Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP035282 | Sporanaerobacter sp. NJN-17 chromosome, complete genome | 10 crisprs | RT,csa3,WYL,cmr1gr7,cas10,cmr3gr5,csx1,cmr4gr7,cmr5gr11,cmr6gr7,cas3,DEDDh,cas2,cas1,cas4,cas5,cas7,cas8b1,cas6,cas8b2,csm3gr7,cas7b,DinG | 0 | 22 | 9 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP035282_1 | 1409844-1409943 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP035282_1
|
1 spacers
spacers of CP035282_1
>1.1|1409868|52|CP035282|CRISPRCasFinder TATTGTTGCATAAAAAACGATGATTTCGGAGATTTTTATAGATGAGATGTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP035282_1
The CRISPR arrays of CP035282_1 >merge|CP035282|1|1409844-1409943|CRISPRCasFinder AAAAAATTAAGAGAATAAAATTTTTATTGTTGCATAAAAAACGATGATTTCGGAGATTTTTATAGATGAGATGTTTTAAAAAATTAAAGAATAAAATTTT >CP035282|1|1|1409844-1409943|CRISPRCasFinder AAAAAATTAAGAGAATAAAATTTT TATTGTTGCATAAAAAACGATGATTTCGGAGATTTTTATAGATGAGATGTTT TAAAAAATTAAAGAATAAAATTTT
>CP035282.1|QAT61287.1|1407466_1408756_+|Ger(x)C-family-spore-germination-protein MLRETSPEGRSDLMKRRILLVIFILPVIIFTGCWDQRELNKIGIVTAMGIDKEGDEFIVTVEVIKPEPVRAGSSVSESNDRVTYTQGRGKSVFDAVRNITLKFDRKAFLSHNSIIIFGEDFAKDGIIKYLDLINRDQETRETSYLLVAEKAKSYEVMGINAGIEEIPGRYIQQLVENEVYNVSSLKMDLVGYLRDYYNVGKQPIIGKISILKKENLNDNGSKYELSVEGASIFNGGRLSGYLNADETECVNFIKGNIGNSIITFNNPEKVPSDGLSTSTPRVGGMPKSVGKDIKQQSVFEIEESKVKRDVEIVDGKILMKVNIKIRGNLAEESGDIDISKREVIEAVEEACSKQLQEDLKKNFETIQRKYKLDVFGFGQLFHIRYPDEWKNVKDNWAQVFSESDCKIEVETHIHTTNLTNTPTGKEKGK >CP035282.1|QAT61286.1|1406064_1407501_+|spore-germination-protein MISKKIDENKKILEEEFNGSSDFSIYEFKSKSGKEFLVSYINNLVDPSSISQYIINNLLNYENKFDITGVVAASRITEISDMNQIIDKILNGNIAIFIEESTIAYTVELKQYEHRAIDEPNAETVIRGPKEGFVEDLNINKSMIRRKIKNKNLVFEDFTLGEQTKTRISVVYIKGIVNIGVLEEVKRRLFKINTDSILESGMIEEYIIDNPKTIYSTISNTQKPDVLAGKILEGRVAVLCDGTPHALTIPKLFIESIQTSEDYYQRPYIASLLRMVRFFSLLVSILLPGIYIALQTFHQEMIPTVFLITMSENREGVPLPAVIEATMMILMLEFLKESGTRLPRAVGSAVSIVGALVLGQASVQAGIVSAPMVIIVAVAAIAEFTIPSQREIIIYYRLFILFLGGFIGLYGITCGLIILVVQAVTQKSFGVDYGYPLTPTNKSGLKDFLVRFPMKFFKVRPEAISKQNVTRDKSRGKK >CP035282.1|QAT61285.1|1404506_1405898_-|sodium-dependent-transporter MEKPKRENFSSGIAVFFATLGSALGLGNMWKFPYLVGNNGGGAFLFVYLICVFLLGIPVMISEFFIGRHTRKNAIGAFTELKANPFWKCIGYMGILSSLFIMFFYTDVAGWVYSYVFRGIKGDFNILSSLESTKAANTTQSIFLNTTGAGNSAINPMIWQLIVLVVVSLIIIAGVKKGIEKVTKTLLPILFILVIICDIRALTLQGSKEGLNFLFNPDFSKLNGSSIMTAMGLAFFKLSLGMGTMITYASYFTNDNNLMRTPIKVALSDIMVSLLAGIAIFPVVFSFGMKPEGSGMGLLFTTVPLIFMKLPFGNLLLIAFFFLTAIAATTALISLLEVPVAFLSEELKINRTKSVIIISSIVLIVGILTVHPGSLFGNAMIGSRNLFDFYDFLTSNILMPLGGFLIALFVGYVVNKNTLYQTLSNNGTLNIAVSFKLYQFVIRYITPILVLLVFLNSLQIITF >CP035282.1|QAT61284.1|1403884_1404445_+|orotate-phosphoribosyltransferase MIIDLLKETGALLEGHFLLSSGKHSGKYIQCAKLLMYPDKAEIAIKDIVEKLKELDFDMVVGPAMGGIIVSYELGRQTGKPAIFVEREDGKMTLRRGFSIEKGQKILIAEDVVTTGKSSYEAAEVVESMGGEVVAIACLVDRSNGNIKYPLYSGTKINVQIFDQEECPLCKKGIPFVKPGSRKIVK >CP035282.1|QAT61283.1|1402977_1403874_+|dihydroorotate-dehydrogenase MLKTKLWGIEFKNPVIAASGTFGFGKEYEDFFSPSELGGICTKGLTLNRREGNKGIRIYETTGGLLNSIGMQNPGVHDFIKEDLPLMEKYGTVLIANIGGSTIDEYIKSVQIISGTSIPIIELNISCPNVKEGGMAFGLKAEIAYKVVKEVRNATNKPLIVKLSPNGENIVDIAENCVKAGADGLSLVNTFSGMAVDIYKRKPVFDNIIAGLSGPCIKPISLRMVYEVSKAVDVPIIGIGGIMDYKDGLEYIMAGASLIQVGSGNFIKPNISVDIIQRMEMFMNENGIKSIDEIVGII >CP035282.1|QAT61282.1|1402250_1402985_+|dihydroorotate-dehydrogenase-electron-transfer-subunit MAKEYVIGKIEENIRIEDGVYELSVGGNFSGNPGQFYMLRGWREGPFLNRPISISNIYKDKIIFLYELKGKGTKIFSQLKENDEIKLIGPLGRGFSFEKDEKAALVSGGIGVAPFVYLSRKIMGDIDLYAGFRKNPYIIKDLKENINQIYISTEDGSVGYKGLVTGVFNPERYTKVYTCGPIPMMKAVVEICIEKNIPVEVSMESRMACGIGACLGCTIETISGMKMVCKEGPVFNGREVVFDA >CP035282.1|QAT61281.1|1401403_1402258_+|orotidine-5'-phosphate-decarboxylase MIIDRLYEEVNKKGSICLGLDTDISYIPDKLKKKYDSVSELLFQFNRTVIDETLDLVPIYKVQIAFYEAYGIEGMKAYRDTLRYIRNNKSMVIGDVKRGDISSTGKMYAKAHFSGDFECDFITVNPYMGMDSIEPYLEYVQEANKGLFVLLRTSNKGAEDIQYLNVKGYKVYNWVGDKIKEIAGNYMGRCGYSSVGVVVGATHTDEGANLRKRYENMFFLIPGYGAQGGKGREAALYLKNGNGGIVNSSRGIIADYKNYEDGEERFEYYVRQAVLLMKEDIRNG >CP035282.1|QAT61280.1|1400214_1401414_+|dihydroorotase MDILVKNGRVVDGFKEFTGDVYIKGGKIEDFGTNLNYNCKKIDAGDLCVMPSFVDMHDHFRDPGFTFKEDIYTGSKAALRGGYTFVNLMGNTNPVCSNMEIVDYVLNKSKKFDLVDVHQVVSITKNFDGETLEHLDTLDKRVKFISDDGKGVVRNDIMYKAFLKAKEKGLVIISHAEDENLTPMDNRLSENLMTIRDISLAKFSGGRLHLAHVSTKEALEEIIKAKKEGVGVTCEVTPHHLALYDNDYKVNPPIREKEDADNLICGLKNGGIDAIATDHAPHSKEDKINGACGISGLESAFSVCYTVLVKRGYIKLSQLSRLMSFRPGELMGIRKGKIEVGYDGDLVLVDLNKKRRIDGSKFLSKGKNTPFDGMEFYGDVIGTVKNGEIKYDGGLTIDY >CP035282.1|QAT61279.1|1399785_1400214_+|aspartate-carbamoyltransferase-regulatory-subunit MLYIDSITKGIVIDHIKVGCGFKIFNYLGLDKIHSTVALIMNAPSKKYGRKDIIKIENDIDIDLNLLGFIDPNITINIIENEKIKEKTRLSLPSKIENVIKCKNPRCVTSTERDIKHVFVLVDKEKGIYKCQYCDQIYTGDI >CP035282.1|QAT61278.1|1398859_1399783_+|aspartate-carbamoyltransferase MLKGRHLIDPLDFSVEELDEIFSFAEEIIAEPKRYSSLCNGKILATLFYEPSTRTRFSFEAAMLRLGGNVIGFSEPNSSSVSKGESIPDTIRTVGSYADIIAMRHPKEGAQKYVSHYSPVPIINAGDGGHQHPTQTLTDLLTIRKEKGSFDNLIIGICGDLKFGRTTHSLIKAMSRYKNVSFVLISPQELKIPDYIKTEILDSKCIKYLEVEKLEDVIGDLDILYMTRVQRERFFNEADYIRLKDSYILDKKKLDLSKKDLKVLHPLPRVNEISIEVDDDPKACYFRQVKNGMFVRMALMAKLLGVV >CP035282.1|QAT61289.1|1409957_1410161_+|cold-shock-protein MVNGTVKWFNSEKGFGFITGDDGNDVFVHFSQINKDGFKTLEEGERVSFEVSKGEKGPQASNVTSIR >CP035282.1|QAT61290.1|1410227_1410497_-|GIY-YIG-nuclease-family-protein MCYVYILKCCDNTFYTGWTNCLKKRLETHKKGKGAKYTRGRLPVELVYFEKFEDKISAQRREYEIKKMTKKEKYKLVCQSKNENFSSIS >CP035282.1|QAT61291.1|1410839_1411844_+|tryptophan--tRNA-ligase MDEKKIVFSGVQPSGKLTIANYLGAIKNWIPLQEEYNSIFCIVDLHAITVPQEPQNLRKNTLDVLALYLACGLDPKKSIIFIQSHVSAHCELTWILDSISYMGQLNRMTQFKEKSQKPGADVNAALFNYPVLMAADILLYQTDLVPVGEDQKQHLELARDLAIRFNNRYSDTFKIPEVFIPKIGSRIMSLQNPEVKMSKSDKDENAYIELLDDPNSVRRKIKRAVTDSYGEVVYRDEQLGIKNLIDIYSVFSGESIKDIENRYIGKGYGKFKDDLAEAIVEVLRPIQERYEEYRKNKDFLEGIYSEGAEKAERLANRTLKKVYKKVGFIPRVNK >CP035282.1|QAT61292.1|1411878_1412511_-|bifunctional-4-hydroxy-2-oxoglutarate-aldolase/2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate-aldolase MKKYEILSKIEEVGITAVVRAKNSEEAKKIALACMDGGINSIEITFTVPGAYKVIESLTEEFGDKLLVGAGTVLDGETARIAILVGAKYIVSPAFDEGTAKLCNRYQIPYIAGCMTVVEMIKAMESGADIIKVFPGSAVGPSFISAIKGPLPQALLMPTGGVNLDNVGEWIKNGCIAVGVGGNLTKGSKEDITRTAKEFVKKVKEARNNK >CP035282.1|QAT61293.1|1412939_1414229_-|IS110-family-transposase MNYKQNDRLNQLTYETLIVGVDIAKEFHVARAQDIRGIEFGKSIKFNNSLSGYLEFENWINEIKVVEEKEQVIIGMEPTGHYWLNIARYLKANDYTVVTVNPMHVKKIKELDDNLQTKTDKKDAKIIAQLVKDARYSTPNLLEGEYEELRNAKNLRQVVIKDLNRTKNQIHNWLDRYFPEYKEAYASWESKSFIKIIKKYIFPSVIERIPPNEIYEMLPPKMRRGVGLGKIERLVTASKNSIGIKEGLSFAKLEIKFLLDKYESFLEQIEEIDDYVTKICNQLDETKKIMQIKGVGLVTASGIVAELGDIRKYKTPKQMIKMAGLSLTENSSGKVKGATSISRRGRKDLRRLLYQVILGMIRTNTAFKEMYIYYTTRRKNQLTGKQAIIALCRKLLRIIHTIILKDVDYDESKMMSQIKYPDEFLNSVA >CP035282.1|QAT61294.1|1414660_1415956_+|IS110-family-transposase MKGGDLMKNNILSTLYVGIDVSSKTNVLCALDFEGNKLLNLKALNNQPGAESILDSIIRCLDSNSLKYVVIALESTSFYSTHIANFLASNEILLAYKPLVYCLNPKTVANYRKTFVDMDKTDPLDAYVIADFARCGKITSKPWRGSQFLALQRLTRHRLHLIEGITREKAYMVSNIYLKFSELTVLDKEERPFSNTYGVTSSAILTEYLSLDDITYSSVEDLVAFIRDKGKNRFNDPNRTAQVLQKAARDSYRLDKILYEPLNVAIASSFNVVKALEDEVKTIDKAIERNIKGINPTEYQSLISIPGVGPVLASGILSEIGTITSFDSHNSLAKYAGLTWRVNQSGNYSSDETRMTKTGNKYLRYYLIEAANSVKNHVPEYKEYYYKKYGEVTTHQHKRALALTSRKFVRLVFGLLTKNQIYSNDKVGEIN >CP035282.1|QAT61295.1|1416227_1417082_-|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MNSTPKAFLQIKSQYSNFNPTEKKIADYILNNPQELIYSTISQIGDKLKLADSTIFRFCKKIDFKGFHDLKISLATDVVKETKNYGTTQILDNDDEAIIINKVFEATISVLNDSLQSIDPKLIEQAVNILLNANQIVCYGNGGSGVAAMDAHHKLLRIGMNVSSYTDYHMQLMSAAQLTENDAVIAISHSGSNINIMNALDVAKKNGTKTIGITSFSKSPISKKVDVPLNVVSHETEYQFEAFASMVAHLTIINVLYINLILKRKELSNIALQKMRNAISYTKI >CP035282.1|QAT61296.1|1417350_1418340_+|hydroxyacid-dehydrogenase MAVKIAIVNSSSFGRIFPEHMERLKKLGEVDRFDLSKDMGGKELAQKLMGYSIIIASVTPLYNKEFFDYKDKTLLIARHGIGYNNIDIEAATKKGTFVTKVDAVVERESVAENAVALLMTVIRQTALASEKAKEGKWAERAKFMGYEIKDKTVGVIGFGNIGSRVGEILKNGFNAKLIAYDPYLTREEIEKRGAQSVSLEELLKNSDIISLNALLNENSYHMMSEKSFALMKKGVFIVNAARGGLIDEKSLIKALDEGIIGGLGLDVVEGEPIDETHPLFAYKNVVITPHTSAYTYECLKGMGDKVVDDAEKIAKNENPNNVVNKELLK >CP035282.1|QAT61297.1|1418371_1419775_+|NADP-dependent-phosphogluconate-dehydrogenase MKDIGLIGLGVMGRNLSLNIGNKGFSVAVFNMTSQKTKDFIENEVGKQDITGYYDIKSFVESLKKPRKILLMVKAGKPVDSVIEKLIPYLDEGDLIMDGGNTYYRDTTRRINELNEKKILYLGIGISGGEEGALNGPSLMPGGSKKAYDLVKDILIKIAAETESGPCCTYIGNDSAGHFVKMIHNGIEYGIMQAMSETYDILGKVLKLSADEIGDIFEKWNEGELNSFLMEISYKIMRHKDEETGKPTVELILDKAGQKGTGKWTVQTSIDMGIPAVSLNAALEGRVLSYFKEERLNLSKKVAKDYPKDLYDKDKIIGDLENSLLFSNLILFSQGLWVMSEGSKVNNFDIDISEVLKIWKGGCIIRSKMLDFMRAVIDEDKENVNLLNNKRVLEFLMTRLDSIKYITNIARNFYIPTLVHNSALDYFFSMIEGNLPANFIQAQRDFFGAHTYNRIDKGGIIFHTKWE >CP035282.1|QAT61298.1|1419927_1420701_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIC MEHSITVAQALIIALWVALVESRALGYATLNLRFSPLMTGLVVGLVMGDVPTAMIATASIQLIYMGMIAPGGAMPSEPAVATAIAVPVAILGGLKPTEAIAVAVPVGLLGSYLYQFRFFLNTFITRLTDKYAAQLNDKGLNFSIIILPTIISFALFTPAMFIALYYGTPVIAKFTATLSGGRIFHILDVIGGGLAALGIALILQVIGKKKYLVFFLLAYFVSVMLQPLKINTVTFAIIGTIVAYLYILVTGEKTETN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP035282_2 | 1669741-1672043 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP035282_2
|
35 spacers
spacers of CP035282_2
>2.1|1669770|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTTTGACAATAATAGGGTAAACAACTTTGATGGT >2.2|1669835|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCCCGCCTTTGTCCATATAGGGTTTACCGCCCATA >2.3|1669899|37|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCGCATGTTAATAAAGATATGTTGAAGAGGGGAAGA >2.4|1669965|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGGCCAGCCCCCATATAGATTTCGGATCCTTTGCAT >2.5|1670030|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTACCTTCTCCATGCGGGAAGGGTTCGACTTGGAA >2.6|1670095|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAATTATACTGGTGTATGGAGTTTTGCGGCAGATA >2.7|1670160|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGCTCAGCACATCTCCAGCTTGGGCTGTTCCGTAC >2.8|1670225|34|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTGACGAGGTTACCGGAGAAAAGCAGATAGCGG >2.9|1670288|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATATCCCCATGCCCTGTATCTCCAAGTTCTTCTT >2.10|1670353|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGCTATAATTTGGTGTTAATTTCAATCCTATCACT >2.11|1670418|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGATTTATCTCCAAATGCAGAAAGCTTTAATCCGG >2.12|1670483|37|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATCTGTTCTATATAATCTTTTGTGATTGTATTTTC >2.13|1670549|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTTTTATTAGAAGAGCCTAATCCGTATATGTCTG >2.14|1670614|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCAAAAACAAATTTTGGCAATGTAGAGGAAACTG >2.15|1670678|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GACGTTATGGCGGCTACAAGGGCCTACAACAGATG >2.16|1670742|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTACAAGCCTACAAAGCGGGGGTAAGGGGCCGCTT >2.17|1670806|37|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTAAGCTACCAAGCCGCTTAACCCGTTAGTTTCCAA >2.18|1670872|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTGGAAGTTTATAAAAGAAAATCCATGTCAGGGCG >2.19|1670937|37|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGCTATGTTGCTATCGGAATGTCCTATTCTTTCGT >2.20|1671003|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCCTACGCAAATAATTTCTTTTGCATAGTCCCCC >2.21|1671067|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTACAGAGATAAGGATGGAAGTATTCAGGCTATAG >2.22|1671132|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAGTCCTACCACAAGTTGTTCTTGTTTGCATATTC >2.23|1671197|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACCATACAACCGCCGCATATGTTGCCAACATAATT >2.24|1671262|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTAAACTTGTGTCACTCCTATTCTTTCTGCTAATT >2.25|1671327|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACCTCGGAGAGGACGATATGACAACAGATAAATT >2.26|1671391|37|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTATGAGCATTTTTAATTTGAGAGTACGTTTTTCG >2.27|1671457|38|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAGGAAGGAGGGCGATATAATGGCATGGCAAGAACCA >2.28|1671524|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTAATAACCTTTCATCATTCTACCTCCCCTATC >2.29|1671588|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGCTGTGGTATATTCATTAAGCATATTCTTTTCTG >2.30|1671653|38|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGGACAGCAGTACATGGAAGTTGACGAAGAAACCGG >2.31|1671720|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCCCCTAACCTTGTACGTAATATCTGCATATTCTG >2.32|1671784|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAACTAAAGGTTCCGGTATAAAATCGCCTTTTTTA >2.33|1671849|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCCGCTATCTTTTCATCCACCGCCGCCTCTGCT >2.34|1671913|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATGCTCCGTTCTTCAATGAAAGCATAGCCATAGTA >2.35|1671978|37|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCACTATCAAAAAGCTTTCTTGCAACCTTTTTATTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP035282_2
The CRISPR arrays of CP035282_2 >merge|CP035282|2|1669741-1672043|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACGATTTTGACAATAATAGGGTAAACAACTTTGATGGTATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACGCCCGCCTTTGTCCATATAGGGTTTACCGCCCATAATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACTTCGCATGTTAATAAAGATATGTTGAAGAGGGGAAGAATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACCGGCCAGCCCCCATATAGATTTCGGATCCTTTGCATATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACGCTACCTTCTCCATGCGGGAAGGGTTCGACTTGGAAATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACATAATTATACTGGTGTATGGAGTTTTGCGGCAGATAATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACCCGCTCAGCACATCTCCAGCTTGGGCTGTTCCGTACATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACTGTGACGAGGTTACCGGAGAAAAGCAGATAGCGGATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACACATATCCCCATGCCCTGTATCTCCAAGTTCTTCTTATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACAGGCTATAATTTGGTGTTAATTTCAATCCTATCACTATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACTAGATTTATCTCCAAATGCAGAAAGCTTTAATCCGGATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACTTATCTGTTCTATATAATCTTTTGTGATTGTATTTTCATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACGATTTTTATTAGAAGAGCCTAATCCGTATATGTCTGATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACTCCAAAAACAAATTTTGGCAATGTAGAGGAAACTGATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACGACGTTATGGCGGCTACAAGGGCCTACAACAGATGATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACGTACAAGCCTACAAAGCGGGGGTAAGGGGCCGCTTATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACTGTAAGCTACCAAGCCGCTTAACCCGTTAGTTTCCAAATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACCTTGGAAGTTTATAAAAGAAAATCCATGTCAGGGCGATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACATAGCTATGTTGCTATCGGAATGTCCTATTCTTTCGTATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACCTCCTACGCAAATAATTTCTTTTGCATAGTCCCCCATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACCCTACAGAGATAAGGATGGAAGTATTCAGGCTATAGATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACACAGTCCTACCACAAGTTGTTCTTGTTTGCATATTCATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACAACCATACAACCGCCGCATATGTTGCCAACATAATTATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACTGTAAACTTGTGTCACTCCTATTCTTTCTGCTAATTATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACTACCTCGGAGAGGACGATATGACAACAGATAAATTATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACTTTTATGAGCATTTTTAATTTGAGAGTACGTTTTTCGATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACGAAGGAAGGAGGGCGATATAATGGCATGGCAAGAACCAATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACTTGTAATAACCTTTCATCATTCTACCTCCCCTATCATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACATGCTGTGGTATATTCATTAAGCATATTCTTTTCTGATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACAAAGGACAGCAGTACATGGAAGTTGACGAAGAAACCGGATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACCCCCCTAACCTTGTACGTAATATCTGCATATTCTGATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACTAAACTAAAGGTTCCGGTATAAAATCGCCTTTTTTAATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACTTTCCGCTATCTTTTCATCCACCGCCGCCTCTGCTATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACGATGCTCCGTTCTTCAATGAAAGCATAGCCATAGTAATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAACCCACTATCAAAAAGCTTTCTTGCAACCTTTTTATTTAATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAAT >CP035282|2|1|1669741-1672043|PILER-CR ATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAAC GATTTTGACAATAATAGGGTAAACAACTTTGATGGT ATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAAC GCCCGCCTTTGTCCATATAGGGTTTACCGCCCATA ATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAAC TTCGCATGTTAATAAAGATATGTTGAAGAGGGGAAGA ATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAAC CGGCCAGCCCCCATATAGATTTCGGATCCTTTGCAT ATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAAC GCTACCTTCTCCATGCGGGAAGGGTTCGACTTGGAA ATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAAC ATAATTATACTGGTGTATGGAGTTTTGCGGCAGATA ATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAAC CCGCTCAGCACATCTCCAGCTTGGGCTGTTCCGTAC ATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAAC TGTGACGAGGTTACCGGAGAAAAGCAGATAGCGG ATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAAC ACATATCCCCATGCCCTGTATCTCCAAGTTCTTCTT ATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAAC AGGCTATAATTTGGTGTTAATTTCAATCCTATCACT ATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAAC TAGATTTATCTCCAAATGCAGAAAGCTTTAATCCGG ATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAAC TTATCTGTTCTATATAATCTTTTGTGATTGTATTTTC ATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAAC GATTTTTATTAGAAGAGCCTAATCCGTATATGTCTG ATTTATAATACCTAATGAGGAATTGAAAC TCCAAAAACAAATTTTGGCAATGTAGAGGAAACTG 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>CP035282.1|QAT61514.1|1667654_1669433_+|aspartate--tRNA-ligase MGEKMGNLRRTDMCGNLRLDDVGREVILMGWVQRQRNLGSLIFVDLRDTSGITQVVFDDTISKEIFKKAEKIRSEYVLAVRGKVRKRESVNNEIPTGKIEILADTLKILDESETPPIYIKDGDEVSEAMRLKYRYLDLRKPSMQKKLKMRHKAAKIIRDFLDENNFVEIETPMLTKPTPEGARDYLVPSRINAGKFYALPQSPQLMKQLLMVSGMDRYYQIVRCFRDEDLRANRQPEFTQVDMEMSFVDIEDVIEVNERLLKRLFKELKGVDITIPIQRMTYKEAMNRFGSDKPDLRFGFEIRDISDLVGNSSFKVFKNTIDNNGQVRGINVDGHEGDFSRKDISKLEEYIKTFGAKGLAWIKITKEEISSPIAKFLSKEELDNIIERMNGKAGDLLLFVADKENIVLDSLGNLRVEIAKKLNVIDKDDLKLLWITEFPLFEWSEEEKRYVSKHHPFTHPMDEDIDLLETQPEKVRAKAYDIVINGDEMGGGSIRINDSDLQERMFKALGFTMEEAWNKFGFLLEAFKYGTPPHGGLAYGFDRLMMLLTESDNIKDVIAFPKTQSATCLLTDAPTEVSEKQLEEVHIKVNLK >CP035282.1|QAT61513.1|1666443_1667310_+|DegV-family-protein MQTVIITDSCSDLPLSFIEGSNVEALSLTCHFKDEEYKDDFGKSISYKDFYNRVRNGETPTTSQINTYTFVEEFKKYISMGKSIIYIGFSSALSGCVASAESAKNEIMKEYPNADVAVVDTKSASLGQGLLVYYAYDMLLKGKSKEDIVNWLEDNKLKMNHYFTVESLFHLLKGGRISKTTAVLGTLLQIKPVLHVNIEGKLVSLHKVKGRKSSLKALAKELQNKIVHPEEQVIAISHGDCLEDANFLRKLVLDECKVKDIIINNVGPVIGSHSGPGTVALFFMGESR >CP035282.1|QAT61512.1|1665371_1666133_+|CoA-activase MYYIGIDIGSTASKVSVFNQDDLVLNMVMPTGWNSLDTSMKIKKSLDEQSIDVDKSVVVATGYGRVSVPYAKKTVTEITCHGKGAYYLAGEDITVMDIGGQDTKIITVKDGNVTNFLMNDKCAAGTGRFIELMSNTLGVSIEEMGEIALYGKNIKITSMCTVFAESEVINLIGSGTKREDIARGVFNSIIGRIKTLLNKNGMSGALYLTGGLCELKPFVQILSESIGQEIHTNPLARYAGSIGGALLAKKLVI >CP035282.1|QAT61511.1|1665131_1665353_+|DUF3343-domain-containing-protein MEKNFILFPNYTQGLKLESLLKNKKIKYVISPTPRQLSKCCGISIMYEKRDEENIKSIIRDNSVEVLGLYSLD >CP035282.1|QAT61510.1|1663872_1665132_+|2-hydroxyacyl-CoA-dehydratase MGSYNEMWQKLNMDLQKHDILCAALPDSFGEIYMTQKNRPDNMNYFNYALAEVHGARIEEIQKSKKNGKKVVGTFCVFVPDEVILAADAVGVGLCSGSQFWVEDGEKVLPRNICPLVKAFMGAKVSRTCPYFQSTDMIVGETTCDAKKKAYEILEEYMPVHVMELPQMKREKDFQEWQDEIKLFIKKIEEFTGNKITVEKLKNSIDLVNKKRRALKRLYDLRKHTPSPISGLDALLVSQVAFVDDPIRFTEKTEELCDELDERIKTMKPNGRKRIMITGTPMSVPNWKIHHIIEGLNAEIVVEETCTGTRYFEKEVFDEGDTIDDLVRNIAERYMNINCACFTPNNDRIDDIIKYAEEYNADGVIYCNLSFCHTYAIEYGKLEKALKENNIPLINIETDYSEEDVGQIRTRVEAFLEMI >CP035282.1|QAT61509.1|1662522_1663668_+|galactonate-dehydratase MKITSLELYKIKPRWIFLKINTDEGISGWGELISGTKTETVVAGAKEMGEYIIGKDPTQIEDLWQVLYRSFFRGGPINMTILSGIEMALWDIKGKYYNMPVYEFLGGRARDKIMVYSWIGGDRPSDVANEALKRKELGFRAVKMNATEELHYIDSYKKVDAVLERVDSIRKAVGYDLEIGVDFHGRVHKAMAKVLAKELEKYRPMFIEEPVLPENNDALEEIASHTSIPIATGERLYTRWAFKDIFRRGIVDIVQPDLALTGGIFEGKKIAAMAEAFDVAVAPHAPYGPIALAATLQLDVCTPNVFIQEQSLGIHYNQGFDLLDFVKNKEIFNYKNGFVDIPKGNGLGIEIDEEYVKKISEEGLHWTNPRWRNYDGTIAEW >CP035282.1|QAT61508.1|1661430_1662390_+|phosphoglycerate-dehydrogenase MKKWKVAATAVTFGRINKEPLKRLEELGCEVTLNPYGRPLTNEEMIQYASDADALIVGNDKVPGNVIEKCKNLKIIAKHGVGVDAIDIKTANKLGIVVTNAPATNSQEVADLAFGFLIMLARGLYQANYDTKAGRWIKPTGISLYKKTIGIVGLGAIGTAAAKRATGFDMDILGYDIEKNSSALKLGIKYVELDELLSKSDFITLHLPLTDKTLNILDADKFKLMKKGAILVDTARKQLVDYDALYKALTDGTLRGYATDVYDFEPPAHMPLFDLPNVILAPHIGGTTIESNRRMGDTAVDNVIAVIKGQTPPNLITLK >CP035282.1|QAT61507.1|1659956_1661330_+|PTS-galactitol-transporter-subunit-IIC MFQTIMKTFGAAVMLPIIILIFELILRVKPTKALRSALYIGVGLNGLVSILNPYFMGLIGGAISDMVTSTGINLPYVDTGWALLAAVGYSTTIGALVIPIGILVNVIMLLLHMTDTLDLDLWNFWHWAFIGSLVYYSTGSLLYGVLITIAVEMFLLVIADITAPTMQKFFNLPGLAFPHASGQGLVLLAVPLKWLFDKIGLTKIQIDSKTVRKRFGILGDSVVIGFLISFAIGIIAWHGKLGEMSTWASILSLGIGTGAFIYLYPKATAALLEGFATLSDKVRGMLSSKGVKRQINFGMDSALTIGHPDVLTTGLLTMITTVPLIFFLPGNKFIMLADLGVTPFFLGSVAVAIMGGNIIASYITDVIGVAITLYASSKIAPVFAATVKKIGIALPDTGSAVVGADMRPIHALFYFLGEKPIGIIIAFAGVFAILFLFKKNPKAWHKAFGYVEDDSNK >CP035282.1|QAT61506.1|1659621_1659936_+|histidine-kinase 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MHENRNEYDEVKKLLILSILAGKIMLKSGAETYRVEDTINRICKSRKNINYVESLVTATGISVSVEYDEEIITYIKRIKSISIDLNKIDMVNNFSREFVNGNISIEEGLKRLERINNTHIYNNLTKLVFGSLAGSFYTIMFGGTFMDFISSLMVSLLVVFVTNYLAKREITFFINNFVGAFLASILSILLVKLHIGKNMDMIIIGSIMPLVPGVAITNSIRDTMSGDFISGSSRGIEAAIIAFSIAFGVGLVLKLYFKGAIM >CP035282.1|QAT61518.1|1674178_1675411_+|serine-hydroxymethyltransferase MDFQNLQKNDPEVLKAIELEISRQRNKIELIASENFVSKQVMEAMGSQLTNKYAEGYPAKRYYGGCEYVDIVENLARDRLKKLFNAEHANVQPHSGSNANLGVYFAVLKPGDKVLGMNLSQGGHLTHGSPVNISGTYFNFVPYGVDKKTERIDYDQLREIALKERPKLIVAGASAYPRIIDFKKFKEISDEIGAYLMVDMAHIAGLVAAGLHPSPVPYADFVTTTTHKTLRGPRGGAILCKEKYAKIIDKAIFPGIQGGPLMHVIAAKAVSFGEALKDDFKDYQKQIIKNAKVLSEELLNKGFRLVSGGTDNHLILIDVRSKGLTGKKAEAMLDEIGITANKNTIPFDPESPFVTSGVRIGTPAVTTRGMKEEDMKEIAEIMNLALDERNDRGELKERVLKLCSRFPLYE >CP035282.1|QAT61519.1|1675554_1676469_+|hypothetical-protein MDKYGYIIIPSILLGFLSRLSMLKVDYRQYPSYPQGVFSHVTLGLIAASLGAVAIPSLMEKEFSAVTFLSLAAQQFREVRNLERQSLEKIDETELVPRGTAYIEDISKAFEARNYMAMLTSLLVSIFITIGGRYFKTVYAMLIGIILGIIIIFLFNRTISRDTIEEIADVYPAKISFDGPLLIVNGVSIINIGYKPSRDIYLKKGIAVEIIPKDKNGVVTLSNLGQRKSIEHNVSVLLGVRKDVDQPDFSPLAARDPDTGKIVMAVVSMENDVNYLVRLVEKTIVLESAKKKPLDSYVGRKASD >CP035282.1|QAT61520.1|1676481_1676676_+|hypothetical-protein MDVEIKGNILAVVTTDEKKIMCGGVPVFLAEDKEEQEKVSLKLSKITSGTIHDLENGCYIIVSH >CP035282.1|QAT61521.1|1676751_1678089_+|DUF512-domain-containing-protein MEFKIANLPKNIIESVEKRSIAEELGIQQGDLLVSVNDHEVRDIIDYKYLISDEYIVVRIEKKNGEVWDLEIEKEYDEDLGIDFFNPLIDKAKSCQNKCIFCFIDQLPKNMRKTLYFKDDDSRLSFLQGNFITLTNLNDEDIDRIIKYRLSPINISVHTTNPDLRIKMLNNKNAGNIMDILRKFKKGKLEVNCQIVLVPHVNDGYELKRTIDDLSELYPSVKSVAIVPVGLTKYRENLFPVEPFNTKMAEELIDSIEKIQGKLFQNINTRFVFLSDEFYAMTDRSLPSYEEYEKFPQYENGVGLMRLFSHEIENELKNIRENISLNRNYIIPTGTLAYKFMLSITEKVSSKFDGLNLRVVPIINNFFGRTITVSGLITGQDLIEQLKEYKNIDGIIIPKCMLRKGEEIFLDDITVEDLKDKLKTNVILSDVSGDSFIKIFKKDLR >CP035282.1|QAT61522.1|1678093_1679416_+|ribosome-biogenesis-GTPase-Der MDRPVVSIVGRPNVGKSTLFNRIVGRRVAITENNPGVTRDRIYEEAEWLNKYFTVIDTGGLEPFSEDKILSQIRRQAEIAIEMSDVILFVVDGLSGVTATDRDISNILRKSKKEVILVCNKIDTPKTPDDIYEFYELGIGEIIPVSAAQGLGIGDLLDEVVKYFPQNKNTEENENIIKVAVIGKPNAGKSSLINNILGEERVIVTDIPGTTRDAIDTYFTYGDNEFILIDTAGLRRKRSISEEVERYSVVRTLSAIERADICILVIDGEDGITEQDAKIAGYAYEKGKACVIAVNKWDIVEKEDRTYLEYERDIKNTLPFMMFSPIIFISAKTGKRVNKLFEIIKSVYSSYTKRVTTGVLNDIVNEAVILNQPPTDKGRRLKVFYATQIGIKPPKFLIFINDKKLMHFSYARYLENQIRNNFGFEGTPLQVEFREREGQN >CP035282.1|QAT61523.1|1679412_1680012_+|glycerol-3-phosphate-1-O-acyltransferase MNKTIFIAAISYLIGNFSSAYVLGRRLKKTDVRKYGSGNAGATNALRVFGVKIGLIVFMLDILKGIIASAIGNKILGFDGIIIAGIFVVLGHDWPIFLKFKGGKGIATSLGVMLYVQFPIALICTLIGFLVIGITKYVSLGSMIATLLVPIFIVLFDRPFNFKLFIFTVILASIAVFKHRSNISRLMNGKESKLGQRIQ >CP035282.1|QAT61524.1|1680031_1681060_+|NAD(P)H-dependent-glycerol-3-phosphate-dehydrogenase MKRKIGVIGGGSWGTAIAILLLNKGYDVNLYLRDEKQLEKIRDSGENAKYLPGIPIPEDIMITTDLEKSLYEREVVVTSVPSQVVRNVLNSAKKYINKEQIIVNVAKGIENHSLLRISQIVEEILPNNKFAALSGPSHAEEVARNVPTAVVAASKEKNLAEYIQDVFMTPYFRVYTNPDVIGVELGGSLKNVIALGAGISDGLGYGDNTKAALMTRGIIEISRLGGKMGANHGTFSGLAGIGDLIVTCTSMHSRNRRAGILIGQGVKIEDAVKRVGMIVEGIKTTESAYELSLKYNVPMPITKEIYEVLYRGSDVKNSVYNLMLRDKKHEMEEAAQENKYNW |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP035282_3 | 1863101-1863198 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of CP035282_3
|
1 spacers
spacers of CP035282_3
>3.1|1863133|34|CP035282|CRISPRCasFinder GCAGAGATTTTGAACCGTTTCTTTTCCAATATGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP035282_3
The CRISPR arrays of CP035282_3 >merge|CP035282|3|1863101-1863198|CRISPRCasFinder ATTTCAAATACATCTTATGTTAAGGTTCAACTGCAGAGATTTTGAACCGTTTCTTTTCCAATATGTGATTTCAATACATCTTATGTTAAGGTTCAACT >CP035282|3|3|1863101-1863198|CRISPRCasFinder ATTTCAAATACATCTTATGTTAAGGTTCAACT GCAGAGATTTTGAACCGTTTCTTTTCCAATATGT GATTTCAATACATCTTATGTTAAGGTTCAACT
>CP035282.1|QAT61707.1|1862753_1863059_-|hypothetical-protein MFINFKSVFNALKIISFLLFVFALAQVLTPLKIQLYGSEWLFMYSCCILGTILGIIGNKNKNTIPSIKKIGKIGVFGNLIMVIMFFPPLYFIWGTWLESIF >CP035282.1|QAT61706.1|1861114_1862485_-|tRNA-(N6-isopentenyl-adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase-MiaB MKQSYYKKGKYCIFTYGCQMNEHDSEEIAWMLENIGYEHTDNIEDSNLIIYNTCLIRENAELKVYGKLGELKKLKRKRPDIILCLCGCMMQREEIRNIILKKYKQVDIIFGVNNIQKLPQLIDTHLQTGKTIVDIEEESRQIEESIDAKRKYSYKAFINIMYGCNNFCTYCVVPYTRGREKSREPEDIICEAEKLSKEGCKEITLLGQNVNSYGKTLNRDYNFSMLLRNLNNIDGIERIRFMTSHPKDLSDDLILTMAQCDKVCEHLHLPVQSGSNKILKAMNRNYTKEKYLSLVSKIKERIPNIALTTDIIVGFPGETEEDFEETIDLAKKCKYDSAFTFIYSVREGTKAAEMKNQVPDEIKHKRFQTLLDELYPIFNENNLKYNNKTVEVLVEEISKNNPKMLTGRTRTNKLVHFKGNKDLIGKLINVKIDTTKTFTMEGHILDNSIAGGDIFE >CP035282.1|QAT61705.1|1858488_1861122_-|DNA-mismatch-repair-protein-MutS MSSLTPMMNQYKKIKSNYKDCILFFRLGDFYEMFFEDALTASKELEITLTQRDCGQKEKAPMCGVPHHAVEPYIAKLIDKGYKVAICEQLEDPKFAKGIVKRDIVKIISPGTITDTNALDEKSNNFIASLYMNEEGVGLTYADISTGEVYTTECMGNEKDIYNFILDEIGKINPSEILVNELLYNNKKIMNFIRNRINAYIDKYDDGIIDEEDYIDKVQKHFNITVNEKNSLFNKNYSIRSMGVLLDYLYSTQKNSLDHLKNISYYEFNEYMILDINARTNLEIVETIRGREKKGSLLWILDKTSTAMGGRLLKKWLEQPLLSIRDINKRLDIIDIFVNDIIFMDKVKDSLSKIYDLERLSGKISNGNCNGRDLISLKISLENLPLIKDLLINSTYEPLITLGKEIDCLEDVYNLIDKSIIDDPPVSLKDGGIIKSSYNEELCELRNLSHNGKGWLSNLEESEKKKTGIRSLKVGFNKVFGYYIEVSNANLDLVPDNYIRKQTLSNAERFITPELKEMEAKILGAEDRMINLEYKLFVQIRDDIKKEMDRIQRVSRIISKLDVLNSLSQVSYKNNYVRPHINNEEKIEIKNGKHPIVEKMLENNDKFFVPNDTCLDEENKMLIITGPNMAGKSTYMRQVALITLMAQIGCFVPADSADIGIVDKIFTRIGASDNLSQGESTFMVEMNEVANIIKNATEKSLIILDEVGRGTSTFDGLSIAGAVVEYIAQHIKAKTLFATHYHELTQLEDKIDGVKNFTIMIQEEGDSIKFLRKIVRGSSDRSYGIEVAKLSGIDESIINRAKEILAEIEMKNSGITDDKKSSSETKIKKKNKNNQIDLFQIKKDKLIEEIKNINILKLTPMDAMNILYKLVENVKNL >CP035282.1|QAT61704.1|1856625_1858476_-|DNA-mismatch-repair-endonuclease-MutL MSKIKLLDEKTKAQIAAGEVIERPASVVKELIENSIDAESKFIVIEIKNGGKSYIRVTDDGTGIDKDDIDYAFFRYSTSKIRSVEDLNHIYSLGFRGEALASISTIGKVEALTKTRDNNMGIQVLVENGKIKEKNIIGCQDGTTMIVKDIFYNLPVRQKFLKDENVESNYIGNIVNKLSLGNPNISFKYIRDNKMTLKTPGNGDLSSCIYSVLGKEILKGLIEVKSTYDSIKVYGLISNNNVYRGNRSHQYIYINGRYIKSYFLSGIIQECYRSLIPINKYPVFILFIEMDPQLIDINVHPTKQEIKFKNEKAVKDVVQGIIRDSLKSGLKIHDINFTESKKDEKSKENIDYIDIVTENRDDKHYNDNVYDYYNEKIEEQQKNGYNNYNEREIVVIDERENNTQKPHEEYNFIDNNTVQIKNIFKNCRKVGILFSTYILLEDRINDYVYLIDQHAAHERIMYEKYKKEYENENVAVQMLISPEVLDLTNDELNLVKDNKELFNKLGFEIEDFGYSSILIRGVPLIFGKPNNKELIYLIIDSLNNNIKSNYEVKIEKIMKIACTSAIKGGDKIHDMEIDSLINELGKAENPFTCPHGRPVFIKMSRKDLEKEFKRII >CP035282.1|QAT61703.1|1855632_1856598_-|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA MPKKIPLCIIAGPTAVGKTDISISVAENLNGEIISADSMQIYKYMDIGTAKVKFEEMKNIPHYMIDIVYPDEEFSVADYKKRAKYYINKIDQNNKLPIVTGGTGFYINSLIYNLSFTEVPSNQELRNKYDLLCKNYGMEYIYEELKKVDVSSAKRINPNDKKRIIRALEIYYTTGKPMSYYYKDFRKRNNSYNAVIIGITMDREKLYKRINKRVEKMIEEGLIEEVNTLLKMGYGPELVSMQGIGYKEIIPYLKGKTTLENAISSIKTNSRRYAKRQLTWFRREKNIEWVNLDNYKSIEEVSDHIIKYVINKLNLNKNKEG >CP035282.1|QAT61702.1|1855386_1855632_-|RNA-chaperone-Hfq MLKTAINLQDVFLNRVRKENVSITVFLINGYQLRGYVKGFDNYIIILDTDGKQQLIYKHAISTIVPTKVLNVSGKILEEED >CP035282.1|QAT61701.1|1854053_1855358_-|aminotransferase-class-V-fold-PLP-dependent-enzyme MNKYTMNVLCKEFGIKEEVINYTLKRESLIKDKFNDINEIKEYNQYKVINAMHKAKLSSSDFHWTTGYGYGDIGRDKVEKIYSYVFNGEDALVRPTIASGTHAITLVLSGILRPEDEFICITGSPYDTLQKIIGIKGHAKGTLLEYNIKYKEVPLDKNNRIDLKTVLETISKKTKLILIQRSTGYSSRNALTIDDIKEAIKEIKEKFPNIIIMVDNCYGEFTQRLEPIDVGADIMAGSLIKNPGGGIALSGGYAVGKKELIELVACRSTAPGLGKECGLTFGTTRSTLQGLFLSPHVVSEAMKGALLMASVYKGLGFRIVPDLNDERSDIIQGVQLGTPEGVEEFCKGIQQASPVDFYVTPEPWDMPGYEDKVIMAAGGFIDGSSIELSADGPMREPYFAYYQGGLTYEHCKLGVMISLNNLYKKNLIEKCKLI >CP035282.1|QAT63420.1|1853266_1854031_+|DeoR/GlpR-transcriptional-regulator MFTEERHNEILNVLNNEGKVVVNDLSEKFNVTKDCIRKDLKILEKRNLLKRTYGGAVPIRKSALYENIDERRNLNLESKAMIAEKAFNLIENNETVFLDISTTNILLAKLISKSDKKLTVVTNMLDIISVINSNENDIKIICPGGIVNKALNGFTGSMTIESILNYRFSKAFIGSCGINIFDKSITTFDFDDGNTKKAVIKNSKTIYLVMENKKFYFDGSFKFATLNDIDAIVTEDYPGKDIANILDKVNVELI >CP035282.1|QAT61700.1|1852387_1853068_-|fructose-6-phosphate-aldolase MKFMFDTANIEDIKEYKDIFPITGITNNPSIIKKEGKIDFFNHFKEIRKILGFEKSIHIQVVAENCEGIIKDAETILENIDNKIYIKIPVTEEGLKAMRLLKSKGVNITATAVYTKIQSLLALETGADFIAPYFNRMENIGINPREVIETTANMINKYNYSTEILTASFRNIGQVVDAFSSGSQAVTVPPQILHDSLMMPSIQKAIGDFTLDWENIFGKEKSIYNL >CP035282.1|QAT61699.1|1851676_1852369_-|ribulose-phosphate-3-epimerase MKKIIENDINISASVSCMDLCHLKKDMEEVEKSGVSFYHFDVVDGKFNRCFILGEPTLKCMSKETDLPIEVHLAVYEPEKFIENYAKNGADYIAVHYEAVKNFNKIFGMIRHYGAEPILAYKSTTPPGEDFISLAKEVPWILKLTVNPGFSGQKMQTTAVKHIRQMRKMLNDADLKTRIQADGNVNVSTIPIIVKAGADILTGGTSGLFLENYTVKKCCSKMIEAAKNAM >CP035282.1|QAT61708.1|1863531_1864731_+|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase MHFSKRIISMQQSPIRKLAPIAQEARKKGKKVYHLNIGQPDIKTPDEFFDAIKNYREEVLSYELSTGMPELIKSFIEYYKKHNIYFDEDEILITNGGSEALIFSLMAICDDGEEILIPEPFYTNYNGFSTMTGVKVIPITTKAEDGFHLPDKSEIIKLISSKTRGILLSNPGNPTGTVYTEKEIYMLRDIAKEYNLYIVADEVYREFIYDGLKHISFCYLDDIKDNVILVDSISKRYSACGARIGCVASKNKKLIKEILKLCQGRLCVATLEQVGACNLINVSERYFEETKNEYVRRRDTVYNALKEMKGVICEKPHGAFYVMAKLPVKNAEDFIIWLLTDFSIDNETVMMAPAEGFYATKGLGIDEVRISYCLNVKDLERAMYILNEALKVYPDKKIL >CP035282.1|QAT61709.1|1865441_1866062_-|MerR-family-transcriptional-regulator MLETDKEYTISEVSETTGYPPHVLRYYEKEFVLDIPRNESNHRYYTYKEIELFQYIKSLQEKGFSNKQIKLIIKTPQMMMSDQDETAITSIVPNKSFDVANIDTTEISKEISGNVQQLLLEELVPILKNGNEHSINTINELKEEIIMLRNEINSKERDVLICENAKLKMKVKEKSYEVAELKEKINRRENSESNFFKRIFKFGKNE >CP035282.1|QAT61710.1|1866240_1867233_-|M42-family-peptidase MNFNGELLKNLVSIYSPSSNEENIRNFISKEIKNYVDEVEVDPLGNLIAHKKGSGKKIMIAGHMDQIGLMVTDIDKNGFLRFTSVGGISPFVSLSQKVVFENGTAGVIFAEHMDDISKLKLENMFIDIGALNKEDAEKKVSIGDICVYKSDYDENDNAVFTKCLDDRVGCFIMIETLKNIKKTVNDLYFVFTVQEEVGTRGAKTSAYKVNPYMGIALDVTGSGDTPKAKRFAISLNKGTAIKVKDNLVIAHPLVKQLMIDTAKENGIPYQLEVLEYGGTDSGAIHLTREGVPSGVISVPTRYVHSTVEMAAKDDILNSIKLLTKLLEKEI >CP035282.1|QAT61711.1|1867233_1868253_-|M42-family-peptidase MLLKKLTEASGVSGNEREVRNIILDEIKDYVDEVKVDRLGNIIAYKKGETNSPRLMVTAHMDEVGLMVTGFGESGLIKFTTVGGVDKRILVSKPVLVGEKKIPGVIGAKPIHLQKKEERDKALNLDQLYIDIGADSKEEAQKNVEIGDYVSFQSNYVEFGKSLVKAKALDNRTGCSILVNLLKEKTKMEFYGIFTVMEEVGLIGAGPAAYAIEPERAIILEGTLCYDMPDTDGHLTSTTLGKGPAISLMDRTTVFDRDMRKKIEETAKKYNIPYQYRKISSGGNDSGKIHQAKGGCVTTTISVPCRYIHSPISVMSKNDYDNTFKLVKSVITEMEKGDF >CP035282.1|QAT61712.1|1868243_1869299_-|M42-family-peptidase MESTEFLERLSNGFGPSGYEYSLKDSIADVMGKYADELKVDNLGNIIAIKRGNKKESKIKIMVAAHMDEIGLMVTAIEDNGFLRFTQIGGIDQRTLLGQEVIVHGEKDLFGVIGVKPPHLQTRDELDKAVKMEDMAIDIGYSKEEVEKIVKIGDVITIRRKLTHLLNEKYTGKALDDRTGIIALYECIKELKKLNHEADAYLVSTVQEEVGTRGAYTSTYGINPDIGIAVDVGFASSPEIPKEYTLDIGKGPGITIGGNIHPGLRKKLVEIAKEYNIPYQFEVEPGPTGTDARAIQISREGIPALCISLPLKYMHTSVEVIDMNDIKNTGKLLALFIASISKENLEGLLCY >CP035282.1|QAT61713.1|1869411_1870191_-|protein-glutamate-O-methyltransferase-CheR MDKYEDFKKQINSLLNIDLNYYKEKQMKRRITSLLTRNNYKDFDDYYLGIKNNKKILNEFINYLTINVSEFYRNPSQWHVLENYILPDIIKKCKGSPKVWSSACSTGEEPYSTVMLLSKFFDLKNIKILATDIDEEAMRKAKIGLYSEKSLQNLPLEFKNKFFDRIESSYKIKDTIKNCVDFKKIDLLKNPFPRDIDLLICRNVMIYFTDKGKELLYKKFFESLSNEGVLFLGSTEQIILPERYNYRSIKTFFYKKIFY >CP035282.1|QAT61714.1|1870400_1872380_-|bifunctional-4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl-diphosphate-reductase/30S-ribosomal-protein-S1 MNILIAEHLGFCFGVKRAVDCAEKEIKNKGENLYSLGPLVHNPQLTDRLKEQGLGIIDDIKDIKAGRVIIRSHGVPLNIYKIIEDNDLKLIDATCPFVKNIQKKVKEFFDKGYKIIIIGDKYHSEIIGINGWCNNEGIIVNNKEEADALPEFDKICVVSQTTNRKEKFDEISNIILKKGKEVKLFNTICNATDLRQTACKEIAEKSDAVIVIGGFQSSNTNKLVEISKKYCKNVFHIETKNDLPIEKISKFNTIGITAGASTPEWIIKEVISTMENYNNEEDIRKALEDSVIRLHRGEIVKGKILSVTDNEIMVNVGYKSDGAIPKEELSNDPFVNPKDLYKEGDEIEVCVLDLDDGEGNVLLSIKKAQEKKGWDEIENIFKEGNDIECKVTEVVKGGVIAIVNGIRAFIPASLASMKYVDDLDVFKGKTIKVKIIDIDRNKNKVILSRKAVEKEELEEKKESLWNTLRKGDIIKGTVKRLTNFGAFVDLGGLDGLIHISDLSWSHIKHPSEVVKEGDNVEAVILDFNKENNRISLGLKQIVPEPWKVFIDENKIGDIVEGEVVNLLDFGAFVRLKEGVDGLIHVSQISNEHINKPSDVLKLGEIVKAKIMDIKEDERRISLSIKEIEKKEEPLKEEEKVDIPKEDMNVTIEDVIKEDK >CP035282.1|QAT61715.1|1872384_1872978_-|1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate-acyltransferase MVFYRCTQFIGNILVRILFRVKVIGKDNIPKNGRIIVCANHESLLDPVIIGILFPRPIHFMAKKELFKNKFLNIIITALGAFPVNRKSADLSAIRTSIDILRKEKVLGIFPEGKRIIEENIENAKPGIALITIKAKSPIVPVLIQSKYKIFSKLTIKIGSPIYFNEYYGKKLSTDEYRVLSKEVMKNIYSLKNNWEE >CP035282.1|QAT61716.1|1872981_1873641_-|(d)CMP-kinase MNKRITIAIDGPAGAGKSTIGKIIAQKINADYIDTGAMYRALTLKLIENNIDLNDTYSLLKELNNTSIDFRNGHIYLDKKIVDKQIRENIVSQNVSDVAKIKEVREELVKIQQNIASQKSVVMDGRDIGTVVLPNADFKFFVIASIHERAKRRFEDLVKAGEKNLTIEEVEDQISRRDKIDSTREKSPLTKSDDAYEIDTTNKSINESVDEILKIIEGR >CP035282.1|QAT63421.1|1873707_1874061_-|chorismate-mutase MVTIRGATTTNNNQKDILLAAKELLEEIRGKNKLDKKGVISILFSATQDLDSVYPARAARELGYTKCGLMCFNEMKVIGSLNKCIRLMILYNGNLSQDEVKHVYLRDAVVLRPDLVK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP035282_4 | 2011882-2012894 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP035282_4
|
15 spacers
spacers of CP035282_4
