Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP023672 | Clostridium septicum strain DSM 7534 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP023671 | Clostridium septicum strain DSM 7534 chromosome, complete genome | 4 crisprs | DEDDh,cas3,cas2,cas1,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL,DinG,csx1,csa3 | 0 | 9 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP023671_1 | 356529-358370 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP023671_1
|
28 spacers
spacers of CP023671_1
>1.1|356557|35|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTCCTCCATATTTTCCCATCGTTTTTGAACTAA >1.2|356620|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATACTCAAATATTCTGTTTATTTCCTCTAAACTGTA >1.3|356685|36|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGAATCCATAAAACGCTCCTTTTTAAATAAATAAA >1.4|356749|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGTATACAATTCAGGATTATAAGACGCGTAAAAAGA >1.5|356814|36|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGACCAAGTTAACAAAATTTGTAGAGTATCAAACTT >1.6|356878|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTGAATAACTCTATCAATCTTGAATGAGCCACCAAA >1.7|356943|36|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGTAAACAGCCATCAGCTTTCTTGTACTTGCTATT >1.8|357007|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAACAACGATATATACGCTATATTAAAAAATTACCC >1.9|357072|36|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTCCATTCGATGCGATTGTAAAAGGTATTCGTGA >1.10|357136|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCCGAAAACACTTTTGTAGAAGATGAACGCTTCCTAC >1.11|357201|36|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTCTGGAGGTGATTGTTGTGATTGAAGCTTTCAC >1.12|357265|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATGTTATGCAAACGTTACATTTGATAATTTTGATAT >1.13|357330|39|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAAAAAATTACTTATGATTCTATTAATTATCTTGCTCA >1.14|357397|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAAGACAGGTTCTTCTAGTTTGCGTGGTGGAATTGA >1.15|357462|38|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGACAAAATTGGTAGCTGTAAATGATTTGCCGTGACG >1.16|357528|38|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTGCATCATTAGCTGTATTATGAACACAAATACCTAC >1.17|357594|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGATATTCTAGAACTAAGCATGATTGGGTGAGAGAA >1.18|357659|36|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAAACTCACATTCCTTGCATTTAGTGTTCATGCAA >1.19|357723|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACTAATAGTATAACTGGTCTTTTTAAAGAAGTTGA >1.20|357788|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTAGATAATGGGTATAATTTTACAAAGACAAGCGA >1.21|357853|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTACAATTTAAATACTTTAGCAGATAATGTTGCCAA >1.22|357918|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAGTTCTAACATAGCCTTAATAAATTCTTTTTTTTG >1.23|357983|36|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATACTAAATATAATACATCTAGTATATATGCACTTT >1.24|358047|38|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTATAGATAAGATATTCCATCTACTAAAAACCCTTAC >1.25|358113|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATAGATTTTGACACTACTTTAGAACATAAATTGTT >1.26|358178|36|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTTATAGCAAAGCAAGGCAAGTATAATCCTACAA >1.27|358242|35|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTATAGCGAAGCGTAGCTAAATAAATATATCTTT >1.28|358305|38|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT GATATAAAATCAATATTTTATCTATTAATTTTTACAAA |
cas2,cas1,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP023671_1
The CRISPR arrays of CP023671_1 >merge|CP023671|1|356529-358370|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTACATTCCACTAGTTAAAATAAAACACTTCCTCCATATTTTCCCATCGTTTTTGAACTAAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACAATACTCAAATATTCTGTTTATTTCCTCTAAACTGTAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACAAGAATCCATAAAACGCTCCTTTTTAAATAAATAAAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACCTGTATACAATTCAGGATTATAAGACGCGTAAAAAGAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACAGACCAAGTTAACAAAATTTGTAGAGTATCAAACTTATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACCTTGAATAACTCTATCAATCTTGAATGAGCCACCAAAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACCCGTAAACAGCCATCAGCTTTCTTGTACTTGCTATTATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACACAACAACGATATATACGCTATATTAAAAAATTACCCATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACAAGTCCATTCGATGCGATTGTAAAAGGTATTCGTGAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACCCCGAAAACACTTTTGTAGAAGATGAACGCTTCCTACATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACAATTCTGGAGGTGATTGTTGTGATTGAAGCTTTCACATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACAATGTTATGCAAACGTTACATTTGATAATTTTGATATATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACGCAAAAAATTACTTATGATTCTATTAATTATCTTGCTCAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACATAAGACAGGTTCTTCTAGTTTGCGTGGTGGAATTGAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACTCGACAAAATTGGTAGCTGTAAATGATTTGCCGTGACGATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACGGTGCATCATTAGCTGTATTATGAACACAAATACCTACATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACTAGATATTCTAGAACTAAGCATGATTGGGTGAGAGAAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACCAAAACTCACATTCCTTGCATTTAGTGTTCATGCAAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACTAACTAATAGTATAACTGGTCTTTTTAAAGAAGTTGAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACGATTAGATAATGGGTATAATTTTACAAAGACAAGCGAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACTTTACAATTTAAATACTTTAGCAGATAATGTTGCCAAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACCAAGTTCTAACATAGCCTTAATAAATTCTTTTTTTTGATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACATACTAAATATAATACATCTAGTATATATGCACTTTATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACGCTATAGATAAGATATTCCATCTACTAAAAACCCTTACATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACATATAGATTTTGACACTACTTTAGAACATAAATTGTTATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACTCTTTATAGCAAAGCAAGGCAAGTATAATCCTACAAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACTCTATAGCGAAGCGTAGCTAAATAAATATATCTTTATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACGATATAAAATCAATATTTTATCTATTAATTTTTACAAAATTTACATTCCACTAGAGTCTGTCAATA >CP023671|1|1|356529-358304|PILER-CR ATTTACATTCCACTAGTTAAAATAAAAC ACTTCCTCCATATTTTCCCATCGTTTTTGAACTAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AATACTCAAATATTCTGTTTATTTCCTCTAAACTGTA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AAGAATCCATAAAACGCTCCTTTTTAAATAAATAAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CTGTATACAATTCAGGATTATAAGACGCGTAAAAAGA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AGACCAAGTTAACAAAATTTGTAGAGTATCAAACTT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CTTGAATAACTCTATCAATCTTGAATGAGCCACCAAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CCGTAAACAGCCATCAGCTTTCTTGTACTTGCTATT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC ACAACAACGATATATACGCTATATTAAAAAATTACCC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AAGTCCATTCGATGCGATTGTAAAAGGTATTCGTGA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CCCGAAAACACTTTTGTAGAAGATGAACGCTTCCTAC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AATTCTGGAGGTGATTGTTGTGATTGAAGCTTTCAC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AATGTTATGCAAACGTTACATTTGATAATTTTGATAT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GCAAAAAATTACTTATGATTCTATTAATTATCTTGCTCA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC ATAAGACAGGTTCTTCTAGTTTGCGTGGTGGAATTGA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TCGACAAAATTGGTAGCTGTAAATGATTTGCCGTGACG ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GGTGCATCATTAGCTGTATTATGAACACAAATACCTAC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TAGATATTCTAGAACTAAGCATGATTGGGTGAGAGAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CAAAACTCACATTCCTTGCATTTAGTGTTCATGCAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TAACTAATAGTATAACTGGTCTTTTTAAAGAAGTTGA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GATTAGATAATGGGTATAATTTTACAAAGACAAGCGA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TTTACAATTTAAATACTTTAGCAGATAATGTTGCCAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CAAGTTCTAACATAGCCTTAATAAATTCTTTTTTTTG ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC ATACTAAATATAATACATCTAGTATATATGCACTTT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GCTATAGATAAGATATTCCATCTACTAAAAACCCTTAC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC ATATAGATTTTGACACTACTTTAGAACATAAATTGTT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TCTTTATAGCAAAGCAAGGCAAGTATAATCCTACAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TCTATAGCGAAGCGTAGCTAAATAAATATATCTTT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC >CP023671|1|1|356529-358370|CRISPRCasFinder ATTTACATTCCACTAGTTAAAATAAAAC ACTTCCTCCATATTTTCCCATCGTTTTTGAACTAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AATACTCAAATATTCTGTTTATTTCCTCTAAACTGTA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AAGAATCCATAAAACGCTCCTTTTTAAATAAATAAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CTGTATACAATTCAGGATTATAAGACGCGTAAAAAGA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AGACCAAGTTAACAAAATTTGTAGAGTATCAAACTT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CTTGAATAACTCTATCAATCTTGAATGAGCCACCAAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CCGTAAACAGCCATCAGCTTTCTTGTACTTGCTATT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC ACAACAACGATATATACGCTATATTAAAAAATTACCC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AAGTCCATTCGATGCGATTGTAAAAGGTATTCGTGA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CCCGAAAACACTTTTGTAGAAGATGAACGCTTCCTAC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AATTCTGGAGGTGATTGTTGTGATTGAAGCTTTCAC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AATGTTATGCAAACGTTACATTTGATAATTTTGATAT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GCAAAAAATTACTTATGATTCTATTAATTATCTTGCTCA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC ATAAGACAGGTTCTTCTAGTTTGCGTGGTGGAATTGA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TCGACAAAATTGGTAGCTGTAAATGATTTGCCGTGACG ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GGTGCATCATTAGCTGTATTATGAACACAAATACCTAC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TAGATATTCTAGAACTAAGCATGATTGGGTGAGAGAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CAAAACTCACATTCCTTGCATTTAGTGTTCATGCAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TAACTAATAGTATAACTGGTCTTTTTAAAGAAGTTGA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GATTAGATAATGGGTATAATTTTACAAAGACAAGCGA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TTTACAATTTAAATACTTTAGCAGATAATGTTGCCAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CAAGTTCTAACATAGCCTTAATAAATTCTTTTTTTTG ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC ATACTAAATATAATACATCTAGTATATATGCACTTT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GCTATAGATAAGATATTCCATCTACTAAAAACCCTTAC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC ATATAGATTTTGACACTACTTTAGAACATAAATTGTT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TCTTTATAGCAAAGCAAGGCAAGTATAATCCTACAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TCTATAGCGAAGCGTAGCTAAATAAATATATCTTT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GATATAAAATCAATATTTTATCTATTAATTTTTACAAA ATTTACATTCCACTAGAGTCTGTCAATA >CP023671|1|1|356529-358370|CRT ATTTACATTCCACTAGTTAAAATAAAAC ACTTCCTCCATATTTTCCCATCGTTTTTGAACTAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AATACTCAAATATTCTGTTTATTTCCTCTAAACTGTA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AAGAATCCATAAAACGCTCCTTTTTAAATAAATAAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CTGTATACAATTCAGGATTATAAGACGCGTAAAAAGA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AGACCAAGTTAACAAAATTTGTAGAGTATCAAACTT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CTTGAATAACTCTATCAATCTTGAATGAGCCACCAAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CCGTAAACAGCCATCAGCTTTCTTGTACTTGCTATT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC ACAACAACGATATATACGCTATATTAAAAAATTACCC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AAGTCCATTCGATGCGATTGTAAAAGGTATTCGTGA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CCCGAAAACACTTTTGTAGAAGATGAACGCTTCCTAC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AATTCTGGAGGTGATTGTTGTGATTGAAGCTTTCAC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AATGTTATGCAAACGTTACATTTGATAATTTTGATAT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GCAAAAAATTACTTATGATTCTATTAATTATCTTGCTCA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC ATAAGACAGGTTCTTCTAGTTTGCGTGGTGGAATTGA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TCGACAAAATTGGTAGCTGTAAATGATTTGCCGTGACG ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GGTGCATCATTAGCTGTATTATGAACACAAATACCTAC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TAGATATTCTAGAACTAAGCATGATTGGGTGAGAGAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CAAAACTCACATTCCTTGCATTTAGTGTTCATGCAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TAACTAATAGTATAACTGGTCTTTTTAAAGAAGTTGA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GATTAGATAATGGGTATAATTTTACAAAGACAAGCGA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TTTACAATTTAAATACTTTAGCAGATAATGTTGCCAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CAAGTTCTAACATAGCCTTAATAAATTCTTTTTTTTG ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC ATACTAAATATAATACATCTAGTATATATGCACTTT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GCTATAGATAAGATATTCCATCTACTAAAAACCCTTAC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC ATATAGATTTTGACACTACTTTAGAACATAAATTGTT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TCTTTATAGCAAAGCAAGGCAAGTATAATCCTACAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TCTATAGCGAAGCGTAGCTAAATAAATATATCTTT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GATATAAAATCAATATTTTATCTATTAATTTTTACAAA ATTTACATTCCACTAGAGTCTGTCAATA
