CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
CP018629	Staphylococcus aureus strain MRSA107 chromosome, complete genome	8 crisprs	DEDDh,csa3,cas3,DinG,WYL	8	2	16	1

1. CP018629

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: CP018629_1

• CRISPR_ID: CP018629_1
• CRISPR_location: 1310368-1310453
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of CP018629_1

Consensus_repeat	Method
CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT	CRISPRCasFinder

spacers of CP018629_1

>1.1|1310398|26|CP018629|CRISPRCasFinder
CCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP018629_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of CP018629_1

>merge|CP018629|1|1310368-1310453|CRISPRCasFinder
CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT

>CP018629|1|1|1310368-1310453|CRISPRCasFinder
CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT	CCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCG
CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
CP018629.1|AUS74969.1|1303165_1303393_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS74971.1|1306383_1307385_-|ornithine-carbamoyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|235269
CP018629.1|AUS74972.1|1307822_1308548_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|171855
CP018629.1|AUS74982.1|1317581_1318088_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS74974.1|1309475_1310192_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|171995
CP018629.1|AUS74981.1|1316825_1317323_-|fibrinogen-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|289007
CP018629.1|AUS74973.1|1308642_1309368_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|106307
CP018629.1|AUS74975.1|1310873_1311020_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS74970.1|1305428_1306361_-|carbamate-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237071
CP018629.1|AUS74979.1|1315315_1315501_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS74967.1|1301476_1301665_-|DNA-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
CP018629.1|AUS76777.1|1303700_1305191_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224207
CP018629.1|AUS74978.1|1314460_1314694_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS74968.1|1301913_1302861_+|permease	unknown	unknown	gnl|CDD|187765
CP018629.1|AUS74983.1|1318759_1319161_+|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|171849
CP018629.1|AUS74980.1|1316321_1316672_-|fibrinogen-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|371594
CP018629.1|AUS76779.1|1314887_1315106_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS74966.1|1300430_1300565_-|phenol-soluble-modulin	unknown	unknown	gnl|CDD|368464
CP018629.1|AUS74976.1|1311587_1312760_-|IS256-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|307151
CP018629.1|AUS74977.1|1313024_1313984_+|alpha-hemolysin	unknown	unknown	gnl|CDD|273388

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
CP018629.1|AUS74971.1|1306383_1307385_-|ornithine-carbamoyltransferase	gnl|CDD|235269	PRK04284, PRK04284, ornithine carbamoyltransferase; Provisional.	0
CP018629.1|AUS74972.1|1307822_1308548_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|171855	PRK13043, PRK13043, superantigen-like protein; Reviewed.	8.18566e-161
CP018629.1|AUS74974.1|1309475_1310192_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|171995	PRK13350, PRK13350, superantigen-like protein; Reviewed.	1.29441e-152
CP018629.1|AUS74981.1|1316825_1317323_-|fibrinogen-binding-protein	gnl|CDD|289007	pfam12199, efb-c, Extracellular fibrinogen binding protein C terminal. This domain family is found in bacteria, and is approximately 70 amino acids in length. There is a conserved VLK sequence motif. It is the C terminal domain of bacterial extracellular fibrinogen binding protein. It contains a helical motif involved in complement regulation. This motif binds to complement and changes its conformation to a form which cannot activate downstream components of the complement cascade.	5.40265e-27
CP018629.1|AUS74973.1|1308642_1309368_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|106307	PRK13349, PRK13349, superantigen-like protein; Reviewed.	7.3468e-148
CP018629.1|AUS74977.1|1313024_1313984_+|alpha-hemolysin	gnl|CDD|273388	TIGR01002, synergohymenotropic_toxin, beta-channel forming cytolysin. This family of cytolytic pore-forming proteins includes alpha toxin and leukocidin F and S subunits from Staphylococcus aureus, hemolysin II of Bacillus cereus, and related toxins. [Cellular processes, Toxin production and resistance].	1.62736e-140
CP018629.1|AUS74970.1|1305428_1306361_-|carbamate-kinase	gnl|CDD|237071	PRK12353, PRK12353, putative amino acid kinase; Reviewed.	0
CP018629.1|AUS74976.1|1311587_1312760_-|IS256-family-transposase	gnl|CDD|307151	pfam00872, Transposase_mut, Transposase, Mutator family.	0
CP018629.1|AUS76777.1|1303700_1305191_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|224207	COG1288, COG1288, Predicted membrane protein [Function unknown].	0
CP018629.1|AUS74968.1|1301913_1302861_+|permease	gnl|CDD|187765	cd09325, TDT_C4-dicarb_trans, C4-dicarboxylate transporters of the Tellurite-resistance/Dicarboxylate Transporter (TDT) family. This subfamily contains bacterial C4-dicarboxylate transporters, which is part of the Tellurite-resistance/Dicarboxylate Transporter (TDT) family. It includes Tellurite resistance protein tehA; the tehA gene encodes an integral membrane protein that has been shown to have efflux activity of quaternary ammonium compounds. TehA protein of Escherichia coli functions as a tellurite-resistance uptake permease.	1.39126e-83
CP018629.1|AUS74983.1|1318759_1319161_+|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein	gnl|CDD|171849	PRK13033, PRK13033, formyl peptide receptor-like 1 inhibitory protein; Reviewed.	3.87075e-77
CP018629.1|AUS74980.1|1316321_1316672_-|fibrinogen-binding-protein	gnl|CDD|371594	pfam11546, CompInhib_SCIN, Staphylococcal complement inhibitor SCIN. SCIN is released by Staphylococcus aureus to counteract the host immune defense. The protein binds to and inhibits C3 convertases on the bacterial surface, reducing phagocytosis and blocking downstream effector functions by C3b deposition on its surface. An 18 residue stretch 31-48 is crucial for SCIN activity.	2.0882e-48
CP018629.1|AUS74966.1|1300430_1300565_-|phenol-soluble-modulin	gnl|CDD|368464	pfam05480, Staph_haemo, Staphylococcus haemolytic protein. This family consists of several different short Staphylococcal proteins, it contains SLUSH A, B and C proteins as well as haemolysin and gonococcal growth inhibitor. Some strains of the coagulase-negative Staphylococcus lugdunensis produce a synergistic hemolytic activity (SLUSH), phenotypically similar to the delta-hemolysin of S. aureus. Gonococcal growth inhibitor from Staphylococcus act on the cytoplasmic membrane of the gonococcal cell causing cytoplasmic leakage and, eventually, death.	6.35158e-13
CP018629.1|AUS74967.1|1301476_1301665_-|DNA-binding-protein	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	0.00787195

Protein sequences

>CP018629.1|AUS74974.1|1309475_1310192_+|hypothetical-protein
MSKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYNENRNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD
>CP018629.1|AUS74973.1|1308642_1309368_+|hypothetical-protein
MNNNITKKIILSTTLLLLGTASTQFPNTPINSSSEAKAHYINQNETNVNELTKYYSQKYLTFSNSTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDQEIIDSFALSQETFTGGVTPAATSNDKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGADNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN
>CP018629.1|AUS74972.1|1307822_1308548_+|hypothetical-protein
MKKNIMNKLVLSTALLLLETTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYTQPHFSLSGKWLWQKPNGSIHATLQTWVWYSHIQVFGSESWGNINQLRNKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYRLFLKYSDKQQTIIGGHEFYKGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITADGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPRNAEIEVILEKSN
>CP018629.1|AUS74971.1|1306383_1307385_-|ornithine-carbamoyltransferase
MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDDIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEIMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVLESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF
>CP018629.1|AUS74970.1|1305428_1306361_-|carbamate-kinase
MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPAFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK
>CP018629.1|AUS76777.1|1303700_1305191_-|hypothetical-protein
MILFILTVVAVIATWVIPAGAYSKLSYEPSSQELKIVNPHNQVKKVPGTQQELDKMGVKIKIEQFKSGAINKPVSIPNTYERLKQHPAGPEQITSSMVEGTIEAVDIMVFILVLGGLIGVVQASGSFESGLLALTKKTKGHEFMLIVFVSILMIIGGTLCGIEEEAVAFYPILVPIFIALGYDSIVSVGAIFLASSVGSTFSTINPFSVVIASNAAGTTFTDGLYWRIGACIVGAIFVISYLYWYCKKIKNDPKASYSYEDKDAFEQQWSVLKDDDSAHFTLRKKIILTLFVLPFPIMVWGVMTQGWWFPVMASAFLIFTIIIMFIAGTGKSGLGEKGTVDAFVNGASSLVGVSLIIGLARGINLVLNEGMISDTILHFSSSLVQHMSGPLFIIVLLFIFFCLGFIVPSSSGLAVLSMPIFAPLADTVGIPRFVIVTTYQFGQYAMLFLAPTGLVMATLQMLNMRYSHWFRFVWPVVAFVLIFGGGVLITQVLIYS
>CP018629.1|AUS74969.1|1303165_1303393_-|hypothetical-protein
MTHLTKVLDTLTGICVVLLFSKYFVAYANMVFDWNLRWYLLENIPHLPIILFILMFIFGVPSEMIKDRQRKNNGV
>CP018629.1|AUS74968.1|1301913_1302861_+|permease
MRLQKAPLVTSGLVLGLLGLGNLLKDLSLTLNAVCGIFAFLIWIHLLCTMIKYFNNVKEQLNSPLVSSVFTTFFMSGFLGTTYLNTFFSNITFINSLITPIWILCLVGIMTHMIIFSIKYLKDFSLKNVYPSWTVLFIGIAIAGLTAPVSGYFFIGQLTVIYGFVATCIVLPIVFKRLKAFPLQTSIKPNTSTICAPFSLVAAAYVIAFPKANAFIVIIFLLLAQIFYFYIIIQLPKLLKEPFSPVFSAFTFPLVISATALKNSLPVLMFPDIWKGLLFIEVLLATVIVLRVFIGYLHFFLKKEKQDKFLRNASQ
>CP018629.1|AUS74967.1|1301476_1301665_-|DNA-binding-protein
MRNQIQKLLDSDLSSLHISKQTGVPQSTIHRMRKNERSLDNMSLKNAELLYKFANSIFSNEN
>CP018629.1|AUS74966.1|1300430_1300565_-|phenol-soluble-modulin
MEGLFNAIKDTVTAAINNDGAKLGTSIVSIVENGVGLLGKLFGF
>CP018629.1|AUS74975.1|1310873_1311020_-|hypothetical-protein
MKLFYIVFLIIIWLNIFLGNEIIHTLTVLITTLYIVNSRKGIKNDRVE
>CP018629.1|AUS74976.1|1311587_1312760_-|IS256-family-transposase
MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK
>CP018629.1|AUS74977.1|1313024_1313984_+|alpha-hemolysin
MKTHIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAADNFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWIDRSSERYKIDWEKEEMTN
>CP018629.1|AUS74978.1|1314460_1314694_+|hypothetical-protein
MVFNDWEINVVYSGEHEVVTNEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIQNPNVDEH
>CP018629.1|AUS76779.1|1314887_1315106_+|hypothetical-protein
MINFGLIIVPLLTTNDADFVWTSSSLIYMILLTSIILIVYIKTKDSLQLTIFILNIALIILYCAPLLFIYVF
>CP018629.1|AUS74979.1|1315315_1315501_+|hypothetical-protein
MNKHINKKAAKLLEDYKKVQQRKSKETDRGCLKSVIMLIVLFFLIIFGIVACSTNVNFFFQ
>CP018629.1|AUS74980.1|1316321_1316672_-|fibrinogen-binding-protein
MKFKKYILTGTLALLLSSTGIATIEGNKADASSLDKYLTESQFHDKRIAEELRTLLNKSNVYALAAGSLNPYYKRTIMMNEYRAKAALKKNDFVSMADAKVALEKIYKEIDEIINR
>CP018629.1|AUS74981.1|1316825_1317323_-|fibrinogen-binding-protein
MKNKLIAKSLLTLAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDATIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVK
>CP018629.1|AUS74982.1|1317581_1318088_-|hypothetical-protein
MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK
>CP018629.1|AUS74983.1|1318759_1319161_+|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein
MKKNITKTIIASTVIAAGLLTQTNDAKAFFSYEWKGLEIAKNLADQAKKDDERIDKLMKESDKNLTPYKAETVNDLYLIVKKLSQGDVKKAVVRIKDGGPRDYYTFDLTRPLEENRKNIKVVKNGEIDSITWY

Crispr_ID: CP018629_2

• CRISPR_ID: CP018629_2
• CRISPR_location: 1315713-1315958
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 4 spacers

Consensus repeat of CP018629_2

Consensus_repeat	Method
TTGGGGCCCCGCCAACTTGCA	CRT

spacers of CP018629_2

>2.1|1315734|35|CP018629|CRT
CATTTTTGTAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTATA
>2.2|1315790|35|CP018629|CRT
TTGTTTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTG
>2.3|1315846|36|CP018629|CRT
CATTTTTGTATGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTGTGT
>2.4|1315903|35|CP018629|CRT
TTGTCTGTTGAAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP018629_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of CP018629_2

>merge|CP018629|2|1315713-1315958|CRT
TTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTTTTGTAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTATATTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGTTTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTTTTGTATGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTGTGTTGGGCCCCACCCCAACTTGCATTGTCTGTTGAAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA

>CP018629|2|1|1315713-1315958|CRT
TTGGGGCCCCGCCAACTTGCA	CATTTTTGTAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTATA
TTGGGGCCCCGCCAACTTGCA	TTGTTTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTG
TTGGGGCCCCGCCAACTTGCA	CATTTTTGTATGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTGTGT
TGGGCCCCACCCCAACTTGCA	TTGTCTGTTGAAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTG
TTGGGGCCCCGCCAACTTGCA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
CP018629.1|AUS74988.1|1320843_1321431_-|non-canonical-purine-NTP-pyrophosphatase	unknown	unknown	gnl|CDD|184835
CP018629.1|AUS74987.1|1320347_1320851_-|YfcE-family-phosphodiesterase	unknown	unknown	gnl|CDD|223695
CP018629.1|AUS74984.1|1319120_1319213_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS74972.1|1307822_1308548_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|171855
CP018629.1|AUS74982.1|1317581_1318088_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS74974.1|1309475_1310192_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|171995
CP018629.1|AUS74981.1|1316825_1317323_-|fibrinogen-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|289007
CP018629.1|AUS76778.1|1310445_1310661_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS74975.1|1310873_1311020_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS74986.1|1320052_1320220_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS74979.1|1315315_1315501_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS76779.1|1314887_1315106_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS74985.1|1319529_1319859_-|fibrinogen-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|289007
CP018629.1|AUS74978.1|1314460_1314694_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS74983.1|1318759_1319161_+|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|171849
CP018629.1|AUS74980.1|1316321_1316672_-|fibrinogen-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|371594
CP018629.1|AUS74973.1|1308642_1309368_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|106307
CP018629.1|AUS74976.1|1311587_1312760_-|IS256-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|307151
CP018629.1|AUS74977.1|1313024_1313984_+|alpha-hemolysin	unknown	unknown	gnl|CDD|273388
CP018629.1|AUS74989.1|1321442_1322243_-|glutamate-racemase	unknown	unknown	gnl|CDD|234851

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
CP018629.1|AUS74988.1|1320843_1321431_-|non-canonical-purine-NTP-pyrophosphatase	gnl|CDD|184835	PRK14822, PRK14822, XTP/dITP diphosphatase.	1.88157e-114
CP018629.1|AUS74972.1|1307822_1308548_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|171855	PRK13043, PRK13043, superantigen-like protein; Reviewed.	8.18566e-161
CP018629.1|AUS74974.1|1309475_1310192_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|171995	PRK13350, PRK13350, superantigen-like protein; Reviewed.	1.29441e-152
CP018629.1|AUS74981.1|1316825_1317323_-|fibrinogen-binding-protein	gnl|CDD|289007	pfam12199, efb-c, Extracellular fibrinogen binding protein C terminal. This domain family is found in bacteria, and is approximately 70 amino acids in length. There is a conserved VLK sequence motif. It is the C terminal domain of bacterial extracellular fibrinogen binding protein. It contains a helical motif involved in complement regulation. This motif binds to complement and changes its conformation to a form which cannot activate downstream components of the complement cascade.	5.40265e-27
CP018629.1|AUS74976.1|1311587_1312760_-|IS256-family-transposase	gnl|CDD|307151	pfam00872, Transposase_mut, Transposase, Mutator family.	0
CP018629.1|AUS74985.1|1319529_1319859_-|fibrinogen-binding-protein	gnl|CDD|289007	pfam12199, efb-c, Extracellular fibrinogen binding protein C terminal. This domain family is found in bacteria, and is approximately 70 amino acids in length. There is a conserved VLK sequence motif. It is the C terminal domain of bacterial extracellular fibrinogen binding protein. It contains a helical motif involved in complement regulation. This motif binds to complement and changes its conformation to a form which cannot activate downstream components of the complement cascade.	4.63429e-22
CP018629.1|AUS74987.1|1320347_1320851_-|YfcE-family-phosphodiesterase	gnl|CDD|223695	COG0622, COG0622, Predicted phosphoesterase [General function prediction only].	9.91823e-44
CP018629.1|AUS74983.1|1318759_1319161_+|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein	gnl|CDD|171849	PRK13033, PRK13033, formyl peptide receptor-like 1 inhibitory protein; Reviewed.	3.87075e-77
CP018629.1|AUS74980.1|1316321_1316672_-|fibrinogen-binding-protein	gnl|CDD|371594	pfam11546, CompInhib_SCIN, Staphylococcal complement inhibitor SCIN. SCIN is released by Staphylococcus aureus to counteract the host immune defense. The protein binds to and inhibits C3 convertases on the bacterial surface, reducing phagocytosis and blocking downstream effector functions by C3b deposition on its surface. An 18 residue stretch 31-48 is crucial for SCIN activity.	2.0882e-48
CP018629.1|AUS74973.1|1308642_1309368_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|106307	PRK13349, PRK13349, superantigen-like protein; Reviewed.	7.3468e-148
CP018629.1|AUS74989.1|1321442_1322243_-|glutamate-racemase	gnl|CDD|234851	PRK00865, PRK00865, glutamate racemase; Provisional.	2.38427e-134
CP018629.1|AUS74977.1|1313024_1313984_+|alpha-hemolysin	gnl|CDD|273388	TIGR01002, synergohymenotropic_toxin, beta-channel forming cytolysin. This family of cytolytic pore-forming proteins includes alpha toxin and leukocidin F and S subunits from Staphylococcus aureus, hemolysin II of Bacillus cereus, and related toxins. [Cellular processes, Toxin production and resistance].	1.62736e-140

Protein sequences

>CP018629.1|AUS74979.1|1315315_1315501_+|hypothetical-protein
MNKHINKKAAKLLEDYKKVQQRKSKETDRGCLKSVIMLIVLFFLIIFGIVACSTNVNFFFQ
>CP018629.1|AUS76779.1|1314887_1315106_+|hypothetical-protein
MINFGLIIVPLLTTNDADFVWTSSSLIYMILLTSIILIVYIKTKDSLQLTIFILNIALIILYCAPLLFIYVF
>CP018629.1|AUS74978.1|1314460_1314694_+|hypothetical-protein
MVFNDWEINVVYSGEHEVVTNEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIQNPNVDEH
>CP018629.1|AUS74977.1|1313024_1313984_+|alpha-hemolysin
MKTHIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAADNFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWIDRSSERYKIDWEKEEMTN
>CP018629.1|AUS74976.1|1311587_1312760_-|IS256-family-transposase
MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK
>CP018629.1|AUS74975.1|1310873_1311020_-|hypothetical-protein
MKLFYIVFLIIIWLNIFLGNEIIHTLTVLITTLYIVNSRKGIKNDRVE
>CP018629.1|AUS76778.1|1310445_1310661_+|hypothetical-protein
MTFRQLLCWGPPQLALSVEFLFEILYVGAPPIIEKCLLHGHFHSVNYYQYNIVEPKTLIYYVLGSIPSFND
>CP018629.1|AUS74974.1|1309475_1310192_+|hypothetical-protein
MSKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYNENRNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD
>CP018629.1|AUS74973.1|1308642_1309368_+|hypothetical-protein
MNNNITKKIILSTTLLLLGTASTQFPNTPINSSSEAKAHYINQNETNVNELTKYYSQKYLTFSNSTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDQEIIDSFALSQETFTGGVTPAATSNDKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGADNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN
>CP018629.1|AUS74972.1|1307822_1308548_+|hypothetical-protein
MKKNIMNKLVLSTALLLLETTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYTQPHFSLSGKWLWQKPNGSIHATLQTWVWYSHIQVFGSESWGNINQLRNKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYRLFLKYSDKQQTIIGGHEFYKGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITADGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPRNAEIEVILEKSN
>CP018629.1|AUS74980.1|1316321_1316672_-|fibrinogen-binding-protein
MKFKKYILTGTLALLLSSTGIATIEGNKADASSLDKYLTESQFHDKRIAEELRTLLNKSNVYALAAGSLNPYYKRTIMMNEYRAKAALKKNDFVSMADAKVALEKIYKEIDEIINR
>CP018629.1|AUS74981.1|1316825_1317323_-|fibrinogen-binding-protein
MKNKLIAKSLLTLAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDATIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVK
>CP018629.1|AUS74982.1|1317581_1318088_-|hypothetical-protein
MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK
>CP018629.1|AUS74983.1|1318759_1319161_+|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein
MKKNITKTIIASTVIAAGLLTQTNDAKAFFSYEWKGLEIAKNLADQAKKDDERIDKLMKESDKNLTPYKAETVNDLYLIVKKLSQGDVKKAVVRIKDGGPRDYYTFDLTRPLEENRKNIKVVKNGEIDSITWY
>CP018629.1|AUS74984.1|1319120_1319213_+|hypothetical-protein
MLKTVKSTRLLGIKKHTELNSCTPNVRKQC
>CP018629.1|AUS74985.1|1319529_1319859_-|fibrinogen-binding-protein
MKKNFIGKSILSIAAISLTVSTFAGESHAQTKNVEAAKKYDQYQTNFKKQVNKKVVDAQKAVNFFKRTRTVATHRKAQRAVNLIHFQHSYEKKKLQRQIDLVLKYNTLK
>CP018629.1|AUS74986.1|1320052_1320220_-|hypothetical-protein
MKRIVILENVIVDNPIWLNHVDYLVKSVLLKSIKLRFQEVKKFEILVKIMNRIHI
>CP018629.1|AUS74987.1|1320347_1320851_-|YfcE-family-phosphodiesterase
MSKWIIVSDNHTESGVLYQIYEMHPDADVYLHLGDSEFAYDDTELSLFNRVKGNCDFYPEFENEAVAKYNDVKAFYTHGHLYQVNRTRDLLAEKGLELGCLFAFYGHTHVAKYEYINGVHVINPGSISQSRSSMEETYAEVIIDDQTLHGTINFKNRHHETISHTTF
>CP018629.1|AUS74988.1|1320843_1321431_-|non-canonical-purine-NTP-pyrophosphatase
MKEIVIASNNQGKINDFKVIFPDYHVIGISELIPDFDVEETGSTFEENAILKSEAAAKALNKTVIADDSGLEVFALNGEPGIYSARYAGENKSDEANIEKLLNKLGNTTDRRAQFVCVISMSGPDMETKVFKGTVSGEIADGKYGENGFGYDPIFYVPKLDKTMAQLSKEQKGQISHRRNAINLLQAFLEGDKNV
>CP018629.1|AUS74989.1|1321442_1322243_-|glutamate-racemase
MNKPIGVIDSGVGGLTVAKEIMRQLPNETIYYLGDIGRCPYGPRPGEQVKQYTVEIARKLMEFDIKMLVIACNTATAVALEYLQKTLSIPVIGVIEPGARTAIMTTRNQNVLVLGTEGTIKSEAYRTHIKRINPHVEVHGVACPGFVPLVEQMRYSDPTITSIVIHQTLKRWRNSESDTVILGCTHYPLLYKPIYDYFGGKKTVISSGLETAREVSALLTFSNEHASYTEHPDHRFFATGDPTHITNIIKEWLNLSVNVERISVND

Crispr_ID: CP018629_3

• CRISPR_ID: CP018629_3
• CRISPR_location: 1594516-1594597
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of CP018629_3

Consensus_repeat	Method
TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGG	CRISPRCasFinder

spacers of CP018629_3

>3.1|1594540|34|CP018629|CRISPRCasFinder
ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP018629_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of CP018629_3

>merge|CP018629|3|1594516-1594597|CRISPRCasFinder
TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG

>CP018629|3|2|1594516-1594597|CRISPRCasFinder
TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGG	ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT
TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
CP018629.1|AUS75263.1|1596295_1596652_-|arsenate-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|239334
CP018629.1|AUS75267.1|1598751_1599174_+|peroxiredoxin	unknown	unknown	gnl|CDD|274649
CP018629.1|AUS75257.1|1592009_1593035_-|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224058
CP018629.1|AUS75262.1|1595757_1596138_-|glycine-cleavage-system-protein-H	unknown	unknown	gnl|CDD|234918
CP018629.1|AUS75261.1|1595580_1595694_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS75256.1|1591321_1592017_-|methionine-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|224922
CP018629.1|AUS75259.1|1593573_1593960_-|topiosmerase	unknown	unknown	gnl|CDD|224572
CP018629.1|AUS75260.1|1594700_1595579_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226395
CP018629.1|AUS76790.1|1587550_1588279_+|exotoxin	unknown	unknown	gnl|CDD|280949
CP018629.1|AUS75268.1|1599572_1600067_+|GNAT-family-N-acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|372596
CP018629.1|AUS75252.1|1586641_1587376_+|DNA-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|238045
CP018629.1|AUS75264.1|1596795_1597116_+|thiol-reductase-thioredoxin	unknown	unknown	gnl|CDD|239245
CP018629.1|AUS75251.1|1586279_1586492_-|transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|379188
CP018629.1|AUS75254.1|1589118_1590339_+|site-specific-integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|271189
CP018629.1|AUS75255.1|1590482_1591304_-|methionine-ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224381
CP018629.1|AUS75258.1|1593284_1593581_-|thiol-reductase-thioredoxin	unknown	unknown	gnl|CDD|239245
CP018629.1|AUS75265.1|1597265_1597805_-|nitroreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|380312
CP018629.1|AUS75269.1|1600221_1600839_+|lysine-transporter-LysE	unknown	unknown	gnl|CDD|224198
CP018629.1|AUS75253.1|1588302_1589031_+|exotoxin	unknown	unknown	gnl|CDD|280949
CP018629.1|AUS75266.1|1597887_1598604_-|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|184156

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
CP018629.1|AUS75263.1|1596295_1596652_-|arsenate-reductase	gnl|CDD|239334	cd03036, ArsC_like, Arsenate Reductase (ArsC) family, unknown subfamily; uncharacterized proteins containing a CXXC motif with similarity to thioredoxin (TRX)-fold arsenic reductases, ArsC. Proteins containing a redox active CXXC motif like TRX and glutaredoxin (GRX) function as protein disulfide oxidoreductases, altering the redox state of target proteins via the reversible oxidation of the active site dithiol. ArsC catalyzes the reduction of arsenate [As(V)] to arsenite [As(III)], using reducing equivalents derived from glutathione via GRX, through a single catalytic cysteine.	1.06191e-56
CP018629.1|AUS75267.1|1598751_1599174_+|peroxiredoxin	gnl|CDD|274649	TIGR03561, organ_hyd_perox, peroxiredoxin, Ohr subfamily. pfam02566, OsmC-like protein, contains several deeply split clades of homologous proteins. The clade modeled here includes the protein Ohr, or organic hydroperoxide resistance protein. [Cellular processes, Detoxification].	5.58225e-61
CP018629.1|AUS75257.1|1592009_1593035_-|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224058	COG1135, AbcC, ABC-type metal ion transport system, ATPase component [Inorganic ion transport and metabolism].	3.37873e-170
CP018629.1|AUS75262.1|1595757_1596138_-|glycine-cleavage-system-protein-H	gnl|CDD|234918	PRK01202, PRK01202, glycine cleavage system protein GcvH.	2.81086e-68
CP018629.1|AUS75256.1|1591321_1592017_-|methionine-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|224922	COG2011, AbcD, ABC-type metal ion transport system, permease component [Inorganic ion transport and metabolism].	9.67625e-100
CP018629.1|AUS75259.1|1593573_1593960_-|topiosmerase	gnl|CDD|224572	COG1658, COG1658, Small primase-like proteins (Toprim domain) [DNA replication, recombination, and repair].	2.45102e-36
CP018629.1|AUS75260.1|1594700_1595579_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|226395	COG3878, COG3878, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	1.16579e-75
CP018629.1|AUS76790.1|1587550_1588279_+|exotoxin	gnl|CDD|280949	pfam02876, Stap_Strp_tox_C, Staphylococcal/Streptococcal toxin, beta-grasp domain.	7.79999e-28
CP018629.1|AUS75268.1|1599572_1600067_+|GNAT-family-N-acetyltransferase	gnl|CDD|372596	pfam13420, Acetyltransf_4, Acetyltransferase (GNAT) domain.	2.53639e-47
CP018629.1|AUS75252.1|1586641_1587376_+|DNA-binding-protein	gnl|CDD|238045	cd00093, HTH_XRE, Helix-turn-helix XRE-family like proteins. Prokaryotic DNA binding proteins belonging to the xenobiotic response element family of transcriptional regulators.	5.1934e-12
CP018629.1|AUS75264.1|1596795_1597116_+|thiol-reductase-thioredoxin	gnl|CDD|239245	cd02947, TRX_family, TRX family; composed of two groups: Group I, which includes proteins that exclusively encode a TRX domain; and Group II, which are composed of fusion proteins of TRX and additional domains. Group I TRX is a small ancient protein that alter the redox state of target proteins via the reversible oxidation of an active site dithiol, present in a CXXC motif, partially exposed at the protein's surface. TRX reduces protein disulfide bonds, resulting in a disulfide bond at its active site. Oxidized TRX is converted to the active form by TRX reductase, using reducing equivalents derived from either NADPH or ferredoxins. By altering their redox state, TRX regulates the functions of at least 30 target proteins, some of which are enzymes and transcription factors. It also plays an important role in the defense against oxidative stress by directly reducing hydrogen peroxide and certain radicals, and by serving as a reductant for peroxiredoxins. At least two major types of functional TRXs have been reported in most organisms; in eukaryotes, they are located in the cytoplasm and the mitochondria. Higher plants contain more types (at least 20 TRX genes have been detected in the genome of Arabidopsis thaliana), two of which (types f amd m) are located in the same compartment, the chloroplast. Also included in the alignment are TRX-like domains which show sequence homology to TRX but do not contain the redox active CXXC motif. Group II proteins, in addition to either a redox active TRX or a TRX-like domain, also contain additional domains, which may or may not possess homology to known proteins.	2.70086e-24
CP018629.1|AUS75251.1|1586279_1586492_-|transcriptional-regulator	gnl|CDD|379188	pfam13443, HTH_26, Cro/C1-type HTH DNA-binding domain. This is a helix-turn-helix domain that probably binds to DNA.	7.52525e-13
CP018629.1|AUS75254.1|1589118_1590339_+|site-specific-integrase	gnl|CDD|271189	cd01189, INT_ICEBs1_C_like, C-terminal catalytic domain of integrases from bacterial phages and conjugate transposons. This family of tyrosine based site-specific integrases is has origins in bacterial phages and conjugate transposons. One member is the integrase from Bacillus subtilis conjugative transposon ICEBs1. ICEBs1 can be excised and transfered to various recipients in response to DNA damage or high concentrations of potential mating partners. The family belongs to the superfamily of DNA breaking-rejoining enzymes, which share the same fold in their catalytic domain and the overall reaction mechanism. The catalytic domain contains six conserved active site residues. Their overall reaction mechanism involves cleavage of a single strand of a DNA duplex by nucleophilic attack of a conserved tyrosine to give a 3' phosphotyrosyl protein-DNA adduct. In the second rejoining step, a terminal 5' hydroxyl attacks the covalent adduct to release the enzyme and generate duplex DNA.	1.81902e-37
CP018629.1|AUS75255.1|1590482_1591304_-|methionine-ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|224381	COG1464, NlpA, ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen [Inorganic ion transport and metabolism].	2.15951e-112
CP018629.1|AUS75258.1|1593284_1593581_-|thiol-reductase-thioredoxin	gnl|CDD|239245	cd02947, TRX_family, TRX family; composed of two groups: Group I, which includes proteins that exclusively encode a TRX domain; and Group II, which are composed of fusion proteins of TRX and additional domains. Group I TRX is a small ancient protein that alter the redox state of target proteins via the reversible oxidation of an active site dithiol, present in a CXXC motif, partially exposed at the protein's surface. TRX reduces protein disulfide bonds, resulting in a disulfide bond at its active site. Oxidized TRX is converted to the active form by TRX reductase, using reducing equivalents derived from either NADPH or ferredoxins. By altering their redox state, TRX regulates the functions of at least 30 target proteins, some of which are enzymes and transcription factors. It also plays an important role in the defense against oxidative stress by directly reducing hydrogen peroxide and certain radicals, and by serving as a reductant for peroxiredoxins. At least two major types of functional TRXs have been reported in most organisms; in eukaryotes, they are located in the cytoplasm and the mitochondria. Higher plants contain more types (at least 20 TRX genes have been detected in the genome of Arabidopsis thaliana), two of which (types f amd m) are located in the same compartment, the chloroplast. Also included in the alignment are TRX-like domains which show sequence homology to TRX but do not contain the redox active CXXC motif. Group II proteins, in addition to either a redox active TRX or a TRX-like domain, also contain additional domains, which may or may not possess homology to known proteins.	7.01368e-14
CP018629.1|AUS75265.1|1597265_1597805_-|nitroreductase	gnl|CDD|380312	cd02135, YdjA-like, nitroreductase family protein similar to Escherichia coli YdjA. A subfamily of the nitroreductase family containing uncharacterized proteins that are similar to nitroreductase YdjA from Escherichia coli. Nitroreductase catalyzes the reduction of nitroaromatic compounds such as nitrotoluenes, nitrofurans and nitroimidazoles. This process requires NAD(P)H as electron donor in an obligatory two-electron transfer and uses FMN as cofactor. The enzyme is typically a homodimer. Members of this family are also called NADH dehydrogenase, oxygen-insensitive NAD(P)H nitrogenase or dihydropteridine reductase.	1.47647e-49
CP018629.1|AUS75269.1|1600221_1600839_+|lysine-transporter-LysE	gnl|CDD|224198	COG1279, COG1279, Lysine efflux permease [General function prediction only].	9.12336e-62
CP018629.1|AUS75253.1|1588302_1589031_+|exotoxin	gnl|CDD|280949	pfam02876, Stap_Strp_tox_C, Staphylococcal/Streptococcal toxin, beta-grasp domain.	3.87599e-25
CP018629.1|AUS75266.1|1597887_1598604_-|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase	gnl|CDD|184156	PRK13575, PRK13575, type I 3-dehydroquinate dehydratase.	1.26721e-148