>4.1|2011910|36|CP035282|PILER-CR TTTGGTCGTGTCGGTCGTGCTTCTAAGGATAGCCCT >4.2|2011974|37|CP035282|PILER-CR TGTCACATTTACCGCTGGTTTTTGTAGGGGCCAGCTA >4.3|2012039|38|CP035282|PILER-CR TGTTGTCCCGTATTCTTTCAATTCATCGTACATTTCTG >4.4|2012105|37|CP035282|PILER-CR TGCTTTTTTTATTGAGAAGGAGGGATAGAATGAAGTT >4.5|2012170|37|CP035282|PILER-CR TCATTAGAAAAGTTGGAAAAGAGGTGAAAGTATGAAA >4.6|2012235|37|CP035282|PILER-CR TAACAGATATAAAATATCCTTTCTACTTTGGAAATTT >4.7|2012300|37|CP035282|PILER-CR TTTGAGGCTTTTGAACAGCATATTAGGGATAGCGAAT >4.8|2012365|40|CP035282|PILER-CR TCTTTCACAAGAGCGTTATCCGCTCCGCATAGAATAGCTT >4.9|2012433|36|CP035282|PILER-CR TTATGAACATCCAGAGAAGTTCGTTTCTTCAAGCGA >4.10|2012497|38|CP035282|PILER-CR TGAGAGCGTTTTAGAGCGTTTCAGAGGTATTCTGACGT >4.11|2012563|37|CP035282|PILER-CR TTTATTGATGTTCCAAGCTCCTGCCATTGACATTCCG >4.12|2012628|38|CP035282|PILER-CR TAAAACTGAAATCCATATTCCCAAGCTTGCAGATCAGA >4.13|2012694|42|CP035282|PILER-CR TATGTCTCCGGAAGCGATAACAAAAAAAGTATGCAGTGATTT >4.14|2012764|37|CP035282|PILER-CR TTGTAATCAGCTGCATCTGTCGCAATTATATAAGCGA >4.15|2012829|37|CP035282|PILER-CR TAATTTCGTCCTCGGCCTCTTTCTTCTCTTCATCATA >4.16|2011911|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT TTGGTCGTGTCGGTCGTGCTTCTAAGGATAGCCCT >4.17|2011975|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT GTCACATTTACCGCTGGTTTTTGTAGGGGCCAGCTA >4.18|2012040|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT GTTGTCCCGTATTCTTTCAATTCATCGTACATTTCTG >4.19|2012106|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT GCTTTTTTTATTGAGAAGGAGGGATAGAATGAAGTT >4.20|2012171|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT CATTAGAAAAGTTGGAAAAGAGGTGAAAGTATGAAA >4.21|2012236|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT AACAGATATAAAATATCCTTTCTACTTTGGAAATTT >4.22|2012301|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT TTGAGGCTTTTGAACAGCATATTAGGGATAGCGAAT >4.23|2012366|39|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT CTTTCACAAGAGCGTTATCCGCTCCGCATAGAATAGCTT >4.24|2012434|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT TATGAACATCCAGAGAAGTTCGTTTCTTCAAGCGA >4.25|2012498|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT GAGAGCGTTTTAGAGCGTTTCAGAGGTATTCTGACGT >4.26|2012564|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT TTATTGATGTTCCAAGCTCCTGCCATTGACATTCCG >4.27|2012629|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT AAAACTGAAATCCATATTCCCAAGCTTGCAGATCAGA >4.28|2012695|41|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT ATGTCTCCGGAAGCGATAACAAAAAAAGTATGCAGTGATTT >4.29|2012765|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT TGTAATCAGCTGCATCTGTCGCAATTATATAAGCGA >4.30|2012830|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT AATTTCGTCCTCGGCCTCTTTCTTCTCTTCATCATA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP035282_4
The CRISPR arrays of CP035282_4 >merge|CP035282|4|2011882-2012894|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAATTTGGTCGTGTCGGTCGTGCTTCTAAGGATAGCCCTGTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAATGTCACATTTACCGCTGGTTTTTGTAGGGGCCAGCTAGTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAATGTTGTCCCGTATTCTTTCAATTCATCGTACATTTCTGGTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAATGCTTTTTTTATTGAGAAGGAGGGATAGAATGAAGTTGTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAATCATTAGAAAAGTTGGAAAAGAGGTGAAAGTATGAAAGTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAATAACAGATATAAAATATCCTTTCTACTTTGGAAATTTGTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAATTTGAGGCTTTTGAACAGCATATTAGGGATAGCGAATGTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAATCTTTCACAAGAGCGTTATCCGCTCCGCATAGAATAGCTTGTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAATTATGAACATCCAGAGAAGTTCGTTTCTTCAAGCGAGTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAATGAGAGCGTTTTAGAGCGTTTCAGAGGTATTCTGACGTGTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAATTTATTGATGTTCCAAGCTCCTGCCATTGACATTCCGGTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAATAAAACTGAAATCCATATTCCCAAGCTTGCAGATCAGAGTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAATATGTCTCCGGAAGCGATAACAAAAAAAGTATGCAGTGATTTGTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAATTGTAATCAGCTGCATCTGTCGCAATTATATAAGCGAGTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAATAATTTCGTCCTCGGCCTCTTTCTTCTCTTCATCATAGTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAA >CP035282|4|2|2011882-2012893|PILER-CR GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAA TTTGGTCGTGTCGGTCGTGCTTCTAAGGATAGCCCT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAA TGTCACATTTACCGCTGGTTTTTGTAGGGGCCAGCTA GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAA TGTTGTCCCGTATTCTTTCAATTCATCGTACATTTCTG GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAA TGCTTTTTTTATTGAGAAGGAGGGATAGAATGAAGTT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAA TCATTAGAAAAGTTGGAAAAGAGGTGAAAGTATGAAA GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAA TAACAGATATAAAATATCCTTTCTACTTTGGAAATTT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAA TTTGAGGCTTTTGAACAGCATATTAGGGATAGCGAAT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAA TCTTTCACAAGAGCGTTATCCGCTCCGCATAGAATAGCTT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAA TTATGAACATCCAGAGAAGTTCGTTTCTTCAAGCGA GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAA TGAGAGCGTTTTAGAGCGTTTCAGAGGTATTCTGACGT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAA TTTATTGATGTTCCAAGCTCCTGCCATTGACATTCCG GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAA TAAAACTGAAATCCATATTCCCAAGCTTGCAGATCAGA GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAA TATGTCTCCGGAAGCGATAACAAAAAAAGTATGCAGTGATTT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAA TTGTAATCAGCTGCATCTGTCGCAATTATATAAGCGA GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAA TAATTTCGTCCTCGGCCTCTTTCTTCTCTTCATCATA GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAA >CP035282|4|4|2011882-2012894|CRISPRCasFinder GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT TTGGTCGTGTCGGTCGTGCTTCTAAGGATAGCCCT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT GTCACATTTACCGCTGGTTTTTGTAGGGGCCAGCTA GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT GTTGTCCCGTATTCTTTCAATTCATCGTACATTTCTG GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT GCTTTTTTTATTGAGAAGGAGGGATAGAATGAAGTT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT CATTAGAAAAGTTGGAAAAGAGGTGAAAGTATGAAA GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT AACAGATATAAAATATCCTTTCTACTTTGGAAATTT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT TTGAGGCTTTTGAACAGCATATTAGGGATAGCGAAT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT CTTTCACAAGAGCGTTATCCGCTCCGCATAGAATAGCTT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT TATGAACATCCAGAGAAGTTCGTTTCTTCAAGCGA GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT GAGAGCGTTTTAGAGCGTTTCAGAGGTATTCTGACGT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT TTATTGATGTTCCAAGCTCCTGCCATTGACATTCCG GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT AAAACTGAAATCCATATTCCCAAGCTTGCAGATCAGA GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT ATGTCTCCGGAAGCGATAACAAAAAAAGTATGCAGTGATTT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT TGTAATCAGCTGCATCTGTCGCAATTATATAAGCGA GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT AATTTCGTCCTCGGCCTCTTTCTTCTCTTCATCATA GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAA >CP035282|4|2|2011882-2012894|CRT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT TTGGTCGTGTCGGTCGTGCTTCTAAGGATAGCCCT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT GTCACATTTACCGCTGGTTTTTGTAGGGGCCAGCTA GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT GTTGTCCCGTATTCTTTCAATTCATCGTACATTTCTG GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT GCTTTTTTTATTGAGAAGGAGGGATAGAATGAAGTT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT CATTAGAAAAGTTGGAAAAGAGGTGAAAGTATGAAA GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT AACAGATATAAAATATCCTTTCTACTTTGGAAATTT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT TTGAGGCTTTTGAACAGCATATTAGGGATAGCGAAT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT CTTTCACAAGAGCGTTATCCGCTCCGCATAGAATAGCTT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT TATGAACATCCAGAGAAGTTCGTTTCTTCAAGCGA GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT GAGAGCGTTTTAGAGCGTTTCAGAGGTATTCTGACGT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT TTATTGATGTTCCAAGCTCCTGCCATTGACATTCCG GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT AAAACTGAAATCCATATTCCCAAGCTTGCAGATCAGA GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT ATGTCTCCGGAAGCGATAACAAAAAAAGTATGCAGTGATTT GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT TGTAATCAGCTGCATCTGTCGCAATTATATAAGCGA GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAT AATTTCGTCCTCGGCCTCTTTCTTCTCTTCATCATA GTTTCAATTCCTCATTAGGTATTATAAAA
>CP035282.1|QAT61849.1|2010878_2011793_+|IS3-family-transposase MTEAIYHEVSEKTEAAKKENRRVSVSGMLKILGVSRSGYLAWQKRVPSDTQKRKEAVKVKIKDIYDDSKQNYGAPKITQKLQQEGETISERTVGKYMKEMGIKAQWIKPWTATTKDSDFSTELHNILDEQFNPDRPNAVWCSDITYIWATRGFVYLISIMDLYSRKIIAWMLSKTMEVSCVINTINKAKARRNTDLPLILHSDRGSQYVSNEYIKATAKMQRSYSKKAFPWDNACIESFHAIIKREWLNRFKIRNYQQAYKLVFEYIEAFYNTKRIHSHCNYMSPDDFEKLYAKVQNDSLLLAG >CP035282.1|QAT61848.1|2010594_2010882_+|transposase MMAKQYDKQFKLDAIQYYQDHKDLGLIGCAENLGISQQSLSRWKKGLEQTGEIVCRGSGNYSSDDEKEIARLKRELRDTKDALDVLKKAISILGR >CP035282.1|QAT61847.1|2009971_2010418_-|acyl-CoA-thioesterase MKKGGLFVKNCTNIRVRYKETDQMGVVYYGNYFTWFEVGRNEFFRDMGYTCEYLETQGIFLPVIETGCKYIYSAKFDDEIIIETKIEKMEGVRLRLKYNIIRKRDNLLLAEGFTEHAFVNKEMKPVNFRKKFKEIWDMLKKAENEEKC >CP035282.1|QAT61846.1|2008895_2009927_-|DUF2399-domain-containing-protein MKPEIVRRILYYFLKNCRKKTICLWEIEDHLRGDVEYDDYAVVINDMLKEGILSPIKASGTTDKPISIPNSFRINKSYFNMAIVDRIASYQLKANKNINLQNYYSLGEKYWERDLPYIMKINSYLNSKGIPTGEYTTSELSYRFVGNEKWIDEEGGKVILERIGLWKRLNINFMPDPLMIAVNRNKILGETHMHLIVENKSTFYALMDDIENTEFTSLVYGAGWKITSGISVLEDQLRLGCEQNKVFYFGDLDYEGISIWNAVNEKREAFLAVDFYKEFFKNHFSYGKHGQIHNDEAVKNFLNNFSVDYKDRIMDMLKRGGYYPQEGLEKEKMREIWRKISWT >CP035282.1|QAT61845.1|2007396_2008905_-|replicative-DNA-helicase MDINIRGILDNYGERVGRLFLYEPLFKLENKREKDNSGNFIDYFSLGLLSLLFFFENMIMRNRNTGVKELAQFFAEVNGGRIDLNIEGFERAARNIIDAFRPPSGKRNSKTFYNWEKRRYETVYYSILKSGLSDTKSNIQYYTLDEQGLELVFSTREYFSEFQISINQLLLRKQLEKGEFAGALRQIDEMRLAVGNLKDRIIKIGHEINRNIVSEESYERYKNLIEDINLRLARENEEFDELLNFVNDTKNKMEYEIKDEKDRKAYELIRKIHNELDEVHSEHRQLLKNSISLKTNALESAQESLYFIGVESFNFEEEITKRLISIPLPLGASRYIINPFMYLSMAKTWSPLRVFYEQKIESERESEDIYEFAEPQEGEIIDEYLNITKFNFRKIMEIVIKMMRNKNEITLEEVVGNMQSEDEDILNHRSFYDFWIILHQKSPIILNDTEYDNNELFKDAFEIFKGKRIKLTVVEKDGIVYGNKRFSIKNMVMRLEENTDGI >CP035282.1|QAT61844.1|2006639_2007407_-|non-ribosomal-peptide-synthetase-module MEYRDVEVLNAFKIYSYLAANGFCEKDEMRLYITDDKVRDLVNQFSSVVGCTVIPAGEYVYLVPTEPLSPFHVSNEEIKKEYLPSRAVNLDIYLMYVAIIVLFGEFYDSYQSTEATRNFLPMKEWLSSLNNHISSIKEIDKDELKKIEKDSEYNWVGIVEKWEAMDDLRENVKVQDARTVSRLSFLNTVKRFLENQGLITDIGNDEIELTEKAKTIVQKYYMEYEFNRGILDFMYQAEREGKERKNAVHIENKVH >CP035282.1|QAT61843.1|2002240_2006671_-|hypothetical-protein MPSISKIRFTNVVYEGGSKRYNDDIFVFEGNNGAILLENGGGKTVFIQTVLQAILPHSDLAERKIKDTLSLEGNPAHIAVEWILNERPRRYALTAVTLFLVNGKLDSYRYVYEYGSSDSNSIENIPFVRNTSNGNKRPAGREEMNDYYQYMSKEHVNAKRFSTIREYQKYIEENFKIIPMEWRRISLINGEEGGVEKFFDGCKTTESLVDRLLIPVAEEALAGNGMKDFADTFENQREHFKQHNYLKKNIDESKLIQDRIRKYVEVYKEYYYSLEKFGKKKGEGKALYEFFLDEHKKTDKELKDVEKAQNDWKSTNEKLVQKEYSYYLECIKQELEKDENEYNNCLRDYEVQKDEFSAKERRLENLEIAQLKKKIKDDEDEILIYKKQLDMLEKDEKTDEAEKQLRINSSAVSGYFDGEFNKLNGKRDEANRKREECNDNLRILREKKDSLDKEYEELVEKKGNLRGELNFSCRQMKDIESEILSNSENETIEEQYPKWTDKINFLEKDLVERRERLKEMYEEKNRINAELSSYREKQEQLSDNRGVLGEKIERIENEEKELLIKIKELISGYEHINSLYIKKEQIVAALEDKCERIRREREELLINERISHRFSDDYKDNEYFTAEPMLDSWINQWRNNFVFLESGAQYIGRAAAVLNKDETEYYQNYPYWASSVIVADNGENKLHEKLKRNIDKISCPIGILTQSKAQLLLEGGKIENDIFLYPSVWKDNIKREDFQAKKTEGQKKAESATRARKEKETELERYTKVLNKIKEFLDQYPYEDFTMLKEDYKHTDEEINTIKCNIEEGEKRVLQIDNDIKNAGNKINNLQEEQNVLNKNIVEAGKYLNFKNSVKGIKKDLFRLDFKIEENNKKKEENKKETERYRGISEKLLLELNKIKGYIDSLSKDELYMEVRDFVPEYSPISIEVLKRERKELKDVLNKKQKDRENISYNIVKISDAKEEHRKDLKNLILRAKYQSEKDMEFPIYGEAEIEDLIKSIKVLSPLLDKKEKELNRFKEKYQNIKSKYEVKEEDYFKVYDKIVEFTDSLGNVKKEIDDEKIELGKRIDYLNSMEEKWDKELKSIEEVLNNLRLKNEKYEYLSDNVISLGLSDDMIQGLPYDRMKYVSLVLNSLENIKKETEENIIKVDKEKRDFEMFCSEHISEPRLKNMALWGIKYKDKYDDIIEWQKNIDKRIDKTVNILEMDMMEHDKEISQFVKYLNSYLKSLAQEIGSISKKTRIKVDDKSKKIYIIDVPEWKEEFGKEEIRNYINIMIKDIESNEFKDEEGKEDKSSVRKYIEDKFQAKQLMKALMAGDGIKVKCRKVTNDGKVNSIPVSWEKTNSWSGGEKWSKNMTLFLGILNYLAEKKQSINFEQKRNRTVILDNPFGEASSNHVLDPVFFIAEQLGFQIIALTAHSEGKYIRDYFPIVYSCRLRPSLDKDTQIFTKEREIKYAFFKDNDPQVLSRLGEKEQLTMF >CP035282.1|QAT61842.1|2000626_2001910_-|serine--tRNA-ligase MLDIKFLRANPEIVKENIRKKFQDEKLILVDEVIKLDEQFRATKTRSDFLRSQRNSISKEIGALMSKGQREEAEKKKKQVEDIAQELADLKTSEDNIESQIRERMLVIPNIIDPSVPIGKDDSENVERERFGEPIVPDFEVPYHVDIMERLNGIDLDSARKTSGNGFYYLCGDIARLHSSILSYARDFMIDRGFTYYIPPFMIRGNVVNGVMSFSEMENMMYKIEGEDLYLIGTSEHSMIGKFIDTILDEEQLPQALTSYSPCFRKEVGAHGIEERGVYRIHQFEKEEMIVVCKPEESPQWFEKLYHITVDFFRSLDIPVRTLECCSGDLADLKVKSIDVEAWSPRQKKYFEVGSCSNLGDAQARRLGIRIRSKEKGNYLAHTLNNTVVAPPRMLIAFLENNLNADGSVTIPKPLQMYMGGKEVIKK >CP035282.1|QAT61841.1|2000019_2000358_+|cytochrome-C-biogenesis-protein MDFSKVKIEIYVPQEYIESLRDELTKIGACQIGKYDHVISFSNVQGYWHPLLGSSPFNGEVGTINFGSECKLEVRCPITKVKDAVATIKKIHPYEEPVINIIPLINDMFEIE >CP035282.1|QAT61840.1|1998709_1999597_-|zinc-binding-dehydrogenase MLNNKKIFINPVWTNVCQYNAVEVGKNVKNFKVGDRAVGANSVPCFHCYFCKRKEYSLCENLQYLNGAYAEYIVIPSQILKYNYLHIPDDLDYKEAALVEPLACVLHGIDEINIKLGDTVAVIGCGPIGLMFVKLSSLKGARVIAADFSEYRLKQAEKFGAVKTINASYKDYPQRIKDITEESKGVDVAIEATGYPEAWENAINMIRPGGQVLTFGGTKKGTYFKIDCVKFHYEEIKIKAVYHHTPYHIKKALDILATRQVDGSEFITGEYPLSKTIDALESIGRQEGIKYAIIP >CP035282.1|QAT61850.1|2013063_2014353_-|IS110-family-transposase MDYPPVAGIDVGKNFSEMCILSPNNEIYHRIKIYHDSIDSIKEAIGLLQKAEKDFAIRPVVVLESTGHYHKILFHYLSDSGFEVSIINPIQSDSIKNIGIRKVKNDKFDAHKIALLYRFSFIKTTVVPDDVIDCLKSLCRQYYKLGDELTTYKNRLIGIIDQVMLNFTDVFQNVYSNTALAVLDRYPSPKQILKANKQTLISLIEKTSKKGLAWSTEKYELLVLKAKEFKDLSINNPGNLAILKVNISMVRTLQDAQKDILDAINEIILADSLEDNPVLAPIINLLCSIPGIGILTAATILAEVGDFSAFSSPNKLVAFFGIDPSVNQSGEFTGTRNKMSKRGSRLLRRVIFTTALANIRSKRNGDKTNPVLYEFYQKKCTNKPKKVALGAVMRKLVNIIFAVMRDKKPFELRTPEEHEELLLTRSSVA >CP035282.1|QAT61851.1|2017640_2018807_-|histidine-kinase MDERSILDMISNGENLYVEFKEESIRAKELAEEFVAFANSEGGIVLIGVNDNGDIKGIENSKIEETIMNICRNNCIPHIIPVFEEVKVGGKKVAAVSIPKGLNKPYYTVDHKYYIRVGTTKRIASREELLRLFEGTGNLHFDISPVEGTTIKDLNVDIIRDYFMKYNTFDLFEENSESTRRILINADILKEVETGTVCTVGGLLIFGKEPERYLPQNGVSFAHFKGNEITDELIDKKVITGRIQDIADQLMVIIRNNMRTPSIINGLRREEKEEYPIIVLREAIVNSLVHRNYSISGSKIRVFMFDDRIEFRSPGRLPNTVTIEKMKIGVSYARNPFLVKYMENMRYIDQLGRGIPMIIKNMKESGAKEPLLMEQGEEFILTIFKIKV >CP035282.1|QAT61852.1|2019210_2019978_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLKIRNLSKTFNIGTENEINIFDKLNLEIESKECVSIIGSNGCGKSTLLNMIGGSVLSDNGEIMLDDINLSSLKEEDRSVYIGRVYQDPSMGVASSLTILENMSLADKKGEKFTLKKLIKKDKINSYKKLLKDLDLGLENKLNTKVKFLSGGQRQALSLIMATMKYPKLLLLDEHTAALDPKTSKVIMKKTKELIKKCSITTVMISHNMKDAINYSNRIIMLDRGKIILDKPSTDVTEDELVGIYKSKLNEQGIY >CP035282.1|QAT61853.1|2019961_2020843_-|ABC-transporter-permease MNSLILTSLEQGLIFAVLAMGVVLTYKVLDIADLSVEGTFPLGAFIFAKFISMGVSPILSSFMSFCFGCSAGLLTSILFIKLKIKPLLAGILTLSILYSVNLKINGKSNIPLYKYGSIFDMGPALFVLIVIVLLVKVSLDMFLKTEIGYLLITTGDNEILVRSLGANSNKYKTMGLVLSNGLVGLSGSLMAQIQGFADITMGSSIVVVALASIIIGDTIKRSSNAVKNTTRAILGAIVYKIIGGIAIDLGLDPNALRAINAIIVIIFIAYNNIAVHLPDLRNKRGVKKSVENT >CP035282.1|QAT61854.1|2020870_2021851_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKVSLVTLILLIALVMTSCGKDSKEVSSNGEKVFKIGISQLSEHPSLDDTRKGFEDGLKELGVNAEIDYRNAQGDIPTSSAIAQKFVKDKVDLIFAIATPAAQSAKQATSDIPILFSAVTDPVKSEIVDDMKNVGGNITGTSDAAPIASQLKMFKEIDPDIKTIGILYNTSETNSEIQIEEVKKLAPEAGLKVVTVGVTNVNELPQGIDSIVKKVDALYLITDNTVASSIELVSKSLIENKMISVSSFAAAVDDGILATNGLDYYELGKQTAEMAKKILVDKEDLSSIPVGTADKTVIKVNKKTLKALGLDLNLKVFKNAVIVDK >CP035282.1|QAT61855.1|2022469_2023807_+|aminopeptidase MKEKISFENLKEFKDNFESDRANKVAMNAAATNGVIKAATNPLVFSNVRHNFSINLEQGDITNQKQSGRCWMFSALNTMRYRIIKKLNLKTFELSQNYPLFYDKLEKSNYFLESILETLDEETNGRLISFLLTAPLNDGGQWDMFVNLVNKYGVVPKYAMPETANSENTREMDGYLTKLLRQYACNIREEYKKGTTVENLRKEKKKYMENIYNILCICLGEPPKIFDFEVRDEDKKYICDKNITPVKFFEKYVGMNLDDYISLINAPTADKPYHKTYTVSYLGNVKEGRPVKYLNLEIDQLKKAAIAQLKDNLPVWFGCDVGQSSLGKQGILDLDAVKVGELFGTEFSMTKAQKLDYGESLMTHAMVFMGVDLDEKGNPIRWRVENSWGKDVGKDGYMVMSDKWFNEYMYQVVVNKKYLPKELQKEWEQEPAKLQPWDPMGSLAE >CP035282.1|QAT61856.1|2023874_2025365_-|glycerol-kinase MSKRYILALDQGTTSSRAILFDKKGNIISLSQKEFTQIYPHPGWIEHNPEEIWKTQIEAAKEAIQKVGLSPSDIASIGITNQRETTVLWDKNTGRSVYNAIVWQCRRTADLCDKIKAAGLSDYIRENTGLIVDAYFSATKIKWILDNIEGVRQRAEKGDILFGNIDSWLVWKLTGGKLHITDYTNASRTMLFNIKSLKWDENLLKELNIPSSILPEVRQSSEIYGNTDKELFGEEIPISGIAGDQQSALFGQLCFQEGMVKNTYGTGCFMLMNTGDKIVKSQSGLITTIAWGIDNKVEYAIEGSIFSAGAAVQWLRDELKIIHDAADSDYFASKVDDTNGVYLVPAFTGLGAPYWDMHARGIIVGLTRGVNRNHIIRATLESIAYQTKDVIDAMINDSEINLTTLRADGGAASNNFLMQFQSDILNANIEIPEVTETTALGVAYLAGLAVDFWKSKGEIVQNWGINRKFKPMMTPKMREKLYAGWKKAVERSKSWA >CP035282.1|QAT61857.1|2025413_2026718_-|MFS-transporter MDNQILIYGITIIATIILSIFLYKKYHLTRYQCLIFILLVLFWSAVNIVRSYRKAYAMAPVDIGGLALGGTLAANIAAAYGLISTFIRLPVFALSDYFKSRKALILFAVSAVLVTSVYVVFKPGYYSLLLSSLALGISASMLSLFNVLFAETFDSNQAMMSVSILSVAPLLAEFIMSPIQYTATKGNIKHYGEMWIVSAALSLITLIFLLFVKDNKEPTRNFSLKGFKKVVSDQRLLILSAVGILVSFIKFSSSGSNLVAFVRLKEIGMSDFLIAYIDFIYSSFQLVAGVLAGLYFKKKIGIRNTLILGLALCGIFSLTLTITTNQWVIFFTHALSGFGYGLTYNILIGVVMEPYAKNVREMTMGVYQTFFGLGIFFGDKIYAWMIDLLPDGISDYMMHIDVFTIITVITFATILLVLYLFRQSNRKFFENKSY >CP035282.1|QAT61858.1|2026932_2027625_-|hypothetical-protein MKIEVDKRYLLFGLMNIVGAILHNVNVKNVLSPKIEQRIQEQQNKALKYDETVIKNNKILEGYRAMIRKSGRSLKKYPPTAEALINNIKDRGHMPRINSIVDIYNMEVISNFLSIGAHDYDKISQTLCFTFAEGEEIFYPIGGGEKRTVRGDFLYRDENDILAYLDARDSELYKISEETKNVILIVQGNANTSKEYRENSLKQIVEQIIDNCGGQYEMFSVDCGNSIIIS >CP035282.1|QAT61859.1|2027674_2028091_-|DUF1648-domain-containing-protein MQNRIPIKFWRNIADVLVLISIILTVLALVFLGNDIVIHWTADGIPNGNMNKWMFFVFPIFTVMSSLSYNSWMKGLKEEEIGGAFTVFLTYLFVVVETHIFLLNIKLIKPSFSLLLILFVFFALFFAVLVGVRLRRNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP035282_5 | 2014767-2017341 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP035282_5
|
39 spacers
spacers of CP035282_5
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP035282_5
The CRISPR arrays of CP035282_5 >merge|CP035282|5|2014767-2017341|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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MPSISKIRFTNVVYEGGSKRYNDDIFVFEGNNGAILLENGGGKTVFIQTVLQAILPHSDLAERKIKDTLSLEGNPAHIAVEWILNERPRRYALTAVTLFLVNGKLDSYRYVYEYGSSDSNSIENIPFVRNTSNGNKRPAGREEMNDYYQYMSKEHVNAKRFSTIREYQKYIEENFKIIPMEWRRISLINGEEGGVEKFFDGCKTTESLVDRLLIPVAEEALAGNGMKDFADTFENQREHFKQHNYLKKNIDESKLIQDRIRKYVEVYKEYYYSLEKFGKKKGEGKALYEFFLDEHKKTDKELKDVEKAQNDWKSTNEKLVQKEYSYYLECIKQELEKDENEYNNCLRDYEVQKDEFSAKERRLENLEIAQLKKKIKDDEDEILIYKKQLDMLEKDEKTDEAEKQLRINSSAVSGYFDGEFNKLNGKRDEANRKREECNDNLRILREKKDSLDKEYEELVEKKGNLRGELNFSCRQMKDIESEILSNSENETIEEQYPKWTDKINFLEKDLVERRERLKEMYEEKNRINAELSSYREKQEQLSDNRGVLGEKIERIENEEKELLIKIKELISGYEHINSLYIKKEQIVAALEDKCERIRREREELLINERISHRFSDDYKDNEYFTAEPMLDSWINQWRNNFVFLESGAQYIGRAAAVLNKDETEYYQNYPYWASSVIVADNGENKLHEKLKRNIDKISCPIGILTQSKAQLLLEGGKIENDIFLYPSVWKDNIKREDFQAKKTEGQKKAESATRARKEKETELERYTKVLNKIKEFLDQYPYEDFTMLKEDYKHTDEEINTIKCNIEEGEKRVLQIDNDIKNAGNKINNLQEEQNVLNKNIVEAGKYLNFKNSVKGIKKDLFRLDFKIEENNKKKEENKKETERYRGISEKLLLELNKIKGYIDSLSKDELYMEVRDFVPEYSPISIEVLKRERKELKDVLNKKQKDRENISYNIVKISDAKEEHRKDLKNLILRAKYQSEKDMEFPIYGEAEIEDLIKSIKVLSPLLDKKEKELNRFKEKYQNIKSKYEVKEEDYFKVYDKIVEFTDSLGNVKKEIDDEKIELGKRIDYLNSMEEKWDKELKSIEEVLNNLRLKNEKYEYLSDNVISLGLSDDMIQGLPYDRMKYVSLVLNSLENIKKETEENIIKVDKEKRDFEMFCSEHISEPRLKNMALWGIKYKDKYDDIIEWQKNIDKRIDKTVNILEMDMMEHDKEISQFVKYLNSYLKSLAQEIGSISKKTRIKVDDKSKKIYIIDVPEWKEEFGKEEIRNYINIMIKDIESNEFKDEEGKEDKSSVRKYIEDKFQAKQLMKALMAGDGIKVKCRKVTNDGKVNSIPVSWEKTNSWSGGEKWSKNMTLFLGILNYLAEKKQSINFEQKRNRTVILDNPFGEASSNHVLDPVFFIAEQLGFQIIALTAHSEGKYIRDYFPIVYSCRLRPSLDKDTQIFTKEREIKYAFFKDNDPQVLSRLGEKEQLTMF 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MDERSILDMISNGENLYVEFKEESIRAKELAEEFVAFANSEGGIVLIGVNDNGDIKGIENSKIEETIMNICRNNCIPHIIPVFEEVKVGGKKVAAVSIPKGLNKPYYTVDHKYYIRVGTTKRIASREELLRLFEGTGNLHFDISPVEGTTIKDLNVDIIRDYFMKYNTFDLFEENSESTRRILINADILKEVETGTVCTVGGLLIFGKEPERYLPQNGVSFAHFKGNEITDELIDKKVITGRIQDIADQLMVIIRNNMRTPSIINGLRREEKEEYPIIVLREAIVNSLVHRNYSISGSKIRVFMFDDRIEFRSPGRLPNTVTIEKMKIGVSYARNPFLVKYMENMRYIDQLGRGIPMIIKNMKESGAKEPLLMEQGEEFILTIFKIKV >CP035282.1|QAT61852.1|2019210_2019978_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLKIRNLSKTFNIGTENEINIFDKLNLEIESKECVSIIGSNGCGKSTLLNMIGGSVLSDNGEIMLDDINLSSLKEEDRSVYIGRVYQDPSMGVASSLTILENMSLADKKGEKFTLKKLIKKDKINSYKKLLKDLDLGLENKLNTKVKFLSGGQRQALSLIMATMKYPKLLLLDEHTAALDPKTSKVIMKKTKELIKKCSITTVMISHNMKDAINYSNRIIMLDRGKIILDKPSTDVTEDELVGIYKSKLNEQGIY >CP035282.1|QAT61853.1|2019961_2020843_-|ABC-transporter-permease MNSLILTSLEQGLIFAVLAMGVVLTYKVLDIADLSVEGTFPLGAFIFAKFISMGVSPILSSFMSFCFGCSAGLLTSILFIKLKIKPLLAGILTLSILYSVNLKINGKSNIPLYKYGSIFDMGPALFVLIVIVLLVKVSLDMFLKTEIGYLLITTGDNEILVRSLGANSNKYKTMGLVLSNGLVGLSGSLMAQIQGFADITMGSSIVVVALASIIIGDTIKRSSNAVKNTTRAILGAIVYKIIGGIAIDLGLDPNALRAINAIIVIIFIAYNNIAVHLPDLRNKRGVKKSVENT >CP035282.1|QAT61854.1|2020870_2021851_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKVSLVTLILLIALVMTSCGKDSKEVSSNGEKVFKIGISQLSEHPSLDDTRKGFEDGLKELGVNAEIDYRNAQGDIPTSSAIAQKFVKDKVDLIFAIATPAAQSAKQATSDIPILFSAVTDPVKSEIVDDMKNVGGNITGTSDAAPIASQLKMFKEIDPDIKTIGILYNTSETNSEIQIEEVKKLAPEAGLKVVTVGVTNVNELPQGIDSIVKKVDALYLITDNTVASSIELVSKSLIENKMISVSSFAAAVDDGILATNGLDYYELGKQTAEMAKKILVDKEDLSSIPVGTADKTVIKVNKKTLKALGLDLNLKVFKNAVIVDK >CP035282.1|QAT61855.1|2022469_2023807_+|aminopeptidase MKEKISFENLKEFKDNFESDRANKVAMNAAATNGVIKAATNPLVFSNVRHNFSINLEQGDITNQKQSGRCWMFSALNTMRYRIIKKLNLKTFELSQNYPLFYDKLEKSNYFLESILETLDEETNGRLISFLLTAPLNDGGQWDMFVNLVNKYGVVPKYAMPETANSENTREMDGYLTKLLRQYACNIREEYKKGTTVENLRKEKKKYMENIYNILCICLGEPPKIFDFEVRDEDKKYICDKNITPVKFFEKYVGMNLDDYISLINAPTADKPYHKTYTVSYLGNVKEGRPVKYLNLEIDQLKKAAIAQLKDNLPVWFGCDVGQSSLGKQGILDLDAVKVGELFGTEFSMTKAQKLDYGESLMTHAMVFMGVDLDEKGNPIRWRVENSWGKDVGKDGYMVMSDKWFNEYMYQVVVNKKYLPKELQKEWEQEPAKLQPWDPMGSLAE >CP035282.1|QAT61856.1|2023874_2025365_-|glycerol-kinase MSKRYILALDQGTTSSRAILFDKKGNIISLSQKEFTQIYPHPGWIEHNPEEIWKTQIEAAKEAIQKVGLSPSDIASIGITNQRETTVLWDKNTGRSVYNAIVWQCRRTADLCDKIKAAGLSDYIRENTGLIVDAYFSATKIKWILDNIEGVRQRAEKGDILFGNIDSWLVWKLTGGKLHITDYTNASRTMLFNIKSLKWDENLLKELNIPSSILPEVRQSSEIYGNTDKELFGEEIPISGIAGDQQSALFGQLCFQEGMVKNTYGTGCFMLMNTGDKIVKSQSGLITTIAWGIDNKVEYAIEGSIFSAGAAVQWLRDELKIIHDAADSDYFASKVDDTNGVYLVPAFTGLGAPYWDMHARGIIVGLTRGVNRNHIIRATLESIAYQTKDVIDAMINDSEINLTTLRADGGAASNNFLMQFQSDILNANIEIPEVTETTALGVAYLAGLAVDFWKSKGEIVQNWGINRKFKPMMTPKMREKLYAGWKKAVERSKSWA >CP035282.1|QAT61857.1|2025413_2026718_-|MFS-transporter MDNQILIYGITIIATIILSIFLYKKYHLTRYQCLIFILLVLFWSAVNIVRSYRKAYAMAPVDIGGLALGGTLAANIAAAYGLISTFIRLPVFALSDYFKSRKALILFAVSAVLVTSVYVVFKPGYYSLLLSSLALGISASMLSLFNVLFAETFDSNQAMMSVSILSVAPLLAEFIMSPIQYTATKGNIKHYGEMWIVSAALSLITLIFLLFVKDNKEPTRNFSLKGFKKVVSDQRLLILSAVGILVSFIKFSSSGSNLVAFVRLKEIGMSDFLIAYIDFIYSSFQLVAGVLAGLYFKKKIGIRNTLILGLALCGIFSLTLTITTNQWVIFFTHALSGFGYGLTYNILIGVVMEPYAKNVREMTMGVYQTFFGLGIFFGDKIYAWMIDLLPDGISDYMMHIDVFTIITVITFATILLVLYLFRQSNRKFFENKSY >CP035282.1|QAT61858.1|2026932_2027625_-|hypothetical-protein MKIEVDKRYLLFGLMNIVGAILHNVNVKNVLSPKIEQRIQEQQNKALKYDETVIKNNKILEGYRAMIRKSGRSLKKYPPTAEALINNIKDRGHMPRINSIVDIYNMEVISNFLSIGAHDYDKISQTLCFTFAEGEEIFYPIGGGEKRTVRGDFLYRDENDILAYLDARDSELYKISEETKNVILIVQGNANTSKEYRENSLKQIVEQIIDNCGGQYEMFSVDCGNSIIIS >CP035282.1|QAT61859.1|2027674_2028091_-|DUF1648-domain-containing-protein MQNRIPIKFWRNIADVLVLISIILTVLALVFLGNDIVIHWTADGIPNGNMNKWMFFVFPIFTVMSSLSYNSWMKGLKEEEIGGAFTVFLTYLFVVVETHIFLLNIKLIKPSFSLLLILFVFFALFFAVLVGVRLRRNK >CP035282.1|QAT63429.1|2028207_2028792_+|SOS-response-associated-peptidase MCGRFSLDVDIDFLIDRYKVIKKIGEFNSKDEIFPTDFSPVIINRGYNELRVLKWGFMPSFAKRPIINSKSETVDIKPTFKNSFYNKRCLIPATSFFEWEKSGDNKIKRRIYVKGEDIFSMAGLYNIFRDDNGVEYYAFTILTTDSNEEMKSIHYRMPVILPKDKEDLWLNINIKNPVILKELLKPYEQSLLIK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP035282_6 | 2030653-2033682 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of CP035282_6
|
46 spacers
spacers of CP035282_6
>6.1|2030682|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGCAGGTATTTTAAACGGCCATAGAGCTCTCCCGAA >6.2|2030747|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCCCGTCGATAAAAACATATCCGCTCCCGTGACAA >6.3|2030812|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTCTAAAAAGCTAAGTAATAGTTTTATATAGCTG >6.4|2030877|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAAACCTCCTTTTAATAATGGCTATCTTAATTA >6.5|2030941|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACAGGAAACCAAGGAAAAATTCTAAAAGGACAAG >6.6|2031005|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGGCATTTTTCTTATTAATTTTATTTTCTCGTCGT >6.7|2031069|37|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGGATTCTAATTCTCTTTGCCTTAGCTCCATTTTTAT >6.8|2031135|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCGTTTTGGACAGAAAAAAACTGCTATAGAGCCGT >6.9|2031200|38|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATACATCATTTATACTTTACCTCCCTTTCTCTCTAAA >6.10|2031267|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGACAATGCGCCACGGAACTTTGCACAAAAGGATA >6.11|2031332|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTTAAATAAAGGGAGGAATTAAAATGAATTTAAT >6.12|2031396|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTAGCGTCGGATGCTATGGGAAAAAACAAAACAT >6.13|2031461|37|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCTACACTGTTCCCCTCAAGGGCGCAAAAAACATTG >6.14|2031527|37|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTATAAAAGTTCATGAACCGTAACACGTGGTGTATT >6.15|2031593|37|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGGAAAGCGGAGAAGTAGAGGACAAATCAAAAGCAAA >6.16|2031659|37|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGAATTTTTCTATTTCCTCTTTGTTCGGCCTTCCTG >6.17|2031725|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTCGCAACCTTGTAAAAAAGCGTAGAGGGAAATTT >6.18|2031790|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCATCTCTTGCCTGTCCATCTTCTTAATCTTTTTA >6.19|2031855|39|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGAATAAAGAAATAGAGTTATTGAAAGAACAAATAGA >6.20|2031923|38|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGAAAGAAGATGTTCAGAGAATAGGTTCCAATATTCT >6.21|2031990|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACACATTATCTGAAACAAGTTCCGGTTTCATCCGGC >6.22|2032055|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCTTTGCTTCCTCATTCTTTGTTTTCCTCCAGCAA >6.23|2032120|37|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTATGAGAATAAGGCAGATGCCCCTATAATTTGTG >6.24|2032186|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACTCTAGCCCATTTTTGTTTTTCAGCATTTTCGTC >6.25|2032251|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCAGAAGATTTAAGAGAGTTAGCTGATACTTTAGA >6.26|2032316|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGATAATGCCTTACCGTTCTTCCTTGGAATCATGA >6.27|2032381|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTGAGCTTCTTTCACTTCTTATCACTCCTTTTA >6.28|2032446|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTGAACGTCAAGCTAAAATACAAGAATTACTTAT >6.29|2032511|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGGAAAGGTGATAAAATGGATAACATGGAAAATAT >6.30|2032576|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGTGCAAGGATTGCCTCAATACAGCTATAGAAAA >6.31|2032640|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAATTCTGAATAGCGTTCATCCGTTGCAGTTCAT >6.32|2032705|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTCGTTGACAGAGGAATAATGAATCCAAATGAAG >6.33|2032770|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCCTATCTGTCAACCTTAAAATTTGATATCCATGAT >6.34|2032835|37|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTCAACTGTTGTGATCTTAGCGGCCATTCCTGCGTT >6.35|2032901|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GACATGTCAAGATAGACTACAAAATTTCAAAATGA >6.36|2032965|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATCTTCGTTCTGCATATCTGCCGTTTTAGGGCCTA >6.37|2033030|37|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTACAAAGCGGGGGTAAGGGGCCGCTTTGAATTAAT >6.38|2033096|38|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTTTTGAAGGAAGTATAGAAGAATTTGAAAAGAAAG >6.39|2033163|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACACTGTTCCTTTTTGCCCCGTAAGCTTATGTGCTA >6.40|2033228|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAGCGGATTAAAGGGCTTATACGTTGACAATACTA >6.41|2033293|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGACGCTCAGTGCAGGAAACGGATTAAGAAAATGA >6.42|2033358|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATTTCCTTGTATTTGGTTGCGTGAATAGAAAACA >6.43|2033422|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAATCGGACACAAAGGGAAGTGTAGATTATGGCAAA >6.44|2033487|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGTGGATTCCTAAGAACACCAGCCTATCGGCTAGT >6.45|2033552|37|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAGGAAGAATGTTTGAAATGCCTTCTTTCATAGAAA >6.46|2033618|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGACAGAAAAAGAAAAATGAAATTTACAAAAAATT |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP035282_6
The CRISPR arrays of CP035282_6 >merge|CP035282|6|2030653-2033682|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>CP035282.1|QAT61861.1|2030336_2030561_+|hypothetical-protein MNNKKLTFEEFMKLPEQEKGEAYKKLSDEDKFKARLGQNPGGTTIGYKPLKEGEKEKYHKEFIQFLKEKHGIDI >CP035282.1|QAT61860.1|2028818_2029952_-|alanine--glyoxylate-aminotransferase-family-protein MKKSLIMTPGPTEVHEDVRRAMAQSITNPDLDVNFFEYYKETCGKLKKLLNTKEDVLILDGEGILGLEAACASLIEPGDKVLCIDNGIFGKGFGDFAKIYGAEITYFKGNYRRSIDLKELENFLEKDNDFKLATLVHCETPSGLTNPVSKICPLLKKYGIITVVDSVSGIGGEPLKVDKWQIDVVLGGSQKCISASPGLTFLSISKKAWDIILNRKTPIASFYCNLAIWKNWYEEKYFPYTPPISDIYGLNCALDRVFKKGDYIERHKKIGTAVREAIMKSELELYPIDGYSNTVTAILIPKGITFSDIYNHMVEEHNIMIGGDFDCLKDKVIRIGHMGENCYEEKVYITLKALDETFKKYGININGSLHKYFADAM >CP035282.1|QAT63429.1|2028207_2028792_+|SOS-response-associated-peptidase MCGRFSLDVDIDFLIDRYKVIKKIGEFNSKDEIFPTDFSPVIINRGYNELRVLKWGFMPSFAKRPIINSKSETVDIKPTFKNSFYNKRCLIPATSFFEWEKSGDNKIKRRIYVKGEDIFSMAGLYNIFRDDNGVEYYAFTILTTDSNEEMKSIHYRMPVILPKDKEDLWLNINIKNPVILKELLKPYEQSLLIK >CP035282.1|QAT61859.1|2027674_2028091_-|DUF1648-domain-containing-protein 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MSKRYILALDQGTTSSRAILFDKKGNIISLSQKEFTQIYPHPGWIEHNPEEIWKTQIEAAKEAIQKVGLSPSDIASIGITNQRETTVLWDKNTGRSVYNAIVWQCRRTADLCDKIKAAGLSDYIRENTGLIVDAYFSATKIKWILDNIEGVRQRAEKGDILFGNIDSWLVWKLTGGKLHITDYTNASRTMLFNIKSLKWDENLLKELNIPSSILPEVRQSSEIYGNTDKELFGEEIPISGIAGDQQSALFGQLCFQEGMVKNTYGTGCFMLMNTGDKIVKSQSGLITTIAWGIDNKVEYAIEGSIFSAGAAVQWLRDELKIIHDAADSDYFASKVDDTNGVYLVPAFTGLGAPYWDMHARGIIVGLTRGVNRNHIIRATLESIAYQTKDVIDAMINDSEINLTTLRADGGAASNNFLMQFQSDILNANIEIPEVTETTALGVAYLAGLAVDFWKSKGEIVQNWGINRKFKPMMTPKMREKLYAGWKKAVERSKSWA >CP035282.1|QAT61855.1|2022469_2023807_+|aminopeptidase MKEKISFENLKEFKDNFESDRANKVAMNAAATNGVIKAATNPLVFSNVRHNFSINLEQGDITNQKQSGRCWMFSALNTMRYRIIKKLNLKTFELSQNYPLFYDKLEKSNYFLESILETLDEETNGRLISFLLTAPLNDGGQWDMFVNLVNKYGVVPKYAMPETANSENTREMDGYLTKLLRQYACNIREEYKKGTTVENLRKEKKKYMENIYNILCICLGEPPKIFDFEVRDEDKKYICDKNITPVKFFEKYVGMNLDDYISLINAPTADKPYHKTYTVSYLGNVKEGRPVKYLNLEIDQLKKAAIAQLKDNLPVWFGCDVGQSSLGKQGILDLDAVKVGELFGTEFSMTKAQKLDYGESLMTHAMVFMGVDLDEKGNPIRWRVENSWGKDVGKDGYMVMSDKWFNEYMYQVVVNKKYLPKELQKEWEQEPAKLQPWDPMGSLAE >CP035282.1|QAT61854.1|2020870_2021851_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKVSLVTLILLIALVMTSCGKDSKEVSSNGEKVFKIGISQLSEHPSLDDTRKGFEDGLKELGVNAEIDYRNAQGDIPTSSAIAQKFVKDKVDLIFAIATPAAQSAKQATSDIPILFSAVTDPVKSEIVDDMKNVGGNITGTSDAAPIASQLKMFKEIDPDIKTIGILYNTSETNSEIQIEEVKKLAPEAGLKVVTVGVTNVNELPQGIDSIVKKVDALYLITDNTVASSIELVSKSLIENKMISVSSFAAAVDDGILATNGLDYYELGKQTAEMAKKILVDKEDLSSIPVGTADKTVIKVNKKTLKALGLDLNLKVFKNAVIVDK >CP035282.1|QAT61853.1|2019961_2020843_-|ABC-transporter-permease MNSLILTSLEQGLIFAVLAMGVVLTYKVLDIADLSVEGTFPLGAFIFAKFISMGVSPILSSFMSFCFGCSAGLLTSILFIKLKIKPLLAGILTLSILYSVNLKINGKSNIPLYKYGSIFDMGPALFVLIVIVLLVKVSLDMFLKTEIGYLLITTGDNEILVRSLGANSNKYKTMGLVLSNGLVGLSGSLMAQIQGFADITMGSSIVVVALASIIIGDTIKRSSNAVKNTTRAILGAIVYKIIGGIAIDLGLDPNALRAINAIIVIIFIAYNNIAVHLPDLRNKRGVKKSVENT >CP035282.1|QAT61862.1|2033844_2034108_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYIILVYDFGENRVAKALKTCRKYLTWVQNSVFEGEITEGDLKKLKIELENKMNKNEDSLIIYTLSNDKYSNKEIIGCEKNKPTIFF >CP035282.1|QAT61863.1|2034121_2035114_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKDMFIFNNGRLCRKDNTLMFEGEEGKKYIPVNNVESIYIFGEVDVNKNFLEFVCSNKITIHFFNYYEYYVGTFYPREYLNSGYVILKQSEAYLNYEKRVIIAKTFIDGAIKNILQVLKYYERRNSNLEGEIEEITNLLDTLQLQSTIETIMAIEGNVRQVYYKSFNKILDDEDFTFTSRTKRPPKDRINSLISFGNSMLYTLVLSQLYQTQLDPRIGYLHSTNDRRFSLNLDVAEIFKPIIVDRTIFSVINKKIITKKDFNKDLGSIILSDEGRMKFIKEFNEKLETTIKYPNFPNRVSYKRLIRLEAYKLQKFITEDEQYLPFIAKW >CP035282.1|QAT61864.1|2035127_2035619_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MEVNGTLIWYYNICKREVWLMSRNIVPDQNDENIDFGRFLHEQTYKRNKKEIAFGNVKFDVILSTKEKLVIGETKKTSKYSQASKWQLLYYLKVLKDAGIDAEGVLLYLEEKKRTEIILNEETLQELEVMKNSIVDIMQNETPPKVEKCKFCYNCGYNEYCYS >CP035282.1|QAT61865.1|2035678_2038033_-|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MEFYSHPDMKLIVHLSQVKEYSLIYGNKEYSKINEIVACGHDFGKYTTYFQDRLFKREKGEKPEGNHAHISAVFTAYVMFNREMGEGVLPLIAYNAVLSHHSRVKNFEKYLPMSYHGNKINKSDAMYWKLQILNKQKQNIKENYTDIYNEYKSLGFGEDFKAFMDDENSIEKTLILLRKKILLLYDEKDAYWIHQQIFSTLIASDKVSASKVKPFEQKFIGYSELNKIREDEFSNKEKNEINNMRNSILKRVQENISKNCNKKVFSITAPTGSGKTMTGFFAALKLKELNSELKKVIYVLPYTSIIDQNYNDIRDLYIADENVKGSEYHYIMKHHHLSDYEKDRDDEIYNAVDYQTFMENWESGVIVTTFVQFLETAIGAKNKMLKKFYALKDSIVLMDEVQAVNIKYFELLNYVFTELAEELNCHIIIMTATKPLFFPKAFELLDSDIYENYCEKFNRTQIVCKLDEGMTLEGFCDYFSKNRRDKSYMIVVNTIGQSLELYKLIKETLENNNEYGHQLYYLSTNLIPKHRVERINLIKKKLKSKEKVILVTTQVVEAGVNLDFDEVYRDIAPLDSIIQCAGRCNRNNRGFIGNVNLIKMVGEDGRTFGEKIYGLDTINVVDEILGPYEKVEEKDYLQLINEYYKKISDIKSQQPSKNFIKSIQEMNFDENDKWEVGHFSLIEENRGYLDVFIEYDEKAEDLLEEYRNCYEIQNINERQKKLIPIKKEMQQYFISMPEKYWRTLDKFTVTPEYEILYIPRIGIGSYYDDMTGYKREEDDSMFFF >CP035282.1|QAT61866.1|2038043_2038778_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKGVVFDIEGKFAHFRKFYTNSSSLSYSLPPRTTVEGLIASILGYERDSYYKVLSSNKLHIAVKKNGPTRSLTQTLNYIKATSASQLCFPDEHTQIPFEIITGCNDDSIVSYRIYAASEEGFMEELQERLIKNKFAYPPCMGTVFFQGDIENVQRCEIYSEKSNEYVPISSVVPSEKIENIKIENYQLVKERMPRDFDENREIKKSGTYIFDHRGVKIDLKLKNDYYVVKSGEESYKSENILFM >CP035282.1|QAT61867.1|2038787_2039678_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MNNGQILYLYDAKLTNPNGDPDEENRPRMDYERGLNLVSDLRLKRYIRDYLNDKGYILYVQKVDGEPVTSAARVKEFVEDGKIDKDSFEELKNTFIDVRLFGATITSKDNKALTGPVQFNWGCSLNKVELLESSITSHFASSDTNKQGAIGKDYRVKYSMIAFSGVISGRRAEKTNLREEDIFLLDEALYKAIPLLATRSKIGQYPRFYLRLDFKDTETILRDLRSYIKLNPDDSSIRDVNECSLDITKLVAYLNENRDSINKIYYFYDEALSLENKGEKILLEKALENFNIIKIQ >CP035282.1|QAT61868.1|2039670_2041611_-|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MLEEIIEIGEKILAEQDIIDSRIVKVNIEDDKNNPKKIVIIDFDTANKKVNFKVKEMDENTVSQYLNLGRDGGPNANQWYVTFTNSVSLTSEVVSQLAEKEIPADIKEKLNLITDEFYYDFGEDVTPKYRYMLDWYKIGVISESLKEIYEKYKDESKPYKEVQSYLQKELQKYLEKSKGAKKKQIGLYTLSIDGQAVGSSKWYRDLVKKRLTVQERSSMESKELYCSFCGSKEECTSDLSEMSIKYYTTNQLIFANNFDRKNYDKNMVLCKSCKDKLLTGEKFVQNHMQGKISKLDVYIIPHIIYSSYEFKQKDLYRLSDKLKQTINTANNIENLKIYKYGLQELNEAVGEGNHYLINFAFYKKMNQATKILKLIKDINPGIFEKIGESINEAQFTFEKYFQLIPKRKYQRGLNLVYYMTPIRLSQKVPTQYQNVLNIYEALFYGRKLNREEIISNITECLKINWFEQVDYNVSSPNSKDFIDFRISDGLYYMLFLENMGNVERSKIMDVSKLNLKDNYKGYITDMRYDDQQASLFLLGCLVGAVGRSQNSKAAAADNSGTYKPILNKINFNGMDFVKVKRLSNEILNKLRQEKILRYTEAIFSAHKMLMGLNEKNWKYNKDENLYYILSGYAYETMKKKEEKKDE >CP035282.1|QAT61869.1|2041642_2042401_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MMRMLCKITFSSNDKIFLPMSYNYIIQGVLYKFINEDSFADFMHNKGYTYNKRSYKLFSFSNVLEKPLLVDREKKHFVFPKDISIYFSSIDNEFFKYVFNSIINTEDFIYVSQNRTSISKVELIKQKISEKEVIKTMSPITTYSTFVTFENSKKTYYYNPYEKEFSTNIQKNLINKYQALYDEPPQNSEFSIVPRGTPHEKIIKYKDFIIKGYTGIFEIEGSKELMDMAFCAGLGSKNSQGFGLIIKNDLDK >CP035282.1|QAT61870.1|2042636_2043068_-|hypothetical-protein MTNKIEYKIQKFNTEDNLKIGLNVVEWSIENNLIQQGFTALEETIRTYVCNETDRNNRERIAKIALMIKSEAITEKNLSTDVKGKVKRIADRLDPEIAKLSYQVSQKRNSINHFEFSDDSNDYNSLKRDLKKYYKEFKKIIEI >CP035282.1|QAT61871.1|2043159_2043924_-|AAA-family-ATPase MKVKLNEEIKEYCNILKLKGIKTHYEEVISEAADYEDFLHKLLTYEMEEKDKRSIECRIRNAHLPYRQYIEDIEIDCLPVDMQKRLPELATLDFIEKGKNIIMTGNPGTGKTMVSIALALKACMAGYKVLFTTIPLLVTTLKESNSAKTLRYFENRFEKYDLVVADELGYTSFDREGTDLLFNNLSLRAARKSTIITSNLSFERWIEVFGDPTVTSAMIDRLTYKAILVDMEGDSYRLRETLRENGASIKSLTA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP035282_7 | 2045608-2049209 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of CP035282_7
