposase|DBSCAN-SWA MNENVIGMLKRFKIIADKYRNRCKRFSLRFNLISGIYNFDLP >LS398551|513679:561585|548158_548605_-|SPR04179.1|DBSCAN-SWA 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52 | Tupanvirus(16.67%) | transposase,integrase,tRNA | attL 518467:518505|attR 554779:554817 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
582502 : 622766
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS398551|582502:622766|DBSCAN-SWA 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MCWKCLFPITIAGFKVVSSSMPDTNASGRLICLCPKPGIPVPIPGIPVGFWEPVRLVDVTKSPMCMVSLGGLSFGSATQKGMKDEAEGSAFYHIHWYVYSMIYWLEILLDFICLEMAAVDIAYLTEFDPLWSDDAKSAILNSETLLFQNVAAYQACIADCMSCSAGLLASDYAFWCAECQGMLYPFIETAAAHNGGVGTSVY >LS398551|582502:622766|619058_619241_-|SPR04396.1|DBSCAN-SWA MSPVVLVASGRVIDVVFKKGFDLREHKKKPHNSTYTPSTSNEKVNSHNQFNQSQKLEEHL |
52 | Indivirus(33.33%) | transposase,integrase,tRNA | attL 602272:602320|attR 635086:635134 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
633633 : 737930
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS398551|633633:737930|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS398551|633633:737930|707718_711372_-|SPR04749.1|DBSCAN-SWA 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>LS398551|633633:737930|646565_646817_+|SPR04479.1|DBSCAN-SWA MSENVVSSNQLKQIIEKIERLEVEKANITEDIQAVYAEAKSYGLDTHTLKQVIKIKKMDKSKFKEQEELLETYLSALGIIKSC >LS398551|633633:737930|699660_700167_-|SPR04716.1|DBSCAN-SWA MISYACSATNNIPVKIYTDGACSGNPGPGGWGVYLSYKNHERKVYGSNINTTNNRMELIATIEALRLLKHSCKVELYTDSQYVQMGITKWIKKWIQNNWETSNKQLVCNVDLWQSLYTLIQKHQVSWHWVRGHSGNIGNEIADKLATNGKIEAMKIVKNNENTKKFLD |
118 | Indivirus(36.0%) | transposase,integrase,tRNA,protease | attL 635086:635145|attR 739240:739279 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
755451 : 800701
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS398551|755451:800701|DBSCAN-SWA 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42 | Wolbachia_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
805626 : 1019486
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS398551|805626:1019486|DBSCAN-SWA TATGCATTTATCAAGATTTCTAGATCCAAAGAATGATGTAGCATTTAAAAAGATATTTGGATCAGAAAAAAACAAGGACATACTAATACATTTTCTGAACGATATATTGTTGTTTGAAGGGAATAGAGAAATAACAGAAGTAGAGTTTTTAGGAACGATATTAGATGCAGACATAGCGTCCAAAAAAGAATCAATAGTAGATGTTTTGTGTAAAGATAAAAACGGTGCGCGATATATAGCAATAACATAGGAAATAGGTACAATCAGATAAACTTCATTAAGTGTTCTACAGCAATGCTAATATCTTTGAATTGAGCAGTAACTTTTCTTATTTCGTTCTTAATCTTAAACCAATAATGTTCTATAGGATTTAAATCTGGACTATATGTAGGTAAGAATAGAATACTGCAGCCAACCGATTCTATTAATACTTTAATTATAGTATGCTTATGAAAGTTGATATTATCCATAATTACTATTTGTCCAGGGCGCAATTCTTTGATTAATATAGTTTCTAGATAAGTTGTAAATATTGCTTTATTACAATTTCCTTCAAATATTACTGGTGCTATAATTTGATTATTACAAAGCCCTGCTATCATACTGACCCTGGATTTATGTTGATAAGCTTTATTGCCATAACATCTAGTACCTTTTATACTCCATCCATATTCTCTACAAGCATTATCCTTTATTCCTGACTCATCAATAAATACTAGATTTTCTTTAGAAATTTGCTTTACCTTCTCGATAAATTCATTCCTTAACACAATATCCATTTTGGAATGAAAATGAGTTTTTTTTATAAGTGTATCCTAGTAGTTTTCTATAATAATTTATTCTAGTTCTTTGTAATCTATTACCTAGTATAATACTTAATTCTTTAGCTGTTTTATCATGATGATTGATAATTAGCTCCTCAAATTCTTTGAGATCTATTTTCGCATTATAACCTTTGGCTGGGCCATAAGGTTTTGCTTTAATATCTCCTGTTTCCCTTTTAAGATGTTTCCATCTATATATCGTATTACGACTTATAGTTAAATATTTTACATGCTTTAACAATTGATAGTCCATCATCTACCGCTTTGAATAGCTTTATTCTTAAATCATAACTGTATCTTCTTGCCATTATTTATCTATTATTATTATTATTATTTATACTCTTTTCATATTAGCATATTATGTACCTATTTCCTACGTTCGTGCTATATAATAGAAATGCAAGTAGATCCTACACAAGGATTTGAAAAAAGAGCCCAGTATTATGCCGCAAAAGCATATGGCAGGCAACCAAATAGAGGAAAGGAAGGAAAATACTCAGACCTAAAGGAAGTTATATTTATAGCTATAGCAGATTATAAATTGTTTCCAAACAAAGAAGACTATATATCAAGGCATGTAATATTGGATAAAAAGACATATGAGCATGATCTAAAGGACTTTTCATTTACCTTTATAGAATTATCAAAATTTAAAAAAGATAGAGTGGAAGAGTTAAATGATATAACAGAGAAGTGGTGCTATTTTTTTAAACATGCAAAAGAAACAACATTAGATGGATATAATAAAATAATAGGTGAAGATTTAATAATAAAAAGAGCGTATGAGGCATTAGATCAGTTTAATTGGAGTGAAGACGAACTAATAACCTATGAACAAGAGTTAAAGCGTATATGGGATAATAAAGCAGTCGAAGATTATAAACTCGAACGCGCTAAAGCTGAAGGTAAAGCTGAAGGTAAAGCCGAAGGTAAAGCCGAAGGCATAAAGCTCGGTGAGGCTAAAGGTAAAGCTGAAGGTAAAGCTGAAGCAAAAAAAGATTTGGCAATAAAATTATTGAAATCTGAATTATCAGTTGAGACAATTGCTGAATATACGGATTTATCAATACAAGAAGTATTAAATTTAAAAAATAGTGTAAAATAATAATGAATATACAACACAAAATCTTACCTTTGATGTGTTGTATGCTACTTCTATTAGATGCTTTATATCACACTACAAGTTCTATACTATACTGAACATTGAGAAGGGCATTCTTTAAGGACTCAATGTCCTTAACATGGCCGCACCATTCTTGACGAAAGCTATTCCATTTTAAGCCATGAAGGCGAATGTGGCGCTTAGTGTTTTCGTCTGGTTCAGAGGTAAATTTTAAAATCACGGCAGCTTTATTTTGCTGTTCTTTATCAAAAATATCTTTACCGATTGTAGTCCAATGATTCTGAACATTTGGATGTAAAGATAGCCGGTTCAAAAAAAGTAGCATTATTTTTTGAACTCTAAGATTTAAGACTATATCTCTTAATATTTAGGAATATTTTTTGATATATAGTCTATAATCTAGAATAATAAAACATTCTTAACTTATGAACATGTGACTCTGTACCTTGATTCTAAAAATTAATCAGTTATGATGCGGAGATTGCTTTTTTTTATTTTTTTTGCAAGTTCATTTGCTAACTGGTATGCGTACACATTATCAGGATCATATTTGATAGCCAGGTTATAACTTTCCATTGCTTCTTGATGTCGCCCCAATTCATTCAAAGCAATTCCTTTATTATTGTAAACGTCAGTTTAGGATAAGGGAAAGTATGAAAAGTAGCGAACAAAAAGCTTGCAAGAAAAAATGTACAATTATGATTATGCGAGATATTAAATATATTGCGCAATTATAATTAGACCTCTTTCGAAACTGGTTAAAGAGTTCAAAATTATAAATGCAAGAGATCAAATTAAATCTATGTGAGTAGACCTAACCAATCGCTCAATTAGGCCCCTCCTCAGAACCGGACTTGCAGAATTACCGCATTCTTGCTCTCAAAAAATAAGATAGGCATTATGCCTTATTTGTTGTCTAGAACATTGAGACAATCTTTCCAATTTTAGGAAAATTTACTCTTTTAAGTATCTCGGTTAGTCTATTCCAATTCATCTTACGTTTTCCTCCCATTCTATTAAACCAGTTATATATTGCCCGTTTACTTTGGTTGATAAATGAACTTACTCGTCTTTTGTTATCCGATATACCATGATAGTTGATCCATTCACCTAATAACTCTAATGACTTGTGATAATAGACATCTTTCGAAACTGGTTAACGTAGTTCAAAATTATAAATGCCAGAGATCAAATTAAAACTAAGACCTAATCTTTTATGTCTATTTTGATATTTATTAGCAATAATTTTGAACTACGTTAACCAGTTTCGAAAGATGTCTATTGTATATTATCTCTTGTATGCCTTTTGCATTATGTTTTTCGTATTTTCTCTTATCCTAATCTGGCGTTAATAAAATCACAGCAAAATATGTACAGCTGATCCTAAGGCTCAATTTCCTTGCTCTAAAACTTAAAGAAGCTATCCTTTTAGGTCACCAACCCCGCCATATGAAATTCGCTGATCTTATGCAAAACATCCACAGGCTTTGGCATGAACAAGGCGAATTATTTGGCTATGAGGTGGTGTGATTTGTTTTACTTTAAAACACTTTGTGAGTATAATATAGTGGCAATACTTCACAACTCGAAGAACCTGACAATTTTGACGATGAGTTGATGAGGTGGCTAGGTAATAAAATTAATGGTAATTTATGAAAATACTTTATTTTGATTTTTACGATGAATTACGCAAAAGGCAGGTCCCTGTCAGCCTTTATCTTCCTGAGAAAGCTAGCAACCCATTACCAACAATAGTTTTTGGTCCAGGCTATCAAGGACTAGAAGGTCTCACAGAAGAAGAGTTACTTAAGCGCTATAAATGTAAGCAATACACCTATTTAGCAGAATATTTTACCGCAAAAGGATATGCTTTTGTGAGTATACAGCATGATGTTTTCGGTGATGTAGATGGTCTTGAGAAGGTTGATCTAAATACGATTCAAGATGAAGCTCGTCGTCATTTATACATTCGCGGAGAAGCAAATATTTTGTTCGCATTAGCGCAATTAGAGCAGCAAAATTTACCTCTTTGTTTAGATAACTTGATACTTAGCGGTCATTCAAATGGTGGTGATATTGCCAAATATTTTGTGAATCAACATCCAGATTTAGTTCATTGTGTGATTTTATTTGATGCAAGAAGAGCAAGGTTAAGGCCTATATCCCCTCTGCCGGTACTCATGTTTGAGGCAGATGATACAACAACAGATGTGGGCGTTATCTCTGAACCAGTCCAGGAAAATAATGCAATGCGAGCGAATCTTGATTTAACTGTTATCAAACCAAGCGGCGCTCTTCATGAAAGTTATATGGATGGTGAAATAACTGAGCCGCTTAAGAAGAAAATTTTCTCGGCACTCGACTGGTTTTTGGAAAGCGTAGCATGATTATGGTACAGGATTTATTAGAGGCTGTTACTAAAGCTTTAGAAGATTGTGTTTTGGTCACAAAGTAAAAATCAACGATATCCCAATTGTTAAGCGAAGCTGATAGAAGGAATCGGATTGCCCGTCTGTTTTTATCCTCAGGCAATAATGAAATGCAATCCGTTATCTTCAAACAGTCACTCTCTGATAAAAGTCAAAAAACTACCGATGAAGATATCCTAGCAACGTCAGTTTAGGATAAGAAAAAGTATGAAAGGCATAATACAAAAGCTCTACAAGAGATATTATGTAATATCTTTAAATATAGTTTCAATTAATAACAGTTTATTTATTGCTCACATGTCTGTAAATGTAAATTTAGGATAAGAAACAATTAGAAAACAGATAATGTATAATTATACATTATCTGTTGTATACCTTTGTATACCTTTTATTTACTAACTTTCATATTTCCCCTTATCCTAAATTGGCGTTGTAAGTGTCTGAAAAATCTGGTTTATACTTAATAGCCAAATCAAAATTCTCTATTGCCTCTTGATATTGTTCTAGTATACATAAAGCAGTTCCTTTACTATTGTAAGGGTCTGCATAATTTGGTCTATATCGAATAGCTTGATCATAATTTTCAATTGCTTCTAGTAGCTTTTCAAGCTTTTTCAAAGCATT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS398551|805626:1019486|942011_943679_-|SPR05584.1|DBSCAN-SWA MSKQIVHSDQCRKKIIEGINVVANAVGITLGPKGRCVAIEQSYGPPKITKDGVSVAKAIQLKDKSLNVGAQFVISVASKTADVAGDGTTTATVIADAAVRELNKAEVAGIDIQEVRKGAEKAVEAVIADVRKNSSAVKNEEEIAQVATVSSNGDREIGEKIANAMKQVGQEGVITVEDSKNFNFEVEVVKGMRFDRGYISQYFATNREKMITEFENPYILLLDQKVSTVQPLVPVLEAVAHTGKPLVLIADDVDGEALTALILNNLKGSIKVVAVKAPGFGDRKKEMLEDIAILTNGEVITEQLGIKLEKVNDTSKLGTANRVIVTKDHTTIVHDKNNSDIEKKVNSRCEQIREAIKDTTSDYEKEKLQERLAKLRNGVAVLKVGGATEVEQKERKDRVEDALHATRAAVEEGIVPGGGVALFYASRVLDSLKFDNEDQRVGINIIKKVLEAPVRQIVKNAGGKEDVVVNELSKSNDKNLGFDARTMQYVDMIKAGIVDPTKVVRTALQDAFSVASLVIATSAMITDHEEDNNTNRSGGGVGGGHHGGGMGGMDF >LS398551|805626:1019486|886705_886840_+|SPR05379.1|transposase|DBSCAN-SWA MLRNEFIEKIKQISKENLVFIDESGIEDNACREYGWSIKGIART >LS398551|805626:1019486|967695_969174_+|SPR05693.1|DBSCAN-SWA 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234 | Indivirus(32.61%) | transposase,integrase,tRNA,protease | attL 833035:833094|attR 1026930:1027346 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1026092 : 1130663
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >LS398551|1026092:1130663|DBSCAN-SWA 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117 | Indivirus(17.39%) | transposase,integrase,tRNA | attL 1059602:1059627|attR 1126332:1126348 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1155690 : 1194337
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >LS398551|1155690:1194337|DBSCAN-SWA 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41 | Indivirus(57.14%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1199207 : 1241479
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >LS398551|1199207:1241479|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >LS398551|1199207:1241479|1203513_1204350_-|SPR06771.1|DBSCAN-SWA MIEYQEKCYQWFKELRDELIKTFELIEQHYASSKKVKVAKFIQSQWSRAGGGGGEMSIMRGNVFAKVGVNISKVYGDVPIALCDIIPCANYGSNFFATGISVVAHMKSPLVPAVHFNTRYLQTNNYWFGGGSDLTPLYPDKLETKKFHQAFQLVCDKYNPSYYEKFKAACDNYFYLPHRKEFRGVGGIFYDYLNSKNFDTDFNFTKNIGEAFLAIYPDIVKSKMFLPWSNSQYEALLVKRGRYVEFNLLYDRGTKFGLMTDGNIDAILMSLPPEVKWP >LS398551|1199207:1241479|1214036_1215602_+|SPR06825.1|DBSCAN-SWA MRPVVFDFLTNGCNFVKNNSNNNDTIFYNFIGNIIPPEWRKLTGDNGKALSKTSKQLLSFIVFRLHIYYNKDIDELQESYQLYEDKLNVGQRRVRQCLVELRDAGFIEIENRTIIKDNLKLRNVPCIKILKNFQHYSEKGKEENIALPEKKFRPNLKEISGQPETFFRDIYRYIKKSKISRSTEGELVENKKNENEEQNFQNVDDFENDIRTLTKNCNQDIESLITKILKSSNGKKEWFKRHRLEEFYPLTPEDVVTLQHKSDRGFNIYFINKLLLKLADQYSNYHFGCKASVLNYMAKALANELRTTDQANSDNCRFDNVEKSNKEKYLTQIETSANLSKESQLKHKIAGSFEAAMAYQILTSCSFGPAVRTRFFVKLLKNITLTECDESKILQAVQDVYGYEIQELQVTPFEQLKTVSQKQINEEEYLLNLSKQLDSNSIWYKVRESLIKSYGQAIDKSWFSSLKVVNEDSVNKKIFIKAKTEFEDSYIRENYLKDLESAFKAQGFSFELVKFSNFNKI 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MTDKINDSNNFNNIHNSKTDIENPKANSWNHNVAVKLTNGDIADGIVLLSDHNSLRADNTLKESINQLINDWKNSKFELQDRLIIAGHKEAENINQNIRNYMKENGDLKGPEYSILISGAESKKYANYMAGDRIIFQTNDKDLQIQNSEFATLVSIDENKFVAKTDTGEDISFDLNKISFKHGYATTVCNPQTAVKKDVYVLHNNGVGIESSNISMIGSADQVRLYYNVQATKNVANLIEQLSTAKTDFINLKEENNDVQANEVRQYQSAQNYRKNDYYSNSEEDLQKLRDAIAYRADTIACDLLGDPNKRLSKYGKLRWGDTGKIQVTTEGKYAGKWYDFSTGQKGDLLSLAQRERGYSFFEAKEYLKSMVGMSNISQRYQRPPKTDDSQQYTQQSESVKIAKVQNLYERSSRIHGYEIDTSPSAEVEIVKKYLENRGITFDKSTASSDLKGSILFDTQTRKNYPALTAFARNSKGEITGVQAVYLNLAGDKANISINRRSFGKISGSFITIAKRNANDPNITIIAEGAETALSLQQSGIKGNIIASAGIANLRNYSPFPGEKIIIAADNDSKNSITNNTVIKAAKTLEMKGAITCIVKPPENGDFNNLLQSCGEQSIRDIIEPEITKLTKAVETTKLTQTENNSIEKQNDITNVKELYNKSSSLYYLKQEEEAKLEAIVVNKFLENHTGIYSAKIFNNSNLRANMVFDEETQKSWPALTIFVKNEAGEITGAKILTLNSKTCNKADVAEKSVGTISGSFAEIAQQNLKYSPVTIITKDIETALTIWQARVEGKILCAIEAENLQNYNPGPKEKIILAVKNDVNTEKAKKVLEDKEAVVCTVKNDFNNVLKTQGLYAVRNIISPEIRKLNEKIESIQTNIQPGLCPKH >LS398551|1199207:1241479|1222250_1222550_+|SPR06855.1|DBSCAN-SWA 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>LS398551|1199207:1241479|1199207_1199417_-|SPR06749.1|integrase|DBSCAN-SWA MLGHSRISTTAKIYTKISVDKVKAATNKVVNNILTSDNANTELDKIIPEILASLGLQEERQIINSLSEK >LS398551|1199207:1241479|1206153_1207071_+|SPR06780.1|DBSCAN-SWA MEIISKNHTNSLDKAILRQPASKIDKLLSCLHCGLLNNKSVVSVIHLTGIIGKVGSFKSGLTLHTLNSVIEKAFSFKKLTAVCLVVNSPGGSPVQSELIASRILQLSNQKNVPVYSFVEDVAASGGYWLACAGKKIYASKSSIIGSIGVIYMGFGLHEAIGKLGIKRRVYTSGNNKSILDPFMPEKDSDIKIIQNLQKKIHNHFISYIKSRRGDKITQEDKVIYNGEFWSGEQALEYGLIDGINDMYSFLNTKYGDSIKIEYVSTKQSWIKRKLGLIIDIGADSLVQKTLKAIEHNASTNKYNLH >LS398551|1199207:1241479|1236898_1237345_+|SPR06911.1|integrase|DBSCAN-SWA MPVILLNFTQSALNKIKVPTKEEKIIQFRDTKERNLLLIISYTGFRRFYLVINIGGRYYKIKIGTSPDLTVKEARKKVMKLKKDIANGIHPMEERRKINRERREKRHKRLELQNGLTFGHVADKYRNRRKRFGLRFNLISDIYNFELR >LS398551|1199207:1241479|1229133_1230612_-|SPR06876.1|DBSCAN-SWA 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>LS398551|1199207:1241479|1233954_1234947_+|SPR06904.1|DBSCAN-SWA MKIAIIGAGAWGTAIAMLLARNNHRVTLYTRHSAHTQEINQLHTNKKYLPNIILPNIISATSNFSDIVDHEIIIIVTPSDQVRATIENLKQHGISNNAIIGIASKGLDHNQSKLLSDVVKDHFANNPLFIIAGPNLANEVAQGLPCTLTIAAIQKEVRCNISALFHSTNVITSTIEDIITIQVASAFKNIIAIIAGIIIAKQYGQNCKASIITQGIKEIVAFARAVGSTNPDISEFGVIGDLILTSYAITSRNTKFGYDLGQYEYYTDLSSNTNPNLIEGIKAAKILYPLTVKLNLNCHIIDCAYSILHNGSKISYAIECMLKKINHETK >LS398551|1199207:1241479|1237451_1237826_+|SPR06917.1|transposase|DBSCAN-SWA MARRYSYDLRMKIFKAVDDGLSIVKACKIFNISRNTIYRWKHLKRETGDIKAKPYGPAKGYNAKIDLKEFEELIINHHDKTAKELSIILGNRLQRTRINYYRKLLGYTYKKNSFSFQKGYCVKE >LS398551|1199207:1241479|1215610_1217059_+|SPR06830.1|DBSCAN-SWA 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MIAGLCNNQIIAPVIFEGNCNKAIFTTYVETILIKELRPGQIVIMDNINFHKNNTIKVLIESVGCSILFLPTYSPDLNPIEHYWFKIKNEIRKVTAQFKDISIAVEHVMKFI |
42 | Indivirus(37.5%) | transposase,integrase,tRNA | attL 1202063:1202082|attR 1237346:1237365 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1254417 : 1300469
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >LS398551|1254417:1300469|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >LS398551|1254417:1300469|1296068_1296497_-|SPR07202.1|DBSCAN-SWA MAQVKHSYFFYDNNTLNKGYSKNSNNEYNHKIQYQNRTAFSESIPNKKKHQHVLNDTQNIIISLFRKINLIFLVLSLTIIFLTSFYLINIQSVNKLYIFILSSLVIMLIGYLINIYKMQKLTSLGLIYDQLYNSKKYDFHNN >LS398551|1254417:1300469|1278804_1279593_+|SPR07097.1|DBSCAN-SWA MTILIINLVIATVLISILLASLGCIILWQRYTSFSDGLVHSCVLAGSMVSIFNLPTLISAFLVALIYSGAIFFFSNNNYNKSTVVFIVSNGMLALSAILSTIVPGAPTVSSLLFGGELWLINSADIIILFILVLIIGALLYTNFKAIILMSLNKELAVVILERHPRVIEMMFLVILSTTIIVTIKIFGGLFLTAWLVIPAATARIISNSAAKMIIYSNLLSVMFNLTGIGVSVYLDTPTTATMVFTNFLAFVVIFIIFKTSD >LS398551|1254417:1300469|1284915_1285407_-|SPR07128.1|DBSCAN-SWA MSIRVMSIRVLRFMIGFIALVNVNNIYAVEYELEADNLLKLEISDSGPTRINLKDEKINDIFMYPQNAAEVVVHESGFLFIAPREEGNKVYLTVIGEYKTIQDLMLIFTPKTPNPVMLVNAATKIEEKDNSKQNNTNLFSNDVNTKELTAKPSKKQSRNTKEK >LS398551|1254417:1300469|1295477_1295861_-|SPR07199.1|DBSCAN-SWA MKRILIIVILPIILSYFIIEKTGILEYMKKSDLQDEDFMIYDDDNIYIYTKPTCPYCLNAKSLLNQKSVSFKEIDISNNQQLHEKLKQATSQTTVPYIFIYGQFIGGYMQLQDLDNTDKLDELLAQK 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>LS398551|1254417:1300469|1267098_1267425_-|SPR07057.1|DBSCAN-SWA MFAVIKTGSRQYRVAKDSIIKIEKIDGEPGSTVEFKEVLMIGEYSKPSFIGTPIVKGASVTAQILNQLRDQKVIVFKKKRRKNYRNKRGHKQEVTQVKIIDIAKASNC >LS398551|1254417:1300469|1285403_1285556_-|SPR07132.1|DBSCAN-SWA MNGVLISGTLRYWFSDSKHIAVDKTYLLTYKRTPNYLLLLTGVKENGIKK >LS398551|1254417:1300469|1290893_1291172_+|SPR07175.1|transposase|DBSCAN-SWA MKFDQIKELKDEKFRRLTGVRKGIFSKMVDILSKADGLKKSKGGRKNKLNLEEQLLMALEYLREYRTYFHIGQNYWISESSAYKAVKLVEAP >LS398551|1254417:1300469|1285536_1285956_-|SPR07137.1|DBSCAN-SWA MNHLFKQNAIQELVKYNKCLLSVTILIAAANIIAIMAAITKEEKWLLIPEMEPDRKMMVSSKNYHETYLKEWAIYVMKLLFATSPNEVERQIANMNVVFSNTESLNKFFQNHLQFVKGSNVSSVFFPKNVEVINEWSIN >LS398551|1254417:1300469|1287790_1287991_-|SPR07149.1|DBSCAN-SWA MLIFINIFNQASTLTINIFAIFVNITKKLKQKVENRLKKILGNLEPVFNLEVNLMIEKYIQPEIDK >LS398551|1254417:1300469|1261085_1261250_+|SPR07029.1|DBSCAN-SWA MQHIVRDILTNGCNFVKNNSNNNTTIFYRFIGNFIPAEWRKLTGDNGKRIKQNI >LS398551|1254417:1300469|1278110_1278824_+|SPR07092.1|DBSCAN-SWA 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>LS398551|1254417:1300469|1289050_1289377_+|SPR07159.1|DBSCAN-SWA MSIRVLRFMIGFIALVNVNNIYAVEYELEADNLLKLEISDSGPTRINLKDEKINDIFMYPQNVSEVVVHESGFLFIAPREEGNKVYLTVIGEHKTIPICSVMTLIQKN >LS398551|1254417:1300469|1275595_1277275_+|SPR07082.1|DBSCAN-SWA MLERQSGYVVWARKYRPKTMCELIGQEVLTKVLTYSMITGCLSQAYLLSGIRGVGKTTAARIIATTINCLQPVVTSKTIFACTKCNSCIAMENNSHPDINEIDAASRTGVEDVRTIIDDSEYKPLISKYKIFIIDEVHMLSKNAFNALLKLLEEPPSHTIFIFATTEINKIPLTVISRCQKFDLRRLDVNNIVQILSNIIAKENVSATKEILEFIAVKADGSARDAISLLEQAKALAQNIADTASSEAVVISLNTVEQMCGVLDLGKSTDLLSAIAEKNAEKGINIVTDLYISGTDFVVCSQNILDLIGYLIKVKTIDGYTESIYASHNNRLNSLSMKLSLSRLTVLWQIFSKSIQELKISHNPRLCFEVVVIKAIYSFSLPTPIDALRQLKSELTDAKTNVDNAANSPAVAESLPASMDKYKLQSYDCYSDVNNIKMLNESNNSNNYLMILVDFLKYLNQIGEVDLYYYLMNIVSVIDITGCSVFLSSKGSNAKMNSQLTMHLCKWRPNNWNVLTVENDTKLPLKAELIQRFKVSKAWDLITTNFKDVEVVDIIMNKK >LS398551|1254417:1300469|1256982_1257117_+|SPR07007.1|DBSCAN-SWA MTVHSIDRNTWLTKLERIKLLPSQNQDIKFNNLGRIIDFNIVYR >LS398551|1254417:1300469|1282479_1282671_+|SPR07109.1|DBSCAN-SWA 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56 | Indivirus(30.0%) | transposase,integrase,capsid | attL 1258782:1258813|attR 1289461:1289492 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1308501 : 1350196
