Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029813 | Blattabacterium punctulatus strain CPUbt chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029813_1 | 360727-360817 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029813_1
|
1 spacers
spacers of CP029813_1
>1.1|360750|45|CP029813|CRISPRCasFinder AAAAAAAAGTTAGGTGTCGTGTTATCAAAAGAAGTAAATATTATA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029813_1
The CRISPR arrays of CP029813_1 >merge|CP029813|1|360727-360817|CRISPRCasFinder CAGAAAAAATAACTAAAAAAATTAAAAAAAAGTTAGGTGTCGTGTTATCAAAAGAAGTAAATATTATACAGTAAAAAATAACTAAAAAAAT >CP029813|1|1|360727-360817|CRISPRCasFinder CAGAAAAAATAACTAAAAAAATT AAAAAAAAGTTAGGTGTCGTGTTATCAAAAGAAGTAAATATTATA CAGTAAAAAATAACTAAAAAAAT
>CP029813.1|AWU43232.1|359425_359689_-|YtxH-domain-containing-protein MKKGGNFFLGLILGTIAGLVIGIILSTKKENKMRNILEKKTEELRNNLQKIGKKIGKKVNRIKSDIEEKWKKNKIDKIDKVEEELGT >CP029813.1|AWU43231.1|359092_359410_-|hypothetical-protein MFTFIKNLINKKLNFFKNEAIKIIVSIMTEIFLNFCLLIFFIMIIFLGSFYLSFFLSYYFGNYILGFGIITILYIFLLFFIFFFCKDFIRFFIKDSFFKIFDKKK >CP029813.1|AWU43466.1|358329_359085_-|23S-rRNA-(guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase-RlmB MSKLKVIYGIHPLIEAIQSKITIKKLFFQIGWEQGANIYKKKLINLSKKNNIQIHSVSKKKFDQWKNKNHQGVFAILSPIKTYHIEDLLPIFYEKGKNPLLLILDRITDVRNFGSIIRTAVCAGVDSIIIPKKDMAMIGSDSIKTSSGALFKVPICKEKNIGKTIEYLIKSGLKIVSATEKSNKYWYDIDFSFPTALILGNEENGISRKYLELSYEKAKIPLIKGISSLNVSVACGIILYEIVRQRKNIIK >CP029813.1|AWU43230.1|357328_358324_+|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-alpha MDKKMDEIKEEIKIFQAKKYEDLEKFRIKFLGKKKGILTILFKKLKTIPIYKRKLYGTIINDLKKKVQEKIQMNHPKNFIKKENTLNFDPTVPGKSIDIGSIHPISILKNRIINIFRKIGFSYVEGPEIENDWHNFTALNFPIDHPSRDMQDTFFLHRNPDILLRTHTSSVQIRYMKKNCPPFRILSIGKVYRNETISSRSHFMFHQAECFSIDRKVSFSDLKKTIQYLIKSLFGEVKIRFRPSYFPFTEPSAEVDIYFKNKNNRGWLEIMGCGMIDPKVLKNVNIDSEIYSGFAFGVGIERIAILIYQINDIRLFFDNDIRFLRQFKSDF >CP029813.1|AWU43229.1|356935_357307_+|hypothetical-protein MKKKFIREFHINWNKVILYIRNNFYIRGKINPIGIIYLIGIQVLGKGKNRFLKKEDKINILHIAICRILEPFGYYVFIGRDREGWPHYLMKKNYSFLKKEEKYFLIKKAIIRYMIEENILDDI >CP029813.1|AWU43228.1|356345_356882_-|CvpA-family-protein MMMITDLIILIIVLYGGYHGYKKGLLSQLFVFMIFFILIYKGIDIFYLVSEILPKKVNSRNKDPFSTSYSIIISFFLIIVIAFLIKKIIEFFFIITWIQPIEKWLGGILGLIKYFFYLSICILLFKEINEKINLIPYNFFKNSFEKEFQYIFSIYRKAPLFFLKKLEELYLQISLNIL >CP029813.1|AWU43227.1|353755_356074_+|inorganic-phosphate-transporter