Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP013847 | Clostridium botulinum strain Af650 chromosome, complete genome | 5 crisprs | DEDDh,csa3,DinG,WYL,cas3 | 2 | 9 | 9 | 3 |
| CP013848 | Clostridium botulinum strain Af650 plasmid pRSJ14_1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. CP013847
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP013847_1 | 1179566-1179917 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of CP013847_1
|
5 spacers
spacers of CP013847_1
>1.1|1179594|39|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT CAAGGGTATTTAAAAGCAATATAGAAGTAATATTATAGA >1.2|1179661|36|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT ATATGATTTCTTAGTAGATATGCAAACGGGAGATGC >1.3|1179725|36|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT TAATCAAGATTTAACCATTCTTTAGCTTCTCGTAGT >1.4|1179789|36|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT TTGGAAAGCTTACTAGATTTCTTACCTATATCGGGT >1.5|1179853|37|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT AAGTTAATTCTTTTGAATTTAATATCATCTGTTACAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP013847_1
The CRISPR arrays of CP013847_1 >merge|CP013847|1|1179566-1179917|CRISPRCasFinder,CRT TGAACATTAACATGAGATGTATTTAAATCAAGGGTATTTAAAAGCAATATAGAAGTAATATTATAGATGAACATTAACATGAGATGTATTTAAATATATGATTTCTTAGTAGATATGCAAACGGGAGATGCTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAATTAATCAAGATTTAACCATTCTTTAGCTTCTCGTAGTTGAACATTAACATAGGATGTATTTAAATTTGGAAAGCTTACTAGATTTCTTACCTATATCGGGTTGAACAATAACATGAGATGCATTTAAATAAGTTAATTCTTTTGAATTTAATATCATCTGTTACACTGAACAATAACATAAGATGTATTATTAA >CP013847|1|1|1179566-1179917|CRISPRCasFinder TGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT CAAGGGTATTTAAAAGCAATATAGAAGTAATATTATAGA TGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATATGATTTCTTAGTAGATATGCAAACGGGAGATGC TGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TAATCAAGATTTAACCATTCTTTAGCTTCTCGTAGT TGAACATTAACATAGGATGTATTTAAAT TTGGAAAGCTTACTAGATTTCTTACCTATATCGGGT TGAACAATAACATGAGATGCATTTAAAT AAGTTAATTCTTTTGAATTTAATATCATCTGTTACAC TGAACAATAACATAAGATGTATTATTAA >CP013847|1|1|1179566-1179917|CRT TGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT CAAGGGTATTTAAAAGCAATATAGAAGTAATATTATAGA TGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATATGATTTCTTAGTAGATATGCAAACGGGAGATGC TGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TAATCAAGATTTAACCATTCTTTAGCTTCTCGTAGT TGAACATTAACATAGGATGTATTTAAAT TTGGAAAGCTTACTAGATTTCTTACCTATATCGGGT TGAACAATAACATGAGATGCATTTAAAT AAGTTAATTCTTTTGAATTTAATATCATCTGTTACAC TGAACAATAACATAAGATGTATTATTAA
>CP013847.1|AUN06166.1|1177933_1178788_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MFIYDTLENIGIETLHETFLNAFSDYQVKMDLPLFKFQHMLQRRGYVPKVSIGAFNDDILVGFVLNGVRNWDGKLTAYDTGTGIIEAYRKQGITSNMLLNVRRLFQQMGVEQYLLEVIQSNTSALQLYKKQGFKILRDFECFHLDKNKYNPITTYKVEHVDMINSNDWRELTEFWDFAPSWQNSIDSINAVSDSFIYSIVRFDDNIVGYGVIDKKTGDIPQIAVNKNYRCKGIARSILTDLIKNTESYNINVINVDGRSKSMKDFLLKLGFECGVSQYEMILKL >CP013847.1|AUN06165.1|1177564_1177888_+|competence-protein-TfoX MASNIEFVEYVCDQISGAGDITYKKMFGDYGVYCNEKIIGLICDNQFFLKITKAGKDLLHEAIEAPAYKGAKPSFLIESLDNREYLAKIVSATYKELPMPKPKKTKK >CP013847.1|AUN06164.1|1176617_1177463_+|glyoxal-reductase MQDIKSYTILNNGVKMPWLGFGTYKVENGDTVIQSVKEALKIGYGHIDTASYYGNEEGVGTAIKESRIPREDIFLVSKVWNSEQGYDKTLKSFEDSIKKLGTDYLDLYLIHWPQPLSKETWKALEKLYKEGRVKAIGVSNFLVDHLKWLLEDAEIMPMVNQVEFHPQLIQKDLIEFCSKNNIQLEAWSPLMRGKVFEIQLLQDIARKYGKTISQIVLRWDLQMGVVTIPKSINPSRIKENADIFDFEISKEDMDKIQQLDKGLRVGSDPNKVYPCQSISNK >CP013847.1|AUN06163.1|1176296_1176500_+|hypothetical-protein MYGKKEIEQFESRRDEFSDYMKGIFNETKHYHDGKWLLIRIQNDKYINELIEMIKIKKKSKKNILHK >CP013847.1|AUN06162.1|1175639_1176233_+|hypothetical-protein MFRFNTKEAKWFFEPKNYLIKEDKVEIITEPNTDFWQRTYYGFRNDNAHVLYVTTDEKYFSFTVRTDFNSTALFDQCGLAIYQNSENWAKACIEFHDNNTSWLGSVVTNHGYSDWATMDIGSSVKSMWYRLSRRGSDYCFENSFDGVNFKQMRIFHLFEGAKEINFGLLACSPSKNSFKATFTEMKITDCLWEEHKA >CP013847.1|AUN06161.1|1175043_1175487_+|N-acetyltransferase MEIKIIKDNKRSFLDLLLLADEQESMIDKYLNRGEMFALYDGDLKSICVVTNEEEGIYEIKNLATYEKYQGQGYGSRLIKFIFEYYKDNCKTMLVGTGDSPLTIPFYKHCGFKVSHRIKNFFTDNYDHPIYESGIQLIDMVYLKKHF >CP013847.1|AUN06160.1|1174372_1174837_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MNIRMYQSEDCREIVELFYNTVHSINSRDYNNAQLDVWASKEIDIDSWDKSFSQHYSIVAEESDIIIGFGDLDATGYLDTLYVHKDYQGIGVATTIANELENYAQENHISIVTTNASITAKSFFKRQGYEVVKEQFIERNGQFLKNFIMKKILG >CP013847.1|AUN06159.1|1172889_1173927_-|transcriptional-regulator MIKENLNLDKVIDFKKWIKLQESLALVTKAAIIIVDYKGNPVTEHSRCNRFCKAVRSNPNLVKYCQKCDSRGGLEAVRLNKPYIYLCHYNIVDIAIPIIIDGKYIGAIMAGQIKLSDNKDSDFLEQIVITPKNSMARHALEEFKEYYDEIPVLSLKEVQEIANMLFSLCNYLVEEALNKNLISEIYQKTVTPKSEIDLNILTGYTMKNIENAKKEMSNVLLDSYVKENLSSDSLDVSVSNTLKPAIEYIYNHKSENITAKKLAEVCHISPSYFSRLFSKETGKSFSSFISNLKIDWAKSLLEETDMHINEISDELGFNETGYFIKIFKKYEGVTPFVYRKYCKKN >CP013847.1|AUN06158.1|1171238_1172369_-|glycerol-dehydrogenase MRKAFICPTKYVQGEDEILNLGYFVKSFGESALLIAHKDDIERVKDKLDSTAKKFGITFVESAFCGECSREEVARLQEIAKNNKCACTIGLGGGKAIDTAKCVAKGNSLIIVPTIAATDAPTSHSAVLYTPDGAFDDYAYFWQSPTVILIDTTVIANAPTRFLVSGMGDALSTYFEARATSNSFSNVNAGLPCGVREGLCAPAKGTNTALTLAKACYKTLLEDGVKAKIASDCNLVTQALENIIETNILLSGLGFESAGLAAAHAIHDGLTILEGTHKYFHGEKVAFGTIAQLVLENAPKEEIDEVINFCLEIGLPVCLEDIGVDSITDEELMEVAKKSCIEEESIHSMPFKVTPEAVAAAIITADTLGKKYKSNK >CP013847.1|AUN06157.1|1169467_1171228_-|dihydroxyacetone-kinase MKKIINRPETVVMEMCNGIAMAHPELEFVRKYKVMKKKNINKNKVSLISGGGSGHEPAHAGFIGKGMLDAAVCGDIFASPSQIQVYKAIKATASEKGTLLIIKNYSGDIMNFKNAAHLASEDGIKVDYVKVDDDIAVEDSLYTVGRRGVAGTVLVHKIAGAAAELGFSLEKVKSIAEKAVSNVRSLGFAFSSCTVPAKRTPTFQLAEDEMEFGVGIHGEPGIVREKVATADELAKKIVDSILKDMKIDGSNNEEVALLINGFGATPLQELYLFNNSVTAELAKKNIKINRTFVGNYMTSIDMEGASVSIMKLDDELKELLSKESDTPAFKVSGPVESVEYISLEDNNDIENEVSFDLETCDCHSEIKDKKITLDNMIYIIDKMSEVIIANEVHFCELDSHAGDGDFGMSVAKGFKQLKREWKHLLKEDNMNIGKFLNECSLVIMEHCGGASGPIWGSAFRAAGKQVGDKKELSVSDFAEMMQAAVKGIQSTGERSFGRGAVVGDKTLIDALVPCADLWSESANNNTSIHEAFQKGAAAAVKGAKMTEEIVARMGRAGTVGERSIGYPDAGAYGLGVIFTEISNSLK >CP013847.1|AUN06167.1|1180530_1181499_+|hypothetical-protein MKKKTTILSIFLAVFMALAMNVGQVKAAATGQDIVNYAKQFQGVPYVWGGTSPSGFDCSGFVQYVYRNAAGIELPRDTYGQITKGTPVSQSNLQPGDLVFPHTGHVGIYVGNGQIIHSPQTGDVVKISPIWKFYAARRIINKPQSYINIDGGGTLACNGTSGMNLIIRDYSSDVVRAFGWVDSDPSCSWAFDVTPPNSNYTKLYKGTNKVINLRNNGSPFTPGGNYKLTVKGYDKNGKVVCERSINLKVPNGIANSSAKPIFPGSYTVTAQTVAREYPRSNGAVTGNLKKGQEVGVFAEYGNWYLVARGTPQWVEKQYLTNK >CP013847.1|AUN06168.1|1182503_1183511_-|adenosine-deaminase MNFKKLPKIELHCHLDGSLRVDTILDIAKKDNIPLPSYNKKELINYVSIMDDCNSLDEYLNKFFIPNKVMQTKENLKRIAFELLEDVAADNVKYIEVRFAPLLHVEKGLNIEEIIESVLEGIKEAEKLYDIKGNLILGCMRNMDIPSAFEVVKKGSKFIGKGVVAIDLCAGEEPHFPGKYIEVLKLAKECGYRITIHAGEAGVGENVLEAITLLNAERIGHGIYIKNCAEAYKLVKEKNIPLEVCPTSNLHTKAFESYETHPFMDFLKDGIKVTINTDNMTVSNTTITKELEMLNKFCGLSIEDYKILYLNAVEASFASPETKEILKSYANEITA >CP013847.1|AUN06169.1|1184407_1186576_+|phage-infection-protein MNRFKNIIKVYKRDIKSLNKNFIAIIIILGVCVLPSLYAWVNIKACWDPYENTSTVPIAVINNDKGTDFGGKELNVGNEMVKKLKSNDKIGWKFTNKKEADMGVIDGTYYASIEIPKDFSADIVSVLSDNPKHPEIIYKVDTKENPVAAKITGMAKNTLINEITTTFITTVNKTVFSSINEIGRNLEKNKNEIIKLKESIISMNRNMDLILAGLESVNTNSKNLNEYLSVVRTTFPEITKGLENINSKSSNTNETINQTNNIFNNSLNNINVILKQAISTNNRVQSVLDNLIVLNNESSNNEANSSIANLIMDIDSANKNIDSMIEFLEKINNTKPNTEVSKFIVSLNNVKGALNEEKQKLIKIQEIASNSSKVNENSINELKRNISNTNKQIESVMNVFNSNTRQELSTIINNFKNSIQDASKLIKAGNGLNTQIENLLATSTKGADLSAKLSKELIDKLTEYKGIIGQLSKKLELVSNDDLIQIISVLQNNPMLMSQTAAYPFNIKEEAVYTIPNYGSAMTPVYSVLALWVGTLILVSLLKTEVVDFEGSENITIRQKYFGKMLTFITLAAMQGFIVAVGNKAILGVYTVSFPLMLAFSVVSSIVFAIITYTLVAIFGKFGNALAIVFMILQLAGSGGTYPIQVDPLIFRILQPFFPFTYSIGGFREAIGGPLVSSVILDFIMLILMGGIFVLIGFFLKSPLHHKISKFDEDFKASGISE >CP013847.1|AUN06170.1|1186601_1188761_+|phage-infection-protein MKKVFRIFSRDLKNIVKHPAAIIVVLGLCFIPSLYAWINIEACWDPYANTGNLPIAIVNKDEGMMVRGKYTNVGNGIIESLKGNKKMGWVFVDEWQANYGLNEGKYYALIEIPSNFTSGLASLKTTDPQKPNIIYRVNEKSNAIATKITNAAKGSLAKEIQTNFVYTVNKEAFKLLNNTGGQLEKNKSKILGIKSTLELGNKSIGEVKNIIDDASKDSESLKQYFNDTKDKLPLITDQINNLQKATEASKNLVNETERDLNGIAKNINNDMIYRESTNSKINSILTNLKEYNNVSNNSEMIKLVDEASKLCDSINSNIDGTIKSLEIVNILKPNKIIEELINSLKNLQEKVNGEKNKLTELKNKISTSNNNKQNINQVVESILLLNDEINKNMRNTSNIFYNQTTMIIENTAKGLNNRLDTANDILDTTKLVIPQLKALGDFGVGTSDAALKDGKKINNKLAEFKKTINKLEEKTSSLTEDNLDKIINLTQKNPEQMASFISSPINIKEEEIYNTGIFGVGLTPFYTVLAIWVGVLLMSSLISVEAEEFEGEKKLTHLQVYFGKLLLFLSIAIIQGVIVTLGDVFILGIKPASMGLLMVFTIVTAITFTFIIYTLVSIFGNLGKAIAVVIMVFQIAGAGGIYPIQTNPKIFGVLQPLWPFTYAIAGFREAIAGPVRAAVIKNLGALFIFSIGSLLLVVLKKPLHKVTEYMNDKFIETGL >CP013847.1|AUN06171.1|1189173_1189476_-|hypothetical-protein MKKKPSVKSSANLLAIVSLIMSIIVILPILNWLFKITPWQKLEGLPLFFGLLISPFGFLLGILSIKIQSNKLGKIGVIINTLLFLLPFIYMTLGVLIFGP >CP013847.1|AUN06172.1|1189681_1190437_+|hypothetical-protein MPFTFSHPAIVLPLEKKWNKYFSFTALILGSMSPDFEYFIRFKPMATIGHGLIGFFLYNLPLCFILAYLFHKIIKKPLIAHGPKPIDSWYYNTALKPWRINSLTQVLVFSYSAIIGMITHVLWDSFTHKGGKFVILFEGLRKNIEILNYDIPVYKTLQHGSTLLGVIFIILYIYSKRNKHINWKTINRIPAINNKEKVSYFTTIFCTALIVLFVYISLLKVNFSIKNVGSFVVTFINGLFIGTIIASVKYR >CP013847.1|AUN06173.1|1190680_1192810_+|DNA-helicase-RecQ MLEDAKDLLKKHFGYNEFRKAQEKVIESIIKKEDTVAIMPTGAGKSICYQIPALIFEGVTVVISPLISLMKDQVDSLKEVGIEATYINSSLNNLEIEKRIFNAREGIYKLIYIAPERLESDSFVRSLNNLNIALVAVDEAHCVSQWGHDFRPSYTKISNFIRKLSKRPIVTAFTATATETVRRDILNSLELQNPKVFVTGFDRENLSFSVIKGEDKEKFIFAYLGNNIGKVGIIYTSTRKEAESLYNKINKKGYKVGVYHAGLNDEERKKTQEDFSFDNIEIIVATNAFGMGIDKSNVRFVIHHNIPKNMEAYYQEAGRAGRDGEESECILLFSPNDIRLQKYFIDESFLSPERKNNEYNKLRAMVDYCYTSKCLRSYILEYFGEDALEEKCNNCSTCNDNREEKDITLEAQKIFSCVYRMKERFGVNMVADVLRGSKNKKLLSLDLDGISTYGIMEEFTQKDIVALMNKLIADDYMVTTDDKFPVVRLRPKSYDVLKGKETVSIKVSKIEKKVKVDNELFEILKQLRKAISQEESVPPFMIFPDATLKELSEYMPTKEEDLLKIKGIGERKAKVYGERFIEAITEYMNEKGIDINNMDNYESTKSNKESKIKTHILSYNLYKEGKTIKEIAEERNLKAITIQEHLFKCLSEGMEVDLDNFIKKDYEKLILDTIKKVGGTKLKPVKDELPPEVDYMCIKSVWYKYKDII >CP013847.1|AUN06174.1|1192920_1193352_+|rubrerythrin-family-protein MDELDIINENQLGIAAENEKIKTDLEGQFRAETGEVGLYIAMARVAQRQGFPEIAEVLKVIAKEEAEHAARYAELNGKVSDCTKENLQKMLQGEIGSNKMKKSLAVKAKEENIDEVHDFIDEASRDEARHAKMLKGLLDRYFQ >CP013847.1|AUN06175.1|1193635_1194181_-|phosphodiesterase MKLFFMSDIHGSAYYLEKALHIFEEEKADYLIILGDELYHGARNPLPKGYDPKKVTEILNSYKDKIIAVRGNCESEVDQMVLNYPIMSDYSIVLYNGKRLFLTHGHIFNKDNMPNISDGDALIYGHTHIPLAEKINNIFVINPGSITFPKENTPHCYGILSDNLFKIKTLEGNTFKEISLI >CP013847.1|AUN06176.1|1194816_1195200_+|two-component-system-response-regulator MSSSQKNILVIDDSASIRSFVRNILEKANYKVYEACDGEEGIEVYKKCGNIDLVMTDIYMPKKSGLEVVVELQNKYKGTQIIVFSDGGKENFTNDSGVCEALGAAYFIRKDLIKDKLLDLVNIIFSK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP013847_2 | 2456513-2456805 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of CP013847_2
|
4 spacers
spacers of CP013847_2
>2.1|2456543|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT TACTTGTGATTTTAAAATAAAGAACATTAGGTAGT >2.2|2456608|37|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGTTAAGTCAGTAATGATACCTTACTTAGAAGATTA >2.3|2456675|36|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCAAGTATCGGGAATCTATAGTTAAGCCCTTCTATT >2.4|2456741|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAAAACAATAAGTAATTCATAATTCAAAAATGAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP013847_2
The CRISPR arrays of CP013847_2 >merge|CP013847|2|2456513-2456805|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTAAATATATCTTATGTTAATGTTTAACTACTTGTGATTTTAAAATAAAGAACATTAGGTAGTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACAGGTTAAGTCAGTAATGATACCTTACTTAGAAGATTAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACTCAAGTATCGGGAATCTATAGTTAAGCCCTTCTATTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACCAAAACAATAAGTAATTCATAATTCAAAAATGAGGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC >CP013847|2|2|2456513-2456805|CRISPRCasFinder GTTTAAATATATCTTATGTTAATGTTTAAC TACTTGTGATTTTAAAATAAAGAACATTAGGTAGT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC AGGTTAAGTCAGTAATGATACCTTACTTAGAAGATTA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TCAAGTATCGGGAATCTATAGTTAAGCCCTTCTATT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC CAAAACAATAAGTAATTCATAATTCAAAAATGAGG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC >CP013847|2|2|2456513-2456805|CRT GTTTAAATATATCTTATGTTAATGTTTAAC TACTTGTGATTTTAAAATAAAGAACATTAGGTAGT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC AGGTTAAGTCAGTAATGATACCTTACTTAGAAGATTA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TCAAGTATCGGGAATCTATAGTTAAGCCCTTCTATT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC CAAAACAATAAGTAATTCATAATTCAAAAATGAGG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC >CP013847|2|1|2456578-2456805|PILER-CR ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC AGGTTAAGTCAGTAATGATACCTTACTTAGAAGATTA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TCAAGTATCGGGAATCTATAGTTAAGCCCTTCTATT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC CAAAACAATAAGTAATTCATAATTCAAAAATGAGG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
>CP013847.1|AUN07299.1|2455700_2455892_-|hypothetical-protein MGKTLRFEIVSNIIKNKEVENDLNYNTYAYFYDNVRKAMYGKEYCIKKNKNTLIHKPILKFYI >CP013847.1|AUN07298.1|2455253_2455547_-|hypothetical-protein MSFFTLNILIGAMAFIINKINNISQNIDSFEAFNDIQKSLEEIDNEKVTNFVNGLINASMSNPSIGYFFMFLVYMTPVLNLLLLIKGIVNYFNRAAG >CP013847.1|AUN07297.1|2454407_2455205_-|MerR-family-transcriptional-regulator MRYSITDLAEILGCTTSAIHYFEKEHLIKVEKGKNGHRYYNVVDVFRLLSYTKYRSMEIPMKTIIAQFGGEENNYKLIEEREAMYQLEALKRAQYYMNLADAIGEHLVSIRRIEELLNKYEFAKSPEVTIMCDDECGWLSKKRSSQRIIHEWVKAMPTVQLGVFDSRMGISNFGYLVKTKKREELELPLGLYTKQLKSTSCIHTIVMADEDFTQHPQKVFKKASEFAIKKGLEIGEIAWGKILLVEVEKGAKLHPYIELWISIKI >CP013847.1|AUN07296.1|2452313_2454311_-|2-enoate-reductase MKDKYKVLYDPIKIGKLEIKNRYVLAPMGPGGMCNADGSFNKRGIEFYVERAKGGTGLIMTGVTMVENNIEKCALPSMPCPTINPLNFITTGNEMTERVHAYGSKIFLQLSAGFGRVSIPSIVGKVAVAPSKIPHRFLPGVTCRELTTEEVKEYVKAFGESAEIAKKAGFDGVEIHAVHEGYLLDQFAISFFNHRTDEYGGSLENRLRFACEVVQEIKKRCGQDFPVSLRYSIKSFIKDWCKGGLPDEEFEEKGRDIPEGIEAAKILVAAGYDALNGDVGSYDSWYWSHPPMYQKKGLYLPYNEILKKVVDVPIITAGRMEDPELSSDAILSGKTDMIALGRPLLADAEIPNKIFEDKYDKVRPCLSCQEGCMGRLQNFATVSCAVNPACGREKEYGLKKAEQIKKVLVVGGGVAGMEAARVAAIRGHKVTLIEKNGYLGGNIVPGGVPDFKDDDRALVKWYEGILKDLDVEIKLNVDASRENIKEFGADEVLLATGSSPRILTIEGADDVYSAEYVLMERKNVGEKVIVIGGGLVGCETALWLKQQGKEVTIVEMQNDILQVGGPLCHANHDMLNDLIKFNKINVKTGSYISKKTDKGFVLNTNGQESIINADSAVVAIGYLSEKDLYNEVRFDIPNARLIGDANKVQNIMYAIWSAYEVAKNI >CP013847.1|AUN07295.1|2451681_2452203_+|DUF4825-domain-containing-protein MKNKLKVLVPVIIILSLNLIGCGVNSEKKSKENIKNSSKVETYDLIKYKGTYVGDNSSVGSIIKNLPANEYSAGFSLQTTKEPYEITVNYKTNENLGEENYNKFWKDKKVEELLEKNSVVLLYLIPNAKIIKFNVENIGEESYKYDRKNLEQKYGNLKSLFKDNDSLNKFLNN >CP013847.1|AUN07294.1|2450490_2451381_-|AraC-family-transcriptional-regulator MNYRKDIENCIEYIEEHIKEPLTVNQITKEIGYSSYHFCRVFSFLKGMPLMEYVRKRKLSLSTIDLLEDQKIIDVAFKWGFETPSSFARAFRKEFGCSPTQYIKKMKSYYKSENNLILGKFMNDPYIVKKHGFKVAGYGIKTNAADSKYTKDVASFWSNYNGENLESKLYKILSPLKHGEVGLCIPCSDSGDVTYLLGVVVEDFSKVTSDMITVEVPKAQYAVFTTNPVNTVDSKDQREFAKIIKESWKYIFDEWFKNNDYEYDEEKLDFEFYDERCHLRSDTVMDIYVPIKKLGR >CP013847.1|AUN07293.1|2449743_2450484_-|SAM-dependent-methyltransferase MINYYGSLCTVMYELLHPHAPEDELQFYLQYAKKEMKILEPLCGSGRFLVPFLERSFNITGFDMSEEMLKELYKKAPKAKVFQSSIEEFSPKEKYDYIFITSGSFSLFLDEDIAFNVLVKMKEALAPKGKFVFAAETTANIIPDREEYLENCHVKTKEGYDIIFKSKSFYDKHKKILSTPSLYELYDGGNLLDKEEMDFRIKLYDFGELDKLILKAGFKGSHVFSDFNRRESIDKNSETFLYECYI >CP013847.1|AUN07292.1|2448233_2449640_+|MFS-transporter MSEKKQKHPIGLWLVNISIALQSYAAYAVVSILILFLTADVSKNGLGLSVPKAAAIIGLYQGINYMGSLVGGYITDKWLGIQKSLILGCFLTACGYLALFFAKPNIGSVWLGLIILIVAGAFFKAQISSLVGELYGKNELSKKDAAYSIFYMFINIGAFFGPIIAGLISDKWFAKVAADGEIAAYGYKYIFLMCTLIMIFIGIFIWIVSPKWLGEIGKYPASKDKKTSTESVSTKSTEKAKAQPLTQLEKNRIKAMIVMFVFVIIFWSAWDQTATSFSLLANKLVNRTIGGFTMPVPWLTSINAIFCVVLSPIIANIWLKLGNSKKGDLSVPTKMGLGMILTGIAFLTLILGISTLGGVLDGSKQMNILFIIVAYFLLTIGELCLSPIGMAMFNKLAPAKYGSLAMGAWYLSFFFSSIISGKLAGFTDTLGYTQIFGLISGIVIVFGVILILLRNGLLKLMSLDELDK >CP013847.1|AUN07291.1|2447549_2447903_+|peptidase-M24 MHLFINENKLNDEIKSNLKENGALFIHSYNKIYKEVKKFTNSDVVLVHPDRMNYALYNNIDKEVITEISSSNKLDTFPAEQGRFIRLSFKPISSFGEHATIVTCILLMENSFMIVTV >CP013847.1|AUN07290.1|2446624_2447239_-|galactoside-O-acetyltransferase MNQKDRMLAGLPYKACLDGLPEERMENKKKIYEYNHCFPDEHEKIHKLIRDILGEAGADVHIEAPFYCDYGKNIQVGDNFFANYNCTILDVGKVIIGNNVQFAPNVSLYTAGHPIHPDSRNSGYEYGIGITIGDNVWLGGNVVVNPGVHIGNNVVIGSGSVVTKDIPDNAIAIGNPCKVIREITEEDRKYYYKNYEFDVDDYKG >CP013847.1|AUN07300.1|2457346_2458282_-|phenazine-biosynthesis-protein-PhzF MRKFEYTLVDVFTNQVFGGNQLAVFKDAEKLSSEEMQSIARELNLSETTFVTDIGPNHKKLRIFTPKTELPMAGHPTIGTAFVLADEGAVETREGINKLIFEEGVGEIAVSIHVEGGRIRSIEMEQPMPVFGQVFEDIRTAAELLSLDIADIDTTSPIQTVSTGVPFLYIPLKSLDAISKIKLRLDTWEKFFSASEDTKHIFAFTRETLHAGSTIHSRMFAPAMGIAEDPATGGASGPLGAYLVEHGLVAHGLVAHGYDGKYMIINEQGIEMGRPSFINITVSKTYNNFSEIKIGGTCVKFGAGLIELPTL >CP013847.1|AUN07301.1|2458606_2460088_+|GntR-family-transcriptional-regulator MNIKIDKTSLITITQQLVHYFSDRIMSGFIKAGQKLPSIRSLAKELGISPMTIIKAYNNLEQNGLVTTIQGKGTYVNERNSTVKSNNITEKDSFQWQMSVPDYLSRSQFRYNPNLSYSNDYYNLSVASLNHKLLPTKTILKDSLGLIQNDIKLLSQYPPAQGDYEFRNIMSQYLRSKEIATSPENILVTSGSQQGISLIASTFIGPGDIVVMEAPTYPGAIDLFKCRGAVILTVPVDSEGMRTDILMNLCDKHSPKLIYTIPNFHNPTGYSMSSKRKAELLDIARYNDILIVEDDPWNEISYKREKIKTIKSIDTDGHVVYIKSLSKILGPSYRLAVIISESRLIAAKANHDLGTSVLIQKTIINFIQSNKITYYIESLNKQLVKRRDKVISLLKSHAPSGMKWAIPEGGINIWITLPKNFNVEKLLSYSITTKNISFLPGTICYPNEVEFNNLRICFTYLDEEFIEDTIIELCNLIKLLYTTKNITDYRPII >CP013847.1|AUN07302.1|2461137_2461590_+|hypothetical-protein MSKLNPEKLSVEFRDGVTNTEPILGGRYTLTHSDITAELFLTIGLTYAYDKIDAMRDEVLGEWIEKEKNCLFHVYLHVDGNNPIVTGVRNHIFRRELPLALEAIRYGDRKFFSFHPKLDNSPIIVHFISSYPSFNRIEKWGTFSDYFLKK >CP013847.1|AUN07303.1|2461671_2462118_-|transcriptional-regulator MSLGEKLLYLRKKAGLSQEDVAEKLSVSRQTVSKWETDQTVPELNKAKLLSELYNVSYDYLIGESHISGDVTGIEMIVDEIDWTGAWSKKYPILASYPGIKGINTYSEKISELYDSFKNDFGFNDTDTVLVLKDILYQKYKMGKKKTK >CP013847.1|AUN07304.1|2462285_2463332_-|esterase MEVNEVKKVIKVGSVILIILVIAGFFIIKNLTETKDDKLNMYVAANLQLYKILNPKSLNSKSIEETRGALNKQSTRWSNKPIPFSNIKNLHIKMNNEKIPVRIYTPEKGSNFPIIIYSHGGFWIGGNVDTIDGVCRKLSQNTKAIVISVNYRLAPENPFPAGLNDVYNVLQWTYKNGKSINGDEKHIAVVGDSAGGNLSAAVSSMSRDKNGPPITCQVLIYPSTNISELNSKSWSYFSNSFNVSTEDMEKYISIYAPKKEDRKDPYGSPLLSKDLSKLPDTLVVTAEIDPLRDEGEAYANKLKESGVKAEVTRYKGITHGFITMDKITNKADEALNQISLYIQKEFQK >CP013847.1|AUN07305.1|2463582_2464935_-|amidohydrolase MNQILIKNGYIITMDSSKKIFEKSDILVEDSKIITIGNVESELIKSSVEIIDANGKIIMPGLVNTHVHLSQQLARGLADDVDLLTWLRKRIWPYESNMDLEDSYISSLACCTELIRSGVTTFCEAGGQEVDGMGKAVEQAGLRGILCRSTMDCGDGLPLKWQETTEESLEKQVELLEKWNGKGDGRIKYWFGLRTIFNTTDKLITKTKELADKYKVGIHMHVAEIEEEVRYAEATRGETTVQHLAKLGVLDKNFLAVHTVWLTEQEIDLFKLHNVKVSHNPGAAMKVVLGFARIPEMLEKGINVSIGTDGAPSNNRMDMFDEMHLTSLIHKGRRLNPKVVPADEVLEMATMNGAKCALWEDEIGSLEVGKKADLIIINPKSIGSLPMHDPIGNIVYSMHSSDVESSMCNGKWLMKNKVLLTINEEDIIREVQERATALVKKAGIVLPKRF >CP013847.1|AUN07306.1|2465010_2466354_-|xanthine/uracil-permease MKNTKDTNLIVGIDEKISLRYAFFLGLQHVFAMDLYIVPIILAGILSLDAQNTAYFIQMSFIAAGIATLIQTGLCMRLPIMQGPSYIPIGALAAIGSKLGLQAMVGSLIPGSLFLMILGYPLRFLSKIISKFIPHIVGGTVIVIVGISLMPVAMTNIFTAPGNLKINCILALISSALLVSCMMIGRKSNKFGKAVRLTSVMISLIGGTIAASLLGVVDFTPVTKAAWFSFPKLLPFGKPVFDLKAILTMLFIYAVILVETSGTWFAVSAVTGSELTDEGLNRGAVGEGIGCFVGALFGGTPMTGYSTNAGIIAVTGVGSRMAIIAGGIILVALGMLPKLMNVIACIPSAVVSGVFAVVCVIIAMNGFKSIQHEEFDERNMLLIGLPILLALGTTVLPKDILNSLPSLANYIFSSGITVGVLAAVILNILLPKAPVEVSKSQEYEEAV >CP013847.1|AUN07307.1|2466791_2467691_+|hypothetical-protein MSNKRNLQSIRSFYLCILIFNIVYSSIFHLNNKGFNIKLFGDLTMRSVVLFTLNSILFLCVVIAVEKKININEEIKTQVSMKIRPLYLVDIFFITYILVCIFLLKNLDVILSSFVMEIIYIGILILTKKIMTLELTDRQLQWQNTCGYIDENCEKSSFLWRFKIWYSPHINVPFKNRWKDPSRLLYDLALVYGIFISKGTLFSLLLLILLFPDVLSWIEGLLGLQTSLTGMCTGITEHHSKNSHVIYHKVYVTDYKNKREITFYVDGPLFIHENSNMTVVHGTFSKRVLYVEGLNLDIR >CP013847.1|AUN07308.1|2468030_2469353_+|amino-acid-permease MLEKKYGLWTTVSMVIGIVIGSGVFFKADNILMASGGNVKTALLAWLVGAISMIFGALVFAECANRFERSNGIVDYAEGMLSEKFAYLIGWFNGIIYYPAIAAVLAWAAGNYTAILFNKDGNFVWIMAAIYMIGIYILNYISPILSGKFQIASTAIKLVPLMLIAILGTFQGLNNGILIENFSKVSTIGDSGSGFAAAVLGAAFAYEGWIIATTINGEIKDAKNTLPKALVFGSLVIVIIYILYFLGIVGMIPTETILKQGDNTVNVAARTVFGNFGASILTTFIIVSCLGTLNGLILGGSRSFYSLAIRGQGIKPEAFSKLDSKTNIPTNSTIANFILICIYLVVWYMNFKGIFPNKMFVDISELPIALIYGIYIIIYIAYMMKMKDLSFIKRFVIPSLALMGALIVVYGGLSKPSVIIDLGISVFVFLSGLLFYNKKK >CP013847.1|AUN07309.1|2469420_2470155_-|protein-kinase MVIKFFKRDTKYLPEQKIHGYTVLKILGEGRFGICYLVQSNNKQYILKQLKTKMLKKIGSKVIYEQEILKNINHNCIPKFIKTLQFKKFFGYVLEYKEGKTFEEIICEDEYVFKREEIYDICIQIIEILKYLHKSGIVHRDIRIPNTIYYKKKVNLVDFGLARWINNKRYIENVDFSYLGDFLLHLYYTSFQCKTFKGKPWYEELDLFSEEMNFLKRLLEIEKKYKNIEEVERDFLLLKSNYNK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP013847_3 | 2460584-2460808 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of CP013847_3
