CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
CP006766	Lactococcus lactis subsp. lactis KLDS 4.0325 chromosome, complete genome	2 crisprs	cas3,DEDDh,RT,csa3,DinG	0	0	15	0
CP007043	Lactococcus lactis subsp. lactis KLDS 4.0325 plasmid unnamed3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
CP029292	Lactococcus lactis subsp. lactis KLDS 4.0325 plasmid unnamed5	0 crisprs	NA	0	0	0	0
CP006767	Lactococcus lactis subsp. lactis KLDS 4.0325 plasmid unnamed1, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
CP029291	Lactococcus lactis subsp. lactis KLDS 4.0325 plasmid unnamed4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
CP029293	Lactococcus lactis subsp. lactis KLDS 4.0325 plasmid unnamed6	0 crisprs	NA	0	0	1	0
CP007042	Lactococcus lactis subsp. lactis KLDS 4.0325 plasmid unnamed2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0

1. CP006766

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: CP006766_1

• CRISPR_ID: CP006766_1
• CRISPR_location: 1494859-1494952
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of CP006766_1

Consensus_repeat	Method
ATAAAATGCTCGCTTTGGTCGCT	CRISPRCasFinder

spacers of CP006766_1

>1.1|1494882|48|CP006766|CRISPRCasFinder
AACGAACGAGAGAATTATCAGCTCCGCTGACAATTCTTTTAGCTATGG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP006766_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of CP006766_1

>merge|CP006766|1|1494859-1494952|CRISPRCasFinder
ATAAAATGCTCGCTTTGGTCGCTAACGAACGAGAGAATTATCAGCTCCGCTGACAATTCTTTTAGCTATGGATAAAATGCTCGCTTTGGTCGCA

>CP006766|1|1|1494859-1494952|CRISPRCasFinder
ATAAAATGCTCGCTTTGGTCGCT	AACGAACGAGAGAATTATCAGCTCCGCTGACAATTCTTTTAGCTATGG
ATAAAATGCTCGCTTTGGTCGCA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
CP006766.1|AGY44343.1|1490990_1491398_+|transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|227646
CP006766.1|AGY44347.1|1494072_1494786_-|orotidine-5'-phosphate-decarboxylase	unknown	unknown	gnl|CDD|234695
CP006766.1|AGY44349.1|1496014_1496803_-|dihydroorotate-dehydrogenase-electron-transfer-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|99814
CP006766.1|AGY44352.1|1500526_1501666_+|ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|369254
CP006766.1|AGY44344.1|1491394_1491925_+|heptaprenyl-diphosphate-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|227110
CP006766.1|AGY44340.1|1488092_1488719_-|5-bromo-4-chloroindolyl-phosphate-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|227252
CP006766.1|AGY44350.1|1497405_1498770_-|MFS-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|341046
CP006766.1|AGY44338.1|1485448_1486597_-|N-acetylglucosamine-6-phosphate-deacetylase	unknown	unknown	gnl|CDD|224733
CP006766.1|AGY44348.1|1495006_1495942_-|dihydroorotate-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|235982
CP006766.1|AGY44353.1|1501662_1502448_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224429
CP006766.1|AGY44345.1|1491915_1492875_+|polyprenyl-synthetase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223220
CP006766.1|AGY45636.1|1505363_1505708_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP006766.1|AGY44339.1|1486769_1487948_-|toxic-anion-resistance-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377557
CP006766.1|AGY44341.1|1488910_1489936_+|NAD(P)H-dependent-glycerol-3-phosphate-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|234629
CP006766.1|AGY44355.1|1504582_1505389_-|WxL-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|372694
CP006766.1|AGY44351.1|1499146_1500358_+|virion-core-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226711
CP006766.1|AGY44354.1|1502477_1503035_-|rRNA-large-subunit-pseudouridine-synthase-E	unknown	unknown	gnl|CDD|211334
CP006766.1|AGY44346.1|1492871_1493609_+|16S-rRNA-(guanine(527)-N(7))-methyltransferase-RsmG	unknown	unknown	gnl|CDD|234637
CP006766.1|AGY44342.1|1489978_1490920_+|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|224131
CP006766.1|AGY45638.2|1506769_1508254_-|RTX-toxin	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
CP006766.1|AGY44343.1|1490990_1491398_+|transporter	gnl|CDD|227646	COG5341, COG5341, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	7.84966e-52
CP006766.1|AGY44347.1|1494072_1494786_-|orotidine-5'-phosphate-decarboxylase	gnl|CDD|234695	PRK00230, PRK00230, orotidine-5'-phosphate decarboxylase.	7.34693e-133
CP006766.1|AGY44349.1|1496014_1496803_-|dihydroorotate-dehydrogenase-electron-transfer-subunit	gnl|CDD|99814	cd06218, DHOD_e_trans, FAD/NAD binding domain in the electron transfer subunit of dihydroorotate dehydrogenase. Dihydroorotate dehydrogenases (DHODs) catalyze the only redox reaction in pyrimidine de novo biosynthesis. They catalyze the oxidation of (S)-dihydroorotate to orotate coupled with the reduction of NAD+. In L. lactis, DHOD B (encoded by pyrDa) is co-expressed with pyrK and both gene products are required for full activity, as well as 3 cofactors: FMN, FAD, and an [2Fe-2S] cluster.	4.12713e-109
CP006766.1|AGY44352.1|1500526_1501666_+|ATP-binding-protein	gnl|CDD|369254	pfam07191, zinc-ribbons_6, zinc-ribbons. This family consists of several short, hypothetical bacterial proteins of around 70 residues in length. Members of this family have 8 highly conserved cysteine residues, which form two zinc ribbon domains.	0.000852226
CP006766.1|AGY44344.1|1491394_1491925_+|heptaprenyl-diphosphate-synthase	gnl|CDD|227110	COG4769, COG4769, Predicted membrane protein [Function unknown].	1.86202e-64
CP006766.1|AGY44340.1|1488092_1488719_-|5-bromo-4-chloroindolyl-phosphate-hydrolase	gnl|CDD|227252	COG4915, XpaC, 5-bromo-4-chloroindolyl phosphate hydrolysis protein [General function prediction only].	2.19745e-89
CP006766.1|AGY44350.1|1497405_1498770_-|MFS-transporter	gnl|CDD|341046	cd17503, MFS_LmrB_MDR_like, Bacillus subtilis lincomycin resistance protein (LmrB) and similar multidrug resistance (MDR) transporters of the Major Facilitator Superfamily. This subfamily is composed of multidrug resistance (MDR) transporters including Bacillus subtilis lincomycin resistance protein LmrB, and several proteins from Escherichia coli such as the putative MDR transporters EmrB, MdtD, and YieQ. MDR transporters are drug/H+ antiporters (DHA) that mediate the efflux of a variety of drugs and toxic compounds, and confer resistance to these compounds. For example, MMR confers resistance to the epoxide antibiotic methylenomycin. This subfamily belongs to the Methylenomycin A resistance protein (also called MMR peptide) and similar multidrug resistance (MDR) transporters (MMR-like MDR transporter) family of the Major Facilitator Superfamily (MFS) of transporters. MFS proteins are thought to function through a single substrate binding site, alternating-access mechanism involving a rocker-switch type of movement.	1.87271e-66
CP006766.1|AGY44338.1|1485448_1486597_-|N-acetylglucosamine-6-phosphate-deacetylase	gnl|CDD|224733	COG1820, NagA, N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase [Carbohydrate transport and metabolism].	1.90012e-178
CP006766.1|AGY44348.1|1495006_1495942_-|dihydroorotate-dehydrogenase	gnl|CDD|235982	PRK07259, PRK07259, dihydroorotate dehydrogenase.	0
CP006766.1|AGY44353.1|1501662_1502448_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|224429	COG1512, COG1512, Beta-propeller domains of methanol dehydrogenase type [General function prediction only].	1.05807e-70
CP006766.1|AGY44345.1|1491915_1492875_+|polyprenyl-synthetase-family-protein	gnl|CDD|223220	COG0142, IspA, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase [Coenzyme metabolism].	3.51865e-84
CP006766.1|AGY44339.1|1486769_1487948_-|toxic-anion-resistance-protein	gnl|CDD|377557	pfam05816, TelA, Toxic anion resistance protein (TelA). This family consists of several prokaryotic TelA like proteins. TelA and KlA are associated with tellurite resistance and plasmid fertility inhibition.	9.67435e-125
CP006766.1|AGY44341.1|1488910_1489936_+|NAD(P)H-dependent-glycerol-3-phosphate-dehydrogenase	gnl|CDD|234629	PRK00094, gpsA, NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase.	3.1574e-179
CP006766.1|AGY44355.1|1504582_1505389_-|WxL-domain-containing-protein	gnl|CDD|372694	pfam13731, WxL, WxL domain surface cell wall-binding. The WxL motif appears in two or three copies in these bacterial proteins and confers a cell surface localization function. It seems likely that this region is the cell wall-binding domain of gram-positive bacteria, and may interact with the peptidoglycan.	8.3145e-27
CP006766.1|AGY44351.1|1499146_1500358_+|virion-core-protein	gnl|CDD|226711	COG4260, COG4260, Membrane protease subunit, stomatin/prohibitin family [Amino acid transport and metabolism].	4.49543e-168
CP006766.1|AGY44354.1|1502477_1503035_-|rRNA-large-subunit-pseudouridine-synthase-E	gnl|CDD|211334	cd02566, PseudoU_synth_RluE, Pseudouridine synthase, Escherichia coli RluE. This group is comprised of bacterial proteins similar to E. coli RluE. Pseudouridine synthases catalyze the isomerization of specific uridines in an RNA molecule to pseudouridines (5-ribosyluracil, psi). No cofactors are required. Escherichia coli RluE makes psi2457 in 23S RNA. psi2457 is not universally conserved.	2.69982e-100
CP006766.1|AGY44346.1|1492871_1493609_+|16S-rRNA-(guanine(527)-N(7))-methyltransferase-RsmG	gnl|CDD|234637	PRK00107, gidB, 16S rRNA (guanine(527)-N(7))-methyltransferase RsmG.	1.1896e-84
CP006766.1|AGY44342.1|1489978_1490920_+|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase	gnl|CDD|224131	COG1210, GalU, UDP-glucose pyrophosphorylase [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	1.35337e-172

Protein sequences

>CP006766.1|AGY44347.1|1494072_1494786_-|orotidine-5'-phosphate-decarboxylase
MQENRPVIALDFPEFSDVKDFLEKFDPSEQLYIKLGMELFYTAGPQVVYYVKSLGHSVFLDLKLHDIPNTVESSMRVLARLGLDMVNVHAAGGVEMMVAAKRGLEAGTPVGRQRPKLIAVTQLTSTSEKIMQNDQKIMTSLEESVINYAQKTAQAGLDGVVCSAHEVEKIKAATSKEFICLTPGIRPEGASKGDQKRVMTPKEARTIGSDYIVVGRPITQAKDPVASYHAIKAEWNQ
>CP006766.1|AGY44346.1|1492871_1493609_+|16S-rRNA-(guanine(527)-N(7))-methyltransferase-RsmG
MTPDEFLSALTEFDIQLSDKQIKQFERYFELLVEWNEKINLTAITEKNEVYLKHFYDSIAPILYGLITDQPVSILDIGAGAGFPSLPMKIIFPELKVTIIDSLNKRINFLSLLTEELGLENVTLLHGRAEDFGRDANYRGTFDFVTARAVARLSVLTEFTIPFLKKNGILLSLKAAQFEEELNDAKKAIATLGGKFIKEVAYELPNGDERHIALIEKKKETPKKYPRKAGTPAKKSNKIKKYGHF
>CP006766.1|AGY44345.1|1491915_1492875_+|polyprenyl-synthetase-family-protein
MDLKNNFWKDYPELEKELVQVQQLMKSHVTIKNSDVKSAIFDIFDAGGKMLRPAYLLLFSGFTDLSENERLALAASVEMMHTATLVHDDVIDHADTRRGVATLSAKYGPEIAVYAGDYLFIAVFRLMSEHSLELSNLTKNIGSIERLLGGELGQLNHHFNLQQTLDDYIENISGKTGELFALSASVAPLISKNNTLTKRAYKIGMNIGISFQIMDDYLDYASTAQTLGKPVLEDIKQGIYSAPVLFALQENNALVSELIKNEKFDEVYDFIKTSDALEKTKALAKSYTLSALNLIDKLPKGKNRELIAEITRKLLERSL
>CP006766.1|AGY44344.1|1491394_1491925_+|heptaprenyl-diphosphate-synthase
MNIKEYVYVSLLTAAAVVMGIIESSLPPFFAFAPGAKVGLANLVMIIAVFTLRWRQVWVMQILRLLITALFTGFSVFLYSFAGGILSLLVMYLMKQFGPKLVSMIGISTVGGFFHNFGQLAMASLLAKTTSVMLYLPWLAFFGILAGFAIGIAGNQLITRVKPIQELFIKESKQWT
>CP006766.1|AGY44343.1|1490990_1491398_+|transporter
MNFFKNTVNFFKSIKTKPLDFVIIFLLFIASFSTLFFFATGSKGAQAELRISGKVIKTFDLNKNQTWTYRDKDGDYNKIQVKNGEIAVVEANCKDQIDVQRGYISKTGETIVCLPHNLVIEVMSGQKDEQVDYKV
>CP006766.1|AGY44342.1|1489978_1490920_+|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase
MKQNIIPTKARKVRKAVIPAAGLGTRFLPATKAIAKEMLPIVDKPTIQFIVEEALKSGIEDILIVTGKAKRPIEDHFDSNIELEQNLLEKGKTELLKLVEETTDINLHFIRQSHPKGLGHAVLQAKAFVGNEPFVVMLGDDLMNITGNETPLTKDLINDYEKTHASTIAVMKVPHDDVDKYGVIDPNGEVSKGLYNVERFVEKPNVDEAPSDLAIIGRYLLTPEIFDVLETQVPGAGNEIQLTDAIERLNKTQRVFAHEFTGKRYDVGDKLGFVETTIEYGLEHPQIGANLKNYIIEKAKELSKDDSKNITKK
>CP006766.1|AGY44341.1|1488910_1489936_+|NAD(P)H-dependent-glycerol-3-phosphate-dehydrogenase
MNPQKIAVLGPGSWGTALSQVLNDNGHEVRIWGNNPEQMAEINEKHTNTRYFKDVVLDKKIKAFDRLDLALEDVDAILFVVPTKVTRLVAKQVAEVLKHKVHILHASKGLEQGTHERISTILEEEIPAQLRGEIVVVSGPSHAEETIVRDITLISAASKNHDEAKYAQAIFSNDYFRLYTNTDVVGVETAGALKNIIAVGAGALHGLGFGDNAKAAIITRGLAEITRLGVAMGAEPLTYSGLSGVGDLIVTGTSIHSRNWRAGDALGRGEKLADIEKNMGMVIEGVSTTKAAFELAQQLDIDMPITETIYKVLYENLDAKTGILDIMRRETRAENEFINNK
>CP006766.1|AGY44340.1|1488092_1488719_-|5-bromo-4-chloroindolyl-phosphate-hydrolase
MPVSLFMNHQDMMFGYGHLGIVNVIFGLVLFFLIIKMIIGISFMRKNPDEREEGYKDKGMSKKENIERYHEAGLSDTDIKIFRENLSEAKENIKTWEKLLKKEDDLQVVESVTGGLEASKQTFKYIVQNPQELTKQNEFLYKDLPNMVKLSEKFIEMKKQSVRTEEINRDLDETLLLIKTLSHSISKNYHEILMDDVNVIKHQVDFDK
>CP006766.1|AGY44339.1|1486769_1487948_-|toxic-anion-resistance-protein
MDNPILDDLITNDKVIKEAEQLDEQQKSEIVKMHEKASLAAVEVLSTEELEKAKELSKQLDESSAQSVINYGASAQDKISAFSQSVLNKVQAQDLGEVGSSLTDLMFNLQQANPNELVAENKGIFTKMFGKVKRSIFEVTQKYQKIGAGIDKISAKLNNEQQGLLQDNEMLDKLYDENLNYFKALNVYIAGAELKVQELDTEIIPQARKEAHDSTDNALIVQKVNDLESYKNRLEKRAHDLRLARQLTIQQAPQIRLIQNTNQELAEKIQTSINTAIPLWKNQVAIALTLLKQKDALTSQRIVSETTNDLLRKNSEMLKASTIEAATENERGLVDIETLKLTQQNLVDTIQETMRIQAEGRQKRQQGEVELSKMEEEIKEKLLQLSNNKQLN
>CP006766.1|AGY44338.1|1485448_1486597_-|N-acetylglucosamine-6-phosphate-deacetylase
MTYYIKADQFFYAYETKKGGFLEITDGKFGEWTEEAPAGADILDYSGQSIAPGLVETHIHGFGGADAQDAEVEGIMGTMSEGLLSAGVTSFLPSPLTDDHEGLKAVCTVVGEHYQEARGAKVRGIFFEGPFFTEEKKGAQNPKYMRDAKMWELEDWQEAAHGMLKKIGLAPERDGSEDFIRKATESGVVIALGHSNATYKQAVDGVQAGASVWVHTFNGMSGMTHQEPGMVGAILNTPNTYAELICDGHHVRPEAAEIVMKMKGADHVVLITDSMRAAGLPDGPYMLGEYEVEVRDGAAWLPTGRPAASILTLKTAVKNVIDWGIATPAEAIMMASLTPAKSVNIDDVCGQIKPGLSADFIVLDNDFDLVATYLDGEKRYEA
>CP006766.1|AGY44348.1|1495006_1495942_-|dihydroorotate-dehydrogenase
MTENNRLSVKLPGLDLKNPIIPASGCFGFGEEYAKYYDLNKLGSIMVKATTLHPRFGNPTPRVAETASGMLNAIGLQNPGLEVIMAEKLPWLNENFPDLPIIANVAGSEEDDYVAVCAKIGDAPNVKAIELNISCPNVKHGGQAFGTDPDVAAALVKACKAVSKVPLYVKLSPNVTDIVPIAKAVEAAGADALTMINTLMGVRFDLKTRKPVLANITGGLSGPAIKPVALKLIHQVAQVVDIPIIGMGGVESAQDVLEMYMAGASAVAVGTANFADPFVCPKIIEKLPEVMDQYGIDSLENLIQEVKNSKK
>CP006766.1|AGY44349.1|1496014_1496803_-|dihydroorotate-dehydrogenase-electron-transfer-subunit
MPKLQEMMTIVSQREVASNIFEMVLKGELVEEMDLPGQFLHLAVPNASMLLRRPISISSWDKVAKTCTILYRIGDETSGTYEISKLQTGAKIDVMGPLGNGFPVDEVVSTDKILIVGGGIGVPPLYELAKQLEEKNCQMTILLGFASEKVKILEKEFAELKNVSLKIATDDGSYGTKGHVGMLMEEIDFEVDALYTCGAPAMLKAVAKKYEQLERLYISMESRMACGIGACYACVEHDKEDENHALKVCEDGPVFLGKQLSL
>CP006766.1|AGY44350.1|1497405_1498770_-|MFS-transporter
MNKNNHFHLLGAVIATGILSFSGVLIETAMNVTFPTLINEFGLSTSKIQWVTTIYLLVIAITIPLSSYFNERFSARKLFLVANLIFLVGVLTNCFSPNFAMLLFGRLLQGVGTGIGLPLMFHLILTKAPLHKRGMMMGIGTLTTSIAPAIGPTYGGIISNSLDWRYIYIFLLPLVVISLVLGLACLPREGAKTPKKLALRPVIALSIMFFAFISALSAEHLMTFALLFIVGLVGAFLFVQFNRKESLIDLGILKNHRFVALIFSLLVYQALLLGLSFVLPSFIQVSAGFSSSVAGLFMFPGALIGAVLAPISGKVLDQIGARKPITTGLILAALGLALLFVFLPTKSLALLLVAHIVLMLGLGISYSNLMTCSLSTLATDQLSDGNALVNTLQQFIGAVATAVVATTLSIFQGHNGFKVGTSHGTSIILALFFILIIVSLIVSFPNLKKIRANH
>CP006766.1|AGY44351.1|1499146_1500358_+|virion-core-protein
MGIIKAATGSLGGALADQWLEVIEPNEMSNQTVFTKGIKVRKDAKRGSNRKGTEDVITDGSIVHVYENMMMILVDGGKIIDYTAEPGYYTVKNDTAPSLFNGDLRDSIQESFFRFKFGGTTPQKQEVYYVNLQEIKGIKFGTATPLQYFDNFYNAELFLRTHGTYSIKITDPLAFYANVIPKNADHVEIQEINDQYLAEFLTALNTSINQYSAQGERVSFLTSKSMELSKYMASVLDEDWKQLRGMEIVSVAVASISYTDDSQKLINMRNQGAMLGDPSIREGFVQGAVARGLEAAGSNTGGATNAFMGMNMGGQNLAGFSQTNQAQMQAQAENKADTWTCPECNTKNTGKFCSNCGQAKPSATPVMPELNMACNECGAVVNLANGVPKFCPECGKPFVAKAL
>CP006766.1|AGY44352.1|1500526_1501666_+|ATP-binding-protein
MSESQVLTHKCPNCGGPLLFEPKNQKFHCEYCGSTFTEQEVSDFEAKQEAAKVTDSPISSVSNAETTDEKEKITDSDQKRADENTDEEIGLFLCPSCGAEIVTDATTASTWCYYCHNPVVLTERLSGKFLPEKILPFQIERKAAEEQFLDWVGKKKFVPKAFFDKKQIQNLSGVYFPYWAVDAELSGGISAQATNLRVWIVGDTEYTEHSQYEIQRGGETKFKDLIKNALKKNLSDKMVGAVQPFDMTAAIPFKNQYLSGFLTEKRDIEFPDMKENVEREFRQYADGLMESTIVGYTSVSNLQSNQQIKNIDEDYVLLPIWLVTYKEAGNDRLFYYAMNGQTGKVAGLLPIDKKKLWTVAIGIFILVLLLGIIVGYLLS
>CP006766.1|AGY44353.1|1501662_1502448_+|hypothetical-protein
MRKKLVFLSLFFLSFFFLLIAPKTSAATFSSGLEDNLQLLGGNVTLLEQEAQKLANETKAGVYVVTTDSSTPASQMAKTYLADKVGAKNNGVILVINMNLRKVYIWATGNLKYYLPSSRIEKTLDIVQPELTDNNYYQAVSGFFDQVSKYYQAGIPTSRKYSINSETGAVTFHRSFQPLSILIALIISLIAAGGFVWTIYRRYQMKDAHAVWRYDYGRNGNLELHQREDILVNTFITTRIIPRPSSDNNNFSDGSGGGRSF
>CP006766.1|AGY44354.1|1502477_1503035_-|rRNA-large-subunit-pseudouridine-synthase-E
MNFCKKIMIILFNKPYDVLTKFTDGEGRKTLKDYIKIPNVYAAGRLDKDSEGLLLLTDDGKLNHLLTDPKSKSYKTYLVQVEGEFSSEAAQKLQKGLLLKDGKTLPAKVKLIDEPDWLWERTPPIRERKAIPTSWVEISIKEGKNRQIRRMTAAVGFPTLRLIRWSIGQYSLGNLKSGEYKIIQK
>CP006766.1|AGY44355.1|1504582_1505389_-|WxL-domain-containing-protein
MKKTILSLSGVAVITATLLSTSVLEVSATSVGSTTSGANVAFQPKKTPTNPVSPGDGKTPISPTTPGVPNTSNPVASDDGLTLDYVPAINFGTHYVDASTAHTWSAWAANDGSGKAIPQFMQVTDNRGTATGPTGWSVSLTQTAQFKGTKAGDLVNAVMTFNNDKTNTVVSTSMNKASSTVNTATNALVPGTAVNIFQADAGTGTNLLSFGAGDGSTLVTDPETLDSATNTTGKVDPNITLNVPAGSAKVDTYTTTLNWNLYSAPGNA
>CP006766.1|AGY45636.1|1505363_1505708_-|hypothetical-protein
MKIKYILWVICALLLLNTSVILAQEIGGTNTTGKVGFLEKEPIEKPPVTSSSQATGQSQILTNQYLPIVGTNQNDPLMPFVVGLVTIGVGSLMIKKTKRIRIKENFNEKNNTQP
>CP006766.1|AGY45638.2|1506769_1508254_-|RTX-toxin
MKGLNAKATAVYENVTVSNGDAIYGAQPIRNDNGKVLFRGTNTFNILQNHNINDTSSAGADNQGEWIQGGAYLEVVTGTTTLNQSWGNDQPFYVYYSSGGSTLQVDAGAAMVWNLNKTYTMYYDDGSLLTVGALNWNINGSFVINGTVNTSSTYAGGWFMALNTLNSWNLNVGQNATLKVTTGGVISLDAFLTGAVKWNFAQGSSVLFNNLNPNQNVVSLAPGLGSSITMTDPKVVTFNTAGGSVFSTTVLTFPITISGSGLRTHSSSTGYTFDSTYDLITPTKGTITPTSSDIWYRMNTGTLTTFNPTLQVTNLSPNSYGSDASSIAAGKYISWYQPLGFQLNATLSSMNRTFNVSLDPTLTQGTPVDGSWSSLINGASTETLVVGDDRAQNPNIHVLVKMTQNNFPNGLQYYWVDPTTKTASQLSLNSALQIASITSDSTLPSWIKMTGAGSWYTMTFPTDSGLNIKANNSLLTQTNTNAGTFQYTVANGPS

