Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019857 | Clostridioides difficile strain DSM 29745 chromosome, complete genome | 12 crisprs | WYL,cas3,DEDDh,cas14j,DinG,csa3,c2c9_V-U4,RT,cas14k,cas5,cas7,cas6,cas2,cas1,cas4,cas8b2,PD-DExK | 0 | 33 | 12 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP019857_1 | 146625-146703 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019857_1
|
1 spacers
spacers of CP019857_1
>1.1|146650|29|CP019857|CRISPRCasFinder TGTAATAAGTTAAAGCAATATGAATCAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019857_1
The CRISPR arrays of CP019857_1 >merge|CP019857|1|146625-146703|CRISPRCasFinder TGTTTATAATGTGGATAATATTTAATGTAATAAGTTAAAGCAATATGAATCAACTGTTTATAATGTGGATAATATTATA >CP019857|1|1|146625-146703|CRISPRCasFinder TGTTTATAATGTGGATAATATTTAA TGTAATAAGTTAAAGCAATATGAATCAAC TGTTTATAATGTGGATAATATTATA
>CP019857.1|AXU85086.1|145604_146144_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein MKIRMSSTISYDSIVDGPGLRMVIWTQGCIHNCKECHNPQTHDLCGGFYMDTEEIINKVKSLKLQKGITLSGGEPFLQPEPLEEIAREAKINGLDVWSYTGFTFEQLLDKKNRAYFKNLNLLKQIDILVDGKFIAEKKDISLKFRGSSNQRIIDVQKSLKYKKVFLVEQYMKDDLSIAE >CP019857.1|AXU85085.1|143231_145583_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase MVEFVKKRDGRVIPFNEDRITRAIFLAATNVAEREGIVPDYKLSEQLTQEVIKFLNHKYSESVPSVEDIQDSVVKVLIETGHAKTSEEYIIYRTERSRIRNSKTRLMKAIEEITFEDAEDADIKRENANINGNTAMGTMLQYGSTVSKEFCKTHILKPEHSFAHDNGDIHIHDMDFLNMGTLTCCQIDVKKLFNGGFSTGHGFLREPQDIISYGALAAIAIQSNQNDQHGGQSIPFFDYGLAEGVYKTFKKFYIGNLAKALKLFKGIENNDVIKNIVYNTEKETNQKVGLKRDELYLNLEKEKLIQTFDIDDELVNKMQNFAFEESYRETDKKTYQSMEAFIHNLNTMHSRAGAQVPFSSVNFGTDTSEEGRMVTKNLLLSQERGLGNGETPIFPILIFKVKEGINLNPEDPNYDLFKLSCRVSAKRLFPNFSFLDAPFNAKYYKKGEPDTEATYMGCRTRVLSNVCGSETVSGRGNISFTTVNLPRLGIKHGIINNEKANLDGFFEELDEKINLIIEQLLERLEVQGNKKMKNFPFLMGQGVWKGSDNLGPEDTLKEVIKQGTLTIGFIGLAECLIALIGKHHGESKEAQELGLKIVSHMRHKMDEATDKYKLNFSLMGTPAEGLSGRFTKIDKKVYGEIKGITDKEYYTNSFHVPVYYNISAYDKIEIEAPYHELTNAGHITYVELDGDPSDNLEAFETVIKAMKDLGIGYGSINHPVDRDPICGFSGVITSNICPVCGRNEDESDIKFERIRRITGYLVGTVDRFNNAKKAEVRDRVKHR >CP019857.1|AXU85084.1|141674_142859_-|aspartate-aminotransferase MLSKRLNFITPSYTIGISSKVKEMESNGVKVINLSIGEPDFNVPNNAKSYGIDSLNKDYTKYDLVPGLKILREEICKKLIEENNCNYSIDEIVVSSGAKNSITNTLLALTDEGDEVLLPKPYWVSYPEMIKLVNAVPVFIDTKKENGFKLTKEELEKSITDKTKILVINNPSNPTGSVYTKDELIEIVDVCIQNKIYILADEIYEKICYTGEFTSIASLSEEAKDITITINGFSKSAAMTGLRLGYTASNKTIAKAMSSIQGHLISHPSLTAQYIAYGALKDCSIDIDNMVKTYKSRRDLIKSKLDSIDNVGYVNPNGAFYIFIDLSKVSEKFEYKDSFSIEFCNQFLEEYNVAVVPGIAFGMDKYIRISYACSENTFLSGLDKLKEFVYKIMA >CP019857.1|AXU85083.1|128391_129144_+|germination-specific-N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MEYYGVFISIHIQGDVVRKYIKHIIFSFAMICLVVVSIFEIKNISEDVIKYMPVTNKTIILDAGHGGIDPGALNKDKSTSEKDINLAITLKLRELIESSGGLVILTREDDSSLYKEENNKTTRQKYNENLKNRKEIISNSNANMFVSIHLNAFEQSKYYGAQTFYPKDKQDSKALSKCIQEELKRVVDKTNNREVKPRDDIYLLKENNIPSVLIECGFLSNEKECKLLTDETYQEKIAWAIYIGIQKYLS >CP019857.1|AXU85082.1|127540_127933_+|30S-ribosomal-protein-S9 MANVQYYGTGRRKSSVARVRLVAGEGNILVNGRALENYFNYETLIRDVKQPLVLTGNENKYDVIVKVEGGGFTGQAGAIRHGISRALLKADLDLRPALKKEGFLTRDARMKERKKYGLKAARRAPQFSKR >CP019857.1|AXU85081.1|127080_127512_+|50S-ribosomal-protein-L13 MKSYIAKPADVQRKWYLVDAEGKTLGRLATEIATVLRGKHKPTFTPHVDGGDFVVVVNAEKIVLSGKKLDQKYYRYHTGYVGGLKEISYRDMMDKKPEEVISHAVSGMLPKNKLRSRMMTRLRVFAGAEHTHAAQNPEVLNFK >CP019857.1|AXU85080.1|126229_126961_+|tRNA-pseudouridine-synthase-1 MRNIKIKIQYNGKNYCGWQKQPDSLGIQGTIERAIYDITKEETSLIGSGRTDSGVHAIGQIANFKINSGISIESIPMALNAKLPKDISVIEACEVNDDFHSRYSAKGKTYKYLVYNSKFRNPILSEISYQVKYELDFDKMCSEAKSLLGTHDFKGFMSSGSSVKDTVRTIYDIDISKKDDLITFEISGNGFLYNMVRIIVGTLVDMGRGRINEPFLDIIQSKTRSRCGHTAPAQGLFLKKVHY >CP019857.1|AXU85079.1|125394_126198_+|ABC-transporter-permease MLKDITIGQYYPTSSAIHKLDPRIKLVATIVFMVSIFVVNKFWPYIVVLLCLLAMIKLANIPVKYIVKGVKPLKWIILFTFLINIFFLPGDEIWSFGFLAITKQGLRQAIFMAIRLIFLVVGTSLLTLTTSPIELTDGIERLLNPFKKIGLPVHELAMMMTIALRFIPTLLDETDKIMKAQMSRGADFESKNLINRAKNLVPLLVPLFVSAFRRADELAMAMEARCYRGGHNRTKMRESVISRRDYMACVFQVVYLGAIIATRFIAI >CP019857.1|AXU85078.1|124534_125401_+|cobalt-transporter-ATP-binding-subunit MSIIVKNLTHIYNEGMPFASKALDDVSFEIKDRDFVGLIGHTGSGKSTLIQHLNGLLKPSSGEIFINDFNITDKNLNLTEIRKRVGVVFQYPEYQLFEETIDKDIAFGPSNLGLEESEIHNRVKASMEAVGLDYEGFKDKSPFELSGGQKRRVAIAGVIAMNPEVLILDEPTAGLDPGGRDEIFNLIKDLHEKKNMTIILSSHSMDDMAKLAKTLIVMNHGSVEFMGTPREVFKSNASKLKDIGLDIPQVLELALKLREKGFDISEDILTLEEAKQEILKVVRGRGLC >CP019857.1|AXU85077.1|123713_124547_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MDNIVKVNNISFEYITDEAKLKAIDNLSLDVKKGEFVAIIGHNGSGKSTLSKNLNAILMPTEGNILIDDMDTKEEERLWDIRQTAGMVFQNPDNQIVATIVEEDVAFGPENLGIEPKEIRRIVEESLKSVGMYDLRDRQPHLLSGGQKQRVAIAGIIAMRPKCIIFDEATAMLDPSGRKEVMKTIKRLNKEENITVIHITHFMEEAVEADRVVVMEKGKKILEGTPREVFSKIKMLKEIGLDVPCMTELSSLLIEEGINISSDILTVDEMVMELCQL >CP019857.1|AXU85087.1|159270_160110_+|DNA-integrity-scanning-protein-DisA MLDINSFLNGFFNIILRMSIYDLIDISIVAYIFYKIFMFIKDTRAEQVFKGIIFLLLATQLSNTFKLHTVYWISLKALDYGVIAALIIFQPEFRAGLEHIGRAKFNLFGKNVNTSEETLNRNIEEIVEALYSLSRQKIGALIIMERETRISDIINTGTIIDAEISRQLLINIFIPNTPLHDGAVVIRDSKVKAAACFLPLTESKDLSKDLGTRHRAGIGVSEVSDCITLIVSEETGGVSIAKAGKLYRDISRERMMNILRSNLKTNTETRSFFKGGIFK >CP019857.1|AXU85088.1|160106_161288_+|membrane-associated-protein MINRLKNNTKIKIISFLSAIALWMYVMAVVDPEETKGFEDIPVSISNMSDLKDKNLVIYPDEKLTADVYIKGSLSKVQSVKKEDIHVYGTIEDPIQGQKEVYLKANIPQGVTLEFKHDVLVVNLEKNIKEKRDIKVEVSGNSKRNINKIELSKEFVDVSGPRTLVKEVKSVRANLDVGNETDDFSKKLQLIPLNSDGTKVEGVTLSSSFVTAKIELLKEKIVPIRVSLNDNKDNDVLKNYKLSKEQVTIKGKKEDIDKISYIKTKPIDLADLANGEEKEVSLEIPEGITLEDSSITIKLNDTKQLSAEFLYNAGDIELRNIPTNMDNPNVISDVDIKVVVESTEDLSKLNKKDISLYIDLSQGPEEDSKYKIKYETTYQFKKINIEPNIVEVE >CP019857.1|AXU85089.1|161591_162494_+|phosphate-butyryltransferase MRSFEEVIKFAKERGPKTISVACCQDKEVLMAVEMARKEKIANAILVGDIEKTKEIAKSIDMDIENYELIDIKDLAEASLKSVELVSQGKADMVMKGLVDTSIILKAVLNKEVGLRTGNVLSHVAVFDVEGYDRLFFVTDAAMNLAPDTNTKKQIIENACTVAHSLDISEPKVAAICAKEKVNPKMKDTVEAKELEEMYERGEIKGCMVGGPFAIDNAVSLEAAKHKGINHPVAGRADILLAPDIEGGNILYKALVFFSKSKNAGVIVGAKAPIILTSRADSEETKLNSIALGVLMAAKA >CP019857.1|AXU85090.1|162515_163595_+|butyrate-kinase MSKIFKILTINPGSTSTKIAVFDNEDLVFEKTLRHSSEEIGKYEKVSDQFEFRKQVIEEALKEGGVKTSELDAVVGRGGLLKPIKGGTYSVSAAMIEDLKVGVLGEHASNLGGIIAKQIGEEVNVPSYIVDPVVVDELEDVARISGMPEISRASVVHALNQKAIARRYAREINKKYEDINLIVAHMGGGVSVGAHKNGKIVDVANALDGEGPFSPERSGGLPVGALVKMCFSGKYTQDEIKKKIKGNGGLVAYLNTNDAREVEERIEAGDEKAKLVYEAMAYQISKEIGASAAVLKGDVKAILLTGGIAYSKMFTEMIADRVKFIADVKVYPGEDEMIALAQGGLRVLTGEEEAQVYDN >CP019857.1|AXU85091.1|163584_164262_+|ATP/GTP-binding-protein MITNDKRIRIITGHYGSGKSEFAMNYVVKLRDMVSGKVAIADLDVVNVYFRTREKKELMKSLGIQPIDSSINAPTLDLPAVSAEVMSPMVDHSYNSVIDLGGDNVGARVIGRFSHLLKEGDYDMLFVINANREKTQTSEEVIQYIKEIEKSSKLKVTGLINNTHLIRFTTIDDVLRGQKVAKEVSEKCNIPIRYVACLENLVEQLPKDLEGEIFPIKLYMREDWM >CP019857.1|AXU85092.1|164304_164520_+|ferredoxin MAKGKVSFNQERCKGCGLCVEACPVKIIQLDSNVINKKGYNPATVFEMEKCIGCASCATMCPDVVITVERD >CP019857.1|AXU85093.1|164548_165628_+|2-ketoisovalerate-ferredoxin-reductase MAKILMKGNEAFGKAAIEAGCKYFFGYPITPQSELPEYLSRELPKIGGAFVQAESEVSAINMVYGGAGAGARVMTSSSSPGVALKQEGITYAVGAEVPCVVLNVMRGGPGLGSIQPSQADYFMSTRGGGNGDYRTPVFAPATVQEAVDMIMEAFDVADYYRSPVMVVADGMIGQMMEPVEFRAPEKKRELPPKDWATVGTKGKRKPNVINSLYLEPEVLEDHCWHLQEKFDAMEKNEVQYEMYKTEDAEFVFAAYGTTSRVVKSAIDILREEGIKAGLIRPKVLWPFPFEAFNQIPNARNILTVEMSMGQMVEDVKMAVEGKLPVYFHGRPGGMTPTPAEIVEKAKKIIAGELVAGGAR >CP019857.1|AXU85094.1|165627_166380_+|subunit-of-oxidoreductase MAVVFKKTEGLQDTQTHYCPGCTHGIIHRLVGEVLEELGVLGDAVGVVPVGCSVLGYKYFNCDTQEAAHGRAPAAATGIKRVHPENTVFTYQGDGDLASIGTAEIVHAAARGEKITTIFVNNTTYGMTGGQMAPTTLVGQRATTAQSGRNAETQGYPIRVSEMLATLTGAVFVERVAVDTPAHVRQAKKAIKKAFQVQQAGLGFGIVEVLSTCPTNWGLAPNDALQWLRDNMIPYYPLGNFKNVEVEEVK >CP019857.1|AXU85095.1|166380_166938_+|subunit-of-oxidoreductase MSTARVICAGFGGQGVMSMGQLLTYAGMLEGKEVSWLPSYGPEMRGGTANCAVTVSNEPVGSPLITDDATAAILLNIPAFEKFKDDVIPGGKIIVNSSLIKEKVDRTDVDVYYIPANELAAELGNDKVANMIMLGAYLKVSDTVDIESVLEAFKKVFGPRKEKFVPLNREALQKGMDATCSKATN >CP019857.1|AXU85096.1|167107_168454_+|phosphoglucomutase/phosphomannomutase-mutase MRKYFGTDGVRGVANTELTCDLAYKLGRAGGFVLAQGDHRVKVVVGKDTRISGDMLEASLIAGLMSVGCDVITVGIIPTPAVAYLTRKYGADCGVVISASHNPVEYNGIKFFNKNGYKLDDEIELKIEEYIDDIDKIDCLPIGENVGRKLHEHCAQRDYVDYLKSIISTDFKGLKVVLDCANGASYKVAPIVFDELGASVISINSLPDGNNINYKCGSTHPEQLQRAVLEHNADLGLAYDGDADRLIAVNEKGQIVDGDHIMILSALNLKKNNKLAQDTLVVTVMSNIGLTIAAKENGINLSTTAVGDRYVLEDMVKNGYNLGGEQSGHMIFLDYNTTGDGVLSSLILANIILQEKKPLSEIASIMSQYPQVLVNATIKNENKNKYMEYPEIKTEIERIESILDGNGRVLIRPSGTEPLVRVMLEGKEEGQIKELATDLANLIQEKLS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019857_2 | 1290628-1290855 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP019857_2
|
3 spacers
spacers of CP019857_2
>2.1|1290657|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACCTTAAAATCGTCAGATATATAACCTTTTTCTTTAT >2.2|1290723|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTATATTAATAAAATCATTTACATTTAAACTCAACA >2.3|1290789|38|CP019857|CRISPRCasFinder,CRT GACCAAGATACTTGAAAAAATATCGCTGACTATTTTGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019857_2
The CRISPR arrays of CP019857_2 >merge|CP019857|2|1290628-1290855|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATACCTTAAAATCGTCAGATATATAACCTTTTTCTTTATGTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTATATTAATAAAATCATTTACATTTAAACTCAACAGTTTTATATTAACTATATGGTATGTAAATGACCAAGATACTTGAAAAAATATCGCTGACTATTTTGAGTTTTATATTAACTATGTGGACAAGAATA >CP019857|2|1|1290628-1290788|PILER-CR GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT ACCTTAAAATCGTCAGATATATAACCTTTTTCTTTAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTATATTAATAAAATCATTTACATTTAAACTCAACA GTTTTATATTAACTATATGGTATGTAAAT >CP019857|2|2|1290628-1290855|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT ACCTTAAAATCGTCAGATATATAACCTTTTTCTTTAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTATATTAATAAAATCATTTACATTTAAACTCAACA GTTTTATATTAACTATATGGTATGTAAAT GACCAAGATACTTGAAAAAATATCGCTGACTATTTTGA GTTTTATATTAACTATGTGGACAAGAATA >CP019857|2|1|1290628-1290855|CRT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT ACCTTAAAATCGTCAGATATATAACCTTTTTCTTTAT GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT TTTATATTAATAAAATCATTTACATTTAAACTCAACA GTTTTATATTAACTATATGGTATGTAAAT GACCAAGATACTTGAAAAAATATCGCTGACTATTTTGA GTTTTATATTAACTATGTGGACAAGAATA
>CP019857.1|AXU86055.1|1288609_1290037_+|cell-surface-protein MKIKKLLIIGLSLSIFIASCPISANALDKIESIKGADKYETAGIIADKQNYTTAILINADSTMADGLSASGLAGAINAPILLTKKNNIPNATLKRLEKAKKVYIIGGENSIDKYTETVLKGKGIEIKRLQGSDRIKTSYNVAKEINSINKVNKVILTNAFKGEPDAMSAAPVAVRDKAAIVLTDGKSVPFNTTGVESYVIGGTSSMNDKIVKDTNSTRLGGTDRYDTNKKIINKFYSGVKEFYIASGTDLVYALVGSTVAKNNAIVLVDNDSNKSVLKSTIKLTAIGNLSDSILQQCLNVTKNIGDSNTGREYTVEDAANAVKKLLGVKKFYYEPNYSEDEDLIFLLDKNFDFSGKEYYVFAYIKQGAEGDVRYCVAKNDMSKVYTYDVNGNMKVCNPDDYKNKGSITEEQAKQIALKECAKRHKVSINNLVVDMIDFRDDIYSGNVYAVKINSKNSNGTFGWFFIDIETGKVYN >CP019857.1|AXU86054.1|1287597_1288419_-|lipoprotein MIISKKITAILVSFLIMISMVGCAPKESATEVAKKYLDSIEIKDYEVAYNLLSKDSKESVSLEKFEEYQDTLFKLQTLKDYKLGEENKVEKYKYSNKEYTNLVKIKETDTIKYITENKEDTANFDRYFIIEDNEYKLLWHKDFKRALSSNYVKIARSETEKDEDKDYNKAAIDIKKAIEIDDKNPLAYYTQSYIYIELQRYDEALKSIDKYLEYLDKNNEAYKIDASDAYNLRGVIFMSKSEFNKARESYNKALELNPDNEYAKTNLNDIKGL >CP019857.1|AXU86053.1|1285955_1287473_-|site-specific-recombinase MSVAIYLRKSRADEEAEKQGEFETLSRHKSTLLKLAKEQNLDVIEIKEELVSGESIIHRPKMLELLKEVEENKYDAVLVMDLDRLGRGDMKDQGIILETFKESKTKIITPRKTYDLTDEFDEEYSEFEAFMARKELKLISRRMQRGRIKSVEEGNFIGTSAPFGYDAVTTGRKERILVPNKDADVVRTIFDLYINEDMGCSKISKYLNNLGIKTATGANWYNSAITNIIKNKVYCGYIQWQKKDYKKSKNPNKIKTVKLRPKDEWIEAKGKHEPLISEITWKKAQNILKKNGHVSYGNQIKNPLAGIVICKNCGRPLVYRPYADHDYIICYHPGCNKSSRFEFIEAAILKSLEDTVKKYQLKASDIDLDKNNKDSNIEFQKRVLKGLETELKELGKQKNKLYDLLERGIYDEDTFIERSNNISSRTEEIKDSIKTVKNRLNTVKKDNSKIIEDIKTVLSLYHDSDSLGKNKLLKSVIDKAVYYKSKEQKLDSFELMVHLKLHEDQ >CP019857.1|AXU86052.1|1283887_1285552_+|penicillin-binding-protein MSKKKTPFLKKVGKRSWCIFTIILIIYSVLIYRLVDIQVLKGDKYKQSVESQSVEKVELNSGRGIIYDRNNKKLTDTSKSQILIVEKEKLNNNYKILELIKKATKMNDLDIYKAVQEQLTRPIIQIQTKNIDKSMKKELEKNGIMVEEKTMRYAKDGLLSHTIGYIKEDDKSGQSGIEKSMDSVLRNSNEKYISAFKAGDAGNEKSLNILKGSVKTVDNKDKDRHLKTTIDYNIQKKLEQILNKEENPTAAIISEASTGEILAMCSRPNFDQNDISKSLKGKNGEFENRVIKATYPPGSVFKMVVLFSALENGVIDENYTYNCTGKTKVGNTNEILRCNKRDGHGFQNLRQAFSNSCNPAFLDIAMKLGKEKILKSAEKLHLFEKVDIGLDEEKIREAPKNISIRNLAIGQENIEFTPLQINQMTQIIANNGTFKPLYLYKSLVDNNMNTIKTYKSSKKEELISPYVCTQVKEYMKSVSRTGTAKDLKDIEGGCGVKTGTAQSSLNKKAIDHGWITGFYPEERPKYVITVLVEGTQKGNKSATPIFKEICESIK >CP019857.1|AXU86051.1|1282568_1283816_+|protease MELNKVELLAPAGDLERLKIAITYGADAVYIGGEIFGMRSAAKNFSKEDMAEGVAFAHERGKKVFVTVNIIPHNEDFLQLEDYLLELEEIGIDAVIIADPGVLSVIKKVIPNMEIHLSTQANTTNYLSANFWYEHGIKRVVVARELSFDEISEIRAKTPLDMDIEAFMHGAMCISYSGRCLISNYMTGRDANKGSCAQSCRWQYHLVEEKRPGEYFPIYEDERGTFFFNSKDLCMIEYIPELIKSGITSLKIEGRMKTAYYVATVVRAYRMAIDEFYRDPENWKFNPMWMEELKKGSHRHFTSGFYLNKPTTEDQNYQSASYVRNYDFIGIVRETEDEDGLIVVEQRNKMCVGDEIEVMGPYKETMFTKIEEMYNEEGEAIESAPHPRQIVKLKLSVKVGKDYMLRKVIEEKVEE >CP019857.1|AXU86050.1|1281907_1282582_+|O-methyltransferase MSNIVNDLVEDYIRVTLKEKEGFLKDLEIYAEENSVPIIHKEVSDLLKVLLKVQKPKRILEVGCAIGYSSIFFATIIGKDADIITVERNEKMIEKAKENIKLAGFDNNITILEGDAEEKLSQVQGEFDLIFIDAAKGQYKLFFDLVIDKLKDGGLLVSDNILYKGMVAHDDFVVRRKKTIVKRMRNYLDYICNCDYLSTSLVPIGDGVALSYKESKRGDVDGIK >CP019857.1|AXU86049.1|1280656_1281736_+|exported-aminodeoxychorismate-lyase MNFKENRLKIAVLIIVILIILAGIFVFIQIGPYDKNNKKDVIIDVPSGASVGKISDILYENKLIKNELLFKLLVKVSNKAPSIKSGTYLLNQSYSNNDIISLLVSGKIYQDGIKVTIPEGATSKEIIAMLVSKNLGDKATFENLIKKPQEFYDKFPYLKEDGITSLEGFLYPETYYFNSKKQSEEDILSEMLKVFDSKYTDKFKKKQKELNMTLQEVMEMASIIEKEAVLDKDRPIIASVFYNRLKVGMPLQSDATIQYIFEERKKIVTYDDLKIDSPYNSYKNKGLPPTPISNPGIKSIEAALYPEKTDYLYFVAKIDGGNNYSTNYQDHLKYVKEYKEARDKQSKDTKATNKENTKK >CP019857.1|AXU86048.1|1279128_1280454_+|pyrimidine-nucleoside-phosphorylase MRMYDIIKKKRDNLELSKKEINYFIENYSKGDIPDYQASALLMSIYLNKMNKQETVHLTEAMMNSGDMINLSEIDGIKVDKHSTGGVGDKTTIALIPLVASCGAPVAKMSGRGLGHTGGTIDKLESIPGFSTEMEISKFIDSVNKSKIAVCGQSAKVAIADKKIYALRDVTATVDNISLISSSVMSKKLASGADAIVLDVKTGDGAFMKTLEESFELAKSMVDIGTGMNRDTIGIVTDMDEPLGFAVGNSLEVIEAIETLKGNGPKDLVELCEVLGAYMLVLSKVAHDFEDGVEKIRESIKSGTAIQKLKEFIENQGGNKDVVDDYSLFKKSKYKYPVKSTKSGYISKIKAEDVGVSAMILGAGRETKDDILDLSAGIILEKKVGDYVNEGEVLAYMYYNDEQKLSLAKGRFIDSYSIVDSKIEKNKLIYGIVTKEEIKKF >CP019857.1|AXU86047.1|1278112_1278925_+|purine-nucleoside-phosphorylase MFEKIAQSSKFINSKSNIKPKIGLILGSGLGDLANDIEDPVTIKYSEIPNFPVSTVAGHAGQLVIGKLEGKEVIAMQGRFHYYEGYSQKEATFPVRVMKELGVEILIVTNAAGGVNKEFKAGDLMLIRDHINFSGSNPLVGKNDDRFGARFPDMSDAYSSKYVDVVKNCAKECNIDVKEGVYMFFSGPNYETPAEVRMAQILGADAVGMSTVPEVIVASHSNIGVIGISCITNMAAGILNQPLSHEEVIETTQKVKSEFMNLVKTTVKNL >CP019857.1|AXU86046.1|1276893_1278066_+|phosphopentomutase MSRVIWIVIDSVGIGALPDAEKFGDSKDVSTLGNIFKEYPDIQIPNMRNLGIGNIDGIDFFESIKEPIGCFGKCKEMSQGKDTTTGHWEMTGIIVDKPFKTFEHGFSKEIIEEFEKKTGRKVVGNKPASGTVIIDEYGEHQIKTGDVIVYTSADSVFQIAANEEVIPLEELYNMCKIAREIMMGDNAVARVIARPFIGKKKGEFVRTSNRRDYSLDPFEPTVLDNIKESGLDVLAVGKIEDIFNGKGITDAIHTKSNMDGVDETLNYMKQDNKGLIYSNLVDFDSKYGHRRDPEGYKKALEEFDSRLPEIMANMREDDILIINADHGNDPTYKGTDHTREYIPVMIYGNKIKKGFNLGVKDTFADIGATVADILNVKLPKHGSSFKEDLF >CP019857.1|AXU86056.1|1290896_1291115_-|DNA-binding-protein MLKKLRKERGMTQNELAEKANYSRAYISDLENKRYKNINISTIIDLSLALEIDFLELCRYYCEEELRKRKLM >CP019857.1|AXU86057.1|1291871_1292048_+|hypothetical-protein MDEMGKNKIITINLEDEIKSLDLDIFIKYIEIFKKKDNDSFLKTLDYMKYSIKKNKAL >CP019857.1|AXU86058.1|1292053_1292374_-|DNA-binding-protein MGLEKINELRKERGLTSEQLSKLSGVPKGTLDKILTGVTKDPKLETLKSIARVLDCTLDDFDDKPNLNKLDDINNKEIKEFAQLFLEVDDETKEYVIGLMKKTLKK >CP019857.1|AXU86059.1|1292531_1292756_+|hypothetical-protein MRELYRELLGEMARNDLNRKKLASKLGVSPKTLSNKLKGNTEFTWKEVKQIRDIVAPNKTLEELFRHEKESVNN >CP019857.1|AXU86060.1|1293057_1293384_+|prophage-antirepressor MSNNLQIFKNNDFGEIRTVEIDGKLYFVATDIARCLGYKDTTNAIKQHCKWVVKHHIPHPQSKTKTLEVNVIPAGDMYRLITNSELPSAEKFERWVFDEVLPSIRKTG >CP019857.1|AXU86061.1|1293493_1294309_+|phage-anti-repressor MNNLQVIERNNKRVLTTQQLADVYETDVRNISNNFNNNKDRFIEGKHYFLLQGDDLKNFKGIHTEYENLKFTSKMYLWTERGANRHCKILDTDKAWEQFDNLEESYFNKKKDTLITNQLSPELQMFKQIFDTVAKQEIEQKQIKQEITETKQEIQSIKDVVTLNTTDWREETRRLLVSMSQNLGGNEYINTLRKESYEFLCKRFNVDLKRRLNNRRRKMAEEGVCKSRREKFNYLDVIQEQNYLIEGYVIVIKDMALKYGISSDLSKNCNN >CP019857.1|AXU86062.1|1294361_1294580_+|hypothetical-protein MKILQQFKPYKYDEEKNIEYDEKIIANQNTEVYIVYPRISDEENRRRWKEFDEVAKEVAINIAMKKAETVES >CP019857.1|AXU86063.1|1294694_1294856_+|hypothetical-protein MLSLDISKKNVMTLKKDGKFLADIVFKDIKTGKKISVGTLNKKSAGQSNQHNK >CP019857.1|AXU86064.1|1295058_1295301_+|hypothetical-protein METARLIAIGQIKQAEKEISRLQGTKNNSSLMWWEAVKFASQNILEGLEHDIELEASTEFREFMIIQEELERDRPIDVQL >CP019857.1|AXU86065.1|1295431_1295749_+|putative-replication-initiation-and-membrane-attachment MNVVKGCNKQLHVTLNSTCLQDNNLSWQAKGLHLYLMTKAENETIYLEDLKNKSSNGRDSTANILNELIEKGYVSREIRRDALTGKVLGGYEYKIYEESLKNIEK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP019857_3 | 1314698-1315056 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP019857_3
|
5 spacers
spacers of CP019857_3
>3.1|1314727|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTTTTCGAGAGTCTCAATTTACAGAAGAAATTGGA >3.2|1314793|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAATTGTCTAATCCTAATTTTTTCTTTGCATCTTCT >3.3|1314859|38|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTAATTAAGTTAGATATGGCAAAAGAAATAGCTATGA >3.4|1314926|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAATGATTCTACAACTCTTACAGACTCAGATGAT >3.5|1314991|37|CP019857|CRISPRCasFinder,CRT GGGTGGGAGATATGGCAACTATCCACACATGAAATTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019857_3
The CRISPR arrays of CP019857_3 >merge|CP019857|3|1314698-1315056|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATAATTTTTCGAGAGTCTCAATTTACAGAAGAAATTGGAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATCAAATTGTCTAATCCTAATTTTTTCTTTGCATCTTCTGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTGTAATTAAGTTAGATATGGCAAAAGAAATAGCTATGAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTTTAATGATTCTACAACTCTTACAGACTCAGATGATGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATGGGTGGGAGATATGGCAACTATCCACACATGAAATTGGTTTTAGATTAACTATGTGGATTCAAAAT >CP019857|3|2|1314698-1314990|PILER-CR GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT AATTTTTCGAGAGTCTCAATTTACAGAAGAAATTGGA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT CAAATTGTCTAATCCTAATTTTTTCTTTGCATCTTCT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TGTAATTAAGTTAGATATGGCAAAAGAAATAGCTATGA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTAATGATTCTACAACTCTTACAGACTCAGATGAT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT >CP019857|3|3|1314698-1315056|CRISPRCasFinder GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT AATTTTTCGAGAGTCTCAATTTACAGAAGAAATTGGA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT CAAATTGTCTAATCCTAATTTTTTCTTTGCATCTTCT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TGTAATTAAGTTAGATATGGCAAAAGAAATAGCTATGA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTAATGATTCTACAACTCTTACAGACTCAGATGAT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GGGTGGGAGATATGGCAACTATCCACACATGAAATTG GTTTTAGATTAACTATGTGGATTCAAAAT >CP019857|3|2|1314698-1315056|CRT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT AATTTTTCGAGAGTCTCAATTTACAGAAGAAATTGGA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT CAAATTGTCTAATCCTAATTTTTTCTTTGCATCTTCT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TGTAATTAAGTTAGATATGGCAAAAGAAATAGCTATGA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTAATGATTCTACAACTCTTACAGACTCAGATGAT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GGGTGGGAGATATGGCAACTATCCACACATGAAATTG GTTTTAGATTAACTATGTGGATTCAAAAT
>CP019857.1|AXU86093.1|1314254_1314416_+|hypothetical-protein MDNFLIGVLASLTASLIGYIVCLCIKKVKSHSVQESDLDVELKFSFKFKKNKH >CP019857.1|AXU86092.1|1313986_1314106_+|phage-protein MGLEINERALAAASILIKIEDEEEAMKEAERERKRGRRR >CP019857.1|AXU86091.1|1313471_1313912_+|phage-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYIASDRFLDEEGKPVEWELKVLSSEEDEVLRRNCTKRVKVIGNNGKPTGQFTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTTFEDKVEEAKN >CP019857.1|AXU86090.1|1312930_1313401_+|phage-protein MFQQIKARDTISASKAECYVTIEGKRYNFMQAINLEAKMEKNKSEVPILGSTTKGNKSTGSKYTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSSAGRQTIILKDCNMDSGIIVKFDADGEYLDEDMDFTCEDWELVEKFNIINGME >CP019857.1|AXU86089.1|1311603_1312914_+|phage-protein MALGGGTFVTQNKVLPGAYINFVSATRATSSLSDRGIVAMPLELDWGIDEEIFTVTSDDFEKYSTKYFGYDYTHEKLKGLRDLFKNIRLGYFYKLNKGVKASCSIATAKYSGTRGNDLKVIVTTNIDDNTKFDVVTLLDNKKVDTQIAKVITDLQDNDYITWKKDTTLEASAGLVFTGGTNGESVTGAEYQAFLDKIESYSFNALGSLATTAEIKSLFVEFTKRMRDKVGAKFQTVLYKKNDADYEGVVSVENKVKDTGLLESSLVYWTTGAIAGCDINKSNTNKKYDGEFDVDVNYTQIQLEEALKSGKFIFHKVGDEVHVLEDINTFVSFTDDKNDDFSSNQSVRVLDQIANDIATLFNEKYLGKVPNDKAGRISFWNDVVKHHKELENIRAIEDFKTDDVSVELGNDKKTVIVSDAVKVINAMSKLYMTVSVS >CP019857.1|AXU86088.1|1311417_1311603_+|hypothetical-protein MIILNKTLSKEDDYKFTKEQIVNSKKYVNRKDLLNAILKENELYSFSEVEEIINNFMKGVS >CP019857.1|AXU86087.1|1310996_1311434_+|phage-protein MLNNIIDGISIKLDKTFGESYTIYSEDVEQGINEPCFFICPLNPSKTSYPNGRTLKKNSFDVHYFPRSKDKSFEINEVAEMLLEELEYIEIDGDLVRGTNMNFEIIDNVLHFFVDYNYFTIKSNDTEKMNDVELFGGLKRGDNFE >CP019857.1|AXU86086.1|1309841_1310648_+|hypothetical-protein MAKFLDITGKKFGRLRVIKFSKEIKSGKRNRKYWLCKCDCGNFKEIRTDSLTSGLVQSCGCLKKEQDKLNLTDKYQFKKKYKVQNKRLYSIWKGIISRCTDKNNKRYNRYGERNIIVCDEWFCYDNFANWALSNGYSEKLTIDRINNEGNYESSNCRWVDIKTQCRNRSTNILVKHEEKEITLIELSEKTGISYSCLRSRYSKGLVGNKLIEKVKIIEESRAKLSIEDVKEIRKKYSDGYTIKQLSEIYPVTYSSISNIVHRRTWKNI >CP019857.1|AXU86085.1|1309441_1309732_+|phage-protein MARWGSVDFREFKRVCKKMEKLTKIDLDKFCKDAARELAARLLGKVIRRTPVDTGFLRQGWNGVAYARSLPVYKQGNNYIIEVVNPTEYALTQWGI >CP019857.1|AXU86084.1|1309094_1309442_+|phage-protein MVSKTRKAIEMLYRDKCTIVEYQPIKDPVTKRTNNKEVIVLENQPCKLSYKNIVSATEGKLAKLEQTIKLFISPDIEIKAGSKLIINDKEYVRSGESAIYPNHQEIILELFKDKA >CP019857.1|AXU86094.1|1315125_1315323_+|hypothetical-protein MNKDIEFIACSMRLKILIQAREDLIENINKYSTKSYEKNIDNYKKLDMIFEDAIKFEAILLSSLK >CP019857.1|AXU86095.1|1315297_1315663_-|hypothetical-protein MKRDLELIRDILIKMEESDADRMSISDFMTDVYDERTISYHLQLLLDVGFIEATPMGVQRCLYKHYIVKRITSFGYDYLDNIRDDTVWNKTKKQLGNFASSASLKVIGSVASSVILKMIGV >CP019857.1|AXU86096.1|1316096_1316339_+|hypothetical-protein MTVTRYNVIINVTSYRKEVNKIATKSRAEYMKNRRKDKRGFSVLLDKEKLDKFDEVLEEKNLTKKEWLEEKIDEELEQKE >CP019857.1|AXU86097.1|1316459_1317326_+|prophage-antirepressor-related-protein MKNLIVKEFNGSQIYTFMWKEKSCWIANQIVGLFDYADVSKTIQDCIKAEDFEIEQEYDVLKGNEFNDFVTTLNVVANNIISNKARSITIFYEDGLYGFLQYTDKPIGVQFRKWLRREVLPAIRQHGAYITNNADPQALREKANEIESLDTVNKTIEILTPFLDNAGIDEKAKLLTAKTIYKKAGIELPLEIEEKEHFFDTVQIATKLNVYSKSNKPAFHAIGEIIKKLDIQDNEKLVVLESKRGWSGSVNKYSQSVIDKIRHWIEENNRPTKIQGEKKNFHVVYKIE >CP019857.1|AXU86098.1|1317380_1317536_+|hypothetical-protein MCENLLDMDRIELIRELGSIFEKMRNENPDKFYRFVSLVKEECRKKEEKNK >CP019857.1|AXU86099.1|1318126_1318651_+|hypothetical-protein MWGKFKKLSLLKKILVIFLIYFVVFTVSMMIHQAIRDSKNRDEVNEGNITKENIISEREKEDIYKQEMQAKVDSMIPEDLKDKTTYYVNILNPTKGEGYIVSIQVENSRFNDENECRNFTKEFVNNIKDMNDIHSVRISFIVDVTLTYNVFLDDWNNIKNNVNLIDDLDFSSGN >CP019857.1|AXU86100.1|1319134_1319956_+|prophage-antirepressor-related-protein MKNELMMFEEKKVEVLEYNGQVLFNPYDCGRCLELSDSAIRNHLSKMNDTQAVLLKNSNVLDKDFRKLHNTGEKFLTESGVYKLIFKSKKEEAERFQDWISDEVLPAIRQTGAYITNNADPDKLREKASEIEKLQLAYNSTSMLKELLDGAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEINEEEHYFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQMAVCEIIKKIDLEENEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKVRNWIEENNRPAKIAGEKKNYHVVYKIE >CP019857.1|AXU86101.1|1320018_1320195_+|hypothetical-protein MCENLLNEYNLKTDEDVEYFVKFATLLYKLKQDNEEKFQEYAEILRGILREQQERENK >CP019857.1|AXU86102.1|1320560_1321334_+|hypothetical-protein MGLFSGNESCCICGEKGKQKISDGVICSECLKKYKDTFSIVEPTDVIKKISSEEIKKSIRLTLENKKRFESFNASKKVGIYLLVDENKKQLIISDKISNLNKNKRVYDFRDIISFELLEDDESIIKSGLGGAIGGGLLFGETGAIAGSILGKKKIKTYVNSLKIKITINNIKNSTKYIYLINSKISTNSSLYKESYNYAQEILSTLSIITSSKSIEDKKESISSSTADEILKYKNLLNMEAITQEEFDAKKKELLNL >CP019857.1|AXU86103.1|1321400_1323689_+|phage-tail-tape-measure-protein MATIQTSIRIFDGMTPAFRHMTNAMNIVLSSFEQLQRTSSNAIDANSIRTAREELARAEAGFDRLEQQIREADEQQKRFNDDVRKGASSTDKLVENAKRLVATYIGLRSVGGLINLSDQMTSTNARLAMINDGQQSDGGLNKMIFQSAERARASYLDTAKIVSRVGMNAGKAFSSTKEIVAFAEQLNKKFVIAGATTEETNSVLLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIQSIADYLEVDIGKIRGMASEGMLTADIVKNSLLSAAEQTNAEFEKMPYTFGQIWTSIKNNAVMIFGVIQKKIEQSMSSRGFRTFIDNFISGLYVLGNVFFNIFNGIISILGSPAFQSFSNTMIVGISLISQALGWIVTQALNLANIFAQNWSIIGPIIAGVVGILGTYLIALGSIWLWETLCKISKNALAIASAIHALAIHAELTETQMATVAQWGLNAAILACPIFWIVAGIIALVAVLFVGVAIFNHFAGTSVSAIGIVAGAISVAAAFVGNLFIATGNLIIDIVALIYNSLANFAEFFANFLDDPIGSVIRAVSRMADAVLGILRSIASAIDTIFGSNLANAVSGWQDKLQGWTDKVAGEAKIKVELMDPNKLHFDRFNCGKAWDAGYKWGDKLETNIKDKFDISKIAEKAKKDLGLDDLWDDKYGLGDGFGSAGLNSPLNDAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNISKDTDVDGIVNVLTEKLNDAMIVSAEGIV |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP019857_4 | 1317634-1317993 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP019857_4
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5 spacers
spacers of CP019857_4
>4.1|1317663|38|CP019857|CRISPRCasFinder CGTACAGATAGTATTGCATTAGAGGAAAGTTTAAAAGC >4.2|1317730|37|CP019857|CRISPRCasFinder,PILER-CR GTTTTTAAAGCTTCTTCAAGTTGTATTTGTGTATAAT >4.3|1317796|36|CP019857|CRISPRCasFinder,PILER-CR CCAACTGAATAAACAATAATTTTATCAATTTCTTTA >4.4|1317861|37|CP019857|CRISPRCasFinder TATTTTACAGATGAACAATTACAATTACTTCTTGAAT >4.5|1317927|38|CP019857|CRISPRCasFinder AAAGCAAAAGATAGGAATGATAATTTTAAAACTCCAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019857_4
The CRISPR arrays of CP019857_4 >merge|CP019857|4|1317634-1317993|CRISPRCasFinder,PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCGTACAGATAGTATTGCATTAGAGGAAAGTTTAAAAGCGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATGTTTTTAAAGCTTCTTCAAGTTGTATTTGTGTATAATGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATCCAACTGAATAAACAATAATTTTATCAATTTCTTTAGTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAATTATTTTACAGATGAACAATTACAATTACTTCTTGAATGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAAGCAAAAGATAGGAATGATAATTTTAAAACTCCAAACTTTTATATTAACAATGTGGAGAAAAACT >CP019857|4|4|1317634-1317993|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CGTACAGATAGTATTGCATTAGAGGAAAGTTTAAAAGC GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GTTTTTAAAGCTTCTTCAAGTTGTATTTGTGTATAAT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT CCAACTGAATAAACAATAATTTTATCAATTTCTTTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT TATTTTACAGATGAACAATTACAATTACTTCTTGAAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAGCAAAAGATAGGAATGATAATTTTAAAACTCCAAA CTTTTATATTAACAATGTGGAGAAAAACT >CP019857|4|3|1317701-1317860|PILER-CR GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT GTTTTTAAAGCTTCTTCAAGTTGTATTTGTGTATAAT GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT CCAACTGAATAAACAATAATTTTATCAATTTCTTTA GTTTTAGATTAACTATATGGAATGTAAAT
