bac_id	spacer_id	hit_phage_id	hit_phage_def	spacer_sequence	hit_phage_region	hit_phage_sequence	mismatch	coverage	hmm_mismatch
NZ_LT906446	1.8|556275|34|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP013615	Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838A, complete sequence	TGAATAAAAGCAATTTCATTTTCTTTTATTCCTT	39718-39751	TTAAAAGAAAAGAAAATGAAATTGCTTATACAGT	2	0.7647058823529411	10
NZ_LT906446	1.8|556275|34|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP039706	Clostridium butyricum strain 4-1 plasmid p-butyl_plas_4-1, complete sequence	TGAATAAAAGCAATTTCATTTTCTTTTATTCCTT	247573-247606	AAACAAAAATTAATTTCATTTTCTTTTATTTCAT	2	0.7352941176470589	8
NZ_LT906446	1.8|556275|34|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP033246	Clostridium butyricum strain CFSA3987 plasmid pCFSA3987, complete sequence	TGAATAAAAGCAATTTCATTTTCTTTTATTCCTT	830060-830093	AAACAAAAATTAATTTCATTTTCTTTTATTTCAT	2	0.7352941176470589	8
NZ_LT906446	1.8|556275|34|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP033248	Clostridium butyricum strain CFSA3989 plasmid pCFSA3989, complete sequence	TGAATAAAAGCAATTTCATTTTCTTTTATTCCTT	830075-830108	AAACAAAAATTAATTTCATTTTCTTTTATTTCAT	2	0.7352941176470589	8
NZ_LT906446	1.8|556275|34|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_AP019717	Clostridium butyricum strain NBRC 13949 plasmid pCBU1, complete sequence	TGAATAAAAGCAATTTCATTTTCTTTTATTCCTT	283192-283225	AAACAAAAATTAATTTCATTTTCTTTTATTTCAT	2	0.7352941176470589	8
NZ_LT906446	1.8|556275|34|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP039703	Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence	TGAATAAAAGCAATTTCATTTTCTTTTATTCCTT	431363-431396	ATGAAATAAAAGAAAATGAAATTAATTTTTGTTT	2	0.7352941176470589	8
NZ_LT906446	1.8|556275|34|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP013238	Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence	TGAATAAAAGCAATTTCATTTTCTTTTATTCCTT	549645-549678	ATGAAATAAAAGAAAATGAAATTAATTTTTGTTT	2	0.7352941176470589	8
NZ_LT906446	1.8|556275|34|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_LR214986	Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13	TGAATAAAAGCAATTTCATTTTCTTTTATTCCTT	436388-436421	ATAAAATAAAAGAAAATGAAATTGATATTGCCGG	2	0.7352941176470589	10
NZ_LT906446	1.8|556275|34|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	AP013441	Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G17, isolate: uvMED-CGR-C22-MedDCM-OCT-S33-C34	TGAATAAAAGCAATTTCATTTTCTTTTATTCCTT	14482-14515	AGTTTTCAGTCAATTTCATTTTCATTTACTCCTT	2	0.7058823529411765	9
NZ_LT906446	1.8|556275|34|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MN694159	Marine virus AFVG_250M1044, complete genome	TGAATAAAAGCAATTTCATTTTCTTTTATTCCTT	25587-25620	AACAAACAAAACAAAATGAAATTGCTTTACAAAA	2	0.7058823529411765	9
NZ_LT906446	1.21|557130|36|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	HG796412	Uncultured bacterium plasmid pRGI00992	CTGAGTAAAAAGTATTGATTTTATTGGGTTTGTGGC	735-770	TTTTAGAAAAAGTATTGATTTTATTGGTTTTGTGGC	1	0.8333333333333334	6
NZ_LT906446	1.21|557130|36|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	AP013454	Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G17, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S33-C36	CTGAGTAAAAAGTATTGATTTTATTGGGTTTGTGGC	15066-15101	GCCACAAACCTAATAAAACCAATACTTTTAGTGTTG	2	0.8055555555555556	8