Protein sequences

>CP018629.1|AUS75259.1|1593573_1593960_-|topiosmerase
MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPLLPNINNERLVLVNE
>CP018629.1|AUS75258.1|1593284_1593581_-|thiol-reductase-thioredoxin
MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK
>CP018629.1|AUS75257.1|1592009_1593035_-|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein
MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEQGPVTQVFENPQHTVTKRFVKDDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG
>CP018629.1|AUS75256.1|1591321_1592017_-|methionine-ABC-transporter-permease
MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR
>CP018629.1|AUS75255.1|1590482_1591304_-|methionine-ABC-transporter-substrate-binding-protein
MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK
>CP018629.1|AUS75254.1|1589118_1590339_+|site-specific-integrase
MWFEKFKNKNKETKYRYYEKYKDPLTNKWRRVSVVLNKNGKQSQKEAQRLLNERIEAKLNDKTPTTLKSLTFHAASDEWFQNYIKTSGSKRTTIKTKLSKLNTLKKFVDEDILINKITLSYAQQVFDEMDSKGYVYQVNKDALSIFKNVFEYTRRIYKLQDLEFLKDITLNKRIKSYDEVKAKRNKYLELNEIQSIIKDINMKAQKMHSGIHKRFYLFVALMTEFQALNGMRIGEMLAIQNEDIDFDNKSLNINGTIHWFHDESGGFGVKDTTKTESSYRTIGLSSRSCEILKKAILENKKDSKWNDGYLNRNFVFTNHKGNPMQTERFNKILREAAKDVGIDKEVSSHILRHSHISLLSQQGVSLKAIMDRVGHSDHRTTLSIYSHVTEQMDKDMMNKLEQVKLG
>CP018629.1|AUS75253.1|1588302_1589031_+|exotoxin
MKKLISILLINIIILGVSNNASAQGDIGIDNLRNFYTKKDFVDLKDVKDNDTPIANQLQFSNESYDLISESKDFNKFSNFKGKKLDVFGISYNGQCNTKYIYGGVTATNEYLDKSRNIPINIWINGNHKTISTNKVSTNKKLVTAQEIDVKLRKYLQEEYNIYGHNGTKKGEEYGHKSKFYSGFNIGKVTFHLNNNDTFSYDLFYTGDDGLPKSFLKIYEDNKTVESEKFHLDVDISYKETI
>CP018629.1|AUS76790.1|1587550_1588279_+|exotoxin
MNKIFRILTVSLFFFTFLIKNNLAYADVGVINLRNFYANYEPEKLQGVSSGNFSTSHQLEYIDGKYTLYSQFHNEYEAKRLKDHKVDIFGISYSGLCNTKYMYGGITLANQNLDKPRNIPINLWVNGKQNTISTDKVSTQKKEVTAQEIDIKLRKYLQNEYNIYGFNKTKKGQEYGYQSKFNSGFNKGKITFHLNNEPSFTYDLFYTGTGQAESFLKIYNDNKTIDAENFHLDVEISYEKTE
>CP018629.1|AUS75252.1|1586641_1587376_+|DNA-binding-protein
MTFGEILKKERVSWKLSVKELSTLSGVSQTYISKLENGKRNFPSLETIFNLLIGFKTHIEYKMGSESPFYEINNSYLDEILIMFINSSNSTISDRDPNELITQFNEYYDVTIKKKQNENSKIESDIFSNKIKLVKGTTKKEVIEKPYFDLNWLLTQNEYEVFFDRSFLLDNNFLNKKHFTEKDMYYYNVLNDNDLKTIKDLIVVFLLNKYNYIKNKDDFFNIFTNSEDDKTKRDALYKILYETD
>CP018629.1|AUS75251.1|1586279_1586492_-|transcriptional-regulator
MNNNLSLLMGKHRVTASKLSTVTGISRTSIHGLYHERTENPDTKTVMKLCEYFNITPNEFFGIIEKEGVK
>CP018629.1|AUS75260.1|1594700_1595579_-|hypothetical-protein
MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMQEETLNQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLDDLPEQQELFPVKEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQAHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS
>CP018629.1|AUS75261.1|1595580_1595694_-|hypothetical-protein
MKEKLLGTIIWSIATFYYSRMMEIMNLAILKIKIGGS
>CP018629.1|AUS75262.1|1595757_1596138_-|glycine-cleavage-system-protein-H
MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVAIIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQIEALLTAEKYSEMIGE
>CP018629.1|AUS75263.1|1596295_1596652_-|arsenate-reductase
MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA
>CP018629.1|AUS75264.1|1596795_1597116_+|thiol-reductase-thioredoxin
MQSIKSNESFKSVINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK
>CP018629.1|AUS75265.1|1597265_1597805_-|nitroreductase
MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEGDMPKAPRKNRNLITLY
>CP018629.1|AUS75266.1|1597887_1598604_-|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase
MTHVEVVATIAPQLSIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFTNDSYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIITHLQQYNKEVVISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGVPQAPGQIDVTDLKAQVTLY
>CP018629.1|AUS75267.1|1598751_1599174_+|peroxiredoxin
MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDSDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD
>CP018629.1|AUS75268.1|1599572_1600067_+|GNAT-family-N-acetyltransferase
MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK
>CP018629.1|AUS75269.1|1600221_1600839_+|lysine-transporter-LysE
MVTAIIHGFILAIGLILPLGAQNVFIFNQGANQPKYRYVLPAIITAGLSDSLLIIIAVVGVSIIIMSLPVLQAIIYIVGLIFLMYMAWTIWHDKPSTDGETQIMSPMKQVSFALSVSLLNPHAILDTIGVIGSSAALYSGSNKIAFTIACISVSWLWFFLLAILGKMVGSIDKTGKLLTIINKISSIIIIIVALMILQKLIQLLF

Crispr_ID: CP018629_4

• CRISPR_ID: CP018629_4
• CRISPR_location: 1644363-1644443
• CRISPR_type: Unclear
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of CP018629_4

Consensus_repeat	Method
AGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAA	CRISPRCasFinder

spacers of CP018629_4

>4.1|1644389|29|CP018629|CRISPRCasFinder
TTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP018629_4

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of CP018629_4

>merge|CP018629|4|1644363-1644443|CRISPRCasFinder
AGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAA

>CP018629|4|3|1644363-1644443|CRISPRCasFinder
AGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAA	TTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCA
AGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
CP018629.1|AUS75319.1|1652145_1653141_-|peptide-chain-release-factor-2	unknown	unknown	gnl|CDD|234799
CP018629.1|AUS75317.1|1650897_1651737_-|peptidase-M23	unknown	unknown	gnl|CDD|226451
CP018629.1|AUS75309.1|1640408_1641848_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|276808
CP018629.1|AUS75322.1|1656515_1657088_-|ribosomal-subunit-interface-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224461
CP018629.1|AUS75316.1|1650073_1650724_-|hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|378993
CP018629.1|AUS75313.1|1644732_1647579_-|excinuclease-ABC-subunit-A	unknown	unknown	gnl|CDD|234734
CP018629.1|AUS75305.1|1635625_1636570_-|DNA-binding-protein-WhiA	unknown	unknown	gnl|CDD|273194
CP018629.1|AUS75321.1|1653570_1656102_-|preprotein-translocase-subunit-SecA	unknown	unknown	gnl|CDD|237259
CP018629.1|AUS75314.1|1647586_1649572_-|excinuclease-ABC-subunit-B	unknown	unknown	gnl|CDD|235395
CP018629.1|AUS75318.1|1651884_1651992_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS75306.1|1636679_1637675_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|211689
CP018629.1|AUS75310.1|1641855_1642341_-|acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|100053
CP018629.1|AUS75304.1|1634465_1635053_-|ATP-dependent-Clp-endopeptidase,-proteolytic-subunit-ClpP	unknown	unknown	gnl|CDD|178955
CP018629.1|AUS75308.1|1639406_1640342_-|thioredoxin-disulfide-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|273540
CP018629.1|AUS75315.1|1649840_1650077_-|protein-CsbA	unknown	unknown	gnl|CDD|227234
CP018629.1|AUS76794.1|1638926_1639061_+|nitrogen-fixation-protein-NifR	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS75311.1|1642348_1643188_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase	unknown	unknown	gnl|CDD|183527
CP018629.1|AUS75312.1|1643193_1644126_-|HPr-kinase/phosphorylase	unknown	unknown	gnl|CDD|235459
CP018629.1|AUS75320.1|1653424_1653529_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS75307.1|1637671_1638583_-|RNase-adaptor-protein-RapZ	unknown	unknown	gnl|CDD|224574

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
CP018629.1|AUS75319.1|1652145_1653141_-|peptide-chain-release-factor-2	gnl|CDD|234799	PRK00578, prfB, peptide chain release factor 2; Validated.	0
CP018629.1|AUS75317.1|1650897_1651737_-|peptidase-M23	gnl|CDD|226451	COG3942, COG3942, Surface antigen [General function prediction only].	2.23913e-42
CP018629.1|AUS75309.1|1640408_1641848_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|276808	sd00008, TPR_YbbN, C-terminal Tetratricopeptide repeat (TPR) region of YbbN and similar motifs. The Tetratricopeptide repeat (TPR) typically contains 34 amino acids and is found in a variety of organisms including bacteria, cyanobacteria, yeast, fungi, plants, and humans. It is present in a variety of proteins including those involved in chaperone, cell-cycle, transcription, and protein transport complexes. YbbN is a thioredoxin-like protein containing two tandem TPR repeats at the C-terminus, separated by two alpha helices. Its N-terminal thioredoxin-like domain is not a functional oxidoreductase. It functions in heat stress response and DNA synthesis as a chaperone or co-chaperone.	4.31987e-06
CP018629.1|AUS75322.1|1656515_1657088_-|ribosomal-subunit-interface-protein	gnl|CDD|224461	COG1544, COG1544, Ribosome-associated protein Y (PSrp-1) [Translation, ribosomal structure and biogenesis].	1.13584e-37
CP018629.1|AUS75316.1|1650073_1650724_-|hydrolase	gnl|CDD|378993	pfam12917, HD_2, HD containing hydrolase-like enzyme. This is a family of bacterial and archaeal hydrolases.	6.51021e-58
CP018629.1|AUS75313.1|1644732_1647579_-|excinuclease-ABC-subunit-A	gnl|CDD|234734	PRK00349, uvrA, excinuclease ABC subunit UvrA.	0
CP018629.1|AUS75305.1|1635625_1636570_-|DNA-binding-protein-WhiA	gnl|CDD|273194	TIGR00647, DNA_bind_WhiA, DNA-binding protein WhiA. This family describes a DNA-binding protein widely conserved in Gram-positive bacteria, and occasionally occurring elsewhere, such as in Thermotoga. It is associated with cell division, and in sporulating organisms with sporulation. [Cellular processes, Cell division].	7.40812e-153
CP018629.1|AUS75321.1|1653570_1656102_-|preprotein-translocase-subunit-SecA	gnl|CDD|237259	PRK12904, PRK12904, preprotein translocase subunit SecA; Reviewed.	0
CP018629.1|AUS75314.1|1647586_1649572_-|excinuclease-ABC-subunit-B	gnl|CDD|235395	PRK05298, PRK05298, excinuclease ABC subunit UvrB.	0
CP018629.1|AUS75306.1|1636679_1637675_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|211689	TIGR01826, Putative_gluconeogenesis_factor, conserved hypothetical protein, cofD-related. This model represents a subfamily of conserved hypothetical proteins that forms a sister group to the family of CofD, (TIGR01819), LPPG:Fo 2-phospho-L-lactate transferase, an enzyme of cytochrome F420 biosynthesis. Both this family and TIGR01819 are within the scope of the pfam01933. [Hypothetical proteins, Conserved].	5.06652e-172
CP018629.1|AUS75310.1|1641855_1642341_-|acetyltransferase	gnl|CDD|100053	cd04647, LbH_MAT_like, Maltose O-acyltransferase (MAT)-like: This family is composed of maltose O-acetyltransferase, galactoside O-acetyltransferase (GAT), xenobiotic acyltransferase (XAT) and similar proteins. MAT and GAT catalyze the CoA-dependent acetylation of the 6-hydroxyl group of their respective sugar substrates. MAT acetylates maltose and glucose exclusively while GAT specifically acetylates galactopyranosides. XAT catalyzes the CoA-dependent acetylation of a variety of hydroxyl-bearing acceptors such as chloramphenicol and streptogramin, among others. XATs are implicated in inactivating xenobiotics leading to xenobiotic resistance in patients. Members of this family contain a a left-handed parallel beta-helix (LbH) domain with at least 5 turns, each containing three imperfect tandem repeats of a hexapeptide repeat motif (X-[STAV]-X-[LIV]-[GAED]-X). They are trimeric in their active form.	4.85181e-30
CP018629.1|AUS75304.1|1634465_1635053_-|ATP-dependent-Clp-endopeptidase,-proteolytic-subunit-ClpP	gnl|CDD|178955	PRK00277, clpP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit; Reviewed.	4.59321e-148
CP018629.1|AUS75308.1|1639406_1640342_-|thioredoxin-disulfide-reductase	gnl|CDD|273540	TIGR01292, Thioredoxin_reductase, thioredoxin-disulfide reductase. This model describes thioredoxin-disulfide reductase, a member of the pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductases (pfam00070). [Energy metabolism, Electron transport].	4.19425e-154
CP018629.1|AUS75315.1|1649840_1650077_-|protein-CsbA	gnl|CDD|227234	COG4897, CsbA, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	4.73465e-34
CP018629.1|AUS75311.1|1642348_1643188_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase	gnl|CDD|183527	PRK12437, PRK12437, prolipoprotein diacylglyceryl transferase; Reviewed.	1.39921e-119
CP018629.1|AUS75312.1|1643193_1644126_-|HPr-kinase/phosphorylase	gnl|CDD|235459	PRK05428, PRK05428, HPr kinase/phosphorylase; Provisional.	1.22623e-170
CP018629.1|AUS75307.1|1637671_1638583_-|RNase-adaptor-protein-RapZ	gnl|CDD|224574	COG1660, COG1660, Predicted P-loop-containing kinase [General function prediction only].	1.09727e-168

Protein sequences

>CP018629.1|AUS75312.1|1643193_1644126_-|HPr-kinase/phosphorylase
MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE
>CP018629.1|AUS75311.1|1642348_1643188_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase
MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGSVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK
>CP018629.1|AUS75310.1|1641855_1642341_-|acetyltransferase
MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR
>CP018629.1|AUS75309.1|1640408_1641848_-|hypothetical-protein
MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDMEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVSENDVMVAWINQGELIIAEKVDLSDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI
>CP018629.1|AUS75308.1|1639406_1640342_-|thioredoxin-disulfide-reductase
MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA
>CP018629.1|AUS76794.1|1638926_1639061_+|nitrogen-fixation-protein-NifR
MGCGPQHREIGFPISTDNASWRGPNTEAGGKSAYNNVQVGVGQR
>CP018629.1|AUS75307.1|1637671_1638583_-|RNase-adaptor-protein-RapZ
MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGVGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK
>CP018629.1|AUS75306.1|1636679_1637675_-|hypothetical-protein
MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK
>CP018629.1|AUS75305.1|1635625_1636570_-|DNA-binding-protein-WhiA
MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL
>CP018629.1|AUS75304.1|1634465_1635053_-|ATP-dependent-Clp-endopeptidase,-proteolytic-subunit-ClpP
MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK
>CP018629.1|AUS75313.1|1644732_1647579_-|excinuclease-ABC-subunit-A
MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK
>CP018629.1|AUS75314.1|1647586_1649572_-|excinuclease-ABC-subunit-B
MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG
>CP018629.1|AUS75315.1|1649840_1650077_-|protein-CsbA
MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR
>CP018629.1|AUS75316.1|1650073_1650724_-|hydrolase
MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE
>CP018629.1|AUS75317.1|1650897_1651737_-|peptidase-M23
MKKSLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVTKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH
>CP018629.1|AUS75318.1|1651884_1651992_-|hypothetical-protein
MCLLKQHMQCAFSNITYGDFQGIELIIENVLNYMV
>CP018629.1|AUS75319.1|1652145_1653141_-|peptide-chain-release-factor-2
MMAEPNFWDNQTKAQDIIDKNNALKAIVNGYKTLQAEVDDMDATWDLLQEEFDEEMKEDLEQEVINFKAKVDEYELQLLLDGPHDANNAILELHPGAGGTESQDWANMLFRMYQRYCEKKGFKVETVDYLPGDEAGIKSVTLLIKGHNAYGYLKAEKGVHRLVRISPFDSSGRRHTSFASCDVIPDFNNDEIEIEINPDDITVDTFRASGAGGQHINKTESAIRITHHPSGIVVNNQNERSQIKNREAAMKMLKSKLYQLKLEEQAREMAEIRGEQKEIGWGSQIRSYVFHPYSMVKDHRTNEETGKVDAVMDGDIGPFIESYLRQTMSHD
>CP018629.1|AUS75320.1|1653424_1653529_-|hypothetical-protein
MLWEESFYFTSVKYFKKCEEVVKRCYVLSFKKSV
>CP018629.1|AUS75321.1|1653570_1656102_-|preprotein-translocase-subunit-SecA
MGFLSKILDGNNKEIKQLGKLADKVIALEEKTAILTDEEIRNKTKQFQTELADIDNVKKQNDYLDKILPEAYALVREGSKRVFNMTPYKVQIMGGIAIHKGDIAEMRTGEGKTLTATMPTYLNALAGRGVHVITVNEYLSSVQSEEMAELYNFLGLTVGLNLNSKTTEEKREAYAQDITYSTNNELGFDYLRDNMVNYSEDRVMRPLHFAIIDEVDSILIDEARTPLIISGEAEKSTSLYTQANVFAKMLKQDEDYKYDEKTKAVHLTEQGADKAERMFKVENLYDVQNVDVISHINTALRAHVTLQRDVDYMVVDGEVLIVDQFTGRTMPGRRFSEGLHQAIEAKEGVQIQNESKTMASITFQNYFRMYNKLAGMTGTAKTEEEEFRNIYNMTVTQIPTNKPVQRNDKSDLIYISQKGKFDAVVEDVVEKHKAGQPVLLGTVAVETSEYISNLLKKRGIRHDVLNAKNHEREAEIVAGAGQKGAVTIATNMAGRGTDIKLGEGVEELGGLAVIGTERHESRRIDDQLRGRSGRQGDKGDSRFYLSLQDELMIRFGSERLQKMMSRLGLDDSTPIESKMVSRAVESAQKRVEGNNFDARKRILEYDEVLRKQREIIYNERNSIIDEEDSSQVVDAMLRSTLQRSINYYINTADDEPEYQPFIDYINDIFLQEGDITEDDIKGKDAEDIFEVVWAKIEAAYQSQKDILEEQMNEFERMILLRSIDSHWTDHIDTMDQLRQGIHLRSYAQQNPLRDYQNESHELFDIMMQNIEEDTCKFILKSVVQVEDNIEREKTTEFGEAKHVSAEDGKEKVKPKPIVKGDQVGRNDDCPCGSGKKFKNCHGK
>CP018629.1|AUS75322.1|1656515_1657088_-|ribosomal-subunit-interface-protein
MIRFEIHGDNLTITDAIRNYIEEKIGKLERYFNDVPNAVAHVKVKTYSNSATKIEVTIPLKNVTLRAEERNDDLYAGIDLINNKLERQVRKYKTRINRKSRDRGDQEVFVAELQEMQETQVDNDAYDDNEIEIIRSKEFSLKPMDSEEAVLQMNLLGHDFFVFTDRETDGTSIVYRRKDGKYGLIQTSEQ

Crispr_ID: CP018629_5

• CRISPR_ID: CP018629_5
• CRISPR_location: 1801091-1801183
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of CP018629_5

Consensus_repeat	Method
TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCATCTTTAG	CRISPRCasFinder

spacers of CP018629_5

>5.1|1801123|29|CP018629|CRISPRCasFinder
CGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP018629_5

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of CP018629_5

>merge|CP018629|5|1801091-1801183|CRISPRCasFinder
TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCATCTTTAGCGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCTTAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCACCTTTAG

>CP018629|5|4|1801091-1801183|CRISPRCasFinder
TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCATCTTTAG	CGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCT
TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCACCTTTAG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
CP018629.1|AUS75466.1|1795958_1796675_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS75470.1|1801400_1802036_-|endonuclease-III	unknown	unknown	gnl|CDD|225140
CP018629.1|AUS75463.1|1792499_1793429_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225778
CP018629.1|AUS75471.1|1802424_1804086_-|arginine--tRNA-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|234964
CP018629.1|AUS75476.1|1808811_1809348_-|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|223728
CP018629.1|AUS76799.1|1804082_1804466_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226896
CP018629.1|AUS75462.1|1792080_1792305_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378571
CP018629.1|AUS75473.1|1804773_1805784_-|alcohol-dehydrogenase-AdhP	unknown	unknown	gnl|CDD|181842
CP018629.1|AUS75475.1|1808166_1808643_-|GNAT-family-N-acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|366181
CP018629.1|AUS76800.1|1806282_1806804_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378039
CP018629.1|AUS75468.1|1797478_1798279_-|alpha/beta-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|223669
CP018629.1|AUS75469.1|1798262_1798982_-|HAD-family-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|223943
CP018629.1|AUS75477.1|1809558_1810497_-|oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|381309
CP018629.1|AUS76798.1|1800134_1800962_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|238563
CP018629.1|AUS76797.1|1799036_1799987_-|enterobactin-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|376439
CP018629.1|AUS75467.1|1796836_1797343_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS75472.1|1804591_1804699_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS75474.1|1806831_1808127_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224004
CP018629.1|AUS75464.1|1794376_1794751_+|transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|130944
CP018629.1|AUS75465.1|1795001_1795790_-|alpha/beta-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|223669

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
CP018629.1|AUS75470.1|1801400_1802036_-|endonuclease-III	gnl|CDD|225140	COG2231, COG2231, Uncharacterized protein related to Endonuclease III [DNA replication, recombination, and repair].	3.98158e-90
CP018629.1|AUS75463.1|1792499_1793429_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|225778	COG3238, COG3238, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	7.93315e-37
CP018629.1|AUS75471.1|1802424_1804086_-|arginine--tRNA-ligase	gnl|CDD|234964	PRK01611, argS, arginyl-tRNA synthetase; Reviewed.	0
CP018629.1|AUS75476.1|1808811_1809348_-|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase	gnl|CDD|223728	COG0655, WrbA, Multimeric flavodoxin WrbA [General function prediction only].	3.16348e-26
CP018629.1|AUS76799.1|1804082_1804466_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|226896	COG4506, COG4506, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	9.50091e-54
CP018629.1|AUS75462.1|1792080_1792305_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|378571	pfam11148, DUF2922, Protein of unknown function (DUF2922). This bacterial family of proteins has no known function.	1.74707e-13
CP018629.1|AUS75473.1|1804773_1805784_-|alcohol-dehydrogenase-AdhP	gnl|CDD|181842	PRK09422, PRK09422, ethanol-active dehydrogenase/acetaldehyde-active reductase; Provisional.	0
CP018629.1|AUS75475.1|1808166_1808643_-|GNAT-family-N-acetyltransferase	gnl|CDD|366181	pfam00583, Acetyltransf_1, Acetyltransferase (GNAT) family. This family contains proteins with N-acetyltransferase functions such as Elp3-related proteins.	1.13315e-11
CP018629.1|AUS76800.1|1806282_1806804_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|378039	pfam08741, YwhD, YwhD family. This family of proteins are currently uncharacterized. They are around 170 amino acids in length.	8.7406e-98
CP018629.1|AUS75468.1|1797478_1798279_-|alpha/beta-hydrolase	gnl|CDD|223669	COG0596, MhpC, Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) [General function prediction only].	1.35732e-24
CP018629.1|AUS75469.1|1798262_1798982_-|HAD-family-hydrolase	gnl|CDD|223943	COG1011, COG1011, Predicted hydrolase (HAD superfamily) [General function prediction only].	3.6864e-38
CP018629.1|AUS75477.1|1809558_1810497_-|oxidoreductase	gnl|CDD|381309	cd19083, AKR_AKR11A1_11D1, AKR11A and AKR11D families of aldo-keto reductase (AKR). Bacillus subtilis aldo-keto reductase IolS, also called vegetative protein 147 (VEG147), is a founding member of aldo-keto reductase family 11 member A1 (AKR11A1). It is able to reduce the standard aldo-keto reductase (AKR) substrates DL-glyceraldehyde, D-erythrose, and methylglyoxal in the presence of NADPH, albeit with poor efficiency in vitro. Bacillus aryabhattai aldo keto reductase is a founding member of aldo-keto reductase family 11 member D1 (AKR11D1).	7.3194e-168
CP018629.1|AUS76798.1|1800134_1800962_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|238563	cd01143, YvrC, Periplasmic binding protein YvrC. These proteins are predicted to function as initial receptors in ABC transport of metal ions in eubacteria and archaea. They belong to the TroA superfamily of periplasmic metal binding proteins that share a distinct fold and ligand binding mechanism. A typical TroA protein is comprised of two globular subdomains connected by a single helix and can bind the metal ion in the cleft between these domains.	1.32108e-72
CP018629.1|AUS76797.1|1799036_1799987_-|enterobactin-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|376439	pfam01032, FecCD, FecCD transport family. This is a sub-family of bacterial binding protein-dependent transport systems family. This Pfam entry contains the inner components of this multicomponent transport system.	5.19191e-48
CP018629.1|AUS75474.1|1806831_1808127_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|224004	COG1078, COG1078, HD superfamily phosphohydrolases [General function prediction only].	5.76708e-150
CP018629.1|AUS75464.1|1794376_1794751_+|transcriptional-regulator	gnl|CDD|130944	TIGR01889, Pleiotropic_Regulator_Of_Virulence, staphylococcal accessory regulator family. This model represents a family of transcriptional regulatory proteins in Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis. Some members contain two tandem copies of this region. This family is related to the MarR transcriptional regulator family described by pfam01047. [Regulatory functions, DNA interactions].	1.77309e-26
CP018629.1|AUS75465.1|1795001_1795790_-|alpha/beta-hydrolase	gnl|CDD|223669	COG0596, MhpC, Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) [General function prediction only].	1.55978e-34

Protein sequences

>CP018629.1|AUS76798.1|1800134_1800962_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein
MKDNDKQGSNDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK
>CP018629.1|AUS76797.1|1799036_1799987_-|enterobactin-ABC-transporter-permease
MTFNKVLLSWIVILIITTSIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLTTLWIPVFSITFSLITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPRKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCIASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVTGGQIMVMADFIGSHILSPVQIPASIIIALIGIPVLFYMLISQSKRLH
>CP018629.1|AUS75469.1|1798262_1798982_-|HAD-family-hydrolase
MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLIHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQEDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKNDNKGENYGSIY
>CP018629.1|AUS75468.1|1797478_1798279_-|alpha/beta-hydrolase
MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKLAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVELLKYLYIEEVAFVCHEMSGIIGADISVRYPEFTSSLTLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNADFEVYQESSAFPFVEEQERFVEDTAAFINKHHDEKHV
>CP018629.1|AUS75467.1|1796836_1797343_-|hypothetical-protein
MKKLLTASIIACSVVMGVGLVNTSAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNEDGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAVTHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK
>CP018629.1|AUS75466.1|1795958_1796675_-|hypothetical-protein
MRINDKILLENIEDYFNHKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFIINFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIAGIFYKRLEFSGIGLLFCQKTVDAMIHNPQSAQIFSLIIWILLVVLVIYFTIRLSSRTRL
>CP018629.1|AUS75465.1|1795001_1795790_-|alpha/beta-hydrolase
MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLEAHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFMNYYLKFLKSVS
>CP018629.1|AUS75464.1|1794376_1794751_+|transcriptional-regulator
MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL
>CP018629.1|AUS75463.1|1792499_1793429_+|hypothetical-protein
MLLFYIIGVLVGMLIPIQTSVNSRLSLYTKSPFYTSFISFSVGTICLIILNIIINPEVFTIHFYNNQSFNYTWVVGGLLGVSFLTGNLLLLPKLGATLTVIATVAGQIIMGVIIDTFGLFGATIHDFNLIKAIGVLLLIVGIVIMNQFNKNNLLLTDQKYLLFWLLLGFIFGFFPPIQTTINSALASHTHSPAFASLVSFTIGSIALLILTAIFNRSLKLKTSHLKFGKLKPIYFTGGILGMAFVTANIILMPHMGAALTTLIGMFGQILMGILIDHFGLFGSPKIAMTSRKTIGLLCILTGIILLRLF
>CP018629.1|AUS75462.1|1792080_1792305_+|hypothetical-protein
MTKTLELSFKSSLDKPVKLQLPQLNNVVTEQVARDSMNALVDLNIIKSNSGTITKVHSAQIIDKTTTVLFEDKK
>CP018629.1|AUS75470.1|1801400_1802036_-|endonuclease-III
MLGTDELYKVLYEHLGPQFWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHILELPIETLQSLIHSSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKGGLRKELLSLKGIGSETADVLLVYIFGRIEFIPDSYTRKIYDKLGYENTKNYDQLKKVVTLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK
>CP018629.1|AUS75471.1|1802424_1804086_-|arginine--tRNA-ligase
MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNVLLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVTAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIKKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM
>CP018629.1|AUS76799.1|1804082_1804466_-|hypothetical-protein
MLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQTTTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE
>CP018629.1|AUS75472.1|1804591_1804699_-|hypothetical-protein
MKDSENLVFFGFEVLFVFYKMAYIYEALIKYGIVN
>CP018629.1|AUS75473.1|1804773_1805784_-|alcohol-dehydrogenase-AdhP
MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADAIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF
>CP018629.1|AUS76800.1|1806282_1806804_-|hypothetical-protein
MEVISLSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKAILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN
>CP018629.1|AUS75474.1|1806831_1808127_-|hypothetical-protein
MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVAPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERLLRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQYGTIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN
>CP018629.1|AUS75475.1|1808166_1808643_-|GNAT-family-N-acetyltransferase
MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF
>CP018629.1|AUS75476.1|1808811_1809348_-|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase
MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQDLEYQWIDVTQHQFKPIRDVRHTAETITSYDDDYLPILDKILASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTAEKPGDIMKDNYALARATEWNSILQ
>CP018629.1|AUS75477.1|1809558_1810497_-|oxidoreductase
MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINLLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDNNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVKALESIAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKRAEQVVENIKAADIVLSDDEIQYIDELFPIED

Crispr_ID: CP018629_6

• CRISPR_ID: CP018629_6
• CRISPR_location: 2067867-2067968
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of CP018629_6

Consensus_repeat	Method
CAAATTTAATACTCAATTCATATA	CRISPRCasFinder

spacers of CP018629_6

>6.1|2067891|54|CP018629|CRISPRCasFinder
TAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP018629_6

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of CP018629_6

>merge|CP018629|6|2067867-2067968|CRISPRCasFinder
CAAATTTAATACTCAATTCATATATAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTTCAAATTTAATACTCAATTCATAAA