|
3 spacers
spacers of CP013847_3
>3.1|2460614|35|CP013847|PILER-CR,CRISPRCasFinder GCAGATACTCTTAAACAAATAAAATCATATCATAA >3.2|2460679|35|CP013847|PILER-CR,CRISPRCasFinder GAGGACAGATGGCGTGGTTCTTATGAGAATTTAGC >3.3|2460744|35|CP013847|PILER-CR,CRISPRCasFinder AGAAACCCTTGTGGATGTGGTTCTAATGTTTTTCA >3.4|2460605|44|CP013847|CRT ATGTTCAACGCAGATACTCTTAAACAAATAAAATCATATCATAA >3.5|2460670|44|CP013847|CRT ATGTTCAACGAGGACAGATGGCGTGGTTCTTATGAGAATTTAGC >3.6|2460735|44|CP013847|CRT TTGTTCAACAGAAACCCTTGTGGATGTGGTTCTAATGTTTTTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP013847_3
The CRISPR arrays of CP013847_3 >merge|CP013847|3|2460584-2460808|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTGAATACATCTCATGTTAATGTTCAACGCAGATACTCTTAAACAAATAAAATCATATCATAAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACGAGGACAGATGGCGTGGTTCTTATGAGAATTTAGCATTTAAATACATCTCATGTTATTGTTCAACAGAAACCCTTGTGGATGTGGTTCTAATGTTTTTCAATTTAAATACATCTCATCTTATTGTTCAAC >CP013847|3|2|2460584-2460808|PILER-CR ATTTGAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC GCAGATACTCTTAAACAAATAAAATCATATCATAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC GAGGACAGATGGCGTGGTTCTTATGAGAATTTAGC ATTTAAATACATCTCATGTTATTGTTCAAC AGAAACCCTTGTGGATGTGGTTCTAATGTTTTTCA ATTTAAATACATCTCATCTTATTGTTCAAC >CP013847|3|3|2460584-2460808|CRISPRCasFinder ATTTGAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC GCAGATACTCTTAAACAAATAAAATCATATCATAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC GAGGACAGATGGCGTGGTTCTTATGAGAATTTAGC ATTTAAATACATCTCATGTTATTGTTCAAC AGAAACCCTTGTGGATGTGGTTCTAATGTTTTTCA ATTTAAATACATCTCATCTTATTGTTCAAC >CP013847|3|3|2460584-2460799|CRT ATTTGAATACATCTCATGTTA ATGTTCAACGCAGATACTCTTAAACAAATAAAATCATATCATAA ATTTAAATACATCTCATGTTA ATGTTCAACGAGGACAGATGGCGTGGTTCTTATGAGAATTTAGC ATTTAAATACATCTCATGTTA TTGTTCAACAGAAACCCTTGTGGATGTGGTTCTAATGTTTTTCA ATTTAAATACATCTCATCTTA
>CP013847.1|AUN07301.1|2458606_2460088_+|GntR-family-transcriptional-regulator MNIKIDKTSLITITQQLVHYFSDRIMSGFIKAGQKLPSIRSLAKELGISPMTIIKAYNNLEQNGLVTTIQGKGTYVNERNSTVKSNNITEKDSFQWQMSVPDYLSRSQFRYNPNLSYSNDYYNLSVASLNHKLLPTKTILKDSLGLIQNDIKLLSQYPPAQGDYEFRNIMSQYLRSKEIATSPENILVTSGSQQGISLIASTFIGPGDIVVMEAPTYPGAIDLFKCRGAVILTVPVDSEGMRTDILMNLCDKHSPKLIYTIPNFHNPTGYSMSSKRKAELLDIARYNDILIVEDDPWNEISYKREKIKTIKSIDTDGHVVYIKSLSKILGPSYRLAVIISESRLIAAKANHDLGTSVLIQKTIINFIQSNKITYYIESLNKQLVKRRDKVISLLKSHAPSGMKWAIPEGGINIWITLPKNFNVEKLLSYSITTKNISFLPGTICYPNEVEFNNLRICFTYLDEEFIEDTIIELCNLIKLLYTTKNITDYRPII >CP013847.1|AUN07300.1|2457346_2458282_-|phenazine-biosynthesis-protein-PhzF MRKFEYTLVDVFTNQVFGGNQLAVFKDAEKLSSEEMQSIARELNLSETTFVTDIGPNHKKLRIFTPKTELPMAGHPTIGTAFVLADEGAVETREGINKLIFEEGVGEIAVSIHVEGGRIRSIEMEQPMPVFGQVFEDIRTAAELLSLDIADIDTTSPIQTVSTGVPFLYIPLKSLDAISKIKLRLDTWEKFFSASEDTKHIFAFTRETLHAGSTIHSRMFAPAMGIAEDPATGGASGPLGAYLVEHGLVAHGLVAHGYDGKYMIINEQGIEMGRPSFINITVSKTYNNFSEIKIGGTCVKFGAGLIELPTL >CP013847.1|AUN07299.1|2455700_2455892_-|hypothetical-protein MGKTLRFEIVSNIIKNKEVENDLNYNTYAYFYDNVRKAMYGKEYCIKKNKNTLIHKPILKFYI >CP013847.1|AUN07298.1|2455253_2455547_-|hypothetical-protein MSFFTLNILIGAMAFIINKINNISQNIDSFEAFNDIQKSLEEIDNEKVTNFVNGLINASMSNPSIGYFFMFLVYMTPVLNLLLLIKGIVNYFNRAAG >CP013847.1|AUN07297.1|2454407_2455205_-|MerR-family-transcriptional-regulator MRYSITDLAEILGCTTSAIHYFEKEHLIKVEKGKNGHRYYNVVDVFRLLSYTKYRSMEIPMKTIIAQFGGEENNYKLIEEREAMYQLEALKRAQYYMNLADAIGEHLVSIRRIEELLNKYEFAKSPEVTIMCDDECGWLSKKRSSQRIIHEWVKAMPTVQLGVFDSRMGISNFGYLVKTKKREELELPLGLYTKQLKSTSCIHTIVMADEDFTQHPQKVFKKASEFAIKKGLEIGEIAWGKILLVEVEKGAKLHPYIELWISIKI >CP013847.1|AUN07296.1|2452313_2454311_-|2-enoate-reductase MKDKYKVLYDPIKIGKLEIKNRYVLAPMGPGGMCNADGSFNKRGIEFYVERAKGGTGLIMTGVTMVENNIEKCALPSMPCPTINPLNFITTGNEMTERVHAYGSKIFLQLSAGFGRVSIPSIVGKVAVAPSKIPHRFLPGVTCRELTTEEVKEYVKAFGESAEIAKKAGFDGVEIHAVHEGYLLDQFAISFFNHRTDEYGGSLENRLRFACEVVQEIKKRCGQDFPVSLRYSIKSFIKDWCKGGLPDEEFEEKGRDIPEGIEAAKILVAAGYDALNGDVGSYDSWYWSHPPMYQKKGLYLPYNEILKKVVDVPIITAGRMEDPELSSDAILSGKTDMIALGRPLLADAEIPNKIFEDKYDKVRPCLSCQEGCMGRLQNFATVSCAVNPACGREKEYGLKKAEQIKKVLVVGGGVAGMEAARVAAIRGHKVTLIEKNGYLGGNIVPGGVPDFKDDDRALVKWYEGILKDLDVEIKLNVDASRENIKEFGADEVLLATGSSPRILTIEGADDVYSAEYVLMERKNVGEKVIVIGGGLVGCETALWLKQQGKEVTIVEMQNDILQVGGPLCHANHDMLNDLIKFNKINVKTGSYISKKTDKGFVLNTNGQESIINADSAVVAIGYLSEKDLYNEVRFDIPNARLIGDANKVQNIMYAIWSAYEVAKNI >CP013847.1|AUN07295.1|2451681_2452203_+|DUF4825-domain-containing-protein MKNKLKVLVPVIIILSLNLIGCGVNSEKKSKENIKNSSKVETYDLIKYKGTYVGDNSSVGSIIKNLPANEYSAGFSLQTTKEPYEITVNYKTNENLGEENYNKFWKDKKVEELLEKNSVVLLYLIPNAKIIKFNVENIGEESYKYDRKNLEQKYGNLKSLFKDNDSLNKFLNN >CP013847.1|AUN07294.1|2450490_2451381_-|AraC-family-transcriptional-regulator MNYRKDIENCIEYIEEHIKEPLTVNQITKEIGYSSYHFCRVFSFLKGMPLMEYVRKRKLSLSTIDLLEDQKIIDVAFKWGFETPSSFARAFRKEFGCSPTQYIKKMKSYYKSENNLILGKFMNDPYIVKKHGFKVAGYGIKTNAADSKYTKDVASFWSNYNGENLESKLYKILSPLKHGEVGLCIPCSDSGDVTYLLGVVVEDFSKVTSDMITVEVPKAQYAVFTTNPVNTVDSKDQREFAKIIKESWKYIFDEWFKNNDYEYDEEKLDFEFYDERCHLRSDTVMDIYVPIKKLGR >CP013847.1|AUN07293.1|2449743_2450484_-|SAM-dependent-methyltransferase MINYYGSLCTVMYELLHPHAPEDELQFYLQYAKKEMKILEPLCGSGRFLVPFLERSFNITGFDMSEEMLKELYKKAPKAKVFQSSIEEFSPKEKYDYIFITSGSFSLFLDEDIAFNVLVKMKEALAPKGKFVFAAETTANIIPDREEYLENCHVKTKEGYDIIFKSKSFYDKHKKILSTPSLYELYDGGNLLDKEEMDFRIKLYDFGELDKLILKAGFKGSHVFSDFNRRESIDKNSETFLYECYI >CP013847.1|AUN07292.1|2448233_2449640_+|MFS-transporter MSEKKQKHPIGLWLVNISIALQSYAAYAVVSILILFLTADVSKNGLGLSVPKAAAIIGLYQGINYMGSLVGGYITDKWLGIQKSLILGCFLTACGYLALFFAKPNIGSVWLGLIILIVAGAFFKAQISSLVGELYGKNELSKKDAAYSIFYMFINIGAFFGPIIAGLISDKWFAKVAADGEIAAYGYKYIFLMCTLIMIFIGIFIWIVSPKWLGEIGKYPASKDKKTSTESVSTKSTEKAKAQPLTQLEKNRIKAMIVMFVFVIIFWSAWDQTATSFSLLANKLVNRTIGGFTMPVPWLTSINAIFCVVLSPIIANIWLKLGNSKKGDLSVPTKMGLGMILTGIAFLTLILGISTLGGVLDGSKQMNILFIIVAYFLLTIGELCLSPIGMAMFNKLAPAKYGSLAMGAWYLSFFFSSIISGKLAGFTDTLGYTQIFGLISGIVIVFGVILILLRNGLLKLMSLDELDK >CP013847.1|AUN07302.1|2461137_2461590_+|hypothetical-protein MSKLNPEKLSVEFRDGVTNTEPILGGRYTLTHSDITAELFLTIGLTYAYDKIDAMRDEVLGEWIEKEKNCLFHVYLHVDGNNPIVTGVRNHIFRRELPLALEAIRYGDRKFFSFHPKLDNSPIIVHFISSYPSFNRIEKWGTFSDYFLKK >CP013847.1|AUN07303.1|2461671_2462118_-|transcriptional-regulator MSLGEKLLYLRKKAGLSQEDVAEKLSVSRQTVSKWETDQTVPELNKAKLLSELYNVSYDYLIGESHISGDVTGIEMIVDEIDWTGAWSKKYPILASYPGIKGINTYSEKISELYDSFKNDFGFNDTDTVLVLKDILYQKYKMGKKKTK >CP013847.1|AUN07304.1|2462285_2463332_-|esterase MEVNEVKKVIKVGSVILIILVIAGFFIIKNLTETKDDKLNMYVAANLQLYKILNPKSLNSKSIEETRGALNKQSTRWSNKPIPFSNIKNLHIKMNNEKIPVRIYTPEKGSNFPIIIYSHGGFWIGGNVDTIDGVCRKLSQNTKAIVISVNYRLAPENPFPAGLNDVYNVLQWTYKNGKSINGDEKHIAVVGDSAGGNLSAAVSSMSRDKNGPPITCQVLIYPSTNISELNSKSWSYFSNSFNVSTEDMEKYISIYAPKKEDRKDPYGSPLLSKDLSKLPDTLVVTAEIDPLRDEGEAYANKLKESGVKAEVTRYKGITHGFITMDKITNKADEALNQISLYIQKEFQK >CP013847.1|AUN07305.1|2463582_2464935_-|amidohydrolase MNQILIKNGYIITMDSSKKIFEKSDILVEDSKIITIGNVESELIKSSVEIIDANGKIIMPGLVNTHVHLSQQLARGLADDVDLLTWLRKRIWPYESNMDLEDSYISSLACCTELIRSGVTTFCEAGGQEVDGMGKAVEQAGLRGILCRSTMDCGDGLPLKWQETTEESLEKQVELLEKWNGKGDGRIKYWFGLRTIFNTTDKLITKTKELADKYKVGIHMHVAEIEEEVRYAEATRGETTVQHLAKLGVLDKNFLAVHTVWLTEQEIDLFKLHNVKVSHNPGAAMKVVLGFARIPEMLEKGINVSIGTDGAPSNNRMDMFDEMHLTSLIHKGRRLNPKVVPADEVLEMATMNGAKCALWEDEIGSLEVGKKADLIIINPKSIGSLPMHDPIGNIVYSMHSSDVESSMCNGKWLMKNKVLLTINEEDIIREVQERATALVKKAGIVLPKRF >CP013847.1|AUN07306.1|2465010_2466354_-|xanthine/uracil-permease MKNTKDTNLIVGIDEKISLRYAFFLGLQHVFAMDLYIVPIILAGILSLDAQNTAYFIQMSFIAAGIATLIQTGLCMRLPIMQGPSYIPIGALAAIGSKLGLQAMVGSLIPGSLFLMILGYPLRFLSKIISKFIPHIVGGTVIVIVGISLMPVAMTNIFTAPGNLKINCILALISSALLVSCMMIGRKSNKFGKAVRLTSVMISLIGGTIAASLLGVVDFTPVTKAAWFSFPKLLPFGKPVFDLKAILTMLFIYAVILVETSGTWFAVSAVTGSELTDEGLNRGAVGEGIGCFVGALFGGTPMTGYSTNAGIIAVTGVGSRMAIIAGGIILVALGMLPKLMNVIACIPSAVVSGVFAVVCVIIAMNGFKSIQHEEFDERNMLLIGLPILLALGTTVLPKDILNSLPSLANYIFSSGITVGVLAAVILNILLPKAPVEVSKSQEYEEAV >CP013847.1|AUN07307.1|2466791_2467691_+|hypothetical-protein MSNKRNLQSIRSFYLCILIFNIVYSSIFHLNNKGFNIKLFGDLTMRSVVLFTLNSILFLCVVIAVEKKININEEIKTQVSMKIRPLYLVDIFFITYILVCIFLLKNLDVILSSFVMEIIYIGILILTKKIMTLELTDRQLQWQNTCGYIDENCEKSSFLWRFKIWYSPHINVPFKNRWKDPSRLLYDLALVYGIFISKGTLFSLLLLILLFPDVLSWIEGLLGLQTSLTGMCTGITEHHSKNSHVIYHKVYVTDYKNKREITFYVDGPLFIHENSNMTVVHGTFSKRVLYVEGLNLDIR >CP013847.1|AUN07308.1|2468030_2469353_+|amino-acid-permease MLEKKYGLWTTVSMVIGIVIGSGVFFKADNILMASGGNVKTALLAWLVGAISMIFGALVFAECANRFERSNGIVDYAEGMLSEKFAYLIGWFNGIIYYPAIAAVLAWAAGNYTAILFNKDGNFVWIMAAIYMIGIYILNYISPILSGKFQIASTAIKLVPLMLIAILGTFQGLNNGILIENFSKVSTIGDSGSGFAAAVLGAAFAYEGWIIATTINGEIKDAKNTLPKALVFGSLVIVIIYILYFLGIVGMIPTETILKQGDNTVNVAARTVFGNFGASILTTFIIVSCLGTLNGLILGGSRSFYSLAIRGQGIKPEAFSKLDSKTNIPTNSTIANFILICIYLVVWYMNFKGIFPNKMFVDISELPIALIYGIYIIIYIAYMMKMKDLSFIKRFVIPSLALMGALIVVYGGLSKPSVIIDLGISVFVFLSGLLFYNKKK >CP013847.1|AUN07309.1|2469420_2470155_-|protein-kinase MVIKFFKRDTKYLPEQKIHGYTVLKILGEGRFGICYLVQSNNKQYILKQLKTKMLKKIGSKVIYEQEILKNINHNCIPKFIKTLQFKKFFGYVLEYKEGKTFEEIICEDEYVFKREEIYDICIQIIEILKYLHKSGIVHRDIRIPNTIYYKKKVNLVDFGLARWINNKRYIENVDFSYLGDFLLHLYYTSFQCKTFKGKPWYEELDLFSEEMNFLKRLLEIEKKYKNIEEVERDFLLLKSNYNK >CP013847.1|AUN07310.1|2470145_2470361_-|hypothetical-protein MSILSKIFNLVNSSSNGYHKNKHRGSSYYKKHHRSKSGFLGSMMSVFSSKSRSYSHSYKRHNRRKKYSSWS >CP013847.1|AUN07311.1|2470641_2471415_-|2-hydroxyglutaryl-CoA-dehydratase MYTMGLDIGSTTSKGVIIKDGEEIVASVLVPVGTGTSGPLKLIKELKEKSNLTEKDIEKTVVTGYGRIQYKDADKQISELSCHAKGVAFLIPGARTIIDIGGQDAKAMKLNNKGKLINFIMNDKCAAGTGRFLDVMAGVLETDVSKLGEISEKSTKEVSISSTCTVFAESEVISHLSANAKKEDIVAGIHTSVVRRVSTLAMRVGIEDQVVMVGGVARNKGIVKAMEKELGHDIKVPKLAQLTGALGAAIYAFEETK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP013847_4 | 2564260-2564746 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of CP013847_4
|
7 spacers
spacers of CP013847_4
>4.1|2564290|36|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT TAACATTATAGTTTTAGAAGATTTTCAAGGTTTTAA >4.2|2564356|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT ATATTGTAGTAAATGCACAAGTAAAATAAGCAAAA >4.3|2564421|34|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT TTTAATGAATTATTACTACAATACTATAAAGAAT >4.4|2564485|36|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT TGACTTCTCTATTTAGGGAATTAATGATTAAGTATA >4.5|2564551|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCACAAAAGAGTAATACTAATGTTCAACAATTAGG >4.6|2564616|36|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAATTTTTGGTTAAGAACTCTCGAGGATATTAACTA >4.7|2564682|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAATAGGTGTAGAATATGAACCAATTTTAACTAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP013847_4
The CRISPR arrays of CP013847_4 >merge|CP013847|4|2564260-2564746|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAATAATACATCTCATGTTAATGTTCAACTAACATTATAGTTTTAGAAGATTTTCAAGGTTTTAAATTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAACATATTGTAGTAAATGCACAAGTAAAATAAGCAAAAATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAACTTTAATGAATTATTACTACAATACTATAAAGAATATTTAAATACGTCTTATGTTAATGTTCAACTGACTTCTCTATTTAGGGAATTAATGATTAAGTATAATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAACTCACAAAAGAGTAATACTAATGTTCAACAATTAGGATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAACGAATTTTTGGTTAAGAACTCTCGAGGATATTAACTAATTTAAATACATCATATGTTATTGTTCAACAAAATAGGTGTAGAATATGAACCAATTTTAACTACATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAAC >CP013847|4|4|2564260-2564746|CRISPRCasFinder TTAATAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TAACATTATAGTTTTAGAAGATTTTCAAGGTTTTAA ATTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAAC ATATTGTAGTAAATGCACAAGTAAAATAAGCAAAA ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAAC TTTAATGAATTATTACTACAATACTATAAAGAAT ATTTAAATACGTCTTATGTTAATGTTCAAC TGACTTCTCTATTTAGGGAATTAATGATTAAGTATA ATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAAC TCACAAAAGAGTAATACTAATGTTCAACAATTAGG ATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAAC GAATTTTTGGTTAAGAACTCTCGAGGATATTAACTA ATTTAAATACATCATATGTTATTGTTCAAC AAAATAGGTGTAGAATATGAACCAATTTTAACTAC ATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAAC >CP013847|4|4|2564260-2564746|CRT TTAATAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TAACATTATAGTTTTAGAAGATTTTCAAGGTTTTAA ATTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAAC ATATTGTAGTAAATGCACAAGTAAAATAAGCAAAA ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAAC TTTAATGAATTATTACTACAATACTATAAAGAAT ATTTAAATACGTCTTATGTTAATGTTCAAC TGACTTCTCTATTTAGGGAATTAATGATTAAGTATA ATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAAC TCACAAAAGAGTAATACTAATGTTCAACAATTAGG ATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAAC GAATTTTTGGTTAAGAACTCTCGAGGATATTAACTA ATTTAAATACATCATATGTTATTGTTCAAC AAAATAGGTGTAGAATATGAACCAATTTTAACTAC ATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAAC >CP013847|4|3|2564521-2564746|PILER-CR ATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAAC TCACAAAAGAGTAATACTAATGTTCAACAATTAGG ATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAAC GAATTTTTGGTTAAGAACTCTCGAGGATATTAACTA ATTTAAATACATCATATGTTATTGTTCAAC AAAATAGGTGTAGAATATGAACCAATTTTAACTAC ATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAAC
>CP013847.1|AUN07392.1|2563468_2564017_+|hypothetical-protein MIDNIINSQRYLNINNKKNTIEQNDQPEDNKFEKYLSDYIPKYTGDEGISKKCNYKEMTVFEKRIFDHYMQTDFLYGVSYEDFKKTLCGFPPVDAPKSIIEAYQNTISKYPENQRKKIMGELSYLESPNDNLDMGTIIKNAIEHCKLVEIITGQSQKHRENLYEDFLNEFNKVNTIDDSHNA >CP013847.1|AUN08881.1|2562857_2563028_-|transcriptional-regulator MREYLMDQKAFAEMLGIKKSTYNTIELNKVQGNAETLLTIAKALNRKVEDIWYLED >CP013847.1|AUN08880.1|2562500_2562671_-|hypothetical-protein MLAERLRVVLEFKKSDLDELQLYGKLLKFSNPAAVVKDILKGTLPIKILYEEELKK >CP013847.1|AUN07391.1|2561736_2562141_-|hypothetical-protein MKICVIYSNTKVEDFKNKQRIKYNSNMELVAKHINTDNKLKRQAVFVLGSLFYVQDVVSAASDLGKIDKAGNTILGIVRKIGYWICIVGCIIDIIKSLMQGDTKSIAKIMMKYALAFAALYIFPWMLDLIKGIF >CP013847.1|AUN07390.1|2561487_2561724_-|hypothetical-protein MEWVQKFIERGQYNAPQDTFVFRSKLLDVLSTNAYWICMFVGIGGILAYLCGYKKGGKLTKFSVVIYWVVAAICSTGK >CP013847.1|AUN08879.1|2559151_2561482_-|hypothetical-protein MPLKDYFQIQKPTYKILKLTPDTSIRNYNSSNIAKAIQYMYKSITQRIHREEKKFIIQTPVKCSYMIDIQKNNVDFYFIVPERYLGLIREKITETWPKVTIEEVTQVKQFSQQAIKYQLNYSKEDALSLNINKKSNEPLNSILNVLDIMQEGDRVGIFYNFIPVVQKGWRKEYKDTIDKIKENKLIDREKFNVKYIIKEGIILLVNLAQDLFDTIGEFVGAEKKKEASTLAEIAVSSLMLEDKKKLSRNTVNKKDAIVLNTQMLILSESKDIKRQENNAVAVLEGYNTVSEDNELIYKKISKKNTFYVTDFKIAGVEENKLSTEECQNLLQLPGRDLLQQHKTIEKINTLETEVPEELRNGTKLIGINEYKGSKQNAYLTIDKDYKNLAVTVVGPTRSGKTSFMGNVARNSIDAGECVIVLDYIENCSLSDDIKACIPSNKVLEINLYNHDKLQGLGYNEAISASDNTFIQYESAKKQTSQLITLINSINVSNSDFTPKMERYLTAASLVSFINNGAIKDVFKILQNHKFRKECIDTIPENQSENLEEYAEYLRELDEWSKGTKDNPSQIIGTHSSYITGIIDRVQKLKSNTYMELMLKKDCSENINLLEEMEKNQAIFIKMPENMFGTPEERDIMTTYWLTKIWMCAQARAWKIKDRYARKTVTVFTDEIAQLKSSEQFIGNKLDQTAKFGVKFILSTMYINQLRIREKLRTANTSYILISGSDKVNYMELKDELNQFGYELEDLMNLKRFHSLNYIKYENGYWAGITKLPPPIK >CP013847.1|AUN07389.1|2558793_2559144_+|transcriptional-regulator MDLALKLGLNEKQGRYIIKDYETRGLYPPPELSIKLAKIFNLNTKYFYDEYYGFLDMDYPNIIKNYRLENNLSKTKLAKLLSTTYETIIRWEKGENISRQYYKKLNKLMQLTTKEP >CP013847.1|AUN07388.1|2557963_2558152_+|hypothetical-protein MSNCEKMQTHVHEFLDSTRLAEIQTEPHNHRFAGVSGQAIRRGSSHEFIFATLINSPISQEA >CP013847.1|AUN07387.1|2556947_2557151_-|hypothetical-protein MGVENPTCHVRILNDETKESVYHWRKEINIVEIEAIKISKKVYCNNQYYDIKTLVFNYDNLTLEIII >CP013847.1|AUN07386.1|2556370_2556634_-|hypothetical-protein MCNQDLFEFSDFDGCCDRERDRDRDCERRCRRRCRRECERERERRCRRECERRCRRECERRCRRECERRCRRRCRRREERITLFCIF >CP013847.1|AUN07393.1|2565200_2565431_-|hypothetical-protein MKKIVISLLTALILGVNVSSAYAAESCPRCGATVGRGENHKCCDYLGHDFKPLHDFHGKLVCMACRNCGYTIPYNN >CP013847.1|AUN07394.1|2565788_2566337_-|hypothetical-protein MTGKKEVLINFLERWGVLISVILTLIVTLYFKFEINKLKHYEQLFSNTITFVSILIGVLMSLMGFLLGFSDEKVVIRIKENNGDKILIKYFIKPIIAGIIIVIMSLVLEMIYGQNISNISQRVYILISVIWSVLCVLFLSSTFRVSLLMYLILTKIFDEADNKGINTNEKGNVTFDNPEDIY >CP013847.1|AUN07395.1|2566348_2567338_-|hypothetical-protein MVNKKPKFKQRFFNVDFLRLYIKKNNHDESEPYNLSKQLSEIEKIDTKERVIFYNGDTVRLQSIERLTETFDNLENCKDLWKLTFIRLKDSELLGVADEEGNYDEEKLKDALEDKQHLASPTPCIYDGEKNIFIIARNREGVFPTAILQFLSKMLKDILGDNGLHFAIIPNEKGLKVDDTIIYKNVEITIDNIKKYTDEQNKLLKKHAGTIYSMINSGKGFGINKVKVRLSASLKKEDSMDKLLVSNELTGLNELRDTPGLGFENIKNLEVDVKESSGTKIETIDLINNKIRDNFSIKFEKGDTIKVREVYTRLLGSYSNKFKIISAKI >CP013847.1|AUN07396.1|2567585_2568347_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MKIGIDCGHTMSGADYGAVGIKAESNLTREVGTKVISKLQALGHTVIKCYKDSCSGLNDSLSYRTNAANNNNVDLYVSIHFNCFNGSAYGTEVFTYGGKELLEARRVLNNICALGYTNRGLKDGSSLYVLKHTKAKAMLIECCFCDNAGDMNRYNAENMANAIVKGLVGKTTSNSTPSKPTSNNDSWINLDGKTGTINTPSGVNIREKKSTSSRILGALPNGAKVNLYRKEGDWMHIYYPPHGGYVYAKYIRY >CP013847.1|AUN07397.1|2568384_2568579_-|hypothetical-protein MKFLEQFLQIKKIIALLTTIVFCILSAKGNLSSTEFLSVFTLIIGFYFGQSSARQAVKESKEQE >CP013847.1|AUN07398.1|2568595_2568850_-|hypothetical-protein MELKICEEKHKRIEEKINVHDIRLNDHSKRIDKIEQSQSRTDAKIENLCDQLKQLVGIMKWYVGLTVGGLVSFFLYAIQHNIFK >CP013847.1|AUN07399.1|2569117_2569414_-|hypothetical-protein MKRGSLIIYDNTGKIWINTGDAEGDVLPHTLPDGLPYIITEFGELNNKIVKGIDVETKELITEDIPHIETQEERLKREKQELENQLMLQADNNIGGIL >CP013847.1|AUN07400.1|2569429_2570596_-|phage-tail-protein MAEKFYTLLTEIGKAKIANSAGFGSKINFVKMKVGDGGGSYYNPREDQEDLINTVWEGNITHVAIDEKNPNWINVEMMIPANVGGFMIREYGVFDEDNNMLAIAKCAESYKPLAEDGSTKELIMKMVLTVSNTENITLKIDPTIIFAKKSEIEILENKIKNIKIPVTSVNSKTGAIELKASDIKTEDGKTIESQLDDITTDNKRLTKDKTITGAINELFTSANNGKKLISDVVGNPLLATDTFQQQHDKIQILKNTFVTNLSKKEQGASSTENLQDLINKINNINVGKKWAEGTGKARESSNKEVCMSVTDLDFSPKTVIINTRSDTYREPYIAIDCTLFKYKTQGWYSGGYIILDDGYVHKNNRGFDFYASNGHISKDTTFQWIAFE >CP013847.1|AUN07401.1|2570598_2571234_-|hypothetical-protein MIKSKKGKEMITYVSPIYEQSKVIQSIFEAIGYEWDTAGLLANDILKQFFPQTATWGLIYWEEAVNVVNNPTEEIERRRRKVIAKLQSRYAINPKRMALILKNYTGADILITEDIAPYTFEVKLTGREGFPKSLEDLYKEVKKIKPSHLSVKYKLISLTESNLYIGATSFSGETITVYPWTPNNIETTGNIEIALAQNAGLETITTYPKEG >CP013847.1|AUN07402.1|2571230_2572361_-|hypothetical-protein MERDLLIPEFLQEDASTIHERMLEKAPPNVSTIEGDFYWDNTRPTAEEKASLMQVQLQNMLRLAFPQTSYGVWLEYLGECKGVFKNLPTKSIGVIKVIGRKGTNIYKDKLIGTIATDDSESVVFKFTENKVIDETGVAYVKAECTKAGTIGNVLKNTITVLMDRINGIESITNEEEFTGGTDLEDEEHYRERVLEEYKNEATSGNNEHYKKWAKEVDGVGYAYVIEEWNGPGTVKVLILDKNNKTATKELIDKVQNYIYEIVPKEENRGGKAPIGAIATIDTPITLVIDIKANFKFKEDFNSEVVLNSLKENLSKYLSGIPIGGTILYTAIHTIVGSMILTGEGIEDFKNLTVNGITENIKLIDQVAVIGEVTNIQ |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP013847_5 | 2656926-2657285 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of CP013847_5
|
5 spacers
spacers of CP013847_5
>5.1|2656956|37|CP013847|CRISPRCasFinder AGCCTTACACAGAAAATGCTGTTATAATAATTAGACT >5.2|2657023|36|CP013847|CRISPRCasFinder AATTATGGCTAATGGATTTGATACTACACAATTAGA >5.3|2657089|35|CP013847|CRISPRCasFinder AGAAGCTCATAACGATACAAGACCACTAAAAAAGA >5.4|2657154|36|CP013847|CRISPRCasFinder TAACAGTGAAAGTTCTATAACATCAAATGTAAAGAA >5.5|2657220|36|CP013847|CRISPRCasFinder TAATACATTAAAAAAATACAAAGCATATCTAAATGG >5.6|2656955|38|CP013847|CRT CAGCCTTACACAGAAAATGCTGTTATAATAATTAGACT >5.7|2657022|37|CP013847|CRT CAATTATGGCTAATGGATTTGATACTACACAATTAGA >5.8|2657088|36|CP013847|CRT TAGAAGCTCATAACGATACAAGACCACTAAAAAAGA >5.9|2657153|37|CP013847|CRT TTAACAGTGAAAGTTCTATAACATCAAATGTAAAGAA >5.10|2657219|37|CP013847|CRT TTAATACATTAAAAAAATACAAAGCATATCTAAATGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP013847_5
The CRISPR arrays of CP013847_5 >merge|CP013847|5|2656926-2657285|CRISPRCasFinder,CRT TTAATAATACATCTTATGTTATTGTTCAACAGCCTTACACAGAAAATGCTGTTATAATAATTAGACTATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAACAATTATGGCTAATGGATTTGATACTACACAATTAGAATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAATAGAAGCTCATAACGATACAAGACCACTAAAAAAGAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAATTAACAGTGAAAGTTCTATAACATCAAATGTAAAGAAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAATTAATACATTAAAAAAATACAAAGCATATCTAAATGGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT >CP013847|5|5|2656926-2657285|CRISPRCasFinder TTAATAATACATCTTATGTTATTGTTCAAC AGCCTTACACAGAAAATGCTGTTATAATAATTAGACT ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAAC AATTATGGCTAATGGATTTGATACTACACAATTAGA ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAAT AGAAGCTCATAACGATACAAGACCACTAAAAAAGA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT TAACAGTGAAAGTTCTATAACATCAAATGTAAAGAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT TAATACATTAAAAAAATACAAAGCATATCTAAATGG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT >CP013847|5|5|2656926-2657284|CRT TTAATAATACATCTTATGTTATTGTTCAA CAGCCTTACACAGAAAATGCTGTTATAATAATTAGACT ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAA CAATTATGGCTAATGGATTTGATACTACACAATTAGA ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAA TAGAAGCTCATAACGATACAAGACCACTAAAAAAGA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAA TTAACAGTGAAAGTTCTATAACATCAAATGTAAAGAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAA TTAATACATTAAAAAAATACAAAGCATATCTAAATGG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAA
>CP013847.1|AUN07497.1|2656147_2656561_+|HicB-family-protein MYKENYIFPAIITKLAETDYNVSFPDFDEIITYGESVEEAYIMAEDALSLELFDLWEDKKEISEPTNVDNLTLENNETLILVKLNLKDVLKKYDNKAVKKTLTIPSWLNKMAEENKVNFSQILQAGLMEYLNINEKR >CP013847.1|AUN07496.1|2655909_2656089_+|addiction-module-toxin,-HicA-family MNAKDVIKQAQNIGWEIKTQRGSHVKLVKDNSTVIIPHHGSKDIPIGTLNKILKQLGLK >CP013847.1|AUN07495.1|2655262_2655511_+|transcriptional-regulator MVFKDRLKGLREDRDLTQDQIANILKITRSAVANYENGIREPDISLLVKIADYFNISLDYLLCRTNKMEPFYKSHSNNLKIK >CP013847.1|AUN07494.1|2653717_2654527_-|DNA-replication-protein MTLKTSINRIMEEIKNQRENGLGINHQNLNYKEIENVRDSYKEVCNKCGGSTWITNIDKEGRIYCRRCSCYEMQRAKDMWNLAGINTEQSKHTFSNYKPYNETTELAKNTAIQYYKNFDEIKNTRQNSIAFIGQVGSGKTHLSIALAVNFLRNKQISVIYMPYRNTITKIKQNMIDEKYYSKVLSKYQKAKILLIDDLFKGKINESDTNIMFEIINYRYINYLPMIVSSEFTVERLLDFDEAIGSRIIEMAKDYTVEIVGKENNYRLKI >CP013847.1|AUN08890.1|2653600_2653711_-|YvrJ-family-protein MSIVGFPVTISVYLLARIEKKFDDLIKAFNDYTKES >CP013847.1|AUN07493.1|2652816_2653359_-|DUF4342-domain-containing-protein MERNEMIEIIIEKANITREEAIEVLEKCNWDIIDSIIYLEKNGKIGNNQTTTIIEVKEEEQQQDKKKNSKKHEEKYGGIGEMVGRMFKFIGKLIRKGNENYFEIKKENEKPMRISLTISILLLIFLSVPTIVLLIIGLFCGYKYSLSGAHNNYDDVNNVFEKASESADNVKNDFKKGCAK >CP013847.1|AUN07492.1|2652126_2652666_-|ubiquitin MDKLKLVDKLREKANVSYEEAKTALENSDWDMLDAVLYLEENEKVKRPSVNIFYTNEARYSGKSEESGKNQENKYEKSNKFQGIFEVICKYIDTCNNIFLEIKKKDKMFVKIPLTVIIIFSFFAFWMIIPLMVTSLFFDIELYIYSKSVDTGKANKILQSISNHVKIIKEKFKKADKNG >CP013847.1|AUN07491.1|2651453_2652134_-|DNA-binding-response-regulator MVKILIVEDEEKLSRFIELELKHEGYEIVKANNGRTGLEIAEKGEADLVLLDIMLPEINGLEVLRRLRRTSDIPIIMLTARDAVMDKVSGLDAGADDYITKPFAIEELLARIRTALKKRIVTVKKDEDIIRCGLLSLDKMRRKVMYDSTEIELTNREFNLLQILMENKNIVLTRSILMEKVCGYDYLGETNVIDVYIRFLRTKIDDAFKVKIITTVRGVGYVIKDE >CP013847.1|AUN07490.1|2650210_2651461_-|two-component-sensor-histidine-kinase MSRKNKTKNVISIAIKLNSVFVRSLFLKFLILDICIIAGFIGVWCIENEINFYGEIVRNAQRSFEFYPIETANYKVIWDNGKVMIKEASTFLNIFIKVISAIGIIEGIMLLMQMIFGTAKNRRILKPLNEIAEAASRLSDIAFDEQKFQSLEDAISKISPATSDERIHIKDSELQGLEEAINNLLDRMRDSYRQQARFVSDASHELRTPISVIQGYANMLDRWGKDDEEVLEESIAAIKSESENMKNLIEQLLFLARGINGKTQLKVMEFSLNDMMKEVLEESKMIDKDHIYRYIDSENINVYGDISLLKQTARILIENAAKYTDKGEDIILRTGKNNKNEPYFSIQDNGIGMDENDVLHMFERFFRADTARVRKNGGTGLGLSIAKWIIDSHKGYFSVLSRKEIGTRITVFLPKR >CP013847.1|AUN07489.1|2648892_2649057_-|hypothetical-protein MPVTVGEYPNSQNTVRLEKGDTVEDIEDIGDGWIKFKSNGKTLTCPKDKLERSY >CP013847.1|AUN07498.1|2657500_2658262_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MKVGIDCGHTLSGDDYGAVGIKAESNLTREVGTRVISKLQALGHTVIKCYKDSCSSLNDSLSYRTNTANNNNVDLYVSIHFNCYNGSAYGTEVFTYGGKELQQARVVLNNICSLGYTNRGLKDGSNLYVLRHTKAKAMLIECCFCDNAGDMNRYNAENMANAIVKGLVGKTTSNSTPSEPTNNNNSWINLDGRTGTINTPSGVNVREKKSTSSRILGALPNSSKVNLYRKEGDWIHIYYPPHGGYVYAKYVRY >CP013847.1|AUN07499.1|2658303_2658498_-|hypothetical-protein MKFLEQFLQIKKIIALLTTIVFCILALKTNISSTEFLSVFTLIIGFYFGQSSARQAVKESKEQD >CP013847.1|AUN07500.1|2658514_2658769_-|hypothetical-protein MELKVCEEKHKRIEEKINVHDIRLNDHSKRIDKIEQNQSRTDAKMENLCDQLKQLVSVLKWYVGLTVGALVSFFFYTIQHNLFK >CP013847.1|AUN07501.1|2658872_2659583_-|hypothetical-protein MKILNKYFELIFVGAITAILYFLTYTYQLGYFSYYNIPSIFIEISPSIIVDKLAWFFLIAIFSITTLRGIFIFIGENRSEQVQDEIKGVLLLLSMSYYFWVINPIFCYISIAFLILVGIDIIRISLDKLRKKEFKNFISYNKINMFYIGMSLELHDILRYLFITVLMASIAYSIGIYKAANDPEKTEIAINNRKAIVVSEYKSKLIIKYKKDKYDKLEDGFSIVDINGDYKIISKK >CP013847.1|AUN07502.1|2659806_2660274_-|hypothetical-protein MKIFKKVSTMVMALTMCLMIFGGDVVFAKTNWGDKFEDPVTIYRHGGGSANVMVPIDNVNDNDWYLIDNSSGSTFSFGVFLTPPPGINYDMQIVRVDENGAITRSTYVDDNGPGNLDGFGTGIEAGCKIYVRVMSHGRNDYDRNRPYELKFIKYD >CP013847.1|AUN07503.1|2660938_2661328_-|hypothetical-protein MRKKKIIFLLSACIISNLALGSIVSAKTVQAEESSVKTVQVKENTTVLNEDEYRSTRAAMGPMLEFLAGYIASKAIDGFIANYQDLYRWSQRDPSGYNRWVNAVNAGKNHCYNMCPIHSKFIDPRDYGY >CP013847.1|AUN07504.1|2661449_2661659_-|hypothetical-protein MILYDLLKNLINNNYYEKEDMNNKLNVFYTFNQINLEQYSELMAKVTPVNKEEEKDLNKEDTKEKVVIQ >CP013847.1|AUN07505.1|2661674_2661980_-|hypothetical-protein MKRGSLIIYDNSGKVWVNTGDAEGCIPPHTPPDGLPYIITEFGEFNDKIIKGIDVTVTPHKLITEDIPHIETEEEKLKKELLKAQSEVVNLKYKEVLNNIK >CP013847.1|AUN07506.1|2661995_2663240_-|hypothetical-protein MAEKFYTILTKVGKAKIANATALGNKVNFTTLKVGDGGGKYYNPTEEQEDLVNEVWQGNINSIRVDENNPNWVVIEVIIPSSVGGFMVREAGVFDDENNMLAIGKYPETYKPQAQDGSTKDLVIRTNLEISNTSSVTLKVDPTVILATQKDIQILDDKIKNIKVPVTKVNEKIGDIVLTASDIKTENGQTIDEQLADITTLTGNKDNLKTTNKTNLVSAINEVFTSGNNVKINTVDALLQLDKSLQITKESKWEDIIKNISKISTGKKWAQGTANVNYYGPEVGIFMESNYPLSSASVNTNCGFKPSIVILTTIGITPRKNPDDYFRSDDRYSEPRIELYIYNELLQVKITFKTKSGYSSDIAYDREYSIEKINSIGNTIYTSLHIMRYSVRVEKGTSTAERYMFDKVNWYAYE >CP013847.1|AUN07507.1|2663243_2663870_-|hypothetical-protein MKKKLIDFLPPQISDIEEFKNIMATENIELELIEKGQERILKENFIDTATDYGIKHKEQLFKIRADLVNDTLEFRKLRIKNRKMDKMPITHRSLEYKLKTLFGEGNYKVEVLNDEYVLKVEINTFDWSMFNEIIDNFRYIIPCNMMLSSTLVQKINTNIYFASAITSGEEITVYPWMPKDIASNGKVNIAMGSNTGVENITVYPRKEA |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP013847_2 | 2.2|2456608|37|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2456608-2456644 | 37 | CP013847.1 | 1695148-1695184 | 1 | 0.973 |
| CP013847_5 | 5.5|2657220|36|CP013847|CRISPRCasFinder | 2657220-2657255 | 36 | CP013847.1 | 1696708-1696743 | 1 | 0.972 |
1. spacer 2.2|2456608|37|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 1695148-1695184, mismatch: 1, identity: 0.973
aggttaagtcagtaatgataccttacttagaagatta CRISPR spacer aggttaaatcagtaatgataccttacttagaagatta Protospacer *******.*****************************
2. spacer 5.5|2657220|36|CP013847|CRISPRCasFinder matches to position: 1696708-1696743, mismatch: 1, identity: 0.972
taatacattaaaaaaatacaaagcatatctaaatgg CRISPR spacer taatacattgaaaaaatacaaagcatatctaaatgg Protospacer *********.**************************
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP013847_3 | 3.3|2460744|35|CP013847|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2460744-2460778 | 35 | NZ_CP013700 | Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence | 121453-121487 | 1 | 0.971 |
| CP013847_3 | 3.3|2460744|35|CP013847|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2460744-2460778 | 35 | NZ_CP006909 | Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence | 164047-164081 | 1 | 0.971 |
| CP013847_3 | 3.3|2460744|35|CP013847|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2460744-2460778 | 35 | NZ_CP013684 | Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence | 52651-52685 | 1 | 0.971 |
| CP013847_4 | 4.5|2564551|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2564551-2564585 | 35 | NZ_CP031100 | Clostridium botulinum strain CFSAN034202 plasmid p1_CFSAN034202, complete sequence | 1221-1255 | 1 | 0.971 |
| CP013847_4 | 4.5|2564551|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2564551-2564585 | 35 | NZ_CP014173 | Clostridium botulinum strain B609 plasmid pRSJ22_2, complete sequence | 21192-21226 | 1 | 0.971 |
| CP013847_4 | 4.5|2564551|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2564551-2564585 | 35 | NZ_CP014218 | Clostridium botulinum strain B515 plasmid pRSJ21_3, complete sequence | 30043-30077 | 1 | 0.971 |
| CP013847_1 | 1.1|1179594|39|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT | 1179594-1179632 | 39 | NZ_CP014218 | Clostridium botulinum strain B515 plasmid pRSJ21_3, complete sequence | 44654-44692 | 2 | 0.949 |
| CP013847_4 | 4.5|2564551|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2564551-2564585 | 35 | NZ_CP014147 | Clostridium botulinum strain CDC_67190 plasmid pNPD12_2, complete sequence | 35933-35967 | 2 | 0.943 |
| CP013847_1 | 1.1|1179594|39|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT | 1179594-1179632 | 39 | NZ_CP014173 | Clostridium botulinum strain B609 plasmid pRSJ22_2, complete sequence | 6458-6496 | 3 | 0.923 |
| CP013847_1 | 1.1|1179594|39|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT | 1179594-1179632 | 39 | NZ_CP014147 | Clostridium botulinum strain CDC_67190 plasmid pNPD12_2, complete sequence | 48962-49000 | 3 | 0.923 |
| CP013847_1 | 1.1|1179594|39|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT | 1179594-1179632 | 39 | NZ_CP031100 | Clostridium botulinum strain CFSAN034202 plasmid p1_CFSAN034202, complete sequence | 45867-45905 | 3 | 0.923 |
| CP013847_2 | 2.1|2456543|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT | 2456543-2456577 | 35 | NZ_CP013709 | Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_2, complete sequence | 138413-138447 | 3 | 0.914 |
| CP013847_2 | 2.1|2456543|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT | 2456543-2456577 | 35 | NZ_CP013682 | Clostridium botulinum strain 1169 plasmid pRSJ8_1, complete sequence | 141490-141524 | 3 | 0.914 |
| CP013847_2 | 2.1|2456543|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT | 2456543-2456577 | 35 | NZ_CP013295 | Clostridium botulinum strain CDC_54064 plasmid pNPD1_1, complete sequence | 152206-152240 | 3 | 0.914 |
| CP013847_2 | 2.1|2456543|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT | 2456543-2456577 | 35 | NZ_CP013844 | Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence | 183850-183884 | 3 | 0.914 |
| CP013847_4 | 4.4|2564485|36|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT | 2564485-2564520 | 36 | KM983327 | Clostridium phage phiCT453A, complete genome | 27142-27177 | 5 | 0.861 |
| CP013847_4 | 4.5|2564551|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2564551-2564585 | 35 | MH319752 | Marine virus AG-345-F15 Ga0172271_14 genomic sequence | 2573-2607 | 6 | 0.829 |
| CP013847_3 | 3.6|2460735|44|CP013847|CRT | 2460735-2460778 | 44 | NZ_CP006909 | Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence | 164038-164081 | 8 | 0.818 |
| CP013847_3 | 3.6|2460735|44|CP013847|CRT | 2460735-2460778 | 44 | NZ_CP013684 | Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence | 52642-52685 | 8 | 0.818 |
| CP013847_3 | 3.6|2460735|44|CP013847|CRT | 2460735-2460778 | 44 | NZ_CP013700 | Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence | 121453-121496 | 8 | 0.818 |
| CP013847_4 | 4.1|2564290|36|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT | 2564290-2564325 | 36 | NC_010180 | Bacillus mycoides KBAB4 plasmid pBWB401, complete sequence | 393605-393640 | 8 | 0.778 |
| CP013847_2 | 2.4|2456741|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2456741-2456775 | 35 | MN693317 | Marine virus AFVG_25M47, complete genome | 27582-27616 | 9 | 0.743 |
| CP013847_4 | 4.7|2564682|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2564682-2564716 | 35 | NC_041878 | Pectobacterium phage CBB, complete genome | 110155-110189 | 9 | 0.743 |
| CP013847_2 | 2.4|2456741|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2456741-2456775 | 35 | MH586730 | Salmonella phage Solent, complete genome | 12186-12220 | 10 | 0.714 |
| CP013847_2 | 2.4|2456741|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2456741-2456775 | 35 | NC_047786 | Salmonella phage vB_SenS_Sasha, complete genome | 9067-9101 | 10 | 0.714 |
| CP013847_2 | 2.4|2456741|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2456741-2456775 | 35 | KY002061 | Salmonella phage vB_SenS_Sergei, complete genome | 11999-12033 | 10 | 0.714 |
1. spacer 3.3|2460744|35|CP013847|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013700 (Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
agaaacccttgtggatgtggttctaatgtttttca CRISPR spacer agaaacccttgtggatgtggttctaatatttttca Protospacer ***************************.*******
2. spacer 3.3|2460744|35|CP013847|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
agaaacccttgtggatgtggttctaatgtttttca CRISPR spacer agaaacccttgtggatgtggttctaatatttttca Protospacer ***************************.*******
3. spacer 3.3|2460744|35|CP013847|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013684 (Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
agaaacccttgtggatgtggttctaatgtttttca CRISPR spacer agaaacccttgtggatgtggttctaatatttttca Protospacer ***************************.*******
4. spacer 4.5|2564551|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP031100 (Clostridium botulinum strain CFSAN034202 plasmid p1_CFSAN034202, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tcacaaaagagtaatactaatgttcaacaattagg CRISPR spacer tcacaaaagagtaatactaatgttcaacaactagg Protospacer ******************************.****
5. spacer 4.5|2564551|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014173 (Clostridium botulinum strain B609 plasmid pRSJ22_2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tcacaaaagagtaatactaatgttcaacaattagg CRISPR spacer tcacaaaagagtaatactaatgttcaacaactagg Protospacer ******************************.****
6. spacer 4.5|2564551|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014218 (Clostridium botulinum strain B515 plasmid pRSJ21_3, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tcacaaaagagtaatactaatgttcaacaattagg CRISPR spacer tcacaaaagagtaatactaatgttcaacaactagg Protospacer ******************************.****
7. spacer 1.1|1179594|39|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014218 (Clostridium botulinum strain B515 plasmid pRSJ21_3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.949
caagggtatttaaaagcaatatagaagtaatattataga CRISPR spacer caagggtatttaaaagcaatatagaagtaatattataat Protospacer *************************************.
8. spacer 4.5|2564551|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014147 (Clostridium botulinum strain CDC_67190 plasmid pNPD12_2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
tcacaaaagagtaatactaatgttcaacaattagg CRISPR spacer tctcaaaagagtaacactaatgttcaacaattagg Protospacer ** ***********.********************
9. spacer 1.1|1179594|39|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014173 (Clostridium botulinum strain B609 plasmid pRSJ22_2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
caagggtatttaaaagcaatatagaagtaatattataga CRISPR spacer caagggtatttaaaagcaatatagaagtaatattattat Protospacer ************************************ .
10. spacer 1.1|1179594|39|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014147 (Clostridium botulinum strain CDC_67190 plasmid pNPD12_2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
caagggtatttaaaagcaatatagaagtaatattataga CRISPR spacer caagggtatttaaaaacaatatagaagtaatattataat Protospacer ***************.*********************.
11. spacer 1.1|1179594|39|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031100 (Clostridium botulinum strain CFSAN034202 plasmid p1_CFSAN034202, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
caagggtatttaaaagcaatatagaagtaatattataga CRISPR spacer caagggtatttaaaaacaatatagaagtaatattataat Protospacer ***************.*********************.
12. spacer 2.1|2456543|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013709 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
tacttgtgattttaaaataaagaacattaggtagt CRISPR spacer tacttgtgattttaaaataaaaaatattaggtaga Protospacer *********************.**.*********
13. spacer 2.1|2456543|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013682 (Clostridium botulinum strain 1169 plasmid pRSJ8_1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
tacttgtgattttaaaataaagaacattaggtagt CRISPR spacer tacttgtgattttaaaataaaaaatattaggtaga Protospacer *********************.**.*********
14. spacer 2.1|2456543|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013295 (Clostridium botulinum strain CDC_54064 plasmid pNPD1_1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
tacttgtgattttaaaataaagaacattaggtagt CRISPR spacer tacttgtgattttaaaataaaaaatattaggtaga Protospacer *********************.**.*********
15. spacer 2.1|2456543|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013844 (Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
tacttgtgattttaaaataaagaacattaggtagt CRISPR spacer tacttgtgattttaaaataaaaaatattaggtaga Protospacer *********************.**.*********
16. spacer 4.4|2564485|36|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT matches to KM983327 (Clostridium phage phiCT453A, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.861
tgacttctctatttagggaattaatgattaagtata CRISPR spacer ctacttctctatttagggaattaatgcttaaataca Protospacer . ************************ ****.**.*
17. spacer 4.5|2564551|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH319752 (Marine virus AG-345-F15 Ga0172271_14 genomic sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
tcacaaaagagtaatactaatgttcaacaattagg- CRISPR spacer tcacaaaatagtaatactaaggttcca-actcaggc Protospacer ******** *********** **** * * *.***
18. spacer 3.6|2460735|44|CP013847|CRT matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.818
ttgttcaacagaaacccttgtggatgtggttctaatgtttttca CRISPR spacer aaagggaaaagaaacccttgtggatgtggttctaatatttttca Protospacer . ** ***************************.*******
19. spacer 3.6|2460735|44|CP013847|CRT matches to NZ_CP013684 (Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.818
ttgttcaacagaaacccttgtggatgtggttctaatgtttttca CRISPR spacer aaagggaaaagaaacccttgtggatgtggttctaatatttttca Protospacer . ** ***************************.*******
20. spacer 3.6|2460735|44|CP013847|CRT matches to NZ_CP013700 (Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.818
ttgttcaacagaaacccttgtggatgtggttctaatgtttttca CRISPR spacer aaagggaaaagaaacccttgtggatgtggttctaatatttttca Protospacer . ** ***************************.*******
21. spacer 4.1|2564290|36|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010180 (Bacillus mycoides KBAB4 plasmid pBWB401, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taacattatagttttagaagattttcaaggttttaa CRISPR spacer atagaagatagttttagaaggttttcaaggatttta Protospacer * * *************.********* *** *
22. spacer 2.4|2456741|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693317 (Marine virus AFVG_25M47, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
caaaacaataagtaattcataattcaaaaatgagg CRISPR spacer caaaacaataagtaatttattattcccgcatgcaa Protospacer *****************.** **** . *** ..
23. spacer 4.7|2564682|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_041878 (Pectobacterium phage CBB, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
aaaataggtgtagaatatgaaccaattttaactac CRISPR spacer cagttaggtgtagaatatgaaccatgtttgccaag Protospacer *. ******************** ***. * *
24. spacer 2.4|2456741|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH586730 (Salmonella phage Solent, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caaaacaataagtaattcataattcaaaaatgagg CRISPR spacer ttcaataataagttattcataattcaaaaacctct Protospacer . **.******* ****************.
25. spacer 2.4|2456741|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_047786 (Salmonella phage vB_SenS_Sasha, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caaaacaataagtaattcataattcaaaaatgagg CRISPR spacer ttcaataataagttattcataattcaaaaacctct Protospacer . **.******* ****************.
26. spacer 2.4|2456741|35|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY002061 (Salmonella phage vB_SenS_Sergei, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caaaacaataagtaattcataattcaaaaatgagg CRISPR spacer ttcaataataagttattcataattcaaaaacctct Protospacer . **.******* ****************.