NZ_LT906446	1.28|557591|36|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	HG796856	Uncultured bacterium plasmid pRGF00250	GCTTGAAATTTTCGTTGCGGTTTTGATGCTAAAATT	676-711	GCTTGAAATTTTCGTTGCGGTTTTGATGCTAAAATT	0	1.0	0
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_014508	Enterococcus faecalis plasmid pEF-01, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	10546-10580	TTTTTAAAATTATTTAGTTGTTCTTGCTATTAACA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP012757	Staphylococcus aureus subsp. aureus strain JS395 plasmid, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	4984-5018	TTTTTAAAATTATTTAGTTGTTCTTGCTATTAACA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP037957	Enterococcus hirae strain CQP3-9 plasmid pCQP3-9_2, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	7729-7763	TTTTTAAAATTATTTAGTTGTTCTTGCTATTAACA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP038162	Enterococcus faecium strain GZ8 plasmid pGZ8, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	26417-26451	TTTTTAAAATTATTTAGTTGTTCTTGCTATTAACA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MT074685	Enterococcus faecium strain T-E1077-31 plasmid pT-E1077-31, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	8138-8172	TTTTTAAAATTATTTAGTTGTTCTTGCTATTAACA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MT074685	Enterococcus faecium strain T-E1077-31 plasmid pT-E1077-31, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	27949-27983	TGTTAATAGCAAGAACAACTAAATAATTTTAAAAA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MT074684	Enterococcus faecium strain E1077 plasmid pE1077-23, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	8146-8180	TTTTTAAAATTATTTAGTTGTTCTTGCTATTAACA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_MH784601	Enterococcus faecium strain 25 plasmid pC25-1, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	35494-35528	TTTTTAAAATTATTTAGTTGTTCTTGCTATTAACA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_MH784602	Enterococcus faecium strain 27 plasmid pC27-2, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	30202-30236	TTTTTAAAATTATTTAGTTGTTCTTGCTATTAACA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_MK140642	Enterococcus faecalis strain E076 plasmid pE076, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	19742-19776	TTTTTAAAATTATTTAGTTGTTCTTGCTATTAACA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_KX274135	Staphylococcus arlettae strain SA-01 plasmid pSA-01, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	47453-47487	TGTTAATAGCAAGAACAACTAAATAATTTTAAAAA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MK798157	Enterococcus hirae strain fas4 plasmid pfas4-1, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	18032-18066	TGTTAATAGCAAGAACAACTAAATAATTTTAAAAA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MN831412	Enterococcus faecalis strain M18/0011 plasmid pM18/0011, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	1355-1389	TGTTAATAGCAAGAACAACTAAATAATTTTAAAAA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP038165	Enterococcus faecium strain HB2-2 plasmid pHB2-2, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	10226-10260	TGTTAATAGCAAGAACAACTAAATAATTTTAAAAA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP038167	Enterococcus faecium strain SC3-1 plasmid pSC3-1, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	25218-25252	TGTTAATAGCAAGAACAACTAAATAATTTTAAAAA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP038171	Enterococcus faecium strain