Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029329 | Clostridium beijerinckii isolate WB53 chromosome, complete genome | 8 crisprs | cas14j,DinG,cas3,DEDDh,c2c9_V-U4,RT,WYL,cas2,cas1,cas4,cas7b,cas8c,cas5,csa3,PrimPol | 1 | 12 | 8 | 0 |
CP029330 | Clostridium beijerinckii isolate WB53 plasmid unnamed1 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029329_1 | 438959-439051 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029329_1
|
1 spacers
spacers of CP029329_1
>1.1|438984|43|CP029329|CRISPRCasFinder GTATGCATCTTGTTAAACGATAATATTTTATATAGAAAAGAGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029329_1
The CRISPR arrays of CP029329_1 >merge|CP029329|1|438959-439051|CRISPRCasFinder ATTAATTATCATTTTGATAAATTAAGTATGCATCTTGTTAAACGATAATATTTTATATAGAAAAGAGTATTAATTATCATTTTGATAATTAAT >CP029329|1|1|438959-439051|CRISPRCasFinder ATTAATTATCATTTTGATAAATTAA GTATGCATCTTGTTAAACGATAATATTTTATATAGAAAAGAGT ATTAATTATCATTTTGATAATTAAT
>CP029329.1|AWK49903.1|437528_438731_-|diaminopropionate-ammonia-lyase MEKILWKENTLPKNDKEGSIKFLNKEEVSKAKNFHESFLEYDKTPLVDLKELSKKIGLGGIYVKDESYRFGLNAFKVLGGSFAMGRYLADKLGEDIKDLPYEKLTSKEVKERLGDITFVTATDGNHGRGVAWTANRLKQKSVVYMPKGSSLMRLNNIKAEGAEASITELNYDDAVRLANKYAEEHNGLMVQDTAWEGYEKIPAWIMQGYGTMALEASEQLKEFDVERPTHIFVQAGVGSLAGAIQGFFASMYPENCPTTVVVESNLADCYYKSAIADDGKARVVGGEMQTIMAGLACGEVNTIGFEVLKNYAKAFVSAPDWVAAKGMRVLGNPLKGDKGIISGESGAVTTGLLYEIMTNDDYKDLKQALGLDENSRVLLFSTEGDTDPEKYRQIVWNGEY >CP029329.1|AWK49902.1|436267_437455_-|YgeY-family-selenium-metabolism-linked-hydrolase MLTNKRKESLTELCQELVRNQSVSGDESKVVDVIKGKFKELGYDECSIDAYGNIIGHIKGNKPGKRILFDGHIDTVPVPDDSKWTHAPFGGEIVDGKIYGRGTSDMKGQTSAMILAAAYFAEDTKRDFEGDIFVVGVVHEEIFEGVSARKISEAIKPDYVVIGESSELNLKIGQRGRAEIVIETFGRPAHSANPEQGINAVYKMSKIIERIQDIETPVHEVLGKGILVLTDIKSSPYPGASVVPDYCRATFDRRLLVGETKEEVLAPIQKIIDELIAVDKEMNAKVSYAVGKETCYTGETIEGERFFPAWLYKEDDEFVKAALKGLRSAGINPEITQYSFCTNGSHYAGEAGIRTIGFGPSKENLAHTIDEYIEQEQLFIGAEGYYGILKSVYNK >CP029329.1|AWK49901.1|434629_436231_-|D-aminoacylase MKILIKKGFIVDGSGNEGYKGDVLVCNERIDKISYEINNENVDKIINAEGLVIAPGFIDTHSHSDLKILENPYNEIKIRQGITTEVLGQDGISMAPLPKEYVASWRKNLAGLDGESDEINWNYETTDNYLKMMENNGVGLNEAYLVPHGNVRMEVLGLDNVQPDEEQLKKMCEVTRREMEAGAYGLSTGLIYMPCAYSGTRELVELCKVVAEFNGVFVIHQRSEADSIISSMKEVIEIGEKSGVRVHFSHFKVCGKKNWKHVDEVIVLLNEAKKKGIKVTLDQYPYATGSTMLGVILPPWAHDGGTDKLLERLASPEMRKKMILDMENNEQNDMEAWDNFIDFAGLDGIYVTSVKHKRNEQFIGKNLVEIGELKGKDPYNATFDLLLEEENAVGMFNYYGIEKHIIKFMKLTEQNVCTDGLLSGKPHPRAYGSFPRILGRFVRKLNVLTLEEAVMKMTSKAANAINIKDRGLIKEGYFADIVIFNADTVIDKGTFEDSTQYPEGIEYVIINGQVAVENGEYKKVKAGIVLRKG >CP029329.1|AWK49900.1|433290_434619_-|putative-aminohydrolase-SsnA MKIVGNGRLITQNKEKPFIENGALIVSDGKIIDYGNTSDILDKYGDVEYIDAKGKVIMPGLINTHGHIYSAFARGMNLDGPTSKDFLDILNNLWWRLDRKLTLEDVKYSAYTTLMDSLKFGVTTFFDHHASPNAAKNSLFTIGKVAEELGIRTSLCYEVSDRDGEEILEEGIKENVDYIKHCIEKKDNMKSGMFGMHASFTLSDESLRKCVKEAEKLDCGYHIHVAEGLADEEECMKKHGKRVVERLNDFNILGKKTIAVHCVHADENEQELIVKTNTSVVHNPESNMGNAVGVSPALDLINKGVTVGLGTDGYTQDMFESMKVANIIHKHNLKDPSVAWGEVPLMLFENNRKIAERHFEGKFGIIEEGANADVIIVDYNPLTPMNESNYNSHVLFGMMGRSVDTTIVNGKVLVRNGKLISVNEEEILAEARKVSQKLWDRI >CP029329.1|AWK49899.1|432144_433233_-|diguanylate-cyclase MSNLNVNILGMKFENPIFTAAGPGAKDGELCFEAVKLGAGGLVTKTISVNPADVPRPCMARTNSGFLNTELWSELPKEQWIEKEYKRAKEAGVPMIISMGYTAEQIKQVAPLIKPYADAVELSTHYVGTDVGPIVEAMKAAKSALDCPVFMKMSPHTDIQVIAKALEDAGADGLVMINSFGPCMAIDTETGYPIMGSKNGYGWLSGAPIRPLAIRNIYDASQVVNIPIIGVGGVTCGKDAAEMLMAGATAVEVCTEAILKGPGVYGKIAKELNEFLEIHGYKDVNEIIGLAHKKAADRTFRTEAIPPVVDQALCVKCGQCKVSCVYEAITIGDELVIDIDKCFGCGLCVTKCPKNALTIQYK >CP029329.1|AWK49898.1|431565_431943_-|reactive-intermediate/imine-deaminase MNKIINTTNAPAAIGPYSQGLVVGGLVYTSGQLPLNPETKVLETEIKTATKQSLENCKAILEEAGTSMDKVFKTTVFVKDLNDFAAVNEVYGTYFKENPPARSCVQIAKLPMDAVIEIEVIATVE >CP029329.1|AWK49897.1|430335_431151_-|putative-selenium-dependent-hydroxylase-accessory-protein-YqeC MKIFECINAEIKEQKSLIEALKIDTNKKRIISFVGGGGKTSLIYELGCELSRLGKKVIITTTTHMFMPKDNVVVTGKEDDIIKLLYSENMITVGMLCDEKYIEFKYNQLKDKKIIDEIEEGRLKKISGLPKEMAIRLIELADFLLVEADGSKRLPLKIPAEHEPVILEGSNLVVGVCGIDAIGKSIKEKCHRSNLVSKFLDTDEQHIINPHDIAKILSSVHGQRKNVKCHYKVIINKADNIREVERAKDISKELVNFGISETIITTFKDQL >CP029329.1|AWK49896.1|429460_430294_-|EF2563-family-selenium-dependent-molybdenum-hydroxylase-system-protein MIVLIKGAGDLATGVAYRLKKCGFDVIMTDISEPTTVRRTVAFSQAVYDNNVEVEGIKATLVSGIEEGIEVIKQGHIAVIVDEKAEILKELKPDVVVDAIIAKKNTGTNINDGPIVIALGPGFTAGVDCHCVIETKRGHYLGKAIYDGSAIPNTGVPGDIGGYTNERIIRATSDGKILPKSKIGDYVEKSDIVAYVNETPIFAQINGIVRGMLQKDVNVFKGMKSGDIDPRCERNHCFTISDKARSIGGGVLEAILYLNQNIDVNNNLRKSKKGGYI >CP029329.1|AWK49895.1|428447_429464_-|GTP-3',8-cyclase-MoaA MIDLYERNIDYIRISITDKCNLRCKYCIPEEDITSTLNNEILTFDEIIKICISASKLGIKKVKITGGEPLLRADVTDLIKSIKSIPLIENVTLTTNGIFLSDKVRDLKESGIDSINVSLDTLNKNKFKDITRRDGFDKVIDGIKRSIKLGIKIKINCVPIRNFNYDEINDIAAIAKDNNIDVRFIEMMPIGIGNLFNSISNKEILEIIEKNFGEFKIWSRGLQAENKKKDLKNFSDNGPATYYQNDNFKGRIGLISAVSNEFCPNCNRIRITSDGFLKPCLCYSDGIDLKALIRNGTSEEELTLSIKNGILNKPEKHGFNKLSKSDNLEVKSMSQIGG >CP029329.1|AWK49894.1|427977_428424_-|MOSC-domain-containing-protein MGNVIAICISEKRGTQKTNIQEGNFIENFGIENDAHAGNWHRQVSLLSYAKIDEFNKKGANVIDGAFGENLVVEGIEFTTLPIGTKLKCNEVILEMTQIGKECHSHCEIYKKMGECIMPKNGVFARVINGGKITCGDNMEILSDVERI >CP029329.1|AWK49904.1|439202_439850_-|hypothetical-protein MSVYDDLDFFKRLIKGIAEEFGPNCEVAIHDLKAGYEHSIIAIENGHVTGRKVGDVASRIAMETIHSNLQHKDHYSYSTRTNDGRILKSTTICIPDENGEAKALLCINYDITQLIVSNKIMKDFVSIKETKNNDYGDDDIAIPTDVNQLLKDLIEESYQLIGKPVAVMTKEDKMKAIKYLESKGALLIKRSGDKISKFYDISKYSLYSYLNSSED >CP029329.1|AWK49905.1|439975_441352_-|dihydropyrimidinase MIIIKNGTIVTESESYFSDIMIENNKISCIGTNLFNDNAEIIDASGMYVIPGAVDVHTHMDLQSGSNRSIDDFYTGTVAAVCGGTTSIIDHVAFGPKNCALRHQIDEYHELANGKAVIDYGFHGVIQHVNDEVLSEMESLVKEGISSFKIYMTYDFKLDDASILKVLKKAKELGVIIAVHAENNDVINDLRENYVSNGCLEAIYHAKSRPDHCEAEAISRVLHIAALAGDAPIYIVHTSTEKGLDEIRKARAQGQKNIFSETCTQYLTMTAEKYLEPDNNGLKYVMSPPLRHKNDVDALWKGVQDGAIDVIATDHCSFKLKGDKEKGINDFTKCPNGAPGVAERVMVIFSEGVMKKKISINRFVELLCTKPARIYGLYPQKGSLIPGADADITIINPNSEYTLTRSMLHGAVDYTCFEGMKLKGDINTVIQNGKVAYKNNEFFGKKGDGKFIRRKVIE >CP029329.1|AWK49906.1|441668_442574_-|carbamate-kinase MMSKIVIALGGNALGKTLDEQMESVKFTAKSIVDLIESGNQVVVTHGNGPQVGMINSEMNEMPLTMCVAMSQAYIGYDLQNAIREEVLSRNLKIPVVTLITQTLVDPNDSAFLNPTKPIGRFYSKEEAEKLEKTGLVMIEDSGRGYRQVVSSPKPIDIIEKETILELMSAGEIVIAGGGGGIPVIEVEHNHLKGVPAVIDKDFEAALLAEEIGADYLIILTAVEKVAVNFGKPDVKWLDSLTMEEANKYIEEGQFAPGSMLPKVQAALQFVSSGEGKTALITLLGKVNDGILGKTGTHFKM >CP029329.1|AWK49907.1|442726_443920_-|knotted-carbamoyltransferase-YgeW MNIVNKYVNELKNLKIDEMYENDFFLTWEKTTDELKAVYAVADALRELRKNNKSTRLFDSGLGISLFRDNSTRTRFSYASACNLLGLEVQDLDEGKSQVAHGETVRETANMISFMADVIGIRDDMYIGKGNQYMHTVANSVKEGYEDGVLEQKPTLVNLQCDIDHPTQAMADMLHIIHEFGGVENLKGKKIAMSWAYSPSYGKPLSVPQGIIGLMTRFGMDVCLAHPEGYEVMEEVENVARDNAKESGGTFTKTNNMAEAFKDADIVYPKSWAPFAAMKERTDLYAEGDSEGIKELEKKLLAQNAEHTDWECTEELMKTTKDGKALYLHCLPADISGLSCEKGEVEASVFDRYRVPLYKEASYKPYVIAAMILLAKVKNPAEVLEKMAQSDDTRFNG >CP029329.1|AWK49908.1|443969_445280_-|YgeY-family-selenium-metabolism-linked-hydrolase MNFEQIKSKSENYKEDMTKFLRDLVAIPGESAEEEGVVKRIEEEMKKVGFDKVEIDPMGNILGYMGTGETLIGFDAHIDTVGIGNRDNWNFDPYEGYETETEIGGRGTSDQLGGIVSSVYGAKIMKDLGLLNEKYTALVVGSVQEEDCDGLCWEYIIKEGKIRPEFVVSTEPTDGGIYRGQRGRMEIRVDVQGVSCHGSAPERGDNAIYKMAEILMNIRDLNENDADENKEIKGLVKMLDEKHNPEFKEANFLGRGTVTTSQVFYTSPSRCAVADSCSISLDRRMTSGETWESCLEEIRQLPAVKKYNATVSMYNYDRPSYTGLVYPIECYFPTWVIPEDHTVTKALEEAYKGLYGTTRIGVAENEAMRKARPLTDKWTFSTNGVSIMGRNGIPVIGFGPGAEAQAHAPNEKTWKEDLVTCAAVYAAVPTLYTENK >CP029329.1|AWK49909.1|445649_448283_-|selenium-dependent-xanthine-dehydrogenase MFKVNVNGKDYQSETDMALMDFLREKLKITSVKNGCKEGACGTCTVIIDGKTTRACIQKLSKLGGKKIETIEGFTDRERDVLVYAFATAGAVQCGFCIPGMVISGKCLIDQNPNPTREDVKQAIRTNICRCTGYAKIEEGILLAAKMLRENLEIPELKQTGKVGEQTCRVDAREKTLGIAKYADDYSFDGMLYGKNVFSKYARAKILSIDISEALKIPGVIAIYTAKDIPGKRYIGHLAQDWPGMIDVGEQTKCCGDTIAMVVAETREQAVAAVKAVEVVYEELEPLRTAEDAAAPGAHQVHGEGFMQFGKFRVPENNVFDHEEVKRGDAETAIANSKFVVEGTFHVPPTEHAFMEPETAVGLPDGDGVKVITGSQGIYDERHELSNYLGLPLEKVRIQSASVGGGFGGKEDMSVQHQAALCAYLTKRPVKVSFSRQESINYHPKRHAMDIYCKIGCDENGILQGMKARLTSDTGAYASLGGPVLQRACTHAGGPYNYQNVDIEGNAYYTNNPPAGAFRGFGVTQSCAVVECLINQLAEKAGLSGWEFRYRNAIRPGQSLPNGQLADEGTAMVETLEAVKEDFEKYEADPNYHVGIASAMKNAGVGVAVPDTGRCNLKIIDGKVHARSSAGAIGQGVQTVLLQMVCETTELTPNQIVVEHPDTKYTPDSGTTTASRQTVFAGEAAHQASLKLKSDLDCGYTLEELEDKEYIGEFDFKTDPIGSPKKNPVSHIAYGYATQLVIIDNEGKLEKVVAAHDIGRIINPLSATGQVEGGVAMGLGYGLTEDFPLKDGIPQAKLGTLGVFKASQMPPVEVHLIEKNDIDSIAFGAKGIGEIVCVMGAPACQNAYYKKDGIFRYKYPLDNTYYRKQKPAPKKVE >CP029329.1|AWK49910.1|449047_450472_-|NCS2-family-permease MKTNANKQKSSFLESYFQLKENNSNVKTEILAGITTFVTMAYIIFVNPNILKLSGMNSANAIGDAAAQLSVGTDPIVSSVFVATCLAAAIGTLIMGLYANLPFAQAPGMGLNAFFTYTVCLTLGFTWNQALSCVLLSGILFIIITVTSIREKIVDAIPQNLKYAISGGIGLYIALIGLKSGGVIVANQATLVGFGNFANPGTLLTIIGITITAILMARGIKGSILIGIISTTIIGIPLKITSLENLHVFSAPPSIAPTFAAFDFAGLFSKGGTSIGGAILSVIMVVITICLVDLFDTIGTLVGTATKAGMLDKDGRVIRMRKALLCDAVATTAGSVLGTSTVCTYVESTSGVSEGGRTGLTSVTVGILFILSMFFSGIVGIVPGQATAPALVIVGVLMMSAIVKIDFDDFTEGLPSFFCIALMPFTYSIANGIAAAMIFYPIVKIATGRQKEISPIVYVLALLFILRYILLPFE >CP029329.1|AWK49911.1|451937_452162_-|hypothetical-protein MSVAKVNQNSGNIMEKIYFLKQYKGKTFKNIFGYKTSLIGEIKTVHPEYRYIRGQEFPKLLKWGRKLDNTSTEP >CP029329.1|AWK53015.1|452423_454184_-|AAA-family-ATPase MKITLKDISDVVNKYSKLLSSILKLDVEVVDSNFERIAGTGIYKDGIGENIESEGYVYKAALSSGNAQVIENPGRNILCKNCKDKGNCKEEMEICVPIKYGNNTFGVIGFVCSTKDQKEYLLNNFETIMSFLEQVSDFISIKIIEQNEVLTNKNDLKFLEQIINSVEDGIIAINSSNKIHLINNKGIKILKLNPSIIGETIKIEDTEDYLPSRNTYKLYIKDIEYKVVGKIIHNYINVETCSQILVFNEIKQINEDAVNLTHGNNKITCDAIVGESLVIKQMKEKIKRIAYSKSTVLITGESGTGKELVARAIHAEGNTRDKPFIAINCGAIPESLLESELFGYVKGAFSGASTSGRIGKFELANKGVIFLDEIGDMPIYLQVKLLRVLQERTLVKIGSNQLINLDIRVIAATNKDLKKLVEEGKFREDLYYRLNVIPFEIPPLKDREGDIELIMNELINKYNKIFNKYIHTVNEDVINKLKEYPWRGNVRELENLVEFMVSISHENGIINMNMLPKAIANYSKNEYVKIDDQINENKEIKKLKDIEMAYIEKILDLCGRDTLGKKEAAKKLGIGIATLYRKLDEK >CP029329.1|AWK49912.1|454610_455252_-|hypothetical-protein MSVYDDLDFFKRLIKGISEEFGPNCEVAIHDLKAGYEHSIIAIENGHVTGRKVGDVASRIAMETIHSNHQHKDHYSYNTRTNDGRILKSTTICIPDKNGETKGLLCINYDITQLIVSNKIMTDFVSINETKNNNQAEVAIPTNVNQLLEDLIEESYELIGKPVAVMTKEDKMKAIKYLESKGALLIKKSGDKISKFYDISKYSLYSYLNSYED |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029329_2 | 561419-561513 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029329_2
|
1 spacers
spacers of CP029329_2
>2.1|561442|49|CP029329|CRISPRCasFinder AGATTTTGGTTCTCTACTTAAGGAAACTCGATTCGCATTCGCTCACTGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029329_2
The CRISPR arrays of CP029329_2 >merge|CP029329|2|561419-561513|CRISPRCasFinder GTAAGTGACTCACACAAAATCATAGATTTTGGTTCTCTACTTAAGGAAACTCGATTCGCATTCGCTCACTGAGTAAGTGATTCACACAAAATCAT >CP029329|2|2|561419-561513|CRISPRCasFinder GTAAGTGACTCACACAAAATCAT AGATTTTGGTTCTCTACTTAAGGAAACTCGATTCGCATTCGCTCACTGA GTAAGTGATTCACACAAAATCAT
>CP029329.1|AWK49989.1|557926_561061_-|cell-wall-binding-protein MNKMKSRFVALLVVFTSIISFLPVGFSGQAAKSATIGTDATSIQVNVTGSTTALTARTDTTTKEEIYTVGGVESGFDISVKDVRTDAGTLEAQAKTSKQSTSGIVGQKVDLISINGTPCYTDADNTIINPILGDIGIGITNYSKVLGIPDRIGKTITGLPLGVNKIEYRITITTQDVVYTPEEKDNSGTVTQVAKTEIKAPVPTTYANQKITIEHATTYVVGKINPMTFKAYVGQASSFNDSDEIIDPTSALNTNNTVPFLYSTEAQPDANMALRYTFDVPDSISTLKYVMTFEQTINLDGAKVYKNGTEAEEGSEYTIDGRQLTGNLERLGQSDSIVVKLNGTSSISKAYAIEIRYNNLSSDKDYSLKNAGITKLDYNDDSTVPAYIGKKFTITNDKSGFKIYKGNIYIDSRSRMISLEPTLIRSKDTVAYVVTNNYVDSSGTTRVKQSMLKNGKQFVDFMASTTSNELQVDVYEGKDGNVINSSTILARYLLKVNLQTDNQFTMNLGFYSSSTTANLTQQGVDKIENIVGFTTSRRTYDLCFGDLSADLAGQDVGDPVTVSFTGKRSDKNEYIRVWLGDDVNSTNPKEAQVSIDNEYNGNLSDTENYLKRNTSLNVTLGTAKKMVVQAYYDEFETKKVNGVDETVLAGSYPVGDKYVFYLPNNYDINTTPTPGDNSTNASLNLLKLKGYTLKDSDENEGFSSDKFDYTSTVAKEDTTVKITAVAEDDNVKSIVATIDGGSESYDLVSGQISELPLNENGKTTIKIVVTAQDGTTSKTYTVVIKNNSKGSNINLKNVILNVGDYTFDPKADTTKVRVDQNVTNIKVTPIAEDSKATVTVNGEEYLGSAISISLKGAQKTDINIEVISEDGKESKTYTLEVNRVDSADWGDDPSDDGDATEDDQFYDEYNECWVDLTKYDEWGSVNGKPTYFDKKSRQVKEAWISTGGKNYYLNNLGYRASGWKVEDADGKTYYLDPKTGEMKKGWMNLNNSWYYLGLNGVMHKGWLFLNQKWYYFTPNGQMVINQSMFIEDKVYRFGQDGAIY >CP029329.1|AWK49988.1|555806_557657_-|LPS-biosynthesis-choline-kinase MLEDKLEVLKALNDNFNINQRELAKRTNMSLGKVNAVLKDFTMEGFIDRIINNRGTLYKVTEKGMKFLEENIASAKSTRLKIHEEEKKIVKQAVILAAGKAEEFGKPVGMLEIEDIKLIDRTLNILKENGITKIVIVIGYKSEYYEERFKNSKNIILVKSDTYKWTGTMHSLSLAKEYIDDDFLLVENDLIFERKAIKELAESENRDCILFTNESGSGDEAFVEIRDNHLFKMSKDIHQFNRIDGEMIGLTKISYKLYNMMLEEFKGNVNPYLNYEYVLLDVARNYNIGFVKIDDLAWGDADTQKEYEKIKNYLYPTIRRRELSYEINNIKAIIREALKVKDEDITEVELAGGMTNKNYRICVKGSRYILRVAGNGTEQMINRNTEMFNSAIASEKGYNVEVPYFSLETGVKISKFIENAETLTHRSIKKEENLKQVTGILRDLHESTDFHMDNEFNMFRELEKYEGILRKDKGDFFEDYDEVREKVMALEEELKICKRVFVPSHNDLVSENLVKDTEGRIYLIDWEYSGTNDDMWDLAALSLENEFSENDIELMFRLYFNGKEADENSRRRLLIHQICQDMLWAVWTLIKEAEGDDFGTYGIDRYNRAKEYLKKL >CP029329.1|AWK49987.1|555096_555792_-|CTP--phosphocholine-cytidylyltransferase MRAILMAAGMGTRLRPLTLNTPKSLIEVNGMSLLERQIINLREVGIDEIIVLTGYLHEKFDDLVKKYNLIKVINDKYDIYNNIYTMYLVREYLEDAYVIDADQYITRNFLPKEMPNTSVYYSACKESIKGEWILKYDEQGKIYGIKIGKEEDKPNYIMSGASFWSAKDGALICKKVQEAIEVNNSTDIYWDNIAVDNLKDMDVYIEKIQSNDIFEIDSIEDLEYLKRTLEL >CP029329.1|AWK49986.1|554024_554717_+|hypothetical-protein MIFMNVTIIYGTIRKASTYNCVQLLLNNIKLNIDIKVTEFFLPRDLPYFCRECTSCLINLENACPHLNDSNYIITSLYKSDLIILACPVFKCDISSNMKLLLDNLSYKFIQDKSNSFMSKKIGLVMSTAAGAGLFYTTKTLEKDLAFWGIKNIFKFSSTIYEINWDHVNLTTKKKMQKKIFTLSCEILNLYTNSFPIKVPIINKITLLQKRTRFKEYNCEVIDFTSCKNH >CP029329.1|AWK49985.1|553419_554028_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MNTKEKIIYESLNLFSIKGFDAISVRDIANKVGIKASSLYNHFKNKQDIFDTVIKKYSNYSNQIFKNINTTNNTNNFIINRFKDLSDDQFLKVHMKMFRFYLEDEYIVKFRKILTIEQFNNPEISKIYNEIFINNILDAQAKILTILIDEKLLIKKDPYTLAIQLCSPIFLLFYKYENMTDKEIKILKNHILEFRNTYIMKG >CP029329.1|AWK49984.1|551569_553027_-|flippase MAKSISKNAIFKAMLNLFNIILPILVIPLVSRSFGDELYGYMGYGDSLTAYFLIFASFGIYQYGLREISKVRDNKAKLRQTFTSLFLFTSVTNIVASSAYMIFVAIFYKNEPYFYTCIILGFNLVFNMFYVEWVNEALENYDFIALKTMVVRIIYSALILLFVREKGDFLFYLYLVVGFNFINNIISFIYVKKKLKFDFSNLQFLIHVKPMLYVVILSNTGVLYTQLDKIMLKDSMGGTTAVGYYYMAQRIMLIVNTLLLTIIQVTMPRLSNYLGNDSKKQYLILLKKVIKIYFLLLFPASIGLLCLSKEAIYIFGGPAFLGAVPVMVVFAIYMLSIGVEGVIANQMIYLHGKEKEDAILVLIGGIINLIFNIILSITGNFNMVSAIITTLIANLIVIALEYRMVKKVIKLDIHLFAYENIKYFYYSLVFIPITFAIKFVISNMIISCVLEVVICGLVYLAILIITKDSVFFELLNKILVKFKHK >CP029329.1|AWK49983.1|549992_551084_-|hypothetical-protein MNEVTGGANASAAAAKKKLSSEFLRKGILIALFSGIMYGFYSAFLTFGMTKGVWADWYGINAAGLSAFVITYLLGALGSAVNDTCSAVWALLFAGVKGKLGDFFRCLNTTPGRVMILAALIGGPISSTAYVVGLQMAGSIVIPISALCPAIGAILGRILFKQELNKRMMLGIVICVIASFMIGSTSIGGDAPEGMFLGICIAFIAALGWGFEGCVAGYGTSMIDSEIGITIRQVTSGISNLIILLPIFGMMAGNVSLSTDLATAAFTSGSAMIWFAASGFCAFISYMTWYKGNSMCGAALGMACNGTYSFWGPFCCWIVLGVFGGIDGWGLAPIAWIAAVLMVLGILVIAMNPLDLFRKKEDK >CP029329.1|AWK49982.1|549724_549991_-|hypothetical-protein MKPLNYAILKYFTKVDEACAEDVIEALKGEYGNFKALKRDAVITALMTAEANGLLEETRFELDQAANLRVYYHAHEEGAATINKYIKD >CP029329.1|AWK49981.1|547103_549503_-|sensor-domain-containing-diguanylate-cyclase MTIRKRFIIFSIILGIVPVIISTSICIANFNAKNIELIKQNIITEANDQSMHLEAFFDQNVSDLNITANIPLVKDLLFDSNNKVNIENQKNNRKILNELFSDRINQQFYLSIGLLINNDGIIIASSDDEYINTEIMISSKEIERLKNNELVITNIIEREDFNGGIKSAIIAKPIFLGNQYQGAVINIINMNYFKNILNNIHFFQSGKISVMDSNGKIAVSNSENLKDSINRINTSNNLYEQWIKIDFHSNPNGLIQYEINGKEKIGYYSTINNTGWIVLSGVEWAEFKNPMYKNISNIITFTIFIFIIVIVSYMFIINYFTKPIYKLLEVIRKIKQGYTKDRFIYDKNNEFGEIATAFNDLIDNIEKNKKHIQEKNRDLQSITSNIPGGVYRCRIENGDHILEFVNGGYLNILGYEKHGFKDVFGKKLIELIYEQDKERVIREIREQLCKSNKYNVEYRVKQKDESVIWLLDKGQIMKNKYGKEISYSVVINITESKIIQEELRLSEERYRIVMSQTEDIIFEWNIKDDSIYFSENWKNKFNYESTIVDISKKIYQSNIIYKDDIKKLGKILNDIINGERYKEIEIRLRKNDGEFIWCKIRATAMFDQENNIFRVIGSIIDIHKEKMEADKLLFKAQRDSLTGLYNKGTVESVIEEYLENEGLNSKGALFMIDVDYFKDINDNLGHLVGDYVLSNISSMLSEVFNENSIIGRIGGDEFIVFLKNIDSQEFLYKKADDLVKGFKTDFVEETKDYKVSGSIGISRFPEHGKSFRELFVNADEAVYLAKNKGRDNYCVFGES >CP029329.1|AWK49980.1|545328_546693_-|6-phospho-beta-glucosidase MKDKKIKIVTIGGGSSYTPELIEGFIKRKDELPIGELWLVDIEDGKEKLEIVGAMAKRMVKAAGIDWKVNLTLDRREALKDADFVTTQFRVGLLDARIKDERIPLSHGIIGQETNGAGGMLKAFRTIPVILDIIDDMRELCPDAWFVNFTNPSGMITEAAIKYGGWDKTVGLCNLAINAIKDCSKVLKIPEKDLFFKFAGLNHFHWHRVWDKDGNERTEEILNKMYNPEFEKEAIGFGVANIKDVKFNFEQLKDLEMLPCPYHRYYYVKDDMLKSELEEFSKGETRAEVVKRTETELFELYKDPKLDYKPEQLTKRGGAYYSDAACELITSIYNDKRITMVVSTTNKGSIEDLPYDSVVEISSIITANGPQPINWGKFNPAARGMVQMMKGMEETIISAAVTGNYNKALHAFTINPLVPSGEIAKELLNEMLLAHKKYLPQFKEAIEQLTMQNE >CP029329.1|AWK49990.1|561745_562144_-|hypothetical-protein MNWLKKFMYGRYGADQLSRALLILSFALIVIAGLLPRNLSSLTAIGYIPTLICIFRIFSKNIYKRKQENYKYLTFENSMAKWFKQKLNRVKDSKTHKYFTCPDCKQKLRVPRGNGKISVTCPKCKKTFKGKS >CP029329.1|AWK49991.1|562442_564473_-|cell-wall-hydrolase MKAIKRLTTFLFAFALVLVLIPITNTKAAITDIKIISETKVTAKQAEQWAKSKGATDAFIGLAELYWKYAPEHGNVNPAIAYVQAAKETGYGNFGGVLDESYKNPCGMKTVVGGADTDPNAHQKFNTWDEGVQAHLDHLALYAGAIGYPKSNTYDPRHFVTIKGNAVTVNALGGKWAPSLSYGEDINKSYNDLLVSAGIVSTPKTEIDDSKVVDNSNKTSEATNSSTNTTKNTGSAATVDKAQTNTIAPTGVQATEPIKTTTNNSTNISSSIGWKLEGGNWYYYKSNGSKSTGWIKPDSNWYYLYSDGSMAKGWLKDGDKWYFLKSSGAMQIGWLKDSGKWYYLQGDGSMATGFKLIDGSKYFLDVSGAMRIGWFEISGQWYYFNTGGNMLTGWIKPNGSWYYLHTNGVMAKGLLDLDGNTYYLNSSGAMATGWISDGGNTYYFRPGSGIMVKGTVINGWQIGPDGKRGNKVSGDTSGKTIVIDPGHNFGGDDGAYATFNGVTYAERDLNMQIAAKLKAKLESQGYNVIMTRNESDREVSSVTESLTNRVNIANNAGAALFVSLHHNAASEAATGVEVYYSSRAQDDNFGGAYSDSKLSASRSLASSISSAITNSTGAINRGAKDGNLFVCRNTIMPSVLIECGFITNPNEAQKCADSSYQDLAADAIANAIASAI >CP029329.1|AWK49992.1|564870_567108_-|cell-wall-hydrolase MNIKKKIITLVLTFAMVLSLVPTLSVQAATTDFKIISNSEVTAKQAEKWAKSKGATETFQDLAELYFEYSSDCGDVNPAIAYVQAAKETGFGKFGGVLDESYKNPCGLKTSSGGGDTDKNAHQKFDTWDEGVQAHMDHLALYAGAKGYPKDDTYDPRHFVTIKGKATTVNSLGTKWAPSATYGEEVNALYKDLLDFAGVDYQKDTDEADEDSNDSDETSNAVPNPGKTESKPSAPNVSEVISENKPQTGDETVDDKTNITSTVGWKNEKGAWYYYKSDNTKAIGWIKPDSNWYYLKDDGKMATNWLSDNGKWYYFNNSGIMVKGWKQLNNDWYFLTDSGVMATGIQYDGSSLYYLKDSGVMATNDGWIKLNDKWYFSEKSGKVKTGWLKDNNSSYYLQGDGSMVTGLNKIDGKSYMFNDNGTLATGWIQLNNYWYYFNTDGSMSTGWILDNGTNYYLYNTGAMAKGWINLDGTWYYLKESGAMATGWVTSNGDSYYLDTSTGRMVTNTKIDGFKIGSDGKKQASSNQDNEDNPATSNPTNNNPSNGKKTIVVDAGHNYGGDGGATATIDGVTYNEADLNIMVASKLKTELENRGYNVIMTRYSGQRETIALIQSLTNRVNIANNANADFFVSIHHNSASETAQGVLTLYSEESQDATFGGKLNSSRIEKSKEMATLINNNIANKLSLNNRGGQEQNLFVCRNANMPAVLVETGFITNKEEAIRCSDPASQQKVAAAIAEVIAGNI >CP029329.1|AWK49993.1|567392_567719_-|hypothetical-protein MSNSNFCDTDFDTLGTNSGTTCDPISDLTLSTMVVENQGVLLNKLIMILLFLYAYTNQNFISYLMCMNEKLIDNQSCLTCKLVDNLMDTLADCQENLGNCRRGKNHNH >CP029329.1|AWK49994.1|568107_569703_-|peptide-chain-release-factor-3 MAAYIKEIEKRRTFAIISHPDAGKTTLTEKLLLYGGAIRLAGSVKARKASKHAVSDWMEIEKQRGISVTSSVMQFNYDGYCINILDTPGHQDFSEDTYRTLMAADSAVMVIDAAKGIEDQTRKLFHVCALRGIPIFTFINKMDREAQDPFVLLDDIENELGIKTYPINWPIGSGKEFKGVYERQNKRVLAFNAGNHGQTEVTSTEGDVNDEIFKDLLGTPLHDKLMEDIELLDIAGDELDPKMVREGDLTPVFFGSALTNFGVEPFLEHFLKMTSAPLSRNSSIGEIDPMDKDFSAFVFKIQANMNKAHRDRIAFMRICSGEFKKGMEVMHMQGGKKLKLAQPQQFLAAEREIIEEAYAGDIIGVFDPGIFSIGDTLCMPSNKFKFEGIPAFAPEHFARVRPVDTMKRKQFVKGVTQIAQEGAIQVFRETHIGMEEIIVGVVGVLQFEVLEYRLNNEYNVDVKMDRLAYRYVRWIENKDIEMDSLNLTSDTKKVKDLKDRNLLIFQNDWGISWALEHNKGLILSAVGKSED >CP029329.1|AWK49995.1|570285_572106_+|cell-wall-binding-protein