>CP019857.1|AXU86098.1|1317380_1317536_+|hypothetical-protein MCENLLDMDRIELIRELGSIFEKMRNENPDKFYRFVSLVKEECRKKEEKNK >CP019857.1|AXU86097.1|1316459_1317326_+|prophage-antirepressor-related-protein MKNLIVKEFNGSQIYTFMWKEKSCWIANQIVGLFDYADVSKTIQDCIKAEDFEIEQEYDVLKGNEFNDFVTTLNVVANNIISNKARSITIFYEDGLYGFLQYTDKPIGVQFRKWLRREVLPAIRQHGAYITNNADPQALREKANEIESLDTVNKTIEILTPFLDNAGIDEKAKLLTAKTIYKKAGIELPLEIEEKEHFFDTVQIATKLNVYSKSNKPAFHAIGEIIKKLDIQDNEKLVVLESKRGWSGSVNKYSQSVIDKIRHWIEENNRPTKIQGEKKNFHVVYKIE >CP019857.1|AXU86096.1|1316096_1316339_+|hypothetical-protein MTVTRYNVIINVTSYRKEVNKIATKSRAEYMKNRRKDKRGFSVLLDKEKLDKFDEVLEEKNLTKKEWLEEKIDEELEQKE >CP019857.1|AXU86095.1|1315297_1315663_-|hypothetical-protein MKRDLELIRDILIKMEESDADRMSISDFMTDVYDERTISYHLQLLLDVGFIEATPMGVQRCLYKHYIVKRITSFGYDYLDNIRDDTVWNKTKKQLGNFASSASLKVIGSVASSVILKMIGV >CP019857.1|AXU86094.1|1315125_1315323_+|hypothetical-protein MNKDIEFIACSMRLKILIQAREDLIENINKYSTKSYEKNIDNYKKLDMIFEDAIKFEAILLSSLK >CP019857.1|AXU86093.1|1314254_1314416_+|hypothetical-protein MDNFLIGVLASLTASLIGYIVCLCIKKVKSHSVQESDLDVELKFSFKFKKNKH >CP019857.1|AXU86092.1|1313986_1314106_+|phage-protein MGLEINERALAAASILIKIEDEEEAMKEAERERKRGRRR >CP019857.1|AXU86091.1|1313471_1313912_+|phage-protein MSNLSAFLSQNAIKVDNVKYIASDRFLDEEGKPVEWELKVLSSEEDEVLRRNCTKRVKVIGNNGKPTGQFTSEIDYNSYVAELCVASTVFPDLKDAELQNSYGVMGEAQLLKTMLTAGEYVNYTVKVNEVNGFDTTFEDKVEEAKN >CP019857.1|AXU86090.1|1312930_1313401_+|phage-protein MFQQIKARDTISASKAECYVTIEGKRYNFMQAINLEAKMEKNKSEVPILGSTTKGNKSTGSKYTGSATFHYNTSIFRELLYRYKETGEDIYFDIQVTNEDPTSSAGRQTIILKDCNMDSGIIVKFDADGEYLDEDMDFTCEDWELVEKFNIINGME >CP019857.1|AXU86089.1|1311603_1312914_+|phage-protein 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MKNELMMFEEKKVEVLEYNGQVLFNPYDCGRCLELSDSAIRNHLSKMNDTQAVLLKNSNVLDKDFRKLHNTGEKFLTESGVYKLIFKSKKEEAERFQDWISDEVLPAIRQTGAYITNNADPDKLREKASEIEKLQLAYNSTSMLKELLDGAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEINEEEHYFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQMAVCEIIKKIDLEENEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKVRNWIEENNRPAKIAGEKKNYHVVYKIE >CP019857.1|AXU86101.1|1320018_1320195_+|hypothetical-protein MCENLLNEYNLKTDEDVEYFVKFATLLYKLKQDNEEKFQEYAEILRGILREQQERENK >CP019857.1|AXU86102.1|1320560_1321334_+|hypothetical-protein MGLFSGNESCCICGEKGKQKISDGVICSECLKKYKDTFSIVEPTDVIKKISSEEIKKSIRLTLENKKRFESFNASKKVGIYLLVDENKKQLIISDKISNLNKNKRVYDFRDIISFELLEDDESIIKSGLGGAIGGGLLFGETGAIAGSILGKKKIKTYVNSLKIKITINNIKNSTKYIYLINSKISTNSSLYKESYNYAQEILSTLSIITSSKSIEDKKESISSSTADEILKYKNLLNMEAITQEEFDAKKKELLNL >CP019857.1|AXU86103.1|1321400_1323689_+|phage-tail-tape-measure-protein MATIQTSIRIFDGMTPAFRHMTNAMNIVLSSFEQLQRTSSNAIDANSIRTAREELARAEAGFDRLEQQIREADEQQKRFNDDVRKGASSTDKLVENAKRLVATYIGLRSVGGLINLSDQMTSTNARLAMINDGQQSDGGLNKMIFQSAERARASYLDTAKIVSRVGMNAGKAFSSTKEIVAFAEQLNKKFVIAGATTEETNSVLLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIQSIADYLEVDIGKIRGMASEGMLTADIVKNSLLSAAEQTNAEFEKMPYTFGQIWTSIKNNAVMIFGVIQKKIEQSMSSRGFRTFIDNFISGLYVLGNVFFNIFNGIISILGSPAFQSFSNTMIVGISLISQALGWIVTQALNLANIFAQNWSIIGPIIAGVVGILGTYLIALGSIWLWETLCKISKNALAIASAIHALAIHAELTETQMATVAQWGLNAAILACPIFWIVAGIIALVAVLFVGVAIFNHFAGTSVSAIGIVAGAISVAAAFVGNLFIATGNLIIDIVALIYNSLANFAEFFANFLDDPIGSVIRAVSRMADAVLGILRSIASAIDTIFGSNLANAVSGWQDKLQGWTDKVAGEAKIKVELMDPNKLHFDRFNCGKAWDAGYKWGDKLETNIKDKFDISKIAEKAKKDLGLDDLWDDKYGLGDGFGSAGLNSPLNDAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNISKDTDVDGIVNVLTEKLNDAMIVSAEGIV >CP019857.1|AXU86104.1|1323704_1324394_+|phage-cell-wall-hydrolase MAYDFYLDGVQLPIPPPKLEIKVTNKNKTVDLINTGEVNILKKEGLSEISFEAEFTHNKLPFYRGAFRDVQFFLSKLELLKTDCKPFQFIVSRELGNKVLFNTNIKVSLEEYAISEDAENGSDTKVAIKLKQYRDYSTKKLVLAPPKNETGRPNVKIEPKRVDSVNATNTKTYTVKAGDSLWSICQKQLGNGSLYKKVYELNKSMMDKANKGKNLSKYTIYKGQVLKLG >CP019857.1|AXU86105.1|1324386_1326279_+|phage-cell-wall-hydrolase MVDELVLANDRDVRLVIAHWEDFYEPAVIDGITWEIERRGTPSKLEFTIVMDDILEFCEGNSVRLYYKGIGIFYGYIFQKKRDKENHIKIVAYDQLRYFKNKDTYVYNNQTASELVKMLAKDFNLKYNVIEDTKYKISRIEENKTLFDMILTALDDTLREKKEMYVLYDDFGRITLKNVASMKLDTVMNNDVIEDFDYNSSIDSDTYTKIKLVRDNEETGKRDVYIAQDSTHMRSWGILQMFDTVDKNMSEAEIKQKCDILLKLYNKKTKSLSLKNVLGDIRVRAGCLVPVFLNLGDIKLQNYMLVEKVKHTFENNSHFMDLTLVDGDEFASYSSSSYSSGNTNNKDEKKNGPAQSTTKKNTGKKVPAIFTAYYPGNNAMEGGKTDCNGKPLDVKSRTVAGPMNREGVKKTWYTDDFLKKHPVFEYGDKVKIILPGTAYDNKVYTVKDNGGRIYVETNGTYHIDILLANASECKKFGRKNGYIIIGGDEEQTYQVEGNNQSSTNNNSKEDKLISIAKSKLGCNYVYGAEGPNNFDCSGFTQWCYKQIGIKIPRTASAQSKAGKAVDLKDRSKWKAGDLLCRIGGGSSNHVVMYIGNNQIIHSPQTGDVVKIESVNSYRKGKAYTHVRRFI >CP019857.1|AXU86106.1|1326292_1326553_+|phage-protein MSQDLLQIIKKAAMDAVETSNPMRVVFGTIESISPLRVKIEQKLSIGEIFLIQTDTFKRYTDKKIGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM >CP019857.1|AXU86107.1|1326557_1326977_+|phage-protein MLPSDNLDYDIEDVSIINFDVRQEPSKTFKLNIEKSKIDGICDDVEALKQTIFLILNTERYQHLIYSWNYGVELNDLIGEPISFVIPELERRIKEALIQDDRVENVDNFEFQNVKGKVHCKFTVYSKYGDIKAEKVVSV >CP019857.1|AXU86108.1|1326977_1328027_+|phage-protein MFELMTFENIIKRMLDSVPDTFDKREGSIIYNALAPVAVELTETYIAMDELLDQTFVDTASYYYLEKRCKERGITPLPATNTIAKGVFNIDIPIDSRFNLGEYNYVAIERISEKTYKMKCETAGPIFELGQLIPIEYIDGLETAELTEILINGEDEESEDSLRQRYYDSLNSQSFGGNIQNYKDEVNKLPDVGGVKVYPVWNGGGTVKLVIINSNFKVPSSDLVNLVQEEIDPLQNQGEGLGLAPIGHRVTVEGVTSTTINISAEITYKNGYTWENIKSIAEEAIDDYLNELNMSWEDEENLIVRISQIETRLLSIDGVLDITNTMINEVKSNLTINSNSIVVRCEVVG |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP019857_5 | 1320277-1320431 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP019857_5
|
2 spacers
spacers of CP019857_5
>5.1|1320302|39|CP019857|CRISPRCasFinder GGGAGTAGGCAAGTTTTATAAACAAATAACAGGAAGATT >5.2|1320366|41|CP019857|CRISPRCasFinder TGCGTTTAGGAATATGACAGCATCTATTAATACGACAAGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019857_5
The CRISPR arrays of CP019857_5 >merge|CP019857|5|1320277-1320431|CRISPRCasFinder TTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGGAGTAGGCAAGTTTTATAAACAAATAACAGGAAGATTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGCGTTTAGGAATATGACAGCATCTATTAATACGACAAGTTTTATATTAACTATGTGGACTTAAAA >CP019857|5|5|1320277-1320431|CRISPRCasFinder TTATATTAACTAAGTGGTATGTAAA GGGAGTAGGCAAGTTTTATAAACAAATAACAGGAAGATT TTATATTAACTATGTGGTATGTAAA TGCGTTTAGGAATATGACAGCATCTATTAATACGACAAGTT TTATATTAACTATGTGGACTTAAAA
>CP019857.1|AXU86101.1|1320018_1320195_+|hypothetical-protein MCENLLNEYNLKTDEDVEYFVKFATLLYKLKQDNEEKFQEYAEILRGILREQQERENK >CP019857.1|AXU86100.1|1319134_1319956_+|prophage-antirepressor-related-protein MKNELMMFEEKKVEVLEYNGQVLFNPYDCGRCLELSDSAIRNHLSKMNDTQAVLLKNSNVLDKDFRKLHNTGEKFLTESGVYKLIFKSKKEEAERFQDWISDEVLPAIRQTGAYITNNADPDKLREKASEIEKLQLAYNSTSMLKELLDGAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEINEEEHYFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQMAVCEIIKKIDLEENEVKGVWETNGSWTGTVNKYTKSVIDKVRNWIEENNRPAKIAGEKKNYHVVYKIE >CP019857.1|AXU86099.1|1318126_1318651_+|hypothetical-protein MWGKFKKLSLLKKILVIFLIYFVVFTVSMMIHQAIRDSKNRDEVNEGNITKENIISEREKEDIYKQEMQAKVDSMIPEDLKDKTTYYVNILNPTKGEGYIVSIQVENSRFNDENECRNFTKEFVNNIKDMNDIHSVRISFIVDVTLTYNVFLDDWNNIKNNVNLIDDLDFSSGN >CP019857.1|AXU86098.1|1317380_1317536_+|hypothetical-protein MCENLLDMDRIELIRELGSIFEKMRNENPDKFYRFVSLVKEECRKKEEKNK >CP019857.1|AXU86097.1|1316459_1317326_+|prophage-antirepressor-related-protein MKNLIVKEFNGSQIYTFMWKEKSCWIANQIVGLFDYADVSKTIQDCIKAEDFEIEQEYDVLKGNEFNDFVTTLNVVANNIISNKARSITIFYEDGLYGFLQYTDKPIGVQFRKWLRREVLPAIRQHGAYITNNADPQALREKANEIESLDTVNKTIEILTPFLDNAGIDEKAKLLTAKTIYKKAGIELPLEIEEKEHFFDTVQIATKLNVYSKSNKPAFHAIGEIIKKLDIQDNEKLVVLESKRGWSGSVNKYSQSVIDKIRHWIEENNRPTKIQGEKKNFHVVYKIE >CP019857.1|AXU86096.1|1316096_1316339_+|hypothetical-protein MTVTRYNVIINVTSYRKEVNKIATKSRAEYMKNRRKDKRGFSVLLDKEKLDKFDEVLEEKNLTKKEWLEEKIDEELEQKE >CP019857.1|AXU86095.1|1315297_1315663_-|hypothetical-protein MKRDLELIRDILIKMEESDADRMSISDFMTDVYDERTISYHLQLLLDVGFIEATPMGVQRCLYKHYIVKRITSFGYDYLDNIRDDTVWNKTKKQLGNFASSASLKVIGSVASSVILKMIGV >CP019857.1|AXU86094.1|1315125_1315323_+|hypothetical-protein MNKDIEFIACSMRLKILIQAREDLIENINKYSTKSYEKNIDNYKKLDMIFEDAIKFEAILLSSLK >CP019857.1|AXU86093.1|1314254_1314416_+|hypothetical-protein MDNFLIGVLASLTASLIGYIVCLCIKKVKSHSVQESDLDVELKFSFKFKKNKH >CP019857.1|AXU86092.1|1313986_1314106_+|phage-protein MGLEINERALAAASILIKIEDEEEAMKEAERERKRGRRR >CP019857.1|AXU86102.1|1320560_1321334_+|hypothetical-protein MGLFSGNESCCICGEKGKQKISDGVICSECLKKYKDTFSIVEPTDVIKKISSEEIKKSIRLTLENKKRFESFNASKKVGIYLLVDENKKQLIISDKISNLNKNKRVYDFRDIISFELLEDDESIIKSGLGGAIGGGLLFGETGAIAGSILGKKKIKTYVNSLKIKITINNIKNSTKYIYLINSKISTNSSLYKESYNYAQEILSTLSIITSSKSIEDKKESISSSTADEILKYKNLLNMEAITQEEFDAKKKELLNL >CP019857.1|AXU86103.1|1321400_1323689_+|phage-tail-tape-measure-protein MATIQTSIRIFDGMTPAFRHMTNAMNIVLSSFEQLQRTSSNAIDANSIRTAREELARAEAGFDRLEQQIREADEQQKRFNDDVRKGASSTDKLVENAKRLVATYIGLRSVGGLINLSDQMTSTNARLAMINDGQQSDGGLNKMIFQSAERARASYLDTAKIVSRVGMNAGKAFSSTKEIVAFAEQLNKKFVIAGATTEETNSVLLQLTQGLGSGVLRGEELNAVFESAPNIIQSIADYLEVDIGKIRGMASEGMLTADIVKNSLLSAAEQTNAEFEKMPYTFGQIWTSIKNNAVMIFGVIQKKIEQSMSSRGFRTFIDNFISGLYVLGNVFFNIFNGIISILGSPAFQSFSNTMIVGISLISQALGWIVTQALNLANIFAQNWSIIGPIIAGVVGILGTYLIALGSIWLWETLCKISKNALAIASAIHALAIHAELTETQMATVAQWGLNAAILACPIFWIVAGIIALVAVLFVGVAIFNHFAGTSVSAIGIVAGAISVAAAFVGNLFIATGNLIIDIVALIYNSLANFAEFFANFLDDPIGSVIRAVSRMADAVLGILRSIASAIDTIFGSNLANAVSGWQDKLQGWTDKVAGEAKIKVELMDPNKLHFDRFNCGKAWDAGYKWGDKLETNIKDKFDISKIAEKAKKDLGLDDLWDDKYGLGDGFGSAGLNSPLNDAAKGAKDTAGNTAKMAKTMDKSQEDLKYLRDIAEQETINRFTGVNIKIDMNNTNNISKDTDVDGIVNVLTEKLNDAMIVSAEGIV >CP019857.1|AXU86104.1|1323704_1324394_+|phage-cell-wall-hydrolase MAYDFYLDGVQLPIPPPKLEIKVTNKNKTVDLINTGEVNILKKEGLSEISFEAEFTHNKLPFYRGAFRDVQFFLSKLELLKTDCKPFQFIVSRELGNKVLFNTNIKVSLEEYAISEDAENGSDTKVAIKLKQYRDYSTKKLVLAPPKNETGRPNVKIEPKRVDSVNATNTKTYTVKAGDSLWSICQKQLGNGSLYKKVYELNKSMMDKANKGKNLSKYTIYKGQVLKLG >CP019857.1|AXU86105.1|1324386_1326279_+|phage-cell-wall-hydrolase MVDELVLANDRDVRLVIAHWEDFYEPAVIDGITWEIERRGTPSKLEFTIVMDDILEFCEGNSVRLYYKGIGIFYGYIFQKKRDKENHIKIVAYDQLRYFKNKDTYVYNNQTASELVKMLAKDFNLKYNVIEDTKYKISRIEENKTLFDMILTALDDTLREKKEMYVLYDDFGRITLKNVASMKLDTVMNNDVIEDFDYNSSIDSDTYTKIKLVRDNEETGKRDVYIAQDSTHMRSWGILQMFDTVDKNMSEAEIKQKCDILLKLYNKKTKSLSLKNVLGDIRVRAGCLVPVFLNLGDIKLQNYMLVEKVKHTFENNSHFMDLTLVDGDEFASYSSSSYSSGNTNNKDEKKNGPAQSTTKKNTGKKVPAIFTAYYPGNNAMEGGKTDCNGKPLDVKSRTVAGPMNREGVKKTWYTDDFLKKHPVFEYGDKVKIILPGTAYDNKVYTVKDNGGRIYVETNGTYHIDILLANASECKKFGRKNGYIIIGGDEEQTYQVEGNNQSSTNNNSKEDKLISIAKSKLGCNYVYGAEGPNNFDCSGFTQWCYKQIGIKIPRTASAQSKAGKAVDLKDRSKWKAGDLLCRIGGGSSNHVVMYIGNNQIIHSPQTGDVVKIESVNSYRKGKAYTHVRRFI >CP019857.1|AXU86106.1|1326292_1326553_+|phage-protein MSQDLLQIIKKAAMDAVETSNPMRVVFGTIESISPLRVKIEQKLSIGEIFLIQTDTFKRYTDKKIGDKLVLIRMQGGQQYLILDRM >CP019857.1|AXU86107.1|1326557_1326977_+|phage-protein MLPSDNLDYDIEDVSIINFDVRQEPSKTFKLNIEKSKIDGICDDVEALKQTIFLILNTERYQHLIYSWNYGVELNDLIGEPISFVIPELERRIKEALIQDDRVENVDNFEFQNVKGKVHCKFTVYSKYGDIKAEKVVSV >CP019857.1|AXU86108.1|1326977_1328027_+|phage-protein MFELMTFENIIKRMLDSVPDTFDKREGSIIYNALAPVAVELTETYIAMDELLDQTFVDTASYYYLEKRCKERGITPLPATNTIAKGVFNIDIPIDSRFNLGEYNYVAIERISEKTYKMKCETAGPIFELGQLIPIEYIDGLETAELTEILINGEDEESEDSLRQRYYDSLNSQSFGGNIQNYKDEVNKLPDVGGVKVYPVWNGGGTVKLVIINSNFKVPSSDLVNLVQEEIDPLQNQGEGLGLAPIGHRVTVEGVTSTTINISAEITYKNGYTWENIKSIAEEAIDDYLNELNMSWEDEENLIVRISQIETRLLSIDGVLDITNTMINEVKSNLTINSNSIVVRCEVVG >CP019857.1|AXU86109.1|1328019_1328637_+|phage-protein MDKEINLINYLPQILQDKEEYIKVFNVENKEIKTLHEKLNDLSNDQFLEDLTPSGIKRWEKIMSITPKSNESLEDRRFRIFSKYISKLPYSERFLRNWLDNVVGEGNYELTINNATYNIHLESDARNQDWFEEVHSFVSSIKPCNMTLDYTRVLVSKDNYMNFGITTLIGQEITIYPWSPPDIETYGEIDVLTGNGVGYQEITIF >CP019857.1|AXU86110.1|1328648_1329425_+|phage-tail-fiber-protein MAIDKSYYTIITDVGKAKIANASITGNKVGFVKIQLGDGGGSEYTPTESQTALKNVVWEGNIGNTTTDETAPNCIILESLIPSSVGGFMIREIGYLDDENNLIAISKYKECYKPSIEQGAVVDMKVKTVLIVSNVNNIELKIDPTIIFATLKDIQDLETKIGTVNTKIDTTKTELNSKVGDTTLLTTTDKTNIVNALNEVKKTSVDSIETTAEKTSYNNATSKLNATNVQGAIDEIVAEVRGNRSSIISSINDNLIPM >CP019857.1|AXU86111.1|1329440_1330901_+|hypothetical-protein MPPAETFICNRIVKKRRGYYSERDVFLSPCPYVYGEGGMYESTYYGEFDLSNSKYITVPTSTKYEKTATRVYFISGGNMITSSSGMKQAITLELIPDPNIIINDDLGVISDSCNINYRIPDSNTSVKFDVTEKLNGVVISKKNYALDGNYTLNLTDEHLSTLSFNSTNNITIELSTYQGGKFLEKTVTFTKGNTKPKLNITSYNSTTAIFTAIDIDNNLSKIEWFIDDVLKETITTDLYLEKTINYELTDNAIHTLKIVATDAENATVEKVLSISKEIMPLQEDASLSDISTKLAEIGEEFRNGKTSIINTLALKNIEASLNNTLVELSEKIKTSFDSSDASVQDLQNRITELNNQLSQRKKWATGRYTFTDLDISNFTLNSESIVQTKSIITDLSFTPSIIIIDSIQMKSGTDRVYFRSITNLDITIGAKYTNSSLPVGGSGYIYIQKPTPSNNFLLILTRLDGQGREISFSPIVGETLTWYAFE |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP019857_6 | 1535237-1536121 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP019857_6
|
13 spacers
spacers of CP019857_6
>6.1|1535266|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAAAATCTAGTTAAAAACTGCATCAAAGTATTGAT >6.2|1535331|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGCAAGAGTCGCAACAACATTAACAACTTCGGGAGC >6.3|1535397|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTATTATTACTTTTTATCAGAATAATCAAAAGATA >6.4|1535463|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAGAAGAAACAGGTTTCAAAACGATAAAAAAATAAT >6.5|1535529|38|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAGAGAAGGGCTATTCTCTCTAGGCTTATCCTTACAA >6.6|1535596|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAACCAATCTTTTTTCCTTGAATCTTTTAAAAGTTCC >6.7|1535662|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTTTAGAACTTCATCCACAAACGAGCTTTCTACA >6.8|1535727|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGTCCTTTTCTAAATTTAGAATCAAGTTTTGGAGT >6.9|1535793|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAGTAAAACAATAGTACAAGAACAAATAAATACAT >6.10|1535858|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTTTTCACGACATTTTTTTATAAAAGGAGGTATTA >6.11|1535924|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAATTATAGACAGAATGATAAATGTATTTGATGCTT >6.12|1535990|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACTTTATAAAACCCAGTAATTGCAACACTTTTATA >6.13|1536056|37|CP019857|CRISPRCasFinder AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019857_6
The CRISPR arrays of CP019857_6 >merge|CP019857|6|1535237-1536121|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTGAAAATCTAGTTAAAAACTGCATCAAAGTATTGATGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCAGCAAGAGTCGCAACAACATTAACAACTTCGGGAGCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTGTATTATTACTTTTTATCAGAATAATCAAAAGATAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGCAGAAGAAACAGGTTTCAAAACGATAAAAAAATAATGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAGAGAGAAGGGCTATTCTCTCTAGGCTTATCCTTACAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAACCAATCTTTTTTCCTTGAATCTTTTAAAAGTTCCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGATTTTAGAACTTCATCCACAAACGAGCTTTCTACAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATATAGTCCTTTTCTAAATTTAGAATCAAGTTTTGGAGTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAGAGTAAAACAATAGTACAAGAACAAATAAATACATGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATACTTTTTCACGACATTTTTTTATAAAAGGAGGTATTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAAATTATAGACAGAATGATAAATGTATTTGATGCTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTAACTTTATAAAACCCAGTAATTGCAACACTTTTATAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGGAATTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA >CP019857|6|4|1535237-1536055|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGAAAATCTAGTTAAAAACTGCATCAAAGTATTGAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CAGCAAGAGTCGCAACAACATTAACAACTTCGGGAGC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTGTATTATTACTTTTTATCAGAATAATCAAAAGATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GCAGAAGAAACAGGTTTCAAAACGATAAAAAAATAAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGAGAGAAGGGCTATTCTCTCTAGGCTTATCCTTACAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAACCAATCTTTTTTCCTTGAATCTTTTAAAAGTTCC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GATTTTAGAACTTCATCCACAAACGAGCTTTCTACA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATAGTCCTTTTCTAAATTTAGAATCAAGTTTTGGAGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGAGTAAAACAATAGTACAAGAACAAATAAATACAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ACTTTTTCACGACATTTTTTTATAAAAGGAGGTATTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAATTATAGACAGAATGATAAATGTATTTGATGCTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TAACTTTATAAAACCCAGTAATTGCAACACTTTTATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT >CP019857|6|6|1535237-1536121|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGAAAATCTAGTTAAAAACTGCATCAAAGTATTGAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CAGCAAGAGTCGCAACAACATTAACAACTTCGGGAGC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTGTATTATTACTTTTTATCAGAATAATCAAAAGATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GCAGAAGAAACAGGTTTCAAAACGATAAAAAAATAAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGAGAGAAGGGCTATTCTCTCTAGGCTTATCCTTACAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAACCAATCTTTTTTCCTTGAATCTTTTAAAAGTTCC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GATTTTAGAACTTCATCCACAAACGAGCTTTCTACA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATAGTCCTTTTCTAAATTTAGAATCAAGTTTTGGAGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGAGTAAAACAATAGTACAAGAACAAATAAATACAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ACTTTTTCACGACATTTTTTTATAAAAGGAGGTATTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAATTATAGACAGAATGATAAATGTATTTGATGCTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TAACTTTATAAAACCCAGTAATTGCAACACTTTTATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGTATAATGTTGAAAAGTTAGAGAGTACAATCAAGGA ATTTTACATTAACTAAAATGTATAGAATA >CP019857|6|3|1535237-1536055|CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGAAAATCTAGTTAAAAACTGCATCAAAGTATTGAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CAGCAAGAGTCGCAACAACATTAACAACTTCGGGAGC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTGTATTATTACTTTTTATCAGAATAATCAAAAGATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GCAGAAGAAACAGGTTTCAAAACGATAAAAAAATAAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGAGAGAAGGGCTATTCTCTCTAGGCTTATCCTTACAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAACCAATCTTTTTTCCTTGAATCTTTTAAAAGTTCC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GATTTTAGAACTTCATCCACAAACGAGCTTTCTACA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATAGTCCTTTTCTAAATTTAGAATCAAGTTTTGGAGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AGAGTAAAACAATAGTACAAGAACAAATAAATACAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ACTTTTTCACGACATTTTTTTATAAAAGGAGGTATTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAATTATAGACAGAATGATAAATGTATTTGATGCTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TAACTTTATAAAACCCAGTAATTGCAACACTTTTATA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
>CP019857.1|AXU86307.1|1533732_1533978_-|hypothetical-protein MNQKKIKISIKMVIIGIFAVIISFVLSRLFVEYIDELLRSNWQYQLFESESSYIIFANCIMFSNILLEIFLIYICRKFRKI >CP019857.1|AXU86306.1|1532456_1532684_-|phage-integrase MIKNQIEVFFKDMKLIDITPSILQSYINNIYNEHMLNSTKNQVDFIKLVLKESYRLKEISENICDFVTTPIKKIV >CP019857.1|AXU86305.1|1530192_1531548_-|drug/sodium-antiporter MDTKISINENMSLGKRFFKYLAPSVVAMWVFSLYTMVDGIFVSKGVGELALAAVNISMPFINFIFAVSLLFSTGASTIIAIYLGKKDIKSANEVFSFNLVSIIILSIIILAITFFNLDRLALFLGATESTIGMVKDYLGIIIFFNGFFIVSYSLEVIIKTDGFPILATVGVIISALTNIILDYLFVIEFGWGVKGAGIATGLSQVFSTIFFLIHFLRKNSTLNFSKFRIDFKTLRKIVFIGFPDSTTELSCGIVVLLFNLSLTKYIGENALIYYSVINYINTLVLMTMMGITQGMQPLTSFYYGAGNIDNVKKLLKMGIKATIIASVAVFVICMAFSGPIVSLFIHPEETMLFNEGVRVFKIFSISFLLVGINVIISGFFVSVEKPSISTVISLGRGLVIVVLSLISMILIFGGQGIWMTTIVSEFICLILSLAFLKKNFSTLDSNLNKVA >CP019857.1|AXU86304.1|1529424_1530075_+|ATP-binding-protein MADEKFVMSFSGGKDSILALNRMLKKGYKPVALLTTISEEHGKSWTHNLEYNMLKQVSSNIGLPLLVAECGVEGYEESFERALIKAKNMGATICAYGDIDIESHRKWDTDRCEAVGMKVDLPLWQESREDLVYEFIDSGFCSVVTKVNLKHLGEEFLGKKLTRELVENIKNAGADPCGEHGEYHTFVVDGPIFKKPVEYEVKGTLIKDGYGYLEIK >CP019857.1|AXU86303.1|1528911_1529340_+|EamA-like-transporter-family-protein MTKLWAIIFALLAGGSTALEAFINGELGKSTTALVATFISLTVGAIFFLASIIVTGDLKCLVSINGFNYKLLLGGVFGGLIIYFTVKAIPNLGVSNTLILTLVSQVLVGFFIDSVILGQETMHLYKYIGVILLILGTFFIVN >CP019857.1|AXU86302.1|1528211_1528760_-|hypothetical-protein MYTNFNIDFNNFNKKENAIKFMLMGVLLIILGLLCLTFKTLGIKLISWTFGIALLFFAYLNLKNINELKRYATKEEIKPSINIQWVLIIACILLFVFPQKIQSIFSLFLGFYLIFNQLVALVNSKNNPYSKFTTWNIVKILFGICLILSPLFLSRFIVSIMSFFIILFGLVLFFSGNTARKY >CP019857.1|AXU86301.1|1527157_1528144_-|radical-SAM-protein MFFVQAQRTILLEIGDFLDKFKYAFDNKRYHTWNYYLRNTFGEKVFKVSINAGFTCPNIDGSLGYGGCTYCSKEGSGDFAGNPKDNLISQFYNIKEMMLKKWPHAKYIGYFQAYTNTYAPLEVLKEKYETILELEDVIGLSISTRPDCLPDDVVEYLSELNKRTNLWVELGLQTIHDSTSKIINRGHDYKTFVEGVEKLKSKNIKVVVHIINGLPGEDYNMMVETAKAVGKMGVDGIKIHLLHVIKDTPMEKMLQNGMLTLMEQDEYINLVCDQLEILPETMIIHRLTGDGKRDELVGPIWSLKKWEILNQIDDTLKARNSYQGCKFV >CP019857.1|AXU86300.1|1525942_1526887_+|membrane-protein MGEKSKGYVFIAIAGLLWATLGLFGKFLMGNGLTSEQVAFTRLFFGFIVLGVYSSIRTPQILKISKKGIIYSVIIGIICQAMFNLCYFKAIDIAGVSIAAVLLYTSPLFLAIFSKICYKENITRSKLFSLILCFIGAIMAVTGGRLDFQGLNAFGLLLGVLSAIAYALMPTISKNALKEFSSSTILVYSFLFGAIFMIPSSRPWEILNYAKDLDVLSCMLMLGIVPAALAYIFYAAGISKGVELSVAGVVASVELVGSVIIGCTILGESFSLGKLFGVMLMLISAVVALNLSYDEIRIFYKSNKLKQIEKTESI >CP019857.1|AXU86299.1|1524194_1525625_-|sigma-54-dependent-regulatory-protein MNLDLEFYQKILEASHDEICVSDDKGIIIYCNKAFEENYGLKKEDILGKNVSFLEDSGYSTKSPIPIVLKTKTKFSLEQDTQTGKKLIITATPIFDENGNLEFTVENCRDITELNNIKNKLEDTKKQVKKYKSEVETLYRTALRIEDTVIMDGIVMRPIINTVNHVSKTDVSVLLLGESGTGKSSLARYIHHNSNRSNGPFITINCATISPQLLESELFGYTSGAFTGASTKGKVGLVELANGGTLFLDEIGDIPQNLQAKFLQLIQDRTFTPVGSLKNKKVDIRIISATNVDLVSKVKEKKFREDLYYRLNVIEIKLPPLRERRDNLVEIIKYYFNRYSSDFNLNKTISKEAMDAIANYRFPGNIRELQNIIQKILLTCTDNHITIDDLPNILTKNIHITNNGNKTHISQINKVIISDSKSTNYKNKNFDTLIKEYEKNIILDAYEKFGSSYKVAKHLEISQSKANRLIRKYTNT >CP019857.1|AXU86298.1|1523410_1523995_-|hypothetical-protein MLMNTHFIMAKSILDNIDENKTFFISEKNFIYGNIKPDAFSKYKLKKHYLDESFNMIVSKINYLCSLNIDSLSKYFSVSRLSQELGVICHFLCDFFCVAHSERWEFKHSLNKHVTYERELGAFAKDVDLSKIKCGTINSSFEKFFTKLYSDYKKKTDYMNDLKFSAYTCNSVINYILDSILSNTIKSYHIANCG >CP019857.1|AXU86308.1|1536446_1538180_-|signaling-protein MSILLKKAPKLAKHIITSFYINRDIDEVLKYLCENVTWIGPGEQEFLTSFNEIKNYFYAGQDEIPSCDINNDIFETVSEDENRCMVLGRYTVRTKENAQMILEVNQRCTFEIIEDRGKLLIKHMHISNPYGEMQLDEYFPTKIGTQSYDYLQRLLKEKTEVIEMITNNINGGLKGSNDDSTYSFFYVNEGLPKILGYTYDEFMEMSGGSAVGAVYPPDLPKALEDCERCFAKGPTYSSEYRIRKKDGTLMWVLDSGMKSLNSDGIVKINSIITDITQLKNIESELKLERERYRIALQNITDIMFEYDIENDTLIKYQRVEIDKKIELENFETKNYSKLLESGKIIHLDDIGKLLEVLHGNLRETIEIRQVNSLTKNEWRWIRVQCSVIYDSDHNPIKTIGVLKDITEDKSKLESLINQAQRDPLTQLYNQRVSQNLIEEYLCSSDSKNNDALLVIDIDDFKTVNDTFGHLEGNEVLVAVSKILLHNTHDKDIVARIGGDEFTIFIKSLTKDLIIKITNDILNDASKIKVKDNHKITLSIGIAFTDDSTKLYKDLFSKADKALYLSKADGKNCYSTYE >CP019857.1|AXU86309.1|1538419_1539265_-|signaling-protein MFKEIFLRTFPGFLIIRDSNYRIIFINDNLKNLIKSYMQDNPLGMTNIEIAKKLPDNIAKFFTDSHNIQLDWEKNYPYDKISNWILEFKKDTTSYWNVLEYKVDVDEKTYIITMANDITKLYEENKRNLHYSITDPLTGAYNRKYLNDRFDIFIGDYIVLIDLDNFKMINDYEGHNVGDKILCDFVSLLNKELINSTSIIRLGGDEFIVIFSSDVDKNYVYSQLEALRENFLKVFSKYKYLSFSYGVDTVKRNLKLTIVELDKKMYKNKEKNKKKFDKNDY >CP019857.1|AXU86310.1|1539295_1541530_-|signaling-protein MQNHNYIKMLNKKVEVLSKELDSRNFKLKTLNEIDFFSKIPNREFMYQHIDDCISKNIHIGIMLLNIDNFKLFNDIYGYLVGENLLITLTQNLLHFIPESKGIVAYLKGEGFLIVLPNVSNKELNNMGATIIESARELKIKLPNEKEIYSNVTFSIGSTIWNGEPNMTTLMLFNQVYSALKKAKSEGKNRYILFDFKDNSFYNKLENDKEFLSEISHVLQTKQIEVFYQPLYNIKNNTIVGCEALARWRHPIKGLLTPDKFIPLFEQFGLITELDLHLFEENCKNIRRWIDNNDVFVPICCNFSRLHFFNPNFPSMLKGITEKYSVSTSNFSIEITENILIENTNTIIQQLAELRSYGFSVSMDDFGSGYSSFGMLQNLPFDIIKIDRIFLSHNLNDFKNTTILYSIINIARALGMLTVCEGVETEQHVEFIKSINCDIAQGYYYAKPMECKEFEKLLSKENNSKKMFIKYSDIGKSLIEKIFDGFFIMQDMKKLRANVTEDIQWFDFYNKTEITSFPKVIEHFEKHIKGKKFSILYKSITPHNTESDSLLISGEAVLSDEASEHQKYSNFYFSANCIISENKLLLAKLHLDLIKTAGYINEFESYSIPKMTNTHLDESNILSQFYSMLPVGIIRYDLFGDMIITYMNEEMFDIIGYTKEQFFGEMGGNLRAIVHPDDLDFVYKKSLDMIDTNKIEPFLYRFIKRDGQIVTVMYTQCNLSAIDGRSIAQGMYVDVNKIKNLTKI >CP019857.1|AXU86311.1|1542313_1543123_+|MerR-family-transcriptional-regulator MKDYYKIGEISKIYGIGRDSLMYYEEIGILRPVRDINGYRMYNISDIWKLNLIKEFRSLNFPMKKIKEYLDDRSIESTKNILNEELDLIDKKIAEFISHKENIIKRLSSIESVIQNTKIDEIEVVYIEKRKALELNADIKRDEDFDFLIQKLQKEYEDRFNILGNNNIGSAFSTEAINKGIFNEFKSVFCFLESNEKVYNIVFDEGYYVTLNYTGSNSNNKMYMEKVFKFIEENNYKIIADPIEIYKIDIHETGIVEEFVTEIQVPITK >CP019857.1|AXU86312.1|1543267_1543507_+|hypothetical-protein MKCSNCGSVNIEKGILTTGGIYAETIGLKYRGDGKLDKVINKTFPVQSTIYSDLCLDCGEIVRTYIKDNTDRNWCKDKK >CP019857.1|AXU86313.1|1543693_1543870_-|hypothetical-protein MFRDEMDKCTHMLTAYISSLYDYCDFIDTQLDDFILEYGENVVESCLHQVMVLVSKYN >CP019857.1|AXU86314.1|1544374_1545049_-|MgtC/SapB-transporter MNHHILIQFEYIARIITAGFCGALIGYERKNRLKEAGIRTHFIVALASALIIIVSKYGFNDIVGTPGIGLDPARVAAQVVSGIGFLGAGLIFIRNQSVSGLTTAAGIWATAGTGLAIGSGLYLVGIVSSIIIVIVQITLHRDRKWMKLPTAEQVSLKISNSTDSIEYIEGKFKKSNIEIINMNIKRLDGDWLEVVIYTKLPKGYKKTNLLKLFSDNPLIETLEI >CP019857.1|AXU86315.1|1545268_1545823_-|isochorismatase MSIALILIDIQNDYFKNGKCELFQSEETAENAKKILLFFRKNNLPVIHIQHISTDKTASFFLPNTHGSEINKIVFPLDNEEIIIKHTPDSFFETDLQSILDKKNITNLVICGMMSHMCIDTSVRTAKKLRYDITLISDACTTKNLSWNNIEINANTVHQVFMASLQNSFADVKNTDKFLSNYHK >CP019857.1|AXU86316.1|1545900_1546266_-|transcriptional-regulator MKIRAEYTCPLEIVHDIIKGKWKTILIFELRQSNKTFSELQHNIYGINQKMLIQQLKELRDFGIIDKISSAGYPLHVEYFLTNRGKKMLKAVEIMQEIGIEYMLEHGQQEILDNKGICYNK >CP019857.1|AXU86317.1|1546496_1546631_+|hypothetical-protein MNISRKAMKIIELAQKIANKRGISVEEAWSEAVTEYKNKYEHIA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019857_7 | 1646383-1646874 | TypeV |
I-A
Consensus repeat of CP019857_7
|
7 spacers
spacers of CP019857_7
>7.1|1646412|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGGGAAAGCTAGAGGGTGTTTGGACTTTAGAGGAAA >7.2|1646478|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGTTCTTGGAATGATAAATATAGAATTGGTTGGATA >7.3|1646543|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTAAGCTCCACCTTGTCTTAAAAGTTTAAGCAATA >7.4|1646609|38|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATACTTATAGGAGTTGGAATTATAATATTAACTACAA >7.5|1646676|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTGATTTTAATGGTACGTTTTCGCTTTCTCTAAG >7.6|1646741|38|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACAACGACTTATATTCTAAAATAAAAATGTAAACTTC >7.7|1646808|38|CP019857|CRISPRCasFinder,CRT CTATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019857_7