MKIFYPSIIVILFILSIFDLIVGVINDSVNFLNSAIGSKVASRKTIMIFASLGILLGSFLSSRMMEIARKGIFDPSYFYFSDIIFIFLAVMISDIILLDIFNTLGLPTSTTVSMVFCLLGGAFSISMIKISSPLSNEPFHHLSQYIKAEKTLTIGIGIFLSIIISFFSGAFIHYFIRILLSFEYKSRLKYSGVIWAAISLSSMTYFLIVRGLHSNFLQKGYIYDNLSGLSLFIQYFIKWIHHNFFLFLILLFTTWILIAKVFVFLGYNILKFVVLYGTFSLAMAFSGNDLVNFIGVPIASIQSYNIWKEAGSPPAEEFNMKNLSGKVQVPSFVLIFAGIIMILTLWVSKKTKTITKTEINLSRQNEGNEKFLSNSFARVIVRFFLFFGNKFFNLFPKRFLVKIEKNFKQKIKKEENIAFDLVRASANLTISSILISIATVKNIPLSTTFVTFMVSMGTSLSDRAWNRESAVYRISGVLKVIRGWFLTGFIAFTMSGFIAYFLYFIKVWALIFFIFLMILVFYKSYKNYQKIQYQKVEEEKTIFDIIGWITLNKTSESSDLLESMLKSIELIYKNSIEGITQENLKLLKNSRKNFLKVKENFNYIQNSLIRVIKKTKNNDPIFGIIYIRIYNKIKEILESEDIMTNCTLFHVINCHNPLKYNQKNNLLTLEHFMIEYFSIIKKIIMNRNCKYVSKKIKINIIKNIEEQINQQVKGIIHKKYSTKNTLLMLDILIQSKKITENIEDFILLYTNCLSYFSSNRDSSILVLKNIKI >CP029813.1|AWU43226.1|353039_353642_+|Holliday-junction-branch-migration-protein-RuvA MITHLRGKFIEINQSYLIIDCNGIGYYIHISLSTYSSFSTKKEGEEIYIYTYLFIKEHQHVLYGFFDRIERKIFSNLISVNGIGPNSAITLLSSLTPYEIEQSIYNEETEVFKRVKGIGIKTAHRIIIELKDKIGIFSKKEKNVTLLENNTPSIIKKEALSALIVLGFSTKESKKVLEDILEKNPRFTVENLIKESIKKL >CP029813.1|AWU43225.1|351659_352988_+|ribosome-biogenesis-GTPase-Der MSYLVSIVGRPNVGKSTLFNRIIGKKKAIVHVKSGVTRDRIYGNSEWNGIHFSIVDTGGYNPPNNNIDIIDTEIRKQILIALKESDVILFLVDMEIGLLDVDIEISKILRKCKKSILLVVNKVDNGKNLYHDTDFFRLGFNNYYCISAINGSGTGEMLDRLIEILKELVVEKKVEEIGGIPRFSVIGRPNVGKSTLINSFLDKDRHIVTNISGTTRDSIDVFYKKLGYKCILFDTPGVRKKSKISESIEFYSTMKTVRTIKYTDICFLMVDAVRGWESQDRNIFRLIEKNQKGVIILINKWDLLHNNKNCSIKKNFEIFIKKNIAPFDNVPILFISAKNKDGLYNIIPIAYHIFRKRKKRLKTNLLNRVMFPIFKKNPPPSINKKLITIKYCTQLPTYTPKFIFFSNYPQYIKESYKRFIENKIRYHFDFIGVPIQIFFRKK >CP029813.1|AWU43224.1|350911_351574_-|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MRIDIVSVIPEILKSPFSNSMIQRAINKKILEIYLHDLRKYGLGKRKKVDDYPYGGGSGMVIRIEPVYRCFHKLFSERDYDEKIFMTPDGNIFSQKYAYEFSCKKNIIILCGRYKGIDQRIRDHLISKEISIGPYVLSGGELAAAVVVEAVTRLLPGVLNNPDSMITDSFQIKSINSPPLYTRPILYKGLSVPKILVSGHHKKIKNWFYEKSILKKKIDS >CP029813.1|AWU43234.1|360938_361742_+|purine-nucleoside-phosphorylase MSITLEEKSTKYIQKKIQKKPDFGIILLENQFNKLVEKIKNPIYISYEEIPNFNKKKLYGKFIFGEIENKKIIFSIEPFYENEKIPFSIIIFKNIGVDKLILINISGGINPNYKIGDFMLVKDHINFLPENTKIIKFIEKNNKYFCITELYDQKMLEIAENIAMNHNIIIQKGIYVTFPYPNYKTYAEHAMIRSMGGDSIGMNTISYIITARCMNLRVFFISMIVGLYENKDSYSNSINFMNPFVYETEKSLPILILIFKDFIKLCS >CP029813.1|AWU43235.1|361758_362796_-|ATP-binding-protein