MIKRMSKATSLLVAAAAIISIIPANAADYKKINSEDGTVYNAIAYKNGNFYIDGEIDDKDDASYYLANGKYTNLDDIDSGASAAGYGSKYVNVEEGDYFLDLETGKVTDDNLKDDAQDDAASALRKNIKKDTDGRYVKTDAETIKNLANKELIGNKFGQVWYQTQYTSLNDTNGFTTATPGQLNVYTDGKGSYIDADYNLGSIKVTTTSTAIGVSPKTVTVTNTDDKFDGAGLNDAVTSTVSTSSTVIGQDSSNIYRIAKITIKTEATVSVSKINGIDVTANAFNTSTQGEVSFNVIQKISKTQASGDIDGAKYAKSVTNYIIADDKGVDASVNLLTKYTVSNGKIITYKIDTTDNSVETATIILTSKNGYYYTDFKKKADEKAAVVDSNNLAVDTDVDGNLWRLSGGYIYRWDNNKDWEKIYKVDGSFNEISVYDKDNIVAWNENDEVYSVIGGTEAETPAEETPEVNTGWVQAPNGTWSYNKADGTKATGWLQDGAWYYLKADGVMATGWYNDNGTWYFLNGSGAMQTGWLNNNGTWYYLQSSGAMKTGWLNDNGTWYFLQSSGAMTTGWLNDNGTWYYLYSNGAMAANTVVDGYNLSSSGALK >CP029329.1|AWK49996.1|573111_574968_+|cell-wall-binding-protein MIKGMSKATSLIVAAATILSIVPASAANYKKVDSEDGIIYDAVAYKDGAALIDGEIEDIDGAYYLNDGNYLELEDVDSGSDYTSYGTKYANVDEGDYFVDLETGSVTDDDLNDDDLDDAASALRKKIKKSDRYLDSISTPNTTVFGDTDIADLTEIAGNKFGESWYEANIAEDKSASSNISKTGLTAGGNPYFTVYTDTRGNYIDADYNLGKIKVSTTNAGIAVTTSAAVTIENTKDTYDLRGGDDTYAKIKQSVTLGQDSNYIYRYAIISVTTTSDKDGQVFINNRAFNITTGAPNSISTVDLKVIQKISKTQDGDDIDDAEYSKTVTNYVISDDDAKLIGNDETNYLNLAKDTTGKTQARVIGGKLVLFQVEENSDDDNVTVQAATLKSKNGYYYTDLEESTTITAEFNDDLDKTAFDTDVDGNLYVIDGGYVKTFDGTDDWDKVYKVDGSMDALSVYDKNNMVLWSQDDEVYSLIGKTTTDGDTTVETPVVSAGWAQATDGTWTYINTDGTKATGWLNLGGVWYYLKADGVMATGWVLDGSTWYYLNPVSTGTQGAMKTGWILDGSTWYFLSGSGAMKTGWINDNGTWYYLYSNGAMAANTVINGYRLSSSGALI >CP029329.1|AWK53016.1|575189_576194_-|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MLAFKKAIEYGADGIETDVQLSKEGIPVIIHDETLDRTTNGHGFVKDYTLDELKIFRTKSVPRVQALKTDALEEMVYLKSKILEDLQIIDNEQLKKIQLVNNEMLKKMPYLKELSFDKIQDSKLEIEGIFDNLNADNIKNLKIGDYTIAEVEYFQNRGGEEIPTLRELLELVAKSDLKVLNLELKNSVIEYKGLEEKVLTMIDNFNLRDRVIISSFNHMSLIKIRKLEDQRIKLNKNLSTKKRITLGALAESILVNIPKYLKAISVECYHPYFPSILNKAYMEEIKKAGIRVNTYTVNNMEDMQKVIEVGVDSIITNEVEILNKLKVNKYTLDI >CP029329.1|AWK49997.1|576550_577612_-|bacteriocin MKHEFFKKLIVAAVITSTIITLAPVGVSAAWVKNDYGNWSYTEGYRYATGWRQISGNWYFFDDIGQMRTGWINSNGEWYYIDLSGIMQTGVIQIEGKIYVFTQSGEMQKGNCIVNGILYNIDDNGVCIGTDVPMPIKGFDYYGNSTLPYVPSQIVSDDIKMSSDIPSDGSKQVKQYKVKFKDPYAEDSDDELLKTRTIDEDTNMTLYKPTKSGYAFVEWNTDSDGDSTSYEYDDKIKIKKDITLYAQWEVDDSSTAEDTKKVEAITVSDSNNLAKITTKSGSLQMTKKVYPNDATDQTVTWSVSNNTNNTTGEATISTSGKLTAVSNGTVTVKATAKDGSGVYDEFYVKITGQ >CP029329.1|AWK49998.1|577759_581161_-|hypothetical-protein MRRKFISKIILGTMISTTLCTLVPIKASAEWVKDYQNNWYYTQDNQRMTGWKRIDGQLYYFDDNGKMQTGWIKAGGSWYFLQNNGVLKTGWINYNKNLYYADSSGEMQTGTVNIAGKVYMLDDNGVAKTRNTVIDGQFYTIGSNGEVVGMKVPTPDKEFDESGNVLTVLKNGHNKSTTSPTDSKFNEVIEDESISDDDPNEGRTFKVRFKDSNGAELKTKSVKNGKSVDLYEPTKSGYVFAGWDTKSDGSGKSYDKNDNIKVKEDINLYAQWADDDAIYVDDITVKGSSYVTINNTSQMTAEISPSDASNTSVTWSVTNGTGKATIDSNGLLTGTANGTVTVKATSKDGSNISGMKEVTVSATEVVVPVSQISVTSNTGVSTITANGGTLQMKASVLPTDANKQDVTWSIENRTGSASIDANGLVTAKSNGTVTVKATATNKDGSTVVGSTTITISGQLLKIPVEGIVLSGADTITADGGTLQMTASILPTTASNKSVTWSVEKVGDTGTIMDGNATISSTGLLKALADGKVTVKATANDGSGIVKTKVITISGQSIIVTKITVNGKDDSTTITADGGTLEMSAIVTPTTASKKAVTWSVENVDGSAKIDSNGVLTAISNGTVTVKATATDGSKVVGTKDIELSGQSTIIPVSSIVVSGTNDATSITTDNGTLKMIATVVPTSTTSQAVTWAVSSGTGTATMDADGTLHAVTNGTVIVKATSVDYPKVIGTKTISLSGQFVEAISITVNSTGNASEAVVDGTLQMSASILPINTTYKTVKWSVDSVAGSTGTATITSTGVLTGKSAGDVNVIATATDGTGIFGSKTIKIIPQVLVDGITVITPSDSNEEIKSPNGTLQMSANFTPYNVTNQVVIWSVESIYDPVTGLTGKATISPTGLLTAVSNGAVKVKAISTDNGKVASNPITITISNQVVKATGFALKGFALNGGVIGTTEVAQITVDKGTLQMQANVFPTNATTTPSAITWSVEQIGDTGTAMTGKASVDSTGKLTAIANGTVTVRSTATILGGTQVITGAKVITISGQIILVTDVLITGLDTVVSGKTLQLPTDIKPTNATNQTVKWTVTDFGGTGDSIHAAIDASGKLTAVSAGTVMVTATANDGSGKSFTKTITIT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029329_4 | 675745-675845 | TypeV |
NA
Consensus repeat of CP029329_4
|
1 spacers
spacers of CP029329_4
>4.1|675773|45|CP029329|CRISPRCasFinder GCTGGGTAAGCGATTCACATCAAATCATAGATTTGAGTTCTCTGC |
cas14j |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029329_4
The CRISPR arrays of CP029329_4 >merge|CP029329|4|675745-675845|CRISPRCasFinder TTATAAAAAACCCGACTCACAGACCTTCGCTGGGTAAGCGATTCACATCAAATCATAGATTTGAGTTCTCTGCTTATAAGAAACCCGACTCACAGACCTTC >CP029329|4|4|675745-675845|CRISPRCasFinder TTATAAAAAACCCGACTCACAGACCTTC GCTGGGTAAGCGATTCACATCAAATCATAGATTTGAGTTCTCTGC TTATAAGAAACCCGACTCACAGACCTTC
>CP029329.1|AWK50062.1|675002_675680_-|arginine-ABC-transporter-permease MNFTFLEKYSGYFLKGTEITIVLAFFAVLFGTILGLALTLLRRSKFKPISFIATAYVEFVRGTPLLVQIYIIYIGFPHFDGLPKFIGIPMEDLLVGVIALALNSAAYVSEIMRAGIDAVDKGQMEAARSLGMNQGLAMFHIVIPQAFKNILPALGNEFISVIKESSQVSVIGVAELMFNAGVVRGNTALGLEPIIVAAVIYFIITFTMTRILGYVERRMKASDIR >CP029329.1|AWK50061.1|674293_675016_-|glutamine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIYVKDLHKSFGKNDVLKGIDEHISKGEVVVVIGPSGSGKSTFLRCLNLLETPTSGTITFEGKDITSKETNIDEMREKMGMVFQQFNLFPHKTVCENICLAPMKVKKLSKDEAKKRTITLLEKVGLVDKVDAYPASLSGGQKQRIAIARALAMQPDVMLFDEPTSALDPEMVGEVLSVMKNLAKEGMTMVVVTHEMGFAREVGDRILFMDGGKIVESGTPEEVFKNPKNPRTIDFLSKVL >CP029329.1|AWK50060.1|672528_673704_+|cation-transporter MFFEHMVNIFIKNNSDIKDNKVRNSYGVFGGIVGILVNALLFIIKLSVGLFVSSIAIMADAFNNLSDAASSLITILGFKLSNKPADREHPFGHGRIEYLSALIVAFMVMLVGVQFIKSSFQRIVNPTPVTFELVPFILLFISIFLKIWLSRFNKFVGEKINSSALKASSVDALGDVFTSTCVAISFLAANFTSFPIDGYIGMVVALFIVYSGFSLVKDTINPLLGEAPDPELVNSIKEMVLSYDKILGTHDLIIHNYGPGKCMASIHAEIPSDICVVAIHEIIDKAEREISTALNIYLVIHIDPICIIEGEVKGAYEEILSLIKKYDYIKSIHDFRVVGEGEVKNLIFDIVVDSLNESPITDSELIDKFSESVQKSHPYYNCIITIDKDFI >CP029329.1|AWK50059.1|671424_672309_-|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-synthase MKDVIFTGAAVAIVTPFTEDGVNFSELKKLIDFNIEKGTDAIVIAGTTGESSTMSDEEHKEAIRFTAEYVNKRVPVIAGTGSNDTMYALELSKYAESVGADALLLVTPYYNKTTQSGLIKHYNYIADRVNIPIILYNVPSRTDVNILPETYVELAKHPRIVATKEASGDISAIARIKALCKDELNIYSGNDDQIIPILSLGGKGVISVFSNIMPKEAHDICSLYFEGKVKESCDLQTKYLDIINTLFIEVNPIPVKTALGLMGYNVGPLRMPLFPMEEKNLEMLRMQLKNNNLI >CP029329.1|AWK50058.1|668615_670031_-|M18-family-aminopeptidase MNNAQELLDFINKSKTAFQSVYEIKCILDKNGYSEVKEEDKWDLKKGGKHYVIKNDSAVIAFEVGTGEIEKDGFRLIGAHTDSPGFRIKPNPEMLVEGHYLKLNTEVYGGPILSTWFDRPLSIAGRVMLKGEDPFNPEVKLIDVNKPILIIPNLAIHMNRNINEGYSYNKQKDTLPLMTIKNNDYSENLTLEVQNNVEIEEENTCNKINNTKTEKLENESLNIVVNKLEKDEYLLKLIAETLKVDYRDILDFDLFLYEYAEGMLIGVNDEFISCGRLDDLWMVFAGLKALLNSNKIKATKVLVALDNEEIGSLTAQGANSSILESILERITLALKKEREDFKRTLSNSIMISADLAHAIHPNYTEKSDPTSKPMLGKGPVLKIAAGGSYSTDSYASAVFKSICENAEVPCQVFVNRSDLRGGTTIGPITAAKLNIPVIDMGAPVLSMHSIRELASVKDNEYTIKAFTEFFN >CP029329.1|AWK50057.1|659155_668362_-|glycosyl-transferase MKNNNFYGVRKNVLRELEDGFSCIRENFKYFSKLSKNGHKVLGACEWLLDNIYMIEKEYKGIKMEMPTDYFKGLPSMSRDLESLILGESLTQEMHASGVSLSREPKSKILRESLTQGTNVSRVSLKDKELIPRIFLVAKNYINNEDEISCDKFIKYINEFQEHSIQNETEWNYVDVHVEEEILNTNAGNNEITFTMGELWAFPLMLKIAIIINLSKYTQEIVNIQKGILNESNGEMNSDFNSNGIKGNLREEFLEKHIGEYINSIRKIEGISWRRFFENTSKVEKILKEDPEDIYNYMDFESKDYYRHKLEKIAKVIQINEISLANYVLELAKSSKDNKEDSYKCHVGYYLIDDGISEIKGYHHNIRGVISEETYLTINILGTLMVSMILLFISSLLGITYTKTQYIISLLIILIPINEIIIGLINWTVSKISEVRLVPKLNFSMGIPDENKTVVVIPAIVNSKEKVKELMDKLEVAYCGNKDKNLYFALLNDFCDSDYESEERDTEIIRCGIECARSLNEKYCNNNRNNNGNSINDVREDKFFFLSRKRIYNKKQNIYMGKERKRGKLMEFMALIRNSNDHTYDVFSSEIHMLSNVKYLITLDEDTFMPRESASKLVGAMSHVLNIPYVKENKVVRGYGVMQPKVSISLESKNQTYFSKVFGGEEGVDGYSVAYSDTYQDLFGEGSFTGKGIINIDEFYPLLHNLIKDDKILSHDLLEGGLARCALVSDVEFIDKYPAFYESSCKRLHRWVRGDWQLIGWLFSNKISFLYKWKIFDNLRRSLLSPNLLLTLILSLTILKGRSQIAVLCFLGLIISLVFTVTDLVVTPKNKLMGTFKNFEQILLIISFIPYQSFLMIHAIIITLFRVCISKKNLLEWQASEFVEKNYSNTFMGYLKRMWIAPIMGLLILYLSFYSSFVVITYNLIVGILWIFSPYIAYSISVKLPDNNKNTLKNEEKNYLRKISRRIYAYYQDFANEENNYLAPDNYQENPFKGVAHRTSPTNIGMGLTSNIVAYDLGYITMFELVDKVELTLNSMKDLKKVNGHYLNWYNTKTKEPLWPRYVSTVDSGNLLGNLWVLKEVMEELKHNKVIRVKEVGALNDIYKIIEDEDSSIKLKFTSHVKIGEYFKVLNEILFKVEEFKNNEKISKLQQLDEVNDDNFNKEENNLNEEENDLSEKENWNKSILKFHNEESNYWISKLTDEVKKKIKYYNCTLGDLEKLYSKEFFEGVPNIIELTNRCEDYKRKNGDNFDCTLGQRIVTLKKYVDKIDKIIEDINKISEEMDFSFLYDKTRELFSIGYNVEENSLGNSYYDLLASESRTASFVAIAKNDVPSAHWFKLSRAMTNAFHTHSLVSWSGTMFEYFMPALIMRNYPRTLLSQTYRSVIKAQINFAKQKKTPWGISESAFYKFDVAENYQYKAFGVPGLGLKRGLEDEIVISPYSTLMTLTFAKNAGIKNLKRFEKIGALGRYGFIEAIDYTKAREDKYIITVSKKETENEIQNETLEKLAVDNYNIKKPNNGRNKDNILSIENNYPQNVDKNGDYVDNYDEIVDSYHKNVDNIWNENKDNDVDNVDNFQVPESIHENNAHEKNVGISNNSQKINKIMTYMVHHLGMSLMSLDNVLNDNILINRFHSLPEVKSTELLLKEKIPQNVTFERNEDFSIKNKYLEGETLIPRIFEKVNTDAPQLLLLCNGEYSSMITASGSGYSKKNDTMLYRWKGNSTSDDSGMFFYIKNLNSNDYWSSTFEPCKNSGDKYVAEFNLDKAKFSRKDGNIETVTEIVVSPEENFEIRKLILSNLGDKARSIEITSYMEITLATFGADVVHPAFSNLFVQTEYDEKENILIGSRRGRVKDAKIPYIFHKVITNGELEGSITYETSRINFIGRNRELKSPLAMDNDKSLNNTVGTVLDPIMSLRTKIRLQPHSQTEVFYITGICDSKEDVLELCRENSSNNKLNKIFKDYSIMIQLELRKFGIRSAEANVFQSIASQIFFLSNIRKNREEYIKNISKHQKDLWSYGISGDLPIIMVAIEKEGDINIVFTMIKFHYYLKLKGVKLDLVIYNNEEISYDEPLQKKIMEAIRFSDGGETLNKAGGIFIHNKATMDIEVKELLIGISRVYVDCKNNLNSYIDLEKNINSYTGVEKKSNSHMDLGRNLNSFGDLSKDLNSHMDIKNSLAPDIMLENNNEITYEEYDHDMDVINGDDLLKGTEETQESQDQSNFNHIKEKIKKVVNEENVEDLDFFNGYGGFSKEDNSYIIKLSNYKNTPAPWINVISNEDFGFHISEAGAGYTWCGNSRENKITPWSNDYIRDPLGEALYIKDNISGNYFSISPKPVRDSGDYLIKHSFGYSEFNHTAYDLKGKLEVFAPKGERVKIQRVTLENLSDEDRDVSVFYYAKLVLGVYEYDSSRYISTYISNGFIGGSNPYSEYFGKLNAYLTILGGENLSFTGDNKEFIGIGGEISEPEGLNHNNLSNRFGGIYDPCLAAVTSIKLRKGEKKEVVILFGQEERENIEKVINKYKIYENVEAELDKVKQYWSHFLGNIQVKTPDKSLDYLLNGWLLYQTLSCRYLSRSAFYQSGGAYGFRDQLQDSMALGVADSKIPKAQILRSASRQYVEGDVQHWWHPVVNSGIRTRFSDDLLWLPYVTAEYINSTGDYEILNQTAPYLEDEPLREGEDERYTIVNQSSKEGTIYEHCLKAIEKSLKFGVHNIPLMGSGDWNDGMSTVGNEGKGESVWLGWFLYSILSSFIEIAEMQNDKETKSHYEERKEFIRENLEKNAWDGGWYRRAYFDDGTPLGSRENPECQIDSLAQSWSIISGALSSEPKSTILCESLTQRAYASRVSLAEGMAKPVDSRARAIEAMEAVDSNLVKKDKGMILLLTPPFSNSKLEPGYIKGYVPGVRENGGQYTHAAVWVILALTKLGLGDKATKYFNMINPINHTKTELECMMYKVEPYVMAADVYIKEPHAGRGGWSWYTGASGWMYRVGIENILGLKKVKDKGYVIEPCIPKDWKEFEIKITNEKEDYNIKVCRTDKENVEENQTQVVINGEIIKDKIIPRNAGKLNINVYLR >CP029329.1|AWK50056.1|657845_658706_-|YitT-family-protein MSTYYKYKKNIIDILFIFSGCMIASLGVNLFLSHAKLLSGGATGVALILEYTAEVPAGIVILIINIPLLILSYKKLEKSFTIYTTIGMLCLSISLMITKPFKYLINMESDLLIFCIYGGVLCGIGYGLVFLRSGSTGGTDIITMLIRKKYSNFNIGSLGFSLNLIIVIIGAIIFGIPQALYTLISLFIQSVVLDRMLKGFSSKKLLLILTRKEKEIIEYVIKDLNRGVTSLFAEGEYTHDKKKMLYCIVSSHQMIELNTVVHNIDPGAFITIVDVSEVRGKGFLNI >CP029329.1|AWK50055.1|656030_657155_-|transposase MILGKKVRLYQTKEQEQKLWQSVGTARFIYNWTLAKQEENYKNGGKFIFDGDLRKELTILKKTEELKWLNDVSNNVAKQAVKDGCNAYKNFFKGLADKPRFKSRRKSKPSFYNDNIKLKVKENSILIEKIGWINIKKNVIPTDCKYTNPRISFDGKYWFIAVGIEKDQPVVELTIESIGIDVGVKDLAICSNGMTFKNINKTRVVKQLEKRLRRLQRRVSRKYIKNKEGSKFVKTSNIIKMEKQIKLLHRTLTNTRSNHNHQATNMIVKTKPSRVVMETLNIKGMMKNRHLSKAIAKQCLYDFKRQMQYKCEFNGIEIVEADKWYPSSKTCSECGHIKPKLPLSVRTYICEECGCVIDRDYNASINLSRYELVV >CP029329.1|AWK50054.1|654121_655852_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MQNNIKKMLVIFPMIFLLCTSFIGIYAKAEVKVDKQDIIVTTSITENKGTGSTNSGRSTTISGQNVEVPSQNDTETKYDEDLNKQTVVQEVLPEWKNIDGRLYYVTKDGILEKTGWFEEKDENPNAKNDNEYYLDKNHAATIGWKKFGRSWYYFNEAGIKQTGWQLIKYNWYHLDEDGMMDIGWIEDDGHKFYLNDEGIMTVGKKYIKDNWYFFRFNGILQTGFYNNNGKIYYSTKDGIMGANEWINTKSNKYYVKADSSIATGNAIIDNKMEEFNSSGKYTGTAKMKNHLFVKYLNVGNADCEFIKLPSGETVLIDTGDVKTPEKVVNFLKEQDLKQKDGKGVIDYIIITHGHSDHIGGLASILDNFKVKKVYMPDIAIMKDWYSDVKVTTENAANIEMMKIDYNVYNDAVKAMKDKNIEFTDTENGEFIDKNKILQFVQSDKDFGPIGSPALVAEYWGVNENSAIVYLNYGDLQALFSADMEWNSEKDFWVNDLLDGRDVDVLKVPHHGNDTSSTVDFIRYLKPDIGIISRSDKSIVKNIAYDNLISNGVSLYETSAKDGVSIYATPENWTVSK >CP029329.1|AWK53019.1|653029_653254_+|hypothetical-protein MTDLSGNIKNAYLPKMRTNYSPSDESVESATGVDFPINMPNPAVDPIVSNNISNAEFDYTQDMISPDNYDLDND >CP029329.1|AWK50063.1|676068_676899_-|amino-acid-ABC-transporter MKSGLVKKIVAVAAVATIAISMVGCGSSTKKESANSNASAIDTIKSKGKLVVGTSADYPPYEFHSEVNGKDEIVGFDIEIAKQLAKDLGVELEVKDMAFDGLLVALQADKVDMIFAGMTPTDERKQNADFSDIYYAATHRFILRSGDETAITSMDDLKGKKIGVQKGSIQEGIAQANFDATNIKSLDKVTDLILDLKNNKVDAVLAEAPVAQINIQKNPGISIADKVVVEDPDGGCAIAMKKNSPELQAEVNKTIKKLTDEKKIEQFVLDANKMVE >CP029329.1|AWK50064.1|677537_679745_-|ATP-dependent-DNA-helicase MNKQVDFLKEENKLNEILDILNKEILNYLEKRKGVTKYIIDSRKKYIEDYKDDEDQVIDYFDHENYVQEESYKTIDKRLMEYTKLKEAPYFGKVNFKENDDIPEDMYVGRYGLTLENSYEPLIVDWRAPIAALFYKGTLGKASYNPPVGEIQADILSRKQLIIKKGELKGVFDSALDVKDEILQMVLTENSSDKLKDIVMTIQREQDEIIREDRNKIVVVNGVAGSGKTTIALHRISYLLYNFREQFGDKVLIFGPNDIFMDYIAQVLPTLGESNIKQTTFENFAKKELGLEKVKIKSFGSYIEEAMNGNESALKEYKYKSSKEFVSLLDSQIETLNKEYFKIQAIKFKGAEIVSIKEIEELFNVYYKDMPLFRRSQKIKRILTSKIKDKRDEEVYKLNAELKEKMDNLSKDELEMEKSNIDYLKRIRIREIVREVINSRNELDSWIIVESVMDIYKKIINLKGIKEDTETLNNQDNNGLRTTLIENNEFLKEEVDNLGYMDLIGILYLMVKLQGLKVKEEIKHIVIDEAQDYSFIQFEIIKEMTGCKSYTIVGDSNQRLITTSKEPAMLHLDEVFEDSNIEIKKYELNKSYRSTQEIMEYANEFLNEDKIVPLVRSGEPVIQEEVTSEDDFINTLISIIEDYEEDGNENIAVIFKGKNELNKFAAAIKERINIQNIDNEDILYKGGKVLIPAYLAKGLEFDGVIVVENKEIQPLVKYIMCTRALHRLSVIKDLI >CP029329.1|AWK50065.1|679926_681993_-|cell-division-protein-FtsH MQNNNNNNGKNKKSDKNNKNSITMAITYFLIAFAFVMAFNYAKDSAINKEITYNEFVRLLSDKEISKVVITSENLIITPSESNEEYKGKTLYTANINDDTLINKLDEAGIDFTGKNPKETPIMNFALTWILPMIFIFFMWKFLFSKMGGGGGGVMGIGKNNAKIYVESDIKVTFDDVAGQEEAKDSLKEVIDFLNAPARYTEIGAKLPKGVLLVGPPGTGKTLIARAVAGEAKVPFFSLSGSSFVEMFVGVGASRVRELFKDAVAKAPCIIFIDEIDAIGKSRDNQMQSNDEREQTLNQLLSEMDGFDSSKGVILLGATNRPEILDKALLRPGRFDRRVIVDRPDFKGREAILAVHAKNVILGDDVDLAEIAKSTPGAVGADLANIINEGALRAVKRKRKTVLQEDLREAVEVVIAGKEKKDRILSPKERKVVAFHEVGHALVAAMIKGADPVHKITIVPRTMGALGYTMQLPEEEKYLTSKEELLNQITVMLGGRSAEEEVFNLVSTGASNDIERATASARSMVSIYGMSDRFDMMALESIQNRYLDGRAVRNCSEETSTILDEETLNIIRTSHKNARQILRDNRDLLDRISGVLLEKETIFGDEFLEIVYEKYPEMKETKEREKSENEKKVKELEERRAKKHSLDIVIDDKDENVKETSETTVDGEDDYKDVVNTKTINEDETKNL >CP029329.1|AWK50066.1|682054_682276_-|DUF3006-domain-containing-protein MDEKYIIDRIEENYAIIEKEDGDMYKISIENIKGNFNEGDILISRGKYFEVDKEFTLNRKNDINDSMKNMWEE >CP029329.1|AWK50067.1|682379_683024_-|signal-peptidase-I MREEDEIMESKDIDSLESSSDYSKSKDIIADKEGNLSKKGFVGIFTSKGGFFREWIIPIVAAIAIAFLINKFLVYNVYIPSESMVPTLNVGDKLMVTRVYDTDKIKRGDMIVFFSEELNEILIKRAIGLPGDHIKIHNGIVNINGEDIKEDYVKNNESFDGSFDVPDNKFFFLGDNRSRSNDARRWINPYIDASNIQGRARIKFYPFKDFGSLN >CP029329.1|AWK50068.1|683275_683830_-|signal-peptidase-I MRENDENEIIKDKKIKKKSIIREWIVDIVAIAFVTLLVWRFVGYGVWITSGSMIPTLEVKDRLIVTRVHNPENLEEGDIVLFKNDEFKDEILIKRLIGLPGDKIEIKDGIVFRNGEELKEDYVKNNEKYNRTFQVPKEKYFFLGDNRANSNDSRYWENPYVDESYIKGKAKIKYFPIKDFEILK >CP029329.1|AWK50069.1|684108_685404_-|diaminopimelate-decarboxylase MKLFGTMKAQGNELVIGGISAKDLVKEYGSPLYVFDEELIREYCRDYREYFKCKENNNRVAFAGKAFLTIQMCKLLKEEEMNLDVVSGGELYTAHKAGFPLEKVMFHGNNKTIDEIELGIKLGVGNFVVDNYYEMDALNDIAKEYNKVQDIYLRITPGIEAHTHDYIKTGQIDSKFGFAPVGTVIEDAIKKAISLSNINLAGIHCHIGSQIFDLEPYEDAVEIMLELVRNTKENFGYLIKEVDFGGGFGIYYTSIDEPRTTEEYCNTIINKVDEVCARTGQERPIITIEPGRSIVANAGITLYTVGSVKEIPNVRKYVSVDGGMTDNIRPALYNAEYECILANRIEGVSEEIITIAGKCCESGDILLENVKLPEVKSGDILAIMTTGAYGYSMASNYNKIPKPAVVMVKDNEARLICKRESYEDLLKNELI >CP029329.1|AWK50070.1|686115_686790_-|hydrolase MVNKEVKFVPQIKGTLRNHVIEVPTVIRNCGGIKIFGKRIKSLLFSTDVALIRNSNADAIIAVYPFTPQPLITQALVMAADVPVFCGVGGGITQGKRVVNLAMDAEFKGAMGVVVNAPTSNEIVKKIRATIDIPVIVTVISEDEDIAKRIEAGATILNVSGGKKTANIVRNIRNRFPEFPIIATGGPNDESISETIQAGANAITYTPPTSASIMCDLMDEYRNE >CP029329.1|AWK50071.1|687918_688896_+|transporter MNQNEFFNILMDGLKDFPEIKLHDIISYYENNFVLELVSGKTEEEIITKLGNPDLIVNKYRTEALKTPINTGYFTTDVDITNIGNKNYINNSNFTTNNNFINADTFNDFKTNDIFNNNNSIENGFKTNNKFNTFKTSSSYDDINLSSDFYNLRSSNQSNYNFTVKSDFNHNNKDDFNYNSSNNFNSDHNSDSNSNSFNDENHKNKILKFNVNTILIICTGILALAIFFPVITGIIGCIIGLLGVAISIFLASIGVLVGGTFTSFIGLPNVPMFVANFPHPSLVLFSLGSISLSILLIFLFYYLFKFLIQMLIKIYNSIKSKGGSF >CP029329.1|AWK50072.1|688895_689822_+|hypothetical-protein MKKKFISTNMKIFLLVLFLLSMTLYASGCIALVQSGYKLSDYADELNIDHQTFKFKFNLNKLNFDFDNSYISMNYPVNDNINEIDLNLNSQDVKVVNYDGEDLKVQIESHSVLSGELPKTESGNKLILNTRYDTPSNSSISLSIPYNFNDRGVLKIITSSGDINISNLSMNTLNLSTASGDIGVFGTTLNYLKLNNSSGDINFNNLTTLNETKLTSSSGDIIGSGTLGTVNGGTSSGDINLQFRNSLSNTFLSTDSGSVTLSLPINLGYKLNYETTSGNLESSNKQLSSGDESSLIDINTISGDLDIK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029329_5 | 683116-683194 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029329_5
|
1 spacers
spacers of CP029329_5
>5.1|683139|33|CP029329|CRISPRCasFinder TTTTTTTAAAGGTGTATATTCTTTAACAGTCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029329_5
The CRISPR arrays of CP029329_5 >merge|CP029329|5|683116-683194|CRISPRCasFinder AAGTTCTTGGTTGCGCTTCGCGCTTTTTTTAAAGGTGTATATTCTTTAACAGTCAAAAGTTCTTGATTGCGCTTCGCGC >CP029329|5|5|683116-683194|CRISPRCasFinder AAGTTCTTGGTTGCGCTTCGCGC TTTTTTTAAAGGTGTATATTCTTTAACAGTCAA AAGTTCTTGATTGCGCTTCGCGC
>CP029329.1|AWK50067.1|682379_683024_-|signal-peptidase-I MREEDEIMESKDIDSLESSSDYSKSKDIIADKEGNLSKKGFVGIFTSKGGFFREWIIPIVAAIAIAFLINKFLVYNVYIPSESMVPTLNVGDKLMVTRVYDTDKIKRGDMIVFFSEELNEILIKRAIGLPGDHIKIHNGIVNINGEDIKEDYVKNNESFDGSFDVPDNKFFFLGDNRSRSNDARRWINPYIDASNIQGRARIKFYPFKDFGSLN >CP029329.1|AWK50066.1|682054_682276_-|DUF3006-domain-containing-protein MDEKYIIDRIEENYAIIEKEDGDMYKISIENIKGNFNEGDILISRGKYFEVDKEFTLNRKNDINDSMKNMWEE >CP029329.1|AWK50065.1|679926_681993_-|cell-division-protein-FtsH MQNNNNNNGKNKKSDKNNKNSITMAITYFLIAFAFVMAFNYAKDSAINKEITYNEFVRLLSDKEISKVVITSENLIITPSESNEEYKGKTLYTANINDDTLINKLDEAGIDFTGKNPKETPIMNFALTWILPMIFIFFMWKFLFSKMGGGGGGVMGIGKNNAKIYVESDIKVTFDDVAGQEEAKDSLKEVIDFLNAPARYTEIGAKLPKGVLLVGPPGTGKTLIARAVAGEAKVPFFSLSGSSFVEMFVGVGASRVRELFKDAVAKAPCIIFIDEIDAIGKSRDNQMQSNDEREQTLNQLLSEMDGFDSSKGVILLGATNRPEILDKALLRPGRFDRRVIVDRPDFKGREAILAVHAKNVILGDDVDLAEIAKSTPGAVGADLANIINEGALRAVKRKRKTVLQEDLREAVEVVIAGKEKKDRILSPKERKVVAFHEVGHALVAAMIKGADPVHKITIVPRTMGALGYTMQLPEEEKYLTSKEELLNQITVMLGGRSAEEEVFNLVSTGASNDIERATASARSMVSIYGMSDRFDMMALESIQNRYLDGRAVRNCSEETSTILDEETLNIIRTSHKNARQILRDNRDLLDRISGVLLEKETIFGDEFLEIVYEKYPEMKETKEREKSENEKKVKELEERRAKKHSLDIVIDDKDENVKETSETTVDGEDDYKDVVNTKTINEDETKNL >CP029329.1|AWK50064.1|677537_679745_-|ATP-dependent-DNA-helicase MNKQVDFLKEENKLNEILDILNKEILNYLEKRKGVTKYIIDSRKKYIEDYKDDEDQVIDYFDHENYVQEESYKTIDKRLMEYTKLKEAPYFGKVNFKENDDIPEDMYVGRYGLTLENSYEPLIVDWRAPIAALFYKGTLGKASYNPPVGEIQADILSRKQLIIKKGELKGVFDSALDVKDEILQMVLTENSSDKLKDIVMTIQREQDEIIREDRNKIVVVNGVAGSGKTTIALHRISYLLYNFREQFGDKVLIFGPNDIFMDYIAQVLPTLGESNIKQTTFENFAKKELGLEKVKIKSFGSYIEEAMNGNESALKEYKYKSSKEFVSLLDSQIETLNKEYFKIQAIKFKGAEIVSIKEIEELFNVYYKDMPLFRRSQKIKRILTSKIKDKRDEEVYKLNAELKEKMDNLSKDELEMEKSNIDYLKRIRIREIVREVINSRNELDSWIIVESVMDIYKKIINLKGIKEDTETLNNQDNNGLRTTLIENNEFLKEEVDNLGYMDLIGILYLMVKLQGLKVKEEIKHIVIDEAQDYSFIQFEIIKEMTGCKSYTIVGDSNQRLITTSKEPAMLHLDEVFEDSNIEIKKYELNKSYRSTQEIMEYANEFLNEDKIVPLVRSGEPVIQEEVTSEDDFINTLISIIEDYEEDGNENIAVIFKGKNELNKFAAAIKERINIQNIDNEDILYKGGKVLIPAYLAKGLEFDGVIVVENKEIQPLVKYIMCTRALHRLSVIKDLI >CP029329.1|AWK50063.1|676068_676899_-|amino-acid-ABC-transporter MKSGLVKKIVAVAAVATIAISMVGCGSSTKKESANSNASAIDTIKSKGKLVVGTSADYPPYEFHSEVNGKDEIVGFDIEIAKQLAKDLGVELEVKDMAFDGLLVALQADKVDMIFAGMTPTDERKQNADFSDIYYAATHRFILRSGDETAITSMDDLKGKKIGVQKGSIQEGIAQANFDATNIKSLDKVTDLILDLKNNKVDAVLAEAPVAQINIQKNPGISIADKVVVEDPDGGCAIAMKKNSPELQAEVNKTIKKLTDEKKIEQFVLDANKMVE >CP029329.1|AWK50062.1|675002_675680_-|arginine-ABC-transporter-permease MNFTFLEKYSGYFLKGTEITIVLAFFAVLFGTILGLALTLLRRSKFKPISFIATAYVEFVRGTPLLVQIYIIYIGFPHFDGLPKFIGIPMEDLLVGVIALALNSAAYVSEIMRAGIDAVDKGQMEAARSLGMNQGLAMFHIVIPQAFKNILPALGNEFISVIKESSQVSVIGVAELMFNAGVVRGNTALGLEPIIVAAVIYFIITFTMTRILGYVERRMKASDIR >CP029329.1|AWK50061.1|674293_675016_-|glutamine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIYVKDLHKSFGKNDVLKGIDEHISKGEVVVVIGPSGSGKSTFLRCLNLLETPTSGTITFEGKDITSKETNIDEMREKMGMVFQQFNLFPHKTVCENICLAPMKVKKLSKDEAKKRTITLLEKVGLVDKVDAYPASLSGGQKQRIAIARALAMQPDVMLFDEPTSALDPEMVGEVLSVMKNLAKEGMTMVVVTHEMGFAREVGDRILFMDGGKIVESGTPEEVFKNPKNPRTIDFLSKVL >CP029329.1|AWK50060.1|672528_673704_+|cation-transporter