The CRISPR arrays of CP019857_7 >merge|CP019857|7|1646383-1646874|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATACGGGAAAGCTAGAGGGTGTTTGGACTTTAGAGGAAAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCGTTCTTGGAATGATAAATATAGAATTGGTTGGATAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTTTTAAGCTCCACCTTGTCTTAAAAGTTTAAGCAATAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTATACTTATAGGAGTTGGAATTATAATATTAACTACAAGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATATTTGATTTTAATGGTACGTTTTCGCTTTCTCTAAGGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTACAACGACTTATATTCTAAAATAAAAATGTAAACTTCGTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCTATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTATGTTTTATATTAACTATACAGAATGTAAGT >CP019857|7|5|1646383-1646807|PILER-CR GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ACGGGAAAGCTAGAGGGTGTTTGGACTTTAGAGGAAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CGTTCTTGGAATGATAAATATAGAATTGGTTGGATA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTTAAGCTCCACCTTGTCTTAAAAGTTTAAGCAATA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TATACTTATAGGAGTTGGAATTATAATATTAACTACAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ATTTGATTTTAATGGTACGTTTTCGCTTTCTCTAAG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TACAACGACTTATATTCTAAAATAAAAATGTAAACTTC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT >CP019857|7|7|1646383-1646874|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ACGGGAAAGCTAGAGGGTGTTTGGACTTTAGAGGAAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CGTTCTTGGAATGATAAATATAGAATTGGTTGGATA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTTAAGCTCCACCTTGTCTTAAAAGTTTAAGCAATA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TATACTTATAGGAGTTGGAATTATAATATTAACTACAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ATTTGATTTTAATGGTACGTTTTCGCTTTCTCTAAG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TACAACGACTTATATTCTAAAATAAAAATGTAAACTTC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CTATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAT GTTTTATATTAACTATACAGAATGTAAGT >CP019857|7|4|1646383-1646874|CRT GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ACGGGAAAGCTAGAGGGTGTTTGGACTTTAGAGGAAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CGTTCTTGGAATGATAAATATAGAATTGGTTGGATA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TTTTAAGCTCCACCTTGTCTTAAAAGTTTAAGCAATA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TATACTTATAGGAGTTGGAATTATAATATTAACTACAA GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT ATTTGATTTTAATGGTACGTTTTCGCTTTCTCTAAG GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT TACAACGACTTATATTCTAAAATAAAAATGTAAACTTC GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT CTATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAT GTTTTATATTAACTATACAGAATGTAAGT
>CP019857.1|AXU86404.1|1643630_1645724_+|signaling-protein MNKHNFEVILNQLQINIYVTNIHTNEIIFMNKKMKEEYNILDPEGKVCWQVLYPEKNSTCSFCKVLELLKNDKKGVLIKWYEKCNKLNRVFENYDSLITWQDGTVVHMHQSIDIANSTSLNKPIKINEFHEISNNKEEKGVFNFSRDNFDYNSTLLYDALIRGTDEYIYICNMKTGVFRYSPSQVELFDLPGEIVKNPLVYWKKIVHPEDWNRFYKSNTEIGKNQMDYHTVEFRAKNRSGEYIWLRCRGQLMRDEFGEPSIFAGIMTQLGKQNKIDSLTQLLNYHEFMSVFEDKISNPMIEKLCIVLLDIDDFKNVNEMYDRDFGDNIIKTLAQSVQSILPDNAELYKLDGDEMGILVDNVEENEILTLYNQIQNMIIHLQLWRKYGLNITISAGCVIYPKHGDTVKELYKCASYSLQYAKEHGKNRLVFFSQEILKNKMYSLEMMRDLKASINDDFRGFSLRFQPQVDTESHKIIGVEVLLRWTNDKCKAISPLEFIPILEENDMINIVGAWVLRMALRTFRKWIDYYPFFKVSVNVSAVQILEDTFIEDIVKIIDDENFPYQNLVLELTESHTVQNMSILQFKFKALQDLGIYIAMDDFGTGYSSLEVLKFSPIDIVKIDRVFVKDILKSKFDATFIHFIVAICHDVGIKVCLEGVETQEEYDLVKQIKPDYIQGYLFGKPQTATEIFDLLKLDN >CP019857.1|AXU86403.1|1642054_1642951_-|NADP-oxidoreductase,-coenzyme-F420-dependent MANYFLSKGYCVSGFYGRNQLSLLESTNLTKTKIYSNLKDIIYENDILFITTSDDSIEIIDKKLSKFNLKHKYICHTSGSLKSSILFCSKKAGALIYSIHPIFAFSNKNTNIKKMKDICFSIESDNEQDDLVIQNFIDDLGNQFFIRDKDTSATYHLANVLVSNLVLSLLDIGVSYFIKLGLSEEESLKAISPLVKKNIENILDNGFTKALTGPVSRGDITPIRKHLSVLDKKDEDIYKILSLNILKIIALGNDNSLKGIKNITIENAIENLISKSEKYKEIYKLLGGKNDEKYHTDF >CP019857.1|AXU86402.1|1641252_1642080_-|3-methyl-2-oxobutanoate-hydroxymethyltransferase MKNTIQTFKNAKYEGKKLSMLTAYDYSIAKIMDECDINGILIGDSLGMVIKGEENTLSVTIDEIIYHTKAVKNGVKNALIVSDMPFLSYHVSIEDAVKNAGRLIKEGGAHAVKLEGGSNVIKQIESIVNAQIPVMGHLGLTPQSVNSFGGFKVQGNTSETARQLIEDAKLIEKAGAFSIVLEGVPTKIAEMVTNSISIPTIGIGAGINCDGQILVYQDMLGMFGDFVPKFVKQYANIGDIMKDSIKNYILEVNTGAFPQEKHSFSINESELEKLY >CP019857.1|AXU86401.1|1640385_1641234_-|pantoate--beta-alanine-ligase MLVKEIKLLRNIIKDWRKHGYSIGLVTTMGFLHEGHQSLIKKAIKENDKVVVSVFVNPTQFGPNEDFNSYPRDIDKDFKYCMDSGATVVFNPSPEEMYLKGNCTTINVSGLTDFLCGAKRPVHFGGVCLVVSKFLNIVTPDKAYFGEKDAQQLAVIKRMVKDLNIDTEIIGCPIIRENDGLAKSSRNTYLSEEERKSALILNKSLSLAKEELVKGNLNPENIKELITAKINSEHLAKIDYVEIVDSETLQPVKQIEHSILVAIAVFIGKTRLIDNFTFELNI >CP019857.1|AXU86400.1|1638046_1638961_-|hypothetical-protein MIDNQKYVILSLELHLFFSRIMKEHALFLEAGFTNKNYNLAMEADHYKKQFEDLLSYTVSASNGIIRPDILYSEELVTTLTSVAEQKTEEFTGIEINKNITTRELNLQSGVNPQVGQDLVNYVAQLNSDAIRLLDGLINFKERVLDGVLSCTIFTSNYPLLLEHIIHEANLYRSYVVDLENKIDIESKNAKEIELFWDHIMMEHALFMRGLLDPSEGELINTSNDFAIKFNELIEKTNEMTDSNIKNITEETLNETVEFKDFKEAGASGIEQCKIKSIILPLLADHVLREANHYIRILESYKNM >CP019857.1|AXU86399.1|1637009_1637657_-|lactate-utilization-protein-B/C MIRQTPLEKRYDKLGPHIVTALKKRYFDAYYCKTRNEALQQILDLIPQNHVVSWGGSETLKEMGVQTAVREKGFKVIDRDLAKTPEERTEIMRQALLCDTFLMSSNAISEDGQLFNIDGNGNRVAAMIFGPKNVIVVAGMNKIVKNIDDAIQRTRTIASPAVVQRFQDVNTPCYINGSCIDCTSPESICAYMVTTRISRPAKKIKVILVGENLGL >CP019857.1|AXU86398.1|1636273_1636843_+|lipoprotein MKKFIICIIMFAISVLVLAGCTNDNKIKNEVDSMFNSIKTQDADTVDKYFPKSGLGNLIYEDKEGFKMYSKNMTWEISDIKNNKDKVTVDLKINNTDMVSILKKNPPKLGEMMPNPTMKDIDSAKKKEFNITLELVKSGDNYVCKVNQESAMKLLNVITGGGIDYLADYNKDYYKQLDEEQKNYENKNS >CP019857.1|AXU86397.1|1635369_1636269_+|iron-sulfur-cluster-binding-protein MKLLSKVNNNIRLITQVAFTALTNGYVNGFLEGTIYGGESKKLCVPGLNCYSCPGALGACPIGSLQAVLSSREYKFSFYVVGFLMAFGAFFGRFVCGWLCPFGLVQDLLHKVPFPVKIKKVYGDKYLKYLKYIVLIMFVIILPVAIVNVAGGGNPWFCKWICPSGTLLGGIPLILGNENLRESIGFLFSWKLSILLLILLMSIITYRPFCKYICPLGAIYGFFNPISIYRFKIDKDKCTNCTACQTKCKLDIPIYKDVNSPDCIRCGECIKVCPQNAITTTFSKDKKENNICAKKYRGI >CP019857.1|AXU86396.1|1634632_1635217_+|thioredoxin MKRFFIVVLGCIFVLGMISGCSKKESKPVEKNKNNSEWFSNLDTEDVDGNKVTKEIFSNKELTLINVWTTWCGPCVGEMPELEALSKEYESNNSNVAIKGLVVEVDKTDMRTGLSNEEKNLVKDIMKKSDATYQQLTVSEELKKTDFKRVMEFPTTYFVDKKGNFVGEKVVGANSKEDWKKIIDERLKMVKANE >CP019857.1|AXU86395.1|1632918_1634244_-|drug/sodium-antiporter MENLFTRKFTTFEFLKFVSPAIISMIFISLYTIIDGIFVSTLVGSDALASINIVLPIINLVCGFGIMMATGGGAIVSIRMGENRQDEANSTFSFIVLFSLIVGILFTVISYFFIKEISILLGATDKLLPYCITYGKVMILCTPFYILKFIFEYFARTDGNSKFSLFLSVIGGVTNIILDYVFIKYFGMGLLGAAVATAIGIILTCVLGIIYFLSNKSTLKLRKPKTDFRLIRDTMINGSSEMVTELSTGITTFLFNVVALKLAGENGLAALTIVLYAHFLMTSVYLGFAAGVSPLISYNFGAENSDKLKETFKHSLKFIFVSSLLVFIIALVFAPFIVRVFVSPDNTVFKLALQGLKIFAFAFLFVGINIFASGFFTAFHNGKISAIISFSRAFVFIIIGIIILPPMLNMTGLWLTVPFAEVITIFISILFIKKYKCRYKY >CP019857.1|AXU86405.1|1647041_1647314_-|hypothetical-protein MKIVIGATIRYLIKHKVNYCNKKSLDKLELKYGNIDREKAVKLEIFYQYLIELEYIEMSLLIRRLDTAITSLALVSIITIASYYLIRKNV >CP019857.1|AXU86406.1|1647532_1648351_+|MerR-family-transcriptional-regulator MEKQYFTTGEFAKLCGISKQTLIFYDKIGIFSPEYKDKNNYRYYSVYQYDTLDILQSLREIGMSLEEIKEYIQNRTPQLCVKMLKEEEKKIREKIKKLRKISSKMQNRINITVEGISKMNSEEIYISKKFEEYLVLSSDLSNMSNSDFMMELIDFTNYCKSKNLYQGYELGVIVSNENIKNGDYLSISSFYLKIDKKIKDKKLYVKPEGMYACIKHIGKYEDSYKSYEKLKKYIYENEYKIIGNSYEESILDFFCESNEDNYMTEISIQVSR >CP019857.1|AXU86407.1|1648483_1650604_-|ferrous-ion-transport-protein MGLTHNSTKMSSLKDMFDIDNKEDQFVIALAGNPNTGKSTVFNHLTGLRQHTGNWPGKTVATARGNFKYKNTEYALIDLPGTYSLFALSQEEIVARDFICFGNPDAVIVVCDATCLERNLNLVFQVMELTDKVILCINLIDEARKKGITIDKKLLEDSLGIPVILTAARNGSGMDELLDTLNDVSFDKYKLNNKPVRYNENIENVVKSIQPELDNIIPGINSRWLGLRLIDGDESIFESMSNYIDKDSIDAINEVKKKIPDNINKQKIRDEFTKINYDYAKKLSDECCSNVAKKSTDREEKVDKILTSKIFGLPIMLLLLGTILWITIEGANYPSTLLSNLLLGFEPSISGILNSINCPSWLNDMLVLGLYRTLAWVISVMLPPMAIFFPLFTLLEDFGYLPRVAFNLDHLFKKACAHGKQCLTMCMGFGCNAAGVIGCRIIDSPRERLIAILTNNFVPCNGRFPTLIAISTIFFSSVITNSFVSSVATALCITLLIILGVIITLLVSYTLSKTLLKGVPSTFTLELPPYRVPQIGRTLYTSIIDRTIFVLGRAVMVAIPAGVITWIFANIYIGDLSILSHVANFLDPLAKLIGLDGFILLAFILGFPANEIVVPILLMAYLATGSMIELDSFSALGQVLREHGWTYLTALNVMLFSLLHWPCATTLLTIKKETGSLKWTALGFLMPTILAFVVCFLTTTVYNLFI >CP019857.1|AXU86408.1|1650629_1650857_-|ferrous-ion-transport-protein MKNLNDIQVKKTVKVEDILSSGNLRERMLALGLTRGAVIDVVRKGPKNNLTVYKIRGSKIALRQEESSLILVSDI >CP019857.1|AXU86409.1|1651183_1651624_-|acetyltransferase MFKIKHFNDLSLDEFYEIAKSRYEVFACEQKIFSLNDYDDIDKSSYHIFLKENGLICAYARIIPKEYSSYNDVSIGRVLVLSSHRRKGLAKQMMDCAIDFIKVNLHENNITLSAQTYIKNLYLSCGFKEISEVYDEAGIEHIKMRL >CP019857.1|AXU86410.1|1651796_1652765_+|putative-membrane-protein MNTTKKLTEAALLSSLFIVVTIIAVSTGFGYAIYLDFIVPVFFCIICLKCDLKYTILSGITSLLIISLVLGNLGTAIWASQSVLLGIMCGYLINKPTMVMDDLVYGSVFGVIVMVFIDIYASTLIGYSFMKEFQGYSKWIYFNGYTNFIYYLMIALFPFGMVFCIYLLSLILGNKLHILDSNSLKKFLIFKNFRNLNQFLCCSKKAFYICVSYLAIFEVLKLLNVKVDSVYLKTIFISITYISVYFIIRDSCMSLQNFIIAKFRKLLYARILFLIIILLLFFIFDVTVISLIIINAFLNKKINIRLSQSNIVNKQINLLIEK >CP019857.1|AXU86411.1|1653241_1654450_+|tyrosyl-tRNA-synthetase MKSIDEQMRIIMKGVDDLIDEKELREKLIKSEKEGKPMIVKLGLDPSAPDIHLGHTVVLRKMKQLQDLGHQIVIIIGDFTGKIGDPTGKSKARKALTTEQVLANAKTYEEQIFKVLDKEKTIVRFNSEWLAKLNFEDVIKLAATITVARMLEREDFKKRYEGQMPISVHEFFYPLMQAYDSIALEADIELGGTDQRFNLLMGRSLQREFGMESQIVIMMPLIEGLDGKEKMSKSLGNYIGIDEEAGIMYQKSMEIPDELIIKYYNLVTDVHPDEVNKIESQLKEGSVNPRDIKMNLAREIVTLYHGEESAKEAEERFKSVFQKGQIPEDIQTIQVKEDGFDLIEVLVSNEIVKSKSEVRRLASQGGVKVNGEKVEDLSTIVKESELVVQIGKKKFVKIELVK >CP019857.1|AXU86412.1|1654510_1655392_-|polysaccharide-deacetylase MVKKRKKKTVTLTILVVIVIGIFSMAWADMSRKKEMKETQERLKAERLEKERIEKEKNEPIIGAKKEAVKEYGYDAKIVWDKLNKYDYSNNGEKIVFLTFDDGPSTTNTPQVLDILKRHGVRGTFFIKGDSLERKGANEILKRTFDEGNAIAHHSYTHDYKKLYPNRSLNLDTFVNELNKTDEAMKKVLGKNFSSNVVRCPGGYMSWKNMEPLGNYLKEKNMASIDWNALNADAEGKKKNAQELFEHAKKSSEGKEMVVLLMHDTYGKQETVNALDQIITYFKDNGYQFKILI >CP019857.1|AXU86413.1|1655807_1656722_+|transporter MKKYFGEIGLIFIAIIWGSGFVATQFALDGGLTPLQIITLRFFLAAIIMNLLFFKQIRANMGKKLLKAGGILGIFLFLAFTVQTIGLMYTTPSKNAFITAANVVIVPFIGFILYRRKLDKIGIISSLVALIGIGILSLEADFSINFGDFLTLICSFGFAFHIFFTSEFAKDNNPMALTAIQFTVAFLMSVVVQTFAGQLKMEAELSGYMGTMYLAVFSTTIGFLFQTICQKRVDGTRTAIILSTEAVFGTIFSIIILKELITAKLVIGSILIFVAIITAETKLSFLKSKKVKLKDSEESSLESI >CP019857.1|AXU86414.1|1656944_1657490_+|ruberythrin MKKFVCTVCGYIHEGDAAPAQCPVCKVGADKFEEMKGEMVWADEHRIGVAQGVDAEIIEGLRANFTGECTEVGMYLAMSRQADREGYPEVAEAYKRIAFEEAEHAAKFAELLGEVVVADTKENLRVRVDAEYGATDGKLKLAKRAKELGLDAIHDTVHEMCKDEARHGKAFLGLLNRHFGK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019857_8 | 1848004-1849414 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP019857_8
|
21 spacers
spacers of CP019857_8
>8.1|1848033|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAAGAAGCTCCACCCCATCTGTTTTTTATTATAGC >8.2|1848098|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTTTTCCATGAACATTTCGAGCTGACTTTTATTGT >8.3|1848163|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACTTCTTGTTTTTTCTTTAAAACACGTACTTGGTC >8.4|1848228|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATCAATGCCAACTATAGGAACGTCGGGATTAATTG >8.5|1848294|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGAGTATAAGGTAAATCGTAAGCAACTCCAGAAAGAG >8.6|1848360|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAATTACAATATTATCTCCAGCATCAAGACTAGGAT >8.7|1848425|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGATAGAAAAAGAAGATTATTTGAAAGTTGAGACTA >8.8|1848491|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGATTGCAATAGATTTCCTGTTAAAATAGGTACAG >8.9|1848557|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTGAACCTACTAGCATTGTAGGGTTGAAGTCTACAA >8.10|1848623|38|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTTTTCAAATTGCATAGTTGGTTATACTTATTATAA >8.11|1848690|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATATGTAAGTTTTAATTTAAAATGATATTCAACT >8.12|1848755|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATATTTAGAGATGGCGTAGAGTGTTAAAAGTTTCA >8.13|1848820|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAATAATAAATAGCATTGTCGAATGGTTTGCAAGCC >8.14|1848886|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATAGCTAATTATTAGATTCAATTTTAATTTCGTTAA >8.15|1848952|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGCAACACTTCATCAGTTGATAAATATAGTATATT >8.16|1849018|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATACATATTTGTAGCTCCTTGCTGAACTGTTGCA >8.17|1849083|38|CP019857|CRISPRCasFinder,CRT TGGTTAAATCTCCAACAGAACATTTATCTAAATTACAA >8.18|1849150|37|CP019857|CRISPRCasFinder,CRT CTTGTTAATGCAAATAAACAACATAGCACTATTAATA >8.19|1849216|38|CP019857|CRISPRCasFinder,CRT AGGGTTTCTGATAAAATCTTCAAACATGTAAAATATGT >8.20|1849283|37|CP019857|CRISPRCasFinder,CRT CTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATAT >8.21|1849349|37|CP019857|CRISPRCasFinder,CRT TGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCTCTTTGAAATTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019857_8
The CRISPR arrays of CP019857_8 >merge|CP019857|8|1848004-1849414|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCAAAGAAGCTCCACCCCATCTGTTTTTTATTATAGCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTGTTTTCCATGAACATTTCGAGCTGACTTTTATTGTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAACTTCTTGTTTTTTCTTTAAAACACGTACTTGGTCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAATCAATGCCAACTATAGGAACGTCGGGATTAATTGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGGAGTATAAGGTAAATCGTAAGCAACTCCAGAAAGAGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGAATTACAATATTATCTCCAGCATCAAGACTAGGATGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCTGATAGAAAAAGAAGATTATTTGAAAGTTGAGACTAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAAGATTGCAATAGATTTCCTGTTAAAATAGGTACAGGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATACTGAACCTACTAGCATTGTAGGGTTGAAGTCTACAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTCTTTTTCAAATTGCATAGTTGGTTATACTTATTATAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAAATATGTAAGTTTTAATTTAAAATGATATTCAACTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATAATATTTAGAGATGGCGTAGAGTGTTAAAAGTTTCAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATGAAATAATAAATAGCATTGTCGAATGGTTTGCAAGCCGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTATAGCTAATTATTAGATTCAATTTTAATTTCGTTAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATATTGCAACACTTCATCAGTTGATAAATATAGTATATTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTTATACATATTTGTAGCTCCTTGCTGAACTGTTGCAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATTGGTTAAATCTCCAACAGAACATTTATCTAAATTACAAGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAATCTTGTTAATGCAAATAAACAACATAGCACTATTAATAGTTTTATATTAACTATGCGGTATGTAAATAGGGTTTCTGATAAAATCTTCAAACATGTAAAATATGTGTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAATCTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATATGCTTTATATTAACTATATGGTATATAAATTGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCTCTTTGAAATTTGTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT >CP019857|8|6|1848004-1849082|PILER-CR GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CAAAGAAGCTCCACCCCATCTGTTTTTTATTATAGC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGTTTTCCATGAACATTTCGAGCTGACTTTTATTGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AACTTCTTGTTTTTTCTTTAAAACACGTACTTGGTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAATCAATGCCAACTATAGGAACGTCGGGATTAATTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GGAGTATAAGGTAAATCGTAAGCAACTCCAGAAAGAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GAATTACAATATTATCTCCAGCATCAAGACTAGGAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTGATAGAAAAAGAAGATTATTTGAAAGTTGAGACTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAGATTGCAATAGATTTCCTGTTAAAATAGGTACAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ACTGAACCTACTAGCATTGTAGGGTTGAAGTCTACAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TCTTTTTCAAATTGCATAGTTGGTTATACTTATTATAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAATATGTAAGTTTTAATTTAAAATGATATTCAACT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AATATTTAGAGATGGCGTAGAGTGTTAAAAGTTTCA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GAAATAATAAATAGCATTGTCGAATGGTTTGCAAGCC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TATAGCTAATTATTAGATTCAATTTTAATTTCGTTAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATTGCAACACTTCATCAGTTGATAAATATAGTATATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTATACATATTTGTAGCTCCTTGCTGAACTGTTGCA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT >CP019857|8|8|1848004-1849414|CRISPRCasFinder GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CAAAGAAGCTCCACCCCATCTGTTTTTTATTATAGC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGTTTTCCATGAACATTTCGAGCTGACTTTTATTGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AACTTCTTGTTTTTTCTTTAAAACACGTACTTGGTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAATCAATGCCAACTATAGGAACGTCGGGATTAATTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GGAGTATAAGGTAAATCGTAAGCAACTCCAGAAAGAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GAATTACAATATTATCTCCAGCATCAAGACTAGGAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTGATAGAAAAAGAAGATTATTTGAAAGTTGAGACTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAGATTGCAATAGATTTCCTGTTAAAATAGGTACAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ACTGAACCTACTAGCATTGTAGGGTTGAAGTCTACAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TCTTTTTCAAATTGCATAGTTGGTTATACTTATTATAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAATATGTAAGTTTTAATTTAAAATGATATTCAACT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AATATTTAGAGATGGCGTAGAGTGTTAAAAGTTTCA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GAAATAATAAATAGCATTGTCGAATGGTTTGCAAGCC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TATAGCTAATTATTAGATTCAATTTTAATTTCGTTAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATTGCAACACTTCATCAGTTGATAAATATAGTATATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTATACATATTTGTAGCTCCTTGCTGAACTGTTGCA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGGTTAAATCTCCAACAGAACATTTATCTAAATTACAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTTGTTAATGCAAATAAACAACATAGCACTATTAATA GTTTTATATTAACTATGCGGTATGTAAAT AGGGTTTCTGATAAAATCTTCAAACATGTAAAATATGT GTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAAT CTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATAT GCTTTATATTAACTATATGGTATATAAAT TGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCTCTTTGAAATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT >CP019857|8|5|1848004-1849414|CRT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CAAAGAAGCTCCACCCCATCTGTTTTTTATTATAGC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGTTTTCCATGAACATTTCGAGCTGACTTTTATTGT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AACTTCTTGTTTTTTCTTTAAAACACGTACTTGGTC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAATCAATGCCAACTATAGGAACGTCGGGATTAATTG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GGAGTATAAGGTAAATCGTAAGCAACTCCAGAAAGAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GAATTACAATATTATCTCCAGCATCAAGACTAGGAT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTGATAGAAAAAGAAGATTATTTGAAAGTTGAGACTA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAAGATTGCAATAGATTTCCTGTTAAAATAGGTACAG GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ACTGAACCTACTAGCATTGTAGGGTTGAAGTCTACAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TCTTTTTCAAATTGCATAGTTGGTTATACTTATTATAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AAATATGTAAGTTTTAATTTAAAATGATATTCAACT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT AATATTTAGAGATGGCGTAGAGTGTTAAAAGTTTCA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT GAAATAATAAATAGCATTGTCGAATGGTTTGCAAGCC GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TATAGCTAATTATTAGATTCAATTTTAATTTCGTTAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT ATTGCAACACTTCATCAGTTGATAAATATAGTATATT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TTATACATATTTGTAGCTCCTTGCTGAACTGTTGCA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT TGGTTAAATCTCCAACAGAACATTTATCTAAATTACAA GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT CTTGTTAATGCAAATAAACAACATAGCACTATTAATA GTTTTATATTAACTATGCGGTATGTAAAT AGGGTTTCTGATAAAATCTTCAAACATGTAAAATATGT GTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAAT CTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATAT GCTTTATATTAACTATATGGTATATAAAT TGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCTCTTTGAAATTT GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT
>CP019857.1|AXU86583.1|1846085_1847357_-|guanine-deaminase MLKVLKGNIIFTKTSETFTVFENSYIILEKGKVKGIFKEIPKEYKNLKVVDYTDKLIIPGMNDLHAHASQFKNLGMAMDKELLPWLETYTFPEESNYKDIEYATKMYKKFVKELWKSGTTRIAVFATVHKEASMKLMDIFKEVGLGAYVGKVNMNMNCPDTLLENTQDSITDTEEIINKYSDTDSIVKPIITPRFIPSCTSELLKGLGDLCLKYNIPIQSHLSENYDEIEWVRSLEPESKFYGDAYNRYNLFGQTPTLMAHCVHCSQDEIDLMRENNVMAVHCPASNFNVGSGAMPIRKLIDNNIRLALGSDISGGHTLSIFKAMVSAIQLSKLYWVNSGKKYNFLSLSEAFYIATKSGGSFFGKVGSFEEGYDFDALIIDDSNLNHDNYSILERLERFIYVGDDRNIIHRYVCGKLIEEPNI >CP019857.1|AXU86582.1|1845184_1845502_-|hypothetical-protein MSEFKNVTAVKKANVYFDGKVSSRVIILPNGERKTLGLMLPGEYTFSTREEEIMEMLAGSMDVKLPGSNEFVTYKEGQKFNVPSDSSFDLKVNEVVDYCCSYIAD >CP019857.1|AXU86581.1|1842741_1845099_+|cation-transporting-ATPase MDKVNLERYSCDINVGLNKNQLQSRIDDNLINAFDNGKTKTYKQIFKDNIFTLFNLINIVLVCLLVSVGSFKNTLFIFIAVINTIIGVIQEIRAKRLLDNLSVIVSNKVSVIREKEKKEIDVQELVLDDIMILKTGNQICADSKVLNGKLEVNESLVTGESDIIIKNKGDFLYSGSFVVSGEAFVRVENIGKDNYANKIANDAKISKKHNSQLRNSLNAILKIVGIIIIPLGIILFAKQHFGNGDSIATSVVGTVAAVNGMIPEGLTLLTSIALAVGTIKLASHKTLVQELYCVETLARVDTLCLDKTGTITEGKMQVDDIVMLEEVDINEIMGNICNSLKDDNATLNAIRDKYNVLDTYKAKNLIPFSSERKYSGVTFENKGTYLLGAFEFIFKEKNKKLRIEVERYSKKGNRVIVLAHSDSYMEDNNIPEDIKPLAFILILDKIRDEAKETLEFFYNEGVDIKIISGDNPITVSEVARKAGLKTASNFIDATTLKNDSDIYKAVDKYSVFGRVSPQQKKQMILALKKQNHTVAMTGDGVNDVLALKEADCSIAMASGSDVTKNVSNLVLLDSNFASMPKVVMEGRKVINNIQRASSLFLVKTIFSFFLSLLTLFFFSRQYPFVPIQLSLIGAVTVGIPSFFLALEANKSRISGNFLLNILKNALPGALCVTVNVIIVYNIVEYLGYSSSVFSTMCAILTGVCGLLILRQQCLPFNKERLFLIVSMTIAFVIGILFLGGLFSFVALSRELILITMVLAILMPIMIKVMLFVLDEILETIVPDLN >CP019857.1|AXU86580.1|1840840_1842298_+|glycine-dehydrogenase-subunit-2 MKEYNSLLIDISKKGRKAYSLPKLDIDDIKIEDMIDPDMARQSELNLPEVGELELVRHYTLLSNKNFGVDTGFYPLGSCTMKYNPKINEDMAALPNFTGMHPYQSSDTAQGSLSLMYDLSRRLAEITGMDEVTLQPSAGSHGEFTGLMIIKAYHENRGDHKRTKVIIPDSAHGTNPASAAMANFDVIQIASDKNGAVDINALKEVLNDEVAALMLTNPSTLGLFEKNIKEIATLVHEAGGLLYYDGANMNAIMGITRPGDMGFDVVHLNLHKTFSTPHGGGGPGAGPVGVKKELVPFLPIPVIERKEDKYVLNYDREKSIGKIKNFYGNFGVLVRAYTYILTMGRDGLKEASEMAVLNANYIKESIKDDYILPIDTLCKHEFVLGGLPRGEANIKTIDIAKRLLDYGYHPPTMYFPLIINEALMIEPTESESIETLDSFIEAMKSVAKEAKEEPELLKTAPHNTLVKRVDDARAVKKPILTWSQR >CP019857.1|AXU86579.1|1838366_1840841_+|bifunctional-glycine-dehydrogenase/aminomethyl-transferase-protein MNELKRVSLYNIHKELGAKLVEFAGWEMPLEYEGINKEHEKVRKSAGIFDVSHMGEVQIKGAESEKFIQNLVTNDISTLKINDIIYTPMCYENGGVVDDLLIYKFGEEDYLLVINAGNIDKDVAWIIKQSEGYNVDIKNISSEVSQLAIQGPKAEEILQKITDIDLNSIKFYKSIPSTKVCGCPCLVSRTGYTGEDGFEIYCKNKYVEIIWNEVLKVGGEDICPAGLGCRDTLRFEAALPLYGHEINEHISPIEGGLSIFVKTNKESFIGKSILSKEKESGAKRKLVGFEMQGKGMPRNGYDIRIGDKTVGFVTTGCASPTTGKILGMGIIDSEYAKVGNEIGIAIRKKVVPAVIVKKPFYKKQYKKDNIILNKENKFSYIPATSEDKSKMLKVVGLNSVDELFSDIPEEVKLKRDLNLEIGKSELEVSKIVKRLSEENLSLEDLTCFLGAGAYDHYIPSIIKHITSRSEFYTAYTPYQAEISQGTLQVVFEFQSMIAEITGMEIANASMYDGATAAIEACIMAMNQTRKSKIVVSKTIHPETLSVLRTYLQYKDCEIVEIDFCNEYGTTDIEKLKASVDKDTACVLIQTPNFFGIIEEMEEIEKITHENKAMLIMSVDPISLGVLKTPGEIGADIVVGEAQSLGNPLNFGGPYVGFLASKSKYTRKMPGRIVGQSLDVEGKIAYVLTLQTREQHVRREKATSNICSNQALNALVASIYMATMGKEGFKEVGMQSMKKAHYTYNKLVQTGKYKPIFKGKFFKEFAVQGNLNIETINDKLLEENILGGYNLEYNYPELKNSTLLCVTEKRSKEEIDKLVGIMEGL >CP019857.1|AXU86578.1|1837045_1837561_+|CF-9-family-membrane-protein MEKYIWLFPLLFIFHDMEEIIGFGIWLKKNKSMLDKKYPFISKVYKNYSTEGMAFAVFEEFILCIIFCILTVITENQYVYLLWLGSFIAYTLHLVIHIGQSIIIRKYIPSLITSIICLPISIWCISKSIYIVDCEMSTTILYSIIGIIIVALNLKFAQSLIGKFTKWMSNI >CP019857.1|AXU86577.1|1834790_1836521_+|Na+/H+-antiporter MRNKKINIIFLTTIMFIMSTVMVFAEEDIDTIALANAEKFGILTLIPPLVAIILAFITKNVIISLLIGILSGSFIIKASGINVFATFIQAFLDLVDRALVSLADPWNAGIILQVLAIGGVINLVAKMGGAKAIAEALAKRAKSAKGTQLITWFLGLLVFFDDYANSLIVGPMMRPVADKMKISREKLAFIIDATAAPVAGLAIISTWIGLEVGLIHDAFESISIDVDAFGIFLNTIPFRFYNILILAFIVISALLLKEFGPMRKAEIKSRSRKISIDLDEGVEELDDLAPKNGVKLSVWNAIIPIGTLIIVALASFYYSGYTSIMGGDDKALIQLFTNSPYSFEAIKEAFSASDASRALFQSALVASLVAIIMAVVKKIFTISEAIDVWIDGMKSLVITGVILILAWSLSSVIKELGTAKFLIHLLSGSLPPFLLPSLIFGLGAIISFATGTAYGTMGILMPLAIPLAYSLNPDMSYVIVSTSAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGAGCNHIDHVNTQMPYAIFTAVITIVFGYIPAGLGLPIYIVLPVAIAAIFVGIQIIGKKVDEAEIELVE >CP019857.1|AXU86576.1|1833320_1834307_-|lipoate-protein-ligase MLLIYNEKTNPYFNLAMEEYLLKNFDEDLFILWRNEPSIIVGKNQNTLSEINLEYIKEYSIPVVRRQSGGGAVFHDLGNINFTFIACNNNNFSDFRRFTQPIIDLLKTLDVNAEFSGRNDLLIDGKKFSGNAQYNYKNKVMHHGTLLFSSEINDLSKALKVKPIKFEGKGIKSVKSRVTNISEHLHSKMDILEFKDAIMDYLSKTNTDNTNYCLSEHDIKQIEKLTKSKYETWDWNFGNSPKYTLSNELKYSGGNVEFNLNVDKGIITSIKFFGDFFGKCDVAFVENKLIGIRHEENALRNTLDSIEINDYFLGADTDILVSGILGVK >CP019857.1|AXU86575.1|1832213_1833011_-|lipoprotein MKFKKLLCLLLCLVLTLAVVGCSKAKDDKKIVVGATLVPGGELLEELKPLIKEKGYTLEVKNFDDYILPNEALNNGEIDANLFQHEPYLKEAVKAKGYKIMAGKKLYVCPAILYSYKIKSVDEFKKGDTIAISNNPSSCSKNLRYLESIGLLTLPKGDGLVSPKDIIENPKGIQFKELDIAQIPSSLPDVTAAFIDTTYAVPAGLDAKKNGIYTAPINDEYANLLAFRTEDKDSEKIKVLQDVLTSDKARSLIEEKYKGIVIPTF >CP019857.1|AXU86574.1|1831511_1832111_-|tellurium-resistance-protein MAIELKKGQKINLTKKENSNLGEILVNLNWNQKVQKKGFFGSLRSSNIDLDLGCLFEMKNGVKGAVQALGNAFGSLDNPPFAQLDGDDRTGSNTQGENLRINGNKIKDIKRILIYAFIYEGVANWSEADGIVTIKQKQDSDLVVKLDEHKNGYNMCSIALIENVNDETFSVEKVVKYFKGHREMDTEFHWGLKWVAGRK >CP019857.1|AXU86584.1|1849822_1850110_+|hypothetical-protein MKKILYALYSFIVIIANFRLKEKNYNFILLAIFFILLLIQNGVLKTGYQNRATFYQDNYFNGEDKNDKIKFMTIKIFIFLSLPLCFNILFNYLTS >CP019857.1|AXU86585.1|1850134_1850233_+|hypothetical-protein MIKVSLCVICSKYKVHIVIKQKFHINEEKNIK >CP019857.1|AXU86586.1|1850648_1851200_-|transcriptional-regulator MSINTVIAKNLNRLRNERNLSLGQLAELSGVSKVMLSQIEKGDSNPTVNTIWKIASGLNVPYTAILEQPQNETFIVSKTDIDVQVSENKDYRLYCYYPNTPTRNFELFQMELEEGHSYTSVGHSEKSQEYIMIIEGQLKLEVNDSIYQLRENDSICFSAESIHTYHNQGEKTLKAVIINYYPV >CP019857.1|AXU86587.1|1851390_1852353_+|cysteine-synthase-A MRVLNNVTEAIGNTHMLHLSKIADEFGVQGNIYAKMEYLNPGFSKKDRVALQMITEAENAGLLVPGQAVVELTSGNTGTGLAIACACKGYKFIACMSKGNSMERARMMKALGAEVVLVDQMPNSVHGQVSGEDLALVEIEAQKIAKERNAFRADQFNLEACNHAHEKYTAEEMWEQLDGNIDVFVDFLGSGSTFAGCSKTLKKHNSSIKCYVVEPETAAIYSGKEITDQGHKIQGGGYSMDLPLVDKKLIDGYIQVTDEEATDVARKLAKLEGVFAGFSSGANVCAAIKLLKSSEKGKNIILTLNDSGLKYLSTDLYEEL >CP019857.1|AXU86588.1|1852647_1854492_+|glycerophosphoryl-diester-phosphodiesterase MQKRILRNFIFTGKNILNKLVFIIKYNFSTLILFELFHKGLALFFIWPSIRYIFDILIKSLHIVYLNMDNFIKVLTNPMSIVLIILSVIILAFYAFFEFTSVIICLNKSIKYEKIGLFELFKISFENSIKLLYPKNILLFIFVILIIPLVNTVLISGFIGKIQIPEYILDYIKSDIILNIIYMIFLLIIYISVIRWIFSIHEITLNTENFKRARKESVNLIKGKIIRTIIYSLILSLVVAIIGYAIYHSGIIFIGIWTKYCTDMEFLKNVFINRCIAFEEYFRLILSIFIFILDIGFISATYYQYKGVSISKNNIKKEKKSISKIVFNLVLILLISYIESVAFSSHINGMFNTSFSFYTTAIAHRAGAEMAPENTLAAIKEASHAKADYAEIDVQEAKDGELIVLHDSNFKRTTGVDKNVWDVNYNEVKTYDAGSFYYYGKGYYDEKFVGEKIPTLKEMIKYSKGKVKLLIEIKLNGHEKGDVVKKVVQLIKENNFENQCIVASMDKTILQKVKKLDENLLTCYFMAIAYGDFSKLNYVDMYGIESTFVNKTVVEKIHKMNKKIFVWTVNSDSLIEKMLDLNVDSIITDNPYLIESAIYWKKNGFISQVSDYLF >CP019857.1|AXU86589.1|1854813_1855398_+|sugar-O-acetyltransferase MTEREKMLAGELYDCGDIELLTQWHKAKDLVRDYNQTDSSDLEKKEKILNELLGGKGKNLWITAPYYVDYGNNIYFGNNCEVNMNCTFLDDNKIIIGDNALIAPNVQIYTAFHPTNAGDRFGNAKEDGSFEFCKTQTAPVTIGDNVWIGGGAIIMPGVTIGDNVVIGAGSIVTKDIPSNMIAYGNPCRIIRENK >CP019857.1|AXU86590.1|1856500_1856677_-|hypothetical-protein MFIGEIDKCTHILTAYISSSYDYCNFLDTQLDDFISEYGETVVETCLHQVLLLVSRYN >CP019857.1|AXU86591.1|1857251_1858274_+|ABC-type-transport-system-involved-in-multi-copper-enzyme-maturation,-permease-component MVNWEIKKLAKSKSMFISLGILVLILMISIFIAPVLETESYYIDKEKGRIEDTRSGIDIGNEKFQNKINVLKQFSNQTDTGEFSKKIELMSKKKLDNLSVNEYKDISFWKVFNYRVTNSLINVGMLIIISIIISNIYVDEVVTSVKDIILSSKEKKKALKSKIFVALLVPLVIYSVYLMGIFIITCMQQGVPVNGDLESFRIVDNVVALKTNLSITKYVILNIGIELLMFEGWAMIAIFGSFISKSSISSISFFIFIISITKIMSVIHILPKKLLSVVSNVNYYDLIFGFNKIIGNYLGDIMIFKVNIDIVNIAIGLLMAILIGTMSLCFLVIKSDYISR >CP019857.1|AXU86592.1|1858287_1859175_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNKLEIENLSKIYGKKVANDKITVTLENGVYGLLGPNGAGKSTLMKQITTLIKPDEGQILYNGEDIFKMDADYRNILGYLPQEFGVYKNFTAKEFLQYIGALKGLRGKYLNSKIGELLDLVGLYDVRNKSIGKFSGGMKRRVGIAQVLLNDPKIIVLDEPTAGLDPQERARFRNLIAKMSRDKIIILSTHIISDIESVAKETIMIKDGKLLMKGTHKDILSHMENKVYNVQVKNECEVDDIQSKYKVVSIQSDINSIVLRIVSEDILSEDNIQPVQAKFEDVYMFYFDLEDAREV >CP019857.1|AXU86593.1|1859180_1859954_+|ABC-transporter-permease MMYLVKAEMIKILKSKSVWIIWLFLIFFGFFLIRKFDVLDTYADIFYKIEGSIPLIGLIMFIITSGNYIKEYDSNMTGLINTTKKGKKSVVLSKLVANGLILSIINISFILLVGIRGFSFFDFKNLNEPIHNLWYFGNSNLNLTVIQMYIIVILTTIFASFIFAQIGLTLSSIFKSAVIPFILGGLIMAIPYFSVGFIPDKAIKFMSVTPNWIMMSQQMVKYNVPSILIVFSIVISIILMIVLTKITYENFTSSKRF |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019857_9 | 2569851-2570337 | TypeV-U4 |
