Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019832 | Streptococcus agalactiae strain SA343, complete genome | 1 crisprs | cas3,cas5,cas7,cas4,cas2,cas9,cas1,csn2,csm6,DEDDh | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP019832_1 | 817362-817456 | TypeII |
II-A
Consensus repeat of CP019832_1
|
1 spacers
spacers of CP019832_1
>1.1|817391|37|CP019832|CRISPRCasFinder CCAAAACTTATTCTATTGTTAAATCGTGTGTTGATGA |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP019832_1
The CRISPR arrays of CP019832_1 >merge|CP019832|1|817362-817456|CRISPRCasFinder GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTTCCAAAACTTATTCTATTGTTAAATCGTGTGTTGATGAGTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCAAATGGTT >CP019832|1|1|817362-817456|CRISPRCasFinder GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCGAATGGTT CCAAAACTTATTCTATTGTTAAATCGTGTGTTGATGA GTTTTAGAGCTGTGCTGTTTCAAATGGTT
>CP019832.1|AUP33072.1|816595_817261_+|CRISPR-associated-protein-Csn2 MIKINFPILDEPLVLSNATILTVEDVSVYSSLVKHFYQYDVDEHLKLFDDKQKSLKATELMLVTDILGYDVNSAPILKLIHADLESQFNEKPEVKSMVERLAATITELIAFECLENELDLEYDEITILELIKALGVKIETQSDTIFEKCFEIIQVYHYLTKKNFLVFVNSGAYLTKDEVIKLCEYINLTQKSVLFLEPRRLYDLPQYVIDKDYFLIGENMV >CP019832.1|AUP33071.1|816267_816609_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MSYRYMRMILMFDMPTETAEERKAYRKFRKFLLSEGFIMHQFSVYSKLLLNNTANNAMIGRLKVNNPKKGNITLLTVTEKQFARMVYLHGERNTSVANSDSRLVFLGDSYDQD >CP019832.1|AUP33070.1|815401_816271_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAGWRTVVVNTHSKLSYKNNHLIFKDSYQTEMIHLSEIDILIMETTDIVLSTMLIKRLGDENILVIFCDDKRLPTAMLMPYYARHDSSLQLSRQMSWIEDVKADVWTSIIAQKILNQSFYLGECSFFEKSQSIMNLYHDLESFDPSNREGHAARIYFNTLFGNDFSREQDNPINAGLDYGYSLILSMFAREVVKCGCMTQFGLKHANQFNQFNLASDIMEPFRPIVDRIIYENRQSDFVKMKRELFTMFSETYNYNGKEMYLSNIVSDYTKKVIKSLNSDGNGIPEFRI >CP019832.1|AUP33069.1|811287_815400_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas9 MNKPYSIGLDIGTNSVGWSIITDDYKVPAKKMRVLGNTDKEYIKKNLIGALLFDGGNTAADRRLKRTARRRYTRRRNRILYLQEIFAEEMSKVDDSFFHRLEDSFLVEEDKRGSKYPIFATMQEEKDYHEKFPTIYHLRKELADKKEKADLRLVYLALAHIIKFRGHFLIEDDRFDVRNTDIQKQYQAFLEIFDTSFENNHLLSQNVDVEAILTDKISKSAKKDRILAQYPNQKSTGIFAEFLKLIVGNQADFKKHFNLEDKTPLQFAKDSYDEDLENLLGQIGDEFADLFSAAKKLYDSVLLSGILTVTDLSTKAPLSASMIQRYDEHREDLKQLKQFVKASLPEKYQEIFADSSKDGYAGYIEGKTNQEAFYKYLSKLLTKQEDSEYFLEKIKNEDFLRKQRTFDNGSIPHQVHLTELKAIIRRQSEYYPFLKENQDKIEKILTFRIPYYVGPLARGNSDFAWMTRKTDDSIRPWNFEDLVDKEKSAEAFIHRMTNNDLYLPEEKVLPKHSLIYEKFTVYNELTKVRYKNEQGETYFFDSNVKQEIFDGVFKEHRKVSKKQLLDFLAKEFEEFRIVDVTGLDKENKAFNASLGTYHDLKKILDKDFLDNPDNESILEDIVQTITLFEDREMIKKRLENYKDLFTESQLKKLYRRHYTGWGRLSAKLINGIRDRESQKTILDYLISDGRANRNFMQLINDDGLSFKSIISKAQSGSHSDNLKEVVGELAGSPAIKKGILQSLKIVDELVKVMGYEPEQIVVEMARENQTTNQGRRNSRQRYKLLEDGVKNLASDLNGDILKEYPTDNQALQNERLFLYYLQNGRDMYTGEALDIDNLSQYDIDHIVPQAFIKDDSIDNRVLVSSAKNRGKSDDVPSIDIVKARKAFWKKLLDAKLISQRKYDNLTKAERGGLTPDDKAGFIQRQLVETRQITKHVARILDERFNNKVDDNNKPIRKVKIVTLKSNLVSNFRKEFGFYKIREVNNYHHAHDAYLNAVVAKAILTKYPQLEPEFVYGDYPKYNSYKTRKSATEKLFFYSNIMNFFKTKVTLADETVVVKDDIEVNNETGEIAWDKKKHFATVRKVLSYPQVNIVKKTEVQTGGFSKESILAHSNSDKLIPRKTKDIYLDPKKYGGFDSPIVAYSVLVLADIKKGKAQKLKTVKELIGITIMERERFEKNPSAFLESKGYLNIRTDKLIILPKYSLFELENGRRRLLASAGELQKGNELALPTQYMKFLYLASRYNESKGKPEEIEKKQEFVNQHVSYFDDILQLINDFSKRVILADANLEKINKLYSDNKDNTPVDELAKNIINLFTFTSLGAPAAFKFFDKSVDRKRYTSTKEVLDSTLIHQSITGLYETRIDLGKLGED >CP019832.1|AUP33068.1|810256_810913_+|Membrane-protein MKDKLLVVLTWIWIISLATLATIYIAWLIYPIEIQFLKLEKVVYLKAETIYYNFNKLMIYLTHPFISDLNMPSFPSSEDGLKHFADVKYLFTLAHGLFVILTFPVIYFLRRGWKQKSIFLYEGFFKIAIMLPIFIVVCAFLLGFDQFFTLFHEVLFPGDSTWQFNPLTDPVIWILPETFFLHCFIIFLLIYETITIILLIIGRKHLKLRKYKNKMQAL >CP019832.1|AUP33067.1|809496_810267_+|HAD-family-hydrolase MAYKGYLIDLDGTIYKGKSRIPAGERFIEHLQEKGIPYMLVTNNTTRTPESVQEMLRGFNVETPLETIYTATLATVDYMNDMNRGKTAYVIGEEGLKKAIADAGYVEDTKNPAYVVVGLDWNVTYDKLATATLAIQNGALFIGTNPDLNIPTERGLLPGAGSLNALLEAATRIKPVFIGKPNAIIMNKALEILNIPRNQAVMVGDNYLTDIMAGINNDIDTLLVTTGFTTVEEVPDLPIQPSYVLASLDEWTFNEG >CP019832.1|AUP33066.1|808758_809496_+|Acyl-ACP-thioesterase MGLLYRETYEVPFYESDTNHYMKLPQLLALALQISAKQSLKLGIGDDIVFKRYGLVWVVTDYIIDIERLPKHAEKIVIETEAKAHNKLLCYRYFYIYGEDGQKIITISSAFVLMDFKTRKIHPVLDDITSIYQSQRIKKVIRGPKYHPIGDSKVKQYHVRYFDLDMNGHVNNSKYLEWMYDVLDLDFLSSHIPKKIDLKYIKEIQYGTDIKSHWYQDGLVTRHDIIGGDAIHAQARIEWQEKKED >CP019832.1|AUP33065.1|807624_808755_+|Coproporphyrinogen-III-oxidase MLKKPTSAYVHIPFCTQICYYCDFSKVFIKNQPVDAYLQALIREFRSYDITDLRTLYIGGGTPTSISAVQLDYLLTELSRDLNLNTLEEFTIEANPGDLTVDKIEVLQKSAVNRVSLGVQTFNDKHLKRIGRSHNEAQIYSTIDALKTAGFQNISIDLIYALPGQTMDNVRSNVAKALSLNIPHLSLYSLILEHHTVFMNKMRRGKLHLPTEDLEAEMFEYIISEMERNGFEHYEISNFTKPGFESRHNLMYWDNVEYYGVGAGASGYLDGIRYRNRGPIQHYLKGVSEGNARLSEEVLSKNEMMEEELFLGLRKKEGVSIGKFEQKFGTSFEKRYGQIVQELQSDGLLKENNGFIQMTKKGLFLGDTVAEKFIVE >CP019832.1|AUP33064.1|807151_807532_+|Pyrimidine-dimer-DNA-glycosylase MRLWHQDIIELLPRQQLLGQHRECCALRGNGWGRKHETIDYVFRYSPYRLFAYHQLVMEEMMERGYRVSKEWLVAEYRGMKCPRYDTLNPVDLETPIYPEHNQDYLQECLWNLKAKGIDLPINKIK >CP019832.1|AUP33063.1|806755_807127_+|hypothetical-protein MTKEAELLWAKHKYLVLSKSQKIYLDIRQTLKSPNCTVLDVQSLIDQAVLLEESPSQVTNAYMHIWGYFKNKAERQEKEEFLILLEKYRKTGYQRRKLLAFLKQLFAKYPNSYLQNSSIFEEE >CP019832.1|AUP33073.1|817808_817946_+|hypothetical-protein MVKGLGCSTLYLIISLTALVLLVIAGVSLSLILASLQGKQRRTYP >CP019832.1|AUP33074.1|818086_818503_+|Nucleoside-diphosphate-kinase MEQTFFMIKPDGVKRGFIGEVISRIERRGFSIDRLEVRHADADILKRHYAELTDRPFFPTLVDYMTSGPVIIGVISGEEVISTWRTMMGSTNPKDALPGTIRGDFAQAPSPNQATCNIVHGSDSPESATREIAIWFNN >CP019832.1|AUP33075.1|818638_820471_+|Elongation-factor-4 MNIEDLKKRQEKIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILEKTETVSSREMQAQLLDSMDLERERGITIKLNAIELNYTAKDGETYIFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNDLEILPVINKIDLPAADPERVRAEVEDVIGLDASEAVLASAKAGIGIEEILEQIVEKVPAPTGEVDAPLQALIFDSVYDAYRGVILQVRIVNGMVKPGDKIQMMSNGKTFDVTEVGIFTPKAVGRDFLATGDVGYIAASIKTVADTRVGDTITLANNPAIEPLHGYKQMNPMVFAGLYPIESNKYNDLREALEKLQLNDASLQFEPETSQALGFGFRCGFLGLLHMDVIQERLEREFNIDLIMTAPSVVYHVNTTDSEMLEVSNPSEFPDPTRVDSIEEPYVKAQIMVPQEFVGAVMELAQRKRGDFVTMDYIDDNRVNVIYQIPLAEIVFDFFDKLKSSTRGYASFDYEISEYRRSQLVKMDILLNGDKVDALSFIVHKEFAYERGKLIVDKLKKIIPRQQFEVPIQAAIGQKIVARSDIKALRKNVLAKCYGGDVSRKRKLLEKQKAGKKRMKAIGSVEVPQEAFLSVLSMDDDDKK >CP019832.1|AUP33076.1|823254_823914_+|Phosphohydrolase MTMVKREDVILNATENMVYHKLKNDPSGHDWFHIVRVRNLAVELAHKEGANTFICQMAALLHDIIDDKICQDSEQASYELTQWLYSQDLAIAEVEHILDILQNISFKAGTGLTMKTLEGQIVQDADRLDAMGAIGIARTMAYSGSKGRLIHDPNLKPRENLTLEEYRNGQDTAIMHFYEKLLKLKDLMNTKQGKMLAQKRHDFLELYLAEFYAEWNGKR >CP019832.1|AUP33077.1|823922_824387_+|GNAT-family-acetyltransferase MIRRAKEKDLPAIAELLQQILVLHHGVRPDIFHTRGSKFSKEQLKEMLIDESKPIFVYESDEGKVVAHLFLQLQEKRDLPRKSFKTLYIDDLCIDEEVRGQQIGQKLMDFARQYAKKHGCYNITLNVWNDNQRAVSFYEKLGFKPQQTQMEEIL >CP019832.1|AUP33078.1|824386_824821_+|Peptide-methionine-sulfoxide-reductase-MsrB MKETQEELRQRIGHTAYQVTQNSATEHAFTGKYDDFFEEGIYVDIVSGEVLFSSLDKFQSGCGWPAFSKPIENRMVTNHQDHSHGMHRIEVRSRQADSHLGHVFNDGPVDAGGLRYCINSAALDFIPYDQMAKRGYGDYLSLFD >CP019832.1|AUP33079.1|824972_827765_+|Haloacid-dehalogenase MASTNNVSDTNTRFAKEELEEVFEELGTTQGGLSDEEVAVRQKKYGLNLLSEVKQESIILLFLKNFTSLMAILLWVGGFVAIVSNSLELGLAIWMVNVINGIFSFIQEYRASQATQALKKMLPSYSRVLRKSSEEKILSEQLVPGDIVLIEEGDRISADGRLIKTTDLQVNQSALTGESNPIYKDSNVENDQSKTLIECDNMVFAGTTVSSGSATMVVTAIGMQTQFGQIADLTQGMKSEKSPLQRELDRLTKQISIISITVGIIFFLAATFFVKEPVSKSFIFALGMIVAFIPEGLLPTVTLSLAMAVQRMAKEHALVKKLSSVETLGATSVICSDKTGTLTQNEMTVNHLWQNGKSYQVTGLGYAPEGQVLFEGDNICFGNSDRGDLEKLIRFAHLCSNAQVLPPNDDRSTYTVLGDPTEACLNVLLEKSGINRQENRKFAPRLKELPFDSVRKRMTTIHSLGGDEKDKKISITKGAPKEILDLSDYVLSDGKVIPLNKEERNKIQLANDTFAKDGLRVLAVSYCDIEGFSKEQWTQENLEQHMVFIGLIAMSDPPREGVREAIDKCHAASIRIIMVTGDYGLTALSIAKNIGIIRNDDAKVISGLELSEMTDSQLKKELSGEVVFARVAPEQKYRVVTILQEMGEVVAVTGDGVNDAPALKKSDIGVAMGVTGTDVAKESADMILTDDHFASIVDAVEEGRAVYQNIKKFLTYIFNSNTPEAVPSAFFLFSKGFIPLPLTVMQILAVDLGTDMLPALGLGVESPETDVMNRPPRRLTDRLLDKGLLIKSFLWYGTIESVLAMGGFFWAHYLRYGNFTFFVANGIPYREATTMTLGAIIFSQIGMVMNSRTSYQSIKTLSIFGNKLINFGIIMEILAFLVLVYVPLFHNLFNTASLGLSHWLYLISCPFIMIGLDEVRKLFSSRKNKR >CP019832.1|AUP33080.1|827764_828808_+|hypothetical-protein MSNIITYLKNNSNLTFDELALNDVDILCLNEFGYISFEKLINTTEMKSVLVCELYHEYLQTMAKSYSFMFTSQRHDLCQLMMTSKRFKNLTLSYYQAEISLEFEKQFAAMVFTIPNIDYHQVVFRGTDANLIGWKEDFKLTYMREISAHRSAIKYLNTILPHFDKVVLSGHSKGGNLALYAAMFTKPDLKAKIDLIWLIDSPGLQKTLLPTTEYKTTKQKCIRLLPEESIVGMMLYSDIEPLIISSNARGILQHDVTTWEIQEPAILKTGTGLSLKSICFEKTFQQWMAELKSQERKLFFDLLFDSFLSSGVSSLDDFNLASRAKMMKAFHSFRELDDDKKGYLTNL >CP019832.1|AUP33081.1|828840_829410_-|Chloramphenicol-acetyltransferase MSTGASYPKYGFSVGKYTYGYQQFFYEGVNLKEIGAFCSIAQNVTITGMNHPTDHITTNPFIYYKSRGFINEDRADLIDEKKNGKVIIGNDVWIGTNVTILPSVTIGNGAIIGAGSVITKDIPDYAVVAGTPAKIIKYRFSEEEITLLNASQWWNWSDEAIKEHISEFSDKKEFFNTLKSIEENKNHKL >CP019832.1|AUP33082.1|830189_830801_+|Membrane-protein MNMKLSKRYRFWQKVIKALGVLALIATLVLVVYLYKLGILNDSNELKDLVHKYEFWGPMIFIVVQIVQIVFPVIPGGVTTVAGFLIFGPTLGFIYNYIGIIIGSVILFWLVKFYGRKFVLLFMDQKTFDKYESKLETSGYEKFFIFCMASPISPADIMVMITGLSNMSIKRFVTIIMITKPISIIGYSYLWIYGGDILKNFLN |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
187472 : 199642
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP019832|187472:199642|DBSCAN-SWA ATTGAATCCGTTCGGGAAACTCAGAAAAAGATGGGGCTTACTGAAATCTCAATTTCAGACATCCTCCTATTTTCCAGTCGCTCCCTTGTCGGACTTGGTATCTTATATGAATAAACGTATTTTTGTTGAGAAAAAGGCTGACTTTGGCATTAAATCGGCTAGTCTTGTGAAAGAGTTGACGCATAATCTACAACTGACTTCTTTGAAGGATTTGCGTATTGTGCAGGTCTATGATGTCTTCAATTTGGCTGAGGATTTGCTGGCGCGTGCTGAGAAGCATATTTTCTCTGAGCAGGTGACAGACTGTCTTTTGACGGAAACTGAAATCACTGCGGAGCTTGATAAGGTTGCCTTCTTTGCCATTGAGGCGCTTCCTGGTCAATTTGACCAACGTGCTGCTAGTTCGCAAGAAGCTTTGCTATTGCTTGGAAGTGACAGTCAGGTTAAGGTCAATACAGCCCAGCTTTACTTGGTCAATAAGGATATTGCAGAAGCAGAGCTTGAAGCTGTTAAGAACTATCTTTTGAATCCTGTTGATTCACGTTTCAAGGACATCACTTTGCCGCTTGAAGAGCAGGCTTTCTCTGTGTCTGATAAGACGATCCCTAATCTTGATTTCTTTGAAACTTATCAAGCTGACGATTTTGCGACTTATAAGGCAGAGCAGGGCTTGGCTATGGAGGTCGATGATTTTCTCTTCATCCAAGATTATTTCAAATCAATCGGGCGTGTGCCAACTGAGACTGAGTTGAAAGTTTTGGATACGTATTGGTCAGACCACTGTCGTCACACAACCTTTGAAACTGAGCTGAAAAACATTGATTTTTCAGCTTCTAAATTCCAGAAACAATTACAGACGACTTATGACAAATACATTGCCATGAGTGATGAGCTTGGTCGTTCTGAAAAGCCACAGACGCTTATGGATATGGCGACTATCTTTGGTCGTTATGAGCGTGCCAATGGTCGTCTGGACGATATGGAAGTCTCAGATGAAATCAATGCCTGCTCAGTTGAGATTGAAGTAGATGTTGATGGTGTAAAAGAGCCTTGGCTCCTCATGTTTAAGAATGAGACTCACAATCACCCAACAGAAATTGAGCCATTTGGTGGCGCAGCAACTTGTATCGGTGGTGCCATTCGTGACCCGTTGTCAGGACGTTCATACGTTTATCAGGCTATGCGTATTTCAGGCGCAGGCGATATTACGACTCCGATTGCGGAAACACGTGCTGGTAAATTGCCACAACAGGTTATTTCTAAGACTGCGGCGCACGGCTATTCTTCATATGGTAACCAAATTGGGCTTGCGACAACTTATGTGCGTGAGTACTTCCACCCTGGCTTCGTAGCCAAACGTATGGAGCTTGGAGCTGTGGTTGGTGCTGCACCTAAGGAAAATGTGGTTCGTGAAAAACCAGAAGCAGGCGATGTGGTCATCTTGCTCGGTGGTAAAACAGGTCGTGATGGTGTCGGTGGTGCGACAGGTTCATCTAAGGTTCAAACGGTTGAATCTGTGGAAACAGCTGGCGCAGAGGTACAAAAAGGGAATGCCATTGAAGAGCGTAAGATTCAACGTCTTTTCCGTGATGGCAATGTCACTCGTCTTATCAAGAAATCAAATGACTTCGGTGCAGGTGGTGTCTGTGTTGCCATCGGTGAATTGGCTGATGGTCTTGAAATCGATTTGGACAAGGTGCCACTTAAATACCAAGGTCTTAATGGTACTGAAATTGCAATCTCAGAATCTCAAGAGCGTATGTCAATCGTTGTTCGTCCTAGTGATGTGGATACCTTCATCGAAGCCTGCAACAAGGAAAATATCGATGCAGTCGTTGTTGCGACCGTTACTGAAAAACCAAATCTTGTTATGACTTGGAATGGCGAAACCATCGTTGACTTGGAACGCCGTTTCCTTGATACCAACGGTGTCCGTGTCGTTGTTGATGCTAAAGTCGTTGACAAGGACTTGACAGTTCCAGAAGCACGCACAACATCAGCAGAGACACTTGAAGCAGATACGCTTAAGGTCTTGTCTGACCTCAACCATGCTAGCCAAAAAGGTCTCCAAACCATCTTTGACTCATCTGTTGGTCGTTCAACCGTTAACCACCCAATCGGTGGTCGCTACCAAATCACACCGACAGAAAGTTCAGTTCAAAAATTGCCAGTTCAACATGGTGTGACAAGAACAGCCTCTGTTATGGCTCAAGGTTACAATCCTTATATTGCTGAGTGGTCACCTTACCACGGTGCTGCCTATGCTGTCATTGAAGCGACAGCTCGCTTGATAGCAACGGGTGCCGACTGGTCTCGTGCACGCTTCTCTTACCAAGAGTACTTCGAGCGTATGGACAAACAGGCAGAGCGTTTTGGTCAGCCAGTATCAGCTCTTCTTGGTTCTGTTGAGGCTCAGATTCAACTTGGCTTGCCATCAATCGGCGGTAAGGACTCGATGTCTGGTACTTTCGAAGAATTGACAGTGCCACCAACCTTGGTAGCTTTCGGTGTGACAACAGCGGACAGCCGCAAGGTTCTCTCTCCTGAGTTTAAAGCGGCTGGTGAGAATATTTACTACATTCCAGGTCAAGCTATTTCAGAAGATATTGATTTTGACCTTATCAAGGCTAACTTTAACCAGTTTGAAGCTATTCAAGCTCAACATAAGATTACCGCTGCTTCAGCCGTTAAATACGGTGGTGTCCTAGAAAGTCTTGCTCTCATGACTTTTGGTAACCGTATCGGTGCTTCTGTTGAAATTGCAGAGCTTGACAGCAGCTTGACAGCTCAACTCGGAGGCTTTGTCTTTACATCAGTTGAGGAAATCGCTGACGCTGTGAAGATTGGTCAAACTCAGGCAGACTTTACAGTCACTGTCAATGGAAATGACCTCGCTGGTGCTAGCCTCCTAGGAGCCTTCGAAGGTAAATTGGAAGAAGTTTACCCAACAGAATTCGAACAGGCAGACGCTCTTGAAGAAGTTCCTGCTGTGGTATCAGATACCGTCATCAAGGCTAAGGAAGTCATTGAAAAACCAGTGGTTTACATTCCAGTCTTCCCTGGTACTAACTCAGAGTACGATTCAGCTAAGGCTTTTGAACAGGTTGGAGCTAGCGTCAACTTGGTACCATTTGTAACCTTGAATGAGGCTGCTATTGCTGACTCAGTTGACACAATGGTCGCTAATATTGCTAAGGCAAATATCATCTTCTTTGCTGGAGGATTCTCAGCAGCGGATGAACCAGATGGGTCTGCTAAGTTTATCGTCAATATCTTGCTTAACAAGAAGGTTCGCGCAGCTATTGACAGCTTCATCGAAAAAGGTGGCCTTATCATCGGTATCTGTAATGGTTTCCAAGCCCTTGTTAAATCAGGTCTTCTTCCATACGGAAACTTCGAGGAAGCTGGTGAGACAAGTCCAACTCTCTTCTATAACGATGCTAACCAGCACGTTGCAAAGATGGTTGAGACTCGTATCGCAAATACCAACTCACCTTGGTTGGCAGGAGTTGAGGTCGGCGATATTCATGCCATTCCAGTTTCACACGGTGAAGGTAAATTTGTTGTCAGCGCTTCTGAATTTGCAGAGCTAAGAGACAATGGTCAAATCTGGAGCCAATATGTGGACTTTGACGGACAACCATCTATGGATTCTAAATACAATCCAAACAGCTCTGTCAATGCCATCGAAGGGATTACCAGCAAGAATGGTCAAATCATCGGTAAGATGGGGCACTCAGAACGCTGGGAAGACGGCCTCTTCCAAAATATCCCTGGTAACAAAGACCAAGCCTTGTTTGCTAGTGCAGTAAAATATTTTACAGGAAAATAATTTTTTCAAATTTTTTCATAAAACAGATAAGGAAACAAGAGCGAAGCGAGCTTAACTGTATCTTTCTGTCGTAGTGGTATTTGGGAGCCGTTGAGGCTAAGACTCAATGATTAGCTTGAAAATAGCTTGATAGATTTTCTATTTTGATGTTGGCATTGATGACGATAGATCCAAAATTGAGAAAATCATCAAAGCTACTTAAGAAGAGATACAAAAAGAATTAGGAAAAAAGAATGACATACGAAGTAAAATCTCTAAATGAAGAATGTGGTGTATTTGGTATCTGGGGGCATTCTCAGGCAGCTCAAGTCACTTACTTTGGGCTTCACAGTCTTCAACACCGCGGTCAAGAAGGTGCTGGTATTGTTTCGAATGATAATGGGAAACTCTATGGTTATCGAAATGTTGGTCTCCTTTCTGAAGTTTTTAAGAATCAATCTGAATTAGATAATTTAACTGGGAATGCGGCTATTGGACATGTTCGGTATGCTACTGCAGGTTCTGCAGATATTCGCAATATTCAGCCTTTTCTTTATAAATTTCATGACGGGCAATTTGCTTTATGCCATAATGGTAATTTGACAAATGCTATTTCTTTAAGGAAAGAATTAGAAAAGCAAGGTGCAATTTTCAATGCCTCCTCAGATACTGAAATTTTGATGCACTTGATTCGTCGAAGCCATAACCCAAGTTTTATGGGGAAGGTAAAAGAAGCTTTAAGCACTGTAAAGGGAGGCTTCGCCTATCTACTGATGACAGAAGATAAATTAATTGCTGCTCTTGACCCTAATGCCTTTCGTCCTTTGTCAATTGGACAAATGCAAAATGGTGCCTGGGTTATTGCCAGTGAGACCTGTGCTTTTGAGGTGGTAGGCGCAAAATGGGTTAGAGATGTTGAACCTGGCGAAGTTATTCTTATAGACGATAGTGGTGTTCAATGTGATCGTTATACTGATGAAACGCAGTTGGCAATTTGTTCGATGGAATATGTCTATTTTGCAAGGCCGGATTCGACTATACATGGTGTTAATGTTCATACGGCTCGAAAAAATATGGGAAAGCGTCTTGCACAAGAATTTAAACAGGATGCTGATATTGTAATTGGTGTCCCAAATTCGTCCTTATCGGCTGCTATGGGCTTTGCTGAAGAATCCGGATTACCAAATGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP019832|187472:199642|193018_194041_+|AUP32498.1|DBSCAN-SWA MSEKNAYAKSGVDVEAGYEVVERIKKHVAHTERAGVMGALGDFGGMFDLSQTGVKEPVLISGTDGVGTKLMLAIKYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYIATGKNNPVKLEEVVSGVAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGEDDYDLAGFAVGVAEKSQLIDGSKVKEGDILLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGKELLPELEGKQLKDVLLEPTRIYVKAALPLIKEVLVNGIAHITGGGFIENVPRMFADDLAAEIDEDKVPVLPIFKALEKYGDIKHEEMFEIFNMGVGLMLAVSPENVNRVKELLDEPVYEIGRIIKKADDSVVIK >CP019832|187472:199642|194208_194757_+|AUP32499.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASANGSNFQVIAEQFPVSFVFSDHRDAYVLERAQNLAIPSFAFELKEFENKAAYEQAIVDLLDKHEIDLVCLAGYMKIVGETLLSAYEGRIINIHPAYLPEFPGAHGIEDAWEAGVDQSGVTIHWVDSGVDTGQVIQQVRVPRLADDSLESFETRIHETEYQLYPAVLDSLGIKRK >CP019832|187472:199642|197291_198191_+|AUP32502.1|DBSCAN-SWA MNKWLVKASSLVVLGGMVLSAGSRVLADTYVRPIDNGRITTGFNGYPGHCGVDYAVPTGTIIGAVADGTVKFAGAGANFSWMTDLAGNCVMIQHADGMHSGYAHMSRVVARTGEKVKQGDIIGYVGATGMATGPHLHFEFLPANPNFQNGFHGRINPTSLIANVVTFSGKTQASAPSIKPLQSTPVQNQSSRLKVYRVDELQKVNGVWLVKNNTLTPTGFDWNDNGIPASEIDEVDANGNLTADQVLQKGGYFIFNPKTLKTVEKPIQGTAGLTWAKTRFANGSSVWLRVDNSQELLYK >CP019832|187472:199642|194779_195532_+|AUP32500.1|DBSCAN-SWA MKLVKNLEIVESIFGDWDETIIWSCVQGIMGEVFVDSLDQPKSSLAKLGRKSSFGFLAGQPTLFLLEVCSGEDIILVPQHKGWSDLIESTYGQNAHSFKRYATKKDTLFERSRLEKFVTQLPNGFELRAIDEKVYNSCLEKEWSQDLVANYATYQYYKKQGIGYVVYYQGNIIAGASSYSTYKNGIEIEVDTHPDFRRRGLATIVAAQLILTCLDKGIYPSWDAHTRTSLNLAEKLGYEFSHEYIAYEID >CP019832|187472:199642|187472_191303_+|AUP32496.1|DBSCAN-SWA MNPFGKLRKRWGLLKSQFQTSSYFPVAPLSDLVSYMNKRIFVEKKADFGIKSASLVKELTHNLQLTSLKDLRIVQVYDVFNLAEDLLARAEKHIFSEQVTDCLLTETEITAELDKVAFFAIEALPGQFDQRAASSQEALLLLGSDSQVKVNTAQLYLVNKDIAEAELEAVKNYLLNPVDSRFKDITLPLEEQAFSVSDKTIPNLDFFETYQADDFATYKAEQGLAMEVDDFLFIQDYFKSIGRVPTETELKVLDTYWSDHCRHTTFETELKNIDFSASKFQKQLQTTYDKYIAMSDELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPIAETRAGKLPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPEAGDVVILLGGKTGRDGVGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRDGNVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLEIDLDKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMSIVVRPSDVDTFIEACNKENIDAVVVATVTEKPNLVMTWNGETIVDLERRFLDTNGVRVVVDAKVVDKDLTVPEARTTSAETLEADTLKVLSDLNHASQKGLQTIFDSSVGRSTVNHPIGGRYQITPTESSVQKLPVQHGVTRTASVMAQGYNPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLIATGADWSRARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVSALLGSVEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEELTVPPTLVAFGVTTADSRKVLSPEFKAAGENIYYIPGQAISEDIDFDLIKANFNQFEAIQAQHKITAASAVKYGGVLESLALMTFGNRIGASVEIAELDSSLTAQLGGFVFTSVEEIADAVKIGQTQADFTVTVNGNDLAGASLLGAFEGKLEEVYPTEFEQADALEEVPAVVSDTVIKAKEVIEKPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQVGASVNLVPFVTLNEAAIADSVDTMVANIAKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNKKVRAAIDSFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFEEAGETSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLAGVEVGDIHAIPVSHGEGKFVVSASEFAELRDNGQIWSQYVDFDGQPSMDSKYNPNSSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEDGLFQNIPGNKDQALFASAVKYFTGK >CP019832|187472:199642|195551_197099_+|AUP32501.