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >LS398551|1308501:1350196|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_13 >LS398551|1308501:1350196|1313737_1314325_+|SPR07289.1|DBSCAN-SWA MKLHHLKELKELVESQFAISSIRAKFNITNHVEAIINKEQLIEVLKLLKNDKELKFTILTDIFAADFPDRNKRFEIVYNLLSIIKNIRLIVKINLNDNELIQSATPVFSNANWYEREIYDLFGIKFANHPHLKRILTDYGFVGHPLRKDFALSGYSQVKYDDKLEKVVYEPVKLDQEYRNFNFSSPWQGPKSTTN >LS398551|1308501:1350196|1342788_1342911_+|SPR07433.1|integrase|DBSCAN-SWA MPVTVFEFTQSALNKIKVPTKEEKIIKFRDIIERNLLFII >LS398551|1308501:1350196|1321261_1321612_+|SPR07311.1|DBSCAN-SWA MKLLSFKQNCYLKPLLMLCFFVLLLSSSIVSAQEVTDPIGEKLCNIVGILSGKTTKALCLVAIVVLGITTFMGKVNMSTAVITICAIIITTQSAKVYEFIAGKDANGNNTTCEKSK >LS398551|1308501:1350196|1316109_1317378_+|SPR07301.1|DBSCAN-SWA 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MSENTFSDTTSIYNQNLSNQGFILANLENLVSWARTRSLWPMTFGLACCAIEMMQTAGSRYDMDRYGMLFRPSPRQADVMIVAGTLTNKMAPALRRVYDQMTEPKWVISMGSCANGGGYYHYSYSVVRGCDKIVPVDIYVPGCPPTPEALLYGILQLQKKINRTQQVKFKR >LS398551|1308501:1350196|1347221_1347398_+|SPR07472.1|DBSCAN-SWA MKSWKLQQLEKDLVKIFNYTLISGEIQEIVNLGGKTAYLVPGNRYPKLLRKISSMQAK >LS398551|1308501:1350196|1324636_1325377_+|SPR07337.1|DBSCAN-SWA MYNNSTIDQDEIEKFNTIANEWWNPNGKFKQLHLMNPARIRFIKQKILLHYNLIDSITRPFHGLKIADIGCGGGITSIPMAKLGATVTGIDASSKNIAVAKMYANNIGMQVNYIHSSIEEYVKISSEKYDVVLCLEVIEHVSNIQSFILYLSKILKLGGMLIISTINKTLKSYVFAIGLAEYLLRYLPIGTHDFNKFLKPSTINNILLSHNMTLKEIQGLSYNPILQQWRLTNDISVNYIMYITAI >LS398551|1308501:1350196|1342004_1342157_+|SPR07429.1|DBSCAN-SWA MVNVIALKVRCSGSRYVLAHSRQKKIGGQTSENPKIFNHRGRRRQRVCKD >LS398551|1308501:1350196|1312827_1313199_+|SPR07280.1|DBSCAN-SWA MLHLLTSLEYLPIVIFFAIALALSFFIIILPKIFASKKYNKSKLESYECGFDTFSEARSKFDIRFYLISMLFIIFDLEIAFLIPWAVNLKETKMFGFYSMMFFLLILVIGFIYEWKKGALEWE >LS398551|1308501:1350196|1335780_1335897_-|SPR07394.1|transposase|DBSCAN-SWA MKSDMNYEVVLIDATDSPIERPKKNKNSIIQERRKGIH >LS398551|1308501:1350196|1344032_1344173_+|SPR07448.1|integrase|DBSCAN-SWA MDERRKINKERREKREKRLKLKNELTFGQVHVKYTRLLSKLDNDIE >LS398551|1308501:1350196|1343339_1343729_+|SPR07443.1|transposase|DBSCAN-SWA MLRDEFIEKIKQISKENLVFIDESGIEDNACREYGWSIKGTRCYGNKAYQHKSRVSMIAGLCNNQIIAPVIFEGNCNKAIFTTYVETILIKELLPGQIVIMDNINFHKNNTIKVLIESVGLQYSILTYI >LS398551|1308501:1350196|1336596_1337187_-|SPR07404.1|DBSCAN-SWA MVKNTSYLFLTGHDVVKQVVGEDISSAKLSGSFVHTTQSGIADLAFENDIAALLEIRKFFNFLPLSNTHLTPYRETNDPADRVNMSLNTLVPINPNKPYDMKELVERIVDEGYFFELQPDFAKNIIIGFGYMEGNPVGIIANQPLYLAVCLDINASRKDARFIRFCDVFSILLVTLVDAPGFLPCQNQESNGIIKH >LS398551|1308501:1350196|1327710_1328202_+|SPR07354.1|DBSCAN-SWA MSDTLIQDVHLSDLSASLTNEPKVVSQPVLPKKDKLGYSYGTGRRKCAVARVWIKQGTGITTVNKKPIASYFKRLAHTQIALSALTITDVAQQFDVKCTVKGGGLSGQAGAIQLGISRALNNFNPELHSVLKKHKLLTRDSRIVERKKYGRHKARKKTQFSKR >LS398551|1308501:1350196|1342978_1343353_+|SPR07438.1|transposase|DBSCAN-SWA MARRYSYDLRMKIFKAVDDGLSIVKACKIFNISRNTIYRWKHLKRETGDIKAKPYGPAKGYNAKIDLKEFEELIINHHDKTSKELSIILGNRLQRTRINYYRKLLGYTYKKNSFSSQKGYCVKG >LS398551|1308501:1350196|1346296_1347136_+|SPR07467.1|DBSCAN-SWA MNHLFKQNAIQELVKYNKCLLSVTILLAAANIIAIMAAITKEEKWLLIPAMEPDRKMMVSSKNYHETYLKEWAIYVTKLLFTTSPNEVERQIADMKVASSNTESLNKFFHDHLQFVKVIMAKLNAASKSGLLNQIQLEFQEKVRQKIMRPVPVKNLSKATENKTQIYDSTYVQKDDIKTKNGIIIVKGGTKINPLEVINWGEPLILIDGDDEDQVAWAKSRPGKIVLVNGNPIELSNLLGRHVFFDQLGFLSMKFKIQAVPAIIEQQNNVLKISEVSTL >LS398551|1308501:1350196|1348400_1348784_+|SPR07485.1|DBSCAN-SWA MVIRVMMLMVLLFVNNANAFFLDKQKTFIFVSFSMSDEALKSYFAESQKAGAQLVMRGLINNSFIQTKNKTMELGISFDIDPSLFEKYKVDVVPVIVIDDEKRGLTKKLTSHIPLAIALEIMENNTP >LS398551|1308501:1350196|1332626_1332755_+|SPR07368.1|transposase|DBSCAN-SWA MLRNECIERIKIILKNKIVFIDEFGIEDNAYLNYGSSSICSR >LS398551|1308501:1350196|1327224_1327707_+|SPR07349.1|DBSCAN-SWA MKTYSAKPAEISKKWILIDATNLVLGRLAAKVAVVLRGKDKPTYTPHMDCGNNVIIINAEHVKLTGDKSNAKNGKFYYRHSGFPGGIKVTTAGKILQSNYPERIIQLAVKRMLPSNKLGRKQFSNLYVYKGQTHPHAAQTPVLYDFAGKNSKNIRNQNIV >LS398551|1308501:1350196|1325363_1326230_-|SPR07342.1|DBSCAN-SWA MRIKDALAIGNNLLSQHEIPNSAFESRLLLAHIIGQSQEYILFHSDHLLLNSNYNQFLKLIKLRTKYLPIAYLIGYKEFYSRNFIVDKSVLIPRPDSETLIDAVVQDYRKIANYQPSAPIKILELGVGSGCLIITLLLELSNAIGVGSDISTSALNIASRNRQKYKLEKSLNLVQSNWFSGLDAGKKYDIIIANPPYVSDSELRILSRETLLHEPHIALFSNNNGLQSYQEIAPMIPSFLNSNGRLYLECSYNKAEMVCAICFKNGLILENKYYDFNSYCRCLKFKLQ >LS398551|1308501:1350196|1308501_1308654_-|SPR07257.1|transposase|DBSCAN-SWA MAYFLYQTRVMNSIILGIDVSNDTFDTAMLINNKVQTKKFNNNALNGFTN >LS398551|1308501:1350196|1337842_1338217_-|SPR07412.1|transposase|DBSCAN-SWA MARRYSYDLRIKLFKAVDDGLSIVKAYKIFNISRNTIYRWKHLKRETGDIKAKPYGPAKGYNAKIDLKEFEELIINHHDKTAKELSIILGNRLQRTRINYYRKLLGYTYKKNSFSFQKGYCVKE >LS398551|1308501:1350196|1317670_1318384_-|SPR07302.1|DBSCAN-SWA 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>LS398551|1308501:1350196|1338911_1340021_+|SPR07420.