Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029805 | Bacillus anthracis strain London_499 chromosome, complete genome | 4 crisprs | cas3,csa3,WYL,cas14k,DinG,DEDDh,cas14j | 0 | 1 | 10 | 0 |
CP029806 | Bacillus anthracis strain London_499 plasmid pX01, complete sequence | 0 crisprs | RT,c2c4_V-U1,csa3 | 0 | 0 | 13 | 0 |
CP029807 | Bacillus anthracis strain London_499 plasmid pX02, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029805_1 | 1064907-1065000 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029805_1
|
1 spacers
spacers of CP029805_1
>1.1|1064932|44|CP029805|CRISPRCasFinder GCGGTATAGGGAAATTACAAGATGGATCCGGAAAAGTAACAGAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029805_1
The CRISPR arrays of CP029805_1 >merge|CP029805|1|1064907-1065000|CRISPRCasFinder GGTTTAAATACGTTAAATAGCAAAAGCGGTATAGGGAAATTACAAGATGGATCCGGAAAAGTAACAGACGGTTTAAATACGTTAAATAGTAAAA >CP029805|1|1|1064907-1065000|CRISPRCasFinder GGTTTAAATACGTTAAATAGCAAAA GCGGTATAGGGAAATTACAAGATGGATCCGGAAAAGTAACAGAC GGTTTAAATACGTTAAATAGTAAAA
>CP029805.1|AWU52034.1|1063389_1063962_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MAIDRKRSIIEAATKYFSAFGYKATTMDQVAKLANVGKGTIYTFFKNKEELFGEIISNLITEMKQVAENAIRSDVSFFENVHRALYSILEFRKEHQLMIKLIQEERDMGTKEVQEVMQQVDVEIVSVIQSYLKIAIDKGEISKCDPEITAFIMLRLYVSLIFDWEKNHEPLEKEKIAELFELYLLKGLSN >CP029805.1|AWU56307.1|1061286_1063176_+|methicillin-resistance-protein MLINVYLPHFFDWLIETSLMASILVGFILCIKILFRNKLTPRWQYMLWIVLMIRLLLPWSPDSSYSIYSLLSYRSSVSEVIPKNMPSTESKMNIESDRKVELESHAETVTKSGKPEVNVSTEQQITLSLYKIAMYVWLVGVFLLAVITFITNRRLYSYIKKQPDITDEQVVTVFNRCKQSMKMKKAVSLRLAGKIASPTVFSFFRPKVLLSKKHMKVLNEQQLQYVFYHELAHIKRNDVAVNWIMYSLILLNWFNPILWYAYFCMREDQELACDAYALTFIDKEEQIAYGHTIITLLEHYSYQAPSLANLSRNKRTMKRRIVMIKKFQKKSYRLSLLGVIVIVAIASLSLFNVRATEGKEKQEDKVEQSKDAFQNAVDMLYGTEENAKKEYHYSARVYEEKTDYLYLAEKALTKDEFQQYIKLSKKIINIQKKGAPRDSDYESTVFREERLSKADRDKLYALYDQAKPFDDKVYESLNYTVKEAQQHVDFQIKKPTYTIEGYNLKDENVGYFIKRRPELIIELEYTNAKGNYTIYQSQVFGESKDPFSHQFVVPENIEQYELEGNQIFYATDHSDSNLQGMKMIVPAKGKNSAYQVVIINHSLERQGEAVFDKNVNKEELEKIMISMLK >CP029805.1|AWU52033.1|1060873_1061272_+|BlaI/MecI/CopY-family-transcriptional-regulator MTNQLPKISEAELEIMKVLWLKSPQTANEIIEELEDPMDWKPKTIRTLINRLVQKEAVSYHQDKGRMYAYYPLVSQDNYLQVETKSLLKRFCGAAFKPLLVNFLKEEKLSSEDINELKRLLDEKTEENKRKD >CP029805.1|AWU52032.1|1059804_1060644_-|hypothetical-protein MMRALRLNIKQAFCNRVSLIIMFSGFVLICIYHYYYVIRYLGDAASGPISTDIKWIGFRDNEMDVYLLLMPIIASLPFSTSYNSDKSDGFKQFVSKGINLFSYSITKYIVTFFCGGLLYTLPFILSLLFCKLTIPDGEMPAGSGIINVNGMFASLYEASPIIYITVYIEINFLFAGLMALLGLAASAWSQKDYMSLLFPFAATSIPYVLLNTVFPTIGGAPIHLYDPKQPLDGMSPYILTVQCAFFLFVSLLMYIRGVKRDRKKYRRRLQKRDRCRKTF >CP029805.1|AWU52031.1|1059454_1059808_+|hypothetical-protein MQAQLNGKLMNQLAIFFSTIVMLQFIADVTGFTQNLDITYNLIHTAASYITFSLAVIFTLIGARRELSKYAIISLCLVVGIKAKGSLFYGDWLARRKRIVNKPLISKIVRKLEVYYT >CP029805.1|AWU52030.1|1056936_1059303_+|endonuclease MAVKKLLSVFLSFILLLSFTGTLVQAEETTSMSVEKAIQVFKQQGKTKGTVEGYIVGYTQSPSKYTKDPAKFDDTNVAIADSPNETNPDKIMPVQLPKGDVRAAVNVKDHPENIGKKVSLTGTLELYFSSPGLKSVTAHKFQGEEQNRVSDVVASPNGGEVAKGTAVTLTTNTEGATIYYTLDGSNPTNKSVRYNGQIIVNENSVMKAIAEKEGLTSSPISTFSFVIVNNEPVRIHDIQGKSHLSPYNGKKVYNVEGVVTALDKNGFYIEDNQPDNDPATSEGMYVYKKDANVAVGDLIQVDGVVEEYVGPGYAERFETDLTTTEIKASRVAVIAKDQPLPAPIVLGENGVKIPDQIIDNDAFGLFDPNEDAIDFYESVEGMRVTMPTPKIIAPQKNGNLYVTVKNGGNKVVTKYGTPVLDENQLNPERLSVKVPRDYVAKVGDTFTGDIIGVVGYDYGSFRIAPITELPSVVDGGFKQIGANIQPRLDKLTVATYNIENFSANKKETTDEKVKALAYSIKYNLKMPDIIGVEEMQDNNGTVNDGTTDASLSAKRIIDAVLEIRGPKYEYVEIAPNNNLDGGAPGANIRVGFFYNPSRVKLATVPKLLDKNVVRIGDENPLFESTRKPLAAEFTFQGQNLVVVANHLNSKIGDATPFGKVQPLVLKSEEKRVQLAQEVNNFVQGIQKKNTNAPVVVLGDMNDFEFAKPLKTLEGTILKNMLNTVPKENRYTYIHEGNAQVLDHILVTNNIAPHTIVDPVHLNTNIMKEHGRVSDHDPVLAQIDLKKAS >CP029805.1|AWU52029.1|1055343_1056696_-|DUF4026-domain-containing-protein MEVQTETYRAAMNGTLERHFSDMIAVIPTRITIEQLKQRLENIATKVDELKIVYSDETSLIVELHMDNKVIPYELHIDETDDPEEYKLYNRQDSTIVDRSFEDAAYGTEIFTRTLFVGDVLNCFFQQLQFLWNLAPDLLFVIDSSAAMKVISRNYIEYHVENELLPDIPDLYVIHSVYEDDKEGEPTQYWFHTHGLLRAGVTEIELIIPNRISSYYGIGDLFQTFANNAVENGQVPMNEPIVIAHSQQGSIHTVAVPWEKGLSYIGHKTSMDQLSSIEDEEVKLQPISAQNTFLGGMDDRDEYHQSPSVLLFKFDTSEEYIESFFKEHEEATGLMFYKTNSETARMAYNAKNTFGYFSNIFQIEQSNEEFRFLAKFGVSYEEGKSEHMWFEMQHITEEFIQGILINEPYFIEDMSEGNSYHLDFDDLTEWVIYAGDAVIKPNNLYMFIGE >CP029805.1|AWU52028.1|1053882_1055304_+|protoporphyrinogen-oxidase MRKKVVIIGGGITGLTTMYHLQKDIRDKNLPIDTLLIEASGKLGGKIQTVRKDGFTIERGPDSFLARKESAARLVKELGLGDELVNNQAGQSFILVNNRLHKMPSGSMMGIPTQITPFLFSGLFSPIGKLRAGFDLLMPRSKPVSDQSLGHFFRHRLGNEVVENLIEPLLSGIYAGDIDEMSLMSTFPQMYQIEQKHRSISLGMRTLAPKAEKAEPKKGIFQTVKTGLESIVESLELKMHEGTIIKGTRIEKVAKQGDGYAITLSNGKEIEADAVVVASSHKVLPSMFAQYKQFRFFRNIPSTSVANVAMAFPKSAIQRDIDGTGFVVSRNSDYTITACTWTHKKWPHTTPEGKTLLRCYVGRPGDEAVVEQTEEELVQLVLEDLRKTMDITEDPEFTVVSRWKEAMPQYTVGHNERMKKLTTFMEKELPGIYLAGSSYAGSGLPDCIDQGEKAAKRVLSHLEKVMNTELIAQ >CP029805.1|AWU52027.1|1052927_1053863_+|ferrochelatase MKKKIGLLVMAYGTPYKEEDIERYYTHIRRGRKPSPEMLEDLTERYRAIGGISPLATITLEQAKKLEKRLNEVQDEVEYHMYLGLKHIEPFIEDAVKEMHNDGIQDAIALVLAPHYSTFSVKSYVGRAQEEAEKLGNLTIHGIDSWYKEPKFIQYWVDAVKSIYSGMSDAEREKAVLIVSAHSLPEKIIAMGDPYPDQLNETADYIARGAEVANYAVGWQSAGNTPDPWIGPDVQDLTRELNEKYGYTSFVYAPVGFVAEHLEVLYDNDFECKVVTDEIGAKYYRPEMPNASDAFIDCLTDVVVKKKESVM >CP029805.1|AWU52026.1|1051866_1052913_+|uroporphyrinogen-decarboxylase MVRTINETFLKACRGERTDYVPAWYMRQAGRSQPEYRKIKEKYSLFEITHNPELCAYVTKLPVDQYNVDAAILYKDIMSPLPAIGVDVEIKSGIGPVIDNPIRSLQDVEKLGEINPEDDVPYILDTIRLLTTEMLDVPLIGFSGAPFTLASYMIEGGPSRNYHNTKAFMYAEPKAWFALIDKLADMVITYLKAQINAGAKAVQIFDSWVGTVNVADYRVFIKPAMERIFAEVRTMGVPMIMHGVGAAHLVNEWHDLPLDVVGLDWRLPIEEARARGVHKAVQGNMDPSFLLAPWSVIEEHVKGILDQGMKQPGYIFNLGHGVFPEVNPDTLKRLTTFIHEYSKGQLAK >CP029805.1|AWU52035.1|1066930_1067146_+|hypothetical-protein MMKGNLTYYFILNPLIIFLVYALSPILFHKEKYINMKDALGILVVYYVLISGYCLMDVVSERMKKDSKDKQ >CP029805.1|AWU52036.1|1067167_1067488_+|DUF2087-domain-containing-protein MEDNKMTESEMKFRDATIRNFFDKEDRLKSIPGQKKKKLVLLEHLISKLNAANQYTEKEMNTFIKQYHDDFCTIRREFIVHGFMDREANMYHINGREVWTKWEELK >CP029805.1|AWU52037.1|1067514_1067868_-|PlcR-regulated-protein-PRP2 MNPILTTAKQLLHKEETILSTLNCSLTGYMITYNVPYPGMLLTTNRRLLFFSQYKNTLIAEFDYEKILSIETKRRIFDKKIIFYYEDEYITLGYITSSNIEEFIDLLRRKCKISTNS >CP029805.1|AWU52038.1|1068001_1068505_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIRLAKETDAEAIMDIRKEIILSKTTTKFFIVSPKKLPNDTNAEREKIRKSNEKGNLYIVYEIDNKVVGFLLFNRYELDRLRHAGTMGIKEAYCNQGIGTKLIEFLIRWAKEQNGLEKICLGVVSVNDRAIKVYKRMGFVEEGRQRKQIKYEDGSYGDDVLMGFYID >CP029805.1|AWU52039.1|1068742_1069720_+|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MSTIEDVAKLAGLSRTTVSRVINNHPYVSDEKKKRVQLAMKHLGFVPNSAARRLRKQKTETIAVLVPRITNPFFSRFIEAIEIAASEHKYKLIICQTRYLPEKEMEYLQLLSTKQVDGIILCSLENPWEDVEPYLQHGPIVLCNEYIEEANIPTVKFDHAQGAYIAAKHVLEQGYRNLIFCRGNETKVVSQQRKMGFLRAITEKSRQVEAIDFLENAFSWEDGKRIFHEVLKDKKNPTAILAGGDEVAAGIISEAKRHNWSIPDDLAVIGFDNQILSQITEPGITTIEQPIDEMARKVVDLMMDKIHTKNYRKKELYEFELELLV >CP029805.1|AWU52040.1|1069795_1069924_-|YhfH-family-protein MIDQPMEFFRNLPTKTCAHCGKEIDEQHEAYHNKCDDCVHEE >CP029805.1|AWU52041.1|1070103_1070838_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MKMTVVGFWGGFPEAGEATSGYLFEHDGFRLLVDCGSGVLAQLQKYITPSDIDAVVLSHYHHDHVADIGVLQYARLITSATKGQLPELPIYGHTFDENGFHSLTHEPHTKGIPYNPEETLQIGPFSISFLKTVHPVTCFAMRITAGNDIVVYSADSSYIPEFIPFTKDADLFICECNMYAHQEAAKAGHMNSTEVASIAKDANVKELLLTHLPHTGNPADLVTEAKQIFSGHITLAHSGYVWNS >CP029805.1|AWU52042.1|1070847_1071837_+|lipoate--protein-ligase MLFIDNKGITDPRINLAIEEYCVKNLDINETYLLFYINEPSIIIGKNQNTVEEINADYVKEKGIHVVRRLSGGGAVYHDLGNLNFSFITKDDGDSFSNFKKFTEPVTKALGKLGVNAELSGRNDILAEGRKISGNAQFSTKGRMFSHGTLLFDSEIDHVVSALKVKMDKIQSKGIKSIRSRVANITEFLNEEMTTEEFRQLLLETIFEGETEIPTYELTEEDWKEIHKLSEERYRNWDWNYGKSPKFNLQHSHRFPVGQVDVRLEVKKGTVTECKIYGDFFGSLDVHDIEERLTGVQFDKDAFTTALEGVDIARYFGNITTEDFLHLFF >CP029805.1|AWU52043.1|1072091_1072520_+|lipoprotein MKRVMYVVLLLSFVIGMTACNDETSSSRTLLSIGKPAKDNVIYFTHTDNKRKIQEIQDMFQNKKWKRNETFSTVNKTPDVVFSIDEDNTGLPALYVTVYFHEDGADVLNLYGEYTSFNKQELAMLREKMSAYYPKMIFGLVS >CP029805.1|AWU52044.1|1072681_1074214_+|fatty-acid--CoA-ligase-family-protein MNLVQSLAETAKKKGDKPAYIFMDQSVSYDQLNKMVTRFSSNLAEMGIGKGDNVALVVGNSPHFLVGLYGTMKAGATVIPVNPIYTADEMHYILQNGDVKTIIVLDVLLPVIQSLTTRLPSLENIIICETSSDFNHTETEKMKTFTRMIGAGDLTYEGPELDEEDVAVILYTSGTTGKPKGAMLTHKNLYSNASDVASYLQYTADDRVVAALPMFHVFCLTVAVNAPIVNGATILMLPKFSPKEVFRICRTYEPTIFAGVPTMYNYLYLFEEASAEDVKTLRLCISGGASMPVALLQNFEKRFDVIVSEGYGLSEASPVTCFNPLDRPRKPGSIGTNIWHVENKIVNELGEEVPVGAVGELIVRGPNVMKGYYNAPEDTAATLKDGWLYTGDLAKMDEEGYFYIVDRKKDIVLVGGYNVYPREVEEVLYMHESVAEVVVIGVPDENLGEAVRAYVVLKQTNVTEEELMHYCTLHLAKYKVPKSIEFLTELPKNTTGKLLRRALREKAMQV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029805_2 | 1177414-1177522 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029805_2
|
1 spacers
spacers of CP029805_2
>2.1|1177439|59|CP029805|CRISPRCasFinder GAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029805_2
The CRISPR arrays of CP029805_2 >merge|CP029805|2|1177414-1177522|CRISPRCasFinder TGTATGATTACCTTCCGCATGAGAAGAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGATTGTATGTTTACCTTCCGCATGAGAA >CP029805|2|2|1177414-1177522|CRISPRCasFinder TGTATGATTACCTTCCGCATGAGAA GAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGAT TGTATGTTTACCTTCCGCATGAGAA
>CP029805.1|AWU52143.1|1175823_1176717_+|RluA-family-pseudouridine-synthase MNRFTLKWDIESAEEGTLVREFLKTKGISKAALTDIKFHGGAIEVNGQHASVRHQLQVGEELRIFFPVEERSEGMIAEDIPLCIVYEDDAVLVINKEANMSTIPSREHPSGSVANALLSHYDKQYLPSTVHIVTRLDRDTSGLMLIAKNRFVHHLLSKQHQQKAVKRTYEAIVHGEMVEREGTIDAPIGRKSDSIIERTVCEEGQRAVTHFRVIDSANHKTHVSLELDTGRTHQIRVHLAHIGHPLLGDNLYGGKRDEMKRQALHSTSLTFYHPILEKEMSFAAMIPSDMQEVLRQT >CP029805.1|AWU52142.1|1175010_1175808_+|NAD(+)-kinase MKFTIMSKGDQSSDTLASTMKEYLLDFGFIMDEQEPDIVISVGGDGTLLYAFHRYYNRLDETAFVGVHTGHLGFYADWLPTEVEKLVIAIAKTPFQVVEYPLLEVIIRYMNGSKESQYLAMNEATVKSAEGTLVTEVEIRGEYFETFRGDGLCISTPSGSTAYNKALGGAIIHPSIEAIQIAEMASINNRVFRTVGSPLVLPKHHTCVLKPTAGMNLQITVDHLTMVHQDVKSIQYRVANEKVRFVRFRPFPFWKRVRDSFVADK >CP029805.1|AWU52141.1|1174353_1174992_+|GTP-pyrophosphokinase-family-protein MNRNWEEFLAPYHQAVAELKVKLKGMRTQFAMLTEHSPIEFVTGRVKSVASIIDKAEKRNVPLDRLREDMQDIAGLRMMCQFVDEIKPVVEYLRKRNDFEIVEERDYVTQKKDSGYRSYHVVISYPVQTIQGEQKVLVEIQIRTLAMNFWATIEHSLNYKYSGRFPEDIKIRLQRAAEAAFLLDEEMSSIRLEIQEAQKAFSRKQETKDSES >CP029805.1|AWU52140.1|1173963_1174323_+|hypothetical-protein MQNKIQVKSVEKRENALIFCAENSEIEVKGLSARNHVLVDSDNLSFLYILENESSFIYVSIPHTCWEAMNNDVVMFVRVNDIEMELEGLKEEVEYLVENIEGNANYGEELVTAVEKVFL >CP029805.1|AWU52139.1|1173238_1173817_-|CYTH-domain-containing-protein MTQEIEIEFKNIVTEEEFHALCKSFSIEVFTKQVNHYFETPNFSLKEAGSALRIRHKGETYTLTLKQPAEVGLLETHQVVTENEAKMMMETNVIISGAVMNQLCKLQIPVSALTYMGSLTTERAETLFEGGTLVFDHSFYYNHDDYEIEFEVQDEETGKAAFIHLLKQHNIPIRHTNNKVKRFFLAKQNKAR >CP029805.1|AWU52138.1|1172659_1173058_-|globin MSKQPMTPFEAIGGEQCIEILVDTFYSYVSKHPDLSPIFPDDLTETARKQKQFLTQYLGGPNLYTEEHGHPMLRARHLPFEITPKRAEAWLSCMEQAMDDTGVHGHIREFVFERLALTAQHMVNTPNETGEI >CP029805.1|AWU52137.1|1171766_1172660_-|DsbA-family-protein MDKQEAKHINMPSPSACEYKSVEAYLFIDPLCKDCWEIEPFIIKLWLEYGKYFSIRHIVTGKVDGTNASSHKWNKPANIRFVWEKTTSLHGFSYDGKVHMQEASSTPYLVSMAIKAAELQGRKAGSKFLRKLQEYIFLENVSNPDCELLLACAKDSDIDVEEFKKDLYSASAKKAFQCDLKFTNEMHITEIPSLVFFHANSDEEGIKIAGTYSYDVYVQLLKELVKCEIEPEPLPSLEVLLEATQFISSKEVAFIYDCSKQEIERELKKLQLKRKVQMIDVKCERYWKWIAKEKDLV >CP029805.1|AWU52136.1|1171363_1171537_-|hypothetical-protein MKKTYILLIILAVIVSFFLYILSLLQAFPKMIAFPLLFGVIVIALSYFNHKKRFKGF >CP029805.1|AWU52135.1|1169417_1171244_+|oligoendopeptidase-F MSEQNTAKTLPDRNEIEESSTWRLEDIFQTDTEWEKEFQAIKELLPKLTEFKGKLGDSANNLLEALQYEDEISMRLGKLYTYAHMRYDQDTTNSVYQALNDRATNLYSQVSSSTAYIVPEILSISEDTLQTFLKENRDLSVYEHALEEITRQRPHVLSEAEEALLAEASEVMSTSSNTFGMLNNADLKFPSIKGEDGEEVEITHGRYIQFLESDDRRVREDAFKAVYETYGKYKNTFASTLSGAVKRNNFNARVRKYDSARQAALSNNNIPEAVYDQLIESVNDNLHLLHRYIDIRKRALGLDELHMYDLYTPLVPEVKMNVKYEEAQDMLLKSLHVLGDEYVDILKEAYENRWVDVYENKGKRSGAYSSGAYGTNPYILMNWHDNVNNLFTLAHEFGHSVHSYYTRKTQPHVYGDYSIFVAEVASTCNEALLNDYLLKTTEDKKERLYLLNHYLEGFRGTVFRQTMFAEFEHIIHKKVQEGHAVTPDMLTEIYYDLNKKYFGDALVIDEEIGLEWSRIPHFYYNYYVYQYATGFSAATALSKQILEEGQPAVERYINEFLKAGSSDYPIEVLKKAGVDMASPEPVKEALQVFEEKLNELEALLFEEK >CP029805.1|AWU52134.1|1168122_1169367_+|competence-protein MIPIFIAKRENGEKIHLLDHHDEELLHHMRKRESFFCIACGKEVLMRLGKQKRWHFAHKKVDSCLAFYEAESTYHMYGKELLYRWFKRQNVHVEIEHYLPEIQQRPDIFIERAGRKIAIEYQCANLSIEQLCKRTYSYWQAGIQVIWIIGGNQLKKHSAYWMKFSSIMAFSLQSYPQPLLIFFCSKQKSFMKCTFITSFSTSIAFSHIIYLPIETTTFEMLFSPVPFQREVLKREWKRRKDYFRQNALPILNYNHKSLLRLLYQCKCNPANFPSEIGVPLPSSFAFQTNSFIWQAFLYMKCIGELAVGDCISLKYVCGYIKKYTKRRMLPYFSQHIWKVAVTEYMTFLCYAGVLYKVGMYTYRKIRDAVPLKTGGEIIKHDEICLAHALSLFEAKFNMRGGKGDIIKTDREGIT >CP029805.1|AWU52144.1|1178293_1179034_-|bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase-PrpE-[asymmetrical] MKYDIIGDIHGCLQEFQNLTEKLGYNWSSGLPVHPDQRKLAFVGDITDRGPHSLRMIEIVWELVIHKKVAYYAPGNHCNKLYRFFLGRNVTIAHGLETTVAEYEALPSHKQNMIKEKFITLYEQSPLYHILDEKRLLVCHAGIRQDYIGRQDKKVQTFVLYGDITGEKHADGSPVRRDWAKEYKGTTWIVYGHTPVKEPRFVNHTVNIDTGAVFGGRLTALRYPEMETVSVPSSLPFVPEKFRPIS >CP029805.1|AWU52145.1|1180410_1181346_-|glycosyltransferase-family-2-protein MENIKNVPLVSILIPTYNRPHYFKIALESALAQTYSNIEIIVGDDSTNNETEKLIYRDYLHKHKHITYIRNPSTLGQFHNALMLLEQSNGEYINFLMDDDIFYNNKIEKMMFYFQKDLDQNLALITSYRTWINDDGDIIEQHPSMKKLYDEDTLLNGKDFGNRMLILGQNIIGEPTTVLFRKRLLTEPFGTLNGRNYNCSVDMASWISLLSKGDAIYITEPLSSFRLHTGQQVHHKYLEGCEDFSHLVLHSKKYGFLQDIDYYKTSLLKACEWYKNATTFYQLYPELIPTTDTHTRLSHCLNIVTKELHAI >CP029805.1|AWU52146.1|1181352_1182120_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MNFWNENKKKITLIPPPELVQYVGGHFEEVGKEFMQYFIEIGNLKSNETVLDVGCGIGRMAVPLMNYLSDDGTYYGFDLFNKGITWCKNNISTRRNNFHFEHVDIYNQFYNPDGKEDASQYKFPYEDESFDFIFLTSVFTHLLPKELEHYVREIARVLKKDGRCFITFFLINPESSYYLNAGLSPLGFYHQIDNCYVLNKDIPNFAVAYPEEDIRTLLNKYGLEMQTPPHYGSWCGRTEHTSYQDIILTQKISER >CP029805.1|AWU52147.1|1182247_1183093_-|macrocin-O-methyltransferase MENKSAVQLYLELLKKTILFEIWLEYEPYLPASLHISKELSYEPVTVPLPLFLKQYVENHNLKIVNPNVSNNERQGGKDWPRAAHSMVGRKRMNQLQEAMETVVKENIEGDFIETGVWRVGSCIFMNGFLQANNITDRTVWVADSFEGLPAPNLEQYPKDYGDYLHTFDYLRVSLETVQENFRKYDLLNDQVKFLKGWFKDTLPSAPIEKIAIARLDGDMYESTMDSLVNLYDKVSIGGFIIIDDYGLITCAEAVTDFRSERNIKTPMTQIDDFGIFWRKE >CP029805.1|AWU52148.1|1183215_1184004_-|hypothetical-protein MSNNNYSNGLNPDESLSASAFDPNLVGPTLPPIPPFTLPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGATGLTGPTGPTGPSGLGLPAGLYAFNSGGISLDLGINDPVPFNTVGSQFGTAISQLDADTFVISETGFYKITVIANTATASVLGGLTIQVNGVPVPGTGSSLISLGAPIVIQAITQITTTPSLVEVIVTGLGLSLALGTSASIIIEKVA >CP029805.1|AWU52149.1|1184169_1185327_+|glycosyltransferase-family-2-protein MLNKQGITISLCMIVRDEEKTIARCLDSVEKIVDEIIVVDTGSIDRTKEIVEKYTSNIYDFQWIDDFAAARNFSFSKATQEYILWLDADDVLLEDAQEALKLLKRELDPKIDAVSMPYHLAMDSNGKPLYCTKRNRLVKREKQFQWFGKVHEYLAISGETFSSNVAITHKKEKKVTNRNLKIFQDAVAAGEELSPRDLFYYANECMDNQKYDDAVLLYETFLNQDEGWYEEKIYACGKLGDCYAKLGLWEKAVESCVKSFRYAIPRGENCTRIGYIYMEQQKYNEAIFWFKLATEVPMATESPFHSPASYTWLPYLQMCICYSKLGEQDKAYYYNELAASYVPNNAAIEYNRKYFRSIFDQQKNRYRLFFLEIAYQDSNSNRLTI >CP029805.1|AWU52150.1|1185420_1186110_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MNSPKNSLYEEKSGHYYNAVNPNLLKHIKKEWKEVLDIGCSSGALGAAIKENGTRVSGIEAFPEAAEQAKEKLDHVVLGDIETMEMPYEEEQFDCVIFGDVLEHLFDPWAVIEKVKPYIKHNGVILASIPNVAHISVLAPLLAGNWSYTEYGLLDKTHIRFFTFNEMLRMFLKAGYSISKVDRVYIDHKMYEPLIEELYGVCKKYRLGSGFMAETVVFQYIIEAEKSSL >CP029805.1|AWU52151.1|1186106_1186793_+|streptomycin-biosynthesis-protein-StrF MSAAEKTILFVTCINDSKMYAQCVRHILRLAVPPGYVVQFMPIRNAKSMTSGYNQAISHPAKYKVYIHQDVFIMNVAFLHGLLQLFNEHEHLGMIGMIGAQYVPPNGVWNEGKGVVGKVIGYMNDLFYMASQEQPYHESKTFMPVECIDGLLMATQYDIPWREDLFDGFDYYDVSQSFEFRKAGYTVGVPVQRDAWCIHYHIDVNMTNYEKYRKIFVEHYMSDVNQDE >CP029805.1|AWU52152.1|1186805_1187486_+|streptomycin-biosynthesis-protein-StrF MKDHTILVVVCINNEELFEQCERQIRNLFVPPGYVVQIFPIRDAKSMASAYNRALSYPAKYKVYIHQDTFLINREMFYTLISLFKDNEKLGLIGVAGAQFLPSNGIWWEGKNLVGKVIEYRRQNYQLLNLDQLFYGNQSFMSVQAIDGLLMATQYDIPWREDLFQGFHFYDVSQSLEFQKAGYLIGIPNQANLWCIHYNGDEFDADTYEKYRKVFVEHYKDILSPS >CP029805.1|AWU52153.1|1187500_1188238_+|glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase MKGIILAGGTGSRLYPITKVTNKHLLPVGRYPMIYHAVYKLKQCDITDIMIITGKEHMGDVVSFLGSGQEFGVSFTYRVQDKAGGIAQALGLCEDFVGNDRMVVILGDNIFSDDIRPYVEEFTNQKEGAKVLLQSVDDPERFGVANIQNRKIIEIEEKPKEPKSSYAVTGIYLYDSKVFSYIKELKPSARGELEITDINNWYLKRGVLTYNEMSGWWTDAGTHVSLQRANALARDINFGKQFNGE |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029805_3 | 2720360-2720557 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029805_3
|
3 spacers
spacers of CP029805_3
>3.1|2720383|18|CP029805|CRISPRCasFinder ATTATTTTGAAAACACCT >3.2|2720424|42|CP029805|CRISPRCasFinder CTCGTTCTATTAATTTACTTTTTAGCTCTATTAAACTATGGA >3.3|2720489|46|CP029805|CRISPRCasFinder TTAATTGTACAGATTGATCATCTCCTACTTTTCTTTTTCACACCCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029805_3
The CRISPR arrays of CP029805_3 >merge|CP029805|3|2720360-2720557|CRISPRCasFinder TTACGGAATGAATATTCATTCCTATTATTTTGAAAACACCTTTTCGGAATGAACATTCATTCCTCTCGTTCTATTAATTTACTTTTTAGCTCTATTAAACTATGGATTTCGGAATGAATATTCATTCCTTTAATTGTACAGATTGATCATCTCCTACTTTTCTTTTTCACACCCTCATCGGAATGAATGTTCATTCCT >CP029805|3|3|2720360-2720557|CRISPRCasFinder TTACGGAATGAATATTCATTCCT ATTATTTTGAAAACACCT TTTCGGAATGAACATTCATTCCT CTCGTTCTATTAATTTACTTTTTAGCTCTATTAAACTATGGA TTTCGGAATGAATATTCATTCCT TTAATTGTACAGATTGATCATCTCCTACTTTTCTTTTTCACACCCT CATCGGAATGAATGTTCATTCCT