Crispr_ID: CP006766_2

• CRISPR_ID: CP006766_2
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Consensus repeat of CP006766_2

Consensus_repeat	Method
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spacers of CP006766_2

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TTTGCTGACAAATCCTTCATCCATTGATAAAAAGCTCAATTCAATCG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP006766_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of CP006766_2

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TTTATTACTGACAGACTTGTCAGCTTTGCTGACAAATCCTTCATCCATTGATAAAAAGCTCAATTCAATCGCTTTTTACTGACAGACTTGTCAGC

>CP006766|2|2|1968061-1968155|CRISPRCasFinder
TTTATTACTGACAGACTTGTCAGC	TTTGCTGACAAATCCTTCATCCATTGATAAAAAGCTCAATTCAATCG
CTTTTTACTGACAGACTTGTCAGC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
CP006766.1|AGY44670.1|1974221_1974923_-|adaptor-protein-MecA	unknown	unknown	gnl|CDD|227199
CP006766.1|AGY45787.1|1964582_1964876_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP006766.1|AGY44660.1|1961167_1961737_-|biotin-transporter-BioY	unknown	unknown	gnl|CDD|224187
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CP006766.1|AGY44673.1|1976620_1977529_-|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|224513
CP006766.1|AGY44671.1|1975052_1975787_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224051
CP006766.1|AGY44661.1|1961881_1963123_+|long-chain-fatty-acid--CoA-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|341288
CP006766.1|AGY44662.2|1964872_1965619_+|KR-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|187594
CP006766.1|AGY44659.1|1960190_1961162_-|biotin--[acetyl-CoA-carboxylase]-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|237010
CP006766.1|AGY44665.2|1968847_1969330_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223659
CP006766.1|AGY44663.1|1966627_1968040_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB	unknown	unknown	gnl|CDD|131035
CP006766.1|AGY45786.1|1964245_1964608_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP006766.1|AGY45784.1|1959868_1960174_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226801
CP006766.1|AGY44668.1|1971942_1972713_-|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC	unknown	unknown	gnl|CDD|223473
CP006766.1|AGY44672.1|1975786_1976473_-|amino-acid-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223836
CP006766.1|AGY44664.1|1968273_1968732_-|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|273918
CP006766.1|AGY45785.1|1963112_1964261_+|acetyl-CoA-C-acyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|273881
CP006766.1|AGY45788.1|1965641_1966487_+|2-nitropropane-dioxygenase	unknown	unknown	gnl|CDD|132195
CP006766.1|AGY44667.1|1970548_1971805_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD	unknown	unknown	gnl|CDD|223791
CP006766.1|AGY44669.1|1972887_1974219_-|undecaprenyl/decaprenyl-phosphate-alpha-N-acetylglucosaminyl-1-phosphate-transferase	unknown	unknown	gnl|CDD|133463

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
CP006766.1|AGY44662.2|1964872_1965619_+|KR-domain-containing-protein	gnl|CDD|187594	cd05333, BKR_SDR_c, beta-Keto acyl carrier protein reductase (BKR), involved in Type II FAS, classical (c) SDRs. This subgroup includes the Escherichai coli K12 BKR, FabG. BKR catalyzes the NADPH-dependent reduction of ACP in the first reductive step of de novo fatty acid synthesis (FAS). FAS consists of four elongation steps, which are repeated to extend the fatty acid chain through the addition of two-carbo units from malonyl acyl-carrier protein (ACP): condensation, reduction, dehydration, and a final reduction. Type II FAS, typical of plants and many bacteria, maintains these activities on discrete polypeptides, while type I FAS utilizes one or two multifunctional polypeptides. BKR resembles enoyl reductase, which catalyzes the second reduction step in FAS. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with structurally conserved Rossmann fold (alpha/beta folding pattern with a central beta-sheet) NAD(P)(H) binding region and a structurally diverse C-terminal region. Classical SDRs are typically about 250 residues long, while extended SDRS are approximately 350 residues. Sequence identity between different SDR enzymes are typically in the 15-30% range, but the enzymes share the Rossmann fold NAD binding motif and characteristic NAD-binding and catalytic sequence patterns. These enzymes have a 3-glycine N-terminal NAD(P)(H) binding pattern: TGxxxGxG in classical SDRs. Extended SDRs have additional elements in the C-terminal region, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P) binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif. Some atypical SDRs have lost catalytic activity and/or have an unusual NAD(P) binding motif and missing or unusual active site residues. Reactions catalyzed within the SDR family include isomerization, decarboxylation, epimerization, C=N bond reduction, dehydratase activity, dehalogenation, Enoyl-CoA reduction, and carbonyl-alcohol oxidoreduction. A critical catalytic Tyr residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase (15-PGDH) numbering), is often found in a conserved YXXXK pattern. In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser (Ser-138, 15-PGDH numbering) and/or an Asn (Asn-107, 15-PGDH numbering) or additional Ser, contributing to the active site. Substrates for these enzymes include sugars, steroids, alcohols, and aromatic compounds. The standard reaction mechanism is a proton relay involving the conserved Tyr-151 and Lys-155, and well as Asn-111 (or Ser). Some SDR family members, including 17 beta-hydroxysteroid dehydrogenase contain an additional helix-turn-helix motif that is not generally found among SDRs.	4.80083e-73
CP006766.1|AGY44670.1|1974221_1974923_-|adaptor-protein-MecA	gnl|CDD|227199	COG4862, MecA, Negative regulator of genetic competence, sporulation and motility [Posttranslational modification, protein turnover, chaperones / Signal transduction mechanisms / Cell motility and secretion].	3.81196e-86
CP006766.1|AGY44659.1|1960190_1961162_-|biotin--[acetyl-CoA-carboxylase]-ligase	gnl|CDD|237010	PRK11886, PRK11886, bifunctional biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] ligase/biotin operon repressor BirA.	2.48657e-70
CP006766.1|AGY45788.1|1965641_1966487_+|2-nitropropane-dioxygenase	gnl|CDD|132195	TIGR03151, enACPred_II, putative enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase II. This oxidoreductase of the 2-nitropropane dioxygenase family (pfam03060) is commonly found in apparent operons with genes involved in fatty acid biosynthesis. Furthermore, this genomic context generally includes the fabG 3-oxoacyl-[ACP] reductase and lacks the fabI enoyl-[ACP] reductase.	3.58449e-84
CP006766.1|AGY44673.1|1976620_1977529_-|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase	gnl|CDD|224513	COG1597, LCB5, Sphingosine kinase and enzymes related to eukaryotic diacylglycerol kinase [Lipid metabolism / General function prediction only].	8.86495e-71
CP006766.1|AGY44671.1|1975052_1975787_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224051	COG1126, GlnQ, ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component [Amino acid transport and metabolism].	1.02808e-157
CP006766.1|AGY44661.1|1961881_1963123_+|long-chain-fatty-acid--CoA-ligase	gnl|CDD|341288	cd17633, AFD_YhfT-like, fatty acid-CoA ligase VraA. This family of acyl-CoA ligases includes Bacillus subtilis YhfT, as well as long-chain fatty acid-CoA ligase VraA, all of which are as yet to be characterized. These proteins belong to the adenylate-forming enzymes which catalyze an ATP-dependent two-step reaction to first activate a carboxylate substrate as an adenylate and then transfer the carboxylate to the pantetheine group of either coenzyme A or an acyl-carrier protein. The active site of the domain is located at the interface of a large N-terminal subdomain and a smaller C-terminal subdomain	2.79647e-68
CP006766.1|AGY45785.1|1963112_1964261_+|acetyl-CoA-C-acyltransferase	gnl|CDD|273881	TIGR01930, 3-ketoacyl-CoA_thiolase, acetyl-CoA acetyltransferases. This model represents a large family of enzymes which catalyze the thiolysis of a linear fatty acid CoA (or acetoacetyl-CoA) using a second CoA molecule to produce acetyl-CoA and a CoA-ester product two carbons shorter (or, alternatively, the condensation of two molecules of acetyl-CoA to produce acetoacetyl-CoA and CoA). This enzyme is also known as "thiolase", "3-ketoacyl-CoA thiolase", "beta-ketothiolase" and "Fatty oxidation complex beta subunit". When catalyzing the degradative reaction on fatty acids the corresponding EC number is 2.3.1.16. The condensation reaction corresponds to 2.3.1.9. Note that the enzymes which catalyze the condensation are generally not involved in fatty acid biosynthesis, which is carried out by a decarboxylating condensation of acetyl and malonyl esters of acyl carrier proteins. Rather, this activity may produce acetoacetyl-CoA for pathways such as IPP biosynthesis in the absence of sufficient fatty acid oxidation. [Fatty acid and phospholipid metabolism, Other].	4.30804e-158
CP006766.1|AGY44660.1|1961167_1961737_-|biotin-transporter-BioY	gnl|CDD|224187	COG1268, BioY, Uncharacterized conserved protein [General function prediction only].	5.72661e-47
CP006766.1|AGY44665.2|1968847_1969330_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|223659	COG0586, DedA, Uncharacterized membrane-associated protein [Function unknown].	3.28577e-22
CP006766.1|AGY44663.1|1966627_1968040_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB	gnl|CDD|131035	TIGR01980, UPF0051_protein_slr0074, FeS assembly protein SufB. This protein, SufB, forms a cytosolic complex SufBCD. This complex enhances the cysteine desulfurase of SufSE. The system, together with SufA, is believed to act in iron-sulfur cluster formation during oxidative stress. Note that SufC belongs to the family of ABC transporter ATP binding proteins, so this protein, encoded by an adjacent gene, has often been annotated as a transporter component. [Biosynthesis of cofactors, prosthetic groups, and carriers, Other].	0
CP006766.1|AGY45784.1|1959868_1960174_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|226801	COG4357, COG4357, Zinc finger domain containing protein (CHY type) [Function unknown].	1.12966e-28
CP006766.1|AGY44668.1|1971942_1972713_-|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC	gnl|CDD|223473	COG0396, sufC, Cysteine desulfurase activator ATPase [Posttranslational modification, protein turnover, chaperones].	2.84318e-148
CP006766.1|AGY44672.1|1975786_1976473_-|amino-acid-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|223836	COG0765, HisM, ABC-type amino acid transport system, permease component [Amino acid transport and metabolism].	4.09368e-76
CP006766.1|AGY44664.1|1968273_1968732_-|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein	gnl|CDD|273918	TIGR01994, Iron-sulfur_cluster_assembly_scaffold_protein_IscU, SUF system FeS assembly protein, NifU family. Three iron-sulfur cluster assembly systems are known so far. ISC is broadly distributed while NIF tends to be associated with nitrogenase in nitrogen-fixing bacteria. The most recently described is SUF, believed to be important to maintain the function during aerobic stress of enzymes with labile Fe-S clusters. It is fairly widely distributed. This family represents one of two different proteins proposed to act as a scaffold on which the Fe-S cluster is built and from which it is transferred. [Biosynthesis of cofactors, prosthetic groups, and carriers, Other].	9.34852e-67
CP006766.1|AGY44666.1|1969331_1970549_-|cysteine-desulfurase	gnl|CDD|131034	TIGR01979, Probable_cysteine_desulfurase, cysteine desulfurases, SufSfamily. This model represents a subfamily of NifS-related cysteine desulfurases involved in FeS cluster formation needed for nitrogen fixation among other vital functions. Many cysteine desulfurases are also active as selenocysteine lyase and/or cysteine sulfinate desulfinase. This subfamily is associated with the six-gene SUF system described in E. coli and Erwinia as an FeS cluster formation system during oxidative stress. The active site Cys is this subfamily resembles GHHC with one or both His conserved. [Biosynthesis of cofactors, prosthetic groups, and carriers, Other].	0
CP006766.1|AGY44667.1|1970548_1971805_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD	gnl|CDD|223791	COG0719, SufB, Cysteine desulfurase activator SufB [Posttranslational modification, protein turnover, chaperones].	2.36892e-131
CP006766.1|AGY44669.1|1972887_1974219_-|undecaprenyl/decaprenyl-phosphate-alpha-N-acetylglucosaminyl-1-phosphate-transferase	gnl|CDD|133463	cd06853, GT_WecA_like, This subfamily contains Escherichia coli WecA, Bacillus subtilis TagO and related proteins. WecA is an UDP-N-acetylglucosamine (GlcNAc):undecaprenyl-phosphate (Und-P) GlcNAc-1-phosphate transferase that catalyzes the formation of a phosphodiester bond between a membrane-associated undecaprenyl-phosphate molecule and N-acetylglucosamine 1-phosphate, which is usually donated by a soluble UDP-N-acetylglucosamine precursor. WecA participates in the biosynthesis of O antigen LPS in many enteric bacteria and is also involved in the biosynthesis of enterobacterial common antigen. A conserved short sequence motif and a conserved arginine at a cytosolic loop of this integral membrane protein were shown to be critical in recognition of substrate UDP-N-acetylglucosamine.	9.45595e-85

Protein sequences

>CP006766.1|AGY44663.1|1966627_1968040_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB
MTENSTQEVVKDLEEYKFGFHDNAELEFTTGLGLTEEVIREISETKNEPEWMLEFRLKSFEAFKKLDMPKWGPDLSGIDFNDIVYYQKPSAKAARSWEDVPQEIKDTFEKIGIPEAERSYLAGASAQYESEVVYHNMKDEFEKLGIIFTDTDSGLRDYPEIFKKYFSKLVPPTDNKLAALNSAVWSGGSFVYVPKGVKCEIPIQAYFRINNEKSGQFERTLIIVEEGASIQYVEGCTAPTYSASSLHAAVVEIFVEEGGYMRYSTIQNWSDNVYNLVTKRAAAEKNATVEWIDGNLGSKVSMKYPAVHLNGPGARGTMLSIAFAGANQNQDTGAKMIHNAPNTSSSIISKSIAKNGGAVNYRGQVTFGKNSKKSASHIECDTILMDDLSKSDTVPFNEIHNSQVALEHEAKVSKISEEQLYYLMSRGLTEKEATDMIVMGFIEPFTKELPMEYAVELNRLISYSMEGSIG
>CP006766.1|AGY45788.1|1965641_1966487_+|2-nitropropane-dioxygenase
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>CP006766.1|AGY44662.2|1964872_1965619_+|KR-domain-containing-protein
MNKRTILITGATRGIGWAIAQKAAQANHKVILTGRDPLSLKSRAEELKKKFPKTEIQAIPLDVSNRSSVANAAKLIKDIDILINNAGITADSTFKKMSPEIWDEVISVNLTGVFNSTHALLDKINQGGQIITLTSKSALFGNFGQANYAASKAGIIAFTKTLAKELQKSMIRVNSVSPAAVTDMTLPVLKSLKETYGQNIPDEWKMGSSSDVANFIINDLIESEMTGKIFSINGSEIGYWQEPTFHKL
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>CP006766.1|AGY45785.1|1963112_1964261_+|acetyl-CoA-C-acyltransferase
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>CP006766.1|AGY44661.1|1961881_1963123_+|long-chain-fatty-acid--CoA-ligase
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>CP006766.1|AGY44668.1|1971942_1972713_-|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC
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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	12923 : 74849	56	Bacillus_phage(18.18%)	tRNA,bacteriocin,protease	NA
DBSCAN-SWA_2	321042 : 330910	15	Lactococcus_phage(100.0%)	integrase	attL 320922:320946|attR 333252:333276
DBSCAN-SWA_3	441732 : 463397	32	Lactococcus_phage(52.38%)	integrase	attL 433602:433621|attR 471168:471187
DBSCAN-SWA_4	521070 : 542031	33	Lactococcus_phage(85.71%)	transposase,head,integrase,protease	attL 521328:521356|attR 539291:539319
DBSCAN-SWA_5	956393 : 1012452	77	Lactococcus_phage(90.91%)	holin,terminase,head,portal,integrase,tail,transposase,capsid	attL 955106:955127|attR 1010485:1010506
DBSCAN-SWA_6	1037405 : 1051190	12	Enterococcus_phage(25.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_7	1059850 : 1068119	9	Staphylococcus_phage(50.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_8	1671512 : 1753505	92	Lactococcus_phage(85.71%)	holin,terminase,tRNA,portal,tail,integrase,head,capsid	attL 1714751:1714780|attR 1751438:1751467
DBSCAN-SWA_9	1879310 : 1889088	9	Prochlorococcus_phage(33.33%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_10	1903851 : 1920058	21	Lactococcus_phage(88.24%)	integrase	attL 1902059:1902074|attR 1916309:1916324
DBSCAN-SWA_11	2037788 : 2118530	98	Lactococcus_phage(74.14%)	protease,holin,terminase,tRNA,portal,tail,integrase,head,capsid	attL 2077671:2077693|attR 2118550:2118572
DBSCAN-SWA_12	2217534 : 2230575	21	Lactococcus_phage(94.12%)	bacteriocin,integrase	attL 2216834:2216851|attR 2230662:2230679
DBSCAN-SWA_13	2339902 : 2397234	62	Lactococcus_phage(89.36%)	protease,holin,tRNA,portal,tail,transposase,capsid	NA
DBSCAN-SWA_14	2466374 : 2483381	26	Lactococcus_phage(88.89%)	head,bacteriocin,protease	NA
DBSCAN-SWA_15	2530162 : 2549705	27	Lactococcus_phage(89.47%)	head,bacteriocin,integrase,protease	attL 2530056:2530075|attR 2544966:2544985

