Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP020008 | Haemophilus influenzae strain 5P28H1 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,DinG,cas3,WYL | 0 | 0 | 7 | 0 |
1. CP020008
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
397543 : 441107
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020008|397543:441107|DBSCAN-SWA CGTGGCAAAAACAATTCAAGCAATTCGTGGTATGAACGATTGCGCCCCAACAGAATCTCCATTATGGCAATGGATTGAAGCACAAGTACGCAATGTATTAAATAGTTATGGCTATTCGGAAGTGCGTATGCCAATTGTAGAAAGTACGCCATTGTTTGCGCGTGCAATCGGCGAAGTAACTGATGTTGTCTCAAAAGAAATGTACACCTTTTGGGATAACGATGAACAATTAACCTTACGCCCTGAAGGCACAGCAGGTTGTGTGCGAGCAGCCATTGAACACGGTTGGATCTATAATAATGAACAACGCTTATGGTATATCGGGCCAATGTTCCGTCACGAACGTCCACAAAAAGGGCGTTACCGTCAATTCCATCAAGTAGGTGTTGAGGTATTCGGTATTGCGAATCCAGAAATCGATGCCGAATTAATCATGCTTACCTATCGTTTATGGAAAGCGTTAGGTATCGATCAACATGTTACACTTCAACTTAACTCAATTGGTTCTTTAGAAGCTCGAGCAAATTATCGTTCAGCTTTAGTTGGATTCTTAGAAAACCATCAAGATTTAATGAGCGATGAAGAAAAAGAGCGTTTAGTAAGAAATCCGCTTCGTATTTTGGATACAAAAAATCCAGAATTACAAAAAGTATTAGATAACGCGCCTAAATTACTTGATTATTTAGATGATGAAAGCCGTGCGCATTTTGAACAATTATGTTCATTATTAGATGCTGTTGGTATTCAATATGAAATTAATCCTAAACTCGTTCGTGGTTTAGATTATTACAACAAAACTGTATTTGAATGGGTAACCTCCGCTCTTGGTGCACAAGGTACCGTGTGTGGTGGCGGTCGTTATGACGGTTTAGTGGAACAACTTGGCGGACACGCAACGCCAAGTATCGGATTTGCGATGGGATTAGAGCGTTTAGTCTTGTTGGTACAAGAAGTTAATCCAAATGTTCCTGCGAAAAGTGCGGTGGATATTTATGTTGTTTATCAAGGCGAAGGCGCAACATTAGTCGCTTTTGAATTAGCGGAAAAAGTACGCTCGGAATTACCGCACTTAAATACCATGTTGCACTGCTCTGGCGGTAATTTTAAAAAACAATTTAAACGTGCAGATAAATCTGGTGCAACATTGGCATTAGTTATCGGCGAAAGCGAAGTACAAAATAAACAAGTCGTTGTTAAACACTTACAAGGTGGCACAGATCAGCAAACCTTAGATTTAGTGAATATAATCGACTATCTTCAAACTCAATTTTAATTTAAAAGGGGAAAAACATGGCTTATTCCATTGAAGAAGAACAAGAGATTAACCAGTTAAAAGACTGGTGGAAAGAGAATGGCAAAACAATTATTGTCGCTTTTATCTTAGGTGTGGGTGGTATGTTTGGATGGCGTTATTGGCAATCGCACCAAGCAGAACAAATCGCTCAAGCTTCTGCACAATACGATACTTTAATTAATTCTGTGCAACAAGACGAACAGGCTAAAAAAGCAAATATAGAACAATTTGTGCAAGCGAATAGCAAAACTGCATACGCTGTATTTGCTTTGTTAGATGAAGCGAAAAAAGCCACTCAAAAACAAGATTTTTCAGCAGCAGAAGCAAATTTAAACCAAGCATTAACCCAATCTCAAGATGAAGTATTAACATCTATTGTTGCATTACGTCTCAGTGCAGTACAATTTCAATTGGGTCAATTAGACAATGCTTTAACCACCTTAAACCAAGTGAAAGGCGAAAGTTTTAATGCTCGCAAAGCGATTTTAACGGGCGATATCCAAGTTGCAAAAGGAGATAAAGTTGCGGCGAAAAACAGCTTTGAGCAAGCACAACAAAGTGGTAGCCAATTAGAACAACAAATGGCAAAAATGAAATTAAACAACCTTTAAAAAATAATACCCGCATCAAAGTGCGGGTATTTTTTCAATCAAATTTCTGATTATTCAAATTCATCCAGCCATTTTAATAAAATAGCCTCAAGAATTGATTCATTTGATTTATTCGGATCGTCATCAAAATCTTCAAGTTCACAAATCCATTTATGTAAATCAGTAAAACGAACTGTTTTTGGATCTAAATCTGGATTACGATCGTAAAGTTCTTCTGCAATTAATTGGGCGTCTGTCCATTTCATTAGTGAGCCGCCTCATTTGCGTGATTAAGGTTATATTTTGGAATTTCTACCACAAGATCTTCATTTCCCACGACGCATTGACAAGATAAACGGCTATCCATTTCTAATCCCCAAGCCTTATCTAGCATATCTTCTTCTTGATCACTCGTTTCATTTAAAGAATCAAACCCCTCACGAACAATCACGTGGCAAGTTGTACAAGCACAAGAACCATCACAAGCGTGATGAATTTCTACTCCCGCATTGTGAGCAACTTCTAATAAGTTATCTCCTGTTGCAGCATCAACGACCATACCTTCAGGACAAAAATCTTCATTAGGTAAAAAAATCACTTTTGGCATAATACTTTCCTCAAAATTATTTAATATCTGACTGCAGTTTTACGGATTTTCAATGTCTGACAGATTTTTACCTGTCAAAGCTTTATTAATTGATGCATTCATTCGGCGAGCAGCAAATTCTTGGGTAGCAGTGTCTAAGGCTTTAATTCCTTGCGCAATTGCATCGCGATCTGAACCTTGTTTTACATCCATTAATTGTTTTAACACAGTTTCAATATGATGAAATTCATCTGTGCTAAGCAATTCAGCCCCATCTGCTTGTAGTGCAACAATCACGCTTTCAATAACACGATCTGCTTCCACACGCTGCTCTGCCAATTCACGTGCTTGTAAATCTTCTTGTGCATTATCAAAAGAAGATTTAATCATTGCGGTTACTTCTTCATCAGTTAATCCATAAGATGGTTTAATTTGTATTGAAGCCTGTACTTTTGTCGATTTTTCCATCGCTGTAACGCTTAATAAACCATCTGCATCCACTTGATAAGTCACTCTAATATGGGCTGCCCCCGCCGCCATTGGCGGAATACCTCGTAGAGTAAAGCGTCCTAAAGAACGACAATCATCGACTAGCTCTCGTTCGCCTTGTAGCACATGAACACTCATTGCCGTTTGCCCATCTTTAAAAGTAGTAAACTCTTGCGCACGAGCCACAGGAATTGTTGTATTACGTGGAATAATTTTTTCCACTAATCCGCCCATCGTCTCAATGCCTAAGGAAAGCGGGACAACATCAAGTAATAACATATCAGAATCAGTTTTATTCCCGACTAAAATATCTGCTTGAATTGCAGCACCAAGTGCCACAACTTTATCAGGATCGATTGAGGTTAATGGTGTTTTACCAAAAAACTCGCCAACTTGTTCTCTTACATAAGGCACGCGAGTTGAACCACCAACCATTACTACGGCTTGTACTTCTTCGGATTCCACATTGGCATCTTTCAATGCCCGACGACAAGTTAGCAATGAACGTTTTACAAGCGGATAAATTAATTCATTGAATTGTTCCCGCGAAATCTCTACTGAAAAATCTTGCCAAGAAATAACCGCACTTTTTTCATTAGTCAAGGTAATTTTAGCTTGGTTGGCAAGGGTTATTAGCTCACGCTGTTGATTTGCTGTTTGTGGTTTTAGCTTAGTTTGTTCTATTACCCAATCTGCAATTAAATGATCAAAATCATCTCCACCTAATGCAGTGTCTCCCCCCGTTGCTAAAACTTCAAAGATACCTTTTGATAAACGTAAAATTGAAATATCAAATGTGCCACCGCCTAAATCATAAACCGCAATAATGCCTTCTTGCCCACTATCCAATCCATAAGCAAGTGCAGCTGCAGTAGGTTCATTCAATAAACGTAATACATTTAGCCCAGCTAAACGCGCAGCATCTTTAGTGCTTTGACGTTGAGCATCATCGAAATAAGCTGGAACTGTAATCACAACCCCAGAAAGCTCACCTCCAAGGCGTTGTTCTGCAATGTGATTTAAGCGCGATAAAATATCTGAAGACACTTCAATTGGACTTTTAGGCCCCTGTGCCGTAATAATTAAAGGTAATCCATTTTCACTCGCCACAAATTCATAAGGCAAACTAGAATAACGAGACTGAACATCAGGAAGGCTGCGACCAATTAAGCGTTTTACTGAAATCACCGTATTTTTTGGATCAAGTGAGGCTTGCTCAAAGGCTTCTAAACCAACTTTCTTCTCTTCAACGCCATAATGAACAACTGACGGCACAAGACTGCGTTCTTGTTCATCATTAAGAATCACGGATTGCCCACTACGCACGGATGCAACCAAAGAATTGGTTGTTCCCAAATCAATCCCAACGGCTAAACGATGTTGATGCGGTGCCGCAGCTTGTCCTGGTTCTGCAATTTGTAATAATGCCATATGCTATTTTCTACTAGTTATGCGACGGAATACGCCAAATCAAATTTATTTTTTTCTGCAAAGTTTGCTTGGTAATGGGTTTCAATATTGACTTCCTGTTTTTGACGTTCATCAATTGCTATTTTTCTGTCTTGGTTTAAATCAGGCGTAAATACAAAAACTTGGTTACCATCTAATTGTTTTACATCATCTTGCCAATTTTTCCAAAATAGCCCTTGATAAAAGGCCTCTACATCGCCATTCAATGCCCAAGCTAAAAATTCTGTGTAAGTAAAATTTAAATTATGCCAAGTAAGATCTTTTGATGAATAGTAATAAATTTTTCCAATATTATTGCCTAACGAACCACCATTTAACGCAAAATAACCACCAATCACATCATCTGCAACTAATAAATATTTTGGTTTTTCGCCTGACTCACTAAAAGATTTACTGAAATTCCAATCCATCAAGCCACGCGGTAATTTAAAACTTCCAGAACCTAAAATACGTAACCAACCATAATGAATTAAAATTCCACCTGTTTCATAGATTACTGCACCCATTGGCGAGGATGTTGGCATTTGCATAGTAAAAAGCTCACGCTCCGCACTGGATTGATCTTTTTTAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP020008|397543:441107|410092_413743_-|AVI99040.1|DBSCAN-SWA 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55 | Aggregatibacter_phage(15.15%) | head,holin,portal,tail,terminase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
445123 : 453313
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020008|445123:453313|DBSCAN-SWA AATGACTACATTAATTTTTCAAAACACTACTCTTCCAGTTATCAATCAACACAACCAAACTTTTATTACAGCGAACGATCTTGGTTTAGCTTTAGAATACGCTATGCCAATGCAAGCGATTTTAAAAATCTACGACCGCAATGCAGACGAATTTACCGCAGAAATGACCGCACTTATCGAAATGCCAACCGCAGGCGGACTACAAAAAGTCCGTATTTTCTCGCTTCGTGGTGCACACCTGATTGCCATGTTCGCCCGCACCAAAGTCGCCAAAGACTTCCGCAAATGGGTACTTGATGTTTTAGATGAAGAAGTCAAAAAATCGACCGCACTTTTACCAAACACAATTACACCAGAGCAACAACAAGCAATTCAATCAGCGGTGCAACAAGCGCACCACAGAACAGGCTTACACTGGCAAGAGATTTACCGCCAATTAAAAGCCATGTTCCACATTGCCAAATACGACCAATTACCACAAGACCAATACGGCAATGCAATGGCGTTCATTATGAACTTACAGCCTATTGTCTTGCCATCAGTCGAAAAGAAATTCACCTGTGAATTTACAGAACATGACCTACAACAGCTCGTCTGGGCGTGGTTTGCTTTATTGCGTGGCACGGAACTTTGCCAAGTACTTCACCCAGCATTAAAACAAATTGGTTCACACTACGCCGCCTCCGTTTATGGTGTGGCTTACGAATATCGCAGCACTCTCCGTCATGCCCATAACGTATTGACACGCATTACAGAGCAATTTGAATGCGAGCAAGGTAATAACTGGCGCGTATTAAAACATCTTCGAGCCTACAACCCTAAAGCAACAGGATTTCAGCTAGATATTCTCTAAAACACCACAAAATCCGACCGCACTTTACCGTGTGGCGGATTTTTACACCCTAAATTCACTAAATCGACTAAAAAGGAAACAAAATGAAACATTCAAAAGCCCCATTACGCCAAGAAAAACAAAGCTTCACGCACTTTATGAATGGCAGTGAAAAATGGCTAAACAGAATCTGCTATTTTCTCGCCGCCTTGATTATTGCCCTGATTGTAGGCGGAATTAGCCTACACGCCAATGCCCACCCAACCGACTGGCACAACAACACACTAAGCGAACAAATCCAACAAGAAGCCCGATGCGAACAGAAAGGGGGCGTATTTGAAAACGGTGTATGTTTACCGCCTAATCTTACACTGGCAGCAGAAAAAGAACTGCAGGCTTACACCGCACAAAAACAAGCAGAAATTAACCGCACTTTAGGAGAAAAGCAATGAAACCCTCCGATGATTACTACTATCAACTTGATGCAGCTTACCAACGTAAAGTGGATTGGCAAGCAGGCTATGAAATCGCCTTAGATGAAGTCGCTACTGAAATCGACAATGATTTAAAACAAGGCGACCAAACGCATTATCACGAACTCACAGAAATGCTGTGTGATAACGATAATTTCTGGCTTGCTATTGGTAGCGGTGCAAGTTATGAGCCTTATAGACAAGAGGCGATTAAGAAAATTGCCAAACGTGAATTGCACGCAAGAATGAATGATTATGACCCAGATTAATGGAGGGCGAGATGACAAACCAAGTCCAACATCAACAAAATAAACAGCCACCTGCGCTTAAAACATTTTTTGAAAGTGCGAATGTGCAAAATAAGATTAAGGAACTTGTTGGCAAAAATGCGGCAACCTTTGCAACAAGTGTCATGCAAATCGCCAATAGCAATGCAATGCTAAAAACAGCAGACCCAATGAGCATTTTTAATGCTGCTTGTATGGCTGCGACACTGAATTTGCCACTACAAAATGGTTTAGGCTTTGCTTACATAGTCCCTTTCAGAAACAACAAAGAAAAGAAAACCGAAGCGCAATTCCAAATTGGCTATAAAGGCTTTATCCAATTGGCACAACGTAGCGGGCAATTTAAACGCTTAGTCGCATTGCCTGTGTACAAAAAGCAACTTATCAAAAAAGATTTCATTAATGGTTTTGAGTTCGACTGGGAGCAAGAACCTGAGCAAAACGAAAACCCAATCGGCTATTACGCCTATTTTAAACTGGTAAACGATTTTTCGGCTGAACTCTATATGAGTCACGATGACATCGTCAAACACGCTCAACGCTACAGCCAAACATTCAAAAAAGGCTATGGCGTATGGCACGATAACTTCGAGGCAATGGCATTAAAAACTGTAACTAAGTTATTGCTATCAAAACAAGCTCCGTTATCGGTTGAAATGCAACAAGCGGTATTAGCCGACCAAACCGTTGTGAAAGATGTAGAAAATCAAGAGTTCAATTACACCGACAATATTCAAGAAGCGGAATTTTTAGCGGTTGTTGATGAAGCCACATTCAAACAATGCAAACAAAGCATTGCCAACGGCGAAACCACCCTACAAGAACTTTGTGATAGCGGAGCTTATGAGTTTAGCCAAGAGCAGATTGCGGAGTTGGAGGCGATTGAGAATGGAAATGTACAAACTCAAAGCTAGATGCTCTGGGCTTGCTGATTTAATGGTTAAACCGAAAAGCGGTGGCGGCATATCTGCTACCGCTAAAAGTGCGGTGAGAAAGATAGTGAAATATGACCTATTTGGCTATCAAGATTTTGAGGGGAATAAATACACTGAGAAAGGCATTGCATTAGAAGAACAAGCTATTAAGTTAAGCGGTCGTAAACGTGGATTACCGCTTAAAAAGAACACAGAAAGGCGTGAAAACGATTGGATTACAGGCGAGTGCGATATTTATGTGCCAAGTCGAAAATTAATCATAGATACTAAATGCTCTTGGGATATTGGCTCACACCCTTTTTTTGCTGATGAGGCAGAAGAAAAAGCCAAAAAAGCGGGGTATGACGCACAAATGCAAGGCTATATGTGGCTATGGGATTGTGATGAGGCGCAAATTGATTTTGTCCTCCTGCCTACCCCTTACGACCAATTATCAAGCTATGACGACCCAAACAGATACATTGACTTGGTTGAGCAAATCCCCCAAGAAAAACGTATCACGACGGTCACAATTAAACGTGATGAGAAAATCATCGAGAAAATCAAGGAGAGAGTAGAAATTGCTCAAGAATATTATCAACAACTTATACAGGAGATGCGCTAATGGCACGTAATACCAACACCGTGATATTAGTCGGTCATTTAGGCAGTGACCCAGAAATCCGCCAATTCCAAAATGGCGGGCAAATTGCCACATTTAATCTTGCTATCGGCGATGATTACCGAGATAAACAAGGTAATACAGTTAAACGTACGCATTGGATACCTATTGTGGTGCATGGCAATTCTGCTGATGTAGCAAGACAATATCTGCAAAAAGGCTCAAAAATCTGCGTAACAGGAAAACTAGTACAGGAAAGCTGGCAAGACCAAAACGGCAATAACCGCACCGCACTTAAAGTAGCGACACAATCCTTTGAAATGCTAGACAGCAAGGCAAACAATGAAACACAACAGCCAACCAAAGACAAAGAAAAACCCGACCCATTAAGCGCAGCAGCTGAACAAGATGGGTTTAATGATGATATTCCGTTTTGAGTTACACCACAAGCCACTAACCAATAGTGGCTTTTTTATTGCTCTCAACCCAGCTCGCTTAAGCGAGCTTTTTATTACCCCCAAAAAATAGGAGAAATAGAATGATTAGAAACAGTAGATGGACACCTGAGGTTCCACGCCCAACACTTAATGATGAACATTTATTTGCAGCCTTTTTAAAGGAGTGGGTAGAAAAAGAATACAAAGATGAAGTTAATTCAGACAAAAAGTACTTTGGAGATGAAGAATTTGATATTGAAGATTTTGGCATTTATCAAAGCATTTTAAAAGAGTGGAGCGGCGATAATGAAGACACCGCTGAAAATCTTATTAAATGGCAAGGCTGGGATTATCGCCAAGCCAAAGAATTTGAAGAAAAAAATCTTGAGTATGATTTTGATAAAGAAAATAACCGCCTATCTAAACAATGGGTAACTGACAATGTTTATACATTGCCTTTTTCTGTCGGTAGTCGCGTAAAATGGGGTTTAAAAGAAGGTATTATTATGGAGGATAAAAATAATAATTACCTACCTTTTGGAAAAGTGTGCGTATTAACAGATAAACAGGCAGCAGAAAATAAAAAATGGCAAGATCAAGGAATATCAAGTAGACATGGTGGTTATATTGTTAATTGGGAATCATTGGAATTGATAGAGGAAAAACAATGAACTTACTAAAATCCTTCGCCAGAAAAATCCTCAAAGAGGAACTCGAAAATAATAAATATCATTTTGAAAAATTAGGCAATGAAAATCTTGCCAAATCAAGACGCATTAAAGAGCTTGAAAGCGATAATGACCGCCTAAGAATTAAAGTAGAACAAATCCGACAGGACAATTTAAAACTCCGAGAAAATCGACCGCACTTTAAACATCATAAGAAAAAAGGAGGGAGAAAATGAATGAAATTAACATCAAAATCCCCTTACATAAATTCCAAGATTTAATGATTAGTCACGTCCGATACAGCTTGCCACGACATACTTATATCGTTAGCGAAACTATTCACGATGTTAAAACCTACTGGAGCGTGTTAAGCAGTAACACTCGAGAGGTAATTACGCGCGATATTAATGAGCATCTGAAACGCTGGGCAAGCGACCGAAATAACGCATTCCACAAACTTGACTACGATTCGTGGGAGGAACTATTTGACTGGATAAATGAAAACCGCAGTAGCCCATCAACAACAGCTACAACAGCAAAACCGATTGTGCCTGTGTTGCCTGTGATTAATCCAAAACAGAGGAAAAAATAACCGCACTATGTTTACCTACGGTTCAATCTGTTCAGGGATTGAAGCGGTAAGCGTGGCATGGAAAGGCTTAAGTAAACCGCTGTGGTTTAGCGAAATTGAGCCTTTTCCTTGCGCCGTGCTTGCTTATCATTATCCCAACATCCCAAATCTTGGTGATATGACCACCTTACCCGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP020008|445123:453313|446707_447628_+|AVI99086.1|DBSCAN-SWA MTNQVQHQQNKQPPALKTFFESANVQNKIKELVGKNAATFATSVMQIANSNAMLKTADPMSIFNAACMAATLNLPLQNGLGFAYIVPFRNNKEKKTEAQFQIGYKGFIQLAQRSGQFKRLVALPVYKKQLIKKDFINGFEFDWEQEPEQNENPIGYYAYFKLVNDFSAELYMSHDDIVKHAQRYSQTFKKGYGVWHDNFEAMALKTVTKLLLSKQAPLSVEMQQAVLADQTVVKDVENQEFNYTDNIQEAEFLAVVDEATFKQCKQSIANGETTLQELCDSGAYEFSQEQIAELEAIENGNVQTQS >CP020008|445123:453313|447650_448253_+|AVI99087.1|DBSCAN-SWA MVKPKSGGGISATAKSAVRKIVKYDLFGYQDFEGNKYTEKGIALEEQAIKLSGRKRGLPLKKNTERRENDWITGECDIYVPSRKLIIDTKCSWDIGSHPFFADEAEEKAKKAGYDAQMQGYMWLWDCDEAQIDFVLLPTPYDQLSSYDDPNRYIDLVEQIPQEKRITTVTIKRDEKIIEKIKERVEIAQEYYQQLIQEMR >CP020008|445123:453313|452287_453313_+|AVI99095.1|integrase|DBSCAN-SWA MPIRKNKNGVWQIDFTTPSGERVRCSSKTTDKKLAQHLHDKLKHEAWQVEQLNKKPEKTVEQALILLLKDAEHKKDKLTKIQHAKYWRDEIGNKLLSSLTSEDIQNAIPTHVVRTGKILSPATQNRYRSSIMRAINLAKQAGWIDVVPYIAKNSEPKKRIRWITEKEAERLLDSLNLNWMKDVCQFALLTGARMTEILSMTWDKINFANKMAIVTGDIAKSGRGRSLPLSDDAINLIKERMKYQVSPYVFHSGTGKLRDDISRRDFKRALQRANIKNFRFHDLRHTWASWHIQRGTPLMVLKELGGWETIEMVQKYAHLNADHLLSYVNQVKFSSNTRLAR >CP020008|445123:453313|445123_445975_+|AVI99083.1|DBSCAN-SWA MTTLIFQNTTLPVINQHNQTFITANDLGLALEYAMPMQAILKIYDRNADEFTAEMTALIEMPTAGGLQKVRIFSLRGAHLIAMFARTKVAKDFRKWVLDVLDEEVKKSTALLPNTITPEQQQAIQSAVQQAHHRTGLHWQEIYRQLKAMFHIAKYDQLPQDQYGNAMAFIMNLQPIVLPSVEKKFTCEFTEHDLQQLVWAWFALLRGTELCQVLHPALKQIGSHYAASVYGVAYEYRSTLRHAHNVLTRITEQFECEQGNNWRVLKHLRAYNPKATGFQLDIL >CP020008|445123:453313|449954_451118_+|AVI99093.1|DBSCAN-SWA MFTYGSICSGIEAVSVAWKGLSKPLWFSEIEPFPCAVLAYHYPNIPNLGDMTTLPEKILNREIPAPDVLVGGTPCQAFSVAGLRNSLDDERGNLTLTLIHILEAIDYVRYQDGKQPCVLLWENVPGVLSTKDNAFGHLLAGLVQEREPLQPTGAKWSNAGYVHSSRTIAWRILDAQYFGLAQRRKRVFLVASARERSVAQILFERKSLQGYSQSCGKTQQGFTCYAEGSFGTYRQSVLGGLVKASGGALGGGSETIVVHGTQDPIISTSTAHCLGRNNGQENVLFDISDRRDVVRIQKDGTTPTLTARMGTDGNNIPCMSINQNIRKLTPSECEKLQGFPPGYTQISYRNKPAEDCPDSPRYKAIGNSMAVPVIKWIGERMINYLNK >CP020008|445123:453313|446058_446406_+|AVI99084.1|DBSCAN-SWA MKHSKAPLRQEKQSFTHFMNGSEKWLNRICYFLAALIIALIVGGISLHANAHPTDWHNNTLSEQIQQEARCEQKGGVFENGVCLPPNLTLAAEKELQAYTAQKQAEINRTLGEKQ >CP020008|445123:453313|446402_446696_+|AVI99085.1|DBSCAN-SWA MKPSDDYYYQLDAAYQRKVDWQAGYEIALDEVATEIDNDLKQGDQTHYHELTEMLCDNDNFWLAIGSGASYEPYRQEAIKKIAKRELHARMNDYDPD >CP020008|445123:453313|448252_448687_+|AVI99088.1|DBSCAN-SWA MARNTNTVILVGHLGSDPEIRQFQNGGQIATFNLAIGDDYRDKQGNTVKRTHWIPIVVHGNSADVARQYLQKGSKICVTGKLVQESWQDQNGNNRTALKVATQSFEMLDSKANNETQQPTKDKEKPDPLSAAAEQDGFNDDIPF >CP020008|445123:453313|448658_448778_+|AVI99089.1|DBSCAN-SWA MGLMMIFRFELHHKPLTNSGFFIALNPARLSELFITPKK >CP020008|445123:453313|451166_451658_+|AVI99094.1|DBSCAN-SWA MEKMTKYFSVDISNDIHIINLCETLEQARETCLAGAVEAHEFADDMDEYENYESNDLPYAVYGVVLGKAECKKKTLTEEEKDEHCSDFDYVLEKPEIVDYQKDGNWIKYDSCPPSEDGFFIAYCPEYDIPVKVAFYDADLCGFTEFTDGEVTHWQPLPQPPEE >CP020008|445123:453313|448788_449358_+|AVI99090.1|DBSCAN-SWA MIRNSRWTPEVPRPTLNDEHLFAAFLKEWVEKEYKDEVNSDKKYFGDEEFDIEDFGIYQSILKEWSGDNEDTAENLIKWQGWDYRQAKEFEEKNLEYDFDKENNRLSKQWVTDNVYTLPFSVGSRVKWGLKEGIIMEDKNNNYLPFGKVCVLTDKQAAENKKWQDQGISSRHGGYIVNWESLELIEEKQ >CP020008|445123:453313|449587_449947_+|AVI99092.1|DBSCAN-SWA MNEINIKIPLHKFQDLMISHVRYSLPRHTYIVSETIHDVKTYWSVLSSNTREVITRDINEHLKRWASDRNNAFHKLDYDSWEELFDWINENRSSPSTTATTAKPIVPVLPVINPKQRKK >CP020008|445123:453313|449354_449591_+|AVI99091.1|DBSCAN-SWA MNLLKSFARKILKEELENNKYHFEKLGNENLAKSRRIKELESDNDRLRIKVEQIRQDNLKLRENRPHFKHHKKKGGRK |
