Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022893 | Staphylococcus aureus strain 61 chromosome, complete genome | 10 crisprs | cas3,DEDDh,csa3,DinG,RT,WYL | 10 | 3 | 9 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022893_1 | 170208-170292 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022893_1
|
1 spacers
spacers of CP022893_1
>1.1|170234|33|CP022893|CRISPRCasFinder TGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022893_1
The CRISPR arrays of CP022893_1 >merge|CP022893|1|170208-170292|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTG >CP022893|1|1|170208-170292|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTG TGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTG
>CP022893.1|AXJ34603.1|169099_170059_+|Cadmium,-cobalt-and-zinc/H(+)-K(+)-antiporter MNGKKANTINRYKYFHHVNHQKIQQSSKKTLWASLIITLLFTVIEFVGGLVSNSLALLSDSFHMLSDVLALGLSMLAIYFASKKPTARYTFGYLRFEILVAFLNGLALIVISIWILYEAIVRIIYPQPIESGIMFMIASIGLLVNIILTIILVRSLKQEDNINIQSALWHFMGDLLNSIGVIVAVVLIYFTGWRIIDPIISIVISLIILRGGYKITRNAWLILMESVPQHLDTDQIMADIKNIDGILDVHEFHLWSITTEHYSLSAHVVLDKKYEGDDYQAIDQVSSLLKEKYGIAHSTLQIENLQLNPLDEPYFDKLT >CP022893.1|AXJ34602.1|166965_168453_+|Putative-aldehyde-dehydrogenase-AldA MAVNVRDYIAENYGLFINGEFVKGSSDETIEVTNPATGETLSHITRAKDKDVDHAVKVAQEAFESWSLTSKSERAQMLRDIGDKLMAQKDKIAMIETLNNGKPIRETTAIDIPFAARHFHYFASVIETEEGTVNDIDKDTMSIVRHEPIGVVGAVVAWNFPMLLAAWKIAPAIAAGNTIVIQPSSSTPLSLLEVAKIFQEVLPKGVVNILTGKGSESGNAIFNHDGVDKLSFTGSTDVGYQVAEAAAKHLVPATLELGGKSANIILDDANLDLAVEGIQLGILFNQGEVCSAGSRLLVHEKIYDQLVPRLQEAFSNIKVGDPQDEATQMGSQTGKDQLDKIQSYIDAAKESDAQILAGGHRLTENGLDKGFFFEPTLIAVPDNHHKLAQEEIFGPVLTVIKVKDDQEAIDIANDSEYGLAGGVFSQNITRALNIAKAVRTGRIWINTYNQVPEGAPFGGYKKSGIGRETYKGALSNYQQVKNIYIDTSNALKGLY >CP022893.1|AXJ34601.1|166155_166539_-|Inner-membrane-protein-YbaN MRLILIVIGLIFTALGIAGAVLPLLPTTPFLLVAVFCFARSSDRFYNWLINQKIYKEYVENFYLHRGYTLQQKIKILISLYIVIGFSIYMVDVLAVRVGLIIMVIIQTAVLFTFVKTLPKSNHKIEE >CP022893.1|AXJ34600.1|165822_166149_-|Heme-oxygenase-(staphylobilin-producing)-2 MFMAENRLQLQKGSAEETIERFYNRQGIETIEGFQQMFVTKTLNTEDTDEVKILTIWESEDSFNNWLNSDVFKEAHKNVRLKSDDDGQQSPILSNKVFKYDIGYHYQK >CP022893.1|AXJ34599.1|164612_165758_+|UDP-N-acetylglucosamine-2-epimerase MKKIMVIFGTRPEAIKMAPLVKEIDHNGNFEANIVITAQHRDMLDSVLSIFDIQADHDLNIMQDQQTLADLTANALAKLDSIINEEQPDMILVHGDTTTTFVGSLAAFYHQIPVGHVEAGLRTHQKYSPFPEELNRVMVSNIAELNFAPTVIAAKNLLFENKDKERIFITGNTVIDALSTTVQNDFVSTIINKHKGKKVILLTAHRRENIGEPMHQIFKAVRDLADEYKDVVFIYPMHRNPKVRAIAEKYLSGRNRIELIEPLDAIEFHNFTNQSYLVLTDSGGIQEEAPTFGKPVLVLRNHTERPEGVEAGTSRVIGTDYDNIVRNVKQLIEDDEAYQRMSQANNPYGDGQASRRICEAIEYYFGLRSDKPDEFVPLRHK >CP022893.1|AXJ34598.1|163273_164536_+|UDP-N-acetyl-D-glucosamine-6-dehydrogenase MKLTVVGLGYIGLPTSIMFAKHGVDVLGVDINQQTIDKLQSGQISIEEPGLQEVYEEVLSSGKLKVSTTPEASDVFIIAVPTPNNDDQYRSCDISLVMRALDSILPFLEKGNTIIVESTIAPKTMDDFVKPVIENLGFTIGEDICLVHCPERVLPGKILEELVHNNRIIGGVTKACIEAGKYVYRTFVQGEMIETDARTAEMSKLMENTYRDVNIALANELTKICNNLNINVLDVIEMANKHPRVNIHQPGPGVGGHCLAVDPYFIIAKDPENAKLIQTGREINNSMPAYVVDTTKQIIKALSGNKVTVFGLTYKGDVDDIRESPAFDIYELLNQEPDIEVCAYDPHVELDFVEHDMSHAVKDASLVLILSDHSEFKNLSDSHFDKMKHKVIFDTKNVVKSSFEDVSYYNYGNIFNFIDK >CP022893.1|AXJ34597.1|162332_163220_+|UDP-glucose-4-epimerase MRKNILITGVHGYIGNALKDKLIEQGHQVDQINVRNQLWKSTSFKDYDVLIHTAALVHNNSPQARLSDYMQVNMLLTKQLAQKAKAEDVKQFIFMSTMAVYGKEGQVGKSDQIDTQTPMNPTTNYGISKKFAEQALQELISDSFKVAIVRPPMIYGAHCPGNFQRLMQLSKRLPIIPNINNQRSALYIKHLTAFIDQLISLEVTGVYHPQDSFYFDTSSVMYEIRRQSHRKTVLINMPSVLNKYFNKLSVFRKLFGNLTYSNTLYENNNALEVIPGKMSLVIADIMDETTTKDKA >CP022893.1|AXJ34596.1|161775_162333_+|putative-sugar-transferase-EpsL MKRLFDVVSSIYGLVVLSPILLITALLIKMESPGPAIFKQKRPTINNELFNIYKFRSMKIDTPNVATDLMDSTSYITKTGKVIRKTSIDELPQLLNVLKGEMSIVGPRPALYNQYELIEKRTKANVHTIRPGVTGLAQVMGRDDITDDQKVAYDHYYLTHQSMMLDMYIIYKTIKNIVTSEGVHH >CP022893.1|AXJ34595.1|160559_161765_+|putative-glycosyl-transferase MSEKKILILCQYFYPEYVSSATLPTQLAEDLIANHINVDVMCGWPYEYSNHKQVSKTEMHRGIRIRRLKYSRFNNKSKVGRIINFFSLFSKFVINIPKMLKYDQILVYSNPPILPLIPDVLHRLLKKKYSFVVYDIAPDNAIKTGATRPGSMIDKLMRYINRHVYKNAENVIVLGTEMKNYLLNHRISKNADNIHVIPNWYDMRQLQDNRIYNDTFKAYREQYDKILLYSGNMGQLQDMETLISFLKLNKDQPQTLTILCGHGKKFADVKTAIEDHRIENVKMFEFLTGTDYADVLKIADVCIASLIKEGVGLGVPSKNYGYLAAKKPLVLIMDKQSDIVQHVEQYDAGIQIDNGDAHAIYNFINTHSSKELHEMGERAHQLFKDKYTREINTMKYYNLLK >CP022893.1|AXJ34594.1|159353_160559_+|hypothetical-protein MVKKVFIMDSVKTIIGTLLIALGLQFLAYPIINQRVGNEAFGSILTIYTIITITSVVLGNTLNNIRLINMNLYKSNHYYWKFVSILLISILIESIALIIVFLYFFNLNTIDIIFLILLNILMCLRIYLNVFFRMTLKYNQILYIALIQFLGLLIGLFLYYLIQNWIVCFITSELFATIYTLVKLRGLTIGEYQSEDNNVVKDYVMLLSTNSLNNLNLYLDRLILLPIIGGTAVTISFLSTFIGKMLATFLYPINNVVLSYISVNESDNIKKQYLKTNLFAIAALCLVMIICYPITLIIVSLLYNIDSSLYSKFIILGNIGVLFNAVSIMIQTLNTKHASITLQANYMTLHTITFIFITILMTIAFGLNGFFWTTLFSNIIKYVILNIIGLKSKFINKKDVD >CP022893.1|AXJ34604.1|170353_170557_-|hypothetical-protein MDKESVVASLARNKKIAVETMAGQRYIIERILHTNDEKHIHILKPKDVVLDVDSIKEIDENHLNDAT >CP022893.1|AXJ34605.1|170735_171248_+|hypothetical-protein MTLFLLEANNLDFASTKEELEAKAASLSTKTIPTLIEVQATENLTHGYFIVEANDEAEAKQFLTEADISIQLVKEVRLVGKDLDEVKNGDAHVDYLVTWNIPEGITMDQYLARKKKNSVHYEEVPEVEFKRTYVCEDMSKCICLYNAPDEEAVRRARKAVDTPIDGIEKL >CP022893.1|AXJ34606.1|171589_172330_+|Bicarbonate-transport-ATP-binding-protein-CmpD MIKIQQLQHHFGSHKVIHNFNLDISKGEIVTFIGKSGCGKSTLLNVIGGFIHPSSGRVIIDNEIKQQPSPDCLMLFQHHNLLPWKTINDNIRIGFQQKISDEEINAQLKLVDLEDRGKHFPEQLSGGMKQRVALCRAHVHKPNVILMDEPLGALDAFTRYKLQDQLVQLKHKTQSTIILVTHDIDEAIYLSDRIVLLGEGCNIISQYEITASHPRSRNDSHLLKIRNEIMETFALNHHQVEPEYYL >CP022893.1|AXJ34607.1|172343_173315_+|Bicarbonate-transport-ATP-binding-protein-CmpC MKRLSIIVIIGIFIITGCDWQRTSKEPSKNAQNQQVIKIGYLPITHSANLMMTKKLLSQYNHPKYKLELVKFNNWPDLMDALNSGRIDGASTLIELAMKSKQKGSNIKAVALGHHEGNVIMGQKGMHLNEFNNGDDYHFGIPHRYSTHYLLLEELRKQLKIKPGHFSYHEMSPAEMPAALSEHRITGYSVAEPFGALGEKLGKGKTLKHGDDVIPDAYCCVLVLRGELLDQHKDVAQAFVQDYKKSGFKMNDRKQSVDIMTHHFKQSRDVLTQSAAWTSYGDLTIKPSGYQEITTLVKQHHLFNPPAYDDFVEPSLYKEASRS >CP022893.1|AXJ34608.1|173311_174073_+|Putative-aliphatic-sulfonates-transport-permease-protein-SsuC MTRPTNNKFILPIITFIIFLGIWEMVIIIGHYQPVLLPGPALVGKSIWTFIVTGEIFQHLAISLWRFVAGFVVALLVAIPLGFLLGRNRWLYNTIEPLFQLIRPISPIAWAPFVVLWFGIGSLPAIAIIFIAAFFPIVFNTIKGVRDIEPQYLKIAANLNLTGWSLYRNILFPGAFKQIMAGIHMAVGTSWIFLVSGEMIGAQSGLGFLIVDARNMLNLEDVLAAIFFIGLFGFIIDRFISYIEQFILRRFGE >CP022893.1|AXJ34609.1|174082_175117_+|hypothetical-protein MMTLETLIKEQLDPHLVEVDEGTYYPRTFIQQLFVDGYFGEAALRKNAEVIEAVSQSCLTTGFCLWCQLAFSTYLENATQPHLNNDLQQQLLSGEILGATGLSNPMKSFNDLEKLNLEHTYVDGQLVVSGRMPAVSNIQEDHYFGAISKHESSDEFVMFILRANQDGITLVEKTNFLGVNGSATYQITLNQVVVPQSQIITHDAKQFAATIRPQFIAYQIPIGLGSIKSSLELIDAFSNAQNGINQYLEYDVEAFKKRYRQLREEYYAILDDGNLTSHLSELISLKKDIGYLLLDVNQASVVNGGSRAYTPYSPQVRKLKEGFFFAALTPTLRHLGKLEAELKG >CP022893.1|AXJ34610.1|175333_175693_+|hypothetical-protein MNTIDTHTKEQQFSNLVRSYRKEYVGKGPNSIRVSFKDNWAIAHMTGVLSKVESFYLNDKRNESMLHYTRTEKIKQMYKEIDVNEMESLVGAKFVKLFTDIDLNDDEVISIFVFDKSIE >CP022893.1|AXJ34611.1|175716_176892_+|Formate-dehydrogenase MLFANFALNLTIIQGGGMSNGAVFFVIFLKQATCNTYFKEVKIYHLGEMDMKIVALFPEAVEGQENQLLNTKKAIGLKTFLEERGHEFIILADNGEDLDKHLPDMDVIISAPFYPAYMTRERIEKAPNLKLAITAGVGSDHVDLAAASEHNIGVVEVTGSNTVSVAEHAVMDLLILLRNYEEGHRQSVEGEWNLSQVGNHAHELQHKTIGIFGFGRIGQLVAERLAPFNVTLQHYDPINQQDHKLSKFVSFDELVSSSDAITIHAPLTPETDNLFDKDVLSRMKKHSYLVNTARGKIVNRDALVEALASEHLQGYAGDVWYPQPAPADHPWRTMPRNAMTVHYSGMTLEAQKRIEDGVKDILERFFNHEPFQDKDIIVASGRIASKSYTAK >CP022893.1|AXJ34612.1|177277_178528_+|putative-transporter MKRLSTTLKVRLISNFLQLIITTAFIPFIALYLTDMLSQSIVGIYLVGLVVLKFPLSIISGYLIEIFPKKLLVLIYQATMVIMLVFMGVFGSHQLWQIIGFCVAYAIFTIVWGLQFPVMDTLIMDAITEDVEHYIYKISYWMTNLSVAIGALLGGLMYGYSMLLLFLIAACIFLIVLFILYIWLPQDRNQVKQSDDKRHASRYQKLQIMNIFRSYKLVLKDRNYMLLISGFSIIMMGEFSISSYIAIRLKDQFETISIGSYDITGAKMLAILLMINTVVVILLTYSISKVVLKIDFKKALITGLLIYIVGYSGLTYLNQFGLLVVFMIIATVGEIIYSPIVSEQRFKIIPKAKRGTYSAVNALGIHFSETLARLGIVLGVFLTSLQMGLYMFIVLTIGASMLVAGVFGGQKQVNTN >CP022893.1|AXJ34613.1|178974_186150_+|Gramicidin-S-synthase-2 MIMGNLRFQQEYFRIYKNNTESTTHRNAYWVKLAKNVEATKMMYALSTIVQQHASIRHFFDVTTDDNLTMILHEFLPFIEIKQVPSSSANYDLEAFFKQELSTYHFNDSPLFKVKLFQFADAAYILLDFHVSIFDDSQIDIFLDDLCNAYRGNTVINNTRQHAHINRNDDKDNQDASHIALDSNYFRLENNSDIHIDSYFPIKHPFEQALYQTYLIDDMTSIDMASLAVSVYLANHIMSQQHDVTLGIHVPSHLPNDLHGNIVPLTLTIDAKDVCQRFTTDFNKCVLQNMSQLQCAKSSLSLETIFHCYHHMMSCCNDVIEDVHQIHDAHTSLADIEIFPHQHGFKIIYNSAAYDLLSIETLSDLVRNIYLQITEENGNKRTTVDELNLMTERDIQLYDDINLSLPEIDDAQTVVTLFEQQVEATPNHVAVQFDGVFITYQTLNARANDLAHRLRNQYGVEPNDRVAVIAEKSIEMIIAMIGVLKAGGAYVPIDPNYPSDRQEYILKDATPKVVITYQALYENGKQNINHIDLNKIAWKNIDNLSKCNTLEDHAYVIYTSGTTGNPKGTLIPHRGIVRLVHRNHYVPLNEETTILLSGTIAFDAATFEIYGALLNGGKLIVAKKEQLLNPIAVEQLINENDVNTMWLTSSLFNQIASERIEVLVPLKYLLIGGEVLNAKWVDLLNQKPKHPQIINGYGPTENTTFTTTYNIPNKVPNRIPIGKPILGTHVYIMQGERRCGVGIPGELCTSGFGLAAGYLNQPELTADKFIKDSNINQLMYRSGDIVRLLPDGNIDYLYRKDKQVKIRGFRIELSEVEHALERIQGINKAVVIVQNHDQDQYIVAYYEAMHTLSHNKIKSQLRMTLPEYMIPVNFMHIEQIPITINGKLDKKALPIMDYVDTDAYVAPSTDTEHLLCQIFADILHVNQVGIHDNFFELGGHSLKATLVVNRIEASTGKRLQIGDLLQKPTVFELAQAIAKVQEQNYEVIPEAIVKDDYVLSSAQKRMYLLWKSNHKDTVYNVPFLWRLSSGLNVAQLQQAVQHLIARHEILRTQYIVVDDEVRQRIVADVVADFEEVNTHFTDEQEIMRQFVAPFNLEKPSQIRVRYIRSPLHAYLFIDTHHIINDGMSNIQLMNDLNALYQHKLLLPLKLQYKDYSEWMSHRDMTKHRQYWLSQFKDEVPILSLPTDYVRPNIKTTNGAMMSFTMNQQMRQLLQKYVEKHQITDFMFFMSVVMTLLSRYARKDDVVVGSVMSARMHKGTEQMLGMFANTLVYRGQPSPDKMWTQFLQEVKEMSLEAYEHQEYPFECLVNDLDQSHDASRNPLFDVMLVLQNNETNHAHFGHSKLTHIQPKSVTAKFDLSFIIEEDRDDYTINIEYNTDLYHSETVRHMGNQCMIMIDYILKHQDTLQICDIPNGTEELLNWVNTHVNDRMLNVPGNKSIISYFNEVVSRQGNHVALVMNDLTMTYETLRNYVDAIAHMLLSNGVGNGQRVALFTERSFEMIAAMLATVKVGASYIPIDIDFPNKRQGAILEDAKVTAVMSYGVEIETTLPVIQLENAKGFVESKENEQYDDLHGNQLENTAMLDNEMYAIYTSGTTGMPKGVAIRQRNLLNLVHAWSTELQLGDNEVFLQHANIVFDASVMEIYCCLLNGHTLVIPDREERVNPEQLQQLINKHRVTVASIPLQMCSIMEDFYIEKLITGGATSTASFVKYIEKHCGTYFNAYGPSESTVITSYWSHHCGDLIPETIPIGKPLSNIQVYIMSDGLLCGIGMPGELCIAGDSLAIGYINRPELMADKWQNNPFGKGKLYHSGDLARYTSDGQIEFLGRIDKQVKVNGYRIELDEIENVILAIRGISDCVVTVSHFDTHDILNAYYVGEQQVEQDLKQYLNDQLPKYMIPKTITHIDCMPLTTNDKVDTTRLPNPSPIQQSNKVYSEPSNEIEQTFVDVFGEVLKQNDVGVDDDFFELGGNSLEAMLVVSHLKRFGHHISMQTLYQYKTVRQIVNYMYQNQQSLVALPDNLSELQKIVMSRYNLGILEDSLSHRPLGNTLLTGATGFLGAYLIEALQGYSHRIYCFIRADNEEIAWYKLMTNLNDYFSEETVEMMLSNIEVIVGDFECMDDVVLPENMDTIIHAGARTDHFGDDDEFEKVNVQGTVDVIRLAQQHHARLIYVSTISVGTYFDIDTEDVTFSEADVYKGQLLTSPYTRSKFYSELKVLEAVNNGLDGRIVRVGNLTSPYNGRWHMRNIKTNRFSMVMNDLLQLDCIGVSMAEMPVDFSFVDTTARQIVALAQVNTPQIIYHVLSPNKMPVKSLLECVKRKEIELVSDESFNEILQKQDMYETIGLTSVDREQQLAMIDTTLTLKIMNHISEKWPTITNNWLYHWAQYIKTIFNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP022893_2 | 429998-430099 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022893_2
|
1 spacers
spacers of CP022893_2
>2.1|430021|56|CP022893|CRISPRCasFinder AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022893_2
The CRISPR arrays of CP022893_2 >merge|CP022893|2|429998-430099|CRISPRCasFinder TTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGAATTGAGTATTAAATTTG >CP022893|2|2|429998-430099|CRISPRCasFinder TTATGAATTGAGTATTAAATTTG AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT ATATGAATTGAGTATTAAATTTG
>CP022893.1|AXJ34840.1|427749_429138_-|L-cystine-uptake-protein-TcyP MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLVYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKRAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLIILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFESNDNAALTSH >CP022893.1|AXJ34839.1|426914_427670_+|NADPH-dependent-oxidoreductase MSDYVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR >CP022893.1|AXJ34838.1|425853_426423_-|Alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-C MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI >CP022893.1|AXJ34837.1|424314_425838_-|Alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDEKSKELKELLTEISDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKNLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMSTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLKDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN >CP022893.1|AXJ34836.1|423943_424189_-|hypothetical-protein MYLSQTNQYENDIEKEKYVNEIIMLLRTIPTSKLIQPIMQLFIDNAILNIVQNDALLIEKATHARNHLRLWSLQGHRDIPN >CP022893.1|AXJ34835.1|423244_423871_-|hypothetical-protein MKKRLLLSTFLASALILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK >CP022893.1|AXJ34834.1|423036_423132_+|hypothetical-protein MRQLMGDFGIDREFKAIKKASNSNMLLDAKW >CP022893.1|AXJ34833.1|422591_422978_-|hypothetical-protein MMKVRITFIILAILSTIVCLFLAAMHPTGPNTVTFEQPYLFTLNIILMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFISAIITLAIGGKSVDKNDSH >CP022893.1|AXJ34832.1|421944_422526_+|2,3-bisphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYEKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQKDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNKVSREEAVDLKVENCKPYIIE >CP022893.1|AXJ34831.1|421267_421519_+|Transglycosylase-associated-protein MFGFIGMLIVGGLIGWAAGAIMGKDIPGGILGNIIAGIIGSWVGGKLFGQWGPELGSIYILPALIGSIILIAIVTLILRAMRK >CP022893.1|AXJ34841.1|430115_431072_-|hypothetical-protein MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLLGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKVLAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVNTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNENAAETSNKEATVDADAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL >CP022893.1|AXJ34842.1|431189_431852_-|hypothetical-protein MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEEMDLRKPF >CP022893.1|AXJ34843.1|431994_432402_-|hypothetical-protein MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHKEVQEHNSAYEEIDITHFAEASKGPKA >CP022893.1|AXJ34844.1|432914_433493_+|Xanthine-phosphoribosyltransferase MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE >CP022893.1|AXJ34845.1|433492_434761_+|Uric-acid-permease-PucK MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILVLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLLICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVK >CP022893.1|AXJ34846.1|434798_436265_+|Inosine-5'-monophosphate-dehydrogenase MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >CP022893.1|AXJ34847.1|436289_437831_+|GMP-synthase-[glutamine-hydrolyzing] MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCKGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >CP022893.1|AXJ34848.1|437943_438480_-|hypothetical-protein MHNKNEFNKKLKDFIGSDKRMALVKGYINEYKLTTVLRALNNSDYTKGTIHTRSIGNLKQIVDNRIIPKNITQNKIFKLSNLTLEVNLYERNTIYHGDFAIYYPVESALIIETDTPRLINHINNNPVQKIFIITTNDWSFNTLELEKIVDETIIYDLKQEDPKQYEILYKNKHGKLPY >CP022893.1|AXJ34849.1|438871_439576_-|PemK-like-protein MSKNINQANSKLNTSNKKLKQAYSKSDSKNMKVIYMPHWLEFYSIAIHSDVTSNKKRYYKSFSRGTVVYVKLGSNIGSEFSGNHFCVILDNKDNKGKETVTIVPLSSKGNKNYLKLNESVLNLTATDLKKQIIDISSKVQALTQKYRDIDIKLSTEDKKLLSNLNQKANELYRVIGVYSKHKGKDTYVNISAITTISKRRISKINDSDPTGTIIISEDDMNEIEKQLKIKFFSN >CP022893.1|AXJ34850.1|439974_440247_-|Transposase MTKERRTFSSEFKLQMVRLYKNGKLKNEIIRKYDLKPSIISNSIKQHQNTGPFNHQDNLKSDEKELIKLRKEVQHLKMEHDVLKQILKLI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022893_3 | 787383-787465 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022893_3
|
1 spacers
spacers of CP022893_3
>3.1|787410|29|CP022893|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022893_3
The CRISPR arrays of CP022893_3 >merge|CP022893|3|787383-787465|CRISPRCasFinder CCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG >CP022893|3|3|787383-787465|CRISPRCasFinder CCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGAACG CCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG
>CP022893.1|AXJ35156.1|786691_787234_+|Putative-5'(3')-deoxyribonucleotidase MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >CP022893.1|AXJ35155.1|785294_786353_+|Histidinol-phosphate-aminotransferase MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >CP022893.1|AXJ35154.1|783540_785055_+|Choline-transport-system-permease-protein-OpuBB MTNFFDILSERKGQLFSTMIEHIQISFIALLIATAIAVPLGILLTKTKTISEIVMNIAAILQTIPSLALLGLMIPLFGIGRVPAIIALVVYALLPILRNTYTGIKEVDPSLIEAAKGIGMKPFRRLTKVELPIAMPVIMAGVRTAMVLIIGTATLAALIGAGGLGDLILLGIDRNNASLILLGAIPAALLAIIFDLILRFMAKLSYKKLLMTLGVIVMIIILAIAIPMFAQKGDKITLAGKLGSEPSIITNMYKILIEEETKNTVEVKDGMGKTAFLFNALKSDDIDGYLEFTGTVLGELTKEPLKSKEEKKVYEQAKQSLEKKYQMTMLKPMKYNNTYALAVKRDFAKQHNIRTIGDLNKVKDQLKPGFTLEFNDRPDGYKAVQKAYNLNLDNIRTMEPKLRYQAINKGNINLIDAYSTDAELKQYDMVVLKDDKHVFPPYQGAPLFKESFLKKHPEIKKPLNKLENKISDEDMQMMNYKVTVKNEDPYTVAKDYLKAKGLIK >CP022893.1|AXJ35153.1|782570_783548_+|Choline-transport-ATP-binding-protein-OpuBA MIKFKNVTKRYGKHVAVDNISFNINEGEFFVLIGPSGCGKTTTLKMINRLIHLSEGYIYFKDKPISDYPVYEMRWDIGYVLQQIALFPHMTIKENIAQVPQMKKWKEKDIDKRVDELLDMVGLEPEKYKNRKPDELSGGQRQRVGVIRALAADPPVILMDEPFSALDPISREKLQDDLIELQTKIKKTIIFVTHDIQEAMKLGDKICLLNEGHIEQIDTPEGFKNNPQSEFVKQFMGSHLEDDAPCVEENAIIRDLDIMKPIDEVTSMSAYPIVYDNQPIEVLYQHLSESERVIVMQEDSVGQYVIDRKDIFKYLSQKKEVAQHD >CP022893.1|AXJ35152.1|780567_782349_+|ATP-dependent-DNA-helicase-RecQ MMQQTLSHYFGYETFRPGQEEIISKVLDHRNVLGVLPTGGGKSICYQVPGLLLGGTTIVISPLISLMKDQVDQLKAMGIQAAFLNSSLTQKEQQRIEKALSNGEIQFLYVAPERFENRYFLNMLQRIKIHLVAFDEAHCISKWGHDFRPSYQNVISKVFTLPQDFTIIALTATATVEVQQDIREKLNIAQTDQIKTSTKRRNLIFKVNPTYQRQKFILDYIKTHDEDAGIIYCSTRKQVEELQEALESQKIESVIYHAGLSNKEREEAQNDFLFDRVKVVVATNAFGMGIDKSNVRFVIHYNMPGDLESYYQEAGRAGRDGLKSECILLFSERDINLHEYFITVSQADDDYKDKMGEKLTKMIQYTKTKKCLEATIVHYFEPNEKLEECEQCSNCVQQDKSYNMTQEAKMIISCIARMKQQESYSVIIQVLRGESTDYIKYKGYDQISTHGLMKGYTTSELSHLIDELRFKGFLNENDEILMCDTSIKKLLSNEVEVFTTPFKQKATEKVFINTVEGVDRVLFSQLVEVRKKLSDKLTIAPVSIFSDYTLEEFAKRKPASKQDMINIDGVGSYKLKHYCPAFLETIQNYKAKV >CP022893.1|AXJ35151.1|778678_780556_+|putative-ABC-transporter-ATP-binding-protein-YjjK MEAYKIEHLNKSYADKTIFDNLDLSISEGEKIGLVGINGTGKSTLLKVIGGIDDDFTANVMHPNQYRIRYSSQKQDLNEDMTVFDAVLSSDTTTLRIIKQYEQAVQAYADDQSDKLFKRMIDAQDAMDQHDAWDYNAEIKTILSKLGIHDTTKYIKELSGGQQKRVVLAKTLIEQPDLLLLDEPTNHLDFESISWLINYVKQYPHTVLFVTHDRYFLNEVSTRIIELNRGKLASYPGNYESYIEMRAEREVTLQKQQQKQRALYKEELAWMRAGAKARTTKQQARINRFNDLENEVNQQYKDDKGELNLAYSRLGKQVFELEDLSKAINDKVLFEHLTEIIQKGERIGVVGPNGAGKTTLLNILSGEDQQFEGKLKTGQTVKVAYFKQTDETLDRDIRMIDYLREESEVAKEKDGTSVSITQLLERFLFPSATHGKKVYKLSGGEQKRLYLLRLLVHQPNVLLLDEPTNDLDTETLTILEDYIHTFGGTVITVSHDRYFLNKVAQSYWFIHDGQMEKIIGTFEDYESYKKSLDKNKSTLKQQSKSYTTVRKKNGLSYKEKLEYEQLMKRIEQAEVRMEEIDVLMIEASADYGKIKELNEEKEQLEIQYDLDITRWSELEEIKEQQ >CP022893.1|AXJ35150.1|776462_778403_+|Lipoteichoic-acid-synthase MSSQKKKISLFAFFLLTVITITLKTYFSYYVDFSLGVKGLVQNLILLMNPYSLVALVLSVFLFFKGKKAFWFMFIGGFLLTFLLYANVVYFRFFSDFLTFSTLNQVGNVESMGGAVSASFKWYDFVYFIDTLVYLFILIFKTKWLDTKAFSKKFVPVVMAASVALFFLNLAFAETDRPELLTRTFDHKYLVKYLGPYNFTVYDGVKTIENNQQKALASEDDLTKVLNYTKQRQTEPNPEYYGVAKKKNIIKIHLESFQTFLINKKVNGKEVTPFLNKLSSGKEQFTYFPNFFHQTGQGKTSDSEFTMDNSLYGLPQGSAFSLKGDNTYQSLPAILDQKQGYKSDVMHGDYKTFWNRDQVYKHFGIDKFYDATYYDMSDKNVVNLGLKDKIFFKDSANYQAKMKSPFYSHLITLTNHYPFTLDEKDATIEKSNTGDATVDGYIQTARYLDEALEEYINDLKKKGLYDNSVIMIYGDHYGISENHNNAMEKLLGEKITPAKFTDLNRTGFWIKIPGKSGGINNEYAGQVDVMPTILHLAGIDTKNYLMFGTDLFSKGHNQVVPFRNGDFITKDYKYVNGKIYSNKNNELITTQPADFEKNKKQVEKDLEMSDNVLNGDLFRFYKNPDFKKVNPSKYKYETGPKANSKK >CP022893.1|AXJ35149.1|774984_775989_+|KipI-antagonist