MFFEHMVNIFIKNNSDIKDNKVRNSYGVFGGIVGILVNALLFIIKLSVGLFVSSIAIMADAFNNLSDAASSLITILGFKLSNKPADREHPFGHGRIEYLSALIVAFMVMLVGVQFIKSSFQRIVNPTPVTFELVPFILLFISIFLKIWLSRFNKFVGEKINSSALKASSVDALGDVFTSTCVAISFLAANFTSFPIDGYIGMVVALFIVYSGFSLVKDTINPLLGEAPDPELVNSIKEMVLSYDKILGTHDLIIHNYGPGKCMASIHAEIPSDICVVAIHEIIDKAEREISTALNIYLVIHIDPICIIEGEVKGAYEEILSLIKKYDYIKSIHDFRVVGEGEVKNLIFDIVVDSLNESPITDSELIDKFSESVQKSHPYYNCIITIDKDFI >CP029329.1|AWK50059.1|671424_672309_-|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-synthase MKDVIFTGAAVAIVTPFTEDGVNFSELKKLIDFNIEKGTDAIVIAGTTGESSTMSDEEHKEAIRFTAEYVNKRVPVIAGTGSNDTMYALELSKYAESVGADALLLVTPYYNKTTQSGLIKHYNYIADRVNIPIILYNVPSRTDVNILPETYVELAKHPRIVATKEASGDISAIARIKALCKDELNIYSGNDDQIIPILSLGGKGVISVFSNIMPKEAHDICSLYFEGKVKESCDLQTKYLDIINTLFIEVNPIPVKTALGLMGYNVGPLRMPLFPMEEKNLEMLRMQLKNNNLI >CP029329.1|AWK50058.1|668615_670031_-|M18-family-aminopeptidase MNNAQELLDFINKSKTAFQSVYEIKCILDKNGYSEVKEEDKWDLKKGGKHYVIKNDSAVIAFEVGTGEIEKDGFRLIGAHTDSPGFRIKPNPEMLVEGHYLKLNTEVYGGPILSTWFDRPLSIAGRVMLKGEDPFNPEVKLIDVNKPILIIPNLAIHMNRNINEGYSYNKQKDTLPLMTIKNNDYSENLTLEVQNNVEIEEENTCNKINNTKTEKLENESLNIVVNKLEKDEYLLKLIAETLKVDYRDILDFDLFLYEYAEGMLIGVNDEFISCGRLDDLWMVFAGLKALLNSNKIKATKVLVALDNEEIGSLTAQGANSSILESILERITLALKKEREDFKRTLSNSIMISADLAHAIHPNYTEKSDPTSKPMLGKGPVLKIAAGGSYSTDSYASAVFKSICENAEVPCQVFVNRSDLRGGTTIGPITAAKLNIPVIDMGAPVLSMHSIRELASVKDNEYTIKAFTEFFN >CP029329.1|AWK50068.1|683275_683830_-|signal-peptidase-I MRENDENEIIKDKKIKKKSIIREWIVDIVAIAFVTLLVWRFVGYGVWITSGSMIPTLEVKDRLIVTRVHNPENLEEGDIVLFKNDEFKDEILIKRLIGLPGDKIEIKDGIVFRNGEELKEDYVKNNEKYNRTFQVPKEKYFFLGDNRANSNDSRYWENPYVDESYIKGKAKIKYFPIKDFEILK >CP029329.1|AWK50069.1|684108_685404_-|diaminopimelate-decarboxylase MKLFGTMKAQGNELVIGGISAKDLVKEYGSPLYVFDEELIREYCRDYREYFKCKENNNRVAFAGKAFLTIQMCKLLKEEEMNLDVVSGGELYTAHKAGFPLEKVMFHGNNKTIDEIELGIKLGVGNFVVDNYYEMDALNDIAKEYNKVQDIYLRITPGIEAHTHDYIKTGQIDSKFGFAPVGTVIEDAIKKAISLSNINLAGIHCHIGSQIFDLEPYEDAVEIMLELVRNTKENFGYLIKEVDFGGGFGIYYTSIDEPRTTEEYCNTIINKVDEVCARTGQERPIITIEPGRSIVANAGITLYTVGSVKEIPNVRKYVSVDGGMTDNIRPALYNAEYECILANRIEGVSEEIITIAGKCCESGDILLENVKLPEVKSGDILAIMTTGAYGYSMASNYNKIPKPAVVMVKDNEARLICKRESYEDLLKNELI >CP029329.1|AWK50070.1|686115_686790_-|hydrolase MVNKEVKFVPQIKGTLRNHVIEVPTVIRNCGGIKIFGKRIKSLLFSTDVALIRNSNADAIIAVYPFTPQPLITQALVMAADVPVFCGVGGGITQGKRVVNLAMDAEFKGAMGVVVNAPTSNEIVKKIRATIDIPVIVTVISEDEDIAKRIEAGATILNVSGGKKTANIVRNIRNRFPEFPIIATGGPNDESISETIQAGANAITYTPPTSASIMCDLMDEYRNE >CP029329.1|AWK50071.1|687918_688896_+|transporter MNQNEFFNILMDGLKDFPEIKLHDIISYYENNFVLELVSGKTEEEIITKLGNPDLIVNKYRTEALKTPINTGYFTTDVDITNIGNKNYINNSNFTTNNNFINADTFNDFKTNDIFNNNNSIENGFKTNNKFNTFKTSSSYDDINLSSDFYNLRSSNQSNYNFTVKSDFNHNNKDDFNYNSSNNFNSDHNSDSNSNSFNDENHKNKILKFNVNTILIICTGILALAIFFPVITGIIGCIIGLLGVAISIFLASIGVLVGGTFTSFIGLPNVPMFVANFPHPSLVLFSLGSISLSILLIFLFYYLFKFLIQMLIKIYNSIKSKGGSF >CP029329.1|AWK50072.1|688895_689822_+|hypothetical-protein MKKKFISTNMKIFLLVLFLLSMTLYASGCIALVQSGYKLSDYADELNIDHQTFKFKFNLNKLNFDFDNSYISMNYPVNDNINEIDLNLNSQDVKVVNYDGEDLKVQIESHSVLSGELPKTESGNKLILNTRYDTPSNSSISLSIPYNFNDRGVLKIITSSGDINISNLSMNTLNLSTASGDIGVFGTTLNYLKLNNSSGDINFNNLTTLNETKLTSSSGDIIGSGTLGTVNGGTSSGDINLQFRNSLSNTFLSTDSGSVTLSLPINLGYKLNYETTSGNLESSNKQLSSGDESSLIDINTISGDLDIK >CP029329.1|AWK50073.1|689949_691137_+|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase MISNKMKSLVSNNSTIRAMFEEGKKLSEIYGEENVFDYSIGNPNVEPPESIKKVITEILNEEKPNLVHGYMNNSGYEDVRDAISTFLNKKNHLNLSRNNIIMTCGAAGGLNIILKSILNPDDEVITFSPYFGEYKNYAQNFDGKLIISPTDTETFEPDLKALSEVITAKTKALIINNPNNPTGIVYSKEVIQSLANLLNEKQKELNTTIYLISDEPYREIVYDGIQVPCLLKYYDNTFIGYSYSKSLSLPGERIGYVVINTLMDAFEEMASALNIANRILGFVNAPSLFQRVIAKSLDAEVDVSIYKKNRDLLYNHLISLGFTCVKPQGAFYLFPKSPIEDDKKFCEDAKQFNLLLVPGSAFGCPGHVRLSYCISYEKIKDSLQAFDKLAALYKL >CP029329.1|AWK50074.1|691283_691814_-|hypothetical-protein MNLLFYITFNFIIYSFIGWIIEEVYWYLTVKRIKKEGFLKGPFKPMYGIASTILILYNQMLDIDGIPLVLLCFLIPTTVEYISGYMLKHIFNKIYWDYSHLKYNIHGFVSLKFSLYWTVLSFIGVYFLQPVVYNIYKGSEEILIIAVCFFSILFMLDFLLTLKEFRKNTILNFREK >CP029329.1|AWK50075.1|692312_693515_+|alanyl-tRNA-editing-protein-AlaX-L MEKIYYDNQYLKQFTAEIVDIKEIDNKFHVILDKTAFFPGGGGQSCDIGILGDQKILDVYEQDEIVYHVVEKKPIKIHKVKCEIDWDRRTDGMHQHLGQHVLSGAFFNLFNANTFAIHLGSDISSVDVYGTLSDTQVKEAEKLANKVIGDALTVESFIPTKSELKKLSLRRALPNTAEDIRIVKIGDFDINACCGLHPTLTQDLRLIKIKKFEKHKEGTRIEFLAGERAVYDSFKKDEFQNSICKYLNCNESEAINGIKNLNENLREANENNKSLNILLAKYQVKEILENATKINDVKVIKKIFDSENLRYVTNLTSKLVESENTIALMAVKSEDRVNLLFACSKDITEIKMNDLLKDAISLIDGKGGGSPFQAQGAGKNNANLESALDYAVSKITQSLN >CP029329.1|AWK50076.1|693542_694442_-|alpha/beta-hydrolase MESVQSKLTKVFLRVFKINKIWKLTGDELRYSIEKRQLSESHKPPKIIKNKFNIVKNEINGYCYYVMKPLRNVGQKHIIFLHGGGYVYEINSMHWEFLRKLSDALSCTITIPIYPLAPKHKHQEVFEMIIPIYKKIISDVRPKDIAIMGDSAGGGMSLALAELLKEKHLQQPGNIILISPALDMSLSNPKIHEVEKLDPMLAVPSLIDIGKWYGGEKGSKHYLISPIYGNLEELGKISLFTGTNDILYPDAKKLKTITNEKGIKINYYEYPSMIHIWPLFFFPESKKAREQIVEIIRTS >CP029329.1|AWK53020.1|694806_694986_-|heavy-metal-transport/detoxification-protein MSCEHCVGHVKEALEGLDKVTSVEAGLENNCAIFETTNSDEELKAAIEEEGYDVVKIEE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029329_6 | 1474055-1474156 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029329_6
|
1 spacers
spacers of CP029329_6
>6.1|1474079|54|CP029329|CRISPRCasFinder ATCACCTTAGAAAAAAGCGCGAAGCGCAACCACGATCATATCACCTTAGAAAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029329_6
The CRISPR arrays of CP029329_6 >merge|CP029329|6|1474055-1474156|CRISPRCasFinder GTGCGTCAGCACAACCACGATCATATCACCTTAGAAAAAAGCGCGAAGCGCAACCACGATCATATCACCTTAGAAAAGGTGCGTCAGCACAACCACAATCAT >CP029329|6|6|1474055-1474156|CRISPRCasFinder GTGCGTCAGCACAACCACGATCAT ATCACCTTAGAAAAAAGCGCGAAGCGCAACCACGATCATATCACCTTAGAAAAG GTGCGTCAGCACAACCACAATCAT
>CP029329.1|AWK50677.1|1472949_1474011_+|stage-II-sporulation-protein-D MKIINIKTTNIKINSSIKIIIIMTLIIFTILITLPLIFLTVSKESVDIFKLNNENIVKSSEIVFPVNGRVKLYHKEEDSVEELDLEEYIMGVVASEVPANFNEEALKAQAIAARTFYMNKRNNPDKDAKNKGAEICDTTDCQVYMSKDERIAKWSSSQAGSNWNKIQKAVLDTKGQVLTYEDSLLEYPQFFATSSGRTEDAKDVFSMDVPYLKSEESKGEEIAPKYKTTVEIPINEFVDKINAKYKNANIKKSNIESLIKIEGYTESGSVKEIKVGNESIRGTEFRTLFNLNSTNFKLDFEKDIIKINCKGYGHGVGMSQWGANVMAKNGSTYEEILKHYYSGVEIQEIKYTH >CP029329.1|AWK50676.1|1471374_1472637_+|UDP-N-acetylglucosamine-1-carboxyvinyltransferase MEKIIVKGVKELKGEVDISCAKNSILPIIAATILCPEPIVIDNAPRLEDVEVICKLLSELNCDVDISKLNNKLTIDTKNIVEMDANAELMRKMRASFLIMGPMLARFGYCKLSLPGGCNIGSRPIDLHLKGFKLLGADVIMGHGFVEVKAKKMIGSRIYLDFPSVGATENIMMASVFAEGTTIIENAAEEPEIWDLARFLNKMGAKIHGAGLGKITIDGVKNLKGINYTPIYDRIEAGTFMIAAAITNSKIKINGVNEEHLRPIIEKLKECGIIFSDYKNDSVIVDGRKSKKPLDIKTLPYPGFPTDMQAQMMSLLSVIEGVSVITETVFENRFMHVAELNRMGANIKIDGRTAIIEGVSKLTGCEVKATDLRAGAAMILSGLVAEGETEISDIYHIDRGYVNIEDKFRNLGAEIYRVNR >CP029329.1|AWK50675.1|1470550_1471201_+|hypothetical-protein MNIKISILIFVLLSFLNMGAISNERSNTKNSFSVLETNITNISEFQENGAKLQYKTKNNIEKESARIKENLNNNIKGSHREINKSQFEIFNNNFYTNIKMWYEDKYTYVEITLINKNAKYTTVDIKNILRKLENQESENTKYFFYYEGKEKELDNNYSIDKLINENNIQKTNLLKINNGYTGTGYLSNGERINFALTRYNTGSHIIIGTPIIFATY >CP029329.1|AWK50674.1|1469940_1470348_+|ATP-synthase-F1-subunit-epsilon MASTFLLKIITPDHEVYNGEVEKVFLKSVDGDFEVLANHENMISSTIPCIAKYKDSKGIEDELFISTSIVHITENEMTICSDAAEFESDIDEKRAEEAMTRAKKRLEEAGKFNKDRAESAFLRAKQRLILKKSNK >CP029329.1|AWK50673.1|1468534_1469926_+|F0F1-ATP-synthase-subunit-beta MPGKIGKVVQVIGPVIDIKFDSDSLPNLYNAISIKMGEHELVAEVEQHVGDDIVRTIAMSATEGLKRGMDAVDTGNPISVPVGQEVLGRLFNVLGEAIDNCGAVDVKEKYPIHRPAPSFKDQTVEPEMFETGIKVVDLLAPYQKGGKIGLFGGAGVGKTVLIQELINNIAKEHGGLSVFTGVGERSREGNDLYHEMMESGVISKTALVFGQMNEPPGARMRVALTGLTMAEYFRDKGQDVLLFIDNIFRYTQAGSEVSALLGRTPSAVGYQPTLATEMGALQERITSTVNGSITSVQAVYVPADDLTDPAPATTFSHLDATTVLSRSIAELGIYPAVDPLESTSRILDPRIVGEEHYKVASDVKHVLQKYKELQDIIAILGVDELGDDDKAVVARARRIQRFLSQSFTVAEQFTGMKGKYVTVKETIRGFKEILEGKYDNLPESAFLFAGSIDDVIEKAKSLG >CP029329.1|AWK50672.1|1467668_1468520_+|F0F1-ATP-synthase-subunit-gamma MGAAGLLEIKKRIKSVENTKKITNAMGLVATSKLRKSRKELLVNNKFIESTEPIVRNLATTASEDGANIYFDGNKSENKLYVVMTSDSGLCGGFNGNVVSYLQTLIGNKKSSTKIIVVGNRGIGYVRRAQLDTVGEYVDISDLPTVREAKVIFDKALQMYIDGEVSEVNIVYSDFISPVKQITKVDKILPIEKFEGKVKKNLIEPSLELVLEDALNIYLKGKIRGILLSSKCSEQSSRMTAMDGATKNANDLLSDLKLKFNRIRQGAITQEISEIVGGAAAQK >CP029329.1|AWK50671.1|1466113_1467628_+|F0F1-ATP-synthase-subunit-alpha MNIKPEEITSIIKREIEKYEKQIQTVDSGTIITIGDGVSRVYGLDNCMEGELLEFPNEVYGMVLNLEQDNVGCVILGDDKGIKEGDIVKGTGKVVEVPVGDQMLGRVVNALGLPIDGKGPIVTTETRPIEVHAPSIIDRSSVNEPLQTGIKAIDSMIPIGRGQRELIIGDRQTGKTAIGIDTILNQKGKDVICIYVAIGQKQSTVANIVNIFTEMGAMDYSIVVSATASESAPLQYLAPYAGCSIGEYFMHKGKDVLIVYDDLSKHAVAYRAMSLLLKRPPGREAYPGDVFYIHSRLLERAAKLSKELGSGSLTALPIIETQAGDVTAYIPTNVISITDGQIFLEADLFFSGQRPAVNAGISVSRVGGNAQIKAMKQVSGTLRLELAQYRELEAFSQFGSDLDNDSSRRLQKGKRLVEILKQDQYSPLEVGKQIAILYAAVNDFLSDIKVSDIKRFEKEFLEYLDTHYREIEKSIITGKTLTDELKSKLEEAIVEFKKVFLQEA >CP029329.1|AWK50670.1|1465563_1466103_+|F0F1-ATP-synthase-subunit-delta MYEYLDRRYALAIYEVAEKKGKVDEYLRDLREICDLIDNNQDFHEVIKHPQINTTKKKQLFTDLFKDKIDEQLLSFMIILIEKNRILYLREKLNQMENIDLERRNIIRGIVKTAIPLLPEELEKMKVIFEEKYDKTIIFDTEIDKSILGGVYVSVGNDIIDDTIKSKIEEMKALMLKKE >CP029329.1|AWK50669.1|1465082_1465562_+|ATP-synthase-F0-subunit-B MEIEYSTTIMTWINFAVLILIMKHFFWDKLKGIIAERQKYVDDKLAKADEDSEKARMYLLKNESILQSAKEEGKKITERQKQKGDKVYEEIIDNAKNEAISLKERTMLEIEREKEKAEYEIKRQAADLALELAIKALEQKIDEDTHRKLIGDFIAKVGI >CP029329.1|AWK50668.1|1464814_1465030_+|ATP-synthase-F0-subunit-C MSLGVLAAGIAVLSGIGAGVGIGIATGKATEAVGRQPEASGKIMTLLILGAGLSEATAIYGLVIAFMVMGK >CP029329.1|AWK50678.1|1474463_1475198_+|M23-family-peptidase MDKKLKEKFGNLVRKEGFYIALFLCLCIIVTVGTVSYKMISNKNEVNKAEDINKDLALNSNNEEKTINEIPNAERVENVPDTSKNNIDKAKTEQSTTVSTTNIVKFSNPIDGVESRNYTYPTPVKMEEGIFRTIRGVNLETKIGTEVKAAAEGVVEVVENSGVEEGVVVEIKHANGLKTRYGNLDENVLVKKGDKVKVNQVIAKVGETAKVFSKEVFGEFLNLQVIDAKGEQVNPEKYFTLKSK >CP029329.1|AWK50679.1|1475480_1475735_+|sporulation-transcriptional-regulator-SpoIIID MKDYIEERVLDVARYIIDSKSTIRKTAKVFGVSKSTIHKDMTERLLKINPEIAEETHSILELNKAERHIRGGKATQMKYKIIES >CP029329.1|AWK50680.1|1475814_1476849_+|rod-shape-determining-protein MCFWKTGTDLAIDLGTATVLVYMKGKGVILKEPSVVAINKSNNKLLAIGEEARKMIGRTPGNIIAVRPLRDGVISDYDITQKMLKELIKKACGTRSIRAPKVIVCVPSQATEVEKRAVIDATMNSGAKTVHLIEEPLAAAIGAGLDITKPNGCMVVDIGGGTCDIAVISLGGVVVRESIKVAGDKFDDSIIKYVRNEYKLMIGEKTAEDLKINIGSAFKNSRNLTCMMKGRNLVTGLPDEVEITTEEIRNAIREPIEIIVQTVKRVLEKTPPELASDIIERGIVMTGGGALIHGLDKLIEFKTGVVTIVAEDSVECVAKGTGKVLSYIDKLDSKMNSQQIVFIE >CP029329.1|AWK50681.1|1476971_1477508_-|spore-protease-YyaC MIKPDINLNTMFSYNLTLEIKNYITKDTVIVCIGTDKCIGDCLGPLVGSILTENFFPLPVYGTLSHPIHALNIDERLDEIYSNHPNASIIGVDACLGDAEDIGDIRIRDYAIRPGKGVGKELPEVGVASVIGIVDSSDNSEFFFSHSIRLSFIMNMAKIIARVFIESYNLNRGQFPMV >CP029329.1|AWK50682.1|1477607_1478012_+|hypothetical-protein MKKITIYLILVFTVIINIYLIFYWEPENRVVNKEESSKAAISYSKSVYKLDKEKALEKLSPADKNDFEKIIGKLSAFDLGKIKDYYEDSNDEEGTVNIFKLLRKRLTTEDYKQIHEISASFLELERIDQRIKNN >CP029329.1|AWK50683.1|1479487_1480663_+|methionine-adenosyltransferase MKRLFTSESVTEGHPDKMCDQISDGILDAILSTDPLARVACETCTTTGMVMVMGEITTNCYVDIPKVVRETVREIGYDRAKFGFDCDTCSVITAIDEQSADIAMGVNEAFESRKGEKDDVEAVGAGDQGMMFGFATNETDEFMPLPIFMAHKLSRRLTEVRKNNILSYLRPDGKTQVTVEYEDNKPKRIDTIVISTQHDEKVTLEQIQEDLKEYVIQAVVPAELLDSETKYFINPTGRFVVGGPQGDSGLTGRKIIVDTYGGYGRHGGGAFSGKDPTKVDRSAAYAARWVAKNLVAAGVADKLEIQLAYAIGVAKPVSIEVETFGTGKVDEDKIVQIVEKVFDLRPGAIIRDLDLRRPIYKQTAAYGHFGRNDLNLPWEQLNKVQEIKKYL >CP029329.1|AWK50684.1|1480912_1483144_+|ATP-dependent-RecD-like-DNA-helicase MEVLNGFVENIVFKSEDTGYVVCKIRNGKELVSAVGTVPFMKEGQNVKLTGYWTVHKQFGNQFNIQEYEELLPNSLDGIEKYLSAGIIHGIGPVTAKKIIEKFGAETLDIMENSIERLTEIEGIGEKKFQIIYESYIEQQGLKDIILYFHKHGMTNNQCVKIYKKFGPNARQIVSDNPYILCDEISGIGFKTADRIAMSIGIENNSEFRIQSAIKYVMNQFCAAGNTFMPKNNIIEECEKNLLISKELIEKNIYDMAAQQKIIIEKINDVEIGFLLQYYYCELGVTSKIITLGLQQIQTINSDVDFEIDVFEKDQKIQFAPSQREAIIGAFNNGIEIITGGPGTGKTTIIKAIIHIYENNGMKVILGAPTGRAAKRMTESTGREAKTIHRLLEMGVSEEDESVFEKGESSPLDCDVIIIDEASMIDIMLMQNLLKAINLGTRLIIVGDVDQLPSVGPGNVLKDLIESEYIKVVRLKEIFRQGAESLIVINAHRINEGEMPLLNQKDKDFFFINENDQDKILNTIIDLMNRRLPKFNKSWDILKDMQVLTPMRKGILGVNNLNIRLQEIFNSPSKDKKEKTSRDILFREGDKVMQTKNNYTLKWVRVNGFGESEGSGVFNGDLGFIESIDEEKKALTIIFDDERKIVYDFNFLDELDLAYATTIHKSQGSEFKVVIIPVFMGSPFLMNRNLLYTGITRAKQLVVVVGFQKALMYMINNTNSIERYSALKHRIRDIITKDEFEDK >CP029329.1|AWK50685.1|1483306_1484323_+|hypothetical-protein MGDVCKVTQEDLKYAYDKIDYWYKKNIKFLTIITVPFNTPCVFSNIISYIAQNNGKVLYVWGKNAENRELINIIRDLNSNITHSYIEKGVSTTNLVFIHHDNLTKLDGQYDMVIFDDITYFSNLSSLNVRDGLEICANLGERVLLYSIEKMALVGEKFELAAYNYKKPFVEPRILTTRIDLNVDIPYTLYDYLKWFKENNHKVAIYVPNKEKLDIVYDYFANKLKLSEVKIIKVSKSDEIKRCERVSKYKDKAIFIITNKIEELLEYCYIDDSVIMFSDNERYNYKKILYVCGQMRNINSKLPEVLLVSNDISEDMDKAKNMARNFNKRVWEKRLRKL >CP029329.1|AWK50686.1|1484295_1484952_+|amidophosphoribosyltransferase MGKKITKIIRKLWEGLLEVVYPRENYCIICKEDDCFGICNTCKDSIKILNEVHQDEVISYGYYGGVLKDLILKLKYKNNFTAGDILAEFLEEYITKNLKYKEYIITYIPLSKKSKKNRGFNQCEYIAKKIARDLSIEVLDVLIKQKETKEQKKLKRDERYENIKDAFEIKKGIEVKNYNIILIDDVVTTGATLQEAYKLLKKFEVKEIKLLTLAKSHI >CP029329.1|AWK50687.1|1485366_1485900_+|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA MKVTVIAKNMELTDALKEIVQKKISKLEKYFEANIEARATLSVQKNRHIIEVTIPFNGVILRGEEATSDMYKSLDLVEDKLERQIRKQKTRLSRRHGASLRFGEINTIDLKPSEEEQGQLVRVKKFGVKPMNSEEAILQMDLLGHNFFVYQDADSNKVNVIYKRKDGDYGLLEPEFI |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029329_7 | 2465351-2465492 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029329_7
|
1 spacers
spacers of CP029329_7
>7.1|2465383|78|CP029329|CRISPRCasFinder TCACATATAAAAAGAGTGCGAAGCACAATCAGGAACTTTTCACATATAAAAAAAGCGCAACCAGGAACTTTTCACCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029329_7
The CRISPR arrays of CP029329_7 >merge|CP029329|7|2465351-2465492|CRISPRCasFinder TAAAAAGAGTGCGAAGCACAACCAAGAACTTTTCACATATAAAAAGAGTGCGAAGCACAATCAGGAACTTTTCACATATAAAAAAAGCGCAACCAGGAACTTTTCACCTCTAAAAAGAGTGCGAAGCACAATGAGGAACTTT >CP029329|7|7|2465351-2465492|CRISPRCasFinder TAAAAAGAGTGCGAAGCACAACCAAGAACTTT TCACATATAAAAAGAGTGCGAAGCACAATCAGGAACTTTTCACATATAAAAAAAGCGCAACCAGGAACTTTTCACCTC TAAAAAGAGTGCGAAGCACAATGAGGAACTTT
>CP029329.1|AWK51507.1|2464293_2465232_+|GTPase MTHIPVFLITGFLEGGKSTFVKEIFNDSEFAEGENITLIVCENGIEEFEENFLKENNVTIVHCNSKEEFTDSFLIECNKEHKPTKVIIEYNGMWEYDIVDKMEFPEGWEIAQVITPIDASTFEGYMNNMKSLLIEQFKDSDLIIFNRCNEKTNKLKYRNSVKAINASASLIFELENGEIDEAPLELPFDINADIIEFEDYDFGVWYLDVTESPEKYEGKSIKMKGIANTNPKYPKNIFAFGRNAMTCCEDDISFLGLLCQSKEPIKIDGKVWIEIEGVIHNKFIEQEQREIPFIAVKKYKSIDKIEDELVYF >CP029329.1|AWK51506.1|2463027_2464182_+|cobalamin-biosynthesis-protein-CobW MTKIDIISGFLGAGKTTLIKKLIEEAFVGEKLMLIENEFGEIGIDGGFLNNSGVEITEMNSGCICCSLVGDFGNALKEALSKYSPERIIIEPSGVGKLSDVIKAVKDIEHDVDIKLNSFVAVVDAMKCKMYMDNFGEFFNNQIESANTIILSRSQKLSEEKLELCVAQIREHNSKANIITTNWDEIHGKQILLAMEKENSLEKELLFEEKKHHNHDEECCEHNHEHYHHDHECFCGHDHESEHHNHDEEHYGHDHEHHHHDHECCCGHDHEHEQHHDEECSCGHNHNHEHHHADEVFASWGMETPKKYSKVEINDILKTLSETSEYGVILRAKGIIPCSEGGWINFDLVPGEYEVRVGVADYTGRLCVIGTNLNKNKIEELFHI >CP029329.1|AWK51505.1|2460938_2462501_+|hypothetical-protein MPNIFDGLRKISDDDLIQQIALLETINMTNISKPIAQKAKKKTISIINFFGSKLGKNHIIEESEVKEIWTLIDEKKDELKNCTRPELDEKLLNILMERFENDIEDPTEDEISVEIIEEVAKLYKLHKNLTPGQKADNIYLKYCEKLKGKAKEYLNEHQLIELKEATESIEDILLNMDEEQRKNFEHSVDVEKLSLLNAWKKMNRQLFARLIWLSVKAYGGSFTPKKEILPSFMGNKKDVEIINKEEHLKESQEILLKLKNKIELCKEKIESIENSLQEKNRLLNNAIKNKSQAEEGIINAKKMNGKLEEVKKSQEDELKELKEKIENATLQELESLMEEFKKVKFDSIDINNKISDINMDITYRNELIKEATLEIASNEKTIGDIGSEFQQFKMEANNLLKAYNEKKEEVNKKEEEKRNEIFERWIKFFDKFTFEFKNLNHVANFTIEELLHVEECLYELHFTKDPIALSMGLIDDKGNKKEEYEYIDVSFSDEFEIEIQYKVSDNEEKNVHIVEITTEL >CP029329.1|AWK51504.1|2459526_2460783_+|UV-DNA-damage-repair-endonuclease-UvsE MSIGYACLTIGVLNTNLKSCVLKNINDDKLLDLISNNLNSLENIIDYNIKNNIQLFRISSDLIPFGSSPANKIPWWNIFSERLEQIGMKIKESSMRVSMHPGQYTVLNSPSLDVVHRAMEDLKYHTKVLDSLRVGSEHKIILHIGGIYNDKKQAIDRFINNYNDLEESVKQRLVIENDDKSYNIKDVLEIGIKLNIPVIFDNLHNYINSSKEEKNQIDWINECKKTWRPKDGNQKIHYSEQNILKKTGSHSNSIKSDQFISFYECLGRNDIDIMLEVKDKNLSAVKCINCTSKHKDIKALELEWSKYKYKVLESSPNDYEKIRNLLKDKNNYPVMEFYKLIENAMDEEITTGNAINAALHIWGYFKKTASDKEKTSFMKSIDEYKNENATISRIKNSLWKMAVKYEEQYLLNSYYFML >CP029329.1|AWK51503.1|2456520_2459481_+|diguanylate-cyclase MKLNFRSKLFLYFVAIILFTSIPVALITYNYMYDSLKNDLYANTKAQMEQIDNTISNNIKQIKEDISFISISADIKKADQSISALFNIPNIETNGKYSKQIPGIESTIYNQLEAYGTTHPQTTYAYLGTKWGGYTRWPDGISSSKFDPRKRPWYSLALDNPNQPIITEPYVSAVDTSKILITVSNAVKNESGEIVGAAGIDVSLEKLSDIMRDIKIGDTGYIFLFLKDGTIVAHPNTNLNFKNISELNELSDTSTETDYFSKIPFGNYNKFIDEENGYFESVINGAPVLVDVYTSPYTGWKMASIIQKSELMDRASKIGYLITIITFCILIVAIVITIIVTKKLTKPITELTPLMNAAGNGNLEVQSNINSNDEFGELGNSFNLMIGNLRENYEELTAVYEELLATEEEIQAQYDELQISDEALRNSEERYRIALDGCNDSIWQWDLVTGNFFISDKLYDITGYKLNNNVNFTKLITEIIHQDDIDIVKKDFENHINNITPIYKSEFRAKISDGSYVWLLSRGKALRNSENKAIKIAGSITDISETKISENKIKFMAYYDALTKLPNRTFFIDKLNEQLELVCSKNVKGAVFFIDLDNFKNINDTMGHDYGDKLLIYLAKQFESLIDKKDTICRLGGDEFILLHPYVKESEVESYAKRFLDLFNKVLKIDNRQMYITASIGVALYPKDGTDTNTILKNADSAMYKAKELGKNRFTLFNPEMYLKLKRKTCIERILRTVIENNELSINYHPQFDAQSNEIFGFEALLRLNSKELGLISPLEFIPIAEECGYITILSRWVLNEACTQSVKWLDAGYKFKSISINISSMDIQQSDFLENIKDILKNTSIDPNIVELEITETVLMRSLDSNINILKKLMGMGIRIALDDFGTGYSSLNYLRAIPITTLKIDKSFIDNITSNKKEESIINNIIQMAHSLDLKVVAEGVETKEQLSILKERSCDYIQGYYFSKPLQDSEIEKLLVRNNNKTK >CP029329.1|AWK51502.1|2455468_2455804_-|rubredoxin MKKLFKCTVCGFISEGEEAPEKCPKCLMGKEKFIELSSEDANKIYQSDRTNDIHMEIIALADKIAKLSIEGIKINLDPNCVGAFEKAKNEVWTIKQRSKAELAGHMTNGKW >CP029329.1|AWK51501.1|2454281_2455259_+|gfo/Idh/MocA-family-oxidoreductase MNKMKMAILGAGSIARQMAFTISKMENVDTYAVAAREFERAEKFAKEFGFEKAYGSYEEMLNDENVDLVYIATPHSHHYEHSIMCLNHGKHVLCEKAFTANAKQAEEVLKLAESKKLLITEAIWTRYMPMAKTLNEVIESGIIGEVTSLNTNLGYIIKDIPRMIEPKLAGGALLDLGVYTINFASMIFGDKIKSISSTAIKTQSGVDAQNSITLCYEDGKMAILNSTMLAVTDRQGVINGDKGYIVVENINNYEKIRVFSLDREEIAVYDRPKQISGYEYEVEAAIKAIQNKEIECPQMPHKETLRIMKLMDSLRHEWGVYYPFE >CP029329.1|AWK51500.1|2453824_2454010_+|hypothetical-protein MNRETNEHLDKEELEKHICELREVLNEICATAEDAEGLKQRLIVSQRMDRLIVQYMNKYNI >CP029329.1|AWK51499.1|2453290_2453623_+|XRE-family-transcriptional-regulator MKSGVNYREVGDRIRAEREQFGISREKFAEILSLSPFFVGQIERGERKMSISTLINVSECLHISIDYLIFGEVHKKEEYNSLLSLIGKCSSEEARIIEEIIKTILPHITK >CP029329.1|AWK51498.1|2451998_2452994_+|ornithine-carbamoyltransferase MALNLRGRSFLKLLDFTPEEIRYLLDLSKELKTLKRTGVPHDRLRGKNIVLLFEKTSTRTRCAFEVAGSDLGLGVTYLDSAGSQMGKKESVADTARVLGRMYDGIEYRGFSQETVEELAKYAGVPVWNGLTDEFHPTQMIADLLTIEEKLGRLKGVNFVYMGDARNNMGNSLMVACAKMGLNFTACAPKELFPAEELVAECKEIAKVSGATIALTEDVKAGTKNADVIYTDVWVSMGEPDEVWESRLKLLSPYQVNKSVMDNANKEAIFMHCLPAYHDLKTKVGKDVGEKFGLTEIEVTDEVFEGKQSVVFDEAENRMHSIKAIILGTLGV >CP029329.1|AWK51508.1|2465586_2466624_+|hypothetical-protein MKSELISIVAIIILILINAYFVALEFAIVQIRASKIDTLIQDGNKKAIKCKTVKDNLNSYLSSTQLGITVVGLLLGWLGEPTVSKIIEPILDMITSNDNVKHSISLIFSFGLITLLEVVFGELIPKAIALSETEKCNLALDSSLVMFHKLTYPITITFDKLTELCLKPFGINPVNETQEIYTKSELEMLVDQSIEDKADKMLLANAFQFSDCKAKDIMIHRKKMVCIDVNATQEQVLNIITINGYTRYPIIDKEKDNIVGFIHVRDIYRNVVSDNKLDLKSCIREVSSFTETMHIRNIFKQLKDKREQFAIVVDEYGGTSGLLTLEDIIEELVGDIQDEFDNEII >CP029329.1|AWK51509.1|2466821_2467214_+|hypothetical-protein MKKSIITDDNGVMEKPSNSSIKKNVKELEKSLGINTKPKNLPGYFILGGWLCVISSIQPIIIVGLILAAIALILSFRNSYKNAYKWNKAITLYFINDIEKAKTLLDKLSSDEKEGQAYKTMLKLLNDKKF >CP029329.1|AWK51510.1|2467559_2468279_+|DUF434-domain-containing-protein MSKIVKRGYLHSDEKEFSNESVEKLHKAGRDLYYLINHGYKIKSASVFVSNHYLLSERQRLALVRAVSSEKSIIIRKDKEVKDNLEGSIVNIDGFNTIISLEVALSDSLLLKCMDGTIRDLAGLRGTYRIIDKTQLAIILIGEILEKNKVGKVIFYLDAPVSNSGKLKELILELLNEFSFNVQVENINNVDTILEKLDNVITSDAIILDKCKSWINLNKKIIESNMHNYSYIDFSLLTN >CP029329.1|AWK51511.1|2468540_2471480_+|diguanylate-cyclase MKLTFRLKLFLYFVAIILFTSIPIALITYNYIYNSQKKDLFSNTQAQMEQIDNNFSNMMKQIKGDTRSLADSADIKKADQSISALFNMPNSETNKKYSSQIPGIESTIYSHFKAYGTNHIETSHVCFGTKWGGYIQWPDGVTITNFDPRIKTWYTQALENPDMVAISAPYESFDETNNVIISASSTIKDTSEDIVGVIGIDVSLDKLSEMIRDIKIGDTGYVFLYLKDGTMLAHPNADLNFKNILQLNTLGYTLAQTNDRINHTFEDYNKFTDENNGSFETVINGSPVLVNIYTSKYTGWKMASVIQKSELISKSNQIGYLIILIAIGALLFVIVLTLIITKKLTKPITELTPLMHAAGNGDFAVKANINTNDEFGELGESFNLMIGKLNSSYEELSSLHEELLATEEELRVQYEELLHNEEAIRNSDERYRLALECANDSIWEWDLITGEFFASDKLVDITGYKLNNNRNVINLVNNLIHPDDVARAKEDYKNHINKITDVYNSEYRIKTSNGSYVWILSRGKVLRDSEDNAIKLAGSISDISNRKISEDRIKFMAFYDSLTKLPNRTLFMKKLNDQLELGYSKNAEGAVFFIDLDNFKNINDTMGHDYGDKLLVHLAKQFKSLIHEKDTICRLGGDEFIILHPYAKESELEHYAKGFLDLFNKTLNINNKQMYITASIGAALYPKDGTDTNTILKNADSAMYKAKELGKNRFVLFDPEMYLKLERKTCIERILRSAIENNELSINYQPQYDAQKNEIFGFEALLRLNSKELGFISPLEFISVAEECGYITKISRWVINESCKQTVKWLNRGYKFKSMSINISSVDIQQSDFLEGIKDILNSTGINPNIIELEITETVLMQSLDSSINILEKLMDMGIRIALDDFGTGYSSLNYLGRIPISTLKIDKSFIDNITSSKKKESMINNIIQMAHSMDLKVVAEGVETKEQLSILKDRDCNYIQGYYFSKPLPESEIEKLLA >CP029329.1|AWK51512.1|2471764_2472772_+|NADH-oxidase MSYLNKKLKNSKLELKNRLVMPPMATAKSEEDGSINKSILDYYDEKSNGGYISLIIIEHSYITKQGKANPNQLSIAEDRLVDDLKGLSDIIHKNGSKAVMQINHAGSATSEANTGLQIVGPSAIENPSKNTGEIPKELTKNDIEVIVRGFKEAALRVKNAGFDGVEIHSAHGYLLSQFISPLTNKRTDEYGGDINGRIKIHLEIIKEVREAVGEDFPILLRLGASDYMEGGLTIEDSTLASIEFEKAGVDMLDISGGLCRFSIPGVNEPGYFAPLSKAIKEKVKIPVIVAGGITDVEVAEKILSEEKADLIGVARAILKDSNWAKNAMESLDTQV >CP029329.1|AWK51513.1|2473089_2473917_+|ATP-dependent-sacrificial-sulfur-transferase-LarE MLLQEKYQLLKDIIKKKESAVIAFSGGVDSTFLIRVAKEVLGDKLIAVTATSSTYPERELNEAIKYAEDIKVKHIIISSEELEIEGFAMNPKNRCYFCKKELYTKINNVAIENGMNSVFDGSNIDDTGDYRPGIQAAKELDVISPLIEAGLTKKDIRELSKELELPTWNKPSFACLSSRFPYGNKITLSKLTMVDKAEQILLDMGITQVRVRHHGEIARIEVEPSEREKFFDIEIMNRIGNELKKIGFTYVTLDMLGYRTGSMNETLSEDDKINA >CP029329.1|AWK51514.1|2474121_2474355_+|hemerythrin MLNFAVSVDVRIYEPRDKHPAIFKAFEGLGSGEIMELINDHDPRPLHYQFIMELPEQFEWEYLEQGPEVWRVAITKK >CP029329.1|AWK51515.1|2474373_2474562_+|ferredoxin MKGFVDKDTCVGCGVCTAICPEIFKMGDDGIAEASEDEISDNLIESAKDAQEQCPVSAITVE >CP029329.1|AWK51516.1|2474837_2475227_+|zinc-ribbon-domain-containing-protein MFFIGIFGIENKDKEIKSLNNISCKKCNMTVTGNLIKNFDFFHFFFIPIFKWNEKYYVVCDKCKSVYIIPKDKGKAIEHGENIEISYWDVQEAYTDGYSNNYYDENKCKNCGAKVDSKFKYCPHCGAKI >CP029329.1|AWK51517.1|2475360_2476410_-|galactose-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKLLKRTILIMITFMIITTLICTIQNNFYINSISAIGNPPRVGVLLFNFNNPYMSLVKQNLENIEKENPDKIRFSFYDSKDNQSVQTATIGNLVNDNIDLLLVNLVDTKQSTVSEIIGKANEKNVPLIFFNIDLPIDVKTNYKKVFVVATESEKGGILQGKILLNLWNTDKQAIDKNNDNILQYIMLQGKSNNESAILRTLYSISTLNDNGVKTEELALKICNWDQDCAKSAINSLFLKYDGKIEAIISNNDAMAVGAIDALQSYGYNKGDKTKTIPVVGVDAIPEAKDLINKGFMAGTVGQDSNELANALYSIGLNLIYNRDPLEGTNYKSEKEGLIKLPYYEYIPST |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029329_8 | 3245095-3247934 | TypeI |
I-C
Consensus repeat of CP029329_8
|
42 spacers
spacers of CP029329_8
>8.1|3245127|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTATTTGGATTGGTTTTTTATGGTTTGTTCTTAA >8.2|3245193|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCAACTATATTTGTGCCTATTTCAGCCATTTTA >8.3|3245259|36|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTATCAGATAGTTTTAAAAGATTGGGGTATGATAA >8.4|3245327|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAGTTTTCAAGATTTTCCTATCGAGATATTAGGA >8.5|3245394|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTCATCTTAAGCCTTCTCCCTTGGTCTATTTG >8.6|3245460|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATTCTGTTAGTCCATTCTTTACCTCTCATTGGA >8.7|3245527|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATGTAATTGGTATATTAGGATCTATTGCATTACA >8.8|3245594|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAAAATATAACTAAAGAGGTGATTTAATATGTAT >8.9|3245661|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGAATATACAAGTATAGAGGATTTAACAAGTATT >8.10|3245728|36|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCCTATTATTGTTGGTGGTGCTGTTCTTACGGAA >8.11|3245796|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATCTTGAGACAATATTTGTAATAACTTTGAAAT >8.12|3245862|37|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATAGAAATGAATACTAAAAAATTAATCGAACTAAGA >8.13|3245931|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATCGGAAAGGCTAAGGGGTTAGACAAATAATAT >8.14|3245997|36|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTCCAATAGTTCCTGTAATTCCAATCCCATTTGCA >8.15|3246065|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAATTTCAATTCTTGTTCCTCAAATTTAGATTTA >8.16|3246132|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCAGCATTGATTAACATTTTTATATATCCATTA >8.17|3246198|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGCACGTTTACCGCTTTCGATTTGGCTTATTGTA >8.18|3246265|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAATACCAAGCGGGAGCGATGGGGCTTAATCTACA >8.19|3246332|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTGCAACTGTTGTTAGTACTTTTGTTGCAGT >8.20|3246398|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAAGATGAAAGAATTAAAAGTGGTTTAACACAA >8.21|3246465|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAGATAACCGCAAGCATCTTTACCATTATTTTTA >8.22|3246532|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATAAAGGAGTTAAGAGCAATGTCGTTAAAAGAT >8.23|3246598|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTATTATGGATATGGATTATTCATTTATTATT >8.24|3246665|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTTCCTGGTAATCTTGATATTTTAAAATCTTTA >8.25|3246732|33|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAAAAAATCCATTAAATCCAAAATACCACCAG >8.26|3246797|36|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAGTAAATTATAACAAGCAAATTATTACTTGTAAA >8.27|3246865|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACAGTATTGTTTAATAAGTAATGGAGATTACA >8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGAGCAACAAAAAGCAAACGATACAGATACCAATA >8.29|3246998|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAATTAAGTGAAGATAACATTCCAGTTAATGAA >8.30|3247064|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGAAAGAGATATGGAAGTACCTAATGCTAATCCT >8.31|3247131|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTTTATTTTACAGTAAAAACAAAAAGATTATTA >8.32|3247198|36|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACTTTTGTTGCAGTTGAATTATCGTTTTTGTCTTG >8.33|3247266|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTTAGATAAATATATAGCAAGTATGTCTTTGAT >8.34|3247333|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGGGAATTATGATAGGTGTTTCTTTAATACCAA >8.35|3247399|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGTAGAATCCAACATAACACCACCGGCAACAAGA >8.36|3247466|36|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATCCTTACCTTGAAAATAAAATTTACGCATAGTTT >8.37|3247534|36|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAATATATTTACAAACATAACCATCATTAACAGTA >8.38|3247602|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTCCTGGTAATCTTGATATTTTAAAATCTTTA >8.39|3247668|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGTTTTATTGTGGGTTATTTATCTAATGTTAAAA >8.40|3247735|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAGATATTCTTACTCGTGATACTGTTAGTTTTA >8.41|3247802|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAAAGATATTCAATTAAAAAGTAAATATGATTTT >8.42|3247869|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGGCAACACCACACCAAGTATTAAGATATTAAGT |
cas2,cas1,cas4,cas7b,cas8c,cas5,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029329_8
The CRISPR arrays of CP029329_8 >merge|CP029329|8|3245095-3247934|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACGTATTTGGATTGGTTTTTTATGGTTTGTTCTTAAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACAGCAACTATATTTGTGCCTATTTCAGCCATTTTAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACGTTATCAGATAGTTTTAAAAGATTGGGGTATGATAAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACTAAGTTTTCAAGATTTTCCTATCGAGATATTAGGAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACTCTTCATCTTAAGCCTTCTCCCTTGGTCTATTTGATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACACATTCTGTTAGTCCATTCTTTACCTCTCATTGGAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACGATGTAATTGGTATATTAGGATCTATTGCATTACAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACTGAAAATATAACTAAAGAGGTGATTTAATATGTATATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACCAGAATATACAAGTATAGAGGATTTAACAAGTATTATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACATTCCTATTATTGTTGGTGGTGCTGTTCTTACGGAAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACAATCTTGAGACAATATTTGTAATAACTTTGAAATATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACGATAGAAATGAATACTAAAAAATTAATCGAACTAAGAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACAATCGGAAAGGCTAAGGGGTTAGACAAATAATATATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACCTTCCAATAGTTCCTGTAATTCCAATCCCATTTGCAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACGAAATTTCAATTCTTGTTCCTCAAATTTAGATTTAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACATCAGCATTGATTAACATTTTTATATATCCATTAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACTTGCACGTTTACCGCTTTCGATTTGGCTTATTGTAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACCAATACCAAGCGGGAGCGATGGGGCTTAATCTACAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACTTTTTGCAACTGTTGTTAGTACTTTTGTTGCAGTATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACTAAAAGATGAAAGAATTAAAAGTGGTTTAACACAAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACGAAGATAACCGCAAGCATCTTTACCATTATTTTTAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACAATAAAGGAGTTAAGAGCAATGTCGTTAAAAGATATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACGTTTTATTATGGATATGGATTATTCATTTATTATTATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACAATTTCCTGGTAATCTTGATATTTTAAAATCTTTAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACGTAAAAAATCCATTAAATCCAAAATACCACCAGATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACCAAGTAAATTATAACAAGCAAATTATTACTTGTAAAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACTAACAGTATTGTTTAATAAGTAATGGAGATTACAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACGGAGCAACAAAAAGCAAACGATACAGATACCAATAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACCAAATTAAGTGAAGATAACATTCCAGTTAATGAAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACTGGAAAGAGATATGGAAGTACCTAATGCTAATCCTATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACTTGTTTATTTTACAGTAAAAACAAAAAGATTATTAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACTACTTTTGTTGCAGTTGAATTATCGTTTTTGTCTTGATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACATGTTAGATAAATATATAGCAAGTATGTCTTTGATATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACATGGGAATTATGATAGGTGTTTCTTTAATACCAAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACCAGTAGAATCCAACATAACACCACCGGCAACAAGAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACAATCCTTACCTTGAAAATAAAATTTACGCATAGTTTATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACGCAATATATTTACAAACATAACCATCATTAACAGTAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACATTTCCTGGTAATCTTGATATTTTAAAATCTTTAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACAGGTTTTATTGTGGGTTATTTATCTAATGTTAAAAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACTTTAGATATTCTTACTCGTGATACTGTTAGTTTTAATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACCTAAAGATATTCAATTAAAAAGTAAATATGATTTTATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGACGGGCAACACCACACCAAGTATTAAGATATTAAGTATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC >CP029329|8|1|3245095-3247934|PILER-CR ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GTATTTGGATTGGTTTTTTATGGTTTGTTCTTAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AGCAACTATATTTGTGCCTATTTCAGCCATTTTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GTTATCAGATAGTTTTAAAAGATTGGGGTATGATAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TAAGTTTTCAAGATTTTCCTATCGAGATATTAGGA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TCTTCATCTTAAGCCTTCTCCCTTGGTCTATTTG ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC ACATTCTGTTAGTCCATTCTTTACCTCTCATTGGA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GATGTAATTGGTATATTAGGATCTATTGCATTACA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TGAAAATATAACTAAAGAGGTGATTTAATATGTAT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CAGAATATACAAGTATAGAGGATTTAACAAGTATT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC ATTCCTATTATTGTTGGTGGTGCTGTTCTTACGGAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AATCTTGAGACAATATTTGTAATAACTTTGAAAT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GATAGAAATGAATACTAAAAAATTAATCGAACTAAGA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AATCGGAAAGGCTAAGGGGTTAGACAAATAATAT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CTTCCAATAGTTCCTGTAATTCCAATCCCATTTGCA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GAAATTTCAATTCTTGTTCCTCAAATTTAGATTTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC ATCAGCATTGATTAACATTTTTATATATCCATTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TTGCACGTTTACCGCTTTCGATTTGGCTTATTGTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CAATACCAAGCGGGAGCGATGGGGCTTAATCTACA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TTTTTGCAACTGTTGTTAGTACTTTTGTTGCAGT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TAAAAGATGAAAGAATTAAAAGTGGTTTAACACAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GAAGATAACCGCAAGCATCTTTACCATTATTTTTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AATAAAGGAGTTAAGAGCAATGTCGTTAAAAGAT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GTTTTATTATGGATATGGATTATTCATTTATTATT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AATTTCCTGGTAATCTTGATATTTTAAAATCTTTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GTAAAAAATCCATTAAATCCAAAATACCACCAG ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CAAGTAAATTATAACAAGCAAATTATTACTTGTAAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TAACAGTATTGTTTAATAAGTAATGGAGATTACA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GGAGCAACAAAAAGCAAACGATACAGATACCAATA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CAAATTAAGTGAAGATAACATTCCAGTTAATGAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TGGAAAGAGATATGGAAGTACCTAATGCTAATCCT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TTGTTTATTTTACAGTAAAAACAAAAAGATTATTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TACTTTTGTTGCAGTTGAATTATCGTTTTTGTCTTG ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC ATGTTAGATAAATATATAGCAAGTATGTCTTTGAT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC ATGGGAATTATGATAGGTGTTTCTTTAATACCAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CAGTAGAATCCAACATAACACCACCGGCAACAAGA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AATCCTTACCTTGAAAATAAAATTTACGCATAGTTT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GCAATATATTTACAAACATAACCATCATTAACAGTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC ATTTCCTGGTAATCTTGATATTTTAAAATCTTTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AGGTTTTATTGTGGGTTATTTATCTAATGTTAAAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TTTAGATATTCTTACTCGTGATACTGTTAGTTTTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CTAAAGATATTCAATTAAAAAGTAAATATGATTTT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GGGCAACACCACACCAAGTATTAAGATATTAAGT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC >CP029329|8|8|3245095-3247934|CRISPRCasFinder ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GTATTTGGATTGGTTTTTTATGGTTTGTTCTTAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AGCAACTATATTTGTGCCTATTTCAGCCATTTTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GTTATCAGATAGTTTTAAAAGATTGGGGTATGATAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TAAGTTTTCAAGATTTTCCTATCGAGATATTAGGA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TCTTCATCTTAAGCCTTCTCCCTTGGTCTATTTG ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC ACATTCTGTTAGTCCATTCTTTACCTCTCATTGGA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GATGTAATTGGTATATTAGGATCTATTGCATTACA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TGAAAATATAACTAAAGAGGTGATTTAATATGTAT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CAGAATATACAAGTATAGAGGATTTAACAAGTATT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC ATTCCTATTATTGTTGGTGGTGCTGTTCTTACGGAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AATCTTGAGACAATATTTGTAATAACTTTGAAAT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GATAGAAATGAATACTAAAAAATTAATCGAACTAAGA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AATCGGAAAGGCTAAGGGGTTAGACAAATAATAT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CTTCCAATAGTTCCTGTAATTCCAATCCCATTTGCA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GAAATTTCAATTCTTGTTCCTCAAATTTAGATTTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC ATCAGCATTGATTAACATTTTTATATATCCATTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TTGCACGTTTACCGCTTTCGATTTGGCTTATTGTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CAATACCAAGCGGGAGCGATGGGGCTTAATCTACA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TTTTTGCAACTGTTGTTAGTACTTTTGTTGCAGT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TAAAAGATGAAAGAATTAAAAGTGGTTTAACACAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GAAGATAACCGCAAGCATCTTTACCATTATTTTTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AATAAAGGAGTTAAGAGCAATGTCGTTAAAAGAT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GTTTTATTATGGATATGGATTATTCATTTATTATT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AATTTCCTGGTAATCTTGATATTTTAAAATCTTTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GTAAAAAATCCATTAAATCCAAAATACCACCAG ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CAAGTAAATTATAACAAGCAAATTATTACTTGTAAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TAACAGTATTGTTTAATAAGTAATGGAGATTACA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GGAGCAACAAAAAGCAAACGATACAGATACCAATA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CAAATTAAGTGAAGATAACATTCCAGTTAATGAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TGGAAAGAGATATGGAAGTACCTAATGCTAATCCT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TTGTTTATTTTACAGTAAAAACAAAAAGATTATTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TACTTTTGTTGCAGTTGAATTATCGTTTTTGTCTTG ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC ATGTTAGATAAATATATAGCAAGTATGTCTTTGAT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC ATGGGAATTATGATAGGTGTTTCTTTAATACCAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CAGTAGAATCCAACATAACACCACCGGCAACAAGA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AATCCTTACCTTGAAAATAAAATTTACGCATAGTTT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GCAATATATTTACAAACATAACCATCATTAACAGTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC ATTTCCTGGTAATCTTGATATTTTAAAATCTTTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AGGTTTTATTGTGGGTTATTTATCTAATGTTAAAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TTTAGATATTCTTACTCGTGATACTGTTAGTTTTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CTAAAGATATTCAATTAAAAAGTAAATATGATTTT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GGGCAACACCACACCAAGTATTAAGATATTAAGT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC >CP029329|8|1|3245095-3247934|CRT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GTATTTGGATTGGTTTTTTATGGTTTGTTCTTAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AGCAACTATATTTGTGCCTATTTCAGCCATTTTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GTTATCAGATAGTTTTAAAAGATTGGGGTATGATAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TAAGTTTTCAAGATTTTCCTATCGAGATATTAGGA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TCTTCATCTTAAGCCTTCTCCCTTGGTCTATTTG ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC ACATTCTGTTAGTCCATTCTTTACCTCTCATTGGA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GATGTAATTGGTATATTAGGATCTATTGCATTACA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TGAAAATATAACTAAAGAGGTGATTTAATATGTAT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CAGAATATACAAGTATAGAGGATTTAACAAGTATT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC ATTCCTATTATTGTTGGTGGTGCTGTTCTTACGGAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AATCTTGAGACAATATTTGTAATAACTTTGAAAT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GATAGAAATGAATACTAAAAAATTAATCGAACTAAGA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AATCGGAAAGGCTAAGGGGTTAGACAAATAATAT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CTTCCAATAGTTCCTGTAATTCCAATCCCATTTGCA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GAAATTTCAATTCTTGTTCCTCAAATTTAGATTTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC ATCAGCATTGATTAACATTTTTATATATCCATTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TTGCACGTTTACCGCTTTCGATTTGGCTTATTGTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CAATACCAAGCGGGAGCGATGGGGCTTAATCTACA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TTTTTGCAACTGTTGTTAGTACTTTTGTTGCAGT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TAAAAGATGAAAGAATTAAAAGTGGTTTAACACAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GAAGATAACCGCAAGCATCTTTACCATTATTTTTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AATAAAGGAGTTAAGAGCAATGTCGTTAAAAGAT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GTTTTATTATGGATATGGATTATTCATTTATTATT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AATTTCCTGGTAATCTTGATATTTTAAAATCTTTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GTAAAAAATCCATTAAATCCAAAATACCACCAG ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CAAGTAAATTATAACAAGCAAATTATTACTTGTAAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TAACAGTATTGTTTAATAAGTAATGGAGATTACA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GGAGCAACAAAAAGCAAACGATACAGATACCAATA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CAAATTAAGTGAAGATAACATTCCAGTTAATGAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TGGAAAGAGATATGGAAGTACCTAATGCTAATCCT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TTGTTTATTTTACAGTAAAAACAAAAAGATTATTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TACTTTTGTTGCAGTTGAATTATCGTTTTTGTCTTG ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC ATGTTAGATAAATATATAGCAAGTATGTCTTTGAT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC ATGGGAATTATGATAGGTGTTTCTTTAATACCAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CAGTAGAATCCAACATAACACCACCGGCAACAAGA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AATCCTTACCTTGAAAATAAAATTTACGCATAGTTT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GCAATATATTTACAAACATAACCATCATTAACAGTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC ATTTCCTGGTAATCTTGATATTTTAAAATCTTTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC AGGTTTTATTGTGGGTTATTTATCTAATGTTAAAA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC TTTAGATATTCTTACTCGTGATACTGTTAGTTTTA ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC CTAAAGATATTCAATTAAAAAGTAAATATGATTTT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC GGGCAACACCACACCAAGTATTAAGATATTAAGT ATTTCAATCCACGCACCCGTGAAGGATGCGAC
>CP029329.1|AWK52116.1|3243509_3245030_+|IS1182-family-transposase MIMNYIIGEDRTQIKIESIDSYVNENNEVRVIDKIVDVMDIESLGFNIGKNDTVGRPKFNPRDILKLYIYGYFNGIRSSRKLAKQCAINKEVIWLVKGLAPKYRVIADFRKDNSDAFEAVFKSFVNYCIELDLYGRELIAVDGTKLEASASKRKHYSKNKLAKMKELAQSKILEYLHDIDINDNNDDEITSKDIDKDKIVESIKRLEEKVAYYDNLENTLIKNDTNEINLTDPDAKTVKFGANQGTDVGYNVQSVVDSKNKLIATFEVINNSADQGQLYNMSKKAKDIFECETIEVLADKGYFDTKDFKKCEQEKIISYVSKPRYSNSIGDSRYFLDRFRYDNNKDIYICPEGKILECINKKTKSNSRRYCNSEACQHCKNKSKCTTSSIGRTITRTEMEQFAEIVNNRVKNNQVKYSQRQALVEHPFGTLKRSMNFYHLLLRGFSKVRGEISITFFSYNLKRVIKILGVKGILQSLKLLISNLICYIYKITTVRFSYNRYSIQKV >CP029329.1|AWK52115.1|3240828_3242523_-|DDE-transposase 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>CP029329.1|AWK52122.1|3252700_3253357_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MGYGIKLKIWGDYACFSRPEMKVERVSYDVITPSAARGILEAIYWKPAIRWVIDEVKIINPIKFENIKRNELSGVISSNTVKRAYLGSKDVNLYQSTKDIVQRGAMVLKDVCYYITAHFELTSEVGESDTVEKHYNIALRRTKKGQCFHRPYLGCREFPAQFQLADEIQEESFYINSEKDLGYMLWDIDFKNDSLPIFFRPTMKDGVISIPDLQRGDR >CP029329.1|AWK52123.1|3253513_3254992_+|ISNCY-family-transposase MFSLNKIKQLNLFDQVSELNYLSTKQPVGFLNLLSDNFDLESFIPESFSNHYYSTLGRDRDYKLSSILSALILMQIFHIPTNVLLHLFLIFSTEIREFCGFYDSVPAESYFSRFKTDFEKDIADLFNSLVPNVIDICNEFNLSLPDNSPYKDRNSMLIYDTSGLKPKVKENNPKTLVSEINKQKSYAKAIKKKDYNAYAAAYKNMPKFSEANPSIKLDFVNGHFGYFYKFGILTNGLGIPLGINFFDENFYSSVKQEFETPEEQKYAYDNASLKSVVKPFINNLKSKTNFQFKTFLGDSEFDSYENFGLLKQLNFQKVFIPLNSRNQKNTKINDLEFNTSGIPLCPLTKEQFKSEGSCGGKNRSVRYKFTCPKSYRDKKGKCYLTCETPCTDNKSGRMTYVYPDKDFRLYPGIQRNSDEWAKTYKIRTIIEREISCFKFNPCIQSPNTVNTTTMRSDLYLTAISKLINVILSHSLNNPEYIRSIRKLIAIAA >CP029329.1|AWK52124.1|3255204_3257379_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029329_9 | 3830298-3830384 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029329_9
|
1 spacers
spacers of CP029329_9
>9.1|3830327|29|CP029329|CRISPRCasFinder GGTGAAAAGATCTTAATTGTGCTTCGCAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029329_9
The CRISPR arrays of CP029329_9 >merge|CP029329|9|3830298-3830384|CRISPRCasFinder TTTTTTTATTTGGGCGCACTTTTTTTATTGGTGAAAAGATCTTAATTGTGCTTCGCACTTTTTTTATTTGGGCGTACTTTTTTTATT >CP029329|9|9|3830298-3830384|CRISPRCasFinder TTTTTTTATTTGGGCGCACTTTTTTTATT GGTGAAAAGATCTTAATTGTGCTTCGCAC TTTTTTTATTTGGGCGTACTTTTTTTATT
>CP029329.1|AWK52635.1|3828282_3829761_+|ISNCY-family-transposase MFSLNKIKQLNLFDQVSELNYLSTKQPVGFLNLLSDNFDLESFIPESFSNHYYSTLGRDRDYKLSSILSALILMQIFHIPTNVLLHLFLIFSTEIREFCGFYDSVPAESYFSRFKTDFEKDIADLFNSLVPNVIDICNEFNLSLPDNSPYKDRNSMLIYDTSGLKPKVKENNPKTLVSEINKQKSYAKAIKKKDYNAYAAAYKNMPKFSEANPSIKLDFVNGHFGYFYKFGILTNGLGIPLGINFFDENFYSSVKQEFETPEEQKYAYDNASLKSVVKPFINNLKSKTNFQFKTFLGDSEFDSYENFGLLKQLNFQKVFIPLNSRNQKNTKINDLEFNTSGIPLCPLTKEQFKSEGSCGGKNRSVRYKFTCPKSYRDKKGKCYLTCETPCTDNKSGRMTYVYPDKDFRLYPGIQRNSDEWAKTYKIRTIIEREISCFKFNPCIQSPNTVNTTTMRSDLYLTAISKLINVILSHSLNNPEYIRSIRKLIAIAA >CP029329.1|AWK52634.1|3827571_3828126_-|hypothetical-protein MGKTLVLDLEDVILQGDILDVGEKNLGIIYNISKEAQDELSLDYVSSDTKIELKDRQYDACTFFFDLNKIWTSLEKEKLIKEISLYLKECGEIFIWDINKERGKVFNNKIKIILPNEKVREFTFRNLNILLSSNIEEIKKILEKYFEIEETKEWEDVFFIRGKKISTKVNAEEKFKHEGTDYSN >CP029329.1|AWK52633.1|3825932_3827597_-|B12-binding-domain-containing-radical-SAM-protein MKVLITAIDSKFIHSNLAVRYLKNFTKDLDYEAKIKELTINDREERILEEIIKEKPDIVAFSTYIWNVELISRVANLIKRVNPQIEILYGGPEVSFDARTFLQNNVGEYVIEGEGEKTYRDFILYKLGEIKIEEVRGLHYKINDVVSSNEKRPLMSMDEIVFPYEEDEDLSNKIVYYEGSRGCPFNCKYCLSSTSHGVRFLDVDRVLKDLMYFINKKVRLVKFVDRTFNCNPKFAMAIWDFLIKQDTNTQFHFEISADILNEEEIKLLANAPKGRFRFEVGVQTTNDDVLKNINRFVNFTDIKEKVLEIEALRNIDQHLDLIAGLPGEDYNSFKKSFNDMYEIKPEEIQLGFLKLLKGSSMREDADKYGMEYSPYPPYEILKTDKLSYEELLKLKKVEEMVDKYYNSLKFNYIIKYFEGKFDSPFDFYYSLGMFFENKGYFNRNIGNAEYYKVFLDFNESILEESNKNLKEIVRFNYLIFNKKRGLPEFLRSDMEKEEEKNIKEKLKDQYSFKEYHLEKFSVNLEKYVLSNEIIEDDSYYVFNNNNEYVYLQNI >CP029329.1|AWK52632.1|3825166_3825727_+|ECF-transporter-S-component MTNKKTFIIIVCAFAAAMNIVLGTLVAQLKIPLIFLDTIGTIFAAIYFGPLYGATVGAVSNIITGMIFSPKDIPFFLVNVVVGLIVGYIVKKYSYSLTTAVVTGLILSVICPLIGSPIAIWLYGGITGSGNDFLVLLLRQTGSDIFTSTFIPRITGNIVDKVVSAVLVWALIKKLPAQYKPEINNV >CP029329.1|AWK52631.1|3824425_3824977_-|hypothetical-protein MKKTKKIVLVSHCILNVNSKVEGLCEFRNTSNNLIKYLMDNDYGIIQLPCPEITIYGIKRWGHVKEQFDTPYYRKHCRNIFEPILEQIEDYINNDYKIKALIAINGSPSCGYNLTCSSPIWGGEFINKENTDKKINDLKFIDKSGTFMEEIENMLMEKNIKINIISIDEENEEATMKTIAELL >CP029329.1|AWK52630.1|3822390_3823992_-|multifunctional-2',3'-cyclic-nucleotide-2'-phosphodiesterase/5'-nucleotidase/3'-nucleotidase MRKKVILSSILSLTLIFSNVTFTFAEDNVKESTSITIIHTNDTHGRVLVDDGGFGFGKIATIVKQTKEKNPNTLVVDAGDALHGMPIINVSKGENAVKILDAVGYDFMVPGNHDFNYGTDRLIELGKLSKFKMLSANLLNKSGNTMLTPYEIVDMNGMKVGIFGLCTPETAYKTNPSNVKNVEFKDPIEVSKNMVRELDKKTDVIVALVHIGLDESSTVTSKEIAQKVNGIDVIIDGHSHTDLPEGLVINNTLIAQTGEYDQNLGVVEINIDNHKVTNKFAKLLKATDYLGLAEDKNISAVVDEIKTANHAIFSEVVASTDIQLDGARENVRNKETNLGNLSADAIKNETKSDIAFVNGGNIRTTIEPGEITKGKLAEVFPFGNTIKVIKLTGEDVKKALEVSVGAYPEDQGGFLQVSGIKFSFDASKENGNRVSELKVNEKDIDLTKQYTVAINDFLAVGGDGYDMFKTKVIAEFGTYEEIFANYLNSNGTKGSELSGRIAVKEITNENAATLFLTHIIHMEYQYNKEKQYS >CP029329.1|AWK52629.1|3821910_3822183_-|hypothetical-protein MDVLKVNIYNQIQTTIYFKEFHEHKDPIVYPGNSECEFLFGKNNAEKVCARLLSMGPQIVVIKLGKDGCIVADNNNILFNETTIKGIIII >CP029329.1|AWK52628.1|3821236_3821563_-|ATPase MALEAIEEIRKFETKAEEIVKSATVEAKDVIQKSFVEAQNQYNDVLFKAKDRANSIINKAIQSGNNEAMPILDKGKKECEDIRNISKDKKNNAVKLVVERIVKIHGNS >CP029329.1|AWK52627.1|3819297_3821250_-|V-type-ATP-synthase-subunit-I MAIVKMNKFTLLAFQSKKEELIEKLQAFSNTEFINLQDENLLENNEVLKELTKDQVDSDLAKWEDQLSKVKFAIQFLEKYVPKQSLIKSLRQEKISLTMLELESKVLDSNWEEVYEKLKEKENELAKLENEKTKLEVSLENLKPYENFNAPLSSLKELKQTSYFLGSVGNPYEETLKNNLNDCYVEIISKDNQETYFFILANKENVNIVEETLRECGFRPFKSDEEETPLKLIQDYNEGISLIGSDKLILKEELARYDEEIKMMKLTYEYYNNLVSRKTISSNFLKTESTTLIQGWVPINQNEKFTTIAKEVLGEDYYLKFEDVKEEEIDDVPILLQNNDLNSSFEAVTGMYSLPKYNYLDPTPLVTPFYLIFFGMMVADAGYGLLMLIGTLLALKFFHFDDGMKKMVKFFMYLSFPTIVFGLMYGSVFGDLIKFKGLIDTNKDFMTILILSLVFGVIQIFFGLAIKAFVLIRMGKPLDAFMDVGSWTITLLSLGGIGAGSMLDLPVLKTISIAGAIIGALLIVFTQGRAAESIGGKIGQGLYELYGITSYIGDLVSYTRLMAIGLSGGSIAGAINMIIKMVPGPIGIFIIGPLLFIIFQTVNLLLSLLSGYVHTLRLTYVEYFSKFYDGGGRPFKPFETTNKYINLKRD >CP029329.1|AWK52626.1|3818798_3819284_-|V-type-ATP-synthase-subunit-K MEMSLVQFLVDNNGGFILGALGVALAVGMSGIGSAKGVGIAGEAAAGLLSEQPEKFGKALILQLLPGTQGLYGFVIGLLVFFKLSPETSFAQGLYLLFACMPIAIAGLWSGISQGKVSAAGIQILAKNPEHNTKGLVLAAMVETYALLGFVVSFLLVNGVF >CP029329.1|AWK52637.1|3832090_3833590_+|stage-V-sporulation-protein-B MDKDNFLKNSFLLIVSNVTTGILGFIFNIYLSKVLGAEGMGLYNLVMPIYNLFICLMTAGIVASISKITAVYNQKGEHNNIVRTIRVVSMFNISWAFLIGIIVFFSAPLIGKYGVNDVRTIDAIRVICPAMVCIAISNILKGYFYGTSKIAVPAIIDIFEKAMRIVTVSLLIFLTQAQTLESMVTLATVALCIGEFQSLFFLFIYYKYSINKMPVSYEKSESRFQLLFDVVLISVPLLMNGFLTNILGTLSTLIVPRRLIVSGFSYTDALSMIGRYNGMALSIITIPLIVVSTINTLLIPDLSQTLVLGKQYEASLRIKKVIKFAFLLGIATTTICSVIPDALGQMFYGRNDLGSYIRFASLTAPIFFPAVTMFGILNGLNRQGIILRNSLIEAIIELICLYIFTAIPSINIFGYSLTMFIACSIGLVLNMYEVNKHIELNLNKSNIIIYILLGFLTFLIINTISKHIFINSLIINNFMVIGFVFLIFTYFGTFGENDN >CP029329.1|AWK52638.1|3833718_3835338_-|polysaccharide-biosynthesis-protein MEEQSANSSSNRGFLILSIAGLLTKVISVFYIPLLQRIIGLDGYGIYQNCYEVFLFVYAVTNLGTQPAIAKVVAELTAIGKSNDAVRTLKIARTLLALVGAILTIFLMLFAFPIGRAIGNPAASYGILMLAPSIFVTSILSSYRGYFQGKNSMTAIAISQVLEQVINIIISLTCAFFLVKISIEYGSAGGTVGTSIGAFVACLYMVYIYGKKRFEEDSIEAQGTNKRIRTKHIIKKLIKYGLPITLCSGLQNFGSLVDMVNVNSRLAVAGFNLQESQVLYGVLGRYKTLLSVPLIIVTALGTTVLPAIVTAMALKDKKEIRRKTTFAFRMIFIITIPAAIGLSSLGREVFELLYGTDQGFELMVMGSVVLILMAVVQIQTVILQSMNKLYFVLGTFSIGIVAKIIANYILVGMPSINILGVVAGNFLWFAIPMFLNQRALKKVLRVKIHMFRNIIKPLTASIVMAGVIFTIKSPALMLITITKAGIMLKGITTLLIIAIGGFVYLYIMLLLGGIKKSDIDSISPRIFNLLPRFIRVKLK >CP029329.1|AWK52639.1|3835347_3836322_-|RluA-family-pseudouridine-synthase MKIEIGPNEAGQRLDKFLRKLLKDVPLSAIFKALRKKDIRVNGAKQNEKYFLQEGDIVEIKYIQSKKEDKTEKFIKVDPKGIKIAYEDENMLILEKWINVLVHSDSNTSKEPTLTDYVLSYLNAKGDYVPENELTFTPAACNRLDRNTSGLIIFGKSFDGLKCINEAIREDEIRKHYYTLAKGKVRDGLYEGYIVKNLETNISTVHDTEVKNSKRIAMEISVVETNGAYSFLDINLITGRSHQIRAHLAHLGNPIIGDNKYGDKKLNSFFENKYGLNYQYLYAYKLIFRNVNDKLSYLKNKTIAVAIPPILKKIKQDVFKFSIR >CP029329.1|AWK52640.1|3836512_3837694_-|amidohydrolase MIDFKKEAEDIKDELIQIRRDLHEHPEIGFEEIRTSKVIKDFLKANEIPYIEVAKTGVCGIIKGTKEGNNKTIALRGDIDALPIKDMKTCDFKSKIEGKMHACGHDAHTTILMGAGKILNDNKDKFSGTVKLLFEPAEETTGGAQHMISEEILENPRVDCILGLHVDEETECGTIKIKKGVVNAASNPFSIKIIGQGGHGASPHTTVDPIVIASHIVIALQTIVSREIAPVNPIVITVGTLHAGTAQNIIPGEATLSGMIRTMTKEDRIFAIKRLNEIVDGIATMSRAKAEINVDESYPCLYNNDEFVDLITESASVVIGKENVLEQRAPKMGVESFAYFANERPSAFYFLGSGNKEKKTTEPAHSNLFNIDEDCLPIGVSIQALAAFNYLTK >CP029329.1|AWK52641.1|3837801_3839910_-|cell-division-protein-FtsA MELKRFNQKDIIFALDIGTRSIIGTVGIIKDKKFHVVCEKYLEHEERAMIDGQIHDITLVASVVQKVKAYLEEELQIQLNEVSIAAAGRFLRTVDIKADIELNEDEEVDKEIVRSLELSAVKKAEGEIAATTEGKLYCVGYSVKSFYLNGFLISNLIGHKGQNIGEEVIATFLPRSVIDSLYSVMNKVNLKVVNLTLEPIAAMEAAIPRNLRLLNIALVDIGAGTSDIAISYKESISAYGMVPMAGDEITEAIVQEYLVEFNTAENIKKSIGKEKEVTYTDIFGIENTILSENVFKLVSVIVNKVSEEISKKILELNGDKAPSAVFLVGGGAHTPGILETIADKLKLQPQRIAIKDRQAVTECVSDNVLGSAGVTVLGIALTAIRSLGNDFIDVILNNDPISLFNSHKHTIMDVLLQAGINPSLLISKNGKSVRFNYNGCKRIVFGEYGTNAKITINGQEATLETEVKASDNITLEYAQNGKDSQPRLSQHIKNINSISIYLDGKIINIDPVIFVNGKKGDLDYVISNGDEVKVFLPCKVCDFKKYILKEDVNLLKEESILEDNYEICEGDYIIKQIKNPKESQLSEEVKDFENNIDDITEDNNDENIKFDYINNPNKTEMTTQNEVAITKEGFSSITVNINGQNTTLKGKLQYIIVDIFDYIDFDLTIAKGIINLNLNGEKSSYTANIKDGDIIEVFWSVI >CP029329.1|AWK52642.1|3840378_3841008_+|hypothetical-protein MQNRSNTSLLKNTYLDAYHAVEACLIQHNFGLLFSRKVENQVFDIMITAQNQKVPVKKLECHKDLNKFCDDLINEYNKSISIMQQIIEGIFTFSLLVFFFTLLDVIFEKGVLKSTLITCLLIFIGYFISNTILRFKKSVTSKIRSLLILGIVLIPFVLMSFLKIKFDLLTTTLSFPNSLFLVLLTCGISVVFYLILSKKYDLFIFIKSN >CP029329.1|AWK52643.1|3841157_3843275_-|hypothetical-protein MYNFVEQIYSNEEKCVGCNKCLTNCPVTGANIVYLVDGNNKIKINTEKCIHCGKCIKVCDHNARDFKDDTERFFQDLCNGKKISIIAAPSLIVNFDEYKKLLGYLKNLGVNLIYDVSFGADITVWAYLRTMKKDNLNTMIAQPCPPIVNYIQKYQPELIDKLAPVHSPMMCTAIYMKKYANIHDDIAFLSPCVAKADEINDINTYGYVKYNVTFKKLTEYLEAKHIDLSQYEEGKFDDIGCSLGFLFSRPGGLKENIELHIKDAWIRQINGPHNAYKYLEDYNNNLKSNKQIPLVVDILNCSYGCNFGTGTCNKYENSTTIDEVDYKFDKLKKIKKTDKGGKLIRKKFNWLHNYFDKNLKLQDFKRLYNKNIIVDDIIEPSDKQYDEIFIKMNKLSEESRNINCSACGYGSCKTMAKCIYNGLNVWSNCIDYNKKEVINEHHLLEERNEFFTNISHELRTPLNVIYSVLQMEMKYYDNLTIDDIIKYNKIIKQNCLRLIRLVNNIIDLSKIEAGFFKPLFVVGNIISIIENITLSITTYAENKKINLVFDTEMEELYFKFDANSIERIMLNLLSNSVKYGKENGTIKVYIYKTDQNNMVVSVKDDGIGIPEEMQKKVFERFKKVDTSLSRKNEGSGIGLSIVKSLVEIQGGTITCRSKLNEGTEFLVTFPFDSEDNKLSSDIGKHILCEKNSTETVDIEFSDIYL >CP029329.1|AWK52644.1|3843475_3844462_-|hypothetical-protein MLLKIFDYIYVYNILKLEEETRYMNKNVKRTIAMALTIGAFSVVGQTNYNIFTTEAHASTLDANELTDLELATSSGRNLDLYEDNDYDHELSGDLEVNRTYYTNTSSSNVVIKGIHGADEDNIRIFKENSNTVYKVNDDITISSETTTTFKVRVYKDEYDENKVYSSSDYNQYTIKVENTEDDDNTKTYNLKIVRTDATQEKGNFDGNNGLHNGWRDKNSTGNNGFHKGWKNENGAWHYLDNDGNMKKGWLKDTDKNWYYLDDYGKMKTGWYRDTDQNWYYLDNNGKMKISWIKDADGNWYYLQSSGKMAKNTTIDGYKLDVNGAWVK >CP029329.1|AWK52645.1|3844750_3846754_-|ATP-dependent-helicase MGYNLDKYQMSAVQAEEKNALIVAAPGSGKTTVIINKVNHLVENKKVSNGNIIVITFTKAAAQNMKKRYQDAFNKNTSPFFGTFHGLFYKMLLRCGESIDIIEGGIAHKIVSNVLSKYFDEVNEDKIKEAINNISLYKTSRASLNEFEPTLTKEIFEEALEKYEGYKKEHNKRDFDDLAIEVLELLKKDEDMLLAYRKLFKYVLVDEFQDCDEMQIDFLKLINDGENNNLFAVGDEDQCIYSFRGSKPEYMVSFDKIFKNGKKYYLSINYRSKMNIVDKSKDVISFNKKRNNKEIKWNKDSYGIIKWFSPYNEKMQAESLTDIIIENKKLGISYEDNAVLYRTNMESMTMIDVLTKRKIPFTLLDREYNFFEHFICRDLIAYLKLSINQFDTNSFLQIINKPFRYISKSNIAYIKNYVKEENPFTILIDKQDTPPFQKKKLDDLRKDIHYLNRVSLSSAIAYIVMDLGYIDHLKGYAQKFNQSSDDLEDIIEEFKLSAESFKTIFEFLQHIEEIKQTIEESKKKTKREGVILSTIHGVKGMEFRNVYVINCCEETIPHASSMKENLEEERRLFYVGITRAIDELYLFSPRNRKGQFKDVSRFIVEGKLNDMPVETYGYEVGNKIAHKAYGIGEVEELNDDKLTISFDNTLRSFSLKVLIDNNLIQKI >CP029329.1|AWK52646.1|3847272_3848757_+|nicotinate-phosphoribosyltransferase MNNKSSFNVKDERNLTMLVDFYELTMGNGYFDKGLQDKIAYFDMFFRRIPDEGGYCIMAGVEQLIEYLKSLKFTDDDITYLRDKNTFSEEFLEYLKNFKFSCDVWAVPEGNPVFPNEPLVTVRGPVIQAQFLETMILLTINHQTLIATKANRICRAAEGRPVMEFGSRRAQGYDGAIYGARAAIIGGCSSTACTLSDRMFNIPAVGTMAHSWVQLYDTEYDSFKAWAEIYPDDCVLLIDTYNVVKSGIPNAIKVFDEILKPLGKRPKGIRIDSGDITYLTGRCREMLDKAGYEDCKIVISNSLDEHIIKDVLDQGASIDSFGVGERLITAKSEPVFGGVYKLVALENNNEIIPKIKISENEEKITNPGFKKIIRIFDKNSHKALADLITLRDEKINETEPLVLFNPIHTWKRKKIKNYYTKDLQVQIFKSGKCIYESPSVLDIKQFAKIEADKLWAEVLRFENPHTYYVDLSQNLWALKHSLLHKYTASYESQD |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029329_9 | 9.1|3830327|29|CP029329|CRISPRCasFinder | 3830327-3830355 | 29 | CP029329.1 | 1822815-1822843 | 2 | 0.931 |
CP029329_9 | 9.1|3830327|29|CP029329|CRISPRCasFinder | 3830327-3830355 | 29 | CP029329.1 | 2397261-2397289 | 2 | 0.931 |
1. spacer 9.1|3830327|29|CP029329|CRISPRCasFinder matches to position: 1822815-1822843, mismatch: 2, identity: 0.931
ggtgaaaagatcttaattgtgcttcgcac CRISPR spacer ggtgagaagattttaattgtgcttcgcac Protospacer *****.*****.*****************
2. spacer 9.1|3830327|29|CP029329|CRISPRCasFinder matches to position: 2397261-2397289, mismatch: 2, identity: 0.931
ggtgaaaagatcttaattgtgcttcgcac CRISPR spacer ggtgaaaagttcttgattgtgcttcgcac Protospacer ********* ****.**************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029329_5 | 5.1|683139|33|CP029329|CRISPRCasFinder | 683139-683171 | 33 | MK893987 | Staphylococcus phage PMBT8, complete genome | 8287-8319 | 6 | 0.818 |
CP029329_5 | 5.1|683139|33|CP029329|CRISPRCasFinder | 683139-683171 | 33 | AP014342 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S37-C78, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 4225-4257 | 7 | 0.788 |
CP029329_8 | 8.38|3247602|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3247602-3247635 | 34 | NZ_CP014325 | Borrelia anserina Es isolate UTHSCSA plasmid lpA89, complete sequence | 49119-49152 | 7 | 0.794 |
CP029329_9 | 9.1|3830327|29|CP029329|CRISPRCasFinder | 3830327-3830355 | 29 | NC_019772 | Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.01, complete sequence | 155124-155152 | 7 | 0.759 |
CP029329_8 | 8.22|3246532|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246532-3246565 | 34 | MN693342 | Marine virus AFVG_25M9, complete genome | 7132-7165 | 8 | 0.765 |
CP029329_8 | 8.27|3246865|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246865-3246898 | 34 | NC_024217 | Nitrincola phage 1M3-16, complete genome | 79201-79234 | 8 | 0.765 |
CP029329_5 | 5.1|683139|33|CP029329|CRISPRCasFinder | 683139-683171 | 33 | MH542234 | Staphylococcus phage Terranova, complete genome | 118896-118928 | 9 | 0.727 |
CP029329_5 | 5.1|683139|33|CP029329|CRISPRCasFinder | 683139-683171 | 33 | NC_041928 | Staphylococcus phage phiIBB-SEP1, complete genome | 84461-84493 | 9 | 0.727 |
CP029329_5 | 5.1|683139|33|CP029329|CRISPRCasFinder | 683139-683171 | 33 | KP027447 | Staphylococcus phage phiIPLA-C1C, complete genome | 85475-85507 | 9 | 0.727 |
CP029329_5 | 5.1|683139|33|CP029329|CRISPRCasFinder | 683139-683171 | 33 | MH321490 | Staphylococcus phage Quidividi, complete genome | 119803-119835 | 9 | 0.727 |
