Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022293 | Lactobacillus plantarum strain DSR_M2 plasmid pDSRM202, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP022292 | Lactobacillus plantarum strain DSR_M2 plasmid pDSRM201, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CP022294 | Lactobacillus plantarum strain DSR_M2 chromosome, complete genome | 1 crisprs | csa3,DinG,cas3,DEDDh | 1 | 1 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022294_3 | 2731092-2731177 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022294_3
|
1 spacers
spacers of CP022294_3
>3.1|2731115|40|CP022294|CRISPRCasFinder CGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022294_3
The CRISPR arrays of CP022294_3 >merge|CP022294|3|2731092-2731177|CRISPRCasFinder TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATTCGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAATAAGAAACTTAAAGTATCTTATT >CP022294|3|1|2731092-2731177|CRISPRCasFinder TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATT CGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAA TAAGAAACTTAAAGTATCTTATT
>CP022294.1|AWY49233.1|2729598_2731077_-|MFS-transporter MQAKAKISKATMTIAWVVVFGAMAPLLDSTMINIAINNLVTSFHSSVTTVQWAVTGYLLATGVAVPFSSWLLNRFDGKAVFVAGEILFGLGSIFAAVAPNIQLLIIARLVQGFAGGLIMPLLTTLLVQTAGAAVMGQMMATVGLPMILGPLIGPVIGGIIIKFASWHWIFWINVPVVLISIALILWKMPNYPAQNRTAKMDFIGILLLIVSSSAIIYSLVNAAHTDRFNNATSIEMLILGAIALISYVVWAAWQKERAVVPLHLFKFASFDGAGLGLFIAGTVLNGAMLLLPLYFQNVRGMSVINAALALLPQGAGMLVSRTLTGRLTDQIGAKYVVLGSVVITFVGTLPFYWFGQQTSYWILALILFVRGIGAGGILMPLMADAYTGMQPGQVPAATIGTRIIQNIGSAFGSALITTIVTAYSTHQVNVFERHLKAETYHVDAAHLQVFTTSHLQAIRLAAFQQGFLVIAIAAIVIILPTLLLTNKLKAAK >CP022294.1|AWY49232.1|2728528_2729482_-|aldo/keto-reductase MKTIQIGASQLKASAVALGIMRMVRLDTDAAANVLETVHDRGVNFIDSADIYGNGDSERIFGQALKQSSLKREDFFIQSKGGIVLDPEKSSGELVFGQRYDFSKQHLIATVDKILQRMQLDYLDSFLLHRPDPLMDPAEVAAAFDELQATGKVRHFGVSNFNPMQVEMLQAAVSQKLMINQLQFGVMHTGPIQFGLHTNMQDTASLNHDGEIIEYSRLHHMTIQAWSPYQYGMFAGTFIDNPKFPELNAKLQELADQYHVTKNAIATAWILRHPANMQVILGSMNPQHLDESIAGTDVTLTRQEWYDVYFAAGNDLP >CP022294.1|AWY49231.1|2727742_2728309_-|hypothetical-protein MNKARLEAFTDAIIAIVLTLLVLDLPRPQTPSVRALFAEWQSIYVYIITFTLLISIWLNHHDLFVQVKKIDRVVFWANSFWLLCQSFIPFMASWITKFPHSKWPAVFYILTGFVWMLAYQLLVAAVRRLNPHIHRMSSPALSVVFGGFLVVLTVALINPDVGLFLIPVHAFASVILATKRKWHLRKYF >CP022294.1|AWY49230.1|2726556_2727594_+|aldehyde-reductase MQKQLVVVTGGSGFIAIHIIRQLLQQGYAVRTTVRSLAKAPVIKEMLTNGGITDLSALEIVVADLAHDEHWSEAMAGATYAIDVASPTPKLNFKNKAEMIRPAVDGVRRVLTASRDAGVKRVVLTSAYGAIFAGHKNRTTPYTEADWSDLNWKAIHPYQESKTRAELAAWDFINHEGRGLELTTVNPVAVMGPVLSAKYSHSNIQIQQFLEGQVKAVPNVDSGYVDVRDVASLHLLAMTAPQANGERFLATTGETLSMLDVANVLRQAFPAFASQLPTKTIPNAAVKLAAKARPELRMVASLVGTYAETSNHKAQTLLDWHPRPAAESIIATAQSMIDLGIVTKP >CP022294.1|AWY49229.1|2725863_2726430_-|TetR-family-transcriptional-regulator MAATNHAQAIKKDPQTYLTTALLQLLRTHDLDTITVTQVVKRAGVSRMAFYRNFTTLEDLLTAYFAPAIAARFQDVLQHVPANRKLLAMGQFFSDFAPTLRLAEQRGFENIIQQLFNANMTNYYQATMTNGMLTAVQLKYWTRFMSAGVYAIWREWLLGGQLESLTTIHEILATLQTATMQALTQAQK >CP022294.1|AWY49228.1|2724976_2725705_+|NAD(P)-dependent-oxidoreductase MKPLVVITGASSGFGAEIAKLFAADNYPLLLLGRRQAKLAALSANFENAMIDTVDVTNYHQFETAVRKAEAKYGKTDLLVNNAGLMLLGNVQNQDPQEWQTMLNTNVMGVLNGTQIVLNDMRDREHGTILNMSSLAGKKTFVNHAAYVASKFGVHGLSETLREENAPKNVRVMLVAPGAAETELLTHVTSKSALSDYEAWKASMGGLTLDPKHVAATVKFMYDMPQNVNIREVDIAATAQDA >CP022294.1|AWY49227.1|2724478_2724844_-|MarR-family-transcriptional-regulator MLKERVTAQPRYRNEFDATMQLIRGKWKIMILFELAEVKVSRFADLQHHIQAVSHKTLASQLKELEQDELIERHDFKTAQPHVEYRLTAKGQSLIPILDAICTWGDQHVDPALIERSLCDE >CP022294.1|AWY49226.1|2723910_2724195_+|DUF1905-domain-containing-protein MKTYQFDAPIQAATIGKGGAYVACPFDIRDLFGKGRVKVHATFDEVPYNGSIVNMGVKNLDGSICYILGIRKDIRAKLHKSIGDVVAVTVTAID >CP022294.1|AWY49225.1|2721042_2723625_-|glycoside-hydrolase-family-25 MNFKSQNPIDASQSERFKLYKSGKLWLVAGLTFFSFLGGSVLNNTNVHADATNATTTSSSAASTASSASVATSSAASDATTKATSVSSSAATQVTSAATTKTTSQAATASSSAATSQSTSTASSSTSQATKTASSAATSTSATATSQATSVASSTATTTQVSHTASSTAASAASSTATVKAVKAASSTVSSAATTATKATAKVAAVAYTAATTSSTDVWTIGDTTRPRVDVVDVASYQSTMTQSDFNKLKAAGVKTVIVKSTEGTDYTNPAALNQAKMANKAGLNVDFYHYATFSTADAAKSEATNMAGFLVKNNVSTKVLLFADMEDSSSYSVNATANLNAFWSTLDSFGYKNHGVYTSNSYLYRDAVVKTVGQSRVWRAQYPYTPSANNLWNTNDGAWQFSDTALLPSGSDYTGYIDVSIDYNGLTEDSAGTNTFVTTTSSNDTTTSEVTTDTSATTNTSTSSTTKKASGWYTFTKNTAIKSAASDSAKTVGTYSKGNRVYYNAEITTNGETWLRYLSYSGSEHFVKIAAAKTTTTKPAASTSKTVTKNETGTYKFTKTTAIKGSVSDSAKTLGTYYKGDTVYYNAKVTKNGETWLRYLSYSGAQHYVKISGAATSTTTTKPATSSSKTVTKAETGTYKFTGTTAIKGSVNDSAKTLGTYYKGDTVYYNAKVTKNGQTWLRYLSYSGAQHYVKISGAATTTTTSSKSTATASAKTVAQSGTYKFAKTTAIKSSASDAASTVGTYYKGNTVNYNAKVTTNGQTWLRYTSYSGAQHYVKVSGGAATTTSSSASKTTAAAGTYTFKTTTNIRTAASLNASVVGQYSAGESVYYIGTVSADGYQWLKYLSNSGAYHYVAKIG >CP022294.1|AWY49224.1|2719359_2720772_+|succinate-semialdehyde-dehydrogenase MAYQTINPYTNEVVKTYDNATTDQIEQALTTGDALYHQWRHEPVSSRAASLHKIAALLREHKDELAKIATIDMGKLLSESQGEVELCAMIADYYADHGAELLAPTPISTQATGDAEIEKQATGVLMLVEPWNFPYYQIMRVFAPNYMVGNPMILKHASNTPGSAAAFAKIVEEAGAPAGSLTNLFLNYDQVSDIIADPRIQGVALTGSKRGGQAVAKAAGANLKKSSMELGGSDAFVVLADADIDEAVNLAWRVRLYNAGQVCTSSKRFIVAADVYDDFLAKLKERFAKLVPGDPMDPQTTLAPMNSKRAKEKLQDQVDRAIAGGATVAYGNEPIDLPGQFFQPTILTDIDQDNPLFYEEMFGPVAQVFKVDSEQAAIDLANNSELGLGGIVFAGTAAHGKAVAQQIETGMVFVNTFLSSLPELPFGGVKGSGYGRELSSLGLMAFVNEKLVVTAQKPDYDNGAGGLVVL >CP022294.1|AWY49234.1|2731194_2731794_+|TetR-family-transcriptional-regulator MTKTRRRGAELENAIYQAARDILNQDGLEQLTFANVAEQAGTSKPVIYRRWRSPLELAIAAIQDQIITENHGQLDEVSLTGQTLSEDLFQVLKRFTVSINTFNQALVITWFHHLDQQANPEVKDLLNAVKKIDAHAIERVCQRAQQRGELRTGTLSCDLQLMPFDWLRYRAFANEPITDATLHLLVDDLLVPAYQHALG >CP022294.1|AWY49235.1|2731914_2732844_-|ferrichrome-ABC-transporter-substrate-binding-protein