CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
CP029811	Blattabacterium punctulatus strain CPUpc chromosome, complete genome	0 crisprs	DEDDh	0	0	1	0

1. CP029811

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	462162 : 478444	12	Synechococcus_phage(20.0%)	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>CP029811|462162:478444|DBSCAN-SWA
ATTATTCCCATTCTATAGTTGCTGGAGGTTTGGAAGTAATATCGTATACTAAACGATTAATTCCATTAACTTCATTAATTATTCTACTAGAAACTTTTTCTAAAAAATTATAAGGTAAATGTGAAAAAGTAGCAGTCATAAAATCTTCCGTATTTGTAACACGTAATACAGCGACATATTCATAGGTTCTTTTATCACCCATTACTCCTACGGATTTTATAGGTAATAATATTATAAAAGCTTGACTTACAGATTTATATATATTATAATTTTTTAATTCTTGCAAAAGAATCATTTCCGCTTCTTTAAGAATAGAAATTTTTTTATTATTAACTTCTCCAATAATACGAATGCTTAATCCAGGACCTGGAAATGGATGTTGATATAAAATTTCTTTTGGAATTCCTAAATATTTTCCTATTTTTCGTACTTCATCTTTAAATAATTCTTTTAATGGTTCCAAAAGTTTCAATTTCATTAAATTAGGTAATCCTCCTACATTATGATGAGATTTAATAAAAAAAGTATTTTTTAATAATTTTAATGAAGAATATGTAGAAGATTCAATTACATCTGAATATATAGTTCCCTGCGCTAAAAATTCTACATTTTTAATTTTTTCTGATTCTTCTTGAAAAATAGAAACAAATTCTTTTCCGATAATTTTTCTTTTCATTTCAGGATCAATAATTCCAATTAAACTAGATAAAAATCGTTTTTTAGCATCTATTATTTTAATAAATAAATTCATTTTTTTACAAAAAAAAGATATTTTTTCTTTTTCTTCTTTTAAAATAAAACCAGTATCAACGAAAATGCAATATAAGGATGAACCAATAGCTTTATGAATGATATAAGCGGCTACAAAAGAATCTACACCTCCTGAAAATCCTAATATTACTTTTTTAGTATCTACAAGTTTTCTTATTTTTTCTACATTTTCTTGTACAAAATGGTTTAGTTTCCAATTTGGGTAACACTTACAAATATGAAGTATAAAATTTTTCATGATTGGAATTCCGAATTCGGTATGATTCACTTCTGGATGAAATTGTACGGCATAAATATCTTTATTTTTATGAATTAAAGCTGCAATAGCACAAGAAGAAGTATGTCCGATCACTTTTAATTCTTTTGGAATTTTTTTTATTTCATCAAAATGACTCATCCAAACAATAGATTTTTTAGGAATTCCGTGGAATAAATCATTTTTACAATGATCTATCATAAAAATGGATTTTCCATATTCTTTATACTTTGATCTTTCTATTTTTCCTCCAAAAAGAAAAGAAATAAGTTGCATTCCATAACAAATTCCAAGTATAGGAATATTCAATTTAAATATATTTTTAGATATTAATGGAGGATTTTCGTCATAAACAGAAAAAGGACTTCCAGATAAAACAATCCCTTTTGGTTTTTTAGATAAAATATTATGAATAGAAATATCATAAGGATATAAAAGTGCATATACCCCTATATCTCGAATTCTTCGTGCAATCATCTTGCTATATTGAGAACCAAAATCTAATACCAAAATAGAGTCTTTTTTCATTATAATTTTTTTGTATCATTGGAATTTTTTTTTAAAAAACTATAATCCAATATCTTTCCTAAAATACAAGTTTTCAAAATGAACTTTTTTTACCTTATTATAAGCTATTTTTCTAGCAGAATCTCCGGTACTACCTATTCCTACGATATTTAAAACTCGTCCATGTGATGTCATCCATTTTTCTTTTTCTTTTTTAGCACCAGCAATATAAAAAGGTTCTTTTAAATAATTTAATCCATTTATAATTTTTCCACTTTCATATTGTTCCGGATAGCCTTTTGAAGATAGTACGATACAACAAGAACATAATTTTTTCCAAGAAATAGATATTTCTTTTTGAATAAATACCGACTGGATTATCTGAAAAAAATTACTTTCCATTAATGGCAATAAAGTTTGAGTTTCAGGATCTCCCATACGAGTATTATACTCTAATAAGTATACACTATTTGAAGTGATCATTAATCCGAAATAAATAAATCCGAAAAAAGTTAATTTTTCTAAAAAAAGTCCTTTTAAAGTTGGTTCCAATATATTTTTTTTAAAATCTATCCAAACTTCATCGTTCATATAGGGATTAGGTGCTATCGTACCCATTCCTCCTGTATTACTCCCTGTTTCTTTTTCTCCAATTTTTTTATAATCTTTAGCGGATAAAAAAGGAATAATATCTTTCCCATTAAATATGGATATAATAGAGGATTCATTACCTTTCAAAAATTCTTCTATGATAACTTTATTTCCAGATTTTCCAAATTTTTTATCTATCATAATAGAAGTCAAAGCCTTCTTTGCTTCATTTTTATTTTTCACTAATATTACTCCTTTACCTCCTGCTATACCACTTGTTTTTATAGCTACAGAATAATTTATTTTTTCTAAAAAATCTACAGCTTTTTGATAAGAAGAAAAAACTTCGTATTTAGGAGTCCGTACTCCATATTTTTTCATAAATGATTTAGAAAAAACACGATCACCTTCTAATCTAGCAGCAAGGTAATGTGGCCCCATAATTTTTAGTCCAAAATTTTTAAATACGTCTACAATTCCATCCAATAGAAAAGTTTCTGAACCAACAATAGTTATATCTATTGCATTTTTTTTAGCATATAAACATAAATCTAATGTTGTATAAGTATTTTTAATATTTTTTCCTATTTCTTCGGTTCCTCCATTACCAGGATAAAAATAAAGATCTATAGTAGGAAAATCTTTTAAAAATTTTTTACCAATAGCATGTTCACGTCCTCCATTTCCGAGAATTAAAACTTTCATAATATTTTTTTTTAATGTTTAAAATGTCTTTTTCCCGTAAAAGCCATAGCTATTCCATGTTCATCACAAGCTTTTATAGATTCTTTATCACGGATAGATCCTCCTGGTTGAATAATTGCTCTTATTTTACCGGATATCGCAGCTTCATCTACTATATCCCGAAAGGGAAAAAAAGCATCCGAAACAAGGACTAAATCTTCTTTTCTTTTTTCTAAAGCTCTTTCTATAGCTTGACGAGCTGCCCAAATTCTATTTGTTTGACCTCCAGAAATTCCTAAAGTTTGTGTACCTTGAGCTACAACAATAGCATTTGATTTTACATATTTTACTACTTTTTGAGCAAAAAATAAAGATCTTATTTCTTGATCAGAAAACTTTTTTTTGGTTACTATTTGATAATCATAAGATAAAGGAGGATCTACTTGTTGTACCAATATTCCTCCATCTATTTTTACATATTCCAATTTATCAGAAATAGGATTTTTTATCCTAATGATTCTTATATTTTTTTTTTGTTTTAAAATACTCAATCCATTTTTTTCATAACTAGGAGATAAAATAACTTCTAAAAATAGATTATTCATTTTATTCGCTAATTCTTTTGTTATTGGAACATTTACTGCCATAATTCCTCCAAAAGAAGAAATAGAATCCGCATAATAAGTTTTTTTAAATGCATCTATAATATTTTTTCCTAAGGCAACACTACATGGTGTTGCATGTTTCACAGTACAACAAGCTGGTTCAGAAAATTGCGATACTACTTTCCAAGCTATATCCATATCTCTTAAATTATTAAAAGAAAGATTTTTACCATGTAATTGATGAAAATTACACATTGCTCCATTATGAATAGTACTAATATAATAAGCTGCTTCCTGATGAGGATTTTCCCCATAACGAAGATTCATTTTTTTTTCATAAGAAAAATGTAAATAAGTAGGAAAATTTTCTTCCATTAAAAAATATTGAGAAATTGCAGAATCATAAGCAGAAGTAAGATTAAATACTTTTCCTGCTAATTTTTTTCTCAACTTTAATGAAGTATTCCCATAGTTTTCAATTTCATTTTGTACTAATATATAATCTTTTTTATCTGTAATAGGAGTTACATGAAAAAAATTTTTAGCTGCTGCTCGCAACATAGATAGTCCTCCTATATCAATAAATTCAATTATAGAATTCATTGATTTTTTATGGAATTTATCAAAAAATGGGTAAAAATTTACCAATACAATATCAATAGGATTAATTCCGTGAAAATGAATACTTTTCATATGTTTATCAATAGAACGATTAGCAAGAATACCCCCATAAATAGATGGATGAATAGTTTTTATTCTTCCATCTAAAATTTCAGGAAAAGAAATGATATTTTCTATTTTTATAACATTAGATATTCCATTTTTTTTTAAGTATTGATAAGTACCACAAGTAGAAATAATTTGATATTCTTTTTTATCTAAAAAAAAGACAAAATCAAATAATTCTTCATTTTTTTCATAAACACTAATCAAAGCTCTTTTCATATATATAATAATTAAAGAATTCGAAATTTTTATGGGATATAAAAAAAATAATATAATAGGTCAGATATTGTTTAAATATTGAATTAGTATCTCTTTTTCTATGATAGATATTTTTTTAGATAACGATATTGGAGTTTCTTTTGAAGAAAGATTACATGATTTTTTTAAAATTATATTTCCTGAATCAATATTTTTAGTTACATAATGAACTGTAGCACCTGATATTTTTTCTTTATTATTAATCACTTTTTGATGTACTCTCATTCCATACATACCTTTTCCTCCATATTTAGGTAAAAGAGATGGATGAATATTTATTATTTTTCCATACCATTTATCACAAAATTCCGAATCAAGTATGGAAAGAAACCCACAAAGTACTATAATATCTGGTATTTTTTTTATAAAAATATTATCTATCTCTTTAGATAGAATTATTTTTTTAGTCTTTTTTAAAGAAAAAGTTGTAATATTTTCTTTTGATGCATATTGAATAGCTTTACAAGATCTATCAGAAATAACTGTATCTATCTTAACTTTAGAAAGTTTTCCATTAGAAATAGATTCTATAATATGCTTCATATTTGTCCCTTTTCCAGAGACCAAAATAGATAGTTTTTTCATGAAAATATTTTTATTTT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CTTGAATCAAGGATTTAGGGTCAATAACCATTCCAGGTGCTATAATACATTTAATAGAAGGATTAACTACTCCAGATGGAATTAAATGAAGAATAAAATTACGATTATTAATATGAATAGAATGACCTGAATTATTTCCTCCTTGATAACGAATTACATAATCTGAATTTTTAGAAAGTAAATCTGTTATTTTACCTTTTCCCTCGTCACCCCATTGGAGACCAACAATAACATTTGAAGGCATGATTTTTTACAATTTTATACTTTTTCTACAAAGTTAGTTTTTTATAAATAGATAATAAAAAATTCTAAAATTTTTTATTATTGCAAATAGCTCGTTTAAGATGTTGATAAGCTAACCTTGTTGCTATTCTACCTCTAAGTGTTCTTATTAAATATCCTTCTTGAATAAGAAAAGGTTCATAAACCTCTTCTATTGTATCGGAATTTTCATTAACAGCTGTTGCTATAGTATTTATTCCAACAGGACCTCCTTTAAAGGAATCAATAATAGATGTAAGAATTCTATTATCCATTTCATCTAATCCATGTTTATCTACATTAAGGGCTTTTAATCCTAAATTACATATGTTACTATCTATAATTCCATTTCCTTTTATTTGAGCAAAATCACGAATTCTACGAAGTAAAGAGTTAGCTATACGTGGAGTTCCACGACTTCTAGTTGCTATTTCATAAGAAGATTCTTCGGTGATTGGAATGTTTAATATTTTTGCACTACGTTCTATAATTATTTTTAATAATTTTTTTTGATAATAAGTTAAACGTAAATTAATTCCAAATCTAGAACGCATAGGTGCTGTTAATAATCCAGATCTTGTTGTTGCTCCTATTAAAGTAAAAGGAGATAAATCAATTTGTACTGATCTTGCATTAGATCCAGAATCGATTATAATATCAATTTTATAATTTTCCATAGAAGAATACAAATATTCTTCAACTATAGGAGAAAGACGATGAATTTCGTCTATAAATAGAACATCGTTCAAATTTAAATGAATGAGTATACCCGCTAAATCTCCTGGTTTATCTAAAACGGATCCTGAAGTTACAGATATATTAACGCCCAATTCATTAGCAACAATATGAGAAAGAGTCGTTTTTCCTAATCCTGGAGGACCATGAAACAGAATATGATCTAAGGCTTCTTTTCTTTTTTTAGCAGCTTGAATAAAAATTGTTAAATTTTCTAAAATATCACATTGCCCAACAAATTCTTGAATTTTTTTTGGATTTAAAGTTTCTTCTAAAATAGGTGACAC

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>CP029811|462162:478444|467154_468141_-|AWU40679.1|DBSCAN-SWA
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>CP029811|462162:478444|474635_476063_-|AWU40525.1|DBSCAN-SWA
MKEYKNPLVERYSSKEMLYNFSPEKKFTTWRKLWLYLAEFQKKLGLNIKEEQINDLKKHLNDIDWNRVFFYEKKFHHDVIAHLYALGEKATIAKPIIHLGATSAFLGDNTDLILLRDGLEIILNKLINVLFRLRNFTLEYHNTPTLAFTHYQPAQLTTVGKRSSLWIQSILMDIEELEFRLQNLCFRGIKGTVGTAASFKELFNGNLKKVKYLEKKLSQKFGFQKIFPVTGQTYDRKVDAQILNLLSNISQSSHKFSNDLRLLQNLKEMEEPFNKEQIGSSAMAYKRNPILSERMASLAKYVISLSNSSAMVAATQWLERTLDDSANRRLVLAQSFLATDAILMIWNNILENIVVYPKMIEKNIYQELPFLITESIIVKSVKNGADRQEIHERIRIHSMKTHSKMKLEGKENDFIKRILNDEKIPINEKELNKMLDPKNFIGFSSDQSLEFIDKKVNPILDRFHRLINSNSNLKI
>CP029811|462162:478444|463755_464991_-|AWU40519.1|DBSCAN-SWA
MKVLILGNGGREHAIGKKFLKDFPTIDLYFYPGNGGTEEIGKNIKNTYTTLDLCLYAKKNAIDITIVGSETFLLDGIVDVFKNFGLKIMGPHYLAARLEGDRVFSKSFMKKYGVRTPKYEVFSSYQKAVDFLEKINYSVAIKTSGIAGGKGVILVKNKNEAKKALTSIMIDKKFGKSGNKVIIEEFLKGNESSIISIFNGKDIIPFLSAKDYKKIGEKETGSNTGGMGTIAPNPYMNDEVWIDFKKNILEPTLKGLFLEKLTFFGFIYFGLMITSNSVYLLEYNTRMGDPETQTLLPLMESNFFQIIQSVFIQKEISISWKKLCSCCIVLSSKGYPEQYESGKIINGLNYLKEPFYIAGAKKEKEKWMTSHGRVLNIVGIGSTGDSARKIAYNKVKKVHFENLYFRKDIGL
>CP029811|462162:478444|477469_478444_-|AWU40527.1|DBSCAN-SWA
MSPILEETLNPKKIQEFVGQCDILENLTIFIQAAKKRKEALDHILFHGPPGLGKTTLSHIVANELGVNISVTSGSVLDKPGDLAGILIHLNLNDVLFIDEIHRLSPIVEEYLYSSMENYKIDIIIDSGSNARSVQIDLSPFTLIGATTRSGLLTAPMRSRFGINLRLTYYQKKLLKIIIERSAKILNIPITEESSYEIATRSRGTPRIANSLLRRIRDFAQIKGNGIIDSNICNLGLKALNVDKHGLDEMDNRILTSIIDSFKGGPVGINTIATAVNENSDTIEEVYEPFLIQEGYLIRTLRGRIATRLAYQHLKRAICNNKKF
>CP029811|462162:478444|466580_467144_-|AWU40521.1|DBSCAN-SWA
