Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP031217 | Arcobacter bivalviorum strain LMG 26154 chromosome, complete genome | 0 crisprs | csa3,DEDDh,cas3,PrimPol,cas4 | 0 | 0 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
27428 : 36836
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP031217|27428:36836|DBSCAN-SWA ACTAATTATCAAACTCTTTATATATCTCTTTATTTTTTGAATAGATTTTATATATTATTCCTTTGTAACTAAACTCTAAATAGTTTGCTTGTAGCCAAAGTCTAAAAGAACCACTTTTTTCAAATCTTTTTTCTTCACTAAGAGTTTTATTTAAATAGGCTTCAGCTATTTCATCATCTATCCCATAAATTGGATCTCCTAATATAGTGTGACCAATTGAGTGTAAATGTATTCTTATTTGATGTTGTCTGCCTGTAATAGGAGTTACTTCTACTAAACTTAGGTCTCTTTTCTCATTATATTTTAAAGGCTTTAACATGGTAATAGACTCTTTACCTTCCTCTTTTGAGCAAGTAGCCATTTTAACACCAATTGCTTTTCCTTCTTTTTTAAGATTCTTATCTATTGTTATTTCATCTTCTATTTTTCCTCTAACAATTGCAAGATAAGATTTTTTATACTCTTTTTTTTCAAACATAATTGCTAAAGAGTTTGTAACTTTTTCATTTTTACCTACTAAAACTAAACCTGAAGTCTCTGCATCTATTCTATGTGCTTGGTTTGCTTTTTCTCCTAAATGGAATCTAATTTCATCTAAAAGTGAATATTCTGTCTTTTTTGAAATAGGGTGTATCATTAAGTTTGAAGGTTTGTCAAAGATAGCAAAATCTTCAAATGTAACAAGTGGTTTTAAGCCTCTTGTATGCCCCTCAAAAACAGCTATATAAATAAAATCTTCTTCAATAATTTGAGACATTTTATAAGCTACTTTATTACTATTAAATATTCTACCTCGACTTAGCATACGGTTCGATATTTTGGGGTTTAGCGTTAAATCTTGTATTAAAGCAATTTGTATTTTCTTACCCTTAGCGACTGAAAATTTTTTTAAAATAAATGGCAAGATGTGTTCCTAAAAATTAAGTAAAATTTTAGCCAAAAAATATACAAAAATTAATGTAGAATTTGGTCTAAGTTTGATACTATATCATACTTAATTTAACAAAGAAATTTTATAAATTTTTAGAAATACAGATAATAAGGGATTAGTAAATGGTTGAAAGGTATGCCAGAGAAGAAATGAGTAAACACTGGACTCAACATGCAAGATATGCTGCATGGCTTGAGGTTGAAAAAGCAGCAGTTAAAGCATGGAATAAATTAGGTCTTATCCCTGATGAAGATTGTAAAAAAATTGTTAACAATGCTACTTTTTCAGTAGAAAGAATTGAAGAGATTGAAGCTGTAACAAAACACGATTTAATTGCATTTAATACAAGTGTTGCTGAGTCACTTGGAAAAGAGTCAAGATGGTTTCACTATGGTATGACTTCTTCAGATGCGGTTGATACAGGTGTTGCTTTACAAATGAGAGACTCTTTAAAAATTATTATTGACGATGTAAAAATGTTAATGGAATCTATTGAAAAAAGAGCACAAGAACACAAATTTACACTTATGGTAGGAAGAAGCCATGGTATTCATGGTGAGCCTATTACATTTGGTTTAACTTTAGCTGTTTGGTATGATGAAGTAGCAAGACATCTTAAAAATCTTGAAGAGACTATGGAAGTAATTTCTGTAGGTCAAATCTCTGGAGCTATGGGTAACTTTGCACATGCACCACTTGAACTAGAAGAGTTAGCAATGGCTGAATTAGGATTAAAACCTGAGCCTTGTTCAAACCAAGTTGTTCATAGAGATAGATATGCAAGATTAGCAACTGCTTTAGCATTACTTGCTTCTTCAGTAGAAAAATTTGCAGTACAAGTAAGACACTTACAAAGAACAGAAGTATATGAAGCTGAAGAGTATTTTGCTAAAGGACAAAAAGGTTCTTCTGCAATGCCTCACAAAAGAAATCCTATTTTAACTGAAAATATTACAGGATTAGCTAGAACTATTAGAGCATATGCAGCTCCTGCAATGGAAAATGTTGCTCTATGGCATGAAAGAGATATTTCTCACTCATCAAATGAAAGATTCTGGTTACCAGATGCATTTATTACAACTGACTTCATGCTTCACAGAATGAACAATGTAATCGCAAACTTAACAGTAATGCCAGAAAATATGATGAAAAATCTTAACCTAACTGGTGGATTAGTATTCTCTCAAAGAGTATTACTAGAATTGCCAAAAGCTGGTGTAAGTAGAGAAGATGCATATAGAATTGTACAAAGAAATGCAATGAAAGTTTGGGAAGAGATTCAACAAGGTAAGCCAACTGTAAATGAAAATGGTGAATCTTTATATCTTGGTCATTTATTAGCTGATGATGAGTTAAGAGCTAAGTTAAGTGAAGAGCAAATTAGAGAGTGTTTCAACTACGAATACTACACAAAAAATGTAGATGCAATTTTCAACAGAGTTTTTCTCAAAGAGAGTGCTAAGTAGCACAAGAAAAAATAAATAATTTATATCGAAAAAGGCAAGCAATATGGCAATTATGATTGAAAAAAGAAATGGGAGAAAAGAGGTTTTAGATATTACTAAAATCCAAAAGATGACAATCGATGCAACTAAGGATTTAGACGGAGTATCTCAATCTGAGTTAGAACTTGATGCTCAAATCAAGTTTGTAGATGGAATGAGTTCTGCAGATATTCAAGATGCACTGATTAAAACAGCAGTAGAAAAAATTGATATAGATGTTCCTCATTGGACATTTGTTGCTGCTAGATTATTTTTATTTGACCTTTATCATAGAGTTGGAAAAGTAACTCATGGTATTAAAGGTGAGCCGTATTGCCATTTAAGAGATTACTTAAGATATGGAAAAGAAGCTGGTAGACTAATCCCTAGTCTTGGAGAAGGTTTTGATTTAGATGAGCTAAATGATTATATTGACCCTGATAGAGATTACTTATTTAACTATTTAGGTATTAAAACTTTATATGATAGATATTTAATCAAAAATAGAAATGGTGACCCAATAGAACTTCCTCAGCAAATGTTTATGGCAATTGCTATGTTCTTAGCTCAAAATGAAGAGAATAAACAAGAAAAAGCAAAAGAGTTTTATGATGTAGTATCTAAGTTTGAAGTTATGCTTGCAACTCCAACACTATCTAATGCTAGAACAAATAGACATCAGCTATCATCTTGTTATATTGGTTCAAGTCCAGATAATATTGAAGGTATTTTTGATGGATATAAAGAGATGGCACTACTATCTAAATATGGTGGTGGTATTGGTTGGGATTGGAACCAAATCAGAGCTTTAGGTGGAATGATTGATGGTCATAAAAGTGCTGCTGGTGGAACAGTTCCTTTCCTTAAAATCACAAATGATATTGCGATTGCAGTTGACCAGTTAGGTACTAGAAAAGGTGCAATTGCTGTATATGTTGAGCCTTGGCATATGGATATTTCTGACTTCATTGACCTTAAGAAAAATTCAGGTGAAGAAAGAAGAAGAGCGCACGATTTATTCCCTTCTTTATGGATTACAGATTTATTTATGGAAAGAATCTTAGCTGATGCTCATTGGACTTTATTTGACCCACATGAAGTAAAAGATTTATCTGAACTACATGGAGATGCTTTCAAAAAAAGATATGAAGAGTATGAAAATGATGATTCTATTACTAAAGAGAAAATCAAAGCAAAAGATTTATGGAAAAAAATCTTAACTTCATATTTTGAATCAGGAAGTCCATTCCTTTGTTTTAAAGATAATGCAAATAGAGCAAATCCAAATGGTCACGTAGGTCATATTAGGTCTTCAAACCTTTGTACAGAGATTTTCCAAAATACAAACCCTAATCACTACAAGATTAAATTAGAGTTTGAAGATGGAACAATTGAAACATACGAAGAAGAAGATATTGTTTTAGTAGATGGTGGACAAGAAAAAAGAGCAAATAAAGTAACTGCACTTGACTCTATCAATGGTAAAAAAGTATTTATAGTTGAAAAAGAGAAGATTGATGGAGATACAGCTGTATGTAACTTAGCTTCTGTAAACTTATCTAGAATCTTTACAAAAGAGGATATTGAAAGAGTTGTTCCTATTGCAATTAGAATGCTTGATAATGTAATTGACCTTAACTTCTATCCATTAAGAAAAGTAAAAGCAACAAACCTAAAATCAAGATCTATTGGTCTTGGAGTTATGGGTGAGTCTCAAATGCTTGCAGAAAATAAAGTTATGTGGGGAAGTACAGAGCACTTTAAAAAGATTGATTTAATTATGGAAGCAATCTCTTATAATGCTATTAAAGCTTCATCTGAACTTGCAGTAGAAAAAGGTATTTATCCTACATTTGAGGGTTCTAACTGGTCAAAAGGAATTATGCCTCATGACCATGCACCTCAAGCTGTAAATGCACTTGTAGATAAAGATTTATTTGATACTTCTTATGATTGGGATGCTCTAAGAGAGCAAGTAAAAGCAAATGGTATGAGAAATGGTTACTTAATGGCTATTGCTCCTACTTCATCTATTTCAATTCTTGTGGGAACAACACAAGCTATTGAACCAGTATATAAAAGAAAATGGTTTGAAGAGAACTTATCAGGACTTATTCCTGTTGTTGTACCAAATCTTAGCCCTGAAACTTGGGTTTATTATAAACCAGCATATGAAGTAGATCAAATTGATATTATTAAAGCTGCTGCTGTTAGACAAAAATGGATAGACCAAGGGCAAAGTACAAATATCTTTATGAGTTTAGAAAAAGCAAGTGGTAGATATTTACATGAAATTTATACTACTGCTTGGAAGCTAGGACTTAAATCAACTTATTATTTAAGATCTCAATCTCCTGAAGCTTCAAATGATGTTGAGGACAGAAGTATGGAGTGTGCAGGTTGTCAATAAGATAACCTTACACTTTTTGTATACAAAAGTCTAAGATTAAAATATAAAATGTTAAAAACATAGAGGAAAGATAAAAGTGGGAAGAAAAACGATATATAATCCAGATTCTAAAGAAACACTTAACGAAAGAAGAATTTTTGGTGGAAATCCTGATGGGATGATTAACTTCACTAAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP031217|27428:36836|34502_36836_-|AXH11074.1|DBSCAN-SWA