CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
CP035142	Leuconostoc mesenteroides strain SRCM103356 plasmid unnamed3, complete sequence	0 crisprs	csa3	0	0	0	0
CP035140	Leuconostoc mesenteroides strain SRCM103356 plasmid unnamed1, complete sequence	0 crisprs	csa3	0	0	0	0
CP035141	Leuconostoc mesenteroides strain SRCM103356 plasmid unnamed2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
CP035139	Leuconostoc mesenteroides strain SRCM103356 chromosome, complete genome	1 crisprs	csa3,cas3,DEDDh	0	0	7	0

1. CP035139

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: CP035139_1

• CRISPR_ID: CP035139_1
• CRISPR_location: 362021-362123
• CRISPR_type: Unclear
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers
• Cas_protein_info: cas3

Consensus repeat of CP035139_1

Consensus_repeat	Method
CCGACTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAC	CRISPRCasFinder

spacers of CP035139_1

>1.1|362047|51|CP035139|CRISPRCasFinder
CTGACTGTTAATCAGGTTGTCGCCGGTTCGAGCCCGGCAGTCGGAGTTTCG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP035139_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of CP035139_1

>merge|CP035139|1|362021-362123|CRISPRCasFinder
CCGACTTAGCTCAGTTGGTAGAGCACCTGACTGTTAATCAGGTTGTCGCCGGTTCGAGCCCGGCAGTCGGAGTTTCGCCGACGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAC

>CP035139|1|1|362021-362123|CRISPRCasFinder
CCGACTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAC	CTGACTGTTAATCAGGTTGTCGCCGGTTCGAGCCCGGCAGTCGGAGTTTCG
CCGACGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
CP035139.1|QAR68615.1|355238_356531_+|tRNA-lysidine(34)-synthetase-TilS	unknown	unknown	gnl|CDD|238950
CP035139.1|QAR68613.1|354446_354728_+|RNA-binding-S4-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224109
CP035139.1|QAR68621.1|362851_363568_+|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|237084
CP035139.1|QAR68626.1|368446_368914_+|LytTR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|197918
CP035139.1|QAR68619.1|360290_361778_+|lysine--tRNA-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|234778
CP035139.1|QAR68610.1|349554_350199_-|CBS-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|341358
CP035139.1|QAR68624.1|366943_367744_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224054
CP035139.1|QAR68617.1|357098_359201_+|ATP-dependent-zinc-metalloprotease-FtsH	unknown	unknown	gnl|CDD|273520
CP035139.1|QAR68620.1|362247_362781_+|rRNA-large-subunit-pseudouridine-synthase-E	unknown	unknown	gnl|CDD|211334
CP035139.1|QAR68614.1|354809_355208_+|septum-formation-initiator-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|368217
CP035139.1|QAR68629.1|373616_374165_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224228
CP035139.1|QAR68612.1|350891_354431_+|transcription-repair-coupling-factor	cas3	cd09639_cas3_CAS-I	gnl|CDD|224118
CP035139.1|QAR68622.1|363616_364564_-|ferrochelatase	unknown	unknown	gnl|CDD|366291
CP035139.1|QAR68628.1|369444_371535_+|DNA-topoisomerase-III	unknown	unknown	gnl|CDD|376463
CP035139.1|QAR68623.1|365375_366824_+|NCS2-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|225161
CP035139.1|QAR68618.1|359309_360203_+|Hsp33-family-molecular-chaperone-HslO	unknown	unknown	gnl|CDD|234643
CP035139.1|QAR68616.1|356531_357071_+|hypoxanthine-phosphoribosyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|223707
CP035139.1|QAR68625.1|367740_368469_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP035139.1|QAR68627.1|368900_369311_+|DUF3021-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378668
CP035139.1|QAR68611.1|350324_350891_+|aminoacyl-tRNA-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|235457

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
CP035139.1|QAR68612.1|350891_354431_+|transcription-repair-coupling-factor	cas3	cd09639_cas3_CAS-I	2.3e-12	41.4	0.3

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
CP035139.1|QAR68615.1|355238_356531_+|tRNA-lysidine(34)-synthetase-TilS	gnl|CDD|238950	cd01992, PP-ATPase, N-terminal domain of predicted ATPase of the PP-loop faimly implicated in cell cycle control [Cell division and chromosome partitioning]. This is a subfamily of Adenine nucleotide alpha hydrolases superfamily.Adeninosine nucleotide alpha hydrolases superfamily includes N type ATP PPases and ATP sulphurylases. It forms a apha/beta/apha fold which binds to Adenosine group. This domain has a strongly conserved motif SGGXD at the N terminus.	2.3734e-74
CP035139.1|QAR68613.1|354446_354728_+|RNA-binding-S4-domain-containing-protein	gnl|CDD|224109	COG1188, COG1188, Ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit (S4 paralog) [Translation, ribosomal structure and biogenesis].	2.99369e-29
CP035139.1|QAR68621.1|362851_363568_+|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator	gnl|CDD|237084	PRK12378, PRK12378, YebC/PmpR family DNA-binding transcriptional regulator.	5.8295e-130
CP035139.1|QAR68619.1|360290_361778_+|lysine--tRNA-ligase	gnl|CDD|234778	PRK00484, lysS, lysyl-tRNA synthetase; Reviewed.	0
CP035139.1|QAR68610.1|349554_350199_-|CBS-domain-containing-protein	gnl|CDD|341358	cd02205, CBS_pair_SF, Two tandem repeats of the cystathionine beta-synthase (CBS pair) domains superfamily. The CBS domain, named after human CBS, is a small domain originally identified in cystathionine beta-synthase and is subsequently found in a wide range of different proteins. CBS domains usually occur in tandem repeats. They associate to form a so-called Bateman domain or a CBS pair based on crystallographic studies in bacteria. The CBS pair was used as a basis for this cd hierarchy since the human CBS proteins can adopt the typical core structure and form an intramolecular CBS pair. The interface between the two CBS domains forms a cleft that is a potential ligand binding site. The CBS pair coexists with a variety of other functional domains and this has been used to help in its classification here. It has been proposed that the CBS domain may play a regulatory role, although its exact function is unknown. Mutations of conserved residues within this domain are associated with a variety of human hereditary diseases, including congenital myotonia, idiopathic generalized epilepsy, hypercalciuric nephrolithiasis, and classic Bartter syndrome (CLC chloride channel family members), Wolff-Parkinson-White syndrome (gamma 2 subunit of AMP-activated protein kinase), retinitis pigmentosa (IMP dehydrogenase-1), and homocystinuria (cystathionine beta-synthase).	1.94521e-07
CP035139.1|QAR68624.1|366943_367744_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224054	COG1131, CcmA, ABC-type multidrug transport system, ATPase component [Defense mechanisms].	6.30651e-50
CP035139.1|QAR68617.1|357098_359201_+|ATP-dependent-zinc-metalloprotease-FtsH	gnl|CDD|273520	TIGR01241, ATP-dependent_zinc_metalloprotease_FtsH, ATP-dependent metalloprotease FtsH. HflB(FtsH) is a pleiotropic protein required for correct cell division in bacteria. It has ATP-dependent zinc metalloprotease activity. It was formerly designated cell division protein FtsH. [Cellular processes, Cell division, Protein fate, Degradation of proteins, peptides, and glycopeptides].	0
CP035139.1|QAR68620.1|362247_362781_+|rRNA-large-subunit-pseudouridine-synthase-E	gnl|CDD|211334	cd02566, PseudoU_synth_RluE, Pseudouridine synthase, Escherichia coli RluE. This group is comprised of bacterial proteins similar to E. coli RluE. Pseudouridine synthases catalyze the isomerization of specific uridines in an RNA molecule to pseudouridines (5-ribosyluracil, psi). No cofactors are required. Escherichia coli RluE makes psi2457 in 23S RNA. psi2457 is not universally conserved.	2.96131e-102
CP035139.1|QAR68614.1|354809_355208_+|septum-formation-initiator-family-protein	gnl|CDD|368217	pfam04977, DivIC, Septum formation initiator. DivIC from B. subtilis is necessary for both vegetative and sporulation septum formation. These proteins are mainly composed of an amino terminal coiled-coil.	1.77007e-05
CP035139.1|QAR68629.1|373616_374165_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224228	COG1309, AcrR, Transcriptional regulator [Transcription].	3.33884e-09
CP035139.1|QAR68612.1|350891_354431_+|transcription-repair-coupling-factor	gnl|CDD|224118	COG1197, Mfd, Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) [DNA replication, recombination, and repair / Transcription].	0
CP035139.1|QAR68622.1|363616_364564_-|ferrochelatase	gnl|CDD|366291	pfam00762, Ferrochelatase, Ferrochelatase.	9.32504e-129
CP035139.1|QAR68628.1|369444_371535_+|DNA-topoisomerase-III	gnl|CDD|376463	pfam01131, Topoisom_bac, DNA topoisomerase. This subfamily of topoisomerase is divided on the basis that these enzymes preferentially relax negatively supercoiled DNA, from a 5' phospho- tyrosine linkage in the enzyme-DNA covalent intermediate and has high affinity for single stranded DNA.	1.63907e-69
CP035139.1|QAR68623.1|365375_366824_+|NCS2-family-permease	gnl|CDD|225161	COG2252, COG2252, Xanthine/uracil/vitamin C permease [Nucleotide transport and metabolism].	1.71168e-119
CP035139.1|QAR68618.1|359309_360203_+|Hsp33-family-molecular-chaperone-HslO	gnl|CDD|234643	PRK00114, hslO, Hsp33 family molecular chaperone HslO.	8.58062e-101
CP035139.1|QAR68616.1|356531_357071_+|hypoxanthine-phosphoribosyltransferase	gnl|CDD|223707	COG0634, Hpt, Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase [Nucleotide transport and metabolism].	3.80407e-78
CP035139.1|QAR68626.1|368446_368914_+|LytTR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|197918	smart00850, LytTR, LytTr DNA-binding domain. This domain is found in a variety of bacterial transcriptional regulators. The domain binds to a specific DNA sequence pattern.	1.41805e-17
CP035139.1|QAR68627.1|368900_369311_+|DUF3021-domain-containing-protein	gnl|CDD|378668	pfam11457, DUF3021, Protein of unknown function (DUF3021). This is a bacterial family of uncharacterized proteins.	1.60212e-08
CP035139.1|QAR68611.1|350324_350891_+|aminoacyl-tRNA-hydrolase	gnl|CDD|235457	PRK05426, PRK05426, peptidyl-tRNA hydrolase; Provisional.	2.28277e-94