SDGJP3 plasmid pSDGJP3, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	37812-37846	TGTTAATAGCAAGAACAACTAAATAATTTTAAAAA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP038169	Enterococcus faecium strain SCBC1 plasmid pSCBC1, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	13058-13092	TGTTAATAGCAAGAACAACTAAATAATTTTAAAAA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP038176	Enterococcus faecium strain HN11 plasmid pHN11, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	68245-68279	TGTTAATAGCAAGAACAACTAAATAATTTTAAAAA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP038173	Enterococcus faecium strain YN2-1 plasmid pYN2-1, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	17906-17940	TGTTAATAGCAAGAACAACTAAATAATTTTAAAAA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_MK140641	Enterococcus faecalis strain E035 plasmid pE035, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	36225-36259	TGTTAATAGCAAGAACAACTAAATAATTTTAAAAA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.29|557657|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_MK861852	Enterococcus faecalis strain C10 plasmid pC10, complete sequence	TTTTTTAAATTATTTAATTGTTCTTGAGCTGATTT	18986-19020	TGTTAATAGCAAGAACAACTAAATAATTTTAAAAA	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	1.31|557788|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_017966	Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM2, complete sequence	CCCAAATTTCCGTTTCCGCCTGCCCACGCTCGGCT	439669-439703	CGCCGAGCGTGGGCAGGCGGTAGCGGTCGACCGGG	2	0.7142857142857143	9
NZ_LT906446	2.3|659002|34|NZ_LT906446|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	NZ_CP029155	Clostridioides difficile strain CD161 plasmid unnamed1, complete sequence	TTGTATTTGGTTCTACATTTGTTTTTGGATCTAC	41778-41811	TTGGATTTGGTTCTATATTTGTTTTGATACTTTA	2	0.7352941176470589	9
NZ_LT906446	2.3|659002|34|NZ_LT906446|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	NZ_CP021643	Campylobacter concisus strain P2CDO4 plasmid pICON, complete sequence	TTGTATTTGGTTCTACATTTGTTTTTGGATCTAC	13204-13237	TGCCGCTTGGTTCTCCATTTGTTTTTGTATATTC	2	0.7058823529411765	9
NZ_LT906446	2.5|659132|36|NZ_LT906446|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	MK817115	Escherichia phage vB_EcoM_phAPEC6, complete genome	ATTGATTAACAAAATAAGTGCTAATAAGTTTTTTAA	116568-116603	TTAAAAAACTTATTAGTACTTTTTTTAGGAGCAAGC	2	0.7222222222222222	10
NZ_LT906446	2.5|659132|36|NZ_LT906446|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	NC_027364	Escherichia phage PBECO 4, complete genome	ATTGATTAACAAAATAAGTGCTAATAAGTTTTTTAA	271839-271874	TTAAAAAACTTATTAGTACTTTTTTTAGGAGCAAGC	2	0.7222222222222222	10
NZ_LT906446	2.5|659132|36|NZ_LT906446|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	MH383160	Escherichia phage UB, complete genome	ATTGATTAACAAAATAAGTGCTAATAAGTTTTTTAA	336906-336941	TTAAAAAACTTATTAGTACTTTTTTTAGGAGCAAGC	2	0.7222222222222222	10
NZ_LT906446	2.5|659132|36|NZ_LT906446|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	MK327931	Escherichia phage vB_EcoM_G17, complete genome	ATTGATTAACAAAATAAGTGCTAATAAGTTTTTTAA	142054-142089	TTAAAAAACTTATTAGTACTTTTTTTAGGAGCAAGC	2	0.7222222222222222	10
NZ_LT906446	2.5|659132|36|NZ_LT906446|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	LC494302	Escherichia phage SP27 DNA, complete genome	ATTGATTAACAAAATAAGTGCTAATAAGTTTTTTAA	12786-12821	GCTTGCTCCTAAAAAAAGTACTAATAAGTTTTTTAA	2	0.7222222222222222	10