>CP023671.1|AYE33251.1|355962_356247_-|hypothetical-protein MYSFILEVLFIMVPLAISLIIYMKIDKKYAITNIISLKLGIKREWMAFFCFCFTILIMLTINMINEYVINILPIVYFILGGIFTGMVVGVKYSK >CP023671.1|AYE33250.1|353406_354537_+|hypothetical-protein MFIKSCNNQNKELTLSIYNNNVALVNELRDLFKGKVINTIEYCDISKFIYENSVIIENVEVSQLNFNYKCCNNDKNKSENSSCNDCLSSFVNSIDIEVDSINSKNIRVYYLTAGVKWDSSYTLILNENKLSMQSWINISNKSGISYNHANLKCISGEVNFDSLSPIPYSKTSYANSEAVENPKLQPLDDYYIYNLSGKYILENNSTKRIKNFSAENIEYTKLYDFGYYNTNADILIKLNNTEDNNLGIPMPSGTVNIYASLNDSLQFLGSDSIKNTPINQELNLNIGKAFDITCERKIINYQKYDNYEFKEIELIINNSKDEDVPIKICYPIFAPWEITSTTDNYEKDSNGNPCFKVKVSANSKKRILFTYKTKIS >CP023671.1|AYE33249.1|352681_353092_-|UDP-N-acetylglucosamine-pyrophosphorylase MKYELTIYELGKLLKNIDSKYNISLLSKIKLSGGWMTMTGEISVIDVPTEAILLKGNNIITLKLKNNNENGSEIKITGLKDSKFVIDISATKYKEIKPGMLNLDVIKVNNNQCKLRIDEDMIFTIDTSVDKVIKCL >CP023671.1|AYE33248.1|351798_352242_-|MarR-family-transcriptional-regulator MFRLEECVGFITSTASKELSDEFNRRLLLKGSTRVQWIALYYIGNEKGISQKVLADKINVKESTIVRLIDRMEKEGIVKREKEETDRRVTNIFLTEKGENLKEELLPLGEKFSDDITKGIKQEHIDIFNSVLRKMVLNINMNVDNIT >CP023671.1|AYE33247.1|351373_351727_-|carboxymuconolactone-decarboxylase-family-protein MKKDPRQMLNDFMQGLNSVGETNGENVQAFMNLLGATYSEGKLTTKTKELISVAIAAYNRCEYCIVFHVYKALEAGANREEIMEAAMVAVAFGGGPSMAYSTTLLKDSIDEFEKDFK >CP023671.1|AYE33246.1|349599_351291_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase MDIKLESLTGHDKSAKVGKINVSIGDMVEINTVLLQVETGKGNSPIKAKGSYKIKEIKVNEGEEVKIGDTLIKVEVLEENNSNKNNFNYFGNMIKGKDEKIETDLIVIGAGPGGYVSAIYAAKRGLKVVSIEKENLGGTCLNVGCIPTKALVKSSEVYYNLVNCNEFGLECENPKVNMGKIIDRKDKIKNTLVSGIDYLLNKNEVKQIKGEASFKDKRTIEVKSGRDKYSITGKNIIIATGSKISKINIKGIEEPFVLNSTTALSSKEKPKSITIIGGGVIGMEFAFMYSNLGVKVNVVEFADRLLTMVDSEISEEIKNIAEKKGITIFNSSKVSRIEKTENGEALVIFNKGEEEKYIVSEKVLVAIGREPNIEGLEIENANIKLNENLRGIEVSETLETNIDGIYAIGDVNNIMQLAHIASHQGIVAVDNILGENKTVDYSAVPNVIFTYPEIASVGLTEDQAKNNDIKYKTSKFYFQGNGKALTMGENEGFIKLVKDIEKDKIIGASIIGPDASSLVSTLTLIIKNNIKEDGIIETIFAHPTTGEVIHEAALELGIGGLHC >CP023671.1|AYE33245.1|348670_349606_-|lipoate--protein-ligase MLKNIIVISKSTDPYCNLAMEEYIFNNIKKNEVIFYLWQNHKTVVIGRNQNPYIECDVDYIEGNGAKIARRMSGGGTVYHDLGNLNFTFVTSKENHNIEKQILVIRKAIEKFGLSVDKSGRNDLTINNKKFSGHAFYEDDNKMFHHGTIMIDVDKLELNNILKPSKIKLKSKGIDSVKSRVINLKECNNDITLNDVFKNLIESFKEVYGEVYSIRETIGKEVKGNLLEKYKNHKWVYGESPEFNVNLETPTDIGNIQILMDIKDNVVKKVRVYSDSLNQISFSDLEQLIVKQEFNRENILKTVYYFLESFK >CP023671.1|AYE33244.1|346949_348626_+|hypothetical-protein MKKLFSILTIIFIFAFPNVVSATTKEYYIDNVNIQAEILQNGDVNVTENLGYDFNGDFNGIFRNLKLNNTLGYKISEVYSIDENGHKQLISEADNEADYTYKLIDNGDSIQIKVFCPSSNEKKSFFFNYTIEKAAKKYSDLSQLYWNFYTVENVSSIKEGSLNLSLNNSNFDSSVFHYDVFGDGDFETTYNDKSVSVNFKNLTSLLGIKLNFQKEFLNDIPEINSTAPTEVESQYQSSTDLNGKCIAFIALFISLGLGGIGFGFFINKLKFKKELEKYRSKFTFIPNEIYVEPPSSTSPALIDLLMNEKVVSKEILTPTLFYLVKKGYYTISESTYYSGKNKSNNLKEDLIFTRVHSKGLPKENHLVFLIDWFSMYEVNGSFSLQKIKKRIQSQSEAQKFINKLNEWIAEVFEDADSYTFFKTIGNKRILRNKYYNEKLKWLSYKNYLINSKENLEHKNLTNIDDPLIYATALDIDYDDIKVILNSLSKDIKRNSSEIPEFSYLYCNNYLFYSLLVNDINGDAHINIDNSPNSTSSSFGGFSSGSGFTGGGGGGSGAF >CP023671.1|AYE33243.1|345197_346826_+|aspartate-4-decarboxylase MKNRNLQREEIENIYGKISPFEFKNKLINLANGEKEKSARTLLDAGRGNPNWTASTPRQSFFTFGQFAVEESQRVIKNGDLAGMPQKDGIYKRFKEFISKNNSAPGISLLNNIIDYGVNKKSFNPDDFVYELADGIIGDNYPFPDRMLTHIEEIVHDYLVQEMCYNKLPTGKFNIFAVEGATAAMCYIFDTLKSNNLLKSRDKIAIMVPIFTPYLEIPHLPRYNLEVIYIKANELTKDHAHTWQYPKNELEKLKDSSIKALFFVNPSNPPSVSINKEGRELLVHIVKNYNKDLMIISDDVYGTFVNDFRSLMADLPYNTIGVYSLSKYFGVTGWRLGTLALHENNVFDKLLKNLSNEEKAILNKRYGDMNLNPESIPFIDRIVADSRQVALNHTAGLSTPQQVQMAFFCAFSLLDKENIYKNLTIDICHRRKKLLFEGLGLDLTEDPYDAAYYTEFDLLEWATNYYGDNFSRYLENNFKLVDVLYKLAEESSIVLLSGSGFQGPEWSIRISLANLNDEAYSTIGKVLHKILEGFVIDWKNSL >CP023671.1|AYE33242.1|344762_344957_+|hypothetical-protein MNNSANQDYIYFGLTTKECIDINDKEKTPKNNFNFSANDNCQEFYINLKSLEISKTLKLTLVDI >CP023671.1|AYE33252.1|358508_359729_-|IS256-family-transposase MSFSKEELIKILAKDPNIKTAEDIQNVLKDLFGGMLQQMLEAELDNHLGYEKHDYQNKNTTNSRNGKSRKTMKSNLGYFDLDVPRDREGSFEPEIVKKHQTDVSHLESSIIGMYAKGMTTRDIASQVNEIYGMDISPTLVSNITDKVIPMIREWQSRPLETVYPIVFMDAIHFKVRKDNTVVSKAAYAAIGVNIEGKKDVLGIWIGASESSKYWLLVLNELKNRGVKDILIASVDGLVGFNEAIRAVYPNTEIQRCIIHQIRNSSKYLSYKDLKAFNADLKLVYTASTEEVALAELDRLEEKWGEKYLIAVRSWRNNWNELSTFFKYPPEIRKIIYTTNAMESYNRQLRKVTKTKSIFPNDESLMKILYLATVDITKKWTQSIRGWAQILAQLSIFFEGRLDDQLF >CP023671.1|AYE33253.1|365456_366677_-|IS256-family-transposase MSFSKKELIKILAKDPNIKTAEDIQNVLKDLFGGMLQQMLEAELDNHLGYEKHDYQNKNTTNSRNGKSRKTMKSNLGYFDLDVPRDREGSFEPEIVKKHQTDVSHLESSIIGMYAKGMTTRDIASQVNEIYGMDISPTLVSNITDKVIPMIREWQSRPLETVYPIVFMDAIHFKVRKDNTVVSKAAYAAIGVNIEGKKDVLGIWIGASESSKYWLLVLNELKNRGVKDILIASVDGLVGFNEAIRAVYPNTEIQRCIIHQIRNSSKYLSYKDLKAFNADLKLVYTASTEEVALAELDRLEEKWGEKYLIAVRSWRNNWNELSTFFKYPPEIRKIIYTTNAMESYNRQLRKVTKTKSIFPNDESLMKILYLATVDITKKWTQSIRGWAQILAQLSIFFEGRLDDQLF >CP023671.1|AYE33254.1|368470_368734_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIITYDVNEKRVNRVRKILKKYVTWTQNSVFEGEITEGKLTKCLAEVKKNLVSAEDSLYIYRVSYSKNITKDVVGVEKNLDELFI >CP023671.1|AYE33255.1|368735_369719_-|subtype-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGKDYYVFSPGRIKRKDNTIYFINTDEEKRGIPIESIERIHFFSEVDLNSKFINYISQYKIILNFYNYYGFYSGSYYPRKKNVSGFLLVEQAVAYKDLESRLFLAKAFIDSAIHHILRNMRRYDKVPNEYFEKIAEEKERMLKANSIPEIMGAEGRIRKIYYESYQYILKNDFGFTNRNRRPPKDPLNALISFGNSVMYTAILGEVYQTQLDPTISYLHEPSTKRFSLILDISEIFKPLIIDTIIFSLINNRRLNNKDFTNEEGVCFLNDEGKKKFLTEFEKKMATSIKHRKLKRSVSYRQLIKLEGYKIIKHLINDEKYKPLKAWW >CP023671.1|AYE33256.1|372549_373284_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKRAVRLEIYQNLVNYKKPTSFQLKETYPLPPPSTVIGMVHFACDYKSYIPMNIGIQGEYNSKINDLYTRYEFAGASYEADRHNVKIDSKEQGKSYGMMRGISTAELLVDCNLVLYIQPEDDSKVEEIFEAFKNPREYISLGRREDLVQINKVEIVELKEVELEENMPLEMDSYIPVSLKNDIKSNATLYTLNKDYTLRTIKKGVETRSWNKIKVIHAVKGSTVIDEYTSLNKDLVNNSVVFLL >CP023671.1|AYE33257.1|373293_374169_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MEKKGLTASFIFEAESANYGEGVGNVTALKKISRGDGEAYSYISRQAIRYNIINQMGEDNTPLGLDGEVLQFHTDATIKDYPEIDFFGYMKTIKPIRTRSAVVRLSNAVALESFNADTEFLTNKGLLDRYNKDLKDKKNGGNIAQSEIHKSYYSYTITIDLDKVGIDENDNIEISNEEKAKRVNKLLDTILFLYRDIRGRRENLSPIFAIGGVYSIKNPFFENRLKIKNNSLRIETINSILDLNEDINNNTNIGLLKGIFNNDESIENALKPIEIGEFFKELKSKVTEYYK >CP023671.1|AYE33258.1|374168_375860_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MAKVRIELSDWMKNAGIVGFVKIINHRLNGSSQIDLKSNYIEFDTEILENFEEVYFEYLIYKYKEFISIEKIVSKYDYINLLLSKEVDEKDLAILNSHIKYTKERLKSASYKSAYEIINDSSYNLLEKEKQLKEIKIKKKQSISDVSEDIKLQCNLLKEIIEYLNEENVRKIIAAKNVIYDVIQGFWSDVSFLNKNNNKKNMYECYINDFINPVINYESSNLEKAKYTCFTCDNKIQKLSKPFAYDITWITKMGVDGSRKSSHYWNFQSDSNICPICNLIYSCIPAGFSVLNGKGLFINNNKSISKIISANNLILYSGKKIDELEQESYFNIIDSMEDKSVNEVNSEIENIQIVKFDKSNNSRPYTFNVLSKNKLEIISKNKKQLSALIGKSVKIAKDYYINIYSEVILRIYNGKNLFDLIALLTRLRISGEYKNSKIIYILISLNNNLMEGKYKVWYKDIDKFRDYGIKLRQIYGRNDENKIPGIAYRLQNALKVKNESRFMDTLLNAYTSRKQPIPIDFIEALKDVNKFQTIGYAFLIGLQGGLENRNQENNGNNIEEDNK >CP023671.1|AYE33259.1|375871_376606_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRILVEIITEKIPLNNNRYLTLSLIKNVLEKQSPELFKAMYEDDENYNYRTKPFTYSLKLNDFKIVGDEFELKGNSTISISTPDPVLGSILYNGFLLTKEYEYNKKYKLSIGRVTLLKEKKVISNEVLFKTLSPLVIKNRRGEFLKIDNENYEKELNYIANKVLESYRGFGLKESLIFQPILMKKRVAKEKIEKFTKETNKDIFYITGYEGVFKLTGNKEDLNLIYNLGLGVRRSSGFGMLQIV >CP023671.1|AYE33260.1|376730_377669_-|WYL-domain-containing-protein MSSLGNLLKMLYILKRGQKVKVKDLAEELEVDHRQIRRYKEELSEYFDIQSITGPNGGYILCDEYFPFKDILTEKEINNLKRAIDTVSYSEEYELGKAIDKINFTILNSQSESLISEQIIPYSRPKMEIEKINKMYNEINLSILSCKEIIIVYVDNKGSLTRRAIQPHKFLRFKGEYYIIATCKLRNEIRYFKLVRIKEYILTEKRFEKMKNIDELINEYKENSIGIFGGNEIEVELEINPPMANTIKERIWVDNQEVIELEDGKILFKAIMKLGPELISWVLSMGDSVKINSSEELKRQVRIKVENIFKNL >CP023671.1|AYE33261.1|378080_380666_-|hypothetical-protein MRVEESKNLNIKLSVLITLFMIFSLFSNLSTPIQAETTRKEYVTTVNDHTIGDELFQFKFSSGWIESTGVNSFYNGDEYWTNATKSFQPSYRLKFYGNKVELYGVKEQTSAICEVSIDGGDIEEVDPYNPTRVTGQKIYEKSGLTDDEHILELKITYRKNQASKNYNGEIDFAKVYHKEIPATGVEMNKESIQIEVGMTDSIKAKVLPSYSTEKNIVYLVEDESIATITEDGEITGIKEGKTNIIATIEGTEIVGKTHLTIIKAGLPLGASIGSTDFHYLQKNYDDIKSLNKTTWNDIAWIGDELNSKIVTWTKDSNVNNVIISSSNFANENGDVIGSINVEISWLKETLANIGRGNPSAPVELFPDIIHNKGDLDIEANKVASAWVNITIPRDAKPGIYNGTITVSAEGLDTPYVFNYSFEVVNLVQPLPKETKTQMEIWQHPYAVARYYGVQKEELFTENHFKYLRPSLEEYRDMGGRGVIAHIVEEAWNHQSYDSDPSMVKWTKSLDGTFKFDYIDFDRWIQFNIDLGIINPKDGFGQIKCYSIVPWNNRIEYYNELTGEKESINPTPGTAEWRVPWTEFLSNFMNHLEEKGWFNITYISMDERSMKDLIASVDLIENIRNSNGESFKISSAMNYQSGNDYSFLDKIDDISIGLSHINHNSEDMKNMAKHRQEAGLLTTIYTCTGDYPNSFTISDSSESAWTMWYSLSQNTDGFMRWSWDGWVEDPLENVSYKYWEPGDPWLIYPAEKNSETKTFYSTPRYERLKEGIRDINKAKYLMENSKELKGEIEALVKSLKRANKGNNGYGSAVAATEKDRELTNNEVKRMRNGINDFAKQYIESKGVSVESVASKHMGNMLY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP023671_2 | 359797-365277 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP023671_2
|
84 spacers
spacers of CP023671_2
>2.1|359825|36|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT GTGTGCCCCCTTGTGGGGTCTACAATTTTAGAAGGG >2.2|359889|35|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT CCTGGTCTTTATGTTTTAGATATGATAATGTTGCC >2.3|359952|38|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT ACGCACTAAAAATAAAATTTGCACCCCTTAATATAATA >2.4|360018|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT TATATTCTCTGCATAATGTTAAACAGATTCAAGGCTA >2.5|360083|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT GCGAGCAGCGTACTTAACTTGATTTTATCTACTTAAA >2.6|360148|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT AGTCAACTTTAACTTGTTCTTACTATCACGAATTCAC >2.7|360213|35|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT AAGTTTTAATAATACTATAAGAACATCTCTGTGCT >2.8|360276|38|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT TCATTTATCACTTTTTTTGGGCAACGCTACGCTATAGA >2.9|360342|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT TTATTTTATATTATATTATATATTCAGTTAATGCAAC >2.10|360407|35|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT CTTAAAAGAGATAAGAGGGAATATTTTTGTATGAT >2.11|360470|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT TTTAATTATTTTGAATTATTTTAAATTATTTTTAAAA >2.12|360535|36|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT GCCTGTTGACAAAACGGAAAAACTTGACAATGTTAA 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cas2,cas1,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP023671_2
The CRISPR arrays of CP023671_2 >merge|CP023671|2|359797-365277|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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CCTTGTGTATCTCTTATGGTGAGATAGTCATATAGAC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GAGCGAAACCCCCTCTACCCCCCTCGACACAATTT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC ATAATGAAATATACACTTACAAAGCTTTGTATCAAGA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AAGAAAATAATATATAACTATATATACCCGGGCGTGTCA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GGTGCTTTCTTGAAGCCATCATTATTAAGAAGCAAAG ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CTCGCTTAGAGGTTTAATGTCTTTATATCCTACAACAG ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GCAATTGCTGTAATCATTATCCATTTCATTTTGTT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC ATGAAATTGAACGGTTACGGAACGTATAATCCCTACTT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TTAAAAAAATATTAAAAAACCTAACTATAATAATAGA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AGTTTTAAACGAAAAACTTGTTGACAAATGCGGACAT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TTAACATTTTTCAATGATTACACGAAAATAAAAATAAC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AGAACTATGCTAATCCAAGAAGGGTTAAATCTAGATGC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GAGCTAAAAACTCTATCCCAGCTCCCGTCTACATAAT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GGAGGCTACAATTATGGAACGCTATAATATATGCGGT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TTGGTGAGTTTGATGTAGAATCAAATATCATTTCACC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TAACAAAAGTAACAAAATAACTGTTTTCACCTAAAAAT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GCTGACCCTGCCAACAACTTGCAAGTTGTGGAAAATA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GGATTGAGCATTATGCAAATGCCACTATCTAAAGAGAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC
>CP023671.1|AYE33252.1|358508_359729_-|IS256-family-transposase MSFSKEELIKILAKDPNIKTAEDIQNVLKDLFGGMLQQMLEAELDNHLGYEKHDYQNKNTTNSRNGKSRKTMKSNLGYFDLDVPRDREGSFEPEIVKKHQTDVSHLESSIIGMYAKGMTTRDIASQVNEIYGMDISPTLVSNITDKVIPMIREWQSRPLETVYPIVFMDAIHFKVRKDNTVVSKAAYAAIGVNIEGKKDVLGIWIGASESSKYWLLVLNELKNRGVKDILIASVDGLVGFNEAIRAVYPNTEIQRCIIHQIRNSSKYLSYKDLKAFNADLKLVYTASTEEVALAELDRLEEKWGEKYLIAVRSWRNNWNELSTFFKYPPEIRKIIYTTNAMESYNRQLRKVTKTKSIFPNDESLMKILYLATVDITKKWTQSIRGWAQILAQLSIFFEGRLDDQLF >CP023671.1|AYE33251.1|355962_356247_-|hypothetical-protein MYSFILEVLFIMVPLAISLIIYMKIDKKYAITNIISLKLGIKREWMAFFCFCFTILIMLTINMINEYVINILPIVYFILGGIFTGMVVGVKYSK >CP023671.1|AYE33250.1|353406_354537_+|hypothetical-protein MFIKSCNNQNKELTLSIYNNNVALVNELRDLFKGKVINTIEYCDISKFIYENSVIIENVEVSQLNFNYKCCNNDKNKSENSSCNDCLSSFVNSIDIEVDSINSKNIRVYYLTAGVKWDSSYTLILNENKLSMQSWINISNKSGISYNHANLKCISGEVNFDSLSPIPYSKTSYANSEAVENPKLQPLDDYYIYNLSGKYILENNSTKRIKNFSAENIEYTKLYDFGYYNTNADILIKLNNTEDNNLGIPMPSGTVNIYASLNDSLQFLGSDSIKNTPINQELNLNIGKAFDITCERKIINYQKYDNYEFKEIELIINNSKDEDVPIKICYPIFAPWEITSTTDNYEKDSNGNPCFKVKVSANSKKRILFTYKTKIS >CP023671.1|AYE33249.1|352681_353092_-|UDP-N-acetylglucosamine-pyrophosphorylase MKYELTIYELGKLLKNIDSKYNISLLSKIKLSGGWMTMTGEISVIDVPTEAILLKGNNIITLKLKNNNENGSEIKITGLKDSKFVIDISATKYKEIKPGMLNLDVIKVNNNQCKLRIDEDMIFTIDTSVDKVIKCL >CP023671.1|AYE33248.1|351798_352242_-|MarR-family-transcriptional-regulator MFRLEECVGFITSTASKELSDEFNRRLLLKGSTRVQWIALYYIGNEKGISQKVLADKINVKESTIVRLIDRMEKEGIVKREKEETDRRVTNIFLTEKGENLKEELLPLGEKFSDDITKGIKQEHIDIFNSVLRKMVLNINMNVDNIT >CP023671.1|AYE33247.1|351373_351727_-|carboxymuconolactone-decarboxylase-family-protein MKKDPRQMLNDFMQGLNSVGETNGENVQAFMNLLGATYSEGKLTTKTKELISVAIAAYNRCEYCIVFHVYKALEAGANREEIMEAAMVAVAFGGGPSMAYSTTLLKDSIDEFEKDFK >CP023671.1|AYE33246.1|349599_351291_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase MDIKLESLTGHDKSAKVGKINVSIGDMVEINTVLLQVETGKGNSPIKAKGSYKIKEIKVNEGEEVKIGDTLIKVEVLEENNSNKNNFNYFGNMIKGKDEKIETDLIVIGAGPGGYVSAIYAAKRGLKVVSIEKENLGGTCLNVGCIPTKALVKSSEVYYNLVNCNEFGLECENPKVNMGKIIDRKDKIKNTLVSGIDYLLNKNEVKQIKGEASFKDKRTIEVKSGRDKYSITGKNIIIATGSKISKINIKGIEEPFVLNSTTALSSKEKPKSITIIGGGVIGMEFAFMYSNLGVKVNVVEFADRLLTMVDSEISEEIKNIAEKKGITIFNSSKVSRIEKTENGEALVIFNKGEEEKYIVSEKVLVAIGREPNIEGLEIENANIKLNENLRGIEVSETLETNIDGIYAIGDVNNIMQLAHIASHQGIVAVDNILGENKTVDYSAVPNVIFTYPEIASVGLTEDQAKNNDIKYKTSKFYFQGNGKALTMGENEGFIKLVKDIEKDKIIGASIIGPDASSLVSTLTLIIKNNIKEDGIIETIFAHPTTGEVIHEAALELGIGGLHC >CP023671.1|AYE33245.1|348670_349606_-|lipoate--protein-ligase MLKNIIVISKSTDPYCNLAMEEYIFNNIKKNEVIFYLWQNHKTVVIGRNQNPYIECDVDYIEGNGAKIARRMSGGGTVYHDLGNLNFTFVTSKENHNIEKQILVIRKAIEKFGLSVDKSGRNDLTINNKKFSGHAFYEDDNKMFHHGTIMIDVDKLELNNILKPSKIKLKSKGIDSVKSRVINLKECNNDITLNDVFKNLIESFKEVYGEVYSIRETIGKEVKGNLLEKYKNHKWVYGESPEFNVNLETPTDIGNIQILMDIKDNVVKKVRVYSDSLNQISFSDLEQLIVKQEFNRENILKTVYYFLESFK >CP023671.1|AYE33244.1|346949_348626_+|hypothetical-protein MKKLFSILTIIFIFAFPNVVSATTKEYYIDNVNIQAEILQNGDVNVTENLGYDFNGDFNGIFRNLKLNNTLGYKISEVYSIDENGHKQLISEADNEADYTYKLIDNGDSIQIKVFCPSSNEKKSFFFNYTIEKAAKKYSDLSQLYWNFYTVENVSSIKEGSLNLSLNNSNFDSSVFHYDVFGDGDFETTYNDKSVSVNFKNLTSLLGIKLNFQKEFLNDIPEINSTAPTEVESQYQSSTDLNGKCIAFIALFISLGLGGIGFGFFINKLKFKKELEKYRSKFTFIPNEIYVEPPSSTSPALIDLLMNEKVVSKEILTPTLFYLVKKGYYTISESTYYSGKNKSNNLKEDLIFTRVHSKGLPKENHLVFLIDWFSMYEVNGSFSLQKIKKRIQSQSEAQKFINKLNEWIAEVFEDADSYTFFKTIGNKRILRNKYYNEKLKWLSYKNYLINSKENLEHKNLTNIDDPLIYATALDIDYDDIKVILNSLSKDIKRNSSEIPEFSYLYCNNYLFYSLLVNDINGDAHINIDNSPNSTSSSFGGFSSGSGFTGGGGGGSGAF >CP023671.1|AYE33243.1|345197_346826_+|aspartate-4-decarboxylase MKNRNLQREEIENIYGKISPFEFKNKLINLANGEKEKSARTLLDAGRGNPNWTASTPRQSFFTFGQFAVEESQRVIKNGDLAGMPQKDGIYKRFKEFISKNNSAPGISLLNNIIDYGVNKKSFNPDDFVYELADGIIGDNYPFPDRMLTHIEEIVHDYLVQEMCYNKLPTGKFNIFAVEGATAAMCYIFDTLKSNNLLKSRDKIAIMVPIFTPYLEIPHLPRYNLEVIYIKANELTKDHAHTWQYPKNELEKLKDSSIKALFFVNPSNPPSVSINKEGRELLVHIVKNYNKDLMIISDDVYGTFVNDFRSLMADLPYNTIGVYSLSKYFGVTGWRLGTLALHENNVFDKLLKNLSNEEKAILNKRYGDMNLNPESIPFIDRIVADSRQVALNHTAGLSTPQQVQMAFFCAFSLLDKENIYKNLTIDICHRRKKLLFEGLGLDLTEDPYDAAYYTEFDLLEWATNYYGDNFSRYLENNFKLVDVLYKLAEESSIVLLSGSGFQGPEWSIRISLANLNDEAYSTIGKVLHKILEGFVIDWKNSL >CP023671.1|AYE33253.1|365456_366677_-|IS256-family-transposase MSFSKKELIKILAKDPNIKTAEDIQNVLKDLFGGMLQQMLEAELDNHLGYEKHDYQNKNTTNSRNGKSRKTMKSNLGYFDLDVPRDREGSFEPEIVKKHQTDVSHLESSIIGMYAKGMTTRDIASQVNEIYGMDISPTLVSNITDKVIPMIREWQSRPLETVYPIVFMDAIHFKVRKDNTVVSKAAYAAIGVNIEGKKDVLGIWIGASESSKYWLLVLNELKNRGVKDILIASVDGLVGFNEAIRAVYPNTEIQRCIIHQIRNSSKYLSYKDLKAFNADLKLVYTASTEEVALAELDRLEEKWGEKYLIAVRSWRNNWNELSTFFKYPPEIRKIIYTTNAMESYNRQLRKVTKTKSIFPNDESLMKILYLATVDITKKWTQSIRGWAQILAQLSIFFEGRLDDQLF >CP023671.1|AYE33254.1|368470_368734_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIITYDVNEKRVNRVRKILKKYVTWTQNSVFEGEITEGKLTKCLAEVKKNLVSAEDSLYIYRVSYSKNITKDVVGVEKNLDELFI >CP023671.1|AYE33255.1|368735_369719_-|subtype-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGKDYYVFSPGRIKRKDNTIYFINTDEEKRGIPIESIERIHFFSEVDLNSKFINYISQYKIILNFYNYYGFYSGSYYPRKKNVSGFLLVEQAVAYKDLESRLFLAKAFIDSAIHHILRNMRRYDKVPNEYFEKIAEEKERMLKANSIPEIMGAEGRIRKIYYESYQYILKNDFGFTNRNRRPPKDPLNALISFGNSVMYTAILGEVYQTQLDPTISYLHEPSTKRFSLILDISEIFKPLIIDTIIFSLINNRRLNNKDFTNEEGVCFLNDEGKKKFLTEFEKKMATSIKHRKLKRSVSYRQLIKLEGYKIIKHLINDEKYKPLKAWW >CP023671.1|AYE33256.1|372549_373284_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKRAVRLEIYQNLVNYKKPTSFQLKETYPLPPPSTVIGMVHFACDYKSYIPMNIGIQGEYNSKINDLYTRYEFAGASYEADRHNVKIDSKEQGKSYGMMRGISTAELLVDCNLVLYIQPEDDSKVEEIFEAFKNPREYISLGRREDLVQINKVEIVELKEVELEENMPLEMDSYIPVSLKNDIKSNATLYTLNKDYTLRTIKKGVETRSWNKIKVIHAVKGSTVIDEYTSLNKDLVNNSVVFLL >CP023671.1|AYE33257.1|373293_374169_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MEKKGLTASFIFEAESANYGEGVGNVTALKKISRGDGEAYSYISRQAIRYNIINQMGEDNTPLGLDGEVLQFHTDATIKDYPEIDFFGYMKTIKPIRTRSAVVRLSNAVALESFNADTEFLTNKGLLDRYNKDLKDKKNGGNIAQSEIHKSYYSYTITIDLDKVGIDENDNIEISNEEKAKRVNKLLDTILFLYRDIRGRRENLSPIFAIGGVYSIKNPFFENRLKIKNNSLRIETINSILDLNEDINNNTNIGLLKGIFNNDESIENALKPIEIGEFFKELKSKVTEYYK >CP023671.1|AYE33258.1|374168_375860_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MAKVRIELSDWMKNAGIVGFVKIINHRLNGSSQIDLKSNYIEFDTEILENFEEVYFEYLIYKYKEFISIEKIVSKYDYINLLLSKEVDEKDLAILNSHIKYTKERLKSASYKSAYEIINDSSYNLLEKEKQLKEIKIKKKQSISDVSEDIKLQCNLLKEIIEYLNEENVRKIIAAKNVIYDVIQGFWSDVSFLNKNNNKKNMYECYINDFINPVINYESSNLEKAKYTCFTCDNKIQKLSKPFAYDITWITKMGVDGSRKSSHYWNFQSDSNICPICNLIYSCIPAGFSVLNGKGLFINNNKSISKIISANNLILYSGKKIDELEQESYFNIIDSMEDKSVNEVNSEIENIQIVKFDKSNNSRPYTFNVLSKNKLEIISKNKKQLSALIGKSVKIAKDYYINIYSEVILRIYNGKNLFDLIALLTRLRISGEYKNSKIIYILISLNNNLMEGKYKVWYKDIDKFRDYGIKLRQIYGRNDENKIPGIAYRLQNALKVKNESRFMDTLLNAYTSRKQPIPIDFIEALKDVNKFQTIGYAFLIGLQGGLENRNQENNGNNIEEDNK >CP023671.1|AYE33259.1|375871_376606_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRILVEIITEKIPLNNNRYLTLSLIKNVLEKQSPELFKAMYEDDENYNYRTKPFTYSLKLNDFKIVGDEFELKGNSTISISTPDPVLGSILYNGFLLTKEYEYNKKYKLSIGRVTLLKEKKVISNEVLFKTLSPLVIKNRRGEFLKIDNENYEKELNYIANKVLESYRGFGLKESLIFQPILMKKRVAKEKIEKFTKETNKDIFYITGYEGVFKLTGNKEDLNLIYNLGLGVRRSSGFGMLQIV >CP023671.1|AYE33260.1|376730_377669_-|WYL-domain-containing-protein MSSLGNLLKMLYILKRGQKVKVKDLAEELEVDHRQIRRYKEELSEYFDIQSITGPNGGYILCDEYFPFKDILTEKEINNLKRAIDTVSYSEEYELGKAIDKINFTILNSQSESLISEQIIPYSRPKMEIEKINKMYNEINLSILSCKEIIIVYVDNKGSLTRRAIQPHKFLRFKGEYYIIATCKLRNEIRYFKLVRIKEYILTEKRFEKMKNIDELINEYKENSIGIFGGNEIEVELEINPPMANTIKERIWVDNQEVIELEDGKILFKAIMKLGPELISWVLSMGDSVKINSSEELKRQVRIKVENIFKNL >CP023671.1|AYE33261.1|378080_380666_-|hypothetical-protein MRVEESKNLNIKLSVLITLFMIFSLFSNLSTPIQAETTRKEYVTTVNDHTIGDELFQFKFSSGWIESTGVNSFYNGDEYWTNATKSFQPSYRLKFYGNKVELYGVKEQTSAICEVSIDGGDIEEVDPYNPTRVTGQKIYEKSGLTDDEHILELKITYRKNQASKNYNGEIDFAKVYHKEIPATGVEMNKESIQIEVGMTDSIKAKVLPSYSTEKNIVYLVEDESIATITEDGEITGIKEGKTNIIATIEGTEIVGKTHLTIIKAGLPLGASIGSTDFHYLQKNYDDIKSLNKTTWNDIAWIGDELNSKIVTWTKDSNVNNVIISSSNFANENGDVIGSINVEISWLKETLANIGRGNPSAPVELFPDIIHNKGDLDIEANKVASAWVNITIPRDAKPGIYNGTITVSAEGLDTPYVFNYSFEVVNLVQPLPKETKTQMEIWQHPYAVARYYGVQKEELFTENHFKYLRPSLEEYRDMGGRGVIAHIVEEAWNHQSYDSDPSMVKWTKSLDGTFKFDYIDFDRWIQFNIDLGIINPKDGFGQIKCYSIVPWNNRIEYYNELTGEKESINPTPGTAEWRVPWTEFLSNFMNHLEEKGWFNITYISMDERSMKDLIASVDLIENIRNSNGESFKISSAMNYQSGNDYSFLDKIDDISIGLSHINHNSEDMKNMAKHRQEAGLLTTIYTCTGDYPNSFTISDSSESAWTMWYSLSQNTDGFMRWSWDGWVEDPLENVSYKYWEPGDPWLIYPAEKNSETKTFYSTPRYERLKEGIRDINKAKYLMENSKELKGEIEALVKSLKRANKGNNGYGSAVAATEKDRELTNNEVKRMRNGINDFAKQYIESKGVSVESVASKHMGNMLY >CP023671.1|AYE33262.1|381027_382248_-|peptidase-T MKKVEERFLEYIKIDTKSDETTGLTPSTKGQLKLAEILAEELKKIGVNKVEISENGYVYAVLEKNCDKNIPTIGFIAHMDTAPDYCGLNVNPQIVQNYDGGDIKLNDEVILSPKFSPELRDYIGKTLITTDGTTLLGADDKAGIAEIMTAIEYLVNHPEIKHGDIKIGFTPDEEIGEGADHFNVEMFKADFAYTIDGGAIGELEFENFNAAGVKVEIKGVNVHPGYAKNKMINSIMVAHEFINKLPLNEVPEKTEKYEGFSHLTDIKGSIEKTTLDFIIRDFFADTFEERKEKFKEIEKELNEVYGEGVVTVKVKEQYRNMKEKIEPIMHIVETAKKAMEDANVTPKVKPIRGGTDGARLSYMGLPTPNLFAGGENFHGKYEYIPIESMEKAVEVILNIVRIYSEK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP023671_3 | 366769-368289 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP023671_3
|
23 spacers
spacers of CP023671_3
>3.1|366797|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGTTCTTTGTCTATAGTAAAAGTTTTAGCTATCTCG >3.2|366862|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTTCCAGCCCATACTCTGTTTGCATTCTTTGTTTGC >3.3|366927|36|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTGTTACTTTTGATGATCAGATGAGTGCTATGAAT >3.4|366991|36|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATAAACACCAACTTAAACAAAAATGTTGAACTAAG >3.5|367055|36|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCCGTTGTTCTAAAGCCTATAGTAATCATTCCTAT >3.6|367119|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTATTACTACCTTTGGCTATCAAATTGCTACCTT >3.7|367184|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGGAGAATTTTTTATGAAACTTTTAGGATTAGATAA >3.8|367249|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGTAGGTTTTAAATTAATCTACTCTTTTTAATTTGT >3.9|367314|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATACTAGATCCACTTATTGAACTTCTACATGATGA >3.10|367379|36|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGCTTTCGACTTCTTATCAGTCTTTAAGCTCTGTA >3.11|367443|38|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGTTTGTATCCCTATCTCTCCATTCTCTTTAGATAA >3.12|367509|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGAGGTATTTATCAGTCAGTAACAGATGGTATAGCAC >3.13|367574|36|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCACCTTACTTTGAAGGGCAATATATTAAGCTACA >3.14|367638|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAACCTAACTATAATAATCGACGGGAGAGAGCAAA >3.15|367703|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATGGAGCAATTTAAAAAAGGGAACGATATGGAAAGG >3.16|367768|38|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGCAACTAGAAGCAAATCTAAATCAAGAGAAAGAGGG >3.17|367834|38|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTAGTTAGACTTTCGGGGGCTATATTTAAGGCTGTAA >3.18|367900|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAATAATATGTTATAATATAGTATAGGAGTTTGATA >3.19|367965|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGAAAAAAGCTAAACAATGGTTATTTAGCATATAAGG >3.20|368030|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAATAGAAGGCAGTAAATTAGTTGTTTATTCTATGGT >3.21|368095|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGACGATATTAATTAAAAGTGGTATTATTAAATCA >3.22|368160|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGTATGAACAAGGATAGATTTAAGAATATTTACTTT >3.23|368225|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATGTGTGAACATTGTAAAGAAAATAAAAGATTTGAT |
cas2,cas1,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP023671_3
The CRISPR arrays of CP023671_3 >merge|CP023671|3|366769-368289|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACTAGTTCTTTGTCTATAGTAAAAGTTTTAGCTATCTCGATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACAGTTCCAGCCCATACTCTGTTTGCATTCTTTGTTTGCATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACCCTGTTACTTTTGATGATCAGATGAGTGCTATGAATATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACTATAAACACCAACTTAAACAAAAATGTTGAACTAAGATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACTTCCGTTGTTCTAAAGCCTATAGTAATCATTCCTATATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACTTTTTATTACTACCTTTGGCTATCAAATTGCTACCTTATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACAAGGAGAATTTTTTATGAAACTTTTAGGATTAGATAAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACGAGTAGGTTTTAAATTAATCTACTCTTTTTAATTTGTATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACTTATACTAGATCCACTTATTGAACTTCTACATGATGAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACCAGCTTTCGACTTCTTATCAGTCTTTAAGCTCTGTAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACATTGTTTGTATCCCTATCTCTCCATTCTCTTTAGATAAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACGGAGGTATTTATCAGTCAGTAACAGATGGTATAGCACATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACAGCACCTTACTTTGAAGGGCAATATATTAAGCTACAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACAAAAACCTAACTATAATAATCGACGGGAGAGAGCAAAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACTATGGAGCAATTTAAAAAAGGGAACGATATGGAAAGGATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACGAGCAACTAGAAGCAAATCTAAATCAAGAGAAAGAGGGATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACGCTAGTTAGACTTTCGGGGGCTATATTTAAGGCTGTAAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACTCAATAATATGTTATAATATAGTATAGGAGTTTGATAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACGGAAAAAAGCTAAACAATGGTTATTTAGCATATAAGGATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACGAATAGAAGGCAGTAAATTAGTTGTTTATTCTATGGTATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACGTTGACGATATTAATTAAAAGTGGTATTATTAAATCAATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACTAGTATGAACAAGGATAGATTTAAGAATATTTACTTTATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAACTATGTGTGAACATTGTAAAGAAAATAAAAGATTTGATATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC >CP023671|3|3|366769-368289|PILER-CR ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TAGTTCTTTGTCTATAGTAAAAGTTTTAGCTATCTCG ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AGTTCCAGCCCATACTCTGTTTGCATTCTTTGTTTGC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CCTGTTACTTTTGATGATCAGATGAGTGCTATGAAT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TATAAACACCAACTTAAACAAAAATGTTGAACTAAG ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TTCCGTTGTTCTAAAGCCTATAGTAATCATTCCTAT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TTTTTATTACTACCTTTGGCTATCAAATTGCTACCTT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AAGGAGAATTTTTTATGAAACTTTTAGGATTAGATAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GAGTAGGTTTTAAATTAATCTACTCTTTTTAATTTGT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TTATACTAGATCCACTTATTGAACTTCTACATGATGA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CAGCTTTCGACTTCTTATCAGTCTTTAAGCTCTGTA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC ATTGTTTGTATCCCTATCTCTCCATTCTCTTTAGATAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GGAGGTATTTATCAGTCAGTAACAGATGGTATAGCAC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AGCACCTTACTTTGAAGGGCAATATATTAAGCTACA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AAAAACCTAACTATAATAATCGACGGGAGAGAGCAAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC 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ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TTTTTATTACTACCTTTGGCTATCAAATTGCTACCTT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AAGGAGAATTTTTTATGAAACTTTTAGGATTAGATAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GAGTAGGTTTTAAATTAATCTACTCTTTTTAATTTGT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TTATACTAGATCCACTTATTGAACTTCTACATGATGA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC CAGCTTTCGACTTCTTATCAGTCTTTAAGCTCTGTA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC ATTGTTTGTATCCCTATCTCTCCATTCTCTTTAGATAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GGAGGTATTTATCAGTCAGTAACAGATGGTATAGCAC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AGCACCTTACTTTGAAGGGCAATATATTAAGCTACA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AAAAACCTAACTATAATAATCGACGGGAGAGAGCAAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TATGGAGCAATTTAAAAAAGGGAACGATATGGAAAGG ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GAGCAACTAGAAGCAAATCTAAATCAAGAGAAAGAGGG ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GCTAGTTAGACTTTCGGGGGCTATATTTAAGGCTGTAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TCAATAATATGTTATAATATAGTATAGGAGTTTGATA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GGAAAAAAGCTAAACAATGGTTATTTAGCATATAAGG ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC 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ATTGTTTGTATCCCTATCTCTCCATTCTCTTTAGATAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GGAGGTATTTATCAGTCAGTAACAGATGGTATAGCAC ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AGCACCTTACTTTGAAGGGCAATATATTAAGCTACA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC AAAAACCTAACTATAATAATCGACGGGAGAGAGCAAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TATGGAGCAATTTAAAAAAGGGAACGATATGGAAAGG ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GAGCAACTAGAAGCAAATCTAAATCAAGAGAAAGAGGG ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GCTAGTTAGACTTTCGGGGGCTATATTTAAGGCTGTAA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TCAATAATATGTTATAATATAGTATAGGAGTTTGATA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GGAAAAAAGCTAAACAATGGTTATTTAGCATATAAGG ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GAATAGAAGGCAGTAAATTAGTTGTTTATTCTATGGT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC GTTGACGATATTAATTAAAAGTGGTATTATTAAATCA ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TAGTATGAACAAGGATAGATTTAAGAATATTTACTTT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC TATGTGTGAACATTGTAAAGAAAATAAAAGATTTGAT ATTTACATTCCACTAGTTAAGATAAAAC
>CP023671.1|AYE33253.1|365456_366677_-|IS256-family-transposase MSFSKKELIKILAKDPNIKTAEDIQNVLKDLFGGMLQQMLEAELDNHLGYEKHDYQNKNTTNSRNGKSRKTMKSNLGYFDLDVPRDREGSFEPEIVKKHQTDVSHLESSIIGMYAKGMTTRDIASQVNEIYGMDISPTLVSNITDKVIPMIREWQSRPLETVYPIVFMDAIHFKVRKDNTVVSKAAYAAIGVNIEGKKDVLGIWIGASESSKYWLLVLNELKNRGVKDILIASVDGLVGFNEAIRAVYPNTEIQRCIIHQIRNSSKYLSYKDLKAFNADLKLVYTASTEEVALAELDRLEEKWGEKYLIAVRSWRNNWNELSTFFKYPPEIRKIIYTTNAMESYNRQLRKVTKTKSIFPNDESLMKILYLATVDITKKWTQSIRGWAQILAQLSIFFEGRLDDQLF >CP023671.1|AYE33252.1|358508_359729_-|IS256-family-transposase MSFSKEELIKILAKDPNIKTAEDIQNVLKDLFGGMLQQMLEAELDNHLGYEKHDYQNKNTTNSRNGKSRKTMKSNLGYFDLDVPRDREGSFEPEIVKKHQTDVSHLESSIIGMYAKGMTTRDIASQVNEIYGMDISPTLVSNITDKVIPMIREWQSRPLETVYPIVFMDAIHFKVRKDNTVVSKAAYAAIGVNIEGKKDVLGIWIGASESSKYWLLVLNELKNRGVKDILIASVDGLVGFNEAIRAVYPNTEIQRCIIHQIRNSSKYLSYKDLKAFNADLKLVYTASTEEVALAELDRLEEKWGEKYLIAVRSWRNNWNELSTFFKYPPEIRKIIYTTNAMESYNRQLRKVTKTKSIFPNDESLMKILYLATVDITKKWTQSIRGWAQILAQLSIFFEGRLDDQLF >CP023671.1|AYE33251.1|355962_356247_-|hypothetical-protein MYSFILEVLFIMVPLAISLIIYMKIDKKYAITNIISLKLGIKREWMAFFCFCFTILIMLTINMINEYVINILPIVYFILGGIFTGMVVGVKYSK >CP023671.1|AYE33250.1|353406_354537_+|hypothetical-protein MFIKSCNNQNKELTLSIYNNNVALVNELRDLFKGKVINTIEYCDISKFIYENSVIIENVEVSQLNFNYKCCNNDKNKSENSSCNDCLSSFVNSIDIEVDSINSKNIRVYYLTAGVKWDSSYTLILNENKLSMQSWINISNKSGISYNHANLKCISGEVNFDSLSPIPYSKTSYANSEAVENPKLQPLDDYYIYNLSGKYILENNSTKRIKNFSAENIEYTKLYDFGYYNTNADILIKLNNTEDNNLGIPMPSGTVNIYASLNDSLQFLGSDSIKNTPINQELNLNIGKAFDITCERKIINYQKYDNYEFKEIELIINNSKDEDVPIKICYPIFAPWEITSTTDNYEKDSNGNPCFKVKVSANSKKRILFTYKTKIS >CP023671.1|AYE33249.1|352681_353092_-|UDP-N-acetylglucosamine-pyrophosphorylase MKYELTIYELGKLLKNIDSKYNISLLSKIKLSGGWMTMTGEISVIDVPTEAILLKGNNIITLKLKNNNENGSEIKITGLKDSKFVIDISATKYKEIKPGMLNLDVIKVNNNQCKLRIDEDMIFTIDTSVDKVIKCL >CP023671.1|AYE33248.1|351798_352242_-|MarR-family-transcriptional-regulator MFRLEECVGFITSTASKELSDEFNRRLLLKGSTRVQWIALYYIGNEKGISQKVLADKINVKESTIVRLIDRMEKEGIVKREKEETDRRVTNIFLTEKGENLKEELLPLGEKFSDDITKGIKQEHIDIFNSVLRKMVLNINMNVDNIT >CP023671.1|AYE33247.1|351373_351727_-|carboxymuconolactone-decarboxylase-family-protein MKKDPRQMLNDFMQGLNSVGETNGENVQAFMNLLGATYSEGKLTTKTKELISVAIAAYNRCEYCIVFHVYKALEAGANREEIMEAAMVAVAFGGGPSMAYSTTLLKDSIDEFEKDFK >CP023671.1|AYE33246.1|349599_351291_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase MDIKLESLTGHDKSAKVGKINVSIGDMVEINTVLLQVETGKGNSPIKAKGSYKIKEIKVNEGEEVKIGDTLIKVEVLEENNSNKNNFNYFGNMIKGKDEKIETDLIVIGAGPGGYVSAIYAAKRGLKVVSIEKENLGGTCLNVGCIPTKALVKSSEVYYNLVNCNEFGLECENPKVNMGKIIDRKDKIKNTLVSGIDYLLNKNEVKQIKGEASFKDKRTIEVKSGRDKYSITGKNIIIATGSKISKINIKGIEEPFVLNSTTALSSKEKPKSITIIGGGVIGMEFAFMYSNLGVKVNVVEFADRLLTMVDSEISEEIKNIAEKKGITIFNSSKVSRIEKTENGEALVIFNKGEEEKYIVSEKVLVAIGREPNIEGLEIENANIKLNENLRGIEVSETLETNIDGIYAIGDVNNIMQLAHIASHQGIVAVDNILGENKTVDYSAVPNVIFTYPEIASVGLTEDQAKNNDIKYKTSKFYFQGNGKALTMGENEGFIKLVKDIEKDKIIGASIIGPDASSLVSTLTLIIKNNIKEDGIIETIFAHPTTGEVIHEAALELGIGGLHC >CP023671.1|AYE33245.1|348670_349606_-|lipoate--protein-ligase MLKNIIVISKSTDPYCNLAMEEYIFNNIKKNEVIFYLWQNHKTVVIGRNQNPYIECDVDYIEGNGAKIARRMSGGGTVYHDLGNLNFTFVTSKENHNIEKQILVIRKAIEKFGLSVDKSGRNDLTINNKKFSGHAFYEDDNKMFHHGTIMIDVDKLELNNILKPSKIKLKSKGIDSVKSRVINLKECNNDITLNDVFKNLIESFKEVYGEVYSIRETIGKEVKGNLLEKYKNHKWVYGESPEFNVNLETPTDIGNIQILMDIKDNVVKKVRVYSDSLNQISFSDLEQLIVKQEFNRENILKTVYYFLESFK >CP023671.1|AYE33244.1|346949_348626_+|hypothetical-protein MKKLFSILTIIFIFAFPNVVSATTKEYYIDNVNIQAEILQNGDVNVTENLGYDFNGDFNGIFRNLKLNNTLGYKISEVYSIDENGHKQLISEADNEADYTYKLIDNGDSIQIKVFCPSSNEKKSFFFNYTIEKAAKKYSDLSQLYWNFYTVENVSSIKEGSLNLSLNNSNFDSSVFHYDVFGDGDFETTYNDKSVSVNFKNLTSLLGIKLNFQKEFLNDIPEINSTAPTEVESQYQSSTDLNGKCIAFIALFISLGLGGIGFGFFINKLKFKKELEKYRSKFTFIPNEIYVEPPSSTSPALIDLLMNEKVVSKEILTPTLFYLVKKGYYTISESTYYSGKNKSNNLKEDLIFTRVHSKGLPKENHLVFLIDWFSMYEVNGSFSLQKIKKRIQSQSEAQKFINKLNEWIAEVFEDADSYTFFKTIGNKRILRNKYYNEKLKWLSYKNYLINSKENLEHKNLTNIDDPLIYATALDIDYDDIKVILNSLSKDIKRNSSEIPEFSYLYCNNYLFYSLLVNDINGDAHINIDNSPNSTSSSFGGFSSGSGFTGGGGGGSGAF >CP023671.1|AYE33254.1|368470_368734_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIITYDVNEKRVNRVRKILKKYVTWTQNSVFEGEITEGKLTKCLAEVKKNLVSAEDSLYIYRVSYSKNITKDVVGVEKNLDELFI >CP023671.1|AYE33255.1|368735_369719_-|subtype-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGKDYYVFSPGRIKRKDNTIYFINTDEEKRGIPIESIERIHFFSEVDLNSKFINYISQYKIILNFYNYYGFYSGSYYPRKKNVSGFLLVEQAVAYKDLESRLFLAKAFIDSAIHHILRNMRRYDKVPNEYFEKIAEEKERMLKANSIPEIMGAEGRIRKIYYESYQYILKNDFGFTNRNRRPPKDPLNALISFGNSVMYTAILGEVYQTQLDPTISYLHEPSTKRFSLILDISEIFKPLIIDTIIFSLINNRRLNNKDFTNEEGVCFLNDEGKKKFLTEFEKKMATSIKHRKLKRSVSYRQLIKLEGYKIIKHLINDEKYKPLKAWW >CP023671.1|AYE33256.1|372549_373284_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKRAVRLEIYQNLVNYKKPTSFQLKETYPLPPPSTVIGMVHFACDYKSYIPMNIGIQGEYNSKINDLYTRYEFAGASYEADRHNVKIDSKEQGKSYGMMRGISTAELLVDCNLVLYIQPEDDSKVEEIFEAFKNPREYISLGRREDLVQINKVEIVELKEVELEENMPLEMDSYIPVSLKNDIKSNATLYTLNKDYTLRTIKKGVETRSWNKIKVIHAVKGSTVIDEYTSLNKDLVNNSVVFLL >CP023671.1|AYE33257.1|373293_374169_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR 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>CP023671.1|AYE33259.1|375871_376606_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRILVEIITEKIPLNNNRYLTLSLIKNVLEKQSPELFKAMYEDDENYNYRTKPFTYSLKLNDFKIVGDEFELKGNSTISISTPDPVLGSILYNGFLLTKEYEYNKKYKLSIGRVTLLKEKKVISNEVLFKTLSPLVIKNRRGEFLKIDNENYEKELNYIANKVLESYRGFGLKESLIFQPILMKKRVAKEKIEKFTKETNKDIFYITGYEGVFKLTGNKEDLNLIYNLGLGVRRSSGFGMLQIV >CP023671.1|AYE33260.1|376730_377669_-|WYL-domain-containing-protein MSSLGNLLKMLYILKRGQKVKVKDLAEELEVDHRQIRRYKEELSEYFDIQSITGPNGGYILCDEYFPFKDILTEKEINNLKRAIDTVSYSEEYELGKAIDKINFTILNSQSESLISEQIIPYSRPKMEIEKINKMYNEINLSILSCKEIIIVYVDNKGSLTRRAIQPHKFLRFKGEYYIIATCKLRNEIRYFKLVRIKEYILTEKRFEKMKNIDELINEYKENSIGIFGGNEIEVELEINPPMANTIKERIWVDNQEVIELEDGKILFKAIMKLGPELISWVLSMGDSVKINSSEELKRQVRIKVENIFKNL >CP023671.1|AYE33261.1|378080_380666_-|hypothetical-protein MRVEESKNLNIKLSVLITLFMIFSLFSNLSTPIQAETTRKEYVTTVNDHTIGDELFQFKFSSGWIESTGVNSFYNGDEYWTNATKSFQPSYRLKFYGNKVELYGVKEQTSAICEVSIDGGDIEEVDPYNPTRVTGQKIYEKSGLTDDEHILELKITYRKNQASKNYNGEIDFAKVYHKEIPATGVEMNKESIQIEVGMTDSIKAKVLPSYSTEKNIVYLVEDESIATITEDGEITGIKEGKTNIIATIEGTEIVGKTHLTIIKAGLPLGASIGSTDFHYLQKNYDDIKSLNKTTWNDIAWIGDELNSKIVTWTKDSNVNNVIISSSNFANENGDVIGSINVEISWLKETLANIGRGNPSAPVELFPDIIHNKGDLDIEANKVASAWVNITIPRDAKPGIYNGTITVSAEGLDTPYVFNYSFEVVNLVQPLPKETKTQMEIWQHPYAVARYYGVQKEELFTENHFKYLRPSLEEYRDMGGRGVIAHIVEEAWNHQSYDSDPSMVKWTKSLDGTFKFDYIDFDRWIQFNIDLGIINPKDGFGQIKCYSIVPWNNRIEYYNELTGEKESINPTPGTAEWRVPWTEFLSNFMNHLEEKGWFNITYISMDERSMKDLIASVDLIENIRNSNGESFKISSAMNYQSGNDYSFLDKIDDISIGLSHINHNSEDMKNMAKHRQEAGLLTTIYTCTGDYPNSFTISDSSESAWTMWYSLSQNTDGFMRWSWDGWVEDPLENVSYKYWEPGDPWLIYPAEKNSETKTFYSTPRYERLKEGIRDINKAKYLMENSKELKGEIEALVKSLKRANKGNNGYGSAVAATEKDRELTNNEVKRMRNGINDFAKQYIESKGVSVESVASKHMGNMLY >CP023671.1|AYE33262.1|381027_382248_-|peptidase-T MKKVEERFLEYIKIDTKSDETTGLTPSTKGQLKLAEILAEELKKIGVNKVEISENGYVYAVLEKNCDKNIPTIGFIAHMDTAPDYCGLNVNPQIVQNYDGGDIKLNDEVILSPKFSPELRDYIGKTLITTDGTTLLGADDKAGIAEIMTAIEYLVNHPEIKHGDIKIGFTPDEEIGEGADHFNVEMFKADFAYTIDGGAIGELEFENFNAAGVKVEIKGVNVHPGYAKNKMINSIMVAHEFINKLPLNEVPEKTEKYEGFSHLTDIKGSIEKTTLDFIIRDFFADTFEERKEKFKEIEKELNEVYGEGVVTVKVKEQYRNMKEKIEPIMHIVETAKKAMEDANVTPKVKPIRGGTDGARLSYMGLPTPNLFAGGENFHGKYEYIPIESMEKAVEVILNIVRIYSEK >CP023671.1|AYE33263.1|382342_383407_-|polysaccharide-deacetylase MNNVERKAYNGRYKNQRKKCKVKNSNINKLKKKRYRRRVRNKIIFKFIMISLFVTILIVIKNNISNYKAEKSKENAKNEIVTTIVDDKSNDNKDTEPKKQERYEKQEEIKKSDPHEIMPNSNVTYEGVTYAMDASDVKAMLYGTYAGSKKYVFLTFDDGPSPNTEKVLDILKENNVKGTFFVLGSMIEASTEAQKTLKRIIKEGNALANHTYTHNLSTLYPRNTIDINYFMEEVNNTNKLMKKILGENFNTKVLRMPGGYMSRKYYNDPSLPAFDDKLNSEGIVSIDWNTLNGDAEGVEYTVEEMVNKVKEGAKEVNQSIVLMHDTYGKEKTVEALPEIINYFKSQGYEFRTIK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP023671_4 | 1521392-1521492 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP023671_4
|
1 spacers
spacers of CP023671_4
>4.1|1521417|51|CP023671|CRISPRCasFinder TTAAAAATTCTTGTCAACAACTTTTTTAAAGTCATTTTTCAAATCTACTAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP023671_4
The CRISPR arrays of CP023671_4 >merge|CP023671|4|1521392-1521492|CRISPRCasFinder AAGCGACTCGTTTATCTTATCACTCTTAAAAATTCTTGTCAACAACTTTTTTAAAGTCATTTTTCAAATCTACTAAAAGCGACTCGTTTATCTTATCATCA >CP023671|4|4|1521392-1521492|CRISPRCasFinder AAGCGACTCGTTTATCTTATCACTC TTAAAAATTCTTGTCAACAACTTTTTTAAAGTCATTTTTCAAATCTACTAA AAGCGACTCGTTTATCTTATCATCA