>CP018629|6|5|2067867-2067968|CRISPRCasFinder
CAAATTTAATACTCAATTCATATA	TAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT
CAAATTTAATACTCAATTCATAAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
CP018629.1|AUS75702.1|2058362_2058566_-|conjugal-transfer-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS75711.1|2066893_2067850_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|235334
CP018629.1|AUS75705.1|2060134_2061676_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|234614
CP018629.1|AUS75717.1|2072127_2073651_+|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F	unknown	unknown	gnl|CDD|237942
CP018629.1|AUS75718.1|2073729_2074023_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS75714.1|2068826_2070215_+|L-cystine-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|224736
CP018629.1|AUS75709.1|2065563_2065971_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378584
CP018629.1|AUS75715.1|2070295_2071051_-|nitroreductase-A	unknown	unknown	gnl|CDD|380322
CP018629.1|AUS75716.1|2071542_2072112_+|peroxiredoxin	unknown	unknown	gnl|CDD|211789
CP018629.1|AUS75707.1|2063204_2064473_-|xanthine-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|274468
CP018629.1|AUS75712.1|2068175_2068433_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS75720.1|2074976_2075360_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS75710.1|2066113_2066776_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS75703.1|2058646_2058847_+|conjugal-transfer-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|371495
CP018629.1|AUS75708.1|2064472_2065051_-|xanthine-phosphoribosyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|181705
CP018629.1|AUS75706.1|2061700_2063167_-|IMP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|235507
CP018629.1|AUS75704.1|2058873_2060067_+|site-specific-integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|271189
CP018629.1|AUS75713.1|2068640_2068742_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS75719.1|2074095_2074722_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380196
CP018629.1|AUS75721.1|2075425_2076007_-|histidine-phosphatase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223483

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
CP018629.1|AUS75711.1|2066893_2067850_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|235334	PRK05035, PRK05035, electron transport complex protein RnfC; Provisional.	0.000748442
CP018629.1|AUS75705.1|2060134_2061676_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase	gnl|CDD|234614	PRK00074, guaA, GMP synthase; Reviewed.	0
CP018629.1|AUS75717.1|2072127_2073651_+|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F	gnl|CDD|237942	PRK15317, PRK15317, alkyl hydroperoxide reductase subunit F; Provisional.	0
CP018629.1|AUS75714.1|2068826_2070215_+|L-cystine-transporter	gnl|CDD|224736	COG1823, COG1823, Predicted Na+/dicarboxylate symporter [General function prediction only].	0
CP018629.1|AUS75709.1|2065563_2065971_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|378584	pfam11181, YflT, Heat induced stress protein YflT. YflT is a heat induced protein.	2.0219e-12
CP018629.1|AUS75715.1|2070295_2071051_-|nitroreductase-A	gnl|CDD|380322	cd02146, NfsA-like, nitroreductase similar to Escherichia coli NfsA. This family contains NADPH-dependent flavin reductase and oxygen-insensitive nitroreductase. These enzymes are homodimeric flavoproteins that contain one FMN per monomer as a cofactor. Flavin reductase catalyzes the reduction of flavin by using NADPH as an electron donor. Oxygen-insensitive nitroreductase, such as NfsA protein in Escherichia coli, catalyzes reduction of nitrocompounds using NADPH as electron donor.	5.03864e-88
CP018629.1|AUS75716.1|2071542_2072112_+|peroxiredoxin	gnl|CDD|211789	TIGR03137, AhpC, peroxiredoxin. This peroxiredoxin (AhpC, alkylhydroperoxide reductase subunit C) is one subunit of a two-subunit complex with subunit F(TIGR03140). Usually these are found as an apparent operon. The gene has been characterized in Bacteroides fragilis, where it is important in oxidative stress defense. This gene contains two invariant cysteine residues, one near the N-terminus and one near the C-terminus, each followed immediately by a proline residue. [Cellular processes, Detoxification, Cellular processes, Adaptations to atypical conditions].	1.50623e-124
CP018629.1|AUS75707.1|2063204_2064473_-|xanthine-permease	gnl|CDD|274468	TIGR03173, pbuX, xanthine permease. All the seed members of this model are observed adjacent to genes for either xanthine phosphoribosyltransferase (for the conversion of xanthine to guanine, GenProp0696) or genes for the conversion of xanthine to urate and its concomitant catabolism (GenProp0640, GenProp0688, GenProp0686 and GenProp0687). A number of sequences scoring higher than trusted to this model are found in different genomic contexts, and the possibility exist that these transport related compounds in addition to or instead of xanthine itself. The outgroup to this family are sequences which are characterized as uracil permeases or are adjacent to established uracil phosphoribosyltransferases.	3.16192e-170
CP018629.1|AUS75703.1|2058646_2058847_+|conjugal-transfer-protein	gnl|CDD|371495	pfam11372, DUF3173, Domain of unknown function (DUF3173). This family of proteins with unknown function appears to be restricted to Firmicutes. These proteins appear to be distantly related to HHH domains and are therefore likely to be DNA-binding. Genomic environment-visualisation confirms the likely function as being DNA-binding, as this short protein lies very closely between an integrase and a replication protein (http://www.microbesonline.org/).	2.02242e-22
CP018629.1|AUS75708.1|2064472_2065051_-|xanthine-phosphoribosyltransferase	gnl|CDD|181705	PRK09219, PRK09219, xanthine phosphoribosyltransferase; Validated.	9.01486e-119
CP018629.1|AUS75706.1|2061700_2063167_-|IMP-dehydrogenase	gnl|CDD|235507	PRK05567, PRK05567, inosine 5'-monophosphate dehydrogenase; Reviewed.	0
CP018629.1|AUS75704.1|2058873_2060067_+|site-specific-integrase	gnl|CDD|271189	cd01189, INT_ICEBs1_C_like, C-terminal catalytic domain of integrases from bacterial phages and conjugate transposons. This family of tyrosine based site-specific integrases is has origins in bacterial phages and conjugate transposons. One member is the integrase from Bacillus subtilis conjugative transposon ICEBs1. ICEBs1 can be excised and transfered to various recipients in response to DNA damage or high concentrations of potential mating partners. The family belongs to the superfamily of DNA breaking-rejoining enzymes, which share the same fold in their catalytic domain and the overall reaction mechanism. The catalytic domain contains six conserved active site residues. Their overall reaction mechanism involves cleavage of a single strand of a DNA duplex by nucleophilic attack of a conserved tyrosine to give a 3' phosphotyrosyl protein-DNA adduct. In the second rejoining step, a terminal 5' hydroxyl attacks the covalent adduct to release the enzyme and generate duplex DNA.	1.36769e-47
CP018629.1|AUS75719.1|2074095_2074722_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|380196	NF033193, lipo_NDxxF, NDxxF motif lipoprotein. Members of this family are lipoproteins, about 200 amino acids long in precursor form, found in Staphylococcus aureus, Bacillus cereus, and various other Firmicutes. The protein family is named for one of its several highly conserved motifs.	1.67126e-71
CP018629.1|AUS75721.1|2075425_2076007_-|histidine-phosphatase-family-protein	gnl|CDD|223483	COG0406, phoE, Broad specificity phosphatase PhoE and related phosphatases [General function prediction only].	2.78414e-49

Protein sequences

>CP018629.1|AUS75711.1|2066893_2067850_+|hypothetical-protein
MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLLGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKALAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVNTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNDNAAETSNKEATVDAEAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL
>CP018629.1|AUS75710.1|2066113_2066776_+|hypothetical-protein
MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEETDLRKPF
>CP018629.1|AUS75709.1|2065563_2065971_+|hypothetical-protein
MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHQEVHENNSAYEEIDITHFAEASKGPKA
>CP018629.1|AUS75708.1|2064472_2065051_-|xanthine-phosphoribosyltransferase
MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE
>CP018629.1|AUS75707.1|2063204_2064473_-|xanthine-permease
MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILLLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLLICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVQ
>CP018629.1|AUS75706.1|2061700_2063167_-|IMP-dehydrogenase
MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF
>CP018629.1|AUS75705.1|2060134_2061676_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase
MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCRGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE
>CP018629.1|AUS75704.1|2058873_2060067_+|site-specific-integrase
MVKDPIKKAKNGTYYFRANLGYDSKGKKIQKYRSGFTTKKEAREEYSKLLLMKPEELSENKDKMTFKHYIFEIFLPWYKTQVKLRTYENRLPTIKKHFSYFDKMAVSDIEPIDVQNWQLKLSKKCKSSYVRAVQGLFSVAMDRAIVLGITTTNPSKIIGNVKKQKSKIEFWTKEEFEKVISLIYKEDYYQHFLFISLWFLFMTGMRIGEATAIQWEDIDFDSGVLTINKTLYYKNQSNYRFVEPKTKASVRHIVLDKCTLTYLSEWKEVQQNLIQTDFVMSYNGIPTQKHTLSYAIERYAKLAGIHRIRIHGLRHSHASLLISMGENPLIIKDRLGHEDIETTLGTYGHLYPNSNFEVANKLNGAISFKEAKQNYDTSPKNQFTVDYLRNKEMKKVQ
>CP018629.1|AUS75703.1|2058646_2058847_+|conjugal-transfer-protein
MITVTKKDLVELGYGTSFSADIIKKAKELMITKGHIYYQSRKLDRVPREAVEEILGIRFSNENRSE
>CP018629.1|AUS75702.1|2058362_2058566_-|conjugal-transfer-protein
MTREEYLSNRTALAKLTGISLLHGSHVAVPIACDASNARTMAIREYHYHDKKVMAAILLKITFELLT
>CP018629.1|AUS75712.1|2068175_2068433_+|hypothetical-protein
MLVTDESHKCTLIFTFTTNAFLLKQKYLFTVAFELPPAHTNTQKMLILIRQNFLQRVCSKRLFKVDHLLSFHSINMRLAIFIKPP
>CP018629.1|AUS75713.1|2068640_2068742_-|hypothetical-protein
MQLNVNMMKFDRWHKGICKQIVLNSVVIGGKGK
>CP018629.1|AUS75714.1|2068826_2070215_+|L-cystine-transporter
MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLIYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKRAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLIILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFDSNDNAALTSH
>CP018629.1|AUS75715.1|2070295_2071051_-|nitroreductase-A
MSEHVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR
>CP018629.1|AUS75716.1|2071542_2072112_+|peroxiredoxin
MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI
>CP018629.1|AUS75717.1|2072127_2073651_+|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F
MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDDKSKELKDLLTEITDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKKLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMNTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLNDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN
>CP018629.1|AUS75718.1|2073729_2074023_+|hypothetical-protein
MINLIYTTRCAIMLKVCTSRKQINMKNDIEKEKYVNEIIMLLRTIPTSKLVQPIMQLFIDKAILNNVQNDALLIEKATHARNHLRLWSLQGHRDIPN
>CP018629.1|AUS75719.1|2074095_2074722_+|hypothetical-protein
MKKRLLLSTFLASTLILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK
>CP018629.1|AUS75720.1|2074976_2075360_+|hypothetical-protein
MKVRITFIILAILSTIVCLFLAAMHPTGPNTVTFEQPYLFTLNIIIMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFTSTIITLAIGGKSVEKNDSP
>CP018629.1|AUS75721.1|2075425_2076007_-|histidine-phosphatase-family-protein
MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYEKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQKDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNKVSRAEAVDLKVENCKPYIIE

Crispr_ID: CP018629_7

• CRISPR_ID: CP018629_7
• CRISPR_location: 2432601-2432751
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 2 spacers
• Cas_protein_info: csa3

Consensus repeat of CP018629_7

Consensus_repeat	Method
AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA	CRISPRCasFinder

spacers of CP018629_7

>7.1|2432629|29|CP018629|CRISPRCasFinder
TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTA
>7.2|2432686|38|CP018629|CRISPRCasFinder
GTTGATGCGTAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP018629_7

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of CP018629_7

>merge|CP018629|7|2432601-2432751|CRISPRCasFinder
AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTAAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCGTAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCTTTCTA

>CP018629|7|6|2432601-2432751|CRISPRCasFinder
AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA	TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTA
AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA	GTTGATGCGTAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTC
AACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCTTTCTA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
CP018629.1|AUS76104.1|2429106_2429772_-|oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|187554
CP018629.1|AUS76107.1|2431491_2432583_+|transcriptional-regulator	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS76102.1|2427472_2427703_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS76116.1|2444237_2444672_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IIA	unknown	unknown	gnl|CDD|227014
CP018629.1|AUS76099.1|2423913_2424357_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223854
CP018629.1|AUS76114.1|2440520_2442059_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICBA	unknown	unknown	gnl|CDD|225123
CP018629.1|AUS76100.1|2424556_2424970_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225556
CP018629.1|AUS76108.1|2433082_2433187_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS76106.1|2430245_2431226_+|cation-efflux-pump	unknown	unknown	gnl|CDD|224151
CP018629.1|AUS76115.1|2442093_2444226_+|PTS-lactose-transporter-subunit-IIB	unknown	unknown	gnl|CDD|226234
CP018629.1|AUS76103.1|2427733_2428672_-|mannose-6-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|224399
CP018629.1|AUS76113.1|2438034_2439840_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing)	unknown	unknown	gnl|CDD|234729
CP018629.1|AUS76110.1|2435298_2435391_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS76098.1|2423082_2423793_+|purine-nucleoside-phosphorylase	unknown	unknown	gnl|CDD|180275
CP018629.1|AUS76109.1|2433873_2435010_-|DNA-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|366887
CP018629.1|AUS76117.1|2444671_2445778_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|235031
CP018629.1|AUS76105.1|2429923_2430244_+|transcriptional-regulator	csa3	COG0640_csa3_CAS-I-A	gnl|CDD|238042
CP018629.1|AUS76111.1|2436095_2436953_-|HAD-family-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|223635
CP018629.1|AUS76101.1|2425427_2426801_-|EVE-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|376640
CP018629.1|AUS76112.1|2437020_2437803_-|iron-ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224044

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
CP018629.1|AUS76105.1|2429923_2430244_+|transcriptional-regulator	csa3	COG0640_csa3_CAS-I-A	3.8e-21	70.4	0.1

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
CP018629.1|AUS76104.1|2429106_2429772_-|oxidoreductase	gnl|CDD|187554	cd05243, SDR_a5, atypical (a) SDRs, subgroup 5. This subgroup contains atypical SDRs, some of which are identified as putative NAD(P)-dependent epimerases, one as a putative NAD-dependent epimerase/dehydratase. Atypical SDRs are distinct from classical SDRs. Members of this subgroup have a glycine-rich NAD(P)-binding motif that is very similar to the extended SDRs, GXXGXXG, and binds NADP. Generally, this subgroup has poor conservation of the active site tetrad; however, individual sequences do contain matches to the YXXXK active site motif, the upstream Ser, and there is a highly conserved Asp in place of the usual active site Asn throughout the subgroup. Atypical SDRs generally lack the catalytic residues characteristic of the SDRs, and their glycine-rich NAD(P)-binding motif is often different from the forms normally seen in classical or extended SDRs. Atypical SDRs include biliverdin IX beta reductase (BVR-B,aka flavin reductase), NMRa (a negative transcriptional regulator of various fungi), progesterone 5-beta-reductase like proteins, phenylcoumaran benzylic ether and pinoresinol-lariciresinol reductases, phenylpropene synthases, eugenol synthase, triphenylmethane reductase, isoflavone reductases, and others. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold, an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Sequence identity between different SDR enzymes is typically in the 15-30% range; they catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser and/or an Asn, contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. In addition to the Rossmann fold core region typical of all SDRs, extended SDRs have a less conserved C-terminal extension of approximately 100 amino acids, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif.	5.74381e-48
CP018629.1|AUS76116.1|2444237_2444672_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IIA	gnl|CDD|227014	COG4668, MtlA, Mannitol/fructose-specific phosphotransferase system, IIA domain [Carbohydrate transport and metabolism].	2.08822e-62
CP018629.1|AUS76099.1|2423913_2424357_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein	gnl|CDD|223854	COG0783, Dps, DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant) [Inorganic ion transport and metabolism].	1.22744e-67
CP018629.1|AUS76100.1|2424556_2424970_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|225556	COG3011, COG3011, Predicted thiol-disulfide oxidoreductase [General function prediction only].	3.14887e-46
CP018629.1|AUS76114.1|2440520_2442059_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICBA	gnl|CDD|225123	COG2213, MtlA, Phosphotransferase system, mannitol-specific IIBC component [Carbohydrate transport and metabolism].	0
CP018629.1|AUS76106.1|2430245_2431226_+|cation-efflux-pump	gnl|CDD|224151	COG1230, CzcD, Co/Zn/Cd efflux system component [Inorganic ion transport and metabolism].	1.049e-108
CP018629.1|AUS76115.1|2442093_2444226_+|PTS-lactose-transporter-subunit-IIB	gnl|CDD|226234	COG3711, BglG, Transcriptional antiterminator [Transcription].	4.09729e-67
CP018629.1|AUS76103.1|2427733_2428672_-|mannose-6-phosphate-isomerase	gnl|CDD|224399	COG1482, ManA, Phosphomannose isomerase [Carbohydrate transport and metabolism].	7.24075e-129
CP018629.1|AUS76113.1|2438034_2439840_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing)	gnl|CDD|234729	PRK00331, PRK00331, isomerizing glutamine--fructose-6-phosphate transaminase.	0
CP018629.1|AUS76098.1|2423082_2423793_+|purine-nucleoside-phosphorylase	gnl|CDD|180275	PRK05819, deoD, DeoD-type purine-nucleoside phosphorylase.	2.10672e-157
CP018629.1|AUS76109.1|2433873_2435010_-|DNA-binding-protein	gnl|CDD|366887	pfam02037, SAP, SAP domain. The SAP (after SAF-A/B, Acinus and PIAS) motif is a putative DNA/RNA binding domain found in diverse nuclear and cytoplasmic proteins.	3.91533e-06
CP018629.1|AUS76117.1|2444671_2445778_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase	gnl|CDD|235031	PRK02318, PRK02318, mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase; Provisional.	0
CP018629.1|AUS76105.1|2429923_2430244_+|transcriptional-regulator	gnl|CDD|238042	cd00090, HTH_ARSR, Arsenical Resistance Operon Repressor and similar prokaryotic, metal regulated homodimeric repressors. ARSR subfamily of helix-turn-helix bacterial transcription regulatory proteins (winged helix topology). Includes several proteins that appear to dissociate from DNA in the presence of metal ions.	1.8473e-17
CP018629.1|AUS76111.1|2436095_2436953_-|HAD-family-hydrolase	gnl|CDD|223635	COG0561, Cof, Predicted hydrolases of the HAD superfamily [General function prediction only].	5.39747e-59
CP018629.1|AUS76101.1|2425427_2426801_-|EVE-domain-containing-protein	gnl|CDD|376640	pfam01878, EVE, EVE domain. This domain was formerly known as DUF55. Crystal structures have shown that this domain is part of the PUA superfamily. This domain has been named EVE and is thought to be RNA-binding.	3.86989e-06
CP018629.1|AUS76112.1|2437020_2437803_-|iron-ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224044	COG1119, ModF, ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA [Inorganic ion transport and metabolism].	4.88024e-103

Protein sequences

>CP018629.1|AUS76107.1|2431491_2432583_+|transcriptional-regulator
MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKNKKVVTEPKNTKVENDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK
>CP018629.1|AUS76106.1|2430245_2431226_+|cation-efflux-pump
MSHSHHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH
>CP018629.1|AUS76105.1|2429923_2430244_+|transcriptional-regulator
MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL
>CP018629.1|AUS76104.1|2429106_2429772_-|oxidoreductase
MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGDQDIKDALTQFENETD
>CP018629.1|AUS76103.1|2427733_2428672_-|mannose-6-phosphate-isomerase
MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV
>CP018629.1|AUS76102.1|2427472_2427703_-|hypothetical-protein
MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN
>CP018629.1|AUS76101.1|2425427_2426801_-|EVE-domain-containing-protein
MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRISNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD
>CP018629.1|AUS76100.1|2424556_2424970_-|hypothetical-protein
MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD
>CP018629.1|AUS76099.1|2423913_2424357_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein
MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLENAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS
>CP018629.1|AUS76098.1|2423082_2423793_+|purine-nucleoside-phosphorylase
MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE
>CP018629.1|AUS76108.1|2433082_2433187_-|hypothetical-protein
MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK
>CP018629.1|AUS76109.1|2433873_2435010_-|DNA-binding-protein
MSVNARDLLVLHTNVNRLVGEEIFANKCLANNDVQIMNSIKKLIEAELLTTTNDFEVSIYKKTRPELQSILKSFGIKTTGNKPDLIKRIDDNFHIINNLDLPYVYIPTKKGEEILKKTEYLTSFIQSYGEISLERAYYLVENYIDENCDDKVAEIYKFEFQRKYDNGEFDFNHGYNFELNMLIDHYKRDVKDYDNARKYSNIYLYFGLRDFLKKLMSNYSYYDSKGNIDLNEIQNDLNRFINSSASGMYERLIYNENLSNNIMFELFKKDTQDYSDLEEQLIEKFINYVVSNVKKESRSNTLIELSKILENGYTIDKEEFKKEDDYLSKYIFTDIDYLKKLESKINVAIDIRSGEIHLVLDDDSLDILIQNQKYGNEF
>CP018629.1|AUS76110.1|2435298_2435391_+|hypothetical-protein
MFIFKTTSKSHFHNNVKSLECIKIPINKNR
>CP018629.1|AUS76111.1|2436095_2436953_-|HAD-family-hydrolase
MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAEHFLAE
>CP018629.1|AUS76112.1|2437020_2437803_-|iron-ABC-transporter-ATP-binding-protein
MLIQLDQIGRMKQGKTILKKISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATSGTVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEIRNEAHQLLKLVGMFAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITANFSKILLLKDGQSIQQGAVEDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE
>CP018629.1|AUS76113.1|2438034_2439840_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing)
MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDTPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEEGTPVVGLATQEKVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE
>CP018629.1|AUS76114.1|2440520_2442059_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICBA
MSQTEEKKGIGRRFQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA
>CP018629.1|AUS76115.1|2442093_2444226_+|PTS-lactose-transporter-subunit-IIB
MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGTDSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFISDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI
>CP018629.1|AUS76116.1|2444237_2444672_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IIA
MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA
>CP018629.1|AUS76117.1|2444671_2445778_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase
MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVEDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAAYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS

Crispr_ID: CP018629_8

• CRISPR_ID: CP018629_8
• CRISPR_location: 2556764-2556957
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers

Consensus repeat of CP018629_8

Consensus_repeat	Method
TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA	CRT

spacers of CP018629_8

>8.1|2556787|33|CP018629|CRT
CATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCACCTTCTG
>8.2|2556843|36|CP018629|CRT
TGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTA
>8.3|2556902|33|CP018629|CRT
CATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP018629_8

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of CP018629_8

>merge|CP018629|8|2556764-2556957|CRT
TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCACCTTCTGTGTTGGGGCCCCGTTCCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGTA

>CP018629|8|2|2556764-2556957|CRT
TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA	CATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCACCTTCTG
TGTTGGGGCCCCGTTCCCCAACT	TGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTA
TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA	CATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTG
TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGTA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
CP018629.1|AUS76236.1|2561249_2561744_+|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-C	unknown	unknown	gnl|CDD|236483
CP018629.1|AUS76238.1|2562282_2563287_-|molybdopterin-biosynthesis-protein-MoeB	unknown	unknown	gnl|CDD|181084
CP018629.1|AUS76226.1|2556057_2556408_-|MarR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|130944
CP018629.1|AUS76227.1|2556533_2556704_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS76237.1|2561745_2562252_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223595
CP018629.1|AUS76225.1|2554744_2555956_+|MFS-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|341042
CP018629.1|AUS76220.1|2548204_2551372_-|multidrug-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|223911
CP018629.1|AUS76224.1|2554311_2554752_+|MarR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|197670
CP018629.1|AUS76239.1|2563456_2564062_-|molybdenum-ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226628
CP018629.1|AUS76221.1|2551488_2552754_-|N-acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|225224
CP018629.1|AUS76219.1|2547700_2548018_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS76234.1|2559445_2559931_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B	unknown	unknown	gnl|CDD|224677
CP018629.1|AUS76223.1|2553385_2554150_-|sulfurtransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|379203
CP018629.1|AUS76230.1|2557098_2558121_-|cyclic-pyranopterin-phosphate-synthase-MoaA	unknown	unknown	gnl|CDD|274250
CP018629.1|AUS76235.1|2559927_2561187_-|molybdopterin-molybdenumtransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|238452
CP018629.1|AUS76232.1|2558746_2558980_-|molybdopterin-converting-factor-subunit-1	unknown	unknown	gnl|CDD|340452
CP018629.1|AUS76231.1|2558140_2558740_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA	unknown	unknown	gnl|CDD|234725
CP018629.1|AUS76233.1|2558985_2559432_-|molybdopterin-synthase-subunit-2	unknown	unknown	gnl|CDD|223391
CP018629.1|AUS76222.1|2553142_2553394_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP018629.1|AUS76218.1|2547291_2547456_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
CP018629.1|AUS76238.1|2562282_2563287_-|molybdopterin-biosynthesis-protein-MoeB	gnl|CDD|181084	PRK07688, PRK07688, thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein; Validated.	3.67241e-132
CP018629.1|AUS76226.1|2556057_2556408_-|MarR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|130944	TIGR01889, Pleiotropic_Regulator_Of_Virulence, staphylococcal accessory regulator family. This model represents a family of transcriptional regulatory proteins in Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis. Some members contain two tandem copies of this region. This family is related to the MarR transcriptional regulator family described by pfam01047. [Regulatory functions, DNA interactions].	2.64009e-20
CP018629.1|AUS76237.1|2561745_2562252_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein	gnl|CDD|223595	COG0521, MoaB, Molybdopterin biosynthesis enzymes [Coenzyme metabolism].	1.02752e-64
CP018629.1|AUS76225.1|2554744_2555956_+|MFS-transporter	gnl|CDD|341042	cd17489, MFS_YfcJ_like, Escherichia coli YfcJ, YhhS, and similar transporters of the Major Facilitator Superfamily. This subfamily is composed of Escherichia coli membrane proteins, YfcJ and YhhS, Bacillus subtilis uncharacterized MFS-type transporter YwoG, and similar proteins. YfcJ and YhhS are putative arabinose efflux transporters. YhhS has been implicated glyphosate resistance. YfcJ-like arabinose efflux transporters belong to the bacterial MdtG-like and eukaryotic solute carrier 18 (SLC18) family of the Major Facilitator Superfamily (MFS) of transporters. MFS proteins are thought to function through a single substrate binding site, alternating-access mechanism involving a rocker-switch type of movement.	1.27961e-72
CP018629.1|AUS76220.1|2548204_2551372_-|multidrug-transporter	gnl|CDD|223911	COG0841, AcrB, Cation/multidrug efflux pump [Defense mechanisms].	0
CP018629.1|AUS76224.1|2554311_2554752_+|MarR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|197670	smart00347, HTH_MARR, helix_turn_helix multiple antibiotic resistance protein.	2.35323e-15
CP018629.1|AUS76239.1|2563456_2564062_-|molybdenum-ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|226628	COG4148, ModC, ABC-type molybdate transport system, ATPase component [Inorganic ion transport and metabolism].	3.32197e-115
CP018629.1|AUS76221.1|2551488_2552754_-|N-acetyltransferase	gnl|CDD|225224	COG2348, COG2348, Peptidoglycan interpeptide bridge formation enzyme [Cell wall/membrane/envelope biogenesis].	4.8324e-143
CP018629.1|AUS76231.1|2558140_2558740_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA	gnl|CDD|234725	PRK00317, mobA, molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobA; Reviewed.	5.68918e-67
CP018629.1|AUS76234.1|2559445_2559931_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B	gnl|CDD|224677	COG1763, MobB, Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein [Coenzyme metabolism].	4.35501e-50
CP018629.1|AUS76223.1|2553385_2554150_-|sulfurtransferase	gnl|CDD|379203	pfam13468, Glyoxalase_3, Glyoxalase-like domain. This domain is related to the Glyoxalase domain pfam00903.	1.50083e-38
CP018629.1|AUS76230.1|2557098_2558121_-|cyclic-pyranopterin-phosphate-synthase-MoaA	gnl|CDD|274250	TIGR02666, Cyclic_pyranopterin_monophosphate_synthase, molybdenum cofactor biosynthesis protein A, bacterial. The model for this family describes molybdenum cofactor biosynthesis protein A, or MoaA, as found in bacteria. It does not include the family of probable functional equivalent proteins from the archaea. MoaA works together with MoaC to synthesize precursor Z from guanine. [Biosynthesis of cofactors, prosthetic groups, and carriers, Molybdopterin].	1.0538e-165
CP018629.1|AUS76235.1|2559927_2561187_-|molybdopterin-molybdenumtransferase	gnl|CDD|238452	cd00887, MoeA, MoeA family. Members of this family are involved in biosynthesis of the molybdenum cofactor (MoCF), an essential cofactor of a diverse group of redox enzymes. MoCF biosynthesis is an evolutionarily conserved pathway present in eubacteria, archaea and eukaryotes. MoCF contains a tricyclic pyranopterin, termed molybdopterin (MPT). MoeA, together with MoaB, is responsible for the metal incorporation into MPT, the third step in MoCF biosynthesis. The plant homolog Cnx1 is a MoeA-MogA fusion protein. The mammalian homolog gephyrin is a MogA-MoeA fusion protein, that plays a critical role in postsynaptic anchoring of inhibitory glycine receptors and major GABAa receptor subtypes.	9.49423e-160
CP018629.1|AUS76232.1|2558746_2558980_-|molybdopterin-converting-factor-subunit-1	gnl|CDD|340452	cd00754, Ubl_MoaD, ubiquitin-like (Ubl) domain found in molybdenum cofactor biosynthesis protein D (MoaD) and similar proteins. MoaD, also termed molybdopterin synthase sulfur carrier subunit, or MPT synthase subunit 1, or MPT synthase small subunit, or molybdopterin-converting factor small subunit, or molybdopterin-converting factor subunit 1, is a conserved small sulfur carrier protein that has beta-grasp ubiquitin-like (Ubl) fold involved in biosynthesis of the molybdenum cofactor (Moco), an essential cofactor of a diverse group of redox enzymes. MoaD is activated in an ATP-dependent manner by sulfurtransferases similar to the activation mechanism of ubiquitin-activating enzyme E1.	8.16473e-25
CP018629.1|AUS76233.1|2558985_2559432_-|molybdopterin-synthase-subunit-2	gnl|CDD|223391	COG0314, MoaE, Molybdopterin converting factor, large subunit [Coenzyme metabolism].	5.56799e-58
CP018629.1|AUS76236.1|2561249_2561744_+|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-C	gnl|CDD|236483	PRK09364, moaC, cyclic pyranopterin monophosphate synthase MoaC.	3.63862e-98

Protein sequences

>CP018629.1|AUS76227.1|2556533_2556704_+|hypothetical-protein
MFRFISFGQLVVYSTTFIPKKDILQLNGMECDINVKEPLKIYYVVILKSGIEMIFS
>CP018629.1|AUS76226.1|2556057_2556408_-|MarR-family-transcriptional-regulator
MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN
>CP018629.1|AUS76225.1|2554744_2555956_+|MFS-transporter
MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFLVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETNVIDKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN
>CP018629.1|AUS76224.1|2554311_2554752_+|MarR-family-transcriptional-regulator
MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND
>CP018629.1|AUS76223.1|2553385_2554150_-|sulfurtransferase
MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV
>CP018629.1|AUS76222.1|2553142_2553394_+|hypothetical-protein
MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNILTILSIVLVIIHMGILAHSTYVYLY
>CP018629.1|AUS76221.1|2551488_2552754_-|N-acetyltransferase
MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEVQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMKTSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYVLNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK
>CP018629.1|AUS76220.1|2548204_2551372_-|multidrug-transporter
MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSIQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASAPNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGENLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQHQEGLGVVSTTYKKVLHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHADGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATTVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR
>CP018629.1|AUS76219.1|2547700_2548018_+|hypothetical-protein
MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF
>CP018629.1|AUS76218.1|2547291_2547456_+|hypothetical-protein
MSLENQLAELKYDYVRLQGDIEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD
>CP018629.1|AUS76230.1|2557098_2558121_-|cyclic-pyranopterin-phosphate-synthase-MoaA
MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG
>CP018629.1|AUS76231.1|2558140_2558740_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA
MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNVYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL
>CP018629.1|AUS76232.1|2558746_2558980_-|molybdopterin-converting-factor-subunit-1
MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQALTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG
>CP018629.1|AUS76233.1|2558985_2559432_-|molybdopterin-synthase-subunit-2
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>CP018629.1|AUS76239.1|2563456_2564062_-|molybdenum-ABC-transporter-ATP-binding-protein
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Self-targeting detection

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2. spacer 3.1|1594540|34|CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 1099600-1099633, mismatch: 0, identity: 1.0

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**********************************

3. spacer 8.2|2556843|36|CP018629|CRT matches to position: 1310487-1310522, mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|1310398|26|CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 1675886-1675911, mismatch: 2, identity: 0.923

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14. spacer 1.1|1310398|26|CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 1675998-1676023, mismatch: 2, identity: 0.923

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17. spacer 4.1|1644389|29|CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 1310487-1310515, mismatch: 2, identity: 0.931

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18. spacer 4.1|1644389|29|CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 1511541-1511569, mismatch: 2, identity: 0.931

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19. spacer 4.1|1644389|29|CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 1594503-1594531, mismatch: 2, identity: 0.931

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20. spacer 4.1|1644389|29|CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 2749703-2749731, mismatch: 2, identity: 0.931

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********** ***************.******

23. spacer 8.1|2556787|33|CP018629|CRT matches to position: 1099646-1099678, mismatch: 2, identity: 0.939

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********** *************** ******