MSIIIEKSGLFSSFQDFGRRGYEHDGVIPCGALDTLAHEIANRLVANDKNEATLEMTNKMATIRFTKPTLIALAGGNVKAYTEHMTISPYKLYLLDKGDVLKFRETSYTSRVYLAVGGGFELDAWLGSNSTDFNVKIGGFKGRTLQDGDEIKLKRDYTARHHKLFENLAHTKQTDWGIDGYALSFNYMSDVFHVVKNKGTEDFKEDAIQRFVKHDYKVTSKANRMGMMLEGEKIKAFYEDMPPYQTVKKGTIQIKRDGTPIILLNDHYTLGSYPQIGTIASYHLTKLAQKPQGSRLKFQFIDILTAEKNLVKYSNWLNQLFHGIEYRMQLEMMK >CP022893.1|AXJ35148.1|774290_775001_+|Kinase-A-inhibitor MKIYSQGDQAIVVAIEKEVSKSLTEDLLTLRSYLIEQNYPFIIEIVPSESDMMIVYDARDMIKHHNIQSPFLYMKALIESIHLNIKHDFNQQDLIEIPIVYGSKYGPDIESLLKHYKIKLETFIELHSKTQYFVSMMGYSPGFPYLTGLNKKLYINHTSKQKKFIPAGSVVLEGKKCGIVTTDTINDWLVIGYTPLSLFNPKESDFARLKLGDNIKFRPINENELEVGAFKDVNHN >CP022893.1|AXJ35147.1|773322_773931_+|hypothetical-protein MQLFETMKIDNGYIPRLTYHTNRIKCSSERLNFKFDEHAWRNELNDVTTKYHSGQYRLKIVLNAESKFETIVSPLPEKSSFTAKFQVLPKVVNPTFIKNKTTERKHLAHNHETDLILLTSEDGKVLEFDIGNIVIEEDGKWYTPSYKDDFLKGCMRDYLIDSDKLVEKDFNKNELIYKYHNNEIRLFLINSLREVADVHLCL >CP022893.1|AXJ35157.1|788112_789030_-|Putative-lipid-kinase MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMSHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >CP022893.1|AXJ35158.1|789408_791013_+|Transposase-DDE-domain-protein MYQNYTINQLCLPIDLEIKLEENDFAHAIVQFVDSIPDEVFLPYYQSMGRPQYHPRMLLSIILCAYIQGVYSGRQIQNMLIDSIRMRYLSQEQFPNFRTINRFRVHPIMNDILDHSFVQFRELLVQSGLISGSALYIDGTKIEADANKYSFVWKKSILKYKDSLDQKALENYQQMVETKILPELIDDLKDELSIEEIERIRQSLEEKENQLIEAIDQTETVEERKLLRKEKSEVHKQKKRFDDFAQRKMSYEEQLVIMGVRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMLNGQLKPGYNIQLATENQFALAYDCYPNPTDTRTFIPFLEKIESKIGLPENIVADAGYASEENYCYVLDETESTPIIPHQGYLKEKKRAHKQNQFHRDNWTYNELDDYYICPNQKRVVFSHYSQRKDRNGFIRNFKIYECEDCTGCPLREKCTKAKEGKNRRLNINPTWEYIKIKANEKIESKETASYYAQRKIDVETVFGNIKQNMKFKRFHVRGAEKIFKEMGLVFLAHNFRKLVTRVRKYEGKTIIQNQI >CP022893.1|AXJ35159.1|791139_792645_-|Di-/tripeptide-transporter MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >CP022893.1|AXJ35160.1|792985_793486_-|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >CP022893.1|AXJ35161.1|793505_794372_-|EamA-like-transporter-family-protein MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFLYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSSREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFVLFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >CP022893.1|AXJ35162.1|795172_795571_+|ribonucleotide-reductase-stimulatory-protein MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >CP022893.1|AXJ35163.1|795533_797639_+|Ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha-2 MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSISFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >CP022893.1|AXJ35164.1|797756_798728_+|Ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >CP022893.1|AXJ35165.1|799060_800074_+|Fe(3+)-dicitrate-transport-system-permease-protein-FecD MIMIIINLKGEKFVMKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >CP022893.1|AXJ35166.1|800060_801017_+|Iron-uptake-system-permease-protein-FeuC MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022893_4 | 830170-830248 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP022893_4
|
1 spacers
spacers of CP022893_4
>4.1|830194|31|CP022893|CRISPRCasFinder CTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGCC |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022893_4
The CRISPR arrays of CP022893_4 >merge|CP022893|4|830170-830248|CRISPRCasFinder TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT >CP022893|4|4|830170-830248|CRISPRCasFinder TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT CTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGCC TGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCT
>CP022893.1|AXJ35191.1|826996_829843_+|UvrABC-system-protein-A MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIDVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGIDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYGKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >CP022893.1|AXJ35190.1|825003_826989_+|UvrABC-system-protein-B MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVDGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >CP022893.1|AXJ35189.1|824498_824735_+|hypothetical-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >CP022893.1|AXJ35188.1|823851_824502_+|5'-deoxynucleotidase-YfbR MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >CP022893.1|AXJ35187.1|822838_823678_+|Secretory-antigen-SsaA-precursor MKKTLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >CP022893.1|AXJ35186.1|821437_822430_+|Peptide-chain-release-factor-2 MAEPNFWDNQTKAQDIIDKNNALKAIVNGYKTLQAEVDDMDATWDLLQEEFDEEMKEDLEQEVINFKAKVDEYELQLLLDGPHDANNAILELHPGAGGTESQDWANMLFRMYQRYCEKKGFKVETVDYLPGDEAGIKSVTLLIKGHNAYGYLKAEKGVHRLVRISPFDSSGRRHTSFASCDVIPDFNNDEIEIEINPDDITVDTFRASGAGGQHINKTESAIRITHHPSGIVVNNQNERSQIKNREAAMKMLKSKLYQLKLEEQAREMAEIRGEQKEIGWGSQIRSYVFHPYSMVKDHRTNEETGKVDAVMDGDIGPFIESYLRQTMSHD >CP022893.1|AXJ35185.1|818473_821005_+|preprotein-translocase-subunit-SecA MGFLSKILDGNNKEIKQLGKLADKVIALEEKTAILTDEEIRNKTKQFQTELADIDNVKKQNDYLDKILPEAYALVREGSKRVFNMTPYKVQIMGGIAIHKGDIAEMRTGEGKTLTATMPTYLNALAGRGVHVITVNEYLSSVQSEEMAELYNFLGLTVGLNLNSKTTEEKREAYAQDITYSTNNELGFDYLRDNMVNYSEDRVMRPLHFAIIDEVDSILIDEARTPLIISGEAEKSTSLYTQANVFAKMLKQDEDYKYDEKTKAVHLTEQGADKAERMFKVENLYDVQNVDVISHINTALRAHVTLQRDVDYMVVDGEVLIVDQFTGRTMPGRRFSEGLHQAIEAKEGVQIQNESKTMASITFQNYFRMYNKLAGMTGTAKTEEEEFRNIYNMTVTQIPTNKPVQRNDKSDLIYISQKGKFDAVVEDVVEKHKAGQPVLLGTVAVETSEYISNLLKKRGIRHDVLNAKNHEREAEIVAGAGQKGAVTIATNMAGRGTDIKLGEGVEELGGLAVIGTERHESRRIDDQLRGRSGRQGDKGDSRFYLSLQDELMIRFGSERLQKMMSRLGLDDSTPIESKMVSRAVESAQKRVEGNNFDARKRILEYDEVLRKQREIIYNERNSIIDEEDSSQVVDAMLRSTLQRSINYYINTADDEPEYQPFIDYINDIFLQEGDITEDDIKGKDAEDIFEVVWAKIEAAYQSQKDILEEQMNEFERMILLRSIDSHWTDHIDTMDQLRQGIHLRSYAQQNPLRDYQNEGHELFDIMMQNIEEDTCKFILKSVVQVEDNIEREKTTEFGEAKHVSAEDGKEKVKPKPIVKGDQVGRNDDCPCGSGKKFKNCHGK >CP022893.1|AXJ35184.1|817487_818060_+|Putative-sigma-54-modulation-protein MIRFEIHGDNLTITDAIRNYIEEKIGKLERYFNDVPNAVAHVKVKTYSNSATKIEVTIPLKNVTLRAEERNDDLYAGIDLINNKLERQVRKYKTRINRKSRDRGDQEVFVAELQEMQETQVDNDAYDDNEIEIIRSKEFSLKPMDSEEAVLQMNLLGHDFFVFTDRETDGTSIVYRRKDGKYGLIQTSEQ >CP022893.1|AXJ35183.1|816752_817427_+|DNA-utilization-protein-GntX MNNCLSCGAKLYENITIYNLFKKPNRLCDRCKENWDNIKLDIKARRCSRCLKHLNQDEAYCLDCKFLSAHFNLMEQLYCQFQYDGLMKEMIHQYKFLKDYYLCELLAHLIEIPQTSYDYIVPIPSSPAHDLSRTFNPVEAVLKAKGIRFDKILKMSNRPKQSHLTKKERLADENPFIIDTELDLNGKEILLVDDIYTTGLTIHRAGCKLYAKNIRKFKVFAFAR >CP022893.1|AXJ35182.1|815677_816760_+|UvrABC-system-protein-B MDNVTRYKITESSQSSSQAYYHLSFELSEQQSYASEHIVRAIRMRQTILLYAVTGAGKTEMMFQGIQYARRQGDNIAIVSPRVDVVVEISKRMKDAFLNEDIDILHQQSSQQFEGHFVVCTVHQLYRFKQHFDTIFIDEVDAFPLSMDKSLQQALKSSSKVEHATIYMTATPPKQLLSEIPHENIIKLPARFHKKSLPVPKYRYFKLNNNKIQKMLYRILQDQINNQRYTLVFFNNIETMIKTFSVYKQKITKLTYVHSEDVFRFEKVEQLRNGHFDVIFTTTILERGFTMANLDVVVIDAHQYTQEALIQIAGRVGRKLECPAGKVLFFHEGVSMNMIQAKKEIQRMNKLALKRGWIDE >CP022893.1|AXJ35192.1|830506_831439_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >CP022893.1|AXJ35193.1|831444_832284_+|Prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >CP022893.1|AXJ35194.1|832291_832777_+|Maltose-O-acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >CP022893.1|AXJ35195.1|832784_834224_+|Anaphase-promoting-complex,-cyclosome,-subunit-3 MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >CP022893.1|AXJ35196.1|834290_835226_+|Thioredoxin-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >CP022893.1|AXJ35197.1|836111_837023_+|glmZ(sRNA)-inactivating-NTPase MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >CP022893.1|AXJ35198.1|837019_838015_+|Gluconeogenesis-factor MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >CP022893.1|AXJ35199.1|838125_839070_+|Putative-sporulation-transcription-regulator-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >CP022893.1|AXJ35200.1|839633_840221_+|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >CP022893.1|AXJ35201.1|840463_841333_-|Epimerase-family-protein MVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGMILSNGGGALQTMKLPYKYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP022893_5 | 835625-835894 | Unclear |
NA
Consensus repeat of CP022893_5
|
4 spacers
spacers of CP022893_5
>5.1|835661|22|CP022893|CRT CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA >5.2|835719|23|CP022893|CRT TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT >5.3|835778|22|CP022893|CRT CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA >5.4|835836|23|CP022893|CRT TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022893_5
The CRISPR arrays of CP022893_5 >merge|CP022893|5|835625-835894|CRT GCTTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGAAATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGAAATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCCTGACTAGAGTTGAAAAA >CP022893|5|1|835625-835894|CRT GCTTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTG CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA TTCTCTTTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTG TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT TTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTG CCTGTAGAATTTCTTTTCGAAA TTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTG TCTGTAGAAATTGGAAATCCAAT TTCTCTGTGTTGGGGCCCCTGACTAGAGTTGAAAAA
>CP022893.1|AXJ35196.1|834290_835226_+|Thioredoxin-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >CP022893.1|AXJ35195.1|832784_834224_+|Anaphase-promoting-complex,-cyclosome,-subunit-3 MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >CP022893.1|AXJ35194.1|832291_832777_+|Maltose-O-acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >CP022893.1|AXJ35193.1|831444_832284_+|Prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >CP022893.1|AXJ35192.1|830506_831439_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >CP022893.1|AXJ35191.1|826996_829843_+|UvrABC-system-protein-A MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIDVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGIDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYGKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >CP022893.1|AXJ35190.1|825003_826989_+|UvrABC-system-protein-B MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVDGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >CP022893.1|AXJ35189.1|824498_824735_+|hypothetical-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >CP022893.1|AXJ35188.1|823851_824502_+|5'-deoxynucleotidase-YfbR MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >CP022893.1|AXJ35187.1|822838_823678_+|Secretory-antigen-SsaA-precursor MKKTLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >CP022893.1|AXJ35197.1|836111_837023_+|glmZ(sRNA)-inactivating-NTPase MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >CP022893.1|AXJ35198.1|837019_838015_+|Gluconeogenesis-factor MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >CP022893.1|AXJ35199.1|838125_839070_+|Putative-sporulation-transcription-regulator-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >CP022893.1|AXJ35200.1|839633_840221_+|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >CP022893.1|AXJ35201.1|840463_841333_-|Epimerase-family-protein MVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGMILSNGGGALQTMKLPYKYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE >CP022893.1|AXJ35202.1|842068_842698_+|hypothetical-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDNASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK >CP022893.1|AXJ35203.1|843398_844412_+|Central-glycolytic-genes-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >CP022893.1|AXJ35204.1|844464_845475_+|Glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase-1 MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >CP022893.1|AXJ35205.1|845613_846804_+|Phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK >CP022893.1|AXJ35206.1|846925_847687_+|Triosephosphate-isomerase MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETEEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022893_6 | 897454-897535 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022893_6
|
1 spacers
spacers of CP022893_6
>6.1|897478|34|CP022893|CRISPRCasFinder ATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022893_6
The CRISPR arrays of CP022893_6 >merge|CP022893|6|897454-897535|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCATCCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA >CP022893|6|5|897454-897535|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA ATTGAGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA
>CP022893.1|AXJ35269.1|896471_897350_+|hypothetical-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMQEETLSQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLNDLPEQQELFPVNEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQVHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >CP022893.1|AXJ35268.1|896356_896470_+|hypothetical-protein MKENLLGTIIWSIATFYYSRMMKIMNLAILKIKIGGS >CP022893.1|AXJ35267.1|895912_896293_+|Glycine-cleavage-system-H-protein MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVATIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQLEALLTAEKYSEMIGE >CP022893.1|AXJ35266.1|895398_895755_+|Regulatory-protein-MgsR MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >CP022893.1|AXJ35265.1|894934_895255_-|Thioredoxin-like-protein-YdbP MQAIKSNESFKSIINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >CP022893.1|AXJ35264.1|894244_894784_+|putative-oxidoreductase MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEEDMPKAPRKNRNLITLY >CP022893.1|AXJ35263.1|893445_894162_+|3-dehydroquinate-dehydratase MTHVEVVATIAPQLSIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFINDLYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIIKHLQQYNKEVVISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGEPQAPGQIDVTDLKAQVTLY >CP022893.1|AXJ35262.1|892875_893298_-|Organic-hydroperoxide-resistance-protein-like-protein MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDSDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD >CP022893.1|AXJ35261.1|891982_892477_-|hypothetical-protein MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK >CP022893.1|AXJ35260.1|891210_891828_-|Arginine-exporter-protein-ArgO MVTAIIHGFILAIGLILPLGAQNVFIFNQGANQPKYRYVLPAIITAGLSDSLLIIIAVVGVSIIIMSLPVLQAIIYIVGLIFLMYMAWTIWHDKPSTDGEAQIISPMKQVSFALSVSLLNPHAILDTIGVIGSSAALYSGSNKIAFTIACISVSWLWFFLLAILGKMVGSIDKTGKLLTIINKISSIIIIIVALMILQKLIQLLF >CP022893.1|AXJ35270.1|898142_898532_+|Ribonuclease-M5 MMAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPLLPNINNERLVLVNE >CP022893.1|AXJ35271.1|898524_898821_+|Thioredoxin MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK >CP022893.1|AXJ35272.1|899070_900096_+|Methionine-import-ATP-binding-protein-MetN-2 MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEHGPVTQVFENPQHTVTKRFVKEDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >CP022893.1|AXJ35273.1|900088_900784_+|Methionine-import-system-permease-protein-MetP MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWIVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >CP022893.1|AXJ35274.1|900801_901623_+|Methionine-binding-lipoprotein-MetQ-precursor MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYDLDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >CP022893.1|AXJ35275.1|901976_902171_+|CsbD-like-protein MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >CP022893.1|AXJ35276.1|902404_903256_-|hypothetical-protein MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTGLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEVVKLNFTGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >CP022893.1|AXJ35277.1|903583_904345_+|YurY MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >CP022893.1|AXJ35278.1|904442_905750_+|FeS-cluster-assembly-protein-SufB MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKHFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDKNASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK >CP022893.1|AXJ35279.1|905864_907106_+|putative-cysteine-desulfurase MAEHSFDVNEVIKDFPILDQKVNGKRLAYLDSTATSQTPMQVLNVLEDYYKRYNSNVHRGVHTLGSLATDGYENARETVRRFINAKYFEEIIFTRGTTASINLVAHSYGDANVEEGDEIVVTEMEHHANIVPWQQLAKRKNATLKFIPMTADGELNIEDIKQTINDKTKIVAIAHISNVLGTINDVKTIAEIAHQHGAIISVDGAQAAPHMKLDMQEMNADFYSFSGHKMLGPTGIGVLFGKRELLQKMEPIEFGGDMIDFVSKYDATWADLPTKFEAGTPLIAQAIGLAEAIRYLERIGFDAIHKYEQELTIYAYEQMSAIEGIEIYGPPKDRRAGVITFNLQDVHPHDVATAVDTEGVAVRAGHHCAQPLMKWLNVSSTARASFYIYNTKEDIDQLINALKQTKEFFSYEF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP022893_7 | 984238-984319 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022893_7
|
1 spacers
spacers of CP022893_7
>7.1|984262|34|CP022893|CRISPRCasFinder CCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022893_7
The CRISPR arrays of CP022893_7 >merge|CP022893|7|984238-984319|CRISPRCasFinder ACAATGCAAGTTGGGGTGGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGTAAGTTGGGGTGGGGGCC >CP022893|7|6|984238-984319|CRISPRCasFinder ACAATGCAAGTTGGGGTGGGGGCC CCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAA ACAATGTAAGTTGGGGTGGGGGCC