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
610049 : 617036
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP013847|610049:617036|DBSCAN-SWA CATGAAAAAGAAGACAACTATATTAAGTATTTTTCTAGCTGTTTTTATGGCGTTAGCACTAAATGTAGGTAATGTTAAAGCTGCAGCAACTGGACAAGATATAGTAAACTATGCTAAACAATTTCAAGGAACACCATATGTTTGGAATGGTACAACTCCATCAGGATTTGATTGTTCAGGTTTTGTACAATATGTGTATAGAAATTGTGCAGGTATAGAATTACCAAGAGATACATATGGACAAATTAAGGCAGGAACTAGAGTTTCAAGAGATCAATTACAGCCTGGAGATCTAGTATTTCCACATACAGGACATATAGGTATATATGTTGGGGATGGTAAGATAATACATTCACCACAAACAGGAGATGTGGTAAAGATATCACCAATATGGAAGTTCTATGCGGGGGTAAGAATAAGTGGAATAACTAACTACTCAAAAGAATTCATTGCATCAGTTCAAAGAGATCTAAGAAAATCTAGGTGTTATTCTGGAGAAGCAACAGGAAATATAGATCAAAAAACAAAAGACGCTATCTGGAAATTTAGAGGGATTGTAGGACTACCAGTTAATACTACTCTAGATAATTCAGTTGTTACTGCTTTAAATCAGATTGTTAAAAAACCAAGATTAACGGTTAATACAAATCTTACATATGCTACAAAATTTGTGCAATGGTGGATTGGTTCTGATAAAAGTGGAATATATGATAATAAGATGAAAGAAAATGTACGTCAATGGCAAATAAAAGCAGGTGTGTGGAGTGCTGCAGGTGCAGATGGCATTATAAGAGAACAAGATTGGAATAAGATACTAAATTAACATACTAGAATAAAAAAGAAGTAGTTCTCATTATTTAAACAAAAAGAACCCTAATAAATAGGGTTCTTTTTGTTTGGGATTTGCCATATATTGATATAGGGATTTAATGAAGCTAGATTTTTATAAAATTGCATGACAATATTAAAAGATACTAAAAATATAGAAAAATGTAATGAAGTGAGTGTAGTAAGAACAATGCTTAAAGGAGTATTTCTAGGTTTAGACTTCTTTAATAAGGAATGTTATGCAATACCAGTTTATTTAAATCTTTTTTAGAAGAATATAATATAAAGAATTATAGGAGGGGTAATAAAGTGGCAGATACAGTTTCATATATAGATAAAGAAAAAGAATTAAATATTCAAGAGGATGATGGTTTTTTCTTGCTAAAATTAGACAAGTTATTTGACGAATATGCTTTAAGTATTATTGTAAGAAGAGAAGTTCTTCAAAAAGTATATGATGTTCTACCAAGTAGTTTATTTGATTGTCCAATCTATGGTGAACTAGAATAACAGTTAATAAATAAGGAGTTGCTTTTATAAGAAGCATAAAGTCAAATTGAATGTTTAAAAGATATAATAGATTTTTTAAAAAGATAACACTACCGTAGTAGAAACTAATATGGCAAGATAAGTGAAAGCCTGGATAAGTTTATATAGAAGTATACAAGAGCATTGGTTATAGCAAGAGAAGCTTTTTTCAAAAAGACAGGCATGACTGAACATTATTTTCTTAGCTAATCATCGAGATAAGAAAATTTTTTTAGAGAATGAATTGATAATTGGTGCAAGAGGTAACTTTATAAAATCACGAAAAAAGTTGATCCAAAGATGGGGATGGGGTTATAAAAAGACCAGAAGATTTTTAAAAAGAAGCGTTGCGTAATACTGTATTTGGATTAAAAGATTTAAAATAGGTAATACTACATTTACATTAAAAGACTTAAAACAAGTGGTATAGGAACTAGTACAAGCGGAAGAAATTATAGAGAAATTAAAATAAATTACAGTATTTATATCCCTAATGATAAGGAGGAAATATGACACCGATAGAAATAATGGAAAAGATAGGGGCATGTCAACGGGGGCTGACGAAAGGGAATATAGAATTAAAAGCTTTAGGAGTGAAGAAGGCTAGAGCAGAACATGACTATAGGATAGCCCTAAGAAAAGAGATTTTAAGATTAAGACAGTTAGAGAATCAGCCAGCAACAATAATAAATGACTTAGCTAAAGGAAAAGAAGATATTGCAAAATTAAGACTAGAAAGGGATATAGCAGAAACTAATTACAGTGTATATATAGAAAGTATGAGGAATTTAAGATTAGAGATTGAGGCGTATAGAAGTTTTCTCACATGGGAACGTGTAGAACTTAAAAATACGTAATGTTAAAATTATGATGAACTAAAGAGAGGTAAAGAAGACATCTTCTTTTCTGATGTAATTTATTATTGGTTGCTTAACTCTGATTTTATTTAATTTCTTTGCTATTGTTTCATGTGCACCAATAAGATGACGAAGATTTTGTAATTCTAGTGAGTTTAAATTTGACATAAAATCACCTCTCTAATAATTAGTTCAATAATATTATTGGAAAGAGAATTAAAAATTATACAGTGATGTTTAATACTTAAATATAAAGTTGAGTGAGCTCATGGCAAAATTCAAATATTGAACTAAGATAAAAGATAAGCTTGTATTAGCTGAAGAAAGGGCAAGAAATGAAGTAAGTAATGGACAAATAATAAAGAATCTAGGGATAGATAAGGGTATATTTTATAAATATAAAAAGCAAGTATATAGGATTTTTTATATCTTAGAAAGGGGGAAGGAGATAATGATGATAGGTTTTGGAATTAAAGATTCACTTTTAAAAAGAACATTAGAATATAAGTATAAGGAAATAACCAAGGAATTAGTATAAGATCATAGGACTAAATTGTATACATATATAATAACTTTGATCATTATTAAATATGTATAATAAATATATCAGTAACATAATGTTGTTTATGAACATATTATATTAAGTAATATAGATTAGAAATATTTTGGAGGGTAACTTTGAAGATTAGTAATATTAAAGAAATAACATTATTTGAGCATCATTTTTGGTTACAGATTTTAGGAGATCATTCTAGATTTATTTTAAACTCACTCTCACCAAAAGAAAAATCTTTCATTGAAGAAGCAAATAGATTTAAAAATTTATTTGATAATTTATTAAGAAAATCAAAACAATCACTTTCAGAAGAAGAGATTTTCGCTTTAAATAATCATGCCTATAATGCAGCTATGAAAATTAGAGAGTTTAAGCTAGATATAATTGATAGGCAGATTACTGATAAAATTGTCATTTCATTGCCACCTACATTTATTAATCATATGGTTAACGAAGTTGATGAATATATATTTATATTAGCTAAATTAATGAAAGAAAATGTATCTAATATAGGACCTATTCATATCCATCTTTTATGGCTTCCAGATGGAGCAGGTCATGCATCCAATATAGCTAGTAGTCTTGATATAACGGAGAAAGAATTGATTAAAAAGAGTAATCAATATTCTAAAAAATTTAATAATTTATACTTAAGGACTATAGAGTACAATGGTTATACAAGAACTGGTATTTGTGATTTCCCGGCACTTGATAGTCTAAATAATAATGCTGACGAAACAATGAGTTGTTTTAAAGAATTTTTAAATGAATTAAAAAAAGGTGTCATAGAAAAGAAAATACTTGGAACTATTGTACCACTAGTACCCGATCATATGTTTAGGGAAGAATGTTACTATTTAACTAAACTTTCAATGGTTTCAAACATAAAAAAACCCGAATGTGATCCTACAAAATCAAGAGTAGAGAGCTAAATTTAGCAAAGCAAAAGAGTCATATTTTATTATCTAGGGTTCTTTTGGTATGACTTTATTATATAGATTGATGTAGTATATTAGTTTATTTTTATTATATCATTATGTAATATAAAATTTGGTTAATGAAATATCTTCATTAATAATAAAAAGTCGACTATTTAGTATATAAAGATGATAAATATATAATAAAATTAAAGTTTGGGAGTAATATGGAAGTGTTTTTTAATCTAGATGTTTTTAATTATTTTTAAAGAATAAATATTAGGAAGATTTAGAAAAAAATATTGACGGATCTTAAGAGGTGATGTATAGTTTTGTTAAGCAGTATAATTTACTACTTAATAAAACTATTTTTACTATTTATTATTATACCATATAGGGGACATTCTTATTTACGCCTCTTTATTTTATTTTCATTTAAAGGATTTCTATTGATATATAGAGGTCCTTTTTTATTTAAAAGATTTTTGTTAATATAAAAATTTTTTTATTTCAAATCATATATATAACAAATTAAATAATTTAGAAAATATAATATTAAAAGTCTATAAATATTTTTAATTTAATAAAATAGAGAATTTAATAAAGTTATAACTTTATCTGAATATAATAATATAAAGAGAGGAGGAGTAGACTTGAAACTAACTTATGTATTAGATACTAATGTTATTTTGTATTCACCAGGAGCTATATTTTCTTTTGCAGATAATGATGTAGTTATACCTGAAGTAGTTCTAGAAGAATTAGATAGCTTTAAAAAGAATAATAATGATTTAGGGGCTAATGCTAGGCATGCAGCAAGAATAATAGATAAATTAAGAAAAGATGGAAGTTTAATAGATGGTATAGTATTACCTGGTGGAGGAACTTTAAGAGTAGAAATGAATCATTATGATGTAAAATTGCCTCCGTCTTGGGATAAGAATAAGCCGGATAACAGAATAATACAGGTTTGTAAGGGATTAAAAGAAAAAGGGGAAGAAGTAGTATTAATTACAAAGGATACCTTTGAGAGGATAAAGGCGGATACTATTAATATAGATGTAGAGGATTTTTATGAAAAGGTAGTACCAGAATATGAAAGTCAATATAAAGGAAGATGTGATGCTTTTGCATCTCACAGTACTTTAGAAAGTTTTTATAAAAATAAATATATGGATGTAGAGAGCTTATTTTTTTATTCAGAAGAGAAAAATGATTACTATAAAGCAGATATCAATATAAATGAATTTATATTAATTAAATCTATGGAAAATCCAAAACAAACAGCTCTGGGAAGATATAATGGAGAAAAAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP013847|610049:617036|612279_612429_-|AUN05670.1|DBSCAN-SWA MSNLNSLELQNLRHLIGAHETIAKKLNKIRVKQPIINYIRKEDVFFTSL >CP013847|610049:617036|616031_617036_+|AUN05673.1|DBSCAN-SWA MENKEKKSKNKKFSFKIFLYFIIFELFFTAATAPFIIFHGPFKNVKKTMVGAAMTTLKHQYIAKTFLSDAKIKEILGEDSIQTIKQDKNSVLKFENKHDSTIERYDISYGKKFKGYMLVVHDPSRVKVGYSSKLPVQGELTSQIARNKRAVAAINAGGFTDKSANSKWTGTGGNVEGVIISKGEVKYNSNKQGEFTGDVAAITKKGALVVGKHSIQELKDLNVQEAITFGPALVVKGQGTITSGDGGWGMAPRTAIGQRDDGAILMLVIDGRQASSLGATLKDVQDIMLQYDAYTATNLDGGSSTTMYHEGEVINNPANSLGERSVPSILYVEP >CP013847|610049:617036|610049_610871_+|AUN05667.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MKKKTTILSIFLAVFMALALNVGNVKAAATGQDIVNYAKQFQGTPYVWNGTTPSGFDCSGFVQYVYRNCAGIELPRDTYGQIKAGTRVSRDQLQPGDLVFPHTGHIGIYVGDGKIIHSPQTGDVVKISPIWKFYAGVRISGITNYSKEFIASVQRDLRKSRCYSGEATGNIDQKTKDAIWKFRGIVGLPVNTTLDNSVVTALNQIVKKPRLTVNTNLTYATKFVQWWIGSDKSGIYDNKMKENVRQWQIKAGVWSAAGADGIIREQDWNKILN >CP013847|610049:617036|614387_615764_+|AUN05672.1|DBSCAN-SWA MKLTYVLDTNVILYSPGAIFSFADNDVVIPEVVLEELDSFKKNNNDLGANARHAARIIDKLRKDGSLIDGIVLPGGGTLRVEMNHYDVKLPPSWDKNKPDNRIIQVCKGLKEKGEEVVLITKDTFERIKADTINIDVEDFYEKVVPEYESQYKGRCDAFASHSTLESFYKNKYMDVESLFFYSEEKNDYYKADININEFILIKSMENPKQTALGRYNGEKVVPLFYKDVKPLGISPRNIGQKFMLEAFLTDSKNAPLVIVKGPAGTAKTLFSLATGLHKVMEEGEDGYRKILICRPNVTMDEDIGFLPGTEEEKIMPFMRPIFDNLEILVDSDEKERYKNEKELYDKIKELFDRRIITTEAVAYLRGRSIVKNWVIIDEAQNLTPKQVKAVITRIGQGTKLILVGDPDQIDQPFLDSRSNGLCYASEKMKGSKLCYQVTLKDHECERSPLAYEGAKRL >CP013847|610049:617036|611913_612261_+|AUN05669.1|DBSCAN-SWA MTPIEIMEKIGACQRGLTKGNIELKALGVKKARAEHDYRIALRKEILRLRQLENQPATIINDLAKGKEDIAKLRLERDIAETNYSVYIESMRNLRLEIEAYRSFLTWERVELKNT >CP013847|610049:617036|611003_611147_+|AUN05668.1|DBSCAN-SWA MTILKDTKNIEKCNEVSVVRTMLKGVFLGLDFFNKECYAIPVYLNLF >CP013847|610049:617036|612939_613749_+|AUN05671.1|DBSCAN-SWA MKISNIKEITLFEHHFWLQILGDHSRFILNSLSPKEKSFIEEANRFKNLFDNLLRKSKQSLSEEEIFALNNHAYNAAMKIREFKLDIIDRQITDKIVISLPPTFINHMVNEVDEYIFILAKLMKENVSNIGPIHIHLLWLPDGAGHASNIASSLDITEKELIKKSNQYSKKFNNLYLRTIEYNGYTRTGICDFPALDSLNNNADETMSCFKEFLNELKKGVIEKKILGTIVPLVPDHMFREECYYLTKLSMVSNIKKPECDPTKSRVES |
7 | Clostridium_phage(33.33%) | bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1685572 : 1703120
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP013847|1685572:1703120|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP013847|1685572:1703120|1690216_1690528_+|AUN06620.1|DBSCAN-SWA MSQKKIFELNILNTMDITTIKECEGMKKGIHSKEQVHHLKFYKNGRTITAVMTDKTGMIKGVGVAKCNPKDTFDIKTGLVLAEMRAREDFYKSTANRFLWEEF >CP013847|1685572:1703120|1692009_1692294_+|AUN06624.1|DBSCAN-SWA MLTSELYADKETQLTMDQQDDRFCLKLSQLFNYDLSIVGQREVFEKLLELIEKNLYDETTTNELYEKLVEKELLLEQAESQIQSLEDRIEFLQR >CP013847|1685572:1703120|1698658_1699174_+|AUN06639.1|DBSCAN-SWA MNKETFKKTERMLYVYYRNLKEIRKLEYICARLEQQKEKVKKDIKETNIDLEEENISISYSERVQTSSQCSYCDREIEHQITKLENEWKSIRKKILKNRARIRQLEREIAPINYNISMLSEEAKEFIKLKYKEHRTIPCIAEMLYGGARMTAYRKREEILENINNFNKIIS >CP013847|1685572:1703120|1702733_1703120_+|AUN06648.1|DBSCAN-SWA MEENNKIPKAPSFLNKEAKDKYYNIAEMLVEEGKWKNGDDIALIALCSNYQRWVQAEKAIKANKDLCFETESGYRQQIPEISIANNAMKSMLSFIKEFSLTPRERVKLREMMLQSNNEDEEMEDMIVK >CP013847|1685572:1703120|1694461_1694650_+|AUN06628.1|DBSCAN-SWA MNNMTDGKKDGLALVYVKDSVAYPVALNEEQLEILDITLGMSLKEIKLINKPIGKVINLLEK >CP013847|1685572:1703120|1700176_1700473_+|AUN06642.1|DBSCAN-SWA MKQAVELNIKGIKCDNPNCDYRNDKVRFEDYKNWLNKPCPKCGTNLLTKEDLEMTKSLINIANIANRVLPKQNNEEERIKAIIEMNGTGRVDFKIKED >CP013847|1685572:1703120|1685572_1686622_-|AUN06611.1|integrase|DBSCAN-SWA MAVYKNEERGTYFCTFYYTDWTGKKKRKKKEGFKRQKDAKDYERDFLNKQKNDPGINFENLVNIYLDDIKNKIRFTTFRQKKLIVDLKIAPYFKDINLNNITPNHIRKWQNKIMENDYSDTYLRTINNQLSAIFNFAIRYYNLSSNPVVKAGPMGKKNADVMQFWTVEEFKTFIEYVKKPIYKLAFKILFWTGIRSGELLALTYKDIDLDRKIININKNYARINKKDIINPPKTLKSKREVTISDFLCEDIKEYKNKIYNLNENERIFTIAKQNINAQLNRTCKKSGIKKIRLHDLRHSHASLLIELGFTPLLISERLGHENIETTLNTYSHLYPNKHTEVAKELDKLY >CP013847|1685572:1703120|1696678_1696867_+|AUN06633.1|DBSCAN-SWA MNIIKVLNKDNTLKKYKAYLNGEYKGIYQLNTDGVLADKNLKGIEDRFYLWDIIHNFKFEEI >CP013847|1685572:1703120|1701526_1701712_+|AUN06644.1|DBSCAN-SWA MYIYEYMTYEGHPYQSAIVVADNKEEALEIVLKEVDRDCKWVLEGEHELKKGLITYGDADC >CP013847|1685572:1703120|1699501_1699771_+|AUN06640.1|DBSCAN-SWA MSSKIEKHKRICVDLNEIYKHKNHDYGDSFGETYKKLGIISAVTRITDKVNRLQSLCIQEQQIKDESMKDTLMDLANYSIMTLIEMRDK >CP013847|1685572:1703120|1698442_1698658_+|AUN06638.1|DBSCAN-SWA MKFSNKISDYIWTGFNINFIVLVIKIRFAITKIYSWKVSIFTDLICFILIGISFRLLVKQLIKITYEVGRE >CP013847|1685572:1703120|1688025_1688727_+|AUN06615.1|DBSCAN-SWA MKELQVLNNKNLTLESIEVTRMLGKEHKQLLREIRDISNILESENFSPSKYFIESEYITAQNKKHPCYLVTKMGCELLGNKLQGAKGTIFTAEYVERFNQMENIKIPKLSKEVQAIFTLDNRTMEIEEKVTNLENNIPLFNVECKELQALVRKVGIKTLGGYKTSAYNDRSLRTKVYSDIQGQLRREFGVTRYEAIKRKQLNKAKEILENYTVPVYLKEEIFSTNNQEEWRCI >CP013847|1685572:1703120|1697254_1697656_+|AUN06635.1|DBSCAN-SWA MKLEINGQELTHWETGKLIKRLPGMNDIVKESKKGRGCYQPYSKMKQYYQTIIYSKAVKLPGFNKVNITIDWYEPNAKRDIDNITAGSKFILDALVKASIIQDDSQKFVKALYHNIHIDKKNPRIEVTLKEVG >CP013847|1685572:1703120|1697655_1697982_+|AUN06636.1|DBSCAN-SWA MELQKLTKAIWDTSKRLDNGINTLNKKAKEYAEAERDYKIALAKEILILRESKVQATLIPDIARGNVGELKFKRDVAEVTYKSCKDMLQGLQAELSGYQSILRVQEDI >CP013847|1685572:1703120|1687824_1688025_+|AUN06614.1|DBSCAN-SWA MTISKTLKYERLKRGMTQKQFAELLETDRGSIAHYENGRVPLPPTLKKFSDKLDVDLAKALMEGDM >CP013847|1685572:1703120|1690881_1691379_+|AUN06622.1|DBSCAN-SWA MENQETFKITDLKGASWALRKIKECKESILEKEELAKAEKERIEEWLLDETKSDLVSLEYFNGLLLQYYKELKQKDPKAKISTPYGKVTSRKNKKWNYGNEEELIKYLASNGYDNLIELKEEVNKTELKKNFSVSNGMVLDKETGEIIPNISVEEVENISVKVVE >CP013847|1685572:1703120|1694661_1694940_+|AUN06629.1|DBSCAN-SWA MHLMILDKEETLPQELLKLQEEFKEVSNAIIANDKENTTEEILDLIQVSVGMLYTKQKTEDMDLEKEINKHNRKLLERGWEFKGKINIKINS >CP013847|1685572:1703120|1689254_1689452_+|AUN06618.1|DBSCAN-SWA MKKYRVKKEFIYDNTQLEYTDLYQQACNLGYAFVKDGNDYRMITINEYKTKPSLLQVDLVNLEII >CP013847|1685572:1703120|1702028_1702319_+|AUN06646.1|DBSCAN-SWA MDYDQRYNQALGYMLDLYTDNHTVDCITTEQFKELFDMFIDSKKDIDNILYNNEPMEEIVQLSNGEFRIRRISNGLEGKRIAQDICDNMRDVLSNM >CP013847|1685572:1703120|1691378_1692008_+|AUN06623.1|DBSCAN-SWA MNLYQKLIEIRKEVIKFSKDTEGHGYNYVSGSQAIAKIREKMDSLGVLLIPKIGATDNYTFDYVTSKGKECTDHIVKGEMFYVWLNAEKPEETLEIPWKLYGAQDDISKAYGSGLTYSERYFILKFFQAPTDELDPDKKDTAGRRSNKTGLSDAQINRLFAIAKSVGIDNKTVKSQVFTKFKTTDIAKLTKSQYDQVCEGYENMKKQEG >CP013847|1685572:1703120|1696876_1697245_+|AUN06634.1|DBSCAN-SWA MKECVICGRPNSEEHHVIYRSECRALIKCKKNLVYLCPVHHREKFGVHGKCGKELNRQLKLEFQNWLEDTFVKDFYGIEEIKDKLGISTNAVKSLSKLIRQKNSVFGREDIIIACMGGKRIV >CP013847|1685572:1703120|1694987_1695707_+|AUN06630.1|DBSCAN-SWA MNNLENSIKDCITKEIEKGIIEKVIAEQLEKCIEKSISDMFGWNGEIKKVIENKVKSVMIPYLEDYDYSEYITKLDSVLVDVLKSSALDNKKMLENFNELMTSEDIKGAITLSDIFKQWTEYCKETIDKDNIDMDYEGGYITTRFEVEEVSNSWSSYKTYMVTFECEEDEELKFEFSIQAWKPTADSKYTSNYKNSCDLRSLRYLNDFEILMMRISEGYENIILDSEGDSEDTFIEYEE >CP013847|1685572:1703120|1695746_1696100_+|AUN06631.1|DBSCAN-SWA MKAYKVYQQDLMGYEGDIVYCKNYNKAIEVFNSVVKKAIADVAGDIVDKADFGDEIASFREWNKDVEIISRKYPYLLYRKKGLLTAQVFYWERASYEYQEYDIVNSIAILEEIEIIE >CP013847|1685572:1703120|1693904_1694459_+|AUN06627.1|DBSCAN-SWA MEKAFIVSKESELFKDIEKYRKLENQQREFINKFFKENDIEANQYRVSGDGLCNVAFEEYEETITLYVIPTDKDKEKFSKMLNKPDNHYLQAFRKTSKIAKEFRKQIIDNHIVVNLYQPRIGDYFESIRWMGCNFSLFEHKNIMYLRVNSEVLKEDDNPKGLTEIKLSEFYKVQEELEKNKGDK >CP013847|1685572:1703120|1701726_1702011_+|AUN06645.1|DBSCAN-SWA MPAVIPTTRPRPKPPGQGRSKLITKEEVLQGYREVCLKYVNNKITEAYNKGEETVGLDTQYIDDELMKEIEREYEIVECVWAIDGIVYMYIKIL >CP013847|1685572:1703120|1688727_1688889_+|AUN06616.1|DBSCAN-SWA MFYTVDQITEMLQISKSKAYKITASLNKELKKMGYITIAGRVPKKFFEEKYYM >CP013847|1685572:1703120|1689044_1689239_+|AUN06617.1|DBSCAN-SWA MISIANLDKRICDIEECENTQTYREFIRESEKEFGIYPYPLDQEHVTDEILKDYVYFLDELWCK >CP013847|1685572:1703120|1686608_1686848_-|AUN06612.1|DBSCAN-SWA MKGDVELRKLRTKLGYTQETLGERIGVEQPYISRLENGEIEFMTIGKLKKLSRALQVHPVKLLEILLKEERKGKRNGCL >CP013847|1685572:1703120|1702330_1702534_+|AUN06647.1|DBSCAN-SWA MYRLNRLQSSALLGDIIQMYNSTHKAEPVAIEQLIDVIKVIVDYINQGEGIEVHVEECSCLSLLNDD >CP013847|1685572:1703120|1692304_1693192_+|AUN06625.1|DBSCAN-SWA MGEVKWKVKWIKIVTDIFDDEKILLIENMPEADSIIVIWFKLLCLAGKNNNSGVFMLNDKIPYTDEMLATIFRRPLNTVRLAINTFEQFGMIEVIDNVITIPNWSKHQTLDQLEERKEYMREYMKGYREKQKLLATGECKVNSKTNSKVNSKANVNPLDIEEDKDIDIEEDKDNTTEVVSSNKLQPIVDKWNSLNLNKLIAINKGTIRYKLLNARIKEYGIDNILKAIENIETRPFLKGQNKKGWTITFDWFVKPNNFIKVLEGNYTDKEGVNGGTKQDSSGNKKQEYDFSKYEG >CP013847|1685572:1703120|1699770_1700154_+|AUN06641.1|DBSCAN-SWA MDYSIQINNILDNLAKKFNVPVEKLFEILHKQAKVELLNNCLELIVWLVICTSIYIIIKKEIKKAKEEEYYDMFTDEGAWGVCKIIYIILGSVIGFAGVIISTQNIIQIFLNPNYYIMEQILKMLNK >CP013847|1685572:1703120|1701066_1701516_+|AUN06643.1|DBSCAN-SWA MLFKLCPYCGIKVPYDMEDCINKCKEKRNKLRNKEYDLYNRDKESTKIYRDKRWIKLTRQCKSKFDGLDIYQLYKHNKIVYGDLSHHIIEVKEDKNRVYDINNLIYVSGSKKHNTHAEIHTAYKKSKEDKLAMQAYLFKIVQRYKEEYK >CP013847|1685572:1703120|1697992_1698151_+|AUN06637.1|DBSCAN-SWA MEIGVLRAETKRYRSFKEKVMLVQKYENKYHVEDIGGWLSLIRRGERGTCTK >CP013847|1685572:1703120|1696113_1696578_+|AUN06632.1|DBSCAN-SWA MKIVKEKKDKGYIITVLVGSRGKNSYWTSPPVYGVDNHHYNFEKEYLVGRYPMINTKAKAETFSRLYRNLWIDVTPYQLDLMKHCIGLDYKKKPYRNYFCTSPDDKDWNELVGKGLAIKSNKEPNNGCICFWLSRQGVEYALGKSVSDKVYKEM >CP013847|1685572:1703120|1689705_1690029_+|AUN06619.1|DBSCAN-SWA MDYSNIYTYNNIPIKHYLEVLKMDKNWCTLLIAILREKPCTREHAAELYDKGTLFRNKRPKEDIEEMIRLRKQGLKFKEIAEIFCLDPSTVCTLVNKKKASCKKLKI >CP013847|1685572:1703120|1687016_1687379_-|AUN06613.1|DBSCAN-SWA MELKDILKNDRKQKEMTQEQYAELVGITRGTLSHLERGREPSIDTSKKLSKYFKKPISELIGKEKIQKLSTLETTNMVIDSLIKKGQIKEDAPISDEVKKLIWTSLELEINLKLKMAEQK >CP013847|1685572:1703120|1693121_1693892_+|AUN06626.1|DBSCAN-SWA MEGLNRILAEIRNRNTTSPNTKVDYKCNKCQDTTFVQGENGFTRCECYKKDLTKRRWAHFGIDPSKVKRISEYAVYSDITKRAKQVAIDYIRDYTTIKTKEENNLAFLGQPGAGKSHLAIGIGANLINKGICTNIVYMPYQEAIRELKANVMDDEYYIKLISKYINCELLIIDDLFKDKVKKGKLTGELKESDLKHIYPIINQRYINNKPTIYNSECTPNMLMDLDQALAGRILEKSNIVIFKYGLENNYRMRKFV >CP013847|1685572:1703120|1690750_1690909_+|AUN06621.1|DBSCAN-SWA MKDYYKGCIHFALQKVICQTDRGEQIIYEPTCMAIRCKREVKEEWKTKKLLK |
38 | Clostridium_phage(56.25%) | integrase | attL 1681021:1681036|attR 1692696:1692711 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1712736 : 1723376