NA
Consensus repeat of CP019857_9
|
7 spacers
spacers of CP019857_9
>9.1|2569880|36|CP019857|CRISPRCasFinder ACAATTATTAATTGTTTTATTATTGAAATCACAGCA >9.2|2569945|36|CP019857|CRISPRCasFinder GTACCCTGCTAAATTTAATTTATACCGTTGTAGCCG >9.3|2570010|37|CP019857|CRISPRCasFinder AAGCATATACACATGTCAGAAGATATTTATAAAAGGA >9.4|2570076|36|CP019857|CRISPRCasFinder AAGACTTAACACAGTAACTAAACTGTACATAATTGG >9.5|2570141|38|CP019857|CRISPRCasFinder GATATAATAATGAAACCTTTTTTTAAACTTATTTTCTT >9.6|2570208|36|CP019857|CRISPRCasFinder GACAGCGAACAAGAGGTTTGGGAGGATGAAAAAAGT >9.7|2570273|36|CP019857|CRISPRCasFinder AAATTTTGTAGTAAATTTCTTCATAGCGTCAAAAAT >9.8|2569880|37|CP019857|CRT ACAATTATTAATTGTTTTATTATTGAAATCACAGCAA >9.9|2569945|37|CP019857|CRT,PILER-CR GTACCCTGCTAAATTTAATTTATACCGTTGTAGCCGA >9.10|2570010|38|CP019857|CRT,PILER-CR AAGCATATACACATGTCAGAAGATATTTATAAAAGGAT >9.11|2570076|37|CP019857|CRT,PILER-CR AAGACTTAACACAGTAACTAAACTGTACATAATTGGT >9.12|2570141|39|CP019857|CRT,PILER-CR GATATAATAATGAAACCTTTTTTTAAACTTATTTTCTTT >9.13|2570208|37|CP019857|CRT,PILER-CR GACAGCGAACAAGAGGTTTGGGAGGATGAAAAAAGTT >9.14|2570273|37|CP019857|CRT,PILER-CR AAATTTTGTAGTAAATTTCTTCATAGCGTCAAAAATT |
c2c9_V-U4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019857_9
The CRISPR arrays of CP019857_9 >merge|CP019857|9|2569851-2570337|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTTGAATCCACATAGTTAATCTAAAACACAATTATTAATTGTTTTATTATTGAAATCACAGCAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAATGTACCCTGCTAAATTTAATTTATACCGTTGTAGCCGATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACAAGCATATACACATGTCAGAAGATATTTATAAAAGGATTTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACAAGACTTAACACAGTAACTAAACTGTACATAATTGGTTTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGATATAATAATGAAACCTTTTTTTAAACTTATTTTCTTTTTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGACAGCGAACAAGAGGTTTGGGAGGATGAAAAAAGTTTTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACAAATTTTGTAGTAAATTTCTTCATAGCGTCAAAAATTTTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP019857|9|9|2569851-2570337|CRISPRCasFinder ATTTTGAATCCACATAGTTAATCTAAAAC ACAATTATTAATTGTTTTATTATTGAAATCACAGCA ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAT GTACCCTGCTAAATTTAATTTATACCGTTGTAGCCG ATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAGCATATACACATGTCAGAAGATATTTATAAAAGGA TTTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAGACTTAACACAGTAACTAAACTGTACATAATTGG TTTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GATATAATAATGAAACCTTTTTTTAAACTTATTTTCTT TTTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GACAGCGAACAAGAGGTTTGGGAGGATGAAAAAAGT TTTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAATTTTGTAGTAAATTTCTTCATAGCGTCAAAAAT TTTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP019857|9|6|2569852-2570337|CRT TTTTGAATCCACATAGTTAATCTAAAAC ACAATTATTAATTGTTTTATTATTGAAATCACAGCAA TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAT GTACCCTGCTAAATTTAATTTATACCGTTGTAGCCGA TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAGCATATACACATGTCAGAAGATATTTATAAAAGGAT TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAGACTTAACACAGTAACTAAACTGTACATAATTGGT TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GATATAATAATGAAACCTTTTTTTAAACTTATTTTCTTT TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GACAGCGAACAAGAGGTTTGGGAGGATGAAAAAAGTT TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAATTTTGTAGTAAATTTCTTCATAGCGTCAAAAATT TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC >CP019857|9|7|2569917-2570337|PILER-CR TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAT GTACCCTGCTAAATTTAATTTATACCGTTGTAGCCGA TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAGCATATACACATGTCAGAAGATATTTATAAAAGGAT TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAGACTTAACACAGTAACTAAACTGTACATAATTGGT TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GATATAATAATGAAACCTTTTTTTAAACTTATTTTCTTT TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC GACAGCGAACAAGAGGTTTGGGAGGATGAAAAAAGTT TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC AAATTTTGTAGTAAATTTCTTCATAGCGTCAAAAATT TTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAAC
>CP019857.1|AXU87247.1|2569507_2569660_-|hypothetical-protein MKNRRKDKRGFSVLLDKEKLDKFDEVLEEKNLTKKEWLEEKIDEELEQKE >CP019857.1|AXU87246.1|2569022_2569388_-|phage-related-regulatory-protein MKNELMMFEGKEIEVFEFEGRILFNSKDVVNCLDIKNVNENIRLMNEKQVVKLRNSDISNTDIRKLNNAGENFLTESGVYKLIFKSRKEEAERFQGWISDEVLPSIRQTGAYINNNAIPKS >CP019857.1|AXU87245.1|2568573_2569026_-|prophage-antirepressor-related-protein MREKASEIEKLQLVYNSTSMLKELLDDAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEINEEEHYFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQMAVCEIIKKIDLEDGEVKGVWEINGSWTGTVNKYTKSVIDKVRTWIEENNRPTKIAGEKKNYYVFYKIE >CP019857.1|AXU87244.1|2568360_2568522_-|hypothetical-protein MCENLLDNMYIEKRKEEYRIKLLKIRETDIDIYNKLESIVYKLSEKKLEKNNK >CP019857.1|AXU87243.1|2567568_2568033_+|hypothetical-protein MDFGEVKSELSDKDLKDNEEALNKYKKYYLKVYKYYSEMDSIKSIQDIEIEQSRLKGQLQKNSNPIFALYISIMAVVFSTTINLTFDLSDITNYFIRMIMTLLFIVLLIFLVNKGILPIAIPYRNNIQFYTTALDVFEDMKNKILRERKYKKRR >CP019857.1|AXU87242.1|2567115_2567433_+|hypothetical-protein MDFGNINLILIGIIVIIGTTIIYLIKPKTAFCSKKYFNKLESIYGNIDKKKTVKLEVLYRYVTGLEYIAIGLFTRRLDITIIAIILVAIITTALYYLIRKKYITI >CP019857.1|AXU87241.1|2566536_2566833_+|hypothetical-protein MYFKTYILKREVNNKQLEITRSFDLDNLICTATEILKDNEIDLIITDEVNNVVWRNEKSTPPARECLVIAIEVYWWYTSIFLLYHINYVIKKSYLNRF >CP019857.1|AXU87240.1|2566104_2566518_+|hypothetical-protein MKVKSKRSFIVGIIVCVLCCASLVIYCILKDKRFLISSFLLIVIAIFNFCNAFSRKGIVEELHDSTDERDLYLTMKTSHILVKIMNYTLFTFTFLFIIAYSAWKNQSLLVIAITLCVIEIFLFVAYLLINIFLEKKE >CP019857.1|AXU87239.1|2565887_2566121_+|transcriptional-regulator MKTKVREFRTNMGLTQQQLADLVHVSNRTIISIEKEQYSPSLMLAYRMAQVFGTTIEELCCLKENKEMEDKKHESKE >CP019857.1|AXU87238.1|2565294_2565669_-|regulatory-protein MKISKLPEAELKVMRYICEANKVLTSRELVAAMEEKYEWNESTTFTVLKRLERREFLSTEKIGKLTHYNILVKEKKYLRFETKEFLKNIHKNSISSLMSALHGEDDEVDEDKLSELEECFKNLK >CP019857.1|AXU87248.1|2570642_2571527_-|hypothetical-protein MVGAFVLPNYAIILSEMSNLWGNFIMWILVPIITIVLLIIAVSSMQYILVMIAFLLIIYSFIEKKIVMGLVSVLFFTYSIYLCATWEDKSLIADNKVETVKAQRETVEREKEMERRRIQEEVDKERYIEKHGMEISENDLKVKLEALVPQEYKGKKYELKVGKFKRYSMYFDLTVQNEKFSNSEECKKFVKEIANDLKKIKISKAYFKFHSKDDGGIYNSVYIDYFRNIQNNVDNVENLEFNEFELKTEEEEKREQEKIEQEKNSYNNYIQNRVVDPLDRIKKLKELLDSGAIT >CP019857.1|AXU87249.1|2571720_2571873_-|hypothetical-protein MDNFLFNVLASVTASYIVYLISKLIKKVKSHSTAKSDLKIDINFKYHRKK >CP019857.1|AXU87250.1|2572146_2572479_-|hypothetical-protein MNDMARDVFSVKMTPLEAQKMVEKNLEADLVSVDIYNLENNKSIIVTIFEKYYARSNSDAGLVVICENTTGKTLVKITSTGSAIGLFQIDWGTGNNLIKRVKKILIDYII >CP019857.1|AXU87251.1|2572505_2572760_-|hypothetical-protein MENKDIKLTICIFAFVIGIIVLFCCIGLGQFNMDCIIKQNGGSIATEQYNIYLEQSISQYRNFGSILVLLGGIGILFDKSVRKY >CP019857.1|AXU87252.1|2573191_2573485_-|transposase-like-protein-B MIRNRKLSRSISDVSWSEFIRQLEYKANWHGRQIVKVGKFFASSQICNKCGYKNEEVKDLNIREWIYPSCNETHDRDINASINILKEGLRLITIQNK >CP019857.1|AXU87253.1|2574181_2574373_-|repressor MKISKLPEAELKVMRYIWESEKVLISREITKSMEQKYEWKDTTIFTVLKRLLKKRVFRSGENR >CP019857.1|AXU87254.1|2574477_2574852_-|regulatory-protein MKEEILIEKLLRAELIVMEYLWKKDTLMPKKEIVKEIKQIYGWHKSTIKILLKRLVAKRYLARYIINSQSHYKIIDSKEYYTFKKKVLKSSKSIKIMRSLTTTHKNVSKEKLDLLDEYYRNLKE >CP019857.1|AXU87255.1|2575655_2576144_+|pilin-protein MKNKKGFTLVELLVVIAIIGILAIVALPALFKNIEKAKIAKLEADISAIKSASLSYYADESKYTEGNIIWWTKKDGKITVNSGIGDEDPLAHKIENLGMPYNGSYTLVSSNGSEEYLELNIIIDGEISKSGLDKLEEDYGSSITIPNDKNMIITFLSNKSDN >CP019857.1|AXU87256.1|2577135_2577369_-|transposase-IS3/IS911-family-protein MTKYDFNFKLKVAKFYLNREGRDILIVKQYGVYNHSQVERWVNILGECALKIKKIFYTIWFKLDVINYMMITKYSVQ >CP019857.1|AXU87257.1|2577530_2577881_+|hypothetical-protein MIQKKFFMGFCGFLGFLSLRYFSSGNVADLTYIGFFAFFSNFIIAKINGDKADERYVQDEKAAMAFTGQLAIIELFILWCITIVSRNIELMCVLLSITYAITLNVYAIKLYILEEK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019857_10 | 2735581-2735738 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP019857_10
|
2 spacers
spacers of CP019857_10
>10.1|2735609|38|CP019857|PILER-CR AATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATT >10.2|2735675|38|CP019857|PILER-CR ACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGCGATGTACC |
cas3,cas5,cas7,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019857_10
The CRISPR arrays of CP019857_10 >merge|CP019857|10|2735581-2735738|PILER-CR AAATCCGATTAGTTAATTTTAAACCTAATAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATTTGAAATCCACTTAGTTAATCTTAAACATACAAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGCGATGTACCTGAAACCCACTTAGTTAATCTTAAACCT >CP019857|10|8|2735581-2735738|PILER-CR AAATCCGATTAGTTAATTTTAAACCTAA TAATAAAACTTCTATTATATCTACTATATCAATATTTG AAATCCACTTAGTTAATCTTAAACATAC AAAATCTCCAACTTATAATTATTTTCGCGATGTACCTG AAACCCACTTAGTTAATCTTAAACCT
>CP019857.1|AXU87407.1|2734491_2735439_-|50S-ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNNWIEVTIKTTTEAVEPITNILYEQGAGGAVIEDPKDFLFQKKNELDWDYVEEEVFKKNEEDDVLIKTYVSEEKNVMEFVEIIKQKVLGLKDFGIDIGEGSVSLDQVNEADWANAWKAYYKPTKVGQRVVVKPTWEDYAMQEGDLIIELDPGMAFGTGTHETTSMCIRELEKYVNKDSKVFDIGCGSGILAIAAAKLGAKEVVAVDLDEVAVKVAKENVLENKVEKSVSVMHGNLTDVIKDKADVIVANIIADIIKILAKDVQNFMKEDAIFISSGIILDKVEEVKESLIENGFEIVEVQKLGEWSAIVSKLKK >CP019857.1|AXU87406.1|2733714_2734473_-|16S-ribosomal-RNA-methyltransferase-RsmE MDRFFVEKNNINLQDKTCTIEGEDVKHISKVLRCKLGEKLEICDKNNNEYICEIMNIDKSIVNLEILEKVDINRESELKVRLYQGLPKAPKMEMILQKLTEVGVEEIILVQTKRSVVKVDDKKEDKKFERWERIIYEAAKQSKRGKIPKLRGVLSFKEALEDMKKNNVNICPYENERTVSIKHALKKCDSNIDSVGIFIGPEGGFSEEEIEQIQKNNCNVVSLGPRILRTETASVVASTIALYELSDLGGEK >CP019857.1|AXU87405.1|2732414_2733713_-|radical-SAM-superfamily-protein MKKVAFYTLGCKVNQYETEAMLELFEKDGYEQVNSEEYADVYVINTCTVTHMSDRKSRQYIRRVKKKNPDAIIAVVGCYSQVSPEEILDIEEVNLVMGTNDRRKIVEEIKKINSSKKVSTVDDIMKVKAFEEIEISQTNGKTRAFMKIQDGCDRFCTYCIIPYARGRVRSRDIDSIVDEVKKLANNGYKEVVLTGIHVASYGKDLKDRDIKLLDVIKQINQIEKIERIRLSSVEPILFTDEFVNEVLKMDKVCPHYHLSLQSGCDETLKRMNRRYTTLEYKTIVDRLRSKMPDVAITTDVIVGFPGETNEEFKKTYEFLKEIELSQMHIFKYSPRKGTPAATMENQVDPQMKHFRSEQLLNLSKVNFNKFATKFIGRELDVLFEQNIEGNKYEGLTSNYIRVVVESDKNIQGQILKVKINDVKDEYVEGILL >CP019857.1|AXU87404.1|2732021_2732372_-|histidine-triad-nucleotide-binding-protein MDCIFCKIANGEIPSTKVYEDDRVLAFNDLNPVAPYHILVVPKKHYDSLIDIPDKEMDIVSHIHVVINKIAKEKGFDQTGFRVINNCGSDGGQEVKHLHYHILAGKKLPNYEAGQN >CP019857.1|AXU87403.1|2731679_2731859_-|30S-ribosomal-protein-S21 MSEVRVRENETLDSALRRFKRQCAMSGIMSEVRKREHYDKPSVKRKKKAEAARRKNAKK >CP019857.1|AXU87402.1|2731206_2731650_-|tRNA-binding-protein MSLKQKLQEDLKSSMKNKDTVRKSVVTLIRASIKQYEVDNRVELDEDGIIDVIAKQLKQRRDALVEFEKAGREDLIKETEGEIEVLKEYLPQQLSEEELEEIVKSTISEVGATSMKDMGKIMSVIQPKVKGRADGKLINKLVKQNLQ >CP019857.1|AXU87401.1|2730598_2731096_-|sensory-protein MIISVKEIRNFLINIFIPLIIGYLSSILTMIISGTDISTYYLQLTKPSFAPPAFIFPIVWTILYILMGISSYLILRKGYNLPKVRDAIFYYGLQLVLNFIWSILFFGFGLRFTALIDIIIMILVSIIMISKFSKIDKRSGYINLIYLMWLVYAGFLNYFIWFINK >CP019857.1|AXU87400.1|2729842_2730406_-|sigma-54-modulation-protein MQIIVSGRQMKLTDGIKGYVDGKLSRLEKYLDPESEVKVTVSAKKDRQKVEVTIIPINGQIIRAEDVEDDLYAAIDIVCDKLSRQVVKYKTKVKDKVQNNKSIRFENLDFIDNSSEFDDYDYDDEEDENIVIERRKKFNVKPMSSEEAILQMELVGHNFYMFRNQDNFEINIVYKRKAGGYGLIEQD >CP019857.1|AXU87399.1|2729393_2729630_-|sporulation-protein-YqfC MLEISTDLQVNQPVITVTSNTFISIENYLSILEYEVDLIRIKTKVKTIKISGDKLSLKYITDSEIGIKGIIYNVEYVD >CP019857.1|AXU87398.1|2728037_2729381_-|stage-IV-sporulation-protein MISFIRGYYVIVVEGVRLEQFLNHLIRNGISVYNVTRIKNTKMEFHIDRQDIKEFKNVYRGSKFDIKVKQKTGVPFIIKRVYKHKGMWICALVSLFLLMSTSQFVTDVYIQSPEGIKKEALRNELYKVGVRPGVYKKSIDRKEVRDHMMSKFNDVAYLSINVKGTNIFVTVTKKAESLKSTDQSNYCNVIALKNGIIEKVIPRSGKSVIKSGDIVQKGDVLLNGANTKSIPEVWASTFYESTKKESYVDTVNKKTGEKKNIYTLSFYDKEFTMRKNIKYKDYVVENKEKKLSIGNYTFPIKIKTSTFYETKKVEVKRNKEELKKELSEKALKELEYIIPASARIIDVKHNFKVNKNMLEYLITVQTSENIAKIYPLSKSEAERFIKEESKPDEGEEEVPSNPEKRPLNDIRNEFDEDNKDNKDQNNSDENNSNQNSNNSQNNNSNNN >CP019857.1|AXU87408.1|2735880_2738289_-|ATP-dependent-helicase MKNIMQKEILAKSYNLRTNQQEQTLVEHIKDLFEVLESILELNLYSDKDVEILKICCALHDLGKINSIMQQKMEINNKISYSCSEEERKKLESDKKSLKKIARHNIFSGAFLKNILEKMNLSEEDKLYIYKSIMLHHGNYEDYMRLSTSKVQKEIYDYIEKGILEKEDFNLEDIEDYIKEILYVDFKFNEDVLDYDYIDKLSESMVIYSDYNNGQIEDSVLNYRKFKYILYKGMLNLIDHSASSRQKGIKFYNDFTDEEIDNMILNEIYKSQGNLEKNNIEFNTIQKRLRELSGRNVLTVAFTGSGKTAADYRKTFKRKFFLVPNKISAESFYRKNIFQNKNDLDTRSSNDYIGLLHGDINLYSENEDNGEHDFVLTLRDIDLSINFCKPCVIATVDQLLLSMFKFPGYEKIFAAVKNASITVDEVHLLEPKMFLILIYFMQFACKYLDVDFHLMTATLPKSYKEQMINKGIIFQEESNENVTDKGEIVFIESNKEEEICEGKDVKVSFIKEKEIKSIVEDALENKQKILIIKNTIDSVNRTYEFLKENLSDKYGGVDIDVLHSRFKFKDKKEKYSKILNGEGDIWISTQSVEISLDLDFNIIISDLATMDSLIQRMGRCNRNNKYEYGNFYILPSEDKIYDNKLKSTTKNILKDILKTNSIFTMGIRKTILDDYYDNSVVKKYFEENFISCDKEIKNIYGVNKEIFDGLDLIFNFEPYKNIVDSKKEAAKIFRDVDVSYKIILEEDFYKEDRELQQDSIQVSGFIFNRLYYYGLISKVEGYMVLKSSSKFEYNSTVGLILK >CP019857.1|AXU87409.1|2738315_2739113_-|CRISPR-associated-protein,-Cas5t-family MKVLQCKLKQPTAHYRDPKVFQNEYISTLNLPSKTTIMGMITYLCDRRLNSDIDIGIIGTHHHRELEFSRGENIDFWNEYTNMRKGKDKEKFLLQGNYYDYYKEHKAQNSILNYEVLKEVELTIFISCKDDEELEFIRKKLESPCKYANLGRKEDFVIPSEKGCFVKEVALKEVIPMNTRDAIKENIKLKNTYVRVDLRDKENVETIINQGVLIALPHKYKDLEANRDDRVYEFCHYIYVDNDGIYPKNIKVNVCIDTKEVFTWL >CP019857.1|AXU87410.1|2739128_2740142_-|CRISPR-associated-autoregulator,-Cst2-family MNEKRVKGVTLTILTESPVPLSYDQGYGNYTPIKKEQYREKIHAKTSIATITYDLRRMLHQEYGWNLSNIVFGKKGNIYPSIKKNVGCVDENGLETDVFGYLIPLKDKGSISKASPLRIIPFRSLNPYKGSTQLITNRGFLSSEFGRKYYDEKEENEVPRDENFPTSQALAIEETLSDYYVYTITLELDRIGVVEVEDGKLLLPEERKFMSKELREKAVKDILDAITVFTRNIKHSSVLLKPLAVMGGAFDKVVPFFWDDVDYNADSGEINLEGVIETIESYSLKESNTILAINDRLKISNKKELNKFNLSKYPVKEIKNLADRLEIGEDNMWYLKE >CP019857.1|AXU87411.1|2740161_2741637_-|hypothetical-protein MREIKAKFYRSGDIVRDIGIVYFYELLMDLKNELEKNDYKLKFTCELNRNYLSLESAEYIDPKYISDYILENQLFKVFKNGKKETLEKIFSNIDNLTYVNFIEELDKSSATAKQKEDIKKDFKNRRFPYVRNSGKYGLNTSLENMETNVKRIVDTVIKSNIEIDEIDKLDLTQYEEKDSVCNVCNINKTTKLDIDLRERKDSKYNFLFRGAEKSGFKRSGQVESNICFECEFFNLMCLLYINLKRPMVFAYTNDLRELAFLNHKIMLKRKMYSDKSFYKKLLHEKISSIRLYRFDIVKNKGIILKFDSIIEYKELLKKIELIDIIDNYNFSREPVNTKNLGKKMIDNGNLSNLKELLLDNISFLKQSTGTSREMDFVSSSYNIGLYIKLCWIVDGGEEYKMKNYMESNLIYSRVGKDLFNKMTDESRRKNFSMKVIQLLKSNDRTQLFQTIMHVLVSNGILIGEGFVEGLMQSSELELNTNVGLFIQEIMK >CP019857.1|AXU87412.1|2741641_2742379_-|CRISPR-associated-Cas-family-protein MSRISIFMESCNGKFPNENSMLSVSFIKNILNAENKDFAKNIFNYGEERKNNKQIKDINTAIYIPNLIRSKNELLVDGDIIFNISFYNYSMFSKLYNGILKVKELEYKGYRFKIKNIKIHKEHEIKENGVIFKTMSPIIVKNKEGKYLDVEDSNYIECLNYIANLTLESVRGSGLRKPLEFIPLNFKKRVLKEKIRGFKVREFYYINAYAGTFFLKGDMEDLNALYKMGIGYRRTENAGMVDILK >CP019857.1|AXU87413.1|2742636_2743746_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSEVILKNISKLYSNGFNAVKNINIDIKDKEFIVLVGPSGCGKSTTLRMIAGLEEISEGELYIGDKLVNDIEPKDRDIAMVFQNYALYPHLSVYENMAFALKLRKLPKDEIDKKVKEAAKILDLLPLLNKKPKTLSGGQRQRVALGRAIVRNPKVFLMDEPLSNLDAKLRTAMRTEITKLHQQLGTTFIYVTHDQVEAMTMADRIVVMKDGVVQQIATPQDVYDYPANIFVAGFIGAPQMNFIDVILIEENDEIYAQNEHIKLKLNKEKHYDLIKDNYINNEVVIGIRPEDIHVEDTFIKSNPDTCFKSRIEIKELMGAETYAHLKLGENTITIRFDSKNRINVGDDLTLSVDNSRVHIFDKETTLAIR >CP019857.1|AXU87414.1|2743775_2744543_+|sugar-diacid-utilization-regulator MEELKDFLERQLNKKINIYPYENQKLDASSHLVTFNNAIYVIDFLDKNNLDNLKGNFYLIYQSHIDFEYLKNIFYNLFEDINIIQHNGFFIVNSKYNLDINVTTQNIIETETYQSTYIFYLGKLDSKADFDFRLQLCSDLLPHIIKDNAENKFLNLFDLIRYKTLDLINEDNILNKLIDFNKIKSIDEELLYTGIKFINNDLNISKTSTSMFLHRNTLVYRLEKINEILGFDLKNFENAMIFYLSVKSYFLYKKI >CP019857.1|AXU87415.1|2744730_2746104_-|transporter MGKTNARRTLFLIAIGSGTMLNPLNSSMISLALHSIQNDFHISFTTVSWIVSAFYLANAIAQPVSGKIGDLIGRKVLFLSGLMLVILSASIVPLVQSFFILIFIRVIQAIGTSTLYPSGVALIQNNIKERQSSALAVLTIFASTTAGLGPTLGGLLLDLGGWHAIFLVNIPVVLVSICLGYFLFPKEVKEKKSIKETLKNVLSRLDIIGILLFSIAMIFILLFLLSMKESFNLEQLVFGIILMCLFIWHELRTKLPFIDIKLFVSNPKLSKVYLQFIILNFFNYILFFGLPSYFQDALHYSAKSTGLFMLFMSGIGIFISPLTGKWIDKSGTRFPLVTSSIFMFISAVLLSVVFIHIPVIGKGIILSLAGISYGVGNVALQSSMFEESPRDSIGTASGLFQTSRYLGSILATVLLGMVFEVNITSEQFQILGYVMVVLGTISFLLNFILKKELRKVE >CP019857.1|AXU87416.1|2746139_2747075_-|glucokinase MYYIGVDIGGTGIQAGVVDNYGKIIFRSECKTVIEKGFEGILNDIKIMIYKLLEDNKLTMSDIKSIGFGVPGFINKEGLVTCVNLKWNKKAFNKELKRRFPDVEIHGENDATVAALGEAKFGSMKGANVGVLYTLGTGVGGGIVINQKVFSGAHGLGSEIGHQIIGENYFNCNCGNNGCVETFCSATAIIKYSQKLIEEGEKSRILDLAEGNLENVNAKMVFDAYRENDLVAIKVINRFKEYLAKTFANTINSLDPEIISIGGGISKSSDIILDGIEDLVRKFVLYKTEDIATITCATLGSDAGIIGAAFL >CP019857.1|AXU87417.1|2748040_2749195_-|chaperone-protein MSTKRDYYEVLGISKGAEAQEIKKAYRKLAMKYHPDRNPGDKEAEEKFKEINEAYEVLSDDTKRKTYDQFGHDGLNGQGGFGGQGGFGGQGFGGFEDMFGDIFGDMFGGSFGGGRARRRGPQRGADIRQSVTISFEEAAFGKKMSIKVNRSEECEECNGTGAKPGTSKKTCSTCNGTGQVRTVQRTPFGNIASSRPCSACNGTGEVIESPCSKCHGTGNTRKVKTIEVDIPAGIDDGQMIKLSGQGEVGEKGAPRGDLYIVVNVKSHPLFTRDGNDIYFEMPITFVQATLGDEIEVPTLDGKVKYSVPEGTQTGTVFRLKEKGIPRIRGNSRGDQYVKVVVEIPKKLNDKQKELLREFAKECGSNVHEKKKTFGQKIEDMFKKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019857_11 | 2817029-2817524 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of CP019857_11
|
7 spacers
spacers of CP019857_11
>11.1|2817058|39|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTGTTTATTGTGATAGTGCCGAACAGGTGTTAATACG >11.2|2817126|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTAATTTAATAGCTTTATTTTTAGCAAAATACCCAA >11.3|2817192|39|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGGTTCCCTCCGAAGTTCATAGAGATTCTTATCAGCATG >11.4|2817260|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATGCTGAAAGATAATTCGGTTGGGGATTTAATGAA >11.5|2817326|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAATAGAGCAGATGAGGCTTTTCAAGAAGCCGATAG >11.6|2817392|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTGATGTTGTGAGATTTGAAAAAAACGGTAAATTGA >11.7|2817458|38|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTGATAAAGTTATTAAAAGTAAAATTGCTGAAATACT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019857_11
The CRISPR arrays of CP019857_11 >merge|CP019857|11|2817029-2817524|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTTGTGTTTATTGTGATAGTGCCGAACAGGTGTTAATACGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAGCTCTAATTTAATAGCTTTATTTTTAGCAAAATACCCAAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACCGGTTCCCTCCGAAGTTCATAGAGATTCTTATCAGCATGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACAAATGCTGAAAGATAATTCGGTTGGGGATTTAATGAAATTTACATTCCATATAGTTAATGTAAAACTAAATAGAGCAGATGAGGCTTTTCAAGAAGCCGATAGATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACTCTGATGTTGTGAGATTTGAAAAAAACGGTAAATTGAATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAACGCTGATAAAGTTATTAAAAGTAAAATTGCTGAAATACTATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP019857|11|9|2817029-2817524|PILER-CR ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTGTGTTTATTGTGATAGTGCCGAACAGGTGTTAATACG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAGC TCTAATTTAATAGCTTTATTTTTAGCAAAATACCCAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CGGTTCCCTCCGAAGTTCATAGAGATTCTTATCAGCATG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AAATGCTGAAAGATAATTCGGTTGGGGATTTAATGAA ATTTACATTCCATATAGTTAATGTAAAAC TAAATAGAGCAGATGAGGCTTTTCAAGAAGCCGATAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCTGATGTTGTGAGATTTGAAAAAAACGGTAAATTGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GCTGATAAAGTTATTAAAAGTAAAATTGCTGAAATACT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP019857|11|10|2817029-2817524|CRISPRCasFinder ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTGTGTTTATTGTGATAGTGCCGAACAGGTGTTAATACG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAGC TCTAATTTAATAGCTTTATTTTTAGCAAAATACCCAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CGGTTCCCTCCGAAGTTCATAGAGATTCTTATCAGCATG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AAATGCTGAAAGATAATTCGGTTGGGGATTTAATGAA ATTTACATTCCATATAGTTAATGTAAAAC TAAATAGAGCAGATGAGGCTTTTCAAGAAGCCGATAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCTGATGTTGTGAGATTTGAAAAAAACGGTAAATTGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GCTGATAAAGTTATTAAAAGTAAAATTGCTGAAATACT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC >CP019857|11|7|2817029-2817524|CRT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TTGTGTTTATTGTGATAGTGCCGAACAGGTGTTAATACG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAGC TCTAATTTAATAGCTTTATTTTTAGCAAAATACCCAA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC CGGTTCCCTCCGAAGTTCATAGAGATTCTTATCAGCATG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC AAATGCTGAAAGATAATTCGGTTGGGGATTTAATGAA ATTTACATTCCATATAGTTAATGTAAAAC TAAATAGAGCAGATGAGGCTTTTCAAGAAGCCGATAG ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC TCTGATGTTGTGAGATTTGAAAAAAACGGTAAATTGA ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC GCTGATAAAGTTATTAAAAGTAAAATTGCTGAAATACT ATTTACATTCCATATAGTTAATATAAAAC
>CP019857.1|AXU87473.1|2816465_2816564_-|regulatory-protein MLNKKLPDAELKIMKYIWNTGYKTVISKDVAD >CP019857.1|AXU87472.1|2814996_2815992_+|L-asparaginase MSIKKKVAIVFTGGTISMTVDDKVGAAIPTLSGEQILSMVTNIDKVADVEVFNFDEIPGPHITPYRMMELKNYVNDLLARKDITGVVITHGTDSLEETAYFLDLTIDNIKPVIVTGAMRSSSELGYDGSSNLSASVCTAVSKDAMGKGVLVVLNNEVLLASEATKTNTLSLNTFKSLTSGPLGIIDCNELVLTRDIVNRTIIDTDKVESKVALFKAYVGENADFIRFAVDSGYKGIVIEAMGRGNIPPQMLSGVEYAREKGLPVVIVSRCHSGRVFDSYGYFGSGRDLKNLGCIFGGDLPGQKARIKLILALGKTDNLDEIKDFFEKGIYC >CP019857.1|AXU87471.1|2813247_2814876_+|aspartate-aminotransferase MKNHTYKEIKNIYGKISPFEFKDKLIDIAKYTAKENNRELLDAGRGNPNWTCSTAREAFFTFGHFAITETRSNWDLGHLAGMPQKKGIKERFFKFINENIDMPGAYLARDIINFGINELGFDGDEFVHELADGIIGDNYPLPDRMLPHMEKIVHDYLVQEMKYDISGKYGDVEIFAVEGATAAMCYIFDSLMANELLKKGDTIALMTPIFTPYLEIPNLPRYDFKVVNINANEVDEKGAHTWQYTKKELEKLRDKSIKALFVVNPNNPASIAMDETSCNNLIDVIENYNKDLMIISDDVYGTFVEDFSSLMSKLPYNTVGVYSYSKYFGVTGWRLGTFALHKKNVFDKKINDLTGELKKSVDKRYSDMSLNPSSLSFMERVVADSRLVALNHTAGLSTPQQVQMAFFSAFALIDKVDAYKKLNMSICHRRQKLLFEALELPINENKNNAAYYTQFDIEEWAKLNYGEGLFKFISKNASPVDVLYKLANDYSVVLLSGNGFYGPEWSIRISLANLYDEAYTKIGKAIREILNGYIVEWQKIKK >CP019857.1|AXU87470.1|2811371_2812589_-|threonine-dehydratase-catabolic MMNVTLTDVKEARETIKNIVKRTDLLESVKLSEKTGANVFYKCENLQKTGSFKLRGACNKIASLTDEEKANGVIASSAGNHAQGVALGAKMTGIKSTIVMPATAPLAKVSATKGYGAEVVLNGAVYDDAYAKAVEIQKETGATFLHPFNDKYVIAGQGTISLEIFEQLDNKVDTILCPVGGGGIISGVAVAAKALNPNVKIVGVQTANIPSMKESIKNGKVTTAFNDTTIADGIAVKTPGDLTFEIINELVDEIVVVEETEIAESILFMMESQKIVSEGAGAVCTAAILSGKYVPAKDENVVCIISGGNIDINTLYRIIGVALAKEGRRYSFSTIMEDKPGNFAELTRIISENGGNILSANQGKLSAGEALGKQSAEFILETIDYDHIARIKKAIEEKGFKIIEL >CP019857.1|AXU87469.1|2810896_2811277_-|translation-inhibitor-endoribonuclease MKHEVIHTNDAPAALGPYSQAIKAGNLLFVSGQVPLVPETMEVVEGDVQAQTAQSLKNLKAILAESGADFSNVVKTTVFIKDMNEFGAINEVYAEYFGENKPARACVEVARLPKDVKVEIEVIAVL >CP019857.1|AXU87468.1|2810130_2810613_-|PTS-system-transporter-subunit-IIA MLNFFKKNKSYKLHAVVSGNSINIEKVNDSVFSKKLMGDGVAIIPNSDVVVAPCNGKVTVLTESKHAFGMVSDEGVEILVHIGIDTVSLQGEGFKNEVSQGDTVKKGSPIISFEREKINSQGIDCTTIIIVLNHSEFSEINCMVENEVVAGQDTVIEIMK >CP019857.1|AXU87467.1|2809294_2810110_-|transcriptional-antiterminator MRVVKIFNNNALSTVTNDRKEAILLGLGIGFNKRPGDKVNEDKIEKIYYVQDHMQTKFLELLKNVSPEVMDASQQIISLIPGNEGKFNNKGILSLVEHISFAIDRMKNNVFLPNLMLLDIKMMYSKEFELGVKALEIIYRVCHIHLPEDEAGYIALHFVNLQSNDNLAYDTLKFVKGSIDLIKECYGLELDESSLSTLRFRTHLKFLAQRIFKNEICQDDKMIEMYDYLINNHPKNKEYLEKLNVYIEKEFRYKLDKPEKIYLLLHLTKIL >CP019857.1|AXU87466.1|2807691_2809242_-|PTS-system-transporter-subunit-IIBC MKEKLLGGLETFAKAMVQPLMYLSSAGILMVVGVLLTNDMLLGVLPFFKWEPIQIFGSLIYNCIMAIINNLAVIFAIGIPAALAKKEKHKAALIGFMSYIIYLTASNTMLTSLGQLAKESKMLGLIGTGQATILGIQVVDTSVFGGIILGCIAGYVFNRTSNKTFKGALQIYSGANFSFICMFFVSILIGVVSNFIWPLAQQGIASLANVIKDTGTFGLFLYGFLERILVPTGLHHLIYTPFQFSDLGGVLKVGADTVSGAYAIVMTEMNLPVERFSDSIYYMATGFTKMFGYIGIGAAFIYTAYKQNKKKVKATIIPLIITAVLASVTEPLDFMFVFCAPLLFFVHAVIAGLFIALLKIFDVTALCGGNLLVSIIMNTTVGVEKTHWPVMMILGLAQIIVYFVVFSFLIKKFNYKTPGREDESTATGEEQSKQLNLDAGIENIIDGLGGKENINTVENCITRLRVNVKDESKINEDIINLTPNSGIVRKGKDIQIIFGLHVHEVRRAVEDFLEAY >CP019857.1|AXU87465.1|2806242_2807595_-|6-phospho-alpha-glucosidase MIITIVGGGSTFTPGIVKSIALREKELELEEIRLFDIDKKRQDKVAVVVNWILKEDVKTDVKLTVTNCEKEAYTDATFIFAQMRVGKYEMREQDEKIPLKYGCVGQETCGCGGMAYGLRTIQPMIKVIDDVEKYAKKDYWILNYSNPAAIVSEACRKLRPNARIINICDMPIAIIDMIAGSLNINDVHNIRYDYFGLNHFGWFTSIDYKHRDLMEEIKEYIKENKILLPKSYIENLNKSRSTGNRHAVSSWIHVWESVYTMLESFPKYLPNTYLTYYLLSKETVEHSNINRTRANEVMESREKDLFEGVRHYLETGEISEKAFYAGLHGDWISDLAVSIKNDTRSRFLVITENRGAIPNMPYDAMVEIPAYIGKDGPEVIARGPIPLFQQGLMMQQLNSEKLIVEAYIENSYEKALQAFTLNKTIPSMNVAKEILDEMIEVNKEYWPELR >CP019857.1|AXU87464.1|2805353_2806067_-|AraC-family-transcription-regulator MITNNLEADTHSHCMLQLFLGIEDSIEITVNEKLVKCNCIIVDKNISHSFSARKKVYYSAIIEPTSIYAEQLTSKMNDFGYWICDNNGLEKLRQQGTFLIDNSSKEQYLRFMEMLNNYLNIPITLKHYDDRITELLNLLRTCNCDNHTISSFADKVSLSASRLSHLFKEQIGIPLKSYILFHQMECAFRELLSGKNVTEASMTAGFDTPSHFAGTVKRMMGMPVSLSLKDSEFLKVY >CP019857.1|AXU87474.1|2817809_2817968_-|hypothetical-protein MDNFLQGILASLSASLIVYIASKLFRKRKKPLKAATKSGWEFDLKIRFHKTK >CP019857.1|AXU87475.1|2818326_2819697_-|cell-surface-protein MKLKKLLSLGLAVSMFAAGPISANALDTIYTIQGKDKYETAALIADEQNYTTAILINADSTMADGLSASGLAGATNAPIFLTKKNNIPNATLKRVEKAKKVYIIGGESSIDKATETLLKDKGIEAKRLQGSDRIKTSYNVAKEINSINKVNKVILTNAFKGEPDAMSAAPVAVRDKAAIVLTDGKSVPFNTTGVESYVIGGTSSMSDKLVNDTNSTRLGGVDRYDTNKKIVNKFYNGAKEFYIASGTDLVYALVASPMAKNNPIVLVDIGSNKDILKNAAKVTGIGNLSDKIMLECENTINNISLPSSNKNIICGLKIDFDSKHIIWQDKGSYLECYDDNLEYYTEKYKDPTVPINIENTSTQNLDVTKLKVYGEANSTLYMGQYAKIKMDFNSFGVLKPGEKCTIYLDIISLDPSRSMTLTFSYVGDKENYKYEQGLASRILFYNPDGEDFFEYK >CP019857.1|AXU87476.1|2821503_2822172_-|vanZF-protein METVTNNQSGVEIQLSLFEAIKDLLLINPIFLLGIILIGIFLVVIFKKNSDIPKVKTSILSLAMYYYLCLTLSHIVGIPTFGEYIRLSQLGETFFNPNINLIPFSDGFSLSFILNILLFVPLGFLCPLISKTFERLRNTFLIGFGLSLFIETIQLFTLHRATDIDDLLTNVIGTIIGYFCFKLIAKLRIVKLHSDDDSMEQDYTVCIPIAIIIVALILGFFS >CP019857.1|AXU87477.1|2823007_2825428_-|leucyl-tRNA-synthetase MSVYNFKEVESKWQKIWKDNNQYKMDTAQTEKPNYYTLEMFPYPSGKIHMGHVRNYSIGDVVARFKKMEGYNVLHPMGWDSFGLPAENAAIKHGIHPHKWTMENIEEMKEQLNLLGISYDWDKEVATSTPEYYRFTQEIFLKFLEHGLAYKKKSYVNWCPSCETVLANEQVVQGACERCKATVLKKDLEQWYFKTTEFAEELLNDLDTLDGWPEKVKTMQKNWIGKSTGADLVFDIDGTDKSMTVFTTRPDTTYGVTYMVLAPEHELVKELVAGTEYEADVETFVQKMHTMTEIERTAADVEKEGMFIGRYVINPLNGKKVPLWIANYVLVEYGTGAIMAVPAHDERDRDFAEKYNLDIIDVITEDNKMINSEEFNGLDASEGFEGIIDKLEKEGRGKRTINYRLRDWLVSRQRYWGCPIPVVYCDECGIVPVKKEDLPVLLPTDVEFTGKGESPLTTSKQFMSTTCPHCGKPARREVDTMDTFVDSSWYFLRYVDSNNENEPFSKELVNRWHPVDQYIGGVEHAIMHLLYARWFVKAFKSMGMVDFNEPFKNLLTQGMVLMDGSKMSKSKGNTVSPMDIIDEYGADTARLFVLFAAPPERDLDWSEQGVDGCFRFLNRVYRLVDELADVVKKDVEFGELNSQDKDMRYTIHSTLKKVTADLSEKFGFNTAISALMELINDMYKYKELDNINEAVIKEGVQTIVTIIAPFAPHLGEELWTMIGKEGSVFDIDWPKYDEKALVKDEIEVVVQVNGKVRGKLTVNSNISKDEMEKVALEDEKIKGLVEGKTIVKVVAVPKKLVNIVVK >CP019857.1|AXU87478.1|2825781_2826132_-|iojap-family-protein MTVEQMTKIAYDAIEDKLGQDTVIINIGKVSSLCDYFIITTASSQRQVKAIADNVEDELAKLGLEPRGKEGQGTQTWVLLDYGDIMVHVFNEENRGFYNLEKLWKDAPYIDIDTLA >CP019857.1|AXU87479.1|2826248_2826821_-|metal-dependent-phosphohydrolase MNLENINQRLNQMLPVGRLSHSKNVAKCAEKLCEIYGCDKEKAYLAGMIHDCAKYLSDKEIEDYVNKYEIYLDPIEDGNRSLSHSVIGAYICEYEFEVEDEDIINAIKYHTTGREDMSLLEKIIYIADLIEEGRKFPVVDTLRELAYGGKLDEALLTSFNNTLMFVINKKEEIHPRTVMARNYLIKEKLL >CP019857.1|AXU87480.1|2826821_2827511_-|nicotinate-nucleotide-adenylyltransferase MRSENLVKMAELKNTEKLEKFNRHKGKIKIGILGGTFDPIHYAHLATAEFIRDKYDIDKIIFIPSGNPPHKLCITTDKYDRYNMTLLATESNEDFLVSKVEIERKKRTYTIDTLKYLKKKYKNADIYFITGADAICSVEEWKDVKKNFELATFIAATRPGISLLRSQETIEKLTKKYNADIITVYVPSLDISSTYIREQLNEGKSIRYLVPENVENYLYENKLYQYGDD >CP019857.1|AXU87481.1|2827786_2828425_+|recombination-regulator-RecX MGIITKIEQQKRNDDRVNIYVDDKFFIAIFKELVYTFNLKKGNEINEEELKPILDDEMYIKAKNKALNILSHADQSEKKLKEKLSSEFDENIIERVIDFLKSYNLVNDSVLAQKIVNTNVNLNKCGKNRIKQNLYNKGINRSTINEAVSELDKDTEFENAMYLAKKRYERVKKEDKKKIYQKISQHLSYKGFDYDIIKRVLNKLLNFDEYDI >CP019857.1|AXU87482.1|2828577_2830581_+|glycogen-branching-protein MKSQKRFKILDIDVYLQPFESDIKKRMKHYEDMKSKTLKNYKDFSSFANAHLYYGFHQTNDGFFYREWAPNADSLSLIGDFNNWNRKSHPLRKIGSGNWEIFIPGQNSLPHKSEVKVQVTANGKTFDRIPLYIKRVIQKDFGGFNGQIWQPKTPFIWTDNNFDLKNITSPLIYECHIGMSTESESIGTYNEFTEKILPKIKKAGYNTIQLMAIMEHPYYASFGYQVSNFYAISSRFGTPEDLKNLINTAHSMGIAVLLDLVHSHAVKNTLEGINEFDGSEHQFFHSGSKGNHPAWGTKLFNYGKPEVIHFLLSNIKFWLNEYHFDGFRFDGVTSMLYHNHGLGVSFDSYEKYFSMNTDIEAITYLQFANELIKEIKPNSISIAEDMSGMPGMCIPIKDGGIGFDYRLAMGVPDFWIKTISNLSDEDWDLGKMWYELTTRRPGEKNIGYCESHDQALVGDKTIIFWLADKEMYWNMEINSNNHVINRAISLIKLIKLITFSLAGEGYLNFMGNEFGHPEWIDFPREGNNWSYKYARRQWSLSEDNNLKYKQLLNFDKSMLELTKYSDIFIQNSHELIHMDNDKKILVYSKGKYLFIFNFHPNLIQSVDISKFQNTNYKTILNTDMVEFGGNTKKENLRDYDVYFNSTPPSSKMPIASRTAIVLLDNGI >CP019857.1|AXU87483.1|2830754_2831396_+|TetR-family-transcriptional-regulator MGRKKEPDNTIQKILDISHKLFLEKGYEQTTIQDIVDNLDGLSRGAIYHHFKSKDEIIKAITSRLYNDGFYGYEVKNDEGKTALEKLQYRLLHAYEQHNKQDIFLMSSSLLRNPKYLATQFDEIINDIVPWIKALIEEGNQDNSMEVKNPEIAAQMFGFLLNTWCIPTVYPGNPQQMIERFTLFGEQAAFMGISFMNDKIMCEYQKFVNKFSK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019857_16 | 3314685-3315427 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of CP019857_16