>CP022893.1|AXJ35342.1|982788_984096_-|Ktr-system-potassium-uptake-protein-B MNKVHKPLYFYLMLFFSTTIIGALLLYLPFTGKKPISFLDALFIASSAFTVTGLSPVDIGSQFNILGEIVILLLIQIGGLGIVTVTLLTLVFLNRKISMKNRFLIMVTWNIDEPGGVIKLIKHLAIYSLVTELIGMICLCLSFIPKFGIGKGLFLSLFTSVSAFNNAGFALFKNNLIDYSSDPIVIITISILIIFGGIGHFVVIDFINCKKLSKLSLHSKLVLTTTSILIIIGAITFFLLEQFNTMQHMGLVEKIGNSFFQSVTTRTAGFNSIDIASINKSTALMLMLLMFIGGAPLSAAGGIKITTFAVAFIFVLNYIRKENNVSVFNKEISDKHIKLSIVTINISFLFISIITFILSIINPNISLIKLLFEVVSAFGTVGLSMNLTTEYHGITKIIIIFVMLCGKVGLLTLLRTFIPPKSPKNYRYTKGQIYL >CP022893.1|AXJ35341.1|981391_982711_+|Transposase MCNDTLELLRIKDENIKYINQEIDVIIKGKKATVVNAVLTYKPSACYCCGVKNEGQIHKHGKRVSRITLLKTQGYNTYLNLAKQRFKCLECNGTFTAKTSIVDESCFISRCVTQKVIEEATKVKTEIDTAEDNCISPSTVSRIRTKAANSLRIKPFNCLPEHIAMDEFKSVKNVTGSMSFIFIDNDTHDVIDILENRTTRFLRAYFERFDLKNRQQVKTVTIDMYEPYVRLFRDLFPNAAIIFDRFHIVQHLNRELNKYRVQVMNEYRNKKGPNYTIFKNNWKVLLMDTSKTIFSKYRWNKSFKAYKRSSDIVEFMLSKDDILRRSYELVQGLRKDLRLCNWPKFINRLNSVSKKSVSKGVWKVVKYYRKHQRMLRNTIYYPAFNNGAIEGINNKIKLIKRISFGYRNFNNFKARIMMIFSLYKGEKKKTTKPNNGLAA >CP022893.1|AXJ35340.1|979112_980729_+|60-kDa-chaperonin MVKQLKFSEDARQAMLRGVDQLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEFTAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAVEALHENSQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGRYISEAMEKVGNDGVITIEESNGLNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMVAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSNRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLDLKDASIDMLGTASKVEVTKDNTTVVDGDGDENSIDARVSQLKSQIEETESDFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNVYQKVSEIEAEGDIETGVNIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSVIVERLKNAEPGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVASIPEKNNDQPNMGGMPGMM >CP022893.1|AXJ35339.1|978752_979037_+|10-kDa-chaperonin MLKPIGNRVIIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVIVAVGTGRLLNDGTRVTPEVKEGDRVVFQQYAGTEVKRDNETYLVLNEEDILAVIE >CP022893.1|AXJ35338.1|977834_978578_-|CAAX-amino-terminal-protease-self--immunity MTRLWASLLTVIIYILSQFLPLLIVKKLPFVQYSGIELTKAVIYIQLVLFLIAATTIILINLKIKNPTKLELEVKEPKKYIIPWALLGFALVMIYQMVVSIVLTQIYGGQQVSPNTEKLIIIARKIPIFIFFVSIIGPLLEEYVFRKVIFGELFNAIKGNRIVAFIIATTVSSLIFALAHNDFKFIPVYFGMGVIFSLAYVWTKRLAVPIIIHMLQNGFVVIFQLLNPEALKKATEQANFIYHIFIP >CP022893.1|AXJ35337.1|976601_977810_+|hypothetical-protein MSYHWFKKMLLSTSILILSSSSLGLATHTVEAKDNLNGEKPTTNLNHNITSPSVNSEMNNNETGTPHESNQTGNEGTGSNSRDANPDSNNVKPDSNNQNPSTDSKPDPNNQNPSPNPKPDPDNPKPKPDPKPDPDKPKPNLDPKPDPDNPKPKPDPDKPKPNPNPKPDPNKPNPNPSPDPDQPGDSNHSGGSKNGGTWNPNASDGSNQGQWQPNGNQGNSQNPTGNDFVSQRFLALANGAYKYNPYILNQINKLGKDYGEVTDEDIYNIIRKQNFSGNAYLNGLQQQSNYFRFQYFNPLKSERYYRNLDEQVLALITGEIGSMPDLKKPEDKPDSKQRSFEPHEKDDFTVVKKQEDNKKSASTAYSKSWLAIVCSMMVVFSIMLFLFVKRNKKKNKNESQRR >CP022893.1|AXJ35336.1|975778_976405_-|Nitroreductase-family-protein MGLFKKDKKAMTFDNAMEERRSIYNLKDSISISDDELESMIAHAVKHVPSSFNSQSTRIVLLLNDNNNKFWDNTKAILKEVMGENRDFEPTEQKIDNFKHSYGTILFYEDQDVVSGLQEQMPNYYDNFAIWSTQTNAMHQFAIWTALATKGIGASLQHYNPLVDEMTSKEFNIPKSWKLIAQMPFGDIREAAGEKTFNPVEDRFVIKK >CP022893.1|AXJ35335.1|974632_975418_-|2-oxoglutaramate-amidase MKVQIYQLPIIFGDSSKNETQITQWFEKNMNAEVDVVVLPEMWNNGYDLEHLNEKADNNLGQSFSFIKHLAEKYKVDIVAGSVSNIRNYQIFNTAFSVNKSGQLINEYDKVHLVPMLREHEFLTAGENVAEPFQLSDGTYVTQLICYDLRFPELLRYPARSGAKIAFYVAQWPMSRLQHWHSLLKARAIENNMFVIGTNSTGFDGNTEYAGHSIVINPNGDLVGELNESADILTVDLNLNEVEQQRENIPVFKSIKLDLYK >CP022893.1|AXJ35334.1|973898_974033_+|Delta-hemolysin MSCLILRIFILIKEGVISMAQDIISTIGDLVKWIIDTVNKFTKK >CP022893.1|AXJ35333.1|973099_973717_-|Accessory-gene-regulator-protein-B MIKDCTKSYNNSEESGVKLNYFDNKIDQFATYLQKRNNLDHIQFLQVRLGMQIIVGNFFKILVTYSISIFLSVFLFTLVTHLSYMLIRYNAHGAHAKSSILCYIQSILTFVFVPYFLINIDINFTYLLALSIIGLISVVIYAPAATKKQPIPIKLVKRKKYLSIIMYLLVLILSLIIHPFYAQFMLLGILVESITLLPIFFPKED >CP022893.1|AXJ35343.1|984539_985763_-|putative-succinyl-diaminopimelate-desuccinylase MTTFSEKEKIQLLADIVELQTENNNEIDVCNYLKDLFDKYDIKSEILKVNEHRANIVAEIGNGSPILALSGHMDVVDAGNQDNWTYPPFQLTEKAGKLYGRGTTDMKGGLMALVITLIELKEQNQLPQGTIRLLATAGEEKEQEGAKLLADKGYLDDVDGLIIAEPTGSGIYYAHKGSMSCKVTATGKAVHSSVPFIGDNAIDTLLEFYNQFKEKYSELKKHDTKHELDVAPMFKSLIGKEISEEDANYASGLTAVCSIINGGKQFNSVPDEASLEFNVRPVPEYDNDFIESFFQNIINDVDSNKLSLDIPSNHRPVTSDKNSKLITTIKDVASSYVEQDEIFVSALVGATDASSFLGDNKDNVDLAIFGPGNPLMAHQIDEYIEKDMYLKYIDIFKEASIQYLKEK >CP022893.1|AXJ35344.1|986101_987274_+|Transposase,-Mutator-family MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK >CP022893.1|AXJ35345.1|987530_988586_+|putative-leukocidin-like-protein-2-precursor MKNKKRVLIASSLSCAILLLSAATTQANSAHKDSQDQNKKEHVDKSQQKDKRNVTNKDKNSTVPDDIGKNGKITKRTETVYDEKTNILQNLQFDFIDDPTYDKNVLLVKKQGSIHSNLKFESHKEEKNSNWLKYPSEYHVDFQVKRNRKTEILDQLPKNKISTAKVDSTFSYSSGGKFDSTKGIGRTSSNSYSKTISYNQQNYDTIASGKNNNWHVHWSVIANDLKYGGEVKNRNDELLFYRNTRIATVENPELSFASKYRYPALVRSGFNPEFLTYLSNEKSNEKTQFEVTYTRNQDILKNRPGIHYAPPILEKNKDGQRLIVTYEVDWKNKTVKVVDKYSDDNKPYKEG >CP022893.1|AXJ35346.1|988607_989624_+|putative-leukocidin-like-protein-1-precursor MIKQLYKNITICSLAISTALTVFPATSYAKINSEIKAVSEKNLDGDTKMYTRTATTSDSQKNITQSLQFNFLTEPNYDKETVFIKAKGTIGSGLRILDPNGYWNSTLRWPGSYSVSIQNVDDNNNTNVTDFAPKNQDESREVKYTYGYKTGGDFSINRGGLTGNITKESNYSETISYQQPSYRTLLDQSTSHKGVGWKVEAHLINNMGHDHTRQLTNDSDNRTKSEIFSLTRNGNLWAKDNFTPKDKMPVTVSEGFNPEFLAVMSHDKKDKGKSQFVVHYKRSMDEFKIDWNRHGFWGYWSGENHVDKKEEKLSALYEVDWKTHDVKFVKVLNDNEKK >CP022893.1|AXJ35347.1|989861_990686_-|Phospholipase-C-precursor MYPNWGQYKRADLIGQSSYIKNNDVVIFNEAFDNGASDKLLSNVKKEYPYQTPVLGRSQSGWDKTEGSYSSTVAEDGGVAIVSKYPIKEKIQHVFKSGCGFDNDSNKGFVYTKIEKNGKNVHVIGTHTQSEDSRCGAGHDRKIRAEQMKEISDFVKKKNIPKDETVYIGGDLNVNKGTPEFKDMLKNLNVNDVLYAGHNSTWDPQSNSIAKYNYPNGKPEHLDYIFTDKDHKQPKQLVNEVVTEKPKPWDVYAFPYYYVYNDFSDHYPIKAYSK >CP022893.1|AXJ35348.1|990742_991780_-|Tyrosine-recombinase-XerC MKTRCYDGKKWQYEFKYEGKRYRKKGFRTKREANSAGLDKLNELRSGFNIDNYITLEEYFENWIKTYKQPVVKENTYRHYRNALQHIQKHKIGKMELSKINRQVYQKFINDYSKEHAKETIRKTNGAIRSALDDALYDGLIFKNPAYKVNYKAGKPTKSEQEKFISVTEYEILKDHVRKKRTRSSLALFIMICTGCRVSGARNIKIEHINQVKNTIFIDERKTDTSPRYISIAKSDMKHIMDVISTFAISYDGYIFKEAGSIINLHAINNALKSACRVNNIPIITSHALRHTHCSYLLAKGVSIHYISKRLGHKNIAITTSVYSHLLEEKFNEEDKKTTKILESM >CP022893.1|AXJ35349.1|991973_992678_-|PemK-like-protein MERNSTKKSSKDKILKAVNNFEEVCNSGKFKFKYLDDWLFTKSIIFKNETTLTNQKNFKVYPRGTIVYAKLGVNIGSEFSGNHFCVVLNKNDNKRNELITIVPLTSKDTKFSLKLQENLILKALEKMKTDHKTLRFDLDRIKEMHARSTKVKNLNPAIEKELDEIENNYMQLAKIIERYERFVGKQTYAIPSQVITISKKRISTLNDYDPTGHISFNEETLKIIEDFMKANILS >CP022893.1|AXJ35350.1|992817_992985_-|hypothetical-protein MKITNCKIKKETIVYEVLTSGNQPFTYELPKDLSSHNARKYLEFISQKIDGDRLN >CP022893.1|AXJ35351.1|993054_993240_-|hypothetical-protein MSTYKEIEHLHINTGGKELTQEQIEEAKAFIDSQEFKDMIREAKESHQRVMESKITDRTKL >CP022893.1|AXJ35352.1|993236_993383_-|hypothetical-protein MDFKEVDINIEEWEMVEIPFYTEEELTYRLNNGLPITKSELEEQESKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP022893_8 | 1420867-1420951 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022893_8
|
1 spacers
spacers of CP022893_8
>8.1|1420893|33|CP022893|CRISPRCasFinder TGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGATTCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022893_8
The CRISPR arrays of CP022893_8 >merge|CP022893|8|1420867-1420951|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTG >CP022893|8|7|1420867-1420951|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTG TGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGATTCCCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTG
>CP022893.1|AXJ35751.1|1418870_1420694_+|Elongation-factor-4 MDNEQRLKRRENIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILENTKSVETRDMQDQLLDSMDLERERGITIKLNAVRLKYEAKDGNTYTFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNELELLPVINKIDLPAAEPERVKQEIEDMIGLDQDDVVLASAKSNIGIEEILEKIVEVVPAPDGDPEAPLKALIFDSEYDPYRGVISSIRIVDGVVKAGDKIRMMATGKEFEVTEVGINTPKQLPVDELTVGDVGYIIASIKNVDDSRVGDTITLASRPASEPLQGYKKMNPMVYCGLFPIDNKNYNDLREALEKLQLNDASLEFEPESSQALGFGYRTGFLGMLHMEIIQERIEREFGIELIATAPSVIYQCILRDGSEVTVDNPAQMPDRDKIDKIFEPYVRATMMVPNDYVGAVMELCQRKRGQFINMDYLDDIRVNIVYELPLAEVVFDFFDQLKSNTKGYASFDYEFIENKESNLVKMDILLNGDKVDALSFIVHRDFAYERGKALVEKLKTLIPRQQFEVPVQAAIGQKIVARTNIKSMGKNVLAKCYGGDISRKRKLLEKQKAGKAKMKAVGNVEIPQDAFLAVLKMDDE >CP022893.1|AXJ35750.1|1418273_1418525_-|30S-ribosomal-protein-S20 MANIKSAIKRVKTTEKAEARNISQKSAMRTAVKNAKTAVSNNADNKNELVSLAVKLVDKAAQSNLIHSNKADRIKSQLMTANK >CP022893.1|AXJ35749.1|1417254_1418229_+|DNA-polymerase-III-subunit-delta MSDNIVAIYGDVPELVEKQSAEIISQFLKSDRDDFNFVKYNLYETEIAPIVEETLTLPFFSDKKAILVKNAYIFTGEKAPKDMAHNVDQLIEFIEKYDGENLIVFEIYQNKLDERKKLTKTLKKHARLKKIEQMSEEEIKKWIQSKLNENFKDIKRDALDLFIELTGINFNIVSQEIEKLILFLGDRPTINKQDVNQIINRSLEQNVFLLTEYIQKRKKEQAIHLVKDLITMKEEPIKLLALITSNYRLFYQCKILSQKGYSGQQIAKTIGVHPYRVKLALGQVRHYQLDELLNIVDACAETDYKLKSSYMDKQLILELFILSL >CP022893.1|AXJ35748.1|1414996_1417198_+|ComEC-family-competence-protein MLYVALSMIVGVLWNSSKVLSTFLFILLLYITYRKNKIVYAPISLFLIIFSSWYLHYSQQAIFNYINYIERNSQFNERAQVIQIQRQGSDTYKGRLSLKNEIYPFFLTDKKNFDLKKIESRNCIVKGQFKVNENKFVTLKLQSIVVQSCLESNRSNLIEKHKQFIMNRIYDSGIKFPDRIMALITGDVKEINEQFKERVKEIGIYHLLAVSGSHIAAIVFLIYQPLKRLNLPLFVIKGITINVLTLYAQYTNYAPSAVRAIIMTTLVLLITKQIKIKGIQLLAFAFIIMFILNPLVVYDIGFQFSFIISFFIMLLFPFLQQLSKLQSLFIITFIAQLASFIVAIPNFHQLQWVGFLSNLIFVPYYSIILFPLSILFFITSHFIVGLTPLNYLVDLSFNFHDWLLDLFTRIKQSHFSVPKFNDWIFIIFIISVYYIFWLLAKRKYILVTFWTIIILTLLITFPTNSHHKITMLNVGQGDSILYEGGKNQNVLIDTGGKVIDDTKQPSYSISKYHILPTLNERGINELEYLILTHPHNDHIGEVEYIISHIKIKHIVIYNKGYSSNTLMLLSKLSHKYNIKLMDVRQVSSFKLGDSSFLFFDSFIPNSRDKNEYSIITMITYQNKKVLLMGDASKNNESLLLKKYNLPEIDILKVGHHGSKTSSSKEFIEMIKPKISLISSGKNNMYHLPNIEVVKRLQRIRSRIYNSQQNGQVTIDLDDNLKVDSNSYGNASGL >CP022893.1|AXJ35747.1|1414560_1414992_+|tRNA-specific-adenosine-deaminase MAQSHLLALRSTCQRLSVGATIVKDNRIIAGGYNGSVAGEVHCIDEGCLIEDGHCIRTIHAEMNALLQCAKQGVSTEGATIYVTHFPCLNCTKSIIQAGIKRIYYAEDYHNHEYATKLLKQSGIEFKKIPFSPEYVAKYLTKG >CP022893.1|AXJ35746.1|1413761_1414439_+|ComE-operon-protein-1 MYQFLLRYKDFLTQWKLYIISAVVLIMVLIGFIFWRQDDYTSRNFENKDTALKQSTSENNSLSKLEDVQVKDGDNSKNKGPVYVDVKGAVKHPNVYKMTSKDRVVDLLDKAQLLDDADVSRINLSEKLTDQKMIFIPHKGQKNVEPQIEVNSVHVKNGNTNNTKVNLNTASVSELMSVPGVGQAKANAIVEYRNQQGAFQEIDDLKKVKGFGSKTFDKLKSYFTI >CP022893.1|AXJ35745.1|1412996_1413713_+|dTDP-3-amino-3,6-dideoxy-alpha-D-glucopyranose-N,N-dimethyltransferase MSQYAEMSLVYDQLTQDQPYEKWFEIVKNHCKDESNILDIGCGTGSLTVQLEALGNVTGMDLSVDMLTVAAQKSANVNWLEGDMTSFDLQQQFDIITIFCDSLNYLQDETAVIETFINVYHHLTDSGVFIFDVHTVYKMMTLFNNQSYIDDKGDIFLAWDAVQGDLPLSVYHDMTFFIRHEDETYSRFDESHFQRTFDEKTYLSWLAQVGFKHVETFTDFNIDEHNEDTERLFFIAKK >CP022893.1|AXJ35744.1|1412640_1412994_+|Ribosomal-silencing-factor-RsfS MNSQELLAIAVDAIDNKKGEDTISLEMKGISDMTDYFVVTHGNNERQVQAIARAVKEVANEQNIEVKRMEGYNEARWILIDLADVVVHVFHKDERNYYNIEKLYQDAPLESYGQVAY >CP022893.1|AXJ35743.1|1412055_1412640_+|putative-nicotinate-nucleotide-adenylyltransferase MNIEKAKRLAKEKLPEKRYNHSLRVAETAIKLAEIYDGDTSKVELAGVLHDFCKYDDLGKMYQIVRQYELGNDLLSYGSEILHGPVCAAIMEHEYGINDEEVLMAIKYHTTGRQQMTKTEKLIFIADYIEPGRTIPGVDDIRDMAYNQGSLDKTIYEISKRTVLFLIQKDITVYNKTIDCLNYYNYSDERIKDD >CP022893.1|AXJ35742.1|1411496_1412066_+|putative-nicotinate-nucleotide-adenylyltransferase MKKIVLYGGQFNPIHTAHMIVASEVFHELQPDEFYFLPSFMSPLKKHNNFIDVQHRLTMIQMIIDELGFGDICDDEIKRGGQSYTYDTIKAFKEQHKDSELYFVIGTDQYNQLEKWYQIEYLKEMVTFVVVNRDKNSQNVENAMIAIQIPRVDISSTMIRQRVSEGKSIQVLVPKSVENYIKGEGLYEH >CP022893.1|AXJ35752.1|1421226_1422384_+|Oxygen-independent-coproporphyrinogen-III-oxidase-1 MDKQSEKRGIKMTVQSAYIHIPFCVRICTYCDFNKYFIQNQPVDEYLDALITEMSTAKYRNLKTMYVGGGTPTALSINQLERLLKAIRDTFTITGEYTFEANPDELTKEKVQLLEKYGVNRISMGVQTFKPELLSVLGRTHNTEDIYTSVLNAKNAGIKSISLDLMYHLPKQTIEDFEQSLDLALDMDIQHISSYGLILEPKTQFYNMYRKGLLKLPNEDLGADMYQLLMSKIEQSPFHQYEISNFALDGHESEHNKVYWFNEEYYGFGAGASGYVDGVRYTNINPVNHYIKAINKESKAILVSNKPSLTERMEEEMFLGLRLNEGVSSSRFKKKFDQSIESVFGQTINNLKEKELIVEKNDAIALTKRGKVIGNEVFEAFLIND >CP022893.1|AXJ35753.1|1422484_1423462_+|Heat-inducible-transcription-repressor-HrcA MITDRQLSILNAIVEDYVDFGQPVGSKTLIERHNLNVSPATIRNEMKQLEDLNYIEKTHSSSGRSPSQLGFRYYVNRLLEQTSHQKTNKLRRLNQLLVENQYDVSSALTYFADELSNISQYTTLVVHPNHKQDIINNVHLIRANPNLVIMVIVFSSGHVEHVHLASDIPFSNDKLNTISNFVTNKLTEFNQNLQDDIVSFVQSEQEEIFINKLINTMNNHISNQSNSIYMGGKVKLIDALNESNVSSIQPILQYIESNRIAELLQDISSPNINVKIGNEIDDSLSDISIVTSQYHFDETLKGQIAVIGPTAMHYQNVIQLLNRIW >CP022893.1|AXJ35754.1|1423493_1424120_+|heat-shock-protein-GrpE MTNKDESVEKNTESTVEETNIKQNIDDSVEQAEESKGHLQDEAIEETSDENVIEEIDPKDQKINELQQLADENEEKYLRLYAEFENYKRRIQKENEINKTYQAQRVLTDILPAIDNIERALQIEGDDETFKSLQKGVQMVHESLINALKDNGLEVIKTEGEAFDPNIHQAVVQDDNPDFESGEITQELQKGYKLKDRVLRPSMVKVNQ >CP022893.1|AXJ35755.1|1424188_1426021_+|Chaperone-protein-DnaK MSKIIGIDLGTTNSCVTVLEGDEPKVIQNPEGSRTTPSVVAFKNGETQVGEVAKRQAITNPNTVQSIKRHMGTDYKVDIEGKSYTPQEISAMILQNLKNTAESYLGEKVDKAVITVPAYFNDAERQATKDAGKIAGLEVERIINEPTAAALAYGLDKTDKDEKVLVFDLGGGTFDVSILELGDGVFEVLSTAGDNKLGGDDFDQVIIDYLVAEFKKENGVDLSQDKMALQRLKDAAEKAKKDLSGVSQTQISLPFISAGENGPLHLEVNLTRSKFEELSDSLIRRTMEPTRQAMKDAGLTNSDIDEVILVGGSTRIPAVQEAVKKEIGKEPNKGVNPDEVVAMGAAIQGGVITGDVKDVVLLDVTPLSLGIEILGGRMNTLIERNTTIPTSKSQIYSTAVDNQPSVDVHVLQGERPMAADNKTLGRFQLTDIPPAERGKPQIEVTFDIDKNGIVNVTAKDLGTNKEQRITIQSSSSLSDEEIDRMVKDAEVNAEADKKRREEVDLRNEADSLVFQVEKTLTDLGENIGEEDKKSAEEKKDALKTALEGQDIEDIKSKKEELEKVIQELSAKVYEQAAQQQQQAQGANAGQNNDSTVEDAEFKEVKDDDKK >CP022893.1|AXJ35756.1|1426156_1427296_+|Chaperone-protein-DnaJ MAKRDYYEVLGISKDASKDEIKKAYRKLSKKYHPDINKEEGADEKFKEISEAYEVLSDDNKRASYDQFGHDGPQGFGGQGFNGSDFGGFSGFGGGGFEDIFSSFFGGGRQRDPNAPQKGDDLQYTMTLTFEEAVFGTTKEISIRKDVTCETCHGDGAKPGTSKKTCSYCNGAGHVAVEQNTILGRVRTEQVCPKCNGSGQEFEEACPTCHGKGTENKTVKLEVKVPEGVDNEQQIRLAGEGSPGVNGGPAGDLYVVFRVKPSETFKRDGDDIYYKLNVSFPQAALGDEIKIPTLNNEVMLTIPAGTQTGKQFRLKEKGIKNVHGYGYGDLYVDIKVVTPTKLTDRQKELMKEFAQLNGEEINEQPSNFKDRAKRFFKGE >CP022893.1|AXJ35757.1|1427299_1428238_+|Ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNWTELSIIINHEAVELATNILENHGSNGVVIEDSDDLINQPEDKYGEIYALKKEDYPDKGVRLKAYFNEMTYDDKLRQQIKDELLNLDELDQHNIQFSEQIIAETDWENEWKNYFHPFRASKKFTIVPSWETYAKEADEELCIELDPGMAFGTGDHPTTSMCLKAIETYVLPQHSVIDVGTGSGILSIASHLIGVKRIKALDIDEMAVSVAKENFRRNHCETLIEAVPGNLLKDETEKFDIVIANILAHIIDEMIEDAYNTLNEGGYFITSGIIKEKYEGIQSHMERVGFKIISEQHDNGWVCLVGQKVSE >CP022893.1|AXJ35758.1|1428239_1428992_+|Ribosomal-RNA-small-subunit-methyltransferase-E MQRYFIDQNADVSQRFFITKKEDIHHITNVMRYDVGSKIILTFNDQTVYLCEIADITSDKIAVDLKEKQNINTELPVDVTICSGLIKADKYEWLLQKATELGASSFIAVSMERSIVKLNEAKVVKKIERWQKIIKEAAEQSYRLVIPSIQFESNLKLICDTIDNYDYILIAYEEEAKDGKLSNFKQTLQQFKAQDKVLMIFGPEGGLSENEISLFSNTSTVVGLGPRILRAETAPLYALSAISYEKELMG >CP022893.1|AXJ35759.1|1428998_1430345_+|Threonylcarbamoyladenosine-tRNA-methylthiotransferase-MtaB MSTVAFHTLGCKVNHYETEAIWQLFKEANYERVDFEANADVFVINTCTVTNTGDKKSRQIIRRAIRQNPDAVICVTGCYAQTSSAEIMEIPGVDVVVGTQDRHKLLGYIDEFRKERQPINGVGNIMKNRKYEELDVPYFTDRTRASLKIQEGCNNFCTFCIIPWARGLMRSRDPEKVVEQATQLVNSGYKEIVLTGIHTGGYGQDLKDYNLAQLLRDLETINGLERIRISSIEASQLTDEVIDVLERSTKVVRHLHIPLQSGSDTVLKRMRRKYTMDRFSERLTKLHKALPDLAVTSDVIVGFPGETEAEFQETYDFIVKHKFSELHVFPYSPRIGTPAARMDDQIDEEIKNERVHKLITLSNQLGKLYASKFDQDVLEVIPEEQGDTEGTLVGYADNYMKVQFEGDESLIGQIVKVKITQANYPLNEGQAIKVVDFATNKSDREVLV >CP022893.1|AXJ35760.1|1430637_1430814_+|30S-ribosomal-protein-S21 MSKTVVRKNESLEDALRRFKRSVSKSGTIQEVRKREFYEKPSVKRKKKSEAARKRKFK >CP022893.1|AXJ35761.1|1431033_1431741_+|hypothetical-protein MSYNNFLQMTTILESTAGDTWVEQVSNIIVQPIFTLILTCLTFLGFVYQLYSKKINAAGIIATLSLLILFLGFLIQGNVNMHSILIFSIGVILVVIELFVVGAVIGIIGMILITISITTLGDNLLFMLANVIVALILTIVEWVILVKIFNRKIPFLDKVILKDSTNSESGYNSHDNRSHLVGKTAQTVTDLRPAGIIFCENERIDAVSDGNFILRNKTVKILEVEGTRVVVREVD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP022893_9 | 2292136-2292216 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022893_9
|
1 spacers
spacers of CP022893_9
>9.1|2292160|33|CP022893|CRISPRCasFinder ATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTT |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022893_9
The CRISPR arrays of CP022893_9 >merge|CP022893|9|2292136-2292216|CRISPRCasFinder CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCT >CP022893|9|8|2292136-2292216|CRISPRCasFinder CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTT ATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTT CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCT
>CP022893.1|AXJ36568.1|2291027_2292119_+|hypothetical-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKDKKVVTEPKNTKVENGKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >CP022893.1|AXJ36567.1|2289784_2290762_+|Cadmium,-cobalt-and-zinc/H(+)-K(+)-antiporter MSHSHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >CP022893.1|AXJ36566.1|2289462_2289783_+|HTH-type-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >CP022893.1|AXJ36565.1|2288645_2289311_-|putative-sugar-epimerase-YhfK MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGEQDIKDALTQFEIEKD >CP022893.1|AXJ36564.1|2287271_2288210_-|putative-mannose-6-phosphate-isomerase-GmuF MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >CP022893.1|AXJ36563.1|2287010_2287241_-|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >CP022893.1|AXJ36562.1|2284965_2286339_-|EVE-domain-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVKKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >CP022893.1|AXJ36561.1|2284095_2284509_-|hypothetical-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >CP022893.1|AXJ36560.1|2283452_2283896_-|General-stress-protein-20U MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLENAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >CP022893.1|AXJ36559.1|2282621_2283332_+|Purine-nucleoside-phosphorylase-DeoD-type-1 MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >CP022893.1|AXJ36569.1|2294151_2295009_-|Putative-phosphatase-YwpJ MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >CP022893.1|AXJ36570.1|2295076_2295859_-|putative-ABC-transporter-ATP-binding-protein-YlmA MLIQLDQIGRMKQGKTILKNISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATTGGVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHHLLKLVGISAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLNILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >CP022893.1|AXJ36571.1|2296090_2297896_-|Glutamine--fructose-6-phosphate-aminotransferase-[isomerizing] MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEVIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEDGTPVVALATQENVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >CP022893.1|AXJ36572.1|2298576_2300115_+|PTS-system-mannitol-specific-EIICB-component MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >CP022893.1|AXJ36573.1|2300149_2302282_+|Transcriptional-regulator-MtlR MLLSTREKEMIALLIKYHSQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGADSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFIPDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >CP022893.1|AXJ36574.1|2302293_2302728_+|Mannitol-specific-phosphotransferase-enzyme-IIA-component MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >CP022893.1|AXJ36575.1|2302727_2303834_+|Mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >CP022893.1|AXJ36576.1|2304152_2311598_-|Extracellular-matrix-binding-protein-ebh-precursor MNLFRQQKFSIRKFNVGIFSALIATVTFISTNPTTASAAEQNQPAQNQPAQPADANTQPNANAGAQANPAAQPANQGGQANPAGGAAQPAGQGNQADPNNAAQAQPGNQAAPANQAGQGNNQATPNNNATPANQTQPANAPAAAQPAAPVAANAQTQDPNASNTGEGSINTTLTFDDPAISTDENRQDPTVTVTDKVNGYSLINNGKIGFVNSELRRSDMFDKNNPQNYQAKGNVAALGRVNANDSTDHGNFNGITKTVNVKPDSELIINFTTMQTNSKQGATNLVIKDAKKNTELATVNVAKTGTAHLFKVPTDADRLDLQFIPDNTAVADASRITTNKDGYKYYSFIDNVGLFSGSHLYVKNRDLAPKATNNKEYTINTEIGNNGNFGASLKADQFKYEVTLPQGVTYVNDSLTTTFPNGNEDSTVLKNMTVNYDQTANKVTFTSQGVTTARGTHTKEVLFPDKSLKLSYKVNVANIDTPKNIDFNEKLTYRTASDVVINNAQPEVTLTADPFSVAVEMNKDALQQQVNSQVDNSHYTTASIAEYNKLKQQADTILNEDANHVETANRASQADIDGLVTKLQAALIDNQAAIAELDTKAQEKVTAAQQSKKVTQDEVAALVTKINNDKNNAIAEINKQTTSQGVTTEKDNGIAVLEQDVITPTVKPQAKQDIIQAVTTRKQQIKKSNASLQDEKDVANDKIGKIETKAIKDIDAATTNAQVEAIKTKAINDINQTTPATTAKAAALEEFDEVVQAQIDQAPLNPDTTNEEVAEAIERINAAKVSGVKAIEATTTAQDLERVKNEEIFKIENITDSTQTKMDAYKEVRQAATARKAQNATVSNATDEEVAEANAAVDAAQTEGLHDIQVVKSQQEVADTKAKVLDKINAIQTQAKVKPAADTEVENAYNTRKQEIQNSNASTTEEKEAAYTELDAKKQEARTNLDAANTNSDVTTAKDNGIAAINQVQAATTKKSDAKAEIAQKASERKTAIEAMNDSTTEEQQAAKDKVDQAVVTANADIDNATANTDVDNAKTTNEATIAAITPDANVKPAAKQAIADKVQAQETAIDANNGSTTEEKEAAKQQVQTEKTAADAAIDAAHSNVEVEAAKNAEIAKIEAIQPATTTKDNAKQAIATKANERKTAIAQTQDITAEEIAAANADVDNAVTQANSNIEAANSQNDVDQAKTTGETSIDQVTPTVNKKATARNEITAILNNKLQEIQATPDATDEEKQAADAEANTENGKANQAISAATTNAQVDEAKANAEAAINAVTPKVVKKQAAKDEIDQLQATQTNVINNDQNATNEEKEAAIQQLATAVTDAKNNITAATDDNGVDTAKDAGKNSIQSTQPATAVKSNAKNEVDQAVTTQNQAIDNTTGATTEEKNAAKDLVLKAKEKAYQDILNAQTTNDVTQIKDQAVADIQGITADTTIKDVAKDELATKANEQKALIAQTADATTEEKEQANQQVDAQLTQGNQNIENAQSIDDVNTAKDNAIQAIDPIQASTDVKTNARAELLTEMQNKITEILNNNETTNEEKGNDIGPVRAAYEEGLNNINAATTTGDVTTAKDTAVQKVQQLHANPVKKPAGKKELDQAAADKKTQIEQTPNASQQEINDAKQEVDTELNQAKTNVDQSSTNEYVDNAVKEGKAKINAVKTFSEYKKDALAKIEDAYNAKVNEADNSNASTSSEIAEAKQKLAELKQTADQNVNQATSKDDIEVQIHNDLDNINDYTIPTGKKESATTDLYAYADQKKNNISADTNATQDEKQQAIKQVDQNVQTALENINNGVDNGDVDDALTQGKAAIDTIQVDATVKPKANQAIEAKAEDTKESIDHSDQLTAEEKTEALAMIKQITDQAKQGITDATTTAEVEKAKAQGLEAFDNIQIDSTEKQKAIEELETALDQIEAGVNVDADATTEEKEAFTNALEDILSKATEDISDQTTNAEIATVKNSALEQLKAQRINPVVKKNALEAIREVVNKQIEIIKNADADASAKEIARTDLGRYFDRFADKLDKTQTNTEVAELQNVTIPAIEAIVPQNDPDANDTNNGTDNNDATANSNANATPENTGQPNVSETTDNGKADASPTTPNNSDAATGETTVTSATDDAKDKPQANNNSSADASTNSPTMDNDVTSKPEVESTNNGTTDKPVTETDNATPAESTTNNNSTTTATNENAPTGSTATAPTTASTEAASSADSKDNASVNDSKQNAEVNNSAESQSTNGKVAQPKSENKAKAEKDGRDSTNQSMVESTTETLPSADITEPNVPSNTSKDKEESTTNQTDAGQLKSETNVASNEADKSPSKADTEVSNKPSTSASSEAKDKMTSTNVSQKDDTATADTNDTQKSVGPVANNKAKDMQTNDTQKSVGSAANNKATQNDGANASPATVSNGSHSMHQDMLNVTKPEENKANAKSDQQGKVNKPKQQAKTLPDTGMSHNDDLPYAELALGAGMAFLIRRFTKKDQQTEE >CP022893.1|AXJ36577.1|2311875_2313231_-|Phosphoglucosamine-mutase MGKYFGTDGVRGVANQELTPELAFKLGRYGGYVLAHNKGEKHPRVLVGRDTRVSGEMLESALIAGLISIGAEVMRLGIISTPGVAYLTRDMGAELGVMISASHNPVADNGIKFFGSDGFKLSDEQENEIEALLDQENPELPRPVGNDIVHYSDYFEGAQKYLSYLKSTVDVNFEGLKIVLDGANGSTSSLAPFLFGDLEADTETIGCSPDGYNINEKCGSTHPEKLAEKVVETESDFGLAFDGDGDRIIAVDENGQIVDGDQIMFIIGQEMHKNQELNNDMIVSTVMSNLGFYKALEQEGIKSNKTKVGDRYVVEEMRRGNYNLGGEQSGHIVMMDYNTTGDGLLTGIQLASVIKMTGKSLSELAGQMKKYPQSLINVRVTDKYRVEENVDVKEVMTKVEVEMNGEGRILVRPSGTEPLVRVMVEAATDEDAERFAQQIADVVQDKMGLDK >CP022893.1|AXJ36578.1|2313257_2314190_-|YbbR-like-protein MLESKWGLRFIAFLLALFFFLSVNNVFGNIFNTGNLGQKSSKTIQDVPVEILYNTKDLHLTKAPETVNVTISGPQSKIIKIENPEDLRVVIDLSNAKAGKYQEKYQVKGLADDIHYSVKPKLANITLENKVTKKMTVQPDVSQSDIDPLYKITKQEVSPQTVKVTGGEEQLNDIAYLKATFKTNKKINGDTKDVAEVTAFDKKLNKLNVSIQPNEVNLQVKVEPFSKKVKVNVKQKGSLADDKELSSIDLEDKEIEIFGSRDDLQNISEVDAEVDLDGISESTEKTVKINLPEHVTKAQPSETKAYINVK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022893_11 | 2412500-2412580 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022893_11