>CP029805.1|AWU53715.1|2717900_2720324_-|MMPL-family-transporter MSKLKNWRSLSFLLWIVITITMIVTMPNMDKLVKEKGHITIPNTEQSSIADKMIKEMNKDGTEKYDIIAVFNSGSKTALTTEQKEEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKELEKQLVSKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHNKVKTKGVKTYLTGSDLIAGDFLTSSQEGVKKTEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTVGVSYLVSMGIIAHLVDQFNFPFSNFTQVFVVVVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLALASFKLYQSTSAVAIGVAVLLLVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKNSVARPFVALIIVFVISIPIVLKYSNTLNYNDLFEVDNKYESKMGINVIEEHFPPGFSSPSTLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVKGVSEVYAPTRPTGERIKELYINKQADELNTGLGDANGGIKEINDGLTTAKDKMGSKDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQLSNGINDGAKGAQQIERGLTSVNENISVLSNATSQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQAIDGAKKGYEQIEMLMTNFIQMKPELANDPNILQTIGIAKEAQKQLGGLSNELNQLATQHNAAMGSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKGAADLKNGLNEGASGSKQIANKSSELQTGLTKINDGQGQVLTGLKDLQEQMGQLQSGLSKSTEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSSEKFYIPKEVLEGEDFQKALNTYMSHDRKTA >CP029805.1|AWU53714.1|2717747_2717900_-|multidrug-transporter MTIILDVNPYSKEAMPIIQEINKTIDGTLKGTELNNAKKQLEGPQLETLT >CP029805.1|AWU53713.1|2717208_2717781_-|hypothetical-protein MGGTTARNVDLKEVTGQDFLRTATIMLIGIAIVLIVITRSLLNTIFIIGSLILAYFASLGISEQISTHLLNVDSLSWNVPFFSFIMIVALGVDYSIFVMMRYNELEGEPATKIVTASRHIGGVVLSAALILGGTFAALIPSGVLALIQVASVVGVALLLLAIIVMPILLPALIGLMSKMKDYAKKLSERK >CP029805.1|AWU53712.1|2716074_2716923_-|hypothetical-protein MNTKLIIVEGLPGFGKSTTAQLINDILSQNKIEVELFLEGNLNHPADYDGVSCFNKFEFDRLLSNSGDFKEVLLKRVLKKGSNYLLPYRKIKNEFGDQFSDELFNDISRNDIYELPFDKNVELIADKWQDFAEIALEDDKVYIFECCFIQNPLTIGMIKYGEQKEKIINYVMKVAKIIENLNPMLFYVEQDDLEFSFRKALKERNPEWSTGIVDYYTNQGYGKEHNHSGVEGAIKVLEARRNLELEIFDMLKMKKEKINNTKYEIGSYRSMLKDKLTIQMVK >CP029805.1|AWU53711.1|2714071_2715697_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MITVSNVSLRFADRKLFEGVNIKFTPGNCYGLIGANGAGKSTFLKILSGEIEPSTGDIHITPGERLAVLKQNHFEYEEFPVLETVIMGHTQLYKVMQEKNAIYMKEDFSDEDGMRAAELEGEFAELNGWEAESEAAILLKGLGIGEDLHDKKLSELTGAEKVKVLLAQALFGKPDILLLDEPTNHLDLKAIQWLENFLMNFENTVIVVSHDRHFLNKVCTHMADLDFGKIQLYVGNYDFWHESSQLALKLTQDANKKKEEKVKELQNFIARFSSNASKAKQATSRKKLLDKITLDDIRPSSRRYPFVGFTPEREVGNDLLTVEGLSKTIDGEKVLDNVYFTLNKGDKVAFIGRNDIAMTTLFKILMGEMEPDSGSFKWGVTTSQSYFPRDNSKYFENSDLNLVEWLRQFSPQDESESFLRGFLGRMLFSGEEVKKNVSVLSGGEKVRCMLSKMMLSGANVITLDDPTNHLDLESITALNNGLIAFKGTMLFTSHDHQFVQTIANRIIEVTPNGVIDKEATYDEFLENEELQKQVDAMYKGQ >CP029805.1|AWU53710.1|2711581_2713555_-|LTA-synthase-family-protein MKQFLLKSKSVLSNHFGFFLFAVILFWLKTYAAYVTEFNLGISNTIQKFLLFFNPLSSAVLFLGLALFAKGKRSYIWLIVINLLLSILLYANVVYYRFFSDFITFPTLTQTNNFGDLGGSIVALLHLYDPLYFLDTIILIVLVATKFANPKPIRVAKYKVSLVFVAGILLFSVNLGLAESDRPELLTRTFDRNYIVKYLGAYNYTIYDGIQSAKASTERALADGDNMTEVRNYLTSTYASPNPEYFGKGKGMNVIYIHLESFQNFLIDYKLNGQEVTPFLNSFTKDANTLYFDNFFHQTGQGKTSDAEFMLENSMFGLPQGSVFTTKSHNTYQSAPAILGQQGYTSAVFHGNYKTFWNRDDIYKSFGFNKFFDASYYDMNEKDVVNYGLKDKPFFNESIPLLETLKQPFYTKFITLSNHFPYPIDKEEATIEPANTGDSSVDTYFQTARYLDESVKGFIDYLKQSGLYDNSIIVMYGDHYGISDNHNAAMSKVMGKEINSFENAQLQRVPLIVRVPGVKGGVQHQYGGEIDVLPTLLHLLGTDTKNYVQFGSDLLSPDHKQVVAFRNGNFVSPTVTALNGKYYDTTTGKPVEFTDEIKQNEQMVQNSLKYSDQVVNGDLLRFYTPEGFTPIDRSKYNYNNRDKNKTKVKTAPEGEAK >CP029805.1|AWU53709.1|2710850_2711522_+|TerC-family-protein MDFLSAEYLSALLAIIVIDLVLAGDNAIVIGLAARRLPKDQQKKVIIWGTIGAIAIRALATLVVVWLLKIPGLLLIGGVLLIWIAYKLIAEGKDHDIKAEEGFWSAIKTIIIADALMGIDNVLAVAGAAHGNFSLVIIGLLVSIPVVVWGSTLILKWVDRYPIIITIGAAVLAYTAAKMIVDEKWFAAFFESNPFIKWAFIIIIIAGVVFFGKAKQKATDGSI >CP029805.1|AWU53708.1|2709088_2709916_+|polysaccharide-deacetylase MHNGIRMTTLMKRAMLICAGVLFTYEAALGSAHTALASTEDEAKSVQLVSEIQSSLAPKEAPKQYNGQVRKVAYLTFDDGPGKYTAELLDMLKKENAKATFFLIGSNVKAFPDLVKREDAEGHYVGMHSMTHNYKKLYTEGHYVDEMKEDQGLIAGVLGKSPVLTRPSYGSMPGLNEALRNKVVENGLKVWDWTIDSLDWRYNKMPVDAASAKIVENVINGANKPTEVILMHDIHPQSVKAVPGIIKGLKEKGYELEAYSENEHFPLNFWHDNRM >CP029805.1|AWU53707.1|2708860_2708983_-|hypothetical-protein MQDFKGMAFLKKRHKKLDKLNYKLETIQEILILGGALIEL >CP029805.1|AWU53706.1|2708610_2708871_-|lipoprotein MNYKKMLSIFMTSIFTVGLLIGCNPAPKDEKEPDPTEEPSEQRQEEKNEKQDPAKEQNNELNKKDEQEPDPTEEPSEEQKKKKENE >CP029805.1|AWU53716.1|2720577_2721144_-|TetR-family-transcriptional-regulator MAKNKQEDIFDAAIQLFAERGYDGTTIPMIAEKAKVGAGTIYRYFENKEALVNSLFTKSVLQLSELIKTDFPVNANIREQFSHTYNRLFEFARQNADAFLFTNSHCDSYFLDEHSNEIFEDFMGFFMDLIEDGIEKGFLRPLPPIALIIIVYQPIEKLIKVMETGQLEYTEELVKELEESCWNAIRII >CP029805.1|AWU53717.1|2721413_2722586_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MEEKYMNVIRLKEDKFREALRLSEYAFQYKVDEDRLQQQITKMKESHEVYGIMEGENLAAKLHLIPFHIYIGKEKFKMGGVAGVATYPEYRRSGYVKELLQHSLQTMKKDGYTVSMLHPFAVSFYRKYGWELCANLLVCHMTKSDLVMKKQVNGTVKRFNKESHPEEVEKLYETFAELFSGMLVRNEKWWLQAVYDDLTLAIYYDENQTAAGYMLYKIENYKMTVEEFVPLHNEARNGLWNFICQHDSMIKDLEMTVSENEPLLYTLQEPRVKTEIKPYFMGRIVDVEQFLKQYELNWNNVQQEVILHITDSFAQWNNITVRIANHEITIIEEPIDKGIKLDINALSTILFGYRRPLELNELELISGSEEEIRAFESVVPVRKPFIYDFF >CP029805.1|AWU53718.1|2722756_2724046_-|3-phosphoshikimate-1-carboxyvinyltransferase MKERTIQPVNNGLNGNITIPGDKSISHRAVMFGAIAEGTTTIKGFLPGADCLSTISCFKEMGVDIVQNGDEVTVVGKGLEGLQEPKAVLDVGNSGTTIRLMSGILANTPFLSCVQGDTSIAKRPMKRVTNPLKQMGANIDGREEGTFTPLTIRGGDLKAIEYTSPVASAQVKSAILLAGLRAEGVTAVTEPHISRDHTERMLEAFGVKVTREGKTVKLAGGQKLTATDVQVPGDVSSAAFFLVAGAIIPNSKLVLENVGMNPTRTGIIDVLEKMGATFTVEPINEGASEPAANITIETSSLKGIEIGGDIIPRLIDEIPVIALAATQAEGITVIKDAHELKVKETNRIDTVVAELTKLGARIEATDDRMIIYGKSALKGNTVNSYGDHRIGMMLAIAGCIAEGKTIIEDAEAVGVSYPTFFEELQKLAK >CP029805.1|AWU53719.1|2724062_2725163_-|prephenate-dehydrogenase MRKKVVLIGTGLIGGSLALAIKKDHDVTITGYDIFQEQVERAKELHVVDEIAVDLQHACEEAHLIVFASPVEETKKLLHKLASFHLREDVIVTDVGSTKGSIMNEAEALFSKEISFIGGHPMAGSHKTGVESAKAHLFENAFYILTPMHHVPNEHVEELKDWLKGTGSHFLVLNTEEHDYVTGIVSHFPHLIAAGLVKQVEKHAGDNPLIHQLAAGGFKDITRIASSSPKMWSDIVKQNREHLMVLLKEWISEMEDLYDTVSSGDAGEIQNYFADAKEYRDSLPVRKRGAIPAYHDLYVDVLDKVGALAHVTSILAREEISITNLQILEAREGLLGVLRISFQREEDRMKAKLALGEEKYQTYETI >CP029805.1|AWU53720.1|2725155_2726256_-|histidinol-phosphate-aminotransferase MQVKDQLSSLQPYKPGKSPEQMKEVYGDHSFVKLASNENPFGCSPRVLDELQKSWLDHALYPDGGATTLRQTIANKLHVKMEQVLCGSGLDEVIQMISRAVLKAGDNIVTAGATFPQYRHHAIIEGCEVKEVALNNGVYDLDEISSVVDNDTKIVWICNPNNPTGTYVNDRKLTQFIEGISENTLIVIDEAYYEYVTAKDFPETLPLLEKHKNILVLRTFSKAYGLASFRVGYAVGHEELIEKLNVVRLPFNVSSLAQKAATIAFGDDEFIEEIVRVNTEGLRQYESFCKENEIPFYQSQTNFIFLPVENGGEIYEACAHAGFIIRPFPNGVRITVGTREQNEGVISVLQQHFENKKRKSRDEANA >CP029805.1|AWU53721.1|2726274_2727447_-|chorismate-synthase MRYITAGESHGPQLTVILEGVPAGLTLAAEHINKELLRRQKGHGRGRRMQIEMDTVEIVSGVRHGMTLGSPITLIVKNDDFKHWTKVMGAEPISEKESKEMKRTITKPRPGHADLNGAIKYGHRDIRNVLERSSARETTVRVAAGAVAKQILKELGVEIAGHVLEIGGVKAKHISNLSIEEIQIITENSPVRCLDKTVEQEMMDAIDNAKSSGDSIGGIVEVIAEGMPIGVGSYVHYDRKLDAKLAGAIMSINAFKGAEIGVGFEAARQPGSKVHDEILWDEEQGYTRKTNNAGGLEGGMTTGMPIVVRGVMKPIPTLYKPLASVDIDTKEAFQASIERSDSCAVPAAGVVAESVVAWELAHALVEQFGKDRMELIQQNITQHNKYAKEF >CP029805.1|AWU53722.1|2727569_2727668_-|hypothetical-protein MVGVNQYKDKHELQPWSIFSANFWRERRSNDR >CP029805.1|AWU53723.1|2727731_2728808_-|3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase MANHELDQLRKQVDEINLQLLHLLNKRGEIVQKIGEQKQVQGTKRFDPVREREVLDMIAENNEGPFETSTVQHIFKTIFKASLELQEDDNRKALLVSRKKKQENTIVDVKGELIGNGTQTFIMGPCAVESLEQVRQVGQAMKDQGLKLMRGGAFKPRTSPYDFQGLGVEGLQILRQVADEFDLAIISEILNPNDVEMALDYVDVIQVGARNMQNFDLLRAVGKVNKPVLLKRGLAATIDEFINAAEYIIAQGNDQIILCERGIRTYERATRNTLDISAVPILKKETHLPVVVDVTHSTGRRDLLLPTAKAALAIGADAVMAEVHPDPAVALSDSAQQMDIPEFHRFMEELKGFKNKLS >CP029805.1|AWU53724.1|2729639_2732189_-|DUF4020-domain-containing-protein MEWLEAEGKLQNLFLITSNYNEVDELLAKWLVEQFLFSHQKELFQLIFKNHSKLSPLLWRTICSYLNETKMKMDPLLFARWTLLLLETAEKDSKSIETISYLLQKCSFPEHKEIALLLLTFILDGKLKLKRERKWGNDTGESIELEESSRLPVSTFSFVEQIWNEKMKPHISYYAVPIMMMGIEKIRMLSLRQAALKKRDKENVEKEFQQNDLAFLIQIVKECLAYLCKNNEKKANYYITEMIEANSVLQNRIAIDAMNKNVFVSADEKMKWLLQEGILLDVTYKHEVFQLIKNHFALSLEKTKEEVIQIVLKDLAEERAFDVCFVLDLLFTCDSNSPSTAKGYELMKQKHPHFHSERYSVQKKEAAEQSITCNVTADGLLQLKDEEIMKQVQQFSQDGVFEQRHFLEMLSKACKLNTEWSISFAYQLVGMHEISNEVWFVCIREWRNNRGLTNEQIQKVIPLLQKFVRNTAFHWLISSFLYEISNRLEELEENSIRNVKRFAFSVFPQVMKSDTDFKLAKQDFYNESIQHPVGKMTAVLLKLLSYDHLYDRNVYEYLFLFEEQVRISTERTNFMIARLVADITFLYHIEKQWCRKYLLPYLELKKENEITKYAWAGLCYTQINLPLFTEMKRFIKYAVEHLEVLHPHTREAFLKWLSFVFIKCVLYWEQKTDWLYPLLIRENEENKIKFMQFLCYYVKTLSAKEQQKFWAAWLSIFLRERPKMGGITAREYVMLLRIILFMDEIVERGLLIICKSFSDVGGKGNQTELKQLFHEILEKTESIKMYKELYANVFFTLLQTLQEANLLKTEIIQIKELLIGYRVEKCVINAIDNEIIRIGIVLENLQEEM >CP029805.1|AWU53725.1|2732143_2733151_-|protein-deacetylase MTFLGKGESSVWITSEVEIPDELIDHLEKGKLVLFVGAGVSMKGKSNLPNFDDLVDEIAKTLYVEKREITEPHDYYLGKIAKTKDVHQVARDLVHIEKSKPNPLHYAIPRLFPLDTEVRIVTTNFDRHFTTAMKEMNRELNVYYAPALPTGRAFKGLAYIHGNIEQEKEALILTDGDFGRAYLTEGWARRFLVDLFSNYTVLFVGYSHNDPVMKYLATGLPPSTRRYAFVAQGENTYHWEHLGIRPIVYPNKGNNHQSLVKAVKRWAELMGDNYITKRMRIRDIVTVPPSVEQEQLSYIKQSIKKLKQSATLLNLLTIMNGWNGLKRKGNYKIYF |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029805_5 | 3266837-3266939 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029805_5
|
1 spacers
spacers of CP029805_5
>5.1|3266862|53|CP029805|CRISPRCasFinder GGTATATTTACATGCCCCGAAGTAGCCGTGGATTGTCTCCTTTCCTTCCTTGA |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029805_5
The CRISPR arrays of CP029805_5 >merge|CP029805|5|3266837-3266939|CRISPRCasFinder AAGTTTAGGTTTCTTTTGAGAATGTGGTATATTTACATGCCCCGAAGTAGCCGTGGATTGTCTCCTTTCCTTCCTTGACAATTTAGGTTTCTTTTGAGAATGT >CP029805|5|5|3266837-3266939|CRISPRCasFinder AAGTTTAGGTTTCTTTTGAGAATGT GGTATATTTACATGCCCCGAAGTAGCCGTGGATTGTCTCCTTTCCTTCCTTGA CAATTTAGGTTTCTTTTGAGAATGT
>CP029805.1|AWU54249.1|3265329_3266274_-|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MRKIISVLVIFFMTGSIFAGGAVHAKAEGKHEWNKNKFLNIAHRGASGHAPEHTFASYDLVKKMKADYLELDIQLTKDGQLIAMHDTAVDRTTNGTGEVRDKTLSEIKSLDAGSWFNKAYPEKAKQEYVGQKVPTLEEIFQKYGRSMKYYIETKSPDVYPGMEEKLLALLEKYNLIGQNMSSSRVMIQSFSKDSLKKIHSINKNIPLVQLLWYYPNENNEIVEWSGITHEPKRVTNDDFQEIKKYAVGIGPNLRNDNGDLIINESYMKMARQNGLLIHPYTINEKPDMRLLMKWGATGMFTNYPDRLHTVLKEK >CP029805.1|AWU54248.1|3264602_3265280_+|YdcF-family-protein MVIPKYPDVPTLTKKQIDQITEITFLKEITPQKCDVIFVFGGSHPGNWQAPLETYRQGLGNRIIVTGGTSLHGMKHPSWNYGDLSEAEVIVNKLMENGVPKGAILFEKNSLHSIANVIEAKKIFDFTKINRLLFVCKNLGAGRQYRVLKKHLPKTITCIPYTFDTSFDGEFIMNRYNWMENEKSRSMIFGEYLRNVCYGRKGGIEPPEKEVHGLEEYVSYYYNLA >CP029805.1|AWU54247.1|3263999_3264509_+|DUF3916-domain-containing-protein MHEKKIRGMKRKTNAMIKRIEEHTKMFPSTFYNDEYWYMPLPVSQDFIESHKTPRKVKRLCIQTLIDRVNHLIKIQPSDTHTYRVVALISIENLWRSQIIVFKNDDYFHNFFNRNNEFQKWILLSNEIDFWETWGISIFPTPQLLRFQEVIYDEDTIDEKEIWFIGELS >CP029805.1|AWU54246.1|3263155_3264007_+|LysR-family-transcriptional-regulator MDIKDLTVFYEVAKENNISHAAKNLNYVQSGVTMRMKQLENELGVPLFYRNGKGVTLTSNGEILLTYAKQIIHLMDQSIKAVQSNGTEPKGTLKIGCTESTTAVRLPSILTTYYEKYPEVELILETNTTEQLIKLVLDRKLDGAFIAGSTQHNELHSNVFHEEELVLISKKTLSSLKDIEDMNLLAFSHGCYYRSLLEDWLQEEDISPKRVLEFGTIEAILACVKSSMGVAIMMKSILKGHEHDVSFNPLPNSFNKVPTTFITRNDIFRSAALQKFMEVTHNA >CP029805.1|AWU56373.1|3261825_3263040_-|MFS-transporter MEERMNSTYKWVMLIVATIAQTTATLITYGVGVFALFWKEEYALTNMESGLLVSVVNVGPLFCMLFIGRLLDQYNEKILISISSFLLGSSLLLTNIVSGFNGLLFVLLLIGMFYSVSQPGGSKVILKWFPKENRGLAMGIRQAGIPIGGALAGVLIPFLTVQYNMTYAINSIACICIIGGVLFFVFYKEPYVQEEARKGHIKISFWMELKVVICKKELYPIYITGICMISLQMVLVGHFMKFLAGEQSITSIVAGTVFSVMFFSGMIGRVALAAISDVFYKGNRRIPLFIAVCASIGLILLLVMSIHTITSGVLYSVSALLGFFSIGWFSLFIAEVAELASEESVGITVSVALTLNQIAIIVAPVLFGYIVDEKGYAYAWLCIVVLLSISAVSLYRRNKKIKES >CP029805.1|AWU54245.1|3261495_3261726_+|hypothetical-protein MKNTDKRNRLDDMMFHYRVTKNNIVLIEYYGKQIMILKGTAAEKFLNKINHAHNDTEKQLIMAKVTGNFKRGNERQ >CP029805.1|AWU54244.1|3260105_3261239_-|penicillin-binding-protein MLKKWLIVFFIFAVFSGSVVALIHASKGKKYDIKAFSNLNNKQKHDMQEVDANEKKHYEVVAGKLDQYLKDKGFNGSVLVASKDHVILRKGYGYANMKDKVFTTPRTKYRIGSITKTVVAISIMQLKEKGKLNIEDNVNKYIPSFPADKNITLRNLLTHTSGLPDQGKGRVDAASRLKLVTWIGSQALQFPAGTGWKYTDYNYMVLAYIVEKITNKPLAEYVKENIFTPVEMHESGMGATLPEDIFLAEGYTRKDNELIAAPRLKMNWLYGCGEMYTTVEDMKRLDEAIMNGKLLSKQSVLDMFTASPARKYGFSFYTYPDYYHNHGVLAGWNTFNNFNWDKKTFVILFSNVQNGMNDTFNQEFRKMANDLIEGNGA >CP029805.1|AWU54243.1|3255617_3257159_-|alpha-amylase MFKKITIVGLSVVLFLPSIYGESKVYADTINNGTLMQYFEWYAPSDGNHWNRLRTDAENLAQKGITSVWIPPAYKGTTQNDVGYGAYDLYDLGEFNQKGTVRTKYGTKAQLKSAIEALHKQNIDVYGDVVMNHKGGADYTETVTAVEVDRNNRNVEVSGDYEISAWTGFNFPGRGDNYSNFKWKWYHFDGTDWDEGRKLNRIYKFRGIGKAWDWEVSSENGNYDYLMYADLDFDHPDVANEMKNWGTWYANELNLDGFRLDAVKHIDHEYLRDWVNHVRQQTGKEMFTVAEYWQNDIQTLNNYLAKVNYNQSVFDAPLHYNFHYASKGNGNYDMRNILNGTVMQNHPALAVTLVENHDSQPGQSLESVVSPWFKPLAYAFILTRAEGYPSVFYGDYYGTSGNSSYEIPALKDKIDPILTARKNFAYGTQRDYLDHPDVIGWTREGDSVHANSGLATLISDGPGGSKWMDVGKNNAGEVWHDMTGNQTNTVTINKDGWGQFHVSGGSVSIYVQQ >CP029805.1|AWU54242.1|3254893_3255523_+|exosporium-leader-peptide-containing-protein MSEKYIILHGTALEPNLIGPTLPPIPPFTFPNGPTGITGPTGATGFTGIGITGPTGVTGPTGIGITGPTGATGLGILPVFGTITTDVGIGFSVIVNTNINFTLPGPVSGTTLNPVDNSIIINTTGVYSVSFSIVFVIQAISSSILNLTINDSIQFAIESRIGGGPGVRATSARTDLLSLNQGDVLRVRIREATGDIIYSNASLVVSKVD >CP029805.1|AWU54241.1|3252379_3254281_-|endonuclease-MutS2 MNTMTFEKLQYNELKDIVKFYCVSGLGKELINKLEPSTSIKVVRNRLNETTEARAILDAEGHVPFFGISNIASTIQKLEKGMILDPEELVSVSDFLRGCRKIKKFMLDKEFFAPVLASYANSMTEYKSIEEEINFSIKGNSIDSAASKELKRIRNNIDSVDGKIKERLTKFLNSSANKKYIQEFFISKKDDRYTIPIKSSYKNQVAGSIVEASAKGSTVFIEPHTVTKLNAELASLKAEEAMEEYQILATLSGMVVENIYHIKINMELISQYDMVFAKAKFSKSIDGIEPKLNDHGHIHLVNCKHPLLSGKVVPLNFEIGQNYRSLIITGPNAGGKTIVLKTIGLLTLATMSGLHIAGDKETEIAIFENVFVDIGDNQSIENALSTFSSHMKNLSEIMRMSNNNTLLLFDEIGSGTEPNEGAALAISILEEFYLAGCITVASTHYGEIKRFSEMHDDFMNAAMQFNSETLEPLYKLVIGKSGESNALWIANKMNVRERVLKRAKAYMGNKEYTLEKVNESKIRKPKFLQEKRENHYEYKIGDRVNLLDHDDFGIIYKEKDNFYNVVVYYNGEFIEVNVKRITLEVAAKELYPEGYDLNTLFVDYKERKMQHDIERGSKKALRKIQKEMRKNRG >CP029805.1|AWU54250.1|3267577_3268231_-|hypothetical-protein MEKYHGKSTEQIIQKLMPGSARSSVVMVWVVINFMILTPFLFPPTFTIYLYVILPFLLIANIWGVWVFFYKPNELRLVHILYNGFMGITFSFGSFIVIQKMAYTFIKIETPLFFIVTFVLYIFTIYKLISIGMKSFLRRLNNEENDNIKISPIVYLSGLGYVIGQICIGTLSQNGLATVLILVFSLFAVVLSISGVYIWVYVDLKRKEMDGMHNGQI >CP029805.1|AWU56374.1|3268247_3268505_-|hypothetical-protein MGVGTTAVSAFAGAKLGVAAAVGTVFGGPIGTVAGACIGFGVSIGSSIVTDGIKFNKGDWNHNGKQDSIKDKVKTGIGAALDKIF >CP029805.1|AWU54251.1|3268846_3270481_-|FAD-dependent-oxidoreductase MEDKYMESNDVPVLIVGGGLSGLASALFLAKHNIEYLLIERHPSTAIHPKAGGITFRTMELFRELGLEQRIRSAGKTLENCRGRIAVHTIAEANQEELAQMRANQYENDEKLLQKIEEISPSKQTACYQITLEEIMLQEARILGGELSFYHELVSYEQNEQGVIATIRNRETEKESVIHCDYVIAADGAKSKIREQLGISAEGRGTIGGYYMNIYFEADVSEFMQGDAFGFSMVLHPEVLGALIPVDNARRWIYHVSYDPLKGERPEDFTIERCKQIIQTAIGSTNVEPEIVSVLPWKAAESTATKFQDNRIFLVGDSAHIMPPTGGFGSNTGIQDAHNLAWKLAAVIKGKAKPKLLETYHEERYPVAKLTTDYAISLLFRAANREEGSLNKMDGLAVTAGYHYSSDAIIDDAVTLHRMDIVQLNGRPGTRAPHFIGMYEEKEVSVLDLLGNDFVLLTGAENDSWAESAHTVSAKLGVNIKVYRVGLSGDFIAQENIFSELYGLSDGGAVLIRPDAFIGWRSEKEVVNLDVVLEEVMSNLLCDF >CP029805.1|AWU54252.1|3270943_3271288_+|ArsR-family-transcriptional-regulator MIEMNKQEQLNVIKKDFIDSQKVLLAIGDETRQAILLVLMETECQTGLRVGEITKQTHLSRPAVSHHLRILREAGIILMRKEGTKNFYYIDIRTKLSLLKNLVLDIEKLLHNFY >CP029805.1|AWU54253.1|3271306_3272305_+|NADP-dependent-oxidoreductase MKAMIIDKYGKVPMRMAEVPIPEINEHEVLAEIHAASINPIDFKIRDGKVKMLLKYEMPLILGNDFAGVIIKVGSKVTRFKIGDEIYARPRKNKIGTFAEYIAIHEDDIALKPKNLSFEEAASIPLVGLTSYQALHDIMQLQKDQKILIHAGSGGVGTFAIQLAKIMGATVTTTASEAGPDLVKSLGADQIINYKTEKFEEILKDYDAVFDTIGGTTLEKSFDIIKSGGNIVSVSGIPNARFSKEFGSGFFKTFLFSLASKKLTALEKKHNAQYSFLFMKPSGDQLRTIANYIEAGKIKPVIDRVFPFEDAQKAMEYSEAGRAKGKIIVKMK >CP029805.1|AWU54254.1|3272483_3273950_+|YdiU-family-protein MTKNNEAGWNLDHSYTTLPQSFYTEIPPTPVSSPELVKLNHSLAISLGFNPEELKKEAEIAIFAGNALPEGAHPLAQAYAGHQFGHFNMLGDGRALLIGEQMTPSGKRFDIQLKGSGPTPYSRRGDGRAALGPMLREYIISEAMYALDIPTTRSLAVVTTGEPTYRETKLPGAILTRVASSHIRVGTFQYAAARGSIEDLQSLADYTIKRHYPEIEAHENRYTALLQEVIKKQASLIAKWQLVGFIHGVMNTDNITISGETIDYGPCAFMDNYDQGTVFSSIDTQGRYAYGNQPYMAAWDLARLAESLIPILHEDEEEVLKIAQDEISKFSVQYEKQWFLGMKKKLGLFSNEEQDQSLIEQLLKMMEKFKADYTNTFRSLTLNTIENTALFESPEFKEWYKLWQSRLERQEESKENAYEMMKNNNPSIIPRNHRVEEALEAAVTNGDYSVMEKLLEALSNPYAYATEQEEYCVPPVPTNRPYRTFCGT >CP029805.1|AWU54255.1|3275296_3275488_+|Phr-family-secreted-Rap-phosphatase-inhibitor MIKKISSVFLGLSVFGILATGIHSSFTYQAGHADLPAPQRPDLVQSVDASKDYNSTTTAEKAL >CP029805.1|AWU54256.1|3275561_3276161_-|FMN-binding-negative-transcriptional-regulator MYIPKYFAIQDEKMKYEIMEQNSFATLFSQHNGEPYATHLPLLLNRETLTLHGHFARPNEQWKDIGTQQVLAIFQGPHSYISPSWYETKNAVPTWNYVAVHVYGELELVEDEQELIDSLQDLVDTYEDPQSTYSLNDVDPNYMEGLSKGIVGFKIKISKIEGKAKLSQNHSVARRKLVVEELEKVGSEGSRGIAELMRK >CP029805.1|AWU54257.1|3276295_3276823_-|GrpB-family-protein MKQRITIEEYNIKWESEFNKLQTLINDVMEDSILSIEHVGSTSIKGLAAKPVLDIDIVIEDYGFFPKVVTKLGAIGYYHQAEWSYKGREAFGRKDAFVPWDGESTDWMEHHLYVCDKESEELRRHIAFRDYLREYEDVAVEYGHLKEELARETKSRTSYSEGKTAFITNILEKIN >CP029805.1|AWU54258.1|3276846_3277194_-|DUF4260-family-protein MQKRIVHFEGLVVFVATIYMYSLYEFSWIIFLIFLLAPDLSMLAYGINNHIGANIYNLFHTYIISILIVIIGVYFKVDTVIMIGLIWTAHIGMDRMFGYGLKYETEFKGTHIQRL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029805_4 | 4.1|3098569|27|CP029805|CRISPRCasFinder | 3098569-3098595 | 27 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 3876-3902 | 4 | 0.852 |
CP029805_4 | 4.1|3098569|27|CP029805|CRISPRCasFinder | 3098569-3098595 | 27 | NC_022766 | Bacillus phage Glittering, complete genome | 9024-9050 | 5 | 0.815 |
CP029805_4 | 4.1|3098569|27|CP029805|CRISPRCasFinder | 3098569-3098595 | 27 | NC_003037 | Sinorhizobium meliloti 1021 plasmid pSymA, complete sequence | 1229260-1229286 | 6 | 0.778 |
CP029805_4 | 4.1|3098569|27|CP029805|CRISPRCasFinder | 3098569-3098595 | 27 | NZ_CP021794 | Sinorhizobium meliloti strain USDA1157 plasmid psymA, complete sequence | 438058-438084 | 6 | 0.778 |
CP029805_4 | 4.1|3098569|27|CP029805|CRISPRCasFinder | 3098569-3098595 | 27 | NZ_CP021809 | Sinorhizobium meliloti strain Rm41 plasmid psymA, complete sequence | 127169-127195 | 6 | 0.778 |
CP029805_4 | 4.1|3098569|27|CP029805|CRISPRCasFinder | 3098569-3098595 | 27 | NC_020527 | Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymA, complete sequence | 1227597-1227623 | 6 | 0.778 |
CP029805_4 | 4.1|3098569|27|CP029805|CRISPRCasFinder | 3098569-3098595 | 27 | NZ_CP021798 | Sinorhizobium meliloti strain USDA1106 plasmid psymA, complete sequence | 850854-850880 | 6 | 0.778 |
CP029805_4 | 4.1|3098569|27|CP029805|CRISPRCasFinder | 3098569-3098595 | 27 | NC_017324 | Sinorhizobium meliloti BL225C plasmid pSINMEB01, complete sequence | 513839-513865 | 6 | 0.778 |
CP029805_4 | 4.1|3098569|27|CP029805|CRISPRCasFinder | 3098569-3098595 | 27 | NC_018683 | Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMA, complete sequence | 498252-498278 | 6 | 0.778 |
1. spacer 4.1|3098569|27|CP029805|CRISPRCasFinder matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer catttctggctcttctggtttcttttc Protospacer *.*.*.*****************.***
2. spacer 4.1|3098569|27|CP029805|CRISPRCasFinder matches to NC_022766 (Bacillus phage Glittering, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer gttcaatggctcttctggtttctcatc Protospacer ** ****************** **
3. spacer 4.1|3098569|27|CP029805|CRISPRCasFinder matches to NC_003037 (Sinorhizobium meliloti 1021 plasmid pSymA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctat Protospacer *. ******************** .
4. spacer 4.1|3098569|27|CP029805|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021794 (Sinorhizobium meliloti strain USDA1157 plasmid psymA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctat Protospacer *. ******************** .
5. spacer 4.1|3098569|27|CP029805|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021809 (Sinorhizobium meliloti strain Rm41 plasmid psymA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctgt Protospacer *. ******************** .
6. spacer 4.1|3098569|27|CP029805|CRISPRCasFinder matches to NC_020527 (Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctat Protospacer *. ******************** .
7. spacer 4.1|3098569|27|CP029805|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021798 (Sinorhizobium meliloti strain USDA1106 plasmid psymA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctat Protospacer *. ******************** .
8. spacer 4.1|3098569|27|CP029805|CRISPRCasFinder matches to NC_017324 (Sinorhizobium meliloti BL225C plasmid pSINMEB01, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctat Protospacer *. ******************** .
