bac_id	spacer_id	hit_phage_id	hit_phage_def	spacer_sequence	hit_phage_region	hit_phage_sequence	mismatch	coverage	hmm_mismatch
NC_009615	1.1|1380450|34|NC_009615|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_015693	Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL01, complete sequence	CAATGTCTTCGGGGTATATTCCTTGCCTTGATAG	85594-85627	CAATGTCTTCGGGGTATTTTTCTTTGACGCGTTC	2	0.7058823529411765	9
NC_009615	1.2|1380516|33|NC_009615|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	FR714877	Flavobacterium phage FL-1 DNA for ORF1 and ORF2	TTGCCATGATATTAGTTTTTAATGTTATTTATT	600-632	TTTTCATGATATTAGTTTTTAAGATTATTGTTA	2	0.7575757575757576	7
NC_009615	1.2|1380516|33|NC_009615|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	KY421186	Flavobacterium phage FL-1, complete genome	TTGCCATGATATTAGTTTTTAATGTTATTTATT	49789-49821	TAACAATAATCTTAAAAACTAATATCATGAAAA	2	0.7575757575757576	7
NC_009615	1.2|1380516|33|NC_009615|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP038614	Arsenophonus nasoniae strain FIN plasmid pArsFIN2, complete sequence	TTGCCATGATATTAGTTTTTAATGTTATTTATT	139472-139504	ACAGAATATCATTAAAAACTAATATAATTAAGA	2	0.7272727272727273	9
NC_009615	1.2|1380516|33|NC_009615|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	CP019696	Shigella sonnei strain 75/02 plasmid pInv_75_02_1, complete sequence	TTGCCATGATATTAGTTTTTAATGTTATTTATT	71939-71971	TATAAATAACATTAAACACTATTATTAGACCGG	2	0.7272727272727273	9
NC_009615	1.2|1380516|33|NC_009615|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	CP053752	Shigella sonnei strain 506 plasmid pMHMC-001, complete sequence	TTGCCATGATATTAGTTTTTAATGTTATTTATT	7429-7461	TATAAATAACATTAAACACTATTATTAGACCGG	2	0.7272727272727273	9
NC_009615	1.2|1380516|33|NC_009615|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	CP010830	Shigella sonnei strain FORC_011 plasmid pFORC11.1, complete sequence	TTGCCATGATATTAGTTTTTAATGTTATTTATT	71943-71975	TATAAATAACATTAAACACTATTATTAGACCGG	2	0.7272727272727273	9
NC_009615	1.2|1380516|33|NC_009615|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	CP046285	Shigella sonnei strain FDAARGOS_715 plasmid unnamed1, complete sequence	TTGCCATGATATTAGTTTTTAATGTTATTTATT	45606-45638	CCGGTCTAATAATAGTGTTTAATGTTATTTATA	2	0.7272727272727273	9
NC_009615	1.2|1380516|33|NC_009615|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	CP000039	Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS_046, complete sequence	TTGCCATGATATTAGTTTTTAATGTTATTTATT	197807-197839	CCGGTCTAATAATAGTGTTTAATGTTATTTATA	2	0.7272727272727273	9
NC_009615	1.2|1380516|33|NC_009615|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	HE616529	Shigella sonnei 53G plasmid A, complete genome	TTGCCATGATATTAGTTTTTAATGTTATTTATT	199185-199217	CCGGTCTAATAATAGTGTTTAATGTTATTTATA	2	0.7272727272727273	9
NC_009615	1.2|1380516|33|NC_009615|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	CP023646	Shigella sonnei strain CFSAN030807 plasmid pCFSAN030807_1, complete sequence	TTGCCATGATATTAGTTTTTAATGTTATTTATT	32022-32054	CCGGTCTAATAATAGTGTTTAATGTTATTTATA	2	0.7272727272727273	9
NC_009615	1.2|1380516|33|NC_009615|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MN694164	Marine virus AFVG_250M1189, complete genome	TTGCCATGATATTAGTTTTTAATGTTATTTATT	50878-50910	AAAAATCTTTATTATTTTTTAATGTTCTTTATT	2	0.7272727272727273	9