|
54 spacers
spacers of CP035282_7
>7.1|2045638|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT CTGCATTAATTATATTAAGTTTATAATTGTTTAATAT >7.2|2045705|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGCTCCAGCTATCTATTAAATCCTGTTCATTTAGGT >7.3|2045771|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATCGTTTGTTATCCACCTTTGAACATATTTTTGTATA >7.4|2045838|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAAATCCTTCTTTGCAGGAATACCGGCGTTCTTTGC >7.5|2045905|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGAGTATTACTTGTCATATATTCCGACATTCCTAA >7.6|2045970|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAATTCCTACCTTCGCCATTAAGGTTAGATTTGCTA >7.7|2046036|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAGCCAGAATTGAAATACTACCAGGCGGTTGAAT >7.8|2046101|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGAGAGAAATTAAGTTTAGAGGCAAGCGGTTAGATAA >7.9|2046168|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTCATAAATCATCTAATAGAATTTGTAATAAAGAA >7.10|2046234|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCTGCCTCTGCATTCTCTTTTTCTCTTCTTTCCTGC >7.11|2046300|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTGCTTTTGCAATTGGGAAGTATTGTAGTCATCA >7.12|2046366|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGAAAGGCTTGAATAGAGAATTGCTCTGCTATTGTA >7.13|2046432|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTACCACGTTGCTCATACATTTCTTGCAAAAATTC >7.14|2046498|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACAATAAATCTTGTGTATCTTTGCAAGTGCAAACAAG >7.15|2046565|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCCATGCCGTATATATTAGTATTTGCAATGCTTTCA >7.16|2046631|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGCCGGAGTTTATATCTACTTCTACATCTTCACCGT >7.17|2046697|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGTGTAGATAGGCTTTACAAGGTTGATAGAGATAC >7.18|2046763|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAAGCCGTTTATCAAATCGATAGGCGGCTTTGGTTTA >7.19|2046830|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGAATGAAACAAATATAAACAATCCTGATATAACTTT >7.20|2046897|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTATCCGGTTAAATTCCGGATATCCTTTCGTAAGCA >7.21|2046963|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTTTTATCCAAAATCTCTATATTCGCATAGAGATC >7.22|2047029|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGGTCACCATTCATCATACAAACTTGATAATTTGCAT >7.23|2047096|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATGTAGAAACTGTCATAGCAGTTTTAAAAAAGAA >7.24|2047161|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CATATGTTTTACAATTCACTTGTTTTCATTATTATT >7.25|2047227|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCCTTGCAAGCCCTGCTACTTCTGCCGCCAATTCA >7.26|2047293|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAGGATAATTCCTTATATAATCGTATCCTTCCCGTCC >7.27|2047360|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGTCTATCACCTTTGCGTCATTATCTCCCATTTCC >7.28|2047426|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACCTTTGTAATTTTCCAGCATCCCTGTCCAGGATAC >7.29|2047492|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGAGCAAAACAGGAATCACTATGGTAATGCGTATGTA >7.30|2047559|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTTATGAATATTCTCTTATTCCCCTTTTATACAAA >7.31|2047625|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTATACAGCAGAGGAGTAAATAATTTATTGCAGCAA >7.32|2047691|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGATTAAAGCACAGATAAACGTCTTGGCATTCTTA >7.33|2047757|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTGTTTATGTTGTAGAGGAAGAAATACAGATTATAGA >7.34|2047824|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATAAAATATATTTACAAGATGCTTGTTTACATTC >7.35|2047889|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTAACCTTGTTTCTTTTATTTCTTTATATTTTTC >7.36|2047955|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCCCATCAGGAAAGATATACCAATACCAATTTCCTTT >7.37|2048022|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGATAATATCATCACACAGCTGAAATATTGTTATGG >7.38|2048088|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGGGGGATTATTCCCCCTTGGCCTATAAAAGTAGG >7.39|2048154|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAACAACGGTTTAAGGGGAATGCTCGATAGCTTTTA >7.40|2048220|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCCTCTATTTCTCTCTCCATTTTCTTTTTCAGCAA >7.41|2048286|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATGTAACTAAGATTGATTGGGATGTATTCATAGAT >7.42|2048352|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTTTCTTGCTACAACTAACATTACCTCCCTGAA >7.43|2048417|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCATTCGGAAAGGCTTGATAAAATAGAGCTTGCAAA >7.44|2048483|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTATACCTTCTCCACGCTTTCCGCTAAAAAAAGTAT >7.45|2048549|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGAATTTGCTATCTGTGATAACCAGGTCGTAAATA >7.46|2048615|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTATCTCACCCCCTTTACAATAGCCTGTCCATCATA >7.47|2048681|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCAATTACGTTGGCAGTAGAAAGAGGTATTTGCTCT >7.48|2048747|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAACAGAAACGGGGCAGTCGGAAGGGCAAAATTGCT >7.49|2048814|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCATATACTCCAAAAGAAACCACGGAGTACGAGAAT >7.50|2048880|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATATACATAAAAAAATTACATCACGATTGACAAA >7.51|2048946|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATAGAAGAAAAATACAATGTAACAGTAATGGGGAT >7.52|2049012|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTTAGCATTGTATATTGACACTCCTTTCAAGCTG >7.53|2049078|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATACCACCTCGCTTTTAATTGTAAAATTTTAGGGT >7.54|2049144|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAAATGAGTATATTCTTTGAGTAGTTTTATCCATC |
cas6,cas8b1,cas7,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,cas8b2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP035282_7
The CRISPR arrays of CP035282_7 >merge|CP035282|7|2045608-2049209|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGCATAAACAACTGTAGTTCTATTAAAACCTGCATTAATTATATTAAGTTTATAATTGTTTAATATATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACCGCTCCAGCTATCTATTAAATCCTGTTCATTTAGGTATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACATCGTTTGTTATCCACCTTTGAACATATTTTTGTATAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACTAAAATCCTTCTTTGCAGGAATACCGGCGTTCTTTGCATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACCGAGTATTACTTGTCATATATTCCGACATTCCTAAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACAAATTCCTACCTTCGCCATTAAGGTTAGATTTGCTAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACTAAGCCAGAATTGAAATACTACCAGGCGGTTGAATATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACTGAGAGAAATTAAGTTTAGAGGCAAGCGGTTAGATAAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACATTCATAAATCATCTAATAGAATTTGTAATAAAGAAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACGCTGCCTCTGCATTCTCTTTTTCTCTTCTTTCCTGCATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACATTTGCTTTTGCAATTGGGAAGTATTGTAGTCATCAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACTGAAAGGCTTGAATAGAGAATTGCTCTGCTATTGTAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACTGTACCACGTTGCTCATACATTTCTTGCAAAAATTCATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACACAATAAATCTTGTGTATCTTTGCAAGTGCAAACAAGATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACGCCATGCCGTATATATTAGTATTTGCAATGCTTTCAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACCGCCGGAGTTTATATCTACTTCTACATCTTCACCGTATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACGAGTGTAGATAGGCTTTACAAGGTTGATAGAGATACATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACGAAGCCGTTTATCAAATCGATAGGCGGCTTTGGTTTAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACTGAATGAAACAAATATAAACAATCCTGATATAACTTTATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACCTATCCGGTTAAATTCCGGATATCCTTTCGTAAGCAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACCTTTTTATCCAAAATCTCTATATTCGCATAGAGATCATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACTGGTCACCATTCATCATACAAACTTGATAATTTGCATATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACGATGTAGAAACTGTCATAGCAGTTTTAAAAAAGAAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACCATATGTTTTACAATTCACTTGTTTTCATTATTATTATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACTTCCTTGCAAGCCCTGCTACTTCTGCCGCCAATTCAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACCAGGATAATTCCTTATATAATCGTATCCTTCCCGTCCATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACAAGTCTATCACCTTTGCGTCATTATCTCCCATTTCCATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACACCTTTGTAATTTTCCAGCATCCCTGTCCAGGATACATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACTGAGCAAAACAGGAATCACTATGGTAATGCGTATGTAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACACTTATGAATATTCTCTTATTCCCCTTTTATACAAAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACGTATACAGCAGAGGAGTAAATAATTTATTGCAGCAAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACAGGATTAAAGCACAGATAAACGTCTTGGCATTCTTAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACGTGTTTATGTTGTAGAGGAAGAAATACAGATTATAGAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACAATAAAATATATTTACAAGATGCTTGTTTACATTCATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACTTTTAACCTTGTTTCTTTTATTTCTTTATATTTTTCATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACGCCCATCAGGAAAGATATACCAATACCAATTTCCTTTATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACAGATAATATCATCACACAGCTGAAATATTGTTATGGATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACGAGGGGGATTATTCCCCCTTGGCCTATAAAAGTAGGATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACCAACAACGGTTTAAGGGGAATGCTCGATAGCTTTTAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACTTCCTCTATTTCTCTCTCCATTTTCTTTTTCAGCAAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACGATGTAACTAAGATTGATTGGGATGTATTCATAGATATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACTTTTTTCTTGCTACAACTAACATTACCTCCCTGAAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACTCATTCGGAAAGGCTTGATAAAATAGAGCTTGCAAAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACGTATACCTTCTCCACGCTTTCCGCTAAAAAAAGTATATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACAAGAATTTGCTATCTGTGATAACCAGGTCGTAAATAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACTTATCTCACCCCCTTTACAATAGCCTGTCCATCATAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACTCAATTACGTTGGCAGTAGAAAGAGGTATTTGCTCTATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACAAAACAGAAACGGGGCAGTCGGAAGGGCAAAATTGCTATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACGCATATACTCCAAAAGAAACCACGGAGTACGAGAATATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACTAATATACATAAAAAAATTACATCACGATTGACAAAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACAATAGAAGAAAAATACAATGTAACAGTAATGGGGATATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACAATTTAGCATTGTATATTGACACTCCTTTCAAGCTGATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACTATACCACCTCGCTTTTAATTGTAAAATTTTAGGGTATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAACAAAAATGAGTATATTCTTTGAGTAGTTTTATCCATCATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAAC >CP035282|7|7|2045608-2049209|CRISPRCasFinder TAGCATAAACAACTGTAGTTCTATTAAAAC CTGCATTAATTATATTAAGTTTATAATTGTTTAATAT ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAAC CGCTCCAGCTATCTATTAAATCCTGTTCATTTAGGT ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAAC ATCGTTTGTTATCCACCTTTGAACATATTTTTGTATA ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAAC TAAAATCCTTCTTTGCAGGAATACCGGCGTTCTTTGC ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAAC CGAGTATTACTTGTCATATATTCCGACATTCCTAA ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAAC AAATTCCTACCTTCGCCATTAAGGTTAGATTTGCTA ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAAC TAAGCCAGAATTGAAATACTACCAGGCGGTTGAAT ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAAC TGAGAGAAATTAAGTTTAGAGGCAAGCGGTTAGATAA ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAAC ATTCATAAATCATCTAATAGAATTTGTAATAAAGAA ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAAC GCTGCCTCTGCATTCTCTTTTTCTCTTCTTTCCTGC ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAAC ATTTGCTTTTGCAATTGGGAAGTATTGTAGTCATCA ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAAC TGAAAGGCTTGAATAGAGAATTGCTCTGCTATTGTA ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAAC TGTACCACGTTGCTCATACATTTCTTGCAAAAATTC ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAAC ACAATAAATCTTGTGTATCTTTGCAAGTGCAAACAAG 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>CP035282.1|QAT61872.1|2043925_2045509_-|IS21-family-transposase MIKLNQKQKIILKHIDGMSNRSIASELHMSKDTVNKYVNEYENQKQELLAKNPETDTKELIQAIVEKPKYNSENRGPNKVTSEMIEVIEECLKVNEWKRANGMSKQQMRKIDIHEYLLKKNFNISYSSVKRLVKTIEDRHREAFIRQEYVLGDVCEFDWGTAKLDIGGEGYKAYQMAVFTPAKSGIRYSMLFKSQDTPAFQQSHAEFFSFCKGNFRTMVYDNMRVAVKKFVGLFEKEPTKALTELSIYYGFNFRFTNIAKGNEKGHVERSVEYVRRKVFSEPGNDKFDTLAEANKFLFEECMKLNNKETSNGLVPMEIFKEEQKHLFPNLPKFESSIYSENRVDKYSTVTVSQNHYSVPDTLVGKMVKVKMFTDKIIIYYDNSIVAKHDRSFKLHDWKIEIHHYLRTLHKKPGALKGSTALLQTDTQIKYIYEQYYTKDAKTFLQVLEIIYEKGIHAVTEALRELEKLSPMDMSADKVKVICESRKEKEICVTVPLNDHLTEKSRSTLSIYDKLAALQSRKLNKEAV >CP035282.1|QAT61871.1|2043159_2043924_-|AAA-family-ATPase MKVKLNEEIKEYCNILKLKGIKTHYEEVISEAADYEDFLHKLLTYEMEEKDKRSIECRIRNAHLPYRQYIEDIEIDCLPVDMQKRLPELATLDFIEKGKNIIMTGNPGTGKTMVSIALALKACMAGYKVLFTTIPLLVTTLKESNSAKTLRYFENRFEKYDLVVADELGYTSFDREGTDLLFNNLSLRAARKSTIITSNLSFERWIEVFGDPTVTSAMIDRLTYKAILVDMEGDSYRLRETLRENGASIKSLTA >CP035282.1|QAT61870.1|2042636_2043068_-|hypothetical-protein 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MGETFYIINNGDLRRKDNNIIITGTNGESKNLKVEVADEIYIFGEVNLNTKVLNFLSQNRIILHVFNYYGFYSGSYYPRETNVSGYLLVNQVRHYDNYEKRIVIARKILNASAHNIYRNLRYYNGRGVELEQFMSQIELLANTIDDGNSIEEIMGIEGNIRKIYYSSWNNIIKQNVKFDKRVKRPPDNMVNSLISFINSLVYTTTLSEIYKTQLNPTISYLHQPGTRRFSLSLDLSEIFKPLIADRMIFSMLNKNQITENDFDKDSNFLYLRENAKRKILAEYDNRLKNTIFHKELGRDVSYQYLIRLECYKLIKHLIGEKEYEAFKMWW >CP035282.1|QAT61874.1|2050684_2051176_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKNITGVMVYYYFVCKRKLWYFNKEINMEFNSELVGMGKLIDENSYGREKKSILIDETINIDFLKDWKIIHEIKKSKKIDIASKWQLKYYIWILRNKGVDIEKGVLDYPLLRKREDIFLTKKEEEGLLHVLDDIQNIIAMGLPPEIINKKTCKKCAYYEICFI >CP035282.1|QAT61875.1|2051187_2053440_-|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MKEFLAKTNPKETIQEHTDQLLKNYNLLKSAYPNLNVDWDMLYMACVYHDLGKINRKFQNRLKHGKRDDSEIPHGILSLAFINYEELENNGYSEEDISVLFHTVGYHHDRKLDFSLKDVDDEIELMQNEIDDFKYDKFKEVILNNTIEEEFFILKDRIYRRNGEEKFFKYIMLKGLLNRIDYAASAHLPVENENNFLLEGMENLLNNWKRENPNSEWNKLQKFMIENRNRNTIVAAQTGMGKTEAGLLWIGNNKGFFTLPIKTAINSIYKRIIENIVTDNFSNKVGLLHSDIMSVYLNTQREEVVEIDIQEYFNKTKQLSLPLTICTIDQTFDFVYRYKGFEPKLATLSYSKVVIDEIQMYSPLLLSYLIVGIKYITQIGGKFSILTATLPKFIVEILKDEKIEFVYPKEGPFIDTTMNRHRIKVIQEDINSEYIKKLYNKNKVLVICNTVKKAQEIYINLKKDKVQNINLLHARFILSDRKDKEKEITDLGKKESKNYGIWISTQIVEASLDIDFDLLITELSDLAGLFQRMGRCYRNRELDNDEFNCHVFIGTDDKKCSGVGRIIDKDIFNLSRKYIINKKGIFTEQEKMDMVDEVYSMDKLKDTDYYKELCKNIDYLQSIEDFEKEKSEVQKKFRNIDSETVIPLKVYEENIDIINECITIVNQKFDECMNEREKKDLKLRKISSKDRLMGFTVNIRGEEVKDYKEKELRINKYESIPIVRCKYDNEIGVLFSNEDKNKNIRSTNMF >CP035282.1|QAT61876.1|2053454_2054213_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MITMKGIRIKLQQDMVNYKKPNSFQLKETYPLPPYSTIIGMVHELCGFKEYNDMRISVVGKYNSKVNDLYTRYEFSNGIKYENGRHQLKAGEYGISRGISTVELLVDVELIIHIIPVDQSLVEKIEKAFLFPIEYPSLGRREDIAIINEVKVVDIIEDKIKKTVRMNEDYSAYIPIEELEKIKFKNREEGVSISGTRYKINKNYELVNLGTLNKPKIIRRWNKIDVIYGGNISALGDEILTMDEDGNVLFAI >CP035282.1|QAT63431.1|2054190_2055072_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MNNLKPKGLAISMIIEAESANYGEGVGNVASLKKMSRGKGNQYTYISRQALRYNIGEQLGEKYAPVKAEGSGEKKVIQFDESATIDEYPEIDFFGYLKTEKGTGGKKRSAKIRISNAISLETFKGDLDFLTNKGLADRLKDDMNIAQAEIHRSYYRYTIVADLDQIGIDEEYSIELPNSEKTRRVKKLLDTVAFLYRDIRGRREDLKPLFAIGGVYDIKNPVFQNVVDIKDNRILVNQIQGVLYDNIAKDTYCGLVEGKFDNDNEIKSKLKSLSMPEFFNKLKAKVDDYYEGN >CP035282.1|QAT61877.1|2055064_2056738_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MSGKIRFYLDDWLFNSGLVGFYNILKKSEDSVVVGKDYLEFEIEVLENFEEKYFNYFISTYEKNLTWYKIISFENTIKYYEEKQFEGFDDKALKTLNKYISDVAKKFIKSNSYLAAFEFLGTKEEMLSLEKQLTPLKVKKNQDLKDIIPDVRNTFDVLKEIINYLNRRDVKKYVAAKNVIYSIINKAWNGICFLNPQTKEKDMYKDYKEYFVKPAMDYFNEDKSKYKYDCFTCDEKIKDMTNDLGFLNAIGFDVKRKASHVWNFNNDISVCPLCKLIYSCVPAGFSYAIDSGIYVNDNFSMSNAIGINSKIKTEVLETTDTNRSLTYRALVESIKEQFTESTKYELADVQVVRYVNEKYRFNILTKNILELIYKCKTELNNLISSGYKEINTYFNIYDIVLDSLFNSQNLYLLMHKMLLYKLTDYNNCYFYGKQINSVMKINYNFMRRLGYMEKVKNYIVDKGRDEGKNLRLGYGKNTDKLSGISYRLLNALKVNDVDMFMDTVLNCYLYVKKSVPPILLEVLKDEDAFKTVGYAFTSGLIEGQDNIKNMEVGKDDK >CP035282.1|QAT61878.1|2056749_2057472_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRIIVEFLLEKGSIDKDKNRIFISIIKSNLESYNKNYYKKLFESGTARKSYCFALYMKDAEFTRDKIIIPSKKIIFKFSTSNLEDSIHFYNAFLQNVKRTYKIKENVLKLNKINIMREKKIYDNQASFTSLSPVVVREHNGDNKKTWYFSLNDENGRILFLNNLRIQLLEEFGQDRILDVEETKVEVLSNKNVKVKNYGIEVLGNLCKINIYAKPYILDYMYKSGVGGLKSSGFGMLDLL >CP035282.1|QAT61879.1|2059355_2060129_-|SDR-family-oxidoreductase MDLGHRGKTVIVTGGSKGIGSGISEVFAKEGANLVINYHSDSVSSEAFSKELMDKYGCKAICAQGDVGNEADVKSIFDAAEEYFDRVDILINNAGKVYTNKVTDISLEEWNKCLKDNLTGQFLMSREFARRVVLKKQKGWIVNVVSKAAMMSTTKGRLAYVSNKAGEWGLTHALAVELTEYGIRVNGVMPGHVMNSRLVKEMENNPEGFKQRINRSPIKRVGEPWEIGNMVAFLASEQCALAVGSVVDVTGGLLLGF >CP035282.1|QAT61880.1|2060192_2061308_-|iron-containing-alcohol-dehydrogenase MSKFRIVPDIYEFDTFKEFTENFPIDKEDLLVTQRFIYEPFMKGLNLSCKIIFQEEFGNGEPSDVMVDAILKKTKGMSYKRVIAVGGGTVIDISKLLSLKSFESAEEIFDDPSKIIREKELILIPTTCGTGSEVTRSAIITSVQRKTKVRMAYDAYFADAAVLIPQLISTLPYRFFAYSSIDALIHGVESFLSPNATPYTDIFAMAAIRTIVKSFLVIANEGQEKRKDIEKDVLLASNYAGISFGNAGCGAVHALAFPLSGRYHVAHGESNYQFFCEVLRKYYSKNPEGKIKNLCKCLTEILNCNTDNVIDELSNLLNKIWPVKKLRDFGMRENEIKEFAEEVYNELQSVLATSYIPLAKEELEEINRNLY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP035282_8 | 2099042-2099334 | Unclear |
III-B
Consensus repeat of CP035282_8
|
4 spacers
spacers of CP035282_8
>8.1|2099072|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT GATGGCAGAATGGGCATATGAAAACGGGTATTACTG >8.2|2099138|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGAATAGGCTTATATACTTTGAACTTATAGAGCC >8.3|2099203|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGTGGCGGAATAAAATGGATAATAAGAATTTGCCAA >8.4|2099269|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACGGGGATACCTTATTCTACATTGTCAAGCCTTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP035282_8
The CRISPR arrays of CP035282_8 >merge|CP035282|8|2099042-2099334|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTCTGATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGATGGCAGAATGGGCATATGAAAACGGGTATTACTGATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACATGAATAGGCTTATATACTTTGAACTTATAGAGCCATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGGTGGCGGAATAAAATGGATAATAAGAATTTGCCAAATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAACGGGGATACCTTATTCTACATTGTCAAGCCTTTAATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC >CP035282|8|8|2099042-2099334|CRISPRCasFinder ATTCTGATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GATGGCAGAATGGGCATATGAAAACGGGTATTACTG ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC ATGAATAGGCTTATATACTTTGAACTTATAGAGCC ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GGTGGCGGAATAAAATGGATAATAAGAATTTGCCAA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AACGGGGATACCTTATTCTACATTGTCAAGCCTTTA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC >CP035282|8|6|2099042-2099334|CRT ATTCTGATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GATGGCAGAATGGGCATATGAAAACGGGTATTACTG ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC ATGAATAGGCTTATATACTTTGAACTTATAGAGCC ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GGTGGCGGAATAAAATGGATAATAAGAATTTGCCAA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AACGGGGATACCTTATTCTACATTGTCAAGCCTTTA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC >CP035282|8|6|2099108-2099334|PILER-CR ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC ATGAATAGGCTTATATACTTTGAACTTATAGAGCC ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GGTGGCGGAATAAAATGGATAATAAGAATTTGCCAA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AACGGGGATACCTTATTCTACATTGTCAAGCCTTTA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
>CP035282.1|QAT61911.1|2098057_2098792_+|metallophosphoesterase MKILLIGDIHGNIEALDAVLTKEVNKIDNVIVLGDIVGYMANPKEAIDSVKDFDCILGNHDYAMCNPDMIWWFNSVARQALTWTKKQLREEDFTFLKGLPFQRIYKNENFTVVHGCLGDDPFEYLLDIYQAEKNFKLMSTDLLFVGHTHVPIIWQEDSLENIKELTTIDYDKEILLDEHLKYIFNIGSVGQPRDEDPRSCYVIYDTEKYSVCYRRQEYDINKTVRKIAENDLPKFLYERLMLGI >CP035282.1|QAT61910.1|2097132_2097333_+|cold-shock-protein MSKGTVKWFNSEKGFGFITVEGGNDVFVHYSAIQDDGFKSLDEGQTVSFDVIQGNKGPQASNVNRI >CP035282.1|QAT61909.1|2094952_2096242_+|IS110-family-transposase MDYPPVAGIDVGKNFSEMCILSPNNEIYHRIKIYHDSIDSIKEAIGLLQKAEKDFAIRPVVVLESTGHYHKILFHYLSDSGFEVSIINPIQSDSIKNIGIRKVKNDKFDAHKIALLYRFSFIKTTVVPDDVIDCLKSLCRQYYKLGDELTTYKNRLIGIIDQVMLNFTDVFQNVYSNTALAVLDRYPSPKQILKANKQTLISLIEKTSKKGLAWSTEKYELLVLKAKEFKDLSINNPGNLAILKVNISMVRTLQDAQKDILDAINEIILADSLEDNPVLAPIINLLCSIPGIGILTAATILAEVGDFSAFSSPNKLVAFFGIDPSVNQSGEFTGTRNKMSKRGSRLLRRVIFTTALANIRSKRNGDKTNPVLYEFYQKKCTNKPKKVALGAVMRKLVNIIFAVMRDKKPFELRTPEEHEELLLTRSSVA >CP035282.1|QAT61908.1|2093475_2094060_-|GrpB-family-protein MSEASNRDKYMEQVTVGKLELHNAEITLNEYDTNWPVLFEREADRIRKALGSKAKLIEHVGSTSVPGLCAKPIIDILLVVEDSADEPSYIPDLEAAGYILRIREPDWYQHRLFKGPDTDINLHVFSEGVSEIERMLRFRDWLRNHESDRQLYAETKRRLAKRKWKYIQNYADAKTEVVQEIMKRACPDSRNVRN >CP035282.1|QAT61907.1|2092720_2093443_-|creatininase-family-protein MYMVNYTSDDFKKNLSKSDLVIVPVGSVEAHGHHLPLGTDIFSPRLFCQRIDKKIGDEVWIAPEIPYGQSYDLSIYPGTVHIPSGVMANYLYYVGKSMFNNGMGKIIFFNGHGGNINALNLASERLVPLGLDVAVINWWLDYSKEILTVTTGQGHAGEDETSAILYYDEKLVNMDKATKNTKKPLIKVRYKNRGKEIFENALTGDATLASKEKGEKIFNILEGKIIEFIHIMKNGKYYTS >CP035282.1|QAT61906.1|2092012_2092618_+|response-regulator-transcription-factor MNIIIIDDDPLVVESLKTIINANEIDISAVGYNGLEAVKLYKKYKPDLILMDIRMEKMSGIDATEEILKTDPHARILLITTFQDDEYIGAALSLGCKGYILKQNIKGIIPAINAVYSGNLVFDSKIVSNIKKYSRKNMDIGLSERELDILLLVAEGLNNKEIAEKLFLSEGTVRNYISNMLDKLSLRDRTQLAIYYYKNLK >CP035282.1|QAT61905.1|2090960_2092007_+|GHKL-domain-containing-protein MRILWEKAVVATFCLYNTYKIKPDGNLAFYFLISIIFSLMMDLLNNKKIKAIIYISFAMICFSDTLFVFYLPLILYNMYLDFSTYIIFSLPLIFMNFSLSNSFISVISVYLAAMTKKHKLILDENKTVRDKLKGETLYLEKYNKQLKIDKEKDVHIAILTERNRIARQLHDSIGHVISSSILQVEALKIISTEDNVIKNLNILQKTLKNGMEDIRKSIHNLYNESLDLESQIEKLCNEVPAIDTEIIYRIEDNLSYNLKFDILSVVKEGITNCIKHSNATKLRISLFSQPKFYSIIIKDNGNNFDKKALLSTKGIGLVSMKEIANKYNGFLNYKFDNGFKIHLTLMKG >CP035282.1|QAT61904.1|2089842_2090775_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIVKVKNLVKRYKELIALDHFNMEVEEGEILGLLGPNGCGKTTAINSILSLLNFDKGEIEVFGKKMTPNSYDIKRKIGVVPQEVSVFENLTVKENIDYFCGLYVDDKNLRKQYVEEAIDFVDLNNYIKFYPKKLSGGLKRRLNIACGIAHKPKLIFLDEPTVAVDAQSRNFILNGIRELNKEGSTIIYTTHYLEEAEMICSRIIIMDKGKDLVSGTTEELKAMITTSEKIVAEFLNIQDETIEKMKSIPHVIDIEKDGKDCIIKFENGTNNLTNLLEFIKENNLAYTKLHSQLPTLNDVFLELTGKGLRD >CP035282.1|QAT61903.1|2088785_2089841_-|ABC-transporter-permease MKSLLRNCIYQGKCSIRDWGFSFWSVLYPLILAVFLYTAFNGMINMKLEDIDVGIEDGNKISYILEETDLLKIHKISRDEIKEKLDNGEIDGFIDNDLNITVKESGINQTIIREIVEQIKQMEKLNRPIENYDFNVNYVLDRNQKANSMIIIFYSLIAMFSTYGVFTGIETVSFIQANLSNIGARINVTPLKKHSFLLAGIIVALALNLLSNGLLLIFIKYVLKIELFKEMKYSSIFIILGNLFGVSLGVFIGVSNKKSVNVKTLISIALTLFLSFLSGMMGPDIKTMIDTRVPVLGKVNPISIITNNLYRINLLDSTKSVGEGIFLLSVYSIVLISISYVFLRRRNYDSI >CP035282.1|QAT61902.1|2087671_2088799_-|ABC-transporter-permease MTVYKYFIKIALRNKWAILSYTIIFFIIAALNGSSTSQREANFVETKLNVGIIDNSKSELSGELKKYLIKKNNIVEVGSDESSIKEEIFLGIADAVIVIPEDFEERVINKEKAVEVYRDDRKMESVQIQTQLNKFFVFINATYENGRFNLSDVNTALDEKTTVNLMKDGGKVKDQGAVQWFRYYYNFTSYVIIGIYIMVMGLVMNDFMNENVDSRRKISSKRFLRFNEEIYLGQLSLAGLITLIFILGSIVLRGKYIGEVNFGMYVANLVVFSFTILCLTFLINNVVKNKFAISAISTVLSLGTSFISGVMVPQQLLGKNVLTVAKFFPTYYYVRINDMQANSFSDVRYEIFMQLLFAAAFLLMGLYFSKAAQKA >CP035282.1|QAT61912.1|2099655_2100138_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MVHELDAKKGVTLNKELITLNFNAKDREDALRKMGAKLLKCGYVNEGFTEAIIEREKNFPTGISTKNMGVAIPHTDVKYVNKTSIAIGILNKPVTFQNMGSDDKLQINIIFMLAIKEPKEQLKMLQKLTEVFQDDNALEKIKNAKNELEVLEIMKSFLDN >CP035282.1|QAT61913.1|2100160_2100811_-|ribulose-phosphate-3-epimerase MLNISPSIASANQINLETIVRRLENMKIDNLHIDIEDGNFIPNITFGLRTIKNLREITDIPFSIHIMGYHPENYLHDLAEIGVDSITVNIEACNYPRKILNMIKSLNIKAGFAINPKTPIEQILYMSDDIDMVLIMTAEPDCCGQLFIREMLNKVEKLSRINHRKFKIWTDGGISKAELSDIYNVGADTAVLGREVFKNGKIEENIKSINKVLSDL >CP035282.1|QAT61914.1|2100906_2101728_-|BtpA/SgcQ-family-protein MGKWTIEALGTDKVIIGMCHFLPLPGDPSFDKKGGIEKVIEAARHDLLALQEGGVDAVMFSNEFSLPYLTDVRTETVASMARIIGELMPDVKIPFGVNVLWDPKQSLNLAAATGAKFVREIFTGVYASDFGLWNTNCGDVVRHQHNIGAEDVKLLFNIVPEAARYLGDRNIIDIAKSTVFNTKPDALCVSGLVAGAETDSQILKKVKEAVPGTVVFANTGVKLNNVEEQLSIADGAIVGTTFKKDGVFENPVDVTRVKEFMDRVKKFRENLKN >CP035282.1|QAT61915.1|2101833_2103186_-|hypothetical-protein MAFFNFISSLGSMIMVPIIIFIVGLIFRNGLAKSLRSGITVGVGFIGLNLVLDLLFKYVGPATDILVKKFNLSFSVIDAGWPAAAAVAFGTKIGALIIPFILIVNVVLLVTKLTKTVNVDIWNYWHYAFTGTLVSTITGSLTYGFIAAAAHAAISLKIADISAPKIKEVIGVPGVSIPQAFAASTVPVFILLDKLYDKIPGLKDIKADAKTINEKLGIFGEPMIIGFILGILFGLIVNYDIKGILEMAFAMAGIMLLLPRMVKIIMEGLVPISESAREFLQRRFSGSEFYIGLDSAITVGHPTTIAVGILLIPIVLILASILPNNTTLPLADLASTAFFVCMATPIHKGNFLRILISGTIMMAIVLLLSSAFAPIITQSAIETGFAFPKGAQAITALSAGNIFAWIISKIMSLRIVGAVIIVLLVLAFLIISKKYEDKKLVESTNEKGMD >CP035282.1|QAT61916.1|2103199_2103484_-|PTS-galactitol-transporter-subunit-IIB MKKQIIVACGGGIATSTIIASKVEKILEDNKIDASIIQCRVSEIDSHKDNTDLIISSANLKKDYGVPVLQAISFISGVGVEETRKKIIEILKNK >CP035282.1|QAT61917.1|2103513_2104620_-|M42-family-peptidase MNDIKTILKELTSLSGVSGHEEEVARYMYEKFKGITDNVAIDNLGNIVCHISSEVKNAPKVLVFGHMDEIGLMIKKVEKNGFLRFERIGGVNRQALPGTHVVVVNSQGTKVNGVIGLKSHHIMKQDEKSRIPEIEEMYIDIGSFSDANVYERGIHVGCFATFKPSFTELNEDIVCSKALDDRAACTVLLRLAEELSKEVDKLNSEVYLVASVQEEFNIRGIMPMVRKINPDIAVGIDITPSFDTPELNCTASDVVLGKGPAITYMNFHGRGTLAGIIPSYKLTEFIEKVAVQNDIKFQREVITGVITETGFICIEGENGIITGNLSIPVRYSHTPIEVADLRDIDMAIKLLLNVIKEIKSFNSFRFIS >CP035282.1|QAT61918.1|2104907_2105687_-|DeoR/GlpR-transcriptional-regulator MLKGERLYNMAEYIDDKKVVTIMELCDHFKVSKATVNRDLRMLEKEKFITRTHGGAMSLTKGTRFEPIYEIKEKEKIDEKQAIGAYAVNFIKQGETILLDSGTTTLLLARQMKDLDNITVITNDLMIAYVLSEANGIDLVVLGGQHRKGVYSLIGPFTENILKELNVDKAFLGADAIDVDRGITNSNIEESNIKKSIVEISKEVIVLADSSKFGNVAFTKVCDIDSVDVIVTDFNISEKELSKFRNTNVKIYIAEKKSV >CP035282.1|QAT61919.1|2105886_2106657_-|creatininase-family-protein MKNWLQENNWEEVKELIKKSKGVAIIPVGSTEQHGLHLPVGTDTYIAITLAEDAALKTNALIVPPLWFGWSPHHMVLPGTITIRPEILSEYLFDIVKSLSVHGIKKFLLINGHRIVNVIWMQLTAEKAQRELDVEIKIFDPAYMSKDIVKELGFGPVGHAEEIESSHMLYRYENLVQIDKAADNPIEEKELYSVDPSYSHDTLCYVPTSVKSARKNAEKAGGVTGEPTKSSRDKGKIYHEHLVKNLVKVINQLQNS >CP035282.1|QAT61920.1|2106934_2107642_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLEIKEISAGYGATEVLHGISLTVEEGKITTLIGGNGAGKTTTLNCIMGVVKTLGGSITWKNRDISKLKTSGIVGMGISLIPEGRHIFPQMTVMENLEMGAYNRIDKKEIIREDLAWVLDLFPVLKSRYKQFAGTMSGGEQQMLAIGRSLMGNPELILMDEPSMGLAPIIVDEVFDIIHKIQNMGKTILLVEQNATLALSSAHYGYVIELGKIVLKGTGQELLNNPEVEKAYLGL >CP035282.1|QAT61921.1|2107619_2108420_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MPLELNILTIKGISVRFGGLQVLNNIDIQVNRNTIHGIIGPNGAGKTTLFNVITGLIRSDSGTISLEGKELPYVKPYQLVSLGFARTFQNIRLFKEMSVLDNVMIGQHIHTPTPIFSIMINGKKSRHYEKVAKEKALEALKFMGIEEKAQETVSNLSYGQQKLVEFARALAAQPKIILLDEPAAGMHPTEKANLLNIVDRLREKGYTIILIEHDMKLVMNICDMISVLDHGKVITQGRPEEVRNNKDVISAYLGKGEYVNARNKRN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP035282_9 | 2465581-2468216 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP035282_9
|
40 spacers
spacers of CP035282_9
>9.1|2465610|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT GGAACAGAAAAATATGGAACACCATTAGAGTCATAA >9.2|2465675|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAAGTATCTGGCTTAATCTGCACTCACTTGATACGA >9.3|2465740|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCTAATACTTCTCCTGTCATAAATTCATTCATTCTA >9.4|2465805|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGTTCAAGGAAGAATCCAAACAAGAAGTTATGAAGA >9.5|2465871|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAAAGAGTCTTCAAATCCAAAGTCCATTCCTACCCT >9.6|2465937|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GACCGGAATTGAAATATCAGCAGGCGGTTGATTTAG >9.7|2466002|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATGGAAATATCTATAAGGATTTTTGTAGTTCACAT >9.8|2466067|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTTTTTATTACTCATTTTCCCACACCCCTATTATA >9.9|2466133|38|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCCTTACTATGGCCTGAATACTCCCGTCCTTTTCCCTA >9.10|2466200|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGAAGCATGAGAATCTTTTCCGCTCCCGGCTTAAG >9.11|2466265|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACATTATCGTTGTCATATCCATGATTGGAGTAAAT >9.12|2466330|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGGGTTGGACACGTGAAACCTTTAGACATAGAAA >9.13|2466394|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGGGGGGTGAGCAACTTAAGAGGACGGATTCTTA >9.14|2466458|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CACCTAATTGCATGGTATGAGGGTAGTTCTTTTGGG >9.15|2466523|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGCTTAAACATGCCATGGCAGATGATATTGTAGA >9.16|2466587|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CACCGACGCAAGCCACCCTATCGCCAGCAGACTGA >9.17|2466651|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTATATGGAAACTATAGACAATTTTATTATTTTTA >9.18|2466716|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCACAGAGTGCAAAAAAGAGATTAAAGAGCAATTTAA >9.19|2466782|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTAAAATTTAGGAGGTTTGAGGCAATGTACAGTGAAG >9.20|2466848|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGGTGGACTAACGAAATGTTAGAAAGTGTAAATGA >9.21|2466912|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGCTTTGTTGTCTGTATCATAATCGGTTATTGAA >9.22|2466976|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCGACATTTGCAAAGTGACAACTTTCAACTTTTGTG >9.23|2467041|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTGAAAGCAAAGGTGAAAAGATGATTAGAAAGTATT >9.24|2467106|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAACGAAAGTTGCAAAAATATTATTAATTCATTTGA >9.25|2467171|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGTTGAGGATGAAAAACCTGTTAAAGATGAATTTG >9.26|2467236|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAAAAGATATAGATGGTCTGATGAAAAGAAAAAATA >9.27|2467302|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGGTATCATGTACTTCTCTATTTCTCTCATTTTCCTC >9.28|2467368|40|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGCTAAAGGAATTCATCAAGCTTATTGGGCCTCAGACGG >9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGACAGTTTTTATTTTTTCCTGTTCTTCGCTCAA >9.30|2467501|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATTATGCAAGGATGGGGCAACTCACTTATGAAGAAT >9.31|2467567|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCAACCAACAGAAACACACATCGGAATTTTAGAAGG >9.32|2467633|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTGGGATTAGTATTTCACGTAGTTAGAACAAAATT >9.33|2467698|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGGAGGTGTAATATTTATCAACACATTGTTTTCCTT >9.34|2467763|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTACCAATGAAGGCAGTTATATAATTTTATATGTT >9.35|2467828|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATAAACAGAGGGATTATTGATTTTACAATTTATTT >9.36|2467892|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CATGTGCTTCATCAAGTTGAAATGTTATTTCCTCCGT >9.37|2467958|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAGTTGTTGGTTTGCAATAGAGTATCGAAATTTAG >9.38|2468022|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTCAGCTTCAAAAAATTGTTCGCCAAAAATTAGTA >9.39|2468086|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCCGCTACCTTCTGCCTGATCCAGCGGTCAAACTGCA >9.40|2468152|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATGCTATCTATGGAAGTTTGTATTTTAGCTTTTCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP035282_9
