bac_id	bac_def	spacer_id	hit_contig_id	hit_contig_def	identity	alignment_length	mismatch	gapopen	query_start	query_end	hit_start	hit_end	crispr_array_of_hit_genome	evalue	bitscore	coverage	spacer_sequence	hit_contig_region	hit_contig_sequence	hmm_mismatch
NC_017737	Helicobacter cetorum MIT 00-7128, complete genome	3.7|1564344|38|NC_017737|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_017737.1	Helicobacter cetorum MIT 00-7128, complete genome	100.000	38	0	0	1	38	652119	652082	494325-494427|1290126-1290230|1563836-1566442	5.80e-12	61.8	1.0	CTAAAAAAGTCGCCACACAATGCGAATAATCCCTGCAT	652082-652119	ATGCAGGGATTATTCGCATTGTGTGGCGACTTTTTTAG	0
NC_017737	Helicobacter cetorum MIT 00-7128, complete genome	3.9|1564496|41|NC_017737|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_017737.1	Helicobacter cetorum MIT 00-7128, complete genome	95.122	41	2	0	1	41	1252492	1252532	494325-494427|1290126-1290230|1563836-1566442	2.03e-11	60.2	1.0	GGTAGCTGGATTAGAATTGATTAAGATAACTCTATAACCCA	1252492-1252532	GGTGGCGGGATTAGAATTGATTAAGATAACTCTATAACCCA	2
NC_017737	Helicobacter cetorum MIT 00-7128, complete genome	3.23|1565576|40|NC_017737|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_017737.1	Helicobacter cetorum MIT 00-7128, complete genome	100.000	40	0	0	1	40	1887484	1887523	494325-494427|1290126-1290230|1563836-1566442	6.99e-13	65.0	1.0	TCTTACCCACTAAAATCATGCCCGCACTCACATAAGTGCC	1887484-1887523	TCTTACCCACTAAAATCATGCCCGCACTCACATAAGTGCC	0
NC_017737	Helicobacter cetorum MIT 00-7128, complete genome	3.29|1566049|39|NC_017737|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_017737.1	Helicobacter cetorum MIT 00-7128, complete genome	100.000	39	0	0	1	39	1303636	1303598	494325-494427|1290126-1290230|1563836-1566442	2.10e-12	63.4	1.0	TTGCTAAAAAGCCTTCACTATGCGCCAATGCACTCCAAG	1303598-1303636	CTTGGAGTGCATTGGCGCATAGTGAAGGCTTTTTAGCAA	0
NC_017737	Helicobacter cetorum MIT 00-7128, complete genome	3.32|1566283|45|NC_017737|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_017737.1	Helicobacter cetorum MIT 00-7128, complete genome	100.000	45	0	0	1	45	1536632	1536676	494325-494427|1290126-1290230|1563836-1566442	3.98e-15	72.9	1.0	TCTAAAGGCGTGAATTGATTAAAAATTTGTGAAATTTTAGGATAA	1536632-1536676	TCTAAAGGCGTGAATTGATTAAAAATTTGTGAAATTTTAGGATAA	0
NC_017737	Helicobacter cetorum MIT 00-7128, complete genome	3.33|1566365|41|NC_017737|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_017738.1	Helicobacter cetorum MIT 00-7128 plasmid pHCW, complete sequence	100.000	41	0	0	1	41	5502	5542	no crispr array in hit genome!	2.51e-13	66.6	1.0	TTCGCTTAAAAGCATTTGATAAATGCGTATTGCATAATAGC	5502-5542	TTCGCTTAAAAGCATTTGATAAATGCGTATTGCATAATAGC	0