>CP023671.1|AYE34175.1|1514783_1516013_-|IS91-family-transposase MKKGKIKRILEDHWKEFEKLYKNKIRPNVKKEVEKVLKCKDTKYGFIELKCNNCNTTKRIGFTCKSRFCTSCGKIYTDNWIDNMLGNLINVRHRHIVFTIPKELREFFGLDRQRLKILPKCAARAVTSWMHSLNRKEEFTPGIVTVIHTFGRDLKWNPHVHMMVTEGGRGNITEWRHIRHISYESLRKRWQKVLLDEITYINGNTKEIKLLKNKLYKEKDKGFYVHAKTEIKSAKTAAKYVGRYVGRPAIAESRILKYDGENVTYKYTRHEDNKVIVETVHVYEFIKRIIRHIPEKNFKMIRYFGIYSRRSKGKFNFIKMIDEKILSIRRSIATWENRILAISGVNPCKCPNCGNKMRFHDIVYPKYGSMRERLRIKIIEENEEKLEKAIENYAITKRILSGKIIPKTT >CP023671.1|AYE34174.1|1514577_1514769_-|hypothetical-protein MKTEEILYICTICGAKENIPKEVVEYFDEMDQSNVDEPPCFSCEKCGGVMRPKEYTGVYGIKY >CP023671.1|AYE34173.1|1513140_1514370_-|IS91-family-transposase MKKGKIKRILEDHWKEFEKLYKNKIRPNVKKEVEKVLKCKDTKYGFIELKCNNCNTTKRIGFTCKSRFCTSCGKIYTDNWIDNMLGNLINVRHRHIVFTIPKELREFFGLDRQRLKILPKCAARAVTSWMHSLNRKEEFTPGIVTVIHTFGRDLKWNPHVHMMVTEGGRGNITEWRHIRHISYESLRKRWQKVLLDEITYINGNTKEIKLLKNKLYKEKDKGFYVHAKTEIKSAKTAAKYVGRYVGRPAIAESRILKYDGENVTYKYTRHEDNKVIVETVHVYEFIKRIIRHIPEKNFKMIRYFGIYSRRSKGKFNFIKMIDEKILSIRRSIATWENRILAISGVNPCKCPNCGNKMRFHDIVYPKYGSMRERLRIKIIEENEEKLEKAIENYAITKRILSGKIIPKTT >CP023671.1|AYE34172.1|1512934_1513126_-|hypothetical-protein MKTEEILYICTICGAKENIPKEVVEYFDEMDQSNVDEPPCFSCEKCGGVMRPKEYTGVYGIKY >CP023671.1|AYE34171.1|1512189_1512648_+|thioredoxin-dependent-thiol-peroxidase MIELGKLAPDFTLIGSDGNEHSLSDYRGKKVILYFYPKDNTPGCSTEACDFRDNNNEINNLNAIVIGISKDSLSSHNKFIEKFHLPFILLSDEEKAVCALYDVIKEKNMYGKKVLGIERSTFIINEEGILIKEFRKVKVKGHVEAVIEELRL >CP023671.1|AYE34170.1|1511275_1512022_-|peptidylprolyl-isomerase MQDKILATVAGKEVKMSDLQSLVMRYPEDKRAYFQTEEAMKQLLEQVIAFELMANLGEELNLNTTEEFKANLKNVERELLTQVTMNKVLSEITVTDKEALDFYNENKNMFVEQPTVSAKHILVDSKETCENVRKEIESGEVTFEEAASKYSSCPSKEQGGSLGAFGRGMMVPEFEDAAFKLEIGVVSEPVQTQFGYHLIKVEDRSEEKTVDFENVKSQIVNKLIQERQQRKYLDVVKELEAKYGVTRN >CP023671.1|AYE34169.1|1509870_1511109_-|IS256-family-transposase MTRKIDTNFDYNEEIKRCKTIDDVMGKNGLIQRLVKDVLENILEGEMEEHLGRNKYERVEVVDQTKKNYRNGYSRKNLRSSFGDVDLDVPRDRNAEFEPQIIKKYETVCTELYKKIISLYAKGMSTSDIQAEIEDLYGITISPSMVSKITDKVLASAAEWQNRALDKIYPIVYLDAMYFKVRSNGKIVNKAVYICLGYTMEGYKDILGIWVDEAEGAKFWLGICNDLKNRGVKEILIACMDGLKGLPQAIKTVFPSVNIQTCIVHQIRNSIKYIASKDKKAFMKDLKEVYKATTEELALAQLDNLKERWGDKYGIVIDSWYNNWSNLSTFFDFSPTIRKMIYTTNILEGFNRQIRKFTKVRVIFPTDESLNKCVYLATMEILEKWTQPIHNWGATLAELSIIFEDQLKDELA >CP023671.1|AYE34168.1|1509019_1509661_+|HAD-family-phosphatase MQNIKAAIFDLDGTLVDSMWVWEQIDIDYLSAIGHKVPNNLKDEITHLSFNETALYFKNRFKLENSVEEIINSWNTMALDYYSNKIKLKKGVSEYLNKLKDNNIKIALATSNSTPLLEATLRNNGIYHYFDAITTTDEVKRNKAYPDVYLLSANKLNISPKDCVVFEDIVQAINGAKLAGMKVIAVYDKSSENQKEELMKLSDKYINDYTELI >CP023671.1|AYE34167.1|1507538_1508888_+|iron-hydrogenase MNKEYTDWFNELVKSYYDGNFDETIKKILSNSNKSPEETFSVISSLCGCNIKYDENYIYNLKKAITNYNVHQKIVEKLQNCFGKCSENIDEIPKCQLACPFDAIIDNKENNTKVIDNERCIDCGLCIDACDNGNFIDKVEFLPIMELIKNNTKVIAAVAPAISGQWGPNTTMDQMRAALINLGFTDMIEVAFAADMLTIKEAVEFNKHVKSSSDLMITSCCCPMWVGILKKVYKSLVKDLSPSVSPMVAAGRVIKKLNKDAKVVFIGPCIAKKAEAKEKDLSDAIDFVLTFQELKEIFNALDICPSSLQGVPSIEYASRGGRLYARTGGVSIAISEAVEELYPEKHKLFKAVQAEGVKNCKEVLAKAQEGSLDANFIEGMGCIGGCVGGPKILVSKEDGKKAVDDFAYNSSIKIATHSNILDNILNDLNITSLDDFKSPEKIHILERDF >CP023671.1|AYE34166.1|1506568_1506874_-|hypothetical-protein MRGSTIVMIMASIGFILIGLVILSSKKIKSLMSDVKIYTDTKKFISFNGMFNIGIGVIGLLLGSLDYFYAELSKYIVIVFIIIMVTASLIQNKLSKKYKKF >CP023671.1|AYE34176.1|1521810_1522488_+|uracil-DNA-glycosylase MKKILDNDWQELLESEFQKEYYQDLRKFLIYEYKTKTIYPNMYDIFNALKFTSYKDVKVVIIGQDPYHGPNQAHGLSFSVNKGIKTPPSLLNIYKELNSDLGCYIPNNGYLKKWADQGILLINTVLTVRAHEANSHKNMGWEIFTDKIISLLNGKDDPIVFILWGNPAIKKSLLITNKNHFILKSPHPSPLSASRGFFGSRPFSKTNEILKFIGKSPIDWQIENI >CP023671.1|AYE34177.1|1522583_1522793_-|hypothetical-protein MLEKLSLSDEEYDYLAKCIAIGVGIGTFVGSLIGNVILGFAAGGVIGIVVSGIRFLSHKLKGMHRKEII >CP023671.1|AYE34178.1|1523284_1523494_-|hypothetical-protein MIDLFSLSSDQLIVVAAFIAADIAQSLTSEEQEIVAWLFEAIGQNLSVFGAVEALRQKNNKNDDSGIVK >CP023671.1|AYE34179.1|1523627_1524056_+|hypothetical-protein MKYLLFIALISGLVGTYFYYDHKLALTRKQLMIASKRNNKLKSRATPKKNLDIKINFSNPTSKIGLTNINTNLYLAPINSSPIIRTIKIRMEVQILDAAETNSQTWYYVNLPIDSNINCRGWLNSTDFSILYSDSTNITKTT >CP023671.1|AYE34180.1|1524135_1525071_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease-domain-containing-protein MKKVFRANLYFLIIILLEIFMPKILVPIYKEIGVTDIRIALAMNHILLFLVPATVYIILTKSSVKNTLKLNKLYFKDILLIILLAFLCQPIMSFFSIITAFFFNNEIGAFITQINSTPYLILLSLVALLPAITEECTIRGVVLSGYENKNMYLAAMVTGLFFGIFHLDPQQFLYTTVLGFILALVVRITNSIFASAIIHFIINGTSVTASKLLNSIPQSTTILEGNMDLSLRALPINEKMIMFVVYGVIALIFATFVYMIIKKLEELNIRRGVLTEERKEIIKDKDSIINIPFILIIVVYIAFMFYKYINI >CP023671.1|AYE34181.1|1525260_1525749_-|damage-inducible-protein-CinA MSNNGNDRSIEYIVGKILCKNKLTISTAESCTGGLVAGKLISYPGISEVFKEGVVTYSNESKMKRLGVKEETLRSFGAVSEETAREMAEGIAREAKTDVSVVTTGIAGPGGGTKEKPVGLVYIGVYVKGKTQVKKFNFKGDRQQVREEAVLSALNMLKHNLE >CP023671.1|AYE34182.1|1525872_1526109_-|hypothetical-protein MPDYKMDIQGNLNLSEYSNIFDYMGVVDMNDSFTITLSNTSQQDINIITSMLRDGDFLIKEQGVNGNGEYYINANKLK >CP023671.1|AYE35836.1|1526201_1528277_-|elongation-factor-G MKDYTINNLRNVGLIGHSGSGKTSLAEALLFHSGNSDRLGKVEDGNTIMDFDQEERRRRISLSVSLASIEFKNTKINLVDIPGYFDFYGEVIQGMRAVDVATIVVCGASGVQVGTEKAWDYCDKIKLPRTFFVNKLDRENSSFDKVLGELKEKFGISVVPIQYPIGKEDDFKGVINIISKRARIYNEKTHKVEITDIPKDLLDKVEECKQMIMEAVAETDEELLEKYFSEGELSDEEIYKGLIKGCADGDIAPVMCGSATKVIGIDSVLDDIVECFPSPEYAIPQKAINLQSDEEVFISLSEDNPFSALVFKTIADPFVGKISIFRVITGKLSNEVSVINSNNDKVEKLSNVFFLKGKNQVQTNKVMAGDIAAVAKLQYTGTGDTLCDSNNKIIYDKMNFPKPIISMSVMPKSKGDEDKISYSLQKLLEEDPSFTMHRDTENAETIISGLGETHLEVIASKLKNKFGADVILDTPKIPYRETIKGFSEVQGKHKKQSGGHGQYGDVKIRFERRDDGGEELEFIDKVVGGAVPRNFIPAVEKGLKDCIEKGILAGYPVIGLRATLYDGSYHPVDSSEMAFKMATSIAYKKGLEIAKPILLEPIMHVEILVPDEYMGDVIGDINKKRGRVIGMELEGKLQKIIGEIPLAEMSKYATDLRSMTQARGTFTSILQRYDEVPEIESKRIIEEVKKM >CP023671.1|AYE34183.1|1528428_1529364_-|glycosyltransferase MSKMISIVVPMYFEEKVVEECYRRLTEVMSNIKYEHELVFVNDGSTDGTLPMLKDIASKDSSVKIIDFARNFGHQIAVTAGIKEAKGDAVIVIDADLQDPPELILEMVDKWENGYEVVYAKRKKRKGETFFKLMTAKYFYKFLQIMSDVDIPRDTGDYRLMDRKVVDVFNSMTEKNRFVRGMVSWLGFNQTYVEFVRAERFAGETKYPLKKMLKLAEDGIVSFSHKPMKIIGGFGVIFLVIFFLQILIAIYNSIFRFGVSDIFCLATYVSLVAGILLISLGVLGSYIARIFDESNGRPLYIIREKVNFDDK >CP023671.1|AYE34184.1|1529684_1530050_-|GtrA-family-protein MEKFLKFGLVGVINTLITMIVFNGLKFIGVNILVANTIGYICGMINSYLWNNRWVFKSNTKDVSTISKFIIVNVVAMLINNGILFVFVNGVGINSTISQALAIVITTVINFVGNKIWTFNK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP023671_2 | 2.80|364951|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 364951-364987 | 37 | MH248069 | Clostridium phage CPS2, complete genome | 14017-14053 | 5 | 0.865 |
CP023671_2 | 2.80|364951|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 364951-364987 | 37 | NC_018084 | Clostridium phage phiZP2, complete genome | 4784-4820 | 6 | 0.838 |
CP023671_2 | 2.80|364951|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 364951-364987 | 37 | JQ729991 | Clostridium phage phiCPV4, complete genome | 4395-4431 | 6 | 0.838 |
CP023671_2 | 2.11|360470|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT | 360470-360506 | 37 | NC_015417 | Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p1BKT015925, complete sequence | 95589-95625 | 7 | 0.811 |
CP023671_2 | 2.10|360407|35|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT | 360407-360441 | 35 | GU943056 | Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C348 genomic sequence | 27714-27748 | 8 | 0.771 |
CP023671_2 | 2.73|364495|35|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 364495-364529 | 35 | MN694483 | Marine virus AFVG_250M1031, complete genome | 26636-26670 | 8 | 0.771 |
CP023671_2 | 2.75|364624|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 364624-364660 | 37 | NZ_AP017970 | Fusobacterium varium strain Fv113-g1 plasmid pFV113-g1-2, complete sequence | 10522-10558 | 8 | 0.784 |
CP023671_2 | 2.75|364624|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 364624-364660 | 37 | NZ_CP038614 | Arsenophonus nasoniae strain FIN plasmid pArsFIN2, complete sequence | 91582-91618 | 8 | 0.784 |
CP023671_2 | 2.11|360470|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT | 360470-360506 | 37 | MH051335 | Escherichia phage vB_EcoM-Ro157lw, complete genome | 68640-68676 | 9 | 0.757 |
CP023671_2 | 2.11|360470|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT | 360470-360506 | 37 | JX128258 | Escherichia phage ECML-117, complete genome | 5023-5059 | 9 | 0.757 |
CP023671_2 | 2.11|360470|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT | 360470-360506 | 37 | NC_048194 | Escherichia phage vB_EcoM_WFH, complete genome | 67576-67612 | 9 | 0.757 |
CP023671_2 | 2.11|360470|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT | 360470-360506 | 37 | NC_048073 | Escherichia phage FEC19, complete genome | 2251-2287 | 9 | 0.757 |
CP023671_2 | 2.18|360923|36|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 360923-360958 | 36 | NZ_CP030933 | Enterococcus gilvus strain CR1 plasmid pCR1A, complete sequence | 575675-575710 | 9 | 0.75 |
CP023671_2 | 2.19|360987|35|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 360987-361021 | 35 | MT178275 | Klebsiella virus KpS8, complete genome | 124394-124428 | 9 | 0.743 |
CP023671_2 | 2.32|361833|36|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 361833-361868 | 36 | LR026976 | Bacillus pumilus isolate 1 genome assembly, plasmid: p576 | 34083-34118 | 10 | 0.722 |
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CP023671_2 | 2.11|360470|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT | 360470-360506 | 37 | MH051335 | Escherichia phage vB_EcoM-Ro157lw, complete genome | 1-30 | 13 | 0.649 |
CP023671_2 | 2.11|360470|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT | 360470-360506 | 37 | NC_048194 | Escherichia phage vB_EcoM_WFH, complete genome | 1-30 | 13 | 0.649 |
1. spacer 2.80|364951|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH248069 (Clostridium phage CPS2, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.865
ggaggctacaattatggaacgctataatatatgcggt CRISPR spacer gtcgtttacaattatggaacgctataatatatgccgt Protospacer * * .**************************** **
2. spacer 2.80|364951|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_018084 (Clostridium phage phiZP2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
ggaggctacaattatggaacgctataatatatgcggt CRISPR spacer gtcgtttacaattatggaacgctataatatacgccgt Protospacer * * .*************************.** **
3. spacer 2.80|364951|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JQ729991 (Clostridium phage phiCPV4, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
ggaggctacaattatggaacgctataatatatgcggt CRISPR spacer gacgtttacaattatggaacgcaataatatatgccgt Protospacer *. * .**************** *********** **
4. spacer 2.11|360470|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015417 (Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p1BKT015925, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tttaattattttgaattattttaaattatttttaaaa CRISPR spacer aatgcttattttgaattattttaatttatttttatta Protospacer *. ******************* ********* *
5. spacer 2.10|360407|35|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT matches to GU943056 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C348 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
cttaaaagagataagagggaatatttttgtatgat- CRISPR spacer atctttagagatacgagagaatatttttgta-gatg Protospacer *. ******* ***.************* ***
6. spacer 2.73|364495|35|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694483 (Marine virus AFVG_250M1031, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
gcaattgctgtaatcattatccatttcattttgtt CRISPR spacer actaatagtgtactcattatccatttccttttggt Protospacer .* * *. **** ************** ***** *
7. spacer 2.75|364624|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_AP017970 (Fusobacterium varium strain Fv113-g1 plasmid pFV113-g1-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaaaaaatattaaaaaacctaactataataataga CRISPR spacer aaaaaaatatattaaaaaaccaaactataaataaaaa Protospacer ***** ************* ******** * *.*
8. spacer 2.75|364624|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP038614 (Arsenophonus nasoniae strain FIN plasmid pArsFIN2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
ttaaaaaaatattaaaaaacctaact--ataataataga CRISPR spacer ttaattaaatattaaaaaacctaacttattgatttta-- Protospacer **** ******************** *.** **
9. spacer 2.11|360470|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH051335 (Escherichia phage vB_EcoM-Ro157lw, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tttaatt--attttgaattattttaaattatttttaaaa CRISPR spacer --taactccattttgaattaatttaaattaattttttct Protospacer ***.* *********** ********* ****
10. spacer 2.11|360470|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT matches to JX128258 (Escherichia phage ECML-117, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tttaatt--attttgaattattttaaattatttttaaaa CRISPR spacer --taactccattttgaattaatttaaattaatttttttc Protospacer ***.* *********** ********* ****
11. spacer 2.11|360470|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048194 (Escherichia phage vB_EcoM_WFH, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tttaatt--attttgaattattttaaattatttttaaaa CRISPR spacer --taactccattttgaattaatttaaattaatttttttc Protospacer ***.* *********** ********* ****
12. spacer 2.11|360470|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048073 (Escherichia phage FEC19, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tttaatt--attttgaattattttaaattatttttaaaa CRISPR spacer --taactccattttgaattaatttaaattaatttttttc Protospacer ***.* *********** ********* ****
13. spacer 2.18|360923|36|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP030933 (Enterococcus gilvus strain CR1 plasmid pCR1A, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aacttcttttttaaaagaaagaagtttcatagaaga CRISPR spacer tagtcattttttaaaagaaagaagtttctcagagag Protospacer * *. ********************** .***...
14. spacer 2.19|360987|35|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT178275 (Klebsiella virus KpS8, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
aaattacaaaaaacctcaaaaatcgaggtttagac CRISPR spacer tcaaaacaaaaaaccacacaaatcgaggttacaac Protospacer * ********** ** *********** .**
15. spacer 2.32|361833|36|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LR026976 (Bacillus pumilus isolate 1 genome assembly, plasmid: p576) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
tactcattgtcctggttatgctgaattcgaccttgt CRISPR spacer tactcattggcctggttaagctgaataaaaaatgta Protospacer ********* ******** ******* .* *
16. spacer 1.2|356620|37|CP023671|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK554696 (Fusobacterium phage Fnu1, complete genome) position: , mismatch: 12, identity: 0.676
aatactcaaatattctgtttatttcctctaaactgta CRISPR spacer atctctcaaatactctgtctatttcctctaggaatgg Protospacer * . ********.*****.***********.. .