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>CP006766|12923:74849|DBSCAN-SWA
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MIDEFLKEINKVIPLIKNNVIVDKIKEIKKSETILLNCLEYYQRTTLGLVMIVKNQEDLVSDVLKTAKSFNLDSYVVVDTGSSDKTVENLLELNFVRTEYLHWEENYGLMRNRAAEFSSMDWVLTLDSDEVFLTEPLDLKVLVSVLYIVLEKPFAINFEQHYNKSSKYGIPDRIYSRKTENFVGLVHEELRNKETKEAVMSIDTRIQIINKGSETKQVIKFDKEERYKNLLFQMIEIEPDNPRWVAFLSNRAIEALIINGQYEKLICKHLFITNKYSKRIGNLKIHKYTKMLLEKYISYLILWKNYDKANELLKVGLLLYPNNMAFIFFKGMIQIESVKNLSKTYLIRDLKKYIESDKQTLCDSSYRDTSSLELIIAELNELAGKKKVAKKIITEINDDNLKYFWDQWNDNL
>CP006766|12923:74849|72430_72613_+|AGY45146.1|DBSCAN-SWA
MKNITDFEQLFLENFNELTEEELLQTNGGGLIDWVMKNQGTMHAIGDISTQLEALGGHGR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AGY45126.1|12923_14915_+|bacteriocin	bacteriocin-associated integral membrane family protein	NA	NA	NA	NA
AGY45127.1|14916_15552_+|bacteriocin	bacteriocin ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.1e-23	36.0
AGY45129.1|15752_16223_+	hypothetical protein	A0A097BYE2	Leuconostoc_phage	4.0e-10	30.1
AGY43404.1|16240_16807_+|tRNA	peptidyl-tRNA hydrolase	NA	NA	NA	NA
AGY43405.1|16807_20293_+	transcription-repair coupling factor	NA	NA	NA	NA
AGY45130.1|20451_20922_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY43406.1|20992_21310_+	RNA-binding S4 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AGY43407.1|21338_21713_+	septum formation initiator family protein	NA	NA	NA	NA
AGY43408.1|21712_22036_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
AGY43409.1|22173_23523_+	serine hydrolase	NA	NA	NA	NA
AGY43410.1|23519_24791_+|tRNA	tRNA(Ile)-lysidine synthetase	NA	NA	NA	NA
AGY43411.1|24771_25323_+	hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase	A0A1V0SEQ1	Hokovirus	1.8e-09	29.7
AGY43412.1|25528_27616_+	ATP-dependent metallopeptidase FtsH/Yme1/Tma family protein	G8DDJ2	Micromonas_pusilla_virus	5.4e-107	49.2
AGY45131.1|28681_30505_+	PTS mannitol transporter subunit IIB	NA	NA	NA	NA
AGY43413.1|30563_32501_+	transcription antiterminator	NA	NA	NA	NA
AGY43414.1|32548_32980_+	PTS mannitol transporter subunit IIA	NA	NA	NA	NA
AGY43415.1|33117_34275_+	mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
AGY43416.1|34892_35342_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AGY43417.1|35418_35661_+	NINE protein	NA	NA	NA	NA
AGY43418.1|35741_37364_-	SulP family inorganic anion transporter	NA	NA	NA	NA
AGY43419.1|37573_38095_+	N-acetyltransferase	A0A1P8CWJ6	Bacillus_phage	6.0e-31	42.9
AGY43420.1|38558_39734_+	pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase	NA	NA	NA	NA
AGY43421.1|39832_40588_+	DNA repair protein RecO	NA	NA	NA	NA
AGY43422.1|40945_42364_-	dihydrolipoyl dehydrogenase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	3.0e-40	27.0
AGY43423.1|42557_44156_-	dienelactone hydrolase	NA	NA	NA	NA
AGY43424.1|44148_45129_-	alpha-ketoacid dehydrogenase subunit beta	NA	NA	NA	NA
AGY43425.1|45131_46256_-	thiamine pyrophosphate-dependent dehydrogenase E1 component subunit alpha	NA	NA	NA	NA
AGY43426.1|46344_47346_-	lipoate--protein ligase	NA	NA	NA	NA
AGY43427.1|47544_48390_-	glycerophosphodiester phosphodiesterase	A0A0S2MYI4	Enterococcus_phage	1.7e-11	31.0
AGY43428.1|48470_49121_-	HD domain-containing protein	A0A1S5XYU7	Kurlavirus	4.4e-15	32.4
AGY43429.1|49237_50263_-|tRNA	tryptophan--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
AGY43430.1|50764_51202_+	OsmC family peroxiredoxin	NA	NA	NA	NA
AGY43431.1|51362_52676_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
AGY45134.1|52735_53086_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY43432.1|53144_54140_-	phosphate acyltransferase PlsX	NA	NA	NA	NA
AGY43433.1|54242_55055_-	HAD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
AGY43434.1|55180_56818_-	ABC-F family ATPase	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	5.3e-49	25.9
AGY43435.1|57945_59226_-	O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase/cysteine synthase	A0A2I2L687	Orpheovirus	1.4e-09	26.9
AGY43436.1|59452_60286_-	KR domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AGY43437.1|60686_61154_+	universal stress protein	NA	NA	NA	NA
AGY43438.1|61282_61480_+	DUF4649 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AGY43439.1|61510_62131_+	esterase	NA	NA	NA	NA
AGY43440.1|62181_63351_+	ring-cleaving dioxygenase	NA	NA	NA	NA
AGY43441.1|63361_63952_+	flavin reductase family protein	NA	NA	NA	NA
AGY45137.1|64549_66697_+|bacteriocin	bacteriocin ABC transporter ATP-binding protein/permease	W8CYL7	Bacillus_phage	7.2e-38	26.5
AGY45139.1|68226_68364_+|bacteriocin	bacteriocin	NA	NA	NA	NA
AGY45140.1|68378_69089_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
AGY45141.1|69514_69967_+	transporter	NA	NA	NA	NA
AGY45143.1|71148_71328_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45144.1|71348_71528_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45145.1|71910_72198_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45146.1|72430_72613_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45147.1|72602_72869_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45148.1|72919_74158_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45149.1|74377_74680_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45150.1|74681_74849_-|bacteriocin	bacteriocin	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>CP006766|321042:330910|DBSCAN-SWA
TCTAAAAATTAGCATATTTTGCGAAAAGTTCTACAGCCTCAGATTCCTTTTCTTTTTCCAGATGGCTATAAATATCCATAGTCATTTTTATACTTGCATGTCCTAATCTTGTTTGAATTTCCTTATATGATACTCCAGCATTCAATAATAATGATGCATGAGAATGCCGAAAGCCATGAAATCCAATATCATGAAGTTCAGTAGCTTTAAAAGTAGCCTGTAGTGATTTTCTAAGCCGTTGATAGTCGAGTATTTTACCTTGATTTGTAGGAAAAATAAGTGATTGATTAGGTTGGCCAAGCTTTAAAAAGTATGACTTTTGATATAAATGCCAACGTTGCAAGTGTGATATTGTTTTGCTGTCAATGATAACTACTCGCTTGCTATGCTTTGTTTTCGGTGTATCTTGTATTGTTTGGTGTCCAGTAGTAGTTTTACTGACAGAAATTGTCTGCTTTTCGAAGTCAATATCAGACCATGATAAGGCAGTGGCCTCGCCAATCCGCAAACCAGAAGCAGTCAGTAAACGACAAATGGCTCTTAGCTCATTATTTACCCAAGTATTTGGCAAACTCTCCATATAATCAAAATAAGACTGTAGTTGTTCTTTGGTGAAATGCTTTACTTCACGTTCAGTGGTTTCCATTTTAACATTAGGGACAATGACAGTTAGGCATGGGTTAGAGCTTACTAGCCCCATAGAAATCGCATATTTAAATATTCTATTAGTTACATTAAGAAGAAGTTTGTACCCTTTGGCATTCCCTTTATTTCTTCTCATCGCTCCATTAAGTGGTTGACCTGCATTTTTAGCCCAGCGATTGACTTGTAGCTGAATTTGAGAAGTTGTCAGTCTATCAATTTTAGTATTGCCAAAAGCTGGCAAGATATATCTGTTTAGATTGGATCGCATTATCTCTATTGAATGGCTTTTGACTGTATGCTGATACATATCAAACCACGATTCAGCAACCTCAGCAAAAGTCTTTAGCTGCTTTTCTTTTTTCATGCATCCATTTTTAATAAAATCATTCTGTAGACGTTGAAGTTTAGTTTTAACGTCTTTTTTTGTGCGTCCTCTTACATCAGTTCGCACTTGCTTACCTGTCAGCACATCAGTACCTATATAAGCGCCACGGAGAATATAGCGTACTTCTCCGCTTTTTGTTTTGTATTCTTTTATATTTAATTTGTTCATGTTGATTCTCCTCTTTGCATTTGCCGTGCGCATAATGGAAAATCATGGATATTGTATTGGGGTCAAGGAGTTCGTGACAAGCTTTGAACTTTTTAAAACGGCATGATATTGGTACGTAATCGAGATTCAATTTCGGAAACTTTTGATTTTATCTCTTTATCAACTTGGTTTGGTTCAAGAATACTAACGTAGTTTGTCAAAAAGTCATTAAACTCATCATTGTAATAATCTTTTGTAAACTCTTTTAAAGCTTCTTCAACTTTTTTATATATTTCCGTATTCATCTTCAAAGATAAAGAAGCATCTTCTAAAAGTGGTTGCTTGTTTATAAATTTAACAAAGCTAGTTAGTTCATCAGGAAACACTACCTCCAAAATTTCTACTTCCATAAAATTCTCAGGAGTACCATCAGAAGCAAATTCAGTCGGAACGTAATCTTCACTATTTTTATATTTTCCAGTAAATTCAAAAGTACCAATGTAAGAATTGAACTTTTGAACTTGAATAAAGATAGTTAGTTCACCGGATGCTTTTATTTCTTCTTCTGTAGATAATACTACTTCAAAATCAAAAGGGGAATAATCAAAAAAATCGTTTGGAGTTATTTTAAAAAAATTGCAGATACTATTCAAAGTTTCATAATCGATTTGGGAGGACCTATTATTATTAATCCTTGTTAGAGTAGATGGTGCAATGCCCGTTTCAACGGCTAACCTATTCGCTCTTACGTTTCTTTCAGCAAGTAAAACAGATAATCTATTTATAATCATTTTTTTCTCCTTTATTTAATATTAGCATATGCGCGAATAAAAAACAATTTAACGAAAATTAAATTTTTATCTTGACTTATATTTTATATTTTGATATTATTTGATTGCGATAAAAAAATATTCACATACGCAAATAAAAAACAAAAAGGAGAATTTTATGATTGCGAATAATTTTTCGATACTATTGCTTAAGAATAATTTTAAAGCAAAAAGTTTTTCTGCTTACACAGGTATTGCAGAAAGCACACTTTCATCGCTTGTCAATATAGTTGAAAATGGCAAAGATATAAAACTATCAACTCTAATTAAAATATGTAATCATCTTAATTGCACATTATCTGAGCTTATTGAATATTTCCCAGAAGAACAATTAATCAATAACAAGTAATCATCAATCCAAGAATAAACAGCACGGTTTGCACAGCTTTCCGTAATGTGCTTACGCAACTATCCAGCCGTTGCAAGTATTGGTAGATGATTCCACAGCCTAAGCAATGGCTATAAACTGCATGTCCTAACATAAAAATAGCATTTGCCGTGCGCTGTAATAGAGAACCAAGAAAAAGACCGCGATTGTCGATAAACTACGTAGAAATGAGGATAAATGAACTTACAATTAGTCAATCAAGAATTATTCAACGGTATTACCTGTGATGTTTGGCGTAATGATAATCATGAAATTTTCATGACAACTGAACAACTTGCTCAGTGTATTGGATATCAAACTAGATATGGTATTACAAAACTAGTACAGAAAAATAAGTATCTCAAAAACAGAGAATTTTCAGTTAGTGCCAAATTGGCACACGGTGACGGAAAGCAATACGATACTCGAGTATTTACTTTTGAGGGAATCAAAGAAATTCTTTTCCTTGCACCAAAGAGTGAAACGGCTCGAAAATTCCGTGAATGGACACGTAGCGTATTGAAAGCTTATTTCAAAGGCGAATTAGTCAAAGCCAAAGAAATGGCAAAAGCCACTATCACACGGCGAGAATTATCGACTGCCATCAGTGAAAGTCCTCACTTTGAGAAAAACTATCATGTTATCTTTGCTGATATGCTGGTAGCTCTTGTTACCAATGGTAAGTATAAGAGCGTTAGAGGCATGAGAAAAGCGCTAGGACGTCCTAACGCAAAACTTAAACAAATGCTTGACAGTCCCAAAGAACTGCAATCACTGCAAACTTATGAATCAAGTATCACTAATTTACTAGATTTAGGTTTTGACAGACACCAAATCAAAGTGTTTTTGACAAAAGAAAAAGCCCAACCGCTACCAACGAAAAAGGCCTAATTCAAAACTTAGCATGAGTCACGCACTAACGTGATTTCATGCTCTTATTTTACCATAATGAGAGGAATTTTCAACATGAATAAACCAATAAACAAAGAAACTTATATCCTTGATGATTCAATCGCCTTTGAACTCATGGACTTATTAAAAGCTAAAGCAAGACATTTTATCCAACTTAATGAGTATGTCTACCGCTTGTTTGACGGTCAATCAGTAGTGACTTTCACAACTTTAGAAAATGACATTCAAGTAGAAATGGTTAAGGGGTAAGACATGAAATTTAAAACATTTGATTTAAGAGTATACCGTCATAATGATGAAACACTTCTTTCATTTGATATCAAAGGCGGACGGATACCATTAATTAAGTTGTTACATATTCCCAAAAGCAAACCATTTAAGATGAAGCTCACTCCTGAAATTGTTGAAAAATACCGTATTAAACAAGAGATAAAGCAAACGCGAAAGAAAACAGACAGCCCTAACGTGTTGTGTCCATTAATTGAAGCCATTGAAAAAGATGTATCTCAATTGTTAAATAAACAAGATAAGGACGATTGGGAGGGACGGAAACGCGTTTTTGCTTACGAATGTCTGTATAACATAGCTTTTAACCGTGGAAAACGTCACGAAAGACAACGCAGAAAAACGAAGCGCAAAGCATTGACGGCTTTCGATGTTATAAGCGCTAATGATGTTATAGAGCTTTCTAATGAGCTAGGAATAAATGAAGACAGACTGACTTATGCAGTACTGGAAGTTATCTCTAAACGTAAAAACGGAGGCAAAAAATGAAAATTAATACTATATCAGATTTAAAAGCGCTTGTAACTTCTCTTGAACGTTATGACGATAATACACCGCTGGCAATTAGTATCACTGGACAAGCTGAAACTAAGAAAAGAGATAAAGCATGAAATTTATAAAAATGGACGTTATAAGCACAGAAATACTACCTACTTGGTTGGTTAAACCTAGTCGTGCTGAAGTAAAAAAAATATTAATTGTCAATGAATCTAAAGCTCCAAAGTTGCATATAAGACTTAAACGAGGAGGGGAATCATGAGTATCTTATCATTTGAAGCAGAGCAGGAACTGACTCAATCAGTATTAAATCGTGTTGATAAATTAGTTGAGGCAAGAGTTGAACAAAGTCGTGAGTTCCCATATGTGCAACAAGCTGAATTATTGAAAGAACTGAACATTTCAACCACATATTTAGCTAAACTTCGGGCACACGGATTAAAGCAAGTGGTTTTAGAAGATGGAGATCGTACTGTTTGGTATAAAAAAAGTCAATTGGAATCCTTGATGGATTCATTGGCTGAATAGGGGGAAGAAGTGACAGAAGTTAAAACTGATTACGGAGATTTGGAAAAACAACGCAAAGCATGGGAACGGTTAGAAAATAATCTAAAAAAGGTGATTAATCTTCCCTGGGAAAAATTTGGAAACATTGATGGCGCTAAGATTCCTCAAAGTCTTGATTTAGTCCATATCTTGCATCGTGATATTTATGAATATCCTTATCTGTCAGTAAAGTCTACAGGAGAAAATAAAAGAATCAAAAGACCTAGTTTGCATTTAAACAATGGTCAAAATACTGTATCTATTTTCTACGGTGGAGTTAATAAAAAAGCTGAAAAAACTGACGATGGAGAAGATAAAGAAGTAGTTACATTAAAATCAAGTAAAAGTATACCTCGTTTTGTCAATGTGATCTTAGATTATCTAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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MTETIKDNSQQHTGNWVEDIRKGAEIERKEIDETSRQRSKEAFDKMRDKANAERDEINGLMKQVAERNYNDSKLKRDKEIKVAKQKAMQQIESEYESKYGVDTDKTERTKQAWSNLLKGL
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MSFNYTKTVVFTVKEKMPFNIPYDEEEFEKFSHALLVDKNAEWLGGYLFNIKNIVSIKRV
>CP006766|321042:330910|325368_325638_+|AGY45257.1|DBSCAN-SWA
MSILSFEAEQELTQSVLNRVDKLVEARVEQSREFPYVQQAELLKELNISTTYLAKLRAHGLKQVVLEDGDRTVWYKKSQLESLMDSLAE