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSEKSGIIDFAKELKNLGWDIISTGGTKVALDDAGVETIAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPNIHGGLLARRDADSHLQAAKDNNIELIDLVVVNLYPFKETILRPDVTYDLAVENIDIGGPSMLRSAAKNHASVTVVVDPADYATVLGELADAGQTTFETRQRLAAKVFRHTAAYDALIAEYFTAQVGEAKPEKLTITYDLKQAMRYGENPQQDADFYQKALPTDYSIASAKQLNGKELSFNNIRDADAAIRIIRDFKDRPTVVALKHMNPCGIGQADDIETAWDYAYEADPVSIFGGIVVLNREVDAATAEKMHPIFLEIIIAPSYSEEALAILTNKKKNLRILELPFDAQAASEVEAEYTGVVGGLLVQNQDVVAENPSDWQVVTDRQPTEQEATALEFAWKAIKYVKSNGIIITNDHMTLGLGAGQTNRVGSVKIAIEQAKDHLDGAVLASDAFFPFADNIEEIAAAGIKAIIQPGGSVRDQESIDAANKHGLTMIFTGVRHFRH >CP019832|187472:199642|191536_192991_+|AUP32497.1|DBSCAN-SWA MTYEVKSLNEECGVFGIWGHSQAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDNGKLYGYRNVGLLSEVFKNQSELDNLTGNAAIGHVRYATAGSADIRNIQPFLYKFHDGQFALCHNGNLTNAISLRKELEKQGAIFNASSDTEILMHLIRRSHNPSFMGKVKEALSTVKGGFAYLLMTEDKLIAALDPNAFRPLSIGQMQNGAWVIASETCAFEVVGAKWVRDVEPGEVILIDDSGVQCDRYTDETQLAICSMEYVYFARPDSTIHGVNVHTARKNMGKRLAQEFKQDADIVIGVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMVDDSIVRGTTSRRIVGLLREAGASEVHVAIASPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHAVDEVCDIIGADSLTYLSIDGLIESIGLETKAPNGGLCVAYFDGHYPTPLYDYEEEYLRSLEEKTSFYIQKVK >CP019832|187472:199642|198337_199642_+|AUP32503.1|DBSCAN-SWA MKMNKKVLLTSTMAASLLSVASVQAQETDTTWTARTVSEVKADLVKQDNKSSYTVKYGDTLSVISEAMSIDMNVLAKINNIADINLIYPETTLTVTYDQKSHTATSMKIETPATNAAGQTTATVDLKTNQVSVADQKVSLNTILEGMTPEAATTIVSPMKTYSSAPALKSKEVLAQEQAVSQAAANEQVSPAPVKSITSEVPAAKEEVKPTQTSVSQSTTVSPASVATETPALVAKVAPVRTVAAPRVTSAKVVTPKVETGASPEHISAPAVPVTTTSTATDNKLQATEVKSVPVAQKAPTATPVAQPASTTNAVAAHPENAGLQPHVAAYKEKVASTYGVNEFSTYRAGDPGDHGKGLAVDFIVGTNQALGNEVAQYSTQNMAANNISYVIWQQKFYSNTNSIYGPANTWNAMPDRGGVTANHYDHVHVSFNK |
8 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
944389 : 953553
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP019832|944389:953553|DBSCAN-SWA AATGACTTACACAGAAAATTTTCAAAAATGGTTAGATTTTGAGCAGCTTCCTGACTATCTTCGTCAAGAATTACTATCAATGGATGAAAAAACAAAAGAAGATGCTTTTTACACAAACTTAGAATTTGGTACTGCTGGTATGCGTGGTTATATTGGTGCTGGTACAAATCGTATTAATATTTATGTTGTCCGTCAAGCAACCGAAGGATTGGCAAAATTAATCGAAACTAAGGGAGAGGACGCTAAAAAACGTGGTGTAGCCATTGCTTATGATTCACGCCACTTCTCTCCAGAATTTGCTTTTGAGTCTGCACAGGTCTTGGCACAGCATGGAATTAAATCTTACGTATTTGAAGCTCTTCGTCCAACACCAGAACTCTCTTTTGCTGTTCGCCATTTAAATGCCTATGCTGGTATTATGGTTACTGCAAGCCACAATCCAGCACCTTTCAATGGTTATAAAGTCTATGGACAAGACGGAGGTCAACTACCACCAGCTGATGCTGATGCACTAACAGACTTTATCCGTGCTATTGAAAATCCATTTGCAGTTGAACTTGCTGATTTAGATGAAAGCAAATCAGCGGGTCTTATTCAAGTTATCGGTGAAGATGTTGATATTGAATATCTTAGAGAGGTTAAAGATGTTAATATCAATCAAGATTTAATCAATAACTTTGGAAAAGACATGAAAATTGTCTATACTCCTCTCCACGGAACTGGTGAGATGTTGACACGCCGTGCCCTTGCTCAAGTCGGTTTTGAATCTGTTGTTGTAGTAGAATCACAAGCTAAGGCAGATCCAGACTTTTCTACTGTCAAATCTCCTAACCCTGAAAGCCAAGCTGCCTTTGCTCTTGCTGAAGAACTCGGACGAGAAGTTGATGCAGATGTCTTAGTAGCTACTGATCCTGATGCAGACCGCCTAGGCGTTGAAATTCGCCAACCAGATGGTTCTTATAAAAACCTTTCTGGAAATCAAATTGGAGCGATTATTGCGAAATACATCCTGGAAGCTCATAAAACAGCAGGAACACTTCCAGAAAATGCTGCTCTCGCTAAATCAATCGTATCAACAGAATTAGTAACAAAAATTGCCGAAAGTTATGGCGCTACAATGTTTAACGTTTTAACTGGATTCAAATTCATCGCTGAGAAAATTCAAGAGTTTGAAGAAAAACATAACCACACCTATATGTTTGGTTTTGAGGAAAGCTTCGGATACCTTATTAAACCATTTGTCCGTGATAAAGACGCTATTCAAGCAGTTCTTTTGGTTGCTGAGATCGCAGCTTATTACCGTTCGCGTGGATTAACACTTGCAGATGGTATTGATGAAATTTACAAAGAATATGGTTTTTTTGCTGAAAAAACGATTTCAGTAACACTTTCAGGTGTAGATGGAGCTGCTGAAATTAAGAAGATTATGGACAAATTCCGTGAAAATGGTCCAAAACAATTTAACAATACTGATATTGTATTATTAGAAGATTTCCAAAAACAAACCGCTACTAAAAATGATGGAACAATATCTAACTTAACAACTCCTCCAAGTAATGTTTTGAAGTACACATTAGCTGATGATTCATGGATTGCAGTTCGCCCTTCAGGAACTGAACCAAAAATCAAGTTCTATATTGCCACGGTCGGTAATGATTTAGCAGATGCAGAAACAAAAATCGCCAATATTGAAAAAGAGATTACAACATTTGTAAATTAATAAAAAAAGCTAGGAAGGCACTGCACCCCATTAGTGGGACAGAAGAAAAACACTCTTATGAAGCCAATTTCCTGAATTGAACAGGAGATTGGTTTTTTAAATGACGTTGAATTCTAGTTTCATTATAAAATGTAATGTAATTTTTAACAATATTTGTTATACTATCTTTGTTGTATTTTCTCCTATCATGGAGATAAAAGGTTTCAGTCTTTAGGACGGAGTGAAACCATTCAATACAGGCGTTATCTGCAGGTGTTCCTTTTCGGGACATTGAGCGGATAATGCCTTTTTCCGTGCAAGCTTGATAGTAAGCCTTAGAAGTATACACTGAGCCTTGATCGCTGTGTAAGACTGCCCCTTTAGGTAATTTTAACTGATTAAGGGTGTCTATTACAAAATCTGTGTCCTGACAATCTGAGATAGTATAAGCTAAAATCTCTCGGTTATAGAGGTCCATAATTGAAGAGAGATACAATTTACAGTTACCGAAATATAGATAAGTAATATCTGTTACAAGCTTTTCCAATGGCTTATCGGCATGGAAATCCCGATTCAATTTGTTATCTGTTAAATAATAAGTTTTACCAAGATTGGGCGATTTCTTTGGACGTGTCCGACAAAGCCAACCATTGTCTTTCATGATACGATAGACTTTCTTTGCATTAACAGTCAATTCGTGGATCTTTTTGAGCAATCGTGTAATGGTACGATATCCATAAATAAAGTGATTCTCCATGCAGAGCTGTTCAATTAATTCAATGACTTCATCTGTTTCTTGTGGTTTCTCGTACTTCTTTTTCCAACGATAATAGGTCGATCGCTTAACATCAAAACAGTCTAGAATGACAGAAATCGGGTAGTTGTTTTTATAGTCTTCCACAAGCTTGATAAGACTTACTTTATCGATTTCCTTATCAAGCCTCGATACTTTTTTAAGAGGTCAACCTGTAATTGTAACTGTTCCACTTCAGACAGATGTTCCAAGCCTTTACCATAGGTATATTGCTTGCCAACACCTTGATGGAAACGATAAAGTTCCTCATTTTCGTGCCATTTTACCCAAGTATAGATTTGACTATCATTCTTGATACCTAGAGTCTCCATAATAAATCTGTTAGACTTGCCTGCTTTTTTCATCTCGATGCAGGCCAACTTCGTTTCCCATGAATATGCTTTTTTAACCATAATAAAACACTCCTGATTCTATTTTACTAGAATTCTCCAGGAGTGTTTTTCTTGTGTCTCACTTTAGGGAGACAGTGCCGAACTTACTCCTAGCTTTTTTTATATCTATCTAACGATGTTCTATTATTTTCAATCATGAAATATAACTGCAATTAACTTCACGATCAAATAATAGAGCAGACTTACAATTAACCACATTATCCCAATAACTGCAACTAAACCTATTAAAACAGATAATACCGTATTCTTAGTTGCTAGTTGGTTACTGATAAACCATGAAACTGCAAAAATAAATATCAGTAATAATAGTTGAAGCCTTTTTTTCATATAATTCCTCTTACTACTTTTGTGCATTTTGCATTTGATAATAAATACCTTTTTGAGCCATTAATTCAGAGTGGTTACCCACTTCTACAATTTCACCAGATACCATAACTAAAATAATATCTGCTGTTTGAATGGTAGATAAGCGATGTGCAATAATAAAGCTTGTTCTCCCCTTCATCAACATTTGGAATGCTTCTTGAAATAGACGATGTCGCCTCATCTAATATCAATATTCTAGGTAATTTAAGAAAAATACGAGCAATTGTCAATAGCTGACATTGCCCCTGTGATAACGAATCTCCAGCATCTTCTAAATACGTATCATATCCATTCGGTAATTGTTTGATAAAGAAATCTGCATTAGCTGCTTTTGCAGCCTCTATCACTTCTTCACGGCTAGCTTTAGGATTGGCATATGCAATGTTATCGTGAATCGTAGCACTTTTTAACCACGTTTCTTGTAATACCATTCCAATTTCTTGCCTTAATTGTGATGGCTCATAATCAGTAATAGGCTTACCATCTAAAAGGATATTTCCCCCGTCAACTTCATAGAAACGCATTAATAAATTGATTAAAGTAGACTTCCCAGCACCTGTTGGTCCTACAATAGCGACCTTAGCTCCTGCTGGAATGTGTAAATTAATACCATTCAATAGTGGTTTTGATTTATTATAACCAAAAACAATGTTTTTAAAATCGATTTGACCTTTGACCGTTGATGAATCAAGTTTTTCTGTACCTGTTATATTTGGTGACGATTCTTCTAAAATAGAGTAAAGGCGTTCTGCACAAGCCAGAGTACTTTGCATCTCAGACAGGACGGAAGAGATGTCATTAAATGGCTTAGTATATTGATTGACATAATTTAAGAAAGTGATTAATTGACCAACACTAAAAGCCCCTGACATAATACGAAGGGCACCAATCCCTGCTAAGAAGCCATAAATCAAACTATTGATAATTGCTCCGTATCGGTAGTCACACGACTAATCAAGTCACCTATGCCACGTTTATCAAGGTAAGCTATAGGCAATAGATTCAACTTTTCCATTACAACCTTTCTTAAAGAAGCAACATAATGAAAAATTAAGCGGTTATAGAGCAGAGGATTAATCCATTGAATAATAGTATTTGCTAAAATAACTGCAATCATCTTCCACATTATAGGTAACAATAATATCATAGAATGAGGCGATAATACAACGTCTACCGCTTGTCCAATTAGAACAGGCAAATAAACAGTGAGGCAAACTTGTACAACCGTCCCTAATAATGCCATTCCTACTAAGCTTTTTTTAGAAAGAAGATCTTGAACAAGCTTTTTTTGTATCTTTTTAGGATGACTTGCTTTCATTTACTCCTCCTCCTTAAAATTTTGTGAATGGTAAATGGACTTATAAACTTTGTTATGAGCTAATAAAGATTGATGATTATCAAAACCAACTTGTTTCCCCTTATCAAGGAGTAAGATTCTATCTGCATTTTGTATACTATTAATTCTCTGTGATACAATAATAAGATTAGTTTGGTTGAAATGTTTAGTTATAGCTTTAAATAAACGAGCTTCTGTTAAATAATCCAATGCAGATGTTGCATCGTCTAAAATCAAAAATGGTATCTTATCTTGAACTAAAGCTCTTGCAATCGTCAACCTTTGCCTTTGACCACCAGAGAAATTCCTACCAAAACTCTCTACAGAGGCATCAAGTTGACCATCTTTTTCTTTTACAAAATCACTAGCTTGTGCTATTTCTAAAGCAGTCCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP019832|944389:953553|944389_946108_+|AUP33186.1|DBSCAN-SWA MTYTENFQKWLDFEQLPDYLRQELLSMDEKTKEDAFYTNLEFGTAGMRGYIGAGTNRINIYVVRQATEGLAKLIETKGEDAKKRGVAIAYDSRHFSPEFAFESAQVLAQHGIKSYVFEALRPTPELSFAVRHLNAYAGIMVTASHNPAPFNGYKVYGQDGGQLPPADADALTDFIRAIENPFAVELADLDESKSAGLIQVIGEDVDIEYLREVKDVNINQDLINNFGKDMKIVYTPLHGTGEMLTRRALAQVGFESVVVVESQAKADPDFSTVKSPNPESQAAFALAEELGREVDADVLVATDPDADRLGVEIRQPDGSYKNLSGNQIGAIIAKYILEAHKTAGTLPENAALAKSIVSTELVTKIAESYGATMFNVLTGFKFIAEKIQEFEEKHNHTYMFGFEESFGYLIKPFVRDKDAIQAVLLVAEIAAYYRSRGLTLADGIDEIYKEYGFFAEKTISVTLSGVDGAAEIKKIMDKFRENGPKQFNNTDIVLLEDFQKQTATKNDGTISNLTTPPSNVLKYTLADDSWIAVRPSGTEPKIKFYIATVGNDLADAETKIANIEKEITTFVN >CP019832|944389:953553|950710_951313_-|AUP33191.1|DBSCAN-SWA MFKFLKRLIALIIIIFIGYRLVIIHENVKKVLQYHDLVQNTLAENGSEANVHLVLSMIYTETKGDAIDVMQSSESISGTTNSITDSHTSIKHGVTLLSQNISQAKKAKVDVWTAVQAYNFGSSYIDYVADHGGENSIELAKNYSKNVVAPSLGNYNGDTYFYYHPLALISGGKLYKNGGNIYYSREVQFNLYLIKIMELF >CP019832|944389:953553|947422_947620_-|AUP33189.1|DBSCAN-SWA MKKRLQLLLLIFIFAVSWFISNQLATKNTVLSVLIGLVAVIGIMWLIVSLLYYLIVKLIAVIFHD >CP019832|944389:953553|947002_947293_-|AUP33188.1|DBSCAN-SWA MVKKAYSWETKLACIEMKKAGKSNRFIMETLGIKNDSQIYTWVKWHENEELYRFHQGVGKQYTYGKGLEHLSEVEQLQLQVDLLKKYRGLIRKSIK >CP019832|944389:953553|946163_946988_-|AUP33187.1|DBSCAN-SWA MEDYKNNYPISVILDCFDVKRSTYYRWKKKYEKPQETDEVIELIEQLCMENHFIYGYRTITRLLKKIHELTVNAKKVYRIMKDNGWLCRTRPKKSPNLGKTYYLTDNKLNRDFHADKPLEKLVTDITYLYFGNCKLYLSSIMDLYNREILAYTISDCQDTDFVIDTLNQLKLPKGAVLHSDQGSVYTSKAYYQACTEKGIIRSMSRKGTPADNACIEWFHSVLKTETFYLHDRRKYNKDSITNIVKNYITFYNETRIQRHLKNQSPVQFRKLAS >CP019832|944389:953553|951455_952292_-|AUP33192.1|DBSCAN-SWA MMDFYIKQIIIHQFSPNDTELVLSDTPLTLTPRIDDYFRKKLSKVFSDEAKRGYFGEDNVFMSHLQDDLYVSSCQIAQLWKEEFVISEDQKTNDLVFIQFDKDGMEHFAFLRISLKEQFAHVSENQEQPITITQNNLPSAAQTPDEALVVNKSSKQYYLIEKRIKHNGSFANYFSENLLQVEPEQSVKKSIKMVEQTAQKIAENFNKDDFSFQSKMKSAIYKNLEEEQELSPEKLADQLFDDNLTARLTFVDELKDAIPGPVQVSDIDHSRQIKKLEN >CP019832|944389:953553|952296_953553_-|AUP33193.1|DBSCAN-SWA MIFDKDNFKEFDQELWQAIHDEEIRQQNNIELIASENVVSKAVMAAQGSVLTNKYAEGYPSHRYYGGTDCVDVVESLAIERAKTLFNAEFANVQPHSGSQANAAAYMALIEPGDTVLGMDLAAGGHLTHGASVSFSGKTYHFVSYSVDPKTEMLDYDNILKIAQETQPKLIVAGASAYSRIIDFEKFRQIADAVDAYLMVDMAHIAGLVASGHHPSPISYAHVTTTTTHKTLRGPRGGLILTNDEAIAKKINSAVFPGLQGGPLEHVIAAKAVALKEALDPSFKIYGEDIIKNAQAMAKVFKEDDDFHLISDGTDNHLFLVDVTKVIENGKKAQNVLEEVNITLNKNSIPFERLSPFKTSGIRIGTPAITSRGMGVEESRRIAELMIKALKNHENQDVLTEVRQEIKSLTDAFPLYEN >CP019832|944389:953553|948977_950699_-|AUP33190.1|DBSCAN-SWA MKRLTYYFKGYIKETIFGPLFKLLEASFELLVPIVIAKMIDETIPRGDRSSLLLQIGLIFFLAAVGVVVAITAQYYSSKAAVGYTRQLTEDLYQKVMSLGKKDRDELGTASLITRLTADTFQIQTGLNQFLRLFLRAPIIVFGAIIMAFSISPSLTIWFLVMVVTLFIIVFVMSRLLNPIYLKIRTSTDYLVKLTRQQLQGVRVIRAFNQVDRESEAFNDINYHYTNLQLKAGRLSSLVTPLTFLVVNITLVVIIWRGNLNIANHLLSQGMLVALINYLLQILVELLKMTMLVTSLNQSYISAKRIIAVFERPSEIIDDKLEPKYSNKALEVQEIAFSYPNSSEKALSDITFSMNVGETLGIIGGTGSGKSTLVNLLLHIYKVQEGDIDIYHQGKSPDTISNWRTLVRVVPQNAQLFKGTIRSNLSLGLGKVSEEKLWTALEIAQASDFVKEKDGQLDASVESFGRNFSGGQRQRLTIARALVQDKIPFLILDDATSALDYLTEARLFKAITKHFNQTNLIIVSQRINSIQNADRILLLDKGKQVGFDNHQSLLAHNKVYKSIYHSQNFKEEE |
8 | Staphylococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1349384 : 1360066
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP019832|1349384:1360066|DBSCAN-SWA TATGAAACTCATTTCATGGAATATTGATTCCCTCAATGCGGCATTAACAAGTGAATCAACACGTGCTTTAATGTCACGCCAAGTTATTGATACTTTAGTTGCTGAAGATGCCGACATCATTGCGATTCAAGAAACTAAACTGTCTGCCAAAGGGCCTACTAAAAAACATTTGGAAGTACTTGAAACTTACTTCCCAGCATATGATTTGGTTTGGCGATCATCAGTCGAACCTGCTCGTAAGGGCTATGCTGGTACAATGTTTTTATATCGTAAAGGGTTAAATCCTATTGTTAGCTTCCCTGAAATCGATGCTCCTACTACAATGGATAATGAAGGTCGCATTATTACTCTCGAATTGGAAAACTGCTATATCACACAGGTCTATACTCCAAATGCAGGTGATGGCCTAAAGCGCTTAGCTGACCGTCAAATATGGGATATTAAATATGCTGAGTATTTAGCAACATTGGATAGTCAAAAACCTGTTCTAGCAACAGGTGACTATAACGTAGCCCACAAGGAAATAGACCTAGCTAATCCTAGCAGTAATCGTCGTTCTGCTGGATTCACAGATGAAGAGCGCCAAGGCTTTACAAATCTACTAGCTAAAGGTTTTACAGATACTTTTCGTTACCTTCATGGCGATGTTCCAAATGTTTATAGCTGGTGGGCACAACGAAGTCGTACATCCAAAATCAACAATACAGGGTGGAGAATTGATTATTGGCTAACAAGTAACCGTGTCGCAGATAAAATTACCAAGTCAGAAATGATTCATTCTGGTGATCGTCAAGATCATACACCAATTATTTTGGAGATTGAACTATAAACCAAAAAAGATGATTGAGTTATAACTCAATCATCTTTTTATACTAAGTTGAGGTCTTTATACTTAGTACGGTAGCCAATCTGAAGAATTTTATTATCTTTAACTAGCAATGGACGCTTAATAAGCATCCCATCCGATGCCAATAAGTCCAAAGCTTGGTCAAGAGTTAAATCATCAAATTTATCTTTTAAGCCTAATTCTCTGTAAGAATTTCCTGAAGTATTGAAAAACTTTTTAAGGTCATAAGGCGAATTCTCTAACAATTCTTTTAATAACGAAGCTTTGGGAGGATTGCTTTTTATATCAATAGCTTCAAAAGTTAAGCCGAGTTCAGTTAACTCTTTTTTTGCTGAACGACAAGTGGTACATTTGGGGTATTCATAAAACGTATACATATTATTTCTCCTTTTCGTATTCTAATAACCAAGATTTTCTTTCTAAGCCACCAGCATAACCAGTTAATTGACCATATCTTCCTAAAACACGGTGACAAGGTATGATTAGAGAAATAGGATTTTTACCTATTGCTCCTCCAACAGCCTGTGCAGATTGACAATTTAGCTCTTTCGCTAATTCTCCATAAGTTTTTGTATCTCCAAAAGGGATTTTCTGTAATTCCTGCCATACTCTCATCTGAAATGCTGTCCCTCTCAATGATAATGGAATACTAGGTAAATTTTGCTGTGAAAAATAAGCATCTAACCACTTCTTACCAAGTAAAGTATAGGAATTTGACATATTAACAATTTCCTCTTGGTTGACTGCTAGCATATCATATTTTTGCCCAACAAAATAAAGCCCTGATAAACCTAGATTGTCTGCTAGAAGGCGAATTTCTCCAAGAGGGGACTGATAGAATTCTTGATATAACATATGATAAGCATAACTTAAAAAGCCATGAAAAGCAATTCATGACTTTTTTTAGTTCTTTATTGTTGTTTTGCAATTAAACGTACACGGACGATATTCTCATCACCTTCAAATTCTTCAATTAAAGTAGAAATCTTGTTATTATCCGTTTCATCTAAATCTATTAGTGTGTAGGCGTAGTCACCCTTTGAACGGTTAATAATGTTATCAATATTTATACCTAACTCTGATACAGCAGTTGAAATTTTAGCCACAATGTTAGGAACATTCTTGTTAATTAAAGTAATACGAAATGGTGCGGTTTGAATTTGATGTACATTGGGGAAATTAACTGAATTAGTGATTTCTCCTGTCTCCATAAAACAACGAATGGTTTGACTTGCCATAATAGCACAATTTAGCTCTGCCTCATCTGTTGATCCGCCTACATGAGGAAAGACTGTAATTCCTTTTTGGTTTAATAATTCTTTGTCTCCAAAATCAGTAATATAGCGCTTGACAACACCAGTTTCTATCGCTTCAAATAGCTCTTGGTTATTGACTAATTCTGCACGAGCAAAGTTGATAATCGTCGTTCCTTTTTTCATGATTGAAAAAGCTTCCGCATCAAAAGTATGCTTAGTTTCATTTGTTAAGGGAACATGAATTGTGATATAGTCACAAGTTTCAAAAATATCCTTAATCTCTTTAACCCTTTGAACATGGCTTGAAATATTCCAAGCTGTTTCAATTGAAACATAGGGATCATAACCAAGAACTGTCATTCCTAAGCGTCTAGCATCATTCGCAATTCTAGCTCCAATGGCACCAAGGCCGATAACTCCCAATTTTTTTCCTGCAATTTCATTACCAGCAAAAGCTTTCTTTCCTGCTTCAATTTGTTTGGGAATATCTGTTCCAGTTAGAGTATTAACCCATCGGTTAGCTCCTAAATAATCACGAGCTGAAAGTAATAAGGCAGCAATGACCGCTTCTTTTACAGCATTAGCATTTGCACCTGGGGTATTAAAGACGACTATTCCCTGTGCACTTGCCTCTTCAATAGGAATATTATTTGTTCCTGCACCCGCCCTAGCAATAGCTTTGAGGTTACTTGGGAAATCTTGATTATGCAAATTTTGACTACGAATAATATAGGCATCAGGATTTTCTGACATATCCCCATCAATCTGGAAACGATTCCCTAACTCTTGTAAACCAATTTGATTAATATTATTAAATGTTTTGACACTAAAAACCATTCTTTTTCACTAAGGTTATCTCTTTAGTCATCATTGACTAAAATAACCCCTTTCTTTTTTTCTTACATGGGATTTCTTTCATCAATCTCACGATAGATGCTCGTTTCTCCCTTTTCTTTTATCTTCTGATAAGCCAATCGTACCCCATCTAGAGGTACTTTACCACAATATTGATAGCCTAATTTATTTAGAATATGCTGCATAGTGACATTTTTTTCATGAGTATCGCAACGAAAATCAGGTCCTTTGTGACCTTCAATTAACCCTTGAAGGAATGTCTGTGCTAGTCCTCTACCACGAAATTGATTTGAGATAGCAATACGATGAAATGTAAGATAGCGATGGTTATCATGGAGCCATTTTCCCTCATAAATAGCATCATAAACCTCTTCATGACCATCAATGACAGCCGCATAAGTCGCTAGCATCCCATCTTCAATACCAACCCAAGCATAACCGTTCAAGATATCATCAATAATATCGTTACGATTAGGGTATCCATCTTCTTTTTGCCATTGATCACTTCCTGTTTTAGCAATTTCGGCACGCGCTTCCTCAATAAGAAGCATAATTTGGTCAATTTCATTTGGAAAAGCTAATCTGATTTGCATTATATTACCCACTTTTATATATTATAGACTATAATAACGGTTTAATTTTCTTTCGTGATAACATTTACTATGCATTTTCTGCTTCAAATGTTTTCATAAAATCAATTAATTCGATGACACCTTGTTTAGGAAAGGCATTATAAAGGCTAGCCCTCATACCACCTACCGAACGATGCCCTTTAATATTTTTAAATCCACGTTCTGTCGCTTCCTTTACAAATTTTTCATCTAAATCTTTATTAATAGTTATGAAAGGAATGTTACATAGAGAACGACTCTTTTTATCTCTGACAGGATTACTATAAAATTCTGAGGAATCAATATAATCATAGAGAAGTCCTGATTTTTCACGGTTAGCTTTTTCCATAGCATCAACACCACCTAGACTTTTCACCCATTCAAAGACTAATTTAGCAATGTAAATACTGTAAGCAGGCGGCGTATTATAAAGAGAACCAGCATCTGACTGAATCTTATAATCCAACATTGATGATAAAGTTGGTTCCTCATTAATCATATCTTCACGGATAATAACTACCATTACACCAGCAGGTCCAATATTTTTTTGAGCTCCTGCATAAATCATTGCAAAATCTTCTACTTTATATTTTACAGCTAAGATATTAGAAGACATATCCGCAATAACAGGCACTCCATTAGTTTTAGGAGTATCATAAAGCGATGTTCCTTCAATGGTATTATTTGTTGTCACATGAACATAGGCAGCTTCAGGATCAATCTCTTTTTCATCAAACTCTGGAATATAATCATAAACTGATTCTTCTGATGAGGCTAATAGAATTGGTTCAAAAGGAATTGTTTTTGATAGTTTTACAGCCTCTGTATAAGCTTTTTTCCCCCACGAACCAGCAACATGATAGTAAGCTTTACGCCCTCTGGCAATATTCAAGGGAATCATACTAAACTGTAAGGATGCACCACCTTGTAAAAAGATTACTTTATAATTATCCGGAATTCCCATCAAATCTCTTAAGTAACGCTCAGCACCTTTGATAATATCATCAAACTCTTTGGAGCGGTGCGATACCTCCAAAACACTCATACTGGACCCTTGATAATTAAGGAGTTCAGATTGGGCTTTTACAAGCACTGGTTTTGGTAAGACTGCAGGACCTGCAGAAAAATTATAAATTGTCATATAACACCTCCATATAATAGTGTAAGATTATAGCACAGTATTTTGAATATTGTAAAGATTTTTTTGATTAATTTTGCTTTTTATTCGTGATATAATGGTAAAGGCGAACAATCAAGTTTAAAGGAGTAATTTATGATTTTGAGGGAATTTTGTGCAGAGAATTTAACAGACTTAACCAGATTAGATAAAGCTATTATTTCACGTGTCGAGCTTTGTGATAACCTTGCTGCTGGAGGCACTACTCCTAGCTACGGTGTTATCAAAGAAGCTAATCAATATTTACATGAAAA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CCATATTCCAATACATAAATTCTCTCTGTTACTTGCATAACCAAGTTCATATCATGTTCAATCAGCATAATAGTAATATCAAAATCATTCTTTATTTGACTAATTAACTGCGTCAATTCTGCAGTTTCTTGAGGATTCATTCCTGCTGCGGGCTCATCCAAAAACAATATTTTCGGTTCTGTTGCTAAAGCACGAACAATTTCTAAACGCCGTTGTTTTCCATAAGGGAGGTTCTTAGCAAGAGCATCTTGATATGCTTTCAAACCAAAAATCTCTAATAGCTCTAGGGCCTTTTTCCTTAAGGCTTTTTCACTATGATAGTATTTGGGTAATCGTAAAAAACTAGCAATAGAATGTGATAAGTGATGATTACTGAGTCCTACTAGTACATTATCTAAAACAGTCATATTTTTAAAAAGTCGGATATTTTGAAAAGTTCTACCTAAACCTAAAGAAGCTATTTTAGCTGGTTTCCTCCCATTTAATATCTTATCATCAAGTGATATTGTCCCTTTACTAGGAAGGTATACTCCTGTTAAGAGATTAAAAAGCGTTGTCTTACCCGCACCGTTGGGGCCGATTAAGCCAATTAATTCACCTTTATGTAATTTCATCGAAACATCACCTACAGCAGTTAGGCCACCGAAATGTTTACTTAAATTTTTTACTTCAAGAAGTGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP019832|1349384:1360066|1356306_1357170_-|AUP33579.1|DBSCAN-SWA MDLKRTQPKLLEKFNTILQSDRMSHAYLFSGNFASLDMALYLAQSQFCEKRQSGLPCQECRACRLIANGEFSDVKIIEPQGQLIKTETIKELTKDFSRSGFEGKSQVLIIKDCEKMHVNAANSLLKFIEEPQSSSYVILLTNDENNVLPTIKSRTQIFRFPKQLDMLVHQAEQAGLLKSQASLLAQVADDPKHLEILLTNKKLLDYLNLSQQFVTTLAKDRQTAYLEVSRLTSQVVDKNDQAFVFQWLTIMLAKEGQLYDLENTYRAQQMWKSNVSFQNSLEYMVLS >CP019832|1349384:1360066|1358591_1359302_-|AUP33582.1|DBSCAN-SWA MTMLKVENLSIHYGVIQAVNDVSFEVNQGEVVTLIGANGAGKTSILRTISGLVRPSQGSISFLGKPIHKLAARKIVGNGLAQVPEGRHVFSSLPVMENLEMGAFLQKDREQNQKMLKKVFDRFPRLEERKNQDAATLSGGEQQMLAMGRALMSRPKLLLLDEPSMGLAPIFIQEIFNIIEDIKKQGTTVLLVEQNANKALTIADKAYVLETGKVVLSGTGKELLVSDQVRKAYLGG >CP019832|1349384:1360066|1355950_1356277_-|AUP33578.1|DBSCAN-SWA MDKKDLFDAFDDFSQNLLVGLSEIETMKKQIQKLLEENTVLRIENGKLRERLSVIEAETETAVKNSKQGRELLEGIYNDGFHICNTFYGQRRENDEECAFCIELLYRD >CP019832|1349384:1360066|1357913_1358573_-|AUP33581.1|DBSCAN-SWA MPVKDFMTKKLVYVSPDTTVAEAADLLREHHLRRLPVVENDQLVGLVTEGTMAEAQPSKATSLSIYEMNYLLNKTKIRDIMIKDIVTVSQYASLEDAIYLMMSRKIGVLPVVDNGQLYGIVTDRDVFKAFLEIAGYGQEGYRLVILADEGIGVLSKVLNRLSSANLSVKRLVIIERKAGKKAVEIQLEGYADKDVLKQELVFDDVIVETLEKTVKKPLS >CP019832|1349384:1360066|1355081_1355945_-|AUP33577.1|DBSCAN-SWA MQVQKSFKSNTHYGTLYLVPTPIGNLDDMTFRAIRILREVDFICAEDTRNTGLLLKHFDITTKQISFHEHNAYDKISGLIDLLKEGRSLAQVSDAGMPSISDPGHDLVKAAIEGDIPVVSIPGASAGITALIASGLAPQPHIFYGFLPRKKGQQITFFETKKDYPETQIFYESPFRVSDTLKHMKEIYGDRQVVLVRELTKLYEEYQRGTISQLLWHIEKVPLKGECLIIVDGKRDTERVKDSSQQDPLVLVKEYIANGDKTNQAIKKVAKELNLNRQELYASFHDL >CP019832|1349384:1360066|1351141_1352323_-|AUP33573.1|DBSCAN-SWA MVFSVKTFNNINQIGLQELGNRFQIDGDMSENPDAYIIRSQNLHNQDFPSNLKAIARAGAGTNNIPIEEASAQGIVVFNTPGANANAVKEAVIAALLLSARDYLGANRWVNTLTGTDIPKQIEAGKKAFAGNEIAGKKLGVIGLGAIGARIANDARRLGMTVLGYDPYVSIETAWNISSHVQRVKEIKDIFETCDYITIHVPLTNETKHTFDAEAFSIMKKGTTIINFARAELVNNQELFEAIETGVVKRYITDFGDKELLNQKGITVFPHVGGSTDEAELNCAIMASQTIRCFMETGEITNSVNFPNVHQIQTAPFRITLINKNVPNIVAKISTAVSELGINIDNIINRSKGDYAYTLIDLDETDNNKISTLIEEFEGDENIVRVRLIAKQQ >CP019832|1349384:1360066|1349384_1350212_+|AUP33570.1|DBSCAN-SWA MKLISWNIDSLNAALTSESTRALMSRQVIDTLVAEDADIIAIQETKLSAKGPTKKHLEVLETYFPAYDLVWRSSVEPARKGYAGTMFLYRKGLNPIVSFPEIDAPTTMDNEGRIITLELENCYITQVYTPNAGDGLKRLADRQIWDIKYAEYLATLDSQKPVLATGDYNVAHKEIDLANPSSNRRSAGFTDEERQGFTNLLAKGFTDTFRYLHGDVPNVYSWWAQRSRTSKINNTGWRIDYWLTSNRVADKITKSEMIHSGDRQDHTPIILEIEL >CP019832|1349384:1360066|1350608_1351085_-|AUP33572.1|DBSCAN-SWA MLYQEFYQSPLGEIRLLADNLGLSGLYFVGQKYDMLAVNQEEIVNMSNSYTLLGKKWLDAYFSQQNLPSIPLSLRGTAFQMRVWQELQKIPFGDTKTYGELAKELNCQSAQAVGGAIGKNPISLIIPCHRVLGRYGQLTGYAGGLERKSWLLEYEKEK >CP019832|1349384:1360066|1353001_1354093_-|AUP33575.1|DBSCAN-SWA MTIYNFSAGPAVLPKPVLVKAQSELLNYQGSSMSVLEVSHRSKEFDDIIKGAERYLRDLMGIPDNYKVIFLQGGASLQFSMIPLNIARGRKAYYHVAGSWGKKAYTEAVKLSKTIPFEPILLASSEESVYDYIPEFDEKEIDPEAAYVHVTTNNTIEGTSLYDTPKTNGVPVIADMSSNILAVKYKVEDFAMIYAGAQKNIGPAGVMVVIIREDMINEEPTLSSMLDYKIQSDAGSLYNTPPAYSIYIAKLVFEWVKSLGGVDAMEKANREKSGLLYDYIDSSEFYSNPVRDKKSRSLCNIPFITINKDLDEKFVKEATERGFKNIKGHRSVGGMRASLYNAFPKQGVIELIDFMKTFEAENA >CP019832|1349384:1360066|1354225_1354861_+|AUP33576.1|DBSCAN-SWA MILREFCAENLTDLTRLDKAIISRVELCDNLAAGGTTPSYGVIKEANQYLHEKGISVAVMIRPRGGNFVYNDLELRIMEEDILRAVELESDALVLGILTSNNHIDTEAIEQLLPATQGLPLVFHMAFDVIPKSDQKKSIDQLVALGFTRILLHGSSNGEPIIENIKHIKALVEYANNRIEIMVGGGVTAENYQYICQETGVKQAHGTRITQ >CP019832|1349384:1360066|1357189_1357825_-|AUP33580.1|DBSCAN-SWA MKKGLMISFEGPDGAGKTTVLEAVLPLLREKLSQDILTTREPGGVTISEEIRHIILDVKHTQMDKKTELLLYMAARRQHLVEKVLPALEEGKIVLMDRFIDSSVAYQGSGRGLDKSHIKWLNDYATDSHKPDLTLYFDVPSEVGLERIQKSVQREVNRLDLEQLDMHQRVRQGYLELADSEPNRIVTIDASQQLDEVIAETFSIILDRINQ >CP019832|1349384:1360066|1352385_1352934_-|AUP33574.1|DBSCAN-SWA MQIRLAFPNEIDQIMLLIEEARAEIAKTGSDQWQKEDGYPNRNDIIDDILNGYAWVGIEDGMLATYAAVIDGHEEVYDAIYEGKWLHDNHRYLTFHRIAISNQFRGRGLAQTFLQGLIEGHKGPDFRCDTHEKNVTMQHILNKLGYQYCGKVPLDGVRLAYQKIKEKGETSIYREIDERNPM >CP019832|1349384:1360066|1350250_1350607_-|AUP33571.1|DBSCAN-SWA MYTFYEYPKCTTCRSAKKELTELGLTFEAIDIKSNPPKASLLKELLENSPYDLKKFFNTSGNSYRELGLKDKFDDLTLDQALDLLASDGMLIKRPLLVKDNKILQIGYRTKYKDLNLV >CP019832|1349384:1360066|1359301_1360066_-|AUP33583.1|DBSCAN-SWA MALLEVKNLSKHFGGLTAVGDVSMKLHKGELIGLIGPNGAGKTTLFNLLTGVYLPSKGTISLDDKILNGRKPAKIASLGLGRTFQNIRLFKNMTVLDNVLVGLSNHHLSHSIASFLRLPKYYHSEKALRKKALELLEIFGLKAYQDALAKNLPYGKQRRLEIVRALATEPKILFLDEPAAGMNPQETAELTQLISQIKNDFDITIMLIEHDMNLVMQVTERIYVLEYGRLIAHGTPEEIKNNKRVIEAYLGSEV |
14 | Streptococcus_phage(84.62%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1811407 : 1818611
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP019832|1811407:1818611|DBSCAN-SWA ACTAGTAACCCCAAGCTGATAAACCTTGAGCACGATAAGCTTTAATAGCTGAATTAACTTGATCCTGAACTGTAGCTGTTGAACCCCAACCTGGCATCGTTTGGAAAAGTCCTGAAGCTCCTGAGGCATTAGCAACATTAGGATTACCATTTGATTCACGGGCAATAATATGTTCCCAAGTAGACTGAGGGACTCCTGTTGCAGCAGCCATTTGTGCTGCAGCTGCTGAGCCAATAGCCCCTGCAGTATTTCCATTACTCAATACTTGGCCACTCGTCTGGTGTTGAGCAGGTCTATAAGTTGTCTCAGTAACAGCATAAGCTTGTTGTGCCTGACTGGTAGCAGGGGTGTTTTCTGTTACAACTGCTTGTTCTACAGCTGCCTCTTCACTCGCAGTAACTTGTTGCTGAGAATTAGCTTCTGTAGATTGAGAACTTGATTTTGGGGCTTCATTAGATGCCTGAGAAGGTTTTGGAGCCTGTTTTACATCTTCTACTTTTGATTTAGATGTCGCCTTAGTCATTTTTGATTTTTTGGCTACGCGAACTTTATCTGCTTTTGACAAAGATTCAGTAGTAACTTGTGAACTTTTAAAGATGACCGTTACAGCCAAAATACATGAAAAAAGGGCTACTAAAGTGATAGCTCCATAAGCTAAATGTTGTTTTTTTACATTCAATTTTGATAATTTTCTTCTTTTATTCATGTTACCTATATTATACTTTATTTGTTACCTTGCAATTGAATAGATGTTAAAAATATTACAAAGAGATTTAATTTTAAGTAAATCTCTTTGTTTTATCAACTTTTATTAATACCAGCCGTTACTATTCCAAAATGATAGCGCTGCCGACCAAGATCCGTAACGAGAAGCCACATAATTGTCCGCTACTTTTTCTTGATTTTCAGGAGATAAGTCGCCATTTAGGTAAGATTGAGACAGTTGATATCTTCCATAATATTGTCCATTCTGTGCAGTATAACTACCATTTGATTCACGACGAGCTATTTCTTCTTTTGCAGCTGAATCACTTGAACTCAAATTTGATGAAGAATTCATTGAATTTTCAATTGTTGGTTGAGATTTTGCTTCTGCTTGACTAGTTGTAGAATTATCCAATTTTAAAACATCACCTATACTGATGACATCAGCGTTACTGATACTATTGAGAGACACTAACTCTTGTACCGTAGTTTTATGATTTTTAGCAATAGCTGATAAGGTATCACCTGATTTCACGGTATAAGATGCTGCGCTTACTGAAAGTGGTAAAGCTAATGAAGCACCCACTAAAAGACCTGCCACTCCTAATTTAAATGGTTTTGATTTTTTAACCGAGGTTATTGACATAATATATGCTCTCTTTCATTAATTGATACGCGTACTATCATACCTTGTAAATATTACTAATTGTTTTGCCTTAGATGAAATTTATTACAAATAAATTGTAAATTAATAAAGAAAAGGCCTCCAAAAAACAATTTTTAGTTTTCTTTAAGTAAAGTTGTTGAGCTTTTCACATTATATAAATGAAAAGGCTAAGACCATAAACTGACCTTAACCTTTTAATTTTTTAATAGAAACAAACTCAAACCCAATAATAACATAAGTAATATACTAAAAGTATCCCGAACAGTCCACTTCAATAAACGGTACTTACTACGATTGGCTCCGCCTTGATAACCTCTTGCTTCCATAGCAATTGCCAACGCATCTGCTCTTTTAAAACTAGAAGCAAATAATGGAATCAAAATAGGGATAATGGACTTAACCTTATGAATTAGGTTTTCCTCTCCAAAATCAACTCCACGAGCTCTTTGAGCATTCATGATACGTGTTGTATCATCCATTAAAGTAGGAACGAAACGTAAGCTAAGGGATAACATCAAACCAATCTCGTGTGCTGGTACTCTCAGTACTTCCAATGGTTTTAACAAAGATTCAACAGCATCTGCTAAACTTAACGGAGTAGTAGTTAAGGTAAGTAATGTCGAAAAGAAGATAATTAAAACAAATCTCATAAAAATAAGTGCTGCTTGTTGTAACCCAAGGCTAGTGATGCTAAAAATCCAAAACGAGAAGATAACCTGCCCGCCTTGTGCAAACAGCATCTGGAACAGGGTTGTAAATAAAATAATACCAACCATCGGTTTAATACCATTGAAAAAATAGGAAAATTTTATCTGAGATAAACCCACAATAACCAACGTAAAAATGAATACGATCACATTTGTCACTACATTATTTGCCCAAAAAACAATAATGATAAAAAGCAACATGGCTAGTAACTTACTTCGAGGATCTAATTTATGAATGAGAGAATTACCTGGTATGTAACGTCCCAAAATCAATTTATCCATGCTTAATAGCCTCCACAAATTCGTTAATAGTAATTGGTAAACTAGGTAAATTTAATCCCTTATGAGATAGTCTTTGAGCAAACTTGGTGATTTTGGGAACTCCTAATTGTTTACTTTCTAGAAGTTCTACTTCTTGAAAAATCTGTTTTGGTTGTCCTGATAGGGTTACTTTCCCTGCTTCTAAAACATACACATAGTCAGTATAATCCGCTACATCGTCCATTAAGTGAGTCACTAAGACGATGGTCATTCCTTTTTTATGAAGATTTTTAAAAAGAGTCATTAATTCTTTTCTTCCCTTAGGATCAAGTCCAGCAGTTGGCTCATCTAGTACTAGTACTTTGGGTTCCATCGCTAAAATACCAGCTATAGCAACCCGCCTCATCTGCCCTCCAGAAAGTTCAAATGGATTTTTATCGAATAAATCCTCACTAATACCAACTAACCTTAATTTTTCTTCAGCCAGCCTTTCAGCTTCAATCTGAGAAATACCAAAATTTTGTGGTCCAAAAGCAACATCCTTTAAAACTGTCTCTTCAAAAAGCTGACTTTCTGGAAATTGAAAAACTAAACCAACTTTTTGCCTTATAAATTTGATTTCTTTGTTCTTGTCCCCTGCTTTAATAGAAAAATCATCGACAATTACCTCACCTTTTGTAGGAATATGTAAACCATTCAAAAGTTGCATAATAGTTGATTTTCCAGAACCTGTGTGCCCAATGAACGCGGTATAGGAAGCATCTTCAATTTTCAGATTGACGTCAAAAAGGGCACGCCCTTCAAAAGGAGTGCCGGCTTGATAGGTATAACTTACATTTTTAAATTCAATTCCCATAATTGTTCTTCTAATTCCTTCTCTGTAAGATACTCTGTCCCTATATCAAGACCATTAGCAGCCAGTGCTGCCATTAACCTACTTGTAAAGGGAACATCTAAACCTAAACTAATCAAATGATTTCCACGACCAAATAACGCTTTTGGAGTGGATGTTGACTCAACTTTACCATTTTTCATAACGATGACACGATCACTCAATGCAACTTCATCTAAGTCATGTGTAATTGAAATAACAGTAAGATTATATTTTTGACGAATAGCTCGTATCGTTCTTATCAGTTCCAATCGTCCCTCAGGATCAAGCATACTAGTCGCCTCATCCAAGATGATAACTTGTGGACGCATAGCTACAGCTCCTGCAATGGCTACACGCTGCTTTTGTCCTCCAGATAAACGTGCAGGCTCCCTCATTTTAAATTCAGACATTCCTACCAAATCAAGTGCTTGGTCCACTCTTTCTTTCATGTCTTTCAAAGAAATACCTTTATTTTCCAAACCAAAGGCAACGTCATCTTCAACAGTTGCCCCTACAAATTGGTTATCTGGATTTTGAAATACCATGCCAATCTTGTGACGTAACTCCCAGACATTATCTTCGGTTAACTCTTGTCCATCAATGATAATCTGGCCAGACTCCGCCTCTAAAAGCCCATCTATTAAACGAACAGTAGTGGATTTCCCAGAACCATTATGACCAATAATAGATAGCCATTCTCCTTGTTTCACATGAAACGATACATTCTCCAATTGATAATGTGTTTGATTACTATCATATTTAAAAAAGAGATTATTAACGGTAATAATATTTGTCATTATTTAAAAGTATCCTTAAATAAGAAGCCTGCACCTTTAAAATAGTCGTAGCCTGAATACAAGGTAAAGAATAAAGCAATGTATAACATGATGTTACCAAGTGTCATCCAATGTACTAACAAAAAAATAACTGCAAACATTTGAGTAGCCGTCTTTATTTTCCCTGGCATAGCTGCCGCAAGTACTGTTCCACCTGTTTCAACTAAAAGTAAACGCAAACCTGTAACTGCTAGCTCTCTACAAATGATAATAGCTGAAACCCAAGCCGGTGCTAAGTCTAGTCCAACTAACATAATAAAAGCACTCATAACTAGCATTTTATCAGCTAATGGATCTGCAAATTTCCCAAAATTTGTTACTACTTGCCATTTACGTGCTAGATAACCGTCTAGGTAATCGGTCAAGCTTGCAATAGCAAATACAATAGCTGCAACAATATGCCAAGTTGTACTTGTTGTTACTGAAGTTAATACTATAAATAACGGAATCATTAAAATTCTGACTACAGTTAATAGATTCGGAATATTTTCTTTCTTCACCATAAATTCTCCTTTTGGAAACATAGTATTCCTATATTATGTTATTTCAAAACTAGTAAAAGACTTTTGACATACCAACTTTATAGATGTCTAAGCTTCCTTATTATATCAAAATTTCAGATTATTTACGAAGATTTTGGAAAAATAACGAAGTCAGATGTGTCAGCGTTATCTAAGAAATCCTTACCAATCGTAATGACATCTTCCAAGTCTAATTCTTCAACGATAGATGGCAAATCCAAATACATCGTTTTTCCATCATATAAATAGGTGACGAATTGCATTGCGAGATTTTCAATAGAATCTAAGCCCCTTAAAAAATCGCCATAGAGCTCTCTCTTAACGTTTTGTAAGTGGCTTTCGGTAAGATCAGATGATTGCAAAGCATTTTTTAGCAATAACCTCAACTGAGTTGAAAAAGCAATTGGCTCTGTCGTATCTAAAGAAATA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP019832|1811407:1818611|1815416_1815980_-|AUP34011.1|DBSCAN-SWA MFPKGEFMVKKENIPNLLTVVRILMIPLFIVLTSVTTSTTWHIVAAIVFAIASLTDYLDGYLARKWQVVTNFGKFADPLADKMLVMSAFIMLVGLDLAPAWVSAIIICRELAVTGLRLLLVETGGTVLAAAMPGKIKTATQMFAVIFLLVHWMTLGNIMLYIALFFTLYSGYDYFKGAGFLFKDTFK >CP019832|1811407:1818611|1812972_1813767_-|AUP34008.1|DBSCAN-SWA MDKLILGRYIPGNSLIHKLDPRSKLLAMLLFIIIVFWANNVVTNVIVFIFTLVIVGLSQIKFSYFFNGIKPMVGIILFTTLFQMLFAQGGQVIFSFWIFSITSLGLQQAALIFMRFVLIIFFSTLLTLTTTPLSLADAVESLLKPLEVLRVPAHEIGLMLSLSLRFVPTLMDDTTRIMNAQRARGVDFGEENLIHKVKSIIPILIPLFASSFKRADALAIAMEARGYQGGANRSKYRLLKWTVRDTFSILLMLLLGLSLFLLKN >CP019832|1811407:1818611|1813759_1814602_-|AUP34009.1|DBSCAN-SWA MGIEFKNVSYTYQAGTPFEGRALFDVNLKIEDASYTAFIGHTGSGKSTIMQLLNGLHIPTKGEVIVDDFSIKAGDKNKEIKFIRQKVGLVFQFPESQLFEETVLKDVAFGPQNFGISQIEAERLAEEKLRLVGISEDLFDKNPFELSGGQMRRVAIAGILAMEPKVLVLDEPTAGLDPKGRKELMTLFKNLHKKGMTIVLVTHLMDDVADYTDYVYVLEAGKVTLSGQPKQIFQEVELLESKQLGVPKITKFAQRLSHKGLNLPSLPITINEFVEAIKHG >CP019832|1811407:1818611|1816081_1817365_-|AUP34012.1|DBSCAN-SWA MTVNKITYQNLQEEVYKLTLESGLNVYLIPKPSFKETVGVLTANFGSLHTRYTRNGCVEHYPAGIAHFLEHKLFELDKGQDAATQFTKYGAESNAFTTFDKTSFYFSTISHITNCLDILLDFVLTTNFTEESITKEKDIIKQEIEMYQDDPEYRLYQGVLSNLYPNSPLAFDIAGDYQSISQITLTDLQENHKDFYQLSNMNLVLVGQFSPQEIITYLQKKSHFTSYSQNIDRDSISLEPVIKNNSCHMTVTKPKLAIGYRKSNHMIHGSYLKEKIGLQLFFAMLLGWTSTINQDWYESGQIDDSFDIEIEVHPDFECVIISLDTTEPIAFSTQLRLLLKNALQSSDLTESHLQNVKRELYGDFLRGLDSIENLAMQFVTYLYDGKTMYLDLPSIVEELDLEDVITIGKDFLDNADTSDFVIFPKSS >CP019832|1811407:1818611|1817366_1818611_-|AUP34013.1|DBSCAN-SWA MKIVEGVSLHLIKNQQFKTNHLTFRFSGDFNNKTVARRSLVAQMLVTANAKYPKVQEFREKLASLYGASLSTKISTKGLVHIVDIDIVFVKNTFTLEQENIVEQIITFLEDMLFSPLISLEQYQTSIFDTEKKNLIQYLEADIEDNFYSSDLALKSLFYNNKTLRLPKYGTASLVESENSFTAYQEFQKMLKEDQLDIFVVGDFDDYRMIQAFNRMAFEPRHKVLAFDYTQTYENITRSQVEDKDVNQSIMQLAYHLPITYKDEDYFALIVFNGLFGAFAHSLLFTEIREKQGLAYTIGSQFNSFTGLFTIYAGIDKENRERFLKLINKQFNNIKMGRFSSTLLKQTKDILKMNYVLASDNPKVIVDHIYHEHYLDQFHTSALFIDKVDDVTKSDIVSVATKLKLQAFYFLEGN >CP019832|1811407:1818611|1812217_1812757_-|AUP34007.1|DBSCAN-SWA MSITSVKKSKPFKLGVAGLLVGASLALPLSVSAASYTVKSGDTLSAIAKNHKTTVQELVSLNSISNADVISIGDVLKLDNSTTSQAEAKSQPTIENSMNSSSNLSSSDSAAKEEIARRESNGSYTAQNGQYYGRYQLSQSYLNGDLSPENQEKVADNYVASRYGSWSAALSFWNSNGWY >CP019832|1811407:1818611|1814577_1815417_-|AUP34010.1|DBSCAN-SWA MTNIITVNNLFFKYDSNQTHYQLENVSFHVKQGEWLSIIGHNGSGKSTTVRLIDGLLEAESGQIIIDGQELTEDNVWELRHKIGMVFQNPDNQFVGATVEDDVAFGLENKGISLKDMKERVDQALDLVGMSEFKMREPARLSGGQKQRVAIAGAVAMRPQVIILDEATSMLDPEGRLELIRTIRAIRQKYNLTVISITHDLDEVALSDRVIVMKNGKVESTSTPKALFGRGNHLISLGLDVPFTSRLMAALAANGLDIGTEYLTEKELEEQLWELNLKM >CP019832|1811407:1818611|1811407_1812112_-|AUP34006.1|DBSCAN-SWA MNKRRKLSKLNVKKQHLAYGAITLVALFSCILAVTVIFKSSQVTTESLSKADKVRVAKKSKMTKATSKSKVEDVKQAPKPSQASNEAPKSSSQSTEANSQQQVTASEEAAVEQAVVTENTPATSQAQQAYAVTETTYRPAQHQTSGQVLSNGNTAGAIGSAAAAQMAAATGVPQSTWEHIIARESNGNPNVANASGASGLFQTMPGWGSTATVQDQVNSAIKAYRAQGLSAWGY |
8 | uncultured_Caudovirales_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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