NZ_LT906446	2.5|659132|36|NZ_LT906446|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	LT603033	Escherichia phage vB_Eco_slurp01 genome assembly, chromosome: I	ATTGATTAACAAAATAAGTGCTAATAAGTTTTTTAA	301297-301332	GCTTGCTCCTAAAAAAAGTACTAATAAGTTTTTTAA	2	0.7222222222222222	10
NZ_LT906446	2.5|659132|36|NZ_LT906446|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	KM507819	Escherichia phage 121Q, complete genome	ATTGATTAACAAAATAAGTGCTAATAAGTTTTTTAA	12813-12848	GCTTGCTCCTAAAAAAAGTACTAATAAGTTTTTTAA	2	0.7222222222222222	10
NZ_LT906446	2.10|659462|34|NZ_LT906446|CRISPRCasFinder,CRT	HG796317	Uncultured bacterium plasmid pRGI00402	TTATCAAAAAAATCAAAAAACTGGGGGGTTAATT	2159-2192	TTCGGAGAAAAATCTAAAATCTGGGGGGTTACTA	2	0.7058823529411765	8
NZ_LT906446	2.13|659464|32|NZ_LT906446|PILER-CR	HG796317	Uncultured bacterium plasmid pRGI00402	ATCAAAAAAATCAAAAAACTGGGGGGTTAATT	2161-2192	CGGAGAAAAATCTAAAATCTGGGGGGTTACTA	2	0.75	8
NZ_LT906446	3.3|733392|37|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP048628	Megamonas funiformis strain JCM 14723 plasmid putative_Mfuni1, complete sequence	GCGAACTTGGATAGTATCTATCTATCTTTTGCACTAT	41600-41636	GTAGTGCAAAAGATAGATAGATACTATCCAAGCTCGC	1	0.972972972972973	2
NZ_LT906446	3.5|733525|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_009927	Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB2, complete sequence	GTTGTATCAGTCAAAGAAATTAACATCTTGATGAC	140162-140196	GCTTGGAAGATGTTGGTTTCTTTGACTGATAGCAA	2	0.7142857142857143	10
NZ_LT906446	3.5|733525|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_027120	Lactococcus phage 1358, complete sequence	GTTGTATCAGTCAAAGAAATTAACATCTTGATGAC	26859-26893	GGCACGAAAATCGAAGAAATTAACAACTTGATGAC	2	0.7142857142857143	10
NZ_LT906446	3.6|733590|36|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	CP054911	Pantoea ananatis strain FDAARGOS_680 plasmid unnamed3, complete sequence	TTGGATGTTGCATAATTTATATTATTAATTCCCCAT	94981-95016	GCATTTAATCCATAATATAAATTATGCAACATTATA	2	0.7222222222222222	11
NZ_LT906446	4.1|1166412|27|NZ_LT906446|CRT	MF417885	Uncultured Caudovirales phage clone 3S_9, partial genome	TGGTATAAATAATACCAGTTTATTTTT	7214-7240	GTAAATCAACTGGTATTACTTATACAG	2	0.8518518518518519	6
NZ_LT906446	4.5|1166671|34|NZ_LT906446|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	NC_015938	Salmonella phage 7-11, complete genome	CCGATAAAACTATTATAAAAAATCACCCTCTTGT	36559-36592	ACATGAGGGTGATTTTTAATAATATAATCACCTA	2	0.7058823529411765	9
NZ_LT906446	4.5|1166671|34|NZ_LT906446|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	MG873442	Salmonella phage SE131, complete genome	CCGATAAAACTATTATAAAAAATCACCCTCTTGT	54348-54381	TAGGTGATTATATTATTAAAAATCACCCTCATGT	2	0.7058823529411765	9
NZ_LT906446	8.2|2131184|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	KJ018210	Flavobacterium sp. phage 1/32, complete genome	TAAAGTTTTTTCTATTGTTTCAAATTTAACCTCAC	33148-33182	TTACCCTAAAATTTAAAACAATGGAAAAAACTTTT	2	0.7428571428571429	9
NZ_LT906446	8.2|2131184|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	GU071101	Prochlorococcus phage P-HM1, complete genome	TAAAGTTTTTTCTATTGTTTCAAATTTAACCTCAC	161922-161956	AGGTAATTAAATGTGAAGCAATAGAAAAAACAATA	2	0.7142857142857143	9
NZ_LT906446	8.3|2131248|35|NZ_LT906446|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MH617498	Microviridae sp. isolate ctcb690, complete genome	TCAACATAAATCGGGATAAGATAGCCAGTGTCGAA	103-137	ATGAATGCGGGTTATCTTATCCCGATTTATGTGGA	2	0.7428571428571429	8