9. spacer 4.1|3098569|27|CP029805|CRISPRCasFinder matches to NC_018683 (Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctgt Protospacer *. ******************** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
258908 : 266857
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029805|258908:266857|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029805|258908:266857|261264_262812_+|AWU51266.1|DBSCAN-SWA MIILKKQHDTIIVLDFGSQYNQLIARRIREFGVYSELHPHTITAEEIKAMNPKGIIFSGGPNSVYGEGALHCDEKIFDLGLPIFGICYGMQLMTQQFGGTVERANHREYGKAVLKVENESKLYANLPEEQVVWMSHGDLVTGLPEGFVVDATSESCPIAGMSNEAKNLYGVQFHPEVRHSEHGNDLIKNFVFGVCGCSEGWNMENFIEVELEKIRETVGDKKVLCALSGGVDSSVVAVLIHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEAEGVMKTFSEGFHMNVIKVDAKERFMNKLKGVEDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEASKLEGMDFLAQGTLYTDIVESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFKLIEPLNTLFKDEVRVLGSELGIPDEIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRESDAILREEIIKAGLDREIWQYFTALPGMRSVGVMGDERTYDYTVGIRAVTSIDGMTADWARIPWDVLEKISVRIVNEVKHVNRIVYDVTSKPPATIEWE >CP029805|258908:266857|265351_266857_+|AWU51269.1|DBSCAN-SWA MKKIFNPFTYIRKARQLIEKLVKGVRKSIRIQLITTFAACALLGVFFAKGAAPFFENANRQATIDYRAGMEQINHEAQRAANSSVHENKLEAISNMIEMENQNLERGSRALKILVTDESGKVLYKTKQAQEEQIDLHNTIRNAASFAINYSNGRDVFENTRKEFIAFSPITIEDKNLYMFVSGIPDGVVMYDTQEGPFPFLIGVLVFIFSFFYITKRKMKQIEAMAEGVKEIEKGNLAYRIEKKGEDEIASLTENINNMAEELMNNIEKERKLEKQKNELITNVSHDLRTPLTSIMGYLRLLRDSKYENKEQHDEYTRIAFAKSEQLKNLIEDLFEYTKLTNEQVVLEKQEVCVNELLEQLIEELVPQAEEHGLTFVKKFPEERAYAAIDSEKMVRVFDNLLMNAIKYSKDDGEIKVSLQRQRWEIQIVIANHSEEFTREELASLFERFYKKDQSRSRVTEGSGLGLAIAKSIVELQGGSIRAEYKDGIIQFIVSLPIIER >CP029805|258908:266857|264666_265368_+|AWU51268.1|DBSCAN-SWA MAHETILVVDDEKEIRNLITIYLKNEGYKVLQAGDGEEGLRLLEENEVHLVVLDIMMPKVDGIHMCMKIREEKEMPIIMLSAKTQDMDKILGLTTGADDYVTKPFNPLELIARIKSQLRRYMKMNGFAIQNEDELEIGEMKINISTHKVIVEGEEVKLTPREFSILELLARNPGMVFSAEQIYEKVWNERSFQSDNTVMVHIRKVREKIEENPRKPRYIKTVWGVGYKIEKDI >CP029805|258908:266857|259231_260866_+|AWU51265.1|DBSCAN-SWA MAKDIKFSEEARRSMLRGVDTLANAVKVTLGPKGRNVVLEKKFGSPLITNDGVTIAKEIELEDAFENMGAKLVAEVASKTNDVAGDGTTTATVLAQAMIREGLKNVTAGANPMGLRKGIEKAVVAAVEELKTISKPIEGKSSIAQVAAISAADEEVGQLIAEAMERVGNDGVITLEESKGFTTELDVVEGMQFDRGYASPYMITDSDKMEAVLDNPYILITDKKISNIQEILPVLEQVVQQGKPLLIIAEDVEGEALATLVVNKLRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAMLEDIAILTGGEVITEELGRDLKSATVESLGRAGKVVVTKENTTVVEGVGSTEQIEARIGQIRAQLEETTSEFDREKLQERLAKLVGGVAVIKVGAATETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTSLMNVYTKVASIVAEGDEATGINIVLRALEEPVRQIAINAGLEGSVVVERLKGEKVGVGFNAATGEWVNMLETGIVDPAKVTRSALQNAASVAAMFLTTEAVVADKPEPNAPAMPDMGGMGMGGMGGMM >CP029805|258908:266857|263196_264522_+|AWU51267.1|DBSCAN-SWA MKRYFQFDELGTNYKTEFIAGLTTFLSMAYVLFVNPATLSLGNVKGLPAGTGMDPGAVFVATALAAAIGSLIMGIFAKYPIALAPGMGINAFFAYTAVLTMGIPWQTAIAGTLMSGIIFIILTASGIREKIINAIPSELKFAVAAGIGLFIAFLGFQNAGIIVKNDAVLVGLGDLTKGTTLLAIFGVVTTIIFMIKKVNGAVFYGMILTAILGVATGLIDTPKAVVGAIPSLEPTFGAALTHFGDIFTVQMGIVIITFFFIDFFDTAGTLVAVANQAGLMKNNKLPRAGKALFADAIATVIGAILGTSTTTSYIESSAGVAAGGRSGFTAVVTAGFFLLALFFSPLLSVVTPAVTAPALIIVGILMVSSLGEIDWKKFEIAVPAFFTIISMPLTYSIATGIAIGFIFYPITMVVSGRRKEIHPIMYVMGVLFVLYFIYVRK >CP029805|258908:266857|258908_259193_+|AWU51264.1|DBSCAN-SWA MLKPLGDRVVIELVQAEEKTASGIVLPDTAKEKPQEGKVIAVGTGRVLENGERVALEVAAGDLIIFSKYAGTEVKYEGTDYLILRESDILAVIG |
6 | uncultured_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
297536 : 305913
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP029805|297536:305913|DBSCAN-SWA GATGATTAGTCGTTATACACGCCCAGAAATGGGTGCGATTTGGACGGAAGAGAACAAATTTAAAGCGTGGTTAGAAGTTGAGATTTTAGCTTGTGAAGCATGGGCTGAGCTTGGCGATATTCCTAAAGAAGATGTTAAGAAAATTCGTGAGCATGCATCATTTGATATTGATCGTATTTATGAAATTGAAAAAGAGACACGTCATGACGTAGTTGCATTCACTCGTGCTGTATCAGAAACACCAGCATTAGGTGAGGAACGTAAATGGGTTCATTACGGTTTAACATCTACAGACGTAGTAGATACAGCGTTATCTTACATCTTAAAACAAGCGAATGAAATCATATTAAAAGACTTAGAAAACTTCGTAAGCATTTTAGCTAACAAAGCGAAAGAGCATAAATACACGATTATGATGGGAAGAACACACGGTGTCCATGCAGAACCAACAACATTTGGTCTAAAACTTGGTCTTTGGTATGAAGAAATGAAACGTAACGTAGAGCGTTTCAAACAAGCTGCTAATACAGTTCGTGTGGGTAAACTATCTGGTGCGGTTGGTACATATGCAAATATTGATCCATTCGTAGAAAAATATGTTTGTGAAAATTTAGGATTAGAAGCAGCACCAATTTCAACACAAACATTGCAACGTGATCGCCATGCTCATTACATGTCAACACTTGCATTAATCGCAACATCTATCGAAAAGATGGCAGTTGAGATTCGTGGTTTACAAAAGAGTGAAACACGTGAAGTTGAAGAAGCTTTCGCAAAAGGTCAAAAAGGTTCTTCTGCAATGCCACATAAGCGTAATCCAATTGGATCTGAAAATATGACTGGTTTAGCTCGTGTTATCCGCGGTTATATGATGACAGCTTATGAGAATGTTCCATTATGGCATGAGCGTGATATTTCTCACTCTTCAGCAGAACGCGTAATTTTACCAGATGCTACAATCGCGTTAAATTACATGCTAAATCGCTTTGGTAATATCGTTAAAAACTTAACTGTATACCCAGAGAATATGAAACGCAATATGACAAGAACATACGGCTTAATTTATTCTCAGCGCGTAATGCTTACATTAATCGATAAAGGTATGGTGCGTGAAGAAGCTTACGATATCGTACAACCTAAAGCGATGGAAGCTTGGGAAACACAAGTACAATTTAAAGAGCTTGTAGAAGCTGATGAGCGTATTACGAGCAAGTTAACACAAGAAGAAATTAATGAATGCTTTAACTATGAGCATCATATGCAACACGTTGATACAATCTTTGAACGCCTAGGATTAAACGAAGCGTAAAATTTCATATGGCACAGAATAGAGTCATTCTGTGCCATTCTTTATAAAAACATTATTCACATTTTTCAAACTACAGGGGGCTTGCGAAATGCAAAAGCTAGAATTGCTGTATGAAGGTAAGGCAAAAAGAATTTATCGTACAGAATCAGCAGATATGGTTTGGGTAGAGTACAAAGATAGTGCGACTGCTTTCAATGGGGAGAAAAAAGAGACGATTACAGGAAAAGGTCGTTTGAACAATGAGATTACAACTTTATTGTTCAGAAAGTTACAAGAAGTAGGAATTAAAACACATTTTGTTGAGAAGTTATCTGAGACAGAGCAACTTGTTAAAAAAGTGAGTATTATTCCTTTAGAAGTTGTCACAAGAAATGTAATTGCAGGAAGTCTTTCAAAACGATTAGGAATGGAAGAGGGAACTGTACTTGCAGAACCAATCGTAGAATTTTACTTCAAAGATGATGATTTAGGAGATCCGCTTGTAACAGAAGATCATATTCGTGTATTAAACGTTGCATCGCCAGAGCAAGTAAGCGTATTACGAGATATGGCTCTACAAATCAATCAAGTGTTGATTGATCATTTCGCAAGCTGTCGTGTAAGATTAGTAGATTTCAAATTAGAGTTTGGTGTAACGGATGAAGGAGCAATCATATTAGCAGATGAAATTTCACCAGATACTTGCCGTTTATGGGATGAAACGAGCAATGAAAAGTTTGATAAAGACGTATTCCGTCGTGATCTTGGAAATTTAACAGATGCTTATGAAGAGATTTTAAAACGTTTAGGGGGAATTTCACATGTATAAAGTTAAGGTATATGTAACATTAAGAGAAAGCGTATTAGATCCACAAGGAACAGCAGTAAAAGGAGCACTTCATAGCCTTTCATTCACAGAAGTACAAGATGTTAGAATTGGAAAATACATGGAATTAACAATTGATAAATCAGTATCTGACCTTGACGCAAAGGTAAAGGAAATGTGTGAAAAACTATTAGCGAACGTTGTAATGGAAGACTTCCGTTATGAAGTTGAGGAGGTTGTCGCACAGTGAAATTTGCCGTAATAGTATTTCCAGGTTCGAACTGTGATGTTGATATGTTCCATGCAATTAAAGATGAGCTTGGCGAAGAAGTAGATTACGTTTGGCACGATACAGAGAATTTAGATGAATATGATGCAATTCTACTACCAGGTGGTTTCTCTTACGGTGACTACTTACGCTGCGGTGCTATTTCTCGCTTTGCGAATGCAATGAAAGCAGTACAGAAAGCTGCTGAGCAAGGAAAGCCAATTTTAGGTGTATGTAATGGATTCCAGATTCTTGTTGAATCAGGATTACTACCAGGGGCATTAATGAGAAACGAAAACTTAAAATTTATGTGTCGAACGGTTCAGTTACGTGTTGAAAATAATGAAACAATGTTTACATCACAATATGAAAAAGATGAAGTAATCAATATTCCAATTGCACATGGTGAGGGGAATTACTATTGTGATGAAGAGACTCTTAAACAATTAGAAGAGAATAATCAAATCGCATTTCGTTACGTAGAAAACCCGAACGGAAGCGTTTCAGATATTGCTGGTATTGTAAACGAAAAAGGAAATGTACTTGGTATGATGCCACACCCAGAGCGTGCTGTAGATGAATTACTTGGCGGTGCTGAAGGGTTAAAAGTCTTTCAATCTATCTTAAAACAGTGGAGGGAAACATATGTCGTTAATGCTTGAACCAAATCCAACACAAATTAAAGAAGAGCGCATATATGCGGAAATGGGGCTAACAGACGAAGAGTTTGCCATGGTTGAAAAGATTTTAGGCCGTCTGCCAAATTATACAGAAACAGGTTTATTCTCTGTAATGTGGTCAGAACATTGTAGTTATAAAAATTCAAAACCAGTGCTTCGAAAATTCCCAACAACAGGTGAGCGCGTTCTGCAAGGACCTGGGGAAGGTGCTGGAATTGTAGATATCGGTGATAATCAAGCGGTTGTATTTAAAATGGAAAGTCATAACCATCCTTCTGCTATTGAACCATATCAAGGAGCAGCAACAGGCGTTGGTGGTATTATTCGTGACGTATTCTCTATGGGGGCACGTCCAGTAGCTCTATTAAACTCACTTCGCTTTGGGGAATTACAATCACCACGTGTGAAATACTTATTCGAAGAAGTAGTAGCAGGAATTGCGGGATACGGTAACTGTATCGGTATTCCGACTGTTGGCGGCGAAGTACAGTTTGATCCATGTTATGAAGGAAACCCACTTGTAAATGCAATGTGCGTAGGCTTAATTAACCACGAAGACATTAAAAAAGGGCAAGCGCACGGTGCTGGAAATACAGTAATGTACGTAGGCGCATCAACTGGTCGTGATGGTATCCACGGTGCAACATTCGCATCTGAAGAGTTATCTGAAAGCTCAGAAGCGAAGCGTCCAGCAGTTCAAGTAGGAGATCCATTTATGGAGAAACTTCTTATTGAAGCTTGCTTAGAACTTATTCAATCGGATGCACTTGTTGGAATTCAAGATATGGGTGCAGCTGGTTTAACATCATCTTCTGCAGAAATGGCAAGTAAAGCAGGAATGGGTATTGAAATGTACTTAGATGATGTACCGCAGCGAGAAACAGGAATGACACCATATGAAATGATGTTATCTGAATCACAAGAGCGTATGTTAATTGTTGTGAAAAAAGGTAGAGAGCAAGAAATAGTAGATTTATTTGAGAAGTATGGTCTTGCAGCCGTTACGATGGGGAAAGTAACGGAAGACAAAATGCTTCGTTTATTCCATAAAGGTGAAATGGTAGCTGAAGTGCCAGCAGATGCTCTTGCAGAAGAAGCACCAATTTATCATAAACCATCAAAAGAAGCAGCATATTTTGCTGAATTCCAGCAGATGAAAATGGAAACACCAAAAGTAGAAAATTATAAAGAAACGTTATTCGCTCTATTACAACAACCGACGATTGCAAGTAAAGAGTGGGTTTATGATCAATATGATTATCAAGTTCGCACAAGCACAGTTGTTACACCAGGTTCAGATGCAGCAGTTGTACGTGTACGCGGTACAGAAAAAGGATTAGCAATGACGACAGATTGTAACTCTCGCTACATTTATTTAGATCCAGAAGTGGGCGGTAAAATTGCAGTAGCAGAGGCAGCACGTAATATCGTATGTTCTGGGGGAGAGCCTCTTGCAATTACAGATTGCTTAAACTTCGGTAATCCAGAAAAACCAGAAATCTTCTGGCAAATTGAGAAATCAGTAGATGGTATGAGTGAAGCTTGTCGTACGTTACAAACACCAGTTATCGGCGGAAACGTATCAATGTATAACGAGCGTAGTGGTGAAGCGGTATACCCAACACCGACAGTTGGGATGGTTGGACTTGTACATGATTTAAAACATGTAACAACACAAGAGTTTAAGCAAGCCGGCGATTTAGTTTATGTCATTGGAGAGACGAAAGCTGAGTTTGGTGGAAGTGAATTACAGAAAATGCTTCACGGAAAAATTTTCGGCCAATCACCAAGTATCGATTTAGACGTAGAATTAAAACGTCAAAAACAAGTATTAGCAGCCATTCAAGCTGGCCTTGTTCAATCTGCACATGACGTTGCTGAAGGTGGTTTAGCGGTTGCGATTTCAGAAAGTGCAATTGGTGCTAACGGCTTAGGTGCTACTGTGAAATTAGACGGGGAAGCAACAGCTGCATTATTTGCGGAATCACAATCTCGCTTCGTAATAACGGTAAAACGTGAAAATAAAGAAGCGTTCGAGAAAGCGGTAGAAGCCATTCAAGTTGGTGAAGTAACAAATACAAATGAAGTAACAATTCATAATGAAGAAAATGAAGTATTACTTACAGCAAATGTAGATGAAATGAGAAAGGCTTGGAAAGGGGCAATCCCATGCTTGCTGAAATAAAGGGGTTAAACGAAGAATGTGGCGTATTCGGAATTTGGGGGCATGAAAATGCGGCACAAGTTTCATACTACGGATTGCACAGTTTACAGCACCGTGGGCAAGAAGGCGCAGGCATTGTCGTAAATAATGGGGAAAAAATCGTCGGTCACAAGGGGTTAGGTTTAATATCGGAAGTGTTTTCAAGAGGTGAGCTAGAAGGATTGAATGGAAAATCAGCAATCGGGCATGTACGATACGCGACGGCTGGTGGAAGTGAAGTAGCTAACGTTCAACCATTATTATTCCGTTTTTCTGATCATAGTATGGCATTAGCTCACAACGGAAATTTAATTAATGCAAAAATGCTTCGCCGCGAATTAGAGGCAGAGGGAAGTATTTTTCAAACAAGTTCAGATACAGAAGTACTTTTACATCTTATTAAACGTAGTACGAAAGATTCGTTAATTGAAAGTGTAAAAGAGGCTTTAAATAAAGTGAAAGGTGCGTTTGCGTATCTTTTACTAACTGGAAATGAAATGATCGTTGCGTTAGATCCGAATGGTTTCCGTCCTCTTTCAATTGGAAAGATGGGTGATGCTTACGTTGTAGCATCAGAAACATGTGCTTTCGATGTAGTAGGTGCAACATACATTCGTGATGTAGAACCGGGTGAATTACTTATCATCAATGATGAAGGAATTCACGTAGATCGTTTTACAAATGAAGTAGATCATGCAATTTGTAGTATGGAATACATTTACTTTGCACGACCAGATTCTAATATTGCTGGTATTAACGTCCATGCAGCACGTAAAAACATGGGAAAACGTTTGGCGGCAGAAGCTCCTATTGAAGCTGATGTTGTTACTGGTGTGCCAGACTCTAGTATTTCGGCAGCAATTGGTTATGCGGAGGCGACAGGTATTCCATATGAGTTAGGATTAATTAAAAATCGTTACGTTGGACGTACATTTATTCAACCTTCTCAAGAACTGCGCGAGCAAGGGGTTAAGATGAAGCTTTCAGCAGTAAGAGGGGTAGTTGAAGGAAAACGAGTTGTTATGATTGACGATTCTATCGTAAGAGGAACAACAAGTAAACGAATTGTTCGCATGCTTCGCGAGGCTGGAGCGACAGAAGTTCACGTAAGAATTGCTTCACCACCTCTGAAATATCCATGCTTCTATGGTATTGATATTCAAACGAGAAAAGAATTAATTGCAGCAAATCATACGGTAGAAGAAATTCGTGAAATGATCGGTGCAGACTCATTAACATTTTTAAGTGAAGATGGATTAGTAGATGCAATTGGACGTCCATATGAAGGGAAATATGGCGGCCTATGTATGGCTTACTTTAATGGGGACTATCCAACAGCTCTTTATGATTATGAGCAAGAGCTTTTAGAAAGTATGAAATAAGAAAAATGAAAAAAGCTTCTACTTCTTTTGATGTAGAAGCTAGCTTCTTTTTTATAAATAGCCCGCCCTGGATGGGGAGAAATTAAAAGACGAGGTGTAAATAACGATGGCGAATGCATATAAGCAAGCAGGAGTAGATATTGAAGCTGGATATGAAGCGGTATCTCGCATGAAAAAACACGTACAAACAACTATGAGAAAAGAAGTACTAGGCGGTTTAGGCGGTTTTGGAGGTATGTTTGATCTATCAAAATTTGCATTAGAAGAACCTGTATTAGTATCTGGAACAGATGGCGTGGGAACGAAATTGATGCTCGCTTTTATGGCAGATAAACATGACACAATTGGTATTGATGCAGTAGCAATGTGTGTAAATGATATTGTTGTCCAAGGAGCAGAGCCGCTTTTCTTCCTTGATTATATTGCTTGTGGTAAAGCTGAACCTAGTAAAATTGAAAACATCGTCAAAGGTATATCAGAGGGCTGTCGCCAAGCAGGTTGTGCTTTAATTGGTGGAGAAACAGCTGAAATGCCAGGAATGTATTCGACGGAAGAATACGATTTAGCTGGTTTTACAGTTGGAATTGTTGATAAAAAGAAAATTGTAACAGGTGAAAAAATTGAAGCTGGTCACGTATTAATCGGCTTAGCATCTAGCGGTATTCATAGTAATGGTTACTCTTTAGTACGAAAAGTATTACTAGAAGATGGAGAACTATCTTTAGACCGCATTTATGGACGCTTAGAGCTACCTCTTGGTGAAGAATTATTAAAACCAACGAAAATTTATGTCAAACCTATTTTAGAACTATTGAAGAATCATGAAGTATACGGTATGGCGCATATTACAGGTGGCGGATTCATTGAAAATATTCCACGTATGTTACCAGAAGGAATCGGTGCAGAAATTGAATTAGGATCTTGGAAAATTCAGCCGATCTTCAGTTTACTTCAAGAAGTTGGAAAGCTAGAAGAGAAAGAAATGTTCAATATTTTTAACATGGGTATTGGTATGGTAGTAGCAGTGAAGGAAGAAGATGCAAAAGATATCGTCCGTCTCCTTGAAGAGCAAGGGGAAACAGCTCGTATTATTGGACGTACTGTACAAGGAGCTGGCGTTACCTTCAATGGGGGCAAAGCACTATGAGTAGATTAGCAGTTTTTGCTTCTGGAAGCGGATCTAACTTTCAATCTCTCGTTAATGCGGTAGAAGAAAAAAGATTGGATGCAGAAATTAGTTTATTAGTATGTGATAAACCAGAAGCACGCGCTGTTGGGCGAGCGAATTATCATCATATTCCGTGTTTTGCTTTTTCAGCGAAAGCATATGAGTCAAAAGAAGCATTTGAAAAAGAAATATTAAACAAGCTAGAAGAGTATGAAATTGATTATGTTATTTTAGCTGGATATATGCGTTTAATCGGGCCGACTTTACTAGAAGCTTACGGCGGAAGGATTATTAATATTCATCCATCATTATTACCAAGTTTTCCAGGTAAGGATGCTGTCGGCCAAGCGTTAGAAGCGGGTGTGAAAGTAACTGGAGTAACGATTCATTATGTAGATGCAGGTATGGATACAGGGCCAATTATTGCGCAAGAAGCAGTAGTTGTTTCTGAAGGTGATACGAGAGAAAGCTTACAAAAGAAAATTCAGCAAGTTGAACATAAATTATACGTAAATACAGTGAATCAAATTGTTCAATCTACGAAAGAACCAACTGTTAATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP029805|297536:305913|297536_298844_+|AWU51281.1|DBSCAN-SWA MISRYTRPEMGAIWTEENKFKAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVKKIREHASFDIDRIYEIEKETRHDVVAFTRAVSETPALGEERKWVHYGLTSTDVVDTALSYILKQANEIILKDLENFVSILANKAKEHKYTIMMGRTHGVHAEPTTFGLKLGLWYEEMKRNVERFKQAANTVRVGKLSGAVGTYANIDPFVEKYVCENLGLEAAPISTQTLQRDRHAHYMSTLALIATSIEKMAVEIRGLQKSETREVEEAFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMTGLARVIRGYMMTAYENVPLWHERDISHSSAERVILPDATIALNYMLNRFGNIVKNLTVYPENMKRNMTRTYGLIYSQRVMLTLIDKGMVREEAYDIVQPKAMEAWETQVQFKELVEADERITSKLTQEEINECFNYEHHMQHVDTIFERLGLNEA >CP029805|297536:305913|298932_299652_+|AWU51282.1|DBSCAN-SWA MQKLELLYEGKAKRIYRTESADMVWVEYKDSATAFNGEKKETITGKGRLNNEITTLLFRKLQEVGIKTHFVEKLSETEQLVKKVSIIPLEVVTRNVIAGSLSKRLGMEEGTVLAEPIVEFYFKDDDLGDPLVTEDHIRVLNVASPEQVSVLRDMALQINQVLIDHFASCRVRLVDFKLEFGVTDEGAIILADEISPDTCRLWDETSNEKFDKDVFRRDLGNLTDAYEEILKRLGGISHV >CP029805|297536:305913|299895_300579_+|AWU51284.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDVDMFHAIKDELGEEVDYVWHDTENLDEYDAILLPGGFSYGDYLRCGAISRFANAMKAVQKAAEQGKPILGVCNGFQILVESGLLPGALMRNENLKFMCRTVQLRVENNETMFTSQYEKDEVINIPIAHGEGNYYCDEETLKQLEENNQIAFRYVENPNGSVSDIAGIVNEKGNVLGMMPHPERAVDELLGGAEGLKVFQSILKQWRETYVVNA >CP029805|297536:305913|304288_305329_+|AWU51287.1|DBSCAN-SWA MANAYKQAGVDIEAGYEAVSRMKKHVQTTMRKEVLGGLGGFGGMFDLSKFALEEPVLVSGTDGVGTKLMLAFMADKHDTIGIDAVAMCVNDIVVQGAEPLFFLDYIACGKAEPSKIENIVKGISEGCRQAGCALIGGETAEMPGMYSTEEYDLAGFTVGIVDKKKIVTGEKIEAGHVLIGLASSGIHSNGYSLVRKVLLEDGELSLDRIYGRLELPLGEELLKPTKIYVKPILELLKNHEVYGMAHITGGGFIENIPRMLPEGIGAEIELGSWKIQPIFSLLQEVGKLEEKEMFNIFNMGIGMVVAVKEEDAKDIVRLLEEQGETARIIGRTVQGAGVTFNGGKAL >CP029805|297536:305913|299644_299899_+|AWU51283.1|DBSCAN-SWA MYKVKVYVTLRESVLDPQGTAVKGALHSLSFTEVQDVRIGKYMELTIDKSVSDLDAKVKEMCEKLLANVVMEDFRYEVEEVVAQ >CP029805|297536:305913|300562_302782_+|AWU51285.1|DBSCAN-SWA MSLMLEPNPTQIKEERIYAEMGLTDEEFAMVEKILGRLPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTTGERVLQGPGEGAGIVDIGDNQAVVFKMESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPVALLNSLRFGELQSPRVKYLFEEVVAGIAGYGNCIGIPTVGGEVQFDPCYEGNPLVNAMCVGLINHEDIKKGQAHGAGNTVMYVGASTGRDGIHGATFASEELSESSEAKRPAVQVGDPFMEKLLIEACLELIQSDALVGIQDMGAAGLTSSSAEMASKAGMGIEMYLDDVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLIVVKKGREQEIVDLFEKYGLAAVTMGKVTEDKMLRLFHKGEMVAEVPADALAEEAPIYHKPSKEAAYFAEFQQMKMETPKVENYKETLFALLQQPTIASKEWVYDQYDYQVRTSTVVTPGSDAAVVRVRGTEKGLAMTTDCNSRYIYLDPEVGGKIAVAEAARNIVCSGGEPLAITDCLNFGNPEKPEIFWQIEKSVDGMSEACRTLQTPVIGGNVSMYNERSGEAVYPTPTVGMVGLVHDLKHVTTQEFKQAGDLVYVIGETKAEFGGSELQKMLHGKIFGQSPSIDLDVELKRQKQVLAAIQAGLVQSAHDVAEGGLAVAISESAIGANGLGATVKLDGEATAALFAESQSRFVITVKRENKEAFEKAVEAIQVGEVTNTNEVTIHNEENEVLLTANVDEMRKAWKGAIPCLLK >CP029805|297536:305913|305325_305913_+|AWU51288.1|DBSCAN-SWA MSRLAVFASGSGSNFQSLVNAVEEKRLDAEISLLVCDKPEARAVGRANYHHIPCFAFSAKAYESKEAFEKEILNKLEEYEIDYVILAGYMRLIGPTLLEAYGGRIINIHPSLLPSFPGKDAVGQALEAGVKVTGVTIHYVDAGMDTGPIIAQEAVVVSEGDTRESLQKKIQQVEHKLYVNTVNQIVQSTKEPTVN >CP029805|297536:305913|302766_304182_+|AWU51286.1|DBSCAN-SWA MLAEIKGLNEECGVFGIWGHENAAQVSYYGLHSLQHRGQEGAGIVVNNGEKIVGHKGLGLISEVFSRGELEGLNGKSAIGHVRYATAGGSEVANVQPLLFRFSDHSMALAHNGNLINAKMLRRELEAEGSIFQTSSDTEVLLHLIKRSTKDSLIESVKEALNKVKGAFAYLLLTGNEMIVALDPNGFRPLSIGKMGDAYVVASETCAFDVVGATYIRDVEPGELLIINDEGIHVDRFTNEVDHAICSMEYIYFARPDSNIAGINVHAARKNMGKRLAAEAPIEADVVTGVPDSSISAAIGYAEATGIPYELGLIKNRYVGRTFIQPSQELREQGVKMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVRMLREAGATEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHTVEEIREMIGADSLTFLSEDGLVDAIGRPYEGKYGGLCMAYFNGDYPTALYDYEQELLESMK |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
446339 : 477006
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029805|446339:477006|DBSCAN-SWA AATGATACAAAAGCAACATGAGAGTAAGTTGGAAGTTGGTCAAACATTTCCTGTGACAATTAAACGTCTTGGGATTAACGGAGAAGGCGTTGGTTATTTTAAGAGACAAGTTGTTTTCATTCCAGGGGCATTACCAGGAGAAGAAGTTGTTGCTGAAACAACGAAAATTCAGCGTGGTTTCGCAGAAGCGAAAGTGAAAAAAGTTCGTAAAGCTTCACCGCATCGTGTGAAAGCACCGTGTCCAGTATATGAGGAGTGTGGCGGTTGTCAGCTGCAACATTTAGATTATAAAGAACAATTGAATCAAAAGCGTGATATCGTTGTACAAGCATTTGAGAAATACATGAAAAACAGTATGGAAGAGAAAATTCGTCCAACGCTTGGCATGGAAAATCCATGGCATTATCGTAATAAGAGTCAATTACAAGTGGGGCGTAAAGACGAAAAGGTTATTACAGGGCTGTATAAACAAAATTCACATCAGTTAATTGATATTGCTCATTGTATGATTCAACATAAAGCAACGAATGAAGCGACAAAAGTTGTAAGACGTATTTTAGAAAAATTAAATGTTTCTATTTACAATGAGAAAAAACAAAAAGGTTTAGTACGTACAATTGTGACACGTACTGCAGTTCAAACAGGGGAAGTACAAGTTACACTTATTACAACAAAAGAAGAGTTGCCAAATAAAGAACAATTTATTGCAGAAGTACAAAAACAGATGCCAGCTGTTAAATCAATTATGCAAAATGTAAACTGGCGTAAAACATCTGTTATTTTCGGAGATAAAACATTTAAATTAGCTGGAAAAGAAGTAATTCAAGAAACACTTGGTGATTTATCATTTGAATTATCAGCACGTGCATTCTTCCAGTTGAATCCAGAACAAACGGTTGTATTATATAATGAAGCGAAAAAAGCCGCTGCTTTAACAGGAAATGAGAAAATTGTAGATGCATATTGTGGTGTTGGTACAATCGGTCTTTGGCTTGCGAATGATGCAGCGGAAGTACGTGGTATGGATGTAATTCCAGAAGCAATTGCAGATGCAAGAAAAAATGCGAAGCGTCACGGATTTACAAATACGAAATATGAAGCAGGTAAAGCTGAACAATGGTTACCTAAATGGGTAAAAGAAGGATGGCGTCCAGATGTAATTGTTGTCGATCCACCACGTACAGGTTGCGACGATAAATTACTGGAAACAATTTTAAAAGTGAAGCCAAAACAAGTTGTTTACGTATCTTGTAACCCTTCTTCATTAGCACGTGATGTACAAGCGTTAATGAAGAGTTATGAAGTGGAATATGTACAACCAGTTGATATGTTCCCGCATACAGCTCATGTTGAGAACGTAGTTAAATTAACGCTGAAATAAAGGGGTTTCAATGAAATTGTTGATGGGTTTGACCACATTCTGACCACATCAACAATTTTTTTATGATTTTAATGCCTCACTTAGCTTTAAAACAGCACTTTCTTGCATATCTATAGTAACATGACTGTAAGTGTCTAATGTGGTCTTAATTGAACTATGTCCTAAACGCTCACTTACGATTTTTGGATTAATACCTAGCTTCAATAAAATTGTTGCATGCGTATGTCGTAAGTCGTGAAACCTAATTTGAGGTACATCGGCTTTTTTTATAAATTGATTAAAAGTAGTTGTCATAGTTCGTGGTAATATTGGCTGTCCAGTTTCTTTAGCAAAAACTAAATCATTATCCTCGTATGACTGCCCAAATAATAATTTGAACTCATTTTGTTTAGCTTTATAAGACTTAAATTCTTTACATAAGTTTTGATCGATAGAAATTAAGCGTTTTGATCCATGTGTTTTGGGTTCTGTAAATCTAAATCCGTTCTCATCATAAATGAGTGTTTCTGTAACGCTTATTTTACCTTCATTCAAATCGAAATTCTTCCACTTTAGACCAAGTATTTCACCACGTCTCATACCTGTATTTAATGCCAATAAGAAAAGATGATAATAGATGACATTTTCAAATTTTGTACGATTTAAGAATTTTTTCGTTTCTTCAATTGACCACGTAGAATTGACCACTTTTCGTGGTCGAGGTATTTCCACATGTTGAAATGGGTTTTTAAACAGGAGCTCCCACCTAACAGCGTCTTCTAATGATCCTTTTAAAACAATGAAAATATATTCAATATACGCAGGTGACAACCCTTCATCAATTAAGGATTTAACGAATCGTTGTCCATGCAAGGGTTTTAAATCCTTTAATTTATGCGAACCAAGCACAGGTATAATTCGACTATTTATAGCTCTTTTATAATTGGTGAATGTAGTTTCTCTTACTCTTTGTTTAGCTGTATTTTCTAGCCATTCTTGTAAATACTCACTAAGAGTAAAATTCTTATCATCAACTAGACTTCCAGTGTTGAATTGATGGATAAGCTCATTGCATGCACGTTCGGCTTCTTTCTTTGTTTTAAAGCCTGATGCTGTTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGTGATAGGATCTTTCCCAATATCAATAGTAAATGACCACTTTTCACCACGTTTTCTAAAGTATCCTTTCATTATCCATACCTCCTTGAACTAATAGTATTCTAATAGCACAAATAATTCCAGTATCAGAAAAAGGAAAAAGCAACTCATCTGAGTTACTTTATGGTAAACTATATTCAACTGTATATGTCGGGTGGCTTGGTTGCTATCCTTTCTCTGTATTTTAGAGAGAAAGGAGGTGACCCTTATGATGGAATATTTACTTTCTTTGTTACAGGATTTACTCAAGGTATTCCTTACTATAGTTGTTACAGCTTATGCAAATAAGTTCGCTAACAATTTGTTTAAGAAAAGTAAAAGAGCCACCCCTCGCCGTAGGAAGCAGGGTAGCTCTAAAAGAAAATAAATAGCAACCTTGCCATCTGATGGCGGCAGTTACTGGAAGAGATGTTAACGGCATCTCTTCTTTTATTCTATGCAATTCAGTTAGGTGTCATACTTAATATATAGTAAATATATGTTCACTATACAGTGGTGATTCTAGTGCCAATATTACCACAGTATCATTTTTGGGTCAACGCAAATAGCAGGGATTGATGGTGAATTTATAATGGTCCACAAAATAAAAAATCATGGTAAAATATATATATCCATACTTCTTAGCCCATACATGTTGTGGGCTTTTTTTATTGATACAAAATCAGTATTTTGTCGAAAGAAAAAAAGAGAGCAAAACGCTCTCTTACCACTACCCAATGGAAAACTTTTCTTCTAAAATGAAATTAAATCAGAATATATCTTGATTATCTTCAAGCATATTGATTAATACGGAGACTTGCTTACAAAAACGTTCCCTCTGTTGTTCATTTAACGCCGCATACGTTGTTTGAACATTAGATAATAGTTCTGTTAAGGGTTCTTCATCAAATTCATTCGTGAACCCAATAAGCGCGTCTACCGAAACATTGAAGAAGGAGGCGATGATAACCAACGTATCTATATCTGGCTGATACCGATCAGTTTCCCAGTTTTTGATTTGGCTTCTACTCAAGTTCAGCTTGTGGGAAAGTTGTTCCTGAGTTAAGCCACGCGACTTCCTTAGTTTTTTTAGAATTTGTCCAAAGTGTCTCATAATTTAAAGTATAAATACTAAACAACTATACTACTATATATGGTCGTTTAACTACCTTTAATGTTAAAATGGTAGTTATGGTTTCTGGAAATAAATCAAAAAACAGAACAAAAGTTCGTATTCTTGTGGTAAAATATGCATGTGAGGTATTCGAAAGTTCCATGCATATTTACATATTTTATTTTCGTTACAGCTGATAAACGTTGGTATATAACGGTTTTACAACTTTCTCAATAATTATCAGATAACTGCATGACTGAAATTTGCCAAAAATATGATATTATGAAAACAAATATAATAAACGGAACGAAAAAAAGACTCACAGCGTGTGTAAGAGTGATTTGGCCCACTCTTACACCGTTCGCCCGACTCACAAGGGGAACATCTGCCATAAGTCTCTTTTCGGTCACTACACGAGTAACACTTACATTATAACATGCCGATATTACTAAAGCATTACTATGGTATTAAATTCCTGTTTTAAAAGTTGAGAAAAGAGCGAAGCGTCTTTGTTCCAAAAGGGAGGAACAAGAAGTGTGGAAAGTTTTAAATGTTCTTGAAGGAGAGTTATATGTAGCTGGAATTAAGAAAAACAAGTTAGCTGATTATTGGGGAGTGAAGCCTGCTACAGTTACCAAGGTATTTAAAGGAGCTAACGATATTAGTTTCGGATATCTTTCGAAGACGCTTATTTTATTAAAAAAGAGTTTGATTTCACAGGCGAAAATTGTTAATGACTATGTAACGAACACAGACCCTAAACCTGAAAATTTAAGAGAAGCTATGGAAGATTTGGCTATTAGAGGTAAATTCGAATTATTGAAAGCAATTATAGATCAAGAGATTCATTCTGATGTTGCCGAAAATAGAGAATTTGCAGAAGTATATGAAATAATTTTTCGAAGATATCATGACGGTTTGAATGCTTCGGCTTATTTCAAATTATTAAGACAAAAGAATAAAAATGTTAAAACGATTGAAATGGAAGTTTTGACAGAAATCTTATTATGCCAGGCGCAATATCAGTCTGGGAATTACAAAACGCTATACGAGAGACTGAAGTCAGTTAGTGAAAAAATAAATGAAATAACAAATAAATTTATAAAAGAATGTTTGTTACTAAGATATAAAGAAGCAATAGCAGTAACTTCTTTACAAGGTGGCGAAGTAGTTGAATCTCGTTCCATATGTCGAGATATATTAGATGAATTAGAGTGGGATGACTTTTTCTCACTGCCAAAACTAAATGCATACTTGAAAATAGGCGAGTCATTAATATTCGAACCTGATAATTACGACAGCGCTAAGTTTTATTTAGAGAAAACATTAGAGTTATTAGGTAATCCTAGTTGCAAAGGATTAGAAAAGAAATGG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029805|446339:477006|472133_472247_+|AWU51469.1|DBSCAN-SWA