Protein sequences

>CP035139.1|QAR68619.1|360290_361778_+|lysine--tRNA-ligase
MAEEKALNDQMLARRQKLATIVSDLHLDPFGKRFERTANAQELHNLYDASSLEELENAKHEVVIAGRMVAKRGAGKVIFADFRDVSGKIQVYARRDDLADNYPIIKRADLGDFLGIKGIMMKTEAGELTVLATELTHLSKALRPMPDKFHGISDVETRYRKRYLDLIANEDSFKKFQERSHIISAIRAYMDRNDFLEVETPILQTEAGGAAARPFITHHNALNIDMYMRIATELYLKRLVVGGMERVYEIGRIFRNEGMDPKHNPEFTTMESYAAYMDFTDVMDETEGIFKAAASVVSDDLKITYQGTEIDLGTKFARKHLVDLIKEQTGIDFWQEMSVEAAQKLADDNHVKYEKYWGVGHIINAFFEEFVEDTLVQPTFVYGHPVEVSPLAKKNTDDPRFTDRFELFIMGSEYANAFTELNDPIDQRARFEAQAAERENGNDEAEGIDEDFIEALEYGMPPTGGLGVGIDRLVMLLTDSDTIRDVVLFPTMRPE
>CP035139.1|QAR68618.1|359309_360203_+|Hsp33-family-molecular-chaperone-HslO
MADQFIKAITKNKYFRTSAVNGTNLVHQAAQIHETSRIAAVVLGRSLLATTLAAQAVLKGEETLSTKINGRGPIGNVVVESDAKGSVRGYVTNPNLETLINEAGQLDVAKAVGKNGFLQVTKFAPYSDPYIGQSQLVSGEIGDDFTYYLAQSEQTPSVIGVSVYMNSDDTVAGAGGFLVQALPDATDEAIDQLEVALKNMKPLSEMIQERYTPLEVLEEIFGKGEVEILQTAGIGLAAEPSKDAYAKMLLTLPASEIQAMIKEDHGAEIVGKFSGKRYFFTEEQLSEILKQIEKNNE
>CP035139.1|QAR68617.1|357098_359201_+|ATP-dependent-zinc-metalloprotease-FtsH
MNNNKGGFLRSSVFYIFIFLAVVGMVYGLFGNDKTTTKTITSSEFIKALNDKELKSVTVQPGNSIYNVTGTYKKAQTATKDKGLSLFQPTQKVTKFTSTLLPNDASLKSVTDAATKTKTELVTKQAENSGFWLNLLVSLVPVLLIVAVFYLMMNQAGGGKGGQGGMMSFGKSKAKPSDPKDNKVRFADVAGAEEEKQELVEVVEFLKAPKKFVNLGARIPKGVLLEGPPGTGKTLLAKAVAGEASVPFFSMSGSDFVEMFVGVGASRVRDLFENAKKSAPAIIFIDEIDAVGRRRGTGMGGGNDEREQTLNQILIEMDGFEGSEGVIILASTNRSDVLDPALLRSGRFDRKILVGAPDVKGREAILNVHAKNKPLADNVDLKAIAQQTPGYVGADLENLLNEAALLAARRNKSKVDAADIDEAEDRIFQGPAKTNHNMSESERRTTAYHEAGHALVGLVRSEASVVRKVTIVPRGRIGGYALMTPKNDRYNLKYSEAKEQLAGLMGGRASEIFMFNEASSGASNDFQQATGLARQMVTAFGMSDKLGMVQLEGNASVGYADQAGNRAYSEETARLIDEEVRRLAREAFDDAIAILRDNKDKLTAIAEALLEVETLDEKQIKDIYLTGTFTRKDIQDDTELAKAKSFEEAKAAADAKDSQAEQRFEKQDEEKSSDDHSESKNEDTDSTDKSETDDNNTENK
>CP035139.1|QAR68616.1|356531_357071_+|hypoxanthine-phosphoribosyltransferase
MDNDIQEVLYDQESIQKAAERLGKQITQDYAGSTPLFLSVLKGAYLWTADLLREVDLYAELEFIKISSYHGGVSSSDEITLVTDVRSDVRGRDVIILEDIVDTGQSLLFLKELLAKRGAKSIKVATLLDKIEGRKVEVDADYAGFNVRNEFVVGYGLDYEEHYRNLPYVGILKKEVYTK
>CP035139.1|QAR68615.1|355238_356531_+|tRNA-lysidine(34)-synthetase-TilS
MTEKILQTIQQYNWPETVIVAVSGGVDSVVLVHALSKTKANLVIAHVNYRLREESDDDADFVRQLATQTGAIFEEQVWQHIPDHAVEKAARQFRYDFFEELAQKYHTNTIAVAHHADDQAETVLLKMIRGGQLQQMGGMQTKNHKVIRPFLSITKQELITYAQDNQLGWRQDKTNFDVDYTPRNLLRNDVLPKLTTINQRAVRHINNMAAQILQQQRLIDNQAKIYANDIQDWQKIPTLWQLPTLKYWLQKNKLFNIKENQLQQMIQLLSNTHKPNGKIALADNFEFIKNYQKISIQKQQNMAQVLTPVMLKLNQWHSFAKTTFMWTDNVPMNGQSFIKFQLTRSLPYLSLRPAKASDKIALINGHKNLRRLAIDEKLTPQERTMMWVLATADDEVIAVHLRSNQWRVNADFAVKENTQPYWLVCQIEET
>CP035139.1|QAR68614.1|354809_355208_+|septum-formation-initiator-family-protein
MAGNFKRRQSNITPLNPAIAREIKKSERANSEAAKHYRKAHARREKKILLFGGLIAIIFVVQLLIGQVKLHAANQELTNTQDRLEKVQKTNTDLTADTKRLKDATYLQQLLRDKYGYSKQGELVYNLPSDNN
>CP035139.1|QAR68613.1|354446_354728_+|RNA-binding-S4-domain-containing-protein
MRLDKYLKISRLIKRRTVAKEIADQGRISINGKVAKSSSDVSTNDELEVRFGNKTLTVKVLKIVETTKKEESADMYEVISEKFQQDFRKIGDE
>CP035139.1|QAR68612.1|350891_354431_+|transcription-repair-coupling-factor
MTLIDFLSDTVTIKKLNEQATVGSAQLLLGVNGTARAASIAALYRKNPRPMLIISDTQVHADQFFDDLSSLLEDLVYNFPAEESIATEMAISSSELRLQRVQTLLALKTEKPIIVVTSLAGAERLVPKKQSLEQAHLHVKVGDAYNLNVIKNTLMMMGYTPTKLVQTPGEFAHRGSIVDVYPITFDDPIRLDFFDDELDQLKSFDVATQKSTTSFDEINIEPATDFIVSEHQYDQAKLAIESAFSDYRTNLSGVDKKHATDGFAPTQYMLNERERGSVLVPYAPFFFDGQTTLLDYFPTDSLIIIDEYTRLMETRLQQMTRDQEWIEQQIEAYQLLPKQTWRTEITDLLASNQHATIYLANFQRGLNRIKFTNVEEVTTRPANQYYGQIPALKNDLIYAQESGITMVLLIPDAKRRANFSRSLSELEVPVTETRDIVKNQVQIMPGELSAGFEWPKLHLTVLTTHELFTQAKHSAPRTRKIANSERLKSYNELNVGDYVVHINHGIGRYEGLQTIEADGGKQDYLTIAYQQNAKIFIPVTQLNLIQKYVGASDVAKKPKLNKLGGSEWAKTKRQVAAKIEDIADDLLELYAKREAQQGYVFPPDDHAQIKFDDSFGYPETPDQIRSIEEIKVDMQKLRPMDRLLVGDVGFGKTEVALRAVFKAAHSGKQVAFLAPTTILVQQHYETMLARFSDFPEIKIGVLSRFQTPTQNKMIIEQLQNHEIDVVVGTHRLLSKDVDFSDLGLLIIDEEQRFGVKHKERLKQLRTSVDVLTLTATPIPRTLNMAMVGARDLSVIETPPANRYPIQTYVLAMDWKIVRDAIEKEIARNGQVFYLHNRVADLDRIVSQIEELIPSARVAAIHGQMSETQLESILYDFLNGQYDVLVTTTIIETGVDIPNANTLIVENADHMGLAQLYQLRGRVGRSTRLAYAYFTYPFTRTPSEEAEKRLEAIRDFTELGSGFRIAMRDLSIRGAGDLLGKQQHGFIDSVGYDMYTQMLKDTVAQKQGKQVTTSQPETDAELILGVLAYLPDEYVSDNAQKIELYSRIRQARTDAEFEDIESDMLDRFGEMPDEVARLLLVGQIKQLADQSQITNIRRQRKQLIMTFNETATKNLAGEAIFETMVDVPLKAAVRTEEGNLQVIFTVNDVAESSIWLNILRNFLLVIINKLSAKTLNELHH
>CP035139.1|QAR68611.1|350324_350891_+|aminoacyl-tRNA-hydrolase
MKFIFGLGNIGAEYDQTRHNIGFMAVDAFATANHMSFSPSKQFALVAKTIIGGESVMLVKPTTYMNDSGKAVRAILDYYDGDVDDVLVLVDDMDLPFGKMRFRAKGSAGGHNGLKSIMTHTGSQTFLRLKFGLGHPVHEQNVVVNYVLGKFTAAEKPDIDAMLDRSTQAIADWIQGATAPELSNRYNG
>CP035139.1|QAR68610.1|349554_350199_-|CBS-domain-containing-protein
MFQKSLVIPKSELTTVTENATIQEVYDIFNDPENAHTRTMPILDESGKLFRGNVYKQHVFEHVAKNGNMNLPATAIMRNSTKFIYTNSKFYEVFFAIRDLPFIAVLDENHQFYGIFTHDALMDLLSQSWSVRSGGVAIAISTHNTQGDLSKISKIITRYSNIESLLTIQSELKPLTVLFTLPLQEDSEQLEKLIKRLEKKGYHVSSVENLNRFR
>CP035139.1|QAR68620.1|362247_362781_+|rRNA-large-subunit-pseudouridine-synthase-E
MIVLFNKPYNVLTKFTDAEGRQTLADYIDIPRVYAAGRLDMDSEGLLLLTDSGKLNHELTDPDNKAYKTYVVQVEGVPTKSQLKQLEQGVALKDGLTLPAKVKRIPYPKWLWEREKPIRIRKNQPTSFIQLKIKEGRNRQVRRMTAAVGIPTLRLIRTHIGEYHIADLKPGQYRIVK
>CP035139.1|QAR68621.1|362851_363568_+|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator
MGRKWENIKMKKAQTDGAAAKVNSKYGIEIYAAAKQGGSSDPEANSTLKFVIERAKQAQVPKHVIERAIEKAKGSGDETFIEGRYEGFGPNGSLIIVDTLTSNVNRTATNVRTAFNKNGGTYGAAGSVSYLFDETGVIVFEGEDADATLETLLDAEVDVRDAEQQDDHIVVYTEPTALHQAIAALRESGVSDFSTTEISMLPQSEMTLAGEDLEIFEKLIDVLESDDDVQKVYHNVES
>CP035139.1|QAR68622.1|363616_364564_-|ferrochelatase
MNKKGLLLVNLGTPDSPHPDDVKAYLKEFLSDTNVIQMPRLLWQPILRGKILPKRSFKSAELYQKIWRKDGSPLMVYAKKQVEQVQQLQPNWIVRCAMTYRKPNIAETLKEMRLAGAEDIVVLPLFPQYSVTSTQSVIDQVRKADKNINIVKSFYNDEAYLDLLARDIREAWAKNDYDRLIISYHGVPESYVRRGDPYVDHCTATTQGVLERVGPLTPDNTHQVFQSRFGPTEWVKPYLSDTLRSLPSQGIKRVLVATPAFVADCLETIEEIHVENHDIFKQAGGEVFDVVQPFNEHIDFSKYIASLANRHFAQN
>CP035139.1|QAR68623.1|365375_366824_+|NCS2-family-permease
MEKLFQLKENKTTVRREIIAGITTFVSMAYIFFLNPQILGQAGVPTQAVFLAAILVAVFGTLFMGLFANVPFALAPGIGMQAYFTYTIVFGFGFTWQQALAIVFLVGVVDIVITLTHGRRAIVKGIPTELKAAIGGGIGLFVTYIGLKNAGFINFIVDPSNIMTLNGKPFTGEVHGAVNSILANGGVTPELTKFNNASTLLALIGFVILVVLVMRKVPGAFLISLIVTTLIGIPMGVTNTHIGAGTSVSHAFGELGQVFGQSLGAQGLGSLFNNWHHASLALVTIFAMGLTGLFDAIGTLIGIGNQTGIFSKEDQKSFESSNGFNSKMDRALVVDTFTTAFAGIVGTSNTTTFIESASGVAAGARTGLANVVTAAGFALMILFAPLVGVVPTAATSPLLILVGIMMMGEFKKISWESLEVALPAFFTSVFMAFSYSISYGIAAGFIFFIIVKFALGKFKEVSPVLLIVSAFFLLNFAVLAFM
>CP035139.1|QAR68624.1|366943_367744_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein
MLNIKNLSVSYGRKVALTVPKLSINKGEIIGVMGKSGSGKSTLVNSCLGLIPFKGQVRIDTDDVGILMQEQHYVDTMTNQKMIEGMLNTRIKRDKKLTELINFFDFSDQLSLHFKNLSGGQKQRMSLIMVLYQEPELLFLDEMTTGLDFESRQALISQLKIYFKQHQTTVLMVTHYAQEIEALADKLLVIHDGQVKAFDEPKNLFKQYIGYSAFIVDNHTEKSIKVQQPEDEYKVACRLIDDGDDFRRTQSDIELVYTEVMKGQRA
>CP035139.1|QAR68625.1|367740_368469_+|hypothetical-protein
MIKKRKLVFEFQNLLGNIITLFFGFAFAPMMALVFGNSYANVPQALNQLYLGFFCTIPLSMVFVGFSSLFSQEVEQGFTLRAELFGYSRVSQALHKFMALTVFVLLSSIIYSWIFLSHFNLPLPNAVIIGQMAIFQILNTAVYFIIVFILTTILKKFSRVYGISMISYFAIMIISGIMGNMDVGKLGDYLPIKLFVTNYTNHLNDTDYISGKIGLYLLILLGILGVILKVIVRNKNGNKHQY
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>CP035139.1|QAR68629.1|373616_374165_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator
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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
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DBSCAN-SWA_2	549476 : 558481	9	Bacillus_phage(28.57%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_3	686032 : 694721	9	Prochlorococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_4	1155142 : 1205180	46	Lactobacillus_phage(50.0%)	tRNA,portal,tail,capsid,terminase,head,protease	NA
DBSCAN-SWA_5	1208283 : 1220997	21	Leuconostoc_phage(69.23%)	integrase	attL 1216537:1216551|attR 1229522:1229536
DBSCAN-SWA_6	1477980 : 1529918	61	Leuconostoc_phage(28.12%)	integrase,tRNA,portal,tail,terminase	attL 1485165:1485180|attR 1527710:1527725
DBSCAN-SWA_7	1776893 : 1791064	22	Leuconostoc_phage(66.67%)	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>CP035139|57749:74803|DBSCAN-SWA
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MNKRLLSAITIIVAFLAVAFIVTSKPNTQEKKSTYVPTVGILQLVTHPALDQIHHGIVAGLKSQGYSGKKIKIDYQNAQADQSNLKTMSQKFANENADLTIGIATPAALSLAKTADGNNPVILAGITDPAGSGLVKTTQRPGNNVTGVSGDSPLQQHLDVVQQVVPKAKTLGIIYTTSDHGGEYNAKNMEKLAKKAGYTVKMYTISTTNDMQQVAETMASQVDVVYAPQDNGVASAMKTLINVTNQEKIPVIPAVDTMVKDGGVATVSVSQYDIGYQAGVMAGQVLKGKNTATYPVKTITKGEMTINLKQAKLLGINLPASMVKEAETKGEVFK
>CP035139|57749:74803|59277_59658_+|QAR70094.1|protease|DBSCAN-SWA
MDFIIPAIFGQNQDISLNQTMIESMFQQGGMVALLFKLNTVIIAPIIEEISFRGIIFEEAKPLGEVVQFIWPTFVFAAVHGPSTPEQWTVYLTAGALLMVVRLVTKKLQYSVMFHMAHNLMATVGL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
QAR68324.1|57749_57920_+|bacteriocin	bacteriocin	NA	NA	NA	NA
QAR68325.1|58091_58289_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR70094.1|59277_59658_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
QAR68326.1|59835_61392_+	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	7.6e-21	32.5
QAR68327.1|61391_62513_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
QAR70095.1|62514_63471_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
QAR68328.1|63510_64425_-	L-lactate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
QAR68329.1|64540_65296_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QAR68330.1|65288_66188_-	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
QAR68331.1|66184_67189_-	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
QAR68332.1|67655_68243_+	XRE family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
QAR68333.1|68300_69038_+	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
QAR68334.1|70093_71443_-|bacteriocin	bacteriocin secretion accessory protein	NA	NA	NA	NA