MTFIILFVTSVTVIIGYSSFIYWNLSSQHERAINLSKTVGDVLSQDIAKLILLKDIAIAADITSGLKSFDNLNSMVLYKLDGEPIFQYSKDDKSFEVKELQTDFKNENNFNKSIFKLFIHADYQDTHLGYIELNFKVDTIWDMIKRDIFILFVFSIALLVFSFLLANFFAKKFTQPILKLVNFLNKIDYIDSLKHKITTREDNEFGKLYDEVNYMLKRIENSQEAEKIAAAAFETKSGMVITNKDRIILQVNRAFCKITGYAKEEVIGKTPSILKSNVQNKSFYKKMRKTLEKYKYWSGELYNKHKDGTIYPEYLTIQTVLDDNGKVIYYVGSFIDLTLQKETEAKVEYLEQYDSLTGLANKKLLINNIQKYLDEEKQKNWGTILCLDLKDFKLINEAYGHSAGDSILQTITKKLKESFTEANLIARIGADEFIIWFSNIAQTKDKASIEAKSLAEFLITKISEPIYYENKAINPLPFIGIALYNNKALDANELFKEADTALHLAKKNEQHFSFFDEQAKNLAQTHLDTYSQLSKAIKRNQFELYYQLQYNHKNEIFGAEALIRWIHPTQGILSPDKFISIAEKTGLIIPITTWVIKNACMQLNIWQKEPKSSSWIIAINISAKEFSQDDFVDIVKKYIHMYEIKANRLKLELTESILVKDIDLVISKMTKLREIGVQISLDDFGTGYSSLQYLRNLPLNQVKIDRVFVNNILNNKNDVAIVKSILLLAESLNLEVVAEGVETKEHYKFLIELGCKLFQGFYLAKPSKIEDIDALIN >CP031217|27428:36836|33743_34115_+|AXH11073.1|DBSCAN-SWA MDRLISKEIRNDETDVLKLLTIYAKNQGSKSPEKLYMVYTKLVYKTLDIESGLRGHFTSSQLSIIATLEIMIAQTVIELMKENIHYKIIYQLVKKKLQQFVGLITVKEIYSTNKKLYSFNLAS >CP031217|27428:36836|28480_29824_+|AXH11070.1|DBSCAN-SWA MVERYAREEMSKHWTQHARYAAWLEVEKAAVKAWNKLGLIPDEDCKKIVNNATFSVERIEEIEAVTKHDLIAFNTSVAESLGKESRWFHYGMTSSDAVDTGVALQMRDSLKIIIDDVKMLMESIEKRAQEHKFTLMVGRSHGIHGEPITFGLTLAVWYDEVARHLKNLEETMEVISVGQISGAMGNFAHAPLELEELAMAELGLKPEPCSNQVVHRDRYARLATALALLASSVEKFAVQVRHLQRTEVYEAEEYFAKGQKGSSAMPHKRNPILTENITGLARTIRAYAAPAMENVALWHERDISHSSNERFWLPDAFITTDFMLHRMNNVIANLTVMPENMMKNLNLTGGLVFSQRVLLELPKAGVSREDAYRIVQRNAMKVWEEIQQGKPTVNENGESLYLGHLLADDELRAKLSEEQIRECFNYEYYTKNVDAIFNRVFLKESAK >CP031217|27428:36836|27428_28331_-|AXH11069.1|DBSCAN-SWA MPFILKKFSVAKGKKIQIALIQDLTLNPKISNRMLSRGRIFNSNKVAYKMSQIIEEDFIYIAVFEGHTRGLKPLVTFEDFAIFDKPSNLMIHPISKKTEYSLLDEIRFHLGEKANQAHRIDAETSGLVLVGKNEKVTNSLAIMFEKKEYKKSYLAIVRGKIEDEITIDKNLKKEGKAIGVKMATCSKEEGKESITMLKPLKYNEKRDLSLVEVTPITGRQHQIRIHLHSIGHTILGDPIYGIDDEIAEAYLNKTLSEEKRFEKSGSFRLWLQANYLEFSYKGIIYKIYSKNKEIYKEFDN >CP031217|27428:36836|29867_32252_+|AXH11071.1|DBSCAN-SWA MAIMIEKRNGRKEVLDITKIQKMTIDATKDLDGVSQSELELDAQIKFVDGMSSADIQDALIKTAVEKIDIDVPHWTFVAARLFLFDLYHRVGKVTHGIKGEPYCHLRDYLRYGKEAGRLIPSLGEGFDLDELNDYIDPDRDYLFNYLGIKTLYDRYLIKNRNGDPIELPQQMFMAIAMFLAQNEENKQEKAKEFYDVVSKFEVMLATPTLSNARTNRHQLSSCYIGSSPDNIEGIFDGYKEMALLSKYGGGIGWDWNQIRALGGMIDGHKSAAGGTVPFLKITNDIAIAVDQLGTRKGAIAVYVEPWHMDISDFIDLKKNSGEERRRAHDLFPSLWITDLFMERILADAHWTLFDPHEVKDLSELHGDAFKKRYEEYENDDSITKEKIKAKDLWKKILTSYFESGSPFLCFKDNANRANPNGHVGHIRSSNLCTEIFQNTNPNHYKIKLEFEDGTIETYEEEDIVLVDGGQEKRANKVTALDSINGKKVFIVEKEKIDGDTAVCNLASVNLSRIFTKEDIERVVPIAIRMLDNVIDLNFYPLRKVKATNLKSRSIGLGVMGESQMLAENKVMWGSTEHFKKIDLIMEAISYNAIKASSELAVEKGIYPTFEGSNWSKGIMPHDHAPQAVNALVDKDLFDTSYDWDALREQVKANGMRNGYLMAIAPTSSISILVGTTQAIEPVYKRKWFEENLSGLIPVVVPNLSPETWVYYKPAYEVDQIDIIKAAAVRQKWIDQGQSTNIFMSLEKASGRYLHEIYTTAWKLGLKSTYYLRSQSPEASNDVEDRSMECAGCQ >CP031217|27428:36836|32328_33348_+|AXH11072.1|DBSCAN-SWA MGRKTIYNPDSKETLNERRIFGGNPDGMINFTKMKYQWALNLWDTMEANTWFPKEVQMTGDAKDYKYLSPAEKRMYDLVLSQLIFMDSLQTNNLMDNINPYITVPEINACLSRQSYEEANHSKSYAVMVESISDNTDEIYDKWKTDEKLREKNNYIADVYHNLAGDITDEKIVLAMFANQILEGLYFYAGFAAMYALGKSGKMLGSSQMIRFIQRDEVTHLLLFQNMINSTRKERPDLFTPELEKTVRAMFRKAVDLEASWGGYITQGQILGFTDAIITQYIQYLADRRLEAVGYAPEYNVKHPIPWVDGYASFNDQRTNFFEGNVVNYSKGSIDFDDF |
6 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
524198 : 533803
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP031217|524198:533803|DBSCAN-SWA CATGAAGGAAAGTTCTATTGCAAGTAAAATTCTAAGTAGAATTTTAGTAGTTGCTGCATTTATCATTGTAATTGCTGCAGGAATCTCATACTATATTGTTATGGGAATGAAGAAAGATATTGAGCTTCAAACAAAAAATCATTTTGAACTTCTTATTCAAGAAAGAATCAAAGCAAAGCTTGATATAGGTATCTCAAATGCAGTTACAATCTCAAAAAACAGTGATATTATTGAAGCCCTAGAAACAAATAATAGAGAATTAGCAGTTGAAGCATTAGCTGGAATCTCTAGTGCAATGAAAAATGGAACCTCTTTCAAAAATGTAAAAATTCATATCCACGATAAAGATGTAAACTCATTTTTAAGAAATTGGAAGCCAGAAAAATTTGGTGATGAATTAAGCTCTTTTAGAAAAACTATCCTGGAAGTTAAAAATACTCAAAAACCTTTAGCTGCAATTGAAGTAGGGCGAGCAGGTTTAGTATTAAGAGGACTTTCTCCTATTTTTAGTAGTAGTGGAGAATATATTGGTTCTTTAGAATTTATTCAAGGTTTTAATTCTGTTGTTAAAGATTTTAAAGCAGAAGATGAATTTCTTTTAGTTTTAATGAATGAGAGTCTAAAAAGAGGAGATGCTTTAACAGAACAAAACAAAGTTGGTAAATATTATATCTCACAAAAAGAAGTTGATGAAAAGTTTAAGAATGCAGCAACTTCTTTAGATTTTAATGATTTATTAACTAAAGGATATTTTACTGATAGTTCGTATTTTTATTCAAGTTTCCCTATTAAAGATTTTCAAGGTAATGTAATTGGTCAATACTTAACAGGAGACCATATTAAACATGTAGATAATAGTTTCAATGAATCTGCAAATTTAGTTTATTTTATGCTTATAATGATGGTTATATTAACTTTAGTTTTAGTTAGTGTAACAGTAATTTTATTTAAGAAAATTGTAACGGGTGGATTAAATAAGTTTAAAAGTTCATTTGCTCATTTTTTAGATTTTATCTCATTTAAAACAAATACTTTTAAAAAACCAGCTGTTTATACAAATGATGAAGTTGGTCAAATGTTGACAATGTTAAATGAAACAGCAGATATTTTTGATAAAAAATTAAAAGATGATATGAAAGTAATTGGAGAGATTGTTCTTACTACAGATAAAGTAGAACAAGGTATTTATAAGTGTAGAATTCATGCAAGTTCTGATAATCCAATGATTGTTACTTTGAAAAATACTCTTAATAAAATGCTTGATGAAAATGAAAAAAATATGAGTGAAGTTGTGAGAACAGTAACTCACTTTGCAAATGATGATTATACAGATAAAGTAAATATCTCTCCAAAACTTCAAGATAAAATGTTAGAAGTTATGGAAAGTATAAATAAGCTAGGAGAGGCATTAGGGAGTAACGCAAGATTAAACTTAAATAATGGACAAACCTTAGAGAATAATTCAGCAACAATGACAGCCTCAATGAATAACCTAGCAGCAAAAGCGAATGAACAAGCAGCCTCATTAGAAGAGACAGCAGCAGCAGTAGAAGAGATTACTTCAATAACAAGAAATAATGCAGAGAATGCTACAAAAATGGCTGAGCTAGGAAAAACAGTAAGAACATCAGTAACAACAGGAGAAGAGTTAGCAAGCAAAACAGCAAGCTCAATGGATGAGATAAATGAAAAAGTAACTTCAATTAATGAAGCAATTACTGTTATTGATCAAATAGCCTTCCAAACAAATATTCTTTCACTTAATGCAGCAGTAGAAGCAGCAACAGCAGGAGAAGCAGGGAAAGGATTTGCAGTAGTAGCACAAGAAGTTAGAAATCTAGCAAATAGAAGTGCAGAAGCAGCAAGAGAAATAAAAGACTTAGTAGAAGATGCAAACCAAAAAGCAAATGATGGTAAAAAGATATCAGATGAGATGATAAACGGATATAAAGAATTAAATACACATATATCAGAAACAATCCATATCATAGAAGATGTGTCAAAAGCAAGTAAAGAACAGATGACAGGAATAGAACAAATAAATGATGCAGTAACAATGCTAGACCGAGTAACACAAGAGAACGCAAGTGAAGCGAATCAAGTAAAAGCAATAGCAGATGAAGTAGCAACAATGGCAAATGAACTAGTAAGTGACGCAAAAAGTAAAAAGTTTAACTAAAGGAAGAGATAGATGGCAGCAGGACAAGAGACAGTATTAGATGAATACGCATTCCTAGTTAGTGAGACAGATGCAAAAGGGATGATAAGATTTGCAAATGATGATTTTTGTAAAATAGCAGAATACTCACTAGAAGAGTTAGTAGGGAATCCGCATAGTATGGTAAGACACAAAGATATGCCAAAGAAAGCATTTAAAAGCTTGTGGGAGACAGTACAAAAAGGTGATACCTGGACAGGATATGTGAAGAATGCAACAAAAACAGGAGGGTATTATTGGGTATTTGCAACAGTATATCCATTTGAGAGTTGTGATGGAACAAAAGGATATTTATCTTGTAGAAGAAAACCATCAAGAGAAGAGATTTTAGCCGCTGAAAAACTTTATGCTCAGTGGAATTTAGAAGAAGGAAGGTAACATGGAAAAAAATAAAATGAATAAAGAAGAAATTGTAAATAATGCTAATACAAGTGAGTATATGACATTTGAACTTGGTAAAATGAAATATGCAATTGAATTACCAAAAATAAGAGAGATTTTAACTTATCCTGATTTAATTACTACTCTGCCAAATACAAAAAAATGGGTAAAAGGTTTAATCAATCTAAGAGGTGAAGTTGTTCCTATTTTAGATATTAGAATCAAATTTAAAACTGGTGAACCAATTTATAATGAGAGTACTGCTGTAATTGCAGTTATTACAGAAGATAAAAGAATGATTGGATTAGTAGTTGATAAAGTTGATGATGTACAAAGAATTGATATCTCGTCTTTAGCTCCTGTATCAGATATGGGGTCTGCAATTCCCTCTAAATATTTAAAAGGTTTTGTAAGATTAGAAAACAATCAAATGTTAGTAATTATGGATGTTGAATCTGTTGTTGATAAAGAAGAACTTCGATAGGTAGGTTTTCATGATGGAAGAAAAAATCAAAAAACTTAGGTCAATGAAACTTCTTTTTGTAGAAGATGAAGAGGATTTAATTGAAATAATATCTGATACATTAGATAAATTAGATAGTAATTATCTAACTGCAAAAAATGGGGAAGAAGCCTTAAAACTTGTAGAAGATAATCCTGATTTATCTATGATAATAACAGATATTAATATGCCCGTAATGAATGGCTTAGAGATGATTGAAGAGTTAAAAGCAAAAAATATTAATCTTCCAATAATTGTAATGTCAGCTCATACAGAATTAGAGTATATAAATAAAGCAAAAGAACTTGGTGTAAATGATTATTTACTAAAGCCTTTTGATTTTATTAAATTTATAAATTTAATTGTTGAATTGGATAAAAATAACTAATGTCTAATATTGATAAAAATCTTTTAAAAAGATTAAAGGTTTTATATGTGGAGGATGATGCTAGTGTTAGAAATGACCTAGTTAGTCTTTTATCAAATTTTTTTCAAAATGTTTTTTTTGCAGAAGATGGCAAAGAAGGACTTAGAGTCTATGAAGAAAATAAAGATGAAATCGATGTAATAATTGCAGATATCAATATGCCAAATTTAAATGGTATTGATATGGTAAAAAAAATTAGAGAAATAGACAAAGATGTTTTTGTACTTTTTGCAACTGCTTATTCAGATAATGAATTTCTTAGTGAAGCTATAAAGTTAAAGGTATTTGAATATGTAACTAAGCCTATTGATATAAGAAAGCTTATGAATATTTTAAATGATTTAGCACTTATGAAATATCAAGAATTTTTATTAGATCAGCAAACAAAAGAACTAAAAAAGTATAAAGATATTATCTATAATAATAATATTGTAATTAGAACTGATAGTGATTTTAAAATCAAATATGTAAATCCTCTTTTTTGTGATATTACAGGTTTTTCAAATGAAGAGTTACTTGATAAAGATATTGATACTCTTAGACATCCTGAAACAGATAAAAAAATCTATGAAAAAATAAAAATGATGGTTCCTGTTAATAAGCAATTTGAAGAGAGAGTTAAAAATATAAAAAAAGATGGAAGTTTTTATATTTCAAATACTTCTGTAGTTGCTGTTTTAAACGACTCTGGTGAGTTTGTTGGTTCTTTAATGATTCAAAAAGATGAGACACAAGAACTTACTAAAAGAAGAGAAGTTCAAACACATTTAATAAAAGACAAAGGTGAAATTTTTATTAAAGGTAAGGAAGCAAGTGCAGAATTACAATATGAAATAAATAGATTAAAATTTGAAATTGAAAAATTAGAAAAAGAGCTAAGAGTATCAAAATCAGATAAAGATAAATATATTTATAGTCTTGAAAAATATAGAGTAGAAAATAAAAAAGTAAAACTACAATATAAACAACTTAAAAATGAAACTGATATGATAGAAGAGAAACATACTCTTGTAAAAAAAGTAAATAAAGAGAATGCTGATTTAAAAATCGAAAATAAAATGTTAAGTACTAAGTTAGAAAATATTGAAACAAATCATGAAAAAGAGTGTAAACAAATAAAAGTAAATTATGAAGTTGAATTAGATGATTTAGAACAAGAACTTAATACTTTAAAAGAGAAACTTGAAAATGTAGAAAATGCAGAAGCTGTATCTCAAAAACTTTCATATTGGAAAGAGAAAGCAAAAGCTGAAGCAAAAAGAGTAGAAAGACTTGAAAAAGAGCTTTTAAATATAGCTCCAAAAGATGTTTTAGTTAGAATATTTGGAAGCTCTTAAAAAGCTTCCAAAATAAGATTATTTAATCTCAATAGAGATAATTTTTTGATCACTTAAAGGTTTATCACCTTGATATCTTCCTGAAGTAGGAACATTTTCTATTTTTTTAACAATATCCATACCACTTTTCACATA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP031217|524198:533803|530839_531703_+|AXH11553.1|DBSCAN-SWA MKKLLETFESHLLNNLPKSKTFHPHFEEALADMLKAGGKRFRPMLLLAVVKSRKPLLIANSLDVALGIEMLHTYSLVHDDLPAMDNADLRRGFQTLHKKYDEVTAILVGDALNTESFNKIVNASLHNDIKIELIKTLSSDGGIDGMIIGQAIDCHFENQKIELEQLEFLHINKTAKLIAGSLKMGATIAEYSDEIKDKLYSFGLDLGLLFQIQDDIIDETQTEEEAGKTTQNDEAKNSFVNLLGLQGAKEAADNLAKKCENQLEKFDETLKENLIELLSKYLFRHNS >CP031217|524198:533803|530136_530520_+|AXH11551.1|DBSCAN-SWA MTFDMLYSKIHRATVSDANLNYVGSITIDEDLMKAAKLRVGQKVEIVNVNNGERFATYVIKGKAGSKDMCLNGAAARKVEIGDKIIVISYASYTEEELENYLPTVVIVDEKNNIETITNELVGSDHV >CP031217|524198:533803|529080_529611_-|AXH11549.1|DBSCAN-SWA MKKIFLFLFSLVMFLEANNPIATIKTNQGDIEIELRADLAPKAVENFVTHSKNGYYNGTVFHRVIKGFMIQGGDPTATGRGGESIWGKPFKDEFSSKALFDKAGILAMANAGPNTNGSQFFITTVPTYWLNGRHTIFGYVKSGMDIVKKIENVPTSGRYQGDKPLSDQKIISIEIK >CP031217|524198:533803|529756_530116_+|AXH11550.1|DBSCAN-SWA MMPQMPQPTFYIFKCEQSAPPGMPKPSCVNEQTQDLFNYLAQSLMQKGIMGPVQAIRTSCLGRCQMGPVMMVEPGHYMYSNLSKEKIDKIVQEHIIGGTPVQEYLIPEQFWGEPINLAQ >CP031217|524198:533803|527293_527686_+|AXH11547.1|DBSCAN-SWA MEEKIKKLRSMKLLFVEDEEDLIEIISDTLDKLDSNYLTAKNGEEALKLVEDNPDLSMIITDINMPVMNGLEMIEELKAKNINLPIIVMSAHTELEYINKAKELGVNDYLLKPFDFIKFINLIVELDKNN >CP031217|524198:533803|524198_526376_+|AXH11544.1|DBSCAN-SWA MKESSIASKILSRILVVAAFIIVIAAGISYYIVMGMKKDIELQTKNHFELLIQERIKAKLDIGISNAVTISKNSDIIEALETNNRELAVEALAGISSAMKNGTSFKNVKIHIHDKDVNSFLRNWKPEKFGDELSSFRKTILEVKNTQKPLAAIEVGRAGLVLRGLSPIFSSSGEYIGSLEFIQGFNSVVKDFKAEDEFLLVLMNESLKRGDALTEQNKVGKYYISQKEVDEKFKNAATSLDFNDLLTKGYFTDSSYFYSSFPIKDFQGNVIGQYLTGDHIKHVDNSFNESANLVYFMLIMMVILTLVLVSVTVILFKKIVTGGLNKFKSSFAHFLDFISFKTNTFKKPAVYTNDEVGQMLTMLNETADIFDKKLKDDMKVIGEIVLTTDKVEQGIYKCRIHASSDNPMIVTLKNTLNKMLDENEKNMSEVVRTVTHFANDDYTDKVNISPKLQDKMLEVMESINKLGEALGSNARLNLNNGQTLENNSATMTASMNNLAAKANEQAASLEETAAAVEEITSITRNNAENATKMAELGKTVRTSVTTGEELASKTASSMDEINEKVTSINEAITVIDQIAFQTNILSLNAAVEAATAGEAGKGFAVVAQEVRNLANRSAEAAREIKDLVEDANQKANDGKKISDEMINGYKELNTHISETIHIIEDVSKASKEQMTGIEQINDAVTMLDRVTQENASEANQVKAIADEVATMANELVSDAKSKKFN >CP031217|524198:533803|526388_526793_+|AXH11545.1|DBSCAN-SWA MAAGQETVLDEYAFLVSETDAKGMIRFANDDFCKIAEYSLEELVGNPHSMVRHKDMPKKAFKSLWETVQKGDTWTGYVKNATKTGGYYWVFATVYPFESCDGTKGYLSCRRKPSREEILAAEKLYAQWNLEEGR >CP031217|524198:533803|530512_530836_+|AXH11552.1|DBSCAN-SWA MFDGIDLSKINLNDVMGQVQEMADKAKEENANRIFTAKAGGGMVEISINGNSEVIDLQIDDSLLEDKDSLQILLISCMNDVIKQSDENKKAMAMSMMGGFGSFGQKS >CP031217|524198:533803|526794_527280_+|AXH11546.1|DBSCAN-SWA MEKNKMNKEEIVNNANTSEYMTFELGKMKYAIELPKIREILTYPDLITTLPNTKKWVKGLINLRGEVVPILDIRIKFKTGEPIYNESTAVIAVITEDKRMIGLVVDKVDDVQRIDISSLAPVSDMGSAIPSKYLKGFVRLENNQMLVIMDVESVVDKEELR >CP031217|524198:533803|531818_532076_+|AXH11554.1|DBSCAN-SWA MNFKPLGKRVLAQRTEVEEKTASGIILVDSAKEKPNTAKVIAVGSEVSELKEGDIIVFEQYRGSELSLEGEDYLVLDIENIIGVM >CP031217|524198:533803|532171_533803_+|AXH11555.1|DBSCAN-SWA MAKEITFSDNARNKLFSGVEKLADAVKVTMGPRGRNVLLQKSFGAPTITKDGVSVAREIELADTLENMGAQLVKEVASKTADEAGDGTTTATVLAHSVFKEGLRNVTAGANPISLKRGMDKACEAILANLKASSKVIADKTEIEQVATISANSDKAIGSMIAEAMDKVGKDGVITVEEAKGISDELDVVEGMQFDRGYLSPYFVTNSEKMIAELENPFILLYDKKISSLKEMLPILESVNQSGRPLLIVAEDVDGEALATLVVNRLRGSLNIAAVKAPGFGDRRKAMLEDIAVLTGGTVISEEMGMKLETAEFSCLGTAARVVIDKDNTTIVDGTGSAEMVQNRVNQIKAEIENTTSDYDREKLQERLAKLSGGVAVIKVGAATETEMKEKKDRVDDALSATRAAVEEGIVIGGGAALIRAAAKVNLELEGDEQIGADIVLRAIKAPMKQIATNAGFDAGVVVNEVEKSDNENFGFNAATGEYVDMFEAGIVDPAKVERVAMQNAVSVASLLLTTEATVTDIKEDKAGPAMPDMGGMGMPGMM >CP031217|524198:533803|527685_529062_+|AXH11548.1|DBSCAN-SWA MSNIDKNLLKRLKVLYVEDDASVRNDLVSLLSNFFQNVFFAEDGKEGLRVYEENKDEIDVIIADINMPNLNGIDMVKKIREIDKDVFVLFATAYSDNEFLSEAIKLKVFEYVTKPIDIRKLMNILNDLALMKYQEFLLDQQTKELKKYKDIIYNNNIVIRTDSDFKIKYVNPLFCDITGFSNEELLDKDIDTLRHPETDKKIYEKIKMMVPVNKQFEERVKNIKKDGSFYISNTSVVAVLNDSGEFVGSLMIQKDETQELTKRREVQTHLIKDKGEIFIKGKEASAELQYEINRLKFEIEKLEKELRVSKSDKDKYIYSLEKYRVENKKVKLQYKQLKNETDMIEEKHTLVKKVNKENADLKIENKMLSTKLENIETNHEKECKQIKVNYEVELDDLEQELNTLKEKLENVENAEAVSQKLSYWKEKAKAEAKRVERLEKELLNIAPKDVLVRIFGSS |
12 | uncultured_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2220168 : 2227102
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP031217|2220168:2227102|DBSCAN-SWA TATGAATAAAACTATTAAAAAAGCAGTTTGTATTCTAAGTGGAGGGATGGATTCTACTTTAGCTTCATATATGGCAAAAAATGAAGGATATGAGATAATTGCTGTTCACTTTAATTATGGTCAAAGAACAGAAAAAAGAGAGTTACAAGCTTTTAGAGATATTTGTGCTGACCTACAAATAAAAGAAAAATATGAAATTGATATACCTTTTTTTACTCAAATTGGAGCAAGTGCATTAACTGATTCATCAATTGATGTACCAACAAATGGTGTAGAAGAAGGTGTTCCAGTTACTTATGTTCCTTTTAGAAATGGTATCTTTCTTTCAATTGCAAGTGCAATTGCAGAAAAAGAAGAAGCAAATGCTTTATTTATTGGAGTTGTAGAAGAGGATAGTTCAGGTTATCCTGATTGTACTGATGAATTTATCTCTAAAATGACAAATGCCATAAATCAAGGAACAAAAGAGTCAACTAAGATAGAGATTAAAACTCCCCTTGTACATTTAATGAAAAATGAGATTGTTGAAAAATCTTTAGAATTAAATGTTCCTCTGGAGCATACTTGGTCTTGCTATAAAGAAGAGAGTGAAGCTTGTGGAGTTTGTGACTCATGTAGATTAAGATTAAATGGTTTCAAAAAAGCGAATGCTACAGATCCAATAAAGTATAAGGAATAAGTTTTGACTTGGAAAATTTCAAAATCTTTTGATTTTTGTTATGGACATAGAGTTTGGTCTCAAACTTTAAATAGTGAATACTCTTTAGACCCTTGTTTAAAGTGTAGACATTTACATGGACATCAAGGACAAATTGTTATCTTTTTAGAAGCAAATGAGTTAAAAGATGGGATGGTAACAGATTTTAAACACTTAAACTGGTTCAAACAATTTTTAGATGATGTACTAGACCATAAATTTATTATCGATATAAATGATCCTCTTTACCCTACTTTACTTCCACATTTTAAAAAAGAAGATTTAATCTACTTTGAACAAGGTTATTATATTCCTGATATGAATAAAATCAAAGAAGAAGCACTTCATATTAAAGAGATGTATGAAGGATATGTAATAGTTGATTTTGTACCTACAAGTGAAAATCTATCTGCTTGGTTTTTAAAAATTGCAAGTGAAAAGATGAAAAATCTTGGTATAAAAGTTTCAAGTGTAGAGTTTGCAGAAACTCCAAAAAGTAAAAGCCATGTCTTTGCTTGAAGTAAATGAGATATTTGGGCCAACAATTCAAGGAGAAGGAAAATTAGTTGGTACTCCCTCTATTTTTATAAGACTGGGTAAATGTAACTTTAAATGTGAAGGTTTTAATGTAGAGTATGAAACTCCTAGTGGGATAAAAAAATGCTCTTGTGACTCATATTATGCAGTTGATATGGCATTTAAAGAGCAGTGGCAACAAATGAATGCACAGCAGATTATAAAAGAGGTTTTACTCCTTGAACCAAACTATAAAATTGATATTGTTATCACTGGGGGAGAGCCACTTTTATATTGGAAAAATGAAGAGTTTCAAAAACTTTTAAAACACTATATTGAGAATAATTATAAAGTAACTATTGAAACAAATGGGTCATTAAATATTGATTTAACAGAAACTTATCAGAAACAAATTCTATTTTCAATGAGTGTAAAACTATCAAACTCTTTAGAACCACTAAAGAAAAGAGTTAATGTAAATACTCTAACAAAAATCATAACTGAAACAGAGGGTTCATACTTAAAATTTGTTATAGATGAAGGCTTTAAAGAAGAAGCAAATATAGAGATACAAAATATTCTTTCTTCTATACCAAAAGTTGATGTTTTCCTTATGCCAATGGGTGATACAGCGGAACAAATAAATAAAAATAGTGAAGCAGTAATTAACTTAGCTATTGAAAATGGATATAAATATTGTGATAGATTGCATATTAGAGTTTGGGACAATAAAAGAGGTGTTTAACAAACTTTAGATATAATATATGCTTTAACATGAATTTAATGTGTTATTTCATTAAAGAAATAAAATACTAAGGTTTCTACAAAGAAACTATTTTAAGGACTAATTGAATGAAATTTAGTGGATCAAATGTACTAGTAACTGGTGCAAGTAGAGGAATAGGTGCTGAAATTGCAAAAACTCTAGCTTCTTATGGTTTAAAAGTTTGGATTAACTATAGAAGCGGTGCTGAAGCTGCAGAAAAAATTAAAGAAGAGATTGAAGCAGCTGGTGGAACTGCTGCGATTGTTAAAGCTGATGTAACAAAAGAAGATGAATTTACTGCTGCTATTAAAACTATTGTTGATGCTGATGGAGAACTTTCTTATTTAGTAAACAATGCTGGTATTACAAAAGATAAATTAGCACTAAGAATGTCAGTTGAAGATTTTAATGATGTAATTGCTGCTAACTTAACATCTGCATTTATTGGATGTAAGGGTGCTTTAAAAGTTATGGGTAAAAAGAAGTTTGGTTCTATTGTAAATATCTCTTCAATTGTTGGAGAAATGGGAAATCCAGGTCAAACAAACTATTCTGCTTCTAAAGGTGGCTTAAATGCAATGACTAAATCATTTGCTAAAGAAGCAGCAGCTAGAGGAATTAGATATAATGCTGTTACTCCTGGTTTTATTCAAACAGATATGACTGATGAATTAAAAGAGGAAGTTAAAGCAGAATATGAGAGAAATATCCCTCTTAGTAGATTTGGTCAACCTAAAGAAATTGCGGACGCAGTAGCATTTTTATTGAGTGATCATTCATCGTATATTACGGGTGAAATACTAAAAGTAAATGGTGGATTATACGTTTAAAAAAGATTTATTAAATCTTTTTATGGTATAATTTGGCGATAATTTTAAAAAAGGAAAAGAATATGGCATTATTTGATGATGTAAAAGAAGTAGTAGTTGAGCAACTTGATTGTGATCCTGCAGAAGTTAAGGAAGAGTCTAAATTTATTGAAGATTTAGGTGCTGACTCACTAGACGTTGTTGAATTAGTTATGGCGTTAGAAGAGAAATTCGATATCGAAATTCCAGACGAAGATGCAGAAGGTATCTTAACTGTTGCTGATGCTATTAAATACATCGAAGATAACGCGTAATTTCTACGCTATTCTTATAGTATAAGCCAGTATTCTATACTGGCTTTTTTTTAATAAAAATTATTTGAATTGTTGAATTTTTAATATTTATTTTAAGAATTGAATTATTTAAATACTTAATTTTGGAGCATATTTAATGAGAAGAGTTGTTATAACAGGTTTAGGAACAATCAATTCAGTAGGACATAACGTAGAGGATTCATTCAATGCCGTTTTAGATGGTAAATGTGGTGTAAATAATATCACTCTATTTGATGCTAGTGAATATTCTGTGCAGTTTGCAGCAGAAGTTAAAGATTTTGATCCTACAACTGTAATGGATAAAAAAGAAGTAAAAAAAGCTGATAGATTCATTCAATTAGGAATCAAAGCAGCAAATGAAGCTATGAATGATGCAGGATACATCAATGCAGAGAATAAAAGAGTTGATGAATCAATTTGTGAAAGATTTGGAGTTATCTCAGCTTCAGGAATTGGTGGATTAGCAACAATTGAAAAAAACTCTGTTACTTGTGAAATAAAAGGACCAAAAAGAATTTCTCCTTTCTTTATTCCTTCATCATTAGTTAATATGTTAGGTGGATTTATCTCAATTGAGCATGGATTAAAAGGTCCTTCATTATCTCACGTAACAGCTTGTGCAGCTTCAACACACGCTTTAGCAGATGCAGTAAAAACTATTGCTACAAATGGTGCAGATAGAGTTTTAGTTGTTGGTGCAGAGAGTGCAATTTGTGGAGCAGGAATCGGTGGATTTGCTGCAATGAAAGCATTATCTACAAGAAATGATAGTCCGCAAACTGCTTCAAGACCATTTGATAAAGACAGAGATGGTTTTGTTATGGGAGAAGGTGCTGGAGCACTTGTTCTTGAAACATTAGAATCAGCACAAGCAAGAGGAGCAAGAATCTATTGTGAAGTAATTGGTTTTGGTGAGTCAGGTGATGCTAACCATATTACAGCACCAGTTATTGATGGTCCATTAAGAGCAATGAAAGCAGCACTTGCAATGGCAAAAGCTAATACAAATGAAGATATTAAAATTGATTATATCAATGCACACGGTACATCAACTCCTGTTGGAGATGTTAATGAATCAAAAGCAATCGTTGAATTATTTAATGGTCTTGAAAACTGTCCTCCTGTAACTTCTACAAAAGGTCAAGTTGGTCACTGTTTAGGTGCAGCTGGTGCGATTGAAGCAATTTTTACAATTAAAGCATTAACAGAAGGAATTATTCCTCCAACAATTAATATTGAAAACCAAGATGAAGAGTGTAAATTAGATTACGTTCCAAATACTCCTAGAAAAGTAGAATTAAATACTGTAATGAGTAATAACTTTGGTTTTGGTGGAACTAACGGTTCTGTAATTTTTAGAAAATTAAAAGACTAAGACTAGAGTTTAAACTCTTTTTTAAAAAGGAATAATATTTGGCAACTTATTTAGATTTTGAAGACAAAATAAAAAAAATTGAAGAAGATATCACAGTTGCAAAAACAAGAAATGATGAACATGCAGTAGAGATACTAGAAAAGAAGTTAGAAAAAGAGGTTGAAAAAACATTTAAAAACCTTAGTGATTATCAAAAACTTCAATTAGCTAGACACCCTGATAGACCATATGCGATGGATTATATCAAGGGATTAATGACTGATTATTACGAAATTCATGGGGATAGACATTATGATGATGACCATGCAATTGTATGTTTCCTTGGTTACATTGGAAATGAAAAAGTTGTAGTAATTGGAGAACAAAAAGGAAGAGGAACTAAAGATAAGTTAAAAAGAAACTTTGGTATGCCCTCTCCTGAAGGTTATAGAAAAGCTTTAAGAGCAGCAAGATTAGCTGAAAAGTTTAACTTACCGATTCTTATGCTTGTTGACACTCCAGGTGCATATCCTGGAATTGGTGCAGAAGAGAGAAATCAAAGTGAAGCAATTGCCAAAAACTTATATGAATTTTCTGAACTTAAAACTCCAACTGTTTCAGTTGTAATTGGAGAAGGTGGTTCAGGTGGAGCTTTAGCTATTTCAGTGGCAGATAAATTAGCAATGATGAGATACTCTGTTTATGCAGTAATCTCTCCTGAAGGTTGTTCTGCTATTTTATGGAATGACCCTGCTAAAGTTGAAACTGCTGCAAATGCACTTAAAATTACTGCTGAATCATTAGAAGAATTAGGTCTAATTGATGATGTAGTAAATGAGCCGTTAATTGGTGCTCATAGAAAAAAAGAAGAAGCAATCAAAGCTTTAGGTGACTATTTTTTAACTTCATTAGCTGAATTAAAACAATTAACACCTGCGCAAAGATATGAAAAGAAATATGAAAAACTTATGAACTTAGGAAAGTTCGAAGAGAAATAAAAAAAGGATAAGAAGTTGTAGAAACTCTACAACTTTTTAATCTCTTACTAATCTACCAACTGGTTCTCCACCAATCATATGAAAATGTAAATGATGTACTTCTTGTCCACCATCATCTCCAATATTAGTAATTAATCTATATCCACTCTCTCTAATACCTAATTTAGAAGCAACTTTATGCATAAATTCTGTCATTGCCGCCATAATTTTTGGAGGAACAACATCAAATGAATCATAGTGCTCTTTAGGGATAATTAAAACATGAATTTTTCTAGCTGGATTAATATCATTAAATGCTAAAAAGTTTTCATCTTCTAAGATAGTTTGATTAGGGATTTCACCTTTAACTATTTTGCAAAAAATACACATATATTCACCTTTTTTAGTTTGGAAAATATTATAACCAAACTCTAATAAATTTTAAAGTATAATCCATACCTTTATAAATAAACAACAGGAGAATAAAAGTGAAAGAATGGCTTGATAAAATAGATAATGCTGATTCACTTGAAGTTCTAGAGAATTTAAGAATTGAAACTTTAGGTAAAAAAGGTATTATCCCTGCAGAATTTGCAAAAATGAAAGATGTTCCAGGGCCAGAAAAGAAAGCTTTTGCTGAAAATTTAAATAAGCAAAAAACAGAAATTACAGAGGCTCTAGAAAATAAAAAAGAGATTTTAGAAAAGCAAGCTCTTGAGGTAAAACTACAAGAAGAGACTATTGACGTTACAAAGTTTAATAATGAATTAACATGTGGTGCAGCTCACCCAGTTGCTTTAACAATGGACAGAATTATTACATATTTTCAAAACCTTAACTTTGCAGTTGAAGAAGGTCCATTAGTAGAAGATGATTTTCATAACTTTGAAGCATTAAATCTTCCTAAACACCACCCAGCAAGAGATATGCAAGATACATTCTATAATAAAGATTATACTCTATTAAGAACGCACACTTCTCCTGTACAAATTAGAACAATGTTAAGTCAGCAAACACCTATTAGGATGATTGCTCCAGGTACTGTATTTAGAAGAGATTTTGATTTAACTCATACTCCAATGTTCCATCAAGTTGAAGCATTAGTAGTTGATGAAGCAGATAAAGTTTCTTTTGCAAACTTAAAACATGTATTAGTAGAATTTTTACATCATATGTTTGGAGATGTTGAAGTTAGATTTAGACCTTCATTTTTCCCATTTACAGAACCATCAGCAGAAGTAGATATTTCATGTGTATTCTGTAAAGGTGATGGATGTAGAGTTTGTTCACAAACAGGTTGGTTAGAAGTACTTGGTTGTGGTGTTGTTGACCAAAATGTATTCAAAGCAGTAGGATATGAAAATAAATCAGGATATGCTTTTGGATTAGGTGTTGAAAGATTTGCAATGCTAATTCATAATATTGGTGATTTAAGATCTCTTTTTGAGAGTGATTTAAGATTATTAGGACAGTTCAAATGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP031217|2220168:2227102|2226109_2227102_+|AXH13188.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKEWLDKIDNADSLEVLENLRIETLGKKGIIPAEFAKMKDVPGPEKKAFAENLNKQKTEITEALENKKEILEKQALEVKLQEETIDVTKFNNELTCGAAHPVALTMDRIITYFQNLNFAVEEGPLVEDDFHNFEALNLPKHHPARDMQDTFYNKDYTLLRTHTSPVQIRTMLSQQTPIRMIAPGTVFRRDFDLTHTPMFHQVEALVVDEADKVSFANLKHVLVEFLHHMFGDVEVRFRPSFFPFTEPSAEVDISCVFCKGDGCRVCSQTGWLEVLGCGVVDQNVFKAVGYENKSGYAFGLGVERFAMLIHNIGDLRSLFESDLRLLGQFK >CP031217|2220168:2227102|2220849_2221383_+|AXH13181.1|DBSCAN-SWA MTWKISKSFDFCYGHRVWSQTLNSEYSLDPCLKCRHLHGHQGQIVIFLEANELKDGMVTDFKHLNWFKQFLDDVLDHKFIIDINDPLYPTLLPHFKKEDLIYFEQGYYIPDMNKIKEEALHIKEMYEGYVIVDFVPTSENLSAWFLKIASEKMKNLGIKVSSVEFAETPKSKSHVFA >CP031217|2220168:2227102|2225678_2226011_-|AXH13187.1|DBSCAN-SWA MCIFCKIVKGEIPNQTILEDENFLAFNDINPARKIHVLIIPKEHYDSFDVVPPKIMAAMTEFMHKVASKLGIRESGYRLITNIGDDGGQEVHHLHFHMIGGEPVGRLVRD >CP031217|2220168:2227102|2222232_2222976_+|AXH13183.1|DBSCAN-SWA