MTIGDCLDYIDEYVELRNPKKEKENTRTATQDDFNNF >CP029805|446339:477006|470404_470761_+|AWU51465.1|DBSCAN-SWA MASIDSLANDIARELQRYGKEVEEKLEVEKEEVANNLVSDLKENSPKNTGKYAKGWRKKKEGNGFIVHNALKPQLTHLLEKGHAQVNGGRVPAKVHIAPAEEKAENEFLERVERAIQQ >CP029805|446339:477006|469843_470116_+|AWU51463.1|DBSCAN-SWA MILKDVKKTLRISHDALDDEINDSIEAARHDLMLSGVSSVKANNDDDPLIKRAIKVYCKAEFVTEAKEAERFQASYNMLKNHLTLAGDYK >CP029805|446339:477006|456302_456476_+|AWU51433.1|DBSCAN-SWA MKPTKVEIDVTDNKIYVVKNGEVTPLNPPATGFGEQIITWQGGKVDRVSTTITEKIK >CP029805|446339:477006|457188_457653_+|AWU51436.1|DBSCAN-SWA MNIMENGVLEATKLISEARKEATVLQIASILSIGELNDYQEATLRTWNNKTDFGGRVSNAALGLTGEAGEVADIVKKAIYHGHGFQPSHCPGEEDGNTYKLALELGDILYYLSIMAHELGYTLQDIAEMNIAKLAKRYPDGFSREASQARVDVK >CP029805|446339:477006|456756_457173_+|AWU51435.1|DBSCAN-SWA 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>CP029805|446339:477006|451670_451838_+|AWU51423.1|DBSCAN-SWA MKEEVEILKKILALLPILLVAGLFTFSADNQQTKDKQEASEPVVQRMMTDPGGGW >CP029805|446339:477006|460719_461094_+|AWU51446.1|DBSCAN-SWA MTVVSRSHRALKRKYRPIRKEFKKDILEATKNNRAFAMMIIETYTASQHRTHIMKVWELLGIHHREAYKDYCDKLMGKHLTGRDEIMRSIYFADKVLYDKYHRKLPECYAMGDALGIAYKVLKQ >CP029805|446339:477006|456083_456278_+|AWU51432.1|DBSCAN-SWA MCVLCHDTGIIRKETYPGVIETNGCNCEVAKRQQAENDKRWQAWLIKFESMKQELERSKQQKAS >CP029805|446339:477006|460018_460465_+|AWU51444.1|DBSCAN-SWA MEEILVQGNITEDLKRLGVKANRTYGDETTSYQVYEVSEEDFRKLSDDAENMDTDDSHWKNGGWRWDTGSNQPIPTDKAEVNNQELVCWVETINDDEETYRNDWYVDLLEYLDVGVGCTAFRNVCAVTKDLAKYNNMSMAELFKKYQG >CP029805|446339:477006|450498_451674_+|AWU51422.1|DBSCAN-SWA MWKVLNVLEGELYVAGIKKNKLADYWGVKPATVTKVFKGANDISFGYLSKTLILLKKSLISQAKIVNDYVTNTDPKPENLREAMEDLAIRGKFELLKAIIDQEIHSDVAENREFAEVYEIIFRRYHDGLNASAYFKLLRQKNKNVKTIEMEVLTEILLCQAQYQSGNYKTLYERLKSVSEKINEITNKFIKECLLLRYKEAIAVTSLQGGEVVESRSICRDILDELEWDDFFSLPKLNAYLKIGESLIFEPDNYDSAKFYLEKTLELLGNPSCKGLEKKWKLVQQTLSFLKIHQQRDLNTLEFVHPSEKAYSMILEGDVLGAKKILLDLKEKNGEWTDIQTAYYALTCEGEERESLLKKSLLMCQKSGNIHYSQLPKNILGFNLKKWYNYL >CP029805|446339:477006|471087_471657_+|AWU51467.1|tail|DBSCAN-SWA MENKVVFGLKKVHYSVITEDSSGKITYGTPAKLPGAVKMKLDPKGEQSDFWADDSNYYTDSSNQGYEGTLNIANITEAFRTDVLGEILDEDDQVLTEVSNAKIKRIALMFEFDGDVKATRHLLYNVSVSRPGFGSSTKSDKTEPNTTELKFVASQHPETLNVKTSTKVTTPAGIYDAWYTKVYEKVVGA >CP029805|446339:477006|457912_458203_+|AWU51438.1|DBSCAN-SWA MVMNIKVDELKENEDGIKGGKITITNEAHTITIHSQHVDDAYYLAGNLEDCANKIEVKQNCEKCCHCDGKGVGLDWGAMKFWECDVCDGTGELDSK >CP029805|446339:477006|454047_454212_+|AWU56293.1|DBSCAN-SWA MEDTTSLVAFAMFIAFSILLLYITYEPIKRWAWSNVEQNKKTHGSGSFKKKQLS >CP029805|446339:477006|462212_462695_+|AWU51451.1|DBSCAN-SWA MTKQLSFLPKIDRTATQEELEGVLESVRIHRQFGMMRKEMKVTPSYEIREHGPTHTVGKPLEDVAIANIQQSKREEWLERMSVRIDQFLNRLGNGRAGSIQRDIIYKRYLEEEDVCDYMVYNEIGMSERTYRRWKSKAFYKLAFALGLEVYETEETGGNE >CP029805|446339:477006|461583_461772_+|AWU51448.1|DBSCAN-SWA MDKIYAFQIATTAGLLAMIVLNIITGQEVRSSSIVVAAVCCVGMLKFNPLFREMIDKYRKRG >CP029805|446339:477006|462014_462185_+|AWU51450.1|DBSCAN-SWA MKVLKDQLREWKKQSNQMKKKPKKKRKEKLSTRDIEGLMGIHGPRYERRRGALRQK >CP029805|446339:477006|454423_455296_+|AWU51430.1|DBSCAN-SWA MNNVVLQIGQMNFRGNVIDHGWFKTLTLDNGKPNMVAISILGEVVYWYKPTEVRDEHSNNVRYKQKFKADTLQKSYQQFADSFGFTKRQVKDACDYLKDRRLVHIEFRTIFVNGTRCNNVMFIEPIPEEIQKISILYWENGTPPTLERKRVLQQNEPPSYDKKEEPPTFKRKTNTENTTKNTTENVSSSSIFSFYENNFGILNSFIAENISQWVNDTSEELVQAAMERALKQQKKWNYAEGILKQWVNNNVKTLKDVDALETEYQRNKGVKKRVGINRKSDDSDSEYIGL >CP029805|446339:477006|464534_464906_+|AWU51459.1|DBSCAN-SWA MASKKELTKEERVNKEIRRLKRIYKELPKDTLMVVEGLIVEAADLRVRLEDIRKDLDENGYDEMFSQSENQEPYERERPAARRYIAMNKSYQTIMKQLGDYIPKKPIENKEKDDGFDDFVTNR >CP029805|446339:477006|471661_472033_+|AWU51468.1|DBSCAN-SWA MKKTIIIDEKAVLLKSTAGTAIRYKSQFRRDMFADILSLGVLSSYISTDGDQSNIDLSQVDLSKLDFEVIYNLVWAFAKTANKEVPDPLTWLDTFGEFPIAEIITEIQDLIKSTVQSKKNNRR >CP029805|446339:477006|453697_454048_+|AWU51428.1|DBSCAN-SWA MKNSTVQIALAVTKFSAQKGWSDEEFWEAIELLRFNKEDARQTAIEKLDTIPVTYDNTNDYPIMLKVDHVAEVLGISQRKAYDIMDQKGFPLVKIGRKKVVPRDAFFNWLERGVSA >CP029805|446339:477006|472264_476200_+|AWU51470.1|DBSCAN-SWA MVGRIKGITIEIGGETTGLQSALKDVNKRSSELSKELKDIERLLKFNPGNVEALAQKQQLLTQQIENTTKKLDSLKSAQQQVQAQFESGAISEEQYRAFRREIEFTEGQLNGFKNSLAGLKAEQEKAASSTRQLETLFSATGKSVDDFADALGNRLVNAIKNGTASSRQLEQAIEIVGREALGAEADIGKLQQALRSVDDGNSIQNIRNDLNQLSQEAEEASESVKGLGVELENVLGGIVAGGGIQEVIGQALDMSELKTKIDITFDVPESSKRSVEDAIRTVVAYGGDAEEALEGVRRQWSLNKDASDAANTEIIKGAANIASSYSQIDFTELIQETNEIGSELNISNKEALGLVNSLLKIGFPPEQLDIIAEYGAQLRRVGYTAQEVQSIMASAAKEKSWNIDNLLDGLKEGRIRSVEMARGLSNSMKDAVRDAVDDTEKMSDAQISAMQKGFAKQESALANSFSNQEKALSKSHSRRQNELAKSLDAEYNAVSKSYENQQKNLEKKLSAEYDAASKNYDRQQKALEKSLDAEVKAFEKSSEQKIKLIDKEYMERMKLIDEEKYNRLKAVDDQINSLDAKTAAEDKYFKDRENAEKRADLKVKISKAKNEEERQAAIKALRDLEEKMRLDKIREERKSQIDRLKEEKDSIKEASDAKKEALKSEFDSRKERVKEQINNEKEALKERQQEQKEAFQQNKQENLKAISESNKAQLDSLREVNQANLSALKENHNERKQALSERLSDEMDAVRESHRAELESFKEMNAEKLELAKNLPDSAAVQEIFAQLEGWGKAIAKGGEEGKQAFVDMVKWLDQIEDADLKEAIGVELFGTMWEDQGQKIINTILQTEQKQADLKQGIDDLQQSVSKTDASPMVKLKEAMNDLKQALEPILLIIADVVSAFAGFISAHPVLAAAITAITVAIGILVGICAALAPVIFLATSGAITFAGVMAALTSPIALVVAAIAGLIAIWVLFGDKIMAIYNEYFKPTIDQIVSIIVSTLKPVFEQGFAIIKDVVQDAFIIIQRVWNEILSPVFSVITSIIKTVLLPAFKFVFSAIGSVVSDAFSGIKDMWNNVLKPILNGIIDFISGIFSGNWEKAWGGIVKIFSGVFEGIKSAAKAPINAVVSMLNGLIEGINSIEMPDWVPFVGGSKPSIPRIPMLATGGHVLGDGSFIAGEAGPELFTKRGNRVSVTPLSSTEKSLGITGTMSRLIGDMSYSMASSMKELSGLKSVMSNVYGSMASSSQAMSRNASQRTAEGNSSSNANKSDSYNFADMFRGSTFVVREEADVQKLAVELGKYIKASGRRVGQL >CP029805|446339:477006|468383_469574_+|AWU51461.1|capsid|DBSCAN-SWA MNKEQLLKRKSEIGELLSDETRSIDNLDTIETELRDINEQLAAIEKREQLLNEARSINEGNAAGANKIETFNANLNLSNEKREIGTNTVEYRNAFMNYVLRGEAIPAELRANAVTKTSDIGSVIPQTVLDKIIEKIEAVGMILPLITRTAIKGGVTVPTSAVKPVATWVAESSGSDKQKKTTGSITFNYHKLRCAVAVSLEVETMSLAVFETTLINNIVEAMTKAIEQAIVSGDGSGKPKGILAETPFEGQALDVAKINYKTLTDAEAALPLEYEASAIWTMTKKTFMEFSAMTDADGQPIARTNYGISGKPERILLGRPVVLCNYVDSFATATEGTAFAFLFNYKDYILNTNYQMGVKKYEDNETDDQVTKAIMIVDGKVVDKNSLVVLKKAPSA >CP029805|446339:477006|452005_452140_+|AWU51424.1|DBSCAN-SWA MKKEQLARELMVKWVLENKETNSEEVLKEITSHTYTEEKLKEAN >CP029805|446339:477006|446339_447719_+|AWU51419.1|DBSCAN-SWA 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MEYIEKATKEIRENWFGDHVAEIQGEEGLQVIYWGKPGTGSYRAKFVLSGYNVFVSGDIGEAVYNLTCPATLENIKGCNLGYFTGKLTAFCEERWNFDQDKAKEELNEFWEEYEMNETKDGKEIYDDIVSAIDESSSMESYHFWVGNVYHNSSLESDTMECIWDFGKRLPRRLIGYWLGLQMAIEQLEKNKPAAEAVTL >CP029805|446339:477006|462694_462988_+|AWU51452.1|integrase|DBSCAN-SWA MNFVQPIRDPEQIQQLKEYFKEKSLRNYILFIMGINTGLRISDILKLKVGDVKGSHISMREKKTGKQKRIQITASLKRELKWFIEEREDNEYLLQSR >CP029805|446339:477006|452682_452904_+|AWU51426.1|DBSCAN-SWA MNNILKNERKKMKFTQKQLAEKLGISTIYVRKIESGYIPRPDIMVKYQEVFDISVKELFPDYFSAFNDKKFII >CP029805|446339:477006|461199_461556_+|AWU51447.1|DBSCAN-SWA MSKVIEGQEVYVSTSGGWVGKSEPNLRKYIVVRANKTSFYANPEGVEDKSPYRFNQKDLSHNTGWGYHYQAYRTEKEYWDMIERGKEKAQLRKELKDTVDKMSLIELRKLKEVLFVTK >CP029805|446339:477006|461746_461899_+|AWU51449.1|DBSCAN-SWA MINIESEVKRMKPLKKRKVRKAIARRAKAVEKHQVDKAWRNIFVRNGYLK >CP029805|446339:477006|456490_456745_+|AWU51434.1|DBSCAN-SWA MKQLTIDDVMGSFNYDAISTSEKFLNPSYEVHFYDKEERQKMDCFDAKTETEAWNATIKEHGKGIQKIRITHSNRTRAEFLALD >CP029805|446339:477006|463015_463237_+|AWU51453.1|DBSCAN-SWA MAYKILSGAAAEFGLDEIGTHTLRKTYGYHMYMQTKNIALLMEIFNHSSEKVTLRYIGVNQDAMDKAMTRFKI >CP029805|446339:477006|464288_464426_+|AWU51458.1|DBSCAN-SWA MSEENKFGCRNWVSPEANLAYEEKVPSKDVLEVKREVLKMKQSPL >CP029805|446339:477006|467774_468365_+|AWU56294.1|head,protease|DBSCAN-SWA MGKLDKTETREIVTQKIEIREDDNGNRTLIGYAVKWEKKSVVMGYYRKFREQFKNGAFTETLQNDDQRFLWSHDTSKVLGRTKNNTLRLNEDAVGLRFELDLPDTTLGNDTYKSIKRGDVDGVSFGFSMISEEIQEPDDDLMLRTVTKAKLLEVSAVAFPAYPDSEVSARGYDPYKHFTEEKKRSEKRRRLYLQTL >CP029805|446339:477006|454241_454427_+|AWU51429.1|DBSCAN-SWA MDLIKYQVLLPNKFWDLAESKDELKKMIEQYFKNSYPHYKIKEIIRSGESHIAICERKWLI >CP029805|446339:477006|452167_452509_-|AWU51425.1|DBSCAN-SWA MTFGEKLKQLRGKRTQGDVANLLNISRATYSHLENNRIEPSMTVLNSIADLFCVSTDYLLGRSSDPRLTEEQDKTADEMARRFMELVADLPKEEQENAWKQAAMYVNFTKNQK >CP029805|446339:477006|452921_453653_+|AWU51427.1|DBSCAN-SWA MNQLQDLRHPVSEFVFTERNQVVTDSLTMAQMFGKEHKNVIRDIEVQLEKLIEANETEWGQLNFEPTQYQHYQNKQWYPKFNLTEDAFAIVAMSYITPEAMKMKIKFLQEFKRMKEHIQKVQQQPKSVEDAIIYSMTELKQIKSRQDHTEEEMNKMKLLVDNELWLTEQHKGSVQRKVKQRVFELKKEGYDNASYQGIYGALKRHFGVAKYDKIPRKYYQNAMRFIAGWYPPERPNTLDDYVS >CP029805|446339:477006|459614_460019_+|AWU51443.1|DBSCAN-SWA MKTYEELVEKCKELVEKGWTPESVRECFEAYSEFGIDAIQSAMNEALLNNGCSDNVLDYRPNLENLKALGLEEDYVFQALAYMGNASQFMSWANTVLALVDDVPEQLKQDIKKVHSGIYEMQEKLREYKKEDDE >CP029805|446339:477006|463369_463480_+|AWU51454.1|DBSCAN-SWA MGKSLVKKYIREEYKNKWQSRDRFLAGNVPVVLEST >CP029805|446339:477006|455264_456068_+|AWU51431.1|DBSCAN-SWA MTRIVNTSACSEETEGYTCEHCNKYIAAITVEVPQLRIKNKILPTCECVVEREEAKIREAQNFAKKREIEKLFSISNLGERFSKSTFESFLDRNGSETAYKVAVKYVKTFKEWNGESLMLWGEPGNGKTHLAAAIVNELSKKGYIVVFQSVPELLQRIRSTFNSENKENETQIMRALLECDLLILDDIGAEKTTEWVEEKLFNIIDGRYRKELPTLYTSNLEPKELKNQVGKRSYDRMVETSLTVKNEAASYRREIAKQRLQRFIEA >CP029805|446339:477006|447779_448904_-|AWU51420.1|integrase|DBSCAN-SWA MKGYFRKRGEKWSFTIDIGKDPITGKRKQKTASGFKTKKEAERACNELIHQFNTGSLVDDKNFTLSEYLQEWLENTAKQRVRETTFTNYKRAINSRIIPVLGSHKLKDLKPLHGQRFVKSLIDEGLSPAYIEYIFIVLKGSLEDAVRWELLFKNPFQHVEIPRPRKVVNSTWSIEETKKFLNRTKFENVIYYHLFLLALNTGMRRGEILGLKWKNFDLNEGKISVTETLIYDENGFRFTEPKTHGSKRLISIDQNLCKEFKSYKAKQNEFKLLFGQSYEDNDLVFAKETGQPILPRTMTTTFNQFIKKADVPQIRFHDLRHTHATILLKLGINPKIVSERLGHSSIKTTLDTYSHVTIDMQESAVLKLSEALKS >CP029805|446339:477006|459433_459571_+|AWU51442.1|DBSCAN-SWA MRERENWDVLCEECDKVIIIGVKTESGDHYCEACYDKLAYGNKDK >CP029805|446339:477006|476196_477006_+|AWU51471.1|tail|DBSCAN-SWA MSLTLDGKPLKQLGLALLPGYQHPAAPPVRDYTVSIPGRPGAYYFGSDIDPMEFNLPLIIKPQENRYELAAAIRKMVDTFIDPYGKPKEVKLIYDYEPDKYYLARYSGSMSIERYFRMGKFELPMIAYDPYAYSIIDSTNGIKWGDPIPWMSDIPISAGDNSYTINSPQNISLNNYGTLVVRPVINISGSAENLTLTLKGERFSLGTFTNSTFLLDAKHYTAIKNGQNYLFQLKGDLEKLELIPGANVIKISGVNLNINITFEYRAKYI >CP029805|446339:477006|464902_466591_+|AWU51460.1|terminase|DBSCAN-SWA MRVQYPLSYNPIIEYYNKIESGEEIVGYKVKRIYKKLVDDIYDQDSIYEYNPKRANHAMEFIENFCKHSKGKWAGKPIDLELWQKAFIGSLFGFIHKIDGTRKYREALLIVARKNGKSTLSSGICLYLQIADGEGGAEVYAVATKEKQAKIVWSEAKRMVKKSPVLSKRIKALVKELNADFNDSTFQPVGSDSDTLDGLNVHGASLDEIHAWKDKNLYDVIVDGTSAREQPLILMITTAGTVRESVYDMKYEEAERLLLSLDDEKEYTDPTFLPIIYELDSRKEWTDPKCWKKANPGLGTIKKIDNLQTKVNKAQANPLLVKNLLTKDFNVRETSSEAWLTFEQLNNKQTFDVMELKPNYGIGGTDLSETTDLTAAKVIFMLPNDINVYVLQMYWLPEELLEQRSKEDKIPYDLWHEAGYLRTTPGNSIHPKFVTEWFLEIRDEYGIYLPWIGYDRWSAKYWVEEMQGYFGKEAMVPVAQGKQTLSMPMKLLGADLEAKRIIYNNNPIDKWCLSNTAIDIDKNLNIQPDKTNNQRRRIDGTAALLDAYVVLQEKKNDYLNMI >CP029805|446339:477006|469589_469847_+|AWU51462.1|DBSCAN-SWA MNHFVLNTFIDKETKVGYSKGDMYESNDSERIAFLIEKGFLKGNKEIPTFPKHTGGGWYELSNGEKVQGKEEAMSAEQSLKDKES >CP029805|446339:477006|464124_464292_+|AWU51457.1|DBSCAN-SWA MNTFFHNTIGVNDAAILLKVSPGHIKNMCAEGKIIAKKIGKTWVIDRSKLKGVRK >CP029805|446339:477006|460499_460688_+|AWU51445.1|DBSCAN-SWA MNMGTLVVNCGEYEFTRFESAVRTLEQEYGYEGEAWEMVVASGDLEILSDFLNSDGLNAEIE |
55 | Bacillus_phage(70.73%) | terminase,head,integrase,tail,capsid,protease | attL 450681:450696|attR 465343:465358 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
480894 : 485120
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029805|480894:485120|DBSCAN-SWA ATTGAAACACATAAAACTTTACGATAAACAATTACAGTTAAAAGCATATCTCGAAAACGCATTTAAAATAAAGTACAGCCCGCCACTCAATGAACTTTGGACGGCGGGTTTTTCATTACCTTTTACCGATCCTAAGCGAGAGGAAATTGAAACGTTTGATTATGTGGAAATATTTGATAACGGTAAACGTATCGGATTGTTCCGTATTATGGATAGCGAGGAAGAAAGGGAAGTAAGTCAAAAAATAATAACTTATGACTGTGAGCATGTTTTATCTACTTTAATGGATAGCGTGCTTTTTGGTTATCACGAAAGAATTAATTTAACGACAAGGGAGAATATTGAGTATCTCTTAAGCAAACAAAGAATAAAGCATTGGAAACTTGGTCAATGTGATTTTGTAAAATATTTTCAATATAGTTGGGAAAATGAAGATACGATATTAGGACCGATATATAGTATTGCAAAACCGTTTGATGAGAAATTCCAATGGACATGGGACGATACTTCCTATCCTTGGACTTTAAATCTCGTGAAATATTCCGATGAAATTACAGGTGAGCTTCGATATAGAAAGAACATGAAAGGCATTAAGCGAAAGGTAGAAGCTAAGGATGTCATGACTAGAATTTATCCACTAGGTTATGGTGAAGGTGTTAATCAACTTAATATCAAAAGTGTGAACAATGGTCTTCCTTATATAGATGCTCCTGATTTTGTCAGAGAGTTACAGGATGGGTTTGATTATATTTGGGTGGATAGACGATTTGAGGACCCAAAAACGCTTTATGCTTCAGCAAAAGCGATGTTATTAAAAGCGTGTATGCCAAAAGTTACATATGAAATTGATGCAATTGATTATGAATTGATTGACCCATACAAAATAGAAAAATATGAAACAGGCAAGTTAGTACGTCTATATGATGAGGATTTTAATATATCTGTTGATTTACGAGTAATGGACCGTTCAAAAGATGATGTTACTGGTAATCCACTTGATGTAAAGCTTGTATTAGAAAATAAAGTCACTGATATTGGGACAATACAAGCAGATATTGAAAAGCGACAGAAAGTAAACGAAGTGTATTCTCAAGGAACAACTAATATTGATAGTCAACCTTTCCAAGATAATTGCGACCCAGATCATCCAGCCATCATAAGGTTTCAAATACCTAACGATGTTAAGAATGTGAATCAACTGATACTGACATTTGAGACATTACGGTTTAGAGCATATGAGCGGGCTATTAAAGGCGGCGGAGCTGTCGTTGCTTCAACTTCTGCCGGTGGTGCGAATGTATCTTCAACAAGTTCCGGTGGTGGTACGGTTGGTTCGACGTCATCAGGCGGAAGTTCTGTGCAAGCAAGTAGTTCCGGTGGTGGTACGGTTAAAGCTTCAAGTAGTGGAGGAGATCATGTTCATAAAATGTTTCATGGTGGCGGAATTGTTCCTGCTGAACCATCAACAATAGGATTATATACAGCTTTTTCTGATCCAGGAAGAAATACATCAGCTTCATTTTACGCAAAAGGAACGGGATCTAGTTTCTACACATATGGTTCTAGTGGGAATCACACTCATGATATATCAATACCTAACCATACTCACAGTATTAATATACCGAATCATACGCATAGCATTAGTATTCCTAACTATACGCACGATATCAGCATTCCGAATCATACACACGATATAACTTTGCCAGACCATACACACGAAATTGAATTTGGTATTTTCGAATTATATGAAACTCCATCAAAAGTGACGATTGAAGTTGATGGGAATAAGTTGCCGTTTGATTCGATACGCGGGCAAGATATAAATTTAATTCCCTATTTAGCGAAGGATGATGAGGGGAAACTTCAACGTGGCCGTTATGTTGAAATTAAAATCACTCCAAATAGTTTAGCTAGAATAAATGCTACTGTTACAGGGAGACTGTTTATTCAGTCTAGAAGTGGTGGTACGTATTAATATAAATCATAAAATATAGAAGGAGATTGATAACATATGCAAACAATTGAAATCCATACACAAGGCGGATTAAAACATAAAGTGCAGACTGAGGTATATAACGCAGAAGCACTGAATACGAAACTAAACGACAACGATTTAATTACAGTATTAATTGGTGATTTTATTATTCAACGTATTGATGTTAAACGTATCATTCCATTAAATATGATTGATGCGGAAGGCGCTAAAAGGGTAGAAGTTCATACAAATGCTGGGAAAGTGATTGAGATTACAACAAACGATTATGATCCAATCTATCTAAACGAGCAATTAAACAATAATAATACAATTACAGTCGTAATTGGTGATTATATTTTCTCTCGAATTGATGTAAAACAAGTAGTTCCTGTGAAAGAAGAACCTAAAGAGCCAGAACAACCACCTGTGACAGAACCTGAGAAACCGACAGAACCAGTTACACCGCCAGGAGAAGGTACAGAAGATGATAGCATTACAACTACAGAGCAGTTATAAACTGGTCTTTTTATTTTGAACAAAATACGGCTTTTACAACAAAACGAAGTGTGCTTATTGCAGGCTTTTTTATTTTGAATAAAGGAGTGAAAAGATGGCTGAATTAAAACACGATGATATGAAGGAATTACTTGTAGGGTTGACCAGAGTAGAAACCAAGCTTGATACACTCGGTAATGTCAAAGAAGTTGCCATTGAAGCCCAACAATCAGCAAAAAGCGCTCATTTGCGTGTGGATAGATTAGATAAATTAGTTTTTTGGTTAGGTACGACAGTTATAGGAGCTGTTATCGTTGGGGCTATTACAGCATTATTCAAATTCGCAGGAAAGTAGGGAGAAGAATGAATAAGGAAAATATCAAAAAAACGATTCCGCAACTGGAAAACATGGGTTGCGGTTTTTTCTTTGCTTGGATTTTTATTTACAAAGTTTGGCGTTCCAGAAGCAAAAAGCTTTTTGGATGAATTAGCACCTTACTTGCTGTCAGTTGGTATCGCATTAGGTATTTGGTCTGATCATGATGTAAATAGCGAAGGAGACGATAAATAATGGGACATATTATTGATATTTCAAAATGGAATGGCGATATTAACTGGTCTATAGCGAAACAACATATAGATTTCATCATTGCTCGCGTACAGGATGGTTCAAATTATGTAGATCCACTATATAAAGGATATGTACAAGCAATGAAGCAGCATGGAATACCATTTGGTAACTACGCATTTTGTCGTTTTGTTTCAATTGCTGATGCAAAGAAAGAAGCACAAGACTTCTGGAATCGCGGCGACAAGAGCGCTACAGTTTGGGTGGCTGATGTAGAAGTAAAAACAATGAATGATATGAGAGCAGGTACACAGGCGTTTATCGATGAGTTATACCGATTAGGGGCTAAGAAAGTTGGTTTATATGTTGGTCATCATATGTATACACCTTTCGGTATGGCGAACGTAAAAAGTGATTTTGTATGGATTCCACGTTATGGTGGTAACAAGCCAGCCTATCCTTGCGATATTTGGCAATATACTGAAACGGGTAATGTACCTGGTATCGGGAAGTGTGACCTTAATTCACTTATAGGCAATAAGTCACTATCTTGGTTTACAGAATCGGCAACCCAGGAATCTGTACAAGCGCCTACACAAAACATCATCCAATCAGGTGCTTTTTCACCTTATGAAACTCCTGACGTTACAGGGGCATTAACATCCTTAAAAATGACTGCTAAATTCATCTTGAAACCTGATGGATTAACATACTTTATTTCTGATCCAACGTCAGATGCTCAATTAAATGCAATGAAAGAATACCTTGACCGTAAAGGTTGGTGGTATGAAGTTAAATAAAACAAAAGAATAGTTTTATAAACAAAAATAAGAGCCGTCAAATGACGGCTTTTTTATTGCAAATCAGATATTTTCTTAACTTCTTTTTCCTTCGCTTTGAATTCCTTCTCGTATTGTTTAAAATCCTCTTTATCAACATGGAACCTTTCACCAGTTGCAACGTTTTTGACTAAATAAGTTTTACGATTGCGTTCCTTAATTAATCCATATAAGACCAAAAACAAAAGGGAGATACCTATCGTCGGAAGAGCTAAAATTATGCATAGTATTAGTACCGTTTTCTCCGATTTGCTATCTTCACGTTTTAAAATAAGTTTCTCTCCTGATGCAGCTTCCGATTGCTTTAATTGTTGCATTCTTTGGAGTGCAGCAACTGTATCAAGACTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029805|480894:485120|483790_483934_+|AWU51477.1|DBSCAN-SWA MLGFLFTKFGVPEAKSFLDELAPYLLSVGIALGIWSDHDVNSEGDDK >CP029805|480894:485120|483933_484731_+|AWU51478.1|DBSCAN-SWA MGHIIDISKWNGDINWSIAKQHIDFIIARVQDGSNYVDPLYKGYVQAMKQHGIPFGNYAFCRFVSIADAKKEAQDFWNRGDKSATVWVADVEVKTMNDMRAGTQAFIDELYRLGAKKVGLYVGHHMYTPFGMANVKSDFVWIPRYGGNKPAYPCDIWQYTETGNVPGIGKCDLNSLIGNKSLSWFTESATQESVQAPTQNIIQSGAFSPYETPDVTGALTSLKMTAKFILKPDGLTYFISDPTSDAQLNAMKEYLDRKGWWYEVK >CP029805|480894:485120|483478_483718_+|AWU51476.1|DBSCAN-SWA MAELKHDDMKELLVGLTRVETKLDTLGNVKEVAIEAQQSAKSAHLRVDRLDKLVFWLGTTVIGAVIVGAITALFKFAGK >CP029805|480894:485120|484784_485120_-|AWU51479.1|DBSCAN-SWA MSLDTVAALQRMQQLKQSEAASGEKLILKREDSKSEKTVLILCIILALPTIGISLLFLVLYGLIKERNRKTYLVKNVATGERFHVDKEDFKQYEKEFKAKEKEVKKISDLQ >CP029805|480894:485120|480894_482868_+|AWU51474.1|DBSCAN-SWA MKHIKLYDKQLQLKAYLENAFKIKYSPPLNELWTAGFSLPFTDPKREEIETFDYVEIFDNGKRIGLFRIMDSEEEREVSQKIITYDCEHVLSTLMDSVLFGYHERINLTTRENIEYLLSKQRIKHWKLGQCDFVKYFQYSWENEDTILGPIYSIAKPFDEKFQWTWDDTSYPWTLNLVKYSDEITGELRYRKNMKGIKRKVEAKDVMTRIYPLGYGEGVNQLNIKSVNNGLPYIDAPDFVRELQDGFDYIWVDRRFEDPKTLYASAKAMLLKACMPKVTYEIDAIDYELIDPYKIEKYETGKLVRLYDEDFNISVDLRVMDRSKDDVTGNPLDVKLVLENKVTDIGTIQADIEKRQKVNEVYSQGTTNIDSQPFQDNCDPDHPAIIRFQIPNDVKNVNQLILTFETLRFRAYERAIKGGGAVVASTSAGGANVSSTSSGGGTVGSTSSGGSSVQASSSGGGTVKASSSGGDHVHKMFHGGGIVPAEPSTIGLYTAFSDPGRNTSASFYAKGTGSSFYTYGSSGNHTHDISIPNHTHSINIPNHTHSISIPNYTHDISIPNHTHDITLPDHTHEIEFGIFELYETPSKVTIEVDGNKLPFDSIRGQDINLIPYLAKDDEGKLQRGRYVEIKITPNSLARINATVTGRLFIQSRSGGTY >CP029805|480894:485120|482904_483384_+|AWU51475.1|DBSCAN-SWA MQTIEIHTQGGLKHKVQTEVYNAEALNTKLNDNDLITVLIGDFIIQRIDVKRIIPLNMIDAEGAKRVEVHTNAGKVIEITTNDYDPIYLNEQLNNNNTITVVIGDYIFSRIDVKQVVPVKEEPKEPEQPPVTEPEKPTEPVTPPGEGTEDDSITTTEQL |