MTKRWQIVKLGLVLGLMGSLLLGACGAKQPTSTTVTRTDYLKHKVKVPKHPKRIVASYLEDDLVALGIKPVVQWSVKNGSGTQAYLKEQLKGVPLIDYSLPYEAVTKAKPDLILIGTSSAVANGKYAQYNKIAPTYVVKNGTTVTWRQTFLDVAKVVNRQAKAKKVLAKYDKQVQTTRQALKKSGQHKVAVLWVTNNTAYMVNDNSASGALLYQDLQLGEPSLVKQVSKSATADWSAVSLEKLAKLDADDIFLVNSQKSASLFKDPLWKNIKAVKNNHLYQYGDSSSWQYSGPIAYSQMIDMVKTDLLK >CP022294.1|AWY49236.1|2733080_2733875_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNTIEAQNISIGYGDKVIVDQLSITIPHGQITTLIGPNGSGKSTLIRAIAHLLPPTTGVILLDHQNIQQIKSKTFAKKIAVLPQTNQTANDLTVEELVSFGRLPYRRPLSGLTTTDHQKIEWALTQASLQDLRQRPLSTLSGGQRQRAWIAMAVAQDTDTIILDEPTTYLDLTHQLEVMQLVKKLNEQAHRTIIMALHDLNHAARISDQLIALKDGHVLAHGPVSTVMTAANLKTIFNIDATLVDYHGTPLILTYNGCQEVAPA >CP022294.1|AWY49237.1|2733871_2734870_+|iron-ABC-transporter-permease MKSTSRYWGWLALSTGVLILVMGLSLRFGADQMRTATVWHALTTTHTGNLDQQIIRHIRVPRVLGAALIGAALAGSGALMQAVTRNPLADSGLLGINAGAGLMLTLCLAFFPKLSTLQTTGWAIIGAAASAGLIFSISTARHVQLDPTILVLAGIAISSLLTALSEGLALVLQLKQDLAFWYFGGLGAVSWTQLKFLGPGLVLGLLLTLLLAPQLNLAYLTDDNAQSLGKSLPLLRGLALICAVILSGISVALVGTITFVGLMIPHMARWLVGANYRNSMPLTLILGATLTVGADLIARLVNPPHETPFGIIISLIGVPCFIYLARKEPMKA >CP022294.1|AWY49238.1|2734866_2735862_+|iron-ABC-transporter-permease MSPNRRLIIWSLLLTASMLGLAILNLSTGTMTISWPALLGILTSRGNATDMLVLVNFRLPRIVLAIMVGWALALSGNVLQTVTNNPMADPSLLGINNGAGLAVMLLIIGAGTNASLTLSLPIVALAGAWLSTALIFLLANQRQRGISSKRLLLVGVALSGCFSALMVLMTLKLSPDNYQFVMNWLAGSLWGTDWSYIGWALPWLAVGSGILFIQLPVLDAFTLGTTTAQTLGINLKRQQLGLISVAAMLAGVSVAISGGISFIGLITPNLARRIVGSRQRYQLPLAGLLGSTLLLAADTLGKLITTTTELPAGVLVALIGVPYFIYLLVRG >CP022294.1|AWY49239.1|2736105_2736618_+|TetR-family-transcriptional-regulator MANQRNQRMQATILLAYENLLSDKPFRKITVQDISDAALVHRSTFYKHFQDQYDLLEALFEQKRQQSKLTIDQIFTHPFETLNSFGNARFQETLRHQFNDDAFRDAFLNYLIHLCKDTVDDDQRLVRFLAVGRIKGLTLWITVGNAPYNIFTDTATLDNIFSNPLNTVNY >CP022294.1|AWY49240.1|2736598_2737492_-|short-chain-dehydrogenase MKVFITGGTGFVGSAVVQELVANGFEVVGLARSETSAQKLISWGAQPVRGSLTSLSTLATAAAQADAIIHLGFNNDFRHFFQAGAMDRRAIETMGRAISGTNKPLVVTYGTTGIRKHVETEHEVADTGLLKWLTPRKSEIVARQLMAQNINAFVVRLSPAVHGAGDMGFTRTVIERAKKSHRAEYFGLGTHAWSAVHRLDAAHLFYLVTMYGLEHPTTNERVFNAVAEESITIAAIARTISRKLNVPLKAKYNPLSFGDTAMLYLINCPTSSQLTRQILGWVPVQPDLLTDISSSRY >CP022294.1|AWY49241.1|2737785_2738532_-|NAD(P)-dependent-oxidoreductase MSIKGKVVVITGASSGIGAATAKLLAAKGAKVVLGARREERLQALSQAIGDNAVYQVTDVTDRQQVRALIDLAVSKFGRVDVLYNNAGTMPQGNLSDREYDKWQMMLNVNIMGVLNGIGEVLPIMQKQHDGLIIATDSVAGHVVYPASAVYNGTKYAVRAIMEGLRQEEKEHGIRSTIVSPGAVRTELVNTIGNTQIQAGISELMNADDRQGLALNPEDIANAVLFAIDQPKHVAISEVLVRPAQQEV >CP022294.1|AWY49242.1|2738548_2739055_-|acetyltransferase MQTIQPIVDANQRRIQALNVTREPSEIRERLAEITGQTIDISVEIRVPLWTDYGRNLKIGKRVFINDNVQITDLGGIKLADDVLIGPGAMLLSVNHPLDPAKRHAVEVQPIHIERNAWIGAGAKVLAGVTVGENAVVGAGAVVTKSVPANTVVAGVPAKVIKTIEQVD >CP022294.1|AWY49243.1|2739313_2740150_+|short-chain-dehydrogenase MQSKLAVIIGGTSGVGKHTAIDLANQNYHVIIVGSRADKGRQAQADISQATGNQAVQLALADLSTKTGVQQFAHQLAAMTDHIDILLNSIGVILPERHLSADGYDLNLVLNYLTHFWTIQALLPLLKHSDQARILLVGALPFVINHAKVSLPDFDAPATSKYNAMTVTAQATAARVLLTLALSERLTATNVTINIFHPGYVPDSNFGAGGSWVSRLAGRILGESFSRKNSPIGAWLATAPELTHTSGHFYDDRLRQVRLSKQYTRSKANDLWRLSSQY |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022294_2 | 2.1|2551380|26|CP022294|PILER-CR | 2551380-2551405 | 26 | CP022294.1 | 2551296-2551321 | 0 | 1.0 |
1. spacer 2.1|2551380|26|CP022294|PILER-CR matches to position: 2551296-2551321, mismatch: 0, identity: 1.0
cattcaatgttccaagcccattagta CRISPR spacer cattcaatgttccaagcccattagta Protospacer **************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022294_2 | 2.1|2551380|26|CP022294|PILER-CR | 2551380-2551405 | 26 | AP014283 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S23-C59, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 15532-15557 | 4 | 0.846 |
1. spacer 2.1|2551380|26|CP022294|PILER-CR matches to AP014283 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S23-C59, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
cattcaatgttccaagcccattagta CRISPR spacer cattaaatgttccatgcccattaaaa Protospacer **** ********* ********. *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
360234 : 428866
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP022294|360234:428866|DBSCAN-SWA TTTAAATTAATGTGCCAATAATTAAAACGGCGTCTGAGATCCAATGGACATAGATGCCGCTCCGTAAAGTATTGGCAGATCGCCATGAAGCAGTTATTGGATAACGCGTAATACCGACGATTAAAGGATAAATCCAGTTGAAATGATAATGTGGAAGGTGCAGACACGCAAATACGATGCACCCCAATACATTGATAATCGGCCACGCATATTTTTTTAGTTGTGTTTGCGATAATAAGCGAATCAACGGAAGTGAAATAGAGGCCATTCCGACTTCCTCACCAACTAGTGATACTAGTAGCGTGAAGGCTATCCATACTCTTTCAATTAAAGGATAATCTCGCCCAGTTGAACTAGTTGTCAATGTTGTATTGTGAAATGACAATAAAGCATGCGAATTAATGATAGCTATAACCACAATCGCAGTGACTTCCAGAACAAGCAATAAAAGCACATACTTAACTACTATGCGCCACTTTGGCGAGGGTAACGGTTGAAAAAACAGTTTTAAGTTAGAAAAACCATATAGCATGACTAAACTAATTATTCCGGCTGTAAGCATTGCTAACCAATCAAAATAAATATTAAGAAAGATCGCACCCATATAACCAGCCACAAAGAGCACTAACACTAGCGGGTAATATTTTTCTTTGAAATCAATTTCTATCACTTATTATAATCCCTTGAACCACCAAGCACGGCCCGTTCAACCGCGCCAAACGCATAACCAATAGCGTATCCAATTCCATTTTTACGACTCCGACGGCCACCAGAAATATTCTTTTCAGCGTCAGCAGTTAATTCTTCAAATTCATTTAAAACAGTTAATTTAATTTTCATAATATACGCTCCTTAATTTAAGTCCATTTATTAACGACGGATTGCTCTGCCAGCTTCGCCATCATAAAATCCTTTTCTTAAACTAGACCAGAAATTTTTCCAAGCGCCTCCCCCAACAACCCCGTTCAACTTATTATTAGAAATAGGTGCAAATGCATCTACTACATCCAAATCCTTAATCATTTTGTTCACAGTCATACCTCTCCCTTTACTGTAGCAGTTAAAAATGGTTCTATGCGCTACGTATTTTTAATGCACTTATTAATATACGCTACAATTTAAAAAAAATTATTTTAAATTTGTTATCGTACTATTTAATCGATTTAACGTAACTTGAAAGTTGAATGTCTGACGATCCCATAACATTAATGGGATTATTTTTGCTATGACGAATTGTTAAATTAAGTGCAATATTTTACCAAAGAAAACTTCACTTGGCCTTTTTCATTTCAAGCTCTTACGTGGCGATTATTTAAATCTATGACTAATGTGATAATTCCTTGATTGTTGAGGTCGTTTAAAGTAGTTCTTTTTTGGAAATGTGTTCGCAAATCAAGTCGTTGGTATTTCGTTAGTTTTGCGGTGTGGTGGTCTGGGCGCGAAGTTAAATGGGCTCAGGCGTCATGGTAATTGCTTAGTCGGTTCTAACATGATCTCTCATACACCGGTTATAAAAAAGCTATTCATCTTGCCGGTCAGATGGGCACAACACATCGGACTGGAGAAGAAAATTCAACACCTAGATTTTGGCGGAAATTAATGGCCGCTTGGATACCATAATTTTGAGCCTAGGAGATTGAATGGCGAAGCTAGACTGGAATCTTTGCGTGTTGACTTTAATTGTTGGTTAAACGTCTATTTTCGTGGTATCGATGAATTATTGTACGATAATATCTAAAAATATTACGTTTATAAAAATATCGTACAATGATTCGACTAAGCGGTATATTAAAAGCGTAGAGAGAGTGATATCAAGCAGTTCGATTGAATTGAATGAAAGCGATTTCTTGTGTGTGAGTCTATATTAAAAATAATTGTTGTTTAGAAAGCAGTGGGAAGATGCTTGAAAGAATTACAGGATTTATTATTATATGTTTTGCTATTTGGCAAATTTATACTGCCTATTTAGCATTTAAACAGGTAAAGCAGGTTGGCAACAAAAGTACTTCACCCTTTATTGCGTTGGGTGTCTGGTCAGGATTATCTTTTGGTATTTTGATGGTTGCGTTTGGAATTGCATTGGCATTTAATGCGATTTGATGATATTCACTGAAGGGGGATGTTTGAAATGGAAAATTTAAAGTTGCATTTCAAATGTATATCGTGAAATGCAAACGGGACTTAGATGTTTATCAAAAGTTGAATGCTTTAAGGAGGAAATGCAATTATGAAAAGTTTAGATAAAATTGCCGGGTTAGGTATCGAAATGGCAGAAAAAGATTTGACTACCGTTGAAGGTGGAAAAAACTATTCTAAGACATGGTGGTACAAGAGCCTTACATTGCTGGGAAAGGTAGCAGAGGGAACTTCGAGTGCATGGCATGGTTTAGGTTAAAAATAACAGCTATTAGGAATTAGCAAAATAATGATGGACTAGTCAATAGTGAAATGATTGGTTCATCATTATTTGATTGTATTCAGAAAGAACAATTAGGTGGGACGGTGTTGTATCATGATTAAATTTAAAGAACGGGGAAATGTTTCATTTAGCAATTTCAGGCTGAAGGAGCATCAGTGTGATTATGAACCGATTATTGGATTAATAATGGTTAAAAATCAAGAAAGGCGGATACTGCAAACGCTAGAATCAATTGTGAACATCTGTGATCAAATAATAATGGTTGATACAGGCTCTAGCGATAACACTGTTGCAATTGTAGAAAGTAATTATAACAGTGTGTTAATAAAGCATGTAGACTGGAAAGAAGATTATGCAGCCATGAGAAATAAATGTCTAACCTTTGTTCCAAATGATACTTGGGTTTTGTTTGTAGATTCTGATGAAATATTTTCTAAAGAATATAATTCAGAAGAAATAAAATCCTTTTTATATGAAGTTGATAAAAGATTCCCAAATCAAGACAAAATTTGCACAGTAAAGCAGATGCAACCGGATCGCCCAACATATGTTCGTCCGGAACGTTTTGTAAAGAAAACGGAGACCCTTTATTATTTTGGATATGTGCATGAAGAACCTAGAACTAAAAGAACAGAAAAATTAGTGAAAATTGACACTGATTTAGAACTCATGAACAATGGATTAACAAAGGGAGAATATGCAAAGTTTAATAAGCAACAACGATATGCGATGCTCTTGAAAAAAAACATTGCTTTAGAACCTGATAATCCACGTTGGACAAGCTTAATTTCACCAATTGATATTCAATTAGGGCTGTTTGAACATGACAAGTATGTAGAGAAGCTGAAAAAAGAGATTCTTAAAGATATTCATGGTGATATCACTGAAAATAATGTGAAACAAGGTGAGTATCTTAATTACTTGTTGGAACGATACTGCATTGAGCTAGTGCATTCAGAAAACATGGAACTAGCCAGTAAGTACATTAAGTTTAGTAAAAAGAAATTTCCCTATGACGTAACTTTTATAGTTTTAGAAATGACTATTTTCTTTACGAGTTTAGAACAAGCAAGTTTGAGAGAGCTTAAAAAGATTATCGATTTTACTAACAATACGGATTTTAATATTATTGACAGTGAATCAGAGGGGTCCGAAGATGCACTTAGCGCTGTTGTAATCAAACTTTTACTGTTAGTCGAAAAGTTTGATCAGGCAAAAGCAGTTTATAAAACTATCAGCGATCCAATTGCCAAGGAATTATTGAATGATGAAAAGAAAATTTTAGAATCCTAAGTAGGATGTTCTTAAAGTGGGGATTTTGTATTGAAAAATAACGATATAATAACTAAAATTGCGATTTGTTTTGTTCTTGTACCTATCGTGTTGATAGTTTTACCATATCTAATTAGTCCGATAATTTCCGAAAAGTATGGACAAATGACAGTGGATTTAATTATTTTTTTGGTTGCAATAGTTTTGAGTCAAAATATCTGGCATATAAAGATAAGCTTTTTAAGCTTAAAGAAGCCTTTGAGTCAATTATGCCAGTTAATACCGAGCATTTTATTTTTGTTATTTACTCGATTTAGCACACTTAGCTCAATGTCTTTTCGCTTGATAGATGCACGAATCATACTGACGGTACTATTTATTGCATTGGCAGAAGAAAGTGTGTACAGAGGCCTATTAATTCCGTTAAGCTTAGTTTTCACAAAAAACAAGCAATATACGGCCATTGTTATTAGCGGTGTAGGTTTTGCGTTGGCACACTTGGTCAATATCGTAAATAGTCCCTGGTCGATAGTTATGCTTCAAATGCTGATTGTTTTTGCAAGTGGTCTGCTTTGGGGAACTTTATATTTAAAAACTAACAATTTGTCGCTAACAATTATGTTACATTTCTTAGATGACTTACCGTTGTTCTTAATGAAAGAAACCTCTGAGCTTGTTACACCTACCCGCCCTCAATTAATTTCTGCAATAATGGCGTATCTAATAGTTGTGGGAATAATTGGAATAATAACATTTTTACAAGTTGAGGGATTACATTTATGGAAATTGAAAAAGTGATTTATGAAAGACTATAAATAGTATACAATTTTATTATTACTTAATTATGTGACGTGGTTATTTTTAATGATTTATAAATCTACTAGGGGGATGTGATTGAAAAATTGCATTTCCCTAATTTGATTTTTTAATGTGTTTTGTTAATTGATGCTTTGAAAATCAAAATTGTGCTAACCCTGTTCCTAGAGATAATAAATTTTTTCTGTCGGAATTTAATGTTTATTATAGGCACTCATAAATATAAATTGTTAAATTGGTTGTATTTTGATTTACAATCTCTAATCATTTTTCGTCTAAAACTAAGTTAATGATGAAATTGAGAATTTGTGCTGTTAAGAATGGAGTGAACTAAAATGAAATCCTACAATATGAAATTGAACCGCGATTTTTATAAAGCATATTCTTTTTGGCTAGGGGTGTTAGCTGTGATTGGTCTTGTAGGAGATGTTTTATTAAAGTACAATACCGCGGTTAGCCCGTGGATAATGATATTAATTGCAATCTATTTATT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67 | Tupanvirus(20.0%) | protease,bacteriocin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1226124 : 1235133
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP022294|1226124:1235133|DBSCAN-SWA TGTGGCACGTGACGGGACCGTCACAGAGACAAATGATTTAAAATTGCACGCATTAGGGGAGATTATCGGGATGAACGAACAAGAAGCATATGTAACGACATTTTATTGGCTCGCGGATTGTTGGTTGGAAACTAGCTATCTGGGACTTGAGGATGAATTTGACGACGATGAAATCGATGACGCCGTCAAGTCACTACTAAATCGGATGCAAGCCGGGGCAATTTATGAGGTAACGGCGGATGATCCAATGTGGCAAGCATGGAAGCGGGCAGTTAGGGCCGTGCTTACGCCCAATGATCATGCTGAACATGAAGTTGATGAGACCGACGGAGAGGATGAATTAGTGCTACCAGCTGGGGTACGACCAGAACGTCAATTAGAAGAAGTTCAAGCCTATGCAGCGATGAACGCGTTTTTGCAGGCACAAGATCAGGAATATCTGCAAGAAATTGGTAAACGGGCGGCCACTCAGGTCAGTGGTGCCGGGTGGCAAGTGTGGCGTGCACATCGTCAGAGCATGCATCCGGAGTCTGCCGCCCCGCTGACGTTGACTGCTGAACAATTACCAGCCGTGATGTGGGCCTTTTTCGATAAGTACCAGGATACTGAGGACTCTTTTGAGATTTTTGAATTGGTTAATCGACTTGAACAATGGCAAAAAAGTGCTGATCGAGATTTGGACGCGCAATGGTCACAGCTTGTGGCGAAAAGTCAGATTGATCCGGCCGCAATTACGCTCATGCAGGGCTTGTCGTTAGCGATTGAGTTCTTTGATCAGCTTGAGTGGGACGGTGATTTGACTGCCAAGGCAACTTTGCAGAATAAATTGATGCAACGCACGCTCGATGACACGCTCAATGATGAGACGACAGCCAACTGGACGGATGCCTGGCAACACTGGGATTTAGCAGATCCGTTGACAACTGAACAGTGGGCCCGACGGTTTGATCCGGCGGACGACTATGAAGACGAGAGTGAAGAAGATGGCGCGGCTCGGCCAGCTTGGCAACTTGGTGCGAGTTATAGTACCGTTTTGATTGCAATGCGCTTAGTCGCTTACGGTGTACTGCGGCCTGAGAGTGTGCCTGGTATGGCAACTGTGAAGATGGCGAACCGTGCACTGGCAGCTACCGTCAGTATTGGTATCGTGTTAGTTGCTTGGCTGGTCACAGCTATTCTGATTACAATTGTAATTTGGGGATGGCGGTGGCTGCGTAAGCTGATTTTTTAGTGCAGCTGAACGGCCAACTGAATCACAATAGTGCCGATTGACTAGGCTGAAGTTTGTGAATCCAGTAGTTGAAGCTGAAAGGACGGGGCGTCAGTGGTAGTGCTTCATGATGGTTCGTAACTCGGACAGAAAGTCGGCATCTAAATGGGGCGATTGTCCTAATTGTAATGGTGCCAATGGCTGATATAACGTTGGTATGTCTGGCTTTAACGGCTGGTTATTGAAGTATTGCTGACCATGGATTTTGACGGTCGCTTTGAGCGTTCCAATCGTCATGACGGCCACGGCGGTATTTAAAAAGACGCCACCATTGAGACTAGTATATCCAGCGGAAGAACGCCCAACTAAAGTAACGTGCGGGTTACGTTTTAGCGCCATGATGATCACCTCCGCGGCACTCGCTGTCTGGTTACCAATAATGGCATAAATATGACGAAAGTGGGCCGCTGTTGGTTGCGAAAAGTTAACGTCATCTTGACCGAGTCCACCAGTGATTCGGCCATGGTACATCATACGTGGCCGGTTACGATGATGGTTCGTGATGCCGGTGTAGATGGTGCCGTCTGGAATGATGGCGGCCAGGCCAGCAATCATCGGTGCCGAACTACCACCAGTATTTGCTGCGAAGTTTAAGATTAAATCGGTTGTCGGCTTAGTTTGTTTAATCAGGTGCTGGAGTTGTGTCCAATACTGTTTTTGTAATTGGTGCTGACTGCTGTAAAATGCTGGCACATTGATGATGGTGAGGCCGGCACTCATTGTCTTGGTCGGACGGGTGGCATGTTCGACTTGGCGGAGATTGGCGACGGCGAATGAATGTAAATTTGCAGCGCGCAGAATTTGATTGAGTTGGGTCAGTGACGTGATTTTGCGACCATGATCAGTCGCATGCAGCATGGCTTGCCATTGCGTGCGATGGTTGATAATGCCATATTTTGACATGTAGGTGATAGCCGGCATAGCGTTGAAGGACGCACGGAGCCGATTAGAAGCGGAAAGACCAAACGTTAGGACTATCGAAATTAGACCTACCAGTCCGTAACGGCATTTATTCGTTATCATGATAAGCCATCCTTACTTTTCGTGACTAGATTAGCATGTATTGGTTAGCTAAAGTGTAGGCGTGGCGTCAAAATTTCGCAACGAAAAGCATATCTTAACTGGTGCGTCTTTGAAATAATGGTTACTGTTAAAATACCCATCTACATTGGCCGTCTTAACGGCTAAGTAGATGGGTATTTGTTGTATCATGAAATTGTTGACGATTGTGCCAGATCGGCTTCTAACTGGGTTAAGAAGATCGTCACCAAGTCTTTTTCCACCTGGTTCAGTGAATGCTCGGCTGGAAAGGCAATGAAATAATTCAGGGACATTAACGCTTGGGGCAAAGGTAAGATGTTATAGCGTTCTGGATCAGGTTGAGTATGCACACTGTCTGGTAAAAAGGTAATACCCAGTCCAGCAGTGGCTAGTTTGGTGATGGTGGCGGTATTCGTGCTCTCAATTACAATATTCGGTGTCACGTTGTGCTTTTGTAATAAGTAGTCAACTTGGCGTCGAATCGATGACCCGTGGGGAGACAAGACTAGAGGCGCTTGTAGCAGGTCGTTAAGGGGTAGCGCTCCCGGATTAATGAAGGCCTGATGGGGTTGGTACCAGTTGACGGTGTTCGGGATAATCGCGTAGTACCCGTCCCGACCGCGGTCATAACTTTCAAGCCCCGGTGCGATAGTTTCCGGGTTTTGACCAATTAAGAAGTCCAGCTCACCGTGGAGCACGCGCTGTTCGTTGCGACTAGCGATATCTTCGGTTAATTCGATCTTAGTGGCCGGGTGGGCTTTCAAAAAAGCAGGTAAGAATAGGGGCAATAAGTAATAGCCGAGGCTAGATAAGACGCCCAGCCGAATTACTTGCTGGTTGGCATGTGTGTATTGCCTAATTTGCTTATTAAAGTAATCCTTCTCGTTTTCGAGCGCCGTCAAATATTGATAATAAGTCCGCCCAGCCGTGGTCAGTCGTAGTGGCGTGACTTCACGATTGATGATGGTGACGCCCAGTTCTTTTTCAACATTGCGGATGCTTTGGGTGAGGTAAGGTTGTGAAATGTAGAGATCTTTAGCCGCCCGGGTAAAATTGCCGTGCTTGAGTAACACATCTAAAAACCGTCGCATTTCGCTGGAATCTGATTTTGGCATAAAGCGCCTTCCTCTCGCATTGTGATTAGGTGAGTATTCGTTTGATTGCTGATTTGGTCATGTTGAGTTAGTTGCATTGCCATAAGGACGTTCAAAACATGTTCAATAAGTTCTGTCAACATCCTAGCGATAGTGGCTAAACAGCATTATGACCAACCATTTTAACATGATTAATTTTAACGCGAATCGTCGACATAGTAAATTTGTTATCGGAGTATAGATAAATAAATATTTCACAAGCGGAGCGCTTTCACTTACACTAATCAGTATTAAGAATGGCCAATCATTCAATAGCTACTCGTCGAAAACGACTGTTTAAATCATCCTGAAAGGATCTGAAATTATGAAATTTGTTGGGATTGTTGGGACGAATGCAACCAAATCGACCAACCGGCAGTTACTGCAATATATGCAACGGCATTTTCAGCAACAAGCCACGATTGAAATTTGTGAAATAAAAGATTTACCGGCTTTTAATGAACCGGAAGACCGAACAGCACCAGTAGCAATTCAACAGCTCAGTGATAAGATCACCGCAGCAGATGGCGTGATCTTTGCCACGCCGGAGTATGATCATTCAATTCCGGCCGTACTAAAAAGTGCAATCGAATGGCTGTCATATACCACGCGGCCGTTAATTAATAAACCAGTTATGATTGTTGGGGCCTCGAACGGCTCACTGGGAACCTCACGCGCTCAAGCGCACTTACGCCAGATTTTAGAAGCGCCGGAATTAAAAGCACTGGTGATGCCAAATATTGAATACTTACTAGGCCGTTCACTACAAGCTTTTGATGATCAGGGCGACCTGACTTATCCGGATAAAGTTCAGGAATTAGACAATGCGTTTGGCGAATTCATTGATTTTGTAGATTTAACGAATAAAATCATGCCGTCGAGTCAGTTTTTCGAAAAGAGTAAGCAGTTCTCGTGGCGGCAAGTGACTGGGGAGGAATAAACATGAAATTTGTTGGAATTGTTGGAACGAATGCTCAGCATTCGTACAATCGGATGTTGCTGGAATTTATGCAACGACATTTTGCGACACAAGCCGAAATCGAAATTTTAGAATTGACTGATGTCCCGATGTTTGATGAATCGAATGATCAAACTGACAGTACCATCATTCAAAACTTTGCCACTAAAATTGCGACGGCTGACGGGGTTATCATTGCCTCACCGGAACACAATCATTCCGTGCCTTCCGCGTTGAAAAGCATTATTGAATGGTTATCATTCAAAATTCACCCATTAGATGGTCAAGCAGTAATGATTGTTGGGGCTTCATACAGCGTCCAAGGATCGTCACGCGCGCAACTACACCTGCGTCAGATTTTAGACGCTCCCGGTGTTAACGCCAGTGTCATGCCCGGTTCAGAATTCTTATTAGGTCGTGCCCAAACGGCTTTTGACGATCAAGGTAATTTAAAGGTGCAAGGGACGGTTGATTTTCTGGACAGTTGTTTTGCAAAGTTTCAGAAGTTTGCGACCATCGTCGCCGAGATGCGGGCACCAGAAGCGCTTAGCTTTGCCCCGGGTACTTATCAGGTGACGGCCACTGGACATAATGGCGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP022294|1226124:1235133|1234893_1235133_+|AWY47847.1|DBSCAN-SWA MYILIGSYDEHGLPATLTWNIAFNPSGKKLGTVVVNDTLGSNQSYLSDSVIAQTGAYNDAGNFVQSGRLCHKWQLMAIN >CP022294|1226124:1235133|1230509_1232948_+|AWY47843.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNAQHSYNRMLLEFMQRHFATQAEIEILELTDVPMFDESNDQTDSTIIQNFATKIATADGVIIASPEHNHSVPSALKSIIEWLSFKIHPLDGQAVMIVGASYSVQGSSRAQLHLRQILDAPGVNASVMPGSEFLLGRAQTAFDDQGNLKVQGTVDFLDSCFAKFQKFATIVAEMRAPEALSFAPGTYQVTATGHNGELPMRVTLSADRIENIEIDTSSETQGIADVAFERIPKEIIAGQTLAVDAISGASITSHGVIDGVARAVKEAGANPDDLKKRRATKQVAQPAVKEVTTDVVVVGAGGAGMTAAAKVLQAGHQAVVLEKFPAVGGNTVRAGGPMNAADPDWQRQFAALPGEKQTLKDLSERDESTIAPEYRADFRKLKQQIDAYLTANTNQKGTLFDSTLLHRIQTYLGGQRTDLNGQEIHGQYDLVKELTDNALDSVKWLQSIGVKFDESQVTMPVGAIWRRGHKPMGDLGFAYIKTLRAFVEQQGGTIMTETPVKELLVTDGQVRGVIATNAAHEKVIVHADAVILASGGFAANTKMLQKYNTYWTAIDDDVKTTNSPAMTGDGIRLGTSVGAALVGMGFSQMMPVSDPETGELFSGLQVPPANFVMVNQQGKRFVNEYGSRDELTQAAIDNGSLFYLIADDEIKKTAYNTTQAKIDQQVANGTLFRADTLTDLAHQIGMDPAALTKTIADYNRYVDAGEDPEFHKTAFDLKVAVAPFYATPRKPATHHTMGGLKIDSDAHVLNTDGQVIDGLYAAGEVAGGIHAGNRLGGNSLSDIFTFGRIAAAHAVAEHVDPVTA >CP022294|1226124:1235133|1233035_1233596_+|AWY47844.1|DBSCAN-SWA MQKPMPVAVTNIADNITHQPAYMTIVLNDHKYSTARKKTPFILKALNEGAAAHGRLTITPSRLSLADERGTVFQTLAPIPTVITDVELGLYRSIVRQLGNGVRMKARYTLAVTLTSDTATYQMLNTDLSVLKPLLAWITDFHLHLTDSLQLATSDIDWPNLTADQFEALTKGTPYFAWQQTIGAHW >CP022294|1226124:1235133|1229892_1230507_+|AWY47842.