|
1 spacers
spacers of CP022893_11
>11.1|2412525|31|CP022893|CRISPRCasFinder CACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022893_11
The CRISPR arrays of CP022893_11 >merge|CP022893|11|2412500-2412580|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTG >CP022893|11|10|2412500-2412580|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTG CACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCT TCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTG
>CP022893.1|AXJ36677.1|2411796_2412147_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >CP022893.1|AXJ36676.1|2410483_2411695_+|major-facilitator-superfamily-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFFVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETDVINKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >CP022893.1|AXJ36675.1|2410050_2410491_+|putative-HTH-type-transcriptional-regulator MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >CP022893.1|AXJ36674.1|2409124_2409889_-|hypothetical-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >CP022893.1|AXJ36673.1|2408881_2409133_+|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNILTILSIVLVIIHMGILAHSTYVYLY >CP022893.1|AXJ36672.1|2407227_2408493_-|Lipid-II:glycine-glycyltransferase MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEVQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMETSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYILNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >CP022893.1|AXJ36671.1|2403943_2407111_-|Swarming-motility-protein-SwrC MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSIQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASAPNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGENLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQHQEGLGVVSTTYKKVLHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHVDGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATTVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >CP022893.1|AXJ36670.1|2403442_2403760_+|hypothetical-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKDNWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >CP022893.1|AXJ36669.1|2403033_2403198_+|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDLEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >CP022893.1|AXJ36668.1|2401992_2402901_-|Membrane-transport-protein MTEQFTMIILLIALGYFLKRINFIKATDSQVIATLVLNVTLPSLVIVNLNSAELKLSFSILPILMIIYGIVAKMIAVWFFRKYDNHMRGSVGMMTGAMNIGLFAYPLIEVIWPKTGLIYFGMADIGGAFVMFGITYFVGSYFSEGSDQFDFKYLGKKLLQSVPLVTYIVMFILNINHIHLPHVAIDFFSILSHANMPLSMILLGVMLNFTLERKYIPATIKYLCLHYGLALVAGLLVHVLLPVSDDMIKTTLLVTWMFPVGVAIISYGIQFKYRTLPFIGMTTNLTIIISIIILYVYQAVFV >CP022893.1|AXJ36678.1|2412723_2413746_-|Cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >CP022893.1|AXJ36679.1|2413765_2414365_-|putative-molybdenum-cofactor-guanylyltransferase MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNIYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >CP022893.1|AXJ36680.1|2414371_2414605_-|Molybdopterin-synthase-sulfur-carrier-subunit MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQALTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >CP022893.1|AXJ36681.1|2414610_2415057_-|Molybdopterin-synthase-catalytic-subunit MKQFEIVIEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >CP022893.1|AXJ36682.1|2415070_2415556_-|Molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-adapter-protein MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKTHGYTVATIKHHGHAKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRDEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >CP022893.1|AXJ36683.1|2415552_2416812_-|Molybdopterin-molybdenumtransferase MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETKTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQKDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKAVKAEVLFNKVAMRPGSVTTVAFADGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >CP022893.1|AXJ36684.1|2416874_2417369_+|Cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-accessory-protein MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIFKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTIIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSGQ >CP022893.1|AXJ36685.1|2417370_2417877_-|Molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-B MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFVTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIEGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >CP022893.1|AXJ36686.1|2417907_2418912_-|Molybdopterin-synthase-adenylyltransferase MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDGCIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKHRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSDCTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >CP022893.1|AXJ36687.1|2419081_2419687_-|Sulfate/thiosulfate-import-ATP-binding-protein-CysA MLKINVKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTTKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSKHIDQLIQTLNINHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022893_1 | 1.1|170234|33|CP022893|CRISPRCasFinder | 170234-170266 | 33 | CP022893.1 | 1693588-1693620 | 0 | 1.0 |
CP022893_4 | 4.1|830194|31|CP022893|CRISPRCasFinder | 830194-830224 | 31 | CP022893.1 | 295110-295140 | 0 | 1.0 |
CP022893_5 | 5.1|835661|22|CP022893|CRT | 835661-835682 | 22 | CP022893.1 | 170195-170216 | 0 | 1.0 |
CP022893_5 | 5.1|835661|22|CP022893|CRT | 835661-835682 | 22 | CP022893.1 | 295035-295056 | 0 | 1.0 |
CP022893_5 | 5.1|835661|22|CP022893|CRT | 835661-835682 | 22 | CP022893.1 | 295145-295166 | 0 | 1.0 |
CP022893_5 | 5.1|835661|22|CP022893|CRT | 835661-835682 | 22 | CP022893.1 | 660671-660692 | 0 | 1.0 |
CP022893_5 | 5.1|835661|22|CP022893|CRT | 835661-835682 | 22 | CP022893.1 | 786424-786445 | 0 | 1.0 |
CP022893_5 | 5.1|835661|22|CP022893|CRT | 835661-835682 | 22 | CP022893.1 | 897527-897548 | 0 | 1.0 |
CP022893_5 | 5.1|835661|22|CP022893|CRT | 835661-835682 | 22 | CP022893.1 | 1086530-1086551 | 0 | 1.0 |
CP022893_5 | 5.1|835661|22|CP022893|CRT | 835661-835682 | 22 | CP022893.1 | 1406320-1406341 | 0 | 1.0 |
CP022893_5 | 5.1|835661|22|CP022893|CRT | 835661-835682 | 22 | CP022893.1 | 1420854-1420875 | 0 | 1.0 |
CP022893_5 | 5.1|835661|22|CP022893|CRT | 835661-835682 | 22 | CP022893.1 | 1693696-1693717 | 0 | 1.0 |
CP022893_5 | 5.3|835778|22|CP022893|CRT | 835778-835799 | 22 | CP022893.1 | 170195-170216 | 0 | 1.0 |
CP022893_5 | 5.3|835778|22|CP022893|CRT | 835778-835799 | 22 | CP022893.1 | 295035-295056 | 0 | 1.0 |
CP022893_5 | 5.3|835778|22|CP022893|CRT | 835778-835799 | 22 | CP022893.1 | 295145-295166 | 0 | 1.0 |
CP022893_5 | 5.3|835778|22|CP022893|CRT | 835778-835799 | 22 | CP022893.1 | 660671-660692 | 0 | 1.0 |
CP022893_5 | 5.3|835778|22|CP022893|CRT | 835778-835799 | 22 | CP022893.1 | 786424-786445 | 0 | 1.0 |
CP022893_5 | 5.3|835778|22|CP022893|CRT | 835778-835799 | 22 | CP022893.1 | 897527-897548 | 0 | 1.0 |
CP022893_5 | 5.3|835778|22|CP022893|CRT | 835778-835799 | 22 | CP022893.1 | 1086530-1086551 | 0 | 1.0 |
CP022893_5 | 5.3|835778|22|CP022893|CRT | 835778-835799 | 22 | CP022893.1 | 1406320-1406341 | 0 | 1.0 |
CP022893_5 | 5.3|835778|22|CP022893|CRT | 835778-835799 | 22 | CP022893.1 | 1420854-1420875 | 0 | 1.0 |
CP022893_5 | 5.3|835778|22|CP022893|CRT | 835778-835799 | 22 | CP022893.1 | 1693696-1693717 | 0 | 1.0 |
CP022893_7 | 7.1|984262|34|CP022893|CRISPRCasFinder | 984262-984295 | 34 | CP022893.1 | 830169-830202 | 0 | 1.0 |
CP022893_7 | 7.1|984262|34|CP022893|CRISPRCasFinder | 984262-984295 | 34 | CP022893.1 | 1906604-1906637 | 0 | 1.0 |
CP022893_4 | 4.1|830194|31|CP022893|CRISPRCasFinder | 830194-830224 | 31 | CP022893.1 | 295055-295085 | 1 | 0.968 |
CP022893_4 | 4.1|830194|31|CP022893|CRISPRCasFinder | 830194-830224 | 31 | CP022893.1 | 1386439-1386469 | 1 | 0.968 |
CP022893_5 | 5.1|835661|22|CP022893|CRT | 835661-835682 | 22 | CP022893.1 | 1386360-1386381 | 1 | 0.955 |
CP022893_5 | 5.1|835661|22|CP022893|CRT | 835661-835682 | 22 | CP022893.1 | 1386593-1386614 | 1 | 0.955 |
CP022893_5 | 5.1|835661|22|CP022893|CRT | 835661-835682 | 22 | CP022893.1 | 2176811-2176832 | 1 | 0.955 |
CP022893_5 | 5.2|835719|23|CP022893|CRT | 835719-835741 | 23 | CP022893.1 | 787374-787396 | 1 | 0.957 |
CP022893_5 | 5.2|835719|23|CP022893|CRT | 835719-835741 | 23 | CP022893.1 | 787652-787674 | 1 | 0.957 |
CP022893_5 | 5.2|835719|23|CP022893|CRT | 835719-835741 | 23 | CP022893.1 | 1086471-1086493 | 1 | 0.957 |
CP022893_5 | 5.2|835719|23|CP022893|CRT | 835719-835741 | 23 | CP022893.1 | 1693579-1693601 | 1 | 0.957 |
CP022893_5 | 5.2|835719|23|CP022893|CRT | 835719-835741 | 23 | CP022893.1 | 2401671-2401693 | 1 | 0.957 |
CP022893_5 | 5.3|835778|22|CP022893|CRT | 835778-835799 | 22 | CP022893.1 | 1386360-1386381 | 1 | 0.955 |
CP022893_5 | 5.3|835778|22|CP022893|CRT | 835778-835799 | 22 | CP022893.1 | 1386593-1386614 | 1 | 0.955 |
CP022893_5 | 5.3|835778|22|CP022893|CRT | 835778-835799 | 22 | CP022893.1 | 2176811-2176832 | 1 | 0.955 |
CP022893_5 | 5.4|835836|23|CP022893|CRT | 835836-835858 | 23 | CP022893.1 | 787374-787396 | 1 | 0.957 |
CP022893_5 | 5.4|835836|23|CP022893|CRT | 835836-835858 | 23 | CP022893.1 | 787652-787674 | 1 | 0.957 |
CP022893_5 | 5.4|835836|23|CP022893|CRT | 835836-835858 | 23 | CP022893.1 | 1086471-1086493 | 1 | 0.957 |
CP022893_5 | 5.4|835836|23|CP022893|CRT | 835836-835858 | 23 | CP022893.1 | 1693579-1693601 | 1 | 0.957 |
CP022893_5 | 5.4|835836|23|CP022893|CRT | 835836-835858 | 23 | CP022893.1 | 2401671-2401693 | 1 | 0.957 |
CP022893_6 | 6.1|897478|34|CP022893|CRISPRCasFinder | 897478-897511 | 34 | CP022893.1 | 1693588-1693621 | 1 | 0.971 |
CP022893_7 | 7.1|984262|34|CP022893|CRISPRCasFinder | 984262-984295 | 34 | CP022893.1 | 1294320-1294353 | 1 | 0.971 |
CP022893_8 | 8.1|1420893|33|CP022893|CRISPRCasFinder | 1420893-1420925 | 33 | CP022893.1 | 1693588-1693620 | 1 | 0.97 |
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CP022893_1 | 1.1|170234|33|CP022893|CRISPRCasFinder | 170234-170266 | 33 | CP022893.1 | 1605266-1605298 | 2 | 0.939 |
CP022893_5 | 5.2|835719|23|CP022893|CRT | 835719-835741 | 23 | CP022893.1 | 984216-984238 | 2 | 0.913 |
CP022893_5 | 5.2|835719|23|CP022893|CRT | 835719-835741 | 23 | CP022893.1 | 1605285-1605307 | 2 | 0.913 |
CP022893_5 | 5.4|835836|23|CP022893|CRT | 835836-835858 | 23 | CP022893.1 | 984216-984238 | 2 | 0.913 |
CP022893_5 | 5.4|835836|23|CP022893|CRT | 835836-835858 | 23 | CP022893.1 | 1605285-1605307 | 2 | 0.913 |
CP022893_7 | 7.1|984262|34|CP022893|CRISPRCasFinder | 984262-984295 | 34 | CP022893.1 | 1689214-1689247 | 2 | 0.941 |
CP022893_7 | 7.1|984262|34|CP022893|CRISPRCasFinder | 984262-984295 | 34 | CP022893.1 | 2870526-2870559 | 2 | 0.941 |
CP022893_11 | 11.1|2412525|31|CP022893|CRISPRCasFinder | 2412525-2412555 | 31 | CP022893.1 | 70386-70416 | 2 | 0.935 |
CP022893_11 | 11.1|2412525|31|CP022893|CRISPRCasFinder | 2412525-2412555 | 31 | CP022893.1 | 374984-375014 | 2 | 0.935 |
CP022893_11 | 11.1|2412525|31|CP022893|CRISPRCasFinder | 2412525-2412555 | 31 | CP022893.1 | 660726-660756 | 2 | 0.935 |
CP022893_11 | 11.1|2412525|31|CP022893|CRISPRCasFinder | 2412525-2412555 | 31 | CP022893.1 | 897789-897819 | 2 | 0.935 |
CP022893_11 | 11.1|2412525|31|CP022893|CRISPRCasFinder | 2412525-2412555 | 31 | CP022893.1 | 1087869-1087899 | 2 | 0.935 |
CP022893_11 | 11.1|2412525|31|CP022893|CRISPRCasFinder | 2412525-2412555 | 31 | CP022893.1 | 1406257-1406287 | 2 | 0.935 |
CP022893_11 | 11.1|2412525|31|CP022893|CRISPRCasFinder | 2412525-2412555 | 31 | CP022893.1 | 1605224-1605254 | 2 | 0.935 |
CP022893_11 | 11.1|2412525|31|CP022893|CRISPRCasFinder | 2412525-2412555 | 31 | CP022893.1 | 1693632-1693662 | 2 | 0.935 |
CP022893_11 | 11.1|2412525|31|CP022893|CRISPRCasFinder | 2412525-2412555 | 31 | CP022893.1 | 1899674-1899704 | 2 | 0.935 |
CP022893_11 | 11.1|2412525|31|CP022893|CRISPRCasFinder | 2412525-2412555 | 31 | CP022893.1 | 2401724-2401754 | 2 | 0.935 |
CP022893_11 | 11.1|2412525|31|CP022893|CRISPRCasFinder | 2412525-2412555 | 31 | CP022893.1 | 2577269-2577299 | 2 | 0.935 |
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43. spacer 6.1|897478|34|CP022893|CRISPRCasFinder matches to position: 1693588-1693621, mismatch: 1, identity: 0.971
attgagaatccaatttctctttgttggggcccat CRISPR spacer attgggaatccaatttctctttgttggggcccat Protospacer ****.*****************************
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ccaacacagagaatttcgaaaagaaattctacaa CRISPR spacer ccaacacaaagaatttcgaaaagaaattctacaa Protospacer ********.*************************
45. spacer 8.1|1420893|33|CP022893|CRISPRCasFinder matches to position: 1693588-1693620, mismatch: 1, identity: 0.97
tgggccccaacacagagaaattggattcccaat CRISPR spacer tgggccccaacaaagagaaattggattcccaat Protospacer ************ ********************
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tgggccccaacaaagagaaattggattcccaat CRISPR spacer tggaccccaacaaagagaaattgtattcccaat Protospacer ***.******************* *********
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tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgtagaaattgggaatacaat Protospacer **************.*** ****
50. spacer 5.4|835836|23|CP022893|CRT matches to position: 984216-984238, mismatch: 2, identity: 0.913
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgttgaaattgggaatccaat Protospacer ***** ********.********
51. spacer 5.4|835836|23|CP022893|CRT matches to position: 1605285-1605307, mismatch: 2, identity: 0.913
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer tctgtagaaattgggaatacaat Protospacer **************.*** ****
52. spacer 7.1|984262|34|CP022893|CRISPRCasFinder matches to position: 1689214-1689247, mismatch: 2, identity: 0.941
ccaacacagagaatttcgaaaagaaattctacaa CRISPR spacer ccaacacagagaatttcgataagaaattccacaa Protospacer ******************* *********.****
53. spacer 7.1|984262|34|CP022893|CRISPRCasFinder matches to position: 2870526-2870559, mismatch: 2, identity: 0.941
ccaacacagagaatttcgaaaagaaattctacaa CRISPR spacer ccaacaaaaagaatttcgaaaagaaattctacaa Protospacer ****** *.*************************
54. spacer 11.1|2412525|31|CP022893|CRISPRCasFinder matches to position: 70386-70416, mismatch: 2, identity: 0.935
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62. spacer 11.1|2412525|31|CP022893|CRISPRCasFinder matches to position: 1899674-1899704, mismatch: 2, identity: 0.935
cacattattgtaagctgactttctgtcagct CRISPR spacer cacattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer **********************..*******
63. spacer 11.1|2412525|31|CP022893|CRISPRCasFinder matches to position: 2401724-2401754, mismatch: 2, identity: 0.935
cacattattgtaagctgactttctgtcagct CRISPR spacer cacattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer **********************..*******
64. spacer 11.1|2412525|31|CP022893|CRISPRCasFinder matches to position: 2577269-2577299, mismatch: 2, identity: 0.935
cacattattgtaagctgactttctgtcagct CRISPR spacer cacattattgtaagctgactttccgccagct Protospacer ***********************.*.*****
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022893_5 | 5.2|835719|23|CP022893|CRT | 835719-835741 | 23 | AP014226 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 28490-28512 | 3 | 0.87 |
CP022893_5 | 5.2|835719|23|CP022893|CRT | 835719-835741 | 23 | AP014225 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 24653-24675 | 3 | 0.87 |
CP022893_5 | 5.4|835836|23|CP022893|CRT | 835836-835858 | 23 | AP014226 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 28490-28512 | 3 | 0.87 |
CP022893_5 | 5.4|835836|23|CP022893|CRT | 835836-835858 | 23 | AP014225 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 24653-24675 | 3 | 0.87 |
CP022893_10 | 10.1|2304483|34|CP022893|CRISPRCasFinder | 2304483-2304516 | 34 | JN882286 | Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome | 23034-23067 | 8 | 0.765 |
CP022893_10 | 10.1|2304483|34|CP022893|CRISPRCasFinder | 2304483-2304516 | 34 | CP030544 | Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence | 7567-7600 | 8 | 0.765 |
1. spacer 5.2|835719|23|CP022893|CRT matches to AP014226 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
2. spacer 5.2|835719|23|CP022893|CRT matches to AP014225 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
3. spacer 5.4|835836|23|CP022893|CRT matches to AP014226 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S44-C3, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
4. spacer 5.4|835836|23|CP022893|CRT matches to AP014225 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C9-MedDCM-OCT-S41-C89, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tctgtagaaattggaaatccaat CRISPR spacer actgtagaaaatggaaatccaac Protospacer ********* ***********.