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP013847|1712736:1723376|DBSCAN-SWA TATGGCTTCCAAGACTATAGGTGTTGTTCTTTCCTTGCAGGATAAAATGAGTGGCGGTTTATTAAAAGTAAATAAAAATGTTCAAGGAGTTTCTAAAGAAGCAAAGAGAGCTTCACAACAAGTTGCGAATTTTGCTACCAAAGCGCAAAAGGGCTTTGAAAAAGCCGGAGATAAAGTTTTGAAGCTAGGTGCAGGTTTGGCAACTCTTGCGGGTGGTTTAATAGTAAAGACAGGTGTTGAAGGATTAGGGGAATTAGACCAAGGTGCTAGAAAAGTTAAATCAATAGCACAAGATAGTTTGCAATTAGATAACATTCAAAAAGGTTTGCTTAAAACTTCCAACGATACTGGAATTGTAATAAAAGAATTGGCTGACACCCAGTATGATGCAATATCTAGTGGTGTGGCGGCCAACGAAAGTATACAAGCAGCAGTTACATCAGCGAAACTGGCTAAAGCTGGATTTTCAGATTCAAACAGTTCGCTCAAAATACTAACTTCAACCATGAATGTCTACGGGTTAACAGGTCAAAAAGCAATGCAAAGCATATCGGATAAACTGTTAGTTACACAAAACCTAGGTGTAACAACTGTTGGGGAATTGGCGAATTCGATGGGATCATTAACACCTATTGCCAAATCTGCTGGTTCTTCTATAGATGAAATGTTAGCAGGAATGGCAAGCTTAACAAAGAATGGATTGAAAACAGAGGAAGCGGTAACATCTTTAAAATCTGTGTTTTCAAGTGTAATTAAACCAACCGAAGAAGCTTCTAAAACCGCTCAGCAATTAGGAATAGACTTTTCAGCGTCTGCGTTAAAAAGTAAAGGATTTGCCAAATTCTTAGAAGAGATAAAAGTTAAAACCGGCGGAAATACTGAAACTATGGGTAAGTTGTTCGGAAACGTTAACGCGTTATCCGGTGCTTTGGTACTTACAGGAAAAGGGTTCGGAGACTTTAATACAAGTCTAGACGCTATGCAAAATAGCGTTGGGCTGACTGACAAAGCTTTTGAAACAATGAATAATAGTTTAATAAGTAAATTTGGGAAAATGAAAAACAGATTAACAAATATGGCTACTGAAATGATGCAAGGAACAGGTGGACAATTAGGAGTTTTAATAGATAACATAACAGGTAAATTAAAACAATGGCAGGAAGATGGGACTATAGAACAGGTCGCTAATAAAGTGGCGACTGGATTTATGAAAATGTATGACATTATTAGTAAGGTTATAAGCTTTCTAGTAGAGCATAAAGATGCAATAGCAAATGTAGCTATTGTATTTGCATCCTTCTATATAGCCATTAAAATTTTCAAGGTACTTAAAGGGGTTATATTCGGAGTACAGATTGCAATAGGATTGCTTAATGGTACTTTAATGCTTACACCTTTGGGATGGGTCATGGTAGCGATAACTGCTGTAATAGCAATAGGATTATTACTATGGAAAAACTGGGATAAAATAAAGCAAGTTGCCCAAACTTTATGGACAGCAATTAAAACAGTATTTACTAATATATGGACAACAATAACAACTGTATTCACTAATATCTGGACCACTATAACAACAGTGGCTAGTAATATATGGACCAGCATAACAACTGTATTCACTAATATATGGACAACAATAACTACTATATTTACAGCTATCTGGACCACTATAACAACAATAGCCACCAATATATGGTCAAGTATAGTTTCTATTTTTACAACTATATGGAATGTTATTGTAACAATATTTACACCTATTAAGTTGTTTATAGAAGCGGTATGGAAAGGCATATTAGCTGTAATAATAATTGTAGGAGCGTTTATTTGGAACGCAATTGTAACAATGTGGACTAACGTATGGAACGTTATACAACCTATACTAACAGCTATATGGAATGTTATAACAACAGTATGGACAGCTATATGGACCACAATAACAACAATAGCAATGGCTATTTGGAACACTATAGTAAACGCATGGAATACTATAGCCGGAGTTGTATCAGCTGTAATGTCTGCAATTTGGGGTGTTATATCTAGTATATGGAGCAGTATTTATGGAACTGTAAGTGGAATTATGTCATCAATTTGGAGTACTATAACAGAGATATGGAACAATATCGTATCTACTGTTAGCGATATTGTTGGTAATATCGCTAGTACAATAAGTGATGGGTTTAATTCTTTAATCGGAACATGTTCCGATATATTCAACAATATAAAAAATACTGTAATGGATATTTTTCAAGGCATATGGCAAGGGATTAAAGATATAATTAACGGTGGAATAGGTATGCTAAATAATTTTATTGGTGGAGTAAATAAAGTTATTAGTAAAGCCAATAAAGTTCCAGGAGTTAATATAGGCGCTGTATCGGAAATACCTAAATTTGCAAAAGGCACTCAATATTCACCCGCAGGAATGGCACTAATTAACGAAGAAGGTGGAGAGTTAAGAAAGCTTTCTTCAGGGGAGACAATTATACCAGCCGATAAATCTCGCCAATTAATGAGCGGGAATTCAAGTCCAGAAATTAATATTTATATAACTGGCAATGTAGGAACAGAAGAGTTCTTTAATCAAGCAGGGGAACATATAACAAATCAAATTAAATTAGCATTGCAAAATATGTAAAGGTGTAGTTTTATAACTATGCCTTTTTTATTTAAGGGGGTGTAATATGGCAAATATATATTTTAGTACATTAGATAGAAAACAATTGTACGAACTTCCCATTTTACCAGAAGAAATGCCGGAACTTAGTAAGAGTAGTAAAAATGAAATATTTGAAACTTTTAACAATGGAGAATATAACTTCCTAGGAGAAGTTAGTTTAATCAGTTTTAGTTTAGAAAGTTGGTTGCCAGCATATCCCAATAAGTATAGATGGGCTAAGAGCCAAATTAATCCTTATTTATTAATAAATATGTGGAATACAGCACAAAACACTAAGAAGCCTCTTAGGATTGTTATAAATAGAAATAAAAATACTTTTTTACCACAAGAATTATTAAACTGGATGGTTTCTATAGAAAATATAAGTTGGCATGAGCTAACCAATGGAGATGTAGCTTATAAATTAGATTTAAAGCAATACAGGGAGATAAAATAATGTGGTACTTATATACTTCCTATATTGTAGGGAAAGGATATACAACTAAAGAAATAATAGGGCAATGCAATAATTTAAGTTGGAGCAATGACGTAGATACATTAGCTACTTCCTTGTCTTTTGATTCTATATTAGATTTAGCAGAGGGAAGAAGTAAAATAATATTAAGACAAGACAAGATAACAGTTTTCGAGGGCGTTGTAGTAAATAAAAATAACAAAGAAAATGTCCACAGCTATACAGCTATGGACTATGCATGGTATTTAAATAAAAATAAATATGTAATGCAATTTAGAAATATAAATGCGAAAAGTGCATTACAACAGATATGTGCTAAGGTAGGTATTAAAGTAAATATAAGAACTAGATTAACTACTAGAATAAATAAATTGTATTTCCAAGAAAGTTTAAGCGATATAATAAAAGACATATTAGAACAATGTAAAAGAGAAATAGGGGAACATTACATAATGGAAATGCAAGGTAAAACACTTTATATTAATAGAGTTATAGATTTAAAAATTAATTCAACTGTATTAATAGAAAAAGATTATAGTATTAGTAGAAGCATAGAAGATATGCAAAACAATATAATAGCGGTCAATAATGATGGCAGAGTTTTAGCCAGTGTAAAAGATAATAAAAATATTAAAATATTCGGAGAACTAACGGACATTATAAGTGTAGAAGATGAAAATACAAGCCGAGCTAACAATATAGCACGTAACGAATTAAAAGAAAAAAATAAGATAAAAAAAGAACTCTCTTTTAATACAATAGATACTGGCAAAGGAATTTATATAAATTGCAATAGATTAATTAGAGTTAATCTAGGCAAATATGGTGTAAATGGGTGGTATAGAATAAAAAGCACACAACATACTTTAAATAATAATATACATAAAATAGGTATAACAATAGATTTTAGCTAGGAGGTTATATATGGATTATGGAATAGAATTTGCCCAATGGCTAAAAAAAAGAAATAATAAAGATAGAATAGGGACAACAATAGGAGAAGTTGTAAGAGGAGGTTTGGATTATAGAATAAGTATTATGGATAATAAATTATATCTAGATCCGAGCAATTCTACTTTATGCAACTCTTTAAAAGATAGAGTAGAAGAAAGAACTATAGAATTAAATAACACTAGCTACAATGCTAAAATAACATATAGTAATATTTTAAAAAAATATGATAAAGTGTTGGTTATTGAAAATGAAAGCGGCCAGCACTTTTTTATTGTAGATAAAATATAGGAGGTGTGAATATGGCACTACTTCCAGAAGAAGATATAATAATTGAAGAAGTGGAACAAATAGAAGAGGAACAAACTTTGTCTAAGTTAGGCAAGGTTTTTTTATTTGATTTTAAAAAGAATAAATATGTAATTAAAGATGGGAAACTAGTTGAATGTACAGAACGACAAGCGTTAGAGCAATGGATACATTGGATATTGCTAACTTATAAAGATAAATACAATGTTTACAAGGGTACAGACTTCTATTGTAATATAGAAGATTTAGCAGGAAAGAAAAGAAATGCATTTATTCTCTCAGAACTACAAAGAGAAGTTGAAGAAGCAGTTATAAAGCATAGATATGTAGATCATATAGAAAACTTTGTAACAACACAAGAAAAATCAATATTGAATGTAAGCTTTGATGTTGTTACAAAAGATAATGAAGTTATTAATATAAGTGCCTAGGAGGTGAAGGGTTGAGTGTAAATGTAAAAACACAGGAAAAATTAATTAAAGATATGCTTAACAACATATCGAACACATATGAGAAAAGCGAAGGACACCTTACATATGATATAACTAAAACTAATGCCATAGAATTAGCTTTACTATATCAATATGCTTTATCTATAGCCAATCTAAGGTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP013847|1712736:1723376|1722479_1722725_+|AUN06674.1|DBSCAN-SWA MKKEIRFLIIGLLLGACTRFIGIATAIEQAEDNCPSNGEYMYCTDQGKPLWISIYDVHQEEKFIYLRQPNSNKIIKLTQLK >CP013847|1712736:1723376|1715844_1716777_+|AUN06662.1|DBSCAN-SWA MWYLYTSYIVGKGYTTKEIIGQCNNLSWSNDVDTLATSLSFDSILDLAEGRSKIILRQDKITVFEGVVVNKNNKENVHSYTAMDYAWYLNKNKYVMQFRNINAKSALQQICAKVGIKVNIRTRLTTRINKLYFQESLSDIIKDILEQCKREIGEHYIMEMQGKTLYINRVIDLKINSTVLIEKDYSISRSIEDMQNNIIAVNNDGRVLASVKDNKNIKIFGELTDIISVEDENTSRANNIARNELKEKNKIKKELSFNTIDTGKGIYINCNRLIRVNLGKYGVNGWYRIKSTQHTLNNNIHKIGITIDFS >CP013847|1712736:1723376|1717607_1718675_+|AUN08852.1|DBSCAN-SWA MLNNISNTYEKSEGHLTYDITKTNAIELALLYQYALSIANLRLVKDLRGDDLTARVYDNKGIVRKVATRAKVILTLTGTGTIDKEDLFGTPNKIEFASLEKKQIEGTGTILAECTQVGNIGMVGANSIAEFPITIAGFTEVNNSNPSYDGFEEESDESLRQRYYESLKNPITSNNQAHFIYWAKSATGVGNAKVIPLWDGDLTVKVIIINSDMQPASVDLVNTVQEYIDPKGILDTNTNTWSLWGTGAGASAIGNYCTVVSATAKNIDLECSITKANGYSDEEIKQNISSKIAEYLKEIAFSATINYVSHAKIISLILSADGVLDATNVKVNGSLSENVIIGEEEVATMGAVTLI >CP013847|1712736:1723376|1720049_1720355_+|AUN06666.1|DBSCAN-SWA MKRGSLIIYDNSGKVWVNTGDAEGCIPPHTPPDGLPYIITEFGEFNDKIIKGIDVTVTPHKLITEDIPHIETEEEKLKKELLKAQSEVVNLKYKEVLNNIK >CP013847|1712736:1723376|1715413_1715845_+|AUN06661.1|DBSCAN-SWA MANIYFSTLDRKQLYELPILPEEMPELSKSSKNEIFETFNNGEYNFLGEVSLISFSLESWLPAYPNKYRWAKSQINPYLLINMWNTAQNTKKPLRIVINRNKNTFLPQELLNWMVSIENISWHELTNGDVAYKLDLKQYREIK >CP013847|1712736:1723376|1722286_1722469_+|AUN06673.1|DBSCAN-SWA MAKSKQTEANKKWYDKNKEHAKYLNKRSHTRSFIKNFAKLEDLEELQKLIEERKELLRQE >CP013847|1712736:1723376|1712736_1715367_+|AUN06660.1|tail|DBSCAN-SWA MASKTIGVVLSLQDKMSGGLLKVNKNVQGVSKEAKRASQQVANFATKAQKGFEKAGDKVLKLGAGLATLAGGLIVKTGVEGLGELDQGARKVKSIAQDSLQLDNIQKGLLKTSNDTGIVIKELADTQYDAISSGVAANESIQAAVTSAKLAKAGFSDSNSSLKILTSTMNVYGLTGQKAMQSISDKLLVTQNLGVTTVGELANSMGSLTPIAKSAGSSIDEMLAGMASLTKNGLKTEEAVTSLKSVFSSVIKPTEEASKTAQQLGIDFSASALKSKGFAKFLEEIKVKTGGNTETMGKLFGNVNALSGALVLTGKGFGDFNTSLDAMQNSVGLTDKAFETMNNSLISKFGKMKNRLTNMATEMMQGTGGQLGVLIDNITGKLKQWQEDGTIEQVANKVATGFMKMYDIISKVISFLVEHKDAIANVAIVFASFYIAIKIFKVLKGVIFGVQIAIGLLNGTLMLTPLGWVMVAITAVIAIGLLLWKNWDKIKQVAQTLWTAIKTVFTNIWTTITTVFTNIWTTITTVASNIWTSITTVFTNIWTTITTIFTAIWTTITTIATNIWSSIVSIFTTIWNVIVTIFTPIKLFIEAVWKGILAVIIIVGAFIWNAIVTMWTNVWNVIQPILTAIWNVITTVWTAIWTTITTIAMAIWNTIVNAWNTIAGVVSAVMSAIWGVISSIWSSIYGTVSGIMSSIWSTITEIWNNIVSTVSDIVGNIASTISDGFNSLIGTCSDIFNNIKNTVMDIFQGIWQGIKDIINGGIGMLNNFIGGVNKVISKANKVPGVNIGAVSEIPKFAKGTQYSPAGMALINEEGGELRKLSSGETIIPADKSRQLMSGNSSPEINIYITGNVGTEEFFNQAGEHITNQIKLALQNM >CP013847|1712736:1723376|1722147_1722300_+|AUN06672.1|DBSCAN-SWA MKILNYLLIISITIILLLLIKLTYNKRKKAKLEIEKHEIENKKGEDNGKE >CP013847|1712736:1723376|1720643_1720847_+|AUN06668.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MENEIIKLVATQGAFAVFFAYLLFYVLRENSRREGKYQDIIKELAEKLNVIEDVKKTVDKIEGKLEG >CP013847|1712736:1723376|1717116_1717554_+|AUN06664.1|DBSCAN-SWA MALLPEEDIIIEEVEQIEEEQTLSKLGKVFLFDFKKNKYVIKDGKLVECTERQALEQWIHWILLTYKDKYNVYKGTDFYCNIEDLAGKKRNAFILSELQREVEEAVIKHRYVDHIENFVTTQEKSILNVSFDVVTKDNEVINISA >CP013847|1712736:1723376|1720848_1721022_+|AUN06669.1|DBSCAN-SWA MDRVLRKITSARWLIAVIMTIVFAILAIKNTLNTEFITIYTMVVAFYFSKDRKEQDK >CP013847|1712736:1723376|1718686_1719217_+|AUN06665.1|DBSCAN-SWA MNIEQQLIANLHKRVRQDSYVKNLCNASGIEMDTIEDVLEDIKKQFKFETMTWSADLLASEMGIKLDPSLKQDEKNSIIAARWKSEGKADLNLLQAICNSWKNGNVKVSFIDGKIVFKFVGEYGIPADLDSLKKQIDLSKPSHLAIDYLFAYLLLKDVEEITLTKLENTTLNKFAF >CP013847|1712736:1723376|1721064_1721823_+|AUN06670.1|DBSCAN-SWA MKIGIDCGHTLSGADYGAVGIKAESNLTREVGTKVIAKLKALGHTVINCYKDSCSSLNDSLSYRTNTANNNNVDLYVSIHFNCYNGSAYGTEVFTYGGKSFTEASRVLNNICALGYTNRGLKDGSGLYVLKHTKAKAMLIECCFCDNAGDMNRYNAENMANAIVKGLVGTTVATPNKPKEVVKVQKPKYDETIPTGESIFKIPGTTGYIEQATDGRLIIHKDRGNYIAIGKGFIDCYWNDNKGNGCNKRLSN >CP013847|1712736:1723376|1722869_1723376_+|AUN06675.1|DBSCAN-SWA MENKKNKKPFYKKWWVWILAIIILAGLGQGTGDKKKAQKTATQQEQKKEDAKRDAEKKAKKEKEKKAKEEAEKKPKKEDNEATLITTAQGVVKKNLKAPSTAKFPWSFKEYNIQESKSENKDMIIYTVTGYVDAENSFSAKIRNNFIVKMECTKDLSKYRVLDVNITE >CP013847|1712736:1723376|1721971_1722112_+|AUN06671.1|DBSCAN-SWA MIEDIGKLIALVISILTIRQLSLQNSKTELEIKKLRLEIKRLKEGD >CP013847|1712736:1723376|1720370_1720556_+|AUN06667.1|DBSCAN-SWA MILYDLLKNLIDNNYYEKEDMNNKLNVFYTFNQIDIEQYSELMAKVNPAAKENTIEKVVTQ >CP013847|1712736:1723376|1716787_1717105_+|AUN06663.1|DBSCAN-SWA MDYGIEFAQWLKKRNNKDRIGTTIGEVVRGGLDYRISIMDNKLYLDPSNSTLCNSLKDRVEERTIELNNTSYNAKITYSNILKKYDKVLVIENESGQHFFIVDKI |
17 | Clostridium_phage(62.5%) | bacteriocin,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1824993 : 1833194
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP013847|1824993:1833194|DBSCAN-SWA ACTATGTCATATTTGAATATATATCATTAATTTTTTTACATTTATCCTTTATAATTTCTCTAATATGATTGGGTTCAAGTACTTCCACACATTCTCCGTAACTTAATATCATGGAATATATCCAGTCATCTTCTAATAAATATGTATCTACAATTACACTACCATCTTCTTGAAACTTTATTTCATCTTTATCAAAACAATCGTCTATTCTATATCTAACTCTTTCAGAAAACTTTAATACAACTCTTGTAGGTACTTGTTCACTCTCACTAATATTTATATATTCTTTATAGGAAATTCTATTTTCATTAATTTTTTCATGTAGAACAGTTAAATTTTCCATTCTTGATAATTTGAAAAATCGGTAATCATTTTTTAATTTGCAAAAGGAAAATAGATACCATGAAAAACCTTTAAAAACAAGAGTTAATGGCTCTACCTGTCTCCAATTATATTCACCTTTTGAGTTTCTATAATCAAAGGCTATACAGTTTTTGTTATCTACAGCATCATATATAATTTTGTATTTTAAGTTTTCTTCTTCACATTTTTTAAAGCCCCAAGGTAATGTATCTATACACATTTGCTCAAAATGTAAATCAAATACTTCTTTTTTTTCTTTAGGAACAATATTTTTTACTTTTTCAATGGCCATTTCAACATTTTTATTATCTAAAAATTTATTCATGTTTTTTAGAGCGTCTATAATTGAGATCATATCTTCTAATGTTAAAAGTTGATGATTGATTTTATAGTTATCTATAATATAAAATCCTCCATTATTTCCAATTTGAGAAACTATAGGAATTCCAGCAAGATTAATTGCTTCAATATCTCTATAAATTGTTCTTACAGAAACCTCAAATTTTTCAGCTAATTCTGATGCAGATATTTTTTCTCTATTTAAAAGCATTACAACAATTGCCAATAATCTATTAATTTTCATGAATCTATAAACCCCCCATAATTTGAAATGACTATTTTATTATATCAAATTAATAACTTGTAAGATTGTTTAGAGAGAAATTGTTGGGGGAATTGCATAAGAAAGTTTTAAAAGAATAAATTCAATATGGTAACTTTTAGGCTGTTTATGGGTATGAACTTGACTTAACAAATGTACTATAGTAAACTTATATCGTAAAAAAGAATAAAGACAGTTCGTAACCATCCTGTCTATAAATAAAACTAGGACGTAGCTACCGCCTTAGGTAGTTTTTTTGTTGATGGGCATTTAATGCCCTTTTTTATTTGCAAAAAATTTACAAATAGGATTTTTTTTAGGTGAAATTTTTAATTTATATAAAATTTAGAAATTGTTATTCAAGGACGCAGAGGTCTTATCCAATGAATTTTTTAACTTAAATATAACAGTATAAGGCTGTTTTTTATAAAGATTGTTCAAATATAACTTAAAAACCTTACAAGGTAGGAAACTTTAAATAGTTGTAAAATATCCTAATAAATAATAATTTATCATAACCATTATAACTTTTTAATGTTTTTAAGTCTAAGTTAGTGTAATAGATTGAAAAATCTATAGCGCAAGGAGGAATGAAAATGAAAAAAATAGGATTAACAACCACAGTACCGGTGGAAGTGCTTATTGCAGCAGGGTATACACCAGTAGATTTAAATAATATATTTATTACCTCAGAGGATTATTTAAAATACATAGATATAGCTGAAAGAGATGGTTTCCCCAAAAGCTTATGTGCTTGGATAAAGGGTATTTATGGAGCATGCCTAGAAAATAATATTAAAGAAATAGTTGGAGTTATGGAGGGGGATTGTTCTAACACTAAAGCCCTCATTGAGGTTTTTAAACTAAGAGGAATAAAAATTTATCCATTTTCATTTCCCCATAGCCATAATTTAAAGGATGTAGAAATTGAAATAAGAAAGTTCATGGATATCTTCAATGTTAACGAGGATAAGGTAGAACAGGTTAGAAAAAGATTAAATAGAGTTAGGAAGCTAGCAAAAAAAATAGATGAAATGACTTATATAGATAATAAGGTTAATGGTTTTGAAAACCATCTATATCAGGTGAGTTCAAGTGACTTTAATGGAAACATAGATGAATTTGAAGAACACCTTAAAAAAGTCATTGAGGGTATGGAGAAAAGAGAGTCAATAAATAAAAAATTAAGATTAGGCTATATAGGAGTTCCTCCAATGACTGGAGATATATATGAGTTTAGTGAAAAATTAAATGCTCATTTTGTATATAACGAAGTTCAAAGAGAATTTGCTTTTCCTAGGGGGATAGAAGCTGCAAATATATTTGAACAGTATTATAATTACACCTATCCTTATGATAATGAGTTTAGAATTAAGGAATTGAAAAAGCAAATAGAAAAGAGAAAGATAGATGCTATAATTCACTACACTCAGGCTTTTTGCCATAGAGCTGTTGAAGATATAGTATTAAAAGAAGAATTAAATATTCCTATGTTAAATATTGAAGGTGATAAGTTAAATACATTAGATGCAAGAACTAAACTAAGATTAGAAGCCTTTCTGGATATGTTGCTGGACTTAAAGCATAAGTAATAGGTGATCTAGTAAGAATTTTTATCTTAATATATTTTTGGATTTAAAGCAAAAGTAACAGACAGTATATAAAAGAAGTTCATGTTTTCTTTATATTTAATGAAGGAGGGGAATTAATGAGATTATTAGGAATAGACCTTGGAAGTAGAGAAGTTAAGATTGTTTTAATGGAAAACAATATTATAGTTCAAAAGAAAAAAGTAAGTACCATGAAATTTTATAGAGATTACTGCAGCTTTCATGGCAAGATTGTAGTAGATTTAGAAAAACTTAATATAAAAGGAATAGATAAAGCGATATCAACGGGTTATGGAAAAAATAATACGGATTTAGAATTTTTTACACCTATAAATGAGATAAAAGCCCATGTTTATGGTGGGATCTATCAAAGTAATTTAAAGGATTTTATACTTTTAGATGTAGGTGGTCAGGACGTTAAGGTGGTAAAGGTAGAAAAGGGCGTTGCAACAGATTTGGAGCTTAATGAAAAATGTGCTGCTTCCTGTGGAAGATACTTGGAGAATATGGCAAATGTACTTGAAATATCCCTAGATGAAATGAGCCAGTACTCGGAAAATCCCGTGGATTTAAATTCCACCTGTGCAGTATTTTCTGAATCAGAATTAATTGGAAAAATAGCCGAAGGGGTACACATAGAAAGGTTATGTGCTGGGGTTAATTACTCTTTGTATAAAAGGCTACAACCTCTTTTAAGTAAGTTTAGGGGGAAGAAATTAGTTATAACCGGTGGTGTTGCAAATAACCATTCAATAAAAAAATATTTAAATAATGATTATGAAGAAATAGTATCCGTAAAAGATCCTCAGTTTAATGGGGCTATTGGATGTTGTTATTACGGAAGCAAATTTTTAAAATAAACTTAGGAGGAAAAAACATGTATACTTTAAAAGTAGAACATAATTTTGATAGTGCTCATTTTCTTGCAGGTTATGAAGGTAAATGTGGAAATATTCATGGACACAGATGGAAGGTTGAAATTCAGGTTCAGGCAGAATCATTAGTACAAGGTGGTCAACTTGACGGGATGATAATAGACTTTGGAGACTTAAAAAAAGATGTTAAATCTATGGTAGATTATTATGATCATGCACTTATAATAGAGAAGGGAACTATGAGGGGGCAATCATTAAGCTCATTAAAGGAGGATGGATTTCGTATAATAGAAGTTAATTTTAGACCAACAGCGGAAAATTTTGCAGCTTTTTTCTATAAAATTATGAAGGATAGAGGATATAATGTAAAAAGTACTACAGTTTATGAAACACCTAATAATAGTGCTACCTATGAAGAAAGTGGGGTAATTTAAAATGGATTTTAAGGTGGTTGAAAGGTTTGTAAGCATAAATGGAGAAGGAAGGCGTTGTGGACAACTGGCTATATTCATAAGATTCGCGGGTTGTAATTTAAACTGTAGCTATTGTGATACACTTTGGGCAAATGAAAAGGATGTACCCTATGAAGTATTAAGTTCCAAAGATATATATGAATATATTAAGTCCAAAGAGGTTAAAAATGTAACTTTAACAGGAGGAGAACCTCTTCTACAAAAGGGAATAATGGAGTTATTAAAACTTTTGTCTAAGGATAAAGAGCTTTATGTGGAAATTGAGACAAATGGCAGCATATTATTAGATGAATTTTTGAATATAGAAAATTCACCAAGTTTTACTATGGATTATAAACTTCCTTTAAGTAATATGGAAAATAAAATGGCATTAGATAACTTTAAATATTTAACTAAGAAGGATACAGTAAAATTTGTATCAGGTAGTATAGAGGATTTAGAAAAAGCTAGAGAAATAATAAATAAGTATAACTTAGTAGATAAAACTAATGTATATATAAGTCCTGTTTTTGGAAAAATTAATTTAGATACTATTGTAGAATTTATGAAAAATAATAGAATGAATGGAGTTAATTTACAACTGCAGCTTCACAAGATTATATGGGAGCCTAGTAAGAGAGGAGTATAGTATATGGCAATTGATGTTAAAGCAATTGAAGAACACATAAGGGGGATTTTGATAGCTTTAGGAGACGATCCAGAAAGAGAAGGTCTAAAGAACACACCAAAACGTGTAGCTAAAATGTATGAAGAAGTATTCAAAGGTATGTGTTATAGCAATGATGAAATTGCAGAAATGTTTAATGTAACCTTTGAAGATGATTTATGTATAAATGATAATGAAAATGATATGGTTTTTATGAAGGAAATAGAAATATTTAGCCATTGTGAACATCATTTAGCACTTATGTACAATATGAAAGTAGCCATAGCATATATACCTAAGAAAAAAATTATTGGGTTAAGCAAAATAGCACGAATAGCAGATATGGTAGGACGTAGACTACAGCTTCAAGAGAGGATTGGAAGTGATATAGCAGAAATACTTCAGAAGATAACTGGCTCAGAAGATGTAGCT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP013847|1824993:1833194|1824993_1825938_-|AUN06768.1|DBSCAN-SWA MKINRLLAIVVMLLNREKISASELAEKFEVSVRTIYRDIEAINLAGIPIVSQIGNNGGFYIIDNYKINHQLLTLEDMISIIDALKNMNKFLDNKNVEMAIEKVKNIVPKEKKEVFDLHFEQMCIDTLPWGFKKCEEENLKYKIIYDAVDNKNCIAFDYRNSKGEYNWRQVEPLTLVFKGFSWYLFSFCKLKNDYRFFKLSRMENLTVLHEKINENRISYKEYINISESEQVPTRVVLKFSERVRYRIDDCFDKDEIKFQEDGSVIVDTYLLEDDWIYSMILSYGECVEVLEPNHIREIIKDKCKKINDIYSNMT >CP013847|1824993:1833194|1827664_1828426_+|AUN06770.1|DBSCAN-SWA MRLLGIDLGSREVKIVLMENNIIVQKKKVSTMKFYRDYCSFHGKIVVDLEKLNIKGIDKAISTGYGKNNTDLEFFTPINEIKAHVYGGIYQSNLKDFILLDVGGQDVKVVKVEKGVATDLELNEKCAASCGRYLENMANVLEISLDEMSQYSENPVDLNSTCAVFSESELIGKIAEGVHIERLCAGVNYSLYKRLQPLLSKFRGKKLVITGGVANNHSIKKYLNNDYEEIVSVKDPQFNGAIGCCYYGSKFLK >CP013847|1824993:1833194|1830319_1830979_+|AUN06774.1|DBSCAN-SWA MNKEKAIVVFSGGQDSTTCLFWAKKKYKEVIAVSFDYNQKHKLELDCAKDICKKYNIEHHILDLNLLNQLAPNSLTRQDITVDKSAPKEGVPNSFVDGRNLLFLSFVAVFAKQKGINTIITGVSQSDFSGYPDCRDVFIKSLNVTLNLAMDYEFEIITPLMWINKAETWKMAYDLGVLDIVKEETLTCYNGIKADGCGECPACKLRKKGYWEFEKYLMN >CP013847|1824993:1833194|1831272_1832091_+|AUN06775.1|protease|DBSCAN-SWA MEKFNENRGISIKESIKLFFEINIWLIIYGIPFTILAIYFKEHGLEVTYESIEQLGEIVAYIFIIKKIYKRFKSQENFRFKIKYKPTLKEGIFVIIATIAYIFVYDNTLGILLQKIPEADWVKNAFIEIESEPLLLQFSSLCLIAPIFEEIICRGIILEQLNKRCGATKAILISSLFFGIMHFNLHQGVNAFFIGVVMGVIYVKTDPLLLTILLHFVNNLYCLIAQYIPYLDQIESNFSVVRLICGVILLFLVYRFFNNSKIDLDRKLNLEA >CP013847|1824993:1833194|1828443_1828875_+|AUN06771.1|DBSCAN-SWA MYTLKVEHNFDSAHFLAGYEGKCGNIHGHRWKVEIQVQAESLVQGGQLDGMIIDFGDLKKDVKSMVDYYDHALIIEKGTMRGQSLSSLKEDGFRIIEVNFRPTAENFAAFFYKIMKDRGYNVKSTTVYETPNNSATYEESGVI >CP013847|1824993:1833194|1828876_1829542_+|AUN06772.1|DBSCAN-SWA MDFKVVERFVSINGEGRRCGQLAIFIRFAGCNLNCSYCDTLWANEKDVPYEVLSSKDIYEYIKSKEVKNVTLTGGEPLLQKGIMELLKLLSKDKELYVEIETNGSILLDEFLNIENSPSFTMDYKLPLSNMENKMALDNFKYLTKKDTVKFVSGSIEDLEKAREIINKYNLVDKTNVYISPVFGKINLDTIVEFMKNNRMNGVNLQLQLHKIIWEPSKRGV >CP013847|1824993:1833194|1826552_1827548_+|AUN06769.1|DBSCAN-SWA MKKIGLTTTVPVEVLIAAGYTPVDLNNIFITSEDYLKYIDIAERDGFPKSLCAWIKGIYGACLENNIKEIVGVMEGDCSNTKALIEVFKLRGIKIYPFSFPHSHNLKDVEIEIRKFMDIFNVNEDKVEQVRKRLNRVRKLAKKIDEMTYIDNKVNGFENHLYQVSSSDFNGNIDEFEEHLKKVIEGMEKRESINKKLRLGYIGVPPMTGDIYEFSEKLNAHFVYNEVQREFAFPRGIEAANIFEQYYNYTYPYDNEFRIKELKKQIEKRKIDAIIHYTQAFCHRAVEDIVLKEELNIPMLNIEGDKLNTLDARTKLRLEAFLDMLLDLKHK >CP013847|1824993:1833194|1832237_1833194_+|AUN06776.1|DBSCAN-SWA MINIFSKKDSKKDNKNDTIEQEVIVEEKHEVETIDTMKFLKEMTIQIEGIIQQHNKVNGEHEVLEKLAKQIENHMVTVSNLTERTNESTDKLFSQGESLLEITKDTVNKSLEGKKSIEGMVKVIENLDIETKDTYENINALGEKLKEIGEIAQLISGIASKTNLLALNAAIEAARAGEQGKGFAVVADEVRKLAEMTGESSSNITNLISGIDSQTKNVLNSVEKSTLVVTEGVKSSKGALEKIEEVLDSFNRVEDDTDSLIKTINTQKEDISKIFNGINGVDKILTETNEQIIKHIDEAHKVDEKLEKSVYHIAQYVK >CP013847|1824993:1833194|1829545_1830136_+|AUN06773.1|DBSCAN-SWA MAIDVKAIEEHIRGILIALGDDPEREGLKNTPKRVAKMYEEVFKGMCYSNDEIAEMFNVTFEDDLCINDNENDMVFMKEIEIFSHCEHHLALMYNMKVAIAYIPKKKIIGLSKIARIADMVGRRLQLQERIGSDIAEILQKITGSEDVAVIIEGEHGCMTTRGIKKPGTKTITTTLRGRFNTDPIVSNKLMMLYTK |
9 | uncultured_phage(33.33%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
2061053 : 2145100