Homologous phage analysis in the prophage region

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AGY45257.1|325368_325638_+	hypothetical protein	Q9AZH3	Lactococcus_phage	1.6e-40	98.9
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AGY45260.1|327916_328123_+	hypothetical protein	Q9AZG9	Lactococcus_phage	1.6e-32	100.0
AGY45261.1|328284_328857_+	hypothetical protein	Q9AZG7	Lactococcus_phage	7.9e-93	94.7
AGY45262.1|328871_329234_+	hypothetical protein	Q9AZG6	Lactococcus_phage	9.9e-33	65.8
AGY45264.1|329832_330063_+	hypothetical protein	A0A1P8BME4	Lactococcus_phage	1.9e-37	96.1
AGY45265.1|330238_330910_+	hypothetical protein	A0A1X9IGJ1	Lactococcus_phage	3.4e-26	31.5
333252:333276	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>CP006766|441732:463397|DBSCAN-SWA
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MNKPVNKETYILDDSIAFELMDLLKAKARHFIQLNEYVYRLFDGQSVVTFTTLENNIQVEMVKG
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MNKTMLIGRLTSASEISKTTNDKSYVRVTLAVNRRFKNEKGEREADFISIIIWGKSAETLVSYAKKGSLISIEGEIRTRNYTDKQNQKHYVTEILGLSYDLLESRATIALRESAIKTEETLLDAEELPF
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MKITDLQRLDQNIIKILADHRGIDKAIDGELLAQSLNVNLRTLQARIEFLQGKGCAIGSIDNIGYFAPLNEEERTKGITKKENMAYSTLKAVMGVRSASLDWLDKMID
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MTEQNGFKYSILASGSTGNSFYLETPKKKILVDAGLSGKKIESLLSEIDRDIHDIDALLITHEHSDHIKGIGVLARKYGIDLYANEDTWSELDSKNALGKIPVEQKHLFEMGKTMTFGDIDIESFGVSHDAIAPQFYRFMKDNKSFVMLTDTGYVSDRMRGTIENADAYLMESNHDIEILRMGAYPWRTKQRILSDQGHLSNEDGAEAAFSIHGNKTKRIFLGHLSLNNNIKELAHLTMDGYLQQHDVDTKKDLKILDTSHEHASQLYDI
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MSKIKKCCNSADCEHELCVNFDKNIGWVICTNSNVYARIIENYETESAVLSHSELTPNHYAELRTKDLQIIRNIISDLEK
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MYLTSEIKTALRKKRGSLNLTKGEAAEQLGINRLTYGRLESPARNEKVRQSTYEAITQWLAKGF
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MIEHYQGYTAIKRYGRNSFRPIGEHPFKLIHNARAVKHDLIQQFEDSTGINFPVGVRNNLCTQVIPVLGKELAAIKLRIKDNKNENN
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MENKFSIQRSFKGLKTAGSLYLVPTPIGNMQDMTLRSLETLKTVDLICSEDTRNTLRLLNHFEIKVPQESFHEHNSQEKIPKLIDFLKKGQSIAQVSDAGMPSISDPGHDLVLAAIDEGIDVIALPGASAGITALIASGLVPQPHIFYGFLPRKKGEQQKFLKSKLSYPETQIFYESPFRVGDTLANMQEIYGDREVVLVRELTKIYEEYRRGKISEVLESLTDQPIKGECLIIVSGADEVAQEVQEPELTALEAVKVLVEQSVKPNVAIKQIAKERGLNRQELYAEFHDL
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MAVRYYWGKPNDVIKWYLRGILHLSAASKQTYIEKTGAEPGNLPRLLKLLEELDEIFDNTATDTIALLCLRYVELLSIPDTAELTGLTNSQISKRTGKIMKKAKEIIAKA
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MSLLSEQAEQELIQSVLKRADKLVELRVEQLREFPYKKKADLKRKLSINEAYYQKLVTAGLREVILEENDKTVWVSEIQLEQLMNRLAE
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MIEEKEAIDHFANYEVEIIKEGVGTCSIHHCNLWQVQREVNSMAGSSKSGEKRTYQPRFCPQCQNEYKDRKLVELGASPEYGTDVTKPQEVDYFEKIKLQKGVDLRKDVVVKYDYADELSVNNAESFVKWITDNIGQSVKVKVIRPDKYAEQRRNRFMSEEEKQKFLKLKYDIETADILILNSLADFVDKELEDINAMLLSVKETGTIVILTIPESDYRLEQLPIRLRKRINKAQIMNISSKGIQR
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MADKYDVFDQLGELENTLNTTLTQISGIRQVLESSMTENATLRMELEKLRDRLAEFEKKEVKKETPKDQPNPNLIQIFNEGFHVCHLHYAERLAEGESCLDCLELLYR
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MENVTPEVFKETLDEFLAPINERLDALEEKQSKKAEIKKEVARGGILVGKSFENGVEEPIFQAGFTEDYLSDRKGILKARLQKAVANGDKTQAELLKLQINDME
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MIATYNTNVGDVLMLITANDKGEKVNFERKGKVARVFIEETGATVAWNIFEAKSLLANLSGNGQVVLSSDDIEMLNKELGKSGFSDVLVHDAQPKFVVAEIVEMEDHPDSDHLHICKVNVGFADPVQIVCGAPNAALGLKTVAALPGAMMPNGSLIFPGALRGVQSYGMLCSARELELPNAPEVRGIIELSSDLFAGKAFDSETMWQA
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MKNVAAINKNILIISTPLEKDSEHRSFGKTSINGHTYANTLFINNNREPMKLKITPNMVEKWKAKQQAKKDLKCITGKSLLDPLFNEVVKISIDKAKNDKDPFWVATDSYWAGYARGIRKQRQTLKEKALSAFNIINADDVRELSQELGVSEDKITTAVMEVISKRKNGGML
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MSKDIKFSSDARTAMMRGIDILADTVKTTLGPKGRNVVLEKSYGSPLITNDGVTIAKEIELEDHFENMGAKLVSEVASKTNDIAGDGTTTATVLTQAIVREGLKNVTAGANPVGIRRGIELAAETAVASIKEMAIPVHDKSAIAQVATVSSRSEKVGEYISDAMERVGSDGVITIEESKGMQTELDVVEGMQFDRGYLSQYMVSNTEKMVAELDNPYILITDKKISNIQEILPLLEQILKTNRPLLIVADDVDGEALPTLVLNKIKGVFNVVAVKAPGFGDRRKAQLEDLAILTGGTVITEELGLDLKDATLEALGQAAKATVDKDHTTIVEGAGSADAISDRVAIIKAQIEKTTSDFDREKLQERLAKLAGGVAVVKVGAATETELKAMKLLIEDALNATRAAVEEGIVSGGGTALVNAIAALDKLSEEGDIQTGINIVRRALEEPVRQIAANAGYEGSVIIDKLRSEEVGTGFNAATGQWVNMIEEGIVDPAKVTRSALQNAASVAGLILTTEAVVANKPEPAAPAMPPMDPSMGMGGMM
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MAKNRIKELRKKNKLTLKELSEKLKDYDLTFSDSQLSQYEQGKRSPRNDKLWEALSEIFDVNISYLLGVSDSVISNYKEMKERLDNDEILSNETRITKDKLYFNAINFLSDQNLSKVNSYRKLYISTFINYITELDNESSELSESELEEIEDVVDRIYEYMRDQIDELRKKRVEKY
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MSRPLITEQEYRRFENIIFKVWRVYRFGETDLTDKEIKHINEVLKKFSTEHHREYKIIIRHHLKHVYYTTIAREQGVSEGYIRKLAKKGAYYFLQLYDNSKDK
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MIIPENIENLAELVKGPEKTVFFFTAGWCGDCNFIKPKMPEIEVENPDFKFVEVDRDEYMDLAIEWGIMGIPSFVVIEDGKEKARLVNKLRKTKEEVNTFLASAK
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MVEKFIDGNVMKVVSEFQEAMAPFNKAEQALLMQREESKKIEELPIEERFSIDNIRKRKSDSLDVESIDKELSELHAEQRKAIADFDLQHKLNKAQNQDRDNLKPIEDLGNDVDTLTDKFIQDVMAVLEKRYALQTEYQGNLTTALGKIKVEFGKAGAEWDTSLNHIFNYTFTFREKADVIKRKVREEIR
>CP006766|441732:463397|450206_450842_+|AGY43700.1|DBSCAN-SWA
MNGILISLEGPDGAGKTTVLKEILPEIQKMKREIVPTREPGGVRVAEEIRQIILDPKNTEIDSKTELMLFAAARRLHMQEKMLPALQAGKVVIVDRFIDSSVAYQGYGRDLGVEVVDWLNYFATDGLKPDLTLYFDVDTDVALERIMKNRADEVNRLDLERAEMHRKVREGYLEIVVKEPERFVKIDASQPLEKVVADTLSVLKKRFVSEF
>CP006766|441732:463397|444863_445148_+|AGY43695.1|DBSCAN-SWA
MLKPLENRVVLRVKEEEEKSMGGIVLTSASQEKPQTAEVVAVGEGKTNHHGTLISPLVKVGDTVIFEKFAGTTVKMDGEEFLILKDSDLLAIVE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
433602:433621	attL	NA	NA	NA	NA
AGY43691.1|441732_442050_+	thioredoxin	A0A0K2FIM3	Achromobacter_phage	4.5e-05	30.4
AGY43692.1|442135_442762_+	DUF4479 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AGY43693.1|442924_444265_+	NADH oxidase	NA	NA	NA	NA
AGY43694.1|444354_444744_+	single-stranded DNA-binding protein	A0A0K0MWE1	Streptococcus_phage	1.8e-24	45.0
AGY43695.1|444863_445148_+	co-chaperone GroES	A0A221S386	uncultured_virus	3.1e-13	44.1
AGY43696.1|445235_446864_+	molecular chaperone GroEL	A0A219YK78	uncultured_virus	4.9e-156	56.8
AGY43697.1|446909_447722_-	MBL fold metallo-hydrolase	A0A0C5AJ83	Bacteriophage	3.1e-34	38.1
AGY43698.1|447892_449335_-	cell wall metabolism sensor histidine kinase WalK	W8CYF6	Bacillus_phage	1.4e-32	33.0
AGY43699.1|449327_450029_-	DNA-binding response regulator	W8CYM9	Bacillus_phage	1.2e-42	39.7
AGY43700.1|450206_450842_+	thymidylate kinase	M1PSC7	Streptococcus_phage	5.4e-74	65.0
AGY43701.1|450974_451835_+	DNA polymerase III subunit delta'	M1NSC1	Streptococcus_phage	5.0e-67	45.2
AGY43702.1|451886_452669_+	Signal peptidase	NA	NA	NA	NA
AGY43703.1|452661_452988_+	DNA replication initiation control protein YabA	NA	NA	NA	NA
AGY43704.1|452987_453863_+	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	8.7e-99	65.4
AGY43705.1|453939_454131_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45276.1|455137_455470_-	hypothetical protein	Q9AZE0	Lactococcus_phage	5.5e-38	70.4
AGY45277.2|455469_455781_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45278.1|456029_456602_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45279.1|456615_456930_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45281.1|457224_457965_-	hypothetical protein	A0A1P8BLT1	Lactococcus_phage	2.4e-41	41.7
AGY43706.1|457964_458729_-	replisome organizer	A0A1P8BLU3	Lactococcus_phage	1.6e-77	67.8
AGY43707.1|458739_459066_-	HTH domain-containing protein	Q9AZE7	Lactococcus_phage	5.2e-49	88.9
AGY45282.1|459052_459316_-	hypothetical protein	Q9AZE9	Lactococcus_phage	1.5e-30	73.5
AGY43708.1|459312_459558_-	hypothetical protein	Q9AZJ0	Lactococcus_phage	1.7e-23	67.1
AGY45283.1|459567_459810_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45284.1|459848_460118_-	hypothetical protein	Q9AZH3	Lactococcus_phage	1.3e-18	59.6
AGY43709.1|460114_460633_-	hypothetical protein	Q9AZJ3	Lactococcus_phage	3.1e-19	47.0
AGY43710.1|460637_460832_-	DUF1655 domain-containing protein	Q9AZJ4	Lactococcus_phage	5.1e-28	96.9
AGY45285.1|460958_461222_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45286.1|461259_461454_-	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AGY45287.1|461600_462131_+	XRE family transcriptional regulator	Q9AZN3	Lactococcus_phage	3.1e-19	71.0
AGY43711.1|462197_463397_+|integrase	site-specific integrase	Q9AZI0	Lactococcus_phage	4.7e-180	79.4
471168:471187	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>CP006766|521070:542031|DBSCAN-SWA
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MANGTVKWFNADKGFGFITSEEGKDLFAHFSAIQSDGFKSLDEGQKVEFDVEEGQRGLQAVNITKA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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521328:521356	attL	NA	NA	NA	NA
AGY43757.1|521455_522604_-|integrase	site-specific integrase	Q9AZF9	Lactococcus_phage	3.0e-208	99.0
AGY45294.1|522728_523226_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45295.1|523244_524144_-	DNA polymerase III subunit epsilon	X2KQX9	Campylobacter_phage	1.4e-38	36.9
AGY45296.1|524182_524617_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY43758.1|524626_524962_-	XRE family transcriptional regulator	A0A182BQC8	Lactococcus_phage	3.0e-23	52.8
AGY45297.1|525257_525464_+	hypothetical protein	A0A182BQC7	Lactococcus_phage	4.6e-27	89.7
AGY45298.1|525478_525739_+	excisionase	Q9AZF3	Lactococcus_phage	8.6e-47	100.0
AGY43759.1|525898_526093_+	DUF1655 domain-containing protein	Q9AZF2	Lactococcus_phage	2.2e-26	90.6
AGY45299.1|526097_526523_+	hypothetical protein	Q9AZF1	Lactococcus_phage	1.8e-70	90.1
AGY43760.1|526557_526797_+	hypothetical protein	Q9AZF0	Lactococcus_phage	4.4e-37	96.2
AGY45300.1|526793_527048_+	hypothetical protein	Q9AZE9	Lactococcus_phage	1.4e-41	97.6
AGY45301.1|527044_527239_+	hypothetical protein	Q9AZE8	Lactococcus_phage	6.7e-28	96.9
AGY43761.1|527225_527552_+	hypothetical protein	Q9AZE7	Lactococcus_phage	3.5e-37	71.3
AGY45303.1|527747_528506_-|transposase	transposase	A0A059NT77	Lactococcus_phage	5.3e-137	100.0
AGY45304.2|528517_529741_-|transposase	IS21 family transposase IS712	A0A059NT83	Lactococcus_phage	4.9e-233	100.0
AGY45306.1|530300_531743_+	hypothetical protein	Q9AZE5	Lactococcus_phage	5.9e-270	96.9
AGY45308.1|532054_532456_+	hypothetical protein	Q9AZI4	Lactococcus_phage	5.1e-30	56.8
AGY45309.1|532611_532797_+	hypothetical protein	Q9AZE3	Lactococcus_phage	7.0e-27	100.0
AGY45310.1|532823_533432_+	hypothetical protein	Q9AZE2	Lactococcus_phage	4.4e-102	99.5
AGY43762.1|533440_534031_+|head,protease	HK97 family phage prohead protease	Q9AZE1	Lactococcus_phage	1.1e-105	98.0
AGY45311.1|534246_534576_+	hypothetical protein	Q9AZE0	Lactococcus_phage	2.7e-53	100.0
AGY45312.2|534678_534999_+	sigma-70 family RNA polymerase sigma factor	Q9AZD9	Lactococcus_phage	3.3e-48	92.5
AGY45313.1|535692_535965_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45314.2|536081_536303_+	hypothetical protein	Q9AZD7	Lactococcus_phage	3.0e-32	100.0
AGY43763.1|536471_536960_+	DUF4065 domain-containing protein	Q9AZD6	Lactococcus_phage	5.0e-88	100.0
AGY45315.1|536925_537492_+	hypothetical protein	Q9AZD5	Lactococcus_phage	4.6e-101	100.0
AWJ95516.1|537810_537993_+	hypothetical protein	Q9AZD4	Lactococcus_phage	5.0e-25	100.0
AGY43764.1|538659_538860_+	cold-shock protein	Q9AZD3	Lactococcus_phage	6.7e-31	100.0
AGY43765.1|539400_539898_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
539291:539319	attR	NA	NA	NA	NA
AGY43766.1|540044_540554_+	methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase	M1PFU9	Streptococcus_phage	6.7e-27	42.7
AGY45316.1|540567_541128_+	methylphosphotriester-DNA alkyltransferase	NA	NA	NA	NA
AGY43767.1|541221_542031_+	ABC transporter ATP-binding protein	W6JKT0	Anomala_cuprea_entomopoxvirus	1.7e-19	36.7

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>CP006766|956393:1012452|DBSCAN-SWA
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MKTEEIVQNYQIKLLKIIFKEIDNLMTKKENADINAQKFAKSSNTVNTSAYWKSVGNAEFYIKEIYQKLSALAEIDRLFHWSDRLHQEQLKFVSKYPKVMEKYRQTNIAGQ

Homologous phage analysis in the prophage region

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955106:955127	attL	NA	NA	NA	NA
AGY45396.2|956393_957527_-|integrase	site-specific integrase	A0A059NT56	Lactococcus_phage	7.8e-193	92.8
AGY45398.1|957849_958716_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY44067.1|958768_959065_-	hypothetical protein	Q9AZF7	Lactococcus_phage	2.1e-49	99.0
AGY44068.1|959144_959345_-	hypothetical protein	A0A1P8BMQ1	Lactococcus_phage	5.8e-27	89.4
AGY45399.1|959396_959831_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY44069.1|959840_960176_-	XRE family transcriptional regulator	Q9AZF5	Lactococcus_phage	5.4e-25	53.6
AGY44070.1|960468_960660_+	hypothetical protein	Q9AZF4	Lactococcus_phage	4.7e-26	95.2
AGY44071.1|960674_961418_+	phage antirepressor Ant	A0A1P8BKE3	Lactococcus_phage	1.4e-129	91.9
AGY44072.1|961430_961763_+	DUF771 domain-containing protein	Q9AZQ3	Lactococcus_phage	3.8e-55	97.2
AGY45402.1|962128_962335_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45403.1|962337_962526_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45404.1|962574_962838_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45405.1|962927_963491_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45406.1|963478_963688_+	hypothetical protein	A0A1P8BLR5	Lactococcus_phage	2.0e-09	81.6
AGY45407.1|963677_964415_+	phage recombination protein Bet	A5GZ45	Lactococcus_phage	5.2e-137	99.6
AGY45408.1|964416_965484_+	DUF1351 domain-containing protein	A5GZ46	Lactococcus_phage	1.1e-169	98.0
AGY44073.2|965746_966673_+	DnaD domain protein	A5GZ47	Lactococcus_phage	2.9e-129	88.3
AGY45410.1|966665_966908_+	hypothetical protein	A5GZ49	Lactococcus_phage	2.5e-40	96.2
AGY45411.1|966920_967331_+	hypothetical protein	A5GZ50	Lactococcus_phage	1.3e-76	100.0
AGY45412.1|967438_967591_+	hypothetical protein	A0A1P8BM01	Lactococcus_phage	6.8e-20	93.9
AGY45413.2|967781_969005_+|transposase	IS21 family transposase IS712	A0A059NT83	Lactococcus_phage	4.9e-233	100.0
AGY45414.1|969016_969775_+|transposase	transposase	A0A059NT77	Lactococcus_phage	5.3e-137	100.0
AGY45416.1|970128_970638_+	hypothetical protein	Q9AZU7	Lactococcus_phage	1.3e-09	100.0
AGY45417.1|970646_970979_+	hypothetical protein	Q9G0E0	Lactococcus_phage	7.5e-11	88.2
AGY45418.1|970959_971226_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY44074.1|971226_971433_+	DUF1125 domain-containing protein	Q9MC26	Lactococcus_phage	1.3e-13	58.8
AGY45419.2|971404_971998_+	hypothetical protein	Q9AZU5	Lactococcus_phage	3.6e-40	56.6
AGY44075.1|971994_972228_+	hypothetical protein	A0A1P8BMH6	Lactococcus_phage	8.9e-19	60.8
AGY45420.1|972224_972557_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45421.1|972546_972840_+	hypothetical protein	Q9MBV6	Lactococcus_phage	3.3e-26	84.1
AGY45422.1|972836_973172_+	DUF1140 domain-containing protein	A0A1B1IMW5	Lactococcus_phage	1.4e-49	90.8
AGY45423.1|973190_973427_+	hypothetical protein	A0A1P8BMS6	Lactococcus_phage	2.9e-09	47.5
AGY45424.1|973423_973624_+	hypothetical protein	A0A1P8BKA6	Lactococcus_phage	1.0e-31	90.9
AGY45425.1|973859_974102_+	hypothetical protein	Q8LTL7	Lactococcus_phage	1.4e-27	71.2
AGY45426.1|974216_974429_+	XRE family transcriptional regulator	Q9AZN3	Lactococcus_phage	1.8e-26	91.4
AGY44076.1|974509_974932_+	DUF722 domain-containing protein	Q9AYX5	Lactococcus_phage	5.5e-75	100.0
AGY45427.1|975115_975709_+	hypothetical protein	D2IYV7	Enterococcus_phage	4.9e-13	27.6
AGY45429.1|975880_976291_+|terminase	terminase	Q9AZ67	Lactococcus_phage	1.6e-66	98.5
AGY44077.1|976283_977666_+|terminase	terminase	Q8LTR4	Lactococcus_phage	3.4e-267	98.5
AGY45430.1|977686_979063_+|portal	phage portal protein	Q9AZ65	Lactococcus_phage	8.8e-239	93.0
AGY44078.1|979066_980107_+|head	phage head morphogenesis protein	A0A1P8BM04	Lactococcus_phage	4.8e-189	97.7
AGY45431.1|980204_980552_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45432.1|980736_981366_+	DUF4355 domain-containing protein	Q9AYW7	Lactococcus_phage	1.9e-63	82.7
AGY44079.1|981384_982248_+|capsid	capsid protein	A0A1P8BKP7	Lactococcus_phage	4.2e-154	97.9
AGY45433.2|982247_982514_+	hypothetical protein	A0A1P8BLK6	Lactococcus_phage	4.9e-21	88.7
AGY44080.1|982535_982868_+	hypothetical protein	A0A1P8BMC5	Lactococcus_phage	9.3e-54	99.1
AGY44081.1|982864_983176_+	hypothetical protein	A0A1P8BLP2	Lactococcus_phage	1.5e-53	95.1
AGY44082.1|983172_983511_+	hypothetical protein	Q77K21	Lactococcus_phage	7.3e-54	97.3
AGY44083.1|983507_983897_+|capsid	phage capsid protein	A0A1P8BKT6	Lactococcus_phage	5.6e-66	99.2
AGY44084.1|983907_984405_+|tail	phage major tail protein, TP901-1 family	A0A1P8BKV6	Lactococcus_phage	2.4e-85	97.0
AGY44085.1|984520_984856_+	hypothetical protein	Q77RZ7	Lactococcus_phage	4.2e-54	99.1
AGY45434.2|984951_985215_+	hypothetical protein	Q9AZ59	Lactococcus_phage	5.0e-42	100.0
AGY44086.1|985229_988043_+|tail	phage tail tape measure protein	Q9G097	Lactococcus_phage	3.6e-287	96.0
AGY45435.1|988056_988818_+|tail	phage tail protein	Q9AYV7	Lactococcus_phage	8.8e-140	98.0
AGY44087.1|988817_991571_+	peptidase M23	A0A1P8BMA1	Lactococcus_phage	0.0e+00	96.4
AGY45436.1|991583_992402_+	DUF2479 domain-containing protein	A0A1L2JXK8	Streptococcus_phage	2.0e-137	88.6
AGY45437.1|992483_993635_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45438.1|993762_994068_+	hypothetical protein	A0A1P8BKN8	Lactococcus_phage	8.9e-51	96.0
AGY44088.1|994054_994279_+|holin	holin	A0A059NT58	Lactococcus_phage	2.7e-28	86.5
AWJ95525.1|995627_995831_+	hypothetical protein	A0A059NTA2	Lactococcus_phage	4.0e-15	84.3
AGY45440.1|995827_996007_+	hypothetical protein	Q9AZG2	Lactococcus_phage	2.3e-22	94.9
AGY44089.1|996564_997011_+	ASCH domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AGY44090.1|997094_997421_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY44091.1|997576_999244_+	formate--tetrahydrofolate ligase	NA	NA	NA	NA
AGY44092.1|999352_999946_+	peptidoglycan endopeptidase	A0A1V0DZX6	Clostridioides_phage	1.9e-17	45.8
AGY44093.1|1000083_1000929_+	amino acid ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
AGY44094.1|1001196_1002084_+	amino acid ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
AGY44095.1|1002095_1002848_+	amino acid ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	9.6e-30	39.2
AGY44096.2|1002852_1003077_+	DUF4059 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AGY44097.1|1003271_1004198_+	thioredoxin-disulfide reductase	G3MA85	Bacillus_virus	4.0e-86	51.4
AGY44098.2|1004837_1007291_+	ribonuclease R	Q0GXV6	Lactococcus_phage	5.6e-103	43.5
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AGY44100.2|1007976_1009035_+	endonuclease	NA	NA	NA	NA
AGY44101.2|1009060_1010002_-	prenyltransferase	NA	NA	NA	NA
AGY44102.1|1010155_1010419_+	ACT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AGY44103.1|1010535_1011873_+	PFL family protein	NA	NA	NA	NA
1010485:1010506	attR	NA	NA	NA	NA
AGY44104.1|1011972_1012452_+|tail	phage tail protein	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>CP006766|1037405:1051190|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

