Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP034097 | Acinetobacter baumannii strain A52 plasmid pA52-OXA-72, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP034096 | Acinetobacter baumannii strain A52 plasmid pA52-4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP034095 | Acinetobacter baumannii strain A52 plasmid pA52-3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP034093 | Acinetobacter baumannii strain A52 plasmid pA52-1, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 3 | 0 |
CP034092 | Acinetobacter baumannii strain A52 chromosome, complete genome | 2 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,csa3,RT | 0 | 1 | 5 | 0 |
CP034094 | Acinetobacter baumannii strain A52 plasmid pA52-2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP034092_1 | 664196-664280 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP034092_1
|
1 spacers
spacers of CP034092_1
>1.1|664220|37|CP034092|CRISPRCasFinder AGTGAAACTGCGCGTAGAGTAAAGAAGATTGATAATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP034092_1
The CRISPR arrays of CP034092_1 >merge|CP034092|1|664196-664280|CRISPRCasFinder TTTTAACTTTGGCGCAAGACAAGCAGTGAAACTGCGCGTAGAGTAAAGAAGATTGATAATCTTTTAATTTTGGCGCAAGACAAGC >CP034092|1|1|664196-664280|CRISPRCasFinder TTTTAACTTTGGCGCAAGACAAGC AGTGAAACTGCGCGTAGAGTAAAGAAGATTGATAATC TTTTAATTTTGGCGCAAGACAAGC
>CP034092.1|QAB39415.1|663821_664190_+|DUF454-domain-containing-protein MRTLFWRTLVVIFITLGIIGAILPGMPTTVFLILAAWAASKGWPQMDAWLLNHPKYGPTLRDWRANGTVPRKAKWIATIMMTASGILMLFTSAPFWVKVFTDTTMLVVAIWLWLRPEPKLKD >CP034092.1|QAB39414.1|662808_663717_-|DUF1853-family-protein MNIASIKTSYFEPWLQFSHPMVRQLAFTIASPNLLSQLPCSLTIRHSFQLHTDKNWEQHFQNYLPRLKQLDEAPEPLLQFMSRLKSTRLGLRFENLLWFWLQEDQYHPYQLLGHSIQKIDGAKTLGELDFLVLNQNTQEIEHWEVALKYYLGEGQLNLEQWSGLNRQDTLSKKLYHFTDKQFQFSEALGFKVQQRFAVLKGQLYLPLNLPQEQPIPEWVNLKRRLGTWGTEIPKSDFYRLERHEWLCPHQKASSNTAYWWTDGLYCQNINETRFYMFRHPALLSLKPSLIKNNGVLQETTSL >CP034092.1|QAB39413.1|662566_662710_-|entericidin-A/B-family-lipoprotein MMKKVLVASVMVAFVLTGCNTFKGFGQDVSKAGDAVTNTAQKTENKM >CP034092.1|QAB39412.1|661304_662441_-|succinyl-diaminopimelate-desuccinylase MNHSDTLSLSLELLQQPSVTPIDHTCQTIMADRLAKVGFHIEPMRFGDVDNLWARRGTEGPVFCFAGHTDVVPTGRLDAWNSDPFAPEIRDGKLYGRGSADMKTALAAMVVASERFVAKHPNHKGSIAFLITSDEEGPAVNGTVKVIETLEKRNEKITWCLVGEPSSTHKLGDIVKNGRRGSLNAVLKVQGKQGHVAYPHLARNPIHEASPALAELCQTVWDNGNEYFPATSFQISNIHAGTGATNVIPGALEVTFNFRYSTEVTAEQLKQRVHEILDKHGLQYEIVWNLSGLPFLTPVGELVNAAQTAILNVTGTETELSTSGGTSDGRFIAPTGAQVLELGVLNATIHQINEHVDVHDLDPLTDIYEQILENLLAQ >CP034092.1|QAB39411.1|660804_661269_+|hypothetical-protein MKGSVNTSLIANMDQQELQHLITVSTGFIDAYIIECNDQVPMLLPQNIVLSAMDVKNGVKHIEWHDVKLPVYSVHNAIDQHAVALVIEGEDISQRFALICKTMPVSTRLRISEIVDEMDEHEAEQHPAVFKYVRMQHQRYYIPNLEYIEKTLGL >CP034092.1|QAB39410.1|656748_657957_-|IS256-like-element-ISAba26-family-transposase MDEATIKSMAAELAKGLKTPEDLNQMTAVFKKFMIETALNTELSDHLGYEKHQPKKGSNSRNGFSSKTITTQDGQLALDIPRDREGSFEPQIIKKHQTRITSMDDQILSLYAKGMTNREIVAFFKEMYDADVSASLISKVTDAVIEQVTEWQNRALDSLYPVVYLDCIVVKVRQHSNVINKSVYLALGINMDGQKELLGMWIAQTEGAKFWLSVMTELKNRGVQDILVACVDGLKGFPDAIASVYPHTDIQLCIVHVVRNSLRFVSWKDYKAVTSGLKAIYQASTEENALKSLDIFCDQWNHQYPKIGESWRANWENIRTIFSYPAEIRHAIYTTNAIESLNSVIRHSTKKRKIFSSDDSVKKVIYLATSNAAKKWTMPIQNWRLAMNWFTIQFDDRLKDHL >CP034092.1|QAB39409.1|652763_653300_+|purine-binding-chemotaxis-protein-CheW MAANGFIELLRLSKRGNKNYASVQNEAQRWSGIAFEMRGQYFVAPLGEVSEVIYPPKYTPVPNTQSWVKGLANIRGRLLSVSDLAHFISGQRSSFSSTQKVLCISHHDQYVGLVVDQVLGIQHFNKKSFFSQSSDLEENLKEYCQGYFHQHNQHWHVFLFSRLLQNPHYMNASTKFIN >CP034092.1|QAB39408.1|652340_652703_+|response-regulator MARILIVDDSPTETFRFKEILTKHGYDVLEASNGADGVTLAKAEQPDLVLMDVVMPGVNGFQATRQITRDEDTKHIPVVIVSTKDQATDRVWGKRQGAIDYLIKPIEEKQLIDVIKQFLN >CP034092.1|QAB39407.1|651933_652317_+|response-regulator MEDAFQNLKVMVIDDSKTIRRTAETLLQREGCEVITAVDGFEALSKIAEANPDIVFVDIMMPRLDGYQTCALIKNSQNYQNIPVIMLSSKDGLFDQAKGRVVGSDEYLTKPFSKDELLNAIRNHVSS >CP034092.1|QAB42217.1|651012_651612_-|hypothetical-protein MSVSIGIASCGALFFSSPTLAANAAPKAVWYRYYDQHGIANISTSVTPAHIRYGYEALDQNMQVIKRNHPYNSEADLNQSSQRALSARYREEDNKLKRAYSNSKTATIKRDQALLAIKKQINYQQDQLSQLQQDKILFKRQEMEYFRKGEQVPERHKTLIENNLMNINKVKQTLEILSKTYNRTNKDYENIIERLKKLE >CP034092.1|QAB39416.1|664340_664844_+|L,D-transpeptidase MSQFKLEDADILIDLANQTLSLPKHNKFYVVSTGKNGIGEQENTGKTPRGWHRVAKKFGMQSPKNAVFIARQPTGEVYSSELAAQFPERDWILSRILWLDGLEEGFNKGEGHDTMQRYIYIHGTPDKEPMGVPMSHGCIRMRNEEIIELFDLVSEDALVYLSEQSLT >CP034092.1|QAB39417.1|665920_666706_-|YdcF-family-protein MQVSKWIRIFLAVIGSILFLDGLFLAFLNKIHVGTLVPLVLGAFFCLYALFYYHLERFFFYHYRLHTLWRFGWLCFWIWLIGLGYFFNFIKENKDASQNLPAVKAIIVLGSGVENGQPSAILAKRLDTAAPVALSQPQAKVILTGGLDFSEKEPEALVMSRYLEQHFHIAKDRMILEDKSTSTELNLKNSKPLLEQAHISINQPIAIVTSDFHTPRAAAIAKKQGYTQVYMVAAETPLITRYNVWLREYFAYASGWLLNEY >CP034092.1|QAB39418.1|666832_669379_-|hypothetical-protein MFKKFLFQIHWFLGISAGLILSIMGVTGAIYSYDQQILKWVNTDSYVVQAQSSPKLTPAQLYQHFTTIQPEIKINSITIAKDPTASSVVNIEKEGERRGYNMMVNPYTAQVLPEVQGRKLLLLIQQIHRNLTAGEFGKQITGACALMLIYFVLSGLYLRWPKKHSARQWLAVKPKLKGRNFIWDLHAVVGTWVIVFYLLFACTGLYWSYDWWRSGMFKVLGIEQPKMQGHSGSGRNKDQLPKIQLDNAQLITALNQTWSGFNNQIGRDYSTLTVNLPKKDDGKIELSFVDATPQHERARNQAVYNYKTANIEKMELYEDKKLNQKIMSSMLPVHRGSFFGPVYQFVAMLASLAMPLFFVTGWMLYLKRRKQKKLTQAARQSLAGHYIDQNAKPWLITYATQTGVAEQLAWSTATSLQEAHQPVQVKSVQQLTEADLQQHEQILFVISTYGTGEAPDLASNFAKKLLKTNLELQHVKYAVLALGSKEYPDTYCSFGYTVDEWLKNNGAKALFDIIEVDNANPADIQNWNQALVKATKLDLHAVNIEKVFDNWTLQQRDLLNPNSLGQPAYNIELTASHEAVWQAGDIAEIQPGNSPERINKFLQHHHILKNAVVDSLQVSIEKALWNKDLTGEIEPFANLDHLLEQLPTLPTREYSIASIPSQQVLRLVVRQQYDESGDLGLGSGWLTQHTEINQNVALRIRTNESFHLIDDNRPIICIGNGTGIAGLMSLLHTRTRHNYTENWLIFGERQRAHDFFYASTIEAWQTMGMLKRLDLAFSRDQEQRVYVQDIIRQNAAELVNWIERGAVLYVCGSIDGMASGVDQALIHILGEEQVDELRQQGRYRRDVY >CP034092.1|QAB39419.1|669536_670112_-|hypothetical-protein MTAKTLYAYTLQPVPYEVSEAEQRNAQLLIWRSTNKISTKIWAIMGVILALAILGLIFIKNYSTVICWVAIVCVVLYYLGRKYGLEWYVKRKMNEFPVQEIKGIRLGVQPHGIVMRQQMGLQEGVGTIGWKNIYEWYNTPDFILVNFKVKDPKGQEQQGAYILPKRMDSKNFSFNTIRKHLKESVGEPKTL >CP034092.1|QAB39420.1|670212_672387_-|TIGR01666-family-membrane-protein MKSWFKRLKRATYNTSFMYNVRMLIAFSGTAFVPYFLGHQLATIPLTLGVVAAGLSDIDDRFSVRIMNLIYTYIGFFITAASVQLLFPYPMLFALGLIASCIGWILLGSLGRRYATISYGCLVVSVYTMLGVHLFDQWYIQPALLVAGAAWYGLIATISFLLFPVRQLQDKLAASYASLGDFLFAKSNLFDVDMTPASYQQSMIDLSLENGKLITIFNDLKTALLTRLKGDRGQKGTRRSLHYYFVAQDIHERADSAHIDYQKLAKIFQHSDILFRFQRILAIQGKACQELNECILQRKPYIHNKRFKQSFENLRLSLVKLRDDQQYDLLWVNALFALYRNLKSIDSQLLNLETEQHIQSDKVKQAENQLKDDDLKGWNDIVVRIKQNLTPESVLFRHAIRVSIVLFIGYVFIQMTHIEYGYWIMLTALFVSQPNFNATKRRLRLRIVGTLVGIIVGLSIVFLVPSVEGQLVMLILSGVLFFELRSKQYAQATAFITILALINFNLDGSAVAAAIPRFVDTLIGCALAWFGVTFIWPDWKFRRLPRSIRRSLQAQCNYLAEVVKQYHEGHNHALNYRIVRRAAHNTDAEVASLISTLATEPDFDPTRKSDIFEFLCLNHTFLSYIAALGAHREKIQDQAVLNVLDQALDDIQGALLRDEMPDLTAQNMLQTIRQRLSQNDEDDQKSLIILQQLSLMLSVLNRFSMLKQRLSHDLDNDASELASL >CP034092.1|QAB39421.1|672514_673729_+|Bcr/CflA-family-efflux-MFS-transporter MSEQTAQRQYSIGWIMLLALLTALGPLSIDMYLPALPQMAHDFGVSTQMVANTLPAYFFGLAIGQLVYGPLSDRIGRKKPLYFGLALYAVASLFCVLATNEWSLIAARILQALGGCVGVVMARAAIRDRLDVQGSAQAFSSMMIVMGLAPILAPMIGAWILIWFPWQAIFIALLIVGAICWLCVHFFFKETLAVDKRLKLSLYQVATLYGAIFKDASFRLPMFAGCLTGAALFCYISSAPAVFMDQYGLNQQEFAYVFGLNAFGIMLMSSLNKHLTTRVEITKRLKAGSMVQVTGASIVLIAGLISAAPLWLVMLGLFLAISGIGLTGPNAMALAMSKQGARAGTASAIMGSMQFACGLLGGVLLNFLIWSASLNMGVMMVLFTLSGFIVVLKAIRQAKSQSLS >CP034092.1|QAB39422.1|673756_674461_-|nitroreductase MNLEQVRLVDEAITSRHSVRAFLSTPIEPEVIKDILRVASRAPSGTNTQPWKVYVVTGHKRDEMVERVCAAQIEVSKNPELAEQYKETFAYYPEKWVSPFIDRRRENGWGLYGLLDIKKGEKEKMAAQQLRNFKLFDAPVGIFFTVNKAMGIGSKMDIAMMIQNVMVAAKARGLDTCPQAAWNHFHPLVLDILGAADDEELVCAIALGHADPEHIVNTFITPREPVENFAVFLD >CP034092.1|QAB39423.1|674971_675175_+|hypothetical-protein MSLPLINKQFMKQGLAITIATMKMNVTHATTEPQEIQQLGTDLNALFFNEKEKGTDSRVMTMACYSL >CP034092.1|QAB42218.1|675357_675498_+|hypothetical-protein MFSGAMNLFYLKGAFSHVTFKGLVLGMMLLKLVTVIAIQVTLKVFP >CP034092.1|QAB39424.1|675597_677073_+|alanine:cation-symporter-family-protein MNEQLNATLMSWVQFFNEPLWDFLVIFLLAVGIFYTVLTGAVQIRMFLQSIRVMKSSRTEGEDEHGLTPFQAFVTGLASRVGVGNIAGVAIAIAIGGPGAVFWMWVTAVLGMSSAFIESTLAQLFKVRDSNSKQFRGGPAYYITQGLRSKTFGVIFALALIFTYGFVFNSVQINAIANASSHAWGWDKANLIAHLGGVDLEISWVGLALVVMVALAIFGGIKRIAKFAEMFVPLKAGLYLSVALYIALSNYAILPDVLKLIVTEAFHFNAAAGGFFGAAVSMAMMQGIKRGLFSNEAGMGSAPNAAAASDVKHPVNQGLVQMLGVFVDTFIVCTSTAIIILVSGVYQDAGFVGVELTQRALETQVGHWGADFLAVLLFLFCYSAVLGNYAYAESNVQFINNNPKVMFIFRIFVLVMVYFGAIGSVPLVWSMADLFMGIMATINLVAILLLTPMARTLLKDYRAQLKQGIKEPVFKINKYPELKKKVDSDIW |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP034092_2 | 1941979-1942060 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP034092_2
