Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP026364 | Proteus hauseri strain 15H5D-4a chromosome, complete genome | 2 crisprs | cas6e,cas5,cas7,cse2gr11,cas8e,cas3,csa3,DEDDh,DinG,WYL | 0 | 22 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP026364_1 | 134142-135574 | TypeI-E |
I-E
Consensus repeat of CP026364_1
|
23 spacers
spacers of CP026364_1
>1.1|134171|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT TCACCTGAAAAGTTCTCCCAGTAACCATGTCC >1.2|134232|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT CTTGTCAACCCTCTAGCGTAACCTCCATCAAA >1.3|134293|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT ATCAGGGAGACAGTCAGAACCATCCCTAATAT >1.4|134354|33|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT GGATGCTTGCTTTTCTACTTTATCCAAGCACTG >1.5|134416|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT TCTATGATTCATCTTCATCTTGGAGAAGCAGT >1.6|134477|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT TCAGTGGTCATGATGCGTGGTTTTTTTTTCAT >1.7|134538|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT GTCGGTAAAACTAAAGATGGTAATTTATTAAT >1.8|134599|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT TCCATTGTTCGAATATTAGTAAGATGACGATA >1.9|134660|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT TAAGCGGTTGTTCAGCAGATAAAAAACCCGAA >1.10|134721|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT GCAGAGTTAGCTCTTGAGTATGACGCTAAAAA >1.11|134782|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT ATCTGCTGATGATAAAGTCGCGCCCACTGTGA >1.12|134843|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT TGTCATTAATTTACCGTTACGCAACTGAAATC >1.13|134904|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCACCGGGGTGTAACTCAACACCGCCTATCAA >1.14|134965|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAATGCCAGAAAAAGAGATGGTGCGCATTTAT >1.15|135026|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGACTGTGCTCCGCTAGTAGGCCGCGAAATCC >1.16|135087|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGATAAACCAGTGTGGTCATTTTTAATAAGCG >1.17|135148|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGATAGTAGAGGAGCAGATGAAGCTGCACCTG >1.18|135209|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATCAACACTTCACTAATGAAAGAAACAGTAT >1.19|135270|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGACGTCTCGGTAATCTGGTCTAGGTTCTCC >1.20|135331|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTATAATATTTCAGGACTGATTGTTAAACGA >1.21|135392|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGTGGTTAATAACCAAAGACCATGACGATGGG >1.22|135453|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAAACAGTATGTATTGAAGCGACAAGATGAA >1.23|135514|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGAACACTCTTCATTATGAGCGCGTCTAATTT |
cas2,cas6e,cas5,cas7,cse2gr11,cas8e,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP026364_1
The CRISPR arrays of CP026364_1 >merge|CP026364|1|134142-135574|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACAGTAATCCCCGTGTATACGGGGAACACTCACCTGAAAAGTTCTCCCAGTAACCATGTCCCGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACCTTGTCAACCCTCTAGCGTAACCTCCATCAAACGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACATCAGGGAGACAGTCAGAACCATCCCTAATATCGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACGGATGCTTGCTTTTCTACTTTATCCAAGCACTGCGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACTCTATGATTCATCTTCATCTTGGAGAAGCAGTCGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACTCAGTGGTCATGATGCGTGGTTTTTTTTTCATCGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACGTCGGTAAAACTAAAGATGGTAATTTATTAATCGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACTCCATTGTTCGAATATTAGTAAGATGACGATACGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACTAAGCGGTTGTTCAGCAGATAAAAAACCCGAACGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACGCAGAGTTAGCTCTTGAGTATGACGCTAAAAACGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACATCTGCTGATGATAAAGTCGCGCCCACTGTGACGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACTGTCATTAATTTACCGTTACGCAACTGAAATCCGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACTCACCGGGGTGTAACTCAACACCGCCTATCAACGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACAAATGCCAGAAAAAGAGATGGTGCGCATTTATCGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACTGACTGTGCTCCGCTAGTAGGCCGCGAAATCCCGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACTGATAAACCAGTGTGGTCATTTTTAATAAGCGCGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACTGATAGTAGAGGAGCAGATGAAGCTGCACCTGCGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACGATCAACACTTCACTAATGAAAGAAACAGTATCGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACATGACGTCTCGGTAATCTGGTCTAGGTTCTCCCGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACTCTATAATATTTCAGGACTGATTGTTAAACGACGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACAGTGGTTAATAACCAAAGACCATGACGATGGGCGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACTTAAACAGTATGTATTGAAGCGACAAGATGAATGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACCGAACACTCTTCATTATGAGCGCGTCTAATTTCGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC >CP026364|1|1|134142-135574|CRISPRCasFinder ACAGTAATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TCACCTGAAAAGTTCTCCCAGTAACCATGTCC CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC CTTGTCAACCCTCTAGCGTAACCTCCATCAAA CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC ATCAGGGAGACAGTCAGAACCATCCCTAATAT CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC GGATGCTTGCTTTTCTACTTTATCCAAGCACTG CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TCTATGATTCATCTTCATCTTGGAGAAGCAGT CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TCAGTGGTCATGATGCGTGGTTTTTTTTTCAT CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC GTCGGTAAAACTAAAGATGGTAATTTATTAAT CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TCCATTGTTCGAATATTAGTAAGATGACGATA CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TAAGCGGTTGTTCAGCAGATAAAAAACCCGAA CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC GCAGAGTTAGCTCTTGAGTATGACGCTAAAAA CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC ATCTGCTGATGATAAAGTCGCGCCCACTGTGA CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TGTCATTAATTTACCGTTACGCAACTGAAATC CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TCACCGGGGTGTAACTCAACACCGCCTATCAA CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC AAATGCCAGAAAAAGAGATGGTGCGCATTTAT CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TGACTGTGCTCCGCTAGTAGGCCGCGAAATCC CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TGATAAACCAGTGTGGTCATTTTTAATAAGCG CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TGATAGTAGAGGAGCAGATGAAGCTGCACCTG CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC GATCAACACTTCACTAATGAAAGAAACAGTAT CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC ATGACGTCTCGGTAATCTGGTCTAGGTTCTCC CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TCTATAATATTTCAGGACTGATTGTTAAACGA CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC AGTGGTTAATAACCAAAGACCATGACGATGGG CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TTAAACAGTATGTATTGAAGCGACAAGATGAA TGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC CGAACACTCTTCATTATGAGCGCGTCTAATTT CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC >CP026364|1|1|134142-135574|CRT ACAGTAATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TCACCTGAAAAGTTCTCCCAGTAACCATGTCC CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC CTTGTCAACCCTCTAGCGTAACCTCCATCAAA CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC ATCAGGGAGACAGTCAGAACCATCCCTAATAT CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC GGATGCTTGCTTTTCTACTTTATCCAAGCACTG CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TCTATGATTCATCTTCATCTTGGAGAAGCAGT CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TCAGTGGTCATGATGCGTGGTTTTTTTTTCAT CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC GTCGGTAAAACTAAAGATGGTAATTTATTAAT CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TCCATTGTTCGAATATTAGTAAGATGACGATA CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TAAGCGGTTGTTCAGCAGATAAAAAACCCGAA CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC GCAGAGTTAGCTCTTGAGTATGACGCTAAAAA CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC ATCTGCTGATGATAAAGTCGCGCCCACTGTGA CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TGTCATTAATTTACCGTTACGCAACTGAAATC CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TCACCGGGGTGTAACTCAACACCGCCTATCAA CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC AAATGCCAGAAAAAGAGATGGTGCGCATTTAT CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TGACTGTGCTCCGCTAGTAGGCCGCGAAATCC CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TGATAAACCAGTGTGGTCATTTTTAATAAGCG CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TGATAGTAGAGGAGCAGATGAAGCTGCACCTG CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC GATCAACACTTCACTAATGAAAGAAACAGTAT CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC ATGACGTCTCGGTAATCTGGTCTAGGTTCTCC CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TCTATAATATTTCAGGACTGATTGTTAAACGA CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC AGTGGTTAATAACCAAAGACCATGACGATGGG CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TTAAACAGTATGTATTGAAGCGACAAGATGAA TGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC CGAACACTCTTCATTATGAGCGCGTCTAATTT CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC >CP026364|1|1|134875-135574|PILER-CR CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TCACCGGGGTGTAACTCAACACCGCCTATCAA CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC AAATGCCAGAAAAAGAGATGGTGCGCATTTAT CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TGACTGTGCTCCGCTAGTAGGCCGCGAAATCC CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TGATAAACCAGTGTGGTCATTTTTAATAAGCG CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TGATAGTAGAGGAGCAGATGAAGCTGCACCTG CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC GATCAACACTTCACTAATGAAAGAAACAGTAT CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC ATGACGTCTCGGTAATCTGGTCTAGGTTCTCC CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TCTATAATATTTCAGGACTGATTGTTAAACGA CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC AGTGGTTAATAACCAAAGACCATGACGATGGG CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TTAAACAGTATGTATTGAAGCGACAAGATGAA TGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC CGAACACTCTTCATTATGAGCGCGTCTAATTT CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC
>CP026364.1|QAV21929.1|132549_133773_-|alanine-racemase MSFGLRYLALVPLLVITACQQPINHNPSVTQTAQVQPVIVNNSWIEISRSALDFNVKKVQSLLGDKSSLCAVLKGDAYGHDLSLVAPVIIENNVQCIGVTNNQELKEVRDLGFKGRLMRVRNATEQEMSQATAYDVEELIGNLDMAKRLDTIAKQQNRIIPIHLALNSGGMSRNGLEVNNQAGLEEAKQIAQLPNLKVVGIMSHYPEEDADKVREDLARFKQQSQKVIDVTGLNRNDITLHMANTFATITVPESWLDMVRVGGIFYGDTIASTDYKRVMTFKSTIASINNYPKGNTVGYDRTYTLKRDSVLANIPVGYADGYRRVFSNAGHALIGGQRVPVLGKTSMNTVIVDITDIKNIQPGDEVVFFGKQGNSEITAEEIEDISGALFTEMSILWGATNQRVLVD >CP026364.1|QAV21928.1|132332_132476_+|hypothetical-protein MTKFILIGLMAICITALCLSLLGHERLCSFNIRCSHTVIQATLPCDK >CP026364.1|QAV21927.1|129621_132021_+|membrane-bound-PQQ-dependent-dehydrogenase,-glucose/quinate/shikimate-family MKISNLYRWIIFIIFIAFGLYFTALGGYLVSLGGSPFYLFTGVILLIIAACFWKQKKLTLLLFNLLFLATIIWSIWESGFDFWALSPRLDIVFILGLLLLPFLSIKNAYACRINKISLLTLLAATLVIILGSMFTDPHAIDGQFSRNQPDVNHSPVGISDNDWPAYGRTQAGVRYSPLTQINSDNVDKLVEKWTFHTKDEKRPDDAVEITNEVTPIKIDDNLFLCTPHQYLISLDPATGKEKWRFDSKLQYNKSFQHMTCRGVAYYDQKNTAEFAKSIEERQPIASTECPQKVFLPVNDGRLIAVNAQTGDVCRDFGSEGEINLLTSMPYAYLGGYNPTSPPIVTGNTIIIGGSVTDNLSTKEPSGVIRGYDVNNGQLMWIFDTGAEDPNTMPGESTEFVHNSPNAWAPLAYDAQTDVVYIPTGVGTPDIWGGDRHPLKERYANSIVALKGSTGELVWHFQTTHHDLWDMDVPSQPSLVDIKTDKNEVIPAIYAVTKTGNVFVLDRRDGSPIVPITEKDVPTTVKLGPQTQGEHYSSTQPFSALNLAPANKLKESDMWGGTMADQLLCRIAFNQLNYEGIYTPPSENGTLVFPGNLGIFEWGGISVNQDRQVAVMNFITLPFISKLYLKDPNDKNVIEGGHGEQGLQPMTGTPYSVDIHPFLSPLGLPCKQPPWGFVAGVDLEKNQLVWKQRFGTIRDSLPNLMELPPLKIGVPGLGGAISTAGNVMFVAASQDNYIRAFNVTNGKMLWEARLPAGGQATPMTYSIDGKQYIVIMAGGHGSFGTKMGDSLVAYGLPDNQ >CP026364.1|QAV21926.1|127243_129388_+|phosphate-acetyltransferase 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MSSKLVLVLNCGSSSLKFAIINPENGEEFLSGLAECFNLPEARLKWKMDGQKHEAALGAGAAHSEALNFIVNTILAEKPELSAQIASIGHRIVHGGEKFTKSVIITDDVIQGIEAAIPFAPLHNPAHLIGIEEARKAFPHLIEKMVAVFDTAFHQTMPEEAYLYALPYSLYKDHSIRRYGAHGTSHFYVSREAAKMLNKPVDELNVITCHLGNGGSVSAIVNGKCVDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPAIVFHLHDALGMSVEDINKLLTKESGLLGLTEVTSDCRYVEDNYDTKADAKRAMDVYCHRLAKYIGSYCALMEGRLDAIIFTGGIGENAAMVRELSLKKLALLGFEVDHQRNLDARFGKSGTITTDNSRLAVVIPTNEELVIAQDASRLTA >CP026364.1|QAV21924.1|125113_125569_-|DUF412-domain-containing-protein MSEPTVTPPGFFKKLRLGNEYLKTWPVEKQLAPVFPENRMVKATRFGIRYMPPIAIFTMTWQIALGGNLGPAITTALFACSLPMQGLWWLGKRAATPLPATLLRWFFDIRTKFEQAGIALAPVEQTPTYLSLAKLLKRAFKQLDRSFLDDV >CP026364.1|QAV21923.1|124479_124974_-|YfbU-family-protein MEMTHAQRLILSNQYKMMTMMDPDNAERYRRYQTIIERGYGLQLRELDRDFDEMSEETCRTIINIMEMYHALQVSRDNLKESDMMDIRRVAFMGFDAATESRYLSYVRFMVNTEGRYTHFDSGSHGFNSQTPMWEKYQRMLAVWLACPRQYHLSAVEIQQILNA >CP026364.1|QAV21922.1|123769_124432_-|sugar-phosphatase 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MGIDLINGNAPISKTNEINESSKSSESHEGIKDVKNTSNEYQAFFNKVKSEEINKVLISKMKELKIERNIYGKLTTRVSNKNPIYSSEPNKNMTQSVSDDLEQIKQAVAKNATAFTQSIANCLVNNNEENFVSQILSNYNNFTSLAPEFHNKSSKAMTDFSISLELKSSDEAIIFSMLENNDKNHSVYYVKQYLNQKYQVYTDAMENKLNITNRAKDILKTMRSNKFDKKIEVLFELVNDFKNKNKNIVRNKSDLNIHDIFQGVAGNYIKDINIHINLEQAESIIEKMIKDTGLAFVVSLSSEERLEQVNLAIDQTLNDMKVVQINKNDIIRLAQGKVKSINRSNVFIRGMKGIRNLVIGKDNSNVDRLNKLTEGLVKSFESNTLRFLADNIKKMEKTKKMEGINEIGGETEIKDKTEIADETKIADKTEITDKTEIAGGTEIEDMGDKNMSSDENKVKNED >CP026364.1|QAV21930.1|135632_135929_-|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MSMIVVVTESVPPRLRGRLAVWLLEVRAGVYIGNVSARIREMIWQQINELAENGNVVMAWGTNTESGFDFQTYGENRREPIDFDGLRLVLFKPLEDDE >CP026364.1|QAV21931.1|136851_137529_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MYLSRVTIRGSSDYLHSLLTNEQQAGYAIHQLLWQLFTEESERSFLYRVEIEKNGIPIFYLLSSVAPTIQHRFFKIETKPFLPKLNTKMKLAFSLRANPTVCITDKEGKRHRHDVLMHAKKQAQLSGNNYNKDDIQNLMQQAALNWISSEERLNKWGISLNHLPDIRAYTPERIKKASGKIMAFSSVDYQGTLTIENPTLFWQQYQQGFGRAKAFGCGLMLIRVI >CP026364.1|QAV21932.1|137528_138266_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MAEYLVFRLYGPLASWGLPAVGGDRQTGLAPSRSAILGFLGAALGIKREDEQSLVQLQQSIVVAVKQIVPSTLLRDFHTAQVPSARKNIIHSTRRSELAEKDLNTVLSNRDYRCDAVWIIAIKLTQHSKYTLEQLKTALLMPTYILSLGRKACPLSLPMMPQIVETEQLREALDTTFPAIMSSDKADNFWFSSDGWVTYYWEGNSQDITGKNIMTLHPWDEPVNRQHWQFRQREMYQMSVKKEGE >CP026364.1|QAV21933.1|138278_139313_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MSQFIQLHILTSYAPSNLNRDDLGRPKTARMGGFERLRISSQSLKRHWRTSELFDTALSGNIGIRTKQFGLQIYDELVKGGITEKNAKKWTELMVDQYGKLKKDSIETEQLVHISHFEKEKIFDLIKLLIEEQREPTKEELDNLKLTKTSVDIALFGRMLASAPKYNVEAACQVAHAISVHSAVVEDDYFTAVDDLNDGKTDTGSAHIGEMGFAAALFYSYICINKTQLIESLEGNEELANKAIQALTEVAIKVSPTGKQNSFASRAYASYVLAEKGNYQPRSLSVAFLKPIDDEDMEFSAITALNQRMENFDKVYGACADSRYQLNVAQGEGSLSELLQFVAE >CP026364.1|QAV21934.1|139345_139933_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MGFYKSDNITLYSHPELQTIVLRWWESLFLSPDELRKKGIAPAPSRYKAELKRCESITAIMLTEGFRSLWLSFPPDLINQAKTEDIERWATIVAVLVYITQNSDKHFATVAGEKDDSKKSIISESRFLQLQSSRTHDEFIRRLRRILIQIKGKTDVLLMSKDIEKWVLEKQKIRSVQTNKQIIVEWAMKYYQAAI >CP026364.1|QAV21935.1|139919_141518_-|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MNIINQPWLPFRFRNGDIKTLPISAISHPDIIDFSLNRADFQGAAYQFAIGLLQTVFAPEDEDEWEAYFETPPSNEKLKIAFDKVAHAFNVTGDTPLFMQDFSSLEEQKNISIAQLLIDAPGENGIKQNTDHFIKRGVADVMSLEMAILALFTLQINAPSGGQGHRVGLRGGGPLTTLILPTDENSTLWQKLWLNIINRDFWQYDDPNFHDGSVFPWLNPLNLKEGMGEKVYPNDVHPLYMYWAMPRRIRLQVENKSATCQISGEHSNITVQYYLTKNYGLDYQEGWLHPLTPYYWDPKKPETLPNSIKGRQGGIHYNLWDRLLLSSSENGQKCATVVSHYLKLYQLLELTRKPRLLIFGYDMDNMKPRGWYALEMPIFHVEDNYHNKIINEIKLIQLLTVECLKNLRNQIKAAWFDRPKDIKGDLSFIDLTFWQRSENIFFKTVENIIEQTKKDDFLTPEQAKSWLNSIRNICFSIFDEYALSALGTQKAISGTIKARQNLVRDLYGNKKIKSFATDFKITKKNGEEHGVL >CP026364.1|QAV21936.1|141514_144205_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MNTDYYNYWGKFKSDNNNEYYHLLPYHSLDVAAVGAILFSADTKIVKDISNFLQISPKSFSKLFLLILSLHDIGKFSSSFQYINQNIIDKNQVPESRFSYDGKNYRHDRLGYYFWKKIEQTIFSLIIPNRDYNQRKLSKGFLVIIETVLGHHGKPINTNDIDYMENFIHKNNEIAAVNFSYDVFTLFNPNISAELFYNKEWMGRLKQISWLLAGMATLSDWIGSNNEYFPYYKNKMPLSEYWRLTLKNAEKAILSSGFNRNYQISPFISVEHHFGYKPTPLQQWAEKVPINEHPQLFILEDTTGAGKTEAALTLAHRLMEADAADGFYFGLPTMATSNAMFSRIVNYYTNIFDKNSEAPSIVLAHGASIMNEQFTSIIRDGNEQYNSKDNTASAQCYQWLSDSRKKALLATIGVGTLDQALLAMLPRRHQSLRLLGLNRKVIIFDEIHSADEFMFEIIEHLLSAHLYQGGSVILLTATLSLKKRQRIINSWFDALNQPPQMIQSKNFPLATHLTYFPEVKKMEYPLESRKEVSRKVKVEIINEEQDCIHIIINAIKNGNCVVWIRNTVNDAIKAYHDINKILPENRDNCLLFHSRFTLQDRKIREAQVLNIFGKLSTAKQRKGAVLIATQVFQESLDADADIMISDICPIDDLIQRSGRLHRHTRTVTGDYTPTGQDKRTAPILYLQAPLFTNDPPSNWLSQSFSSTEAVYRSPGRLWLTLKSIIQLGEIKMPQQARQLIESVYSDNAYDQIPQSLIRQENNNLGEQKAKIVKAKIQLLKLNKGYSEESSEFWTEDHYDISTRYSDIEIANILLLKKVENNYIPWVEDTHFSIALSTVKIAKHKYADKLATVTENIKEKINNQYPQTRYLQLWIPEEDTHYQYDPLIGFSERQELS >CP026364.1|QAV21937.1|145468_146725_-|PTS-ascorbate-transporter-subunit-IIC MDFFRFLMSDVLSEPSILVGLIALIGLIAQKKPVTECIKGTVKTIMGFVILGAGAGLVINSLGDFSTIFQHAFGIQGVVPNNEAIVSIAQKSFGKEMALIMFFAMLINILIARLTPWKFIFLTGHHTLFMSMMVAVILATAGLEGTVLVAVGSLVVGVSMVFFPAIAHPYMKKITGSDDVALGHFSTISYVLAGFIGSKFGNKEHSTEEMNVPKSLLFLRDTPVAIAFTMGIIFIITCLFAGDTFVREVSGGKNWFMFSLMQSITFAAGVYIILQGVRMVIAEIVPAFKGISDKLVPNAKPALDCPVVFPYAPNAVLVGFLSSFAAGVIGMFVLYLLDWTVIIPGVVPHFFVGATAGVFGNATGGRRGAILGAFAQGLLITFLPVFLLPVLGDIGIANTTFSDADFGVIGILLGIIVR >CP026364.1|QAV21938.1|146735_147023_-|PTS-ascorbate-transporter-subunit-IIB MKITVVCGNGLGSSLMMEMSIKSILKDIAVNAEVDHVDLGSAKGTPSDIYVGTRDIAEQLTAQAVNGKIVSLDNMIDKVAMKEKLSTALRELGAL >CP026364.1|QAV21939.1|147056_147500_-|PTS-mannitol-transporter-subunit-IIA MLKTLLTPDVVQVVPHVSDWREAIKVACQPLIDKGYIEPRYVDAIYKSHEQIGPYYVLGPGIAMPHARPEEGVNKLSLALTIVEQGVEFGADENDPVKLLIVLAATDNDSHINAIVKLAELFDNDDDIQSLLNAKSKAEVFAVINNY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP026364_2 | 144395-145341 | TypeI-E |
I-E
Consensus repeat of CP026364_2
|
15 spacers
spacers of CP026364_2
>2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT CGAAAAATTATTGCTGTTAAAAAAGTGATCCG >2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT ATCATCAATCTCAATATATTCCCATTCAAGTC >2.3|144546|33|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATTTTTTTTTGCTTGATGTTTCCATGCCATGC >2.4|144608|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCTTCACCACGAAGAACGCCAGAACCTAATG >2.5|144669|33|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCACACCGTTTGCCACTGTTAGCGCATTATCCG >2.6|144731|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCCCTTGCCTTAGCGATTAGCTCATCAGTCAG >2.7|144792|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGAAGCTAATTAATAGCGGATTAGCTGGCGA >2.8|144853|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATAATGTTCAGCAAATAAAATTCTTTCTGTA >2.9|144914|33|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACGTCGTAAATAGGTTTCGACGTCATACAGGGG >2.10|144976|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGTAAAAGTAACTTCGCATACTCAAGATAAT >2.11|145037|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGGCATATTCAAACTCACCATTATCATTGAC >2.12|145098|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAATTTCCTCACTTTCTGGCTATATTGACCTA >2.13|145159|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTGGTAAGTTATCGCGCAATTTTGAAAAAT >2.14|145220|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATGTGCATGTTGCGGTGATGGTTTCGGTTTC >2.15|145281|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGGGAGCCGCTAGACGTGACTTCTCATTATG |
cas3,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP026364_2
The CRISPR arrays of CP026364_2 >merge|CP026364|2|144395-145341|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAATTGTCCCCGTATATACAGGGAACACCGAAAAATTATTGCTGTTAAAAAAGTGATCCGCGGTTTACCCCCGTGCATACAGGGAACACATCATCAATCTCAATATATTCCCATTCAAGTCCGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACACGATTTTTTTTTGCTTGATGTTTCCATGCCATGCCGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACACTTCTTCACCACGAAGAACGCCAGAACCTAATGCGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACACCCACACCGTTTGCCACTGTTAGCGCATTATCCGCGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACACTCCCTTGCCTTAGCGATTAGCTCATCAGTCAGCGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACACATGAAGCTAATTAATAGCGGATTAGCTGGCGACGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACACGATAATGTTCAGCAAATAAAATTCTTTCTGTACGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACACACGTCGTAAATAGGTTTCGACGTCATACAGGGGCGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACACCTGTAAAAGTAACTTCGCATACTCAAGATAATCGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACACATGGCATATTCAAACTCACCATTATCATTGACCGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACACAAATTTCCTCACTTTCTGGCTATATTGACCTACGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACACATTTGGTAAGTTATCGCGCAATTTTGAAAAATCGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACACGATGTGCATGTTGCGGTGATGGTTTCGGTTTCCGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACACATGGGAGCCGCTAGACGTGACTTCTCATTATGCGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC >CP026364|2|2|144395-145341|CRISPRCasFinder TTAATTGTCCCCGTATATACAGGGAACAC CGAAAAATTATTGCTGTTAAAAAAGTGATCCG CGGTTTACCCCCGTGCATACAGGGAACAC ATCATCAATCTCAATATATTCCCATTCAAGTC CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GATTTTTTTTTGCTTGATGTTTCCATGCCATGC CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTCTTCACCACGAAGAACGCCAGAACCTAATG CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CCACACCGTTTGCCACTGTTAGCGCATTATCCG CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TCCCTTGCCTTAGCGATTAGCTCATCAGTCAG CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATGAAGCTAATTAATAGCGGATTAGCTGGCGA CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GATAATGTTCAGCAAATAAAATTCTTTCTGTA CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ACGTCGTAAATAGGTTTCGACGTCATACAGGGG CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CTGTAAAAGTAACTTCGCATACTCAAGATAAT CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATGGCATATTCAAACTCACCATTATCATTGAC CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC AAATTTCCTCACTTTCTGGCTATATTGACCTA CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATTTGGTAAGTTATCGCGCAATTTTGAAAAAT CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GATGTGCATGTTGCGGTGATGGTTTCGGTTTC CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATGGGAGCCGCTAGACGTGACTTCTCATTATG CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC >CP026364|2|2|144395-145341|CRT TTAATTGTCCCCGTATATACAGGGAACAC CGAAAAATTATTGCTGTTAAAAAAGTGATCCG CGGTTTACCCCCGTGCATACAGGGAACAC ATCATCAATCTCAATATATTCCCATTCAAGTC CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GATTTTTTTTTGCTTGATGTTTCCATGCCATGC CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTCTTCACCACGAAGAACGCCAGAACCTAATG CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CCACACCGTTTGCCACTGTTAGCGCATTATCCG CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TCCCTTGCCTTAGCGATTAGCTCATCAGTCAG CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATGAAGCTAATTAATAGCGGATTAGCTGGCGA CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GATAATGTTCAGCAAATAAAATTCTTTCTGTA CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ACGTCGTAAATAGGTTTCGACGTCATACAGGGG CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CTGTAAAAGTAACTTCGCATACTCAAGATAAT CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATGGCATATTCAAACTCACCATTATCATTGAC CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC AAATTTCCTCACTTTCTGGCTATATTGACCTA CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATTTGGTAAGTTATCGCGCAATTTTGAAAAAT CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GATGTGCATGTTGCGGTGATGGTTTCGGTTTC CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATGGGAGCCGCTAGACGTGACTTCTCATTATG CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC >CP026364|2|2|144517-145341|PILER-CR CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GATTTTTTTTTGCTTGATGTTTCCATGCCATGC CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC TTCTTCACCACGAAGAACGCCAGAACCTAATG CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CCACACCGTTTGCCACTGTTAGCGCATTATCCG CGGTTTATCCCCGTGTATACGGGGAACAC TCCCTTGCCTTAGCGATTAGCTCATCAGTCAG CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATGAAGCTAATTAATAGCGGATTAGCTGGCGA CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GATAATGTTCAGCAAATAAAATTCTTTCTGTA CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ACGTCGTAAATAGGTTTCGACGTCATACAGGGG CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC CTGTAAAAGTAACTTCGCATACTCAAGATAAT CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATGGCATATTCAAACTCACCATTATCATTGAC CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC AAATTTCCTCACTTTCTGGCTATATTGACCTA CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATTTGGTAAGTTATCGCGCAATTTTGAAAAAT CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC GATGTGCATGTTGCGGTGATGGTTTCGGTTTC CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC ATGGGAGCCGCTAGACGTGACTTCTCATTATG CGGTTTATCCCCGTGCATACGGGGAACAC
>CP026364.1|QAV21936.1|141514_144205_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MNTDYYNYWGKFKSDNNNEYYHLLPYHSLDVAAVGAILFSADTKIVKDISNFLQISPKSFSKLFLLILSLHDIGKFSSSFQYINQNIIDKNQVPESRFSYDGKNYRHDRLGYYFWKKIEQTIFSLIIPNRDYNQRKLSKGFLVIIETVLGHHGKPINTNDIDYMENFIHKNNEIAAVNFSYDVFTLFNPNISAELFYNKEWMGRLKQISWLLAGMATLSDWIGSNNEYFPYYKNKMPLSEYWRLTLKNAEKAILSSGFNRNYQISPFISVEHHFGYKPTPLQQWAEKVPINEHPQLFILEDTTGAGKTEAALTLAHRLMEADAADGFYFGLPTMATSNAMFSRIVNYYTNIFDKNSEAPSIVLAHGASIMNEQFTSIIRDGNEQYNSKDNTASAQCYQWLSDSRKKALLATIGVGTLDQALLAMLPRRHQSLRLLGLNRKVIIFDEIHSADEFMFEIIEHLLSAHLYQGGSVILLTATLSLKKRQRIINSWFDALNQPPQMIQSKNFPLATHLTYFPEVKKMEYPLESRKEVSRKVKVEIINEEQDCIHIIINAIKNGNCVVWIRNTVNDAIKAYHDINKILPENRDNCLLFHSRFTLQDRKIREAQVLNIFGKLSTAKQRKGAVLIATQVFQESLDADADIMISDICPIDDLIQRSGRLHRHTRTVTGDYTPTGQDKRTAPILYLQAPLFTNDPPSNWLSQSFSSTEAVYRSPGRLWLTLKSIIQLGEIKMPQQARQLIESVYSDNAYDQIPQSLIRQENNNLGEQKAKIVKAKIQLLKLNKGYSEESSEFWTEDHYDISTRYSDIEIANILLLKKVENNYIPWVEDTHFSIALSTVKIAKHKYADKLATVTENIKEKINNQYPQTRYLQLWIPEEDTHYQYDPLIGFSERQELS 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MKISNLYRWIIFIIFIAFGLYFTALGGYLVSLGGSPFYLFTGVILLIIAACFWKQKKLTLLLFNLLFLATIIWSIWESGFDFWALSPRLDIVFILGLLLLPFLSIKNAYACRINKISLLTLLAATLVIILGSMFTDPHAIDGQFSRNQPDVNHSPVGISDNDWPAYGRTQAGVRYSPLTQINSDNVDKLVEKWTFHTKDEKRPDDAVEITNEVTPIKIDDNLFLCTPHQYLISLDPATGKEKWRFDSKLQYNKSFQHMTCRGVAYYDQKNTAEFAKSIEERQPIASTECPQKVFLPVNDGRLIAVNAQTGDVCRDFGSEGEINLLTSMPYAYLGGYNPTSPPIVTGNTIIIGGSVTDNLSTKEPSGVIRGYDVNNGQLMWIFDTGAEDPNTMPGESTEFVHNSPNAWAPLAYDAQTDVVYIPTGVGTPDIWGGDRHPLKERYANSIVALKGSTGELVWHFQTTHHDLWDMDVPSQPSLVDIKTDKNEVIPAIYAVTKTGNVFVLDRRDGSPIVPITEKDVPTTVKLGPQTQGEHYSSTQPFSALNLAPANKLKESDMWGGTMADQLLCRIAFNQLNYEGIYTPPSENGTLVFPGNLGIFEWGGISVNQDRQVAVMNFITLPFISKLYLKDPNDKNVIEGGHGEQGLQPMTGTPYSVDIHPFLSPLGLPCKQPPWGFVAGVDLEKNQLVWKQRFGTIRDSLPNLMELPPLKIGVPGLGGAISTAGNVMFVAASQDNYIRAFNVTNGKMLWEARLPAGGQATPMTYSIDGKQYIVIMAGGHGSFGTKMGDSLVAYGLPDNQ >CP026364.1|QAV21937.1|145468_146725_-|PTS-ascorbate-transporter-subunit-IIC MDFFRFLMSDVLSEPSILVGLIALIGLIAQKKPVTECIKGTVKTIMGFVILGAGAGLVINSLGDFSTIFQHAFGIQGVVPNNEAIVSIAQKSFGKEMALIMFFAMLINILIARLTPWKFIFLTGHHTLFMSMMVAVILATAGLEGTVLVAVGSLVVGVSMVFFPAIAHPYMKKITGSDDVALGHFSTISYVLAGFIGSKFGNKEHSTEEMNVPKSLLFLRDTPVAIAFTMGIIFIITCLFAGDTFVREVSGGKNWFMFSLMQSITFAAGVYIILQGVRMVIAEIVPAFKGISDKLVPNAKPALDCPVVFPYAPNAVLVGFLSSFAAGVIGMFVLYLLDWTVIIPGVVPHFFVGATAGVFGNATGGRRGAILGAFAQGLLITFLPVFLLPVLGDIGIANTTFSDADFGVIGILLGIIVR >CP026364.1|QAV21938.1|146735_147023_-|PTS-ascorbate-transporter-subunit-IIB MKITVVCGNGLGSSLMMEMSIKSILKDIAVNAEVDHVDLGSAKGTPSDIYVGTRDIAEQLTAQAVNGKIVSLDNMIDKVAMKEKLSTALRELGAL >CP026364.1|QAV21939.1|147056_147500_-|PTS-mannitol-transporter-subunit-IIA MLKTLLTPDVVQVVPHVSDWREAIKVACQPLIDKGYIEPRYVDAIYKSHEQIGPYYVLGPGIAMPHARPEEGVNKLSLALTIVEQGVEFGADENDPVKLLIVLAATDNDSHINAIVKLAELFDNDDDIQSLLNAKSKAEVFAVINNY >CP026364.1|QAV21940.1|147727_148774_+|LacI-family-transcriptional-regulator MIKTRKRRNTGRVTLQDVAKHAGVGSMTVSRALRTPELVSDKLREKVNQSVEELGYIPNASAGALASAQSHIVSVLLPSFTDKASADFMQSLQQVLNRHQYQILVGCYEHQPHKATDVINMLLQSNPAALVTFGSQLSTPHFLHISNANVPVVSVASQSNDQAAISIECPYEQAAFELTHYLVSQGKRCIGYIGALQGQRFHHQQITGWSRALLKNYLNAEQSVTTPDPASMAYGRQALTEILLRQPELDAVICSHESIALGMIFECQRRLIKIPQDLAIACLEGSDNSAQIFPSLTSIHFDYHKMGKDAGKHLITLLQRLRDEDDNAIFEDTVINYAYRFETGQSTP >CP026364.1|QAV21941.1|148770_149313_-|NUDIX-hydrolase MEQENTAVVEWVDIVDDKNEVVAQATRQQMRAENLRHRATYIVIHDGMGKILAQRRTETKDFYPGWLDATAGGVVQQGENLLESARREAEEELGIAGVPFAEHGQFYYDDKSCRVWGSLFSCVSHGPFALQAEEIEEVRWLTPSEITERCDEFTPDSLKALSLWLTRNNSTRLEARETVD >CP026364.1|QAV21942.1|149511_150126_+|thiol:disulfide-oxidoreductase MIDLYYADTPNGQKITLFLEEAEIPYQLHSIDISKGDQFKPEFLAISPNNKIPAIVDHKPIDGGEPIAIFESGAILIYLAEKSGKLFSQELREKTHQLQWLFWQVGGFGPMLGQNHHFTRYASETVPYAIKRYTEETQRLYNVLNKRLSQSTYLGGQHYSIADIATYTWVRAHKHHNISLTNYPAVEKWFNAISQRPAAKKLFG >CP026364.1|QAV21943.1|150196_151102_+|TIGR01777-family-protein MKILITGGTGLIGKALVCQLALDNHHITVLSRSPQKVYSHFCNEITCWTQLGDKNSLDEFDAVINLAGEPIADQRWTPSHKQKLVDSRCELTQKLVDLLKAGSSPPSVFISGSAVGFYGDQKNTLVTEKTPANPEFTHDLCAKWESIALEAQTPLTRVCLLRTGIVLSTLGGALPKMSKPFKLGLGGKLGSGTQYMPWIHIDDMVNAIVFLLNEEQAKGAFNLTAPNPVQNKEFTYILGKVFKRPALMTVPATALRLIMGESATLVLGGQQAIPEKLLNAGFEFRYPQLEEALTDIINTGK >CP026364.1|QAV21944.1|151237_151819_-|3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate-carboxy-lyase MKKLIVGLTGASGAIYGIRLLEILKCVPSVETHLVISQAARRTISLETTYSLKDIYELADVIYDDRDIGATISSGSFRVNGMVILPCSIKSLSGIVHSYTDTLVTRAADVVLKEGRKLVLCVRETPLHLGHLRLMTQAAELGAIIMPPVPAFYFQPKTIDDIVNQTINRVLDQFDVDLPDDLFQRWQGDKPAR >CP026364.1|QAV21945.1|151940_153458_-|amidophosphoribosyltransferase MCGIVGIAGVNPVNQSIYDALTVLQHRGQDAAGIATIDGNNGFRLRKANGLVKDVFETRHMLRLKGTIGIGHVRYPTAGSSSASEAQPFYVNSPFGITLAHNGNLTNAHLLRRQLFETARRHINTTSDSEILLNVLAYELDRFDHFPLEPDNIFTAVAAMHKKLCGAYACVALIISHGLLAFRDPFGIRPLVLGKRTLEDGRHEYMVASESVALDTLGFEFLRDVAPGEAVYITEQGQLFTRQCAENPQLMPCLFEYVYFARPDSFIDKISVYNARLRMGQKLGAKIAKEWDELQIDVVIPIPETSCDIALEIAHILNKPYRQGFVKNRYVGRTFIMPGQQERRKSVRRKLNANRAEFRDKNVLLIDDSIVRGTTSEQIVELAREAGAKKVYFASAAPEVRFPNVYGIDMPNANELIAHGREVDEIRKLIGADGLIFQELGDLIAAVQEENPDISQFECSVFDGVYITKDIDQDYLDYLENLRRDDEHKIRDQNEIENLEIYNEG >CP026364.1|QAV21946.1|153471_153978_-|colicin-V-production-protein MVWIDYAIIAIIGFSALVSLIRGFVREALSLITWGCGFFVASQFYPYLAVYFTRFEDELVRNGIAIVSLFIATLIVGAVVNYVISSLVQRTGLSGTDRVLGVCFGALRGVLIVSALLFVLGAFTPMAESADWQRSELIPQFNHIIRWFFDYLQNASSFVSENVTSPSG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP026364_1 | 1.9|134660|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 134660-134691 | 32 | KY420199 | Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome | 36581-36612 | 0 | 1.0 |