17. spacer 2.11|360470|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH051335 (Escherichia phage vB_EcoM-Ro157lw, complete genome) position: , mismatch: 13, identity: 0.649
tttaattattttgaattattttaaattatttttaaaa CRISPR spacer -------attttgaattaatttaaattaattttttct Protospacer *********** ********* ****
18. spacer 2.11|360470|37|CP023671|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048194 (Escherichia phage vB_EcoM_WFH, complete genome) position: , mismatch: 13, identity: 0.649
tttaattattttgaattattttaaattatttttaaaa CRISPR spacer -------attttgaattaatttaaattaatttttttc Protospacer *********** ********* ****
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
407806 : 420920
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP023671|407806:420920|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP023671|407806:420920|409925_410927_-|AYE33278.1|DBSCAN-SWA MITYKEAGVNIEEGYRSVKLIKEYASRTMSEYVLNGLGSFAGMVELPEGYKKPVLVSGTDGVGTKLDIAFKTKKYDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAEVAADLVKGVSEGCIQGDCALIGGETAEMPGFYRDGEYDMAGFAVGIVDKDKIINGKNIKEGDKLIGITSSGIHSNGYSLVRKIFTDLNEDLNGQEIWKTLITPTKIYVKPVLELLKSFEIKGMSHITGGGFIENVPRMFNGNNLTAVIKKNSYPLSAIFERIMEKGVDENHMYNTFNMGIGFILCVKESDVEGIIKKLIEMGEKAYEIGYITSGGEGCCLK >CP023671|407806:420920|419519_419924_-|AYE33286.1|DBSCAN-SWA MGIMEILSYIFLGLSVLTYIFISIAMYNVAKKKGYNKEWLAWIPIVQDYVVIKYAKGIPWVLLLYIPYFFTTGLLASIISFIIGLYLVIMAVRICKEFNVDYTWLIVGLFIPGVAAISYYKLYKSTIKSEVEVI >CP023671|407806:420920|410936_412364_-|AYE33279.1|DBSCAN-SWA MNSSLELILDPSNDKFKDECGVFGVYANREMDVASMTYYGLYALQHRGQESAGIAVANGDVVNIHKGMGLITEAFSQSDLNKLQGNAAIGHVRYSTSGDTRIENAQPLLSKTKLGSIAMAHNGTLVNAEVIRELLEDGGHVFHTSIDSEVIANLIARGAKKGIERAVLDAIQAVRGSFAMVILTENKLIGVRDPHGIRPLCLGKFEDGYVLSSESCALDAIGAELVRDIDPGEIVVIDECGINSYRYSENTQCQTCAFEYIYFARPDSTIDGLDVHESRVKAGQELFKQYPIEADIVVAVPDSGIPAAIGYAKASGIPYDTGFVKNRYVGRTFITPSQEIRERAVAVKLNPLKVNIKDKKVVLIDDSIVRGTTSKHLVDSLKRAGAKEVHFLVASPIVKFPCYFGIDTPYRSELIGTKGSVDEIREMIGCDTLGYLDIENMYKCFKENSGYCVGCFNGVYPVATPIETAKDHIER >CP023671|407806:420920|419064_419220_-|AYE33285.1|DBSCAN-SWA MEDKKIICKDCGKEFVFTVGEQEFYKEKGFDNEPVRCMDCRRARKAQNNRR >CP023671|407806:420920|409326_409938_-|AYE33277.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLASGSGSNLQSIIDAIENKRLNCKIEMVIGSKEEIFALDRARANAIETHVVSKKEYGDKTSDKILELTKGKVDLIVLAGYLSILQGDILKEFKGRIINIHPSLIPSFCGPSMYGIKVHEAVLKSGVKVTGCTVHFVNEEIDGGEIILQEAVKVDFEDTKEDIQKKVLAFEHKLLPRAIDLISKGNIEIINGRVKIVE >CP023671|407806:420920|407806_409309_-|AYE33276.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVFDKEGILDFSNFLSAKGVEIISTGGTFKHLKENGVNVTEVNEVTNFPEMLDGRVKTLHPILHAGILAIRDNEEHMNTIKERNIEPIDMVIVNLYPFFKKVREDLSFDEKIEFIDIGGPTMLRAAAKNFKDVAVISDKEDYKVVREEIEALGEVSFKLRKKLAGKVFNLMSAYDAAISNFLLEDEEYPEYLSISYKKLQSLRYGENPHQSAAYYGRTEIDGAMNSFEVLNGKELSYNNIKDLDIAWKVVCEFEEIACCGLKHNTPCGVAIGETPFEVYTKAYNADPTSIFGGIVAINRKIDKATAEEMVKIFLEVVAAPDFDEDALEVLKTKKNLRVIKCNNTPQDKKFMVTVDGGMLVQEEDKKLVEEIKVVTEKVPTEEEMRDLVFGMKVVKYVKSNAIVTIKDGVAVGIGGGQVNRIWPTEDALRRGKGATVLASDAFFPFRDVVDTCAKHGIKAIIQPGGSMRDEESIEACNEHGIAMVFTGIRHFKH >CP023671|407806:420920|417854_418364_-|AYE33283.1|DBSCAN-SWA MEINQLINYFSSYGMIFVFIIVFLEYLNLPGLPAGIILPLIGVLSSKGEGNLALVLIISVIAGAIGSWGLYCVGWFGGDFILNKYTNKFPKHKTYIDKSINVLKEKGNIGVFISMLIPMLRTMISVPAGVLKLNFIQYSIYSTLGIILWNSSLILSGYFFGDAVFKILA >CP023671|407806:420920|419981_420920_-|AYE33287.1|DBSCAN-SWA MGLIIGVVMLVFLLLLILSSIKIVNTGYLYVVERFGQYHRILEPGWHFLIPFVDFVRKKVSTKQQILDVPPQSVITKDNVKISVDNVIFYKLLNARDAVYNIEDFKSGIVYSATTNMRNIIGNMSLDEVLSGRDKINQDLLSIIDEVTDAYGIKILSVEIKNIIPPAEIQEAMEKQMKAERDKRAMILQAEGQRQSQIEKAEGEKQSQILRAEAEKQANIRRAEGLKESQLLEAEGKAKAIAKIAEADAEAIRKVNEAIIQSGTNETVIALKQVEALKEMANNPANKLILPNETLSSLGSIAAIGEMLKGEK >CP023671|407806:420920|418620_418776_-|AYE33284.1|DBSCAN-SWA MEDKKIICKDCGNEFVFTVGEQEFYKEKGFDNEPVRCVDCRRARKAQNNRR >CP023671|407806:420920|413611_417358_-|AYE33282.1|DBSCAN-SWA MLGTRCIFVEKKNGFDVEAKSLLQDFKSNLGIKELESVRLINKYTLGEINEEFYKKSLYTIFSEKTVDNVYENNIELKDGDIAFAVEYLPGQYDQRADSASECYQLLTAENKIEVKSAKVVILNGTLTDEEIEKIKAYYINPVDSREVSLDSMELTSFFTEPKDVEILNGFIDKDNKELEAFHKELGLAMSLEDIKMIRDFFKKEKRNPSITEIKVIDTYWSDHCRHTTFSTAIEEVNIEEGIYSKPISKAYEAYIKSREYVYGETNRDETLMDIAVITMKEMRKKGMLEDLDVSEEINACSIKVNIETNSGIEEYLVMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRTYVYQAMRVTGSADPTTPVEETIKGKLPQRTITLGAAHGYSSYGNQIGLATGQVSEVYHPNYVAKRMEVGAVIAAAPKENVVREEPKVGDVVILLGGRTGRDGLGGATGSSKEHTEYSINQCGAEVQKGNAPTERKIQRLFRNKEVSQMIKRCNDFGAGGVSVAIGELTRGLDIDLDKVPKKYEGLDGTELAISESQERMAVVVDKENAERFIALSKEENLEAVVVAEVTDKERLRMFFKNKKIVDLKRKFLDTNGARQTIEVEVKAPTKYPFDIKDLDVKEEWIKTLKNLNVSSQKGLVERFDSTIGTGTVLMPFGGKYQSTEAEGMAAKIPVLNGESKDATLMTYGFNPDIGMWSPYHMAYYSVIEAVTKLAAMGGNYKKARLTLQEYFEKLGSNKEKWGKPFAALLGAYTAQMELGIPAIGGKDSMSGSFGNIDVPPSLVAFAVGVEKAANVISPEFKKVGSEVIFLMGQKKEDMTLDIERYKRNLETLYKLILEGKVISALTVKFGGVSEVLTKMALGNRIGIEFKNLTKEELFGLNYGSLVLEVKAGVNIEEEFKGCAYKTIGSTINSEAIISTEYDINFEIEKLSDVLEEKLSKVFKIKTEDKNEKIKTVLYKEGVVKSPAIKIAKPRVFIPVFPGTNCEYDCARAFRNEGAEVSELVLNNLNKESLKESILRMEKTIKESQIIMLPGGFSAGDEPDGSGKFIATVFRNERIKSAVMDLLKNRDGLMLGICNGFQALIKLGLVPYGEIVDIEEDMATLTYNEINRHMSSMVRTKVVSNKSPWFSEVKPGDIHTIAISHGEGRFVASEKLINELMENGQIATQYVDLNGEVSMNMPYNPNGSVLGIEGITSKDGRILGKMGHSERIGENLYKNIPGDFDQKIFKSGVNYYK >CP023671|407806:420920|413119_413599_-|AYE33281.1|DBSCAN-SWA MKVAIFLGSKSDTEVMRGAANCLREFGVSYEAYILSAHRVPEKLTETLKKAEKSGCEVVIAGAGLAAHLPGVIASQTTMPVIGVPIKGAVEGLDALFSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQILAVKDKAIREKLNKFRENMKEKFIEENAEGVDL >CP023671|407806:420920|412415_413120_-|AYE33280.1|DBSCAN-SWA MERLEMMYEGKAKKIYATENKDEVIVYYKDDATAFNGEKKGSIEDKGVLNNAITSMLFEMLNENGIKTHFLKKLSDREQLCKKVEIVPLEVIVRNVAAGSMAKRLGLEEGFELKTTVFELSYKDDSLGDPLINDYHAVGIGATTFEELEKIYDMTAKINELLKKFFMEQNIRLIDFKLEFGKYNGEIVLADEISPDTCRFWDAKTGEKLDKDRFRRDLGNVKDAYVEILNRITN |
12 | Prochlorococcus_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
638715 : 693723
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP023671|638715:693723|DBSCAN-SWA ATCACTCCTTATTAATTGCAAATATTCCTGCTACTAAAATACCAACTATTAATCCACCTATGTGACCAAAATTATCTATATTAGTTGCTGTTAATCCAATAACTATATTTAATATTATTACTTGAATAATATTCATCATATATTCTTTACCTATAGTTTTTCTTTTATTAAATGCAAAAATAAGCATAGCTCCTAAAAGCCCAAATACCGCTCCTGATGCTCCAACTGAAACGCTACTTTGTGAAAATAAATAACTAAGAAAAGAACTTCCTATTGCTGATAAAAAATATATTACAGCATATTTTTTTCTTCCATATATTTCTTCAACTTGTACACCTATTATTTTTAAAGCCATCATATTAAAAGTAATATGAATAATTCCACCATGTAAAAAGGCTGAAGTTATTAATCTATATATTTGTCCCTGATTTATCAAAGGATTAACTTTAGCACCCATTTGTATTAAAGTACCAATATCTATATATATAATATTTTTAGCTTTAATTGCTGATATCATGTATATTAATATATTTACAACTATCAATGTATATGTAAACTTATATTTATTAAGTTTATCTTTAGGAGATGTATCTATTTTAACTATATACTCAATAATTGGTATTAGTGGCTTTGCTGATTGAGAACAATAAATTATCTTTCTATCTTTTAAAGAAAATATTAACTTATCTTCATTACTAGATATTTTATTTTCTATATATTCTCCTGAAGCTAGTATAACAGAGTTTAAAATCTGAGGCTTATTAAAAGCCCCAGTTAAATATTCTTTTGCCTCTCTATAGTTTATATCCTCTTCATCATCCCCAGTTACTATTACACCTAAAACTGAATTACCTAAATCCAAAATCCCAATCCACTTAGTCTTCTTATGAAATTCACTATAATAATTCTTCATAAAAAAACCAGCATTCTTAGTTAATAAGTTATAGAATACTTTTTCAAATTTCTCCATATAGTCCTCATTAAATTTCTTTATCTAACATATCTAAAAGCTCATTAAATCTTTCTATTGTAGCTTCTAATGGCTTTGATGTAGTCATATCTACTCCAGCCTTTTTAAGAATATTTATAGGATAATCACTTCCGCCACTTTTTAAGAATCCAACATATTTTTCCACAGCATCCTTTTCACCTTCTAATATTGATTTTGCAAAAGCTGATGCTGCTGCATATCCTGTTGCATATTGATAGACATAAAAATCTGAATAGAAATGTGGAATTCTTGACCATTCTGAATCAATTATCTCATCTACTATCATATCTTTACCAAAATATTTAACATTTAAATCATGCCATATCTTATTATAGTCATCTGATGTAAGTGAATTTCCACTTTCTAAAGTTTCATGAGTATATAACTCAAACTCTGCAAACATCAATTGCCTAAATACAGTTGTTCTTATTTGTTCTAATTCTTGGTTTATTAAATATAATTTCTTATTTCTATCTGATTCTTTATTTATTAAATAATGTATAAGTAATGCTTCATTTGTAGTTGATGCAACTTCTGCACAAAACAAAGTATATCCAGCATAAATATAAGGTTGCTCTTTTCTTGAATAATATGAATGAATTGAATGTCCCATTTCATGTACAAGAGTAGATACATCATTTAATTCATAATTATAGTTTAATAGTACATATGGCATTGTACTATATCCTCCCCAAGAGTATGCCCCACCTCTTTTGCCTTTGTTTTGATAAATGTCTATCCAGCCTTCTTCTATTCCATTTTTAAATATTTTTAAATATTCCTTACCTAATGGATTAAGACCTTCTACAGCCATTTCTATAGCTTTGTCAAACTCTATATGTTCTTTATTAATTTCTATAACTGGAACATATAAATCGTACATATGCATTTCATCTAGACCTAGCAATCTTTTCTTTAAAGTTACGTATCTATGAAGAGAAGATAAATTATCATTAATAGTTTTAATTGCATTTTTATATACTTCTTGTGGAATATCGTTAGGACTTAACGATGCATCTAAAGCATTTTTATATTTTCTTATTCTAGCATTAAAATTAAAGTTTTTTATTGAACTTGATAAAGCAGTAGCTAAAGTATTTTCAAAAGCTTTATATTCCTTATATAAAGTTTCAAATGCTGCTTTTCTTACACTTCTATTTTTACTTTTTATAAATGATGAATAATTTCCCTCTGTTAACTCAACTTCATGTCCCTCTTCATCTAAAATTTTACCAAATTTCAGATCTGCATTTGTTAACATATTGTGAATTGCTTCTGGAGCTGCTAAACAATCTGATACACTAGCCAAAAGTTCTTCTTCATTTTTGCTTAAAATATGAGGTTTTTCTTTAAAGATATCTTCAAACATAAAATCATAAATTTTAAGCTCTGGCAATTTTACCATACACTCTTTTATAAATTCTTCTGATAAAGTTAGAATTTCCGGTACAAAATATGCTGTATATGTTGAGAATTCAGCCATATATGCATCTATTCTATTCATCATACCTTGATATTTAGAATTTGAAGTATCTTCATCAGACTTTAAATGTGCATATACATAAATAGTTTCTGCTTTTATACCAATATCAACATAAAGTTTAAGATACTCTAAAATATTTTCTGCACTATTTAATTTCCCTTCATAATTCTTTAAACTAGGTGCATTGCTTTTAAGTTCATTAAAAGCCGCTTCCCACTCTTCATCTGTTTTAAAAATTTTATCTACTTTCCACTTATCTTCCTCTTTAATCTCATCCCTTTTTTTTAAAATCTTACTTTCACTCATAAAAATTCGCCTAGTAACTAGGCTCCTCCCTTCTAAATATATTCTTGTTCCTTACCTAAAATATCTTTAAATACCTTTTCCATGGATTCTTCAATTAGCTTTACACATTTATCTAGTTTTTCTTTAATAACAGCATAATCCTCGTTATAATCAAACCTTATCATAAATGTTGGGTTGTATTCATCTAAAACATCTTCTACTGTGAATCCATTTTCTTCAAATACTTTATAATTAAATAAATCATATATTGCAGAGTATTCCCATTCTTCTACATCTTTATTTGTATCAAAATATAAATTAATAATATTATCTAATACAAATAACTTTTTTACATACAATGCTCCTTCTGATACCTCAAAACTTCCTAATTCTTTTGTTATAAATCCTGTTTCCTTATCTTTCTCCATTAATACTAAACTTGAAAAATCCATCTTAATATTTTCCTCCAATTCATTTTTTATCTAATGTTTTAAAATATATATCTATTATATGTTTTAAACCTATAATAAAGCAAGATATGTATTTACTTAATGTTAAATTATGGTAATATTATTTTAAAGGGTTTTTTAAAGGAGGTTTTTTATGAGTAAAAAAGTTTCAAGAAAAGTTTTAAAAATGAAAAGAAAGGAAAGACTTAAACATAGGAGGAAAAAATTCTTTATAGCTATATCTATAGGAATAGCTATTTTATTATCCTCAACATTCCTTATTTATACTTTAATAATTAATAATAAGCTAAAAGATTTAAACTATGCTATAGACTATCACTTTACAAGTAGAAATATAAAATCTGATAGACTACTTAGAGTTCAGCAATATGATTTACTTTTTGCTGATGGTGATAATGTTATAGTTGAAGCTCATGGGCTTAGTCATGAAGAGCCTCATGCTGAATCTAGCGTTAAAGCTAAGCTTACAAAAAATAAAAAAGGAATATGGGAGTTAAATAAGGAAACTTTAGTTGCTAATGAAAAGTAGTTATTGCAAACTATTTGCATTATCATATATAATAGAGCTAGAAAATTTAGGAGATGATTTAATGATTAATATAAACAATTTATGTTTTTCATACACTAATAAGCAACCTTACTTACTTAATAATATTAATTTAAGTATTCCTAAAGGTGCTTACGTTTCTGTTATTGGAGAAAATGGTAGCTGTAAGACAACACTTATAAAATTAATTTTAGGATTATTATCCCCCTCTTCTGGCTCTATTGAAAATGAAGCTACTTCTATAGGATATGTTCCTCAAAGATTAGATTCGTTTAATGCCCAATTTCCAATTACAGTTTTTGAAGTATTAGACTGTCATAGAAAAACATTAAAAAGTACTAAAAATATAAATATAGAATCTGCTTTAAAACAAGTCAATATGTATAATTTTAAGAATACTCTTCTTGGAAATTTATCTGGTGGACAACAACAACGAATATTAATTGCTCGTGCTCTAATGGGAAATCCTGAAATTTTAATTTTAGATGAACCATCTACAGGAGTTGATGAAATAAATCAAAAAGAAATTTATACAGTATTAAATACTTTAAATAAAGATAAAAATAAAACTATTATTTCTATAGAGCATAACATTAATATAGCTATTAGATATTCAACTCATATACTTAAAGTCCATAATGGTACTATTAATTTATATACTGTGAAAGATTATATTAAAGTTAGAGAACAAAATTCAATTTTAGATAATGCAATTTAAACAAATAATATAAAAAATTATATTATTCAAAGAAAGGTAGGCTTTAATGTTTCAATTAGGATTTATGCAAAATGCCTTTATGGCAAGCTTTATTATAGCTATATTATGTCCTTTTATAGGACTTTTTTTGGTGCTAAGAAGATATTCAATGATAGGGGATACCCTATCTCACTCATCCTTTGCTGGAGTTGCCATAGGATTAGTTATTGGAGTTAATCCATTAATTTCAGCATTTTTATTTACTACATTTTGTGCACTCATTATAGAATTCTTAAGAGATTATTATAAAAAATATGCTGAATTAGTAATGTCTTTAGTATTAACTTTTAGTTTAGGTATTGCAATTATACTTATTAGTAGTGGAAAAGCCTCTACTAATGTTAATTCTTATTTATTTGGAAGTATTTTAACAGTAAGTACAAGCGATATAGTTATGATTTCAATTATTGGGATTATATGCTTAATAACTTTAATAGTTTTATACAATAAACTTGTATACATAACCT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51 | Tupanvirus(15.38%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2037142 : 2045860