MKQKISKALENVFILENKKNIIESGIVKKIDVFKDEIRIHISLYNPTMHIKKKLKKDILQSIKYQNLDKKKIFLKIEIQLKNTDKKISGIKNILAVASGKGGVGKSTIATNLSVSLVKMGFNVGLLDADIYGPSIPLMFNLEEDKIQSSILKKKNNSYVMNPITSYGVKIISLGFFSKSGEAVVWRGPMATKALRQFIHNTDWGNLDFLIVDLPPGTGDIHLSILQDIPLKGIIIVSTPQKISLSDVHRSVAMFRIKSIQVPILGIIENMSFFIENKTKKKQYFFGKNGVKNFSKKMNIFFLGEIPMLQEIREYSDLGVPVVLENDQIRKIFEKITKNIINKLSK >CP029813.1|AWU43236.1|362907_363543_+|phosphopantetheinyl-transferase MFILNKFNHIHTKIIVFRCKHLKTMLLEKFIFSDKERKFFLSLSEKRKKEFLGVRYALRYIGINMNLLYNEKRKPFLFPTKGKYISLSHSFELISIAISSYPIGIDIEKLRKDQKIIKIKKKFVRNDESVFIHPNYEEDYLHIIWGIKESLYKLEGGESSNFLNHYKVSPFFIKKDSCISCWIIKNSYSKRFSAFYRKIDNHYLVYIIDDK >CP029813.1|AWU43237.1|363557_364175_+|nicotinamide-mononucleotide-transporter MNEWINIFLSPYHNKSWGDIILELTAVILSIFSVIFAQKNNIWLYPIGIFSTIIYSYLTFIYFLYGDFIINIYYTGMGFYGWYLWTYKKDKKKQKIPITYSNKKDYFYTALFFLSTCIFSITVYFFNGKLNNNFDWMDVLTTGIFFSGMYQMAIKKVENWIFWLVGNLISIPIYFFKGLILTAFLFIFLAVLSIIGYVLWNKKAY >CP029813.1|AWU43238.1|364219_365638_-|histidine--tRNA-ligase MKNPSIPKGTRDFSSIEMNRRNYLIQIIRNKFELFGYYPIETPSFENISTLIGKYGQEGDTLMFRLLHSGNFLKKGISDFLMKNKETKVDIFKKLLTEYISNKALRYDLTVPFVRYVVMHRNEIFFPFKRYQIQPVWRADKPQRGRFREFYQCDADFIGIESLSLWSEIELIKLCDEIFTKLNFPIIIHINHRDILGGLVEISGIKNNLWKDFTISLDKWNKMGKNIVKKEMLRKGISSESFEKIAFFFDMKENFYKKIESLTFALKNSKKGKKGIKDLSFIFRKIKNISLKNTKLEWNISLARGMNYYTGTIFEIFPKYNKESSHLNSIGGGGRYDQLSSFFGMKNFSGVGVSLGLDRIYLSMIKENLFHNISSSPSKILFINFGDEEVLYAYNMINFLRKKGISTQLYPNAVKINKQFRYANDNNIPFTISIGKNEIEKNKIRVKNIKKRVEIEYDNINDFFHQLSKDSF >CP029813.1|AWU43239.1|365682_367071_-|cell-division-protein-FtsZ MKKENFIQKKENVPFGFSKNRSASIKVIGVGGGGSNALSYMFEQGITGVDFIACNTDAQALNNNPVPLKIQLGASITEGLGAGADPEVGEKAALESLEEIKSILDSNTKMTFITAGMGGGTGTGAAPIIAGISKEKGILTVGIVTIPFHFEGKMRLQQAQKGIETLRKNVDSLIVINNDKLRELYGNLGFKAGFSKADEVLTTAAKGIAEVITHHYKQNIDLRDTRTVLKESGTAVMGSSISVGENRAKEAVVQALDSPLLNDNKITGAKNVLLLIVSGKIEITIDEIGIISDYIQAEAGNNANIIMGIGEDENLEESISVTIVATGFPTEVQRVINHEEKKIFHRLEEPYKQRLTKIEEIPSYFNSKRIESIASKKKDIYNNKMDSSINYNKGKFSLNLNQKKNIINHPSSSLVEKKYKRYMLEDNFNIPISYEEKNKILKNNQMKLTNKIIIKKENNKHE >CP029813.1|AWU43240.1|367074_368433_-|cell-division-protein-FtsA MEYQDIAIGLDVGTTKIVAMVGRINEYNKIEILGIGRSKSTGVHRGVVNNITQTIEAIREAVNEAEHSSGLKIKEVIVGIAGQHIRSLQHNDYITRLDFENVINQKDIQKLINQVHKLVMLPGEEIIHVLPQEYKVDSQSEIGEPIGMYGSRLEANFHVVVGQISSIRNIGRCVKAAGLNLSGMTLEPLASAEAVLNIEEREAGVALVDIGGGTTDVAIFKDNIIRHTAVIPFGGNVITENIKTDCLIIERQAELLKIKFGSAWPGENKETEIVCIPGLRGRDPKEITLKLLSKIIHTRVCEILEQVNIEIKNYGNEEQKKRLIAGIVMTGGGSQLKHIRPLTEYITGMDVRIGYSNEHISGGENGMISDPEYATSIGLVIKGIEDKKKYICTEMESRYYDETSEFFSSKLYDKNRRFNNNKEQEDKKNKKKSKSFLEIWADKFRQILNDTE >CP029813.1|AWU43241.1|368437_369169_-|cell-division-protein-FtsQ MRKHQKNFIPTLLFLYMIFMIFFFYFSQKVHKNRNLEKINIIMEPLSKNHFINEKIIKNFLFSKTEKIEKKIGQLCILKMEQKLNNYPFIKKSEVFLSADGTLNIKIWQKEPILRIKNGNKEYYLTKELENLGLSSFYSSKVILAKGYFSKEEKKYLSDLVKTINSDELLKNQIISIKKTVSNLFILIPKIGNHHIILGNLKDFKSKLNKLKAFYKQYLNKIDINQYKSIDLQYKDQVVAKKR >CP029813.1|AWU43242.1|369184_370561_-|UDP-N-acetylmuramate--L-alanine-ligase MNLNQIDAFYFLGIGGIGMSSLARYFHYMGKKVYGYDRYKTFLTKKLEKEGIFINYQDNIEMVPEWIHSQRCLIVYTPAIPSTHKQWIFIKKYGKNIKKRSQVLALITENKICIAIGGTHGKTTTSALLGHILYNSGKKVTAFLGGISENYQSNLILNGTEIFLVEADEFDHSFLYLSPNIACITSLDQDHIDTYPKKESLIKAYIKFSNKLKNPYKKLFLCKEEYFPYSNKNAIYYSVGKIGNYYSNCISIKGDKWYFDFHTPKETWKSLLLPIPGLHNLKNVTAALAISDYLKIDSENIRKSLFLFKGIKRRYSIHYQSKKKIYIDDYAHHPTEINALISTIRKCFPSKKILGIFQPHLFSRTKFFEKKFAKSLEKLDFLILLDIYPAREFPIEGISSNSLLEKIKMNSKNKEVTSLSRVLEKIGKKNFDVLLTIGAGNIDTLIFPIKKWLYKKYG >CP029813.1|AWU43243.1|370565_371684_-|undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide-beta-N-acetylglucosaminyltransferase MKNTFLPRIIIGSGGTGGHIYPGIAIADELKKQIPKVNILFIGSKNNMEMQEIPKFGYKIEGICISGGKDKFFSISGFFIQSIELVYSYFLAKKILKKFSPDIVIGTGGYVSFPTLYAAKKKKIPIVIQEQNSFPGFTNRIFSRYAQKVCIAFEESRKYFPKGKTIITGNPVRSEILKKFPSRNKACHYLGLKKNRSIILSMGGSQGSNSINNAWMNGLKKLIHFDIQLIWQVGKSNIHRIKKNNPLSNHKNFIVMEFIENIPICYAAADIIVSRAGALTISEICLIGKPYILIPFPWSSDDHQNKNAKILEEKEAAIIIKNEEIEKKLVDSTIQILNDSDRKKKMRKNILQLGKPQATNDIVNEILHILLG |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
457885 : 474168
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029813|457885:474168|DBSCAN-SWA 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12 | Synechococcus_phage(20.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_2 |
489603 : 500007
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP029813|489603:500007|DBSCAN-SWA TTTAATAAATAAGTTTATGTATTATAATTTTTGATTTTTTTAAAAAATTTAATCCATCATTTTTTTCGGAATATTTATGTAAATATACCACTCTTTTAATTTTAGATTGATGAATCAATTTACTACATTCTTTGCATGGAGAATGTGTAATATATAAATACGAATCTTTACAAGATTTTGAAGAAAAAGCCATTTTTAATATAGCATTTGCTTCTGCATGTAAAACATACCATTTAGTATTTCCATTTTGATCTTCACATATATTATCAAATCCACTTGGAGTTCCATTATATCCATCGGATATAATCCGATGATTTTTTACTATAATAGCTCCTACTTTTTTATTTTTACAATAAGATAATTTAGAACATTTTATGGCTTTATTCATATAAATTATATCCTTTTTTTTATAAATTTCACAATTCATTATAAAATATTTTATGGAAAAAAAACATGGGTTACGTAATATAAAAATTAAAAATTTAATAAAGATTTATAAAAAAAAAAAGGAGAATAAAATGTTCCTTGTTGAAGGAGTCAAAGAATTTGAAATGGCTATAATAGGAAATTATAGACCAATAGGAATATTTATATGTAAAAATATATTTTATCAAAATAATATGATAAAATCCTTTCATAAGATTGTATTTTTTATTAATATAAAAACTTTTCAAAAATTAGCATGTAGAAAAAATTCAGGTGGAATAATTGCCTTGTTTAAGGAAAAAAAAATTTCTAGTTTAGAAAGTATAAAAGTTCCTAAAAATCCTTTTATTCTTATATTGGATGGAATAGAAAAACCCGGAAATTTGGGATCTATATTAAGGACTGCTGATGCAGCAGGAGTACATTTTATTATATTATGTAATACGAAAACATATATTTTTAATCCTAATGTAATTAGATGTAGTGTAGGATGTGTTTTTACAAAAACAATTTTTATAGAAAAAATAAAATCAATTATTTCTTGGTTACAAAAAAAAAAAATAGAAATTGCAGTAACAGGATTCCATAATAAAAAATCTAAAAAATTATATCAAACTAAATTTTCTTCACATTTAGCTATTGTTTTAGGTTCCGAAAGCAAAGGAGTATCCAATATATGGTTTAATATATCCGATAAAATAATAACGATTCCTATGTTTGGATCTATCGATTCTATGAATGTAAGTAATGCAACATCTGTAATTATCTATGAAATAATTAGACAAAGAAATACATATAAGTTTTCTAAATAGTTTTTTTTAAATTTTCTTTTTCATATACATGATCTATTTTCAATTTTTTATTTTTGGATGCTTCTACAGATAATCGATCGCAATAATCATTAATATAATGAAGATAATGACCTTTAACCCATTGAAAAATAATAAAATGTTTATGAAATAAATTTAAAAATCGTATCCATAAATCCACATTTTTTTTTTTTTTAAAGTTATTTTTTTTCCATTTAAAAATCCAATTTTTTTGAATAGAATTTATTATATATTTAGAATCAGTAAAAATAATAATATTTTGTTTTTTTTTCGTAATTTTTTCTAGACCAACTATTATAGCTAATAGCTCCATCCTATTATTGGTTGTATAACGAAATCCTTCGGAAATAATTTTCCAATAAGACGTTCCTGCAATTTCTATAAAAATAGCATATCCTCCTGGACCAGGATTCCCTTTAGAAGATCCGTCAGTGTAAATATGAATTTTTTTATTCACTAAAATATCTGTTTATTTTTTTCACGTTCAAATTTTTTTAATTGAAATTGTATTAAATTAAAACATTTTTCTTTTAGAAAGTTTTTGTCTTTTAAGGATAAGTTTTTTGTTAAAATAGAATGGTGTTGTTTGATACGTATTTTTCCAGGTCCTCCTTTTATAGGAGATCTAGGAAACTTTTTTTTTATATCAGCTATAGTAAATGGAATAATCGATATATTTTTTATTATGGCTATATAAAAAGCTCCATTTTTAAAATGATCTAAAAAAATAGAGGGATTAGGAACTCCACCTTCTGGAAAGATACAAATACTTTTTCCAGAATCAATTTTTTTTTGGATTTGTTTAAATACTTGCATACAACTAGACAAATTTTTTCTATTTATTAATATATTACTTCTTTTATAAACAAATCCGAAAAAAGGAAGTTTAGCTAATTCCGCTTTTCCTACAAAAACTAAAGGATGATTTCTCATCAAAGAATAAATCAACATAATATCCATGATAGAACTGTGATTGCTAATAATCATATATTGTTTTTTTTTATCTAAAATTTCTTTATCTTTTTCTAATACATACCAAAAACCCATAAGAAAAAGATTACTTCTAGCCCAAATTTGGTAAAACCAATATGCTATATAATAATATTTCTCTTTAAATAGAAATGGAATCGAAGCTCCTGCTAATAATGGTATTAGAAATATATTTATTATAAAAAACCATACACGCCATAATAATATTAATGATACTTGAATAATTTTCATTAATTAACGAAATTTATCAATATATTGTAATTCATTCATATGATTTATCATAATGTATTTTGTTTTTATTTTTTTACTTTTTTTAAGATAAATTTTAAAAAATTTAAAACTTTTTTTTTTATGTTTAAAAAATAGTTCAAGAAATTTTTTTTTATAGATTTAGTTAGCGCGTATTAATGCCCTTTTTTTTCTCTTTCTTTATAAGTTTATAAATATTTTTTATTACATTTAGAGATTAGGTAGCTAAAGAAAGAAGAGAAATGGGTATAACGAAAGATCGTTTAAATTTTAAGCCTTTCGAATATCAGTGGGCTTATGAGTATTGGTTTAAGCAACAAAATGCGCATTGGTTGCATACGGAGATCAACATGCAGTCGGATATTCATGATTGGAATGAAAATTTATCAGATCTAGAAAAGAATGTTATTGGAGATATATTAAAGGGTTTTACTCAAACGGAAACAGAAGTGGGCAATTATTGGTCCGAAATGATTCCCAAGTGGTTTCCCATTCCAGAGATAAAAATGATGGGTCAAGCTTTTGGTTCTTTTGAGACGATTCATGCTGTGGCTTATTCTTATTTGAATGATATTTTAGGGTTAGATAATTTTCATGCTTTTTTAGAAGATGAAGCAACCATGAAAAAATTGAAAGTATTGATGGATATTAGAAAAAGTGATCATGGTAAGTATAATAGAAAGGAGATTGCAAAGAGTATTGCTTTGTTTTCTGCTGCAGCAGAAGGAATTCAATTGTTTTCTTCTTTTGCGGTATTATTGTCTTTTAGAAAATCTAATCGTTTGAAGGGGATAGGGCAACAAATTATTTTTTCTGTTAGGGATGAGTCTCTTCATTCGGAAGCTGGGTGTAAGATTTTTCGTACATTTTGTGAAGAAAATGATGGATTAAAAAATTCGGTGGCCGATTCTATTTATTATGGAATGGATTTAGCATTAAAAAATGAATTTATTTTTATTGATCAAATTTTTGATAATGGTGATATTCCAACTATTAAGAGAGAAGAATTGAAAAATTTTATGAAAGATAGAACCAATATTAAATTGAAAGAATTAGGACTATCGGATGCTTATTGTATAGATAAAAATATGTTAGATAACATGAGTTGGTTTTATATAACGATATCTGGAGAACAGCAAACTGATTTTTTTGATAATCGTGAAACAGGATATAGTAAGCCTAATGAAGATTGGAATGAAGATCTTTTTGTTTTGGATGATAAAAAAACTTATAAAGAAAAAAAAATATTAGAAATTCTTTTAAAGAATAAGAAAGAAAATTTAGGAAATTCTGGATGTGTATCCTGTGAGTCTTAGATTATTGGTTATGGATAATTTTGATATAAATTGAAAAGAAAAATTACACCTTGGTACAATACTTTAGGAAAAGAACAACTATTGCATAGTTCTGTTTGTGATTATTTAGATTATGAATATCCGCATATTTTTTATTTTCATCCTCATAATGAAGCAAGAAGAACTCCTTATGAGAGGTTTCTTATAAAAGTGATGAGATTAAGACCAGGTCTTCCGGATATATTGGTTCCTATTCCAAAAAAAGGTAGGACGGGGATGGCTTTGGAATTAAAAATAAAACCAAATAAATTAACAGAAAATCAGATTCATATAATAGATATATTCAATTCGTACAATTGGAAAGTGAATGTTTGTTATGATTTTGACGAAGCAAAGATTTATATAGATCAGTATTTAAAAAAAACCGATTAGTATAATATAAAATGAGAAACAATAAAACTTCCATGCAATATGATGTCATATCTAATGAATGTAGAACTCATTTTTTGAAAAAAAAGTTTTTGATTCCTAAAAAGTTCTGTAATTATATTTTAATTAAAATAGATCAGAATAATTGGATTGAAATTGTTAATTATTCTGTTTTAGCAGGAATAATGATTCAACAAAAAAAAATAGACTCTATGCTTTCGGTTTCTGCTACAAAAATAATAATAGATGTATATGATCAATATATAAAAAAGGCTAAATCTCTTATGGAAAAAAAAAATTCGGATTATGAAGAAGCTTGGAAATATATGAGCATTTCTTCTATTAAAGATTTAATTATGCAAAAAATTTTTAGGATTCAAGGAATGGAAAAACGTTTCTATGAAGTAGAAAATTATGCTTATAAAGTTCAAGATAATTATATAGATATATTGAATTATGCTATTTTTGCTTTGATAAAAATGAAAAATCCATAAAAATTTATTTCTTTTTTATTTCATTCCATTTTACTTTTTCGTATTTGTAAACTATTATTTGCGCTATTCTATCGCCGTCTTTTACAGTAAAAGTATGACTAGATAAGTTTATGAGTAATATTTTTATTTCTCCTCTATAATCTGAATCGATAGTCCCTGGATTGTTTAGAACAGTTATACCATGACGTAAGGCTAATCCGCTTCTAGGTCGTATTTGAGCTTCATATCCTGTAGGTATTTCTATGAAAATACCTGTTTTTATGATTTTTCTTTCCATAGATGGAATA