QAR68335.1|71460_73608_-	peptide cleavage/export ABC transporter	F2Y352	Organic_Lake_phycodnavirus	2.9e-23	30.9
QAR68336.1|73838_74015_+|bacteriocin	class IIb bacteriocin, lactobin A/cerein 7B family	NA	NA	NA	NA
QAR68337.1|74045_74207_+|bacteriocin	class IIb bacteriocin, lactobin A/cerein 7B family	NA	NA	NA	NA
QAR68338.1|74203_74509_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR68339.1|74665_74803_+|bacteriocin	class IIb bacteriocin, lactobin A/cerein 7B family	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>CP035139|549476:558481|DBSCAN-SWA
AATGGTAGCAAAGAAAACGACTAAAAAAGACGATCAAGCAAAGAAAGATGGTCGTCGAGCCGCGCTAGATGAAGCGCTAAAGAAAATTGAAAAGAACTTTGGGAAAGGTTCAGTGATGACGTTAGGAGATAACGCGCTAACGCAGATCGAAACGATCCCTTCTGGTTCTGTTAAAATTGATGTTGCTTTGGGTGTTGGTGGCTATCCCAAGGGGCGTATTATTGAAGTATACGGTCCAGAATCATCAGGTAAAACAACCATCGCACTTCATGCAGTTGCTGAAGTTCAAAAGCAAGGCGGAACGGCTGCCTATATTGATGCTGAAAATGCTTTGGACGTTAAATATGCTGAAGCCCTCGGCGTTAAAAAAGACGAATTACTTTTGTCACAACCGGATACAGGCGAACAGGGATTAGAAATTGCTGATGCTTTGGTACAATCAGGTGCCGTAGATATGATTGTTGTTGACTCAGTTGCTGCATTAGTACCTCGTGCCGAAATCGAAGGTGAAATGGGTGATGCGCACGTTGGATTGCAAGCTCGTTTAATGAGTCAAGCACTACGTAAGTTAGCAGGAACCCTGAACCGAACGGGAACAATTGCTATTTTCATCAATCAAATTCGTGAAAAAGTCGGCGTAATGTTTGGAAACCCAGAAACTACACCCGGTGGTCGTGCACTAAAGTTTTATTCGACAGTACGTTTAGAAGTTAGACGTTCAACACAAATTAAAGACGGTACTGATGTCACTGGTAATTTGACAAAAGTTAAAATTGTTAAAAACAAGGTGGCTCCACCATTCAAAGTTGCTGAAGTTGATATTATGTATGGCCATGGTATTTCACAAACTGGTGAAATTCTTGATCTCGCTGTTGATCAAGATATTATCGACAAAGCAGGTGCATGGTATGCTTACGAAGGTGAACGAATTGGTCAAGGGCGTGAGAAAGCTAAAGACTATTTGGATGATCCTGAGCATGCCGCATTGCGACAAGAACTATATGTCAAGGTGCGTCAAGCATATGGTATTGATTCTAATGCGAATGGTACTGCCGTTTCAAATACGGAGGCTCAAGCAGAAAAATCTGATGAGCAAATTAATCTGCCGGATTTGGATACAACGACTGATGATTCTTTAACGGACGAACCAATTGTATAAATTACGTAAATATTGAGAAAAACGTTAGGTCGTTTTTCTTTTTTTTGTTACAATGCAAGTATAGAAACGCATGGAGATAGACATGACTAAGATACTTGTTGTTGATGATGAAACGGCAATTGCAACGCTGCTGCAATACAATTTGCAACAGAATGGTTACGAAGTAACAGTTGCATCGGATGGTTTATCCGCTTATCAAAAGGCAAAAGAGCAACAATTCAATGCAATATTGTTGGATCTAATGCTGCCAGAAATGGATGGCATGACCGTTTTAAAGCAGTTACGTCAAGATAAAGTTAGCACACCAATAATTTTGGTGACTGCAAAAGGGGATGAGTTTGATCGTGTGCTTGGCTTAGAATTAGGTGCAGATGATTATATCACTAAGCCTTTCAGCCCTCGAGAAGTTGTAGCAAGACTAAAAGCTGTATTACGTCGTTCACAAGTTAGTACAGATACCAACAAAACGGACGAAATGGTTATTTCTATACAAGATTTGCTCATCAATGATAGCAAAAAAACAGTTATGAAAGAAAATATTGTTTTGTCCTTAACGCCACGGGAATATGATTTATTATTATATTTTGCACAGCGATTGGGACGTGTAATTGATCGTGAAACAATTTTGACGGCTGTGTGGGGATATGAATATACTGGCGAAAGCCGTATGGTAGATATGCATATCAGTAACTTACGAGATAAGATTGAGTCAAATCCAAAGGCGCCTAAAATATTGAAAACAGTTCGCGGATTTGGATATACTATGACGAATTAGTGTTTTCATAAGACATATGTGGCGTTATTATAGTAAATGGCAAACTGTAGACATAGCGTCGAAGGTGAGCCATTTTTGTTTTGTAAATTTTTCTTTACACGCATTTACAAGAATGCGACCAAATTGTGGCGTGTTTCATAACATAACTCCCGTAATATATAAGTTGTAAACAAGGAGCGGCACCCAAGAGCCTCTACTACAACCTTGTTTCACTACATATTTCTAAGGGAGAAATCTTCATGAACAAAAAGATTGTAGGAATTATTGGTGGTATAGTGGTCATTGCGGCTGGAATAGCCTTGTATACTTCTGCTAATGATAAGTCCAGCGATAATAAAACAAGTACGACGTCATCTTCTAATGTTAGTGGAAAAGTGTTATCGTTAGGATCAACAGCATTACAGCCTTTAGCAGAGCAAGTTGCTAAGTCATTCCAAGAGAAAAATCCTAATGTAACAATTACAGTGCAAGGTGGTGGATCGGGTGCCGGGTTAAGTCAAGTATCTGATGGATCAGCACAAATTGGTAACTCAGATGTGTTTGCTGAAGAAAAAGATGGTATTGACGCCACTAAACTAGTGGATCATAAAGTAGCTGTGGTTGGTATTGCGCCAGTTGTGAATAGTGATGTGCAGATCACGAGTTTAACAAAAGAACAGTTGCGTAATATTTTTACTGGTAAGGTAACAAATTGGAAAGAAGTTGGTGGTAACGATGAAAAAATTGTCGTTATCAATCGTGCAACTGGGTCAGGAACACGGGCTGTTTTTGAAAAAAGTATCTTGGACGGTCAGGATGCTGTACAAGCGACCGAACAAGATTCCAATGGCACGGTGCAAAAGATTGTCAAAACAACACCAGGATCGATTTCGTACCTGGCATTTGCTTACCTCGACTCTGACGGTATTAAGGCACTGGACTTAAATAAAGTTCATCCTAATAAACAAAATGTTGAAGATAATTCATGGCCAATTTGGGCTTACGAACACATGTACACTAAGGGGAAGCCAACTGGGGCTACTAAGTCATTCTTAGAGTACTTCACGACCAAAGAGGTTCAAAAAAATATTGTACCTAAGCTAGGATACATTGGATTAACAGATATGAAAGTCACTCGCGATGCAAGTGGTAAAGTGACAGATAAATAAGTATATTTGATAAGGACAAGCAGAGTGCTTGTTTTTTTGTGCGTTACCGTTATGCAAATTCAAAACCATGATAGAATAAACTTATGAAGAAAAGAATTGGCAAAATAACCAGTATATATAGTCTAAATATTTTATTATTATTTATAGTAACTCGAGTGATACACGTGTCTCATAATCAGATCTACATATTAGTTATTATATTTTTTGTTGTAGCTAATTTTGAAGTATGGTTTTTAAATTTTTGGCAAAACAAAGAAACAGCAGAATTAACAATTATGAAGAATAGAATGATTGCTACTTCAGCTGGAGAAACACCACGGGGTGTTTTAGCAGAACCAACATCTCCATACTACGAATTATTAGAACAATTCAATGAATTACAAAGTTATGTTCGCCATTCGCAATATAGTGCCAATCGTGAAATAAATAATTATCAGACATTATTGGCCAGCTTACCAGTTGGGGTCATTAATGTTAGTCGTCATCATATGATAGATGTTTTCAATCAAACCGCTGCCGATATGCTTGGTGTAGAGATGCCAGAAGTACCAATTTTAGACAGTTTAGTGATTCGTCAGTTTACTTTGTCAGAAATCATTAATCATACCTTTAATACTAATCAAAGGCAGCATTCCATTTTGAACTTGATGATTGATGGCGAGGCGCGACAATATGATGTTAGCACATTATTTCATCAATCTGGATCAAATGCAGAAGTGATGGTTATGTTGTATGATTTGACAGAGGTATTGAAATTAGAGCGCATGCAAGCCGATTTTTTGGCAAATGCTTCGCATGAGTTTAAAACACCGTTGACTGCAATAACAGGATTTGTTGAGACGTTACAGGGTGACGCAGGGGCGGATGAAGAAACGAGAACCCAATTTTTGCAAATTGTGGCGGATGAGGCAAAACGTTTGTCAGCACTGGTTAATGACATATTGTCTTTGTCACGTATGCAACACAAAGTGGATGAAAAAATATCTAATTTGCAAATTTCAGCCATTGTTGAACAACAATTAGAAAAAATTGATACTAAAACGGTTACGGTACACAATGATATTGCACCGGACTTCAGTGTGTCAGGTATTGCTAGCGATGTGTCTACTATCGTCCAAAATTTATTAACTAATTCGGTTAAGTATAATAAAACAGACGGTGAAGTTTGGATATCAGCATATAAAGACACGCAACAATGGCAAATAAAAGTTAGTGATTCGGGTATTGGTATTCCGTTAAACCAGCAGTCTCGTATATTTGAGCGCTTCTATCGTGGTGACGAATCAAGACAACGTAAAATAGCAAGTGGTACTGGATTGGGGCTCGCTATTGTCAATGAGATTGTGAACCAACATAATGGGGAAATCAATATTAAATCACAGGTAGGTGTCGGTACGACAATCAGTGTTATTCTACCCTTGTAGAAACGCGTCAAAACATTAAAATTGATGTTTTTTTGTATGAAAACATCATGCTCTTTACACAATCTTTACATAAAAGCGTTTTGACATTTACATAAGTTTAAGATAATAAATATGTAGTAGTAAATCTTGGGAGGCATTAACATGTCGAAATCATATCGCGGTTCAATCGTATTCACGATTGTAGCCGTGGCAGTTGCTGCAGCGCTTGGAACAGCGTATGCAATGCGCGATAAAAGTGCGTCAAATACGTCGATCACTGCAGTTGGGTCAACGGCTTTACAACCGCTGGTTGAAGCTGCTGGCGAGGAATACGCTAAAGACAATCTTGGTACCTTCATCAACGTTCAAGGCGGTGGAACAGGTACAGGGTTAAGTCAGGTGTCGCAAGGCGCTGTTGACATTGGTAATTCTGATGTATTTGCTGAAGAAAAAGACGGTATTGATGCCAAAGAGTTAGTAGATCATCAAGTCGCAGTTGTCGGCATTGCGCCACTATTGAACAAACACAATGGTGTCAAAAATTTGACAACTAAACAACTCATTGCTGTTTTTACTGGAAAGGTAACGAATTGGAAAGAGGTTGGTGGTAATGATCAAAAAATTGTCATCATTAACCGTGCGGCCGGATCAGGGACACGAGCCACTTTTGAACAATGGGGATTGAATGGCGCACAAAGTACTGAGGCACAGGAACAAGATTCTTCAGGAATGGTTCGTTCAATTGTCAGCACGACACCAGGGGCTATCTCATATGCAGCCTTTGGTTATATTGATGACAGTGTGGTAGCGGCTAAAGTTAATGGTGTAAAACCTACTAAACAGAATGTCGTTTCTGGAAAATATGCTATTTGGTCATATGAACATGTTTACACCAAAGGAAAACCATCCGAACCTGTAGCTAAGTTTTTAAAGTATTTAACTTCCAAAAAGGTTCAATCAACACTTGTATCGAAACTAGGATACATATCAATTCATGACATGAAGATTAGTCGTGACGTAAATGGTCAAGTGACTAGAAAATAAACATATTTCTTGTTCGAAAATATCATATTTCGACATGCACCTTGGAGAAAAAATGGATAACATTACAAAAAAACTTATGCAGAGATCTGAATCCACGCATAAGGACACGTTTGGACGTGCTGTTAGTTTAACGGCATTAGCCTTGATTGGTATTGTGGTCGTGGCAATTTTCGCCTTTGTTCTGAGTCGCGGACTTTCAACATTCTTTAGAGATGGCGTTAATGTTAAAGACTTTCTATTTGGAACAACTTGGAATCCGTCTGTAACCAACCCGGCAACAAAGCAGCCTTATATTGGTGCATTACCAATGATCATTGGTTCATTTTTAGTAACCTTTTTAGCTGCGGTAGTTGCTACGCCATTTGCGATTGGAACATCTTTGTTTATGACTGAAATAGCGCAAAAACGCGGGGCAAAAATTATGCAACCAATTATTGAATTGCTGGTTGGTATTCCCTCAGTTGTCTATGGGTTCATTGGTTTAACTGTCGTCGTTCCTTTTATACGAAATATAACTGGTGGCTCTGGTTTTGGTATTTTATCTGGAACAATAGTTTTGTTTGTTATGATATTACCAACTATCACCTCGATGACCGTGGACACATTAAAATCAGTTCCGCGTTATTACCGAGAATCTGCTTTAGCAATTGGTGCTACACGTTGGCAAATGATTTATAAAGTTGTTTTGCGTTCAGCAACACCTGGTATTATGACAGCGATTGTGTTTGGCATGGCACGTGCATTTGGTGAAGCCCTAGCTGTTCAAATGGTTATTGGTAATGCTGCATTAATGCCTACAGGCTTAACTACTCCAGCATCTACCTTAACGTCTGTTTTGACCATGGGTATTGGAAACACGGTTATGGGCTCACTACAAAATGATGTTTTGTGGACTCTGGCAATGATTCTATTACTGATGTCATTGGTATTTAATTTGATTGTTCGTGCAATTGGACGTAGAGGAGCGATGAAATAATGAATGCAAAAACTGCTGATAAAATTGCAACAGGCGTTATTTACGCTATTTCTGGCATTGTCGCTTTAATTTTGTTTGCGATGCTAGCTTTTATTCTTGTACAAGGCGTACCACATTTATCATGGCACTTCTTAACTTCTCCAGCACGTGCATTTGAAGCAGGCGGTGGTATTGGAATACAACTTTTTAATTCTTTCTACTTGTTAATTTTAGCCATGTTGATTAGCTTTCCCATTGCGTTGGGTGCAGCAATTTATCTTAATGAATATGCGCAAAAAAATCATTTTACAGCAATTATACGTACAGCTATCGAAATATTAAGTTCTTTGCCTTCTGTTGTTGTTGGTTTGTTTGGATTCTTACTTTTTGTTGTACAATTTAAATTAGGTTTTTCTATTTTGTCTGGTGCAATTGCATTAACATTGTTTAATCTACCTCTTTTGACACGTTCAATCGAAACGAGTTTAGCACAAATTCCTGATTTACAGCGTGAAGCAGGTGCGGCACTTGGCTTGTCACGATGGGAAACGGTTTTGCATGTTATTTTGCCTGCAGCCGTTCCATCAATTGTGACGGGTGTTGTTCTATCGGCTGGACGAGTATTTGGTGAAGCTGCAGCCTTAATTTATACTGCAGGACAATCTGCTCCAGCTTTGAATTTTGCCGACTGGAATCCATTCAACATTTCGAGCCCTTTGAATCCAATGCGACCAGCAGAGACACTAGCTGTACATATTTGGAAAATTAATTCTGAAGGTATTATGCCTGATGTTAGTGCCGTGTCAGCAGGAGCTTCTGCTGTTTTGATTATTGTTGTGTTGCTATTCAACTTTAGCGCACGAAAATTAGGTATGAAGCTTTACAAGAAGTTAACGAGTGCGTGAGGCCATTATGATAAATTCAAATACAGATCTTAAACCAGCTAGTGAGTTCATTAGAGAAAATGCACCAGAGCGGTTTATTTATAAAATGGATACCGAAAAACATGAAATTGCTCTGTCCACACATGACTTGCAAGTGTTTTATGGTGATAATCTTGCCTTGAGCGAAGGCGACCTGCAGTTTGAGCGTTATAAAATTACGAGCTTGGTTGGCGCTTCAGGATCCGGGAAATCAACATTTTTACGTTCACTAAACCGTATGAATGATGGTGTTGCTACCGTTAATGGGAACATTATGTATCGCGGTTTGGACATTAATACCAAGAAAATTGATGTTTATGAAATGCGTCGACATATCGGCATGGTATTTCAACGTCCCAATCCTTTTGCCAAGTCAATTTATGACAATATAACTTTTGCACTAACTAGCCGAGGTAATTACACTAAGCAGCAACTAGATGAAGTAGTTGAAACCAGCTTGAAACAAGCTGCTTTATGGGATCAAGTTAAGGATGAACTAAATAAATCCGCATTAGCATTATCCGGTGGTCAAGCACAGCGATTGGTGATCGCTCGTGCGTTGGCATTGAAGCCTGATATTTTGTTGTTAGATGAGCCTTCGAGTGCGCTAGATCCTATATCATCCGCTCAGGTTGAAGACACGCTACTTAAATTAAAAGATCAATATACAATTATTATTGTTACTCACAACATGCAACAGGCAGCCCGAATTAGTGACTATACAGCATTCTTTCATATGGGCAAGGTCATTGAATACGATCTAACACGAAAAATATTTACGCGACCAAAAGTAGCACTTACAAACGATTACATATCAGGTAACTTTGGATGACAGATAATAAAGAAAAAACAATTTTATCAACCCGCGATGTACATCTGTGGTACGGTAAAAAAGAGGCGTTGCATGGTATTGACTTAGATTTTCCAGAGAAGGGCATTACTGCGTTAATCGGCCCTTCGGGATCAGGAAAGTCAACATACTTACGTGCAATTAATCGTATGCATGATTTAGAAGATAATGTGACGGTGACAGGGTCTTTCAAATTCAAAGATACGGATATTTATGCACCCACAACCGATACGGTTGACCTACGCAAACGTATTGGTATGGTCTTTCAACAGCCTAATCCATTTCCGTTTTCAACTTATGAAAATGTGGCATTTGGCTTGCGACTTGCTGGGGTCAAAGATAAAGCTGTTTTAGATGAAGCGGTAGAAAAAGCTTTGAAGCAATCTTCTGTTTGGGATGAAGTGAAAGATAATTTGCACAAGTCAGCTCTTGGATTATCCGGTGGTCAACAGCAACGTGTCTCCATTGCACGTGTTTTGGCTACATCCCCAGAACTTTTATTGTTAGACGAACCTACATCTGCGTTAGATCCAGTGTCTAGTCACAACATTGAAGAAACTTTGTTAAAATTGCGCGACGATTATGCAATGATTATTGTGACACATTCGATGTCACAAGCATCACGAATTTCTGATCGTACTGCATTTTTCTTGAGTGGTGACTTAATTGAAGTTGATGAGACAAAGCATATCTTCTTGGATCCAGCAAAAAAAGAAACACAAGATTACGTTTCAGGTCGTTTTGGCTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