24. spacer 8.1|2556787|33|CP018629|CRT matches to position: 1310434-1310466, mismatch: 2, identity: 0.939

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********** *************** ******

25. spacer 8.1|2556787|33|CP018629|CRT matches to position: 1412482-1412514, mismatch: 2, identity: 0.939

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********** *************** ******

26. spacer 8.1|2556787|33|CP018629|CRT matches to position: 2830049-2830081, mismatch: 2, identity: 0.939

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28. spacer 8.2|2556843|36|CP018629|CRT matches to position: 428623-428658, mismatch: 2, identity: 0.944

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31. spacer 8.3|2556902|33|CP018629|CRT matches to position: 1310434-1310466, mismatch: 2, identity: 0.939

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32. spacer 8.3|2556902|33|CP018629|CRT matches to position: 1412482-1412514, mismatch: 2, identity: 0.939

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cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg	Protospacer
********************..***********

33. spacer 8.3|2556902|33|CP018629|CRT matches to position: 1639003-1639035, mismatch: 2, identity: 0.939

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*********************.*.*********

34. spacer 8.3|2556902|33|CP018629|CRT matches to position: 2830049-2830081, mismatch: 2, identity: 0.939

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cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg	Protospacer
********************..***********

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
CP018629_4	4.1|1644389|29|CP018629|CRISPRCasFinder	1644389-1644417	29	MN693281	Marine virus AFVG_25M371, complete genome	6448-6476	7	0.759
CP018629_2	2.4|1315903|35|CP018629|CRT	1315903-1315937	35	KY971610	Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome	73937-73971	11	0.686

1. spacer 4.1|1644389|29|CP018629|CRISPRCasFinder matches to MN693281 (Marine virus AFVG_25M371, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759

tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca	CRISPR spacer
cacttagaagaaatcctacaaacaatgca	Protospacer
. .. *.*******.**************

2. spacer 2.4|1315903|35|CP018629|CRT matches to KY971610 (Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686

ttgtctgttgaaattggtgatcctatttctctctg	CRISPR spacer
aaagctgttcaaattggtgaccctatttcatgtgg	Protospacer
  . ***** **********.******** . . *

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	1483 : 54770	56	Streptococcus_phage(30.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	338722 : 413967	110	Staphylococcus_phage(85.54%)	protease,tail,head,holin,capsid,integrase,portal,terminase	attL 325623:325638|attR 356213:356228
DBSCAN-SWA_3	479509 : 593863	112	Staphylococcus_phage(91.04%)	protease,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_4	726048 : 735091	7	uncultured_Mediterranean_phage(50.0%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_5	805504 : 813816	7	Caulobacter_phage(16.67%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_6	868940 : 956677	109	Staphylococcus_phage(80.77%)	protease,tail,head,holin,capsid,tRNA,integrase,portal,terminase	attL 864768:864785|attR 930839:930856
DBSCAN-SWA_7	1138416 : 1144408	10	Staphylococcus_phage(83.33%)	transposase,head	NA
DBSCAN-SWA_8	1402536 : 1410991	9	Synechococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_9	1429903 : 1448637	21	Staphylococcus_phage(50.0%)	protease,bacteriocin,transposase	NA
DBSCAN-SWA_10	1578227 : 1593035	23	Staphylococcus_phage(89.47%)	integrase,coat,terminase	attL 1575922:1575940|attR 1590483:1590501
DBSCAN-SWA_11	1631732 : 1640342	8	Streptococcus_phage(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_12	1672808 : 1687538	19	uncultured_Caudovirales_phage(50.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_13	1699510 : 1707330	10	Pandoravirus(16.67%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_14	2029385 : 2081370	56	Streptococcus_phage(60.87%)	integrase,transposase,protease	attL 2034013:2034028|attR 2086578:2086593
DBSCAN-SWA_15	2127878 : 2183362	73	Staphylococcus_phage(96.97%)	protease,tail,head,holin,capsid,integrase,portal,terminase	attL 2119507:2119526|attR 2171314:2171333
DBSCAN-SWA_16	2194427 : 2323838	143	Staphylococcus_phage(92.7%)	transposase,tail,holin,tRNA,integrase,terminase	attL 2226640:2226699|attR 2262946:2264269

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>CP018629|1483:54770|DBSCAN-SWA
TATGGATTTAGATACAATTACGAGTATTTCAACACCAATGGGTGAAGGGGCAATTGGAATTGTTCGATTGTCTGGACCGCAAGCCGTTGAAATTGCTGACAAATTATATAAAGGAAAACATCTTTTAAATGATGTTCCATCACATACGATTAATTACGGTCATATTATTGATCCAGAGTCTAAAGAAGTGGTTGAAGAAGTTATGGTGTCTGTGTTAAGAGCACCAAAAACATTTACACGCGAAGATATTATAGAAATTAATTGTCATGGTGGTATTTTAACGATTAATAGAGTGCTGGAACTTACTATGACATATGGCGCTAGAATGGCTGAACCAGGTGAATTTACAAAACGTGCCTTTTTAAATGGTCGTATTGATTTATCTCAAGCTGAGGCAGTTATGGACTTTATTCGCTCGAAAACAGATAGAGCTTCTAAAGTTGCGATGAATCAAATTGAAGGTCGTCTAAGTGACTTAATCAAAAAACAACGTCAATCTATATTAGAGATACTCGCTCAAGTGGAAGTGAATATTGATTATCCTGAATACGATGATGTTGAAGATGCGACTACTGAATTTCTTTTAGAGCAGTCTAAAGAAATCAAACAGGAAATTAATCGTTTATTAGATACCGGTGCGCAGGGTAAAATTATGCGTGAAGGTTTATCTACAGTTATTGTTGGTAAACCAAATGTAGGTAAATCATCGATGTTAAATAATTTAATACAAGATAATAAAGCGATTGTAACTGAGGTAGCAGGTACGACTAGAGATGTCTTAGAAGAGTACGTCAATGTTCGTGGCGTGCCATTAAGATTAGTTGATACTGCTGGTATACGTGAGACAGAAGATATAGTAGAGAAGATTGGTGTTGAACGCTCTAGAAAGGCTCTTAGCCAAGCGGACTTAATTTTATTTGTATTAAACAATAACGAAGCATTGACTCAAGAAGATTACACATTATATGAAGTGGTTAAAAATGAAGATGTAATCGTAATTGTTAATAAAATGGATTTAGAGCAAAATATAGATATTAATGAAGTTAAAGATATGATAGGCGATACGCCATTAATTCAAACTTCAATGTTAAAACAAGAAGGTATTGATGAATTAGAAATACAAATTCGAGATTTGTTCTTTGGTGGAGAAGTACAAAATCAAGATATGACTTATGTTTCTAATTCAAGACATATTTCATTATTAAAACAAGCAAGACAAACGATACAAGATGCGATTGATGCAGCAGAATCTGGTGTGCCTATGGATATGGTACAAATCGATTTAACTAGAACTTGGGAAATATTAGGAGAAATTATTGGTGAGACTGCAAGTGATGAACTCATCGATCAGTTATTCAGTCAATTCTGCTTAGGTAAATAGTAATTGAAATAGACGGAATACCGTCTTAAGAAGGCTAGTAAGATATCAAATAAGGAGGTTTATATTGTGGTTCAAGAATATGATGTAATCGTTATAGGTGCGGGACATGCAGGTGTAGAAGCAGGTTTAGCATCTGCAAGACGTGGTGCTAAAACATTAATGCTAACAATAAATTTAGATAATATTGCATTTATGCCATGTAACCCATCTGTAGGTGGACCAGCTAAAGGTATCGTTGTTCGTGAAATTGATGCTTTAGGTGGACAAATGGCAAAAACAATCGATAAAACACACATTCAAATGAGAATGTTAAATACTGGTAAAGGACCTGCTGTAAGAGCACTAAGAGCGCAAGCAGATAAAGTACTTTATCAACAAGAAATGAAACGCGTGATTGAAGATGAAGAAAATTTGCATATAATGCAAGGTATGGTAGACGAACTTATTATAGAAGATAATGAAGTTAAAGGTGTACGTACAAATATTGGTACAGAGTATTTATCTAAAGCAGTAATTATTACAACGGGAACATTTTTACGTGGTGAAATCATTTTAGGTAATATGAAGTATTCAAGTGGACCAAATCACCAATTACCATCAATCACATTATCAGACAATTTAAGAGAACTTGGTTTTGATATTGTTCGTTTTAAAACAGGTACACCACCGCGTGTAAATTCAAAAACAATTGACTATTCGAAGACTGAAATACAACCAGGTGACGATGTGGGTCGTGCATTCAGCTTTGAAACAACAGAATATATATTAGATCAATTGCCATGTTGGCTAACGTATACTAATGCTGAAACACACAAAGTTATCGATGATAATTTACATCTATCTGCAATGTATTCAGGGATGATTAAAGGAACCGGGCCACGTTATTGCCCTTCAATTGAAGATAAATTTGTTCGATTTAATGATAAGCCGCGACATCAACTTTTCTTAGAGCCTGAAGGTCGTAATACAAATGAAGTATATGTGCAAGGATTGTCTACAAGTCTTCCTGAACATGTGCAACGTCAAATGTTAGAGACGATACCAGGTCTTGAAAAAGCAGATATGATGCGTGCCGGCTACGCAATTGAATATGATGCGATTGTGCCAACGCAGTTATGGCCTACACTTGAAACGAAAATGATTAAAAACCTATACACTGCAGGTCAAATTAATGGTACATCTGGTTATGAAGAAGCAGCAGGACAAGGATTGATGGCAGGTATTAACGCTGCAGGTAAAGTGTTAAACACAGGCGAAAAGATATTAAGTCGTTCAGATGCATATATAGGTGTATTAATCGATGATCTTGTAACTAAAGGTACTAATGAACCTTATCGTTTACTAACATCACGTGCAGAATATCGTTTGTTACTACGTCATGATAATGCTGATTTGAGATTGACGGATATGGGATATGAACTTGGTATGATTTCTGAAGAACGATATGCACGTTTTAATGAAAAACGTCAGCAAATTGATGCGGAAATTAAGCGTTTATCAGATATTCGTATTAAACCAAACGAACATACGCAAGCGATTATTGAACAACATGGTGGTTCTCGCTTAAAAGATGGTATTTTAGCTATCGATTTATTACGCAGACCTGAAATGACTTACGATATAATTTTAGAAATTTTAGAAGAAGAACATCAATTGAATGCAGATGTTGAAGAACAAGTAGAAATACAAACAAAATATGAAGGTTATATCAATAAATCACTACAACAAGTTGAGAAAGTTAAACGTATGGAAGAGAAGAAAATTCCAGAAGACTTAGATTATAGTAAGATTGATAGTTTGGCGACTGAAGCGCGAGAAAAATTATCAGAAGTAAAACCTTTAAATATTGCACAAGCTTCTAGAATATCAGGGGTAAATCCAGCAGACATATCTATATTATTGATTTACTTAGAACAAGGTAAACTCCAAAGGGTGAGTGACTAATGACTGTAGAATGGTTAGCAGAACAATTAAAAGAACATAATATTGAATTAACTGAGACTCAAAAACAACAGTTTCAAACATATTATCGTTTACTTGTTGAATGGAATGAAAAGATGAATTTGACAAGTATTACAGATGAACACGATGTATATTTGAAACATTTTTATGATTCCATTGCACCTAGTTTTTATTTTGATTTTAATCAGCCTATAAGTATATGTGATGTAGGCGCTGGAGCTGGTTTTCCAAGTATTCCGTTAAAAATAATGTTTCCGCAGTTAAAAGTGACGATTGTTGATTCATTAAATAAGCGTATTCAATTTTTAAACTATTTAGCGTCAGAATTACAATTACAGGATGTCAGCTTTATACACGATAGAGCAGAAACATTTGGTAAGGGTGTCTACAGGGAGTCTTATGATGTTGTTACTGCAAGAGCAGTAGCTAGATTATCCGTGTTGAGTGAATTGTGTTTACCGCTAGTTAAAAAAGGTGGACAGTTTGTTGCATTAAAATCTTCAAAAGGTGAAGAAGAATTAGAAGAAGCAAAATTTGCAATTAGTGTGTTAGGTGGTAACGTTACAGAAACACATACCTTTGAATTGCCAGAAGATGCTGGAGAGCGCCAGATGTTCATTATTGATAAAAAAAGACAGACGCCGAAAAAGTATCCAAGAAAACCAGGGACGCCTAATAAGACTCCTTTACTTGAAAAATAATGCATAATCCTTTACAACTAACATAAAAGGAGCGAATGGATAATGAAAAAACCTTTTTCAAAATTATTTGGTTTGAAAAACAAAGATGACATCATTGGACATATTGAAGAAAATCGCAATAGTAATGTTGAATCCATTCAAATTGAACGTATCGTTCCCAACCGTTATCAACCAAGACAGGTATTTGAACCAAATAAAATTAAAGAACTTGCTGAATCAATACATGAACATGGTTTATTACAGCCTATTGTTGTAAGACCGATTGAAGAAGATATGTTTGAAATTATTGCTGGAGAGCGCCGATTTAGAGCAATACAATCACTAAATTTACCTCAAGCAGACGTTATTATTCGTGATATGGATGATGAAGAGACGGCTGTTGTGGCATTAATTGAGAATATTCAAAGAGAAAATTTGTCTGTTGTTGAAGAAGCGGAAGCCTATAAGAAATTATTGGAAATTGGTGATACAACGCAAAGTGAATTGGCAAAAAGTTTAGGTAAAAGTCAAAGCTTTATTGCAAATAAGTTGCGTTTATTGAAGTTGGCGCCGAAAGTACTACTTCGCTTAAGAGAAGGTAAAATTACTGAACGCCATGCGAGAGCGGTATTATCATTGTCTGATAGCGAACAAGAAGCGTTGATTGAGCAAGTCATTGCACAAAAACTAAATGTGAAACAGACTGAAGATAGAGTACGCCAAAAAACTGGGCCCGAAAAAGTCAAAGCACAAAACCTTCGCTTTGAACAAGATGTCACGCAAGCACGAGATGAGGTAGGCAAAAGTATCCAAGCGATTCAACAAATAGGATTACATGTTGAGCATAAAGACAAAGATCATGAAGATTATTATGAAATAAAAATTCGAATATATAAACGTTAGTAGTAGGATGTCGTATACATGATGACTAACACATAAAAGACAAAGCTAAGATCATTACAGCTTTGTCTTTTTTG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MTYDKKMINRINRIQGQLNGVVKMMEEEKDCKDIITQLSASKGSIQRLMGIIISENLIECVKTAEENNESSQELINEAVNLLVKSK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AUS73738.1|1483_2863_+|tRNA	tRNA uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34) synthesis GTPase MnmE	NA	NA	NA	NA
AUS73739.1|2929_4807_+|tRNA	tRNA uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34) synthesis enzyme MnmG	NA	NA	NA	NA
AUS73740.1|4806_5526_+	16S rRNA (guanine(527)-N(7))-methyltransferase RsmG	NA	NA	NA	NA
AUS73741.1|5568_6408_+	nucleoid occlusion protein	A0A2K9V477	Faecalibacterium_phage	1.8e-05	23.4
AUS73742.1|6614_7100_+|transposase	IS200/IS605 family transposase	A0A1P8BMC0	Lactococcus_phage	4.9e-19	35.4
AUS73743.1|7391_7730_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS73744.1|7823_8135_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS73745.1|8150_8657_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS73746.1|8677_8995_+	DNA recombinase	NA	NA	NA	NA
AUS73747.1|9113_10199_+|transposase	transposase	A0A0A8WIF9	Clostridium_phage	4.5e-12	28.3
AUS73748.1|10195_12088_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AUS73749.1|12094_12472_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AUS73750.1|12651_13017_+	transcriptional regulator	E4ZFI8	Streptococcus_phage	7.7e-25	49.6
AUS73751.1|13009_15424_+	cadmium transporter	E4ZFI9	Streptococcus_phage	2.3e-250	63.6
AUS73752.1|15504_16122_+	cadmium resistance protein CadD	NA	NA	NA	NA
AUS73753.1|16389_17034_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS73754.1|17033_17294_-	cytoplasmic protein	NA	NA	NA	NA
AUS73755.1|17429_18494_+	dihydroneopterin aldolase	NA	NA	NA	NA
AUS73756.1|18525_19464_+	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
AUS73757.1|19554_19860_+	rhodanese	NA	NA	NA	NA
AUS73758.1|19973_21122_-	XylR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AUS73759.1|21281_21494_-	fudoh	NA	NA	NA	NA
AUS73760.1|21965_23723_-	methicillin resistance protein	NA	NA	NA	NA
AUS73761.1|23822_25829_+	penicillin-binding protein 2A	NA	NA	NA	NA
AUS73762.1|25874_26303_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS73763.1|26399_27143_-	glycerophosphoryl diester phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
AUS73764.1|27912_28122_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS73765.1|28219_28609_-	nucleoid-structuring protein H-NS	NA	NA	NA	NA
AUS73766.1|28644_29319_+|transposase	IS6 family transposase	A0A0N9RU54	Staphylococcus_phage	2.6e-127	99.1
AUS76732.1|29407_30211_-	replication initiation protein	NA	NA	NA	NA
AUS73767.1|30888_32130_-	plasmid recombination enzyme	NA	NA	NA	NA
AUS73768.1|32318_33698_-	tetracycline efflux MFS transporter Tet(K)	NA	NA	NA	NA
AUS73769.1|33894_34569_+|transposase	IS6 family transposase	A0A0N9RU54	Staphylococcus_phage	2.6e-127	99.1
AUS73770.1|34687_35203_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS73771.1|35212_35395_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS73772.1|35397_36048_-	alkylmercury lyase	NA	NA	NA	NA
AUS73773.1|36129_37773_-	mercury(II) reductase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	1.7e-50	29.4
AUS73774.1|37830_38169_-	mercury transporter	NA	NA	NA	NA
AUS73775.1|38304_38985_-	cytochrome C biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
AUS73776.1|38981_39335_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS73777.1|39351_39759_-	Hg(II)-responsive transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AUS73778.1|40058_41405_-	pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
AUS73779.1|41687_42362_+|transposase	IS6 family transposase	A0A0N9RU54	Staphylococcus_phage	2.0e-127	99.1
AUS73780.1|44716_45283_-	peptidase	NA	NA	NA	NA
AUS73781.1|45432_45654_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS73782.1|46120_46537_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS73783.1|46599_47127_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS73784.1|47261_47750_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS73785.1|47765_48056_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS73786.1|48112_48985_-	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AUS73787.1|49532_50195_-	SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
AUS73788.1|50553_50757_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS73789.1|50703_51435_+	23S rRNA (adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(B)	E4ZFQ0	Streptococcus_phage	1.9e-51	47.5
AUS73790.1|51560_52343_-	aminoglycoside nucleotidyltransferase	NA	NA	NA	NA
AUS73791.1|52493_52871_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AUS73792.1|52877_54770_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>CP018629|338722:413967|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>CP018629|479509:593863|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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MNKVILVDDHYIVRQGLRFLLSTIENIEVLQDFADGETFLEYLKEHEHPDIVLLDLVMPGMNGIEITEYIKAHYPDIKVLVLTSYVDDEHVISAINKGADGYEMKDVEPQQLIETIRRVMNGEKMIHLKAQDVFETVSQKPHYTNKLSKREIEVLREMVKGKTNKEIAETLFVSEKTIKTHVSHIFSKLQVSDRTQAAIYAMENKLI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AUS74190.1|479509_480652_+|tRNA	tRNA epoxyqueuosine(34) reductase QueG	NA	NA	NA	NA
AUS74191.1|480656_481127_+|tRNA	tRNA (uridine(34)/cytosine(34)/5- carboxymethylaminomethyluridine(34)-2'-O)- methyltransferase TrmL	NA	NA	NA	NA
AUS74192.1|481285_481885_+	glucosamine-6-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
AUS74193.1|481909_482062_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74194.1|482357_482720_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74195.1|482838_483234_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74196.1|483429_484815_+	fumarate hydratase, class II	NA	NA	NA	NA
AUS74197.1|485277_486099_-	RNA pseudouridine synthase	NA	NA	NA	NA
AUS74198.1|486261_487374_+	histidine kinase	NA	NA	NA	NA
AUS74199.1|487395_488019_+	DNA-binding response regulator	NA	NA	NA	NA
AUS74200.1|488374_488839_+	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AUS74201.1|489017_490142_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74202.1|490210_490555_+	hypothetical protein	A0A1X9I5Y8	Streptococcus_phage	7.5e-06	29.7
AUS74203.1|490937_491036_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74204.1|491326_492523_+	DNA repair exonuclease	NA	NA	NA	NA
AUS74205.1|492512_495449_+	DNA repair protein Rad50	NA	NA	NA	NA
AUS74206.1|495445_496387_+	3'-5' exoribonuclease YhaM	NA	NA	NA	NA
AUS74207.1|496507_497470_-	peptidylprolyl isomerase	NA	NA	NA	NA
AUS74208.1|497674_498232_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74209.1|498964_499330_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74210.1|499471_499894_-	HIT family protein	NA	NA	NA	NA
AUS74211.1|500027_500768_+	multidrug ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.2e-24	29.8
AUS74212.1|500760_501984_+	multidrug ABC transporter ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
AUS74213.1|502107_502611_-	signal transduction protein TRAP	NA	NA	NA	NA
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AUS74215.1|502873_503911_+	uroporphyrinogen decarboxylase	NA	NA	NA	NA
AUS74216.1|503968_504892_+	ferrochelatase	NA	NA	NA	NA
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AUS74275.1|565323_565794_-	RNA polymerase subunit sigma	A0A2H4PQT5	Staphylococcus_phage	1.0e-82	99.4
AUS74276.1|565992_566217_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74277.1|566492_567347_+	autolysin	Q4ZCC7	Staphylococcus_virus	9.8e-39	38.6
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AUS74279.1|568054_569347_-	arsenical efflux pump membrane protein ArsB	A0A2H4PQU3	Staphylococcus_phage	5.0e-228	99.5
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AUS74284.1|575053_575518_+	6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase	A0A2H4PQS3	Staphylococcus_phage	5.8e-70	99.4
AUS74285.1|575639_576641_-	proline dehydrogenase	A0A2H4PQT6	Staphylococcus_phage	9.0e-185	99.7
AUS76757.1|576549_576741_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74286.1|576752_576872_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74287.1|576874_577702_+	lysophospholipase	NA	NA	NA	NA
AUS74288.1|579153_580326_+|transposase	IS256 family transposase	A0A0N9STL0	Staphylococcus_phage	3.5e-135	100.0
AUS74289.1|580613_581015_+	MarR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AUS74290.1|581134_581698_-	16S rRNA (cytosine(1402)-N(4))-methyltransferase	A0A2H4PQV0	Staphylococcus_phage	8.3e-103	99.5
AUS74291.1|581694_582648_-	TIGR01212 family radical SAM protein	A0A2H4PQV5	Staphylococcus_phage	2.2e-79	100.0
AUS74292.1|582757_583939_+	MFS transporter	A0A2H4PQR6	Staphylococcus_phage	5.6e-218	100.0
AUS74293.1|584229_586644_+|tRNA	leucine--tRNA ligase	A0A2H4PQS0	Staphylococcus_phage	0.0e+00	99.2
AUS74294.1|586665_586977_+	sulfurtransferase	A0A2H4PQR9	Staphylococcus_phage	1.6e-52	100.0
AUS74295.1|587302_593863_+	peptidase	A0A2H4PQU6	Staphylococcus_phage	2.0e-304	98.1

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>CP018629|726048:735091|DBSCAN-SWA
CATGAATGAGCGTATGGTTGATCAATCAATGCATAGTGAAGAAACTGATTTCGAATTGTCGCTTAGACCTACGAGATTACGACAATATATTGGTCAAAATTCAATAAAAAGTAATTTAGAAGTATTTATTAAAGCGGCTAAACTTCGTCATGAACCATTAGATCATGTATTGCTTTTTGGCCCCCCTGGATTAGGTAAGACAACATTATCTAATATCATTGCCAATGAAATGGAAGTTAATATACGTACAGTATCAGGGCCTTCATTAGAAAGACCTGGTGATTTGGCTGCAATTTTATCAGGACTTCAACCTGGAGATGTTTTGTTTATTGATGAAATACACAGACTGAGTAGTGTTGTTGAAGAAGTGTTATACCCTGCAATGGAAGATTTCTTTTTAGATATTATCATTGGTAAAGGCGATGAGGCTAGAAGTATCCGTATCGACTTACCTCCATTCACTTTGGTAGGTGCAACAACGCGAGCTGGCAGCTTAACAGGTCCACTAAGGGATCGATTTGGTGTGCACTTAAGATTAGAATATTATAACGAATCAGATTTAAAAGAAATCATTATTAGAACAGCTGAGGTTTTAGGCACAGGTATTGATGAAGAAAGTGCCATTGAACTTGCTAAACGTTCTAGAGGGACTCCAAGAGTAGCAAATCGACTATTGAAGCGGGTAAGAGACTTCCAGCAAGTGAATGAAGATGAACAAATATACATTGAAACAACGAAGCACGCATTAGGTTTACTTCAAGTTGATCAACACGGACTAGATTACATTGATCATAAAATGATGAACTGTATTATTAAGCAGTATAATGGCGGACCTGTTGGTTTAGATACGATTGCCGTAACAATTGGTGAAGAACGTATTACAATTGAGGACGTTTATGAGCCATTTCTTATTCAGAAAGGCTTTTTAGAACGTACGCCACGTGGCAGAAAAGCAACACCATTAGCTTATGAACATTTTGCAAAGTCGAATGAGGAGAGAGAATAACGTGAATATTGAAGAATTTGACTATGACTTACCAGAATCATTAATTGCTCAAACGCCTTTAAAAGATCGTGATCATAGTCGTTTATTAGTCATGGATAGAGAAACTGGTGAAATGAAACATTTACATTTCAAAGATATCATTGAGTATTTTAGACCTGGTGATACATTAGTGCTTAACGATACGCGAGTAATGCCAGCTAGACTTTTTGGTTTAAAAGAAGAAACTGGTGCAAAAGTTGAAATGTTAATGTTAACTCAAATTGAAGGTAATGATTGGGAAGTCTTACTGAAACCAGCTAAGCGTATTAAAGTTGGTAATAAATTGAATTTTGGTAATGGCAAAATTATAGCTGAATGCATAAAAGAAATGGATCAAGGTGGACGCATCATGCGTTTACATTATGAAGGTATTTTACAAGAAAGATTAGATGAATTAGGGGAAATGCCACTGCCACCATACATCAAAGAACGTTTAGATGATCCAGATCGTTATCAAACAGTTTACGCTAAAGAAAGTGGTTCAGCGGCAGCACCAACAGCAGGATTACATTTTACTGATGAGTTATTAATTGAAATTAAAAATAAAGGTGTTAATATCGCATTTGTTACATTACATGTTGGGTTAGGTACGTTTAGACCGGTGAGCGTAGACGATGTGAATGACCACGAAATGCATAGTGAATATTATCAAATGACACAAGAAACAGCTGATTTATTAAATGATACTAAGTCCAAAGGACATCGCATTATATCAGTTGGTACAACTTCAACACGTACACTTGAAACAATTCGACGCGATCATGATAAATTTGTTGAAACGAGTGGCTGTACTAATATATTTATTTATCCAGGATTTGATTTTAAAGCAATTGATGGCCAGATTACTAATTTTCATTTACCAAAATCAACATTAGTTATGCTAGTATCAGCGTTTAGTAGTCGTGAAAATGTTCTGAATGCTTATAAAACGGCAGTAAATTTAGAATATAGATTCTTTAGTTTTGGCGATGCAATGTTAATTATATAAAAAGAATGTGAGGATTTTGAATATGCCTGCAGTAACATACGAACACATTAAAACTTGTAAACAATCAGGTGCGCGTTTAGGTATCGTGCACACACCACACGGTTCATTTGAAACACCTATGTTTATGCCAGTTGGTACTAAAGCAACCGTTAAAACAATGAGTCCAGAAGAGTTAAGACAAATTGAAGCAAAAATCATTTTGGGCAACACATATCATTTGTGGTTACAACCCGGAAATGATATTATCAAACACGCTGGGGGATTACATAAATTCATGAATTGGGATGGTCCGATTCTTACAGATTCAGGCGGTTTCCAAGTGTTTAGTTTAAGTAATTTACGTAAAATTACAGAAGAAGGCGTGGAATTTAGACATCATACTAATGGGTCTAAATTATTTTTGAGTCCTGAGAAATCAATGCAAATTCAAAATGATTTAGGATCTGATATTATGATGGCATTTGATGAATGTCCACCGATGCCTGCTGAATATGATTATGTAAAAAAATCTATTGAACGTACAACACGTTGGGCGAAAAGATGTCTAGATGCACACCAAAGACCTGAAGATCAAGCATTGTTCGGCATTATACAAGGTGGCGAATATGAAGATTTAAGAGAACAAAGTGCAAAGGATTTAGTAGAATTAGATTTTCCTGGTTATGCAATCGGCGGTTTGTCAGTTGGTGAACCTAAACCGGTTATGTATAAAATGGTTGAACATACAGAGCAGTTTATGCCTAAAGATAAACCAAGATATTTAATGGGTGTAGGATCTCCAGATGCGTTAATCGAATGTAGTATTCGCGGCATGGATATGTTTGATTGTGTCTTACCGACACGTATTGCCAGAAATGGTACTTGTATGACATCGCAAGGTCGTTTAGTTATTAAAAATGCAAAATTTGCAGATGATTTAAGACCGTTAGATGAGAATTGTGACTGTTATACATGTCAAAACTATTCAAGAGCGTATATACGTCATTTAATCAAGGCAGAGGAAACTTTTGGTATTCGTCTTACTACTATTCATAATTTACATTTTCTGCTAAAATTAATGGAAGATATAAGACAAGCCATTCGAGAAGATCGTCTTTTAGATTTCAAAGAAGAATTCTTCGAGCAATATGGATTAAATGTTGAGAACCCAAAAAACTTTTAAGCAAGAGGAGCGTATAAAATGCAATTTTCATTACTAATATATATAGTCGTAATTTTTGCGGTTATGTATTTCTTGATGATCAGACCACAACAAAAACGTGCGAAACAGCATCGTGAGTTGATTAATAACATTCAATCTGGTCAAAGAATTACAACTATTGGTGGTATTAAAGGTACTGTTAAAGCAGTAGATGAAACAACTGTTGTTATTACAGTTAATGGTCATGGTACTGAATTAACTTTCGAAAAACCTGCTATTAAACAAGTTGACCCTTCATAATGAGAAGTGGTATTAAAAAGGATGAAACGAATAGCGTTTCATCCTTTTTAAGTTATAAGTAGTATGTAGAATAGCTTATTTTTATTCCAAAAAAAGAAATTGTGATACATAATAATTGTTAAATTTAAATTAAATATATCTATGACTATTTTTACTCCCTGCTCTAGTATGTTAATATGTATAAGGCTAATAAATTTTGTAAGAAAGATTTAACTTGCGTTATAAAATAGTATTCAAGTATTCTAAATACATACGTAAATAATGAGGTGTTCATGTGAAGAAAAGTAGTAGAATAATTGCGTTCTTGCTTTTAGTCGTATTGTTGTTTGCCGGAATGGCTGCAACTTATAAAAGTGTTATAAAGAATGTCAATTTAGGACTTGATTTGCAAGGTGGATTTGAGGTGCTTTATCAAGTCGATCCTTTAAATAAAGGCGACAAAATAGATAAAAAAGCCTTACAATCAACAGCGCAAACATTAGAAAATCGTGTTAACGTTTTAGGTGTTTCGGAACCTAAAATTCAAGTTGAAGAACCTAATAGAATTAGAGTACAACTTGCTGGTGTAACAGACCAGAATGAAGCACGTAAAATTTTATCTTCTCAAGCTAATTTAACAATTCGCGATGCAGAAGATAAAGTAAAATTAAGCGGTTCTGATATTAAACAGGGATCTGCCAAACAAGAATTTAAACAGGAAACAAACCAGCCTACAGTTACTTTTAAAGTAAAAGACAAAAACAAATTTAAAAAAGTAACGGAAGAAATCTCTAAGAAACGTGATAATGTCATGGTTGTTTGGTTAGATTTCAAAAAAGGTGACAGCTATAAAAAAGAAGCACAAAAGAAAAACCCTAAATTTATTTCTGCAGCAAGTGTTGATCAACCAATCAATTCTGATAGCGTAGAAATCTCGGGTGGATTTAAAGGACAAGAAGGCGTTAAAAAAGCAAAACAAATCGCCGAATTGTTAAATGCAGGTTCTTTACCAGTTGACTTGAAAGAAATTTATTCAAACTCAGTAGGTGCCCAATTTGGTCAAGATGCATTAGATAAAACTGTGTTTGCATCGTTTATTGGTGTAGCATTAATTTATTTATTCATGCTTGGATTCTACCGATTACCTGGTTTAGTAGCGATTATTGCATTGACAACTTATATCTATCTAACGTTAGTAGCATTTAATTTCATTTCCGGGGTTCTAACTTTACCAGGATTAGCGGCGTTGGTATTAGGTGTAGGTATGGCTGTAGATGCCAATATTATCATGTATGAGCGTATTAAGGATGAACTTCGAATAGGTAGAACGATAAAGCAAGCCTTTTCTAAAGCAAACAAAAGTTCATTCCTAACAATTTTTGATTCTAACTTAACAACAGTTATCGCCGCAGCAGTATTATTCTTCTTCGGTGAAAGTTCAGTTAAAGGTTTCGCGACAATGTTATTATTAGGTATTCTAATGATCTTTGTTACAGCCGTGTTCTTATCAAGATTCTTATTATCATTACTTGTTTCATCAAATATAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