The CRISPR arrays of CP035282_9 >merge|CP035282|9|2465581-2468216|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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MIIDGSSLLYRAFYALPLLSTKDGIYTNGVYGFLTMFYKIKDEYDLDYICIAFDKKGPTFRHIEFDKYKANRQQMPNELSIQFPILKEVLKAMNVTFIETDGYEADDIAGTVCNIGKENNMEVILVSGDKDYLQLVSPHSKVLLVRKGITQLEEYDEKKMEERYGITSQQFIDLKGLMGDQSDNIPGVPGIGEKTGIKLIKQFGSIENIFEHIDEVSGNKVKNSLIEYKQGAFMSRKLSEIITNVPLDIELEDLKVRKADFKQLKEIYEKLEFKSLINKIPEDEIEHNNKNIYRSEYFIGGKDNINTILKGIDKEKKFSFKFVFEDSDYIKDEILGVALKCNDFPSLYLDFLGEPSLIDEFKHNFKEYFERDDIEKIGHDLKGDILGLFRMGIDIKNITFDSAIAQYLINPSQTDYSIGKLSEKYLNVNIEDKEKILGKGKNKRTFKDLSVSERAEYFSNILNMVYSLENTMEGFIESFGMTELYNNVELPLIEVLASMEWYGFKVDENILKSLGEEFEEEIEKLTHKIFDLAGEEFNINSPKQLGEILFEKLNLPVIKKTKTGYSTDAEVLGKLKDKHSIVDNILKYRQLVKLKSTYIDGFIALIDKNTGRVHSSFNQTVTNTGRISSTEPNLQNIPVKTEEGKRIRKAFVPENNDYLLVDGDYSQIELRVLAHISDDPKLKESFFHDEDIHTRTASEVFKVKKEDVTPAMRGRAKAVNFGIIYGISDYGLSRNLNISRKEAKEYIKNYLENYSMVESYMDDIVKRGRETGYVETILHRRRYIPELNSKNFNVRSFGERIAMNTPIQGSAADIIKVAMVNVYYELKKRKLKSRLILQIHDELIVEAEKEEKDEVMKLLKDIMEKSTVLNVPLKADVKVGESWYETK >CP035282.1|QAT62240.1|2461397_2462012_-|dephospho-CoA-kinase MKQNRCKIIGITGGIASGKSTVSDILRKKGYTVIDADDISRKVTDIGESAYEKIHEYFGDDILRKDLSIDRKKLGSIIFGDEEKRKKLNEMVHPEVYKKMIQEIRINAQRDEIIFLDIPLLIEEIENSKKYGIEYDEIWLVFVSEKEQRERLMMRDKISSEEAEKRIKSQMSMDFKRKYATRLIDNQYGKEHLTKIVEKLVKSL >CP035282.1|QAT63457.1|2460717_2461281_-|lytic-transglycosylase-domain-containing-protein MYPVNYGDYIEKYSKNFGVDPYLVAAIINVESKYDEDARSHKDARGLMQISLVTGEWAFTELNIDGYTLDKLYEPETNIMVGCWYLNVLQEEFNGDLRLVLAAYNGGSGNVSKWLKDEKYSKDGKTLDRIPYKETEEYVNKVLRYNEIYRKVYKNGFMEEERFIKNNFVYLINNFKKLLKKFVTIVR >CP035282.1|QAT62239.1|2458949_2460710_-|peptide-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKLKFRRIIAVFLLVVLTILSVGCKNKNEVGGTIDNNKEKIESGEEEKPEYGGTLRVPLTTVETLNPLISENISYYNFSKLIFEGLFKLDKNLNIENQLAQNCEIKEDGKVIGIKLRENVVWHDGEKFTAKDVKFTIDTLKYAGNDNIYKNSILSNFKSYTSSDLRHIMDVKIIDDYNIEIVFDRAFSNGLEILTFPIIPRHIFVKGRENSSSYKAALAEDNYTPIGTGPYKFSKYEKIKSINLEANTNWWQGKPYISTIIGEIMKDEDLAMTSFEANQVDLTTSVGVDWEKYFQSKRVKIIEYVSQNYELLGFNFSRKIFADEKGKELRKAIAYGIDRQSIIQKVYMGHATQVDLPIYPNSWLISDNSNIYGFNIDKAKEILSSAGYKDENGDGFVEDENGKTLTLKVTTNSYNPLRLKTADLIVENLKAIGINATKDYEDNVPNNITDEEVEEQWQKYTQKIKKGDFDIALMGWQLSDVCDLSFAFHSSQIYYGTNFIRYSDEEMDQLLFDAFSATNREEKKKAYGKLEDKILEDLPYVSLFFRNEALLIDKNIKGNINPQSNNLYYNIEKWYIPKEFQEKNVD >CP035282.1|QAT62238.1|2456949_2457402_-|N-acetyltransferase MEIKQIFENKKQYIDLLLLADEQESMIDKYLERGDMFVLCDDDLKAICVVTNEGKGIFEIKNIATVPKYQGQGYGKQLVNYLFEHYRSECSTMLVGTGDSPATIPFYQKCGFVISHRIKDFFIDNYDHPIFEGGKRLTDMVYLKKHLSNK >CP035282.1|QAT62237.1|2456199_2456670_-|hypothetical-protein MEFKLALFQHSLIQKQAVSEIIKCNDLTMRYGLVLTEKQAIELVETRFFALKETGRIEFGGGVIDKIIYEFCDSPYISMHNYEETLHDLIEMFYYYKNETLDLISDDDLISYMKNAFDGKCRGSLELLSGRELYKLAHNLRYGYSADDEEGEDGEY >CP035282.1|QAT62236.1|2454848_2456213_-|hypothetical-protein MESIDKISRIDRSKLSGEYYFQSLLEQAYHCGLLLDSDLERIQFDCLSILAKQTERYNSGDSSSIRIETAQNILVSVMYTIGMCLKTYTNPDDAVIALQNEKMETLFEEGRRQIDRMVNTTKILHSNIIQHLVDTQNVFYRSTVVDAIRGFFKLYYPEFGAQEIHITGDYPTCNGVSDLAGVEFIRKYLESIYCENTFCACFPVENIHHLLCGYHEDYQNLLFNIYEPVLTSALGCALVDKDIRALELSFFDITYLDRLFKNTDKSEIESILRQVLDKVKQALSLSDNLMNYLNDSLSRIATDIWNSSRTHTTDKVFVIPYYPENDPFVSFSYGEKMDNDRYRKLVEEIMQCNMTEDKIMIIKEKINSFADFADILLDAEFSSAEIPEVLKLLNPVELAALAKKYPYQNDLEMLDMKENERLLCNCLKKFVNSLTNEEQKWIERMVKLLKLKEE >CP035282.1|QAT62235.1|2453524_2454736_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MSRKKNLKMHKVGVEHLEQYNQLLRYVFQVTDNDLHKIGWEDRDMVRAKSPVLKEADVLGWFDGDKLVSQVAVYPFQVRIFNHTYDMGGLTGVGTFPEYSNQGLMHKLLYQALSNMQEKKQSISFLYPYSIPYYRRKGWEIISDKITFEVNDYQLPKNKQVSGEVERTDVKSDAIKKTYERFALQTHGAMLRNDLAWNEYWLWDPDDLMAAIYYNDERQPDGYVLYWIEDEVFHIKDMIFVNEEARSGLWNFISAHFSMISKVIGDIHMDEPLAFLLEDADIKETIAPYYMARIVDLEQFIKQYPFKPDTGKREWTFTLDDPLLSWNQGTFTLRISPDGKGEVVRAAERSSAKTDIQTMTTMLLGYKRPDYLHRIGRISCTPEILDMLEDAIEQQTPYFSDYF >CP035282.1|QAT62234.1|2451859_2453062_-|hypothetical-protein MINNKLNFYFFGEIGDYDRYNPAYVCNKEYVPEILYIIASNEPYSISKYEIANILRLNEEKVDNIINDLGLINAIECRDNTYRTTFPVFLEGDITKMEQYLSNIGEVIGDKIISLQNVINPKLSDLECSKHYNKERILYHIICDDVFDDMSFDFFAERGIFCTSKIQPGNRAYIIIGYEDSKTVETHSNKLLCSSNNYRSSEFIFNSFGDSNGSRRDMYRFFRMIEEYIDNATPFHDLNISYNRTLNDMNKEIAQNCGELIINILTKHTKYNQFSEREKNLLNLLKQLKYININEFDNSITIDVPIFYSSEKTIIKDISDIILSNIFPIVREAFQKFQVKMPGLTALKHEVDIKEIANELWHQIFGLTNEYLVKKEVVSLPPDIYGEGRYLRSFKINSTL >CP035282.1|QAT62242.1|2468713_2469298_+|DJ-1/PfpI-family-protein MDINILLFPDFETLDAFGPVEILSRIEEYHMHYISINGGIIKSRQGTNIFTAPLKNADFYGILLVPVGQGTRSLVTDIKFIEKLTQIAAHSTYCLTVCTGSALLAKTNLLDGKKATSNKRALKWVKSVNSKVDWITHARWAVDGKFYTSSGISAGMDMALGFIAERFGVNKAKEIADSIEYIWNSDKDNDPFAK >CP035282.1|QAT62243.1|2469525_2471214_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNYLMKIVKKNKLLVGSYLLLGILLAFLENFTASYFQTLINKFNDRSLTASVIIIYAFVLVMLCVLSYLDEYPGRKLEHGIFLDLKIEALKKISRVDYKSYQTMGTGKLVQRIENGASAGKSMLFDFIFELTRKLIPSILFSMIFIYRINKIIMWVILIGYIFVFIVTNLLLKRLYRIKEHILLNEEEMNHFLVRGFMEMVIFRINKRFNYEIEKAKFAEKEIVGSKVKMTLIHEAFFTIFELMVISVKVAVIVYGWITKSFGIGAVVALISLVDNAYIPIAIFNVLYVQYKLDKGAFKRYTDFLDLDNDYQFGKGKMIPALRGNISFYGLKFLYGNRLIFNNLNLTVNSGEKIAFVGESGSGKSTLIKLLAGLLKPGGGKILVDDYDLSRIDLNSYYDYIDYVPQESSIFDGTLRENLVFNKNVDDKEIVNVLNQVELSGLYYKLKDGLGTELGEKGISLSGGERQRIALGRLWFSKANIILLDEATSAMDNITEENVMNHVMDLLKEKTVIVTAHRLNSIKNFERIVVFKNGDIIGQGKFQELLENNPYFRELYYATVNK >CP035282.1|QAT62244.1|2471556_2472171_-|hypothetical-protein MIRLMIVAHSILANVFVSFVNLVMKIISICAISYIGRIFMILSLFTEVFTNKAGNYVFHVKKTDQYYLISEKNINSVGMFQNLLFNSISVAIIIGWLAKLSYWLWVVIGLFMYMGFTVYFNKKILPQLPAIKNEKAKRKKEIKFSKGKVMFEIVVFFAISIGLIISLFYEPLNNSKVDDSIVLLGAVVAIVLGIKHIIYYNHNK >CP035282.1|QAT62245.1|2472324_2473167_-|PTS-system-mannose/fructose/sorbose-family-transporter-subunit-IID MDNETTVNKKSKLTKKDVDRAFLTWHITSHLTYNYQRMQAGAMATVMGPILDKLYPNNKQKIAEGLQRQMVFFNTEPRWGAVIPGITVALEEGYANNPDTIDPNTITDTKTALMGPLAGIGDTITQALIKPLILSIFLGWAIQGHVWAALAWGIVMFTYDFLVTKFSFVRGYKLGLNSIDKLLDEGFVSKVTTFLGIVGLFSLGAMVVKFVSIAPIYNTVLSTGSKFSLADVFDKILPKLLPLIVTLFAWRLQVKGKSASFVLLMLFIIGFIGGALGIIG >CP035282.1|QAT62246.1|2473168_2473915_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIC MVQALLVALVALFNGIQGPLHWYFFREPVMAGFWVGLIYGKPVEGVILGATINISYLGWISAGGANASDLYWAGLLGTLVGIQTGLSTDAAVAFAVPIGLIGNYAHVAFMTISSIWPARMDKLAEEGDYKTLGRIQLLAGPITVIFIRALPVFLIVYFGSDYIQLMINNIPAWAMAGFSAVGKTLPALGMSMLFKFMYKKNLIVFFILGFIVSAYLGITDLLFFALAGSCLAYLFTIYGSNKVSGEVK >CP035282.1|QAT63459.1|2474072_2474570_-|PTS-mannose/fructose/sorbose-transporter-subunit-IIB MMKNIKLTRVDFRLIHGQVMTRWVVNLGITKIVVIDDNSAHNPIFSRILVNAVPNGTVVNVYDQDSAIKKWNEDHFGDGNILLLFKDIKTAKKIWEEGLEFTDMQIGGIGGAAGQKNVYKQVVMSKEDYDRLKVLYNGGVNIYLQPIPEDRPYPFSNIIEKKVFE >CP035282.1|QAT62247.1|2474599_2475181_-|ketohydroxyglutarate-aldolase MAIVRVDTIDRGLKIAEGCLNGGVDVLEISYTNNNAGEVIKALKKKFGSPLLIGAGTVLDSETARLAILNGAEFIIAPTFNKNIAELANIYQIPYEPGCSTYTEIVEALKYGAYFIKAFPISNFYGSKLVDIFTTPVPTLPILASGGITLDNLSEWIKAGVMTVGAGGLLTKGSKEEITANAKEMREIVVANR >CP035282.1|QAT62248.1|2477101_2477665_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIRKATIQDLEGIMTILKTLGNPNKDSVQGFLIADYAGQESKYRPIYEEKLQKLQYFYVNEHEGQIQAFLIAYTQEEWLLREPNWLKETCWDPRFDQTKLKNFVLVSQTAMLPHLTRKGIGSALYQSFIWDLQKDKIKNIFAETVIAPIPNFASLNFRLKQQYTLVGLRYEKHNKVNYTTLIYHKGI >CP035282.1|QAT62249.1|2477722_2478739_-|magnesium/cobalt-transporter-CorA MEMNTPKRNSHSLIEVIEYNSKKYKEYTTETTKKYNFRLLGDIPEGNVRWINIDGQCSEEVLNKISDVFNIHPLVTKNILNNNQRAKIEEYEDFLYIVAKMIYYSGDELVLEHIRFILGKNYVISFGETKGDVFDDIRDKIRNEGTQIRKFGADYLMYSLLDAIVDGYLDVLEVLDEKIDTLEEQVIMNNSQERLYKIRKIKKILLNISKYIWPLREVTSLMGKESNQLIQPSTEPYIRDVYEHIAQAIETTETYREILTGLMELYVSNTSYKLNEIMKVLTIISTIFIPLTFIVGVYGMNFRYMPEIEYRWGYAITWAIMIAISSFMVYYFKKKKWF >CP035282.1|QAT62250.1|2478759_2479944_-|winged-helix-DNA-binding-domain-containing-protein METYNLTNDQGRNFILLKQGLIGDYKFEDKGGVCDYVRQAGCIQFDPIDICGKNPELVLHSRVLGFTKEMLYQLLYEDRKLIDYFDKNMSIFRVEDWEYFARLRENYRSYGRSHDKVDKVAGEIKGIIKEKGCVSSKDIDLKQMVDWPWAPTTLSRAVLETLYFRGDLIIHHKKGNNKYYSLAEDYIEEMILNTEDPNKTEDDFTKWQVLRRIGSVGLLWNKASDAWLGINKFNGERRNNIFSLLLSENKIVGCKVEGIQATLYFLKEDEELIKTVLSQDAFKQRLEFIAPLDNMLWDRKLIRALFDFDYKWEIYTPKSQRKYGYYVLPVLYGNRFVGRIEIVLDKKVRQLNVLNFWKEGNTKIDDDFYKLFQTEINQFMFFNHCETFKIKCKI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP035282_10 | 2592795-2594613 | TypeI-B |
III-B
Consensus repeat of CP035282_10
|
27 spacers
spacers of CP035282_10
>10.1|2592831|36|CP035282|PILER-CR AGAAGTTGTCAATGGAGTAACGGTCACTGAACAACC >10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR AGCTAAAATGACAAAAATAAAGAAAAAATAC >10.3|2592830|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT GAGAAGTTGTCAATGGAGTAACGGTCACTGAACAACC >10.4|2592897|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT AAGCTAAAATGACAAAAATAAAGAAAAAATACTATAA >10.5|2592964|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT GTTATTTTCTCTGGCTGCTCTGTTATTGTTACTCCAT >10.6|2593031|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT GAAAATCGTAAAAGATACTTTGAGCAAGAAAACAAG >10.7|2593097|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGGGTACATGACATGGCTAAGTTTCAAATATGCCA >10.8|2593163|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGAGATCATCGGCAGAAGCGCAAGCGCGTTCCCTGC >10.9|2593229|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGTGTGCAATCAATGGAAATTAAAGATACAATATA >10.10|2593295|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTGCCGAGTGTATATGGCAATTAAAAAATATAG >10.11|2593360|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCAAGTTGACCGTAGCCATTTTCACCGCAGGCCCA >10.12|2593425|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACGGAGATTATGTGCATGGAGAGGGTGAAGAAAAAG >10.13|2593491|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGTAGATACTCCAAAAGAAGATAAAAAGATAGTAGC >10.14|2593557|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTTGTGGAGTGGTTTTTGGAAGTTCAAAACCAATA >10.15|2593623|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGATATAATAATCGTTCTTACAGTAGAAGTAGAAAA >10.16|2593689|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGGTTTTAGAGAAGATGTTCCTACGATTGATACTG >10.17|2593755|34|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGATGCTCGAAAACCGAATCAAACTTCAATTTTC >10.18|2593819|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTTTTCTCGTATTCAGCATTCATCTTATTTATGCTT >10.19|2593886|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTATACCTTGCAAAGTATGCCAAGTCGACGGCATA >10.20|2593952|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGTTGCCATAACTCGTCGGTGTCGGGCTTTCCCA >10.21|2594017|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAATCGGGGCCTCGTCGGGCGAAATGGCAAAATATTC >10.22|2594084|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAGGAAAAATTGGGTTCTGAATATAACTTTAATTA >10.23|2594150|38|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATAGCAGAGGTAGCAAAGGATTTCGGAGCTGAATCAAA >10.24|2594218|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATTAGCGATATATTCACAATATTATGTTGTAGCTTA >10.25|2594285|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGGACGACTGGAGAGTTGTTCCTGGAGATCCATA >10.26|2594350|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAGAGATAGAAAGGTTATACGGTTTATATTTTTT >10.27|2594415|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTCTTGCCATTACTCTATATGTGCAAGACCAACAAGT >10.28|2594482|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGAAGAAAAGACTCCTTTATATTCATTTTGTTATGGA >10.29|2594549|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAAGATATAGAGAATACCAAAGAATACATGATGCG |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7b,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP035282_10
The CRISPR arrays of CP035282_10 >merge|CP035282|10|2592795-2594613|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATAAATTCCAGTACATCTTATGTTAAGGTTCAACGAGAAGTTGTCAATGGAGTAACGGTCACTGAACAACCATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAAGCTAAAATGACAAAAATAAAGAAAAAATACTATAAATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGTTATTTTCTCTGGCTGCTCTGTTATTGTTACTCCATATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGAAAATCGTAAAAGATACTTTGAGCAAGAAAACAAGATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAAGGGTACATGACATGGCTAAGTTTCAAATATGCCAATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAGAGATCATCGGCAGAAGCGCAAGCGCGTTCCCTGCATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGAGTGTGCAATCAATGGAAATTAAAGATACAATATAATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTTTTGCCGAGTGTATATGGCAATTAAAAAATATAGATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACCCAAGTTGACCGTAGCCATTTTCACCGCAGGCCCAATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACACGGAGATTATGTGCATGGAGAGGGTGAAGAAAAAGATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAGTAGATACTCCAAAAGAAGATAAAAAGATAGTAGCATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTGTTGTGGAGTGGTTTTTGGAAGTTCAAAACCAATAATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAGATATAATAATCGTTCTTACAGTAGAAGTAGAAAAATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGAGGTTTTAGAGAAGATGTTCCTACGATTGATACTGATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAGATGCTCGAAAACCGAATCAAACTTCAATTTTCATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTGTTTTCTCGTATTCAGCATTCATCTTATTTATGCTTATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACATTATACCTTGCAAAGTATGCCAAGTCGACGGCATAATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACCTGTTGCCATAACTCGTCGGTGTCGGGCTTTCCCAATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAAATCGGGGCCTCGTCGGGCGAAATGGCAAAATATTCATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAAAGGAAAAATTGGGTTCTGAATATAACTTTAATTAATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACATAGCAGAGGTAGCAAAGGATTTCGGAGCTGAATCAAAATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTATTAGCGATATATTCACAATATTATGTTGTAGCTTAATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACATGGACGACTGGAGAGTTGTTCCTGGAGATCCATAATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAAAGAGATAGAAAGGTTATACGGTTTATATTTTTTATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGTCTTGCCATTACTCTATATGTGCAAGACCAACAAGTATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAGAAGAAAAGACTCCTTTATATTCATTTTGTTATGGAATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGAAGATATAGAGAATACCAAAGAATACATGATGCGATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC >CP035282|10|8|2592795-2592964|PILER-CR TATAAATTCCAGTACATCTTATGTTAAGGTTCAACG AGAAGTTGTCAATGGAGTAACGGTCACTGAACAACC ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAAGCTA AAATGACAAAAATAAAGAAAAAATACTATAA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGTTATTTTCTCTGGCTGCTCTGTTATTGTTACTCCATATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGAAAATCGTAAAAGATACTTTGAGCAAGAAAACAAGATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AAGGGTACATGACATGGCTAAGTTTCAAATATGCCA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AGAGATCATCGGCAGAAGCGCAAGCGCGTTCCCTGC ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GAGTGTGCAATCAATGGAAATTAAAGATACAATATA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC TTTTGCCGAGTGTATATGGCAATTAAAAAATATAG ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC CCAAGTTGACCGTAGCCATTTTCACCGCAGGCCCA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC ACGGAGATTATGTGCATGGAGAGGGTGAAGAAAAAG ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AGTAGATACTCCAAAAGAAGATAAAAAGATAGTAGC ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC TGTTGTGGAGTGGTTTTTGGAAGTTCAAAACCAATA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AGATATAATAATCGTTCTTACAGTAGAAGTAGAAAA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GAGGTTTTAGAGAAGATGTTCCTACGATTGATACTG ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AGATGCTCGAAAACCGAATCAAACTTCAATTTTC ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC TGTTTTCTCGTATTCAGCATTCATCTTATTTATGCTT ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC ATTATACCTTGCAAAGTATGCCAAGTCGACGGCATA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC CTGTTGCCATAACTCGTCGGTGTCGGGCTTTCCCA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AAATCGGGGCCTCGTCGGGCGAAATGGCAAAATATTC ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AAAGGAAAAATTGGGTTCTGAATATAACTTTAATTA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC ATAGCAGAGGTAGCAAAGGATTTCGGAGCTGAATCAAA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC TATTAGCGATATATTCACAATATTATGTTGTAGCTTA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC ATGGACGACTGGAGAGTTGTTCCTGGAGATCCATA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AAAGAGATAGAAAGGTTATACGGTTTATATTTTTT ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GTCTTGCCATTACTCTATATGTGCAAGACCAACAAGT ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AGAAGAAAAGACTCCTTTATATTCATTTTGTTATGGA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GAAGATATAGAGAATACCAAAGAATACATGATGCG >CP035282|10|10|2592800-2594613|CRISPRCasFinder ATTCCAGTACATCTTATGTTAAGGTTCAAC 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ATTATACCTTGCAAAGTATGCCAAGTCGACGGCATA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC CTGTTGCCATAACTCGTCGGTGTCGGGCTTTCCCA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AAATCGGGGCCTCGTCGGGCGAAATGGCAAAATATTC ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AAAGGAAAAATTGGGTTCTGAATATAACTTTAATTA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC ATAGCAGAGGTAGCAAAGGATTTCGGAGCTGAATCAAA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC TATTAGCGATATATTCACAATATTATGTTGTAGCTTA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC ATGGACGACTGGAGAGTTGTTCCTGGAGATCCATA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AAAGAGATAGAAAGGTTATACGGTTTATATTTTTT ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GTCTTGCCATTACTCTATATGTGCAAGACCAACAAGT ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AGAAGAAAAGACTCCTTTATATTCATTTTGTTATGGA ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GAAGATATAGAGAATACCAAAGAATACATGATGCG ATTTCAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
>CP035282.1|QAT62331.1|2591855_2592773_-|ketopantoate-reductase-family-protein MKIKNVAMIGMGAIGTVYGSFLYKRYGSDFAVIAGEKRNIELKSKGITLNNNTLYPLVLSPDKKDIKYDLIIFCVKNYQLDKAIDDVRNFVGENTIILTILNGITARDRILSAYPDNKVLYGLSTHMNAVRTHKGVFSTEYGEIQFGNGDNTVIAPEVQAVQELLNEARIKNKVFPDMIRAMWKKFMLNVGVNQVTAITKASYEKVASVKTNLILYKEAMMEVLKVAQASGVDLREKDVEELMASITSRLSAKEKTSMLQDVEAKRKTEVDYFSGLVVEMGKKLSIPTPVNHVLYCLIKSIEELY >CP035282.1|QAT62330.1|2590027_2591572_-|IS1182-family-transposase MLRQVQKQMSLHSILYNKISENHILKKINYVVDFSFINKLLEDSYCKNFGRPAKEPEMMCKLLFLQHLYILSDEKVIEEANLNLGYMYFLGINPEDELPDKSLLSKFRTQRLEEATLDEIITEIVRQCVEKGIIGGTSVSVDATHIEANTIRKTPERLMKHLARKIIKTYEKENNQVLEEIPEVPKYKEIEDHTEAKAVMKDYLENVISKVKKNIRKDCSESIKTKETIEKAREIIEDPKFLNQKGVRSIIDEDARVGRKSKNQEFYGYKTEFMMTADERIITSVRTADGAYVDGTYADELIEQTLKSGMKIEEVYGDKAYFRKPILNSIEEIKAKAYIPVSESVYRIDESEFSYNKDSDEWECREGNITVKKKYYKIKGKSRPDREGYKYYFEPEQCKRCPKHDECAKKSARKILQIGLNTIEFYEISQYQKTEEYLEKYKKRASIEGKNAELKRFHGLYRARGYGLLSVSMQSKLAAIAVNIKRIAAIAASKFCIFTLNIKIFSQYYKFCLN >CP035282.1|QAT62329.1|2588918_2589968_+|flavodoxin-family-protein MNDLFLIIPEKPSFMLEKMIQAVIQDRDPVIINDENHVSSLRQGKIIFALEVNNIGFSNNLSNIFSKLYSMGNSSLFGFQGIVLTHSNTELYTRSAAQNIIFHGNQLGLRFIGRPLVEATGNLENFIPMKSIYNDSLENICLNSCYELGQRFFKDNISPIKNPKILIIYSSNWRTSNSLLLWNMVKRNLNSCKIREIHIGNGTIYDCKGCPYKTCKHYGQQVSCFYGGIIVEEVYPALLQSNAVVFICPNYNDSVSANIMAVINRLTALFRRTKFYDKTLFSIIVSGYSGSDIVAKQIISSLNLNKTFRLPPYFSLMATANNKDSIKDVPNIEEKAKCFAENIMKEIKK >CP035282.1|QAT62328.1|2587671_2588922_+|lactate-dehydrogenase MFNYYKYKNKYLFSTYEYSMFKKVSLDEFIANKNKYYYLKKSDPLYSRRSFSVSHPDFILSEREDIDIILDIKEEKEYSLPEWLIKDIYNGNIISINTNYPHWSELLEEKSHNKWKVNILALGDVGSTLLIGLKLLGGELIEKIGICDRNENNKIRWEYEMNQVRKAFSNEKFPMVKGIDIESLFDCDMFVFCASKGVPPTNSKAGDVRMVQFNGNSAIIKEYAYMARKKHFKGIFAVISDPVDLLCKKAFLESNKDEYGNLDFEGIPADKVIGYGLGVMNGRAAFYAEMDEKTKHFLNEGRVFGPHGEGLIVADSIKNYNENLSNLLTEKTKNANLKIRSLGYKPYIAPSLSSGALSLLSTMSGDWFYGSTYMGGAYIGAKCRLINNNIEVEKLNLPEPLFSKIKSAYERLVKII >CP035282.1|QAT62327.1|2582838_2587662_+|cytidyltransferase MYEEVYNSMFNIINQQSDIDGKDELLEYIKADSFKRSLNRSLANFSVDPSSLLDLFWDYIKDHFSFNKEECLKYIYYWILYKSFPQKINIDFNHSYDNLVSTYLYILREFCKYEISYNKKSFLHKYPVSFLTKEEEENIKNPEYFHFKEIFFKNWIYELMKLDQCITGHNTIEHIAGVNNLSLYLSRQLKNLEIPLDLGIIAGASIGHDIGKYGLKEGEEKRVAYLHYYYTDEWFKHFSINTIGHIATNHSTWDLELENLPIESLILIYSDFRVKSKNTDGVNHIHIYTLDEAFDVILNKLDNVDEKKEKRYRKVYSKLKDFENFMKSLGVNTETVKKNFKKPELKLFSLMQEKEIVENLKYFSIEHNIFLMNKLMNNQSFNNILESARSEYNWQKLSTYLQIFYEYSTYLTQEQKIKTLYFLYDLLLHKEEAIRKEAAQLIGILIGSYDEEYRKETPKSVNNDTFELKSSDILNNAIKLILFPEHKIQDFQEEWLYNIKNVINSLFLHCHKSKYESYADVLISYYNNYLILSETQQFYLLQTVEYIPFESLNRTELSQISKYIIEQIKSPNFEIRLQAWDSIKDLSPYLKNDNKFIPALKEYMEENYAPSSSIAEDFLRVKIADKLALRDNIINTYKNSYARHKDIMSDIFFNNLKTATSWINKKINIDILYEELMKSSDPNGLHTAMHFCNLLKVSAVERVRNYAGETLIKIFNFLTLDQRNDIVIELSRALEMQSYQFTKYIPEYLGRIILYLRPIELDELIDDMEIEIKKSNVQIAILLLKTVGVAIENYKSYGNNFKEETKVNRKRLKRLLGILLMEMANFNPEISTYAFRVLGTDIFGSSKLTLNEKHDIFLLVSKKILTLLTKREENEFLFLNNSASLNYIYRFISDYEFNYGEIDLKRKKNIAFFPGTFDPFTLSHKEIAMEIRDMGFEVYLAVDEFSWSKRTQPHSFRINIMRMSIAQELDIYLFPSEIPIGLNNSKDLNKLKNLFPDSDVYIVIGSDVILNASSYKNNSPIHKFPHIIFNRETYISEENQSSILEEKIKKIKGHVVRLSLPPQYEDISSTKIRESIDKNRDISKLIDSVAEQYIFKLGLYVKEPQYKTLVQQKTFEVKVYESLGESLIEDIIRSIGKNIDITFLENIKNKSETRVLVIKDSENKNVLAFSLYHWLKSSMIFDEFQNSNLTEEIRKNAKGRIVVLDGIYAKNNSKVLIETILNETLAFLVSDDYNYCIYKNNTQWQKMVENILPLLGFAKSVRSYNGKPIFMVDMNNPSTLDLDIEDSLKEIFRENKDINKVIEEKRNELKKAIVNLYPGELLLSFSKDMIYSKLIQQICDTNKVSSASQQSRQSGPCICAPFGSILNGCILPNTITKTIHTEKIFDSDIKNFSISAFPNYLSLENQIKVLRSFNKPLILVDDLLHKGYRIKVLEPLVRGSNIKIEKIIVGILSGRGKEIADMRNLNVSCAYFIPNLKLWFNESAQYPFLGGDMVQIKNRLDKNLIPSINLILPYVSPNFIKNTSKDNIYNLSEVCLKNTYEILEKVEEVYQDINKKNLTLKRLKEVIQTPRCPDIGINMDYDMNLSPSVYVKRDLEHLNRLKNIFKR >CP035282.1|QAT62326.1|2581966_2582833_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha MFNNGKELLKLCKEQNKKIYEIVILKECSSSNISGEELKNEMKKILNIMISSSSSGLNKKINSISGLTGGYAKKVEEYKNAGKTICGDTIISAMARALSTSEVNASMGQIVAAPTAGASGILPGAIITVKEKFNLKEEDMINGLFTAAGIGEIIAKNATISGAYGGCQAECGTASAMAGAGIVEMLGGTPQQCLNAASFSLINVMGLVCDPIAGLVEFPCIIRNASGVINALLSADLSLSGVDCIVPFDEVVDAMYKVGRELPTSLKETALGGLAATPTGEELKRRLL >CP035282.1|QAT62325.1|2581293_2581962_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-beta MKEYGIFDILGPIMIGPSSSHTAGAAKLGKTSEEIYGDDFDKVDFYLHGSFAKTYKGHGTDKALVAGILGMEPSSEKLKDSFIIAKEKGIEFNFYETDLGYEHPNTVKIVFHKDNKRDFYIIGSSIGGGSILITDINGNKVELTGESPTLILEYPDKKGVISKVGTILAYNNINIANMKVSRFDKNATMIVETDNFMDKKILDEISAGEEIIYGNIINPVRR >CP035282.1|QAT62324.1|2580576_2581221_+|di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase MRIPNHIGIIPDGNRRWAVKNGMTKEKGYNMGLKPGLELFKLCEKEGINEITYYGFTTDNTKRPKFQRVAFTQACIDAVKMLSKENASLFIVGNTESPMFPRELIPYTIKRQTFGNGKTKINFLVNYGWQWDLNDCFASNEKDKNMMDLIRSREISRIDLIIRWGGRRRLSGFLPLQSVYSDLYIIDEYWPEFTPKHFYNALEWYDKQDITLGG >CP035282.1|QAT62323.1|2580016_2580415_+|PspC-domain-containing-protein MARKIYRSKDNKIISGVCGGLGEYFNVDPSIMRLLWIILAFVTAGFAIIAYFICALVIPQGDSDVIYYGDDDDNTFKNNSSFIGIVLIIFGSFMLIKKLFPWFTAKWFNIGRYWPILLIIAGIYIIYTQRKQ >CP035282.1|QAT62322.1|2579431_2579863_-|FHA-domain-containing-protein MYNILSLVFKYLFIFVIYFFMINIIRLIYLDIKGINMTTFDKNTYLKLINRKEALPFKVKEYYSVDDGVSIGRGNQNNIVIKDQYISKQHLKIVKDEDEYYLEDLNSANGSFVNGQRVMDVIRIKNGDRINLGQVEFLFVNKD >CP035282.1|QAT62332.1|2594792_2595077_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MKISNYNYAFLFYDVNEKRVNKVFKVCKKYFKHHQKSVFRGNITPSNLIKLTAELKKIINPKEDFISIIKLMNEDSFDEETIGTNYKDSESLIL >CP035282.1|QAT62333.1|2595080_2595959_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGKHTRYIMSMGELSRKDNSILFRNEKGNNYIPVEDTREIYCLNEISMNTKFLDFASRAGIAKAIVLGIAENIYEVLYHYYKHGKKELKEFLYWLKEDIPNFLDKDLDIKHILFIEGQIWMKFYDSFKYFLPEDFIMNKRVKRPPDNPINALISFGNSILYSRTITQIYNTHLNQTISFLHEPRESRFSLSLDLSEVFKPVVVYKSIFELVNNRKIQVDKHFVKKFNYCLLNDSGKKIFIESIENRFSNVFEHKILKRKISYETAIKLDGYKLIKYCMEGKEFKPFSLKEMM >CP035282.1|QAT62334.1|2595983_2596478_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKVNGTMINYYFHCKRQCWLFANRINLEDNSEDVHIGRVLHELKYNGNENAEVSIENIKVDKITNDYLVEIKKSDADVKAAKWQTLLYLKILKEKGINRKGKIEFIEKNKQNKKIITLELTEEEKNKLNELENEIIEFVSSDKLPDPIYKPKCKKCAFYEYCFI >CP035282.1|QAT62335.1|2596493_2599088_-|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MIFDGVKLFDMDKFIPNNEDIYAHLKEDRNRKDDIKERLKEHSDLAYSYFLKLCEEKKLNGVFKNLENVFFGKDEYDGIKLWEEMVCNEIYMHDLGKINSGFQYRKMRNEKYENKPTEDSKHSMLSACIYFDYFFKKIRKFIGNIEENKNLCSTLLTFLFLNSYIISRHHSSFDDLYEFGEKFQESYKKYRNNKIIYEDYNVDFFATENHVKAVFKLCGDFLKNYDKSQPWNCMNIYIYTKFVYSLLVASDFYSTSEFINGNEIKKFGTIKDVDRFYDIYKENKNYKSIRRYEKCINGEGIKPYKDGDINELRSSMFLEAEKNLENHLNENIFYLEAPTGSGKTNTSINLAFKMLKNNSNLNKIFYIFPFNTLVEQTKKSLNDIFKGNKDIQNDITVVNSITPIKLIDEEEDNKLHLKGSLKQEINYERAVLDRQFLHYPIVLTTHVGFFSHLFGNEREEVFPLVHLANSVVILDEIQSYRNDIWKEIILFLKKYTEILNIKIIIMSATLPKLDKLTDTKEEFVSLIENKDKYFKNPLFKNRVKPDYSLLNVSENLWDRLKEKLIEVAKSTDKNIAIEFITKKSAEKFYDELYHNKELSGKKILLLTGDNNKFERNEIIKDVNDENNIILVSTQIIEAGLDVDMYAGFKDISILDSEEQFMGRINRSCLKKMAVVYFFDLDKASTVYKKDYRKDSSVTLKQGYIRDILENKDFDKFYEIIMRRIEENLNRENPDNIKNFRESIIELNYRIISKRMELISDDMKEYTVFINREVNLEKKGKLIGREVWQEYKKVLMDKNIGYAEKKVKLSEVMEKMSYFIYKVRSLNVSYNDLIGEIFYLEDGEKYFEDGKFKRALLEEGNCDIL >CP035282.1|QAT62336.1|2599143_2599899_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MDGIKFLLKGRTAFFKKPDVNTYLYFTYGNIHKIALLGIIGAAMGFKGYTFQDEKTYPEFYEKLKDLKFSVVPDNNPGGFIPKKIQTFNNSVGYASQESGGNLVVTEQWLENPSWEIYILIDDNPYIDEIKDRLLNGKFVYLPYLGKNDHFADILDTKLVKLEEVSDFDRLDSLFLKDYFEILDKADAFTGIFNEDYKEEKLWKYEEKLPEKLDENTNQYITKRYVFTNMNVKPKKKCPVFSDGNKNLFFS >CP035282.1|QAT63463.1|2599903_2600884_-|CRISPR-associated-protein MKKRVYGVIGIKSIMSNWNADFSGYPKSISTGEIFGSDKALKYPMKRMWLDQGEKILYIKSLKMAEDKKGKKELRPKSLEERYEEIFSVPKLKDEDKKEVVQNLFTALDVKNFGATFAEEGNNISITGTVQIGQGFNKYDKTSVEEQQILSPFRVENEEIKRKNKRNKEEGKEMEEANASTLGTKIVSSEAHYFYPFVINPTSYNDYIKLGVTEGYTEEDYKKFKEAALVSATAFNTNSKIGCENELSIFIETESDLYLPDITQYIEFEKGGEKDIIRFSKELIDLIDKLSDKIINTEVYYNSLKIHIDKNFPKAKYYNIFTREEL >CP035282.1|QAT62337.1|2600888_2602622_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b/Csh1 MLKDCIDTFKKIYEEKDDRIIIDNYVLPEGSYILVDGKGDIEKILEVNKEDTDRNDSMYYIFAEMDYLSRLVDMNKPVDPKKVIHSNNCFSFFIKKPNVNSKKLTGEVIDNYYKNILYPEKRYEGKKKDMYLDIEKKYGKADEKIIEKNKNWIKNRIYTIIEEENIKNDKNYLKIFFKADMEQYKIESEKYIIPNIYNDAKYNIKIGDEVLGLPNDNMGLNSKKPYLEHKTRKNKLPYLISEEDVMIQKKFFDYLMNYASQGRTNIYISDSDIKCLTNDESPDKDFSGYFLKVQKGKEVEIKDFDEIVLYENKIKNLNIENVLSIKYEGKEQHLNNYGPLENWKDLKNVINEVYFSKYLTNNYFTEPKDLKVYDPEIGRNILRYRKAFFDWLYKGDEMVIRQVFPQVTMNLIENSICNGYILRAKEQFNLRESIIKYFGGVKNMGDILKDISDKLREKIKKDSTDQIETDKGYYFAVGQLVSFLISKNKSSKKMHSLINPILNCSTDEKLKDELRKLFIKYNYDIWKDSKKFNNLYAMVIGYVPEKDGIMKDILIGGYLYSNLLYEKDKEEVKEDGK >CP035282.1|QAT62338.1|2602640_2603336_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MKVYEFKLKVYALENMNSKRSLEYISQLIDKSFLKNKELSDFHEENVFKNYVHNGFYPVEKSKIYQKGNIYTVIIRTVDERLADHFEKYLANEYTRYLKALTVEKSIIPDRGIIEKIYSITPAVAKFEEGYWRKSESVGNYEKRLMGNIIKKYNDYFNEKIEENFELFTFLKFDNMKPVASEFKNIQLLGDKLTLYVAENKMAQKLAYFALGVGILELNSRGFGYVNCKWF >CP035282.1|QAT63464.1|2603877_2604261_-|N-acetyltransferase MTADEDDYNELIDPDMRGETYFEVLSGCELIGFLTLNISENVADIGIGMRPDLTGRGLGTEFMSSCLNFITKKHRNVKAITLSVACFNIRAIKVYKKLDFKEEYHFDQQTNGGNFKFVSMRKKVSLE >CP035282.1|QAT62339.1|2604743_2605292_-|hydrolase MSRFNLDTKDAVLLIIDIQGKLVKVMKYGKQVIDKTNILISASEELKFPIIYTEQYPKGLGGTVPELQEGLKTAKKFEKVNFSAYLEEIKKELENTGRKKIIITGMETHVCVFQTAKDLIENGYDVFIVSDGVCSRTKENHKNGLSLMRDMGAVITNTETVVFDLLKKAGTPEFKVISKLIK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP035282_6 | 6.46|2033618|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2033618-2033653 | 36 | NZ_CP053834 | Arcobacter cloacae strain LMG 26153 plasmid pACLO, complete sequence | 80947-80982 | 5 | 0.861 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | MT074146 | Bacteroides phage SJC03, complete genome | 42866-42896 | 5 | 0.839 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP040345 | Bacillus albus strain DLOU-Yingkou plasmid unnamed1, complete sequence | 59013-59043 | 5 | 0.839 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP053657 | Bacillus cereus strain CTMA_1571 plasmid p.1, complete sequence | 279709-279739 | 5 | 0.839 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP020859 | Lactobacillus salivarius strain ZLS006 plasmid unnamed1, complete sequence | 218048-218078 | 6 | 0.806 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP046110 | Enterococcus faecalis strain 133170041-3 plasmid pTEF2, complete sequence | 12949-12979 | 6 | 0.806 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP034857 | Buchnera aphidicola (Sitobion avenae) strain Sav plasmid pTrp, complete sequence | 716-746 | 6 | 0.806 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_AP019370 | Silvanigrellales bacterium RF1110005 plasmid 68K, complete sequence | 51647-51677 | 6 | 0.806 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | AP013441 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G17, isolate: uvMED-CGR-C22-MedDCM-OCT-S33-C34 | 10138-10168 | 6 | 0.806 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP047433 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-5, complete sequence | 15422-15452 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP047433 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-5, complete sequence | 15377-15407 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP053308 | Spiroplasma citri strain C5 plasmid pScpC5-4, complete sequence | 12634-12664 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP053308 | Spiroplasma citri strain C5 plasmid pScpC5-4, complete sequence | 12589-12619 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NC_021336 | Bacillus phage MG-B1, complete genome | 58-88 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NC_007390 | Spiroplasma citri pSci4 plasmid | 1045-1075 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NC_007390 | Spiroplasma citri pSci4 plasmid | 1090-1120 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NC_007391 | Spiroplasma citri pSci5 plasmid | 20990-21020 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NC_007391 | Spiroplasma citri pSci5 plasmid | 21035-21065 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP047438 | Spiroplasma citri strain BLH-MB plasmid pSciBLHMB-1, complete sequence | 23352-23382 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP047438 | Spiroplasma citri strain BLH-MB plasmid pSciBLHMB-1, complete sequence | 23397-23427 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP045340 | Vibrio sp. THAF190c plasmid pTHAF190c_b, complete sequence | 202342-202372 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP022605 | Ochrobactrum quorumnocens strain A44 plasmid unnamed1, complete sequence | 651411-651441 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | MH622943 | Myoviridae sp. isolate ctbc_4, complete genome | 155138-155168 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP047432 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-4, complete sequence | 3907-3937 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP053311 | Spiroplasma citri strain C5 plasmid pScpC5-7, complete sequence | 6810-6840 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | MN855764 | Siphoviridae sp. isolate 508, partial genome | 47819-47849 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP013227 | Staphylococcus aureus strain UTSW MRSA 55 plasmid UTSW55_1, complete sequence | 20396-20426 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NC_007389 | Spiroplasma citri pSci3 plasmid | 17459-17489 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP046370 | Spiroplasma citri strain BR12 plasmid pScpBR12-2, complete sequence | 30349-30379 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP047441 | Spiroplasma citri strain BLH-MB plasmid pSciBLHMB-4, complete sequence | 28528-28558 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP042473 | Spiroplasma citri strain CC-2 plasmid pScpCC2-1, complete sequence | 18490-18520 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | KY744233 | Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 5, partial genome | 35352-35382 | 7 | 0.774 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | KY744235 | Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 6, partial genome | 34713-34743 | 7 | 0.774 |
CP035282_5 | 5.24|2016298|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2016298-2016332 | 35 | MN694145 | Marine virus AFVG_250M840, complete genome | 36188-36222 | 8 | 0.771 |
CP035282_5 | 5.32|2016819|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2016819-2016855 | 37 | KC821619 | Cellulophaga phage phi18:1, complete genome | 618-654 | 8 | 0.784 |
CP035282_5 | 5.32|2016819|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2016819-2016855 | 37 | KC821627 | Cellulophaga phage phi18:2, complete genome | 618-654 | 8 | 0.784 |
CP035282_6 | 6.6|2031005|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2031005-2031039 | 35 | NZ_CP023246 | Bacillus cereus strain HBL-AI plasmid unnamed1, complete sequence | 501203-501237 | 8 | 0.771 |
CP035282_6 | 6.6|2031005|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2031005-2031039 | 35 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 238516-238550 | 8 | 0.771 |
CP035282_6 | 6.11|2031332|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2031332-2031366 | 35 | NZ_CP006909 | Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence | 198994-199028 | 8 | 0.771 |
CP035282_6 | 6.11|2031332|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2031332-2031366 | 35 | NC_010379 | Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence | 106597-106631 | 8 | 0.771 |
CP035282_6 | 6.27|2032381|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2032381-2032416 | 36 | KX495186 | Bacillus phage PK16, complete genome | 20324-20359 | 8 | 0.778 |
CP035282_7 | 7.35|2047889|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2047889-2047924 | 36 | MN694568 | Marine virus AFVG_250M879, complete genome | 50179-50214 | 8 | 0.778 |
CP035282_9 | 9.18|2466716|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2466716-2466752 | 37 | NZ_CP019601 | Brachyspira hyodysenteriae strain BH718 plasmid pBH718, complete sequence | 3075-3111 | 8 | 0.784 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP045273 | Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301A, complete sequence | 125520-125550 | 8 | 0.742 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NC_007390 | Spiroplasma citri pSci4 plasmid | 997-1027 | 8 | 0.742 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NC_007391 | Spiroplasma citri pSci5 plasmid | 20942-20972 | 8 | 0.742 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | CP053591 | Aquimarina sp. TRL1 plasmid unnamed, complete sequence | 23400-23430 | 8 | 0.742 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 498366-498396 | 8 | 0.742 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP026129 | Acinetobacter baumannii strain ABNIH28 plasmid pABA-2f10, complete sequence | 84772-84802 | 8 | 0.742 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP053316 | Bacillus circulans strain GN03 plasmid unnamed, complete sequence | 153427-153457 | 8 | 0.742 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | JQ287645 | Sulfolobus virus STSV2, complete genome | 6249-6279 | 8 | 0.742 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | MH341451 | Listeria phage PSU-VKH-LP019, complete genome | 10263-10293 | 8 | 0.742 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | KP399677 | Listeria phage vB_LmoS_188, complete genome | 10266-10296 | 8 | 0.742 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | MN855961 | Bacteriophage sp. isolate 145, complete genome | 5191-5221 | 8 | 0.742 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | DQ003642 | Listeria phage A006, complete genome | 10279-10309 | 8 | 0.742 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | AF128887 | Shigella flexneri bacteriophage VI tailspike protein gene, complete cds | 473-503 | 8 | 0.742 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NC_005344 | Enterobacteria phage Sf6, complete genome | 14172-14202 | 8 | 0.742 |
CP035282_3 | 3.1|1863133|34|CP035282|CRISPRCasFinder | 1863133-1863166 | 34 | MN693342 | Marine virus AFVG_25M9, complete genome | 7576-7609 | 9 | 0.735 |
CP035282_4 | 4.25|2012498|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT | 2012498-2012534 | 37 | KX397365 | Erwinia phage vB_EamM_Caitlin, complete genome | 64889-64925 | 9 | 0.757 |
CP035282_5 | 5.32|2016819|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2016819-2016855 | 37 | KC821615 | Cellulophaga phage phi12:3, complete genome | 591-627 | 9 | 0.757 |
CP035282_5 | 5.32|2016819|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2016819-2016855 | 37 | NC_021791 | Cellulophaga phage phi12:1, complete genome | 591-627 | 9 | 0.757 |
CP035282_6 | 6.6|2031005|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2031005-2031039 | 35 | NZ_CP031069 | Bacillus sp. JAS24-2 plasmid pl626, complete sequence | 610693-610727 | 9 | 0.743 |