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLNLKVAKEQATIVVAMSGGVDSSTVAAILKEDGYNVIGITMQLYNHDTAINRKGACCAGQDIYDAKFVANQLQIPHYVLNYKDKFKESVIDNFIESYINGETPLPCVQCNQSVKFHDLLNFAKDLQADALVTGHYVRRIDTANGIELHKAVDSKKDQSYFLFATTKSQLQYLHFPLGNMTKDETRYHANRHGLHIADKPDSQDICFVADGSYHNVVAKLKPNAKKPGKIIHIDGYILGEHQGIINFTIGQRRRIGISFSDPLYVINIDAQQNIVYVGPESKLFKTTFMIHSLNWLGPGNMLVEPLDVEVKVRSTHSAVRAKLYPYSNSMVKVILNEPEKAIAPGQACVIYKGDLVLGGGWIAKEQTQS >LS398551|1308501:1350196|1315537_1316092_+|SPR07297.1|DBSCAN-SWA MNSATKPEFSFSSDTLVIAKKIINNYPAGKEASAVLAILDLAQNQNNNWLSNSCIEYVANLLKMPYIKVYEIASFYTMFNLQPIGKYHIQICCTTPCWLRGSDDIMNFCKKLLKIETGKTSQDKLFTVSETECLGACRNAPVVQINHDYYENLTNDKIEEIINNLHAKDLQKKSELKPDNKSDL >LS398551|1308501:1350196|1337349_1337856_-|SPR07407.1|transposase|DBSCAN-SWA MLRNEFIEKIKQISKENLVFIDESGIEDNACREYGWSIKGTRCYGNKAYQHKSRISMIAGLCNNQIIAPVIFEGNCNKAIFTTYVETILIKELRPGQIVIMDNINFHKNNTIKVLIESVGCSILFLPTYSPDLNPIEHYWFKIKNEIRKVTAQFKDISIAVEHVMKFI 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57 | Indivirus(80.0%) | transposase,integrase,tRNA | attL 1337321:1337349|attR 1357249:1357277 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_14 |
1354886 : 1402149
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >LS398551|1354886:1402149|DBSCAN-SWA 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55 | Indivirus(71.43%) | transposase,integrase | attL 1361416:1361475|attR 1393061:1393164 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1407032 : 1455126
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >LS398551|1407032:1455126|DBSCAN-SWA 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52 | Indivirus(37.5%) | transposase,integrase | attL 1422082:1422111|attR 1453726:1453755 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1462501 : 1503679
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >LS398551|1462501:1503679|DBSCAN-SWA 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48 | Indivirus(40.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1516972 : 1547510
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >LS398551|1516972:1547510|DBSCAN-SWA 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MSPVVLVASGRVIDVVFKKGFDLREHKKKPHNSTYTPSTSNEKVNSHNQFNQSQKLEEHL >LS398551|1516972:1547510|1529916_1530159_-|SPR08438.1|transposase|DBSCAN-SWA MTKQLKHDSLAKTIMSDPVAAQEFLEYYLPTDFKSLIDLSQIKVEQESYIEESLKKKYSDIVYRVATKKHGNAFIYSHLQ |
48 | Indivirus(71.43%) | transposase,integrase | attL 1517885:1517912|attR 1526602:1526629 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1558638 : 1609005
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >LS398551|1558638:1609005|DBSCAN-SWA 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53 | Indivirus(33.33%) | transposase,integrase,tRNA | attL 1558829:1558888|attR 1621036:1621107 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1619565 : 1664171
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >LS398551|1619565:1664171|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_19 >LS398551|1619565:1664171|1636656_1637385_-|SPR08982.1|DBSCAN-SWA MPIEDEGQNKINKLTEKLSTEGINSTTIKQIDAELQKLYCQLEESGQVSIKLIDWIQYFRRIVNDYNKKKVNIIASLNGIIFLFRQYIESTNVRIETFNIEPLINNTVIRMRKNFENENINLNVQNDINPILIGDSFRIKAVISQLIGSAVINSSKNSKIIVNVNQNSEILQFIVQNIGLSTSKEKLERINAELENTNLVMYQELGEGLAFIKHLTHQMKGNLRVKEQNNYVTFSFDVPTIV >LS398551|1619565:1664171|1639937_1640390_+|SPR08992.1|DBSCAN-SWA MQSLSMEATRMKLEQQKNQLFNEQKHYIAKQENRSHIELNSQMRKIFKQKSATSKLLKKLINCIQDVNKSSEEKKEQIDSLMEGGIPSKFKSLLKKQHSGEQGIITKVLQVEARKADEEYDSNEKISSFVQDKIVKYSGSALDLIDDWDI >LS398551|1619565:1664171|1663814_1663919_-|SPR09255.1|DBSCAN-SWA MNYEVVLIDATETPIERHKKNKNSIIQERRKGIH >LS398551|1619565:1664171|1629946_1630219_+|SPR08933.1|transposase|DBSCAN-SWA MKCDQIKELKDEKFRRLTRVRKGTFSKMVDILRKADGLNKSKGVSKNKLDLDEQLLMVLEYLREYRTYFHIGQNYEISESSAYIVIYNEV >LS398551|1619565:1664171|1652167_1653019_+|SPR09195.1|DBSCAN-SWA 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57 | Indivirus(38.46%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
1673426 : 1725803
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >LS398551|1673426:1725803|DBSCAN-SWA 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MANLMQQKITLQQKKAKLIMDEVNLKIKERKMRTRRLIEMGGLVAKAKLDHLSTNTLFGAIVSLKETLTQHPNVQDHWTTIGKDIFDKEQQNKAAVILKFSSEPDENTKRHIRLHGLKWNSFRQEWCGHVKDIEALKNGLLNVQYSIELVV |
51 | Streptococcus_phage(30.0%) | transposase,integrase | attL 1695702:1695718|attR 1722117:1722133 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
1731282 : 1815542
