Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP035107 | Ornithobacterium rhinotracheale strain FARPER-174b chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,RT,cas3,cas9,cas1,cas2 | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. CP035107
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
535560 : 617001
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP035107|535560:617001|DBSCAN-SWA TATGAGCAACCTAGAGGCAAGTTACAATTTTATTTTGAATAAACTAATAGAAATTTCAGGAACTGAAAATTTCTATTTTAAACCAGTGAAACCAAAATTATCTGATATAGAGTTGATAAGCTTAATTATTTTAGCAGAATTTAAATCTATCGATTCTGAGTACCAGCTTTTTAGAGAGATAAAAGGTTGGGCTATTGAATCTAAAATTGAAAGGAGTGTTTACAACAGAAGAAAACGAAAACTCTTCCCTTTTCTTGAAGAAATTAGGTGCAAAATGGTGAAAAAGTTCAATGATTTTGAAAACTATTTCTTGGTGGACAGCATGCCTTTAGAAGTGTGTAAATTATCCCGCTCTTCCAGAAGCAAAATCTGTAAAGAAAATAGCTTTTCAATGCCAAATAAAGGTTTTTGTGCTTCTCAAAATCTACACTTTTATGGTTACAAGCTACATGCGATCTGTTCTATTGCTGGTGTGTTCCAAAGTTTTGACTTATCTCCCGCCTCCGTTCACGACATTCATTATTTGAAAGACATAAAACTTCAAATTTCTGATTGCGTGTTACTTGGAGACAGGGGCTATCTTTCTCAAACGGTTCAGCTTGACTTGTTCAATGAGGTGAAAATCCAGTTAGAAACCCCTAAAAGAAAAAATCAAAAAGATTACAAACCTCAGTTCTATCCATTCAGAAAGTGTAGAAAACGTATAGAAACTTTATTCTCGCAGTTGTGTGACCAATTTATGATACGGCGTAATTATGCCAAATCTTTTGAAGGATTCAAAACAAGAATATTGGCAAAAATTACCTCCTTGACTACTATTCAATATCTCAATAAATTTGTCTTTCATAGTAACATTAACAATTTAAAAATTAATCTCATTCGATAATGCACTACGGGTTATATGTAGCATTTGTTGAAATAGTGTATTTTTGCACACATAGATAAAGTGAAATATGAGAATAGTAGTATGTAGCGTGATTTTAATCAGTTTTATCGCACAAAGTGCAAAAGCCCAAGTAGGAATCAATACCGAACAGCCCAAGGCCACTTTAGATGTTGTAGTAAAAGACCCAGATAACCCTGAAACTTCTGCAGGGGTATTGGTGCCAAGAGTAAGCAAAAATCCAGAATCAGGAAATGAAAAAGGACAACTTATTTTTAATACCACCAGCAACCAATTCTATTTTTGGGACGGCACAAAATGGGCTCCCATTGCATCTAATGCAGAAATAGCTACAGCAGGGACTTCCTATTTTGCAGATACAAAAAACAGTACGCCTATTAGCCTAGACCAAAACTCATCTGAGACTTTAGTCCCACAAACAGCAATTGAATTTAGCCTTGCCAAGGAGCAAGAAGTGCAATTCACCTCCACCGTTAATTTCAAAGGAAGAAGTTCTGCATTTGCACCACTGTTTAAATTAAAACTAACGAAAACCGATGCCAGTACGGAGGAGATAATCGATAAAGTGTCTAATACATTCTTATCTGATGGTATTTCTGATTATTATGGAAACCTGCAGCTTTTGTCTATTAAAAAGCTCCCAGCAGGAAGTTATAAAGCAGAAATAGTGGCATATTATAACAATTGTTGCGATTTCAACTTCATCTACGAAGTAGGTGGTGCAGAAACCCCCGTAAGTTTATTAATTCAATACAAATAGATGATGCTAAGATATTTGTTCATTATTTTGTTTGTCTTTAGTAGTATAATTAATGCTCAAACCAAAAATGAGGAACCTGAGTTTTATCAAATGATGAAATCTACTAATCCTAATGTGTATCAAGTAGATTCTCTATATGAAATTTATAGAACACAAACCTCAAATGAGTTTAGCCCAGAAGTACTAAGCCTTATAAAAGCTGAAAAGCAAAAGCATAAAGAGCCCCGCTCCAATTGGCTCTCAAACGCTAGGAAAGAAAGAGCCCCGATGAAAAAGGAATTCCGTAGCGAATATGAAAAAGAATACCTTGAATGGAGAAAAGAGGTACAGCCTTATATAAATGAAAAAGGCTTTGTAGAATACCCTACTGAGCACGAGATGAAAGCTAATTTTAGCATTCAGCCTAAGGCTAAAAAGCGCACGAGAAGAAGTCTTTTAACAAGTGCCTCTTCCATCTATGATAGCGAGGAAGTGCCCTATCATGCTACTTTTCAGGGGTGGCATTATTACGGCCCTGTGAAGATGCTTACCAATGATGGGAGGCCGCGTGTAACATCGCAAGCCAATGTGCGAGCCTTTGCACAGTCTCTTGCCAACCCAAACCACGCCGTATGTGCCGTAGAAAATGGAACCATCTATGTCTCTAAAAACAAGGGCGGTATGTGGCATTATGCTACAAAGAATTATAATATAAAAGGAGTAACGGCATTGTCTTTTTCTGCCTCTAATGAAAATGTAATTTTTGCGGGCGTTTCTGCTGGTAGGGGTGTCGGTAGATTGTATGTTTCTAGAGATGGGGGAGTAACTTGGAAAGACATAACATCTAATTTTAATGAATTGCCTAAATACAACAGCCCTGGAAATGCAATTTCCAAAATTATAAGCATTTCGGTGGACGATAATCCCATAAATGATATTGTGTTGCTGGCAACTAATAGAGGCGTTTTGAGATTGAGGCAAAGCTCTGAAGGAAATGATGTGTCTTATCAATTTGAGGTATTGTTAGGGAAAGGAATTACAGATGTAGTGATTCGCCCAAATCACAAAGATGAATTTTATGCATTGGCTTTTGATGATGCTAAAAATCATCTATATTTTTATAAATCTACAGATGGAGGAGCTACTTGGGAGATAAAAGGAACGGCAGGCAAAGGATGGTTTGAACCTGAAAAAAGAATGCTAAAAAGTTTTGGAGGAAGGCTGGCCACCTCTTTAAGCAATGATAATATAGTATATGCCTATCTAATTGAAAATAGAGAAACCTCAGACAACGGGTTTCTAGGCGTATACCGTAGCGATGACGCAGGAGAACACTGGCTTTTGCCCAACACAAATGGCCCTGGAAGAGGTGCCAATGGTTATAACTCTACAACCAATAAAAACCTGGCAACCTTTCCATTCCAGCCTTTGGGAAGTTATACACAAGGTTTTTACAACTGTGCTATCGTTGTGTCTCCTACCAATTCAAATCACATCGTGTTAGGCGGATTGAATGCTTGGGAATCCAAAGATGGAGGGCAAAGCTTTACCTCTTTCGGGGGCTACCAAGGTGCTCACCAGCTACACCCAGATATGCAAACCTTTTTTCAGCAAAAAAATGCAGATGGTACAGTAGATACTTGGCTCACAACCGATGGAGGAATTAACTACTCTACTGATTTTTTTGAAAATGAAAACATCGTAAAAACCAATGGACTTGGAGGAGATTACTGGGGATTTGATGTAGGAGAATACAATACCACCATGGGAGGAGGAATGTACCATAATGGAGACTCTTATCATGTTTCCTCTTATGGAACAGGCGTCTTTAAACACTTAGGAGGTGGCGAATCTTCTACAGGAACTGTACTTCCTCTAAATGACGAAAGACAAATGTATTTTGTGGATTTCGGAGGCGTAATTGTCTCTCCTAATTTAAATGAAGGATTTAAAACTACCACACCTCTAAATCCACCACCACCAGAACCCTACGCAGGAGGAGATAACCAATATTATACACAAAGAGATTATATCGGGAACACCTATTATTATGTGCAATCTAAAGAGGAAAAAGCAAAAGGCGAAGCAAAATTATACTATTTCAGTAGTAAGGAAAATAAAAGTCTTCTGTTAGAAGAATTACAATTCAGCCCTAATGCCTCTGTACAGCAATATGTAGTATCCTTCTCCAATCCGCTATACCAATACCTTATGGTAGATAATCTAATCTACGCTTCTAATGATGGAGGGAAAAACTGGACACCGAAAAACAAACCTTTTACAAGTGGAAGCATCACATTTACAATATCCGATACAGATCCCAAAACCATCTATGCATTACAACGATATAATACAAAAGAAAACATCATAAAAGTAAGCAAAGATGGCGGAGAAACCTATGCAGATTTACCCAATCCAGAAGTGGGCATTAATTATCGCCATATCTTAAATGTTAGAGGAACAGATATCATTTTCATATTTGGAAATAACAAATCCAAAGTATTTTACTACATAGACGGAAACTGGAAAGAATACAGCGAAGACCTCCCTTTTAATCTTTCTATTATTGAGCCTAAAATACAATACCGAACAGGAGAATTCTTTATGGCAACATCAGGTGCCGGAATTTGGACACGCAAACTCCCAAACGAAGTACTCGCCAAAATGAATATCCTAAAACTAAATATAGACGCTCCTGAAAAATTCAGTTACAACAAAGAATATATATTTAATGTTACCAACACCTCTCTCTACTACGGGAAAAACATTACCAATATAACTTGGGATTTTCCAGGATCCTCAGAAGTAACCGATGGAAACACCAACACCCCAAAAGTAAAATATAATAAATACGGAAGATTTGGAGTGCGTCTCACGCTACAAGATGATAAAGGTAATAGTTACACACATTATTTCCCAGATTATCTTACGGTATACCCATATTGTGCTTGTGATGTGCCAGATGCCATAAAAAATATCCTACCACATATCAAAGTATGGGCAGATGCCTCCAAAACCAATCTGTCCAAAAAAACACTTACCGATAGATTTACAGGCAAAGTTTATACTCTAGCAGGAGATGCCATCACGCTAAAACAAGTAGGAGATAACAAAGTTTTAAACTTTGGAGAACAAAACAACTATATCGATTTAGGAAAAAACTATGAAGGGAAAACACTATTTATCATATCCAAACTAAATGAAAATACCACTAGCGGAATAAGCATGCTATTTGGGCATGATGGAGGAGCAGATTTTCATGGTGGCGGAAAAAAAGGGCCCATCTTTAGCCAACGGTATATGACAGATAAAAACAAATTTGATGAAAGCAACGGAGGAAGAACAATGATTAACAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP035107|535560:617001|557627_558296_+|QAR30323.1|DBSCAN-SWA MIKARNIYKYHGDLQVLKGVDLEVATAEVVSIVGASGAGKTTLLQILGSLDKASETEKNQTSILLDGVEISGMNDKAISKFRNENIGFIFQFHQLLPEFSALENVCMPAMIAGKSLKEATPRALELLSFFGLKDRATHKPQQLSGGEQQRVAVARALMNQPKVIFADEPSGNLDSKNAEELHQLFFDLRDEFGQTFVIVTHNKDLAEMADRKIVMKDGNLVC >CP035107|535560:617001|615155_616052_-|QAR30359.1|transposase|DBSCAN-SWA MINYHKITDIFCIVDDFCNDFEKFTQPFLLGKPPKKKPKMSNAEVITIMILFHLSGFRTFKHFYIYYVQKHMQQEFPQTVSYNRFTELMQSNIMALTMFAKTCALGSCTGISFVDSTPIRVCGNKRIKRNKVFKDLATTGKSTMGWFHGFKLHLVINDKGEILSFCVTQANVDDREPLKNEGFLKQIFGKLFGDKGYISEKLNQLLFVDGIQLITNIRNNMKNSLMTMSDKILLRKRSIIETVNDELKNICQIEHSRHRSIGNFMTNLVAGIIAYHFLPKKPSLKYETLKTNQLAMFY >CP035107|535560:617001|537226_541447_+|QAR31785.1|DBSCAN-SWA 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>CP035107|535560:617001|551786_552215_-|QAR30316.1|DBSCAN-SWA MRRVLFIPAETTYLLRNEILRPGLPIESVHFNGDLVAGTFHLGVFVDGTLACVGSFMLSEFNGMPAYQLRGMATHEKFQQQGLGRLLLEKAEKIVFANDIKSIWCNAREIAVPFYTKLGYHTHGDFFMIEGVGNHVVMAKDL >CP035107|535560:617001|588041_588824_+|QAR30337.1|DBSCAN-SWA MLNTLAKKILNLVPRPWLIRMSYLARPVLSVLYKGTKFQDPIDGKKYRKLLPYGYHTTRENALAPGSLSLERHRLMWLYLQHETNFFKQKNLKVLHIAPEQCFYSRFKKQKNLEYTTLDLESPIADIKADICNMPLPDNHFDVVFCNHVLEHIPEDSKAMQELHRVMKAGGWGIFQVPIKPDLATTYEDFSITTPEERQKHFGQYDHVRWYGADYFDRLKKAGFKIINQEFVLKFTPDEIKYFALAPQEPLPVVYKPARD >CP035107|535560:617001|602051_602282_+|QAR30345.1|DBSCAN-SWA MVIITLQRDKCIGCNYCAEFAPEFFRMSKKDGKSVLLKSKDKKGFHTFKTPIPDAFEPCEKAAKACPVNIIDVKTT >CP035107|535560:617001|574499_576125_-|QAR30331.1|DBSCAN-SWA 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57 | Staphylococcus_phage(11.11%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
891520 : 967040
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP035107|891520:967040|DBSCAN-SWA 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60 | Flavobacterium_phage(22.22%) | tail,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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