6 | Bacillus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1838333 : 1847066
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP029805|1838333:1847066|DBSCAN-SWA TATGAAAAAAGTAATTGCAGGTTTAGCAGCAGCTTCTGTAGTAGGTGTTGCAGTTCCAGGTATGGATTCTGCTCAAGCACAAGTTTCAAACGAAGCGCTAAAAGAAATTAATGGACAAGCTCAAACTCAAACGACTGTAACTGAAACAAAAACTGTAGAAACAAAATCTGACTTAAAATACACAGTAACTGCTGATGTATTAAATGTTCGTTCAGGTGCTGGTACAGGACATAGCGTTATTTCTAAAGTAAAACAAGGTCAAGTACTACAAGTAATTGGACAAGAAAACGGTTGGTTCAAAGTAACTGTAAACGGTCAAACTGGTTATGTAAGTGGTGACTTCGTAACAACTGGTGGTAAAACAGGAACTACTGTTCAACAAGGAACTGGTACTTACACAGTAAACGTTTCTTCACTTAACGTACGTACAGGTCCAAGTACATCTCATACAGTATTAGGCTCTGTAAATAAAGGTAAAACAGTACAAGTTGTTAGTGAAGTACAAGATTGGTTTAAAATCAACTTCAATGGTGGAACTGGATATGTAAGCAAAGACTTCGTAACAAAAGGTGGTTCTGCTGTATCTAACCAAACACAACAACCAACTACAAACAACAATACTACAACAGTTCAAACTGGTGGTTCTTATGTTGTTAACACTGGTGCTCTAAAAGTACGTACAGGCCCAGCTACATACAACGCTGTAATCGGTGGTGTAACAAACGGTACAGTATTAAACGTTACTGGCGCTGAAAATGGTTGGTACAAAATTAACCATAACGGCCGCACAGGTCACGTAAGTGCAGACTTCGTTAAGTTTGTAAAAGGCGGAGTAAACAACGTTACGAATAACGTTCAACAACCAGTTAAAGACGTACAAAAACCAACAACAGGTGGAAATACATCTTCAATCGCTGGATTCGCTAGATCTTTAAATGGTTCACCGTACAGAACTGCTGGTACAACACCTGCTGGTTTTGACTGCAGTGGATTCATTCACTACGTATTAAATCAAACTGGTCATAAAGGCGCTCGTCAAACAGTTGCTGGATACTGGAGCTCTAAAACAAAAACTAGCAATCCACAACCAGGTGATTTAGTATACTTCCAAAACACTTATAAATCAGGTCCTTCTCACATGGGTGTTTACTTAGGAAACGGTCAATTCATTAGTGCAGAAACTGATGCAACTGGCGTACGTATTAGTTCAGTAAGCAACTCTTACTGGAGCAAGCACCTTTTAGGTTACACAAAAGCATACTAAGAAAAAGTAGTTTATATACTTTTCGAATAGAGAAAAGGCTTTCCAGGGAAACTTGGGAAGCCTTTTTATAGTTGAATAAATTGGGAGTATAGTAGTTTTTACTTTAACTTCCCGTTTAAAAATCGATCGTATAAGTCATGGAAATAGTTAGGGCGAAATAAATTTGCTGCATGTCCTGCTAACGGTATTTCTTTATATAAAACGTTAGGAAGAATGGACTTTAAATCAAAAAGACAAGATTTATAGAGATGATCATGTTCACCCATTACCCATAGAATAGGGTGGGGAAGTGATTTTAATTTAGATTTTAAATCGAATTCTAACCGATGTCGTAATGATTGGGCAATAATTGATGAATGTAATTGCAATCCGAAACGGTAATAAATATTTCTTGAAATGACTGCAAATGGGTTTGCTTTTAGTATGCCACTTGGAAAAATGGTATTTGCGTATTGAGAGAGCCATTTAGAGTAATCGTCTCCTCGTTTCTCCCAAAATTTTTGAAATACGCTATATAAAAGAGAAGGATTATTATAATGTCCACCAATATGACAAATGCTTAATACTTTTTCTGGGTGCATTTGTGCAAAAATGGTAGAGATATAACAGCCGTAGCTTAAAGCACAAATATGAGCTTTTTGAATGCCTTCTTTTTCGTATAAATTCAATAATTGATCAACGAGGCGCTGTAATGAAAATTCGATAGCTTCACCTTTATCATCGCCGTGACCTAATAAATCATACGTAATAATGTTGTAGGAGGTTGAAAATCGTTTATGCTCTTTTTTGAAGGCACGACGATTACCAACTAATCCATGAATAAAAATGATTGTTTCCTTTTCGGAATGTATATTTGTTTGCAAAAAAGATACTCCTTTCAATAACTGGAGATTTATATAGTATTTTAAATTAGTTATTTATAATTCACATAGAATAATATTAAGTACCAGGTAATAATATCAGATGTTTATATCTGTTGTAAAGATGAGTTTTTATGTATATTTTGTAAAAATACAAAATGTGTGTTTACATTCAGTTTACATTTGTATTGTATTCTATTTTTAGAAAGAACAGTTTTGTTTAACACGAGGAGATGAACATGAATGGAAGTTAGAGATGAAATAAAGAAAAAAGGGAATTGGAGGCAGTTTTTACGCCTTATTCAAGATACAAAGCCTCCGAAAGGGATTCTTGTTTTTGCGTTATTAATGAGTTTGCTTTCTACGGGAGCAAGTTTATTTATTCCGATGTTAACAAAAGGGTTAGTAGATAATTTTTCACTTTCCTCAATTAGTACAGGACAAATTGTTGGATTAGTTGCATTCTTTATTATGCAAACTATAGCTGCAGGATTGTCTATATATTTATTAAATTATATAGGACAGAAGATTGTAGCTGGACTGAGAGAACGTTTGTGGAAAAAGGTACTTATATTGCCAGTATCTTATTATGATCAAAATAGAACAGGCGATACAATTAGCCGCATGACAAATGATACAGGTGTTGTGAAGACATTAATTTCTGAGCATTTGTCAAACTTACTAACAGGTGGTATTTCAATCGTCGGATCATTAATTGTATTATTTGTTTTAGATTGGAAAATGACACTTTTACTTTTAACGGTTATTCCATTATCAGTACTGATTTTAGTTCCACTAGGAAGAAAAATGTATAAGATTTCAAAAGCGCTTCAAGATGAAACAGCTTCTTTTACAAGTGTGCTAACATAAGTATTATCAGAAATTCGTTTAGTGAAATCTTCGAACACAGAAAAAAGAGAATATGAAACTGGAAATAAAGGTATCGAGAAGTTATTGCAATTTGGTTTGAAAGAGGGAAAAGTGCAAGCGTTAATTTCACCAGTTATGTCGTTTGTTTTAATGGCACTGCTTGTTATTATCGTAGGATATGGTGGGATGAGAGTTTCTAGTGGTGCATTAACAACTGGGGAACTAGTAGCGTTTATTTTATATTTAGTTCAAATTATAATGCCGATGAGTCAATTATCTATGTTCTTTACACAATTCCAAAAGGCGATTGGTGCAACGGAAAGAATTAATACCATTTTAGAATATGAAGTAGAAGATCATGAAACTGGTGTGAAAGTCACAAATGCTAAGCAACCAATTGTTCTTGAAAATGTACATTTCGAGTATAACGAAGAAGAGCAAGTGTTAAAGAATATTGATTTCACAATTGAATCTGGAAAAGTAACAGCAATTGTAGGGCCAAGTGGTAGCGGGAAAACGACGTTATTCTCACTATTAGAACGTTTTTATGAGCCAACTAGCGGTGCCATTAAATTAGGAAAAGATGCAATTACGAACTATTCATTACAGTCATGGCGACGTCAAATTGGTTACGTTTCACAAGATAGTCCGTTAATCGATGGAACGATTCGTGATAATATTTGTTACGGTGTTGAGGGGGAAGTAACAGATGAAGAAATTGAAAAAGTAGCAGCGATGGCATATGTTGATGCATTTATTCATGATTTGCCAAACGGATATGCAACAGAAGTGGGAGAACGGGGGGTAAAACTTTCTGGAGGACAAAGGCAGCGAATTGCCATTGCCCGAGCATTACTTCGAAATCCACAAATTCTTATGTTAGATGAGGCAACTTCAAGTTTAGATAGTAAGTCCGAGTCCGTCGTTCAAAAGGCATTAAATAACTTAATGAAAGGCAGAACAACGTTAGTTATTGCACATAGACTGTCTACTGTTGTAGATGCAGATAAAATTATCTTTATTGAAAAAGGGAATCTTACAGGAAGTGGTACACATGATGAATTATTACGTACACATGACATGTATCGTGAATTTGCAACGCAACAATTGAAAATTAAAGAGGCGGCATTATAAAATGAATAATCAGTGGGGATTGTACTCCACTGATTATTCATTTTTAAAAGTTTTGTTAAGGATGCTAATTAGAAAGGAAATGGTTTCTTTGATACCTAACATTTTAATAGTAGACGATGATCCGCATATTAGAGAACTCGTTTCTGTATTTTTAGAGTGTGAAGGTTTTCAAACATATGAGGCAATTGATGGTCTAGATGCACTTCAAAAAATAAATCAAGTGAAAGTTGATATGGTTATTCTTGATATCATGATGCCGAATATGGATGGATTTGATGTATGTTTCGAATTAAGAAAGTACTATGATATTCCGATTTTGATATTAACTGCTAAAGGGGAAACGTCTCAAAAAGTAAAAGGATTTCATCTTGGTACGGATGATTATCTTGTAAAACCATTTGATCCCATAGAACTAGTAGTGAGGGTTAAGGCGTTATTGAAACGTTACCAAATTACAGTGTCGCAATCAATTCAAGTTGGAACTGTACTGTTAAATCGTAAAACATTTGAAGTTACAATTGGAGAACAAACGGTTACGTTACCGTTAAAAGAATTCGAATTGCTCTTTACTTTAGGCTCTAAAGCGGGGAGAACTTGTTCGAGAGAGCAATTAATTGAAGATGTATGGGGATATGATTTTGAAGGGAATGAACGCACACTAGACGTTCATATAAATCGGTTACGTGAGAAGTTTCAAGAAGAGAAGTCGAAATTTAGTATTAAAACAATAAGGGGTTTAGGATATCGCTTAGAGGTAAGTAAATGAGAAAAAGAGGACGAATGAGTAAATTCAAGATGCTGAAAGTAACAGGAGCGATAATAGCACTCTTTTCTTTTCTTACTATTATTTGGTCTACAGCATTTTATGTATCATCTAGTATATTGGATGCCCTTGCAATACATTTATCTCCTTTTGTTACTTACCTCATTAGTGACATACTCAGTTTTATATTTATGATTCTTGTTTGGATATTAATTGCAGTATTAATGAGACCGAAGCGAGAGGCGATGATTTGGACTATTATTGAACCGATACAAAAAATTGCAAAAGGGGACTTTTCGGTAAAAATACGAAATGAAGAGAAATATGATGGGGAAATTGGTGTGCTCGTAAAAAGTATAAACGATATGACAGATGAACTGAATGCGATGGAGAAGATGCGTCAGGAATTTGTTTCGAATGTTTCTCATGAAATACAGTCACCATTAACTTCTATAAAAGGGTTTGCTAGAGCACTACAAGATACTAATCTTCCTGAGGAAAAAAGAAAGCATTATCTTACCATTATTGAAACAGAAACGACGAGATTATCTAAACTAAGTCAAAATTTACTGAAACTCACCCTATTAGAGTCGGAAGAATATACACCAGAAAGAGTTACTTATCGATTAGATCAACAGTTAAAGCAAATTGTGTTAAATAGTGAACCGCTTTGGGCTGAGAAAGAAATTGAATTAGACCTTGATTTAGAAAAAGTGCATATAACTGCTGACCAAGAAAGTATGAGTCAAGTTTGGATTAATTTAATTCATAATAGTATTAAATTTACTCCAAGTAGCGGTACGATTTCAATCAAGCTAAAAGAATATGAGACATTAGTAGAAGTACGTATACGTGATACGGGAAGTGGGATATCCGAAGAACAGAAGCAACATATTTTTGAGCGTTTTTATAAAGCAGACTCTTCACGAAATCGTGCTTATGGAGGAAGTGGTTTAGGTTTAGCGATTGTGAAAAAAGTACTCGATCTTCATCAGGGGGAAATAAAAGTTGAGAGTGAGGAAGGGAATGGGACGGAATGTATTGTTTGTATTCCAAATTATGAAGAGAAATAGTGTTAGGAGGGAATCCTTCTAACACTATTTCTCTTTAAAAATACATTTCCCATTACTGCAGCTATACTGATAAGCTTTTCCTTCGCTATTCATACGGTATGAATAATCAGATTCTTTATCTTTTATAAAGTCAACGTATGCTTCTGCACCGTTTTTATCATCATCTATATCAATGAAATGAACGTGTCGTATAGAATAATCCCTTTTTTCACTTAAACCTCTTTCTTGTAAGTTTGTATGAATCCCTTGTATTAGTTGATCGAACAGTGACCAATTTAAATTAAGATGCTCAAATGATTCAGTATGTCTTCCTAAAATGCCATTGTCTTGTATTATTTTTTTATTATTATCGTATGTATAAGAGTATGTAAAATAAGGTTCGTCTTTATATACGACTTCTGCATAATAGCCGATATTATAAAGGGGAGTATATTTTCCGGCTATACTTTGTATTTCTTTTTGCTTATATCCTTTTATAGTATGGAGATATTCGTTAGTATCTTTTTCTATTACTTTATAATGTAATGGATTACCAAATATAAAGTACATAGCCAAAAATATGCTAAATAGTCCGACTGCAGATAGTGACAAGTACCATTTTTTTCTTTTCATACACAAACACTCTCCTATGTGGAATTTATTTCTATTTTACATGAATTATGGAAAAACATGAGAGTTATAAATAAAAACTTTCTATAGTTACCTACAAGTAACCTACGCACATGAAAGTGCATCATTGCCTTTTTACATAAACATAGATACAATTTTAATATAATACATAACTGAGATGATTAAGGAGTGTTATACTTGGCAGAATTATTACAAGGCAAAAATGCTTTAATTACAGGAGCAGGTAGAGGGATTGGTCGCGCTGTAGCGATCGCATTAGCGAAAGAGGGCGTAAATGTAGGGCTTTTAGCTCGCTCAGAAGAAAACTTAAAAGCTGTAGCGAAAGAAGTAGAAGCAGAAGGCGTAAAAGCTGTTATTGCAACTGCTGATGTTTCTTCATACGAAGAAGTGACTACTGCAATTGAGACATTAAAAAACGGTTTAGGATCTATCGATATTTTAATTAATAACGCTGGTATTTCTAAGTTCGGTAAGTTTTTAGAATTAGACGTTGCTGATTGGGAAAAAATCATTCAAGTAAACTTAATGGGTGTATACTATGCAACTCGTGCAGCGTTACCAAGCATGATTGAACAACAATCTGGTGATATCATTAACATTTCATCTACAGCAGGACAAAAAGGTGCACCTGTAACAAGTGCATATAGTGCTTCTAAATTTGGTGTTCTTGGCTTAACAGAATCGTTAGCGATGGAAGTTCGTAAACATAACATTCGCGTAACTGCTTTAACTCCAAGTACAGTAGCAACTGATATGGCTGTAGATTTAGGACTAACTGATGGAAATCCTGATAAAGTTATGCAAGCAGAAGATATTGCAGAGTTTATCGTAGCGCAGCTGAAATTAAATAAACGTACATTTATTAAATCAGCAGGACTTTGGTCTACTAATCCGTAAGGGATACATGTATAAACAAAAGAAGGGACATCTATTTTGTAATGAAGTAGATGTCCCTTCTTTATTTTTTGTATATGAGACAGAATTTTCGGTATAATTGAAAGCGAATAGTAGAAATGCATTGGAAAATTGAAGGGGATGGTATTTACATGAGTACGATTGAGAAATGGACGGCTGTTGATCAATATGTGAGTGATGTATTAATACCGAAAGATTCTACATTTTCGTAAAAGAATAACGAAAGGAGATAAATAGAATGAAAAAGATGTTTGAAAAATTATAACTTGTATCGTATATAACGCAGTTAGCTCGTGGACCTCCTATATACATATCACTATATTTTATATAAAAAATTGGAGGTTGTGAGTAGATGAGAACGGAAAAAGAAATGATAGACTTAATTATGAATACAGCAAAAGAGGATGAAAGAATCCGAGCGGTTATTATGAACGGATCACGTGTAAATCCGAATGTAAAAAAAGATTGTTTTCAAGACTTTGATATTATTTACGCTGTAAAAGATATACGATCTTTTACGTCTAATCATAATTGGATTCATAGATTTGGAGAAATAATGATTGTACAAATGCCGGAAGAAATGTCATTAATTCCAGCAGATGAAGACGGGAAGTTTCCGTATTTAATGCAGTTCATGGATGGAAATCGGATTGATTTAACACTAGCCCCAGTTGAGTTAATAAATAATTTCGTTAGACAAGATAGTTTAAGTAAATTACTTCTTGATAAAGATAATTGTATGGAAGGATTCCCGCCAGCAAGCGATAAGGATTACTTAATAAAAAAGCCTACAGAAAAAGAGTTTTTGGATTGCTGTAATGAATTTTGGTGGTGTAGTACGAATGTGGCAAAAGGGTTATGGCGAGAGGAACTTTCTTATGTGAAAGGGATGCTTGATGGCCCAGTGCGAGATATGTTAATTGTAATGCTAGAATGGCATATTGGTATGAAAACAGACTTTATAGTTAATGCAGGGAAGTTTGGAAAGCATTTCGAGAAATATATTGAAAAAGATATGTGGGTGCAATTTAAGAGGACATTTTCTAATGCAGAATATGAAAACATATGGGAATCATTCTTTGACATGGGTAATTTATTTAGGGAAGTGGCGAACGAAATTGCTAACGCTTATGGATATCCGTACCCGCAAGGTGATGATGACAGAGTGACAAGTTATTTAAAACATGTGAAAGCTTTACCGAAAGATAGTACATCAATTTATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP029805|1838333:1847066|1845939_1846053_+|AWU52811.1|DBSCAN-SWA MHWKIEGDGIYMSTIEKWTAVDQYVSDVLIPKDSTFS >CP029805|1838333:1847066|1842461_1843226_+|AWU52808.1|DBSCAN-SWA MNNQWGLYSTDYSFLKVLLRMLIRKEMVSLIPNILIVDDDPHIRELVSVFLECEGFQTYEAIDGLDALQKINQVKVDMVILDIMMPNMDGFDVCFELRKYYDIPILILTAKGETSQKVKGFHLGTDDYLVKPFDPIELVVRVKALLKRYQITVSQSIQVGTVLLNRKTFEVTIGEQTVTLPLKEFELLFTLGSKAGRTCSREQLIEDVWGYDFEGNERTLDVHINRLREKFQEEKSKFSIKTIRGLGYRLEVSK >CP029805|1838333:1847066|1839694_1840459_-|AWU52807.1|DBSCAN-SWA MQTNIHSEKETIIFIHGLVGNRRAFKKEHKRFSTSYNIITYDLLGHGDDKGEAIEFSLQRLVDQLLNLYEKEGIQKAHICALSYGCYISTIFAQMHPEKVLSICHIGGHYNNPSLLYSVFQKFWEKRGDDYSKWLSQYANTIFPSGILKANPFAVISRNIYYRFGLQLHSSIIAQSLRHRLEFDLKSKLKSLPHPILWVMGEHDHLYKSCLFDLKSILPNVLYKEIPLAGHAANLFRPNYFHDLYDRFLNGKLK >CP029805|1838333:1847066|1843240_1844296_+|AWU56331.1|DBSCAN-SWA MSKFKMLKVTGAIIALFSFLTIIWSTAFYVSSSILDALAIHLSPFVTYLISDILSFIFMILVWILIAVLMRPKREAMIWTIIEPIQKIAKGDFSVKIRNEEKYDGEIGVLVKSINDMTDELNAMEKMRQEFVSNVSHEIQSPLTSIKGFARALQDTNLPEEKRKHYLTIIETETTRLSKLSQNLLKLTLLESEEYTPERVTYRLDQQLKQIVLNSEPLWAEKEIELDLDLEKVHITADQESMSQVWINLIHNSIKFTPSSGTISIKLKEYETLVEVRIRDTGSGISEEQKQHIFERFYKADSSRNRAYGGSGLGLAIVKKVLDLHQGEIKVESEEGNGTECIVCIPNYEEK >CP029805|1838333:1847066|1846193_1847066_+|AWU52812.1|DBSCAN-SWA MRTEKEMIDLIMNTAKEDERIRAVIMNGSRVNPNVKKDCFQDFDIIYAVKDIRSFTSNHNWIHRFGEIMIVQMPEEMSLIPADEDGKFPYLMQFMDGNRIDLTLAPVELINNFVRQDSLSKLLLDKDNCMEGFPPASDKDYLIKKPTEKEFLDCCNEFWWCSTNVAKGLWREELSYVKGMLDGPVRDMLIVMLEWHIGMKTDFIVNAGKFGKHFEKYIEKDMWVQFKRTFSNAEYENIWESFFDMGNLFREVANEIANAYGYPYPQGDDDRVTSYLKHVKALPKDSTSIY >CP029805|1838333:1847066|1838333_1839596_+|AWU52806.1|DBSCAN-SWA MKKVIAGLAAASVVGVAVPGMDSAQAQVSNEALKEINGQAQTQTTVTETKTVETKSDLKYTVTADVLNVRSGAGTGHSVISKVKQGQVLQVIGQENGWFKVTVNGQTGYVSGDFVTTGGKTGTTVQQGTGTYTVNVSSLNVRTGPSTSHTVLGSVNKGKTVQVVSEVQDWFKINFNGGTGYVSKDFVTKGGSAVSNQTQQPTTNNNTTTVQTGGSYVVNTGALKVRTGPATYNAVIGGVTNGTVLNVTGAENGWYKINHNGRTGHVSADFVKFVKGGVNNVTNNVQQPVKDVQKPTTGGNTSSIAGFARSLNGSPYRTAGTTPAGFDCSGFIHYVLNQTGHKGARQTVAGYWSSKTKTSNPQPGDLVYFQNTYKSGPSHMGVYLGNGQFISAETDATGVRISSVSNSYWSKHLLGYTKAY >CP029805|1838333:1847066|1844320_1844914_-|AWU52809.1|DBSCAN-SWA MCMKRKKWYLSLSAVGLFSIFLAMYFIFGNPLHYKVIEKDTNEYLHTIKGYKQKEIQSIAGKYTPLYNIGYYAEVVYKDEPYFTYSYTYDNNKKIIQDNGILGRHTESFEHLNLNWSLFDQLIQGIHTNLQERGLSEKRDYSIRHVHFIDIDDDKNGAEAYVDFIKDKESDYSYRMNSEGKAYQYSCSNGKCIFKEK >CP029805|1838333:1847066|1845094_1845823_+|AWU52810.1|DBSCAN-SWA MLYLAELLQGKNALITGAGRGIGRAVAIALAKEGVNVGLLARSEENLKAVAKEVEAEGVKAVIATADVSSYEEVTTAIETLKNGLGSIDILINNAGISKFGKFLELDVADWEKIIQVNLMGVYYATRAALPSMIEQQSGDIINISSTAGQKGAPVTSAYSASKFGVLGLTESLAMEVRKHNIRVTALTPSTVATDMAVDLGLTDGNPDKVMQAEDIAEFIVAQLKLNKRTFIKSAGLWSTNP |
8 | Bacillus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2156167 : 2163291
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP029805|2156167:2163291|DBSCAN-SWA ATTACTTTTTAAAAATTTCTCTTGAGATACTGTCCTTAGCGTGTATACCACCTTGATGTTCATCAGGGTATTTAGCTGGGTGCATATTCCACCATTCATGTTCTCCGCCATGTGCATTTTCAATAAAATGATGTGCATCAAATGGCTTATCAATTCTCCGTGATACTTTACCTCTTCTAGAAATAACTTCCTCCGTATATGTAGGCCATGTTTGGCCTGTTTCTTTTTCCCATTCAGCTATCAGCTTATTTTTTATAGTATTGAACTCAGCCCTTCTTTGATCTACTTCTTCCTTGCTTAATCGTTCATAAGCATTCTTTTCTAAAGCTTCCTGAAGCAATTCTCTTTGATTTTCAGGGATTTTTCTGTTTGTTATTTCTTCTACTTGGCTAAGATATTCTTGGAATCTAGGTGTATTTAAATTACCAGGGTCAGCAAACATAAATGTATTACGTGCATCTTCTAAAGAATTAAAAGAAGTTTTTGGAATATCTCTAAACTCACTAACGCTAGCATATGCAAAGCGATCTCCCATTTGCAATTTATTCGTAAAATGCGAAATACCTTCTGAGAATTTTGCTACACTCGCACCCTTTGCGAGTGTAGTGACTTTGCTTATTCCTTTATCACCAATAAGTCCTAAACCAACTTGAGTTAAAGCATAACTTCCCCATTTTGCACGACTTTCTGCGTCACCATTTATTACATCATTAATAAATGAATCTGACAATACATTATACATGGTACTAAGGGTATCAATAGGGTGCAGGGCGGCATTCCCCATGTTTTCCCACGTCTCCCATTTACCAAGTGCCTTAAAGCCTTCTACTGTATCTTCAACAGCTTGTCCCGTACCTTCTACAATACCGTCCCACACCTTTTTTATTGTAGATTTTTCAGGGGGTTTACCACACATTGCACCTTCTTCCATTGTAACATCTTGATTATCTGCATTGCGGAATTTTTCAGCAATCCGTTTCAAGTCTTCTTCTACTTTTACAAGTGAATTAATAGATGTAAAAGCTTTTGGTCTCGCATCATTGAACATTTGAATGAACTGTTGATTAGAGGCACCAATCCATTGAAAACACAATTGATCTATTTCGTTACATAAATTATTATGTATAGATTCTAATGCGATTCTGGTATTATTTGCACGATTAGCCACTTCTTCTAGCATTTCAGGTGTTACTTTGATTTGAACCATTTTTTTCCTCCCTTTCCCAATTAAAATTATGAGATAAAAAGAAAAAAATGTAAACATGGAAATTTTAGATTAGTATAATAATATTTATGTGAAGTAAAATCTGTTTAATTATAAATAAACCCTATGTGTACGTGAAGTAAAAAGAGCCGCCCTGTTGGGCAGCTTTTTTAATATCTATCAATTATTTTCTTTTAATACCTATGAATAATGAATCATAGCCTTTTGTTTGAGGACTTGTGCCTAACTCGATTTGGTATTTCCCTTTATCTAAGTAAGTGTGATAATCTCGCCCTCTTGCTTTTTGGGAAGGCATTGCTATAACATCATTAATTTCTTTATCTAGATTAAGATCTGAATTTATTAAAGTAATCCAACTTTTTGCTAATTCAACAGTTGCGTTATCAATTATAAACATAATATAGAAATCATGTTCATTTTCACCTTGTACAAAGAACTGTCCTTGTCCTAAATCATAAACCCTTCCCAAATTAGGGTTAGAAGTACGTAACTGTACACTTTCAGGAAGGCCCATACTACTGACAGATGCGCTTTCGTATTTATAATCTTCATTATATTTCTTGTTTATCTTTGTAATTAGATTTTGCGCTTCATTAGATACAGATTTTTTTAGCACCGGTGAAGCATTTTTCCAATTGTTACTGTTGTAATAAAAATCATTTGTAATCATAGAGCTAGGGATACCGAAAGGTGTTAATTCAGGTTTAACTTCTACTGTATTCATTGCATTATATAGAAATTGTGCATACTGCTCACGAGTTACAATATTTTTAGGTTCAAATAGATTATCTCCTGTGCCAGCAGCAATTTTATTTTCTTGTAATGCACTAATAGCATTTGTCGCCCAGTAATTTTTATCTACATCTTTGAAAGTGGTAGTAGATGTCGCTTTGAAGTTAAAAGCCTTTGTTAATACAACAGCTAATTGTTCACGTGTTAAAACATTATCTGGACCAAATTTTCCATCGCCAAAACCGTTCATAATACCTGCTTTACTAAGACTTAAAATTTCTTTTTCAAACATATGTCCTTTGACATCAGTGAAAGGATTTGGTGCATTATGTTCATCTGCTGGTTTCAAGTAGGCATATATCAGTCTAGCTACTTGTCCTCGTGTGATATTATCCCCAAAACCAAACATTCCGTTTCCATAGCCAGCCACAATATTTTTCTCTTTTAAACCCATAATTGCATTATAAGACCAATGATCTGAAGGAACATCGCGAAATCCAGTCTCAGCTTGTGCGTTTGTTAAAGAGGTAAACGTTGATGTAGCAAGAACAGCGCCTGCTAAAATAATTTGTTTGAATTTCATTAGTGAGCTCCTTTTAATTAATTTTTTACAAATTAATTACTTATTTTATTAGTAAATTTAAATATAATAATTAATAGTATATTTGTGTTTGTAAATTAAATCAATATTTAGTTGTAAATGGATATTGAGATAGATGTTATAATTTAAAATAAAGAGATGTAGCGATGTAGCGATGTAGCGATGTAAAGGAGAGGGACAATATGAAACAAAAGATTTCAAATGTCACAGGAGAAATAATTTTATCTTATAAAGAAAATGGCTATCAAGTAGTACTAGATGAATTTAAACATGCAAAATGTATTAATATTGTGACTTATAATATTAATACATATGAATCTAATTCGGTACTAATCAAAGAACTTAGAAAGTTGAATAAAACTACAAAGATAAACATTATCTTGAATATTCCAAACGGTAGTTACGTGAAAAATTTCAAAAATAGGATAGACCAAAAAGAGTTTGATAAGGTTAAATGGAAAATTAAAAACGCTTTGAGTGTTTTGGAACAAGAGAAATTCGGAAATTTAGAAGTGTATATCAATCTTGAGAATCACGCAAAATTAATTATGACTGATCACATCGCCTATATTGGTTCACAGAATTTTTCTGATGCTAGTGAAGGTAATTTTGAATTAGGTTTTTTAGTAAAAGATTCAAAAGTAATCAGAGACATTGAGAGAAATATTTTTGCAGAAATTAAGAACAAATCAATATACTGTATCATTTCTGAATATAGGGCTACAATGGAAGAGATATCTGTAAAATTGGCAAATAAGTTACAAAATATTCGAGAAGATATTTTAACATGGGTTGGAGATCCACCTTTTACTTTTAGGCAAGAGGTCTTTTTTATTGATGACGCATATTTTCATAAAGAAAGATGGGAAGAATTTAAGGAGTTTCACTCTGAATTTGAAGTTATAACCGAAAAACTAATAGATGAGTATCCTTCTGAATTTAATAAAGAAAGCGCAAGGGAAACAGTAAAACATTTAAGAAAACTAGTAAAGCTACTTGTTTCTGAATTGGACGAACTGGCTAAATTTAAAACAAATCAAGAAGAGAGTATGATGTGGGATAAGTTTCATCAACTTGATGTGGGTGAAAATATGGAAGAAGCTTTAGAAGACGCCCGATATTATGTAGAAAATTATAAAGAAAAGAATTACCGAGAAATAGAGTATAAAGGGAAAGAGTTAATTAAAACATTTGATTATATAAAAGAATCTATTCAAGATATTGAAACAATTGTTGATGAAATAAAGGATTCTATGATTAGAAAAGCTCTCAATCAAAATATAGAGAGAATCTTACAAGATATAAAAAAACAATAACAAAAAACGACTGTAAAAACGGTCGTTTTTTTTATGACTTCATCATATGAATGAGCGCTTCACCATCAATGAGCTCAATATTTTTGTTCGCAGCATATTGCCTTGCGTTCTTATTGAAATTACTCAGTGTAACGAAATATCCTCCAACTGCATCACCATCAATAATAGCACTATGTAATTTTTGAATGTATGGCCTTCCGATAGATTCTTTTGTATATCTTTTCACTTCAACAAATTTCACTTCATCGTCTTTCCAAAGGATAATGTCTTTTCCACCATCATTAGAGCCAGGGGTAACTTGTGCTCGATACCCAAGAGAATAAAACAAATCAGCAATTAAGTATTCAAATTTTCGTGGATCCATTTTCTCTAGATATTCACGATTAGCCTGCTCTCTTAAGTGGTTCATACGAATTTCCTCTTCTGAAACTTGTGGTGCTTTAAGGATAATTCCTAATGCAAAAACGACGACCAATGAAAGAATAGCCCAAATCATACAATTCACCTCAGTATGAGTATAACCAGCTTATGGCTATTCTATTTCCTCTTCAATCCAAATGTCTTCTACAGATAAATCAAGTGTTTTTGCAATGCGCATTGCAACTCTCAATGTTGGTTCACTTTTTCCTCTTGCTATTAAGCTAAGTGTTTGGTCTGTAATACCTACGATTTTAGCGATATCGGATTGCTTTATCATTCTCTCAGCCAAGATTACTTTTAATTTGCATTTCATAAATTTATCACCGTCCTAGTTTTATTGTTCAATTTAAATTTTAAAAAACCTTTTTGATTTTTTATGGTGGACAAACAAGATTTTTAATTTTAGGTCATATACCTATATCAAGACCACGAGGAATACCAAGTGGAATCAAGGACAACAAGAGGGGAGAGGGCGCGCATGCGTTGGCAATATTCACATTTAAACGAAACGCCTTACCTGTATCCATCGAAGGAATTAAGAAAAATGTATAGAGATTCTAATGGTAAAAAAGAAACAAATGCGATAGTGGACCACATGGAAAGATATGAGGTTTTTAACAATCGTGAATATAAAGGCTATTACCGTTTATCGAACGATATTATGGATGATTTATATGAAGATGAGGACGAAGTGCTTGATTGGGGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP029805|2156167:2163291|2160938_2161241_+|AWU53132.1|DBSCAN-SWA MRWQYSHLNETPYLYPSKELRKMYRDSNGKKETNAIVDHMERYEVFNNREYKGYYRLSNDIMDDLYEDEDEVLDWGDVINEYQPVMTPKGLQLIRKEGFK >CP029805|2156167:2163291|2156167_2157430_-|AWU53126.1|DBSCAN-SWA MFTFFSFYLIILIGKGRKKMVQIKVTPEMLEEVANRANNTRIALESIHNNLCNEIDQLCFQWIGASNQQFIQMFNDARPKAFTSINSLVKVEEDLKRIAEKFRNADNQDVTMEEGAMCGKPPEKSTIKKVWDGIVEGTGQAVEDTVEGFKALGKWETWENMGNAALHPIDTLSTMYNVLSDSFINDVINGDAESRAKWGSYALTQVGLGLIGDKGISKVTTLAKGASVAKFSEGISHFTNKLQMGDRFAYASVSEFRDIPKTSFNSLEDARNTFMFADPGNLNTPRFQEYLSQVEEITNRKIPENQRELLQEALEKNAYERLSKEEVDQRRAEFNTIKNKLIAEWEKETGQTWPTYTEEVISRRGKVSRRIDKPFDAHHFIENAHGGEHEWWNMHPAKYPDEHQGGIHAKDSISREIFKK >CP029805|2156167:2163291|2160071_2160536_-|AWU53129.1|DBSCAN-SWA MIWAILSLVVVFALGIILKAPQVSEEEIRMNHLREQANREYLEKMDPRKFEYLIADLFYSLGYRAQVTPGSNDGGKDIILWKDDEVKFVEVKRYTKESIGRPYIQKLHSAIIDGDAVGGYFVTLSNFNKNARQYAANKNIELIDGEALIHMMKS >CP029805|2156167:2163291|2161237_2161420_+|AWU53133.1|DBSCAN-SWA MTIVGEAVIVWTATGLSVITMKVAEKMGLSVPHWLPRMTMYTTLTGSFLYLLRYVLFAFL >CP029805|2156167:2163291|2157554_2158706_-|AWU53127.1|DBSCAN-SWA MKFKQIILAGAVLATSTFTSLTNAQAETGFRDVPSDHWSYNAIMGLKEKNIVAGYGNGMFGFGDNITRGQVARLIYAYLKPADEHNAPNPFTDVKGHMFEKEILSLSKAGIMNGFGDGKFGPDNVLTREQLAVVLTKAFNFKATSTTTFKDVDKNYWATNAISALQENKIAAGTGDNLFEPKNIVTREQYAQFLYNAMNTVEVKPELTPFGIPSSMITNDFYYNSNNWKNASPVLKKSVSNEAQNLITKINKKYNEDYKYESASVSSMGLPESVQLRTSNPNLGRVYDLGQGQFFVQGENEHDFYIMFIIDNATVELAKSWITLINSDLNLDKEINDVIAMPSQKARGRDYHTYLDKGKYQIELGTSPQTKGYDSLFIGIKRK >CP029805|2156167:2163291|2160826_2161012_+|AWU53131.1|DBSCAN-SWA MIFYGGQTRFLILGHIPISRPRGIPSGIKDNKRGEGAHALAIFTFKRNALPVSIEGIKKNV >CP029805|2156167:2163291|2161538_2162729_+|AWU53134.1|DBSCAN-SWA MIELLLVPAAGLTVALFGEKFKSKNDDKRKIQVFFEVAGIAIKRNNEEKLQYPKFQKQIDDDRSTTYVYTLPLGMPSKIIQKVEDVVSEGLNKPVRIQYDNYKLNIRVFRREIPKNWSWSMDLVTKGKWCIPVGQSLETIVYHDFDETPHMAVGGLIRMGKTVFLKNMFASLSLANPDHAHFYLIDLKEEGLEFSEYKKLKQVEQIAETSEQAHGMLLKVMEKMHERGKYMKERGIKNIVHTKEKDRYFIVVDEGAVLAPAKGLPRAHNKMLEECQYMLSHIARVGGALGFRIVFCTQYPTGDTLPRVVKQMANAKLGFRLPTRTASEVVIDQSGLEQLPSIPGRAIYMKERFTVLQVPYIDDVVMWKHLKEYEVEKYEHPEPYENQPSDGDTCDD >CP029805|2156167:2163291|2162670_2163291_+|AWU53135.1|DBSCAN-SWA MNIQSHMKINRQMVILATIRKLQFATRRHLMSVHNMGGIRNANRILGDLKPYVNKTMQGKEYVYYLNKEGHAMFGDDGKVVSRGKLAHALLRNEAWLHLFCPDDWQIETDIRYIKNKEKMKIVPDVKFRDEENILHAVEVDRSQKMKVNEEKIKKYEEFTQIYKQKHNGKMPVIHFFTVTKYREKKLEELAAKYDVLASVYVIEEI >CP029805|2156167:2163291|2160572_2160773_-|AWU53130.1|DBSCAN-SWA MKCKLKVILAERMIKQSDIAKIVGITDQTLSLIARGKSEPTLRVAMRIAKTLDLSVEDIWIEEEIE >CP029805|2156167:2163291|2158906_2160040_+|AWU53128.1|DBSCAN-SWA MKQKISNVTGEIILSYKENGYQVVLDEFKHAKCINIVTYNINTYESNSVLIKELRKLNKTTKINIILNIPNGSYVKNFKNRIDQKEFDKVKWKIKNALSVLEQEKFGNLEVYINLENHAKLIMTDHIAYIGSQNFSDASEGNFELGFLVKDSKVIRDIERNIFAEIKNKSIYCIISEYRATMEEISVKLANKLQNIREDILTWVGDPPFTFRQEVFFIDDAYFHKERWEEFKEFHSEFEVITEKLIDEYPSEFNKESARETVKHLRKLVKLLVSELDELAKFKTNQEESMMWDKFHQLDVGENMEEALEDARYYVENYKEKNYREIEYKGKELIKTFDYIKESIQDIETIVDEIKDSMIRKALNQNIERILQDIKKQ |