>CP035139|549476:558481|550716_551409_+|QAR68785.1|DBSCAN-SWA
MTKILVVDDETAIATLLQYNLQQNGYEVTVASDGLSAYQKAKEQQFNAILLDLMLPEMDGMTVLKQLRQDKVSTPIILVTAKGDEFDRVLGLELGADDYITKPFSPREVVARLKAVLRRSQVSTDTNKTDEMVISIQDLLINDSKKTVMKENIVLSLTPREYDLLLYFAQRLGRVIDRETILTAVWGYEYTGESRMVDMHISNLRDKIESNPKAPKILKTVRGFGYTMTN
>CP035139|549476:558481|552640_553981_+|QAR68787.1|DBSCAN-SWA
MKKRIGKITSIYSLNILLLFIVTRVIHVSHNQIYILVIIFFVVANFEVWFLNFWQNKETAELTIMKNRMIATSAGETPRGVLAEPTSPYYELLEQFNELQSYVRHSQYSANREINNYQTLLASLPVGVINVSRHHMIDVFNQTAADMLGVEMPEVPILDSLVIRQFTLSEIINHTFNTNQRQHSILNLMIDGEARQYDVSTLFHQSGSNAEVMVMLYDLTEVLKLERMQADFLANASHEFKTPLTAITGFVETLQGDAGADEETRTQFLQIVADEAKRLSALVNDILSLSRMQHKVDEKISNLQISAIVEQQLEKIDTKTVTVHNDIAPDFSVSGIASDVSTIVQNLLTNSVKYNKTDGEVWISAYKDTQQWQIKVSDSGIGIPLNQQSRIFERFYRGDESRQRKIASGTGLGLAIVNEIVNQHNGEINIKSQVGVGTTISVILPL
>CP035139|549476:558481|555979_556864_+|QAR68790.1|DBSCAN-SWA
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>CP035139|549476:558481|555056_555980_+|QAR68789.1|DBSCAN-SWA
MDNITKKLMQRSESTHKDTFGRAVSLTALALIGIVVVAIFAFVLSRGLSTFFRDGVNVKDFLFGTTWNPSVTNPATKQPYIGALPMIIGSFLVTFLAAVVATPFAIGTSLFMTEIAQKRGAKIMQPIIELLVGIPSVVYGFIGLTVVVPFIRNITGGSGFGILSGTIVLFVMILPTITSMTVDTLKSVPRYYRESALAIGATRWQMIYKVVLRSATPGIMTAIVFGMARAFGEALAVQMVIGNAALMPTGLTTPASTLTSVLTMGIGNTVMGSLQNDVLWTLAMILLLMSLVFNLIVRAIGRRGAMK
>CP035139|549476:558481|549476_550634_+|QAR68784.1|DBSCAN-SWA
MVAKKTTKKDDQAKKDGRRAALDEALKKIEKNFGKGSVMTLGDNALTQIETIPSGSVKIDVALGVGGYPKGRIIEVYGPESSGKTTIALHAVAEVQKQGGTAAYIDAENALDVKYAEALGVKKDELLLSQPDTGEQGLEIADALVQSGAVDMIVVDSVAALVPRAEIEGEMGDAHVGLQARLMSQALRKLAGTLNRTGTIAIFINQIREKVGVMFGNPETTPGGRALKFYSTVRLEVRRSTQIKDGTDVTGNLTKVKIVKNKVAPPFKVAEVDIMYGHGISQTGEILDLAVDQDIIDKAGAWYAYEGERIGQGREKAKDYLDDPEHAALRQELYVKVRQAYGIDSNANGTAVSNTEAQAEKSDEQINLPDLDTTTDDSLTDEPIV
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MSKSYRGSIVFTIVAVAVAAALGTAYAMRDKSASNTSITAVGSTALQPLVEAAGEEYAKDNLGTFINVQGGGTGTGLSQVSQGAVDIGNSDVFAEEKDGIDAKELVDHQVAVVGIAPLLNKHNGVKNLTTKQLIAVFTGKVTNWKEVGGNDQKIVIINRAAGSGTRATFEQWGLNGAQSTEAQEQDSSGMVRSIVSTTPGAISYAAFGYIDDSVVAAKVNGVKPTKQNVVSGKYAIWSYEHVYTKGKPSEPVAKFLKYLTSKKVQSTLVSKLGYISIHDMKISRDVNGQVTRK
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MINSNTDLKPASEFIRENAPERFIYKMDTEKHEIALSTHDLQVFYGDNLALSEGDLQFERYKITSLVGASGSGKSTFLRSLNRMNDGVATVNGNIMYRGLDINTKKIDVYEMRRHIGMVFQRPNPFAKSIYDNITFALTSRGNYTKQQLDEVVETSLKQAALWDQVKDELNKSALALSGGQAQRLVIARALALKPDILLLDEPSSALDPISSAQVEDTLLKLKDQYTIIIVTHNMQQAARISDYTAFFHMGKVIEYDLTRKIFTRPKVALTNDYISGNFG
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MNKKIVGIIGGIVVIAAGIALYTSANDKSSDNKTSTTSSSNVSGKVLSLGSTALQPLAEQVAKSFQEKNPNVTITVQGGGSGAGLSQVSDGSAQIGNSDVFAEEKDGIDATKLVDHKVAVVGIAPVVNSDVQITSLTKEQLRNIFTGKVTNWKEVGGNDEKIVVINRATGSGTRAVFEKSILDGQDAVQATEQDSNGTVQKIVKTTPGSISYLAFAYLDSDGIKALDLNKVHPNKQNVEDNSWPIWAYEHMYTKGKPTGATKSFLEYFTTKEVQKNIVPKLGYIGLTDMKVTRDASGKVTDK
>CP035139|549476:558481|557710_558481_+|QAR68792.1|DBSCAN-SWA
MTDNKEKTILSTRDVHLWYGKKEALHGIDLDFPEKGITALIGPSGSGKSTYLRAINRMHDLEDNVTVTGSFKFKDTDIYAPTTDTVDLRKRIGMVFQQPNPFPFSTYENVAFGLRLAGVKDKAVLDEAVEKALKQSSVWDEVKDNLHKSALGLSGGQQQRVSIARVLATSPELLLLDEPTSALDPVSSHNIEETLLKLRDDYAMIIVTHSMSQASRISDRTAFFLSGDLIEVDETKHIFLDPAKKETQDYVSGRFG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
QAR68784.1|549476_550634_+	recombinase RecA	A0A0S2MVG1	Bacillus_phage	1.1e-117	65.1
QAR68785.1|550716_551409_+	response regulator transcription factor	W8CYM9	Bacillus_phage	4.8e-36	34.5
QAR68786.1|551648_552557_+	phosphate ABC transporter substrate-binding protein	M1U9L0	Synechococcus_phage	9.2e-11	28.2
QAR68787.1|552640_553981_+	two-component sensor histidine kinase	A0A1V0SGX0	Hokovirus	6.1e-19	27.4
QAR68788.1|554122_555004_+	phosphate ABC transporter substrate-binding protein PstS family protein	M1U9L0	Synechococcus_phage	1.7e-09	32.0
QAR68789.1|555056_555980_+	phosphate ABC transporter permease subunit PstC	NA	NA	NA	NA
QAR68790.1|555979_556864_+	phosphate ABC transporter permease PstA	NA	NA	NA	NA
QAR68791.1|556871_557714_+	phosphate ABC transporter ATP-binding protein	A0A1V0SE00	Indivirus	1.0e-11	28.4
QAR68792.1|557710_558481_+	phosphate ABC transporter ATP-binding protein	A0A1V0SJ29	Klosneuvirus	3.7e-13	26.0