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >LS398551|1731282:1815542|DBSCAN-SWA AATGGCAAGAAGATACAGTTATGATTTAAGAATAAAGCTATTCAAAGCGGTAGATGATGGACTATCAATTGTTAAAGCATGTAAAATATTCAATATAAGTCGTAATACGATATATAGATGGAAACATCTTAAAAGGGAAACAGGAGATATTAAAGCAAAACCTTATGGCCCAGCCAAAGGTTATAATGCAAAAATAGATCTCAAAGAATTTGAGGAGTTAATTATCAATCATCATGATAAAACAGCTAAAGAATTAAGTATTATACTAGGTAATAGATTACAAAGAACTAGAATAAATTATTATAGAAAACTACTAGGATACACTTATAAAAAAAACTCATTTTCATCCCAAAAGGGATACTGTGTTAAGGAATGAATTTATAGAGAAGATAAAGCAAATTTCTAAAGAAAATCTAGTATTTATTGATGAGTCAGGAATAGAGGATAATGCTTGTAGAGAATATGGATGGAGTATAAAAGGTATAGCACGAACGTAGGAAATAGGTACATAATATGCCAATATGAAAAGAGTATAAAAAAAAATAGATAAATAATGGCAAGAAGATACAGTTATGATTTAAGAATGAAGATATTCAAAGCGGTAGATGATGGACTATCAATTGTTAAAGCATGTAAAATATTCAATATAAGTCGTAATACGATATATAGATGGAAACATCTTAAAAGGGAAACAGGAGATATTAAAGCAAAACCTTATGGGACAGCCAAAGGTTATAATGCAAAAATAGATCTCAAAGAATTTGAGGAGTTAATTATCAATCATCATGATAAAACAGCTAAAGAATTAAGTATTATACTAGGTAATAGATTACAAAGAACTAGAATAAATTATTATAGAAAACTACTAGGATACACTTATAAAAAAAACTCATTTTCATTCCAAAAGGGATACTGTGTTAAGGGATGAATTTATAGAGAAGATAAAGCAAATTTCTAAAGAAAATCTAGTATTTATTGATGAGTCAGGAATAGAGGATAATGCTTGTAGAGAATATGGATGGAGTATAAAAGGTACTAGATGTTATGGCAATAAAGCTTATCAACATAAATCCAGGGTCAGTATGATAGCAGGGCTTTGTAATAATCAAATTATAGCACCAGTAATATTTGAAGGAAATTGTAATAAAGCAATATTTACAACTTATCTAGAAACTATATTAATCAAAGAATTGCTCCCTGGACAAATAGTAATTATGGATAATATCAACTTTCATAAGAATAATACAATTAAAGTATTAATAGAATCGGTTGGCTGCAGTATTCTATTCTTACCTACATATAGTCCAGATTTAAATCCTATAGAACATTATTGGTTTAAGATTAAGAACGAAATAAGAAAAGTTACTGCTCAATTCAAAGATATTAGCATTGCTGTAGAACACGTAATGAAGTTTATTTGATTGTACCTATTTCCTACGTTATTGCTATAACTTCATATCATTGCCTATAGCATGTTGTAAGTTATTGCTTTCAAAGATCTATAATATCGAATTTGGTAATCATTAGACTTCTTTCGAAGCTAGACAATGATGTAGAATAGTGTTATAAAGATCTGATTTGAGGTAATAATGAAATGTGATCAGATTAAAGAGTTAAAGGATGAAAAATTTCGTCGATTAACATGGGTAAGGAAAGGAACATTTTCAAAGATGGTGGATATTTTGAGGAAAGCTGATGGTCTTAAGAAATCAAAAGGTGGGCGTAAAAATAAGCTCAATTTGGAGGAACAGTTGCTGATGGTCTTAAAATAATACCTTAGAGAATACCGTACTTATTTCCATATATGTTAGAACTATGGAATTAGTGAAAGTTCATCATATAAAGCTGTAAAATGGGTAGAAGACACCCTAGTTAAACACCCAAATTTTGCTCTTCCAGGTCGTAAAGCTCTAATGAAGAGTGATATGAATTATGAAGTAGTCTTGATTGATGCTACTGAGACTCCTATAGAAAGATATAAAAAAAACAAAAATTCTATTATTCAGGAAAGAAGAAAAGGCATACACTAAAAACTCAAATAGTGGTAGACAAAAAAACGCACCAAGTAATATGTACAGATTTTTCTAACTGTAAAAAACATGACTTTAGATTATTTAAGGAATCCAAAATTCTTATCAATCCTAAGGTTAAAGTGATTACTGATACAGGATATTAAGGTATACAAAAAATTCACAATAATTCTGAATTACCAAAGAAAAAAAGCAAGAAAAATCCTTTAACTAAAAATGATAAAAAGAATAATTGTAGATTAGCAGGAGAAAGAGTTGTTAATAAAACCGTTATTGGTATGCTAAAACGGTTCAAAATTATTGCTGACAAATATCGAAATAGACGTAAAAGATTCGGTCTTAGATTTAATTTGATCTTTGGCATTTATAATTTTGATCTACCTTAACCAGTTTCGAAAGAGGTCTATTATATAATCCAATCTTCTCATATATAGTCATTTACAATGAAGTTTGCGTATAAAATATCATGTTGGTAAATCTTATGATGCTATTATCGCTTTTTCTATACTCAAACTTCATTGTAAATGACTATAATTCTCTTCTACGACACCTTTTTCAGCATAAGCCTCAACTTCACGTAATTGCATTAGATGATATCCTACTTTCTTCTCTATCAAGTCGCTTACATATCCAAAACCAACTGCTAGAGTTACCAACCCTAAAGTAATTTATCCAGCAGCTCGTAATATCTGGTTGATAAGATATATAGTCATTTTCAATGGGGTTGAAGCATAGAAAAAAGCGATAATAGATTCATAAAATTGGGTAATTTGATTTCTAATCCACATCTTCATATTAACTCAAAACTTTTCTATCGAATTTAAATCTAGAGAATAAGATAGCAGAAAAATAACTTTACAACCAACAGATTATATTAACTATTTTATCTCTTCTTTCTATGCTCAAACATCATTGTAGATGACTATATTTTCCTTCTCATGCCTTGTAATTCTATAGATATTTTTATCATTCGTCATTACCTCCATTGCTGTTGAAATAATGTTATCAGTATGGTACGTTTGCTCCACAGGCATTACACTACTTCATTGCTAATACATACCACTCTGTCATCCTCTCATGTTCAATTTATTTCATAGTTTACTAGTTATAGAATCTACATTGCTCTAGAATCTTTCTTTCTGGAACGAGAGTATTTCTCCAATTACTTAATATGTACTTATTATCATGCCGCCACTACCACTCAGCTATAATGTTCAACTGTATCAGTTATAGTTTTCAGTTAAGCATTCTGCTTTCGCTATACTGTCGCTAGCTCAGCCTTTTGGACTTATCACTTTCAGAGCCATCCATGTATTCGCTTTCGTTGCAGCTTGATAATTTGCTCTTATCCTTTCGATAAGTTTGTCGATATGTTCCAACATCTCAATTTCTCTCCATGCTGCTATCCTAACTATAGATTTCTAACTCTTCATATAGTAGGGTTACCTCACACTGTACATATTAGCTCCTCTGGATATACAACTAGTACGTGATGCTTTGGCATCACATTACTCAAGCCTCTTTAAGCACAATTTCTGTTGAACAGGTTTAATATGTGTAAGCAAACATTGCAAAGCTTTTGCTTTATTCCATCTGCTTTCCTGTATTGCATTTACGATACGAGTTCGATGATTTTTAACAACTTTATTACATTTCTTCAAGTTTATACTGTGCCAATGTATTTTGTTATCAGTAGACGCACTAGCTGTAAAATTTATAACCATCATTTGCTTTTCTCATTGCAAAGTTTTATCAAATTCTCTCATCATAAGAGACCATGACAGAAGACTCCAACTTTCGTGTGGAGCATTTTTTTCTGTTTTCCTCTGCTTGCACCTTCATCAGCTTACCTTACATCTCACCTTCAATATTGGAAAAGATACAGGCTTACTGTGTTCTATCTATATAACATAAATTGGTTATGTTCTACCTGTCCGCATGTGATCATATAGTCTACGTATTGTCAGGTTCTAAGGCAAATAATCAGATCATTTCTCTTTTGAACAAAGCCTTACAGTATCCTTTGCTTTTTATTACTAACAACATTCATCAGTAGTTTACTTATGTTAACTATGCCATTTACCTAGCCTCTGGCTGCATGATATAGCACGAACGTAGGAAATAGGTACATAATATGCTAATATGAAAAGAGTATAAAAAAAAATAGATAAATAATGGCAAGAAGATACAGTTATGATTTAAGAATGAAGATATTCAAAGAGGTAGATGATGGACTATCAATTGTTAAAGTATGTAAAATATTCAATATAAGTCGTAATACGATATATAGATGGAAACATCTTAAAAGGGAAACAGGAGATATTAAAGCAAAACCTTATGGCCCAGCCAAAGGTTATAATGCAAAAATAGATCTCAAAGAATTTGAGGAGTTAATTATCAATCATCATGATAAAACATCTAAAGAATTAAGTATTATACTAGGTAATAGATTACAAAGAACTAGAATAAATTATTATAGAAAACTACTAGGATACACTTATAAAAAAAACTCATTTTCATTCCAAAAGGGATACTGTGTTAAGGAATGAATTTATAGAGAAGATAAAGCAAATTTCTAAAGAAAATCTAGTATTTATTGATGAGTCAGGAATAGAGGATAATGCTTGTAGAGAATATGGATGGAGTATAAAAGGTACTAGATGTTATGGCAATAAAGCTTATCAACATAAATCCAGGGTTAGTATGATAGCAGGGCTTTGTAATAATCAAATTATAGCACCAGTAATATTTGAAGGAAATTGTAATAAAGCAATATTTACAACTTATGTAGAAACTATATTAATCAAAGAATTGCTCCCTGGACAAATAGTAATTATGGATAATATCAACTTTCATAAGAATAATACAATTAAAGTATTAATAGAATCGGTTGGATGCAGTATTCTATTCTTACCTACATATAGTCCAGATTTAAATCCTATAGAACATTATTGGTTTAAGATTAAGAAC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117 | Indivirus(57.14%) | transposase,integrase,tRNA,protease | attL 1724864:1724892|attR 1815587:1815614 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
1829392 : 1921035
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >LS398551|1829392:1921035|DBSCAN-SWA 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100 | Indivirus(23.81%) | transposase,integrase,tRNA | attL 1847487:1847502|attR 1930568:1930602 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
1930391 : 2093921