13 | Mannheimia_phage(42.86%) | integrase | attL 439620:439634|attR 456307:456321 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1150510 : 1159576
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020008|1150510:1159576|DBSCAN-SWA TTTATTTAAGTGTAATGGCTGCGACAAAACAGGTAATTTTACATTCTCCGCACCCATTGCAACGTTCATTATCAATCTCTAAAGTGCTGGAGATTGCTTGTTGTGGGCAAGCGGTTTGGCAGTCTGGACAGGTTTGATTTTGTAGGATTAAACAGGCTGAGGAAAATTGTGGACGAAGTAATGTATCCGCTGGAAAATTAGGATGTAGTGCATTTGTCGGACAAACTTCTGCGCATTTACCACACAAATCACAAGGTGCGTAGTCAATTTCAAGGGTGGCTTGTTGCTGTTTTAGTTGAATTAAACCATTAGGGCAAGCTGAAGCGCATTCCCCACAACCATTGCAGACGGCGGAAAATAAATCTTCTCGTGCTGAAAAGGGAGGACGAGACTGCGTTTTTTCTATTGTTGATTTTGTAGCTGGAAATACATGACGCAATAGTCCTCTACGAGAAATATGATGGTGGCTTAAATAAGCCTGATAATAGGCTTCGTTTTTCATTATCGATAAAATCTTACTGTCGGTACATTAATATGTAAATCTACTTGCCATTGTTGTAAAGTTTTTATGGTAAGTAATGCAAGAGCTTGATAAAAATCAGAATTTTCTATTTTGCTTAGTTGTTCAAGGAAATGATACGCCCAAGTTAAGAAGTGTTCACGTAGAAATTCGATTAATAAGTGCGGTCGATTTTCTGCTAAATATGCAGCAAGCATTAGCATTAAGCCAATATGATCTTCTGGTTCATCTTGTTGCGTTTGAAATGCGATTTGATGTTGTTGTAAGAAATCGCGTAATGCTAAGAGAGAATTACCAAAAATAACACATTCAGGATCAAGATATACGGATCCCCAAGGTGGCGTAGGTAATTCATTTGGACCAATAAATAAATACTGATATTGTTCAGTGATATTTTGTTGCAGCCCTTTTTCAATAAGTGCGGTGATTTTTTTATGTGTTTTTACATCAAATGAAATTTCCCATTCTTGCATCCAATTTGGTTGGCGAAAGAATGTCAAAATATCAGTAAGTCGTGCATCATTAGGCTCATAGTAAAATACTGCACCGAGTAAACGCCCATAAATAGAAATTTGTTGAAGAGTATTTTGCATAGTATCTCCGAAAACAATTTGTCATTAGTGAATGGGGATATGAGGGTTGGTTAAATATTACTAATTAACGTTTCTAAAAATTGAGGCGTATGCTATACGCCTCAACATAATTTAACCACCAATCGCCATACCATATGTCATGTGCAATCCATAAAATAACGCACGACCAATGCCTTCAGCAACAAAAGTTAAAATAACTCCACCCCATAATAAACCCGCATTTTTAGCACGGAAGAATAGGAATGACGCAATAGCTAATAAACATAAACGTACAGCTGTCATCACCGCATAATCTGGCACGAGAGCTGCTGCATTTTGGATCGCACTATGAATACCTTGTAAATTAAAGCATTGATATATACAAACCACGGCAACACATAACACTGCAAAGGCAAATAAACCTGGTACAAAGTTAAGTTGATAGCTTCGTTGTTTATTTGGCATTAAAAGCACATAAGCTAAAGCCAAACCGCCTAATGCTACGGTGAGATAGAATGACCAAGAAGTCAGGATGGTATTCCAAGTCGGTACGCTGACAATATGATAAACCTGATTCATCATATACATAAAACAAAGCCCAGTAAGTGCGGTCAAAATTCGCCACACATTTCCAAGGGAGGCAGGCATTTTACCTAAAATACCAATCAGCCAATATAACCCAGACAAACCAAAGAATACTGCACCTGAGGCGATCTCGTTACTCATCATCGATTCGCCTACACGATTAAGAGAGTTGAACGCCCGCATTGGCGTTCCCAAATGCATGACCGAAGCAATAAAACCCAAACCTAAAATAGCCAAAATCACAAACATCGCTTGATGAATGTAGGCTCTACTTTTGTCATTTTTTTCACCCAATAGCACGAAAGTAAAAACAAGCCAAGCACCGACAGTACTTTGTGCCAAAACTGTAAAAAATACTAATGGCAGCTCATATAATCCTGTATTCATCTTACACCTCTCTTGGGTTTCCTAAGAACCCACTTGTATCGCCACTTAAACGAGCGTATTTATTGGGTTTTACCACTAAATTTGGTTGAGTGATATCAGCCGGTGGTAGTGGTGCGATGGAGGCTTGTGTGCCATATTTTGTTCGAAGTTCATCAATAGGAGCGAAATCCAATGCTCGTAGTGGGCAGGCATCAACACAAATCGGTTTTTGACCTGATTTTACGCGAGAATAACATCCATCACATTTTGTCATATGACCTTTTGTGCATCATATTGCGGTGCATCATAAGGACACGCCATATGACAATAACGACAACCGATACAAATTTCTTCATTGACGATCACGAAACCATCTGCATTTTTGTGCATTGCACCAGTTGGGCAAACTTTTGTACAAGCAGGATCTGCACAATGATTACAAGAAATAGACATATAATAAGCAAATATATTTTGATGCCAGCATCCATCTGCTTGTTGATTCCACTGACCACCTGTATATTCATAAATACGACGAAAATTGACTTCTGTGCCAAGATCTTTGTAATCCTTACAGGCTAATTCACAAGTTTTACAGCCTGTGCAACGTTCAGAATCAAAATAAAAACCATATTGTTCCATAATTATCCCCCTACAAACGTTCCACTTGAACTAAATTAGAATGTTGCGGATTACCTTTCGCAAGCGGTGATGGGCGTTGTGTCGTAAGTACATTAATGCAACCTGAATGATCGATACGATCTTTATCTGGTGCATATCAAGCCCCCTCGCTTAATGCCACAACCCCCGGAATAATACGGGGTGTAATTTTTACATTAATATGTACTTCGCCTCGATCATTAAAGATACGAATCATATCGCCATTTTTAATATTACGAGGTTTTGCATCAATAGGATTCATCCAAACTTCTTGTGGATTAGCTGCTTTTAATACATCCACATTGCCATAAGTTGAATGGGTTCTCGCTTTATAGTGAAAACCACTTAGTTGTAACGGATATTTTTCCATTAATGGATCACCGTAATGCTCAAAACTTTGGGCGTGAATAGGTAAGGGATGAATTACGTCATCTTCTGCTAATTTCCAAGTTTTTGCTATTTCAGCTAGACGAGAAGAATAAATTTCAATTTTGCCAGATGGCGTTTTAAGTGGATGGGCTTCTGGATTATCACGGAAATCTTTGTATGCAACTTTAAAGCCATTAGGATCAACTTTTTTAAAAATACCTTGTTGTCTAAATTCTTCAAAAGTGGGTAATTCAGGTAATTTTTCTCGAGATTGCTTATAAATATGGCGTAACCACTCTTCTTGTGTTCGTCCTTCAGTAAATTTTTCCTTTACGCCCATTTTCTCAGCTAAATCACTCAACATATCGTAAATAGGTCTACATTCAAAAGATGGTTTGATCACTTGATCTGCAAAAATGACATATGCCATATTGGATACAAAGGCATCTAAAGCGAAATCCATTTGTTCTGAAGTTGTACAATCTGGTAATAAAATATCACTGTATTTGGCAGTAGATGTCATATGATTATCAATAGTAATGATCATTTCACATTGCGTATCATCTTGTAAAATATCGTGAGTACGATTGATTTGTGCGTGTTGATTAATCAAACAGTTACTTGCGTAATTCCAAATTACTTTAATTGGGGACGATAATTTATCAACACCACGAATACCATCTGTAAGTGCGGTCATTTCTGTGCCACGAATAATTGCATCTGTCCATAAAAACATTGGAATGCTTGCTTTCACAGGATTTTTCAGCGTTGGCATCCGCACAAATGGAATGCTATACGCACTTTCACGTGCACCAGTGTTACCGCCGTGAATTCCAACATTACCCGTTAAGATTGGTAACATTGCAATGGCACGAGAGATTAATTCTCCATTACTACGACGTTGAGGCCCCCAACCTTGGGAAATAAAGGCAGGTTTTATACTACCAATTTCACGTGCGAGTTTAATAATTCTCTCCGCTGGAATACCCGTGATTTTAGCCGCCCATTCTGGGGTTTTAGCGATACCATCATTACCATAACCTAAAATATAGGCTTTATAATGACCATTTTTAGGGGCATCCGCAGGTAATGTTTTTTCATCATAACCAACACAATATTTATCTAAGAAAGGTTGATCCACGAGATTTTCTTGAATCATTACATAAGCAAGGGCAGAAACGAGGGCTGCATCAGTGCCTGGACGAATTGGGATCCACTCATCTTCACGCCCTGCACCAGTATCATTATAACGAGGATCGATAATAATCATTTTGGCATTGGAACGAGCTTTGGCTTGTTCAATACAATAAGTTAAACCACCTCCACTCATACGAGTTTCTGCAGGATTATTACCGAATAACACTATTAATTTGGTGTTTTCAATGTCAGCCATTCCATTTCCCAATGCCCAACCACCACCATAGGTATAATCTAAACCGACAGCAATTTGTGCGGTGCTGTAATCACCATAATGGTTTAAATATCCACCAATACAATTCATAAAACGAGCGATCATAGTGGATGCAGGTGGCCAAGATTTAGCCATTGTGCCACCGAGTGTTCCCGTACCATAGTTTAAATAAATTGATTCATTGCCATATTTTTTGATATTGCGTTTCAATGCGTCTGCAATTTCAGTTAAAGCCTCATCCCAACTGATTCGTTTGAATTTACCTTCTCCGCGTTTACCTATACGTTTCATTGGATATTTTAAACGGTCTGGGTTATACACTCGACGACGCATAGAACGTCCACGTAGACAAGCACGAACCTGATGATCAAGATTATATGTTTCTGTCCCCGTATTATCGGTTTCCACATAAGTGATTCGGTTATCTTTTACGTGCATTCGTAATGGACAACGGCTACCACAGTTTACTGTACAAGCGCTCCAAACAATACGTTCCTGACTATTTTCATTGAGGTGTTGTGTCTCTTTAGCCATTACATTGAAAGGTAAAGTAAGATTTGAAACTGCCAGTGCAGCTCCCGCAGATGACGCCTTGACAAAATCTCGGCGACTTATTTGATTAAAGTTACTCATAATATCGTCCCCCACAGTAAGAGCGAGTAATAACTAAAACGAGTTAATTATAATCTTTGTATAGAAGTTTTACTTGAGCCAAATCAATTAATCATGAATAGGCATATTATTTATAGGGTATTTTAGTAGGTTGATGTTTTAATAAATTTTGGAATAACAAATTGACTATAGATTTAAAAATCCGTTAGCATAGTGGCGTATTAGTTTATCTAATATGTTAAGTTTAACTATTATTAACTAGAGGCTCTTTTCATGAAGAAACTTATCGCGGTTGCGGTGCTTTCTGCGTGTGGCTCGTTAGCTCATGCAAACACCAATATTCCAAACTACAATACAGACGCCCATCTTTACGAATTCACGCAAACCTACGATTTAGTTGCACTAAAAGGCTCGCAAGGACAAACCAATTTATGGGTTCCATTGCCATTTAATGGAGAATACCAACAAGTGAAATCGATTCACTTTGAAGGTAATTACATGAATGCCTATGTAACAGAAAACAATAAATACGGAGCGAAAACCTTATTTGCCACTTGGGATAAAGATGCACAAAAACGTGATTTAAAAATCACTATGGTCATTGAAACAAAAGACCGTGAACCGATGGTGAAAGGTGCTTTAGAGAATTATACTCCGCCAAAAGATATTCAGTATTCAGTGGATGTACAAGAGTATTTAAAAGCTACTCAACACATTAAAACTGATGGCATTGTGAAAGAATTTGCTGACAAAATCGTAGGTAAAGAAACTAATCCATTGAAAAAAGCAGAACTTATTCACCATTGGATCGTAAAAAATATGGAACGTGATAATTCTGTATTAGGTTGTGGCGACGGCGATGTAGAAAAAATTCTTACTACTGGCGTATTAAAAGGTAAATGTACCGATATTAACTCTGTATTTGTGGCGCTTGCTCGTGCGGCAGACATCCCAGCCCGTGAAATTTTTGGTATTCGCTTAGGTGCGGCAGAGAAAATGGGCAAATATTCCAAAGGTGCTTTCGGTAGTGCGAATGAACAAGGCATCGCAAACGTAAGTGGCGGTCAGCACTGCCGTGCTGAATTCTACCTTGCTGGTTTTGGATGGGTACCAGTTGATTCCGCTGACGTTGCCAAAATGCGTTTAGCAGAGAAAAAATCTGTTGAAGATAAAGATACACAAGCCGTAGTAAAATATTTGTTTGGTAACTGGGAAGCAAACTGGGTGGGATTTAATCATGCCCGTGACTTTGATTTATATCCACAACCAGAACTGGCTCCAATCAATAACTTCGGCTATCCGTATGCTGAAGTGGGTGGCGATCCGTTAAATTCCTTTGATCCAAAAGAATTTAAATATGACTACGTCTCTAAAAAGCTCTAATAAATCCTTTTGGGTTGCCATAGCCACCGCACTTAGTGCCGCGGTGGCGTCAACTTTATGCTGTATTGTGCCATTAATCTATTTAGTATTTGGTGTCTCGTCCACTTGGTTGATTGGCTTGGGCGAATATGATTATTTGCGTATTCCCATGCTCATAATTTCATTATGCGCCTTTGCCTATGGATTTTGGCTGTTGATGTTTTCCAAAAAAATCATTTGTAGCAAATATATTTCCCGTAAAAAACTCATCGTTTTATATTGGATTGTATTTATCGTGATGATTTTTTTCTTAACCTATCCAACAATTTTGCCTTGGATTTTAGAATTAGCTAATTAGGAATAAAAATGAAGAAATTATGTACCGCACTTTTGCTTTCGCTGTTTGCCATTTCTTTCGCCCATGCGAATGAAACCAAACAAATTGTGCTAAAAGTAAAAGAAATGAATTGCCAGCTTTGCGCTTACTTAGTCAATAAAGAACTGCGTAATATCGATGGCGTTATTTCAACAAAAGCATCTATTAAAGATGGTTTAGTGACGGTTGTGGAAGATCCAAAAGTCACAAACCAACAATTATTCGATGCGATTCACAAGCTGAAATATACTGCTGAAGTCGTGAATTAAACGCTAAATCTCTAGCAAAAAAGTGCGGTGAAATTTACCGCACTTTTCTTTAGCTATTAAATTAGACTAATTTTTTAATTAGTTTGATTACAGTGCAATTAATTAAATATGATAAACGCAATATTATTCAGCACTTCCGCTTAAAAATCCGCCACTTTGATGATTCCAAAGTTTAGCATATAAGCCATTGAGTTCTAGTAATTCAGCGTGCGTACCTTGTTCAACAATTTGTCCTTTATCAAGTACGATTAGACGATCCATCGCTGCGATGGTGGATAAACGATGGGCAATGGCAATCACTGTTTTATTTTCCATCATCTTATCGAGACTTTCTTGTATCGCCACTTCCACTTCAGAATCCAGTGCGCTTGTGGCTTCATCTAACAATAGAATTGGTGCGTCTTTTAACATGACACGAGCAATAGCAATACGCTGACGCTGACCACCAGAAAGTTTTACCCCGCGTTCTCCAACATGAGCATCATAGCCTTTTCTACCTTGAGCATCAGTGAGGAATGGAATGAAATCAGCCGCTTCTGCTCTTTCAGCAGCTAAAACCATTTCTTCATCTGTGGCATTAGGGCGTCCATAAATAATATTGTCACGAACAGAGCGATGTAGCAGAGAAGTGTCTTGAGTCACTAAACCGATTTGGCTGCGTAGGCTTTCTTGTTGCACATTGAGTACATTTTGTCCATCAATGGTAATTTCGCCTTGTTGTGCTTCATAGAAACGCAGCAATAAGTTCACAATCGTAGATTTTCCTGCACCAGAACGACCGATTAACCCAACCTTTTCCCCCGGTTTGATAGTGAGATTGAAATGATTGAGTAATGGTTTTGTTGGATCATAAGCAAAGGTAATATCGTTAAACTTAATTTCCCCTTGTTTAACTTGTAACGGCGATGCTTGTGGTTTATCTACAATGGTGTGAGGTTTAGTTAAAGTATTCATTCCGTCGTTTACGGTGCCGATATTCTCAAACAATCGGGCAGATTCCCACATAAGCCGACTAGAAAGCCCGTTTACGCGTAATGCCATTGCAGTTGCAGTCGCTATTGCCCCCACGCCAACTTGACCATTTTTCCATAAAATAATGCCAAGTATTGCGGTGCTTAATGTAAGTAGAATATTTGTAGCGTAAGTGAGAGAATTTAGTGATGTTGCCAAACGCATTTGGGCGTGTACTGTTACCATAAAATCTTGCATCGAACGCTTGGCATAAGTAGCTTCGCGTGAGCCGTGAGAAAATAATTTTACTGTAGCAATATTGGAATAAGCATCTGTAATGCGTCCTGTCATTAAAGAACGAGCATCAGCTTGTCGTTGTGCGGTTTTTGATAGTTTAGGAATTAGGGTTCGTAGGATAAAAATAAAAATCGTAATCCAAGCAATAAATGGTAGTAAGAACCAAGAATCTAATGCTGCGAGAACTAATCCTGATGTAATAAAATATACGATGACATATACAAACATATCCGCAAGTGTAAGTACTGTATCACGTACTGCAAGGGCAGTTTGCATCACTTTTGCGGATACTCTACCTGCAAATTCGTCTTGATAAAAACTTAAACTTTGTCCAAGCATTAAACGATGGAAATTCCAACGTAATCGCATTGGAAATACGCCTTGTAAGGTTTGTAAATGCACAGTCGAAGCTAAAAATCCCCATACAATACTAATAAGTGATAGAGCAGCCATGCCAATTAATAAATGACCTTTTTCTTGCCATAATCTTTCAGGTGTAAATGTGCCTAACCAATCTACAAGCGTTCCCATAAATTGGAATAATACAGCTTCCATTACACCTGTACCTACGGTTAAAATTGCGAGCAAAAGAATCCAGCCTTTCATTCCTGTAATACTAGACCAAATAAAACGGAACAAACCTTTTTTAGGTGTTGTTGGATTGTTTTCTGGATAGGGATTTAAACGGTTTTCAAACCACGAAAAAATTTTGTTAAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP020008|1150510:1159576|1157329_1157608_+|AVI99772.1|DBSCAN-SWA MKKLCTALLLSLFAISFAHANETKQIVLKVKEMNCQLCAYLVNKELRNIDGVISTKASIKDGLVTVVEDPKVTNQQLFDAIHKLKYTAEVVN >CP020008|1150510:1159576|1151733_1152573_-|AVI99766.1|DBSCAN-SWA MNTGLYELPLVFFTVLAQSTVGAWLVFTFVLLGEKNDKSRAYIHQAMFVILAILGLGFIASVMHLGTPMRAFNSLNRVGESMMSNEIASGAVFFGLSGLYWLIGILGKMPASLGNVWRILTALTGLCFMYMMNQVYHIVSVPTWNTILTSWSFYLTVALGGLALAYVLLMPNKQRSYQLNFVPGLFAFAVLCVAVVCIYQCFNLQGIHSAIQNAAALVPDYAVMTAVRLCLLAIASFLFFRAKNAGLLWGGVILTFVAEGIGRALFYGLHMTYGMAIGG >CP020008|1150510:1159576|1152574_1152826_-|AVI99767.1|DBSCAN-SWA MTKCDGCYSRVKSGQKPICVDACPLRALDFAPIDELRTKYGTQASIAPLPPADITQPNLVVKPNKYARLSGDTSGFLGNPREV >CP020008|1150510:1159576|1151010_1151622_-|AVI99765.1|DBSCAN-SWA MQNTLQQISIYGRLLGAVFYYEPNDARLTDILTFFRQPNWMQEWEISFDVKTHKKITALIEKGLQQNITEQYQYLFIGPNELPTPPWGSVYLDPECVIFGNSLLALRDFLQQHQIAFQTQQDEPEDHIGLMLMLAAYLAENRPHLLIEFLREHFLTWAYHFLEQLSKIENSDFYQALALLTIKTLQQWQVDLHINVPTVRFYR >CP020008|1150510:1159576|1153327_1155622_-|AVI99769.1|DBSCAN-SWA MSNFNQISRRDFVKASSAGAALAVSNLTLPFNVMAKETQHLNENSQERIVWSACTVNCGSRCPLRMHVKDNRITYVETDNTGTETYNLDHQVRACLRGRSMRRRVYNPDRLKYPMKRIGKRGEGKFKRISWDEALTEIADALKRNIKKYGNESIYLNYGTGTLGGTMAKSWPPASTMIARFMNCIGGYLNHYGDYSTAQIAVGLDYTYGGGWALGNGMADIENTKLIVLFGNNPAETRMSGGGLTYCIEQAKARSNAKMIIIDPRYNDTGAGREDEWIPIRPGTDAALVSALAYVMIQENLVDQPFLDKYCVGYDEKTLPADAPKNGHYKAYILGYGNDGIAKTPEWAAKITGIPAERIIKLAREIGSIKPAFISQGWGPQRRSNGELISRAIAMLPILTGNVGIHGGNTGARESAYSIPFVRMPTLKNPVKASIPMFLWTDAIIRGTEMTALTDGIRGVDKLSSPIKVIWNYASNCLINQHAQINRTHDILQDDTQCEMIITIDNHMTSTAKYSDILLPDCTTSEQMDFALDAFVSNMAYVIFADQVIKPSFECRPIYDMLSDLAEKMGVKEKFTEGRTQEEWLRHIYKQSREKLPELPTFEEFRQQGIFKKVDPNGFKVAYKDFRDNPEAHPLKTPSGKIEIYSSRLAEIAKTWKLAEDDVIHPLPIHAQSFEHYGDPLMEKYPLQLSGFHYKARTHSTYGNVDVLKAANPQEVWMNPIDAKPRNIKNGDMIRIFNDRGEVHINVKITPRIIPGVVALSEGA >CP020008|1150510:1159576|1157180_1157321_+|AVI99771.1|DBSCAN-SWA MFSKKIICSKYISRKKLIVLYWIVFIVMIFFLTYPTILPWILELAN >CP020008|1150510:1159576|1150510_1151011_-|AVI99764.1|DBSCAN-SWA MKNEAYYQAYLSHHHISRRGLLRHVFPATKSTIEKTQSRPPFSAREDLFSAVCNGCGECASACPNGLIQLKQQQATLEIDYAPCDLCGKCAEVCPTNALHPNFPADTLLRPQFSSACLILQNQTCPDCQTACPQQAISSTLEIDNERCNGCGECKITCFVAAITLK >CP020008|1150510:1159576|1155874_1156984_+|AVI99770.1|DBSCAN-SWA MKKLIAVAVLSACGSLAHANTNIPNYNTDAHLYEFTQTYDLVALKGSQGQTNLWVPLPFNGEYQQVKSIHFEGNYMNAYVTENNKYGAKTLFATWDKDAQKRDLKITMVIETKDREPMVKGALENYTPPKDIQYSVDVQEYLKATQHIKTDGIVKEFADKIVGKETNPLKKAELIHHWIVKNMERDNSVLGCGDGDVEKILTTGVLKGKCTDINSVFVALARAADIPAREIFGIRLGAAEKMGKYSKGAFGSANEQGIANVSGGQHCRAEFYLAGFGWVPVDSADVAKMRLAEKKSVEDKDTQAVVKYLFGNWEANWVGFNHARDFDLYPQPELAPINNFGYPYAEVGGDPLNSFDPKEFKYDYVSKKL >CP020008|1150510:1159576|1157731_1159576_-|AVI99773.1|DBSCAN-SWA MFNKIFSWFENRLNPYPENNPTTPKKGLFRFIWSSITGMKGWILLLAILTVGTGVMEAVLFQFMGTLVDWLGTFTPERLWQEKGHLLIGMAALSLISIVWGFLASTVHLQTLQGVFPMRLRWNFHRLMLGQSLSFYQDEFAGRVSAKVMQTALAVRDTVLTLADMFVYVIVYFITSGLVLAALDSWFLLPFIAWITIFIFILRTLIPKLSKTAQRQADARSLMTGRITDAYSNIATVKLFSHGSREATYAKRSMQDFMVTVHAQMRLATSLNSLTYATNILLTLSTAILGIILWKNGQVGVGAIATATAMALRVNGLSSRLMWESARLFENIGTVNDGMNTLTKPHTIVDKPQASPLQVKQGEIKFNDITFAYDPTKPLLNHFNLTIKPGEKVGLIGRSGAGKSTIVNLLLRFYEAQQGEITIDGQNVLNVQQESLRSQIGLVTQDTSLLHRSVRDNIIYGRPNATDEEMVLAAERAEAADFIPFLTDAQGRKGYDAHVGERGVKLSGGQRQRIAIARVMLKDAPILLLDEATSALDSEVEVAIQESLDKMMENKTVIAIAHRLSTIAAMDRLIVLDKGQIVEQGTHAELLELNGLYAKLWNHQSGGFLSGSAE >CP020008|1150510:1159576|1152822_1153191_-|AVI99768.1|DBSCAN-SWA MEQYGFYFDSERCTGCKTCELACKDYKDLGTEVNFRRIYEYTGGQWNQQADGCWHQNIFAYYMSISCNHCADPACTKVCPTGAMHKNADGFVIVNEEICIGCRYCHMACPYDAPQYDAQKVI |
10 | Escherichia_phage(85.71%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1286449 : 1294958
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP020008|1286449:1294958|DBSCAN-SWA TTTAATCAATATGGAAACAAGCGATTAATTTTCCATCAGTATATTGTTCCAAGTGCGGTTGATTTTCACGACATTTTTCTGTCGCTTTCCAACAACGAGGATTAAATGCACAGCCTTTTGGCGGATTAATTGGGCTTGGCAATTCGCCTGTCAGTTTTATGCGTTCACGGCGCAAGTTTGGCGACAAACGTGGTGTCGCTGAAAGTAACGCTTTGGTATAAGGATGCTGAGGATTAGAAAAAATCTGCTCTGTCGTCCCTTTTTCAACACAACGACCTAAATACATCACCATCACTTCATCAGCGATATGTTCTACCACAGAAAGATCGTGTGAAATGAATACGTAAGACAAGCCTAATTCATCTTGTAAATCCATCATTAAATTCAGTACTTGTGCACGCACGGAAACATCCAATGCAGAAACAGGCTCATCGGCAACAACGACATCGGGATCTAACATTAAACCACGAGCGATGGCAATACGTTGGCGTTGTCCGCCTGAGAACATGTGGGGATAACGATCATAAAATTCAGCGCGCAAGCCCACTTTTTCCATCATCGATAAAACTTTTTCTCGCCGTTCTTTGGCGGAAAGTTTTGTATTGATGATTAATGGTTCTTCCAAAATTGAACCAATCTTTTTGCGTGGATTTAACGATGCGTAAGGATTTTGAAAAACTATTTGAATTTTTTTACGACGTAGTGCTTTTGTTTCAGAATCATTTTCTAAAAAATTATGTCCTTTGTAATAAAGTTCGCCTTTGGTTGGTTCTTCAATCATTGTCAATAAACGACCTAGCGTTGATTTTCCACAACCTGATTCACCCACGACTGCTAAAGTTTTACCTCGTTCAAGCTGAAAAGAGACACCATCCAACGCTTTTACTTGCTGTGGTTTTGCAAACAAGCCTTTTTTTACAGGGTAATATTTTTTTAAGCCAATGGCATTTAATAATGGCGTATTTTCTTTTACTTCATTCGTCATTATTAAGCTCCTTGATATTCAACTGGATTGCCTTGCTCGTTCAGCGGAGTATGGCATTTTACTTTACGCGAACCGATATGATGCAATTGAGGTTCAACTTGGCGACAATATTCGGTGGCATAAGGGCAGCGAGGATTTAATAAACAGCCTGTTGGGCGATCGTATTTTCCAGGGACGACCCCTTGTAATGATTCTAAGCGAGATTTTCCCTCTGCAAATTCAGGTAATGAACGTAACAAGGCTTGTGTGTAAGGGTGTTTTGGCTCGCGGAAAATATCTTTTGCGGTGCCTTCTTCAACGATTTGTCCAGCATACATCACGATAATTCGCTCTGCCGCTTCAGCCACAAGTGCTAGATCGTGAGTAATCAAAATTAGGGACATACATTCTTTCTTTTGCAATTCAAGTAAGAGTTCCATAATTTGAGCTTGGATAGTCACGTCCAATGCCGTGGTTGGTTCGTCAGCAATCAATAATTTAGGTCTGCAAGCAATTGCCATCGCAATCATCACGCGCTGGCTCATTCCACCAGACAGCTGATGGGGATAAACATCAATCCGAGATTCAGGATCAGGAATACCGACCAATTTTAAAAGCTCTAAAGTGCGGTCTTTTCTTGCCTTTTTTGTGCCGCCTTCGTGAGTTTTCAACGCTTCCATAATTTGGAAACCCACAGTATAAGCAGGATTCAAACTTGTCATCGGATCTTGGAAAATCATTGCTACATCAGCACCAATAAGCTGGCGTTTAGCTTTACTCTCTAAAGTGAGTAAATCAGTATTTTCAAATTGCAAGGATTCAGCAGATACACGTCCAGGATGATCAATTAATCCCATAATTGCGAGAGAACTCACAGATTTACCCGAACCTGATTCTCCCACAATGCCAAGCACTTCGCCTTGTGCGACTTGATAGCTAATGCGATCCACTGCTTTAAATGGCGTTTTTTTATCGCCAAAGTGAACAGAAAGTTCTTTTACGTCTAATAATGCCATTCTGTTTTCCTATTGTTTGAGTTTTGGATCAAGGGCATCACGCAAGCCATCGCCCATTAAGTTGAAAGCTAATACCAAAGATAAAATCACTAAGCCAGGAATTGTAACTAACCAGTTTGCCGCTTGCATAAAACCACGAGCTTCGGAAAGCATTGTGCCAAGTTCTGGTGTTGGTGGTTTTGCACCAATGCCTAAGAAACCAAGTGTCGCGAGTTCTAAGATAGCATTGGATATTCCCATAGTCATTTGCACAATTAAAGGGGCTAAACAGTTTGGTAAAATCACAATAAACATGAGGCGTAAAATACCTGCCCCTGCCACTTTAGATGAAGTCACATAATCACGATTTTTTTCATTCATCATCGCTGCTCGAGTTAAACGCACATAGCTAGGAATCGATACCACGGCGATCGCTAAAGTGGCATTGGCGAGTGATGGCTCTAAAATAGAGACGACAACAATCGTCAAAAGTAAGTTTGGAATTGCGAGCATAATATCAATTAGGCGAATGATAATTGTATCTAGCACGCCGCCATAATAACCAGAAATCAAGCCAAGGCTGGTACCAAAGGCGCAAGATAGTAATACGATGATAAATCCCGCAAAGACGGAAATTCGCGTTCCATAAATAATACGCGAAAGAATATCTCGCCCAATATCGTCTGTGCCGAGTAAATAAGCAGGATTACCGCCCTCATACCAAGCGGGTGGCAGTAAAAGTGCGGTACGATTTTGTTCTGTTGGATCAAAAGGTGCAATATAAGGTGCGAGAATGCTGATTAAGGCAACAATCAAAATAAAAATTAAACCAATTAGCGCACCACGATTTTGTTTAAAGTAAAACCAAAATTCTTGTAAGGGTGTTTTTGGCGCAAAAGTTAAAGGCGTGTCAGACATAATTTCTCCTACAATTAATGACGGATACGCGGATTGACCACGCCGTAAAGTAAATCGACGGTTAAATTTACCACAATAATAATCGTCGCAATAATCAGTACAGAACCTTGCAACACAGGATAATCACGGGCTTGAATGGCATCAATAATCCATTTTCCAATCCCCGGCCAAGAGAAAATAGTTTCTGTGAGAACTGCACCAGAAAGCAATTGACCTACAATTAACCCGACCACAGTGACAACAGGAATTAACGCATTACGCAATGCGTGAACAATAACAATTCGAGTATAGCTTAAACCTTTTGCTTTTGCCGTGCGAATGTAATCTTCGCCTAATACTTCCAACATCGCAGATCGTGTCATACGCGTAATAATGGCGAGAGGAACTGTGCCTAGGACTATTGCAGGAAGAATTAAGGATTTCACCGCATTTTTGAAGGCACCTGGCATACCAGAAAGCCAGCTGTCAATAAGCATAAATCCTGTTGGTGTATCGATCCAAAATTCATTATCTAAACGTCCACCTTGTGGCAAACCGAGTTGTGGCGAAACATATAAAATTAAAATTAAACCCCACCAGAAAATCGGCATAGAATAACCTGTGAGCGATGCAGCTGTAACGGTGTGAGAAATCCAACTGTCTTTTTTTACTGCGGCAATCGTGCCTAAAATTATTCCACCTAATAATGACCAAAATAACGCAAAAAAAGCTAATTCAGCGGTAGCAGGAAAAAGCGTAAAAAATTCAGTAAGGACAGGTTGTTGAGTGCGGAACGATGCACCGAAATCCCCTTGAATTACATTGCCAATATAGTGGAAATATTGCTGATAAAGAGGTAAATCTAAACCCAATTGGTGCATCATTTGTTGATGTACTTCTGCCGTTAAGCCACGTTCCCCCATCAGAATTTCCACAGGATCACCGGGAATAAAATGCACAAGGGCAAAGGTAATAAGAGTAATGGCAATAAAAGTAGGGATCACCATTAAGATTCGTTTGAATACAAATTTAAACATTCCATCACTCGTAGATAATAAAAGTGCGGTAAAAATTCACCGCACTTTTCAAAGAAATTAATCGGTAAAAAATATAATACTCTTGAATTCTACCGCACTTTTTCCAATTTTGCCAAATGCGCAATCAACCATTTAATGCCTTGAGCTTGGAACGCTATTTGTAAACGTGTGTTATTTTCAGATCCTTCCACATTAATCACTGTGCCGAAACCAAATTTTTCGTGTTTAACTTTTTGACCCATTTTCCATTCATTTTCGACCGCACTGGTATTCGACAATGAACCGACTTTTGCGAGGTTCATCGCACGCGTGACTGTCCCTCGTAAACGAATTTCTTGGATACATTCTCTCGGTAATTCTGCGATAAACCGTGATGGCAAATGGCGTTCTTCTTTGGCATATAATCGACGGCTTTCCGCATAAGAGATGGTCAGTTTTTTCTGCGCACGAGTAATACCGACATAAGCTAAACGACGCTCTTCTTCTAAACGTCCGGGTTCTTCAAAAGAACGAAAACTTGGGAATAATCCTTCTTCTACGCCCACCATAAATACACGAGGAAATTCTAAGCCTTTCGCAGAGTGCAACGTCATCATTTCTACACAAGATTGATGCGGCGAGGCTTGTTCTTCGCCAGCTTCTAAGGAAGCGTGCGTTAAAAAGGCAGTGAGTTCGGTCATTTCTTCCGCATTATCAGGTTTGATAAATTCACGGGTTGCGGTAACTAATTCTTCCAAATTTTCAATACGCACTTCGCCTTTTTCGCCTTTTTCTTGTTGATACATTTCATATAAGCCCGAATGTTTAATCACAAAATCAGTTTGTGCGAAAAGCGGCATTTCTGCGGTATCAAGTTGTAGTGAATTAATTAATTCTTGGAAACGTAATAAGGCTGTTGAGGCTCGCCCTGCCAACATATTTTCTTGTGTTGCGACTTGTACTGCTTGCCATAAGGTAATTTGGCGTTCACGTGTTAAGTTACGCAATATATCTAAAGTGCGGTCGCCAATGCCACGGGTTGGCGTATTAATTACACGCTCAAAAGCCGCATCATCTTGACGATTATTAATCAAACGAAGATAGGCTAACGCATCTTTAATTTCTTGACGTTCGAAGAAACGCATACCGCCATAAATACGGTATGGAATTTGACAACGAATTAAAGCTTCTTCAATAACCCGTGATTGGCTATTACTACGATAAAGTACAGCGCAATCATCAAGTTTTCCGCCATGTTCCACCCAATCCTGAATTTGTGAGGCGATAAATTTTGCTTCGTCTAATTCATTAAAGGCAGCATAGATGCCCACAGGATCGCCTTTTTCACCCTCTGTCCATAAATTTTTACCAAGACGATCACTATTGTTTGCAATTAATTCATTTGCGCTGTTTAGGATATTGGCGGTAGAACGATAGTTTTGTTCAAGGCGAATTGTTTCGGCTTTGAAATCTTTCAAGAATTTTTGGATATTTTCTATTTGTGCACCACGCCAACCGTATATAGATTGATCATCATCGCCCACAATCATGACTTTGCCTGTTTTTCCAGAAAGAATTTTGATCCATTTATATTGGATTTTATTGGTGTCTTGAAATTCATCCACCAAAATATGCTGAAAACGTTGTTGATAACGTTGCAAAATTAATGGTTTTTTCTCAAATAATTCATAGACCCGAATTAATAATTCAGCAAAATCGACCAACCCTGCGCGATCGCAAGTGTCTTGATAGATCTGATAAATTTTAATCCATTCACGTTCTTGGCGATCATTAAAATCTTCAATATCATTTGGTCGCAAGCCTTCATCTTTTTTGTTATTGATGTACCAACAAGCCTGTTTAGGCGGAAAAGCTTTTTCATCAAAATTATGTAATTTTAATAATCGTTTAATTAAACGAAGTTGATCTTCTGAATCTAAAATTTGGAAATCTTGTGGCAATCCCACATCTAAATGATGAGCTCGTAATAAACGATGGGCAATGCTGTGAAAGGTGCCAATCCACATACCAACTAATTGATGTTGTGCGTGTTTGGCAAGGGTAGATTGAATACGATGACGCATTTCTGCTGCGGCTTTATTGGTAAAGGTCACCGCCATAATGCTGCCTTCAGAAATATTTTCGACCGCAATTAACCAAGCAATACGGTGCGTCAATACACGCGTTTTGCCCGATCCTGCACCAGCTAGCACTAGGTGATTACCAAGAGGAGCAGCTACGGCTTCGCGTTGTTTATCGTTAAGCCCGTCAAGTAATTCAGAAATATCCATCATAAACTATCTTTAATCTGTTTAAATTTACAGTTATTATAGTCTCATCTATCTTGTGAAACAATAAGATTTGTGAGTATATCAAAAGTAGGGTAGAACATTTTAAGAATAATATTAAGCGGGATTCTCCTATATCCTTAAACTCAACATCAAAACCATATGCTTTGAAAGCTATTTTTATACTATCTATAAACAAATTTTTAATTCGTTTACCTCTCATTCCTAAAATGCAAGGTTTCTCATTTTTCCAAAAATACCCATGATGTAATAGTATAGGAATGTTGTTTAATGACTTAATCAATACTTGATTTGCTAGGATTCCTGTAATGATTTTATAAACATTTGCTTTTCCTTCTACTTGCACGCCATTTTACGCATAGTCGGTGATTTTGTCCGAATTAAGTTTTAGGTTAAAAAGTTACTCAAATTCAATGTTATTCATAATTAATACAAATAAGAAAGAGTGAGATATGGTACAAAATTTCAAAAAATGGTTAGCACAAAGGAATGGGAGAAGTGTGCTATCCAAGTTTCATTATGATCACTCTCTAAAGTAGAAAACGTCATATACTAAATTATATACTGATCAAAAAATAATATTTCCTTCTATTACTCAATACCAATCAATTTATGTGTTTGTAAACTTAGCTGCCATTTAGGTTTATTTGAACGTTGATTCAATTGACCAAGTAAAGTGATAGTCTCAAGTAAATTCATTTTCCCATCAATTTCACAAGGTGAAAGATAGTAATTCTTTGCTTTTATTTTTTGCTCGATCAATTCACAAAATGATGGCATATTACTGTCCATTACAATACGTACTTCATTTGCAAATGGAATGCAACGCTTTTCATACTTATGAGCATAAAGGCTCTTAGGACTCGTCGCAATATAATCTATTTGTGCAGGAATTGCTTTTAGACCATTGGTTTCAATTGCAAGAAAATAGCCATCTGATTTAAATTGCTCAAGTAAGTATTCAATTTTTGGTACAATTGTTGGCTCACCACCTGTGATGATAATATTCTTTGACGAAAATGACCGCACTTTTTCTAGAATTTGTGATACAGACCAGCGTTTAAAATTATTATAAGGTGTATCACACCAAGGACAGTCTAGATTGCATTTACCAAATCGTACAAAAACACTTGGCATTCCCGTATTGAAGCCCTCCCCTTGCAGACTTTCAAAAATTTCGACTATGTTAAAGTTCGGTTCAAAATCATGATATTTTTCCATCAACATTTACTCCTGATACTCGCAAAATGAAGCTGGGGTTTCCCATAAACGAATGGATGATATGGACAGTTGTTCATCATGTTTTAAACGATTAAAAATAAAACGAGCTATTTCTTCTGCCGTAGTTCTAAAGGGAACACCAAAAGTTTTTGAGTTTAACTTTTGCAATAGAGTGGCAATTTGGCTTTCTCGCTCATTGGTTTGATCATAAATAAAGGCGTGATCCATCGGATCTAAAATAACTTTTTTCACAATAGACTTTAGATCTGAAAAATCAATGACCATTGCTTTTTTTGCACCTGATTCATATAAGTCACCCGAAATTTCAACTTGTAATTTATATGTGTGTCCATGTAAATTTTGACATTTCCCATCATGTCCATCTAATAAATGTGCCATGTCAAAGCTAAATTCTTTGGAAATTTTAAACATTTTTTCTACCTTTTTGAGTCAAATATTTCTTTAGACCTTTATTGCGTAAAATACAGCTTGGGCATTTTCCGCATCCACCTTCGATGCCTTCATAGCAAGTGTGAGTATGTTTTTGTACATAATCTAATACGCCTAATTCATCAGCAAGCTGCCAAGTTTGGGCTTTAGTGAGATACATTAATGGTGTTTTGATATTGAATTGATAATCCATAGCTAAATTTAATGTGACATTCATTGACTTGATAAACACATCTCGGCAATCTGGATAACCGCTGAAATCTGTTTCACATACGCCAGTGATAATATCTTGAATGCCTTGGCCTTTCGCATAAATCGCTGCATAAAGTAAAAATAGGGCATTGCGACCATCAACAAAAGTGTTTGGCAATTCATTCTCTTTTTGCTCAATATGCGCCTGTTCATCCATTAATGCATTATGTGTGATAGCTTTCATAACAGATGTATCAATCAAGGTTTGTTTAATGCCGAGATCTTGCACAATGGCGCGCGCCTTTTCTAATTCAATAGCATGACGCTGCCCATATTGAAAGGTAATGGCTTCTATGTTTTCTTTGCCGTATTCAGCAATAGCTTGGAATAAACAAGTCGTGGAGTCTTGTCCACCTGAAAAGATGACAATCGCTTTACGATCGTGGTTTGGATTGAAAATATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP020008|1286449:1294958|1290285_1290402_+|AVI99904.1|DBSCAN-SWA