|
11 spacers
spacers of CP019857_16
>16.1|3314714|35|CP019857|CRISPRCasFinder,CRT GGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTGATTCTACAA >16.2|3314778|35|CP019857|CRT AAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTC >16.3|3314842|37|CP019857|CRT CTGACACTGTGCCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCT >16.4|3314908|35|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTTGTTAGATAAATCATATGCTTTAGTTGCTTTAG >16.5|3314972|36|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACTTCGAAATTGCAGTTTTCAGCATGTTATTGCGCA >16.6|3315037|37|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAATTCGAGGTCTTGATTTTGAAGTTTTTGGTTATGC >16.7|3315103|34|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GGTTTCTACCAATCAAATCACGCATAATTATAGA >16.8|3315166|37|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AATCATTTTGTATGATTGTTCCATTTTTTTTGAAAAC >16.9|3315232|36|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTCTGTGACTCCATATTTTTTTGCAATATATAATTC >16.10|3315297|37|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CATTTGTAAATCTTTATGATTATGTAATATATTCATA >16.11|3315363|36|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTTTGAATGTTGAAGATTTTGTTAATGCAGGGAAA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019857_16
The CRISPR arrays of CP019857_16 >merge|CP019857|16|3314685-3315427|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGTGGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTGATTCTACAATTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAATAAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCTACTTATCTACCCTTAGTTGATATAAAACCTGACACTGTGCCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTTGTTAGATAAATCATATGCTTTAGTTGCTTTAGATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACACTTCGAAATTGCAGTTTTCAGCATGTTATTGCGCAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAATTCGAGGTCTTGATTTTGAAGTTTTTGGTTATGCATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGGTTTCTACCAATCAAATCACGCATAATTATAGAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAATCATTTTGTATGATTGTTCCATTTTTTTTGAAAACATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCTCTGTGACTCCATATTTTTTTGCAATATATAATTCATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCATTTGTAAATCTTTATGATTATGTAATATATTCATAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTTTTGAATGTTGAAGATTTTGTTAATGCAGGGAAAATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC >CP019857|16|15|3314685-3314778|CRISPRCasFinder ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGT GGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTGATTCTACAA TTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAATAAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCTACTTATCTACCCTTAGTTGATATAAAACCTGACACTGTGCCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTTGTTAGATAAATCATATGCTTTAGTTGCTTTAG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ACTTCGAAATTGCAGTTTTCAGCATGTTATTGCGCA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AAATTCGAGGTCTTGATTTTGAAGTTTTTGGTTATGC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GGTTTCTACCAATCAAATCACGCATAATTATAGA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AATCATTTTGTATGATTGTTCCATTTTTTTTGAAAAC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CTCTGTGACTCCATATTTTTTTGCAATATATAATTC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CATTTGTAAATCTTTATGATTATGTAATATATTCATA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTTTTGAATGTTGAAGATTTTGTTAATGCAGGGAAA >CP019857|16|8|3314685-3315427|CRT ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGT GGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTGATTCTACAA TTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAAT AAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTC TACTTATCTACCCTTAGTTGATATAAAAC CTGACACTGTGCCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCT ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTTGTTAGATAAATCATATGCTTTAGTTGCTTTAG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ACTTCGAAATTGCAGTTTTCAGCATGTTATTGCGCA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AAATTCGAGGTCTTGATTTTGAAGTTTTTGGTTATGC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GGTTTCTACCAATCAAATCACGCATAATTATAGA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AATCATTTTGTATGATTGTTCCATTTTTTTTGAAAAC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CTCTGTGACTCCATATTTTTTTGCAATATATAATTC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CATTTGTAAATCTTTATGATTATGTAATATATTCATA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTTTTGAATGTTGAAGATTTTGTTAATGCAGGGAAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC >CP019857|16|10|3314879-3315427|PILER-CR ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTTGTTAGATAAATCATATGCTTTAGTTGCTTTAG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ACTTCGAAATTGCAGTTTTCAGCATGTTATTGCGCA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AAATTCGAGGTCTTGATTTTGAAGTTTTTGGTTATGC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GGTTTCTACCAATCAAATCACGCATAATTATAGA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AATCATTTTGTATGATTGTTCCATTTTTTTTGAAAAC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CTCTGTGACTCCATATTTTTTTGCAATATATAATTC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CATTTGTAAATCTTTATGATTATGTAATATATTCATA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTTTTGAATGTTGAAGATTTTGTTAATGCAGGGAAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC >CP019857|16|16|3314879-3315427|CRISPRCasFinder GGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTGATTCTACAA TTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAATAAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCTACTTATCTACCCTTAGTTGATATAAAACCTGACACTGTGCCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCTATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GTTGTTAGATAAATCATATGCTTTAGTTGCTTTAG ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC ACTTCGAAATTGCAGTTTTCAGCATGTTATTGCGCA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AAATTCGAGGTCTTGATTTTGAAGTTTTTGGTTATGC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC GGTTTCTACCAATCAAATCACGCATAATTATAGA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC AATCATTTTGTATGATTGTTCCATTTTTTTTGAAAAC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CTCTGTGACTCCATATTTTTTTGCAATATATAATTC ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC CATTTGTAAATCTTTATGATTATGTAATATATTCATA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC TTTTTGAATGTTGAAGATTTTGTTAATGCAGGGAAA ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC
>CP019857.1|AXU87870.1|3314195_3314624_-|acetyltransferase MIKKLNNKDINKIMEIWEKSTIKAHDFISKEYWQNNYNTVKNEYIPISDTFVYDDGDEIKGFISIIDKSFIGALFIKPKYQNLGIGGKLLDYATKKYKSLSLAVYKDNKKAVVFYNKKGFNIVKEQVNEDSGFKEYIMEYSK >CP019857.1|AXU87869.1|3312961_3313741_+|hypothetical-protein MKVNENNINNIDEELDELSRKVYLESPDFWISISDKIIDKVFDEMLLFFAVKYNYFNIVCFAIENNYLDLNMPSKNKKYTNIMEHLLDTSKQNEDKKIYNYLLSLNKGNNLDERPILDELNCNISSDTFEKKDIYLPKYLCPSCNSNIFDTGYKVSNDITYKFSSKEAEPIEMCSEVSSIRCCNCDELLEDITLDKLYNLCKIQNCNNCGSNLTKVGIIAKKKMNFDENTEKFKDVSTSYCCGNCDSEINLSQREHFKI >CP019857.1|AXU87868.1|3312092_3312638_-|biotin-synthase MKNTKVNIQDLTKMSICVALLCISSYIYIPLPFTPAGVTAQTIMINLIALILTPRQAFSTVGVYIMIGLIGIPVFGGGTSGIGKLLSPTGGFYFGFLFAALIISLLKGRNNDIKRYILITIFVGMPIIYFMGTVFMCYFNQMTVEAALFAAVVPFLIGDTIKSVIASFLGTKLNNVLRRNL >CP019857.1|AXU87867.1|3310924_3312061_-|thiolase MKEVFILGGLRSHIGLKNGIFQFVQPELLGASVLKDLIKKYEIDKIDEIICGNAVGTGGNIARLMTLTAGVSNEVPAFTVDMQCASAMMSIDIAFSKVKSGQCDLIIAGGFESSSLQPMRTYHKNDKRYNTNNPNYTVAQFSPDDNSQNSMLEGAERVAELYQIEKADLDFWVKESHKRAKEAREEKILEDIISPINNSTYDEGIRDKMSQRLLDRMPSILGKETITNAANSCLINDGASFIIICSKKYLEHVKKKPKAKIINTCTIGTDATLSPTSAIQAMDKLLEIESLNYLDVSAVEFNEAFAVIDVLFQRKYPELIDRYNIFGGALAYGHPYGASGAIIALHLLKALEETKGRYGICSIAAAGGLGSALLLERV >CP019857.1|AXU87866.1|3309529_3310921_-|AMP-binding-protein MNYYELLRIKKERHKNKNFLIIDGEKYTYENLLSYSEELGKQISLGENIPILIYSKNIMFQLISFFAINYSKNIPIICHYNLSKKVLDDILLKNNISIIISDESMDVIDLYDDNNNEVAKKVNFSIFNPKFNIYMYQYKKLINYLDKSICMGALSSGSTSVPKVLYRTYESWAGFFPIQNGIFNISGESILFVNGTLSFTGNLNSIMSVLYEGGSIVISSGLNCKSWIRTIKQYNVTNIYLIPTKLQLLVKHLKEPVLKVVSIFTGSQLLFEDTARNLKKYMPKSEIILYYGASELNYITYLCYDELIEKPLSVGRPFPGIDIYIREGKIFVNTEYAVYNATKPYSVNDIGYYDNDGYLIFEGRSDDILNIGGFKVSSTKIENEVKKIPQIEDAIVLPYSDTIRGNQIVLFVITIDKITKKDLLIKMKDNLMKNEIPKKIIFLNSFPYTSSEKIDRLALLKML >CP019857.1|AXU87865.1|3308578_3309454_-|dipicolinate-synthase-subunit-A MSNQYDITVIGGDLRQVYMVKKLINKGYSVVTYGISNEIINGIVGKSTSLAEALSKSSIILCPIPFTKNQVNIENTDDCLDATIDNLLINLSPNQILFGGNIPTKVCKFCEQHSIQIYDFMKMNDVAILNAVATAEGAIAEAIKRSIINIHQSNCLVLGYGRCAQILAKKLYTLDANVCVGARNNDARSTANAFGYSSISLSQLDEKLLQFDYIFNTIPECILTKERLEKVSQEVTIIDIASSPGGVDYSVVKEAGINATLCLGLPGKYSPKTSGEILVNAIENIINERRD >CP019857.1|AXU87864.1|3307985_3308576_-|dipicolinate-synthase-subunit-B MRLEGLTIGVGFTGSFCTYDKIFIELENLVKEGANVHTIFSDVSQNIDCRFGNSEEFMKKAYELTGNKPIVTIEEAEPFGPKGIADIIIIAPCTGNTAAKLANGITDSPVLMAAKGHLRNDKPLVISISTNDALSFNFKNIGILLNSKNIYFVPFGQDNCKAKPNSMIAHTELIIPTIELALENKQLQPVIKSPHQ >CP019857.1|AXU87863.1|3307578_3307779_+|hypothetical-protein MKKLKTISIFSLIISVILTIGGIGIVTYYVDNLFIRGLSVFVLIMSSSFVSTTVRLIFEESKRYKF >CP019857.1|AXU87862.1|3304420_3307075_-|bifunctional-acetaldehyde-CoA/alcohol-dehydrogenase MAHKEQVIIENKKENEVMSVGLDTVNNVESLVKKLAKIREAQKIFATYSQEQVDKIFLAASLAANKQRVPLAIMAQKETGMGIAEDKVIKNHYASEYIYNAYKETKTCGVIEKDEAFGMTKIAEPIGVIAAVVPTTNPTSTAIFKALLALKTRNGIIFSPHPRAKNSTIEAAKVVLEAAVLAGAPEGIIGWIDEPSLELTTTVMKEVDLTLATGGPGMVKSAYSSGKPAIGVGAGNTPAIIDDSADIKTAVNSILVSKTFDNGMICASEQSVIVLENIYNEVKKEFKERGAYLLDKDETEKIRNIILVNGGLNSKIVGQTACTIAKLAGFEVPVDTKVLIGEVESVEIEEAFAHEKLSPVLAMYKASDFDDAVRKAEKLVEDGGFGHTSSLYIDDVNQREKLDKFTSAMKTCRILINTPSSQGGIGDLYNFKLAPSLTLGCGSWGGNSVSENVGVKHLLNIKTVAERRENMLWFRAPEKVYFKKGCLGVALKELKDVMNKKRAFIVTDTFLYNNGYTKAVTDLLDEMNIKHTTFFEVEPDPTLECAKIGAKAMREFNPDVIISIGGGSAMDAGKIMWTLYEHPDVDFQDLAMRFMDIRKRVYTFPKMGEKANFVAIPTSAGTGSEVTPFAVITDQDTGVKYPLADYELMPNMAIVDSDMMMNMPKSLTSASGIDALTHALEAYVSMLATDYTNGLALQAIKSIFEYLPRAYDNGAKDPEAREKMANASTMAGMAFANAFLGVCHSMAHKLGAFHHVPHGVANALLITEVMKFNSSDAPKKMGAFSQYKYPEALKRYAEIASFLGLKGNSDEEKFQSLLVAIEDLKLKVGIPKSIKEFGVEESKFMDSIDEMVIQAFDDQCTGANPRYPLMNEIKDMYLNSYYGR >CP019857.1|AXU87861.1|3301925_3304145_-|signaling-protein MTGRNKSFTLITILFLTSLFLTMGYIYIEDTKHLLMSEAKIHIKEVAVQGSQLAQRQIEKDLDVLNIFSNYYASNPDIPNEEKMKNLLDEMENQKFYTMAIVDINGNAENTKGDKFSVKDREFFKNSIKGKKYVSSPYVDEVNKSIKKIAISVPLLNNDKVVGVLYCTYNINTLMKLINISFYENNSISYVVKNNGTIILHPQGDSLSKNIYKLLKQDNDIQEVNRLKKELQENKTGATVLNMLEERRYLGYATMDNGNSENNYIKDWNLIFSIPETVVFSNSKQIINRAVYAVLSIVLIFIAIIFYIIYIKKSNEKEILSLAYEDKVTYIGNQNKFYRECSKYLLDKPSLNYIIVYFDINNFKMINDTFGYEFGDNLLITIAKALKEELTEGEVYARLSSDYFAIFCDYKNGRNKIIRKLDNIRSNIESNLSIVFEISLCVGIYFVEEGEVDIQKAVNKANMARSVAKGKNINYAIYNEDVRNKLSEESMILDDIKIALVKNQFEVYYQPKFSLVTGEMIGSEALIRWNHPEHGFISPAVFIPIAEKSKLILKIGRFVFERVCNDLYEWKKQGKKIVPVSVNLSRVELYQPDIVKFINKTIKMYNLSSDFIEIEITETVAINELNILKNVLNELRTYGFSISMDDFGTGYSSISCLRDMPIDILKLDKSFLGGIEHDERSRNIAKSIVSLAKSLDLVVIIEGVESKEQAELMKQFGCDLVQGFYFARPMPAKNFLDLL >CP019857.1|AXU87871.1|3315610_3315877_-|CRISPR-associated-Cas2-family-protein MFVIVTYDIVEARSLNRIRRILRKYLTWTQNSVFEGNITEGKLHKCISEIENIIDNSEDSIYVYEIKNPNSIKKKCYGIDKYSDEMFI >CP019857.1|AXU87872.1|3315879_3316860_-|maturase-related-protein MYKDYYIISNGDIKRKENTIYYYNLEGEKKILPVEQVDDIHIYGEVDLNTKLINYISKYGVMLHFYNYYGYYSGTYYPRKKNVSGFSLVCQSACYLDKNERLYLAKSFVESASYHILRNMRYYKVDESLIDTIKDELNDLNDVKEISELMGKEGRIRKTYYKSFNQILKDDFEFYKREKRPPKDPVNALMSFGNSIMYTNVLSEIYKTQLDPTISFLHEPSTKRFSLSLDIAEIFKPIIVDTIIFSLINNKRINKNDFEYQDKICYLSEKGKKKFLQEFENKMQTTIKHRNLNRKVSYRMFIRLECYKLIKHFINDERYKVLKVWW >CP019857.1|AXU87873.1|3316943_3317432_-|CRISPR-associated-Cas4-family-protein MIFILTMWLKFTKEGDFVPIDLEVLKVQGVKINYYYVCKRKLWLFSKGITMEQNSSRVLSGKIVHEDSYKRMKNKEILIDDILKLDIIKDEYVKEVKISSKMKEADEMQLYYYLYYLKNSMGIEKKGTINYVKEKKQEELILTEEKERIIENTLININEINM >CP019857.1|AXU87874.1|3317428_3319750_-|CRISPR-associated-helicase,-Cas3-family MLYAKSNPVETLREHTDELLKQMNVLRESYGKNINSLDFLEEEIFWQLLDFVIEFHDIGKAFSPFQELIKSRMDTKINEPKIVTHLENNVGHNYLSPAFIDYSYIDRKKNKELRAVLNQVIVYHHERDIFIDKDFKNLIQKILDEDLINKVYELQHEFKVRYPIKTERLSKVYLQSVEKRIDKNHKYYNLYIMLKGILHRLDHSASAHEVVECNNVINIGEQTENYLMKEFGSLREAQSFAKSNRNKNIILIASTGMGKTETALIWIDKDKAFFTLPLRVSINALFDRAKNIVGVGESNDTFLGLLHSTAIDYLEESNQENSSEIVDLAKLLSCKLTFSTIDQIFKFPFLYRGYEKVYSTLAYSKVVIDEIQAYSPEIAAVLVKGIEMIHKIGGRFMIMTATMPTIYIDELKKRGVMNSNLADLTCNTEKIRHCVSIVENSIDENLGKIIQSGMNKKVLVIVNTVKSAVEKYELIEEIVKPKGIDVNLNLLHSMYIQEDRAKLEKYIKEFADSDSNGIWITTQLVEASLDIDFDELHTENSTLDSLFQRFGRCYRSREYEENSPNIFIYTEKATGIGSIYDKDIVEKGLELLKTFINGKECVKMKEKYKVEMVKILYSKESLEGTAFEKRFTSALNILDTITPYSLGSKDAQNILRNIEGYTVIPEDIYNKIEETLIKDYEELGQELINAYSNDDRQLINKIKSKRKKARREIIKKTVNLPIYKAKQNVIDIQVKGLEDLKILLYKYDIHENKHTKQIFGKGVLISNEIDQFI >CP019857.1|AXU87875.1|3319760_3320462_-|CRISPR-associated-protein,-Cas5t-family MKVLKLDLFQETACYKKPFAMKITETYPLPPYSTINGLIHKVLNATEYIPFNISVQGTYESIFNNYQTTYFYKKDSITSMPMNSHMLLNVNLIIHIGGDFDLLEEIYDSLLNYDEHLSLGRKEDLVRINDIRFVEVNKFEVDEDIQLDDYENYKLSECNIRMPIYIPKTSLQDTDIDGISYRLNNYYDNNAVEDKKRVWNKVDSYYVEDGNTISIGDILLDNEGDLLYFNNIN >CP019857.1|AXU87876.1|3320463_3321378_-|CRISPR-associated-autoregulator,-Cst2-family MKRGLTFTVIAQAQSLNYGEGIGNISELKKLSRADGNMYTFASRQCLRYDIVRLAAELFNWNLQVVDKEKGTIQFKDNISIRESEEMDLFGYMKTNKKDEKDKKGGSLTREATVRLSNAISLEPYRSDMDFLNNKGFADRIGEHPNLANIEQHLSYYTYTVTIDLSKIGKDGDIELDNKEKCRRVVEFLEIIKVLNRNIRGRQENLSPLFVVGGVYEIANPFFLGRIKLKGDKNGFKINKQAIEEVIQGTFLGKDLKEFTYVGMVDGVFINKEEFKGLFEDNFLSVDKFFGQLVKEVKEYYGVN >CP019857.1|AXU87877.1|3321379_3323257_-|CRISPR-associated-protein-Cas8a1/Cst1,-subtype-I-B/TNEAP MKLRVYRGDWFFNMGIVGFLNIIKKADKQAEIFIMEDYIEFDSLFLENFHEYYFNYFMDEYDVSKRIKKNIDYSINFIKSKPDRIKDGIKKIKDSVKQQNDKIKKFDEEKFNLIKEKLDSMSKIKSYDEFDSLESLVDETIDIFKIKSINDRLTANLYKYVVQDNYFGQVSFFNVAKAKLDLDGLKQVMFNDYLRQIIYFGELEDLLEENDYDKLKNYLNDRLNSIAKDINEKKVSKSSINTIEKIMKEINKNFIKKNKSIEDIKEYMDSLEVCEMCGLYKGILDEYSESNFAPLGVSTNNARNMFWNQEYVSSICDVCKLILFCTPAGATYTRKNYLINEENEFYLFVNMDTSINELFERNNSLKAQKSESSDSKDENPFNQLIKSIVEENTLKSEWQLRNILFVEFKASIDSKKCKINYFNIPTYLAKFFTDKYANKKIQSIYDYKLKSNVLDLLLKNRDLKHLTNNILRNKVKNDMESNNKSNISGIDCFRVVQLRVLINSYKKGVYKMDSKNLEKNDEKLKIIYYLGCDIHDYFVNKNSKNKIDGVSYKLLNSVKVGNKSDFMDTIIRVFMSAEKQIPAFILDIEIEKDLDFESIGHAFISGLISGKYEGKDKLPNEKEEK >CP019857.1|AXU87878.1|3323262_3324000_-|CRISPR-associated-Cas-family-protein MKMKIEFSTGCIPISYNSLFMSIIKEAIRKSNEDYYKNMYYYKEKNNKKTKNFTFSVYIKKYSIEGDNFIIEDKVILNISTPDLELGFHIYNGLMTSKKCLYKAYELTRIRIDLSREKKVTEERVLFNALSPICVKSKEGKFLEITDDRYIEELNYITNEVVKNYRGNGLKRKLEFENIGLKKVVVKESLREFKKITGKEYQYINGYKGKFILKGDIDDLNLIYNLGIGFRRAQGFGDVDILEWR >CP019857.1|AXU87879.1|3324077_3324965_-|putative-transcriptional-regulator MKCKELSEELEVSERQIKSYKMYLEQAGIFINSTPGIYGGYEIDKCNSISLIKLLDSEVSILDMINSQLEYNNDIYKNEFNNIVEKIKAVLNTGEKSDTYMDYFTVQAQRNCDYESEKNKCNEIIRAYTTKHKFWIEYYSLNSGNSERIVHPYGLFNYKSDTYMVAFCEKRFKFIDFKLCRIKDYKVLEEKYNVDKSFSWDEYSKNSIGIYKGEEINVVIKISHPFSTIIKEKVWVNNQQIIEYDDKSIMFKAKMRGYEEIKSWILSMGAYVEVVEPDRLRNDILSEIEKMKKIY >CP019857.1|AXU87880.1|3325273_3327190_-|ABC-transporter-permease MNIKQFAINNISRNIKAYLGYLASIVISSSLLFSFIMFTSHPDLDVSQFPDYLKEGLKMSKIIAYLFLFFFVFYSVSVFLKSRYKEFGILYITGISKRQVMKLIFIENMIINIVSSVIGIIIGLIFAKIFLVVMSTFLELSPLKFYIPFNAILSTLIYFMILAVLTSIFTSFIVKENQVLKLLKGTKTPKPEPKTSLMLAILSICLFIIAYYNAITSTDQYTTYLRLVPVTSLTIVATYLFFSQFSVFFMKKLKLNKRFYRKNTNMLWISNLIYKVKDNARIFFLITITSAVAFTAIGTVYSFWKDVERQINLIYPNTIYYSTMTLHNDPKKPDSKEKDKERMMFIENNLKKEDVDYTRTNGEFKTVFPKKSDFNVRIMKESKYLEITETIGVKPISFEDNECISLLSSSLPGNNNVKENIIVGNRGLKVAKQVEECVMPAYYKNMYVVKDNFYDSIESKFIVDRFTAFEVEDSSKTIEICREFENKFNNESGMQPYLFFSKELMIGTGKLMYSTFIFLAIFIGLIFFVTTSSFLYNKFYMDCQVDKKKYEQLNKLGMTYNEIKKASTIEIGIVFLFPYVVAVIHSIFALTALKNSFDIEVASSAVLVMGSLFLVQIVYFLIVRNNYLKEIRLNLVNF |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019857_1 | 1.1|146650|29|CP019857|CRISPRCasFinder | 146650-146678 | 29 | NZ_CP033215 | Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence | 5105-5133 | 0 | 1.0 |
CP019857_4 | 4.2|1317730|37|CP019857|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1317730-1317766 | 37 | HG531805 | Clostridium phage CDMH1 complete genome | 9722-9758 | 0 | 1.0 |
CP019857_4 | 4.3|1317796|36|CP019857|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1317796-1317831 | 36 | NZ_CP029155 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence | 52281-52316 | 0 | 1.0 |
CP019857_4 | 4.3|1317796|36|CP019857|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1317796-1317831 | 36 | MF547662 | Clostridioides phage LIBA6276, complete genome | 133621-133656 | 0 | 1.0 |
CP019857_7 | 7.5|1646676|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1646676-1646711 | 36 | NZ_CP029155 | Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence | 39008-39043 | 0 | 1.0 |
CP019857_8 | 8.13|1848820|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1848820-1848856 | 37 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 14871-14907 | 0 | 1.0 |
CP019857_9 | 9.4|2570076|36|CP019857|CRISPRCasFinder | 2570076-2570111 | 36 | NZ_MF547664 | Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence | 25530-25565 | 0 | 1.0 |
CP019857_9 | 9.11|2570076|37|CP019857|CRT,PILER-CR | 2570076-2570112 | 37 | NZ_MF547664 | Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence | 25530-25566 | 0 | 1.0 |
CP019857_11 | 11.2|2817126|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2817126-2817162 | 37 | LN680005 | Clostridium phage phiCDHM4 gp01 gene for putative capsid protein | 620-656 | 0 | 1.0 |
CP019857_16 | 16.9|3315232|36|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3315232-3315267 | 36 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 3353-3388 | 0 | 1.0 |
CP019857_3 | 3.1|1314727|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1314727-1314763 | 37 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 26166-26202 | 1 | 0.973 |
CP019857_3 | 3.1|1314727|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1314727-1314763 | 37 | NC_028905 | Clostridium phage phiCD111, complete genome | 25940-25976 | 1 | 0.973 |
CP019857_3 | 3.1|1314727|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1314727-1314763 | 37 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 25662-25698 | 1 | 0.973 |
CP019857_3 | 3.1|1314727|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1314727-1314763 | 37 | NC_028958 | Clostridium phage phiCD146, complete genome | 25224-25260 | 1 | 0.973 |
CP019857_3 | 3.1|1314727|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1314727-1314763 | 37 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 35854-35890 | 1 | 0.973 |
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CP019857_8 | 8.13|1848820|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1848820-1848856 | 37 | LN881738 | Escherichia phage slur17, complete genome | 5167-5203 | 10 | 0.73 |
CP019857_8 | 8.13|1848820|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1848820-1848856 | 37 | KU057941 | Clostridium phage CDSH1, complete genome | 15234-15270 | 10 | 0.73 |
CP019857_8 | 8.13|1848820|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1848820-1848856 | 37 | HM568888 | Clostridium phage phiCD38-2, complete genome | 14730-14766 | 10 | 0.73 |
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CP019857_16 | 16.10|3315297|37|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3315297-3315333 | 37 | NZ_CP023496 | Staphylococcus simulans strain FDAARGOS_383 plasmid unnamed, complete sequence | 97606-97642 | 11 | 0.703 |
1. spacer 1.1|146650|29|CP019857|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033215 (Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgtaataagttaaagcaatatgaatcaac CRISPR spacer tgtaataagttaaagcaatatgaatcaac Protospacer *****************************
2. spacer 4.2|1317730|37|CP019857|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtttttaaagcttcttcaagttgtatttgtgtataat CRISPR spacer gtttttaaagcttcttcaagttgtatttgtgtataat Protospacer *************************************
3. spacer 4.3|1317796|36|CP019857|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ccaactgaataaacaataattttatcaatttcttta CRISPR spacer ccaactgaataaacaataattttatcaatttcttta Protospacer ************************************
4. spacer 4.3|1317796|36|CP019857|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ccaactgaataaacaataattttatcaatttcttta CRISPR spacer ccaactgaataaacaataattttatcaatttcttta Protospacer ************************************
5. spacer 7.5|1646676|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029155 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atttgattttaatggtacgttttcgctttctctaag CRISPR spacer atttgattttaatggtacgttttcgctttctctaag Protospacer ************************************
6. spacer 8.13|1848820|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gaaataataaatagcattgtcgaatggtttgcaagcc CRISPR spacer gaaataataaatagcattgtcgaatggtttgcaagcc Protospacer *************************************
7. spacer 9.4|2570076|36|CP019857|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF547664 (Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagacttaacacagtaactaaactgtacataattgg CRISPR spacer aagacttaacacagtaactaaactgtacataattgg Protospacer ************************************
8. spacer 9.11|2570076|37|CP019857|CRT,PILER-CR matches to NZ_MF547664 (Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagacttaacacagtaactaaactgtacataattggt CRISPR spacer aagacttaacacagtaactaaactgtacataattggt Protospacer *************************************
9. spacer 11.2|2817126|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN680005 (Clostridium phage phiCDHM4 gp01 gene for putative capsid protein) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tctaatttaatagctttatttttagcaaaatacccaa CRISPR spacer tctaatttaatagctttatttttagcaaaatacccaa Protospacer *************************************
10. spacer 16.9|3315232|36|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctctgtgactccatatttttttgcaatatataattc CRISPR spacer ctctgtgactccatatttttttgcaatatataattc Protospacer ************************************
11. spacer 3.1|1314727|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aatttttcgagagtctcaatttacagaagaaattgga CRISPR spacer gatttttcgagagtctcaatttacagaagaaattgga Protospacer .************************************
12. spacer 3.1|1314727|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aatttttcgagagtctcaatttacagaagaaattgga CRISPR spacer gatttttcgagagtctcaatttacagaagaaattgga Protospacer .************************************
13. spacer 3.1|1314727|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aatttttcgagagtctcaatttacagaagaaattgga CRISPR spacer gatttttcgagagtctcaatttacagaagaaattgga Protospacer .************************************
14. spacer 3.1|1314727|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aatttttcgagagtctcaatttacagaagaaattgga CRISPR spacer gatttttcgagagtctcaatttacagaagaaattgga Protospacer .************************************
15. spacer 3.1|1314727|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aatttttcgagagtctcaatttacagaagaaattgga CRISPR spacer gatttttcgagagtctcaatttacagaagaaattgga Protospacer .************************************
16. spacer 4.5|1317927|38|CP019857|CRISPRCasFinder matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
aaagcaaaagataggaatgataattttaaaactccaaa CRISPR spacer aaagcaaaagacaggaatgataattttaaaactccaaa Protospacer ***********.**************************
17. spacer 6.5|1535529|38|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
agagagaagggctattctctctaggcttatccttacaa CRISPR spacer agagagaagggctattctctctaggcttatccttacag Protospacer *************************************.