CP035282_6 | 6.6|2031005|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2031005-2031039 | 35 | NZ_CP007513 | Bacillus bombysepticus plasmid pBb, complete genome | 76365-76399 | 9 | 0.743 |
CP035282_6 | 6.6|2031005|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2031005-2031039 | 35 | CP046512 | Bacillus cereus strain JHU plasmid p1, complete sequence | 446749-446783 | 9 | 0.743 |
CP035282_6 | 6.11|2031332|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2031332-2031366 | 35 | CAJDKB010000002 | Enterococcus phage vB_EhiS_268 genome assembly, contig: phage268-genome, whole genome shotgun sequence | 31633-31667 | 9 | 0.743 |
CP035282_6 | 6.11|2031332|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2031332-2031366 | 35 | CAJCJZ010000002 | Enterococcus phage vB_EfaS_140 genome assembly, contig: phage140-genome, whole genome shotgun sequence | 36833-36867 | 9 | 0.743 |
CP035282_6 | 6.11|2031332|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2031332-2031366 | 35 | MN694090 | Marine virus AFVG_250M1127, complete genome | 34754-34788 | 9 | 0.743 |
CP035282_6 | 6.11|2031332|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2031332-2031366 | 35 | NC_007021 | Staphylococcus phage Twort, complete genome | 94551-94585 | 9 | 0.743 |
CP035282_6 | 6.11|2031332|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2031332-2031366 | 35 | MT151386 | Staphylococcus virus Twort, complete genome | 6374-6408 | 9 | 0.743 |
CP035282_6 | 6.11|2031332|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2031332-2031366 | 35 | MT151386 | Staphylococcus virus Twort, complete genome | 136912-136946 | 9 | 0.743 |
CP035282_7 | 7.7|2046036|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2046036-2046070 | 35 | LT985193 | Pseudomonas syringae strain CFBP 2116 genome assembly, plasmid: PP2 | 4894-4928 | 9 | 0.743 |
CP035282_7 | 7.7|2046036|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2046036-2046070 | 35 | NZ_LT963410 | Pseudomonas syringae isolate CFBP3840 plasmid PP1, complete sequence | 89488-89522 | 9 | 0.743 |
CP035282_9 | 9.4|2465805|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2465805-2465841 | 37 | MK448842 | Streptococcus phage Javan110, complete genome | 10296-10332 | 9 | 0.757 |
CP035282_9 | 9.4|2465805|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2465805-2465841 | 37 | NZ_CP013848 | Clostridium botulinum strain Af650 plasmid pRSJ14_1, complete sequence | 42685-42721 | 9 | 0.757 |
CP035282_9 | 9.4|2465805|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2465805-2465841 | 37 | NC_019782 | Lactobacillus phage AQ113, complete genome | 33730-33766 | 9 | 0.757 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | MN694499 | Marine virus AFVG_250M606, complete genome | 17402-17436 | 9 | 0.743 |
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CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP016716 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC063 plasmid pUC063B, complete sequence | 34095-34125 | 9 | 0.71 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NC_014633 | Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence | 656410-656440 | 9 | 0.71 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP053834 | Arcobacter cloacae strain LMG 26153 plasmid pACLO, complete sequence | 17294-17324 | 9 | 0.71 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP026534 | Bacillus velezensis strain DKU_NT_04 plasmid p1_DKU_NT_04, complete sequence | 38970-39000 | 9 | 0.71 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | CP029292 | Lactococcus lactis subsp. lactis KLDS 4.0325 plasmid unnamed5 | 27054-27084 | 9 | 0.71 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP020611 | Lactococcus lactis subsp. lactis bv. diacetylactis strain FM03 plasmid pLd7, complete sequence | 20120-20150 | 9 | 0.71 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP034581 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC06 plasmid pUC06F, complete sequence | 18893-18923 | 9 | 0.71 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | CP034573 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC77 plasmid pUC77C, complete sequence | 43552-43582 | 9 | 0.71 |
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CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP032858 | Bacillus subtilis subsp. subtilis strain 2RL2-3 plasmid unnamed1, complete sequence | 93984-94014 | 9 | 0.71 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP032873 | Bacillus subtilis subsp. subtilis strain 2KL1 plasmid unnamed1, complete sequence | 115021-115051 | 9 | 0.71 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_CP016696 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain 229 plasmid p229C, complete sequence | 20020-20050 | 9 | 0.71 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NC_017487 | Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56B, complete sequence | 21207-21237 | 9 | 0.71 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | CP034582 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain C10 plasmid pC10B, complete sequence | 36839-36869 | 9 | 0.71 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NC_019765 | Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.01, complete sequence | 278179-278209 | 9 | 0.71 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | KP296792 | Bacteriophage Lily, complete genome | 4961-4991 | 9 | 0.71 |
CP035282_10 | 10.10|2593295|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2593295-2593329 | 35 | NC_013792 | Bacillus pseudofirmus OF4 plasmid pBpOF4-01, complete sequence | 148757-148791 | 9 | 0.743 |
CP035282_6 | 6.10|2031267|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2031267-2031302 | 36 | HQ316581 | Vibrio phage martha 12B12 genomic sequence | 27938-27973 | 10 | 0.722 |
CP035282_6 | 6.11|2031332|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2031332-2031366 | 35 | MT416612 | Bacillus phage YungSlug, complete genome | 33102-33136 | 10 | 0.714 |
CP035282_6 | 6.46|2033618|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2033618-2033653 | 36 | NZ_CP017573 | Bacillus thuringiensis strain SCG04-02 plasmid PSCG61, complete sequence | 27397-27432 | 10 | 0.722 |
CP035282_7 | 7.33|2047757|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2047757-2047793 | 37 | NZ_CP015177 | Bacillus thuringiensis serovar alesti strain BGSC 4C1 plasmid pBMB267, complete sequence | 184935-184971 | 10 | 0.73 |
CP035282_9 | 9.4|2465805|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2465805-2465841 | 37 | MK448903 | Streptococcus phage Javan310, complete genome | 10154-10190 | 10 | 0.73 |
CP035282_9 | 9.26|2467236|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467236-2467272 | 37 | EU350361 | Abalone shriveling syndrome-associated virus, complete genome | 2472-2508 | 10 | 0.73 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NZ_CP019166 | Listeria monocytogenes strain HPB5415 plasmid pLM5578, complete sequence | 43308-43342 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NZ_KU513859 | Listeria monocytogenes strain IZSAM_Lm_15_17439_A144 plasmid pLmA144, complete sequence | 66702-66736 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NZ_CP022021 | Listeria monocytogenes strain FDA709873-33 plasmid pCFSAN021445, complete sequence | 94646-94680 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NZ_CP023753 | Listeria monocytogenes strain AT3E plasmid pLM58, complete sequence | 35081-35115 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NZ_CP025439 | Listeria monocytogenes strain MF4697 plasmid pMF4697, complete sequence | 25384-25418 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NC_022045 | Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid, complete sequence | 54557-54591 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NZ_CP023053 | Listeria monocytogenes strain FDA709873-31 plasmid pCFSAN021143, complete sequence | 13080-13114 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | MK134858 | Listeria monocytogenes plasmid pLM1686, complete sequence | 68981-69015 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NC_013767 | Listeria monocytogenes 08-5578 plasmid pLM5578, complete sequence | 74783-74817 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NC_018889 | Listeria monocytogenes SLCC2372 plasmid pLM1-2cUG1, complete sequence | 18164-18198 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NZ_CP025561 | Listeria monocytogenes strain PIR00545 plasmid pPIR00545, complete sequence | 18461-18495 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NZ_CP045744 | Listeria innocua strain CFSAN044836 plasmid pCFSAN044836, complete sequence | 29516-29550 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NC_014495 | Listeria monocytogenes serotype 1-2b str. SLCC2755 plasmid pLM1-2bUG1 complete sequence | 25845-25879 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NZ_CP025569 | Listeria monocytogenes strain PIR00540 plasmid pPIR00540, complete sequence | 14948-14982 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NZ_CP015985 | Listeria monocytogenes strain 2015TE24968 plasmid pl2015TE24968, complete sequence | 54525-54559 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NZ_CP013725 | Listeria monocytogenes strain Lm N1546 plasmid pLmN1546, complete sequence | 37645-37679 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NZ_HG813248 | Listeria monocytogenes R479a plasmid pLMR479a, complete sequence | 66702-66736 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NZ_CP025260 | Listeria monocytogenes strain MF4624 plasmid pMF4624, complete sequence | 25384-25418 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NZ_CP025083 | Listeria monocytogenes strain MF4626 plasmid pMF4626, complete sequence | 35082-35116 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NZ_CP023051 | Listeria monocytogenes strain FDA971911-001-001 plasmid pCFSAN059932, complete sequence | 33357-33391 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NC_021828 | Listeria monocytogenes strain R2-502 plasmid, complete sequence | 45845-45879 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NZ_CP041214 | Listeria monocytogenes strain LMP18-H8393 plasmid pCFSAN074382, complete sequence | 14647-14681 | 10 | 0.714 |
CP035282_9 | 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2467437-2467471 | 35 | NZ_CP045973 | Listeria monocytogenes strain AUSMDU00000224 plasmid pAUSMDU00000224_01, complete sequence | 25516-25550 | 10 | 0.714 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | NZ_MK275625 | Clostridium perfringens strain JXJA17 plasmid p7, complete sequence | 8414-8444 | 10 | 0.677 |
CP035282_10 | 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR | 2592903-2592933 | 31 | KU878088 | Bacillus phage AR9, complete genome | 106679-106709 | 10 | 0.677 |
CP035282_10 | 10.4|2592897|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT | 2592897-2592933 | 37 | NZ_CP020859 | Lactobacillus salivarius strain ZLS006 plasmid unnamed1, complete sequence | 218047-218083 | 10 | 0.73 |
CP035282_10 | 10.4|2592897|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT | 2592897-2592933 | 37 | NZ_CP046110 | Enterococcus faecalis strain 133170041-3 plasmid pTEF2, complete sequence | 12948-12984 | 10 | 0.73 |
CP035282_10 | 10.25|2594285|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2594285-2594319 | 35 | NC_014633 | Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence | 354948-354982 | 10 | 0.714 |
CP035282_3 | 3.1|1863133|34|CP035282|CRISPRCasFinder | 1863133-1863166 | 34 | NZ_CP023670 | Methylomonas koyamae strain LM6 plasmid pLM6, complete sequence | 118922-118955 | 11 | 0.676 |
CP035282_4 | 4.25|2012498|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT | 2012498-2012534 | 37 | MN850639 | Escherichia phage radambza, complete genome | 54667-54703 | 11 | 0.703 |
CP035282_5 | 5.16|2015779|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2015779-2015814 | 36 | KU878088 | Bacillus phage AR9, complete genome | 12242-12277 | 11 | 0.694 |
CP035282_5 | 5.16|2015779|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2015779-2015814 | 36 | MF360957 | Bacillus virus PBS1, complete genome | 172802-172837 | 11 | 0.694 |
CP035282_6 | 6.6|2031005|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2031005-2031039 | 35 | NC_015861 | Lactococcus lactis subsp. lactis plasmid pIL3, complete sequence | 4274-4308 | 11 | 0.686 |
CP035282_9 | 9.4|2465805|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2465805-2465841 | 37 | MK448921 | Streptococcus phage Javan374, complete genome | 9397-9433 | 11 | 0.703 |
CP035282_10 | 10.13|2593491|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2593491-2593526 | 36 | NZ_CP053932 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed1, complete sequence | 12791-12826 | 11 | 0.694 |
CP035282_10 | 10.13|2593491|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2593491-2593526 | 36 | NZ_CP009719 | Bacillus thuringiensis strain HD682 plasmid pBGN_1, complete sequence | 6297-6332 | 11 | 0.694 |
CP035282_6 | 6.46|2033618|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2033618-2033653 | 36 | NZ_CP024772 | Bacillus thuringiensis LM1212 plasmid pLM1, complete sequence | 126402-126437 | 12 | 0.667 |
CP035282_6 | 6.46|2033618|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2033618-2033653 | 36 | NZ_CP041074 | Bacillus tropicus strain LM1212-W3 plasmid p1, complete sequence | 103685-103720 | 12 | 0.667 |
1. spacer 6.46|2033618|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053834 (Arcobacter cloacae strain LMG 26153 plasmid pACLO, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.861
tggacagaaaaagaaaaatgaaatttacaaaaaatt CRISPR spacer tatagaaaaaaagaataatgaaatttacaaaaaatt Protospacer *. * *.******** ********************
2. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to MT074146 (Bacteroides phage SJC03, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer agaaagaatgagaaaaataaagaaaaaatag Protospacer ** *.***** ******************
3. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP040345 (Bacillus albus strain DLOU-Yingkou plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac- CRISPR spacer ggctaaaatgataaaaataaag-agagatact Protospacer .**********.********** *.*.****
4. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP053657 (Bacillus cereus strain CTMA_1571 plasmid p.1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac- CRISPR spacer ggctaaaatgataaaaataaag-agagatact Protospacer .**********.********** *.*.****
5. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP020859 (Lactobacillus salivarius strain ZLS006 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer gtctaaaatggcaaaaataaagaataaagat Protospacer . ********.************* *** *.
6. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP046110 (Enterococcus faecalis strain 133170041-3 plasmid pTEF2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer tgtaagaatggcaaaaaaaaagaaaaaatac Protospacer *. *.****.****** *************
7. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP034857 (Buchnera aphidicola (Sitobion avenae) strain Sav plasmid pTrp, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer ataaataatgaaaaaaataaaaaaaaaatac Protospacer * * ***** *********.*********
8. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_AP019370 (Silvanigrellales bacterium RF1110005 plasmid 68K, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aggaaaaatgaaaaaaacaaagaaaaaaaat Protospacer ** ******* *****.********** *.
9. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to AP013441 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G17, isolate: uvMED-CGR-C22-MedDCM-OCT-S33-C34) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
agcta-aaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer -gttattgatgacaagtataaagaaaaaatac Protospacer *.** .*******. ***************
10. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP047433 (Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-5, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer gaatactatgaaaaaaataaagaaaaaataa Protospacer .. ** **** ******************
11. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP047433 (Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-5, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aaatattatgaaaaaaataaagaaaaattat Protospacer *. ** **** *************** **.
12. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP053308 (Spiroplasma citri strain C5 plasmid pScpC5-4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer gaatactatgaaaaaaataaagaaaaaataa Protospacer .. ** **** ******************
13. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP053308 (Spiroplasma citri strain C5 plasmid pScpC5-4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aaatattatgaaaaaaataaagaaaaattat Protospacer *. ** **** *************** **.
14. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NC_021336 (Bacillus phage MG-B1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aattaaaataataaaaataaagaaaaaagtt Protospacer *..******.*.**************** .
15. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NC_007390 (Spiroplasma citri pSci4 plasmid) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer gaatactatgaaaaaaataaagaaaaaataa Protospacer .. ** **** ******************
16. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NC_007390 (Spiroplasma citri pSci4 plasmid) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aaatattatgaaaaaaataaagaaaaattat Protospacer *. ** **** *************** **.
17. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NC_007391 (Spiroplasma citri pSci5 plasmid) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer gaatactatgaaaaaaataaagaaaaaataa Protospacer .. ** **** ******************
18. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NC_007391 (Spiroplasma citri pSci5 plasmid) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aaatattatgaaaaaaataaagaaaaattat Protospacer *. ** **** *************** **.
19. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP047438 (Spiroplasma citri strain BLH-MB plasmid pSciBLHMB-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer gaatactatgaaaaaaataaagaaaaaataa Protospacer .. ** **** ******************
20. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP047438 (Spiroplasma citri strain BLH-MB plasmid pSciBLHMB-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aaatattatgaaaaaaataaagaaaaattat Protospacer *. ** **** *************** **.
21. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP045340 (Vibrio sp. THAF190c plasmid pTHAF190c_b, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer ggctaaaatgaccaaaataaagaccacttag Protospacer .*********** ********** * **
22. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP022605 (Ochrobactrum quorumnocens strain A44 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaa-aaaatac CRISPR spacer gcgttaaatgacaaaaataaagaataatgta- Protospacer . * ******************* ** .**
23. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to MH622943 (Myoviridae sp. isolate ctbc_4, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aaatattatgataaaaataaagaaaaaattg Protospacer *. ** ****.*****************
24. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP047432 (Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aaatattatgaaaaaaataaagaaaaattat Protospacer *. ** **** *************** **.
25. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP053311 (Spiroplasma citri strain C5 plasmid pScpC5-7, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aaatattatgaaaaaaataaagaaaaattat Protospacer *. ** **** *************** **.
26. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to MN855764 (Siphoviridae sp. isolate 508, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaa-atac CRISPR spacer cttaaaaatgacaaaaatattgaaaaagata- Protospacer . *************** ****** ***
27. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP013227 (Staphylococcus aureus strain UTSW MRSA 55 plasmid UTSW55_1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaaga-aaaaatac CRISPR spacer ggtaaaaatgataaaaataaagacaaagaca- Protospacer .*. *******.*********** ***.*.*
28. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NC_007389 (Spiroplasma citri pSci3 plasmid) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aaatattatgaaaaaaataaagaaaaattat Protospacer *. ** **** *************** **.
29. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP046370 (Spiroplasma citri strain BR12 plasmid pScpBR12-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aaatattatgaaaaaaataaagaaaaattat Protospacer *. ** **** *************** **.
30. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP047441 (Spiroplasma citri strain BLH-MB plasmid pSciBLHMB-4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aaatattatgaaaaaaataaagaaaaattat Protospacer *. ** **** *************** **.
31. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP042473 (Spiroplasma citri strain CC-2 plasmid pScpCC2-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aaatattatgaaaaaaataaagaaaaattat Protospacer *. ** **** *************** **.
32. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to KY744233 (Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 5, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aacagaaatgagaaaaataaagaataaaaaa Protospacer *.* .****** ************ *** *
33. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to KY744235 (Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 6, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aacagaaatgagaaaaataaagaataaaaaa Protospacer *.* .****** ************ *** *
34. spacer 5.24|2016298|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694145 (Marine virus AFVG_250M840, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ctggcgattgaggacttctcaatacagatggctat CRISPR spacer gttgtggtaaaggacttctctatacagatgactat Protospacer * *.*.* .********** *********.****
35. spacer 5.32|2016819|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KC821619 (Cellulophaga phage phi18:1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
cttggtgggagtccttgtcaggggtttagtaaaacag CRISPR spacer attggaggtagtccttgtcaggggtttagctttgcag Protospacer **** ** ********************. .***
36. spacer 5.32|2016819|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KC821627 (Cellulophaga phage phi18:2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
cttggtgggagtccttgtcaggggtttagtaaaacag CRISPR spacer attggaggtagtccttgtcaggggtttagctttgcag Protospacer **** ** ********************. .***
37. spacer 6.6|2031005|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023246 (Bacillus cereus strain HBL-AI plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
gggcatttttcttattaattttattttctcgtcgt CRISPR spacer ttgcatttttcttattactattattttcccatgtt Protospacer *************** * ********.*.* *
38. spacer 6.6|2031005|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
gggcatttttcttattaattttattttctcgtcgt CRISPR spacer tagcatttgtcttattaatattattttttgattgt Protospacer .****** ********** *******.* .*.**
39. spacer 6.11|2031332|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tgttaaataaagggaggaattaaaatgaatttaat CRISPR spacer gctaaaataaggggaggatttaaaatgaatatgac Protospacer * ******.******* *********** *.*.
40. spacer 6.11|2031332|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010379 (Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tgttaaataaagggaggaattaaaatgaatttaat CRISPR spacer gctaaaataaggggaggatttaaaatgaatatgac Protospacer * ******.******* *********** *.*.
41. spacer 6.27|2032381|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX495186 (Bacillus phage PK16, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tttttgagcttctttcacttcttatcactcctttta CRISPR spacer tctaaacgcttctttcacttcttatcaatcctttct Protospacer *.* . ******************** ******.
42. spacer 7.35|2047889|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694568 (Marine virus AFVG_250M879, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ttttaaccttgtttcttttatttctttatatttttc CRISPR spacer attcactaatgtttcttttaactctttatatttttc Protospacer **.* . *********** .**************
43. spacer 9.18|2466716|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019601 (Brachyspira hyodysenteriae strain BH718 plasmid pBH718, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tcacagagt---gcaaaaaagagattaaagagcaatttaa CRISPR spacer ---cagatttaaagaaaaaataaattaaagagcaatttaa Protospacer **** * . ****** *.*****************
44. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP045273 (Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer gaagagaatgataaaaataaagaaaaaattg Protospacer .. *.*****.*****************
45. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NC_007390 (Spiroplasma citri pSci4 plasmid) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer gaatattatgaaaaaaataaagaaaaattat Protospacer .. ** **** *************** **.
46. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NC_007391 (Spiroplasma citri pSci5 plasmid) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer gaatattatgaaaaaaataaagaaaaattat Protospacer .. ** **** *************** **.
47. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to CP053591 (Aquimarina sp. TRL1 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer ttttaaaatgaaaaaaaaaaagaaaaaacta Protospacer .******** ***** **********.
48. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer gatgaaaatgaaaaaaataaataaaaaaaat Protospacer ... ******* ********* ****** *.
49. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP026129 (Acinetobacter baumannii strain ABNIH28 plasmid pABA-2f10, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer tcggaaaatgacaaaaataaaaaacaagaac Protospacer *****************.** **. **
50. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP053316 (Bacillus circulans strain GN03 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer attaaaaatgaaaaatataaagaaaaagcaa Protospacer * . ******* *** ***********..*
51. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to JQ287645 (Sulfolobus virus STSV2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer actgatgatgaaaaaattaaagaaaaaataa Protospacer * . * .**** **** *************
52. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to MH341451 (Listeria phage PSU-VKH-LP019, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aaagaaaatgacaaaaacacagaaaaactct Protospacer *. *************.* ******* * .
53. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to KP399677 (Listeria phage vB_LmoS_188, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aaagaaaatgacaaaaacacagaaaaactct Protospacer *. *************.* ******* * .
54. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to MN855961 (Bacteriophage sp. isolate 145, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aattgaaatgacaaaaacaaagaaagaaatt Protospacer *..*.************.*******.** .
55. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to DQ003642 (Listeria phage A006, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aaagaaaatgacaaaaacacagaaaaactct Protospacer *. *************.* ******* * .
56. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to AF128887 (Shigella flexneri bacteriophage VI tailspike protein gene, complete cds) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer actcagcatgacaaaaataaagaagcaataa Protospacer * ..*. *****************. ****
57. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NC_005344 (Enterobacteria phage Sf6, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer actcagcatgacaaaaataaagaagcaataa Protospacer * ..*. *****************. ****
58. spacer 3.1|1863133|34|CP035282|CRISPRCasFinder matches to MN693342 (Marine virus AFVG_25M9, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gcagagattttgaaccgtttcttttccaatatgt CRISPR spacer cataaaattttgaaccatttcatttccaataggc Protospacer .*.**********.**** ********* *.
59. spacer 4.25|2012498|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT matches to KX397365 (Erwinia phage vB_EamM_Caitlin, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
gagagcgttttagagcgtttcagaggtattctgacgt CRISPR spacer gagagcgttatagagcgttttagagggtatatcgggt Protospacer ********* **********.***** * * . **
60. spacer 5.32|2016819|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KC821615 (Cellulophaga phage phi12:3, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
cttggtgggagtccttgtcaggggtttagtaaaacag CRISPR spacer attggaggtagtccttgtcaggggtttagctttgcgg Protospacer **** ** ********************. .*.*
61. spacer 5.32|2016819|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_021791 (Cellulophaga phage phi12:1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
cttggtgggagtccttgtcaggggtttagtaaaacag CRISPR spacer attggaggtagtccttgtcaggggtttagctttgcgg Protospacer **** ** ********************. .*.*
62. spacer 6.6|2031005|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031069 (Bacillus sp. JAS24-2 plasmid pl626, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
gggcatttttcttattaattttattttctcgtcgt CRISPR spacer ttgcatttttcttattactattattttcccacgtt Protospacer *************** * ********.*.. *
63. spacer 6.6|2031005|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP007513 (Bacillus bombysepticus plasmid pBb, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
gggcatttttcttattaattttattttctcgtcgt CRISPR spacer ttgcatttttcttattactattattttcccacgtt Protospacer *************** * ********.*.. *
64. spacer 6.6|2031005|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP046512 (Bacillus cereus strain JHU plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
gggcatttttcttattaattttattttctcgtcgt CRISPR spacer ttgcatttttcttattactattattttcccacgtt Protospacer *************** * ********.*.. *
65. spacer 6.11|2031332|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CAJDKB010000002 (Enterococcus phage vB_EhiS_268 genome assembly, contig: phage268-genome, whole genome shotgun sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tgttaaataaagggaggaattaaaatgaatttaat CRISPR spacer acataaataagaggaggaattaaaatgaaaaaaag Protospacer *******..***************** **
66. spacer 6.11|2031332|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CAJCJZ010000002 (Enterococcus phage vB_EfaS_140 genome assembly, contig: phage140-genome, whole genome shotgun sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tgttaaataaagggaggaattaaaatgaatttaat CRISPR spacer tgtaaattaaagggaggaattaaaaatgacaaaag Protospacer *** ** ****************** .*. **
67. spacer 6.11|2031332|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694090 (Marine virus AFVG_250M1127, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tgttaaataaagggaggaattaaaatgaatttaat CRISPR spacer aataaaatatagggagaaattaaaatgaagatcac Protospacer .* ***** ******.************ * *.
68. spacer 6.11|2031332|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007021 (Staphylococcus phage Twort, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tgttaaataaagggaggaattaaaatgaatttaat CRISPR spacer attcaaataaagggaggaataataatgaaaattgt Protospacer *.**************** * ****** * .*
69. spacer 6.11|2031332|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT151386 (Staphylococcus virus Twort, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tgttaaataaagggaggaattaaaatgaatttaat CRISPR spacer attcaaataaagggaggaataataatgaaaattgt Protospacer *.**************** * ****** * .*
70. spacer 6.11|2031332|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT151386 (Staphylococcus virus Twort, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tgttaaataaagggaggaattaaaatgaatttaat CRISPR spacer attcaaataaagggaggaataataatgaaaattgt Protospacer *.**************** * ****** * .*
71. spacer 7.7|2046036|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LT985193 (Pseudomonas syringae strain CFBP 2116 genome assembly, plasmid: PP2) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
taagccagaattgaaatactaccaggcggttgaat CRISPR spacer acatccaggattgaaagactaccaggcggtaatag Protospacer * ****.******* ************* . *
72. spacer 7.7|2046036|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LT963410 (Pseudomonas syringae isolate CFBP3840 plasmid PP1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
taagccagaattgaaatactaccaggcggttgaat CRISPR spacer acatccaggattgaaagactaccaggcggtaatag Protospacer * ****.******* ************* . *
73. spacer 9.4|2465805|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448842 (Streptococcus phage Javan110, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ctgttcaaggaagaatccaaacaagaagttatgaaga CRISPR spacer gcattactggacgaatccaaaccagaagttatgaaaa Protospacer ..** *** ********** ************.*
74. spacer 9.4|2465805|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013848 (Clostridium botulinum strain Af650 plasmid pRSJ14_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ctgttcaaggaagaatccaaacaagaagttatgaaga CRISPR spacer cagtaagtggaagaattcaaacaagaaattatgatgc Protospacer * ** . ********.**********.****** *
75. spacer 9.4|2465805|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019782 (Lactobacillus phage AQ113, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ctgttcaaggaagaatccaaacaagaagttatgaaga CRISPR spacer gagtagacggaagaattcaaactagaagttatgacaa Protospacer ** * ********.***** *********** .*
76. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694499 (Marine virus AFVG_250M606, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer aattcagttcttattttttcttgttcttccttaga Protospacer * *****.**********.******** .* .*
77. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NC_011263 (Borrelia recurrentis A1 plasmid pl6, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer taaaaaaatgaaaaaaataaataaaaaaagt Protospacer . ******* ********* ****** ..
78. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP016716 (Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC063 plasmid pUC063B, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer tacgtcaatgatgaaaataaagaaaaaattt Protospacer .* *****..**************** .
79. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NC_014633 (Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer tttacacatgacaagaataaagataaaatag Protospacer . * *******.******** ******
80. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP053834 (Arcobacter cloacae strain LMG 26153 plasmid pACLO, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer aatcttgattacaaaaataaagaaaaactag Protospacer *... .** ***************** **
81. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP026534 (Bacillus velezensis strain DKU_NT_04 plasmid p1_DKU_NT_04, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer tctgaaagtgacaaagataaagaaaaagcaa Protospacer . ***.*******.***********..*
82. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to CP029292 (Lactococcus lactis subsp. lactis KLDS 4.0325 plasmid unnamed5) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer tacgtcaatgatgaaaataaagaaaaaattt Protospacer .* *****..**************** .
83. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP020611 (Lactococcus lactis subsp. lactis bv. diacetylactis strain FM03 plasmid pLd7, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer tacgtcaatgatgaaaataaagaaaaaattt Protospacer .* *****..**************** .
84. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP034581 (Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC06 plasmid pUC06F, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer tacgtcaatgatgaaaataaagaaaaaattt Protospacer .* *****..**************** .
85. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to CP034573 (Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC77 plasmid pUC77C, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer tacgtcaatgatgaaaataaagaaaaaattt Protospacer .* *****..**************** .
86. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NC_015863 (Lactococcus lactis subsp. lactis plasmid pIL5, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer tacgtcaatgatgaaaataaagaaaaaattt Protospacer .* *****..**************** .
87. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP032858 (Bacillus subtilis subsp. subtilis strain 2RL2-3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer tctgaaagtgacaaagataaagaaaaagcaa Protospacer . ***.*******.***********..*
88. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP032873 (Bacillus subtilis subsp. subtilis strain 2KL1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer tctgaaagtgacaaagataaagaaaaagcaa Protospacer . ***.*******.***********..*
89. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_CP016696 (Lactococcus lactis subsp. lactis strain 229 plasmid p229C, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer tacgtcaatgatgaaaataaagaaaaaattt Protospacer .* *****..**************** .
90. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NC_017487 (Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56B, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer tacgtcaatgatgaaaataaagaaaaaattt Protospacer .* *****..**************** .
91. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to CP034582 (Lactococcus lactis subsp. lactis strain C10 plasmid pC10B, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer tacgtcaatgatgaaaataaagaaaaaattt Protospacer .* *****..**************** .
92. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NC_019765 (Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer cgactaatttacaaaaataaagaaaaaaagg Protospacer * . ** * ****************** .
93. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to KP296792 (Bacteriophage Lily, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer caagaaagagacaaaaataaagaaaaaggaa Protospacer . ***. ******************. *
94. spacer 10.10|2593295|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_013792 (Bacillus pseudofirmus OF4 plasmid pBpOF4-01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttttgccgagtgtatatggcaattaaaaaatatag CRISPR spacer tttgcttttgtgtatttggcaattaaaaaatgtac Protospacer *** .. ****** ***************.**
95. spacer 6.10|2031267|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HQ316581 (Vibrio phage martha 12B12 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
cagacaatgcgccacggaactttgcacaaaaggata CRISPR spacer atggaaatgcgccacggcactttgaacaaaatgtat Protospacer *. ************ ****** ****** *
96. spacer 6.11|2031332|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT416612 (Bacillus phage YungSlug, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tgttaaataaagggaggaattaaaatgaatttaat CRISPR spacer agttaactaaagggaggaattaagatgtacacgtg Protospacer ***** ****************.*** *. ..
97. spacer 6.46|2033618|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017573 (Bacillus thuringiensis strain SCG04-02 plasmid PSCG61, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
tggacagaaaaagaaaaatgaaatttacaaaaaatt CRISPR spacer gagcttgaaaaagaaaaaggaaagttacaaaaagaa Protospacer .* . ************ **** *********.
98. spacer 7.33|2047757|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP015177 (Bacillus thuringiensis serovar alesti strain BGSC 4C1 plasmid pBMB267, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
gtgtttatgttgtagaggaagaaatacagattataga CRISPR spacer gaaaattgtttgtagaggaaaaaatagagattataca Protospacer * . * ***********.***** ******** *
99. spacer 9.4|2465805|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448903 (Streptococcus phage Javan310, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
ctgttcaaggaagaatccaaacaagaagttatgaaga CRISPR spacer gaatcacaggacgaatccaaacaagaaattatgagaa Protospacer .*. **** ***************.******..*
100. spacer 9.26|2467236|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to EU350361 (Abalone shriveling syndrome-associated virus, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
taaaaagatatagatggtctgatgaaaagaaaaaata CRISPR spacer tcgttctagagagatggtctgatgaaaaacaaaaata Protospacer * . * * *****************. *******
101. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019166 (Listeria monocytogenes strain HPB5415 plasmid pLM5578, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
102. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KU513859 (Listeria monocytogenes strain IZSAM_Lm_15_17439_A144 plasmid pLmA144, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
103. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP022021 (Listeria monocytogenes strain FDA709873-33 plasmid pCFSAN021445, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
104. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP023753 (Listeria monocytogenes strain AT3E plasmid pLM58, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
105. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP025439 (Listeria monocytogenes strain MF4697 plasmid pMF4697, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
106. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_022045 (Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
107. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP023053 (Listeria monocytogenes strain FDA709873-31 plasmid pCFSAN021143, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
108. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK134858 (Listeria monocytogenes plasmid pLM1686, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
109. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_013767 (Listeria monocytogenes 08-5578 plasmid pLM5578, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
110. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_018889 (Listeria monocytogenes SLCC2372 plasmid pLM1-2cUG1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
111. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP025561 (Listeria monocytogenes strain PIR00545 plasmid pPIR00545, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
112. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP045744 (Listeria innocua strain CFSAN044836 plasmid pCFSAN044836, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
113. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_014495 (Listeria monocytogenes serotype 1-2b str. SLCC2755 plasmid pLM1-2bUG1 complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
114. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP025569 (Listeria monocytogenes strain PIR00540 plasmid pPIR00540, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
115. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP015985 (Listeria monocytogenes strain 2015TE24968 plasmid pl2015TE24968, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
116. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013725 (Listeria monocytogenes strain Lm N1546 plasmid pLmN1546, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
117. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_HG813248 (Listeria monocytogenes R479a plasmid pLMR479a, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
118. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP025260 (Listeria monocytogenes strain MF4624 plasmid pMF4624, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
119. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP025083 (Listeria monocytogenes strain MF4626 plasmid pMF4626, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
120. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP023051 (Listeria monocytogenes strain FDA971911-001-001 plasmid pCFSAN059932, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
121. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_021828 (Listeria monocytogenes strain R2-502 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
122. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP041214 (Listeria monocytogenes strain LMP18-H8393 plasmid pCFSAN074382, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
123. spacer 9.29|2467437|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP045973 (Listeria monocytogenes strain AUSMDU00000224 plasmid pAUSMDU00000224_01, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tagacagtttttattttttcctgttcttcgctcaa CRISPR spacer tcagaaattttttgtttttcctgttcttcgcttgg Protospacer * .. *.***** ******************...
124. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to NZ_MK275625 (Clostridium perfringens strain JXJA17 plasmid p7, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.677
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer ttagaaaatgaaaaaagtaaagaaaaaggta Protospacer ******* ****.**********.
125. spacer 10.2|2592903|31|CP035282|PILER-CR matches to KU878088 (Bacillus phage AR9, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.677
agctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatac CRISPR spacer tttctttatgaaaaaaataaaaaaaaaataa Protospacer .. **** *********.********
126. spacer 10.4|2592897|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020859 (Lactobacillus salivarius strain ZLS006 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
aagctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatactataa CRISPR spacer tgtctaaaatggcaaaaataaagaataaagatatgaa Protospacer . ********.************* *** *. **
127. spacer 10.4|2592897|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP046110 (Enterococcus faecalis strain 133170041-3 plasmid pTEF2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
aagctaaaatgacaaaaataaagaaaaaatactataa CRISPR spacer gtgtaagaatggcaaaaaaaaagaaaaaatactgtgt Protospacer . *. *.****.****** **************.*.
128. spacer 10.25|2594285|35|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_014633 (Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
atggacgactggagagttgttcctggagatccata CRISPR spacer tttttagcctggagagatgttcctgtagatccaac Protospacer * * ******** ******** *******
129. spacer 3.1|1863133|34|CP035282|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023670 (Methylomonas koyamae strain LM6 plasmid pLM6, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
gcagagattttgaaccgtttcttttccaatatgt CRISPR spacer cgcggctttttgaaccgttttttttcgaataccc Protospacer *. *************.***** ****. .
130. spacer 4.25|2012498|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN850639 (Escherichia phage radambza, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
gagagcgttttagagcgtttcagaggtattctgacgt CRISPR spacer tagagcgttttagagcgttttagtggttgcccttccc Protospacer *******************.** *** .*. * .
131. spacer 5.16|2015779|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KU878088 (Bacillus phage AR9, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
gagaagaaaaatgaaaaagaaatatgaattgacagg CRISPR spacer aagaagaaaaaataaaaagaaatatgactattttaa Protospacer .********** ************** * . ..
132. spacer 5.16|2015779|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF360957 (Bacillus virus PBS1, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
gagaagaaaaatgaaaaagaaatatgaattgacagg CRISPR spacer aagaagaaaaaataaaaagaaatatgactattttaa Protospacer .********** ************** * . ..
133. spacer 6.6|2031005|35|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015861 (Lactococcus lactis subsp. lactis plasmid pIL3, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
gggcatttttcttattaattttattttctcgtcgt CRISPR spacer tcatatttttctcaataattttattttctagctca Protospacer ..********.* ************** *..
134. spacer 9.4|2465805|37|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448921 (Streptococcus phage Javan374, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
ctgttcaaggaagaatccaaacaagaagttatgaaga CRISPR spacer ggatcactggacgaatccaaacaagaagttacgagaa Protospacer .*. *** *******************.**..*
135. spacer 10.13|2593491|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP053932 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_794 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
agtagatactccaaaagaagataaaaagatagtagc CRISPR spacer ttccattattccaaaagaagataaaaagaaagttaa Protospacer . . **.******************** *** .
136. spacer 10.13|2593491|36|CP035282|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009719 (Bacillus thuringiensis strain HD682 plasmid pBGN_1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
agtagatactccaaaagaagataaaaagatagtagc CRISPR spacer ttccattattccaaaagaagataaaaagaaagttaa Protospacer . . **.******************** *** .
137. spacer 6.46|2033618|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024772 (Bacillus thuringiensis LM1212 plasmid pLM1, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.667
tggacagaaaaagaaaaatgaaatttacaaaaaatt CRISPR spacer gatcttgaaaaagaaaaaggaaagttacaaaaggaa Protospacer . . ************ **** ********..
138. spacer 6.46|2033618|36|CP035282|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041074 (Bacillus tropicus strain LM1212-W3 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.667
tggacagaaaaagaaaaatgaaatttacaaaaaatt CRISPR spacer gatcttgaaaaagaaaaaggaaagttacaaaaggaa Protospacer . . ************ **** ********..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
482925 : 495332
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP035282|482925:495332|DBSCAN-SWA CTTAATGTTTGAAATGTCTCATGCCTGTAAATAGCATTGCTATTTTATACTTATCAGCCATATCTATTGAATCCTTATCCCTTACTGAACCGCCTGGCTGAATAACTGCAGTGATTCCGGCTTTTGCGGCTGCTTCAATACAGTCGGAAAAAGGGAAAAAGGCATCCGATGCCATTACACTTCCGCGAACACTTTCTTCACCTTGCTTTATGGCGTTTTCCAATGCCCATATTCTGCTGACCTGTCCGGGGCCTACAGCTACGGTTCCTTGATTTTTAGCCAATACTATGGCATTTGATTTGGTATTTTTGACTACCTTCCATGCAAACAATAAATCCTTCAATTCTTCATCGGAAGGTTTTCTTTGAGTAACTATTTTTAAATCCTCATACATTTTTCCCTGATTTCTGTCTTGAAGGAGAACTCCTCCCAATATTTTTTTCATATCATAAGTTGAATATTTGTTATAGTTTATATGAGGCAATCTTAATAATCTGATATTTTTCTTAGCTTCTAAAATTTCCAAAGCAGATTCAGAATAAGAAGGTGCTATAACAACTTCTATAAAAATATCTTTTATCATCTTTGCGGTATCAACATCTATTTCATCATTTGCGGCTATTATTCCTCCAAATATAGACTGTTTATCCGATTCGTAGGCTTTTTTAAATGCTTCGGCTATATTTTTTCCGCTTCCTACTCCGCATGGATTGGCATGTTTTACGGCTACAACGGTTGGAAGGGTAAATTCCTTAAGGATTTCCAATGCTCCGTTTCCATCACCGATATTATTGTAGGATAATTCTTTCCCATGAAGTTTAACTGCTTCCGAAAGTGTACCTGTGGTTTCCAGTTCTTCAGTATAAAATGCAGCCTCTTGATGAGGATTTTCTCCGTATCTCAAATCCTGTTTTTTTTCAAAGGTTAGAGTTATAGTATCTGGGAATTTAATATTCGTTTTTTCATTAAAATAGTGAGAAATCAATGCATCATAGTTACTTGTATGCTGAAAGACTTTGGCGGCAAGATATTCTCTTGTTTTATATGATACTTCGCCTTTATTTTCAAGCTCATCTATTATTGTATTATAATCCTTCGGATCTACTATTACCGTTACGAATTTATAATTTTTTGCAGCAGCTCTTAACATGGAAGGTCCGCCTATATCAATATTTTCTATTATATTTTCATGAGTCGATTCTGTCTTTAGAATGGTTTCTTTAAAAGGATATAAATTATTCACCACCATATCTATAGGCTTTATGTCCAATTCTTTCATAGTCTTTAAATGGTTTTCATCATCCCTTAATGCTAAGATACCACCATGTATTTTAGGATGAAGAGTTTTTACCCTTCCGTTAAAACATTCAGGAAAGCCTGTAACATCTGAGACATCAGTGACTTTTAGTCCTGAATCGGAAAGAATCCTTGATGTTCCTCCCGTAGAAATAATCTCCCATCCCATATGGGAAAGCTTTTTAGCAAATTCTATTATTCCTTTCTTATCATAAACACTTATCAATGCCCTTTTCATATTTTCACTCCTTTATCGATACTTTTCTTCCGTCTATGGTTATTCTGCCTTCACAATATAATTTTACTGCTTCCGGAAGAAGTGTATGTTCTATTTTTAATACTTTATTTTGAAGAGAACCTACGGTATCACTTTCATCTATCATCACCGGCCTTTGAAGTATTATAGGGCCGGCATCTGCTTCTTCGTTTACAAAATGGACAGTAGCTCCTGTAACTTTTGCTCCGTAATCCAACACAGCCTTATGGACCTTTTCTCCATAGTAGCCCTTTCCGCAGAAACTTGGGATTAAAGAAGGATGGATATTTATTATCTTATTTTTGTATTCATTAATAAATTTGCTGCTCAAAATTTTTAAATATCCTGCCAATACAACAAGGTCCACATCTCTTTTTTTAAGCTCATACATAATCGCCCTGTTGAATTCTTCTTCATCTTTAAAGATTTTTTTGTCGATATAAGCGGTATCTATTCCGTTATTTTTAGCCCTTATAAGCCCGTAAGCATTTTTTCTGTTGGATATGACTACTTTGATTTTTGCGTTTATGTTTCCGGCATTTATATGGTCGATTAACGACTGGAGATTCGTTCCGTTACCGGATATGAGTACTCCCATACTTACCGGCGACATATTGACAGACCCCCGTTTCCTTCAATAACGCTTCCTATTATATAGGCCTCTTCATTTTTACATTTTAAAAATTTTATTATATTGTCAGCGTCTTTTTCGTCAACTGCCATTACTATTCCTATTCCCATGTTGAATGTGGAATACATCTCATCGATATCGATATTTCCAAGTTCTTGGATGAGTTGAAAGATAGGAGGGATACTGACATGGTTTCTGTCTATAAAGCCTGTCAATCCTTCAGGGAACATTCTCGGTATATTTTCATAGAATCCTCCTCCGGTTATATGGCTGATTCCCTTTATATCGAATTTATCATTCAGTTCCGTTAAAGGGTCATAATATATTCTTGTGGGCTTCAGGAGTTCTTCTCCCAAGGTGGTACCCAAATCCTCTATATATTGATCAATTTTATATTTTTTAATATCAAAGAACAGCTTCCTTACCAAAGAAAATCCGTTACTGTGCAATCCGCTGGAGGGAAGGCCTATAAGAACATCACCTTTCTTAATTTTTTCTCCCGTTATGATTTTTTTCTTGTCCGCTATTCCTACGGCAAATCCTGCCAAATCATATTCGTCTTCTTTGTACAATCCGGGCATTTCCGCTGTTTCTCCTCCTATAAGAGCACATTTTGCCTTTATGCATCCGGTGGAAATACCTGATACTATTTTTTCTATTTTTTCGGGATTTAATATTCCTGAGGCTACATAATCCAAGAAAAATAGCGGCCTTGCTCCTTGACACAATATATCGTTTACACACATGGCCACACAATCCTGTCCAATTGTATCATGCTTATCCATCATGAAAGCAATCATCAGTTTGGTTCCCACACCGTCGGTGCCTGATAACAATACAGGTTCTTCAAATTCATTTTTATTTAATGCAAACATTCCGCTGAATCCGCCTATGTCCGACAAAACTCCTTCCGTAAATGTGCTGTGTACGTGGGCTTTCATGCGTTTAACTGCTTCATATCCCGCATTTATATTTACTCCCGAATCCTTATAAGTCAGTCCTTTATTATTCATCTAATTCCAACCCCTCTCTTGGTATTTCCATAGGATAATCTCCGTTGAAGCAGGCAGAACAGAACTGGTCGCTTTTCCCCGTGGATTTAATAAGACCTTCTTGAGATAGAAATCCTAAACTGTCCGCATTAATCATTTCACATATTTCATCAGAGGTCTTATTTGCACCTATCAGATATTTTCTGTAAGGAGTATCAATGCCGAAATAACAAGGGTATGATACCGACGGAGAGCTTACTCTTAAGTGAACTTCTTTAGCTCCTGCTTTTTTAAGCATATTTACGATTCTTTTACTCGTTGTCCCTCTTACGATTGAATCATCTACAAGAACTACCCTTTTTCCTTCAATATTTTCTTTTATAACATTTAATTTTATTTCTACTCCTTTTTCTCTTGCCTTTTGATTTGGACTTATAAATGTTCTTCCTATATATCTGTTTTTTATTAAGCCTATGCTGTAGGGTATGCCTGATTCTTCCGCATATCCTATGGCAGCGGGAGTACCGGAGTCCGGAACGGAGATTACCACATCGGCGTCTACCGGATATTCACTTGAAAGTATTTTTCCGGCTTCTTTTCTTGCGGAATAAACGTTTATACCGTCTATTATACTGTCAGGTCTGGCAAAATAGATAATTTCAAATATGCATAATTTTTTTCTGTTCCATTTATCGTTGAATATACTTCTTATGCCGTTTTTATCTATTATGACTATTTCTCCGGGTTCAATATCCCTTACAAGTTCCGCTCCTATAGCATCCAACCCGCAGCTTTCCGAAGAGAGAACGTATCCGTCATCTGTTTTTCCAAGGCAGAGAGGCCTTATACCCTGATTGTCTCTTACACCTATGAGTTTATCTTCCGTCATTATTATAAGGGCGTAAGAACCTTTTACTATTTCCATTACTCCCTTTATGGCTTTTTCTATATCATCTTTATAATACCTTGCTATCATATTAGCCATGACTTCACTGTCGTTTGTGGTTTGAAAAGACACTCCTTCTGATTCAAGGATCTTTCGTATACTTCCGGCATTTACTATATTACCGTTGTGAACCAGTGCCATTTCTCCGTTTTTACATTTGACAATCAGAGGCTGAGCATTTACCGCTAAACTTTCTCCTGTTGTAGAATATCTTACATGACCTACCCCTATATTTCCCTCTAATCTTTCCAATTTATTTTTATCGCTGAATACCTGAGATACAAGGCCCATATCTTTATAGCAGTCTATTTTACTATCTTTGCTTACGGCAATTCCGGCACTTTCCTGACCTCTGTGTTGAAGGGCATAAAGACCGTAATAGATCATATGGGAAACATTTTGCACTTTTGAATATACTCCCATAACTCCGCATTCTTCTTTTAACTTATCTTCATCCATCAAATCGAAACCCATTTTATGTTCCTCCTGACTGCTGCTTCTATTTAGATAACCTGGATAATACTTCCTCATAGGCTTCCTCCACATTTCCCAGATCTCTTCTGAACCTGTCTTTGTCTAATTTTTCATTAGTCTCAACATCCCAAAGTCTGCATGTATCGGGAGATATTTCGTCTGCAAGAATTACTTTTCCGTCATATAATCCGAATTCCAATTTAAAATCAATTAACTTCATCTTTTTTTCTCTGAAAAATTTAATCAATATATCGTTAATTTTAAAAGCGTAATCTTTTATTATATTCAACTGTTCATCCGTTGCAAGTTCCATGGCTTTTATGTGATAATCATTAACAAGGGGATCTCCGAGTTCGTCGTTTTTGTAGCTGAATTCAAGAACGGTACTTTTTAATTCGGTCCCTTCCTTAAGTCCGAGCCTTTTTGACAGAGAACCTGCCGCAACGTTTCTTACTATAACCTCCAAAGGAAGTATTTTTACGGCCTTCACGAGCATTTCCCGGTCGCTTAAAAGTCTTTCAAAATGAGTGGGGATATTTTCTTTTTCAAGGAGTGTAAATAATTGAGCCGACATTTTATTGTTTATTACTCCTTTTCCTACTATGGTTCCTTTTTTTACTCCGTTGAAAGCAGTAGCATCGTCTTTATATTCTACAATATACTTTTTATCATCATCGGTTTTAAATACCTTTTTAGCTTTACCTTCATATAACATTTCAAGTTTTTCCATCCCGACTACCTCCATTAAATTAATTTTTGTTGAATTTCTTTATCTTTTTCGTTGATTTCTTCCGCCATTTTTTTTCTGTATTCTCTAAGTTTTATTTTTAAATTTTCATCCTTTACGGATAATATTTGAATTGCTAAGAGAGCAGCATTTTCCGCTCCGTCTATTGCCACGGTAGCCACGGGAATACCTTTAGGCATTTGAACCGTAGATAACAGAGAATCCAGTCCGTCCAAAGTCGATGATTTTATCGGCAATCCGATAACCGGTACAATACTTACTGCCGCTATTATTCCTCCAAGATGGGCAGCCTTTCCTGCAGCCGCTATTATTACATCAAAGCCGTTTTTTTCTGCATTTTTTCCGAATTCAACTGCTTCATCCGGAGTTCTGTGAGCCGATATAACTCTTACTTCCGTGCCGACTCCGAATTCCTTTAAAATTCTAAAACTTCTTTCCACTACGGGAAGATCAGAATCACTTCCCATAATTATTGCGACTTTCATAATACTTCCTCCCTTATTTAAAATAGCTGATTCCGGCCTCAAACAATCTTTGATCCGATTTGCCGGCGATGTTTTTATATAGATGCTTTCCTATTCTTTCCGAATGTCCCATCTTGCCTAATATTCTCCCATCAGGGCTGGTTATTCCTTCTATACATTGGAAAGACCCGTTGGGATTGAAGCTGCCGTCATAATTGGCGTTTCCGTAGAAGTCAACGTACTGAGTAGCTATTTGCCCATTTTTTGTCATTTCTTTAAATATTTTTTCGTTTGAGATCAATCGTCCTTCTCCATGGGATATAGGAATGGTAAATATATCTCCTACTTTTACATTGCTGAACCAAGGAGAAAGATTGGAAACCACTTTTGTTTGAACCATACGGGATATATGCCTTCCGATTTTGTTAAAGGTCAATGTAGGAGATTCCTCATCCATTTCTCTTATTTCCCCGTAAGGAAGGAGGCCTAACTTTATAAGGGCCTGAAATCCGTTACATATTCCCAATATGAGGCCATCTCTATTATTTAAGAAATTAGTTACTTCTTCTGCTATATATGGATTTTTGAATACAGTTGCTATAAATTTTCCGGAACCGTCAGGCTCGTCTCCTGCACTGAATCCTCCAGGCAGAGCTATAATTTGGCTGTTTTTGATCTTTTCTGCCATTGATTTTATAGAGTCCTTTATATCCTGAGGAGCTAAATTTTTGAATACGAAGATGTCAACATCGCCTCCCGCCTTTTCAAAAGCTCTTTTCATATCGTATTCACAATTTGTTCCGGGGAATACGGGGATGAAAACTTTTGGCTTTGATGTTGAAAATTTTGCCTTAAATGTATTCTCCCTTTCATAGCTGATATTTTCAGCACTATCATTTATGCTTCTTCTTATGGGAAATACATTGTTTAAAGGTTCTTCCCATTTTTTTATGGCACATTCCAAGTCTATCTTGGTGCTATTTATATTTATTACCGAATTTTTATTTGTACGTCCGATTATTTCATATTTTAAATTTCCCAATAGTTCATTTAAATTTTCTTTTTCATCTATTTCCAAGATTATTGAGCCGTAGTCGGGAGAAAATAATTTTTTTCTTGTCATTTCACGGGTAAATACCATCCCTATCTTGTTTCCGAAGGCCATTTTGCTTATTGATGCAGCTATTCCGCCGATCCCTATGGTATAAGCCGAGAGTATTTTTTTATTTATAATCAATTCATGTATTGCCGAAAAATTTTTATTGAGTGTTTCAAAGTCCGGCAACTGATTTTCTTTTCGCGGAGATTTGATTATAACAATTTGACTTCCGACTTTTTTAAACTCCGGCGATATTATGTTTTTCGCATTGCCTACACATACGGCAAAGCTCACTAAGGTAGGAGGAACATTTAAATCGTTGAAACTTCCCGACATGCTGTCCTTTCCTCCTATGGCTGCAACTTTAAGATTTTTCTGTGCTTCGTAAGCTCCCAATAGAGCAGACAGAGGCTTTCCCCATTTTTTATCATCAGTTAATTTTTCAAAGTATTCCTGAAAGGTAAGTTTTATATTTTTGTGATTTCCTCCCATTGCCACAATTTTTGCGACTGAATCAACTACCGCATACATTCCGCCATGGAATGGACTCCAAGTGGAAAGTTCGGAATCGAATCCGTAAGCCATGAGGGTACATGTATCTGTATATCCTCTTAGAACGGGAATTTTAGCCGTCATTCCCAAAGAAGGGGTGAGCTGATATTTTCCTCCGAAAGGCATCAATATAGTACCGGCACCTATGGTGGAGTCGAATCTTTCGACTAATCCCTTTTGGCTTGCTACATTGATGCTTTTTAAATTATCTATAAAAGCAGTTTTTAAAGAATTTTTATTTAAACATTCGGGGATTGTATTAAAATAATTTTCAGAATCGGGTTCTTCCACATAGACATCAGTGTTTTGCTGAGCGCCGTTGGTATCTAAAAATTTTCTGTCTATATCCAATATTTTTTTGTTTTTCCACATCATCTTTAATCTGTTGTCGTCCGTTACTTTTCCTACTATTGTTGCTTCGAGATTTTCTTCTTCCACATATTTTTTCATCAATTCTAAATCTTCTTTGTTTATTACTACTGCCATTCTTTCTTGAGATTCGGATATGGCAAGTTCGGTTCCGTCAAGACCTTCATATTTCTTCAATACATTATCCAAATTGATTTCTATACTGTCAGTCAGTTCCCCTACAGCCACCGAAACTCCTCCGGCTCCAAAGTCATTACACCTTTTTACTATTTTACTGAATTGAGGATTTCTGAATAATCTTAACAGTTTCCTTTCTGTTGGAGCATTTCCTTTTTGTACCTCTGAGCCGCAGGTCAATATGGATTTGTCCGTATGGGATTTAGACGAACCGGTAGCTCCGCCGCAACCGTCTCTCCCTGTTCTTCCTCCTATTAAGATGATTAGATCTCCTGTTTTTGGCTTTTTTCTTATTACATTTTCTTTTTTGACAGCTGCTATTACCGCTCCTATTTCCATTCTCTTTGCTACATATCCTTCGTTGTATATTTCAGATACATGACCTGTAGCTATGCCGATTTGATTTCCGTAGGAGCTGTATCCTCTGGCGGCTTCCGTAGTTATTTTTCTTTGGGGAAGTTTTCCGGGAAGAGTGTCTTCTATACTTTTTCTCGGATCTCCGCTTCCTGTAACTCTCATTGCCTGATATACATAGGCTCTCCCTGATAGGGGGTCTCTTATAGCTCCTCCCAAACATGTTGCAGCGCCGCCGAAAGGTTCTATTTCGGTAGGATGATTGTGAGTTTCGTTTTTAAACATTACAAGCCATTTTTCTATTTTACCGTCTACATCCACATCTACATTTATACTGCAGGCGTTTATTTCGTCGGAATCGTCCAAATCATTTAACAATCCTCTTTTTTTAAGTTCTTTCATTCCGATAACTGCAATATCCATCAGACAGACATTTTTTTTACTGTTGCCGTAAACATATTCCCTTGTACTGAGATATTCTTCATATGCTTTTTTGATAGAATCACAATAAAAGCCCTTATCGAAATTTACGGAATTTATTTTTGTCTGGAAGGTGGTATGCCTGCAGTGATCCGACCAATAAGTATCTATGACTTTTATTTCAGTTATAGTGGGATTTCTCTTTTCCGTGAGCTTAAAATATTCCTGGCAGAACTTAATATCCTCGATGCTCATGGCAAGACCCAAAGTATTTTTAAATTCTTCCAACTCTTTGGGGGATTTTTCGATGAACCCGTCTAATGTTATTACATTGTCGGGAGAAATTATTTCATTTTCCAGATTATCAGGTTTGGTTAATTCTGCTTCTCTGCGGTCTACAGGATTTATACAATAATGTTTAATCTTTTTAAATTCTTCATTTGTAATATTTCCCTTAAGAATTATTATTTTTGCCGTATTTATAATCGGTTTTTCTTTTTCCGTCAGTATTTCGATGCATTGGACGGCAGAATCCGCTCTCTGGTCGTATTGACCGGGCAGATATTCTATCCCAAATATTTTCCATTCATCTTTTGTTTCTATTTTTTCTTCATATACCGTATCCACATTTGGTTCAGAGAATATGGTTTTTAATGATTTTAGGTATGCATCATCGGAAATTTCCTGGATATCATATCTGTTTAAAATTCTTACTTCTTCCAATCCTTTTATGGATAAATTTTGTTTTAAATCATTATATAGCCGTTCTGCTTCTATGTTGAACTTTCTTTTCTTTTCTACAAATATTCTTCTTACCGGACTATTCACAATTATACCTCCTAAAAAATAATAAACCCAGGCAGAGTAAGATCACTACAAGTGAAACCTACCCCCTGGGTTTTATCCTGAAGGCATTACATAAGCAATACAAATAAGCACCTTCGGAATCCTAAGTGCATTTTCATTCATAGTCAAGTAATTTACGGTCACTTGGTAGAGACTTCTCAGCCATATTGTGAGATTTATATGAACGTACATTATATAAAATTGTCTTACAATGACATAATATCAGTAAAAAAAAGATAAGTCAATAGAAAATTATTCATATAATAATAAACAATAAAAGTTTTTTTATATTTATTGTTTTTTTATTGACAAGAAATCCGTATACCTCTAAAATTAGAGATGTATATTGGATATATTGATTTTAATGTTTTTTATC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP035282|482925:495332|494192_495332_-|QAT60510.1|DBSCAN-SWA MKFVLSPDSFKESMSAKEVAESMERGLKVVFPQAQYIKIPMADGGEGTVESLVEATSGKIYNVSVTDPLGNPVVANFGILGDKKTAVIEMASASGIQLVPQDKRNPSVTTTYGTGELIKAALEKGANHLIIGIGGSGTNDGGAGMLQALGVRFLTKNNEEIPRGGKNLNLIHKIDISNLDSRLSKVKVEVACDVTNPLTGKEGASYIFGPQKGATEEMVKELDNNLKHYAKVIREQIGKDVENISGAGAAGGLGAGLLAFLDTKLVRGVDLIIHYTNLESHIKDADFVFTGEGSIDSQTLFGKTPFGVASVAKKYNVPVIVLAGRIGKGYEKLYDHGITAIFNILSKVTTLEHALKDGSQNVETTSQNIGRLIKASQDI >CP035282|482925:495332|486112_487504_-|QAT63358.1|DBSCAN-SWA MDEDKLKEECGVMGVYSKVQNVSHMIYYGLYALQHRGQESAGIAVSKDSKIDCYKDMGLVSQVFSDKNKLERLEGNIGVGHVRYSTTGESLAVNAQPLIVKCKNGEMALVHNGNIVNAGSIRKILESEGVSFQTTNDSEVMANMIARYYKDDIEKAIKGVMEIVKGSYALIIMTEDKLIGVRDNQGIRPLCLGKTDDGYVLSSESCGLDAIGAELVRDIEPGEIVIIDKNGIRSIFNDKWNRKKLCIFEIIYFARPDSIIDGINVYSARKEAGKILSSEYPVDADVVISVPDSGTPAAIGYAEESGIPYSIGLIKNRYIGRTFISPNQKAREKGVEIKLNVIKENIEGKRVVLVDDSIVRGTTSKRIVNMLKKAGAKEVHLRVSSPSVSYPCYFGIDTPYRKYLIGANKTSDEICEMINADSLGFLSQEGLIKSTGKSDQFCSACFNGDYPMEIPREGLELDE >CP035282|482925:495332|485076_486120_-|QAT60505.1|DBSCAN-SWA MNNKGLTYKDSGVNINAGYEAVKRMKAHVHSTFTEGVLSDIGGFSGMFALNKNEFEEPVLLSGTDGVGTKLMIAFMMDKHDTIGQDCVAMCVNDILCQGARPLFFLDYVASGILNPEKIEKIVSGISTGCIKAKCALIGGETAEMPGLYKEDEYDLAGFAVGIADKKKIITGEKIKKGDVLIGLPSSGLHSNGFSLVRKLFFDIKKYKIDQYIEDLGTTLGEELLKPTRIYYDPLTELNDKFDIKGISHITGGGFYENIPRMFPEGLTGFIDRNHVSIPPIFQLIQELGNIDIDEMYSTFNMGIGIVMAVDEKDADNIIKFLKCKNEEAYIIGSVIEGNGGLSICRR >CP035282|482925:495332|482925_484458_-|QAT60503.1|DBSCAN-SWA MKRALISVYDKKGIIEFAKKLSHMGWEIISTGGTSRILSDSGLKVTDVSDVTGFPECFNGRVKTLHPKIHGGILALRDDENHLKTMKELDIKPIDMVVNNLYPFKETILKTESTHENIIENIDIGGPSMLRAAAKNYKFVTVIVDPKDYNTIIDELENKGEVSYKTREYLAAKVFQHTSNYDALISHYFNEKTNIKFPDTITLTFEKKQDLRYGENPHQEAAFYTEELETTGTLSEAVKLHGKELSYNNIGDGNGALEILKEFTLPTVVAVKHANPCGVGSGKNIAEAFKKAYESDKQSIFGGIIAANDEIDVDTAKMIKDIFIEVVIAPSYSESALEILEAKKNIRLLRLPHINYNKYSTYDMKKILGGVLLQDRNQGKMYEDLKIVTQRKPSDEELKDLLFAWKVVKNTKSNAIVLAKNQGTVAVGPGQVSRIWALENAIKQGEESVRGSVMASDAFFPFSDCIEAAAKAGITAVIQPGGSVRDKDSIDMADKYKIAMLFTGMRHFKH >CP035282|482925:495332|488765_492530_-|QAT60508.1|DBSCAN-SWA MNSPVRRIFVEKKRKFNIEAERLYNDLKQNLSIKGLEEVRILNRYDIQEISDDAYLKSLKTIFSEPNVDTVYEEKIETKDEWKIFGIEYLPGQYDQRADSAVQCIEILTEKEKPIINTAKIIILKGNITNEEFKKIKHYCINPVDRREAELTKPDNLENEIISPDNVITLDGFIEKSPKELEEFKNTLGLAMSIEDIKFCQEYFKLTEKRNPTITEIKVIDTYWSDHCRHTTFQTKINSVNFDKGFYCDSIKKAYEEYLSTREYVYGNSKKNVCLMDIAVIGMKELKKRGLLNDLDDSDEINACSINVDVDVDGKIEKWLVMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRAYVYQAMRVTGSGDPRKSIEDTLPGKLPQRKITTEAARGYSSYGNQIGIATGHVSEIYNEGYVAKRMEIGAVIAAVKKENVIRKKPKTGDLIILIGGRTGRDGCGGATGSSKSHTDKSILTCGSEVQKGNAPTERKLLRLFRNPQFSKIVKRCNDFGAGGVSVAVGELTDSIEINLDNVLKKYEGLDGTELAISESQERMAVVINKEDLELMKKYVEEENLEATIVGKVTDDNRLKMMWKNKKILDIDRKFLDTNGAQQNTDVYVEEPDSENYFNTIPECLNKNSLKTAFIDNLKSINVASQKGLVERFDSTIGAGTILMPFGGKYQLTPSLGMTAKIPVLRGYTDTCTLMAYGFDSELSTWSPFHGGMYAVVDSVAKIVAMGGNHKNIKLTFQEYFEKLTDDKKWGKPLSALLGAYEAQKNLKVAAIGGKDSMSGSFNDLNVPPTLVSFAVCVGNAKNIISPEFKKVGSQIVIIKSPRKENQLPDFETLNKNFSAIHELIINKKILSAYTIGIGGIAASISKMAFGNKIGMVFTREMTRKKLFSPDYGSIILEIDEKENLNELLGNLKYEIIGRTNKNSVININSTKIDLECAIKKWEEPLNNVFPIRRSINDSAENISYERENTFKAKFSTSKPKVFIPVFPGTNCEYDMKRAFEKAGGDVDIFVFKNLAPQDIKDSIKSMAEKIKNSQIIALPGGFSAGDEPDGSGKFIATVFKNPYIAEEVTNFLNNRDGLILGICNGFQALIKLGLLPYGEIREMDEESPTLTFNKIGRHISRMVQTKVVSNLSPWFSNVKVGDIFTIPISHGEGRLISNEKIFKEMTKNGQIATQYVDFYGNANYDGSFNPNGSFQCIEGITSPDGRILGKMGHSERIGKHLYKNIAGKSDQRLFEAGISYFK >CP035282|482925:495332|493048_494152_+|QAT60509.1|DBSCAN-SWA MSMNLMEYMNGGIERIVRKALKSSLKNPRESAFLLRYMIAQKDAVKKRNQLESQGTHIPSFLIASITTQCNMFCKGCYARANQSCSTYPQQEKLTCDQWKRIFQEANQLGISFILLAGGEPLLSRCIIETAAEFPDVIFPIFTNGTIMDESYIDLFDKNRNLVPVFSMEGGLIETDKRRGEGVYTSLVGKMKQMNTRGIFYGTSITVTMENLDVVTSKEFIDTLYKEGCGVVFYIEYVPAEPSTENLVLTEGGRKILEERQDILRKQYEDIIYLSFPGDEKYMGGCLAAGRGFFHINTAGRAEPCPFSPYSDMNLKDCSLLEALQSPLFQKLNTQGLMNEEHEGGCVLFGKQDEIRKLLGYNDTNIK >CP035282|482925:495332|488263_488752_-|QAT60507.1|DBSCAN-SWA MKVAIIMGSDSDLPVVERSFRILKEFGVGTEVRVISAHRTPDEAVEFGKNAEKNGFDVIIAAAGKAAHLGGIIAAVSIVPVIGLPIKSSTLDGLDSLLSTVQMPKGIPVATVAIDGAENAALLAIQILSVKDENLKIKLREYRKKMAEEINEKDKEIQQKLI >CP035282|482925:495332|484462_485089_-|QAT60504.1|DBSCAN-SWA MSPVSMGVLISGNGTNLQSLIDHINAGNINAKIKVVISNRKNAYGLIRAKNNGIDTAYIDKKIFKDEEEFNRAIMYELKKRDVDLVVLAGYLKILSSKFINEYKNKIINIHPSLIPSFCGKGYYGEKVHKAVLDYGAKVTGATVHFVNEEADAGPIILQRPVMIDESDTVGSLQNKVLKIEHTLLPEAVKLYCEGRITIDGRKVSIKE >CP035282|482925:495332|487544_488249_-|QAT60506.1|DBSCAN-SWA MEKLEMLYEGKAKKVFKTDDDKKYIVEYKDDATAFNGVKKGTIVGKGVINNKMSAQLFTLLEKENIPTHFERLLSDREMLVKAVKILPLEVIVRNVAAGSLSKRLGLKEGTELKSTVLEFSYKNDELGDPLVNDYHIKAMELATDEQLNIIKDYAFKINDILIKFFREKKMKLIDFKLEFGLYDGKVILADEISPDTCRLWDVETNEKLDKDRFRRDLGNVEEAYEEVLSRLSK |