5. spacer 10.1|2304483|34|CP022893|CRISPRCasFinder matches to JN882286 (Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttgcatatctttagctttattgtttgcaactggg CRISPR spacer ttgcatatctttagctttatagcttttatatgct Protospacer ******************** *.** .* **
6. spacer 10.1|2304483|34|CP022893|CRISPRCasFinder matches to CP030544 (Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttgcatatctttagctttattgtttgcaactggg CRISPR spacer ttgaataactttagctttattgttataaacagta Protospacer *** *** **************** *** * .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
398473 : 415727
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP022893|398473:415727|DBSCAN-SWA ATTAAAAGAATGGAATGATTTTACTCGCGTAAATAATATCTTGAGTGCTGAAAAATTGTTTGCCTTCGCCAGTATAAGCAGGCTCTAAAACAAGATTAGCCTTTGCACAATAAAGCCATTCAGGATGAATGCCACTATTAAGTATCTCTTGGAATTCTTGAAAATCTTTAGACCAATCAATATTTAAATTCATTCCTTACCACCTCACAACCATTATAGAACATGCGTTCGCTTTTGTGAAGTGTATTTTTAAAAATATCATAGAAAATTTCAAATGAATTAATGTCAAAAATGATATGAAGAGTAGTTTGAATTATTATTGTAAAAAGTAATGGCGCATGATATAATTCTTTATTGTGAGTAATGAAAATTATTCCTTGCTTATCTGTTTTAAGATTGATAAGCCGTATAGACCACAAGGAGGTGCAAATATAAAATGAGAACATATGAAGTTATGTACATCGTACGCCCAAACATTGAGGAAGATGCTAAAAAAGCGTTAGTTGAACGTTTCAACGGTATCTTAGCTACTGAAGGTGCAGAAGTTTTAGAAGCAAAAGACTGGGGTAAACGTCGCCTAGCTTATGAAATCAATGATTTCAAAGATGGCTTCTACAACATCGTACGTGTTAAATCTGATAACAACAAAGCTACTGACGAATTCCAACGTCTAGCTAAAATCAGTGACGATATCATTCGTTACATGGTTATTCGTGAAGACGAAGACAAGTAATAATTAGAGGGGGCGTTTAAATGCTAAATAGAGTTGTATTAGTAGGTCGTTTAACGAAAGATCCGGAATACAGAACCACTCCCTCAGGTGTGAGTGTAGCGACATTCACTCTTGCAGTAAATCGTACGTTCACGAATGCTCAAGGGGAGCGCGAAGCAGATTTTATTAACTGTGTTGTTTTTAGAAGACAAGCAGATAATGTAAATAACTATTTATCTAAAGGTAGTTTAGCTGGTGTAGATGGTCGCTTACAATCCCGTAATTATGAAAATCAAGAAGGTCGTCGTGTGTTTGTTACTGAAGTTGTGTGTGATAGCGTTCAATTCCTTGAACCTAAAAATGCGCAACAAAATGGTGGCCAACGTCAACAAAATGAATTCCAAGATTACGGTCAAGGATTCGGTGGTCAACAATCAGGACAAAACAATTCGTACAATAATTCATCAAACACGAAACAATCTGATAATCCATTTGCAAATGCAAACGGACCGATTGATATAAGTGATGATGACTTACCATTCTAATAAAAATTAACGAAATTAAAGCGAAAAAATTATCAAAGGAGGCACACAATCATGGCAGGTGGACCAAGAAGAGGCGGACGTCGTCGTAAAAAAGTATGCTATTTCACAGCAAATGGTATTACACATATCGACTACAAAGACACTGAATTATTAAAACGTTTTATCTCAGAACGCGGTAAAATTTTACCACGTCGTGTAACTGGTACTTCAGCTAAATATCAACGTATGTTGACTACAGCTATCAAACGTTCTCGTCATATGGCATTATTACCATATGTTAAAGAAGAACAATAATATATAACGTATAACAAAACCCTTTAGCAATCAGGCTAGAGGGTTGTTTTTGTGTTTATTTTTATAAAAATTTCGCAATTTTTTCGCAGAGTGTGAAAAGTTTGATGATTAAAATTAAAAAAACGGACAAATAATTGTCCGTCTTTGCGAGATATTAATCTCATATAATAGTTTGGTGAGGACTCGCCTCTATATATGTAAATGATAACTGATTATTATTTGTACGTCAATCTAATTGATTAGCTTATTTTTAATTTCATTATCTACTAATTTCATACTATCAAAATCGAGTTTCATTCTACCAGAAGGATCTTCAGCGTTAATTTTTAAAATTCTTAATTTGCTAATAGTTACTACATTCTGTGTGCAGGCAAATGTATTTTTATCAAATTTTTTATATTTATTAATAACTTCTCTAAGGTTATTAACTTTTGATTTTCTATCGTTTACATCAATTAGCAAATAATTAAACAAAGCAGAAAAATTTTTCGGGTCATTGTATAAATTAAATGATTCTACTATGTTTTTACTTTTATTAATTACTTCTCTTTCTGTAGGGAAGCGTGTTTTAATTGCAAAATCATCTAAATAATCTATAGTGTTTTGTTCCAAAGTGTTTTGTAAATTATTTTTATTAATAATTTCTATAACCGTAAAAATTACGTGATTTATAACGTCTAAATCAAATTCGATATTATCAACTGTCTTGTTCAAAATTGATAATGATGTTTTAAATACAATATTTTGTAATGGTAAATAGTGTTTTTTATTTTTTGAACTTAATGGTACAACTGTTACTAAAGAATTATATGGACTATCATTTTTGTTTAATACTATTCCAAAATGTCTGCCAGAAAATTCATGCCCAATATTGATGCCAAAATCTAAATATATAATAGATCCCCTTGAGAATTTTTTGTATTTTTTGTTTATATTGTTATTATGCTCCATATTAAACCAATATGATGTTGTCTCTAACCAATTTGGTAAAAATTTAAACTTTTTATTATCTGTGTTATATAACAGAATAAATACTCACAGCTTTATTTATTCTGTTATCCATCTAACTCCCTATCCCCTCTAATTTATTCATCATATCTTTTGCCATCTTATCAGTAACATGTGTGTATATCTCTAAGGTGGTTTTATAGTCCGAGTGACCTACACGCTCTTGTATCGCTTTTAGGTTAATTCCTAATTGCGCAAGTGTAGATATGTGTGTGTGACGTAATGTGTGCGTTGTCACACGCTTGTTAATTGAACTTATATCAGTAGCTTCTTTAATAATATTATTCACCTTATTTAAGTCAATAGGGCTACCAGCAGTGTTAGTAAATATATAACCTCTATCTATGAATTTATCATTCCACTGATTCTCTTTTTTATTTTCTAGCATGAGTTTTTTAAGTAAATTAATACTTTGAGCTGTGAGGCCTATTGTTCGATAACTCTTACTCGTCTTAGTCGTTTCTTTCACTCCAAATGCTCCAGTTACTACATCTGTAACCCAGTTAATTGTGCCATCAATCTCTAGTGTTTTATTCTCCACGTCTACATTGTCTGTCTTGATTGCTAGGAGTTCGCCAATGCGCATTCCATTGTTAATTTGAAATTCTACTAATGCTTTTACCATTTCATAGTTACGTTTACGCGTAGCATGACGCTTATGTTTAATTAGATAGTCGAAGCACTCTAGTAACTCCTTTACTTCGCTATCTTCTAAATAGTTATTACGTTTAGCTTGAAACTCGTTTCTGGTTTGGGCTTTCTTAGGTATATCTATTTTATCTAACACACTAATATCGTGCAGATCATAATATTTAAACGCATATTTGAAAACGGAACGAATAACAATAACAAGAGATTGAACATGGCCAATACTATGTGATTTAGCCCATTCATTAATGATGTTTTGTAAGTAGGTGTGCGTAATCTTGCTGATGAGTACTTTGCTATCAATAGCATTTTTAACTGTATTAGTATTACTTTTCTTTTCTTTAATAGTGGTTGGTTTCGAGCCTGAATGTGTCTTGTAATGCTCTAACCATTCATCGCACGCATCATGGAACGTTAAGTTTTCAAGTTGTTTCGTACTGTAATGTTTCAAACGTTGCTCAATTATTTTATTTAATTCTAATTGAGCGTCCTTTTGGCTACGTACATTATTCTTGTTACGTGTAACTGATACTGTTTTATACTTGCCAGTTAAAGGGTCTGTATAGCGCTCTAAATAGCGATAGGCCGTACTATTGTTTTTGGTGATTTCACGAACCCACATTTGTCATCCCTCCTTTAGATATTCTGTTTTTAAAATGTCTGAAATAAACAAGTAACTATCAAGTGTAGTACAAAATAGGCAAAGTTACGTATGTTTATAGGATTGTACGGTAGTAATATTTGTAGTATTAGCTTTAAGTATTTATTTTAGCGTGCTTTGTTCAGTTCTTTTTATCTAACTTATCATCTATATAATCGCTTAATTTTACTAATTGTTCCCAGTTTTCATTTTTATCTCTTAAAGTTTTTGTGTTCTCTTTTATAATAACTGATTTATTTTCGAAATAATTATTTAAAATTTTATCGATGTTATTTTTATCGTTATCCGTTAATCTAATGCCTTTGTAAAATTTATAATTATTAATATCTTGCAGATGAAAGTGCAAATCATTAATGCTAATGTTAAAAATTGTGAAACTCTTTTCGTTATTGTCATCAAAAGATATGAATTCTCTAGAATATGGTATATCCATCATTCTATCTATAATTTCCATTTTATTTGTTACATTAGAAACTTTGTTTAACTTAACTTTATTTTTCGTTATCTTAGCTATTTCATCAACATAAAAATTATACTCCTCATTAGTGTCTTTTATGTTCATTAAGTAACTTTCGATAAGTTTATTGCTTGGAAAAGATTTAACACCATTTTCAATGCCACTTATATGCCCTTGAGAATACTGCATTTGTTTACTTATTTCGCTTGCTGTCTTCCCTTTTTGTTTTCGGATAGACTTTAAAAATCTGCCTAATTCTTTTTTTAATTCATCATTTGATTCAACCATTGGCGACACCTCCGTATTTTTAATGATAAACCATGCATAAAAATAATACAATATTATTCTTGACATTCCTAAAAGAAGGTGCGATACTCTATTTATGCATAAAGGAATAAAAATAAATGCATATATTCTTAAGGTGAGGGGTGATTTTATGTTTATGACTGTAAAAGAAGTTGCTCAATTGTTACGTATAAGTGAACGCCATACTTATAAACTTCTTCAAAAAAACGTTATACCACATACTAAAATTGGCGGAAAGATATTAGTTAACAAAGAAAGGTTATTAGAAACTTTAGAAAAAAAGGAGGTTAAATAAATGCCTAGAACAAAGTTACAAGATTTTCCATCAAAAGAAAATACAGTTACAGAACCGGAACAAGTTGTAGTAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP022893|398473:415727|411217_411787_+|AXJ34821.1|DBSCAN-SWA MSELTAKQARFVNEYIRTLNVTQSAIKAGYSANSAHVTGCRLLKKPHIKQYIQEQKDKIIDENVLTAKELLHVLTNAAVGDETETKEVVVKRGEYKENPQSGKVQLVYNEHVELIEVPIKPSDRLKARDMLGKYHKLFTDKHDINGDVPIFINIGEWDGDDEELDKTVKDVSNANPNHTVIVDDIPLED >CP022893|398473:415727|409268_409613_+|AXJ34817.1|DBSCAN-SWA MSEFEVKEKTYNLPNEHRQVLNVIRNTSNKYITKTKLLNQLGYEYNSSNERWLRRVINSLVYDYGYPIGCSYKPSERGYYIITTEQEKQQAMRSIKKLADGSMKRYEALKRIEV >CP022893|398473:415727|401086_402301_-|AXJ34804.1|DBSCAN-SWA MWVREITKNNSTAYRYLERYTDPLTGKYKTVSVTRNKNNVRSQKDAQLELNKIIEQRLKHYSTKQLENLTFHDACDEWLEHYKTHSGSKPTTIKEKKSNTNTVKNAIDSKVLISKITHTYLQNIINEWAKSHSIGHVQSLVIVIRSVFKYAFKYYDLHDISVLDKIDIPKKAQTRNEFQAKRNNYLEDSEVKELLECFDYLIKHKRHATRKRNYEMVKALVEFQINNGMRIGELLAIKTDNVDVENKTLEIDGTINWVTDVVTGAFGVKETTKTSKSYRTIGLTAQSINLLKKLMLENKKENQWNDKFIDRGYIFTNTAGSPIDLNKVNNIIKEATDISSINKRVTTHTLRHTHISTLAQLGINLKAIQERVGHSDYKTTLEIYTHVTDKMAKDMMNKLEGIGS >CP022893|398473:415727|412063_413032_+|AXJ34822.1|DBSCAN-SWA 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>CP022893|398473:415727|400254_400974_-|AXJ34803.1|DBSCAN-SWA MEHNNNINKKYKKFSRGSIIYLDFGINIGHEFSGRHFGIVLNKNDSPYNSLVTVVPLSSKNKKHYLPLQNIVFKTSLSILNKTVDNIEFDLDVINHVIFTVIEIINKNNLQNTLEQNTIDYLDDFAIKTRFPTEREVINKSKNIVESFNLYNDPKNFSALFNYLLIDVNDRKSKVNNLREVINKYKKFDKNTFACTQNVVTISKLRILKINAEDPSGRMKLDFDSMKLVDNEIKNKLIN >CP022893|398473:415727|399780_400023_+|AXJ34802.1|DBSCAN-SWA MAGGPRRGGRRRKKVCYFTANGITHIDYKDTELLKRFISERGKILPRRVTGTSAKYQRMLTTAIKRSRHMALLPYVKEEQ >CP022893|398473:415727|399225_399729_+|AXJ34801.1|DBSCAN-SWA MLNRVVLVGRLTKDPEYRTTPSGVSVATFTLAVNRTFTNAQGEREADFINCVVFRRQADNVNNYLSKGSLAGVDGRLQSRNYENQEGRRVFVTEVVCDSVQFLEPKNAQQNGGQRQQNEFQDYGQGFGGQQSGQNNSYNNSSNTKQSDNPFANANGPIDISDDDLPF >CP022893|398473:415727|398473_398665_-|AXJ34799.1|DBSCAN-SWA MNLNIDWSKDFQEFQEILNSGIHPEWLYCAKANLVLEPAYTGEGKQFFSTQDIIYASKIIPFF >CP022893|398473:415727|403682_403856_+|AXJ34808.1|DBSCAN-SWA MKMYLTYICLVSLLTILLLAISNMYVAFSVYGMMVTYGFNLTGEITTCENKLLLQKQ |
27 | Staphylococcus_phage(76.19%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
765502 : 773323
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP022893|765502:773323|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTATATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGTTAATACAGAGGCAACAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCATTTTTTTAGGTGAGAAAATATTTATCTGAACTAGATAACACTATAAAACACTTCTGATATTTTGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGCTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATTGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATAAAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGATTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACAACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAGAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACAAGGAATGTGATGTGCAGCCGAAAAATTAAAATCTTTATTTAATTCGAATTGATATGGATGCGTTGTACTAGGATAGATTTGTTGTAACATTTTAAAGCGCTCCTTTACTTTCAAGATATTGATTTAGTCCACGTTGACGTAAATGACAAGCTGGACATTCACCACAGCCATCCCCAATGATACCGTTATAGCATGTTAATGTTTTTGTACGAATATAATCTAAAACTTCGAGTTCATCACTTAATTTCCACGTTTCTGCTTTGTTTAACCACATTAAAGGAGTATGAATGACAAAATCTTTGTCCATAGCTAGGCTTAATGTTACGTTCATTGATTTTATAAAACTATCGCGACAGTCTGGGTAGCCTGAAAAGTCTGTTTCACATACGCCTGTAATAATATGCTTAGCCCCAATTTGATAAGCTAGAGCGCCTGCAAACGACAAGAAAAGTAAATTTCTAGCTGGAACAAATGTATTAGGTATACCATCTTCATTATTAGTAATTTCCATATCATGTTGTGTTAATGCGTTTGGAGTAAGTTGTGATAATAATGACATATCTAAAACGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATGTTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGATAAGCCCGTTTTTAATTTATAAAATAAAAAAAGCCTATCTCCATAAAAGATAGACGAAAGAAATGGGTTGCTCCTATAATATATATTAAAGGTTTACCAACGAATGTTTGAAATTTCAATGTCTAGTTTTTTATAGAGGGTTTCAGCTAGAAACCTCTGATATTCATTTATGTACGATGAATAGAATATACCATATATTAGTTAAAATCAAGGTCAGGATAATGACAATGCTTTTAAAGTTTTAGCTACATCCAATACATATTATAAAAATAAAACACATTTAGAACGGAGTATACAATGATTCTAGTCATAGATAATAATGATTCATTTACATATAATTTAATAGACTATATTAAGACTCAAACGAAACTAACAGTTCAAGTTGTTGGTATTGATAATCTGCTGATAGAAGACGTCATTAATATGAAGCCAAAAGCAATTGTTATTTCGCCTGGGCCGGGTAATCCGGATGATTATCCTATCTTGAATGAAGTGTTAGAACAATTTTATCAGCGTGTACCTATACTAGGTGTATGTTTAGGATTTCAATGTATCGTGTCTTATTTTGGTGGAAATATCATTCACGGCTATCATCCTGTACACGGACATACTACACAGTTACGCCATACCAATGAAGGTATTTTTCAAGGACTGCCTCAAAATTTCAATGTAATGCGTTATCATTCATTAATTGCTGACGGAGCGACTTTTCCAAATTGCTTAAAGATTACAGCAAAAAACGATGAAGCGATTATTATGGCATTTGAGCATATTAGATTTCCGGTTTTTGGTGTGCAATATCATCCTGAATCTATTTTGAGTGAATACGGTTATCGACAAGTTGAATTATTTTTATCGAAGGTAGGTGATTACTGTGAGAATAGAATATAATTATCGCTACTATTTAACTGAAAATGAATATAAGCAATACCATATTCAATTAAAGGGATTTATAAAGAAGTATGTTGCTACTAAGTTGGCTGATGTGGGAGAAGTGATACACTTTGCACAAGCGCAGCAACGACAAGGTAGATATGTCTCGTTATATTTAAGTTACGAAGCGGCAAAGTATTTTAATCATGTTATGTGTACACATTCATTAGCTAAAGATGATATTTATGCAGTAGCTTATAGTTTTGAAAAAGCGGAAAGCATAAATTCAACATATGAACATCAAACTTCTTATGTATCAAAGCATCATTTTTCATTTGTTGAATCTTCTGAGGTTATGATGACTAATATTAAACGTGTCCAACAAGCAATTGTTGAAGGTGAAACGTATCAAGTGAACTATACGGCGCGCTTAACGGATAACATTTATTATCCTATTAGTACTTTATATGAACGATTAACTCAATTTAGTAATGGTAATTATACTGCGTTATTACAAACTGATGAAATCCAAGTAGCGTCTATCTCACCAGAATTATTTTTTCAAAAAGGACAATTTAACAATGTCGATAACGTTATCATAAGCAAACCGATGAAAGGGACAATGCCTAGAGGTAAAACGGAAGCTGAAGATCAACAGTATTATAAAACATTGCAAACTTCTTCGAAAGATCGTGCAGAAAATGTCATGATTGTTGATTTGCTAAGAAACGATATAGGGAGAATATCACAGAGTGGCTCAATTAAGGTGTATAAACTATTTTTTATTGAGGCATATAAAACTGTATTTCAAATGACTTCGATGGTAAGTGGAACTTTAAAAACTAATACAGACTTAACTCAAATTTTAACATCGTTATTTCCTTGTGGTTCGATTACAGGTGCACCGAAACTGAATACAATGAAATATATTAAACAATTTGAAAGTTCACCTCGTGGTATATACTGCGGAGCAATTGGACTATTACTTCCAACTGAAGATGATAAAATGATTTTTAATATTCCGATTCGTACTATTGAGTATAAATATGGACAAGCGATTTATGGAGTCGGAGCAGGTATTACAATTGATTCTAAGCCAAAAGATGAAGTAAATGAATTTTACGCAAAAACCAAGATTTTGGAGATGTTATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP022893|765502:773323|770154_770574_-|AXJ35143.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >CP022893|765502:773323|772171_773323_+|AXJ35146.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQFESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >CP022893|765502:773323|770575_771244_-|AXJ35144.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >CP022893|765502:773323|765502_766558_-|AXJ35137.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >CP022893|765502:773323|768034_768475_-|AXJ35140.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >CP022893|765502:773323|766557_767244_-|AXJ35138.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >CP022893|765502:773323|768754_769339_-|AXJ35141.1|DBSCAN-SWA MILYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >CP022893|765502:773323|767218_767692_-|AXJ35139.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >CP022893|765502:773323|771594_772188_+|AXJ35145.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >CP022893|765502:773323|769437_770151_-|AXJ35142.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
788112 : 801775
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP022893|788112:801775|DBSCAN-SWA CTTACAAATCATTGACAGTAAGTAACTGAATAGCATTTGGTATAACCTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGCTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTAATTTCATTCCAATTCATGCTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATACGACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGTTAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCTATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATGAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCTATATTTAGCGTTTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATGCCAATAGGGAGTTGAAGGTCATGTGACATAACACCATTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAGTTTTTAGTTTTGATTTCTTGGCAATATTTAATAATGTCACCTTCGTTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGCTTACAAATTGAACTTAATGCTGTTGTAACTTCCCCAATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTGTGTTCATGGTAAAAGAGGACACCATGTGTATATTTATTTTCCATAGTTTAGCCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATATATATACCCACTTTTAATTGTTAATACCAAAAATATGTTTTTAAATAGAGAAAATGGTAATAACTGACATTGATGTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAACGAGCATATTAAGCTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAAGGGGCTGACCCAAAAGTAGCTCCTATATGAAAAATAGAGGTCTTTCCATTTAGATAGTAGTGGAAAGACCTCTATTTATCTTTTGAAAGTGAATACAAAAATAAAGCACACTCTGCTATAATATAGGTGATTAATCCATTTGAGAGAGGTGCTTTATCATGTATCAAAATTATACCATAAACCAACTTTGTTTGCCTATAGATCTTGAAATTAAATTAGAAGAAAATGATTTTGCTCATGCCATTGTGCAGTTTGTTGACTCTATTCCCGATGAAGTCTTTCTTCCTTATTATCAATCTATGGGTAGACCCCAATATCATCCTCGTATGCTACTTTCCATTATTCTTTGTGCCTATATTCAAGGGGTTTATTCGGGCCGCCAAATACAAAATATGCTGATAGATAGTATTCGGATGCGCTACTTATCTCAAGAGCAATTCCCTAACTTTCGTACTATTAATCGTTTTCGCGTTCATCCGATTATGAACGATATTCTAGATCATTCATTTGTTCAATTTCGTGAGCTACTGGTTCAAAGTGGCTTAATCAGTGGCAGTGCTCTATACATTGATGGTACAAAAATTGAAGCGGATGCGAATAAATACTCTTTCGTTTGGAAAAAAAGTATTTTAAAGTATAAGGATAGCCTTGATCAAAAAGCCCTTGAAAACTACCAACAAATGGTGGAAACAAAAATCTTACCTGAGTTAATAGATGATTTAAAGGATGAACTTTCTATAGAAGAGATTGAAAGGATTCGTCAATCTTTGGAAGAAAAGGAAAATCAATTAATTGAAGCGATTGACCAAACCGAAACAGTAGAAGAACGAAAATTACTTCGTAAAGAAAAATCTGAAGTTCATAAGCAGAAGAAGCGATTCGATGATTTTGCCCAAAGAAAAATGAGCTACGAAGAACAATTAGTGATTATGGGTGTACGCAATAGTTTCTCAAAGACGGATCATGACGCTACTTTTATGCGAATGAAAGAAGATCACATGCTTAATGGCCAACTAAAACCAGGTTATAATATTCAACTTGCGACAGAAAATCAATTTGCTCTTGCTTATGATTGTTATCCAAATCCAACAGATACACGAACATTTATCCCATTTCTTGAAAAGATTGAATCAAAAATAGGTTTACCAGAAAATATTGTCGCAGATGCCGGTTATGCAAGTGAAGAAAATTATTGTTATGTGTTAGACGAAACAGAATCCACCCCCATCATTCCGCATCAAGGTTACTTAAAAGAGAAGAAACGCGCCCATAAACAAAATCAGTTTCATCGAGATAATTGGACTTACAACGAGTTGGATGATTACTATATTTGTCCCAATCAGAAAAGAGTAGTGTTCTCACATTATTCACAACGTAAAGATAGAAATGGATTTATTCGAAACTTCAAAATCTATGAATGTGAAGATTGTACAGGATGTCCATTGAGAGAGAAATGTACCAAAGCAAAAGAAGGAAAAAATCGACGTTTGAATATTAATCCAACCTGGGAATATATAAAAATAAAAGCGAATGAAAAGATAGAAAGCAAAGAAACAGCCTCATACTATGCGCAGCGAAAGATAGATGTCGAAACAGTTTTTGGAAACATTAAACAAAATATGAAATTTAAAAGATTCCATGTCCGAGGAGCTGAAAAAATTTTTAAGGAAATGGGACTTGTATTTCTTGCGCACAATTTTAGGAAATTAGTAACTAGAGTAAGGAAATATGAGGGAAAAACAATCATACAAAACCAAATATAGGGGGAAAATCCTCTATATTTCATCCAAAAAAAACAAAAATCGAAGACATCTTTCACGGGTGCCTTCGATTTTTTGGTTCAAAAGGGACTAATGGGTCAGCCCCTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAAAGTACCATTGATTGCTTGTGCAGAAGCGTTAGTTAAGTACCAAATACTCATCATTTGGGCATTAAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCCGTTGGTGATAAGCATAGCTCACCGATAACACAAATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAGAAGTTTGATGAACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTTACTGGCAGGCTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGAGCTAATAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAGATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATTCCATATATGTTTAATACATTAGACCCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATAAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAGTTAGTTAATGCACCAATAACGATAATTAATACAATTGCTAAGACAACACTTCCGATAATAAGACCATACTTTTTCTTTTCAGCTGGTGTCAATGGGTTAGTAGGTTTCATACCAACGCTACCTAAGTTTTTGCGGTTGAAAAGTACATACCATACTAAACCTAATGCCATACCAACTGCTGCAATCAAGAATCCGCCGTGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCAGGATATAAACGGCCAACGATATTTGAAATGTTTGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATGATGAAGAACATTGATGTGAATAAGCCGATTAATGCAAATGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAAGACTGCACCTAATAAAGTAGCGCCTCTAGTGCCTGTAATTCTGTCAGCAATCCATCCGCCTGGTATTGATGTCATATAGATTAATGAACCATAAACTGACATAATTGACATAGCTGTTGTTTTATCAATTCCAAGGCCATTATCTGTTACGGCAAAGTACATGTAGAAAATGAGTAGGGCACGCATGCCATAATAACTAAACCTTTCCCAGAACTCTACAAAGAAGAGTACGCCTAGTCCTCGAGGATGCCCGAAAAATCCTGTTTGAGGTATGTCTTGAATTTGATTTCCATGGGAGTTTTGTTGTGTCATGTATACATCCCATCCTTTCTTCCCCTAATACAATAGTTTAAGTAAATTTGATTGTGCCTTATCAACTAAATATTCCAACAAATCACAAAAAAATAAAAATATTGAGAATATTCTGTTATTAAGCGCGCACAATTAATTAGAGATAATATAAAAATATACTTATTGACGTTAAAGTGCAATAGGTTTCTATAAAAATGTTGTTTAATTCGTGTACTAATATTCTTTTGGTGTACTTTGGTATAAAATGTTATTTTAATGTAACCTATTATGTATGCTAAATGAAAAACACACCAATAAGTTAGGAAAATCAACTTATTGGTGTGTTTATTAAATGATACATTTAACGATTATCTATTTTTTCGGGATATAAATCATGATTCATCAAACGATGCTCAGCCATTTTTTCATATTTAGAATTTGGACGTCCATAGTTTGTATAAGGATCAATAGAAATTCCACCACGTGG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP022893|788112:801775|795533_797639_+|AXJ35163.