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>CP035139|686032:694721|DBSCAN-SWA
TATGCCTCAAGTTGCAGTTGTCATGGGATCAACTAGTGATTGGTCCAGCATGAAAAAAACGACAGAAATTTTGGATATATTAGGTGTTACTTACGAAAAACACGTCATTTCAGCGCATCGCATGCCTCAAGAATTACAAGCATTTGGCACACAAGCAAGAGACAATAAGATTCAAGTAATTATTGCTGGTGCCGGCGGCGCAGCTCATTTGCCTGGTATGCTGGCAGCTAATACAACGCTACCAGTCATCGGCGTGCCGATGCAATCACGGGCACTAAATGGACTGGATTCTTTACTCTCTATTGTTCAAATGCCAGCGGGGGTTCCCGTTGCAACAGTTGCAATAGGTGATGCAGGTGCAAAAAATGCGGCAATTCTAGCTGCACAAATTATTGCTTTAAATGATAATGACGTATTGCAGGCCTTGAATGAATATCGAGAACGCCAAACAAAGACTTCTATTGAAAGCGAGGCAGAATTGATATGACGGGAGTAATTTTACCGCCGGCAACGATTGGTATTATTGGTGGTGGCCAACTTGGTCAAATGATGGCTCTTTCTGCAAAAGAAATGGGGTACCGTGTCGGAATTTTGGATCCCACGAAAGGCTCTCCAGCTGGGCAAGTATCAGATTTTCAGATAGTTGCTGATTATGATGATGTCGAAGCATTAAATGAATTATCACGACGAAGTGAAGTGTTAACATATGAATTTGAAAATGTTGATCGAGATGCATTGAATGAGCAAAGCGATGCAGAATTGCCGCAAGGTACAGAACTACTAAGAATTACAAGCGATCGCATTACTGAAAAAAAGTTTATTCGGGATGATGCTAAAGTACCAGTCACAAATTTCATTGAAGTAAATTCACCCGAAGATTTACGAAAGGTAACTTTACCAGCTATCTTAAAAACAGTGAGTGGAGGATATGATGGCCACGGTCAGTGGTCAATTAATACAGTGCAAGATATTGTTAATATTGAAAAAGATTTTCCAGATACGCAATTAATTTTAGAACAAGTTGTGAATTTTAAACAAGAGCTAAGTATTATGGTTTCACGTTCCCAAGATGGGCAAATTGTGACCTGGCCGATTGTCGAAAATGTTCATGAAAATCACATTTTAAAAACGACAACAGCACCTGCTGACATCTCATTGACACTCAAGAATAAAATTGAAGCAATTGCTGAGAATATCGCTGAGTCACTTAAATTGCGTGGCGTACTTGGTATTGAGTTATTTGTCGCTGACGAGGAAGTATGGGTTAACGAATTAGCACCGCGACCACATAATTCTGGACATTATAGTATTGAAGCGACAAATGTATCACAGTTTGAAGGACATGTTAGAAGTATTGTCGGTCTACCTATACCAAAAATTGAGTTGCAAAGCCCTGCTACAATGTTAAATTTGTTGGGCGATGAGTTAACACAAGCTAGAGAAGATTTAATTCATCATCCTGAGTGGCATTTTCACGATTATGGTAAATTGGCTGTTAAACTTAATCGTAAAATGGGACATATTACGGTACTAGGAACAGAAAATGGTCGAAAATTAAAAGAATGGGGTGACTTGCATGAGCAGCGCAACTGAATACGAAGACAAAACAGTGACTCGCGGAGAACTGAAATATCAAGGCAAGGCGAAACAAGTTTATTTCACAGATAATCCTACAATTTTGTGGGTTCATTATATGGATCAAGCAACAGCTTTAAATGGTAAGGTACATGAAAATATACCAGAAAAAGGCCAATTGAATAGTGCAATTTCGCATATATTATTTGAACATTTAACACGTCAGGGCATTGAAAATCATTATCTTTCTTCGGTTTCTGAAACAGACGAATTGGACTTAGCCCTTGAGATTTTGCCCATTGAAGTGGTTACGCGAAACTACGCATCAGGGCATTTTGTAAGTAAATTTAACGCAACGCCAATGCAAAAATTAACACCAGTTGTTCAAGAATTTTACTATAAATCAGACGAGCTGGATGATCCCTTCATGAATGATTCTCAAATTTTAGCTCTTGGTTTTGCCACATTATCTGAACTCACAAAATTACGTGCTTATGCCCAAGAAGTTAATCAAGCGCTCACAGAAATATTTGATGAAATTAATATTAACTTAGTCGACTTTAAATTAGAATATGGTCGTGATAGTGAGGGAAAGTTAATCTTGGCTGATGAATTGTCACCAGATAATATGCGTTTGGTCGACCAAAAAACAGGTAAGTCACTTGATAAAGATGTGTTTCGAAAACATGCTGGTGATGTTACTGTTGGTTATCGTGATGTTCTATCACGTTTAGAAAATTTGGAGAAATAATATGTACTTAGCAAAAATATATGTCACATACAAGCCATCAATCCTTGATCCACAAGGTGAAGTGATTAAAGCTGCGTTAAATCGTATGGATTATAGCGGAATCGAGCAAGTATCACAAGGAAAATATTTTGAAATTAAGCTGAAAGCGACCGATGTTGATGCTGCTACTTCAGAAGTTGAAAGTTTCACTGATGCCCTATTAATCAATCAAAATACCGAAACCTACCGCTTTGATTTATCTTTGGTAGATGAGGACGAGGTACTATCATGAAAGCTGCGGTTATTAGTTTTCCAGGATCAAATTGTGATTTTGACATGTTACATGCATTGCAAGAATTTGGTGTTGACGCAGAAATTGTTTCTGCAAAACATAATAATTTGAAAGCATATGATGCAATCTTTTTACCAGGGGGTTTTTCATACGGAGATTATTTGCGTACAGGAGCGATTGCCCGTTTTTCACCAATCATGAGTGCTGTGACACAGGCGGCTAATGATGGCAAGCTTATTGTTGGCATTTGTAATGGATTTCAAATTTTGACAGAAGCTGGTTTGCTACCTGGACAACTATTAACAAATAAAAAACCAGGATTTATTTGCGATGAGATAGCACTTTCAATTGCAAATCCAAACACCGCTTATACAAATGCTTATGATTCTGAAGAAATAATTAATATTCCTGTGGCACATGCAGAAGGAAATTATTATGCCGATGCAGAAACATTGACGAAACTTGAAGAGGATAATCTGATTGTTTTCCGATATGTGGATAATCCCAATGGATCAGCACATGATATAGCGGGGATTATGAATGAAAATGGTAACGTCTTTGGTATGATGCCACACCCAGAGCGTGCAGTTGATGCAGTGACTGGTAACGAAGATGGTAAGAACTTTTTCAAAAGTATTTTGAGCGGCATTCTAGCAGGAGCCTAATATAATGACAACAAATGAATTATCACCCGAAGAAGTACGTGACAGTAAAATTTATATAGAGTGGGGGCTTACAGAACAGGAATATGATTTGATTGTTAAGGAGTTAAAGCGTCTACCTAATTTTACTGAAACAGGCATTTTTTCAGGAATGTGGTCGGAACACGTTTCTTATAAGAAATCAAAGCCAATTTTGCGCAAATTCTGGTCATCCAACGAACGTGTTTTACAGGGACCAGGTGAAGGGGCTGGAATTTTAGACATTGGTGACAATCAAGCAGTTGTTTTTAAGGCTGAAAGTCATAATCATCCTTCATTTGTTGAACCGTATGAGGGGGCAGCAACCGGAGTTGGCGGTATCTTACGTGATATTTTTTCAATGGGTGCCCAACCTATTGCTGTACTGGATTCGCTACGTTTTGGTGAATTGGACAATGCGCATACAAAACATATTGTTGACGGTGTCATAGCAGGAATTGCGGGATACGGTAATGCGATTGGTATTCCCACAGTGGGAGGCGAAATTGGTTTCGATGGCGTTTACGCTGGCAATCCATTGGTAAATGTTATGGCTGTTGGCTTGATGGACCAAAATGCTATGCAAGTTGGACAAGCTAAAGGCATAGGAAATTCAATTATCTATGTTGGTGCTAAAACTGGTCGTGATGGTATTAATGGCGCCTCATTTGCTTCTGCTGAGTTCTCAAGTGCAGAAAAATCTGATCGTTCGGCTGTTCAAGTTGGCGATCCATTCTTGGAAAAGTTGGTGATGGACGCAACGCTCCAAGCAATACGTGAACATTCTGATATTATTGTTGGCATTCAAGATATGGGTGCAGCTGGACTCCTATCCTCGAGTTCTGAAATGGCTGCTAAAGCAGGCATGGGTATTCACTTGAACTTGGATATGGTCCCTCAACGTGAAACAGGAATGACGCCATATGAACTAATGTTGTCAGAGTCGCAAGAACGCATGGTGCTGGTTGTTAAAAAGGGTGAAGAACAAGCTATTATTGACTTGTTCCAATCGGCTGATTTAGATGCTGTAATCATTGGTCAAGTTACCGATGATGGTCGTTATCGATTAAACTTTAAAAATGAAGTAGTTGCAGATGTGCCTGTTGATTTCTTAACGCATGCGCCAAAGCAAGACTTACCAATGATTGAACCGGCAAGATTGGCGAACTTTACAGATGAACAATTTGAGCCAGACATGGGTAACGTCAAAGAAACAATATTAACATTACTCGCACAACCAACAATTGCTTCTAAAGCATCGTTGTTCCGACACTTTGATTCTCAAGTGCGCGCTGATACGGTTATTAAGCCTGGTGGAGATGCGGCGTTGATTCGTATTCGTGATACGCAAAAGGCATTAGCGATGACAACAGATGTCAATGCTCGTTATTTATATCTCAATCCACGTGTGGGTGCCAAAATGGCAGTTGCTGAAGCGGCTAGAAATATTGTATCCACAGGGGCAAAGCCAATTGGCATCACAGATGGCTTGAACTTTGGTTCACCGGATAATCCAGAAGTTTATTATGAGTTGGATCAAGCTGTTGCTGGGATTAATGACGTGGCTAAACAGCTTGACACACCAATTATTTCTGGAAACGTGTCTCTTTACAACGAAACAGATGGGCAAGCAATTTATCCCACACCAATGATTGGCATGGTTGGTTTGCTTGAAGATATCACAAAAGCAACACGAACGGCATTTCAAAAAGCAGGCGATAACATTTATCTTGTAGGGCGAACGAAAGATAGCTTTAACGGTTCAGAAATTCAAAAGATGCAAACAGGACATATTGCCGGTCAATTATTTGATTTTAATGATGAGGACGAGTTAGCAGCGCAACAGGTCATTCTAGATGTCACTGATCAACGTCTGCTTAATAGTGCGCATGATTTATCTGAAGGTGGATTAATCGTTGGTCTTCTTGAGAGCGCCTTTGCTGGAAATCTTGGTTTTGATATCTCGGTAGACTTAGCCGATAAGTATTTATTTTCGGAAACACCAAGTCGTTTTGTAGTCAGTGTGTCACCTGAAAATAGGACAACATTTGAATCACTAGCCGGTGACCGAGTAATAAAATTAGGTGTGGTTACAGCAGATGATACGATTAATATTACAACGACAACAAGCGATATTCAATTGTCATTAAGCGAAACGAAGAAAATCTACCAGGAGAGTATCGCATGGAAACTAAACGCGGAGTAACGATGATGAACGAACAAAAAAATGAAACATCACGTCTTAATGTGCGTAGTTTGAATGAAGAATGTGGCATTTTTGGCGTCTGGGGTCGATCCGATGCGGCGCAATTAACATACTATGGACTACATGCATTACAACATCGTGGTCAAGAGGGTGCTGGTATTGTTGCTAACAATAATGGTCATTTGTGGCAAGAACGTGGTTTAGGTCTATTGAGTGATGTTTTTCGAGATACATCTCGCATTGAAGCATTAGCTGGGAAAAGTGCTATTGGTCATGTGCGTTATGCCACAGCTGGATCTAATGGGTTAGAAAATATCCAACCTTTGATGGTGAATTTTCATGACATGCAAATCTCATTAGCGCACAATGGTAATTTGACAAATGCCCTTACATTACGTGAAAATTTGGAAGAAGAAGGGGCCATTTTTCAATCATCTTCTGATTCTGAAATTTTATTGCATTTAATTCGCCGATCTAAAGCAGACAAATTTATTGATAAACTAAAAGAAGCTTTAAACATTGTACATGGTGGATTTGCGTTCTTGCTATTGACGCCACATGGAATGTTTGCTGCGTTGGATCCACACGCGTTTCGACCTTTTGTCATTGGTCAAATGCCGGATGGCCACTACATTGTTACATCTGAAACAGCTGCTATTGAAGTTGTTGGTGCCAAGTTCGTACGCGATGTACAACCTGGCGAACTAATCGCGATCGACGACAATGGTTTAACCATCGATACATATACTGATAAAACCACTTTAAATATTGACTCGATGGAATATATCTATTTTGCTCGCCCTGATTCAATGATTTATGGTGTGAATGTACACAAGGCACGTAAGCGGATGGGGGCAGCTTTAGCAGCAGAACAGCCGGTTCCGGAAGCAGACATTGTTGTTGGCATTCCGAACTCTAGTTTGAGTGCAGCCGCTGGGTTTGCTGAAGCCAGTGGTTTACCAAATGAGATGGGGTTAGTAAAAAATCAATACATTGCGCGTACATTTATTGAACCAACACAAGATAAAAGAGAACGAGCCGTTCGTATGAAATTAAGCGCTGTTCGTGACGTTGTTGTTGATAAAAATGTCGTTTTGATAGATGACTCAATTGTTCGTGGAACAACATCTATGTTTATCGTGCGAATGCTGAAAGAAGCTGGTGCTAAATCAGTTCATGTAAGAATTGCGAGTCCTATATTTAAATTTCCGTCATTTTATGGTATTGATATGCAAACAACAGAAGAACTGATGGGCGCAAATCATTCATTGCTTGAAATGACAAAAATGATTGAAGCTGATTCACTTGGATTTTTGTCAGTTGATGCACTGGTTAAGGCAATTGACTTACCATATGATGGAGAAGGAACTGGGCTAACGACCGCTTACTTTGATGGGCATTATCCAAGTCCAATTTATGATTATAAAGCCAGTTTAGACCAATTTGTTCGTTCTGGAGAAGTTGATTTCGTTCCTGAACCAGTAACCACTTATCATCCCCGTCAAGTGGCTTCATTGCGACATCAGGAGCTTTTGTCAGATGGCACTATCCATTTAGATTCACAAACAATTCAGGGGGTGGAAATATGAGTGAGAAAAATGCGTATCAGAAAGCTGGCGTCGATATCAAGGCTGGAGAACGTGCTGTTGATTTAATGAAAGATGCAGTTGCAGATACATATAATGACCAAGTGCTTGACGGTATTGGTGGTTTTGGCGCTGCATTTGCTTTAGGAAAAGGATACACTGATCCGGTTTTGATTTCAGGCGCTGATGGGGTAGGAACAAAACTACTGTTGGCTATCGCTGCGGATAAACATGATACAATTGGACAAGATTTAGTAGCGATGGTGGCTAATGATATCTTAGCTCAGGGCGCAAAGCCAGCTTTCTTACTGGATTATTTAGCTGTGGACAAGATGAGACCAGAAGTTGTTGCTGAAATTGTCACTGGCATTGCCAAAGCCGCCAAAACATCAAATATGTCTCTAATTGGTGGTGAAAGTGCTGAACTACCAGGATTGTACGCGGAAAAACATTATGACTTAGCAGCTTTTGCTGTTGGTATTGCAGAGCGGCAACAATTATTGTCTGCAAAAAATGTCTCTGAAGGAGATGTTTTGATTGGTTTGCCATCTTCTGGAATTCACTCTAACGGCTATTCGCTAGTACGTCAGGTTTTTGGTGTTCAGTCGGATGACGACTTTAATCAATTATCTCCTGAGACCAAGGCAACCTTACTGACTCCAACATCTTTATATGCTCAATCTGTTTGGCCGCTTGTTGCAGCCAACCTTGTGCAGTCCATGGCGCATATTACTGGTGGAGGAATCATAGAGAACTTACCTCGAGCATTGCCCGATAATGTTTCTGCTGAAATAAGCTGGGGTTCATGGCCGATTTTGCCTATTTTCCACGAACTACAAGCTAAAGGACATTTATCTTTAGAAGATATGCTATTGACGTTCAATAATGGATTAGGTATGATTCTGATTGTAAAGCCACAAAAATTAGCAGATGCAATGACCTTATTAACTCATCAAAATCAAACAGCCTACGTGCTTGGTAAAATAACGCCTGCTCAGAACGATCGAGTTGTCTTTACAGGTAATGAACCATGGTGAGAAAAGTAAATTTAGCAGTTTTTGCGTCTGGTACGGGGACCAACTTTCAAGCATTAAATGATGCTATTTTACAAAGAAATCTGAATGCTGAAATCGTACGTTTGATTGTTGATAAATCAACTGCTGGTGCCCTGAATTTAGCAAAATTATTCGGTATTCCTGCTACAGCAATCAAATATTCTAATTATGAAACGAAGACCGAAGCGGAACAGGTCATTATTAATCAACTTAAAACAGATCAAGTTGATGGTATTTTATTGGCTGGTTATATGCGTATTTTGACGCCAAAGTTAATCGATGCCTATTCAGGGAAGATTATTAATCTCCATCCGGCCATGCTGCCTAAATTTCCGGGACGACACAGCATCCTAGATGCCTTTGAAGCCGGTGTTTCAGAGACCGGTGTAACCGTTCATTTTGTGGATAATGGCATTGATACCGGTGAGATAATTGCTCAAGAAGCTGTCCCAATTTTGGTGAATGATACCATTGATTTACTTGAGACACGTATTCATAATGTTGAACATGTGCTGTATCCCAACACACTTGCAAAGTTAATAGATGAAGGAGTATTTTTAAAATGA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