CP026364_1 | 1.16|135087|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135087-135118 | 32 | MN840487 | Proteus phage 2207-N35, complete genome | 13451-13482 | 0 | 1.0 |
CP026364_1 | 1.16|135087|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135087-135118 | 32 | NC_041925 | Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome | 33064-33095 | 0 | 1.0 |
CP026364_1 | 1.16|135087|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135087-135118 | 32 | MG575420 | Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome | 30954-30985 | 0 | 1.0 |
CP026364_2 | 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144485-144516 | 32 | NZ_KX774387 | Providencia rettgeri strain 30905 plasmid pC131, complete sequence | 42381-42412 | 0 | 1.0 |
CP026364_2 | 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144485-144516 | 32 | NZ_KX832929 | Providencia rettgeri strain 06-1619 plasmid p06-1619-1, complete sequence | 40923-40954 | 0 | 1.0 |
CP026364_2 | 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144485-144516 | 32 | NZ_CP053895 | Proteus mirabilis strain JPM24 plasmid pJPM24, complete sequence | 80419-80450 | 0 | 1.0 |
CP026364_2 | 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144485-144516 | 32 | NZ_CP047288 | Proteus cibarius strain G11 plasmid p152, complete sequence | 69831-69862 | 0 | 1.0 |
CP026364_2 | 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144485-144516 | 32 | NZ_CP053372 | Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-177, complete sequence | 65086-65117 | 0 | 1.0 |
CP026364_2 | 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144485-144516 | 32 | NZ_CP053043 | Proteus cibarius strain HNCF44W plasmid pHNCF44W_NDM-1, complete sequence | 102929-102960 | 0 | 1.0 |
CP026364_2 | 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144485-144516 | 32 | MG516912 | Proteus penneri plasmid pPp47, complete sequence | 49446-49477 | 0 | 1.0 |
CP026364_2 | 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144485-144516 | 32 | MG516911 | Proteus mirabilis plasmid pPm60, complete sequence | 49358-49389 | 0 | 1.0 |
CP026364_2 | 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144485-144516 | 32 | NZ_CP045540 | Proteus mirabilis strain CRE14IB plasmid pIB_NDM_1, complete sequence | 48992-49023 | 0 | 1.0 |
CP026364_2 | 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144485-144516 | 32 | NC_022589 | Providencia rettgeri strain 09ACRGNY2001 plasmid pPrY2001, complete sequence | 42115-42146 | 0 | 1.0 |
CP026364_2 | 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144485-144516 | 32 | NZ_CP047114 | Proteus mirabilis strain SCBX1.1 plasmid plas1.1.2, complete sequence | 38697-38728 | 0 | 1.0 |
CP026364_2 | 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144485-144516 | 32 | NZ_CP053897 | Providencia rettgeri strain YPR31 plasmid pYPR31, complete sequence | 83650-83681 | 0 | 1.0 |
CP026364_2 | 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144485-144516 | 32 | NZ_CP053899 | Proteus mirabilis strain YPM35 plasmid pJPM35-1, complete sequence | 108929-108960 | 0 | 1.0 |
CP026364_2 | 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144485-144516 | 32 | NZ_MH491967 | Proteus mirabilis strain HFK418 plasmid pHFK418-NDM, complete sequence | 71348-71379 | 0 | 1.0 |
CP026364_2 | 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144485-144516 | 32 | NZ_LC507075 | Providencia rettgeri strain BML2526 plasmid p.BML2526, complete sequence | 97253-97284 | 0 | 1.0 |
CP026364_2 | 2.9|144914|33|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 144914-144946 | 33 | MN062188 | Proteus phage Saba, complete genome | 49346-49378 | 0 | 1.0 |
CP026364_1 | 1.7|134538|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 134538-134569 | 32 | MN840487 | Proteus phage 2207-N35, complete genome | 12756-12787 | 1 | 0.969 |
CP026364_1 | 1.8|134599|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 134599-134630 | 32 | MG575420 | Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome | 23407-23438 | 1 | 0.969 |
CP026364_1 | 1.18|135209|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135209-135240 | 32 | NC_041925 | Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome | 21565-21596 | 1 | 0.969 |
CP026364_1 | 1.18|135209|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135209-135240 | 32 | MG575420 | Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome | 20171-20202 | 1 | 0.969 |
CP026364_1 | 1.20|135331|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135331-135362 | 32 | NC_041925 | Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome | 52081-52112 | 1 | 0.969 |
CP026364_1 | 1.23|135514|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135514-135545 | 32 | MN840487 | Proteus phage 2207-N35, complete genome | 52377-52408 | 1 | 0.969 |
CP026364_2 | 2.11|145037|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 145037-145068 | 32 | MK047642 | Phage NG55, complete genome | 34038-34069 | 1 | 0.969 |
CP026364_1 | 1.17|135148|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135148-135179 | 32 | NC_041925 | Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome | 44304-44335 | 2 | 0.938 |
CP026364_1 | 1.19|135270|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135270-135301 | 32 | MN840487 | Proteus phage 2207-N35, complete genome | 45636-45667 | 2 | 0.938 |
CP026364_1 | 1.19|135270|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135270-135301 | 32 | NC_041925 | Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome | 43234-43265 | 2 | 0.938 |
CP026364_1 | 1.19|135270|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135270-135301 | 32 | MG575420 | Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome | 16-47 | 2 | 0.938 |
CP026364_1 | 1.20|135331|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135331-135362 | 32 | MN840487 | Proteus phage 2207-N35, complete genome | 36014-36045 | 2 | 0.938 |
CP026364_1 | 1.23|135514|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135514-135545 | 32 | MG575420 | Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome | 47030-47061 | 2 | 0.938 |
CP026364_2 | 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144485-144516 | 32 | NZ_KX832927 | Providencia rettgeri strain 16pre36 plasmid p16Pre36-NDM, complete sequence | 39443-39474 | 2 | 0.938 |
CP026364_1 | 1.17|135148|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135148-135179 | 32 | MN840487 | Proteus phage 2207-N35, complete genome | 44566-44597 | 3 | 0.906 |
CP026364_1 | 1.17|135148|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135148-135179 | 32 | MG575420 | Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome | 1087-1118 | 3 | 0.906 |
CP026364_1 | 1.18|135209|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135209-135240 | 32 | MN840487 | Proteus phage 2207-N35, complete genome | 25138-25169 | 3 | 0.906 |
CP026364_1 | 1.20|135331|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135331-135362 | 32 | MG575420 | Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome | 9379-9410 | 3 | 0.906 |
CP026364_2 | 2.4|144608|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 144608-144639 | 32 | NC_014838 | Pantoea sp. At-9b plasmid pPAT9B01, complete sequence | 251555-251586 | 3 | 0.906 |
CP026364_1 | 1.23|135514|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135514-135545 | 32 | NC_041925 | Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome | 9814-9845 | 4 | 0.875 |
CP026364_1 | 1.20|135331|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135331-135362 | 32 | KM236246 | Bacillus phage Moonbeam, complete genome | 78779-78810 | 7 | 0.781 |
CP026364_2 | 2.4|144608|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 144608-144639 | 32 | MH321493 | Salmonella phage Skate, complete genome | 25630-25661 | 7 | 0.781 |
CP026364_2 | 2.4|144608|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 144608-144639 | 32 | KY860935 | Salmonella phage LPST10, complete genome | 15968-15999 | 7 | 0.781 |
CP026364_2 | 2.4|144608|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 144608-144639 | 32 | MN871490 | UNVERIFIED: Salmonella phage SEzh_1, complete genome | 25518-25549 | 7 | 0.781 |
CP026364_2 | 2.4|144608|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 144608-144639 | 32 | MN692673 | Salmonella phage VB_StyS_BS5, complete genome | 16007-16038 | 7 | 0.781 |
CP026364_2 | 2.4|144608|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 144608-144639 | 32 | MH791402 | UNVERIFIED: Salmonella phage Segz_1, complete genome | 19894-19925 | 7 | 0.781 |
CP026364_2 | 2.8|144853|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 144853-144884 | 32 | MT773554 | Myoviridae sp. isolate BML_2 genomic sequence | 138347-138378 | 7 | 0.781 |
CP026364_2 | 2.8|144853|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 144853-144884 | 32 | AP013378 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G14, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S23-C32 | 29912-29943 | 7 | 0.781 |
CP026364_2 | 2.8|144853|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 144853-144884 | 32 | AP013772 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C39-MedDCM-OCT-S34-C80, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 18321-18352 | 7 | 0.781 |
CP026364_1 | 1.5|134416|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 134416-134447 | 32 | NZ_CP040393 | Kosakonia radicincitans strain DSM 107547 plasmid pKrDSM107547, complete sequence | 94583-94614 | 8 | 0.75 |
CP026364_1 | 1.9|134660|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 134660-134691 | 32 | NC_014172 | Bacillus thuringiensis BMB171 plasmid pBMB171, complete sequence | 196215-196246 | 8 | 0.75 |
CP026364_1 | 1.14|134965|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 134965-134996 | 32 | NZ_CP007649 | Lactobacillus salivarius strain JCM1046 plasmid pLMP1046, complete sequence | 49832-49863 | 8 | 0.75 |
CP026364_1 | 1.17|135148|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135148-135179 | 32 | NZ_CP017468 | Staphylococcus nepalensis strain JS11 plasmid pSNJS1102, complete sequence | 14319-14350 | 8 | 0.75 |
CP026364_1 | 1.19|135270|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135270-135301 | 32 | MN694224 | Marine virus AFVG_250M369, complete genome | 4066-4097 | 8 | 0.75 |
CP026364_1 | 1.19|135270|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135270-135301 | 32 | NC_031058 | Pseudomonas phage NP1, complete genome | 18485-18516 | 8 | 0.75 |
CP026364_1 | 1.20|135331|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135331-135362 | 32 | JQ680364 | Unidentified phage clone 2200_scaffold1335 genomic sequence | 13864-13895 | 8 | 0.75 |
CP026364_2 | 2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144424-144455 | 32 | NZ_CP054832 | Staphylococcus saprophyticus strain UTI-045 plasmid pUTI-045-1, complete sequence | 36527-36558 | 8 | 0.75 |
CP026364_2 | 2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144424-144455 | 32 | NZ_CP013715 | Staphylococcus equorum strain C2014 plasmid pC2014-1, complete sequence | 2809-2840 | 8 | 0.75 |
CP026364_2 | 2.6|144731|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 144731-144762 | 32 | NZ_CP050268 | Salinivibrio costicola strain M318 plasmid pM138.1, complete sequence | 25997-26028 | 8 | 0.75 |
CP026364_2 | 2.11|145037|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 145037-145068 | 32 | NC_018878 | Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p, complete sequence | 234678-234709 | 8 | 0.75 |
CP026364_2 | 2.11|145037|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 145037-145068 | 32 | MN865127 | Vibrio alginolyticus strain C1579 plasmid pC1579, complete sequence | 96717-96748 | 8 | 0.75 |
CP026364_2 | 2.11|145037|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 145037-145068 | 32 | NC_016983 | Photobacterium damselae subsp. damselae plasmid pAQU1, complete sequence | 87866-87897 | 8 | 0.75 |
CP026364_2 | 2.14|145220|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 145220-145251 | 32 | MF919516 | Propionibacterium phage LilBandit, complete genome | 17637-17668 | 8 | 0.75 |
CP026364_2 | 2.14|145220|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 145220-145251 | 32 | NC_018849 | Propionibacterium phage P105, complete genome | 17780-17811 | 8 | 0.75 |
CP026364_1 | 1.7|134538|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 134538-134569 | 32 | MN692981 | Marine virus AFVG_117M36, complete genome | 18320-18351 | 9 | 0.719 |
CP026364_1 | 1.9|134660|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 134660-134691 | 32 | MF417925 | Uncultured Caudovirales phage clone 3F_9, partial genome | 34139-34170 | 9 | 0.719 |
CP026364_1 | 1.17|135148|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135148-135179 | 32 | NZ_CP034471 | Pantoea agglomerans strain CFSAN047153 plasmid pCFSAN047153_2, complete sequence | 157299-157330 | 9 | 0.719 |
CP026364_1 | 1.17|135148|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135148-135179 | 32 | NZ_CP034476 | Pantoea agglomerans strain CFSAN047154 plasmid pCFSAN047154_2, complete sequence | 38508-38539 | 9 | 0.719 |
CP026364_1 | 1.20|135331|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135331-135362 | 32 | JQ680362 | Unidentified phage clone 2019_scaffold260 genomic sequence | 2764-2795 | 9 | 0.719 |
CP026364_2 | 2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144424-144455 | 32 | MN693408 | Marine virus AFVG_25M188, complete genome | 7499-7530 | 9 | 0.719 |
CP026364_2 | 2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144424-144455 | 32 | MN693471 | Marine virus AFVG_25M187, complete genome | 24655-24686 | 9 | 0.719 |
CP026364_2 | 2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144424-144455 | 32 | MN693418 | Marine virus AFVG_25M180, complete genome | 7498-7529 | 9 | 0.719 |
CP026364_2 | 2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144424-144455 | 32 | MN693559 | Marine virus AFVG_25M310, complete genome | 8745-8776 | 9 | 0.719 |
CP026364_2 | 2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144424-144455 | 32 | MN693567 | Marine virus AFVG_25M189, complete genome | 7665-7696 | 9 | 0.719 |
CP026364_2 | 2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144424-144455 | 32 | AP014244 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S24-C27, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 2311-2342 | 9 | 0.719 |
CP026364_2 | 2.3|144546|33|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 144546-144578 | 33 | NZ_CP021649 | Acidovorax sp. T1 plasmid p1-T1, complete sequence | 65134-65166 | 9 | 0.727 |
CP026364_2 | 2.4|144608|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 144608-144639 | 32 | MG945191 | UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 696-1711, complete genome | 764-795 | 9 | 0.719 |
CP026364_2 | 2.8|144853|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 144853-144884 | 32 | NC_014660 | Acinetobacter phage Ac42, complete genome | 146497-146528 | 9 | 0.719 |