18. spacer 6.5|1535529|38|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
agagagaagggctattctctctaggcttatccttacaa CRISPR spacer agagagaagggctattctctctaggcttatccttacag Protospacer *************************************.
19. spacer 6.9|1535793|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547662 (Clostridioides phage LIBA6276, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
agagtaaaacaatagtacaagaacaaataaatacat CRISPR spacer aaagtaaaacaatagtacaagaacaaataaatacat Protospacer *.**********************************
20. spacer 6.9|1535793|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF547663 (Clostridioides phage LIBA2945, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
agagtaaaacaatagtacaagaacaaataaatacat CRISPR spacer aaagtaaaacaatagtacaagaacaaataaatacat Protospacer *.**********************************
21. spacer 8.13|1848820|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaaataataaatagcattgtcgaatggtttgcaagcc CRISPR spacer gaaataataaatagcattgtcgaatggtttgtaagcc Protospacer *******************************.*****
22. spacer 8.13|1848820|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaaataataaatagcattgtcgaatggtttgcaagcc CRISPR spacer gaaataataaatagcattgtcgaatggtttgtaagcc Protospacer *******************************.*****
23. spacer 8.13|1848820|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
gaaataataaatagcattgtcgaatggtttgcaagcc CRISPR spacer gaaataataaatagcattgtcgaatggtttgtaagcc Protospacer *******************************.*****
24. spacer 9.3|2570010|37|CP019857|CRISPRCasFinder matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aagcatatacacatgtcagaagatatttataaaagga CRISPR spacer aagcatatacacatgtcagaagatatttataaaaggt Protospacer ************************************
25. spacer 9.5|2570141|38|CP019857|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF547664 (Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
gatataataatgaaacctttttttaaacttattttctt CRISPR spacer gatagaataatgaaacctttttttaaacttattttctt Protospacer **** *********************************
26. spacer 11.4|2817260|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX145341 (Clostridium phage phiMMP02, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aaatgctgaaagataattcggttggggatttaatgaa CRISPR spacer aaatgttgaaagataattcggttggggatttaatgaa Protospacer *****.*******************************
27. spacer 11.4|2817260|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX228400 (Clostridium phage CDKM15, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aaatgctgaaagataattcggttggggatttaatgaa CRISPR spacer aaatgttgaaagataattcggttggggatttaatgaa Protospacer *****.*******************************
28. spacer 11.5|2817326|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029156 (Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
taaatagagcagatgaggcttttcaagaagccgatag CRISPR spacer tagatagagcagatgaggcttttcaagaagccgatag Protospacer **.**********************************
29. spacer 11.5|2817326|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029153 (Clostridioides difficile strain CDT4 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
taaatagagcagatgaggcttttcaagaagccgatag CRISPR spacer tagatagagcagatgaggcttttcaagaagccgatag Protospacer **.**********************************
30. spacer 11.5|2817326|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN681541 (Clostridium phage phiMMP01, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
taaatagagcagatgaggcttttcaagaagccgatag CRISPR spacer tagatagagcagatgaggcttttcaagaagccgatag Protospacer **.**********************************
31. spacer 16.8|3315166|37|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.973
aatcattttgtatgattgttccattttttttgaaaac CRISPR spacer aatcattttgtatgattgttccattttttttaaaaac Protospacer *******************************.*****
32. spacer 2.3|1290789|38|CP019857|CRISPRCasFinder,CRT matches to AY855346 (Clostridium difficile bacteriophage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gaccaagatacttgaaaaaatatcgctgactattttga CRISPR spacer gatcaagatactttaaaaaatatcgctgactattttga Protospacer **.********** ************************
33. spacer 2.3|1290789|38|CP019857|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007917 (Clostridium phage phi CD119, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gaccaagatacttgaaaaaatatcgctgactattttga CRISPR spacer gatcaagatactttaaaaaatatcgctgactattttga Protospacer **.********** ************************
34. spacer 2.3|1290789|38|CP019857|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028996 (Clostridium phage phiCDHM19, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gaccaagatacttgaaaaaatatcgctgactattttga CRISPR spacer gatcaagatactttaaaaaatatcgctgactattttga Protospacer **.********** ************************
35. spacer 4.3|1317796|36|CP019857|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP020426 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
ccaactgaataaacaataattttatcaatttcttta CRISPR spacer cctattgaataaacaataattttatcaatttcttta Protospacer ** *.*******************************
36. spacer 4.3|1317796|36|CP019857|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to CP011970 (Peptoclostridium phage phiCDIF1296T strain DSM 1296, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
ccaactgaataaacaataattttatcaatttcttta CRISPR spacer cctattgaataaacaataattttatcaatttcttta Protospacer ** *.*******************************
37. spacer 4.3|1317796|36|CP019857|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to LN681537 (Clostridium phage phiCD211, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
ccaactgaataaacaataattttatcaatttcttta CRISPR spacer cctattgaataaacaataattttatcaatttcttta Protospacer ** *.*******************************
38. spacer 6.5|1535529|38|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
agagagaagggctattctctctaggcttatccttacaa CRISPR spacer agagagaagggctattccctctaggcttatccttacag Protospacer *****************.*******************.
39. spacer 6.5|1535529|38|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
agagagaagggctattctctctaggcttatccttacaa CRISPR spacer agagagaagggctattccctctaggcttatccttacag Protospacer *****************.*******************.
40. spacer 6.5|1535529|38|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
agagagaagggctattctctctaggcttatccttacaa CRISPR spacer agagagaagggctattccctctaggcttatccttacag Protospacer *****************.*******************.
41. spacer 6.5|1535529|38|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
agagagaagggctattctctctaggcttatccttacaa CRISPR spacer agagagaagggctattccctctaggcttatccttacag Protospacer *****************.*******************.
42. spacer 6.5|1535529|38|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
agagagaagggctattctctctaggcttatccttacaa CRISPR spacer agagagaagggctattccctctaggcttatccttacag Protospacer *****************.*******************.
43. spacer 6.5|1535529|38|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
agagagaagggctattctctctaggcttatccttacaa CRISPR spacer agagagaagggctattccctctaggcttatccttacag Protospacer *****************.*******************.
44. spacer 8.7|1848425|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to FN668942 (Clostridium difficile BI1 plasmid pCDBI1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ctgatagaaaaagaagattatttgaaagttgagacta CRISPR spacer ttggtagaaaaagaagattatttgaaagttgagacta Protospacer .**.*********************************
45. spacer 9.1|2569880|36|CP019857|CRISPRCasFinder matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
acaattattaattgttttattattgaaatcacagca CRISPR spacer acaattattaattgttttattaataaaatcacagca Protospacer ********************** *.***********
46. spacer 9.8|2569880|37|CP019857|CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
acaattattaattgttttattattgaaatcacagcaa CRISPR spacer acaattattaattgttttattaataaaatcacagcaa Protospacer ********************** *.************
47. spacer 9.10|2570010|38|CP019857|CRT,PILER-CR matches to JX145342 (Clostridium phage phiMMP04, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
aagcatatacacatgtcagaagatatttataaaaggat CRISPR spacer aagcatatacacatgtcagaagatatttataaaaggtg Protospacer ************************************
48. spacer 9.12|2570141|39|CP019857|CRT,PILER-CR matches to NZ_MF547664 (Clostridioides difficile strain LIBA-6289 plasmid LIBA6289, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.949
gatataataatgaaacctttttttaaacttattttcttt CRISPR spacer gatagaataatgaaacctttttttaaacttattttctta Protospacer **** *********************************
49. spacer 11.7|2817458|38|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.947
gctgataaagttattaaaagtaaaattgctgaaatact CRISPR spacer gctgataaagttattaaaaggaaaattgctgaaacact Protospacer ******************** *************.***
50. spacer 16.7|3315103|34|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
ggtttctaccaatcaaatcacgcataattataga CRISPR spacer ggtttctaccaatcaaatcacgcatgattatgga Protospacer *************************.*****.**
51. spacer 16.7|3315103|34|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
ggtttctaccaatcaaatcacgcataattataga CRISPR spacer ggtttctaccaattaaatctcgcataattataga Protospacer *************.***** **************
52. spacer 6.5|1535529|38|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK473382 (Clostridium phage JD032, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.921
agagagaagggctattctctctaggcttatccttacaa- CRISPR spacer agagagaagggttattctctctaggc-tatccttacagc Protospacer ***********.************** **********.
53. spacer 7.7|1646808|38|CP019857|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG973074 (Clostridioides difficile strain HSJD-312 plasmid pHSJD-312, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.895
ctatcttttgttgctttacataaatttatattacttat CRISPR spacer ccatcttttgttgctttgcatagatttatattacttac Protospacer *.***************.****.**************.
54. spacer 8.7|1848425|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020425 (Clostridioides difficile strain FDAARGOS_267 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
ctgatagaaaaagaagattatttgaaagttgagacta CRISPR spacer ttaatagaaaaagaagaatatttaaaagttgagacta Protospacer .*.************** *****.*************
55. spacer 8.7|1848425|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011969 (Clostridioides difficile ATCC 9689 = DSM 1296 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
ctgatagaaaaagaagattatttgaaagttgagacta CRISPR spacer ttaatagaaaaagaagaatatttaaaagttgagacta Protospacer .*.************** *****.*************
56. spacer 8.12|1848755|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
aatatttagagatggcgtagagtgttaaaagtttca CRISPR spacer aatatttagagatggtgtagagtgttaaaaattttg Protospacer ***************.**************.***..
57. spacer 8.12|1848755|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
aatatttagagatggcgtagagtgttaaaagtttca CRISPR spacer aatatttagagatggtgtagagtgttaaaaattttg Protospacer ***************.**************.***..
58. spacer 8.12|1848755|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
aatatttagagatggcgtagagtgttaaaagtttca CRISPR spacer aatatttagagatggtgtagagtgttaaaaattttg Protospacer ***************.**************.***..
59. spacer 8.12|1848755|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
aatatttagagatggcgtagagtgttaaaagtttca CRISPR spacer aatatttagagatggtgtagagtgttaaaaattttg Protospacer ***************.**************.***..
60. spacer 8.12|1848755|36|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
aatatttagagatggcgtagagtgttaaaagtttca CRISPR spacer aatatttagagatggtgtagagtgttaaaaattttg Protospacer ***************.**************.***..
61. spacer 3.2|1314793|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HG531805 (Clostridium phage CDMH1 complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.865
caaattgtctaatcctaattttttctttgcatcttct CRISPR spacer aaggtcatctaatcctaattttttctttgcatcttct Protospacer *..*..******************************
62. spacer 1.1|146650|29|CP019857|CRISPRCasFinder matches to KY971610 (Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tgtaataagttaaagcaatatgaatcaac CRISPR spacer tacgataagttacagcaatacgaatcatc Protospacer *...******** *******.****** *
63. spacer 16.8|3315166|37|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
aatcattttgtatgattgttccattttttttgaaaac--- CRISPR spacer aatcattttgtacgattgttccatttttc---aaaatcgg Protospacer ************.***************. ****.
64. spacer 16.8|3315166|37|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_028905 (Clostridium phage phiCD111, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
aatcattttgtatgattgttccattttttttgaaaac--- CRISPR spacer aatcattttgtacgattgttccatttttc---aaaatcgg Protospacer ************.***************. ****.
65. spacer 16.8|3315166|37|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
aatcattttgtatgattgttccattttttttgaaaac--- CRISPR spacer aatcattttgtacgattgttccatttttc---aaaatcgg Protospacer ************.***************. ****.
66. spacer 16.8|3315166|37|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_048665 (Clostridium phage phiCDHM14, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
aatcattttgtatgattgttccattttttttgaaaac--- CRISPR spacer aatcattttgtgcgattgttccatttttc---aaaatcgg Protospacer ***********..***************. ****.
67. spacer 16.8|3315166|37|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to HG796225 (Clostridium phage phiCDHM13 complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
aatcattttgtatgattgttccattttttttgaaaac--- CRISPR spacer aatcattttgtgcgattgttccatttttc---aaaatcgg Protospacer ***********..***************. ****.
68. spacer 16.8|3315166|37|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to LN681538 (Clostridium phage phiCD481-1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
aatcattttgtatgattgttccattttttttgaaaac--- CRISPR spacer aatcattttgtgcgattgttccatttttc---aaaatcgg Protospacer ***********..***************. ****.
69. spacer 16.8|3315166|37|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to HG798901 (Clostridium phage phiCDHM11 complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
aatcattttgtatgattgttccattttttttgaaaac--- CRISPR spacer aatcattttgtgcgattgttccatttttc---aaaatcgg Protospacer ***********..***************. ****.
70. spacer 11.7|2817458|38|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448895 (Streptococcus phage Javan274, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gctgataaagttattaaaagtaaaattgctgaaatact-- CRISPR spacer tctgataaagttactaaaagtaaaactg--aaatcaatag Protospacer ************.***********.** .** .* *
71. spacer 11.7|2817458|38|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448769 (Streptococcus phage Javan471, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gctgataaagttattaaaagtaaaattgctgaaatact-- CRISPR spacer tctgataaagttactaaaagtaaaactg--aaatcaatag Protospacer ************.***********.** .** .* *
72. spacer 11.7|2817458|38|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448684 (Streptococcus phage Javan151, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gctgataaagttattaaaagtaaaattgctgaaatact-- CRISPR spacer tctgataaagttactaaaagtaaaactg--aaatcaatag Protospacer ************.***********.** .** .* *
73. spacer 16.11|3315363|36|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MN693244 (Marine virus AFVG_25M166, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tttttgaatgttgaagattttgttaatgcagggaaa CRISPR spacer tttttgaatgatgaagattttgctaatggtatttat Protospacer ********** ***********.***** . *
74. spacer 2.2|1290723|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029750 (Staphylococcus aureus strain Smith plasmid pSS41, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tttatattaataaaatcatttacatttaaactcaaca----- CRISPR spacer tttatattaataaattcatttaaatt-----ccgtcagtttt Protospacer ************** ******* *** .*. **
75. spacer 3.2|1314793|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013332 (Fusobacterium hwasookii ChDC F174 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
caaattgtctaatcctaattttttctttgcatcttct CRISPR spacer ctaattgtctaatattaattttttctttatcagctgt Protospacer * *********** .*************.. .* *
76. spacer 4.1|1317663|38|CP019857|CRISPRCasFinder matches to LC168164 (Tenacibaculum phage pT24 DNA, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
cgtacagatagtattgcattagaggaaagtttaaaagc CRISPR spacer actgtaattattatggcattagaggaaagtttaaatac Protospacer *..*. ** *** ******************** .*
77. spacer 8.13|1848820|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028958 (Clostridium phage phiCD146, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
gaaataataaatagcattgtcgaatggtttgcaagcc CRISPR spacer gctataataaataatattgtcgaatggtttaaacaaa Protospacer * **********..***************. * .
78. spacer 8.13|1848820|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN881738 (Escherichia phage slur17, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
gaaataataaatagcattgtcgaatggtttgcaagcc CRISPR spacer gctataataaataatattgtcgaatggtttaaacaaa Protospacer * **********..***************. * .
79. spacer 8.13|1848820|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU057941 (Clostridium phage CDSH1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
gaaataataaatagcattgtcgaatggtttgcaagcc CRISPR spacer gctataataaataatattgtcgaatggtttaaacaaa Protospacer * **********..***************. * .
80. spacer 8.13|1848820|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM568888 (Clostridium phage phiCD38-2, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
gaaataataaatagcattgtcgaatggtttgcaagcc CRISPR spacer gctataataaataatattgtcgaatggtttaaacaaa Protospacer * **********..***************. * .
81. spacer 16.9|3315232|36|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK448421 (Streptococcus satellite phage Javan312, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
---ctctgtgactccatatttttttgcaatatataattc CRISPR spacer aaaatcc---actttatatttttttgcaatatataaacg Protospacer **. ***..********************* .
82. spacer 16.11|3315363|36|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_019782 (Lactobacillus phage AQ113, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
tttttgaatgttgaagattttgttaatgcagggaaa CRISPR spacer aattttaatgttgaagattttattaatgttgaaagt Protospacer *** ***************.******. *..*.
83. spacer 11.2|2817126|37|CP019857|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693317 (Marine virus AFVG_25M47, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
tctaatttaatagctttatttttagcaaaatacccaa CRISPR spacer tctaatttaccagctttatttttagctctgctttcag Protospacer ********* .*************** .. ..**.
84. spacer 16.10|3315297|37|CP019857|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023496 (Staphylococcus simulans strain FDAARGOS_383 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
catttgtaaatctttatgattatgtaatatattcata CRISPR spacer ttatcttaaatctttgggattatgtaatatatcttaa Protospacer . *. *********. ***************.. *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
284406 : 300583
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP019857|284406:300583|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP019857|284406:300583|298306_298864_+|AXU85203.1|DBSCAN-SWA MGKINVIKTKIEGLYIVEPNVFYDERGYFMESYNKKDFIEQGLDMCFIQDNESSSRKGVLRGMHFQVKYPQGKLVRVTEGEVFDVAVDLRKDSQTFGKWEGVILSDKNKKQFYIPEGFAHGFLVLSEKAVFSYKCTNYYYPEFENGFIWNDKQISIEWPLKGIEEIFLSEKDKKQKSFKDICTRR >CP019857|284406:300583|297388_298258_+|AXU85202.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPITKCISKQTLPIYDKPMIYYPMSVLMLAGIQDILIISTPRDIKAFEELFGDGSSLGINITYAIQEKANGIAEAFIIGEEFIGNDRVSLVLGDNIFYGYGFSERLENAVKRKGATIFGYHVSNPNSFGVVEFDKDFNVLSIEEKPTVPKSNYAIPGLYFYDNDVVEIAKLVEPSDRGELEITSINSEYLKRGKLKVELLGRGMAWLDTGTHKGLLDASNYVEVVQTRQGLYIACLEEIAYTKGYISREQLMKLAKPLIKTEYGQYLLKLASEDM >CP019857|284406:300583|285850_286549_+|AXU85194.1|DBSCAN-SWA MLLYEGKAKQVYSTDNENEYVVYYKDDATAFNGEKKAEISSKGILNNKISTIIFEMLKENNINTHFIKSLSDREMLVKKVEILPLEVIVRNIAAGSICKRVGLEEGVVFDEPIFEISYKNDAYGDPMLNDDYAVAMKLATREELKFLREETLKINELLKAFFLKLNLKLVDFKIEFGKDSEGNIILADEVSPDTCRLWDVNTNEKLDKDRFRKDLGDLVEGYTEVLSRMNNK >CP019857|284406:300583|289577_291110_+|AXU85198.1|DBSCAN-SWA 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>CP019857|284406:300583|287921_288998_+|AXU85196.1|DBSCAN-SWA MLTYKESGVDIDEGNRAVDLIKGKIKGTYDGNVVGDLGNFSGLYSLKDFVGMKEPVLLASTDGVGTKLKIAQMMDKHDTVGIDLVAMCVNDLICQGAKPLFFLDYIALGKLVPEHIEKIVGGIADGCKMSGCALIGGETAEMPGMYGEDDYDLAGFSVGIADKEKIVSGNNVKSGDVLVGISSSGVHSNGFSFIRKIFLETYNYKMEQYVEELGMTVGEALLTPTKIYVKLALDVLAKHDIKAIAHITGGGLIENITRVIPKGLGLDINKKSWEKPPIFKMIEGFNAVDERELHKSFNMGIGLVLIVDKENADDVVNFINNRENDNADYVDKKYSELLEDKAYIIGEVVDSHEGVELC >CP019857|284406:300583|298901_299885_+|AXU85204.1|DBSCAN-SWA MKKILITGGAGFIGSNFIHYMLNKYVDYFIVNLDLLTYAGNLETLIEIQDNSNYKFVKGDISNREQVYKLFEEERFDIVVNFAAESHVDRSVENPDLFIKTNIIGTQVLLDASIKYGVKRYHQISTDEVYGDLPIDRKDLFFTEQSSINPSSPYSASKASADLLVNSYYRTYGLLTTISRCSNNYGPYHFPEKLIPLMILNALENKQLPVYGNGENVRDWLHVYDHCTAIDLIIHKGNIGEIYNIGGHNERSNLEVVKVILNLLGKSEELISYVNDRPGHDLRYAIDATKIENELGWKAKYDFDLGIKETVKWYIENESWWKAVLSV >CP019857|284406:300583|299914_300583_+|AXU85205.1|DBSCAN-SWA 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14 | Synechococcus_phage(23.08%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1282568 : 1338364
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP019857|1282568:1338364|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP019857|1282568:1338364|1299061_1299541_+|AXU86070.1|DBSCAN-SWA MDKESIKEIVRELRKEEREDRKKGVLYNTRLLMKHYNDFKRHINLALSEAKEVNYLEEDLSDFEDEELYILSIKKSKTRTIIMIAHIDSALKTLKLRQERLQSYEKYRALELYYFDEKTYEEIAEILNCGVVTSRRWVNEMITELGIYLFGVDGLKSIV >CP019857|1282568:1338364|1293057_1293384_+|AXU86060.1|DBSCAN-SWA MSNNLQIFKNNDFGEIRTVEIDGKLYFVATDIARCLGYKDTTNAIKQHCKWVVKHHIPHPQSKTKTLEVNVIPAGDMYRLITNSELPSAEKFERWVFDEVLPSIRKTG >CP019857|1282568:1338364|1306982_1307546_+|AXU86080.1|DBSCAN-SWA MDWLKELLEGIKVEDNKIDVASLQKSIEKKIKETTVTQEDYANIETQLNTANEAIKKFEGGMTKEDVENLKTTYETDKKTLEETYKKEIEEKDFNYWLGDAFKSVKCRDEIALKAHLDIEALRNSKDRQKAFEEQINPLKQDKDYLFNATLEGEEPKIDTITPGQEPKINDFGFNFTGVRPHENNNK >CP019857|1282568:1338364|1302214_1302640_+|AXU86075.1|DBSCAN-SWA MAKYEYWITEEGLIKIEGWARDGLTDEQIAFNIGINVKTLYDWKKKYSNICNALKKGKEVIDRQVENALLKRALGYEYDEITYEEGQETKRVTKQVVPDTTAQIFWLKNRKPAEWRDKRDIEHSGNLGDITIKVGDEEYGN >CP019857|1282568:1338364|1326557_1326977_+|AXU86107.1|DBSCAN-SWA 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>CP019857|1282568:1338364|1309441_1309732_+|AXU86085.1|DBSCAN-SWA MARWGSVDFREFKRVCKKMEKLTKIDLDKFCKDAARELAARLLGKVIRRTPVDTGFLRQGWNGVAYARSLPVYKQGNNYIIEVVNPTEYALTQWGI >CP019857|1282568:1338364|1309094_1309442_+|AXU86084.1|DBSCAN-SWA MVSKTRKAIEMLYRDKCTIVEYQPIKDPVTKRTNNKEVIVLENQPCKLSYKNIVSATEGKLAKLEQTIKLFISPDIEIKAGSKLIINDKEYVRSGESAIYPNHQEIILELFKDKA >CP019857|1282568:1338364|1329440_1330901_+|AXU86111.1|DBSCAN-SWA MPPAETFICNRIVKKRRGYYSERDVFLSPCPYVYGEGGMYESTYYGEFDLSNSKYITVPTSTKYEKTATRVYFISGGNMITSSSGMKQAITLELIPDPNIIINDDLGVISDSCNINYRIPDSNTSVKFDVTEKLNGVVISKKNYALDGNYTLNLTDEHLSTLSFNSTNNITIELSTYQGGKFLEKTVTFTKGNTKPKLNITSYNSTTAIFTAIDIDNNLSKIEWFIDDVLKETITTDLYLEKTINYELTDNAIHTLKIVATDAENATVEKVLSISKEIMPLQEDASLSDISTKLAEIGEEFRNGKTSIINTLALKNIEASLNNTLVELSEKIKTSFDSSDASVQDLQNRITELNNQLSQRKKWATGRYTFTDLDISNFTLNSESIVQTKSIITDLSFTPSIIIIDSIQMKSGTDRVYFRSITNLDITIGAKYTNSSLPVGGSGYIYIQKPTPSNNFLLILTRLDGQGREISFSPIVGETLTWYAFE >CP019857|1282568:1338364|1318126_1318651_+|AXU86099.1|DBSCAN-SWA MWGKFKKLSLLKKILVIFLIYFVVFTVSMMIHQAIRDSKNRDEVNEGNITKENIISEREKEDIYKQEMQAKVDSMIPEDLKDKTTYYVNILNPTKGEGYIVSIQVENSRFNDENECRNFTKEFVNNIKDMNDIHSVRISFIVDVTLTYNVFLDDWNNIKNNVNLIDDLDFSSGN >CP019857|1282568:1338364|1311417_1311603_+|AXU86088.1|DBSCAN-SWA MIILNKTLSKEDDYKFTKEQIVNSKKYVNRKDLLNAILKENELYSFSEVEEIINNFMKGVS >CP019857|1282568:1338364|1290896_1291115_-|AXU86056.1|DBSCAN-SWA MLKKLRKERGMTQNELAEKANYSRAYISDLENKRYKNINISTIIDLSLALEIDFLELCRYYCEEELRKRKLM >CP019857|1282568:1338364|1296676_1297366_+|AXU86067.1|DBSCAN-SWA MNQDTEYKCLKCKDRLFIETDEGFKECKCRKLRIAENILKNSGVSEEFRKLKFDNFNYQVDSSVAKAFTKAIEYSNYFEQIREIRRNSIIFMGQVGSGKTHLSLAIANSLMNRSISVIYMPYRDSMTLIKQNIMDEETYRREVGKYKSAKVLLIDDLYKGNITNSDINIMFEIINYRYLNKMPLIVSTEKNFDELLEIDEAIGSRLIEMSKNYLIELKGKRLNYRIYGG >CP019857|1282568:1338364|1299963_1300314_+|AXU86072.1|DBSCAN-SWA MKKNILGVLLPLLTMIIIFFLSFENTITNNLGLSEMDIKGILISGVVLYIPVSFLVNGIICAKKQINWKIPALISLLGSVVIMMYLRFDSTEMALYLSYYSMSYCIGYWITSVMKK >CP019857|1282568:1338364|1333460_1333751_+|AXU86115.1|DBSCAN-SWA 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71 | Clostridium_phage(81.48%) | tail,portal,protease,capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1466452 : 1484281