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSISFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >CP022893|788112:801775|797756_798728_+|AXJ35164.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >CP022893|788112:801775|799060_800074_+|AXJ35165.1|DBSCAN-SWA MIMIIINLKGEKFVMKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >CP022893|788112:801775|789408_791013_+|AXJ35158.1|DBSCAN-SWA MYQNYTINQLCLPIDLEIKLEENDFAHAIVQFVDSIPDEVFLPYYQSMGRPQYHPRMLLSIILCAYIQGVYSGRQIQNMLIDSIRMRYLSQEQFPNFRTINRFRVHPIMNDILDHSFVQFRELLVQSGLISGSALYIDGTKIEADANKYSFVWKKSILKYKDSLDQKALENYQQMVETKILPELIDDLKDELSIEEIERIRQSLEEKENQLIEAIDQTETVEERKLLRKEKSEVHKQKKRFDDFAQRKMSYEEQLVIMGVRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMLNGQLKPGYNIQLATENQFALAYDCYPNPTDTRTFIPFLEKIESKIGLPENIVADAGYASEENYCYVLDETESTPIIPHQGYLKEKKRAHKQNQFHRDNWTYNELDDYYICPNQKRVVFSHYSQRKDRNGFIRNFKIYECEDCTGCPLREKCTKAKEGKNRRLNINPTWEYIKIKANEKIESKETASYYAQRKIDVETVFGNIKQNMKFKRFHVRGAEKIFKEMGLVFLAHNFRKLVTRVRKYEGKTIIQNQI >CP022893|788112:801775|788112_789030_-|AXJ35157.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMSHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >CP022893|788112:801775|795172_795571_+|AXJ35162.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >CP022893|788112:801775|800060_801017_+|AXJ35166.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >CP022893|788112:801775|801013_801775_+|AXJ35167.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >CP022893|788112:801775|791139_792645_-|AXJ35159.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >CP022893|788112:801775|793505_794372_-|AXJ35161.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFLYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSSREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFVLFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >CP022893|788112:801775|792985_793486_-|AXJ35160.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR |
11 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
852627 : 869589
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP022893|852627:869589|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP022893|852627:869589|863828_864407_+|AXJ35227.1|DBSCAN-SWA MKTESYFKEYNQFVIDQQKAIQELEQERNALESKIKIDKSTYKQLIMDGQDDKADNLYQATDADEKKLKALNKRLETKKSVSKEVKYQKTIELLKHQSELSSLYESEKQSALGKLKKVVDAYNEIIDEIEDINDRYEDEHQQYASIYSQEQLYDDKEAREALNGYFRENIFTSYINGNDLPYEHNNKLFLKR >CP022893|852627:869589|855021_855486_+|AXJ35213.1|DBSCAN-SWA MAKKKSPGTLAENRKARHDYNIEDTIEAGIVLQGTEIKSIRRGSANLKDSYAQVKNGEMYLNNMHIAPYEEGNRFNHDPLRSRKLLLHKREIFKLGEQTREIGYSIVPLKLYLKHGHCKVLLGVARGKKKYDKRQALKEKAVKRDVARDMKARY >CP022893|852627:869589|856048_857155_-|AXJ35214.1|integrase|DBSCAN-SWA MSYNLNLSHNIYKDAKLGTYYFRITYYDKSNTRKYITRKGFKQRKDAVKKCNEMMDELEGVGHLNRLPFDKLVEEYIDWYSARRKTSSVKALKTHTNNHLLPYFKSMDVFKMTTQDVMKFQNKKLKEGHSGDYLKKMHVYLVSLLNHAMKFHELKQNVASLVGNFEIESQKRLNYWTLEQFNQFYEALATQQQKLFFKLLFYSGARKGEIRALTWRDINFDDDFIHINKTDYHGEVTAPKTKSAIRDIYLPTHMMYDIKDYLIWYKENNIYKDDYVLFGTFYKAYSESTIDRWFTNALKVLDEQLPNGQNFPRIVIHELRHSHASMLVNLGASVMIIAQRLGHSDTTEVYNRYGHLYPSTQKEIVKYL >CP022893|852627:869589|862110_862383_+|AXJ35224.1|DBSCAN-SWA MQAVKEDYNLDEQAQRIGLITGISNEIYYCSISYLSTVYLEYIDNTWTAWRESYIPKLNKRTSYKVIASGSFELVLARLKSYLNYIKRSK >CP022893|852627:869589|867980_868331_+|AXJ35235.1|DBSCAN-SWA MNNIGIIITIIGTILTVFNTISAIRWRRRNYNYRKQIDYYKNELEEANQKYIKNLNNKKELTEFINNFVKLSYSTIMSCISFLYTLDFITKSLTKNNEYISQEKLEKLLQRQIKSV >CP022893|852627:869589|864693_865221_+|AXJ35229.1|DBSCAN-SWA MKLLKTKNCLYYRNGDNKLSEYQLLTQFNPAFINKKIKMCEFQIESMYHMSASTTTCDEIMGVVSVSYPIEKLVIKIIETKAGLQNYKNRSINNTALLKKVLNHYTEKEQKQVVKYMRSNGRYKPYNVIERLQVDLYQASIKQRSERQKQRNTAIENSKIARVNAYHQSSYVKVV >CP022893|852627:869589|863475_863817_+|AXJ35226.1|DBSCAN-SWA MQSIAEKETYHLPTEHLQVFNVIKNTSNKYITKTKILNQLGYEYNSSNERWLRRVINSLVYDYGYPIGCSYKPSERGYYIFTTEQEKQQAMRSIKKLADGSMKRYEALKRIKV >CP022893|852627:869589|867234_867675_+|AXJ35234.1|DBSCAN-SWA MASIGFKTYNFNHISYSKNKELDIENVDTFEVNSDFSAKVAFENEEAYIIMDCQIGNNKPNCPFIINMQLTGVFDIEYENDVEDKNSLKILLTQNAIAILYPYIRSLVSDLTSKANMFDTFIMPVVNVAKMMEENNRIEIVGLDKK >CP022893|852627:869589|858776_859160_+|AXJ35220.1|DBSCAN-SWA MEIKQKYQLSKVVKILEVVLYEEDKFKSDKDYHYQDKAFYEYALKLVHNGLFNILAELDFEDEAFLILDEVTMTLSDVMKETQHVYRYSVIDEKGEHKHTTDRKGHVIGMLEWALDYIVGNIEVEEL >CP022893|852627:869589|857965_858172_+|AXJ35216.1|DBSCAN-SWA MNNKVSNYRRYIGLTQNQMANNLKISVTAYRNKERGITPFKDSEKVFIKNKLIENGIKDITIDDIFFN >CP022893|852627:869589|868416_869589_+|AXJ35236.1|DBSCAN-SWA MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK >CP022893|852627:869589|866938_867235_+|AXJ35233.1|DBSCAN-SWA MGLKLKEYINDSNRKLDKETVRKHLVDILNYTVEENSFLDQMTVGKRLYSNQYKNSPSVSLTVNHKIKINEVTSDFSYKFSDNETQTFNLSNELGVVA >CP022893|852627:869589|866345_866918_+|AXJ35232.1|DBSCAN-SWA MCTTIDIRGYHGTDRSCYDNLEINKEFPVNKLPSDLGNGLYLFIDRKNKVGEAIKNAKNYLDRWKPKYEKKIIAQIDIKVKENRLMDLDDHDNQYEFNSFVEENEETIYNELDKLINNNTKSRGNIDGLIIEIMIREYNLEIDAIQKETYTQFDKSKKRKRSNIPNGKELCIRQNDIIKNKCIYNENVVT >CP022893|852627:869589|864424_864643_+|AXJ35228.1|DBSCAN-SWA METKYELNNTKKVANAFGLNEADTNLLINAVDLDIKNNMQEISSELQQSEQSKQKQYGTTLQNLAKQNRIIK >CP022893|852627:869589|852627_855000_+|AXJ35212.1|DBSCAN-SWA MNLKQSIEEIINQPEYEPMSVSDFQDALGLSSADSFRDLIKVLVELEQSGLIERTKTDRYQKKHSSKGHSKLIKGTLSQNKKGFAFLRPEDEDMEDIFIPPTKINRALDGDTVIVEIHQSKGEHKGKIEGEVKSIEKHSVTQVVGTYSEARHFGFVIPDDKRIMQDIFIPKGQSLGAVDGHKVLVQITKYADGSDNPEGHISAILGHKNDPGVDILSIIYQHGIEIEFPDEVLQEAEAVPDHIENTEIKGRHDLRDELTITIDGADAKDLDDAISVKKLANGNTQLTVSIADVSYYVTEDSALDKEAYDRATSVYLVDRVIPMIPHRLSNGICSLNPHVDRLTLSCRMEIDASGRVVKHEIFDSVIHSDYRMTYDAVNQIITEKDPNIREQYKEITPMLDLAQDLSNRLIQMRKRRGEIDFDISEAKVLVNEVGIPTDVQLRQRGEGERLIESFMLIANETVAEHFSKLNVPFIYRVHEQPKSDRLRQFFDFITNFGIMIKGTGEDIHPTTLQKVQEEVEGRPEQMVISTMMLRSMQQAHYDDVNLGHFGLSAEYYTHFTSPIRRYPDLTVHRLIRKYLIEKSMDNKEVKRWEDKLPELAEHTSKRERRAIEAERDTDELKKAEYMIQHIGDEFEGIVSSVANFGMFIELPNTIEGMVHIANMTDDYYRFEERQMALIGERQAKVFRIGDTVKVKVTHVDVDERLIDFQIVGMPLPKNDRSQRPARGKTIQAKTRGKSLDKSKSDDKGRKKKGKQRKGKNQRNNDKSGNSKHKPFYKDKSVKKKARRKKK >CP022893|852627:869589|858571_858775_+|AXJ35219.1|DBSCAN-SWA MRKQVIITKTVVGWYNIKDTQHNLMLNIPPKVFEQYFPDVSKDVQVACLEMDLSKITEIKNKKKVGS >CP022893|852627:869589|859528_861145_+|AXJ35222.1|DBSCAN-SWA MDEVSLYKKHFEFHSKLDYVSTINLSRIKEISKRINFASISTDRQVFNNKGNAYHREKDNVAGDYISNLTLDYTIKPKEIGLVYGTVNIKTVDKNGEEEKQSTFKTSHFHNYARFIADLISDRVIYSKQLDCFIIVKNNQYEVIDNTNFALTYPVDNKYYIDDFLDVMLELYREHLNVTHNFKIYPYCIAGNDWVYDCQNLTLTEQKLKSDELYSIKYDVDIKDINLEIPRNFFDLVTDNKKSKNNLMLTHAYTMYRKMKLIQAEKWFLLKDFGRSGKGLFMATFEKLMTVNKVNFDSLISGGFESANEWMNFYGADIAHANETGEITKQMMRILRKIATGETISGRGIGRNAFTFKNNAVLILDTNESVDTGEITANTTRTVKISLKDRPINETDEERYQIFKPYWDFIQPNGNTSVNASVSFLITSLEYLKENGREFKFKDVTLKYYFNEDELTETQITMIRLLSKQGFILAGDETLQRLIERDYSSLRYKNAKEDMRKIGISINNQKKIDGVNTKVHKVGNIELFNMALELISEH >CP022893|852627:869589|858207_858435_+|AXJ35217.1|DBSCAN-SWA MTKLTYPMLYITRKEKGDTQKKVASKLGISPQRYQLKESGKAIFNLNECQILSEMYDMPIDELFSSKIKVEGSRQ >CP022893|852627:869589|865223_865565_+|AXJ35230.1|DBSCAN-SWA MDKKQIKDFVCDYHKRTRSDVLIDDEINTDEFFSIGDENSNEWMADDNIDDHIVKNHLEMIVDQVANDKEFYIFDSLIQGRSFKDISNVLECSEQSVRLWYETLLDKIVEVIE >CP022893|852627:869589|861320_862124_+|AXJ35223.1|DBSCAN-SWA MTGYHVAKHLLSKNIEVIPLNNHKKPTVSFADIDITDEFVEYHSNIYHQTNVLGVLTRGVWCIDIDVDHEDGKNGFDSLKQIPYYEELVTNAQNTLVQTTASGGKHIIFKKHDNIEYGQKIGYLPSVDIKAHPNNYFVLAGSQTAKGIYTHNGVNVTEYQGEFEKRIFSKAGNYKQQVLEPYSIRRALPNYSFSHVRVGKGGEGKRAYQRIIDGQSEYRNNDLYKAVSYAIQCNVDIEPLRVLIGDNKNGDVFTERDWEATVRSASR >CP022893|852627:869589|858431_858605_+|AXJ35218.1|DBSCAN-SWA MKMYLTYICLVSLLTILLLAISNMYVAFSVYGMMVTYGFNLTGEITTCENKLLLQKQ >CP022893|852627:869589|859160_859484_+|AXJ35221.1|DBSCAN-SWA MNWEIRNLMCNIEIVKEKLEDVATTHTWFVDGRFTKRSLKTKEEVVNYGLAYNEHRIHNEQVTELMLTYLEELDGLMNKFHEIEKASLSTDQSESNANVQSIYLNKY >CP022893|852627:869589|862384_863026_+|AXJ35225.1|DBSCAN-SWA MNIETIVNQFETRAGTLLRYYTGLLEHSKVQPCCFKLYNDPFDMVYVMMNSKLFGHVYIKDCKVRQSFELASPKHTEGLIRSIEGHYVGYELHDGKHLSISDMMASHLFEDEYFMYGLQTYAESNNSDVFEYLENGFDTDTLEGIQSSNTDVIANIEMLYQLATGINEPEPELVEGLKLVTEFIQDENATQEDYKALERKLNDLKASYYSLSK >CP022893|852627:869589|857160_857745_-|AXJ35215.1|DBSCAN-SWA MEEFGEKFTHKAHKSIVSKWEKGLTKPSNERLKEIAKLGNISVHQLIYGDFLGLLESIANEEIKFILDTNMCANNSFLANELSSSVSRFIFSYYERGKENFNENLFRKLLQHYLQLELDLGNRDLESLTYFAYQRTINAQELVVDYYEDSKAKEFLKDESIDEFLTTISNKYFDLLEYIDDYRVKHDLEKISEE >CP022893|852627:869589|865561_866131_+|AXJ35231.1|DBSCAN-SWA MSELTAKQARFVNEYIRTLNVTQSAIKAGYSANSAHVTGCRLLKKPHIKQYIQEQKDKIIDENVLTAKELLHVLTNAAVGDETETKEVVVKRGEYKENPQSGKVQLVYNEHVELIEVPIKPSDRLKARDMLGKYHKLFTDKHDINGNVPIFINIGEWDGDDEELDKAVKDVSNANPNHTVIVDDIPLED |
25 | Staphylococcus_phage(81.25%) | integrase | attL 853999:854014|attR 861397:861412 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
986101 : 1033491
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP022893|986101:1033491|DBSCAN-SWA CATGACCCAAGTACATTTTACACTGAAAAGCGAAGAGATTCAAAGCATTATTGAATATTCTGTAAAGGATGACGTTTCTAAAAATATTTTAACAACGGTATTTAATCAACTAATGGAAAATCAACGAACAGAATATATTCAAGCAAAAGAATATGAACGAACAGAAAACCGACAAAGTCAACGAAATGGCTATTATGAGCGCAGCTTTACGACACGTGTAGGCACGCTAGAATTAAAAGTACCCAGAACACGTGATGGCCATTTTTCACCCACAGTGTTTGAACGTTATCAACGAAACGAAAAAGCCCTCATGGCTTCAATGTTGGAAATGTATGTATCAGGCGTTTCAACTCGTAAAGTATCAAAAATTGTGGAAGAACTTTGTGGTAAATCCGTCTCTAAGTCCTTCGTTTCTAGCTTAACAGAACAGCTAGAACCTATGGTTAACGAGTGGCAGAATCGTTTATTATCAGAAAAAAATTATCCTTACTTAATGACCGATGTACTCTATATAAAAGTACGAGAAGAAAATCGAGTACTCTCAAAAAGCTGTCATATAGCGATTGGAATAACCAAAGATGGCGACCGTGAAATTATCGGCTTCATGATTCAAAGTGGCGAAAGCGAAGAGACCTGGACAACATTTTTTGAATACCTAAAAGAACGCGGTTTACAAGGTACGGAACTCGTTATTTCTGATGCGCACAAAGGATTAGTCTCTGCCATTAGAAAATCCTTCACCAACGTAAGTTGGCAAAGATGCCAAGTTCACTTCCTAAGAAATATCTTTACCACCATTCCTAAAAAAAATTCAAAATCTTTCAGAGAAGCTGTTAAAGGAATTTTTAAGTTCACAGATATTAACTTAGCGCGTGAGGCTAAAAATCGATTGATTCATGATTATATCGATCAACCAAAATATTCAAAAGCTTGCGCATCATTGGATGATGGATTCGAAGACGCCTTTCAATATACCGTACAAGGAAATTCCCACAATCGACTAAAGAGTACCAATCTAATTGAACGACTGAATCAAGAAGTACGCAGAAGAGAAAAGATTATTCGCATCTTCCCCAATCAAACATCAGCCAATCGCTTAATTGGAGCCGTTCTTATGGACCTACATGATGAATGGATTTATTCTTCAAGAAAATACATCAATTTTGATAAGTAGAAATGGTAAAAACATTGTATAGCATTTTACACAGGAGTCTGGACTTGACTAAATCGATGGTTATTAACTACTAAATAAAAATATTTGCTAAATTAATGACTTTGTACACACATTATTTTTAAAGAGGATAAAGTATTTAATAATATTAACAAAATCATTTAATAAATAGTTAAATATATATTCTCTATTTTTGTGATATTATTCACATGTCGATACATATCAACAAATATCAATCATACGAAAGAAGGTTATAACAATGAAAAATAAAAAACGTGTTTTAATAGCGTCATCATTATCATGTGCAATTTTATTGTTATCAGCAGCAACGACTCAAGCAAATTCAGCTCATAAAGACTCGCAAGATCAAAATAAGAAAGAACATGTTGATAAGTCTCAACAAAAAGACAAACGTAATGTTACTAATAAAGATAAAAATTCAACAGTACCTGATGATATTGGGAAAAACGGTAAAATCACAAAACGAACTGAAACAGTATATGATGAGAAAACAAATATACTCCAAAATTTACAATTCGACTTTATCGATGATCCAACTTATGACAAGAATGTATTACTTGTTAAAAAACAAGGCTCAATTCATTCAAATTTAAAGTTTGAATCTCATAAAGAAGAAAAAAATTCAAATTGGTTAAAGTATCCAAGTGAGTACCATGTAGATTTTCAAGTAAAAAGAAATCGTAAAACTGAAATATTAGACCAATTGCCGAAAAATAAAATTTCAACTGCGAAAGTAGACAGTACATTTTCATATAGCTCAGGTGGTAAATTCGATTCAACGAAAGGTATTGGACGAACTTCATCAAATAGCTACTCCAAAACGATTAGTTATAATCAGCAAAATTATGACACAATTGCCAGCGGTAAAAATAATAACTGGCATGTACACTGGTCAGTTATTGCGAATGACTTGAAGTATGGTGGAGAAGTGAAAAATAGAAATGATGAATTATTATTCTATAGAAATACGAGAATTGCTACTGTAGAAAACCCTGAACTAAGCTTTGCTTCAAAATATAGATACCCAGCATTAGTAAGAAGTGGCTTTAATCCAGAATTTTTAACTTATTTATCTAATGAAAAGTCAAATGAGAAAACGCAATTTGAAGTAACATACACACGAAATCAAGATATTTTGAAAAACAGACCTGGAATACATTATGCACCTCCAATTTTAGAAAAAAATAAAGATGGTCAAAGGTTAATTGTCACTTATGAAGTTGATTGGAAAAATAAAACAGTTAAAGTCGTTGATAAATATTCTGATGACAATAAACCTTATAAAGAAGGATAATATTGAAAGGGCGGATTACTAATGATTAAACAATTATACAAAAACATCACAATTTGTAGTTTAGCAATATCTACTGCATTAACTGTATTTCCGGCAACTTCTTATGCAAAAATTAATTCTGAAATTAAAGCTGTTTCTGAGAAGAATCTTGATGGTGATACTAAAATGTATACACGTACAGCTACAACAAGTGATAGTCAAAAAAATATTACTCAAAGCTTACAATTTAATTTCTTAACTGAACCTAATTATGATAAAGAAACAGTATTTATTAAAGCAAAAGGTACAATTGGTAGTGGTTTGAGAATTTTAGACCCAAATGGTTATTGGAATAGTACATTAAGATGGCCTGGATCTTATTCAGTTTCAATTCAAAATGTTGATGACAACAACAATACAAATGTGACTGACTTTGCACCAAAAAATCAGGATGAATCAAGAGAAGTTAAATATACGTATGGTTATAAAACAGGTGGAGATTTTTCGATTAATCGTGGAGGCTTAACAGGAAATATTACAAAAGAGAGTAATTATTCAGAGACGATTAGTTATCAACAACCATCATATCGTACATTACTTGATCAATCTACGTCACATAAAGGTGTAGGTTGGAAAGTAGAAGCACATTTGATAAATAATATGGGACATGACCATACGAGACAATTAACTAATGATAGTGATAATAGAACTAAAAGTGAAATCTTTTCTTTAACACGAAATGGAAATTTATGGGCGAAAGATAATTTCACACCTAAAGACAAAATGCCTGTAACTGTGTCTGAAGGGTTTAATCCAGAATTTTTAGCTGTTATGTCACATGATAAAAAAGACAAAGGTAAATCACAATTTGTTGTTCATTATAAAAGATCAATGGATGAGTTTAAAATAGATTGGAATCGCCATGGTTTCTGGGGCTATTGGTCTGGTGAAAACCATGTAGATAAAAAAGAAGAAAAATTATCAGCATTATATGAAGTTGATTGGAAGACACATGATGTGAAGTTTGTAAAAGTACTTAATGATAATGAAAAGAAATAAGTAATAAAAGTTGCCTGCTACATAGAATGTAGTAGGTAACTTTTATTTATATTTGAGTAGATAGATTTATTATGATGTGCAGTGTATGAATCTTGTTTGAGTGTAGAGTAAAGACTTGTATTAATGAAAAATTAAAGTTGTTAAGATGATTTTATTAAAATGTAAGTCAATTCAAATTTTAACAATATAACTCGCTTCGTCCTTTTAGAACGAAGCGAGTTATTAGTTAGTTGAGCACTATTTACTATAGGCTTTGATTGGGTAATGATCTGAAAAATCATTGTAAACGTAGTAATATGGGAACGCATATACATCCCATGGCTTAGGTTTTTCAGTCACAACTTCATTGACTAATTGTTTTGGTTGTTTATGATCTTTATCTGTAAATATATAGTCTAAATGTTCTGGTTTACCATTAGGGTAATTATATTTCGCAATTGAATTTGATTGAGGGTCCCATGTGCTATTATGACCTGCATATAGAACATCATTTACATTCAAGTTTTTAAGCATATCTTTGAACTCTGGAGTGCCTTTATTAACATTAAGGTCGCCACCTATATATACCGTTTCATCTTTAGGGATATTTTTCTTTTTAACAAAGTCACTGATTTCTTTCATTTGTTCAGCTCTAATTTTTCGATCATGTCCAGCACCACAACGTGAATCTTCAGATTGTGTATGTGTACCGATAACGTGAACGTTCTTACCATTTTTCTCTATTTTTGTATAAACAAAGCCTTTGTTGCTATCATTATCGAATCCACAACCGCTTTTGAAAACATGCTGGATTTTTTCTTTAATAGGATATTTACTTACAATCGCTACGCCACCATCTTCAGCAACAGTTGATGAGTAGCTACCTTCAGTTTTGTCCCAACCTGATTGAGAACGACCGAGTACAGGTGTTTGGTAAGGATATTCTTTTTTCACATTACTTAATAATTTGTCTGATGCACCATTATCAAATGCTTCATTGAATATTACGACATCATTATTTTTAATATAAGAAGATTGTCCGATTAAATCAGCGCGTTTATATTGTCCCCAGTTTGGATACATAGAAACCTTGTAACAACAGTATTTATTGGGTTTGGAGTCCCTAATGGGTCCCTAAATTACATACTTTCTAAAATTTTAGTTGTTTTTTTGTCCTCTTCATTAAATTTTTCTTCTAACAAATGAGAATACACGGATGTAGTTATTGCTATATTTTTATGACCTAATCTTTTAGAAATGTAATGTATAGATACACCTTTTGCTAGTAAATAAGAACAATGAGTGTGTCTTAATGCGTGCGATGTAATAATTGGTATATTATTGACTCTACAGGCTGATTTCAAAGCATTATTGATAGCATGAAGGTTAATTATAGATCCGGCTTCTTTGAAAATGTAACCATCATAGCTAATTGCAAATGTACTTATGACGTCCATAATGTGTTTCATATCAGATTTAGCGATACTGATATATCTA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>CP022893|986101:1033491|1007030_1007231_+|AXJ35382.1|DBSCAN-SWA MWITMTIVFAILLLVCISINSDHAREIQALRYMNDYLLDEVVKTKGYNGLEEYRIELKRINNDIKK >CP022893|986101:1033491|1011501_1012239_+|AXJ35388.1|protease|DBSCAN-SWA MKVEIKGVIVSNEDKWVYEMLGMDSTCPKDVLTQLEFSDEDVDIIINSNGGNLVAGSEIYTHLRAHKGKVNVRITAIAASAASLIAMAGDHIEMSPVARMMIHNPSSIAQGEAKDLNHAAETLEHVGQIMAEAYAVRAGKNKQELIEMMAKETWLNADEAIEQGFADSKMFENDNMQIVASDTQVLSKDVLNRVTALVSKTPEVNIDIDAIANKVIEKINMKEKESEIDVADSKLSANGFSRFLF |