10 | Bacillus_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3446395 : 3483269
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP029805|3446395:3483269|DBSCAN-SWA TTTATGCCAGCGCTAATAAGCGTATGGCTTCTTTTTTGATATTGATCGCTGCGTTATAATCACGGCCGATTGTGAGTCCACACGAACACGCATACGTGCGTTCACATAATGGCATTTCTTTTTTATTTCCACAACGACTACACATCTTTGTAGAAGGAAACCATTTATCTATCTTTACAAGTTGTTTTCCTTGTTCTTGTAGCTTATATGCTAAAAATGCCGTGAACATCCGCCAACCGTTGTCCGCTACACTCTTACCAAATCTAAGTGCTCTTGACATTCCTTTCATATGTAAGTCTTCGATTGCTACAACGTCAAAACTCGTAGCTAATTCTTTAGACTTGTGATGAAGAAAATTTTTACGTTGATTGGCGACCTTTTCATGCAATTTCGCTACACGAATGCGTTGTTTATTCCAGCGCTCTGAACCTTTCACACGTCTTGCTAATACTCGTTGTGCCTTCGCTAATTTCTCTAACATCTGACGATAAAAGCGAGGATAATTGGCTTTCTCATCTTCGCTACTCACGTACAATTCAACCATTGCGAAGTCTAATCCAACTACACGTTCTACTTCTTTTGGAGTGATTTCTTTTTCATATTCGGTCAAAATAGACACGTAATACTTACCAGTAGGTGTCATCGAAATCGTACACGATTTGATGATATGTTTTGGCGGGATTTCTCTATGTTGCTTCAGTTTCACCATTTTCAATTTTGGTAATTTGATATAACCATGAAATAACATAATATTTCCGTTTACTCGATTCGTTGTATAGGATTTTCTACTCTTTTTACTTTTGAATGTAGGAAAATCACTTTGACCACTAAAAAAATTCTTATAAGCAGTTTGCAAGTTTAATTGAGCGTTGGCCAATGCCAATGAATCAACTTCTTTCAACCATTCATACTCCACTTTGTATTTTGCAGGTGTAGAAAATTTTTGCTCCTTCAGTTCTTCCTTATTCGCTTTGTGTTTTTCATATACTTCCTTTCGTTCAGCCAGCATTTTATTATATACAAAGCGTACACACCCGAACGTTTTACGTATGAGATGTGCTTGTTCTTCTGTTGGATACAGACGAAACTTGTACGCCTTATTCTGCTTTGTCATATCCATTCACCTCACTTTTCGCTTCATTTCCCATAAGCTATGACGGTGATTCCACGGACCTGAACACTACATGATTATTATCTACTTTCATTGTTATACCAAACTTTACCTCTTATAAGACTGATTATAGCAGGGGCGAAATAAATGGGAAAACCAAATGTTTGGTTACGCCAAACCGAAATCCATCTCCCACCTACCGCTAGGCTATCGTCTTTCACACGCCCCAGGAAGGAGATTTCTTTCGGATAATGCGTTAAAAATACCAAAAAATATCTACATTCGATGCTTCTCAAATCAGTTAAACAATCCGTTTCCGAATCGAACTTGAAATAAAATCAATGATAATGACCATTAAAATGATGCCCAATAAAATTATTCCCACGCGAGACCAATTACGTGAACTCAGCGCAAAAATTAGGGGCGTACCAATACCACCTGCTCCAATAACACCTAAAATGGCAGCGGATCGTACATTAATTTCGAACCTGTATAATGTATACGATAGAAAATCTGGTAATACTTGTGGCAATACTGCATACCAAAGTATTTGGAACCGGTTTGCGCCTGTAGCTATTAACGCCTCTGTCGGCCCCTTATCTATATTTTCAATTCCTTCTGAATATAATTTCCCTAACATTCCAATAGAGTGTAATCCTAAAGCTAGAACGCCGGCAAAAGAGCCTGGTCCAACAGCCTTTATAAATAAAAGAGCCATAACTAATTCAGGAAATGTACGAACAAAACTAAGTACAAATTTCCCAGTTCCTGAAGTTAGTTTTCCACTGCTCATATTCGTCGCCGCCCAAAAAGCAAATGGAACAGATAAAAAGGCAGAAATAAATGTACCTAATATCGCAATTGCCAACGTATCAATTAAACCATGTAATAAATCTTCACCATCTGGCAAAGATACATACGCCCAATCTGGATTCAATACACCTGTCATAATTGCTTTTGTAATTTCTCCTGCCGTATCCTTGATCCCTTCTAGCGGTACTCCTGAAAAAGCCCATACGTAAACAAATGTAAGTGCTATAAAAATAAACGAGCGATACACACTCGGCTTCTTAGGTTTTTGTACGATTATCGTCGTTTTACTCATTATAATTTCTCCCGCAACAATGTACTTACATAATCAATTAACAATACAACAACAAGGGTATAAATAATAATAGATGCAGTTTGCTGATATTGTAAAAATCCAAGTGTACGATCATAGTATAATCCAATACCACCTGCTCCTACTAAACCTAAAACAGCTGCTGCACGTACGTTCACCTCAAATGTATACAGAACATAAGAGACAAAATGCGCTTTCACTTGCGGAATTACTCCATAAACAATCCATTGCACTTTATTTGCTCCTACTGCTGTCATCGCCTCTAACGGACCTGGATCAATTGATTCGATTGACTCATAAAACAATTTCGCCACGAGCCCAATTGAGAAAAAAGTAAGAGCCAGAATACCTGGAAGTGGCCCGATTCCAAAAATCGCTACGAAAATTGCCGCTAATAATAAATCTGGTATCGTTCGGATAAAATTTAATATCATTCGAGCTGGGATGTATAAAAATGTACTAGTAAATACATTACTTGCCGCACACAATGCCAGCGGAATAGCTAAAATCGCTCCTAAAGTCGTCCCAATAATCGCCATACGTATTGTATCTAACATCGCTGTTGTAATAACTTGAAAATAACTCCAATCTGGCGGCACCATCTCTTTTAACAAATCCATCATATTAGGAAAACCAACTACTAGTTTTGACAATGATGCATCGACCTGTACACTACTTCCCCACAACAGTAAAATGACTAGAACAGCCGTTAACATATGTTTCAACTTACTCGGTGGCTTCGGTATCGATTTCGAGTATATCGTCACGTCATTCATTTAACTGCCACCTCTAACAATTCACTTTTCTGTACTACGTCACCATAAATTTCAGCAAACTTTTCATCCGTTGCCTCTTCTACTAAGCCATCAAAAACAATTTCTCCTGCATGTAATCCAATAATGCGCGTCGCATATTGCCTAGCTAAATCAATAGAATGTAAGTTTACAATTGTTGTAATTCCAAAATCTTCATTAATTTTCTTCAAATCTTCTAATACTTGCTTTGTTGTTAGCGGATCTAACGATGCAACAGGTTCATCTGCCAATATGATTTTTGCTTCTTGCGCCAACGCTCTAGCAATCGATACACGTTGCTGTTGTCCTCCTGATAATTCATCAGCACGCGCATATGCTTTTTCTAAAATATTTACTCTTTTTAACGATTGAAAAGCAAGCTCCAAATCTTCTTTCGGAAATAGACCTAACGTTGTACGCAACGTCGAATGATACCCAACACGGCCAGCTAATACGTTCTTTAATACTGTTGATCGCTTTACAAGGTTAAAACTTTGAAAAATCATACCAATATCCCGGCGCATGCGGCGTAATCCTTTTCCTTTCGCAGCCGTAATAGATTCACCTTCAATCATGATTTCTCCTTCTGTAATCTCATGAAGACGATTTACCGATCTTAGAAGTGTAGACTTTCCAGCTCCGGAAAGCCCTACCATTACAACAAACTCACCTTTTTGAATTTTCAAGTTTATATTATTCAATCCTTTTGTACCATTTGGATACACTTTGGAAACATTTCGAAACTCTATCACACATCTTACCTACCTTCTATGAATTCAAAACGGCAAACTAACTGAAAACATACCTTTCCAGCTAGCTGCCATTTCCATATGTATTATTGCGTTTTTACTTTCTTCCCATATTCACGAACGATATCAAATTTACTATCATCAGATTTAACATATCCTTCATGTGAATATACTTCTTTAATGATTTTGTGCCCTTCCTCATTCTTTCCAATTTCAATGAAAGCATCCTGTAATTTCTTGCTCCACTCTTCATCTAAATCAGAACGTACCGAAATCGTATCGTTTGGAATTTTCTCCGTAAATTTCACTATTTTCGTTTGATCGAATATATTCGGATAATCTTTTTTTACAATATTACGAGCATCTTGGAATACAACAGCTGCATCTACATCACCATTTAAAAGAGCAATAAGCGACTGATCGTGACCTTTTAATGTAACAGGTTTCACATCTTTTAACGGATCAACGCCCTCTTTTAATAATACAGCCGCAGGCCACACATATCCCGCTGATGACGTTACATCTTGATAGCCAATTTTTTTACCTTTTAAATCTTTTACACTATTAATATTTGAATCTTTCTTAACAACAAACTCAGATTTATAAAAGTCTACTAAGTCCTTTTTAGGAGCTCCCGTTTCATCATCTACGCCAAAACGTTGCGCTTGTAAAATTACGTTTGCAGCCTTTTTCTCATGTGCTAGCACATACGCTGTTGGAGGTAAAAACCCTACATCTACTTGCTTAGATGCCATCGCTTCTACAATTGTATTGTAATTCGTTGAAATACTAACTTTTACTGGAATATTTAACTTATCACTTAATAGCTTCTCAAGTGGTTTTGCCTTCGCCTCTAACGTATCTGCATTTTGAGAAGGAACAAATTGAACATTTAAAGTCTTCGGTACATACCCTTTTTTCGTATCTGCATTTTTATTTGCACTTGATTCCTTCGTTCCACAGCCACTTAATAACCCCGCTGCTAGTACAACTGTTGTGCTCATTGCAAAAAATTTTTTCAACATATTAGTGCCTCCATTTTTCATTGTTATAAAATAACCTTTCATAAACATGAAGAAATATATCACACATTTTTACAAAAATTTGATTATTTACAGAATCTTTACACATTCTATACACTCACATTAAAATTCCCTTCATATATTTGATATGCTTAATTAGTAGATAACAATAGAAAAGGTGAATAATATTGAATCCAAATC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MEIRKKLVDPSKYCIKCPYTMNPEFITVHNTYNDATAENEVAYMIRNDNQVSFHIAVDDKEAVQGIPLERNAWHTGDGNGNGNRKSIGVEICYSLSGGDRYYKAEDNAAIVVAQLMKQYNIPIKKVRTHQSWSGKYCPHRMLAEGRWNNFIERVQNAYNGDGKVTPTLIPPSTNGTGIAYIEGNGINLRKGLGTGYGVIRQLGKGESYEVWGQSNGWLNLGGNQWIYNDSSYIRYTGESTPTSSQSVNNGVGIVTITADVLRVRKGPGTNYDIVKNVYQGEQYQSWGYRDGWYNVGGDQWVSGEYVKFED >CP029805|3446395:3483269|3473531_3474125_-|AWU54443.1|tail|DBSCAN-SWA MSENKVSFGLKNVHYATYETKDGVVTFGTPIPLPGAVELTNEPRGDLIEFYADDMLYYSADNNQGYEGTLNIALLPEQFAIDALGEQLDETDGVLNELADAKGKPFALLFEFDGDVKATRHVMYNCSASRPNISSKSKTNSAEPNTNELKFVASPIILATGGRPMVKTKTTSKTTPAIHDNWYKKVYVKTPTAPKGA >CP029805|3446395:3483269|3460235_3460505_-|AWU54433.1|DBSCAN-SWA MEKRQGRKVSMDYKMSREEIEKLVNQVVLTANETVNLLGVTTQRLHVLVKQGRIVPIKVVDRVSLYFREDVEKLAEELGQLREKYRPYE >CP029805|3446395:3483269|3481935_3482358_+|AWU54456.1|DBSCAN-SWA MSTYQDRYIYPSIFDFSNEQVTVTFPDLTDCHANGNNYEDAFEMAKKTLATHLYEIEENKGTIPPASNPTSIQTKDNQVIGLMEVWMPPFRSEIENKAVKKTLTIPHWLDKMGKANNVNYSQVLQDALKKHLGVTENKNV >CP029805|3446395:3483269|3474451_3474808_-|AWU54445.1|DBSCAN-SWA MSNIDTLASDIARELQRYANLVEEDIEDAKEKVATNLVNELKQKSPKKTGKYGKGWRKKKDGSAIIVYNALKPQLTHLLEKGHAKANGGRVAAKVHIAPAEEKAINELIERVERAIQQ >CP029805|3446395:3483269|3477425_3478637_-|AWU54451.1|portal|DBSCAN-SWA MGLFDKIFGKKQAPTTTRFEMINDNGGGFFAWNGDIYQSDIIRACIRPKAKAVGKLIAKHIRDNSTEFKVNPDSYMRFLLEEPNPLMTGQMFQEKMAVQLELNHNAFAYIKRDDFGYPTEIYPIPCTTVEVVEGAQGDIFLKFYFKNGKQMTIPYTDIIHLRKDFNDNDFFGEHPGNALAQLMEIVTTTDQGIVKAIKNSAVVKWILKFKSVLKQEDIDSQVKNFVNNYLNISNDGGAASSDPRYDLEQVKPEAFVPDSKQMQETVQRIYNFFNTNEKIIQSKYNEDEWNAYYESEIEPFAMQLAGEFTRKLFSRRERGFGNRIIFESSSLQYASMGTKMNLVQMVDRGSLTPNEWRAILSLGPIEGGDKPIRRLDTALVKEGNVTDEGGDDNEQDGKEGATE >CP029805|3446395:3483269|3447585_3447801_-|AWU54417.1|DBSCAN-SWA MRSIECRYFLVFLTHYPKEISFLGRVKDDSLAVGGRWISVWRNQTFGFPIYFAPAIISLIRGKVWYNNESR >CP029805|3446395:3483269|3453897_3454707_+|AWU54424.1|DBSCAN-SWA 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MLRVLLNISGVKEGRIKMAEFGAGVDKSMQEVLDKTKISADQFEKWGQAIAGGGENGQKAMLEATKALAGVENATDRNALGTKMFGTLWEDQGKKIIDTILKAEGKQVDLKKGVEDLHGATSKIDASPAVKFQKAMQDLQMALQPVLGVIADVVAKIADWISNNPKLAATLAAIAVAAGVIAGAFMALAPIVVVISGVGAAMMGWVALIAIVVAAVVALGIAIYQNWDSIKQWTIDAWNAIGEFLVGIWDGIVQWASEAWNSISESTSAVWNSIKEFLIGIWNGIVEFVVTWGTAILEAYVGIWTSIFNFCMEIWNGIVEYLTSVLQGIATFFTEIWTSISTFFQETWNGLVAFITPILQGIADFFSMIWNGISTVIQTVWNFITQYLQAIWTAILYFATPLFESIKNFISECWNTISSTTSFVWETIKNFLVSCWNGLVAFVMPIFEQIKSWIISVWDTISSATMTVWNAVKNFLQSCWNGLVAFVTPIFNSIKDWIINTWNTISSTTSAVWNTIKSFLSGLWNSIVSTASSVFNNIKEAISTVWNMISSTSSSIWNGIKSTLSNIWEGIKSTASSVWNGLKDAIMTPVRWVTNAVSGAFEGMKSAVLGVWDGIKSGIRTAINGIIRIINKFIDGFNTPAELLNNIPGVSAPTIPHVPMLAKGGKPVGDGSFITGEAGPELFTKKGNSITVTPLSSKEKSLGITGTMNQLMGDMSRMMASSMSQLAGLKSVMSGVYGSMSNSRQAMAGNIANQVFNYSSGQTGGNELIPAQGGDLVIEVPVILDGRDLARGTFRYTKEYQEREEKRNSDF >CP029805|3446395:3483269|3446395_3447508_-|AWU54416.1|transposase|DBSCAN-SWA 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MSQFLGVLGTVGEDGTIKIPLDMLETAGIKPNTKVELFSDTSNLFVRTAERFCDICGVNTNTTRIGNQEICKDCLDRITQASQEKQNVPSE >CP029805|3446395:3483269|3480874_3481171_-|AWU54454.1|DBSCAN-SWA MAKEYAKKFYKSTAWKKCRDSYFKFRYGLCERCKGTGKIVHHKDYITPENINNPEITLSFHNLELLCQDCHNREHHEKNSPVVEGVMFDENGDLIQKE >CP029805|3446395:3483269|3457196_3457346_-|AWU54428.1|DBSCAN-SWA MKKIKITLMGLIGIAVLSFGLNSPSIEKSAAPTLKQENIISYSEHGTGI >CP029805|3446395:3483269|3473155_3473527_-|AWU54442.1|DBSCAN-SWA MEKTIVIDGKQVRLKSTVATVKRYKAQFRRDLFADMMALGAIGTFTPQDGSQPSIDLSNVDLKKIDFEVIYDLVWLYAKTADPNLPDPITWLDGFEEFPIYEIIPEINDMIQSTMGAKKTKEK >CP029805|3446395:3483269|3450257_3451196_-|AWU54421.1|DBSCAN-SWA MLKKFFAMSTTVVLAAGLLSGCGTKESSANKNADTKKGYVPKTLNVQFVPSQNADTLEAKAKPLEKLLSDKLNIPVKVSISTNYNTIVEAMASKQVDVGFLPPTAYVLAHEKKAANVILQAQRFGVDDETGAPKKDLVDFYKSEFVVKKDSNINSVKDLKGKKIGYQDVTSSAGYVWPAAVLLKEGVDPLKDVKPVTLKGHDQSLIALLNGDVDAAVVFQDARNIVKKDYPNIFDQTKIVKFTEKIPNDTISVRSDLDEEWSKKLQDAFIEIGKNEEGHKIIKEVYSHEGYVKSDDSKFDIVREYGKKVKTQ >CP029805|3446395:3483269|3459734_3460067_+|AWU54432.1|DBSCAN-SWA MSYDTVASLQRMQQLQQSEAAAGDRLILKRADSKAELIITVSAIVLTPFTLGISLVLFAIWFLIKELTAKTYLVKNVATGEKFRVDRNDFKQYKKDFKAKEKEVKKISDL |
43 | uncultured_Caudovirales_phage(33.33%) | holin,terminase,head,tail,capsid,transposase,protease,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3495607 : 3507161
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP029805|3495607:3507161|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP029805|3495607:3507161|3502883_3503231_-|AWU54488.1|DBSCAN-SWA MLFLKRLVNLVGIENLVLPEDAELAKSLRNKKENYIKNQFLLTRIASKKNVEGKTKEFYEACKEYEACGEKAKECDKQLKELIFKKKENDRVQHVVERMREVGIKEDVIQKVLYK >CP029805|3495607:3507161|3503190_3503376_-|AWU54489.1|DBSCAN-SWA MGRGKDGLMMFTIDYNNVKVSDYLRLLAQYKLPNKKQRRLIENRFVCLNALFKKAGESSGN >CP029805|3495607:3507161|3503726_3504440_-|AWU56379.1|DBSCAN-SWA MVVDEKEESFVKGDQESLVFIKDNKVVTDSLTVAEVLKKQHKHVLRDIKVQMEKLESAGEGEFTESNFGLSFYKDVTGRTLQKIDMTEDAFTILMFSYNTIETMKIKVRFIEEFKRMRAFIENQSILPTDTFSQIELLATGTSNLNKRVSSLEQVVEKQLTVDYGQQRVIEKTKAKRIYFLWENGHVDSEVHDSTRKLFGLLGRNLKDAFNVNSYRDILKKDFEEALNFINGWRPMI >CP029805|3495607:3507161|3504927_3505341_+|AWU54492.1|DBSCAN-SWA MSLVNTIKNLCKNHDTSISALEKDLEFGNGTIRKWDKAYPSADRLQKVADHFNVTTDFLLGRTNQMHLTTKDEKDIEKRMEEIKRDLQGEDGLMFSGEPMSEEAVESLLDAMEYIVKQTKVINKKYVPKKYRSTDDN >CP029805|3495607:3507161|3495607_3495892_-|AWU54473.1|DBSCAN-SWA 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25 | Bacillus_phage(68.42%) | integrase | attL 3489700:3489716|attR 3513496:3513512 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3713574 : 3789759
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP029805|3713574:3789759|DBSCAN-SWA ATTATTTTACATAATTTTCTTTAACAACCGTTGCACAACGCTCACATAATGTTTCATGCTCAGCGTCTTTACCAATTGTTTCTGAAACTACCCAACAACGTTCACATGTTTCACCAGTTGCTTGAGCAACAACAACCGCTGTATGTTCATACTTCGGTGCATCTGCTGGCGCTTCTTCCATCATGCCACCAAGTTTGTACTCAGAAACGATGAATAATTGCTTTAAGTCTTCGTTAATAGACTCTAACATAGCTTTCATTTCTGCAGTTGGATATAGCGTAATGCTTGCATTTAATGACTTACCGATTACCTTCTCATTACGGGCTACTTCTAACGCTTTTAATACGTCATCACGCAATGTCATAAATGCATCCCATTTTGTTTTTAATGCTTCCGCATCATCTAATTGTACAGCTTCTGGCATATCAGTTAATTGTACACTTTCTTCTGTTACGCCTGGAATGTATGGCCATACTTCATCAGCTGTATGCGGTAAGATTGGTGTTACAAGTTTCGTCAATGCAACAAGAACATCATATAATACTGTTTGGATTGCACGACGATCTTCATGGTTCGCACCTTCAATGTATAAAATGTCTTTTGCAAAGTCTAAGTAGAATGAACTTAAATCAATTGTACAGAAGTTATGAATTGCATGATATACAGCAGCGAAGTCGTATGTCTCATATGCTTCTTTTACTTTTGTAATTAAGTCATTTAATTTCACTAACATGTAACGATCTACTTCACGAAGTTCAGCTACAGCTACTGTATTTTCACTTGGCTTAAAGTCGTCTAAGTTTCCTAATAAGAAACGGAATGTGTTACGGATTTTACGATATACTTCTGCAACTTGTTTTAAAATATCATCTGAAATACGTACGTCAGATTGATAGTCAACAGAAGATACCCATAAGCGTAAAATATCTCCGCCTAATTGATCCATAATTTTCTTCGGTACGACGATATTTCCAATCGACTTACTCATTTTACGTCCTTCACCATCTAATACGAAGCCATGGCTTAGTACACCTTTATATGGAGCTTTGCCTGTTACAGCAACTGCTGTTGATAATGAAGAGTTAAACCAACCACGATATTGGTCAGATCCTTCTAAATATAAATCAGCTGGACGTTGTAAGTCATCGCGCTCTTCTAATACCGCTTGGTGAGAAGAACCTGAGTCGAACCATACATCCATGATGTCTGTTTCTTTACGGAATTCACCATTCGGGCTACCTGGATGTGTGAATCCTTCTGGTAATAGATCTTTCGCTTCACGCTCGAACCATACGTTAGAACCGTGCTCACGGAATAAATCTGCTACATGGTTAATTGTTTCATCTGTAATAATTGGATCACCATTCTCAGCATAGAATACAGGAATTGGCACACCCCATGCACGCTGACGAGAAATACACCAGTCACCACGGTCACGAACCATGTTATGAAGACGAGTTTCTCCCCATGCTGGTACCCATTTTGTTTCCGCAACAGCTTCTAATAACTCTTTACGGAATGCTTCAATAGATGCAAACCACTGTGCTGTCGCACGGAAAATAATTGGTTTTTTCGTTCTCCAATCATGTGGATATGAATGGGTAATGAATGTTAGTTTCAGTAACGCGCCTACTTCTTCTAATTTTTCTGTAATTGGCTTGTTAGCTTTATCATAGAATAAGCCTTCAAATCCAGGTGCTTCCTCTGTTAATACACCTTTATCATCAACTGGGCAAAGTACTTCTAATCCATACTTTTTACCAACAATGAAGTCATCTTCCCCGTGTCCTGGTGCTGTATGAACACAACCTGTACCTGCATCTGTTGTTACGTGATCTCCTAGCATAACTAATGAATCACGATCATAGAATGGATGTTTTGCAACTGTATACTCAAGTTCGCTACCTTTTACCGTTTTCACAACTTCAGCATTTTCCCACTCTAACGTTTTTGCAACTGTCTCAAATAGTTCAGAAGCAATAATATATTTTTCATCATTTACTTTTACAATAGCGTATTCAAGTTCTGGATGAACAGAAATACCTAAGTTTGCAGGTAACGTCCAAGGTGTTGTTGTCCAGATAATGTATTTCTCATCACCTTCTAATACGTTCTTTCCATCTTTAACAGAGAATGCTACGTAAATAGATGCTGATTTCTTATCTTGGTATTCAATTTCAGCTTCCGCTAAAGCTGATTCACTCGTTGGTGACCAGTAAACTGGTTTTTGTCCTTTATAGATATAACCTTTTTTCGCCATATCACCAAACACTTTAATTTGTTGTGCTTCATAAGCTGGCTCTAAAGTAATGTACGGGTTATCCCAATCAGCACGTACACCTAAACGCTTAAATTGTTCACGTTGACGTTCTACTTGTTCATATGCATACTCTGCACATAACTTACGGAACTCAGCAACTGTCATTTCTTTACGCTTTACACCTTTATTTGTTAAAGCTTGTTCAATTGGTAAACCGTGCGTATCCCAACCTGGGACATATGGTGCACAGAAACCAGTCATTGATTTATAACGAACGATAAAGTCTTTTAATACTTTATTTAATGCATGTCCCATATGAATGTCGCCATTCGCATATGGAGGTCCATCATGCAGTACAAATAAAGGACGACCTTTCGTATGTTCTTGTACCGTTTCATAAATATTCATTTCCGCCCACTTTTCTTGCATTGCAGGCTCACGTTTTGGTAAATTCCCACGCATTGGGAACTCTGTTTTTGGCATTAGTAATGTATTTTTGTACTCCATGCTCAATTCCTCCTTACATGTATAAAAGAAAGACCTAAAAAACGGAATAAAAAAGAGACTTTCTCATCCCAAAAAGGGACGAGAAAGTCTCCCGCGGTACCACCCTAGTAGATCCTATACGTATGTATACAACCCTCTTTATATTCTTAACGCGAATATACGCCTACGCTTACTCTATTTGTTCAGCGCGGAACTCCAGGGTGATATTCCCATTATCTCCTTATCCTGAGCTTACACCATCCTCAGTTCGCTATATAAGGTATGAAAAAGGTACTTATCCCTATCTTCGTTTTTCTTAATAAATATGTTGTTTAAAATTATATGTAATAATGAGAAAAACGTCAAGCTTACACTGTTTCTTCTTTTTTCAACAGCTCATCTACTTCGTCTTCTAACTCAATTAGTTTATCCCAATCATCGTTGTTTAACATTTCAAGCTGTGTTTCTAATAACATACGGAAACGAGTGCGGAATACTTTCGCTTGTTTCTTTAGCTCTTCAATATCGAAAGCAACTTTTCTTGATTTTACTAACGCTTCATTAATAATACGGTCTGCATTCTTTTCAGCTTCACGTACGATTAATTTTGCTTCTTTTTGCGCATTACGTTTTACTTCTTCCGCTGCTTCTTGTGCAACAACGATAGATTTGTTTAACGTATCTTCAATATTAGAGAAATGATCTAATTTCCCTTCTAATTGCGCAACTTTTTCTTCTAAAGCTTTTTTCTCACGAATGACTAATTCATAATCTTTGATAATTTGATCAAGAAACTCATTTACTTGATCCTCATCATAGCCACGGAATCCGCGACCAAATTCTTTGTTATGAATATCTAATGGTGTTAACGGCACAACGCCACCTCCAAGTAGTTATCTAAATTTCCTCTTTCAATTATATCTTTTCTTCGACAAAATAGGAGGATTTCCTTCTAAAAAACCAATCATTTTAGTATACCATACAAAATTCTCCATTTGTCGCGCTTTGTTCTACCTTCTACAGAAAACAATTTACTTCTTCCATACCCTCTCACTGAAAAAACATCTCCTGGATAACATTCATAAGAGGTTTGCTCCACTGTTTTCCAATTGACTTTTACTAAACCATTTTTTATGAAAGGTTGTACTTTTTGTCTAGATATATGTAACATTTCAGCTAACATAACATCTAAACGAAGTGAAGAAACCGTTCCAGATTTCTCTCCCCATGTTTCTTGTATCTGTAGAATTTTTTCTCCTTTCACTGGTGATAAGGAGACTTTCACTTTCCCTATAGATTGTAAGTTCATCTCAATATAAGATACAACTTCTTTTGCGACTACAATTTGGGCACGATCTTCTTGAAGCAAAATATCACCACATTTTTCTCTCGTTAAACCGAGAGACATAAATGTACCTAATATTTGCCTATGCTCTAGCGTATAAAACTTGGAAGGATAGTCAATTTCCAATCCTTCTACTTGAAATTCCTCTTCATTTACTACTAGATAATCCGGATAAATGAGTGCTCTTTTACGCTCTGCACGAGACGTTGCACCATCAAACTGTACAGCAATATCCCCTTGTCCTATTACCATAGTGACAATTTGTTGTTGTCTTGGATCAAGAAAGTCTGTTAACTTCACTTGATGGTACTCAGCCGCCTGTTTCCACTCTAATACTTTATCCACAAAGACTACTTCATCAGGTCTAAAATGCTCGTAGATGCTCATTCATCTAACCTCTTACTATAAGAAATAGCCAAATAAAGTTACTAAACCACTTGTAGCAAGTTTCAACGCAAAAATCGCAACGAGTGGTGAGATGTCAATCATACCAAGCGGCGGGATAAATCTGCGAAATGGTTCTAAATACGGTTCACAAATACGCGCAAGAAAATCTCCGAAAGTTGATTCCTTTGCACCTGGGAACCATGATAGGAGAATGTAAATAATAAGTGCCCACGAGTATATCTCGATAGCAGTAACTAAAAGCCTTAAAACTGTTTCCATGGCGTATTACCACCTCTTTATATTTGTGTCGTCTTCTTCACCGAATAACTCTGAAATTGCACCAACAATATCTACATTTTCAGGCGTACACATAAATGTTTTCGGTCCTATTTTTTGAATGTCCCCGCCTATAGCGTATACAGTACCACTTAAAAAGTCAACGATACGTACAGCTTGATCAGTAGACATTCGTTGTAAATTAATTACAACAGCTCGTCTACCTTTTAAATGGTCCGCAATTCC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99 | Bacillus_phage(92.98%) | holin,terminase,head,integrase,tail,tRNA,capsid,protease,portal | attL 3746966:3746982|attR 3791550:3791566 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
4818508 : 4860742
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP029805|4818508:4860742|DBSCAN-SWA 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51 | Staphylococcus_phage(26.67%) | holin,terminase,head,tRNA,capsid,protease,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
0 : 1765
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029806|0:1765|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029806|0:1765|597_807_+|AWU56430.1|DBSCAN-SWA MYIIINFEPLSPVMNDIAIKLAMVLFIPLFLALIVKVILMKFMKESIAGRIASLSLLFFMYYVFIFVTG >CP029806|0:1765|1126_1765_-|AWU56431.1|DBSCAN-SWA MEVLIFELILIAVLIPLNSVVKKHVPKWKGKAGEKLVKRMLSKLDPKSYYVLHNVTVYTEYGDTTQIDHIVIAETGVFVVETKNYEGWIYGSEKAARWTQGIFRKKSSFQNPFHQNYKHIKAIEWLIEQQLPCISMAAFHPKCSLKRVNVHSKEKHVLYYNDLQKCIESYTDVQLTNDEVQHIYHTILRANIMDKDIEKKHVKYLHNKFAKQ |
2 | Clostridioides_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_2 |
6659 : 8468