>CP018629|726048:735091|727054_728080_+|AUS74419.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLIEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGCTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSSRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII
>CP018629|726048:735091|726048_727053_+|AUS74418.1|DBSCAN-SWA
MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE
>CP018629|726048:735091|734572_735091_+|AUS74424.1|DBSCAN-SWA
MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE
>CP018629|726048:735091|732277_734551_+|AUS74423.1|DBSCAN-SWA
MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTATTILVITLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDVEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKQVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQIIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS
>CP018629|726048:735091|729260_729521_+|AUS74421.1|DBSCAN-SWA
MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS
>CP018629|726048:735091|729795_732075_+|AUS74422.1|DBSCAN-SWA
MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV
>CP018629|726048:735091|728102_729242_+|AUS74420.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AUS74418.1|726048_727053_+	Holliday junction DNA helicase RuvB	B3GAM6	uncultured_virus	1.7e-05	29.1
AUS74419.1|727054_728080_+|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
AUS74420.1|728102_729242_+|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	5.4e-85	44.7
AUS74421.1|729260_729521_+	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	8.2e-05	35.3
AUS74422.1|729795_732075_+	protein translocase subunit SecDF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-31	35.8
AUS74423.1|732277_734551_+	single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ	A7KV88	Bacillus_phage	1.2e-62	28.8
AUS74424.1|734572_735091_+	adenine phosphoribosyltransferase	A0A1V0SKE5	Klosneuvirus	5.6e-29	46.5

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>CP018629|805504:813816|DBSCAN-SWA
TTTGCGAATAGATCAATCGATCATTAATGAAATAAAAGATAAAACCGACATTTTAGACTTGGTAAGTGAATATGTAAAATTAGAAAAGAGAGGACGCAATTATATAGGTTTGTGTCCTTTTCATGATGAAAAGACACCTTCATTTACAGTTTCTGAAGATAAACAAATTTGTCATTGTTTTGGTTGTAAAAAAGGTGGCAATGTTTTTCAATTTACTCAAGAAATTAAAGACATATCATTTGTTGAAGCGGTTAAAGAATTAGGTGATAGAGTTAATGTTGCTGTAGATATTGAGGCAACACAATCTAACTCAAATGTTCAAATTGCTTCTGATGATTTACAAATGATTGAAATGCATGAGTTAATACAAGAATTTTATTATTACGCTTTAACAAAGACAGTCGAAGGCGAACAAGCATTAACGTACTTACAAGAACGTGGTTTTACAGATGCGCTTATTAAAGAGCGAGGCATTGGCTTTGCACCCGATAGCTCACATTTTTGTCATGATTTTCTTCAAAAAAAGGGTTACGATATTGAATTAGCATATGAAGCCGGATTATTATCACGTAACGAAGAAAATTTCAGTTATTACGATAGATTTCGAAATCGTATTATGTTTCCTTTGAAAAATGCGCAAGGAAGAATTGTTGGATATTCAGGTCGAACATATACCGGTCAAGAACCAAAATACTTAAATAGTCCTGAAACACCTATCTTTCAAAAAAGAAAGTTGTTATACAACTTAGATAAAGCGCGTAAATCAATTAGAAAATTAGATGAAATCGTATTACTAGAAGGTTTTATGGATGTTATAAAATCTGATACTGCTGGCTTGAAAAACGTTGTTGCAACAATGGGTACACAGTTGTCAGATGAACATATTACTTTTATACGAAAGTTAACATCAAATATAACATTAATGTTTGATGGGGATTTTGCGGGTAGTGAAGCAACACTTAAAACAGGTCAAAATTTGTTACAGCAAGGGCTAAATGTATTTGTTATACAATTGCCATCAGGCATGGATCCGGATGAATACATTGGTAAGTATGGCAACGATGCATTTACTGCTTTTGTAAAAAATGACAAAAAGTCATTTGCACATTATAAAGTGAGTATATTAAAAGATGAAATTGCACATAATGACCTTTCATATGAACGTTATTTGAAAGAACTAAGTCATGATATTTCGCTTATGAAATCATCGATTTTGCAACAAAAGGCTTTAAATGATGTTGCACCATTTTTCAATGTTAGTCCTGAGCAATTAGCTAACGAAATACAATTCAATCAAGCACCAGCCAATTATTATCCAGAAGATGAGTATGGCGGTTACATTGAACCTGAGCCAATTGGTATGGCACAATTTGACAATTTGAGCCGTCAAGAAAAAGCGGAGCGAGCATTTTTAAAACATTTAATGAGAGATAAAGATACATTTTTAAATTATTATGAAAGTGTTGATAAGGATAACTTCACAAATCAGCATTTTAAATATGTATTCGAAGTCTTACATGATTTTTATGCGGAAAATGATCAATATAATATCAGTGATGCTGTGCAGTATGTTAATTCAAATGAGTTGAGAGAAACACTAATTAGCTTAGAACAATATAATTTGAATGACGAACCATATGAAAATGAAATTGATGATTATGTCAATGTTATTAATGAAAAAGGACAAGAAACAATTGAGTCATTGAATCATAAATTAAGGGAAGCTACAAGGATTGGCGATGTAGAATTACAAAAATACTATTTACAGCAAATTGTTGCTAAGAATAAAGAACGCATGTAGCATGTGATTTTAAAGAATAATACGAATAATGATTATGTCAAAATGTATAAGGGTAAATGATAGTTACCGCATTTAAACAACACTATTGAAAAATAAATATTGGGATTAGTTCCAATTTGTAAAATAAAATTAAAAATATGGATGAATTAATTAAGAATTTAGTTTAAAATAGCAATATTGAATAAATTTCGAATGTTCATATTTAAAATCGGGAGGCCGTTTCATGTCTGATAACACAGTTAAAATTAAAAAACAAACAATTGATCCGACATTAACATTAGAAGATGTTAAGAAGCAATTAATTGAAAAAGGTAAAAAAGAGGGTCATTTAAGTCATGAAGAAATTGCTGAAAAACTTCAGATTTTTGATATCGACTCTGATCAAATGGATGATTTCTTTGATCAATTAAATGATAATGATATTTCACTAGTTAATGAAAAAGATAGTTCAGATACTGACGAGAAACTGAATCCAAGTGATCTTAGTGCCCCTCCAGGTGTTAAAATAAATGACCCAGTTCGTATGTACCTTAAAGAAATTGGGCGTGTTAACTTATTAAGTGCACAAGAAGAAATCGAATTAGCCAAACGTATTGAACAAGGTGATGAAGTAGCAAAATCAAGACTTGCAGAAGCGAACTTACGTTTAGTTGTAAGTATTGCTAAAAGATACGTAGGTCGTGGTATGTTATTCCTTGATTTAATCCAAGAAGGTAATATGGGTCTTATTAAAGCTGTTGAAAAATTTGACTTTAACAAAGGATTTAAGTTTTCAACATATGCAACATGGTGGATTAGACAAGCAATCACTCGTGCAATTGCTGACCAAGCACGTACGATTCGTATCCCTGTGCATATGGTAGAAACAATTAATAAATTAATTCGTGTTCAACGTCAATTATTACAGGACTTAGGTCGAGATCCAGCACCAGAAGAAATTGGTGAAGAAATGGATTTACCAGCAGAAAAAGTTCGTGAAATTTTAAAAATTGCGCAAGAACCTGTTTCATTAGAAACACCAATTGGTGAAGAAGATGATAGTCATTTAGGAGACTTTATTGAGGATCAGGAAGCACAAAGTCCTTCAGATCATGCTGCTTATGAATTATTAAAAGAGCAATTAGAAGATGTGCTTGATACATTAACTGATAGAGAAGAAAATGTATTACGATTAAGATTTGGTCTTGATGACGGCAGAACAAGAACACTTGAAGAAGTTGGTAAAGTTTTCGGTGTTACACGTGAACGTATTCGACAAATTGAAGCAAAAGCACTTAGAAAATTAAGACATCCAAGTCGTAGTAAACGTTTGAAAGACTTTATGGATTAATTTATATCAATTTTAATGATTGATACCAAGACATGAATAAGCGCTTATTTATTTTTAGATTAAGATTTAACTTGAGTGAGGTTGGTACATTGAATAATGTTCAACCTCTTTTTTCATAAAGGAGAATAAAATGATTTCGTTAAATAACCGATTAACGACGGTAAGTCGATTTTTAAAACAAGGTACAATCGCGGATATTGGCTCAGATCATGCTTATTTGCCAATCTATGCAATTCAAAACCATTTATGCGAATGCGGTATTGCTGGAGAAGTTATTCAAGGCCCTTTTCAAGCTGCTGTGAAAAATGTAGCTGCAAACCAATTAGTAGATAGAATTGATGTACGTTTGGGGGATGGCTTAAGTGTTATTCAACCTGAGGACGTAATCGATAATATCACAATTTGTGGTATGGGCGGACCACTTATTGCTAAAATTTTAAAAGATGGGCAAGATAAGTTAAGTCAACATCCAAGGTTGATTTTACAAAGTAATATCCAAACTGAAAATTTAAGACAAACATTACAACAATTGAATTATGAAATAATTGATGAAATAATAATGGAAGAAAAAGGCCATATTTATGAAATTGTTGTAGCAGAATATTCTACAGAATTAATAGAGCTATCATCTGATGAATTGAAATTCGGACCAAAATTGCTGAACAACAAAAATGAATATTTTATAAAAAAATGGCAAAGAGAGTTAGAAGCACTTTATCATATTAAATCGAAACTCAATACTGAACAACATCATCAACGTTTAGCTCAAATTAATGACGAAATTGCTGTAATTGAAAGGGTGTTATAGTAATGAAAATAGCTGATTTAATGACATTGTTAGATCATCATGTGCCATTTAGTACTGCTGAATCTTGGGATAATGTAGGATTGTTAATAGGTGATGAAGATGTTGAAGTTACTGGTGTTTTAACAGCATTAGACTGTACGTTGGAAGTAGTAAATGAAGCAATCGAAAAAGGTTATAATACTATTATTAGTCATCATCCTCTAATCTTTAAAGGCGTAACATCATTAAAAGCTAATGGTTATGGTTTGATCATTAGAAAACTAATTCAACATGACATTAATTTAATAGCGATGCATACAAATTTAGATGTAAATCCGTATGGTGTCAATATGATGTTGGCGAAGGCGATGGGTTTGAAGAACATTTCAATAATAAATAATCAACAAGATGTATACTATAAAGTTCAAACATATATACCTAAGGATAATGTTGGACCATTTAAAGATAAGCTTAGTGAAAATGGATTAGCGCAAGAAGGTAATTATGAATATTGTTTCTTTGAAAGTGAAGGAAGAGGGCAATTCAAACCAGTTGGTGAAGCTAATCCAACAATAGGACAAATTGATAAAATTGAATATGTAGATGAAGTTAAAATTGAATTTATGATAGATGCATATCAAAAGTCAAGGGCTGAGCAATTAATTAAACAATACCATCCATATGAAACACCGGTATTTGATTTTATTGAGATAAAACAAACATCCCTTTATGGACTTGGCGTTATGGCAGAAGTGGATAATCAAATGACATTGGAAGATTTCGCAGCTGATATTAAATCTAAATTAAATATCCCAAGTGTCCGTTTTGTTGGTGAGTCTAATCAGAAAATTAAACGTATTGCAATTATTGGTGGTTCAGGTATTGGATATGAATATCAAGCTGTCCAACAAGGCGCAGATGTCTTTGTTACAGGTGATATTAAACATCATGATGCCTTAGATGCTAAAATTCATGGTGTGAATTTAATTGATATTAATCATTACAGCGAATATGTGATGAAAGAAGGTTTAAAAGCGTTACTAATGAATTGGTTCAATACAGAAAAAATAAATTTAGATGTTGAAGCATCTACAATTAATACAGATCCATTTCAATATATTTAAACTAAAATCTCGGGATTTCTAAATTTTGAAATTTCGAGGTTTTAATATTTTTATTTAAAATAGCACATTTATACTTTATAATAGTAAAGATGAACATATAAGGAGGCCAAATCATGGCAAAACATCCATTCGAACAATTTAATCTAGAATCTAGTTTAATTGACGCTGTGAAAGACCTTAATTTTGAAAAACCAACTGAAATTCAGAATCGAATTATTCCAAGAATACTAAAGAGAACAAATTTAATTGGTCAATCTCAAACGGGTACAGGGAAATCTCATGCATTTTTATTACCATTAATGCAGTTAATTGATAGTGAAATAAAAGAACCACAAGCAATCGTAGTTGCACCAACAAGAGAACTTGCACAACAACTATACGATGCAGCGAACCATTTAAGCCAATTTAAAGCTGGTGTTTCAGTTAAAGTTTTTATTGGTGGTACAGATATAGAGAAAGATAGACAACGTTGTAATGCACAACCACAATTGATTATAGGCACCCCTACTAGAATTAATGACTTAGCTAAAACGGGACATTTACATGTGCACTTAGCATCATATTTAGTTATTGATGAAGCGGATCTTATGATTGACTTAGGATTAATTGAAGATGTAGATTACATTGCTGCAAGATTGGAAGATAATGCAAATATTGCGGTGTTTAGTGCTACAATCCCACAACAGTTACAACCATTTTTAAATAAATATTTAAGTCATCCAGAATATGTAGCTGTCGACAGTAAAAAACAAAATAAAAAGAACATCGAATTCTATTTAATACCTACTAAAGGTGCAGCTAAAGTTGAAAAGACTTTAAATTTAATTGATATACTAAATCCATACTTATGTATTATTTTCTGTAATAGTAGAGATAATGCAAATGATTTAGCACGTTCACTAAATGAAGCTGGTATTAAAGTTGGTATGATTCATGGTGGCTTAACGCCACGTGAACGTAAACAACAAATGAAACGTATACGTAATTTAGAATTCCAATACGTTATTGCCAGCGATTTAGCATCTCGTGGTATTGATATTGAAGGTGTTAGTCATGTCATCAATTTTGATGTGCCAAATGATATTGACTTCTTTACGCATAGAGTCGGACGAACTGGTCGTGGGAATTATAAAGGTGTAGCAATTACGCTTTATAGTCCTGATGAAGAACACAATATTTCATTAATAGAAGATCGCGGTTTTGTATTCAATACTGTTGATATTAAAGATGGTGAGTTAAAAGAAGTTAAAGCGCACAATCAGCGTCAAGCAAGAATGCGCAAAGATGACCATTTAACTAATCAAGTGAAGAACAAAGTTCGAAGTAAAATTAAAAACAAAGTTAAACCAGGTTATAAGAAGAAATTTAAACAAGAAGTTGAAAAAATGAAACGTCAAGAGCGTAAGCAATTTAGTAAGCAGCAAAATAGACAAAAACGTAAGCAAAACAAAAAAGGTTAGGTGTGTTTTATGTTATTAGGATCACATGTTTCAATGAGTGGTAAAAAGATGTTAGAAGGTTCTGCTATAGAAGCGCATGAATATGGTGAAACAACATTTATGATTTATACTGGTGCACCTCAAAACACGCGCCGTAAAAGTATTGAAGATTTAAATATAACTAAAGGTCATGAAGTGATGGAAAAATATGGTTTATCTAATATTGTTGTTCATGCACCATACATCATTAATATTGCAAATACAACCAAACCAGAAACGTTTAATCTTGGTGTAGATTTCTTGCAACAAGAAATTGAAAGAACGCAAGCTATAGGGGCTAAAGATATTGTATTACATCCAGGTGCGCATGTTGGAGCTGGTGTTGATGCCGGAATTAATAAGATTATTGAAGGATTAAATGAAGTTTTAACGAATGACAATAATGTACGTATTGCGCTTGAAACGATGGCAGGTAAAGGTACAGAGATTGGTCGCTCATTTGAAGAGTTAGCACGTATTATTGATGGAGTTCATAATAACGAACGTTTATCAGTATGTTTTGATACATGTCATACGCATGATGCTGGATATAATGTTAAAGAGGACTTTGATGGCGTATTAAATGAATTTGATAAAATCATTGGAGTCGACAGAATCAAAGTTGTTCATGTCAATGATTCTAAAAATGACCGTGGCGCTCAAAAAGACCGACATGAAAATATTGGCTTCGGTTACATTGGTTTTGATGCATTAAATTACATTGTGCATCATGATAGTTTTAAAGATATTCCGAAAATCTTAGAAACACCTTATGTTGGTGAAGATAAGAAAAATAAAAAACCGCCATATAAACTTGAAATTGAAATGTTAAAACAACAGCAATTTGACCCAGAATTAAAAAATAAGGTTATGCAACAATAAAATGATAATGCTCTCTTCAAGAAATGCGATAAATAAAACTTGAAGGGGGCATATCTCTTTATTTTGTCTAATTTTGAGTCGTAAACATTACTGTTTACATATGTTACTAGGAGTTGTATAGTTGAATGCGAGGTGAGAATACGATGACACCAGTCTTTGAATTGAAAAATGTCAATTACTACTATGATCATAAAAAAGTGTTAGAAAATATAAACATTAAAATAAATAAAGGTGAATTTTTAGCAATTGTTGGACCAAATGGTGCTGGTAAATCAACATTATTGAAGTTGATTCTAGGGTTATTACCTTTACAAAGTGGTGAGATTTTTGTTGAAGGTATTGATTTTAAAAATAAGAAAACATCAATTAAATTAAGCTATGTATCACAAAAAGCAAATGCCTTTAATTCAGGTTTCCCAGCAAGTGTTAAAGAAGTTGTTTTAAGCGGATTAACAAAGACAAAACGTCTTTTCCAAACATTTAATAGCAAAGATAATGAAAAAGTGATTAAAGTACTAGAAAGACTGAATATAAGTGATTTAATTCATAAAAATATAGCAGAATTATCAGGTGGTCAACAACAACGTGTAATGATTGCTCGAGCATTGATTTCAGAACCTGCAGTATTAGTACTTGATGAACCAACGAATGGTATTGATGCAAAACATGTAAGTGAATTTTATAATACTTTAGATCAATTAAAACAAGAAGGTATCACCATTATCTTAGTTACTCATGATATCGGTGTTGTAGCAGATACTGCTACTGAAGTAGCATGTTTAAATAAGCATTTGCATTTCCATGGTACAACTGATGAGTTTAAATCACTTGATGAAGTTGAAATTTCAAAAATTTATGGACATCCTGTACGTTTTGTCGATCATCAGCATAATCGAGAATGTTGTAATTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

>CP018629|805504:813816|807527_808634_+|AUS74495.1|DBSCAN-SWA
MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQIFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD
>CP018629|805504:813816|809444_810545_+|AUS74497.1|DBSCAN-SWA
MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPYGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKALLMNWFNTEKINLDVEASTINTDPFQYI
>CP018629|805504:813816|810658_812005_+|AUS74498.1|DBSCAN-SWA
MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFYLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG
>CP018629|805504:813816|812014_812905_+|AUS74499.1|DBSCAN-SWA
MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ
>CP018629|805504:813816|808764_809442_+|AUS74496.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCECGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIQPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTELIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL
>CP018629|805504:813816|805504_807304_+|AUS74494.1|DBSCAN-SWA
MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQNLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKALNDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM
>CP018629|805504:813816|813030_813816_+|AUS74500.1|DBSCAN-SWA
MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AUS74494.1|805504_807304_+	DNA primase	A0A0K1LMQ9	Caulobacter_phage	4.6e-54	36.0
AUS74495.1|807527_808634_+	RNA polymerase sigma factor RpoD	A0A2I7SAT0	Vibrio_phage	1.1e-37	38.1
AUS74496.1|808764_809442_+|tRNA	tRNA methyltransferase	NA	NA	NA	NA
AUS74497.1|809444_810545_+	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	A0A1S5V250	Saudi_moumouvirus	5.2e-08	29.6
AUS74498.1|810658_812005_+	DEAD/DEAH box helicase	A0A1V0SIR5	Klosneuvirus	5.3e-55	33.7
AUS74499.1|812014_812905_+	deoxyribonuclease IV	A0A2H4UU70	Bodo_saltans_virus	2.0e-26	33.1
AUS74500.1|813030_813816_+	zinc ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	8.0e-19	28.3

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>CP018629|868940:956677|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

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Homologous phage analysis in the prophage region

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864768:864785	attL	NA	NA	NA	NA
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AUS74566.1|869646_871398_+	two-component sensor histidine kinase	A0A1V0SGX0	Hokovirus	1.7e-21	33.6
AUS74567.1|871702_872572_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74568.1|872564_874592_+	hypothetical protein	B5WZK7	Staphylococcus_phage	6.9e-115	97.7
AUS74569.1|874634_875840_-|integrase	site-specific integrase	A0A2I6PEZ6	Staphylococcus_phage	1.6e-223	100.0
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AUS74572.1|876813_877209_-	hypothetical protein	A0A2I6PEJ7	Staphylococcus_phage	3.8e-70	100.0
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AUS74576.1|878910_879354_+	hypothetical protein	A0A0H3U2S6	Staphylococcus_phage	2.0e-75	99.3
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AUS74615.1|902358_902754_+	hypothetical protein	A0A2I6PEQ4	Staphylococcus_phage	8.8e-67	100.0
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AUS74627.1|917278_917443_+	hypothetical protein	A0A2I6PES4	Staphylococcus_phage	4.9e-24	100.0
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AUS74629.1|917923_918226_+|holin	phage holin	A0A2K9VBR4	Staphylococcus_phage	9.1e-48	100.0
AUS74630.1|918237_919692_+	amidase	A0A2K9VBR6	Staphylococcus_phage	1.4e-290	100.0
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AUS74638.1|925006_925255_-	ferredoxin	A0A127AYY7	Bacillus_phage	8.3e-15	48.0
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AUS74641.1|927837_929298_+	peptidoglycan-binding protein LysM	NA	NA	NA	NA
AUS74642.1|929422_929539_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74643.1|929699_930686_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74644.1|930800_931769_-	L-asparaginase	NA	NA	NA	NA
930839:930856	attR	NA	NA	NA	NA
AUS74645.1|931845_932505_+	cytidylate kinase	NA	NA	NA	NA
AUS74646.1|932535_932652_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74647.1|932677_932815_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74648.1|932768_932960_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74649.1|933216_934392_+	30S ribosomal protein S1	NA	NA	NA	NA
AUS74650.1|934613_935924_+	ribosome biogenesis GTPase Der	NA	NA	NA	NA
AUS74651.1|935940_936939_+	glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
AUS74652.1|937109_937382_+	DNA-binding protein	A7KV42	Bacillus_phage	4.2e-28	73.3
AUS74653.1|937571_937886_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74654.1|937812_938385_+	heptaprenyl pyrophosphate synthase subunit A	NA	NA	NA	NA
AUS74655.1|938387_939113_+	bifunctional demethylmenaquinone methyltransferase/2-methoxy-6-polyprenyl-1,4-benzoquinol methylase	NA	NA	NA	NA
AUS76768.1|939129_940074_+	heptaprenyl diphosphate synthase	A0A1V0SE37	Indivirus	1.3e-10	24.4
AUS74656.1|940165_940615_+	nucleoside-diphosphate kinase	D2E8E1	Anguillid_herpesvirus	2.4e-28	43.8
AUS74657.1|941410_942577_+	chorismate synthase	A0A291AU41	Pandoravirus	7.6e-34	32.1
AUS74658.1|942602_943667_+	3-dehydroquinate synthase	NA	NA	NA	NA
AUS74659.1|943676_944975_+	3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
AUS76769.1|945122_946226_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74660.1|946239_946815_+	hypothetical protein	G3MAV7	Bacillus_virus	2.7e-08	27.2
AUS74661.1|946804_947392_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS76770.1|947463_948144_+	zinc metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
AUS74662.1|948480_948798_+	nucleotide pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
AUS74663.1|949038_950181_+	N-acetyl-alpha-D-glucosaminyl L-malate synthase BshA	NA	NA	NA	NA
AUS74664.1|950185_951388_+|tRNA	CCA tRNA nucleotidyltransferase	H7BUW3	unidentified_phage	3.2e-35	42.5
AUS74665.1|951374_952346_+	biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] ligase	NA	NA	NA	NA
AUS74666.1|952369_955063_+	ATP-dependent helicase	A0A1X9I5C8	Streptococcus_phage	8.2e-47	34.4
AUS74667.1|955384_956677_+|tRNA	asparagine--tRNA ligase	A0A2P1EMB4	Moumouvirus	1.9e-54	30.0

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>CP018629|1138416:1144408|DBSCAN-SWA
TCTACATTATTATATCCATTTTTTTAATATTTTTCCCTTCTCTTAAACGTTGCCAACTTTGAGCCATATAAAAGTCAGGATCAAATTGTTTAAATCCACTTTCTAATAAATACTTATTTTCAAATATATGTTCATAAACTCTTTGAATTAAATCTTTATTTATATTAGTATTTTTAGCAATTTTAGAAATCTCTATCTGTTTATCTCGATTTCTAACTGAATTATAATAAATTTGAGCATGTCTGTTCCTTTTGATACCGTATTCATCACTTTTATTATTAAGTGCACCTGATTCAATAAAACAACCTTCTACTTGATATTTACCTTCACGCTCTTTAAAGAACTTGTCTCGCCAATTGCCGACATGTGGCACTGTGGTACTTCTACACCAAGGATGCATAGGTGGCGCATTCACACCTGGTATCATATCTTTAACTTTAAATATTTTTCCGTTGAGTGAATGACATAATTTAGATGTTTTACTATCTATTTTGGCAACATATTTATATTCGCCATCTTCACCAAGTTCTTTTAAATATGTTAACTTTTGTGACTCTTCTTTTTCAACGAATAATGAAAAAAGCATATAAAAATAGCATCGCTTTCTCTTTATCTGTGTAGAAAGGATGCTTTAATACCATGCTATTTTATAATTTTCGGGAAATTCTTGCTTCTCGATAAAGTCTCTTACTACAGAAAAAGACTTATTACGATATAACATAAAATATTCTTCATTTTCTATTTCAGATAATGAGAAATCTATAACCTCTGCATCTTTTTTATTAAAAGTTACTGAACCTTTACCGTTACTTATATCATCTTCAGGTATATATTCATATATTATAACCTGTTCATCTTCTTTCAATTTTATTAATGTAAGCATTTAATCCACCTTCTTTTTTATAAAAATTGAATAATCGTATTTTTTTGATACAATTTTATGTGCATAATCATAGTTGAAATTATACTTATTCATCAAATAATGTTCAAGCGCCTCATGACGCAGCAGTATTAAATCTTGTTTTTTATTGTTTTTCCTTCTCTTAAACGTTGCCAACTTACTGCGATATTATATTCTGGATAATAACTTAAAATCGAATAATTCACTTTGAACATAACAACTCACTCCTTGTATAGTGGTGAAGCAAGTATTATTATTAAATTGTAGGAGGGAAAGTCCCTCCTGACTGATTAACGCTCGAATGTCCATTCAATCTTTATAAAGTAGAGATTTATTAAGATTAACAATTTGGTACATTTGAGCTTTTTTATTTCCTTCACTCGCACCTTCTTAAACTTATATGTTCATTATACAAATATAAAAAGCTATAACAATTTAATGAAAATGCCCCCTTCGAAGTCGACATTGAAAAAATGAAAACTTTGAAGGGAGCATTTCAAGACGATCCATTCCAATCTTTTTTATCATTTAAAACTTAACACTTATTTTCCCTTATTCGATGCTAATTTCGTGCAATAAATTCTAAATGAAACGACATACTCCTTTTTCACAAATTGGAATCTACTATTTTTGTATTTTAATTATTATAATATCCATTCACCATATGATTTTTATTAATAGTTAAATCAAATAAACATAGCTTGATTAATTTATACATTAGTTAAATTACAAAACTTTATTGGCATATTCATATAATTTTTCTGTTGTATTCAGGGTTAGATTATCTACTTCGCGTTTGCCCTGTCTTAATTGTGAAAGTACGTATTGAGAAACTCCAGTTTTTTTAGAAATTTCATATCCTGTTAAATTACTTTCAATTAATTCAATTATTTTTTTCTTGTATTCTGACATTTTTTCATCTCCATATCTGTACAATGTTTTCTGCTTTTTTTCGAAATTCTGTGAACTTAACGTATTTTTTATCTATAAATGATTTTATTATTTTTCTATTCATTAATGGCTATCATCACTTCATAATAGTTAAATTTTATATTTTCAATTTTTGTTTCTACATATTAACGACTTTTCATCATCAATTACTTTGTCAAAGATAAACGATTTGTCTTGTATACCTTACGCCTTTTACAAAACTTCAATGTTTAGTATTCATTGAAGTTTACAGCCACTTCTAAAGTTTAACCTTTTATGTATTTTTATTAGATTAGTGTCTTTCAATATTCAAACTACTAACTCCAGTAGTCTATTAAATTTGAGATATTGAGATATCTTTAGAATTTAATTTTTCCGGAGTCATATAGACTTCTCAAATACTATACATTTATTTCATAATTTTGAACCCTAATATTACTAAAATAATTATAAACGTCCCTATTAAAAATTCTATTTTCTCTTTTTTATTTGTTTTTCGCACTTTAATAGTCATCTTCATTTTACTAATGGTGAGAAAGTAATATTTTATTCAAAGAATATGACTTCATATTAAATCAAACCTCACATTCTTATTAGATTGCAAATTCAATAGTCCTACCAGAATTGAAATCAAAACATTCAAACTATTTTATCGTTTTAACTTCCTCGACCATTTTCACCTCCTTATAATCTATATAAATTATGTTTACCACACGATTCTTTACACTCGAAAAATTAATTTTGTTAAGAAACATTTAGCCATGTAACTTTGTAATAAAAACATTTTCAAATAAATGTACCAAAAACTTTCATGAAATAAAGTATACTTTTCAAATCTATTAATTTTAGAATCATAAAACCAAATGCTATATTACAATATAATTATCACAAATCATCATATATGCCAATTACACAATTTAATATAAAAAATTGTCAATGAAAAATTGATAAAGTCCGTATAATTGTGTAAAAGTAAAAAGGCCATATAACAGTCCTTTTACGGTACAATGTTTTTAACGACAAAAACATACCCAGGAGGACTTTTACATGACCCAAGTACATTTTACACTGAAAAGCGAAGAGATTCAAAGCATTATTGAATATTCTGTAAAGGATGACGTTTCTAAAAATATTTTAACAACGGTATTTAATCAACTAATGGAAAATCAACGAACAGAATATATTCAAGCAAAAGAATATGAACGAACAGAAAACCGACAAAGTCAACGAAATGGCTATTATGAGCGCAGCTTTACGACACGTGTAGGCACGCTAGAATTAAAAGTACCCAGAACACGTGATGGCCATTTTTCACCCACAGTGTTTGAACGTTATCAACGAAACGAAAAAGCCCTCATGGCTTCAATGTTGGAAATGTATGTATCAGGCGTTTCAACTCGTAAAGTATCAAAAATTGTGGAAGAACTTTGTGGTAAATCCGTCTCTAAGTCCTTCGTTTCTAGCTTAACAGAACAGCTAGAACCTATGGTTAACGAGTGGCAGAATCGTTTATTATCAGAAAAAAATTATCCTTACTTAATGACCGATGTACTCTATATAAAAGTACGAGAAGAAAATCGAGTACTCTCAAAAAGCTGTCATATAGCGATTGGAATAACCAAAGATGGCGACCGTGAAATTATCGGCTTCATGATTCAAAGTGGCGAAAGCGAAGAGACCTGGACAACATTTTTTGAATACCTAAAAGAACGCGGTTTACAAGGTACGGAACTCGTTATTTCTGATGCGCACAAAGGATTAGTCTCTGCCATTAGAAAATCCTTCACCAACGTAAGTTGGCAAAGATGCCAAGTTCACTTCCTAAGAAATATCTTTACCACCATTCCTAAAAAAAATTCAAAATCTTTCAGAGAAGCTGTTAAAGGAATTTTTAAGTTCACAGATATTAACTTAGCGCGTGAGGCTAAAAATCGATTGATTCATGATTATATCGATCAACCAAAATATTCAAAAGCTTGCGCATCATTGGATGATGGATTCGAAGACGCCTTTCAATATACCGTACAAGGAAATTCCCACAATCGACTAAAGAGTACCAATCTAATTGAACGACTGAATCAAGAAGTACGCAGAAGAGAAAAGATTATTCGCATCTTCCCCAATCAAACATCAGCCAATCGCTTAATTGGAGCCGTTCTTATGGACCTACATGATGAATGGATTTATTCTTCAAGAAAATACATCAATTTTGATAAGTAGAAATGGTAAAAACATTGTATAGCATTTTACACAGGAGTCTGGACTTGACTGAAAAATTATGTGCATAAACATTATTACAAAATATGTATAGTATAGAATACTGCATTAAAGTTAACTTATTTACTGTGTTCAGCCTTTTATATCATCGCTTAAAGATCATTCAAGATTTAATGGCAATGATAATTTCATAATATGCATTTTTGATTATTTAACCATGTACAATTTCTAAAACTAAGAGATTATCTTATTGAGGTGGACAAAACGTGGACAGACAACCATGAAATCATTAGAAATTTAATTTCTTGTCCACCTAACCTAACAAAATATTTTTGTTAACATTCTGTTTTATTTTCTAATGTTCTTTGATATTCATATAACTTGATTATCGTTTTAAATTTAGCTTCTTTTATTTTAGTTTTACCTACCTTTAAATCAGTAACTGTTTGACGTGGTACACCTGAGTTTTTTGAAATACTATATGGTGTATTGTTAGTTAATAACTTTTCTATTTCACTTATAATAGTTTCAATCTCATTCATTATTAATCACACTCTCTTTCTATTTATAATTATAATAATCCTAATGCAGTAACTACGTTTAGCAATACATTGTTTTTTTCTAGTTGCCAAACTAGTTAATTCATAAACTAATACCTAATAGTATTGGCGTTTTTTTTATATATTGATAAAATTTCTTGTCTCCATCTATTCTATATTATATTATTTGATAATTTTTTATTTATATTCACATTAAGTTATCCATATTTAATATACTTTAAAATTAGATGACTTAAAAGGCTCACTCCATGATATTTCAAAAATATGGCCTTATTTTAATCTTCAATCATTATTTCTAATTGTTTTTGGTAATTATAGAGTTTTTCCGCTGTTTCTAAAGTTAAATTATTCACTTTTCTTTTCCCGCTTCTTAATTCACTTATACCACCATAAGAAACATCAGTGTCTTGATTAATTCTATAATTAGATATTGATTTATCATTTAGTAATTTTTCTATTGTATTATAAATTTCTTTAAACTGGTTCATAATTTTTGTCAAAATGAAAGAATAATTTATTTTTTCTAGTTAAATTAATAATAAATAATATTAAAGTTGCAATGTTAAGATAGAGAGTTAATTTTTTCCTTAATTCTCTTGTCATAAATACCACCTCCCTATTTAATGTGGTAAAGGTCTTTTGCCCTTTACCTTTTTAAAAGAACGATTTGATAAAATTAAGTACTTGAATTATTAAGCTCGTCACAGCTATTCGAAATTTAATTTTGCTATTCGTTCTTTTTCTTTAACCATTCTTATCATTTTTTCTCCTTTCCTCTTTATAGTTATTTAACATTCCACAAATTGGGGTAAGTGACATGTTGAACTCCCATATCCACTGGCAAGATTTATAATTTGTAATTCTAAAGTATAATAGCCTATATTTTTCAAAATCTCTTTTTTTATGATTAACATCCCTCTAAGTGCACCTAAAGGTTTTTATGTAATGTATTAAATATTTCCATTTATACATATACATCTTGTATAAAAAGAAAGAACTCCATATATACTCAAAAGGTATACTGAAGCTCTATATATTATATAAAATTATTATACTATTTTGAAAAACATAAGTAAATCACTAAACATGATTTCTTTCACTTTTAGAAAACTTTTAATACTATAAAAGCACCCACTCAGTCACTAGTTTGGGCAGTTATTGTATGCCTATTGAACTCAATGCTTATATTACAATACCTTTTTCGCATATTCATATAAGATCTTTGCATTCTTTAAGCTTAAATTTTCTATTCTTCTTTCTCTACGGCGCATAGCATTAATATTACCGTAACTTATCCCAGTATCTTTATTAATTTGATAACTCGATATCTCTTTGTTTTCTATCAATTCTTTGATTGTATTGAATATTTCATCATAGCAATTCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