>CP035139|686032:694721|687607_688357_+|QAR68909.1|DBSCAN-SWA
MSSATEYEDKTVTRGELKYQGKAKQVYFTDNPTILWVHYMDQATALNGKVHENIPEKGQLNSAISHILFEHLTRQGIENHYLSSVSETDELDLALEILPIEVVTRNYASGHFVSKFNATPMQKLTPVVQEFYYKSDELDDPFMNDSQILALGFATLSELTKLRAYAQEVNQALTEIFDEININLVDFKLEYGRDSEGKLILADELSPDNMRLVDQKTGKSLDKDVFRKHAGDVTVGYRDVLSRLENLEK
>CP035139|686032:694721|688358_688628_+|QAR68910.1|DBSCAN-SWA
MYLAKIYVTYKPSILDPQGEVIKAALNRMDYSGIEQVSQGKYFEIKLKATDVDAATSEVESFTDALLINQNTETYRFDLSLVDEDEVLS
>CP035139|686032:694721|686032_686518_+|QAR68907.1|DBSCAN-SWA
MPQVAVVMGSTSDWSSMKKTTEILDILGVTYEKHVISAHRMPQELQAFGTQARDNKIQVIIAGAGGAAHLPGMLAANTTLPVIGVPMQSRALNGLDSLLSIVQMPAGVPVATVAIGDAGAKNAAILAAQIIALNDNDVLQALNEYRERQTKTSIESEAELI
>CP035139|686032:694721|686514_687624_+|QAR68908.1|DBSCAN-SWA
MTGVILPPATIGIIGGGQLGQMMALSAKEMGYRVGILDPTKGSPAGQVSDFQIVADYDDVEALNELSRRSEVLTYEFENVDRDALNEQSDAELPQGTELLRITSDRITEKKFIRDDAKVPVTNFIEVNSPEDLRKVTLPAILKTVSGGYDGHGQWSINTVQDIVNIEKDFPDTQLILEQVVNFKQELSIMVSRSQDGQIVTWPIVENVHENHILKTTTAPADISLTLKNKIEAIAENIAESLKLRGVLGIELFVADEEVWVNELAPRPHNSGHYSIEATNVSQFEGHVRSIVGLPIPKIELQSPATMLNLLGDELTQAREDLIHHPEWHFHDYGKLAVKLNRKMGHITVLGTENGRKLKEWGDLHEQRN
>CP035139|686032:694721|688624_689293_+|QAR68911.1|DBSCAN-SWA
MKAAVISFPGSNCDFDMLHALQEFGVDAEIVSAKHNNLKAYDAIFLPGGFSYGDYLRTGAIARFSPIMSAVTQAANDGKLIVGICNGFQILTEAGLLPGQLLTNKKPGFICDEIALSIANPNTAYTNAYDSEEIINIPVAHAEGNYYADAETLTKLEEDNLIVFRYVDNPNGSAHDIAGIMNENGNVFGMMPHPERAVDAVTGNEDGKNFFKSILSGILAGA
>CP035139|686032:694721|694130_694721_+|QAR68915.1|DBSCAN-SWA
MVRKVNLAVFASGTGTNFQALNDAILQRNLNAEIVRLIVDKSTAGALNLAKLFGIPATAIKYSNYETKTEAEQVIINQLKTDQVDGILLAGYMRILTPKLIDAYSGKIINLHPAMLPKFPGRHSILDAFEAGVSETGVTVHFVDNGIDTGEIIAQEAVPILVNDTIDLLETRIHNVEHVLYPNTLAKLIDEGVFLK
>CP035139|686032:694721|689297_691514_+|QAR68912.1|DBSCAN-SWA
MTTNELSPEEVRDSKIYIEWGLTEQEYDLIVKELKRLPNFTETGIFSGMWSEHVSYKKSKPILRKFWSSNERVLQGPGEGAGILDIGDNQAVVFKAESHNHPSFVEPYEGAATGVGGILRDIFSMGAQPIAVLDSLRFGELDNAHTKHIVDGVIAGIAGYGNAIGIPTVGGEIGFDGVYAGNPLVNVMAVGLMDQNAMQVGQAKGIGNSIIYVGAKTGRDGINGASFASAEFSSAEKSDRSAVQVGDPFLEKLVMDATLQAIREHSDIIVGIQDMGAAGLLSSSSEMAAKAGMGIHLNLDMVPQRETGMTPYELMLSESQERMVLVVKKGEEQAIIDLFQSADLDAVIIGQVTDDGRYRLNFKNEVVADVPVDFLTHAPKQDLPMIEPARLANFTDEQFEPDMGNVKETILTLLAQPTIASKASLFRHFDSQVRADTVIKPGGDAALIRIRDTQKALAMTTDVNARYLYLNPRVGAKMAVAEAARNIVSTGAKPIGITDGLNFGSPDNPEVYYELDQAVAGINDVAKQLDTPIISGNVSLYNETDGQAIYPTPMIGMVGLLEDITKATRTAFQKAGDNIYLVGRTKDSFNGSEIQKMQTGHIAGQLFDFNDEDELAAQQVILDVTDQRLLNSAHDLSEGGLIVGLLESAFAGNLGFDISVDLADKYLFSETPSRFVVSVSPENRTTFESLAGDRVIKLGVVTADDTINITTTTSDIQLSLSETKKIYQESIAWKLNAE
>CP035139|686032:694721|691492_693103_+|QAR68913.1|DBSCAN-SWA
METKRGVTMMNEQKNETSRLNVRSLNEECGIFGVWGRSDAAQLTYYGLHALQHRGQEGAGIVANNNGHLWQERGLGLLSDVFRDTSRIEALAGKSAIGHVRYATAGSNGLENIQPLMVNFHDMQISLAHNGNLTNALTLRENLEEEGAIFQSSSDSEILLHLIRRSKADKFIDKLKEALNIVHGGFAFLLLTPHGMFAALDPHAFRPFVIGQMPDGHYIVTSETAAIEVVGAKFVRDVQPGELIAIDDNGLTIDTYTDKTTLNIDSMEYIYFARPDSMIYGVNVHKARKRMGAALAAEQPVPEADIVVGIPNSSLSAAAGFAEASGLPNEMGLVKNQYIARTFIEPTQDKRERAVRMKLSAVRDVVVDKNVVLIDDSIVRGTTSMFIVRMLKEAGAKSVHVRIASPIFKFPSFYGIDMQTTEELMGANHSLLEMTKMIEADSLGFLSVDALVKAIDLPYDGEGTGLTTAYFDGHYPSPIYDYKASLDQFVRSGEVDFVPEPVTTYHPRQVASLRHQELLSDGTIHLDSQTIQGVEI
>CP035139|686032:694721|693099_694137_+|QAR68914.1|DBSCAN-SWA
MSEKNAYQKAGVDIKAGERAVDLMKDAVADTYNDQVLDGIGGFGAAFALGKGYTDPVLISGADGVGTKLLLAIAADKHDTIGQDLVAMVANDILAQGAKPAFLLDYLAVDKMRPEVVAEIVTGIAKAAKTSNMSLIGGESAELPGLYAEKHYDLAAFAVGIAERQQLLSAKNVSEGDVLIGLPSSGIHSNGYSLVRQVFGVQSDDDFNQLSPETKATLLTPTSLYAQSVWPLVAANLVQSMAHITGGGIIENLPRALPDNVSAEISWGSWPILPIFHELQAKGHLSLEDMLLTFNNGLGMILIVKPQKLADAMTLLTHQNQTAYVLGKITPAQNDRVVFTGNEPW