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP023671|2037142:2045860|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP023671|2037142:2045860|2044240_2045860_+|AYE34591.1|DBSCAN-SWA MKKGIAASKGYAIGKVFLQEHEEIVITDAKVSDIAVEKDNLQKALDQAKLQLTAIRDKALAEIGEHEAQVFEAHLTLLDDPEFTGGMLLEIESNSINAMKAVENVTNTFVMIFESMEDEYMRERAADIKDVSKRIISNLAGRGGDAFAITEENTIVVAHDLTPSDTAQLDRSKVVGFLTNIGGRTSHSAIMARTLEIPAIVGLKDITTSVKNGDFVIVDGIEGVCIINPEQSVVDEYTAKRENFLKEQEELKKLIDVKTVTKSGKRVEVCGNIGSPADAEAVVANGGDGVGLFRTEFLYMDRDSAPTEEEQFESYKKVLEIMNGKQVVIRTLDIGGDKTLPYLPLPEEMNPFLGYRAIRLCLDRKDIFRVQIRALLRASVYGNLAVMFPMISGLEEFKQAKEFVEECKAELKAEGIAYSENIQWGIMVEIPAAAVYADELAKYVDFFSIGTNDLIQYTLAADRMSEKVSYLYNPMHPSVLRLIKMTIDGAHKHGKWVGMCGEMAGDETAIPTLVEYGLDEFSMSATSILTAKKIILEQE >CP023671|2037142:2045860|2037821_2039597_+|AYE34586.1|DBSCAN-SWA MKEKIKNYLRGVWGAEIVIVIILIITLVSSYNKTFSGKLASMGAGTFDALFHPENYIRARIFYDSQNISEHIYDLTNNLQNMTPIVEENNFKNQNYLYSDKINYIILDNSTGRFTTNDSKFNSYVEKNKGSKFISEDTIKDFINENKLASITIDNKNKFNYYVNNTKESILKKDLGKYTEIYYQEPLAYSYIIKTESVTAQVMILAIILTVLLAIKVLINLTFNRQNIHLEIKAISKLIYVLKYGFKYKATRNKILISLFGAAGVIVAYLYLVAGIRSQNVLVTFLTTYPFKGTLIIVLIPLLCVLYSLKKSLDISIINDGLKKLNAGDFEYNLKNYGEREVKELVENINQIKDGYKIAVVEKVKNEKLKTELISNVSHDLKTPLTSIINYVNILKDPNITEDERRDYLLILEKKSMKLKLLIEDLFEVSKLNSGRMTINRHVIDIVSLVYQGVGEYSNLYEDKNINFKVNSNKEEIFVNLDGKLMSRLFENIIINSLKYSLENTRVYIDILENDDDVEISFKNVSNYEMDFSTEEIFERFVRADKSRTSLVEGSGIGLAIAKSIVELHGGSINIEVEGDMFKLYIVIPKK >CP023671|2037142:2045860|2037142_2037838_+|AYE34585.1|DBSCAN-SWA MFNVLVVDDEKEIRDAIDIYLRGEGMKVYKAKDGIEALEILDTEKIHLIVLDIMMPRLDGIKTCLKIRESKNLPIIMLSAKGEDSDKILGLNVGADDYVAKPFNHLELVARVKSQLRRYQKPLDMDEQSEDIIEVKDLVINSKEKTITLRGEDIKVTATEFKILYLLASNLGKVFSIKEIYEKVWEEPFYRSENTVTVHIRRIREKIEINTKEPEYIKVVWGVGYKIEREN >CP023671|2037142:2045860|2042482_2043517_+|AYE34589.1|DBSCAN-SWA MSINKKPLFNEMGDIEISKKRIINGNTTNLNDFNNMKYSWVSEWYRQAMNNFWIPEEINLAQDLKDYNKLTEDERIAYDKILSFLIFLDSIQTANLSNINNYITASEVNLCLTIQAFQEAVHSQSYSYMLDTICSPEKRNEILYQWKDDKILLERNKFIGNLYNDFLENPTEGNLLRTIMANYILEGIYFYSGFMFFYNLERNGKMPGSAQEIRYINRDENTHLWLFRNILKELQEERPEIFTDSMKQELIDMMRTGVEHEIAWGHYVIGDNIQGLNKTLIDNYIKYLGNLRMKAIGFEDIYEGYNKNPAMWVDILADANSVKTDFFEAKSTAYAKAGALIDDL >CP023671|2037142:2045860|2043585_2043885_-|AYE34590.1|DBSCAN-SWA MLIKCINNSLCTTLTLNKEYPVIEEGPNYYVIIDDVLEEITTKKERFIVVEDNDLSKKTKATINELNYQLENDFPDIRDFKTRKNSKGEIKEIVIKFKY >CP023671|2037142:2045860|2040215_2042447_+|AYE34588.1|DBSCAN-SWA MDYLLNICDLALNGIVSEDGLYTREKLMNSLKHIIRPNMNKDEIRDSIIQVALELTSDIEPNWQYVASKIYVNKLYDEVKRDRNLSIEDNPYEDLYSFITMLTNKGLYGRYILENYSQEDILELEKEIKPERDFLFTYSGINLLSKRYLIQDFNRKPLELPQQMFMGIAMHLAIPETKENRVKWAKRFYDVLSSLKATMATPTMSNARKPFYQLSSCFIDTVDDSLKGIYKSLDNFAEVSKFGGGMGIYLGKVRALESPIRGFKGASGGVVPWIKLFNDTAIAVDQLGVRNGSVAIWLDAWHKDVPEFLQLKTNNGDDRKKAHDIFPGLCYPDLFWKLAENDINAKWYMMCPHEIRLAKGYSLEDFYGEEWEKKYFECVEDERINKRVMSVKDIVRLIIKSAAETGTPFAFYRDTVNKMNPNKHEGIIYSSNLCTEIMQNMSAMNIQKSQIKDENGDTIVIEKIKSGDFVVCNLSSVVLGNVDVNNDEELGYVVETQIRAMDNVIDLNYYSVPFAEITNKKYRAIGLGTSGYHHMLANNFIHWTDDEHAKFADKIYERINYHAIKSSMNIAKEKGTYSCFKNSDWQTGEYFTLRGYNTKEWDELREDISIYGMRNGYLMAIAPNGSTATIAGTSEGVDPVMARFWLEEKKGSIIPKTAPDLSEENYWYYNSAYNLDQKWCVKINGIRQRHIDQGQSFNLYITTDYTMRQIMNLYIEACKSGVKSIYYVRSKSLTVGDCESCSA >CP023671|2037142:2045860|2039654_2040005_+|AYE34587.1|DBSCAN-SWA MIFVEYPKCTTCKRAKKFLTDNNIEFIDRNIIENNPTKEELKEWIEKSGLPINKFFNTCGKLYREMGLKDKVKTLKEDELLDILASDGMLVKRPILVNSDKVLIGFKEENWIEATK |
7 | Bacillus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2180847 : 2238879
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP023671|2180847:2238879|DBSCAN-SWA GATGGATAAAAAATTAATATTATCAATAGAATCAAGTTGTGATGAAACATCAGCAGCAGTAATAAAAGATGGAAGAGAGGTTCTATCGAATATTATAGCAACTCAAATAGACACACATATGAAATATGGAGGAGTTGTTCCTGAAGTAGCTTCTAGAATGCATATAGAAGTTATAAATGGAGTTGTAATGGAAGCACTAGAAAAAGCAGGAGTTACATTAGATGATATAGATGCCATAGGAGTTACATATGGTCCTGGCTTAGTTGGAGCATTACTAGTAGGACTTCAATATGCAAAAGGGTTAGCTTTTGCAAGTAAGAAACCTTTAGTTGGTGTAAATCACATAGAAGGACATATTAGTGCAAATTATATACAGCATAAAGATTTAGAGCCACCGTTTGTTTCTTTAGTAGTATCGGGAGGACATACTTTTATAGTTCATGTTAAGAATTATGGAGAATATGAAGTTATTGGTCAAACAAGAGATGATGCAGCTGGAGAAGCTTATGATAAAGTAGCAAGAGCATTAGGTCTTGGTTATCCAGGAGGTCCTAAAATTGATAAGCTAGCTAAAGAGGGAAATGAAAATGCAATAGAGTTTCCAAAAGCCAATTTTCATGAAGAGACATTAGATTTTTCTTTTAGTGGAGTAAAATCATCAGTTTTAAATTATATTAATAAATGTAAGATGCAAAACATAGAATTTAATAAGGCTGACGTAGCAGCATCTTTTCAAAAAGCAGTAATAGATGTTTTAAAGGATAATGTAATTAAGACATGTAAGAAGAAAAAGGTTGATAAGATTGCAATTGCAGGGGGAGTTGCATCAAATTCTTCGTTAAGGAAAGAATTAATAGAAGCGGCAGGTAAATTAGGAATACAAGTACTATTTCCAGAACCGATATTGTGTACAGATAATGCAGCTATGATTGGAAGTGCAGCATATTTTAATCTTACTAATGGAAAAATTAGTCCTTTAAATTTAAATGCAAAGCCAAATCTAAAGTTATAGTATAAAGAAAAATAGGGGGAGAGGTATAGGAATGAAACTTTTACCACATTCTAATGGCCTATACAAGGTAAATATGAAGAAGCCTATGAAGCCTAAAGACATAGCCAAAAGAACTTTAATTGTAATAGGCATACTTTTACTTTTGGGATTGGTATTTCAAAACATAAGTAATTTTATAGCAAAAGAAACATTAAAAGATAGAGTAGATTATACAAGAGTTGATGATAAGAGAGTAGATTACATAGTAAAAGGTGAAGGTAAACATACAATTATTTTTGATGGAGCTATTGGGGGAAATTTAAATCAATGGAATGATGTTTGTGATAAATTATTATCAGAATATGATGATATAACTGTATTTGTATATAATAGACGAGGATATGGATTTAGTGATGGAGGTCAAGATAGGACTCCATTAGAACAAGCCCATGATTTAAAAATACTTTTACGAAAAGCAGCTTTATCACCTCCATATATTTTAGTTGGAGAAGAGTATGGAAGTTTGGTATTAGGTAATTTTGCTAAAGAATATAAAGAAACTGTAGCAGGGGTAGTCTTAGTAAATCCAATAGTAGAGGAAAAAATTAAAGAAAAAGATTTTAAAAGGGGATTTACACTGGAAAAAATAAGACGAAAGATAGAACATTTAGGTTCATATATAGGACTTACGACTTTATTAGACCAGTTAAACCTAGATACTAAGGTATATGGATTTGAAGATAAATTGCAAGGAGAAAAGTTAGAAGAATTTAAGGTACATAGAACTAAATCAAATTATACAAGTGCTGTATATAATGAGTTAAATAATGTTTCAAAAGGATTAAGTGATAGTCAGGAGACAGGAGTGCTTTCCGGAATTCCTTATTATGTAATAGCTAAAGAGGGACAAGAATCATTAGAAAGATTAGGGGATGAGGATTTAACAAAGGTATATAAAACTAATTCTAACAGTAATTTTATATCAATAGAAGATCCCGATGCTGTAGTAATTGGAATAAGGCAAGTTATTAAAAAAGTTAATGATATGGAACGAAGAAATAAAAAAAGTAGTTAAAAAAAGGCAATTGTGTATACTTTATTTACATAGTTGCCTTTAAAAATTTTATAGAATAAAAATATATTAATAAAATAATTCTTAGAACCGTGTCATATAATTGACACAAAAACAGGGTATATTATAGTCATGAAGAAAATGTTTGAGGAGGATATACAAATGAGTGATGAAAATAAAATATATGATGTTGATAACTATGAGCATGTAAATATAGAGAAGGAAAGTGAATTTAATCAGGAAGAAGTAAAAAATAATTATGAAAAAATAAATGATAGTAAGAACGAGGATAATAATATTAAGTTTTCTAATATAAATGAAAATGTTAATAAGAAGAAAAAGAAAAGAGGAGTTAAGAATATAGCTCTTATGTTAGTAATAGGTATTTTAGGAGGTGCAGTAGGTGGTGGTGCCACTTATTATGCTGTTAAAAGTATAAATGGTGATGGTAATGTAGTTTCAACACCTAATCCACCAACATTTAAAGCCGATGAAAACGAAGCATTAACTAAAATACAAGCGTTTGAAAAAGTTGCACCAGCAGTTGTTATAGTTTCAACTAAGGGAGTTCAAAATTATGGGGGTTTTATTCCAAAAGAAGTAGAAGGAATAGGATCAGGTTTTATAATTAATGAAGAAGGGTATATATTAACTAACTATCATGTTATAGAAGGAGCTCAAGAAGTTACAGTTACTTTAAGTGATAAGAGAGAAGTAAAAGCAAAAGTAGTTAATTATGATCAAAATCAAGATGTAGCTATGCTAAAGATAGTTGATAACATTAAAGTGCCAGCAGTAGTGGAACTTGGAGATTCTGATGCTTTAAAAGCAGGAGAAGAGGTTTTAGCAATTGGAACACCTCTTTCTAAGGAGTTTTCTCAAACAGTAACAGGAGGTCTTGTTAGTGCTTTAAATAGAAACATAGAAACTAGTAGTGGAGTAAAATTGAATTTAATACAAACAGATACTGCAATAAATCCAGGGAATAGCGGAGGACCTTTAATAAATACTAAAGGGCAAGTAATTGGAATAAATACATTAAAGATTAGTGGAACAGCTGAAGGTATTGGATTTGCTATTCCAATTAATGAAGTAAAGGGAAGAATAGAATCATTGTCTAAGCCAATATTAAATTTAGGGGTATCAATTAGAGAAGTAGATGAAAATTTAGCAAAACAATATGAAATGCCACAAGGGCTATATGTTGTAGAAGTAACGCAATTTTCACCAGCAGAAAAGGCAGGAATAAAAGGTGGAGATGTTATTACTAAATTTGATGGTAAAAGAATAAAAACTTTTGAAGAATTAAAAGAGATAAGAGATTCTAAAAAAGAAGGAGATACAGTAAGAGTAGAAATTGTTAGAAATCAAGAAACAATTACAGTTGAGGTAGAGTTAACAGCACAATAGATAAAAAAACAAAGGATAAGAAGTTATTAATTAACTTCTTATCCTTTAATTATTTTTTTAGGAATATATTATTCTATTGATTTTATAATAAATTGTGATAAAGTATTGTATATTGAGAGAAAAATTAATTAATAAAATAAAAATCACATTATAATATAAAGAGCTATTTTAAGGAGGCGTCCATAATTATGAAAAAAATAGTTTTATTATGTTCAGAAGGTATGTCAACATGTTTTTTAGTATCTAAGATGAAGACAGAAGCATTAAATCAAGGAGTTGATTGTATAATAAATTCTTGTTGTGAATCAGATTTAGGTACGTTTAAAGATAACATGGATGTATTACTTTTAGCACCACAGATTAAATTTTTAAAGGAAGAAATAACTACTAAATTTAAAAATGTACCCATTGGTGTTATAAATTCACTAGATTATGGAACAATGGATGGTGTAAAAGTATTTAATCAAGCATTAGAATTATTAAAATAGAACAATAACTTATTTTTTACCTAGGTAAATTCACTTTTTTTATCTTAAGGCATATCTTATAGTATAAGAAAAATTTAAGAGATAAACTTAGGAGGGAAAAGTTATGAGCGGAAGAATAGCATCATGTCCTTTAACAACAGGAGTTAATGAACAAATAGAAGCGGTTGTTAGACTACCAGAAGAAAAAAGATCAGTTATATTTGGAACTGTTTTAGATCCTAATGGAAACCCTGTACCTGATGCGGTTGTTAAACTATTAAAAGTAGTAGATGGATGTAAATATCCATATCCATTAACCCATACATTTACAGATTGTTATGGTCAATTTTTATTAGGACCTTTATGTCCAAATACTAAATATATGTTAAAAATATATAAAGACAATATAAATATAAAATTTACAACATTACAACCAAACCAATATAATGGACATTGTTTAGGAAAAAATGTATGTGAATCTAATCCAGAACCAGATGACCCACCATGCGGATGCGGATGCGGATGTGGATGTGGCTGTTAGTATAACTGAATGAGATTTTATAACGAAAAAGCTTTTTACTTTAGTAAAAGGCTTTTTTGCTATTAAAAAATCTGTTAAAATTTTATTGATTATTATAAATTAGGAGAAAAAATAAAAAATGGAAAAAATAGTATTATATATAGTGGCATCATTTTTTGTTATAGGATGTTTAGATTATATTTTAGGTAATAAATTAAAGTTAGGTGTAAATTTTGAAGCTGGTATTAATAATATGGGACCGTTAGCATTATCTATGATTGGAATATTATCAATAACTCCAATAATCTCAGATATTATAATTAGATATATAGCACCATTAACTAGTAGTATAGGAATTGATTCATCTATAATATCATCTAGTTTTATAGCTATAGATATGGGGGCTTTTAATATAGCTAGAAATGTAGGTGGAAGTAATGAGCTAGTTTATTTCTCAGGAGTATTAATTGCTTCAATTTTAGGGTGTACTATTAGTTTTACTCTTCCGTTGGCATTAGGAATGATAAAAGATAAGAATAT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59 | Clostridium_phage(16.67%) | coat,transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2853304 : 2896667
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP023671|2853304:2896667|DBSCAN-SWA 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56 | Clostridium_phage(41.94%) | integrase,tail,portal,capsid | attL 2855922:2855945|attR 2905169:2905192 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3282095 : 3289733
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP023671|3282095:3289733|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP023671|3282095:3289733|3287137_3288271_+|AYE35891.1|DBSCAN-SWA MDDGVEETYKEWDTEVFNDEGINVEAKSALLIEPTTGKIIYEKNIDEKFAPASVTKIMTMLLTMEAVDSGKITLQDKVTCSENAKKMGGSTMLLETGEVRTVEELLKGVAIASGNDAAVALAEYLGGTEEAFVEMMNKKAKELEMTNTTFKNCNGLPAQGHESTARDISIMSMELLKHPQILKYSGTYMETISEGRKSPIELVNHNKLVRFFEGCDGLKTGYTEEAKYCISATATKSGVRMLSVIMGAPTYKIRNRDAGMLLNYGFSKYEGKKLVLKDEDVETVYLSKQTDKFFMAKAKDDLIVVLPKGSNGELEKRIVMDEIKKEYKEGEAVGKCEVYLGEEKVGEVELYSDRDIKVGGFFENFKFNMKNMFKKGI >CP023671|3282095:3289733|3282095_3282614_+|AYE35659.1|DBSCAN-SWA MNLNEKTLKERIIHKGNFMTFVNVDVELPNGKLGNRDILKHPGACAILPFLDDEKVILVKQFRKPLEKTLIEIPAGKLDKGEEPKKCAIRELEEETGYIAKEISYLGKIATAPGFCDEIIYLYKATGLIKGKKNCDEDEFTELVVMSLEEVKEKIKSGEIIDTKTISVLAYL >CP023671|3282095:3289733|3288385_3289129_+|AYE35663.1|DBSCAN-SWA MEMPSIKVADFEGPFDLLLHLIKKHEMDIYNIEIYKITNQYLRYLDEMKEMDLDITSEFIVVAATLIEIKSKKLLPKVAVQEENEEDIEKNLMIKLIEYKKFKNVSEFFRERYISSGDVYTKMPELIEEKKEQVKTEDLLKNVTLLDLYKLYNDLLETYRLKRNNESVIQKRIFVDKYKLEDKIQYVLEKLQNIKVIEFNEFIAESECKMEAVVTFLALLELIKLRMVRVYQDNSFDNILIKRRHNE >CP023671|3282095:3289733|3285612_3286917_+|AYE35662.1|DBSCAN-SWA MRMYDVILKKRMGEELTKEEIEFFVNGYTKGEIPDYQASALLMAIFFNKMNKRETADLTMAMVRSGDEIDLSSIKGVKVDKHSTGGVGDKTSICLTPLVASLGAPVSKMSGRGLGHTGGTIDKLESFPGFTVELTEEQFINNSNDIGIAIMGQTGNITPADKKIYALRDVTATVDNRSLIAASIMSKKIASGSNAIVLDVKVGEGAFMKTPEDAKALAQAMVDIGTHCGRETIGVISDMDQPLGFAIGNALEVKEAIELLKGNGPKDLLELVLTLGSNMLVCGKIAKDFEEGKKLLMQNIENGKGLAKLKEFVAAQGGDASYVDDVEKLPKAKYVVEVKSEEEGFVSKIHAEEFGLIAMELGAGRATKESEIDLAVGIVLNKKRGDKVNKGDVLAYIHSNDENNIAKTSKKIKENFVITEKFENNIPLIYDIVK >CP023671|3282095:3289733|3283476_3284355_+|AYE35661.1|DBSCAN-SWA MKEIVNEYRESLLKSHKSENTVYAYVTDVNLYVKYLNNKNIDINETDNVSVLGYIQYLLSQGKSERSINRIVISLRSFYNYLKDQKVVKEIPKIYYKSTATAKKLPEILTVEEIDRIIKIVDKDCNKGTRDNALLELMYATGMKVSEIIGLKVWDVNLDLSFVKCHDNKNYERLIPIGRSALEALKDYFKIRDQIASAGVDNLFVNLNGNQLTRQGVWRIVKEYSHKAGIKKEVNLNTFRHSFAVHLLQNGANVRAVQKLLGNQVLTYMDTYYEIINNDKINLVYKNSHPRA >CP023671|3282095:3289733|3284401_3285568_+|AYE35890.1|DBSCAN-SWA MKRAILVVMDSLGVGALPDADLYGDAGSHTLDHVYKACGGLNIPNLENLGFGNIEGVTELKKVDKTTGAYGRLMERSKGKDTVTGHWEIGGVILEKPLNTYPNGFSDEIINEFLAKVNKKGILGNCVASGTAIIEELGDEHVKTGYPIIYTSADSVFQIAAHEDVIPLEELYKMCQIAREMLVGEHAVGRVIARPFVGKSGEYKRTPNRRDYALDPFSKTMLEYLKENGKEVAAVGKIEDIYNQKGVTDAIHTKNNMDGVDVTLKYMDTVKEGLIFTNLVDFDMLYGHRNDPKGYGKAIEDLDGRLNEIYSKMTDEDILILTADHGCDPTTSSTDHSREYIPVLIYGKNIKPVNLGTKTGFTDIGKTILDYFNIENDIDGSSFLKEIL >CP023671|3282095:3289733|3282771_3283407_+|AYE35660.1|DBSCAN-SWA MNIISRLNSNLKENKVLYILVLIFFFVGIILGSYVVRYMSGGDAKDLSSYFTSFITSLGEKPIDKATLIFDILKKNLLLIIIILALGFTVFGTPFILIIDLIKGFTLGYTFSFLLTTFEGKGIWIALASTLPQNILYIPFFIGISIISLEISSRKLKEHFFNGNKVNRIVTNQLLMKLSIFISIFVIGAIVETYISPSLIKIIVAKVYKIV >CP023671|3282095:3289733|3289121_3289733_+|AYE35664.1|DBSCAN-SWA MNNIEINQCEFQGASKKARIKSSIEALLFVSGESLSLRTLSTHLEVSAKDLEKILEEMIVEYEEEHRGIKLISINGEYQLVTKAQNSDVIQKLLKKNKRQSLSQASLESLAIIAYKQPITRIDIDEIRGVKSESAIQRLIEKELIKEVGRLEVPGRPILFGTTEEFLRQFGLKTLKELPSIDLYGENEIEESIEVLNKAMKDI |