|
1 spacers
spacers of CP034092_2
>2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder TTCCACTCGAGCACAGCTCTCGTCTTGCGCTCGGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP034092_2
The CRISPR arrays of CP034092_2 >merge|CP034092|2|1941979-1942060|CRISPRCasFinder AAAGCGTTGCTTTACTTATCCTCTTCCACTCGAGCACAGCTCTCGTCTTGCGCTCGGGTAAAGCGTTGCTTTACTTATCCTC >CP034092|2|2|1941979-1942060|CRISPRCasFinder AAAGCGTTGCTTTACTTATCCTC TTCCACTCGAGCACAGCTCTCGTCTTGCGCTCGGGT AAAGCGTTGCTTTACTTATCCTC
>CP034092.1|QAB40533.1|1941085_1941877_-|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MLLLVVEGIVIGFLLGLTGAGGGILAVPALMTSQGWSVAQAAPIGLLAVALSTLIGTIEGLFKKIVRYRAAIWIALIGAPMAHIGILIANTISPIWLMLMFSLVMFTVGYRLISNRVSDFHNPPCQVNPSTGRFIWNFKTGSVLASIGIIAGLLTGMLGVGGGFVIVPALRKVTNLDMHSIVATSLMIIFLISGMSIVMHIAEGFHYPVAITSAFALACAFGMLLGRRAIRFIPSAIVQRVFALMVFAVAIYMVIKIVNLTNI >CP034092.1|QAB40532.1|1939971_1940976_-|homoserine-dehydrogenase MKRINVAICGFGRIGQQIAELLLNRSTYYKQKYQIDARLVGVCNSSSGLIDQEGLQASKWLDKTQYQAGLTEQKFLEQVQADVIIETGPSDYVTGGKGLFYLNYALTHNMNAIAVSKGALVVEGKKIISLAHQHNKKLFFSGATAAALPTVDLFEYNLAGCQILEIEGVFTGTTNFILNDMLQHECAFADSLEKAQAKGIAEPNSSFDVDGWDTAAKITILANTVLGADVKIQDIPRQGISHVTADHIRDWKKENVIPRLVGFIHVKNQQIQTGVELRLVPANHPFAHLQGSNKCIRVLTQEMGEFVVSGGASAPLATAAAALKDFELMLKTGC >CP034092.1|QAB40531.1|1939021_1939939_+|EamA-family-transporter MNILLYVAVVLIWGTTWIGIAVQSHYATPVVAILWRFAISALLLWVVLLFLGKLQRIALKDHLFCMLQGLCVFGLNFICFYTAVKYVNSGLESVIFSMAVFFNAINALIFFKQKPSPNFAPAALLGLSGIVLLFWHDLINSQFNAQLLMGIGLCAIGTYGFSLGNMISVRHQKRGLNIFSTNCYAMTYGALVMLILALFTGQDLMPPMNFPFLSSVLYLAVFGTVIGFSAYFSLVGRIGAAKAAYSTLLFPLVALTVSTFFEGYEWTLNAVFGILLILLGNYLMFSKFEIGKKLFSNQKNCEKQA >CP034092.1|QAB40530.1|1938000_1938855_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MAYQTLEQLQQSKAKLHETVVLDENMQLAFWSNQQDRVSVCSDHHTLSLYIQDGYESYQKTPAGWKNGGGPGRFCLLPEHQESTWDIRGGLKFVHLYYTDQHLRDVAEKIWDKEPNQIELNEVVFNDDERIRALYQFFLLDCDWQDSSNHLQMSTTASLLLNHLIRKYSSVQWQQPTIKGGLAPHKLKYIQEWIEDHLDQALTLSDLANVVNLSEYHFAHMFKQSMNMAPHQYVMQRRLTKAKGLIQSSQLSLQDIALVCGFSSASHLSHRFKQFYGMSPSQLR >CP034092.1|QAB40529.1|1937608_1938004_+|transcriptional-regulator MTVTIPHDIQSSDCQRVSQVLARVGEKWSILIVMTLASHPHRFSEIKRRINGISQRMLTLCLRGLERDGLVKRTVYPVVPPHVEYELTPLGHSLTEPVIALGQWAQQHIADIDAARAAFDAAQEKPITLDT >CP034092.1|QAB40528.1|1936904_1937513_-|FMN-dependent-NADH-azoreductase MKLLQIDTSILGEQSVSRQLTSSVIRQLSTAYPDAEIIHHDFALEPIPHLSDAEFLAWQGVEPNNEAAQQRVARNTQYLDEFLSSDIVVIGAPMYNFSFPSQLKAWLDRLSVAGKTFRYTENGPQGLVEGKRVIIASSRGGVYSEGSPAEALDYQETYIKAFFNFIGVTDITFVRAEGIAFGPEARQAALDNAAAQIAQLAG >CP034092.1|QAB40527.1|1935471_1936821_+|chromate-efflux-transporter MQQKQLNTPDDSVEQVTFWQAFLFWLKLGFISFGGPAGQIAVMHQELVEQKRWISEKRFLHALNYCMLLPGPEAQQLATYIGWLMHRTVGGLVAGILFVLPSLFILIGLSWVYIKFGDVPVIAGIFYGIKPAVTAIVFHATYRIGSRSLKNKFLWVVAIAAFFAIFVLKLPFPLIVLSAGIAGYLASKKYPELFSSAGGHKASQKDYGPAYIDDDTPTPEHAKFHWSRLARLIFVAIALWLLPILALGAYFGWHHSYTQMAWFFTKAALLTFGGAYAVLPYVYQGAVNHFGWLSPTQMIDGLALGETTPGPLIMVVAFVGFLGGVNHSLLGSEHLFFAGALGAVIVTWFTFLFSFVFIFAGAPIIESTHNEIKFTAPLTAITAAVVGVILNLALFFSYHVLWPQGFSGHFDIVAALITVAAFIALFRFNINVLYVIFASALVGLAVTFF >CP034092.1|QAB40526.1|1934486_1935230_-|GntR-family-transcriptional-regulator MSQLPQDPKNHKPLYDQLRELILNKIVNGEYAVLSQIPSENEFAEQFGVSRITVRQALNQLQLEGYIFKVPGKGTFVSKPKTFQNISSLQGFAEAMSSAGHEILNRVISAELKQIPMHVVPKLKLPVKANVYEIQRVRLLNRQPVSYELTYLPEHIGLKLKEKAIDLRTTDIFKALEQECDIPLGHADLSIDATVADEELAALLQVEIGTPVLRVERLTHDANGQPIDYEYLYFSGDTFQYRLRIHR >CP034092.1|QAB40525.1|1932724_1934458_-|fumarate-reductase/succinate-dehydrogenase-flavoprotein-subunit MENKYLEFDIVVIGGGTAGPMAAIKAKQENPNLKVLLIEKANVKRSGAISMGMDGLNNAVIPGYATPEQYTKEITIANEGVVNQTTVYAYAKHSFTTIQQLDQWGIKFEKDETGEFAVKKVHHMGAYVLPMPEGHDVKKVLYRQLKRAQVKINNRIVTTKLLKNEQGAINGVLGFDCRSGDFYVIKTKAAILCCGAAGRLGLPASGYLMGTYENPTNAGDGYAMAYHAGAELANLECFQINPLIKDYNGPACAYVTGPLGGYTANSKGERFIECDYWSGQMMWEFYQELESGNGPVYLKVDHLAEETIQTIEEILHTNERPSRGRFHEGRGTNYRQDMVEMHISEIGFCSGHSASGVWVNEKAETSVKGLYSAGDMAAVPHNYMLGAFTYGWFAGVNAAQYVNAVEDSELNQSEIEAEKARIFAPLNCSEGLPPEQVEYKLRRFVNDYLQPPKTRQKMEIGLKRFEEIKQDIKRISARNPHELMRAAEVSFIRDCAEMAARASLFREESRWGLYHYRADFPQKNNSDWFCHAHLKKDEHGNMVSFKKPIEPYVVPINQDEAVSYDHLRIQKDVALAD >CP034092.1|QAB40524.1|1932458_1932704_-|ferredoxin-family-protein MAFIFKEVQHRTVAPVIIDEDKCIADKGCTVCVDVCPMDLLAIDPTTQKAYMQFDECWYCMPCEKDCPTNAVKVNIPYLLK >CP034092.1|QAB40535.1|1943717_1944413_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MFFKQFFEKESSTYTYMLGCEETRGAVLIDPVASDIEIYAKELEQHQFTLIYTLDTHVHADHITAADLLRERFHCKSVLHRNSEVSCGDILITDGCMLKVGNLSIEARYTPGHTNACTSYLVGNMIFTGDALLIDGCGRTDFQQGNAGTLYDSIHKQLFSLPDNTILYPGHDYKGRLSSTIGYERLNNSRLGQNRSREDFIELMNNLNLPYPKQIDKALPANQACGSISQL >CP034092.1|QAB40536.1|1944605_1945877_+|sigma-54-dependent-Fis-family-transcriptional-regulator MAKLNFELEQDFYILFEQLKALFPNASLFLADTTTQAIHYKFNTDDISVENIAALTQDHHNQYLEINTPKMRKRFIYQEHDIYIAEHRIIGKLHILQPVSIENDIVDEVELTEQLQDLAKVFNSCSPEMTRMFSIIQRVAITEFPVLVRGESGSGKELVAKAIHDYSQRKNKIFVAINCAALNSNILESELFGHVKGAFTGAIRDHKGVFERAAGGTLFLDEIAEIPLELQAKLLRVLETGEFTPVGGEKPIQANVRIITATHKALREEAKAGRFRHDLLYRLRVIPIFIPPLRERKVDIPLIVDQILKESTTQLDTMPRHVNQKAMQVLLNYDWPGNVRELKNTLLYALTMANGKDEIEVEDLPNELLDADEYVKLPENNAELTPENVQAALEKYNHNLNMVANIFGISRTTLWRYRQKHKL >CP034092.1|QAB40537.1|1945946_1946858_+|bestrophin MIVRDKSNVFKLLFAWKGTILPKVLPALSFVVLISACVVWLSYYHWIQIPTVPAIGFTIFGVILSICTGFRNNACYDRWWEGRKLWGALIANARHIVRDSHVLSNEKREHLIHQVLIFSNLLRDRLRQQTVEPTKFLEHAYLNNSSLNYLNEHINAPQFVLENIQKDLVKALKDGEISDIIYSTLNRHIIELGNIQAGCDRIAGTPLPYSYSVLLHRAVYCFCFILPFSLEAALGIWTPLIVGLIAYMFLGLDALSAQIEEPFGLQENDLPLDSIVRLIERESLSSLGQPLPPIIEAQNNNLL >CP034092.1|QAB40538.1|1946905_1947964_-|2,3-butanediol-dehydrogenase MKAARFYDRGDIRIEDIPEPEVTPGTVGIKVAWCGICGTDLHEFMEGPIFIPPCGHPHPISGESAPITMGHEFSGVVYAVGEGVDDIEIGQHVVVEPYIVADDVPTGPGDNYHLSKNMNFIGLGGRGGGLSEKIAVKRRWVHPISNKIPLDQAALIEPLSVGHHAFVRSGAKAGDIALVGGAGPIGLLLSAILKAKGLKVIITELSAKRKEKAKESGVADYILDPSEVDVVSEVMKITNGDGVDVAFECSSVNKVLDTLVAAVKPTGVIVIVSIWSHPASINVHSVVMKELDVRGTIAYVNDHQETIKLVEEGKINLEPFITQRIQLDDLISQGFETLIHNNESAVKIIVHP >CP034092.1|QAB40539.1|1947993_1948779_-|acetoin-reductase 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MSEIKTLEIPKWGLSMEEGTIAQWLIKEGDSFNKGDEICEIETTKIVNVLEAPFAGTLRKILAKDGDTLPVGGLIAVCADSEVSDAEIEKFIASLGGSAAQAPEAPSEQSKAETSAPVAEKTEQPQTVAASASAPAKVAKEDYAVPESLQGYQTSNELFATPHALKLAEKHNVNLAKVTGSGREGRISVQDIQKAVQAAGGQWPDVKQQTQAKVVKSTADDSQVLATPVARRLAKQWGINLNDCRVSGTRGRVCKEDVEAVYYRNNPTSVNEQPVQCAAQPQSTVTTVAMNGMRKAIASRLQAAKRNAPHFRLVVDLNVEALQKLRKQINETVPQVKLSINDMLIKAAAAALIKVPEVNVQFDEATQSILQFSQADISVAVAIPNGLITPIVKAANQKSLAQISDDMRDLATRAKTGKLQPDEFQGGSFSISNLGMLGIKQFDAIINPPQGAIMALGASESRAVVENGNVVVREIVTATLSCDHRVIDGAVGAKFLASFKQFVENPALILV >CP034092.1|QAB40542.1|1951756_1952776_-|alpha-ketoacid-dehydrogenase-subunit-beta MPNKSFRNAIKEAIESEMRRDPTVFVVGEDVRGGHGGKNTEENQLEGFGGVLGVTKGLWTEFGSERVIDTPITESAIIGMAAGAAATGLRPVADLMFMDFYGVCHDMLYNQAAKFRYMFGGKAKAPMVVRGMIGAGFSAAAQHSQSPYNVFAAVPGLKVVVPSSPYDVKGLLIQAIRDDDPVVFCEHKMLYDIKGEVPDDAYTIPFGVANYTREGTDVTIIALGLMVHRANEVADKLAKDGISVEVVDPRTISPLDEEGILESVASTGRVVIVDESAARCGFGHDVAALIAQKGFHYLKAPVELVTPPHTPVPFSPVLEKEWIPSVERIEQAVRKTLEA >CP034092.1|QAB40543.1|1952789_1953752_-|thiamine-pyrophosphate-dependent-dehydrogenase-E1-component-subunit-alpha MQLTEEQLLAAYKRMRDIREFEDRLHEENTNGDIPGFIHLYSGEEAVAVGICENLTDKDYITSTHRGHGHCIAKGCDIHAMMLEIFGKDDGLCRGKGGSMHIADLDKGMLGANGIVGGGPPLAIGAALTAKTLKTGGVGLSFTGDGGSNQGLTFEAMNMAVVLKLPVIFVFENNGFGEGTGHDYAVGSKDIAGRAAGFGLPAVKVDGTDFFAVYEAAQTAIERARRGEGPSVIETITNRFYGHFEGDPGLIRSKEEVEFIKENKDPLKIFREKVKGKIDEAKLDEIDAASKANVDDAVAKARAAAYPKPEQLLTDVYVSY >CP034092.1|QAB40544.1|1954116_1955103_+|lipoyl-synthase MDLKRQIETGIKLRGIDKVSRIPIKILPTEELPKKPEWIRAKITDFEEIQRIKNLLRQQKLHSVCEEAACPNLPECFGGGTATFMIMGDICTRRCPFCDVAHGRPMPLDENEPKHLAETVANLNLKYVVITSVDRDDLHDGGAAHFVKCIEEIRNRCPDTLIEILVPDFRGRLETALSTLSLSPPDVFNHNIETVPRLYKAMRPGSDYQHSLNLLKRFKKYCPDIKTKCGLMVGLGEIEAEVIALLNDLKDHDVDLVTIGQYLQPSKSHAPIHRFVNLQEFERYTQHGQRLGFKNIWSAPMVRSSYFADRQYFGESAPKPFSREDVLS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP034092_2 | 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder | 1942002-1942037 | 36 | NZ_CP012711 | Psychrobacter urativorans strain R310.10B plasmid 5, complete sequence | 43400-43435 | 3 | 0.917 |
CP034092_2 | 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder | 1942002-1942037 | 36 | NZ_CP024448 | Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-5, complete sequence | 20098-20133 | 4 | 0.889 |
CP034092_2 | 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder | 1942002-1942037 | 36 | NZ_CP024446 | Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-3, complete sequence | 63667-63702 | 5 | 0.861 |
CP034092_2 | 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder | 1942002-1942037 | 36 | NZ_CP024445 | Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-2, complete sequence | 29619-29654 | 6 | 0.833 |
CP034092_2 | 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder | 1942002-1942037 | 36 | NZ_CP024186 | Moraxella osloensis strain TT16 plasmid p1, complete sequence | 95169-95204 | 6 | 0.833 |
CP034092_2 | 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder | 1942002-1942037 | 36 | NZ_CP024186 | Moraxella osloensis strain TT16 plasmid p1, complete sequence | 29226-29261 | 6 | 0.833 |
CP034092_2 | 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder | 1942002-1942037 | 36 | NZ_CP024177 | Moraxella osloensis strain YHS plasmid pYHS1, complete sequence | 95137-95172 | 6 | 0.833 |
CP034092_2 | 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder | 1942002-1942037 | 36 | NZ_CP024177 | Moraxella osloensis strain YHS plasmid pYHS1, complete sequence | 29194-29229 | 6 | 0.833 |
CP034092_2 | 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder | 1942002-1942037 | 36 | NZ_CP024186 | Moraxella osloensis strain TT16 plasmid p1, complete sequence | 25313-25348 | 8 | 0.778 |
CP034092_2 | 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder | 1942002-1942037 | 36 | NZ_CP024177 | Moraxella osloensis strain YHS plasmid pYHS1, complete sequence | 25281-25316 | 8 | 0.778 |
CP034092_2 | 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder | 1942002-1942037 | 36 | NZ_CP040258 | Moraxella osloensis strain MOXF1 plasmid pMOXF1, complete sequence | 46821-46856 | 8 | 0.778 |
CP034092_2 | 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder | 1942002-1942037 | 36 | NZ_CP024446 | Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-3, complete sequence | 38673-38708 | 9 | 0.75 |
CP034092_2 | 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder | 1942002-1942037 | 36 | NZ_AP017383 | Moraxella osloensis strain KMC41 plasmid pMOSL2, complete sequence | 53808-53843 | 9 | 0.75 |
CP034092_2 | 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder | 1942002-1942037 | 36 | NZ_CP024183 | Moraxella osloensis strain KSH plasmid p3, complete sequence | 11703-11738 | 9 | 0.75 |
1. spacer 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012711 (Psychrobacter urativorans strain R310.10B plasmid 5, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
ttccactcgagcacagctctcgtcttgcgctcgggt CRISPR spacer tcccactcgagcacagctctcgtcttgggctcgggc Protospacer *.************************* *******.
2. spacer 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024448 (Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-5, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
ttccact-cgagcacagctctcgtcttgcgctcgggt CRISPR spacer -tccactacgagcatagctctcgccttgcgctcgggc Protospacer ****** ******.********.************.
3. spacer 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024446 (Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-3, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.861
ttccactcgagcacagctctcgtcttgcgctcgggt CRISPR spacer gcccactcgagcatagctctcgccttgcgctcgggc Protospacer .***********.********.************.
4. spacer 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024445 (Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
ttccactcgagcacagctctcgtcttgcgctcgggt CRISPR spacer aatcactcgagcacagctctcgccttgcactcgggc Protospacer .*******************.*****.******.
5. spacer 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024186 (Moraxella osloensis strain TT16 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
ttccactcgagcacagctctcgtcttgcgctcgggt CRISPR spacer aatcactcgagcacagctctcgccttgcactcgggc Protospacer .*******************.*****.******.
6. spacer 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024186 (Moraxella osloensis strain TT16 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
ttccactcgagcacagctctcgtcttgcgctcgggt CRISPR spacer gcctactcgagcatagctctcgccttgcgctcgggc Protospacer .*.*********.********.************.
7. spacer 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024177 (Moraxella osloensis strain YHS plasmid pYHS1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
ttccactcgagcacagctctcgtcttgcgctcgggt CRISPR spacer aatcactcgagcacagctctcgccttgcactcgggc Protospacer .*******************.*****.******.
8. spacer 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024177 (Moraxella osloensis strain YHS plasmid pYHS1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
ttccactcgagcacagctctcgtcttgcgctcgggt CRISPR spacer gcctactcgagcatagctctcgccttgcgctcgggc Protospacer .*.*********.********.************.
9. spacer 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024186 (Moraxella osloensis strain TT16 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ttccactcgagcacagctctcgtcttgcgctcgggt CRISPR spacer gcccactcgagcatagctctcgccttgcgtcggggc Protospacer .***********.********.******.. ***.
10. spacer 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024177 (Moraxella osloensis strain YHS plasmid pYHS1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ttccactcgagcacagctctcgtcttgcgctcgggt CRISPR spacer gcccactcgagcatagctctcgccttgcgtcggggc Protospacer .***********.********.******.. ***.