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP019857|1466452:1484281|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP019857|1466452:1484281|1480846_1481659_+|AXU86260.1|tail|DBSCAN-SWA MAEQKYYTLLTKAGKASIANATALGKKVDLVKLQLGDGGGSEYSPTEEQTSLKEVVWEGNISNVKIDDDNSNWIVIETVIPGSIGGFMIREVGIFDSENKLIAISKYPETYKPTADSGSVKDLIIRIILVVSNTSSVNLKVDPTVILATLKDIQELDKKIDTTKITLTSGIETTKIELNTKIDNTKTDVTSKIGDTTLLNTTDKTSLVNAVNEVKEGLDSIETTAEKTSYDNTVSKLAATNVQGAIDELCTSVNTARISLINDIKDMLPI >CP019857|1466452:1484281|1471168_1471612_+|AXU86249.1|DBSCAN-SWA MLKYKEILETIIEILKKNFTESIFIDDESVQGSEGSCFFVSILSVICTPVMLNTNNKDIVISIKYLPKPQSKSIRMYEVSDELNKLFNRNIKVTDRKLNITKLEQSIKKEESIYVLNFTLTLNYLDSVYEEDVVYENMEEINLNLGE >CP019857|1466452:1484281|1483215_1483425_+|AXU86263.1|DBSCAN-SWA MDARKKWIPFLGVQVKQRLIELNMTQRELAKKIGVNENYLSAILNGRRTGKKYKSSIYQLLNIEYSEDD >CP019857|1466452:1484281|1476897_1478415_+|AXU86255.1|DBSCAN-SWA MIINRSKDSSSVNINFTAKDMGFLLLQSEVSYNFKDKLVEDIAKQVFADNKLAIGNIPKTNVKYTKMFISVNGYDTIMSAYTEASKTTKKKYMIEANLDKFNIIEKGTVTLNIIFEEGFNLINTTFSESMENVKNKVLLVDQYGNKISEKVNNSLFKEVNVIMQKVIQQQENSTTDIENEFKGIERTCSLKGYGDTSCITGRGVKVKDSYTKLVGLFYIDTDKHTWQNGDYQIELELNFQNIMDEKSVGQDEQKEEISDLSGNGALNGREVKAEFTAYYPSNDPMEGGLYQKMDGKKLVPSNNTCAAPEVLKFKTQIQVKGTGTNIDGKTYTVTDRGGAIKVVNGIYKIDILMSSKKECYNFGRRKGTIIIGDGTGYTNSTGKVKELISIAKGKKGCKYVWGASGPNTFDCSGFTQWCYKKIGINIPRVSRAQGSVGKQVEKKSLQPGDLVFFSSKGPKGTIDHVGILIGNNEFIHSPHTGDVVKISSLKGSYYSKNYVGARRFL >CP019857|1466452:1484281|1482497_1482917_-|AXU86262.1|DBSCAN-SWA MDTLGERIVYLRKAKNLKQYELEEMLGCDNLSKFERNIRKPNYEILKSIAEIFNVSVDWLLNGDNLSHKSDLICDSSSNYPLNSINSNEIKLLNNFRKLNDYDKAKIEGMIELKLHEYEKEKDLGKIEYNKNKDEKIDK >CP019857|1466452:1484281|1483456_1483666_+|AXU86264.1|DBSCAN-SWA MCKLDSDGVIECCRAIDDFITALSNIKSLNMERLNTLTKYSSTCSILLKEGNYEGCTIVYRKMLEELKT >CP019857|1466452:1484281|1481814_1482270_-|AXU86261.1|DBSCAN-SWA MGLRDKFAQSFARSKTMSGPEKKANEIMGKLLLKKAILPIVLMFVIIIAGAMLKINSWVTLGINLVIAVGAFFYIRNSSKKYQNFKPYVGNLISLEKKGKKEYVAIIKQGKLPVKLQIAYGGEDLEHVKKNQMVQISYNPDAKIAILVNRQ >CP019857|1466452:1484281|1469100_1469607_-|AXU86245.1|DBSCAN-SWA MNNLDKLFELASQEEIIIHYTTYIAGDLEGLYINKHGIKIISLLSNLKQNSKKLTSILAEELGHHFTSLGYYVSSYNDYYTKIIIDKCENKALKWACEFLITEEDIINIINSGITCVYEMADILNVDITFFQKRLEFLSLKKQSLQLGNNKYLILTNLPYFYIFDPIS >CP019857|1466452:1484281|1466452_1466653_+|AXU86241.1|DBSCAN-SWA MKTGVVKWFNNEKGFGFISVEGEGDVFVHFSAITGDGYKTLEEGQSVEFEVVDGAKGPQAANVVRL >CP019857|1466452:1484281|1472694_1473123_+|AXU86251.1|DBSCAN-SWA MANMEARNVMSGTWGELWLDGDKVAEVKKFQAKMEFTKEDIIIAGQMGTDTKYMGYKGKGSITLYHVSSRMHKLIGEKIKRGSEPRFVAISKLNDPDSYGAERIAVKNIAFDDLTLADWEVGVKGEIEAPFTFTEYDFLDII >CP019857|1466452:1484281|1483882_1484281_-|AXU86265.1|DBSCAN-SWA MDTLGKRIAYLRNSKKLTQRKLMDILKFENLGKYETGDRKPNCDILMSIADYFNVTTDWLLYGKEKVNVNSSVKEDKEDYLHVTNDEMMILNLYRQLNERDKIKIEGILELKISEYKDLKKHSSNNNEDKMV >CP019857|1466452:1484281|1478754_1479186_+|AXU86257.1|DBSCAN-SWA MSNTIFPFIGVPEDYEIPKKEELGLFREVAWNFEKDEPIVENGDFKIIEKNEAIKVWVYKCIKTNKNEHEIYSNDYGTELTDLIGQKYSKGLTESEASRYIKEALLMNPYILQVDVVNTNFKKDILGAYIKISTIYGEVEINV >CP019857|1466452:1484281|1476206_1476629_+|AXU86254.1|DBSCAN-SWA MEMWLRQAEDRFRFPVIPPSISINGKSTINSSNILKVGEIATFGGVALKSINISSFFPNKEYSFCNYKGFPSPYDCVNKIQRWMNEGLILRFTVTETNINMEVIIEGFSYEERDGTRDVYFSLDLREYKRLQILRANPKK >CP019857|1466452:1484281|1467073_1467502_+|AXU86242.1|DBSCAN-SWA MNILFFLTPKSEVAYIYEDYTIRQALEKMEYHKYSAIPIISKDGKYVGTITEGDFLWTLKNDLNLDLKGLEDVPVTDINRKMDNSPVSINADIEDLVIKSLNQNFIPVIDDQDTFIGIIKRRDVIGYCYEIIRGYKNLANDN >CP019857|1466452:1484281|1471616_1472681_+|AXU86250.1|DBSCAN-SWA MAIGLPSINISFKELATTVKERSARGIIAMVLKDAKALGLNEIHEKEDIPVDLSAENKEYINLALMGNVNTPNKLLVYVIEGEADIQTALDFLETKEFNYLCMPKAVEADKTAIKNWIIKLRDIDKVKVKAVLGKVVGNHEGIINFTTEDVLVGEKKYSVDEFTSRVAGLIAGTPLSQSVTYTKLSDVVDIPKMTKVDAESKVNKGELILIKEAGAIRIARGVNSLTELTAEKGEMFQKIKIVDTLDIINNDIKKVIIDDYIGRVPNSYDNKCILIVAIKEYLEELEKEELIEVGSLVDIDIEAQKQYLKSKNIDISNMKEQEIREANTGSKVFLKAKIKMLDAMEDIDLSIEI >CP019857|1466452:1484281|1479178_1480228_+|AXU86258.1|DBSCAN-SWA MYSNQTYETIKNRTLKNINLDVYKGEGSFLNDMVSGNTFELSKMYVELSNIYKMAFIEDTYNQLLDKRVNEFGVYRKLGTEATGEVEFIGENGVEISNGTIISYKDLSFVVIKDIVIGGEEGNISPVEALEIGTRYNLPSDCEFKVNDNIFGIEKITNINKFSGGTEIETDEELRERFFRVQKNQATSGNKAHYEEWALEVDGVYNAKVYPRWNGAGTVKVLLFGQNNQAVEEEIITKCREHIEEEMPIGATLTVTTPIPLNITISASMELESGYTLDMVKNSFIENINQYFRSITGEIVYTKIMGILISTSGVHDLSNLLVNNSTDNITIEDDKIPSVTTLDFSEVEV >CP019857|1466452:1484281|1469688_1470009_-|AXU86246.1|DBSCAN-SWA MFAKRLRELRKEFGLTQRELGEKVGVSQRVLGYYETENRFPDEHILNKLADVFNVSVDYLLGRTLVKENIDTVAAHRKNPHEELPEEAQEQLNDYIEFLLNKYKKK >CP019857|1466452:1484281|1473876_1476207_+|AXU86253.1|DBSCAN-SWA MGNVREEGINMYITDNYTPKMNQIISVTEALKRVTVSVSPSVNTMANSIKSSMASASSSINSINSSIKKMTSSIKSLSNSIEKMNGSMNNSGSSNKDFSEGLETLGRSAENARSKLVRLSQVANSKKGRDTHKNVKAKNNESKNNKSDKPEKIKTVQDIVKRVKTQTVDTSKKIVTGKLPELKNKVFNSNLVMGVKGNNIVQNTLNILNKIKNSKWISSISVKDLAKNVLIGTLSKLKQFAGRMWTGAISIKDKASSILGGIKDKISDITNGFSIGGAVKKGVDLVGKGQNQKAVLTNVVQRTTGVKDKIEAKSEANNYYNDVIKDIALKSPFDPSEVISMSTKAMTISGGKIDKSKDITQAMVNVRALNMETSSDQDVSAAFVSASKGNMDALNTLVGENYKTLDDALEGIKEKQNGLANEMAGTIPGLLSSASTYIDMGLNSMIEPFDSILEGGLKKINSFLEKVPSGIGGFSQKVADVMNGKKIAENKQNPIETQVATALGHVPQSIGNTSQMLVQNIDFTALTNSLLPVVNLVNVLLDSINNKSPVAQGIISIFGTVVTTVFQLIGPVVEAVSPIIMRIFTFLGEYAPQINNFIETLGVIWKTVWETLGPLLETGWKIIEPILGAFFNILDKVCKIVKDICKWWQTMINKIKNGSITGTVLNLVEKSKKNYKDNPYAGTKAGDSGKAYSSKKGNNAFGLNYVPYNDYQTRLHEGEMVLTKQEANQYRSRKNGGNINIAKLADTIVIREEADIEKITSKLVASIQVAQLGGVL >CP019857|1466452:1484281|1478428_1478755_+|AXU86256.1|DBSCAN-SWA MANSINEFIGIIRKEGKYYNKPSFFVGKIINKLPDLKVSMNNIVLDKDNLLIDNWLFDRATKSFIITQSNNHTHELNESLTNQLDKGDTVIMFKVGEKFAIISKLVSL >CP019857|1466452:1484281|1480227_1480845_+|AXU86259.1|DBSCAN-SWA MKLIDKLPSFYKNYMVEAIQDSYDSELSSLKENIDDTINQMFVNTSTWGLDMWESILCIQNNEDLNYETRRSNIKAKMRSLGTTKLKVIKNICEAYTKTDVEVTVLSNEFIFILEFIVNNCSYNSIVELDKVLENVKPCHLEHKFKMILLNKNELFCGTAINTGETVTVYPWTPSNIEIFGEITISTGNDRSMEKVILYPKQEAI >CP019857|1466452:1484281|1473236_1473683_+|AXU86252.1|DBSCAN-SWA MNENGLSKNINIVDLLLNADTENLERPSTIVELKRLSTIFGQEFKVMCRALTISKDEEIQNTCLKIDENMKTDIDLPEMQMLTIIEGVCDLDGKLLFKNKELMDKFKAPTPKELARKLLLPGEITNLYRILQDVMGYGKNAVIEEVKN >CP019857|1466452:1484281|1467644_1468400_-|AXU86243.1|DBSCAN-SWA MEKKVLATVGEKEITNIDIENALKSLDPYQAMQFKTEEGKKHLLNDLVNQELFFLDAKEEKLDEEEIFKLEMKKIEENVLKQFAINKVLSSVNVTEDEKVKFFEANKSSFSKPESATAKHILVDSDEKAKEILAQIKSEEISFEDAALKHSSCPSKDMGGDLGTFGRGQMVPEFEEAVFSMAKGEVSEPVKTQFGYHIIKLEDLQESTESTFDEVKAEVEKSLLYQKQNEVYGNKINALNAKYGNLVKYND >CP019857|1466452:1484281|1470479_1470920_+|AXU86248.1|DBSCAN-SWA MENKKDILFKETDKRLHNYKYLDIKIKNINLDIKRCENEYSGCGAMVYTEKTSNTYNISSSVENEVLKREERLRKLKMEKEDIEIEKEKIENALTCLNDIEMEFFNLFYNSKTKNNMTYISMKLHLDRTSCYNLKKKMIFKLSEIL >CP019857|1466452:1484281|1468520_1468937_-|AXU86244.1|DBSCAN-SWA MYKEKLFDNYFKFLALLFWPIMWYKWIVISNGTLENMLFTIYAIVAIVFIILYSVFMIKYKDITQIDFFYRISTLLAFIFTLFSFLIYPKSLFFLYLKIIFTGIYLYYSIVKTLKFKDDEGVVGIMSSLLLIVITLFY >CP019857|1466452:1484281|1470177_1470375_+|AXU86247.1|DBSCAN-SWA MFKNNLKYYRKCKGMTQIQLARKAGITNDYISQIERGIKNPGLLMAKKISSILEQNIEEVFFIQL |
25 | Clostridium_phage(52.63%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1566252 : 1575979
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP019857|1566252:1575979|DBSCAN-SWA TATGATTCTTATGATAGACAATTATGATTCTTTTGTATACAACCTAGTCCAATATATAGAAGAATTAGGGGAAACAGTTGTAGTAAAAAGAAATAATGAAATCAAAATAAGTGACATTGAAGAACTAAATCCAGAGGTAATTGTGTTATCTCCAGGACCGTGTTCTCCAAAAGAAGCTGGTATTTGCATAGATATTGTTGAGCATTTTAAGGGGAAAAAACCTATACTAGGAATTTGTTTAGGTCACCAAACTATTGGACATGTTTTTGGAGGAGATATTATAAAAGCACAACAGCCTGTGCATGGAAAAGTATATAGTATCAACCATACTAATAAAGGAGTTTTTAGGGGACTTAAAAATCCTTTAAATGTCACTAGGTATCATTCACTAATAGTTGACTCCAATACAGTTCCAAAAGAATTAGAAATTACAGCAATTACTGATAAAGGGGAAATAATGGGGATTAGGCATAAGAAATATTTAATAGAAGGAGTACAGTTTCATCCAGAAGCTATTTTGTCAGAGTATGGTCATGAAATGCTTAAAAATTTTATAACAGAAGCTAGAGAAAGGGTACATATGTAATATGATAAGAGAGATAAATACTAAATTAAATTCTTTTGAGATATTTACTATTTTTAGAAATGAACATGACAGTTTTATATTAGACAGTGCTATGGATAAAGAAAAATTGGGAAGATATTCTTTTATAAGTAGCCAACCATTTAAGGTATTAAAGTATAAAGATACTGATGAAAATCCTTTAGAAGTTTTAAAAGAAGAACTACATAAGTATAGGGTTGTAAATGATACTAATCTTCCATTTGTAGGAGGTGCTGTGGGATATTTATCTTATGATTTAGGTAATTACATAGAAAATTTACCTAGAACTGCTGTAGATGATATTGAGATGCCTGATATGTATTTTGGATTTTATAATCATGTAATAGTTATAGACCATCTTGTGCAAAAAACTTATATAGCTACTCCAAACATAGATATCGAATTAGAAGAAAAGATAATAGATGATATAGAACAAAGAATATTAAAAGAAGAGAAAAAAGGTATAGATAGCATATGTTATGAAGAAAAAGAAGTAACATCTATAAGACTTAAATCTAATTTTACAAAGGAAGAATTTAAAAATGCAGTTCAAAGTGTTAGAGAGTACATAAGACAAGGAGATATATATCAAGCTAATTTAACACAAAGGTTCAGTGGAGAAACAGAACTTACAAGCTTTGAATTGTATAGGGACTTAAGAAGATTTAGCCCAGCACCATTTGGGGCATTCTTAAACTTTGAAGATGCACATATATTATCAAATTCTCCAGAAAGATTTATAAGATGTGTTAATAAGAGAATAGAAACTAGACCAATAAAAGGTACTCGTCCAAGAGGGAAAGATAAAGAAGAAGATTTAAGACTTCAACAAGAACTTAGAAATAGTGAAAAAGATAGAGCTGAACTACTTATGATAGTAGATTTAGAAAGAAATGATATTGGGAGAATATCTAAAACTGGAAGTGTTAAAGTTCCAGAGCTATTTGTAATTGAACCATATGCAAATGTAAATCACTTAGTTTCCACAGTTGTAGGTGAGTTAAAAGATGATAAAGATGCTACTGATGTAATAAAAGCAACTTTTCCAGGGGGGTCTATAACAGGAGCACCTAAGATTAGAGCAATGGAAATTATAGACGAATTAGAGCCAACGCAAAGAAATGTATATACTGGTTCAATAGGTTATATAGGTTTTAATGGTGATATGGATTTTAATATAGCAATTAGAACAATAATCAAAAATGACAAAAAAGTCTACTTTCAAGTTGGAGGAGGAATGACTTGGGATTCTGACCCAGATGAAGAATATCAAGAAACACTTGATAAAGCTAAATCCATAATGAAGGCTTTGAGGGGATATTATGAAGAATAATGTAGGTTTTGATAGTAGTTTAAGTAAATTTGGAATTGGTTTGTTTGAAACTATTAGAGTTAAAAATGGAATAGCAGTAGATTTAGATATCCATATAGAAAGAATGCTAAGCTCAATAAATTGTTTGGATTTAGATATAAACTATACAAAAGATTTCTTGATAAATGAAATTGTTACATATATAAAAAAAGAAAATGTCATTAATAAAGCACTTAGAATTACTGTTTTTGATGAAGGTTATAATATATCTATTAGGGATGTTCCATATAATCAAGAGACGTATGAGAAGGGGTTTAAATTAGCTATATCTCCAATAGTTAGGGGGAATAGTTTAATTCATAGACATAAGACTACTAATTATTTTGAAAACATATATACCAAAAATATCGCAAATAAGACTGGTTATAATGATGGTATATTTTTAAATTCAGAAGGTGTAATATTAGAATGTTCTATGAGCAATATTTTCTTTATAAAAGGAGAAAGAGTGTACACTCCTAGTGATAGATTACCGATATTAAATGGAATAATAAAAAAAAGGATTATAGAGATTTGTGACGAATTACATATAGAGTTGATAGAAAATGAAATTAATATATCAGAAATTAGTAGTTTTGATTTTGTTTTTGTCACAAATAGTCTTATGGGCGCTATAAAGGTTACAGAAATTGACAAAATAAAATTTAATAAAGAAAATGTTGTTTTTGATAAAATAGTGAAGTTATTAGAATAAATTAAAATATTAACAATTTGTTGGAGACAAAAGATGATAGGTTGTATTTATGAAGTATACAATGAAGAGATAACTAAAATAATAGAAAACCAAAACACTTTGGCTGTATATTTAGTGGGTTCTAGTAAAGACGTAGATTTTACTCTTTATGATGTAGAGATAAACGATATTGATGTGTTCGTTTTTGTAAAAGAAGGGGAAAAACAAGAGAGAATACTGTTTAAAAAAAAGGGAATAGAATTTGATGTAAATTACTTTTCAAAAGATGGTGTAAAAAAATTATTATCAAATAGGGAATATTTCTTTGTGAAAGAAATGAAAGATGCTAAAGTACTGTTTGATAGGGAGAATATATCACATATTATAAAAGATATAAGTAGAAATATTTACTTAGAAGGACCCAGTAAAATGTCATTAGAGGAAAAGTCTTTTATAAAGCAAGATATTGGAGCAAAAATATCGAATTTAAAAAATAAAGAAAAATTTGATGTTTTTGAATATCATTTTTTGACGAATTTATATTTAAAAGATATAATAATTGGGTACTTTAATATAAATGATAAATGGGTACCAAAAGACAAAAAATTGCTAAAAGTTTTAAAAAAAGAAAATAATGAGCTTTTTGAACTAGTGTCAAAAGTAAGTGAAAATTATGACTATCAAAGACTTTTAGATGTTTATAATTATATTTTTAAAGAAATTGAGACAAAAGAGGTTATAAAACTAATCTTCTAGTCACAAATCAATGGGGGGAGTTTAAATGAATAAAGTTGATAAAGAAAAGATACAACATGCAGTAAGAGAAATACTAGAGGCAATTGGGGAAGACCCAGATAGAGAAGGTCTAATCGAAACTCCAAATAGAGTTGCTAGGATGTATGAAGAGATATTCTCTGGTCTTAGTGAAGAACCAAGAGACCATTTAAAAGTTCTTTTTGCAGATGAAAAACATGAAGAGTTAGTATTGGTAAAAGATATTCCATTTTATTCATGTTGTGAGCATCATCTAGTTCCTTTCTTTGGAAAAGCTCATATTGCTTATTTACCAAAAGGAGGAAGACTTACAGGGCTTTCTAAACTTGCTAGAGTAATAGATACATTGGCAAAAAGACCACAATTACAAGAAAGAATCACTAAAAATGCTGCAGATATAATAATGGAAGAATTACAACCTTATGGTGTCTTAGTAGTAGTAGAAGCTGAACATATGTGCATGACAATGAGAGGCGTAAAAAAACCAGGTTCAAAAACTGTTACATCAGCAGTGAGAGGAATATTTGAAAAGGACATTGCGTCTAGAGCCGAGGCTATGAGTTTGATTACTATGAAGTAGCAATTTATTATAGATATAATCATTTATTGAGATAAAATTTAATTTAAGGGAGTGTCATTAATTGTGTTTGATTATGGTAAAAGAACTTATATAATGGGAATATTAAATGTAACTCCAGATAGTTTTTCTGATGGAGGAGATTTTAATAACTTGGACATAGCAATACAACATGCAAAAGATATGGTTGACCAAGGTGCAGATATAATAGACCTAGGAGGAGAGTCTACACGCCCAGGTCATAGCTATGTAGACTCAGACGAAGAGCTAAGAAGAGTAATCCCTGTAATAAAAAAACTTAAACAGGAATTGGATATACCAATATCAATAGACACTTATAAGGCAGATGTTGCAGAAGAAGCATTAAAATTAGGTGTCACTATGGTAAATGATGTTTGGGGCCTTAGAAAAGATAAAAATATGGCTTCTGTAATAGGAAAATATGATGCAGAAGTGTGTATAATGCATAATCAAGATGGGACAAACTATGACAAAGATATAATGGAGTCAATAAAAGACTTTTTTAAGGTAAGTATAGAAATGGCAATGAGTTATGGTGTAAAAAAAGAAAAAATAGTACTTGACCCAGGTGTAGGATTTGGCAAGGATTTTGAACAAAATATTGAAGTATTGAGAAGATTAAATGAATTAAAAGATTTAGGGTATCCTATTTTGCTTGGGACATCCAGAAAATCAGTAATAGGAAAAGTACTTCCAGTTGAGCCTAAAAAAAGATTAGAAGGTACAATAGCTACTACTGTTCTTGGTATAAGAGATGGCGTAGATATAGTTAGAGTACATGATGTTTATGAAAATTTAATGGCAGCTAGAATGACTGATGCAATATATAGAAAGTAGGTATAATATAATGGATAAAATATTACTTAGTAATCTAGGATTCTATGGATATCATGGTGTTCTTAAAGAAGAAAATTTTCTAGGTCAGAAATTCTTTGTCGACATGGAACTTTATATTGATTCAAGAGAAGCAGGTCTTAGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP019857|1566252:1575979|1571119_1571485_+|AXU86340.1|DBSCAN-SWA MDKILLSNLGFYGYHGVLKEENFLGQKFFVDMELYIDSREAGLSDDINKSVSYAEVYNVVKDITENKQFNLLEALAENIAEEVLNKFILINGVRVRVRKPEAPVNGIYDYFGVEIRRARDE >CP019857|1566252:1575979|1573004_1574795_+|AXU86343.1|DBSCAN-SWA MNDIKDIIEEIKARCDIASIISEYMNIKQSGANYKGLCPFHGEKTPSFYINTSKQIYKCFGCGEGGDVINFVMKMENLDFMDAVKILANKCGIEINTNMNEETRIKIEKSKKFQDIHTEAARFYLSNLLGSKNLGYEYLRIRGLDDKIIKKFGLGFSLDSWNSLMNTLISKGYKKQDLLECGLIAKNRDGTNCYDKFRNRVMFPIFDYRGNIIGFGGRVLDDSLPKYLNSPDTLIFNKKQNLYGLNFARKNLESKTIVLVEGYMDLISLYQYGIKNVVATLGTALTEQQGILIKRYADTAIISYDSDEAGIKATLRAIDILTKLGINVKVLDLKDAKDPDEFVRKYGLSDYKKAMDVSTHYIKYKIDHLKKEFNIQKDEERVKFAKEASKIIKQLTSPVEIDFYTKYLSNQIDINVESIKREVYGKNYNKPYNNKNQKKIEEKVIEKVEVRQDGKQLVEETLIKIMLEDKKIREIALLKVEESDFLLKESKEILNYMIKNQELDKITIDKLKSLNISEEYLKELNSISLNSINLENTKEIEGIITNIRKNSLEEQINSLLREQQELENNNDMKEVDGRVMEIALKIVEINKILKSL >CP019857|1566252:1575979|1574812_1575979_+|AXU86344.1|DBSCAN-SWA MENKSNKKELKKVTAKTLIEKGKKQGSLTLAEIMEAFSETELDKDQVENLYETLGNLGIEITETKNYKADIDFSVADDDLSIGHLDEDAEAISHDDSSAIEIETVDLSLPKGISIDDPVRMYLKEIGKIPLLKPHEEVEFARRMHEGDEIAKQRLVEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNLGLIKAVEKFDYTKGYKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVSRQLLQELGRDPKPEEIAKEMEMTEDKVREIMKIAQDPVSLETPIGEEEDSHLGDFIPDDDAPAPAEAAAYSLLKEQIEDVLGSLNDREQKVLKLRFGLEDGRARTLEEVGKEFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKKLRDYLD >CP019857|1566252:1575979|1571477_1571984_+|AXU86341.1|DBSCAN-SWA MNKAYLGIGTNMGDRFDNLSRACELLKNSDSIYKVKESSLYETKPWGYTEQADFLNMCVEIETEFEPYELLEYCQEIERELHRERIVHWGPRTIDVDVLFFNDVVSTDERLTIPHPRIQDRAFVLIPLMDLNEKLIINEKTIKEHLNLLSAEEREEVKELVGYERKPI >CP019857|1566252:1575979|1568177_1568921_+|AXU86336.1|DBSCAN-SWA MKNNVGFDSSLSKFGIGLFETIRVKNGIAVDLDIHIERMLSSINCLDLDINYTKDFLINEIVTYIKKENVINKALRITVFDEGYNISIRDVPYNQETYEKGFKLAISPIVRGNSLIHRHKTTNYFENIYTKNIANKTGYNDGIFLNSEGVILECSMSNIFFIKGERVYTPSDRLPILNGIIKKRIIEICDELHIELIENEINISEISSFDFVFVTNSLMGAIKVTEIDKIKFNKENVVFDKIVKLLE >CP019857|1566252:1575979|1568954_1569656_+|AXU86337.1|DBSCAN-SWA MIGCIYEVYNEEITKIIENQNTLAVYLVGSSKDVDFTLYDVEINDIDVFVFVKEGEKQERILFKKKGIEFDVNYFSKDGVKKLLSNREYFFVKEMKDAKVLFDRENISHIIKDISRNIYLEGPSKMSLEEKSFIKQDIGAKISNLKNKEKFDVFEYHFLTNLYLKDIIIGYFNINDKWVPKDKKLLKVLKKENNELFELVSKVSENYDYQRLLDVYNYIFKEIETKEVIKLIF >CP019857|1566252:1575979|1571964_1572750_+|AXU86342.1|DBSCAN-SWA MKENLFNNNSKIEINTNNKKITVKKDKLIIAGPCAIESYEQLLETAKFVKSQGANILRGGAYKPRTSPNSFQGLKKEGLEILKAVKDEVGMAVITELMDVRDMDELYSISDIIQIGSRNMQNFTLLSEVGKQNKPVMLKRGIASTITEWIGASEYIAIEGNSNIIMCERGIRTYNDYTRNTLDLAAVPIIQKETGLPVVVDPSHATGVRYLVKPMSLASFACGADGIMVEVHPDPENALSDGAQSLCFNEFEDLMKSINNY >CP019857|1566252:1575979|1566252_1566837_+|AXU86334.1|DBSCAN-SWA MILMIDNYDSFVYNLVQYIEELGETVVVKRNNEIKISDIEELNPEVIVLSPGPCSPKEAGICIDIVEHFKGKKPILGICLGHQTIGHVFGGDIIKAQQPVHGKVYSINHTNKGVFRGLKNPLNVTRYHSLIVDSNTVPKELEITAITDKGEIMGIRHKKYLIEGVQFHPEAILSEYGHEMLKNFITEARERVHM >CP019857|1566252:1575979|1566838_1568188_+|AXU86335.1|DBSCAN-SWA MIREINTKLNSFEIFTIFRNEHDSFILDSAMDKEKLGRYSFISSQPFKVLKYKDTDENPLEVLKEELHKYRVVNDTNLPFVGGAVGYLSYDLGNYIENLPRTAVDDIEMPDMYFGFYNHVIVIDHLVQKTYIATPNIDIELEEKIIDDIEQRILKEEKKGIDSICYEEKEVTSIRLKSNFTKEEFKNAVQSVREYIRQGDIYQANLTQRFSGETELTSFELYRDLRRFSPAPFGAFLNFEDAHILSNSPERFIRCVNKRIETRPIKGTRPRGKDKEEDLRLQQELRNSEKDRAELLMIVDLERNDIGRISKTGSVKVPELFVIEPYANVNHLVSTVVGELKDDKDATDVIKATFPGGSITGAPKIRAMEIIDELEPTQRNVYTGSIGYIGFNGDMDFNIAIRTIIKNDKKVYFQVGGGMTWDSDPDEEYQETLDKAKSIMKALRGYYEE >CP019857|1566252:1575979|1570317_1571109_+|AXU86339.1|DBSCAN-SWA MFDYGKRTYIMGILNVTPDSFSDGGDFNNLDIAIQHAKDMVDQGADIIDLGGESTRPGHSYVDSDEELRRVIPVIKKLKQELDIPISIDTYKADVAEEALKLGVTMVNDVWGLRKDKNMASVIGKYDAEVCIMHNQDGTNYDKDIMESIKDFFKVSIEMAMSYGVKKEKIVLDPGVGFGKDFEQNIEVLRRLNELKDLGYPILLGTSRKSVIGKVLPVEPKKRLEGTIATTVLGIRDGVDIVRVHDVYENLMAARMTDAIYRK >CP019857|1566252:1575979|1569681_1570254_+|AXU86338.1|DBSCAN-SWA MNKVDKEKIQHAVREILEAIGEDPDREGLIETPNRVARMYEEIFSGLSEEPRDHLKVLFADEKHEELVLVKDIPFYSCCEHHLVPFFGKAHIAYLPKGGRLTGLSKLARVIDTLAKRPQLQERITKNAADIIMEELQPYGVLVVVEAEHMCMTMRGVKKPGSKTVTSAVRGIFEKDIASRAEAMSLITMK |
11 | Pandoravirus(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1710909 : 1725231
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP019857|1710909:1725231|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP019857|1710909:1725231|1712841_1715052_-|AXU86467.1|DBSCAN-SWA MKERIKGAFTKKKIFHFLKMALFVVALSLILLSLLGTVAHATGLVDDTINAENLYSKYPLSNYQLDFYVDNSWSWLPWNWLDGIGKSVQYGLYCITNFVWTISLYLSNATGYVVQEAYKLDFINDMADSIGKSIQTLAGVTANGFSSSGFYVGFLLLIILVVGLYVAYTGLIKRETSKALHAVINFVVVFVLSASFIAYAPDYIKKINEFSSDISTASLDLGTKIMLPNSDSEGKDSVDLIRDSLFSIQVEQPWLLLQFGNSNAEEIGADRVEALVSASPEDEDGKTREEVVKTEIEDNDNNNLTIPQVVNRLGMVFFLFIFNIGITIFVFLLMGIMMLSQILFIIFAMFLPISFLLSMIPSQENLAKQAIVRVFNTIMTRAGITLIVTVAFSISSMFYNISKDYPFFMVAFLQIVCFAGIFIKLGDLMNMFSLNAGDSQNMGRRIFRRPYLFMRHRARRMEHRIARAVSAGGISGGVAGAVAGSAVAGKRAERKNTASKENRGNTTSSMGQRAGSKVGAVLDTKNKVKDKANAVKENIKDMPTQTAYAVYSAKEKAKSSVSDFKRGMVQEQQSRQTGRLEKQEQRRQNIADKRMELQKAQEARQAQRKADGSATTGATRPHERPATASTIPKPSVEKMQEVKRPATATTSKISEPVKTSVIKERPLSSGASDRKASQPIQPAHRQNVEKVVSQETHQNYKAERTTKAQTFEQSKRTTEHTEKNRNLVMKKGQKKK >CP019857|1710909:1725231|1710909_1711821_-|AXU86465.1|DBSCAN-SWA 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18 | Streptococcus_phage(91.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2007149 : 2027757
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP019857|2007149:2027757|DBSCAN-SWA 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20 | Streptococcus_phage(84.62%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2239728 : 2259923
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP019857|2239728:2259923|DBSCAN-SWA 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MQETRVLVETKGTTGEETTSYWFDLPIDVAEFEEKLGVGAESGDYRIIEKVLPFADEVHEHTSVYQLNELDFMYRQLSSDMQEEYVSLLTVYENLEALYICRNVITVYPDCKSMIDVARQKLMNDPTFKHLSEDCQEYYFDFEAYASHLQEHGKFLVTEHGIFELPE >CP019857|2239728:2259923|2247077_2248085_-|AXU86967.1|DBSCAN-SWA MKLKHIALIGSLFPILFSIVLFFGVLISADSDDENSNFSSGITGMNLSAEVLKHQPMVEKYARENGISEYVNVLLAIIQVESGGTAEDVMQSSESLGLPPNSLDTESSIKQGCKYFASLLSSCKNQGIDDLNVAIQSYNYGGGYVGYVAGKGKKHTFNLAESFAREKSGGKKVTYTNPIAVAKNGGWRYQYGNQFYVELVNQYLTVPQVSGELAQKVMNEALKYQGWKYVYGGSNPNTSFDCSGLTQWCYGKAGISLPRTAQAQYDATQHLPLSQAKAGDLVFFHSTYNAGSYVTHVGILVSPTQMYHAGDPIGYADLSSSYWQQHLIGAGRVKQ >CP019857|2239728:2259923|2244086_2244824_+|AXU86963.1|DBSCAN-SWA MNKNIKYSQNFLTSEKVLNQIIKQLNLKETDTVYEIGTGKGHLTTKLAKISKQVTSIELDSHLFNLSSEKLKLNIRVTLIHQDILQFQFPNKQRYKIVGSIPYHLSTQIIKKVVFESHASDIYLIVEEGFYKRTLDIHRTLGLLLHTQVSIQQLLKLPAECFHPKPKVNSVLIKLTRHTTDVPDKYWKLYTYFVSKWVNREYRQLFTKNQFHQAMKHAKVNNLSTVTYEQVLSIFNSYLLFNGRK >CP019857|2239728:2259923|2245431_2245848_-|AXU86964.1|DBSCAN-SWA MKHKIQKVELFIGVIIFLGGLLTYGLGVHQLLPVPRPDLVVYGTTLIGIILIFMGCDIFSKPTKEMQILENDERNIAITNASLANAYKVTLTLLVLVLFALVFMGYMSKVVFFSIAGVIAIGQITWVITARYLDKNTS >CP019857|2239728:2259923|2246148_2247060_-|AXU86966.1|DBSCAN-SWA MFRKNKKQTETIKEPKEKKVRTFKVGTHKKSVIALWVVLIASVSFGAYKNFTAIDQHTTHEKEIIELRLQDTNGIENFVKNFAKPYYTWSNSKEAIEARTQAISGYLTKELQDLNVDTIRTDIPTSSTVTDVIVWSIEQSGTDTFSATYEVDQQIKEGEQTSNVKATYTVKVHVDADGDMVIVQNPTLAPAIEKSDYEPKTPEANASVDADTVNDATAFLETFFKLYPTATEKELAYYVSGNVLEPIGRDYIYAELVNPIFTKDGDNVKVKVAVKFLDNQTKATQISQYELVLHKDSNWKIVG >CP019857|2239728:2259923|2255656_2256853_-|AXU86976.1|DBSCAN-SWA MVLNEEQWIKELREKRIAYGISQGRLAVASGITREYLNKIESGKMKPSKELLNTLHKELAKFNPEAPLTMLFDYVKIRFPTLDIQHIIKDILKLNINYMLHENYGRYSYTEHYSLGDIFIYTSADEEKGVLLELKGRGCRQFESYLLAQQRSWYDFLMDALIDGGVMKRIDLAINDHTGILDIPELAEKCRKREYIGKSRSYKFYQSGELIKHREDDREYMGRTLYLGSLKSDVYFCIYEKDYEQYVKLGTPLEEADIINRFEIRLRNERAYYAVRDLLTYYDAEQTAFSIINQYVRFVDEEPDKRKNDWKLNDRWAWFIGDNRQSLKLTTKPEPYTLDRTLRWVQRQVAPTLKMLKKIDKGNGTDYMETIEQQAKLTEKHEMIIKQQTTPAKDLVES >CP019857|2239728:2259923|2242514_2242739_-|AXU86960.1|DBSCAN-SWA MIGLKKRDIKKALKAGAKAGGVSLADVRADIEATIDEAMNSTDPEVQENFRKYFGNKRPTPEEYIYKITKKTKV >CP019857|2239728:2259923|2240996_2241200_-|AXU86957.1|DBSCAN-SWA MNNTDVPIWEKYTLTIEEASKYFRIGEKKLRKLAEENIDAGWVIVNGNRIQIKRKQFEKIIDTLDEI >CP019857|2239728:2259923|2242770_2243196_-|AXU86961.1|DBSCAN-SWA MKKKLSFIIEIIIGIIFICFGYFVIDTDYYATLFYAMGFGLAFASGVQLLKICYYEMPKNKEKLQNINRENHINNVDERKIFLRMKAGSLVYQLMTFVYLFVAFVLALLHIEAWIIGIIFGLFLLQTFLGIILYKHFEKHF >CP019857|2239728:2259923|2239728_2240997_-|AXU86956.1|integrase|DBSCAN-SWA MSLSRRYGIINIAYHGSFHDGKELYTMSNVKRKDGKNRNLRNGESQRKDGRYVYKYTDIYGKPQFVYSWKLVPTDKTPAGKRDDISLREKEAQIKKDLNDGIDTVGGKMTVCQLYDKKNSQRKNIKRATEKGRQYLMNALKNDPLGMRAIDTVKQSDAKEWAIRMSEKGYAYKTIDNYKRSLKASFYMAIQDDCIRKNPFEFKLSDVLEDDTEQKVILTPEQEERLLAFMEKDKIYSKYYDEVVLLLETGLRISEFCGLTTHIDMQNRILNIDHQLLKDSEIGYYIETPKTKNGKRELPLTERAYQAIQRILKSRGKAQPLIVGGYSNFLFLNREGLPKVAGNYEGMVRGLIKKYNKYHTDKLPNITPHSFRHTYCTNMANRGMNPNTLQYLMGHANITMTLGYYAHGTFQSAKAELERLAC >CP019857|2239728:2259923|2255509_2255644_-|AXU86975.1|DBSCAN-SWA MWVLLKDFLLVSMGMGIGVVLMCILNVGKEADYEMEQLKESEDN >CP019857|2239728:2259923|2253228_2253732_-|AXU86971.1|DBSCAN-SWA MIDDMAVYIANLGKYNEGYLVGAWFTFPIDEEDVKEKIGLNEQYEEYAIHDTDNFPIAIGEYVSIEELNEMYEMIEELPDYIVECLDEFISHYGTLEEVVEHKDDIYYYPDCETMTDVAYYYIDELQALGDIPPSLQNYIDYEAYGRDLDMGGCFIETSRGMCEIPY >CP019857|2239728:2259923|2252713_2253112_-|AXU86970.1|DBSCAN-SWA MKKIKSYTGIWNVEKVLYAINDFNLPFPVTFTQITWFVITEFLIILFGDIPPLSMIEGAFLKYFGIPVALTWFMSQKTFDGKKPYSFLKSQITYALRPKITYAGKAVKLHKQILNETITAVRSVNYVPDKIY >CP019857|2239728:2259923|2255287_2255509_-|AXU86974.1|DBSCAN-SWA MNFGQNLYQWFLSNAQSLVLMAIVVIGIYLGFKREFSKLIGFLVVALIAVGLVFNAGGVKDVLLELFNKIIGA >CP019857|2239728:2259923|2258514_2259117_-|AXU86978.1|DBSCAN-SWA MNNNRPTFNEIKSYDEFVKYYWYRDELSKICKQLGIDNTGTKQELNQNIKEYFNGNLIKKKKSRSRTNLIAEVTLNSPLLDCGFSFNTKFREFFSQQTGVNNFKFTADMATAWRKVKKENDTSFTIQDMLNIYYCKSDYAKYDNSTCEWNKFLKDFCADERNTQFKNKLKVASILWKIVRDSDLPKVYTYDLVIKYLKTV >CP019857|2239728:2259923|2248081_2250286_-|AXU86968.1|DBSCAN-SWA MKERIKGAFTKRKILHFLKMALFVVALSLILLSLLGTVAHATGLVDDTINAENLYSKYPLSNYQLDFYVDNSWSWLPWNWLDGIGKSVQYGLYCITNFVWTISLYLSNATGYVVQEAYKLDFINDMADSIGQSIQTLAGVTENGFSSTGFYVGFLLLIILIVGLYVAYTGLIKRETSKALHAVINFVVVFVLSASFIAYAPDYIKKINEFSSDISTASLDLGTKIMLPNSDSEGKDSVDLIRDSLFSIQVEQPWLLLQFGNSNAEEIGTDRVEALVSVSPEDEDGKTREEVVKTEIEDNDNNNLTIPQVVNRLGMVFFLLFFNLGITIFVFLLTGMMLFSQILFIIFAMFLPISFLLSMIPSYESMAKQAIVRVFNTIMTRAGITLIVTVAFSISSMFYNISTDYPFFMVAFLQIVCFAGIYMKLGDLMSMFSLNAGDSQNMGRRIFRRPYLFMRHRARRMEHRIARAVSAGGISGGVAGAVAGSAVAGKRAERKNTASKENRGNTTSSMGQRAGSKVGAVLDTKNKVKDKANAVKENIKDMPTQTAYAVYSAKEKAKSSVSDFKRGMVQEQQSRQTGRLEKQEQHRQNIADKRMELQKAQEARQRKTDGSATTGATRPHERPATASTIPKPSAEKMQEVKRPATATTSKASEPVKTNVVKERPLSSGASDKKATQPAQPVHRQNVEKVVSQETRQNYKAERTTKKQTFEQSKRTTEHTEKNRNLVTKKGQKKK >CP019857|2239728:2259923|2241806_2242487_-|AXU86959.1|DBSCAN-SWA MSWKVLSIILYGHTLPNSILLTTEYLTALIARTDYMFCAGFFCTRKNFFIFFQNHATNHTLLYRYGAERGINTFHVITERGCDDMKPSDFQKTIQCQFDCKLKRVVKGIVRNYRKELKRRRNKEISYCELPEIVVEKLAVWDEYESDYTAFDVCGIEVRVLDDDLAEAIKYLSEKDREILLMYFFLGMSDTEIGDRLKINRSTSFRSRKNSLEEIKKKLKENMNDE >CP019857|2239728:2259923|2245844_2246048_-|AXU86965.1|DBSCAN-SWA MKNRLEELRKQRGIKQEDLATALEVSRQTIGSLENGRYNPSIILAFKIARYFQMSIEEIFIYEEESK |
25 | Streptococcus_phage(100.0%) | integrase | attL 2230282:2230301|attR 2252638:2252657 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2568573 : 2574852