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >LS398551|1930391:2093921|DBSCAN-SWA 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171 | Indivirus(29.41%) | transposase,integrase,tRNA | attL 1962688:1962729|attR 2094734:2094777 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_24 |
2101595 : 2123966
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >LS398551|2101595:2123966|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_24 >LS398551|2101595:2123966|2102335_2102443_-|SPR11625.1|transposase|DBSCAN-SWA MLRNEFIEKVKQISKENLVFIDESGIEDNACREYG >LS398551|2101595:2123966|2101595_2101913_+|SPR11609.1|transposase|DBSCAN-SWA MIQTCEKAIEILFGLKTEAIVLAFFNIEKFNFAKQVVAFAGLNLKHSQSCTFIHCASRISRTGNVNNLCKKLIICLCYVCLNTISHAVFFQQQAHIRFVMCTNTI >LS398551|2101595:2123966|2116351_2117518_+|SPR11702.1|DBSCAN-SWA MISKKLIIELLKQLISFKSVTPNDNGAIDFITNLLVKQGFKVYVKEFGQEYKVKNLYGYFGNGQPNICFAGHIDVVPAGFIEQWKYPPFCATQYKDKIYGRGVVDMKGAISAMLSAVFCFIDNNNDFNGTISFLITADEEGEALFGTKKMLEWINKQGHKIDFTILGEPTCTNKIGDTIKIGRRGSINFDLKVFGKQGHVAYPHLAINPNHLIVKILNRLIAYKIDEGNEFFAPSNLEVVSIDTNNNITNIIPEIAKSKFNIRFNDIYTNEQLLEIIKNTVEQFTTSYDLQSSCRSKPFLAKMSPYIFSFKELVHKVTKIKPEFSTSGGTSDAYFFKDYSPIVEFGLLNTMAHKINEYCLINDLQTLCRVYYNALCLFLMSNSKFRTN >LS398551|2101595:2123966|2108094_2108424_+|SPR11672.1|DBSCAN-SWA MAVKIRLARSGAKKCAYFKIVIANNCSPRDGAFIEKVGHYNPMLPKDNHERVVLKTDRIEHWLSHGAQPTEKVINFIQQFSITLPLAIQKKHSIKLKKYVAKPSKKVSK >LS398551|2101595:2123966|2117671_2119138_+|SPR11708.1|DBSCAN-SWA MSQIIELQSEGLEKHFQISIPASVIKDKTDQKVISLTARANMPGFRKFKSGSHITSKAMQVKQLQIRRQYEASIKNDVQNDVIVAAVESLIKSNNFSLIGDPSIKINDDSSIEVNSEQNSNAEEKDITVDVKFTVYPEIKIPDFSQITLKKHIIQCTEESVNEFINGLRHEVYEYKDCSEQEKAIKGSKLVIDIAITGDGIEDHNKEDIEFILGSGKLISKDIEERFTDSIVGSQLDISTTLPDNYPDSKAAGKLANLRVTVKKIQQPVLITEQQILDKYKVTSIDELKVKVKELQNKEFMGLSQILLRARLLNQLDKMLDYDLPKQLLKSEYAVVRQNVLAALKDNNNNNNGIKVALDKSSDQDIEQYCQFVATRRVRIGLFVLHYADKKNITVTNEEKNMLLLQYLNKGKEEANAIMRAYNNNLRWLSNSIAMEAKEIKVINHILENEVQIIEEPCTSDEIEGFADEISKDMGLSFTDDASYKRKY >LS398551|2101595:2123966|2105518_2105662_-|SPR11651.1|DBSCAN-SWA MLKNKGAIAVKELMIPEIMKLVNNQNVKIESEQVVKTDIAPKIGLRR >LS398551|2101595:2123966|2102429_2102804_-|SPR11630.1|transposase|DBSCAN-SWA MARRYSYDLRMKIFKAVDDGLSIVKACKIFNISRNTIYRWKHLKRETGDIKAKPYGPAKGYNAKIDLKEFEELIINHHDKTSKELSIILDNRLQRTRINYYRKLLGYTYKKNSFSFQKGYCVKE >LS398551|2101595:2123966|2110858_2111092_+|SPR11677.1|transposase|DBSCAN-SWA MKFEQIKELEDEKFRRLTGVRKGTFSKMMDILRQADDLKKSKGVGKNKLNLEEQLLIVLEYLREYRTYFHIELELWD >LS398551|2101595:2123966|2121879_2122179_-|SPR11730.1|DBSCAN-SWA MRIGIEMAIQFTRIEFLTRSKGGDSCRKAAYNARTIVKNKQTDIKYNFSRKKDNVYHTVLIPDYVNQEFKNIQTLMNEVERTAKKGNSQLLKDGAKFRA >LS398551|2101595:2123966|2103300_2103624_-|SPR11641.1|DBSCAN-SWA MSLQQSGIKGNIIASAGISNLTNYSPFPGEKIIIAADNDSKNSITNNTVIKSAKMLEMKGAITCIVKPPENGDFNNLLQSCGDQSIRDIIEPEITKLTKAVETTKLT >LS398551|2101595:2123966|2120234_2121641_-|SPR11723.1|DBSCAN-SWA MQEIKLNLIPNLLRLFRYLSAIILNSLTSFERSLVKGQRCIIRDSEMIHEIAKEETNAYFAELGLPYRVDETSEVPGKHIGPRRIRNLINEVVNENELRKEAHLKIINDADVITDSITHYKSIFTKQDVEKAVKDIPDLTAREQLVQQVLSSNRILELYHDDGESSKYFTTIEVRNEETRIIRIANKINDQVYYNNIYNLKSDIEGLANVSEEQKQALRHILLSTSGVRVLRGRAGTGKSYVLIKAHKLATNRGQKVIGLAPTHKAVSELRSKGYTEVYTVKGFLYNRKKIFMQDSLIVVDEAGMVGTKAYAELFRVVRNNNCQLILAGDEKQLASIERGGMFEMLSNIFGSHVLVNIRRQSKNWSRKAAMEFAESNILSGITLLRQNNCVRFDNTLQDSMSKLIYNWSLSKFKPHEKLVITVRNKDVDILNSSIRSLLKANGTLQGTEYGRSIAERKESYMAGDRIV >LS398551|2101595:2123966|2105773_2106148_+|SPR11655.1|transposase|DBSCAN-SWA MARRYSYDLRIKLFKAVDDGLSIVKACKIFNISRNTIYRWKHLKRETGDIKAKPYGTAKGYNAKIDLKEFEELIINHHDKTSKELSIILGNRLQRTRINYYRKLLGYTYKKNSFSFQNRYCVKE >LS398551|2101595:2123966|2114294_2116187_+|SPR11697.1|DBSCAN-SWA MSVETYKFDAEVGKVLHLVIHTLYTNKKIFLRELISNASDACDKLRYLSQSNAELLQGESDFKITVSMDKEKRYIILQDNGIGMNKEDLTQNLGTIASSGTQKFLEQLGNDAKKDNMLIGQFGVGFYSSYMVADEVKVISKKAGEAQAYQWSSKGEGEYYIEDCEADFIRGTKITLHIKPEYDNYLDHFQIKDIIKTYSDHISVPIYYVGVDGKEQQVNSSSALWTRAKSDITDEQYEEFYRNIAYAIDKPWITIHNKSEGVIEFTNLLFIPSSKTFDLFHPDRKSRVKLYIKKVFITDENVALIPKYMRFLRGVVDSEDLPLNISRETLQHSPLIDKIQASITKKVITELEKQKTKDQGEYETFWNNFGAVLKEGLCEGTADVDKLLKICLFRSALQDKFISLDEYIANLKSEQKNIYYITGDDLEALKSSPQIEGLLSRNIDVLLLTDDVDKFWVMVTRKYNDYVLKSVTSANIEIDNCDTKTAESSDTNNDAKDDTSSSDDKNCEQLIKYFKEVLGDKVKSVEVSKKLTRSPVCLTVPEGSMDIRTERFLIEQKQLSSHSSKILEINPNHTIIKKINENIKLNQNLDVSKQLVMTLLDQSYLIEGQPIPDLQDYCNRINFFIEKSVN >LS398551|2101595:2123966|2102149_2102275_-|SPR11620.1|transposase|DBSCAN-SWA 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>LS398551|2101595:2123966|2113648_2113855_-|SPR11693.1|DBSCAN-SWA MPKLKTKSAVKKRFSLSSSGKLKVTQAGKRHFMRRRTKKQLRNLRSTTTLIGQDAKNIIKYLMPYGVQ >LS398551|2101595:2123966|2113263_2113629_-|SPR11687.1|DBSCAN-SWA MSRARSGKVNKNRHKKILKLAKGYRGRAKNCFRIAIQKVEKALQYSYRDRRNRKRQFRALWIQRINAAVRQYDITYSQFINGLKQANITVDRKVMADLAVHNADSFVHLVELTKKSLAKTA >LS398551|2101595:2123966|2101937_2102144_-|SPR11615.1|transposase|DBSCAN-SWA MDNINFHKNTIIKVLIESVGCSILFLPTYSPDLNPIEHYWFKIKNEIRKVTPQFKDISIAVEHVMKFI >LS398551|2101595:2123966|2119299_2119806_-|SPR11713.1|transposase|DBSCAN-SWA MLRNELIEKIKQISKENLVFIDESGIEDNACREYGWSIKGTRCYGNKAYQHKSRVSMIAGLCNNQIIAPVIFEGNCNKAIFTTYVETILIKELLPGQIVIMDNINFHKNNTIKVLIESVGCSILFLPTYSPDLNPIEHYWFKIKNEIRKVTAQFKDISIAVEHVMKFI >LS398551|2101595:2123966|2107915_2108086_+|SPR11667.1|DBSCAN-SWA MSRKKKKVLVKLVSSAETGVFWVKQRNPKTQTEKLSFRKYDPKVRKHVQFTEAKIK >LS398551|2101595:2123966|2119792_2120167_-|SPR11718.1|transposase|DBSCAN-SWA MARRYSYDLRMKIFKAVDDGLSIVKACKIFNISRNTIYRWKHLKRETGDIKAKPYGPAKGYNAKIDLKEFEELIINHHDKTSKELSIILGNRLQRTRINYYRKLLGYTYKKNSFSFQKGYCVKE |