CP029329_5 | 5.1|683139|33|CP029329|CRISPRCasFinder | 683139-683171 | 33 | MH321491 | Staphylococcus phage Twillingate, complete genome | 121429-121461 | 9 | 0.727 |
CP029329_5 | 5.1|683139|33|CP029329|CRISPRCasFinder | 683139-683171 | 33 | MF417868 | Uncultured Caudovirales phage clone 7AX_1, partial genome | 63081-63113 | 9 | 0.727 |
CP029329_8 | 8.23|3246598|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246598-3246632 | 35 | NZ_LR217738 | Candidatus Erwinia haradaeae strain ErCipiceae isolate 3303 plasmid pBio | 25344-25378 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.23|3246598|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246598-3246632 | 35 | CP024689 | Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-5-125K, complete sequence | 79420-79454 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.25|3246732|33|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246732-3246764 | 33 | NC_019521 | Sphingomonas phage PAU, complete genome | 26907-26939 | 9 | 0.727 |
CP029329_8 | 8.25|3246732|33|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246732-3246764 | 33 | GU071095 | Synechococcus phage S-SM2, complete genome | 124950-124982 | 9 | 0.727 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | KX346250 | Lactococcus phage MW18S, complete genome | 9247-9281 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | KC182543 | Lactococcus lactis phage 645, complete genome | 10586-10620 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | NC_028900 | Lactococcus phage SL4, complete genome | 8554-8588 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | NC_049361 | Lactococcus phage 936 group phage PhiL.6, complete genome | 9079-9113 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | KX379672 | Lactococcus phage 16W12L, complete genome | 9684-9718 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | KY554760 | Lactococcus phage R3.4, complete genome | 8139-8173 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | DQ054536 | Lactococcus phage P008, complete genome | 8316-8350 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | NC_001909 | Lactococcus phage bIL170, complete genome | 9840-9874 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | MF448569 | Lactococcus phage 88605, complete genome | 10130-10164 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | KX379673 | Lactococcus phage MW18L, complete genome | 9905-9939 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | NC_021852 | Lactococcus phage P680, complete genome | 9649-9683 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | NC_049373 | Lactococcus phage 16W23, complete genome | 9379-9413 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | MF448564 | Lactococcus phage 62601, complete genome | 8439-8473 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | NC_049480 | Lactococcus phage CHPC129, complete genome | 8400-8434 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | KX346242 | Lactococcus phage 8R06S, complete genome | 8860-8894 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | KP793117 | Lactococcus phage 936 group phage PhiG, complete genome | 10119-10153 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | MF448567 | Lactococcus phage 66901, complete genome | 9235-9269 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | KC182542 | Lactococcus phage 340, complete genome | 10585-10619 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | NC_049483 | Lactococcus phage CHPC52, complete genome | 9827-9861 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | KC182550 | Lactococcus lactis phage P475, complete genome | 8890-8924 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | AF009630 | Bacteriophage bIL170, complete genome | 9840-9874 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | MF448566 | Lactococcus phage 63302, complete genome | 9521-9555 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | KY554761 | Lactococcus phage R31, complete genome | 7932-7966 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246931-3246965 | 35 | KC182545 | Lactococcus phage fd13, complete genome | 10610-10644 | 9 | 0.743 |
CP029329_8 | 8.7|3245527|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3245527-3245561 | 35 | AJ972879 | Yersinia phage phiR1-37 complete genome | 135946-135980 | 10 | 0.714 |
CP029329_8 | 8.7|3245527|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3245527-3245561 | 35 | NC_016163 | Yersinia phage phiR1-37, complete genome | 135946-135980 | 10 | 0.714 |
CP029329_8 | 8.8|3245594|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3245594-3245628 | 35 | NZ_KY807920 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B isolate 12-02541 plasmid pSE12-02541, complete sequence | 1547-1581 | 10 | 0.714 |
CP029329_8 | 8.8|3245594|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3245594-3245628 | 35 | NZ_KY807921 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B isolate 13-SA01718 plasmid pSE13-SA01718, complete sequence | 1547-1581 | 10 | 0.714 |
CP029329_8 | 8.8|3245594|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3245594-3245628 | 35 | NC_025830 | Escherichia phage Av-05, complete genome | 22288-22322 | 10 | 0.714 |
CP029329_8 | 8.16|3246132|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246132-3246165 | 34 | KU234532 | Nostoc phage N1, complete genome | 31342-31375 | 10 | 0.706 |
CP029329_8 | 8.27|3246865|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3246865-3246898 | 34 | MN694445 | Marine virus AFVG_250M317, complete genome | 16387-16420 | 10 | 0.706 |
CP029329_8 | 8.41|3247802|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3247802-3247836 | 35 | MN694579 | Marine virus AFVG_250M1138, complete genome | 22353-22387 | 10 | 0.714 |
CP029329_8 | 8.41|3247802|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3247802-3247836 | 35 | MN694540 | Marine virus AFVG_250M802, complete genome | 20881-20915 | 10 | 0.714 |
1. spacer 5.1|683139|33|CP029329|CRISPRCasFinder matches to MK893987 (Staphylococcus phage PMBT8, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
tttttttaaaggtgtatattctttaacagtcaa- CRISPR spacer tttttctaaaggagtatattctttta-ggtcata Protospacer *****.****** *********** * .****
2. spacer 5.1|683139|33|CP029329|CRISPRCasFinder matches to AP014342 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S37-C78, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
tttttttaaaggtgtatattcttt--aacagtcaa CRISPR spacer tttttctaaaggtttatattcttttagaaaatc-- Protospacer *****.******* ********** .* *.**
3. spacer 8.38|3247602|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014325 (Borrelia anserina Es isolate UTHSCSA plasmid lpA89, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
atttcctggtaatcttgatattttaaaatcttta--- CRISPR spacer agttgcaggtaatcttgatattttaag---tttaaat Protospacer * ** * *******************. ****
4. spacer 9.1|3830327|29|CP029329|CRISPRCasFinder matches to NC_019772 (Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.01, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
ggtgaaaagatcttaattgtgcttcgcac CRISPR spacer tcacaaaagttcttaattgtgcttcccaa Protospacer ***** *************** **
5. spacer 8.22|3246532|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693342 (Marine virus AFVG_25M9, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
aataaaggagttaagagcaatgtcgttaaaagat CRISPR spacer aataaatgaattaagagcaatgtcaccagaggag Protospacer ****** **.**************...*.*.**
6. spacer 8.27|3246865|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_024217 (Nitrincola phage 1M3-16, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
taacagtattgtttaataagtaatggagattaca CRISPR spacer taacagtattatttaataaataatataaacaata Protospacer **********.********.****. *.*. *.*
7. spacer 5.1|683139|33|CP029329|CRISPRCasFinder matches to MH542234 (Staphylococcus phage Terranova, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tttttttaaaggtgtatattctttaacagtcaa CRISPR spacer tttctttaaaggtgtaaattcttttttattttc Protospacer ***.************ ******* .* *.
8. spacer 5.1|683139|33|CP029329|CRISPRCasFinder matches to NC_041928 (Staphylococcus phage phiIBB-SEP1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tttttttaaaggtgtatattctttaacagtcaa CRISPR spacer tttctttaaaggtgtaaattcttttttattttc Protospacer ***.************ ******* .* *.
9. spacer 5.1|683139|33|CP029329|CRISPRCasFinder matches to KP027447 (Staphylococcus phage phiIPLA-C1C, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tttttttaaaggtgtatattctttaacagtcaa CRISPR spacer tttctttaaaggtgtaaattcttttttattttc Protospacer ***.************ ******* .* *.
10. spacer 5.1|683139|33|CP029329|CRISPRCasFinder matches to MH321490 (Staphylococcus phage Quidividi, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tttttttaaaggtgtatattctttaacagtcaa CRISPR spacer tttctttaaaggtgtaaattcttttttattttc Protospacer ***.************ ******* .* *.
11. spacer 5.1|683139|33|CP029329|CRISPRCasFinder matches to MH321491 (Staphylococcus phage Twillingate, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tttttttaaaggtgtatattctttaacagtcaa CRISPR spacer tttctttaaaggtgtaaattcttttttattttc Protospacer ***.************ ******* .* *.
12. spacer 5.1|683139|33|CP029329|CRISPRCasFinder matches to MF417868 (Uncultured Caudovirales phage clone 7AX_1, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tttttttaaaggtgtatattctttaacagtcaa CRISPR spacer tttctttaaaggtgtaaattcttttttattttc Protospacer ***.************ ******* .* *.
13. spacer 8.23|3246598|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR217738 (Candidatus Erwinia haradaeae strain ErCipiceae isolate 3303 plasmid pBio) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
gttttattatggatatggattattcatttattatt CRISPR spacer tataaaacatcgatatgcattattcatttattatc Protospacer * * .** ****** ****************.
14. spacer 8.23|3246598|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP024689 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-5-125K, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
gtttta----ttatggatatggattattcatttattatt CRISPR spacer ----taaaagccagggatatggattattcatctattgtt Protospacer ** ..* *****************.****.**
15. spacer 8.25|3246732|33|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019521 (Sphingomonas phage PAU, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtaaaaaatccattaaatccaaaataccaccag CRISPR spacer gtaaaaacttcattaaatccaaaaggtcaaaca Protospacer ******* *.************** ..** .
16. spacer 8.25|3246732|33|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU071095 (Synechococcus phage S-SM2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gtaaaaaatccattaaatccaaaataccaccag CRISPR spacer ttaaaaaatccattaaatcacaaatccaaattc Protospacer ****************** **** * * .
17. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX346250 (Lactococcus phage MW18S, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagaacttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
18. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KC182543 (Lactococcus lactis phage 645, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagaacttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
19. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028900 (Lactococcus phage SL4, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagaacttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
20. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_049361 (Lactococcus phage 936 group phage PhiL.6, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagaacttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
21. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX379672 (Lactococcus phage 16W12L, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagaacttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
22. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY554760 (Lactococcus phage R3.4, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagagcttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
23. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to DQ054536 (Lactococcus phage P008, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagagcttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
24. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_001909 (Lactococcus phage bIL170, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagaacttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
25. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF448569 (Lactococcus phage 88605, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagagcttaaga Protospacer *************** ******** ..** *
26. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX379673 (Lactococcus phage MW18L, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagaacttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
27. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_021852 (Lactococcus phage P680, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagagcttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
28. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_049373 (Lactococcus phage 16W23, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagaacttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
29. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF448564 (Lactococcus phage 62601, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagagcttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
30. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_049480 (Lactococcus phage CHPC129, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagagcttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
31. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX346242 (Lactococcus phage 8R06S, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagaacttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
32. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KP793117 (Lactococcus phage 936 group phage PhiG, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagagcttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
33. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF448567 (Lactococcus phage 66901, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer tcagcaacaaaaagcaatggatacagaacttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
34. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KC182542 (Lactococcus phage 340, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagaacttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
35. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_049483 (Lactococcus phage CHPC52, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer tcagcaacaaaaagcaatggatacagaacttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
36. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KC182550 (Lactococcus lactis phage P475, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer tcagcaacaaaaagcaatggatacagaacttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
37. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AF009630 (Bacteriophage bIL170, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagaacttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
38. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF448566 (Lactococcus phage 63302, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagaacttaaga Protospacer *************** ******** ..** *
39. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY554761 (Lactococcus phage R31, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagagcttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
40. spacer 8.28|3246931|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KC182545 (Lactococcus phage fd13, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagcaacaaaaagcaaacgatacagataccaata CRISPR spacer ccagcaacaaaaagcaatggatacagagcttaaaa Protospacer *************** ******** ..** *
41. spacer 8.7|3245527|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AJ972879 (Yersinia phage phiR1-37 complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gatgtaattggtatattaggatctattgcattaca CRISPR spacer ctagaagcgggtatattaggatttattgtattacc Protospacer * *.. *************.*****.*****
42. spacer 8.7|3245527|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_016163 (Yersinia phage phiR1-37, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gatgtaattggtatattaggatctattgcattaca CRISPR spacer ctagaagcgggtatattaggatttattgtattacc Protospacer * *.. *************.*****.*****
43. spacer 8.8|3245594|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KY807920 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B isolate 12-02541 plasmid pSE12-02541, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tgaaaatataactaaagaggtgatttaatatgtat CRISPR spacer ggagaatataactaaaggggtgatttcaacaaggt Protospacer **.*************.******** * . .*
44. spacer 8.8|3245594|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KY807921 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B isolate 13-SA01718 plasmid pSE13-SA01718, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tgaaaatataactaaagaggtgatttaatatgtat CRISPR spacer ggagaatataactaaaggggtgatttcaacaaggt Protospacer **.*************.******** * . .*
45. spacer 8.8|3245594|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_025830 (Escherichia phage Av-05, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tgaaaatataactaaagaggtgatttaatatgtat CRISPR spacer cagcatactaactagcgaggtgatttaatatgttt Protospacer ... * ******. ***************** *
46. spacer 8.16|3246132|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU234532 (Nostoc phage N1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
atcagcattgattaacatttttatatatccatta CRISPR spacer ttggatattgattaacactttaatatatccagct Protospacer * ...***********.*** ********* .
47. spacer 8.27|3246865|34|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694445 (Marine virus AFVG_250M317, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
taacagtattgtttaataagtaatggagattaca CRISPR spacer aatggatattatttaataagttatggagattggg Protospacer * ..****.********** *********. .
48. spacer 8.41|3247802|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694579 (Marine virus AFVG_250M1138, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
ctaaagatattcaattaaaaagtaaa-----tatgatttt CRISPR spacer ttaaaaatattcaattaaaaactaaagtacctaaa----- Protospacer .****.*************** **** ** .