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
QAR68907.1|686032_686518_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	6.2e-22	45.6
QAR68908.1|686514_687624_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
QAR68909.1|687607_688357_+	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	E3SPA9	Prochlorococcus_phage	1.2e-35	35.5
QAR68910.1|688358_688628_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurS	NA	NA	NA	NA
QAR68911.1|688624_689293_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurQ	NA	NA	NA	NA
QAR68912.1|689297_691514_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurL	A6N228	Microbacterium_phage	1.7e-143	38.9
QAR68913.1|691492_693103_+	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	5.4e-46	31.3
QAR68914.1|693099_694137_+	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	A0A0E3HPW9	Synechococcus_phage	1.8e-58	39.6
QAR68915.1|694130_694721_+	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	2.0e-27	40.3

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>CP035139|1155142:1205180|DBSCAN-SWA
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MTFNLDSNIAILVIVWLIVQVLKPTKINNHLLPLIAVIVGALVAIGLSFYTKDTKLVQDIVLGVWAGFASTGLNETATKSITSIIDGFANGFGKSEDNKTE
>CP035139|1155142:1205180|1179569_1179830_-|QAR69358.1|DBSCAN-SWA
MSYDDKLIEEINKRFTKKKNTLYWVRIVYQRYSKQLNVFFEYAKIGMATHSEQIGRYVESEKDRMPELAKRIKKETNVNVELGDLE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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QAR69339.1|1156914_1158216_-|tRNA	histidine--tRNA ligase	A0A2K9L0H9	Tupanvirus	9.4e-25	25.5
QAR69340.1|1158624_1159620_-	galactose mutarotase	NA	NA	NA	NA
QAR69341.1|1159793_1160723_+	AraC family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
QAR69342.1|1160719_1161892_-	galactokinase	NA	NA	NA	NA
QAR69343.1|1161920_1163333_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
QAR69344.1|1163527_1164535_-	L-glyceraldehyde 3-phosphate reductase	NA	NA	NA	NA
QAR69345.1|1164527_1167638_-	beta-galactosidase	L0N6M2	Herpes_simplex_virus	3.3e-310	50.9
QAR69346.1|1167861_1169217_+	threonine/serine exporter family protein	NA	NA	NA	NA
QAR69347.1|1169276_1170221_-	phosphoglycerate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
QAR69348.1|1170439_1171483_+	branched-chain amino acid aminotransferase	NA	NA	NA	NA
QAR69349.1|1171758_1172256_-	DUF1027 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QAR69350.1|1172255_1173599_-	bifunctional metallophosphatase/5'-nucleotidase	NA	NA	NA	NA
QAR69351.1|1173683_1174130_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69352.1|1174131_1175226_-	aminopeptidase P family protein	NA	NA	NA	NA
QAR69353.1|1175342_1175660_-	50S ribosomal protein L27	NA	NA	NA	NA
QAR69354.1|1175687_1175987_-	50S ribosomal protein L21	NA	NA	NA	NA
QAR69355.1|1176171_1176753_-	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
QAR69356.1|1177289_1177550_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69357.1|1178067_1178280_+	hypothetical protein	A0A097BYI6	Leuconostoc_phage	2.2e-16	62.9
QAR70118.1|1178597_1178798_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69358.1|1179569_1179830_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69359.1|1180007_1180937_+|protease	CAAX protease	A0A059NT88	Lactococcus_phage	1.4e-67	42.3
QAR69360.1|1180975_1181281_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69361.1|1181290_1182382_-	1,4-beta-N-acetylmuramidase	E3W8H6	Leuconostoc_phage	1.8e-186	88.7
QAR69362.1|1182385_1182610_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69363.1|1182627_1183434_-	hypothetical protein	Q5K5I3	Oenococcus_phage	1.1e-44	46.0
QAR69364.1|1183445_1184537_-	hypothetical protein	Q5K5I4	Oenococcus_phage	4.7e-118	57.0
QAR69365.1|1184533_1184959_-	hypothetical protein	Q5K5I5	Oenococcus_phage	2.1e-37	53.3
QAR69366.1|1185008_1185242_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69367.1|1185400_1189561_-	hypothetical protein	E3W8G8	Leuconostoc_phage	3.8e-11	75.5
QAR69368.1|1189574_1190693_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69369.1|1190758_1195849_-	hypothetical protein	E9LUR1	Lactobacillus_phage	1.6e-136	44.9
QAR69370.1|1196087_1196648_-	hypothetical protein	K4I0D9	Lactobacillus_phage	1.2e-05	35.0
QAR69371.1|1196529_1197177_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69372.1|1197180_1197552_-	DUF806 family protein	NA	NA	NA	NA
QAR70119.1|1197548_1197947_-	HK97 gp10 family phage protein	A8YQJ5	Lactobacillus_phage	8.7e-14	40.5
QAR69373.1|1197969_1198314_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69374.1|1198294_1198633_-|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	E9LUQ4	Lactobacillus_phage	4.2e-17	45.0
QAR69375.1|1198697_1199915_-|capsid	phage major capsid protein	E9LUQ3	Lactobacillus_phage	2.3e-134	61.2
QAR69376.1|1199920_1200676_-|protease	Clp protease ClpP	E9LUQ2	Lactobacillus_phage	1.4e-68	59.8
QAR69377.1|1200659_1201826_-|portal	phage portal protein	E9LUQ1	Lactobacillus_phage	8.8e-115	52.6
QAR69378.1|1201828_1202026_-	DUF1056 family protein	Q94MB1	Lactococcus_phage	5.1e-07	48.4
QAR69379.1|1202022_1203900_-|terminase	terminase large subunit	E9LUP9	Lactobacillus_phage	4.5e-270	70.4
QAR69380.1|1203886_1204354_-|terminase	phage terminase small subunit P27 family	E9LUP8	Lactobacillus_phage	1.4e-50	65.8
QAR70120.1|1204733_1205180_-	HNH endonuclease	E9LUP7	Lactobacillus_phage	7.2e-41	52.3