MAIKVGITIKIRLNTNLNIPSLVDNKSAVKIHRTFQRN >CP020008|1286449:1294958|1286449_1287433_-|AVI99900.1|DBSCAN-SWA MTNEVKENTPLLNAIGLKKYYPVKKGLFAKPQQVKALDGVSFQLERGKTLAVVGESGCGKSTLGRLLTMIEEPTKGELYYKGHNFLENDSETKALRRKKIQIVFQNPYASLNPRKKIGSILEEPLIINTKLSAKERREKVLSMMEKVGLRAEFYDRYPHMFSGGQRQRIAIARGLMLDPDVVVADEPVSALDVSVRAQVLNLMMDLQDELGLSYVFISHDLSVVEHIADEVMVMYLGRCVEKGTTEQIFSNPQHPYTKALLSATPRLSPNLRRERIKLTGELPSPINPPKGCAFNPRCWKATEKCRENQPHLEQYTDGKLIACFHID >CP020008|1286449:1294958|1294274_1294958_-|AVI99908.1|DBSCAN-SWA MNIFNPNHDRKAIVIFSGGQDSTTCLFQAIAEYGKENIEAITFQYGQRHAIELEKARAIVQDLGIKQTLIDTSVMKAITHNALMDEQAHIEQKENELPNTFVDGRNALFLLYAAIYAKGQGIQDIITGVCETDFSGYPDCRDVFIKSMNVTLNLAMDYQFNIKTPLMYLTKAQTWQLADELGVLDYVQKHTHTCYEGIEGGCGKCPSCILRNKGLKKYLTQKGRKNV >CP020008|1286449:1294958|1288437_1289325_-|AVI99902.1|DBSCAN-SWA MSDTPLTFAPKTPLQEFWFYFKQNRGALIGLIFILIVALISILAPYIAPFDPTEQNRTALLLPPAWYEGGNPAYLLGTDDIGRDILSRIIYGTRISVFAGFIIVLLSCAFGTSLGLISGYYGGVLDTIIIRLIDIMLAIPNLLLTIVVVSILEPSLANATLAIAVVSIPSYVRLTRAAMMNEKNRDYVTSSKVAGAGILRLMFIVILPNCLAPLIVQMTMGISNAILELATLGFLGIGAKPPTPELGTMLSEARGFMQAANWLVTIPGLVILSLVLAFNLMGDGLRDALDPKLKQ >CP020008|1286449:1294958|1290430_1292611_-|AVI99905.1|DBSCAN-SWA MDISELLDGLNDKQREAVAAPLGNHLVLAGAGSGKTRVLTHRIAWLIAVENISEGSIMAVTFTNKAAAEMRHRIQSTLAKHAQHQLVGMWIGTFHSIAHRLLRAHHLDVGLPQDFQILDSEDQLRLIKRLLKLHNFDEKAFPPKQACWYINNKKDEGLRPNDIEDFNDRQEREWIKIYQIYQDTCDRAGLVDFAELLIRVYELFEKKPLILQRYQQRFQHILVDEFQDTNKIQYKWIKILSGKTGKVMIVGDDDQSIYGWRGAQIENIQKFLKDFKAETIRLEQNYRSTANILNSANELIANNSDRLGKNLWTEGEKGDPVGIYAAFNELDEAKFIASQIQDWVEHGGKLDDCAVLYRSNSQSRVIEEALIRCQIPYRIYGGMRFFERQEIKDALAYLRLINNRQDDAAFERVINTPTRGIGDRTLDILRNLTRERQITLWQAVQVATQENMLAGRASTALLRFQELINSLQLDTAEMPLFAQTDFVIKHSGLYEMYQQEKGEKGEVRIENLEELVTATREFIKPDNAEEMTELTAFLTHASLEAGEEQASPHQSCVEMMTLHSAKGLEFPRVFMVGVEEGLFPSFRSFEEPGRLEEERRLAYVGITRAQKKLTISYAESRRLYAKEERHLPSRFIAELPRECIQEIRLRGTVTRAMNLAKVGSLSNTSAVENEWKMGQKVKHEKFGFGTVINVEGSENNTRLQIAFQAQGIKWLIAHLAKLEKVR >CP020008|1286449:1294958|1293220_1293850_-|AVI99906.1|DBSCAN-SWA MEKYHDFEPNFNIVEIFESLQGEGFNTGMPSVFVRFGKCNLDCPWCDTPYNNFKRWSVSQILEKVRSFSSKNIIITGGEPTIVPKIEYLLEQFKSDGYFLAIETNGLKAIPAQIDYIATSPKSLYAHKYEKRCIPFANEVRIVMDSNMPSFCELIEQKIKAKNYYLSPCEIDGKMNLLETITLLGQLNQRSNKPKWQLSLQTHKLIGIE >CP020008|1286449:1294958|1293856_1294249_-|AVI99907.1|DBSCAN-SWA MAHLLDGHDGKCQNLHGHTYKLQVEISGDLYESGAKKAMVIDFSDLKSIVKKVILDPMDHAFIYDQTNERESQIATLLQKLNSKTFGVPFRTTAEEIARFIFNRLKHDEQLSISSIRLWETPASFCEYQE >CP020008|1286449:1294958|1287435_1288428_-|AVI99901.1|DBSCAN-SWA MALLDVKELSVHFGDKKTPFKAVDRISYQVAQGEVLGIVGESGSGKSVSSLAIMGLIDHPGRVSAESLQFENTDLLTLESKAKRQLIGADVAMIFQDPMTSLNPAYTVGFQIMEALKTHEGGTKKARKDRTLELLKLVGIPDPESRIDVYPHQLSGGMSQRVMIAMAIACRPKLLIADEPTTALDVTIQAQIMELLLELQKKECMSLILITHDLALVAEAAERIIVMYAGQIVEEGTAKDIFREPKHPYTQALLRSLPEFAEGKSRLESLQGVVPGKYDRPTGCLLNPRCPYATEYCRQVEPQLHHIGSRKVKCHTPLNEQGNPVEYQGA >CP020008|1286449:1294958|1289339_1290311_-|AVI99903.1|DBSCAN-SWA MVIPTFIAITLITFALVHFIPGDPVEILMGERGLTAEVHQQMMHQLGLDLPLYQQYFHYIGNVIQGDFGASFRTQQPVLTEFFTLFPATAELAFFALFWSLLGGIILGTIAAVKKDSWISHTVTAASLTGYSMPIFWWGLILILYVSPQLGLPQGGRLDNEFWIDTPTGFMLIDSWLSGMPGAFKNAVKSLILPAIVLGTVPLAIITRMTRSAMLEVLGEDYIRTAKAKGLSYTRIVIVHALRNALIPVVTVVGLIVGQLLSGAVLTETIFSWPGIGKWIIDAIQARDYPVLQGSVLIIATIIIVVNLTVDLLYGVVNPRIRH |
9 | Planktothrix_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1479397 : 1522342
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP020008|1479397:1522342|DBSCAN-SWA ATTATTTTACTTGCATGCCCGCAGTGACACCGCTATCAGCAGAAAGTAAGAATAAGTCACTACCGCCTGTTCCTGCGGATAGAATCATTCCCTCAGACACGCCGAATTTCATTTTACGTGGTGCAAGGTTTGCCACCATAATCACAAAACGACCTTCTAATTCTTCAGGTTTATTGTAAGCCGCTTTAATGCCAGAGAAGACTTGACGAGTATGATCACCAAGATCCAATTCAAAACGTAAAAGTTTATTAGATTCTGGCACTGCTTCGCATTTCAGTACTTTTGCTACACGCATATCAAGTTTGGCGAAATCATCAATCGTGATGGTTTCAGCAATAGGTTCAACGGTAGAAAGTGCGGTTGGTTTTGCTTCTGTTTTTTCAGCGGCTTTATTGGCTGCTGCAAATAAGGCTTTGGTTTCTTCCACAACGGCATCAATTTGTTTTTTCTCTAAACGAGAGAATAAGGCTTTAAACGGTGCAAGGGTATGACCAAGCAATGGTTGATGAATATTATCCCAACGTAATTCAGCTTGTAAGAAGGTTTCTGCACGTTCTGCTAGTTTTGGAAGAACGGGTTTTAAGTAAGACATCAATACGCGGAAAAGCTCAATACCCATTGAACATACGGCTTGCAATTCTGCCTCTTTGCCTTCTTCTTTTGCAATTACCCAAGGGGCTTTTTCATCAATATATTTATTGGCTTTATCCGTTAATGCCATAATTTCACGAATGGCTTTATTGTATTCACGGCTTTCGTAATAAGCGGCGATTTGCTCGGCTTGAGCGGTAAATTCTGCAAATAATGCTTCGTCTTCCAGTTTATCCGCAAGTTTGCCTTCAAAGCGTTTCGCAATAAAACCTGCATTGCGTGAAGCTAAATTCACTAATTTGTTTACGATATCTGTATTTACACGTTGTACGAAATCTTCAAGGTTAAAGTCTAAATCTTCAATGCGATCATTTAATTTTGCTGCATAGTAATAACGCAAACATTCAGGATCGATATGATTCAAATAAGTGCTGGCTTGAATGAATGTGCCGCGAGATTTTGACATCTTCGCCCCATCCACCGTGACATAGCCATGAGCGAACACATTAGTCGGTTTACGATAGCCACTGCCTTCAAGCATTGCAGGCCAGAATAGGCTGTGGAAATAAACGATATCTTTACCGATGAAATGATAAAGCTCCGCATCGCTGCCTTCAGCCCAAAATTCGTTGAAATCAATGCCTTCACGCTCACATAGATTTTTGAATGAAGCCATATAGCCGATTGGCGCATCTAACCAAACATAGAAGAATTTATCTTTTGCGCCGGGAATTTCAAAACCGAAATAAGGTGCATCACGTGAAATATCCCATTGTTGTAAACCGCTCTCAAACCATTCTTGCATTTTATTCGCAATTTCAGATTGAAGTGAGCCAGAACGAGTCCATTCTTTTAACATCCCTTCAAATGCAGGCAAGTCAAAGAAAAAGTGTTCAGATTCTTTTACGATAGGTGTTGTGCCAGAAACAGCTGAACGAGGATTAATTAAATCCATTGGGCTATAAGTAGAAGCACACACTTCGCAGTTATCGCCATATTGATCTTCTGCTTTGCATTTCGGGCAAGTGCCTTTCACAAAACGATCAGGCAAGAACATATTTTTTTCAGGGTCGAATAACTGAGAAATAACTTTACTCTTAATAAAGCCATTGGCTTTGAGTTTATTGTAAATTTCTGCAGTGAGCTGTTTGTTTTCTTCGCTGTGAGTGGAATGATAGTTATCAAAACTAATATTGAAACCTGCAAAATCACGAATGTGATCGGCTTTTGCTTTAGCAATTAATTCTTCAGGTGTAATGCCAAGTTTATCAGCATTCAACATAATCGGCGTGCCGTGCGCATCGTCTGCACAGACAAAATGGATTTTATTGCCACGCATACGTTGAAAACGCACCCAAATATCCGCTTGGATATGTTCTAACATATGGCCTAAATGAATTGCCCCATTGGCATAAGGCAAGGCGCAAGTGACTAAAATTTTACGGGGTTGAGTTGTCATTTATTATTCTCTTTTTTAGCATACAAAAATTGTGCTTATCTTACTTTAAATAGGGGATTTTTTCTAGTTTGAAAAACTTTAACTTAACATACCACACTTTCCGTGATTAAATATGCCCGACAAATTTACTCTACTAAACAGGAAGTTATTATGGCAACCTACTTTTCTGATAATTTGACTGCCGACCAGCAAAACCAAGTTCAGCAGATTATTCAACAATTTCAGCATCCAACTCTGCAAAAGGATCTGATTGTGCTTAATACTTTGAAAAAAGTGGAAAAGGGCGGTGATACGTTACGTATTGAATTGAAATTGCCTTTTGCATGGAATTCTGGTGCAGAACAGTTAAAACAAGCGGTTTCAGATGCGTTGTTGAAAGCAACAGATTGTAAATTAATTAAATGGGCGGTGGCTTATCAAATCGCCACACTTAAACGTGCAAATAATCAACCTGCTGTAAAAGGTGTGAAAAATATTATTGCTGTGAGTTCTGGTAAAGGCGGCGTAGGGAAATCATCGGTTTCCGTTAATCTAGCTTTAGCATTACAAGCACAAGGCGCACGTGTTGGGATTTTAGATGCGGATATTTATGGTCCTTCTATTCCACACATGTTAGGTGCAGCGGATCAACGCCCGACTTCGCCAGATAATCAACACATTACCCCAATTAAAGCACATGGTTTATCTGCAAATTCCATTGGCTTTTTAATGAATGAAGATAGCGCAACAATTTGGCGTGGCCCAATGGCGAGTAGTGCATTAAGCCAATTATTAAATGAAACCCTATGGGATAGTTTAGATTATCTTATTATCGATATGCCTCCTGGCACTGGCGATATTCAACTTACCTTATCACAACAAATCCCTGTGACTGGTGCAGTGGTTGTGACAACTCCACAAGATATTGCTCTGCTTGATGCAGTGAAAGGTATCTCAATGTTTGAGCGAGTATCCGTACCAGTGTTAGGCGTTGTGGAAAATATGTCGATGCATATTTGTAGTAAGTGCGGTCATCACGAAGCAATTTTTGGCACAGGCGGAGCAGAGAAAATGGCGGAAAAATACAATGTGAAAGTATTAGCTCAACTTCCTCTGCATATTCGTATCCGTGAAGATTTAGATGCAGGCAACCCGACCGTTGTGCGAGTGCCTGAAAATGAAATTTCACAAGCGTTCTTACAACTTGCAGAAAAAGTCTCTACAGAACTTTACTGGCAAGGTTCCGTAATCCCAAGCGAGATTTTATTTAAAGAAGTGAAATAATCAAAAAAGATAGGGCTGCATTTGCAGCCCTTTTTTAATGGGATTTTTACCCCACCCATCTCACCACTTCATCCAACGTTTTACGGGATTTTTTCGCAATATCGCGTGAGCGATAGCCAAAGGTTGCGGCGACAGAAACCGCATATTCTTGAGGATCGAATAATCCTTCTTCGGCGAGGCATTCATTCATTTTGTCGTAATGAAAACCTTCAATTGGGCAAGAGTCGATGCCAAGGGCTGAAGCTCCAGTAAGCATATTTGCAAGGGCGATATAAGTTTGTTTACTGCACCAATCAAATAAAGTGCGGTCGCTTTCCAGTAATTTCATATCTTCTTCTTGCAGGGTTTTGTATTTTGCGAGGGCGGCTTGTTGTTGCTCTGCGTTCAAGCCTTTGCGCGCCATTACATCCACAAAAAACGGACTATCATAACGGGCATTTTTTTTCGCAAGAATTACCACAAGATGACTGCAATTATCAAGCTGATTTATCATTCCCCAGCTAAAAGGTTTCATTTTTTCGCGTAAGGTTTTATTTTGAATCACTAAAAATTTCCAAGGCTCAGAGCCTACAGAACTCGGCGATAATCGACCGCACTCTAAAATACATTCAAAATCTTCATCACTGATTTTTTTTGTTGGGTCGTAATAACGTGTTGAGCTGCGTTGATGGAAGAGTTCAAGAACTTGTTCACGAGTAAGTTGAGTCATTTTATTTCCTCTTTGTTAAACAAAAATGTGGTGCCATATTAAAGATTAGTTTTTGCTAAAACAAGGGAAAGATTCTAGAATAGTCAGCACTTTTATCACAGAGGGTGAAAATAATGACAAGAATTGCAATTATTCCTGCGAGAGCGGGTTCTAAAGGAATTAAAGATAAAAATTTACAGCTTGTGGGGGGCGTTTCTTTGGTGGGGCGAGCGATTTTGGCAGCGCAAGAATCGGGTATGTTTGATCAAATTGTGGTGACATCAGATGGCGAAAATATTTTAAAAGAGGCCACAAAATACGGCGCAAAACCAGTGGCACGCCCTGAAAGTTTGGCGCAAAGTGATACACGCACCATTGATGCGATTTTGCATTGCTTAGAAACACTTAATATTTCACAAGGCACCGCTGTACTTTTGCAACCAACCAGCCCATTGCGTAATGCTTTAGATATTCGTAATGCAATGGAAATTTTCCTTGGCGGCAAATATAAATCAGTGGTTTCAGCTTGCGAATGTGAGCATCATCCTTATAAATCCTTCACTTTAGAAGGTACCGAAGTTCAGCCTATTCATGAATTAACGGATTTTGAAGCCCCTCGCCAAAAATTACCCAAATCTTATCGTGCAAATGGCGCAATTTATATTAATGACATCGAAAGTCTCTTTGAAGAAAAACGCTTTTTTATTGCGCCAATGCGTTTTTATTTAATGCCAACTTATCGTTCCATTGATATTGACTCCACACTTGATTTGCAATTAGCCGAAAGTTTAATTTCAAAAGAATTCTAAAAAAATTGGCCGCACTTTTGATCTGCACTCCAAAAGTTGGATTAAATAACCAACTAAGGTGCAGATTTTTTATGACCAAATACAATTTTTTTTCAAGCAACAAGTCATCGAGTTTTATCTTCAAAATAGTAAAAATTGTTGATTTCCCTGCAGGCATTTTCAACTTACCAGCAGAACATTGTGACATTGG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63 | Mannheimia_phage(54.84%) | head,portal,tail,terminase,tRNA,plate,capsid,integrase | attL 1502227:1502242|attR 1525875:1525890 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1607452 : 1619515
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP020008|1607452:1619515|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP020008|1607452:1619515|1614796_1616227_+|AVJ00209.1|DBSCAN-SWA MITQDFTKPIDSATVLQKIVLDKAQWVKAKEKEFPLSQFKQNIQKSDRSFYAALAKGTHQKPAYILECKKASPSKGLIRAEFNLEEIANVYKHYASAISVLTDEKYFQGNFEFLPLVRDIVSQPVLCKDFMISEYQVYLARYYQADAILLMLSVVNDETYRVLADLAHSLGMGVLTETSNEQEFERALALGAKIIGVNNRNLHDLTVDLNRVVELTEKLSDRIPADVRIISESGIYNHKQIRQLQKVAHGFLIGSSLMGNQDLNNAVRSVIFGENKVCGLTRAQDVKIVYKNGALYGGLIFAEHSKRCVSLRQAQELVTAAPLRFVGVFQNQEIDFIVKIANQLQLYAVQLHGAETETFITALRQQLPENTQIWKAISVNTETQSAVDFTDDLNVDRYIFDSQTANQQGGTGKTFDWSLIPEHLKHKIILAGGISPNNVKQAIQQNCLGLDLNSGVESSVGVKDQEKVRLVFNNIY >CP020008|1607452:1619515|1616668_1619515_-|AVJ00211.1|tRNA|DBSCAN-SWA MADRFNPSAVEQALYQHWEESGYFKPSGNENAPSYCIAIPPPNVTGSLHMGHAFQQTLMDTLIRFNRMEGHNTLWQAGTDHAGIATQMVVERKIGAEEGKTRHDYGREAFINKIWDWKAYSGGTISQQMRRLGNSIDWERERFTMDDGLSNAVKEVFVRLHEEGLIYRGKRLVNWDPKLHTAISDLEVENKESKGSLWHFRYPLANGAKTADGKDYLVVATTRPETMLGDTAVAVHPEDERYKDLQGKTVILPLANREIPIIADEYVDREFGTGVVKITPAHDFNDYEVGKHHSLPMVNVLTLNADIRDEAEIIGTDGKPLAGYEATIPTDYRGLERFAARKKIVADFEALGLLDEIKPHDLKVPYGDRGGVPIEPMLTDQWYVSVKPLADVAIKAVEDGEIQFVPKQYENLYFSWMRDIQDWCISRQLWWGHRIPAWYDAEGNVYVARNEEEVRSKYNLDSAVELKQDEDVLDTWFSSGLWTFSTLGWPEQTKELKMFHPTDVLITGFDIIFFWVARMIMFTMHFVKDENGKPQVPFKTVYVTGLIRDEQGQKMSKSKGNVLDPIDMIDGISLEDLLEKRTGNMMQPQLAEKIAKATRKEFADGITAHGTDALRFTLAALASNGRDINWDMKRLEGYRNFCNKLWNASRFVLTNDKLDLSEGEIEFSLADRWIQSEFNRTVETFRNSLSQYRFDLCANAIYEFTWNQFCDWYLELTKPVFANGNAAQIRAASQTLVHVLEKLLRLAHPLIPFITEEIWQKVKGFVDITADSIMLQPFPQVEENGFDPEAEAEIEWLKEVIVAVRNIRAESNIAPSKGLDLLFRNLSAENAKILEKQTALLKAMAKLDNVQVLAANETAPLAVAKLVGNAELLVPMAGFINKEAELARLTKEIEKYQNEVKRIENKLSNEAFVAKAPEAVIAKEREKQAEYQSGLEKIQEQYKAIEAL >CP020008|1607452:1619515|1607452_1608472_-|AVJ00201.1|DBSCAN-SWA MFMHKMKKNLIIVLTLGTLPFAQANSITGAGASFPYPIYAKWASLYEKETGNKVNYQSIGSGGGQQQIIAKTVDFGASDDPMKSELLQQHQLVQFPAVIGGIVPVVNLPEIKPGKLKLSGKLLAEIFLGKIKKWNDPDLVALNPTLPLPNKNIIVIHRSDGSGTTFGFTNYLSKISNDWKNQVGEGKSVKWLTGQGGKGNEGVASYVRQMKYSIGYVEYAYAKQNQLAWISLQNQAGQFVQPSNESFMAAASHAKWHEKAGMGVILTNETGEKSWPITAASFILLNKYSDNPETTKNVLAFFDWAFSRGQDAATELDYVPIPADVVSTIKSQWKTELKQ >CP020008|1607452:1619515|1610261_1611026_+|AVJ00204.1|DBSCAN-SWA MAIKSVQNKTYPCKHYVFVDGNIFWDKAKSILEQFPDVIPIYLPMNTGKNGILNGAINAVAAFLVEEDIICYLDDDNQLREDHVESLVNVIEQGADFAYSLRSFYDSNHQFICNDDFDSLGNWNTKSDIFVDVKIEDIQKQIHFTFNEVNGHIDTNCYAVSREIAQKTSYSWNTPLIGDRSFLSALKSLGLIGQTSGKYTVKYRADFNKLIAVRRVFPQLSLSDEDNNNISAQILEVINQQNIEYYGGRPWAKE >CP020008|1607452:1619515|1611127_1612684_+|AVJ00205.1|DBSCAN-SWA MNIQTQAFIAVTAQSIPYYADTTAIFNTLCQSNSNSLLLDSAEIGSKNSLQSLILVNVAVKITCLGHNVTFKALNKNGKQVLKEIHPKLTALGKISAVNFEEEFSVQFSPLDNQLDEDSKLQSATIFDGLRVISTLYQHSQTPIFLGGLFAYDLVANFIPMDGITLKNDGINCPDYSFYLAEHLITIDHQNQQATLKSFCFAQEEQVNIAKTSLSIAQKLKNIDYVLSIKSASDEVKTNFDDPEFTGIVKALKHHINIGDVFQIVPSRRFSLACPNTLASYAQLKQNNPSPYMFYMNDEDFILFGASPESALKYAPENRQLEIYPIAGSRPRGFNAHGNIDPELDVRLELELRLDHKEQAEHLMLVDLARNDIARVCQSGTRKVAELMQVDRYSHIMHLVSRVVGKLRPELDALHAYQACMNMGTLTGAPKIKAMQLIYQFEQQKRHSYGGAVGYLTSDGHFDTCIMIRSAFVQNGIAHVQAGCGEVLDSDPQMEADETRHKAAAVLKAIRQVNTQAK >CP020008|1607452:1619515|1616358_1616634_+|AVJ00210.1|DBSCAN-SWA MCLGVPGQIIKIDANYLQLATVDVCSVQREVNISLVCTGNPADLLGKWVLVHVGFAMSVIDEDEAKKTQEALLAMSQLEHEVGDFLGLNQK >CP020008|1607452:1619515|1613325_1613712_+|AVJ00207.1|DBSCAN-SWA MITVFGLKSKLAPRREQLAEVIYNSLHLGLDIPKGKHAIRFLCLEKDDFYYPFDRSDDYTVIEINLMAGRMEGTKKRLIKMLFSELEYKLGIRAHDVEITIKEQPAHCWGFRGMTGDEARDLDYDIYV >CP020008|1607452:1619515|1608974_1609463_+|AVJ00202.1|DBSCAN-SWA MLNQIIINKLNDQINLEFYSSNVYLQMSAWCSKHGYEGAATFLLRHADEELEHMQKLFNYVSETSGMPILGKIDAPKHDYSSLREVFEITLEHEKLVTSKINELVEVTFESKDYSTFNFLQWYVAEQHEEEKLFSGIIDRFNLVGEDGKGLFFIDRELATLE >CP020008|1607452:1619515|1609478_1609976_+|AVJ00203.1|DBSCAN-SWA MLSENVVKLLNDQMNLEFYSSNLYLQMSAWCDQQGFEGTAKFLSVHAAEEMQHMRKLFTYLNETGSLAVISAIEAPAHEYKSLKEVIEATYEHEKLITSKINELVGKTFEEKDYSAFNFLQWYVEEQHEEEKLFSSIVDKLNFLGEDGKGLFLIDKDLGNLSTKA >CP020008|1607452:1619515|1613764_1614766_+|AVJ00208.1|DBSCAN-SWA MQHEQLLEQFYNGQTLNKAESAVIFNAIMQGELNNEQIAAMLIALKVRGVSIDELSGAVSASLQNAKAFPYPDYPFADIVGTGGDGQNTINISTASAIVAASMGAKVAKHGNRSVSSKSGASDVLTALGVNVNVTPEQARQALDEIGVCFLFAQQYHSGFRHVAPVRASLKTCTIFNILGPLINPARPTYHLLGVYVPELVKTYAETAVALEHQHSFVVHGSGLDEVALHGETQVAEIKNGKIEYFTLTPEDFGLKTQSLESLRGGEPQENAQILTALLQGKGKAEHANAVAANTALLLKLFGYNDLKQNVQNVLAHLTSGKAFETLQNLTKY >CP020008|1607452:1619515|1612695_1613277_+|AVJ00206.1|DBSCAN-SWA MANILFLDNFDSFTYNLVDQFRVLGHNVTIYRNDCDLEKLVETALNTADTILALSPGPGTPSEAGILLSLIERLKNQVPIIGICLGHQALIQAFGGKVVHAGEVLHGKVSRITHDNEAMFKDLANPMPVARYHSLMGQDLPQEFIVNAEYNGIIMAIRHRDLPICAFQFHPESILTVQGSQLLQQSIEWLLNR |
11 | Acinetobacter_phage(42.86%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_7 |
1627813 : 1658945