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MSLKQLKDVTYFKLNNEINIPVNGSIPLAKDKEAITAFFKENVEPNRYEADTYIDKLNWLVKEEYLEAEFLEKYKPEFITNLRKELSKFEFHFDSFMAAYKFYNQYAMKNNDGSLYLEDFEDRVLMNALYMADGDEKLANNLAFAMINRRYQPATPTFLNAGRKRRGEFVSCFLLQLTDDMNSIGRTINSALQLSKNGGGVGLNLTNLRAAGAPIKGYDGVAAGVVPVMKLFEDAFSYANQLGQRQGAGVVYLSLFHPDIMEFLSTKKENADEKIRVKTLSLGVTVPDKFYELVKKGETMYLFEPYFVEKYYGKPFAEVDITAEYDKMVANPEIRKTSINARELEQELSKLQQESGYPYIVNVDTVNQANPVDGVISMSNLCSEILQVQTPSVLNDDQTYKVVGTDVACNLGSTNVLNMMTSSNEFGTSIEAMVRALTFISETSNLDTVPTVRKGNDEIHAIGLGAMGLHSFLAQNQIHYDSKEAVEFTSVYFMLLNYYTLVASNKLAVEKGSSFKNFEKSAYADGSYFDKYLTHDYFAAVSSKVQELFKGIAVPTIEDWTALRDTVKTSGLYNSYRMAVAPNGSISYINDCSSSIHPIVNRIEERQEKKVGKIYYPAAGLATETIPYYKSAYDTDMRAVIDVYAAATEHVDQGLSLTLFMRSTLPEGLYEWKVANNKMTTRDLSILRNYAYKKGIKTIYYIRTFTDDQEEVGANQCESCVI
>CP006766|1037405:1051190|1047161_1047995_+|AGY44134.1|DBSCAN-SWA
MSEKYVVFDFETTGFSAQKNEIIQIGAVKYDENNQEQARFNQLVKNQRSYVSTEITQLTGIKPADLLNQPTIEEILPEFLDFIKGHLLVAHNAPFDISFLYQAIIDCAITDVEAFRVYDTLAESKKLLTMSSYALENFKDLLEMNDLRSHDALNDCLITAKLYQYLQKIEEVELSVESEVTDELGQLDLFGDSSDEITDSLRRKLNLPITKALVYYQQNLELKWERFEVLGISIEREYSVGSSLNIRLHNSEKVKIHSDFLKEMQKANFVTIMEEEK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AGY44126.1|1037405_1038098_+	cell division ATP-binding protein FtsE	G9BWD6	Planktothrix_phage	2.7e-31	34.4
AGY44127.1|1038090_1039026_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
AGY44128.1|1039127_1040105_-	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta	A0A096XT60	Enterococcus_phage	2.4e-118	66.2
AGY44129.1|1040454_1042623_-	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha	A8E2R1	Enterococcus_phage	3.0e-257	61.1
AGY44130.1|1042758_1043181_-	protein NrdI	A0A142F1R4	Bacillus_phage	2.3e-12	37.3
AGY44131.1|1043182_1043401_-	NrdH-redoxin	C3U2K9	Lactococcus_phage	7.6e-12	47.6
AGY44132.1|1043574_1044216_-	glycerol-3-phosphate 1-O-acyltransferase PlsY	NA	NA	NA	NA
AGY44133.1|1044490_1046425_+	DNA topoisomerase IV subunit B	G3M9Z3	Bacillus_virus	5.4e-125	43.4
AGY45443.1|1046629_1047169_+	cysteine hydrolase	NA	NA	NA	NA
AGY44134.1|1047161_1047995_+	3'-5' exonuclease	A0A0K2SUJ2	Clostridium_phage	3.1e-21	39.4
AGY44135.1|1047991_1048441_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AWJ95526.1|1048715_1051190_+	DNA topoisomerase IV subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	3.2e-98	32.2

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>CP006766|1059850:1068119|DBSCAN-SWA
GATGAAAAAAGACGAATACTACATGGATTTAGCAATTGTACTTGCAAAAAAAGGAGGTGGTAATGTCAACCCTAACCCTCAAGTAGGAGCCCTTATTGTCAAAGAAGGGAGAATTATTGGTCAAGGTTATCATGAAAAATATGGGAAAGCTCACGCGGAAATCAATGCTTTTAAGGATTGTAACGAATCTCCCGAAGGAGCCACGCTTTATGTGACCTTAGAGCCTTGTGCGCATCAGGGAAAACAACCCCCTTGTTTTGAAGCGATTATAAAAAATGGAATTAAGCGTGTTGTTATCGGGCATTTAGACCCCAATCCCTTGGTTTTAGGAAAAGGAATTAAAGCAATGAGAGAAGCTGGAATTGAAGTTTCTCTCAATGTTTTAGAAAAAGAATGTGAAGAATTAAATAAAATTTTCTTTTATTATGTTAGTCAAGGGCTTCCCTATGTCATGATGAAGTATGCAATGACTTTAGACGGAAAAATTGCGACATCAGCAGGTCAATCAAAATGGATTACAGGTGAAATTGCAAGACAGAAAGTACATCAAGACCGTTCACGTTTTATGGCAATTATGATTGGTGTTGAAACGCTTATTTTAGATGATCCACAACTCTCTGTCAGGTTGGAAAATGGAAAAAATCCGATAAGAATCATTTGTGATACTCATTTAAGAAGTCCTTTGGCTTCCAAGATTGTTTCCACAGCTACTGAAATTCCAACGATTATTGCTACAGCTGAGTCTGACCCCGAAAAACAAGCTCCCTTTCTTAAAGCGGGTTGTGAAATTATCTTAGTTTCTTGCCTAGAAGGAAGATTAAATTTGAAAGAATTGACCAAAAAGTTAGGAGAAAAGGGGATTGACAGTATCATCTTGGAAGGTGGAGGAACATTAAATGCTTCGGCATTAAAAGCAGGGATAGTCCAAAAAGTTCAAACTTATATTGCCCTTAAAATATTTGGTGGAAAAGAAGCACCAAGTCCAGTTGAAGGACATGGAATCGAGCAACCCAATCAAGCCTATCTCCTAGAAGGGGCTCAAATAACCTATCTAGGAGAAGATATTTTATTAGAAAGTGAGCTTCTTTAATGTTTACAGGAATAATTGAAGAATTAGGGGAAGTGAGTCGCCTGCAAAAAAGAGAAAAATCCTTCAAAATTAGTATCCGTGCTTCCTTGATTTTAGAGGATATGAAACTTGGAGATTCTATTTCAACAAATGGTTTATGCCTGACCGTTTCTGAATTTAATCAAAAAGAATTTACGGCTGATATTATGCCTGAAAGTCTAAATCGCTCAAATCTTGGGACCTTAAATGTGGGTGCCAAAGTTAACTTAGAACGAGCGATGCCATTAAATGGCCGATTTGGTGGGCATATTGTGTCATGGCATATTGATGGAGTTGGCCAGATTTTAGAAGTAAAAAAAGAAGAAAATGCCATCTGGTTTGAAATCAAAACGAGCTTAAATTTAATGAGATACACCGTCGAAAAAGGCTCGATTACGATTGATGGGATTAGTCTTACAGTTGCTCAGGTTAAGTCGAAATCTTTTAGTGTTTCCATTATTCCACATACGCTCAAAGAAACGATAATGGCAGATAAAAAAGTGGGTGATACTGTTAATTTAGAAAATGATATTTTGGGGAAATATATAGAAAAATTATGGGGCGATAGTAGTTCTTCGATGAAAGAATCTTCAGTAACTAAAGAAAAGCTATTTAACAACGGATTTTTATAGGAGATAAAATGTTCCAATATAATAAAGTAGAAGAAGCACTTGCTGCACTTAAAGCAGGGGAAATGATTATCGTTAGTGACGATGAAAATAGAGAAAATGAGGGCGACCTTATCTGTGCGGCCGAATTTATCAGTCCAGAAATAATTAATTTTATGGCAAGTGAGGCCAAAGGATTGATATGCGCACCACTCAGTGAAACTTATGCTAAGAATTTACAATTAGAAGCAATGGTAGAGAAAAATACAGATAATCATGGAACAGCTTTTACAGTTTCGGTTGATCATATTGAAACTAGCACAGGAATTTCGGCTTTTGAACGGGCCTTAACCATAAAAAAACTTGTTGATGCCGAGAGTTTACCAAGTGATTTTCGTAGACCAGGTCATGTATTTCCACTTATTGCCAAGAAAAATGGTCTTTTTGAGCGAAATGGTCATACTGAGGCTACGGTTGACTTGTTGCGTCTGGCTGGTTTAAAAGAAGTAGGTGTCTGCGTTGAAATAATGGACGAAGATGGAACAATGATGCATAAGGAGAAACTGAAGGAAAAAGCGCAAGAGTGGGGCTTGAAATATATCACAATTAAAGCTATTCAAGAGTATCTTAAGCAAAATGAACTACAAGTAGAACAGGTGACTAGAGCTAAACTACCGACGAAATATGGTATGTTTGATATTTTAGGATTTGTCAATAAAATAAATGGTGAGCACCATGTTGCTTTAGTTAAAGGAGATATTGGTGACGGTCAAGCTATTCTTTGCCGCGTTCACTCAGAATGCTTAACTGGTGATGCTTTTGGTTCTTTGAAATGTGACTGCGGTGGACAATTAGAAGAAGCATTAAAAAAAATAAATGATGAGGGGCGTGGCGTACTTTTATATCTTCGACAAGAAGGACGTGGAATTGGTTTGATTAATAAACTTCGTGCCTACTCACTTCAAGATGAAGGACTTGATACGGTTGAAGCTAATTTAGCTTTGGGGTTTGAAGAAGATGAGCGAGAATATTCTATTGGAGCACAAATTTTAAAAATAATTGGGGTGAAATCATTGAAATTAATGACTAATAATCCGCAAAAGATTAATGATTTTCAAAAATATGGTCTAGTAGTTGAAGAAAGAGTAGCTCTCCAAATCAAAGATAACCCCTTTGACCTTGATTATTTAAAAGTAAAACAAAATAAAATGGGACATTTGTTTGACTAAAGTAAAATAGAAAGTAAGGATAGAAATATGACAATTATTGAAGGAAATTTAAGAACAGAGAATGCAAAATATGGGATTGTAGTTGCTCGATTTAATGAATTTATCAATGCAAAACTTTTGTCAGGAGCATTAGATGCACTCAAAAGACATGGAGTCCAGGAAGAAGAAATTGATATAGCATGGGTTCCAGGTGCATTTGAAATTCCCATTATTGCCCAAAAAATGGCGACTTCCAATAAATATGAAGCAATTATATGTTTAGGGACTGTCATCAGAGGCTCAACTTCTCATTATGATTTTGTTTGTAATGAAGTTTCTAAGGGGATTGCTCATGTTTCCTTAAACTCTAATATTCCGGTCATGTTTGGTGTACTAACAACTGAAAATATAGAACAAGCCATTGAGCGTGCAGGCACAAAAGCTGGAAATAAAGGTTTTGAAGTAGCGGTTGGAGCAATTGAAATGGTTGATTTAATGAGAAAGATTGGCTAATTTATCTATAAGTGCATTTATTTAAATGTGCTTTTTATTTTGAAATAGGATAAAAACTGTTCTAGCGAGCTATCAGATTGCGAAATATGCTATAATTAAAGCATGAAAAAACTACTGTCACTTGTTATTATCGTTGTCGGAATTGTTGCTGACCAAATTTTTAAAAATTGGATTGTTGCTAATATTCAGCTTGGAGATACAGAAAAAATTTGGCCTAATGTTCTTAGTTTAACTTATATCAAAAATGATGGAGCAGCTTGGTCTTCATTTTCAGGTCAACAATGGTTTTTCCTTATCTTAACACCGATCGTCTTAGTTGTTGCCCTTTGGTTTTTATGGAAAAAAATGGCACAAAACTGGTATTTTATTGGATTAACTTTAATTATTGCGGGTGCTTTGGGAAATTTTATTGACCGAATTCGTCAAGGATTTGTTGTTGATATGTTCCAAACTGAATTTATTAATTTTCCAATTTTTAATATTGCGGATATCTTATTATCTGTTGGTTTTGTTCTTCTTTTCATTGCAATTTTGACAGACAAAGAAACAAAATAAATTGATTAAAAAATCACTGACAGAAAGTTTTATTTAACATTTATAAAAAGGAAAACACACTTGCCTATCATAAAAATTAACGAAGAAAACAAAGGCTTACGTCTTGACAAGGCGCTTGCCAATCAAACAGAATACTCACGGAGCTTACTGACAGAACTTATCAAAAATGATAAAGTATTTGTTAACAGTGAAGCAAAAAAAGCAAAGTATAAAGTAAAAGTAGGGGACAGGATTGAATTTGAAGTTCCGGAAGCGGAAGTTCTTGATATTGTTGCTGAAGATTTGCCACTAGAAATCATTTATGAAGATTCAGATGTTGCAGTAGTAAATAAACCTCAAGGAATGGTAGTTCATCCTGCAGCCGGTCATGCTTCAGGGACATTGGTTAATGCAATCATGTATCATATCAAAGATCTTTCAAGCATTAATGGTGTAATTCGTCCAGGAATTGTGCATCGTATTGATAAGGATACGAGTGGTCTTTTGATGATTGCCAAAAATGATAAAGCACACGAAAGTTTGGCAGCACAATTAAAAGATAAGACTAGCAAACGTCGTTATTTAGCGATTGTCCACGGTGAAATTGCTAATGATAAAGGAACCATTGAAGCGCCAATTGGTCGTAATCTTAAAGATCGCAAAAAACAAGCCGTAGTTTCTGGCGGAAAACCAGCCGTGACTCATTTTGAAATTTTAGAACGATTTTATGGCTATACTTTGATTGCATTACGCTTGGAAACTGGGCGTACACATCAGATTCGTGTACATATGAATTACATTGGTCATCCTGTGGCTGGTGATCCACTCTATGGGCCAAATAAAACATTGACACCTAATAAAGGGCAATTTTTGCATGCTGAAACATTAGGTTTTGACCATCCAACAACTGGTGAGTTTATGGAATTCCAAGTTGATGCTCCTGAGATATTCAATGAACAATTAGAAAAGCTTAGAGAACAAGTTTAAACTTGTTTTTTTTGTATTTAAAAAAGAACTATATTTACTGACAGACTTTCTGTATTTGTCAGCAAATCAGACATCAATAAAAGATAGATGATGTATAATAGAGTTACTGATAGTTAGTAGGTTTTTATTAGTAAAAGGAGACTATTATGAACTTTTTTAATCAGATTTTTCATAATCAAATTTTAATGACAGCCATTGTGAGTTGGGCTCTGGCTCAGTTAATTAAAATAATTATCGAACTTATTCGGACACATCGTATTAATTGGCAATTAATTTTTGCAACAGGTGGAATGCCCAGCTCTCATAGTTCATTGGTTGTTGCTTTGGCAACGGCTACTGGATTGAGACAAGGATTTGATTCATCGCTTTTTGCTATTGCTACTGTTTTAGCCTTCGTTGTTTTATATGATGCCCAAGGTATTAGAAGACAGGCAGGAAATCAAGCCAGAATTATTAATCGAATGTTACAAAATGTCGAAAATGCCGGAATCAAAGTAGATAAAAATTTAAAAGAATTATTGGGGCATACACCAATTCAAGTGATGGGTGGAACAATTTTAGGAATAATAGTTGCTTTAGTAATGAATTAAGAAAAAATTCTGTTGCAATCAGAGTCGTAAGCGTTAACTATAGTGTAGTTTATAAATGCGAAGTAAAAAAATGAGAAATTATCATCTAAAAATTAAGGTTATTGTAAGAAACAAAAGCCAAGCTATGGTAAAATGGTAATATGAATAATATAGTATTTATTAAGTATAAAAAAGGATTCTGTCTTGCATTAATGATAGGAATCTTTCTTTTAATTAACGGGATTGCTATTTCTTTGACGCAAGTGTGGAACGCAGATCACATCATTGCGCTTTTGTTAGGAAATATTCTTTTAATAGCAGCCTATTTTTATTTTGTTGGAATTTATAAATTATCGAAAAAACTTTTTGACTCGAAGAATAAAAATGAAACTACTGACAAGTCTGTCAGTAAAATTGAGTTACTTACAGACTTGTCAGTAACAAAATATTATCGAATAAGCTTTTGGTTAGTAGCTTTGTTAACTTTTATCTTGCCGTTTCTTTTTATGATTCATGTGCCTGATAGTAAGCATGCTTGGGACTATTTCGTTATATTTAATTCTACGACAGAACTCCATGGTCAATCTTTTGGACTGTTACCTGAAACTGCTTCGCGTTTAGGATATTTTCTTCGTTATCCAAATAATCAATTTTTAGGAATTTTATTTAATCAAGTTTTCTCACCATTTGCAGGAAGTGTTGAACTAAAAATGTGGGTTGTGACAGCAGTGTCTGCACTGTTGACAAGTCTCGGAGTTTTAGCTGGAACCTTAAGTGTTAAGGCTTTGAGCGGGAAAAGACATGCGCTCTTATACAATGTTTGTGCTCTCGGGTTCTTACCTTTTTACGTTTATGGTGCACAACTCTATAGTGATACGATTACACTTCCTTTTGTATCCTTTAGTTTGTTGTTCTTTATATATGCCATTAAATCACAAAAAATAACTCAACAAGTTCTATGGTATTTTTTGGCAACAGTATTGGCAGTTATAGGTTATGAATTTAAGCCAACAGTGTTAATTGTGCTTATTGCTGTTTTGATTTTCCTTGGACTTAATAAAAAATGGAAACAACTTTTGCTTTTACTCCCAATGTTTGCTATTTTATTTGTTGGGGGACATTTCATGGTTAAAGCAACTATTGCGACCGAGCCAGCTTTTTCTCAAGAGGCTAATGAACGTCGTAATCTTCCGATGATGCACTGGATTGCTATGTCTTGGTCGCCAACTAATAAAACGGGTGGATTCAATAAGAAAGTGAGGCTTTATTCTGAATCTTTCCCAACTTATGAAGCGAAAAAAGAGGCTGATAAACAACTCTTCATAGACAATCTTAAGAAGATGGGACCTGTCGGAGTTGTGCGACAAATTGGACGTAAGTTGGCCTATACTTGGTTATATGGTGATTTGAACAGTTCGTTTTATACTTATCATCATGAAAATAAATTTATTAATCGTTACTTTGATTATTTATCAGGAACCTCATTTTCTTTGGATGGCCCTGGTAATATAACAGGTTGGTTTATGCTAAAGGCTGTTCAAACCCTTTATTGGATTGGCCTAGTTGTTTTACTGTGGCGTCAAATCTGGCGAATTTTAATCAGCAAGAGAAATTGGTCAAATCCCTGGTTTATTCCAGCTTTGGCCTTTGTTGGATTGAGTTTTTTCCTTATTCTATGGGAAACAAATTCACGTTACCTTTATCAATTTGCCCCTGTTATGATTGCTTTAGCAAGTTTAGGTTTAATAGATAAGCAGTTTAAAAAGAAAAAAATTAAGGAGTGAATATGACTAAGATTCTTTATATGGTCGTGCCATGTTACAATGAAGAACTGGTACTTGATGAAACTTCCGAACGTCTCAAGGCTAAATATGAACAATTGATTTCAAATAATATTATTAGTCCAAAAAGTAGAGTTGTCTATGTTAATGATGGCTCAAAAGATAAGACTTGGGAAAAAATTCAAGAAAAACATAATGAAAATCCGATGTTTAGTGGGATTAATCTCTCGAGAAATCGAGGACATCAAAATGCTTTGCTCGCTGGTTTAATGACCGTGAGAAATTTAGCAGATTGCGTTATTTCAATGGATGCAGATTTGCAAGATGATATTAATGCAATTGATGAAATGCTTGAAAAATTTGAAAATGAGAACTGTGATATCGTTTATGGTGTACGGGATAATCGGGACACTGATACAGTTTTCAAAAGAAGAACTGCTGGAGCTTTTTATAAATTAATGCAAGGTTTGGGGAGCCAAAGTGTTCCTAATCATGCTGATTTTCGTTTAATGAGTCGCCGTGCCCTTGACGGTTTAGCTCAATTTCCTGAACAAAATCTCTTCTTAAGAGGAATGGTTCCTTTGGTTGGCTATAAATCTGATATCGTTTATTATAAACGTGGAGAACGTTTTGCCGGTGAAAGTAAGTATCCTTTGAAAAAAATGATTAGTTTTGCGCTGGATGGAATTACTTCAACATCAGCTACACCGATGCGTTTGATTTTTTGGATTGGTTTAATTTGGTTTTTGCTAGCTATTGTAGGAGCAATTTATATTATTGCTCGCCATTTTATTAATGGTTCTGACGTTGCAGGTTGGGCTTCGACAATGCTGGCTATTGTTGGATTTGGTGGGGCTAATCTATTAGCTCTAGGTGTAATTGGTGAATATATCGGAAAAATCTTCTTGGAAGTTAAACAACGTCCTCGTTATTTGATTGAAGACTTCATTAACGAAGATTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