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>CP035139|1208283:1220997|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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QAR69392.1|1211386_1211791_-	hypothetical protein	A0A1I9KKG9	Lactobacillus_phage	1.3e-25	46.3
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QAR69395.1|1213534_1213936_-	hypothetical protein	A0A097BYE9	Leuconostoc_phage	3.8e-33	51.1
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QAR69397.1|1214456_1214657_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69398.1|1214952_1215675_-	oxidoreductase	A0A1X9H088	Staphylococcus_phage	5.0e-76	63.4
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QAR69401.1|1216349_1216697_+	XRE family transcriptional regulator	E3W8B9	Leuconostoc_phage	1.9e-28	59.3
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QAR69402.1|1216693_1217125_+	ImmA/IrrE family metallo-endopeptidase	E3W8B8	Leuconostoc_phage	2.5e-46	61.8
QAR69403.1|1217173_1217785_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69404.1|1218373_1219441_+|integrase	site-specific integrase	E3W8I1	Leuconostoc_phage	1.1e-119	60.3
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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

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>CP035139|1477980:1529918|1481967_1482948_-|QAR69645.1|DBSCAN-SWA
MSVIEEQILEQIKRYDTIIIHRHQRPDPDAFGSQLGLKEILKASFPEKKIYAVGKEVQGLAWMNEDDNFMDVIPDAAYNKALVIVTDTANAPRVDDQRWPDGLEVIKIDHHPNDESYGDWQWVKDGHSATSTMIFEFYEKLKGQGLVMTKKAARLLYIGIIGDTGRFMYSIDSETFRVVSELFKYDFDYQEIHHAMATISENAAKLSGYVLQNLSILPSGFAYVILTKELLKQFDLKDAGTAFVVPLPSKIDCVKSWAIFEEQDEGNYRVRLRSRTIAINKIANQFEGGGHPMASGAWAQDQGDIDRLINIVDSALSEKQDAEKED

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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QAR69641.1|1479448_1479757_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatC	NA	NA	NA	NA
QAR69642.1|1479977_1480247_+	30S ribosomal protein S15	NA	NA	NA	NA
QAR69643.1|1480296_1480548_+	30S ribosomal protein S20	NA	NA	NA	NA
QAR69644.1|1480603_1481968_-	DEAD/DEAH box helicase	Q5GF26	Diachasmimorpha_longicaudata_entomopoxvirus	3.6e-51	31.6
QAR69645.1|1481967_1482948_-	bifunctional oligoribonuclease/PAP phosphatase NrnA	NA	NA	NA	NA
QAR69646.1|1482987_1484073_-	DNA polymerase IV	NA	NA	NA	NA
QAR69647.1|1484120_1485122_-	DNA polymerase III subunit delta	NA	NA	NA	NA
1485165:1485180	attL	NA	NA	NA	NA
QAR69648.1|1485707_1485965_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69649.1|1486056_1486440_-	DUF805 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QAR69650.1|1486539_1486740_-	cold-shock protein	Q9AZD3	Lactococcus_phage	2.5e-22	77.3
QAR69651.1|1487018_1487894_-	peptidoglycan hydrolase	A0A059PAR6	Leuconostoc_phage	1.7e-86	59.8
QAR69652.1|1487895_1488366_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69653.1|1488370_1488610_-	hypothetical protein	E3W8H4	Leuconostoc_phage	7.7e-26	85.5
QAR69654.1|1488691_1489114_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69655.1|1489130_1495370_-	hypothetical protein	A0A2P0ZLE1	Lactobacillus_phage	9.0e-89	41.6
QAR69656.1|1495366_1496194_-	hypothetical protein	G8FV36	Pediococcus_virus	1.2e-41	36.4
QAR69657.1|1496193_1499922_-|tail	phage tail tape measure protein	Q597U6	Lactobacillus_virus	2.6e-11	32.7
QAR69658.1|1499908_1500145_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69659.1|1500237_1500687_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69660.1|1500729_1501326_-|tail	phage major tail protein, TP901-1 family	A0A2P0ZL04	Lactobacillus_phage	1.2e-62	62.8
QAR69661.1|1501339_1501705_-	hypothetical protein	D2IYX1	Enterococcus_phage	1.4e-18	40.3
QAR69662.1|1501701_1502064_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69663.1|1502065_1502368_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69664.1|1502367_1502715_-	hypothetical protein	A0A2P0ZL02	Lactobacillus_phage	2.7e-19	49.1
QAR70124.1|1502753_1502846_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69665.1|1502898_1503921_-	replication protein	O03966	Lactobacillus_phage	2.9e-98	53.6
QAR69666.1|1503941_1504547_-	DUF4355 domain-containing protein	A0A2H4J4U9	uncultured_Caudovirales_phage	6.1e-11	35.0
QAR69667.1|1504711_1504954_-	hypothetical protein	A6MA87	Lactococcus_virus	1.7e-25	66.2
QAR69668.1|1504966_1505923_-	hypothetical protein	D2IYW4	Enterococcus_phage	2.9e-55	38.6
QAR69669.1|1505915_1507487_-|portal	phage portal protein	D2IYW2	Enterococcus_phage	2.1e-135	50.5
QAR69670.1|1507489_1508773_-|terminase	PBSX family phage terminase large subunit	A0A097BYD0	Leuconostoc_phage	3.8e-143	60.4
QAR69671.1|1508772_1509261_-|terminase	terminase small subunit	A0A097BYC9	Leuconostoc_phage	4.4e-52	68.9
QAR69672.1|1509374_1510043_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69673.1|1510113_1510893_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69674.1|1510955_1511273_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69675.1|1511319_1511517_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69676.1|1511637_1512174_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69677.1|1512564_1513281_-	site-specific DNA-methyltransferase	A0A2P0ZL38	Lactobacillus_phage	4.5e-77	60.9
QAR69678.1|1513463_1513898_-	DUF722 domain-containing protein	E3W8E2	Leuconostoc_phage	1.0e-15	39.7
QAR69679.1|1513891_1514689_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69680.1|1514685_1515234_-	LemA family protein	A0A1X9IGG1	Lactococcus_phage	4.7e-34	45.6
QAR69681.1|1515470_1515899_-	RusA family crossover junction endodeoxyribonuclease	E3W8D5	Leuconostoc_phage	3.6e-50	67.4
QAR69682.1|1516084_1516765_-	hypothetical protein	E3W8D3	Leuconostoc_phage	4.4e-34	37.3
QAR69683.1|1516940_1518269_-	replicative DNA helicase	A0A097BYG3	Leuconostoc_phage	1.3e-143	62.5
QAR69684.1|1518271_1519375_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QAR69685.1|1519424_1520141_-	DUF669 domain-containing protein	E9LUU2	Lactobacillus_phage	9.4e-35	47.3
QAR69686.1|1520141_1520804_-	nucleotide-binding protein	O03911	Lactobacillus_phage	3.1e-72	61.4
QAR69687.1|1520800_1521772_-	DUF1351 domain-containing protein	U5U3Y3	Lactobacillus_phage	5.4e-17	27.0
QAR69688.1|1521952_1522153_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69689.1|1522209_1522419_-	XRE family transcriptional regulator	A0A0A8WJU5	Clostridium_phage	3.8e-05	47.4
QAR69690.1|1522559_1522784_+	DUF2188 domain-containing protein	E8ZD70	Streptococcus_phage	5.2e-16	58.1
QAR69691.1|1522780_1522972_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69692.1|1523162_1523444_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69693.1|1523493_1523787_-	XRE family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
QAR69694.1|1523859_1524267_+	XRE family transcriptional regulator	D6PSS9	Lactobacillus_phage	6.1e-15	39.0
QAR69695.1|1524263_1524683_+	ImmA/IrrE family metallo-endopeptidase	E3W8B8	Leuconostoc_phage	3.5e-29	46.6
QAR69696.1|1524728_1525223_+	hypothetical protein	V9QKI2	Oenococcus_phage	1.4e-08	39.0
QAR69697.1|1525319_1526225_+	Abi family protein	NA	NA	NA	NA
QAR69698.1|1526461_1527595_+|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
QAR69699.1|1527650_1529918_-	DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2	Q332B9	Clostridium_botulinum_C_phage	2.6e-22	25.7
1527710:1527725	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

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MKIIIVIIFLALIGYILEQRRHTKFLEKVNFNQETRHIMTAHEIFLLKHQIGTYVYSLETLGYSQDNINKGDYTKHEPSPEKLQALQEEFQMKERIYRSKNIQFETELELRGVE
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MAEIDTTALPEKNSVPDWLNTNDNGDVKGIDTLKLSEAIIRDSPVLGVPFNGSIRYYKYNGISWENLTEKSARAYIEREALEKLKRYHAYNVKRMQDVSKTTLIQTISEHNPFEDQRTDIIAFKNGTYEIETGSITPNKQTHYLVNGHDIEINKDGQAPNIEAWGGYLFGNSWQFIKELLGYAFIPEYKTFNTIAIIVDEMGGTGKSYFFDTIVFPLLGTKNIVAKDMDTIAGSNGKSARFGLIGLFEKLSNIHLDLPDTRIEVPDTLRSLSGGDRIDVEAKNADALSLKFYALLLFGANQTPNIAVNVALSQRIKIVPVTAPRARERPQEQAKRALLWDEKQAVKEVGAFAYSVLTAYQQAKQRGKFSTSDEIETATREWLERQDLVTTFLKDVTREDDNDLSGGATKEQTWKLFQIWLQENAINSKIQRKQFNDKMEQLGYISIKTRQHQSSEDTANPVWSWESLDLDPYFNE
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MALLEISGLSMAYAEKTLYEDAAFELQAGEHMGIVGQNGAGKSTLIKIITGQELPLSGKIEWQKGLKVGYLDQYAEIPEGMTLVDFLHTAYQDLYDKQDRITELYNEYAESLSDKLLERAGRMQEELDAAGFYDVDTKIERVISGLGLEAIGRTRALESMSGGQRAKVILAKLLLENDDVIILDEPTNYLDVAHIEWLEDFLQSFEGSAMIISHDFDFLDKVTNAIIDLSFGKITKFRGSFKKAMRQKDERAEQQLRQYEKQQGEIEKAQKFIAKNKARASTSKQAKSREKMLARMDRVDPPSEALQAKFNFPYVNSQSANALTVNELSVGYVTPVLEPVTFSMTSGQKVVFKGFNGAGKSTLIKSVLGVIPALGGEAEFSPSAVVNYFDQDLEWDNDQKTPLQEMQDRFPKLEPKALRTRLAAAGINAENAQKPMKQLSGGEQTKVKLAIMEMKPSNFLILDEPTNHLDEGTKNALRAAIDKFPGNVIIVSHETSFTKGLGDKELNVAALSYKEEAE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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QAR69930.1|1777234_1777492_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69931.1|1777926_1779354_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69932.1|1779340_1780159_-	DNA replication protein	NA	NA	NA	NA
QAR69933.1|1780161_1780344_-	hypothetical protein	A0A097BYL1	Leuconostoc_phage	1.5e-21	90.0
QAR69934.1|1780340_1780565_-	hypothetical protein	A0A097BYF2	Leuconostoc_phage	3.6e-17	68.7
QAR69935.1|1780567_1780888_-	MarR family transcriptional regulator	A0A097BYF1	Leuconostoc_phage	1.3e-47	99.0
QAR69936.1|1780884_1781202_-	hypothetical protein	A0A097BYJ5	Leuconostoc_phage	1.6e-34	68.6
QAR69937.1|1781218_1781455_-	MerR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
QAR69938.1|1781532_1781691_-	serine/threonine protein kinase	NA	NA	NA	NA
QAR69939.1|1781791_1782055_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69940.1|1782051_1782318_-	hypothetical protein	A0A097BYE6	Leuconostoc_phage	7.8e-27	81.2
QAR69941.1|1782574_1782946_+	XRE family transcriptional regulator	A0A097BYI9	Leuconostoc_phage	1.9e-34	65.9
QAR69942.1|1782946_1783378_+	hypothetical protein	A0A097BYJ1	Leuconostoc_phage	4.4e-64	81.8
QAR70129.1|1783733_1784255_+	hypothetical protein	A0A0F6N4L7	Staphylococcus_phage	1.1e-29	39.9
QAR69943.1|1784497_1784857_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69944.1|1784870_1785110_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69945.1|1785243_1785762_+	DUF4065 domain-containing protein	Q938J3	Temperate_phage	7.1e-24	36.8
QAR69946.1|1785764_1786667_+	hypothetical protein	Q938J2	Temperate_phage	4.4e-05	30.6
QAR69947.1|1788122_1788488_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69948.1|1788480_1788819_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QAR69949.1|1789507_1791064_-	ABC-F family ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L0W2	Tupanvirus	1.6e-42	26.4