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP020008|1627813:1658945|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP020008|1627813:1658945|1649090_1650002_+|AVJ00260.1|DBSCAN-SWA MTNQVQHQQNKQPPALKTFFESANVQNKIKELVGKNAATFATSVMQIANSNAMLKTADPMSIFNAACMAATLNLPLQNGLGFAYIVPFRNNKEKKTEAQFQIGYKGFIQLAQRSGQFKRLVALPVYKKQLIKKDFINGFEFDWEQEPEQNENPIGYYAYFKLVNDFSAELYMSHDDIVKHAQRYSQTFKKGYGVWHDNFEAMALKTVTKLLLSKQAPLSVEMQQAVLADQAVVKDVENQEFNYTDNIQEAEFLAVVDEATFEQCKQSIANGETTLQELCDSGAYEFSQEQLTKLEELENQKAE >CP020008|1627813:1658945|1632831_1633179_+|AVJ00232.1|DBSCAN-SWA MNALTNIQYINNEQGVPAFAVMPIATLNWLKQKANFSDPIETGIPESVAKLALLNNYSALRAWREHLGLTQAEVASRLGISQAAYSQHENSQTLRKSTRIKIATALGINPAQLDF >CP020008|1627813:1658945|1637783_1638371_-|AVJ00242.1|DBSCAN-SWA MAKEYKCKMCGNYFIKTVSSLQKVCSPECAIKLSREQTRKAREKKDKQARIENRKKMTALKEKNKTKHELTKEAQATVNKYIRLRDMGKECISCGTPLVAEQLGGGFDAGHYRSRGAAPHLRFYTLNIHGQCKKCNRYYGGNVHQYRLGLLDRLGSEKVEQIEADNHPRHYSPDDLRRIKQIFNKKCRLIEKRKG >CP020008|1627813:1658945|1646393_1647224_+|AVJ00256.1|DBSCAN-SWA 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>CP020008|1627813:1658945|1651168_1651813_+|AVJ00262.1|DBSCAN-SWA MYQLKARCSGLADLMAKPKSGNGISATAKSAVRKIVKFDLFGYQDFEGNKYTEKGIALEEQAIKLSGRKRGLPLKKNTERRENDWITGECDIYVPSRKLIIDTKCSWDIGSHPFFADEAEEKAKKAGYDAQMQGYMWLWDCDEAHIDFILLPTPYDQLSSYDDPSRYIDLVEQIPQEKRITTVTIKRDEKIIKKIKERVEIAQEYYQQLIQEMH >CP020008|1627813:1658945|1650346_1650958_+|AVJ00261.1|DBSCAN-SWA MTTLTFQNTTLSVINQNNQTFLTAIELGKALQYAHSDNVLRIYDRNADEFTAEMTALVEMQTAGGIQKVRIFSLRGAHLIAMFARTKVAKDFRKWVLDILDCEVSQNTNQIQPLADEPLNLLVQAYHFLYQASDLRTKVQPTFIGIDIDRHFGRHYLHNLGKPLSQCMENIQAYIHASAERLMFVQGMASLLETPTAKKAVFK >CP020008|1627813:1658945|1653726_1654623_+|AVJ00265.1|DBSCAN-SWA MYWFRNAIIYQLTKQIDFENIEKQLKECEFTPCGSADVSHFGWSAPLVTSENLAHQANGKILLVAKREEKILPVEVVNRELNKRITALEEKEQRKLKKVERSSLKDDVIATLLPQAFSRIKTTALYIDTLKQLIFVDTASSKTAEDVLALLRKSLGSLPVVPLAFNCAPCEVMTRWVTDTAPDWLILRKEVEIREKEDLGVIHCKQKDIEDEEIIDLVQNGLISKLALEWENNLKFILVEDGTLKRLKFDDNITEQNDDIVKEDVTARFDVDFVLMASVLGKTVDSLIKEFGGIRDRL >CP020008|1627813:1658945|1658546_1658945_-|AVJ00274.1|integrase|DBSCAN-SWA 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>CP020008|1627813:1658945|1652309_1653602_+|AVJ00264.1|DBSCAN-SWA MTEENKEIIAYKGFNQDWTCRGYQYEIGKTYEHKGDVKACESGFHACEYPLDVLNYYSPAVSKFAVVKMSGETSKDSDDTKIASAKITIETEINLPEMVKKAVEWIKGKVDWDAAKVFNTGDQSVATNTGYRSVATNTGDQSAATNTGYWSAATNTGDRSAATNTGYWSAATNTGYRSAATNTGYWSAATNTGYQSAATNTGYRSVATNTGDQSAATNTGDQSVATNTGYQSAATNTGDQSAATNTGYWSAATNTGYRSVATNTGYRSVATNTGDQSAATNTGYWSAATNTGDRSAATNTGYWSAATNTGYRSVATNTGYWSAATNTGYQSAATNTGYRSVATNTGDQSAATNAGDQSVAEVSGKQSIAVALGWQSKAKASINGAIVCVYRNHDGELIHIKASKVGENNIKADTWYTLDEIGEFVEVKDD >CP020008|1627813:1658945|1641085_1641346_+|AVJ00249.1|DBSCAN-SWA MVLLHKWGVRKYQQTLDNYAYIPSMMCIAVLTTLGSFSKEELIEFGFKFLLTESSWSYFVLKLSFFFWSLTLLPVVLDKFFNKNQK >CP020008|1627813:1658945|1633681_1634224_-|AVJ00235.1|DBSCAN-SWA MILTKTRKALGVCSVITVMGLMYAQFGSELRLSPVGAEIIGNAEGCRRDPYQCPADVLTVGIGSTEYGGKKINPKHRYTDLEIAERWKNDIVIAERCVNKYGNGEMLPQSVFDSAVSITFNVGCGAVSKSTMFKYLRAKQYEKACGEFPRWVYASGKKLAGLVVRREKEKALCLADLKLP >CP020008|1627813:1658945|1628130_1629312_-|AVJ00226.1|head|DBSCAN-SWA MTDDVERAMQQPQGSFFMDDAKGFQAISAKALMKVLEKYEKSDRTSQAENIANGFVGRGDAQNHAEVSTNLKNQTGIDLSAYLRNSPNIAERVNALTAGNIQLIKSIRSQYLDKVQNTVMQAMVRGSLNKDLAAQVKDLGKTTEKRAMFIARDQSSKLNAALTQARHEEVGIKKYMWSTSGDERVRESHAEKDGQIFEYANPPADTGHPGHDVNCRCVQIPVLDDVVNLKSEETELSYQAAEPNKTGKMDLDELFESSIGGGGNKSFSNFGGVNSELITLAKESIGLDITDWQHSIDESSIRHILKQHGNEKAENKRGQRAVTKKDILLLPLVVSAFDSIEYTGTSDSGNETFLIKKEIDDEIFSVQEVRKRHKKIAVKTMWIKRKKKATSSA >CP020008|1627813:1658945|1638463_1638880_-|AVJ00243.1|DBSCAN-SWA MSQYKPFFLRDQRIKNNCLDLIKELPTDDKKPLVVKIQPITRSLEQNSKLHALLSDISKQCEFNGKKRDIDTWKMIMVSAHKIATGGQAEMVIGLEGEVINLRESTAQMSVKRLASLIEYITSWGVQNGVRFNDRWGL >CP020008|1627813:1658945|1630676_1630844_-|AVJ00228.1|DBSCAN-SWA MKAELSRPRVDYDNNGRVKVESKKDMKKRGIPSPNMADALVMCYATTKPKSLLDL >CP020008|1627813:1658945|1647728_1648349_+|AVJ00257.1|DBSCAN-SWA MSNLAILDTSIRQLDNLFSLTDLHKASGGGEKHKPVLFLRLDQTKDLISEIENDKVQICTLPVKTVRGGKNPSTYACEELVLAYAMWISPKFHLIVLRAFLAMHKSESQNANPIQPLADEPLNLLVQAYHFLYQASDLRTKVQPTFIGIDIDRHFGRHYLHNLGKPLSQCMENIQAYIHASAERLMFVQGMASLLETPTAKKAVFK >CP020008|1627813:1658945|1637416_1637782_-|AVJ00241.1|DBSCAN-SWA MQTKHILDIKLTARRYGKWAREGVGINYPAIQPFLRKSTPDHGIPMLDDETAMRIHDATLIMRNVTPELYQVFMLRYVSNLSQGNVGREMGVSVPTIKSYLYAAHQSLKLLLTQNKCIFLA >CP020008|1627813:1658945|1657957_1658230_+|AVJ00272.1|DBSCAN-SWA MSENNGWINCANELPEPFSTDLEYRNATNKHLIYFTEDGDHWAVGLGWYLYDDKSDCEGCLIPYWESDENPGEEVEVIYWQPLPQPPEDE >CP020008|1627813:1658945|1657163_1657652_+|AVJ00270.1|DBSCAN-SWA MKVLDEHILEYIWDETLDRIAQGTLVTYIGGSVGTYSDDYAEKRAEDFAILSVRHLIAGSGLSESQFRRRVKKLMAQGVLLQRVGPNSFVINSEVVKNVAVQAARCWRSIGVPYGMDDTGRACKTLPINALPRSIFELKTNCYRILRSEYPSYKGKGVGNEQ >CP020008|1627813:1658945|1629340_1630675_-|AVJ00227.1|DBSCAN-SWA MNILDGIKSLALKLGSKQDQTYYARGLSLTDDLMQIEALWRDNWIANKVCIKRSEDMVRNWRDIFSNDLKSEQLDEFTKLERRLKLRETLTKALQWSSLYGAVGLLLVTDTINITSPLQPTERLKRLIILPKWKISPTGQRDDDVFSPNFGRYSEYTIIGGTQSVLVHHSRLLIINANDAPLSDNDVWGVSDFEKIIDVLKRFDSASANVGDLIFESKIDIFKIAGLSDKISAGLENDVAHVISAVQSIKSATNSLLLDAENEYDRKELSFGGLKDLLTEFRNAMAGAADMPVTILFGQSVSGLASGDEDIQNYHESIHRLQETRLRPVLEVLDTLLCNELFGGQPDDWWFEFLPLTVVKQEQQVNMLNTFATAANTLIQNGVVNEYQVANELRESGLFANISAEDIEEMKNVNEFAGNFEEPENTEDAQVQASEDEQENGALV >CP020008|1627813:1658945|1648438_1648789_+|AVJ00258.1|DBSCAN-SWA MKHSKTPLRQEKQSFTHFMKGREKWLTRISYFLAALIIALIVGGISLDANANANPTDWHDNELSQQIQQEARCELKGGIYENGVCLPPNLTLATEKELQDYTAQKQAEINRTWSKQ >CP020008|1627813:1658945|1632006_1632519_-|AVJ00230.1|terminase|DBSCAN-SWA MSDVKGKSTSGRGLTPKQEKFCQLYIELGNASEAYRQSYDCQDMKSESINRLAKKELDKIKIRSRVDVLQQEHRQRHNLTLDNIIADLQEYRDICMGRKPLTITTVVKNAQEGTAQSVNTECFVFEPTGANKALELLGKHLGMFTNKVDVTTDGKPLPTVINVTFSDEPA >CP020008|1627813:1658945|1656667_1657084_+|AVJ00269.1|DBSCAN-SWA 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MSQLNIQFPTKFRPLFESIWPFIIFYGGRGSGKSFSIARALVLRAYQSPVRVLCCREIQKSISDSVIQMLADQIEMLGLQNFFDVQKTQIIGQNGSRFTFAGLKTNITSIKSMTGIDVVWVEEGENVSKESWDILIPTIREDGSQIIVSFNPKNILDDTYQRFVIHPPERCKSVLVNWQDNPYFPKELMEDMEQMRERDYELYRHVYEGEPVADSDLAIIKPVWIECAVDAHLKLGFTAKGMKKVGFDVADEGADSNDNAFVHGSVVLDIEVWKNGDVIDSANRTNQSAVKFKADLIIFDSIGVGAGVKAHFKRLPKSLQVEGFNAGGAVAYPEREYIKGKKNQDMFSNIKAQSWWALRDRFYKTY >CP020008|1627813:1658945|1636858_1637344_-|AVJ00240.1|DBSCAN-SWA MITYAQLCEQNIRYQAMLHDNAQALRSVINRFTLALESDLGLTDKTYSKELAKDQLAPYVDVLDSENHKPCPWYQLKVEFDQNMPEIAFELALTLEKAPNVYPKNTLISPMRATYLNDNSIQLEFTAHRDKPQFIISINEKDAFSHVINTYKQLILEMLKC >CP020008|1627813:1658945|1641720_1642626_+|AVJ00251.1|DBSCAN-SWA MKTMKEIRHDNLLLLIDEAGSTSELASKTGIAVSYLLQIKNKNAIQNGKPKGIGDKIAAKLEDGMGKPRGWLDQQHQAIEEKQPVHLLDNVKFLMRKKGISLPLLAERTEIEKSRLLELLNSDNVENEKLFLSTLEQLFLVSADCLLYDDLSQNPKGVNFLKMRSIPVNHVPIRGYAQLGTEGHWIDLEYPVGEGEGYIWWPSRDEDVYALKCQGDSMTPRIKHSEYVIIEPNHEIKNGDEVLVVTDEDQVMVKIYAYEQGGRLTLYSVNENHEPINLYQENIRKMQYIAGIAKESLVLDL >CP020008|1627813:1658945|1640088_1640448_-|AVJ00247.1|DBSCAN-SWA MAELSGAELKCYLAILRKTKGWNKDFDAVSVTQLMSVTGLSNRAVIDACNHLVELNLLYQKTGSRGVKIFSVNLCNNFTSEKSSPVTSEKSSHTKNNIKNTTQNTNKKTTQKKFARFAC >CP020008|1627813:1658945|1657689_1657965_+|AVJ00271.1|DBSCAN-SWA MDDYQRDQLKISKNTQVLGGNIVLLDWEGGVFDEVDGYRKLFEVVDSNLMGIAFDNMKDETFIGELQLAIKRVVTPIIKAKRKAILEGKNE >CP020008|1627813:1658945|1658271_1658475_+|AVJ00273.1|DBSCAN-SWA MEPIKLSQKAEEEIVNAARMAALSNLTEKSQNLITLEDIAIYFGRHYQTVAKIISKLPNFPNPVTVD >CP020008|1627813:1658945|1633373_1633709_-|AVJ00234.1|DBSCAN-SWA MFSRFETAIKLTALCLILGLCGWTWFQSQKISSLKAENQAQAQTIQQQEDANKSLSLALQQERDAVIAQQERNDEIERIATENAESVNTIIKTQPCANTRLPQSVLDRLYK >CP020008|1627813:1658945|1638916_1639141_-|AVJ00244.1|DBSCAN-SWA MTSYKCPKCGAELEDFYTPDYFISSSEWDDDRFRCNGHLIEPIPFPQVSKYSAVNRTKSCGYFGLEDLGVEYKE >CP020008|1627813:1658945|1641358_1641472_-|AVJ00250.1|DBSCAN-SWA MPTNRCPDIERITEGKVTCEELRPDVNWGVLRNSKGQ |
50 | Haemophilus_phage(17.65%) | head,terminase,integrase | attL 1649852:1649868|attR 1665638:1665654 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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