9 | Synechococcus_phage(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1058040 : 1066522
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP035282|1058040:1066522|DBSCAN-SWA AATGAGTAAATTAAGCATTAAGATTTTAAAGATAGTAATGATAATATCACTTTTATCAATGGTTATCTTAGGGGTAACCAATATTTATGTTTTTAAGTCTATATTTTCTAATCTTCAAACGGAGGCTGTAGACATCGTTAAAGACTCGGTTAATTCCATTTCTGAGGACGAATTGCAAAAAGTAATTCTTAATAAATCTATGGATAGCATTGAATATAAGAATCTACAAGAATCTATGATGATATTTAAAAGTGACAAAGATATTAAGTACCTTTATACAATGATAAAGGGAGAAGATAATAAGGCGTACATGGTGGTTGATGCATCGTTAGAAAATGCATCTCCTTTTGGAGAAGAATATGAATTAGAAGATGCAATGAATAAAGCATTTAACGGTGAGGTATCATTTACAGAGAATCCAGTATCAGATGAGGATGGCACATTTATTTCTGCTTATGCACCAATAAAAGATTCCTCTGGAAAAGTAATCGCAATTGTAGGTGCTGATAAAGATGTTGCTACTTTCGCTTACATACAAACAACAATGTTAAAAACCGCAGTTAAAATTATCGTAGCTATTATAGCATTGTCCGTTATATTGAGCATTATATTAACAAAAAAAATTACTGCAAGTGTGAATGAAGTAGTCATTGGCTTAAATAAAATGTCACAAGGGGATTTAACAGTATCTGTTAATGTAAATTCAAAGGATGAAATTCAAACAATTTCAAAATCAATTGATCATGTTAGGAATAATATGGTAGAGATGCTTAGTAAGTCAAAGCAGTTATGTGAAGCAGTAATGGATGGAAGTATCAATCTATCAGCTGCATCGGATCAAATGGCTGCATCTTCAGAGGAAGTATCATCAGCAATACAAGAAGTTGCAAAAGGAATGAATTCTCAGTCGAATGAAATGGCTAAGATTAATGAAATTATGAACACTTTTGGTCTGAAAATTGATGATACCGTAAAAGGCATTGGTGAAATAAATTCAAAAATAGAAATAATCAACTCAAAAGCCCAAAACAGCAATCATGATTTAGTAACGCTTGAAGATGGGATGAAGGAGTTGGATGATTCATTTACGGTAATGAATCAAGAGATAAAAGATTTAGGTGTTTATTTATCACAAATTGGTGAAGTTACAAATCTTATCAATAGTATTGCAGAACAGACTAATCTACTTGCTTTAAATGCTGCAATTGAAGCGGCTAGAGCAGGTGAAACGGGAAAAGGCTTTGCCGTTGTAGCAGATGAAATCCGAAAACTTGCCGAACAATCTAAAAATTCAGCTTCTAATATAAGTAGTCTACTTGATAATGTGACTATTAAAAGCAATTTGGTAGTAAAAACATCAGAAAATATGAATGGAAAATTAATCGAACAGGATAAGGTAATTAATAACTCTATAAAATCTTTTAAGGATATTATCGATAATGTAGAAGAGATAATTACAAGAATCAATGCCATAAACAATCATATGAATGATATCAATATAGAAAAAGTAAATATTATTCAAAGTGTTGAAGAAACAGCTTCCGTATCAGAGGAAGTTTCAGCTTCTTCAGAAGAGATCGCGGCATCCTCCCAAGAATTAAGTGCATCCTCTGAGGAGGTTGCAGCGGCAACGCAAGAATTAAGCGAGTTATCAAAAAATATGATGGAGACTATGGAACAATTTAAAATTTAGGCTTTTTAGGAGAATTAAAATTAATGTACAGGCTATCAACTAAGGGATCTTCTTGGCTGACAGTGTGGCGAATAGCAATTGAAAAGAAAGTAGGAGAAACCATTAGGATTATTGATTATTCACATTAATAGTGAAGTTACATATAAAACAAGCGCCATGGATATGTTTCCATCTGTACTTAGCACAAAAATACGGTAGATATGTTTCAGAGAATAGAAGGTTCCAAAGTTTCCCGTTCTGTTCTCTTGAGAAGCATGTCCAATTGAAAGAAACGGAATTTGTAGAAGTAGAAAAGATCGTATGATTATATTTTTGTATGTATTCTATTGACATACGATAAAATATATGAGGTCAGTAATTATAGAAATTGTTCGGTTATTTATTCTCCCCTATATGATACGTTTCTATTTTAAGCATGAAGCAAGGTGAGAGATTGCAAATCCTTATCGGTAATTTTCTAACACCACACAGGACGCAGGTCTAAGTCGAAGTACAGAGGTAGGTGATAAAATAATATGAGTGATGAAAAATGGATAGGATGCCCTGTTTGTGGTAATAAAACTCGAACAAAAGTAAGGTCTAATACAATCTTAATTAATTTTCCACTTTATTGCCCTAAATGCAAGCAGGAAAGGACAGTAAATGTACAGCAATTTAAAGTAAAAGTTATCAAAGAGCCAGACGCTAAGACGCAGAGCCGATAACCCGTGATTAATAAGGGTTGTTGGCTCTTTCTTTTTGTAGTGATTTTGTTATATGTTTGTTGAAATTTTACAAAGGATACAAAACTGTTGTTTTAGAGATAGTTGTAGATATTCGTTCAGCGGCGGTTTTGAAATATTATTCAAAGCTACCGTGTTTTTGTTGAAAATATGTTTTTATAAGGTGTATTAAAGTTACCCTTTTTTAAGGACAGGACACGGCGGAATCAAGGGAGGTATCGTCGTGTCTATTTCTCATTATCTTGTTTCACCTAATTTTAACTTATTAAAAAAAATCTATATTCTATAATAGCATATTACTGCCATCAATATGAACACACACATCATTATATGCAATTTATTAGGCCATCTTATGCCCGGCTATATTTTCAGTCGGGCATTTTTGTGTCTTTTTTAAACTTTATTCAAAAAATTTCTGAAAAGTTTGGCAGTTTTGTAATTCTCACCGTAATAGTGGCGAAAGGGGAACAGCGGGGTCACCGCCCGAAAGGGGGTGAGAATGTGAAACCTAACAGCCATGAGCAAAGCAAGCGACACGCCTTTGACAGCTTTTGCAAAAAGATACTAAAACATGAGGCAAGGGATTATTACGATGAGCTGAAAAGCCAGCGTAATCGAGAAGTATCCTTTTCCGATTTGTCTGCAAAGGAAATGGATGAGCTTTATACAGAGGATAGATACTTCGTTACCGAGCAGATTTTCAATGTTTTAGGTCTTGATGTCATTGTTACAGATGATGTTATTGCAGGGGCATTACAAAGTTTGCCGGAACGCAAGCGTGATATTATCTTGCTTTCCTATTTCCTTGAGTTGTCTGACCGAGAAATTGGGGACAAGCTGAATATGCTGCGTTCAACTGTCCAGTACCAAAGAACAAGCACGTTGCAACAGCTAAAAAATTTTATGGAGGGAGATACCTATGAGCGACAAGACAAGAAATAATCATCTGCTTTCCTACCCTGTTATTGTATTAGCCTCTGGTGGCGATGTGGATGCTATCAATGCTGTTCTGAAACATTATGAAGGGTACATAGCAGCATTGTCTATGAGGACATTTTACGATGAAAGCGGCAATCCCCATCTGTGTGTAGATGAGGCATTACGCCGCAGGCTGGAAACTAAGCTGATTACAAAAATCTTAACTTTTAATGCGGCTTAACGGATAAATCCATATGGGAAGTACGCTCCCCTTTCTGTACCTCCAGTTTATGGTTTCGTTGCCATTCAATAAAAGTTCATTGATGAAGTGAGCTTTTATTGCCTGATAACTTAGGCTGATGTTCCTTGACAAAGAAAGCAGGTCAGATAACGGCTTTGCAGTATAATGCAAATCGGATACATTCCATTTATATAGAGCCATGCGGTTGATACGCCATGACCTCTGTTTAGAGTGAGCGAATAATATCAGACCGTAAAACAAATATGGCAGTTTGTAGGCGATGACATATAAATGGGACAATGATACTCCCTTATAGCCACAGTCCGAGCGTTGAAAGCGTCGCAGGCAATGGGTAGGGTTTCGGCAGAACGTCGAGAGGGTGAAATTCCCGTGGAGCTGTGCCAACAGCCGTCCGATTTTACTAAAAATTATATACATTTGCTAATACAGTTATTGCACCTGATTTGAAAGGAGATGGAGTATATGAATGACTGCATTATGCGTGGAGATATTTTCTGTGCCAATCTAAACAATGGAATTGGAGCTGAACAAAGAGGATACCGACCAGTTCTGATTATCCAAAATAATATAGGAAATAAATTTAGTCCAACGGTTATTGTAGCAGTAATCACAGGACAAATTCATCACAAAGCAAGACTGCCCACTCATTGCCAACTAAGTTCTCATTCTGCATTATCCATTCCATCAATGGCATTGTTAGAGCAGATTACTACAATAGATAAAAGACGGTTGAAAAAATATATAGGAAGAATAAGCGAGGAAGAAATTTCTTGTATCAATAAGGCTCTCTCAATCAGTGTAGGATTGGAGAGCCTATAATTATGTCTTTTTTGCTTTTCTAAAGATGTTGAGTTGAAATAGAAAATCGATACATTTCACATAAATTTAAAACCTATTTATAATGGAGGCATGTAATCACGGAGGTGTTTACAGATGGAAAATATCAAGCACGAATCAGAACATTTAACGGAAAAAGAATTTATTCCAAAAGGAACAGCTTGCTCCTCTGGGTCAAAAGCATATAACACTTTCATAAATACCATAGTGAGTGTAGTAGAAAAGTATGGAGCTGAGATTTTAGAAGAAATAGATTGTGCTGTGTAATTCACAGCACGTTACATAGGATATTTTCCATTTGTTTAATCAGAAAAGGAGGTTTTATTTATGAACAGAAGTGGCATGAAATGTGTTTTATATCCTCGTGTCAGCACAGAAATGCAGGTTGATGGATTTAGCTTAGATGGTCAGAGAAGTAGCTTAAAACGCTTTGCAGATAGAGAAGAAATGATAGTAGTAGACATCTATGAAGATGCAGGTAAATCCGGAAAATCCATTGAGGGCAGACCTGCCTTTAAAAAGATGTTATCAGATATAGAAAATGGCTTACAAATAGATTACATACTGGTGTATAAGCTATCCCGTTTCGGGAGAAATGCAGCAGATATTCTAAATTCTTTAGAGTTTATACAATCCTATGGGATAAATCTTATCTGTATTGAAGAAGGAATAGATTCATCACAGGCAAGTGGAAAACTCCTCATATCGGTGCTTTCAGCGGTTGCCGAGATTGAAAGAGAAAATATTATTGAGCAGACAATGAATGGTCGTAAGGAAAAAGCAAGACAAGGTGGCTGGAATGGTGGTTTTGCTCCTTATGGTTATTATTTAAAAGATAAAAATTTATTCATTCAGGAAGAAGAAGCGGAGGTTATCCGCATAATATATGATAAGTTTGCTAATACGGAAATGGGTTACGGCGGTGTTGCCCAATATCTTAACCTACAAGGTATTAAGAAAATTCAAAGGCAGAATGGGAAACTTAGCGAATGGAGTGGTCATTTGGTTAGGCAGATTTTAGACAACCCTGTTTACTATGGAAAAATTGCTTTTGGCAGACGGGCAAGGGAAAAAGTGAAGGGTACAAAAAATCAATACCGGCAAGCGTGGCAAGAAGAGTATATTGTTGCGGATGGTAAGCATGAGGCTATCATCAGCGAGGAATTATGGAACAAGGTTCGTGAAAAAAGAATAGAAACTGGAATAAAGCAGCCATCAAAAGTGGGCAAGGATCGGTCACATTTACTCACAGGGCTTTTGAGATGCCCAGTTTGCGGTGGTCCGATGTATACCAATAAACACGCATGGACAAATAAAGATGGTACATACAAAGAAGTATATTATTATGTATGTAGTCGTAATAGAATGGTCAGAGGAAAAAGCTGTACTTATAAAGCAATGCTTAAAAAAACAGAAATTGAGCCGCTTGTTATTGCCTCAATTAAAGAATTGGTTAGCAATAAAACCTTTGCTAAGGAAGTTAAATCAAGAATAGGCACTCAAATTGATACAACAACAATTGATAGGGAGATTAAGAATTACGAAAGCAAGCTCAGAGAGGTTGACTTGAACAAAGCACGTTTGGAGAATGAAATTGATACCTTACCTGAAGATACCCGTTATAGGGAGAGAAAGCTGCATGATATGACTATTCGATTAGATGGGCTGTATGATATAATGGTGGAATTAGAAGAAAAAATTGAAGATGCAAAGCTAAAGCGACGTTCTGTGGAAATGAACGCTATCACATTAGACAATGTTTACAGATTGATGATTAACTTTGAAAAAATGTACGATAGAATTAATGATGAAGAACGGAAAGCTCTTGTATCGTCCTTGATTAAAGAAATTCAGATATATCCTCGTGATGAAACAGAAGTACCATTAAAGTCGATTTTCTTTAACTTTCCTGTCTTTAAAGACGGAGAAGAAGTGCAGGAACTTTTGTGGGATAAAGATACGCACGTTGAGAGTATAATAATGATGACGCATTGTGGCGATAAGGAGAAAAGGTAGGGTTCAACCACAACATATAGTGGTTTGAGGACAAAAATTGGGTCAAAAATCGGAGTAAAAACACCGTTTTTTGACCCTTAAAAATAGGGTAAAATATAGATGACATAGGAAAAATGAAAATTTTAGTTGATAAATCGGTGGATGAATTATATTATATATTACAGAAAAGTAGAGTAGTGAAACATGAATGATTTATAAGCTATTAGACAAATAGGAATTTGACTCTTCCTTTGATATGAAAAAACCGCAAAATTAAGCAATGTAAAGTCTAGTTGCGGTATTGTAAAGCTTATGTGGTAGTATTTTAGCATGATTTTAACTACAATAAAATTACCAAAACAAAGGAGGATTTTATTGTGAAATTATCAGATAAGATTATAATTTTAAGGAAACAACATGGTATGTCTCAAGAGGATTTGGCCGAAAAACTGAATATATCTCGTCAAGCAATCTCTCGTTGGGAAAATGGGTCTGCCACACCTGATGCATCAAATATTTTACAACTCAGCAAACTTTTTAATGTTACCACCGACTATTTGTTGAATGATGATTTTAAAAGTGATAATGACTTGCCAAAACTCAAGGAGACGAAAGAAAATAACCTAAAGCAAATAATGATATATTTGATTACGCTTGAGGTCATGGTTTTGCTGATGCAAATTATGGCTACTATCATCCTACAAAATGTTTTCTTTGTTGTTTTAAGTATCATACCATTTGTGGCGTTGGTCGGTGGTTTTGAATATGCATATCAAAAAAACGGGAATGAAACATCTGCTATTTTCAGAAAGAGTTTCTATAAAATATCTGTATGGCTTGGATTATATTTCCCTACAAGGTTTCTGGTAACTTTAGCAATGCATTTTTACCCTCACCCCTATTCGACCATTATTTTTGAAATTATGGTAGTGAGTGTGTACCTGATGCTTTCCATGATAGTGATGCTATCCATTGATGAAAAAGCATAAATTGAAGCAAAGGGGACGGTTCTTTTTGTTTGATAAGTTTTAAGGAATGTGATATGTTTATGATATATTTGTATGGGGATGATTGTGTGCCAAGACAAGCAAGAGTTATAAGCAGTACCGGAATTATCATGTCTTTAGTTCCCTTATTATCGCAGTATATAAGAAATTCAGGATAGTATTAATATTATCTGTAATCTATATAATATCTAACTGTCTGAGATATTTAAACCAATAGATATATTATTAGATTTAAACTATCTATTTATTTTAGTTTATATTTTAATAATATATATTTTTATTTCAAATATATGTAATAGTATAAGAAAAAAATTATATAAAAGTAGTTTATGCAGTGTTCATAGGTGGGGGGACGAATGTTGTTTAGGAAAAAGAGAGTAGTATTTTTGACCATTTTACTGGGTTTAGTTATATTGATTATTATAAAGGGCATTCCCTTTATAGATAGAAATTTTAAATCTTCGAAGAGAGTAATAGTAGTTGATCCCGGGCATGGAGGTAAAGATCCGGGAACTATCGGGTTTAGCGGTAATTATGAAAAAGAAGTCAATTTAGAGATTTCTAAAAAGCTAAAGAAAAAATTAAAGTCAAATGGCTATAAAGTTATTTTAACCAGAGATAGTGATGAATATGTGGACAATCTGTTAAGAGCGAAGACAGCAAATAAAAAGAGGGCTAGGGTATTTATTAGTATTCATTGCAATTCTATGGAAAATAATAGTTCTGTAGATGGGGTTCAGGTACTTTATTATCCAAATAGAGAAAGTACAATTGGGGATTTAAACAATAATGAATTGGCACAAATTATGATGAATTCAATGGTTAATGGAACCGGAGCTAAGGATAAGGGAATAATAGAAAGAAAAAATTTAATTGTACTGAATCAGACAAAAATGCCGGCAATAATAATTGAGTGTGGATTTTTATCTAATAAAAACGAAGAAAAACTTTTGCTAACAGAGGATTATCAAAATAAGATAGTGGATTCAATAATAGATGGATTGGAAGAGTATCTTAGTCTGAATACTGGTAGTGAAATGAGGAAGTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP035282|1058040:1066522|1065829_1066522_+|QAT61004.1|DBSCAN-SWA MLFRKKRVVFLTILLGLVILIIIKGIPFIDRNFKSSKRVIVVDPGHGGKDPGTIGFSGNYEKEVNLEISKKLKKKLKSNGYKVILTRDSDEYVDNLLRAKTANKKRARVFISIHCNSMENNSSVDGVQVLYYPNRESTIGDLNNNELAQIMMNSMVNGTGAKDKGIIERKNLIVLNQTKMPAIIIECGFLSNKNEEKLLLTEDYQNKIVDSIIDGLEEYLSLNTGSEMRK >CP035282|1058040:1066522|1062096_1062453_+|QAT61001.1|DBSCAN-SWA MNDCIMRGDIFCANLNNGIGAEQRGYRPVLIIQNNIGNKFSPTVIVAVITGQIHHKARLPTHCQLSSHSALSIPSMALLEQITTIDKRRLKKYIGRISEEEISCINKALSISVGLESL >CP035282|1058040:1066522|1062798_1064487_+|QAT61002.1|DBSCAN-SWA MNRSGMKCVLYPRVSTEMQVDGFSLDGQRSSLKRFADREEMIVVDIYEDAGKSGKSIEGRPAFKKMLSDIENGLQIDYILVYKLSRFGRNAADILNSLEFIQSYGINLICIEEGIDSSQASGKLLISVLSAVAEIERENIIEQTMNGRKEKARQGGWNGGFAPYGYYLKDKNLFIQEEEAEVIRIIYDKFANTEMGYGGVAQYLNLQGIKKIQRQNGKLSEWSGHLVRQILDNPVYYGKIAFGRRAREKVKGTKNQYRQAWQEEYIVADGKHEAIISEELWNKVREKRIETGIKQPSKVGKDRSHLLTGLLRCPVCGGPMYTNKHAWTNKDGTYKEVYYYVCSRNRMVRGKSCTYKAMLKKTEIEPLVIASIKELVSNKTFAKEVKSRIGTQIDTTTIDREIKNYESKLREVDLNKARLENEIDTLPEDTRYRERKLHDMTIRLDGLYDIMVELEEKIEDAKLKRRSVEMNAITLDNVYRLMINFEKMYDRINDEERKALVSSLIKEIQIYPRDETEVPLKSIFFNFPVFKDGEEVQELLWDKDTHVESIIMMTHCGDKEKR >CP035282|1058040:1066522|1060247_1060436_+|QAT60998.1|DBSCAN-SWA MSDEKWIGCPVCGNKTRTKVRSNTILINFPLYCPKCKQERTVNVQQFKVKVIKEPDAKTQSR >CP035282|1058040:1066522|1058040_1059732_+|QAT60997.1|DBSCAN-SWA MSKLSIKILKIVMIISLLSMVILGVTNIYVFKSIFSNLQTEAVDIVKDSVNSISEDELQKVILNKSMDSIEYKNLQESMMIFKSDKDIKYLYTMIKGEDNKAYMVVDASLENASPFGEEYELEDAMNKAFNGEVSFTENPVSDEDGTFISAYAPIKDSSGKVIAIVGADKDVATFAYIQTTMLKTAVKIIVAIIALSVILSIILTKKITASVNEVVIGLNKMSQGDLTVSVNVNSKDEIQTISKSIDHVRNNMVEMLSKSKQLCEAVMDGSINLSAASDQMAASSEEVSSAIQEVAKGMNSQSNEMAKINEIMNTFGLKIDDTVKGIGEINSKIEIINSKAQNSNHDLVTLEDGMKELDDSFTVMNQEIKDLGVYLSQIGEVTNLINSIAEQTNLLALNAAIEAARAGETGKGFAVVADEIRKLAEQSKNSASNISSLLDNVTIKSNLVVKTSENMNGKLIEQDKVINNSIKSFKDIIDNVEEIITRINAINNHMNDINIEKVNIIQSVEETASVSEEVSASSEEIAASSQELSASSEEVAAATQELSELSKNMMETMEQFKI >CP035282|1058040:1066522|1064843_1065455_+|QAT61003.1|DBSCAN-SWA MKLSDKIIILRKQHGMSQEDLAEKLNISRQAISRWENGSATPDASNILQLSKLFNVTTDYLLNDDFKSDNDLPKLKETKENNLKQIMIYLITLEVMVLLMQIMATIILQNVFFVVLSIIPFVALVGGFEYAYQKNGNETSAIFRKSFYKISVWLGLYFPTRFLVTLAMHFYPHPYSTIIFEIMVVSVYLMLSMIVMLSIDEKA >CP035282|1058040:1066522|1061373_1061613_+|QAT61000.1|DBSCAN-SWA MSDKTRNNHLLSYPVIVLASGGDVDAINAVLKHYEGYIAALSMRTFYDESGNPHLCVDEALRRRLETKLITKILTFNAA >CP035282|1058040:1066522|1060784_1061396_+|QAT60999.1|DBSCAN-SWA MQFIRPSYARLYFQSGIFVSFLNFIQKISEKFGSFVILTVIVAKGEQRGHRPKGGENVKPNSHEQSKRHAFDSFCKKILKHEARDYYDELKSQRNREVSFSDLSAKEMDELYTEDRYFVTEQIFNVLGLDVIVTDDVIAGALQSLPERKRDIILLSYFLELSDREIGDKLNMLRSTVQYQRTSTLQQLKNFMEGDTYERQDKK |
8 | Streptococcus_phage(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1574078 : 1626243
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP035282|1574078:1626243|DBSCAN-SWA AGTGATAAAATTGAATCAAAAACAAAAAATCATACTTAAACATATTGACGGTATGAGCAATCGAAGCATTGCCAGTGAGCTTCACATGAGCAAGGATACTGTAAATAAATATGTAAATGAGTATGAAAATCAAAAGCAAGAACTTTTAGCAAAAAATCCTGAAACAGATACAAAAGAATTAATTCAAGCAATTGTTGAAAAACCAAAATACAATTCTGAAAACAGAGGGCCAAACAAGGTAACATCTGAGATGATTGAAGTAATTGAAGAATGCTTAAAGGTTAATGAATGGAAGCGTGCTAACGGTATGTCAAAGCAGCAAATGAGAAAAATTGATATTCATGAATACTTGTTAAAGAAAAATTTTAATATTAGTTATTCATCAGTTAAAAGATTAGTTAAAACAATCGAGGATAGGCATCGTGAAGCTTTCATAAGACAAGAATATGTTCTTGGAGATGTATGTGAATTTGACTGGGGTACGGCAAAATTAGATATAGGGGGAGAAGGATATAAAGCTTATCAAATGGCAGTTTTTACTCCTGCTAAAAGCGGAATCAGATATTCAATGCTTTTTAAATCTCAAGATACTCCAGCATTTCAACAATCACATGCAGAATTTTTCTCATTTTGCAAAGGTAATTTTAGAACAATGGTCTATGATAATATGAGGGTTGCAGTTAAGAAATTTGTTGGATTGTTCGAAAAAGAGCCAACAAAAGCATTGACAGAATTATCAATATACTATGGATTCAACTTTAGGTTCACGAATATTGCAAAAGGCAATGAAAAGGGCCACGTTGAGAGAAGTGTAGAATATGTTAGAAGAAAAGTATTCAGTGAGCCGGGTAATGACAAATTCGACACTCTTGCAGAAGCAAACAAGTTTCTTTTTGAAGAATGTATGAAGCTTAATAATAAAGAAACATCTAACGGATTGGTGCCGATGGAAATCTTTAAAGAAGAGCAAAAACACTTGTTTCCTAACTTACCTAAGTTTGAAAGCAGTATTTATTCAGAAAACCGTGTTGACAAATATTCGACCGTAACGGTAAGTCAAAATCATTATTCTGTGCCGGATACATTAGTTGGTAAAATGGTAAAAGTGAAGATGTTTACAGATAAGATAATTATCTACTACGATAACAGCATTGTAGCTAAACATGACCGCAGTTTTAAACTGCATGACTGGAAAATTGAGATTCATCATTATCTTAGAACTCTACATAAAAAACCAGGTGCCCTCAAAGGAAGCACAGCACTGCTCCAAACGGACACCCAGATCAAATATATCTATGAACAGTATTATACCAAAGATGCCAAGACATTTCTACAAGTTTTAGAAATTATTTATGAAAAAGGAATCCATGCTGTGACAGAAGCTTTAAGGGAACTTGAAAAACTGTCACCAATGGATATGAGTGCTGATAAGGTTAAGGTGATTTGTGAAAGTAGAAAGGAAAAAGAAATTTGTGTTACTGTTCCATTAAATGATCATCTAACTGAAAAATCAAGGAGCACATTATCGATTTATGATAAACTTGCAGCACTCCAATCAAGAAAGCTTAACAAGGAGGCTGTATAGTATGAAGGTTAAATTAAATGAAGAGATTAAAGAATACTGTAATATATTGAAACTTAAAGGAATTAAAACTCACTATGAAGAAGTAATATCTGAAGCGGCTGATTATGAGGATTTTCTTCATAAGCTTTTAACTTATGAGATGGAAGAAAAGGATAAGCGTTCCATTGAATGTCGTATTCGAAATGCACATTTGCCTTACAGGCAATATATTGAAGATATTGAAATTGACTGTCTCCCAGTAGATATGCAGAAAAGACTTCCTGAGTTAGCAACACTTGATTTTATCGAAAAAGGCAAAAATATCATAATGACCGGTAACCCGGGAACCGGAAAAACTATGGTTAGTATTGCTTTAGCATTAAAGGCTTGCATGGCAGGTTATAAGGTTCTGTTCACGACAATTCCACTACTGGTTACTACATTGAAGGAAAGCAATAGCGCTAAGACCTTGAGATATTTTGAGAATAGATTTGAAAAATATGACCTTGTAGTGGCAGATGAACTTGGGTACACCTCGTTTGACCGGGAAGGGACAGATCTGCTGTTTAATAATCTTTCTTTAAGGGCAGCAAGGAAATCAACAATAATTACTTCTAACCTTTCATTTGAGCGTTGGATTGAGGTTTTCGGTGATCCGACAGTTACAAGTGCGATGATAGATAGACTTACTTACAAGGCAATTCTTGTCGACATGGAGGGTGATTCTTATCGGCTAAGAGAAACATTAAGAGAAAATGGTGCATCTATTAAATCTTTAACAGCTTAAAGTATTTGTGCCTTTGTACACAAATTTTAGAGGCACATTTATTTACAAGAAAGTGACCTAAAATTAAATGGTCTTTTGACCTAATTTTCGGTTGACAAATACAATTGTGGGAGGGGTGTTTTATGGTGAAATTAAATGGCAAAAATGTATATCTTGCAACCCTTGAAAGAAAAGACTGTAAAAAGTTATGGGATGATTTCGAATATGATTTTGAGGCAATGACTGAACCCTTGAATATTGGTCATTCTATTGAGAAAGCAGATAAGTGGTTTGACGAAATTCAAGATGTTCAAATGAATAAACATATTCGTTTGGGAGTGTTTTTATCTGACGGAACTGTAATAGGAGATGTTGCGCTGCAGGATATTGACTGGAGAAATCGCTCCTGTACCATTGGATTGGGAATCTCAAAAATTAAGGATCGCTGTAAGGGATACGGAACCGAGGCTGTAAAGTTAATTTTAGAATATGGTTTTAATAATATTGGGTTAGAACGGATTTCTGCGAATACATTAGAACAAAATAAGGCGACGCAACGTGTATTGAAAAAATTAGGTTTTACGTTAGAAGGTACGGAAAGAAAAGCTGTATATTTTGCAGGAAAGAAATGGGACAGGTTAAATTATGCTATATTGAGGGAAGAATTCAAGATTCGGTGAAAAAATGGTGTGAAGTAAAATAGAGGAAAATTTTTAGTGAAATAAGCATACTCCATTATCTAAACGAACTCAGCCAAAACCATACTTGCAAACGGCGGTATATTAGAAAATGAGGTTGTGAAGGTGATAGAAATGCTGTTCAAAATATAAAAAATATCTTTTGGACATTGACTTATTTAATGTTACTTTATATGAATAAGGTGACATTCTTACGCATCAAATGCTGATAATATTGAATATATGATCTGGGGGCCGAATGATGAAAAGGCCACCGTTGATTTTATTGACGAATGTATTGCTTGGGAATCAAAATCACCTCGTCTGCACTATGATTTTGCAATTACACTTAAAGAGAACGGAAAGCTGATCGGCGGATGCGGAATTTATCTGAAAGACAACTTAAGGCAAGGAGTATTAGGCTGGGTACTTCATATGAAATATTGGAAGCAGGGGTACATGCCTGAAGCAGCCAATGCATTATTATCCTTTGGATTTGAAAAATTAAAGCTTCATCGGATTTATGCCACGTGTGACGCCGATAACTACGGTTCCTATAGGGTGATGGAAAAATGCGGCATGCGAAGGGAAGCTCACTTTATAAAAAACAGATTCGGCCGAAACGGTGACAGAGAACATTGGTATGATGAATACCATATGAGATAGTTTAAATAAACAAAGGTTCTTGGACAGGAGTAATGTCTTACCGTTTTTCCATATCATAAAACTCTTGTATTAAAAATAACATTATGATAAGATGCACTTGAAAGACTGCATATAAAAATAAAAGCAGGCTAAGGGGTGCAAAAGATGGATAAAATTTATAAAATAAAGAATGAGTTTATTAAACATGGAGGAGTTTTGAAGACATCAGAACTTAACAATATAGGATTTTCAAGTCGTCAAATAAGAAAGTTGATAGAAGAAGGCATAATTGCTAAAATAAAGTATGGATTTTATGAATTGACAGATTATATTCCAAGAGAAGAAGTTATTATAGCAAGGTTATTTCCTAAGGCTGTAATTTTTCTTGAAAGTGCACTTTTTTATTATGAGTATACAGATAGAATACCTCAAGCTTTGCAAATAGCGGTAGATAGGTATAGCAAAACAACGCAGTATAATATTGATTATCATGTAGTAAAGCCCTATTATTTAGAGCCTAAATTTATAGAAATCGGTGTAGATACAGTAAAAATAGAGGGAATAAAAGTCAGAGTATATAACAGAGATCGTACAATATGTGACGTTCTTAGATACGAAACGAAACTTGAAAATGAAATATTTACCGGTGCAATAAGGCGTTATATTAAAGATTCAAAGAAAAATGTAAGAAATCTATTTGAATATGCTGAAATATTCAATATTAAAAACAAGGTACAAACGTATATAGGAGTGTGGTTGTAATGGTTGATATGGCAGTATCAGTCTTAGCAAAACTAAAGAATAAGGTAAGAAGGCAAGGTGTTCCATTACAACAACTGTTAAATCTATTTTGTCAAGAGGAATTTATAAGAAGACTTTCTGAGTCTTATTATAAAGACAATCTTATTCTTAAAGGCGGTTTTCTATTATATTCTATTAGTGGATTTACTGCAAGAGCAACAGTTGATGCAGACTACCTCTTAAAGAATTATTCAAATGATTTAGATTCTATAGAGAAACTTGTTAATGAAATTATTTCTTTGCCTAATAAAAATGATTTTGTTAGATTTGAAATTAGAGGTATGGAGATAATTAATGAAATTAAAAAATATCATGGTATTAGAGTTAATCTTACTGGTATTATCGGAAGGACAAAGACACCCTTTAACATAGATTTTGGAGTGGGAGATATTATTGTCCCCTCACCGGTAGAAAGAACTCTTCCTGTGCTTCTTCCGGAATTTAAGAAACCTGTAGTTTTAACATATTCTTTGGAATCTACGGTGTCGGAAAAGTTAGATTCAATAATATCTTTAATGGAAGCTACGAGCCGCATGAAAGATTTTTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP035282|1574078:1626243|1587814_1588060_+|QAT61444.1|DBSCAN-SWA MSYKSKVVKNILTNPISTQGCADCSGNCQGECGKLCESNCGSNCYTTCSGSCEDDCVNSCKGDCENTCTFVCAATCSHQVG >CP035282|1574078:1626243|1585490_1587731_+|QAT61443.1|DBSCAN-SWA MNLSKKTKQILLGVILLVVITVGIIGLKLSNNRNKDVQKAEKTATVNTDDKLFYYVEKKLYEEHNIHEKLTPYFVNYKGNTAKAIETENGMKLVNMKNMKNIADVPHEVIVNSTGYWIDEDSNFVTVKYNKEKKAVLVRTFDKDGKEIEEPVALKEFGGRINDDSYINVMEFRIDTKYIYLVSAADPRPILQIFNKNGSLHKNYADIGNFETDNNGSIYITFGVSGEHKYNGFEKINVESGEVEYSVDTKILPNHIRYNKEKDAVYVMDDNGVTRYNASDGKNEKNIFTFGKDSTYVLDSLQVEDFFVGNEEELYISLFYFEGDEYICLYYGYEPKEGIRPERTVTLTVTAPYRQDFLSDAITRYEMKYPDQKVKYDYKYNSEEEFVANTEQYGQQLSLSILGGDVGDVVMTGGSGLNYEEVFKTDAFMDLSSLIEKDKNYDVLNKDVIEGLRIKGAVRGLPISITRSYYEVNTKLLDSIGVKLDYNNLSWKDVIFLTKVIEEKAPDVHVFTGNEYVGDYLIPMIGANISQLVDFENKKINLNQEWFVDLLKDLKEAMKSKNFVKTHTGSDVIDKLQGSLFVHRSTERKYYRDMVYNYLHYNEEGKESLYIPIFVGEKSNKRGVQVNNMYSINNKSKNKEDAWKFLSFLLGDNIQKLRTLRAEPVNTKANKEILEAAAEEFSRTYGDDALKVVDMMMNIFDRTDYVDMYYDKQDIYDPLMSYINDEMSLEDALKKAEENVWIRLNE 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MEINKRSYYNLTHPQKRIWYIDKVNLNSPVHNIGGCLNIKGNIDVEKMKETINLIVKGNEGLRLRITEKDGQLVQYVAEFKKEDIDFVDFSNYKEPEKEHERWAEGLFKRSFELEDSRLYYFAVYKIDEEEYGVLLKIHHIIADGWSTALIEKQICEIYTKLVRNEEVCFDGYHSYIDFIEEEREYLNSEKFIKNKNFWREKLKNPPEEFLYNTSNELEGRRLSFNIDNDLSKKIKEFLKYNRCSLNTLFIGLLLIYLRKTTYKNDLVIGTPVFNRIGRKQKSMVGMFTSTMPFRFLLDEELKGKDLIKSINRELKLCFFNQRYPYDILVKDLNLSRKGYDSLFKICVNYYNSQYINDINGMAGEVREYYSGNQGNSLQLTVKEWKDDNIILNFDYKIREYKEEEIQGMYKSMINILRQLLTDGDIKVRDIKLVDEREFNYKIYTLNSTDGPYPKKTVYELFEEQAIKAPHKIALEFRDEVMTYEQLNEKSNQLAHYLRQKGIGRGSVLGIMMNHSMELVIGILGILKAGGAYLPIDPEYPPERISYMLEDSKSAVLLTDFKAGRDIEFKGSIIDIKDINLNLYGKENPPKVNKLNDLAYIIYTSGTTGKPKGVMIEHRGLTNYIWWAKKMYLKDENEAMPLYSSISFDLTATSVFTPLISGNRIIIYNTDENEFVLYKILKENKATVVKLTPAHLTLLKDMDNRSSNIKRFIVGGDDLKISLTQEICESFGKNIEIYNEYGPTEATVGCMIHKYDMEKDRGISVPIGRPAGNVQIYILDGDLNVVPANATGEIYISGDGISRGYLNRPELTEEKFIENPFIKGRKMYKTGDLAKYLKDGSIEYKGRLDNQVKIRGYRIELGEIEKHLSENEAVKDAAVVFKEDSSGNKSLNAYIVKEKEITELELKNYLLKFLPRYMIPANFVFMDRFPLNLNGKVDAASLPNPVRVKKEFVKYKTEKERKLVEAVEEILGIENVSMNDNFYQLGGDSIKAIQISSRLKNEGLDIKVKDILSCDSVEEIGFHIRENQNIGMIDQGQSQGAIERTPITEWFFSRNFSDENRYNQYVLLKYNKISDIDKIRIAVGRLTEHHDTLRINYDRKNHRLYYNNDNSKSSSCVKYVDLSGYCGSEDNMSVKELIDKAEINFDIGKGPLFNVTIFDLSGGRQALLFTAHHLTVDGVSWRIILEDFLTAMKQLDNNEEVKLPAKTHSFKDWAKVLKEYSKKDFGEERRYWQEISDKSFVYPTDFDKGKDTVGTSGILIRDIDEDILNKLSKKTGEIYNTEFSETLIILLVLTISSMTNSDEVVIELEGHGRKDINDYIDVKRTVGWFTVMYPVYFRIEDGDLNLRIKSLKEQLRNVPDNGFNYGILRFLNNELEEREEKYIRFNYLGDFDNIIGDIPDIEFGLDSDEENSLTSLMDIDAFIIKGRLKLKITYSKNKFSESTIRRFADKYTETIKSLLNQCIKNDSKEFTPSDFDAADISQEDLDSLFK >CP035282|1574078:1626243|1594735_1595860_+|QAT61450.1|DBSCAN-SWA MIKKIGAVSCIVLLILLIVFQIHVINSFESLPERAEIFLIDDDGRKFSTEDIEPLNQDFLISRIKERNISVGKNKISVILTDENYPNFWNFDMARGKWFSENKDEAVISNNLAEKLFHTEDAVGKEIDLGDVSYTVSGVYEEKDLYKKAASERERIYVPLNSNFDEGNTDVSVFFATGKKGECEKFFAERFAEKFSLYTGAENYKDYEIKDMTRNKDIISQFLTGYVFIVQLLLFIFICRLFIRDFGLCFDKYRKASEKQYLGEIVSENTTEILITAIKWTVMVFASIFLVRKIIGFQFYVPGKYLPPDYVFDFKFYSGIFSQKSEISSMFLSDYKNLYINVFHLCTVISASEIFLSLVLYLVLWKKIFSRRAA >CP035282|1574078:1626243|1611959_1612229_+|QAT63408.1|DBSCAN-SWA MIIADNVKYHHFKGINEYLKELKNIEFLYLPSYCSELNAIEHLWENIRAAVTHNTLFDQFTELLNQVQSYLCSINKNKSKLKKLCAYIC >CP035282|1574078:1626243|1600089_1600533_+|QAT61455.1|DBSCAN-SWA MYSLKYKGHQWLKSTFPNIEISSDYNPWFGGIQTLPEDWDFNSKPVLKEKIKTDFIEISDSCGNIWHGINSRLLIKEYNEFKGLEINEYFLMLPKVPVLCHVIEVSQDMKIFMKNRAFITKTFFNLNNDLTKSYVVAENEEHDFIKY >CP035282|1574078:1626243|1590563_1590752_+|QAT61446.1|DBSCAN-SWA MSYKSKVTKNILTNPILSSTICSDCTGTCAGSCSGFCGQLCSGSCEDTCTFVCSATCSHHTG >CP035282|1574078:1626243|1597888_1598887_+|QAT61453.1|DBSCAN-SWA MHKRYIDMLICPSCHNELIWNIEDEDEDRIINGNAVCPSCKSVYEIRNEIAVFLTNDLSRNDLWKHGESELERYLGENPDIYDKLMNIPEGEMNGADYWFKASYFESKNDFKTSSGMFKNAYKKIYTQDYIDGWKSQIDFIVNNIKSDRPIIDIASGKGYLVEKLLKERKNYVVATDFSPTVLERNKEYYKYKGLYDKLSLISFDARKTPFKDNSIEILTSNMGLQNIECPGEVIKEMNRITKGTFMSVMFFIDKEDKIHMDLFNKYGNAAYVTRSNAVDTFKKAGWNVNIANSFLANIMPTPEGKILKGASIDGFPIADTKIEFCVIQATK >CP035282|1574078:1626243|1588246_1590478_+|QAT61445.1|DBSCAN-SWA 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46 | Streptococcus_phage(37.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1817895 : 1825962
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP035282|1817895:1825962|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP035282|1817895:1825962|1821307_1822792_+|QAT61671.1|DBSCAN-SWA MLLPRLSFQEMIYDMTYIKKVILENFQSHKHTEILFDEHLNVIVGPSDQGKSAIIRGIQWALFNEPSGDFFIREGEKECSIIIYFSDNTAIKRYKSRSKNLYYYYDEFGKETIYEGFGLEVPKEIVDKIKIRKIFLSGKQSNAINISEQLEGPFLLSENTNTRANAIGRLIGVHIVDDAIKDTLKDKTNLNSLKKNNEEQYQNLSDDLKKYDYLDDLKRILDKFEIIQGSINEKQAKLEKLIGIRKDYIDCSNNIGNVKSIINRLENIDIVKEKSDRLNNCIRIYNIVNSKKVNLINIDEKINENLNILKYSSNIDEMGNILINLDDKTKKLLLLKSIDEKYRYINKNLSDSNLIIENLKTIYIVSNMTDDIEKNIHGLNNLSTIYKNLMDLDKRIEQGNNYIKKFKNISEGDLLVQNISGKLKGFNTFINVEKRYTDILSNINNTNKIIKDEKDNISLFLEEYKSLLLKLGICPLCLSKIDSKTIEKIISNYS >CP035282|1817895:1825962|1823963_1825493_+|QAT61674.1|DBSCAN-SWA MELLKLVISAIIGIIAGFYIRRTISEGKIKNSEELAKKILDDANKDAETKKKEVLLEAKEEIHKMRSEFEKESRERRNELQKLERRLMHREESLDRKSESLEKKDDLVSKKIKELDEKEELINQLYEKQVEELERLSGLTSEEAKELLLNDVKKEITHESAIMIKEIESKAKEEADKKAREIISCAIQKCASDHVAETTVTVVPLPNDEMKGRIIGREGRNIRTLETLTGIDLIIDDTPEAVVLSGFDPIRREVARIALEKLIIDGRIHPARIEEMVEKAKKEVENIIREAGEQAAFECGINGLHPELIKLLGRLKYRTSYGQNVLRHSIEVSRLAGVMASELGADVKIAKRAGLLHDIGKAVDHEVEGPHVTIGVDLAKKYKESKEVLHAIAAHHGDIEPQTVEAVLVQAADAISAARPGARRETLEAYIKRLEKLEEIANSFEGIEKSYAIQAGREIRIMVKPELINDDEIVHTAREIVKRVEEELDYPGQIKVNVIRETRAIEYAK >CP035282|1817895:1825962|1817895_1819131_+|QAT61668.1|DBSCAN-SWA MKAEIINVGTELLLGSTLNTNAQFLSQRLAELGEEVYFHTVVGDNRGRLKDALNLALKRSQLIILTGGLGPTQDDLTKEVVCETLNLKLNLNKEVLNEIKRYFNKLHREMSENNIKQAYIPENSIVLKNDIGTAPGVLVNWNDKKIAILPGPPNEMKTMFNKYLSPLIKENYIIKSKTLKTIGISESTLELMIKDFIDSQTNPTIATYVKEGQVDVKITAKEENKENSDDLINDMVEKVEKRIGKYIYSYDDETIEEALYKILKDRGFKIAFCESCTGGLVSGRFTKIPGVSQVFDRGIVTYSNRAKVEELNVKEDTLRKYGAVSEETAIEMAEGLLKKSNVDIALSTTGIAGPDGGSEEKPVGLVYIGVATKEGSHAVKFTFPGNRISIQNRTATMVFDEGRKCLLKLNN >CP035282|1817895:1825962|1822874_1823126_+|QAT61672.1|DBSCAN-SWA MQDYEKKLNTLKDDLEKAKSLRYKAEARLEQLNKQKEDLIKELESLKVNPNNLDEEIKKLTLEIDSLFDEANKLLPKDLLEKK >CP035282|1817895:1825962|1825701_1825962_+|QAT61675.1|DBSCAN-SWA MDVLKVSAKSSPNSVAGALAGVLREKGSAEIQAIGAGALNQAVKAVAIARGFVAPSGIDLICIPAFTDIEIDGEERTAIKLIIEPR >CP035282|1817895:1825962|1820361_1821348_+|QAT61670.1|DBSCAN-SWA MKILYFTDTHIRGTTPQNRKDNLVETLEKKFNEVIGIINEENIDYVIHGGDLFDRPDVSVSIVSKFAEILNKIKVPIYIVSGNHDIYGHNPETLGKTMLGLLNAINILHVIDSGEKIILEKNGVKVQLTGQPYIYNLDDPINRDKYIIKSKPDNIKYLIHVVHGMLLDRPFIKGIPYTLIDDIKETKADITLCGHYHSGFGIKIIDGKYFINPGSLIRITNSVKEIERIPQVVIMDLSKKIDIKLVPLKTAQKGELILDRKEIENYMYKNERLNEFKQSIDETVNFDKLDINKILSEISHTEGIKPQVKEEALRRIASSQIKFSGDDI >CP035282|1817895:1825962|1819230_1820298_+|QAT61669.1|DBSCAN-SWA MADSKNKNNENSKEKALEVAITQIEKQFGKGSIMRLGENSKMNVESIPTGALSLDIALGIGGLPKGRIIEVFGPESSGKTTVALHSIAESQKLGGIAAFIDAEHALDPVYAKNLGVDIDNLIVSQPDTGEQALEIAEALVRSNAIDVIVLDSVAALVPKAEIEGEMGDSHVGLQARLMSQALRKLAGAISRSNAIIIFINQLREKIGISYGNPETTTGGRALKFYASVRLDVRKIDSIKQGDDIIGNRVKVKVVKNKVAPPFKQAEFDIMYGKGISKEGNIVDLGVTSEIINKSGSWYSYGEDRLGQGRENVKDYFKEHKDIADEIENKIREKNGLKPLELKKVSKEKKDKEKAE >CP035282|1817895:1825962|1823136_1823793_+|QAT61673.1|DBSCAN-SWA MISNLEDLNKNIDNLKRLYSKESGKKEKILEQMEKVKKEINEIDSKIDLLEEVNLLLQKTSEFAREQSKKQIETLVTNCLQYVFENDMEFNIDIVELRNKPNAEFYVISRYGTHTIKTKPELSRGGGVVDVISLALRIAFMQIYRPQICGPLILDEPAKHVSEEYIFNVADFLQKTSEMFNKQIIMVTHNNYLSSIGTNAYRVELKGSESIVRKITPD |