>CP018629|1138416:1144408|1142798_1143005_-|AUS74828.1|DBSCAN-SWA
MNEIETIISEIEKLLTNNTPYSISKNSGVPRQTVTDLKVGKTKIKEAKFKTIIKLYEYQRTLENKTEC
>CP018629|1138416:1144408|1143298_1143511_-|AUS74829.1|DBSCAN-SWA
MNQFKEIYNTIEKLLNDKSISNYRINQDTDVSYGGISELRSGKRKVNNLTLETAEKLYNYQKQLEIMIED
>CP018629|1138416:1144408|1139046_1139298_-|AUS74822.1|DBSCAN-SWA
MLTLIKLKEDEQVIIYEYIPEDDISNGKGSVTFNKKDAEVIDFSLSEIENEEYFMLYRNKSFSVVRDFIEKQEFPENYKIAWY
>CP018629|1138416:1144408|1139426_1139531_-|AUS74824.1|DBSCAN-SWA
MFKVNYSILSYYPEYNIAVSWQRLREGKTIKNKI
>CP018629|1138416:1144408|1140655_1140766_-|AUS74826.1|DBSCAN-SWA
MKMTIKVRKTNKKEKIEFLIGTFIIILVILGFKIMK
>CP018629|1138416:1144408|1139298_1139472_-|AUS74823.1|DBSCAN-SWA
MATFKRRKNNKKQDLILLRHEALEHYLMNKYNFNYDYAHKIVSKKYDYSIFIKKKVD
>CP018629|1138416:1144408|1138416_1139001_-|AUS74821.1|head|DBSCAN-SWA
MLFSLFVEKEESQKLTYLKELGEDGEYKYVAKIDSKTSKLCHSLNGKIFKVKDMIPGVNAPPMHPWCRSTTVPHVGNWRDKFFKEREGKYQVEGCFIESGALNNKSDEYGIKRNRHAQIYYNSVRNRDKQIEISKIAKNTNINKDLIQRVYEHIFENKYLLESGFKQFDPDFYMAQSWQRLREGKNIKKMDIIM
>CP018629|1138416:1144408|1144210_1144408_-|AUS74830.1|DBSCAN-SWA
MNCYDEIFNTIKELIENKEISSYQINKDTGISYGNINAMRRRERRIENLSLKNAKILYEYAKKVL
>CP018629|1138416:1144408|1141293_1142466_+|AUS74827.1|transposase|DBSCAN-SWA
MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK
>CP018629|1138416:1144408|1140042_1140228_-|AUS74825.1|DBSCAN-SWA
MSEYKKKIIELIESNLTGYEISKKTGVSQYVLSQLRQGKREVDNLTLNTTEKLYEYANKVL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AUS74821.1|1138416_1139001_-|head	phage head morphogenesis protein	Q4ZE35	Staphylococcus_virus	2.0e-30	72.0
AUS74822.1|1139046_1139298_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74823.1|1139298_1139472_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74824.1|1139426_1139531_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74825.1|1140042_1140228_-	hypothetical protein	A0A0F6N3H3	Staphylococcus_phage	2.4e-19	78.7
AUS74826.1|1140655_1140766_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS74827.1|1141293_1142466_+|transposase	IS256 family transposase	A0A0N9STL0	Staphylococcus_phage	3.5e-135	100.0
AUS74828.1|1142798_1143005_-	hypothetical protein	A0A2H4PQT0	Staphylococcus_phage	1.3e-13	59.7
AUS74829.1|1143298_1143511_-	hypothetical protein	A0A1W6JNK0	Staphylococcus_phage	3.1e-18	71.0
AUS74830.1|1144210_1144408_-	hypothetical protein	A0A1W6JNK0	Staphylococcus_phage	1.7e-10	48.4

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>CP018629|1402536:1410991|DBSCAN-SWA
CTTATTTTACAATTTTAGCAATAACACTTGGATATAACTCATATTCCAATTTTTTTACTTTCTCTTCTAATTGTTCTTTTGAATCGTCCGGTCTAATATCACATTTTCTCTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACTATCAACATAATGTACTGTCGAACCAGTAATAGTATCGCCACTATGATATGCTTGGCCTATTGCGTCAATCCCCTTATATTTCGGCAATAGAGATGGATGTATATTCAATATTTTACCTTCAAATGAAGCTAATAAGTCTGGACCAATTAGACGCATGTAGCCAGCTAGAATAATCCACTCTACCTTATCTTCATTTAATAATGTTACTAAATGTTGTTCATACGCTGCTTTTGAATCAAATTGTTTTGGTTCATTAATATAAACAGGAATATCGTGCTTTTTTGCTCTATCTATACAAAACGCATTTTGATGATCCGTATATAGCGCCGTAACTTCAATATTTTCAAGTTTTCCTGATTCAACATGCTCAACTATATTTTCAAAGTTACTTCCTGAACCTGATGCAAAAATCGCAATTTTAACCATTGTTATACCCCCAACAATTCAATTGCAGTTGACTCATTTTTCACAATATGACCAATTTGATAGGCTTCCACATTTTGTTCTGCTAAAATCTTCAAAGCGCGTGATACATCTTTTTCATCAACGATAACCGTATAGCCAATACCCATATTAAAAATGTTATACATTTCATTTGTGTCTATATTGCCTTGTTGTTGTAACCAATCAAATATTTTTGGTGTTGGAAATGATGTAGTATCAATTCTAGCAGCATATCCGGCTGGCAATGCACGTGGAATATTTTCATAAAAACCTCCACCAGTAATATGATTCATTGCCTTAATAGAAACTTCTTTTTTCAAAGCAAGTACAGGTTTGACATATAATTTAGTTGGTTCTAAAAAGACATCGATAAATGGACGATTATCGAAGTTTGATGCCAAATCAATGCCTGATTCATTAATTAATTTGCGCACTAAACTGTATCCATTTGAATGAATGCCACTTGACGCAAGCCCTATAACAACTTGTCCCTCTTTCACTTCTGAACCATCTACATAGTCATCCTTTTCAACTGCTCCAACAGCAAATCCAGCTACATCATATTCGCCTTCGTGATACATTTCACCCATTTCAGCAGTCTCTCCACCGATAAGTGCAGTATTCGTTTCAACACATGCATCACTAATACCTTTAACAATTTGTTCAATAACTTCAGGAACAACTTTGTTTGTAGCAATGTAATCTAAAAAATATAATGGTTCTGCACCTGTCGTTAAAATATCATTAACACACATTGCGACTGCATCGATACCTATCGAATCATGTTTACCATAGTCGATAGCTAGTTTTAATTTCGTACCTACTCCGTCTGTTCCAGAAACTAAAACTGGCGCTGTCATATTTAATTGTGATAAATCAAATGTAGCACCGAATCCACCTAAACCACCGATAACTTCTTTACGCATCGTACGTTTAACATGACTAGACATTCTTTCTACAGCTTCATAACCAGCATGAATATTTACACCAGATTGTTCATATGCTTTAGACATTTAAATTTCCCTCGCTATCAAAAAAGTGTTTGTTTTTAGAAATATATTGCTTTTGTCGATGACTTAAATGCGCTTTATAATTTGCTTCATAATCATATAACCCTGCAGGATAATCTCCAGTGAAACTTTCTACACATAAGCCACTATATGGCGCGTCATAATCTAAACCAATTGATTCAATTAACCCATCTACAGATAGATATGCTAATGAATCAGCGCCAATATAATCTTTAATTTCTTCAGGTGATTTGCTTGCAGAAATTAATTCTGCCGTAGTTGAAACATCGATTCCGTAAAAACTTGGAAACATAAATTCCGGTGATGCTATACGCACATGCACTTTATTTGCACCAGAATCTTTTAACATTTTCACAATGCGTCGAATTGTCGTACCGCGAACAATGGAATCATCAACAAGAATGATATTTTTCCCATCTACTATATCTTTTACCGCAGATAACTTCACTCTCACACCTTGCTCACGTAATTCTTGAGTTGGTTGAATAAATGTTCTTGCAACATATTGATTTTTAACTAGTCCCATTTCATATGGCAAACCTATTTCTTCAGCATAACCACTCGCAGCTGATAGCGATGAATTGGGTACACCGATGACCATATCAGCATTTACAGGGCTTTCTTGGGCTAATTTTTTACCAGAAGCTTTACGTACTGCATGGACATTTTTACCAGCTATTGTTGAGTCTGGTCTAGCAAAATAAATATATTCCATCGCAGAAATTGCAGTTGTCGTATGATGTGTATAAGATTTAACTGTAATACCTTTATCGTTAATCACGACATATTCACCTGCATGAATATCTTGAACAAATTCTGCACCTAACACATCTATTGCACATGTTTCACTTGCAAGGATGTATGTCCCATCTTTCATTTTACCTACAACAAGTGGTCTGATAGCATTTGGATCTACTGCGCCATATAACGCATCTTTAGTTAAAATCGCAAATGTAAAACCGCCTTTAACTTTTCGCAAACTTTCTTTCAACGCTTCCTCAAAAGTAGGAGCTTTACTTCGACGTATCAAATGCATAATGACTTCAGTATCAGAAGACGAATGGAAGATAGCACCTTGTTTTTCTAAATTCTGACGCAATGATTTAGCATTAATGAGGTTACCATTATGACAAATACCTACACTCATATCATAAAAGTGATACAGAAACGGTTGAATATTTTCAATACCTTTATTACCTGAAGTAGCATAACGGACGTGACCAATTGCATGTTGATATCCTTTTAATCGTTCCATTTGATCATCTTTAATCGCTTCAGTTAGTAAGCCTAATCCTCGCTCGCCTTTTAATTCATTTTGATCAGAAACAACTATACCTGCACCTTCTTGACCACGATGTTGCAAACTATGAAGTCCCATATATGTTAGTTGCGCTGCTTCAGGATGATTCCAAATACCAAACACGCCACATTCTTCGTTTAATCCTGAGTAGTTAAACATTGAGCAATTGCCCCTTCCCATATTTGTTTAATATCTGAAACATTTTCACTAATCTCTGTATATGGTGTTGTTACCTTGAAATTATCACTATCTGTTAAAAGTCCAATTTCTATTGCATTATCAATATTTAAAGTTTTACCTGATTTAACAGAAACAACATATCGGCCTTGCGTCTCACTAAACAATTGTGCATTTGTTATATCTATTGAAGATTTTAATCCTAAACCGTAATGCGCACTTAGTTTAGCTAAGGTAATCAGTAAGCCACCTTTACCAACTGTTTGAACATGTGATAATAGTCCTTCACGAATAGCGGTCTTGATTGATTCACCTTTTTCAACTTCTGAACTCAAATCTAATGACTCAAATTCATGATTAACTTTGCCATAAATTAACTTTTCAAGTTGACTACCACCAAAGTCGTCCTTAGTATCACCGATTAAATATAATTTATCTCCAACTTGAGGTTCAAAATCATTTAAATAATTTACATTTTCAATCAAACCTACCATTCCAACAACTGGTGTTGGGAAAATAGAAGTACCTTTCGTTTCGTTATATAAAGATACATTACCAGAAACTACTGGTGTCTTAAGAATGTCGCATGCTTCTGCCATACCTTTCGTTGAATCTATCAACTGTTGATAGATTTCTTTCTTTTCAGGAGAACCATAATTTAAACAATCTGTCATTGCTAATGGTGTTGCACCCACGGCAATTAAATTTCGATAAGCTTCAGCTACTACCATCTTTCCACCTTCATATGGATTGTTATATACATAACGCGCTTCACCATCAATTGTTGAAGCAATTGCCTTATTTGTGCCTTCCACACGTACTACCGATGCTTGAAGTCCTGGCTTAATTATCGTATTGGCACCAACTTGTTGGTCGTATTGATCATATAAATAGTGTTTAGATGCTATAGTCGGATGCTTAAGTAATTTAAAGAAAGTATCTTTAACATCGATGTGTGTATAATCATTTTTAGAAGTATTATAATCTTTTTCTTCTCCTTCTAAAATATATACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGGTTCAACTGGAATGTCAGCATAAACTTCGTCATCATATGTTAAAACAAAACGATTTGTATCTGTAACTTCACCTATAACAGCACTATCCAATTCGTGCTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCAGTACCTTTTTCAACAACTAGTAACATACGTTCTTGAGTTTCTGAAAGCATCATTTCATAAGGAGAAATACCTGGCTCACGTGTTGGCACTTGTTCTAATCTCAAATGTAACCCACTACCACCTTTTGCCGCCATTTCAGACGATGAAGATGTTAAACCAGCAGCACCCATATCTTGAATACCAACTAATTCATCAAATGTAATTGCTTCAAGTGTTGCTTCCATTAATTTTTTACCTACAAATGGATCACCGATTTGTACAGAAGGTCGTTTACTTTCGCTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGATGCAAAAGTAGCACCATGAATACCATCTCGACCAGTTTTCAAACCAACATAAATGACCGAATTACCTACACCTTTTGCTGTGCCTTTTTGAATCATGTCGTGATTGATAACACCAACACACATTGCATTAACAAGTGGATTGCCATCATAACGTTCATCAAATTCGATTTCACCAGCAGTTGTTGGAATACCAATGCAGTTACCATAACCTCCGATACCCTTTACAACACCTTTAAGTAATCTTTGGTTTTGTTTATTATCTAATTCTCCAAATCTAAGACTGTTTAACAAATTAATAGGTCTAGCCCCAATAGAGACAATGTCACGAATGATTCCACCAACGCCTGTAGCAGCCCCTTGATATGGTTCAATTGCTGATGGATGATTGTGAGACTCTACTTTAAATACTACAGCTTGATTATCACCTATATCGACTACCCCTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

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MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV
>CP018629|1402536:1410991|1408707_1409412_-|AUS75077.1|DBSCAN-SWA
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>CP018629|1402536:1410991|1409415_1410540_-|AUS75078.1|DBSCAN-SWA
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>CP018629|1402536:1410991|1404126_1405611_-|AUS75073.1|DBSCAN-SWA
MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV
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MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV
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MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA
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MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGDHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD
>CP018629|1402536:1410991|1402536_1403103_-|AUS75071.1|DBSCAN-SWA
MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRKCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK
>CP018629|1402536:1410991|1410526_1410991_-|AUS76782.1|DBSCAN-SWA
MGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ

Homologous phage analysis in the prophage region

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AUS75073.1|1404126_1405611_-	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	3.2e-45	31.7
AUS75074.1|1405589_1407779_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase II	A6N228	Microbacterium_phage	1.0e-140	39.7
AUS75075.1|1407771_1408443_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase I	NA	NA	NA	NA
AUS75076.1|1408444_1408708_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase	NA	NA	NA	NA
AUS75077.1|1408707_1409412_-	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	M4R1E8	Synechococcus_phage	7.3e-48	42.1
AUS75078.1|1409415_1410540_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
AUS76782.1|1410526_1410991_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	1.5e-20	43.8

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>CP018629|1429903:1448637|DBSCAN-SWA
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MKKDEERSEMDGYGRIRGRYCQRDIWQLKGMGFS
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>CP018629|1429903:1448637|1448364_1448637_-|AUS76784.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA
MFGTILYLTLALGLSTAAYASTEYAEGGTWSHGVGSKYVWSYYYHGHKGHGATAIGKYRSFSGYTRAGVKAKASATKHNWWVNRAYYNIY

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AUS75095.1|1429903_1430914_+|protease	serine protease	A0A2H4PQP7	Staphylococcus_phage	6.2e-16	32.3
AUS75096.1|1430995_1432177_+|protease	cysteine protease	NA	NA	NA	NA
AUS75097.1|1432214_1432544_+|protease	cysteine protease	NA	NA	NA	NA
AUS75098.1|1432782_1433604_-	1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase	NA	NA	NA	NA
AUS75099.1|1433596_1434400_-	2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase	NA	NA	NA	NA
AUS75100.1|1434386_1436060_-	2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3- cyclohexene-1-carboxylic-acid synthase	NA	NA	NA	NA
AUS75101.1|1436046_1437258_-	isochorismate synthase	NA	NA	NA	NA
AUS75102.1|1437334_1437439_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75103.1|1437589_1438528_+	1,4-dihydroxy-2-naphthoate polyprenyltransferase	NA	NA	NA	NA
AUS75104.1|1438579_1439131_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AUS75105.1|1439220_1439511_+	hypothetical protein	A0A060AN66	Enterococcus_phage	7.5e-07	38.0
AUS75106.1|1439574_1439706_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS76783.1|1439751_1440678_-	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
AUS75107.1|1441187_1441544_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75108.1|1441632_1443114_-	glycosyl transferase family 1	NA	NA	NA	NA
AUS75109.1|1443319_1444492_+|transposase	IS256 family transposase	A0A0N9STL0	Staphylococcus_phage	3.5e-135	100.0
AUS75110.1|1445017_1445308_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75111.1|1445395_1446037_-|bacteriocin	bacteriocin ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	2.2e-19	33.7
AUS75112.1|1446033_1446354_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75113.1|1446356_1448321_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS76784.1|1448364_1448637_-|bacteriocin	bacteriocin transporter	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

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MNKIFRILTVSLFFFTFLIKNNLAYADVGVINLRNFYANYEPEKLQGVSSGNFSTSHQLEYIDGKYTLYSQFHNEYEAKRLKDHKVDIFGISYSGLCNTKYMYGGITLANQNLDKPRNIPINLWVNGKQNTISTDKVSTQKKEVTAQEIDIKLRKYLQNEYNIYGFNKTKKGQEYGYQSKFNSGFNKGKITFHLNNEPSFTYDLFYTGTGQAESFLKIYNDNKTIDAENFHLDVEISYEKTE
>CP018629|1578227:1593035|1585646_1585856_-|AUS75249.1|DBSCAN-SWA
MNNEQKEVIEHVVYQLELSVMNNLESYEHTEYVNGIEVVSEISREKHLELIMKWCAQELKNNFQLEKGE
>CP018629|1578227:1593035|1582919_1584377_-|AUS75246.1|DBSCAN-SWA
MENVTNDEVFEMIDSRTGVLNANDWKSQLRRSATTQALKKTTTNAEIILCNDESLKGLVQYDAFEKVTKLKRLPYWRSKGDANYYWADIDTTHVISHIDKLYNVQFSRDLIDTVIEKEAYQNRFHPIKSMIESKSWDGIKRIETLFIDYLGAEDNHYNREVTKKWMMGAVARIYQPGIKYDSMIILYGGQGVGKSTAVSKLGGHWYNQSIKTFKGDEVYKKLQGSWICEIEELSAFQKSTIEDIKGFISAIVDIYRASYGKRTERHPRQCVFVGTTNNYEFLKDQTGNRRFFPITTDKNKATKSPFDDLTPDVVQQMFAEAKVYFDENPTDKALLLDKEASEMALKVQEAHSEKDALVGEIEEFLERPIPSDYWYRTLEEKRVSAHDVIDQDYIKLYGDGKLIELPNTKPGAYVWRDKVCSMEIWKVMMKRDDQPQQHHLRKIDKALRNTNYCGTVKKQTRYGEGIGKQYGFSVDLASYYKNLKV
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MKKLISILLINIIILGVSNNASAQGDIGIDNLRNFYTKKDFVDLKDVKDNDTPIANQLQFSNESYDLISESKDFNKFSNFKGKKLDVFGISYNGQCNTKYIYGGVTATNEYLDKSRNIPINIWINGNHKTISTNKVSTNKKLVTAQEIDVKLRKYLQEEYNIYGHNGTKKGEEYGHKSKFYSGFNIGKVTFHLNNNDTFSYDLFYTGDDGLPKSFLKIYEDNKTVESEKFHLDVDISYKETI
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MKMYLTYICLVSLLTILLLAISNMYVAFSVYAWLITLGCNLTGGLENE
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MNEIKLEYDTHVSVVHYESLDSRSFKSFSKPKWSKLINKLSVPIEANYKYARGVAVYGDIKNGANDHGEIIKKHRNDVNVVYRDVIVLDYDEINDLKQLHEAISSALSNVAWFWHTSFSHTTEQARIRLYIPLNERISADDYRKYTKVLANKIGHKVDEGSYQPSRCFALPVIQKGHIFIKRVNDCPIIDVDMLEQWSKEFEQSNGSPNIKGYTRRDSAYWRDIAFGVSEGERNSTLASITGYLLRRYVDPNLVYGLVSAWASVCKPAINQSEVNNTFKSILKKDSKSS
>CP018629|1578227:1593035|1586641_1587376_+|AUS75252.1|DBSCAN-SWA
MTFGEILKKERVSWKLSVKELSTLSGVSQTYISKLENGKRNFPSLETIFNLLIGFKTHIEYKMGSESPFYEINNSYLDEILIMFINSSNSTISDRDPNELITQFNEYYDVTIKKKQNENSKIESDIFSNKIKLVKGTTKKEVIEKPYFDLNWLLTQNEYEVFFDRSFLLDNNFLNKKHFTEKDMYYYNVLNDNDLKTIKDLIVVFLLNKYNYIKNKDDFFNIFTNSEDDKTKRDALYKILYETD
>CP018629|1578227:1593035|1592009_1593035_-|AUS75257.1|DBSCAN-SWA
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>CP018629|1578227:1593035|1578227_1578797_-|AUS75239.1|terminase|DBSCAN-SWA
MSDLTAKQARFVNEYIRTLNVTQSAIKTGYSANSAHVTGCRLLKKPHIKQYIQEQKDKIIDENVLTAKELLHVLTNAAVGDETETKEVVVKRGEYKENPQSGKVQLVYNEHVELIEVPIKPSDRLKARDMLGKYYKLFTDKHDINGNVPIFINIGEWDGDDEELDKAVKDVSNANPNHTVIVDDIPLED
>CP018629|1578227:1593035|1578793_1579006_-|AUS76787.1|DBSCAN-SWA
MTDDNIDDHIVKNHLEMIVDRVANDKEFYIFDSLIQGRSFKDISNVLECSEQSVRLWYETLLDKIVEVIE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
1575922:1575940	attL	NA	NA	NA	NA
AUS75239.1|1578227_1578797_-|terminase	terminase small subunit	A0A1W6JQF0	Staphylococcus_phage	3.5e-101	97.9
AUS76787.1|1578793_1579006_-	pathogenicity island family protein	Q4ZE86	Staphylococcus_phage	3.2e-31	97.1
AUS75240.1|1579137_1579665_-|coat	spore coat protein	Q4ZE87	Staphylococcus_phage	1.6e-87	96.0
AUS76788.1|1579715_1579934_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75241.1|1579951_1580530_-	pathogenicity island protein	A0A2H4JBG0	uncultured_Caudovirales_phage	3.3e-30	40.0
AUS75242.1|1580541_1580883_-	pathogenicity island protein	Q4ZE66	Staphylococcus_phage	1.6e-56	98.2
AUS75243.1|1581331_1581973_-	pathogenicity island protein	Q4ZE67	Staphylococcus_phage	2.7e-113	94.8
AUS75244.1|1581969_1582254_-	pathogenicity island protein	A0A1W6JQE4	Staphylococcus_phage	1.6e-49	98.9
AUS75245.1|1582255_1582618_-	pathogenicity island protein	A0A1W6JQD5	Staphylococcus_phage	2.9e-64	96.7
AUS75246.1|1582919_1584377_-	virulence-associated protein E	A0A1W6JQD6	Staphylococcus_phage	1.4e-279	96.7
AUS75247.1|1584393_1585263_-	mobile element-associated protein	A0A1W6JQL5	Staphylococcus_phage	4.2e-162	96.9
AUS75248.1|1585350_1585644_-	pathogenicity island protein	A0A1W6JQH0	Staphylococcus_phage	1.8e-24	61.8
AUS75249.1|1585646_1585856_-	pathogenicity island protein	Q4ZE76	Staphylococcus_phage	7.7e-30	95.7
AUS76789.1|1585848_1585995_-	pathogenicity island protein	NA	NA	NA	NA
AUS75250.1|1586006_1586279_-	pathogenicity island protein	Q4ZE77	Staphylococcus_phage	3.4e-46	100.0
AUS75251.1|1586279_1586492_-	transcriptional regulator	Q4ZE78	Staphylococcus_phage	3.4e-33	98.6
AUS75252.1|1586641_1587376_+	DNA-binding protein	Q4ZE79	Staphylococcus_phage	8.5e-132	98.4
AUS76790.1|1587550_1588279_+	exotoxin	A0EX09	Staphylococcus_phage	7.9e-29	35.4
AUS75253.1|1588302_1589031_+	exotoxin	A0EX09	Staphylococcus_phage	2.4e-22	32.3
AUS75254.1|1589118_1590339_+|integrase	site-specific integrase	Q4ZE80	Staphylococcus_phage	3.5e-98	47.3
AUS75255.1|1590482_1591304_-	methionine ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
1590483:1590501	attR	NA	NA	NA	NA
AUS75256.1|1591321_1592017_-	methionine ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
AUS75257.1|1592009_1593035_-	methionine ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.2e-27	36.8