8 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3297895 : 3328834
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP023671|3297895:3328834|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP023671|3297895:3328834|3300840_3301644_+|AYE35675.1|DBSCAN-SWA MFYRQKVYKLIKKMNVKTKESQEVLDISMFPITMFEKKKSRKRKKRESRVVQKNLNDKNAKKYFYRKVQCNFDTSDYIWCISYDKKPKNDEEANRDFENLIRRINNYRKKKGLERTRYMAVKEGGEGTKKRIHYHIIIDGDIDRNTLESFWKKGYSNTRTLRAREDGFKDLTQYMTKEGNSKKRWKCSRGNLVEPQAMINDNRFSRKKMREMLTQHPSREEIEALYPGYTLTDYSIKYNEENGGVYMNILMRRTVKNYLDKRRKRSD >CP023671|3297895:3328834|3315013_3315349_+|AYE35690.1|DBSCAN-SWA MSMTQLEKIKLRLEIDKEDKSKDDLINIVLEDAKCEILDYCNRNVILAKMEALQRELAILYYNRIGSEGESSRNEGGISVNYIIDIPESIKNRLNAFRKLKAVGIANENKE >CP023671|3297895:3328834|3327041_3328019_+|AYE35703.1|DBSCAN-SWA MKIAFRGGHNEQATGASALIDELTEDRKVLAECINVARGYGHEVLDCTPGPCDVNTDLVYGVKKANEWGADIYIPIHFDKAYDNYNGALGTGTFVYSKSDAYKDEDIAQKISNNIAALGFKNRGVKEADYYDLRMTTMPAVLVEVCFCEATEDVALYRKLGARKIAEAIVSGITGKNIEQSVQSDIGMRVALDEPNHITIDSNKLKVRGWALNHAKLEILIDNVSYGTVETGQKREDVYEAYPQYNNHFAGYEKTLEFTELEKGQYKCTVRATDNNNKTIEVTKTFTASKTISNNNEIFKKENEILRKENKELKEKMSKIKNIVE 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>CP023671|3297895:3328834|3299259_3299814_-|AYE35673.1|DBSCAN-SWA MNYEIFKTIVPPVIAGLITYRVANKNIFSNIRLQVANEQLKKVYLPLFIFLEPYLYKQPDIQIIKSFINMFNEIKSTNYELIDSDLLNCVQILEKSIHDNKYNFNYYESVCSILDKLFERTRKLLKLPTRSISYRLNNKQYGTSINEAIKFIEDIVLKVLPILLLTIIFIIIHTFINTFIHLLK >CP023671|3297895:3328834|3307903_3309187_+|AYE35683.1|terminase|DBSCAN-SWA MIKVKLKSIIAASFYEAHKDIKRGFHTHYWFKGGRGSTKSSFISIEIVLGIMKDAQEGIMSNALILRRVKDTLSESVRDQIKWAIDTLGVSDYWHVPEAKLTITYKPTGQVIRFKGADNPKKVKSTKVPKGYIKYLWYEEVDEFENKSKIDTINQSILRGGPKFFVFYSFNPPESQRNWCNQEVIETREDKYIHHSDYRTVPKEWLGEQFIIEAAHMKKVNPTKYEHDYLGAVTGTGGEVFRNLTIREITDEEIKIFDRLKNGLDFGYAADPLAYLLMHYDKTRKRLYIFGEVYKVQLSNSKAVEEINKLNKLNKRVIADSAEPRTINEFKKLGLNIIGAKKGPDSVEHGLKFLSEEIEEIIIDPVRCPNAKREFMEYEIEKDKNGNLKGEYPDKNNHTIDAARYGMESEINSRKVRVKSKSKLGLR >CP023671|3297895:3328834|3298954_3299167_+|AYE35672.1|DBSCAN-SWA MNNEKIEVISKGILEDDNLIEEEKEIALKILKDLEGTLVIRATSILKFCLKAIQYSKIKKSKVTSKEVPI >CP023671|3297895:3328834|3307188_3307911_+|AYE35682.1|DBSCAN-SWA MGKSRSPNRDKAFKIYRDSDGTILIKDIATTLNEKVSNIYAWKRNDNWDKKLKRGAPKGNKNAIGNKGGAPKGNLNALKHGEYCDSSKFLDKGFLQKYIPAATKNIIKGAVDENISAVDILWCNIMFLYASIVRAQKIMYVKNHDDLTKELKKQSWGKTGLEEYELQFAWDKQERFIKAQASAMNTLNKMINDYEVLIHKNWDLATEEQKTRIEVLKNKISQNDYNSTTEGIQVVDDIDD >CP023671|3297895:3328834|3315649_3316123_+|AYE35692.1|DBSCAN-SWA MSRSVVGLDNLLKKLNKLGGNVEETLYKSMQRQGELVKGDAKDLCPVDTGDLRQSIKSETKNYKNKITTRVYTNSDHAAYVEFGTGKVGERTNKNNKVNVSYKQDKWLANIPDVGVRWVEGQPAQPYLYPALKNNEKIVVENIKEDVKKEIERILRR >CP023671|3297895:3328834|3299899_3300139_+|AYE35674.1|DBSCAN-SWA MKREEAIIKLKDLLYNFKEFTSIETMEEDVQALEYAIKELERTVQEQYVTLKIDSTEIARVVIDEINRQQKRSHRILIV >CP023671|3297895:3328834|3310729_3312454_+|AYE35685.1|head|DBSCAN-SWA MKSRINAYWERRANARMENYHKGSDETIYKINKAYDKAIKDINEDINKIFYKYQLNSNLNTTEARELLNSKISNKELDSIRARLYNIQDEELKQYMMAQLNANAYKARITRLEALKESIYINTKIAADVEIKQSTKLYTDNINKAYYTNLFDIQKGLGIGFNVAKMPLETIQEILKNNWSGKHYSKRIWNNTDVLAEKLEEVITAGLMSGKSSRRMALELQDLTDYGKFSCERIIRTETTYVTNMADIESYKECGIEKLIFLATLDLRTSKRCREMDGKIIDVDKAIPGENIPPLHPHCRSTTRAYFENMKRLQRRARDPETGKNYIVPEDMNYNEWYDKFVIDKYGKDKAEVFEKMIKNKTSDKKQYEEYKIVLKDMIPKSFDKFRGLKYTDVNKYQQIEDNFKAVNLYKIDFGYVSPQKILELDRQAFAEKRNNQISKYKKQGNFAVLEYNRKTRFASSKIASEEDSHFIKYKGEKEKLVLLKEHREFVTKEIGEIVDGKINEIPRYYDTEAKFFEFLNDKIKDEDIKEIFMLSEKAMCESCKDVAKQFIRKYHNIKVNVISGKSFDGWKGR >CP023671|3297895:3328834|3316978_3317374_+|AYE35695.1|DBSCAN-SWA MALYKILTVGEKEYKLKLTTSATICIEEKLGCNILDPILEMGSSAPMDNKGNINMKKVTKIPIPSLKYLVTVLWGSLQKFHHGMTFEKTCDLLDEYIESGKTQMDLFEFIMNLLTESGILGTPEEKTENLK >CP023671|3297895:3328834|3301672_3302782_+|AYE35893.1|DBSCAN-SWA MDNNSDPLVKLIGNHLLKQIDINKVAVEKILKEKECIKNFTKYVESNYKDIGIQDYIELATDYFGIDAVQENVINISSNGELSVKRTPGLIAAEINDIKFKTKKMVLYNSIEIGRKLVEAKELLPHGEWGNWLEKEVEYSKSTANNLMKIFKEYGAEQTTLLGDNTKIQAFGSLSYSQAVLLLGIPLERREDFIKDNNVENLSTRELEKIIRELKQEKEEIIKEKKRALEKVNDLEETNKAFEVAFNSGAEERNRLETKIEKLEEEINQLVNKQIDATAGSTDSKLQEEVYRLKKEKEEKEVQLQNLQNELYTGNLNLKIYFDQAESIFKTLLKELEKVHVSKDEFERYSSLMESYGESILNKLENNYV >CP023671|3297895:3328834|3314093_3315002_+|AYE35689.1|capsid|DBSCAN-SWA MMAVNYAQQYSKELANAYPYVLYSGRLWSTENDKKYKVVDAKTIKIPKLSTTGRVNGDRSKIGDFSQNFSNDWETKELKNHRIWQTLVHPQDVNQTNQVASITNITQTMNETQKFPELDAMMFSTLYKLKNEKKAIVQEKTDLDSKSALVKFDAMMDEMDEGLVPATGRVLYVDTFTKTLLDNAVAIVRTNGDKTLTRTVSRLDEVDIVGVPTALMKTAYTFNDGKTGGQESGGITAKGEAKNMAMILVHPSAILPIVSYSFAQLQSPSALSQGKYVYFEESFEDVFILEERAAAIQICIKK >CP023671|3297895:3328834|3322503_3322881_+|AYE35700.1|DBSCAN-SWA MKISNEKIVNSIGVLSKVTGMDLNIKVSYAIAKNISKIEKELEIYNKEKGKLIDKYAFKDEEGKIKSNKDGAVDIDDIENWNKDIKELLEIENDIDIHLIEIEDLSKCSCNITPGELMLISYMFK >CP023671|3297895:3328834|3304959_3305292_+|AYE35894.1|DBSCAN-SWA MYLEGFNSSEISRLLNNKGIKVTKAAIQKYIQRNLKNLKYIHERKVIERREIIKATNYEAKRHMTDKAFIMKNRSIYKTKANGDIVLNKTIAPAVTWDTPRRLSNENKIS >CP023671|3297895:3328834|3303568_3303802_+|AYE35677.1|DBSCAN-SWA MKNKLIDLNDHLFEQLERLNDEELKGEKLQEELRRAKAIVNVASQIISNANVVLKAQQFIADIDGRSKVSVPKMLGE >CP023671|3297895:3328834|3297895_3298318_-|AYE35671.1|DBSCAN-SWA MISLFSRRFNMDIKERIKILRKDILKLTQTDFGNRIGVAKSTIAGYELGTRRPIDRAINSICREFNVSHAWLTEGIGDPFIQSDDDDIIELINKALSNENEFIRNVFKSFAKLDTKHWEALEEFMKISLGIDEKKQENKK >CP023671|3297895:3328834|3306543_3307158_+|AYE35681.1|DBSCAN-SWA MIFGYVRVSSKEQNENRQVKALKDFCNELKYENIYIDKESGKDFNREKYQELKKILRKGDTLIVKELDRFGRNKEDVKNELDYYKEKKIRVKILNIPTTLMDFPEGSEWVFEMINNILIEVLGAIAEEERNKIRSRQREGIEIAKKEGKYKGRPKSELPQGFEKLYRQWKDNNITAIQFTKLLGLKSRTTLYKYIKRYEEIKDV >CP023671|3297895:3328834|3317804_3321896_+|AYE35697.1|DBSCAN-SWA MTLEELEVVINANTRQFNTQVAQVQSKVDSMATRVNNKIDSMSGTFAKLGKILASAFAITAIGRFTKSCLDLGSNLAEVQNVVDVTFGSMSDKVNEFAKNAWQTVGLSETMAKQYMGNFGAMSKSMGFTVDSAEQMAETLTNLSGDVASFYNIKQNEAYTKLKSVFTGETETLKELGVVMTQENLNQYALANGYGKTTEKMNQQEKVALRLAYVTNNLSAANGDFARTSGSWANQVRLLSLQYRSFKSAIGQGLIAVLTPVINVINTIMSKLVQMANTFNSVLSAIGFNITGGSGGSSGPIAFNGATSGIDGATDAMNNLGGATDGVGKSADKTKKKLEALMGIDEINKVNSNDDSGSGGNGGAGGLGSIASPSIDTSATENSLSEFSNKVNKILSELLSPLKKAWDNYGDWFLSKWDYFKKAFGYSCDELKNFLISVWNHGGKEFVQHMAEIGIVIGGVAVQIGGDILVALGRLWRHINPDNNSYTRKFINAMNSLAIAVRDFIISAGNWFGKFLDLGGQAFINVIGDIVVLLGTILAKVIRDAIKFITNFMNSWARSAIIGTVAMTLNIVAGVIKALLIVIEKCHKVLELFISLWAAWKVTNLVTNFLSVTNSLKAMKDGFLIAKEEMKLFNTVGGKLANKLFKVGTSLTNTKELGKSAIMTLKSLGESIYLNTLYLKDWIVALGKNTIMALKSFGQTIYLSTLYLKDWIAALGKNTVIALKSFGQTIYLSTLYLKDWIVALGKNATKALVNFGQNIKFNLWYLKELAIEMGVKAVKSLVKFIISIGTNTAALIGLTTAEGTATTGAIALGLALDALGIGLIIAAASGLIIVIKKLGDKFGWWSKISNALGSVLGWIGEKVGWLWDKIKSFFGWDTDAAVKENIEEIGTVAEDAAKTTDDAFGTATSNVNKYLDSIHFNATRLSQEVDEATKSATEKFGMLSQNAQDYLDAIYEHNTEKLAEMGDNQSIYNEEVKSMYSDLTEAEKNEFMKRYGIIQGINDDMLNYEGLKYDERVARHTAYLQTIEKDESLSYQEKKEKMDQANADFQAGIDAEVQKYHDSIVSKQQALDELLATHGNTTDQGKVYEQDLRDAIAADRESIENLTKTSYDNQVKTTEEATQAMSQANKDNAKEQEEAYKNLTTIVDESMSKINDSLSGARENIELFANDSNNLSNKLRNLFDKLSSEFTKAGNMIKSTLTQIQNIAINTTSNIRNNITNNMKEAYRNVSNYINNIKSLFNNFDATLRVKIPHFYMEGSFNAETKEVPRVGVNYFAKGGIVDRATLGIVGEAGREAIMPLENNTGWITDLAEKVATRMPQRSNDNYSSGDLTLIIDGSVIGKVALKQLKRMQRQGNITLIPT >CP023671|3297895:3328834|3309348_3310740_+|AYE35684.1|portal|DBSCAN-SWA MTIYKDRELVNEDGTIPEKLLIKCLEEHNLQKIRYLELLDYYEGKHKILNRVMSNEDLPNNKLVCNHASYITDMAVGYVFGVPISYSGEGNGDELLNQIFTEIDEDSHNNELALDISILGIGNELIYMNDEDIPGIELAVLSPLNTFVVFDTTVKHKPIFAVNYTEKQDIEGTVKGLDVNVYTKYKLYRYFTANTSFNGLNLIDENEHYFDDIPIIEYKNNKTSTGDFETVLTLIDAYNTLQSDRINDKAQLADALLAVIGASLGDDETEQTNTAKLIKEMKILELDEGGDAKYLTKQLNETEVEVLKKSIKDDIHEFSKVPCLTDENFVGNSSGVAMKYKLLGFEQLAKTKERYFKKGLRQRIKLIANLEGTRAKIIDSNKIDIVMKRSLPVDDELKVRILQETEGSLSWETRIKEYNPEIDTEEEKKRLYEENQKKIEQQQKAFGSYDIKSTEKDGEVDEE >CP023671|3297895:3328834|3317505_3317808_+|AYE35696.1|DBSCAN-SWA MTINEVTKIRESFFRRREVKRKDTADMVYRLSTLITNGTACIMSKDNKPIEFLDMFGDLFSEEKKINEEKRIENQIEINKQHMKDFANRVNLQRKGGEDK >CP023671|3297895:3328834|3328624_3328834_+|AYE35704.1|DBSCAN-SWA MASNNNGSNRNLVPEAKAGLNRLKNEVASSIGLNNYEETDKGNLSSRQNGSVGGEMVKKMVEQYENQIK >CP023671|3297895:3328834|3313424_3314072_+|AYE35688.1|DBSCAN-SWA MKRKLIMNLQLFGLGRISRPFLNADAGDGNGSAGTGTDNSNGEGAGEQGESKTFDDVLKDKSYQSEFDKRVAKALETAKSKWETEKATELENAKTEAEKLAKMNAEQKAKYAEEKRLAELEKREKDITTRELKAQAYETLAEKNLPKELIGTLNFSDAEQCNKSIEAVEKAFQSAVEKAVNDKLRGGNTPKGGQGNNNQTTFGFNFTGVRSRETK >CP023671|3297895:3328834|3323065_3326395_+|AYE35701.1|DBSCAN-SWA 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>CP023671|3297895:3328834|3313052_3313316_+|AYE35687.1|DBSCAN-SWA MNEKEFLEWCKQEVCNYTNKHLDKTDKKEITTDDVFMVWSCKTLQNNKALISTTLFDGMYYECTYNGDKKEMYVDAYKKWENYKVEK >CP023671|3297895:3328834|3305420_3306065_+|AYE35680.1|integrase|DBSCAN-SWA MSKRNWEKGTAQPIPNSKYTRFKETLREHSEVNSERNIMLFILARATGYRMQDLVCLTIKDIKLALKAGEFNIQEQKQYKQWVSNLKNYPNRKKPEKRKAEIGPKLERYLMNYVKNKKDSDFAFESKKGNRNEFITQKSYSLILSEVGKKIGLKNISGHSPRKTYATKIYEESNFNVEKVRVALGHKSIEETKRYLGLKEAMKSDAARIADEGI >CP023671|3297895:3328834|3322268_3322517_+|AYE35699.1|DBSCAN-SWA MLDINENINLNGNVNIENQQVVNMTASIYTEGNNYPNINITVVDKKIYKKKFDVCKQGINEFIDKALKKQYEMLGDVTSENK >CP023671|3297895:3328834|3303806_3304400_+|AYE35678.1|DBSCAN-SWA MEVSKSKIHRWSEEEKKYLAEITPGKHYSEILELMNKKFKNTFTISQIKGAIGRYKLNTGFTGKFEKGNIPKNKGTKGLTGANKTSFKKGNRPVNYRAIGSERINVDGYLEVKVADPNKWRLKHRVIWEQYNGKIPKGYNVLFGDSNKLNLDINNLILVSKKQLLVMNKNKLIQDNFYLTKTGSIIAKLIIMVGEKK >CP023671|3297895:3328834|3315332_3315647_+|AYE35691.1|DBSCAN-SWA MKIKNKKTYYLRKKTIIEDNEGGKYPGYSESIEIQSNIGPASGKLQAEIYGERLNYILNMLYDGPKTINEGDGICVYVSKDSDPDYKVISIKRYSHLFIELEKI >CP023671|3297895:3328834|3304451_3304685_+|AYE35679.1|DBSCAN-SWA MNKLINVGYENTVNMEKVISITNAKSSPTRRMIQRAKEKDLLVDATEGKKTVTAIVMESGHVILSAVRIETLKKRIG >CP023671|3297895:3328834|3312459_3312807_+|AYE35686.1|DBSCAN-SWA MELEYLEEIKDDFINTYDVHLKDSGLNPLVNWFIHENDLYMTDEYPVENACHYLAIGAYLIYKNKIEELNNKILEKIKESYNLINSGIYDENFTEEDKVYIKQDIKKIEESKLFK |
36 | Clostridium_phage(42.86%) | capsid,portal,integrase,terminase,tail,head | attL 3288030:3288045|attR 3315075:3315090 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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