bac_id	spacer_id	hit_phage_id	hit_phage_def	spacer_sequence	hit_phage_region	hit_phage_sequence	mismatch	coverage	hmm_mismatch
NC_003869	2.1|2326800|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP031090	Spiroplasma phoeniceum P40 plasmid pSPh387, complete sequence	CAGTTTCAAATTGGATATAAAGGTTATATTCAACTCG	25802-25838	CTAATTGAATATAACCTTTATAACCTATTTCATATTT	2	0.7027027027027027	8
NC_003869	2.3|2326934|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MK573636	Escherichia phage vB_EcoM_PHB13, partial genome	CTGGGCAAAAGAAGCAATTGTGAATATGTTTCAGAAA	93777-93813	TTAATCAAAAGAAGGAATAGTGAATATGTTTAAACGC	2	0.7027027027027027	11
NC_003869	2.3|2326934|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MN850574	Escherichia phage kaaroe, complete genome	CTGGGCAAAAGAAGCAATTGTGAATATGTTTCAGAAA	128887-128923	TTAATCAAAAGAAGGAATAGTGAATATGTTTAAACGC	2	0.7027027027027027	11
NC_003869	2.3|2326934|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MN655998	Escherichia phage E26, complete genome	CTGGGCAAAAGAAGCAATTGTGAATATGTTTCAGAAA	141593-141629	ACGTTTAAACATATTCACTATTCCTTCTTTTGATTAA	2	0.7027027027027027	11
NC_003869	2.3|2326934|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MH560358	Escherichia virus KFS-EC, complete genome	CTGGGCAAAAGAAGCAATTGTGAATATGTTTCAGAAA	85473-85509	GCGTTTAAACATATTCACTATTCCTTCTTTTGATTAA	2	0.7027027027027027	11
NC_003869	2.3|2326934|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MT764208	Escherichia phage JEP8, complete genome	CTGGGCAAAAGAAGCAATTGTGAATATGTTTCAGAAA	56187-56223	GCGTTTAAACATATTCACTATTCCTTCTTTTGATTAA	2	0.7027027027027027	11
NC_003869	2.3|2326934|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MT478991	Escherichia phage vB_EcoM_011D4, complete genome	CTGGGCAAAAGAAGCAATTGTGAATATGTTTCAGAAA	92724-92760	ACGTTTAAACATATTCACTATTCCTTCTTTTGATTAA	2	0.7027027027027027	11
NC_003869	2.3|2326934|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MK327941	Escherichia phage vB_EcoM_G37-3, complete genome	CTGGGCAAAAGAAGCAATTGTGAATATGTTTCAGAAA	144573-144609	GCGTTTAAACATATTCACTATTCCTTCTTTTGATTAA	2	0.7027027027027027	11
NC_003869	2.3|2326934|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_009821	Enterobacteria phage Phi1, complete genome	CTGGGCAAAAGAAGCAATTGTGAATATGTTTCAGAAA	141864-141900	ACGTTTAAACATATTCACTATTCCTTCTTTTGATTAA	2	0.7027027027027027	11
NC_003869	2.3|2326934|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MF327006	Shigella phage Sf20, complete genome	CTGGGCAAAAGAAGCAATTGTGAATATGTTTCAGAAA	77349-77385	GCGTTTAAACATATTCACTATTCCTTCTTTTGATTGA	2	0.7027027027027027	12
NC_003869	2.3|2326934|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_025425	Enterobacteria phage GEC-3S complete genome	CTGGGCAAAAGAAGCAATTGTGAATATGTTTCAGAAA	141211-141247	GCGTTTAAACATATTCACTATTCCTTCTTTTGATTAA	2	0.7027027027027027	11
NC_003869	2.3|2326934|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MK327947	Escherichia phage vB_EcoM_G5211, complete genome	CTGGGCAAAAGAAGCAATTGTGAATATGTTTCAGAAA	141506-141542	GCGTTTAAACATATTCACTATTCCTTCTTTTGATTAA	2	0.7027027027027027	11