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP013847|2061053:2145100|DBSCAN-SWA ATTATTTAAAATATTTTCCTTTCTTTCTAATTATAGATATTAGTTCATCAGAAATTTTATTCATATTAACTTTAAGCTCTTTACTGATTTTCAAAGTGTAATCTATATTAGAAACTTCAATAGCTAGAATGTATCCCTTTATTTCATTATAATAAAGTTTAACTAAGTCTATAAAACTATAGCTATGTTGGGTATATCCATTTTTATGTGATGTATAAGTATCTAGAGGTAATATTGTTATATCTCCTATTTTTTTACCATAGTATCCCGCATCTAATATAAATAAGAAATCCTCCTTTTTTATTCTTGAAAGGCAATATTCAAAATCCGTTTCTCCTATTATAAGATCTATATGATTTTCTTTCAAAAATCCCTCAATATTTTTAGCTATTTTTATGGCTATACCATCATCACCCATTAAAATATTTCCTATAGAAATAACTTTAATAGCTATACTAATACTTCAACTTTAACTGGTTCATTATTATTACTTACTAAATGGGTGGCACAGGAAATGCAAGGATCAAAAGAACGAATTATTCTTCCTATTTCTACGGGTTTTTCTATATTATCTATTTTTGAGCCTATTAAGGATTTTTCTCCTACACCTCTTGTACCCTTTGAATCCTTAGGAGATATATTCCAAGCTGTAGGAGTTATAATATTATAGTACTTTATAGTTTTATTCTCTATTTTTATAAAGTGTGATAAGGCTCCCCTAGTAGTATCTATAAGACCTTCTCCAAAGGCGCCTTCTGGAATATTATATGCAGATTGATTATTAGATAGTAATTGAATCTTTTCTGATATATTATATAATATATTTATTATTTTTTTAGTTTCTAGAACACGGGCTATATTTCTATCCATAGAGGAATTGCCTCCGGTATATTCTCCTGCAATTTTTAATCGAGCTAGAGGACCTACTTCCATAGGTAAATCAGCATATCTAGGTGCTTTTACGAAACTATAAGCTCCTTCTTTTTTTAAATCTACAGTATATTCATTGTTCATAATCGGATTTTCTATTATAGTATCGCTTACATACCAAGCATAGCGAATGTTTTCTGTTATTTTATCTCTATCAAAATTTTCTAATTTATTATTTATTATTACTCCCGGTTTTACATAGCTTATATTTTTATCCTTATATTTATCAAATACACCAAAACTCATAAAATTCCCATAAGTGTTTCCAAGATTAAAATATTCAGGGTAATACTGAGCAATTATATTCATATCCTCTAACATATAGATATTTACAAACTTTTTTATTGCCTTTAATATGGATTGTATTTTTGTTAATTTGTAAGAATCTATATTTACAGTAACTCCTCCTACGAAAATACCATGACTATGAGGTGCTTTACCTCCCAATACAGCTAAGGCTTCATGGGCTAACCTACTATATTTTATGCCCTCTTCATAATGGGAACTTATTCTTTCATTTAGCTTTTTAGGCAATCTAAAATCACTATATTCCTGAGGGTATATAGGTCTTATATTAGGTAGGTTTACATAGCTTGGCACAGTAAAACAATAAAACTGCCTTAGGTGGTTTTGTATAAATTCAAATCCATGCATCATATCTCTTATATATATATCATTTATACTTGGAGTTATATTTAATGCATTTTCTAAAGCTAAAGTAGATGCCGTAGCATGGGCAGTAGAACATATGCCACATATTCTTTCAGTAAAATATATAGAATCTAAAGGAGGTCTTCCTTCTAACATTTTTTCAAAGCCTCTAAATAATAATCCGCTGGTTTCACCATCTACAATAATGTTGTCTTCTACCTTTACCTTTATTTCTAAAAATCCACTAATCCTAGTTATAGGATCAATAGTAATAATCTTTCCCATAATGACCTCCCATTTTTATAATTCAAAGTTTACTTAGTTATCTTAAGCATAAATAATTTAAACTAAAAAATTAATATACTTTATTTTTTAAACTATAGAAATTAATACCTAACAAAGGGCTCCATACCATCTGGAAATCTTTCTTGGGCACAGCCTATACAATTTGTGTTGTCTCCAATAGGCCAATTTACATAACCATTCCATTTTCTTCTGGGGCAATCTGTTTTTGTAACAGGTCCTCTACATCCTAACTTAAACATACATCCTTCTTCTCCAAATTTTTTGGCAAAGATTCTTTTATCAAAAAAGCCTCTTCTTGTACAACTATCATGAATAGTTATTCCATAAAATAATATAGGTCTCCCTTTATTATCTAATTCTGGTTTACCGTAAGTAACTAGATGAGCTAAAGTACCTACCACCCAGTCAGGATGACAAGGACACCCTGGTAATTTTATTACTTCTTTATTTATAACAGCGTCTACGCTTTTGCTACCAGAAGGATTAGGCTTAGCTGCAGAAATACCACCATAAGAAGAACAGGTTCCTACAGTTACCACATATTTTGCTTTTTCACCTGCCATTTTTATTGCTTCTAATGCGGTAACAGGTTTTCCTTTATAATTAGCAATAATGTTATAATAGCCATTTTCTTTAGTGGACACAGCTCCATCTACTAATAATATAAATTCTGTGTCCAAGGTATTTAAAAACTGTTCATATGCAAATTCTCCTTCAGCTCCCATTAAAGAATTATTAAAAGTTAAATTAACTATATTTCTAAGTATATAAATAAGCCCTGGATTTTCTGCGTTCAAAAGAGAAATTATATTTCCGGAACAGCCTGTTACTTCTAGCCATATAGCATTTATTTTTTTTGTTTTTTTATGATTAATTGATTCCATAGCTTCTTTGCAAAGCATTTTTGAAGTGGTATCTTTCCTTTCAATTAATGGGCAAAAGCTATTATTCATTACTCCTCCTAAAAATTTATTAATTACCATATAAAAAATATACTCCAATAAATTATATAAATAAAAATTATTTATTATGCTATTGGAACATAAATAAAGTTTGTGTGGATCTATTAATAATACTTAAAATTATTAATGATTATTAGAATTAATTAAGTTTTTTATTACATTATTGTAATGTTTCTGTAATATAAATAAATTCCTCTATGTCTTGTAAACATATATAATTCTATTCATAAAAGGAATGCTTAAAGGAGGTTTTATATTATGAAATTAGATAGTTTTAAATTAAAAATTATAGCAATGATACTTATGGTGTTAGATCATTTGCCTAAAGCTTTTAATAACACTCCAATATGGTTTGGATGGCTTGGTAGGTTGGTAGCTCCTATATTTTTCTTTTTTGTGGCAGAAGGATTTTTTCACACAAGGAGTAAGAGTAAATATTTAATAAGGTTATTTGGATGGGGCGCAATCATGTTTGCAGGATCATCAATATTAAATTATGCTCTACCAGGAAAGGAGCCTTTACAAAATAATATATTTTTATCCTTAGGATTATCAGTACTTTTGATGTGTATTATTGATTATACTAGAAAAAGTAAAAATTATAAATTTGGTATTCCGTTAGCTATTATAGTGAGTATAGTATCTTTGTTTACAGAAGCATCTTTTGATGGAGTATTAATGACTTTAGTTTTCTACTTTTTTAGAGAGGATAAAATTAAATTATCTATTGGATATATTTTAATTTCTTTATTTGAATTTATTATGGTTAGTGGTGAAGGGCTAACTTATTTGAATTTATTCGTATTAAATTACCAATGGTTAATGATTTTTGCTCTTCCTCTTATTCTTATGTATAACGGTGAAAGAGGACTAAACAATAAATTTATAAAATATATGTTTTATGCTTTTTATCCTATACATTTATGGATAATTACTATAATATCTCACTTTCTAAAATAATATAAAAAGGTTAGTACTTATACTGTATAATTGTAGATTTTACCCGTGGTGGTTATTTAATATCTACAATTATATTTTTATTTCTGATATAAAAATTAGGTAGGGTTAATATTTTTTTACTTAAAATATTAACCCTACTACATATAATAAATAAATAAAAATAAGTATTTAATATATATTAATATTATATTAGAAAAAACTTTAAAAAAGCATTGTAGTTATATGAGTTTTTTTTGCATATAATGATAGTATAGAGATATAACAAAACCTAATTAGTGTTTACTTATGACTATACTAGGTGGTAAAATTATGGTATACTATAAAAAAATTCAAATTTCGTAGAAGTGGATGGCTACGGTGGTTGTACGTTTTCCACCTTGGGCTATAGATGATTTTTCATTATAGCTTAAGGGGGTGGTATTGGATATGCTAGAACTTTTAATAAAAGGAGTTTTTGTGATTTGTATTATTAGTTTAATATTGAAACACAATCTTTTTATTTCCACTATAAAAATTAAGGTTAGATTTCTTGGTTTAGATATAGAAGTTGATAGCAAAGAGAAAAAGCACCCATCCTCCAAAGATTAGTGCCTTTTCCCTTGTTTAACATATTTATAATTTAAAAATCCAATAGCCCTAAAACAACACCATTAAAGTGGTAAGCAGTTGTACCAAATAATAAATTTGGACTTTTGCTTAAAAACGTTCTAGGATCGGCTTAGTGTTCTCAGCACTGAGCCTTTTCTAATTAGAATTTTTAAAAACTTGGTTTTAAAGTTCTGTACTTCTCAGTTTGCCTGTGAATTTTACCTAATATATATTATAACAAAAATTATATAAAAATAAACATAATAACTTAATTAATATAAATATTTTATAACCATAAATATTATATTCATATACAGTACTTTCAGTACTATAAAAATTAAAAAATATATTTAGTACTTTTTATTAATGACCCTAAACTTTATTTATTATAAATCCGAAGAAATTATTACATAAATTCAAAAAATATAATAAAATTTTTGAACTGTATTCCATTGCTCTAGACATATATACTTGTAAATTTTTTTATTCAGTATATATTTATATTAATTATTTTCTATGAAACATAGATTTTATATTATCATTATATGTTATTAAGGGTACTTTTTCAATGATTTTATTGTAAATATAGTTAAATCATACATT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MKFNGWNSFEDLARACGYTNSHKDSDNTSETSNNNATNESCNMGCYDIPNGFQSLNPQLFVAIGGILGDILAGSIPANVQAALGNWLLLVGQAIVTFNAQQIYFQQGPGRYFNPQNYNVDNPFCQTTSQNTTQNNSSSKNSKNSSKSKEKNSNSDYNKKSSSKNKVDKIEELELRINQLISEVERIKNEIEK |
82 | Clostridium_phage(58.06%) | integrase,bacteriocin,head,portal,terminase,protease,capsid,tail | attL 2102953:2103012|attR 2145240:2145337 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2565788 : 2614259
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP013847|2565788:2614259|DBSCAN-SWA TTTAATAAATATCTTCTGGATTATCAAACGTTACATTTCCCTTTTCATTAGTATTTATTCCTTTATTATCAGCTTCATCAAATATTTTTGTTAGTATTAAATACATAAGCAAACTTACTCTAAAAGTTGAAGATAAAAATAGAACACATAGAACAGACCATATAACTGATATAAGAATATATACTCTTTGTGAAATATTAGAAATATTTTGCCCATATATCATTTCCAAGACTAAAGACATAATAACAATAATAATTCCTGCTATTATAGGTTTTATAAAATACTTAATTAATATTTTGTCTCCATTATTTTCTTTAATTCTTATAACTACTTTTTCATCAGAAAATCCCAATAAAAATCCCATCAACGACATTAATACCCCTATTAGAATGGAAACAAAAGTTATTGTGTTGGAAAAAAGTTGTTCATAATGTTTTAATTTGTTTATCTCAAATTTAAAATATAATGTAACTATTAAAGTTAATATAACACTAATTAACACACCCCAACGTTCCAGAAAATTAATCAGTACCTCCTTTTTACCAGTCATACTATCACCTCTTAAATTTTTGCAGAAATAATTTTAAATTTATTCGAATATGATCCTAACAATCTTGTATATACTTCTCTTACTTTAATTGTATCACCTTTTTCAAATTTTATGCTAAAATTATCCCTAATTTTATTATTTATTAAATCAATAGTTTCAATTTTGGTCCCTGAAGATTCTTTAACATCAACTTCCAAATTTTTTATATTTTCAAATCCTAAGCCCGGGGTATCTCTTAATTCATTTAATCCTGTTAGTTCATTAGAAACTAATAATTTATCCATAGAATCCTCTTTTTTTAAGCTTGCGGATAATCTAACTTTTACCTTATTAATACCAAAACCTTTACCAGAGTTAATCATACTATATATAGTTCCAGCATGTTTTTTTAAAAGTTTATTTTGTTCATCTGTATATTTCTTAATGTTATCTATTGTAATTTCTACATTTTTATAAATAATCGTATCATCTACTTTTAAACCTTTTTCATTTGGTATTATAGCAAAATGTAATCCATTATCTCCAAGAATATCTTTAAGCATCTTAGATAGAAATTGTAAAATAGCAGTTGGAAATACACCCTCTCTATTTCTAGCTATTATAAATATATTTTTTTCTCCATCATAAATGCATGGTGTAGGAGAAGCTAAATGTTGTTTATCTTCAAGTGCATCTTTTAGCTTTTCTTCATCATAATTTCCTTCTTCATCAGCGACTCCAAGCAATTCACTATCTTTTAATCTAATAAAAGTAAGCTTCCATAGATCTTTGCAATTTTCTAGATTATCGAATGTTTCGGTCAATCTTTCAATACTTTGTAATCTTACTGTATCTCCGTTATAAAAAATAACTCTTTCCTTTGTGTCAATTTTTTCAATTTCGCTCAACTGCTTAGATAGATTATATGGTTCGCTTTCATCATGATTATTTTTTTTAATATACAACCTTAAAAAATCTACATTAAAAAATCTTTGTTTAAATTTTGGTTTTTTATTTACCATTTTATATCTCCCCTTGTAATTTTATTCTTGCATTTTCAATAAAATCACCTTATACTAGAGGTAATTAGAATTAAATATGCTTTTGTTATTAGAACTATTGCTGACCTCTAAATCTACAATAGTTTCTTTTTATATATCAAATGTTAATATTTTCATCTTTTGTATGTTATTCTACAAATTATTATAAATTCCTTCAAAAAATAAAAAAATAGGTAACTATAGCATAAAACTACAGTTACCTTTAAAATTAATATCTTATATATTTAGCATATACATATCCACCATGTGGAGGATAATAAATATGCATCCAATCTCCTTCTTTACGATATAAATTAACCTTGGCACCATTAGGTAAAGCACCTAATATTCTACTAGATGTAGATTTCTTTTCTCTAATATTTACACCACTCGGTGTATTTATTGTACCTGTTTTACCATCTAAATTAATCCAACTATCATTATTACTTGTTGGTTTGCTTGGTGTGCTATTGCTTGTAGTTTTCCCTACTAGTCCTTTAACTATAGCATTAGCCATATTTTCGGCATTATATCTGTTCATATCTCCTGCATTATCACAGAAACAACATTCTATTAGCATAGCTTTAGCTTTTGTATGTTTCAATACATAAAGACTAGAACCATCTTTTAAGCCTCTATTTGTATATCCTAAGGCACAAATATTATTTAATACCCTTCTAGCTTCTAATAATTCCTTTCCTCCATAAGTAAAAACCTCAGTTCCATAAGCACTCCCATTAAAACAATTAAAATGGATAGATACATATAAATCTACATTATTGTTATTAGCTGCATTAGTTCTATAACTTAAACTATCATTTAAACCACTACAACTATCCTTATAACACTTAATAACTGTATGCCCTAATGCTTGTAATTTACTTATTACTTTTGTTCCTACTTCTCTAGTTAAATTAGATTCTGCTTTTATTCCTACTGCTCCATAATCTGCACCAGACATTGTATGTCCGCAATCAATCCCTATTTTCATAAAATTACCTCCTAAAAATTTTTAAAAAAGAACAGGTCTATTCCTGCTCTTTACTTTCTTTTACTGCTTGTCTAGCTGAACTTTGTCCAAAGTAAAACCCTATTATTAATGTAAATACACTCAAAAATTCTGTACTGGATAGATTCCCTTTTGCACTTAAAATGCAAAATACTATAGTAGTTAATAATGCTATTATCTTTTTAATCTGTAGAAATTGTTCTAAAAACTTCATTTATACGCCCACCTTTCTATTTAAAAATATTATGTTGAATTGCATATAAAAAAAAGCTTACTAAGCCTCCTACTGTTAATCCTACATACCACTTCATAATACCTACAAGCTGCTTTAATTGGTCACAAAGATTCTCAATTTTAGCATCTGTCCTAGATTGGCTTTGTTCTATTTTATCAATTCTCTTTGAATGATCATTAAGCCTAATATCATGAACATTAATTTTTTCTTCTATCCTTTTATGTTTTTCTTCGCAGATTTTTAATTCCACATTACACCTCCAGTAATTAAAAATAGGCAAAATAAAAAGACCTTCTTGGTCCCTACTTTGCCTTTATTAAGTTTTTATTTACTTCATAATATTTATCTATTCCGTCTTAAACTTCTGGTGTATTTTGTAGTATATAATCCTCTATAGCTTCTCTATAATCTGTATTTGTCACATCATCTATTATATAAGTCTTGCTTGTTTTAGGATTTAATCCATTATTAACTATTCTCTCTGCACATATTCTTACTATCACCATATTAATTTCCATTATAAAATCCCTCCTATATTATTGTCTGCTTGAAGCATTAATTGATTTTCTAATTCTTGCTTTTCTCTTTTTAATCTTTCTTCTTGCGTTTCTATGTGTGGAATATCTTCTGTTATTAATTCCTTAGTTTCTACATCTATACCTTTTACAATTTTGTTATTTAGCTCCCCAAACTCTGTAATTATATAGGGTAAACCATCTGGTAATGTGTGAGGGAGTACATCCCCTTCAGCATCCCCAGTGTTTATCCAGATTTTACCCGTATTATCATAGATAATTAAACTACCTCTTTTCACAGCTATTCACCTCTCTTATTCAAAAGCTATCCATTGAAATGTAGTATCTTTGCTTATATGACCATTACTGGCATAAAAGTCAAAACCTCTATTATTTTTGTGTACATATCCGTCATCCAGTATTATATACCCCCCACTATACCAGCCTTGTGTTTTGTATTTAAATAGTGTACAATCAATTGCGATATAGGGTTCTCTATAGGTATCACTTCTAGTATTAATAATAACTGTTTTTGGGCTAAAATCTAAATCAGTAACAGACATACAAACTTCTTTATTAGAACTTTCTCTAGCCTTTCCTGTTCCTTCAGCCCATTTTTTACCAACATTGATATTATTAATTTTATTAATCAAGTCTTGCAAATTTTCTGTGCTTGATGCACCTTGTTCTTTTTTGCTTAAATTAGTTACAAAAGTATTTTTTAATATTTGTATCTTATCATGTTGTTGTTGAAACGTGTCAGTAGCCAATAATGGATTTCCCACAACATCAGATATTAATTTTTTACCATTATTGGCAGAGGTAAAAAGCTCATTTATAGCTCCTGTGATTGTTTTGTCTTTAGTTAATCTTTTATTATCTGTCGTAATATCATCCAATTGTGACTCAATTGTCTTTCCATCTTCTGTTTTTATATCTGATGCTTTTAATTCTATTGCACCAGTTTTACTATTTACAGAAGTTACTGGGATTTTAATATTTTTTATTTTATTTTCAAGTATTTCAATTTCAGACTTTTTAGCAAAAATTATAGTTGGATCTATCTTAAGAGTTATATTTTCTGTATTAGAAACTGTTAATACCATTTTCATTATTAGCTCTTTTGTACTGCCATCTTCAGCAAGTGGTTTATAGCTTTCTGCACATTTAGCTATAGCTAACATATTATTATCTTCATCAAATACCCCATATTCCCTAATCATAAAGCCGCCAACATTTGCAGGAATCATCATCTCTACGTTTATCCAATTAGGATTTTTCTCATCTATAGCCACATGAGTTATATTACCTTCCCATACTGTATTGATTAAATCTTCTTGATCTTCTCTTGGATTGTAATAAGATCCTCCACCATCCCCAACTTTCATTTTTACAAAGTTAATTTTACTTCCAAATCCAGCACTATTAGCTATTTTAGCTTTGCCTATTTCTGTAAGTAAAGTATAGAATTTTTCTGCCAAGTTTATCCCTCCTTTGGATATGTTGTTATAGTCTCTAATCCTGCATTCTGTGCTAATGCTATTTCTATGTTTCCAGTTGTTTCAATATTGTTTGGTGTCCATGGATATACAGTTATAGTTTCTCCACTAAAAGAAGTTGCTCCAATATATAAATTACTTTCTGTCAATGAAATTAGCTTATATTTAACAGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP013847|2565788:2614259|2587189_2588716_-|AUN07422.1|DBSCAN-SWA MEKQARTIRDTLLKLPDNEIAERKRVFTDYYYYKGKSIDLEKAKQNPALYGQNWPVDDNVDYSPTQDIRNKVKPLLKKQARWMFGKKPTLIFKADDLKDKEQCEELRKFIEDVFENNNFWNNTRKAFLEATIKKRVLLRAEANPGDPVTIKYESIENFFYKEKNGKLLKAIFFEEDEMNVYKEEDKDKIYYLHTYYYNADENTKALQAWYRKETYKNIELQKELTIDQDTGFSIIPCWLIRNGGELNNTFGESDITDLRDAQNQYNKRNSDFADALRFQMFGSESIIDGNEDDVNRLTIVPNAVHAIKTRDEALAEGKQATIQRQEYNIGSSSALDSYLDRADSDMKETLDMPKISDLNNIPSAKAMVYLYNDLIARCEEKFNDWEKPLLSLMNFIIEVGSVCYPGIFNKAWVQMKYTKIIKQNYPIPNDEDEKKTLAMKEVEADVRSRKSYIKEYSDEEDVEKAFEEILDEKAMMINAESDQYNKALDNELDNLDDKSNNKGIVGDE >CP013847|2565788:2614259|2610603_2611038_+|AUN07455.1|DBSCAN-SWA MNKIIKNQVNKLIKKYNTHNAFEIADELGIIVIKEPLDDNINGFYQYFKRNRIIYINSKLDEHNQLIVASHELGHAILHSKLNIVFLEENTFCVKNRYEKEANMFAIELLLQDKILNQYIGYTLDQISAAESIPLELLKLKFKV >CP013847|2565788:2614259|2595874_2596870_-|AUN07432.1|integrase|DBSCAN-SWA 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MRRLSMMGSSKYEFNPEQFNEDVKKHRENYRRKEEKITKILEEFINQDTYQDRNFRIITKVLKMLKIRYDL |
70 | Clostridium_phage(34.69%) | integrase,portal,terminase,capsid,tail | attL 2589925:2589942|attR 2611340:2611357 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_7 |
2658514 : 2698278
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP013847|2658514:2698278|DBSCAN-SWA 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MNYTMYLGINDGEEGFILPVLPEKIEFDEDGNNKTYDIINLGEINTINKPKLMEISFESFFPKHKGPYVSSEKLFEPSFYIAKIREWRDKKQKIRFIFTGSPLEINDLFTIESFKPSEEGGEVGDIHYSIELKRYKNYAAKKIVIVTSKTAAANQSVKKVIANSKATRPSNTNKPKTHTVSGNDTLWHIAKRYLGDGNKWPQIYNLNKDKIKNPNLIYTGQVLRLP |
48 | Clostridium_phage(83.33%) | portal,terminase,tail,coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
3254740 : 3264176
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP013847|3254740:3264176|DBSCAN-SWA TCTAGTGTTTAAAATGTCTTATTCCTGTAAATACCATAGAAATCCCTTTTTCATTACATACCTTTATAGATTCTTCATCTCTTATAGAACCGCCTGGTTGAATTATAGCTTTTATTCCCCATTTTGCAGCTTCTTCTGCTACATCTCCAAATGGGAAAAAAGCATCTGAAGCTAAAACTACGCCATCTCCAGCTCTATCTAATGCTTCCTTTGCTGCCCATATTCTATTTACTTGGCCTCCCCCAATACCTTTTGCCATACCATCTTTAACTACTACAATAGCGTTGGATTTCACATATTTAACTACTTTCATACCAAATATAAGATCTTTCATTTCTTGCTCTGTTGGAGATTTTTCTGTAACTACTTTTGTATTTTCTAATAATTTATTATCACTCTTTTGTACTAATATTCCTCCATCTACCTTTGCCATATCTTTTCCTTCTGTAGATTTTTCTTCACATTTTATAACCCTTAAATTTTTCTTGTTTTTTAAGACTTCTAAAGCATCTTCATCAAAATCTGGTGCTACAACTATTTCTAAAAATATTTTTGCAAGATTTTCTGCTGTTTCCTTATCTACTTTTCTATTAAAAGCAACTATGCCACCAAATATAGATATAGGATCACATTCATAGGCCTTAGTATAAGCTTCCTGTACAGTATCCCCTATAGCCACACCACAAGGTGTATTATGTTTTAATGCACAACAAGCCACCTCTTCAAATTCACAAACGGTTTTCCACGCTATATCCATATCCTTTATATTATTGTAGGATAATTCTTTTCCATTTAACTTTTCAAAATTTTTCATAGGATATTTTCCAACAGTAGATGTGTAATAAGCTGCTGTTTGATGAGGATTTTCTCCATATCTTAAATCCATGTTCTTTTTATAGGATAGAGTTAAATATTCTGGATATTCCTCTTCTAATAAGAAATTACTTATAGCTGCATCATAGGCTGACATTAGATTGAAAACTTTTCCTGCTAATTTTTTTCTAGTTTGTGTATTAACCTGATTATTTTCTTTTATCTCATTTATGACATTTTCATAATCCTTAGTATCTGTTAGTACTACTACATCTTTAAAATTTTTAGCTGCTGCTCTTATCATAGTAGGTCCACCAATGTCTATAAACTCTACTTTTTCATCAAAACTTAAATTTTCTTCTACTTTATTAAAGAAAGGATATAAATTCACTACTACCATATCTATAGGGTTTATGCCCTTTTCTTCTATTACCTTCATATGCTCTTCATTATCTCTTATAGCTAATATGCCTCCATGAATTAAAGGATTTAATGTTTTTACTCTTCCATCTAACATTTCTGGGAAACCTGTTACCTCTTCTATATCTATTACTTTTACTCCATTTTCTTTTAAATGTTTATAAGTTCCACCTGTAGATATTATTTCTACATCTCTACTTTCTAAAAACTTTGCCAAATCTAAAATTCCTGTTTTATCAAATACACTTATTAATGCTCTTTTTATCACTTAAACTCCCCCAGTTTCAATATTTTTTATTATCTTATTTATCTGTCATAAGTAACTGCCACCAATATACCTTCTTTCAAAGAAAACATATAAGTGGCACTATTTCAATTTACAAACTACAATTTTTTATATTTCAATAAATTTAATCTACTCTAAACACATTTTTCTATTAGTTTCATTTATATTAATAGTAATTTTTTCATTATTATAAATTTAGTATGTTTTAATAAAAACTTTTCTTCCTTGTAATTTTACTTTTTCTTCACTTATAAGTTTTATAGCTTCTGGTAATGCCTCATGTTCTTTTTCTAGAACTCTTTTTTGCAATATTTCTGCTGTATCTTCTGCAAAAACTGGTACAGATTTTTGTATTATTATAGGTCCACTGTCCGTACCCTCATCTACAAAATGAACAGTGCACCCAGATACTTTTACTCCGTATTCTAATGCTTTTTGGTGCACTTTTATACCATACATTCCATCTCCGCAAAAGCTTGGTATTAATGAAGGATGTATGTTTATTATCTTATTTTCAAATTTATTTACCAAATCCCCATTTAATATAGAAAGCCATCCTGCTAAAACTATTAAATCTACGTTTCCATATAAACACTCACATATTTTATTAGACAGATTGCTTTTATATATTTTTCTATCTAGAGTTAAAGTTTTAATTCCCTTTTTTTCTGCTCTTTCTATACCATAAATATTAGATCTATCCCCTATAACCATTTCTATCTTGCAATTTTTTATATATCCCTCTTCTATTTTATCTATTATAGATTGAAGATTGCTTCCTCCCCCTGAAACAAGTACTGCAATTTTAAACATCTTATTCTCCTTTAATTTAAAGAAAATTTTTCATATATACTCTATAAATAATTAATTCCCCAATCAATTATTTTAAAGATCTAATCTATGAACTAATTTTTATTATAAATTTATTTAATGCCTTTTTTAAATTAGTTCAACAGACTTATCTCCTTTTTTAACATATCCTATTTTATAACCCTTTTCTCCCATTTCTATCAGGTCTTTTATTATATTTTCCCCATCTTTTTCATTTACACATAATACAAAACCAATCCCCATATTAAAAGTATTGTACATATGATCTTCTTCTATCCCTAAACTTATTAGATGGCTAAATATATTTGGTAATGGATAAGATTTTTTATTTATAACTGCTGTAAAATCCTCTTTAAACATTCTAGGAATATTTTCATAAAAACCTCCTCCAGTTACATGAGCCATACCTTTTATATTATATTTTTCTAAAAGTTTCATTACAGGTTTTACATATATTTTTGTAGGAGTTAAAAGAGTATTTCCTATTTTATTTCCTTCAAAATCTTTATGTAAATCTTCTACTAATTTTCTTATAAGAGAATATCCGTTGCTATGAGGTCCTGAAGATGCTATACCTATTAATATATCCCCATCTTCTATTTTACTTCCATCTATTATTTCATCTTTTTCTGCTATACCTACAGCAAAACCAGCTATATCATATTCCCCATCTCTATAAAAGCCTGGCATTTCTGCTGTTTCTCCACCTATTAGAGCACATTCACTTTGGATACAACCATTGCTAACCCCTTCTACAAGCTGAGCTGCAACTTCTGCTTCCAATTTCCCACAAGCTATATAATCTAAGAAAAATAACGGCTTAGCACCATGACATAATATATCATTTATGCACATAGCTACGCAGTCTATTCCCACTGTATTATATTTTTTCATTCTAAAGGCTATATCTAATTTAGTTCCAACTCCGTCAGTTCCTGATACTAATACGGGATTTTTATATTTAGGAAGTTCAAACATTCCTGCAAAACTTCCTAAATTATTTAATACTCCCTTTGTAAATGTCTTTGAAGCATGTTTTTTTATAAGATCTACTGATTTATAACCTTCCTCTATATTAACCCCAGCTTCTTTATAAGATACCATGAATAACATTCCCTTCTTTACATTATTAGTTATTCTCAAAATTTAAAAAACTTAAATTCCCTATTCCAAACTATCTTTAGGCATTTCTATAGGTGCAGATATAGGATATACGCCATTAAAACATCCCAAGCAAAAACCTTTATCTTTATTAAGTGTTTCTACTAAGCCTTCCATACTTATATAAGCTAGACTATCTGCTCCTATTTTTTCTCTTATTTCTTCTACTTCTGAGTGAGCACCTATTAAATCTTTTCTATAAGGAGTATCTATTCCAAAATAGCAAGGATATTTAACCACTGGAGATGATACTCTAAAATGAACTTCCTTAGCTCCAGCTTTTCTTAATATTTGTACTAATCTTTTACTAGTAGTTCCTCTTACTATGGAATCATCTATTATTACTACTCTTTTTCCTTCTACATTTATTTTAAGTGGATTTAGTTTTACAGATACAGCTTTTTCTCTTAATTCTTGAGAAGGTGCTATAAAAGTTCTTCCCACATATTTATTTTTTATAAATCCTATACCATAAGGTATTCCTGAAGCTTCAGCATATCCTACCGCAGCTGGTATACCTGAGTCTGGGACTCCTATAACTATATCTGCCTCTACTGGGTATTCTTCATAAAGTTTTCTTCCCGCTCTAACCCTTGATTCATAAACATTTATACCATCCATAGTACTATCTGGTCTTGCAAAATATATATATTCAAAAGCACAGGTATGACATTTTGTTTTTTCTGTAAACTTAATTGAATTTATTCCACTTTCGTCTATAATAACTATTTCTCCAGGCTCTATATCCCTTATAAACTCTCCACCTACACAATCAAAAGCACAACTTTCCGAGCTTAATAAATAATCATCCCCAATTTTTCCTAGGCACATAGGCCTTATACCATGAGGATCACGTGCTCCTATTAACTTATCTTCTGTAAGTATAACGATAGCATAGGAACCTTTAATTGCTTGTATTGCATCTACTACTGCTTTATCTATACCTTTTTTAGCGCTTCTTGCTATTAAGTTTAATAATACCTCTGTGTCTATAGAAGTTTGAAAAATACATCCGCCATCTTCTAAAAGTTCTCTTATAACTGCTGCATTAACTAAATTACCATTATGAGCTATAGCAATAGAACCTAACTTATAAGTACCTACTATAGGTTGTGCATTATCTGATTTACTCGCTCCTGTAGTTGAATATCTAACATGTCCTATAGCAGAATTTCCTATTAATCCTTCTATAGTTTCTTTGCTAAAAACATCCGATACAAGACCCATACCCTTATGATATTTAAATTTTTCTCCATCAGATACTACTATTCCTGCACTTTCTTGTCCCCTATGTTGAAGAGCATATAATCCGTAATAAGTTATTTCTGCTGACTTTGATTCATTATCTTTAGAAAATACTCCAAATACCCCACATTCTTCTTTAAACTTATCTCCTTCTAAATCAAAGGGCATATTTTCATTTAAATCATCTAACATATAGCACATACTCATTTTTACTCCCCACTTATTTTCTATTTTAAAAATTTAATCTTCTCTTAGATTATTTCCAGCTGCTGTAAAAATAATTTTAAACTATAACAATCTATTTATTGACTCTTTTTAATATTTCCATATAAGCTTCTTTTACATTTCCCATGTCTCTTCTAAATCTATCTTTATCTAACTTTTCTCCTGTGCTTTTATCCCATAATCTACAAGTATCTGGGGATATTTCATCTGCTAAAAGGAGCTCACCATTAAATCTTCCTATTTCTATTTTAAAATCAACTAAATTTATTCCTTGCTCATCAAAGAATTCTTTTAATGTATTATTTACTTTTTCTGCTATAGAATACATTTCTTTTAGTTCTTCAAAGGTTGTAAGTCCTATAGCCACTGCATGATAGTCATTTATAAGAGGGTCATTTAAATCATCATTTTTATAACTTATTTCAAATACAGTAGTATCTAATTTTCTTCCTTCTGAAAGACCTAATCTTTTTGCCATACTTCCTGCTGCTATATTTCTAACTATAACTTCTAGTGGAACTATTTCTACTTTTTTGCAAAGCTGTTCTCTTTCATTTATCTTTTCTATAAAATGTGTTTTTACGCCCTTTTTTTCTAAAAGTTCAAATAACATTGCCGTTATAGAGTTATTCATAACTCCCTTATCTTCAATAGTTCCTTTCTTTTCCCCATTAAAAGCTGTGGCATCATCTTTATAATACACAACAACTGTATCCTTATCATCCGTTCTGAATATTTTTTTAGCCTTTCCTTCATATAACATATCCTTCTTTTCCATTATAACTCCACTCCCTCTTTGTTATCATTTATAAATTTTTCTTTCATATTTTTTCTATATTCTATAAGTTTTTCTCTTAACTTTTCATACTTTAAAGATAATATTTGTACCGCAAGCATTCCTGCATTATAACTATTATTTATACCTACTGTAGCTACAGGTATAGATTTAGGCATTTGAACTATAGATAAAAGTGAATCCATTCCTCCAACTGCAGCCTCTATAGGCACTCCTATAACCGGAAGAACCGTATGAGAAGCTATAACCCCAGGTAAATGTGCTGCAAGACCTGCCCCAGCAATTATACATTCATAACCTTCCTTTTCTAAATCTTCAATTGTTTCCATCAACTTTTCTGGTACTCTGTGCGCTGAAAGTATGTAAGCTTTATATTCTATACTAAACTCTTTTAAAGCTTTAGCCGCTCCCTTCATTTTATCAGTATCAGATTTACTTCCAAAAATAATAGCTACTTTCATGTACTAGACCTCCTTATATTTAAATATATAAAAAATTCCGCTAAGATTTCTATGGAGAATCCTAAAGCGGAACTTAAGCGCACTGCAAAAGCATAGCTAAGATTCATCCATAGACAGGGAATTTATGGTTCCCTCGTAGAGACTCTCAAACCTTATTATTGAGATTATATGGATGATATATTCATTTGTTTTATGTACTCATGGTAACATACAATTCTTAATAAATCAACATATTTTAAGAAAAATATTCGTATTTTATTGGTATCTTTTTTATGTTTTTATCATAATATTCGTACCATGACGAACATTTCATTTGATGAGAAATTCACTTTAATACATATTATATATATATGTCTGAAAATAAAATAGATTTAATTTTTAAATAGCAAACAAAAAAAATAAACATATAAATAAGCTTTAACATTTTTATCTTTTCAAATTAGAAATCTTGTTATTCATTAAAGGAAAAACGTGAAAAACCGGTGGCAAAGCTAAAATTAGCATCTCCACCGGGTAAAACTTTATGATAAAAAATTTAAACGTTTCAAAAATAAGCAGTTTATATATATTTTTTTATATTTGCATAGTTAAAATTAAATCTATTTTAGAATAGTTTCATGCAAAAAAATTATTTTTTCCTTCTATAAGCAGTATCCTCAAGTGGAAGCTTTTTTCTAAAGTTTCCATCAAATTTATAGTAAGCACCTTGAGCTGCTGGGGCTGTTGGTATGGTTGTAATTTCTCCTATTCCTTTTGCACCATAAGCTAAATCATTAGTATTCTTTTCAATTATTGTTGTTTCAATTTCTGGTATATCAGTAGCTCTAAACAAACCTAATGTGCCAAATTTAGCAGTTGGGATAGATTTATTTAATGGATAATCTTCTGTAAATGCATACCCAAGTCCCATAACTATTCCACCTTCAATTTGTCCTTCTACATTAGTTAAATTTATAGCTTTTCCCACATCATGTGCTGCAACCACTTTTTCTACTTTTCCATCATCATCAAGAATAACAACTTGTGTTGCATAGCCATAAGCCACGTGGCTTACTGGATTCTTTTTATCAGAATTAATAGGATCTGTAATACTTTCATATTCCCCATAAAATTCTTCACCTTCACACTCTTCTAATGATGTAGTTAATAATTTTTCCTTAAGCTTTAATGATGCCATTCTTGTGGCTTCTCCAGTAAATACTGTTTGTCTTGATGCTGTAGTTGTCCCTGAATCTGGTGCAAATTTTGTATCTGGTAAATCTAAAATTATCTGTTCTGGTAATAAACCTATTGTTTCACATATTATTTGTGTAAGAATTGTTCCAAGACCTTGACCTATGCAAGCTGCACTAGTTCTTATATGAACCTTTCCATCTATTACTATTAAGTTACATCTTCCAATATCCGGTATTCCAACACCAACTCCTGAATTTTTCATACAACAGGCTATTCCTGCACATTTACTCTTTTTATATACATCTTTCACAGCTAATATAGTTTCTTTAATTGCAGTTCCTTTATCGGCAATTTGTCCATTAGGTAGTGCATCTCCAGGTTCTACTGCGTTTTTAAATCTTATTTCCCAAGGAGATATACCAACTTTTTCAGCTAAAAGATTTAAGTTGCACTCTGATCCAAAAACTGATTGTGTTACTCCAAATCCCCTAAAAGCTCCTCCTGGGGGATTGTTAGTATATACAGCTGTACCTTTTATCTTCACATTAGGGCATTTATATGGGCCAGCTGCATGAGTACAAGCTCTTTGAAGTACAGGTCCTCCTAATGATGCATAGGCACCAGTATCTGATATAATATCTGCTTTAAAAGCAGTTAAATTTCCTTTTTCATCACATGCAGTAGTAATTGTCATTTCCATAGCATGTCTTTTAGGATGAATCTTTATACTTTCCTTACGACTTAAAGTTATTTTAACGGGCTTTTTAATAGTCCATGCAAGAAGAGCGGCATGATGTTGTACACTCATATCTTCTTTTCCACCAAAGCCTCCACCCACATATTTGCTAATAGTCCTTACTTTTTCTTTAGGAAGCCCTAAAAGCTCAGAAATCTCTCTCTGCTCATCATATATACCTTGGCTTCCTGTATAAATAATAACTCCATCCCCATCTGGCATAGCTAAAGCACTTTCAGGCTCTAAAAAAGCATGTTCAGTAAAGGGAGTAGAATAATGATTAGTAACCACATACTTAGAATTGGCTATTGCCTCATCTACATCTCCTCTATTAACTTTTTCCACTGTTAAAATATTTCCCTTAGGATGAATTTTAGGAGCATCTTCAGCTATTGCAATATTAGGATTAGAAATAGGTTCTAATTCTTCATATTCTACCTTTATTAAATTAAGTATTTCTTTTAAAGTCTTCTTGCTTTTTGCTGCCACTAAAGCCACTGCATCACCAACATACCTTGTTTCTTCTCCTACGGCTATCATTGCTGGCCAATCCTTTACAATATGTCCTATAAGCCTATTTCCTGGGACATCTTCTGCTGTAAGAATAGCTTCAACTTCTGGATGTTTTAAAGCTTCACTTATATCAATGCTTTTTACTAAAGCTCTAGGATATTTTGATCTTAAAGCAGAACCATAAACCATTCCTTCTATCTTCATGTCATCTACATATTTTCCTATACCTAAAATTTTATCTTTTGCATCTATTCTTGGAATATTTTCACCTATTTTCCCTTTATATTCTTTCGCAAATGGAAGTTTACCATTTCTAAATGCCTCTGCTGCCATTTCAATGGCTTTTATTATTTTCACATATCCAGTACATCTACATACATTTCCTCTAATAGCAGTTTTAATTTCTTTCTTATTTGGATTTAGATTTTTATCTAAAAGTGCCTTTGCACTTATTATCATCCCTGGAATACAATATCCACACTGTACTGCTCCAGCTTTAGAAAAAGCCCAAGTAAAAACATCCTTTTCAAATTCTGTTAACCCCTCTACAGTCTTAACATCTTTTCCATTCACCTTTGCAGTTGTACATATACAGGCTCTAAGTGCCTTACCATTAACAAGTATCATACAGGCTCCACAGGCTCCTTCTGCACACCCATTTTTTACTGAAGTTAAATCCTCATTATCCCTCAAATATTCAAGTAAATTAATATCCTCTGAAACAGATACATTTCTTTCATTTAATATAAATTCATACACATTTATTACCCCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP013847|3254740:3264176|3254740_3256240_-|AUN08031.