67 | Staphylococcus_phage(98.51%) | portal,capsid,protease,holin,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1166652 : 1232346
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP022893|1166652:1232346|DBSCAN-SWA ATTAAATCAATAAACCTATCTTTTCATCTAATTCGCTATAATCTATTGTACTAATATAGTTTTCATGAAGAAGATTTTTATTATGTTCATTTATTTCTTTTTTTGAGTCATTTAAAATAAAAATAAACTCATTTTGCCTGTGTCTTTTTATTTTTTTTGCTTGCATAGCATCCGTTATTTTCGACTTAATAATCATAGAATTATTAGGGTTAGAAAAAACATTGATAAATTTTTCTTTTTGATTTTTCTTAGCGCTAATAAAAAAGTCGAAATTATGAACAACACCACTGCTTCCTATAATAGGTATATCTCTTCCGTAATAAATGTTATGTTCATCCAATTTGTTTGCAACATCTTCTGTAAATATGTTCTGTGACTTAGGATTAGAAAGTAAGTACATATCATTAACAAATATAAGGCACTGTAATAAATTATGTTTCGATTTATTAAAATTTTTAAAGTTAGTTTGAACAAAAATTTCGTGAGTTTTATCGTTATATTTAATACCGTAAGCTGAAAGGTGCTCTTCAAAAATCTTTTTACGTTTTTTAAATTTATTTATAGAAACACCGTTATTTTCTAAACCAAATATAGTATAGCCGTCATCAGTCAGTGTAATCATGTCTCTGGACTGATCGTATAAAGCGTATATTTTTAAATTATCTAAAGAATTATCTTTAAAAGGGGTATCTATTTTTACTGAATTGTTTGATAAATTAGAAAACTCTAAAATCTGATTATACCAATCAAGATATTCTTTTTTTAATTTTTTAGCATCAAACGTAGTCATATTATCCCTCCTTTATTCAAGGTCTTTTATATTTTTTTACTCTAAAAACGACATATACACATTATACAAGTTATAGATGTCGGGGAAATCTTTCAAGTTAATTTCATAAGCAAACCTATCCTTTTTATCACACTTATCATTATATATGTGAATATGACTTTTCGGAGCGATTGTTCCATCTGGATTATCGTGAGTACCACCGTTAATATCTATTCTAACTAGGGTGTGATAGGTATCTTTGAAAATGATTGAAATTGAAAACCTATCTTTTTCTATGTTATCCCTTTTTATTGTTAAGAAGTACTTTATTCCTAACTTAAAACTTATTATTTCTTGCCTTTCATTTATTCGACTAGCAACTATTGTTTTTTATTCATTTACATCGATATGAGTTTCTGGATATTTTAATTCATTTATTAATAATTTTACGTGCTCATCGTCAAGACTATTTAAATCAAGTTTAGCCATGTCTGTTCCTCCTTTAACGTTGTATAGGCATTAATTTTTAATACTTTCTTATTTGAAAAAAGCAAAAAAAGATAGGTGAGATGCATACACAACCAAAAGTGTATATCATCAATTTAGTACCTCGCAATATAATTTTATACAATGTATAATAAGATTTAAAGATGTAGTTCATCAACATTTTCATAGGGGATTTTTAAAATTAAGTATTGAAAAATAAAATATTTATATTATAATATAAATAAGTCAACGACCATGCGTGGACAGTAAAACGAAGTACATGCGAATGTAGTAGCCGTTTACTATGAGACTAGGCATTATAATTGAATATCATAGTATAAATTGCCATGAGAGTAGAAGCTTCAGTTTATGAAGACTTCGAAATCATGGTTTTTTATTTTTAAAGTGAAATTTTAGTTCATAGTAAATATATATATGTTTTTAATTCGGCTAAATCATAGCATTAAATTTTTTAGATGAAGCTAGCGATATTACGAAATGATATATAGAAGATTTCAGTTATAACAGTATACGAAGTAATCCTCTCCGTTTAACGGACAATAGTTAATAATCAGTTAATTTTAAATTCAATTATAGATTATTTTTGATAATACAAACATTATTTTTTAAGATTTGATTAAAGTTCGTTTTGATTTTTATAGCGAAAAAGTTGAGCATCGGCAATTTTATCATATTGTTCGAGTATAAAGGGAACTATTTAAATGTAATGAAGGTTGCGCCAAAATGACCGGTTTTCAGCATCATAAATGAATAAATTGTATCATTTTTAATATTTTATAGCATTTTATTTTTTTAATGAACAGTTAATTTTATAAATAAGTGAAATAATCTATAATAAATTTGTATTAAAAATTTATATAGAAAGAAAGTGAAACTTATGTTTAAGAAAAAAATGTTAGCTGCAACTTTGTCAGTAGGACTGATTGCGCCTTTAGCATCTCCGATTCAAGAATCTAGAGCTAATACTAATATAGAGAATATTGGTGATGGTGCTGAAGTAATCAAACGTACGGAGGATGTAAGTAGTAAGAAATGGGGCGTTACTCAAAATGTTCAATTCGACTTTGTAAAAGATAAAAAATATAACAAAGATGCTTTAATTGTTAAAATGCAAGGTTTTATTAATTCCAGAACTTCATTTTCAGATGTGAAGGGTAGTGGATATGAATTGACTAAACGAATGATTTGGCCATTCCAATATAATATAGGACTGACGACTAAAGATCCAAATGTTAGCTTAATCAATTACCTTCCTAAAAACAAAATAGAAACTACTGATGTTGGTCAAACATTAGGATATAACATTGGAGGTAATTTCCAGTCAGCACCATCTATAGGTGGCAATGGCTCATTTAATTATTCTAAAACAATTAGTTATACCCAAAAGAGTTATGTCAGTGAAGTAGACAAGCAAAACTCAAAATCAGTTAAATGGGGTGTTAAAGCAAACGAATTTGTTACGCCTGATGGTAAAAAATCTGCGCATGATAGATATTTATTCGTACAAAGTCCAAATGGTCCAACAGGTTCAGCAAGAGAATATTTTGCTCCTGATAATCAATTGCCACCTTTAGTTCAAAGTGGCTTTAATCCATCATTTATCACTACACTATCACATGAAAAAGGTTCAAGTGATACGAGTGAATTTGAAATTTCATATGGTAGAAACTTAGATATTACATATGCGACTTTATTCCCTAGAACTGGTATTTACGCAGAAAGAAAGCATAATGCATTTGTAAATAGAAACTTTGTAGTTAGATATGAAGTTAATTGGAAAACACACGAAATTAAAGTGAAAGGACATAATTAATATGAAAATGAAAAAATTAGTCAAATCATCAGTTGCTTCATCAATTGCACTGCTTTTGCTATCGAATACAGTTGATGCAGCTCAACATATCACACCTGTAAGCGAGAAAAAAGTAGATGACAAAATCACTTTATACAAAACAACAGCAACATCTGATAATGATAAATTGAATATTTCTCAAATTTTAACGTTTAATTTCATTAAGGATAAAAGTTATGACAAAGATACATTAGTACTTAAGGCAGCCGGAAACATTAATTCAGGTTATAAAAAGCCTAATCCAAAAGATTACAATTACTCACAGTTTTATTGGGGCGGTAAGTATAATGTTTCGGTTAGTTCAGAATCAAATGATGCTGTAAATGTTGTTGACTATGCACCTAAAAATCAAAATGAAGAATTCCAAGTTCAACAAACATTAGGTTATTCTTATGGCGGAGATATTAATATATCTAATGGCTTATCAGGTGGATTGAATGGATCAAAATCATTTTCAGAAACAATAAATTATAAACAAGAAAGTTACAGAACTACGATTGATAGAAAAACAAATCATAAATCAATTGGCTGGGGTGTTGAGGCGCACAAAATTATGAATAATGGTTGGGGACCATATGGTAGAGATAGTTATGACCCAACATATGGTAATGAACTGTTTTTAGGTGGTAGACAAAGTAGTTCAAATGCTGGACAAAATTTCTTGCCAACACATCAAATGCCTTTATTGGCGCGTGGTAACTTTAACCCAGAATTTATAAGCGTACTTTCTCATAAACAAAATGATACAAAAAAATCTAAAATCAAAGTAACTTACCAAAGAGAAATGGATAGATATACTAATCAATGGAATCGACTACACTGGATTGGTAATAACTACAAAAATCAAAATACAGTAACGTTTACATCTACTTATGAAGTTGACTGGCAAAACCATACTGTTAAATTAATCGGTACGGATTCTAAAGAAACTAATCCTGGAGTATAGAATTGTATATGATTAAATAATCAACAAAGTGCAATTATTTCAATTATCAAACGGAATTAAAGAACTAACATAATTTTTATTTACACACATGATAATTTTTAGTTAGGGAAATGTAGATTACTTTGCTAAATAGCAGGGTGCTAAATTTACGAAAGTAGAATTATTTAGAAACTTCCAACATATAAAAAATTATTAAAAAAATGGAACCACGTCTTAATCGGCGTGGTTCGTTTTGTAGATATAGCATCTATGATTGTATGACGGTGAAAGTTCATTACAAACTTGGTATTGGTAAATTTATCATTTTAAGTATCGGTGATTTAATTGAAATAGAAACTATTATCGAAGAAACATTATATAACACGATAATTATACGTTACTAAACTTTTCTTCAAGTTGTTTTTTGTTTTCAAATGAAAATACCTCTACATTATATTGAGACAACATTGTTGATACTGCTTCGCTAATATCATCTTGTTGTTCTGTAATGATATTAAGTCTAGCATTAGAATCAAAATTTTTATTTCTATGTATTTCAACATCATTCCAATCGAAAAGGACATTTTTTGCATTGTTTTTATCGATTCGTTTAATTGTTTTAACATACTCTGTAGCTTCTCCTGGAAATACTGCTTCGAAACTATGGATTAACTTAGATTTCCCCTCTACCTTAAATTCGGGAAATATATTAGGATAAATCTTTCTGTTTGATAGAAAATATTGCATCACTTCGTCTTTAAATAAGGACTTAATATTTTCTTTCTTTAATATTCCCAAATAACTGATCTCGGAAATAGCCAAAACATAATCATGAATAGCTTGAGATAAGTTTATTCTATTTGTATAAAAGTTTATGTGCTTATTTTCGATGACTAGACTGTAGTTTTGTACAATATTATTGAGAAGTTGATACTTTTTTTGTTTTT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60 | Staphylococcus_phage(94.12%) | tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1362237 : 1371280
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP022893|1362237:1371280|DBSCAN-SWA CATGAATGAGCGTATGGTTGATCAATCAATGCATAGTGAAGAAACTGATTTCGAATTGTCGCTTAGACCTACGAGATTACGACAATATATTGGTCAAAATTCAATAAAAAGTAATTTAGAAGTATTTATTAAAGCGGCTAAACTTCGTCATGAACCATTAGATCATGTATTGCTTTTTGGCCCCCCTGGATTAGGTAAGACAACATTATCTAATATCATTGCCAATGAAATGGAAGTTAATATACGTACAGTATCAGGGCCTTCATTAGAAAGACCTGGTGATTTGGCTGCAATTTTATCAGGACTTCAACCTGGAGATGTATTGTTTATTGATGAAATACACAGACTGAGTAGTGTTGTTGAAGAAGTGTTATACCCTGCAATGGAAGATTTCTTTTTAGATATTATCATTGGTAAAGGCGATGAGGCTAGAAGTATCCGTATCGACTTACCTCCATTCACTTTGGTAGGTGCAACAACGCGAGCTGGCAGCTTAACAGGTCCACTAAGGGATCGATTTGGTGTGCACTTAAGATTAGAATATTATAATGAATCAGATTTAAAAGAAATCATTATTAGAACAGCTGAGGTTTTAGGCACAGGTATTGATGAAGAAAGTGCCATTGAACTTGCTAAACGTTCTAGAGGGACTCCAAGAGTAGCAAATCGACTATTGAAGCGGGTAAGAGACTTCCAGCAAGTGAATGAAGATGAACAAATATACATTGAAACAACGAAGCACGCATTAGGTTTACTTCAAGTTGATCAACACGGACTAGATTACATTGATCATAAAATGATGAACTGTATTATTAAGCAGTATAATGGTGGACCTGTTGGTTTAGATACGATTGCCGTAACAATTGGTGAAGAACGTATTACAATTGAGGACGTTTATGAGCCATTTCTTATTCAGAAAGGCTTTTTAGAACGTACGCCACGTGGCAGAAAAGCAACACCATTAGCTTATGAACATTTTGCAAAGTCGAATGAGGAGAGAGGATAACGTGAATATTGAAGAATTTGACTATGACTTACCAGAATCATTAATTGCTCAAACGCCTTTAAAAGATCGTGATCATAGTCGTTTATTAGTCATGGATAGAGAAACTGGTGAAATGAAACATTTACATTTCAAAGATATCATTGAGTATTTTAGACCTGGTGATACATTAGTGCTTAACGATACGCGAGTAATGCCAGCTAGACTTTTTGGTTTAAAAGAAGAAACTGGTGCAAAAGTTGAAATGTTAATGTTAACTCAAATTGAAGGTAATGATTGGGAAGTCTTACTGAAACCAGCTAAGCGTATTAAAGTTGGTAATAAATTGAATTTTGGTAATGGCAAAATTATAGCTGAGTGCATAAAAGAAATGGATCAAGGTGGACGCATCATGCGTTTACATTATGAAGGTATTTTACAAGAAAGATTAGATGAATTAGGGGAAATGCCACTGCCACCATACATCAAAGAACGTTTAGATGATCCAGATCGTTATCAAACAGTTTACGCTAAAGAAAGTGGTTCAGCGGCAGCACCAACAGCAGGATTACATTTTACTGATGAGTTATTAACTGAAATTAAAAATAAAGGCGTTAATATCGCATTTGTTACATTACATGTTGGGTTAGGTACGTTTAGACCGGTGAGCGTCGATGATGTGAATGACCACGAAATGCATAGTGAATATTATCAAATGACACAAGAAACAGCTGATTTATTAAATGATACTAAGTCCAAAGGACATCGCATTATATCAGTTGGTACAACTTCAACACGTACACTTGAAACAATTCGACGCGATCATGATAAATTTGTTGAAACGAGTGGCTGGACTAATATATTTATTTATCCAGGATTTGATTTTAAAGCAATTGATGGCCAGATTACTAATTTTCATTTACCAAAATCAACATTAGTTATGCTAGTATCAGCGTTTAGTACTCGTGAAAATGTTCTGAATGCTTATAAAACAGCAGTAAATTTAGAATATAGATTCTTTAGTTTTGGCGATGCAATGTTAATTATATAAAAAGAATGTGAGGATTTTGAATATGCCTGCAGTAACATACGAACACATTAAAACTTGTAAACAATCAGGTGCGCGTTTAGGTATCGTGCACACACCACACGGTTCATTTGAAACACCTATGTTTATGCCAGTTGGTACTAAAGCAACCGTTAAAACAATGAGTCCAGAAGAGTTAAGACAAATTGAAGCAAAAATCATTTTGGGCAACACATATCATTTGTGGTTACAACCCGGAAATGATATTATCAAACACGCTGGGGGATTACATAAATTCATGAATTGGGATGGTCCGATTCTTACAGATTCAGGCGGTTTCCAAGTGTTTAGTTTAAGTAATTTACGTAAAATTACAGAAGAAGGCGTGGAATTTAGACATCATACTAATGGGTCTAAATTATTTTTGAGTCCTGAGAAATCAATGCAAATTCAAAATGATTTAGGATCTGATATTATGATGGCATTTGATGAATGTCCACCGATGCCTGCTGAATATGATTATGTAAAAAAATCTATTGAACGTACAACACGTTGGGCGAAAAGATGTCTAGATGCACACCAAAGACCTGAAGATCAAGCATTGTTCGGCATTATACAAGGTGGCGAATATGAAGATTTAAGAGAACAAAGTGCAAAGGATTTAGTAGAATTAGATTTTCCTGGTTATGCAATCGGCGGTTTGTCAGTTGGTGAACCTAAACCGGTTATGTATAAAATGGTTGAACATACAGAGCAGTTTATGCCTAAAGATAAACCAAGATATTTAATGGGTGTAGGATCTCCAGATGCGTTAATCGAATGTAGTATTCGCGGCATGGATATGTTTGATTGTGTCTTACCGACACGTATTGCCAGAAATGGTACTTGTATGACATCGCAAGGTCGTTTAGTTATTAAAAATGCAAAATTTGCAGATGATTTAAGACCGTTAGATGAGAATTGTGACTGTTATACATGTCAAAACTATTCAAGAGCGTATATACGTCATTTAATCAAGGCAGAGGAAACTTTTGGTATTCGTCTTACTACTATTCATAATTTACATTTTCTGCTAAAATTAATGGAAGATATAAGACAAGCCATTCGAGAAGATCGTCTTTTAGATTTCAAAGAAGAATTCTTCGAGCAATATGGATTAAATGTTGAGAACCCAAAAAACTTTTAAGCAAGAGGAGCGTATAAAATGCAATTTTCATTACTAATATATATAGTCGTAATTTTTGCGGTTATGTATTTCTTGATGATCAGACCACAACAAAAACGTGCGAAACAGCATCGTGAGTTGATTAATAACATTCAATCTGGTCAAAGAATTACAACTATTGGTGGTATTAAAGGTACTGTTAAAGCAGTAGATGAAACAACTGTTGTTATTACAGTTAATGGTCATGGTACTGAATTAACTTTCGAAAAACCTGCTATTAAACAAGTTGACCCTTCATAACGAGAAGTGGTATTAAAAAGGATGAAACGAATAGCGTTTCATCCTTTTTAAGTTATAAGTAGTATGTAGAATAGCTTATTTTTATTCCAAAAAAAGAAATTGTGATACATAATAATTGTTAAATTTAAATTAAATATATCTATGACTATTTTTACTCCCTGCTCTAGTATGTTAATATGTATAAGGCTAATAAATTTTGTAAGAAAGATTTAACTTGCGTTATAAAATAGTATTCAAGTATTCTAAATACATACGTAAATAATGAGGTGTTCATGTGAAGAAAAGTAGTAGAATAATTGCGTTCTTGCTTTTAGTCGTATTGTTGTTTGCCGGAATGGCTGCAACTTATAAAAGTGTTATAAAGAATGTCAATTTAGGACTTGATTTGCAAGGTGGATTTGAGGTGCTTTATCAAGTCGATCCTTTAAATAAAGGCGACAAAATAGATAAAAAAGCCTTACAATCAACAGCGCAAACATTAGAAAATCGTGTTAACGTTTTAGGTGTTTCGGAACCTAAAATTCAAGTTGAAGAACCTAATAGAATTAGAGTTCAACTTGCTGGTGTAACAGACCAGAATGAAGCACGTAAAATTTTATCTTCTCAAGCTAATTTAACAATTCGCGATGCAGAAGATAAAGTAAAATTAAGCGGTTCTGATATTAAACAGGGATCTGCCAAACAAGAATTTAAACAGGAAACAAACCAGCCTACAGTTACTTTTAAAGTAAAAGACAAAAACAAATTTAAAAAAGTAACGGAAGAAATCTCTAAGAAACGTGATAATGTCATGGTTGTTTGGTTAGATTTCAAAAAAGGTGACAGCTATAAAAAAGAAGCACAAAAGAAAAACCCTAAATTTATTTCTGCAGCAAGTGTTGATCAACCAATCAATTCTGATAGCGTAGAAATCTCGGGTGGATTTAAAGGACAAGAAGGCGTTAAAAAAGCAAAACAAATCGCCGAATTGTTAAATGCAGGTTCTTTACCAGTTGACTTGAAAGAAATTTATTCAAACTCAGTAGGTGCCCAATTTGGTCAAGATGCATTAGATAAAACTGTGTTTGCATCGTTTATTGGTGTAGCATTAATTTATTTATTCATGCTTGGATTCTACCGATTACCTGGTTTAGTAGCGATTATTGCATTGACAACTTATATCTATCTAACGTTAGTAGCATTTAATTTCATTTCCGGGGTTCTAACTTTACCAGGATTAGCGGCGTTGGTATTAGGTGTAGGTATGGCTGTAGATGCCAATATTATCATGTATGAGCGTATTAAGGATGAACTTCGAATAGGTAGAACGATAAAGCAAGCCTTTTCTAAAGCAAACAAAAGTTCATTCCTAACAATTTTTGATTCTAACTTAACAACAGTTATCGCCGCAGCAGTATTATTCTTCTTCGGTGAAAGTTCAGTTAAAGGTTTCGCGACAATGTTATTATTAGGTATTCTAATGATCTTTGTTACAGCCGTGTTCTTATCAAGATTCTTATTATCATTACTTGTTTCATCAAATATAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP022893|1362237:1371280|1363243_1364269_+|AXJ35697.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >CP022893|1362237:1371280|1364291_1365431_+|AXJ35698.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >CP022893|1362237:1371280|1365984_1368264_+|AXJ35700.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >CP022893|1362237:1371280|1368466_1370740_+|AXJ35701.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDVNHDALQLSDMTKAIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >CP022893|1362237:1371280|1370761_1371280_+|AXJ35702.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >CP022893|1362237:1371280|1365449_1365710_+|AXJ35699.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >CP022893|1362237:1371280|1362237_1363242_+|AXJ35696.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERG |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1939794 : 1985506
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP022893|1939794:1985506|DBSCAN-SWA TCTAACTGATTTCTCCCCATAAGTCACCTAATATCTGATTAGGTGGGGCAGAACCATTCCATGTTCTAATAGGCAAGTAATAACGTTGCCCCTCCCATGTATATCCTACCCAAACATGACCATCTTGTAACATCACTTCTGTATAATCACAATATCCACCAGGTTGGAACTGATAACCCACTGGACAAGATAAGAATGGCCCCACTTTTCTTACTGTGATTGGTTGATTGCCGTTTGTGAATCTAGCACTTTCTTCCATGTAGTAAGTACCATATTTATTACGTTTCCATGCACTTGCAACTGGTTTAACTGTATTACTTGAAGCGCTTGACTCATTAGAGACAGTGGCAACCGGTATTTTACCATCCATGTACGCCCTAATCTGCTTGATAAAGTAGTCTTTAAGTTGCAACCGCTTGTCTTCTGGCAATAGACCGCGAGTTACTGGGTCAAAACCAGTGTGTAAAACCGAACTTCTATGAGGGCATGATGTTGAAGTAAATTCATTGTGCAATCTGATTGTATTTCTGTTTGCTGGTAATCCCCATTTTTTCAACAATCTAGCGCATTCTTGGAAAGTTGCCTGTTCATTTTTTAAGAATGTCGCGTTATCTGCGCCCATTGATTGACATACTTCAATACCGTAATAATATTTATTACCTATTTGATTAGCGGTATGCCAACCTACTTGTGATTCATCTAAGGCTTGCCAAACTGTGTTGCCTGATACGTAACTATGCGCAATGCCCGCTTCTAATCTTGATAAAGGTGCATTTACTAATCCGTTACGATATGCTTCAGCAGTCGCCCCTTTGCTTCCTGCGTCGTTGTGTATAACTATACCTTTAGGGTTACTACCACGCTTAGGTAGGTCATAACCTTTAACCACATCTTTGATGATTTTAAGTTCTACTGCTTTAGGTTGTGGCTTAGCTGTTTCTTTTTTAGGTGCTTGTGTAGGAGATTGAACTGATCGTGGCGCTGTCTCACTTTTAAAATTCGGACGGATAAACCACATAGGGAAATCATAAGCATGTTGTCGTCTTGTAACTTTTTCCCAACCCCAGCCGGGTTGTTCGATTCCGTCAGTCCAGCCACCGCCTAGCCAATTCTGCTCATATACAATGATGTAATCTAAAGTTGCTTCAATTACCCATGCAACGTGACCATATCCAGCACCGTAGTTGCTACCGAATACCACCATGTCGCCAGGTTGTGCTAAGAAGTCCGGTGTATTTTGGTATACAGTAGCTAGTCCATCAAAATTGTTTGCAAATGGTATATCTTTTGCACCTAAACCTTTTAGAAGTAATCCAAACAAAACTTTCCAACCAGCATTGGCATAATCAAAGCATTGAAATCCATACCATAAGTCCACATTGAATTGTTTTCCCTCAGAAGTTTTCAACCATTCTATAAACTCTTTTTTAGTTAATTTTGCTTGCATCGTCGCCACCTCCATGATGATACTCATTCACGTCAAAACCAACATCGTTAGAGGCGTCTGTAAACGGCTGTGATGTATCATATTCTTTCGGTGCTTTTGTACTTAATTCTGGCGTTAAATTACTGTCTTGAGATGTTTTCCAAGTAACCTGTTGTTCTTCTTTGCTACTATCTCTAGGCGCTTGATATGTCTGTGCTATAGATGAATCTGAGACGCCTTTTGACGTTGGATCAGTAATAACACCAATACCTGTGAGTAGCGTGAGAATAGCACCTATAATCGCGCTAGCTTGATTTAATTGAGTTGATAAATCTAATCCGAATAAGTCTGTAATTTGCTTGATAAATAGCAACAATGCTCCAACTAAACCAGTTAGTACTGCTTTGTTTTTGAATCTCAATTTCCAGTTAATATCCATTTGTTTGCTCCTTTTATCCAAAATAAAAAAACGACTAAAAATTAGTCGTTTAAAATTATTCAATGGTCAATGTCGGAGATCCTGAATAAACATCACTTATAGTGACATACAACATCCCTGAAGGATTACTAAAGTTGATATTTTTACTTGCAACTCCGCTATTGACTCCTGATATTCCTAAATCACTTGAACCTAAATTAGTTTGCGAAACCCTCATTATACCGCTACGTACATTTTCTATTGTCACCTGATAACTTTTATTAGGTTCAACTCCATTTATTGTCCATTTTGCTGTTGATTCTTCTATGCTATCCGGATATTTATTTTTAGGTAAGGGTTTTATTACAAAAGATGAAGGCTTTTTCCATACTTGGATATTTCCAGCATATACTTTTGTATATTCTTCGCCTTCGTAAATAAGTTTCTTTACATTTTTAAAATTACCTTCCATAAAAATCACCCCTTAATTAAGTAAAGTGTATTAGGGTCTTTTTGATATATATAGTTATATTCATTTTCTGTTCCTGTCCAAATTTTAACCGTCGGTTGAGATGCGCTTTTTAGTTGATATAAACTATCCGCTTGTTGTTTAGTAAAAGCTTGAGATGACAAAACATACCGCTCGTCATGATTATGATTTTTTGGAGCATATAAATCATTTAGTGTTTGTTTGAACCTCTCAAAATCTTCTGTACTAACTTTTGAGCCAATCTGTTGCAATACACTTTCTGAAATAGAGTTGTTTTGTATTGCTTCTGCTAATTCTCTTAGTGTATTCATAGATTCAGGCGCGCTATCAACTAGTTCAGCAATTTTTGAATCTGTATACGTTTTAGAGTCTTTGAGAGTTGCCTCTTTGTTTTTTTCAACTTCTTGCAATTTATCTTCTAACCCTTCAACATTTGCGATATTGATTTTATCCAATAACTCAGGTTCTGCTTTGATATCTGTATCTTTACCGTCAATTTGCCACATTTTAGTGTCAGGATTGATTGATACTACAGTACCGTTCTTACCGGGTGCACCTTGTTCTCCTTTTTTACCTGCTTCACCTTTTGCACCAGGTTGTCCCGGTTCGCCTTTATCACCTTTCGCACCTTTAAATCTACTTTCATTCTTTTCGATGTAAGAAATAACATCTTTATCTATTTTCTCTTTAAAGTCTTTGCTCAATAAATCTGTCGCGTTATCTTTTAAGATTCTCGTAATAGCATCATCTACCAATTTAACATCGATTTCTTTTGCTACAGCAGATTCAATACCACTATCAACGATATTGAAAGAAAAGTTCGCGACATGTATTTTTTCTTCTTCTTTCTCTAAAAACAGCTTACAACGAACATAACCAGCGTGTTTGATAACCTTTTTAGGTATCTTGTAGGTAATGAATCCTTTTACAACATCGTCGATAATAAGGGGCTCATTTTTGAATATAGAGCCATCTTCCATAAACAAATGTAATCTAGGTGTTAAGCCATGTGCTTTTAGATCGATACGACCTTGTTTGTCATTGATACCTATTCTTATAGATGCTGTATTTTCATCTTCAGTGTAAAATCGACAGCCAATGTCACCTAAGTCAACACCATCATTTTTTATTCTCGTTTCAACATCTTTTATTTTGTACATTTACACACCTCTTTATTTATATTTATCCCTTGTGAAGTAGATACCTTTTAAGCCGATTTGTTTATATAACTTAGCGATTGTACTTGCTTGATGTTGGCACCACTCTATAGCAGTAGCGTATTGGTGGGTAGCTGGATTCTTAGGATTCCATCTAATTCGGTACAATGTGTTTTGACCTTTATTGATGTAATCCTTTCTTACGAAGCTAGCACCGCCCATGATTGCTTTTGCTGGAGATGTCCAACCTTTATTTTTAGCAAACGTCATTGCATAATCAGGGTCGTTGTCGAATGCACCAATACCGAAGTAATTATATGCACCGTATCTACCATTAGCGAAGTTACTTGTTCCGTATCCACTTTCTAAGAAAGCGTGCGCGATCAAATAAATTTCGTTAATGTTGTTTTTCTTACAAGCTTCCGCGAATGCTTTGCCTTGTCCGTCGAGCGTTCCTTTTCCTTTAAGTATTTTGTTAAGCGCACTAACTGAAATGCCTTGATACTTGCCTAAATTAAGCATTTGATAGCATTGCGTGTTACTTTCCCATATTCGCTTAACATTCATTGCCGAGCTCGTTTGTGCTCGTGTTGCATTAGCCCAGCCCCATGTATGAGATTTTTTCGGGTTACCCCTAGACATTTGTCTATCCAGTGCTTGCTGGAATGTGAATGGACTTGTTTCAGTAACGATGCTTGGTTTTTCGTCTGATGGAGTAGGGCCTCGTGTGGACGCACTATCAACTGATGTTTTATCACTAATTCTTATTGTTGTTTTTGTCGTTACTTCTTTTATATTTTCTCGTGTCAATATATCTCGTTTAATGTATGTCTCAAGCATTTTCTTTTTAACTTGCTCATACTTTGCGTTATCCGGTATACCTTGCTTAATCAAGTCGTAATTAATTAAATCTTTCATACTACGCCAAATATTAGGGTCTACCTTTAACGTCGTTTCAGATAAGTTTTTATCAATCCCTGACAATAACCAAACACCACGTATTAACGCTTGTATTTGATTCAATAAGAATTGTCGTTTGCTATCTGTTTGACCACCACATACTTCAATAACTAGCCAATTAGGGTGACGCGGGTCATCAAAATTGGTTGGTCTAGCAAGCCATGTAGCCTCTCTATCGACATATAAATGCGGTATTTCATAATCGCTTATAAACTTATTTCTTTGCGTATACAGTTCGTCTACAGAACGCATATGCATTGATTCTTTTATATATAATCCTTGAATATCTGAGCGTTCATCACCCATTACAACTATATGATCAATGAAGTGCTCTTCTTTATCTAAAACATTGCTGTAAGCAGTGTATTTTACTGTTTTAACTTCTTTAAATTGCGGTTTCTTCGCTTCGCCAGTAATTGTTGAGTCATTGGCTTTTGATGCTGAACTTGTATCAGTACTACTAGGTTTGCTAGTATCTTTTGAATATGGAGGTCTGACAAAGCCTGTAACACTTACATAAGGGTGTCTTACTAAACTTCCCGGAGAACC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>CP022893|1939794:1985506|1965111_1965606_-|AXJ36235.1|DBSCAN-SWA MIKLTPKQEKFVLGLIEGKSQRKAYIDAGYSTKGKSDNYIDSRAFELSKNSAILDRYEELRQEAAEQSKWTRQKAFEEYEWLKNVAKNDIEIEGVKKATADAFLASLDGMNRMTLGNEVLTNKKIETEIKMLEKKIDQMDKSENNSQEAEVAKALIKLAGVNND |