MKFSGSNVLVTGASRGIGAEIAKTLASYGLKVWINYRSGAEAAEKIKEEIEAAGGTAAIVKADVTKEDEFTAAIKTIVDADGELSYLVNNAGITKDKLALRMSVEDFNDVIAANLTSAFIGCKGALKVMGKKKFGSIVNISSIVGEMGNPGQTNYSASKGGLNAMTKSFAKEAAARGIRYNAVTPGFIQTDMTDELKEEVKAEYERNIPLSRFGQPKEIADAVAFLLSDHSSYITGEILKVNGGLYV >CP031217|2220168:2227102|2223405_2224665_+|AXH13185.1|DBSCAN-SWA MRRVVITGLGTINSVGHNVEDSFNAVLDGKCGVNNITLFDASEYSVQFAAEVKDFDPTTVMDKKEVKKADRFIQLGIKAANEAMNDAGYINAENKRVDESICERFGVISASGIGGLATIEKNSVTCEIKGPKRISPFFIPSSLVNMLGGFISIEHGLKGPSLSHVTACAASTHALADAVKTIATNGADRVLVVGAESAICGAGIGGFAAMKALSTRNDSPQTASRPFDKDRDGFVMGEGAGALVLETLESAQARGARIYCEVIGFGESGDANHITAPVIDGPLRAMKAALAMAKANTNEDIKIDYINAHGTSTPVGDVNESKAIVELFNGLENCPPVTSTKGQVGHCLGAAGAIEAIFTIKALTEGIIPPTINIENQDEECKLDYVPNTPRKVELNTVMSNNFGFGGTNGSVIFRKLKD >CP031217|2220168:2227102|2221369_2222125_+|AXH13182.1|DBSCAN-SWA MSLLEVNEIFGPTIQGEGKLVGTPSIFIRLGKCNFKCEGFNVEYETPSGIKKCSCDSYYAVDMAFKEQWQQMNAQQIIKEVLLLEPNYKIDIVITGGEPLLYWKNEEFQKLLKHYIENNYKVTIETNGSLNIDLTETYQKQILFSMSVKLSNSLEPLKKRVNVNTLTKIITETEGSYLKFVIDEGFKEEANIEIQNILSSIPKVDVFLMPMGDTAEQINKNSEAVINLAIENGYKYCDRLHIRVWDNKRGV >CP031217|2220168:2227102|2224703_2225642_+|AXH13186.1|DBSCAN-SWA MATYLDFEDKIKKIEEDITVAKTRNDEHAVEILEKKLEKEVEKTFKNLSDYQKLQLARHPDRPYAMDYIKGLMTDYYEIHGDRHYDDDHAIVCFLGYIGNEKVVVIGEQKGRGTKDKLKRNFGMPSPEGYRKALRAARLAEKFNLPILMLVDTPGAYPGIGAEERNQSEAIAKNLYEFSELKTPTVSVVIGEGGSGGALAISVADKLAMMRYSVYAVISPEGCSAILWNDPAKVETAANALKITAESLEELGLIDDVVNEPLIGAHRKKEEAIKALGDYFLTSLAELKQLTPAQRYEKKYEKLMNLGKFEEK >CP031217|2220168:2227102|2220168_2220846_+|AXH13180.1|DBSCAN-SWA MNKTIKKAVCILSGGMDSTLASYMAKNEGYEIIAVHFNYGQRTEKRELQAFRDICADLQIKEKYEIDIPFFTQIGASALTDSSIDVPTNGVEEGVPVTYVPFRNGIFLSIASAIAEKEEANALFIGVVEEDSSGYPDCTDEFISKMTNAINQGTKESTKIEIKTPLVHLMKNEIVEKSLELNVPLEHTWSCYKEESEACGVCDSCRLRLNGFKKANATDPIKYKE >CP031217|2220168:2227102|2223038_2223269_+|AXH13184.1|DBSCAN-SWA MALFDDVKEVVVEQLDCDPAEVKEESKFIEDLGADSLDVVELVMALEEKFDIEIPDEDAEGILTVADAIKYIEDNA |
9 | Campylobacter_virus(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2265536 : 2275446
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP031217|2265536:2275446|DBSCAN-SWA TTTAATACTTTAGTCCCTCTTTTAATAAAGCTTTTCTTATCTTTGAAATTTGTTCATGCTTATTTTTACACCACATAGGAGCTAATAAAGTACTATCATCAATTCCTGCTGTGATTCTTTGAATAGAGATATTATCAGGTAATCTTTTTATTGACTCAACTACTGTTTGAATATATAACTCTTCTGAGATAGGAGTAAAACTACCTCTTTTATAATCTTTTGTAAGAAGTGTATTTTTAACCACATATAAAGGGTGGAATTTAATAGAATCTACATTTAAAGCAATTGTTTCATCTAAAGTATTTAACATCATCTCTTTATTTTCATCAGGTAAACCATAAATTAAATGTCCGCAAACATTTAATCCTTTTTCTTTAGTCTTTTTAATCCAATACCTCATATTAGAAGCATCATCTCCTCTATTAATCTTTACTAAGGTTTCATCATAAAAAGATTGTATTCCATACTCAACCCAAATCTCTTTATCTTTACTAAGGTTTACTAAAAAATCTAATATCTCTTCCGTCATACAATCCGTTCTTGTACCAATAGAAAGACCAATTACATTTTCAAAAGATAGAGCTTTTGTATATAGAGCTTTTAATGTCTCCAATGGAGCATAAGTATTTGTAAAAGATTGAAAATAAACAATATATTTTTTTACCCCAAATTTATTTTTCAATCTATCTCTTGTAGCATTAAATTGTAGCTCAAGTTGTTTTAGTTGATTATCTAAAAAAGGGTTCTCTTTTACTGTTGGATTTAATTTAAATTTAGGTTTTCTCTCAGTTAGATTAGGAGAGAAGGAGTCATTTTCACAAAAGGTGCAACCACCTTTTGCTACTGTTCCATCAATGTTTGGACAAGTAAAACCACCTATTGAAATAGGTACTTTATATACCTTGTGTCCAAACTTATTTTTGAAGTATCTTCCTATTGTTAGAACTTCTTTATTTTTATATTTAATTTTTTTATTATTTTTATTTTGTAACGAAATAGTCACCATCAAAGCTTTCTAGGGCATAATTAGCATCATTACCTATTGATTCTTTTAAATCTTCAATAGATAAATACTCTAATGTATCTGCCTCAATATATTCACAAATTTCATCTTTTGTCATTCTTGAAGAGATTAATTCCTCTTGGTTAGGAGTATCAATTCCATAATAACAAGGGAACTTAATTTCTGGACTTGCCACTCTAAAGTGAACTTCCTTTGCTCCCGCTTCTTTTAACATTTTTACAATTCTTTTAGAAGTTGTACCTCTAACAATTGAATCATCAATTACTAATAATGATTTACCATCAATTAAAGATCTCATTGGTGAAAGTTTCATTTTAACTTTCATATTTCTCATCTCTTGTGTTGGTTCAATAAATGTTCTTCCAACATAGTGGTTTCTAATAATCCCATATTCAAAAGGAATTCCACTCTCCGCTGCATAACCAAGGGCAGCTGGAACTCCTGAATCAGGAACAGGAACAACCATATCAACTTTTACAGGATCTTTTTTATCATTTTTAGCAAGAGCTCTTCCCATATTCTCTCTTGTTCTATATACATTTTTACCATTTATTACAGAATCTGGTCTTGCAAAATATACATATTCAAAAGCACAAGGTCTATATTCTGGTTCAAATAACTGAATTGATTCTGGCTCATCATAACCATCTGCAAAAATCAACATTTCTCCTGGTTTTACATCTCTAATGAATTCAGCATCTACTAAATCAAAAGCACAAGTCTCACTTGCAACAATATATCCACCAGTTTTTAATTTTCCTAAAGATAAAGGTCTAATTCCATATCTATCTCTAATTACAAACTGTTTAGATCTAGATTGAATAATAAAACAATATGCACCTATTGTTTTATTAAGTCCCTCTTTAATTCTATCTCTTAATCTTTCATGGCTACTTTTTGCAATTAGATGGATTAAGTTTTCTGTATCCATTTCTGTTTGAAAAATTGCACCTTCTTCTATTAACTCTTGTCTAACCTCATTTTTATTAATAAGGTTTCCATTATGAACAATAGACATTTCCCCCAATTTATACTTAGCAGAAACTGGTTGTGCATCAAAAATAGACTCTCCACCCGCAGTAGAGTATCTATTATGACCAATAGCCATATTACCTTTTAGGTAAGTTAAAGCATCCTCAGTAAATACTTCAGAAACTAATCCACTATCTTTTTTAGTATAAATTTTTCCATCACAAGATGATGAGATTCCAGTTGCTTCTTGCCCTCTATGTTGCATAGAGAATAGAGCTAAAGAAGCAAGTCTAGCGGCATTTTCATTACCATAGATTCCAACTATCGCACACATTTATTTAACCTTTAAAAAAAAATGAAAAGTGAACTTGAGTGCTGAAATTTCTTTTCATTTTTAATATTAATTTATTTTTTATTTTATAGACCTAAACAGTCATTAATTGAATAAAGCCCTGGCTCTTGATTTACAAGCCATTTTGCAGCTCTAATTGCACCTTTTGAAAAAGTATTTCTTGCAGTTGCAGTATGATGTAACTCAATAAACTCACCGTCATTGTATAATCCAACAGTATGTCTACCAACAATATCACCACCTCTTAAACTCATAACACCAATTTCATCTTTTGTTCTTGCACCAATTTCACCATCTCTACCAGATACTCTAACTGCATCTAAATCTAGGTCTCTTGCACGTGCTGCATGTTCTGCTAAAGTTAAAGCTGTTCCTGATGGAGAATCAACTTTATATCTATGGTGTTGTTCAACTATTTCACAATCAAAATCTCTTAATGCTTTACTTGCAAGTGATACTAATTTATTTAAAACTGCAACACCTAAACTCATATTTGTAGCATAAAGAACTGGTACTTTTTTTGAAGCTTCAAGTAATAAATTTTGTTGATGTTTATTAAAACCAGTTGTAGCAATTACCAATGGTTTAGTTCCACCATTTTCTACAATCTCTTCTAGTAGGCTTTGTGTAGCAACTGGAGCTGAAAAATCAATAACAACATCACAAGTGTCTACTAATACTTTCATATCATTTGTAACTACTGTATTTTCTGGAACACTTTTTGTTAGCGTGTCAAAAACATGACAAGCTGATAACTTAGCTTCATTATCAACTGCTAAATCATCAATTAAAAGAGAACCTACTCTTCCTGTACTTCCTACAATTCCTACATTAATCATAAGATTTTCCTTTTATATTTTATAATTCAATAATATTAATTTAGCAACTCATATTATACTAGTTACTATTTTAAAAAGTTTAATAAAGGTGGTATAGTACTTAAAAAATATTAAGTATAAGGTTAATTAAATTTCATGCATAAAAAAAAGACAAGATTTCTCTTGCCTTTTTAGTTTTTTTAATTAGATTAAAGAGTTTAGCTTATCAGCAAAAGCTTGTTTTGAAGCTGCTCCAATCATTTGGTCTACAACTTCTCCATCTTTAATAAAAAGAATTGTAGGTACCGATCTAACTGCATATTTAACTGCTAAATCTTGTTGCTCATCTGTATTTACTTTACAAATATTAGCTTTACCTTCAAACTCTTCTGCTAACTGATCGATTACTGGAGCTAACATTCTACAAGGCCCACACCAAGGAGCCCAAAAATCAACTAAAGAAACACCACTATTTACTGTTGCTTCAAAATTATCTTGTGTTAAATCTATATATTTTCCCATTTTATTATCCTAAATATTCTATAATATCAACTGCTGCTGTTGCACCATCTGCTGCTGCACATACAACTTGTTTTGCTGCTTCAATTCTTACATCACCTGCTGCATAAAGACCTGGAACATTTGTTCTCATTTTAAGATCAACTACAACTTCAGTTTGCTCATTTACTTCACAAAGATATGAACCATCATCTTGTTTTAAAGCATCACTTAAAACATCTCTACCAACAAATACAAATACACCAGGTACATCTAATTGTCTTAACTCATCATTCTCTTTTGATTTAACAATTAAACCTGTTACTCCCATATTGTCACCAATAACTTCTTCTACAGTTACATTAGTTACTTCTTCAATATTTTCACAAGCTCTCATATGCTCAATTGTACTTGGAGCAGCTCTATATGTATCCCTTCTATGTACTAAATAAACTTTTGAACAAATTTTTGAAAGATATACCGCTTCTTCTAAAGCAGAATCTCCACCACCAATTACCGCTACTTCTTTATTTTTATAAAAAAATCCATCACAAGTTGCACAAGTTGAAATCCCTCTTCCAAAGAACTCTTTTTCACCTTTGAATCCACCTTTTTTAGGAACTGAACCTGTTGCTAAAAGTACAGCTCTTGCTTCTTGCTTTGAACCATCTGCTAATTCTACTTCAAAGTTATCACCAGCTTTTCTTACTTTTAAAACTTGTTGCATTTCATGTTTAAGTCCAAATCTCATCGCTTGTTCTGGCCATGTTTGCATTAAATCCATCCCAGATACAACTTTTTCTTGTCCTGGATAGTTTTCAATTTCACTACTTCCAGTAATTTGTCCACCTGGCATACCCATTTCAAACATTGTTACGTTTTTTAGTCCACCTCTAGTTGCATATAAACCAGCTGTTAAACCAGCAGGTCCTCCACCAATAATTGCTAAATCTAACATATATTATCCTTTTTGTGCATTTTATTTTGTACCAAATGAAATAACTACTTCTAGTATTTTAAGGTCGTAATAATACTATAGTTTTGTTAAGCATTCGTTTAACCTTTTCTTAGAAGATAATTTTTTTCCTTTAGTAAATTTTATCGTATTAAACCTTAATATTTCTAAGGCTTTGCTTTGACGAATAATTATTCATTTTTTTTTAACTAACTCTAAGGTATTATACAAGCTTTCAAATTTAAGGGGTATAAAATGGAAATATTAGAAAAGATGATATCTACCGCCTCAGATTTTGTATGGGGAGTACCAATGCTAGTTTTATTAGTTGGTACAGGACTATTTTTAACTATTAGATTAAAAGGTATGCAATTTTGGGCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP031217|2265536:2275446|2269227_2270157_-|AXH13230.1|DBSCAN-SWA MLDLAIIGGGPAGLTAGLYATRGGLKNVTMFEMGMPGGQITGSSEIENYPGQEKVVSGMDLMQTWPEQAMRFGLKHEMQQVLKVRKAGDNFEVELADGSKQEARAVLLATGSVPKKGGFKGEKEFFGRGISTCATCDGFFYKNKEVAVIGGGDSALEEAVYLSKICSKVYLVHRRDTYRAAPSTIEHMRACENIEEVTNVTVEEVIGDNMGVTGLIVKSKENDELRQLDVPGVFVFVGRDVLSDALKQDDGSYLCEVNEQTEVVVDLKMRTNVPGLYAAGDVRIEAAKQVVCAAADGATAAVDIIEYLG >CP031217|2265536:2275446|2266515_2267865_-|AXH13227.1|DBSCAN-SWA MCAIVGIYGNENAARLASLALFSMQHRGQEATGISSSCDGKIYTKKDSGLVSEVFTEDALTYLKGNMAIGHNRYSTAGGESIFDAQPVSAKYKLGEMSIVHNGNLINKNEVRQELIEEGAIFQTEMDTENLIHLIAKSSHERLRDRIKEGLNKTIGAYCFIIQSRSKQFVIRDRYGIRPLSLGKLKTGGYIVASETCAFDLVDAEFIRDVKPGEMLIFADGYDEPESIQLFEPEYRPCAFEYVYFARPDSVINGKNVYRTRENMGRALAKNDKKDPVKVDMVVPVPDSGVPAALGYAAESGIPFEYGIIRNHYVGRTFIEPTQEMRNMKVKMKLSPMRSLIDGKSLLVIDDSIVRGTTSKRIVKMLKEAGAKEVHFRVASPEIKFPCYYGIDTPNQEELISSRMTKDEICEYIEADTLEYLSIEDLKESIGNDANYALESFDGDYFVTK >CP031217|2265536:2275446|2267948_2268722_-|AXH13228.1|DBSCAN-SWA MINVGIVGSTGRVGSLLIDDLAVDNEAKLSACHVFDTLTKSVPENTVVTNDMKVLVDTCDVVIDFSAPVATQSLLEEIVENGGTKPLVIATTGFNKHQQNLLLEASKKVPVLYATNMSLGVAVLNKLVSLASKALRDFDCEIVEQHHRYKVDSPSGTALTLAEHAARARDLDLDAVRVSGRDGEIGARTKDEIGVMSLRGGDIVGRHTVGLYNDGEFIELHHTATARNTFSKGAIRAAKWLVNQEPGLYSINDCLGL >CP031217|2265536:2275446|2272443_2272761_-|AXH13233.1|DBSCAN-SWA MGKYIDLTPENFDATVNSGVSLVDFWAPWCGPCRMIAPVIEELAEDFEGKANICKVNTDEQQDLAVKYGIRSIPTILFMKDGEIVDQMVGASSKQALAEKINSLV >CP031217|2265536:2275446|2268905_2269223_-|AXH13229.1|DBSCAN-SWA MGKYIDLTQDNFEATVNSGVSLVDFWAPWCGPCRMLAPVIDQLAEEFEGKANICKVNTDEQQDLAVKYAVRSVPTILFIKDGEVVDQMIGAASKQAFADKLNSLI >CP031217|2265536:2275446|2271804_2272419_+|AXH13232.1|DBSCAN-SWA MKSKLFYIVLLLLLSKSIFAKEYDLSSIFTQNFDFKAEVLVVPANVKNSWTNETRVVEKNSSEIKVEDKDYENGNLKEIAYHWYDKNGIRIKYKSASKEYSIKNQNYKASFKNLELGDKGDLPTLYTTQGEMIKSNWELFKEKEELCLKILIKYISSNNLINESIEYNYYLNESGKIKSFIFNYYTGDKIFHLLKVESKEVNYK >CP031217|2265536:2275446|2265536_2266541_-|AXH13226.1|DBSCAN-SWA MVTISLQNKNNKKIKYKNKEVLTIGRYFKNKFGHKVYKVPISIGGFTCPNIDGTVAKGGCTFCENDSFSPNLTERKPKFKLNPTVKENPFLDNQLKQLELQFNATRDRLKNKFGVKKYIVYFQSFTNTYAPLETLKALYTKALSFENVIGLSIGTRTDCMTEEILDFLVNLSKDKEIWVEYGIQSFYDETLVKINRGDDASNMRYWIKKTKEKGLNVCGHLIYGLPDENKEMMLNTLDETIALNVDSIKFHPLYVVKNTLLTKDYKRGSFTPISEELYIQTVVESIKRLPDNISIQRITAGIDDSTLLAPMWCKNKHEQISKIRKALLKEGLKY >CP031217|2265536:2275446|2270409_2271750_+|AXH13231.1|DBSCAN-SWA MEILEKMISTASDFVWGVPMLVLLVGTGLFLTIRLKGMQFWALGHAVKLIFTKEKNADGDISHFQALMTALAATVGIGNIVGVATAITFGGPGAVFWMWVTGLVGMATKYSEAILAVKYREKGKNGFKGGPMYYLSKGLNMPKLAFLFALFTVLASFGIGNMTQSNAISNALFAQFETPNWVTGIILLTITSFVVIGGIKSIGKTTSFLIPFMIIIYLGTSLTIIFTNFDKVGDAFGMIFYYAFNPIAAGGGFAGAAVAAAIRYGIARGVFSNESGLGSAPIAAAAAKTNDPAKQALVSMTQTFIDTLVVCTMTALIILMAPVWQTGGSAGELTLKSFEYFLGDFGAIIIVLATVLFGYSTILGWSYYGERAFEYIFGEKSIKLYRIVFVSFIVVGAMIELKLVWNFSDLANGLMAIPNLIALLLLSKVVSEETNRYFKEKKLYKK >CP031217|2265536:2275446|2272878_2275446_+|AXH13234.1|tRNA|DBSCAN-SWA MDIRKEYLEFFKSKGHEVVSSMPLVPDDPTLMFTNAGMVQFKDIFTGAVPKPSNPTATSCQLCVRAGGKHNDLENVGYTARHHTLFEMLGNFSFGDYFKKEAIAYAWEFVTVNLALPTDKLWVTIHNDDDEAYELWKEHIDASRIKRFGDKDNFWSMGDTGPCGPCSEIFYDQGEEHFSSSEDYLGGDGDRFLEIWNLVFMQYEQTKNADGTITRTELPKPSIDTGMGLERVIAIKEGVFNNFDSSNFQPIIKKLEELAKKKADKETIGSFRVIADHLRANSFMLSQGILFGNEGRPYVNRRIMRRAVRHGYLLGFRKPFMAKLYDTLCDIMGSHYIELVEQKEYVKEQLTLEEERFFKTIESGMTLFNEELANTKDKFSGEVAFKLYDEKGFPLDLTQDMLRDRNLDVDVEKFDELMAEQKAKAKASWKGSGDTASEGDFKAILEKYGVNEFVGYKNITIKSKIIALLDENFKEVSTLEKGTKGWVMLDKTPFYATSGGQMGDIGALEDNEHIAIIEATEKFHGINLSKVKVEKSNICVGEEVNAIVANRGEVAKHHSATHLLQSALKMVLGDTVSQAGSLNDASRLRFDFTYPKAMTTEQIDEVEDLVNSMIARGLEGNIEELPIEEAKEKGAIAMFGEKYGDVVRVVSFGDVSVEFCGGTHVKNALDIGSFYITKESGVSAGVRRIEAVCGLAAINYTKAIINEMAQVKAEVKNSDVITGIKKLKEQIKELKKELDDAQNSIQTPISEETINDTKIVVDIIENGDLKKLVDDYKNGNEKVAILLIQAKGDKVMLVAGSKNTNIKAGDWIKAIAPIVGGGGGGRPDFAQAGGKDVSKVKEAKEAALNFVKENL |