>CP006766|1059850:1068119|1059850_1060939_+|AGY45450.1|DBSCAN-SWA
MKKDEYYMDLAIVLAKKGGGNVNPNPQVGALIVKEGRIIGQGYHEKYGKAHAEINAFKDCNESPEGATLYVTLEPCAHQGKQPPCFEAIIKNGIKRVVIGHLDPNPLVLGKGIKAMREAGIEVSLNVLEKECEELNKIFFYYVSQGLPYVMMKYAMTLDGKIATSAGQSKWITGEIARQKVHQDRSRFMAIMIGVETLILDDPQLSVRLENGKNPIRIICDTHLRSPLASKIVSTATEIPTIIATAESDPEKQAPFLKAGCEIILVSCLEGRLNLKELTKKLGEKGIDSIILEGGGTLNASALKAGIVQKVQTYIALKIFGGKEAPSPVEGHGIEQPNQAYLLEGAQITYLGEDILLESELL
>CP006766|1059850:1068119|1062821_1063286_+|AGY44138.1|DBSCAN-SWA
MTIIEGNLRTENAKYGIVVARFNEFINAKLLSGALDALKRHGVQEEEIDIAWVPGAFEIPIIAQKMATSNKYEAIICLGTVIRGSTSHYDFVCNEVSKGIAHVSLNSNIPVMFGVLTTENIEQAIERAGTKAGNKGFEVAVGAIEMVDLMRKIG
>CP006766|1059850:1068119|1067162_1068119_+|AGY44142.1|DBSCAN-SWA
MTKILYMVVPCYNEELVLDETSERLKAKYEQLISNNIISPKSRVVYVNDGSKDKTWEKIQEKHNENPMFSGINLSRNRGHQNALLAGLMTVRNLADCVISMDADLQDDINAIDEMLEKFENENCDIVYGVRDNRDTDTVFKRRTAGAFYKLMQGLGSQSVPNHADFRLMSRRALDGLAQFPEQNLFLRGMVPLVGYKSDIVYYKRGERFAGESKYPLKKMISFALDGITSTSATPMRLIFWIGLIWFLLAIVGAIYIIARHFINGSDVAGWASTMLAIVGFGGANLLALGVIGEYIGKIFLEVKQRPRYLIEDFINED
>CP006766|1059850:1068119|1060938_1061589_+|AGY44136.1|DBSCAN-SWA
MFTGIIEELGEVSRLQKREKSFKISIRASLILEDMKLGDSISTNGLCLTVSEFNQKEFTADIMPESLNRSNLGTLNVGAKVNLERAMPLNGRFGGHIVSWHIDGVGQILEVKKEENAIWFEIKTSLNLMRYTVEKGSITIDGISLTVAQVKSKSFSVSIIPHTLKETIMADKKVGDTVNLENDILGKYIEKLWGDSSSSMKESSVTKEKLFNNGFL
>CP006766|1059850:1068119|1063388_1063841_+|AGY44139.1|DBSCAN-SWA
MKKLLSLVIIVVGIVADQIFKNWIVANIQLGDTEKIWPNVLSLTYIKNDGAAWSSFSGQQWFFLILTPIVLVVALWFLWKKMAQNWYFIGLTLIIAGALGNFIDRIRQGFVVDMFQTEFINFPIFNIADILLSVGFVLLFIAILTDKETK
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MNFFNQIFHNQILMTAIVSWALAQLIKIIIELIRTHRINWQLIFATGGMPSSHSSLVVALATATGLRQGFDSSLFAIATVLAFVVLYDAQGIRRQAGNQARIINRMLQNVENAGIKVDKNLKELLGHTPIQVMGGTILGIIVALVMN
>CP006766|1059850:1068119|1065537_1067160_+|AWJ95527.1|DBSCAN-SWA
MNNIVFIKYKKGFCLALMIGIFLLINGIAISLTQVWNADHIIALLLGNILLIAAYFYFVGIYKLSKKLFDSKNKNETTDKSVSKIELLTDLSVTKYYRISFWLVALLTFILPFLFMIHVPDSKHAWDYFVIFNSTTELHGQSFGLLPETASRLGYFLRYPNNQFLGILFNQVFSPFAGSVELKMWVVTAVSALLTSLGVLAGTLSVKALSGKRHALLYNVCALGFLPFYVYGAQLYSDTITLPFVSFSLLFFIYAIKSQKITQQVLWYFLATVLAVIGYEFKPTVLIVLIAVLIFLGLNKKWKQLLLLLPMFAILFVGGHFMVKATIATEPAFSQEANERRNLPMMHWIAMSWSPTNKTGGFNKKVRLYSESFPTYEAKKEADKQLFIDNLKKMGPVGVVRQIGRKLAYTWLYGDLNSSFYTYHHENKFINRYFDYLSGTSFSLDGPGNITGWFMLKAVQTLYWIGLVVLLWRQIWRILISKRNWSNPWFIPALAFVGLSFFLILWETNSRYLYQFAPVMIALASLGLIDKQFKKKKIKE
>CP006766|1059850:1068119|1061597_1062794_+|AGY44137.1|DBSCAN-SWA
MFQYNKVEEALAALKAGEMIIVSDDENRENEGDLICAAEFISPEIINFMASEAKGLICAPLSETYAKNLQLEAMVEKNTDNHGTAFTVSVDHIETSTGISAFERALTIKKLVDAESLPSDFRRPGHVFPLIAKKNGLFERNGHTEATVDLLRLAGLKEVGVCVEIMDEDGTMMHKEKLKEKAQEWGLKYITIKAIQEYLKQNELQVEQVTRAKLPTKYGMFDILGFVNKINGEHHVALVKGDIGDGQAILCRVHSECLTGDAFGSLKCDCGGQLEEALKKINDEGRGVLLYLRQEGRGIGLINKLRAYSLQDEGLDTVEANLALGFEEDEREYSIGAQILKIIGVKSLKLMTNNPQKINDFQKYGLVVEERVALQIKDNPFDLDYLKVKQNKMGHLFD
>CP006766|1059850:1068119|1063901_1064807_+|AGY44140.1|DBSCAN-SWA
MPIIKINEENKGLRLDKALANQTEYSRSLLTELIKNDKVFVNSEAKKAKYKVKVGDRIEFEVPEAEVLDIVAEDLPLEIIYEDSDVAVVNKPQGMVVHPAAGHASGTLVNAIMYHIKDLSSINGVIRPGIVHRIDKDTSGLLMIAKNDKAHESLAAQLKDKTSKRRYLAIVHGEIANDKGTIEAPIGRNLKDRKKQAVVSGGKPAVTHFEILERFYGYTLIALRLETGRTHQIRVHMNYIGHPVAGDPLYGPNKTLTPNKGQFLHAETLGFDHPTTGEFMEFQVDAPEIFNEQLEKLREQV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AGY45450.1|1059850_1060939_+	bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase RibD	A0A1V0SE20	Indivirus	1.1e-50	38.8
AGY44136.1|1060938_1061589_+	riboflavin synthase	A0A2H4PQS5	Staphylococcus_phage	6.1e-41	43.1
AGY44137.1|1061597_1062794_+	bifunctional 3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase/GTP cyclohydrolase II	A0A2H4PQS2	Staphylococcus_phage	2.7e-111	51.3
AGY44138.1|1062821_1063286_+	6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase	A0A2H4PQS3	Staphylococcus_phage	1.8e-39	53.7
AGY44139.1|1063388_1063841_+	signal peptidase II	NA	NA	NA	NA
AGY44140.1|1063901_1064807_+	RluA family pseudouridine synthase	A0A2H4UV25	Bodo_saltans_virus	7.0e-11	27.8
AGY44141.1|1064953_1065397_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AWJ95527.1|1065537_1067160_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY44142.1|1067162_1068119_+	glycosyltransferase	I1TED8	Salmonella_phage	4.0e-49	37.5

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>CP006766|1671512:1753505|DBSCAN-SWA
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MAITDDIKKLLGGSSDERLEVIEKRTRERLLLILGSDIEEVPPELEYVVLDVSLKRFNRIGQEGMQSYSQEGLSMTFSESDFDEYADEIESWRKSKETEGDKKIGRFRLY

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AGY44450.2|1671512_1672709_-|tRNA	CCA tRNA nucleotidyltransferase	H7BUW3	unidentified_phage	3.9e-41	48.1
AGY44451.1|1672928_1673465_-	GNAT family acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AGY44452.1|1673513_1674296_-	4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase	NA	NA	NA	NA
AGY44453.1|1674396_1675242_-	DegV domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AGY44454.1|1675259_1675652_-	DUF1149 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AGY44455.2|1675777_1676521_-|tRNA	tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD	NA	NA	NA	NA
AGY44456.1|1676525_1677041_-	ribosome maturation factor RimM	NA	NA	NA	NA
AGY44457.2|1677211_1678039_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
AGY44458.1|1678179_1679124_-	ferrochelatase	NA	NA	NA	NA
AGY44459.1|1679385_1679625_-	KH domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AGY44460.1|1679720_1679993_-	30S ribosomal protein S16	NA	NA	NA	NA
AGY44461.1|1680081_1681314_-	hydroxymethylglutaryl-CoA reductase, degradative	NA	NA	NA	NA
AGY44462.2|1681394_1682534_-	acetyl-CoA C-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
AGY44463.1|1682842_1683997_+	hydroxymethylglutaryl-CoA synthase	NA	NA	NA	NA
AGY44464.1|1684057_1684765_-	glucosamine-6-phosphate deaminase	NA	NA	NA	NA
AGY44465.1|1686173_1687211_+|tRNA	S-adenosylmethionine:tRNA ribosyltransferase-isomerase	NA	NA	NA	NA
AGY44466.2|1687287_1687584_-	XRE family transcriptional regulator	A0A1S5SAD3	Streptococcus_phage	6.9e-08	42.0
AGY44468.1|1695190_1695946_-	WxL domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AGY44469.1|1695983_1696742_-	WxL domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AGY44470.2|1696779_1697508_-	WxL domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AWJ95555.1|1698505_1698601_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY44471.1|1699420_1700038_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY44472.1|1700051_1700222_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY44473.2|1700249_1701557_-	GTPase ObgE	NA	NA	NA	NA
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AGY44475.1|1702891_1703965_-	undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N-acetylglucosaminyltransferase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>CP006766|1879310:1889088|DBSCAN-SWA
TTTATCCAAATTTACCAGAAATATAATCAGAAGTTTCTTGTTTTTCTGGATTTAAGAAAATACTTTTCGTATCATTATACTCAATCAGATTTCCGTCTAACATAAAGGCGGTACGATCTGAAATTCGTGATGCTTGTTGCATACTATGTGTAACAATCGCGATTGTATAATCTTTTTTAAGTTCAAGCATGGTTTCTTCGACACGAGCCGCTGAAATTGGGTCAAGGGCTGATGTTGGTTCGTCCATTAGGATAATTTCGGGATTGACAGCAAGGACACGTGCAATACAAACCCTTTGTTGTTGCCCACCTGAAAGTCCAAGTGCTGAACTGTGCAAAATATCCTTAACTTCATCCCAAATATTTGCTGCTTTGAGTGAATTTTCCACCACTTCATCAAGGAGTGCCTTATCTTTCACTCCTTTTAAACGCAATCCATAAACCACATTTTCATAAATTGAAAATGGAAAAGGATTGGGTTGTTGGAAAACCATGCCAATTTCTTTACGTAAATCCACAGTATCAACTTTAGGACTGTAAATATTTTTACCTTTATAATCAATGGCTCCAGTAATTGTTACTGTTGGAATCAAATCATTCATTCGATTGATTGAACGTAAAAGCGTTGATTTTCCACATCCTGAGGGACCAATGAGCGCTGTAATTTCATTCTTATAGAATGTCATGTTTATCGTATTCAACGCTTTTTTCTTGCTGTAATAAAGCGATAAGTCGCTGACGGTTAAAACTGCTTCTTTTTCCATATTTTACCTTTTTATAAGTTACTGATAGAACTACTAGCACATTCGTAATGTACTAAAGTACAAACGACTGTCCTATGACGGACAAGTTTTTCGACAAATCAAGAATCCGTCAGTAGTTTTTTTACTAACGAAAATTCCGTCAGTAATTTTAAACTTTATTTTCTCTTAACCAAAGTGACCAGAAACATAATCTTCTGTTGATTGCAAACTAGGTTGAGTAAAAATTGTGCTTGTTTTATCATACTCAATCAAATCTCCTGAATAGAAGAAAGCTGTATTGTCAGAGGCCCGAGAAGCCTGAGCCATATTGTGAGTCACAATGATAATCGTATAATTTTCTTTAAGTTCCATCATTGTTTCTTCAATTTGCATTGTTGAAATTGGGTCAAGAGCTGACGCTGGTTCATCCATCAAAATAATTTCTGGTTTTACTGACAATGCTCTTGCAATACATAAGCGCTGTGCTTGTCCACCGGACATGGCAAGTGCGGATTGATTAAGATTATCTTTTACTTGATCCCACAAAGCAGCTTGCTTTAATGAAGTTTCAACAATCTCATCCAGTTTTTTCCTGTCTCTCACGCCATCACGACGATGAATGAAGGCAATATTTTCATAAATTGATTTTGGAAATGGATTAGGTCTTTGGAAAACCATCCCAATTTGCTTACGAACTTCAAAAACATTCACTTTATTTTCGTTAATATTGACCCCTTCATAATTGATTTCGCCAGTCACCCGAGCGCCATCAATCGTGTCATTCATGCGATTCAAAGCACGTAAATAGGTTGATTTACCAGAACCTGAAGGGCCAATAAGTGCTGTGATTTCATTTTTAGGAAAAGACATTGTCACGCCATGGATTGCTTCTTTTGTTCCGTTATAGAAAACACGCAAATCATTTGTTGATAATGCAATTTCTTCTTTCTCAGGCACCATAATTTTGCGCTGAGACCAGTCATATGTTGTTGCCATAATTATTCTTTCTCTATAAAATCTTTGATTTTCTTAGTTAGAAGATGTTAACTTCTTGTGAATTCGATTTCCAAGGAAACGTGCCCCCAAGTTAAAGAGGAGAACAAAGATAATCAATACTGCTGAAGCTCCTGCAGAAATTTGTTGTGCTGTTGAAATCGTTCCTTCGGTATTAAGTGCCCAGATATGAACAGCCAAAGTTTCAGCTGGTCTGAAAAGTGAGAGTGGCGAAGTCAAGCTCATCGGATTCCAGTTTGCCCAGTTAATTGGTAAGTTCGTTTGTCCAGCAGTGTAAATCAAAGCCGCGGCTTCACCAAAAACACGTCCTGAAGATAAGATAACCCCAGTAATGATTCCGGGCACAGCAGCTGGTAAAATGACTTGTGTTGCCGTTTCCCAACGTGACATTCCGAGTGCCAAACCACCTTCACGTTGTGAAGTTGGAATCGCTCGAAGTGATTCTTCCACATTCCGAGTCATCAATGGTAAGTTGAACACAGTTAGTGCCAAGGCACCTGATAGAACTGAGAAACCAAGACCAAATTGTAATACGAAAATTAACATCCCGAAAAGTCCAACAACGATTGAAGGAAGTGAAGATAAAACTTCAATAGCTGAGCGAACAACACCAGTTAACCAATGTTTTTGATTCGCATACTCAGACAGATAAATTCCTGCGCCAAGTGATAAAGGAACAGAAATAATCAAAGTGACAATCAAAAGATAAACAGAGTTAAAAAGTTGGACTGCAATCCCACCACCTGTCAATGGATTTGACGCGGTGATGATAAATTTAGGATCTTTAAAGATAACTGGCAAACCTTTAATTAAAATATAAGCCAGTAAAAAAGCGAGGATAAGAACAATGATGCCAGAAAGGACGTAAAGGACACCAGTGGCAATCTTGTCAGAGCGTTTAGCGTTCATTATTTAAGACTTCCTTTCTTAGCAATAGCACGCATTGCGAGGTTGAAAAAGAGTGACATAATCAAAAGGAGTAAGGCAAGTGACCAAAGTGCATTCAATTGAATACCAGGTGTTGCATTTGGAATTCCTGATGTCAAGATTGAAGTCAAGGTTGAAGCTGGTGAAATCAAATCTTTTGGCATCATTACAGCATTACCTACCACCATTTGAATAGCAAGAGCTTCACCAAAAGCACGCGCCATTCCAAAGATAACAGCGGTCAAAATCCCTGGTGTTGCGGCTCTTAGAAGAACACGCCAAATTGTTTGCCAACGCGTTGCACCAAGTCCGAGTGACGCTTCTTTATAATAAGAAGGGACAGCTTTCATAGCATCCACAGTCATTGAAGTTACAGTTGGTAAAATCATGACAAAGAGTACAAACACACCTGACAAGAGACCCAAACCAGTTCCACCAAAAACATTACGAATGGCTGGAACAACAACAGTCAAACCAATAAAGCCATAAACAACTGAAGGAATACCAACAAGAAGTTCAATGACAGGTTGCAAAATTTTCTTACCATATTTTGGTGAAATTTCTGTCATATAAATTCCCGCACCAATCGCAAATGGAGTGGCAACAAGGGCTGAAAGTACAGTAACAATCAATGACCCCGTAAACATCGGCAATGCGCCAACTGCAGGTTTACCGTCAGGGCCAAGATTACCCGGTGACCAATTTGTTCCAAAAAGGAAACGGAAAGGATTAACACCATCTGAATAGAAAGTTGACAGACCTTTTTGAGCAACAAAGACAAGAATTGCACCTACAACGAAGACAATAAGGGCAATACATAAGAAAGTTAAACTCTTACCTAATTTTTCAAGTCTTGAATTTTTATTGCTTGAAAGCAATTTTTCTTTGATTTTTGAATTTTCCATAGGGACCTAACTATTTTTGTTAATTTGCATCTATCTGATTAATGCAAATGAAGTTATTGATTAAACTTATTTTGACTAATTTTTTTACTGACGGAGGATAAGTTTAATTTCCATCAGTAGTTATTTAATTTTTTCAACATTTCCTTTAGCATCACGGTCAACCTTCATTTCAGAAACACGGATATAACCAAGCTGCTCTAGGGTTTTCTTATCATTTTGAACGTATTCGATAAATTTATTTTCGATTGTGTTCTTACGAGATTTGTTGGTGTACATATGCTCATATGACCAAATTTTCCATGCATTAGTTTTTACATTGTCATAATTTGGCGCAACACCATCAACATTAACCGCCTTTACACCGGGTTTATTGGTGTAACTGAAAGCAACATATGAAATAGCCCCTGGCGTTTGCCCAACTAATTGAACAACAGAACCTGAAGCATCTTGGGTTGGACCATTCACTTCTGTGGCACCATTCAAAGCATATTTATCAAAATTTACTCGCGTTCCTGAACCAGCAGTACGACCAATGACCGTAATTTTTTGGTCTTGACCTCCTACTTCTTTCCAGTTGGTAATTTTACCAGTGAAAATATCAATCAGTTCTTGTTGAGTCAAATTTGAAACTTTTAACTTTTTGTTGATAATTGGTGCGAAACCAATGACAGCAACTTTATGGTCAATAATTTTATCAACTGCTATTCCTGATTTTTCTTCAGCGAAAATATCAGAATTCCCAATCTGGAAAGAACCAGCCGCAACTTGAGCCAATCCGACACCAGAACCACCACCTTGAACCATAATAATTTCATCAGGATTTTGCTTCATATATGCCATAGAAGCATGTTCAACCATGGGTTGCAAGGCAGTTGAGCCACCTGCTGTGACCTGTTTATTTCCAGAACCACAAGCTGCCAATGCAAATAAACTCACACTGGCCATCAAAGCAATAAAAATTTTCTTCTTCATAGCTTAATTATACCATAATGGCCTATCAATGAGCGGTTGATGATAGCGTTCTTATGTAAATGTTTTGTAAATAATACGGGAAAATGCCCAACTCTGAAAAAGAGTGAGCAATTTCCTGTCTTTTAGGGAAAGAATTATGAAGAAAAATTTAAAGATAGTCTCTCATCAGTTCATCCTGTTTATGTTCACTGATAAAATTTTTATAAAAAAGGAGTCAAACTTTTAAATTTTAATTTATGAAGAAGAAAATTTTTATTGCTTTGAATCCTATGGTTATAAACTAATTTATTAATTGTTAAATTTACTGACAGACTTAAATTATTTTGAAATTGACTTACTGTCAGTATTATTTTTTAGTGATATTTCCGTCAGCGTCACGTTCAACTTTCATGTCACTGATTGGAATGTATCCCAATTTTTTGATATCTTTGTTGTTTTCT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9