11. spacer 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040258 (Moraxella osloensis strain MOXF1 plasmid pMOXF1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ttccactcgagcacagctctcgtcttgcgctcgggt CRISPR spacer ccccactcgagcatagctctcgccttgcgtcggggc Protospacer ..***********.********.******.. ***.
12. spacer 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024446 (Moraxella osloensis strain NP7 plasmid pNP7-3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ttccactcgagcacagctctcgtcttgcgctcgggt CRISPR spacer gctcactcgagcatagctctcgccttgcgtcggggc Protospacer ..**********.********.******.. ***.
13. spacer 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP017383 (Moraxella osloensis strain KMC41 plasmid pMOSL2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ttccactcgagcacagctctcgtcttgcgctcgggt CRISPR spacer gcccactcgagcatagctctcgccttgcgtcgcggc Protospacer .***********.********.******.. **.
14. spacer 2.1|1942002|36|CP034092|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024183 (Moraxella osloensis strain KSH plasmid p3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ttccactcgagcacagctctcgtcttgcgctcgggt CRISPR spacer gcccactcgagcatagctctcgccttgcgtcgcggc Protospacer .***********.********.******.. **.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1007361 : 1012253
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP034092|1007361:1012253|DBSCAN-SWA ATTACCCCTCCTTACTTTCCGCTTTTCTAAAAAACAAATCGTTCAACACTACATCGTCATTAATTACAGTTCCGTCTTCGATATAGTCACAGCCATTATCTATAAAGTACTGCTTATCATCAGGATGAGGGCGCATAACCAGATCGATAGATGGGAAAGCAGAAAGACCATCAAAAGTTGTTAAGATCGAATGAACCAGACCTTCACATTTTTCTAAATCAGTGCCTTTACTTTGTGCCCAGTATCTTGCCAAGTTTCTAAAGTTCTCAAGCAATTCTTCACGAATCACTTCTTTTGGAATTGGTTCACTCATCCCTCAGCTCCCGATTCGCTTGGCACTTTGTGGTAGAACATCCAGTGTGTAGGTGGATCTCTCTCAAAATTGGCCCAAATATGATTTAAATCTTCATCACAGGTCATGTAGTCACTTTCTGGCTGAACATCTGGTGAGTCTGACCAACAAATTAAAACCATAGTATCTGCTGGTGGCTCTTCATCTTTAACGCTAATCCAAGACGGCACCGTCTGAGCTTTGGCTTTTTCTTGCATAAAAGTAATGGCTTTTTTCCACATTGCCCAACCGCTATTTACACGATGGTAAATGTCAAAAAGATCGTCTTCACTAAGATCAGTTTTTACATCTATAGGTATTTCAAAACAGCCGCCATCCATATTAAATTCAAGAACATCTAAGTGCTCTGGAAGCCAATATTTTTCTTTAAATAATGGTAGTTGCTCTGCCCAAAAAGCTTGTTTCTTATTCAAATCTGTCATGCTGCCACCTTACTTAAATGCCAATTTTTTAGTTCTAATGAACTCAATGCCCTTAATATCAGTTATAGATTCACGAGCATTGAGTAGGGCACGCTTATCTACTTCGACTGTAGTTTTTTCTCGTTTAAATTGAGCTGGAATTTCTTCCTCATTTTTCACAACTACAGACCAAGGATTTTCTTTAACCTTGATTGAAAGAACTGGATCTTCAATTTCACTGACACCAAACTCAAGCATTTGATCTAGTAAAAGATCGTGAAGATATCCATATGTACTTTTAATACGTTTGGCTTTATCAGAAAGACGCTGTGCCTCAGTAGCTATCAGTTTTTCTTCCAACATCATTTGATGGACAAACTTTGCTACACGCTTTGACTTCTCTTTCCATTCGCCTTCTTTAGCAACCATGCCTTCTAGTAACAGTTGAACTTCTTCATTATCGGAACTTGCACCTTCAGCTAAAAGATCTTGAATTCGCTCAACCTGTTCAGCTAGGTCATATCCAATGTCATATAAAGTTGTCATAATAATCCTCCCCAGGATTGAGGGCTTTCATTAGCCCTCGATTCTTGACAATAATTAGAACGGTAAATCGTCATCTAAATCAGAAGATTGATTACCTTGAGTTTGTGAATATTGACCATAGCCACCAGATTGTTGCGGTGCATTTTGCTGCGCACGTTGTGCATCACCCATGGCAATTAATCGATCAAGTGCTTTAGGCAGTAATTCGGGTGAAGTTTTACGCTCAAGAATTTCTTTAGCCATTAATTCACTATCTGCATTAAATGAAGCGAAGAAATTCATTTGATGGCGTTGCTGACCACTTCCATTTAAGTAATTTTCGCGCTGTAGCAAAACACCAATACGCTTATTAGTCATTTCAGGCGCAACTACACATGTTTGTTGTACTTTTTGTTTAAGATCAAAATCATATTTCTCTAATTTTTGATCCGTAGGTGTGAGGCTCTTAACACTCGCACAAGCCATAATCGCATTGATTTTATGTACACCTGAAAGTGCAGTACCATCAGCTTTGACAGTCCAAATAGTGAAGTTTGTATACTCCTTTGAATCAGACTCAAAGTTGATTTCAAAACCTTGTGTACCTTGTTTAGAGGTTACAAACTCCATTGATTTAATTACACCTACGTATTTGCCAGTAGTTTCAATACGTCCACCTGCATCCGCTTGTTTTGCTGATTCAGTATTCAAATTAAATGCTTGATAGTTACCCATGATTATTGCCTCTTATGCTGTTTCAGTAGTTGTTTGTGTTTCAGTTTTTGCTATTCCGTAGTAATCACAGATAGCTGTATCAACGGCCTCTAAATCGTTTTCAATATGATCAGACTCAAATAAGCCGATAGGGGATTTAACAGTGTTTAACCCGCTGTTTTTGGTATGAAAAATATATTGTTCGTTGATAACACCTGTTTGAAGACAAATTGTTACCATTCCCTCTAAAGTGATTTTTTCATCTAGCATTTTTCCAATAGTTTTGATCTTGGTTTTGCCAGATTCGGCCTCTTCTGTGTGGCTTAAAATGTAGACGCGCTTGTTGTCTGCAAGGTTTGAAGCTTCTGTGAATACATCCCAAGTTTTGCGCCCAATTTCAGTAAACTTTTTGAACCCAGTTTCAGTGCTTCTGCGCATATATTCATTTGCCATAACATATTGATAGTCATCAATAATGATGATTGGCTTAGATGTTTGTTGCATACGCTTAATAATCACTTCTGGATTATCTGTCACATAAATAGAGCCACCATCTTTTGAAAGGTACTTCCATTCAGCAGAACGGAAAGGGAGGGGCTTTTTCACCACCTGAATCAACAAAACTTCATTTGGGTTTAAGTTACGAAGACTTGTTGATTTACCAGTGCCTGACTGGCCTAAAATTAATGTTGCAATACTCATTTTTCATTCCTCATTCGTCATTTGAGTTATGAATGGCCTATGGCGCATTCATAATCTTCTCCTAATTCTTTTCTGCTAACTTTTTGAAGTGTTGGCACATACTTCTGACAACTTTGAACAACCACTTTTCTTCTCTTTGGGTTGTATGTCTTGAGGTGGTAGTGAAGAGTTGAACTACATGTTCATGGCATTCTTGGCTGTACCATTGTTCCAAGAAGTACTCTTCGATAGTCTTGAAGCCACAACTACCTCGATAAGCAGTCCAAGCACAATCCCAACAACGGATAGTTACTTGAAATGCTTGTTCGCCATACCAGACAACAAATACGTCAATTGGGTCTACACCGTTGTTTGCTGGAATGTGGTGTGCATGTACGCTTTTAACTTCCATCACACCACTCCCGCTTCTTCATCTGCCAATTCTTCGGCGTAGTATTTAAGCTGCTCGTTTAAGCTGTGTACTTGTGCGTCTGTGAGCTTGAAACGTAAGCCTATAGGTGACTCAATTCCGTCTTTATCAGTTACGATTGCATGAGTTTTTGTGTCAACTACAAGTACTTCATACTCTTGGTCACGGGCACAACCACTGGACTGATCAGTTACTTCACGAGTGTCGTAAGTCGTTTCAGCTTTAATCTGGCAGTTAAGAACATTGCAGCCGTAAGTTAAGTCGAAATAAACCGTTTCACCTTCAACTTGAATGTCAGTAGATAGGTCCAAGTAAGGAAAAGAAGGGCACAGCAACTCTGGTTTAAGGGCAAACATATTCATCAGTTAGCTCCTTCCACTTGCACACGCACATACATGTTCTGTTTTGCTTTGAGTTCGTTTACGTATTGCTCGTCGGCACAGCCTTTTAAGAATGCAAATACAATGAAGGTGATAATCCAGAAAGCTAAAAAAGCTTTAGAGCCATCCCGGAAGGCCTGGCTAAACTTGTACTTTTCAATTCTTTGATTCATACTTATCTCCGCATTTGATGCAAACCGCCTATACTTCGACCCCTATGGCGGTTTTTTTTGTGTATGAATTTATAGTAAGGTAACTTACCAAAATGGTCAAGAGAAATGGTAATTAAAATTACTTTTTATTTTTGTTAACTTACTTTTTATTTGATAGATAAAAGAAAACCCGCACATGGCGGGTAATTAAAATTAGCTATTCTTAGCCTGCGCGCCACACTTGGCGGCCCATAACCTTAAAATTCAATCCATTTTGTTCAGTAACAATTCTATCTCGGTACTTTTCGTTAAAGCTGTGCAGAACTAAAGAACCATCAGCTTCTTTGAAAATCTGCTTAATCATTCCTTCACCTGCAAAGTAAATTGCATAAATCTCACCATCTATGATTTCGGTTTGAGATAAGTCGATACCCACAAGGTCCTGATCATGAATGTAATCAGCCATACTGTCGCCTTTAGCTTTAATGAGCCTTAAGCATTTAGGGTCCACCATCTTTCTTTGAAAGAACGAAGGAGGGAACGGATATTTTTCATTAATTACATCAAAATGGAATTCAATTGATTCCCCAGTACCACACGAAAAGTTAGCTTCCACAACATCAATCCATATATAACCGTTGACCTCATCAAACTCGACAACATCAGGTTCAATGATACTGTCTGTGTCAAATGAAGCTTCTTCTTTAGTAGTTAGTCCATGCTTATTAATAAAGTCTTGAATATTAAAATTAGTAAGATTTTTAGGCTCTTTACCTTTCAAGAGGTACTCTGTAGAGCTACCCAAGGCTTTGGCTAATGCCATTAAGCTTTCATGCTTAGGTACATTTTCGTCTTTTTCCCAGTAAATAACAGAAGTTTTAGACACACCAACAAGATCAGCTAAAGCTTGTTGAGTAAGTTTTTTCTGTTTACGCAGATTTTTCAAGCGAATACCAAGCGTTTCCATTTTAATTCCACCAGCAGAACGTAAGTTATCTTACCAATTGACTTGGTAAGTTTTATGTAGTTAAATAAGGTAAGTTAAATTACTTTATAGGTAAGTTAGATGACTAAGTCGGAGGCTTTAGCCCTGCTTAACTGCTCTGTTACTCAATTGGCAGAAAAACTAGGAATTTCTCACAACGCGGTAAGTCAATGGGAAGAAAAGAAAATTCCATTACTTCGTGAATATCAAATCCGTGACATGGCTTCCAAATTAAAGCCAGCAAAACGCAAAAAAGTTCGTACAGCGGCTTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP034092|1007361:1012253|1007669_1008134_-|QAB39701.1|DBSCAN-SWA