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP029806|6659:8468|DBSCAN-SWA TCTAGTATTTAAACTTTTTAAATGTATTTAACATTGTTCTAACTGCTTTTTTGCTGTTGATAGGTATCTTTTGAGATTTTAAATAAGCTTGTACTTTAGGTAGCTGTTTTCCGTTCCCGTACCATTCTAAAAGGGCATGATGCTGTTTATGACAACTACAATGAAGTAATTCAAGATTATCGTACTCATCTTTTCCACCTATAACTTTAGGAACAATGTGATTACTTTCAAGTGGTTCCTCTCCAACTAATGAATTGTTGCAAACTCTGCATTTATATTTAGTTTTTTTCGCTAATTTTCTCTTGGAATTTGTATTGAACCTATTGAATATCTTTTCATCCCTTTTTGCGAAGTATTTTTTAAGATTAGCGTCATCTGGACTATTCTTGTACTTAATCAGTACATGTCTTACAATTGGTGTCCATCTCATACGAATCAATTGATTTTTGTGATTATCAGGGTCCGTTAGTAACCATTTGTCTTGGCTAACACCTGTATGGTCTGGATGGAAATATTTCTTATTTATCCATCTAGCGCCTTTTCGGTGATGTTTATATTTAAGATGGTGCATTACCTTCTTATGAACATAACTGTCAATGTCGCCATAAATTACTTTTGCTACAACAGGTGACCAGTAATTTGCTATACCTGTTATAACTGGATTTAGTTTTCTGATTAATTGTCCAATTGAACGTCCTCTATGAGATTTAAATATTTCGCTTATCTTTTCTTTAGCTTTTTTGACACTTTGGTTGGATGGTTTAATGAAGAGTTGTGACCCTTCTTTAGTAGGATATTGTCTAAAATTAAAGCCTAAGAAATCAAAACCATCAGTAATGTGTACTACTCTGGTTTTTTCCTCTGCCAATTTTAACCCTCTTTTATCAAGATAAGGTTGAAGTTTAGCATACATACTTTCAGCTTCTTCTTTAGAATTACAAACTATAACAAAGTCATCTGCATATCTTACTATCCCAATTGAATCGGGATATAACATAGCTCCATCCCTTTTTGGGAAATGGTATCTTACTCCTAATTCCTTTTCCATTCCATGTAAAGCGATATTAGCTAATAAAGGTGAAATAATTCCCCCTTGTGGAGTACCAGTTTCTGTTTTGTAGAAGGTTTTATTATCTATACATCCTGCGTTTAACCATTGGTTAATTGCATTACTATAAGGAAAACCTTCTATACAGGATAAAATATGCTCATGATTCAGGTTATCAAAACAACCTTGAAAATCACCTTCGAATATCCATGCTCTATTAGTCCCTCTACTTAATTTAAGGAAAAGGTTTGCCATAGCGTCATGAGCACTTCGTTTGGGTCTAAATCCATAAGACATAGACTCAAAGCGACATTCCCATTGAGGTTCTAGTGCATTTTTGACCATATTTTGAAATATCCTATCTTTGATAACTGGAATCCCTAAAGGTCTTTTCTTTCCATTCTTCTTAGGAATATAAGCTCTTTTCACTGGAAATGCCTTAATGTTTCTAACACTATACCCTTTTAATAAGTGGAACAATTTAACTCTATCCTCTGGTGTGTTAGTAGTAATCCCATCAATTCCAGCAGTACGTTTTCCTTGATTGATTTGCGTTACTCTCTTAATACTTAATAACAGGTTCGCCTTACTTCTCAACATTAGACGTTGAAGTTTTCTCACCTTACGTTTATTACCGAATTGTTCGGCACGATAGATTCGTTGTCGAAGTTTCTTCACATAGTTTTCAATTTCCTTCCATTGTATGGAGTTCCATTGAGTTACCTGTGGAGAAACAGCCGACTTCATATTGACAGTATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP029806|6659:8468|6659_8468_-|AWU56437.1|DBSCAN-SWA MNTVNMKSAVSPQVTQWNSIQWKEIENYVKKLRQRIYRAEQFGNKRKVRKLQRLMLRSKANLLLSIKRVTQINQGKRTAGIDGITTNTPEDRVKLFHLLKGYSVRNIKAFPVKRAYIPKKNGKKRPLGIPVIKDRIFQNMVKNALEPQWECRFESMSYGFRPKRSAHDAMANLFLKLSRGTNRAWIFEGDFQGCFDNLNHEHILSCIEGFPYSNAINQWLNAGCIDNKTFYKTETGTPQGGIISPLLANIALHGMEKELGVRYHFPKRDGAMLYPDSIGIVRYADDFVIVCNSKEEAESMYAKLQPYLDKRGLKLAEEKTRVVHITDGFDFLGFNFRQYPTKEGSQLFIKPSNQSVKKAKEKISEIFKSHRGRSIGQLIRKLNPVITGIANYWSPVVAKVIYGDIDSYVHKKVMHHLKYKHHRKGARWINKKYFHPDHTGVSQDKWLLTDPDNHKNQLIRMRWTPIVRHVLIKYKNSPDDANLKKYFAKRDEKIFNRFNTNSKRKLAKKTKYKCRVCNNSLVGEEPLESNHIVPKVIGGKDEYDNLELLHCSCHKQHHALLEWYGNGKQLPKVQAYLKSQKIPINSKKAVRTMLNTFKKFKY |
1 | Pseudomonas_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_3 |
25239 : 33123
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029806|25239:33123|DBSCAN-SWA AATGAACGAGACAATTAGCTTAGAAGAAACCTTAGAAGATTTTTCTGCTTATTTGAATGAAAAAGGCCGAAAGTATTCTACGATTCAACGTTATGCATACGATATTAAAGATTTTTATAGATGGTTAGAAATTAATAAGATGCTTTTACATATCAAATCATGGAATGAATTATCTCAAGAAATTTATCAAGCTTATTTCTCTGAGTTAGAACATAAGCGGAAGTATTCCCAGAAAACAAGGCACAGAATATGGGTCGTTTTAAAGAAGTTACATACGTTTTTAGGAATAGTTAGCCCATTAGATGGTATTCACCTTTCCTTAATTCCGGATCAATCACTAAGTGATAGTGATTTTATTACAGAATTAGAAGAAACGCTTTTAAAACAAACGGTTCTATCTACAAAAGGGCTAACAGAAAGACAAGCTAAATATCGGCCTCTAATCATGGATAGAAATGCTTGTATAATTAATTTAATAGTAAACTACGGTTTGTCTCTACAAGAGCTTGTATCGCTTAATATGAGCCATATACAGTTTGCTAGAAACATTTTAATTGTTCCAGGGGAAAATAAATTAACTAGATCTGTTTCTTTAACTATGGAAGATACACAACAGCTTTACAAATATTATACGACTATTCCGGAACCCGTAAGACCTCAACAACACACAAATAATCCCCTATTTGTGGCATTTGATTTCAATCGAGGTACCTTTCGATGGGTTTACGAAAATGATGCGCCTAAGGCTTTGTCTGAGGTTGCTATACAAAAGATGATTCGACTTGAAGTGAAACGAGCAGAATTAGATAGGAGAATTTCTGCACAGCAGATGAGAAACACTTTTATTCTCCGTCTTATTAGGCAAGGAGTAACTGAAAAAGATTTGGTAAGTATGATGGGGTTTAAAACTAAAATATCTTTAAAAAGATATTATCAATATTTACAGTGACCTATATTAACCATACTAAAATAAGAAGACGTGTTCTATAAATAGAATACGTCTTCTTATTAATGTACTTTTCTTTGATTACTTCTTACTTTTCCTCATCTATCTTTTTAATTGCAGCTTCGTTCTGACTGATTATATCTTGAAAATGCTCTTGCTTATTTTCTTCTACAAACTGTATAAGTTCTTCGAATTTCATTATTATCACCTTATTTCATTAACTTTGATTACTTGTTCTAATTCGAATACAGAAAGTACCTGGATGTGTAAAAATGTCTTTAGGGCATTCCCAACCTCGTTATATCCAGGATTTCCTTTTTTAAGGCATGCTTTATGTATAGTAAACGAAACCGGATCAGTTTTTACATCTTGATATAGTACAAGTGTAGGAACCCAATCAATTGGAGTATATAGGTGCATAAGATTCTCCAAACATTTCTTTAGAACGCTATTGTCTCCTATGCAATGTATTTCACAGAACTAAGCTTCATTCCTCCCACTTCTTTAGAGGTGGGAGGAATGAAGTGTTTTTTTCTTTATAGAACATACGTTTATATTGTATAATATAAATAATTAAAAAGAAAGGAGTGACGGGCAATGGCAAAACCAAAGAAAGATTGTTTTATTATAGAACTGAAATTAATTGTGGATACATGGCAAAAGGATATTTTACTCAAACGTTTTGAAATTGCTCGTAAACTCTATAACACTACACTATCTTATGCCATGAAACAATATACACTCATGAAAGAAGCTAAAGCTTATAGAAAACAATTGCATTGCTATCAAAAGGCAAAAAAAGCAAATCATCCAAAAGAATGGAAAGAAATATCAAAAGATTTAGATAGCATCCGTCAATCCTTTGGATTAAGTGAGTATCAACTTCATGCTTATATCAAAAAACACCAACACAATTACAAAAAACATATAGATAGCAATACCTCTCAAAAAATTGCTTCTACGGTTTGGAAAGCTATGCAAGACGTAATATTTAAAGGGACGAAAACCCATTTTAAACCATTCGGAATGCTCCATTCTGTAGAAGGGAAATCCAATAAAGCGGGTATTCGATTCAAAGAAAACAGGGTCTATTGGAATGGATTACACCTTCCTGTTCGCTTTCGCAAGAATGATTTATTTATAGAAGAATCACTCGCTCTTCATAAGATAAAATATTGTCGTCTTGTCAAAAAAGTGATTCGTGGAAAAGATACGTTTTATCTGCAACTTATTATGGGTGGGATGCCTCCTACAAAGAGAATCAATAAAACAGGAGCCTTTCGACATTCCTACCAAAAGAAAAAGCGAGTAGGCATAGATATTGGTCCTTCTACGATTGCCATCGTTTCGGAAGAAACTGTTTCTATTCAACAACTCGCTCCTGATGTTCCGTTATTTGAGAGGGAAAAAAGACGTTTATTACGTAAGTTGGATAGAAGTCGTAGAAGTACAAATCCAAATAACTTTAACACAAATGGCACAATAAAATGTGGCATCAAGCTTCATTGGACATGTAGTAAAAACTATCAAAAAACAAAAAGTCTATTAAACGAGTTGTACCGAAAAAAAGCTGCTTATATCAAAGAAAAACATGGTGCATTGGCAAATAGCATCTTATCCTTAGGTGATGAATTGTATATTGAAACGATGCACTTTAATGGATTAGCAAAACGTACAAAAGAGACAAAAACAAATCAACAAGGCAAGTTCCAATCCAAAAAGCGTTTTGGTAAAAGTATTGGGAATCATGCCCCTGCCATGTTAGTGGAAATTATCAATCAAAAATTGAAGTATGGGAAACAAGAGATACAAAAAGTAAATACGATAACTTTTAGAGCCAGTCAATATAACCATGTAACAAATAGCTATGAAAAGAAAAAACTCCATCAACGATGGAGTCAAATTGGAAATTATCTCGTACAACGAGATTTATATAGTGCCTTTTTATTAATGAATAGTGATGCAACATTAAAACAAACCAATCAAGAACACTGTATCGAAACGTTCGATACCTTTGTAAAGCTACATCATCAACACATAGAATCCTTACAACAAACAAATAAAAAATACCCGCTGAGCATGGGTATCATATAAATAAGGAAGTATTCCTTCGTAGGTAGAGCTACCTGCCTTCGTTAAAGCTTATCGCCAACACAATATTGGTTGTGTAGATAAGAAAGTCTTATGGAACAGAAGATAAATCAAAGATGTTGTACACAGAACATAGCAACACCATCTGTGGAGAGCTTTGTAACGCTTCTATCAAGTACATAAGAACCCCACTGCTTTAGCTGTGGGAGTAGTCAGTCGGATGTATCTCTCTAACGTAAAATGGTACTTGTTCTTCATAATGTTTATATATCCTTTTAAATGCTTCTATGGCCTTTTCTATTGATGTCGCATTAATAAAACTGATTTTATGTTCCGTAGTAATTTCTAATATGTATAGGCGCATAATTATTCATCCCCTATATTTTCTATATATTAATTGATACATTGTATCTTCTTACTTTTAATTTAAAGAAAGTACCTATTTTAATGGTACTCTCTTTAAATATATCTCCTATTTATATATTAATCTATTGGAAATGACTCGTTTCCTAATTCCTTAAGTACTTTTGCAAAGAGATGGTTTGTCTCTTCGGATAGCATTTCCTCTGTTTCTATTAATCTAGAAAGTCTATTTGTAAACTCTGCAGCATACAAAAGCTTCGTACTGGCTTTTTCATCTTCTTTAAACAATTGTTCATTCTTCATGGATTGAATTAAGATCTGAATAAGCATTTGTTTATGTTGTTCGTTTTTCTTTCCTTGGTACATATCCATTCCTAACCAATGACGGACAATTCGTTCAGCGTTTCTTGCTTCTGTTACATCAACTCTAGATACAACAAAGGTTAGCTTGTTCCAAGTTAATTTTGCTACTTCATTTGAATAATTGGAAGGAAAGAAGAAAAAGCTTCGGTGTGTAATTCTTTGCCGTTCTTTAATCCAACGAAATAGTTCCTGCTTTCCTAGATGAATATCTATTTCTACAAAAAATACGGGAAACGGTGACGTTGTTTTTTCCTCATTTATTGTACAATCGGGCTTGAACACCAATTCACCTAGATATGCGTGGTATACAGGTTCCAATTCATCTCGATATACTCTAATTCCATCTGTTTCATACCAAGCTTGAAGAATAGCTTCGATCTCTTCTTCAGATATAAGAATCGTATTCATCTCTTGCTGCGTAAAAAGTAAATACTCTAAAAGCATTCTTCGACCTTTTACAGTAAGTCCTCCTGGTGCATAATCTCCTTTTTCTGTGCGATCAAACATAATATAGTCGTATTCAGCATGATTATGAATTGAAAATAAGTCTGAATCCCTTTTATTTTCGTTTCTAAGGAGTGTTTGTAGACTGCGTCTATTCATTACATTCCGATAACGAATATCGTTTCTAATGGAATGTAAGAAGCTTTTCCATGATTGTAGGTAAGCATAATCTGTATACCCCTCACTTATTAACTGGGTTAGCATTTTATCCTCACCATTCATCATCAGACAAGTCCAACACCCACTACGCGAATTTGCAGCTCCACAAGCATTTCCTTGCTGTTTTCCACCTGTTTTTATGCCACATTCAAACATAGCCTGTCCATACTGTATGCTCATTTCTTCTACATCTACGCCAAAAGGCAATAATCCTCTATCTAAAAGTAACATCCATACTTCATCACCGGTTAAGAATTTGACCGGGTTAAAGCAGAGAATATTCTTCATGTCATTATGACGTGAAAATAAGGAATCATTACTTATTTCGTGCTTTTGGATACTGTGTCTTCTTCGAGCGCTCTCTTCATTACGAACGGCCAGCATTAGCACACCATCATATTCATCAAAGCATTCTATTACATTCGTAGTTTGAGATTCTATTAATATTTCTTTCGTTTTACGCTGCATAGGTTTTACTTTGAGCGAATCAGTACACCATCTCAATCTACTATTACCACTCGGTGGAAGAACACCCCTTCCTAGAACGGAAGATTTTGTTTATCTGCATTCTCTTGAATCTTTCGTAATGTACGTGAGATATAAGCAGTCATAGCTGGTGTTTCTACTCCAACCTCTGATGTTAAGATATGAATTGGTTTCGTACGCTCCTCTATTGGCAATTCTGCAATTGCATCCCATAGTAAGGTCAACATAGCAGAACTATCTTTTCCCCCGCTGTAACCTACAAAACAACAATCACGAGATAAATAGACTTTTTTCATTTCCTTTTTAATTTCTTTATGTATATCCATCATTATATTGTTATCCCCATAGCAAAGTATCATTTCATACTGCCATGGAGCATTCCTCCTCTTTTTTAGATAGAAAAAAAGAGTCCCTATTTAATAGGCACTCTCTTTTATGTATATCCTCTATTTTTAATCAAATGTGATTTCATGTATATTCAACTTGTTTAACTTTTCCTTATAGAAATTCATTACTTTTTGAGCATGTTGTATAGCCATTAATCCATCTTGAACAGTAAATGCTTCAAAATACGGATAACGAATGTCTGTAGCATAACCATTCAGCTGCACGCACTGTTCTAAAATCAATGAGAATTCCTCATCTAATTTCCGACACAATTTGTGCAGCATTAAAAGGTTATGAGTTTTTGGGACTGTTCTACCGTTTAATGCAAGAAATCCTTTTAGAAGTTTTTCCACACATTGTTGACTATGATAACAAATAATTGCAGTAGGGAAAGGGTTCATGTGAGTTAAGTAACTAGCAGAATCTAAATCGGATTTTGCTATAAACACCCACTCTTTAAGATCCTCAGTATTTATTGTCGATAGGTAAGTGTTTGAAGCTATCTCCAACTTTTCCCCCGATCCGCACGGTACGTGCCACTTTCACGGCATACCGCGGTCCATCTATATTGTAGTTTTCTTTTCATCAAAATAATGATAAGTTCTAAGCGAACAACGCTAGTTGTTCATGTTTCATTTCCACTTCATTTTGTGATTAAATACAGATTTCCTCGTTTTTGACTAATTTTCGCAATTTATTGAGTTTGCCTAACTGTTCCTCATTGAATTTGAGTTCATTGAGTAGTTGGTTTATGGTTTCTATCTTGGTTGCGTGTATTAGTCTATGGACACTTGGTTTGATGATGGTAAGATTCTTGTAGCTGTCGTCCTTTGTTTCACTCCATAATCGCTTATGGTGACAATGAATGTCCCAAGGTAAGAGTTTCTCACCTGTTACACTGCATTTGCCTTTTTGTGCGACATAAAGAGAAATTCGGTTGTCATTGTATTCTACGGTTGCCCGTTCATTTATAACTGGATTTTCTCTTAACCATTTCAGTTCCGCTTCGGTTATGTCTGCCAAGTTTTTATGTATCAGGGCTCGTCCTTCTGCGGTGTACTTGTTAATGGCTTGCTTTTTCATCATCGGGTTTTTGTGTTGAATATAGGAGATTGGTAGGATGGGACGTTTCATGAGAAATCTCGTCATTTTTGACTTTAGATATGGTTTAATACCTTTGTCTTTTCCTTTATATTCTCCTATATTCGTGTATCCATTTGTGTTGCTTTTACCTCCAGTTGTTGACTTAGGGAATCTGTTATACATTATGTGGTCAAGATTATGGTTCATTTTACTGAAATCCTGGGAGGCATGCGTAGCTATTTTATAATAGTTGTGCTTACCAATGACCATGCTGTTGTATATGCTGATTCTCTTAATTGTTTCATTAGAGTTTGGGGTTTTCTGTATTCTTCTCACTTGTTTTGCTAAATCTTGTTTTGTTTTTTCCAGTGCTTTTGGGGAAACGTGTGTTACTGCAATGTATCGTGTGTCGCCGTTCTTCTTTTTACCTTTCTTTACAGCTTTGAGGGTGAAACCTAAGAATTCACTTTGTTGCTTTGTCAGATTGGTTACTTTAGACTTTTTGGCTGAGATAGACAGTTTTAGACGTTCTTCTAACCACATTTGAGTCGCTTTGAAAATTTTCTCCGCATTACTACGTGTGTTTGTGAAGATTTTAAAGTCATCTGCGTACCTTACGATGTACATTGGTTTCATCTTGGAAGTTTTGGTGAGTTGTGTCGTTACAACGTCATTGCACCAAATTCCCCTCATGCATCTCGGTTTTACCTTTTTAGCTTTGAATGTCTCCCATTGTCTACTTATCCACCAGTCGAATTCATTAAGATTGACGTTGGCAAGTATAGGACTAAGAATACCGCCTTGTGGGGTGCCCTTAGTCGGGAACATTGTTGTGCCGTCAGGCATTTGCACTGGGGCTTTCAGTATTTTTCGGATAATGACCAGAAGTTGTTTGTCACGGATACCCAATGTCCATAATTGACGCATGAGCTTGACGTGATTTACCTCGTCAAAAAACCCTTTAATGTCTACGTCTACTACATATGTAAGGTTTTGTTTATTTACTCGCACTGATGCATCTGCTAGGGCATGTTCAGCACTTCTGTTTGGGCGAAAACCATAACTTCGGTTACTGAAGTGCGCTTCGCAGATTGGCTCCATGACTTGTAAGATGCACTGTTGGATTATCCTATCCCACATAGCCGGTATTCCCAGGGGTCTGGTTTGTCCGTTGGGCTTCGAAAATTCTTTACGTCTTACTTTCTGCGGTTGGTAGTTTTGAAAGCGTCTTTTAACTTCATTCAAGAAATAGCTTTGTTCCATTCCCTCAATATTCTTTATATTTACATTATCACAAGCTGCAGTTCTACTTCCTTTGTTCCCCTTAATATTGCGGTAGGCGAGAAGTATATTTTCGTCTGATATAATGATAGACATTAGGTTTTTGAAAGAATTTCCCTTTGTTGCTTTTTGGTATAAGTTATCTAGGACAGGTTGAATACCGTAGTATTCGTTGTGTCTTAGTTTCTTCCCCTTTGGCGCGGACTTAGAATTGCCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029806|25239:33123|30602_31046_-|AWU56454.1|DBSCAN-SWA MEIASNTYLSTINTEDLKEWVFIAKSDLDSASYLTHMNPFPTAIICYHSQQCVEKLLKGFLALNGRTVPKTHNLLMLHKLCRKLDEEFSLILEQCVQLNGYATDIRYPYFEAFTVQDGLMAIQHAQKVMNFYKEKLNKLNIHEITFD >CP029806|25239:33123|31191_33123_-|AWU56455.1|DBSCAN-SWA MNGNSKSAPKGKKLRHNEYYGIQPVLDNLYQKATKGNSFKNLMSIIISDENILLAYRNIKGNKGSRTAACDNVNIKNIEGMEQSYFLNEVKRRFQNYQPQKVRRKEFSKPNGQTRPLGIPAMWDRIIQQCILQVMEPICEAHFSNRSYGFRPNRSAEHALADASVRVNKQNLTYVVDVDIKGFFDEVNHVKLMRQLWTLGIRDKQLLVIIRKILKAPVQMPDGTTMFPTKGTPQGGILSPILANVNLNEFDWWISRQWETFKAKKVKPRCMRGIWCNDVVTTQLTKTSKMKPMYIVRYADDFKIFTNTRSNAEKIFKATQMWLEERLKLSISAKKSKVTNLTKQQSEFLGFTLKAVKKGKKKNGDTRYIAVTHVSPKALEKTKQDLAKQVRRIQKTPNSNETIKRISIYNSMVIGKHNYYKIATHASQDFSKMNHNLDHIMYNRFPKSTTGGKSNTNGYTNIGEYKGKDKGIKPYLKSKMTRFLMKRPILPISYIQHKNPMMKKQAINKYTAEGRALIHKNLADITEAELKWLRENPVINERATVEYNDNRISLYVAQKGKCSVTGEKLLPWDIHCHHKRLWSETKDDSYKNLTIIKPSVHRLIHATKIETINQLLNELKFNEEQLGKLNKLRKLVKNEEICI >CP029806|25239:33123|30203_30509_-|AWU56453.1|DBSCAN-SWA MILCYGDNNIMMDIHKEIKKEMKKVYLSRDCCFVGYSGGKDSSAMLTLLWDAIAELPIEERTKPIHILTSEVGVETPAMTAYISRTLRKIQENADKQNLPF >CP029806|25239:33123|26388_26604_-|AWU56451.1|DBSCAN-SWA MHLYTPIDWVPTLVLYQDVKTDPVSFTIHKACLKKGNPGYNEVGNALKTFLHIQVLSVFELEQVIKVNEIR >CP029806|25239:33123|28758_30132_-|AWU56576.1|DBSCAN-SWA MQRKTKEILIESQTTNVIECFDEYDGVLMLAVRNEESARRRHSIQKHEISNDSLFSRHNDMKNILCFNPVKFLTGDEVWMLLLDRGLLPFGVDVEEMSIQYGQAMFECGIKTGGKQQGNACGAANSRSGCWTCLMMNGEDKMLTQLISEGYTDYAYLQSWKSFLHSIRNDIRYRNVMNRRSLQTLLRNENKRDSDLFSIHNHAEYDYIMFDRTEKGDYAPGGLTVKGRRMLLEYLLFTQQEMNTILISEEEIEAILQAWYETDGIRVYRDELEPVYHAYLGELVFKPDCTINEEKTTSPFPVFFVEIDIHLGKQELFRWIKERQRITHRSFFFFPSNYSNEVAKLTWNKLTFVVSRVDVTEARNAERIVRHWLGMDMYQGKKNEQHKQMLIQILIQSMKNEQLFKEDEKASTKLLYAAEFTNRLSRLIETEEMLSEETNHLFAKVLKELGNESFPID >CP029806|25239:33123|25239_26187_+|AWU56450.1|integrase|DBSCAN-SWA MNETISLEETLEDFSAYLNEKGRKYSTIQRYAYDIKDFYRWLEINKMLLHIKSWNELSQEIYQAYFSELEHKRKYSQKTRHRIWVVLKKLHTFLGIVSPLDGIHLSLIPDQSLSDSDFITELEETLLKQTVLSTKGLTERQAKYRPLIMDRNACIINLIVNYGLSLQELVSLNMSHIQFARNILIVPGENKLTRSVSLTMEDTQQLYKYYTTIPEPVRPQQHTNNPLFVAFDFNRGTFRWVYENDAPKALSEVAIQKMIRLEVKRAELDRRISAQQMRNTFILRLIRQGVTEKDLVSMMGFKTKISLKRYYQYLQ >CP029806|25239:33123|26781_28278_+|AWU56452.1|DBSCAN-SWA MAKPKKDCFIIELKLIVDTWQKDILLKRFEIARKLYNTTLSYAMKQYTLMKEAKAYRKQLHCYQKAKKANHPKEWKEISKDLDSIRQSFGLSEYQLHAYIKKHQHNYKKHIDSNTSQKIASTVWKAMQDVIFKGTKTHFKPFGMLHSVEGKSNKAGIRFKENRVYWNGLHLPVRFRKNDLFIEESLALHKIKYCRLVKKVIRGKDTFYLQLIMGGMPPTKRINKTGAFRHSYQKKKRVGIDIGPSTIAIVSEETVSIQQLAPDVPLFEREKRRLLRKLDRSRRSTNPNNFNTNGTIKCGIKLHWTCSKNYQKTKSLLNELYRKKAAYIKEKHGALANSILSLGDELYIETMHFNGLAKRTKETKTNQQGKFQSKKRFGKSIGNHAPAMLVEIINQKLKYGKQEIQKVNTITFRASQYNHVTNSYEKKKLHQRWSQIGNYLVQRDLYSAFLLMNSDATLKQTNQEHCIETFDTFVKLHHQHIESLQQTNKKYPLSMGII |
7 | Bacillus_phage(33.33%) | integrase | attL 14544:14558|attR 30439:30453 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
98262 : 98550
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029806|98262:98550|DBSCAN-SWA TATGAAGGGACGTTTTGCAAATGTTAGAACAAAGAAGCAAGTTGAATTCATAAAACGTAGATATAAAGAAGCATATCAAACGGTAATTGGTGTGATGGACGGATTAAAGGTAGGCGACAAGGTAGTAATACACACTTGCTTAGAGTCAAAGCGTTATGACGGAAAAGTATGGACTTGTAGGACAAATCAGTTTACAGCAGAGAGTGGCACGCAAGTGGTTTTTCTAGAAGGGTTTAGAGGGTACTTTGCAGTTAAGTTTTTACAACGAATTAGTTTGTTAGAAAACTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029806|98262:98550|98262_98550_+|AWU56509.1|DBSCAN-SWA MKGRFANVRTKKQVEFIKRRYKEAYQTVIGVMDGLKVGDKVVIHTCLESKRYDGKVWTCRTNQFTAESGTQVVFLEGFRGYFAVKFLQRISLLEN |
1 | Bacillus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
111553 : 113799
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP029806|111553:113799|DBSCAN-SWA AGTGAAGATTAGAAAAGCGATTATCCCAGCAGCGGGATTAGGCACAAGATTTTTACCCGCAACAAAAGCACAACCTAAAGAAATGTTGCCAATTGTAGATAAGCCAACTATTCAATATATTGTTGAAGAAGCTGTTAGCTCAGGAATAGAGGATATTATTATTGTAAGTGGGAGAGGGAAGCATGTTATAGAAGATCATTTTGATAAATCTTATGAGCTAGAACAAACTTTATTTAAGAAAAACAAAATAAAGACTCTTGAAGACATTGAATGCATTTCTAATTTAGCGAATATCCATTATATTCGGCAAAAAGAACCTAAAGGATTAGGACATGCTATATATTGTGCTAGACGTTTTATAGGTGAAGAACCTTTTGCAGTTTTACTTGGTGATGATATTGTTAGCTCTACGTATCCATGTCTCAAGCAATTGATAGATGTTTATGAGGAACATCACTGTTCAGTGGTAGGTGTTCAAAGGGTATTAGAAACAGAAGTGTCTAAATATGGAATAGTTAAATCGGCAAATCAAAATGTTAATCAATCTATTATTCCTATTTCTATGCTAGTTGAAAAACCACCTCTGGAAACTGCACCTTCAAATTTAGCTATAATGGGCAGATATATACTAAAACCAGATATTTTTGAGGTGTTAAAAAATTTACCTGTCGGATCAGGTGGAGAAATTCAGTTAACCGATGCAATCAATGTTTTAAATAAACAACAAAAAGTACTCGCCTTTGAATTTGATGGGAAAAGATATGATGTAGGGGATAAATTTGGCTTTATTAAAGCGACTATAGATTTTGCACTTCAGAGAGAAAGTCTAAAAGAAGATGTTTTGAGTTATTTGAGAAATATCACTCGAGATAAACTTATCAATAAATAAAATATGTAAAAAGTGAGGAAGTCTTAATGAATATATCTATAGTAGGAACAGGCTATGTTGGCTTAGTAACAGGTGTGTGTCTATCAGAAGTAGGTCATAACGTCACTTGTATTGATATAGACGAAGAAAAAGTAAAAAAAATGAAATTGGGTTATTCACCAATATTTGAGCCATGTTTAGAGGAATTAATGAAGAATAATATTATAAAGGGAAGATTACATTTTACAACTAACTATGTTGATGGAGCTGATGGGGCAGAAATTTTTTATATTGCAGTTGGTACACCACAAAAAGAGGACGGTTCAGCCGATTTAAGCTTTATTAAGCAAGCAGCTATTAATATTGCTCGTACAATTAAGAATGATGTTATTATTGTGGTAAAAAGTACCGTGCCTGTAGGCACCAATATATATATTAAGAATCTTATTTTGAAAAATTTAAATTATGATGTAAAAGTAGATATTATTTCAAATCCAGAATTTTTACGTGAAGGTTCAGCTGTAAATGATACTTTTTATGGGGATCGTATTGTAATTGGATCGGAAAATAAAACATCGGCAAATGTTATGGAAGAAGTATATAAACCCTTTGGTACACCAATATTCAAAACAGATATCCAAAGTGCCGAAATGATAAAGTATGCGTCTAATACATTCTTAGCCACAAAAATTAGTTTTATTAATGGGATAGCGAATTTATGTGAAATGGTTGGAGCAGATGTGGAAAAGGTAGCACAAGGGATGGGACAAGATAAAAGAATTGGTTCTCAATTTTTAAATGCAGGAATAGGATACGGTGGATCATGTTTTCCTAAAGATACACATGCGTTGGTTAAAGTTTCTGAAAGTTTACAACATAAATTTCATCTTTTAGAATCTGTTATTAAGCTGAATAAAAATCAACAAACAGTTTTGATAGAAAAAATAAAAAAACGTTTTGGAAGTATTGTTGGCAAAAAAATTGCTTTATTAGGACCTTCTTTTAAACCGAATACGGATGATTTAAGAGAAGCTCCCTCTATTCCCATAGCAAGAAAATTAGTAGAAGAAGGTGCACAGGTGATTGCATATGACCCAGTTGCAATTAAGAACGCGCGAGAAGTGTTGCCTAAAGAGGTACATTATGTATATTCTACTATGGAGGCTCTTACTGAAGCAGACATTGCCTTAGTTCTAACAGAGTGGGATGAAGTGGTCGATTCTTTACTATTAAAAGCAAGTCAATTAATGAAAGAACCCGTAATTTTTGATGGTCGAAATTGTTTCGAACTTAATGAGGCTAAAAATTACGATGTTGAATACCACTCGATTGGAAGACCCTCAGTTTTAAGAGAAGTAAAAGGAGAGATAACAGCTTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP029806|111553:113799|111553_112441_+|AWU56521.1|DBSCAN-SWA MKIRKAIIPAAGLGTRFLPATKAQPKEMLPIVDKPTIQYIVEEAVSSGIEDIIIVSGRGKHVIEDHFDKSYELEQTLFKKNKIKTLEDIECISNLANIHYIRQKEPKGLGHAIYCARRFIGEEPFAVLLGDDIVSSTYPCLKQLIDVYEEHHCSVVGVQRVLETEVSKYGIVKSANQNVNQSIIPISMLVEKPPLETAPSNLAIMGRYILKPDIFEVLKNLPVGSGGEIQLTDAINVLNKQQKVLAFEFDGKRYDVGDKFGFIKATIDFALQRESLKEDVLSYLRNITRDKLINK >CP029806|111553:113799|112467_113799_+|AWU56522.1|DBSCAN-SWA MNISIVGTGYVGLVTGVCLSEVGHNVTCIDIDEEKVKKMKLGYSPIFEPCLEELMKNNIIKGRLHFTTNYVDGADGAEIFYIAVGTPQKEDGSADLSFIKQAAINIARTIKNDVIIVVKSTVPVGTNIYIKNLILKNLNYDVKVDIISNPEFLREGSAVNDTFYGDRIVIGSENKTSANVMEEVYKPFGTPIFKTDIQSAEMIKYASNTFLATKISFINGIANLCEMVGADVEKVAQGMGQDKRIGSQFLNAGIGYGGSCFPKDTHALVKVSESLQHKFHLLESVIKLNKNQQTVLIEKIKKRFGSIVGKKIALLGPSFKPNTDDLREAPSIPIARKLVEEGAQVIAYDPVAIKNAREVLPKEVHYVYSTMEALTEADIALVLTEWDEVVDSLLLKASQLMKEPVIFDGRNCFELNEAKNYDVEYHSIGRPSVLREVKGEITA |
2 | Bacillus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
124283 : 124616
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP029806|124283:124616|DBSCAN-SWA CATGGAATCTCGAGGGTTTATTTTTGGTTGCCCAGTTTCATATGCTTTGGGAATAGGTTTTATACCGGTTCGTAAATTAGGGACCCTGGTTGGATTTGATAATGAGAACGTAAAAGATATTCTAACAATAAATAATGATGCGATTAAACCAGGGCAACGTGTGTTAATTACTGATGATGTGTTAACTACTGGAAGAACTATTGAAGCAATTATCAAGTTAGTTGAGGAGGCTGGTGGAATTATATCGGGAATCGTATTTCTAGTAGAACTAACAGACTTAGATGGCCGTAAAATGTTAGATGGTTACGATGTATTGGTTTTGGGAATAGATTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP029806|124283:124616|124283_124616_+|AWU56531.1|DBSCAN-SWA MESRGFIFGCPVSYALGIGFIPVRKLGTLVGFDNENVKDILTINNDAIKPGQRVLITDDVLTTGRTIEAIIKLVEEAGGIISGIVFLVELTDLDGRKMLDGYDVLVLGID |
1 | Klosneuvirus(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
132110 : 135811