CP026364_2 | 2.11|145037|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 145037-145068 | 32 | KJ019089 | Synechococcus phage ACG-2014j isolate Syn7803US23, complete genome | 49505-49536 | 9 | 0.719 |
CP026364_2 | 2.11|145037|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 145037-145068 | 32 | MF975721 | Pseudomonas phage VW-6B, complete genome | 32607-32638 | 9 | 0.719 |
CP026364_2 | 2.11|145037|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 145037-145068 | 32 | NZ_KX711616 | Bacillus subtilis strain 72 plasmid pBS72, complete sequence | 81201-81232 | 9 | 0.719 |
CP026364_2 | 2.14|145220|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 145220-145251 | 32 | JQ680367 | Unidentified phage clone 2203_scaffold802 genomic sequence | 45189-45220 | 9 | 0.719 |
CP026364_1 | 1.9|134660|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 134660-134691 | 32 | NC_011371 | Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG204, complete sequence | 138965-138996 | 10 | 0.688 |
CP026364_1 | 1.9|134660|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 134660-134691 | 32 | NZ_CP035002 | Rhizobium acidisoli strain FH23 plasmid pRapFH23d, complete sequence | 627978-628009 | 10 | 0.688 |
CP026364_1 | 1.21|135392|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 135392-135423 | 32 | NC_022111 | Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence | 1470110-1470141 | 10 | 0.688 |
CP026364_2 | 2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144424-144455 | 32 | MF001361 | Enterococcus phage EF5, partial genome | 21194-21225 | 10 | 0.688 |
CP026364_2 | 2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 144424-144455 | 32 | MF001358 | Enterococcus phage EF1, partial genome | 96121-96152 | 10 | 0.688 |
CP026364_2 | 2.8|144853|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 144853-144884 | 32 | MT773557 | Myoviridae sp. isolate BML_S_1 genomic sequence | 67213-67244 | 10 | 0.688 |
CP026364_1 | 1.7|134538|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT | 134538-134569 | 32 | MN693342 | Marine virus AFVG_25M9, complete genome | 38395-38426 | 11 | 0.656 |
CP026364_2 | 2.12|145098|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 145098-145129 | 32 | NZ_CP015507 | Bacillus oceanisediminis 2691 plasmid pBO1, complete sequence | 347884-347915 | 11 | 0.656 |
1. spacer 1.9|134660|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to KY420199 (Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taagcggttgttcagcagataaaaaacccgaa CRISPR spacer taagcggttgttcagcagataaaaaacccgaa Protospacer ********************************
2. spacer 1.16|135087|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN840487 (Proteus phage 2207-N35, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgataaaccagtgtggtcatttttaataagcg CRISPR spacer tgataaaccagtgtggtcatttttaataagcg Protospacer ********************************
3. spacer 1.16|135087|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_041925 (Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgataaaccagtgtggtcatttttaataagcg CRISPR spacer tgataaaccagtgtggtcatttttaataagcg Protospacer ********************************
4. spacer 1.16|135087|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG575420 (Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgataaaccagtgtggtcatttttaataagcg CRISPR spacer tgataaaccagtgtggtcatttttaataagcg Protospacer ********************************
5. spacer 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KX774387 (Providencia rettgeri strain 30905 plasmid pC131, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc CRISPR spacer atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc Protospacer ********************************
6. spacer 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KX832929 (Providencia rettgeri strain 06-1619 plasmid p06-1619-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc CRISPR spacer atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc Protospacer ********************************
7. spacer 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053895 (Proteus mirabilis strain JPM24 plasmid pJPM24, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc CRISPR spacer atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc Protospacer ********************************
8. spacer 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP047288 (Proteus cibarius strain G11 plasmid p152, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc CRISPR spacer atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc Protospacer ********************************
9. spacer 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053372 (Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-177, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc CRISPR spacer atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc Protospacer ********************************
10. spacer 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053043 (Proteus cibarius strain HNCF44W plasmid pHNCF44W_NDM-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc CRISPR spacer atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc Protospacer ********************************
11. spacer 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to MG516912 (Proteus penneri plasmid pPp47, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc CRISPR spacer atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc Protospacer ********************************
12. spacer 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to MG516911 (Proteus mirabilis plasmid pPm60, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc CRISPR spacer atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc Protospacer ********************************
13. spacer 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045540 (Proteus mirabilis strain CRE14IB plasmid pIB_NDM_1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc CRISPR spacer atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc Protospacer ********************************
14. spacer 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_022589 (Providencia rettgeri strain 09ACRGNY2001 plasmid pPrY2001, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc CRISPR spacer atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc Protospacer ********************************
15. spacer 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP047114 (Proteus mirabilis strain SCBX1.1 plasmid plas1.1.2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc CRISPR spacer atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc Protospacer ********************************
16. spacer 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053897 (Providencia rettgeri strain YPR31 plasmid pYPR31, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc CRISPR spacer atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc Protospacer ********************************
17. spacer 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053899 (Proteus mirabilis strain YPM35 plasmid pJPM35-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc CRISPR spacer atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc Protospacer ********************************
18. spacer 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MH491967 (Proteus mirabilis strain HFK418 plasmid pHFK418-NDM, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc CRISPR spacer atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc Protospacer ********************************
19. spacer 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LC507075 (Providencia rettgeri strain BML2526 plasmid p.BML2526, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc CRISPR spacer atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc Protospacer ********************************
20. spacer 2.9|144914|33|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN062188 (Proteus phage Saba, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
acgtcgtaaataggtttcgacgtcatacagggg CRISPR spacer acgtcgtaaataggtttcgacgtcatacagggg Protospacer *********************************
21. spacer 1.7|134538|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN840487 (Proteus phage 2207-N35, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
gtcggtaaaactaaagatggtaatttattaat CRISPR spacer gttggtaaaactaaagatggtaatttattaat Protospacer **.*****************************
22. spacer 1.8|134599|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to MG575420 (Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
tccattgttcgaatattagtaagatgacgata CRISPR spacer tccattgtgcgaatattagtaagatgacgata Protospacer ******** ***********************
23. spacer 1.18|135209|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_041925 (Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
gatcaacacttcactaatgaaagaaacagtat CRISPR spacer aatcaacacttcactaatgaaagaaacagtat Protospacer .*******************************
24. spacer 1.18|135209|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG575420 (Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
gatcaacacttcactaatgaaagaaacagtat CRISPR spacer aatcaacacttcactaatgaaagaaacagtat Protospacer .*******************************
25. spacer 1.20|135331|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_041925 (Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
tctataatatttcaggactgattgttaaacga CRISPR spacer tttataatatttcaggactgattgttaaacga Protospacer *.******************************
26. spacer 1.23|135514|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN840487 (Proteus phage 2207-N35, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
cgaacactcttcattatgagcgcgtctaattt CRISPR spacer cgaacactcttcgttatgagcgcgtctaattt Protospacer ************.*******************
27. spacer 2.11|145037|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK047642 (Phage NG55, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
atggcatattcaaactcaccattatcattgac CRISPR spacer atggcatattcaatctcaccattatcattgac Protospacer ************* ******************
28. spacer 1.17|135148|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_041925 (Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
tgatagtagaggagcagatgaagctgcacctg CRISPR spacer tgatagcagaggagcagatgaagctgcaccag Protospacer ******.*********************** *
29. spacer 1.19|135270|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN840487 (Proteus phage 2207-N35, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
atgacgtctcggtaatctggtctaggttctcc CRISPR spacer ataacatctcggtaatctggtctaggttctcc Protospacer **.**.**************************
30. spacer 1.19|135270|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_041925 (Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
atgacgtctcggtaatctggtctaggttctcc CRISPR spacer ataacatctcggtaatctggtctaggttctcc Protospacer **.**.**************************
31. spacer 1.19|135270|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG575420 (Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
atgacgtctcggtaatctggtctaggttctcc CRISPR spacer ataacatctcggtaatctggtctaggttctcc Protospacer **.**.**************************
32. spacer 1.20|135331|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN840487 (Proteus phage 2207-N35, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
tctataatatttcaggactgattgttaaacga CRISPR spacer tctataatatttcagggctgattgtcaaacga Protospacer ****************.********.******
33. spacer 1.23|135514|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG575420 (Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
cgaacactcttcattatgagcgcgtctaattt CRISPR spacer cgaacactcttcgttatgagcacgtctaattt Protospacer ************.********.**********
34. spacer 2.2|144485|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KX832927 (Providencia rettgeri strain 16pre36 plasmid p16Pre36-NDM, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
atcatcaatctcaatatattcccattcaagtc CRISPR spacer atcatcaatctcaatatattcccattcgagcc Protospacer ***************************.**.*
35. spacer 1.17|135148|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN840487 (Proteus phage 2207-N35, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
tgatagtagaggagcagatgaagctgcacctg CRISPR spacer tgatagcagaggagcagatgaagctgcaccaa Protospacer ******.*********************** .
36. spacer 1.17|135148|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG575420 (Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
tgatagtagaggagcagatgaagctgcacctg CRISPR spacer tgatagcagaggagcagatgaagccgcaccgg Protospacer ******.*****************.***** *
37. spacer 1.18|135209|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN840487 (Proteus phage 2207-N35, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
gatcaacacttcactaatgaaagaaacagtat CRISPR spacer aatcaatacttcactaatgaaagaaatagtat Protospacer .*****.*******************.*****
38. spacer 1.20|135331|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG575420 (Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
tctataatatttcaggactgattgttaaacga CRISPR spacer tttataatatttcaggactgattgtcagacga Protospacer *.***********************.*.****
39. spacer 2.4|144608|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_014838 (Pantoea sp. At-9b plasmid pPAT9B01, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.906
ttcttcaccacgaagaacgccagaacctaatg CRISPR spacer ttcttcaccgcgaagaacgccggaacctaacg Protospacer *********.***********.********.*
40. spacer 1.23|135514|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_041925 (Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
cgaacactcttcattatgagcgcgtctaattt CRISPR spacer cgaacactcttcattatgagcacgtcggatct Protospacer *********************.**** .**.*
41. spacer 1.20|135331|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KM236246 (Bacillus phage Moonbeam, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
tctataatatttcaggactgattgttaaacga CRISPR spacer ttcataatatgtcaggaatgattgttaatata Protospacer *..******* ****** ********** *
42. spacer 2.4|144608|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH321493 (Salmonella phage Skate, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
ttcttcaccacgaagaacgccagaacctaatg- CRISPR spacer ttcttcaccacgcaaaacgccag-ccgcaatac Protospacer ************ *.******** * .***.
43. spacer 2.4|144608|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY860935 (Salmonella phage LPST10, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
ttcttcaccacgaagaacgccagaacctaatg- CRISPR spacer ttcttcaccacgcaaaacgccag-ccgcaatac Protospacer ************ *.******** * .***.
44. spacer 2.4|144608|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN871490 (UNVERIFIED: Salmonella phage SEzh_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
ttcttcaccacgaagaacgccagaacctaatg- CRISPR spacer ttcttcaccacgcaaaacgccag-ccgcaatac Protospacer ************ *.******** * .***.
45. spacer 2.4|144608|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN692673 (Salmonella phage VB_StyS_BS5, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
ttcttcaccacgaagaacgccagaacctaatg- CRISPR spacer ttcttcaccacgcaaaacgccag-ccgcaatac Protospacer ************ *.******** * .***.
