assembly_id	genome_id	genome_def	crispr_array_locus_merge	crispr_array_location_merge	crispr_locus_id	crispr_pred_method	array_in_prot	prot_within_array_20000	prot_in_genome	crispr_type_by_cas_prot	consensus_repeat	repeat_length	self-targeting_spacer_number	self-targeting_target_number	spacer_location	protospacer_location	repeat_type	spacer_locus_num	spacer_num	correct_crispr_type	genome_cas_prots	unknown_protein_around_crispr	L10	L10_domain	L9	L9_domain	L8	L8_domain	L7	L7_domain	L6	L6_domain	L5	L5_domain	L4	L4_domain	L3	L3_domain	L2	L2_domain	L1	L1_domain	R1	R1_domain	R2	R2_domain	R3	R3_domain	R4	R4_domain	R5	R5_domain	R6	R6_domain	R7	R7_domain	R8	R8_domain	R9	R9_domain	R10	R10_domain
GCA_003697225.1_ASM369722v1	CP033214	Clostridioides difficile strain 12038 chromosome, complete genome	1	32023-32108	1	CRISPRCasFinder	no			Orphan	GTTGGCGCTGTGCATTAGCACTTT	24	1	12	32047-32084|32047-32084|32047-32084|32047-32084|32047-32084|32047-32084|32047-32084|32047-32084|32047-32084|32047-32084|32047-32084|32047-32084	CP033214.1_1140333-1140370|CP033214.1_2994599-2994562|CP033214.1_3793054-3793017|CP033214.1_3923535-3923498|CP033214.1_17816-17853|CP033214.1_134517-134554|CP033214.1_141359-141396|CP033214.1_151875-151912|CP033214.1_158714-158751|CP033214.1_169231-169268|CP033214.1_174645-174682|CP033215.1_3131-3094	NA	1	1	Orphan		NA,NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA
GCA_003697225.1_ASM369722v1	CP033214	Clostridioides difficile strain 12038 chromosome, complete genome	2	149850-149928	2	CRISPRCasFinder	no			Orphan	TGTTTATAATGTGGATAATATTTAA	25	0	0	NA	NA	NA	1	1	Orphan		NA,NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA
GCA_003697225.1_ASM369722v1	CP033214	Clostridioides difficile strain 12038 chromosome, complete genome	3	167204-167282	3	CRISPRCasFinder	no			Orphan	TGTTTATAATGTGGATAATATTTAA	25	0	0	NA	NA	NA	1	1	Orphan		NA,NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA
GCA_003697225.1_ASM369722v1	CP033214	Clostridioides difficile strain 12038 chromosome, complete genome	4	693241-693348	4	CRISPRCasFinder	no			Orphan	TATTAATTGTATTTACTTATTTGATTG	27	0	0	NA	NA	NA	1	1	Orphan		NA,NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA
GCA_003697225.1_ASM369722v1	CP033214	Clostridioides difficile strain 12038 chromosome, complete genome	5	960371-960605	5	CRISPRCasFinder	no			Orphan	AAAATCAAACAGAAAAAATATGTATGGAAGCAGTTA	36	0	0	NA	NA	NA	3	3	Orphan		NA,NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA
GCA_003697225.1_ASM369722v1	CP033214	Clostridioides difficile strain 12038 chromosome, complete genome	6	960697-960934	1,6	PILER-CR,CRISPRCasFinder	no			Orphan	GTAAAAAATCAAACAGAAGAAATATGTATGGAAGCAGTTAG,AAAATCAAACAGAAAAAATATGTATGGAAGCAGTTA	41,36	0	0	NA	NA	NA:NA	2,3	3	Orphan		NA,NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA
GCA_003697225.1_ASM369722v1	CP033214	Clostridioides difficile strain 12038 chromosome, complete genome	7	1336465-1337021	2,7,1	PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT	no			Orphan	GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG,GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG,GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG	29,29,29	1	1	1336691-1336728	CP033214.1_42189-42226	I-A:I-A:I-A	8,8,8	8	Orphan		NA,NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA
GCA_003697225.1_ASM369722v1	CP033214	Clostridioides difficile strain 12038 chromosome, complete genome	8	1672683-1672780	8	CRISPRCasFinder	no			Orphan	TTATATTAACATAACTATATTTTACTTGATAAA	33	0	0	NA	NA	NA	1	1	Orphan		NA,NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA
GCA_003697225.1_ASM369722v1	CP033214	Clostridioides difficile strain 12038 chromosome, complete genome	9	1819440-1821118	3,9,2,4	PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	no			Orphan	GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT,GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT,GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT,GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT	29,29,29,29	0	0	NA	NA	I-A:I-A:I-A:I-A	23,25,25,23	25	Orphan		NA,NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA
GCA_003697225.1_ASM369722v1	CP033214	Clostridioides difficile strain 12038 chromosome, complete genome	10	2146593-2148530	10,3,5	CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	no			Orphan	CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC,CTTTACATACCACATAGTTAATATAAAAC,GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAG	29,29,29	0	0	NA	NA	I-A:I-A:I-A	29,29,28	29	Orphan		NA,NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA
GCA_003697225.1_ASM369722v1	CP033214	Clostridioides difficile strain 12038 chromosome, complete genome	11	2195405-2196167	11,4,6	CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	no			Orphan	ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC,ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC,GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT	29,29,29	0	0	NA	NA	I-A:I-A:I-A	11,11,10	11	Orphan		NA,NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA
GCA_003697225.1_ASM369722v1	CP033214	Clostridioides difficile strain 12038 chromosome, complete genome	12	2306269-2308142	12,5,7	CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	no			Orphan	ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC,ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC,ATTTAAATACATCTCATGTTACTGTTTAAC	30,30,30	0	0	NA	NA	III-B:III-B:III-B	28,28,27	28	Orphan		NA,NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA
GCA_003697225.1_ASM369722v1	CP033214	Clostridioides difficile strain 12038 chromosome, complete genome	13	3038261-3038569	13	CRISPRCasFinder	no			Orphan	TTTCTTTTACAGCTTCTAAACATATA	26	0	0	NA	NA	NA	4	4	Orphan		NA,NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA
GCA_003697225.1_ASM369722v1	CP033214	Clostridioides difficile strain 12038 chromosome, complete genome	14	3038741-3038965	14	CRISPRCasFinder	no			Orphan	TTTCTTTTACAGCTTCTAAACATATA	26	0	0	NA	NA	NA	3	3	Orphan		NA,NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA
GCA_003697225.1_ASM369722v1	CP033214	Clostridioides difficile strain 12038 chromosome, complete genome	15	3039167-3039258	15	CRISPRCasFinder	no			Orphan	TTTCTTTTACAGCTTCTAAACATATA	26	0	0	NA	NA	NA	1	1	Orphan		NA,NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA
GCA_003697225.1_ASM369722v1	CP033214	Clostridioides difficile strain 12038 chromosome, complete genome	16	3240850-3243699	16,6,8	CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	no			Orphan	CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC,CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC,GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG	29,29,29	0	0	NA	NA	I-A:I-A:I-A	43,43,43	43	Orphan		NA,NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA
GCA_003697225.1_ASM369722v1	CP033214	Clostridioides difficile strain 12038 chromosome, complete genome	17	3574229-3575414	7	CRT	no			Orphan	CCNGTTGNNCCNGTTNNTCCNNTTG	25	0	0	NA	NA	NA	20	20	Orphan		NA,NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA
GCA_003697225.1_ASM369722v1	CP033214	Clostridioides difficile strain 12038 chromosome, complete genome	18	3685616-3686226	8	CRT	no			Orphan	CCTGTTGNNCCTGTTNNNCC	20	1	2	3685726-3685750|3685726-3685750	CP033214.1_3686209-3686233|CP033214.1_3686716-3686740	NA	12	12	Orphan		NA,NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA
GCA_003697225.1_ASM369722v1	CP033215	Clostridioides difficile strain 12038 plasmid unnamed1, complete sequence	1	5079-5158	1	CRISPRCasFinder	no			Orphan	TTATAATATTATCCACATTATAAACA	26	0	0	NA	NA	NA	1	1	Orphan		NA,NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA	NA|NA	NA