MKKLSILVSGKGTNMKHIIESISNGKLSKVKIDTVISDRSCKAIQYASKENITTFSLKKTKKIILSKEIDNIFIKKIPDIIVLCGFLSILDSEFCDKWYGKIINIHPSLLPKYGGKGMYGMRVHQKVINNKEKISGATVHYVTKNIDSGNIILKKSCNLSSKETPISLSKKISIIEKEILIQYLNNI
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MSQLFPILEKKNYYDKFHEECGVFGIYSIHKIDTFSLIQFGLFALQHRGQEACGFSVLRDGFILSHKSEGLVLDSFRKISNSECYHGNAVIGHTRYSTEGGQSQKNIQPFFGEDIYGKSIISIVHNGNLINAKTIRKNLESKGIRFISSDSDSEVILRLIQKYLSESENNLKIAIQKTTFDIQGAYSVIVLMDNKIAAFRDPNGIRPLCYGMLNEKTYIFSSETCGIDSVGGYYVRDLFPGEIAIVDQKSIQFSLLRKKRDTKRRICSFEYIYFSRPDSFIENINVYAVREKSGEVLYEQHPVVADVVIGVPDSGVPAAIGYSKVSGIPFKPILVKNKYIGRSFILPKQEMREKMVNLKLNSILNEIRGKRIVIIDDSIVRGTTSRRLVYILRKSGAKEIHFRSASPPIIAPCYLGIDTPTQKDLISFNIDKESIAKFLDVDSLEFLSMDNLIDILGSNNYCFGCFTGNYPIHKKK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AWU40518.1|462162_463716_-	GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)	A0A1V0SH76	Hokovirus	1.5e-29	38.3
AWU40519.1|463755_464991_-	phosphoribosylamine--glycine ligase	NA	NA	NA	NA
AWU40520.1|465002_466520_-	bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/inosine monophosphate cyclohydrolase	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	2.1e-55	43.6
AWU40521.1|466580_467144_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	1.5e-14	29.7
AWU40679.1|467154_468141_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	A0A1D7SCX2	Cyanophage	8.4e-58	42.9
AWU40522.1|468159_469590_-	amidophosphoribosyltransferase	A0A1B1ISH6	uncultured_Mediterranean_phage	6.5e-51	31.2
AWU40680.1|469637_470357_-	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	A0A0E3ELR0	Synechococcus_phage	7.7e-37	38.7
AWU40523.1|470371_470854_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	6.0e-17	41.4
AWU40524.1|470865_474588_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase	A6N228	Microbacterium_phage	9.0e-28	26.8
AWU40525.1|474635_476063_-	adenylosuccinate lyase	NA	NA	NA	NA
AWU40526.1|476100_477405_-	adenylosuccinate synthase	A0A2R8FF47	Brazilian_cedratvirus	6.7e-63	32.9
AWU40527.1|477469_478444_-	Holliday junction branch migration DNA helicase RuvB	A0A127AWE7	Bacillus_phage	1.1e-06	30.8