NC_003869	2.3|2326934|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	AY343333	Enterobacteria phage RB49, complete genome	CTGGGCAAAAGAAGCAATTGTGAATATGTTTCAGAAA	141933-141969	GCGTTTAAACATATTCACTATTCCTTCTTTTGATTAA	2	0.7027027027027027	11
NC_003869	2.3|2326934|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_012740	Enterobacteria phage JSE, complete genome	CTGGGCAAAAGAAGCAATTGTGAATATGTTTCAGAAA	144325-144361	GCGTTTAAACATATTCACTATTCCTTCTTTTGATTAA	2	0.7027027027027027	11
NC_003869	2.3|2326934|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MN894885	Escherichia virus Ec_Makalu_001, complete genome	CTGGGCAAAAGAAGCAATTGTGAATATGTTTCAGAAA	141365-141401	GCGTTTAAACATATTCACTATTCCTTCTTTTGATTAA	2	0.7027027027027027	11
NC_003869	2.3|2326934|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MN882349	Escherichia virus Ec_Makalu_003, complete genome	CTGGGCAAAAGAAGCAATTGTGAATATGTTTCAGAAA	140562-140598	GCGTTTAAACATATTCACTATTCCTTCTTTTGATTAA	2	0.7027027027027027	11
NC_003869	2.15|2327736|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MK504445	Lactobacillus phage ATCCB, complete genome	TTCCATACAAATCTACAGCAACCAAAAGTCTTTTCAA	68934-68970	TTCCAAACAAATCTACAGCAGCCAAAATTAAATATAA	2	0.7297297297297297	8
NC_003869	2.25|2328402|36|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MK448820	Streptococcus phage Javan617, complete genome	ACTGGCGATTTATTGGCAGTTTTAATGTTGCTGCTT	7162-7197	AAGCAGCAACATTAAATCTACCAATAGAGCCAAGTT	2	0.7222222222222222	6
NC_003869	4.30|2542575|35|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	AY939844	Prochlorococcus phage P-SSM2, complete genome	GCAGATGAAACAAGTTTTGGAGATGCTGCAGCAGT	76142-76176	GCAGATGAAACAATTTTTGGATATGAAGATGGGGA	2	0.7142857142857143	9
NC_003869	4.30|2542575|35|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	HQ632825	Prochlorococcus phage P-SSM5 genomic sequence	GCAGATGAAACAAGTTTTGGAGATGCTGCAGCAGT	11153-11187	TCCCCATCTTCATATCCAAAAATTGTTTCATCTGC	2	0.7142857142857143	9
NC_003869	4.115|2548272|36|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP018781	Ochrobactrum pituitosum strain AA2 plasmid pOAAA2, complete sequence	CTCCCTTTCTCGCTTTTTCTGCCTCCATTTTACACC	86073-86108	CAACCTTTCTCGCTTTATCTGTCTCCATTGCATGAT	2	0.7222222222222222	10
NC_003869	4.126|2549015|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP025589	Lactobacillus plantarum strain KC3 plasmid unnamed3, complete sequence	ATTCATCAAGAAAACTTACACAGGACTATTTTACAAG	25023-25059	ATTAATCAAGAAAACTTACACAGGATTATTAATACTA	2	0.8108108108108109	5
NC_003869	4.134|2549552|35|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NC_008757	Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP01, complete sequence	TAGGACACCGTTTGAGTACCCCGAACTGCTGGATG	170001-170035	CATCCAGCAGTTCGGGGAACTCAAACTGCGCCTCT	1	0.7428571428571429	7
NC_003869	4.206|2554362|35|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP044300	Escherichia coli strain P59A plasmid pP59A-2, complete sequence	TTGCACATAATTTTTAACCTTCCTTCTTCAGTGTT	61633-61667	AGAGTTGATGAAGAAAGGTTAAAAATTATGCATTG	2	0.7142857142857143	11