46. spacer 2.4|144608|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH791402 (UNVERIFIED: Salmonella phage Segz_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
ttcttcaccacgaagaacgccagaacctaatg- CRISPR spacer ttcttcaccacgcaaaacgccag-ccgcaatac Protospacer ************ *.******** * .***.
47. spacer 2.8|144853|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT773554 (Myoviridae sp. isolate BML_2 genomic sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
gataatgttcagcaaataaaattctttctgta CRISPR spacer tatattgttgagcaaataaaattctttcgcct Protospacer *** **** ****************** .
48. spacer 2.8|144853|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP013378 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G14, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S23-C32) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
gataatgttcagcaaataaaattctttctgta CRISPR spacer tagcataatcagcaaataaaaatccttctgta Protospacer * **. ************* **.*******
49. spacer 2.8|144853|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP013772 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C39-MedDCM-OCT-S34-C80, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
----gataatgttcagcaaataaaattctttctgta CRISPR spacer aagctataa----cagcaaataaaattctttattta Protospacer **** ****************** * **
50. spacer 1.5|134416|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040393 (Kosakonia radicincitans strain DSM 107547 plasmid pKrDSM107547, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tctatgattcatcttcatcttggagaagcagt CRISPR spacer attctgattcatcttcatcatgaagaatcttt Protospacer .* *************** **.**** * *
51. spacer 1.9|134660|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014172 (Bacillus thuringiensis BMB171 plasmid pBMB171, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taagcggttgttcagcagataaaaaacccgaa CRISPR spacer aaggcggttattcagcatataaaaaacagaag Protospacer *.******.******* ********* .*.
52. spacer 1.14|134965|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP007649 (Lactobacillus salivarius strain JCM1046 plasmid pLMP1046, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aaatgccagaaaaagagatggtgcgcatttat CRISPR spacer aaatgtcagaaaaagagatgatgactagttta Protospacer *****.**************.** .* **
53. spacer 1.17|135148|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017468 (Staphylococcus nepalensis strain JS11 plasmid pSNJS1102, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tgatagtagaggagcagatgaagctgcacctg CRISPR spacer taaattaaaaggagcaaatgaagctacacctg Protospacer *.* *.*******.********.******
54. spacer 1.19|135270|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694224 (Marine virus AFVG_250M369, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atgacgtctcggtaatctggtctaggttctcc CRISPR spacer tttcattttcggtgatctggtctaggttcacc Protospacer * *.*****.*************** **
55. spacer 1.19|135270|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_031058 (Pseudomonas phage NP1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atgacgtctcggtaatctggtctaggttctcc CRISPR spacer aggacgtctcgataatctcgtctaggagcgaa Protospacer * *********.****** ******* *
56. spacer 1.20|135331|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JQ680364 (Unidentified phage clone 2200_scaffold1335 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tctataatatttcaggactgattgttaaacga CRISPR spacer ttgattatatttcaggactgattgttgcgggg Protospacer *. ** ********************. . *.
57. spacer 2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP054832 (Staphylococcus saprophyticus strain UTI-045 plasmid pUTI-045-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cgaaaaattattgctgttaaaaaagtgatccg- CRISPR spacer cgaaaagttattgct-tttaaaaactaacctat Protospacer ******.******** ** ***** *.*.*..
58. spacer 2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013715 (Staphylococcus equorum strain C2014 plasmid pC2014-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cgaaaaattattgctgttaaaaaagtgatccg- CRISPR spacer cgaaaagttattgct-tttaaaaactaacctat Protospacer ******.******** ** ***** *.*.*..
59. spacer 2.6|144731|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP050268 (Salinivibrio costicola strain M318 plasmid pM138.1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tcccttgccttagcgattagctcatcagtcag CRISPR spacer gctttgaacttagcgatttgctcatccgtcag Protospacer *..* . ********** ******* *****
60. spacer 2.11|145037|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_018878 (Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggcatattcaaactcaccattatcattgac CRISPR spacer tgttcatattcatactcaccatcatcatttaa Protospacer ******** *********.****** *
61. spacer 2.11|145037|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN865127 (Vibrio alginolyticus strain C1579 plasmid pC1579, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggcatattcaaactcaccattatcattgac CRISPR spacer tattcatattgaagctcaccattatcatcaac Protospacer ****** **.**************..**
62. spacer 2.11|145037|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_016983 (Photobacterium damselae subsp. damselae plasmid pAQU1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggcatattcaaactcaccattatcattgac CRISPR spacer tattcatattgaagctcaccattatcatcaac Protospacer ****** **.**************..**
63. spacer 2.14|145220|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF919516 (Propionibacterium phage LilBandit, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
gatgtgcatgttgcggtgatggtttcggtttc CRISPR spacer atggtgtattttgcggtgatggtttcggggtt Protospacer . ***.** ****************** *.
64. spacer 2.14|145220|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_018849 (Propionibacterium phage P105, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
gatgtgcatgttgcggtgatggtttcggtttc CRISPR spacer atggtgtattttgcggtgatggtttcggggtt Protospacer . ***.** ****************** *.
65. spacer 1.7|134538|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN692981 (Marine virus AFVG_117M36, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
gtcggtaaaactaaagatggtaatttattaat CRISPR spacer caaggacaaaataaagatggtaatttagtaga Protospacer ** *** **************** **.
66. spacer 1.9|134660|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to MF417925 (Uncultured Caudovirales phage clone 3F_9, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
taagcggt----tgttcagcagataaaaaacccgaa CRISPR spacer ----ccgcatcacgttcagcacataaaaaagccgaa Protospacer * *. .******** ******** *****
67. spacer 1.17|135148|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP034471 (Pantoea agglomerans strain CFSAN047153 plasmid pCFSAN047153_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tgatagtagaggagcagatgaagctgcacctg CRISPR spacer aactgcaacaggagcagttgaagctgcaactg Protospacer . *. * ******** ********** ***
68. spacer 1.17|135148|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP034476 (Pantoea agglomerans strain CFSAN047154 plasmid pCFSAN047154_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tgatagtagaggagcagatgaagctgcacctg CRISPR spacer aactgcaacaggagcagttgaagctgcaactg Protospacer . *. * ******** ********** ***
69. spacer 1.20|135331|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JQ680362 (Unidentified phage clone 2019_scaffold260 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tctataatatttcaggactgattgttaaacga CRISPR spacer ttgattatatttcaggtctgattgttgcgggg Protospacer *. ** ********** *********. . *.
70. spacer 2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693408 (Marine virus AFVG_25M188, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cgaaaaattattgctgttaaaaaagtgatccg CRISPR spacer ggaaaaattattgcagctaaaaaagcattaga Protospacer ************* *.********.. * .
71. spacer 2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693471 (Marine virus AFVG_25M187, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cgaaaaattattgctgttaaaaaagtgatccg CRISPR spacer ggaaaaattattgcagctaaaaaagcattaga Protospacer ************* *.********.. * .
72. spacer 2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693418 (Marine virus AFVG_25M180, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cgaaaaattattgctgttaaaaaagtgatccg CRISPR spacer ggaaaaattattgcagctaaaaaagcattaga Protospacer ************* *.********.. * .
73. spacer 2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693559 (Marine virus AFVG_25M310, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cgaaaaattattgctgttaaaaaagtgatccg CRISPR spacer ggaaaaattattgcagctaaaaaagcattaga Protospacer ************* *.********.. * .
74. spacer 2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693567 (Marine virus AFVG_25M189, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cgaaaaattattgctgttaaaaaagtgatccg CRISPR spacer ggaaaaattattgcagctaaaaaagcattaga Protospacer ************* *.********.. * .
75. spacer 2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014244 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S24-C27, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cgaaaaattattgctgttaaaaaagtgatccg CRISPR spacer gataaaaatattgttgttaaaaaagtaaaact Protospacer . **** *****.************.* *
76. spacer 2.3|144546|33|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP021649 (Acidovorax sp. T1 plasmid p1-T1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gatttttttttgcttgatgtttccatgccatgc CRISPR spacer atgacttttttgcttgctgttgccatgccataa Protospacer . .*********** **** *********.
77. spacer 2.4|144608|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG945191 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 696-1711, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttcttcaccacgaagaacgccagaacctaatg CRISPR spacer actcttaccacgaagaaggacagaacctaaac Protospacer ...*.*********** * **********
78. spacer 2.8|144853|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_014660 (Acinetobacter phage Ac42, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
gataatgttcagcaaataaaattctttctgta CRISPR spacer atttggattcaacaaagaaaattctttctgaa Protospacer . * . .****.**** ************* *
79. spacer 2.11|145037|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019089 (Synechococcus phage ACG-2014j isolate Syn7803US23, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
atggcatattcaaactcaccattatcattgac CRISPR spacer tgtgcatattgaaactgaccattatcatattg Protospacer ******* ***** ***********