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>CP018629|1631732:1640342|DBSCAN-SWA
CATGACCCAAGTACATTTTACACTGAAAAGCGAAGAGATTCAAAGCATTATTGAATATTCTGTAAAGGATGACGTTTCTAAAAATATTTTAACAACGGTATTTAATCAACTAATGGAAAATCAACGAACAGAATATATTCAAGCAAAAGAATATGAACGAACAGAAAACCGACAAAGTCAACGAAATGGCTATTATGAGCGCAGCTTTACGACACGTGTAGGCACGCTAGAATTAAAAGTACCCAGAACACGTGATGGCCATTTTTCACCCACAGTGTTTGAACGTTATCAACGAAACGAAAAAGCCCTCATGGCTTCAATGTTGGAAATGTATGTATCAGGCGTTTCAACTCGTAAAGTATCAAAAATTGTGGAAGAACTTTGTGGTAAATCCGTCTCTAAGTCCTTCGTTTCTAGCTTAACAGAACAGCTAGAACCTATGGTTAACGAGTGGCAGAATCGTTTATTATCAGAAAAAAATTATCCTTACTTAATGACCGATGTACTCTATATAAAAGTACGAGAAGAAAATCGAGTACTCTCAAAAAGCTGTCATATAGCGATTGGAATAACCAAAGATGGCGACCGTGAAATTATCGGCTTCATGATTCAAAGTGGCGAAAGCGAAGAGACCTGGACAACATTTTTTGAATACCTAAAAGAACGCGGTTTACAAGGTACGGAACTCGTTATTTCTGATGCGCACAAAGGATTAGTCTCTGCCATTAGAAAATCCTTCACCAACGTAAGTTGGCAAAGATGCCAAGTTCACTTCCTAAGAAATATCTTTACCACCATTCCTAAAAAAAATTCAAAATCTTTCAGAGAAGCTGTTAAAGGAATTTTTAAGTTCACAGATATTAACTTAGCGCGTGAGGCTAAAAATCGATTGATTCATGATTATATCGATCAACCAAAATATTCAAAAGCTTGCGCATCATTGGATGATGGATTCGAAGACGCCTTTCAATATACCGTACAAGGAAATTCCCACAATCGACTAAAGAGTACCAATCTAATTGAACGACTGAATCAAGAAGTACGCAGAAGAGAAAAGATTATTCGCATCTTCCCCAATCAAACATCAGCCAATCGCTTAATTGGAGCCGTTCTTATGGACCTACATGATGAATGGATTTATTCTTCAAGAAAATACATCAATTTTGATAAGTAGAAATGGTAAAAACATTGTATAGCATTTTACACAGGAGTCTGGACTTGACTAAGTTTTTTAGATTGTTATATTACTATGTATTCTTAAATTTGTTTAAAAAATTAATGCTTTAAATTGATGTATAATGGGAATAAGAAATAAATAAAAACGACCCGCACGATTAACGTACGGGTCCACTACTAAAGGGAGTCAAATTTTTACCTTCGTTTGTATCATGCAGCGTTTTACACATACTTTTAAGAGATGTTTATTCGTTATCGAAGGTACACCTTTATTATAACTTATATCATTTTTATTAAAATACAATTCAAAAAAAGTTATTGACATATTATTGTCTAAATAATGTATAACCTTTGAACAACAATAATGATTATTAAATAGTAACTAAATACAAAATTACATGGGGTGAATGATAATGAAACAATACTTAATTACTGGTGGGACTGGTATGGTTGGATCTCAATTAGTTAATGAAATTAAAAAATCAGATTCACATATCACGATATTAACGCGACACGACCAAATTTCAAATGATAAGAAAATTTCATATGTCAACTGGGCTAAATCTGGGTGGGAACACAAAGTTCCTCAAAATATCGATGTGGTCATCAACTTAGCAGGTGCTACATTGAATAAACGATGGACACCGGAATATAAACAAACGCTAATGCTAAGTAGAATTCAATCTACGCAAGCTTTATATGAATTGTTTAAATCACGTAATAAAGCACCTAAAGCTTTATTTAATGCTAGTGCCACTGGTTACTATCCTCCTGATTTATTTATGAGTTACACAGAAGTTTATAAAACTTTACCTTTTGATTTCTTATCAGATATTGTGTATCAATGGGAACGTTTCGCACAACAATTTGAACAATTAGGTACACGAGTTGTCATCGGTCGTTTCGGTATAATTTTATCGAATGAAGGCGGTGCGTTACAAACAATGAAACTACCATACGAATATTACATTGGTGGTAAATTAGGTTCTGGTCAACAATGGTATTCATGGATTCATATCAATGATTTAATTCAAGCTATTTTATTTTTAATAAATAACGAGTCAGCTAGTGGTCCGTTTAATTTAACTGCACCTATACCTGAACGTCAAAATTTATTTGGCTACACTTTAGCAAGAGCTATGCATAAGCCTCATGAAACTTGGGCACCAAGTCTTGCAATGCGTCTCATACTTGGTCAAATGTCAACAGTAGTATTGGATACTCAAAAAGTATTACCTAATAAAATTCAAGCATTGGGATTCCAATTTAAATATAGTAATTTAAAAATGGCACTTGAAGATTTAATTAAAGAATAATCAATACCATTAATGAGCATTAGAAACAACATATGTACTAAATGTAATGTCTAGAGCGACTTACAAACAAAGGATTGAAATGTTCCTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAACATTTCATATAGTTACGGTTCAACTAGCTTCATTCAATCATATTTCCGCTCAAAGTATAGTAAACAAATTATTGACACCTTGGTTTACTCATACAAAAAGAGCAGACAGCTTAGTCTACTCTTTACTTTGAATTATTTTGTTTCAGGTACCATCACTTCATCAATTAAGCCATATTCTTTAGCTTCTTCTGCAGTTAAGAAGTTATCACGATCTGTGTCTTTTTGTATTTTTTCAATACTTTGACCAGTACGCTCTGATAAAATGCGGTTTAATTTTTCACGTGTTTTTAAAATGTGATTTGCAGCAATTTCGATTTCAGTTGCTTGTCCTTGAGCACCACCTAATGGTTGGTGAATCATTACTTCTGCATTTGGTAACGCGAAACGTTTACCTTTTGCACCAGCTGCTAATAAGAATGATCCCATTGATGCAGCCATACCGATACAAATTGTTTGAACATCAGGTTTAATGTGTTGAATTGTATCATAAATCGCAAAACCAGCTGTTACACTTCCACCTGGTGAATTAATGTATAAATAAATATCTTTCTCTGAGTCTTGCGCTTGTAAGAATAATAACTGTGATACGATTGAATTTGCTACGTTGTCATCAATTTGTGAACCTAACATAATAATACGGTCTTTTAATAAACGTGAGTATATATCATATGCACGTTCACCGCGGTTTGTTGTTTCAATAACTGTAGGAATTAAATTCATCTATATTTCCTCCTTGTAATAACTGTTACTCATTATTTTACATATTAAGTCAAATTTGGTCAAACACTTTGACTTTAAATAGTTACATTGTTTGACGCTTTTCTCTTTCCTTTGTAAACTGATAATATCTATTTTAGATTGTACTTATTTTACTTCTCATAGTACAGAGATATGATTACATATTTGCTCCTTGTGGTGTAATGGATAACACGTAAGATTCCGGTTCTTAAGATAGGGGTTCAATTCCCTTCAAGGAGGCTGTTTTAATAAAATACAATACTTTTCAATACAGAGAATCCCGCAATGTCGGGATTCTTATTTATGCTGATTTTGTTTTTGTCTATGATCAGGGACTTTCAGGGACTCAATTAATTATCACATTCATATTTTCTTATGACCAAATTGATACATATGATGCTATTTAATGAGAAAATTAGGCATCACTTGGTTATTGAATTTCCTTCATTAAACTTTCCAGCTCAATTTAATAGTTAGTCGACTATTATTCATTAAACACTTTTTAATCATAAAAAAGTGTTTTTGATAATTCACTACCAAAAACACCTTCTTACTTATAATTCTATTTGTTCACCATTTCTAATCTTATCGGCTAAATCATTCAGTTTTCTTAATCGGTGATTTACACCTGATTTTGAAATTGGACCAGTTGATACCATTTCTCCAAGCTCTTTCAACGAAATTTCTTGATGTTCTACTCGAATTCTAGCAATCTCTCTCAACCTGTCTGGTAAATTTTCAATACCAATTTCTTTATCAATCAATTTAATGCTCTCAACTTGTTTCATCGCAGCACTAACTGTTTTATTTAGATTGGCCGTTTCACAATTAACGAGTCGGTTAACAGAATTACGCATATCTCTTACAATACGTACGTCTTCAAATTTTAATAACGCTTGATAGCCACCTATCAAACTAAGAAAATCCGAAATCTTTTCCGCTTCTTTTAAATACGTAATACTTCCTTTTTTTCGCTCTAAATGTTTTGCATTCAACTCATAACTATTCATTAGTTTCGTTAAGCCTTCTGCATGACTCTCATTTTGAGAAAAAATTTCCAAATGGTACGAAGATGTTTCAGGGTTATTCACTGAGCCACCTGCCAGAAAAGCTCCTCTCAAGTAACTGCGTCTCATTTCGTCATCTTGAATCATTGAATGATCAATTTCATGCGTAAAAATGCCGTCTTTTAAAATTCCTAATTCATCAAGAATTTCTTTCGCTTTCATCTTTGTACGACAAATATAAATATTATTTTTTTTAAGTTTCATTTTTTTACGGACTAATATTTCAACTTCCACATTAAAGACACGTTTAATCAACGAATAAATACGTCTTGCCGTTGTTGCATTTTCCGTTTGAACATTTATAACAAATTGTTGATTTGAAAGACTAAGTGCACCATTCATTCGAATCAGTGCACTGAGCTCTGCTTTTGCATTCATTTCATCGACGTCTATTCTAGTTAATTCATTTTTCATTTCTGATGCAAAGCTCATCGTACAGTCATTCCTTTCTTATTTAAAACATGATTCACCTTAGAACCACTGTCTATTTTCATTTTTTTCACAGCTCTATTATCATATCATAATATGATTACGTTCTATATTATTTACGTTTATCACTTGGTACGAAAGGAATAGTACTAATTAATTCTAAAGCTATGTCATAAATCATTGTCGATAACACTTTAGTATTATGTCTTACTAAATGATTTTCAGAAATTTCAACTAAATTTGAAGATGTTTTTACATTTATGCTTTCTTTTTCAAGTTCAGCCTTATTAACTTCAACTGGTTTAGAATGTTTTTCTTCATATTTTTTCAAAACTTGAGCATTGAAAGTTTGTGTACTACAAATGACATAATCAATAAACGGTTGTCCAGCTTGTCTATGAATCGCATCGATATGATCTTTCACGCTATAACCATCTGTTTCCCCAGGTTGCGTCATCACATTAGAAACATATAGCTTAGGCGCATCAGAATGAATTAACGCATCTGAAATACCATTCACACATAAGTTAGAAATAACGCTCGTATATAATGACCCTGGTCCAAGAACGATTAAATCTGCTTCCCTTAAAGCATCGATTGCTTCTTCCATTGGTTGCACATCGTTAGGTTCTAAAAACACACGATCAATTTTTTTATGTTTTTTAGGAATATTTGTTTCTCCAAAAACAATTTCTCCATCTTCCATAACAGCATTTAATTGCACACTTGTATTTGTAGATGGAATGACTCTACCTTTAATATTTAAAATTTTACTTAATGCTTTAATGGCATGTCCGAAATCATTCGTAATATTAGTCATACCTGCGATTAATAAATTACCTAATGAGTGACCGCTAATTTGATTTTCTTCAAAGCGATACTGAAAAAGTTGGCTTAAAACTGACTCAGAATCACTTAAAGCTGCAATCACATTTCTGATGTCTCCTGGTGCTGGTATATCCATTTCATCTCTGATTTTCCCTGTACTCCCACCATTATCAGCAACTGTTACAATCGCCGTAATATCAATTGGGAATTCTCTTAATCCCCTAGCCATAACTGATAAGCCAGTGCCACCACCGATAAGTACAACTTTTATTTGTCTCATTTTTTCTCGCCACTTTCAATATGTGCGTCCCTATGATGCACATAAACATTATATTCAAATACTTCATTTAGATAATTACCTAGTCGTTCTGCTAATGCTACAGATCGATGTTGTCCACCCGTACAACCGATGGCAATTACTAATTGAGATTTCCCTTCTTTTTTATACCCGGGTATCATAAAATCTAACAAATCAGTTAATTTTTCAAAGAAAATCTCCGTCTCTTTCCATTTCATAACATAATTATAAACGTCTTTATCTAATCCTGTTAAAGGTCTTAAATCTACTACATAATATGGATTTGGTAAAAATCGTACATCAAATACTAAATCTGCATCCATCTGAATCCCATGTTTAAAACCGAAACTTGTGACATTAATTGTAAAAGTTTCAAACTCTTCATCTTCATAGTATCGACGAATGCGTTCTTTTAATTCTTTAGGTGATAACTTTGTAGTATCTATAACAAAATTAGCTATACTTCTAATTTGAGACAAATGCTCTCGCTCATCATTAATTGCATTGATTAACGATCTTTTACCTTGTTCCATCAAAGGATGTGCACGACGCGTTTCCTTATATCTTGAAATTAATTTTTCAGTACTTGCTTCTAAAAACATAACATCAATGATGACGTCACTTTCACTTTTGACTTTATCCACTACTGCAACTAATGAATTAAATAGTTCCTTACCTCTTAAATCAATTGCAATTGCCACTTTTCTTAAGGATGGATTTCCTTGTTCCATCAACTCTACAAATTTAGGCAATAACACTGGTGGTAGATTATCTACACAAAAATATCCCATGTCTTCTAAACATTGAATAACCAAAGATTTACCTACGCCAGATAAACCTGTTACAACTAATAGTTCACTTTTACTTTTTTCTTTTTCATTATTATCCATTATTTTTTCACCGCCAAAACGAATTTCATGATGTTAATTTAAATGTTCTATGACAAAATTAAGCAACGATGTTTTATATTTATTTCCAACTATGTCTAGATTAAATTTCTAAAAATATACATCATTTAAAAGGAGCTTGGGACATAAATCAATGTCCTAGGGTCTATAATATTATATTGCTAGTAGTTGACTGAATGAAAATGCGCTTGCAACAAGCTTTTTTCAACTCTAGTCAGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGACAACGATAAAGTAATACTTTTTCTATAGAAATTAGTATTTCTTATGCATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGGCTAATGTTTAAGAACCACTACATAATAAATCATTAGTGGCTCTTTATCATTTCTGTCCCACTCCCATAAAGTTATAAGTTTAATATAACATATAAAAAAACTAGAACTCATTGAAACGCACAAATGATACGTACTAAGTTCTAGTTTTCTATATAATTTGCTTTAATTTAAAAGTAAGACATTATTTTAACGCTGTGATGACACTATTAAAATAAATATCCAAATAATTTACAGCTCAACATCTTAATTCGACTTCGAATTAAGCTTGATCGTTTAAATGTTCAATATATTCCGCTGCACTTTGCGCTGCAATACTACCATCGCCAGTAGCAGTGACAATTTGGCGTAAACCTTTGTCGCGAACATCTCCTGCTGCAAAAATACCTGGTACTGATGTTGTCATATCATCTTTTGTTACAATATAACCAACATCATTTGTAATACCTAAGTCTTTAAATGGCGCTGTTAATGGTTTCATACCAATATAGATGAATACACCATCAGCCTCGTGTGTTTCTTCTGAACCATCTTTTGTAGACGTTAATGTCACAGAACCCACTTTGCCGTCTTTTTCATTAATTGATTTCAAAGTATGACTCCAAATAAAGTCGATTTTATCATTTTTGAATGCTCTATCTTGTAAAATACGCTGTGCACGTAACTCATCACGACGGTGAACGATTGTTACTTTGTCAGCAAATTTAGTTAAGAATGTTCCCTCTTCTACTGCTGAATCACCACCACCGATAACGAATAGGCGTTTATTTTTAAAGAATGCACCATCACATACTGCACAATAACTTACACCGCGTCCACCAAGTTCTTGTTCACCCGGAACACCAATTTTCTTGTATTCTGCACCTGTAGCAATAATAACCGCTTTCGCTGTTAATTCTTTATTACCAAAGTTAATCACTTTATATTCGCCTTTATCTTCTACAGATTTAATATCTCCATATTGATAAACTGCACCAAACTTTTTAGCGTGTTCAAACATTTTTGTAGATAAATCTGGACCTGTAATCATTTCGAAACCAGGGAAGTTCTCTACTTCTTCTGTATTAGCCATTTGACCGCCTGGAATACCTCTTTCAATCATAACTGTTTTTAAATTAGCACGTGATGCGTATACTGCAGCAGTCATACCAGCTGGACCTGCACCGATAATTGCTATATCAAAATCTATTTCAGTCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_11

>CP018629|1631732:1640342|1634465_1635053_-|AUS75304.1|DBSCAN-SWA
MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK
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MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK
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MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL
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Homologous phage analysis in the prophage region

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AUS75304.1|1634465_1635053_-	ATP-dependent Clp endopeptidase, proteolytic subunit ClpP	A0A223W000	Agrobacterium_phage	8.2e-53	55.3
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AUS75306.1|1636679_1637675_-	hypothetical protein	A1IMD5	Streptococcus_phage	4.8e-53	41.9
AUS75307.1|1637671_1638583_-	RNase adaptor protein RapZ	A0A0R8VB27	Thermobifida_phage	1.1e-08	36.1
AUS76794.1|1638926_1639061_+	nitrogen fixation protein NifR	NA	NA	NA	NA
AUS75308.1|1639406_1640342_-	thioredoxin-disulfide reductase	G3MA85	Bacillus_virus	2.9e-84	49.2

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>CP018629|1672808:1687538|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12

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MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ
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MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK
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MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR
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MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL
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MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ
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MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE
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MIFLTYWCVFHLAYIIGYIKITFYTKVHQKNISTRIKQHFYRNLLHFNVNKYIFILSLINCARLITEYSQYFYFFVICWNI
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MVINEIDFYRVGRENIVIAVYNEHIKFLFILIS
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MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ
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MYNAIYIGSSWRGPNTEAGGKSANNIVQVGGAPT
>CP018629|1672808:1687538|1685586_1686129_-|AUS75353.1|DBSCAN-SWA
MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPYAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK
>CP018629|1672808:1687538|1680544_1681411_+|AUS75347.1|DBSCAN-SWA
MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK
>CP018629|1672808:1687538|1685372_1685489_+|AUS76796.1|DBSCAN-SWA
MSKEKVFLYVGAPPTCIVCRNWESNFSMLGPRSQLLPI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AUS75339.1|1672808_1673570_-	iron ABC transporter ATP-binding protein	Q9EMR9	Amsacta_moorei_entomopoxvirus	8.5e-18	31.6
AUS75340.1|1673566_1674523_-	iron ABC transporter permease	A0A2H4J116	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-05	57.8
AUS76795.1|1674509_1675481_-	iron ABC transporter permease	A0A2H4IY97	uncultured_Caudovirales_phage	4.3e-139	78.9
AUS75341.1|1675519_1675675_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75342.1|1675951_1676056_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75343.1|1676188_1677160_-	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta	A0A2H4J4P3	uncultured_Caudovirales_phage	4.2e-171	91.3
AUS75344.1|1677277_1679383_-	ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha	A0A2H4J2N6	uncultured_Caudovirales_phage	0.0e+00	91.7
AUS75345.1|1679345_1679744_-	ribonucleotide reductase assembly protein NrdI	A0A2H4J545	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-52	72.0
AUS75346.1|1679893_1680160_-	ribonucleoside-diphosphate reductase	NA	NA	NA	NA
AUS75347.1|1680544_1681411_+	EamA family transporter	NA	NA	NA	NA
AUS75348.1|1681430_1681931_+	NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase QueF	E7DN65	Pneumococcus_phage	5.9e-52	71.5
AUS75349.1|1681960_1682206_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75350.1|1682271_1683777_+	peptide ABC transporter permease	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	2.0e-58	32.2
AUS75351.1|1683854_1683956_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75352.1|1684046_1684964_+	lipid kinase	A0A1V0SBJ0	Catovirus	3.7e-07	22.0
AUS76796.1|1685372_1685489_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75353.1|1685586_1686129_-	5'(3')-deoxyribonucleotidase	NA	NA	NA	NA
AUS75354.1|1686353_1686458_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75355.1|1686479_1687538_-	histidinol-phosphate transaminase	A0A1X6WGT4	Pacmanvirus	7.9e-22	26.7

Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>CP018629|1699510:1707330|DBSCAN-SWA
ATTATAACATCTCCAAAATCTTGGTTTTTGCGTAAAATTCATTCACTTCATCTTTTGGCTTAGAATCAATTGTAATACCTGCTCCGACTCCATAAATCGCTTGTCCATATTTATACTCAATAGTGCGAATCGGAATATTAAAAATCATTTTATCATCTTCAGTTGGAAGTAATAGTCCAATTGCTCCGCAGTATATACCACGAGGTGAACTTTCTAATTGTTTAATATATTTCATTGTATTCAGTTTCGGTGCACCTGTAATCGAACCACAAGGAAATAACGATGTTAAAATTTGAGTTAAGTCTGTATTATTTTTTAAAGTTCCACTTACCATCGAAGTCATTTGAAATACAGTTTTATATGCCTCAATAAAAAATAGTTTATACACCTTAATTGAGCCACTCTGTGATATTCTCCCTATATCGTTTCTTAGTAAATCAACAATCATGACATTTTCTGCACGATCTTTCGAAGAAGTTTGCAATGTTTTATAATACTGTTGATCTTCAGCTTCCGTTTTACCTCTAGGCATTGTCCCTTTCATCGGTTTGCTTATGATAACGTTATCGACATTGTTAAATTGTCCTTTTTGAAAAAATAATTCTGGTGAGATAGACGCTACTTGGATTTCATCAGTTTGTAATAACGCAGTATAATTACCATTACTAAATTGAGTTAATCGTTCATATAAAGTACTAATAGGATAATAAATGTTATCCGTTAAGCGCGCCGTATAGTTCACTTGATACGTTTCGCCTTCAACAATTGCTTGTTGGACACGTTTAATATTAGTCATCATAACCTCAGAAGATTCAACAAATGAAAAATGATACTTTGATACATAAGAAGTTTGATGTTCATATGTTGAATTTATGCTTTCCGCTTTTTCAAAACTATAAGCTGCTGCATAAATATCATCTTTAGCTAATGAATGTGTACACATAGCATGATTAAAATACTTTGCCGCTTCGTAACTTAAATATAACGAGACATATCTACCTTGTCGTTGCTGCGCTTGTGCAAAGTGTATCACTTCTCCCACATCAGCCAACTTAGTAGCAACATACTTCTTTATAAATCCCTTTAATTGAATATGGTATTGCTTATATTCATTTTCAGTTAAATAGTAGCGATAATTATATTCTATTCTCACAGTAATCACCTACCTTCGATAAAAATAATTCAACTTGTCGATAACCGTATTCACTCAAAATAGATTCAGGATGATATTGCACACCAAAAACCGGAAATCTAATATGCTCAAATGCCATAATAATCGCTTCATCGTTTTTTGCTGTAATCTTTAAGCAATTTGGAAAAGTCGCTCCGTCAGCAATTAATGAATGATAACGCATTACATTGAAATTTTGAGGCAGTCCTTGAAAAATACCTTCATTGGTATGGCGTAACTGTGTAGTATGTCCGTGTACAGGATGATAGCCGTGAATGATATTTCCACCAAAATAAGACACGATACATTGAAATCCTAAACATACACCTAGTATAGGTACACGCTGATAAAATTGTTCTAACACTTCATTCAAGATAGGATAATCATCCGGATTACCCGGCCCAGGCGAAATAACAATTGCTTTTGGCTTCATATTAATGACGTCTTCTATCAGCAGATTATCAATACCAACAACTTGAACTGTTAGTTTCGTTTGAGTCTTAATATAGTCTATTAAATTATATGTAAATGAATCATTATTATCTATGACTAGAATCATTGTATACTCCGTTCTAAATGTGTTTTATTTTTATAATATGTATTGGATGTAGCTAAAACTTTAAAAGCATTGTCATTATCCTGACCTTGATTTTAACTAATATATGGTATATTCTATTCATCGTACATAAATGAATATCAGAGGTTCCTAGCTGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACATTGAAATTTCAAACATTCGTTGGTAAACCTTTAATATATATTATAGGAGCAACCCATTTCTTTCGTCTATCTTTTATGGAGATAGGCTTTTTTTATTTTATAAATTAAAAACGGGCTTATCAATGCCATTAACCTCTTTATTAATATTATTAATGATAGGAGCAATTACAAAATGGAAAGTGTATTAAATAATGAAAAAGCCATCGTTGTCTTTAGTGGTGGTCAAGACAGTACAACATGTCTCTTTTATGCAAAAAAACATTTCAAAGAAGTTGAACTCGTAACGTTTAATTATGGCCAAAGACATGATACTGAAATTGAAGTCGCAAAACAAATTGCACAAGATCAAGGAATGAAACATCACGTTTTAGATATGTCATTATTATCACAACTTACTCCAAACGCATTAACACAACATGATATGGAAATTACTAATAATGAAGATGGTATACCTAATACATTTGTTCCAGCTAGAAATTTACTTTTCTTGTCGTTTGCAGGCGCTCTAGCTTATCAAATTGGGGCTAAGCATATTATTACAGGCGTATGTGAAACAGACTTTTCAGGCTACCCAGACTGTCGCGATAGTTTTATAAAATCAATGAACGTAACATTAAGCCTAGCTATGGACAAAGATTTTGTCATTCATACTCCTTTAATGTGGTTAAACAAAGCAGAAACGTGGAAATTAAGTGATGAACTCGAAGTTTTAGATTATATTCGTACAAAAACATTAACATGCTATAACGGTATCATTGGGGATGGCTGTGGTGAATGTCCAGCTTGTCATTTACGTCAACGTGGACTAAATCAATATCTTGAAAGTAAAGGAGCGCTTTAAAATGTTACAACAAATCTATCCTAGTACAACGCATCCATATCAATTCGAATTAAATAAAGATTTTAATTTTTCGGCTGCACATCACATTCCATGTGAAGAAGCAGGTATTTGTCAAAATGTCCATGGTCATACTTACTTTGTTAATTTAACAATTGTCGGTGATAAACTAGATGACACTGGCTTCTTAGTGAACTTTAGCCATTTGAAAAAGATGATACACGGTAAATTTGACCATCAACCGTTAAATAACTTACCTGCTTTTAAAAACAAAATCCCTTCAACTGAAATCGTAGCGGAAACAATTTATCAAATTGTTAAAGAAAATTTGGCATCGCTCGAACACCAACCAAAATGTATTCAAGTATTTGTAAGAGAAACACCAACAAGTTATGTCGTATTTAGACCAAAGGAACAGGTGTAACTAATGGCTAAAATTCCTGTACTCGAAATATTCGGTCCAACCATTCAGGGTGAAGGTCGAGTAATCGGTAGAAAAACGATGTTTGTGAGAACAGCTGGATGTGATTATCGCTGTAGCTGGTGTGATTCTGCATTTACTTGGGATGGTAGTGCTAAAGGCGATATAAAACTCATGACCGCTGAAGAAATTTATGATGAATTAAAACGAATTGGTGGCGATTTATTTAACCACGTTACAATTTCTGGTGGTAACCCAGCATTAATTAAAGGTATCCAAGAGTTAGTTGACTTATTTCAAGATAAAGGTATTTTCAGCGCACTGGAGACACAAGGCAGTAAATTCCAACCTTGGATGACACAAATTGATGATTTAACGATTAGTCCAAAACCACCAAGTTCAACTATGACACCTGATTTAAAAAAGTTAGATGAAGTGATTACACAATGCGTACCTTCATCATTAAACTTAAAAGTAGTTGTATTCGACGATAAAGATTATGATTTTGCCAAAATGATACACCACCGTTATCCAGATATTCCCTTCTATTTACAAGTTGGTAACCCATATTTATCAGACAGCGTAGATAATCATACCGAAAAGTTGTTAGAACGCTACGAGCAGTTGGTGGATTTAGTTATGCAAAGTAATGATATGAATCACGTTTATGTGTTACCACAACTTCATACATTACTTTGGAGCAATAAAAAAGGTGTATAAAGGATAACTTATTTTACTTTTTGCAAGTCATATCTAATGAATAACAATATATTAATTGATATAATAGTTGATTGAAGTATAACGAACAGGAGTCCATCATGATTGTATATATATTAATTAATATTGCTATCGTCGTACTTATAACTGGATTCAATTTATATAGGCATCAAATGCAACATTTATCATTAAGTGCAATGTTGTTATCTATTACGATAAACGCCTTTATAAATACATTCATAATTGATAAATATAACTTTATTACTCTGTGTACTATAACGATGTTTATCATTTGGACGATACTACAGTTTTACATTGATAAAAAATTAAAACCTGTATACATTACAGACCAAAAATTTATTGCTATCATATTAACGATTGTTGTCAGTTTAACGCAACGTGTTACCGACTTTTCAAGTACACAATCAATATATATGTCTATTCCATTTTTAGCCCCTGCCATTTTCATCATTGGTGGTATTATGTTGTTTATTTCAACATTTAATAGCTTAGATGAAACTGCTGAAAATAATAACAAAATAAAGAAACTAATGATTAAAGGACTTATCATTATTAACATTTCATTTATCGTTATGATGGTTTTAACACCATATTGGTACTTGTATTTAATCGTCTATCTTATTTTCTTGTTGTTTTTATTGTGGCAAAAGGTTTATAAATTTTAATACCAAAACTATTAAACACTTCTGATATTCTTAGTTCAAAATATCAGAAGTGTTTTATAGTGTTATCTAGTTCAGATAAATATTTCCTTACTTAAAAAAACGCCCTCCTCTTATTTTGACCCCTATTTATTTAAATCAGACAATTATTTTCATTTTCAAATTATTCTTTCTTCAATATTAGTTAAGCGATATTTAAACGAAGTTAAGAATTAGTTAATGGCATATTATTTGCCTTCATTTTAAACTTAACTTATCAAATTGAAGAAATGAGGAGTTAGCATGAATACAAAATATTTTTTAGCAGCTGGTGCTGTTATCACAACATTAGCTTTAGGTGCTTGTGGTAATTCTAATTCACAAGATCAAGGTAACAAAACTGAACAAAAAACAAAGTCAGAAGATAGCAATGTTAAAACTGATAAAACAAAACACCTAACAGGTACATTCAGTTCTAAAAACGGTGAAACTGTTGAAGGTAAAGCTGAGATTAAAAATGGTAAATTAATGCTTACTAACTACAAATCATCAAAAGGTCCAGATTTATACGTCTACCTAACAAAAAATGGCGACATTAAAAACGGTAAAGAAATCGCAATGGTTGACTACGATAAAGAAAAACAAACATTTGATCTTAAAAATGTAGATTTAAGCAAATATGATGAAGTAACAATCTATTGTAAAAAAGCTCACGTCATCTTCGGCGGCGCTAAATTAAAATAATCAATTTCTGAGTTAAACTTTTATTTACAACATACTATTACTATACATTACAAATTTTTAAAATATACATTACACTCATTACTCAATGGAAAGCGTATGATTTCACAGCCCCCCTAGCTTGTAGAAATCATACTTTCCTTTTTTCAATATATATACAACTATTAAATCCCATAAGATTGCAGAGCACATAAGTAAATTTTTTTAGAGCTTGAGGTTTGTTTAGCTTAAGCAACCCATGAGCTCAAACACTTCCTGTTCACATAACACTACAAATCGCATTATGTTGCTTAATCTTATGTTTATATAAATTACACACAATAAATAGAAAGAATGTGAACATCATGAATAAATTATTGCTACTCGTTACATTTATCATTCGTGTGGGTTCAGGTATTGTTATGTTAATGCAAGGCTACGAAAAATTAACGGGCGGATTTACGCTGAAAGGTTTAGTACCAGTCATCGCTAACAATACTGATTCACCAGAGTGGTATAAGTGGTTTTTCGCAAATATAGTTGCACATACGACGTCATTATTTGATATTGTTGTCCCACTCGGAGAGATTGCAATTGGATTAGGTTTAATTTTTGGAGTTTTTGCATATGCTGCTAGTTTCTTTGGAGCCTTTGTTATGATAAATTATATCTTAGCAGATATGATATTTACGTATCCTCTTCAATTAACTTTCTTTATCCTTTTACTAATGAGTCACTCATTGTTAAAACAGATTTCACTTAAAGAAATCATTAATTACTTTAGAGGTCGTAAGAACAGAGGTGAAAAAATAGATGACCCACTTACTGATCGTGGATGATGAACAAGACATTGTAGACATTTGTCAAACCTATTTTGAATATGAAGGTTACAAAGTAACAACGACAACTAGCGGTAAAGAAGCAATTTCTTTACTATCAAATGATATTGATATCATGGTACTTGATATCATGATGCCAGAAGTTAATGGTTACGACATTGTCAAAGAAATGAAAAGGCAAAAATTAGATATCCCCTTTATCTATTTAACTGCCAAAACACAAGAACATGATACCATTTACGCCTTAACTTTAGGTGCAGATGACTATGTCAAAAAACCATTTAGTCCAAGGGAACTCGTTTTACGTATTAATAATTTACTTACAAGAATGAAGAAATACCATCATCAACCAGTTGAACAACTGTCGTTTGATGAATTAACACTTATTAACTTAAGTAAAGTTGTGACTGTAAATGGTCACGAAGTCCCTATGCGTATTAAGGAATTTGAGTTATTGTGGTATTTAGCTTCTAGAGAAAATGAAGTTATTTCTAAATCAGAATTACTTGAAAAAGTTTGGGGATATGACTATTACGAAGATGCTAATACCGTGAATGTCCATATACACCGTATTAGAGAAAAATTAGAAAAAGAGAGCTTTACAACATATACCATCACAACTGTATGGGGATTAGGATATAAATTTGAAAGGAGCCGATAATGGTGTTATCAATTAGAAGTCAAATCATTATTGGCGTCGTATCGAGTATACTATTAACTTCAACTATTTTAGCAATTGCATATATTTTAATGTGGTTTAACGGCCATATGACACTAACTTTGACCTTAACGACAATAATTACAAGCTGTTTAACCTTATTAATATGTAGTATTTTTATTAATCCACTTATACAAAAAATTAAGCAGTTTAATATAAAAACTAAGCAATTTGCTAACGGAAATTACGCAAGCAATGATAAAACGTTTAATTCACCAAAAGAAATTTATGAATTAAATCAATCTTTTAATAAAATGGCTTCTGAAATTACGCAACAAATGAATCAAATTAAATCCGAACAACAAGAAAAAACAGAACTGATTCAAAACTTAGCCCATGATTTAAAAACACCTTTAGCAAGCATTATTTCATATTCTGAAGGACTACGTGATGGTATAATCACTAAGGATCATGAGATTAAAGAGTCATACGACATATTAATTAAACAAGCAAACAGATTATCAACATTATTTGATGATATGACTCATATTATCACTTTAAATACAGGTAAAACATATCCCCCAGAATTAATACAACTAGACCAATTACTTGTATCAATATTGCAACCATATGAGCAACGTATCAAACATGAAAACCGCACATTAGAAGTGAATTTCTGTAACGAAATTGATGCATTTTATCAATATCGAACGCCACTTGAGCGTATTTTAACAAACTTACTTGATAATGCGCTAAAATTTTCAAATGTTGGTAGTCGCATTGATATTAATATTAGTGAAAACGAAGATCAAGATACTATCGACATTGCTATTAGCGATGAAGGTATTGGCATTATACCAGAACTACAAGAACGTATATTCGAACGTACATTCAGAGTAGAAAACTCTCGTAATACAAAAACGGGTGGTTCTGGATTAGGCTTATATATAGCTAATGAACTCGCGCAACAAAATAACGCAAAAATCAGTGTAAGCAGTGATATAGATGTAGGAACTACGATGACTGTAACATTACACAAATTAGACATTACGTCATAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_13

>CP018629|1699510:1707330|1702682_1703396_+|AUS75369.1|DBSCAN-SWA
MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV
>CP018629|1699510:1707330|1706274_1707330_+|AUS75374.1|DBSCAN-SWA
MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCNEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENEDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS
>CP018629|1699510:1707330|1699510_1700662_-|AUS75365.1|DBSCAN-SWA
MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHAMCTHSLAKDDIYAAAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKYHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKNNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML
>CP018629|1699510:1707330|1705140_1705614_+|AUS75372.1|DBSCAN-SWA
MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG
>CP018629|1699510:1707330|1703494_1704079_+|AUS75370.1|DBSCAN-SWA
MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF
>CP018629|1699510:1707330|1702259_1702679_+|AUS75368.1|DBSCAN-SWA
MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQPLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV
>CP018629|1699510:1707330|1705588_1706275_+|AUS75373.1|DBSCAN-SWA
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>CP018629|1699510:1707330|1704358_1704799_+|AUS75371.1|DBSCAN-SWA
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>CP018629|1699510:1707330|1701589_1702258_+|AUS75367.1|DBSCAN-SWA
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>CP018629|1699510:1707330|1700645_1701239_-|AUS75366.1|DBSCAN-SWA
MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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AUS75366.1|1700645_1701239_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	4.4e-38	42.9
AUS75367.1|1701589_1702258_+	7-cyano-7-deazaguanine synthase QueC	A0A2H4J8Q7	uncultured_Caudovirales_phage	9.6e-66	57.5
AUS75368.1|1702259_1702679_+	6-carboxytetrahydropterin synthase QueD	S4U060	uncultured_phage	3.7e-07	28.7
AUS75369.1|1702682_1703396_+	7-carboxy-7-deazaguanine synthase QueE	A0A1U9WRB6	Streptococcus_virus	6.5e-52	43.5
AUS75370.1|1703494_1704079_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75371.1|1704358_1704799_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75372.1|1705140_1705614_+	DoxX family protein	NA	NA	NA	NA
AUS75373.1|1705588_1706275_+	DNA-binding response regulator	NA	NA	NA	NA
AUS75374.1|1706274_1707330_+	two-component sensor histidine kinase	A0A1V0SGX0	Hokovirus	2.1e-14	30.0

Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>CP018629|2029385:2081370|DBSCAN-SWA
CATGTCGGAAATCGCAGACTTGATTGAGAAAATGTATGGGCATTACTACACGCCCCAAACCATGTCCAATATAACAAAATCATTTACAGAAGAGGTAACGGCGTTTAATGGGCGGGAGCTTCATGACCGTTATGCTGCTATTTATATGGACGCAACGTATATTCCGTTAAAGCGGAAAACCGTCGCCAAGGAAGCTATTCATATCGCAGTTGGCATTCGCCCGGACGGATCAAAGGAAGTATTGAGCTATGCGATTGCACCGACTGAATCCATCACGATTTGGGAGGAAATTTTATTGGACCTTCAAGAGCGCGGTTTGAAAAATGTCCTCCTGTTCATCACGGATGGCTTAAAGGGGATGGTAGGAGCGATTAGTCGGTTCTATCCCAAAGCTCGTTTTCAACATTGTTGTGTACACGTTTCCCGTAATATCAGTCACAAAGTGCGTGTCGATGATCGTAAGGAAGTCTGTGATGATTTTAAAATGGTATATCAAGCCTCATCTAAAGAGGTGGCGTTGGAAGCACGTGGTGCTTTTGCGGAAAAATGGAAAACCAGCTATCCAAAAGTGGTTGAATCGATTCTTTCGAACGATCACTTGCTCACTTTCTATGATTTCCCCTTGGCCATACGCAAGAGTATTTATTCTACGAACTTGATTGAATCCTTTAATAAGCAAATCAAGAAATACAGCCACCGCAAGGAACAGTTCCAAAACGAAGAGTCGATGGAACGTTTCTTAGTCTCGTCTTTTGATACTTACAACCAAAAATTCCTAGGTCGCAGTCATAAAGGCTTTCAACAGGCCGAAGGCGAACTTGAACAAATGCTAAGCCAACTGATTGAGAATTAGAAACAATCTGCAGTAGGGAAGAATCATTTACACAAAATTATTGACGCTCCCTTATAATGAGAACTTTTACTAACATAATTTATGATAAACTTACTATATAATCATATTAATTAAATAGTTAGGAGATCTGCTTATGTTTATATCTACTCTTCAAATTCGAAATTTTAGAAATTATGAATCCGAAATCTTTCGATTCGATAATGAGACAAATACTATTATAGGTGAGAATGATTCAGGGAAAACCAATGCTCTTACTGCATTGAGAATCTTATTAGATGATAGTTATTACTATAGTAGTAAAACACTGAAAGAATCAGATTTTTTTCATGGAATTCAAAATGGGTGGCAAGGGCATTGGATTATTATCTCTGCGACATTTGAAGGAATCAGCGAAGAAGAATTTGACAATGAGATTTGTGCTTCCATTTCTTTAAATTCTGAAAGTCAAACAATCTTAGAAGAATTGATTTCAAATGCAGATAAAGGTGTAGGTAGTATTTCTCTATTTATTAGACCTAACAAAGCTATTAGAAAGCAATTATTTGATATTTCCACTGAATTAGACTCTCATCAATTTAACGAATTTAGAAATTCTATTCGTCTATCCGACTATGAATTTTACTACACATCTAAATCAAATCTAAATTTCTGTATCAATGAAAATTATGATAAATTGGTAGGAAGACTCAATGACAATATAGCTAGTAATCCTGAAGAAGACGATGAAGCTCTGTTGGGCTCAAGAATTGACATGTCAGATATTTTCAAGCATATTTCGGTTGTTTATGTTGACGCTCTTCGAGATGTTCTTAGAGAAATGAAAAACAATCGAAACCCAGTCAAAAGAATCATGGAAACAATTGAATCAAAAATATCATCAGATAATGTTGAGTCATTAAAAACAATTATACAGCAATTAAATGAGACTATTACCAGTGTTCCTGAAATTAGGAAAATTGGCGAAAATATTAATCGGCAACTAAATAGCATAATTGGTTCAGTGTATTCTCCTAATCTTCTTCTTTCCTCAACTATGTCAGATGATATGGGTTCTTTAGCAAAATTTCTTTCAATGAAGCCAGAACAAAATATCGACTTAGACTTACTAGGGTTAGGACATCTAAATATGATTTATTTAGCTTTGAAAATAGTCGAATTTGAAGCGTGTCGTTCAAGAGAACTACTTAATATTATGTTGATTGAAGAACCAGAAGCTCATATTCATCATCATATTCAAAAAACTCTGTTCGAAGGATTAAATCTTCAAAAAAACTATACTCAGATTCTCATGACCACACATTCTGTACATTTAGCTGAAGTGTCTGAAATATCTCGGATGAATGTATTAAAATCGTTTAATGGCAAATCTATCGTTATGAATCCAGCAAATAATCTGAACTCATTTGCTAAAGAAAAGTTAAAAAAGAACAATCTAAATCTAATAAACGCAGTAGAGAGATATTTAGATGTTAAAAGAAATGGATTGCTTTTTTCTAAAGGTGTTATCTTAGTTGAAGGAGATGCTGAAGAAATACTTATTCCTCAAATAGTAAAAAAATTATTTGGTATAAACTTAGACGAACTTGGAATAGGTTTGATTAATGTTGGTAGTACTTCGTTTGAATATATCGCTAGCTTGTTTGACGATGATAGAATACAGAGAAAGTGTGCTATTGTAACTGATTTAGATGAACAGGCAATCCCATCAGAACATCGATTGTATAAAAGCACTGCACAAGAGAAAGGTCAAGCAAGAAAAGAAAAATTATCCTCCCTTTTTAATGAAAACAATTGGGTTAATTGTTTTTATGCTAATACAACATTTGAAATTGAGTTTTTAGATGTGAATAAAGAAAATATTCTAACTTATGTCAGTCCAATTATAGATGACGCATTCAAAGATAAAAAAACAATAACTGCTTATAAAGAAGAAATACAAAGTGAACAATATTTAGAAAGAAATTTAGCGATGTTAAAACTAGCCAATCATGTTGGTAAGGGGTGGTTTGCAATTGAGTTAGGTGAAAAAATTGACTTTTTAATCAAAATTCCTAAGTATATTCTTAATGCTATTGCTTTTGCATGTCAGGAAATAGTAGATCTCTCAATTTATAAAAAAATTCTACTCCATACAATCGACTTGTACGAGGAAACTACAGAATTGTCAGCTTTATCAGCTAGTTTAAAAACAAGTGATACAGCTGATTTGAATATAGCAATAATTTCTTTATTAGAGTACTTTGGTAAAGATGAGGATGTTGTGTATCTAATCAATCAGATAGAAAATTACACAAAAATACTTTATGCTGAGGTTTCAAAATGACAAATATCTTCGAAAAAATCGTAAATGATTTAAATTTAGAACAAAAAGATGTTGTGGAAAGTGAAGATAACCTTTATGTAAATGCATGTCCTGGGAGTGGGAAAACAAGGGTACTTACAAGGAAAATTGCTTACCAAGCAATTAAACACGATGGATCACTAAAAAGAATAATTGCTATCACATACACTAATAGAGCTGCTGAAGAAATTAAGGAACGCCTAAGTTTACTTAGTATAGATGATGATATTAATATTTGGGTGGGGACAATACATCAGTTTTGTCTTGAATTTATTATTTATCCTTTTAAAATGAATCTCTCAAGAGTATCAAAAGGATTTACAATTATTGATGATTATACTCAAAGAGCTTACGTCAGCCAAATTAATAATATGCTGAATTTAAATCTCAAAACGTATGAACTGAACAAAATTGATTTGTCACTTTCTCATGATTTTAAAATTAATGAAGTTCAGTATACTCAAGTTTCTGAAATGTATCACACTATGTTGGAAAAAAATAAAGAAATTGATTTTGATATGATTTTACTAGTAGCGTATAAAATTTTAACTGTAAACAGTAACGTTGCACGTAATATTGCTAGTAATATAAGGGCGATTTATGTGGATGAATTTCAAGATACTAGAGAATTACAATACAATGTAATAGCTAAATTACTTCAAAACAACCCTCAAATTCAGTCAATGTTTGTTGGAGATATTGACCAAGCAATTTATGGATCATTAGATGGTATAGCTAAATCAGTTGAAGAACTAGAAATGCTAACTAGTCACACTTTTCAATCAAAGACGCTACATGGCTGTTACAGGTCTAATCAGAGATTAGTAGACTTCTACTCTAATTTTCAGAGTTGTCCTTACGAGATTGAAAGCAGAGGGAATAATAAAAACGACCGTGGTTTTATAAGTTATGATTGCAAAGTTACTAAGGAGGATTTACCCAACATAATAAAAAATATAATAAAGGAAAAGATTGAAAGCGGCATTCATGAAAAAGATATTTGTGTACTTGCTCCTCAACACTATCCTCTGTTTTCACTGGGTGAGTATTTAAAGAAAGAATTACCGTATTGCAATTTTGATGCTATAAATATATCACCAATTAAGGTAAATAATCATAGTTTATTTTTCAAGTTAGCAATTTTGTACTTTACTGAATCAGGTGAAAAGGTTCGAAGAAAAAAGCTAATTGCAAACGATATTTTAATTATATTAAAAAATGAATTTGGAATAGAAGTTAAAGATTATTTTATTGACTTAGATTTATTACAGCTAATAAACAGTGTGAAAAGAATGTATAGTGGAGACGACAACGGTGTTGATTTATACAAATTTGTTACCAAACATATATTTGTTAATCTTAATATTGACGAGAAAAATTACCCGTCTATTTTTAAGCACTATCTATTTTTTATTAACGAAGTAGAAGATCGGATAAAAAATAATTCATTATCTAGTAGTGTATCTAGTTTTAAGAAGATGTTTAAATCTCGAGATGGTATCACACTTACTACAGCACATAAAGTTAAAGGAAATGAGTATGATACTGTTATCGCTATTAATCTTCTAAACGGGAAAATTCCTCATTGGAATGAAATTTTTAATGTTTCTGATAAAGGAATTAGTTCAGCGAGAAAACTACTATACGTAATTTGTTCAAGAGCAAAAAATAATTTATTTCTTTTCTCAGAGGTGGGTTATTTTACGAGTAAAGGAGACTTGCTTTATCCCACTCAATTATTAGATAAAATAGAATTTGATTATAATATTTAAAATACCTAGGTAGTCGTTGTTTTAAATATAGTAG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>CP018629|2029385:2081370|2040222_2040723_+|AUS75687.1|DBSCAN-SWA
MEMKVYVANLGRYNEGELVGAWFTPPIDEEEMAERIGLNEDYEEYAIHDFELPFDVDEYTPISEINRLCEAIQEIEGTPIYNELKEIQGMWFSSLEELLENKEDIHCYSDCDSMEDVARYYVEETGQLGEVPSNLQNYIDYQSLGRDMEIEGNYLVTSHGVFEYCQ
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MNFGQNLYNWFLDNAQSLVLLAIVVIGLFLGFKREFSKLIGFLIIALIAVGLVFNAAGVKDVLLNLFNRIIGA
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MILKYPENICMLCIPMVMHKNPSDKSIYHWDFYALLGF
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MIIKIERKEKKEKPKKSKKPSKQRKVPMIKVGTHKKLTFVLWVLLIGSVGFGIYKNFTAIDTHTVRETEIIKQQIVDTNQVESFVKSFAKDYFSWQQSQEAIDKRNEKLTHYLTEELQVLNEEMIRKDIPTSSSVNDIQVWQVSQVNENTFEVLFSVEQVITEDKDKETISSSFHVVVHIDESDNMVIIKNPTMSKKPQKSDYQPKQLESDHTVDTETMDEITSFLETFFQLYPTATEKELTYYVSNHVLPMINKEYVFEELVNPIFTRKDNQVIVNVAVKYLDQETKATQISQFELILEKQDNWKIVK
>CP018629|2029385:2081370|2058646_2058847_+|AUS75703.1|DBSCAN-SWA
MITVTKKDLVELGYGTSFSADIIKKAKELMITKGHIYYQSRKLDRVPREAVEEILGIRFSNENRSE
>CP018629|2029385:2081370|2056369_2056558_+|AUS75698.1|DBSCAN-SWA
MINYKWILCPICGNKTRLRIRVDTILKNFPLYCPKCKNETLINVQKMNIITIKEPDAKTQSR
>CP018629|2029385:2081370|2056615_2056969_-|AUS75699.1|DBSCAN-SWA
MRKKEDKYDFRAVGLAIKEARMKRGLTREQVGTMIEIDPRYLTNIENKGQHPSTQVLYDLVSLLHVSIDEFFLPTDNLIKSTRRLQVEKYMDSFTDKELSLMEALAKGINEARNIEG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AUS75676.1|2029385_2030237_+|transposase	IS256 family transposase	NA	NA	NA	NA
AUS75677.1|2030370_2032560_+	ATP-dependent endonuclease	NA	NA	NA	NA
AUS75678.1|2032556_2034350_+	AAA family ATPase	E3T5J8	Cafeteria_roenbergensis_virus	9.0e-26	23.8
2034013:2034028	attL	NA	NA	NA	NA
AUS75679.1|2034549_2034864_+	conjugal transfer protein	A0A1S5SF38	Streptococcus_phage	1.2e-42	77.7
AUS75680.1|2034884_2035262_+	conjugal transfer protein	A0A1S5SF96	Streptococcus_phage	9.6e-47	76.4
AUS75681.1|2035271_2036045_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75682.1|2036048_2037470_+	ATP-binding protein	A0A1S5SFB5	Streptococcus_phage	9.9e-177	66.7
AUS75683.1|2037651_2038836_+	Cro/Cl family transcriptional regulator	A0A1S5SEX3	Streptococcus_phage	6.3e-161	68.1
AUS75684.1|2038832_2039123_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75685.1|2039119_2039341_+	hypothetical protein	A0A1S5SEY0	Streptococcus_phage	3.1e-29	93.2
AUS75686.1|2039382_2040162_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75687.1|2040222_2040723_+	antirestriction protein ArdA	A0A1S5SF25	Streptococcus_phage	1.7e-54	63.0
AUS75688.1|2040990_2042418_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AUS75689.1|2042417_2043146_+	ATP-binding protein	A0A2L1IVB6	Escherichia_phage	7.8e-37	39.0
AUS75690.1|2043174_2043804_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75691.1|2044109_2044607_+	hypothetical protein	G3MBI7	Bacillus_virus	4.0e-40	49.1
AUS75692.1|2044678_2046631_-	insertion element protein	NA	NA	NA	NA
AUS75693.1|2046637_2046934_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75694.1|2047160_2047556_+	hypothetical protein	A0A1S5SEX7	Streptococcus_phage	5.9e-47	72.6
AUS75695.1|2047539_2049984_+	ATP/GTP-binding protein	A0A1S5SF64	Streptococcus_phage	0.0e+00	78.4
AUS75696.1|2052008_2053031_+	peptidase P60	A0A1S5SEZ8	Streptococcus_phage	2.4e-132	75.5
AUS76807.1|2053047_2053977_+	conjugal transfer protein	A0A1S5SF22	Streptococcus_phage	1.1e-83	56.6
AUS75697.1|2054221_2054338_+	tetracycline resistance determinant leader peptide	NA	NA	NA	NA
AUS75698.1|2056369_2056558_+	conjugal transfer protein	D0R0F6	Streptococcus_phage	7.4e-16	61.4
AUS75699.1|2056615_2056969_-	transcriptional regulator	A0A1S5SFA6	Streptococcus_phage	2.2e-53	89.7
AUS75700.1|2057499_2057922_+	DNA-binding protein	A0A1S5SEW0	Streptococcus_phage	7.5e-48	68.6
AUS75701.1|2057918_2058149_+	hypothetical protein	A0A1S5SEX1	Streptococcus_phage	1.0e-27	78.9
AUS75702.1|2058362_2058566_-	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
AUS75703.1|2058646_2058847_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
AUS75704.1|2058873_2060067_+|integrase	site-specific integrase	A0A0S2MV79	Bacillus_phage	8.3e-44	34.2
AUS75705.1|2060134_2061676_-	glutamine-hydrolyzing GMP synthase	A0A1V0SH76	Hokovirus	1.2e-23	32.6
AUS75706.1|2061700_2063167_-	IMP dehydrogenase	A0A1V0SHK8	Klosneuvirus	5.2e-96	40.5
AUS75707.1|2063204_2064473_-	xanthine permease	NA	NA	NA	NA
AUS75708.1|2064472_2065051_-	xanthine phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
AUS75709.1|2065563_2065971_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75710.1|2066113_2066776_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75711.1|2066893_2067850_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75712.1|2068175_2068433_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75713.1|2068640_2068742_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75714.1|2068826_2070215_+	L-cystine transporter	NA	NA	NA	NA
AUS75715.1|2070295_2071051_-	nitroreductase A	NA	NA	NA	NA
AUS75716.1|2071542_2072112_+	peroxiredoxin	NA	NA	NA	NA
AUS75717.1|2072127_2073651_+	alkyl hydroperoxide reductase subunit F	A0A249XZT7	Enterococcus_phage	1.9e-40	33.6
AUS75718.1|2073729_2074023_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75719.1|2074095_2074722_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75720.1|2074976_2075360_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75721.1|2075425_2076007_-	histidine phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
AUS75722.1|2076184_2076394_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75723.1|2076432_2076684_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75724.1|2076983_2077247_+	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AUS75725.1|2077384_2077957_-	peptidase	NA	NA	NA	NA
AUS75726.1|2078137_2078506_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75727.1|2078874_2079486_-	toxin	NA	NA	NA	NA
AUS75728.1|2079845_2080004_+|integrase	integrase	Q4ZE80	Staphylococcus_phage	6.7e-10	66.7
AUS75729.1|2080081_2080393_+|integrase	integrase	Q4ZE80	Staphylococcus_phage	5.5e-24	70.5
AUS76808.1|2080431_2081370_+|protease	CAAX protease	NA	NA	NA	NA
2086578:2086593	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>CP018629|2127878:2183362|DBSCAN-SWA
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MTNEAKFVLLQLYSIYLDRIDEGMSKRSASYFGSDESSFNAFFLDFNFEDYIDAVLELKHRDFVIASAEDGGFLEMALSREGIAYSESESKKDYKTLMDLIRDLKKLII
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MLQKFRIAKEKNKLKLKLLKHASYCLERSNNPELLRAVAELLKKVN

Homologous phage analysis in the prophage region

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2119507:2119526	attL	NA	NA	NA	NA
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AUS75784.1|2131014_2134800_-	hypothetical protein	D2JLF9	Staphylococcus_phage	0.0e+00	99.7
AUS75785.1|2134815_2136300_-|tail	phage tail protein	A0A2I6PDJ0	Staphylococcus_phage	1.2e-294	98.6
AUS75786.1|2136296_2140826_-|tail	phage tail tape measure protein	A0A1W6JPL0	Staphylococcus_phage	0.0e+00	96.9
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AUS75788.1|2141470_2141695_-	hypothetical protein	A0A075LYE8	Staphylococcus_phage	3.0e-32	100.0
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AUS75837.1|2167247_2168285_+|integrase	site-specific integrase	A0EWV2	Staphylococcus_phage	9.1e-180	100.0
AUS75838.1|2168341_2169166_+	sphingomyelin phosphodiesterase	A0A1P8L6H7	Staphylococcus_phage	6.8e-162	100.0
AUS75839.1|2169403_2170420_-	gamma-hemolysin subunit B	A0A2I6PER8	Staphylococcus_phage	1.5e-25	29.0
AUS75840.1|2170441_2171497_-	succinyl-diaminopimelate desuccinylase	A0A1X9IGW5	Staphylococcus_phage	2.8e-35	34.3
2171314:2171333	attR	NA	NA	NA	NA
AUS75841.1|2171931_2173155_+	succinyl-diaminopimelate desuccinylase	NA	NA	NA	NA
AUS75842.1|2174431_2175343_-	ferrichrome ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
AUS75843.1|2175503_2176811_+	potassium transporter KtrB	NA	NA	NA	NA
AUS75844.1|2177663_2178107_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AUS75845.1|2178271_2178649_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75846.1|2178966_2179557_-|terminase	terminase small subunit	Q4ZE85	Staphylococcus_phage	1.1e-97	95.8
AUS75847.1|2179553_2179766_-	pathogenicity island family protein	Q4ZE86	Staphylococcus_phage	1.1e-23	74.3
AUS75848.1|2180467_2182084_-	chaperonin GroL	A0A240F779	uncultured_virus	1.2e-157	54.7
AUS75849.1|2182159_2182444_-	co-chaperone GroES	A0A221S386	uncultured_virus	1.6e-14	47.3
AUS75850.1|2182618_2183362_+|protease	CAAX protease family protein	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>CP018629|2194427:2323838|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_16

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Homologous phage analysis in the prophage region

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AUS75864.1|2195884_2196109_-	oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
AUS75865.1|2196168_2196963_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75866.1|2197028_2198567_-	recombinase family protein	A0A0N9RZT8	Staphylococcus_phage	5.3e-277	100.0
AUS75867.1|2198556_2199138_-	DNA-binding protein	A0A0N9SK69	Staphylococcus_phage	1.6e-101	97.9
AUS75868.1|2199339_2199933_-	crossover junction endodeoxyribonuclease RusA	A0A0N7GFG7	Staphylococcus_phage	7.9e-112	100.0
AUS75869.1|2199916_2200309_-	hypothetical protein	A0A0N9RRM7	Staphylococcus_phage	2.0e-63	96.9
AUS75870.1|2200310_2201057_-	NTP pyrophosphohydrolase	A0A0N9SIY2	Staphylococcus_phage	5.3e-121	88.7
AUS75871.1|2201069_2201309_-	hypothetical protein	A0A0N9S8B1	Staphylococcus_phage	8.2e-36	94.9
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AUS75873.1|2201613_2202216_-	hypothetical protein	A0A0N9RTZ3	Staphylococcus_phage	9.8e-110	99.0
AUS75874.1|2202243_2203266_-	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta	A0A0N9SK77	Staphylococcus_phage	4.3e-198	99.7
AUS75875.1|2203310_2203667_-	ribonucleoside-diphosphate reductase	A0A2H4J2N6	uncultured_Caudovirales_phage	5.9e-38	60.2
AUS75876.1|2203980_2206890_-	response regulator SirA	A0A0N7GFG8	Staphylococcus_phage	0.0e+00	99.4
AUS75877.1|2206911_2207358_-	hypothetical protein	A0A0N9STF9	Staphylococcus_phage	5.1e-71	93.2
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2226640:2226699	attL	NA	NA	NA	NA
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AUS75937.1|2243920_2244346_-	hypothetical protein	A0A0N9RRS4	Staphylococcus_phage	4.5e-53	87.0
AUS75938.1|2244521_2244797_-	hypothetical protein	A0A0N7GFH6	Staphylococcus_phage	2.0e-41	92.3
AUS75939.1|2244809_2245007_-	hypothetical protein	A0A0N9SH39	Staphylococcus_phage	3.2e-25	92.3
AUS75940.1|2245017_2246055_-	hypothetical protein	A0A0N9RU46	Staphylococcus_phage	8.8e-191	97.7
AUS75941.1|2246311_2247049_-	MBL fold hydrolase	A0A0N9RZK9	Staphylococcus_phage	7.0e-134	99.6
AUS75942.1|2247242_2249009_-	single-stranded DNA-binding protein	A0A0N9SK20	Staphylococcus_phage	0.0e+00	99.7
AUS75943.1|2249011_2250124_-	hypothetical protein	A0A0N9RRG7	Staphylococcus_phage	1.8e-218	99.7
AUS75944.1|2250140_2251673_-	helicase DnaB	A0A0N9SIU7	Staphylococcus_phage	2.4e-293	99.0
AUS75945.1|2251694_2252213_-	hypothetical protein	A0A0N9S850	Staphylococcus_phage	1.8e-91	99.4
AUS75946.1|2252289_2253258_-	hypothetical protein	A0A0N9SGS5	Staphylococcus_phage	1.0e-180	99.4
AUS75947.1|2253380_2254340_-	hypothetical protein	A0A0N7GFF9	Staphylococcus_phage	2.5e-168	99.7
AUS75948.1|2254383_2255064_-	hypothetical protein	A0A0N9RTS7	Staphylococcus_phage	2.0e-127	100.0
AUS75949.1|2255081_2255570_-	hypothetical protein	A0A0N9SK25	Staphylococcus_phage	2.3e-53	99.4
AUS75950.1|2255585_2255834_-	hypothetical protein	A0A0N9SHT9	Staphylococcus_phage	1.7e-39	97.6
AUS75951.1|2255992_2256997_-	hypothetical protein	A0A0N9ST56	Staphylococcus_phage	3.8e-183	99.1
AUS75952.1|2257008_2258289_-	hypothetical protein	A0A0N9RZM2	Staphylococcus_phage	1.1e-235	99.8
AUS75953.1|2258587_2259631_-|integrase	integrase	A0A0N9SK33	Staphylococcus_phage	8.0e-192	98.6
AUS75954.1|2260322_2260751_-	hypothetical protein	A0A0N9RRH5	Staphylococcus_phage	9.5e-75	98.6
AUS75955.1|2260828_2261350_-	hypothetical protein	A0A0N7GFG0	Staphylococcus_phage	1.7e-89	98.3
AUS75956.1|2261349_2261613_-	hypothetical protein	A0A0N9SIV3	Staphylococcus_phage	4.3e-38	89.7
AUS75957.1|2261782_2262955_+|transposase	IS256 family transposase	A0A0N9STL0	Staphylococcus_phage	3.5e-135	100.0
AUS75958.1|2263247_2263928_-	hypothetical protein	A0A0N9S858	Staphylococcus_phage	8.5e-118	93.4
AUS75959.1|2264023_2264347_-	hypothetical protein	A0A0N9RTT7	Staphylococcus_phage	1.7e-52	92.5
2262946:2264269	attR	NA	NA	NA	NA
AUS75960.1|2264394_2265054_-	antirestriction protein ArdA	A0A0N9SK30	Staphylococcus_phage	7.7e-116	93.2
AUS75961.1|2265208_2265598_-	hypothetical protein	A0A0N9SHU5	Staphylococcus_phage	1.3e-62	93.0
AUS75962.1|2265734_2265995_-	hypothetical protein	A0A0N9ST70	Staphylococcus_phage	3.5e-40	98.8
AUS76815.1|2266069_2266285_-	hypothetical protein	A0A0N7GFG1	Staphylococcus_phage	2.2e-32	94.4
AUS75963.1|2266736_2267021_-	hypothetical protein	A0A0N9SK40	Staphylococcus_phage	1.2e-44	96.8
AUS75964.1|2267066_2267345_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AUS75965.1|2269018_2269276_-	hypothetical protein	A0A0N9RRI7	Staphylococcus_phage	4.3e-14	95.0
AUS75966.1|2271140_2272016_-	hypothetical protein	A0A0N9SIV7	Staphylococcus_phage	6.3e-166	99.7
AUS75967.1|2272051_2274337_-	helicase	A0A0N9S864	Staphylococcus_phage	0.0e+00	100.0
AUS75968.1|2274472_2275969_+	hypothetical protein	A0A0N9SGU3	Staphylococcus_phage	8.3e-267	98.6
AUS75969.1|2276227_2276557_+	DNA-binding protein	A0A0N9RTU9	Staphylococcus_phage	8.1e-50	95.4
AUS75970.1|2276582_2276768_+	hypothetical protein	A0A0N7GFG2	Staphylococcus_phage	1.7e-25	100.0
AUS75971.1|2276776_2277961_+	hypothetical protein	A0A0N9SK37	Staphylococcus_phage	4.8e-217	97.5
AUS75972.1|2279659_2280544_+	hypothetical protein	A0A0N9SHV5	Staphylococcus_phage	4.5e-172	100.0
AUS75973.1|2280536_2282336_+|terminase	terminase	A0A0N9RZP6	Staphylococcus_phage	2.0e-206	99.7
AUS75974.1|2282353_2283916_+	hypothetical protein	A0A0N9SK48	Staphylococcus_phage	6.6e-299	100.0
AUS75975.1|2283908_2285288_+	hypothetical protein	A0A0N9RRJ7	Staphylococcus_phage	4.1e-244	97.8
AUS75976.1|2285315_2285756_+	hypothetical protein	A0A0N9SIW4	Staphylococcus_phage	3.0e-76	98.6
AUS75977.1|2285795_2286797_+	hypothetical protein	A0A0N9S885	Staphylococcus_phage	5.6e-110	99.5
AUS75978.1|2286871_2287423_+	hypothetical protein	A0A0N9SGV3	Staphylococcus_phage	1.5e-80	100.0
AUS75979.1|2287440_2287875_+	hypothetical protein	A0A0N9RTW0	Staphylococcus_phage	3.5e-69	100.0
AUS75980.1|2287864_2288182_+	hypothetical protein	A0A0N9SK47	Staphylococcus_phage	2.6e-53	100.0
AUS75981.1|2288185_2288851_+	hypothetical protein	A0A0N9SHW2	Staphylococcus_phage	3.8e-123	99.5
AUS75982.1|2288840_2289362_+	hypothetical protein	A0A0N9ST98	Staphylococcus_phage	2.0e-95	100.0
AUS75983.1|2289367_2290240_+	hypothetical protein	A0A0N9RZR7	Staphylococcus_phage	1.5e-159	100.0
AUS75984.1|2290278_2291070_+	hypothetical protein	A0A0N7GFG4	Staphylococcus_phage	8.6e-138	97.7
AUS75985.1|2291153_2291711_+	hypothetical protein	A0A0N9SK55	Staphylococcus_phage	2.7e-98	100.0
AUS75986.1|2291710_2292184_+	hypothetical protein	A0A0N9RRK6	Staphylococcus_phage	2.5e-84	98.1
AUS75987.1|2292193_2293216_+	recombinase	A0A0N9SIX3	Staphylococcus_phage	2.3e-196	99.4
AUS75988.1|2293312_2301586_+|tail	phage tail tape measure protein	A0A0N9S894	Staphylococcus_phage	0.0e+00	99.8
AUS75989.1|2301607_2303689_+	hypothetical protein	A0A0N9SGW2	Staphylococcus_phage	0.0e+00	99.3
AUS75990.1|2303749_2311951_+	hypothetical protein	A0A0N9RTX0	Staphylococcus_phage	0.0e+00	89.9
AUS75991.1|2311953_2312328_+	hypothetical protein	A0A0N9SK58	Staphylococcus_phage	8.6e-56	87.9
AUS75992.1|2312529_2315199_+	hypothetical protein	A0A0N9SHX2	Staphylococcus_phage	0.0e+00	99.8
AUS76816.1|2315245_2315707_+	hypothetical protein	A0A0N9STA8	Staphylococcus_phage	7.3e-65	96.2
AUS75993.1|2315688_2316201_+	hypothetical protein	A0A0N9RZS7	Staphylococcus_phage	7.9e-44	85.3
AUS75994.1|2316222_2316552_+|holin	phage holin	A0A0N9SK62	Staphylococcus_phage	1.0e-52	96.3
AUS75995.1|2316603_2318265_+	hypothetical protein	A0A0N9RRL9	Staphylococcus_phage	1.9e-115	91.3
AUS75996.1|2318264_2318792_+	hypothetical protein	A1BU75	Staphylococcus_virus	2.9e-09	29.4
AUS75997.1|2318948_2320451_+	N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase	A0A0N9SGX6	Staphylococcus_phage	9.8e-276	95.4
AUS75998.1|2321421_2323071_-	hypothetical protein	A0A0N9SHY1	Staphylococcus_phage	6.1e-312	94.5
AUS75999.1|2323223_2323838_-	cell surface protein	A0A0N9STB7	Staphylococcus_phage	6.8e-74	96.6

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
CP018629.1|AUS76794.1|1638926_1639061_+|nitrogen-fixation-protein-NifR	1638926_1639061_+	44 aa aa	NA	HTH_WhiA	NA	1631732-1640342	yes

Protein sequences of CP018629.1|AUS76794.1|1638926_1639061_+|nitrogen-fixation-protein-NifR

>CP018629.1|AUS76794.1|1638926_1639061_+|nitrogen-fixation-protein-NifR
MGCGPQHREIGFPISTDNASWRGPNTEAGGKSAYNNVQVGVGQR

HTH_WhiA HTH domain information

• Identity: 0.6309523809523809
• Hit_domain_coverage: 1.0

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
CP018629_1	Orphan	1.1|1310398|26|CP018629|CRISPRCasFinder	1310398-1310423	26	1639015-1638990	1
CP018629_8	Orphan	8.3|2556902|33|CP018629|CRT	2556902-2556934	33	1639035-1639003	2

1. spacer 1.1|1310398|26|CP018629|CRISPRCasFinder matches to CP018629 position: 1639015-1638990, mismatch: 1

ccgccagcttctatgttggggccccg	CRISPR spacer
ccgccagcttctgtgttggggccccg	Protospacer
************.*************

2. spacer 8.3|2556902|33|CP018629|CRT matches to CP018629 position: 1639035-1639003, mismatch: 2

cattattgtaagctgactttctgtcagcttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgactttccgccagcttctg	Protospacer
*********************.*.*********