NC_003869	4.206|2554362|35|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	MG516909	Escherichia coli plasmid pEc1675, complete sequence	TTGCACATAATTTTTAACCTTCCTTCTTCAGTGTT	49030-49064	AGAGTTGATGAAGAAAGGTTAAAAATTATGCATTG	2	0.7142857142857143	11
NC_003869	4.206|2554362|35|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP046008	Escherichia coli strain 1919D62 plasmid p1919D62-2, complete sequence	TTGCACATAATTTTTAACCTTCCTTCTTCAGTGTT	19717-19751	AGAGTTGATGAAGAAAGGTTAAAAATTATGCATTG	2	0.7142857142857143	11
NC_003869	4.206|2554362|35|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP029688	Escherichia coli strain E706 plasmid pLKJULY7989, complete sequence	TTGCACATAATTTTTAACCTTCCTTCTTCAGTGTT	33987-34021	AGAGTTGATGAAGAAAGGTTAAAAATTATGCATTG	2	0.7142857142857143	11
NC_003869	4.206|2554362|35|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP029493	Escherichia coli strain HS30-1 plasmid pHS30-1, complete sequence	TTGCACATAATTTTTAACCTTCCTTCTTCAGTGTT	142788-142822	CAATGCATAATTTTTAACCTTTCTTCATCAACTCT	2	0.7142857142857143	11
NC_003869	4.206|2554362|35|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP017847	Escherichia coli strain FMU073332 plasmid pEcoFMU073332c, complete sequence	TTGCACATAATTTTTAACCTTCCTTCTTCAGTGTT	8888-8922	CAATGCATAATTTTTAACCTTTCTTCATCAACTCT	2	0.7142857142857143	11
NC_003869	4.206|2554362|35|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP040928	Escherichia coli strain YY76-1 plasmid pYY76-1-1, complete sequence	TTGCACATAATTTTTAACCTTCCTTCTTCAGTGTT	100456-100490	CAATGCATAATTTTTAACCTTTCTTCATCAACTCT	2	0.7142857142857143	11
NC_003869	4.206|2554362|35|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP010244	Escherichia coli strain S56 plasmid B, complete sequence	TTGCACATAATTTTTAACCTTCCTTCTTCAGTGTT	68455-68489	CAATGCATAATTTTTAACCTTTCTTCATCAACTCT	2	0.7142857142857143	11
NC_003869	4.206|2554362|35|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP033252	Escherichia coli strain ECCHD184 plasmid pTB212, complete sequence	TTGCACATAATTTTTAACCTTCCTTCTTCAGTGTT	35093-35127	CAATGCATAATTTTTAACCTTTCTTCATCAACTCT	2	0.7142857142857143	11
NC_003869	4.215|2554963|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP007184	Campylobacter coli RM1875 plasmid pRM1875_35kb, complete sequence	AAGACATACGTAAAGAGAAAAATTAGAGAATTAAAGA	24770-24806	TCTTAAAATCTCTAATTTTTCTCTTTGATTAAAATCC	2	0.7027027027027027	11
NC_003869	4.215|2554963|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	NZ_CP038864	Campylobacter jejuni strain SCJK2 plasmid p2, complete sequence	AAGACATACGTAAAGAGAAAAATTAGAGAATTAAAGA	30485-30521	TCTTAAAATCTCTAATTTTTCTCTTTGATTAAAATCC	2	0.7027027027027027	11
NC_003869	4.215|2554963|37|NC_003869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	CP013734	Campylobacter coli strain OR12 plasmid pOR12Vir, complete sequence	AAGACATACGTAAAGAGAAAAATTAGAGAATTAAAGA	30191-30227	GGATTTTAATCAAAGAGAAAAATTAGAGATTTTAAGA	2	0.7027027027027027	11