49. spacer 8.41|3247802|35|CP029329|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694540 (Marine virus AFVG_250M802, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
ctaaagatattcaattaaaaagtaaa-----tatgatttt CRISPR spacer ttaaaaatattcaattaaaaactaaagtacctaaa----- Protospacer .****.*************** **** ** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1210111 : 1223654
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029329|1210111:1223654|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029329|1210111:1223654|1216563_1216839_+|AWK53038.1|DBSCAN-SWA MNIQELKKQLQEGTFYYHKFGLLVKGKVNIVLQESEDTLNVNFVGGNVDVYIDKIEPVKRPGNIIAKFEWCYLLKNYYHDVIGYIGLKKED >CP029329|1210111:1223654|1213385_1213895_-|AWK50474.1|DBSCAN-SWA MAYSYFSENLKRVRKQKKLTQAALGKIIGKSESTIRKYEAGNVDAPFTTICDISEKLNIPMMDLTEKHYNSEEEVTIDRINTIEYEAFMTVDNNCNDFKHYVHYLVQTRAFKKEFNINYKELSKIEQRDLKRDIYNSIQLICSKKNDISIFDDFSNNNLELSKTLQEGE >CP029329|1210111:1223654|1214299_1216444_+|AWK50476.1|DBSCAN-SWA MDKENFISISKDIFPIVPLFDNSKIPNVKWSDRNCQIKTKEEFKNISSRAYKKEVTGFSLLTGKDSNIIVIDIDKNHGDGSVDGEESFNELIKDLSEEDKQKIKDTFTVKTPNGGSHLYFKYKEGLKNKADYLPGVDIRTDGGIIVLPGSKAKVKDEIREYKLLNDTNINEMPKPLFDKFIQLGQPVKKKATQVVGPAASSTYKEGVRNQELFKEVIGIVSKSSIRDITTITSIAKGLNLLKCNLPLDDEEVENIIGSISQRLNPSYCDEKGNINNYSLSEYIIQDQPSYTKGNLWFMYDNKKGFYKYMEFREVQRMYFKYAINDKDKTIIKSKNFAELLMLSSEDAREIHDEKRYINCLNGVIDIGNNTMLPHDPKYKTEVQFKANLITEPTKYKELFDKSEFKKFLNSTLDEGSIKTLQESWGLMLSPHAREVQNCFIYKGEGSNGKSVTFDIQEALIEDDNHICSIGLGDFGETFAISVAEGKHVNIVRDDELSGKTVSKAFKSMCCGEPVTVNRKNKDLVRLGFNMTMFFGLNRLPSAADKSTGFFRRPIIIPFNNSFGTDKEVSEGTRDKVKDPKIAERIIENELDIVFTFAYVGLNRVKKNNWKVTVSKAAEHEMEEYREEVDSAYAFFKEKITKVHKKNIKISKGEVYKTYNDWCISNSIMPMNKTHFGRQLSSFGVKHIKSNSVGYYLDIEVDDLILIEDKRGIFK >CP029329|1210111:1223654|1214096_1214285_+|AWK50475.1|DBSCAN-SWA MNNTTVEKIVISPKEAMQYLGCGRNTMYEVLLKDKNFPKFKIGSKFYINKDKLQEWANKQCR >CP029329|1210111:1223654|1221340_1221673_+|AWK50483.1|DBSCAN-SWA MAIAISKDMKQLKTLLKQIPKDRQPIAESIYNELSFMQKTLNSLKKQVEEEGAVSMFKQGRQEFLREHPALKGYNTTVQRYSLLYKQLVDLLPPVEVPKETDPLLEFIKE >CP029329|1210111:1223654|1211004_1211439_+|AWK50471.1|DBSCAN-SWA MKSYIAKASEIERKWYVVDADGKTLGRVASQIASILRGKNKPIFTPNVDCGDFVIVINAEKVVLTGKKLDQKLMRKHSFYPGGLKETPYRVVLDKKPEFAFEEAVRRMLPNGVLGRQMLKKLNVYRGAEHNHAAQKPEVLELKY >CP029329|1210111:1223654|1212185_1213385_-|AWK50473.1|integrase|DBSCAN-SWA MAKTNYLKRTINGKEYYYFRLRHKNLNKPKDVYAPTVKELDQKIRTIRNELENNIVNNKDFFETFFANWLFDVKFSIVKPSTKERYESIYRNYIKDSSLSKIKIKDIALTDIQGYYNELIKSGSSVNCVATLNKLIAPCIKYAYNNNILIKDFTGAIVLPKEDQQTKLTKAGKVQPFTLDEQQMFISSIKDNQLEMLFLTALNTGMRQGELFALTWEDIYFEECYIDVNKTVKSVADVSREGREPLKTIIQTPKTVNSVRRVSIPSALSEQLKQYRLKQLEKKFKLANLYTDNNLVFCTSYGKYLDSSSVRKRMNKIIDNINTAETDKTKIINNRKFHDLRHTYATRLFELGEVPKTVQKLLGHSDISITLDIYTHVLEDMKIMAASKLNDLYVSMRAK >CP029329|1210111:1223654|1219346_1220600_+|AWK50480.1|capsid|DBSCAN-SWA MKFTTVAEAFNYYRNFSLEGIETRAAQIKGTIDNDPNADVMSMNIEIEGLNQAKQNIQQKKPGALAEGEAPAQRSQFNPITGMNFNGDVEAPKGDVFASNEYRSAFFKNMLGQKLTDPEERTYKRAMEIVDTEKRADAFSTTTSAAAVLPTQTLNEVISKARTMGGLIASCRNFNIPTNLSVPIGTPSTKAAWHVEGAAVASEAAATTSVSFAAYEIVKVMSMSAAAKKMTILAFESYITDELTNCVMETIADSLVNGTGTTQGTGLLTGVVWSASNSFTFAKAGNVAYTDFTKMVGMLKRGYGAGAKFAMNNSTLYNQVYSLVDLNKRPIFIADPKNEEIGYILGKPVVIDDNIADDVILLGNFNYMGYNIPQGIIIETSRDSSFKSGLIDYRALAIADTKPLVTEAFIKLSRATA >CP029329|1210111:1223654|1221669_1223313_+|AWK50484.1|terminase|DBSCAN-SWA MMNYVIEYFEAIKAGECIVSKRVYKQYEKLVNEINNPGKYIFDEAKALKPIKFIETFCKHSKGEWATKPVLLELFQKAYISALFGFIDKNTGLRRYKESMFYVARKNGKSTMLSGIAAYMLVADGEPGAEIYSCATKKDQAKLVFDETLNMIKQSPYLSKHIKKRKTDLYFPLTMSKFQPLGKNSDTLDGLNAHCVIIDELHGVKDRNLYEVMKQSQSARRQPLLLMITTAGTIRECIFDDMYDYACNIVDGNFEDETFLPILYELDKKEEWLEPGAWAKANPALGTIKKLDDLERKVEKAKNSPKDLTGVLTKDFNIRDTISSAWLTFEDLNNEETFNIEDFKNCYAIGGADLSITTDLTCATLLLIDKVTQKRYIHQMYWLPSDNFEQRVKLEKIPYDIWLKRGLIRLCSGNSINYSDVTAWFVEMLNNYGITPLWIYYDSYSAKYWVEEMEQNGFKMVRAIQGARTLSLPMQQLGADLKANKINYNNNPILKWCLTNTGIQEDRNGNIVPIKNQAAKQRIDGLASMLDSYVGLYEHFEEFIRAL >CP029329|1210111:1223654|1210111_1210846_+|AWK50470.1|tRNA|DBSCAN-SWA MRNIKLIIEFDGSNFSGWQRQPIGRTVQSVIEIAIFKATGENIIINGSSRTDAGVHARGLVASFFTNSTIPGDKFREAINTRLPEDVSIIKSEEVDKNFHARYSSKGKTYSYTIVNRYERLSLGHQYLYHCRYKLDVDEMRKACKYFIGKHDFKAFMSPGSSIKTTTRNIEELYIEQKRDRIKIFITADGFLYNMVRIIVGTLIKVGNGKLKAEEIESIIIEGNRKRAGMCISPNGLILEKVFY >CP029329|1210111:1223654|1220926_1221232_+|AWK50482.1|DBSCAN-SWA MAKEYAKSFYESSAWKKCRKGFMQSKHYICERCGGSAYITHHKQHITPTNINNLNIILNWDNLQALCLDCHNVVHGNNATVNGISFDNEGNLIYTAPGQEK >CP029329|1210111:1223654|1220658_1220922_+|AWK50481.1|DBSCAN-SWA MIITLEETKNLLRVDFSEDDNLIQNLIDTIPQYLENKTGKAWNTEPINPLVKTLAGFLLQSWYEGSTGALDKVIDNIIATLTPMARI >CP029329|1210111:1223654|1218785_1219343_+|AWK50479.1|head,protease|DBSCAN-SWA MKEVRNAQIQSNDELELIGTPIVFDEVTTINDPNGSYNEIIKRGALDGADLTDIRLLYNHDTNKIPLARVPKTMQFNVDDKGLHMRATLPGTEEAKSVHTAVSRGDLTGMSFAFKVPKGGSLYDPKTNTRTITKIEKVYECSVVPYPAYQTTSIEARNQITEVQKLESQKDQIKIKINKLLLKEC >CP029329|1210111:1223654|1211465_1211858_+|AWK50472.1|DBSCAN-SWA MAKVQYMGTGRRKKSVARVRLVPGNGNVVINKREIENFFGLETLRVIVNQPLVLTATKDKFDVLVNVHGGGFTGQAGAIRHGIARALVKSDEALKSELKKAGFLTRDPRMTERKKYGLKKARRAPQFSKR >CP029329|1210111:1223654|1217520_1218714_+|AWK50478.1|portal|DBSCAN-SWA MNLIDKLFKKNKDPASTEHVEVMNGSAAIFTPFSGNAYESDIYRAAVDSIARNAAKLKPVHVVTIAGQRKDGDSSLNRILQVRPNPYMSAYDLIYKLVTHYYLYNNAFAYLQKDDKGNLTGIYPLSPLNMEYITDLTGILYCRFLFMGGKQFIVPFTEVFTIRRFFNSNDLLGDTNTAILPTLDLAHTQSEGIENSIKSSASIRGLLKYNQILSPENLKKEKEAFISDYLTISNNGGIVALDSKLEYVPLDLKPTIINDKQILSIKQKIYEYLGISENIVNSTYTENEWAAFYESIIEPLGVQFSLELTEKLFTPREQAFGNSILLEANRLQFASNTTKTQILKELMPLGLFTVNQALEILNLPSVEDGDRRVQTLNVASTDIVDNYQMKDKGENDG >CP029329|1210111:1223654|1217084_1217312_+|AWK50477.1|DBSCAN-SWA MKREIELLIKGANIEIIKVLRDFNDTMNATLGDTVTITSNTGVITRKATLRDTIEFYQDEWCRVLEKLNELGIEI >CP029329|1210111:1223654|1223327_1223654_+|AWK50485.1|head,tail|DBSCAN-SWA MGKYRKDKKISIIKLTSYQDEIGNDIEEEAPVPGCENIWAYYRHISGTEYFAAATTNTKVEVTFQINWRTGIDTSMKILYNNKTYCITHIDDFEGKKTDLKIYAYKIN |
17 | Clostridium_phage(33.33%) | capsid,terminase,tail,head,tRNA,portal,protease,integrase | attL 1211881:1211904|attR 1225311:1225334 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1397589 : 1431802
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP029329|1397589:1431802|DBSCAN-SWA TTTAATATTGTTGCACTTCATTGAAGATGGCTCCTGTTGCATCTATTTCTGTCTGCGGTGCTGGAGACAAAGCATAAAAACCACTTTTAACCATCCATTGCCATACTTCATAAGCATGATTACAACTCATTGTAAAAGCATCTTTTAAGAATTCTCGAAGTTCTGGATTACTTGCTTCCATAGCACTCCATGCATACTCTCTTCCAGCTCTTTTTAAAGTTAAAAGATATCCTGTAGCTATTTCCCTATCATTCAATTGTTGTACATCTGTTCTAGGTGTAACTGGAATTGTTGCAACTGGCGCTTTAGTAAAGTCTTGTAGAATTTTTGTTAATACTGGAACATTCAACTTTTCTGTAGGTGCAGTTGCATCTTTAACAAATTTAACTTTCATATTATAATCTTGAACATGAACTGGAAAATGAGTTTCTATCATAGATTTTAATTGTGGGTCTGTAACCATATTTTTGTAAAGTGCCATATTAGTTATAGAATTTACGCAGCTTAAAATTAATTCACTCAAATTATGTAATTCACCACATGATAATTGCATGATACTTTCCTCCTGCTAATTATATATTTTAAACAGTAATATTAAACTTTATTTTCTAGGGTTTTCAAAAGATGGTGGTGTTGGGTCTGGAGCTTTTTGTGCTGGTCCAGGTGTAGATAAATCAAAATAAAGTTTAGAATCTTGAGTAACACCAAAATCTTTATTTGAACCAGTATTTTGTACCTTATTTAAGGCTTCTCTAAATAAGGCATTATGAGCTTCTTCTCTATTAAGTAAGAAATCAATTGTTGCTCTAACTTCTTTGTCTTCAATTTGGCGATACAAGTACTCATATACAACTTTAGCTCTTTGTTCAGATGCTATATTAGATAATAAATCTGCAACTAAATCACCAGTAACAGTTACATAATCTGCTGTCCAAGGTGCTCCAGATGAATTAATTAATACAGGTGATAAGCCACATTGTACATGGGTTTGAATTTCACCATTAGTAACTTGTGTATTATTTACATCATGACCATTTAGCAAGTTTATTGTTTGTGCTACCATTTCCATGTGACTAAGTTCTTCTGCGCCAATATCCAAAAATAAATCTTTTATTTCAGGGTCTTTTATCCTAAAGCTTTGAGAAAGATATTGCATTGCTGCTTTAACCTCTCCATTGCCTCCACCTAATTGTTCTTGCATTAATACTGCATATTGTGGATTCGGTCTTTCAACTTTTACTTCATGTAATAATTGTTTCTTATGCTCGAACATAAAAACACCTCCAAGTAATAAATTTTACTTTCATAGTATTTGTTTTATTATCATTAATATTCATGTGTAATTACCAATACTGACTATTATGAAGCTCAATTTTTATTGTTATTGATAAAAATAATGTAGTCCTACAGGCAACTAACAAATTAATGGAGATAAGTGTATAGTATTAAAAAAAGTGGAATACTAATTATGAGGTGATTTACATGGAAAGTGTATGGAATTCTGAGATTAATTTTAGAAAAAGAGAAGTTTTAAGTAAAGATATAGAGTGTGATATTCTTGTAATAGGAGCTGGAATGGCTGGATTACTCACAGCATATATGCTTGCTAAAAGTGGGAGAGAAGTTGTTATTATTGATGCTAAAAGTACTGCTAATGGAGTTACGAAAAATACAACAGCAAAGATAACATGTCAGCATGACTTAATTTACGATAGTATAATTAAGGAATTTGGAGAAGAAGGAGCAAGGCAATATGCTAAGGCTAATGAACTTGCAATAGAAAAGTATAAAGAAATAATTGATGAGGAAAATATTGATTGTGATTTTGAACGCAAGGATGCATATGTGTATTCTTTAGATAATACTGAAAGCCTTAAAAGTGAATATATTGCAGTAAAAAAACTAGGAATTGATGCAGAGTTAGTGGATGAAGTAAATCTTCCTTTTAAGGTTAAAGGAGCATTGAAGTTTAAGAATCAAGCACAGTTTAATCCACTTAAATTCTTAAGAACAATTTCAGAAAAATTGACTATTTATGAAAATACAACAGCACTTGATATTACAGAAGAAATTTCTGTAGTTACAAAAGATGATATAAAAATTAAGGCAAATAAAATAATAGTGGCAACACATTATCCATTTTTAAACACTCCAGGCTATTATTTTATGAGAATGCATCAAGAAAGATCATATGTTTTAGCTTTAGAAAATGCTCAAGATGTAAATGGAATGTATAAAGGTATTGATAAGAATGCATATTCATTTAGAAATTATAAAAATTTATTAATATTTGGTGGTGAAGCACAAAGAGCTGGGGAAAATGAAGAGGGTGGAGCCTATGAAAAACTCAGAAAAGCAGCCAAAGAACTTTATCCGAATTCAATAGAAAAATATCATTGGTCAGCACAAGATTGTATGACCTTAGATAATATACCTTATATAGGTCATTACTCATCAAAAACCCCTGATATTTATGTTGAAACAGGATTTAAAAAATGGGGAATGACAACTTCAATGGTAGCTGCAATGATAATAAGTGATATGATTCTTGAAAAGGAAAATGACTTTTCGGAAATATTTTCACCAGGAAGATTTGATATGTCAGCATCAATGAAAAATGCTGCTAATGATCTTATGATAACTGCAAAAAACTTTATTGCGCAGAGGATAGATATTCCAGAGGAAAGTATTGTAAGTCTTAAAAATGGTCAAGGCGGTATAGTAGAATATAAAGGTCGAAAGACTGGCGTGTATAAGGATAATGATGGAAGAATATTTGCAGTATCAACAAAATGTGCTCATCTAGGATGTGAGCTTCACTGGAATGCTGACGAATTAACTTGGGATTGTCCTTGCCATGGTTCAAGATATGATTATAAGGGCAATTGGATAGAAAGCCCTACAAATAAGTCTCTTGATGAAATATAGCTTTACAAAAGTGGAGTTTTATGCAGCATAAATGAAGATAGATATAATAAAAAAGATATAAGTATAATGCATTTCCTAAGTATACTTTTAAAGGAAGTGAATATGAAATCAACTAATAAAGGTTATGAATTATAATTATTCTAATATTTACATAGATTATTATTTATCATAGTGGTTAATATATTACTGCCAACAAATTTATTATAATTAAAGGAGGTAGATATATATGGGCTCAAACAACAATTCAAGTAACAGAACTTTAGTACCAGAAGCAAGACAAGGGTTAAACAAATTTAAAACTGAGGTTGCTTCATCAATTGGATTACAAGACTATGAAAGCACAGATAAAGGAAACCTTTCTTCAAGACAAAATGGAAGCGTTGGTGGGGAAATGGTAAAGAGAATGGTAGAAAGTTACGAAAAAGGACTTTAAAAATTAACTGATTATACATGCACTAAGCTAGCTCTTGGTGCATGTATAATTATGTAAAAGGCACTATTAAATATTAATGATGGTTAATTAAAGTGCCGTATTATTAAAAATGAATTTGCCATATCTAAATGAATAATACTTAAGTTTTTAAATTAACTAGTATTATAATTTATGCAATTATTAATATTTTATTTTTAAATTTTCAATACCTTTATTCCTAAATACCCTGTAAAGCTAAGTCTTAAGTTTAAACTTAAGATATATGTAGGCAATACAGGGTATTTTAATATATTTTTTTAAACTAATAGTAAGAAAAAAGATAGAACTTCAATAGATTGATAGTCATATATAATTTTTAGTGAGGAATGAATAAATTAAAAAAGTCTGAGAAAAATAAATTACATAAGTTTAAGTAGCAGGAGGTAATAATACTTGAGTAGTATAAATGGAATTTGAGTAAGTATACCGAGAAAATAAGCTTTTGATAAAGTTACAGGAGATAAACCAGGATGTGAAAATGGAGACTGTGGTGCATGCACTATTCTTATAGATGGATGGCCTATAAAATCTTACTTAATGCTGACGGTTGAAGCAATAAATAAAAAGATAGTTACTGTTGAAGGCTTGAAAAATGCACCAATACAAAAAGCTTTTGTAGATAATTTTAGTTTTCAATGTATATAAAGCTAATTTCAATATTATTATTTAAAAATATAGATTTATTGATTCAATAATTATTTGGATTTTGATCAAAAACAATGGTAGGCTGTTTTATAAAGTAAAAGTATATAAAGACATGAAAAGATGGTTATAAATTATAATGATTCTAATATTTACATAGGTTATTATTTATCATAGTGGTTAATATATTACTGCCAACAAATTTATTATAATTAAAGGAGGTAGATATATATGAGCTCAAACAACAGTGGAAGTAACAGAACTCTAGTACCAGAAGCAAAACAAGGTTTAAACAAATTAAAAACTGAGGTTGCATCAGAAATCGGATTACAAAACTATGAAAGCACAGATAAAGGAAACCTTTCTTCAAGACAAAATGGAAGTGTTGGTGGGGAAATGGTAAAGAGAATGGTAGAAAGCTACGAAAAAGGACTCTAGAAGATAACTAATTATACATGCACTAAGTTAATTCTTGGTGCATGTATAATTATGTAAAAAAGTACTGATGTTGCAATTTGCAGTATATTTAATCTATTACGACATAGTTATATTTGAAATAGGTGATTTCAATGGAACAATATTTTAGGATTACTATGAAAATAATTTCAAAATCAACATAAGTATACTTGTTTCTAAGTTAGACCAGGGTTTAAGAATAAACTCTGGTTTATTTTGATTTGAAATATTTTTCAGATAAGTAGACAAAAAAATATGCTAGATTTAATAATTGATTTTTATATGATTAATGTATAGTGATTAAAGATTTACCTTGAAATAAAGAACTATTTCAAAGTAGATCTTTTGTTTATTTTAAAAACATGTATTATTTGCAACAATAAATTAAATAATACTATTAGACTACTTTTTAAGTAAAGTTAGTGAACAAGTTAGCAATGCAGGAAAATCACAATGTAAATGAGACAATATATTAAGGAGGAACATGGCTATGAAAAAAAAT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24 | Bacillus_virus(50.0%) | coat,protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1885467 : 1894720
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029329|1885467:1894720|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029329|1885467:1894720|1885467_1886628_-|AWK51015.1|integrase|DBSCAN-SWA MQGSVRKKGNRWYYYFDIIDIGGKRKRIERSGGKTKPEAEEALNKALYKYNNGYVEPHKLKYDEYVDDWLENYIKQNRKINTYVRYKELYTNNVKPYLGQYLLKDIKPMLIENLINSEKKKGLSNTTLQTIFGVINTSLNRAVKLQVVNDNICRFVERPRRDKFIANILTIDEFNIMINHLDKTIYGNYIFELVLMVTIELGLRRGEVAGLEWENIDFENNIIKIQNNLIYINTSVELGTPKTSESRRNIYVSDEILQKLKDHKELQASNKAKYGELYETNIFNNRLCNFVFTWESGKYIHPNYFTLKFNRLSKDSGINKRVRFHDLRHTNATLLLEQGVDFKIIQERLGHSDIGTTLNIYSHVTTEMQKSASKKLSDLFSPNKKK >CP029329|1885467:1894720|1892986_1894720_+|AWK51024.1|DBSCAN-SWA MRNNKQIILTALASVMTLSILTTFGITEKYSVANASTTSVKSETEKSPVIAAGPNIAVVETEAGKVQGYSRNGIYTYHGIPYAAAKERFVPAEKVEHWDGVKLAFDYGQISPQQQRAGGSDSSWENPSRQFAMDNNSQNLNIWTPGINDKAKRPVMVWLHGGGFSSGSSAQTAAYDGANLSQKGDVVVVSVNHRLNVLGHFDLSQYSEKYKYSENVGITDIVASLKWIRDNIAQFGGDPDNVTVFGESGGGAKVLALMTTPYAKGLFQKGIVESGATDTMGVNFTSQEASKRVTELTLQNLGITADQIEKLQTIPYEELSQASDKALQQTAEELHIPAALGTGYGLSWEPVVDGDYMPTSPVTKEGFAEAGKDIPLLIGSNLTEWTAFSPIMNMAKAQSDNKDTWTEEEIDKHLKETYGDKADEIVNTFLKAYPDKKKADALYIDSTTIRLPLLKIMSHKADQQGAPVYSYIFSWESPIMNGVFTSYHTSEIPFVFNNIDKADTTIGGGEDAKILEDRMSQAWINFARNGKPSTDNLPDWESYDRQGGATMIFDNKVKLVHNHDKELMKLLAPDYQY >CP029329|1885467:1894720|1890602_1890845_+|AWK51021.1|DBSCAN-SWA MKASGIIRNVDPLGRVVIPKEIRKVMGINEGDPMEIVQVNNDIVLRKYSKGCIFCGSDEDISEFNTVPVCSRCRKALGQD >CP029329|1885467:1894720|1887604_1887829_+|AWK51017.1|DBSCAN-SWA MYSKLKGLMVEKRITQQELAQILKITASALNFKINGRSDFSVTEAKLVSSFFGKTIEEIFIIDEVNKMKTVKNV >CP029329|1885467:1894720|1889925_1890552_+|AWK53051.1|DBSCAN-SWA MQPLAISCECRKIEKIKSEWRYSGINVEQSKLTFASFEIWNQASQRTKDTAVAYCNDFDEIREGRRNSILFCGQVGSGKTHASIALALNFLKQKVRVVYMPYRDVITKIKQNMIDEEYYTKTISKYQLCEVLLIDDLFKGKINDSDINIVFEIINYRYLNFLPIIVSSEFSIDRLLAFDEGVASRIYEMSKDYVVEIEKDIRNNYRLK >CP029329|1885467:1894720|1887994_1888216_+|AWK51018.1|DBSCAN-SWA MEPVLYTVTEAAELLKVNRNSVYDLLKNNVIRGLKLGSLKITRTELIKFLEENNGKDLSNLEDIKDLTFERDQ >CP029329|1885467:1894720|1886975_1887350_-|AWK51016.1|DBSCAN-SWA MSKFPIRLKELREEKGLLSKDFAKLMSVEPATITNWEKGNRFPKDDVLIKIADYFDCSTDYLLGRTDDKLSKVYSGMLHNQTIEIEIDKGYPHELTAEDVQNIIRQLDAVGLDVKKLIENSKKK >CP029329|1885467:1894720|1888631_1889876_+|AWK51020.1|DBSCAN-SWA MADIKWIKLATGMPDDEKMKLIDAMPERDTVYYLWIRLLIQAAKTNADGEIFLSEDMPYTDKMLAVIFSRPLASIKLALKTLSRLGMIEITSDKVIRIVNWDKHQNIEGMERVREQNRKRAENHREKKKQEKKDSKSNNEETYEDEVLEENKDLEEKNDLQKNKTLDENESLENLQTSEEASTNAINDEKTNTATNEAGSNNIVETGDNDCDVTKNTSNVTQNESNVKVTEQNKKEIENKKKNKKEKKEIDKDTESKKSTYDVNNKNSACGEEVSQSSLFEQRNNTKSESGEEADINLKALELMQYHEKITGKVGGCDYVALRSAINLHGEKRVKMAMDIGFEKSCPEIKYAIGILKNWRRDGYPKDDMEVKTNGFRSTGKSNTTDKNEFAGFKPKEPRKLTEAERKKADANLI >CP029329|1885467:1894720|1888298_1888490_+|AWK51019.1|DBSCAN-SWA MIRKFEGLTANDLIEILKSYPRDAKVCTQMLGENFPVKQVEECIYYDFQNGKRVQQHKGILIK >CP029329|1885467:1894720|1891703_1891922_-|AWK51022.1|DBSCAN-SWA MEYSLSMTFLTAAGLKTNLSISGVKPTLTKDEVNTLMDNIIAKNIFTTNSGDLVKKSGAQLTQRQVTKYEVA >CP029329|1885467:1894720|1891965_1892190_-|AWK51023.1|DBSCAN-SWA MAVTKTIDTVSFSIEVEKGLDKAGDPIYAKKTFANVKTNAAPQNIYDVANAITAVLEASTRDYFVNESSALANS |
11 | Clostridium_phage(28.57%) | integrase | attL 1877867:1877882|attR 1901782:1901797 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2112417 : 2124065
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029329|2112417:2124065|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029329|2112417:2124065|2120780_2121782_+|AWK51208.1|DBSCAN-SWA MITYKEAGVNIEEGYKSVKLIKEYAARTMSEYVLNGLGSFAGMVELPSGYEKPVLVSGTDGVGTKLEIAFKNKKYDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAEVASDLVKGVSDGCVESDCALIGGETAEMPGFYSDGEYDMAGFAVGIADKDKIINGSNIKEGDKLIGIASSGVHSNGYSLIRKVFPDLNEEFNGEEVWKTLITPTKIYVKPVLKLLESYEIKGMAHVTGGGFIENVPRMFNGGDFTAVIKKDSYPLPAIFERIIEKGVDKDHMYNTFNMGIGFVLAVSEADVAPIIKALVEMGEKAYEIGYVTSGGEGVCLK >CP029329|2112417:2124065|2114115_2117862_+|AWK51204.1|DBSCAN-SWA MLDIRSVFVEKKNGFNVEAQSLLNDFKDNLGVAGLENVRLVNKYIISDISQEYYNKALHTIFSEATVDVVYEAELPIKEGEVAFGVEFLPGQYDQRADSASECLALLTAEDKVEIKSAKIVILKGNLSQKDIEKIKNYYINPVDSREVDINNKDLSTLSNIPKDVQILDKFTQKTLEQLKEFHSEQGLAMSTSDLVMIQDYFKEEKREPSITEIKVIDTYWSDHCRHTTFSTILEDVQIEDNKYTNPIKASYEGYIKSREYVYGEKEKNKTLMDMAVIAMKELRKRGKLEDLDISEEINACSINVKIETDKGMEDYLVMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRTYVYQAMRVTGAADPTVAIEDTLEGKLPQRKIVLGAAHGYSSYGNQIGLATGQVEEVYHPNYAAKRMEVGAVIAAAPKENVVREEPKLGDVIILLGGRTGRDGVGGATGSSKEHTVDSINECGAEVQKGNAPTERKIQRLFRNSKVAKMIKRCNDFGAGGVSVAIGELCRGLDIDLDKVPKKYDGLDGTELAVSESQERMAVVVTKENADEFIRLCNEENLEANLVANVTDTDRLRLFWRGKQIVDLKRTFLDTNGATQRTNVTVKAPKEYPYTIADINVKEEWINNLKKLNVSSKQGLSERFDATIGGGTVLMPFGGKYAKTPAEGMAAKIPVLHGESKDATLMTFGFNPELGTWSPYHMAYYSVIESLTKLAAMGGDYRRARLTFQEYFERLGSEASRWGKPFAALLGAYNAQMAFEIPAIGGKDSMSGSFGDLDVPPTLVSFAVGVEKAKNVISPEFKGVGSSLVLLETEKLEDGTINIDRLKKNLDVLYTLIQDKKVISASAIKFGGVSEALTKMTLGNRIGVEFESLTKNELFAFNYGTIILEVKKGINIEEEFKNCLYKMVGKTIDSATIVSKEYDLNLNVCDLEKTYEEKLTSVFKIKTADVNEKIETVLYDNKSVLSPKFKIAKPRVVIPVFPGNNCEYDCARAFEKEGAEVTQVVFRNITKEALTESIDRLAKEISNSQILMIPGGFSAGDEPDGSGKFIANALRNEKIMNSVMELLKNRDGLAIGICNGFQALIKLGLVPYGEIVDIKEDMATLTYNNINRHMSSIITTKVVSNKSPWFNEVNLGDMHSVAISHGEGRFVAPESLIKELIKNGQVATQYVDFDGNVSLNMPFNPNGSMYGIEGITSPDGRVLGKMAHSERIGSDLYRNIPGDFDQKIFKAGVKYFK >CP029329|2112417:2124065|2122556_2124065_+|AWK51210.1|DBSCAN-SWA MKKRALISVFDKDGVLDFAKFLVSKDVEIVSTGGTYKYLKENGLDVIEINEVTNFPEMLDGRVKTLHPLVHAGILAIRDNEEHMNTLKGRDIHTIDYVIVNLYPFFEKVKEDLEFEEKVEFIDIGGPTMLRAAAKNFQDVVVISDKNDYNVVMEEVEANGETSLKTKKKLAGKVFNLMSAYDGAISNFLLADDEEEYPEYLSVSYKKMQGLRYGENSHQSAAVYSSTMLDGAMNTFEMLNGKELSYNNFKDVDIAWKCSSEFEEPSCCALKHNTPCGVAIGTDAYEAYMKAYEVDPTSIFGGIVAFNRKVDKRTAEEMVKIFLEVIAAPEYDEDALEVLKTKKNLRVLKFNNTPKADKCMVTVDGAILVQEEDSKLIEEIKVVTEVKPTDEEMKDLLFGMKVVKYVKSNAIVVAHNGIALGIGGGQVNRIWPTEDALKRGIGATILASDAFFPFRDVVDQAAKAGIKAIIQPGGSMRDQESIDACNEHGIAMVFTGLRHFKH >CP029329|2112417:2124065|2118581_2119289_+|AWK51206.1|DBSCAN-SWA MEKLEMLYEGKAKKIYATEKADEVIVYYKDDATAFNGEKKGQIEDKGVMNNEITSILFELLEKKGVKTHFIKKLNEREQLCKKVEIVPLEVIVRNVAAGSMAKRLGLEEGFKLKTTVFEFSYKDDELGDPLINSYHAVAIGAATFEEIDTLLAMTAKINDILKEVFAAQNINLIDFKIEFGRCPDGTIVLADEISPDTCRFWDATTGEKLDKDRFRRDLGNVKDAYIEILKRISK >CP029329|2112417:2124065|2119323_2120742_+|AWK51207.1|DBSCAN-SWA MSNPNFELIMDPSNDKFKDECGVFGVYANNPIDVASMTYYGLYALQHRGQESAGIAVADGEKIDIHKGLGLITEAFKQDDLEKLKGHIAIGHVRYSTAGGKGIENAQPILATSKMGPIAMAHNGTLVNADVIKELLEDGGQIFHTSTDSEVIACLIARSAKKGLAKAVVDAMSAVRGSFALTIMSKDKLIGARDPHGIRPLSLGKIEEGYVLTSESCALDAIGAELIRDIEPGEIVIIDEEGIHSYRYSENTQCQTCAFEYIYFARPDSRIDGLEVHTTRVKAGEQLFKEHPLDADIVIAVPDSGIPAAIGYAKASGIHYDTGFIKNRYVGRTFISPSQEIRERAVAVKLNPLKVNLEGKRVILIDDSIVRGTTSKHLIESLRRVGVKEISFLIASPSVKYPCYFGIDTPYRSELLAANNTVEEMRDMIGADYLGYLSEEGLYKSCEGKKGFCMGCFNGVYPVAAPVENQVQ >CP029329|2112417:2124065|2112417_2113101_+|AWK51202.1|DBSCAN-SWA MLKVNNIKKKFGDTEVLKGVNLEIKQGEILVVVGHSGGGKTTLLRCVNALEHCDEGDIEVNGKILCKDGKYVEKKSLKEIRKDIGLVFQNFNLFPHMTVLENLIEAPQRVFGWTKEEAIKKAEETLGFLDLLEKKDNYPFELSGGQKQRVAIGRALVLEPKIMCFDEPTSALDPGLTGEVANLIKSLSVKGMSMMIITHDMDFAKKVADRIVSMNAGKLQDGLIFED >CP029329|2112417:2124065|2113322_2113490_+|AWK51203.1|DBSCAN-SWA MDDRTLVCKDCGKEFIFTAGEQEFYKEKGFENDPVRCPDCRRARKQERNNRNYDR >CP029329|2112417:2124065|2121769_2122378_+|AWK51209.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLVSGGGTDLQSVIDAVENKYIDGKIEMVIGSRDNIYALERAKKHNIDTFVVSRREYGEKSSDKILELTKGKVDLIVLAGFLAILDGEILKEFDNKIINIHPSLIPSFCGPGMYGLKVHEAVIKSGVKFSGCTVHFVNSEVDGGAILLQEAVPVYFEDDAETLQNRILEKEHLILPEAIKLISEGRVQFVNGKAKIN >CP029329|2112417:2124065|2118102_2118582_+|AWK51205.1|DBSCAN-SWA MQVGIFFGSKSDTEVMRGAANALKEFGIEYKAFVLSAHRVPEKLEETLQEIEAQGCQVIIAGAGLAAHLPGVIASKTILPVIGVPVKAALEGVDALYSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQMLSVNNEELKNKLKQFRIDMKKKFIEDNAEGVEL |