9 | Achromobacter_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2624350 : 2635554
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP031217|2624350:2635554|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP031217|2624350:2635554|2626690_2627755_-|AXH13568.1|DBSCAN-SWA MAVPKVFVSSTCYDLGEIREQLHNFIESFGFEAVLSENGDIFYHPDLHTHEACIKEVSNCELFILIIGGRFGGEYIVDKTKSITNAEYIAAKNNNIPIFALVKKSVYLNHHIYKENKNKEFVGDIGYPAIDKQEYALDIFQFIDEVRRASTNNALESFDSFQSIDSYLRKQWAGMFFDFLKTREVKTQIDATNHLVSEINNSSKNLEALVKSLYLSTSDNKSLAEKEIESIEINSLVEMFFDSVLFPSWQNSEYYPIDPLKFDVKKIAKISPKSLSWDKYLVKVGLFEYDNISNDEDELETYLQCVVNTYSNRYFLLNIKESIEHEKLFEKGVKNSTLKQREKVLNRILLKYSK >CP031217|2624350:2635554|2624350_2626489_+|AXH13566.1|DBSCAN-SWA MKRLLILFLFILSIQLNAKTITLTEEEKEFIKNNPVIKVGIMPDFTPFSYYIKNTPVGFEHELLNILSQRTGLMFEKKIDKWTTIYTAFKNKEVDVITSISYKKFREPFTTFTSSYYDIPIMIFVRDDFGEYKGIKSLEGKKVGVLKDVFYIKELEKMGTIDLVYYDTYEELTKDLVFGKIDALMQNLTNINYLIKKNLYSNLKLASELILPNTKKEDLRLGIIPEKPILSSILQKGLNSITKKEKEELVTKWIGSIKEYKGGHIELDKDEKAYLNTKVIKYCINPDGLPFEGLNEEKEHSGISSDYYSLFEKILSAKFELVKTKNWNESITFIKEGKCNMLALGMETYERKKYLNFTSSYLDVPLVVATKVDVPFINHILDLEGEKVGIIKGDAFVKILRQKYPSLDLVEVENINEGLDRVKKGELFGFIDTLASIGYEFQQKYFGELKIAGKISETLKLSMAVVKEDTTLLNILQKAINSMTNELHREIFHKWIPIKYEKGVNYDLVWKIAITSLIVILLVIYWNRKIIKTNKLLEEAQRKIEEKNKELEKLATTDKLTNLYNRRKIEELLEIEINRSERFNHNFGLAIVDIDKFKEVNDTYGHQVGDKVLKEIANILNTNRRKTDFVGRYGGEEFVIICPESSLEGVLRLMEIFKEKISTHKFYEVGDKTASFGVTISQKDDTIESILKRADDALYQAKDNGRNKIEYK >CP031217|2624350:2635554|2629462_2630731_+|AXH13570.1|DBSCAN-SWA MQKETIAVHGGYNNKEGWGTMAVPIAQTTAYAFRDAEHAANLFALKELGSIYTRLTNPTTDVLEQRFAQLEGGAAAICVASGQSAIFYAIANVAEAGDNILISDKLYGGAVTLLTHTIKRFGITAKVFKSADASDLEEQIDDKTKAIFFESLSNPQIAIADIEKIVEIAKRNGVLTVCDNTVASAALFNPISWGVDVVVHSTSKYTNGQGTAIGGIIVERDGLAEFFKENAKRYSHFVEPDESYHGLVYTDVPLPNFCLRVRLALLRDIGAAQSPHNSWLLLQSIETLDIRMEKHSNSALEVAKFLESHPKVKAVNYPGLESNENYAKAQKYFKDGKASGLISFEAESYEAAKTVIDAAKLFSVVVNIGDSKSLIVHPASTTHSQMSESELLKAGVNPTTVRLSIGLENPKDLIEDLEQALA >CP031217|2624350:2635554|2634087_2635554_+|AXH13576.1|DBSCAN-SWA MAHQSDLIAQNIEAYLKEHENKEILRFITCGSVDDGKSTLIGRLLYDSKMIFEDQLASIEKDSKKSGTTGDKIDLALLVDGLASEREQGITIDVAYRFFSTDKRKFIIADTPGHEQYTRNMATGASTADLAIILIDARQGVLTQTKRHSYIASLLGIKNLIVAINKMDLVDFSSERFEEIKKDYEAIIPNLPHNSDINFNYIPISALDGDNIVSISPKCSWYKGLPLMELLDTVAIHHDENDDFRLPVQYVNRPHLNFRGFSGTIASGKISVGDEITVLPSRKTSVVKSIVSNDIKDLRPIGKDETVETIETAFAPMATTITLKDEIDISRGDMIVKSNSIPQVSNKLEVMVVWMNEKSLELNGNYIIKRATSVINGSFKSIEFKKDINTFKEIATDKLELNDIAKCTLALDRQIAVDPYNDNRHTGSFIIIDRYTNTTVGAGMIISSVASEATNNEEKVREYTKAEIALNQYIRNNFPEWECKEILG >CP031217|2624350:2635554|2633164_2634088_+|AXH13575.1|DBSCAN-SWA MSDINISAERLTHLKQLEAESMHIMREVIAEFSNPAMLYSVGKDSSVMLHILQKAFYPAPPPLPLVHVDTKWKFKEMIEFRDRRAKEVGMELIVYSNPKGIEMDISPFKHGSAVHTDIMKTEGLKNMLNIQKFDAVFGGARRDEEKSRAKERIYSFRDENHRWDPKNQRPELWNIYNGRHTKGESIRVFPLSNWTELDIWQYIYLEQIPIPDLYFSKEREVVEYMGTKIMVDDERMPEELRATAKKEKVRFRTLGCYPLTGAVESSATTLPEIIQEMLICTTSERQGRLIDSDGDASMEKKKQEGYF >CP031217|2624350:2635554|2632139_2632364_+|AXH13573.1|DBSCAN-SWA MAEKAYRSVVKTVSWRTVGTLDTIIISYFITGNLGMAASIGSIELVTKMVLYYFHERAWNKISFGKTKEPDYQI >CP031217|2624350:2635554|2630741_2631155_+|AXH13571.1|DBSCAN-SWA MPLISTKGVYGLTAMYELSKYEDESPMQIKEISSNANIPQNYLEQLLGKLRRAELVKSIRGAKGGYVLAKKPEDISVKDILVALEGDLKIIDSKADNPILNIFFDDAKKSTKELFDISLAKLDEYQDRYNEFLHYSI >CP031217|2624350:2635554|2627935_2629171_-|AXH13569.1|DBSCAN-SWA MSKIAIIGAGAAGLIAAITAKKDNNSLEIDLFDINNAIGKKILASGNGRCNISNINATINNYIGENPTFVSYALKQFDFNSFKKFSKSLGLLLDVKEDGKVYPLSNEAKSVTTLLQSKLESLGLNFIGDTKIVKIKKEEGKFTLFSDENEFKAYDKVLISSGLAAAPQLNSTEIGLDLASSFGHSFNMTYPSLVGLQTDFEHKTRLQGVKKESLVTLYIDGQKEKEIEGDVLFTKYGVSGFAILDISQYAVYPMALYQDVQIAINLFPKQNRNEVLGMIESLIKSLPEEKLENILSGIVSNKLIPVIIDMIKVDKEIKAKEINAKHIRAIVNTLINLRMKVIDTQGFKHAEASGGGVRTDEVDDKTFESKKCAGLYLAGEVLDIVGNRGGYNLQFAWASGYLAGKSLARGK >CP031217|2624350:2635554|2626489_2626678_+|AXH13567.1|DBSCAN-SWA MTIEQRFLQKAVEDKNYVSFSYEGKSYKKVKPLKIEENILHSDSRKFELGKLSRVQVLRDRF >CP031217|2624350:2635554|2631175_2632102_+|AXH13572.1|DBSCAN-SWA MKFAQNVTELIGNTPLVKLQAASEKSGATVLGKCEFMNPTHSVKDRIGTNMIKAALEQGLINENTTVIEPTSGNTGIALASVCAGLGIKLILTMPSSMSIERRKLLKALGAELVLTEPEKGMKGAVEKANELAEKTENSFVPQQFANGANPDIHRKTTAEEILRDTDGKVDILVAAIGTGGTITGTGEVLKQHNPDIQVIAVEPEASPVLSGGKPGPHRIQGIGAGFVPDVLNTTVYNEVIQVSNEDAIATSQELARKEGLLVGISAGANAFIAQQVASRPENKGKTIVTILCDTGERYLSVGLYDDE >CP031217|2624350:2635554|2632375_2633071_+|AXH13574.1|DBSCAN-SWA MDVNNLNQKFQNSNAQEIIEYFIKEYGQDAALSSSLGAEDQVLTDMILKVDNNANIFTLDTGRLHPETYDVMDATNLKYGVKLNVFFPLNEKVEELYQKQGINGHFESIENRKNCCNIRKMEPLRRALKPLKVWITGLRAAQSVTRTDMPIVEYDENFKVIKVNPLINWNEEDVWNYIKQNNVPYNKLHDQGFPSIGCAPCTRAIKDGEDIRAGRWWWENPEHKECGLHAK |
11 | Bacillus_virus(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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