80. spacer 2.11|145037|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF975721 (Pseudomonas phage VW-6B, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
atggcatattcaaactcaccattatcattgac CRISPR spacer ccacaaacctcaaacccaccattatcattgac Protospacer .. * .******.****************
81. spacer 2.11|145037|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KX711616 (Bacillus subtilis strain 72 plasmid pBS72, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
atggcatattcaaactcaccattatcattgac CRISPR spacer ttggcatattcaaagtgaccattaaagtctat Protospacer ************* * ******* .*. *.
82. spacer 2.14|145220|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JQ680367 (Unidentified phage clone 2203_scaffold802 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
gatgtgcatgttgcggtgatggtttcggtttc CRISPR spacer gcctcggtggtttcggtggtggtttcggtttc Protospacer * . .* *** *****.*************
83. spacer 1.9|134660|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011371 (Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG204, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
taagcggttgttcagcagataaaaaacccgaa CRISPR spacer ctgcggattgttcagcagcgaaaaaacccggt Protospacer . . *.*********** **********.
84. spacer 1.9|134660|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035002 (Rhizobium acidisoli strain FH23 plasmid pRapFH23d, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
taagcggttgttcagcagataaaaaacccgaa CRISPR spacer ctgcggattgttcagcagcgaaaaaacccggt Protospacer . . *.*********** **********.
85. spacer 1.21|135392|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_022111 (Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
agtggttaataaccaaagaccatgacgatggg CRISPR spacer ttggcttaataaccaaagagcaagacgaaaat Protospacer * ************** ** ***** ..
86. spacer 2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to MF001361 (Enterococcus phage EF5, partial genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
cgaaaaattattgctgttaaaaaagtgatccg CRISPR spacer aataaaattattgctgatagaaaagtattaga Protospacer . ************* **.******. * .
87. spacer 2.1|144424|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to MF001358 (Enterococcus phage EF1, partial genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
cgaaaaattattgctgttaaaaaagtgatccg CRISPR spacer aataaaattattgctgatagaaaagtattaga Protospacer . ************* **.******. * .
88. spacer 2.8|144853|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT773557 (Myoviridae sp. isolate BML_S_1 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
gataatgttcagcaaataaaattctttctgta CRISPR spacer tgtaatgttcagcaaatagagttctcaatcct Protospacer .****************.*.****. * .
89. spacer 1.7|134538|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693342 (Marine virus AFVG_25M9, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
gtcggtaaaactaaagatggtaatttattaat CRISPR spacer ccaaataaagataaagatggtaatttatatta Protospacer . ..****. *****************
90. spacer 2.12|145098|32|CP026364|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP015507 (Bacillus oceanisediminis 2691 plasmid pBO1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
aaatttcctcactttctggctatattgaccta CRISPR spacer ttttttcctcgctttcaggctatattttgacg Protospacer *******.***** ********* ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
157950 : 230665
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP026364|157950:230665|DBSCAN-SWA 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97 | Cronobacter_phage(21.15%) | lysis,tRNA,holin,terminase,tail,head,coat,integrase | attL 178832:178850|attR 236906:236924 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
576469 : 617134
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP026364|576469:617134|DBSCAN-SWA 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>CP026364|576469:617134|611030_611756_+|QAV25177.1|DBSCAN-SWA MKTTLAQRLKKARRLSGLSQKELGEAVGVSQAAIQKIEVGSAQNSTKLIEIAKVLRVSPEWLSSGNGDDPTLPAIHTSEVSNINTATHSEIGSGVSNAYKVEILDIQASAGPGVMVIDDFIETITAIEYSADEAKRLFGGRPSNTIKMITVKGDSMSETFEPRDQIFVDITTNFFDGDGIYVFVLDNQLYIKRLQKQHKRLAVISDNSRYETWYLDEEAISGLYIHAKVLVSQSIKYRFHG >CP026364|576469:617134|615788_616046_+|QAV22366.1|DBSCAN-SWA MQIAFKNAQGMRVNTDDKTVMEFDDSSKLSIETGSFSELAKVTEIDPVEALQWIMQFDKEEIDRIVNEASKDAPVSKMNLLRRVA >CP026364|576469:617134|592665_593070_-|QAV22331.1|DBSCAN-SWA MAIVELNKTTFRAMFPEFSNISDDLLLFLFDQATDYLDNTEFSLVYQADKRERLLYLLMAHLAYMRYGDKDGKGGSGMVGRVSSASEGSVSVSSELGAIEFRNAWYTLSPYGMDYWQATKVYRMASYYPGSIYG >CP026364|576469:617134|593072_593276_-|QAV25174.1|DBSCAN-SWA MTRDVPADAWEAFEKSFKDQKIFLNGIVFAVTDYKSAEDASKERAKQKTGLEQASAKSAGVEPLTED >CP026364|576469:617134|593400_594426_-|QAV22332.1|DBSCAN-SWA 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64 | Acinetobacter_phage(26.19%) | lysis,holin,terminase,tail,head,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2604071 : 2614845
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP026364|2604071:2614845|DBSCAN-SWA ATTACTCATTTGGTGTCTCCTTATCCAGTGCTTGTAACAACATTCCTTTTGAAATTAAACCAAGGTAGCGGTTTTTATCATCAATAACAGGAATGGCACAGGGAGATTGTGCAACAGTGGAAATCAGTTCATTTAACGGTGTTTCACCATTAATGGCGCAAGGCTCAGTTAAAATTGCAGATTCAATAGGTTGTTTATTTTTTAATGCTTCTTCCAGTGAATTAATCGAGACAATGCCGATAAATTTTCTACCTCGCTCAATAAGATAACCAAAGTTTCTATCTTCATCTTCAAGCACTTTTAATGCAGAACGAGGGCCAAATCCTGGGGCAACATGCAGTAATGTTTCAGGGCGGCGTTTTGCGACATCTTTTGCACTAAATACGTGGCTAATATCAACACCTCTAAAGAAGGTGCGTACATAATCATTCGCTGGATTATTCAGTATTTCATCGGGTGTACCAATTTGAACGACCACACCACCTTGCATAATGGCAATTCTATCGCCAATACGCATTGCTTCATCAAGATCATGAGAAATAAATACTATCGTGCGTTGTTTATCGCCTTGCAAACTTAGCAATTCGTCTTGCATTTCGGTACGTATTAATGGGTCAAGTGCGGAAAATGCTTCATCCATCAATAAGATATCAGGATCATTTGCTAATGCTCGAGCAAGCCCAATACGTTGGCGCATACCACCTGATAGCTCATCAGGCCATGAGTTAGCATGATTTCCAAGGTTTACCTGCTCTAAAGCGGCCATCGCTTTTTCATAGCGTTCTTCTTTGCTTAACCCAGCAAGATCCATACCGAAAGCTGTATTATCAAGTACATTCATATGTGGCATTAAAGCAAAAGATTGAAACACCATACTGATTTTTTTACGACGTACCTGGCGGAGTTCCTTATCAGTCATTGTGGCAATATTTTCGCCATCAATAAGTACTTCGCCTCGGGTTGGATCTATCAGACGATTGAGAAGGCGCACTAATGTGGATTTACCAGATCCTGATAATCCCATGATGACAAATATTTCGCCTTCTTCAATGGCCAGATTTGCATTTTGAACACCGACGGTTAACCCTGTTTTATCAAAAATCTGGTCTTTATTCATACCCGATTCTAATAAATCAAAGGCACGTTTTGGGTGCTCGCCAAATACCTTATAGAGGTTTTTAACTTCTAATTTAATTGCCATGCAATATATCGTTCCCTATTAAAATAATGGAAAGAATAAATAAAAATATAATGAATTTATGGTGCTTAAATTCCTAATTAACGTTTTTAGTAAGGGAAATACCCTACCATAATGAAGCTGCCTGACAACCCTATGTTAATTAGAATTAACTAAATAAATTCTCTTTTTTTCTATCATATTGTTAATGATTAATAATTAAATAAAGCGAAATAATCTTTTTTTATAAAAAAATAATTGTTGTGATAACCCACTGAAATAACGTTATTTTTATAGACATTATTATTTTAATTATGATCTCAATAGAAATGATAATAAAAAGGCTATTTATAGAAATACTTTCAAGAAAATAAAAATGAATATAAATGCACTTACATTAATGTTTTTAATGTTTTATTGTGGTTGATAGGTGAATTATAAGGAAAATCATTAAAAATCATTCGTAAAAAATTGGCTATTTCAGATAATCGAACGGTAAAAACCATATAATTAGATTAATTAATGAGCAATAAAAAACGCACTAAAAAATAAGTTATATTTTTCAGTGCATTATATTTTTATTGTTAATACATAATTAAAATCAATGTATGCTGGCGTTGCTTTTGATTAGACACTTTTGGGTTAAATTAAAAATCCCAATCATCATCTTCTGTATTAATTGTTTTACCAATAACATAAGAAGAACCAGAGCCGGAAAAGAAATCATGATTCTCATTAGCATCTGGTGATAATGAAGAAAGAATAGCAGGGCTTACATCGGTTAATTCATCTGGGAATAAAGCTTCATAGCCTAAGTTCATTAATGCTTTATTGGCATTATAATGAAGAAATTTTTTTACATCTTCAGTCCAGCCTACAGAGTCATAAAGATTTTCAGTATATTTCACTTCATTATCATATAAATCTAACAGTAAAGAGAAAGCAAAATCTTTGATTTCTTGTTTTTCTAATTCTGATTTATTTAATAACTGATTTTGAAATTTATAGCCAATATAATAACCATGAACAGCTTCATCTCTAATAATAAGACGAATTAGATCAGCAGTATTGGTTAATTTACCTCTACTTGACCAATACATAGGTAAATAGAAACCGGAATAGAATAGAAATGATTCTAAAAAGACGCTGGCAATCTTTTTCTTAAGTGGGTCGACATCTTGGTAATAGCGTAGAATTATTTCAGCTTTCTTTTGTAAAAAAGGATCCTCTTCACTCCATCGATAAGCGGCATCTACATCGGTCGTTAAACAAAGTGTAGAGAAAATAGAGCTGTAAGAGCGAGCATGTACGGCTTCCATAAAGCAAATATTAGATAATACAGCTTCTTCATGTGGTGTAAGAGCATCTGGCATTAAAGTGGGTGCACCTACCGTATTTTGAATAGTATCGAGTAACGTTAATCCAGTAAAAACACGAATAGTGAGTTGCTTCTCTTTTGCTGTAAGCGTATTCCAAGAAGGAATATCATTAGAAAGTGGTATTTTTTCAGGTAGCCAAAAATTCATAGTAAGACGATTCCATACTTCAAGATCTTTCTCATCTTCTATACGATTCCAATTAATCGCATTAACACGATTTAAATAAGGTGCTGACATATTGCATCCTCCTTATTGTTATTTATTTTTATTAAAGTGCACATGAAACACAGCCTTTTATTTCAGTTCCGGCTAATGCTGTTTGTCGAATACGAATGTAATACAAGGTTTTAATACCTTTGCGCCAAGCATAGATTTGGGCTTTATTGATATCTCTTGTTGTTGCCTCATCAGAAAAGAACAAGGTTAATGATAAGCCTTGATCAATATGCTGTGTAGCTTGAGCATAGGTATCGATAATTTTTTCAGCACCAATTTCGTAAGCATCTTGATAATAGTGGCGATTTTCATTGGTCATAAACGGAGCTGGATAATAAACTCGACCAATTTTACCTTCTTTTCTTATTTCTATAGGCGCTGCAATAGGGTGGATGCTTGATGTAGAGTGGTTGATATAAGAAATAGAACCAGTAGGTGGTATTGCCTGTAAGTTCTGATTATAAATGCCGTAAGTCATGATCGATAGTTTAAGTTTTTGCCAATCTTCTTGAGTTGGAATATGTACATTTGATTGGCTAAATAGCTGGTGGATTTTTTGTGTTTTAGGCAGCCACTGTTGGGATAAATATTTATTAAAATATTCACCGGAAGCGTATTTTGAATTTTCAAAATTATTGAAAGTCTGTTTTTTTTCAATGGCTAATTGATTTGATGCTAATAAAGCATAATAAGTGACGGTATAAAAATAGATATTAGTAAAATCTAATGCTTCTTCAGAACCATAATAAATACCTTCTCGGGCTAAATAACCATGTAAATTCATTTGCCCTAAACCAATGGCATGAGAAGCTTGGTTGCCTTTTTGAATAGAAGGCACCGATTCTATTTTAGTCATATCAGCGACATTACTTAATGCTCTAATAGCAATATTAATCGTACGAGCAAAATCAGGCGAATCCATCGCCATCGCAATATTCATTGAACCTAAATTACAGCTGATATCATGGCCAATATAGCGATAACTTAAATCGGGGTGGTATTCACTGGCACTATTAACTTGAAGAATTTCAGAGCATAAATTACTCATATTAATTCGACCCGCAATAGGGTTATTTCGATTCACCGCATCTTCAAACATAATATAGGGATAGCCAGATTCAAATTGAATTTCAGCTAATGTTTGAAAAAACTCTCTAGCTTTAATTTTCTTTTTGCGAATATTGGCGTTATTTACCATTTCAGCATATTTTTCGCTAATGCTTATTTCAGACATAGGCATGCCATAAACCCGCTCTACATCATAAGGTGAAAAGAGGTACATATCTTCATTACGCTTAGCGAGCTCAAAGGTAATATCAGGAATAACGACACCTAAAGAAAGTGTTTTAATTCTGACTTTTTCATCTGCATTTTCTCGCTTAGTATCAAGAAAATGATAAATATCAGGGTGGTGAGCATGAAGATAAACGGCACCAGCACCCTGTCTCGCACCTAATTGATTGGCGTATGAAAATGCATCTTCAAGCATTTTCATTACAGGTACGACGCCAGAAGATTGATTTTCTATACGCTTAATTGGCGCACCAGCTTCACGCAAGTTTGTTAGTAAAAAAGCAACGCCGCCGCCGCGTTTAGAGAGTTGTAGTGCAGAGTTAACTGACCTACCAATAGATTCCATATTATCTTCAATACGCAAAAGAAAGCAGGAGACCAATTCGCCTCGTTGTTGTTTGCCACAATTTAAGAATGTAGGCGTTGCGGGTTGAAAGCGGCCACTAATAATTTCATCAACAATATGTATAGCAAGGTCGGTATTTCCTTGCGCAAGTGTTAATGCCACCATGCATACTCTGTCTTCATAGCGCTCAAGATAGCGTTCGCCATCAAAAGTCTTTAAGGTATAGCTGGTATAGTATTTAAAGGCGCCAAGAAAGGATTGAAAGCGAAATTTCTTGCTATAAGCATGCTTAAAAAGCTGTTTTATAAAGGAAAATTCATATTGTTCTAAAACTTGCGCCTCGTAATAGTGCTGCTGTACTAGAAAATCAAGTTTCTCTTTAAGATCGTGAAAAAATACCGTGTTTTGATTAACATGCTGACGAAAAAAGTGGTGGGTCGCTAATTTGTCTTTCTCAAATTGAATATTGCCTTGTTCGTCATAGAGATTGAGCATGGCATTTAACGCATGGTAATCAAGTTGTTCAGTTGATTGAGTCATGTTTATTATCTCACTGCATTGTTCAGGTCATTTAAACAGTTGACCAAAACGCACTTAATCCGGTTTTTACGCGCTTAACATCTTCTGGCGTGCCTAGAAGCTCAAATCGATAGAGAAAAGGCACTTGGCATTTTTGAGCGATAATATCGCCGGCTAATCCATAAGCGACACCAAAATTAGTATTGCCAGAAGCGATTACGCCACGTATTAAATGGCGGTTTTCAGGAATATTTAAAAACTGAATAACCGTTTTGGGAACTGCACCTTGAGTTCCACCGCCACCATAAGTAGGGCTAAGCAATACAAAAGGTTGTGTTGCAAGTAGCTGCTCATCTTCAATTAATCTTGTTGCTTGTATATTGAGCTTTTGCACGAAGCGGTGACAATTTTCAGAGCGACTTGAAAAATAGATTAAAGGTGCCGTTTGCATTAGTAGCTCCTTTTAGAGCGTAATTTGTCTTATTTTATCAGGACAAAATCCAGACCAATGTTGTTCGCCATTAACAACGACAGGCACTTGTCGATATCCCATCGAAACAATCTGTTCTAATGCTTGCGTATCTTTCGTGAGATCTACAGAGACAAACGGAATATTTTTCTGTTTTAACGCACGTTCAGTGGCACTGCATTGAACGCAATTCGGTTTGGTATAGAGGATCACAGACATAAACTAACCCTTATAAAAATGTAAACGCACAACAATAACGCTCACAATGAAAAGTGATTAGATACTATATATAGAGTTATTTATTTTCAACCACACAATATATGGTGGTTTTGTTGTTTGATAATGATTATTATTAAAATTAAACAGTTAGCGCACTAATTTTATTTTTCAATCGCTTTATTGATCAATTTTTATTAGGTATGCGAGTAATTAGATGATTGCTTTATAAATAAAGCATGATTTAATCTTGTGAATACAGACGGATCAGCAGAGAAAACATTATGTACCAAGACTATCTCGATACACCAAAAGAATTCCCAAAACCCTATATATCGATTACTGCAAATGAAGAGGGAATTACAAGCCTTTATTTTGTAGATGAAAAAGAAATTGCCGTTCATTCAAGTCCGATAATTAATCAATGTGTTAAGCAATTGAAAGAGTATTTTGCAGGTAAACGTACGACATTTTCAGTGCCATTAGCACCAGAGGGAACTGAATTTCAAGGCCGTGTTTGGCAAACACTTCAAACGATACCTTTTGGTGAAATTTGGAGTTATAAAAAATTAGCGCTTACATTAGGTTCAGTCAATTATTGCAGAGCGGTTGGAATGGCAAACTCACGTAACCCAATCTCTTTAATCATCCCTTGTCATCGAGTTATTGGACATAATGGAAAATTAGTGGGCTATACTGGTGGGTTAGATATTAAACGTTGGCTACTTCGTTACGAAAAAGTTGATATTGATGAATAGTTCATACTGTTAGTATTAAGTATTATTTCTTAAGAGAACTATGGCTTAAGTTATGAGATTTGTCTGAATATTAATCGGTTGGCAGAAAAAAAATGCGCGTTTCGTGATCTAGACTGTGGACAGCGAATCATCATTTTTGTTTTACTATAGCCAACGCAAAACGCTTGCGTTTATTTTCTATTTTAAAGGTAAACTTGATGTCTAAATTAAAAGGTAACGTTAAGTGGTTTAACGAAACTAAAGGTTTTGGTTTTATCACTCCAGAAGATGGCAGCAAAGATGTATTTGTACATTTTTCCGCTATTAGTTCAGAAGGCTTTAAAACCCTTGCTGAAGGTCAAAAAGTAGAGTTTGAAGTTACTGACGGCGCGAAAGGGCCATCTGCTGCAAACGTTGTCGCTATCTAATTAACGACTTCTTTGAGACAGTAAAAACCCGTTATTTAACGGGTTTTTATATTTAGAGTATTACATTTCTCTTAATAGCCAAAATGCAAATGCAGTCATTAAAAATGAACCTGCTAAGTTTGCTCCCATCGTTCCTAGTGCCCAACCTATTTTGCCTTCGGTAAGTAGCGCCACCACTTCAACCGAGAAGGTTGAAAATGTAGTTAAGCCACCACAAAACCCAGTAGTTAACATTATTTTCCAAATGGGGTCGATATGAGGCGCTTTACTAAACCAAGCAATTCCAAAAGCGATAATAAAAGCACCAATGCAGTTAGCTACAAATGTACCTGTTGCAAAGTGAGGAAAGAGAGAATTTAGGCGGTAGCTAATTAGCCAGCGTAACACGCTACCTAAACCACCACCTATAAATACAGCTATTGCAATATTGAGCATATTAAGAGATTAATTGTTATTTAACCTCAATCCCCTGAGCTTGAAGATCAGCATGATAAGATGAGCGAACAAATGGACCACAAGCTGCATGAGTAAAGCCCATCGCCAGTGCTTGTTCTTTCATGTATTCAAACTCGTCAGGACTGACGTAGCGTTGAACAGGAAGATGATGACGGCTTGGTTGCAGATATTGCCCCAGTGTCAGCATCGTTACCCCATGTTTGCGCAGATCACGCATAACGTCAATAATTTCTTCGTTTGTCTCACCTAGCCCAACCATTAAACCTGATTTTGTTGGAATATCAGGGTGTGCTTGCTTAAAACGCTCTAATAATGTAAGTGACCATTGGTAGTTAGCGCCTGGGCGTACTTGACGATAAACACGTGGCACATTTTCTAAATTGTGGTTGAAAACGTCAGGCGGTGTTTCTGTTAGGATCTCAAGTGCTTTATCCATACGGCCACGAAAGTCTGGTACTAATGTTTCAATACGAATAGTTGGATTTTTCTCACGGATTGCCGCGATACAATCAGCAAAGTGCTGAGCCCCCCCATCACGCAAGTCATCACGGTCGACAGAGGTGATAACGACATAGCGCAATCCCATATCTTTAATGGTTTGAGCTAGTTTTTGTGGCTCTTGTGGATCGGGTGCATTTGGGCGACCATGTGCCACATCACAGAATGGGCAGCGTCGTGTACAGATAGCACCTAAAATCATAAAGGTTGCTGTACCGTGGTTAAAACATTCCGCTAGGTTAGGGCAAGAGGCTTCTTCACATACTGAGTGAAGACCATTTTTGCGCATTGCCGCTTTGATGCCCTGAATCTTACTTGAATCAGCGGGCAGCTTTATTTTCATCCACTCAGGTTTACGTAGTAGTTCTTCTCGTTCTGTAACGACCGTTTTAACAGGAATAAGTGCCATTTTATCGGCGTCGCGATATTTAACTCCGCGTTCCATCTGAATAGGTTTACTCATAATTGTGCCAGTTCCAGTTATCTAGAGTGATTAACACGATGTGACTGAGGTAATCAGGGTTTTAAAAAAAAATGACAAATGTTAAAAAAATTATAGCATTTTTATTGCTGTGGTTGGAATCCTAGTTGCGTACAAAAATTTTTCACTAATAACGGTGTTATTTGTTCTGTCGTTACATTAGGCACAAAATCAACAAGTTGTGTCATTTTTAAATCAGGGTAACCACAGGGATTAATACGCATAAAAGGTGATAAATCCATATCAATATTTAATGCAAGACCATGAAAAGAGCAGCCTTTGCGAATACGTAGCCCTAATGAGCAAATTTTATTACCACTAACATATACACCTGGCGCATCTGTACGAGCGTAGGCTTCAACATTGAATGTAGCAAGGGTATCAATCACCGTATTTTCTAATGCAGTGACTAATTGACGAACGCCAATATGGTTACGTTTTAAATCAAGCAACACATACATCACTTGCTGACCTGGGCCATGATAAGTCACTTGGCCACCTCGATCAGATTGAATAACAGGAATAGTGCCTGTATTTAACAGGTGCTCTTCTTTACCTGCTTGGCCTTGGGTAAATACCTGCTCATGTTGAACGAGCCAAATTTCATCAGGTGTGTGACTTTCCCGTTTTTCCGTAAACTGATGCATAGAATCAGAAACCGGTAAATAAGGTTTTACACCCAATTGGCGAATAATGATTGTTTTGTCTTGCACCGTGAAAATCTTCATTTGTAGCGTAATTGTGAAAGGCAGTATAACGCTCTGGCAAATGAACTACCAGATTGAGATGTTTTTTTTCCGAAAGCAATAAAAAAATTAGCAGGAAAAATACAAAAAGGGCGCCTAACTTGGCGCCTTTTCTAAATAAATAATTGAATAAAAATAGATGATTACAGAACCATACGTACTAATTCAAGTTCACCAAGCTCTTTATATAGCGTTTCTACTTGGTCGATATGAGTTGCATTAATAGTAATAGAAACAGAGTGGTAGTTACCTTTGCTACTTGGTTTTACTGATGGTGTATAGTCACCTGGAGCATGACGTTGAATAACTTCAACTACTTGATCAACCAACTCTGGTTTTGCATGTCCCATGATTTTATAAGTAAATGAACAAGGGAACTCTAACAGTTCGTTTAATTTGGTTTTCATATTAAGTCCTTAAAGCAACAGACATTATTGTTGCAATCGATATATTGATATACCCAATATTGATAAATAAAAAGCGCATTCCTTAGTAAATAAGGAATGCGAGAGTGTTATTAGGGCAAATATCAAAATGGTAAATGGTGTTAAGCCAATATCTATATGTTAGTTATATATGGACAGATTTACCCATTTCAAGGTTTAGCTAAACCAGTGTGAAAATAATAATTTGATGTAATCAATCATGCGACTGAAAAAGCCACCTTCTTTTACTTCATTCATAACAACTAACGGGCGTTGCTCAATAATTTGGCCATCAAGTTGAAAGTTAATTACACCAACAACTTGGTTTTTAGCAACAGGTGCATGAAGCTCAACATTATCAAGAATATAACTGGCTTTTAAATCTTTTAAACGGCCACGAGGGATCGTTAAGTAAACGTCTTTTTCTACACCTAATTGCACTTTATCCATTTCGCCATACCAAATAGGTTCGGCTGCAAATTCTTTACCCACTTGCAGAGGTTTTACCGTTTCAAAAAAGCGAAAGCCCCAAGTCAGTAGTTTTTTACTTTCGGCATCACGGCCTTTAGGCGAGTGTCCGCCCATTACTGCAGAAATTAAGCGCATATCGCCTTCAGTTGCTGAAGCGACAAGGTTATAACCTGCCGATGCAGTATGGCCTGTTTTAATACCATCAACATTTAAACTCGTATCCCACAACAGACCATTACGGTTAGTTTGGCGAATATTGTTGTAGGTATATTCTTTTTCTTTATAGATTGCGTATTCATCAGGAACATCGCGAATAAGCGCTGCACCGATTAATGCCATATCACGAGCGGTGCTGTATTGGCCAGGCGCATCAAGTCCATGAACCGTTTGAAATTGAGTATTTTGTAGACCTAGGCGTTTAACGTAGTCATTCATCATGGTAACAAAAGTATCTTGGCTACCAGCAACATAAGAAGCCATTGCCACACAAGCATCATTACCTGATTGTAGATTAATACCACGGGTTAATTGCGCTACAGTAACCTGATCGCCCGGTTTTAAAAACATCAGCGACGAACCACGGAAAACAGGATTACCCGTTGCCCAAGCTTCTTCACCAATAGGAACGATATCGCTGTTTGAAATTTTTCCAGCACGAATAGATTGCCCAATAACATAACTGGTCATCATTTTGGTTAAGCTTGCTGGGTCACGGCGAACGTCTGCGTTCATTTCCGCTAGCACTTTTCCAGAATTATAATCGATAAGAATATAGGATTCGGCTTCGATACTAGGAACAGCAGGTATCATTGTTTTGATTGAATCATCAGCAAAGCTGTTATGGCTAAAAGCCAGTAATGCAAAAGTAGTGCTGAGTATGCTGGTTCTTAGTAATTTAGCTGGGAGTGTCTGTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP026364|2604071:2614845|2613633_2614845_-|QAV23995.1|DBSCAN-SWA MKQTLPAKLLRTSILSTTFALLAFSHNSFADDSIKTMIPAVPSIEAESYILIDYNSGKVLAEMNADVRRDPASLTKMMTSYVIGQSIRAGKISNSDIVPIGEEAWATGNPVFRGSSLMFLKPGDQVTVAQLTRGINLQSGNDACVAMASYVAGSQDTFVTMMNDYVKRLGLQNTQFQTVHGLDAPGQYSTARDMALIGAALIRDVPDEYAIYKEKEYTYNNIRQTNRNGLLWDTSLNVDGIKTGHTASAGYNLVASATEGDMRLISAVMGGHSPKGRDAESKKLLTWGFRFFETVKPLQVGKEFAAEPIWYGEMDKVQLGVEKDVYLTIPRGRLKDLKASYILDNVELHAPVAKNQVVGVINFQLDGQIIEQRPLVVMNEVKEGGFFSRMIDYIKLLFSHWFS >CP026364|2604071:2614845|2609969_2610443_+|QAV23989.1|DBSCAN-SWA MYQDYLDTPKEFPKPYISITANEEGITSLYFVDEKEIAVHSSPIINQCVKQLKEYFAGKRTTFSVPLAPEGTEFQGRVWQTLQTIPFGEIWSYKKLALTLGSVNYCRAVGMANSRNPISLIIPCHRVIGHNGKLVGYTGGLDIKRWLLRYEKVDIDE >CP026364|2604071:2614845|2609052_2609451_-|QAV23987.1|DBSCAN-SWA MQTAPLIYFSSRSENCHRFVQKLNIQATRLIEDEQLLATQPFVLLSPTYGGGGTQGAVPKTVIQFLNIPENRHLIRGVIASGNTNFGVAYGLAGDIIAQKCQVPFLYRFELLGTPEDVKRVKTGLSAFWSTV >CP026364|2604071:2614845|2606894_2609021_-|QAV23986.1|DBSCAN-SWA MTQSTEQLDYHALNAMLNLYDEQGNIQFEKDKLATHHFFRQHVNQNTVFFHDLKEKLDFLVQQHYYEAQVLEQYEFSFIKQLFKHAYSKKFRFQSFLGAFKYYTSYTLKTFDGERYLERYEDRVCMVALTLAQGNTDLAIHIVDEIISGRFQPATPTFLNCGKQQRGELVSCFLLRIEDNMESIGRSVNSALQLSKRGGGVAFLLTNLREAGAPIKRIENQSSGVVPVMKMLEDAFSYANQLGARQGAGAVYLHAHHPDIYHFLDTKRENADEKVRIKTLSLGVVIPDITFELAKRNEDMYLFSPYDVERVYGMPMSEISISEKYAEMVNNANIRKKKIKAREFFQTLAEIQFESGYPYIMFEDAVNRNNPIAGRINMSNLCSEILQVNSASEYHPDLSYRYIGHDISCNLGSMNIAMAMDSPDFARTINIAIRALSNVADMTKIESVPSIQKGNQASHAIGLGQMNLHGYLAREGIYYGSEEALDFTNIYFYTVTYYALLASNQLAIEKKQTFNNFENSKYASGEYFNKYLSQQWLPKTQKIHQLFSQSNVHIPTQEDWQKLKLSIMTYGIYNQNLQAIPPTGSISYINHSTSSIHPIAAPIEIRKEGKIGRVYYPAPFMTNENRHYYQDAYEIGAEKIIDTYAQATQHIDQGLSLTLFFSDEATTRDINKAQIYAWRKGIKTLYYIRIRQTALAGTEIKGCVSCAL >CP026364|2604071:2614845|2610910_2611285_-|QAV23991.1|DBSCAN-SWA MLNIAIAVFIGGGLGSVLRWLISYRLNSLFPHFATGTFVANCIGAFIIAFGIAWFSKAPHIDPIWKIMLTTGFCGGLTTFSTFSVEVVALLTEGKIGWALGTMGANLAGSFLMTAFAFWLLREM >CP026364|2604071:2614845|2610607_2610850_+|QAV23990.1|DBSCAN-SWA MRLFSILKVNLMSKLKGNVKWFNETKGFGFITPEDGSKDVFVHFSAISSEGFKTLAEGQKVEFEVTDGAKGPSAANVVAI >CP026364|2604071:2614845|2604071_2605271_-|QAV23984.1|DBSCAN-SWA MAIKLEVKNLYKVFGEHPKRAFDLLESGMNKDQIFDKTGLTVGVQNANLAIEEGEIFVIMGLSGSGKSTLVRLLNRLIDPTRGEVLIDGENIATMTDKELRQVRRKKISMVFQSFALMPHMNVLDNTAFGMDLAGLSKEERYEKAMAALEQVNLGNHANSWPDELSGGMRQRIGLARALANDPDILLMDEAFSALDPLIRTEMQDELLSLQGDKQRTIVFISHDLDEAMRIGDRIAIMQGGVVVQIGTPDEILNNPANDYVRTFFRGVDISHVFSAKDVAKRRPETLLHVAPGFGPRSALKVLEDEDRNFGYLIERGRKFIGIVSINSLEEALKNKQPIESAILTEPCAINGETPLNELISTVAQSPCAIPVIDDKNRYLGLISKGMLLQALDKETPNE >CP026364|2604071:2614845|2611301_2612267_-|QAV23992.1|DBSCAN-SWA MSKPIQMERGVKYRDADKMALIPVKTVVTEREELLRKPEWMKIKLPADSSKIQGIKAAMRKNGLHSVCEEASCPNLAECFNHGTATFMILGAICTRRCPFCDVAHGRPNAPDPQEPQKLAQTIKDMGLRYVVITSVDRDDLRDGGAQHFADCIAAIREKNPTIRIETLVPDFRGRMDKALEILTETPPDVFNHNLENVPRVYRQVRPGANYQWSLTLLERFKQAHPDIPTKSGLMVGLGETNEEIIDVMRDLRKHGVTMLTLGQYLQPSRHHLPVQRYVSPDEFEYMKEQALAMGFTHAACGPFVRSSYHADLQAQGIEVK >CP026364|2604071:2614845|2605894_2606863_-|QAV23985.1|DBSCAN-SWA MSAPYLNRVNAINWNRIEDEKDLEVWNRLTMNFWLPEKIPLSNDIPSWNTLTAKEKQLTIRVFTGLTLLDTIQNTVGAPTLMPDALTPHEEAVLSNICFMEAVHARSYSSIFSTLCLTTDVDAAYRWSEEDPFLQKKAEIILRYYQDVDPLKKKIASVFLESFLFYSGFYLPMYWSSRGKLTNTADLIRLIIRDEAVHGYYIGYKFQNQLLNKSELEKQEIKDFAFSLLLDLYDNEVKYTENLYDSVGWTEDVKKFLHYNANKALMNLGYEALFPDELTDVSPAILSSLSPDANENHDFFSGSGSSYVIGKTINTEDDDWDF >CP026364|2604071:2614845|2613174_2613438_-|QAV23994.1|DBSCAN-SWA MKTKLNELLEFPCSFTYKIMGHAKPELVDQVVEVIQRHAPGDYTPSVKPSSKGNYHSVSITINATHIDQVETLYKELGELELVRMVL >CP026364|2604071:2614845|2612368_2613013_-|QAV23993.1|DBSCAN-SWA MKIFTVQDKTIIIRQLGVKPYLPVSDSMHQFTEKRESHTPDEIWLVQHEQVFTQGQAGKEEHLLNTGTIPVIQSDRGGQVTYHGPGQQVMYVLLDLKRNHIGVRQLVTALENTVIDTLATFNVEAYARTDAPGVYVSGNKICSLGLRIRKGCSFHGLALNIDMDLSPFMRINPCGYPDLKMTQLVDFVPNVTTEQITPLLVKNFCTQLGFQPQQ >CP026364|2604071:2614845|2609463_2609688_-|QAV23988.1|DBSCAN-SWA MSVILYTKPNCVQCSATERALKQKNIPFVSVDLTKDTQALEQIVSMGYRQVPVVVNGEQHWSGFCPDKIRQITL |
12 | Mycobacterium_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
3116285 : 3129829