72 | Staphylococcus_phage(75.36%) | head,portal,holin,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2748033 : 2758387
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP022893|2748033:2758387|DBSCAN-SWA CATGTATCAAAATTATACCATAAACCAACTTTGTTTGCCTATAGATCTTGAAATTAAATTAGAAGAAAATGATTTTGCTCATGCCATTGTGCAGTTTGTTGACTCTATTCCCGATGAAGTCTTTCTTCCTTATTATCAATCTATGGGTAGACCCCAATATCATCCTCGTATGCTACTTTCCATTATTCTTTGTGCCTATATTCAAGGGGTTTATTCGGGCCGCCAAATACAAAATATGCTGATAGATAGTATTCGGATGCGCTACTTATCTCAAGAGCAATTCCCTAACTTTCGTACTATTAATCGTTTTCGCGTTCATCCGATTATGAACGATATTCTAGATCATTCATTTGTTCAATTTCGTGAGCTACTGGTTCAAAGTGGCTTAATCAGTGGCAGTGCTCTATACATTGATGGTACAAAAATTGAAGCGGATGCGAATAAATACTCTTTCGTTTGGAAAAAAAGTATTTTAAAGTATAAGGATAGCCTTGATCAAAAAGCCCTTGAAAACTACCAACAAATGGTGGAAACAAAAATCTTACCTGAGTTAATAGATGATTTAAAGGATGAACTTTCTATAGAAGAGATTGAAAGGATTCGTCAATCTTTGGAAGAAAAGGAAAATCAATTAATTGAAGCGATTGACCAAACCGAAACAGTAGAAGAACGAAAATTACTTCGTAAAGAAAAATCTGAAGTTCATAAGCAGAAGAAGCGATTCGATGATTTTGCCCAAAGAAAAATGAGCTACGAAGAACAATTAGTGATTATGGGTGTACGCAATAGTTTCTCAAAGACGGATCATGACGCTACTTTTATGCGAATGAAAGAAGATCACATGCTTAATGGCCAACTAAAACCAGGTTATAATATTCAACTTGCGACAGAAAATCAATTTGCTCTTGCTTATGATTGTTATCCAAATCCAACAGATACACGAACATTTATCCCATTTCTTGAAAAGATTGAATCAAAAATAGGTTTACCAGAAAATATTGTCGCAGATGCCGGTTATGCAAGTGAAGAAAATTATTGTTATGTGTTAGACGAAACAGAATCCACCCCCATCATTCCGCATCAAGGTTACTTAAAAGAGAAGAAACGCGCCCATAAACAAAATCAGTTTCATCGAGATAATTGGACTTACAACGAGTTGGATGATTACTATATTTGTCCCAATCAGAAAAGAGTAGTGTTCTCACATTATTCACAACGTAAAGATAGAAATGGATTTATTCGAAACTTCAAAATCTATGAATGTGAAGATTGTACAGGATGTCCATTGAGAGAGAAATGTACCAAAGCAAAAGAAGGAAAAAATCGACGTTTGAATATTAATCCAACCTGGGAATATATAAAAATAAAAGCGAATGAAAAGATAGAAAGCAAAGAAACAGCCTCATACTATGCGCAGCGAAAGATAGATGTCGAAACAGTTTTTGGAAACATTAAACAAAATATGAAATTTAAAAGATTCCATGTCCGAGGAGCTGAAAAAATTTTTAAGGAAATGGGACTTGTATTTCTTGCGCACAATTTTAGGAAATTAGTAACTAGAGTAAGGAAATATGAGGGAAAAACAATCATACAAAACCAAATATAGGGGGAAAATCCTCTATATTTCATCCAAAAAAAACAAAAATCGAAGACATCTTTCACGGGTGCCTTCGATTTTTTGGTTCAAAAGGGACTAATGGGTCAGCCCCCTCAAAATTACCAGAGATTAAGCTCAGCCAGATATAAGGACTCCAGCCTTACTTTCTACGCAACAACGCCACACACTCCACATGCCTTGAGTGGGCAAAAAAGATGTCGCACCCCACTGGTATCCCCTTGGCGGAAGCCCATATTTCTGAAACAGTCGCCTGGATAGGCTATTTTTCATTGATTTGGTGCCTGCTTTTGCGTTACAATCCAAGTAATTGTAAGCAATAAAGCCTTCAAAAGCATGTTGTCCTCTTGAAGGCTTTATTCGGTACAACTTTAAAATTGGTTTACTTATCTTTATCTTCCTCTCTAAGATACTTAACTAGCCCCGGATAATTGCTTATCCTTACAGTTCGGATCAATTAGAATTAGCCGAAAACGGCGGCGAAGAAACGAACCACCGAGAAGCACCGCCGCATTGCCGAGCTTGATACCCTCATTGAACGACTGTATGCGGACCGGAAAAGGCGCGGTTGACCGCCTTGCCCTCAAAGGCTTAGGGGCATATCAACTATATATTGGGGCCGAGTGCCGTTACTTTAACACCGCCGCTAGCCATGAGCTTATGCTTCCTTTAGGACACTGTCCCAACAGACACTTTTTAAAGTATGCTGCACTAATCCTTATTTTTCACAGCATAGCGCAATGACAGACAGCCATGTTCTGCATTCTCTGTTCCCTGCAATTCCAAATTAACTTTTTCAGATAACAGAAGGTTATCAAATAGTTGTTTTTCTTTATTACCTACAAAACATGGTGATATCACAAGACTGATTTCATCAATAAGTCCGTTTTCTAATAATTTGTTGGTTAATCCACCGCCACTGTCTGTCCGCATGTATTTACACCCATATTGCTCATGCAGGATCTGAAAGGCTTTTTCATAGTCCACATGATCATTTCCTGACACAATATATGGGTAATGCCTTTCCTCCAAATAATTCAAATATTCCTTCGGAGTGGCAGTTGATACCAGAATGACAATTTCCTTCAGATATCCAAGATTTCTTAAGCAATGAAGACTTCTCAAGATACCTCTGCTGTCAGGTATGACTCCTATTGGTCTGGGGTCCTCCGGGCTTGTTATGATTTTCTCAAAATCAGCCTCTGTTTCAGCAGGATATTTTTCAAATGCAGTAAAAACAGTATTGGACCCAAACAGCACCGCATCCGAATGAATTCCCCCGGCAACCTGGTAGTAAACTTCCGGATTATCAAAGCCTTTAATGCGGCCATCAAGGCTAATTTGTGTGTGCATAATTATCTTTGGTTTCATATTTTTCAATCCTCCTTTTTGATAGTAGAATATCATAATACACTGACAGCTGTATGTCAGCAGGGGATATGAAACCTTACAAAAAATACATAACAGACCAATCGCTTTCTCTAAATCAAGTTTAGGCAGTGATTCGTAATTTGTGCCAGGTGTTTACGGGTTATGCATTTTAATTCATCAGGTTGGACTATTTCAATGCCTGATCCATATTCAATCAGCTGCTTGCTCAATATCTCAAAGGAATCTGTCTGGAATTCGATTTCCATTTTACTTCCCAAATCGGTTTCTTCAAGGAAGCCGAGAGAATACCTGTTCTTGATAGAATTGTATGTCTCCCCTTTTTCAGCTCTAAGAATTACATTATATAGTTTTTTATATGAAAGCATTTGTTTTAATATTTGTTCCAAAGAGCCATCATGGCTTTGACAGAGCTCTTCTTCTATGCAAATGCTTTTAATCCGATCCACACGAAAATTCCTATATTCATTTCTTAGCCTGCAAAACCGATTAAGTACCAGTTCTGTTCATAAAACCCCAGTGATATAGGCTCTATCATTCTGCTTTCCGGTTCTTGCCCTCCTGATGCAGGATATTGAATTGATATTACCCTTTTATTGCAGATTGCAGTCTGAATTGCTGCAATAACGTTATCCGCCAATGTATTTTTCTGTCCAGATGTGCTGTACACGTTAATACTGTTCTCCAACTCCTGTGCATAGTTTTTTTCACCATGCTTCAAAATAGATTTGATTTTATACATAGCTGAATCAAAATCCTTTATAAATGATTCATCTCCATGGCAATTTAAAAATTTCCCTGCTGTAATCAATGCACCCACTTCCGCCGCTGTAAACATTACCGGCGGAAGTAGGAAGCCCTCTACAAGAAAATATCCTTTTCCGGCCTCAGATCCAATTGGTATTCCGGCTTCTTCAAGTGTCCGGATATCTCTGTAAACTGTCCTTAAGCTTATATTAAATCGCTGTGCAATTTCTTTGGCAGGAATTATTTTTTTTGATTGCAGCTGAATAAGAATAGAGGTTACTCTGTTAATCCTGTTCAAATTTTATTCCTCCTCTGTGACTTCCATAAAAAGTATATCCTATGCGTTCTTAAGCTAGCTGCTGTTAGTGCTTCTCATTGCACCCTGGTTATAAAAGCCATACTCACAAACCTCTTCACCAAAACTCTTTACATCTCTAATATAGAACTCTATCTAGCGAACTTTTAGAAAAGATATAAAACATCAGAGTATGGACAGTTGCGGATGTACTTCAGAAAAGATTAGATGTCTAAAAAGCTTGTAGTTAAAGCTTTTTAGACATCTAAATCTAGGTACTAAAACAATTCATCCAGTAAAATATAATATTTTATTTTCTCCCAATCAGGCTTGATCCCCAGTAAGTCAAAAAATAGCTCGACATACTGTTCTTCCCCGATATCCTCCCTGATCGACCGGACGCAGAAGGCAATGTCATACCACTTGTCCGCCCTGCCGCTTCTCCCAAGATCAATAAAGCCACTTACTTTGCCATCTTTCACAAAGATGTTGCTGTCTCCCAGGTCGCCGTGGGAAAAGACAAGTTCCTCTTCGGGCTTTTCCGTCTTTAAAAAATCATACAGCTCGCGCGGATCTTTAAATGGAGTGTCTTCTTCCCAGTTTTCGCAATCCACATCGGCCAGATCGTTATTCAGTAAGTAATCCAATTCGGCTAAGCGGCTGTCTAAGCTATTCGTATAGGGACAATCCGATATGTCGATGGAGTGAAAGAGCCTGATGCACTCCGCATACAGCTCGATAATCTTTTCAGGGCTTTGTTCATCTTCATACTCTTCCGAGCAAAGGACGCCATCGGCCTCACTCATGAGCAGATTGCTCCAGCCATCATGCCGTTCAAAGTGCAGGACCTTTGGAACAGGCAGCTTTCCTTCCAGCCATAGCATCATGTCCTTTTCCCGTTCCACATCATAGGTGGTCCCTTTATACCGGCTGTCCGTCATTTTTAAATATAGGTTTTCATTTTCTCCCACCAGCTTATATACCTTAGCAGGAGACATTCCTTCCGTATCTTTTACGCAGCGGTATTTTTCGATCAGTTTTTTCAATTCCGGTGATATTCTCATTTTAGCCATTTATTATTTCCTTCCTCTTTTCTACAGTATTTAAAGATACCCCAAGAAGCTAATTATAACAAGACGAACTCCAATTCACTGTTCCTTGCATTCTAAAACCTTAAATACCAGAAAACAGCTTTTTCAAAGTTGTTTTCAAAGTTGGCGTATAACATAGTATCGACGGAGCCGATTTTGAAACCACAATTATGATAGAATTTACAAGCTATAAGGTTATTGTCCTGGGTTTCAAGCATTAGTCCATGCAAGTTTTTATGCTTTGCCCATTCTATAGATATATTGATAAGCGCGCTGCCTATGCCTTGCCCCCTGAAATCCTTACATACGGCGATATCTTCTATATAAGCGTACCGGTTCCAATTTTTTCGCAGTTTAACTTTTCCGACGCATTTATCGTCTTGGTAGTAAAGATATATTATCTTATCAGTATTGTCAATATATTCAAGGCAATCTGCCTCCTCATCCTCTTCATCCTCTTCGTCTTGGTAGCTTTTTAAATATGGCGCTTCATAGAGTAATTCTGTAAAGGTCCAATTCTCGTTTTCATACCTCGGTATAATCTTACCTATCACCTCAAATGGTTCGCTGGGTTTATCGATATCTTTCAGGTGCCCTGCTTTCATTTCTGTAATCACTGTTCCCGCCTCTCTTCTATATCAGCGGCATATGTGCTATCCAGGCAGCCGGTTTTACCAGTGTATTTTTTATACATGTCCCTGGTATATTTTGTTATATTCCTATCATACTCCGGATAGGCATAATGAAGCCTTTCCGCCACCTCACCGGATACCGCCCTGAACAATTGATGGCATAGAAATAATGCTTCCCATATGTTTTCATAGGAATCCATCCGGTAGGTGGACAAAAGTTTCTCCCACAAATCCTCGGATATATACCTTTCAATAAACTTATAGTTCTTGCCTACACTTAATTTAAAGCCTGTTTCGATGCCGACCTTCCATGATATCATTCTCAGCAGCTCATGGCGAACAATCTGATTAAAATGATCAATAGCAAATAAAATTTCCTTACGGCACAATCCTTTAATAACATAAGGTGTTACATTCCAAAATTCATTGCAGCAATCATCATACTCCCTTGCGCTTGGCTTTCTTACATGATAATCTATATCAGTCGGAACTATGTCCCTTTTAATTCTACAATCTTTATCAATTAGAACCTTTATTAATTTATCGCCCTTTAGGTAATTATCTAACTCTTCCAAGGGCAATAAGGTAAGATCAATTTTATTGTAATCATCAAATAGCATAAGATAGGAAAATCCCTTTTCTTCAGGTGGGAATAATTCCATATCCTCCGGCTTTTGCATCATTATTATATTCCCAAATTGATTAAGCCAGTCATCATTAGATATAAACGGTTCTATATCACTTACAAAATATGTAATATCATAATCCTGAAATTCATCTTTAGGTATATTAATATTTGCGCGTGACCCCTCAAGGGTCACAATTCGAATACGTTCATCCTGTTCTGCTAAAGAAAGTACTAAATCCATCATTTCTTTTTCTGATCTCATTTACATACTCCTCGTTTATTTTTTCTATATTATTACATCTTCTTTTTTGCCGATACAATCAGCATCATTGGGCGTCGCATTTCATCCGCCATCCCCGGAATATCCATCATGTTCTCTGGCGGCTGTGGCTCCACAATCTGATTTATTATAAAACTATTTGAAAGCAGTGTATTTAGATATGTGGTCAGTGTTCTATGATATTTTGTAACCTTTTCTTCCAAAAACATAGCTGTCCGTTTGCCCTCATAATAATAATTGTCCACCGGGAAATGCAGTATTTCTCCTTTTTCGTTATAATACCAGTCTTGTGTTCCATGAGCAGTAAAAACAGGATGTTCAACTGTAAAAACTAAATTGCCACCAGCCTTCAGCATCCTATATATCTTTTTTATTAAATTCTCATAGTCTGCTACATAATGAAACGCAAGCGAACTTAGTATTACATCAAAGCTCTCCTCTGGGAAATCCACATCTTCTATGGCACAGCATTCATATTCAATCTGTGGAAAATGGGTTTTTCCTTTTGCTACTTCGAGCATTTTATGAGAAATATCAACACCTACTACAGAGGAAGCACCGTTTTCCATCGCATATATACAGTGCCATCCATAGCCGCATCCTAAATCAAGCACACGCTTACCCTTAAAATCAGGTAGCATCTTTTTCAAAGTCTCCCATTCTCCCGCACCAGCCAGTCCTTTCTGCGAGCGACTCATTTGACTGTATTTTTGAAAAAATATATTATCATCATATTTGTTTTCTTTCATCTGAACTCTCCTCGTTTAAAAAGTTATTTATCTCCGATACAATTTCATTCACTTCATTATAAAGCTTCTCGGTCATGTCGTAGCATTCAAAAAGTGAGATACCGAGTACTTCAAAAATATGATTTACCTTCTCGGTATATTTTTCAGGTTTATGTTCAAAAGTTTCAAGCAGTTTTATAGCTTTCTTTTCGTTGATACAATAAGCATTATTACATGCAAATAACACTTGATTTAAACATGAAACTATACGAAAAACATGACCCGCAATATAATATTTATCGTCTGTTCCCGAATTTGCTTTTACAAACATTAAAGAGAACCCTGCTTCAAACATAAAAAAGTTAACTAAACTTTTCTGCAAAGCATTGGGATAAGTTTCTGCCTGTTTTTTTAATTCGCATAAGCTTTCATTCTTAGCATATAGTATTTTGCTAATCGCTAATTCTCCTCGATACATTGCACTAATATAACCATGGGGATGCCCAGTCTGATAATTGGCAGTAACAATTCCGTGCTCTGTATCTTTCATTATTTGTTCCACACGTTTAATATCACGTAAAATTAAATCCACATGATACCCGTTTATGACTAACCATCCGCCGCCATTAATCCAATCACCCCATGCTCCGGGAGGTACAACAAGGTTATTTCTATGCTCATCATCCAGCTTTGTAGCGAATTGATTAATAGTATTTATGTCAAATGATTCTGAATTGTAATAGATGCCGATATCTATATCCGAATCCTCTGTATGGGTGCCCCTTGCACGTGAACCACCTAAAACAATACCTTCTATATAAGACAGAGAGGATAATTTCTCTGCTACTGATTTAATAATATTATCTACCATCAAGCATGCTCCTTTTATCGATTCACTGCTGTAAAAATTCCAAGCCAAATCTTTTGCTTCTACTCAACATATTTATAATTTTTTTAATTTCACAAAAGATAGTTAAAACTTATCAATTGTCTTTTTATACCTCTGCTGATTAGATGAAGTCTTTTCAATAGCCTTTAAATTACCATTCATTTTGCTAACATGGTTTAAAAATAACGTTCCAAGCAGAAGTCGATCCTTTCTGGGTATCCTATTCCCCACATATCCCTTGAATAAATCTTTAACAAGAAAAACTTCGCCATCATTTAGATTTTCAGTTTCTCTAATAGCTTCTTCCAATAGCTCATTTACATCAATCATGTTGTCCACTCCTTATTAATAATGGGGCTGACCCATTAGTCCCTTTTGAACCAAAAAATCGAAGGCACCCGTGAAAGATGTCTTCGATTTTTGTTTTTTTTGGATGAAATATAGAGGATTTTCCCCCTATATTTGGTTTTGTATGATTGTTTTTCCCTCATATTTCCTTACTCTAGTTACTAATTTCCTAAAATTGTGCGCAAGAAATACAAGTCCCATTTCCTTAAAAATTTTTTCAGCTCCTCGGACATGGAATCTTTTAAATTTCATATTTTGTTTAATGTTTCCAAAAACTGTTTCGACATCTATCTTTCGCTGCGCATAGTATGAGGCTGTTTCTTTGCTTTCTATCTTTTCATTCGCTTTTATTTTTATATATTCCCAGGTTGGATTAATATTCAAACGTCGATTTTTTCCTTCTTTTGCTTTGGTACATTTCTCTCTCAATGGACATCCTGTACAATCTTCACATTCATAGATTTTGAAGTTTCGAATAAATCCATTTCTATCTTTACGTTGTGAATAATGTGAGAACACTACTCTTTTCTGATTGGGACAAATATAGTAATCATCCAACTCGTTGTAAGTCCAATTATCTCGATGAAACTGATTTTGTTTATGGGCGCGTTTCTTCTCTTTTAAGTAACCTTGATGCGGAATGATGGGGGTGGATTCTGTTTCGTCTAACACATAACAATAATTTTCTTCACTTGCATAACCGGCATCTGCGACAATATTTTCTGGTAAACCTATTTTTGATTCAATCTTTTCAAGAAATGGGATAAATGTTCGTGTATCTGTTGGATTTGGATAACAATCATAAGCAAGAGCAAATTGATTTTCTGTCGCAAGTTGAATATTATAACCTGGTTTTAGTTGGCCATTAAGCATGTGATCTTCTTTCATTCGCATAAAAGTAGCGTCATGATCCGTCTTTGAGAAACTATTGCGTACACCCATAATCACTAATTGTTCTTCGTAGCTCATTTTTCTTTGGGCAAAATCATCGAATCGCTTCTTCTGCTTATGAACTTCAGATTTTTCTTTACGAAGTAATTTTCGTTCTTCTACTGTTTCGGTTTGGTCAATCGCTTCAATTAATTGATTTTCCTTTTCTTCCAAAGATTGACGAATCCTTTCAATCTCTTCTATAGAAAGTTCATCCTTTAAATCATCTATTAACTCAGGTAAGATTTTTGTTTCCACCATTTGTTGGTAGTTTTCAAGGGCTTTTTGATCAAGGCTATCCTTATACTTTAAAATACTTTTTTTCCAAACGAAAGAGTATTTATTCGCATCCGCTTCAATTTTTGTACCATCAATGTATAGAGCACTGCCACTGATTAAGCCACTTTGAACCAGTAGCTCACGAAATTGAACAAATGAATGATCTAGAATATCGTTCATAATCGGATGAACGCGAAAACGATTAATAGTACGAAAGTTAGGGAATTGCTCTTGAGATAAGTAGCGCATCCGAATACTATCTATCAGCATATTTTGTATTTGGCGGCCCGAATAAACCCCTTGAATATAGGCACAAAGAATAATGGAAAGTAGCATACGAGGATGATATTGGGGTCTACCCATAGATTGATAATAAGGAAGAAAGACTTCATCGGGAATAGAGTCAACAAACTGCACAATGGCATGAGCAAAATCATTTTCTTCTAATTTAATTTCAAGATCTATAGGCAAACAAAGTTGGTTTATGGTATAATTTTGATACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP022893|2748033:2758387|2755438_2756308_-|AXJ36998.1|DBSCAN-SWA MVDNIIKSVAEKLSSLSYIEGIVLGGSRARGTHTEDSDIDIGIYYNSESFDINTINQFATKLDDEHRNNLVVPPGAWGDWINGGGWLVINGYHVDLILRDIKRVEQIMKDTEHGIVTANYQTGHPHGYISAMYRGELAISKILYAKNESLCELKKQAETYPNALQKSLVNFFMFEAGFSLMFVKANSGTDDKYYIAGHVFRIVSCLNQVLFACNNAYCINEKKAIKLLETFEHKPEKYTEKVNHIFEVLGISLFECYDMTEKLYNEVNEIVSEINNFLNEESSDERKQI >CP022893|2748033:2758387|2750358_2751018_-|AXJ36991.1|DBSCAN-SWA MKPKIIMHTQISLDGRIKGFDNPEVYYQVAGGIHSDAVLFGSNTVFTAFEKYPAETEADFEKIITSPEDPRPIGVIPDSRGILRSLHCLRNLGYLKEIVILVSTATPKEYLNYLEERHYPYIVSGNDHVDYEKAFQILHEQYGCKYMRTDSGGGLTNKLLENGLIDEISLVISPCFVGNKEKQLFDNLLLSEKVNLELQGTENAEHGCLSLRYAVKNKD >CP022893|2748033:2758387|2756410_2756656_-|AXJ36999.1|DBSCAN-SWA MIDVNELLEEAIRETENLNDGEVFLVKDLFKGYVGNRIPRKDRLLLGTLFLNHVSKMNGNLKAIEKTSSNQQRYKKTIDKF >CP022893|2748033:2758387|2748033_2749638_+|AXJ36990.1|DBSCAN-SWA MYQNYTINQLCLPIDLEIKLEENDFAHAIVQFVDSIPDEVFLPYYQSMGRPQYHPRMLLSIILCAYIQGVYSGRQIQNMLIDSIRMRYLSQEQFPNFRTINRFRVHPIMNDILDHSFVQFRELLVQSGLISGSALYIDGTKIEADANKYSFVWKKSILKYKDSLDQKALENYQQMVETKILPELIDDLKDELSIEEIERIRQSLEEKENQLIEAIDQTETVEERKLLRKEKSEVHKQKKRFDDFAQRKMSYEEQLVIMGVRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMLNGQLKPGYNIQLATENQFALAYDCYPNPTDTRTFIPFLEKIESKIGLPENIVADAGYASEENYCYVLDETESTPIIPHQGYLKEKKRAHKQNQFHRDNWTYNELDDYYICPNQKRVVFSHYSQRKDRNGFIRNFKIYECEDCTGCPLREKCTKAKEGKNRRLNINPTWEYIKIKANEKIESKETASYYAQRKIDVETVFGNIKQNMKFKRFHVRGAEKIFKEMGLVFLAHNFRKLVTRVRKYEGKTIIQNQI >CP022893|2748033:2758387|2751128_2751485_-|AXJ36992.1|DBSCAN-SWA MDRIKSICIEEELCQSHDGSLEQILKQMLSYKKLYNVILRAEKGETYNSIKNRYSLGFLEETDLGSKMEIEFQTDSFEILSKQLIEYGSGIEIVQPDELKCITRKHLAQITNHCLNLI >CP022893|2748033:2758387|2753243_2753786_-|AXJ36995.1|DBSCAN-SWA MITEMKAGHLKDIDKPSEPFEVIGKIIPRYENENWTFTELLYEAPYLKSYQDEEDEEDEEADCLEYIDNTDKIIYLYYQDDKCVGKVKLRKNWNRYAYIEDIAVCKDFRGQGIGSALINISIEWAKHKNLHGLMLETQDNNLIACKFYHNCGFKIGSVDTMLYANFENNFEKAVFWYLRF >CP022893|2748033:2758387|2756782_2758387_-|AXJ37000.1|DBSCAN-SWA MYQNYTINQLCLPIDLEIKLEENDFAHAIVQFVDSIPDEVFLPYYQSMGRPQYHPRMLLSIILCAYIQGVYSGRQIQNMLIDSIRMRYLSQEQFPNFRTINRFRVHPIMNDILDHSFVQFRELLVQSGLISGSALYIDGTKIEADANKYSFVWKKSILKYKDSLDQKALENYQQMVETKILPELIDDLKDELSIEEIERIRQSLEEKENQLIEAIDQTETVEERKLLRKEKSEVHKQKKRFDDFAQRKMSYEEQLVIMGVRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMLNGQLKPGYNIQLATENQFALAYDCYPNPTDTRTFIPFLEKIESKIGLPENIVADAGYASEENYCYVLDETESTPIIPHQGYLKEKKRAHKQNQFHRDNWTYNELDDYYICPNQKRVVFSHYSQRKDRNGFIRNFKIYECEDCTGCPLREKCTKAKEGKNRRLNINPTWEYIKIKANEKIESKETASYYAQRKIDVETVFGNIKQNMKFKRFHVRGAEKIFKEMGLVFLAHNFRKLVTRVRKYEGKTIIQNQI >CP022893|2748033:2758387|2752356_2753151_-|AXJ36994.1|DBSCAN-SWA MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKMTDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYEDEQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDTPFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIAFCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF >CP022893|2748033:2758387|2753782_2754691_-|AXJ36996.1|DBSCAN-SWA MRSEKEMMDLVLSLAEQDERIRIVTLEGSRANINIPKDEFQDYDITYFVSDIEPFISNDDWLNQFGNIIMMQKPEDMELFPPEEKGFSYLMLFDDYNKIDLTLLPLEELDNYLKGDKLIKVLIDKDCRIKRDIVPTDIDYHVRKPSAREYDDCCNEFWNVTPYVIKGLCRKEILFAIDHFNQIVRHELLRMISWKVGIETGFKLSVGKNYKFIERYISEDLWEKLLSTYRMDSYENIWEALFLCHQLFRAVSGEVAERLHYAYPEYDRNITKYTRDMYKKYTGKTGCLDSTYAADIEERREQ >CP022893|2748033:2758387|2751508_2752081_-|AXJ36993.1|DBSCAN-SWA MNRINRVTSILIQLQSKKIIPAKEIAQRFNISLRTVYRDIRTLEEAGIPIGSEAGKGYFLVEGFLLPPVMFTAAEVGALITAGKFLNCHGDESFIKDFDSAMYKIKSILKHGEKNYAQELENSINVYSTSGQKNTLADNVIAAIQTAICNKRVISIQYPASGGQEPESRMIEPISLGFYEQNWYLIGFAG >CP022893|2748033:2758387|2754723_2755458_-|AXJ36997.1|DBSCAN-SWA MKENKYDDNIFFQKYSQMSRSQKGLAGAGEWETLKKMLPDFKGKRVLDLGCGYGWHCIYAMENGASSVVGVDISHKMLEVAKGKTHFPQIEYECCAIEDVDFPEESFDVILSSLAFHYVADYENLIKKIYRMLKAGGNLVFTVEHPVFTAHGTQDWYYNEKGEILHFPVDNYYYEGKRTAMFLEEKVTKYHRTLTTYLNTLLSNSFIINQIVEPQPPENMMDIPGMADEMRRPMMLIVSAKKKM |
11 | Streptococcus_phage(80.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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