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP019857|2568573:2574852|DBSCAN-SWA TTTACTCAATTTTGTAAAATACATAATAATTCTTCTTCTCACCTGCAATCTTGGTAGGTCTATTATTTTCCTCTATCCAAGTTCTCACCTTATCTATTACACTCTTTGTATATTTATTTACAGTACCAGTCCAAGAACCATTAATTTCCCAAACACCTTTAACTTCACCATCTTCTAAATCAATCTTTTTAATAATCTCACAAACTGCCATCTGAGCTGGTTTATTACTCTTAGAATATATTTTCAGTTTAGATGCTATTTGTTTTGTATCAAAATAATGTTCTTCTTCGTTTATCTCTATTGGTAAATCAATTCCTGCTTTCTTATATAATGTTTTAGCTGTTAATAGTTTTGATTTATTGTCAAAGCCTGCATCATCTAGCAATTCTTTTAACATAGATGTACTGTTATAAACCAACTGTAATTTTTCAATCTCACTTGCTTTTTCTCTCAACTTTTCGGTATTGCATTATTATTTATGTATGCACCAGTTTGTCTTATGCTTGGTAAAACTTCATCACTTATCCAGCCTTGGAATCTCTCAGCTTCTTCTTTTCTTGATTTAAAGATTAATTTATACACTCCACTTTCAGTAAGAAAATTTTCTCCAGCATTATTAAGTTTTCGGATGTCAGTATTACTGATATCCGAATTTCTTAACTTTACAACTTGCTTTTCATTCATAAGTCTTATATTCTCATTAACATTTTTTATGTCTAAACAGTTTACTACATCTTTTGAGTTGAATAAAATTCTTCCTTCAAATTCAAATACTTCAATCTCTTTTCCTTCAAACATCATTAATTCATTTTTCATAATATTACACTCCTTAATAATTGATTTTTTTAAGGAATGACATATACTATAATTGATATACGATAGTATACGTCATAGGGGTTACTCAAACTTTGGTCGGTGGGAGTGACCCTTATTTTTTATTCCTTTTGTTCCAGTTCCTCGTCGATTTTTTCTTCTAGCCATTCTTTCTTGGTTAGATTCTTTTCCTCTAACACTTCATCAAATTTATCTAACTTTTCTTTGTCTAAAAGTACACTAAAACCTCTTTTATCTTTTCGACGATTTTTCATATACTCTGCCCTACTTTTAGTTGCTATTTTATTCACCTCTTTTCTGTAACTCGTTACATTAATAACAATATTGTAACGAGTTACAGTCAATAGGTTTTTACTAACTTTTTCTAATTATTTTACCCAACCGACCAATTTTGAGCAGAATAAAAGCACCTACATATTTGTAAGTGCTTTCTTTGTTTATTTAATTTTGAATCCACATAGTTAATCTAAAACACAATTATTAATTGTTTTATTATTGAAATCACAGCAATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAATGTACCCTGCTAAATTTAATTTATACCGTTGTAGCCGATTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACAAGCATATACACATGTCAGAAGATATTTATAAAAGGATTTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACAAGACTTAACACAGTAACTAAACTGTACATAATTGGTTTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGATATAATAATGAAACCTTTTTTTAAACTTATTTTCTTTTTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACGACAGCGAACAAGAGGTTTGGGAGGATGAAAAAAGTTTTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACAAATTTTGTAGTAAATTTCTTCATAGCGTCAAAAATTTTTACATTCCATATAGTTAATCTAAAACCCCAAAATAAACTTAGCATTTCCAATACCTACATATATACAATACTCTTAAAATTGCAGTGAGGGGGCAATAGTGCAATTGATAACACTTATCACGCACCCTCAACATCTTAGATTTCAAGTATTAAGCCCTACTTTGTAACAAATATCGCACACTGCAAAACTTCTATATTTTTATTATATCATAAAATCTAAACTATAAAATTAAAATGGAATACTTTGTAAATTTAAAAGCACCTACATACCTGTAAGTGCTTACTATATTATCTATTCTAATAATTCTTTTTTCTTTTTATTATATTCTTCCTATGTAATTGCTCCTGAATCTAGCAACTCTTTTAGTTTCTTTATTCTATCTAGTGGGTCAACCACTCTGTTTTGAATGTAGTTATTATAACTGTTTTTTTCTTGTTCTATTTTCTCTTGTTCTCGCTTCTCTTCTTCTTCGGTTTTAAGTTCAAACTCATTGAATTCTAAATTTTCAACATTATCTACATTATTTTGTATGTTTCTAAAATAATCAATATAAACAGAATTATATATACCGCCGTCATCTTTTGAATGAAACTTAAAGTACGCCTTGCTTATTTTAATTTTTTTAAGATCATTAGCAATTTCTTTTACAAATTTTTTACATTCTTCAGAATTACTAAATTTTTCATTTTGTACAGTTAAATCAAAATACATACTATATCTTTTAAATTTTCCTACTTTTAATTCATATTTCTTCCCCTTATATTCTTGAGGTACTAAAGCCTCTAGCTTAACTTTTAAATCATTTTCTGATATTTCCATTCCATGTTTTTCAATATATCTTTCTTTGTCTACTTCTTCTTGTATTCTTCTTCTTTCCATTTCTTTTTCTCTTTCTACAGTTTCTCTTTGTGCCTTAACAGTCTCAACTTTATTATCTGCTATCAAGGATTTATCTTCCCAAGTTGCACAAAGATAAATTGAATAAGTGAAAAAAAGAACTGACACAAGACCCATAACTATTTTCTTTTCTATAAAAGAATATATAATCAACAAAAAAGCTATCATAACTAAAATATATTGCATAGAAGAAACAGCTATTATAAGTAATACTATTGTTATTATTGGTACTAATATCCACATTATAAAATTCCCCCACAAATTACTCATCTCACTCAATATTATAGCATAATTTGGCAAAACAAAAGCACCTACCATTTAAGTAAGTACTTTCTTATTTACAATTAAATTTATTCATCTAGTTAGATTCATCATCATTGTGTATAAAAAATTTCATATTTTTATTGACTATAAAAAATATTATATGCAATATTTTTTCTAATTTGTGGTATAATAAAAACAAGAAGAACTACAATCTATTTGCGGTAGAGTGAAGTTCTATAACTGAAAGTTATTTTTTACGATGATATTTAAAATTTATATCAATCTTTAAGTCACTCTTTGCGGTAGAGTGGCTTTTTACTTTTTTGATTAACTTGCTAATCAAATAAACTATGTAACTAGCTGTTACACTAGCTAACACATTAAATAAAAAATTATCCATGTATATTCACCTCCCTTCTTATCGTTGGGAGGATAATTTTTTAATACATGAACTCCACTCTATAAATTGTAGATTACATCTTCTTGCTACAATTATTATAACATATAATTCTTACATATTTTTCCTATATCTTACTTTTTATTTTATTTTCTATTTTTTCAATAAAAAGCACCTACATATTTGTAAGTGCTTTCTATGTTTATTTAGTTTTATTGATTACTTAATAGGTTAGTACAAATTCCATACCAACCTAAGAATATCTACATAAAATAATTAAATAATATAATCAATAAGTATTTTTTTTACTCTTTTAATCAAATTATTACCTGTTCCCCAATCAATCTGAAATAGTCCAATTGCACTACCAGTTGAGGTAATTTTAACAAGTGTTTTTCCTGTAGTATTTTCACAAATCACTACCAAACCTGCATCACTATTGCTTCTTGCATAATATTTTTCAAAGATTGTAACTATTATAGACTTATTATTTTCTAGGTTATAAATATCAACAGAAACTAAATCTGCTTCCAAATTTTTTTCTACCATTTTCTGTGCTTCTAGTGGTGTCATCTTTACACTAAATACATCTCTTGCCATATCATTCATCACATCCTAAATAAAAATATACTTTTTTAGTATTTTCTGACACTTTTATCAAACAGTATTCCTATTCCTCCTAGTAAAACCAGTATAGAACCAAAATTTCTATATTGTGAAATAGATTGTTCTAAATATATGTTGTATTGTTCGGTAGCTATTGACCCACCATTTTGTTTTATAATACAATCCATATTAAATTGACCTAGACCTATACAGCAAAATAACACTATTATTCCAATTACAAAAGCAAATATACATATTGTAAGTTTAATATCTTTATTTTCCACCCCTCATAATTTAGATTTATTTGTTGTTTTTTACTTGGTGATATATTATCTACATTATACTATACAACATATATATCCATCTATTTCCAAATTTGTAACATTTTCATATATTAGCAATGTAACTATTTTAACTTTAAATTCTACCTTCTTCTACCTCTCTTTTTCTCTCTTTCAGCTTCTTTCATTGTTTCTTCTTCATCTTCAATTTTAATAAGTATTGAGTCGGCTGCTAATGCTCTCTAATTAACTTCTAAATTCATATATTCACTAGGTTTCCACTTTAGCTTTTGAATACAATAATGAGTAATACTAGCCTGAACCTCCCATGACTAAAGTCACAGGTTTCCTGCTTCACAGAATTTTGCATACTAACATATGTCTTACTAATTCTCCACAGGCTATCCCCGTAGTTCCTACGGTTCTTACATACGTTATTTATTTTGAATTGTTATTAGTCTTAATCCTTCTTTTAATATATTTATACTTGCATTTATATCTCTATCGTGAGTTTCATTACAACTAGGATAAATCCATTCTCTTATATTTAAGTCCTTCACTTCCTCGTTTTTATACCCACATTTATTGCATATTTGTGAACTTGCAAAGAATTTACCCACCTTTACAATTTGTCTACCATGCCAATTAGCCTTGTATTCTAATTGACGAATAAACTCTGACCATGACACATCAGAAATTGAGCGAGATAGTTTACGATTCCTAATCATATTCTTTACTTGTAAATCTTCTATGCAAATAATATCGTTCTCTTTTATTAATTTAGTAGATAGTTTTTGTAGAAAATCATTTCTTTGATTAGCTATATGTTCTTGAAGTCTTGCAACTTTTAATCTTGCTTTATTTCTATTTAAACTACCGATTGTTTTTCTTGATAATTCTCTTTGTAATTTAGCAAGTTTGTTTAATGACTTCTTAAGATTTGAGATAAATTGAGGTTTATTTGAATAAATTGATTTGAATTATGTTATTTTCAGATTACTTTTATTTAAGTATTTTGATTGGATTCAGCTGAATTAATGTATATTAATTCTTATTGAACAGTTTTTATTTTTATACATTCTATCTACTATATACTATACATATTCTATTAAAATTTATATAAATAAAATACAAACTTATTTCATTTTCTTAACATGTTCAGAATAATAAACAAAATGAAGGTAGAAAAAGTTATAATTTCATACCTTCATTTTATTTATTATGTATCAATTTGTCATTTTCTTATTTCAAATTCTTAAAATATTCTTCTAATAAATTTAAAATATCACCATCTACTTCATCATCCTTACTACATAGTGCTGACATTAAACTTAATATTGAATTTTTATGTGTATTCTTTAAAAATTCTTTTGTTTAAAATCTCTGATATTATTTTTTTTACTAATACATTATAGTGTGTACACTTATCTATTTTCTCCGCTTCTAAAAACTCTCTTCTTTAGTAATCTTTTTAATACTGTAAATATAGTTGTATCTTTCCATTCATATTTTTGTTCCATAGACTTGGTGATTTCTCTTGATATTAATACCTTTTCTGATTCCCAAATATATCTCATAACTTTTAATTCCGCTTCTGGTAATTTACTAATTTTCATAGTATACATTCCTTTACCAATTTATGTATATGTTAAATTCTGTATCAATAAAGTTTTACAAACAAAAGAATTAAGGTAAATAATTACATTCGATTTTTACTATATCATTCTTTTAAGTTTCTATAATACTCATCTAATAGGTCTAACTTCTCTTTACTTACATTTTTATGTGTAGTGGTAAGTGAACGCATTATTTTTATGCTTTTACTAGATTTTAGTACCTTTTTCTTAAAAGTATAATATTCTTTACTATCTATTATTTTATAATGAGATTGAGAATTTATAATATATCTAGCCAAATACCTTTTAGCAACTAGCCTTTTTAGTAGTATTTTTATTGTACTTTTATGCCATCCATAAATCTGTTTTATTTCTTTTACAATTTCTTTTTTAGGCATTAGAGTGTCTTTTTTCCATAAATACTCCATTACTATTAATTCTGCTCTTAATAATTTTTCTATTAATATTTCTTCTTTCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP019857|2568573:2574852|2571720_2571873_-|AXU87249.1|DBSCAN-SWA MDNFLFNVLASVTASYIVYLISKLIKKVKSHSTAKSDLKIDINFKYHRKK >CP019857|2568573:2574852|2570642_2571527_-|AXU87248.1|DBSCAN-SWA MVGAFVLPNYAIILSEMSNLWGNFIMWILVPIITIVLLIIAVSSMQYILVMIAFLLIIYSFIEKKIVMGLVSVLFFTYSIYLCATWEDKSLIADNKVETVKAQRETVEREKEMERRRIQEEVDKERYIEKHGMEISENDLKVKLEALVPQEYKGKKYELKVGKFKRYSMYFDLTVQNEKFSNSEECKKFVKEIANDLKKIKISKAYFKFHSKDDGGIYNSVYIDYFRNIQNNVDNVENLEFNEFELKTEEEEKREQEKIEQEKNSYNNYIQNRVVDPLDRIKKLKELLDSGAIT >CP019857|2568573:2574852|2573191_2573485_-|AXU87252.1|transposase|DBSCAN-SWA MIRNRKLSRSISDVSWSEFIRQLEYKANWHGRQIVKVGKFFASSQICNKCGYKNEEVKDLNIREWIYPSCNETHDRDINASINILKEGLRLITIQNK >CP019857|2568573:2574852|2572505_2572760_-|AXU87251.1|DBSCAN-SWA MENKDIKLTICIFAFVIGIIVLFCCIGLGQFNMDCIIKQNGGSIATEQYNIYLEQSISQYRNFGSILVLLGGIGILFDKSVRKY >CP019857|2568573:2574852|2569022_2569388_-|AXU87246.1|DBSCAN-SWA MKNELMMFEGKEIEVFEFEGRILFNSKDVVNCLDIKNVNENIRLMNEKQVVKLRNSDISNTDIRKLNNAGENFLTESGVYKLIFKSRKEEAERFQGWISDEVLPSIRQTGAYINNNAIPKS >CP019857|2568573:2574852|2568573_2569026_-|AXU87245.1|DBSCAN-SWA MREKASEIEKLQLVYNSTSMLKELLDDAGFDNKSKLLTAKTLYKKAGIDLPIEINEEEHYFDTKQIASKLKIYSKSNKPAQMAVCEIIKKIDLEDGEVKGVWEINGSWTGTVNKYTKSVIDKVRTWIEENNRPTKIAGEKKNYYVFYKIE >CP019857|2568573:2574852|2574181_2574373_-|AXU87253.1|DBSCAN-SWA MKISKLPEAELKVMRYIWESEKVLISREITKSMEQKYEWKDTTIFTVLKRLLKKRVFRSGENR >CP019857|2568573:2574852|2572146_2572479_-|AXU87250.1|DBSCAN-SWA MNDMARDVFSVKMTPLEAQKMVEKNLEADLVSVDIYNLENNKSIIVTIFEKYYARSNSDAGLVVICENTTGKTLVKITSTGSAIGLFQIDWGTGNNLIKRVKKILIDYII >CP019857|2568573:2574852|2569507_2569660_-|AXU87247.1|DBSCAN-SWA MKNRRKDKRGFSVLLDKEKLDKFDEVLEEKNLTKKEWLEEKIDEELEQKE >CP019857|2568573:2574852|2574477_2574852_-|AXU87254.1|DBSCAN-SWA MKEEILIEKLLRAELIVMEYLWKKDTLMPKKEIVKEIKQIYGWHKSTIKILLKRLVAKRYLARYIINSQSHYKIIDSKEYYTFKKKVLKSSKSIKIMRSLTTTHKNVSKEKLDLLDEYYRNLKE |
10 | Clostridium_phage(71.43%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3127211 : 3136164
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP019857|3127211:3136164|DBSCAN-SWA TCTACTTTTCTCTAGTTGTTGCAATTTCTTTGATATTAGCATCTTCTGGTTTAATATAAGTTGGCACTAATTCCCTCATAATACCATCTATTTTTTCAACCTCTTCATTGTTAGTAATTTCTCTTAAAAGTTTTAAGTATTTTGTTATTTTTTCTCTATCAACATCTATTGGTCTACCAATAAAAATCTTTTTATGCTCTGTATCCAACAGACCTTCTTCTGACATAAGTAGTTCTTCATACAACTTTTCTCCTGGTCTAAGACCAGAAAATTCAATTTTTATATCAACATCTGGCTCAAATCCACTGAATTTAATTAAGTTTTTTGCTAAATCCAATATTCTTACAGGTTCTCCCATATCAAGTACAAATATTTCTCCACCTTTAGCCATAGCCCCAGCTTGTATGACTAAGCCTACTGCTTCTGGTATTGTCATAAAATATCTAATAATATCTGGATGAGTAACTGTCACTGGTCCGCCATCTTCAATTTGCTTCTTAAAAAGTGGAATTACACTACCATTACTACCAAGCACATTTCCAAATCTAACAGCAACAAATTCAGTCTGGCTTTCAGCATTCATAGTCTGTATAATCATTTCAGCAGCTCTTTTAGTAGCTCCCATTATGTTAGTAGGGTTTACAGCCTTATCTGTAGATATAAGGACAAATTTCTTAGCTCTATATTTTGAAGACAAGCCAGCTATGTTTAAAGTTCCAAATATATTATTCTTTATAGCTTCGCCAGGGCTCGATTCCATAAGAGGAACATGTTTATGTGCTGCTGCATGAAATACCACTTCTGGTTTATATTTATTAAATATTTCATCCATTCTTTTTTCTTCTCTTATTGATGCTATTACTGTTTTTAAATCTAATTTATTTTTATATTTTCTAAGTAATTCTTGTTGTATTGAGTAAGCATTATTTTCATAATTATCAACTATAATAAGCTCTTTAGGATTAAATCCTGCAATCTGTCTGCAAAGCTCTGAACCAATTGAGCCTCCTCCTCCAGTTATTAAGATTACTTTTCCCTCAATGTAATTACTTATCTCTCTTAAATTTGTTTTTATAGGCTCTCTACCCAACAAGTCTTCTATCTCTACTTCTCTAATCTGTTTTATATCAACTTTTCCATCTATAATTTCGTAAATTCCTGGTATTGTCTTTATTTTACAGTTAGTGTTTTTACATATATCAATAATATCTTTTTTTCTACGTTTCTCTATGTTTGCTATTGAAAAGATTATCTCATCTACATTGTACTTTTCTACCACATCTTTTATATCTGAAGTTGTTCCTACAATTTTCACATTATGGATTATTCTTCCAATTTTATTTTTATCATCATCAATTATAGCCACTGCTACTTTTTTAAGTTCTGGATTTCTTTTTAGTTCCTGTATAACCATTTCTCCTGCATCTCCTGCACCAATTATAAGGATATTTGAAACCTTTCCTCTAGAATATGTCTTGTTCATGACTATTCTTATAGCTCTATAGGCTATTCTTGCGCCACTTGTAAACATTATAATAAATATTGTATTTAATACATAAAACATTATAGGATAATCAAACCCTAATAATTTATTTATTATATAAATCGGAATTAAATAAGCTAAAGTTGCCACAAAAATAGATATAATTTCTTCTTCTCCTGCATATCTCCATAATGTGTTGTAGCACTTAAACAATCTAAATGATACTATATGAAGTACTATATATATACACACTGAAATTATTATATCATTAGTGGTAAATGCATTTAAATTACCTGTCAAGCTTAAAGACATTCGAAACGCTACTAGTACGCTACAAATATCTAGAATTAATAGTGTTAAATGTCTAAATTTATATTTTTTAAAAAGCCTATTAAAAAAGCTTTCTTTCTCTAAATCTATACTTTCTCGCATAACTAGAAGCCCTCCTTTAAACAGCAAAAGCTACGCACCTAAGCATAGCCAACAACATCTATCTTTTGCTGTATTTTTTCATTTTATTTTTTATATTTATCAAATATAGAATCATAAATTTTTTCTATATCATTAAAGTTTAAATTAACCTCATAATTTTCTCTAACAAATTGACGCCCTTTCTTACCCATATTAAGTCTAAGTTCATCATTTTCCATTAGTTTTATTATAGCATTTTTTATTTCTTCTGGTTGTTTTGGTTCTACAATTAAGCCAGTTTCATTTTCCCATACAGATTCTGGATGTCCTCCTACATTTGTAACTATAACAGGTACTTCACATGCTTCTGATTCTATAGCTGCCACTCCAAATCCCTCTCTTAAAGAAGGAAATACAGTTACATCAAAAGAATTAAAAGTCTTGCTTACATTTTCTGGAGATATTCTTCCTAAAAACTGAACATCATTTTCTATACCCAATTCTTTAGCTAAATTTATTAGGTTGTCCATCTGACTTCCAGAGCCACCTATTTTAAGAATTATTTTCTTATCTTTATATTCATCTTTAAGCATCTTAAATGCTTGTATTAAATATTCTATTCCATATTTTTTTTCTAAACTCTTTATAATTCCTATTACAAAAGCGTCTTCTTTTTCTACTTCCATAGGCTTAAACCTATCCATATCTACTCCAAAAAAGGTTACATCTACATGTTTAGCTGTATATTTATTAGCCTCTTTAGCCATATCTCTACTATTTGAAAAGATATAGTCTGCTTTTCTAAAGTTATGTTTTATAATTTGTTTTTGTATAAAACCATTATTAGGGAAATCATAAATATCAGTACCCCAAACAGAAATAATATATGGATGATACCCAAGTAGACTTCCTATAAATCCATAACTACTTGCATACTGTGCATGCAATATATCTGGCTTTATTTCATTTACTAGCTTCTTTATCTGCTTTATTGAACCTAAGTATCCCGTTTTTTTAGAAATATTTTCATTTTTTAGTTCTTCTACATTAGAACCAAAATTATAAATTTTTATTCCTTCCATGTGACCTCCATTTAAAGAGATTACATGAATGTCATATCCTTTATTTTTAAAAAAACTACACCATTTTAAAGTATGAGGATTTGACCCATCAGCTAAATAACAAACAGTCTTCATAATATTTACCTTCCTATCGAATAATACTCAATTCCTAACTCTTCCATATCTTTAATTTTATAACAATTTCTTCCATCAAGGACTAAAGGATTTTTCATCTTTTCCTTATACTTATGTATATCATAATTTAATACATCTTTCCATTCTGTCATTATAAAACATATCTCTGCATCTTCTATCGCATCATCTACAGAATCAGCATAAAGTATAGAATCACCAAATATTTTCTTAGTATTATTTACACCAATTGGGTCATATACAGTAACTCTTGCCCCTCTTTCGAGCAAATATTTTATATTTGGTATAGATGGTGCTTCTCTTATATCATCAGTATCTGGCTTAAAAGTCAAACCTAAAACAGCAACCTTCATATCTTGAAAGCTCTCTACTAACTTAGATGCCTTTCTAACTAATTTAAGTTTTTGACTTTCATTAACTTCTATTGCAGCTTTTACTGTTTTTAATTCATAACCATTATGTTCAGATAACCAGTGAAGAGCTTTTGTGTCTTTTGGAAAGCAAGAACCACCATATCCTATTCCCGCCTTTAAAAACTTACTTCCTATTCTATCATCATAACTCATTCCTAAAGCTACATCTTCTATGTTAGCTCCTGCTATTTCACAAAGATTTGCAATATCATTCATAAATGATATTTTAAGAGCTAAGAAGTTATTTGATGCGTATTTTATCATCTCAGCACTATTTCTATTTGTAACTATTATAGGTTGATTAAAAGGCTTATAGATTTCCTCTAATATTTCTCTAGCCCATTCACTTTCTACACCTATAACGATTCTTGAAGCATGTAGAGTATCTTTTACTGCTGTTCCTTGTGATAAAAACTCTGGATTAGATGCAAGTTCTACTTTTACATCATTTTTTAGGTTTCTATTTATATAATCTTCTATCTCTTCATTTGTACCAATTGGAACTGTAGATTTTATTACTACTAGAGTATCTTTTGTCACAGTTTCAGCTATTTGCTTTGCAACTGCCTTTATATAATCTAGGTTGGCTGAGCCATCACTTCTCTCAGGTGTACCTACAGCTATTAATATTACATCTACATCTTCATAAGCTTTTTTATAGTCTGTAGTGTAATCTATTCTTCCTCTGTTGTAATTTTTAACCATAAGTTCTTCTAGGCCTTCTTCATATATAGGTGCTATTCCAAGTTTCATTGATTTAACCTTTTGTTCATCTACATCAACACAGACTACATTTTCATTGCCTACCTCTGCTAGACAAACACCTGTAACCAAACCTACATATCCCGTCCCAGCTATAGCTATTTTCATTTTTTTACCTCCAAGTATATAAAACTTATACTCTTTTTTTAATGGCATTAAAAACATAGAAACAAAATACATATAGACTTTTTGGTAAACTTAAATTTTCAACATTTCTATAAGTATTCCAAGTTCGTTTTAATGCTTTTATCTTGTTACTTGATATAGAATTTCCAACTAATCTGTAATTCACTAAATCTTCTTGAATCCCATATGCATATTTTTCCTTTTTAAGTAACTGTAACCAGGTTGCAGTATCTTGTCCTCTTCTTACCAAAGGCATGCTGAACTCTCCTACAATCTCCTTATCAATGACCACTGTAGAACATCCTATTATAGTATTTCTAAGTAATCCTTCATAGTCAATTTTCTTAGGAGCTCTTGCAACCTTATTCGTTTTTGACCCATCTTGTCTCATATATCTATAAGATGTAAAAGAAAAACCTACATTTTCTTTTAACATATATTCTATCTGAATCTCTAATTTTCTACTATCCCATAAATCATCACTATCTACAAATGCAATAAATCGACCTTCCGCATTCTTAATACCAACATTTCTAGATACTGCAGCTCCAGAATTTTTTTCAAGCTTTATATATTTTATTCTAGCATCTTCTTTTCGAAAACTTTTTATAATTTCACTTGAATTGTCCTTAGAACAATCATCCACTAATAAAAGCTGCCAATTTTTATAAGTTTGATTTTGGATTGACTTTATCGTCTCTGATAAAAACTCTTCTGAATTATAAACAGGAGTAATTATCGATACTAAAGGCTCATTCATATTTTTACTCTCCTTATATAGCAACTAGCAGTACTATACCAACAAGTTTACTTAGATACTAATTTTCTTTGTCCAATATATTTGTAATATCCTAATGGGAATAATGCTAAATACAACAATTTATCAGATACTTTTCTTAATTCACCAAAATAATGACTATCAGACAACAATGAGTATCTGGCTAAATTTATGTAATTTTTTATCCACATATATGGATATCTACTTAATGGATATGTATTTTGATTTATTAAATATAAAAACTCTAATGCTCTACCTCTTAATGCATTTTTACTTAATATATTCTTAGTCAAACCATCATCCAAATAATCTCTTATTATCATAGGTTTATTTACACATATAACTTTATAGTATTTAGACATTTCATTCCATACTACACTTTCTGGTAAAAATCTCACTTCTTTTCTTTCTGGAAAAGGAAATTTTATAAGCTCATCAGTTACAAATACTATGCTTTTATCTCCCTTAACGCCATACTTAAAATATAGGTCTGCAAAGTGACATATTTTCTTATCTTCAGGCATTTCTGTCCCTATCAAATCTCCACTTGGATATACACAAAGTCCAACAACTCCACTAAATCCTTCTTTATTCTCTAAAGAATCCCACTCATCATTAGCAATTTCAAGAGAATCTTTAATTAAACCATCATCACTATCTACAATGAAAAATAGCTCTCCATCTGCATTTTTTACACCTAGATTTATTGCAGTATGTTTTCCTCCATTTTCTTTGTATATATATCTTATATTTAATTTATTTTCTGATATAAATTTTTCAACTAACTCTTTAGTACTGTCGCTACTTCCATCATCAACAATCAACCATTCAAAATCATTGAAATCATAAGTTTGAGCTTTTAAATCATTGTACAAATTTTCAAGTAAATGAGCTCTGTTATACGTCGGAGTAAATACAGTAAATTTATATTTATACATTAATTAAATCTTCCTCTCTGTCTAACTTTTTTTGATTCCGTTTATTCCATAATTAATAAAGTAGTATATAGCTTTGTATAAAGGTATTTTTTCTATATTTCTATATATATTCCAAGTCCACATAGCAGCTTTTATTTTATTACCACTTAGGGAATTGCTAGATTTTCTATATAATGCTAGAACTTCATTTATTCCATGAGCAATATGCCCTTTTTTCAATATCGATAACCATAAAACATAATCTTCATGTCTTACACCACTCATTCTTATTTCAAAATCCAATTTAGACTTATCAATCACAACAGTAAGACATCCTAAGATATTTCCTTTTAATAATCTTCTATAATCTACATTAGGTGGAACTTTTATTACTTTGTTTAATTTTTTATCATTTTCATCCATCAGTTCATATGAAGTAAATGAAATTACATAGTCATTTTCTAACATAAAATTTACTTGTTTTTCTAACTTACTACTATTCCATTGGTCATCACTATCTAAAAAAGCTATAAATTGTCCTGTTGCCTTACTTAGTGCTAAATTTCTAGCATTAGAGACACCCTTATTAGTCTCAGTCTTTATACATTTTATTCTACTATCCTGTTGCATATAAGATTTGACTATATTAGGACTATTATCTGTTGAGCAATCATCAATAATTAACATTTCCCATTCTTGATAAGTTTGGTTTAATACTGATTTTATGGTTGCTTCAATAAATTTTTCAGAATTATACATGGGAGTAATTATAGATACTAAATTCTTCTTCATATTACCTTCCTCATCATTTATAAAATATTTATTTAATTTTACTTAATACACAATCATATATCCTCTTGCAGTTCTTATTATCATTATATCTGAAAAACTTATTTCTTTCATTTTTTTGGTTATCCATAACCTCAAAATTATTTTCAATAATATCAATAAGTTTATTCACGGCTTCATCATTATTATAAGCCAAAGACCCAAACATTTCACTTTTTAAATCTATATATGAATCAACTTTTTCCATATATTCATCCAAATCGAATTGGTAAAACAAGATAGGTCTATTCATATACAAAAAGTCTATGGCTACACTTGAATAATCAGTTATATTTGCAGCTGATTTTCTGATTTCATTTGCTAGAGTTACCCCTTTATCTAAAAACACAATTCGTTTTCCTGTTATATTTTCTTTTATATCATCTATAAACTCATGCATAAGATGATGCATATAAATTTTTACATTTATATCTTTCTCATCTAATATTTTATTTAATTTGTCATCATTTAAAAAATTCATTATATTTTTAAAATAATCTGTATCCGTAAATTTTCCTGAACTAAATTTTATCCAATCTCTCCATGTAGGAGTATATAATATATCTCGAGTTTGTGCAACTTCATTTGTTGGTAAATTGTCATATCTTGCATTTCCAATTATATAAACTGAGTCATCTAACATTCCCCAATCATTTACCATAACATTTCTTTCAAATTCAGAACTTGCTGTAACTATATTATAGCTTTTATATAGGTTATCTATAATATTTTTGAACTTTTTGTTCATAGGTTTTCTTTTTTTAAAACTTATAGTCCCATGATTTAAAAACACTTTTATCGTTTTTTTATGAAAATAATTAAGAACAGGTACAGCAAAATTGTATGGTGCTATATCTGCTGATGGTGCATGTGAAAATACTATAGCTTTTGAATTGTAATAATACAGATAGTTTTCTACACTTCCTCTTATTAATTTTTTGCCTGGAATTTTATCAAATACTTTACTGTCTTTATTTACTACCCAATAAGTTTCTACATCATTATGTTCTTTTAGCATATACTCATAAAAAAACTTTGAATTATCATTGTATATATCCCCTGAATGTCCACCTATAAGCCAGATATCTCTACCATTAAACTTATGCTTATTAAATGGATATATAAAAAAAGCCAAAAGCATATTTATTAAAAATTTAACCTTGTCCATAAACACCATCCTCATTATAACTTGTACTGTCTAAATCCATTAATTCTTCCTTTTATAGTGGCACTATGATAATCTCTATTGGAACTCAATATAAGACCTCCTATATTTCTTACAAGTTTTGATACCATAACTTTTGCAAACTTATAATTTTTTCTATAGACTATTTCCTTTTTGCAAAGCGCTCCAAAGCCTCTTCCATAGTTATAATCTTTTTGATACTTTTCTTTAGATTTAGAATGTTTTTTTGCAGGATGGTAAATTATATCATTTCCAAAGTATTTTCCTTTAAAACCTAAACTCAATAAGTTTAAAACATAATCTATCTCTTCACCAGCACCAAACTCTCCACCAACACCCAATTTCTCATCAAATCTTGTATAGTCTTTACCTTCAAAATCAATAAAAAAAGTTATGGATGTTATAGTATCCAAAACGTTGGAACTTGTGATATCACAAGTTCCATCATACATTTTCTTAAATGCATCAACTTTATTTGAATCCATAGTTTTGCAACTGTATATTTTATAATCTTTATTTTTATTAAAGAAATTTATAACTTTTTCTAATGTATCATTTTCGTAGACACAATCATCATCAGGGAAACCTATAATTTGCCCTACAGCATTGTCTATGCCTACATTTCTGTTATAACTCAATCCTTTTTTAGAGCTTTTTATATACTTTATATCTAACTTATCAATGTATTTATCAACTATTTCTTTAACTTTGCTATTATCATTTTGGTCTACTACTATAAGTTCAAAGTTTTTGTAAGTTTGATTTTCTAAGCTGTCCATAAGTAAGTATATATCATCATATCTATTTAATGTTGGCATTATTAATGATATTAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP019857|3127211:3136164|3133356_3134106_-|AXU87730.1|DBSCAN-SWA MKKNLVSIITPMYNSEKFIEATIKSVLNQTYQEWEMLIIDDCSTDNSPNIVKSYMQQDSRIKCIKTETNKGVSNARNLALSKATGQFIAFLDSDDQWNSSKLEKQVNFMLENDYVISFTSYELMDENDKKLNKVIKVPPNVDYRRLLKGNILGCLTVVIDKSKLDFEIRMSGVRHEDYVLWLSILKKGHIAHGINEVLALYRKSSNSLSGNKIKAAMWTWNIYRNIEKIPLYKAIYYFINYGINGIKKS >CP019857|3127211:3136164|3127211_3129125_-|AXU87725.1|DBSCAN-SWA MRESIDLEKESFFNRLFKKYKFRHLTLLILDICSVLVAFRMSLSLTGNLNAFTTNDIIISVCIYIVLHIVSFRLFKCYNTLWRYAGEEEIISIFVATLAYLIPIYIINKLLGFDYPIMFYVLNTIFIIMFTSGARIAYRAIRIVMNKTYSRGKVSNILIIGAGDAGEMVIQELKRNPELKKVAVAIIDDDKNKIGRIIHNVKIVGTTSDIKDVVEKYNVDEIIFSIANIEKRRKKDIIDICKNTNCKIKTIPGIYEIIDGKVDIKQIREVEIEDLLGREPIKTNLREISNYIEGKVILITGGGGSIGSELCRQIAGFNPKELIIVDNYENNAYSIQQELLRKYKNKLDLKTVIASIREEKRMDEIFNKYKPEVVFHAAAHKHVPLMESSPGEAIKNNIFGTLNIAGLSSKYRAKKFVLISTDKAVNPTNIMGATKRAAEMIIQTMNAESQTEFVAVRFGNVLGSNGSVIPLFKKQIEDGGPVTVTHPDIIRYFMTIPEAVGLVIQAGAMAKGGEIFVLDMGEPVRILDLAKNLIKFSGFEPDVDIKIEFSGLRPGEKLYEELLMSEEGLLDTEHKKIFIGRPIDVDREKITKYLKLLREITNNEEVEKIDGIMRELVPTYIKPEDANIKEIATTREK >CP019857|3127211:3136164|3132426_3133335_-|AXU87729.1|DBSCAN-SWA MYKYKFTVFTPTYNRAHLLENLYNDLKAQTYDFNDFEWLIVDDGSSDSTKELVEKFISENKLNIRYIYKENGGKHTAINLGVKNADGELFFIVDSDDGLIKDSLEIANDEWDSLENKEGFSGVVGLCVYPSGDLIGTEMPEDKKICHFADLYFKYGVKGDKSIVFVTDELIKFPFPERKEVRFLPESVVWNEMSKYYKVICVNKPMIIRDYLDDGLTKNILSKNALRGRALEFLYLINQNTYPLSRYPYMWIKNYINLARYSLLSDSHYFGELRKVSDKLLYLALFPLGYYKYIGQRKLVSK >CP019857|3127211:3136164|3134134_3135310_-|AXU87731.1|DBSCAN-SWA MDKVKFLINMLLAFFIYPFNKHKFNGRDIWLIGGHSGDIYNDNSKFFYEYMLKEHNDVETYWVVNKDSKVFDKIPGKKLIRGSVENYLYYYNSKAIVFSHAPSADIAPYNFAVPVLNYFHKKTIKVFLNHGTISFKKRKPMNKKFKNIIDNLYKSYNIVTASSEFERNVMVNDWGMLDDSVYIIGNARYDNLPTNEVAQTRDILYTPTWRDWIKFSSGKFTDTDYFKNIMNFLNDDKLNKILDEKDINVKIYMHHLMHEFIDDIKENITGKRIVFLDKGVTLANEIRKSAANITDYSSVAIDFLYMNRPILFYQFDLDEYMEKVDSYIDLKSEMFGSLAYNNDEAVNKLIDIIENNFEVMDNQKNERNKFFRYNDNKNCKRIYDCVLSKIK >CP019857|3127211:3136164|3131626_3132379_-|AXU87728.1|DBSCAN-SWA MNEPLVSIITPVYNSEEFLSETIKSIQNQTYKNWQLLLVDDCSKDNSSEIIKSFRKEDARIKYIKLEKNSGAAVSRNVGIKNAEGRFIAFVDSDDLWDSRKLEIQIEYMLKENVGFSFTSYRYMRQDGSKTNKVARAPKKIDYEGLLRNTIIGCSTVVIDKEIVGEFSMPLVRRGQDTATWLQLLKKEKYAYGIQEDLVNYRLVGNSISSNKIKALKRTWNTYRNVENLSLPKSLYVFCFYVFNAIKKRV >CP019857|3127211:3136164|3129208_3130300_-|AXU87726.1|DBSCAN-SWA MKTVCYLADGSNPHTLKWCSFFKNKGYDIHVISLNGGHMEGIKIYNFGSNVEELKNENISKKTGYLGSIKQIKKLVNEIKPDILHAQYASSYGFIGSLLGYHPYIISVWGTDIYDFPNNGFIQKQIIKHNFRKADYIFSNSRDMAKEANKYTAKHVDVTFFGVDMDRFKPMEVEKEDAFVIGIIKSLEKKYGIEYLIQAFKMLKDEYKDKKIILKIGGSGSQMDNLINLAKELGIENDVQFLGRISPENVSKTFNSFDVTVFPSLREGFGVAAIESEACEVPVIVTNVGGHPESVWENETGLIVEPKQPEEIKNAIIKLMENDELRLNMGKKGRQFVRENYEVNLNFNDIEKIYDSIFDKYKK >CP019857|3127211:3136164|3130305_3131601_-|AXU87727.1|DBSCAN-SWA MKIAIAGTGYVGLVTGVCLAEVGNENVVCVDVDEQKVKSMKLGIAPIYEEGLEELMVKNYNRGRIDYTTDYKKAYEDVDVILIAVGTPERSDGSANLDYIKAVAKQIAETVTKDTLVVIKSTVPIGTNEEIEDYINRNLKNDVKVELASNPEFLSQGTAVKDTLHASRIVIGVESEWAREILEEIYKPFNQPIIVTNRNSAEMIKYASNNFLALKISFMNDIANLCEIAGANIEDVALGMSYDDRIGSKFLKAGIGYGGSCFPKDTKALHWLSEHNGYELKTVKAAIEVNESQKLKLVRKASKLVESFQDMKVAVLGLTFKPDTDDIREAPSIPNIKYLLERGARVTVYDPIGVNNTKKIFGDSILYADSVDDAIEDAEICFIMTEWKDVLNYDIHKYKEKMKNPLVLDGRNCYKIKDMEELGIEYYSIGR >CP019857|3127211:3136164|3135324_3136164_-|AXU87732.1|DBSCAN-SWA MLISLIMPTLNRYDDIYLLMDSLENQTYKNFELIVVDQNDNSKVKEIVDKYIDKLDIKYIKSSKKGLSYNRNVGIDNAVGQIIGFPDDDCVYENDTLEKVINFFNKNKDYKIYSCKTMDSNKVDAFKKMYDGTCDITSSNVLDTITSITFFIDFEGKDYTRFDEKLGVGGEFGAGEEIDYVLNLLSLGFKGKYFGNDIIYHPAKKHSKSKEKYQKDYNYGRGFGALCKKEIVYRKNYKFAKVMVSKLVRNIGGLILSSNRDYHSATIKGRINGFRQYKL |
8 | Catovirus(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3495822 : 3519902
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP019857|3495822:3519902|DBSCAN-SWA 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MASIKQRKSSFSVIYWYLDSAGERKQKWDTLETRKEAKQRKAFIEYYQEKFGYVIVPLEEQFAHQIENSKKELDVVDKDITLRDFLEIFVNLYGTSKWSPSTFSSKVGSIENYINPIIGDWKLNEITTKSLSKYYNDLLSVPEVPRANRKATGRCVQPANIKKIHDIIRCALNQAIRWEYIDTNKRNPASLATLPKIPKTRRKVWSVQTFREAVKATEDDLLSICMHLAFSCSMRIGEITGLTWEDVIIDEESIATNNAKVIINKELSRVNAEAMQKLKEKDILKIFPTQKPHCTTRLVLKTPKTETSNRVVWLPKTVAELLVQYKKDQQELKEFLGSAYNDYNLVIALDNGNPVESRIVRDRFQKLCEENDYEVVVFHSLRHLSTGYKLKMTNGDVKSVQGDTGHAEAEMVTDVYSEIIDEDRRFNAQKMDKEFYSTLNDDTDNPKQDTDLTDSDMALLELIKSLSPEMKEQFLKQALQR >CP019857|3495822:3519902|3502009_3502492_+|AXU88027.1|DBSCAN-SWA METRETTGEETTSYWFDLPIDVAEFEEKLGVGAESTAYRIIEKVLPYADEVHEHTSVYQLNELEFMYRQLSSDMQEEYVSLLTVFENLEALYICRNVITVYPDCKSMIDVARQKLMNDSTFKHLSEDCQEYYFDFEAYASHLQEHGKFLVTEHGIFELPE >CP019857|3495822:3519902|3513568_3513841_+|AXU88041.1|DBSCAN-SWA MAVTYEKTFEIEIINELSASVYNRVLNYVLNHELNKNDSQLLEVNLLNQLKLAKRVNLFDYSLEELQAVHEYWRSMNRYSKQVLNKEKVA >CP019857|3495822:3519902|3515788_3516667_+|AXU88046.1|DBSCAN-SWA MIQYYYTKKEWGVVMEKEELKILEELRRILNSKNEAIVILNNYFKGGVGKSKLSTMFAYLTDKFNLKVLMIDKDLQATLTKDLAKTFKVELPRVNFYEGLKNGNLASSIVHLTDNLDLIPGTFDLMLLPKLTRSWTFENESRLLATLLAPLKSDYDLIIIDTVPTPSVYTNNAIVASDYVMIPLQAEEESTNNIQNYISYLIDLQEQFNPGLDMIGFVPYLVDTDSTTIKSNLEELYKQHKEDNLVFQNIIKRSNKVSTWSKNGITEHKGYDKKVLSMYENVFFEMLAYSMQ >CP019857|3495822:3519902|3515260_3515392_+|AXU88045.1|DBSCAN-SWA MSRFCKFGKLHVTKGNVDKLLGILLTASKELKRSLAPTGNLYR |
34 | Streptococcus_phage(86.96%) | integrase | attL 3491246:3491261|attR 3520554:3520569 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3758994 : 3819145
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP019857|3758994:3819145|DBSCAN-SWA 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57 | Agrobacterium_phage(15.38%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
3892969 : 3915130
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP019857|3892969:3915130|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP019857|3892969:3915130|3910711_3910846_-|AXU88370.1|DBSCAN-SWA MWELVKDFLLVSMGMGIGVVLMCILSIGKEADYEMKQLEESEDN >CP019857|3892969:3915130|3912238_3913633_-|AXU88372.1|DBSCAN-SWA MRKIWNKGHRIRASDKHLVYHFSIGTLLFVFVAVLLLLNIKQLMRTDWEHFSLLEKGLTLSPYNLITILIATGVCALVAFLYYRFCYDSFKKLLHRQKLARMILENKWYEADTVQDSGFFTDLQSRSREKIVWFPKIYYQMEKGLLHIRCEITLGKYQDQLLRLEDKLESGLYCELTDKTLHDGYIEYTLLYDMIANRITIDEVRAENGCLRLMKNLVWEYDALPHALIAGGTGGGKTYFLLTLIEALLHTNAVLYILDPKNADLADLGTVMGNVYHTKEEMIDCVNSFYEGMVQRSEEMKQHSNYKTGENYAYLGLPPCFLIFDEYVAFFEMLGTKESVSLLSQLKKIVMLGRQAGYFLIVACQRPDAKYFSDGIRDNFNFRVGLGRISELGYGMLFGSDVKKQFFQKRIKGRGYCDVGTSVISEFYTPLVPKGHDFLKTIGSLAQARQDGTATCEAKGDGTD >CP019857|3892969:3915130|3897792_3900456_-|AXU88361.1|DBSCAN-SWA 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19 | Streptococcus_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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