9 | Cyanophage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
3223228 : 3290117
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP029329|3223228:3290117|DBSCAN-SWA 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53 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | coat,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3347156 : 3374340
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP029329|3347156:3374340|DBSCAN-SWA ATTAAATCGCCTCCTTGGGATATGTTGTTATACTCTCATTCCCCGAACTTTGAGCCATTGGAATTGTAAGATTTATTTTGGTATCAATATCTTTTGGAGTCCAGGGATAAACAATTATTTCTTCACCAACAATTGTTATAACTCCAATATTTATAGTTCCTTCTGTAGTAAAAAATATATTTAATACGTCAATCCATGAACGTTTATTTTTATATGCATTTATTAAAGTATCTAATTTTTTTAACTCTTCTGGTGATGCTCCTGTTTGTGTTACATCAACATCCAAACTAAAATAAAAAGGATCTGCATCATATTCAAACCATTCTCTTAATTTTGTTCTGCCAAATACTGTTGTTGCTGCATCAATTACTGCTTGTGGAGTACCTTTTATTCTATGGAATCTTAATGCATTCCGAACAAGCTCTTGTTTCTTCTGTAATGGTAAAGTATAATCATAAAAATCTACATGAAATTGCCAGGCTAATGAATCAACAGTTTCTTCATCCAATTCATTAACTCTTCCATAAATATATGTCAATCTTATATCTTGATCTATACTTTTAAAATAAGGACCAAGAGCTTTACATAGAGCTTTTACAAATGGATCTTGCTGAAGATATGAAGTTTGTAAACTCAATAAATCAATATTACTAAGTTCCATTACTCCATTCCCCCATAAGTCACTCTTATATTTTCAACTTTTGCAATTTCATCTTCTTCTATGACTTTGTGCACTGGTGAAGTAACTTCAATTCGCCTCACTCCTGAAATTTTTCTATCATTAACTTCATATGTTGCTGAATTTTGAATCTGATATTTTAATTCGTCTGGATTTATTGATTTACCTATTTCACTTTGCTGCCATTTAATAAATTCTCTTATAGCTCCATTACTAAAATCTAGATTATCTCCTTCAATAGCTTTTCTCCATTTACCTTCGCTAGTTACAAAGTTTTTGTCTAAGTAATACGTCAATTCAATATCATAATTACTAACTGTTGGAGTTCCTACTTCAACTTTATCTGTAAGTGGTCTTCTATCTTTAGGTGAACATTGCTCATATACCTTATCTAATATCTCTTGCGAAGGTATTTCCCCATCATCTACTACAACAAATATCTTAACCACTCCTGGAGTTGGTGATGTTACTTTGATTCCTGAAATAGAATTGTCAGCTGAATATGCAAAATATTCATAAGCTCCATCTGGGCCTGCTGTGCTTTTACTTTCCATTGATAACCTGGATCTTTCCCTGTATGATTTATCATCTTCAATATCTGAGCCTGACTTAGATACTTCAGTATTATATATTTCTGATACATAGGCTATAGGATCAACAATATGATTAATTTTACCTATTTCAAATCCATTATATTTTTCACCAGTTGATGCAGCTATAAGAATAATATTTGCTTCCAAAGTCCCTTTAAGAACAATGACATCATCCCTAATCTTAAACATTGTCATTCCATCTGGGGTTACTTTTGTTCCAGCTTTTATAAGAATATCCTCATTTTGAGCAGTAGATAACTTTACCTTTCCACTACAAAATGAATATGTTGCTTGTAATCTACTTGTACTATGATAATCTTTAGCAATGGCATCAAGCTTTTCATCTCTTGCACTCTTTAATAAATTTTGATTTGCAGTATCATTGATTTTATTTGCCATCCCTACAACTATTGGCATTAATGATCTCAAAAAAAGCTTTCTTTCATCACCATCATGTAATGTCTGTCCCAATTCTGTTTCAACAGTATTTAACATGTCATTAAATATAGTCTCAGGATTAATGTCTACAAAGTTAATCAATTGTCACCACCACCTTTATTATTGGAATTTTAATATTTTCATTATCTTCACTTTGCTTATATTCAATTTCTACGCTTTTAACATTTGCCCTTGTCTCATAGCTATTTATTAGATCATAAGTTTCTTCAATAAGAGCTGCTTTATTTTTCTCAAAAACTCCATCCAAATTTTTAGGATTCCTACCCATTAGACGATCATAAGGCACTTCATATTTGATTGTACTAAGGATATTATTAATGTTTTGGAGTATTCTTTCATCTCCTTTAGCATTCCAATTAATTAACCCTGTATTATTTGAATCCACTGTATACTCCATAGTTATCCTCCGAAAATTTCACTTTCTAAATCATCAACTTTTGCACTATCTTCATCTGACATTTCACTAGTTGAAGAACTACTTTTTTTATTTGATGTCTTAGCCTTTTTTGTTGTACTTGAAGTTCCTTCTTCTTTTTTAACGCCTGCTCTTACGTATTCTTTAAAAGTTAATTTCATTGTACTTTTAACTAGTTTTCCAGGTGACACATAATTATTATCAGTCAAACTAACACCAGTTAATAGAAATTGATTACTTGAAACAGGCTTATCTCCAAGAAAAAGCATATATGGAATTCCTGCTTCACAAATGATCTTCCAATCATTAATTTCTGTTTCAACATCAATAGTATTAGATTGTCTTAATTTAACATTGATACTTACAGGTTCAAGATTTATCCCTTTTATATAGGTTGAAGGTTTACTCCCTTCAACTTCTTGATCTTCTACATTAAGTGAAATATCTCTAGTGAATTCATCAAATGTATATATCTTATTTTGACTTACTTCAAAAAACTTATTACTAAAACTACCTAACGACATTTAATCACCTCATTCTTGCCATAATAACACCACTTTTTAAATCATTATTATAAAAACAAACTAAAACTTCTTCACCTACATTAAAATCAATCATATTTACGTGGCTTGCTATTTGTAATTCATATGAAACACTGTCATCTAATTCTGGGAACTTTACTCTTGCAGTGGTTGTGCCAATTGTAGACACAATCCCTTTTCTATTCATCAATATACCTCCGATATTTTTCTAACTGATACTCTTGATTTACCAGCTATTAAATCATGAATGATATTTTCAATAATGTACTTTCCATTAAAACTATCCAAGCTTTCAATTTTGATTACATTTCCTGCTGCAATTGATGTATTTTTATTTATAGTGAATATACCTACCGTTTCATTTTTATTCAATGAATTTATAATATTCTTTGCAAATCTATTTGCTTCACCTATAGAGCTAATAGGCATATCTGTGATTTTGATTATATCTCCATTTGATTTATCTGATATATAGCTGCCTTTTATAAGTGTTTTAGAAAATGAAATTATTTCACAACCACCATATATATTATTTGATGTACATTTAAAATCATATTTACCTATAAAAAAAGATGGATCTAATACTAAAACCTCCTTTTGTTTTTTCAAAAATTCTTCTGAAACAATTAATGCTTTTCCATTGCTAATTTTTAAATTATATCCTTCGACCATACACCTATAGTTTAAGAATTCTATATTATTTTTTTGAACTTGGTCTACTCTTAAATATTGAAATTCATTAACTCCATAGGTCTCTAATTTTATTCCCAGTTCTTCAGTAAGATCTTTTGCTAAATCTAAGAATTTTACATTTTCCCAGGTTCGTGTCTTTTTTGTTTTGAAGCTTTTCTTTATTGAAATAGCATTAACATCATAAGAACCATTGCTACATCCAAAACCATCAACATACATAATTCCTGTGCTAAATGGATCTTCTATAATTTCTATTGTATGATTTTTAGTAAAATCCCATTTTCTACATTCATTCTTTATATCTGCAAATGAAATGGCAAGACTATCAGCCTTGCCTCCCATGCTATCATTAATTCTACAACCCGATACTTGAAGATTAATTTCAGTACCTTCATAGACAACTTTAATATTGACCACCTACCTTTTCCATGGTGGAAGTGTTGAAGTATTTTTAATATTTATTTCAGGTATCTTAATTTTTACTCCATACTCAAAAATCAAAGTGCTTATTAGATCTGGGTTAAGTTGCATAATGAATACGGAATATTTCTCTTCTCCATAAAAATCAAGAGCAATACTGTCAAAAGTATCACCCTCATTTGTTGTATATATTGAATATATTCTAGCCAAAAGCAACCCTCTCTTCATCATTTAATACTTCTCGAACCATGGCTTTAAATTCTTCAAAACTTTGTTTTAATTGGTTAATTGTTTCAACATCAACACTACCTGATATTTGAGGTGAAAAAATAAATGTTGGAGAACTATTACTTTTGTTGCCATCCCATCCAATAGTGGCTGCTGTTTTCTCCAGTAACGATATACTTCTTGGATTATTCCTTTTAAGTGGAATTGCAGCTTCTGGGCCTGCTTCACCGAAAATAGAAGGAACATTTGTAAAACCACCCTTTGCAAACATTGGAATAGTAGGGATATTAACTCCAAAATGTTTTCCTCCCATTCCTGGTATCCAATCGGGAACATCAATTTGAATATTGCTATTAATTGAACTTATTGCTGCATTTATTAGACCTATAACTGCGTTAAGTGGAGCTTTCATTACAGTTCCTATTCCGTTCATTAAACCTGAGAATATTTGAATTATTCCAGACCAAGCTAATGACCAATCTCCTGCAAATACTCCACTTACAAAATCAATAACTCCACTAAATACTAATTTAATAGAATTCCATATACCACCAATAATAAAGAAGAAACTATTTAATATTGCTCCTAATGCTCCAAAAGATGTAGTCCAATCAGTTTGCATAGCTGTAGTAAGCCATATACCAAAAGATTGTATCCCTGATTTTATACTTTGCCACATATAAATAAAGAAATTTCTAAAACCTTCACATTTATTCCAAAGCAATACGAATATTGCAATTAATGCTACTATACCTATGATAAATAAAGTTATAGGATTTGCACTCATTGCGGCATTTAATGCCCATTGTGCTGCTGTCTGTGCTCCTGTAGCTACTGTAGATGCCCCTTTTACTATTGCATCTTTTGCATAGAGTGCATTAAGATATAACGTCTCAAGTTTATCCTTTGCTTTAGCAATGCTTAAAGCAGTATATCCTGATTTAAGTATAAGTAATGACTTATGAACACTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP029329|3347156:3374340|3365615_3365843_-|AWK52224.1|DBSCAN-SWA MKGYYISYKCQRCHNEVILITEEVSSTLKTGKYISCSHCGCKKLKEEKATDDLRECMKHPSYRREHGAIRQVIHE >CP029329|3347156:3374340|3366039_3366432_-|AWK52225.1|DBSCAN-SWA MEINKNEFKQYKDKIEDNLKKYPYYQISIELPGLGAAAIPNGVLSQNNKISDPVGDAIIGDEYKRNLVNKINYVLDKLPQSSKRIVECAYFMDGVISNDEVIEELNINKNKYYDLKKDALCKFGMVFGYF >CP029329|3347156:3374340|3368428_3368659_-|AWK52229.1|DBSCAN-SWA MIAIKQVAKLMTLKELEKRFEMLGSYVQDKITGKNYHCPHDLGFNFTLDDCISSGCCKDCWIKAKDIMKLKDSKII >CP029329|3347156:3374340|3349829_3350030_-|AWK52206.1|DBSCAN-SWA MNRKGIVSTIGTTTARVKFPELDDSVSYELQIASHVNMIDFNVGEEVLVCFYNNDLKSGVIMARMR >CP029329|3347156:3374340|3373641_3373890_-|AWK52235.1|DBSCAN-SWA MEDILFTVDEASKLLKTDKPTIRKLIDKGLLKALKLGRLKVRKLEIERFLLWAEDKDLNDLDNIKDLDYVTQGRREQFKCVQ >CP029329|3347156:3374340|3368675_3368831_-|AWK53105.1|DBSCAN-SWA MDKKAEVIDKIVNAYFEQPEKTLEEVFGEYTEDLTQEEKEKFFNNLKAIIN >CP029329|3347156:3374340|3357475_3358498_-|AWK52215.1|capsid|DBSCAN-SWA MSIYETKTMLQAIEQKKPVFTFLRDTFFPNIETLLTEKAEVDIKKGKRKLAPFVAPRIGGKVMKREGFKTSVITTPKIAPIRVITADDIKKRTPGESVYSTKTPEERAIVMLANDLVELDDAITRREEWMCAQVLLGEVIDIDVEGATQSIDFGFTNEVILSAGKKWNAAGTDPLVDLKDWRQKIIKATGKTPDICIMSDNVVDAFIGNTKVKELLDIQRLNVGAIEPSYQGAGVTFIGKLPSLGLEIYSYTEYYIADDEEETEMQLIPDGKVIVGATKSGKRYYGAVTQKEKGSWITYEGIRVPKYTNDDKNEIDELRLTARPLPTPEDVDSWVVATVL >CP029329|3347156:3374340|3359938_3361486_-|AWK52218.1|portal|DBSCAN-SWA MNVIDKAIGVISPNVALKRQVARQKLSIMNSGYSHHGASRTKKSLLGWMFGGGSPKEDIEDNIQVLRERSRDLYMGTPIATSAIKTLRTNVVGGGLRLKSQLDYELLGLSDDAAEKLETIIEREFSLWADSVNCDLARLNNFYELQQLVFLSSLMCGDAFALLPYTQRIGMPYDLRIQLIEADRVCDPYYKKGYQNISAGVECNDNGEVTAYHIANFHPLSTYRSNSTWTRVEAFGEKTGRRNVIHIMESERIGQRRGVPILAPVIESLKQLGRYTEAELMAAVISGMFTVFIESKSNSEEAPLGSMIPGDEEVDGGDENSYELGNGAIVALGEGETAKETNPGRPNTAFDGFIASVCKQIGAALEIPHDLLLKQFNASYSASRAALLEAWKMFRMRRIWLSNDFCQPIYEEWLSEAVAKGRIYAPGFFDSPIIKKAYCNAEWSGPSQGQLDPVKEANAAVIRVENCFSTRAKETIELTGGDFVKNNRQRIKEEKMRQELLALNQKEVKVINENS >CP029329|3347156:3374340|3358513_3358876_-|AWK52216.1|head|DBSCAN-SWA 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MDYLEGPLPSNLQAEQAVLGCIISSLDKLIEVEPIVIADDFYVDKHKKIYEVVMSLANRRIGIDLVTVIEEIRKKGLLDRCGGVTYLTELATSYFESSNVIAYAEIVKEKANRRRLIKTSKRLLQKAHEEENIKSIIDDTENELYKVSSSQSTNDIVPIADAVEQTLINLEERYRNGGQLVGLSTGFNDLDKVTSGLKKSDFVVIAARPSMGKTALALNIGQAVSKNANVAIFSLEMPKDQLMDRLLAAKCLVDFSNVSTGQLNDKEFEKISLGANDLTKRKLFIDDTSSLLTDIKAKCRKLKIQSGLDLVLIDYIQLIRTTLNTTNREQEVAYISREIKGLAKELGINIIALAQLSRAPEQRADHRPILSDLRESGSIEQDADVIHFLYRDEYYNKESEDRNIAEVITAKNRNGKTGTTKLAWLGQYQRFGSLDVIRR >CP029329|3347156:3374340|3356295_3356919_-|AWK52212.1|DBSCAN-SWA MGVGIKIDDKGLKQTIKKLSAFPKEIPKATVAALNRTATFANTKIKKEVTKKYSIKSGEVQQTLTMKRATTQNLTTYISSEGRRYTLAHFERNLKSAAKRGGGVKVQVKKGGTKTVNTHPGAFVASMSGPKKKRGVKKTTTSGIFLIAQRVGVARYPIKVLRTLSVPQMISSNDISERVLTESQSMLQKRIEHEVEYRLSKLNKSGG >CP029329|3347156:3374340|3356920_3357232_-|AWK52213.1|DBSCAN-SWA MNFKEQLGADLNIFFNPDEFGEAHIINNQKLNIIIDNEVLKQRNRKEYDGILQADLLYYVKVTDIIKKPVSGAVQTFDGVLYTVFDVKIDSGVYEVVLQAGRN >CP029329|3347156:3374340|3357221_3357500_-|AWK52214.1|DBSCAN-SWA 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MINFVDINPETIFNDMLNTVETELGQTLHDGDERKLFLRSLMPIVVGMANKINDTANQNLLKSARDEKLDAIAKDYHSTSRLQATYSFCSGKVKLSTAQNEDILIKAGTKVTPDGMTMFKIRDDVIVLKGTLEANIILIAASTGEKYNGFEIGKINHIVDPIAYVSEIYNTEVSKSGSDIEDDKSYRERSRLSMESKSTAGPDGAYEYFAYSADNSISGIKVTSPTPGVVKIFVVVDDGEIPSQEILDKVYEQCSPKDRRPLTDKVEVGTPTVSNYDIELTYYLDKNFVTSEGKWRKAIEGDNLDFSNGAIREFIKWQQSEIGKSINPDELKYQIQNSATYEVNDRKISGVRRIEVTSPVHKVIEEDEIAKVENIRVTYGGME >CP029329|3347156:3374340|3348959_3349283_-|AWK52204.1|DBSCAN-SWA MEYTVDSNNTGLINWNAKGDERILQNINNILSTIKYEVPYDRLMGRNPKNLDGVFEKNKAALIEETYDLINSYETRANVKSVEIEYKQSEDNENIKIPIIKVVVTID >CP029329|3347156:3374340|3350029_3350878_-|AWK53102.1|DBSCAN-SWA MGGKADSLAISFADIKNECRKWDFTKNHTIEIIEDPFSTGIMYVDGFGCSNGSYDVNAISIKKSFKTKKTRTWENVKFLDLAKDLTEELGIKLETYGVNEFQYLRVDQVQKNNIEFLNYRCMVEGYNLKISNGKALIVSEEFLKKQKEVLVLDPSFFIGKYDFKCTSNNIYGGCEIISFSKTLIKGSYISDKSNGDIIKITDMPISSIGEANRFAKNIINSLNKNETVGIFTINKNTSIAAGNVIKIESLDSFNGKYIIENIIHDLIAGKSRVSVRKISEVY >CP029329|3347156:3374340|3353396_3353714_-|AWK53103.1|DBSCAN-SWA MEENILILKKPVFIDGEEKTKIPYDFDKLSGENIENVFKASTKSGYMVSASYELDPVIGARMFAEAADLDYADVKRFTMSDYSKAASVARDFFIQGLAGNQEENN >CP029329|3347156:3374340|3370317_3371166_-|AWK52231.1|DBSCAN-SWA MKYTIEGFSQQTLIDFNLDEKDALILRYFIDFKDSGNMTIKIIDDKPFYWLKSAALLKDLPILKIKSNDVLKRRLNKLIECKVLEHEHVLKGGSYSFYAVGESYHKLITTDTTQKSEEYDSKVGGGTTQKSEGYDSKVGAKNPSTKNPSTKNIISCGTGQPDSTVPYELIINMFNSTCKSLPRVKARNKTRDKHIKTIFRSLGINKIKELFIMTESSDYLSGRSGKWPNCGFDWIIKESNYIKVLEGNYNRQRGNVIPITSKAKETHEASEIEINKELLGDL >CP029329|3347156:3374340|3347156_3347816_-|AWK52202.1|tail|DBSCAN-SWA MELSNIDLLSLQTSYLQQDPFVKALCKALGPYFKSIDQDIRLTYIYGRVNELDEETVDSLAWQFHVDFYDYTLPLQKKQELVRNALRFHRIKGTPQAVIDAATTVFGRTKLREWFEYDADPFYFSLDVDVTQTGASPEELKKLDTLINAYKNKRSWIDVLNIFFTTEGTINIGVITIVGEEIIVYPWTPKDIDTKINLTIPMAQSSGNESITTYPKEAI >CP029329|3347156:3374340|3363558_3364155_-|AWK52221.1|DBSCAN-SWA MSDEGKKIDSVDQVTVSSTVLSNLFGLTTRRIRQLENEGIIKKIARGKYSLQDNIKSYITFIKASADLKENKTEEGKIDYDEEHALLERRKREKIELELAAMRGTMHFSEDVERVMNDMLSNFRAKILALPSRTAPRLMGIDTIADIQEILQIEVLDVLNELSRYNPSDFYSEKYVDVVEDEINDEDLEINEEETTDS >CP029329|3347156:3374340|3367047_3367257_-|AWK52228.1|DBSCAN-SWA MSQWIQITLIICGTIIIVQFLGFLMIKSLWNKNNKPRKLQGYQGTRQPDTSSGEVITRIKPPSIGSGIK |
39 | Bacteriophage(21.74%) | capsid,terminase,tail,head,portal,integrase | attL 3355592:3355607|attR 3368855:3368870 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3689719 : 3750409
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP029329|3689719:3750409|DBSCAN-SWA 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56 | Leptospira_phage(14.29%) | transposase,integrase | attL 3701881:3701900|attR 3715438:3715457 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
4017964 : 4028410
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP029329|4017964:4028410|DBSCAN-SWA 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ATTGCAGCTGATGGCTCTAAAGAAAGAAAACAAATAATACAAGTTCCAAAAACAAAAGGTTCCATAAGAGAAGTATCTTTTCCACTCAACTTAACATCAGCATTCAATGATTTAAAATTAAAACAAAAGAGATACAAATTAAAATGTGGATTATCTTATGAAAATTCAGATTATATATTCACAACATCAAGTGGTTCCCTAATTGATGTAACAAACCTCTCCCACGCTTGGGAAAACATACTCAAGCAAGCTGGACTACCACATAAAAAATTCCATTCATTAAGACATACATTTGCAACTAAATTATTTGAAAATGAAGTTCCGTTAAAAACAGTATCTGAACTTCTTGGCCATAGCTCTATAGATATAACTGCTAATACTTATACTCATGTTATTCCTAAGGAGAAGAGTAATGCTGTTGAAAAATTGAATTATATTTTTAATTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP029329|4017964:4028410|4019412_4019769_-|AWK52790.1|DBSCAN-SWA MAEVKDLYKEIAAAISTYTNEITEGLEATKLETAKNVVKILKDSSPKDTGGYAKGWRVSKVGTAQVIHNKTDYQLTHLLEHGHLKVGGGRVGAKVHIRPAEEKAIEDFINGVEKVVKG >CP029329|4017964:4028410|4020904_4021129_+|AWK52794.1|DBSCAN-SWA MAVTKVINSTTLSIEVQKGIDKAGDPIFSKKNFSNVRNDIVEQNAYDVAEAIKAVLAASTRDTSLIVTSNLENA >CP029329|4017964:4028410|4020063_4020339_-|AWK52792.1|DBSCAN-SWA MDIATVLQLVKEVLGIKSTIRDGYLTAIIKGVIKELEDEKGLILNGVNDYHLLFVVDYVAWCYQNKDNAGMPRHLQFRLHNLIIHVGGSTI >CP029329|4017964:4028410|4025970_4026237_-|AWK52800.1|DBSCAN-SWA MEEILKEILVELRKKDIEEKEITEVKLTYSLKECSYLSGIGLNTLQEEISKQNGNFPFFKIGKKVMVDRGLFHQWLENISKTHHELRR >CP029329|4017964:4028410|4017964_4018153_-|AWK52786.1|DBSCAN-SWA MNDKVITTESFILLCRKCDLYREDLEDMTIGMCLDFIEEYIEMNKPSNKKVRIASQKDFDNF >CP029329|4017964:4028410|4027243_4028410_+|AWK52803.1|DBSCAN-SWA MAVKTNCNKNGTSYFRSTASVGRDSNGKLIRKEFYGKSKSEAESMRDEYLLGIKSGLNIDTRNILLGKLMHTWLFETVRVSDRIKPTTFEKYECIYRLYVKDSDIYSIKIVELKALQIQRYYNKLSEKGKSKNQIENLNKLLKQFLNYAVDEGYLTKNPCIGKKIVIPGEKKSKEEVQHFSDEELHILISNLDNNVYRELILIAIGTGLRRGELLALTWEDIDLKNYSIRVNKSLSKVYIIAADGSKERKQIIQVPKTKGSIREVSFPLNLTSAFNDLKLKQKRYKLKCGLSYENSDYIFTTSSGSLIDVTNLSHAWENILKQAGLPHKKFHSLRHTFATKLFENEVPLKTVSELLGHSSIDITANTYTHVIPKEKSNAVEKLNYIFN >CP029329|4017964:4028410|4022386_4022662_-|AWK52796.1|DBSCAN-SWA MKGEQLELMRVIEFPKNKNIEDIRYKEKKEITKRVIDMLKGDFSVVINGSEDIFEEQINTDTIVITTDKEEFISRLSIYKDRKYHILDDKQ >CP029329|4017964:4028410|4018167_4018509_-|AWK52787.1|DBSCAN-SWA MEKTIIIDEKEIRFKSTAATPLRFKAQFGKDYFVEIIKLNKLSAFKEEKSNYEVLENADFEIFYNIIWTLAKTANKDIPEPITWLDGFDEFPLFEIIPQVQDLIAASIKSKKK >CP029329|4017964:4028410|4019770_4020067_-|AWK52791.1|head,tail|DBSCAN-SWA MTYDYELTLIQQTYTEDEIGNQTPTEIKTVIYCGLKSIGRTEFYNAVAHELKPEVIFNINKFEYSGEQLIEFEGKKYKIICTYSNDFEKIELTCEKVI >CP029329|4017964:4028410|4023759_4025022_-|AWK52798.1|DBSCAN-SWA MAYIKWIKLATGMPDDEKMKLMDAMPERDTNHYIWIRLLVQAGKTNSDGFIFLSENIPYTDEMLATIFNRPVESIKLALKTLSDFEMIEIAPNNIIKIINWDKHQNIEGMERVRAQNRKRAENHREKKKQIEKTTGDNHQEEKQNNYDVKVQEDQGENSNVKAKDSENIVPLDNSEVNSKTNIEEDGNDTENTMEDFISNTNSNSSNSGIAKNSCNVTEDYFSVTQNQSNVTVTEQNKKEIENKKKNKREIESNNKTGDINNKGSTHDVEVKESGLSQGVKESSLAKNKNIKEKPIAIADDDISSKAIEIMTYYEKITGAIGGINYGALRLAIDMHGADSVKMAINKALEVNQTDMRYINGILKNWRREGYPSERDENKNGVRSTGKNNSADKNEFTGFKPKKPRNLTEDERKGAEQNLI >CP029329|4017964:4028410|4019086_4019416_-|AWK52789.1|DBSCAN-SWA MTLSELVTILKTTGYPVVYSHFNVRENNPMPEPPYITYIFTYSSNMYADNKVYKKINNIQIELYTNKKDLQAEAKLEDILDSHEITYQTSETFIESENIFQKVYEMRVI >CP029329|4017964:4028410|4022772_4023015_-|AWK52797.1|DBSCAN-SWA MKESGIVRKVDPLGRIVIPKEIRKVMSINEGDALEIVKDNNGILLRKYTRGCIFCGSDESIIEFKEMIVCTKCKKGLIEE >CP029329|4017964:4028410|4020536_4020719_-|AWK52793.1|DBSCAN-SWA MGISNNLYNLALILLGGSIITLVVIVFYIIGIIRYAKKQRILIKELAQIEINNMNYKENI >CP029329|4017964:4028410|4026325_4026523_-|AWK52801.1|DBSCAN-SWA MILVNELKGKIRAKGYTQDKLAKELGISPKTLSNKLSKGVFGSDEIDKMIRILEIENPIEIFFVK >CP029329|4017964:4028410|4026692_4027025_+|AWK52802.1|DBSCAN-SWA MDFKENLKNRRLELNLTLDDVSKKLSISKPTLQRYESGVISNVPSDKIERLAEILETTPAILMGWQEKKLEITQSLTKAQQSLLDKYNTLDYVGKHTVDTVLQMEFNRCN >CP029329|4017964:4028410|4023083_4023710_-|AWK53129.1|DBSCAN-SWA MQPLAITCECRKIEKIKNDWKSCGINTEMCKHKFSNFEVWNAAAERSKDTAIAYYQDFDDVRGGRRNSILFCGQVGSGKTHLSVALAINFLQKKTRVVYMPYRDVITKIKQNMLDTEYYSKMISNYQLCEVLLIDDLFKGKINESDINIMFEIINYRYLNFLPIIVSSEFSIDRLLAFDEGVGSRIYEMCKDYVVEIEKDMNNNYRLK >CP029329|4017964:4028410|4025171_4025771_-|AWK52799.1|DBSCAN-SWA MDRLGKLESLFKRKDKIEGIDIGAILGLDKYRSITNVFEEKTKVVENSQRAVEARYWINTLEEVVSREFMIRTRKKIRKNNINSIDKDYEFMASNVNRKIIGENSILDCKLINGIDENDIFSVEFSKKFVMQAQHDMKVKKADKCYIAILINGENFIIREVMRDENLISKIVKVEEEFWNNYIEKNVEPKKPLSLDELD >CP029329|4017964:4028410|4021178_4021397_+|AWK52795.1|DBSCAN-SWA MEYVLSMTFLTEYGEKSTLSINGVKSTITQVEANALMDTIIAKNIFLPAAGALVSKSTAQLTERKVTKYEVA >CP029329|4017964:4028410|4018521_4019085_-|AWK52788.1|tail|DBSCAN-SWA MSENKVNFGLTNVHYAPFTVVDGVITYGTPKPIQGAITLSLDPRGDMTEFYADNILYYSASNNQGYDGTLSIANIPEEFAISALGEEKDSIDLVLTEKANLVGKPFAIMFQFEGDIKATRFVLYNCTASRSKVGSSTKSDKTEPNENELAFIASPRATDLAVKTKTTTGTPLAIYDAWYSKVYEKAV |
19 | Geobacillus_phage(28.57%) | tail,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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