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP029806|132110:135811|DBSCAN-SWA TTTATTTCTGTTTTATTCTATTTTTCCGTAGTGGTCGTAAGTTTTCAAAATTCAATTCTTGATTTAAATTCCAAATATAATCTCCTGTAAGTGCGATATGTTCCCAGCCTAATGGAGAGATGTGCTGAATATATTCCTCTGGAATATGAATACCATTATTCCGTAACGTTTCAATTGCACGAGAGATATAGATAGAATTCCAAGTTACAATCGCAGAAATAATGAGTTGAAGTCCACTTGCACGATGCAATTGATCTTCATAGGATCGGTCACGAATTTCTCCTAATTGATTAAAAAATACAGCTCTAGCCAAAGAATTTTTACTTTCGCCTTTATTTAATTCAACCTGAACTTTTCTTCTGTGCTCAGGATCTTGTATCCACTTTAACATATATAAACTTCTTTCTATTCGGCCGATTTCACGAAGTGCGATACATAAACTATTCTGTCTAGGGTAAGATGATAATTTTTTTAAAATCAGGGAAGCTGTAACTGTTCCTTGTCGTACAGAGCTAACTAAACGTAATATTTCATCCCAATTTTCACGTATTTTCTTTACCTGAATTGTTCCGCCAACCATGAAGTTAATATGGTCATATATTGTTGGAACAGATAATGTATATATTTTATGATTATCAATCGTTTTAATTCGTGGTGAAAAGCGAAACCCTAACATATGGCACATTCCAAATATATGATCAACAAAACCCGCGGCATCTGTATAATGTTCTTCAATTTGCAAATCTGTTTCATGATACAGTAGCCCATCAATAATATGTGGTGCCTCTTCTGAGGAACTAATAACTTGGACATAAAATGGATGATATTGATCTGATATATGTGTATAAAAACTTAATCCTGGGTCATGACCATACTTACCATTTACTTGTGCTAGGGGACTGGAAGTCCCACCGGCACGAAAAAATTGTCCATCTGAAGATGAAGTAGTGCCCTCTCCCCAATAGGAAGAAAAGGGTTGTTTATGATGAAAATTTGCAATATCTCCAAGTGCTTTCGTATAGCTTTCATCTCTTATATACCAATCTGCTATCCAAGCTAGCTGAGAATATGAGATATTTGGACAAGCATCAGCCATTTTACTTAATCCTAAATTAATTCCATCTGATAAGATAGCCGCAAATAAAATTGATTTTTCTTTTGGAGCCTTTTGAGTGTGAAGATGAACAAAGTGTTTGCTAAACTGTGTCCAAGTATCTACTTCTACTAATAAATCTGTTAATTTAATACGCGGCAATAAGTCATACACAAGTCGAGTAATTTCTTCTACATCTTCTGGAACCATCTTTTTTAGAGAAGCGACTTGTATTTTATCTCCATATATCGTTACACCTTGCAAATCTTGATTTGCAATTAAACAATTGACTTTTGAAAGCTCTATATCTAATTGTTCAAAGCGTTTGTTTAAATATTTCTCTACATCCTCTGTAAATTCCAGGGGAATTTGTTGTGTTTGCTTCATGTGCTGCCAAGTATGGGGTGGTAAAAGATACTCTTCAAAATCTTTATATTGCTTGCTGCCTTTTACCCACATATCACCAGAACGAAGGGTATTCAATAACTCTGAAAACACACTAAATTCATAGTAATGTCGATTTATTTTATCGTCTTGGTACACATATTTCATCCATTTAGACTTTATAAAATCAGTCGGTACATTATCAGGTATTTTTCGTTTTCCAGATTGATTGGCTTCTTTTAATAGTTCTAATGCTTGTAATACAGTTTGGCTGGTTGAAGAAGCTTTAAACACATATCTATTGAGTAAACGTGGAGCCATTTTACGAAAATGTCCATAATGATTATCGAGCAAATCTAGATAATCAAATTCTATTGGTCTAGCTAAGCTTTCAGCTTCATGTACAGAGTGAATAAATTTCTCCCAAGATATAATAGATTGTACAGCTTCGAAAGGATCTGTTTCTAATTCTTTTGCTTCAATTAATGCTTTTCCTATTTCGACATAAAGTCTAACTTTTTCATTTATTGATTTCCCATCTTTTTGAAATAGTTTATTATGTTTATTTTCTCCACGGTTAAACATTCGTCCCATTAGTTTTGCAAACATATCTAAACCTTGATCAGTTAAAAAAGCATAGATATGGATAAGGAATGCCATGATCGTTGCATATCGTTTCCTCTCATTAAACCTAGATAAATGTTGTATAGAATAACGAGAGCCCTCACGGGCCATTTGTATTAACCTATTCTGATGAATTTCTTTCCCATTATCTAAAGGTAAATCTAAACTTTGAATAAACTCTAATCGATCCAAAATTTCATGAAAATTTTTAAGCGCTATAACACCCGGTGGTTGACGTAACCATGATAAAAGTGAACTTTTTTTCTCTTCATGAGTATAAAGTAATGTATCTAGTTGTTCGTATTGATAAGAAGAAAGTCCTTTCGTTAAATATTTAAAAATTCTTTTCCTAGCGCGTTCTCTTACAGACCAGGCTAAATGTTCTATAGCGTAAACTGCTGGAAGGATAATTTTCCGTTTTCTCATTTCCTGAATAAGAGCTTCTACCAGTAAATACCCGTTTTCAGTTTTCATTGCTAGAGGGAGAAGCCACCGTGCTAATTCACGGTATTCTCTCAGAGTAAAAGTACGTAAATTGTAAAGATTCCGTATTTTATTTACATGCTCTCGCCGTGTGGTATCTCGAGTACGTGCGTAATTTTGTACCTCCCAAGAGGCTACACCTATTTGTTTGGCAAGAAAATTCACAAGAAATTGTGGAATTTTTTCTTTAGCCAATAAAGGCCTCCCTGGAAAACGAGGATAAGAAATTTGAATAGCAAATCCTAATCGGTTATGATCACCACGCTGTTGATTAACTATTTGTAACTCTTCATCAGATAATGTGTAATAGCGAATTAATTCACGTTCATCCATCTGACTAGGAATTTTATAAAAAAATGTTCGTTGTATATCTGTAAGAAGTTCTCTTGTTTTCAATATTGGATTCCTTTCTTCTAAAAAATCAATTATTATCAATAGAGTATACCCTATTGATAATGTTTTGTCTCCTTGATAATAAAGGGTTCACAGACTATCAATAGCACTTATCAAAAATAAAGAGAAAAAAGGTGAAAAAAATGATATATGGATATGCTCGTGTCAGTGCACAAGATCAAAATTTAGATACACAAATTGAACAACTTCTAAAATATGGAGTTGATAAGATTGTTAAAGAGAAAATTAGCGGTGTAAGTCAAGAAAAAATAGAATTAGATGATTTACTTTCTCAATTACTAAAAGGAGATACGCTCGTGGTAACAAGAATGGACCGGCTAGGACGGAATACAATTCAATTACTACAATTTGTTGAACATCTTCGTGAAAAAGGCGTACACTTTGCAGTGTTAAATTTAGGAATTGACACAAGAACTCCAACAGGAAAGTTCTTTTTAACGGTTATGTCTGCCTTTAGTGAATTAGACCGAGAAATGATTAAGGAAAAACAAATTGCTGGAATCAAACTTGCAAAACAAAAAGGAGTTTACCGGGGGAGAATAAAAAAATATACAGAACAACATGCAGGAATGAACCATGCGATTGAATTACGCCAACAAACGAAGAAAACAATTAAAGAAATTTGTGCTATCACAGATGTAAGTCAAGCTGCGTTATATCGGAAATTAAGAGAATTGAAAAAAGATGAAAAGACGATTCTTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP029806|132110:135811|135229_135811_+|AWU56537.1|DBSCAN-SWA MIYGYARVSAQDQNLDTQIEQLLKYGVDKIVKEKISGVSQEKIELDDLLSQLLKGDTLVVTRMDRLGRNTIQLLQFVEHLREKGVHFAVLNLGIDTRTPTGKFFLTVMSAFSELDREMIKEKQIAGIKLAKQKGVYRGRIKKYTEQHAGMNHAIELRQQTKKTIKEICAITDVSQAALYRKLRELKKDEKTIL >CP029806|132110:135811|132110_135089_-|AWU56580.1|transposase|DBSCAN-SWA MKTRELLTDIQRTFFYKIPSQMDERELIRYYTLSDEELQIVNQQRGDHNRLGFAIQISYPRFPGRPLLAKEKIPQFLVNFLAKQIGVASWEVQNYARTRDTTRREHVNKIRNLYNLRTFTLREYRELARWLLPLAMKTENGYLLVEALIQEMRKRKIILPAVYAIEHLAWSVRERARKRIFKYLTKGLSSYQYEQLDTLLYTHEEKKSSLLSWLRQPPGVIALKNFHEILDRLEFIQSLDLPLDNGKEIHQNRLIQMAREGSRYSIQHLSRFNERKRYATIMAFLIHIYAFLTDQGLDMFAKLMGRMFNRGENKHNKLFQKDGKSINEKVRLYVEIGKALIEAKELETDPFEAVQSIISWEKFIHSVHEAESLARPIEFDYLDLLDNHYGHFRKMAPRLLNRYVFKASSTSQTVLQALELLKEANQSGKRKIPDNVPTDFIKSKWMKYVYQDDKINRHYYEFSVFSELLNTLRSGDMWVKGSKQYKDFEEYLLPPHTWQHMKQTQQIPLEFTEDVEKYLNKRFEQLDIELSKVNCLIANQDLQGVTIYGDKIQVASLKKMVPEDVEEITRLVYDLLPRIKLTDLLVEVDTWTQFSKHFVHLHTQKAPKEKSILFAAILSDGINLGLSKMADACPNISYSQLAWIADWYIRDESYTKALGDIANFHHKQPFSSYWGEGTTSSSDGQFFRAGGTSSPLAQVNGKYGHDPGLSFYTHISDQYHPFYVQVISSSEEAPHIIDGLLYHETDLQIEEHYTDAAGFVDHIFGMCHMLGFRFSPRIKTIDNHKIYTLSVPTIYDHINFMVGGTIQVKKIRENWDEILRLVSSVRQGTVTASLILKKLSSYPRQNSLCIALREIGRIERSLYMLKWIQDPEHRRKVQVELNKGESKNSLARAVFFNQLGEIRDRSYEDQLHRASGLQLIISAIVTWNSIYISRAIETLRNNGIHIPEEYIQHISPLGWEHIALTGDYIWNLNQELNFENLRPLRKNRIKQK |
2 | Salmonella_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_8 |
142765 : 145060
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP029806|142765:145060|DBSCAN-SWA TATGAAAAAACGAAAAGTGTTAATACCATTAATGGCATTGTCTACGATATTAGTTTCAAGCACAGGTAATTTAGAGGTGATTCAGGCAGAAGTTAAACAGGAGAACCGGTTATTAAATGAATCAGAATCAAGTTCCCAGGGGTTACTAGGATACTATTTTAGTGATTTGAATTTTCAAGCACCCATGGTGGTTACTTCTTCTACTACAGGGGATTTATCTATTCCTAGTTCTGAGTTAGAAAATATTCCATCGGAAAACCAATATTTTCAATCTGCTATTTGGTCAGGATTTATCAAAGTTAAGAAGAGTGATGAATATACATTTGCTACTTCCGCTGATAATCATGTAACAATGTGGGTAGATGACCAAGAAGTGATTAATAAAGCTTCTAATTCTAACAAAATCAGATTAGAAAAAGGAAGATTATATCAAATAAAAATTCAATATCAACGAGAAAATCCTACTGAAAAAGGATTGGATTTCAAGTTGTACTGGACCGATTCTCAAAATAAAAAAGAAGTGATTTCTAGTGATAACTTACAATTGCCAGAATTAAAACAAAAATCTTCGAACTCAAGAAAAAAGCGAAGTACAAGTGCTGGACCTACGGTTCCAGACCGTGACAATGATGGAATCCCTGATTCATTAGAGGTAGAAGGATATACGGTTGATGTCAAAAATAAAAGAACTTTTCTTTCACCATGGATTTCTAATATTCATGAAAAGAAAGGATTAACCAAATATAAATCATCTCCTGAAAAATGGAGCACGGCTTCTGATCCGTACAGTGATTTCGAAAAGGTTACAGGACGGATTGATAAGAATGTATCACCAGAGGCAAGACACCCCCTTGTGGCAGCTTATCCGATTGTACATGTAGATATGGAGAATATTATTCTCTCAAAAAATGAGGATCAATCCACACAGAATACTGATAGTCAAACGAGAACAATAAGTAAAAATACTTCTACAAGTAGGACACATACTAGTGAAGTACATGGAAATGCAGAAGTGCATGCGTCGTTCTTTGATATTGGTGGGAGTGTATCTGCAGGATTTAGTAATTCGAATTCAAGTACGGTCGCAATTGATCATTCACTATCTCTAGCAGGGGAAAGAACTTGGGCTGAAACAATGGGTTTAAATACCGCTGATACAGCAAGATTAAATGCCAATATTAGATATGTAAATACTGGGACGGCTCCAATCTACAACGTGTTACCAACGACTTCGTTAGTGTTAGGAAAAAATCAAACACTCGCGACAATTAAAGCTAAGGAAAACCAATTAAGTCAAATACTTGCACCTAATAATTATTATCCTTCTAAAAACTTGGCGCCAATCGCATTAAATGCACAAGACGATTTCAGTTCTACTCCAATTACAATGAATTACAATCAATTTCTTGAGTTAGAAAAAACGAAACAATTAAGATTAGATACGGATCAAGTATATGGGAATATAGCAACATACAATTTTGAAAATGGAAGAGTGAGGGTGGATACAGGCTCGAACTGGAGTGAAGTGTTACCGCAAATTCAAGAAACAACTGCACGTATCATTTTTAATGGAAAAGATTTAAATCTGGTAGAAAGGCGGATAGCGGCGGTTAATCCTAGTGATCCATTAGAAACGACTAAACCGGATATGACATTAAAAGAAGCCCTTAAAATAGCATTTGGATTTAACGAACCGAATGGAAACTTACAATATCAAGGGAAAGACATAACCGAATTTGATTTTAATTTCGATCAACAAACATCTCAAAATATCAAGAATCAGTTAGCGGAATTAAACGTAACTAACATATATACTGTATTAGATAAAATCAAATTAAATGCAAAAATGAATATTTTAATAAGAGATAAACGTTTTCATTATGATAGAAATAACATAGCAGTTGGGGCGGATGAGTCAGTAGTTAAGGAGGCTCATAGAGAAGTAATTAATTCGTCAACAGAGGGATTATTGTTAAATATTGATAAGGATATAAGAAAAATATTATCAGGTTATATTGTAGAAATTGAAGATACTGAAGGGCTTAAAGAAGTTATAAATGACAGATATGATATGTTGAATATTTCTAGTTTACGGCAAGATGGAAAAACATTTATAGATTTTAAAAAATATAATGATAAATTACCGTTATATATAAGTAATCCCAATTATAAGGTAAATGTATATGCTGTTACTAAAGAAAACACTATTATTAATCCTAGTGAGAATGGGGATACTAGTACCAACGGGATCAAGAAAATTTTAATCTTTTCTAAAAAAGGCTATGAGATAGGATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP029806|142765:145060|142765_145060_+|AWU56542.1|DBSCAN-SWA MKKRKVLIPLMALSTILVSSTGNLEVIQAEVKQENRLLNESESSSQGLLGYYFSDLNFQAPMVVTSSTTGDLSIPSSELENIPSENQYFQSAIWSGFIKVKKSDEYTFATSADNHVTMWVDDQEVINKASNSNKIRLEKGRLYQIKIQYQRENPTEKGLDFKLYWTDSQNKKEVISSDNLQLPELKQKSSNSRKKRSTSAGPTVPDRDNDGIPDSLEVEGYTVDVKNKRTFLSPWISNIHEKKGLTKYKSSPEKWSTASDPYSDFEKVTGRIDKNVSPEARHPLVAAYPIVHVDMENIILSKNEDQSTQNTDSQTRTISKNTSTSRTHTSEVHGNAEVHASFFDIGGSVSAGFSNSNSSTVAIDHSLSLAGERTWAETMGLNTADTARLNANIRYVNTGTAPIYNVLPTTSLVLGKNQTLATIKAKENQLSQILAPNNYYPSKNLAPIALNAQDDFSSTPITMNYNQFLELEKTKQLRLDTDQVYGNIATYNFENGRVRVDTGSNWSEVLPQIQETTARIIFNGKDLNLVERRIAAVNPSDPLETTKPDMTLKEALKIAFGFNEPNGNLQYQGKDITEFDFNFDQQTSQNIKNQLAELNVTNIYTVLDKIKLNAKMNILIRDKRFHYDRNNIAVGADESVVKEAHREVINSSTEGLLLNIDKDIRKILSGYIVEIEDTEGLKEVINDRYDMLNISSLRQDGKTFIDFKKYNDKLPLYISNPNYKVNVYAVTKENTIINPSENGDTSTNGIKKILIFSKKGYEIG |
1 | Clostridioides_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_9 |
154243 : 155287
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP029806|154243:155287|DBSCAN-SWA ACTAAAACAATGAATTTCCTATATCTATTGTGGCCAAGTTTTGACGTCTTGTACGTTCTCTTAAATAACGTTCCGTCGTCATAATAGACTCATGTCCTAAATAGTCACGTATTTTCTTAAGTTCGACTCCTTTTCCCATCAAATGATTGGCGAAGAAGTGTCTACAGGTGTGGGGAGTTATTCTATGTTTTCGGTAACGCAGAAATGGTAAATTAGTTTCTTCAATTTTTTCTGCTACATATTTTGATAAGTAGTCGGCTCTATAATGAGAACCGTCCGCTTTAGGTAGAAAGGCAGATGAACTAGAGGCATCTAATTCACTTTTCTGTTTTCGTAATTGACGAAGATGACAGAGATCGTTGAGTACATCTTCAAAGATACGAACTTCTCTCGTTTTATTTCCTTTTCCAACTACACGTAGAAGATAAACATTTAAAGAAGGGTGAAATACAAGGTCAGCCCACTTTGCATTTGCGACTTCCTCAATACGGAGTCCAGTAGTTGTAAGTAGGAAAAACAAGGAATACATAAAGAAATTTGTTTTCTTCAATGTATCTAGAATTTCATTCACTTCTTCTGGAAAGAGATCCCGATTGACTAACTCTTCTTTTTTTACAGATACTTTTTTGAGACGACTACTAAAGTTGTCTGAGAGACCATTGTTATCATACACATATTTTAAAAACTGCTGAACCACTGTTTTCTTTCGACGTAATGTGGTGGCCGCATACTTTTTACTTAGTTGATAGAAGTAGATTTCCATCTCATTATGGGATAACTCCTTAATGATTCCGATTGTTTCTTTTATGTAACGAAGAAAATGAGAAAGATCATGCAGATAAAGTTTTTTTGTTCGCTCACTTCTTTTTTTCGTTAAAGAAGGCTCATCGTGTAAAAATAAATAAACTAATGATCCTTCACTTAATTGGGAATAGTCAATATTTCGAATGCCCATGCCCATAATTTTTTCGAAATGACTGCTATCAAAAAAATCCGATTTGGATTTTACAAGTTGATTATTATGTTCGTAATTTATAATATTCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP029806|154243:155287|154243_155287_-|AWU56550.1|integrase|DBSCAN-SWA MNIINYEHNNQLVKSKSDFFDSSHFEKIMGMGIRNIDYSQLSEGSLVYLFLHDEPSLTKKRSERTKKLYLHDLSHFLRYIKETIGIIKELSHNEMEIYFYQLSKKYAATTLRRKKTVVQQFLKYVYDNNGLSDNFSSRLKKVSVKKEELVNRDLFPEEVNEILDTLKKTNFFMYSLFFLLTTTGLRIEEVANAKWADLVFHPSLNVYLLRVVGKGNKTREVRIFEDVLNDLCHLRQLRKQKSELDASSSSAFLPKADGSHYRADYLSKYVAEKIEETNLPFLRYRKHRITPHTCRHFFANHLMGKGVELKKIRDYLGHESIMTTERYLRERTRRQNLATIDIGNSLF |
1 | Bacillus_phage(100.0%) | integrase | attL 146588:146602|attR 157195:157209 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_10 |
159264 : 160497
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP029806|159264:160497|DBSCAN-SWA AATGAGCACACAAATTAAGGTAACACCGGAACAATTAGAACAAGCTGCTAAAACCGTAAAAAATACGAGATCATCATTAGAATATATACATCAAGATTTATACTCTCAAACTGAATATATAGCTTCTCAGTGGAGCGGCGCAAGTAGTGATCGTTTCTATCAGATGTTTAATGAAGCGAAGCCAATGATGTTTAACATTTTGCAAGAATTAGATAAAATCGCAGTAGAATTAGAGCGTGCAGCTGTTAAATTCCGAGAAGCAGATGAATTGTATGGCGGAAATTTAGTTGACTCTGATATTCAAGAAGGGGCTATGTGTGGAAAAATCCCTCCAAAATCGGAAGAGTCATTTTTTAATAATAAGGATTTAAATGCTGCGTGGACTGGTATTTCTACTGGGTTTGTAGATGGTGCAGTGGATGCGTGGGAAGGACTGATATCCTTAGGTGATAAAGAAACCTGGTTGAATATGCGAGATGCGATTGTAAATTATGAGGAAACTATTCCTGCTGCATTGAATGCTCTATCAGATTCATTTGTAAACAATCTTTGGCATGGAGATATGGAAAGTAGAGAACATTATGCAGCTTATGGTATAGCAACGTTAGGGCTCGGGCTTCTAGGTGATAAGGGTCTTAGTAAAGCAGGACAAGTAGGGAAGGGAGCTGCCATTACAGGGTTTACTAAAGGGAAATCACTTGTGACTAATTCTCCGGCATACAGAAATGCATTACACATATTAAATAACTATGAATTTAAAGCTGGAAATCACCTTTCATATGCGGGAGTCGGAAGTATTCAAAAGTACTTGCAGAAAGCAGCTCCATATACTTATGAGGGGCCAAATGGTCCGAAAACAATAAGATTAAGGTTGGGTGAGTTAGCAGGGGACAAACATCCTGTTACAGGCATTCGGTATGATTTAGATGGTTTCCCTATTTTTAAAGCTCTTTCTGAAGTTAAATTAAAAGAAGCTGATTTTAAAAAATCTAGACCAACACATGATAGAATATGTAGTAAAGCATTATACGAACAAATAATGAAAGACCCTAAGTTAGCTGCAAAATTCACAGAAGAAGAAATAGAGTTATTTAAGCTAGGCGAGGTACCAGAAAATTATACATGGCATCATCATCAAGAAGCAGGACGAATGCAACTTGTTGATTATGAAACACATAGGAAAACAGGTCACACTGGTGGATATAAAATTTGGGGGAAAGACAGCGATAAGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP029806|159264:160497|159264_160497_+|AWU56556.1|DBSCAN-SWA MSTQIKVTPEQLEQAAKTVKNTRSSLEYIHQDLYSQTEYIASQWSGASSDRFYQMFNEAKPMMFNILQELDKIAVELERAAVKFREADELYGGNLVDSDIQEGAMCGKIPPKSEESFFNNKDLNAAWTGISTGFVDGAVDAWEGLISLGDKETWLNMRDAIVNYEETIPAALNALSDSFVNNLWHGDMESREHYAAYGIATLGLGLLGDKGLSKAGQVGKGAAITGFTKGKSLVTNSPAYRNALHILNNYEFKAGNHLSYAGVGSIQKYLQKAAPYTYEGPNGPKTIRLRLGELAGDKHPVTGIRYDLDGFPIFKALSEVKLKEADFKKSRPTHDRICSKALYEQIMKDPKLAAKFTEEEIELFKLGEVPENYTWHHHQEAGRMQLVDYETHRKTGHTGGYKIWGKDSDK |
1 | uncultured_Caudovirales_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
166979 : 168065
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP029806|166979:168065|DBSCAN-SWA CATGAGTAACCAAGAAAAAGAAAAGTTTAAAATACTAATTGATAAGCATAAAAGTAAAATGCCCTGGTATATCATAGAGTATGCAGAAATGAAAACAGCCCTCTCCCCCGCTACATTGTATGCTTATATTACTGAATTTGAAAAGTTTCTAAAATGGCTTATAAGTAATCGATTAGCCGTTGAAAACGGTAAGGTGGTCACTAATATATGTGATGTACCAATTTCAACACTAGAAAATCTACCATTAAATGAAGCTAGAACTTTTCAAAGATATCTACAGGGAGAAGGTATTGAGACAAGAGCTATTAACAGAACTTTCTCCGCTTTAAAATCCCTATTCAAGTACTTAGCTCAAAATACAGAGAACGAACAAGGGGAAAATTACATCTCACGTAATGTAATGGATAAAATTGAACTGCATAAGGAGAAAGTAGATGCAGCAGCAAGAGCAGATGACGTTGCAAACATGATATTTAATGAAAAAGATGATGTAGCTTTTCTTCAATTTCTAGCAAATGATTATGGTGAAATGTTGAAGGATATATCACCCAAAAAATATAGTTTTTTTCAGCGTGATAAAGAAAGAGACATAGCCATCATAAGCCTTATTTTAGGCACTGGCCTTCGAGTTTCTGAGGTAGCTAGTCTTACTATATCTAGTATAAACTTCCGTCAGGGGAAAGTAAAAGTGACGCGTAAAGGTAATAAGAGATCTTCCGTATTAGCTACTCGCTCTTGCTTAGATGATGTTCAGGAGTACATTAAGGTTCGTCCTAGTAAATATAACTGCCCTCAAGATGAAGACTTACTCTTCGTAACAAATTATAAAGGGAAATATACACAGTTAACTGTTAGAGCTATACAGAAGTTATGTGACAAATATTCAAGTGCATTTGATGAAAAGCGTAGCCCTCATAAACTACGACACACATATGCAACAAACCATTATAAAGAAAACAAAGATCTTGTATTGCTGCGAGATCAACTTGGCCACACTTCTGTTGAGGTTACAAGTATTTATACTAATATTAATAACGAGAAAAAACGTGAGGCTGTTGATCGCTTGGAAAGAAGACAATTTGAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP029806|166979:168065|166979_168065_+|AWU56560.1|DBSCAN-SWA MSNQEKEKFKILIDKHKSKMPWYIIEYAEMKTALSPATLYAYITEFEKFLKWLISNRLAVENGKVVTNICDVPISTLENLPLNEARTFQRYLQGEGIETRAINRTFSALKSLFKYLAQNTENEQGENYISRNVMDKIELHKEKVDAAARADDVANMIFNEKDDVAFLQFLANDYGEMLKDISPKKYSFFQRDKERDIAIISLILGTGLRVSEVASLTISSINFRQGKVKVTRKGNKRSSVLATRSCLDDVQEYIKVRPSKYNCPQDEDLLFVTNYKGKYTQLTVRAIQKLCDKYSSAFDEKRSPHKLRHTYATNHYKENKDLVLLRDQLGHTSVEVTSIYTNINNEKKREAVDRLERRQFE |
1 | Brevibacillus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
171296 : 172391
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP029806|171296:172391|DBSCAN-SWA AATGATTGTTTCAGTAAAGGGGAACGAGCAAATTACTAAAATGTTAAATGACTGGTATATAGAGATACGTGCCAGACATGTAGGAAAGGCACATAATTTAAAACTTGAGATTGATCAAAAGATACATAACATTGAAGAAGACCAAAACCTACTTTTATACTATGCCCTTTTAGATTTTCGTCATCAATATATGCTTGATAGTTTAAGTATTGGAAAAGATAGTTTTGATAAAGTAGATTCACTGGGTGTACCTGCGGATCAGTTTTTACAATACTACTACCACTTCTTTAAAGCTATTCATTCAAATATTACAGGTGATTTTACATCTGCAAAAGAACATTATAATCAAGCTGAATTACTCTTAAAACATATTCCCGATGAAATTGAACATGCTGAATTCCGTTTTAAATTATCAACTTTTCATTATCATATTTATAAACCGCTTGCAGCAATCAAAGAAGCTACCAAAGCAAAGGATATCTTTAAAAAACATGCAGGATATGAAACTAATATTGGATTATGTGATAATTTAATTGGATTAGCTTGTACTCATTTAAAACAATTTGAGGAAGCTGAAGAACATTTCATTACAGCTATTAATACATTCAAAAAATCTGGTAAAGAAAAGAATATCACGTTTGTACGCCATAACTTAGGTTTAATGTATTCAGGTCAAAATTTATCTGAACTAGCAATACGATACCTCTCTGAAGTAACACAAGAACTCCCTAAAGATTATAAAGCAATTTTTATTAAAGCTAGGGAGCATATGAAAATCGGGGAGTCCAAAGAAACTTATAATCTTATAGTGAAAGGCTTAGAAATTTGTAAAGAGCTAAAGAATGAAGAATACGAACATCACTTTTTAATTTTAGAAAAATTAAATCAAAAGGTCTCTGCTGACGAATTAGAGAAGACAATTAAAACAGGAATCTCTTATTTTAAGAGAGAAAACCTACATGAGTACGTACAGGAATACGCTAAAAAATTAGCAGTTTTATTCCACCAAGAAAATAACCGTTCAAAAGCAAGCGATTATTTTTATCTTAGCCATCAAGCAGAAGAACAAAACTTTGAAAAGGAGGCTTTAAAATGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP029806|171296:172391|171296_172391_+|AWU56565.1|DBSCAN-SWA MIVSVKGNEQITKMLNDWYIEIRARHVGKAHNLKLEIDQKIHNIEEDQNLLLYYALLDFRHQYMLDSLSIGKDSFDKVDSLGVPADQFLQYYYHFFKAIHSNITGDFTSAKEHYNQAELLLKHIPDEIEHAEFRFKLSTFHYHIYKPLAAIKEATKAKDIFKKHAGYETNIGLCDNLIGLACTHLKQFEEAEEHFITAINTFKKSGKEKNITFVRHNLGLMYSGQNLSELAIRYLSEVTQELPKDYKAIFIKAREHMKIGESKETYNLIVKGLEICKELKNEEYEHHFLILEKLNQKVSADELEKTIKTGISYFKRENLHEYVQEYAKKLAVLFHQENNRSKASDYFYLSHQAEEQNFEKEALK |
1 | uncultured_Caudovirales_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
175747 : 178411
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >CP029806|175747:178411|DBSCAN-SWA ATTATTTCTTCTTCTCATATATAAACGTGACTCTCTTCTGTGTAGAGTCATATGTTAATTTAGCATCGAATGATTTCCCTGTTTTTTTCGATACAAATCCTTTTACTGTATCCGTCATATTCTTTTCTAATAATTTCTTGATTTGACTGGCTGTAATTCTTTTTTCAAGTATCATTCCTGAAACAATAAAATCACAACCCCTCTTGTATTGTTCGCATAGATAGTTTGTTTTCCCGATTATGACTCTACTCTGGCATAATGGACATTTACCTACCGTACGATCATCTGTAGTTGGAAATTCAAAACAAATACTAAGATCCGTTTTTAATCGAATCGCAGCTGTGAATTCTCCTTTTTCTCCACTAAAACCATTGATGAAGTCTGTCACATGATTATTCACTAGTTTTTTAATCTGGCTATCGGATAATTTCTTACCTTTAATTTTAGCCGGCAACATAAAATCGCATCCGTTTTGATATTCTGAGCACCCAAAAAACGTTTTACGGTTTAGAATTTTTCCTTTTTGACACTTTGGACACTGCCCTAGCGATAATTCTTCAACTGAAGGCAAATTAAAGCTGACTTCACCGTTAACAAATGCTAGATACGCAGAAAATTCTTTACCATTAGATTTAAAACCTTTTATAATGTCCGTTTTATTCTCTTCAAACAGTTTTTTAACTTGTGCTGTGGGAATCGTTTTTTCCTTTACTCTTTTGGGTAATCCCTTGTTACAGTTCGGGTGATTGCTACACCCGAAAAACTTTCCTCTATCTAAGATTATTCCATTTCCACAAGGGCATTGGCATACTTCTATTTGTTTCTTCCAGGTCTCTATTAGATTATACGAAACTGTGTCAGGGATTCTTATAATCTCTTGTGTTATTTTTTGTACAAACGCATTTGTTTGTGCAATAAAGTTCTCATAACTCATTTCATTCTTTTCAATGCGATGTATCATTCCTTCCATTTCTGCTGTGTACAACGGATCTTTAATTTGCTGAACGGGAAATTGTTCAATAAAGGCACGGCCAATTGGAGTTGTTATAATTTTCCCCTTTTCAATGTCTATAAAGTTCTTCTCGTGTAAAACGGGAATAAAAGCCGCTTCCGTTGCTACGGTTCCAATTCGTTTTCCTTTCATCAGCTCTTTTAAATGTTCATCATCAATTTTACGACCAGCCGTTTCCATAAAAGTAAGAATTGAGCTTTCTGTGTGTAGAGCTGGTTTCTTTGTTTTGGATTCCTGTAACTCAAAATCATAGATTTGAAGTTCTTGTCCTTTCTGCAGGATAGGAACTTTAAATGTTTCCACACTTTCTTCCTTTACTTCCTCTTGGAACACTTCTAGGAAACCTTTTTCTCGAAGCACACTTTCTTTTATTTGATAAGTATTTCCCATTGCATCAATAAGGGATACATCTCTTACCAGGTACACTGCAGGACGCATGAAATTGCCCACAAAACGTTTTACCACGAGGCTATATAGTTGTTTTTCAATCTCTGGACGACCTTCCTCTTGATATTGTTTAGTCGTCGGTATAATGGCAAAATGGCTTGATACAAGATCATCATCAAATGTTTTATGTTTTATATCAATGGCGTCAATATCGACGGATTGTACCAGTAAAGAATAACGACTCTTAGCTAGCGCCTGCATAACACCTTTTACCCGATCCACTTGTTCTGTAGGTAAATGCCTAGACGAAGAGCGTGGATAGGTTATGAAACCTTCTTCATACAAGTTCTGAATGTGTTTTTTTGCAGTTTCAGCATTAATTTGTAATTGTGCATGGGCGTCTTTGTACAAGTCCGTTAAGTTGTATAGCAATTTAGGATTTTGTTTCCTAGTGCCCTCTTTAAAATCCTCAACCGTGAGATATTGATCTTTTAGGTTCTCCCCCAAACTTTTTAATGGAGATGGGTTTAACACCTGGTCTTCTGTTTTCATAACTGGTTTAAGTCCTAAATCTGTTATTAGCTGCAGATGATAATAAGATTGCTCCCTATAGTTTTCAATCGCTAACTCCCGCTGGCGTATCTCATGTAGCAAACACATTTGTACACGTCCAGATGACAATAAGAATTTATTTTGTGCTAATTTCGTGGTACATCCCCTGGTTATATTCATACCTAATAGATAATCCAAATACTGCCTTGCTTTAGCAGAATAAGCTAGTCCATCATACTTAGACGCGCTTTCTAATCGATTGAGAGCTGCTTCTAGTTCTGCAGCTTCAAAGGAGGATTTATATACGCGAGATTGCTTTTTATTCACCCCTGCGTATTCGTACACTTCCCTATAGATTAACTCTCCCTCGCGGTCCGCGTCACAAATATTCACGGCATGGTCAACATCAGGTCGCTGTAACAGTTTAACAAGTATTTGTAGTTGCTCTGCATTCTCTTGTATCACCTTATACGATGGCTGAAAAATTAAAGGTAAATGCTCTAACTGAAACAACTTATACTTTGGATCCATCTCTTCCGGATTTTTTAGTTCAAGCAGATGTCCACGGCACCAACTGACAATATAATGATCATTTTCATAATAACCGTAATAAGGTTTGCTACCAATGTACTTTTGTGAATGACGGAAGCGTGGCGATTTCATAATTTCATTGGCCACTTTTGGTTTTTCTGCAATAAATAACGTTTTCCCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_13 >CP029806|175747:178411|175747_178411_-|AWU56573.1|DBSCAN-SWA MGKTLFIAEKPKVANEIMKSPRFRHSQKYIGSKPYYGYYENDHYIVSWCRGHLLELKNPEEMDPKYKLFQLEHLPLIFQPSYKVIQENAEQLQILVKLLQRPDVDHAVNICDADREGELIYREVYEYAGVNKKQSRVYKSSFEAAELEAALNRLESASKYDGLAYSAKARQYLDYLLGMNITRGCTTKLAQNKFLLSSGRVQMCLLHEIRQRELAIENYREQSYYHLQLITDLGLKPVMKTEDQVLNPSPLKSLGENLKDQYLTVEDFKEGTRKQNPKLLYNLTDLYKDAHAQLQINAETAKKHIQNLYEEGFITYPRSSSRHLPTEQVDRVKGVMQALAKSRYSLLVQSVDIDAIDIKHKTFDDDLVSSHFAIIPTTKQYQEEGRPEIEKQLYSLVVKRFVGNFMRPAVYLVRDVSLIDAMGNTYQIKESVLREKGFLEVFQEEVKEESVETFKVPILQKGQELQIYDFELQESKTKKPALHTESSILTFMETAGRKIDDEHLKELMKGKRIGTVATEAAFIPVLHEKNFIDIEKGKIITTPIGRAFIEQFPVQQIKDPLYTAEMEGMIHRIEKNEMSYENFIAQTNAFVQKITQEIIRIPDTVSYNLIETWKKQIEVCQCPCGNGIILDRGKFFGCSNHPNCNKGLPKRVKEKTIPTAQVKKLFEENKTDIIKGFKSNGKEFSAYLAFVNGEVSFNLPSVEELSLGQCPKCQKGKILNRKTFFGCSEYQNGCDFMLPAKIKGKKLSDSQIKKLVNNHVTDFINGFSGEKGEFTAAIRLKTDLSICFEFPTTDDRTVGKCPLCQSRVIIGKTNYLCEQYKRGCDFIVSGMILEKRITASQIKKLLEKNMTDTVKGFVSKKTGKSFDAKLTYDSTQKRVTFIYEKKK |
1 | Klosneuvirus(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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