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>CP006766|1879310:1889088|1881973_1882897_-|AGY44601.1|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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AGY44603.1|1884215_1885112_-	phosphate ABC transporter substrate-binding protein	E3SM63	Prochlorococcus_phage	7.2e-08	32.4
AGY44604.1|1885389_1885857_-	SsrA-binding protein SmpB	W5RAM5	Staphylococcus_phage	4.7e-43	56.6
AGY44605.1|1885888_1886383_-	esterase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>CP006766|1903851:1920058|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10

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MTDSNIEKTLINGEIEHLKNVRKRNCTTKTPKMYGKFKDGSIVELEDIKSSGVGFNGYTPYYRVLAAINREEGRDEEG
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MSDKVIMVYTVNDSSAFVFNQTLDNMKVIGKWQDDPDQLFKLGTTVFNGSHVVAIKVAKRGPLGTVPE

Homologous phage analysis in the prophage region

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1902059:1902074	attL	NA	NA	NA	NA
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AGY45764.2|1905566_1905686_-	GNAT family acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AGY45765.1|1905715_1906105_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45766.1|1906663_1906900_-	hypothetical protein	A0A1P8BLF8	Lactococcus_phage	1.6e-12	70.2
AGY45767.1|1906997_1907228_-	hypothetical protein	A0A1P8BME4	Lactococcus_phage	2.5e-37	94.7
AGY45769.1|1907839_1908202_-	hypothetical protein	Q9AZG6	Lactococcus_phage	3.9e-29	61.7
AGY45770.1|1908217_1908790_-	hypothetical protein	Q9AZG7	Lactococcus_phage	1.8e-92	94.7
AGY45771.1|1908951_1909158_-	hypothetical protein	Q9AZG9	Lactococcus_phage	1.6e-32	100.0
AGY45772.1|1909176_1909359_-	hypothetical protein	Q9AZH0	Lactococcus_phage	5.3e-27	98.3
AWJ95540.1|1909728_1910043_-	hypothetical protein	Q9AZH1	Lactococcus_phage	4.1e-51	94.2
AGY45774.1|1911435_1911705_-	hypothetical protein	Q9AZH3	Lactococcus_phage	3.6e-40	98.9
AGY45775.1|1911701_1911854_-	hypothetical protein	Q9AZH4	Lactococcus_phage	1.7e-15	86.0
AGY44617.1|1912035_1912206_-	DUF1655 domain-containing protein	Q9AZH6	Lactococcus_phage	5.1e-24	94.6
AWJ95557.1|1912276_1912414_-	hypothetical protein	Q9AZH7	Lactococcus_phage	4.0e-11	89.7
AGY45778.1|1913071_1913263_-	XRE family transcriptional regulator	R9QNG3	Lactococcus_phage	4.6e-21	79.4
AGY44618.1|1913261_1913900_+	XRE family transcriptional regulator	R9QMZ5	Lactococcus_phage	1.4e-08	30.6
AGY44619.1|1913974_1915186_+|integrase	site-specific integrase	Q9AZI0	Lactococcus_phage	1.2e-117	54.6
AGY44620.1|1915306_1916221_-	diacylglycerol kinase family lipid kinase	A0A1V0SBJ0	Catovirus	1.9e-11	26.1
AGY44621.1|1916377_1916890_-	HD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
1916309:1916324	attR	NA	NA	NA	NA
AGY44622.1|1917222_1917456_+	30S ribosomal protein S20	NA	NA	NA	NA
AGY44623.1|1917553_1920058_-	ATP-dependent RecD-like DNA helicase	A0A1W6JK95	Lactococcus_phage	1.2e-44	25.9

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>CP006766|2037788:2118530|DBSCAN-SWA
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MALITAQELLDENHIDSNYDEIATMNRLIHDASALIRGSISDSVTDEQIMDNLPDQYNRAVSALATRLYFSRDLSEGYGIGIQIMINQIRARMWEVLNGTT
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MGLTFRKRDDFDKMMDDLGVSTVDLVTDDDKKSVPSPEKKEDPFAKFLTPKENNKEKDPN
>CP006766|2037788:2118530|2069662_2069941_-|AGY44746.1|DBSCAN-SWA
MPKPLLTDEVIEQAKQDKKNLERRLQRELEEDTEIAEKYDSIEKNLSKNAVYKSRRIENAKAQKRGKAINKWLFIVTLIVVLLAVAFFLYYF
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MIYLDNAATTPLLPDVITAISESLSANFGNPSSIHSLGRASSQIVRKARETVANALEVPSRNIIFTSGASEANNQALIGYALANKDKGNHIITTAIEHPSVLNTVQYLHDRYGFDVSFVKPKADGTFPASLIEENLRPDTILVSMMWANNETGQLLPVKEVGELLKQHQAVFHVDATQVMGKISVHPLYVSADFLSASAHKFHGPKGVGFLYYNEKLHFDALVHGGEQEEKRRAGTENLHSLVGLAKALELALESIESNYQAVEKLNETLLTKLEEQKISFYKNNFGPSMPHVLNLAFPNENHDLLLTKLDLAGFAISTGSACTAGTIEPSHVLEAVYGKNSEKLKENIRISFSEMNTIDEVNLFVEKLSSILKK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AGY44718.1|2037788_2039135_-|tRNA	cysteine--tRNA ligase	A0A2K9V966	Bandra_megavirus	3.1e-47	29.5
AGY44719.1|2039147_2039741_-	DUF1211 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AGY44720.1|2039754_2040354_-	serine O-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AGY44721.1|2040460_2041231_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY44722.1|2041439_2043761_-	polyribonucleotide nucleotidyltransferase	NA	NA	NA	NA
AGY44723.1|2044044_2045190_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY44724.1|2045554_2046520_+	ribose-phosphate diphosphokinase	A0A2K9L2G2	Tupanvirus	1.0e-36	32.8
AGY44725.1|2046641_2047073_-	universal stress protein	NA	NA	NA	NA
AGY44726.2|2047312_2048440_+	cysteine desulfurase	H7BUW1	unidentified_phage	2.9e-30	36.4
AGY44727.1|2048463_2048808_+	cysteine desulfurase	NA	NA	NA	NA
AGY44728.1|2048898_2050086_-	elongation factor Tu	A0A076FFS6	Aureococcus_anophage	2.0e-34	29.4
AGY44729.1|2050328_2050511_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45801.2|2050569_2050686_+	DUF4044 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AGY44730.1|2050743_2053542_-|tRNA	isoleucine--tRNA ligase	A0A1V0SJ93	Klosneuvirus	4.8e-82	25.9
AGY44731.1|2053857_2054784_-	DivIVA domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AGY44732.1|2054840_2055632_-	cell division protein	NA	NA	NA	NA
AGY44733.1|2055628_2055904_-	YggT family protein	NA	NA	NA	NA
AGY44734.1|2055903_2056494_-	cell division protein SepF	NA	NA	NA	NA
AWJ95543.1|2056537_2057206_-	YggS family pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
AGY44735.1|2057209_2058463_-	cell division protein FtsZ	NA	NA	NA	NA
AGY44736.1|2058493_2059864_-	cell division protein FtsA	NA	NA	NA	NA
AGY44737.2|2060024_2060894_-	fatty acid-binding protein DegV	A0A0N9SI50	Staphylococcus_phage	3.8e-14	35.3
AGY44738.1|2061006_2061735_-	23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB	A0A2D1A6G0	Rhodococcus_phage	5.5e-06	27.2
AGY44739.1|2061880_2062999_-	FAD-binding oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
AGY44740.1|2063129_2063975_-	aldo/keto reductase	A0A1V0SDE7	Indivirus	4.8e-30	32.9
AGY44741.1|2063986_2065315_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
AGY44742.1|2065480_2066359_-	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AGY45802.1|2066374_2066779_-	MerR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AGY44743.2|2066860_2068171_-	aminopeptidase C	R4TV59	Phaeocystis_globosa_virus	9.7e-62	31.5
AGY44744.1|2068299_2068893_-	HD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AGY44745.1|2068950_2069631_-	5'-methylthioadenosine/adenosylhomocysteine nucleosidase	NA	NA	NA	NA
AGY44746.1|2069662_2069941_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY44747.1|2069933_2070518_-	NUDIX hydrolase	NA	NA	NA	NA
AGY44748.1|2070622_2071999_-	bifunctional UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase GlmU	A0A0G2Y8M0	Acanthamoeba_polyphaga_mimivirus	7.1e-31	35.3
AGY44749.1|2072226_2073015_+	pyrroline-5-carboxylate reductase	A0A1X9I6T5	Streptococcus_phage	1.7e-32	33.6
AGY44750.1|2073093_2073363_-	30S ribosomal protein S15	NA	NA	NA	NA
AGY44751.1|2073544_2075428_-	serine/threonine protein kinase	A0A1V0SDC3	Indivirus	3.1e-21	31.6
AGY44752.1|2075427_2076204_-	Stp1/IreP family PP2C-type Ser/Thr phosphatase	NA	NA	NA	NA
AGY44753.1|2076284_2077559_-	16S rRNA (cytosine(967)-C(5))-methyltransferase RsmB	NA	NA	NA	NA
2077671:2077693	attL	NA	NA	NA	NA
AWJ95558.1|2078193_2078370_+	hypothetical protein	A5GYL5	Lactococcus_phage	2.3e-19	85.7
AGY45804.1|2078485_2078908_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45805.1|2078907_2079210_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45806.1|2079223_2079751_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY44754.1|2079943_2080723_-|holin	phage holin	Q38323	Lactococcus_phage	1.5e-126	98.5
AGY44755.1|2080722_2081010_-|holin	phage holin	Q9AZL0	Lactococcus_phage	1.6e-46	98.9
AGY45807.1|2081022_2081373_-	hypothetical protein	A0A1P8BKU2	Lactococcus_phage	2.0e-54	99.1
AGY45808.1|2081385_2081616_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45810.1|2085645_2087181_-|tail	phage tail protein	Q9AZL3	Lactococcus_phage	1.5e-101	43.3
AGY45811.2|2087180_2091314_-	hypothetical protein	Q9AZL4	Lactococcus_phage	7.0e-199	89.2
AGY45813.1|2091483_2091834_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY44756.1|2091893_2092499_-	hypothetical protein	Q9AZL7	Lactococcus_phage	1.3e-106	97.5
AGY45814.1|2092500_2092896_-	DUF806 domain-containing protein	Q9AZL8	Lactococcus_phage	1.4e-67	100.0
AGY44757.2|2092892_2093378_-	hypothetical protein	Q9AZL9	Lactococcus_phage	2.0e-84	99.4
AGY44758.1|2093374_2093710_-|head,tail	head-tail adaptor protein	Q9AZM0	Lactococcus_phage	5.9e-56	100.0
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AGY45816.1|2094012_2095326_-|capsid	phage major capsid protein	Q9AZM2	Lactococcus_phage	1.1e-187	90.8
AGY44759.1|2095315_2095903_-|head,protease	HK97 family phage prohead protease	Q9AZM3	Lactococcus_phage	2.4e-105	98.5
AGY44760.1|2095902_2096982_-|portal	phage portal protein	Q9AZM4	Lactococcus_phage	1.2e-198	99.7
AGY45817.1|2096978_2097143_-	hypothetical protein	Q9AZM5	Lactococcus_phage	5.7e-20	96.3
AGY44761.1|2097151_2098966_-|terminase	terminase large subunit	Q9AZM6	Lactococcus_phage	0.0e+00	99.8
AGY44762.1|2098965_2099358_-|terminase	phage terminase small subunit P27 family	Q9AZM7	Lactococcus_phage	6.8e-19	38.9
AGY44763.1|2099554_2100058_-	HNH endonuclease	Q9AZM8	Lactococcus_phage	1.2e-92	99.4
AGY44764.1|2100341_2100764_-	DUF722 domain-containing protein	Q9AZ68	Lactococcus_phage	5.0e-52	100.0
AGY45819.1|2100844_2101057_-	XRE family transcriptional regulator	Q9AZN3	Lactococcus_phage	1.1e-28	97.1
AGY45820.1|2101028_2101349_-	DUF1359 domain-containing protein	Q9AZZ2	Lactococcus_phage	5.5e-43	91.7
AGY45822.1|2102368_2103157_+	peptide transporter	Q7M293	Enterobacteria_phage	5.2e-10	27.3
AGY45824.1|2103773_2103938_-	hypothetical protein	Q94M83	Lactococcus_phage	9.4e-07	48.4
AGY45825.1|2103934_2104078_-	hypothetical protein	A0A1P8BMD9	Lactococcus_phage	4.6e-18	97.9
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AGY45826.1|2104801_2105041_-	hypothetical protein	A0A1W6JL86	Lactococcus_phage	7.5e-13	49.3
AWJ95559.1|2105030_2105219_-	hypothetical protein	Q77MW5	Lactococcus_phage	7.2e-19	92.0
AGY44766.1|2105608_2106028_-	aminotransferase	Q9AYX8	Lactococcus_phage	2.5e-72	99.3
AGY44767.1|2106024_2106588_-	DUF1642 domain-containing protein	Q9AYX9	Lactococcus_phage	7.1e-70	74.6
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AGY45829.1|2106826_2107459_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY44768.1|2107473_2107671_-	DUF1125 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AGY45830.2|2107667_2107874_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY44769.1|2107882_2108089_-	hypothetical protein	Q9MC28	Lactococcus_phage	4.8e-32	100.0
AGY45831.2|2108196_2108673_-	hypothetical protein	A5GZ50	Lactococcus_phage	4.1e-71	92.6
AGY44770.1|2108596_2108761_-	hypothetical protein	A0A1P8BKY2	Lactococcus_phage	5.5e-23	98.1
AGY45832.1|2108770_2109661_-	prepilin peptidase	Q38098	Lactococcus_phage	1.0e-163	99.7
AGY44771.1|2109670_2110432_-	DNA replication protein	A0A1P8BKE9	Lactococcus_phage	4.0e-108	79.1
AGY44772.1|2110556_2110982_-	single-stranded DNA-binding protein	Q9MC32	Lactococcus_phage	3.6e-74	98.6
AGY44773.1|2110974_2111733_-	hypothetical protein	Q0ILF6	Lactococcus_phage	3.4e-144	97.6
AGY45833.1|2111741_2112260_-	hypothetical protein	Q9XJE3	Lactococcus_phage	6.3e-89	100.0
AWJ95544.1|2112375_2112591_-	DUF1408 domain-containing protein	Q38272	Lactococcus_phage	2.4e-34	100.0
AGY45834.1|2112693_2112972_+	hypothetical protein	A0A059NT68	Lactococcus_phage	1.1e-47	100.0
AGY45835.1|2112926_2113160_-	hypothetical protein	A0A059NT46	Lactococcus_phage	1.2e-34	98.7
AGY45836.1|2113252_2113522_-	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AGY44775.1|2113534_2114293_-	phage repressor protein/antirepressor Ant	A0A1B1IMQ3	Lactococcus_phage	2.5e-118	86.2
AGY45837.1|2114304_2114553_-	XRE family transcriptional regulator	J7KK54	Streptococcus_phage	2.2e-07	51.7
AGY45838.1|2114655_2114922_+	hypothetical protein	Q38335	Lactococcus_phage	7.0e-44	100.0
AGY45839.1|2114915_2115110_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45841.1|2115465_2115699_-	hypothetical protein	Q9AZQ6	Lactococcus_phage	1.8e-35	94.8
AGY44776.1|2115994_2116492_+	transcriptional regulator	J7KJ52	Streptococcus_phage	1.3e-22	50.4
AGY45842.1|2116497_2116932_+	zinc peptidase	NA	NA	NA	NA
AGY45843.1|2116945_2117281_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY44777.1|2117348_2118530_+|integrase	site-specific integrase	Q9AZK8	Lactococcus_phage	1.3e-89	47.2
2118550:2118572	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>CP006766|2217534:2230575|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

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MADKLDRIIGDYLTGKLAANIKARELDLRARKPTDNLGIRTQSFGIAPQESEFLRVEEDELNGILGKMKRQKEILDMFWDVECSETKQALLLHYQQRMTWYGVAQEMFVGVTTLWRWNKSFKEMIRPYL
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MKIVIVGSSHAGICAGLRALEEYPEAEITLYDKRNQVSFVSQGIISYLAGQKSVLNQSSYSSVEELKAAGLNMQMETVVEEIDTKNKRLFYRRVNSKKTKLALYDKLIFATGSYPAMTSVPFDKKSKLYFLKSMDDAIKTDEFLKTAKNIAVIGGGMTGVEVARIAQERGIQTTLIHRNKNLLNDYLDEPASHLLESWMNAEGTRLLLNTEVTEIGFDEENTIIQTANGQKIPVDGVIFTIGFRPNSYLLNQQVELGDSGAVIVDEYMQTSCPDVFAVGDVSTTYVNLLEKSYYLPHASDAVRDGEIAAINLLAPRQKINSSQGTYHVPMNNLVMAMTGITIRQAVDAGYDADAVHLLNEHLDGYSPSNIWMIYERRTHQILGLQCIGKTSDMAEYVNIFSLAIQQKLKIEDIEFTDFYFEHGYKDPRGLNRILARLVRENER
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MMQRIITGVVAGGIFLALLLLGGAYFQILVALLVIIAMQELFRMYKLQVFSFEGILATLAALSLALPVGKHWLGLNADGGVMLFTLFLFMMLTGMVLSNGKYSFVDVGFPFLSAFYVGIGFQNLLTARQTSVYIVFLALFIVWATDIGAYAFGRSLKDRFPQKLLPSVSPNKTVVGSVGGIVSAVVVALVMYFLFTKELPQIGFVKLVIFTIIFSVVGQIGDLVESSIKRHFGVKDSGKILPGHGGILDRFDNLIFVFPIMHLLGLF
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MAKAKYEEWILEEGLLKIQGWARDGLTEEQIAHNMGIAVSTLGNWKKSHLEILEALKKGKEVVDIQVENALLKRALGYEFVEVTKERMSSESQKKRHDGQSKLTEKQWATCIDYFDSSCCYCGKSGKLTKDHLQPLKQKGELEIANVVPACASCNSSKKDNQWLSWFQKQEFYTQDKAKLIQKWITFSLSIKELFEEEPSESEMVISKEVTKQVAPDTTAAIFWLKNRKPNEWRDKRETQISGDIGVRNPMQNLTEEELRRLANGIDGT

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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AGY44972.1|2340681_2340969_-|holin	phage holin	Q9AZL0	Lactococcus_phage	1.6e-46	98.9
AGY45886.1|2340994_2342557_-	DUF2479 domain-containing protein	Q9AZR3	Lactococcus_phage	7.1e-245	96.0
AGY44973.1|2342568_2342793_-|holin	holin	A0A1B1IMU8	Lactococcus_phage	6.1e-33	100.0
AGY45887.1|2342805_2343036_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45888.1|2343047_2346080_-|tail	phage tail protein	A0A1B1IMK1	Lactococcus_phage	4.9e-282	57.8
AGY45889.1|2346079_2347603_-|tail	phage tail protein	A0A1B1IM42	Lactococcus_phage	1.3e-81	37.1
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AGY45896.1|2354053_2354488_-|capsid	minor capsid protein	A5GYM4	Lactococcus_phage	7.4e-75	99.3
AGY45897.1|2354487_2354817_-	hypothetical protein	A5GYM3	Lactococcus_phage	4.4e-56	100.0
AGY45898.1|2354813_2355158_-|capsid	minor capsid protein	A5GYM2	Lactococcus_phage	3.1e-60	100.0
AGY45899.1|2355147_2355549_-	hypothetical protein	A5GYM1	Lactococcus_phage	6.8e-59	100.0
AGY45900.1|2355622_2355859_-	hypothetical protein	A5GYM0	Lactococcus_phage	4.2e-32	100.0
AGY45901.1|2355887_2356805_-|capsid	phage capsid protein	A5GYL9	Lactococcus_phage	1.4e-163	99.0
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AGY45912.1|2364309_2364504_-	hypothetical protein	A0A1W6JL55	Lactococcus_phage	5.3e-17	68.8
AGY44976.1|2364520_2365171_-	hypothetical protein	A0A1P8BL14	Lactococcus_phage	5.4e-122	98.6
AGY45913.2|2365157_2365487_-	hypothetical protein	A0A1W6JKT3	Lactococcus_phage	3.3e-27	64.7
AGY45915.2|2365804_2365984_-	hypothetical protein	A0A0D3MT42	Lactococcus_phage	7.1e-24	88.1
AWJ95560.1|2366070_2366256_-	hypothetical protein	A0A1P8BKA8	Lactococcus_phage	4.0e-22	93.4
AGY44977.1|2366566_2367475_-	DnaD domain protein	Q8LTN2	Lactococcus_phage	1.7e-41	69.5
AGY45917.1|2367702_2368773_-	DUF1351 domain-containing protein	A5GZ46	Lactococcus_phage	6.1e-139	86.3
AGY45918.1|2368774_2369641_-	recombinase RecT	A0A286QQF5	Streptococcus_phage	2.6e-39	43.4
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AGY44979.1|2369919_2370168_-	hypothetical protein	A5GZ43	Lactococcus_phage	1.0e-33	93.9
AGY45920.1|2370299_2370482_-	hypothetical protein	A5GZ68	Lactococcus_phage	2.4e-27	100.0
AGY44980.2|2370497_2371148_-	toxin-antitoxin system, toxin component, Bro family protein	A0A1P8BKT1	Lactococcus_phage	1.7e-112	94.9
AGY44981.1|2371266_2371476_-	XRE family transcriptional regulator	A0A1P8BKS6	Lactococcus_phage	1.5e-33	100.0
AGY44982.1|2371668_2372094_+	XRE family transcriptional regulator	A0A1B1IMJ4	Lactococcus_phage	8.5e-76	100.0
AGY44983.1|2372104_2372689_+	hypothetical protein	A0A1B1ILZ7	Lactococcus_phage	2.5e-110	96.9
AGY45921.1|2372744_2373284_+	hypothetical protein	A5GZ63	Lactococcus_phage	2.8e-92	99.4
AGY44984.1|2373403_2374861_+	recombinase family protein	A0A1B1IM01	Lactococcus_phage	2.8e-275	99.4
AGY44985.1|2375011_2376085_-	type II secretion system F family protein	NA	NA	NA	NA
AGY45923.2|2375978_2376917_-	type II/IV secretion system protein	NA	NA	NA	NA
AGY44986.1|2377036_2382013_-	PolC-type DNA polymerase III	A0A0K2SUJ2	Clostridium_phage	1.6e-19	37.2
AGY45924.1|2382125_2382662_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY44987.1|2382667_2383999_-	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
AGY44988.1|2384014_2385865_-|tRNA	proline--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
AGY44989.1|2385934_2387221_-|protease	RIP metalloprotease RseP	NA	NA	NA	NA
AGY44990.1|2387239_2388043_-	phosphatidate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
AGY44991.1|2388042_2388777_-	isoprenyl transferase	R9W0U9	Flavobacterium_phage	4.5e-16	37.0
AGY44992.1|2389148_2389481_-	preprotein translocase subunit YajC	NA	NA	NA	NA
AGY45925.1|2389575_2390274_-	DNA alkylation repair protein	NA	NA	NA	NA
AGY44993.1|2390292_2390772_-	23S rRNA (pseudouridine(1915)-N(3))-methyltransferase RlmH	NA	NA	NA	NA
AGY44994.1|2391146_2392373_+|protease	serine protease	A0A1B1IRD3	uncultured_Mediterranean_phage	2.2e-07	26.3
AGY44995.1|2392498_2393497_+	glycosyl transferase	NA	NA	NA	NA
AGY44996.1|2393622_2394963_+	glycosyltransferase family 4 protein	NA	NA	NA	NA
AGY44997.1|2395070_2395295_+	DUF1797 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AGY44998.1|2396481_2397234_-|tRNA	tRNA1(Val) (adenine(37)-N6)-methyltransferase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_14

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MTLKKLSDEEKQALSEFMESGKAYEILKAKSDTEIKNLTIETLYKGDDLLAVTRQFDEISDLEAVSILLNVLIADARDCTDIDSFIKTIISMWGTYDEAEGKL
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MVRYYWGRPQDVVRWYLRGTLYLSAQSRKSYIEKTGADLGNLPRLLKLLDNLDELFDSVDTDSIALLCLRYVELLSIAETTKRTGLPAYQITAKTGKVMKKAKEIISKV
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MEKIVFVCLGNICRSPMAEFVMKDLVEKAGNESNFLIESRATSSWEHGNPIHSGTQTKLKEQKIAFDLQKGSQKISSEDFYEFDKIIAMDESNLENLRKMAPEGTSQKIAMLLEQGVPDPWFTGDFQETYQLVKTGCQRLLDEIV

Homologous phage analysis in the prophage region

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AGY45939.1|2467962_2468403_-	type II toxin-antitoxin system death-on-curing family toxin	NA	NA	NA	NA
AGY45940.1|2468399_2469395_-	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
AGY45044.1|2469484_2469679_-	hypothetical protein	Q9AZK1	Lactococcus_phage	6.7e-28	96.9
AGY45046.1|2470016_2470643_-	XRE family transcriptional regulator	A0A1P8BMG3	Lactococcus_phage	4.3e-15	44.8
AGY45941.1|2470925_2471132_+	XRE family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AGY45942.1|2471133_2471412_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45047.2|2471411_2471585_+	hypothetical protein	A0A1B1IMG1	Lactococcus_phage	4.4e-23	94.7
AGY45048.1|2471767_2471962_+	DUF1655 domain-containing protein	Q9AZJ4	Lactococcus_phage	1.5e-27	96.9
AGY45049.1|2471966_2472578_+	hypothetical protein	Q9AZJ3	Lactococcus_phage	5.0e-45	61.6
AGY45050.1|2472570_2472852_+	hypothetical protein	Q9AZJ1	Lactococcus_phage	5.1e-45	93.5
AGY45051.1|2472894_2473134_+	hypothetical protein	Q9AZJ0	Lactococcus_phage	4.8e-36	92.4
AGY45943.1|2473130_2473385_+	hypothetical protein	Q9AZE9	Lactococcus_phage	1.8e-36	88.0
AGY45944.1|2473381_2473693_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45052.1|2473689_2474019_+	hypothetical protein	Q9AZI7	Lactococcus_phage	1.2e-53	94.4
AGY45053.1|2474022_2474817_+	hypothetical protein	Q9AZI6	Lactococcus_phage	2.1e-144	91.3
AWJ95561.1|2476708_2476864_+	hypothetical protein	Q9AZE3	Lactococcus_phage	4.5e-19	92.2
AGY45945.1|2476891_2477500_+	hypothetical protein	Q9AZE2	Lactococcus_phage	3.1e-95	94.6
AGY45054.1|2477508_2478099_+|head,protease	HK97 family phage prohead protease	Q9AZE1	Lactococcus_phage	7.6e-107	98.0
AGY45946.1|2478316_2478646_+	hypothetical protein	Q9AZE0	Lactococcus_phage	7.3e-51	94.4
AGY45947.2|2478748_2479069_+	sigma-70 family RNA polymerase sigma factor	Q9AZD9	Lactococcus_phage	5.1e-49	94.3
AGY45055.1|2479786_2479987_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45056.1|2480045_2481386_-	type I glutamate--ammonia ligase	A0A2P1EM84	Moumouvirus	1.8e-10	23.7
AGY45057.2|2481447_2481813_-	MerR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AGY45058.1|2481913_2482351_-	low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase	NA	NA	NA	NA
AGY45949.1|2482763_2483381_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	5.9e-09	28.2

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>CP006766|2530162:2549705|DBSCAN-SWA
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MEVKYKNKSVEVWEISKTNEQPDWVKQAFKENYLSWYDDRLKILLTGINPTAKRNIKLGIMNGILSVGQGFGGTYAMGNIGDFLDITNGRVISKKYFIKHYYIKIDDE
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MKLSDYLNSIDHLDERMEKAVIIAGYEKMFGEHYRLPQEQFADLMELPLPKLRRVIHEMKKAID
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MIEHHQGYTTIKRYGRNSFRPVGKHPFKMIHNARAVKYDLIQQFEVSTGIILPSGVKSNLCTQSVPFLGRDLAVMKLQIKENRK
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MTKKTEINFGINSKLEIRDANKKAGFIGQIAGYAIVFNKPRVPNAPFIEYIAPTALNNVDLSDVLALYNHDYANVLGRVDAGTLKLSIDKVGLHFVLDMPDTTVGHDVYNNIKAGNLKGMSFGFVVADRGDSWQQGSSKPIRTINQLETLGEISVVSKPAYDDTSINVTRSIKQFEDERTRKYKEKVRAYLDGLSD
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MTDQLEKLVAETPQGNVRSPKPQIEDFTDYGEDGKKVVNIAGYQDSLTDWLEQEKEIINQPDYVKANTQTLRAVRKLFFEHRNLFLSTPKEDGKPPKSLSPLETARIIYKTLKVIKLDHQSGLLGVYNPELGIYETNENFFHRLIYWLEPSYSQARSKEVLFKLETLAEVKQQTAEAHLIPVANGIFNKKTQQLEPFSPKYVFTSTIATKYNDKAKVPNINGWNVDDWLLDLMSGDKELVSLLWQIISASTNGNYSYRKGVWLVGKGNDGKGTFQSLIMNLIGRENVASVKAEQFAERFALSQVVGKTCIIGDDSQVSYLDNAGNYFSVVTGDPVPIEAKGKQPTLAVFNKLVIQSTNFLPKFRNKSNGTYRRLLIVPFNKSFTADNDNWKIKDDYIKRKDVLEYVLKIALSLNFEKFDDPKATQGLLDDFKISNDNVLAFVNDMFEEFVSDFLPTAFLSALYRAWCEDEGVKPFTKREFENKLPDHIKEKWIKTTQRPNSAGFNRAVDLHRANEMELFRRLFYWDDEKHKKVTKGYLRKKK
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>CP006766|2530162:2549705|2535531_2536200_+|AGY45962.1|DBSCAN-SWA
MKDLAFLTSPDMSKAEVVTNHVVIAEYAGLNKISVRKLIDNNKQDLEELGILSFEMTKPIKGSTGGRPTKIYQLNRNQAMLLITWLDNTEPVRAFKLALVKRFNEMEKELQARKIARAVEKPKGVNLHQSISEWVHYPRHGNTWHTIIRSLLATTVTGLTKKQIQARDTDWRKEKTLLDLLNSEEMERYKMLESIAIAMIEAGSDYEPIKTAIKATMTTKKP
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MLSVSSVNFFYCFFIEVEEETILKSTSFFNVKRFQEKWTSFAFVERFLREFMFANFKKSVKIKE
>CP006766|2530162:2549705|2539258_2540053_+|AGY45103.1|DBSCAN-SWA
MTPKEQALNCINRGFSVIAGYPAGKSERAVIKGTSSGTLDEITVSEWFDEIPNRNIMINLRNSGLICIDLDQHENGQNGRAVFSRLWNEHSEGEILSTYVEKTPTGNGLHVFFKVPKELFSQPIVSELADGVEIKTHFTPIYPSKRTDGDYIPLNDTETNEPLTFDNLSDCPDWLLEMIQRPQKRQNPTLGSRTYGAEMWELFNQGARKGNRNNDTNRILHYWRKIGIDNNSCMDLLRTFNNRTSPPLPDDELATIWKSVFKMK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
2530056:2530075	attL	NA	NA	NA	NA
AGY45093.1|2530162_2531341_-|integrase	site-specific integrase	Q9AZK8	Lactococcus_phage	2.8e-92	47.6
AGY45094.1|2531787_2531952_-|bacteriocin	bacteriocin	Q9AZK6	Lactococcus_phage	3.0e-21	96.3
AGY45960.1|2532920_2533247_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45095.1|2534203_2534398_-	hypothetical protein	Q9AZK1	Lactococcus_phage	1.1e-27	95.3
AGY45096.1|2534538_2535009_-	XRE family transcriptional regulator	U3PBN8	Staphylococcus_phage	1.4e-07	40.8
AGY45961.1|2535139_2535370_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45962.1|2535531_2536200_+	hypothetical protein	R9QNB1	Lactococcus_phage	2.7e-92	80.6
AGY45097.2|2536541_2536664_+	CopG family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AGY45963.1|2536850_2537072_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45098.1|2537086_2537284_+	DUF1655 domain-containing protein	Q9AZF2	Lactococcus_phage	5.4e-25	93.4
AGY45099.1|2537280_2537814_+	hypothetical protein	Q9AZJ3	Lactococcus_phage	2.0e-50	63.2
AGY45100.1|2537806_2538088_+	hypothetical protein	Q9AZJ1	Lactococcus_phage	2.7e-46	95.7
AGY45101.1|2538130_2538370_+	hypothetical protein	Q9AZJ0	Lactococcus_phage	2.6e-37	96.2
AGY45964.1|2538366_2538621_+	hypothetical protein	Q9AZE9	Lactococcus_phage	1.4e-36	86.7
AGY45965.1|2538617_2538929_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45102.1|2538925_2539255_+	hypothetical protein	Q9AZI7	Lactococcus_phage	1.2e-53	94.4
AGY45103.1|2539258_2540053_+	hypothetical protein	Q9AZI6	Lactococcus_phage	1.2e-144	91.7
AGY45104.1|2540063_2541692_+	DNA primase	Q9AZI5	Lactococcus_phage	2.6e-298	93.4
AGY45966.1|2541908_2542091_+	hypothetical protein	Q9AZE3	Lactococcus_phage	7.9e-23	93.1
AGY45967.1|2542116_2542725_+	hypothetical protein	Q9AZE2	Lactococcus_phage	1.6e-96	95.0
AGY45105.1|2542733_2543324_+|head,protease	HK97 family phage prohead protease	Q9AZE1	Lactococcus_phage	2.3e-103	95.9
AGY45968.1|2543536_2543866_+	hypothetical protein	Q9AZE0	Lactococcus_phage	2.8e-50	93.6
AGY45969.1|2543968_2544289_+	sigma-70 family RNA polymerase sigma factor	Q9AZD9	Lactococcus_phage	3.5e-50	96.2
AGY45106.1|2545072_2546083_-	type I glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
2544966:2544985	attR	NA	NA	NA	NA
AGY45970.1|2546158_2546353_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AGY45107.1|2546362_2546884_-	DUF536 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AGY45108.1|2547011_2549705_+	cation-translocating P-type ATPase	M1HLC0	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	3.6e-71	27.5

2. CP029293

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	2409 : 89513	62	Streptococcus_phage(20.83%)	transposase,protease	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>CP029293|2409:89513|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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AWJ95620.1|3178_3769_-	DUF805 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AWJ95621.1|4673_5816_+	cation:proton antiporter	NA	NA	NA	NA
AWJ95622.1|5832_7170_+	Trk family potassium uptake protein	NA	NA	NA	NA
AWJ95623.1|7189_7858_+	TrkA family potassium uptake protein	NA	NA	NA	NA
AWJ95624.1|7946_8447_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AWJ95625.1|8833_9058_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AWJ95626.1|9059_9869_-	ParA family protein	A0A1V0DZZ0	Clostridioides_phage	1.8e-18	26.8
AWJ95627.1|10014_11169_-	RepB family plasmid replication initiator protein	A0A1V0E006	Clostridioides_phage	1.1e-05	27.3
AWJ95628.1|11487_12327_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
AWJ95629.1|12604_13621_+	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	3.4e-14	30.9
AWJ95630.1|13617_14577_+	oligopeptide transport ATP-binding protein OppF	F2Y302	Organic_Lake_phycodnavirus	7.7e-08	24.7
AWJ95631.1|14557_15517_+	peptide ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
AWJ95632.1|15526_16411_+	peptide ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
AWJ95633.1|20575_20872_+	hypothetical protein	A0A1S5SEW3	Streptococcus_phage	4.2e-05	39.3
AWJ95634.1|20906_21128_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AWJ95635.1|21477_22032_-	recombinase family protein	A0A0A7NPV4	Enterobacteria_phage	3.6e-42	50.6
AWJ95636.1|22266_23463_-	amidohydrolase	NA	NA	NA	NA
AWJ95637.1|23735_25262_-	chitinase	Q9WAX4	Chlorella_virus	1.4e-19	32.1
AWJ95638.1|25318_27580_-	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
AWJ95639.1|28265_29165_-	peptidylprolyl isomerase	NA	NA	NA	NA
AWJ95640.1|29536_35425_+	peptidase S8	NA	NA	NA	NA
AWJ95641.1|36510_37704_-	glycosyl transferase	M1HN86	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	4.0e-46	31.6
AWJ95642.1|37740_38928_-	nucleotide sugar dehydrogenase	M1HV26	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	6.5e-97	48.8
AWJ95643.1|39110_39326_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AWJ95704.1|39783_40095_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AWJ95644.1|40568_41250_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.0e-107	83.2
AWJ95705.1|42230_43481_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
AWJ95645.1|43587_44334_-	heme-dependent peroxidase	NA	NA	NA	NA
AWJ95646.1|44566_45940_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
AWJ95647.1|45979_47509_-	copper oxidase	NA	NA	NA	NA
AWJ95648.1|47603_48284_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	3.6e-108	83.2
AWJ95649.1|50947_51208_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
AWJ95650.1|51300_51882_+	recombinase family protein	A0A1J1J8Z4	Escherichia_phage	8.5e-34	45.1
AWJ95651.1|52007_52109_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AWJ95652.1|52379_53147_-	DeoR/GlpR transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AWJ95653.1|53623_54049_+	galactose-6-phosphate isomerase subunit LacA	NA	NA	NA	NA
AWJ95654.1|54065_54581_+	galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB	A0A222YX14	Synechococcus_phage	4.3e-05	36.0
AWJ95655.1|54591_55524_+	tagatose-6-phosphate kinase	NA	NA	NA	NA
AWJ95656.1|55526_56507_+	tagatose-bisphosphate aldolase	NA	NA	NA	NA
AWJ95657.1|56534_56852_+	PTS lactose/cellobiose transporter subunit IIA	NA	NA	NA	NA
AWJ95658.1|56855_58562_+	PTS lactose transporter subunit IIBC	NA	NA	NA	NA
AWJ95659.1|58666_60073_+	6-phospho-beta-galactosidase	A0A0B5JD41	Pandoravirus	2.3e-45	29.2
AWJ95660.1|60364_61264_+	aldose 1-epimerase family protein	NA	NA	NA	NA
AWJ95661.1|61514_61889_+	large-conductance mechanosensitive channel protein MscL	NA	NA	NA	NA
AWJ95662.1|64644_65475_+	AAC(3) family N-acetyltransferase	O64018	Bacillus_phage	6.2e-46	39.8
AWJ95663.1|67973_68255_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AWJ95664.1|68260_68638_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AWJ95665.1|68753_69026_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AWJ95666.1|69039_70197_-	RepB protein	A0A1V0E006	Clostridioides_phage	4.3e-05	26.1
AWJ95667.1|71280_71640_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AWJ95668.1|71706_72597_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
AWJ95669.1|72866_73505_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AWJ95670.1|73645_75112_+	DNA polymerase	M1Q231	Streptococcus_phage	8.4e-131	50.9
AWJ95671.1|75108_75501_+	hypothetical protein	A0A182BQ76	Lactococcus_phage	1.3e-06	60.0
AWJ95672.1|75515_76541_+	recombinase RecA	A0A2D1GPX2	Mycobacterium_phage	2.4e-71	42.7
AWJ95673.1|77929_78811_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AWJ95674.1|79010_79607_-	resolvase	A0A1J1J8Z4	Escherichia_phage	8.7e-34	44.0
AWJ95675.1|79763_79997_+	hypothetical protein	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	7.8e-07	90.0
AWJ95676.1|81655_82414_-|transposase	transposase	A0A059NT77	Lactococcus_phage	5.3e-137	100.0
AWJ95677.1|82425_83649_-|transposase	IS21 family transposase IS712	A0A059NT83	Lactococcus_phage	4.9e-233	100.0
AWJ95678.1|86063_89513_+	type II restriction endonuclease	A0A2R2ZGH5	Clostridioides_phage	3.5e-26	24.2