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVFDKTGILDLAKFLESRDVEIISTGGTYKHLKENGVKVIDIEEVTGFPEMLDGRVKTLNPLIHGGILAIRDNEEHMKVIEEKGINPIDMVVVNLYPFFNKVEENLSFDEKVEFIDIGGPTMIRAAAKNFKDVVVLTDTKDYENVINEIKENNQVNTQTRKKLAGKVFNLMSAYDAAISNFLLEEEYPEYLTLSYKKNMDLRYGENPHQTAAYYTSTVGKYPMKNFEKLNGKELSYNNIKDMDIAWKTVCEFEEVACCALKHNTPCGVAIGDTVQEAYTKAYECDPISIFGGIVAFNRKVDKETAENLAKIFLEIVVAPDFDEDALEVLKNKKNLRVIKCEEKSTEGKDMAKVDGGILVQKSDNKLLENTKVVTEKSPTEQEMKDLIFGMKVVKYVKSNAIVVVKDGMAKGIGGGQVNRIWAAKEALDRAGDGVVLASDAFFPFGDVAEEAAKWGIKAIIQPGGSIRDEESIKVCNEKGISMVFTGIRHFKH >CP013847|3254740:3264176|3256453_3257071_-|AUN08032.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLVSGGGSNLQSIIDKIEEGYIKNCKIEMVIGDRSNIYGIERAEKKGIKTLTLDRKIYKSNLSNKICECLYGNVDLIVLAGWLSILNGDLVNKFENKIINIHPSLIPSFCGDGMYGIKVHQKALEYGVKVSGCTVHFVDEGTDSGPIIIQKSVPVFAEDTAEILQKRVLEKEHEALPEAIKLISEEKVKLQGRKVFIKTY >CP013847|3254740:3264176|3258253_3259702_-|AUN08034.1|DBSCAN-SWA MSMCYMLDDLNENMPFDLEGDKFKEECGVFGVFSKDNESKSAEITYYGLYALQHRGQESAGIVVSDGEKFKYHKGMGLVSDVFSKETIEGLIGNSAIGHVRYSTTGASKSDNAQPIVGTYKLGSIAIAHNGNLVNAAVIRELLEDGGCIFQTSIDTEVLLNLIARSAKKGIDKAVVDAIQAIKGSYAIVILTEDKLIGARDPHGIRPMCLGKIGDDYLLSSESCAFDCVGGEFIRDIEPGEIVIIDESGINSIKFTEKTKCHTCAFEYIYFARPDSTMDGINVYESRVRAGRKLYEEYPVEADIVIGVPDSGIPAAVGYAEASGIPYGIGFIKNKYVGRTFIAPSQELREKAVSVKLNPLKINVEGKRVVIIDDSIVRGTTSKRLVQILRKAGAKEVHFRVSSPVVKYPCYFGIDTPYRKDLIGAHSEVEEIREKIGADSLAYISMEGLVETLNKDKGFCLGCFNGVYPISAPIEMPKDSLE >CP013847|3254740:3264176|3261605_3264176_-|AUN08037.1|DBSCAN-SWA MGVINVYEFILNERNVSVSEDINLLEYLRDNEDLTSVKNGCAEGACGACMILVNGKALRACICTTAKVNGKDVKTVEGLTEFEKDVFTWAFSKAGAVQCGYCIPGMIISAKALLDKNLNPNKKEIKTAIRGNVCRCTGYVKIIKAIEMAAEAFRNGKLPFAKEYKGKIGENIPRIDAKDKILGIGKYVDDMKIEGMVYGSALRSKYPRALVKSIDISEALKHPEVEAILTAEDVPGNRLIGHIVKDWPAMIAVGEETRYVGDAVALVAAKSKKTLKEILNLIKVEYEELEPISNPNIAIAEDAPKIHPKGNILTVEKVNRGDVDEAIANSKYVVTNHYSTPFTEHAFLEPESALAMPDGDGVIIYTGSQGIYDEQREISELLGLPKEKVRTISKYVGGGFGGKEDMSVQHHAALLAWTIKKPVKITLSRKESIKIHPKRHAMEMTITTACDEKGNLTAFKADIISDTGAYASLGGPVLQRACTHAAGPYKCPNVKIKGTAVYTNNPPGGAFRGFGVTQSVFGSECNLNLLAEKVGISPWEIRFKNAVEPGDALPNGQIADKGTAIKETILAVKDVYKKSKCAGIACCMKNSGVGVGIPDIGRCNLIVIDGKVHIRTSAACIGQGLGTILTQIICETIGLLPEQIILDLPDTKFAPDSGTTTASRQTVFTGEATRMASLKLKEKLLTTSLEECEGEEFYGEYESITDPINSDKKNPVSHVAYGYATQVVILDDDGKVEKVVAAHDVGKAINLTNVEGQIEGGIVMGLGYAFTEDYPLNKSIPTAKFGTLGLFRATDIPEIETTIIEKNTNDLAYGAKGIGEITTIPTAPAAQGAYYKFDGNFRKKLPLEDTAYRRKK >CP013847|3254740:3264176|3257197_3258193_-|AUN08033.1|DBSCAN-SWA MVSYKEAGVNIEEGYKSVDLIKKHASKTFTKGVLNNLGSFAGMFELPKYKNPVLVSGTDGVGTKLDIAFRMKKYNTVGIDCVAMCINDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAEVAAQLVEGVSNGCIQSECALIGGETAEMPGFYRDGEYDIAGFAVGIAEKDEIIDGSKIEDGDILIGIASSGPHSNGYSLIRKLVEDLHKDFEGNKIGNTLLTPTKIYVKPVMKLLEKYNIKGMAHVTGGGFYENIPRMFKEDFTAVINKKSYPLPNIFSHLISLGIEEDHMYNTFNMGIGFVLCVNEKDGENIIKDLIEMGEKGYKIGYVKKGDKSVELI >CP013847|3254740:3264176|3259793_3260498_-|AUN08035.1|DBSCAN-SWA MEKKDMLYEGKAKKIFRTDDKDTVVVYYKDDATAFNGEKKGTIEDKGVMNNSITAMLFELLEKKGVKTHFIEKINEREQLCKKVEIVPLEVIVRNIAAGSMAKRLGLSEGRKLDTTVFEISYKNDDLNDPLINDYHAVAIGLTTFEELKEMYSIAEKVNNTLKEFFDEQGINLVDFKIEIGRFNGELLLADEISPDTCRLWDKSTGEKLDKDRFRRDMGNVKEAYMEILKRVNK >CP013847|3254740:3264176|3260497_3260977_-|AUN08036.1|DBSCAN-SWA MKVAIIFGSKSDTDKMKGAAKALKEFSIEYKAYILSAHRVPEKLMETIEDLEKEGYECIIAGAGLAAHLPGVIASHTVLPVIGVPIEAAVGGMDSLLSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQILSLKYEKLREKLIEYRKNMKEKFINDNKEGVEL |
7 | Synechococcus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
3413683 : 3436543
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP013847|3413683:3436543|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP013847|3413683:3436543|3428335_3428701_-|AUN08188.1|DBSCAN-SWA MANMNRGKISKKIYEQLEKKDLLREIKILRIGKNAFDEKLDEVYVCTIKGYYYRNNSNIITTSMEGLEFNNLYNDKLLIIYNDISSKIQKDDYFILDGTKYEIVDTGNIQNLVFDMILNRV >CP013847|3413683:3436543|3428700_3428985_-|AUN08189.1|DBSCAN-SWA MRTPLEILKFNLQEKQYPYFEDKELELLLEINNNDVEKSSYKGCILKAIADDGIEVAGVKLQSNRAYWLTLAEHFKEEQKILKNQISVERVDEH >CP013847|3413683:3436543|3420091_3421069_-|AUN08178.1|DBSCAN-SWA MSLPKYIINFEELTEDLKNHLLSLIDDNIRINYPEINTNNIQNLLQQLKDLLPSVQYEGLKKKIDTFIYRKIEGIQKVKGILLDIPAIQNDYKEQIKFDKDIYITGLHFNQTGWKKDDRYSLEVNKIKIIDNATTKEIGEHKYFNTFYKVNANTLISFIFHNLSGNSRQTMIDLEYIDGEDSNIPIEPPGIEDIDNEWDIAVVMNWEENTDADIDLHGEIDGKKVWYGNKSYDGFYLNFDYTSHKTNKNPEIISVKGYKNKKLLISIKNFNGVELKEPVTLEIYQYRPYGNKLLKKFNVNLDTNRDLKDIFIMDLNTLKITNLNK >CP013847|3413683:3436543|3432725_3432935_-|AUN08195.1|DBSCAN-SWA MTTAKKLKAYRCLKGAKQEDIARLIGVSLNTYNFKENGKKSFTLNEAKIISDFFDTTIDELFFRRNGKL >CP013847|3413683:3436543|3414556_3415642_-|AUN08173.1|DBSCAN-SWA MSEFFNVTLDKDIILDDSVISNKTGWSSEKIQKEIIDKRITKFEELEDVDVTNKKNKQLVAYSEETGKFTTIDGIDAGEIVGAGMKQISKMGIVGSAETPRSVNIPVNTVDFKVPRVNVLRYDTENTQDLISVKNEFTNDESNDFIDDNMMIFDGKAHLETNHISDFEVVQDTESSTEYSVNVDKTLFKKIEGFETFEDGVIQKLKTTAIPFDRLLIPKGDMNLSNVDHIDYFRLTANGNNITIVCSVDSGNTWKTFSGEKWKNVNLTVDDVRKSGMNIATFNAINDVFWNELVTTKKIRFAYLFSMDSITDIEEIDKLDLQYDGVGRWRQVKEDLYEVIYASNTLLQVECKFSGDIKINY >CP013847|3413683:3436543|3415653_3416652_-|AUN08174.1|DBSCAN-SWA MKLIQVKNGLLEAENFFLASSFADFAGESNITRDIKTGKLKLISNNKIERKFDYKEFVIEVEKENFNDIKDMDYSMLYLGNSDHIFGIKDLKSNEQNRYWKILKKDNYIQAYSSNDGKNYTNMGGMEFAEPLTKQGFMKYSDEDFILNNYKVYANPYVTIQNFPENTLCELYDLDNNLIKTRLFNSDMECKVFIDSKISGYFTFKDRDGKVIYTSDALQLQYGDMWVFSPYNFEIIYHGNVVTNVSPAMLQDLEELITIKNIGDKDYNNIKIGTETPSNDLIQLSFDGINYADSLTIDSIRQSESKGIYVKITKNAENHNFVVRDFHLVISE >CP013847|3413683:3436543|3432451_3432664_-|AUN08194.1|DBSCAN-SWA MTVIKTKEYRIIRNLSISKLSCKSKIARSYITELEEGKYGNPGLKVICNLCKALQITPNELIDQELWKWW >CP013847|3413683:3436543|3427558_3427978_-|AUN08186.1|DBSCAN-SWA MSKFNYKVPGDSIQQDIINNAIPETLWQKVYLYLKKLGYNVYAPGQKRNKCTESYVVIRENGVHALVGNISGYKLFDIIVYRPMDQYSTMEFYVENLKEALKKIEDLRPTGNETPSIIDYDVQAYTTSIEYQQFKSLRR >CP013847|3413683:3436543|3426666_3427554_-|AUN08185.1|DBSCAN-SWA MISGKTLVNVVKVNFIDEVTNTKHTIETSNEIDIEPINSKGKRDILRIKNKIYGINETDDIVIGYKLKMKDNLFNIETMALIDGGTIQDNKYCGTEVGIAVERHPFTMEIFTEEKDYSRTTGYVKFVYKHCKGKPAKYKIQDGKFLVSSYEAESIPFRNEKPVEIEFINKLEENDNGEKPGESTPIEDIGVEGGEVENNNPDVGVSITNRVVWSFSNQINQDDVNLENFIIKRKSDNSRVNGNVTIDDTKKIVTFVPDSLAIDTVYIAEAKEINKLDGSGKTTALSTEFKTIKIR >CP013847|3413683:3436543|3430662_3431511_-|AUN08192.1|DBSCAN-SWA MRQVGEALEKTLKSRELDYNIAGENERVEICSVCGEAIEKITYIPGLNRCIKGPVMCKCKREALMAKEKEEINKEKQLRLKKIIKNSLIDEKFRNSKLKNWDFTKGNDKMYKIANKYTKKFENMKKESVGLLLYGSPGNGKTYTVACIANFLIEKMLPVICVNADSLLNRIKDTYKKSGKEVEEDILRGLDNADLLIINDLGTEQDTEWTRTKIYNILDSRYRNGLPLIITTNLSLIELKNRYEKRTYYRILEMCTPILNDGKNIREEKAKEKTEILKELLK >CP013847|3413683:3436543|3421070_3422420_-|AUN08179.1|DBSCAN-SWA MGLPSYVVNFDELSDLIKDYLQNGVKVDIGNINFSTKDMENLLSEIKDKIQGVDYNDLINALNALGVKLDNLSGNLGISGTQKIYGKMLEIPAVKGQHIIEFKGNGQITGITYSQSSWRFEDSWDLQVGNDKLFESVRTKEYGEHKFLNVFYPINGTVKFIYNNISGTSKILWVDFNILENSNLPTPTTPTIPTTSEKNYRFLAIGESEYTLQGANNLMGCTYDADNMSNLFKEHKESAKFTKNIVAKNKTKSEALNLIKSTFQDAQDNDISYLFWSGHGTVYEDKFALVAKDNIITVYELQTILDDIKGTKVIFIDTCHSGLAIDKNFAYTLAVVEEKLRSIDKTLNKQGYKVLTASAGSETSGDLSAGYNGNPNPSGAFTWALTQSIKTKKSDKDKNRIVTLEELYQSVLHFYDEFNIKNPYLKITQTAQVYPRNDTSSIFEYKEGA >CP013847|3413683:3436543|3416663_3416918_-|AUN08175.1|DBSCAN-SWA MLTSTIDFKKTRQKMWGILKNKTLAQLPYGHETDKNGSEITSYATNCYEDALEEAHTLLANGIGTKDIQIVEFVPYDYIMQPRV >CP013847|3413683:3436543|3426235_3426652_-|AUN08184.1|DBSCAN-SWA MDLKVTNIEDLKKVAQGEVIQLPQFGQGIPFNARVKRVSLLNLVRKGVVPNKLLSAAEELFYGKQSSKENVDLTQMTDVMYIMAENALVEPSIEDLKSVELELTDEQIVALFNYTQEGVSELDSFREESENTECNINK >CP013847|3413683:3436543|3422434_3422776_-|AUN08180.1|DBSCAN-SWA MAHMGYKNFREPVVYILDQELRKRNFKNQINTNEDSKYIGELPEYPCRIIRDSNNKAYKFIYANGTDMQWQEELIRNAEGKVYRIKTTYPNNTNKTIQLIKDNHGKLEIIDYV >CP013847|3413683:3436543|3426033_3426201_-|AUN08916.1|DBSCAN-SWA MTNDYEAFCFDEACVYILNEISKEDARDPKFIDGDRTNKTNNEDVIQWLNANNKS >CP013847|3413683:3436543|3422788_3423874_-|AUN08181.1|DBSCAN-SWA MTKCKVEFYKKNGYQAFENGDANKITLEHCLVSVKINRNLTTPTAEATITAQYENLPTAIFAGGTQGIIDNFAQVKIYIEDVLQFTGVIKKYDYNTLDKTIEMTCHDMYYRMLNLCDKELKFYNKTAADIISTVVSDAKCSFQRSGGNNYTVPKLECEIGTMYNDIISNLVETMYARIRANKNGAIILEEQYPAYNESNHEANHHDYVLSVDTNLSSETASRDSSLMRNILKICCNDKYSIFESKAMTSYLNGERWVDIIDNPLASTSLLKQKVAGYKFLDMWRESTALNVVPVAGIPNIDLGQVVKLVNNQRGNGWYLIVGISTEINADTYVDTLQLQGMRDKTKVYDQCIQIGSGRLKQ >CP013847|3413683:3436543|3427983_3428331_-|AUN08187.1|DBSCAN-SWA MREFEVNIDSVIDGLSEFEMQSKTAISGYADIAAKKLEEDAKKNAPWKDQSGKDIETIKGGKQWEGDKCNIYISGNKDYYSSLELCNDKKYAILKPTIDKLSPQILKGMSNLFGK >CP013847|3413683:3436543|3433126_3433537_+|AUN08196.1|DBSCAN-SWA MAEIKDRLKCERLRKDLNQTELAKFLNVSKQTVSNWENGNRIPDTLTLSKLADFFNCSVDYILGRSENRNGIISKANIDGSNYEFELDKSIFPNGITREQMINYIKELEERNKELEKEAEISRKLKEAGFDFNPDK >CP013847|3413683:3436543|3418833_3420069_-|AUN08177.1|DBSCAN-SWA MATDNFYFVEGNTSVKNLVKTLATEITQNSGIYKWDLVYPDSMDKIGSTGEESTINLITDDSKTDKVDTVFTVGSQNDKCIIKVITTYGKEFYVKIDREKADLNKEEKKALVDFKSLHRYSTASGYGTRTDAQVLEVMAGISDRWSKSGDYNAYVSAMTKSNSINNIKLQISDKLNADKTDLGISKNIQAEYNYRLAWYRKLQPEIKDFLPVQYWINITKDSINLVLRGDPSADVHPYENYLTSYAYIGALKPVEDSAYTDDKYNFGITVSSDIEPNYSKFYGERTATGVTDMCMIANKIGMPYQPHYPAFYATNPFMDKCNVEGSRYNHKKHQFSDITLVHPVDMERGKMINVLVGDASAINDTDRLAYKKDTEEEEYYKKFKITAPYCFLNNSANINYCVAIRCYKTTK >CP013847|3413683:3436543|3413683_3414466_-|AUN08172.1|DBSCAN-SWA MNAYYLNPNDRGTVQLSNNNRSVTSVLTSWQGVRSTLPVNKTQKQKIYIEIYINSFNANNSIIALAKKDASLTNYNIGNSYWSDGNGYGEAWKIGDTIGILYDSTINNGTLEFYKNGISEGVRSTNLNNSELYLEILVFKGSKLQELIVNFGEKPFKYNKPNGYDKLNINSLFLIKQKSNYYTIKSEFYKNGQVVPINKLEGKETLTKTDFEAYGIDDLNLLTKPMDAQDVKGTDKGSLGNGKLFEILFSNDFLSIGEVK >CP013847|3413683:3436543|3430285_3430606_-|AUN08191.1|DBSCAN-SWA MSTILVKEIENKVFEEIGSFREENAVLKILLKEYVKKSIDYEKLLKESINLLDKHQEALEFLRVAKNSWTDEVVKHYFTIKDLQKALDIVGKEIMIYELNKNNKEM >CP013847|3413683:3436543|3433838_3433988_+|AUN08197.1|DBSCAN-SWA MFNFSGVLSIKKEGEIIYEKKDTFTLNRKKTSCKKSSKDKIQLVHKVNT >CP013847|3413683:3436543|3423860_3424295_-|AUN08182.1|DBSCAN-SWA MDLNRIKDFKVDLLYEDRKNTGGVITNYKPPRPAYFRKGIRTVQGYTYFEKSVKSDCIIEFTVAFNIKGENDEKTQSNITKFLNFRKNYSGRFIFIDEFGIQYKGYLQNKFEIDTPIEGDIYYINLELLCNHEASGWVKDNDKV >CP013847|3413683:3436543|3416923_3418819_-|AUN08176.1|DBSCAN-SWA MPLHKIPLCSFEYVGDNAFSSGTFIYDTTEKVLKTTEKLFYKETTIEIDKVKENKLFYKQLKDNIGKEKNKYLFKEVADIKKQFEKELKLRNKEINKNNTISLDKIKYISINRITSKELDVRKNTDISICYNNKLLGREILQLNKANNLINLSIDRENLQLNKSKDIYTDSIVEKEIFKDESLQKLKLGKYINIEKGVGYYFNRSYCKEIDIDKFKFVKKHGNKNINKNKYRFIDRSNLKEVAKISNKTMLNKDIIIGIDIDTSINNLKILDLKDIDRNYKTMLMYNIALKYMEKYRIKNALNKIAHKEICKDHNKKYFYKDVFKFIDKSVNGYLDRQAIRSIFKYNNRYLDREYTTNIFKHNEKYFGNNPIINIYKQIERDLLNLSIWQIYRQSNKYLNNEAIKQIYVPNKNKFIEITKRWWWLKPTNATDRLIVPNKDYIYNNDLLNNLDYEYLRFNNHPIEWGKDWGVDYKIPPMTISIEIMLDLTNILIMIWHKNTQSWLSCTGKESIQFIMELIYDWYTLDTSSPNIDYIRAYRWIKWEAEKVYFLDAKNGLQAIGLLIANLIDYLKQHHFNLVPIWHNPKAMDIERKFNKIATNGDIIKDLDKLKGKRNYMIETQNFEKKNIFGR >CP013847|3413683:3436543|3424307_3425849_-|AUN08183.1|DBSCAN-SWA MAVNVGEAVAHLTLDTSEFKKALNGAGKDLEIFVHKVEKEKTRIEKLQEALAKEAGTLSKIGKSMEKPSAAAQNLLKTGMKNTLAEEAKSKNPKKGPANIAKGNYDKIQKDIQASIKKVQDSFAQLQTSIVKQLIPIFNNQLVPILNNKLIPIFTKLANKAVELMNSFNKLPNPVKNAIAIIIVSIAGVAKTFTVLSKLVGTINNVIGIFGKLKKAGGIFGLLKTIITSKTLLILVAIAAIGLIVYEVIKHWDTLKKYATRFGNFIANIFKGIGRVINSIIQGAIHAFQGFIRILQWVGGMVHNIINGCIAIFRGVGTILHGIVQGWINIFRGLGNLAGALFNIGRNIVEGLINGIRAMFGRVGQVIGNLASEISSRFKKMLGINSPSRVFADYGNFIGEGLIHGIDNQESAINNKFKGIANKIKGLGNVRPNFNGLNNMSLSGAYGGTYASPYGPNNMNKSMGLTQDIKMYVTIPNADKEGANKIANEFKQMTESSMKNVMTGLFMNDVLRD >CP013847|3413683:3436543|3431452_3432358_-|AUN08193.1|DBSCAN-SWA MDKKESGDMLAEVKWIKITTNMFDDEKIKLIDAMPERDTVHYIWMRLLVQAGKTNANGYIFLNDNVPYTEEMLSTIFNRPLNSLRFALKVLRDFGMIQIQEDKLIKITNWSKHQNIEGMEKVRQQTRERVAKHRAKKKELLEETKKQSCKNNDNKKNVMLHETLSNGRDIDIEDIDIEIKEDRKSDIRKNLDKINEAYFNTFYRQISATYLNQVLKVMAKEDYTDLLIYALNITKRREQEQGKIKGFKYTMSILESWINKGYKLPQDVKKNEISKKWREGEVYETSRRSFGEDLKKQGIGL >CP013847|3413683:3436543|3429651_3430173_-|AUN08190.1|DBSCAN-SWA MLDKKLYIKTEERLYRYFRSKKELSKLKNRIKHLSNRIEIIMDKIKNNNVTLEEESRSRTYDEIVQTSSNGTSYAERELIRQIERLEIELGEKIKKKGKVEYKIREIEEEISVMEDNLSSLNEENKKFIRLKYGENKSVDWIAVEMFGRARSTAYRKKNELVEHVAQLNNLIV >CP013847|3413683:3436543|3435055_3436543_+|AUN08198.1|DBSCAN-SWA MLFNSMHFLLFFPIVTFIYFFIPHKFRYIWLLITSYYFYMSWNPKYALLIGISTIITYLSGILIEKSNKITDKQKSKFFKKLWVFLSLFINLSILFLFKYCNFFTYTLTKIFSLINITIKVPSFDFILPVGISFYTFQALSYTIDVYRGNIKFEKNLGKYALFVSFFPQLVAGPIEKSKDLLNQFNEKHIFDYNRVKNGLVLMLWGFFQKVFVSDRLAILVDTVFNNPSNYKGLEIIVASVFFAIQIYCDFSSYSNIARGAAEVMGFDLSLNFKQPYFSKSIQEFWRRWHITLGAWFKDYLYIPLGGNKCSKWRRYFNNMVVFLISGLWHGAAINFIIWGGLHGFYIIIGDMLKPLKEKIISNLKIKTNVFSFKLFQTLFTFILVDFSWIFFRANSFSEAKLLIKNMFYFNPWIFTYGSIYKLGLDQKDFKMSILGILIVFIIDSIARNKDVRVELSNQNIVFRWAIYLSAIFFVLILGIYGAGYDANQFIYFQF |
28 | Clostridium_phage(81.82%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP013847.1|AUN06616.1|1688727_1688889_+|transcriptional-regulator |
1688727_1688889_+
Protein sequences of CP013847.1|AUN06616.1|1688727_1688889_+|transcriptional-regulator>CP013847.1|AUN06616.1|1688727_1688889_+|transcriptional-regulator MFYTVDQITEMLQISKSKAYKITASLNKELKKMGYITIAGRVPKKFFEEKYYM |
53 aa aa | NA | NA | NA | 1685572-1703120 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.2|2456608|37|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP013847 position: 1695148-1695184, mismatch: 1 aggttaagtcagtaatgataccttacttagaagatta CRISPR spacer aggttaaatcagtaatgataccttacttagaagatta Protospacer *******.***************************** 2. spacer 5.5|2657220|36|CP013847|CRISPRCasFinder matches to CP013847 position: 1696708-1696743, mismatch: 1 taatacattaaaaaaatacaaagcatatctaaatgg CRISPR spacer taatacattgaaaaaatacaaagcatatctaaatgg Protospacer *********.************************** |
|||||||||||||||||||||
| CP013847.1|AUN06617.1|1689044_1689239_+|hypothetical-protein |
1689044_1689239_+
Protein sequences of CP013847.1|AUN06617.1|1689044_1689239_+|hypothetical-protein>CP013847.1|AUN06617.1|1689044_1689239_+|hypothetical-protein MISIANLDKRICDIEECENTQTYREFIRESEKEFGIYPYPLDQEHVTDEILKDYVYFLDELWCK |
64 aa aa | NA | NA | NA | 1685572-1703120 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.2|2456608|37|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP013847 position: 1695148-1695184, mismatch: 1 aggttaagtcagtaatgataccttacttagaagatta CRISPR spacer aggttaaatcagtaatgataccttacttagaagatta Protospacer *******.***************************** 2. spacer 5.5|2657220|36|CP013847|CRISPRCasFinder matches to CP013847 position: 1696708-1696743, mismatch: 1 taatacattaaaaaaatacaaagcatatctaaatgg CRISPR spacer taatacattgaaaaaatacaaagcatatctaaatgg Protospacer *********.************************** |
|||||||||||||||||||||
| CP013847.1|AUN06618.1|1689254_1689452_+|hypothetical-protein |
1689254_1689452_+
Protein sequences of CP013847.1|AUN06618.1|1689254_1689452_+|hypothetical-protein>CP013847.1|AUN06618.1|1689254_1689452_+|hypothetical-protein MKKYRVKKEFIYDNTQLEYTDLYQQACNLGYAFVKDGNDYRMITINEYKTKPSLLQVDLVNLEII |
65 aa aa | NA | NA | NA | 1685572-1703120 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.2|2456608|37|CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP013847 position: 1695148-1695184, mismatch: 1 aggttaagtcagtaatgataccttacttagaagatta CRISPR spacer aggttaaatcagtaatgataccttacttagaagatta Protospacer *******.***************************** 2. spacer 5.5|2657220|36|CP013847|CRISPRCasFinder matches to CP013847 position: 1696708-1696743, mismatch: 1 taatacattaaaaaaatacaaagcatatctaaatgg CRISPR spacer taatacattgaaaaaatacaaagcatatctaaatgg Protospacer *********.************************** |
2. CP013848
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
0 : 8940