MTDLNKKQAFWAEQLPLFKEKYWLPEHLDVLEFNMDGGCFEIPIDVKTDLSEDDLFDIYHRVNSGWAMWKKAITFMQEKAKAQTVPSWISVKDEEPPADTMVLICWSDSPDVQPESDYMTCDEDLNHIWANFERDPPTHWMFYHKVPSESGAEG >CP034092|1007361:1012253|1010115_1010445_-|QAB39705.1|DBSCAN-SWA MEVKSVHAHHIPANNGVDPIDVFVVWYGEQAFQVTIRCWDCAWTAYRGSCGFKTIEEYFLEQWYSQECHEHVVQLFTTTSRHTTQREEKWLFKVVRSMCQHFKKLAEKN >CP034092|1007361:1012253|1008713_1009373_-|QAB39703.1|DBSCAN-SWA MGNYQAFNLNTESAKQADAGGRIETTGKYVGVIKSMEFVTSKQGTQGFEINFESDSKEYTNFTIWTVKADGTALSGVHKINAIMACASVKSLTPTDQKLEKYDFDLKQKVQQTCVVAPEMTNKRIGVLLQRENYLNGSGQQRHQMNFFASFNADSELMAKEILERKTSPELLPKALDRLIAMGDAQRAQQNAPQQSGGYGQYSQTQGNQSSDLDDDLPF >CP034092|1007361:1012253|1010444_1010825_-|QAB39706.1|DBSCAN-SWA MNMFALKPELLCPSFPYLDLSTDIQVEGETVYFDLTYGCNVLNCQIKAETTYDTREVTDQSSGCARDQEYEVLVVDTKTHAIVTDKDGIESPIGLRFKLTDAQVHSLNEQLKYYAEELADEEAGVV >CP034092|1007361:1012253|1008143_1008659_-|QAB39702.1|DBSCAN-SWA MTTLYDIGYDLAEQVERIQDLLAEGASSDNEEVQLLLEGMVAKEGEWKEKSKRVAKFVHQMMLEEKLIATEAQRLSDKAKRIKSTYGYLHDLLLDQMLEFGVSEIEDPVLSIKVKENPWSVVVKNEEEIPAQFKREKTTVEVDKRALLNARESITDIKGIEFIRTKKLAFK >CP034092|1007361:1012253|1009385_1010054_-|QAB39704.1|DBSCAN-SWA MSIATLILGQSGTGKSTSLRNLNPNEVLLIQVVKKPLPFRSAEWKYLSKDGGSIYVTDNPEVIIKRMQQTSKPIIIIDDYQYVMANEYMRRSTETGFKKFTEIGRKTWDVFTEASNLADNKRVYILSHTEEAESGKTKIKTIGKMLDEKITLEGMVTICLQTGVINEQYIFHTKNSGLNTVKSPIGLFESDHIENDLEAVDTAICDYYGIAKTETQTTTETA >CP034092|1007361:1012253|1010824_1011016_-|QAB39707.1|DBSCAN-SWA MNQRIEKYKFSQAFRDGSKAFLAFWIITFIVFAFLKGCADEQYVNELKAKQNMYVRVQVEGAN >CP034092|1007361:1012253|1007361_1007673_-|QAB39700.1|DBSCAN-SWA MSEPIPKEVIREELLENFRNLARYWAQSKGTDLEKCEGLVHSILTTFDGLSAFPSIDLVMRPHPDDKQYFIDNGCDYIEDGTVINDDVVLNDLFFRKAESKEG >CP034092|1007361:1012253|1011218_1011962_-|QAB39708.1|DBSCAN-SWA METLGIRLKNLRKQKKLTQQALADLVGVSKTSVIYWEKDENVPKHESLMALAKALGSSTEYLLKGKEPKNLTNFNIQDFINKHGLTTKEEASFDTDSIIEPDVVEFDEVNGYIWIDVVEANFSCGTGESIEFHFDVINEKYPFPPSFFQRKMVDPKCLRLIKAKGDSMADYIHDQDLVGIDLSQTEIIDGEIYAIYFAGEGMIKQIFKEADGSLVLHSFNEKYRDRIVTEQNGLNFKVMGRQVWRAG >CP034092|1007361:1012253|1012061_1012253_+|QAB39709.1|DBSCAN-SWA MTKSEALALLNCSVTQLAEKLGISHNAVSQWEEKKIPLLREYQIRDMASKLKPAKRKKVRTAA |
10 | Acinetobacter_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1015422 : 1037813
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP034092|1015422:1037813|DBSCAN-SWA 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MLIKRPLFYATIYSLLVFIFSLYIVPLYIDGDQLHYRDFYKYCLYENLTPLQQFFCYEITLGTKEPGYFYISKIAYPYLSKDLYITLANTVLTFVMTLVIFKYYKIVWHRHVFLILILMNYYFIVMLTSAERLKFSFIFLALALLINSNKKIIMFGLALMTHVQTILLMAPYYIGQFFDKSESKFLKILMILGFVAVSGATFFVLQEHIESKFTSYSNSVDEDGLGIIGSIKTSVFIILAVATTRKLLPLICGLPLIVMAFFLGSDRIGMLAFILYAGVVIYYKRRMDVVLFIVMIYFVYKSSEFISNILEYGTGYHFIN >CP034092|1015422:1037813|1019524_1020037_+|QAB39717.1|DBSCAN-SWA MTEVISPDNKELLTYVLGDIHNKLYIDVVRDLKQQTEQKLESGELEPADFPITHHFAPGVYSRQMDAKAGSFCISKMHRTEHLNVLMKGALTIITEDGLKYLEAPQVIKSQAGTMRIGYFHQDTSWLTIHPTNETDLEAIERDVIVPEHEIEAFLASIGHTPKEIALCLG >CP034092|1015422:1037813|1034080_1034635_+|QAB39728.1|DBSCAN-SWA MTVKNFFDAARVIAGGKLTQAQVDDLNKVVDKLAPSGMTTSDVGVDLISGFEGTRFTAYDDGVGVWTIGTGTTVYPNGVKVKKGDTCTPEQAKAYFKHDLAKFEKTVNESVSVPLSQNQFDALVSLTYNIGSGAFNNSTLLKKLNKGDYQGAADQFLVWNKAGGKVMKGLVRRREAERALFLKK >CP034092|1015422:1037813|1036556_1037813_+|QAB39731.1|DBSCAN-SWA 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>CP034092|1015422:1037813|1015422_1016331_+|QAB39713.1|DBSCAN-SWA MAQDMATNGAMITAAFKRQFHDAFEVKCQQDKSVLQVAVKDRGPIQGSSFTINDMGMVEMQPSGSRFGDTVWSVPEAGTRLATMADYDLFVPIEPRDEPKLSANPTNEYMQACLAAEMRQRDRVIFNALGASIQRKNIDGETYTPTSLPANQKIAAAATPMNKAKIVRARKLFRQNHADKFPLYMIYNAEILEQILIDDELTKWDKETIQAIQDGDVAKKWAGFLWLPYEDITSVTAGSPAVTTQTTFAFAQGAIHYGRNSISNFDIATRPDKKNVKQIGGIASYGAGRANEQKVVQIDFIV >CP034092|1015422:1037813|1034950_1036168_-|QAB39730.1|DBSCAN-SWA MLSDSKIKTLKPTEKMYRILDAERLYIEVRPSGKKIWRFKYTLNGKEGTISFGEYPSVSLADARKRKEDAKALLAKGINPVEDRNQKEEEKRAATNNSFKAVTEEFIKEKMKYKSEGYVDRFKGAMERDIYKIIGSKPIKEVNSADVLQIMKNTMERIKKQDNFATGEAAANLNRRFIGLVMRYAIVTLRTDTDPTYAVKEAIESPQVEHARPLEPHERITLRTNIDTYKGSSTVRNATLTLLYSMLRTIEVRKMEWPFVHFDDRIIKFPRSSRRRRQERSMKMDRVHIVPMSDQLYEILKDQYAITKGQKYVFASPQKRDCMISRTTLNKMLMYIGLREVTAHDFRATASTLLYEKGYEEAWIEKQLAHAEQNRTKASYDHSQHLEARRKMMQDWADIVDSWKD >CP034092|1015422:1037813|1030255_1032538_+|QAB39725.1|DBSCAN-SWA 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MTKPKISFLAFFLLWADVQKWKVPDFHALVCIFLENFYIKGRTALLMMPRGHSKSTILDVFNAWVIYCWPETQILHQGTTDDDAYKCSNGTKLVLEKHPLCVDNPEVKRKKGETERWWVAGTDDVRYGTMLAKGILSGVTGHRAHFIQNDDVETPKTTGSPEAREKLTYRLSEQTHIAFPGAKKLWIGTPHSHDSLYDKIKKLRKVDILVLKMFENEKRIENALAGGKYLLDFEPIHAFAGIGQGAKYLSKGQDYTLKKVNDLYEVTLANDHYVADFYSEGIWAERFDAEEMASRREECKTLNEWDSQYQMHAKPIGDVRLDPDKIIAYNCEPVLKRANRTTMFMIGERQIVGATFRWDPSSGKLKSDISSTALVFHDDIGNKYWHRSIALKGEVIETDADGRVIGGQVWQLCNIIKEFHLSKVTIETNGIGNFAPAALKAALKTRGIRCGVTEQHSTKSKNKRILDGIEGPLISGLLWAHVSVLEDENGEDSAQVKQMREFNPAITDQPDDYLDSLAGAIVEAPERVGKSLNQTDYEETPNWRTNGGVYEATVDFD >CP034092|1015422:1037813|1025386_1027912_+|QAB39721.1|DBSCAN-SWA 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19 | Acinetobacter_phage(35.71%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1163517 : 1178324
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP034092|1163517:1178324|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1421579 : 1461689
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP034092|1421579:1461689|DBSCAN-SWA 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52 | Acinetobacter_phage(71.79%) | tail,head,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2702202 : 2738789
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP034092|2702202:2738789|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP034092|2702202:2738789|2705866_2706367_+|QAB41204.1|DBSCAN-SWA MSEIAPSIIQIKPYLQKGFVLSEVMSIKLVVPSTHMLVPYALEKISAGFPSPAQDYVDKALDMNEHLIKNATSTFIVKVASLSMLNAGIDIDDELIVDRSLDAKHGDIVVALIDNDFTVKRLMIDESGQWLKAENPEYKNIYLQEGQELIIWGVVTHIIKMTRKRS >CP034092|2702202:2738789|2735849_2736791_-|QAB41235.1|DBSCAN-SWA MSLDATIWAFKAEVKTSSQRLVLLALADRAGESHKCYPSIKRMVKDTVLNRKTVIKVLDELEAISLIRFTGEITGNGVKVYQLIGVMGREENDLTSPKNGTSTNNGTSSNFGTGSKNGTSTNNGTATSPKNGTETSPNIGTQNLSGNLSDESKNKKTWLSLKKLGEEIRLATDQETYEHIKNATWFDRELRAFELYNAEKNLCDELMNYHFADWLINACGKYQAREQTGFRNSGSQVRCSPSAPHQLSDKQVHTFAQKLSQHPEFASQFAAAGESYDQLAARIAVKLSDPAQAKQWEPYLKQVGFKGSLQGAA >CP034092|2702202:2738789|2705084_2705720_+|QAB41203.1|DBSCAN-SWA MCANYEPIRKDRVHLLNLFEPTFDYKNDVYPGYDCPLIFSKDGHIEWRQVKFGMIPPWNHDLKFSKYTYNARTETVDKKPSFRHAWAKSQFALLPVEKIYEPRYVNGKAERWGIYREDGLPFTVAAIYDSTVIDGQQVRSMSMLTINADNHPFMSQFHKPEDEKRSIIVIPEEYREDWLNSKKEDADQFFFEMPIGEFTAEYFPKPRKSAN >CP034092|2702202:2738789|2731276_2731918_-|QAB41227.1|DBSCAN-SWA 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>CP034092|2702202:2738789|2709203_2709386_-|QAB41207.1|DBSCAN-SWA MNQSEENVSTKPGISIEGKMSEKDAGRAAVIMAWGKAISLVIGSVAGAITAITTFFKYIF >CP034092|2702202:2738789|2704036_2705056_+|QAB41202.1|DBSCAN-SWA MNINYKSIFPPLELHYDFTKCIICMASNDENNKNKKLTDEHIVPEFIGGQIVVKNVCKECNSTLGHSLEGPLAKNIYFKLYAYTNEIKGKKNKLTNPLAGEYSYNGIRFRYESDFSLYQLPVIDQQLTDDGAFTFKASIDKRDLKTIENDIFKAISRKAKKEGRVLREDKLRDDIKKIIEDSKENIKVLEQPEINISFSLDYDLMALLALKIVYELIAWLWGEEFISANQFNFMRLSLKGLKLHRKLKYINKDFYEILRQLLKENPYSPLKDTSYIDNIFGQNKTIIVFMGGGCSIRILNIWFNFLMPEALKNAFLIFTSDSRTGDFNFYREEIFLNHR >CP034092|2702202:2738789|2729352_2730561_+|QAB41225.1|transposase|DBSCAN-SWA 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>CP034092|2702202:2738789|2725451_2726555_-|QAB41223.1|head|DBSCAN-SWA MAKDNKNLLEVLTQHQAYLYRASSQSVNELLGLFNDDTNAMLSKLRDLLDELSDSEKIALAGGKYTTSNLREIRDLISQWFSSVNTSLPEAFAVSATAMAVYEASYMAKLFGAKINKPDGEKLFTAAKKVPLAGGALVDDLLSRIAENARQKVEYAIRDGISTGKTNQEIVQRIRGTKRLNYEDGILNGTKTDIDRTVRTVRSHVANQAYLNSFNQLGFEYVRFVSVLDGRTSKLCASLDGSIWEINDPAKRVPPLHPHCRSILVPVEKDGKLLGERPFVMDERKVKDIPKDERSQLIGQLDANTTFKEFFKKTDDFFQKEWLGPKRYKLYKEGKFDFEKFFDPEGRLYSLAELRKLDEKSIKKLGL >CP034092|2702202:2738789|2709486_2709693_-|QAB41208.1|DBSCAN-SWA MTLQAADYYEKLSTTNIMKRPPSGGNSFFTGRKTGMKRESTNRNNFLTKLAEALPPDIKKRKGVKFVY >CP034092|2702202:2738789|2738057_2738789_+|QAB42307.1|DBSCAN-SWA MVHNGDAMTSQTDLVKQEFAKRLHKAMDKAGYPLRGRARVMSKEFNISDKGAGKWLNGDAIPETSKIPLIAQFLKVNSEWLLSGAGDIDISRNKNTFDNNIDIENKIEIYGKLIPVISWVAAGTWTSIDAIPVGTQFDEWLPPNPKCGKNGYGLIVRGESMSPKFEPNDRIYVNPDFQVSDLKTGDLVIVSCEGDKEATFKKLVIETDGMYLEPLNPKWHEKIMELHEGCKLIGKVVGLYREV >CP034092|2702202:2738789|2714511_2714910_-|QAB41213.1|DBSCAN-SWA MYKLKLNPQTSGYGVTPGDDVKRQQMDGGRGRYYIDVKRNSHIVDVNWNLSKSDFNKMMAFWRIYQNKPASFYADLVIDQGTRQQYLCNFIPNSFKTNEVNGNLYRVNAQLEVVQNQANLAADIALIKDWEV >CP034092|2702202:2738789|2713646_2714009_-|QAB41211.1|DBSCAN-SWA MKSHDHLLDKQYDEEHYNCVHFAHEAAMDLYDINRGEALEFFMKPVKEKVFLPSRLKLLNPLPMPKEGCIVAFHSRYRNKPPHVGLFRLGRILHLQESGVSWMPIQVVQAFGFNRVSFYD >CP034092|2702202:2738789|2733500_2733737_-|QAB41230.1|DBSCAN-SWA MTIITLLDVKTKKKVIVRSVIDPIARIDKKGNIQIIQIHKWLYDESGDFVDEDLYEALNNGEVGIYITLQYMIINIEN >CP034092|2702202:2738789|2725013_2725442_-|QAB41222.1|DBSCAN-SWA MLYFLKHQNLYNMKTIAFVCLTLISITCLAEPSQKYLKEYDRLSEALESAMANAYSFDPTTGQVKQATQYLEAKNNLCRAAQAKLNLTTFLKDNLEESKELYKSIDGAETLDKNYLSGQQQEQQTLVSNLKKDLVGTGFNCE |
42 | Acinetobacter_phage(74.19%) | tail,transposase,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 78401
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP034093|0:78401|DBSCAN-SWA
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76 | Pseudomonas_phage(29.27%) | capsid,integrase,tail,terminase | attL 20456:20474|attR 61668:61686 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
92770 : 100661
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP034093|92770:100661|DBSCAN-SWA GTTGAACCATATTGAGTTATTTGCAGGCTGTGGTGGATTGTCATTGGGACTAGAGTCTGTAGGCTTTAAATTAGTTATGGCAAATGAACTATCACCTATGGCAGCAGAAACATTCGCCTATAATTTTTTTAATGAAGATCTTGAAAAATTAAATAATAAAAAGAGCAAAGTTAAATGGTTAAGCAGTAAATTTACAAATGAGGATATAAAATCTAGATTAAGGGAAGACCCTAGAACTTTTCCAGAGCTAAATGAAGGGCAATCAGATCTAGATGATCATTCAGATTTAAGTGGAAAGTTAATCATAGGTAATATTGTCCAACTTAATAAATGGCTTGAGAAACATCCCTTTCAAGTTAATGATCTTAGTATGGCGTATGGCCAAAAAGGCGGACTTGATCTTGTTTCAGGTGGGCCGCCATGCCAAAGCTTTAGTATGGCGGGGTTAAGACAATTTAGTAATAATCGGAATACCTTGCCTTGGGAATTCGCAAAATTTGTTCAAATGACGCAACCTAAAATTGCGTTACTTGAGAATGTAACAGGAATCTTGCGAGCTTTTGATGTAGAAGGTAAGAAGTTCTATGCTTGGTTTGAAGTAGCTAAAGCATTCGCACAGATAAATTACATACCTTTATGCTTACATATTAATGCGAAATATGCTGGTGTTGCTCAAAACCGCCCAAGGTTTATATTGGTTGGCATCAGACATGACGTTTTTGACCAAGTTTATTCATCTTTTAATGAGTATGAAAAAAAACTTTATTCACAAGCGATAAGCTTTGTTGATAATTTAAAAAAAGGATTACAAGTCGAATATGGCACCTTATCTTATTTTGATGTTGAATATGATGAACATTTAACATTATTCAAAAATACGTTCTTGAATCCTTTGATCAAATATAAGGAAAGTGAATTTACTGTTAAAGATGCTATTGATGATCTGAGAACTAAAGGTTTAGAAAAGTCTAAATATATTGAACTAATTAATTCTACTTTAATGCCTTATAGTAAGGGTGACTCTGTACTTCGGAATCATGATTTAAGAAACAATGGTATTCATGTTCAACGAAGATTTAGGATTTATCAAATCCTTCAAATGTTAGATAGTACAACTAAAAAAGAAGCTCTTGATTTACTTAAAGGAAAAATAGATAAAGTTTCTGAGTCAACAGCTAAGCAATTGTTGAATTATGATTATCTCATTGAGCCAAATACATATGAGAAATTCGAATCAATTGATAGTTTGATAAGTTACTTTAATGAGCATCAAACTAAAAAACAGACGCAAAAAGCTTTAATTGCAAATCAGCCGGCTCCTGCAGCTCTATCTATTCCAGATGATGCTTGTCATTACCATCATGATGAATTAAGAACTTTGACAGTTCGTGAGATGGCTCGTATACAGTCTTTTCCTGACCATTTTGTATTTAGATCCAAAGTGACGACTGGTGGCCAAATGAGGCAATTTGAAGTACCACAATATACACAAGTTGGTAATGCTGTGCCGCCGCTATTGGGACAAGCGTTAGGGCACGTTATAAAAGCAATCCTAGATAAATATCAAAGTTCTAATTAGCATAGAAATTATATTTATAGGGAGATACGGAGATACATGTGTTTACGTTGATCCCTATAACTCATACAACATTTTGCTTATATACACATCTAAACGGTTAAAATAAAAACAAATAAGCTGAAGTGGATTAACTATGACTCATGATGAGTATTCTTCACCTCGCTCAAAAATCATGTCTAGTATTAAGAGTAAAAACACAAAACCTGAACTGATAGTTCGTCAAAGACTACATGCTTTAGGCTTTAGATATATCTTGCACGACAAGAGGTTGCCAGGAAAACCCGATATTGTCTTACCTCGTTATAAAGCAGTAATACAAATTCAAGGCTGCTTTTGGCATGGGCATGATTCATGTTACTTATTTAAATGGCCTAAAAGTAGGCCTGAATTTTGGTATGAAAAGATAAATAAAAATATTACTAGAGACAAGGCTAATCAGGAAAAATTATTAGAGTTGGGGTGGCGAGTTCTAATTTGGTGGGAGTGTAATATACGTAATTCCCAGGATTTTGAAATAGGTTTAATGGAAACGGTTGAGTGGATTAAAGGCAATCAGTCATATATGGAAATTAGATGAATTGTAGGGGGGAGTATTCCTATAATTTTTTCTCATAATTCATACCATAATACTATTATCGAGCGTAGTGCTGGCGGACGCGGGTTCAACTCCCGCCATTTCTACTAGGATTCGTAAAAAGCCCTTAAATATAAGTTTTATTTTCTGTTTAGTCTTTTATATTTCCTTGGAGTAATTTAGCTGGATAATTTGCAGGTTAAATAAAAATTTATAAAGGCTGAACCTAAGAAAAACAGATATTGTCCATCAGATTCAGAAAATTTTGAGAGTGATTTGCCATTTATAGATAAAAGATGTTAAAGAAATATAGAAAGATTTGATTTTCACTATAAATAAAATAAGATTAAGTTACGATAAAATTAGATTTTAAGTAAGTTTATAGACTGTTTTAAGGGGATTACTAAATGGATTTTGTGATTTTAGATAGTAAAAAGTGGTTACCTGATTCAGGAATAAACACTGTTTATCTTAGAGTAGATAATTGGAATGATTATTCATATTACACTCAGTTTCAAGTAAAAGTTTTTGATAATGCTGGGAAAGAATATGATCTTGGCGATGTGAAAATTGCGTATAAAGGACAAGAAGAGGGTTTTGAAAACTCAACTGCTAAAAAGTTAGAATGGCGTTTCAATAAGTTGCCAGAGAATTTCTTTTCATTAGCTCCAAACGTGGAGTATTACAAAGTACTAAGTAATATGCCTGAGGCATTAAGAAAAATTTATTTAGATGGCTTAAATGACTTGGTTGCTCACCCTGAACTGATACCTATAATTGAGAATGAACAAGTCTTTGGAACATCTTTATTAAGAGATGTTTATTTATCTTCTATTCGGGGTAAATTTAAAAGTGTTTTAGAAGGAAATAAGGAAGCAACGCCATTTCAATTTCATTTTATAAGAGAGGAAAGTGAACGAGTTGGAGAAATAAATTTATTTTTTAATGTAGAAGTAGATGTTAAACCACCGACTAATATACATGCAATTATTGGGCGTAATGGCGTTGGCAAAACAACCTTATTAAATGACATGATTTCCGCAATTAGATATCCTCAAGATAATCAAAGGTGTCGAATAGAAACGAATGATTACAGATATACCTCAAATGATAAAGATTACTTTAGTTCTTTGATTTCTGTATCTTTTAGTGCTTTTGATCCATTTATACCACCAGCCGAACAGTCCGATCCAGCAAAAGGAACTTGTTATTTTTATTGGGGATTAAAGAGAGCTGGTGATCAAGAAAGATTACTTGGTTTTAGCGAGCTCAGACGGGAGTGTATTCGTTCATTAATGAATTGTTTTACGAAGAAAGATAAAGCAGAGCGTTGGTTGAAAGCGATTCAAAAATTATCTTCAGATATAAATTTTGCAGAAATGCAATTATCAAACTTTTATCAATTCTATAATGATTTAATGACGAAATATCAAATAAACAGTAGAGATGATAAAGAAATATATGAGAAAAAAAGAGAACAGATGCGACAGGAATATGAATGGGAGGTATTAAAATTACTAGAAAGAATGAGCTCTGGTCATGCCATTGTATTTATGACATTAACGCGACTTGTTGAAAAAGTCGATGAGCGATCTTTAGTCTTGTTAGATGAACCTGAAAGTCATTTACATCCTCCTTTATTATCAGCATTTATTCGAGCATTATCAGATCTATTAATGAATCGAAATGCGATATCAATTATTGCAACACATTCACCAGTTGTTCTCCAAGAAGTGCCACAGTCATGTGTATGGAAATTATTTAGACGTGGAAAGAATAGTGAAGTAGCTCGCCCGAAGATTGAGACTTTTGGTGAAAATGTAAGCGACCTTACAAGTGAGGTTTTTGGTTTAGAAGTCGTCAATTCTGGTTTCCATAATTTATTACAAGATTCTGTGAATGAGGGGAAAACTTACCAAGAAATATTACAAGAGTTTGATAACCAAATTGGCTTTGAAGGTCGTGCACTGCTTAAAGTAATGATTGCTGATAGAGCTAACGGAGATAAACAATGAAAAAATTAGATAAACCTAATTATGATTTTGATGGGGTACTTGATCTGTGTGTAAATAATATATTGCGTGGTAATCAAGATTTAAAGGATGTTATTCAAAACGATAAAAATGATATTTTATTAGATGGCAAATGCTATGAAAGAGATGCTAACAATGGTCAGTTGTATAGCTATCAAGAATTAAAAAGATGTCATAATTCTGTACCAATATCATTAATTACTAAAGACCATTATATCCATCTTTATGAAACATATTTTGTACCTGAGACAAAAATTGAAACACGTAAAATTTATGATGCCATCCTTAATGCTGCAAAAGAAGAATGCCCCTTTTGTGGTGGACTAGGTGTACCTAAAAATTTAGATCATTTTTTACCCAAAACAAAGTTTCCTCAATTTAGTGTTTTTCCAATAAATTTAATTCCAGCTTGCTTAGATTGTAATTTAGATAGTAAAAAAGTATCTTATGCAACTTCTGAAGATGAGCAAACTATTCATCCCTATTTGGATAAATCTAATTTTTTTAATGAACAATGGATAACCGCTGATTATATTGTAGATGCTGATAATCATCCGGGTCGCTTTAACTATTATGTTAAAGCGCCTGAACATTGGAACAATGTAGATAAAATAAGGGCTCAAAATTATTTTGAGGACTTTAAATTAGCAAGCCGCTATGCTAAACAAGCAACTTCTTCACTAAAACCAAAGTTGAGATTTATTCAGAGAGAGATAGATAAGGGTGTAAGTATTCAGGAAATTATAAGAGATGTAATTCAACCTGATATTGATGAGGCGCCTTTCGTAAATTATTGGGAAGTAGGTATGTGCGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP034093|92770:100661|94481_94925_+|QAB42458.1|DBSCAN-SWA MTHDEYSSPRSKIMSSIKSKNTKPELIVRQRLHALGFRYILHDKRLPGKPDIVLPRYKAVIQIQGCFWHGHDSCYLFKWPKSRPEFWYEKINKNITRDKANQEKLLELGWRVLIWWECNIRNSQDFEIGLMETVEWIKGNQSYMEIR >CP034093|92770:100661|98530_98893_-|QAB42462.1|DBSCAN-SWA MLSMRLDVLQAARQLATAYYNVPKAEFSMIQNHRDGSILVEISAKTRLDTSPIVHIRYDAEGTNITVKVPPAYNAVTQLDADDWVFFSEWINRLYTEDEFVKANRDFWIRKGRIETNKLF >CP034093|92770:100661|92770_94348_+|QAB42457.1|DBSCAN-SWA MNHIELFAGCGGLSLGLESVGFKLVMANELSPMAAETFAYNFFNEDLEKLNNKKSKVKWLSSKFTNEDIKSRLREDPRTFPELNEGQSDLDDHSDLSGKLIIGNIVQLNKWLEKHPFQVNDLSMAYGQKGGLDLVSGGPPCQSFSMAGLRQFSNNRNTLPWEFAKFVQMTQPKIALLENVTGILRAFDVEGKKFYAWFEVAKAFAQINYIPLCLHINAKYAGVAQNRPRFILVGIRHDVFDQVYSSFNEYEKKLYSQAISFVDNLKKGLQVEYGTLSYFDVEYDEHLTLFKNTFLNPLIKYKESEFTVKDAIDDLRTKGLEKSKYIELINSTLMPYSKGDSVLRNHDLRNNGIHVQRRFRIYQILQMLDSTTKKEALDLLKGKIDKVSESTAKQLLNYDYLIEPNTYEKFESIDSLISYFNEHQTKKQTQKALIANQPAPAALSIPDDACHYHHDELRTLTVREMARIQSFPDHFVFRSKVTTGGQMRQFEVPQYTQVGNAVPPLLGQALGHVIKAILDKYQSSN >CP034093|92770:100661|95329_96937_+|QAB42459.1|DBSCAN-SWA MDFVILDSKKWLPDSGINTVYLRVDNWNDYSYYTQFQVKVFDNAGKEYDLGDVKIAYKGQEEGFENSTAKKLEWRFNKLPENFFSLAPNVEYYKVLSNMPEALRKIYLDGLNDLVAHPELIPIIENEQVFGTSLLRDVYLSSIRGKFKSVLEGNKEATPFQFHFIREESERVGEINLFFNVEVDVKPPTNIHAIIGRNGVGKTTLLNDMISAIRYPQDNQRCRIETNDYRYTSNDKDYFSSLISVSFSAFDPFIPPAEQSDPAKGTCYFYWGLKRAGDQERLLGFSELRRECIRSLMNCFTKKDKAERWLKAIQKLSSDINFAEMQLSNFYQFYNDLMTKYQINSRDDKEIYEKKREQMRQEYEWEVLKLLERMSSGHAIVFMTLTRLVEKVDERSLVLLDEPESHLHPPLLSAFIRALSDLLMNRNAISIIATHSPVVLQEVPQSCVWKLFRRGKNSEVARPKIETFGENVSDLTSEVFGLEVVNSGFHNLLQDSVNEGKTYQEILQEFDNQIGFEGRALLKVMIADRANGDKQ >CP034093|92770:100661|98329_98539_+|QAB42461.1|DBSCAN-SWA MRDFLTPTQAVEVLKDAFKDIGCETELDDFDNLILLTITDCSTVEITRSRYSKRKKLEETIAYLKRSLE >CP034093|92770:100661|99797_100661_-|QAB42463.1|DBSCAN-SWA MNAKATNQVKDDELLISNLFDQLDIDESELDMALEPTAESAAVQDEKLVDEELHDVELLDNLNNGAFDDLINEEELDLNLEAEETEQPIVPEKQNSAPQKVTTENKAAKEKPKSTQQRVTHYNSKKSEVLLDRLGGSADMILLEASDIDLPNDKLKEKQENLLRILNNQPTVIGTRGNVETVQKKVAEKVIILFTYFKNGGNLNKVMRIAFETIITDGYITTGKGGNLYNNLLNAHYSEGTARAQAGQMLQMFPLLKIATKEGNKLIPNEQSLILAKMKADLFPSEK >CP034093|92770:100661|96933_97800_+|QAB42460.1|DBSCAN-SWA MKKLDKPNYDFDGVLDLCVNNILRGNQDLKDVIQNDKNDILLDGKCYERDANNGQLYSYQELKRCHNSVPISLITKDHYIHLYETYFVPETKIETRKIYDAILNAAKEECPFCGGLGVPKNLDHFLPKTKFPQFSVFPINLIPACLDCNLDSKKVSYATSEDEQTIHPYLDKSNFFNEQWITADYIVDADNHPGRFNYYVKAPEHWNNVDKIRAQNYFEDFKLASRYAKQATSSLKPKLRFIQREIDKGVSIQEIIRDVIQPDIDEAPFVNYWEVGMCDGLIRYLNNI |
7 | Enterobacteria_phage(40.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
103888 : 109351
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP034093|103888:109351|DBSCAN-SWA TTCATACTTCCACCTGAAAGAAACCTCGCTCTCTTGCCTTAAAGAAGCACTGCATCATCACGTCTACGTCATACGATGCAGCGTGTGCTGCTGATGCGTCATATTCAACGCCTAACGAAAAACACAAATCTGCTAACTTTGGGTATTTGCCATCAAACGTTGCCCAACGGCCATATTCCATCGTGCAGAAAGAAGAAACTTTCTTAGGCGTCATGCCTGCACGTTTCAGTTCAGTTGCGATAAAAGGGCCATCAAATGCAAAGTTATGAGCCACTAACAAAGAGGCGTGATTTACGATTGAGGCAACTTCTTCTGCTATATCTACAAATTTTGGGCAACCAATAAGGTCTGAATAGGAAATGCCATGCACAGCTTGAGCTTTTGGATCAATGTTTCGTTCAGGATCAATTCGCTGTACGAATTCCTCTAGCTTTGCGCCGTCCAAGTCATATTTAATGAGAGCGATTTCAATAATCTTGTCGCCATTTTCTACTTCTAGCCCTGTCGTTTCAGTATCGACTCCAAGAATATATGGAATCATAGCTAACACTCCGAAATATAAGCAGTTATTTAACTTTCGTTTTGAAATATAGCATTGATAAATAAGGATATCGCAGGGATATATATTTATATCCCTGAAATATATTATAGTAAGCTCTTACTAATAATCTTGATTCTTAAAAATTCATTTAATGCGGTCTAAATACTTACCATAGGTAATATGATTGCATTTAGAGCATTTCCATTCACTGCGGGCATAACCCATGTTGATAATTTCATCGCCATGAATGGCATTATTCCTGTCTCTCCCCAATTCGTGTTTCGATGGCTGTAGCAGGACGAATCATTTCTAAAATGCATCTGCGGCTACCTTTGGCAAAATAAGCGTAACCATCTTCAATAAGTTCAATGGTTTCGGTGCGATCAGGCATAAAGTCATCCACATAGACAACCGTCTGACCTACGTAGAAGGAAGTGCCAGTAATATTTGAATAATCCCTATCTAATGCAGGAGCTTGGTTAGAACGCGCATTCTGGTTTTCTTGGATGGCATTAAACGTTTCTTTGCAAAAATCGGCTTCTGTGTGGGTAATTGCGCAAACAAAAGTCATTGAAATAGCGAAAAGGGCGATAACCCAGTTAAATAAGGTGCTATTAAAAAGAAACGTCAGAATTGCAGCGATAATGCATACAAAGAAAGCATAGAAGTAGTTATCAACGCCATGATGCGGTTTTCGCTCTTTCTTTGGTTTTTGAGTGAGTTTAATTACTGTCCAAATTGCAACGATAAAACCAAGTCCTAACATTGCTCCTGTCAGGAATTTATCGAATAGCATTAGCCAATGAATTTTTAATGGAAAAATAAAACAACTATTCATCGCATTATCCCTCTTTAGCTGTTAATACAAAATCTTTCGTTCCAATAATATTTTCTAAATCATCAACTGATTCTTTGAACCATTTGATAGCTTGCTCAATAATTCCGCCTTCTTCACTAGAAATCAGTGCAGAACCAAAAGCTTTCGTCATGAGAAAAACCTCATTTAAAATTTACTTTCAAATAGATAGTAATGATTTTCTTTTGGAACAAAACTGTTCGTGAAATTTATCCAGTAAATGAAAGCCACCCGAAGGTGGCTCTCTCTGAGTAGGGCAACTCAATTAATTATAAGCACAATAATAAAGTAAGTGCTTACTAATAATCTAGCCCCAAATAAAAATTATTGCGGGAGACTTGAAGGGGTGAAGTATGCATTAAAACCACTTTCCGAACTGTTCCAGTTAAAGACACGATCATTATCCATATTTCGTAACATTGAACGGGCCAATGCGTCTGAACATACGGCAACTCGACGTTTTAAATTGGTCACATTTCTTGGGATATAAAACATCGGTACTTCGTTTACTCGTTCATCATTAATCAGACCAAAAATAAGCGAATTTAGATGTTCAATAAACCCTAAAGCGGCGGGTGCAGATTTTTCATCCTCTTTAAGTTCAATGCCCGGCTGAACCAGCAAGATGCCGATACAGTGATCTCGCGCTACCTGCGCACAGCGGTCGATATAGCGCATAAGGCGCTTAGACTGTTCCTCAGTAATATCAGGTCCAGCATGTATCAACGCATATGCCATAAGATCAATAGGGGAGCGATCCGCTACTGCATCGATGTGGTAATTGGCTTCATAAATGTCATTCAGGCGCTCAATGAGGTGTTCCTGAACTTTCATTCGCTCATCAAAGCTATAGCTCTGATTAGCTGAATTAAAGCCAATTTCCTTTTGCAATCTAGTAATCGACATAGGGATAAATTTTGCCCCTGAAACTCTGGCAAATTCTTGAGCCAAAGTAGTCTTGCCGGTTCTATGACTGCCACATAATGCAAAAATCATGCTTCCACCTTATCCGCACGAGCTTGGGCTTGTTCATTTGAATAAGTGCCTTTGCTATAGCGCTTACCCAATTTTGCCATATTCGCCGCAATCGTTTCCTCACGGCTTACCCCGATGATTTGGCGAATACGTTCCATGTAGAACTCTAAATCACCAAGTTCTTCAATCACGTTTTCACGATCTAGCGGTTTGCCGTAAATTGCATGTTTCTTGATTGCGTCAAGAAGTTCACCAGATTCACCTGAAACACCGACACCCATGTGAAGTAAATCGGCTTGCTCTGGTGTCATATCATTCAGGATGTCCTGACCTTTTTTCACCAAAGCCGTGACCATTTCGCTAAAAATGATTTGATCAGCCAACTTTGTTCTCCAAGTTAGTTACACGCGAATTCAAGCTATTGATTGAATTGCCTTGAGTGACATTCACTCCTTCTGCATTATTCATGCGGCTTGTCAAAGTTGAAATTGAGGTGCTTTGACTAGCGTTAGTGTTTTCAACATTTGTAACGCGATTAGCAAGAGTATTAACGGAAGCAACATCAGCCTTTTGAGTCAATTGGCTCTTAAGGTTGTTAATTTCCATTTCGATCTGTTCGTTAGTCATAGTCATGTGCTATCTCCTGTTAATGACATAAACGGTTTAGACTTTTATTTTCTTTTTGACCTCAAGGTCTTCATTACCTGCGGCTTGATAAGCTGCGGTCAAATGCTCAATTGCAGCATCAATGTGGCGATTAAATTCAGGATTGATGCGCTCTAGGTAATACTGATGCCTAGTCAGGTGGTCATTCACCATGCTTAAAAGGACATAAGATGTATGTAATGCCTCATGTCTGAACCACTTAGGATTTACCTTCGTTTTACTCATTACCCGTTCATCTCCTGAAAGACTTCCGTTAATGCTTTTCGTGTTTTGATAGCGCGCGCAATTTCGACATTGTTATCTTCAATGCGAGTTGTAGCGGATCGAATTAATTCATTTTGAACATCGTTTTCCTCTAGCAGGCGCTCTTCTAAATCGAAAAGCTCACTCAGCTTTTGCTCAAGATCAGCCGTGATATGGCGAACTGTTTTAGGCTTGACTTGGCCCATGCCAACTTTTTCTTCAAGATGTTCGGTAGCTTTACTTTGTCCGATTCCAAAAATATTCATGACTTACTCCTTGTTTTTCGATAAGAAGATTTCTGCTTCAATGAATTTGCGATGTTGTAACCAGCCTTTTAGATTCCCGTGCATTGTTGGGTTGGCATACTTTTCCGTGCGGTGATCAAAGCTGTCAGGTGTTGCTTGGTGCTCAAAAGGTGAAGCATGCAAAGGTTCAGCTCCGACCAAGCGTTCGCAAAGTTTTAAATCTTCACCAACATTTGATTTATTGCCGTAATGGTTCAAGAAAGAGACGCGGCAACAACGGGCACCAGATACCTTTTTTAATACCTCGATTTTGTGCTGCTTCCGTTCCTCGTCTGTGATATATGGCAAGTGCCATTCACCAAATTTGAGCTTTTTAGGTGTTGAAGTACGCATTGCTTTTTCAATGAGATAAGCAACAGCGAAGATTTCGAACTGTGCGTCCTCATGGATACGGAGATCGAAAAAGTTATCCATTTCCGTAGAGCTAAGAACCACATGCATAAATTGCCAAGGCATCAATAAGCGGTTGGCCGTTTGCTTGTGCAGTCCTAATTTCATTAAGGACCATACAACACCGCACATCAGGCGACCTGACCATTTCCATGCAAATCGGCACAAGCGAATCTTGCGTTTTGAAAACTGTTCATTCGCTTGCATGCCAGCCTTGTTTTTGCCCCAAAAGATTGGATATGCCGGATTGTTCCAGACTTGCTGAATGATCTTTGAAATAGGAATGGCGCGGTTTGATGCTGCATTACGGCTAAATACACGGTGAGTCATCATTTCGGCATGTATTGGTAACCAATACATAAGCTCAAAGGTGACAAGGCGATCGCCGTATTCATTGATGCTGTCTGCCAAGATTTTTACTTTGATTTGACCTTCCTCAATTGCTTTATCAATGAGGTGTACGAGGTCGAAATTAGTAATTTGCAATTTAGCTCCTCCTTACCAAACCAAAGCACCGCCAACTTTGTAGTCAGTGACGCGGGTTTCGAAGAAGTTCTTTTCTGACGTATTAGGTTTAGAGAACTGCTCAACCCAAGGGAATGGATTTTTTACGCCTGGATATGGCACAAACGGCGCTTGAATTTGTTCAGCACGGAGGTTTGCAAGATGCTTGATGTAATCCTCAATAGCTTTAGGATTCGTTACGCCTTTAGTAATGTATTTCCCCCAACTGATTTCCATTTCTGATGAAGTCAGGAACACTTCAAGAGCTTTATTCCAGAAGGATTGGGTAAAGACGTCATTATTTTCGTGACGAAGGGTGTCTAGCATATGTACGAACAAATCTAGGTGCGTTCCTTCTTCATCACGTTGGATATAGCGAATCATGTCGGCTGAACCTAACATTTCACCCTTATCGGCAAGCAGATAGAACGAAAGGAAACCAGAGAAGAAATAAACACCTTCAAGCAAGACGTTTGATACACATGAAAGGGCAAAGCCTTCAGCCGAGAAATTTTCACCGAGTAATCGCGACTGTTTGAGAATGAACTGGTTTTTTTGAGCCAATAACCCATCACGTTCAAATGTCATGTAAACGCTCATTGGATCAAGACTGACTGTCTCAATGATCGTGGCGTATGACTTGACGTGTAGCGCTTCTTCCCATGCTTGACGTGACAAACACATGGAAACTTCCGGAGAGGTTACGTGTTTTGCAATATTCTGGTTGATGTTGTTGAATTGAATGCCGTCTAGGTTTGACAAGAAAGCTAATGCTTTATCAAACATGAAACGATCTGCGGCATTTAAGCGGTTATAACTGGCAACATCATCTGCCATATTTACGACATGCGGAAACCACGTATTATTTTCCATGCGGTCGAGAATGCCTTTTGCCCATGTATGCTTCATCGGGCTAATTGCCATTAGGTCATCCTTGGGACCTAAAATTAGACGTCGGTCATTAATACGATTTGCGTAAGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP034093|103888:109351|107437_108349_-|QAB42477.1|DBSCAN-SWA MQITNFDLVHLIDKAIEEGQIKVKILADSINEYGDRLVTFELMYWLPIHAEMMTHRVFSRNAASNRAIPISKIIQQVWNNPAYPIFWGKNKAGMQANEQFSKRKIRLCRFAWKWSGRLMCGVVWSLMKLGLHKQTANRLLMPWQFMHVVLSSTEMDNFFDLRIHEDAQFEIFAVAYLIEKAMRTSTPKKLKFGEWHLPYITDEERKQHKIEVLKKVSGARCCRVSFLNHYGNKSNVGEDLKLCERLVGAEPLHASPFEHQATPDSFDHRTEKYANPTMHGNLKGWLQHRKFIEAEIFLSKNKE >CP034093|103888:109351|107149_107434_-|QAB42476.1|DBSCAN-SWA MNIFGIGQSKATEHLEEKVGMGQVKPKTVRHITADLEQKLSELFDLEERLLEENDVQNELIRSATTRIEDNNVEIARAIKTRKALTEVFQEMNG >CP034093|103888:109351|106922_107150_-|QAB42475.1|DBSCAN-SWA MSKTKVNPKWFRHEALHTSYVLLSMVNDHLTRHQYYLERINPEFNRHIDAAIEHLTAAYQAAGNEDLEVKKKIKV >CP034093|103888:109351|106276_106642_-|QAB42473.1|DBSCAN-SWA MADQIIFSEMVTALVKKGQDILNDMTPEQADLLHMGVGVSGESGELLDAIKKHAIYGKPLDRENVIEELGDLEFYMERIRQIIGVSREETIAANMAKLGKRYSKGTYSNEQAQARADKVEA >CP034093|103888:109351|106634_106892_-|QAB42474.1|DBSCAN-SWA MTMTNEQIEMEINNLKSQLTQKADVASVNTLANRVTNVENTNASQSTSISTLTSRMNNAEGVNVTQGNSINSLNSRVTNLENKVG >CP034093|103888:109351|103888_104428_-|QAB42470.1|DBSCAN-SWA MIPYILGVDTETTGLEVENGDKIIEIALIKYDLDGAKLEEFVQRIDPERNIDPKAQAVHGISYSDLIGCPKFVDIAEEVASIVNHASLLVAHNFAFDGPFIATELKRAGMTPKKVSSFCTMEYGRWATFDGKYPKLADLCFSLGVEYDASAAHAASYDVDVMMQCFFKARERGFFQVEV >CP034093|103888:109351|104681_105266_-|QAB42471.1|DBSCAN-SWA MNSCFIFPLKIHWLMLFDKFLTGAMLGLGFIVAIWTVIKLTQKPKKERKPHHGVDNYFYAFFVCIIAAILTFLFNSTLFNWVIALFAISMTFVCAITHTEADFCKETFNAIQENQNARSNQAPALDRDYSNITGTSFYVGQTVVYVDDFMPDRTETIELIEDGYAYFAKGSRRCILEMIRPATAIETRIGERQE >CP034093|103888:109351|108361_109351_-|QAB42478.1|DBSCAN-SWA MTYANRINDRRLILGPKDDLMAISPMKHTWAKGILDRMENNTWFPHVVNMADDVASYNRLNAADRFMFDKALAFLSNLDGIQFNNINQNIAKHVTSPEVSMCLSRQAWEEALHVKSYATIIETVSLDPMSVYMTFERDGLLAQKNQFILKQSRLLGENFSAEGFALSCVSNVLLEGVYFFSGFLSFYLLADKGEMLGSADMIRYIQRDEEGTHLDLFVHMLDTLRHENNDVFTQSFWNKALEVFLTSSEMEISWGKYITKGVTNPKAIEDYIKHLANLRAEQIQAPFVPYPGVKNPFPWVEQFSKPNTSEKNFFETRVTDYKVGGALVW >CP034093|103888:109351|105608_106280_-|QAB42472.1|DBSCAN-SWA MIFALCGSHRTGKTTLAQEFARVSGAKFIPMSITRLQKEIGFNSANQSYSFDERMKVQEHLIERLNDIYEANYHIDAVADRSPIDLMAYALIHAGPDITEEQSKRLMRYIDRCAQVARDHCIGILLVQPGIELKEDEKSAPAALGFIEHLNSLIFGLINDERVNEVPMFYIPRNVTNLKRRVAVCSDALARSMLRNMDNDRVFNWNSSESGFNAYFTPSSLPQ |
9 | Pseudomonas_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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