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP026364|3116285:3129829|DBSCAN-SWA AATGCCAATTATTACTCTTCCTGATGGAAGCCAACGTCAATTTGAAAATGCAGTATCTGTCATGGATGTTGCTGCAGATATCGGCCCCGGTCTCGCAAAAGCCTGTATTGCAGGTCGTATTAATGGTGAGCTGGTGGATGCCTGTGAATTAATCGAAAACGATGCCAATCTAGCAATTATTACCGCCAAAGATGATGAAGGTCTTGAGATTATTCGTCACTCTTGTGCCCACTTATTGGGACATGCAATTAAACAACTTTGGCCTCAAACCAAAATGGCGATTGGTCCTGTTATCGAAAACGGCTTCTACTATGACGTCGATTTAGACCGCTCTTTGACGCAGGAAGACTTAGAAACTCTAGAAAAACGTATGCTAGAGTTGGCGAAAACAGATTATGACGTTATTAAAAAACGCGTAAGCTGGCGCGAAGCCCGTGACACTTTTGTTGCGCGAGGCGAAGATTATAAAGTGGCTATTCTTGACGAAAACATCAGTCAAGACTCGCAGCCAGGACTTTATCATCACCAAGAATATGTTGATATGTGCCGTGGTCCTCATGTACCAAACATGCGTTTCTGTCATGATTTTAAATTACAGAAAATTTCTGGCGCATACTGGCGTGGTAATAGCGATAACAAAATGCTACAGCGCATTTATGGTACCGCTTGGGCTGATAAGAAACAGTTAAAAGCCTATTTACAACGTTTGGAAGAAGCAGCAAAACGCGACCACCGTAAAATTGGTAAACAGCTTGATTTGTATCATATGCAAGAAGAAGCGCCGGGTATGGCATTCTGGCATAATGATGGCTGGACAATTTTCCGTGAGTTAGAAACATTTGTGCGTTGTAAATTAAAAGAATATGATTATCAGGAAGTAAAAGGTCCATTTATGATGGATCGCGTTCTTTGGGAAAAAACAGGTCACTGGGAAAACTACAAAGAACATATGTTTACAACGTCTTCAGAAAATCGTGAATATTGCATCAAACCAATGAACTGCCCGGGCCATGTACAAATATTTAAACAAGGTCTGCGTTCTTACCGTGATTTACCATTACGTATGGCTGAATTTGGTAGTTGTCATCGTAATGAACCATCAGGTGCATTGCACGGTTTAATGCGTGTTCGTGGCTTTACACAAGACGATGCACACATCTTCTGTACAGAAGAACAAATATTAAGTGAAGTAAATGACTGCATCAAATTGATTTATGATGTATATTCTACTTTCGGATTTGAAAAAATCGTTGTTAAGCTGTCAACTCGCCCAGAAAAACGCATCGGTGAAGATGCTTTATGGGATATCGCAGAAGCAGACTTAGCAAAAGCGCTGACTGATAATAATATTGAATTTGAATATCAGCCAGGCGAAGGGGCGTTTTATGGCCCTAAAATTGAATTTACACTTTACGACTGTTTAGATCGTGCGTGGCAGTGTGGTACAGTACAGCTGGACTTCTCACTCCCAGGTCGGTTAAATGCATCTTACGTTGCTGAAAATAATGAGCGTAAAGTACCTGTAATGCTTCACCGAGCGGTATTAGGTTCGTTAGAACGTTTTATTGGTATTCTGACAGAAGAATACGCAGGGTTCTTCCCGACTTGGTTAGCACCACAGCAGGTTGTCGTGATGAATATCACGGATGGACAGGCTGATTATGTACAAAAACTCGTCAAAGAATTGCAAGATGCCGGAATTCGTGCAAAAGCAGACTTGAGAAATGAGAAGATTGGCTTTAAAATTCGTGAACATACTTTACGTCGTGTTCCGTACATGCTTGTTTGCGGTGATAAAGAAGTCGAATCAGGCAAAGTAGCGGTTCGTACTCGCCGAGGAAAAGACCTTGGCAGTGTCGACGTTAACGAATTTAAAGAAAAGCTTCTGCAAGAAATTAGAAGCAGAAGTCTTCATCAGTTGGAGGAATAAGGTATTAAAGGCGGAAAAAGAATTCAATCAACGCGTCAGAATCGTATCAACAGTGAGATTCGCGCTCATGAAGTTCGTTTAACAGGTTTAGATGGCGAACAGATTGGTGTTGTTAGTCTGAAAGAGGCTCTTGAGAAAGCCGAGGAAGCAGGTGCTGATTTAGTAGAAATTAGTCCTAATGCCGAGCCGCCGGTTTGTCGTATTATGGACTACGGCAAATTCCTCTATGAGAAAAGTAAGACTCTCAAAGAACAGAAAAAGAAACAAAAAGTTATTCAGGTCAAGGAAGTTAAATTCCGTCCTGGTACAGATGAAGGCGACTATCAGGTCAAACTACGCAACCTGATTCGTTTTCTTGAAGATGGCGATAAAGCTAAAGTAACACTACGTTTTCGTGGTCGTGAAATGGCGCACCAACAAATCGGTATGGAAGTGCTTAACCGCATCCGTCAGGATTTGGATGAACTGGCAACTGTTGAATCTTTCCCTAATAAGATTGAAGGTCGTCAGATGATCATGGTGCTCGCACCGAAGAAGAAATAATCGGGCAACTCAAGTAATAGCGCCAACTCTTCGGAGTTGGTAGTTATTCGCCTAATTATTTTATGTTATTAACAATGCGAAGTGGATTATAGAAATGCCAAAGATTAAAACAGTACGCGGTGCAGCTAAACGCTTTAAAAAAACTGCAGGTGGTGGCTTTAAGCGCAAACATGCTAACCTCCGTCACATTCTGACTAAAAAATCAACTAAGCGTAAACGTCATTTACGTCCAAAAGGCATGGTCTCTAAAGGAGATTTAGGCCTGGTCGTAGCTTGCTTACCATACGCATAAGTATCATTTTTTAACAGAATTCAAGACATTAGGAGATTAATATGGCTCGTGCTAAACGTGGCGTTGTCGCCCGTGCTCGTCACAAAAAGATTTTAAAGCAAGCTAAAGGTTATTACGGTGCACGTTCACGTGTATATCGTGTTGCTTTTCAGGCTGTTATCAAAGCTGGTCAATATGCGTACCGTGACCGTCGTCAGAAAAAACGTCAGTTCCGTCAACTGTGGATTGCGCGTATCAACGCAGCAGCTCGTCAGAACGGTATGTCTTATAGCCGTTTCATCAATGGTCTGAAAAAAGCATCCATTGAAATCGACCGTAAGATTCTGGCTGACATCGCTGTATTCGACAAAGTAGCATTTGCTGCACTTGTTGAAAAAGCGAAAGGTGCTCTGGCTTAATTAGTCAGTAAGTAGAAGAGGGAGTTTTCTCCCTCTTTTATTTTGTTTGAATTTATGGCTTAATGTTAGAAATTCAATAAGTTAATACTCAACGAGATACAAAAAATGTTAAGTTTCGCTTTTTTCCGCTTCTTTTTTTACTTTAGCGCCTAATTTAGGGGGCTTTTGCGCGTAAGAAAAGAAACGAAAAGTAGCGCCTGAAGCCTCCAATATGGAGGCTTTTTTGTTTTCAACTCTCATCTTGAGAGAGAAATCAAAAAGGCAATTTTTTAATCGTCATCATTGATAACAACTAATAGACCTCATCAGGTCAAAGGAAGAGGAAACGATGCCACATCTCGCTGAACTCGTTGCTCAAGCTAAAGCAGCTATCGAAGAGGCACAGGATGTTGCTGCGCTGGATTCGGTTCGTGTTGAATACTTGGGGAAAAAAGGTCATTTAACGCTTCAGATGTCCACGCTGCGCGACTTACCCGCTGAAGATCGTCCAGCTGCAGGGGCTGTCATTAATCAGGCTAAACAAGAGGTTCAGCAAGCGCTGAATGCTCGTAAAGAACAGATGGAATCAGCAATATTAAATGAACGTCTATCTGCTGAGAAAATTGATGTCTCTTTGCCTGGTCGTCGCATTGAAAATGGTGGCCTTCACCCAGTCACTCGTACTATTGAACGTATTGAAACTTTCTTTGGCGAATTAGGCTTTTCTGTTGAGAATGGCCCTGAAATTGAAGATGATTATCATAACTTTGATGCGTTAAATATCCCTGCTCATCATCCAGCAAGAGCAGACCATGATACATTCTGGTTTGATGCCAAACGTTTGTTACGTACGCAAACTTCAGGTGTGCAAATTCGTACCATGCAAGACAAACAACCACCTATCCGTATTATTGCACCTGGTCGCGTATATCGTAATGATTACGACCAAACGCATACCCCAATGTTCCACCAAACTGAAGGCCTGATTGTTGATAAAGATATTAGCTTTACCAACTTAAAAGGCACATTGCACGATTTTCTAAAAAACTTCTTTGAAGAAGATATGGAAATTCGCTTCCGTCCTTCTTATTTCCCATTCACAGAGCCTTCTGCAGAGGTTGATGTTATGGGTAAAAATGGTAAATGGCTGGAAGTATTAGGCTGCGGTATGGTGCACCCAAATGTATTGCGTAATGTTGGTATTGATCCTGAAGTATACTCAGGTTTTGCGTTCGGTATGGGTATGGAGCGCCTAACAATGTTACGTTACGGTGTAACTGATTTGCGTTCATTCTTCGAAAATGATCTTCGTTTCCTCAAACAGTTTAAATAAGGTGGGATTATCTCATGAAATTCAGTGAACTTTGGTTACGTGAGTGGGTAAACCCAGCGATTACTAGCGAAGAACTTTCTGAACAGCTGACGATGGCGGGTTTAGAAGTTGATGGCGTAGAAAAAGTTGCCGGTGATTTTCACGGTGTTTATGTGGGGGAAGTTGTTGAATGTGGACAACATCCTAATGCTGATAAACTGCGGGTGACAAAAGTCAACGTAGGCGGTGATAGATTATTAGATATCGTTTGTGGTGCACCTAATTGCCGTTTAGGTTTAAAAGTTGCTGTCGCAACTGTTGGCGCTGTATTACCTGGCGATTTCAAAATTAAGGCAGCCAAATTACGTGGCGAATCATCAGAAGGCATGTTGTGTTCATTTTCTGAATTAGCTATTTCAGAAAGCCATGATGGTATTATTGAATTGCCTGCTGATGCGCCTATTGGTATTGATATTCGTGAATACTTAAAACTTAATGATAATGCAATTGAAATTAGCATTACACCTAACCGTGCTGATTGCTTAA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12 | Tupanvirus(55.56%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
3418015 : 3466239
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP026364|3418015:3466239|DBSCAN-SWA 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53 | Salmonella_phage(31.25%) | lysis,capsid,portal,holin,tail,head,plate,integrase | attL 3410270:3410287|attR 3464646:3464663 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3732674 : 3767267
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP026364|3732674:3767267|DBSCAN-SWA TCTACTTCATCTGCTCCTCAACCTGATTTAATAATGGTGACAAATAAAACAAGTTTTGGAAAGGTAATAGTTTGCGTACAGATCGCACTTCTCTATCATCAAACTCACCATTTAATACACCTGATGTAATGTTTTTAATATCACCACCAAGGTCAAATGTAGGACCTAATAAGGCACCAATCCCATTACGACTTTGATAACGTGATGCTGGTGGACCACCAAACATGGCACTCATACCATAAGTACCACCGCTCAGGTTTTCCAATACGTTGTTAGGCTCACCTAACCAGCCCATCATTCCTGACCAGTCTAAACCCTCTTTTACTAAATTAGCCGGTTCGGTATTAATATCTCGTCCTGCCATTTTGGCCTTGAGAACATAGACTAGGGATCCAAGTGCTACCTGAAGTAATGCCCCATAATAAAATGATGCATCACCCGATTGTATGCCTGAGACCAGCGCTCTATTGTGAGTAGCAAAGAAGAAGGTTTTAAACTGCATAACTATCTTACCTAGTTCACTGCTCATCATTAATGGTGTATCACCAATGCCCGGTGTGATAACCGTGGTTCTTACGTCTTTTAATACTGCCGCTTGGAAAGTTTCACGCACAACACGATCATCCCATAAGTGGCTATGTCCTGTTAACATGCCGTCTAAGTCTTCACCGTGTCGCTTAAACTGATCTGCTATACGCTTTAGCATTGATTCATCGATACCAATATGAGCCAGCTTCTTTATTTCTTGTTTACTTAGCGTACCACCAGCATCTAAAGTATTTGCCGCTCTAAGTACCTTAGATTGAGTAATAACACCAGACCACATTTTCATAGTATCGGTGTATTGATTCATCAACGTAAGGTTGCCAAATTTCTGTGATGACCATTGTAACCCACGTTCTAAATAACTACGTCTGCTATATGGATCATTAAGGTCAGCAATCACCTTAGAACGACTGGATAATACATATTCAAGACCAATACCCATTTCACGTAAATCAGCTTTAGCAATACGCATAGCACCGATATCAGTTAGCATCTTACCCAATGGTTTTAACGCACTACGTAAACCGTGTTGCATAATCGGACGAGCCATATCAGGTAATGATGATATTGTCATGCCACCCAATAAACGTAAGAAGTTAACGTGACGAGCCACACGACCGGCACGAACAAAGAAACTAGAGGGATCTTTAGGTGCGCCATAAGTTCCTAATAGACGATCACGCATAGCACGAATATCACGTAAATCAGCCTCTCTTCTCGCTTCTAATCGGCTACGTTCTTTAGGTGTGGTTGCATCAGCAATAAGATGGTTGTATTCCTCTGTAATCGCTTTGATTTGATTATCCATATCAACACGACCAAATTTAGCCGTGAGTTCAATTTCAGGCGCGACTTGGCGAATATAGTTTTCCATTACATAGTTAACATCTGATTCGAGATAGTCTTTAATGCGTTCATCAGGAATGTTTAGGGTTCTATCTTTTGTAAAACCAGCACGTTTAACTAACCCATCGGGGATCAGTTCACTGGGTACAATGCCTGACGGTGCCCCGATAATTTTATTAACGATATCATCTGCTGCGGCATCTAACTCTTCACGCTCTAAAGGTGTCATGCGATTTAATGCCGATTGTCTAATTCTGTCATGACGAGTTAATGAATTCGCAGTTCGTGTTAAACGACGATGTTCATTTCTAAACTTGCGAGGGTTATCAAGAATATCTACGCTACGTTGTAACGCAGGCAATTTATTCTCAGCATCATTAATACGCTGTAATTTTCTTTGTAATGTTGCTTGTCTTCTTGTTTGTGTTTTATTTAATTTAGCAAGATTAGAAAGTGAATTTAACTCAACTTCTACCGCACTCTTTTCATTAATGATTTTTTGGTATTTATTAATATCATCCATCAACAAGGATTTTTTACCTGACCAACTCTCAGCCTCTTTAATTTCAAGCCCTAAACGTTCAGCTTGTGGTGAAGCGTTACGTGCTTTATCAATACCAATTTCAGCACGATCAAGACTACCTTTGGCTTTATTTATCGAGGTTTGATTAATCTCTTCTAACCAGTCAGCAATGATTTTCTTAAACTCAGTACGATCATTTAAAATTTTGTCGAATTTATAAATACGAGGGAAGTAGCTTTGTGCTGTTGTCACCTTTACACCTTCACGTAAGATCCCTAATTCAACCATTCTATCTTTGGTTGCTTCGACAATAGGTCTAATAGAACGTGCCGCCTCTGTAATTTGTGGTATCGCATGAGTATCACCATTGCGCATAGCGTCACCAACAGCTTCACTAAATTGGTAATAGCTCATATCACGGCCACCAGATTGACGATACTGTTTAAAGTGATCTTTCGTCGATTCTACTTGCTTATAAACAAGTGTTTCATAACCTCTCACTTTTGTTTCAACAGCGGTAAATGTCGCAATACCTTCTTCATTTTTAGCAAAGGTAAAGTTATTTTCTGTAAGTTGTTGGTTAATTTGGCGCGCTGTTTTAGAAGGTGATTGAGCAACACGGCCAACAGGGCTAACCATCATTGTTCTATTAACAAAAGAGGGCCCTTTTAGTGTCTCTTGTTCAAGTGTGGTATTAGCAACTTCCGCAGCACCAATGCTTCGATCACCAGATTGATTGGCTGGTGGATTATTACTTGGTTGAGGCTCAATAATGTCATTTCTAACTTTATTAATTAACTCACCTCGATTTCTAACTAATTGCGCAGCTGAACCTAAGGTTCCACCGATCATGGCATCCAGCGTAACGTTAATCGCACTCTCAGTTAATGTTCGTGTTTCTTGGGTACTATGTAATGCCATTTCAGAAGCTACGCCACCAGCAGTATTTGCCAATGCAAACTTACCTGCGGTTGCACCAACACTACCGCCTTTTACTATTGCCCCACCCGGTATCATCATTGCAGCAACATTAATTGGATCAATAACCCCCATTGCTATGCTACTCACAATACCGGCACCGCCTGAATCCATTAATTGCTGTCTGTCGTTCTTCTCACGATCAATGCGTTGTTTTATTGCTGCGGTTTCTTGAGGAGAGTTTGAATGAATAAAGGCATCGGCATAGTCTTCATAACCTGAAAGCGTTAATTCATCTTCAAATGGGTTATAACCTTCTACATCTTCAAATTGATTAAAAGGTGCAGTAGCAATCAAGCTACCCACTGAGTTATCGATACGAAACGCCGCATCACGTAATTCTTTAGTTTGCCGTCTATCATCAAGCGGATTAATAGGGTCATACCAAGACGGTGAAACATTATCACCATAAGTAGGTTCTGTTTGCTGAACAGCATTAATATCCGCAGATAAAACATCATCAGGTTGTTGTTCGTAAATAGGCATCAGTCTTTATCCCAAGAAAAATAATTATTGAATTTATTTACTCGCTCATTGTGAGCTTCTTTATATTGCTCACGGATACTTTGACGACGTTCATCAAATTCTGAGCGCGATTTATCCAATGCTTCTTCTCGTTCCCTTTTATCCTGAGCTTCCTTAACGCTTTGCTGGCGTTTTTCCATTACCTCTTTATACATTGGTGATGATGACTGTTCTGGTTTAAAGCGAATAGGTAAACCGTTATCTCCCGTGTATGGGCGATAAATAGGGATATCATCACTACCGGTTTGTTTTATCATTATGCCGTAGCTGTAATCTCTGGGAGTCACTGCATCAGAGACAATAACGATTTCAGTGCCAGAAGAAGCGCCACCAAATGACTTAGACATTAATTGCTTTTTCTCTTCTTCCCATTGTCCAGCGATCCAGTTGCCAGCACCTGATTCATTAATACCGTATACGGCTTCGGGTGCATAACGCATAACCTCTTCACTGCCATTGATATTAGATACCGCCCACGTTCTTTTAATTTGAGCGTTGGTCATTTTCTTGGCTAGTTCTGCGTCACCGCCTGTTTCAGCAAAGTTAGCGTCATACAGTGTTTGATAGTCACGTAAGTAAGCGCCATTTTGAGTACCAGGCTTACTAACGCTTGGTGAAGAAAATGGTTTATACCAAGGGTAAAAATCATTGATATTAGATTGCGCTGCTTTATCTCTATCCTTGATATATCCTTTATCCCTGATTTGAGAAGCGATCATTTGCTTAGTGCGTTCATCTTGTTCAAATGTCGTCTTAAATGCAGTTTCTACCGCTTTCTCATCAGGCATACCAGCTCGACTTAAACTATATACTTTTGAGTAATACGCCATTGTGCTTGATGGAATATCAGTCGCTGATGCCGGATTGTTATCAAATATCTGCCCATACATTTTCGCGATAGGAAGAACAACTTCAGGATCTTTAGACGTTGCCCCCATATTCAATACAGACTTAACTTGTGATGGGATAATCCCTGTTCTTGCTGTAAGTTCAGCAACGGCATTTAAGCTATTATCATCACGTAAATTAAAGCTCTGCTGAATATGTTGTTCAAAGTAATCATCTGCTGCCTGCTGATTATTCTTATCATTAGGATCAAGCGGAAAGTTATTTTGTATTGAAAGTTGTAATCGGTTAGCAGCAAACTGCTTATCTTGTTCCTTGATATTACCTTCAACGAACTTACCAAATTTCTCCCAACGTTGAATTTTGCTTTCGTAGTTTGCTTCGCCCGTTTGTGGTCTGATTTGAGATAACAAAGCCTGCTGTGCTTGTGGAGACATCTCTTTAGCTGCTGACATAAAACCAGCATAACGCTTAGCTTCTTGCATATCGGCAGACATAGCAGAACCTTTGTCATAGCCAAACGCAGAGATTAACTCATCATGAGTAGGCGCATTAGGTGCATCAAGTCCTCTTTCCCATGCTGCGTAAGAGTCAGCTACACGAGTACCGAATTGTTGCTGTAACTCACCTTGTTTTTGCTTACGTAACTGTTCTGCTTGTCGTAAATATTTTGCTTGGTCAGCTTCATCTAAGGCATCGAAAGCGGCAGATCCAGTTAATAGTTTTGGTGCTTCAG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42 | Escherichia_coli_O157_typing_phage(20.0%) | terminase,tail,integrase | attL 3756044:3756059|attR 3772058:3772073 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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