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP013848|0:8940|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP013848|0:8940|6096_7377_-|AUN08933.1|DBSCAN-SWA MLPHSIEAEKNLLGSILIENDIISDISEILTPDDFYNKSNKILYSKMLDMHYKNIAIDTLTLSNTLGVENLEAIGGISYITEIASGVVTVSNAKSYADIVKDKANRRKLIKVCTLALGEAKEKDIKSVSVKLEDILLEINNTKKEEIVTDEELMNDTLAVIQKNYENGGEIPGMKTGLKSLDKATNGLKRGDVIVIAGRPSMGKTCLALNIGSNMERKVALFELEMRKEDLGMRRLAAKSLINSYKLQQGKLDDKEWTRLATRANQIAYNNNVFTDTSSCLTMIEIKSRCKKIKIKYDLDVVIIDHLGLIEPTNKNDSKNNQIAEMTRQAKIIAKDLDVAVILLSQLSREVEKRVDKRPILSDLRDSGAIEQDADLIMFVYRDEYYDNETEDKGIMEVIIGKQRNGKTGTLKYAYKPEYQLIAEMF >CP013848|0:8940|1480_1801_-|AUN08924.1|DBSCAN-SWA MKNQQLSFLKPIEKPIKKHEIYDVTICDRCCCNQCKHSVEICPNLSDKECKTLKYSCFNCDECYYYGMDNENLSRNKIKFKCDKFEMSNYYKELEAKRKRKSFKII >CP013848|0:8940|1027_1414_-|AUN08982.1|DBSCAN-SWA MKEKLTKIWRLCETKQLSEIFEEYMKSIGIRKHDGRRKNNNNTYMIDGHCTGWNRVQCYYHKDSFKYSEENLLIVLRKRAGNYFIIERKGIRAFEVDYSGIRHYEENLLNEIMKEHKPLFDSLMRLVN >CP013848|0:8940|7393_8185_-|AUN08934.1|DBSCAN-SWA MESKIEFINAEIPFFQTPNNIFDLDIIVIAEKKTNKKKGCNETIVVKRKLKPFEKLVYIYLCRCGNNGKRAFPSYNKIAEKCSISRQSAIDAITVLKKNNLIAKKIRKSNKEQYTNEYFVNVLLATSQPSRPGVVYEVDHPSQPSIPKKELYKKNNINIYTLVINHLNQKCGTNFKSTTKKTQQLINARLRDGFVVEDFYTVIDTKVKDWKGQITADGKNMEDYLRPETLFGNKFEGYLNQKTKKVVSNEKANNNAYKEFEFD >CP013848|0:8940|3829_4549_-|AUN08928.1|DBSCAN-SWA MNNLENSIKDCITKEIEKGIIEKVIAEQLEKCIEKSISDMFSWGGDVKKVVEEKVKSVMIPYLENYDYSQYIVKLDSVLTDVLKSSTLENRNLLENFKNLMVSEDGSREVKISDIFSEWNEYCKSEIDNDELDFDCGGAYITTSFDVEEVSETWSSYKTFMVRFECEEDEKLKFEFSIHAWKPEEGSKYTSQYMKTTDLRSLRYLNDFEILMMRISEGYENIILDSEGDSEDTFIEYEE >CP013848|0:8940|507_816_-|AUN08981.1|DBSCAN-SWA MQHLSDDKRFYTSDNKSRRHKEICKQLNKIYESKNHDYGDSFGETYKNLGIISAVTRITDKVNRLQSLCIKEHKVKDESIKDTLKDLANYTIMTLIELKEGE >CP013848|0:8940|3359_3788_-|AUN08927.1|DBSCAN-SWA MNAAVMFSSETDLWATPQDFFDKLNKEFNFDLDPCATKENAKCSKYFTKEIDGLKQDWGGYKVFCNPPYGREISKWVEKAYKESKKQNTTVVMLIPARTDTKYFHSYIYHKAKEIRFIKGRLKFGNAKNSAPFPSMIVVFRG >CP013848|0:8940|5275_5677_-|AUN08931.1|DBSCAN-SWA MLKRWSPKEIQLLKKYCGKIPNKELFKMFSNRTKRAVLNKAVEKGYLERNGIVEKEQKIREKENNFNIKIQNGDYVKVDILHENARKTRNIKGTITDITKYFILIKSNKYKECFLKNDLKCGRVKIEVLNKCS >CP013848|0:8940|1833_1965_-|AUN08925.1|DBSCAN-SWA MNIYQKKIAKRAKLIKKQTGFPWSACKGIAKYRALYDFIRICG >CP013848|0:8940|2658_3318_-|AUN08983.1|DBSCAN-SWA MEGMKQIPDKYFELAIVDPPYFDGPNKRKYYGRTVNKLNIKRKQYNVIEDWSVPGKEYFKELLRVSKNQIVWGCNYFDYYLGPGLIIWDKVNGKSSFSDCEVAYCSMHNKTKMFRYMWNGMMQGKSISEGHIMQGDKSKNEIRIHPTQKPVNLYKWILLNYAKQGDKILDTHVGSASSLIACYEMGFDFLGFEKDREIFKLASNRLESIINQLNMFNII >CP013848|0:8940|8571_8940_+|AUN08935.1|DBSCAN-SWA MGDMHKRIALVRKDNNLSQAAFGKKLGVSRDVISNIEYNRVAPKQLFIDHLCKVCKVNKEWLMTGTGQMYSVPEEDLLLAKALADIASSENSTVHTIVSKLTKLDEEHLDLVLNLITALSKK >CP013848|0:8940|2170_2626_-|AUN08926.1|DBSCAN-SWA MRLEKVENRNRGYDIYLIIANREYKSWWTSPPKSVDHAGLEYLKDRYPKINTKARMETFKELYKNLWIDITKTQRQNMKHCIGLDYKKKPYRNYYCTSYKDENWNNLVEKGLAVKSSKELNSYGCTCFWLSKQGVEFILDKSISDKVYEEL >CP013848|0:8940|4967_5285_-|AUN08930.1|DBSCAN-SWA MQLMVLEHSTKLGIDNRKLTLENFVDKLQEEVTELKEAVKNKNNTDHIVEEAWDCLQMCTEVLDKLESKHNVNLKTSLNKHHKKIKERGWKAKKMIIFQVFNDYH >CP013848|0:8940|4655_4955_-|AUN08929.1|DBSCAN-SWA MKVEITKRYCDICKKEIQWHDDSRTNEIIVKVVFGNEKGHCRDSIYETKEVCDECMEEMGFTVLPNSWELNKEKNNLDGKFKNIIRKIFNRESGGIKNK >CP013848|0:8940|5654_6080_-|AUN08932.1|DBSCAN-SWA MEDVRNQLYSFIEKYGTLDPRTLEKSRELDSLIVKEMKKIKPISMLEAVKEIEELKSLNKSLAQKLSEKTVLNMELESQLKKAKEEIKILKDSASLWADEVAKNYHLTGDLEKSQRMTGIEIMAYELSKGRENNSAKEMES |
15 | uncultured_Caudovirales_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
15362 : 42512
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP013848|15362:42512|DBSCAN-SWA CTTATTCCTTTTCGCATTTTAAATTCCCTTCTCTTTCTTTTAATAAATTCCTAAGTTCTTCTATATCTTCTAGTGTTGCTTTATTTCTTATAAAACTTCTAGCACTGCTACGACTTTTCAAATAGCTTGCATACTCTCTATTTTTCTTTTCCCAATTTTGGTTAGCTATTGTTTGAGGTGATTTTTTATCATTCATAATTAAAATACTCCTTTCATCATTAGGATTATTAAGCCAACAATTATTATGATTAACCAGGCTATACTACCTGCTAGTTTTAAAGCTTCTTTTATTAAACTTTTTTTCATGTTGAATTAAGATGGTTAATGTGATATTTTATTAGTAAGGGAGGTTTTACCCTCCCTATGGGTTTATTTTAGGCTATCTAGCACCATTTTAATGACCGCTAGTAAAGTGCCTATTTTAAGTGCCAAGTCGGTAAGTGCCTCAATCACTTTACCGACTTTTTTAATTTTGTCAACCACCTTTTTTCTCACCTCCCTTCTACAATTATAATTATACTACACGTAGTATGAGAAGTCAACACCTTTTATTGAAATATCTATATATTTTATAATAATTTTTCCAATAAAAAAAGAGGGTACTTCCATTATCAAAGTACCCTCAAAATTGAAAGTTTATATATTTCTAATTGATTAATTTTTCTACATCTGGATATAATAAAAATAGACCAATACATAGCACCAATATATAAATCCATACAAAAAGAACCCCAATAAAAGGGGTTCTTTTTTTAAAAATACAGAGGTCTATGAGTAACTTATAGAAAACTATTATATTTATAATTCTACAAATGTTAAAAAATTTCTTTAAATAATAAAAAATGGGTAACTATACATAAAACTACAGTTACCTTTTCCAAAAATCTATAATACTTTCATAAAGTCTATTATCTCCTTTGCGGTTAAATACCTGTCTTGTCCTTTTATATTTCTAATGTTATTCCCTTTTGGAACCTCTCCGCCACCTGCAAGATAAATAAAATCGTATTTAGTTACATCTATATCTCTATTTTCTTTTAATGGACAATTTAGTTTATATGCTAAATATTCAGCGGCTCTTTTATCCACATGATTATTAAAAATAACTAGTTTATTTTTTGCATTTTTCTCTTCTGATGTTATGATATATTTAGTTACATTCCATTTTATATTGTTTTTTGTTAAAATATAACCTATTGTTCTTTCGAACGTGTTATATTCATTTGATCCAGTAATTAAAGTATTTAAATAAGATGTATAATCCTCTTTATCTCCACCTATAGCAAATACATTTGTCACATCTTTATAGTTATAATGTCTATGTGCCTCTATTGTTGAACAACTTAAAAAGTCTCCTAGGTACTCAGCTGCATTTTTATTCAATCCGTATAAATAGCAAATTATATTTTCCACTTTTTTATTTTCCTCCTTTTGTTGAATAGGTTTAGGACTAGAATTTATAAATATTCCATCATAAAAATTATTCATATCAACATTACCATTTACACCATTTACACGTCCTGTCTCTGTATATTGATGACCGACAACTGCAAACCCCGTTTGCATAGGTGTATTAACTCCATAATGTGCAATCCACCCTTTGCATTTCTTTACCCTGCTATCTAAGTTGTCCCTTCCAAAATAACCGCCTGTATAAATAAGGCAATCATAACCAGATAAAGCTTTAAATTTAGTTAAGAACTCTATGCATCTGTCTGATATTTGTTTTTGGCTTCTTCCCATGTTATTAGTTTCTATATCTAAACAAGGTATTACATTAAACTGTTTCCCTTTTATAGCGTTCCAGAAATCCACAGCTTGCTGGCTTGGACTAGTTTTTTCTGACATAAAGTGATAAAACCCTATATTAATATCTTGAGCCTTAGCACCTTGATAGTGCTGATTTAAAAAAGGATCTACATATTCTACTCCTTCGGTTGCTTTAATAATAACAACATTGATACCTTCATTTTTAACTTGTGCAAAATTAATATTATTATTATGCATACTAATATCTATACCTTTCATGTAAAAACCTCCTATAAAATTAATTAAAAGAGAACAAGACTATTTGTCCTGTTCTTTATGCATATCTTTTTCTTGTAATTGCTCTAATGCATTTTTTAATGCTGGTGGATAGTTAACACCACATTTACCTACATTCTCTATAATACTTAATCCCTCATTTGCTATGTAGAAGTAGCAAATAAGGGTACGAAATACCCATGTTCCATCGTTAAGTAGCCTGTCTAATAGTACTCCTAAAATTAATACTAATAAAATCATACATTTTCTTAAAATACCTTTAAACCCTATTTTGCTATTAAGCTTGTCGGTTATATAAGATGCAGCTATTCCTGTTACATAATCTACAAGCATAAACCCTACTAATGCTGCTAAAGGAGTATCCCATGCACCAAAAATATAAGTAAACCATGTACCTATAGCTGCTACAATACCGTTAAAAACATTTTCTTTATTCATTCTACACCTTCCTTTAATAATTAGTTATAATTAATTCTTTGTATTTTCCTCTCCCTTTTTTATCCTTTGATACAGAATAATTGACTTCAACTTGTTTTATATTAAATTCTTTATACCATTCTCTTACTTGCGGGTGGTCATTTATAGTTAATAAGGATTTCCCTTTTAATTTTTTTAATTTATCTCTTAAAATTAAATGTTCTTTTTCTCCAAATTCATTCCCATAACCTGTGGTTTCAAAGTATGGTGGATCACAGAAAAAGAAAGTATGTGACCTATCATATTTTTCAATGATTGTTTTAAAATCTAGATTTTCTACAAAAGTACTTTTTAATCTTTCTCTTAATTTCAAAAGATAATCATTTAGAAATATTTGCTGTGCTGGTTTACCTGTTGTCTTATAACCATAAGTAGTTCCTTTACTGGCAAAACTTTGAGATATTAAATATAGAAATCTTACAGCCCTATGTATCTCTGTAAGATATTCTATAGTATAATTCTTATACTCTTTAAAAATATCTCTTCCTGAAAATTCATACTGTAATAACCTCTCTATTTCTGGGGCATGATACTTAATCATTTTAAATAAGTTTACAAGTTCTTTGTCTATATCATTTATAACTTCTACCTTACTAGGTTCTTTGCCAAAATAAACCCAGCCAGCTCCGAAGAAAGGTTCAACATAACAGATATGATCTTTTGGTATCATCTCTATAATTGTTTTTCGTAGTATGCTTTTCCCTCCCATTCTCGTAATCGGTGGTTTTAACATTAGCATCATTCCTTTCTTTTCTTCTTTTGTATTGTAAAAAAAGACAAAAGAAAAAGACCTTCCTGGTCCTTATTTTGCCTTTATTAAGTTTTTATTTACTTCATAATTTTTATCTATTGTGTAACAACTTCTTCTGTAGTATCTTCTACATTTAATCCTTGGTTTCCTAAATCTTCTTTTTCAGCTGGATTAACTGTAGCCATTAATTCACTATACTGTTCTAAATTAATCTGGTTAAAAGTATAAAATACATTTAGTTTATTATTCATGTCCTCTTTTTCATAGTAATTATTATTAATTAAATTTTTTAATAAATCATATAGTATCATAATATCATTTCCTTTCTATTTTATATTATTTAACACTTCTTTATATTTTAAATTAACTACTTCTGATTGTGCTTTTAACAATTCTTTTTTTAGTTTTTCTTCTTCTGTTTCTATATGTGGAATATCTTCTGTTATTAATTTATGTGGTGTAACTGTTACATCTATGCCTTTAATTATTTTATCATTAAATTCTCCAAATTCAGTAATTATATAAGGTAATCCATCTGGTGGTGTATGTGGAGGAATACATCCCTCTGCATCACCAGTATTAACCCATACTTTACCTGAGTTATCATATATAATTAAGCTCCCTCTTTTCATATAATCATCTCCTCTCTATTCATATGCATACCAATTTACTTTATCGAACATATATCGTTCTGCTGTGCTAGTCCCTTTTTCTACACGTACACTATAACGCATAATATGAAGAGATGTATAAATTGTATTACCAATGGAATTTATTTTCTCAATACTATACTCACGATCATAAGCAATATCGCTACTGTATCCGCTTTTCGTTTTAAATGTAATTTTTACTTGTAATAATTCATTATAAATATATAATTCTATTCTTGGTTCTGAGTACCTATCATCAGAGCGAAAATAATCGTCTGGGTTTTTTCGTGGGGTTATTCCTATTGTTGTTAAAATCACGATAGATGGCTTAAATCCACAATTTGTATTTACGCTTGCAGAAGATAAAGGATAATTTGATTCCATAAATATTCCTACTTCAGGACCATAATAGTTAACATTTGCTGTACCCTGTGCCCATTTTTTACCTGTGCTAATTTTACTAATGTTTTTTATAATATCTTCCCATTTGCTTTCTTTTGTAATCTGTAGACTTTTATCTAATTGCAATAATGCGTCTACAGTATTAATTTTTACATTATTGCCAGAAGTAAAAACCTCATTAATTGCACTTACTAAATTTGTTTTATTGGTAGTTTTTAAGTTATCTTTATTACCTGTTAGTGTCGTAATATCAGCCAATTGTGTATTAATTTCGCTTATATCTTCAGTATTTTTGGTTACTTTTTTAGATAAATCGGTCATTTTGCTAGTTATTACTTCTATATCTTTTTTTGTGGCCAATACTACAGATGGATCTATCTTTAAGGTTACACTTGCAGCATTAGAAACTTCTAAAATCATTCTAATATATAGATCCTTTGCACTTCCTTCAGAAACTATAGGTTTATAAGTTTCTGGATATTTACCTATAGCTATTAAGTTACCTTCTACATCTAAAACACCTGCTTCTCTAACCATAAAGCCTCCATCTGTAGACGGTATAACTGTTTCTAAAACTATCCAGTTAGGATTTTCTTTATCTATTCCTATGGAACTTATATTACCTCTCCAAACTTCTTTCCTTAAAACTGTTTGGTCTTCTGTGGGATTATAAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP013848|15362:42512|31919_32258_-|AUN08967.1|DBSCAN-SWA MVSEVFTPENIFAGNVMPVVTEAALVDVKQTIKKLSIVEKNPTGKIVTPSDTIEPGNAYGIAAEEVTTDEGETKSIVLYMTGEFNASSIVFPDGKTVEDYRMPLRKLGIFLK >CP013848|15362:42512|40855_41299_-|AUN08979.1|DBSCAN-SWA MEYKKNDIAKLERLLYRYREMIAEIKNIDIEIEYIKQHPDGVNSISYEEKSSPTNKFNSSVENEVIAIDKKIEMLKEQKAEQVYWTSKIDNALEVLDQRSKQIIEMKYFEKINNTKIAARLNLTEEWICKLKNDSLKQLFKLILIKN >CP013848|15362:42512|18730_18946_-|AUN08949.1|DBSCAN-SWA MILYDLLKNLINNNYYEKEDMNNKLNVFYTFNQINLEQYSELMATVNPAEKEDLGNQGLNVEDTTEEVVTQ >CP013848|15362:42512|39473_39812_-|AUN08976.1|DBSCAN-SWA MAELNVNINAPVGDSYFDGGLLQLIGWTLLGFIITTCTFGICYPWAVCMIYGWKINHTVVNGRRLKFHGTAMGLFGNWIKWLLLSVITLGIYLFWVGIAIEKWKAKNTTFAS >CP013848|15362:42512|17428_17845_-|AUN08947.1|DBSCAN-SWA MNKENVFNGIVAAIGTWFTYIFGAWDTPLAALVGFMLVDYVTGIAASYITDKLNSKIGFKGILRKCMILLVLILGVLLDRLLNDGTWVFRTLICYFYIANEGLSIIENVGKCGVNYPPALKNALEQLQEKDMHKEQDK >CP013848|15362:42512|38851_39409_-|AUN08975.1|integrase|DBSCAN-SWA 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MLLQKKQKIKIKTIRLFSKVVKVLAPPPKLTVSKWADNYRKLSPESSAEPGQWNTDRAPYQREIMDALSDKDVETVIVMSSAQVGKTELINNIIAYFIDYDPAPILLLMPTLELATSYSKKRLATMIRDTPALKGKVKDAKAKDSDNTLLEKGFPGGYIAIVGANSPTGLSSRPIRILLADEVDRFPASAGIEGDPLSLAEKRTKTFWNKKKFFVSTPTEKGISRIEKEFENSTKEEWCVPCPVCGRYQPYLWAQIKFEDVTMECKYCKERCSEFDWKAGEGKWIAFNTEVERKRGFHLNALASPWERWENIIEDFREAKKKGIETLKTWVNTTLGEAWEDKEGESMDENVLFKRRETYNCEIPDQVLVLTAGVDVQDDRLEVEVVGWGVGKESWGIEYKKFYGDLAQDAVWNQLDEYLLKEFKYSNGQKLLITTTCIDSGGHFTSEVYKFCKAREHRRIFAIKGSGESGKPFIGKASRNNRERVILFIIYVSTGKETLMSRLKIEFQEGESTPGYCHFPIDFQRGYDIEYFKGLTSEKRVLRYFKGKPRFEWIKKTTRNEPLDLRNYATAALEILNPDLEALAEQNKNGNIFLQSKKINKKKRRIVSKGL >CP013848|15362:42512|32261_33422_-|AUN08968.1|DBSCAN-SWA MPKVKQTLKNQKNQKKNKFWNFINNADEENAELYLYHDISSSESWWDDVVTADNFREELKNLGEKEEIIVRINSCGGDVFAASTIYSLLKDNSASITVKIDGFCASAATIVAMAGDKICISPAGMFMIHDPLSGLMGYYNAKELKEIATTLDKVKESIMNTYLDRTSKSKEELDKMMEDSTWMSPDEALEDGFVDEIMFKTNDEEDETIFDGQNIIINSVSMDISKFKALPTNLIKNMKIKNSSSNFTMNSSFFNSKKNKKEMEEDKIMDKNELKNKYPDIFNEVKKEGIQEERERIKNIDQLSMPGYEEILNKAKFESGITAEMTAMEIVKTQKEKGSNFLENREKEVINSNVNKVNGTVETDKTEDEEKEVDSVLDKLFGKDVK >CP013848|15362:42512|17858_18617_-|AUN08948.1|DBSCAN-SWA MLKPPITRMGGKSILRKTIIEMIPKDHICYVEPFFGAGWVYFGKEPSKVEVINDIDKELVNLFKMIKYHAPEIERLLQYEFSGRDIFKEYKNYTIEYLTEIHRAVRFLYLISQSFASKGTTYGYKTTGKPAQQIFLNDYLLKLRERLKSTFVENLDFKTIIEKYDRSHTFFFCDPPYFETTGYGNEFGEKEHLILRDKLKKLKGKSLLTINDHPQVREWYKEFNIKQVEVNYSVSKDKKGRGKYKELIITNY >CP013848|15362:42512|30855_31902_-|AUN08966.1|capsid|DBSCAN-SWA MPINLFEPRTLGKVVTRMPKPKTFLRDTFFRNPLTFPTKRVEVDFTKGNRKIAPFVHPKIGGKTVENTGYKTNIFEPALVAPDTITTADDLLKRMPGENLYSGISPDERAIKKVATDMEKLEAMITRREELMCAQAIFLGKIPVIGEGLNYEIDFDFTNKETLSGGDLWSTDTSDPIKKIKELHREVQKTGFVNCDVCIMAADVADRFIDHPKVKEKLDVRNYNLATISPKELPNGATYVGTIPELGLDIYQYNEWFLDDWTNPLKPEQKPLVPTGTIVLLSTNAEYSMAYGAVTLIDKDSENFYTVEASRVADSWIKKKPARRFLQLNSKPLPVPHEVDSWFVAKVL >CP013848|15362:42512|23236_24151_-|AUN08956.1|DBSCAN-SWA MKLFYNDKDITNDVDIIYASIKDNSGGIADTIDIEFSDIKKLWRKWNPKKDDEIILSKDNFSSGKMYIDELQIVKGKYFIRAISTPLKSKTNNTKSWEKATFIEIAQGLVQELGLQLETYYIKNYLYERVDMINKTNLEFLNYLCILESFNLKISNGKAIIYDERTLEDFKSIKTFTEDDFISNYSFNAISNGLYGSCLIKHFGEKLIEHKITINNIGPTLQKDIKVTNLAEAERFGIGLLRYSNKNETTGTFPIKLDTSLAAGNTIDIKNLGHFNGKYFISSVKHILTKNKSYLNVRKVLEGY >CP013848|15362:42512|21140_22307_-|AUN08953.1|DBSCAN-SWA MENEINFVETDSKTIYSEIINGFESAYGNTLYPADERRIFLQQCLPVIVGIKNNINDSAKQNLLRYARDEKLDALGEDIFNTKRLEPQYASCFGIAKLTAIQNIDIIIPAGTRITPGGNLYFKVKEDVTIPAGILEKELILVAVEHGSKFNNFLPGQIKNIVDSNLPFVESIVNTEVTTGGADIEGHERYRERCRLAPESYSTAGPDGAYEYWAKTASQNIVDVKIISPTPGTVRIVPLLKDGEIPDKNVLDKVFSICSSRDKRPLTDKVEVISPTEVTYNIDLTYYLDKTHQTEELKFRKYIEGEKLDCKNGAIRDYINWQKERLGLTINPDELRFKIQSAATYTTVENKVYTAVRRVVVNSPNFIDIKDTEVAKVGTITVNYGGLE >CP013848|15362:42512|37209_37803_-|AUN08972.1|DBSCAN-SWA MAESKKIQNVDSVTVSSSVLSDIFGLTERRVRQLAEEGIIVKIKRGRYDLSSSVRNYIIHLKTNNDLKEDKTDKEIDYDMEHALLERARREKVELELAAMRGQMHHSEDVERVMNDMLANFRSKLLALPTKASPMLIARDDIGTIQEILHNQMLEVLQELSDYNPEEFYNDQYIDIEDDNLEGDVVAEKTEDKNKNN >CP013848|15362:42512|37961_38204_-|AUN08973.1|DBSCAN-SWA MVGILFIILMILWSSACIFSMYIDYEKLKLFKQKKYVIEEKLNQELNKLYREYEKNTNNLISYHSIAGDLARVKEDKKEK >CP013848|15362:42512|24360_26526_-|AUN08958.1|DBSCAN-SWA MQKAFSFASKYASKTSEIMSKSNTRVATMAQNTGSKITGLYGKIAAVGATIGAAKIGKTMISQAGDMEAYRNTLNVVMKDTQKAGKMFAWATNFANKTPFETDDVVQATVRLQSYGLEAQKLIPTVGDMASVMNTDLMSAVEAVADAQTGELERLKSFGITKDMIQKQAKSMNMDVINNKGQITDLNKFNQALETLMKNRFGGGMEKQAKTFKGAMSTVTGVAKNSLAQIAGIAANGDVKKGSLFDILTKGAIGLGNTLQNLADSGIFNNISAGIGNGLSFILKIFSGGSIGSITTFFNELSRGASVSHGVFMSLQNVLGEGLAGTISNLVGYVEFGTKGILAFLQGDLSKAGDMFYAMFPDEGETQGKVSKIISFLQTASSTFTSVFGTVKNIAYSIFSGIGGIISSVAPYIGQFIGSILNGVQQILPYVSSVISTIGTGIATLIPIVSSIINFVASNVLPILSNLVQFIITYIVPVIVNTFNAIVPRIISIVQSIWAFLQPCLQNIMTVIAFVMPFIQQAVLVAINVISGVLRGLFQILDGIITFISGIFTGNWSKAWQGIVDIFGGIFSTLGAILKAPLNAVIGLINGAIDNINSISIDIPDWVPGLGGKHFGINVPKIPMLAKGGFTSIPSICGEAGPEAVIPLKKRNPRSLSLLSQTAEKLGVSTSKGNGSTQITYAPQIYGSSKEEIHEILDDDFERFKTWADRYFHDKAREEYA >CP013848|15362:42512|33369_34938_-|AUN08969.1|portal|DBSCAN-SWA MNIIDKFLYNVAPHKALKREVARKRLSILNTGYSQYGANRTKKSMLGWNSRGGSVKEDIIDNLKMLRERSRDLYMGVPIATGALKTTRTNVVGSGLKLKSQIDSKFLGLTEEETIELEEKIEREFSLWADSVHCDLERMNNFYELQQLAFLSWLMNGDCFTSLPINERPNMPYDLRIQLIEADRISTPKDKQYKDNIHAGVEFNENGEVVAYHISNEHPLAETCTQQKWVRVEAFGQITGRPNILHLMDAERIGQKRGVPILAPVIESLKQLGRYTDAELMAAVISGMYTVFIETKDGDTGNIPIGEGIREEERIDIQDENSYELGNGAIIALGEGESVKEANPGRPNTAFDGFVTSICRQIGAALELPYELLIKHFTASYSASRAAMLEAWKMFKMRRTWLATDFCQPIYEEWLSEAVAKDRINAPGFFYDPIIKKAYCGAEWNGPTQGQLDPLKEVKAATERVNQGFSTRAKETTELTGGDFFKNLDQRVREEKLMREGGLVINAKSKTDTEESEEPKEE >CP013848|15362:42512|19282_20482_-|AUN08951.1|DBSCAN-SWA MAENFYTILTTVGKAKIANASALGTKINLTTFVVGDSNGVYYNPTEDQTVLRKEVWRGNISSIGIDKENPNWIVLETVIPSTDGGFMVREAGVLDVEGNLIAIGKYPETYKPIVSEGSAKDLYIRMILEVSNAASVTLKIDPSVVLATKKDIEVITSKMTDLSKKVTKNTEDISEINTQLADITTLTGNKDNLKTTNKTNLVSAINEVFTSGNNVKINTVDALLQLDKSLQITKESKWEDIIKNISKISTGKKWAQGTANVNYYGPEVGIFMESNYPLSSASVNTNCGFKPSIVILTTIGITPRKNPDDYFRSDDRYSEPRIELYIYNELLQVKITFKTKSGYSSDIAYDREYSIEKINSIGNTIYTSLHIMRYSVRVEKGTSTAERYMFDKVNWYAYE >CP013848|15362:42512|26744_27053_-|AUN08959.1|DBSCAN-SWA MSKLQLSKEVEINGKLTKEIEYDFEDLNGDVMEVAIKELQKSGYVPSVQETDVLLHAHIFAQAAQLDYLDIKRLGIRDYMKATSLVRNFFFEGLADSQEENL >CP013848|15362:42512|40389_40605_-|AUN08978.1|DBSCAN-SWA MLSVYSSFICKSCRNEFILLSEELENSRGYLVCPYCSSRRIKKENATDNLKECMQERTYKRIKGALRQTSR >CP013848|15362:42512|30515_30740_-|AUN08965.1|DBSCAN-SWA MSIKALENITHDGVLYKNGDEITEITKDEAIRLVDLQVAELINDKFKEPKKVIKEKISSQKRNRKNEEEEYLNA >CP013848|15362:42512|38419_38674_-|AUN08974.1|DBSCAN-SWA MFEFQSKGIPYTNILVIADTEDEARKLLLIEGKKRKEEAIRKGKDEWIYPEYSSAEELEEGSKDNLMNVYEIKKGYLTRYYTED >CP013848|15362:42512|41474_42512_-|AUN08980.1|DBSCAN-SWA MEYIKEVNINEAVVHILDKNSEEPILNEYKLRLDDENYKFILKHVEKCLKDQQLRYAKFKNERNIVKEASQEYLNGQNDLLDVSKELARQFFGLMKVNESIESCDLMIVSISTEYGPMLAIFKMDYIKNYIHVVDKIENRIGIDIVPEVTSLPLSASKIKKCAFIKPIREEQEFNLMVIDKQKKSKDSKEYGANYFINKYLGCSIIENERDATKNFVQATEKWIETNLNEDAATSEKIIRKVNKVLKEDDVIDIKEISNNIFGENHDAKLNYEGFILEQGVKEKIPVDKDWVDKKFRKIKLKIENNIDLYIDEETYNDSSKFEVKNIGDGSVNIIIKNVYNYMQK >CP013848|15362:42512|18961_19267_-|AUN08950.1|DBSCAN-SWA MKRGSLIIYDNSGKVWVNTGDAEGCIPPHTPPDGLPYIITEFGEFNDKIIKGIDVTVTPHKLITEDIPHIETEEEKLKKELLKAQSEVVNLKYKEVLNNIK >CP013848|15362:42512|34955_35189_-|AUN08970.1|DBSCAN-SWA MNIRLEKAKERLNYYYEAELAVLSGQEYRIGTRTMRRADLAEIRRAITDLEKQIKQLEALESRKGTRRVFRGVPRDL >CP013848|15362:42512|20484_21141_-|AUN08952.1|tail|DBSCAN-SWA MNLNNINLLDLQTSYMKKDPTTIAMCKALEPQFKKLNEESKFVLIYSRIDYLNEEVIDELAWQMHVDFYDYTLSLNKKRELVKNSLYWHKIKGTPKAVLDVATSVFGRTTLEEWFEYDDEPFFFRLNVEVTEQGASKENIEKLETLVNAYKNTRSWIRVINIFLTGKGKIYFGACTTSGEEITVYPWAVTETSSLGKVNLATKNTNIENITIYPKKEG >CP013848|15362:42512|27096_27618_-|AUN08960.1|tail|DBSCAN-SWA MVSKIGNKTINYNIYVRQNNKLNKILDTSEVTLPSIENLTDTIKGSGILGEIDFPAYYQPGAMSLEISTRVSNADLGILISAIDIEIRWVTDEFDSSNAKIGINSHKAFFKVINKKFEEGKLAMGEAQEGSLEYEVLAYKRVINGKEVLNIDKLNGIFAINGKNLAQDIQAAL >CP013848|15362:42512|22614_23031_-|AUN08954.1|DBSCAN-SWA MAIAVWGPMVFSVSLNKIYTFDGFSLSSSIDIEEQEREGSKPSTYIKGLNSDEISFTIPLIKQRKVNIRNEYINWINTQNKRIPYMLIINNKPVTSSKFLLTSVKLSNTLLDRKGDYFKATIEVTFKEFVRKGKKENN >CP013848|15362:42512|29081_29609_-|AUN08962.1|DBSCAN-SWA MTDSIVLSALKKFLDEKVCKDVKLEKPPEDLNIEDGDYKLVNPATYIGWIPPKNYLTEYGYDIPSILIMEDGGEDNGDEGTINIRLGIATYDPGDTTELGIEINSKGYKDLLNLITKIRIELAKSMVIEEKTIIEKPIKWGMYEEQQFPYWHAWITFTATILPLNYIEEGINKFL >CP013848|15362:42512|15362_15557_-|AUN08946.1|DBSCAN-SWA MNDKKSPQTIANQNWEKKNREYASYLKSRSSARSFIRNKATLEDIEELRNLLKEREGNLKCEKE >CP013848|15362:42512|30208_30523_-|AUN08964.1|DBSCAN-SWA MLNAKDYFYNDLNNFINTNEFAEMHKIANKTLNVIVDNDRLKERSKKEYDGIIVGDVLIFVKAKDYGQPPKPDSILYFDGKPYLVFDVRNDMGMYEIILKLNAS >CP013848|15362:42512|24155_24368_-|AUN08957.1|DBSCAN-SWA MHKEYFKYETIEGDTFDSIALTFLKDEFKSNKIMELNPDFIDTITFKRGIILKIPILEEEDTSTLPPWKR >CP013848|15362:42512|27614_29069_-|AUN08961.1|DBSCAN-SWA MPYKHGAYGELVETTQQISTLNQGTIPFYVGTAPVHRLKDFSNAINKPILINNLDEAKTKIGYSDLDNFEKFTLSASVYAHFKNKLQPIGPIVVVNVLNPLENSKSDSEEIILINKIGYIAKDALISSVTVDTFKKDVDFTLEYTPEGKIKFTAINDSITSPVTVNFNVADISMVSEKEIIGAYDPNTDKRTGLNNINIAYEELGVVPSVISAPGFNHKPNVEKALVEATKNIGGHWDAICVTDIDPTADTLEEAKKWKKENKYDNEREKVCWPFGEMNGKKMWMSILAIVRMQQTDFKNTGIPYESSSNKQLDITNLLIGDNPVKFNQEQGNKLNEKGITTAIYSGGKWVLWGPHMGNYEYGVTEISPSNFGKIFDINIRTNIYLSNDFQLRNAGLVDAPIARNDIDGIMNIEQIRLDALKSEGKILYGKIEFIPENNQINDLVQGNFVFNTAVTNTPPGKSLTNRIQYTSTGINTLLEGGDE >CP013848|15362:42512|29609_30203_-|AUN08963.1|DBSCAN-SWA MSSNIFVDYKELNQIKIELGKVPGQIPGATASALNRTLRYTFTHTDKEVRNLYSIKSKDVKSTMKKHLASKSNLYAYLSSTGSTINLTKFPHRPRKFSKRNKKRIVQVKIKTNGGYKGINTTPKAFVQTIGGKTNIWKRKGKERFPVTTLRTLSVPQMIKNEKISEKVQRLSNEKLEERIEHEINWRLDKLSKKGGK >CP013848|15362:42512|22296_22596_-|AUN08984.1|DBSCAN-SWA MYTIYSNQELNWNAKGEERILQNVTNLLNTYIYEVSYNRKMGRNLENIDKPLDIFIARVIEETYDLIEEYEPRVSIKDIEYIGLEEAIPVLKVVLEIGE |
36 | Bacteriophage(29.17%) | portal,terminase,tail,integrase,capsid | attL 21196:21211|attR 41746:41761 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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