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GCTTTTATATTAAATAAATACCCTATTTCTTTTGTTACTTGTATTAATAGTTTACCAAATGGTATTTGCATTGATATCAATAAAGAATCTGTAGTGATTCATCCAAAAAAAGGGTTTGGTGGAATAGGTGGATTCTCGATAAAACCATTTGCACTTGCTAATGTTCGTAAATTTTATACTTATCTTCGTAAAGATATTCCTATAATAGGATGTGGAGGAATTTGTACTGGAAAAGATGTATTTGAATATATATTATGTGGAGCATCTGCAGTTCAGATTGGGACTCAATTTTTAAAAGAAGGGATTCCTGTATTTGATAGATTAATCAAGGAATTAATTACTATTCTAAAAAATAAAAATTATTCATCTTTAAATAGTTTTAAAGGAAAATTAAATGTATTTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP029813|489603:500007|496527_496896_+|AWU43344.1|DBSCAN-SWA MKVQFKIKGSKNIINTIKYGKSLFFFPIYTYVLFYSNKIYPEGIKLIGTLVKKKNFKKSVHRNKIKRLLRSSFLWNKSILEEKKDKYKSYHIVFFYKGVLLPNFEEINQSVKKIFYEVIKWE >CP029813|489603:500007|496924_497497_-|AWU43345.1|DBSCAN-SWA MKWIHSLISCFMILFSIIDILGNAPIIMGFKSKGNIIDTKKVIISSFIIFLSFLFLGLPMLKIIGVDIYSFSVAGSIVLFLIGLEMILGIDIHKVTKNSQTSIVPIAFPLIAGPGSLTTLISLRSTYDVNIILLSLIINMIVVYLVIDKCDIIAKTIGNNGLDILKKIFGIILLAFSVKIFGANAGQLFQ >CP029813|489603:500007|494319_494712_-|AWU43341.1|DBSCAN-SWA MSVLIKIRNLSHHIFPYYATEGAAGIDLQAYLEKEIIIPSMERKIIKTGIFIEIPTGYEAQIRPRSGLALRHGITVLNNPGTIDSDYRGEIKILLINLSSHTFTVKDGDRIAQIIVYKYEKVKWNEIKKK >CP029813|489603:500007|499062_500007_+|AWU43347.1|DBSCAN-SWA MIMKKIDISTNINGIKISSCIMNASGILCCTEKELYNLMMSSSGAVVTKSCTIKPRKGNLKPRYFEWKGGSINSMGLPNLGIDFYLNFLEKKNFKKPFLLSISGLSIEENYLILRKANISSNMNAIELNLSCPNLLEKDKILGYDFSKISDFLENLFKFYKKPLGVKLPPYFEDFHFRKMAFILNKYPISFVTCINSLPNGICIDINKESVVIHPKKGFGGIGGFSIKPFALANVRKFYTYLRKDIPIIGCGGICTGKDVFEYILCGASAVQIGTQFLKEGIPVFDRLIKELITILKNKNYSSLNSFKGKLNVF >CP029813|489603:500007|490832_491315_-|AWU43336.1|DBSCAN-SWA MNKKIHIYTDGSSKGNPGPGGYAIFIEIAGTSYWKIISEGFRYTTNNRMELLAIIVGLEKITKKKQNIIIFTDSKYIINSIQKNWIFKWKKNNFKKKKNVDLWIRFLNLFHKHFIIFQWVKGHYLHYINDYCDRLSVEASKNKKLKIDHVYEKENLKKTI >CP029813|489603:500007|495530_496520_+|AWU43343.1|DBSCAN-SWA MYTLGEFIIENRDHFSYPTEGLLRLFSSIKLAAKAINKEVNKAGLTEKIIGSSGIINIQGENQQKLDNFAHQVFIESLKSRNIVCGIASEESKDFIVVKGEKENSFQKKYIVLIDPLDGSSNIDVNVSIGTIFSVYRRKSSMNLTMDDFLQKGNKQILAGYIIYGSSTILVYTTGNGVHGFTLDPSVGTFYLSHPNLRYPKIERIYSINEGNYSRFPNGIKKFIRYCQEKKENRPYTARYIGSLVGDFHRNMIQGGIYIYPKTEYSPKGKLRLLYECNPMAFLTEQAGGKASDGENRILDIEPLNLHQRTPFICGPVRMVTKLEEFINP >CP029813|489603:500007|493835_494315_+|AWU43340.1|DBSCAN-SWA MRNNKTSMQYDVISNECRTHFLKKKFLIPKKFCNYILIKIDQNNWIEIVNYSVLAGIMIQQKKIDSMLSVSATKIIIDVYDQYIKKAKSLMEKKNSDYEEAWKYMSISSIKDLIMQKIFRIQGMEKRFYEVENYAYKVQDNYIDILNYAIFALIKMKNP >CP029813|489603:500007|490042_490840_+|AWU43335.1|DBSCAN-SWA MEKKHGLRNIKIKNLIKIYKKKKENKMFLVEGVKEFEMAIIGNYRPIGIFICKNIFYQNNMIKSFHKIVFFINIKTFQKLACRKNSGGIIALFKEKKISSLESIKVPKNPFILILDGIEKPGNLGSILRTADAAGVHFIILCNTKTYIFNPNVIRCSVGCVFTKTIFIEKIKSIISWLQKKKIEIAVTGFHNKKSKKLYQTKFSSHLAIVLGSESKGVSNIWFNISDKIITIPMFGSIDSMNVSNATSVIIYEIIRQRNTYKFSK >CP029813|489603:500007|492339_493413_+|AWU43338.1|DBSCAN-SWA MGITKDRLNFKPFEYQWAYEYWFKQQNAHWLHTEINMQSDIHDWNENLSDLEKNVIGDILKGFTQTETEVGNYWSEMIPKWFPIPEIKMMGQAFGSFETIHAVAYSYLNDILGLDNFHAFLEDEATMKKLKVLMDIRKSDHGKYNRKEIAKSIALFSAAAEGIQLFSSFAVLLSFRKSNRLKGIGQQIIFSVRDESLHSEAGCKIFRTFCEENDGLKNSVADSIYYGMDLALKNEFIFIDQIFDNGDIPTIKREELKNFMKDRTNIKLKELGLSDAYCIDKNMLDNMSWFYITISGEQQTDFFDNRETGYSKPNEDWNEDLFVLDDKKTYKEKKILEILLKNKKENLGNSGCVSCES >CP029813|489603:500007|494795_495143_+|AWU43342.1|DBSCAN-SWA MKKLFFFILSMMFFTSCNDDNLTGGHPPEEEPEKTNTPTIGMAIDPPPPSPTTSSPFLSDLEKEEKEIYRLKIEEIMNQDSQLKKIIAELAKAEKEKAEKAKAEKAKAEKAKHHK >CP029813|489603:500007|493443_493824_+|AWU43339.1|DBSCAN-SWA MKRKITPWYNTLGKEQLLHSSVCDYLDYEYPHIFYFHPHNEARRTPYERFLIKVMRLRPGLPDILVPIPKKGRTGMALELKIKPNKLTENQIHIIDIFNSYNWKVNVCYDFDEAKIYIDQYLKKTD >CP029813|489603:500007|489603_490029_-|AWU43334.1|DBSCAN-SWA MNCEIYKKKDIIYMNKAIKCSKLSYCKNKKVGAIIVKNHRIISDGYNGTPSGFDNICEDQNGNTKWYVLHAEANAILKMAFSSKSCKDSYLYITHSPCKECSKLIHQSKIKRVVYLHKYSEKNDGLNFLKKSKIIIHKLIY >CP029813|489603:500007|491314_492079_-|AWU43337.1|DBSCAN-SWA MKIIQVSLILLWRVWFFIINIFLIPLLAGASIPFLFKEKYYYIAYWFYQIWARSNLFLMGFWYVLEKDKEILDKKKQYMIISNHSSIMDIMLIYSLMRNHPLVFVGKAELAKLPFFGFVYKRSNILINRKNLSSCMQVFKQIQKKIDSGKSICIFPEGGVPNPSIFLDHFKNGAFYIAIIKNISIIPFTIADIKKKFPRSPIKGGPGKIRIKQHHSILTKNLSLKDKNFLKEKCFNLIQFQLKKFEREKNKQIF >CP029813|489603:500007|497619_498987_-|AWU43346.1|DBSCAN-SWA MKDKEQFFFKIYNLGILKFGHFTLKSGMNSPIYIDLRPIASRPDLLIKLSDLLLNEVPPHTFELICGVPYAALPIATALSLRSNIPLIIKRKENKGYGTKKMIEGIYKKGQKCLIIEDVITSGDSLLKTVIDLEKEGLIIKNILSILDREQGGIENIKNKGFNIRSLFRIGEVLKILEKKNLLKEKEIHIIKFFLQKKYIKNIQKKRISYEEKKEKIYHPIGKKLIDIALKKKTNLIFSADLIHSKKILELVNLIGDQICGLKLHVDIISDFSFSFISFLKKISLKKKFLLFEDRKFCDVGTTNYLQLHHGIHKISSWADVITVHVLAGSKSIENLNIPSNIGLITISEMSSYGRLSDDNYIRKALNISLKNSKVIGTVAQRKVDNRLLLFTPGIHFSDSIKNYKGNNYIHPNQAFIKKNCDFIIVGKAIYQSDNPKIVAENYRKAGWIAYENSF |
14 | Hokovirus(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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