8 | Bacillus_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2399989 : 2412927
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP035282|2399989:2412927|DBSCAN-SWA CTTATTTCGAAATTATACCGTTGAGGATCTCAATTTTTTTATTATAAGAATTGAAATGGGAAGACCGAATGTGACTGATAACTATAAACCCCGAATCCTTCAGCTTCAATAAAGCACCGTCGATCCCTTCAACAATGTCAGAATCCAAATCCGCAAAGGGTTCATCGAGAACAATCAAATCGGGATCTTTTACAATTGCTCTTGCAACCCCTATTCTTCTTTTCTCCCCTCCGGAAATATTTGTTCCGTTTTCCGTAATAACAGTATTCAATCCGGCAGGCAATTCGGAAATAAACTTGTTAAGGCCCGACAATTCAATTGCCTTATTGAGCTTCTCCTGTTCACACTTAGAAAACATTGTAATATTATTTAAAACCGTATCCTCAAACAGGAAGATATCCTGAGGGACATATTGAATCCTGCCGTAATAATCATCTGTTTGAATACCCGAAATGGAATCTCCGTTAATCAATATTTCCCCTGAATCGGGAGAAATATATCCGATTAAGAGCTTGACTATTGTTGATTTTCCCGACCCGGAAAGCCCATAGATAAAATAGCTCAAGGAGGTATTGAAAGTATAGGTAAAATTTTTGATTATCTCCTTGCCTCCGGCATCATATTGAACATTTTTAAATTCAATGCTTTTTACCCTGTCCCTAAGTTTTTTCTTTTCAGTAACATCATTTTTTACTCCGAATTTTGCGATTATTCTCTTTAGAATCGAATACCCTCCCTTTAATCTCGGAATTGAAACTGTTACCATTACCGTAGGGGATATGATTTTGTCGGAGGAGTTCGAAATTATGATAATCGTTCCTATTGTAATCAAACCGATCTTATACATATAAAGTGACATGACAAGGAGTACTGAAAAGCTCAAAATGTATATGAGCTGATGTATAGCTGATATGTATGTTAGGAATTTGTCTATTTCATAGCCCTTATCCTGAACGTTTTTATTGACGGTTTCGAAGTCGGATTTAACCCTTGAAAATAAGTTGTTATTTTTGATGATCGTATAACCTGAAAGTATTTCTTTGACGTAAGAGGTATATTGGCCAAATATCTCGCTTTTTTCACCATATTTCTCTTGAAGGAATGATGCTGTTTTTATTATATAAACGGAAATTCCGACGGATATAAACAAAATCGCAATCAAAAATCTATAATCAATCTTCATAAGAATTACAATCCCCAATACAAAATTTGAAATATGATAAATCATATCAAGAAGATTTCCGCAAAAATCTGATTCTACGGCAGCCATATCGTTTGTAAAATTGGATAAAAACTTTCCTATACCGGCTTCTTTTAAGCTGAAGGAATCGGATTCTAAGATCATATTCAGATAACCGGACTTTAAGAATTTCATTGTATTTTTCTTCACATTCAGCTTGAAGTAATCAGCAGCCATGGAAATTATCAGCAACATAATCTCCAACAGGAGAAAATTTCTAACCGTCTTGAGTACCCTTGAGCTTCTGCTAATCAAAAAATCAACGGAATCCCCCATGAAAAGTAATGCTTTGTATTTAACTATATTGAGGATTAAAATAAAAATAATATAAATGACAAGGAATAAAATTATCCTTTTCTTATTTTTCATCTCTATTCCTCCAATATGAAGCCGAATCCATAAGCCGTATTTTCCCATCAACAATTTGAATTACATAATCATATTTAATGTGAATATCCTTTATAAGTTTATGGGTTGCATTTATTACGGTAAAATCTCCCGACAGAATAATATCCTCTATTCTTCTTGAGTTCTCCTCATCAAGGCCTTTTGTCATTTCATCAAGGAGAATCAATTTCGGTTCTTTTATCAATTCTCTTGCCAGTGAGACCTTCTCTTTTTCTCCTCCTGATAAGGTTAAATACGGATTATTGTCCGAAGTGATTTTTTCTATACCCATCAATCGGATGATTTTCTGATACAGCTCCTCACTTTCGGCTTTATAGAGCTTAATATTATTTTCAACGGTATCGTTGAATAAAAATACATCTTGGGTGAGAAAGGATACGTTTTCAAAATATTTTTTGAGGCTTATTTTCCTTATATCACAGCCGTCATACTTGATTTCACCTGAAAAAGATTTATTCATACCGGATATGCACTTTAAAAATGTGGATTTCCCCGAACCGCTTTTCCCCAGAAGAAGGTATTTCTTTCCCCTTTCAATTTCAAAATCGGAGGACTGTAATATTTTTCTGCTGTCGTAAGCAAATGAAAAATCCTTGATTTCAATTTCCTTCTCAAATCTGAAATCCCTTCCGATATCATAATCATCTGCTGTTTTTTCTGAAATATATCCGTCTAAAATGTCATATGCAGCCTTCATTCTGTTGTATGAAAAACCTATTTCGGAAATTGACGAAAACATTGAAATTGAAAAGGGTAAAACTATAGACAAAAGTTTTGAACTGATTTCTAAGTCAAAATACATTATCCCAATATAGAATATAATAATCGGAGTGACAATACTGAAAAACTCTTTGCCAATCCTTAGGATAGAATAGAGAAATTGTTGATTAAACTTGACTTTCTCATTAAGTTCCACATTCCAATTAATCCTGTCAGCATAAGCTTTCTCAACAAGATTCATCTTCAATTCCTGAAGTCCGCCTAAAAAATCGGAGAAGATTTTCATAAGCTTTGAGTTTGTCTTATTTACTCCTAACTGTAATTCTTTTGTATATTTTCTTAAGAAGAAGGTAAAGACTAAAAAAAGCATACTCGCTGAGAACAAACCCAATGCGATTTTTCTGTTATTTATAAAAATTATTCCGAATGAAAAGATGTAAACAAGAATTGCTGAAATGTTTTCAAGCAGCACGGGAAAAAAATTGCTTTCAAATTGAGAAATGTCGTTAGTAAGCCTTGACAGGTATTCGGAAGTTAGATGTTCGAAATATTCTTTATAACTCTTATGTAAAACGCTTTCAAAAATTTTCTTTCGAATTTCACTTAACGCATCACGAATGAAACCGATCCTGAAAATCCTTGAAATAAGATAAAGTATCGGATTCAAAATACTTATTGTGATTAAAATAAAAAGAACCGCCTTCAAGCTCAATTGTGAAGCAGGCGAAACAGCATAAAGTACGACGGTAAAGATCAACTGCAAAAGAATCGTAGTTACTGCGGAAAAAACAATTCCGATAAAAAATTTGATAATTCCTTTCTTGTCGCCGAATAGAATATCTCTCATATATCCATGTTCTCCCCCTTTGATTTAAACTCAAATCTGACAAGCTTAATTTTCTATCAGCATCTTCGAATACCTGTCCTCGAACTCTTCAATCAAATTATATACTAAGTTAACATCATATTCCAAGTAATATTAAATAAATTTTTTATGTTAAACCGCCTTTAATAAATTAAGAAGGCCTTTTTTGAAACCCACGTTGTGGGAAATACATTTAAGAAAATTATGATTTTCCTATGAGTTATAAAAAAAGGCCAGGAATTAATCCTGACCAATTTTTCTCGTCTTTCGGCTATATAACTTATTTCTTATATTAAAATTTTATATTCTACTTCACTCTTGTCTTTTCTGATTTCGGATCTGTTATAATCTCATAGGTTCCCATAGACGATACAGAAATAATGACAGCATTTATTATTGTCAGAACAACTCCTTGAATCCCCTGTCCCGTTCTTGCAAATACAAAGGCAAGTACAAGGGCAATCAAGAAAGTATAAAGTCTTACAAAAGCATCTCCAAATTTATTTTTGATTATTGATTTTGAGAACTGAACTATTAAAGTTACCGCCGCTACTAGACCGGCAAAGGTCCCCAAAGTCTCTAAAGTCATAAAATCATTATACATATTTATTTCCCTCCTGCAATCTAAAACATAGGCTCTTAATCAGCACTCATTTTATGATACTACTATAGCATCATAGCCTTTACTTCTTAACTCTGCTGCTAAATTATCCGCATTTTCTCTTATGTTAAATGCCCCCACCTGTACTTTATATAATCCTCCCACATAAACTACTATAGCATCGTATCCTTTTTCCTGAAGCTCAGCGGCAAGATTATCTGCATTTGATTTTATTGCAAAAGCCCCTACCTGCACTTTATAAAGAGTCGTTCCTCTGTAGGGTATCCCCAAATTTTTCAGTATACCCTTTGCTATGGCTAATGCCAATTCATCCTGTCTGTTTTTTAATATATTGGCATCCTGGGCGTTTGTTATAAACGCTGTTTCTATCAGAGTCGCCGGCATATTTGTCAGCCTTAGAACCGCAAAATTGGCTGTTTTCATCCCTCTGTCCACAGTATATACCCCTTCTGAAATTATACTGTCGTGTACATCTTTCGATAATTTTCCCCCTGAAGTACTTCCAGGATAGCTGTAAGTTTCCATTCCCTTAGCCGAAGAATCCGTAAAAGCATTGCAGTGAACAGAGACAAATACATTTGCTCCAAAGTTGTTTGCCAGCGAAGCTCTATCCTCTAATTCCACGAATATATCTGTAGTCCTTGAATAACCTACATTTATATCATGATTCTTTAATATATCCCCTATTTTTAACGTCACCGGCAGTGTTATATTTTTTTCTTGTATTCCGTTTCCTCCGGCTCCAGGATCTCTGCCTCCATGACCTGCATCCAAAAATACTTTTGCCATAATAAATCCCCCTTGTACAATATAGTTATAATCAAATTACAGTTTTCCACTGTAATAATTATCAATTTCTTAAATAATAATATAGTCTTCTTTTCTAATCATTAAATACATTTCTTTGGCTTCTCACCCTAGCCATAAAGCCAGTTTAATTTGGCCTGAACCATGAACAATATTGTATAATTAATTTATGGATTTGGAGGTTGATGCAATTCCTCCTAGGACGCCTTTATGCGACTACCTGTAAAAAAGAGTATCTATCCATTCTCATAAGATTACATTATTTGGCTGGTTGAGGCCAGTTAACACTGGTTCCTCGTGTCACATGCAAGGTTGTGTACTTATTTGAGAAGGAATGGATTTCTAAATCCAAATACTTTATTTAGGAGGTTTCTTATGGATTATCCACCTGTAGCTGGAATTGATGTTGGTAAAAATTTTAGTGAGATGTGTATTTTGTCCCCTAATAATGAGATTTATCATCGTATTAAGATCTATCATGATTCAATTGACAGTATTAAAGAGGCTATAGGTCTATTGCAAAAAGCAGAAAAGGATTTTGCAATTAGGCCTGTCGTAGTCTTAGAATCCACTGGGCACTATCACAAAATCCTCTTCCACTATCTTTCTGATTCTGGATTTGAGGTCTCTATCATAAACCCCATCCAATCTGATTCTATCAAAAATATTGGAATAAGGAAAGTAAAAAATGATAAATTTGATGCCCATAAGATTGCATTGCTTTATAGGTTTTCTTTTATTAAGACTACTGTTGTTCCTGATGATGTTATTGACTGCCTTAAAAGCCTTTGTCGCCAATATTACAAGTTAGGTGATGAACTTACTACTTACAAGAATAGGCTTATTGGCATTATTGATCAAGTAATGCTAAACTTTACAGATGTCTTCCAAAATGTATATTCAAACACTGCCTTAGCAGTACTTGATAGGTATCCTTCACCTAAGCAAATTCTAAAGGCTAACAAACAAACATTAATATCACTTATTGAAAAAACTTCTAAAAAAGGTTTAGCGTGGTCCACTGAAAAATATGAACTTTTGGTTTTAAAAGCTAAGGAATTTAAAGATTTAAGCATCAATAACCCTGGAAATCTAGCCATTCTCAAAGTTAATATTTCCATGGTAAGAACCTTACAAGATGCCCAAAAAGACATACTTGACGCAATTAATGAAATTATTTTAGCAGATTCTTTAGAAGATAATCCTGTATTGGCACCTATTATTAATCTGCTATGCAGTATTCCTGGTATCGGGATACTAACTGCTGCCACGATACTTGCTGAGGTTGGTGATTTTTCTGCATTTTCTAGCCCCAATAAACTTGTAGCTTTCTTTGGAATTGACCCCTCTGTTAATCAATCGGGTGAATTCACCGGAACCCGTAACAAAATGTCTAAAAGGGGCTCTAGATTGCTTCGTAGGGTCATCTTTACAACTGCTTTAGCCAATATTCGAAGTAAGAGAAATGGTGACAAAACTAATCCAGTGCTCTATGAGTTCTACCAAAAAAAGTGTACAAACAAGCCCAAAAAGGTTGCATTAGGTGCTGTAATGAGAAAATTAGTAAATATTATATTCGCCGTCATGAGAGACAAAAAGCCTTTTGAGCTAAGAACCCCAGAAGAGCATGAGGAACTACTTCTTACTAGGTCTTCAGTAGCCTAATGATCTGTATTTAATGTTTAGTTTTCAAAGAACAATTTTAAATAACAGCTTCGTTTTTTAAACCAATAATCATTGGTTTATTAGGTGTGCATTTTTTTATTATTAATTTTTCAAAAAATATTTAATATTATTTTGCTAAAATCTATTGACTTTAATTAGCTGGTCTTTTTTATTTCAGGATTATTTTACCCTGTAATATATAAATAGATATTAAAATCAAATTTTACTATTCTTAATTTAAAATTTTTTTATAAAATATAAGAAAATTTAATTTATCTTAATAAAAATTTAGCCTTAAATAAATTTCAAAAAGGCTTCCTTAACGTATTCTGCTTTAATGGAAGCCCTTTCGATTTATAGTCAATATAGATTAATTTAATCAAAGATTATAAAATTCCTTTAGTTTTCCTTTATTTATTTTTTAATTCATCCTTTATACAGGTAACATCATTTTGAATGTCTTCCACTATTCCGAATTTCTGAGATAACTCCTTTATAATATCCTGATTTTCCTTTATGGTCTCCTGATACTTGCTCTCCCTCTTTTTACTGTCATACAGTACATATAAAAAGAGAAACACAAATAATGCAGACCAAATACCGTTACCTGCTGCTAATTTGAAAAGCTGCTGTTCCAATCTGCCACCTCCAAAATTAATTTAAATAATTTATAAATTCTTCTTTACATACGTGTTAATACGTGCTATAATATTTATAGAGAGTGAGGGAAGATAATGAAAACAAGTGAATTGTTAAAACTACTTAAAAGTAATGGAATTCGTCTTTATCGTCATGGGAAGAAGCATGATATTTATTATAGTCCCATAACTGATAAGACCTTCCCGGTGCCAAGGCATAACACCGAAGTTGCCGGCGGCACTCTCAAAAGCATTTTAAAAGATGCAGGGTTGAAATAATCCTGCATCTAAATGAAAATAATACACTTAAGGAGGTGTATCATATGTCTAAATATTTATTTCCGGCAATATTTACCCCTGAATCAAATGGAAGTTATTCTGTAAACTTCCCTGATATTGAAGGTTGCTATACTCAAGGAAATAATTTAAAAGAAGCTTATGAAATGGCAGAAGATGTATTGTGCCTTTGTCTATATGATATGGAAGAAACTAATAAACCAATTCCCTCACCTTCCAATCCAAAGGATATTGTAAAAGATGATAACTCCTTTGTAGCAATAATCGGAGTTGATACTCTTGAATACCGTATGTTTTACGATAATAAAGCAGTTAAAAAAACTCTTACAATTCCGCAATGGTTAAATACCATGGCTGAACGTGAAGGCGTAAACTTCTCCTATGTTTTACAATCAGCTTTAAAAAAACAACTCGGTATAACAGATAGATAAGAGGTCCAACAAAGACCTCTTTTTTCTATCTTAGCTGCCACCTCCAAAATTGCATTAAAAAAGAACCTACCTGAGTAAGTTTTCTTTGAAAAATTTCAGATAATATAAAAAGCAGCCAAAGCCGCATATAATTAATGGCGGGAGCATGTGGGAATCGAACCCACCCAGGACGCTATTAACGCCCTATACTGATTTTGAAGACCAGAAGGCACACCAGCACCTATCTACCCCCATGTGAACAAATACCATTATAAGATATAAAACGACATATTACAAGTTGTTTTTAAAAATTCGTTTCAGTTATTTTAAAGTTTCCCTTCTCGTTTACAATTTTAAAATTCACTACCTTTTTTTCTTCAACCTTCTCTTTTGTACTGATGGATACTCCTGTAAGTACTTCAATATTGTTGGAATAACCAGACATCGTATATCCTATTAAATTATACTGATCTATATAATCTATATTACTTTTTAAATAGGCTACCTTCGTATTATAATTAATATTATCATTACCCTCTATTTTCATGATACTCAAAAGCCCATTCAAATTTTCCTGAGTTATATAATCATAATATTGTTTCACTATATCTATAGGACTCGCGTAATCTTTATTAACAATTAATGAGCTGAATGATAACGGTTCTCTTATTAGGTAATATTTTGTCAAAACATTCCTCATTTTCCCATCGATAAGGATTTGAACCTTTTTTATAGAGGAAATACTCGTCAATGAGTTGACTATAGAATATATTACAAATGCTTCTTCCTTCTCGGAATAATCTTTTAATATTTCCTTTGAAAAATTTACATATGCCGTATCGTCAATAACTTCCGCCGATAGCAGTTTTACTTCCCGTGGAATAATATTTCTTAATTTATTTTTGTCAGTTCCTTTTAATAACTCTTGAATCACCACATTTGCCAGTTCCTCATTGCTTCTCGATACCAACCTTATTTCCGGAAGCAAAAATTTCATCTTATTATTAGGATAATAAAGCACTATTTCGGTCTTATCTCCCGGAAGAGGGCTGATGGGAGGATAATTATTACTTCCTTCATATATTACATCATAATTCTGACAAGAAGAAAGTATTGAAATTAAAAGGAGCATAGTAATTATGATAGAAATTACTCGTTTCATGCATATTCCTCCAATTAAATGAATCATAAAAGTTACTGCAAAGGTAATTTTATATAAAAAGTACTTCCCTTTCCGTACTGACTGTCAACCTCAATTATTCCTTTATGAAGAGACACTATCTGCCAAGAAATAGACAAACCTAATCCGGTCCCTCCTGTTTCTCTGGACCTGGCTTTATCCACTCTGTAAAACCTTTCAAATATATGAGGGATACAATCTTCAGGTATCCCAATACCGTTATCTTTAATAGCAATTACTGCATATTGTTCTAAAGTATATAATTTTATTTCAATTAATCCGTTTTGTTGAGTATACTTAATAGCATTATCTATAACATTAATTACAGCTTGTTGAATTTTATCTTGATCTATTGATATCTGAACCTTTTCTTCCAATATCAATGTTAGTTTTATGGATTTTTTTTCAGCCAAAGGTTTCATACTTAAAACTATTTTCTCCAATAAAAAATTGATATAAGTGGTTCTATAATTTAAAATAATATTTTCCTTTCCCAAAGTTGTTAAAGAAAGCAGATCGCTGATTATATTATTCAGCCTATCAACTTCACTGTCTATATCCTGTAAAAACTCCCTGTAAATTTCTATATTTTCTTCATTTTCACTCAGCAGAGATTCTGATAATATCTTTATGGAAGAAAGAGGAGTCCTGAGCTCATGAGAAACATTAGCTACAAAATCTTTCCGCTCCGTATCTGCCTGATCCAATTTAAGTATCATCATATTAAAAGCATCTGCTACATCCCTAAACTCATCATTTGTTTCAATATTTATCTTCTCTTTTAAATTTCCCTGGGAAGCCTTATTTATTACTCTTTTAAATTCATCTAAAGGTTGAAATATCAAACCCATTAATAGAAAGCTGATGCAGATGTTTACCAGCATACTTACAATAGATATTATAATGATCTTGTTTTGTATATGTTGAACCTCTTCATAAATACTGTTGATAGAAGCAGATATAAGAGTAGCCCCGATTACATTTTTGTCAACAGTAACAGGAACAGCTACATACATAACTCGTCCCATAATCTTAAAATTATGAATGTTGGAAGTTGCCATCCCTTTTAAAGCACTATTTATCTCGTCATGCTTAAAAACTTCCCCTACAAATGTATCTCCTGAGTCCGCCTGCACTATATTATTTGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP035282|2399989:2412927|2399989_2401645_-|QAT62181.1|DBSCAN-SWA MGKYGLWIRLHIGGIEMKNKKRIILFLVIYIIFILILNIVKYKALLFMGDSVDFLISRSSRVLKTVRNFLLLEIMLLIISMAADYFKLNVKKNTMKFLKSGYLNMILESDSFSLKEAGIGKFLSNFTNDMAAVESDFCGNLLDMIYHISNFVLGIVILMKIDYRFLIAILFISVGISVYIIKTASFLQEKYGEKSEIFGQYTSYVKEILSGYTIIKNNNLFSRVKSDFETVNKNVQDKGYEIDKFLTYISAIHQLIYILSFSVLLVMSLYMYKIGLITIGTIIIISNSSDKIISPTVMVTVSIPRLKGGYSILKRIIAKFGVKNDVTEKKKLRDRVKSIEFKNVQYDAGGKEIIKNFTYTFNTSLSYFIYGLSGSGKSTIVKLLIGYISPDSGEILINGDSISGIQTDDYYGRIQYVPQDIFLFEDTVLNNITMFSKCEQEKLNKAIELSGLNKFISELPAGLNTVITENGTNISGGEKRRIGVARAIVKDPDLIVLDEPFADLDSDIVEGIDGALLKLKDSGFIVISHIRSSHFNSYNKKIEILNGIISK >CP035282|2399989:2412927|2406725_2406953_-|QAT62186.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MEQQLFKLAAGNGIWSALFVFLFLYVLYDSKKRESKYQETIKENQDIIKELSQKFGIVEDIQNDVTCIKDELKNK >CP035282|2399989:2412927|2407049_2407232_+|QAT62187.1|DBSCAN-SWA MKTSELLKLLKSNGIRLYRHGKKHDIYYSPITDKTFPVPRHNTEVAGGTLKSILKDAGLK >CP035282|2399989:2412927|2401586_2403203_-|QAT62182.1|DBSCAN-SWA MRDILFGDKKGIIKFFIGIVFSAVTTILLQLIFTVVLYAVSPASQLSLKAVLFILITISILNPILYLISRIFRIGFIRDALSEIRKKIFESVLHKSYKEYFEHLTSEYLSRLTNDISQFESNFFPVLLENISAILVYIFSFGIIFINNRKIALGLFSASMLFLVFTFFLRKYTKELQLGVNKTNSKLMKIFSDFLGGLQELKMNLVEKAYADRINWNVELNEKVKFNQQFLYSILRIGKEFFSIVTPIIIFYIGIMYFDLEISSKLLSIVLPFSISMFSSISEIGFSYNRMKAAYDILDGYISEKTADDYDIGRDFRFEKEIEIKDFSFAYDSRKILQSSDFEIERGKKYLLLGKSGSGKSTFLKCISGMNKSFSGEIKYDGCDIRKISLKKYFENVSFLTQDVFLFNDTVENNIKLYKAESEELYQKIIRLMGIEKITSDNNPYLTLSGGEKEKVSLARELIKEPKLILLDEMTKGLDEENSRRIEDIILSGDFTVINATHKLIKDIHIKYDYVIQIVDGKIRLMDSASYWRNRDEK >CP035282|2399989:2412927|2403876_2404632_-|QAT62184.1|DBSCAN-SWA MAKVFLDAGHGGRDPGAGGNGIQEKNITLPVTLKIGDILKNHDINVGYSRTTDIFVELEDRASLANNFGANVFVSVHCNAFTDSSAKGMETYSYPGSTSGGKLSKDVHDSIISEGVYTVDRGMKTANFAVLRLTNMPATLIETAFITNAQDANILKNRQDELALAIAKGILKNLGIPYRGTTLYKVQVGAFAIKSNADNLAAELQEKGYDAIVVYVGGLYKVQVGAFNIRENADNLAAELRSKGYDAIVVS >CP035282|2399989:2412927|2407964_2408849_-|QAT62189.1|DBSCAN-SWA MIHLIGGICMKRVISIIITMLLLISILSSCQNYDVIYEGSNNYPPISPLPGDKTEIVLYYPNNKMKFLLPEIRLVSRSNEELANVVIQELLKGTDKNKLRNIIPREVKLLSAEVIDDTAYVNFSKEILKDYSEKEEAFVIYSIVNSLTSISSIKKVQILIDGKMRNVLTKYYLIREPLSFSSLIVNKDYASPIDIVKQYYDYITQENLNGLLSIMKIEGNDNINYNTKVAYLKSNIDYIDQYNLIGYTMSGYSNNIEVLTGVSISTKEKVEEKKVVNFKIVNEKGNFKITETNF >CP035282|2399989:2412927|2411016_2412927_-|QAT62191.1|DBSCAN-SWA MKHIIVGTAGHIDHGKTTLIRAITGRDTDRLEEEKRRGISIDLGFTYFDLPSGKRAGIIDVPGHEKFIKNMLAGAMGMDVVILVIGADEGIMPQTKEHMAILDLLGTKKGFVVLTKIDLVDDEWRKLVVEDIRNETKGTFLENCDIIPASSMTGEGIDKVISAIDKAADEVEERDFTGTPRLPVDRVFVLPGIGTIVTGTLLSGTFKVGDEVQIFPGNKVCRIRSLQVHDEDVSIAYAGQRVAANLAGVKKNEIQRGDVLGYKGSMKKTMMIDGKIRLLKDISRSIENRTRLRLYIESKEVLCRIILLDKESLYPGESAYVQLRLEEEIVAKKGDKFILRFYSPMFTIGGGEIIEVNPEKKKRFDEKIIKELELKEKGDISHIIEKIIFEKSRLYPTIKDISMYSVIPEEKVEEEVKKLSKADKIILFPLTKDTAVIHKDYFERLKNNIINELNIYHKDNPLKAGISKEELRSKYLKDTKQKVGDLFINYMIEKGYIKQVKESISLKEFEIKYSDVQKKIKEEIEKVYMDSELNPPNKEEILRIMKYDKKETEKVFAALLDEGIILKIKDDFFIHKEIYLKALNILEEYFKNNDKISVGNYRDLLNTNRKAALNLLENFDEMKITKRIDNERIYLK >CP035282|2399989:2412927|2403528_2403825_-|QAT62183.1|DBSCAN-SWA MYNDFMTLETLGTFAGLVAAVTLIVQFSKSIIKNKFGDAFVRLYTFLIALVLAFVFARTGQGIQGVVLTIINAVIISVSSMGTYEIITDPKSEKTRVK >CP035282|2399989:2412927|2405025_2406315_+|QAT62185.1|transposase|DBSCAN-SWA MDYPPVAGIDVGKNFSEMCILSPNNEIYHRIKIYHDSIDSIKEAIGLLQKAEKDFAIRPVVVLESTGHYHKILFHYLSDSGFEVSIINPIQSDSIKNIGIRKVKNDKFDAHKIALLYRFSFIKTTVVPDDVIDCLKSLCRQYYKLGDELTTYKNRLIGIIDQVMLNFTDVFQNVYSNTALAVLDRYPSPKQILKANKQTLISLIEKTSKKGLAWSTEKYELLVLKAKEFKDLSINNPGNLAILKVNISMVRTLQDAQKDILDAINEIILADSLEDNPVLAPIINLLCSIPGIGILTAATILAEVGDFSAFSSPNKLVAFFGIDPSVNQSGEFTGTRNKMSKRGSRLLRRVIFTTALANIRSKRNGDKTNPVLYEFYQKKCTNKPKKVALGAVMRKLVNIIFAVMRDKKPFELRTPEEHEELLLTRSSVA >CP035282|2399989:2412927|2408854_2410063_-|QAT63453.1|DBSCAN-SWA MDLAYIKSMVKEYSNEIKSRIIIVDTNNIVQADSGDTFVGEVFKHDEINSALKGMATSNIHNFKIMGRVMYVAVPVTVDKNVIGATLISASINSIYEEVQHIQNKIIIISIVSMLVNICISFLLMGLIFQPLDEFKRVINKASQGNLKEKINIETNDEFRDVADAFNMMILKLDQADTERKDFVANVSHELRTPLSSIKILSESLLSENEENIEIYREFLQDIDSEVDRLNNIISDLLSLTTLGKENIILNYRTTYINFLLEKIVLSMKPLAEKKSIKLTLILEEKVQISIDQDKIQQAVINVIDNAIKYTQQNGLIEIKLYTLEQYAVIAIKDNGIGIPEDCIPHIFERFYRVDKARSRETGGTGLGLSISWQIVSLHKGIIEVDSQYGKGSTFYIKLPLQ >CP035282|2399989:2412927|2410259_2410955_-|QAT62190.1|DBSCAN-SWA MDTKILIVDDEKIFVKGLKYSLEQDGYTVDTAFDGHEALDKTFKRDYDLIILDLMLPGIDGLEVCQRIRQDSQIPIIMLTAKGDDIDKILGLEYGADDYLTKPFNILELKARIKAVLRRINMKNTKIVDQVVQIDDFTINTLGRKLTVKGREVNLTAKEFDLLLLLVTNPGKVFTREELLETIWGYEYFGDLRTVDVHIRRLREKIEKDSSQAEYILTKWGVGYYFRSKVQ >CP035282|2399989:2412927|2407276_2407681_+|QAT62188.1|DBSCAN-SWA MSKYLFPAIFTPESNGSYSVNFPDIEGCYTQGNNLKEAYEMAEDVLCLCLYDMEETNKPIPSPSNPKDIVKDDNSFVAIIGVDTLEYRMFYDNKAVKKTLTIPQWLNTMAEREGVNFSYVLQSALKKQLGITDR |
12 | Bacillus_phage(55.56%) | transposase,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2590027 : 2627232
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP035282|2590027:2627232|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP035282|2590027:2627232|2609167_2609671_-|QAT62344.1|DBSCAN-SWA MELWDIYDEKGKSTGKKVSKGSIFSKKEYHLAMEAWIINPDNHILIQKRSENCEVLPGIWALTTGRMISGESSLEGCIREIHEELGIAVDKKDCSFIRRIFRNNSNLIWDLYLVRIDMSTENFVLQKDEVDEVKWVTSAEFKQMLKSGILFEYPEIYEVFSYVCQIN >CP035282|2590027:2627232|2599903_2600884_-|QAT63463.1|DBSCAN-SWA MKKRVYGVIGIKSIMSNWNADFSGYPKSISTGEIFGSDKALKYPMKRMWLDQGEKILYIKSLKMAEDKKGKKELRPKSLEERYEEIFSVPKLKDEDKKEVVQNLFTALDVKNFGATFAEEGNNISITGTVQIGQGFNKYDKTSVEEQQILSPFRVENEEIKRKNKRNKEEGKEMEEANASTLGTKIVSSEAHYFYPFVINPTSYNDYIKLGVTEGYTEEDYKKFKEAALVSATAFNTNSKIGCENELSIFIETESDLYLPDITQYIEFEKGGEKDIIRFSKELIDLIDKLSDKIINTEVYYNSLKIHIDKNFPKAKYYNIFTREEL >CP035282|2590027:2627232|2594792_2595077_-|QAT62332.1|DBSCAN-SWA MKISNYNYAFLFYDVNEKRVNKVFKVCKKYFKHHQKSVFRGNITPSNLIKLTAELKKIINPKEDFISIIKLMNEDSFDEETIGTNYKDSESLIL >CP035282|2590027:2627232|2614045_2614984_-|QAT62348.1|DBSCAN-SWA 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MNKFGNAIKAEFVNLFGDFKSYYLNYIFYNINMYLLFLGLFYGMEKQSKESIEILYFLIGLILWWYTTTAIQSVSIIIQDEARQGTLEQIFMTKSKVGQITLCKLIANYLFETLQIIFVILLCTLSFGLADLFKLNISYINLLINILMTLVGLCGIGYAVAGLSIIYKKAQAVARATSNVILFFSGLILPITAVPNIFRYIAKAFPFYWSMESINQSIYNSKTILDLFNRSFGMLTLVSLIWVGVGILTFNHSIKIVKVKGSISHY >CP035282|2590027:2627232|2613258_2614059_-|QAT62347.1|DBSCAN-SWA MRNLKLLGAEIVKIMGDLKAYWFNYLFGNLNVFFLFLGIFYAFQKSNGTAIDTFNLLIGLMIWYYGVHAIDLIAIIIEEEAEEGTLEQIFVTRSSFIKVLFNRIMSQIIFDTIKGVFVFVLCVITFKIPFSFIKSINWLWTLIIFFLTLSGLYGIGYAVAGLSIIYKKTTAVAGTCSNLLLFFTGIIIDLDKLPKAFIYLSKVLPLHWGMNTLNDLIRNDFQLFKIVRSSNFIYLIISCLFWILFGVFIFKICEEKARIKGTLNQY >CP035282|2590027:2627232|2604743_2605292_-|QAT62339.1|DBSCAN-SWA MSRFNLDTKDAVLLIIDIQGKLVKVMKYGKQVIDKTNILISASEELKFPIIYTEQYPKGLGGTVPELQEGLKTAKKFEKVNFSAYLEEIKKELENTGRKKIIITGMETHVCVFQTAKDLIENGYDVFIVSDGVCSRTKENHKNGLSLMRDMGAVITNTETVVFDLLKKAGTPEFKVISKLIK >CP035282|2590027:2627232|2605936_2606179_-|QAT62341.1|DBSCAN-SWA MTIRRIFDFALINVSVPVLAVCIILFIIGIIVIKTRYNKMPIWWKTIVVAIVGFTASILIVVTVLIISFYSIGLSAFLLS >CP035282|2590027:2627232|2599143_2599899_-|QAT62336.1|DBSCAN-SWA MDGIKFLLKGRTAFFKKPDVNTYLYFTYGNIHKIALLGIIGAAMGFKGYTFQDEKTYPEFYEKLKDLKFSVVPDNNPGGFIPKKIQTFNNSVGYASQESGGNLVVTEQWLENPSWEIYILIDDNPYIDEIKDRLLNGKFVYLPYLGKNDHFADILDTKLVKLEEVSDFDRLDSLFLKDYFEILDKADAFTGIFNEDYKEEKLWKYEEKLPEKLDENTNQYITKRYVFTNMNVKPKKKCPVFSDGNKNLFFS >CP035282|2590027:2627232|2620143_2621259_-|QAT62353.1|DBSCAN-SWA MFIMKKKISSILIIILAILVFISGCEKEINVVKYEEGKVTVSVDPRIELISIIQTLAGVKPLTRLTFDYKNNVLDYFNEYRDCPAIKSFKKYNSKGFNYYKPMYFMLCCNYNKGLLSFEEELYNKNPIGIFFKDKSKIDDLIHQLNDFISVSKFDKFFDSNKNRYAKYISDYEKVVNIADVKERMEQYYGIEKNTYNVILVPLIVTGGYGFSIKNEEKLRNVYCIMGPIDIKNNDLLFYIKDLPKYVEYHEFSHSFIDLLIFKNEAKIKENHELVKLFEEVQDDMAVQPYGSVENFLDELIVRSVVARLINKYEGEEYYKNVIEYEKGIGFIYIEEVCNSLENYENNRDKYPTFESYYGEIIKCLSSIEVK >CP035282|2590027:2627232|2603877_2604261_-|QAT63464.1|DBSCAN-SWA MTADEDDYNELIDPDMRGETYFEVLSGCELIGFLTLNISENVADIGIGMRPDLTGRGLGTEFMSSCLNFITKKHRNVKAITLSVACFNIRAIKVYKKLDFKEEYHFDQQTNGGNFKFVSMRKKVSLE >CP035282|2590027:2627232|2590027_2591572_-|QAT62330.1|transposase|DBSCAN-SWA MLRQVQKQMSLHSILYNKISENHILKKINYVVDFSFINKLLEDSYCKNFGRPAKEPEMMCKLLFLQHLYILSDEKVIEEANLNLGYMYFLGINPEDELPDKSLLSKFRTQRLEEATLDEIITEIVRQCVEKGIIGGTSVSVDATHIEANTIRKTPERLMKHLARKIIKTYEKENNQVLEEIPEVPKYKEIEDHTEAKAVMKDYLENVISKVKKNIRKDCSESIKTKETIEKAREIIEDPKFLNQKGVRSIIDEDARVGRKSKNQEFYGYKTEFMMTADERIITSVRTADGAYVDGTYADELIEQTLKSGMKIEEVYGDKAYFRKPILNSIEEIKAKAYIPVSESVYRIDESEFSYNKDSDEWECREGNITVKKKYYKIKGKSRPDREGYKYYFEPEQCKRCPKHDECAKKSARKILQIGLNTIEFYEISQYQKTEEYLEKYKKRASIEGKNAELKRFHGLYRARGYGLLSVSMQSKLAAIAVNIKRIAAIAASKFCIFTLNIKIFSQYYKFCLN >CP035282|2590027:2627232|2621395_2621929_-|QAT62354.1|DBSCAN-SWA MGIIFQDFTKYELTCRENIGLGNINLMDNDVKLQAAINKAYANETVDALPKGIDTQLGVWFSGGVQLSGGQWQKIALSRAFLRDADCYILDEPSASLDPVSEYEIFQRVSELTKGKISIFISHRLYNLRKISSRILVLKDGQLTEQGTHEELMDLNGHYGYLYRLQNNIEFVPNSDI >CP035282|2590027:2627232|2624882_2625647_-|QAT62359.1|DBSCAN-SWA MKVKLNEEIKEYCNILKLKGIKTHYEEVISEAADYEDFLHKLLTYEMEEKDKRSIECRIRNAHLPYRQYIEDIEIDCLPVDMQKRLPELATLDFIEKGKNIIMTGNPGTGKTMVSIALALKACMAGYKVLFTTIPLLVTTLKESNSAKTLRYFENRFEKYDLVVADELGYTSFDREGTDLLFNNLSLRAARKSTIITSNLSFERWIEVFGDPTVTSAMIDRLTYKAILVDMEGDSYRLRETLRENGASIKSLTA >CP035282|2590027:2627232|2622942_2623173_-|QAT62356.1|DBSCAN-SWA MEPIYNPNSKVIIANNDLTNNPTDVKNEEFGLSKSTTMGEMVEPDDTNISCCVSCCCCGGGGGGGTASLIEEDVIL >CP035282|2590027:2627232|2602640_2603336_-|QAT62338.1|DBSCAN-SWA MKVYEFKLKVYALENMNSKRSLEYISQLIDKSFLKNKELSDFHEENVFKNYVHNGFYPVEKSKIYQKGNIYTVIIRTVDERLADHFEKYLANEYTRYLKALTVEKSIIPDRGIIEKIYSITPAVAKFEEGYWRKSESVGNYEKRLMGNIIKKYNDYFNEKIEENFELFTFLKFDNMKPVASEFKNIQLLGDKLTLYVAENKMAQKLAYFALGVGILELNSRGFGYVNCKWF >CP035282|2590027:2627232|2611508_2612234_+|QAT62345.1|DBSCAN-SWA 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MKNKNFLFFALSQGISSFGDIFFDTSILLLVYDSTRSVLQSAMVGVAWHISSMILSPIAGALSDSYDRKRILMFSNFIGFIVTFCVALFYLINEKLSLSVALSAIVLSNIAQTFIRPASKSILPDISGEENIAGATGTLRYITDIFNFIGTLSVGFVIEFFGGFTAIIIDSITFFIASVIIVFINIPQRSISIDINKNDNLLGKIRDGWGVLSSNVLLKRIVVAAILINVVSFIGPLLPAFIDEKFSGGSIDYSVIETVSLIAGILVGSTASTLTEHIQSKKLISYGWIGMGLSILGTSIFKGRFIIYVMFFLQSLFVTVSAVNLDIFMLREVEQKFRGRIIGIVSSLSVISIPLSTLIAGIVGDRVPVMYIFMFAGIYATVIGILCFITVKKVNVPPEIEH >CP035282|2590027:2627232|2600888_2602622_-|QAT62337.1|DBSCAN-SWA 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MGKHTRYIMSMGELSRKDNSILFRNEKGNNYIPVEDTREIYCLNEISMNTKFLDFASRAGIAKAIVLGIAENIYEVLYHYYKHGKKELKEFLYWLKEDIPNFLDKDLDIKHILFIEGQIWMKFYDSFKYFLPEDFIMNKRVKRPPDNPINALISFGNSILYSRTITQIYNTHLNQTISFLHEPRESRFSLSLDLSEVFKPVVVYKSIFELVNNRKIQVDKHFVKKFNYCLLNDSGKKIFIESIENRFSNVFEHKILKRKISYETAIKLDGYKLIKYCMEGKEFKPFSLKEMM >CP035282|2590027:2627232|2619121_2619784_-|QAT62352.1|DBSCAN-SWA MNEGNVKKAYSSSKNVYDDILTQTKWWSKLYIRFFWNGINDNEIADKVLKMIPSDFAGKLLDVPVGTGIFTLGKYMTLPNAEITCIDYSEDMLLQAQKRFSDSKLRNVTCMQGDVGNLKFSNETFDIVLSMNGFHAFPDKEKAFSETARVIKKGGIFCGCFYIKGQCKRTDFIVNSLLAKKGWFTPPFQSLEELRSKLSAIYTHAEVVNQKSIAYFKCVK >CP035282|2590027:2627232|2617199_2617997_-|QAT62350.1|DBSCAN-SWA MKKLFYLFKVSIEKSVIDLVRYRFNTISEIISFYIPFIMMFYIIRMFGISMDVSPIKLGGTLEGFVIGYFLWVVMVMAYADTANNIINDANRGTLEQISMSNLGLHNVLIVRSITNLIVNLLVCFIILFTIMATTNYWLDIKVGQLLILIFIGIFSILGIALIFGGLALIFKKIQSFLNMVQYFLIALVIQGPNSFSLLISALLPFRLSIESVYRIVLGGESITDFSLGDFGIMIGNSAAYFFVGLLVFKLCSKIARKNGLLGQY >CP035282|2590027:2627232|2606226_2607906_-|QAT62342.1|DBSCAN-SWA MLLEIKNVSKSIGDRELLKDISFKLYKNDKVGLIGKNGIGKTTLLKIITSQTEKDSGSVKINGRWGYLPQNLFLRNDKNFECVNQIVNKSESYGKFLELLKKFELNGAENRPIETLSGGEKTKLYIIKLLLQNPDILIMDEPTNHLDYETIQWLENFIKNFKGAVFIVTHDRYFLNNTVSQIFELENKTIKEYSGNYTFYYNQKKEETERIKLEYHQYINKRKELEKAARKHMEKSKRYNNMSQNDFQRHKSAKVAKRSKAIISRIKNMEEKEKPFVPKNVNIKFKRDEEKTGDILIKGRKLSKSYDKVLFKDISFDLYKNKKVAIIGKNGVGKSTFLKGIIGKIKIDGEIYISPSAKIGYFSQELENLDMDMTVLDNLKRISFDESSIRNILGSLLFKGDDIYKKLWDLSYGEKVKVSFAEILLEKTNVLILDEPTNFLDIPTKEIIEDALSEYDGAILFVSHDRYFINKMAQEIWEISNEGFTKYEGGYNYYIDKKSWLNTSNSDINKKEELFKLEMELSYISFKISSCKEEKKTELERKYFDVVKKMKDIKEDLNK >CP035282|2590027:2627232|2605388_2605877_-|QAT62340.1|DBSCAN-SWA MDENIKTVVGEKALDFTFKSKNNDDMKLSDFIGKKNVILYFYPKDNTPGCTLEAMDFTDLYPEFEAADTEILGISRDSAKSHESFCNDLGIPFPLISDESGEIHNLYGVLKPKSGKEENGFSTERSTFIIDKKGILVKEYRKVKVAEHANNVLKFVKNNLQS >CP035282|2590027:2627232|2609988_2611515_+|QAT63465.1|transposase|DBSCAN-SWA MLTMAQIYDIRKLYFEEGKNISQISRETGYDRKTIREYINKNDWNKPVPAVKTNMEFSKLDPYKSIITQWLENDKKAKKKQRHTATRVYNRLKEEIEGFDCSYRTVAAFVTLKKKEIFHTEKEGYLPLEHPAGEAQVDFGDAQFYENGVLHDGKYLNVSFPYSNQGYLQLFYGENIECLLEGLKAIFEYIGGVPTRLWFDNTKTIVTKILKEGSRNLTEKFMRFREHYGFDTVFCNPEAGHEKGNVESKVGYHRRNMLVPIPRFQELRKYNEELLVKCNEDGNREHYRKSDFISKLFEEDKKNFLPLPATEFDTAGYHIVHTNGYGRFYLNNGLHEYSVSPKYANTRVVIKVTSSYVIPMDENQNEIVRHKRLYGDHKQQSMKWLPYLRQLAKRPGALKYSGIYNIMPEDMKKYLDKCKRSERGKILSVIASLTEKNGFENAAQTVTQVLCYDAVDVDSLISMHRHLCSEIRELPPMKTESRIPRLKPTKTDLSKYDKALKKWGKRTC >CP035282|2590027:2627232|2617996_2618920_-|QAT62351.1|DBSCAN-SWA MKAIEVNNLVKRYGEVFAVNNVSFSVEKGSICAILGPNGSGKTTTIKSICNLIIPDEGEIKVYGKDNKKTMDKMAALFEGNRNLYWRLTPTENLRYFAGIRGLGGKEINEKIDELLTRFNLENKKNVVVNNLSKGMQQKVAIAMTLICNTDIILLDEPTLGLDVRSCMDIERELRTIAREMEKTVLLSTHDMKLVQNVCDDVVILDKGKIVADGTVENLLRMFRGMTYEFVLLNPMSEEIKDYLLGLNYNFYFTKDDTVLETEISDSKEIYSIIDTLRAKNILVKEIKQKDVNFERVYLNFTGGEGN >CP035282|2590027:2627232|2623487_2624129_-|QAT62357.1|protease|DBSCAN-SWA MKMKEGTIKYVIVILVALLSYTVIERILRHFSVLKSNRDPLWSGVWYYLYGICLLVSLLAIRPIDFVFKIPSRIGFSLLIIGVMMLFLLLNLKEGNKIYYPTADNILKCVNFSVIQPLFEEVAFQGIILPILAFLFKEYFRAEIIIAIDGILFALFRKNCWSFIKESSVTYFFIQGGIFAYIAYTTQSIWLLVIYRVLLNITITVYKNKKVKA >CP035282|2590027:2627232|2591855_2592773_-|QAT62331.1|DBSCAN-SWA MKIKNVAMIGMGAIGTVYGSFLYKRYGSDFAVIAGEKRNIELKSKGITLNNNTLYPLVLSPDKKDIKYDLIIFCVKNYQLDKAIDDVRNFVGENTIILTILNGITARDRILSAYPDNKVLYGLSTHMNAVRTHKGVFSTEYGEIQFGNGDNTVIAPEVQAVQELLNEARIKNKVFPDMIRAMWKKFMLNVGVNQVTAITKASYEKVASVKTNLILYKEAMMEVLKVAQASGVDLREKDVEELMASITSRLSAKEKTSMLQDVEAKRKTEVDYFSGLVVEMGKKLSIPTPVNHVLYCLIKSIEELY >CP035282|2590027:2627232|2595983_2596478_-|QAT62334.1|DBSCAN-SWA MKVNGTMINYYFHCKRQCWLFANRINLEDNSEDVHIGRVLHELKYNGNENAEVSIENIKVDKITNDYLVEIKKSDADVKAAKWQTLLYLKILKEKGINRKGKIEFIEKNKQNKKIITLELTEEEKNKLNELENEIIEFVSSDKLPDPIYKPKCKKCAFYEYCFI |
34 | Escherichia_phage(40.0%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2813539 : 2857071
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP035282|2813539:2857071|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP035282|2813539:2857071|2815445_2816735_-|QAT62508.1|DBSCAN-SWA MNFNVEKKENNIVTFKAEIEEDKFERAIDRAYLKIRNKFNVAGFRKGKAPKKIIELNYGESIFYEEALNILLPEAYEEAVKELELEPVDQPQVDIEQLEKGKPVILKLDVTVKPEVKLGDYKSIEIEKAKYNVTEEDVKKEIENMQDMNSRLIDADDKEAENGDILTINFEGYMDGEKFEGGTAENQNLELGSKKFIPGFEEQLIGKKVGEKVDVNVKFPDDYFEEKLRSKDALFKVEIKEIKIKEKPKLDDEFAKDVSEFDTLDELKSSIKEKLEKEAKDKEKVENETKAIEKLMEISEVEIPEVMIDRQIDDEVSEFDYRLKMQGLSLDKYFEFANTSLEKLKEQFKERSGNKVKSDLVLGELAKQENIQATEEEIDKEIEKIAAEYNPKDTEKFKEDVKKGDLEWIKSGIIKDKAIELLIKNVKFV >CP035282|2813539:2857071|2831440_2832298_-|QAT62523.1|DBSCAN-SWA MFDYKTLENTNIEMLYKGFLGAFSDYQVEIDLSLFDFCQLLQRRGYVPGISIGAFKDEELAGFVLNGLRNWRGEQTVYDIGTGVIREYRKQGITNNMLLKVKELFNKKDVSRYLLEVIQSNTSAVRIYKKQGFKIIRNLLCFELDNKDEYDHSMAYKVEHVNRIKSNEWKLMTSFWDFIPSWQNSIDSINAVSDTFVYSVVRVNNTKIGYGIVSKKTGDIPQIAVDKNYRHKGIGRSIITDLLKNTESQKIRIFNIDEDSESMTNFIFKSGFKYKVGQYEMALKL >CP035282|2813539:2857071|2850550_2851396_-|QAT62539.1|transposase|DBSCAN-SWA 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43 | Bacillus_virus(20.0%) | tRNA,transposase,protease,integrase | attL 2826487:2826503|attR 2857846:2857862 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3321254 : 3385674
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP035282|3321254:3385674|DBSCAN-SWA 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>CP035282|3321254:3385674|3337081_3337288_-|QAT62978.1|DBSCAN-SWA MLRISYNKLWKLLIDKNMNKQDLKIATGISSASIAKLGRGDNITTAVLLKICETLDCNLEDIMETIKE |
63 | Erysipelothrix_phage(31.11%) | portal,capsid,protease,head,holin,transposase,tail,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3657420 : 3727887
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP035282|3657420:3727887|DBSCAN-SWA 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58 | Bacillus_phage(16.67%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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