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNATKSTNRQLLQYMQRHFQQQATIEICEIKDLPAFNEPEDRTAPVAIQQLSDKITAADGVIFATPEYDHSIPAVLKSAIEWLSYTTRPLINKPVMIVGASNGSLGTSRAQAHLRQILEAPELKALVMPNIEYLLGRSLQAFDDQGDLTYPDKVQELDNAFGEFIDFVDLTNKIMPSSQFFEKSKQFSWRQVTGEE >CP022294|1226124:1235133|1234451_1234919_+|AWY47846.1|DBSCAN-SWA MRNKLFSVLLGLLTVLVTVIVLGRIGQADDVSTAGLTGNEARVTDRYGNVITDTSQLSKWEDFTVEYDWAIRNGQPIAAGDTELPNGTVAPVDLGFPLKDDNGRVAGHFKIKAGETAGLITFNDALSQMGTNRASTLQFYVKGTADSDVYFDWKL >CP022294|1226124:1235133|1227444_1228416_-|AWY47840.1|DBSCAN-SWA MITNKCRYGLVGLISIVLTFGLSASNRLRASFNAMPAITYMSKYGIINHRTQWQAMLHATDHGRKITSLTQLNQILRAANLHSFAVANLRQVEHATRPTKTMSAGLTIINVPAFYSSQHQLQKQYWTQLQHLIKQTKPTTDLILNFAANTGGSSAPMIAGLAAIIPDGTIYTGITNHHRNRPRMMYHGRITGGLGQDDVNFSQPTAAHFRHIYAIIGNQTASAAEVIIMALKRNPHVTLVGRSSAGYTSLNGGVFLNTAVAVMTIGTLKATVKIHGQQYFNNQPLKPDIPTLYQPLAPLQLGQSPHLDADFLSELRTIMKHYH >CP022294|1226124:1235133|1226124_1227354_+|AWY47839.1|DBSCAN-SWA MARDGTVTETNDLKLHALGEIIGMNEQEAYVTTFYWLADCWLETSYLGLEDEFDDDEIDDAVKSLLNRMQAGAIYEVTADDPMWQAWKRAVRAVLTPNDHAEHEVDETDGEDELVLPAGVRPERQLEEVQAYAAMNAFLQAQDQEYLQEIGKRAATQVSGAGWQVWRAHRQSMHPESAAPLTLTAEQLPAVMWAFFDKYQDTEDSFEIFELVNRLEQWQKSADRDLDAQWSQLVAKSQIDPAAITLMQGLSLAIEFFDQLEWDGDLTAKATLQNKLMQRTLDDTLNDETTANWTDAWQHWDLADPLTTEQWARRFDPADDYEDESEEDGAARPAWQLGASYSTVLIAMRLVAYGVLRPESVPGMATVKMANRALAATVSIGIVLVAWLVTAILITIVIWGWRWLRKLIF >CP022294|1226124:1235133|1233666_1234107_-|AWY47845.1|DBSCAN-SWA MAQIYIASPFFSPEQVTRVTQLEEALAKNPTVTDFYSPRLHQDAQAEQFTKTWATEIFHRDMAQIAAAQVIVTVLDFEAKNLDSGTAYELGVATMRDLPIIALQEKDEAVNLMITESLHWYTKQVSDFETYDFQQLPKGDFIGEIL >CP022294|1226124:1235133|1228601_1229549_-|AWY47841.1|DBSCAN-SWA MPKSDSSEMRRFLDVLLKHGNFTRAAKDLYISQPYLTQSIRNVEKELGVTIINREVTPLRLTTAGRTYYQYLTALENEKDYFNKQIRQYTHANQQVIRLGVLSSLGYYLLPLFLPAFLKAHPATKIELTEDIASRNEQRVLHGELDFLIGQNPETIAPGLESYDRGRDGYYAIIPNTVNWYQPHQAFINPGALPLNDLLQAPLVLSPHGSSIRRQVDYLLQKHNVTPNIVIESTNTATITKLATAGLGITFLPDSVHTQPDPERYNILPLPQALMSLNYFIAFPAEHSLNQVEKDLVTIFLTQLEADLAQSSTIS |
9 | Lactobacillus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1719418 : 1820863
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP022294|1719418:1820863|DBSCAN-SWA AATGCGAGGATCAATTAGAAGACGTGGCAACCGCTGGTATTATGCATATGAAGGCCCCACCATAGACGGTAAACGGCAGCGAATCGAGCACGTTGGTGGTCGGACCCGTGAAGAAGCAGAACGGGCCCTGCGCAAAGCAATTGATGAGTTTGAGCGCGGCGGTGTTGTCATCAAGTTGACAGAGATGAGTGTAGCAGACTACTTCGATTATTGGCACGAGAATTTTGTTGTAAAGACTCTTAAATATAACACGCAAACGAATTATCGTAATATTATCAACAATTACATTAAGCCCGATATCGGCATGTACCGAATGAAATCAATTGGTCCAGCATCAATTCAAAAGTTCGTAAATGACCTACCCACAGACAAGCTCTCAAAGCACACTATTGAGATCATTGTTTCAGTCTTACGTAAGGGCTTTAAGATGGCCGTCTTCCCTTACCAATTAATCAAAGAAAATCCAGCAAACTACATTGTAAAGCCCACTAATAATAATGATGATGAAATAACCCAGCAAGCTGCTCGAGATAAGCTCAAAATCATCAATATGGGCCAGTTCAAGCAGATACTAGCACTTGTTCCTGAATCTAACCCCTTGTATCTCCCACTTATTATCAGCTTCAACACTGGCTTGCGCCGTGGTGAGGTTTCAGGACTCACATGGGACAACATCGATTTTGATAACAAAACCTTGACCGTGAACAAGCAAATGATTATGAAGAAAAAAGAATTTGACGTTACGTCACCCAAAACTAAGGCAAGCTATCGTACAATTGCAGTCGGAAATTCACTGCTAACTGTTTTAAAGCGTTTCAGAACTTACCAGAAGGAAAATAAAGTGCGTTACGGACAATTTTACTTTGATAGCCCATTTGTTTGTACCAAACAAAATGGTAAGCCGATTACCCCTAGCGTAATTAAATACGACACAACTAAACTATCACAGGAATTAGACTTTCCATTTAATTTTCACTCATTACGGCACACACACGCAACGATGCTGCTAGAAAATGGAGCCAAGTACAAAGAAATACAGCAACGCCTTGGTCACTCACGTATTTCAACAACGCTAGATATCTATTCCCACGTAACCAATAAGATGAAACGTGATACTGTTGATATCTTCGAAAATATGTTAAAAAACAACAGTTAAAAAGATGATAGACACTTTTTCGATATATGTATATTTTGCCAACATCACAGTTTCAATGTTGGCAAAATGTTGGCAAAACGGAAAAATAAAAGAGCTCCGCTTACGCGGAACCCTATCAGTTCGGCTTTTCGTCTTCGTCGGTTTTCAGAACAGCCATGAACGCTTCTTGCGGGATTTCGACTTTACCGACAGCCTTCATACGCTTCTTACCAGCTTTTTGCTTTTCAAGTAGCTTCATCCGCCGCGTCCGGTCACCACCGTACAGATGGGCCGTCACGTCCTTACGGTAAGCTTTAATATTCGTCCGAGCAATGACTTTAGAACCAATCGTTGCCTGTACCGGAATTTCAAAGTTTTGCCGGGGGATAATCGTCTTGAGCTTGGCGGCAATCTCGCGTCCACGCGCAGGTGCAAAGTCGCGATGTGCGATAAAACTCAGAGCATCAACTTGGTCACCGTTTAATAAGATATCGATCTTAACGAGGTCACTGGCACGGTAGCCGTCTAAATCATAATCTAACGAGGCATAGCCGCGCGTGTTCGACTTTAATTTATCAAAGAAGTCAAAAATGATTTCGGACAACGGAATGTGATAAACCACGTTGACCCGATTACTATCCAAGTACTCCATCGTATCAAACTCGCCCCGTTTACGCTGGGCTAATTCCATGACCGCACCAACGTAATCATTAGGCACCATAATCTGAGCTTTCACATACGGTTCACGAATTTCCTTGATTGCAGACGCCTCAGGCATTTCAGCCGGGTTTTCCACCTTTTTCTCCGTGCCATCAGTCATCCGCACATGATACGTTACGGACGGCGCCGTGGTAATTAGTTCAAGATTAAATTCCCGTTCGAGGCGCTCCTGAATGACGTCCATGTGTAGCAGTCCCAGGAATCCACACCGGAACCCAAAGCCCAGTGCTTGTGATGATTCCGCTTCAAATTCCAATGCGGCATCGTTCAATTTTAATTTTTCCAACGCTTCCCGTAAATCGGTGAATTTGGCATTATCAGTCGGATAAATCCCAGCGTAGACCATCGGATTCATTTCACGGTAACCCGCCAATGGTTTTTCGGCCGGATTTTTCGCGTTCGTGACCGTATCACCTACTCGGGTATCCTGAATATCCTTGATGCTAGCCGTAATGTAACCAACATCCCCCGCCATCAAATAATCCCGTGCTAACGGTTTCGGTGAATTAACGCCGACTTCCGTCACTTCATATTCACTACCACTGTTCATCAACCGGATCCGATCTCCTGGACGAACGATGCCTTCATGAATCCGAACACTCAGCACCACGCCCCGATAATCGTCATAGACGGAATCAAACACTAGGGCCTTGAGTGGCGCATCAAGATCCCCCTGAGGAGCCGGAATCTTATGCACGATTTGCTCGAGCAGATCTTCGATACCAATACCGGCTTTCGCTGAAGCTAGAACAGCATCTTCCGCATCAATCCCAATGTCATCTTCAATTTCTTTGCGCACCTTTTCAGGTTCAGCCGATGGCAAGTCAATCTTGTTGATCACCGGGACAATTTCCAAGTCATCATCAATGGCTAAATACACGTTGGCTAGCGTCTGGGCTTCGACCCCTTGCGCCGCATCCACGACTAAAACCGCCCCTTCACAGGCTGCGAGGCTCCGTGAGACTTCATACGTGAAGTCAACATGTCCAGGTGTATCGATCAAGTGGAAGATATAAGTCTCCCCATCCTTTGCTTGATAGTGTAACTCTACCGCATTCAATTTGATCGTAATCCCACGTTCACGTTCCAAGTCCATTGAGTCCAACACTTGGTCTTGCATCTCACGTTTGGAAATCGTATCAGTTAGTTCCAGAATACGATCCGCCAACGTCGATTTGCCGTGATCAATATGGGCGACGATTGAAAAATTCCGAATATGTTGTTGTCGGTCTTGCATTGTCGCTTTATCCATTGATTTTCCTACTTTCTTCCTAAATCCTAATCCCTACAATTATACCAAGTTAGTGGCACAAGCACAATTTTTCTATCAGACCGCTCCAGACACCCCGCTGCGCCACTGAATAAATGACGTAACAAAAAAGTACAAGCCAATATGGCCTGTACTTTTTAGTAGGTTATTCAAAATCCTTGATTTCACTGGGTTTGAGTAATTGCCATTCTTTTGAATAGAAGTCGTCATTAATCTGATAATGAACCGGCTTCGTCTTCTTAGTCAAGAATGGATCAACCTTTTGATCCACGGCTAACCAACCACGCCAGCCAAGATGAATCGTATCAGTCATGAAGTAGTCCTTACCACCGTCCTGGGTCAGGTCCAAGACGTTATTAAACCCTTGACTCTTCAACTGGTACTGAATCTTCTTGTCAAACTGAGCAATCATCTTCATTGACAGTCCGGTATAAGCAGACCAGCGCTGATTGATTGGTGGAATGATGAACAAGACATCGGTGTGTGTCTTTGCAAACTGATTCAAAACCAGTTGAAAATCGGCAAATTCTGGTGACTTCGTGTAATTCAAGTGTCGCTGTGAATCTTTGAGTCGCTTGTAATTACGTTTTAACTTCGTGTTCCAAAATTGATTGCTGATTTCAAGACTGTTCGAGTCCGTTTGCGCCGCACCGATTTTACCGGCTAATTGGTTTAACTGATTAAAGTTATATGTCGCTGGTAACTTGTTAGCTTGCGCATTGACAGTCCGTAAATTTTTGCCCGCAATTCCAAAACGTGAGAAGAACTCATCCTCACTGCCAAGGACACGTGCCTTATAGTTAATATACGTCATTTGTGCGCTCGTTGGTTTAAACCCAGCTGCCACACGTGCCAGGGCGCCTTCCAAAATGCGATCAGAAGAACCCGATGGCATCTGTAACAAACGTTGAGCGGCATACCGGTCCATTGCCGTATTCTGCTCATCCTGTAACCAATCAATGGTCTGCAGTGGTGAGTAATAGTACGAAAACGCATCTTTCCGCGTTCCTTGTGGCACAAACCATTGTGGCGAAATTACAAAGACGGCCTTCTTATTTGTAATCTGCTTTTTCACCGATTGCATCGCGAAATACTGCGTCAACGACTGGGTCCCCCGCGCACCGAGTAGAAATGGTCGGTAATTGCGGTGATATTTTGTTGCCAGTACGGACGGATGCATTGGATCAAATCGTGACCATTCTGAAGAACCAAAGAACGGGACATAGCCATCATCCAGCGCCTGTCGTTTAACTAACCGACCTTTTAATACGTTGGCTGACAAGGAAACGGCCGCTTTTTTCTCAGTATCCTTAGAAATATGGTTTAATCCAAATGAGAACGGTGAAAGCAGTACGGCCAATAATAAGACGGCTGCCAAAATAATTGGCCCAAAAATCTTAAAAAGGCGTTTGGCAACGTTCATTGCAAGTTCTCAACCTTTGCAACAATCTTAGCCGGTGTATCCCATTCTGACCGTTGAAATTCAGAGACCGGCACTTCGATTCCTAATTGATTTTGAAGTTCCAATAAAAGTTGGACGGAACCCATTGAATCTAAGATTCCTTCATCAAACAGGTTAACGTCCATGTTACTGGAAACATCTTCCCCCGTTAAGTCTGCTAAAATTGATAAAACCGTTGCTTTTGTATCATCCATTGTCATTACGCTCCCTTATTGTAATTATATTATGGCCGGGCTCCAAAGAATAACGTGTTCAAGAATCCTGAGAAGATCAAGAAACTGAAACAAACGACGTTAAACGTTAGGAAAATCGCAAAGTATTCCGTAAATTTATTAGACGGCAACTGCGCTTGATGTTTCTTCTTGTACCGTAACCAAGCATCGTTGACAACCATTGCTAAACCATGGAATAGC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106 | Lactobacillus_phage(67.92%) | tail,capsid,portal,tRNA,transposase,head,terminase,protease,integrase,holin | attL 1761316:1761333|attR 1827802:1827819 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2142502 : 2179627
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP022294|2142502:2179627|DBSCAN-SWA 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47 | Lactobacillus_phage(37.5%) | tail,capsid,portal,head,terminase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2379998 : 2388512
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP022294|2379998:2388512|DBSCAN-SWA CTTAAATTGCTCCTTCATTAATGAGTGTCTGTAATACATCTGGATAAAATTGGTGTTCACAATCATGAATCCGGGTCGCCAGGCTGGCTAGCGTATCGTCTGGTGCAACCGGAACGACCCGCTGGGCAATAATTTGCCCGGTATCGATTCCGGCATCGATATAGTGAATGGTAACGCCCGTCTCAGTCACACCAGCGGCAAAAGCATCCTCGATGCCGTGACGACCAGGAAACTTTGGTAACAATGCTGGGTGAATATTGATGATTTTATGAGCATACGCATTCAAGAGGGTCGGACCAATAATGCGCATGTACCCGGCCAATAATACCAGTTCAATTTGCCGTGCTTGCAAGGCCGTCAAAATGATTGCTTCCGCGGCCGCTTTATTCGCATAATCATGAAAATCAACAATTAATATCGGTACGTTAGCTGCCCGGGCCTTGTCAATTACCGGCGCTGTCGGCTGATCACACACAAGTAACCCAATCACTACCGGTAATTGTCGTTCGATAATCGCTTGGTGGAGTGCAACAAAGTTGGTGCCGTTACCCGAAGCAAATACTGCAATTTTATTAGGCATGCTCAGCCTCCTCAAAAACAACGGGTGTCGTACCAGTTTGGACTGTTCCAACTCGATAATAGGACTGAGCGTTGGCCGTCAAATTAGCCGTCACAGCTGCCACTTGGTCGGAGTGAACGATCAGAACCATTCCCAAGCCCAAGTTAAAGGTCGACCGAAGATCCATAGCAGTCAGCCCACCGAGTTCGGCCAATAACGTCATAATCGGCGGTGCCGGCCATTGACCCAATTCAAGGTGCGCACTCAAGCCCGCCGGTAACGCTCTGGCGACGTTCTCAATCAAGCCGCCCCCGGTAATGTGGGCGATACTCGTCACTAATTTCTGCTGTAATAATGGTTGAACTGCATCAACGTAAATGGTCGTTGGTCGTAAAAGTTCCGTTTGTAAATCATGACCAAGTTCGTCAAAAACCGTGGTCAATTGGTAGTCGTGTTGTTTGAATAAAATATCACGAACTAGACTAAACCCATTCGAGTGGAGGCCATTAGACGGCAACCCAATCAAGACGTCCCCAGCCCGAACATTTGCCGGTGATAACAGGTCCGCGCGGTTCGCAATTCCGACCGCAAAACCAGCGAGGTCGTAATGGTCCTGACCATACATATCGGGCATCTCCGCAGTCTCGCCACCAATCAACGCTGTATGGGCCTGCTGACAGCCCGCGACGACGCCAGTCAAAATGGCTTTGACCCGTTTCTGATCCGTATGTCCAAGACCTAAGTAATCTAAAAAGAACTGGGGGGTCGCGCCTTGTGCCAAAATATCATTCACACACATTGCGACCAAGTCAATTCCAATCGTGGTATGTTGATCAGCAGCGATTGCGACTAAGAGCTTAGTCCCCACACCATCCGTCCCCGCTACTAACACGGGATCGTTGGCAGTTGCATCCGGACTAAGTGGAAACGCCCCCCCAAACGCGCCTAATTGCTGATTGCCACTCATTTGTTTGACCGTCTTTAAGACGTCGTAACCAGCGTTGATATCAACGCCAGCCCGCTTATACGCATCGCTCACTTGATCACCCCTTCATGATTGGCTTGTAATTGCGCAATTTCCGCATCATACTCGGCTTGGTAATCATACAGGGCCGTTGGATAATCCCCATTAAAGTAGGCCATACATAGTCCACCATACGGTTCAGTGGTTGACAAGCCAACTGCATCAACGACGCCCTGTTCACTGAGAAAACCAAGTGAGTCCGCACCAAACGTCTGACACATCTCCGGAATCGTTTGCTGAGCCGCAATCAATTCATTAGTCGATTGAATATCGATACCGTAAAAACATGGATAGCGTAATGGTGGCGATGCAATTCGTAAATGAACTGACTTTGCACCCGCATCTTTCAATAATTTGACGATCCGCCGACTGGTGGTACCACGTACAATCGAATCATCGATTAAGACGACTCGTTTACCAGCGACAACACCTTTGACTGCTGAAAGCTTCATCCGAACCCCCTGTTCTCGCAATGCTTGGGTCGGCTGAATAAAGGTCCGTGACGAATATTGATTTTTAATTAATCCCATCTCGTAAGGCAGGCCACTCGCTTCCGCATAGCCGGTCGCCGCTGATAAAGATGAATTGGGTACCCCGACAACAATGTCGGCGTCCACAGGCTGTTCAACAGCGAGCTGAGCACCCATTCGTTTACGTGCAGAATGGACGTTGACGCCGTGAATATCAGAATCTGGACGTGCAAAGTAGATAAACTCCATTGAACAAATCGCCAACTGTGTATCAGTCGTATAATGGTCGATCGTCAAACCATGATCATCGATCGTTAACAATTCTCCCGGCTGAACATCTTGAACAAACGTCGCACCAATCGTATCAAGCGCGCAAGTTTCACTACAAACGACGTACCCGCCCGTGGGTAACTGACCGACGACTAATGGTCGTAACCCGTTAGGATCCAAAGCGGCAATCAAACAATCATTCGTTAGTAGTAAGTAAGCAAAGCCTCCGTGGACTTGACGTAAAGCATCCTTAACCTGTTCCGTTAACGTTGCTGCGGGGCTGCGTCGAATCAGATGCATTAAAATCTCACTATCAGAACTAGCATGAAAAATGGCACCATGCTGTTCCAACCGTCGCCGCAGTGTCACCGCATTCGTCAAATTGCCGTTATGTGCGAGTGCAAACTGTGAGTCGCTAAAATTAAAACTCAAGGGTTGAATGTTTTCCAATCCATGATTACCAGCCGTGGCATAACGTACATGGCCGACTGCAGCTTGACCCGTCAAACGTGCCAACCGCCGTGGGTCCCGAAAGACATCAGCCAACAACCCTAGTCCGCGTTCCGTCTGCAGTTTGCCGTGATCATTCGCCGTGATACCGGCTCCTTCTTGCCCCCGGTGTTGTAACGCATGGAGCCCAAAGTACGTTAATTGGGCGGCGTCCGGCGAGCCCCAAACCCCAAAGACGCCACATTCTTCATTCAGACTTCTTACTTCAGTAGGCATGGTAAGGCCCCTTCCCACAACTGTTTGGCGAAACTAACCTTAATATCAAACGCCTGATCAGCAGTTTGAACGTGTAGCCGATCCGTTGCAGTTGTTCGTCCTAAATAGGTCACATATGGTTCCATTAAACTTTCAAACGCGGCTTGCTGTGCTGGTGTCACCGAGATAACAAATCGTGACTGCGTTTCCGCAAAGAAGTTGGCAGCGGGCAAGTCACTGGCCAGTTCCACCCCGATATTTTGTGGAAAACATGATTCGGCAATCGTCGTAATCAAGCCACCTTCAGAAACATCGTGGGCACTAGCAACTAGTCCTTTTTGAATCGCAGTTAACAATAGACGCTGATTACGATTTTCAGTCACAAGGTCAAAATCAAACAGCTCGCCACTGATCGTTCCCGTCAACATCTTTTGCAGCTCACTACCATTGAAATCGGCTTCTGTGGTACCTAACACGTAGACTGCATCGCCAGCGTGTTTAAAATCGCTAGTCGTAATATCTTTCTGATGCTTAATTAACCCGACCATCCCAATCATTGGGGTGGGATAGATGGCTTCCCCGTTCGATTCATTGTTCAACGAGACATTGCCAGAAATCACGGGCGTATTGAATAATTGGCATGCACGAGCGATGCCCATCGCCGATTCGTCCAAATCGTAAAATTGTTCAGGTTTCTCTGGATTACCATAGTTCAAGCAATCAGTGATGCCTAAAGGTTGCCCACCGGAAGCGACAATGTTTCGAGCAGCTTCCGCAACGGCGATTTCCCCACCGACACGGGGGTTTAAGTATAAGTATCGCCCGTTAACATCGGTGGTGACCGCCAACGCCTTATCCGTATGTCGAATCCGTATGACCCCCGCATCGGAACCCGGCTTGACGACCGTATTCGTTTGGACCTGCGAGTCATACGTTCCATATAACGACGCTTTGGAAGCAATCGTTGGCTGTTGGAGCATCTTCTTCAATGTGCCAGTTGCATCAACTAGTCGTGGCATAAATTGATGATGGCTCTGATGGTTCAAGCGCGTTGGTCGTTTCTTTTCGCGTTCATAGACCGGCGCTTTGGTCGCAAGTGCATCGACGGGAACATCTGCAACTAACTTACCATGATGGAATAATTGATACTGGTGGCCGGCTGTCACTTTACCAATTGTGACAGCATCAAGACCGTACTTTTCAAAGACTTGATAAATTTCTGCTTCGGCACCAGCTTTGACACATAGTAACATCCGCTCCTGTGATTCAGAGAGCATCAGTTCAAACGGCGTCATGCCAGTTTCACGTTGTGGTACCAAGTCAAGATTCAGTGACAACCCACTGCCTGCTTTGGACGCCATTTCGGCTGAGGAGGAAACTAGGCCCGCCGCGCCCATATCTTGAATCCCGATTAAAACATCACGATGTTCATGAATAACCTCGAGACACGCCTCCATCAATAATTTTTCCATAAAGGGATCACCAACTTGAACCGCGGAACGCTGGGTTTCATTGGCGTCATTAAATTCAGCAGAGGCAAAGGACGCACCGTTAATGCCGTCACGCCCCGTTTTTGCGCCGACATAAATAACGGCGTTGCCAATTCCTGTTGCTTGGCCCTTCTGAATATCAGCTTGATCCAAGATTCCAACACACATGGCGTTCACCAACGGGTTCTTCTGATAACTCGCATCAAATACCGTATCACCACCGATTGTCGGAATTCCAATACAGTTGCCATAACCGCCAATGCCGGCGACTACTTGCGAAATCAAGTATTTCGTATGAGCATCAGTCGGTTCCCCAAAGCGAAGACTGTCCAGCAGCGCAATCGGCCGGGCCCCCATCGAAAAGATGTCCCGAATGATACCACCCACACCCGTTGCCGCACCCTCATAAGGTTCAACTGCAGACGGATGATTATGACTTTCAGCTTTAAAGACCACGGCCTGACCATCACCGATGTCGATAATACCGGCGCCTTCACCAGGCCCTTCAAGTACCTGTTCACCCTGCGTCCAAAATTTTTTCAAGACTGGTTTTGAATTCTTGTAGGAGCAATGTTCGCTCCACATGCCGGAAAACAACCCGGTTTCAGTCTCGTTAGGTAAGCGTTGAAGGACCTTATCCGTTAATAATTGATACTCAGCATCGGTTAAGCCCCAATCCCGATAGACCTTAGAATCGCGAACATCTGTAGGTGATAATGGTTGCTTTTTAAGCATGGGTGACCTCCTCTTGACTCGCAATGACCGATTGAAAAATTCCGAGACCGTCCGTGGAACCTAAGATCATCTCCACGGCCCGTTCCGGATGGGGCATCATCCCAAGCACATTTCCCGCTTCATTTGTAATGCCAGCAATATTAGCCGTGCTGCCATTTGGATTCTCGACGTATTCGAAGATGATTTGATGATTAGCACGTAATTGCGCCAAGGTGGCCTCATCACAATAATAATTGCCTTCGCCGTGGGCAATCGGTAAACTAATTTGATCTGTCGATCCGTATGCGGTGGTAAAAATCGTCTCATGATTGGCAATTCGTAATGGGCTGTCCTGACAAATAAACTTCGCTGAGCGATTGGCCTGCAATGCACCAGGTAATAATCCGGCTTCGGTCAAGACTTGAAAGCCATTGCAGATTCCGATGACTGGTTTACCAGCGTTAGCAAATGCAATAACGGCCGGCATGATGGGCGCAAAGCGGGCAATCGCACCACTCCGTAAATAATCACCGTACGAAAAGCCACCAGGTAACACCACCGCGTCATAACCTGCTAATGAGGTCGCTGTCGCCGGAATCAAATCAGCCGTAACGTGTAAAATATCGCGCAAGGCATTCACCATGTCATGATCACAATTAGAACCAGGAAAGACTGGTACGGCAAATTTCATCATTACAAAGCCTCCATCTCAGTAATTTCGTAACGATAAGTTTCCATATTAACGTTGGCTAACAAGCGATCACACATCTCGTCGATTTCAGCGGCAACTGGCCGATCATCCGCGTGAATTTTCACCTCAAAATACTTACCTAATTCAACGGCATCGACATTCGTATATCCAAGTCGGTGTAAGGCATCATGAATCGCCTCACCCTTGGGGTCTAGAATTGATTGCTTATAAGTCACATAGATTTTAACTAAGTACATGTTAGGCCTCCTCAACGGTTGCTAGCCGCGTCAATACTTCCTGATAAACACTAGTCAAGTCGCCTAGATCCTTGCGGAAGACATCCTTATCAAGCGATGCACCGGTCTTTAGGTCGACTAACCGACAACTATCTGGTGAGATTTCATCAGCCAGCAAGACTTTACCGGTGGTCGTCAACCCAAATTCGATTTTAAAATCAACGAGCTGTACCCCCATCGCCGCAAAAATTGCCGTCAAACGCTGGTTAACCTGTAAGGCCTGCCGTTTAATTTCCGCCACGATTGCCGGTGTTGCAACATTTAGCGCGTGGATTTGTGAATCATTGATAAATGGATCATCCAGCTGATCACTCTTATAGAAAAATTCCAGTACTGGTTCTGCAAATTTGGTTAAGTGTGGCACGGCAAATTTACGCTCAAAACTACCCGAAGCCGCATTCCGAACAACTGTCTCCAAGGGAATCATGGTCACGCGACGGACAAGTTGCACATAGTCTGAAGGTTGCTCAATAAAATGGTTGGCAATGCCGTGATTGGCTAAGTCTTTGAAAATCAAACTCGCGATGCGATTATTCAATCGGCCTTTCTGGTCAATGGGAACCTTCCGCTTACCATTTAGCGCTGTTGCTTGATCTAAGTATTCGACCCATAGAATTTCAGGATCATTAGTGGCATACATCGCTTTCGCTTTACCCGTGTAAAGCAAAGCTTGTTTCTCAATCGCTGCCGTCATTATTATTGTTCCCCTTTCAAATTTGCCAACGACGCTAATGCTGCGTCAATATCGTGATTTAATACGGTGACATGACCCATCTTGCGCTGGGGCTTAATGGCCGCCTTACCGTAGTCGTGAAAATGCCATTCTGGGTGTTCAACCAACTGTTGACGTGCCACTGTTAAGTCATCACCTAGCAGATTACGCATCACTGCCGGACTGGTCTGCGTAATGGCCGGAATCGGTAAGCCACAGATACTTCGAATATGGGCCTCAAACTGCGAGATGTTGCAGGCCTCAATCGTATAGTGACCAGAATTATGTGGGCGTGGTGCCAGTTCATTGACTAATAAAGTATCATCCGGTAAAACAAAGAATTCGATTCCTAGCACGCCGCGTAGTTCCAGAGATTCAGCAATCGAAACCGCAATTTTGCGGGCCGCACTATGAACACTGGGCTGAACATTAGCTGGGGCAATCGTTGTGTGTAAGATATGATGTTGATGCTGATTTTCAACTAACGGAAAAGTCGTAACAACACCAGCAGCACTACGCGTCACCATCATGGAAACTTCTGTTCGAAATTTCTGCCGCGCCTCTAGAATGCACGGCTGTGTCAATAAGGCACTAGCGGCTTTTGTCACCACTGCTGTGTCTAGATCCGTTTGTCCGTGACCATCGTAGCCACCTGCCGCCGTTTTGAGAATTGCCGGCGTACCAACACGGTTGAGGGCGTAATTTAATGACTGTAAATCCGTCACCGGTGCGAAAGATGTGACTGGGATGCCATGATCATGAAGAAATTGCTTCTCATTAAGACGATCTCCAGTAATATGCAGGAGTGCAGTGCCCTGCGGTAACTTTGCATAGGCTTGCGCAGCAATCAAAGCATTCTCATCAACGTTTTCAAACTCGTAGGTCAAGACATCACTACGGCGCGCTAGATCAAGTAAAGCCGCCTGATCATCATAAGCCGCAACAATCTGAAAGTCTGCGACCTGGGCTGCCGGTGCTTTGGGTGTCGGGTCAAGGACACCTACCCGATAGCCCATCGCCTTCGCGCTAAGCGTCATCATCTGACCGAGTTGACCGCCACCAACGATTCCGATCGTTGCGGGTGGTAAGAGTGCTTCCTTAAAATTGGCGTTCACTTTGTTCAGCCTCCTGACGTTGACGAGCACGAAATTCTCCAATTGCATGTTGTACTTGTGGTTCCCGTAAACCGATAATTTGGGCGGCCATTAGCGCACCATTCTTAGCCCCCGCATCACCAATCGCCATCGTCGCCACGGGTACGCCAGCTGGCATCTGTACGATTGACAATAACGAATCAACTCCGTTCAACGTATGGGTCTTAATGGGCACCCCAATTACCGGGAGTAGTGTATTGGCAGCTAGCATCCCGGGTAAATGGGCAGCGCCCCCCGCACCCGCAATAATAACTTGAATTCCCCGTGACGCTGCTTCTTCACCATAGGATTGTAATGTCTGGGGCATTCGGTGGGCCGAAATAACGTGACGCTCATAAGAGACTCCCAGTGCCGTTAACTGTTCTGCCGCTAATTGCATGGTTGGCCAATCAGAAATTGACCCCATAATCAAACCAACTTTCGCCATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP022294|2379998:2388512|2385922_2386177_-|AWY48926.1|DBSCAN-SWA MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLGYTNVDAVELGKYFEVKIHADDRPVAAEIDEMCDRLLANVNMETYRYEITEMEAL >CP022294|2379998:2388512|2379998_2380577_-|AWY48921.1|DBSCAN-SWA MPNKIAVFASGNGTNFVALHQAIIERQLPVVIGLLVCDQPTAPVIDKARAANVPILIVDFHDYANKAAAEAIILTALQARQIELVLLAGYMRIIGPTLLNAYAHKIINIHPALLPKFPGRHGIEDAFAAGVTETGVTIHYIDAGIDTGQIIAQRVVPVAPDDTLASLATRIHDCEHQFYPDVLQTLINEGAI >CP022294|2379998:2388512|2385242_2385923_-|AWY48925.1|DBSCAN-SWA MMKFAVPVFPGSNCDHDMVNALRDILHVTADLIPATATSLAGYDAVVLPGGFSYGDYLRSGAIARFAPIMPAVIAFANAGKPVIGICNGFQVLTEAGLLPGALQANRSAKFICQDSPLRIANHETIFTTAYGSTDQISLPIAHGEGNYYCDEATLAQLRANHQIIFEYVENPNGSTANIAGITNEAGNVLGMMPHPERAVEMILGSTDGLGIFQSVIASQEEVTHA >CP022294|2379998:2388512|2388026_2388512_-|AWY48929.1|DBSCAN-SWA MMAKVGLIMGSISDWPTMQLAAEQLTALGVSYERHVISAHRMPQTLQSYGEEAASRGIQVIIAGAGGAAHLPGMLAANTLLPVIGVPIKTHTLNGVDSLLSIVQMPAGVPVATMAIGDAGAKNGALMAAQIIGLREPQVQHAIGEFRARQRQEAEQSERQF >CP022294|2379998:2388512|2381591_2383046_-|AWY48923.1|DBSCAN-SWA MPTEVRSLNEECGVFGVWGSPDAAQLTYFGLHALQHRGQEGAGITANDHGKLQTERGLGLLADVFRDPRRLARLTGQAAVGHVRYATAGNHGLENIQPLSFNFSDSQFALAHNGNLTNAVTLRRRLEQHGAIFHASSDSEILMHLIRRSPAATLTEQVKDALRQVHGGFAYLLLTNDCLIAALDPNGLRPLVVGQLPTGGYVVCSETCALDTIGATFVQDVQPGELLTIDDHGLTIDHYTTDTQLAICSMEFIYFARPDSDIHGVNVHSARKRMGAQLAVEQPVDADIVVGVPNSSLSAATGYAEASGLPYEMGLIKNQYSSRTFIQPTQALREQGVRMKLSAVKGVVAGKRVVLIDDSIVRGTTSRRIVKLLKDAGAKSVHLRIASPPLRYPCFYGIDIQSTNELIAAQQTIPEMCQTFGADSLGFLSEQGVVDAVGLSTTEPYGGLCMAYFNGDYPTALYDYQAEYDAEIAQLQANHEGVIK >CP022294|2379998:2388512|2386178_2386910_-|AWY48927.1|DBSCAN-SWA MTAAIEKQALLYTGKAKAMYATNDPEILWVEYLDQATALNGKRKVPIDQKGRLNNRIASLIFKDLANHGIANHFIEQPSDYVQLVRRVTMIPLETVVRNAASGSFERKFAVPHLTKFAEPVLEFFYKSDQLDDPFINDSQIHALNVATPAIVAEIKRQALQVNQRLTAIFAAMGVQLVDFKIEFGLTTTGKVLLADEISPDSCRLVDLKTGASLDKDVFRKDLGDLTSVYQEVLTRLATVEEA >CP022294|2379998:2388512|2380569_2381595_-|AWY48922.1|DBSCAN-SWA MSDAYKRAGVDINAGYDVLKTVKQMSGNQQLGAFGGAFPLSPDATANDPVLVAGTDGVGTKLLVAIAADQHTTIGIDLVAMCVNDILAQGATPQFFLDYLGLGHTDQKRVKAILTGVVAGCQQAHTALIGGETAEMPDMYGQDHYDLAGFAVGIANRADLLSPANVRAGDVLIGLPSNGLHSNGFSLVRDILFKQHDYQLTTVFDELGHDLQTELLRPTTIYVDAVQPLLQQKLVTSIAHITGGGLIENVARALPAGLSAHLELGQWPAPPIMTLLAELGGLTAMDLRSTFNLGLGMVLIVHSDQVAAVTANLTANAQSYYRVGTVQTGTTPVVFEEAEHA >CP022294|2379998:2388512|2383030_2385250_-|AWY48924.1|DBSCAN-SWA MLKKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQLLTDKVLQRLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDASYQKNPLVNAMCVGILDQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLEVIHEHRDVLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLSLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTAGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYEREKKRPTRLNHQSHHQFMPRLVDATGTLKKMLQQPTIASKASLYGTYDSQVQTNTVVKPGSDAGVIRIRHTDKALAVTTDVNGRYLYLNPRVGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNYGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQKDITTSDFKHAGDAVYVLGTTEADFNGSELQKMLTGTISGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLITTIAESCFPQNIGVELASDLPAANFFAETQSRFVISVTPAQQAAFESLMEPYVTYLGRTTATDRLHVQTADQAFDIKVSFAKQLWEGALPCLLK >CP022294|2379998:2388512|2386912_2388043_-|AWY48928.1|DBSCAN-SWA MNANFKEALLPPATIGIVGGGQLGQMMTLSAKAMGYRVGVLDPTPKAPAAQVADFQIVAAYDDQAALLDLARRSDVLTYEFENVDENALIAAQAYAKLPQGTALLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTSFAPVTDLQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQTDLDTAVVTKAASALLTQPCILEARQKFRTEVSMMVTRSAAGVVTTFPLVENQHQHHILHTTIAPANVQPSVHSAARKIAVSIAESLELRGVLGIEFFVLPDDTLLVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPAITQTSPAVMRNLLGDDLTVARQQLVEHPEWHFHDYGKAAIKPQRKMGHVTVLNHDIDAALASLANLKGEQ |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 45428
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP022292|0:45428|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP022292|0:45428|42989_43271_+|AWY46746.1|DBSCAN-SWA MAVKEKKRVQVKIDKDLADDTEAVLSELGLNPTTAINMFYKRIVANGALPFNASLSEEEKANLRFLKATEGTPVTEFKDAKEVADWLNDLDED >CP022292|0:45428|41412_41625_+|AWY46754.1|DBSCAN-SWA MNHGDTVSSSKEVIPKKLHKKKHPPTGIGERHTKVNSFTDYYIMAGAIFKALGDKLGSKSKGTRLPVRLQ >CP022292|0:45428|41631_41838_-|AWY46744.1|DBSCAN-SWA MLPPLIINLRFRFNLLKNALVGVGNTYLCLFDHQLISGTKPKLRFTTRAVNGRAHHSPPSRTDDLVVV >CP022292|0:45428|29083_29257_-|AWY46733.1|DBSCAN-SWA MGTWNNLQEGFTVNERLPGTLVDVAVWHVFNRATQLYRQAPQIKKPPCVTLVGYRVA >CP022292|0:45428|5042_6434_-|AWY46717.1|DBSCAN-SWA 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>CP022292|0:45428|7104_8184_+|AWY46719.1|DBSCAN-SWA MNIQSVNSFLSKKAESLKSIKANVTVDGRGLLPRFFYRGQSNDFKSSNNVASIFRQKELSGYTHEYSFTNEYMRRYANDFNNLENNFSRLSYMQHFGLPTRLLDVTTNALVALYFACQSHLDSERHETDGIVTMFFSNKTQNIDDFTYYSSRSDTVEVLSTLALMDEEKKKSIYRKISSFNKNIDDLLKEDENHLYQSWYMDLVKQFPEGYYEQLSEENQKVYDSLNDFYKEINQSYEMQCLYHDIKRDTGYFADLINFRTLLHPFFVEPSINNERLRAQSGFFLFEPYDGTSCSLENIHDDIDNKVSLYNGHNEPIRLVIPGEKKQQILNELNQSLEINQATLFPDKENVASYIKNNF >CP022292|0:45428|16543_16996_+|AWY46725.1|DBSCAN-SWA MLYISLSGNTKYFISRLTTYFEKERHVRVSSINVKEHPEFTTLDQPFVTFLPAFLKGGNGVNNGYTEILTTILGDYLAYEGNYQHCYGIIGSGNRNFNKQFALTAKQYAKRFDFPYITDFELRGTAHDIPRIADAILTYRNQFCFQTTKE >CP022292|0:45428|32086_32803_-|AWY46735.1|DBSCAN-SWA MKIKNLVLSSTAALALFAISTTVANADTYTVKAGDTVSAIAQAHNTSVSAIEKANKLANVNLIFIGDKLEVNGTTTTTTTSAATSAAPQSATSQATSSAASTTSTTSTQTTQQTTTTQSSAQTSQTQAQPSQASQTQSSQTQTSKPAAQTTTQTSSSTSNYSNNGSDSAAKAWIAGKESGGSYSARNGQYIGKYQLSASYLNGDYSAANQERVANSYVASRYGSWSNAKSHWLANGWY >CP022292|0:45428|17002_19171_+|AWY46726.1|DBSCAN-SWA 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>CP022292|0:45428|23950_24725_+|AWY46730.1|transposase|DBSCAN-SWA MTTPKRYELEDAQWDRIKGYFPPYRTGRPSSLDNRTALNAILWLMRSGAPWRDLPERYGSWKTVYSRFRAWVSSGLFEQVFLELIDDPDMENLSLDSTIVRAHQKATGGKKNAECMVENQAIGLSRGGRTTKIYALVDGLGNPLGFRLTGGQVHDSQVASELLEGFDISQSNIIADKAYGTAKLRQYIEDKAGVYTIPPKENTKDKWTCDYHVYCERHLIENFFNQLKNFRRIATRYDKLAHVYLATVYIASICILLK >CP022292|0:45428|43836_44544_+|AWY46747.1|transposase|DBSCAN-SWA MGRKGSRYTIKEKLFYIGLVTQGMAPNAVQRKYGVEHSQVSRWVKRYGLQGIDGLRHRLMGKYPSELKLKIVLEYLEGHSSYPRLCDKYNIPNVSTIYQWVHQYTSGKQLTTRSVKQVKDGRKTTQLERVEIVQWIIANDMDYSRAMNKYNVSYGQVYSWTRKFKQGGPEALVDRRGKGKTVHDQLTDNEKRDLEVKRLKARIEHLSTENAVLKKLQELERLDATHHTSTKQSKL |
40 | Paenibacillus_phage(18.18%) | transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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