27 | Indivirus(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_25 |
2189158 : 2239748
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >LS398551|2189158:2239748|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_25 >LS398551|2189158:2239748|2220971_2222111_-|SPR12274.1|DBSCAN-SWA MKNACKKLAIILSLILLNTAAVAAEQSIQQDLIQDRAVLAKEYFNIGNSFLKLKKYQEAIENFNIAIKYDPSYATAYNSKGMALNDLGKPLKAIENFNIAIKYNTSYASAYNNKAVSYRKLGKNEEAIMLCNIAIKYKPNFAEAYINKGASLNDLGQYEEAMENFDIAIRYNSSYPEAYYNKGIALLNLGDIHGAIENYDTAIKYRPNYSEAYHNKGLTLAFLGQLQNAIEHFDLAIKYDPSYLKTYCNKGYILSLLKRYSEAIESCNLAIKYDPNYADIYYNKGMILEKLGKHQEAVENFDIAIKYNPNFAENYLEKGISLVSLGQYSNAKENFSLAIKYMPNLIAEYEATIKRLTEFKNFTIAKDYEQKLQILKKYS >LS398551|2189158:2239748|2211663_2212119_-|SPR12241.1|DBSCAN-SWA MANLMQQKITLQQKKARLIMDEVNLKIKERKMRTRRLIEMGGLVAKAKLDHLSANTLFGAIVSLKETLTQHPNVQDHWTTIGKDIFDKEQQNKAAVILKFASEPDENTKRHIRLHGLKWNSFRQEWCGHVKDIESLKNGLLNVQYKLELIS >LS398551|2189158:2239748|2210353_2210929_+|SPR12231.1|DBSCAN-SWA MIDFYSESLLNKLFETNVRFDTKIDLDKVEKAIFYAQKYHGQQKRDTGEPYYMHPLEVARMVGYYSFETDTIITAILHDILEDTTLTKEKIVKVFGKKIAEQVSDLTRIKDNKKISSREMIQTFYRQNKTELLLIKLFDRFHNIQTVSIKPYEKRQEIILETQQEFIPLAKYLNLPEIAIELNKYCELYAS 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50 | Pseudomonas_phage(18.18%) | transposase,integrase | attL 2197710:2197729|attR 2243870:2243889 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_26 |
2243939 : 2272484
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >LS398551|2243939:2272484|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_26 >LS398551|2243939:2272484|2262698_2262851_+|SPR12522.1|DBSCAN-SWA MVKHFDFRLVKTNQCKTKIQKTPRMIAQTSLLKKTKKNIPQGLYRNQLIE >LS398551|2243939:2272484|2244260_2244377_+|SPR12404.1|transposase|DBSCAN-SWA MKSDMNYEVVLIDATESPIERPKKNKNSIIQERRKGIH >LS398551|2243939:2272484|2253040_2253367_+|SPR12451.1|DBSCAN-SWA MEKDLAKIAPSNIQAEQMILGAILINNRVLYNINEFLLPKHFYEPLHGKIYKSINLIISKGISATVISLKNMLGNELAFEEIGGVDYLAKLTTLALSIVNANEYGKIV >LS398551|2243939:2272484|2249392_2249554_+|SPR12435.1|transposase|DBSCAN-SWA MTIINNKGEIMTVKITKANKSDLSAALVIAKSLSGKLFADKAYILSVISSALH >LS398551|2243939:2272484|2265214_2265436_-|SPR12537.1|transposase|DBSCAN-SWA MKKCTITVYYLIDNFCKIYHELERKRLIPSSNQRNRDGKLSLAELLTIVIYFYLSPCKDFKNYYLYYVSYKYK >LS398551|2243939:2272484|2245445_2245766_-|SPR12416.1|transposase|DBSCAN-SWA MDYQLLKHVKYLTISRNTIYRWKHLKRETGDIKAKPYGPAKGYNAKIDLKEFEELIINHHDKTSKELSIILGNRLQRTRINYYRKLLGYTYKKNSFSFQKGYCVKE >LS398551|2243939:2272484|2272109_2272484_-|SPR12589.1|transposase|DBSCAN-SWA 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45 | Indivirus(75.0%) | transposase,integrase | attL 2256241:2256277|attR 2269206:2269242 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_27 |
2285761 : 2329387
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >LS398551|2285761:2329387|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_27 >LS398551|2285761:2329387|2322542_2324117_+|SPR12832.1|DBSCAN-SWA MFGAKAVAKIRDVQIQDSITLTNTKEFLRQCFMKPYIIGNILGKKAAAQQTNDIIGFIEQNIPNNFGIYYREPSNLAISFKSCRQATPLIKAAIHKELNEGLLTKFAAAIGVQSDQSHMLSQRLKVMTGDTLKYLQREQQDIHEWMKQAMLLNANRESYDDWREKFSLSRIYPNLVSMHAIRGLFQQSFSYLVAGEMAAHMMPILQSVFFALVVSMIFIVFPMGLLPGGYNILKTWILLIIWVSSWPVFFTIIHCLGMISLSSKSGAFGSDYGLNMLSQGSFAEMILYSYATFQMLASSIPMLSWSVIKACAHATANLASQFSPIQVASSLGSNIVDNNLSMDNYSIGNRTISQQNLAPSLHMADNIIDYGSYKIITGNNGEQFVIQTVHSLETNFRSSALLQTGYQNQFVSSQSMLNSLTQKEADLISTGNSMAIDIGKRLTHDEALSIGLTESEYQALQEVGSNSIATTDHTGTSHSKSSSTSTSAGGGVWGVNTTISGGQIYNRLLSKLDNDVELCYKNLI >LS398551|2285761:2329387|2314940_2315246_+|SPR12769.1|DBSCAN-SWA MNASIHKDFDRERFSKHFVYESYDEKTQLFFNRGSIGFVLLACPLAEASVSAQNEIAEFLKSDENLPAESSLQVLMIGSNNIENFLSNWQSYRKGEIFIEL >LS398551|2285761:2329387|2326208_2326529_+|SPR12854.1|transposase|DBSCAN-SWA MDYQLLKHVKYLTISRNTIYRWKHLKRETGDIKAKPYGPAKGYNAKIDFKEFEELIINHHDKTAKELSIILGNRLQRTRINYYRKLLGYTYKKNSFSFQNGYCVKE 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MLSTDISKSWHLENPYRGWYKICKKAGIKNLRIHDLRRTFASCMADEGAGQYIISAALNHSDIKSTSIYTKVSLEPVRQYMSKVTQMISDCSKIDI >LS398551|2285761:2329387|2319200_2320445_+|SPR12817.1|DBSCAN-SWA MNNGNLLHDLYHAVRHDNIDDVQRILAQDMSLINSIHNALYNDGGLGLAVNGSALHTAVFYKRINIATFLFNIGANADVQDDVGFTPLHYALSRYDANMVMLLLNNGADPNVPSYEDCITPLHCVVTYNYYNTDRIELLVSRGGNIHAQKNNGRTVLHDAAEYGQRDIVEYLLARNANALLRDNSGKISAHFAAQYGYKDIVKLFLDKDYNIINLQDNDGQTVLHLAVLRHYAFLNREPNEEYIRYEERCFSMDERLDALGYSAEWINTMYDHGGIDFSLKNKDGYTVLDLALAIELDLATEHDQHKISNLLQEKRGLWRKEVVYNTNKLLLKTANEKKKISEISEVLEKTDKEKKVEILEKNDNSIDVLFEYWHNLPTEITNKILHYCDDGTLVEFQHLNKEVIGAVLIHERI |
58 | Indivirus(42.86%) | transposase,integrase | attL 2316189:2316217|attR 2342279:2342307 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_28 |
2334223 : 2454297
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >LS398551|2334223:2454297|DBSCAN-SWA 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118 | Indivirus(26.92%) | transposase,integrase,tRNA,protease | attL 2352308:2352335|attR 2392893:2392920 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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